本発明は、コンビナトーリアル人工受容体アレイのような人工受容体を使用する方法に関する。本発明の受容体は、形成ブロック分子の異種および固定化された組合せを含む。特定の具体例において、支持体上のもう一方の近くで固定化された2、3、4、または5の異なる形成ブロック分子の組合せは、本発明の方法で使用できる分子構造を提供する。本発明の方法は、次いで、受容体のリガンドを検出するのに使用できる人工受容体を開発し得る。本発明の方法は、１以上の結合相互作用を撹乱する化合物を発見することができる。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
テストリガンドを結合させるための人工受容体を作成する方法であって：
少なくとも１つの候補人工受容体をテストリガンドと接触させ；
ここに、該候補人工受容体は、支持体の領域にカップリングされた複数の形成ブロックを含み；
少なくとも１つの候補人工受容体への該テストリガンドの結合を検出し；次いで
テストリガンド結合が、該テストリガンドに対して作用する人工受容体として検出された少なくとも１つの候補人工受容体を選択することを特徴とする該方法。
【請求項２】
候補人工受容体のアレイをテストリガンドと接触させることを特徴とする請求項１記載の方法。
【請求項３】
該アレイが、少なくとも約100の候補人工受容体を含む請求項２記載の方法。
【請求項４】
該アレイが、少なくとも約10,000の候補人工受容体を含む請求項２記載の方法。
【請求項５】
該アレイが、少なくとも約1,000,000の候補人工受容体を含む請求項２記載の方法。
【請求項６】
該テストリガンドが、依存性薬物、ペプチド、ポリペプチド、オリゴヌクレオチド、ポリヌクレオチド、および微生物のうちの少なくとも１つを含む請求項１記載の方法。
【請求項７】
該テストリガンドが、異性体、蛋白質の立体配座、およびプロテオームのうちの少なくとも１つを含む請求項１記載の方法。
【請求項７】
さらに
少なくとも１つの候補人工受容体を、第１の蛋白質と接触させて、少なくとも１つの蛋白質処理候補人工受容体を生成させ；
該蛋白質処理候補人工受容体をプロテオームと接触させ；ここに、該プロテオームは、プロテオーム蛋白質を含み；
該少なくとも１つの蛋白質処理候補人工受容体への少なくとも１つのプロテオーム蛋白質の結合を検出し；次いで
該第１の蛋白質および少なくとも１つのプロテオーム蛋白質の両方を結合する候補人工受容体を、作用する人工受容体として選択する；あるいは、分析のために、結合が検出された該少なくとも１つのプロテオーム蛋白質および該第１の蛋白質を選択することを特徴とする請求項１記載の方法。
【請求項８】
少なくとも１つの候補人工受容体を、該テストリガンドおよび候補撹乱物質を含む混合物と接触させ；
該候補撹乱物質の存在下で、少なくとも１つの候補人工受容体への該テストリガンドの結合を検出し；次いで
テストリガンド結合が、候補撹乱物質の不存在下で起こったが、テストリガンド結合が、該候補撹乱物質によって撹乱された少なくとも１つの候補人工受容体を、該テストリガンドに対して作用する人工受容体として選択することを特徴とする請求項１記載の方法。
【請求項９】
少なくとも１つの作用する人工受容体を、テストリガンドを含有すると疑われる試料と接触させ；
ここに、該作用する人工受容体は、支持体の領域にカップリングした複数の形成ブロックを含み；ここに該少なくとも１つの作用する人工受容体は、該テストリガンドを結合することが分かっており；
該少なくとも１つの作用する人工受容体への結合をモニタリングし；ここに、該少なくとも１つの作用する人工受容体への結合は、試料中のテストリガンドの存在を示すことを特徴とする該テストリガンドを検出する方法。
【請求項１０】
該少なくとも１つの作用する人工受容体が、複数の人工受容体を含む請求項９記載の方法。
【請求項１１】
該テストリガンドの結合が、該複数の人工受容体の中に、検出可能なパターンを生成する請求項１０記載の方法。
【請求項１２】
該テストリガンドが、依存性薬物、ペプチド、ポリペプチド、オリゴヌクレオチド、ポリヌクレオチド、および微生物のうちの少なくとも１つを含む請求項９記載の方法。
【請求項１３】
該テストリガンドが、異性体、蛋白質の立体配座、プロテオームのうちの少なくとも１つを含む請求項９記載の方法。
【請求項１４】
複数の候補人工受容体を、第１のテストリガンドと接触させ；
ここに、各候補人工受容体は、独立して、支持体の領域にカップリングした複数の形成ブロックを含み；
少なくとも１つの候補人工受容体への該第１のテストリガンドの結合を検出し；次いで
該第１のテストリガンドを結合した該少なくとも１つの人工受容体の位置または組成を整理することを特徴とするテストリガンドを検出する方法。
【請求項１５】
さらに：
１以上の複数の候補人工受容体を、第２のテストリガンドと接触させ；
少なくとも１つの候補人工受容体への該第二のテストリガンドの結合を検出し；次いで
該第２のテストリガンドを結合した該少なくとも１つの人工受容体の位置または組成を整理することを特徴とする請求項１５記載の方法。
【請求項１６】
さらに：
該第１のテストリガンドを結合した該少なくとも１つの人工受容体の該位置または組成を、該第２のテストリガンドを結合した該少なくとも１つの人工受容体の位置または組成と比較し；次いで
該位置または組成の比較を整理することを特徴とする請求項１５記載の方法。
【請求項１７】
さらに、該第１のテストリガンドを、該組成に基づき、該第２のテストリガンドから識別することを特徴とする請求項１６記載の方法。
【請求項１８】
テストリガンドの相互作用を撹乱する化合物を検出する方法であって：
少なくとも１つの作用する人工受容体を、該テストリガンドおよび候補撹乱物質を含む混合物と接触させ；
ここに、該作用する人工受容体は、支持体の領域にカップリングした複数の形成ブロックを含み；ここに該少なくとも１つの作用する人工受容体は、該テストリガンドを結合することが分かっており：
該少なくとも１つの作用する人工受容体への該テストリガンドの結合を減少させる候補撹乱物質をモニタリングし；ここに、減少した結合は、該候補撹乱物質が、主要な撹乱物質であることを示すことを特徴とする該方法。
【請求項１９】
該テストリガンドが、依存性薬物、ペプチド、ポリペプチド、オリゴヌクレオチド、ポリヌクレオチド、および微生物のうち少なくとも１つを含む請求項１８記載の方法。
【請求項２０】
該テストリガンドが、異性体、蛋白質の立体配座、およびプロテオームのうちの少なくとも１つを含む請求項１８記載の方法。
【請求項２１】
該候補撹乱物質が、500未満の分子量を有する化合物を含む請求項１８記載の方法。
【請求項２２】
該候補撹乱物質がポリペプチドを含む請求項１８記載の方法。
【請求項２３】
