アジペート、ヘキサメチレンジアミン、及び6−アミノカプロン酸の生合成のための微生物及び方法
本発明は、6-アミノカプロン酸、カプロラクタム、ヘキサメチレンジアミン、又はレブリン酸経路を有する天然に存在しない微生物生物体を提供する。微生物生物体は、6-アミノカプロン酸、カプロラクタム、ヘキサメチレンジアミン、又はレブリン酸経路それぞれにおける酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含有する。本発明は、6-アミノカプロン酸、カプロラクタム、ヘキサメチレンジアミン、又はレブリン酸を産生するための方法をさらに提供する。方法は、6-アミノカプロン酸、カプロラクタム、又はヘキサメチレンジアミンを産生する微生物生物体を培養することを含むことができ、微生物生物体は、6-アミノカプロン酸、カプロラクタム、ヘキサメチレンジアミン、又はレブリン酸経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を、それぞれの産物を産生するのに十分な量で、6-アミノカプロン酸、カプロラクタム、ヘキサメチレンジアミン、又はレブリン酸を産生するための条件下で、且つそれに十分な期間、発現する。
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【特許請求の範囲】
【請求項1】
6-アミノカプロン酸を産生するのに十分な量で発現される6-アミノカプロン酸経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含む6-アミノカプロン酸経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該6-アミノカプロン酸経路は、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノイル-CoAデヒドラターゼ;6-アミノヘキサ-2-エノイル-CoAレダクターゼ;及び6-アミノカプロイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ、6-アミノカプロイル-CoAシンターゼ、又は6-アミノカプロイル-CoAヒドロラーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項2】
6-アミノカプロン経路酵素をそれぞれコードする2つの外因性の核酸を含む、請求項1記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項3】
6-アミノカプロン経路酵素をそれぞれコードする3つの外因性の核酸を含む、請求項1記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項4】
6-アミノカプロン経路酵素をそれぞれコードする4つの外因性の核酸を含む、請求項1記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項5】
6-アミノカプロン経路酵素をそれぞれコードする5つの外因性の核酸を含む、請求項1記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項6】
前記5つの外因性の核酸が、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノイル-CoAデヒドラターゼ;6-アミノヘキサ-2-エノイル-CoAレダクターゼ;及び6-アミノカプロイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ、6-アミノカプロイル-CoAシンターゼ、又は6-アミノカプロイル-CoAヒドロラーゼをコードする、請求項5記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項7】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項1記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項8】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項1記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項9】
6-アミノカプロン酸を産生するための方法であって、6-アミノカプロン酸を産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項1記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項10】
前記天然に存在しない微生物生物体が、実質的に嫌気性の培地中にある、請求項9記載の方法。
【請求項11】
前記微生物生物体が、6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする2つの外因性の核酸を含む、請求項9記載の方法。
【請求項12】
前記微生物生物体が、6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする3つの外因性の核酸を含む、請求項9記載の方法。
【請求項13】
前記微生物生物体が、6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする4つの外因性の核酸を含む、請求項9記載の方法。
【請求項14】
前記微生物生物体が、6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする4つの外因性の核酸を含む、請求項9記載の方法。
【請求項15】
前記4つの外因性の核酸が、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノイル-CoAデヒドラターゼ;6-アミノヘキサ-2-エノイル-CoAレダクターゼ;及び6-アミノカプロイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ、6-アミノカプロイル-CoAシンターゼ、又は6-アミノカプロイル-CoAヒドロラーゼをコードする、請求項14記載の方法。
【請求項16】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項9記載の方法。
【請求項17】
6-アミノカプロン酸を産生するのに十分な量で発現される6-アミノカプロン酸経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含む6-アミノカプロン酸経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該6-アミノカプロン酸経路は、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAシンターゼ、又は3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAヒドロラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノエートレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノエートデヒドラターゼ;及び6-アミノヘキサ-2-エノエートレダクターゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項18】
6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする2つの外因性の核酸を含む、請求項17記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項19】
6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする3つの外因性の核酸を含む、請求項17記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項20】
6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする4つの外因性の核酸を含む、請求項17記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項21】
6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする5つの外因性の核酸を含む、請求項17記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項22】
前記5つの外因性の核酸が、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAシンターゼ、又は3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAヒドロラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノエートレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノエートデヒドラターゼ;及び6-アミノヘキサ-2-エノエートレダクターゼをコードする、請求項21記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項23】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項17記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項24】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項17記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項25】
6-アミノカプロン酸を産生するための方法であって、6-アミノカプロン酸を産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項17記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項26】
前記天然に存在しない微生物生物体が、実質的に嫌気性の培地中にある、請求項25記載の方法。
【請求項27】
前記微生物生物体が、6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする2つの外因性の核酸を含む、請求項25記載の方法。
【請求項28】
前記微生物生物体が、6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする3つの外因性の核酸を含む、請求項25記載の方法。
【請求項29】
前記微生物生物体が、6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする4つの外因性の核酸を含む、請求項25記載の方法。
【請求項30】
前記微生物生物体が、6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする5つの外因性の核酸を含む、請求項25記載の方法。
【請求項31】
前記5つの外因性の核酸が、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAシンターゼ、又は3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAヒドロラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノエートレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノエートデヒドラターゼ;及び6-アミノヘキサ-2-エノエートレダクターゼをコードする、請求項30記載の方法。
【請求項32】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項25記載の方法。
【請求項33】
カプロラクタムを産生するのに十分な量で発現されるカプロラクタム経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むカプロラクタム経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該カプロラクタム経路は、6-アミノカプロイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ又は6-アミノカプロイル-CoAシンターゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項34】
前記外因性の核酸が、6-アミノカプロイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼをコードする、請求項33記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項35】
前記外因性の核酸が、6-アミノカプロイル-CoAシンターゼをコードする、請求項33記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項36】
6-アミノカプロン酸経路をさらに含む、請求項33記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項37】
前記6-アミノカプロン酸経路が、CoA依存性のアルデヒドデヒドロゲナーゼ;及びトランスアミナーゼ又は6-アミノカプロエートデヒドロゲナーゼを含む、請求項36記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項38】
前記6-アミノカプロン酸経路が、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAシンターゼ、又は3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAヒドロラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノエートレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノエートデヒドラターゼ;及び6-アミノヘキサ-2-エノエートレダクターゼを含む、請求項36記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項39】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項33記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項40】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項33記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項41】
カプロラクタムを産生するための方法であって、カプロラクタムを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項33記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項42】
カプロラクタムが、6-アミノカプロイル-CoAのカプロラクタムへの自発的な環化によって産生される、請求項41記載の方法。
【請求項43】
前記天然に存在しない微生物生物体が、実質的に嫌気性の培地中にある、請求項41記載の方法。
【請求項44】
前記外因性の核酸が、6-アミノカプロイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼをコードする、請求項41記載の方法。
【請求項45】
前記外因性の核酸が、6-アミノカプロイル-CoAシンターゼをコードする、請求項41記載の方法。
【請求項46】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項41記載の方法。
【請求項47】
ヘキサメチレンジアミンを産生するのに十分な量で発現されるヘキサメチレンジアミン経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むヘキサメチレンジアミン経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該ヘキサメチレンジアミン経路は、6-アミノカプロイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ又は6-アミノカプロイル-CoAシンターゼ;6-アミノカプロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);及びヘキサメチレンジアミントランスアミナーゼ又はヘキサメチレンジアミンデヒドロゲナーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項48】
6-アミノカプロン酸経路をさらに含む、請求項47記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項49】
前記6-アミノカプロン酸経路が、CoA依存性のアルデヒドデヒドロゲナーゼ;及びトランスアミナーゼ又は6-アミノカプロエートデヒドロゲナーゼを含む、請求項48記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項50】
前記6-アミノカプロン酸経路が、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAシンターゼ、又は3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAヒドロラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノエートレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノエートデヒドラターゼ;及び6-アミノヘキサ-2-エノエートレダクターゼを含む、請求項48記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項51】
ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする2つの外因性の核酸を含む、請求項47記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項52】
ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする3つの外因性の核酸を含む、請求項47記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項53】
前記3つの外因性の核酸が、6-アミノカプロイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ又は6-アミノカプロイルCoAシンターゼ;6-アミノカプロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);及びヘキサメチレンジアミントランスアミナーゼ又はヘキサメチレンジアミンデヒドロゲナーゼをコードする、請求項52記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項54】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項47記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項55】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項47記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項56】
ヘキサメチレンジアミンを産生するための方法であって、ヘキサメチレンジアミンを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項47記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項57】
前記天然に存在しない微生物生物体が、実質的に嫌気性の培地中にある、請求項56記載の方法。
【請求項58】
前記微生物生物体が、ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする2つの外因性の核酸を含む、請求項56記載の方法。
【請求項59】
前記微生物生物体が、ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする3つの外因性の核酸を含む、請求項56記載の方法。
【請求項60】
前記3つの外因性の核酸が、6-アミノカプロイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ又は6-アミノカプロイルCoAシンターゼ;6-アミノカプロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);及びヘキサメチレンジアミントランスアミナーゼ又はヘキサメチレンジアミンデヒドロゲナーゼをコードする、請求項59記載の方法。
【請求項61】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項56記載の方法。
【請求項62】
カプロラクタムを産生するのに十分な量で発現されるカプロラクタム経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むカプロラクタム経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該カプロラクタム経路は、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノイル-CoAデヒドラターゼ;及び6-アミノヘキサ-2-エノイル-CoAレダクターゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項63】
カプロラクタム経路酵素をそれぞれコードする2つの外因性の核酸を含む、請求項62記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項64】
カプロラクタム経路酵素をそれぞれコードする3つの外因性の核酸を含む、請求項62記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項65】
カプロラクタム経路酵素をそれぞれコードする4つの外因性の核酸を含む、請求項62記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項66】
前記4つの外因性の核酸が、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノイル-CoAデヒドラターゼ;及び6-アミノヘキサ-2-エノイル-CoAレダクターゼをコードする、請求項65記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項67】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項62記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項68】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項62記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項69】
カプロラクタムを産生するための方法であって、カプロラクタムを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項62記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項70】
カプロラクタムが、6-アミノカプロイル-CoAのカプロラクタムへの自発的な環化によって産生される、請求項69記載の方法。
【請求項71】
前記天然に存在しない微生物生物体が、実質的に嫌気性の培地中にある、請求項69記載の方法。
【請求項72】
前記微生物生物体が、カプロラクタム経路酵素をそれぞれコードする2つの外因性の核酸を含む、請求項69記載の方法。
【請求項73】
前記微生物生物体が、カプロラクタム経路酵素をそれぞれコードする3つの外因性の核酸を含む、請求項69記載の方法。
【請求項74】
前記微生物生物体が、カプロラクタム経路酵素をそれぞれコードする4つの外因性の核酸を含む、請求項69記載の方法。
【請求項75】
前記4つの外因性の核酸が、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノイル-CoAデヒドラターゼ;及び6-アミノヘキサ-2-エノイル-CoAレダクターゼをコードする、請求項74記載の方法。
【請求項76】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項69記載の方法。
【請求項77】
ヘキサメチレンジアミンを産生するのに十分な量で発現されるヘキサメチレンジアミン経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むヘキサメチレンジアミン経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該ヘキサメチレンジアミン経路は、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノイル-CoAデヒドラターゼ;6-アミノヘキサ-2-エノイル-CoAレダクターゼ;6-アミノカプロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);及びヘキサメチレンジアミントランスアミナーゼ又はヘキサメチレンジアミンデヒドロゲナーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項78】
ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする2つの外因性の核酸を含む、請求項77記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項79】
ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする3つの外因性の核酸を含む、請求項77記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項80】
ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする4つの外因性の核酸を含む、請求項77記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項81】
ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする5つの外因性の核酸を含む、請求項77記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項82】
ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする6つの外因性の核酸を含む、請求項77記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項83】
前記6つの外因性の核酸が、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノイル-CoAデヒドラターゼ;6-アミノヘキサ-2-エノイル-CoAレダクターゼ;6-アミノカプロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);及びヘキサメチレンジアミントランスアミナーゼ又はヘキサメチレンジアミンデヒドロゲナーゼをコードする、請求項82記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項84】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項77記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項85】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項77記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項86】
