【課題】安価かつ簡便に、細胞の種類、状態等を確認するための技術を提供する。
【解決手段】分類モデル生成装置は、未知の細胞が撮像された撮像画像である未知属性撮像画像、又は、前記未知属性撮像画像内の細胞を、細胞の形態的な特徴に基づいて属性毎に分類する分類モデルを生成する分類モデル生成装置であって、既知の同一属性の複数の細胞が撮像された撮像画像である既知同一属性撮像画像から個々の細胞の撮像領域を個々の細胞オブジェクトとして認識する細胞オブジェクト認識部と、前記細胞オブジェクトの形態的特徴量及び前記細胞オブジェクトとして認識された前記細胞の属性に基づいて、前記分類モデルを生成する分類モデル生成部とを備える。 （もっと読む）

【課題】分子グラフに関して、２分子間の原子対応を求め該対応に基づいて２分子を重ね合わせする方法を実現する高速グラフマッチアルゴリズムを提供する。
【解決手段】第１の分子Ａの夫々の原子と第２の分子Ｂの夫々の原子を対応付け（ｍ（Ａｉ）＝Ｂｋ）て重ね合わせ、ＡＢの間の最適な原子間対応を求める方法であって、Ｓ１（Ａｉ，Ｂｋ）、Ｓ２（Ａｉ，Ｂｋ）及びＳ３（Ａｉ，Ｂｋ）の各々を全ての｛ｉ，ｋ｝の組について求める工程と、その工程にて最大のＳ３（Ａｉ，Ｂｋ）を算出した原子（Ａｉ，Ｂｋ）の対応から開始して、未対応の原子の対の中で最大のＳ３（Ａｊ，Ｂｌ）を持つものを対応させることを、対応可能原子の組が無くなるまで続けたときの全体の対応におけるグラフマッチスコアＭ（Ａ，Ｂ）を求める工程と、その工程におけるＭ（Ａ、Ｂ）が閾値より大きいならば、ＡとＢにつき重ね合わせを出力する工程を含む方法を提供する。 （もっと読む）

【課題】稲穂などの穂の分岐構造を含む穂の形態を解析する汎用的な解析装置を提供する。
【解決手段】本発明による植物の穂の分岐構造を解析する解析装置は、穂の画像を採取する画像採取部（１０１）と、該穂の画像から枝および籾を抽出する部分抽出部（１０３）と、枝の分岐の状態を定める分岐状態決定部（１０５）と、枝の分岐の状態に対応した木構造を有するデータファイル（１１５）と、を含む。該分岐状態決定部は、該枝の分岐の状態を該データファイルに格納する。 （もっと読む）

【課題】生体物質情報を格納している複数のデータベースから、必要な情報を簡易に抽出する。
【解決手段】データセンタが、生体物質情報を格納している複数のデータベースからデータをダウンロードし、該データから前記複数の生体物質に関する情報の関連を示すリンク情報、詳細情報、ホモロジー検索のためのデータ、を生成し、これらと生体物質情報データベース間の許容ルートの情報が格納されたルートテーブルとをユーザ施設へ配信し、ユーザ施設が、配信された情報を用いて、ルートテーブル及びリンク情報によって表示された検索ルートで定義された許容ルートのみを追従することでデータ検索を実行する。 （もっと読む）

【課題】タンパク質の立体構造原子座標データを利用して変異型タンパク質のアミノ酸配列を設計する変異型タンパク質のアミノ酸配列設計方法を提供する。
【解決手段】目的のタンパク質の立体構造原子座標データを入力し、該タンパク質のアミノ酸配列の中から変異の対象とする部位を指定し、該タンパク質の立体構造原子座標データを用いて、指定された変異対象部位を含む部分セグメントの主鎖のコンフォメーションを特定する。特定された主鎖コンフォメーションを安定に形成するアミノ酸配列を予測する処理を行い、予測された安定形成アミノ酸配列を用いて、変異対象部位のアミノ酸残基に置き換えて導入される他の種類のアミノ酸残基を選定する。選定された置換後アミノ酸残基を利用して変異型タンパク質のアミノ酸配列を設計する。 （もっと読む）