テストリガンドに対するアフィニティー支持体を作成する方法であって、
少なくとも１つの候補人工受容体を該テストリガンドと接触させ；
ここに、該候補人工受容体は、第１の支持体の領域にカップリングした複数の形成ブロックを含み；
少なくとも１つの候補人工受容体への該テストリガンドの結合を検出し；次いで
テストリガンド結合が検出された少なくとも１つの候補人工受容体を、該テストリガンドに対する作用する人工受容体として選択し；
該作用する人工受容体を第２の支持体に結合させて、アフィニティー支持体を形成することを特徴とする該方法。
【請求項２４】
該テストリガンドが、依存性薬物、ペプチド、ポリペプチド、オリゴヌクレオチド、ポリヌクレオチド、および微生物のうちの少なくとも１つを含む請求項２３記載の方法。
【請求項２５】
該テストリガンドが、異性体、蛋白質の立体配座、およびプロテオームのうちの少なくとも１つを含む請求項２４記載の方法。
【請求項２６】
該テストリガンドを含有する試料を作用する人工受容体と接触させ；
ここに、該作用する人工受容体は、支持体の領域にカップリングした複数の形成ブロックを含み；ここに該作用する人工受容体は該テストリガンドに結合することが分かっていることを特徴とするテストリガンドを単離する方法。
【請求項２７】
反応物質に対する反応支持体を作成する方法であって：
少なくとも１つの候補人工受容体を該反応物質と接触させ；
ここに、該候補人工受容体は、第１の支持体の領域にカップリングした複数の形成ブロックを含み；
少なくとも１つの候補人工受容体への該テストリガンドの結合を検出し；次いで
テストリガンド結合が検出された少なくとも１つの候補人工受容体を、該テストリガンドに対する作用する人工受容体として選択し；
少なくとも１つの作用する人工受容体を該反応物質と接触させ、該反応物質の反応をモニタリングし；
該反応物質が反応人工受容体として観察された作用する人工受容体を選択し；
該反応人工受容体を第２の支持体に結合させて、反応支持体を形成することを特徴とする該方法。
【請求項２８】
該反応物質が、依存性薬物、ペプチド、ポリペプチド、オリゴヌクレオチド、ポリヌクレオチド、および微生物のうちの少なくとも１つを含む請求項２７記載の方法。
【請求項２９】
該反応物質が、異性体、蛋白質の立体配座、およびプロテオームのうちの少なくとも１つを含む請求項２７記載の方法。
【請求項３０】
さらに、少なくとも１つの作用する人工受容体を、第２の反応物質と接触させることを特徴とする請求項２７記載の方法。
【請求項３１】
該反応物質を含有する試料を、作用する人工受容体と接触させ；
ここに、該作用する人工受容体は、支持体の領域にカップリングした複数の形成ブロックを含み；ここに、該作用する人工受容体は、該テストリガンドに結合することが分かっていることを特徴とする反応物質を反応させる方法。
【請求項３２】
さらに、該作用する人工受容体を、第２の反応物質と接触させることを特徴とする請求項３０記載の方法。
【請求項３３】
反応物質に対する触媒支持体を作成する方法であって：
少なくとも１つの候補人工受容体を該反応物質と接触させ；ここに、該候補人工受容体は、第１の支持体の領域にカップリングした複数の形成ブロックを含み；
少なくとも１つの候補人工受容体の存在下で、反応物質の反応の触媒作用を検出し；次いで
触媒作用が、テストリガンドに対する作用する人工受容体として検出された少なくとも１つの候補人工受容体を選択し；
該作用する受容体を第２の支持体に結合させて、触媒支持体を形成することを特徴とする該方法。
【請求項３４】
該反応物質が、依存性薬物、ペプチド、ポリペプチド、オリゴヌクレオチド、ポリヌクレオチド、および微生物のうちの少なくとも１つを含む請求項３３記載の方法。
【請求項３５】
該反応物質が、異性体、蛋白質の立体配座、およびプロテオームのうちの少なくとも１つを含む請求項３３記載の方法。
【請求項３６】
さらに、少なくとも１つの作用する人工受容体を第２の反応物質と接触させることを特徴とする請求項３３記載の方法。
【請求項３７】
反応物質を含有する試料を、作用する人工受容体と接触させ；
ここに、該作用する人工受容体は、支持体の領域にカップリングした複数の形成ブロックを含み；ここに、該作用する人工受容体は、該テストリガンドに結合し、反応を触媒することが分かっていることを特徴とする該反応を触媒する方法。
【請求項３８】
さらに、該作用する人工受容体を、第２の反応物質と接触させることを特徴とする請求項３７記載の方法。
【請求項３９】
テストリガンドを結合しない表面を作成する方法であって：
少なくとも１つの候補人工受容体を、該テストリガンドと接触させ；
ここに、該候補人工受容体は、支持体の領域にカップリングした複数の形成ブロックを含み；
少なくとも１つの候補人工受容体への該テストリガンドの結合の欠乏を検出し；次いで、
リガンド結合のテスト欠乏が、該テストリガンドに対する非結合表面として検出された少なくとも１つの候補人工受容体を選択することを特徴とする該方法。
【請求項４０】
該テストリガンドが、複数のテストリガンドを含む請求項３９記載の方法。
【請求項４１】
テストリガンドの第２のリガンドとの相互作用を撹乱する化合物を検出する方法であって：
該テストリガンドを、少なくとも１つの作用する人工受容体に結合し；
ここに、該作用する人工受容体は、支持体の領域にカップリングした複数の形成ブロックを含み；ここに、該少なくとも１つの作用する人工受容体は、該テストリガンドに結合することが分かっており；
該少なくとも１つの作用する人工受容体を、該第２のリガンドおよび候補撹乱物質を含む混合物と結合したテストリガンドと接触させ；
該テストリガンドへの該第２のリガンドの結合を減少させる該候補撹乱物質につきモニタリングし；ここに、減少された結合は、該候補撹乱物質が主な撹乱物質であることを示すことを特徴とする該方法。
【請求項４２】
該テストリガンドが、ペプチド、ポリペプチド、オリゴヌクレオチド、ポリヌクレオチド、および微生物のうちの少なくとも１つを含む請求項４１記載の方法。
【請求項４３】
該候補撹乱物質が、500未満の分子量を有する化合物を含む請求項４１記載の方法。
【請求項４４】
該候補撹乱物質が、ポリペプチドを含む請求項４１記載の方法。
【請求項４５】
該テストリガンドが第１の蛋白質を含み、該第２のリガンドが第２の蛋白質を含み；ここに該第１の蛋白質および該第２の蛋白質が複合体を形成する請求項４１記載の方法。
【請求項４６】
該テストリガンドが蛋白質を含み、該第２のリガンドがポリヌクレオチドを含み；ここに該蛋白質および該ポリヌクレオチドが複合体を形成する請求項４１記載の方法。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【図６】

