説明

アデノウイルスの検出及び鑑別方法並びにそれに用いるオリゴヌクレオチド及びDNA断片

【構成】 (i) アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ部分を、該遺伝子領域内の血清型に共通な塩基配列に相補性を有する2種のオリゴヌクレオチドを5’末端側及び3’末端側のプライマーとして用いて増幅し、(ii) 該増幅DNA断片をアガロースゲル電気泳動法等により検出することを特徴とするアデノウイルスの検出方法、亜群鑑別及び血清型鑑別方法並びにそれに用いるプライマー、DNAプローブ及びヘキソン領域DNA断片。
【効果】 本発明によれば、確実、迅速かつ簡便にアデノウイルスの検出、亜群鑑別及び血清型鑑別ができる。

【発明の詳細な説明】
【0001】
【産業上の利用分野】本発明は、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の塩基配列を用いるアデノウイルスの検出及び鑑別方法並びにそれに用いるオリゴヌクレオチド及びDNA断片に関する。アデノウイルス(以下これを「mastadenovirus」と称することがある)は眼、呼吸器等に炎症を起こす、人に対する重要な病原ウイルスである。
【0002】
【従来の技術】アデノウイルスは、現在A〜F亜群の6種類の亜群、更に47種類もの血清型に分類されており、それぞれ多彩な感染像をしめす。その中でもB亜群の3型、11型、D亜群の8型、19型、37型、更にE亜群の4型は、ヒトの目に感染し結膜炎、角膜炎等を発症させる。
【0003】アデノウイルス感染症の診断は、アデノウイルスの分離同定、アデノウイルス抗原検出、電子顕微鏡による形態学的検査及び中和抗体価測定や補体結合抗体価測定等の血清学的検査で行われている。このうち、血清学的検査はアデノウイルスに対する抗体を検出する間接的方法であり、アデノウイルス自体を検出する検査は、分離同定、形態学的検査及び抗原検出である。
【0004】確実な診断手段である分離同定法では、判定までの期間が約1ヶ月程かかり、また検出感度が低く、検出感度を上げようとすると培養に相当の時間が必要となり培養操作が煩雑になる。また、血清型の鑑別は、中和抗血清を用いた分離ウイルスの中和試験で行われているが、非特異的選択による交差反応によって、鑑別が困難になる場合がある等の問題点を有している。
【0005】アデノウイルスDNAを直接検出する方法として、高感度且つ特異的にDNAを増幅するポリメラーゼ・チェーン・リアクション法〔Polymerase Chain Reaction 法、以下これを「PCR法」と略記する;Saiki et al., Science, 230巻,1350-1354 (1985)〕を用いた方法によるヘキソン(Hexon), E1A領域を増幅しての検出〔A. Allard, et al; J. Med Virology 37巻, 149-157 (1992)〕等の報告がある。しかしながら、これらの方法では、感染の有無のみの検出もしくは特定の亜群血清型(とくにF亜群−下痢症適疾患の原因ウイルス)のみの鑑別は可能であるが、確実な亜群、血清型鑑別は困難である。
【0006】
【発明が解決しようとする課題】本発明は、上記問題点を解決する、確実で、迅速かつ簡便なアデノウイルスの検出並びに亜群及び血清型の鑑別方法の提供を目的としてなされたものである。
【0007】
【課題を解決するための手段】本発明者等は、上記目的を達成すべく鋭意研究を重ねた結果、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ部分を、該遺伝子領域内の血清型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチドを用いて増幅し、該増幅遺伝子DNA断片を検出すれば、アデノウイルスを、確実に、迅速かつ簡便に検出可能なことを見いだし、また、該増幅DNA内の亜群共通塩基配列を検出することによりアデノウイルス亜群の鑑別が、更に亜群及び血清型特異的塩基配列を検出することによりアデノウイルス血清型の鑑別が可能であることを見いだし、本発明を完成するに至った。
【0008】即ち本発明は、下記1〜43に記載のアデノウイルス検出方法、亜群及び血清型の鑑別方法、それらに用いるオリゴヌクレオチド及びDNA断片を提供するものである。
【0009】1.(i) アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ部分を、該遺伝子領域内の血清型に共通な塩基配列に相補性を有する2種のオリゴヌクレオチドを5’末端側及び3’末端側のプライマーとして用いて増幅し、(ii) 該増幅DNAを検出することを特徴とするアデノウイルスの検出法。
【0010】2.亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ部分が、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の3’末端側である、上記1.記載の方法。
3.亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ部分が、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の1263塩基対の大きさの部分である、上記2.記載の方法。
4.亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ部分が、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域の1897〜2861番目の塩基対間の965塩基対の大きさの部分である、上記2.記載の方法。
【0011】5.5’末端側のプライマーが配列番号16又は配列番号18で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドであり、3’末端側のプライマーが配列番号17又は配列番号19で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドである、上記1.記載の方法。
6.5’末端側のプライマーが配列番号16で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドであり、3’末端側のプライマーが配列番号17で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドである、上記1.記載の方法。
7.5’末端側のプライマーが配列番号18で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドであり、3’末端側のプライマーが配列番号19で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドである、上記1.記載の方法。
【0012】8.(i) アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ該遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の1263塩基対の大きさの部分を、該遺伝子領域内の血清型に共通な塩基配列に相補性を有する配列番号16で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを5’末端側のプライマーとして及び配列番号17で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを3’末端側のプライマーとして用いて増幅し、(ii) 該増幅DNAを検出することを特徴とするアデノウイルスの検出法。
【0013】9.(i) アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ該遺伝子領域の1897〜2861番目の塩基対間の965塩基対の大きさの部分を、該遺伝子領域内の血清型に共通な塩基配列に相補性を有する配列番号18で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを5’末端側のプライマーとして及び配列番号19で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを3’末端側のプライマーとして用いて増幅し、(ii) 該増幅DNAを検出することを特徴とするアデノウイルスの検出方法。
【0014】10.(i) アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ該遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の1263塩基対の大きさの部分を、該遺伝子領域内の血清型に共通な塩基配列に相補性を有する配列番号16で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを5’末端側のプライマーとして及び配列番号17で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを3’末端側のプライマーとして用いて増幅し、(ii) 該増幅DNAの、亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ該遺伝子領域の1897〜2861番目の塩基対間の965塩基対の大きさの部分を、該遺伝子領域内の血清型に共通な塩基配列に相補性を有する配列番号18で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを5’末端側のプライマーとして及び配列番号19で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを3’末端側のプライマーとして用いて増幅し、(iii) 該増幅DNAを検出することを特徴とするアデノウイルスの検出方法。
【0015】11.(i) アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群に特異的な塩基配列を持つ部分を、該遺伝子領域内の各亜群に特異的な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチドと、血清型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチドとをプライマーとして用いて増幅し、(ii) 該増幅DNAを検出及び解析することを特徴とするアデノウイルスの亜群の鑑別方法。
12.亜群に特異的な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチドが、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23及び配列番号24で示されるオリゴヌクレオチドより成る群から選ばれる少なくとも一種のオリゴヌクレオチドである、上記11.記載の方法。
13.血清型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチドが、配列番号16、配列番号17、配列番号18及び配列番号19で示されるオリゴヌクレオチドより成る群から選ばれる一種のオリゴヌクレオチドである、上記11.記載の方法。
【0016】14.(i) アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群に特異的な塩基配列を持つ部分を、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23及び配列番号24で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオドより成る群から選ばれる少なくとも一種の該遺伝子領域内の各亜群に特異的な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチドと、配列番号16、配列番号17、配列番号18及び配列番号19で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチより成る群から選ばれる一種の血清型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチドとをプライマーとして用いて増幅し、(ii) 該増幅DNAを検出及び解析することを特徴とするアデノウイルスの亜群の鑑別方法。
【0017】15.(i) アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ部分を、該遺伝子領域内の血清型に共通な塩基配列に相補性を有する2種のオリゴヌクレオチドを5’末端側及び3’末端側のプライマーとして用いて増幅し、(ii) アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを標識してDNAプローブとし、(iii) 上記(i) の増幅DNAと上記(ii)のDNAプローブとをハイブリダイズせしめ、(iv) ハイブリダイズしたDNAプローブの種類を解析することを特徴とするアデノウイルス血清型の鑑別方法。
【0018】16.亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ部分が、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の1263塩基対の大きさの部分である、上記15.記載の方法。
17.亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ部分が、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域の1897〜2861番目の塩基対間の965塩基対の大きさの部分である、上記15.記載の方法。
【0019】18.5’末端側のプライマーが配列番号16又は配列番号18で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドであり、3’末端側のプライマーが配列番号17又は配列番号19で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドである、上記15.記載の方法。
19.5’末端側のプライマーが配列番号16で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドであり、3’末端側のプライマーが配列番号17で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドである、上記15.記載の方法。
【0020】20.5’末端側のプライマーが配列番号18で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドであり、3’末端側のプライマーが配列番号19で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドである、上記15.記載の方法。
21.亜群及び血清型に特異的な塩基配列を有するオリゴヌクレオチドが、配列番号25、配列番号23、配列番号26、配列番号27、配列番号28及び配列番号29で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドより成る群から選ばれる少なくとも一種のオリゴヌクレオチドである、上記15.記載の方法。
【0021】22.(i) アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ該遺伝子領域の1897〜2861番目の塩基対間の965塩基対の大きさの部分を、該遺伝子領域内の血清型に共通な塩基配列に相補性を有する配列番号18で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを5’末端側のプライマーとして及び配列番号19で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを3’末端側のプライマーとして用いて増幅し、(ii) アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を有する配列番号25、配列番号23、配列番号26、配列番号27、配列番号28及び配列番号29で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドより成る群から選ばれる少なくとも一種のオリゴヌクレオチドを標識してDNAプローブとし、(iii) 上記(i) の増幅DNAと上記(ii)のDNAプローブとをハイブリダイズせしめ、(iv) ハイブリダイズしたDNAプローブの種類を解析することを特徴とするアデノウイルス血清型の鑑別方法。
【0022】23.配列番号16、配列番号17、配列番号18又は配列番号19で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の血清型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
24.配列番号20で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内のB亜群に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
25.配列番号21で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内のC亜群に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
26.配列番号22で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内のD亜群に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
【0023】27.配列番号23で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内のE亜群及び4型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
28.配列番号24で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内のF亜群に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
29.配列番号25で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の3型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
【0024】30.配列番号26で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の8型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
31.配列番号27で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の11型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
32.配列番号28で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の19型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
33.配列番号29で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の37型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
【0025】34.配列番号6に記載の塩基配列又はアミノ酸配列で示される、アデノウイルス1型のヘキソンの一部をコードする遺伝子を含むDNA断片。
35.配列番号7に記載の塩基配列又はアミノ酸配列で示される、アデノウイルス3型のヘキソンの一部をコードする遺伝子を含むDNA断片。
36.配列番号8に記載の塩基配列又はアミノ酸配列で示される、アデノウイルス4型のヘキソンの一部をコードする遺伝子を含むDNA断片。
37.配列番号9に記載の塩基配列又はアミノ酸配列で示される、アデノウイルス6型のヘキソンの一部をコードする遺伝子を含むDNA断片。
38.配列番号10に記載の塩基配列又はアミノ酸配列で示される、アデノウイルス7型のヘキソンの一部をコードする遺伝子を含むDNA断片。
【0026】39.配列番号11に記載の塩基配列又はアミノ酸配列で示される、アデノウイルス8型のヘキソンの一部をコードする遺伝子を含むDNA断片。
40.配列番号12に記載の塩基配列又はアミノ酸配列で示される、アデノウイルス11型のヘキソンの一部をコードする遺伝子を含むDNA断片。
41.配列番号13に記載の塩基配列又はアミノ酸配列で示される、アデノウイルス14型のヘキソンの一部をコードする遺伝子を含むDNA断片。
42.配列番号14に記載の塩基配列又はアミノ酸配列で示される、アデノウイルス19型のヘキソンの一部をコードする遺伝子を含むDNA断片。
43.配列番号15に記載の塩基配列又はアミノ酸配列で示される、アデノウイルス37型のヘキソンの一部をコードする遺伝子を含むDNA断片。
【0027】以下、本発明について更に詳細に説明する。本発明の実施においては、特に指示されない限り当該分野の技術範囲内にある分子生物学、微生物学、組換えDNA、および免疫学に於ける従来の手法が採用される。このような手法は文献中に詳しく説明されている。例えば次のような文献を参照されたい。Maniatis, Fitsch 及び Sambrook, MOLECULAR CLONING;A LABORATORY MANUAL (1982) ; Kevin Struhlら, CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULARBIOLOGY, 1 巻および2 巻 ; 村松正實編, ラボマニュアル遺伝子工学 (1990); 村松正實 岡山博人 編, 遺伝子工学ハンドブック , 実験医学 別冊 (1991) ; 東京大学医科学研究所制癌研究部編 , 細胞工学実験プロトコール (1991)。
【0028】本発明で用いる、アデノウイルスのヘキソン(hexon)をコードする遺伝子領域(以下これを「ヘキソン領域」と略称することがある)内の血清型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド(以下これを「血清型共通プライマー」と略称することがある)塩基配列は、既知のアデノウイルスヘキソン領域遺伝子配列に基づいて設計することができる。
【0029】アデノウイルス遺伝子配列は、通常用いられる遺伝子配列データベース、例えばDNASIS−DB(日立ソフトウエアエンジニアリング社製)を用いて知ることができ、本発明に用いたアデノウイルス2型、5型、40型及び41型のヘキソン領域の一部をコードする塩基配列は配列番号1〜5で示される通りであり、それらは下記の文献に開示されている。
【0030】2型(配列番号1):ADRCG Accession J01917〔Akusjaervi,G. and Pettersson,U.: Sequence analysis of the gene for adenovirus type 2 hexon. Virology 91, 477-480(1978)〕〔Joernvall,H.,et al.:Order of the CNBr fragmentsin the adenovirus hexon protein. J. Biol. Chem. 256, 6204-6212 (1981) 〕〔Akusjaervi,G., et al.:The sequence of the 3'noncoding region of the hexon mRNA discloses a novel adenovirus gene. Nucleic Acids Res. 9, 1229-1240 (1981)〕〔Akusjaervi,G., et al.:The gene for the adenovirus 2 hexonpolypeputide. J. Biol. Chem. 259, 13976-13979 (1984)〕。
【0031】5型(配列番号2):Ad5-ADRA2 Accession J01966〔Kinloch,R., et al.:Adenovirus hexon:sequence comparison of subgroup c serotypes 2 and 5. J. Biol. Chem. 259, 6431-6436 (1984) 〕。
5型(配列番号3):Ad5-AD5002 Accession X02997 〔Kruijer,W.,et al.:Structure and function of adenovirus DNA binding protein: Comparison of the amino acid sequence of the Ad5 and Ad12 proteins derived from the nucleotidesequence of the corresponding genes. Virology 128, 140-153 (1983)〕、〔Kinloch,R., et al.: Adenovirus hexon: sequence comparison of subgroup c serotypes 2 and 5. J. Biol. Chem. 259, 6431-6436 (1984) 〕。
【0032】40型(配列番号4):Ad40-ADTY40HEX Accession X51782 〔Toogood,C.I.A.: Direct Submition. Submitted (06-FEB-1990) Toogood C.I.A., University of St Andrews, Dept of Biochemistry & Microbiology, North Street, St Andrews Fife, Scotland, U K.〕。
