粒子の検出のための装置および方法
本発明は、粒子を定性的および／または定量的に検出する装置および方法に関する。詳細には、本発明は粒子を検出する装置に関し、第１表面と第１表面に対向して配置された第２表面の間のチャンバ本体内に形成された反応チャンバと、１つ以上の転位器とを含み、第１表面と第２表面の間の距離が、第１表面および／または第２表面の表面領域の少なくとも１つ以上の部分で１つ以上の転位器によって変化可能である。本発明はまた、粒子検出に対応する方法に関し、検出すべき１種以上の粒子を含むと思われるサンプルを反応チャンバ中に配置すること、反応チャンバ内のサンプルの少なくとも一部を１つ以上の転位器によって転位すること、および１種以上の粒子の存在および／または数を示唆する値を検出／判定することを含む。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本出願は、独国特許出願第１０２００５０５２７５２号の優先権を主張するものであり、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。さらに本出願は、独国特許出願第１０２００５０５２７１３号および「Ｍｅｔｈｏｄ ａｎｄ ｄｅｖｉｃｅ ｆｏｒ ｔｈｅ ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ ｏｆ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ」の名称で２００６年１１月０６日出願の国際特許出願（Ｍａｉｗａｌｄ参照番号Ｃ７７９４）に関し、両方ともその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【０００２】
本発明は、粒子の検出のための装置および方法に関する。
【背景技術】
【０００３】
ヒトおよびヒト以外の体液などのサンプル中の細胞またはウイルスなどの１種以上の粒子の存在の検出および／または絶対レベルの計数は、人間および哺乳動物全体の健康状態を決定するのに非常に重要である。そのような用途の臨床的に重要な例は、ＨＩＶ陽性被験者中のＣＤ４＋細胞、化学療法を受けている患者の顆粒球および小板、血液バッグ中の白血球の計数を含む。他方、非医学的用途は、下水の環境サンプルまたは食品中の（細菌性）汚染の検出を含む。
【０００４】
そのような分析を行うための主要な分析プラットホームは、現在フローサイトメトリーに基づく分析システムである。フローサイトメトリーは、目標粒子をその中に有するサンプルを含む流体をフローサイトメトリーの検出領域に送達することを含む。粒子はシース流体内での水力学的な集束を用いてコア流に沿って単一列に配置される。次いで、粒子は個別に光ビームによって検査される。典型的に、検出領域の目標粒子は、目標粒子による発光現象を発生させるレーザーを用いて照射される。光学系および検出電子機器が、サンプル中の目標粒子の光の吸収、散乱、蛍光、および／または分光特性、または替わりに、目標粒子に添付した蛍光標識のそれぞれの特性を測定する。蛍光の場合、各目標粒子はそれが照明領域を通過する際に蛍光光子を放出する。さらに、照明または励起光からの蛍光の区別はフィルタまたはフィルタの組み合わせによって達成することができる。蛍光の検出は光電子増倍管またはフォトダイオードを用いて達成される。他の技術は目標粒子による照明ビーム中の光子の散乱によるものである。目標粒子は散乱の角度の関数として、すなわちそのサイズおよび形状ならびに散乱された光子の波長の関数として、その光散乱によって識別される。
【０００５】
したがって、単一目標粒子の良好な検出および識別はいくつかの要因に依存する。第１に、レーザーエネルギーは目標粒子が照射領域をすばやく通過する間に十分大きな数の蛍光（または、替わりに散乱）光子を発生させるのに十分でなければならない。典型的に、粒子の検出は、目標粒子からの蛍光の放出が背景の光子の不規則な変動から確実に区別されるように、十分な数の光子が発生するとき行われる。第２に、サンプル中のキャリア液体または液体中の不純物によって放射される散乱または蛍光、ならびに流体が通過する毛管の壁など装置自体から発生するこれらの望ましくない背景光子を最小化することが重要である。
【０００６】
フローサイトメトリーおよびそれらの異なる用途における使用方法は、例えば、Ｓｈａｒｐｉｒｏ，Ｒ．Ｍ．（２００２）Ｐｒａｃｔｉｃａｌ Ｆｌｏｗ Ｃｙｔｏｍｅｔｒｙ，４ｔｈ ｅｄ．，Ｗｉｌｅｙ−Ｌｉｓｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，ＮＹ、ならびに、中でも、国際公開第９０／１３３６８号、第９９／４４０３７号、および第０１／５９４２９号に記載される。
【０００７】
しかし、従来のフローサイトメトリーシステムは典型的に嵩高い機器のため通常の臨床使用には不便であり、これは「現場」測定（例えば、ベッド脇での試験）を困難にするばかりでなく、分析ごとに高い経費を生じる。したがって、好ましくは類似の性能特性を有する、簡単でより小型で安価なシステムが必要であるのは明らかである。
【０００８】
したがって、より小さなサンプルおよび試薬容積しか必要としないサイトメトリーを開発するために、近年の微小流体技術が用いられた（例えば、Ａｌｔｅｎｄｏｒｆ，Ｅ．ら、（１９９７）、Ｓｅｎｓ．Ａｃｔｕａｔ．１，５３１−５３４、Ｈｕｈ，Ｄ．ら（２００５）Ｐｈｙｓｉｏｌ．Ｍｅａｓ．２６，Ｒ７３−Ｒ９８、Ｄｉｔｔｒｉｃｈ，Ｐ．Ｓ、およびＭａｎｚ，Ａ．（２００５）Ａｎａｌ．Ｂｉｏａｎａｌ．Ｃｈｅｍ．３８２，１７７１−１７８２を参照されたい）。これらの努力に基づく分析機器は従来の装置よりも小さく、より携帯性がある。
【０００９】
そのような小型化されたフローサイトメトリーの例は、国際公開第０２／１０７１３号に記載される。この装置はそれぞれサンプル流体受容器および流体を支持する貯蔵器に結合された不正確な流体駆動器を用いる、閉ループフィードバック経路によって制御され、したがって、より小型の機器設定が可能である。
【００１０】
また、フローサイトメトリーを使用する替わりに、対象の粒子に特定の分子マーカー（すなわち標識）を用いることによって、所与のサンプル中の粒子の存在および／または数を間接的に求めることが可能であり、そのサンプル中のコピー数が粒子の数に相関する。現在、そのような分析を行うには、例えば、ＥＬＩＳＡに基づく分析（例えば、Ｋａｎｎａｎｇａｌ，Ｒ．ら、（２００１）Ｃｌｉｎ．Ｄｉａｇｎ．Ｌａｂ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．８，１２８６−１２８８参照）、ならびに、被覆された常磁性ビーズ（例えば、Ｃａｒｅｌｌａ，Ａ．Ｙ．ら、（１９９５）Ｃｌｉｎ．Ｄｉａｇｎ．Ｌａｂ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２，６２３−６２５参照）または被覆されたラテックスビーズ（例えば、Ｂａｌａｋｒｉｓｈｎａｎ，Ｐ．ら、（２００４）Ｊ．Ａｃｑｕｉｒ．Ｉｍｍｕｎｅ Ｄｅｆｉｃ．Ｓｙｎｄｒ．３６，１００６−１０１０参照）の使用を含む顕微鏡に基づく方法などの異なる手法が可能である。さらに、特に標識を付けた粒子を、顕微鏡光学系を用いてそれらを画像形成する前に膜上に捕捉することも可能である（Ｒｏｄｒｉｇｕｅｚ，Ｗ．Ｒ．ら、（２００５）ＰＬＯＳ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ ２，ｅ１８２，６６３−６７２）。
【００１１】
粒子を計数する他の種類の分析装置は、国際公開第２００５／００８２２６号に記載されている。装置は、染料で標識を付けた分析すべき粒子を含むサンプルチップの部分領域に光を投射する光源と、直前に撮影された領域に隣接するある領域が光の入射点に移動するように、チップの位置を所定時間間隔ごとにそれぞれ対物レンズおよび光源に対して所定の距離移動させるための移動器とを含む。したがって、サンプルチップ上の部分領域は連続的に撮影される。各部分領域中の粒子数が計数され、数学的に処理されてサンプル中の粒子の総数が計算される。
【００１２】
さらに、米国特許出願第２００６／００２４７５６号は磁気的に標識を付けた目標粒子または細胞の検出のための小型画像形成サイトメトリー装置に関する。その目的のために、分析すべき生物サンプル中に存在するすべての細胞は蛍光で標識が付けられるが、強磁性ビーズに結合した単クローン抗体を用いて目標細胞だけが磁気的に標識が付けられる。標識を付けられたサンプルはチャンバまたはキュベット中で２つの楔形状の磁石の間に置いて、キュベットの観察表面上で磁気的に標識を付けた細胞を選択的に動かす。ＬＥＤが細胞を照明し、ＣＣＤカメラが目標細胞によって放射される蛍光の画像を捕捉する。デジタル画像分析は元のサンプルの目標細胞濃度に相関し得る表面上の細胞の計数を提供する。
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【００１３】
しかし、これらの上述の全ての装置および方法は比較的複雑な検出技術を必要とし、これは初期コストおよび必要な分析機器の保守の両方とも高価になり、高度に訓練を受けた人を必要とする。これは従来のシステムを通常の医療、「ベッド脇」試験、または遠隔地での実施には不適切である。
【００１４】
したがって、上述の制約を克服する、サンプル中の１つ以上の粒子を定性的および／または定量的に検出するための分析装置が必要である。詳細には、所与の粒子が少量（すなわち少数）であっても、高感度だけでなく実施が容易でコスト効率良く検出可能な装置が必要である。
【００１５】
さらに、迅速に信頼性高く所与のサンプル中の１種以上の粒子の存在を検出し、および／または量を正確に測定するための、そのような分析装置を用いる対応方法が必要である。詳細には、「現場」で、すなわち、分析すべきサンプルの収集の間、または直後に実施することのできる方法が必要である。
【００１６】
したがって、本発明の目的はそのような分析装置ならびにそれを用いる対応方法を提供することである。
【課題を解決するための手段】
【００１７】
第１の態様において、本発明は粒子の定性的および／または定量的検出に関し、第１表面と第１表面に対向して配置された第２表面の間のチャンバ本体内に形成された反応チャンバと、１つ以上の転位器（ｄｉｓｐｌａｃｅｒ）とを含み、第１表面と第２表面の間の距離は、第１表面および／または第２表面の表面領域の少なくとも１つ以上の部分で１つ以上の転位器によって変化可能である。
【００１８】
１つ以上の転位器は第１表面および／または第２表面に一体化された部分（「転位構造」）とすることができ、または第１表面および／または第２表面に対向して配置された内蔵式（ｓｅｌｆ−ｃｏｎｔａｉｎｅｄ）本体（「転位体」）とすることができる。１つ以上の転位器は弾性的に変形可能な材料から作ることができる。好ましい実施形態において、装置は２つの転位器を含み、同じ表面または異なる表面のいずれかに対向して配置することができる。
【００１９】
第１表面および／または第２表面の少なくとも一部分は透明な材料から作られるのが好ましい。さらに、第１表面および／または第２表面の少なくとも１つ以上の部分は弾性的に変形可能であるのが好ましい。少なくとも１つ以上の弾性的に変形可能な部分が１つ以上の転位器に対向して配置されるのが特に好ましい。少なくとも１つ以上の弾性的に変形可能部分は、検出が行われる表面領域とは異なることができる。
【００２０】
いくつかの実施形態において、本発明の装置は反応チャンバが弾性的に変形されたとき、反応チャンバの容積を本質的に一定に保つことを可能にする１つ以上の手段をさらに含む。１つ以上の手段は反応チャンバの側面境界を定める弾性側壁を含むのが好ましい。
【００２１】
さらに他の態様において、本発明は少なくとも２つの部分を含むシステムに関し、少なくとも２つの部分の各々が第１表面と第１表面に対向して位置する第２表面の間のチャンバ本体内に形成された反応チャンバと、１つ以上の転位器とを含み、第１表面と第２表面の間の距離は第１表面および／または第２表面の表面領域の少なくとも１つ以上の部分で１つ以上の転位器によって変化可能であり、少なくとも２つの部分の反応チャンバは互いに連通する。
【００２２】
反応チャンバ、第１表面、第２表面および／またはシステムの一部分である少なくとも１つの転位器は、本発明の装置で述べたようにして形成することができる。
【００２３】
一実施形態において、システムは、反応チャンバが弾性的に変形されたとき反応チャンバの容積を本質的に一定に保つことを可能にする１つ以上の手段をさらに含む。１つ以上の手段は反応チャンバの側面境界を定める弾性側壁を含むのが好ましい。
【００２４】
他の実施形態において、システムは検出システムをさらに含む。
【００２５】
システムは少なくとも２つの装置の反応チャンバの各々に連通するサンプル導入通路と、場合によって、２つ以上の反応チャンバ間に過渡的な流体連通を可能にする１つ以上の手段を含むのが特に好ましい。