【図７】

【図８】

【図９】

【図１０】

【図１１】

【図１２Ａ】

【図１２Ｂ】

【図１３】

【図１４】

【図１５】

【図１６】

【図１７】

【図１８】

【図１９】

【図２０】

【図２１】

【図２２】

【図２３】

【図２４】

【図２５】

【図２６】

【図２７】

【図２８】

【図２９】

【図３０】

【図３１】

【図３２】

【図３３】

【図３４】

【図３５】

【図３６】

【図３７】

【図３８】

【図３９】

【図４０】

【図４１】

【図４２】

【図４３】

【図４４】

【図４５】

【図４６】

【図４７】

【図４８】

【図４９】

【図５０】

【図５１】

【図５２】

【図５３】

【図５４】

【図５５】

【図５６】

【図５７】

【図５８】

【公表番号】特表２００７−５０４４７０（Ｐ２００７−５０４４７０Ａ）
【公表日】平成１９年３月１日（２００７．３．１）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００６−５２６２２５（Ｐ２００６−５２６２２５）
【出願日】平成１６年９月３日（２００４．９．３）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００４／０２９０５０
【国際公開番号】ＷＯ２００５／０２４３８３
【国際公開日】平成１７年３月１７日（２００５．３．１７）
【出願人】（５０４３３０３１７）レセプターズ　エルエルシー (4)
【Ｆターム（参考）】