【0033】41型(配列番号5):Ad41-ADTY41HEX Accession X51783 〔Toogood,C.I.A.: Direct Submition. Submitted (06-FEB-1990) Toogood C.I.A., University of St Andrews, Dept of Biochemistry & Microbiology, North Street, St Andrews Fife, Scotland, U K.〕。
【0034】血清型共通プライマーは、上記遺伝子配列に基いて設計することができ、その塩基配列は、ヘキソン領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ部分、特にヘキソン領域の3′末側にある該部分をはさむ塩基配列であれば特に制限されるものでないが、好ましくは、5′末端側の配列として配列番号16、3′末端側の配列として配列番号17で示される塩基配列を挙げることができる。
【0035】上述したプライマーは、それ自体既知の通常用いられる核酸合成装置、例えばアプライド・バイオシステムズ(Applied Biosystems) 社製、モデル381−ADNA合成機等を用いる固相合成法により、容易に化学合成することができる。
【0036】これらプライマーを用いて、次のとおり、ヘキソン領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ部分を増幅し、該増幅DNAの塩基配列を決定し、さらにその塩基配列から血清型共通プライマー、亜群に特異的な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド(以下これを「亜群特異的プライマー」と略称することがある)および血清型に特異的な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド(以下これを「血清型特異的DNAプローブ」と略称することがある)を設計することができる。
【0037】先ず、亜群及び血清型が既知のアデノウイルス標準株(国立予防衛生研究所で継代培養されており当研究所より入手可能)から常法によりウイルスDNAを抽出し、該抽出DNAを鋳型とし、前記血清型共通プライマーを用いて、前記ヘキソン領域の一部、例えばヘキソン領域の1645〜2907番目の塩基対ではさまれる1263塩基対の部分を増幅する。DNA断片の増幅は、通常用いられるPCR法〔Saiki 等、サイエンス(Science) 239巻、487-491 頁参照〕により容易に行うことができる。
【0038】この増幅DNAを、常法、例えばアガロースゲル電気泳動法等により、抽出、精製後、平滑末端化処理し、適当なベクター、例えばファージベクターM13mp18RF(宝酒造社製)等にクローニングする。
【0039】各アデノウイルス標準株に由来する遺伝子DNAを保有する各クローンを分離し、アデノウイルス由来の挿入DNA断片の塩基配列を決定する。DNA断片の塩基配列は、例えばサンガー法〔F. Sanger 等、プロシーディングス・オブ・ザ・ナショナル・アカデミー・オブ・ザ・サイエンス・オブ・ザ・ユナイテッド・ステイツ・オブ・アメリカ(Proceedings of the National Academy of the Science USA) 、74巻 5463-5467頁参照〕により決定することができる。
【0040】かくして得られる各アデノウイルス標準株の「ヘキソン領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ部分」の塩基配列を、配列番号6(1型由来)、配列番号7(3型由来)、配列番号8(4型由来)、配列番号9(6型由来)、配列番号10(7型由来)、配列番号11(8型由来)、配列番号12(11型由来)、配列番号13(14型由来)、配列番号14(19型由来)、配列番号15(37型由来)に示す。
【0041】上記DNA断片もまた本発明に包含されるものであり、上記塩基配列を包含する本発明のDNA断片は、アデノウイルス標準株染色体DNAから分離されたもののみならず、通常用いられる核酸合成装置、例えば上記アプライド・バイオシステムズ社製、モデル381−A DNA合成機を用いて合成されたものであってよい。
【0042】上記塩基配列に基き、さらに前記血清型共通プライマーを設計することができる。かくして得られる血清型共通プライマーとしては、例えば配列番号18(5′末端側)及び配列番号19(3′末端側)に示されるオリゴヌクレオチドを挙げることができる。PCR法でこれらプライマーを用いれば、ヘキソン領域の1897〜2861番目の塩基対ではさまれる965塩基対の部分を増幅することができる。
【0043】また、前記配列番号1〜5で示される既知のヘキソン領域の配列、上記配列番号6〜15で示される本発明DNA断片の塩基配列中の、亜群に特異的な配列を解析することにより、亜群特異的プライマーを設計することができる。かくして得られる亜群特異的プライマーとしては、例えば配列番号20(B亜群特異的)、配列番号21(C亜群特異的)、配列番号22(D亜群特異的)、配列番号23(E亜群特異的)、配列番号24(F亜群特異的)に示されるオリゴヌクレオチドを挙げることができる。
【0044】さらに、血清型特異的DNAプローブは、同様に上記配列番号1〜15で示される配列中の、血清型に特異的な塩基配列を解析することにより設計することができる。かくして得られるDNAプローブとしては、例えば、配列番号23(4型特異的)、配列番号25(3型特異的)、配列番号26(8型特異的)、配列番号27(11型特異的)、配列番号28(19型特異的)、配列番号29(37型特異的)に示されるオリゴヌクレオチドを挙げることができる。
【0045】上記した、本発明で用いるヘキソン領域DNA、プライマー、DNAプローブ、該プライマーを用いて増幅可能なDNA断片等の一例を図5に示す。図中、2桁の数字は配列番号、( )内の数字はプライマーもしくはDNAプローブが結合するヘキソン領域内の位置(塩基対番号)、〔 〕内の数字は増幅されるDNAの大きさ、bpは塩基対を示す。
【0046】上記したプライマー又はDNAプローブを用いて、次のとおり、アデノウイルスを検出し、亜群及び血清型を鑑別することができる。先ず、診察時に採取した臨床検体、臨床検体からのウイルス分離培養株から、常法によりウイルスDNAを抽出する。該抽出DNAを鋳型として、前記血清型共通プライマーを用いて、ヘキソン領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ部分、例えば前記1263塩基対又は965塩基対の部分を、前記PCR法により増幅する。該増幅DNAを適当な方法で検討することにより、アデノウイルスを検出することができる。増幅DNAの検出は、通常ポリアクリルアミドやアガロースゲル電気泳動等により増幅DNAを分離し、適当な染色剤、例えばエチジウム・ブロマイド等で染色後、紫外線照射等により発色させ、そのDNAバンドを確認することにより行うことができる。
【0047】さらに、高感度のアデノウイルス検出を必要とする場合は、先ず血清型共通プライマー、例えば配列番号16及び17で示されるオリゴヌクレオチドを用いて、ヘキソン領域の一部、例えば前記1263塩基対の部分を増幅し、さらに該増幅DNAの内側の塩基配列と相補性を有するように設計された血清型共通プライマー、例えば配列番号18及び19で示されるオリゴヌクレオチドを用いてヘキソン領域の一部、例えば前記965塩基対の部分を増幅し、該増幅DNAを検出すれば良い。
【0048】亜群の鑑別は、同様に前記抽出DNAを鋳型とし、前記血清型共通プライマーの一種と前記亜群特異的プライマー、例えば配列番号20〜24の少なくとも一種のプライマーを用いて、前記PCR法により増幅し、各亜群に由来する大きさの増幅DNAを前記方法で検出することにより行うことができる。用い得る血清型共通プライマーは、5’末端側のもの、例えば配列番号16及び18で示されるオリゴヌクレオチドであっても、3’末端側、例えば配列番号17及び19で示されるオリゴヌクレオチドであっても良い。
【0049】血清型の鑑別は、前記ヘキソン領域の一部を血清型共通プライマーを用いて増幅したDNA断片と、前記血清型特異的DNAプローブ、例えば配列番号23、25〜29で示されるオリゴヌクレオチドを標識してプローブとし、固相上で常法によりハイブリダイズさせ、標識された血清型特異的DNAプローブの種類を検出・解析することにより行うことができる。
【0050】固相上へのDNAの結合は、それ自体既知の通常用いられる方法、例えば、増幅DNAを変性後、適当な固相、例えばナイロンメンブレンに、常法により化学結合させることにより行うことができる。DNAプローブの標識は、5’末端のリン酸化反応により、〔γ−32P〕ATP、T4 ポリヌクレオチドキナーゼ(東洋紡績社製)を用いて行うことができる。また、標識物の検出は、標識されたDNAとのハイブリダイズを行ったナイロンメンブレンのオートラジオグラフィーを行い、各プローブとのハイブリッド形成の有無を調べることにより行うことができる。
【0051】次に実施例を挙げて本発明をさらに詳細に説明するが、下記の実施例は本発明について具体的な認識を得る一助としてのみ挙げたものであり、これによって本発明の範囲は何等限定されるものではない。
【0052】
【実施例】
実施例1 アデノウイルス標準株のヘキソン領域のPCR法による増幅及び増幅DNAの検出(A)使用微生物国立予防衛生研究所において継代培養されている下記14種類のアデノウイルス標準株を用いて実験を行った。これらのアデノウイルスは、いずれも特異抗血清を用いた中和試験で亜群及び血清型が同定されている標準株である。
株名(血清型) 亜群 略号
アデノウイルス1型 C Ad−1 アデノウイルス2型 C Ad−2 アデノウイルス3型 B Ad−3 アデノウイルス4型 E Ad−4 アデノウイルス5型 C Ad−5 アデノウイルス6型 C Ad−6 アデノウイルス7型 B Ad−7 アデノウイルス8型 D Ad−8 アデノウイルス11型 B Ad−11 アデノウイルス14型 B Ad−14 アデノウイルス19型 D Ad−19 アデノウイルス37型 D Ad−37 アデノウイルス40型 F Ad−40 アデノウイルス41型 F Ad−41
【0053】(B)DNAの抽出アデノウイルス1型、2型、3型、4型、5型、6型、7型、8型、11型、14型、19型、37型、40型、41型の各ウイルス培養液を Proteinase Kで処理し、さらに Phenol-Chroloform 法によりアデノウイルスDNAを抽出し、エタノール沈殿によりDNAを精製した。
【0054】(C)血清型共通プライマーの設計と合成遺伝子塩基配列データベース(DNASIS−DB;日立ソフトウエアエンジニアリング社製)を用いて既知のアデノウイルスヘキソン領域遺伝子配列〔配列番号1(2型)、配列番号2(5型)、配列番号3(40型)、配列番号4(41型)〕を検索・解析し、これらの配列からアデノウイルスヘキソン領域を共通に増幅できるプライマーペアを、配列番号16(5’末端側)、配列番号17(3’末端側)のように設計した。これらのオリゴヌクレオチドをホスホアミダイド (Phosphoamidide) 法により、アプライド・バイオシステムズ社製、モデル381−A DNA合成機を用いて合成し、OPCTMカートリッジを用いて精製後、PCRのプライマーとして使用した。なお、このプライマーペアを用いて増幅されるDNAは、ヘキソン領域の1645〜2907番目の塩基対間の1263塩基対部分である。
【0055】(D)標的DNAの増幅(PCR法)
反応液として、10×反応用緩衝液 (Reaction Buffer)10μl 、デオキシヌクレオチド3−リン酸混合液(dATP,dGTP,dTTP,dCTP;各1.25mM含有)16μl 、上記オリゴヌクレオチド合成プライマー(配列番号16及び17;各50μM )各2.0μl 、前記(B)項で抽出したアデノウイルスDNA 100ng〜1μg 、およびTaq ポリメラーゼ(日本ロシュ社製)1μl(5unit) に蒸留水を加え、計100μl としたものを調製した。PCRの1サイクルは、塩基鎖の変性工程を94℃1分、アニーリング工程を60℃1分、塩基鎖伸張工程を72℃2分に設定し、アンプリフィケーションシステム(Amplification System、シータス社)を用いて標的DNAを35サイクル増幅した。
【0056】(E)ゲル電気泳動法による増幅DNAの確認2.0%のアガロースゲルにエチジウムブロマイドを0.5μg/ml 加え、上記(C)項で増幅したDNAの電気泳動を行った。泳動後、254nmの紫外線を照射し、エチジウムブロマイドの発色反応によりDNAバンドを検出し、ヘキソン領域の一部に由来する1263塩基対の増幅DNAを確認した。なお、マーカーとしてファージφx174の制限酵素HaeIII 分解物を同時に泳動した。その結果、図1に示すように、用いたアデノウイルス標準株(14株)の全ての血清型について、1263塩基対の標的DNAバンドが確認された。
【0057】実施例2 ヘキソン領域の塩基配列決定実施例1で増幅したヘキソン領域DNAを、常法(アガロースゲルからのエレクトロエリューション法)によりゲルから抽出した。抽出DNAをDNAブランティングキット(宝酒造社製)により平滑末端化処理し、ファージベクターM13mp18RF(宝酒造社製)に組み込んだ。
【0058】この組換えファージベクターと、YT培地〔Bacto-Triptone (DIFCO 社製) 8g 、Bacto-Yeast Extract (DIFCO 社製) 5g 、NaCl 2.5g を1L の蒸留水に溶解し、pHを7.4に調製した後、121℃で15分間滅菌処理〕中で生育させたエシェリッシア・コリ(Escherichia coli)JM109株(宝酒造社製)と、37℃に保温した5mlの軟寒天培地〔YT培地に Bacto-Agar(DIFCO 社製) 6g/L を含む〕とを混ぜ合わせ、YT寒天培地〔YT培地に Bacto-Agar(DIFCO 社製) 12g/L を含む〕上にまき、37℃で4〜6時間培養した。
【0059】培養後、培地上にできたプラークよりアデノウイルスヘキソン領域DNAを含む組換えファージを釣り上げ、2倍濃度のYT培地中でエシェリッシア・コリJM109株と共に培養し、培地から常法にて一本鎖ファージDNAを抽出した。各血清型から1〜10個ずつのクローンが得られた。それぞれのクローン由来のファージDNAに含まれるアデノウイルスヘキソン領域DNAの塩基配列を、サンガー法(F. Sanger 等、前出)により決定した。
【0060】その結果を、配列番号6(1型)、配列番号7(3型)、配列番号8(4型)、配列番号9(6型)、配列番号10(7型)、配列番号11(8型)、配列番号12(11型)、配列番号13(14型)、配列番号14(16型)、配列番号15(37型)に示す。
【0061】実施例3 アデノウイルス標準株の2段階PCR法による検出(A)DNAの抽出実施例1の(A)項に記載した各ウイルス標準株から、同(B)項に準じてDNAを抽出・精製した。
【0062】(B)血清型共通プライマー(2段階PCR用)の設計と合成アデノウイルスの検出感度を更に高めるために、実施例2で決定した各血清型のヘキソン領域塩基配列を解析し、前記プライマー(配列番号16及び17)より内側に、ヘキソン領域の一部を共通に増幅できるプライマーペアを配列番号18(5’末端側)、配列番号19(3’末端側)のように設計した。これらのオリゴヌクレオチドを実施例1の(C)項記載の方法で合成した。なお、このプライマーペアを用いて増幅されるDNAは、ヘキソン領域の1897〜2861番目の塩基対間の965塩基対部分である。
【0063】(C)標的DNAの第1段階増幅(PCR法)
実施例1の(D)項に準じてヘキソン領域DNAを増幅した。
【0064】(D)ゲル電気泳動法による第1段階増幅DNAの確認増幅DNAを、実施例1(E)項に準じてゲル電気泳動法で分離・検出した。その結果、図1に示す通り、ヘキソン領域由来の1263塩基対のDNAバンドが確認された。
【0065】(E)標的DNAの第2段階増幅(PCR法)
上記(C)項で増幅したDNAサンプルを鋳型として、上記(B)項で調製した合成プライマー(配列番号18及び19;各50μM )を用いて、実施例1の(D)項に準じてヘキソン領域DNAを増幅した。
【0066】(F)ゲル電気泳動法による第2段階増幅DNAの確認増幅DNAを、実施例1(E)項に準じてゲル電気泳動法で分離・検出した。その結果、図2に示す通り、用いたアデノウイルス標準株(14株)の全ての血清型についてヘキソン領域由来の965塩基対のDNAバンドが確認された。
【0067】実施例4 アデノウイルス標準株の亜群鑑別(A)DNAの抽出実施例1の(A)項に記載した各アデノウイルス標準株から、同(B)項に準じてDNAを抽出・精製した。
【0068】(B)亜群特異的プライマー(亜群鑑別用)の設計と合成実施例2で決定した各血清型のヘキソン領域の塩基配列を解析し、ヘキソン領域内の亜群に特異的な塩基配列に相補性を有するプライマーを、配列番号20(B亜群用)、配列番号21(C亜群用)、配列番号22(D亜群用)、配列番号23(E亜群用)、配列番号24(F亜群用)のように設計し、実施例1(C)項に準じて合成した。
【0069】(C)標的DNAの増幅(PCR法)
実施例3の(C)項で増幅したDNAを鋳型として、上記各亜群特異的プライマーと血清型共通プライマーを用いて、亜群特異的DNA領域を次の通り増幅した。反応液として、10×反応用緩衝液 (Reaction Buffer)9.8μl 、デオキシヌクレオチド3−リン酸混合液(dATP,dGTP,dTTP,dCTP;各1.25mM含有)16μl 上記亜群特異的プライマー〔配列番号20、21、22、23、24;各50μM 各2.0μl 、血清型特異的プライマー(配列番号19;50μM )2.0μl 、実施例3の(C)項で増幅した標的DNA100ng〜1μg 、及び Taq ポリメラーゼ(日本ロシュ社製)1μl(5unit) に蒸留水を加え、計100μl としたものを調製し、実施例1の(D)項に準じて増幅した。
【0070】(D)ゲル電気泳動法による増幅DNAの確認増幅DNAを、実施例1(E)項に準じてゲル電気泳動法で分離・検出した。その結果、図3に示す通り、B亜群は1168塩基対、C亜群は74塩基対、D亜群は375塩基対、E亜群は100塩基対、F亜群は256塩基対のヘキソン領域由来のDNAバンドが確認された。交差反応は認められず、亜群特異的なDNAバンドが検出でき、この方法により亜群の鑑別が可能であることが判明した。
【0071】実施例5 アデノウイルス標準株の血清型鑑別(A)血清型特異的DNAプローブの設計と合成実施例2で決定した各血清型のヘキソン領域の塩基配列を解析し、ヘキソン領域内の血清型に特異的な塩基配列に相補性を有するDNAプローブを、配列番号25(3型用)、配列番号23(4型用)、配列番号26(8型用)、配列番号27(11型用)、配列番号28(19型用)、配列番号29(37型用)のように設計し、実施例1(C)項に準じて合成した。このDNAプローブの標識は、5’末端のリン酸化反応により〔γ−32P〕ATP、T4ポリヌクレオチドキナーゼ(東洋紡績社製)を用いて行った。
【0072】(B)ドットブロット法実施例3の(C)項で増幅したDNAを試料とし、その分子数を260nmの吸光度により算出した。この増幅DNA 1012 molecule /2μl を、Tris−EDTAで変性させた後ナイロンメンブレンに滴下し、254 nm の紫外線1.2×105 μJOULES/cm2(UV stratalinkerTM ;ストラタジーン製)により固着させた。
【0073】32Pで標識されたDNAプローブは、1回のハイブリダイゼーションにつき106cpm/ml 使用した。プレハイブリダイゼーションは、反応液として6×クエン酸標準緩衝液、5×デンハルト(Denhardt's)試薬、10%SDS(ドデシル硫酸ソーダ)、0.1%脱脂粉乳、100μg/ml 変性サケ精子DNAを用いて、60℃で1時間行った。
【0074】ハイブリダイゼーションは、反応液として3.0M テトラメチルアンモニウムクロライド、0.1M リン酸ナトリウム(pH6.8)、0.5mM EDTA(pH7.6)、10%SDS、100μg /ml 変性サケ精子DNA、0.1%脱脂粉乳を用い、60℃で一晩行った。ハイブリダイゼーション後、余分なプローブを、6×SSCを用い、60℃で5分間、3回繰り返し洗浄した。その後、3.0M テトラメチルアンモニウムクロライドで、60℃で10分間洗浄した。その後、配列番号29のプローブは60℃から65℃まで、また配列番号25及び28のプローブは60℃から68℃まで温度を上げながら(約5分)、3.0M テトラメチルアンモニウムクロライドで洗浄した。ナイロンメンブレンを乾燥後ラップに包み、オートラジオグラフィーを−80℃で4時間から一晩行い、各プローブとのドットハイブリッド形成の有無により試料の血清型を鑑別した。
【0075】その結果、図4に示す通り、血清型特異的DNAプローブと各血清型のアデノウイルス標準株から得られたDNAとの間で、交差反応はなく、特異的な結合パターンが認められた。この結合パターンからアデノウイルスの各血清型の鑑別が可能である事が判明した。
【0076】
【配列表】
配列番号:1配列の長さ:1263配列の型:核酸鎖の数:二本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:Genomic DNA起源生物名:Mastadenovirus株名:2型配列の特徴特徴を表す記号:CDS存在位置:1−1263他の情報ヘキソンをコードする遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の配列配列AAT CCC TTT AAC CAC CAC CGC AAT GCG GGC CTC CGT TAT CGC TCC ATG 48 Asn Pro Phe Asn His His Arg Asn Ala Gly Leu Arg Tyr Arg Ser Met 5 10 15 TTG TTG GGA AAC GGC CGC TAC GTG CCC TTT CAC ATT CAG GTG CCC CAA 96 Leu Leu Gly Asn Gly Arg Tyr Val Pro Phe His Ile Gln Val Pro Gln 20 25 30 AAG TTT TTT GCC ATT AAA AAC CTC CTC CTC CTG CCA GGC TCA TAT ACA 144 Lys Phe Phe Ala Ile Lys Asn Leu Leu Leu Leu Pro Gly Ser Tyr Thr 35 40 45 TAT GAA TGG AAC TTC AGG AAG GAT GTT AAC ATG GTT CTG CAG AGC TCT 192 Tyr Glu Trp Asn Phe Arg Lys Asp Val Asn Met Val Leu Gln Ser Ser 50 55 60 CTG GGA AAC GAT CTT AGA GTT GAC GGG GCT AGC ATT AAG TTT GAC AGC 240 Leu Gly Asn Asp Leu Arg Val Asp Gly Ala Ser Ile Lys Phe Asp Ser 65 70 75 80 ATT TGT CTT TAC GCC ACC TTC TTC CCC ATG GCC CAC AAC ACG GCC TCC 288 Ile Cys Leu Tyr Ala Thr Phe Phe Pro Met Ala His Asn Thr Ala Ser 85 90 95 ACG CTG GAA GCC ATG CTC AGA AAT GAC ACC AAC GAC CAG TCC TTT AAT 336 Thr Leu Glu Ala Met Leu Arg Asn Asp Thr Asn Asp Gln Ser Phe Asn 100 105 110 GAC TAC CTT TCC GCC GCC AAC ATG CTA TAC CCC ATA CCC GCC AAC GCC 384 Asp Tyr Leu Ser Ala Ala Asn Met Leu Tyr Pro Ile Pro Ala Asn Ala 115 120 125 ACC AAC GTG CCC ATC TCC ATC CCA TCG CGC AAC TGG GCA GCA TTT CGC 432 Thr Asn Val Pro Ile Ser Ile Pro Ser Arg Asn Trp Ala Ala Phe Arg 130 135 140 GGT TGG GCC TTC ACA CGC TTG AAG ACA AAG GAA ACC CCT TCC CTG GGA 480 Gly Trp Ala Phe Thr Arg Leu Lys Thr Lys Glu Thr Pro Ser Leu Gly 145 150 155 160 TCA GGC TAC GAC CCT TAC TAC ACC TAC TCT GGC TCC ATA CCA TAC CTT 528 Ser Gly Tyr Asp Pro Tyr Tyr Thr Tyr Ser Gly Ser Ile Pro Tyr Leu 165 170 175 GAC GGA ACC TTC TAT CTT AAT CAC ACC TTT AAG AAG GTG GCC ATT ACC 576 Asp Gly Thr Phe Tyr Leu Asn His Thr Phe Lys Lys Val Ala Ile Thr 180 185 190 TTT GAC TCT TCT GTT AGC TGG CCG GGC AAC GAC CGC CTG CTT ACT CCC 624 Phe Asp Ser Ser Val Ser Trp