【課題】特定の化合物に偏ったタンパク質の構造変化の影響を軽減し、より精度の高いドッキングシミュレーションとシミュレーション結果に基づくｉｎ ｓｉｌｉｃｏスクリーニングを実現する。
【解決手段】スクリーニング対象となる化合物ライブラリーの中から化合物の属性情報に基づいて複数の化合物を選択し、複数の化合物の各化合物とタンパク質とのドッキングシミュレーションにより複数の化合物の各化合物とタンパク質との結合様式を生成し、構造を最適化してタンパク質の結合部位に対応する複数の鋳型ポケット構造を生成し、生成した複数の鋳型ポケット構造の各ポケット構造と化合物ライブラリーの各化合物とのドッキングシミュレーションにより、化合物ライブラリーの各化合物と各ポケット構造との結合様式をそれぞれ生成し、化合物ライブラリーの各化合物と各ポケット構造との結合様式に関するパラメータを算出する。 （もっと読む）

【課題】血液中のアミノ酸の濃度を利用してＩＢＤの状態を精度よく評価することができるＩＢＤの評価方法、ならびにアミノ酸情報処理装置、アミノ酸情報処理方法、アミノ酸情報処理システム、アミノ酸情報処理プログラムおよび記録媒体を提供することを課題とする。
【解決手段】本発明にかかるＩＢＤの評価方法は、評価対象から採取した血液からアミノ酸濃度データを測定し、測定した評価対象のアミノ酸濃度データに基づいて評価対象につき炎症性腸疾患の状態を評価する。 （もっと読む）

【課題】 蛋白質折り畳みの基本構造の形成を描写、分析及び予測する方法、アルゴリズム及び応用を提供する。
【解決手段】 本発明の蛋白質折り畳みコ−ドの方法及びアルゴリズムは、あらゆる種類の蛋白質の立体構造の分析及び描写、特に蛋白質及び蛋白質セグメントに関する幾何構造の分析及び描写に対して適用可能である。本発明は、既知のデ−タを利用して、蛋白質の五つのアミノ酸セグメント毎に、主な炭素チェ−ン原子の二面角及び伸展距離を導出し、それにより生じる２７個の折り畳みコ−ドベクトルが、蛋白質の折り畳み構造を連続的に描写する。本発明の蛋白質折り畳みコ−ドの方法、アルゴリズム及び応用は、パソコン技術及びソフトウエアプログラムを通じて表現可能であり、更に他の核酸や炭水化物、糖蛋白質等の生物分子の３Ｄ構造の描写、分析及び予測に応用できる。又、有機分子の立体構造を描写するツ−ルとなり、特に薬物の設計及び開発の応用に適合する。 （もっと読む）

【課題】PPI（PPI:Protein-Protein-Interaction）ネットワーク上において、タンパク質の機能経路の探索を行う方法を提供する。
【課題を解決するための手段】
PPIネットワーク上のタンパク質の機能経路探索システムは、上記タンパク質の２項間関係情報を用いて、上記入力装置を介して入力されたタンパク質を始点とするPPIネットワークを作成する手段と、上記タンパク質の機能情報を用いて、上記PPIネットワーク上において上記入力装置を介して入力された機能と同一の機能を有するタンパク質を探索する手段と、上記探索したタンパク質の連鎖からなる機能経路を作成する手段と、上記PPIネットワーク上に上記機能経路を表示する手段と、を有する。 （もっと読む）

【課題】非結合構造に関するエネルギー項を用いて教師付き学習を行うことで、スコアリングに関する最適な予測モデルを構築し、従来よりも高い精度で蛋白質・化合物間の結合配座や結合能を予測できる仮想スクリーニング方法及び装置を提供する。
【解決手段】配座サンプリング手段２１により化合物の多様な配座を生成し、エネルギー計算手段２２により、生成した配座に対して、スコアリング関数を構成するエネルギー値の計算を行う。また、学習手段２３により、化合物の配座に対するエネルギー値と結合指標とを用いた教師付き学習を行って予測モデルを学習する。そして、予測スコア計算手段２４により、予測スコアを計算し、化合物の結合配座及び結合能を予測する。 （もっと読む）