ヘキサメチレンジアミンを産生するための方法であって、ヘキサメチレンジアミンを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項77記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項87】
前記天然に存在しない微生物生物体が、実質的に嫌気性の培地中にある、請求項86記載の方法。
【請求項88】
前記微生物生物体が、ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする2つの外因性の核酸を含む、請求項86記載の方法。
【請求項89】
前記微生物生物体が、ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする3つの外因性の核酸を含む、請求項86記載の方法。
【請求項90】
前記微生物生物体が、ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする4つの外因性の核酸を含む、請求項86記載の方法。
【請求項91】
前記微生物生物体が、ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする5つの外因性の核酸を含む、請求項86記載の方法。
【請求項92】
前記微生物生物体が、ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする6つの外因性の核酸を含む、請求項86記載の方法。
【請求項93】
前記4つの外因性の核酸が、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノイル-CoAデヒドラターゼ;6-アミノヘキサ-2-エノイル-CoAレダクターゼ;6-アミノカプロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);及びヘキサメチレンジアミントランスアミナーゼ又はヘキサメチレンジアミンデヒドロゲナーゼをコードする、請求項92記載の方法。
【請求項94】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項86記載の方法。
【請求項95】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含む6-ACA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該6-ACA経路は、4-ヒドロキシ-2-オキソヘプタン-1,7-ジオエート(HODH)アルドラーゼ、2-オキソヘプタ-4-エン-1,7-ジオエート(OHED)ヒドラターゼ、2-オキソヘプタ-4-エン-1,7-ジオエート(OHED)レダクターゼ、2-オキソヘプタン-1,7-ジオエート(2-OHD)デカルボキシラーゼ、アジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ、アジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)、2-オキソヘプタ-4-エン-1,7-ジオエート(OHED)デカルボキシラーゼ、6-オキソヘキサ-4-エノエート(6-OHE)レダクターゼ、2-オキソヘプタン-1,7-ジオエート(2-OHD)アミノトランスフェラーゼ、2-オキソヘプタン-1,7-ジオエート(2-OHD)オキシドレダクターゼ(アミノ化)、2-アミノヘプタン-1,7-ジオエート(2-AHD)デカルボキシラーゼ、2-オキソヘプタ-4-エン-1,7-ジオエート(OHED)アミノトランスフェラーゼ、2-オキソヘプタ-4-エン-1,7-ジオエート(OHED)オキシドレダクターゼ(アミノ化)、2-アミノヘプタ-4-エン-1,7-ジオエート(2-AHE)レダクターゼ、4-ヒドロキシ-2-オキソヘプタン-1,7-ジオエート(HODH)ギ酸リアーゼ、4-ヒドロキシ-2-オキソヘプタン-1,7-ジオエート(HODH)デヒドロゲナーゼ、3-ヒドロキシアジピル-CoAデヒドラターゼ、2,3-デヒドロアジピル-CoAレダクターゼ、アジピル-CoAデヒドロゲナーゼ、2-オキソヘプタ-4-エン-1,7-ジオエート(OHED)ギ酸リアーゼ、2-オキソヘプタ-4-エン-1,7-ジオエート(OHED)デヒドロゲナーゼ、2-オキソヘプタン-1,7-ジオエート(2-OHD)ギ酸リアーゼ、2-オキソヘプタン-1,7-ジオエート(2-OHD)デヒドロゲナーゼ、又はピルビン酸ギ酸リアーゼ活性化酵素を含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項96】
6-ACA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該6-ACA経路が、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDレダクターゼ;2-OHDデカルボキシラーゼ;又はアジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ若しくはアジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)を含む、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項97】
6-ACA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該6-ACA経路が、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDデカルボキシラーゼ;6-OHEレダクターゼ;又はアジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ若しくはアジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)を含む、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項98】
6-ACA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該6-ACA経路が、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDアミノトランスフェラーゼ若しくはOHEDオキシドレダクターゼ(アミノ化);2-AHEレダクターゼ;又は2-AHDデカルボキシラーゼを含む、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項99】
6-ACA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該6-ACA経路が、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDレダクターゼ;2-OHDアミノトランスフェラーゼ若しくは2-OHDオキシドレダクターゼ(アミノ化);又は2-AHDデカルボキシラーゼを含む、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項100】
6-ACA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該6-ACA経路が、HODHアルドラーゼ;HODHギ酸リアーゼ及びピルビン酸ギ酸リアーゼ活性化酵素若しくはHODHデヒドロゲナーゼ;3-ヒドロキシアジピル-CoAデヒドラターゼ;2,3-デヒドロアジピル-CoAレダクターゼ;アジピル-CoAデヒドロゲナーゼ;又はアジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ若しくはアジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)を含む、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項101】
6-ACA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該6-ACA経路が、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDギ酸リアーゼ及びピルビン酸ギ酸リアーゼ活性化酵素若しくはOHEDデヒドロゲナーゼ;2,3-デヒドロアジピル-CoAレダクターゼ;アジピル-CoAデヒドロゲナーゼ;又はアジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ若しくはアジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)を含む、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項102】
6-ACA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該6-ACA経路が、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDレダクターゼ;2-OHDギ酸リアーゼ及びピルビン酸ギ酸リアーゼ活性化酵素若しくは2-OHDデヒドロゲナーゼ;アジピル-CoAデヒドロゲナーゼ;又はアジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ若しくはアジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)を含む、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項103】
6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDレダクターゼ;2-OHDデカルボキシラーゼ;及びアジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ又はアジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)をコードする、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項104】
6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDデカルボキシラーゼ;6-OHEレダクターゼ;及びアジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ又はアジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)をコードする、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項105】
6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDアミノトランスフェラーゼ又はOHEDオキシドレダクターゼ(アミノ化);2-AHEレダクターゼ;及び2-AHDデカルボキシラーゼをコードする、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項106】
6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDレダクターゼ;2-OHDアミノトランスフェラーゼ又は2-OHDレダクターゼ(アミノ化);及び2-AHDデカルボキシラーゼをコードする、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項107】
6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、HODHアルドラーゼ;HODHギ酸リアーゼ及びピルビン酸ギ酸リアーゼ活性化酵素又はHODHデヒドロゲナーゼ;3-ヒドロキシアジピル-CoAデヒドラターゼ;2,3-デヒドロアジピル-CoAレダクターゼ;アジピル-CoAデヒドロゲナーゼ;及びアジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ又はアジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)をコードする、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項108】
6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDギ酸リアーゼ及びピルビン酸ギ酸リアーゼ活性化酵素又はOHEDデヒドロゲナーゼ;2,3-デヒドロアジピル-CoAレダクターゼ;アジピル-CoAデヒドロゲナーゼ;及びアジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ又はアジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)をコードする、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項109】
6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDレダクターゼ;2-OHDギ酸リアーゼ及びピルビン酸ギ酸リアーゼ活性化酵素又は2-OHDデヒドロゲナーゼ;アジピル-CoAデヒドロゲナーゼ;及びアジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ又はアジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)をコードする、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項110】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項111】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項112】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項1記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項113】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項112記載の方法。
【請求項114】
前記条件が、浸透圧保護剤をさらに含む、請求項112記載の方法。
【請求項115】
前記浸透圧保護剤が、グリシンベタインである、請求項114記載の方法。
【請求項116】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該HMDA経路は、6-アミノカプロエートキナーゼ、[(6-アミノヘキサノイル)オキシ]ホスホネート(6-AHOP)オキシドレダクターゼ、6-アミノカプロン酸セミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ、6-アミノカプロン酸セミアルデヒドキシドレダクターゼ(アミノ化)、6-アミノカプロエートN-アセチルトランスフェラーゼ、6-アセトアミドヘキサノエートキナーゼ、[(6-アセトアミドヘキサノイル)オキシ]ホスホネート(6-AAHOP)オキシドレダクターゼ、6-アセトアミドヘキサナールアミノトランスフェラーゼ、6-アセトアミドヘキサナールオキシドレダクターゼ(アミノ化)、6-アセトアミドヘキサンアミンN-アセチルトランスフェラーゼ、6-アセトアミドヘキサンアミンヒドロラーゼ(アミド)、6-アセトアミドヘキサノエートCoAトランスフェラーゼ、6-アセトアミドヘキサノエートCoAリガーゼ、6-アセトアミドヘキサノイル-CoAオキシドレダクターゼ、[(6-アセトアミドヘキサノイル)オキシ]ホスホネート(6-AAHOP)アシルトランスフェラーゼ、[(6-アミノヘキサノイル)オキシ]ホスホネート(6-AHOP)アシルトランスフェラーゼ、6-アミノカプロエートCoAトランスフェラーゼ、及び6-アミノカプロエートCoAリガーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項117】
HMDA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該HMDA経路が、6-アミノカプロエートキナーゼ;6-AHOPオキシドレダクターゼ;又は6-アミノカプロン酸セミアルデヒドキシドレダクターゼ(アミノ化)若しくは6-アミノカプロン酸セミアルデヒドアミノトランスフェラーゼを含む、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項118】
HMDA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該HMDA経路が、6-アミノカプロエートキナーゼ;6-AHOPアシルトランスフェラーゼ;6-アミノカプロイル-CoAオキシドレダクターゼ;又は6-アミノカプロン酸セミアルデヒドキシドレダクターゼ(アミノ化)若しくは6-アミノカプロン酸セミアルデヒドアミノトランスフェラーゼを含む、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項119】
HMDA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該HMDA経路が、6-アミノカプロエートCoAトランスフェラーゼ若しくは6-アミノカプロエートCoAリガーゼ;6-アミノカプロイル-CoAオキシドレダクターゼ;又は6-アミノカプロン酸セミアルデヒドキシドレダクターゼ(アミノ化)若しくは6-アミノカプロン酸セミアルデヒドアミノトランスフェラーゼを含む、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項120】
HMDA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該HMDA経路が、6-アミノカプロエートN-アセチルトランスフェラーゼ;6-アセトアミドヘキサノエートキナーゼ;6-AAHOPオキシドレダクターゼ;6-アセトアミドヘキサナールアミノトランスフェラーゼ若しくは6-アセトアミドヘキサナールオキシドレダクターゼ(アミノ化);又は6-アセトアミドヘキサンアミンN-アセチルトランスフェラーゼ若しくは6-アセトアミドヘキサンアミンヒドロラーゼ(アミド)を含む、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項121】
HMDA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該HMDA経路が、6-アミノカプロエートN-アセチルトランスフェラーゼ;6-アセトアミドヘキサノエートCoAトランスフェラーゼ若しくは6-アセトアミドヘキサノエートCoAリガーゼ;6-アセトアミドヘキサノイル-CoAオキシドレダクターゼ;6-アセトアミドヘキサナールアミノトランスフェラーゼ若しくは6-アセトアミドヘキサナールオキシドレダクターゼ(アミノ化);又は6-アセトアミドヘキサンアミンN-アセチルトランスフェラーゼ若しくは6-アセトアミドヘキサンアミンヒドロラーゼ(アミド)を含む、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項122】
HMDA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該HMDA経路が、6-アミノカプロエートN-アセチルトランスフェラーゼ;6-アセトアミドヘキサノエートキナーゼ;6-AAHOPオキシドレダクターゼ;6-アセトアミドヘキサナールアミノトランスフェラーゼ若しくは6-アセトアミドヘキサナールオキシドレダクターゼ(アミノ化);又は6-アセトアミドヘキサンアミンN-アセチルトランスフェラーゼ若しくは6-アセトアミドヘキサンアミンヒドロラーゼ(アミド)を含む、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項123】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、6-アミノカプロエートキナーゼ;6-AHOPオキシドレダクターゼ;及び6-アミノカプロン酸セミアルデヒドキシドレダクターゼ(アミノ化)又は6-アミノカプロン酸セミアルデヒドアミノトランスフェラーゼをコードする、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項124】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、6-アミノカプロエートキナーゼ;6-AHOPアシルトランスフェラーゼ;6-アミノカプロイル-CoAオキシドレダクターゼ;及び6-アミノカプロン酸セミアルデヒドキシドレダクターゼ(アミノ化)又は6-アミノカプロン酸セミアルデヒドアミノトランスフェラーゼをコードする、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項125】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、6-アミノカプロエートCoAトランスフェラーゼ又は6-アミノカプロエートCoAリガーゼ;6-アミノカプロイル-CoAオキシドレダクターゼ;及び6-アミノカプロン酸セミアルデヒドキシドレダクターゼ(アミノ化)又は6-アミノカプロン酸セミアルデヒドアミノトランスフェラーゼをコードする、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項126】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、6-アミノカプロエートN-アセチルトランスフェラーゼ;6-アセトアミドヘキサノエートキナーゼ;6-AAHOPオキシドレダクターゼ;6-アセトアミドヘキサナールアミノトランスフェラーゼ又は6-アセトアミドヘキサナールオキシドレダクターゼ(アミノ化);及び6-アセトアミドヘキサンアミンN-アセチルトランスフェラーゼ又は6-アセトアミドヘキサンアミンヒドロラーゼ(アミド)をコードする、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項127】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、6-アミノカプロエートN-アセチルトランスフェラーゼ;6-アセトアミドヘキサノエートCoAトランスフェラーゼ又は6-アセトアミドヘキサノエートCoAリガーゼ;6-アセトアミドヘキサノイル-CoAオキシドレダクターゼ;6-アセトアミドヘキサナールアミノトランスフェラーゼ又は6-アセトアミドヘキサナールオキシドレダクターゼ(アミノ化);及び6-アセトアミドヘキサンアミンN-アセチルトランスフェラーゼ又は6-アセトアミドヘキサンアミンヒドロラーゼ(アミド)をコードする、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項128】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、6-アミノカプロエートN-アセチルトランスフェラーゼ;6-アセトアミドヘキサノエートキナーゼ;6-AAHOPオキシドレダクターゼ;6-アセトアミドヘキサナールアミノトランスフェラーゼ又は6-アセトアミドヘキサナールオキシドレダクターゼ(アミノ化);及び6-アセトアミドヘキサンアミンN-アセチルトランスフェラーゼ又は6-アセトアミドヘキサンアミンヒドロラーゼ(アミド)をコードする、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項129】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項130】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項131】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項132】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項131記載の方法。
【請求項133】
前記条件が、浸透圧保護剤をさらに含む、請求項131記載の方法。
【請求項134】
前記浸透圧保護剤が、グリシンベタインである、請求項133記載の方法。
【請求項135】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該HMDA経路は、グルタミル-CoAトランスフェラーゼ、グルタミル-CoAリガーゼ、ベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソ-6-アミノピメロイル-CoAオキシドレダクターゼ、3-ヒドロキシ-6-アミノピメロイル-CoAデヒドラターゼ、6-アミノ-7-カルボキシヘプタ-2-エノイル-CoAレダクターゼ、6-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成)、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノトランスフェラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項136】
前記HMDA経路が、少なくとも2つの外因性の核酸を含む、請求項135記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項137】
前記HMDA経路が、少なくとも3つの外因性の核酸を含む、請求項135記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項138】
前記HMDA経路が、少なくとも4つの外因性の核酸を含む、請求項135記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項139】
前記外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項135記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項140】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項135記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項141】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項135記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項142】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項141記載の方法。
【請求項143】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、グルタミル-CoAトランスフェラーゼ又はグルタミル-CoAリガーゼ;ベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノピメロイル-CoAオキシドレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノピメロイル-CoAデヒドラターゼ;6-アミノ-7-カルボキシヘプタ-2-エノイル-CoAレダクターゼ;6-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノトランスフェラーゼ又はアミノ化オキシドレダクターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項144】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項143記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項145】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項143記載の方法。