Pro Gly Asn Asp Arg Leu Leu Thr Pro 195 200 205 AAT GAG TTT GAG ATT AAA CGC TCA GTT GAC GGG GAG GGC TAC AAC GTA 672 Asn Glu Phe Glu Ile Lys Arg Ser Val Asp Gly Glu Gly Tyr Asn Val 210 215 220 GCT CAG TGC AAC ATG ACC AAG GAC TGG TTC CTG GTG CAG ATG TTG GCC 720 Ala Gln Cys Asn Met Thr Lys Asp Trp Phe Leu Val Gln Met Leu Ala 225 230 235 240 AAC TAC AAT ATT GGC TAC CAG GGC TTC TAC ATT CCA GAA AGC TAC AAG 768 Asn Tyr Asn Ile Gly Tyr Gln Gly Phe Tyr Ile Pro Glu Ser Tyr Lys 245 250 255 GAC CGC ATG TAC TCG TTC TTC AGA AAC TTC CAG CCC ATG AGC CGG CAA 816 Asp Arg Met Tyr Ser Phe Phe Arg Asn Phe Gln Pro Met Ser Arg Gln 260 265 270 GTG GTT GAC GAT ACT AAA TAC AAG GAG TAT CAG CAG GTT GGA ATT CTT 864 Val Val Asp Asp Thr Lys Tyr Lys Glu Tyr Gln Gln Val Gly Ile Leu 275 280 285 CAC CAG CAT AAC AAC TCA GGA TTC GTA GGC TAC CTC GCT CCC ACC ATG 912 His Gln His Asn Asn Ser Gly Phe Val Gly Tyr Leu Ala Pro Thr Met 290 295 300 CGC GAG GGA CAG GCT TAC CCC GCC AAC GTG CCC TAC CCA CTA ATA GGC 960 Arg Glu Gly Gln Ala Tyr Pro Ala Asn Val Pro Tyr Pro Leu Ile Gly 305 310 315 320 AAA ACC GCG GTT GAC AGT ATT ACC CAG AAA AAG TTT CTT TGC GAT CGC 1008 Lys Thr Ala Val Asp Ser Ile Thr Gln Lys Lys Phe Leu Cys Asp Arg 325 330 335 ACC CTT TGG CGC ATC CCA TTC TCC AGT AAC TTT ATG TCC ATG GGC GCA 1056 Thr Leu Trp Arg Ile Pro Phe Ser Ser Asn Phe Met Ser Met Gly Ala 340 345 350 CTC ACA GAC CTG GGC CAA AAC CTT CTC TAC GCC AAC TCC GCC CAC GCG 1104 Leu Thr Asp Leu Gly Gln Asn Leu Leu Tyr Ala Asn Ser Ala His Ala 355 360 365 CTA GAC ATG ACT TTT GAG GTG GAT CCC ATG GAC GAG CCC ACC CTT CTT 1152 Leu Asp Met Thr Phe Glu Val Asp Pro Met Asp Glu Pro Thr Leu Leu 370 375 380 TAT GTT TTG TTT GAA GTC TTT GAC GTG GTC CGT GTG CAC CAG CCG CAC 1200 Tyr Val Leu Phe Glu Val Phe Asp Val Val Arg Val His Gln Pro His 385 390 395 400 CGC GGC GTC ATC GAG ACC GTG TAC CTG CGC ACG CCC TTC TCG GCC GGC 1248 Arg Gly Val Ile Glu Thr Val Tyr Leu Arg Thr Pro Phe Ser Ala Gly 405 410 415 AAC GCC ACA ACA TAA 1263 Asn Ala Thr Thr *** 420
【0077】配列番号:2配列の長さ:1263配列の型:核酸鎖の数:二本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:Genomic DNA起源生物名:Mastadenovirus株名:5型配列の特徴特徴を表す記号:CDS存在位置:1−1263他の情報ヘキソンをコードする遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の配列配列 AAC CCA TTT AAC CAC CAC CGC AAT GCT GGC CTG CGC TAC CGC TCA ATG 48 Asn Pro Phe Asn His His Arg Asn Ala Gly Leu Arg Tyr Arg Ser Met 5 10 15 TTG CTG GGC AAT GGT CGC TAT GTG CCC TTC CAC ATC CAG GTG CCT CAG 96 Leu Leu Gly Asn Gly Arg Tyr Val Pro Phe His Ile Gln Val Pro Gln 20 25 30 AAG TTC TTT GCC ATT AAA AAC CTC CTT CTC CTG CCG GGC TCA TAC ACC 144 Lys Phe Phe Ala Ile Lys Asn Leu Leu Leu Leu Pro Gly Ser Tyr Thr 35 40 45 TAC GAG TGG AAC TTC AGG AAG GAT GTT AAC ATG GTT CTG CAG AGC TCC 192 Tyr Glu Trp Asn Phe Arg Lys Asp Val Asn Met Val Leu Gln Ser Ser 50 55 60 CTA GGA AAT GAC CTA AGG GTT GAC GGA GCC AGC ATT AAG TTT GAT AGC 240 Leu Gly Asn Asp Leu Arg Val Asp Gly Ala Ser Ile Lys Phe Asp Ser 65 70 75 80 ATT TGC CTT TAC GCC ACC TTC TTC CCC ATG GCC CAC AAC ACC GCC TCC 288 Ile Cys Leu Tyr Ala Thr Phe Phe Pro Met Ala His Asn Thr Ala Ser 85 90 95 ACG CTT GAG GCC ATG CTT AGA AAC GAC ACC AAC GAC CAG TCC TTT AAC 336 Thr Leu Glu Ala Met Leu Arg Asn Asp Thr Asn Asp Gln Ser Phe Asn 100 105 110 GAC TAT CTC TCC GCC GCC AAC ATG CTC TAC CCT ATA CCC GCC AAC GCT 384 Asp Tyr Leu Ser Ala Ala Asn Met Leu Tyr Pro Ile Pro Ala Asn Ala 115 120 125 ACC AAC GTG CCC ATA TCC ATC CCC TCC CGC AAC TGG GCG GGA AAG CGC 432 Thr Asn Val Pro Ile Ser Ile Pro Ser Arg Asn Trp Ala Gly Lys Arg 130 140 GGC TGG GCC TTC ACG CGC CTT AAG ACT AAG GAA ACC CCA TCA CTG GGC 480 Gly Trp Ala Phe Thr Arg Leu Lys Thr Lys Glu Thr Pro Ser Leu Gly 145 150 155 160 TCG GGC TAC GAC CCT TAT TAC ACC TAC TCT GGC TCT ATA CCC TAC CTA 528 Ser Gly Tyr Asp Pro Tyr Tyr Thr Tyr Ser Gly Ser Ile Pro Tyr Leu 165 170 175 GAT GGA ACC TTT TAC CTC AAC CAC ACC TTT AAG AAG GTG GCC ATT ACC 576 Asp Gly Thr Phe Tyr Leu Asn His Thr Phe Lys Lys Val Ala Ile Thr 180 185 190 TTT GAC TCT TCT GTC AGC TGG CCT GGC AAT GAC CGC CTG CTT ACC CCC 624 Phe Asp Ser Ser Val Ser Trp Pro Gly Asn Asp Arg Leu Leu Thr Pro 195 200 205 AAC GAG TTT GAA ATT AAG CGC TCA GTT GAC GGG GAG GGT TAC AAC GTT 672 Asn Glu Phe Glu Ile Lys Arg Ser Val Asp Gly Glu Gly Tyr Asn Val 210 215 220 GCC CAG TGT AAC ATG ACC AAA GAC TGG TTC CTG GTA CAA ATG CTA GCT 720 Ala Gln Cys Asn Met Thr Lys Asp Trp Phe Leu Val Gln Met Leu Ala 230 235 240 AAC TAC AAC ATT GGC TAC CAG GGC TTC TAT ATC CCA GAG AGC TAC AAG 768 Asn Tyr Asn Ile Gly Tyr Gln Gly Phe Tyr Ile Pro Glu Ser Tyr Lys 245 250 255 GAC CGC ATG TAC TCG AAG AAT AGA AAC TTC CAG CCC ATG AGC CGT CAG 816 Asp Arg Met Tyr Ser Lys Asn Arg Asn Phe Gln Pro Met Ser Arg Gln 260 265 270 GTG GTG GAT GAT ACT AAA TAC AAG GAC TAC CAA CAG GTG GGC ATC CTA 864 Val Val Asp Asp Thr Lys Tyr Lys Asp Tyr Gln Gln Val Gly Ile Leu 275 280 285 CAC CAA CAC AAC AAC TCT GGA TTT GTT GGC TAC CTT GCC CCC ACC ATG 912 His Gln His Asn Asn Ser Gly Phe Val Gly Tyr Leu Ala Pro Thr Met 290 295 300 CGC GAA GGA CAG GCC TAC CCT GCT AAC TTC CCC TAT CCG CTT ATA GGC 960 Arg Glu Gly Gln Ala Tyr Pro Ala Asn Phe Pro Tyr Pro Leu Ile Gly 305 310 315 320 AAG ACC GCA GTT GAC AGC ATT ACC CAG AAA AAG TTT CTT TGC GAT CGC 1008 Lys Thr Ala Val Asp Ser Ile Thr Gln Lys Lys Phe Leu Cys Asp Arg 325 330 335 ACC CTT TGG CGC ATC CCA TTC TCC AGT AAC TTT ATG TCC ATG GGC GCA 1056 Thr Leu Trp Arg Ile Pro Phe Ser Ser Asn Phe Met Ser Met Gly Ala 340 345 350 CTC ACA GAC CTG GGC CAA AAC CTT CTC TAC GCC AAC TCC GCC CAC GCG 1104 Leu Thr Asp Leu Gly Gln Asn Leu Leu Tyr Ala Asn Ser Ala His Ala 355 360 365 CTA GAC ATG ACT TTT GAG GTG GAT CCC ATG GAC GAG CCC ACC CTT CTT 1152 Leu Asp Met Thr Phe Glu Val Asp Pro Met Asp Glu Pro Thr Leu Leu 370 375 380 TAT GTT TTG TTT GAA GTC TTT GAC GTG GTC CGT GTG CAC CGG CCG CAC 1200 Tyr Val Leu Phe Glu Val Phe Asp Val Val Arg Val His Arg Pro His 385 390 395 400 CGC GGC GTC ATC GAA ACC GTG TAC CTG CGC ACG CCC TTC TCG GCC GGC 1248 Arg Gly Val Ile Glu Thr Val Tyr Leu Arg Thr Pro Phe Ser Ala Gly 405 410 415 AAC GCC ACA ACA TAA 1263 Asn Ala Thr Thr *** 420
【0078】配列番号:3配列の長さ:1263配列の型:核酸鎖の数:二本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:Genomic DNA起源生物名:Mastadenovirus株名:5型配列の特徴特徴を表す記号:CDS存在位置:1−1263他の情報ヘキソンをコードする遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の配列配列AAC CCA TTT AAC CAC CAC CGC AAT GCT GGC CTG CGC TAC CGC TCA ATG 48 Asn Pro Phe Asn His His Arg Asn Ala Gly Leu Arg Tyr Arg Ser Met 5 10 15 TTG CTG GGC AAT GGT CGC TAT GTG CCC TTC CAC ATC CAG GTG CCT CAG 96 Leu Leu Gly Asn Gly Arg Tyr Val Pro Phe His Ile Gln Val Pro Gln 20 25 30 AAG TTC TTT GCC ATT AAA AAC CTC CTT CTC CTG CCG GGC TCA TAC ACC 144 Lys Phe Phe Ala Ile Lys Asn Leu Leu Leu Leu Pro Gly Ser Tyr Thr 35 40 45 TAC GAG TGG AAC TTC AGG AAG GAT GTT AAC ATG GTT CTG CAG AGC TCC 192 Tyr Glu Trp Asn Phe Arg Lys Asp Val Asn Met Val Leu Gln Ser Ser 50 55 60 CTA GGA AAT GAC CTA AGG GTT GAC GGA GCC AGC ATT AAG TTT GAT AGC 240 Leu Gly Asn Asp Leu Arg Val Asp Gly Ala Ser Ile Lys Phe Asp Ser 65 70 75 80 ATT TGC CTT TAC GCC ACC TTC TTC CCC ATG GCC CAC AAC ACC GCC TCC 288 Ile Cys Leu Tyr Ala Thr Phe Phe Pro Met Ala His Asn Thr Ala Ser 85 90 95 ACG CTT GAG GCC ATG CTT AGA AAC GAC ACC AAC GAC CAG TCC TTT AAC 336 Thr Leu Glu Ala Met Leu Arg Asn Asp Thr Asn Asp Gln Ser Phe Asn 100 105 110 GAC TAT CTC TCC GCC GCC AAC ATG CTC TAC CCT ATA CCC GCC AAC GCT 384 Asp Tyr Leu Ser Ala Ala Asn Met Leu Tyr Pro Ile Pro Ala Asn Ala 115 120 125 ACC AAC GTG CCC ATA TCC ATC CCC TCC CGC AAC TGG GCG GCT TTC CGC 432 Thr Asn Val Pro Ile Ser Ile Pro Ser Arg Asn Trp Ala Ala Phe Arg 130 135 140 GGC TGG GCC TTC ACG CGC CTT AAG ACT AAG GAA ACC CCA TCA CTG GGC 480 Gly Trp Ala Phe Thr Arg Leu Lys Thr Lys Glu Thr Pro Ser Leu Gly 145 150 155 160 TCG GGC TAC GAC CCT TAT TAC ACC TAC TCT GGC TCT ATA CCC TAC CTA 528 Ser Gly Tyr Asp Pro Tyr Tyr Thr Tyr Ser Gly Ser Ile Pro Tyr Leu 165 170 175 GAT GGA ACC TTT TAC CTC AAC CAC ACC TTT AAG AAG GTG GCC ATT ACC 576 Asp Gly Thr Phe Tyr Leu Asn His Thr Phe Lys Lys Val Ala Ile Thr 180 185 190 TTT GAC TCT TCT GTC AGC TGG CCT GGC AAT GAC CGC CTG CTT ACC CCC 624 Phe Asp Ser Ser Val Ser Trp Pro Gly Asn Asp Arg Leu Leu Thr Pro 195 200 205 AAC GAG TTT GAA ATT AAG CGC TCA GTT GAC GGG GAG GGT TAC AAC GTT 672 Asn Glu Phe Glu Ile Lys Arg Ser Val Asp Gly Glu Gly Tyr Asn Val 210 215 220 GCC CAG TGT AAC ATG ACC AAA GAC TGG TTC CTG GTA CAA ATG CTA GCT 720 Ala Gln Cys Asn Met Thr Lys Asp Trp Phe Leu Val Gln Met Leu Ala 225 230 235 240 AAC TAC AAC ATT GGC TAC CAG GGC TTC TAT ATC CCA GAG AGC TAC AAG 768 Asn Tyr Asn Ile Gly Tyr Gln Gly Phe Tyr Ile Pro Glu Ser Tyr Lys 245 250 255 GAC CGC ATG TAC TCC TTC TTT AGA AAC TTC CAG CCC ATG AGC CGT CAG 816 Asp Arg Met Tyr Ser Phe Phe Arg Asn Phe Gln Pro Met Ser Arg Gln 260 265 270 GTG GTG GAT GAT ACT AAA TAC AAG GAC TAC CAA CAG GTG GGC ATC CTA 864 Val Val Asp Asp Thr Lys Tyr Lys Asp Tyr Gln Gln Val Gly Ile Leu 275 280 285 CAC CAA CAC AAC AAC TCT GGA TTT GTT GGC TAC CTT GCC CCC ACC ATG 912 His Gln His Asn Asn Ser Gly Phe Val Gly Tyr Leu Ala Pro Thr Met 290 295 300 CGC GAA GGA CAG GCC TAC CCT GCT AAC TTC CCC TAT CCG CTT ATA GGC 960 Arg Glu Gly Gln Ala Tyr Pro Ala Asn Phe Pro Tyr Pro Leu Ile Gly 305 310 315 320 AAG ACC GCA GTT GAC AGC ATT ACC CAG AAA AAG TTT CTT TGC GAT CGC 1008 Lys Thr Ala Val Asp Ser Ile Thr Gln Lys Lys Phe Leu Cys Asp Arg 325 330 335 ACC CTT TGG CGC ATC CCA TTC TCC AGT AAC TTT ATG TCC ATG GGC GCA 1056 Thr Leu Trp Arg Ile Pro Phe Ser Ser Asn Phe Met Ser Met Gly Ala 340 345 350 CTC ACA GAC CTG GGC CAA AAC CTT CTC TAC GCC AAC TCC GCC CAC GCG 1104 Leu Thr Asp Leu Gly Gln Asn Leu Leu Tyr Ala Asn Ser Ala His Ala 355 360 365 CTA GAC ATG ACT TTT GAG GTG GAT CCC ATG GAC GAG CCC ACC CTT CTT 1152 Leu Asp Met Thr Phe Glu Val Asp Pro Met Asp Glu Pro Thr Leu Leu 370 375 380 TAT GTT TTG TTT GAA GTC TTT GAC GTG GTC CGT GTG CAC CGG CCG CAC 1200 Tyr Val Leu Phe Glu Val Phe Asp Val Val Arg Val His Arg Pro His 385 390 395 400 CGC GGC GTC ATC GAA ACC GTG TAC CTG CGC ACG CCC TTC TCG GCC GGC 1248 Arg Gly Val Ile Glu Thr Val Tyr Leu Arg Thr Pro Phe Ser Ala Gly 405 410 415 AAC GCC ACA ACA TAA 1263 Asn Ala Thr Thr *** 420