【００２６】
さらに他の態様において、本発明は粒子の定性的および／または定量的検出方法に関し、検出される１種以上の粒子を含むと思われるサンプルを反応チャンバ中に配置すること、反応チャンバ内のサンプルの少なくとも一部を１つ以上の転位器によって転位すること、１種以上の粒子の存在および／または数を示す値を検出／判定することを含む。
【００２７】
分析すべきサンプルは生物サンプルであり、検出すべき１種以上の粒子は、原核生物細胞、真核生物細胞、およびウイルス粒子からなる群より選択されるのが好ましい。
【００２８】
好ましい実施形態において、サンプルを反応チャンバ内に配置することはこのサンプルを本発明による装置の反応チャンバ中に導入することを含む。
【００２９】
サンプルの少なくとも一部は、第１表面および／または第２表面の表面領域の１つ以上の部分で第１表面および／または第２表面へ１つ以上の転位器の少なくとも１つで圧力を加えることによって、好ましくは第１表面と第２表面の間の距離を変化させ、特に好ましくは縮小させることによって、転位することが好ましい。
【００３０】
本発明の方法の好ましい実施形態において、サンプルの少なくとも一部を転位した後に、縮小した距離は続いて再び拡大される。この距離の縮小および続く再拡大は繰り返し行うことができる。検出は第１表面と第２表面間の距離が縮小された後に行われるのが好ましい。
【００３１】
一実施形態において、本発明の方法は、複数の粒子を含むサンプルを反応チャンバ中に配置することと、反応チャンバ内のこの複数の粒子の部分集合を１つ以上の転位器によって転位することと、反応チャンバ内に転位された粒子の部分集合の数を示す１つ以上の値を求めることと、場合によって、検出の間に得た１つ以上の値から反応チャンバ中の複数の粒子の総数を計算することとを含む。
【００３２】
いくつかの実施形態において、方法は、検出を行う前に、各々１つ以上の検出可能な部分を含む１つ以上の薬剤を反応チャンバ中に配置／導入することをさらに含む。１つ以上の薬剤は核酸、ペプチド、プロテインドメイン、プロテイン、炭水化物、低分子量化学化合物、およびその類似品および／または混合物からなる群より選択され、検出すべき１つ以上の粒子に結合親和性を有する。
【００３３】
さらに他の態様において、本発明は、サンプルの複数の粒子を検出チャンバ内に配置することと、複数の粒子の適切な部分集合だけが残るように、複数の粒子のいくつかを検出チャンバから転位することと、複数の粒子の部分集合の粒子を光学的に検出することと、検出された粒子に基づいて、粒子の部分集合の粒子数を示す値を求めることとを含む方法に関する。
【００３４】
一実施形態において、方法は、適切な部分集合の粒子数を示す値に基づいてサンプル中の粒子の数または存在量の数を示す値を求めることをさらに含む。場合によって、この測定はさらに検出チャンバの検出容積のサイズに基づく。
【００３５】
好ましい実施形態において、方法はさらに、サンプルの複数の粒子を検出チャンバ内に配置して複数の粒子のいくつかを検出チャンバから転位するステップを繰り返すステップをＮＲ回繰り返すことを含み、いずれの場合にも、複数の粒子の適切な部分集合だけが残るようにされ、ＮＲ≧２の場合、ＮＲ繰り返し数のＮＤについては、複数粒子の部分集合の粒子を光学的に検出すること、および検出された粒子に基づいて、粒子の適切な部分集合の粒子数を示す値を求めることを含み、ＮＤ≧ＮＲである。
【００３６】
本発明の方法のさらに他の好ましい実施形態において、配置と転位のステップをＮＲ回繰り返すことは、ＮＲ回の繰り返しごとに、転位された複数粒子の少なくともいくつかを検出チャンバに再導入することを含む。
【００３７】
本発明の他の好ましい実施形態において、複数粒子のいくつかを転位することは、検出チャンバ容積の減少、すなわち、チャンバの第１壁と第２壁間の距離の縮小を含むことができる。
【００３８】
さらに他の実施形態において、本発明の方法は、サンプルの複数粒子を検出チャンバ内に配置すること、複数粒子の適切な部分集合だけが残るように複数粒子のいくつかを検出チャンバから転位すること、複数粒子の部分集合の粒子を光学的に検出すること、および粒子の部分集合中の目標粒子の存在を求めることを含む。
【００３９】
他の実施形態において、本発明の方法は、サンプルの第１の複数の粒子を検出チャンバ内に配置すること、検出チャンバの容積を減少させること、検出チャンバ内の粒子を光学的に検出すること、および検出された粒子に基づいて、検出チャンバ内に存在する粒子の数を示す値を求めること、検出チャンバの容積を増加させること、サンプルの第２の複数の粒子を検出チャンバ内に配置すること、検出チャンバの容積を減少させること、および検出された粒子に基づいて、検出チャンバ内に存在する粒子の数を示す値を求めることを含む。
【００４０】
さらに他の態様において、本発明は、複数の粒子を含むサンプルを受容するように構成された検出チャンバと、複数粒子の適切な部分集合だけが残るように検出チャンバから複数粒子のいくつかを転位するように構成されたアクチュエータと、粒子の部分集合の粒子を検出するように構成された検出器と、検出された粒子に基づいて、粒子の適切な部分集合の粒子数を示す値を求めるように構成されたプロセッサとを含む装置に関する。
【００４１】
装置は、アクチュエータを操作して、転位された複数粒子の少なくともいくつかを検出チャンバに再導入し、続いて、複数粒子の第２の適切な部分集合だけが残るように複数粒子のいくつかを検出チャンバから転位するように構成され、プロセッサは検出器を操作して第２の適切な部分集合の粒子を検出し、検出された粒子に基づいて粒子の第２の適切な部分集合の粒子の数を示す値を求めるように構成されるのが好ましい。
【００４２】
装置は、検出チャンバから転位された粒子を受容することのできる貯蔵器をさらに含み、その粒子から検出チャンバへ再導入することができる。
【００４３】
一実施形態において、プロセッサは検出された粒子に基づいて、粒子の部分集合の粒子中に目標粒子の存在を測定するように構成することができる。
【発明を実施するための最良の形態】
【００４４】
第１の態様において、本発明は粒子の定性的および／または定量的検出のための装置に関し、
（ａ）第１表面と第２表面の間のチャンバ本体内に形成され、第２表面が第１表面に対向して配置された反応チャンバと、
（ｂ）１つ以上の転位器と、を含み、
第１表面と第２表面の間の距離は、第１表面および／または第２表面の表面領域の少なくとも１つ以上の部分で１つ以上の転位器によって変化可能である。
【００４５】
本発明の範囲内において、「反応チャンバ」（本明細書において「反応空間」または「検出チャンバ」、または「チャンバ」とも呼ばれる）は第１表面と第２表面の間のチャンバ本体内に形成される空間を指す。反応チャンバは任意の基本的形状、例えば、円形、楕円形、正方形、矩形とすることができる。本発明の好ましい反応チャンバは、立方形または円筒形の三次元形状を有する。特に好ましい反応チャンバは（毛管）チャンネルとして構成される。場合によって、反応チャンバは、テーパーの付いた部分を含むことができる。例えば、反応チャンバは中央領域から一方または両方の終端領域へテーパーを付けることができる。反応チャンバは側壁によって側面境界が定められる。第２表面は第１表面に対向して、または実質的に対向して配置される。第１および第２表面は互いに平行または実質的に平行に配置される。
【００４６】
第１表面と第２表面間の距離は、反応チャンバに面する装置の第１表面の側と反応チャンバに面する第２表面の側の間の距離で画定され、反応チャンバの厚さとも呼ばれる。本発明によれば、反応チャンバの厚さは通常最大１ｃｍ、好ましくは最大５ｍｍ、特に好ましくは最大３ｍｍ、最も好ましくは最大１ｍｍである。
【００４７】
本発明のいくつかの実施形態において、反応チャンバは毛管間隙として設計され、これは第１表面と第２表面の間に働く毛管力によって充填することができる。通常、毛管間隙は最大１ｍｍ、好ましくは最大７５０μｍ、特に好ましくは最大５００μｍの厚さを有する。本発明の好ましい実施形態において、毛管間隙は３００μｍの厚さを有し、厚さ２００μｍがさらに好ましく、厚さ１５０μｍが特に好ましい。
【００４８】
本発明による分析装置において、第１表面と第２表面の間の距離は可変である。好ましい実施形態において、距離は０ｍｍ〜１ｍｍの範囲で可変である。第１表面と第２表面の間の距離のさらに好ましい下限は、５０μｍ〜２００μｍの範囲である。さらに好ましい上限は０．３ｍｍ〜０．５ｍｍの範囲である。
【００４９】
本明細書に用いられる用語「転位器」または「アクチュエータ」は、第１表面および／または第２表面の表面領域の少なくとも１つ以上の部分で第１表面と第２表面の間の距離が変化する際に、本発明の装置の反応チャンバ内、または反応チャンバの少なくとも１つ以上の部分内の溶液を転位するのに適した手段を指す。言い換えれば、本発明の転位器は、第１表面および／または第２表面、または互いに対してその少なくとも１つ以上の部分の縦の動きを可能にする手段であると定義することもできる。本明細書に用いられる用語「表面領域の少なくとも１つ以上の部分」は、転位器による第１表面と第２表面の間の距離の変化が必ずしも第１表面および／または第２表面の表面領域全体に起きる（すなわち、この表面の一方または両方の全体が互いに対して縦に動く）必要はなく、この表面の一方または両方の表面領域の少なくとも一部に局部的に制限され得る（すなわち、それぞれの表面の表面領域のこれらの１つ以上の部分だけが互いに対して縦に動き、それぞれの表面の表面領域の１つ以上の残りの部分の距離は実質的に一定に保たれる）と理解すべきである。本発明の好ましい実施形態において、特に好ましくはこの表面の一方または両方の少なくとも一部に圧力を加えることによって、第１表面および／または第２表面の間の距離は縮小される。
【００５０】
本発明による転位器は第１表面または第２表面の一体化された部分を構成することができ（本明細書において、「転位構造」とも呼ばれる）、または反応チャンバの外側に配置された独立の、すなわち内蔵式の本体（本明細書において「転位体」とも呼ばれる）を有することができる。転位器が転位構造、すなわち、第１表面または第２表面の一体化された部分として提供される場合、反応チャンバの内側に延在する凸状体として設計することができる。そのような凸状体は、本発明の方法を実施するとき反応チャンバ内の溶液の転位を起こさせるのに適した任意の形状を有することができる。そのような凸形状は、特に、窪み、隆起、バックル、およびふくらみを含み、ふくらみが好ましい。第１表面または第２表面の一体化された部分としての性質により、そのような転位構造はそれぞれの表面の残りまたは少なくともその一部と同じ材料から作ることができる。
【００５１】
本発明の他の実施形態において、転位器は第１表面または第２表面に一体化されないが、この表面のいずれか一方に対向して配置された独立の転位体を構成し、転位器は反応チャンバから離れて面するそれぞれの表面の側に配置される。いくつかの実施形態において、転位器は反応チャンバのそれぞれの表面に直角に配置される。そのような転位体は、本発明中で用いられるとき、反応チャンバ内の溶液の転位を起こさせるのに適した任意の形状を有することができる。そのような転位体の例は、特に、ヒトの指、棒、ピン、プランジャー、スパイク、サオ、タペット、およびステンシルを含み、最後の２つが特に好ましい。
【００５２】
本発明の範囲内で、装置は１つ以上の転位器を含むことができ、その全ては第１表面および／または第２表面の一体化された部分とすることができ、または転位体とすることができる。しかし、本発明の装置は少なくとも１つの転位体およびこの表面の１つに一体化された少なくとも１つの転位構造とすることも可能である。本発明の好ましい実施形態において、装置は２つの転位器を含む。他の実施形態において、装置は少なくとも３つの、少なくとも４つの、少なくとも８つの、または少なくとも１２の転位器を含む。
【００５３】
本発明の装置の転位器の全ては、第１表面または第２表面のいずれかに一体化されおよび／または対向して配置することができる。替わりに、装置は、この表面の両方に一体化されおよび／または配置された少なくとも２つの転位器を含むことも可能である。本発明の好ましい実施形態において、装置は第１表面および／または第２表面に対向して配置された単独の転位体型である少なくとも２つの転位器を含む。特に好ましい実施形態において、装置は２つの転位器を含み、両方の転位器は第１表面および／または第２表面のいずれかに対向して配置される。他の特に好ましい実施形態において、装置は同様に２つの転位器を含むが、１つの転位器は第１表面に対向して配置され、他の転位器は第２表面に対向して配置される。第３の好ましい実施形態において、異なる表面に対向して配置された２つの転位器は互いに対向して配置される。
【００５４】