【請求項146】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該HMDA経路は、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートレダクターゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナールアミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナールアミノ化オキシドレダクターゼ、3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノ化オキシドレダクターゼ、3-オキソピメレートキナーゼ、5-オキソピメロイルホスホネートレダクターゼ、3-オキソピメレートCoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートリガーゼ、5-オキソピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成)、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレートCoAトランスフェラーゼ、3-アミノピメレートリガーゼ、5-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成)、3-アミノピメレートキナーゼ、5-アミノピメロイルホスホネートレダクターゼ、3-アミノピメレートレダクターゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、ホモリジンデカルボキシラーゼ、3-アミノピメレート2,3-アミノムターゼ、2-アミノピメレートキナーゼ、2-アミノピメレートCoAトランスフェラーゼ、2-アミノピメレートCoAリガーゼ、2-アミノピメレートレダクターゼ、6-アミノピメロイルホスホネートレダクターゼ、6-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成)、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、又は3-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項147】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートレダクターゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノ化オキシドレダクターゼ、3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノ化オキシドレダクターゼ、3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項148】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートキナーゼ、5-オキソピメロイルホスホネートレダクターゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノ化オキシドレダクターゼ、3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノ化オキシドレダクターゼ、3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項149】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートCoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートCoAリガーゼ、5-オキソピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成)、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノ化オキシドレダクターゼ、3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノ化オキシドレダクターゼ、3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項150】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートレダクターゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノ化オキシドレダクターゼ、3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項151】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートキナーゼ、5-オキソピメロイルホスホネートレダクターゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノ化オキシドレダクターゼ、3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項152】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートCoAトランスフェラーゼ若しくは3-オキソピメレートCoAリガーゼ、5-オキソピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成)、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノ化オキシドレダクターゼ、3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項153】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ若しくは3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレートレダクターゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項154】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ若しくは3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレートキナーゼ、5-アミノピメロイルホスホネートレダクターゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項155】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレートCoAトランスフェラーゼ、3-アミノピメレートCoAリガーゼ、5-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成)、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項156】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレートレダクターゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7−アミノトランスフェラーゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノ化オキシドレダクターゼ、3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項157】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレートCoAトランスフェラーゼ、3-アミノピメレートCoAリガーゼ、5-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成)、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項158】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレートキナーゼ、5-アミノピメロイルホスホネートレダクターゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項159】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレート2,3-アミノムターゼ、2-アミノピメレートレダクターゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項160】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレート2,3-アミノムターゼ、2-アミノピメレートキナーゼ、6-アミノピメロイルホスホネートレダクターゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項161】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレート2,3-アミノムターゼ、2-アミノピメレートCoAトランスフェラーゼ、2-アミノピメレートCoAリガーゼ、6-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成)、2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項162】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートレダクターゼ;3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノトランスフェラーゼ又は3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノ化オキシドレダクターゼ;3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノトランスフェラーゼ又は3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノ化オキシドレダクターゼ;3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項163】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートキナーゼ;5-オキソピメロイルホスホネートレダクターゼ;3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノトランスフェラーゼ又は3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノ化オキシドレダクターゼ;3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノトランスフェラーゼ又は3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノ化オキシドレダクターゼ;3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項164】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートCoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートCoAリガーゼ;5-オキソピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノトランスフェラーゼ又は3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノ化オキシドレダクターゼ;3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノトランスフェラーゼ又は3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノ化オキシドレダクターゼ;3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項165】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートレダクターゼ;3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノトランスフェラーゼ又は3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノ化オキシドレダクターゼ;3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項166】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートキナーゼ;5-オキソピメロイルホスホネートレダクターゼ;3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノトランスフェラーゼ又は3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノ化オキシドレダクターゼ;3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項167】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートCoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートCoAリガーゼ;5-オキソピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノトランスフェラーゼ又は3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノ化オキシドレダクターゼ;3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項168】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノピメレートレダクターゼ;3-アミノ-7-オキソヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項169】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノピメレートキナーゼ;5-アミノピメロイルホスホネートレダクターゼ;3-アミノ-7-オキソヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項170】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノピメレートCoAトランスフェラーゼ、又は3-アミノピメレートCoAリガーゼ;5-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);3-アミノ-7-オキソヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項171】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノピメレートレダクターゼ;3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノ化オキシドレダクターゼ;3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項172】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノピメレートCoAトランスフェラーゼ又は3-アミノピメレートCoAリガーゼ;5-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は3-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ;3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項173】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノピメレートキナーゼ;5-アミノピメロイルホスホネートレダクターゼ;3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は3-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ;3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項174】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノピメレート2,3-アミノムターゼ;2-アミノピメレートレダクターゼ;2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項175】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノピメレート2,3-アミノムターゼ;2-アミノピメレートキナーゼ;6-アミノピメロイルホスホネートレダクターゼ;2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項176】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノピメレート2,3-アミノムターゼ;2-アミノピメレートCoAトランスフェラーゼ又は2-アミノピメレートCoAリガーゼ;6-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項177】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項178】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項177記載の方法。
【請求項179】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該HMDA経路は、2-オキソ-4-ヒドロキシ-7-アミノヘプタノエートアルドラーゼ、2-オキソ-4-ヒドロキシ-7-アミノヘプタノエートデヒドラターゼ、2-オキソ-7-アミノヘプタ-3-エノエートレダクターゼ、2-オキソ-7-アミノヘプタノエートアミノトランスフェラーゼ、2-オキソ-7-アミノヘプタノエートアミノトランスフェラーゼアミノ化オキシドレダクターゼ、ホモリジンデカルボキシラーゼ、2-オキソ-7-アミノヘプタノエートデカルボキシラーゼ、6-アミノヘキサナールアミノトランスフェラーゼ、又は6-アミノヘキサナールアミノ化オキシドレダクターゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項180】
前記HMDA経路が、少なくとも2つの外因性の核酸を含む、請求項179記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項181】
前記HMDA経路が、少なくとも3つの外因性の核酸を含む、請求項179記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項182】
前記HMDA経路が、少なくとも4つの外因性の核酸を含む、請求項179記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項183】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項179記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項184】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項183記載の方法。
【請求項185】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、2-オキソ-4-ヒドロキシ-7-アミノヘプタノエートアルドラーゼ;2-オキソ-4-ヒドロキシ-7-アミノヘプタノエートデヒドラターゼ;2-オキソ-7-アミノヘプタ-3-エノエートレダクターゼ;2-オキソ-7-アミノヘプタノエートアミノトランスフェラーゼ又は2-オキソ-7-アミノヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項186】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項185記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項187】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項186記載の方法。
【請求項188】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、2-オキソ-4-ヒドロキシ-7-アミノヘプタノエートアルドラーゼ;2-オキソ-4-ヒドロキシ-7-アミノヘプタノエートデヒドラターゼ;2-オキソ-7-アミノヘプタ-3-エノエートレダクターゼ;2-オキソ-7-アミノヘプタノエートデカルボキシラーゼ;及び6-アミノヘキサナールアミノトランスフェラーゼ又は6-アミノヘキサナールアミノ化オキシドレダクターゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項189】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項188記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項190】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項189記載の方法。
【請求項191】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該HMDA経路は、6-アミノカプロエートレダクターゼ、6-アミノカプロン酸セミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ、6-アミノカプロン酸セミアルデヒドキシドレダクターゼ(アミノ化)、6-アミノカプロエートN-アセチルトランスフェラーゼ、6-アセトアミドヘキサノエートレダクターゼ、6-アセトアミドヘキサナールアミノトランスフェラーゼ、6-アセトアミドヘキサナールオキシドレダクターゼ(アミノ化)、6-アセトアミドヘキサンアミンN-アセチルトランスフェラーゼ、又はアセトアミドヘキサンアミンヒドロラーゼ(アミド)を含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項192】
前記HMDA経路が、少なくとも2つの外因性の核酸を含む、請求項191記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項193】
前記HMDA経路が、少なくとも3つの外因性の核酸を含む、請求項191記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項194】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項191記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項195】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項194記載の方法。
【請求項196】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、6-アミノカプロエートレダクターゼ;及び6-アミノカプロン酸セミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ又は6-アミノカプロン酸セミアルデヒドキシドレダクターゼ(アミノ化)を含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項197】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項196記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項198】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項197記載の方法。
【請求項199】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、6-アミノカプロエートN-アセチルトランスフェラーゼ;6-アセトアミドヘキサノエートレダクターゼ;6-アセトアミドヘキサナールアミノトランスフェラーゼ又は6-アセトアミドヘキサナールオキシドレダクターゼ(アミノ化);及び6-アセトアミドヘキサンアミンN-アセチルトランスフェラーゼ又は6-アセトアミドヘキサンアミンヒドロラーゼ(アミド)をコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項200】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項199記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項201】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項200記載の方法。
【請求項202】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該HMDA経路は、2-アミノ-7-オキソサバレートケト酸デカルボキシラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートデカルボキシラーゼ、6-アミノヘキサナールアミノ化オキシドレダクターゼ、6-アミノヘキサナールアミノトランスフェラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノトランスフェラーゼ、ホモリジンデカルボキシラーゼ、2-アミノ-7-オキソサバレートアミノ酸デカルボキシラーゼ、2-オキソ-7-アミノヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、2-オキソ-7-アミノヘプタノエートアミノトランスフェラーゼ、2-オキソ-7-アミノヘプタノエートデカルボキシラーゼ、2-アミノ-7-オキソサバレートアミノ化オキシドレダクターゼ、2-アミノ-7-オキソサバレートアミノトランスフェラーゼ、又は2,7-ジアミノサバレートデカルボキシラーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項203】
前記HMDA経路が、少なくとも2つの外因性の核酸を含む、請求項202記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項204】
前記HMDA経路が、少なくとも3つの外因性の核酸を含む、請求項202記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項205】
前記HMDA経路が、少なくとも4つの外因性の核酸を含む、請求項202記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項206】
2-アミノ-7-オキソサバレートを産生するのに十分な量で発現される2-アミノ-7-オキソサバレート経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含む2-アミノ-7-オキソサバレート経路をさらに含み、該2-アミノ-7-オキソサバレート経路が、2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートアルドラーゼ、2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートデヒドラターゼ、又は2-アミノ-5-エン-7-オキソサバレートレダクターゼを含む、請求項202記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項207】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項202記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項208】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項207記載の方法。