【0079】配列番号:4配列の長さ:1263配列の型:核酸鎖の数:二本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:Genomic DNA起源生物名:Mastadenovirus株名:40型配列の特徴特徴を表す記号:CDS存在位置:1−1263他の情報ヘキソンをコードする遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の配列配列AAT CCC TTT AAC CAC CAC CGC AAT GCT GGT CTG CGC TAC CGT TCT ATG 48 Asn Pro Phe Asn His His Arg Asn Ala Gly Leu Arg Tyr Arg Ser Met 5 10 15 CTC CTG GGT AAC GGC CGC TAC GTG CCT TTT CAC ATC CAA GTG CCC CAG 96 Leu Leu Gly Asn Gly Arg Tyr Val Pro Phe His Ile Gln Val Pro Gln 20 25 30 AAA TTT TTC GCC ATT AAA AAT CTC CTG CTC CTG CCC GGG TCC TAC ACC 144 Lys Phe Phe Ala Ile Lys Asn Leu Leu Leu Leu Pro Gly Ser Tyr Thr 35 40 45 TAT GAG TGG AAC TTC CGG AAG GAT GTT AAC ATG ATT CTC CAA AGC AGT 192 Tyr Glu Trp Asn Phe Arg Lys Asp Val Asn Met Ile Leu Gln Ser Ser 50 55 60 CTC GGT AAC GAC CTC AGG GTC GAT GGA GCC AGC GTC AGG TTT GAC AGC 240 Leu Gly Asn Asp Leu Arg Val Asp Gly Ala Ser Val Arg Phe Asp Ser 65 70 65 80 ATT AAC CTG TAT GCC AAC TTT TTC CCC ATG GCT CAC AAC ACC GCT TCC 288 Ile Asn Leu Tyr Ala Asn Phe Phe Pro Met Ala His Asn Thr Ala Ser 85 90 95 ACC TTG GAA GCA ATG CTT CGT AAT GAT ACC AAC GAT CAG TCT TTC AAC 336 Thr Leu Glu Ala Met Leu Arg Asn Asp Thr Asn Asp Gln Ser Phe Asn 100 105 110 GAC TAC CTC TGC GCC GCA AAC ATG CTT TAC CCC ATA CCC GCC AAC GCT 384 Asp Tyr Leu Cys Ala Ala Asn Met Leu Tyr Pro Ile Pro Ala Asn Ala 115 120 125 ACT AGC GTG CCC ATT TCT ATT CCT TCG CGA AAT TGG GCT GCT TTT CGG 432 Thr Ser Val Pro Ile Ser Ile Pro Ser Arg Asn Trp Ala Ala Phe Arg 130 135 140 GGG TGG AGT TTT ACT AGA CTA AAA ACT AAA GAA ACC CCC TCT TTG GGG 480 Gly Trp Ser Phe Thr Arg Leu Lys Thr Lys Glu Thr Pro Ser Leu Gly 145 150 155 160 TCC GGG TTT GAT CCA TAT TTC ACC TAC TCT GGC TCC GTC CCA TAC TTG 528 Ser Gly Phe Asp Pro Tyr Phe Thr Tyr Ser Gly Ser Val Pro Tyr Leu 165 170 175 GAT GGC ACC TTT TAC CTG AAC CAT ACT TTT AAA AAG GTG TCC GTT ATG 576 Asp Gly Thr Phe Tyr Leu Asn His Thr Phe Lys Lys Val Ser Val Met 180 185 190 TTC GAC TCC TCT GTG AGC TGG CCT GGT AAC GAC CGA CTA CTT ACT CCC 624 Phe Asp Ser Ser Val Ser Trp Pro Gly Asn Asp Arg Leu Leu Thr Pro 195 200 205 AAC GAG TTT GAA ATC AAA CGC ACC GTG GAT GGG GAA GGA TAC AAC GTG 672 Asn Glu Phe Glu Ile Lys Arg Thr Val Asp Gly Glu Gly Tyr Asn Val 210 215 220 GCT CAA TGT AAC ATG ACC AAG GAC TGG TTC CTC ATA CAA ATG CTC AGT 720 Ala Gln Cys Asn Met Thr Lys Asp Trp Phe Leu Ile Gln Met Leu Ser 225 230 235 240 CAC TAC AAT ATT GGC TAC CAG GGT TTC CAC GTA CCA GAA AGC TAC AAG 768 His Tyr Asn Ile Gly Tyr Gln Gly Phe His Val Pro Glu Ser Tyr Lys 245 250 255 GAC AGG ATG TAC TCC TTT TTC CGA AAC TTC CAA CCC ATG AGC CGC CAG 816 Asp Arg Met Tyr Ser Phe Phe Arg Asn Phe Gln Pro Met Ser Arg Gln 260 265 270 GTG GTA GAC ACT ACC ACC TAC ACG GAG TAT CAG AAT GTA ACT CTC CCT 864 Val Val Asp Thr Thr Thr Tyr Thr Glu Tyr Gln Asn Val Thr Leu Pro 275 280 285 TTC CAG CAT AAT AAC TCT GGC TTT GTA GGA TAC ATG GGA CCT GCC ATA 912 Phe Gln His Asn Asn Ser Gly Phe Val Gly Tyr Met Gly Pro Ala Ile 290 295 300 CGG GAG GGA CAA GCT TAC CCC GCC AAC TAT CCA TAC CCC CTT ATT GGT 960 Arg Glu Gly Gln Ala Tyr Pro Ala Asn Tyr Pro Tyr Pro Leu Ile Gly 305 310 315 320 CAG ACG GCC GTA CCA AGC CTG ACT CAG AAA AAA TTT CTT TGC GAT CGT 1008 Gln Thr Ala Val Pro Ser Leu Thr Gln Lys Lys Phe Leu Cys Asp Arg 325 330 335 ACC ATG TGG CGC ATT CCC TTT TCC AGC AAC TTT ATG TCT ATG GGG GCC 1056 Thr Met Trp Arg Ile Pro Phe Ser Ser Asn Phe Met Ser Met Gly Ala 340 345 350 CTG ACT GAC CTG GGG CAA AAC ATG CTG TAC GCC AAC TCC GCC CAC GCG 1104 Leu Thr Asp Leu Gly Gln Asn Met Leu Tyr Ala Asn Ser Ala His Ala 355 360 365 CTC GAC ATG ACT TTT GAG GTG GAC CCC ATG GAT GAG CCC ACA CTT CTC 1152 Leu Asp Met Thr Phe Glu Val Asp Pro Met Asp Glu Pro Thr Leu Leu 370 375 380 TAT GTT CTG TTC GAA GTT TTC GAC GTT GTG CGC ATC CAC CAG CCG CAC 1200 Tyr Val Leu Phe Glu Val Phe Asp Val Val Arg Ile His Gln Pro His 385 390 395 400 CGC GGC GTC ATC GAG GCC GTC TAC CTG CGT ACG CCG TTC TCG GCC GGT 1248 Arg Gly Val Ile Glu Ala Val Tyr Leu Arg Thr Pro Phe Ser Ala Gly 405 410 415 AAC GCC ACC ACA TAA 1263 Asn Ala Thr Thr *** 420
【0080】配列番号:5配列の長さ:1263配列の型:核酸鎖の数:二本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:Genomic DNA起源生物名:Mastadenovirus株名:41型配列の特徴特徴を表す記号:CDS存在位置:1−1263他の情報ヘキソンをコードする遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の配列配列AAC CCC TTC AAT CAC CAC CGT AAC GCC GGT CTG CGC TAT CGA TCC ATG 48 Asn Pro Phe Asn His His Arg Asn Ala Gly Leu Arg Tyr Arg Ser Met 5 10 15 CTC TTG GGC AAC GGG CGT TAC GTA CCC TTC CAC ATT CAA GTC CCC CAG 96 Leu Leu Gly Asn Gly Arg Tyr Val Pro Phe His Ile Gln Val Pro Gln 20 25 30 AAG TTT TTT GCC ATT AAA AAT CTC CTC CTC TTA CCG GGT TCC TAC ACC 144 Lys Phe Phe Ala Ile Lys Asn Leu Leu Leu Leu Pro Gly Ser Tyr Thr 35 40 45 TAC GAG TGG AAC TTC AGG AAG GAC GTT AAC ATG ATC CTC CAG AGC AGT 192 Tyr Glu Trp Asn Phe Arg Lys Asp Val Asn Met Ile Leu Gln Ser Ser 50 55 60 CTG GGT AAC GAC CTG CGG GTC GAC GGA GCC AGC GTC AGG TTC GAT AGC 240 Leu Gly Asn Asp Leu Arg Val Asp Gly Ala Ser Val Arg Phe Asp Ser 65 70 75 80 ATT AAT CTG TAC GCC AAC TTT TTT CCC ATG GCT CAC AAC ACC GCC TCC 288 Ile Asn Leu Tyr Ala Asn Phe Phe Pro Met Ala His Asn Thr Ala Ser 85 90 95 ACC TTG GAA GCT ATG CTG CGC AAT GAC ACC AAC GAC CAA TCG TTT AAC 336 Thr Leu Glu Ala Met Leu Arg Asn Asp Thr Asn Asp Gln Ser Phe Asn 100 105 110 GAC TAC CTC TGC GCT GCA AAC ATG CTT TAT CCC ATT CCT TCT AAT GCT 384 Asp Tyr Leu Cys Ala Ala Asn Met Leu Tyr Pro Ile Pro Ser Asn Ala 115 120 125 ACT AGC GTT CCA ATT TCT ATT CCT TCG CGG AAC TGG GCC GCT TTT CGG 432 Thr Ser Val Pro Ile Ser Ile Pro Ser Arg Asn Trp Ala Ala Phe Arg 130 135 140 GGC TGG AGT TTT ACT CGA CTG AAA ACC AAA GAA ACC CCC TCT TTG GGT 480 Gly Trp Ser Phe Thr Arg Leu Lys Thr Lys Glu Thr Pro Ser Leu Gly 145 150 155 160 TCG GGA TTT GAT CCC TAC TTC ACC TAC TCT GGC TCC GTT CCA TAC TTG 528 Ser Gly Phe Asp Pro Tyr Phe Thr Tyr Ser Gly Ser Val Pro Tyr Leu 165 170 175 GAT GGT ACC TTT TAC CTC AAC CAC ACT TTT AAA AAG GTG TCC ATC ATG 576 Asp Gly Thr Phe Tyr Leu Asn His Thr Phe Lys Lys Val Ser Ile Met 180 185 190 TTT GAC TCC TCT GTG AGT TGG CCT GGC AAT GAC CGA CTG CTT ACC CCC 624 Phe Asp Ser Ser Val Ser Trp Pro Gly Asn Asp Arg Leu Leu Thr Pro 195 200 205 AAT GAG TTT GAA ATC AAA CGC ACC GTG GAT GGG GAA GGG TAC AAC GTG 672 Asn Glu Phe Glu Ile Lys Arg Thr Val Asp Gly Glu Gly Tyr Asn Val 210 215 220 GCT CAA TGT AAC ATG ACC AAA GAC TGG TTT CTG ATT CAG ATG CTT AGT 720 Ala Gln Cys Asn Met Thr Lys Asp Trp Phe Leu Ile Gln Met Leu Ser 225 230 235 240 CAT TAC AAC ATT GGA TAT CAG GGT TTT TAT GTA CCC GAA AGC TAC AAA 768 His Tyr Asn Ile Gly Tyr Gln Gly Phe Tyr Val Pro Glu Ser Tyr Lys 245 250 255 GAT AGA ATG TAT TCC TTT TTC CGA AAC TTC CAG CCA ATG AGT CGT CAG 816 Asp Arg Met Tyr Ser Phe Phe Arg Asn Phe Gln Pro Met Ser Arg Gln 260 265 270 GTG GTA AAC ACT ACC ACC TAC AAG GAA TAT CAG AAT GTT ACC CTT CCT 864 Val Val Asn Thr Thr Thr Tyr Lys Glu Tyr Gln Asn Val Thr Leu Pro 275 280 285 TTC CAG CAT AAT AAC TCA GGC TTT GTG GGA TAC ATG GGA CCC ACC ATG 912 Phe Gln His Asn Asn Ser Gly Phe Val Gly Tyr Met Gly Pro Thr Met 290 295 300 CGG GAG GGA CAA GCT TAC CCC GCT AAC TAC CCT TAC CCC CTT ATT GGT 960 Arg Glu Gly Gln Ala Tyr Pro Ala Asn Tyr Pro Tyr Pro Leu Ile Gly 305 310 315 320 CAA ACG GCC GTG CCA AGC CTG ACA CAG AAA AAA TTC CTG TGC GAT CGC 1008 Gln Thr Ala Val Pro Ser Leu Thr Gln Lys Lys Phe Leu Cys Asp Arg 325 330 335 ACC ATG TGG CGC ATT CCG TTT TCC AGC AAC TTC ATG TCT ATG GGG GCA 1056 Thr Met Trp Arg Ile Pro Phe Ser Ser Asn Phe Met Ser Met Gly Ala 340 345 350 CTG ACC GAC CTG GGG CAG AAC ATG CTG TAC GCC AAT TCC GCC CAC GCC 1104 Leu Thr Asp Leu Gly Gln Asn Met Leu Tyr Ala Asn Ser Ala His Ala 355 360 365 CTC GAC ATG ACT TTT GAG GTC GAT CCC ATG GAT GAG CCC ACA CTT CTT 1152 Leu Asp Met Thr Phe Glu Val Asp Pro Met Asp Glu Pro Thr Leu Leu 370 375 380 TAT GTT TTG TTT GAA GTT TTC GAC GTC GTG CGC ATC CAC CAG CCC CAC 1200 Tyr Val Leu Phe Glu Val Phe Asp Val Val Arg Ile His Gln Pro His 385 390 395 400 CGC GGC GTC ATC GAG GCC GTC TAC CTC CGT ACG CCG TTC TCG GCC GGT 1248 Arg Gly Val Ile Glu Ala Val Tyr Leu Arg Thr Pro Phe Ser Ala Gly 405 410 415 AAC GCC ACC ACA TAA 1263 Asn Ala Thr Thr *** 420
【0081】配列番号:6配列の長さ:1263配列の型:核酸鎖の数:二本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:Genomic DNA起源生物名:Mastadenovirus株名:1型配列の特徴特徴を表す記号:CDS存在位置:1−1263他の情報ヘキソンをコードする遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の配列配列AAT CCC TTT AAC CAC CAC CGC AAT GCG GGC CTA CGC TAC CGC TCC ATG 48 Asn Pro Phe Asn His His Arg Asn Ala Gly Leu Arg Tyr Arg Ser Met 5 10 15 TTG CTG GGC AAC GGT CGC TAC GTG CCC TTT CAC ATC CAG GTT CCT CAG 96 Leu Leu Gly Asn Gly Arg Tyr Val Pro Phe His Ile Gln Val Pro Gln 20 25 30 AAG TTT TTT GCC ATT AAG AAC CTC CTA CTC TTG CCG GGC TCA TAC ACC 144 Lys Phe Phe Ala Ile Lys Asn Leu Leu Leu Leu Pro Gly Ser Tyr Thr 35 40 45 TAC GAG TGG AAC TTC AGG AAA GAT GTT AAC ATG GTC CTG CAA AGC TCC 192 Tyr Glu Trp Asn Phe Arg Lys Asp Val Asn Met Val Leu Gln Ser Ser 50 55 60 CTA GGA AAC GAC CTA AGA GTT GAC GGA GCC AGC ATT AAG TTT GAC AGC 240 Leu Gly Asn Asp Leu Arg Val Asp Gly Ala Ser Ile Lys Phe Asp Ser 65 70 75 80 ATT TGC CTC TAC GCC ACC TTT TTT CCG ATG GCC CAC AAC ACC GCC TCA 288 Ile Cys Leu Tyr Ala Thr Phe Phe Pro Met Ala His Asn Thr Ala Ser 85 90 95 ACG CTT GAA GCC ATG CTT AGA AAC GAC ACC AAC GAC CAG TCC TTT AAC 336 Thr Leu Glu Ala Met Leu Arg Asn Asp Thr Asn Asp Gln Ser Phe Asn 100 105 110 GAC TAC CCA TCC GCC GCC AAC ATG CTT TAC CCC ATA CCC GCC AAC GCC 384 Asp Tyr Pro Ser Ala Ala Asn Met Leu Tyr Pro Ile Pro Ala Asn Ala 115 120 125 ACC AAC GTG CCC ATC TCT ATC CCC TCG CGC AAC TGG GCG GCT TTC CGA 432 Thr Asn Val Pro Ile Ser Ile Pro Ser Arg Asn Trp Ala Ala Phe Arg 130 135 140 GGC TGG GCC TTT ACG CGC CTT AAG ACT AAG GAA ACC CCA TCC CTG GGT 480 Gly Trp Ala Phe Thr Arg Leu Lys Thr Lys Glu Thr Pro Ser Leu Gly 145 150 155 160 TCC GGC TAC GAC CCT TAC TAT ACC TAC TCT GGC TCC ATA CCC TAC CTA 528 Ser Gly Tyr Asp Pro Tyr Tyr Thr Tyr Ser Gly Ser Ile Pro Tyr Leu 165 170 175 GAC GGA ACC TTT TAC CTT AAT CAC ACC TTC AAA AAG GTA GCC ATC ACC 576 Asp Gly Thr Phe Tyr Leu Asn His Thr Phe Lys Lys Val Ala Ile Thr 180 185 190 TTT GAC TCT TCT GTT AGC TGG CCT GGC AAT GAC CGT CTG CTT ACC CCC 624 Phe Asp Ser Ser Val Ser Trp Pro Gly Asn Asp Arg Leu Leu Thr Pro 195 200 205 AAC GAG TTT GAG ATC AAG CGT TCA GTT GAC GGA GAG GGC TAC AAC GTT 672 Asn Glu Phe Glu Ile Lys Arg Ser Val Asp Gly Glu Gly Tyr Asn Val 210 215 220 GCC CAA TGC AAC ATG ACC AAA GAC TGG TTC TTG GTA CAG ATG CTA GCC 720 Ala Gln Cys Asn Met Thr Lys Asp Trp Phe Leu Val Gln Met Leu Ala 225 230 235 240 AAC TAC AAC ATA GGC TAC CAG GGC TTT TAT ATC CCA GAA AGC TAT AAG 768 Asn Tyr Asn Ile Gly Tyr Gln Gly Phe Tyr Ile Pro Glu Ser Tyr Lys 245 250 255 GAC CGC ATG TAC TCC TTC TTT AGA AAC TTC CAG CCC ATG AGC CGT CAG 816 Asp Arg Met Tyr Ser Phe Phe Arg Asn Phe Gln Pro Met Ser Arg Gln 260 265 270 GTG GTG GAC GAT ACC AAA TAC AAG GAC TAC CAA CAG GTG GGC ATC CTC 864 Val Val Asp Asp Thr Lys Tyr Lys Asp Tyr Gln Gln Val Gly Ile Leu 275 280 285 CAC CAG CAC AAT AAC TCT GGC TTT GTT GGT TAC CTC GCT CCC ACC ATG 912 His Gln His Asn Asn Ser Gly Phe Val Gly Tyr Leu Ala Pro Thr Met 290 295 300 CGA GAG GGA CAG GCC TAC CCC GCC AAC TTC CCC TAC CCG CTT ATA GGC 960 Arg Glu Gly Gln Ala Tyr Pro Ala Asn Phe Pro Tyr Pro Leu Ile Gly 305 310 315 320 AAG ACC GCG GTT GAC AGT ATT ACC CAG AAA AAG TTT CTT TGC GAC CGC 1008 Lys Thr Ala Val Asp Ser Ile Thr Gln Lys Lys Phe Leu Cys Asp Arg 325 330 335 ACC CTT TGG CGC ATT CCA TTC TCC AGT AAC TTT ATG TCC ATG GGT GCA 1056 Thr Leu Trp Arg Ile Pro Phe Ser Ser Asn Phe Met Ser Met Gly Ala 340 345 350 CTC ACA GAC CTG GGC CAA AAC CTT CTC TAT GCA AAC TCC GCC CAC GCG 1104 Leu Thr Asp Leu Gly Gln Asn Leu Leu Tyr Ala Asn Ser Ala His Ala 355 360 365 CTA GAT ATG ACT TTT GAG GTG GAT CCC ATG GAC GAG CCC ACC CTT CTT 1152 Leu Asp Met Thr Phe Glu Val Asp Pro Met Asp Glu Pro Thr Leu Leu 370 375 380 TAT GTT TTG TTT GAA GTC TTT GAC GTG GTC CGT GTG CAC CAG CCG CAC 1200 Tyr Val Leu Phe Glu Val Phe Asp Val Val Arg Val His Gln Pro His 385 390 395 400 CGC GGC GTC ATC GAG ACC GTG TAC CTG CGC ACG CCC TTC TCG GCC GGC 1248 Arg Gly Val Ile Glu Thr Val Tyr Leu Arg Thr Pro Phe Ser Ala Gly 405 410 415 AAC GCT ACN NNN NNN 1263 Asn Ala Thr Xaa Xaa 420