転位器は、好ましくは第１表面および／または第２表面に、この表面間の距離に変化（すなわち、縮小）を起こさせる圧力を加えることによって、反応チャンバ内の溶液に少なくとも部分的な転位を起こさせるのに適した任意の材料から作ることができる。典型的に、転位器は非晶質材料から作られる。本明細書に用いられる用語「非晶質材料」は、原子の長い範囲で位置の規則性のない固体、すなわち、非結晶質材料を指す。そのような非晶質材料は中でも、酸化アルミニウムセラミックなどのセラミック材料、ボロフロートガラスなどのガラス、シリコーン、およびポリスチレンまたはポリテトラフロオロエチレン（Ｔｅｆｌｏｎ（登録商標））などの合成ポリマーを含む。場合によって、非晶質材料は光学的に透明、すなわち、光透過性とすることができる。適切な透明材料の例は、中でも、ガラスまたは窓ガラス、ボロフロートガラス、石英ガラス、トパーズガラス、サファイアガラスなどのガラス状材料、ならびにポリメチルメタクリレート、ポリカーボネート、ポリスチレン、またはアクリルなどの合成ポリマーを含む。本発明の装置が１つ以上の転位器を含む場合、それらの全ては同じ材料から作ることができ、またはそれらの少なくとも１つは異なる材料から作ることができる。
【００５５】
本発明の好ましい実施形態において、１つ以上の転位器の少なくとも１つは弾性的に変形可能な材料、すなわち、変形された後に、さらに外部操作を行うことなく独立に少なくとも実質的にその元の形状に復元する材料からつくることができる。場合によって、本発明によるそのような弾性的に変形可能な材料は、生物学的／化学的に不活性であり（すなわち、化学試薬および／または生物学的試薬に対して反応性がないか非常に低い）、光学的に透明および／または非自己蛍光であることがさらに好ましい。そのような材料の例は、中でも、シリコーンエラストマー、ポリウレタン、リン酸トリエチル、アクリル樹脂、およびアクリル酸塩、を含み、シリコーンエラストマーが特に好ましい。シリコンエラストマーは主として架橋したシリコーンポリマーから構成される。これらのポリマーは化学式［Ｒ２ＳｉＯ］ｎのＳｉ−Ｏ−主鎖を有し、式中、Ｒはメチル、エチル、フェニルなどの有機側基を表し、２つ以上のポリマーを架橋するのに使用することができる。Ｓｉ−Ｏ−主鎖の長さ、側基、架橋を変化させることによって、シリコーンは広範囲の特性および組成物で合成することができる。それらは液体からゲル、ゴム、硬質プラスチックへ矛盾なく変化することができる。最も一般的な種類は線状ポリジメチルシロキサンである。シリコーン材料の他の群はシリコーン樹脂に基づき、これは分岐およびカゴ状オリゴシロキサンによって形成される。特に好ましい実施形態において、弾性的に変形可能な材料は、シリコーンゴムおよびシリコーン油からなる群より選択される。さらに適切な材料は、パラゴム樹（Ｈｅｖｅａ ｂｒａｓｉｌｉｅｎｓｉｓ）から抽出される天然ゴム、ならびに例えば、イソプレン、（２−メチル−１，３−ブタジエン）、２−クロロ−１，３−ブタジエン、および架橋のための少量パーセントのイソプレンを備えるメチル−プロペンを含み、さまざまなモノマーの重合によって作ることのできるさらに他の合成ゴム（通常合成ゴムと呼ばれる）を含む。適切な合成ゴムの例は、中でも、スチレン−ブタジエンゴム、アクリロニトリル−ブタジエンゴム、ウレタンゴム、ポリエステルゴム、クロロプレンゴム、ブチルゴム、エピクロロヒドリンゴム、およびフォスファゼンゴムを含む。
【００５６】
本発明のいくつかの実施形態において、第１表面および／または第２表面は検出が行われる表面領域、すなわち検出領域（本明細書において「検出ゾーン」と呼ばれる）を含む。すなわち、分析すべき１種以上の粒子の定性的および／または定量的検出は、この表面の一方または両方のいずれかの個別の表面領域に限定され、例えば、粒子の検出および／または計数は、多分に、用いられる検出システムの空間的制約のため、第１表面および／または第２表面の中央部分だけで行うことが可能である。第１表面および／または第２表面の検出領域によって制限される反応チャンバの区画の容積は、定量的分析を可能にするために知られていることが好ましい。本発明のいくつかの実施形態において、第１表面と第２表面間の「検出領域」は、反応チャンバの中央に配置されるのが好ましい毛管間隙として設計され、この領域の表面間の距離は、場合によって反応チャンバの残りの部分の距離よりも短くすることができる。
【００５７】
本発明の他の実施形態において、第１表面および／または第２表面の少なくとも１つ以上の部分は弾性的に変形可能である。すなわち、それぞれの表面の１つ以上の部分は弾性的に変形可能な材料、例えば、１つ以上の転位器に関して上述した弾性膜から作られる。本発明による特に好ましい弾性膜はシリコーンゴムから作られる。したがって、一実施形態において、第１表面および／または第２表面の表面領域全体が弾性的に変形可能な材料から作ることができる。本発明の一実施形態において、反応チャンバ全体、すなわち、第１表面、第２表面、および側壁は弾性的に変形可能である。第１表面および／または第２表面の少なくとも１つ以上の弾性的に変化可能な部分は１つ以上の転位器に対向して配置されることが好ましい。したがって、転位器に対向して配置された本発明の装置の表面領域全体は弾性的に変形可能とすることができる。しかし、転位器に対向して配置されたそのような表面領域の少なくとも１つが弾性的に変形可能ではないことも可能である。本発明の好ましい実施形態において、第１表面および／または第２表面の少なくとも１つ以上の弾性的に変形可能な部分は検出が行われるそれぞれの表面領域とは異なる。
【００５８】
本発明によれば、第１表面および第２表面は同じ材料または異なる材料から作ることができる。さらに、第１表面および／または第２表面は、それぞれの表面領域の残りとは異なる材料から作られた表面領域を含むことも可能である。例えば、第１表面および／または第２表面の中央、場合によって矩形（ｒｅｃｔａｎｇｕｌａｒ）の表面領域などの１つの表面領域（すなわち、「窓」）が、透明材料から作られ、それぞれの表面領域（すなわち、「境界」）の残りが不透明材料から作られる。そのような透明な材料の「窓」は検出が行われる表面領域内に配置されることが好ましい。
【００５９】
本発明による装置の第１表面および／または第２表面の少なくとも一部は非晶質材料から作ることができる。本明細書に用いられる用語「非晶質材料」は、原子の長い範囲で位置の規則性のない固体、すなわち、非結晶質材料を指す。そのような非晶質材料の例は、中でも、酸化アルミニウムセラミックなどのセラミック材料、ボロフロートガラスなどのガラス、シリコーン、およびポリスチレンまたはポリテトラフロオロエチレン（Ｔｅｆｌｏｎ（登録商標））などの合成ポリマーを含む。
【００６０】
本発明の好ましい実施形態において、第１表面および／または第２表面の少なくとも一部は透明材料、すなわち、光透過性材料から作られる。適切な透明材料の例は、中でも、ガラスまたは窓ガラス、ボロフロートガラス、石英ガラス、トパーズガラス、サファイアガラスなどのガラス状材料、ならびにポリメチルメタクリレート、ポリカーボネート、ポリスチレン、またはアクリルなどの合成ポリマーを含む。
【００６１】
本発明による装置は、反応チャンバの第１表面および／または第２表面上に配設されたマイクロアレイ（本明細書において「アレイ」または「アレイ素子」とも呼ばれる）をさらに含むことができる。本明細書に用いられる「マイクロアレイ」は、支持体（「サブストレート」とも呼ばれる）上の捕捉分子（例えば、１種以上のプローブ分子または物質ライブラリー）が画定された空間的配置（レイアウト）を指し、マイクロアレイ内の各分子の位置は個別に求められる。マイクロアレイは特定のパターンに配置することのできる画定された部位または所定の領域、すなわち、いわゆるアレイ素子またはアレイ点を含むことが好ましく、各アレイ素子は１種の捕捉分子だけを含むことが好ましい。支持体上の捕捉分子の配置は共有反応または非共有反応によって生成することができる。マイクロアレイのための適切なサブストレートは、中でも顕微鏡スライド、ウェハ、またはセラミック材料を含む。しかし、捕捉分子は第１表面および／または第２表面上に直接不動化することもできる。
【００６２】
本発明による装置は、第１表面と第２表面の間の距離が縮小されるとき、反応チャンバの容積を本質的に一定に保つことの可能な１つ以上の手段をさらに含むことができる。すなわち、補償ゾーン（または「貯蔵器」）が提供され、この表面間の距離が縮小されるとき、第１表面と第２表面の間の反応チャンバ中に存在する任意の液体材料を転位することができる。本明細書に用いられる用語「本質的に一定」は、第１表面と第２表面の間の距離が縮小される際に、「圧縮された」状態の反応チャンバの容積が「圧縮されない」状態の元の容積と正確に同じではないことを理解すべきである。「圧縮された」状態の反応チャンバの容積は、「圧縮されない」状態の少なくとも９０％であることが好ましく、少なくとも９５％であることが特に好ましい。本発明のいくつかの実施形態において、検出可能な部位（すなわち、標識）または緩衝剤を含む薬剤など、本発明の方法を実施するために必要な任意の試薬は、好ましくは乾燥した形（例えば、粉体、顆粒またはペレットなど凍結乾燥された形）で補償ゾーンまたは貯蔵器に提供される。
【００６３】
これは弾性材料から作られた側壁によって側面境界が定められた反応チャンバを提供することによって達成されることが好ましい。本発明によれば、１つ以上の側面側壁は弾性材料から作ることができる。特に好ましい弾性材料はシリコーンゴムである。
【００６４】
いくつかの実施形態において、本発明の装置は、チャンバ本体をさらに含む。本明細書に用いられる用語「チャンバ本体」は、反応チャンバを取り囲む固体本体を指すものと理解すべきであり、第１表面、第２表面、および側面側壁によって形成される。
【００６５】
第１表面、第２表面、および１つ以上の側面側壁はチャンバ本体の一体化された部分とすることができる。すなわち、チャンバ本体の一体化された部分であるそれぞれの表面はチャンバ本体と同じ材料から作ることができる。替わりに、１つ以上の第１表面、第２表面、および／または１つ以上の側面側壁は、それぞれ、チャンバ本体とは他の材料から作ることができる。したがって、本発明の範囲内で、反応チャンバを画定する４つの表面全てを同じ材料から作ること、２つまたは３つの表面は同じ材料から作られるが、残りの表面は異なる材料から作られ、または各表面が異なる材料から作ることが可能である。
【００６６】
反応チャンバの境界を定める第１表面および／または第２表面および／または１つ以上の側面側壁は、１つ以上の開口部をさらに含むことができ、これらは閉止可能および／または封止可能であり、分析すべきサンプル、ならびに、場合によって、本発明の方法の実施に必要とされる任意の追加の試薬、検出薬剤などを直接導入するために用いることができる。替わりに、そのような開口部は、中でも、充填ユニット、処理ユニット、温度制御ユニット、特定の（すなわち、複雑な）検出ユニット、および廃棄物容器など、チャンバ本体の一体化された部分として設計されなかった、装置の任意の追加（補足）のモジュールを取り付けるために用いることもできる。反応チャンバと１つ以上のそのような追加のモジュールの間の接続は、中でも、剛性または可撓性チューブ、ノズル、カニューレ、針などの１つ以上を用いることによって達成することができ、これらは、反応チャンバおよび追加のモジュールに、それぞれ、中でも、圧入（「ルアーシステム」とも呼ばれる）またはツイストオン固定（「ルアーロックシステム」とも呼ばれる）によって取り付けることができ、ツイストオン固定が好ましい。両方のシステムは当分野で十分に確立されており、市場で入手可能である。
【００６７】
チャンバ本体は少なくとも部分的に非晶質材料、特に透明材料から作られることが好ましい。適切な材料は、中でもガラス、Ｍａｃｒｏｌｏｎ（商標）、ナイロン、ポリメチルメタクリレート、Ｔｅｆｌｏｎ（登録商標）などの合成材料、および高級鋼、アルミニウム、ブラスなどの金属を含む。いくつかの実施形態において、チャンバ本体は導電性材料から作られ、５〜３０％の炭素繊維を有するポリアミド、５〜３０％の炭素繊維を有するポリカーボネート、２〜２０％のステンレス鋼繊維を有するポリアミド、および５〜４０％の炭素繊維を有するポリフェニレンスルフィドからなる群より選択されることが好ましい。
【００６８】
本発明による装置は典型的に単独（すなわち、個別の）本体として操作される。しかし、１つのサンプルを並行して複数の分析を行うために、２つ以上のそのような装置を分離した反応チャンバを含む複式（ｍｕｌｔｉｐａｒｔ）システムに組み立てることも可能であり、上述の装置は複式システムの一部またはユニットまたは本体に相当する。したがって、さらに他の態様において、本発明は、少なくとも２つの部分を含み、この少なくとも２つの部分の各々が第１表面と第１表面に対向して配置された第２表面の間のチャンバ本体内に形成された反応チャンバと、１つ以上の転位器とを含むステムに関し、第１表面と第２表面の間の距離は、第１表面および／または第２表面の表面領域の少なくとも１つ以上の部分で１つ以上の転位器によって変化可能である。システムの少なくとも２つの部分の反応チャンバは互いに連通することができる。