【請求項209】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、2-アミノ-7-オキソサバレートアミノ化オキシドレダクターゼ又は2-アミノ-7-オキソサバレートアミノトランスフェラーゼ;2,7-ジアミノサバレートデカルボキシラーゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項210】
2-アミノ-7-オキソサバレートを産生するのに十分な量で発現される2-アミノ-7-オキソサバレート経路酵素をコードする外因性の核酸の第2のセットを含む2-アミノ-7-オキソサバレート経路をさらに含み、外因性の核酸の該第2のセットが、2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートアルドラーゼ;2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートデヒドラターゼ;及び2-アミノ-5-エン-7-オキソサバレートレダクターゼをコードする、請求項209記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項211】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項209記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項212】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項211記載の方法。
【請求項213】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、2-アミノ-7-オキソサバレートアミノ酸デカルボキシラーゼ;2-オキソ-7-アミノヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ又は2-オキソ-7-アミノヘプタノエートアミノトランスフェラーゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項214】
2-アミノ-7-オキソサバレートを産生するのに十分な量で発現される2-アミノ-7-オキソサバレート経路酵素をコードする外因性の核酸の第2のセットを含む2-アミノ-7-オキソサバレート経路をさらに含み、外因性の核酸の該第2のセットが、2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートアルドラーゼ;2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートデヒドラターゼ;及び2-アミノ-5-エン-7-オキソサバレートレダクターゼをコードする、請求項213記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項215】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項213記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項216】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項215記載の方法。
【請求項217】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、2-アミノ-7-オキソサバレートアミノ酸デカルボキシラーゼ;2-オキソ-7-アミノヘプタノエートデカルボキシラーゼ;及び6-アミノヘキサナールアミノ化オキシドレダクターゼ又は6-アミノヘキサナールアミノトランスフェラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項218】
2-アミノ-7-オキソサバレートを産生するのに十分な量で発現される2-アミノ-7-オキソサバレート経路酵素をコードする外因性の核酸の第2のセットを含み、外因性の核酸の該第2のセットが、2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートアルドラーゼ;2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートデヒドラターゼ;及び2-アミノ-5-エン-7-オキソサバレートレダクターゼをコードする、2-アミノ-7-オキソサバレート経路をさらに含む請求項217記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項219】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項217記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項220】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項219記載の方法。
【請求項221】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、2-アミノ-7-オキソサバレートケト酸デカルボキシラーゼ;2-アミノ-7-オキソヘプタノエートデカルボキシラーゼ;及び6-アミノヘキサナールアミノ化オキシドレダクターゼ又は6-アミノヘキサナールアミノトランスフェラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項222】
2-アミノ-7-オキソサバレートを産生するのに十分な量で発現される2-アミノ-7-オキソサバレート経路酵素をコードする外因性の核酸の第2のセットを含む2-アミノ-7-オキソサバレート経路をさらに含み、外因性の核酸の該第2のセットが、2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートアルドラーゼ;2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートデヒドラターゼ;及び2-アミノ-5-エン-7-オキソサバレートレダクターゼをコードする、請求項221記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項223】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項221記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項224】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項223記載の方法。
【請求項225】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、2-アミノ-7-オキソサバレートケト酸デカルボキシラーゼ;2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ又は2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノトランスフェラーゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項226】
2-アミノ-7-オキソサバレートを産生するのに十分な量で発現される2-アミノ-7-オキソサバレート経路酵素をコードする外因性の核酸の第2のセットを含む2-アミノ-7-オキソサバレート経路をさらに含み、外因性の核酸の該第2のセットが、2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートアルドラーゼ;2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートデヒドラターゼ;及び2-アミノ-5-エン-7-オキソサバレートレダクターゼをコードする、請求項225記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項227】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項225記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項228】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項227記載の方法。
【請求項229】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含む6-ACA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該6-ACA経路は、グルタミル-CoAトランスフェラーゼ、グルタミル-CoAリガーゼ、ベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソ-6-アミノピメロイル-CoAオキシドレダクターゼ、3-ヒドロキシ-6-アミノピメロイル-CoAデヒドラターゼ、6-アミノ-7-カルボキシヘプタ-2-エノイル-CoAレダクターゼ、6-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成)、又は2-アミノピメレートデカルボキシラーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項230】
前記6-ACA経路が、少なくとも2つの外因性の核酸を含む、請求項229記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項231】
前記6-ACA経路が、少なくとも3つの外因性の核酸を含む、請求項229記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項232】
前記6-ACA経路が、少なくとも4つの外因性の核酸を含む、請求項229記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項233】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項229記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項234】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項233記載の方法。
【請求項235】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含む6-ACA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、グルタミル-CoAトランスフェラーゼ又はグルタミル-CoAリガーゼ;ベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノピメロイル-CoAオキシドレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノピメロイル-CoAデヒドラターゼ;6-アミノ-7-カルボキシヘプタ-2-エノイル-CoAレダクターゼ;6-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);及び2-アミノピメレートデカルボキシラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項236】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項235記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項237】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項236記載の方法。
【請求項238】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含む6-ACA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該6-ACA経路は、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレート2,3-アミノムターゼ、又は2-アミノピメレートデカルボキシラーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項239】
前記6-ACA経路が、少なくとも2つの外因性の核酸を含む、請求項238記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項240】
前記6-ACA経路が、少なくとも3つの外因性の核酸を含む、請求項238記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項241】
前記6-ACA経路が、少なくとも4つの外因性の核酸を含む、請求項238記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項242】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項238記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項243】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項242記載の方法。
【請求項244】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含む6-ACA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノピメレート2,3-アミノムターゼ;及び2-アミノピメレートデカルボキシラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項245】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項244記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項246】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項245記載の方法。
【請求項247】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含む6-ACA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該6-ACA経路は、ホモリジン2-モノオキシゲナーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項248】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項247記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項249】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項248記載の方法。
【請求項250】
6-ACAを産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含む6-アミノカプロン酸(6-ACA)経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該6-ACA経路は、アジペートレダクターゼ、アジペートキナーゼ、又はアジピルホスフェートレダクターゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項251】
前記6-ACA経路が、アジペートレダクターゼを含む、請求項250記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項252】
前記6-ACA経路が、アジペートキナーゼ及びアジピルホスフェートレダクターゼを含む、請求項250記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項253】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項250記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項254】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項253記載の方法。
【請求項255】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含む6-ACA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該6-ACA経路は、2-アミノ-7-オキソサバレートケト酸デカルボキシラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートデカルボキシラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートオキシドレダクターゼ、2-アミノピメレートデカルボキシラーゼ、6-アミノヘキサナールオキシドレダクターゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートデカルボキシラーゼ、又は2-アミノ-7-オキソサバレートアミノ酸デカルボキシラーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項256】
前記6-ACA経路が、少なくとも2つの外因性の核酸を含む、請求項255記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項257】
前記6-ACA経路が、少なくとも3つの外因性の核酸を含む、請求項255記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項258】
2-アミノ-7-オキソサバレートを産生するのに十分な量で発現される2-アミノ-7-オキソサバレート経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含む2-アミノ-7-オキソサバレート経路をさらに含み、該2-アミノ-7-オキソサバレート経路が、2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートアルドラーゼ、2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートデヒドラターゼ、又は2-アミノ-5-エン-7-オキソサバレートレダクターゼを含む、請求項255記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項259】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項255記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項260】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項259記載の方法。
【請求項261】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含む6-ACA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、2-アミノ-7-オキソサバレートケト酸デカルボキシラーゼ;2-アミノ-7-オキソヘプタノエートオキシドレダクターゼ;及び2-アミノピメレートデカルボキシラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項262】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項261記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項263】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項262記載の方法。
【請求項264】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含む6-ACA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、2-アミノ-7-オキソサバレートケト酸デカルボキシラーゼ;2-アミノ-7-オキソヘプタノエートデカルボキシラーゼ;及び6-アミノヘキサナールオキシドレダクターゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項265】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項264記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項266】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項265記載の方法。
【請求項267】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含む6-ACA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、2-アミノ-7-オキソサバレートアミノ酸デカルボキシラーゼ;2-アミノ-7-オキソヘプタノエートデカルボキシラーゼ;及び6-アミノヘキサナールオキシドレダクターゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項268】
2-アミノ-7-オキソサバレートを産生するのに十分な量で発現される2-アミノ-7-オキソサバレート経路酵素をコードする外因性の核酸の第2のセットを含む2-アミノ-7-オキソサバレート経路をさらに含み、外因性の核酸の該第2のセットが、2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートアルドラーゼ;2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートデヒドラターゼ;及び2-アミノ-5-エン-7-オキソサバレートレダクターゼをコードする、請求項267記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項269】
前記外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項267記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項270】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項267記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項271】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項267記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項272】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項271記載の方法。
【請求項273】
レブリン酸(LA)を産生するのに十分な量で発現されるLA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むLA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該LA経路は、3-オキソアジピル-CoAチオラーゼ、3-オキソアジピル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソアジピル-CoAシンターゼ、3-オキソアジピル-CoAヒドロラーゼ、又は3-オキソアジペートデカルボキシラーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項274】
前記LA経路が、少なくとも2つの外因性の核酸を含む、請求項273記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項275】
前記LA経路が、少なくとも3つの外因性の核酸を含む、請求項273記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項276】
レブリン酸(LA)を産生するための方法であって、LAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項273記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項277】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項276記載の方法。
【請求項278】
レブリン酸(LA)を産生するのに十分な量で発現されるLA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むLA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、3-オキソアジピル-CoAチオラーゼ;3-オキソアジピル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソアジピル-CoAシンターゼ、又は3-オキソアジピル-CoAヒドロラーゼ;及び3-オキソアジペートデカルボキシラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項279】
前記外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項278記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項280】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項278記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項281】
レブリン酸(LA)を産生するための方法であって、LAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項278記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項282】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項281記載の方法。
【請求項1】
6-アミノカプロン酸を産生するのに十分な量で発現される6-アミノカプロン酸経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含む6-アミノカプロン酸経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該6-アミノカプロン酸経路は、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノイル-CoAデヒドラターゼ;6-アミノヘキサ-2-エノイル-CoAレダクターゼ;及び6-アミノカプロイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ、6-アミノカプロイル-CoAシンターゼ、又は6-アミノカプロイル-CoAヒドロラーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項2】
6-アミノカプロン経路酵素をそれぞれコードする2つの外因性の核酸を含む、請求項1記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項3】
6-アミノカプロン経路酵素をそれぞれコードする3つの外因性の核酸を含む、請求項1記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項4】