【0082】配列番号:7配列の長さ:1263配列の型:核酸鎖の数:二本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:Genomic DNA起源生物名:Mastadenovirus株名:3型配列の特徴特徴を表す記号:CDS存在位置:1−1263他の情報ヘキソンをコードする遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の配列配列AAT CCC TTT AAC CAC CAC CGC AAT GTG GTT CTG CGC TAC AGG TCC ATG 48 Asn Pro Phe Asn His His Arg Asn Val Val Leu Arg Tyr Arg Ser Met 5 10 15 CTT CTG GGA AAT GGT CGT TAT GTG CCT TTC CAC ATA CAA GTG CCT CAG 96 Leu Leu Gly Asn Gly Arg Tyr Val Pro Phe His Ile Gln Val Pro Gln 20 25 30 AAA TTC TTT GCT GTC AAG AAC CTA CTT CTT CTA CCT GGC TCC TAC ACC 144 Lys Phe Phe Ala Val Lys Asn Leu Leu Leu Leu Pro Gly Ser Tyr Thr 35 40 45 TAC GAG TGG AGC TTC CGA AAG GAT GTG AAC ATG GTC CTG CAA AGT TCC 192 Tyr Glu Trp Ser Phe Arg Lys Asp Val Asn Met Val Leu Gln Ser Ser 50 55 60 CTT GGA AAT GAC CTC AGA ACG GAT GGT GCT ACC ATA AGT TTC ACC AGC 240 Leu Gly Asn Asp Leu Arg Thr Asp Gly Ala Thr Ile Ser Phe Thr Ser 65 70 75 80 ATC AAT CTC TAT GCC ACC TTC TTC CCC ATG GCT CAC AAC ACA GCT TCC 288 Ile Asn Leu Tyr Ala Thr Phe Phe Pro Met Ala His Asn Thr Ala Ser 85 90 95 ACC CTT GAA GCC ATG CTG CGC AAC GAT ACC GAT GAT CAG TCA TTT AAC 336 Thr Leu Glu Ala Met Leu Arg Asn Asp Thr Asp Asp Gln Ser Phe Asn 100 105 110 GAC TAC CTC TCT GCA GCT AAC ATG CTT TAC CCN ATT CCT GCC AAT GCA 384 Asp Tyr Leu Ser Ala Ala Asn Met Leu Tyr Pro Ile Pro Ala Asn Ala 115 120 125 ACC AAC ATT CCA ATT TCC ATC CCA TCT CGC AAC TGG GCA GCC TTC AGG 432 Thr Asn Ile Pro Ile Ser Ile Pro Ser Arg Asn Trp Ala Ala Phe Arg 130 135 140 GGC TGG TCC TTC ACC AGA CTC AAA ACC AAG GAG ACT CCA TCT CTT GGA 480 Gly Trp Ser Phe Thr Arg Leu Lys Thr Lys Glu Thr Pro Ser Leu Gly 145 150 155 160 TCA GGG TTC GAT CCC TAC TTC GTA TAT TCT GGA TCT ATT CCC TAC CTG 528 Ser Gly Phe Asp Pro Tyr Phe Val Tyr Ser Gly Ser Ile Pro Tyr Leu 165 170 175 GAT GGC ACC TTT TAC CTT AAC CAC ACT TTC AAG AAG GTC TCC ATC ATG 576 Asp Gly Thr Phe Tyr Leu Asn His Thr Phe Lys Lys Val Ser Ile Met 180 185 190 TTT GAC TCC TCA GTC AGC TGG CCT GGC AAT GAC AGG CTG TTG AGT CCA 624 Phe Asp Ser Ser Val Ser Trp Pro Gly Asn Asp Arg Leu Leu Ser Pro 195 200 205 AAT GAG TTT GAA ATC AAG CGC ACT GTG GAC AGG GAA GGA TAC AAC GTG 672 Asn Glu Phe Glu Ile Lys Arg Thr Val Asp Arg Glu Gly Tyr Asn Val 210 215 220 GCA CAA TGC AAC ATG ACC AAA GAC TGG TTC CTG GTT CAG ATG CTT GCC 720 Ala Gln Cys Asn Met Thr Lys Asp Trp Phe Leu Val Gln Met Leu Ala 225 230 235 240 AAT TAC AAC ATT GGC TAC CAG GGC TTC TTA CAT CCC CTG AGA TAC AAG 768 Asn Tyr Asn Ile Gly Tyr Gln Gly Phe Leu His Pro Leu Arg Tyr Lys 245 250 255 GAT CGC ATG TAC TCC TTT TTC AGA AAC TTC CAG CCT ATG AGC AGG CAG 816 Asp Arg Met Tyr Ser Phe Phe Arg Asn Phe Gln Pro Met Ser Arg Gln 260 265 270 GTG GTT GAT GAG GTT AAT TAC ACT GAC TAC AAA GCC GTC ACC TTA CCA 864 Val Val Asp Glu Val Asn Tyr Thr Asp Tyr Lys Ala Val Thr Leu Pro 275 280 285 TAC CAA CAC AAC AAC TCT GGC TTT GTA GGG TAC CTT GCA CCT ACT ATG 912 Tyr Gln His Asn Asn Ser Gly Phe Val Gly Tyr Leu Ala Pro Thr Met 290 295 300 AGA CAA GGG GAA CCT TAC CCA GCC AAT TAT CCA TAC CCG CTC ATC GGA 960 Arg Gln Gly Glu Pro Tyr Pro Ala Asn Tyr Pro Tyr Pro Leu Ile Gly 305 310 315 320 ACT ACT GCC GTT AAG AGT GTC ACC CAG AAA AAG TTC CTG TGC GAC AGG 1008 Thr Thr Ala Val Lys Ser Val Thr Gln Lys Lys Phe Leu Cys Asp Arg 325 330 335 ACC ATG TGG CGC ATT CCC TTC TCC AGC AAC TTC ATG TCC ATG GGG GCC 1056 Thr Met Trp Arg Ile Pro Phe Ser Ser Asn Phe Met Ser Met Gly Ala 340 345 350 CTT ACC GAC CTG GGA CAG AAC ATG CTC TAT GCC AAC TCA GCC CAT GCG 1104 Leu Thr Asp Leu Gly Gln Asn Met Leu Tyr Ala Asn Ser Ala His Ala 355 360 365 CTG GAC ATG ACT TTT GAG GTG GAT CCC ATG GAT GAG CCC ACC CTG CTT 1152 Leu Asp Met Thr Phe Glu Val Asp Pro Met Asp Glu Pro Thr Leu Leu 370 375 380 TAT CTT CTT TTC GAA GTC TTC GAC GTG GTC AGA GTG CAC CAG CCA CAC 1200 Tyr Leu Leu Phe Glu Val Phe Asp Val Val Arg Val His Gln Pro His 385 390 395 400 CGC SSC GTC ATC GAG NGC GTC TAC CTG CGC GCA CCG TTC TCG GCC GGC 1248 Arg Xxx Val Ile Glu Xxx Val Tyr Leu Arg Ala Pro Phe Ser Ala Gly 405 410 415 AAC GCC ACC ACA TAA 1263 Asn Ala Thr Thr *** 420
【0083】配列番号:8配列の長さ:1263配列の型:核酸鎖の数:二本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:Genomic DNA起源生物名:Mastadenovirus株名:4型配列の特徴特徴を表す記号:CDS存在位置:1−1263他の情報ヘキソンをコードする遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の配列配列AAT CCC TTT AAC CAC CAC CGC AAT GCG GCC TTN CGC TAC CGC TCC ATG 48 Asn Pro Phe Asn His His Arg Asn Ala Ala Xaa Arg Tyr Arg Ser Met 5 10 15 CTC CTG GGC AAC GGG CGC TAC GTG CCA TTC CAC ATC CAG GTG CCC CAG 96 Leu Leu Gly Asn Gly Arg Tyr Val Pro Phe His Ile Gln Val Pro Gln 20 25 30 AAA TTT TTT GCC ATT AAG AGC CTC CTG CCC CTG CCC GGG TCC TAC ACC 144 Lys Phe Phe Ala Ile Lys Ser Leu Leu Pro Leu Pro Gly Ser Tyr Thr 35 40 45 TAC GAG TGG AAC TTC CGC AAG GAC GTC AAC ATG ATC CTG CAG AGT TCC 192 Tyr Glu Trp Asn Phe Arg Lys Asp Val Asn Met Ile Leu Gln Ser Ser 50 55 60 CTT GGC AAC GAC CTG CGC ACA GAC GGG GCC TCC ATC ACT TNC ACC AGC 240 Leu Gly Asn Asp Leu Arg Thr Asp Gly Ala Ser Ile Thr Xaa Thr Ser 65 70 75 80 ATT AAC CTC TAC GCC ACC TTC TTC CCN ATG GCG CAC AAC ACC GCC TCC 288 Ile Asn Leu Tyr Ala Thr Phe Phe Pro Met Ala His Asn Thr Ala Ser 85 90 95 ACG CTT GTG GCC ATG CTG CGC AAC GAC ACC AAT GAC CAA TCC TTC AAC 336 Thr Leu Val Ala Met Leu Arg Asn Asp Thr Asn Asp Gln Ser Phe Asn 100 105 110 GAC TAC CTC TCG GCG GNN AAC ATG CTC TAT CCC ATC CCG SCC AAC SCC 384 Asp Tyr Leu Ser Ala Xaa Asn Met Leu Tyr Pro Ile Pro Xaa Asn Xaa 115 120 125 ACC AAC GTG CCC ATT NCC ATG CCC TCG CGC AAC TGG GCC GCA TTT CGC 432 Thr Asn Val Pro Ile Xaa Met Pro Ser Arg Asn Trp Ala Ala Phe Arg 130 135 140 GNN TGG TCC TTC ACG CGA CTC AAG ACC AAA GAG ACG CCC TCG CTG GGC 480 Xaa Trp Ser Phe Thr Arg Leu Lys Thr Lys Glu Thr Pro Ser Leu Gly 145 150 155 160 TCC GGG TTC GAC CCC TAC TTC GTC TAC TCG GGC TCC ATC CCC TAC CTC 528 Ser Gly Phe Asp Pro Tyr Phe Val Tyr Ser Gly Ser Ile Pro Tyr Leu 165 170 175 GAC GGC ACC TTT TAC CTC AAC CAC ACC TTC AAG AAG GTC TCC ATC ACC 576 Asp Gly Thr Phe Tyr Leu Asn His Thr Phe Lys Lys Val Ser Ile Thr 180 185 190 TTC GAC TCT TCC GTC AGC TGG CCN GGC AAC GAC CGN NTC CTG ACG TCA 624 Phe Asp Ser Ser Val Ser Trp Pro Gly Asn Asp Arg Xaa Leu Thr Ser 195 200 205 GAC GAG TTC GAA ATC AAG CGC ACC GTC GAC GNC NAG GGA TAC AAC NTG 672 Asp Glu Phe Glu Ile Lys Arg Thr Val Asp Xaa Xaa Gly Tyr Asn Xaa 210 215 220 GCC CAG TGC AAC ATG ACC AAG GAC TGG TNN CTG GTN CAG ATG CTG GCN 720 Ala Gln Cys Asn Met Thr Lys Asp Trp Xaa Leu Val Gln Met Leu Ala 225 230 235 240 NAC TAC AAC ATC GGC TAC CAG GGC TTC TAC STG CCC GAG GCG TAC AAG 768 Xaa Tyr Asn Ile Gly Tyr Gln Gly Phe Tyr Xaa Pro Glu Ala Tyr Lys 245 250 255 GAC CGC ATG TAC TCC TTC TTC CGC AAC TTC CAG CCC ATG AGC CGC CAG 816 Asp Arg Met Tyr Ser Phe Phe Arg Asn Phe Gln Pro Met Ser Arg Gln 260 265 270 GTG GTG GAC GAG GTT AAC TAC AAG GAC TAC CAG GCC GTC ACC CTG GCC 864 Val Val Asp Glu Val Asn Tyr Lys Asp Tyr Gln Ala Val Thr Leu Ala 275 280 285 TAC CAA CAC AAC AAC TCG GGC TTC GTT GGA TAC CTC GCG CCC ACT ATG 912 Tyr Gln His Asn Asn Ser Gly Phe Val Gly Tyr Leu Ala Pro Thr Met 290 295 300 CGC CAG GGC CAG CCC TAC CCC GCC AAC TAC CCC TAC CCG CTC ATC GGC 960 Arg Gln Gly Gln Pro Tyr Pro Ala Asn Tyr Pro Tyr Pro Leu Ile Gly 305 310 315 320 AAG AGC GCC GTT ACC AGC GTC ACC CAG AAA AAG TTC ATC TGC GAC AGG 1008 Lys Ser Ala Val Thr Ser Val Thr Gln Lys Lys Phe Ile Cys Asp Arg 325 330 335 GTC ATG TGG CGG ATC CCC TTC TCC AGC AAC TTC ATG TCC ATG GGC GCG 1056 Val Met Trp Arg Ile Pro Phe Ser Ser Asn Phe Met Ser Met Gly Ala 340 345 350 CTC ACC GAC CTC GGC CAG AAC ATG CTC TAT GCT AAC TCC GCC CAC GCG 1104 Leu Thr Asp Leu Gly Gln Asn Met Leu Tyr Ala Asn Ser Ala His Ala 355 360 365 CTA GAC ATG AAT TTC GAA GTC GAC CCC ATG GAT GAG TCC ACC CTT CTC 1152 Leu Asp Met Asn Phe Glu Val Asp Pro Met Asp Glu Ser Thr Leu Leu 370 375 380 TAT GTT GTC TTC GAA GTC TTC GAC GTC GTC CGA GTG CAC CAG CCC CAC 1200 Tyr Val Val Phe Glu Val Phe Asp Val Val Arg Val His Gln Pro His 385 390 395 400 CGC GGC GTC ATT GAG GCC GTC TAC CTG CGC ACC CCC TTC TCG GCC GGC 1248 Arg Gly Val Ile Glu Ala Val Tyr Leu Arg Thr Pro Phe Ser Ala Gly 405 410 415 AAC GCT ACN NNN NNN 1263 Asn Ala Thr Xaa Xaa 420
【0084】配列番号:9配列の長さ:1263配列の型:核酸鎖の数:二本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:Genomic DNA起源生物名:Mastadenovirus株名:6型配列の特徴特徴を表す記号:CDS存在位置:1−1263他の情報ヘキソンをコードする遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の配列配列AAT CCC TTT AAC CAC CAC CGC AAT GCG GCC CTG CGT TAC CGC TCC ATG 48 Asn Pro Phe Asn His His Arg Asn Ala Ala Leu Arg Tyr Arg Ser Met 5 10 15 TTG TTG GGA AAC GGC CGC TAC GTG CCC TTT CAC ATT CAG GTG CCC CAA 96 Leu Leu Gly Asn Gly Arg Tyr Val Pro Phe His Ile Gln Val Pro Gln 20 25 30 AAG TTT TTT GCC ATT AAA AAC CTC CTC CTC CTG CCA GGC TCA TAC ACA 144 Lys Phe Phe Ala Ile Lys Asn Leu Leu Leu Leu Pro Gly Ser Tyr Thr 35 40 45 TAT GAA TGG AAC TTC AGG AAG GAT GTT AAC ATG GTT CTG CAG AGC TCT 192 Tyr Glu Trp Asn Phe Arg Lys Asp Val Asn Met Val Leu Gln Ser Ser 50 55 60 CTG GGA AAC GAC CTT AGA GTT GAC GGG GCT AGC ATT AAG TTT GAC AGC 240 Leu Gly Asn Asp Leu Arg Val Asp Gly Ala Ser Ile Lys Phe Asp Ser 65 70 75 80 ATT TGT CTT TAC GCC ACC TTC TTC CCC ATG GCC CAC AAC ACG GCC TCC 288 Ile Cys Leu Tyr Ala Thr Phe Phe Pro Met Ala His Asn Thr Ala Ser 85 90 95 ACG CTG GAA GCC ATG CTC AGA AAT GAC ACC AAC GAC CAG TCC TTT AAT 336 Thr Leu Glu Ala Met Leu Arg Asn Asp Thr Asn Asp Gln Ser Phe Asn 100 105 110 GAC TAC CTT TCC GCC GCC AAC GTG CTA TAT CCC ATA CCC GCC AAC GCC 384 Asp Tyr Leu Ser Ala Ala Asn Val Leu Tyr Pro Ile Pro Ala Asn Ala 115 120 125 ACC AAC GTG CCC ATC TCC ATC CCA TCG CGC AAC TGG GCA GCA TTT CGC 432 Thr Asn Val Pro Ile Ser Ile Pro Ser Arg Asn Trp Ala Ala Phe Arg 130 135 140 GGT TGG GCC TTC ACA CGC TTG AAG ACA AAG GAA ACC CCT TCC CTG GGA 480 Gly Trp Ala Phe Thr Arg Leu Lys Thr Lys Glu Thr Pro Ser Leu Gly 145 150 155 160 TCA GGC TAC GAC CCT TAC TAC ACC TAC TCT GGC TCC ATA CCA TAC CTT 528 Ser Gly Tyr Asp Pro Tyr Tyr Thr Tyr Ser Gly Ser Ile Pro Tyr Leu 165 170 175 GAC GGA ACC TTC TAT CTT AAT CAC ACC TTT AAG AAG GTG GCC ATT ACT 576 Asp Gly Thr Phe Tyr Leu Asn His Thr Phe Lys Lys Val Ala Ile Thr 180 185 190 TTT GAC TCT TCT GTT AGC TGG CCG GGC AAC GAC CGC CTG CTT ACT CCC 624 Phe Asp Ser Ser Val Ser Trp Pro Gly Asn Asp Arg Leu Leu Thr Pro 195 200 205 AAT GAG TTT GAG ATT AAG CGC TCA GTT GAC GGG GAG GGC TAT AAC GTA 672 Asn Glu Phe Glu Ile Lys Arg Ser Val Asp Gly Glu Gly Tyr Asn Val 210 215 220 GCT CAG TGC AAC ATG ACA AAG GAC TGG TTC CTA GTG CAG ATG TTG GCC 720 Ala Gln Cys Asn Met Thr Lys Asp Trp Phe Leu Val Gln Met Leu Ala 225 230 235 240 AAC TAC AAT ATT GGC TAC CAG GGC TTC TAC ATT CCA GAA AGC TAC AAA 768 Asn Tyr Asn Ile Gly Tyr Gln Gly Phe Tyr Ile Pro Glu Ser Tyr Lys 245 250 255 GAC CGC ATG TAC TCG TTC TTC AGA AAC TTC CAG CCC ATG AGC CGG CAA 816 Asp Arg Met Tyr Ser Phe Phe Arg Asn Phe Gln Pro Met Ser Arg Gln 260 265 270 GTG GTG GAC GAT ACT AAA TAC AAA GAT TAT CAG CAG GTT GGA ATT ATC 864 Val Val Asp Asp Thr Lys Tyr Lys Asp Tyr Gln Gln Val Gly Ile Ile 275 280 285 CAC CAG CAT AAC AAC TCA GGC TTC GTA GGC TAC CTC GCT CCC ACC ATG 912 His Gln His Asn Asn Ser Gly Phe Val Gly Tyr Leu Ala Pro Thr Met 290 295 300 CGC GAG GGA CAA GCT TAC CCC GCT AAT GTT CCC TAC CCA CTA ATA GGC 960 Arg Glu Gly Gln Ala Tyr Pro Ala Asn Val Pro Tyr Pro Leu Ile Gly 305 310 315 320 AAA ACC GCG GTT GAT AGT ATT ACC CAG AAA AAG TTT CTT TGC GAC CGC 1008 Lys Thr Ala Val Asp Ser Ile Thr Gln Lys Lys Phe Leu Cys Asp Arg 325 330 335 ACC CTG TGG CGC ATC CCC TTC TCC AGT AAC TTT ATG TCC ATG GGT GCG 1056 Thr Leu Trp Arg Ile Pro Phe Ser Ser Asn Phe Met Ser Met Gly Ala 340 345 350 CTC ACA GAC CTG GGC CAA AAC CTT CTC TAC GCA AAC TCC GCC CAC GCG 1104 Leu Thr Asp Leu Gly Gln Asn Leu Leu Tyr Ala Asn Ser Ala His Ala 355 360 365 CTA GAC ATG ACC TTT GAG GTG GAT CCC ATG GAC GAG CCC ACC CTT CTT 1152 Leu Asp Met Thr Phe Glu Val Asp Pro Met Asp Glu Pro Thr Leu Leu 370 375 380 TAT GTT TTG TTT GAA GTC TTT GAC GTG GTC CGT GTG CAC CAG CCG CAC 1200 Tyr Val Leu Phe Glu Val Phe Asp Val Val Arg Val His Gln Pro His 385 390 395 400 CGC GGC GTC ATC GAG ACC GTG TAC CTG CGC ACG CCC TTC TCG GCC GGC 1248 Arg Gly Val Ile Glu Thr Val Tyr Leu Arg Thr Pro Phe Ser Ala Gly 405 410 415 AAC GCT ACN NNN NNN 1263 Asn Ala Thr Xaa Xaa 420