【００６９】
本明細書に用いられる用語「互いに連通する」は、共通のサンプル導入通路などの追加の手段による、個別の反応チャンバ、充填ユニット、処理ユニットなどの間の直接または間接的なあらゆる相互接続を指す。しかし、本明細書に用いられる用語は、サンプルを導入した後、反応チャンバが互いに恒久的に流体連通していることを必ずしも意味しない。
【００７０】
好ましい実施形態において、システムは、少なくとも２つの装置の反応チャンバの各々と連通するサンプル導入通路をさらに含む。サンプル導入通路（本明細書において、「サンプル充填ゾーン」または「サンプル領域」とも呼ばれる）は、上述のように、分析すべきサンプルを導入するための１つ以上の閉止可能（ｌｏｃｋａｂｌｅ）なおよび／または封止可能な開口部を含むことができる。サンプル導入通路は、それぞれの反応チャンバがそこから分岐するチャンバとして構成することができる。サンプル導入通路と反応チャンバを接続する開口部は、同様に閉止可能および／または封止可能とすることができる。特に、サンプルをそのような複式システムの分離した反応チャンバに導入した後、さまざまな試薬（捕捉分子、標識など）を含む異なる反応チャンバからのサンプル溶液の混合を招き、したがって並行して実施すべき複数の個別の分析物の適切な検出を妨げる反応チャンバから共通のサンプル導入通路への液体の逆流を防止することが好ましい。
【００７１】
したがって、本発明のさらに他の好ましい実施形態において、システムは少なくとも２つの反応チャンバ間の過渡的な流体連通を可能にする１つ以上の手段をさらに含む。サンプル導入通路から分離した反応チャンバへ逆方向ではなく一方向流体連通だけが可能であることが特に好ましい。これはサンプル導入通路と反応チャンバ間の接続に、反応チャンバからのサンプルの逆流を防止する一方向弁を提供することによって達成されることが好ましい。
【００７２】
本発明の好ましい実施形態において、装置は反応チャンバに接続された検出システムをさらに含む。検出システムは、第１表面および／または第２表面に対向して配置されるのが好ましく、場合によって検出が行われる特定の表面領域に配置される。
【００７３】
適切な検出システムの選択は、場合によって検出に用いられる追加の薬剤（例えば、染料または標識）の存在または検出すべき粒子の種類など、いくつかのパラメーターによる。さまざまな光学的および非光学的検出システムは当分野では十分確立されている。本発明で用いることのできる検出システムの一般的な説明は、例えば、Ｌｏｔｔｓｐｅｉｃｈ，Ｆ．、およびＺｏｒｂａｓ Ｈ．（１９９８）、Ｂｉｏａｎａｌｙｔｉｋ，Ｓｐｅｋｔｒｕｍ Ａｋａｄｅｍｉｓｃｈｅｒ Ｖｅｒｌａｇ，Ｈｅｉｄｅｌｂｅｒｇ／Ｂｅｒｌｉｎ，Ｇｅｒｍａｎｙ、特に２３．３章および２３．４章に見ることができる。
【００７４】
本発明の好ましい実施形態において、検出システムは光学的検出システムである。一般に、本発明による方法の実施は、複雑な設備の使用を必要とせず、好ましくは蛍光、光学吸収、共鳴伝導などのパラメーターの測定に基づく簡単な検出システムを含む。
【００７５】
本発明による特に好ましい実施形態は、濁度計、比濁計（概観するには、例えば、Ｔｉｆｆａｎｙ，Ｏ．（１９８６）Ｆｌｕｏｒｏｍｅｔｒｙ，ｎｅｐｈｅｌｏｍｅｔｒｙ，ａｎｄ ｔｕｒｂｉｄｉｍｅｔｒｙ，ｉｎ Ｔｉｅｔｚ，Ｎ．Ｏ．（ｅｄ．）Ｔｅｘｔｂｏｏｋ ｏｆ Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ．ＷＢ Ｓａｕｎｄｅｒｓ Ｃｏ．，Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ，ＰＡ，ｐｐ．７８−９７参照）などの吸収測定に基づき、これは当分野において確立された光度計装置で達成することができる。両方の方法は、それぞれ光の透過または散乱の際のこの濁度効果の測定に基づいて溶液中の「曇り」または濁度の測定を可能にする。液体の濁度はその中に懸濁する粒子の存在によって起きる。光のビームが濁ったサンプルを通過すると、その強度が低下する。濁度計は非散乱光、すなわち、粒子の濁った溶液を透過する光の測定を指し、標準的な光度計を用いて行うことができる。他方、比濁計は、（側面）散乱光の測定である。この技術は、検出器が入射光ビームに対して所定角度で設定される特別な装置が必要である。
【００７６】
また、フルオロフォアで標識を付けたスペクトル的に励起された粒子の蛍光強度の比較に基づく検出システムは、本発明で好ましく用いられる。蛍光は、特定の波長の光で励起されたとき、特性的な吸収および放射挙動を起こすそれら自体の光を放射する特定分子の能力である。特に、蛍光信号の定量的検出は、蛍光顕微鏡の改良された方法によって行われる（概観するには、Ｌｉｃｈｔｍａｎ，Ｊ．Ｗ．，ａｎｄ Ｃｏｎｃｈｅｌｌｏ，Ｊ．Ａ．（２００５）Ｎａｔｕｒｅ Ｍｅｔｈｏｄｓ ２，９１０−９１９；Ｚｉｍｍｅｒｍａｎｎ，Ｔ．（２００５）Ａｄｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｅｎｇ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．９５，２４５−２６５を参照されたい）。それによって、それぞれ光吸収および光放射から得られる信号は１つ以上のフィルタおよび／または二色性結晶（ｄｉｃｈｒｏｉｔｅｓ）によって分離され、適切な検出器上に画像が形成される。データ解析はデジタル画像処理によって行われる。
【００７７】
画像処理は当分野によく知られているいくつかのソフトウェアパッケージ（Ｍａｔｈｅｍａｔｉｃａ Ｄｉｇｉｔａｌ Ｉｍａｇｅ Ｐｒｏｃｅｓｓｉｎｇ，ＥＩＫＯＮＡ、またはＩｍａｇｅ−ＰＲＯなど）で達成することができる。本発明は、反応チャンバからいかなる溶液の除去および／または転位（ｒｅｐｌａｃｅｍｅｎｔ）もしないで実施する（すなわち、検出は任意の拘束されない標識の存在中で実施され、不特定の信号バックグラウンドを発生させる）ことを意図するので、バックグラウンドノイズの補正を効率的かつ正確に可能にする画像処理ソフトウェアを使用することが好ましい。特定の信号の検出は信号の強度の相違を測定することによるだけではなく、やはり検出すべき粒子の形状によって決定される検出すべき信号の「形状」などの追加のパラメーターを同時に考慮することによって達成されることが特に好ましい。例えば、蛍光抗体で標識を付けた円形状の細胞などの円形粒子は、光学的検出中に記録された画像中の「円形信号」をもたらす。そのような目的に適した好ましいソフトウェアはＩｃｏｎｏｃｌｕｓｔソフトウェア（Ｃｌｏｎｄｉａｇ Ｃｈｉｐ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ ＧｍｂＨ，Ｊｅｎａ，Ｇｅｒｍａｎｙ）である。
【００７８】
本発明に用いることのできる他の光学検出システムは、共焦点蛍光顕微鏡とすることができ、対象物は点光源によってレンズの焦点面で照明される。点光源、対象物、および点光検出器は光学的な共役面に配置されることが重要である。そのような共焦点システムの例は、例えば、Ｄｉａｓｐｒｏ，Ａ．（２００２）Ｃｏｎｆｏｃａｌ ａｎｄ ２−ｐｈｏｔｏｎ−ｍｉｃｒｏｓｃｏｐｙ：Ｆｏｕｎｄａｔｉｏｎｓ，Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ ａｎｄ Ａｄｖａｎｃｅｓ，Ｗｉｌｅｙ−Ｌｉｓｓ，Ｈｏｂｒｏｋｅｎ，ＮＪに詳細が記載されている。本発明の蛍光光学システムは、自動焦点ではなく、例えば固定焦点の蛍光顕微鏡であるのが特に好ましい。
【００７９】
本発明による代替の装置において、分析物の電気化学的検出を行う手段は、例えば、第１表面および／または第２表面に接続された電極による酸化還元電位の変化の測定（例えば、Ｚｈｕ，Ｘ．ら（２００４）Ｌａｂ Ｃｈｉｐ．４，５８１−５８７参照）またはサイクリックボルトメトリー（例えば、Ｌｉｕ，Ｊ．ら（２００５）Ａｎａｌ．Ｃｈｅｍ．７７、２７５６−２７６１；およびＷａｎｇ，Ｊ．（２００３）Ａｎａｌ．Ｃｈｅｍ．７５，３９４１−３９４５参照）によって提供される。さらに、電気的検出を行う手段は、例えば、インピーダンス測定によって提供することも可能である（例えば、Ｒａｄｋｅ，Ｓ．Ｍ．ら（２００５）Ｂｉｏｓｅｎｓ．Ｂｉｏｅｌｅｃｔｒｏｎ．２０，１６６２−１６６７参照）。
【００８０】
典型的に、本発明による装置およびシステムは内蔵式である。すなわち、分析の実施中に必ずしもサンプルおよび／または反応チャンバ中のいかなる他の試薬の取り出しおよび／または転位を必要としない。したがって、本発明による装置およびシステムの好ましい実施形態はサンプル入口を含むが出口を含まない。
【００８１】
さらに他の態様において、本発明は、
（ａ）検出すべき１種以上の粒子を含むと思われるサンプルを反応チャンバ中に配置することと、
（ｂ）反応チャンバ内のサンプルの少なくとも一部を１つ以上の転位器によって転位することと、
（ｃ）１種以上の粒子の存在および／または数を示す値を検出／判定することとを含む、粒子の定性的および／または定量的検出の方法を提供する。
【００８２】
本発明の好ましい実施形態において、「サンプルを反応チャンバに配置する」は、このサンプルを上述の本発明の装置またはシステムの反応チャンバ中に導入することを含む。
【００８３】
本発明のさらに他の特に好ましい実施形態において、方法は、
（ａ）複数の粒子を含むサンプルを反応チャンバ中に配置することと、
（ｂ）反応チャンバ内のこの複数の粒子の部分集合を１つ以上の転位器によって転位することと、
（ｃ）ステップ（ｂ）で転位された粒子の部分集合の数を示す１つ以上の値を測定することとを含む。
場合によって、方法は、
（ｄ）ステップ（ｃ）で得られた１つ以上の値から、反応チャンバ中の複数の粒子の総数を計算することをさらに含む。
【００８４】
本発明のいくつかの実施形態において、ステップ（ｃ）の定量的検出／判定は、サンプル中の１種以上の粒子の計数、例えば、生物学的サンプルの細胞の計数を含む。
【００８５】
本明細書に用いられる用語「サンプル」は、本発明による装置を用いて分析され、検出すべき１種以上の粒子を含むと思われる液体を指す。分析すべきサンプルは生物学的サンプルであることが好ましい。本発明を用いて分析することのできる液体サンプルの例は、中でも、有機および無機化学溶液、飲料水、下水、全血液、血漿、血清、尿、唾液、サルビアまたは髄液などのヒトまたはヒト以外の体液、動物からの細胞抽出物、植物または組織培養物、原核生物細胞および真核生物細胞懸濁物、ファージ製剤などを含む。サンプルは、希釈剤、溶剤、または場合によって反応チャンバ中へ導入（配置）する前にサンプルの精製および／または処理から得ることのできる緩衝剤などの１つ以上の追加の薬剤をさらに含むことができる。
【００８６】
分析すべきサンプルは本発明を実施するとき、検出すべき１種以上の粒子を含むことができる。本明細書に用いられる用語「粒子」は、本発明の方法を実施することによってその検出が可能な、特定の結合挙動および／または特有の反応性を有する任意のものを指す。したがって、用語「粒子」は、文字通り細胞またはウイルスなどの「真の」粒子であると解釈されるだけでなく、検出すべき分子、特に、核酸、タンパク質、脂質、および炭水化物などの（生物学的）巨大分子、ならびに分析すべきサンプルに存在しまたは加えられたあらゆる（合成）粒子に対して結合親和性を有する類似物および／またはその混合物を含むものと理解すべきである。
【００８７】
用語「粒子」に伴って本明細書に用いられる用語「種」は、特定の種類の粒子、すなわち、例えば特定の種類の細胞または特定のファージを指す。したがって、用語「１種以上の」は１つ以上の異なる種類の細胞など、１つ以上の異なる種類の粒子を指す。
【００８８】
本発明による「真の」粒子は、天然ならびに合成粒子を含む。そのような天然粒子の例は、中でも、原核生物細胞（例えば、大腸菌または枯草層などのバクテリア細胞）、真核生物細胞（例えば、サッカロマイセスセレヴィシエなどのイースト細胞、Ｓｆ９またはＨｉｇｈ５細胞などの昆虫細胞、ＨｅＬａまたはＣｏｓ細胞などの不動化細胞ライン、および哺乳動物血液細胞などの一次細胞）またはウイルス（例えば、Ｍ１３またはＴ７ファージなどのファージ粒子）を含む。合成粒子の例は、中でも、場合によって本発明によって検出すべき１種以上の分子でコーティングされた（常磁性）ポリスチレンビーズおよびラテックスビーズ、特に核酸、タンパク質、脂質、または炭水化物など１種以上の（生物学的）巨大分子を含む。
【００８９】