6-アミノカプロン経路酵素をそれぞれコードする4つの外因性の核酸を含む、請求項1記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項5】
6-アミノカプロン経路酵素をそれぞれコードする5つの外因性の核酸を含む、請求項1記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項6】
前記5つの外因性の核酸が、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノイル-CoAデヒドラターゼ;6-アミノヘキサ-2-エノイル-CoAレダクターゼ;及び6-アミノカプロイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ、6-アミノカプロイル-CoAシンターゼ、又は6-アミノカプロイル-CoAヒドロラーゼをコードする、請求項5記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項7】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項1記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項8】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項1記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項9】
6-アミノカプロン酸を産生するための方法であって、6-アミノカプロン酸を産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項1記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項10】
前記天然に存在しない微生物生物体が、実質的に嫌気性の培地中にある、請求項9記載の方法。
【請求項11】
前記微生物生物体が、6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする2つの外因性の核酸を含む、請求項9記載の方法。
【請求項12】
前記微生物生物体が、6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする3つの外因性の核酸を含む、請求項9記載の方法。
【請求項13】
前記微生物生物体が、6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする4つの外因性の核酸を含む、請求項9記載の方法。
【請求項14】
前記微生物生物体が、6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする4つの外因性の核酸を含む、請求項9記載の方法。
【請求項15】
前記4つの外因性の核酸が、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノイル-CoAデヒドラターゼ;6-アミノヘキサ-2-エノイル-CoAレダクターゼ;及び6-アミノカプロイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ、6-アミノカプロイル-CoAシンターゼ、又は6-アミノカプロイル-CoAヒドロラーゼをコードする、請求項14記載の方法。
【請求項16】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項9記載の方法。
【請求項17】
6-アミノカプロン酸を産生するのに十分な量で発現される6-アミノカプロン酸経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含む6-アミノカプロン酸経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該6-アミノカプロン酸経路は、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAシンターゼ、又は3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAヒドロラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノエートレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノエートデヒドラターゼ;及び6-アミノヘキサ-2-エノエートレダクターゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項18】
6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする2つの外因性の核酸を含む、請求項17記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項19】
6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする3つの外因性の核酸を含む、請求項17記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項20】
6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする4つの外因性の核酸を含む、請求項17記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項21】
6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする5つの外因性の核酸を含む、請求項17記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項22】
前記5つの外因性の核酸が、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAシンターゼ、又は3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAヒドロラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノエートレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノエートデヒドラターゼ;及び6-アミノヘキサ-2-エノエートレダクターゼをコードする、請求項21記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項23】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項17記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項24】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項17記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項25】
6-アミノカプロン酸を産生するための方法であって、6-アミノカプロン酸を産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項17記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項26】
前記天然に存在しない微生物生物体が、実質的に嫌気性の培地中にある、請求項25記載の方法。
【請求項27】
前記微生物生物体が、6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする2つの外因性の核酸を含む、請求項25記載の方法。
【請求項28】
前記微生物生物体が、6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする3つの外因性の核酸を含む、請求項25記載の方法。
【請求項29】
前記微生物生物体が、6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする4つの外因性の核酸を含む、請求項25記載の方法。
【請求項30】
前記微生物生物体が、6-アミノカプロン酸経路酵素をそれぞれコードする5つの外因性の核酸を含む、請求項25記載の方法。
【請求項31】
前記5つの外因性の核酸が、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAシンターゼ、又は3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAヒドロラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノエートレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノエートデヒドラターゼ;及び6-アミノヘキサ-2-エノエートレダクターゼをコードする、請求項30記載の方法。
【請求項32】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項25記載の方法。
【請求項33】
カプロラクタムを産生するのに十分な量で発現されるカプロラクタム経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むカプロラクタム経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該カプロラクタム経路は、6-アミノカプロイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ又は6-アミノカプロイル-CoAシンターゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項34】
前記外因性の核酸が、6-アミノカプロイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼをコードする、請求項33記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項35】
前記外因性の核酸が、6-アミノカプロイル-CoAシンターゼをコードする、請求項33記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項36】
6-アミノカプロン酸経路をさらに含む、請求項33記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項37】
前記6-アミノカプロン酸経路が、CoA依存性のアルデヒドデヒドロゲナーゼ;及びトランスアミナーゼ又は6-アミノカプロエートデヒドロゲナーゼを含む、請求項36記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項38】
前記6-アミノカプロン酸経路が、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAシンターゼ、又は3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAヒドロラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノエートレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノエートデヒドラターゼ;及び6-アミノヘキサ-2-エノエートレダクターゼを含む、請求項36記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項39】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項33記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項40】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項33記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項41】
カプロラクタムを産生するための方法であって、カプロラクタムを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項33記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項42】
カプロラクタムが、6-アミノカプロイル-CoAのカプロラクタムへの自発的な環化によって産生される、請求項41記載の方法。
【請求項43】
前記天然に存在しない微生物生物体が、実質的に嫌気性の培地中にある、請求項41記載の方法。
【請求項44】
前記外因性の核酸が、6-アミノカプロイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼをコードする、請求項41記載の方法。
【請求項45】
前記外因性の核酸が、6-アミノカプロイル-CoAシンターゼをコードする、請求項41記載の方法。
【請求項46】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項41記載の方法。
【請求項47】
ヘキサメチレンジアミンを産生するのに十分な量で発現されるヘキサメチレンジアミン経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むヘキサメチレンジアミン経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該ヘキサメチレンジアミン経路は、6-アミノカプロイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ又は6-アミノカプロイル-CoAシンターゼ;6-アミノカプロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);及びヘキサメチレンジアミントランスアミナーゼ又はヘキサメチレンジアミンデヒドロゲナーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項48】
6-アミノカプロン酸経路をさらに含む、請求項47記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項49】
前記6-アミノカプロン酸経路が、CoA依存性のアルデヒドデヒドロゲナーゼ;及びトランスアミナーゼ又は6-アミノカプロエートデヒドロゲナーゼを含む、請求項48記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項50】
前記6-アミノカプロン酸経路が、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAシンターゼ、又は3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAヒドロラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノエートレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノエートデヒドラターゼ;及び6-アミノヘキサ-2-エノエートレダクターゼを含む、請求項48記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項51】
ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする2つの外因性の核酸を含む、請求項47記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項52】
ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする3つの外因性の核酸を含む、請求項47記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項53】
前記3つの外因性の核酸が、6-アミノカプロイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ又は6-アミノカプロイルCoAシンターゼ;6-アミノカプロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);及びヘキサメチレンジアミントランスアミナーゼ又はヘキサメチレンジアミンデヒドロゲナーゼをコードする、請求項52記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項54】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項47記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項55】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項47記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項56】
ヘキサメチレンジアミンを産生するための方法であって、ヘキサメチレンジアミンを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項47記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項57】
前記天然に存在しない微生物生物体が、実質的に嫌気性の培地中にある、請求項56記載の方法。
【請求項58】
前記微生物生物体が、ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする2つの外因性の核酸を含む、請求項56記載の方法。
【請求項59】
前記微生物生物体が、ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする3つの外因性の核酸を含む、請求項56記載の方法。
【請求項60】
前記3つの外因性の核酸が、6-アミノカプロイル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ又は6-アミノカプロイルCoAシンターゼ;6-アミノカプロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);及びヘキサメチレンジアミントランスアミナーゼ又はヘキサメチレンジアミンデヒドロゲナーゼをコードする、請求項59記載の方法。
【請求項61】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項56記載の方法。
【請求項62】
カプロラクタムを産生するのに十分な量で発現されるカプロラクタム経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むカプロラクタム経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該カプロラクタム経路は、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノイル-CoAデヒドラターゼ;及び6-アミノヘキサ-2-エノイル-CoAレダクターゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項63】
カプロラクタム経路酵素をそれぞれコードする2つの外因性の核酸を含む、請求項62記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項64】
カプロラクタム経路酵素をそれぞれコードする3つの外因性の核酸を含む、請求項62記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項65】
カプロラクタム経路酵素をそれぞれコードする4つの外因性の核酸を含む、請求項62記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項66】
前記4つの外因性の核酸が、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノイル-CoAデヒドラターゼ;及び6-アミノヘキサ-2-エノイル-CoAレダクターゼをコードする、請求項65記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項67】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項62記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項68】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項62記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項69】
カプロラクタムを産生するための方法であって、カプロラクタムを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項62記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項70】
カプロラクタムが、6-アミノカプロイル-CoAのカプロラクタムへの自発的な環化によって産生される、請求項69記載の方法。
【請求項71】
前記天然に存在しない微生物生物体が、実質的に嫌気性の培地中にある、請求項69記載の方法。
【請求項72】
前記微生物生物体が、カプロラクタム経路酵素をそれぞれコードする2つの外因性の核酸を含む、請求項69記載の方法。
【請求項73】
前記微生物生物体が、カプロラクタム経路酵素をそれぞれコードする3つの外因性の核酸を含む、請求項69記載の方法。
【請求項74】
前記微生物生物体が、カプロラクタム経路酵素をそれぞれコードする4つの外因性の核酸を含む、請求項69記載の方法。
【請求項75】
前記4つの外因性の核酸が、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノイル-CoAデヒドラターゼ;及び6-アミノヘキサ-2-エノイル-CoAレダクターゼをコードする、請求項74記載の方法。
【請求項76】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項69記載の方法。
【請求項77】
ヘキサメチレンジアミンを産生するのに十分な量で発現されるヘキサメチレンジアミン経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むヘキサメチレンジアミン経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該ヘキサメチレンジアミン経路は、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノイル-CoAデヒドラターゼ;6-アミノヘキサ-2-エノイル-CoAレダクターゼ;6-アミノカプロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);及びヘキサメチレンジアミントランスアミナーゼ又はヘキサメチレンジアミンデヒドロゲナーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項78】
ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする2つの外因性の核酸を含む、請求項77記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項79】
ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする3つの外因性の核酸を含む、請求項77記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項80】
ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする4つの外因性の核酸を含む、請求項77記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項81】
ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする5つの外因性の核酸を含む、請求項77記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項82】
ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする6つの外因性の核酸を含む、請求項77記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項83】
前記6つの外因性の核酸が、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノイル-CoAデヒドラターゼ;6-アミノヘキサ-2-エノイル-CoAレダクターゼ;6-アミノカプロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);及びヘキサメチレンジアミントランスアミナーゼ又はヘキサメチレンジアミンデヒドロゲナーゼをコードする、請求項82記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項84】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項77記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項85】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項77記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項86】
ヘキサメチレンジアミンを産生するための方法であって、ヘキサメチレンジアミンを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項77記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項87】
前記天然に存在しない微生物生物体が、実質的に嫌気性の培地中にある、請求項86記載の方法。
【請求項88】
前記微生物生物体が、ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする2つの外因性の核酸を含む、請求項86記載の方法。
【請求項89】
前記微生物生物体が、ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする3つの外因性の核酸を含む、請求項86記載の方法。
【請求項90】
前記微生物生物体が、ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする4つの外因性の核酸を含む、請求項86記載の方法。
【請求項91】
前記微生物生物体が、ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする5つの外因性の核酸を含む、請求項86記載の方法。
【請求項92】
前記微生物生物体が、ヘキサメチレンジアミン経路酵素をそれぞれコードする6つの外因性の核酸を含む、請求項86記載の方法。
【請求項93】
前記4つの外因性の核酸が、3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノヘキサノイル-CoAレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノヘキサノイル-CoAデヒドラターゼ;6-アミノヘキサ-2-エノイル-CoAレダクターゼ;6-アミノカプロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);及びヘキサメチレンジアミントランスアミナーゼ又はヘキサメチレンジアミンデヒドロゲナーゼをコードする、請求項92記載の方法。
【請求項94】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項86記載の方法。