【0085】配列番号:10配列の長さ:1263配列の型:核酸鎖の数:二本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:Genomic DNA起源生物名:Mastadenovirus株名:7型配列の特徴特徴を表す記号:CDS存在位置:1−1263他の情報ヘキソンをコードする遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の配列配列AAT CCC TTT AAC CAC CAC CGC AAT GCT GGT CTG CGC TAC CGG TCC ATG 48 Asn Pro Phe Asn His His Arg Asn Ala Gly Leu Arg Tyr Arg Ser Met 5 10 15 CTT CTG GGC AAT GGT CGT TAT GTG CCT TTC CAC ATA CAA GTG CCT CAA 96 Leu Leu Gly Asn Gly Arg Tyr Val Pro Phe His Ile Gln Val Pro Gln 20 25 30 AAA TTC TTT GCT GTC AAG AAC CTA CTT CTT CTA CCT GGC TCC TAC ACC 144 Lys Phe Phe Ala Val Lys Asn Leu Leu Leu Leu Pro Gly Ser Tyr Thr 35 40 45 TAT GAG TGG AAC TTC AGA AAG GAT GTG AAC ATG GTC CTG CAA AGT TCC 192 Tyr Glu Trp Asn Phe Arg Lys Asp Val Asn Met Val Leu Gln Ser Ser 50 55 60 CTT GGA AAT GAC CTC AGA ACA GAT GGT GCT ACC ATA AGT TTC ACC AGC 240 Leu Gly Asn Asp Leu Arg Thr Asp Gly Ala Thr Ile Ser Phe Thr Ser 65 70 75 80 ATC AAT CTG TAT GCC ACC TTC TTC CCC ATG GCT CAC AAC ACA GCT TCC 288 Ile Asn Leu Tyr Ala Thr Phe Phe Pro Met Ala His Asn Thr Ala Ser 85 90 95 ACC CTT GAA GCC ATG CTG CGC AAC GAT ACC AAT GAT CAG TCA TTC AAC 336 Thr Leu Glu Ala Met Leu Arg Asn Asp Thr Asn Asp Gln Ser Phe Asn 100 105 110 GAC TAC CTC TCT GCA GCT AAC ATG CTT TAC CCC ATC CCT GCC AAT GCA 384 Asp Tyr Leu Ser Ala Ala Asn Met Leu Tyr Pro Ile Pro Ala Asn Ala 115 120 125 ACC AAC ATT CCA ATT TCC ATC CCA TCT CGC AAC TGG GCA GCC TTC AGG 432 Thr Asn Ile Pro Ile Ser Ile Pro Ser Arg Asn Trp Ala Ala Phe Arg 130 135 140 GGC TGG TCC TTC ACT AGG CTC AAA ACC AAG GAG ACT CCA TCT CTT GGA 480 Gly Trp Ser Phe Thr Arg Leu Lys Thr Lys Glu Thr Pro Ser Leu Gly 145 150 155 160 TCA GGG TTC GAT CCC TAC TTN GTA TAT TCT GGA TCT ATT CCN TAC CTG 528 Ser Gly Phe Asp Pro Tyr Xaa Val Tyr Ser Gly Ser Ile Xaa Tyr Leu 165 170 175 GAT GGC ACC TTT TAC CTT AAC CAC ACT TTC AAG AAG GTC TCC ATN ATG 576 Asp Gly Thr Phe Tyr Leu Asn His Thr Phe Lys Lys Val Ser Xaa Met 180 185 190 TTT GNC TCC TCA GTC AGC TGG CCT GGC AAT GAC AGG CTC TTG AGC CCA 624 Phe Xaa Ser Ser Val Ser Trp Pro Gly Asn Asp Arg Leu Leu Ser Pro 195 200 205 AAT GAG TTT GAA ATC AAG CGC ACT GTG GAC GGG GAA GGG TAC AAT GTG 672 Asn Glu Phe Glu Ile Lys Arg Thr Val Asp Gly Glu Gly Tyr Asn Val 210 215 220 GCC CAA TGT AAC ATG ACC AAA GAC TGG TTC CTG GTT CAG ATG CTT GCC 720 Ala Gln Cys Asn Met Thr Lys Asp Trp Phe Leu Val Gln Met Leu Ala 225 230 235 240 AAC TAC AAC ATT GGC TAC CAG GGC TTT TAC ATC CCT GAG GGA TAC AAG 768 Asn Tyr Asn Ile Gly Tyr Gln Gly Phe Tyr Ile Pro Glu Gly Tyr Lys 245 250 255 GAT CGC ATG TAC TCC TTT TTC AGA AAC TTC CAG CCT ATG AGC AGG CAG 816 Asp Arg Met Tyr Ser Phe Phe Arg Asn Phe Gln Pro Met Ser Arg Gln 260 265 270 GTG GTT GAT GAG GTT AAT TAC ACT GAC TAC AAA GCC GTC ACC TTA CCA 864 Val Val Asp Glu Val Asn Tyr Thr Asp Tyr Lys Ala Val Thr Leu Pro 275 280 285 TAC CAA CAC AAC AAC TCT GGC TTT GTA GGG TAT CTT GCA CCT ACT ATG 912 Tyr Gln His Asn Asn Ser Gly Phe Val Gly Tyr Leu Ala Pro Thr Met 290 295 300 AGA CAA GGG GAA CCT TAC CCA GCC AAT TAT CCA TAC CCG CTC ATC GGA 960 Arg Gln Gly Glu Pro Tyr Pro Ala Asn Tyr Pro Tyr Pro Leu Ile Gly 305 310 315 320 ACT ACT GCC GTT AAG AGT GTC ACC CAG AAA AAG TTC CTG TGT GAC AGG 1008 Thr Thr Ala Val Lys Ser Val Thr Gln Lys Lys Phe Leu Cys Asp Arg 325 330 335 ACC ATG TGG CGC ATT CCC TTC TCC AGC AAC TTC ATG TCC ATG GGG GCC 1056 Thr Met Trp Arg Ile Pro Phe Ser Ser Asn Phe Met Ser Met Gly Ala 340 345 350 NTT ACC GAC CTG GGA CAG AAC ATG CTC TAT GCC AAC TCA GCC CAT GCG 1104 Xaa Thr Asp Leu Gly Gln Asn Met Leu Tyr Ala Asn Ser Ala His Ala 355 360 365 NTG GAC ATG ACT TTN GAG GTG GAT CCN ATG GAT GAG CCN ACC NTG CTT 1152 Xaa Asp Met Thr Xaa Glu Val Asp Xaa Met Asp Glu Xaa Thr Xaa Leu 370 375 380 TAT CTT CTT TTC GAA GTC TTC GAC GTG GTC AGA GTG CAC CAG CCA CAC 1200 Tyr Leu Leu Phe Glu Val Phe Asp Val Val Arg Val His Gln Pro His 385 390 395 400 CGC GGC GTC ATC GAG GCC GTC TAC CTG CGC ACA CCG TTC TCG GCC GGC 1248 Arg Gly Val Ile Glu Ala Val Tyr Leu Arg Thr Pro Phe Ser Ala Gly 405 410 415 AAC GCT ACN NNN NNN 1263 Asn Ala Thr Xaa Xaa 420
【0086】配列番号:11配列の長さ:1263配列の型:核酸鎖の数:二本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:Genomic DNA起源生物名:Mastadenovirus株名:8型配列の特徴特徴を表す記号:CDS存在位置:1−1263他の情報ヘキソンをコードする遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の配列配列AAT CCN TTT AAT CAC CAT CGC AAT GCG GCN CTG CGC TAC CGC TCC ATG 48 Asn Pro Phe Asn His His Arg Asn Ala Xaa Leu Arg Tyr Arg Ser Met 5 10 15 CTG CTG GGC AAC GGG CGC TAC GTG CCC TTC CAT ATT CAA GTG CCC CAA 96 Leu Leu Gly Asn Gly Arg Tyr Val Pro Phe His Ile Gln Val Pro Gln 20 25 30 AAG TTT TTT GCC ATT AAG AAC CTG CTT CTG CTC CCG GGC TCC TAC ACC 144 Lys Phe Phe Ala Ile Lys Asn Leu Leu Leu Leu Pro Gly Ser Tyr Thr 35 40 45 TAC GAG TGG AAN TTC CGC AAG GAT GTT AAC ATG ATT CTG CAG AGT TCC 192 Tyr Glu Trp Xaa Phe Arg Lys Asp Val Asn Met Ile Leu Gln Ser Ser 50 55 60 CTT GGC AAC GAC CTG CGC ACA GAC GGG GCN TCA TCA CGC TTC ACC AGC 240 Leu Gly Asn Asp Leu Arg Thr Asp Gly Ala Ser Ser Arg Phe Thr Ser 65 70 75 80 ATT AAC NTC TAC GCN ACC TTC TTC CCN ATG GCG CAC AAC ACN GCC TCN 288 Ile Asn Xaa Tyr Ala Thr Phe Phe Pro Met Ala His Asn Thr Ala Ser 85 90 95 ACG CTT GAG GCN ATG CTG CGC AAC GAC ACN NAT GAC CAA TCN TTA ANC 336 Thr Leu Glu Ala Met Leu Arg Asn Asp Thr Xaa Asp Gln Ser Leu Xaa 100 105 110 GAC TAN CTN TCG GCG GCN AAC ATG TTA TCA TCC GGC CAA CGC ACA ACC 384 Asp Xaa Leu Ser Ala Ala Asn Met Leu Ser Ser Gly Gln Arg Thr Thr 115 120 125 ACC AAC GTG CCC ATT TCC ATC CCC TCG CGC AAC TGG NCC GCC TTT CGC 432 Thr Asn Val Pro Ile Ser Ile Pro Ser Arg Asn Trp Xaa Ala Phe Arg 130 135 140 CGG TGG AGT TTC ACC CGC CTA AAA ACC AAG GAA ACT CCC TCC CTC GGC 480 Arg Trp Ser Phe Thr Arg Leu Lys Thr Lys Glu Thr Pro Ser Leu Gly 145 150 155 160 TCG GGT TTT GAC CCC TAC TTT GTT TAC TCG GGC ACC ATC CCC TAC CTC 528 Ser Gly Phe Asp Pro Tyr Phe Val Tyr Ser Gly Thr Ile Pro Tyr Leu 165 170 175 GAC GGG ACC TTC TAC CTG AAC CAC ACC TTT AAG AAG GTC TCC ATC ATG 576 Asp Gly Thr Phe Tyr Leu Asn His Thr Phe Lys Lys Val Ser Ile Met 180 185 190 TTC GAC TCC TCG GTT AGC TGG CCN GGC AAC GAC AGG CTG CTT ACG CCG 624 Phe Asp Ser Ser Val Ser Trp Pro Gly Asn Asp Arg Leu Leu Thr Pro 195 200 205 AAC GAG TTT GAA ATT AAG CGC NCN GNC GAC NGG GAG GGC TAT AAC GTG 672 Asn Glu Phe Glu Ile Lys Arg Xaa Xaa Asp Xaa Glu Gly Tyr Asn Val 210 215 220 GCC CAA TGC AAC ATG ACC AAG GAC TGG TTC CTG GTN CAG ATG CTT TCC 720 Ala Gln Cys Asn Met Thr Lys Asp Trp Phe Leu Val Gln Met Leu Ser 225 230 235 240 CAC TAC AAC ATT GGC TAC CAG GGC TTC CAT GTG CCT GAG GGC TAC AAG 768 His Tyr Asn Ile Gly Tyr Gln Gly Phe His Val Pro Glu Gly Tyr Lys 245 250 255 GAC CGC ATG TAC TCC TTC TTT CGC AAC TTC CAG CCC ATG AGT AGG CAG 816 Asp Arg Met Tyr Ser Phe Phe Arg Asn Phe Gln Pro Met Ser Arg Gln 260 265 270 GTG GTC GAT GAG ATT AAC TAC AAG GAT TAC AAG GCC GTT GCC CTT CCC 864 Val Val Asp Glu Ile Asn Tyr Lys Asp Tyr Lys Ala Val Ala Leu Pro 275 280 285 TTC NAG CAC AAC AAC TTG GGC TTA CCG GTC TAC CTT GCA CCT ACC TTG 912 Phe Xaa His Asn Asn Leu Gly Leu Pro Val Tyr Leu Ala Pro Thr Leu 290 295 300 CGC CAG GGA CAG CCC TAC CCC GCC AAC TTA CCC TAC CCG CTT ATC GGC 960 Arg Gln Gly Gln Pro Tyr Pro Ala Asn Leu Pro Tyr Pro Leu Ile Gly 305 310 315 320 AAG AGC GCC GTT ACC AGC GTC ACC CAG AAA AAG TTC ATC TGC GAC AGG 1008 Lys Ser Ala Val Thr Ser Val Thr Gln Lys Lys Phe Ile Cys Asp Arg 325 330 335 GTC ATG TGG CGC ATC CCC TTC TCC AGC AAC TTC ATG TCC ATG GGC GCC 1056 Val Met Trp Arg Ile Pro Phe Ser Ser Asn Phe Met Ser Met Gly Ala 340 345 350 CTC ACC GAC CTC GGC CAG AAC ATG CTC TAT GCT AAC TCC GCC CAC GCG 1104 Leu Thr Asp Leu Gly Gln Asn Met Leu Tyr Ala Asn Ser Ala His Ala 355 360 365 CTA GAC ATG AAT TTN GAA GTC GAC CCC ATG GAT GAG TCC ACC CTT CTC 1152 Leu Asp Met Asn Xaa Glu Val Asp Pro Met Asp Glu Ser Thr Leu Leu 370 375 380 TAT GTT GTC TTN GAA GTC TTC GAC GTC GTC NGA GTG CAC CAG CCC CAC 1200 Tyr Val Val Xaa Glu Val Phe Asp Val Val Xaa Val His Gln Pro His 385 390 395 400 CGC GGC GTC ATC GAG GCC GTC TAC CTG CGC ACG CCC TTC TCG GCC GGC 1248 Arg Gly Val Ile Glu Ala Val Tyr Leu Arg Thr Pro Phe Ser Ala Gly 405 410 415 AAC GCT ACN NNN NNN 1263 Asn Ala Thr Xaa Xaa 420
【0087】配列番号:12配列の長さ:1263配列の型:核酸鎖の数:二本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:Genomic DNA起源生物名:Mastadenovirus株名:11型配列の特徴特徴を表す記号:CDS存在位置:1−1263他の情報ヘキソンをコードする遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の配列配列AAT CCC TTT AAC CAC CAC CGT AAC CTG GCT TGG CGT TAC CGA TCC ATG 48 Asn Pro Phe Asn His His Arg Asn Leu Ala Trp Arg Tyr Arg Ser Met 5 10 15 CTT TTG GGT AAC GGA CGT TAT GTG CCT TTC CAC ATA CAA GTG CCT CAA 96 Leu Leu Gly Asn Gly Arg Tyr Val Pro Phe His Ile Gln Val Pro Gln 20 25 30 AAA TTC TTC GCT GTC AAA AAC CTG CTG CTT CTN CCA GGC TCC TAC ACT 144 Lys Phe Phe Ala Val Lys Asn Leu Leu Leu Leu Pro Gly Ser Tyr Thr 35 40 45 TAT GAG TGG AAC TTT AGG AAG GAT GTG AAC ATG GTC CTA CAG AGT NCC 192 Tyr Glu Trp Asn Phe Arg Lys Asp Val Asn Met Val Leu Gln Ser Xxx 50 55 60 CTC GGT AAC GAC CTN GCG GTA GAT GGC GCC ACG ATC AGT TTC ACG AGC 240 Leu Gly Asn Asp Leu Ala Val Asp Gly Ala Thr Ile Ser Phe Thr Ser 65 70 75 80 ATC AAC CTC TAT GCT ACT TTT TTC CCC ATG GCT CAC AAC ACC GCT TCC 288 Ile Asn Leu Tyr Ala Thr Phe Phe Pro Met Ala His Asn Thr Ala Ser 85 90 95 ACC CTT GAA GCC ATG CTG CGG AAT GAC ACC AAT GAT CAG TCA TTC AAC 336 Thr Leu Glu Ala Met Leu Arg Asn Asp Thr Asn Asp Gln Ser Phe Asn 100 105 110 GAC TAC CTA TCT GCA GCT AAC ATG CTC TAC CCC ATT CCT GCC AAT GCA 384 Asp Tyr Leu Ser Ala Ala Asn Met Leu Tyr Pro Ile Pro Ala Asn Ala 115 120 125 ACC AAT ATT CCC ATT TCC ATT CCT TCT CGC AAC TGG GCG GCT TTC AGA 432 Thr Asn Ile Pro Ile Ser Ile Pro Ser Arg Asn Trp Ala Ala Phe Arg 130 135 140 GGC TGG TCA TTT ACC AGA CTG AAA ACC AAA GAA ACT CCC TCT TTG GGG 480 Gly Trp Ser Phe Thr Arg Leu Lys Thr Lys Glu Thr Pro Ser Leu Gly 145 150 155 160 TCT GGA TTT GAC CCC TAC TTT GTC TAT TCT GGT TCT ATT CCC TAC CTG 528 Ser Gly Phe Asp Pro Tyr Phe Val Tyr Ser Gly Ser Ile Pro Tyr Leu 165 170 175 GAT GCT ACC TTC TAC CTG AAC CAC ACT TTT AAG AAG GTC TCC ATC ATG 576 Asp Ala Thr Phe Tyr Leu Asn His Thr Phe Lys Lys Val Ser Ile Met 180 185 190 TTC CAC TCC TCA GTC AGC TGG CCT GGA AAT GAC AGG CTA CTA ACT CCT 624 Phe His Ser Ser Val Ser Trp Pro Gly Asn Asp Arg Leu Leu Thr Pro 195 200 205 AAC GAA TTT GAA ATA AAG CGC ACT GTG GAT GGC GAA GGC TAC AAC GTA 672 Asn Glu Phe Glu Ile Lys Arg Thr Val Asp Gly Glu Gly Tyr Asn Val 210 215 220 GCN CAA TGC AAC ATG ANC AAG GAC TGG TTC NTG GTA CAG ATG CTC TCC 720 Xaa Gln Cys Asn Met Xaa Lys Asp Trp Phe Xaa Val Gln Met Leu Ser 225 230 235 240 AAC TAC ANC ATC GGC TAC NAG GGC TTC TNA CAT TCA GAA NGA TAC AAG 768 Asn Tyr Xaa Ile Gly Tyr Xaa Gly Phe Xaa His Ser Glu Xaa Tyr Lys 245 250 255 NAC CGC ATG TAT ACA TTT TTC AGA AAC TTC CAG CCC ATG AGC AGG CAG 816 Xaa Arg Met Tyr Thr Phe Phe Arg Asn Phe Gln Pro Met Ser Arg Gln 260 265 270 GTG GTT GAT GAG GTC AAT TAC AAA GAC TTC AAA GCC GTC GCC ATA CCC 864 Val Val Asp Glu Val Asn Tyr Lys Asp Phe Lys Ala Val Ala Ile Pro 275 280 285 TAC CAA CAC AAC AAC TCT GGC TTT GTG GGT TAC ATG GCT CCG ACC ATG 912 Tyr Gln His Asn Asn Ser Gly Phe Val Gly Tyr Met Ala Pro Thr Met 290 295 300 CGC CAA GGT CAA CCC TAT CCC GCT AAC TAT CCC TAT CCA CTC ATT GGA 960 Arg Gln Gly Gln Pro Tyr Pro Ala Asn Tyr Pro Tyr Pro Leu Ile Gly 305 310 315 320 ACA ACT GCC GTA AAT AGT GTT ACG CAG AAA AAG TTC TTG TGT GAC AGA 1008 Thr Thr Ala Val Asn Ser Val Thr Gln Lys Lys Phe Leu Cys Asp Arg 325 330 335 ACC ATG TGG CGC ATA CCG TTC TCG AGC AAC TTC ATG TCT ATG GGG GCC 1056 Thr Met Trp Arg Ile Pro Phe Ser Ser Asn Phe Met Ser Met Gly Ala 340 345 350 CTT ACA GAC TTG GGA CAG AAT ATG CTC TAT GCC AAC TCA GCT CAT GCT 1104 Leu Thr Asp Leu Gly Gln Asn Met Leu Tyr Ala Asn Ser Ala His Ala 355 360 365 CTG GAC ATG ACC TTT GAG GTG GAT CCC ATG GAT GAG CCC ACC CTG CTT 1152 Leu Asp Met Thr Phe Glu Val Asp Pro Met Asp Glu Pro Thr Leu Leu 370 375 380 TAT CTT CTC TTC GAA GTT TTC GAC GTG GTC AGA GTG CAC CAG CCA CAC 1200 Tyr Leu Leu Phe Glu Val Phe Asp Val Val Arg Val His Gln Pro His 385 390 395 400 CGC GGC ATC ATC GAG GCA GTC TAC CTG CGT ACA CCG TTC TCG GCC GGC 1248 Arg Gly Ile Ile Glu Ala Val Tyr Leu Arg Thr Pro Phe Ser Ala Gly 405 410 415 AAC GCT ACN NNN NNN 1263 Asn Ala Thr Xaa Xaa 420