分析すべきサンプルは、第１表面、第２表面および／または１つ以上の側面側壁に存在する閉止可能および／または封止可能な１つ以上の開口部を経由して、反応チャンバ中に直接導入することができる。サンプルは、場合によって追加の試薬と一緒に、適切な圧力発生手段、例えば、ピペット、注射器、または例えば、処理装置の機能ユニットとすることのできる自動化ユニットを用いて反応チャンバ中に移動することができる。替わりに、例えば、反応チャンバを画定する任意の表面に存在する開口部の１つにサンプルを隣接させて配置することによって、外部操作なしで毛管力によってサンプルを反応チャンバ中に導入することもできる。
【００９０】
本発明の方法の特定の実施形態において、サンプルは１つ以上の転位器を操作することによって発生した負の圧力によって反応チャンバ中に導入される。この実施形態において、最初に、すなわち、サンプルを加える前に、反応チャンバの少なくとも１つ以上の部分の第１表面と第２表面間の距離、または言い換えれば、第１表面および／または第２表面の表面領域の少なくとも１つ以上の部分の距離は、１つ以上の転位器によって第１および／または第２表面に向かって圧力を加えることによって縮小する。距離はゼロまたはほとんどゼロの値に向かって縮小することが好ましい。次いで、この縮小した距離は、転位器を再設定することによって（すなわち、それを後方向に動かすことによって）好ましくは初期の値まで再び拡大され、したがって反応チャンバ内に負の圧力が発生し、したがって、サンプルは反応チャンバ中に導入される。
【００９１】
本発明の方法は、方法を実施する間、反応チャンバ中のサンプルおよび／または他のいかなる試薬の除去および／または転位を必要とせずに行うことが意図される。特に、例えば、用いられる検出方法の信号対ノイズ比を向上させるために、そのような除去／転位に必要な水洗または洗浄ステップを必要としないことは本発明の方法の利点である。しかし、いくつかの用途は、対象粒子のさらに他の検出を可能にするために、反応チャンバ中への追加の試薬、例えば任意の標識を含む１つ以上の薬剤の導入を必要とする。そのような追加の溶液も、上述のように、サンプルの導入前、またはサンプルと同時に、またはサンプルが反応チャンバ中に導入された後に直接反応チャンバ中に導入することができる。好ましい実施形態において、追加の試薬は特に粉、顆粒、またはペレットなどの凍結乾燥／乾燥形状でサンプルを加える前に装置内（例えば、補償ゾーン中）に提供される。
【００９２】
替わりに、分析すべきサンプル、および場合によってさらに他の試薬の導入は１つ以上の充填ユニットによって間接的に可能である。
【００９３】
本発明の範囲内で、「充填ユニット」は、本発明の装置の一体化された部分、または充填するための反応チャンバにそれを取り付けて、使用後に取り外すことのできる分離した部分として設計することのできる反応チャンバの充填手段を意味する。本発明で分析すべき液体サンプルを保持することができ、反応チャンバに（可逆的に）接続することのできる任意の容器を充填ユニットとして用いることができる。反応チャンバと充填ユニット間の接続は、中でも、管、ノズル、カニューレ、針など、既に上述した手段によって達成することができる。所与のサンプルは、反応チャンバへの直接導入について上述したように同様に充填ユニットの１つ以上の閉止可能および／または封止可能な開口部中に導入することができる。
【００９４】
特定の実施形態において、装置の反応チャンバに充填ユニットを接続するために１つ以上のカニューレが用いられる。用いられるカニューレは反応チャンバに含まれる１つ以上の開口部の閉止および／または封止を貫通する。本発明に用いられる好ましいカニューレは、高級鋼または合成ポリマーから作られ、通常０．０５ｍｍ〜２ｍｍの直径を有する。好ましくは、２つのカニューレが配置され、１つがサンプルを反応チャンバ中に導入するために用いられ、他の１つは過剰のガス状材料および／または余剰の液体を反応チャンバから取り出すために用いられる（詳細の説明は、その関連内容が本明細書に完全に参照されている国際公開第０１／０２０９４号を参照されたい）。
【００９５】
充填ユニットは一体化された、または取り外し可能な分離した廃棄物容器を含むことができ、反応チャンバからの余剰媒体を取り出す働きをする。場合によって、廃棄物容器は、さらに可逆的または非可逆的に余剰物質と結合するガス状、液体、中でも、セルロース、フィルタ材料、およびシリカゲルなどの固体充填媒体を含む。さらに、廃棄物容器は１つ以上の空気孔を含むことができ、または、廃棄物容器への余剰材料の移動を向上するためにその内部に真空を与えることができる。
【００９６】
充填ユニットは、充填ユニットが反応チャンバのそれぞれの取り付け部位に正確に嵌合する、すなわち、充填ユニットが反応チャンバに対して正確に配置され、閉止可能および／または封止可能な開口部などの好ましい部位で、１つ以上のカニューレ、ノズルなどによって充填ユニットを反応チャンバに接続することを可能にする機械的手段をさらに含むことができる。そのような機械的手段は、中でも、特別に設計されたスナップ固定具またはスプリング固定具を含む。機械的手段は、サンプル、および場合によって任意の試薬を反応チャンバ中へ導入した後、充填ユニットの取り外しが可能であることが好ましい。
【００９７】
本発明の一つの利点は、１０μｌ未満の容積のサンプルを分析できることである。典型的に、サンプル容積は１〜１，０００μｌ、好ましくは１〜１００μｌ、さらに好ましくは１〜２５μｌ、最も好ましくは１〜５μｌの範囲である。
【００９８】
本発明の装置および方法は、水洗および洗浄ステップの実施を必要とせずに所与のサンプル中の任意の粒子の定性的および／または定量的検出が可能なように特別に設計されるので、分析すべきサンプルは他に精製を必要とせずに反応チャンバに導入することができる。しかし、場合によって、例えばさらに他の検出を妨害する可能性のあるあらゆる原料汚染物を除去するために、少なくとも部分的にサンプルを精製することが好ましい。そのようなサンプルの（部分的な）精製は異なる方法によって、例えば、それを反応チャンバへ導入する前にサンプルを濾過することによって達成することができる。
【００９９】
さらに、本発明の装置の反応チャンバ全体へのサンプルの拡散を妨げる比較的高い粘度のため、分析すべきサンプルの希釈が必要であり得る。サンプルの拡散はサンプルに希釈剤を加えることによって容易に達成することができる。適切な希釈剤の例は、中でも、水、有機および無機溶媒、リン酸緩衝食塩水などを含む。希釈剤はサンプルを装置へ導入する前に加えることができ、または上述のように、充填ユニットおよび／または反応チャンバに直接加えることができる。
【０１００】
サンプルおよび場合によって任意の追加の試薬を反応チャンバに導入した後、または１つ以上の充填ユニットから反応チャンバ中に移動した後、場合によってサンプルは反応チャンバ中で所与の時間インキュベートして反応空間全体に適切に拡散させることができる。典型的に、インキュベーション期間は１秒〜３０分間、好ましくは１０秒〜１５分間、特に好ましくは３０秒〜１０分間の範囲である。
【０１０１】
いくつかの好ましい実施形態において、本発明による方法は、ステップ（ｂ）を行う前に、各々１つ以上の検出可能な部分を含む１つ以上の薬剤を装置の反応チャンバ中へ導入することをさらに含む。すなわち、１つ以上の検出可能な部分を含む薬剤はサンプルを導入する前、または上述のように、サンプルが直接または充填ユニットを経由して導入された後に、サンプルと同時に反応チャンバ中に導入することができる。
【０１０２】
本明細書に用いられる用語「１つ以上の検出可能な部分を含む薬剤」は、化学的、物理的または酵母反応中に、直接または間接的に検出可能な化合物または信号を発生する１つ以上の適切な化学物質または酵素（すなわち、１つ以上の「部分」）を含む任意の化合物を指す。したがって、そのような薬剤は、この粒子との相互作用の形成可能性によって、１種以上の対象粒子の検出に必要であり、または検出を容易にする。
【０１０３】
本明細書に用いられる用語は、検出可能なマーカー（「標識」とも呼ばれる）ならびに１つ以上のそのような検出可能なマーカーに結合した任意の化合物などの両方を含むものと理解すべきである。
【０１０４】
好ましい実施形態において、１つ以上の薬剤は、核酸、ペプチド、プロテインドメイン、プロテイン、炭水化物、低分子量化学化合物、およびその類似品および／または混合物からなる群より選択される。
【０１０５】
本発明で用いることのできる核酸の例は、デオキシリボ核酸（ＤＮＡ）またはリボ核酸（ＲＮＡ）などの天然核酸、ならびに、中でも、ペプチド核酸（ＰＮＡ）または固定核酸（ＬＮＡ）などの核酸類似物を含む。天然核酸の特定な例は、ゲノムＤＮＡまたはｃＤＮＡ分子などのＤＮＡ配列、ならびにｈｎＲＮＡまたはｍＲＮＡ分子などのＲＮＡ配列、またはその逆補完核酸配列を含む。そのような核酸は任意の長さとすることができ、単一ストランドまたは二重ストランド分子のいずれかとすることができ、単一ストランド分子が好ましい。典型的に、本発明に用いられるそのような核酸は長さ１０〜１０００ベース、好ましくは１５〜５００ベース、さらに好ましくは２０〜１００ベース、特に好ましくは２０〜４０ベースである。
【０１０６】
本発明による薬剤として用いることのできるペプチド、プロテインドメイン、またはプロテインは、天然、ならびに例えば、組み換えＤＮＡ技術によってまたは化学合成によって人工的に設計された分子を含む。そのようなプロテイン系分子の設計および調製の方法は、当分野に十分確立されている（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ，Ｊ．ら（１９８９）Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ，Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，２ｎｄ ｅｄ．，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹを参照されたい）。典型的に、本発明のペプチド薬剤は長さ２〜２００アミノ酸、好ましくは２〜１００アミノ酸、さらに好ましくは５〜５０アミノ酸、特に好ましくは１０〜２５アミノ酸である。
【０１０７】
本明細書に用いられる用語「プロテインドメイン」は、リガンド結合または触媒活性などを示す特定の機能に関して定義されるポリペプチド配列の一部を指す。そのようなプロテインドメインの好ましい例は、中でも、抗体のファブフラグメント、Ｇ−プロテイン結合受容体、受容体チロシンキナーゼまたは核受容体などの細胞受容体のリガンド結合ドメイン、およびレクチンの炭水化物結合ドメインである。
【０１０８】
本発明の薬剤として使用できる炭水化物の例は、グルコースまたはフルクトースなどの単糖、ラクトースまたはスクロースなどの二糖、ならびに少糖およびデンプンなどの多糖を含み、単糖が好ましい。
【０１０９】
本明細書に用いられる用語「低分子量化学化合物」は、少なくとも２つの炭素原子であるが好ましくは７つ以下の回転可能な炭素結合を含み、分子量が１００〜２，０００ダルトンの範囲、好ましくは１００〜１，０００ダルトンの範囲であり、場合によって１つまたは２つの金属原子を有する、好ましくは有機分子の分子を指す。そのような分子の例は、中でも、イミダゾール、インドール、イソキサゾール、オキサゾール、ピリジン、ピリミジン、およびチアゾールを含む。
【０１１０】
本発明により使用することのできる検出可能なマーカーまたは標識は、化学的、物理的または酵母反応中に、直接または間接的に検出可能な化合物または信号を発生する任意の化合物を含む。標識は、中でも、酵母標識、着色標識、蛍光標識、発色標識、ルミネセント標識、放射能標識、ハプテン、ビオチン、金属錯体、金属、およびコロイド状金から選択し得ることが好ましく、蛍光標識が特に好ましい。これらの全ての種類の標識は当分野に十分確立されている。そのような標識によって媒介される物理反応の好ましい例は、放射能標識を用いるとき、Ｘ線の照射または励起または放射の際の蛍光または燐光放射である。アルカリ性リン酸塩、セイヨウワサビペルオキシダーゼ、β−ガラクトシダーゼ、およびβ−ラクタマーゼは酵母標識の例であり、発色反応生成物の形成を触媒反応させ、本発明に用いることができる。好ましい酵母標識は、特に３−アミノ−９−エチルカルバゾール、４−クロロ−１−ナフトール、３，３’−ジアミノベンジジン、および３，３’，５，５’−テトラメチル−ベンジジンからなる群より選択される物質と共にセイヨウワサビペルオキシダーゼであり、３，３’，５，５’−テトラメチル−ベンジジンは特に好ましい。
【０１１１】