【請求項95】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含む6-ACA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該6-ACA経路は、4-ヒドロキシ-2-オキソヘプタン-1,7-ジオエート(HODH)アルドラーゼ、2-オキソヘプタ-4-エン-1,7-ジオエート(OHED)ヒドラターゼ、2-オキソヘプタ-4-エン-1,7-ジオエート(OHED)レダクターゼ、2-オキソヘプタン-1,7-ジオエート(2-OHD)デカルボキシラーゼ、アジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ、アジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)、2-オキソヘプタ-4-エン-1,7-ジオエート(OHED)デカルボキシラーゼ、6-オキソヘキサ-4-エノエート(6-OHE)レダクターゼ、2-オキソヘプタン-1,7-ジオエート(2-OHD)アミノトランスフェラーゼ、2-オキソヘプタン-1,7-ジオエート(2-OHD)オキシドレダクターゼ(アミノ化)、2-アミノヘプタン-1,7-ジオエート(2-AHD)デカルボキシラーゼ、2-オキソヘプタ-4-エン-1,7-ジオエート(OHED)アミノトランスフェラーゼ、2-オキソヘプタ-4-エン-1,7-ジオエート(OHED)オキシドレダクターゼ(アミノ化)、2-アミノヘプタ-4-エン-1,7-ジオエート(2-AHE)レダクターゼ、4-ヒドロキシ-2-オキソヘプタン-1,7-ジオエート(HODH)ギ酸リアーゼ、4-ヒドロキシ-2-オキソヘプタン-1,7-ジオエート(HODH)デヒドロゲナーゼ、3-ヒドロキシアジピル-CoAデヒドラターゼ、2,3-デヒドロアジピル-CoAレダクターゼ、アジピル-CoAデヒドロゲナーゼ、2-オキソヘプタ-4-エン-1,7-ジオエート(OHED)ギ酸リアーゼ、2-オキソヘプタ-4-エン-1,7-ジオエート(OHED)デヒドロゲナーゼ、2-オキソヘプタン-1,7-ジオエート(2-OHD)ギ酸リアーゼ、2-オキソヘプタン-1,7-ジオエート(2-OHD)デヒドロゲナーゼ、又はピルビン酸ギ酸リアーゼ活性化酵素を含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項96】
6-ACA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該6-ACA経路が、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDレダクターゼ;2-OHDデカルボキシラーゼ;又はアジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ若しくはアジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)を含む、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項97】
6-ACA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該6-ACA経路が、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDデカルボキシラーゼ;6-OHEレダクターゼ;又はアジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ若しくはアジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)を含む、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項98】
6-ACA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該6-ACA経路が、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDアミノトランスフェラーゼ若しくはOHEDオキシドレダクターゼ(アミノ化);2-AHEレダクターゼ;又は2-AHDデカルボキシラーゼを含む、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項99】
6-ACA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該6-ACA経路が、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDレダクターゼ;2-OHDアミノトランスフェラーゼ若しくは2-OHDオキシドレダクターゼ(アミノ化);又は2-AHDデカルボキシラーゼを含む、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項100】
6-ACA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該6-ACA経路が、HODHアルドラーゼ;HODHギ酸リアーゼ及びピルビン酸ギ酸リアーゼ活性化酵素若しくはHODHデヒドロゲナーゼ;3-ヒドロキシアジピル-CoAデヒドラターゼ;2,3-デヒドロアジピル-CoAレダクターゼ;アジピル-CoAデヒドロゲナーゼ;又はアジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ若しくはアジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)を含む、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項101】
6-ACA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該6-ACA経路が、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDギ酸リアーゼ及びピルビン酸ギ酸リアーゼ活性化酵素若しくはOHEDデヒドロゲナーゼ;2,3-デヒドロアジピル-CoAレダクターゼ;アジピル-CoAデヒドロゲナーゼ;又はアジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ若しくはアジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)を含む、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項102】
6-ACA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該6-ACA経路が、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDレダクターゼ;2-OHDギ酸リアーゼ及びピルビン酸ギ酸リアーゼ活性化酵素若しくは2-OHDデヒドロゲナーゼ;アジピル-CoAデヒドロゲナーゼ;又はアジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ若しくはアジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)を含む、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項103】
6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDレダクターゼ;2-OHDデカルボキシラーゼ;及びアジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ又はアジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)をコードする、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項104】
6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDデカルボキシラーゼ;6-OHEレダクターゼ;及びアジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ又はアジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)をコードする、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項105】
6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDアミノトランスフェラーゼ又はOHEDオキシドレダクターゼ(アミノ化);2-AHEレダクターゼ;及び2-AHDデカルボキシラーゼをコードする、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項106】
6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDレダクターゼ;2-OHDアミノトランスフェラーゼ又は2-OHDレダクターゼ(アミノ化);及び2-AHDデカルボキシラーゼをコードする、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項107】
6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、HODHアルドラーゼ;HODHギ酸リアーゼ及びピルビン酸ギ酸リアーゼ活性化酵素又はHODHデヒドロゲナーゼ;3-ヒドロキシアジピル-CoAデヒドラターゼ;2,3-デヒドロアジピル-CoAレダクターゼ;アジピル-CoAデヒドロゲナーゼ;及びアジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ又はアジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)をコードする、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項108】
6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDギ酸リアーゼ及びピルビン酸ギ酸リアーゼ活性化酵素又はOHEDデヒドロゲナーゼ;2,3-デヒドロアジピル-CoAレダクターゼ;アジピル-CoAデヒドロゲナーゼ;及びアジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ又はアジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)をコードする、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項109】
6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、HODHアルドラーゼ;OHEDヒドラターゼ;OHEDレダクターゼ;2-OHDギ酸リアーゼ及びピルビン酸ギ酸リアーゼ活性化酵素又は2-OHDデヒドロゲナーゼ;アジピル-CoAデヒドロゲナーゼ;及びアジペートセミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ又はアジペートセミアルデヒドオキシドレダクターゼ(アミノ化)をコードする、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項110】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項111】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項95記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項112】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項1記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項113】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項112記載の方法。
【請求項114】
前記条件が、浸透圧保護剤をさらに含む、請求項112記載の方法。
【請求項115】
前記浸透圧保護剤が、グリシンベタインである、請求項114記載の方法。
【請求項116】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該HMDA経路は、6-アミノカプロエートキナーゼ、[(6-アミノヘキサノイル)オキシ]ホスホネート(6-AHOP)オキシドレダクターゼ、6-アミノカプロン酸セミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ、6-アミノカプロン酸セミアルデヒドキシドレダクターゼ(アミノ化)、6-アミノカプロエートN-アセチルトランスフェラーゼ、6-アセトアミドヘキサノエートキナーゼ、[(6-アセトアミドヘキサノイル)オキシ]ホスホネート(6-AAHOP)オキシドレダクターゼ、6-アセトアミドヘキサナールアミノトランスフェラーゼ、6-アセトアミドヘキサナールオキシドレダクターゼ(アミノ化)、6-アセトアミドヘキサンアミンN-アセチルトランスフェラーゼ、6-アセトアミドヘキサンアミンヒドロラーゼ(アミド)、6-アセトアミドヘキサノエートCoAトランスフェラーゼ、6-アセトアミドヘキサノエートCoAリガーゼ、6-アセトアミドヘキサノイル-CoAオキシドレダクターゼ、[(6-アセトアミドヘキサノイル)オキシ]ホスホネート(6-AAHOP)アシルトランスフェラーゼ、[(6-アミノヘキサノイル)オキシ]ホスホネート(6-AHOP)アシルトランスフェラーゼ、6-アミノカプロエートCoAトランスフェラーゼ、及び6-アミノカプロエートCoAリガーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項117】
HMDA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該HMDA経路が、6-アミノカプロエートキナーゼ;6-AHOPオキシドレダクターゼ;又は6-アミノカプロン酸セミアルデヒドキシドレダクターゼ(アミノ化)若しくは6-アミノカプロン酸セミアルデヒドアミノトランスフェラーゼを含む、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項118】
HMDA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該HMDA経路が、6-アミノカプロエートキナーゼ;6-AHOPアシルトランスフェラーゼ;6-アミノカプロイル-CoAオキシドレダクターゼ;又は6-アミノカプロン酸セミアルデヒドキシドレダクターゼ(アミノ化)若しくは6-アミノカプロン酸セミアルデヒドアミノトランスフェラーゼを含む、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項119】
HMDA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該HMDA経路が、6-アミノカプロエートCoAトランスフェラーゼ若しくは6-アミノカプロエートCoAリガーゼ;6-アミノカプロイル-CoAオキシドレダクターゼ;又は6-アミノカプロン酸セミアルデヒドキシドレダクターゼ(アミノ化)若しくは6-アミノカプロン酸セミアルデヒドアミノトランスフェラーゼを含む、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項120】
HMDA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該HMDA経路が、6-アミノカプロエートN-アセチルトランスフェラーゼ;6-アセトアミドヘキサノエートキナーゼ;6-AAHOPオキシドレダクターゼ;6-アセトアミドヘキサナールアミノトランスフェラーゼ若しくは6-アセトアミドヘキサナールオキシドレダクターゼ(アミノ化);又は6-アセトアミドヘキサンアミンN-アセチルトランスフェラーゼ若しくは6-アセトアミドヘキサンアミンヒドロラーゼ(アミド)を含む、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項121】
HMDA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該HMDA経路が、6-アミノカプロエートN-アセチルトランスフェラーゼ;6-アセトアミドヘキサノエートCoAトランスフェラーゼ若しくは6-アセトアミドヘキサノエートCoAリガーゼ;6-アセトアミドヘキサノイル-CoAオキシドレダクターゼ;6-アセトアミドヘキサナールアミノトランスフェラーゼ若しくは6-アセトアミドヘキサナールオキシドレダクターゼ(アミノ化);又は6-アセトアミドヘキサンアミンN-アセチルトランスフェラーゼ若しくは6-アセトアミドヘキサンアミンヒドロラーゼ(アミド)を含む、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項122】
HMDA経路酵素をそれぞれコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含み、該HMDA経路が、6-アミノカプロエートN-アセチルトランスフェラーゼ;6-アセトアミドヘキサノエートキナーゼ;6-AAHOPオキシドレダクターゼ;6-アセトアミドヘキサナールアミノトランスフェラーゼ若しくは6-アセトアミドヘキサナールオキシドレダクターゼ(アミノ化);又は6-アセトアミドヘキサンアミンN-アセチルトランスフェラーゼ若しくは6-アセトアミドヘキサンアミンヒドロラーゼ(アミド)を含む、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項123】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、6-アミノカプロエートキナーゼ;6-AHOPオキシドレダクターゼ;及び6-アミノカプロン酸セミアルデヒドキシドレダクターゼ(アミノ化)又は6-アミノカプロン酸セミアルデヒドアミノトランスフェラーゼをコードする、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項124】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、6-アミノカプロエートキナーゼ;6-AHOPアシルトランスフェラーゼ;6-アミノカプロイル-CoAオキシドレダクターゼ;及び6-アミノカプロン酸セミアルデヒドキシドレダクターゼ(アミノ化)又は6-アミノカプロン酸セミアルデヒドアミノトランスフェラーゼをコードする、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項125】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、6-アミノカプロエートCoAトランスフェラーゼ又は6-アミノカプロエートCoAリガーゼ;6-アミノカプロイル-CoAオキシドレダクターゼ;及び6-アミノカプロン酸セミアルデヒドキシドレダクターゼ(アミノ化)又は6-アミノカプロン酸セミアルデヒドアミノトランスフェラーゼをコードする、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項126】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、6-アミノカプロエートN-アセチルトランスフェラーゼ;6-アセトアミドヘキサノエートキナーゼ;6-AAHOPオキシドレダクターゼ;6-アセトアミドヘキサナールアミノトランスフェラーゼ又は6-アセトアミドヘキサナールオキシドレダクターゼ(アミノ化);及び6-アセトアミドヘキサンアミンN-アセチルトランスフェラーゼ又は6-アセトアミドヘキサンアミンヒドロラーゼ(アミド)をコードする、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項127】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、6-アミノカプロエートN-アセチルトランスフェラーゼ;6-アセトアミドヘキサノエートCoAトランスフェラーゼ又は6-アセトアミドヘキサノエートCoAリガーゼ;6-アセトアミドヘキサノイル-CoAオキシドレダクターゼ;6-アセトアミドヘキサナールアミノトランスフェラーゼ又は6-アセトアミドヘキサナールオキシドレダクターゼ(アミノ化);及び6-アセトアミドヘキサンアミンN-アセチルトランスフェラーゼ又は6-アセトアミドヘキサンアミンヒドロラーゼ(アミド)をコードする、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項128】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、6-アミノカプロエートN-アセチルトランスフェラーゼ;6-アセトアミドヘキサノエートキナーゼ;6-AAHOPオキシドレダクターゼ;6-アセトアミドヘキサナールアミノトランスフェラーゼ又は6-アセトアミドヘキサナールオキシドレダクターゼ(アミノ化);及び6-アセトアミドヘキサンアミンN-アセチルトランスフェラーゼ又は6-アセトアミドヘキサンアミンヒドロラーゼ(アミド)をコードする、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項129】
前記少なくとも1つの外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項130】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項131】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項116記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項132】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項131記載の方法。
【請求項133】
前記条件が、浸透圧保護剤をさらに含む、請求項131記載の方法。
【請求項134】
前記浸透圧保護剤が、グリシンベタインである、請求項133記載の方法。
【請求項135】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該HMDA経路は、グルタミル-CoAトランスフェラーゼ、グルタミル-CoAリガーゼ、ベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソ-6-アミノピメロイル-CoAオキシドレダクターゼ、3-ヒドロキシ-6-アミノピメロイル-CoAデヒドラターゼ、6-アミノ-7-カルボキシヘプタ-2-エノイル-CoAレダクターゼ、6-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成)、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノトランスフェラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項136】
前記HMDA経路が、少なくとも2つの外因性の核酸を含む、請求項135記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項137】
前記HMDA経路が、少なくとも3つの外因性の核酸を含む、請求項135記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項138】
前記HMDA経路が、少なくとも4つの外因性の核酸を含む、請求項135記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項139】
前記外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項135記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項140】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項135記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項141】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項135記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項142】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項141記載の方法。
【請求項143】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、グルタミル-CoAトランスフェラーゼ又はグルタミル-CoAリガーゼ;ベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノピメロイル-CoAオキシドレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノピメロイル-CoAデヒドラターゼ;6-アミノ-7-カルボキシヘプタ-2-エノイル-CoAレダクターゼ;6-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノトランスフェラーゼ又はアミノ化オキシドレダクターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項144】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項143記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項145】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項143記載の方法。