【0088】配列番号:13配列の長さ:1263配列の型:核酸鎖の数:二本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:Genomic DNA起源生物名:Mastadenovirus株名:14型配列の特徴特徴を表す記号:CDS存在位置:1−1263他の情報ヘキソンをコードする遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の配列配列AAT CCC TTT AAC CAC CAC CGT AAC GCT GGC TTG CGT TAC CGA TCC ATG 48 Asn Pro Phe Asn His His Arg Asn Ala Gly Leu Arg Tyr Arg Ser Met 5 10 15 CTT TTG GGT AAC GGA CGT TAT GTG CCT TTC CAC ATA CAA GTG CCT CAA 96 Leu Leu Gly Asn Gly Arg Tyr Val Pro Phe His Ile Gln Val Pro Gln 20 25 30 AAA TTC TTC GCT GTC AAA AAC CTG CTG CTT CTC CCA GGC TCC TAC ACT 144 Lys Phe Phe Ala Val Lys Asn Leu Leu Leu Leu Pro Gly Ser Tyr Thr 35 40 45 TAT GAG TGG AAC TTC AGG AAG GAT GTG AAC ATG GTG CTA CAG AGT TCC 192 Tyr Glu Trp Asn Phe Arg Lys Asp Val Asn Met Val Leu Gln Ser Ser 50 55 60 CTC GGT AAC GAC CTA CGG GTA GAT GGC GCC AGC ATC AGT TTC ACG AGC 240 Leu Gly Asn Asp Leu Arg Val Asp Gly Ala Ser Ile Ser Phe Thr Ser 65 70 75 80 ATC AAC CTC TAT GCT ACC TTT TTC CCC ATG GCT CAC AAC ACC GCT TCC 288 Ile Asn Leu Tyr Ala Thr Phe Phe Pro Met Ala His Asn Thr Ala Ser 85 90 95 ACC CTT GAA GCC ATG CTG CGG AAT GAC ACC AAT GAT CAG TCA TTC AAC 336 Thr Leu Glu Ala Met Leu Arg Asn Asp Thr Asn Asp Gln Ser Phe Asn 100 105 110 GAC TAT CTA TCT GCA GCT AAC ATG CTC TAT CCC ATT CCT GCC AAT GCA 384 Asp Tyr Leu Ser Ala Ala Asn Met Leu Tyr Pro Ile Pro Ala Asn Ala 115 120 125 ACC AAT ATT CCC ATT TCC ATT CCT TCT CGC AAC TGG GCG GCT TTC AGA 432 Thr Asn Ile Pro Ile Ser Ile Pro Ser Arg Asn Trp Ala Ala Phe Arg 130 135 140 GGC TGG TCA TTT ACC AGA CTC AAA ACC AAA GAA ACT CCC TCT TTG GGG 480 Gly Trp Ser Phe Thr Arg Leu Lys Thr Lys Glu Thr Pro Ser Leu Gly 145 150 155 160 TCT GGA TTT GAC CCC TAC TTT GTC TAT TCT GGT TCT ATT CCC TAC CTG 528 Ser Gly Phe Asp Pro Tyr Phe Val Tyr Ser Gly Ser Ile Pro Tyr Leu 165 170 175 GAT GGT ACC TTC TAC CTG AAC CAC ACT TTT AAG AAG GTT TCC ATC ATG 576 Asp Gly Thr Phe Tyr Leu Asn His Thr Phe Lys Lys Val Ser Ile Met 180 185 190 TTT GAC TCT TCA GTG AGC TGG CCT GGA AAT GAC AGG TTA CTA TCT CCC 624 Phe Asp Ser Ser Val Ser Trp Pro Gly Asn Asp Arg Leu Leu Ser Pro 195 200 205 AAC GAA TTT GAA ATA AAG CGC ACT GTG GAT G?G CGA AGC TAC AAT GTA 672 Asn Glu Phe Glu Ile Lys Arg Thr Val Asp Xxx Arg Ser Tyr Asn Val 210 215 220 GCC CAA TGC AAC ATG ACC AAA GAC TGG TTC TTG GTA CAG ATG CTC GCC 720 Ala Gln Cys Asn Met Thr Lys Asp Trp Phe Leu Val Gln Met Leu Ala 225 230 235 240 AAC TAC AAC ATA GGC TAT CAG GGC TTC TAC ATT CCA GAA GGA TAC AAA 768 Asn Tyr Asn Ile Gly Tyr Gln Gly Phe Tyr Ile Pro Glu Gly Tyr Lys 245 250 255 GAT CGC ATG TAT TCA TTT TTC AGA AAC TTC CAG CCC ATG AGC AGG CAG 816 Asp Arg Met Tyr Ser Phe Phe Arg Asn Phe Gln Pro Met Ser Arg Gln 260 265 270 GTG GTT GAT GAG GTC AAT TAC AAA GAC TTC AAG GCC GTC GCC ATA CCC 864 Val Val Asp Glu Val Asn Tyr Lys Asp Phe Lys Ala Val Ala Ile Pro 275 280 285 TAC CAA CAC AAC AAC TCT GGC TTT GTG GGT TAC ATG GCT CCG ACC ATG 912 Tyr Gln His Asn Asn Ser Gly Phe Val Gly Tyr Met Ala Pro Thr Met 290 295 300 CGC CAA GGT CAA CCC TAT CCC GCT AAC TAT CCC TAT CCA CTC ATT GGA 960 Arg Gln Gly Gln Pro Tyr Pro Ala Asn Tyr Pro Tyr Pro Leu Ile Gly 305 310 315 320 ACA ACT GCC GTA AAT AGT GTT ACG CAG AAA AAG TTC TTG TGT GAC AGA 1008 Thr Thr Ala Val Asn Ser Val Thr Gln Lys Lys Phe Leu Cys Asp Arg 325 330 335 ACC ATG TGG CGC ATA CCG TTC TCG AGC AAC TTC ATG TCT ATG GGG GCC 1056 Thr Met Trp Arg Ile Pro Phe Ser Ser Asn Phe Met Ser Met Gly Ala 340 345 350 CTT ACA GAC TTG GGA CAG AAC ATG CTT TAT GCC AAC TCA GCT CAT GCT 1104 Leu Thr Asp Leu Gly Gln Asn Met Leu Tyr Ala Asn Ser Ala His Ala 355 360 365 CTG GAC ATG ACC TTT GAG GTG GAT CCC ATG GAT GAG CCC ACC CTG CTT 1152 Leu Asp Met Thr Phe Glu Val Asp Pro Met Asp Glu Pro Thr Leu Leu 370 375 380 TAT CTT CTC TTC GAA GTT TTC GAC GTG GTC AGA GTG CAT CAG CCA CAT 1200 Tyr Leu Leu Phe Glu Val Phe Asp Val Val Arg Val His Gln Pro His 385 390 395 400 CGC GGC ATC ATC GAG ACA GTC TAC CTG CGT ACA CCG TTC TCG GCC GGC 1248 Arg Gly Ile Ile Glu Thr Val Tyr Leu Arg Thr Pro Phe Ser Ala Gly 405 410 415 AAC GCT ACN NNN NNN 1263 Asn Ala Thr Xaa Xaa 420
【0089】配列番号:14配列の長さ:1263配列の型:核酸鎖の数:二本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:Genomic DNA起源生物名:Mastadenovirus株名:19型配列の特徴特徴を表す記号:CDS存在位置:1−1263他の情報ヘキソンをコードする遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の配列配列NAT CCA TTT AAN NAN NAC NNN AAN GCT GGC CTA GGC TAN NGC TCC ATG 48 Xaa Pro Phe Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Ala Gly Leu Gly Xaa Xaa Ser Met 5 10 15 CTC CTG GGC AAC GGC NGC TAC GTG CCC TTC CAC ACC CAA GTG NNN NAA 96 Leu Leu Gly Asn Gly Xaa Tyr Val Pro Phe His Thr Gln Val Xaa Xaa 20 25 30 AAG TTC TTT GCC ATC AAG AAC CTG CTC CTG CTC CCC GGC TCC TAC ACC 144 Lys Phe Phe Ala Ile Lys Asn Leu Leu Leu Leu Pro Gly Ser Tyr Thr 35 40 45 TAC GAG TGG AAC TTC CGC AAG GAT GTC AAC ATG ATC CTG CAG AGT TCC 192 Tyr Glu Trp Asn Phe Arg Lys Asp Val Asn Met Ile Leu Gln Ser Ser 50 55 60 CTC GGA AAC GAC CTG CGC GTT GAC GGG NCC TCC GTG CGC TTC GAC AGC 240 Leu Gly Asn Asp Leu Arg Val Asp Gly Xaa Ser Val Arg Phe Asp Ser 65 70 75 80 GTT AAC CTC TAC GCA NCA TTC TTC CCC ATG GCG CAC AAC ACC GCC TCC 288 Val Asn Leu Tyr Ala Xaa Phe Phe Pro Met Ala His Asn Thr Ala Ser 85 90 95 ACC CTG GAA GCC ATC GTG CGC AAC GAC ACC AAC GAC CAG TCC TTC AAC 336 Thr Leu Glu Ala Ile Val Arg Asn Asp Thr Asn Asp Gln Ser Phe Asn 100 105 110 GAC TAC CTC TCG GCC GCC AAC ATG CTC TAC CCC ATC CCG GCC AAG GCC 384 Asp Tyr Leu Ser Ala Ala Asn Met Leu Tyr Pro Ile Pro Ala Lys Ala 115 120 125 ACC AAC GTG CCC ATT TCC ATC CCC TCG CGA AAT TGG GCG GCG TTT NNN 432 Thr Asn Val Pro Ile Ser Ile Pro Ser Arg Asn Trp Ala Ala Phe Xaa 130 135 140 AGG TGG AGT TTT ANN NGG CTA ANG NNN GAA GAA ANT CCN TCC CTT GGT 480 Arg Trp Ser Phe Xaa Xaa Leu Xaa Xaa Glu Glu Xaa Pro Ser Leu Gly 145 150 155 160 TCG GGT TTC CCT CCC TAC TTG ANA TAC TTG GGC TCT ATC CCC TAT CTC 528 Ser Gly Phe Pro Pro Tyr Leu Xxx Tyr Leu Gly Ser Ile Pro Tyr Leu 165 170 175 GAN GGG ACC TTC TAC CTC AAC CAC ACC TTC AAG AAG GTC TCC ATC ATG 576 Xaa Gly Thr Phe Tyr Leu Asn His Thr Phe Lys Lys Val Ser Ile Met 180 185 190 TTC GAC TCC TCG GTC AGC TGG CCC GGC AAC GAC CGG CTC GTC ACG CCG 624 Phe Asp Ser Ser Val Ser Trp Pro Gly Asn Asp Arg Leu Val Thr Pro 195 200 205 AAC GAG TTC GAG ATC AAG CGC AGC GTC GAC GGG GAG GGC TAC AAT GTG 672 Asn Glu Phe Glu Ile Lys Arg Ser Val Asp Gly Glu Gly Tyr Asn Val 210 215 220 GCC CAA TGC AAC ATG ACC AAG GAC TGG TTC CTC GTC CAG ATG CTC TCC 720 Ala Gln Cys Asn Met Thr Lys Asp Trp Phe Leu Val Gln Met Leu Ser 225 230 235 240 TAC TAC AAC ATC GGC TAC CAG GGC TTC CAT GTC GCC GTA GGG TAC AAG 768 Tyr Tyr Asn Ile Gly Tyr Gln Gly Phe His Val Ala Val Gly Tyr Lys 245 250 255 GAT CGC ATG TAC TCC TTC TTC CGC AAC TTC CAG CCC ATG AGC AGG CAG 816 Asp Arg Met Tyr Ser Phe Phe Arg Asn Phe Gln Pro Met Ser Arg Gln 260 265 270 GTG GTC GAT GAG ATC AAC TAC AAG GAC TAC AAG GCC GTC ACC CTG CCC 864 Val Val Asp Glu Ile Asn Tyr Lys Asp Tyr Lys Ala Val Thr Leu Pro 275 280 285 TTC CAG CAC AAC AAC TCG GGC TTC ACC GGC TAC CTA GCA CCC ACC ATG 912 Phe Gln His Asn Asn Ser Gly Phe Thr Gly Tyr Leu Ala Pro Thr Met 290 295 300 CGT CAG GGG CAG CCC TAC CCC GCC AAC TTC CCC TAC CCG CTC ATT GGC 960 Arg Gln Gly Gln Pro Tyr Pro Ala Asn Phe Pro Tyr Pro Leu Ile Gly 305 310 315 320 TAC ACC GCA GTG CCC TCC GTC ACC CAG AAA AAG TTC CTC TGC GAC AGG 1008 Tyr Thr Ala Val Pro Ser Val Thr Gln Lys Lys Phe Leu Cys Asp Arg 325 330 335 GTC ATG TGG CGC ATC CCC TTC TCC AGC AAC TTT ATG TCC ATG GGC GCC 1056 Val Met Trp Arg Ile Pro Phe Ser Ser Asn Phe Met Ser Met Gly Ala 340 345 350 CTC ACC GAC CTG GGT CAG AAC ATG CTC TAC GCC AAC TCG GCC CAC GCG 1104 Leu Thr Asp Leu Gly Gln Asn Met Leu Tyr Ala Asn Ser Ala His Ala 355 360 365 CTC GAC ATG ACC TTC GAG GTG GAC CCC ATG GAT GAG CCC ACC CTC CTC 1152 Leu Asp Met Thr Phe Glu Val Asp Pro Met Asp Glu Pro Thr Leu Leu 370 375 380 TAT CTT CTC TTC GAA GTT TTC GAC GTG GTC ANA GTG CAC CAN CGG CAC 1200 Tyr Leu Leu Phe Glu Val Phe Asp Val Val Xaa Val His Xaa Arg His 385 390 395 400 CGC GGC GTC ATC GAG GCC GTC TAC CTG CGC ACG CCC TTC TCG GCC GGC 1248 Arg Gly Val Ile Glu Ala Val Tyr Leu Arg Thr Pro Phe Ser Ala Gly 405 410 415 AAC GCT ACN NNN NNN 1263 Asn Ala Thr Xaa Xaa 420
【0090】配列番号:15配列の長さ:1263配列の型:核酸鎖の数:二本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:Genomic DNA起源生物名:Mastadenovirus株名:37型配列の特徴特徴を表す記号:CDS存在位置:1−1263他の情報ヘキソンをコードする遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の配列配列AAT CCC TTT AAC CAC CAC CGC AAT GCG GCC CTG CGC TAC CGC TCC ATG 48 Asn Pro Phe Asn His His Arg Asn Ala Ala Leu Arg Tyr Arg Ser Met 5 10 15 CTT TTG GGC AAT GGC CGC TAC GTG CCC TTC CAC ATC CAA GTG CCC CAA 96 Leu Leu Gly Asn Gly Arg Tyr Val Pro Phe His Ile Gln Val Pro Gln 20 25 30 AAG TTC TTT GCC ATC AAG AAC CTG CTC CTG CTC CCC GGC TCC TAC ACC 144 Lys Phe Phe Ala Ile Lys Asn Leu Leu Leu Leu Pro Gly Ser Tyr Thr 35 40 45 TAC GAG TGG AAC TTC GCA ACG NAT GTA AAC ATG ATC CTG CAG AGT TCC 192 Tyr Glu Trp Asn Phe Ala Thr Xxx Val Asn Met Ile Leu Gln Ser Ser 50 55 60 NTC GGA AAC GAC CTG CGC GTC GAC GGC GCC TCN GTG CGC TTC GAC AGC 240 Xaa Gly Asn Asp Leu Arg Val Asp Gly Ala Ser Val Arg Phe Asp Ser 65 70 75 80 GTC AAC CTC TAC NCC ACC TTC TTC CNN NTG GCG CAC ANC ACN GNN TCC 288 Val Asn Leu Tyr Xaa Thr Phe Phe Xaa Xaa Ala His Xaa Thr Xaa Ser 85 90 95 NCC NTG GAG NCN ATG CTG CGC AAC GAC ACN NAC GAC NAG TCN TTN CAC 336 Xaa Xaa Glu Xaa Met Leu Arg Asn Asp Thr Xaa Asp Xaa Ser Xaa His 100 105 110 GNC TNN CTC TCN GCN GCN AAC ATG CTC TAC CCC ATC CCG GCC AAG GCC 384 Xaa Xaa Leu Ser Ala Ala Asn Met Leu Tyr Pro Ile Pro Ala Lys Ala 115 120 125 ACC AAC GTG CCC ATT TCC ATC CCC TCG CGC AAC TGG GCC GCC TTC CGC 432 Thr Asn Val Pro Ile Ser Ile Pro Ser Arg Asn Trp Ala Ala Phe Arg 130 135 140 CGG TGG AGT TTC ACC CGG CTC AAG ACC AAG GAA ACT CCC TCC CTT GGC 480 Arg Trp Ser Phe Thr Arg Leu Lys Thr Lys Glu Thr Pro Ser Leu Gly 145 150 155 160 TCG GGT TTT GAC CCC TAC TTT GTC TAC TCG GGC TCC ATC CCC TAC CTC 528 Ser Gly Phe Asp Pro Tyr Phe Val Tyr Ser Gly Ser Ile Pro Tyr Leu 165 170 175 GAC GGG ACC TTC TAC CTC AAC CAC ACC TTC AAG AAG GTT TCC ATC ATG 576 Asp Gly Thr Phe Tyr Leu Asn His Thr Phe Lys Lys Val Ser Ile Met 180 185 190 TTC GAC TCC TNG GTC AGC TGG CCT GGC AAC GAC NGG CTG CTT ACG CCG 624 Phe Asp Ser Xaa Val Ser Trp Pro Gly Asn Asp Xaa Leu Leu Thr Pro 195 200 205 AAC GAG TTN GAG ATC AAG CGC ANN GTC GAC GGG GAG GGT NAC AAC GTG 672 Asn Glu Xaa Glu Ile Lys Arg Xaa Val Asp Gly Glu Gly Xaa Asn Val 210 215 220 GCC NAA TGC AAC ATG ACC AAG GAC TGG TTC CTG NTN CAG ATG NTN TCC 720 Ala Xaa Cys Asn Met Thr Lys Asp Trp Phe Leu Xaa Gln Met Xaa Ser 225 230 235 240 ANC TAC AAC ATN GGC TAC NAG GGC TTC CAT GTG CCC GAG GCG TAC AAG 768 Xaa Tyr Asn Xaa Gly Tyr Xaa Gly Phe His Val Pro Glu Ala Tyr Lys 245 250 255 GAC CGC ATG TAC TCC TTC TTC CGC AAC TTC CAG CCC ATG AGC AGG CAG 816 Asp Arg Met Tyr Ser Phe Phe Arg Asn Phe Gln Pro Met Ser Arg Gln 260 265 270 GTG GTC GAT GAG ATC AAC TAC AAG GAC TAC AAG GCA GTC ACC CTG CCC 864 Val Val Asp Glu Ile Asn Tyr Lys Asp Tyr Lys Ala Val Thr Leu Pro 275 280 285 TTC CAG CAC AAC AAC TCT GGC TTC ACC GGC TAC CTG GCA CCC ACC ATG 912 Phe Gln His Asn Asn Ser Gly Phe Thr Gly Tyr Leu Ala Pro Thr Met 290 295 300 CGT CAG GGG CAG CCC TAC CCC GCC AAC TTC CCC TAC CCG CTC ATC GGC 960 Arg Gln Gly Gln Pro Tyr Pro Ala Asn Phe Pro Tyr Pro Leu Ile Gly 305 310 315 320 TCC ACC GCA GTG CCA TCC GTC ACC CAG AAA AAG TTC CTC TGC GAC AGG 1008 Ser Thr Ala Val Pro Ser Val Thr Gln Lys Lys Phe Leu Cys Asp Arg 325 330 335 GTC ATG TGG CGC ATC CCC TTC TCC AGC AAC TTC ATG SCC ATG GGC GCC 1056 Val Met Trp Arg Ile Pro Phe Ser Ser Asn Phe Met Xaa Met Gly Ala 340 345 350 CTC ACC GAC CTG GGT CAG AAC ATG CTC TAC GCC AAC TCG GCC CAC GCG 1104 Leu Thr Asp Leu Gly Gln Asn Met Leu Tyr Ala Asn Ser Ala His Ala 355 360 365 CTC GAC ATG ACC TTC GAG GTG GAT CCC ATG GAT GAG CCN ACC NTN NTN 1152 Leu Asp Met Thr Phe Glu Val Asp Pro Met Asp Glu Pro Thr Xaa Xaa 370 375 380 TAT CTT CTC TTC GAA GTT TTC GAC GTG GTC AGA GTG CAC CAG CCG CAC 1200 Tyr Leu Leu Phe Glu Val Phe Asp Val Val Arg Val His Gln Pro His 385 390 395 400 CCC GGN NAC ATC GAG GCC GTC TAC CTG CGC ACC CCC TTC TCG GCC GGC 1248 Pro Gly Xaa Ile Glu Ala Val Tyr Leu Arg Thr Pro Phe Ser Ala Gly 405 410 415 AAC GCT ANN NNN NNN 1263 Asn Ala Xaa Xaa Xaa 420