本発明の好ましい実施形態において、１つ以上の検出可能な部分を含む１つ以上の薬剤は１種以上の検出すべき粒子に直接結合し、本発明において、そのような結合は典型的に「全体として」の粒子ではなく、この粒子の表面上の１種以上の特定分子、好ましくは核酸またはプロテインなどの巨大分子に起きることに留意されたい。そのような「表面分子」は、細胞の表面に天然に生成する分子（例えば、Ｇ−プロテイン結合受容体または特別の炭水化物部分などの細胞表面受容体）とすることができ、または例えば、ビオチン／アビジン結合によって常磁性ビーズに結合した核酸分子（「捕捉分子」または「分子プローブ」とも呼ばれる）を粒子の表面に人工的に被覆することができる。標識反応、すなわち、１つ以上の検出可能な部分を本発明の薬剤に付着させることは、本発明の装置の外側で、すなわち、サンプルを導入する前に行うことができ、または装置の中で直接行うことができ、場合によって既に上で述べた充填ユニット中で行うことができる。標識付与は当分野でよく知られている方法によって達成することができる（例えば、上述のＳａｍｂｒｏｏｋ，Ｊ．ら、およびＬｏｔｔｓｐｅｉｃｈ，Ｆ．、および上述のＺｏｒｂａｓ Ｈ．参照）。
【０１１２】
各々１つ以上の検出可能な部分を含む１つ以上の薬剤は、それらが結合する特定な「表面分子」（またはそれらの粒子）に結合親和性を有することが好ましい。そのような薬剤の例は、中でも、抗体ならびにそのフラグメント（例えば、ファブフラグメント）、抗体状分子（例えば、アンチカリン）およびＤＮＡ−またはＲＮＡ−結合プロテインならびにそのフラグメントを含む。本発明に用いるべき適切な抗体または抗体フラグメントは、検出すべき特定の分析物に対して発生する一次抗体、および一次抗体が発生した動物種の免疫グロブリンＧに対して発生する二次抗体の両方を含む。標識付与は薬剤を上述の１つ以上の検出可能なマーカーに結合させることによって達成される。
【０１１３】
他の好ましい実子形態において、各々１つ以上の検出可能な部分を含む１つ以上の薬剤、および検出すべき粒子上の「表面分子」（またはそれらの粒子）は、反応チャンバ中に存在する間に互いに分子相互作用を行うことが可能である。最終的に、これらの分子相互作用は適切な検出方法を用いて検出される。
【０１１４】
場合によって任意の追加の試薬と一緒に、反応チャンバ中へサンプルを導入した後、サンプルの少なくとも一部は１つ以上の転位器によって反応チャンバ内に転位される。本明細書に用いられる用語「転位される」は、第１表面と第２表面の間の距離を、第１表面および／または第２表面の表面領域の少なくとも１つ以上の部分で、好ましくは、この表面の１つまたは両方のいずれかまたはその少なくとも１つ以上の部分に圧力を加えることによって１つ以上の転位器によって変化させること、好ましくは縮小させることによって、サンプルが反応チャンバ内を動かされると理解すべきである。したがって、この表面の表面領域全体を通して第１表面と第２表面間の距離を変化させること、または反応チャンバの一終端部など表面領域の一部だけの距離を変化させること、または、反応チャンバの両終端部などの表面領域の少なくとも２つの個別部分で第１表面と第２表面の間の距離を変化させること、はいずれも本発明の範囲内である。
【０１１５】
第１表面と第２表面間の距離の変化、好ましくは縮小は、第１表面および／または第２表面を１つ以上の転位器によって互いに対して縦に動かすことによって達成される。本明細書に用いられる用語「縦の動き」は、装置の表面の１つまたは両表面のそれらのそれぞれの表面領域に垂直または実質的に垂直の動きを指し、したがって、それらの間の距離の変化をもたらす。第１表面と第２表面間の距離の変化は、２つの表面のいずれか１つをいずれかの方向に縦に動かすこと、または両方の表面を同時に反対方向に動かすことによって達成することができる。したがって、装置の第１表面と第２表面間の距離の縮小は、第１表面またはその少なくとも１つ以上の部分を第２表面に向かって動かすこと、第２表面またはその少なくとも１つ以上の部分を第１表面に向かって動かすこと、または両方の表面またはそれぞれその少なくとも１つ以上の部分を互いに向かって動かすことによって達成することができる。逆に、装置の第１表面と第２表面間の距離の拡大は、第１表面を第２表面から離すように動かすこと、第２表面を第１表面から離すように動かすこと、または両方の表面を互いに離すように動かすことのいずれかによって達成することができる。この１つ以上の転位器によって、圧力および／または吸引を１つの表面または両方の表面に加えることによって第１表面と第２表面間の距離を変化させることが特に好ましい。本発明の範囲内で、所与の装置中に存在するすべての転位器によって、またはその少なくとも１つだけを使用して他の少なくとも１つの転位器は使用せずに、圧力および／または吸引を同時に加えることが可能である。したがって、例えば、２つの転位器を含む本発明の装置において、反応チャンバ内のサンプルを転位するために、両方の転位器によって、またはその１つだけで第１表面および／または第２表面の少なくとも一部に圧力および／または吸引を同時に加えることが可能である。
【０１１６】
したがって、上で定義した異なる種類の転位器の観点から、第１表面と第２表面（以降において、用語「第１表面」および／または「第２表面」はそれぞれの表面領域の少なくとも一部も指すことを理解すべきである）の間の距離の変化、好ましくは縮小に関する異なるモードが考えられ、最終的に反応チャンバ内のサンプルの少なくとも一部の転位がもたらされる。
【０１１７】
第１に、転位器がこの表面間の距離を縮小するための第１表面または第２表面の一体化された部分（例えば、反応チャンバの内部に延在する凸状体として設計された転位構造）を構成する場合、転位構造を含むそれぞれの表面を対向側の表面に向かって縦に動かすこと、対向表面を転位構造を含む表面に向かって縦に動かすこと、または両方の表面を互いに対して縦に動かすことが可能である。場合によって、「一体化された」転位構造に対向する表面もそれぞれの（すなわち、反対側の）位置に転位器を含み、同様に表面に一体化することも、または以下に説明するように操作される、転位体とすることができる。それぞれの表面の縦の動きは、転位体型の１つ以上の転位器またはこの表面の縦の動きを可能にする１つ以上の追加の手段によって達成することができる。そのような手段は装置の第１表面および／または第２表面に一体化または取り付けることができ、または独立の本体を含むことができる。いくつかの実施形態において、１つ以上の手段は人間の指、棒、ピン、タペット、およびネジからなる群より選択される。装置が自動化処理システムに一体化されるならば、反応チャンバに接続されたスタンプまたはプランジャーなどの１つ以上の手段を用いて第１表面および／または第２表面に圧力を加えることができる。表面に圧力を加えるための他の手段は、単に人間の手でそれらを互いに押し圧することである。
【０１１８】
第２に、転位器がこの表面の間の距離を縮小させるための転位体の形で存在する場合、この転位器を表面に向かって動かすことによって、それに対向して転位器が配置されたそれぞれの表面に圧力を加えることができ、表面領域の少なくともこの部分は場合によって弾性的に変形可能な材料から作ることができる。転位器によるそれぞれの表面の（弾性的な）変形、すなわち、表面の縦方向の「動き」は、第１表面と第２表面間の距離の縮小をもたらす。場合によって、第２転位器は反応チャンバの他の「側」の上述の転位体に対向して配置することができる。この第２転位器はそれぞれの表面に一体化された転位構造、またはそれに対向して配置された他の転位体のいずれかとすることができる。第２転位器の縦の動きは第１転位器とは逆方向に起きる。
【０１１９】
反応チャンバの第１表面と第２表面間の距離を表面領域の少なくとも１つ以上の部分で縮小させることは、距離が縮小したそれぞれの部位で同時に（空間的に制限された）反応空間が減少する。したがって、分析すべきサンプルは少なくとも部分的にこれらの部位から連続的に転位され、反応チャンバ内を、好ましくは補償ゾーンへ「動かされ」、反応チャンバの容積を本質的に一定に保つ。
【０１２０】
第１表面と第２表面間の少なくとも１つ以上の部分で距離が縮小された後、以下に説明するように、直ちに検出を行うことが可能である。
【０１２１】
本明細書に用いられる用語「１種以上の粒子の存在および／または数を示す値を検出／判定する」は、サンプル中の所与の粒子の定性的および／または定量的測定を可能にする導電性、酸化還元電位、蛍光強度または生物発光などのパラメーターの測定を指す。本発明の範囲内で、これらのパラメーターの１つだけを測定することができるが、１つ以上のパラメーター（例えば、導電性および適切な標識によって発生した蛍光信号の強度）を同時にまたは連続的に測定することも可能である。
【０１２２】
検出は上述のように、第１表面および／または第２表面の検出領域間に配置された反応チャンバの部分で行われるのが好ましい。反応チャンバのこの部分は「検出ゾーン」とも呼ばれる。定量的測定、すなわち、粒子の計数については、それぞれ容積の知られた反応チャンバおよび検出ゾーンを含む装置を用いることが好ましい。
【０１２３】
しかし、本方法のこの段階で、反応チャンバの第１表面と第２表面の少なくとも１つ以上の部分間の距離を再拡大させることが好ましい。反応チャンバの第１表面と第２表面の間の元の距離、すなわち、縮小前の距離を再現することが特に好ましい。これは、少なくとも１つの転位構造の縦の動き、および場合によってこの表面の逆方向の縦の動きを可能にする上述の手段の縦の動きによって、すなわち、それぞれの表面または表面領域への圧力印加を停止することによって、達成することができる。場合によって、第１転位器による圧力を加えることによって所与の表面領域で縮小された第１表面と第２表面の間の距離の再拡大は、第２転位器による圧力を加えて他の表面領域の距離を縮小させることによって改善することができる。両方の転位器は、同じ表面に対向して、すなわち、第１表面または第２表面のいずれか、または異なる表面に対向して配置することのできる転位体であることが好ましい。第１表面および／または第２表面の少なくとも１つ以上の表面領域で２つの表面間の距離を再拡大することは、同時に２つの表面間の（場合によって空間的に制限された）反応空間の増加をもたらす。さらに、好ましくは与えられた補償ゾーン中の反応空間内の転位されたサンプルは、逆方向に拡散して戻る。したがって、上述のように、第１表面および／または第２表面の表面領域の異なる部位に配置された、反対方向に操作される少なくとも２つの転位器を用いることによって、反応チャンバ内のサンプルの連続的な転位、したがって混合を達成することができる。
【０１２４】
本発明の特に好ましい実施形態において、後続の第１表面と第２表面の少なくとも１つ以上の部分間の距離の縮小と再拡大は、少なくとも２回繰り返される。第１表面と第２表面の少なくとも１つ以上の部分間の距離が２つ以上の連続的な「圧縮／弛緩サイクル」の間に縮小される大きさは、同じであることが好ましい。すなわち、装置の圧縮された状態の２つの表面間の距離は一定に保たれる。しかし、第１表面と第２表面の少なくとも１つ以上の部分間の距離が２つ以上の連続的な「圧縮／弛緩サイクル」の間に縮小される大きさは、例えば、サイクル数を増加させて大きさを拡大させることによって変化させることも可能である。続いてこの距離の縮小と再拡大は、サンプルが反応チャンバ内に均一に配分されるまで、すなわち、平衡状態が確立されるまで繰り返され、これはサンプル中の粒子の計数など定量的分析の信頼性にとって重要である。したがって、反応チャンバの特定の「検出ゾーン」内で検出を行うとき、（反応チャンバ全体ならびに「検出ゾーン」の容積が知られているならば）この領域内で繰り返された検出ステップの平均値を求めることによって反応チャンバ全体内の粒子の実際の数の正確な測定値が得られる。実施することのできる縮小と再拡大のサイクル数は実施者の考えによる。典型的に、サイクル数は２〜２０００の範囲、好ましくは１０〜１５００の範囲、さらに好ましくは５０〜１０００の範囲、特に好ましくは１００〜５００の範囲である。
【０１２５】
本発明によれば、１種以上の粒子の存在および／または数を示す値の検出／判定は反応チャンバの第１表面と第２表面間の距離の縮小と再拡大の各サイクルの後に行うことができるが、検出はこの距離が縮小された後に行うことが好ましい。しかし、検出を数回繰り返し、例えば、２回目または５回目の縮小／再拡大サイクルごとの後に繰り返すことも可能である。さらに、最後の縮小／再拡大サイクルの完了の後に１度だけ検出を実施することも可能である。好ましい実施形態において、検出は各縮小／再拡大サイクルの後に行われる。本発明の他の好ましい実施形態において、検出は、定量的分析がサンプル中に存在している１種以上の粒子の総数を示すことのできる測定値としてそれまでに行われた検出ステップで得られた結果の平均値を求めることをさらに含む。例えば、２回目の縮小／再拡大サイクルの後、それぞれ１回目および２回目の縮小／拡大サイクルの後に得られた結果の平均値が計算され、３回目の縮小／再拡大サイクルの後、それぞれ１回目、２回目、３回目の縮小／拡大サイクルの後に得られた結果の平均値が計算され、以降繰り返される。検出の１つ以上のサイクルで得られたデータは、当業者には知られている適切なコンピュータソフトウェアを用いて解析し、数学的に処理されて粒子の存在の測定および／または数の計算を行うことができる。