【請求項146】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該HMDA経路は、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートレダクターゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナールアミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナールアミノ化オキシドレダクターゼ、3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノ化オキシドレダクターゼ、3-オキソピメレートキナーゼ、5-オキソピメロイルホスホネートレダクターゼ、3-オキソピメレートCoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートリガーゼ、5-オキソピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成)、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレートCoAトランスフェラーゼ、3-アミノピメレートリガーゼ、5-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成)、3-アミノピメレートキナーゼ、5-アミノピメロイルホスホネートレダクターゼ、3-アミノピメレートレダクターゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、ホモリジンデカルボキシラーゼ、3-アミノピメレート2,3-アミノムターゼ、2-アミノピメレートキナーゼ、2-アミノピメレートCoAトランスフェラーゼ、2-アミノピメレートCoAリガーゼ、2-アミノピメレートレダクターゼ、6-アミノピメロイルホスホネートレダクターゼ、6-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成)、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、又は3-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項147】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートレダクターゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノ化オキシドレダクターゼ、3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノ化オキシドレダクターゼ、3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項148】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートキナーゼ、5-オキソピメロイルホスホネートレダクターゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノ化オキシドレダクターゼ、3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノ化オキシドレダクターゼ、3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項149】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートCoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートCoAリガーゼ、5-オキソピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成)、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノ化オキシドレダクターゼ、3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノ化オキシドレダクターゼ、3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項150】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートレダクターゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノ化オキシドレダクターゼ、3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項151】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートキナーゼ、5-オキソピメロイルホスホネートレダクターゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノ化オキシドレダクターゼ、3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項152】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートCoAトランスフェラーゼ若しくは3-オキソピメレートCoAリガーゼ、5-オキソピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成)、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノトランスフェラーゼ、3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノ化オキシドレダクターゼ、3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項153】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ若しくは3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレートレダクターゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項154】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ若しくは3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレートキナーゼ、5-アミノピメロイルホスホネートレダクターゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項155】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレートCoAトランスフェラーゼ、3-アミノピメレートCoAリガーゼ、5-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成)、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項156】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレートレダクターゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7−アミノトランスフェラーゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノ化オキシドレダクターゼ、3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項157】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレートCoAトランスフェラーゼ、3-アミノピメレートCoAリガーゼ、5-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成)、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項158】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレートキナーゼ、5-アミノピメロイルホスホネートレダクターゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、3-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項159】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレート2,3-アミノムターゼ、2-アミノピメレートレダクターゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項160】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレート2,3-アミノムターゼ、2-アミノピメレートキナーゼ、6-アミノピメロイルホスホネートレダクターゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項161】
前記HMDA経路が、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレート2,3-アミノムターゼ、2-アミノピメレートCoAトランスフェラーゼ、2-アミノピメレートCoAリガーゼ、6-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成)、2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、又はホモリジンデカルボキシラーゼを含む、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項162】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートレダクターゼ;3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノトランスフェラーゼ又は3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノ化オキシドレダクターゼ;3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノトランスフェラーゼ又は3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノ化オキシドレダクターゼ;3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項163】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートキナーゼ;5-オキソピメロイルホスホネートレダクターゼ;3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノトランスフェラーゼ又は3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノ化オキシドレダクターゼ;3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノトランスフェラーゼ又は3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノ化オキシドレダクターゼ;3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項164】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートCoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートCoAリガーゼ;5-オキソピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノトランスフェラーゼ又は3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール7-アミノ化オキシドレダクターゼ;3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノトランスフェラーゼ又は3-オキソ-7-アミノヘプタノエート3-アミノ化オキシドレダクターゼ;3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項165】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートレダクターゼ;3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノトランスフェラーゼ又は3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノ化オキシドレダクターゼ;3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項166】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートキナーゼ;5-オキソピメロイルホスホネートレダクターゼ;3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノトランスフェラーゼ又は3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノ化オキシドレダクターゼ;3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項167】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートCoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートCoAリガーゼ;5-オキソピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノトランスフェラーゼ又は3-オキソ-1-カルボキシヘプタナール3-アミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノ化オキシドレダクターゼ;3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項168】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノピメレートレダクターゼ;3-アミノ-7-オキソヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項169】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノピメレートキナーゼ;5-アミノピメロイルホスホネートレダクターゼ;3-アミノ-7-オキソヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項170】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノピメレートCoAトランスフェラーゼ、又は3-アミノピメレートCoAリガーゼ;5-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);3-アミノ-7-オキソヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項171】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノピメレートレダクターゼ;3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノ化オキシドレダクターゼ;3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項172】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノピメレートCoAトランスフェラーゼ又は3-アミノピメレートCoAリガーゼ;5-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は3-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ;3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項173】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノピメレートキナーゼ;5-アミノピメロイルホスホネートレダクターゼ;3-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は3-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ;3,7-ジアミノヘプタノエート2,3-アミノムターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項174】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノピメレート2,3-アミノムターゼ;2-アミノピメレートレダクターゼ;2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項175】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノピメレート2,3-アミノムターゼ;2-アミノピメレートキナーゼ;6-アミノピメロイルホスホネートレダクターゼ;2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項176】
HMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含み、外因性の核酸の該セットが、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノピメレート2,3-アミノムターゼ;2-アミノピメレートCoAトランスフェラーゼ又は2-アミノピメレートCoAリガーゼ;6-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);2-アミノ-7-オキソヘプタノエート7-アミノトランスフェラーゼ又は2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項177】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項146記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項178】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項177記載の方法。
【請求項179】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該HMDA経路は、2-オキソ-4-ヒドロキシ-7-アミノヘプタノエートアルドラーゼ、2-オキソ-4-ヒドロキシ-7-アミノヘプタノエートデヒドラターゼ、2-オキソ-7-アミノヘプタ-3-エノエートレダクターゼ、2-オキソ-7-アミノヘプタノエートアミノトランスフェラーゼ、2-オキソ-7-アミノヘプタノエートアミノトランスフェラーゼアミノ化オキシドレダクターゼ、ホモリジンデカルボキシラーゼ、2-オキソ-7-アミノヘプタノエートデカルボキシラーゼ、6-アミノヘキサナールアミノトランスフェラーゼ、又は6-アミノヘキサナールアミノ化オキシドレダクターゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項180】
前記HMDA経路が、少なくとも2つの外因性の核酸を含む、請求項179記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項181】
前記HMDA経路が、少なくとも3つの外因性の核酸を含む、請求項179記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項182】
前記HMDA経路が、少なくとも4つの外因性の核酸を含む、請求項179記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項183】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項179記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項184】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項183記載の方法。
【請求項185】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、2-オキソ-4-ヒドロキシ-7-アミノヘプタノエートアルドラーゼ;2-オキソ-4-ヒドロキシ-7-アミノヘプタノエートデヒドラターゼ;2-オキソ-7-アミノヘプタ-3-エノエートレダクターゼ;2-オキソ-7-アミノヘプタノエートアミノトランスフェラーゼ又は2-オキソ-7-アミノヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項186】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項185記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項187】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項186記載の方法。
【請求項188】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、2-オキソ-4-ヒドロキシ-7-アミノヘプタノエートアルドラーゼ;2-オキソ-4-ヒドロキシ-7-アミノヘプタノエートデヒドラターゼ;2-オキソ-7-アミノヘプタ-3-エノエートレダクターゼ;2-オキソ-7-アミノヘプタノエートデカルボキシラーゼ;及び6-アミノヘキサナールアミノトランスフェラーゼ又は6-アミノヘキサナールアミノ化オキシドレダクターゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項189】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項188記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項190】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項189記載の方法。
【請求項191】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該HMDA経路は、6-アミノカプロエートレダクターゼ、6-アミノカプロン酸セミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ、6-アミノカプロン酸セミアルデヒドキシドレダクターゼ(アミノ化)、6-アミノカプロエートN-アセチルトランスフェラーゼ、6-アセトアミドヘキサノエートレダクターゼ、6-アセトアミドヘキサナールアミノトランスフェラーゼ、6-アセトアミドヘキサナールオキシドレダクターゼ(アミノ化)、6-アセトアミドヘキサンアミンN-アセチルトランスフェラーゼ、又はアセトアミドヘキサンアミンヒドロラーゼ(アミド)を含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項192】
前記HMDA経路が、少なくとも2つの外因性の核酸を含む、請求項191記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項193】
前記HMDA経路が、少なくとも3つの外因性の核酸を含む、請求項191記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項194】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項191記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項195】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項194記載の方法。
【請求項196】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、6-アミノカプロエートレダクターゼ;及び6-アミノカプロン酸セミアルデヒドアミノトランスフェラーゼ又は6-アミノカプロン酸セミアルデヒドキシドレダクターゼ(アミノ化)を含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項197】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項196記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項198】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項197記載の方法。
【請求項199】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、6-アミノカプロエートN-アセチルトランスフェラーゼ;6-アセトアミドヘキサノエートレダクターゼ;6-アセトアミドヘキサナールアミノトランスフェラーゼ又は6-アセトアミドヘキサナールオキシドレダクターゼ(アミノ化);及び6-アセトアミドヘキサンアミンN-アセチルトランスフェラーゼ又は6-アセトアミドヘキサンアミンヒドロラーゼ(アミド)をコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項200】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項199記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項201】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項200記載の方法。
【請求項202】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該HMDA経路は、2-アミノ-7-オキソサバレートケト酸デカルボキシラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートデカルボキシラーゼ、6-アミノヘキサナールアミノ化オキシドレダクターゼ、6-アミノヘキサナールアミノトランスフェラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノトランスフェラーゼ、ホモリジンデカルボキシラーゼ、2-アミノ-7-オキソサバレートアミノ酸デカルボキシラーゼ、2-オキソ-7-アミノヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ、2-オキソ-7-アミノヘプタノエートアミノトランスフェラーゼ、2-オキソ-7-アミノヘプタノエートデカルボキシラーゼ、2-アミノ-7-オキソサバレートアミノ化オキシドレダクターゼ、2-アミノ-7-オキソサバレートアミノトランスフェラーゼ、又は2,7-ジアミノサバレートデカルボキシラーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項203】
前記HMDA経路が、少なくとも2つの外因性の核酸を含む、請求項202記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項204】
前記HMDA経路が、少なくとも3つの外因性の核酸を含む、請求項202記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項205】
前記HMDA経路が、少なくとも4つの外因性の核酸を含む、請求項202記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項206】
2-アミノ-7-オキソサバレートを産生するのに十分な量で発現される2-アミノ-7-オキソサバレート経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含む2-アミノ-7-オキソサバレート経路をさらに含み、該2-アミノ-7-オキソサバレート経路が、2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートアルドラーゼ、2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートデヒドラターゼ、又は2-アミノ-5-エン-7-オキソサバレートレダクターゼを含む、請求項202記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項207】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項202記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項208】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項207記載の方法。
【請求項209】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、2-アミノ-7-オキソサバレートアミノ化オキシドレダクターゼ又は2-アミノ-7-オキソサバレートアミノトランスフェラーゼ;2,7-ジアミノサバレートデカルボキシラーゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項210】
2-アミノ-7-オキソサバレートを産生するのに十分な量で発現される2-アミノ-7-オキソサバレート経路酵素をコードする外因性の核酸の第2のセットを含む2-アミノ-7-オキソサバレート経路をさらに含み、外因性の核酸の該第2のセットが、2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートアルドラーゼ;2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートデヒドラターゼ;及び2-アミノ-5-エン-7-オキソサバレートレダクターゼをコードする、請求項209記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項211】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項209記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項212】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項211記載の方法。