【課題】標的物質と親和性を有するアプタマーなどの核酸分子の塩基配列のうち、各塩基配列の共通性と、塩基配列の有する親和性に関する評価値とに基づいて、標的物質との親和性の発現に必要な塩基配列を同定する方法、及び同定された塩基配列を含む核酸分子の二次構造を予測する方法、並びにこれらの方法を実行する装置及びプログラムを提供する。
【解決手段】標的物質への親和性を有する核酸分子の塩基配列のうち、前記親和性の発現に必要な塩基配列の同定方法であって：前記核酸分子の塩基配列から、ステム構造を形成し得る塩基を除外して一本鎖領域を抽出する工程と；前記一本鎖領域から、前記親和性の評価値に基づいて、モチーフ配列を探索する工程と；
を有することを特徴とする。 （もっと読む）

【課題】複数の一般薬の成分と処方薬との間のすべての相互作用をわかり易く利用者に通知し、利用者の負担を軽減させること。
【解決手段】相互作用分析装置１００は、一般薬に含まれる成分と処方薬とを併用した場合の利用者に与える作用の情報を記憶部１４０に記憶し、相互関係検索部１５０ａが、この記憶部１４０に記憶された情報に基づいて一般薬の成分と処方薬とを併用した場合の危険度を判定し、一般薬の成分と処方薬とを危険度に応じた特徴を付加して対応付けたマップ情報を生成し、マップ表示処理部１５０ｃがマップ情報に基づいた分析結果マップをディスプレイ（出力部１２０）に表示させる。 （もっと読む）

【課題】高密度なＳＮＰアレイデータを用いた薬剤の感受性予測に有用な遺伝子座の同定方法を提供する。
【解決手段】
ＳＮＰアレイデータに含まれる複数のマーカＩＤを、染色体上の物理位置情報を用いてそれぞれのマーカＩＤが属するサイトジェネティックバンド毎のリストに分類する（ステップＳ１１）。次に、複数の細胞株を薬剤への感受性の高さに応じて順位付けし（ステップＳ１２）、順位付けされた細胞株を高感受性株群と低感受性株群とに分類して（ステップＳ１３）、両群間でＤＮＡコピー数が有意に異なるマーカＩＤをｔ−検定により算出する（ステップＳ１４）。次に、ｔ−検定により算出されたマーカＩＤの集団（ｍ）と、各サイトジェネティックバンドに分類されたマーカＩＤの集団（ｎ）との間で、所定数以上のマーカＩＤが重複する確率を算出して類似性分析を行い（ステップＳ１６）、分析結果が所定条件を満たすサイトジェネティックバンドを選出する（ステップＳ１８）。 （もっと読む）

【課題】エクソンアレイから得られたエクソン発現データの解析システム及び解析方法を用いた、疾患特異的選択的スプライシング同定法を提供する。
【解決手段】ｍＲＮＡをエクソン・アレイに入力し（５０１）、エクソン・アレイがｍＲＮＡに含まれるエクソンを検出し（５０２）、エクソン・アレイにより検出された観測データをコンピュータに入力し（５０３）、ＣＰＵによる観測データの統計処理からエクソン発現プロファイルを算出し（５０４）、算出されたエクソン発現プロファイルを記憶装置に記憶し（５０５）、記憶されている複数のサンプルに関するエクソン発現プロファイルをＣＰＵで比較し（５０６）、比較結果を出力する（５０７）。 （もっと読む）

【課題】範囲を伴う特許情報を有する特許文献からなる特許群において、特許情報同士の関係を整理し分析するための特許マップを作成するシステムを提供すること。
【解決手段】１）分析対象特許群における特許情報を種類別に細分類するための基準を設ける手段、
２）上記特許群における各特許を、上記手段１）で定めた細分類の基準に従ってそれぞれ細分類する手段、
３）上記手段１）で細分類した特許情報同士の全ての組合せを作成する手段、
４）上記手段２）で細分類した特許情報同士の全ての組合せを作成する手段、
５）上記手段３）で作成した全ての組合せの中で、上記手段４）で作成した組合せが存在する部分を明示する手段、
を有する特許マップ作成システム。 （もっと読む）