【０１２６】
検出すべき特定の種類ならびに用いられる検出可能なマーカーの性質に応じて検出は様々な方法によって行うことができ、それらの全ては当分野に確立されている（例えば、上述のＡｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．ら、Ｃｏｌｉｇａｎ、Ｊ．Ｅ．ら（２０００）Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，Ｈｏｂｏｋｅｎ，Ｎ．Ｊ；および上述のＬｏｔｔｓｐｅｉｃｈ，Ｆ．，および上述のＺｏｒｂａｓ．Ｈ．参照）。
【０１２７】
したがって、本発明による方法の実施は、一般に複雑なまたは嵩高の装置を必要とせず、好ましくは蛍光、光学吸収、共鳴伝導などのパラメーターの測定に基づく簡単な検出システムを含む。本発明による特に好ましい検出システムは、既に上で述べたように、濁度計、比濁計などの吸収測定に基づき、これは当分野に確立された光度計装置で達成することができる。それらの簡単さにかかわらず、これらの方法はサンプル中の１種以上の所与の粒子の存在だけでなく、その数の正確な判定を可能にする（概観するには、例えば、Ｔｉｅｔｚ，Ｎ．Ｏ．（ｅｄ）．Ｔｅｘｔｂｏｏｋ ｏｆ Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ．ＷＢ Ｓａｕｎｄｅｒｓ Ｃｏ．，Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ，ＰＡ，ｐｐ．７８−９７参照）。
【０１２８】
さらに特に好ましい検出システムは、落射蛍光または暗視野蛍光顕微鏡などの蛍光信号を測定する「古典的な」方法に基づく（例えば、Ｌａｋｏｗｉｃｚ，Ｊ．Ｒ．（１９９９）Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ ｏｆ Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ Ｓｐｅｃｔｒｏｓｃｏｐｙ，２ｎｄ ｅｄ．，Ｐｌｅｎｕｍ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏｒｐ．，ＮＹに概説される）。
【０１２９】
本発明に用いることのできるさらに他の蛍光検出方法は、中でも、全内部蛍光顕微鏡（例えば、Ａｘｅｌｒｏｄ，Ｄ．（１９９９）Ｓｕｒｆａｃｅ ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ ｍｉｃｒｏｓｃｏｐｙ ｗｉｔｈ ｅｖａｎｅｓｃｅｎｔ ｉｌｌｕｍｉｎａｔｉｏｎ，ｉｎ：Ｌａｃｅｙ，Ａ．（ｅｄ）Ｌｉｇｈｔ Ｍｉｃｒｏｓｃｏｐｙ ｉｎ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｏｘｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，３９９−４２３参照）、蛍光寿命画像形成顕微鏡（例えば、Ｄｏｗｌｉｎｇ，Ｋ．ら（１９９９）Ｊ．Ｍｏｄ．Ｏｐｔｉｃｓ ４６，１９９−２０９参照）、蛍光共鳴エネルギー移動（例えば、Ｐｅｒｉａｓａｍｙ，Ａ．（２００１）Ｊ．Ｂｉｏｍｅｄ．Ｏｐｔｉｃｓ ６，２８７−２９１）、生物蛍光共鳴エネルギー移動（例えば、Ｗｉｌｓｏｎ，Ｔ．，ａｎｄ Ｈａｓｔｉｎｇｓ，Ｊ．Ｗ．（１９９８）Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｃｅｌｌ Ｄｅｖ．Ｂｉｏｌ．１４，１９７−２３０参照）、蛍光相関分光（例えば、Ｈｅｓｓ，Ｓ．Ｔ．ら（２００２）Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ４１，６９７−７０５参照）を含む。
【０１３０】
上述の検出システムの代替は、例えば、国際公開第００／１２７５９号、第００／２５１１３号、第９６／２７０２５号に記載されている白色光設定、例えば、米国特許第５，３２４，６３３号、米国特許第６，０２７，８８０号、米国特許第５，５８５，６３９号、および国際公開第００／１２７５９号に記載されている共焦システム、例えば、米国特許第５，７６０，９５０号に記載されているＮｉｐｋｏｗディスクに基づく共焦励起システム、例えば、国際公開第９９／２７１４０号に記載されている微小光学系を用いる大規模集積蛍光検出システム、例えば、国際公開第００／１２７５９号に記載されているレーザー走査システムを含む。そのような従来の検出システムを用いる検出方法の全体的な説明は例えば、米国特許第５，３２４，６３３号に見ることができる。
【０１３１】
さらに、上で既に説明したように、例えば、第１表面および／または第２表面に接続された電極による酸化還元電位変化を測定することによって（例えば、Ｚｈｕ，Ｘ．ら（２００４）Ｌａｂ．Ｃｈｉｐ．４，５８１−５８７参照）、またはサイクリックボルトメトリーによって（例えば、Ｌｉｕ，Ｊ．ら（２００５）Ａｎａｌ．Ｃｈｅｍ．７７，２７５６−２７６１およびＷａｎｇ，Ｊ．（２００３）Ａｎａｌ．Ｃｈｅｍ．７５，３９４１−３９４５参照）、電気化学的検出方法を用いることができる。さらに、電気的検出方法は、例えば、インピーダンス測定によって用いることができる（例えば、Ｒａｄｋｅ，Ｓ．Ｍ．ら（２００５）Ｂｉｏｓｅｎｓ．Ｂｉｏｅｌｅｃｔｒｏｎ．２０，１６６２−１６６７参照）。また、検出は、例えば、Ｚ．Ｇｕｔｔｅｎｂｅｒｇら（２００５）Ｌａｂ．Ｃｈｉｐ．５，３０８−３１７に記載された音響表面波の検出手段によって達成することができる。
【０１３２】
本発明の特定の実施形態において、検出はＦＲＥＴまたはＢＲＥＴを用いて行われ、これは、目標分子が多孔質マトリックス上に不動化された捕捉分子に結合した際に蛍光信号だけが発生するように、それぞれ蛍光または生物発光停止対が形成されることに基づく。また、ＦＲＥＴの使用も例えば、Ｌｉｕ，Ｂ．ら（２００５）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ １０２、５８９−５９３、およびＳｚｏｌｌｏｓｉ，Ｊ．ら（２００２）Ｊ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．８２，２５１−２６６に記載されている。ＢＲＥＴの使用は、例えば、Ｐｒｉｎｚ，Ａ．ら（２００６）Ｃｈｅｍｂｉｏｃｈｅｍ．７，１００７−１０１２、およびＸｕ，Ｙ．ら（１９９９）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ９６，１５１−１５６に詳細が説明されている。
【０１３３】
本発明は、単に本発明の特定の実施形態を例示するためであり本発明の範囲を制限するものとは解釈されない以下の図面および実施例によってさらに説明される。
【０１３４】
図１は、本発明による分析装置の概略の断面図を示す。装置の反応チャンバは第１表面、第２表面、ならびに側面側壁によって画定され、第２表面の少なくとも中央領域は弾性的に変形可能な材料から作られる。装置は、第２表面に対向して配置された転位体の形の転位器をさらに含む。第１表面と第２表面の間の距離は、転位器によって第２表面に圧力を加えることによって変化可能である。反応チャンバは、チャンバ本体内に配置されて封止される。光学検出システムは反応チャンバの第１表面に対向して配置される。
【０１３５】
図２は転位体の形の２つの転位器を含む装置を用いる本発明の分析の概略図である。これらの転位器の１つは、第１表面に対向して配置され、他の１つは装置の第２表面に対向して配置される。さらに、転位器は、それらが互いに対向して位置するように配置される。第１表面および第２表面は、少なくとも転位器に対向して配置されたそれぞれの表面領域が弾性的に変形可能な材料から作られる。複数の粒子を含むサンプルは、特定種の粒子に対して結合親和性のある標識と一緒に反応チャンバ内に配置されている。２つの転位器で第１表面および第２表面に圧力を加えることによって、この表面間の距離は反応チャンバの中央部で縮小され、したがって、反応チャンバ内（好ましくは、補償ゾーン（図示せず））のサンプルは少なくとも部分的な転位が行われる。さらに、２つの表面間の距離を縮小することによって「間隔」が形成され、それらの存在および／または数を示す値を記録することによって特別に標識を付けられた粒子の検出が行われる。その後、２つの転位器をその元の位置に再設定することによって（すなわち、表面への圧力印加を停止することによって）、表面間の距離を再拡大することが好ましい。したがって、転位されたサンプルは「戻され」、再び距離を縮小する前に反応チャンバ全体に再分配される。「検出ゾーン」内で行われた繰り返し検出ステップ中に得られた結果の平均値を求めることによって、（反応チャンバならびに「検出ゾーン」の容積が知られているならば）反応チャンバ全体内の検出すべき標識を付けた粒子の正確な総数の測定値が得られる。
【０１３６】
図３は、装置の２つの終端領域において同じ表面（下の「第１表面」とも呼ばれる）に対向して配置された転位体の形の２つの転位器を含む装置を用いる本発明の代替の分析の概略図である。反応チャンバの中央部分は所定の容積を有する毛管間隙として構成される。２つの転位器に対向して配置された第１表面のそれぞれの表面領域は、弾性的に変形可能な材料から作られる。複数の粒子を含むサンプルは、特定種の粒子に結合親和性のある標識と一緒に反応チャンバ内に配置されている。第１転位器によって反応チャンバの１つの終端領域で第１表面に圧力を加えることによって、第１表面と第２表面の間の距離は反応チャンバのこの部分で縮小され、他の終端領域に向かって反応チャンバ内のサンプルの転位が起きる。続いて、他の終端領域に配置されたそれぞれの第２転位器は転位された液体によってその元の位置に押し戻され、反応チャンバのこの部分で第１表面と第２表面の間の距離の拡大がもたらされる。サンプルの転位は、検出が行われる毛管間隙内の反応チャンバに存在する標識を付けた粒子の個別部分集合の配置をもたらす。続いて、第２転位器によって第１表面に圧力を加えることによって、サンプルは「戻り方向に」反応チャンバ内に転位され、毛管間隙内の標識を付けた粒子の他の個別部分集合の配置をもたらす。したがって、反対方向に操作される２つの転位器を用いることによって、反応チャンバ内のサンプルの連続的な転位、したがって混合も達成される。「検出ゾーン」内で行われた繰り返し検出ステップ中に得られた結果の平均値を求めることによって、（反応チャンバの容積が知られているならば）反応チャンバ全体内の検出すべき標識を付けた粒子の正確な総数を計算することができる。
【０１３７】
図４は、本発明の装置とシステムならびにその対応する動作モードの特定の実施形態を示す。図４Ａ（頂部図）は第１表面と第２表面によって画定されたチャンネルとして構成され、補償ゾーンまたは貯蔵器の一端部へ達する単一装置または部分を概略的に示す。貯蔵器の少なくとも一部は弾性的に変形可能な材料から作られる。この貯蔵器領域内に、好ましくは乾燥した形で試薬（緩衝剤または標識）を提供することができる。転位器は貯蔵器（図示せず）の１つの表面に対向して配置される。装置の対向端部にサンプル導入通路（すなわち、サンプル充填ゾーン）が提供される。チャンネルは特定の検出領域（すなわち、検出ゾーン）を含む。そのような装置または部分の少なくとも２つは、分離した反応チャンバを含む複数部分のシステムに組み立てて、１つのサンプルに複数の並行分析を行うことができる。それぞれの反応チャンバは共通のサンプル導入通路によって互いに連通する。図４Ａ（中間および底部図）は、それぞれ２つおよび３つの装置を含むそのような複数部分システムの２つの例示的実施形態を示す。図４Ｂは、ユニットが（単一装置または複数システムの部分のいずれかとして）どのように操作されるかを概略的に図示する。上部図はその初期状態の装置の断面図である。特定の検出領域を包含するチャンネルは、剛性の第１表面（ハッチング部）と弾性的に変形可能な材料（「皮膜」）から作られた第２表面によって境界が定められる。転位器（「ステンシル」）は貯蔵器の第２表面に向かって押し圧され、第１表面と第２表面の間のこの表面領域の距離は、好ましくはゼロまたはゼロに近い値に縮小される。１滴の液体サンプルがサンプル導入通路に置かれ、転位器の解放（すなわち、逆方向の動きによって）から得られる負の圧力によって反応チャンバ中に導入され、したがって、貯蔵器の弛緩がもたらされる（図４Ｂ、中間図）。最終的に転位器は再び貯蔵器の第２表面に向かって押し圧される。このようにして、２つの表面間のこの表面領域の距離がもう１回縮小することによって、サンプルは反応チャンバ内に少なくとも部分的に配置される。したがって、貯蔵器の連続的な圧縮と弛緩の繰り返しによって１種以上の粒子の検出が行われる前にサンプルの攪拌／混合を達成することができる（図４Ｂ、下部図）。
【０１３８】