【0091】配列番号:16配列の長さ:20配列の型:核酸鎖の数:1本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:他の核酸 合成DNA他の情報アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域の1645〜1664番目の塩基対間の配列と相補性を有する配列配列AATCCCTTTA ACCACCACCG 20
【0092】配列番号:17配列の長さ:20配列の型:核酸鎖の数:1本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:他の核酸 合成DNA他の情報アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域の2888〜2907番目の塩基対間の配列と相補性を有する配列 配列GTAGCGTTGC CGGCCGAGAA 20
【0093】配列番号:18配列の長さ:20配列の型:核酸鎖の数:1本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:他の核酸 合成DNA他の情報アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域の1897〜1916番目の塩基対間の配列と相補性を有する配列配列GCCACCTTCT TCCCCATGGC 20
【0094】配列番号:19配列の長さ:20配列の型:核酸鎖の数:1本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:他の核酸 合成DNA他の情報アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域の2842〜2861番目の塩基対間の配列と相補性を有する配列配列GCCTCGATGA CGCCGCGGTG 20
【0095】配列番号:20配列の長さ:21配列の型:核酸鎖の数:1本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:他の核酸 合成DNA他の情報アデノウイルスB亜群のヘキソンをコードする遺伝子領域の1694〜1714番目の塩基対間の配列と相補性を有する配列配列TTCTGGGTAA CGGTCGTTAT G 21
【0096】配列番号:21配列の長さ:23配列の型:核酸鎖の数:1本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:他の核酸 合成DNA他の情報アデノウイルスC亜群のヘキソンをコードする遺伝子領域の2787〜2809番目の塩基対間の配列と相補性を有する配列配列CACCCTTCTT TATGTTTTGT TTG 23
【0097】配列番号:22配列の長さ:20配列の型:核酸鎖の数:1本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:他の核酸 合成DNA他の情報アデノウイルスD亜群のヘキソンをコードする遺伝子領域の2497〜2516番目の塩基対間の配列と相補性を有する配列配列GTCACCCTGC CCTTCCAGCA 20
【0098】配列番号:23配列の長さ:20配列の型:核酸鎖の数:1本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:他の核酸 合成DNA他の情報アデノウイルスE亜群及び4型のヘキソンをコードする遺伝子領域の2753〜2772番目の塩基対間の配列と相補性を有する配列 配列ACATGAATTT CGAAGTCGAC 20
【0099】配列番号:24配列の長さ:21配列の型:核酸鎖の数:1本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:他の核酸 合成DNA他の情報アデノウイルスF亜群のヘキソンをコードする遺伝子領域の2606〜2626番目の塩基対間の配列と相補性を有する配列配列TTCTGGGTAA CGGTCGTTAT G 21
【0100】配列番号:25配列の長さ:23配列の型:核酸鎖の数:1本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:他の核酸 合成DNA他の情報アデノウイルス3型のヘキソンをコードする遺伝子領域の2471〜2493番目の塩基対間の配列と相補性を有する配列 配列AGGTTAATTA CACTGACTAC AAA 23
【0101】配列番号:26配列の長さ:20配列の型:核酸鎖の数:1本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:他の核酸 合成DNA他の情報アデノウイルス8型のヘキソンをコードする遺伝子領域の2145〜2164番目の塩基対間の配列と相補性を有する配列配列TGTTTACTCG GGCACCATCC 20
【0102】配列番号:27配列の長さ:20配列の型:核酸鎖の数:1本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:他の核酸 合成DNA他の情報アデノウイルス11型のヘキソンをコードする遺伝子領域の1788〜1807番目の塩基対間の配列と相補性を有する配列配列TTATGAGTGG AACTTTAGGA 20
【0103】配列番号:28配列の長さ:配列の型:核酸鎖の数:1本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:他の核酸 合成DNA他の情報アデノウイルス19型のヘキソンをコードする遺伝子領域の2601〜2620番目の塩基対間の配列と相補性を有する配列 配列TGGCTCCACC GCAGTGCCCT 20
【0104】配列番号:29配列の長さ:20配列の型:核酸鎖の数:1本鎖トポロジー:直鎖状配列の種類:他の核酸 合成DNA他の情報アデノウイルス37型のヘキソンをコードする遺伝子領域の2145〜2164番目の塩基対間の配列と相補性を有する配列 配列TGTCTACTCG GGCTCCATCC 20
【図面の簡単な説明】
【図1】ヘキソン領域に由来する大きさが1263塩基対の増幅DNAのアガロースゲル電気泳動による検出図。
【図2】ヘキソン領域に由来する大きさが965塩基対の増幅DNAのアガロースゲル電気泳動による検出図。
【図3】ヘキソン領域に由来する各亜群に特異的な大きさの増幅DNAのアガロースゲル電気泳動による検出図。
【図4】血清型特異的DNAプローブと各血清型由来のDNAとの結合パターン。
【図5】本発明で用いる、ヘキソン領域DNA、プライマー、DNAプローブ、該プライマーを用いて増幅可能なDNA断片。

【特許請求の範囲】
【請求項1】 (i) アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ部分を、該遺伝子領域内の血清型に共通な塩基配列に相補性を有する2種のオリゴヌクレオチドを5’末端側及び3’末端側のプライマーとして用いて増幅し、(ii) 該増幅DNAを検出することを特徴とするアデノウイルスの検出法。
【請求項2】 亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ部分が、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の3’末端側である、請求項1記載の方法。
【請求項3】 亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ部分が、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の1263塩基対の大きさの部分である、請求項2記載の方法。
【請求項4】 亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ部分が、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域の1897〜2861番目の塩基対間の965塩基対の大きさの部分である、請求項2記載の方法。
【請求項5】 5’末端側のプライマーが配列番号16又は配列番号18で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドであり、3’末端側のプライマーが配列番号17又は配列番号19で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドである、請求項1記載の方法。
【請求項6】 5’末端側のプライマーが配列番号16で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドであり、3’末端側のプライマーが配列番号17で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドである、請求項1記載の方法。
【請求項7】 5’末端側のプライマーが配列番号18で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドであり、3’末端側のプライマーが配列番号19で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドである、請求項1記載の方法。
【請求項8】 (i) アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ該遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の1263塩基対の大きさの部分を、該遺伝子領域内の血清型に共通な塩基配列に相補性を有する配列番号16で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを5’末端側のプライマーとして及び配列番号17で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを3’末端側のプライマーとして用いて増幅し、(ii) 該増幅DNAを検出することを特徴とするアデノウイルスの検出法。
【請求項9】 (i) アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ該遺伝子領域の1897〜2861番目の塩基対間の965塩基対の大きさの部分を、該遺伝子領域内の血清型に共通な塩基配列に相補性を有する配列番号18で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを5’末端側のプライマーとして及び配列番号19で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを3’末端側のプライマーとして用いて増幅し、(ii) 該増幅DNAを検出することを特徴とするアデノウイルスの検出方法。
【請求項10】 (i) アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ該遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の1263塩基対の大きさの部分を、該遺伝子領域内の血清型に共通な塩基配列に相補性を有する配列番号16で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを5’末端側のプライマーとして及び配列番号17で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを3’末端側のプライマーとして用いて増幅し、(ii) 該増幅DNAの、亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ該遺伝子領域の1897〜2861番目の塩基対間の965塩基対の大きさの部分を、該遺伝子領域内の血清型に共通な塩基配列に相補性を有する配列番号18で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを5’末端側のプライマーとして及び配列番号19で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを3’末端側のプライマーとして用いて増幅し、(iii) 該増幅DNAを検出することを特徴とするアデノウイルスの検出方法。
【請求項11】 (i) アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群に特異的な塩基配列を持つ部分を、該遺伝子領域内の各亜群に特異的な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチドと、血清型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチドとをプライマーとして用いて増幅し、(ii) 該増幅DNAを検出及び解析することを特徴とするアデノウイルスの亜群の鑑別方法。
【請求項12】 亜群に特異的な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチドが、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23及び配列番号24で示されるオリゴヌクレオドより成る群から選ばれる少なくとも一種のオリゴヌクレオチドである、請求項11記載の方法。
【請求項13】 血清型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチドが、配列番号16、配列番号17、配列番号18及び配列番号19で示されるオリゴヌクレオチドより成る群から選ばれる一種のオリゴヌクレオチドである、請求項11記載の方法。
【請求項14】 (i) アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群に特異的な塩基配列を持つ部分を、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23及び配列番号24で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオドより成る群から選ばれる少なくとも一種の該遺伝子領域内の各亜群に特異的な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチドと、配列番号16、配列番号17、配列番号18及び配列番号19で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチより成る群から選ばれる一種の血清型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチドとをプライマーとして用いて増幅し、(ii) 該増幅DNAを検出及び解析することを特徴とするアデノウイルスの亜群の鑑別方法。
【請求項15】 (i) アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ部分を、該遺伝子領域内の血清型に共通な塩基配列に相補性を有する2種のオリゴヌクレオチドを5’末端側及び3’末端側のプライマーとして用いて増幅し、(ii) アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを標識してDNAプローブとし、(iii) 上記(i) の増幅DNAと上記(ii)のDNAプローブとをハイブリダイズせしめ、(iv) ハイブリダイズしたDNAプローブの種類を解析することを特徴とするアデノウイルス血清型の鑑別方法。
【請求項16】 亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ部分が、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域の1645〜2907番目の塩基対間の1263塩基対の大きさの部分である、請求項15記載の方法。
【請求項17】 亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ部分が、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域の1897〜2861番目の塩基対間の965塩基対の大きさの部分である、請求項15記載の方法。
【請求項18】 5’末端側のプライマーが配列番号16又は配列番号18で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドであり、3’末端側のプライマーが配列番号17又は配列番号19で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドである、請求項15記載の方法。
【請求項19】 5’末端側のプライマーが配列番号16で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドであり、3’末端側のプライマーが配列番号17で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドである、請求項15記載の方法。
【請求項20】 5’末端側のプライマーが配列番号18で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドであり、3’末端側のプライマーが配列番号19で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドである、請求項15記載の方法。
【請求項21】 亜群及び血清型に特異的な塩基配列を有するオリゴヌクレオチドが、配列番号25、配列番号23、配列番号26、配列番号27、配列番号28及び配列番号29で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドより成る群から選ばれる少なくとも一種のオリゴヌクレオチドである、請求項15記載の方法。
【請求項22】 (i) アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を持つ該遺伝子領域の1897〜2861番目の塩基対間の965塩基対の大きさの部分を、該遺伝子領域内の血清型に共通な塩基配列に相補性を有する配列番号18で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを5’末端側のプライマーとして及び配列番号19で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを3’末端側のプライマーとして用いて増幅し、(ii) アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の亜群及び血清型に特異的な塩基配列を有する配列番号25、配列番号23、配列番号26、配列番号27、配列番号28及び配列番号29で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドより成る群から選ばれる少なくとも一種のオリゴヌクレオチドを標識してDNAプローブとし、(iii) 上記(i) の増幅DNAと上記(ii)のDNAプローブとをハイブリダイズせしめ、(iv) ハイブリダイズしたDNAプローブの種類を解析することを特徴とするアデノウイルス血清型の鑑別方法。
【請求項23】 配列番号16、配列番号17、配列番号18又は配列番号19で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の血清型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
【請求項24】 配列番号20で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内のB亜群に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
【請求項25】 配列番号21で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内のC亜群に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
【請求項26】 配列番号22で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内のD亜群に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
【請求項27】 配列番号23で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内のE亜群及び4型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
【請求項28】 配列番号24で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内のF亜群に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
【請求項29】 配列番号25で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の3型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
【請求項30】 配列番号26で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の8型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
【請求項31】 配列番号27で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の11型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
【請求項32】 配列番号28で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の19型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
【請求項33】 配列番号29で示される塩基配列を有する、アデノウイルスのヘキソンをコードする遺伝子領域内の37型に共通な塩基配列に相補性を有するオリゴヌクレオチド。
【請求項34】 配列番号6に記載の塩基配列又はアミノ酸配列で示される、アデノウイルス1型のヘキソンの一部をコードする遺伝子を含むDNA断片。
【請求項35】 配列番号7に記載の塩基配列又はアミノ酸配列で示される、アデノウイルス3型のヘキソンの一部をコードする遺伝子を含むDNA断片。
【請求項36】 配列番号8に記載の塩基配列又はアミノ酸配列で示される、アデノウイルス4型のヘキソンの一部をコードする遺伝子を含むDNA断片。
【請求項37】 配列番号9に記載の塩基配列又はアミノ酸配列で示される、アデノウイルス6型のヘキソンの一部をコードする遺伝子を含むDNA断片。
【請求項38】 配列番号10に記載の塩基配列又はアミノ酸配列で示される、アデノウイルス7型のヘキソンの一部をコードする遺伝子を含むDNA断片。
【請求項39】 配列番号11に記載の塩基配列又はアミノ酸配列で示される、アデノウイルス8型のヘキソンの一部をコードする遺伝子を含むDNA断片。
【請求項40】 配列番号12に記載の塩基配列又はアミノ酸配列で示される、アデノウイルス11型のヘキソンの一部をコードする遺伝子を含むDNA断片。
【請求項41】 配列番号13に記載の塩基配列又はアミノ酸配列で示される、アデノウイルス14型のヘキソンの一部をコードする遺伝子を含むDNA断片。
【請求項42】 配列番号14に記載の塩基配列又はアミノ酸配列で示される、アデノウイルス19型のヘキソンの一部をコードする遺伝子を含むDNA断片。
【請求項43】 配列番号15に記載の塩基配列又はアミノ酸配列で示される、アデノウイルス37型のヘキソンの一部をコードする遺伝子を含むDNA断片。

【図1】
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【図2】
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【図3】
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【図4】
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【図5】
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