【課題】遺伝子発現解析結果のデータに含まれる欠損値に対して意味のあるデータを予測することができる遺伝子発現解析の欠損値補完システムを提供する。
【解決手段】遺伝子発現解析の欠損値補完システムは、欠損値補完処理を行う対象のデータセットから仮データセットを生成する仮データセット生成部と、上記仮データセットに対してクラスタ解析を行い、非類似のデータを除去するクラスタ解析部と、上記クラスタ解析結果に基づいて、トレーニングデータを生成するトレーニングデータ生成部と、上記トレーニングデータをデータ学習プログラムに入力して分類器を作成する分類器作成部と、上記欠損値を含むデータから生成した入力データを上記分類器に入力して、欠損値を予測する欠損値予測部と、を有する。 （もっと読む）

【課題】高速かつ安価な化学構造検索手法を開発すること。
【解決手段】コンピュータに入力された化合物の化学構造を、原子に対応するノードと、原子間の結合に対応するエッジからなる木構造として表現し、ノードの１つからルートノードを選択し、該ルートノードから深さ優先探索により経路決定を行い、該決定された経路に従い該化合物の化学構造を文字列化する手段と、
該木構造を基に、該化合物を構成する全ての部分構造を文字列化する手段と、
得られた化合物の化学構造の文字列化表現及び化合物の部分構造の文字列化表現を、該化合物を識別するユニークなＩＤと共に、化学構造データベースとして記録保存するための記憶媒体と
を備える、所定の部分構造を有する化合物を検索するための化学構造検索システム、ならびに、該システムを用いる化学構造の検索方法。 （もっと読む）

【課題】有害事象などが起こった場合の原因追求に好適な臨床試験の支援システムを提供する。
【解決手段】臨床試験データベース４２０に治験依頼者に関する情報、治験実施機関に関する情報、治験薬の製品名、分類区分、化学構造式、体内動態を含むプロダクト情報、治験名称、対象疾患、相、終了状態を含む治験情報、治験実施機関名、契約症例数、終了状態を含む契約情報、性別、生年月日、身長、体重、終了状態を含む被験者情報、来院日、検査結果、医用画像データを含むVISIT情報等を記憶し、情報制御機構４１０によって治験依頼者及び治験実施機関に対して有害事象分析のための検索インタフェースの配信及び検索結果の配信処理を行う。 （もっと読む）

【課題】大規模な化合物ライブラリの中から特定の観点／特性の下、クエリ化合物と類似の化合物を検索する方法を提供する。
【解決手段】特性・部分構造関連情報記憶領域１２１と、重要度スコア及び類似度スコア導出関数情報記憶領１２２を有する化合物データベース１２０と、検索すべき化合物情報の入力手段である入出力端末１５０と、特性別スコアを用いて類似化合物を検索する手段であるデータベース制御機構１３０と、検索した結果を特性別にクエリ化合物との類似度順で表示する手段である情報制御機構１１０を具備し、入出力端末１５０から入力した化合物をキーとして検索し、結果を特性別に類似度順で表示する。 （もっと読む）

【課題】本発明の実施形態は、遺伝子ネットワークを含む、複雑な生物学的情報の解析に対する新規の推論法の適用を含む。新規方法は、ベイズ推論法の修正、および発現遺伝子間の因果関係を決定するための、およびある実施形態においては、調節遺伝子の上流エフェクターを決定するための当該方法の適用を含む。
【解決手段】ベイズ法の追加的な修正は、発現遺伝子間の因果関係を推論するための経時的データの使用および遺伝子破壊データの使用を含む。他の実施形態は、より正確に発現遺伝子間のネットワーク情報を提供するためのブートストラップ法の使用およびエッジ効果の決定を含む。遺伝子ネットワークについての情報は記憶装置に格納され得るとともに出力装置に転送され得るか、または遠隔地に転送され得る。 （もっと読む）