【請求項213】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、2-アミノ-7-オキソサバレートアミノ酸デカルボキシラーゼ;2-オキソ-7-アミノヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ又は2-オキソ-7-アミノヘプタノエートアミノトランスフェラーゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項214】
2-アミノ-7-オキソサバレートを産生するのに十分な量で発現される2-アミノ-7-オキソサバレート経路酵素をコードする外因性の核酸の第2のセットを含む2-アミノ-7-オキソサバレート経路をさらに含み、外因性の核酸の該第2のセットが、2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートアルドラーゼ;2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートデヒドラターゼ;及び2-アミノ-5-エン-7-オキソサバレートレダクターゼをコードする、請求項213記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項215】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項213記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項216】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項215記載の方法。
【請求項217】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、2-アミノ-7-オキソサバレートアミノ酸デカルボキシラーゼ;2-オキソ-7-アミノヘプタノエートデカルボキシラーゼ;及び6-アミノヘキサナールアミノ化オキシドレダクターゼ又は6-アミノヘキサナールアミノトランスフェラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項218】
2-アミノ-7-オキソサバレートを産生するのに十分な量で発現される2-アミノ-7-オキソサバレート経路酵素をコードする外因性の核酸の第2のセットを含み、外因性の核酸の該第2のセットが、2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートアルドラーゼ;2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートデヒドラターゼ;及び2-アミノ-5-エン-7-オキソサバレートレダクターゼをコードする、2-アミノ-7-オキソサバレート経路をさらに含む請求項217記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項219】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項217記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項220】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項219記載の方法。
【請求項221】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、2-アミノ-7-オキソサバレートケト酸デカルボキシラーゼ;2-アミノ-7-オキソヘプタノエートデカルボキシラーゼ;及び6-アミノヘキサナールアミノ化オキシドレダクターゼ又は6-アミノヘキサナールアミノトランスフェラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項222】
2-アミノ-7-オキソサバレートを産生するのに十分な量で発現される2-アミノ-7-オキソサバレート経路酵素をコードする外因性の核酸の第2のセットを含む2-アミノ-7-オキソサバレート経路をさらに含み、外因性の核酸の該第2のセットが、2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートアルドラーゼ;2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートデヒドラターゼ;及び2-アミノ-5-エン-7-オキソサバレートレダクターゼをコードする、請求項221記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項223】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項221記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項224】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項223記載の方法。
【請求項225】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するのに十分な量で発現されるHMDA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むHMDA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、2-アミノ-7-オキソサバレートケト酸デカルボキシラーゼ;2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノ化オキシドレダクターゼ又は2-アミノ-7-オキソヘプタノエートアミノトランスフェラーゼ;及びホモリジンデカルボキシラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項226】
2-アミノ-7-オキソサバレートを産生するのに十分な量で発現される2-アミノ-7-オキソサバレート経路酵素をコードする外因性の核酸の第2のセットを含む2-アミノ-7-オキソサバレート経路をさらに含み、外因性の核酸の該第2のセットが、2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートアルドラーゼ;2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートデヒドラターゼ;及び2-アミノ-5-エン-7-オキソサバレートレダクターゼをコードする、請求項225記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項227】
ヘキサメチレンジアミン(HMDA)を産生するための方法であって、HMDAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項225記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項228】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項227記載の方法。
【請求項229】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含む6-ACA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該6-ACA経路は、グルタミル-CoAトランスフェラーゼ、グルタミル-CoAリガーゼ、ベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソ-6-アミノピメロイル-CoAオキシドレダクターゼ、3-ヒドロキシ-6-アミノピメロイル-CoAデヒドラターゼ、6-アミノ-7-カルボキシヘプタ-2-エノイル-CoAレダクターゼ、6-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成)、又は2-アミノピメレートデカルボキシラーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項230】
前記6-ACA経路が、少なくとも2つの外因性の核酸を含む、請求項229記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項231】
前記6-ACA経路が、少なくとも3つの外因性の核酸を含む、請求項229記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項232】
前記6-ACA経路が、少なくとも4つの外因性の核酸を含む、請求項229記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項233】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項229記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項234】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項233記載の方法。
【請求項235】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含む6-ACA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、グルタミル-CoAトランスフェラーゼ又はグルタミル-CoAリガーゼ;ベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソ-6-アミノピメロイル-CoAオキシドレダクターゼ;3-ヒドロキシ-6-アミノピメロイル-CoAデヒドラターゼ;6-アミノ-7-カルボキシヘプタ-2-エノイル-CoAレダクターゼ;6-アミノピメロイル-CoAレダクターゼ(アルデヒド形成);及び2-アミノピメレートデカルボキシラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項236】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項235記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項237】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項236記載の方法。
【請求項238】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含む6-ACA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該6-ACA経路は、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ、3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ、3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ、3-アミノピメレート2,3-アミノムターゼ、又は2-アミノピメレートデカルボキシラーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項239】
前記6-ACA経路が、少なくとも2つの外因性の核酸を含む、請求項238記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項240】
前記6-ACA経路が、少なくとも3つの外因性の核酸を含む、請求項238記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項241】
前記6-ACA経路が、少なくとも4つの外因性の核酸を含む、請求項238記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項242】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項238記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項243】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項242記載の方法。
【請求項244】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含む6-ACA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、グルタリル-CoAベータ-ケトチオラーゼ;3-オキソピメロイル-CoAヒドロラーゼ、3-オキソピメロイル-CoAトランスフェラーゼ、又は3-オキソピメロイル-CoAリガーゼ;3-オキソピメレートアミノトランスフェラーゼ又は3-オキソピメレートアミノ化オキシドレダクターゼ;3-アミノピメレート2,3-アミノムターゼ;及び2-アミノピメレートデカルボキシラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項245】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項244記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項246】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項245記載の方法。
【請求項247】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含む6-ACA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該6-ACA経路は、ホモリジン2-モノオキシゲナーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項248】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項247記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項249】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項248記載の方法。
【請求項250】
6-ACAを産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含む6-アミノカプロン酸(6-ACA)経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該6-ACA経路は、アジペートレダクターゼ、アジペートキナーゼ、又はアジピルホスフェートレダクターゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項251】
前記6-ACA経路が、アジペートレダクターゼを含む、請求項250記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項252】
前記6-ACA経路が、アジペートキナーゼ及びアジピルホスフェートレダクターゼを含む、請求項250記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項253】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項250記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項254】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項253記載の方法。
【請求項255】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含む6-ACA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該6-ACA経路は、2-アミノ-7-オキソサバレートケト酸デカルボキシラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートデカルボキシラーゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートオキシドレダクターゼ、2-アミノピメレートデカルボキシラーゼ、6-アミノヘキサナールオキシドレダクターゼ、2-アミノ-7-オキソヘプタノエートデカルボキシラーゼ、又は2-アミノ-7-オキソサバレートアミノ酸デカルボキシラーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項256】
前記6-ACA経路が、少なくとも2つの外因性の核酸を含む、請求項255記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項257】
前記6-ACA経路が、少なくとも3つの外因性の核酸を含む、請求項255記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項258】
2-アミノ-7-オキソサバレートを産生するのに十分な量で発現される2-アミノ-7-オキソサバレート経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含む2-アミノ-7-オキソサバレート経路をさらに含み、該2-アミノ-7-オキソサバレート経路が、2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートアルドラーゼ、2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートデヒドラターゼ、又は2-アミノ-5-エン-7-オキソサバレートレダクターゼを含む、請求項255記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項259】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項255記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項260】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項259記載の方法。
【請求項261】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含む6-ACA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、2-アミノ-7-オキソサバレートケト酸デカルボキシラーゼ;2-アミノ-7-オキソヘプタノエートオキシドレダクターゼ;及び2-アミノピメレートデカルボキシラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項262】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項261記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項263】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項262記載の方法。
【請求項264】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含む6-ACA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、2-アミノ-7-オキソサバレートケト酸デカルボキシラーゼ;2-アミノ-7-オキソヘプタノエートデカルボキシラーゼ;及び6-アミノヘキサナールオキシドレダクターゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項265】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項264記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項266】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項265記載の方法。
【請求項267】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するのに十分な量で発現される6-ACA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含む6-ACA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、2-アミノ-7-オキソサバレートアミノ酸デカルボキシラーゼ;2-アミノ-7-オキソヘプタノエートデカルボキシラーゼ;及び6-アミノヘキサナールオキシドレダクターゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項268】
2-アミノ-7-オキソサバレートを産生するのに十分な量で発現される2-アミノ-7-オキソサバレート経路酵素をコードする外因性の核酸の第2のセットを含む2-アミノ-7-オキソサバレート経路をさらに含み、外因性の核酸の該第2のセットが、2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートアルドラーゼ;2-アミノ-5-ヒドロキシ-7-オキソサバレートデヒドラターゼ;及び2-アミノ-5-エン-7-オキソサバレートレダクターゼをコードする、請求項267記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項269】
前記外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項267記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項270】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項267記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項271】
6-アミノカプロン酸(6-ACA)を産生するための方法であって、6-ACAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項267記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項272】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項271記載の方法。
【請求項273】
レブリン酸(LA)を産生するのに十分な量で発現されるLA経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性の核酸を含むLA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、該LA経路は、3-オキソアジピル-CoAチオラーゼ、3-オキソアジピル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソアジピル-CoAシンターゼ、3-オキソアジピル-CoAヒドロラーゼ、又は3-オキソアジペートデカルボキシラーゼを含む、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項274】
前記LA経路が、少なくとも2つの外因性の核酸を含む、請求項273記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項275】
前記LA経路が、少なくとも3つの外因性の核酸を含む、請求項273記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項276】
レブリン酸(LA)を産生するための方法であって、LAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項273記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項277】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項276記載の方法。
【請求項278】
レブリン酸(LA)を産生するのに十分な量で発現されるLA経路酵素をコードする外因性の核酸のセットを含むLA経路を有する微生物生物体を含む、天然に存在しない微生物生物体であって、外因性の核酸の該セットは、3-オキソアジピル-CoAチオラーゼ;3-オキソアジピル-CoA/アシル-CoAトランスフェラーゼ、3-オキソアジピル-CoAシンターゼ、又は3-オキソアジピル-CoAヒドロラーゼ;及び3-オキソアジペートデカルボキシラーゼをコードする、前記天然に存在しない微生物生物体。
【請求項279】
前記外因性の核酸が、異種の核酸である、請求項278記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項280】
実質的に嫌気性の培地中にある、請求項278記載の天然に存在しない微生物生物体。
【請求項281】
レブリン酸(LA)を産生するための方法であって、LAを産生するための条件下で、それに十分な期間、請求項278記載の天然に存在しない微生物生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項282】
前記条件が、実質的に嫌気性の培養条件を含む、請求項281記載の方法。
【図1】
【図2】
【図3】
【図4】
【図5】
【図6】
【図7】
【図8】
【図9】
【図10】
【図11】
【図12】
【図13】
【図14】
【図15】
【図16】
【図17】
【図18】
【図19】
【図20】
【図21】
【図22】
【図23】
【図24】
【図25】
【図26】
【図27】
【図28】
【図29】
【図30】
【図31】
【図32】
【図33】
【図34】
【図35】
【図36】
【図37】
【図2】
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【図8】
【図9】
【図10】
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【図12】
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【図14】
【図15】
【図16】
【図17】
【図18】
【図19】
【図20】
【図21】
【図22】
【図23】
【図24】
【図25】
【図26】
【図27】
【図28】
【図29】
【図30】
【図31】
【図32】
【図33】
【図34】
【図35】
【図36】
【図37】
【公表番号】特表2012−525856(P2012−525856A)
【公表日】平成24年10月25日(2012.10.25)
【国際特許分類】
【出願番号】特願2012−510039(P2012−510039)
【出願日】平成22年5月7日(2010.5.7)
【国際出願番号】PCT/US2010/034144
【国際公開番号】WO2010/129936
【国際公開日】平成22年11月11日(2010.11.11)
【出願人】(511062818)ゲノマチカ, インク. (10)
【Fターム(参考)】
【公表日】平成24年10月25日(2012.10.25)
【国際特許分類】
【出願日】平成22年5月7日(2010.5.7)
【国際出願番号】PCT/US2010/034144
【国際公開番号】WO2010/129936
【国際公開日】平成22年11月11日(2010.11.11)
【出願人】(511062818)ゲノマチカ, インク. (10)
【Fターム(参考)】
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