図５は、ヒトの血液中のＣＤ４＋細胞の数を判定するための本発明による分析結果を示す。ヒトの血液中のＣＤ４＋細胞サンプルは、ＣＤ３ＣＤ４キットを用い、製造者（ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｈｅｉｄｅｌｂｅｒｇ，Ｇｅｒｍａｎｙ）の使用説明書に従って抗ＣＤ４＋フィコエリスリン共役モノクローナル抗体で標識を付けた。血液サンプルは５００細胞／μｌ未満の濃度に希釈し、ポリジメチルシロキサンから作られた毛管チャンネルとして構成された反応チャンバ中で分析した。反応チャンバは約２μｌの総容積を有した。サンプルを毛管力によって反応チャンバ中に導入した後、反応チャンバの１つの表面にタペットによって圧力を加えることによって攪拌し、サンプルを部分的に転位した。このようにしてサンプルの転位を１０回繰り返した。標識を付けた細胞を、１０倍対物レンズ（画像視野１７２７×１３８５μｍ）とＦｌ−ＦＩＴＣフィルタ（Ｚｅｉｓｓ（登録商標） ＃０９）を備える顕微鏡（Ａｋｉｏｓｋｏｐ；Ｃａｒｌ Ｚｅｉｓｓ ＧｍｂＨ，Ｊｅｎａ，Ｇｅｒｍａｎｙ）を用いる光学検出によって分析した。露出時間は２５００ｍｓであった。検出は５〜７回繰り返した。代表的な顕微鏡画像を示す。サンプル中のＣＤ４＋細胞の数は適切なコンピュータソフトウェアパッケージ（ＮＩＨ Ｉｍａｇｅ推奨の公開ドメインＪａｖａ（登録商標）画像処理プログラム、イメージ Ｊ ソフトウェア バージョン１．７１）を用いて、個々の測定で得られた細胞数の平均値を計算することによって求めた。画像視野、したがって「検出ゾーン」の容積ならびに反応チャンバの容積は知られており、ＣＤ４＋細胞／サンプルμｌの濃度を計算することができた。
【０１３９】
図６は、フローサイトメトリーによって得られたヒトの血液中のＣＤ４＋細胞数と本発明による分析の比較をそれぞれ示す。ヒトの血液サンプルのＣＤ４＋細胞は、図５に説明したように標識を付けた。サンプルはＧｕａｖａ（登録商標） ＰＣＡフローサイトメーター（Ｇｕａｖａ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｉｎｃ．，Ｈａｙｗａｒｄ，ＣＡ，ＵＳＡ；励起波長５３２ｎｍ、放射波長：５８０〜５８３ｎｍ）を用いて、製造者の使用説明書に従い、ならびに図５に説明した本発明の分析によって分析した。結果は５〜７測定の平均値±ＳＥＭであり、１μｌ血液中のＣＤ４＋細胞の数として表わされる。
【０１４０】
（実施例１）
ヒトの血液中のＣＤ４＋細胞の存在の判定
ヒトの血液サンプルのＣＤ４＋細胞は、ＣＤ３ＣＤ４キットを用い、製造者（ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｈｅｉｄｅｌｂｅｒｇ，Ｇｅｒｍａｎｙ）の使用説明書に従って抗ＣＤ４＋フィコエリスリン共役モノクローナル抗体（ＣＤ４−ＰＥ）で標識を付けた。簡単に、１０μｌの血液を２μｌのＣＤ４−ＰＥ（１：２５に希釈した原溶液）と２μｌ ２０ｍＭのＥＤＴＡに混合した。次いで、混合物を暗所で１５分間インキュベートした。
【０１４１】
血液サンプルは５００細胞／μｌの濃度に希釈し（高濃度は装置の適切な取り扱いを妨げる）、ポリジメチルシロキサン、すなわち、弾性的に変形可能な材料から作られた、毛管チャンネルとして構成された反応チャンバ中で分析した。反応チャンバは２．０４８ｍｍ×０．０４ｍｍ×２４ｍｍのサイズであり、したがって、約２μｌの総容積を有する。
【０１４２】
サンプルを導入するために、２．５μｌの希釈した血液サンプルをチャンネルの開口部に隣接させて置き、他に外部から操作することなく、毛管力によって導入した。その後、タペット（またはピンセット）で反応チャンバの１つの表面に圧力を加えることによって反応チャンバを攪拌し、サンプルの部分的な転位を起こさせた。このようなサンプルの転位を１０回繰り返した。
【０１４３】
次いで、標識を付けた細胞を、１０倍対物レンズ（画像視野１７２７×１３８５μｍ）とＦｌ−ＦＩＴＣフィルタ（Ｚｅｉｓｓ（登録商標） ＃０９）を備える顕微鏡（Ａｋｉｏｓｋｏｐ；Ｃａｒｌ Ｚｅｉｓｓ ＧｍｂＨ，Ｊｅｎａ，Ｇｅｒｍａｎｙ）を用いる光学検出によって分析した。露出時間は２５００ｍｓであった。検出は、５〜７回繰り返された。代表的な顕微鏡画像を図５に示す。
【０１４４】
サンプル中のＣＤ４＋細胞の数は、適切なコンピュータソフトウェアパッケージ（ＮＩＨ Ｉｍａｇｅ推奨の公開ドメインＪａｖａ（登録商標）画像処理プログラム、イメージ Ｊ ソフトウェア バージョン１．７１）を用いて、個々の測定で得られた細胞数の平均値を計算することによって求めた。画像視野、したがって「検出ゾーン」の容積ならびに反応チャンバの容積は知られており、ＣＤ４＋細胞／μｌサンプルの濃度を計算することができた。
【０１４５】
（実施例２）
ヒトの血液中のＣＤ４＋細胞の数を測定するためのフローサイトメトリーと本発明の分析の比較
本発明の分析が定量的分析に適しているかどうかを試験するため、ヒトの血液中のＣＤ４＋細胞数の測定について従来のフローサイトメトリーと比較した。ヒトの血液サンプル中のＣＤ４＋細胞を実施例１で説明したようにして標識を付けた。サンプルはＧｕａｖａ（登録商標） ＰＣＡフローサイトメーター（Ｇｕａｖａ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｉｎｃ．，Ｈａｙｗａｒｄ，ＣＡ，ＵＳＡ；励起波長５３２ｎｍ、放射波長：５８０〜５８３ｎｍ）を用いて、製造者の使用説明書に従い、ならびに実施例１に説明した本発明の分析によって分析した。結果は図６に示され、５〜７測定の平均値±ＳＥＭで表わされる。結果は、１μｌ血液中のＣＤ４＋細胞の数として表わされる。
【０１４６】
２つの方法について得られた平均値ならびにそれぞれのパーセントの差を以下の表にまとめる。
【表１】
【０１４７】
見ることができるように、実施した９つの独立分析中の５つの中で２つの方法の間の変化は５％未満であり、３つの場合１０％未満である。分析Ｎｏ．６だけはより高い約３０％の変化が得られたが、この場合２つの分析が並行して、すなわち同一の血液サンプルで実施されなかったことによるものである。しかし、他の結果は本発明の方法が生物サンプル中の粒子の定量的検出に適していることを明らかに示している。
【０１４８】
本明細書に図示した本発明は、本明細書で特別に説明されなかった要素または複数の要素、制限または複数の制限なしに適切に実施することができる。したがって、例えば、用語「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」、「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」、「包含する（ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ）」等は拡張して制限なく解釈すべきである。さらに、本明細書に用いられた用語および表現は説明用語として非制限的に用いられ、そのような用語および表現を用いる上で、示され説明された特徴のいかなる等価またはその部分を排除する意図は存在せず、特許請求された本発明の範囲内でさまざまな修正を加えることが可能であるものと理解される。したがって、本発明は好ましい実施形態および任意選択的な特徴によって特別に開示されたが、本明細書に開示されそこで実施される本発明の修正および変更は当業者であれば容易に到達することができ、そのような修正および変更は本発明の範囲内であると考えられるものと理解すべきである。
【０１４９】
本明細書において本発明は広く一般的に説明した。一般的な開示範囲内のより狭い種群および亜群の各々も本発明の部分を形成する。これは、削除された材料が特に本明細書に記載されているかどうかにかかわらず、いかなる主題も種から取り除かないという条件で、または制限なしで、本発明の一般的な説明を含む。
【０１５０】
他の実施形態は以下の特許請求の範囲内である。さらに、本発明の特徴または態様はマーカッシュグループに関して説明され、当業者であれば、本発明は、説明されるマーカッシュグループの個別メンバーまたは部分メンバーに関してもそれによって説明されることを理解する。
【図面の簡単な説明】
【０１５１】
【図１】光学検出システムを含む本発明の分析装置の概略断面図である。
【図２】装置の異なる側に互いに対向して配置された２つの転位器を含む装置を用いる本発明の分析の概略図である。
【図３】装置の同じ側の異なる位置に配置された２つの転位器を含む装置を用いる本発明の分析の概略図である。
【図４Ａ】本発明の分析装置または本発明の分析システムの特定の実施形態を示す図である。
【図４Ｂ】本発明の分析装置または本発明の分析システムの操作モードの特定の実施形態を示す図である。
【図５】ヒトの血液中のＣＤ４＋細胞の数を求めるための本発明による分析の結果を示す図である。
【図６】フローサイトメトリーによって得られたヒトの血液中のＣＤ４＋細胞数の比較および本発明による分析を示す図である。
【技術分野】
【０００１】
本出願は、独国特許出願第１０２００５０５２７５２号の優先権を主張するものであり、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。さらに本出願は、独国特許出願第１０２００５０５２７１３号および「Ｍｅｔｈｏｄ ａｎｄ ｄｅｖｉｃｅ ｆｏｒ ｔｈｅ ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ ｏｆ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ」の名称で２００６年１１月０６日出願の国際特許出願（Ｍａｉｗａｌｄ参照番号Ｃ７７９４）に関し、両方ともその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【０００２】
本発明は、粒子の検出のための装置および方法に関する。
【背景技術】
【０００３】
ヒトおよびヒト以外の体液などのサンプル中の細胞またはウイルスなどの１種以上の粒子の存在の検出および／または絶対レベルの計数は、人間および哺乳動物全体の健康状態を決定するのに非常に重要である。そのような用途の臨床的に重要な例は、ＨＩＶ陽性被験者中のＣＤ４＋細胞、化学療法を受けている患者の顆粒球および小板、血液バッグ中の白血球の計数を含む。他方、非医学的用途は、下水の環境サンプルまたは食品中の（細菌性）汚染の検出を含む。
【０００４】
そのような分析を行うための主要な分析プラットホームは、現在フローサイトメトリーに基づく分析システムである。フローサイトメトリーは、目標粒子をその中に有するサンプルを含む流体をフローサイトメトリーの検出領域に送達することを含む。粒子はシース流体内での水力学的な集束を用いてコア流に沿って単一列に配置される。次いで、粒子は個別に光ビームによって検査される。典型的に、検出領域の目標粒子は、目標粒子による発光現象を発生させるレーザーを用いて照射される。光学系および検出電子機器が、サンプル中の目標粒子の光の吸収、散乱、蛍光、および／または分光特性、または替わりに、目標粒子に添付した蛍光標識のそれぞれの特性を測定する。蛍光の場合、各目標粒子はそれが照明領域を通過する際に蛍光光子を放出する。さらに、照明または励起光からの蛍光の区別はフィルタまたはフィルタの組み合わせによって達成することができる。蛍光の検出は光電子増倍管またはフォトダイオードを用いて達成される。他の技術は目標粒子による照明ビーム中の光子の散乱によるものである。目標粒子は散乱の角度の関数として、すなわちそのサイズおよび形状ならびに散乱された光子の波長の関数として、その光散乱によって識別される。
【０００５】
したがって、単一目標粒子の良好な検出および識別はいくつかの要因に依存する。第１に、レーザーエネルギーは目標粒子が照射領域をすばやく通過する間に十分大きな数の蛍光（または、替わりに散乱）光子を発生させるのに十分でなければならない。典型的に、粒子の検出は、目標粒子からの蛍光の放出が背景の光子の不規則な変動から確実に区別されるように、十分な数の光子が発生するとき行われる。第２に、サンプル中のキャリア液体または液体中の不純物によって放射される散乱または蛍光、ならびに流体が通過する毛管の壁など装置自体から発生するこれらの望ましくない背景光子を最小化することが重要である。
【０００６】
フローサイトメトリーおよびそれらの異なる用途における使用方法は、例えば、Ｓｈａｒｐｉｒｏ，Ｒ．Ｍ．（２００２）Ｐｒａｃｔｉｃａｌ Ｆｌｏｗ Ｃｙｔｏｍｅｔｒｙ，４ｔｈ ｅｄ．，Ｗｉｌｅｙ−Ｌｉｓｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，ＮＹ、ならびに、中でも、国際公開第９０／１３３６８号、第９９／４４０３７号、および第０１／５９４２９号に記載される。
【０００７】
しかし、従来のフローサイトメトリーシステムは典型的に嵩高い機器のため通常の臨床使用には不便であり、これは「現場」測定（例えば、ベッド脇での試験）を困難にするばかりでなく、分析ごとに高い経費を生じる。したがって、好ましくは類似の性能特性を有する、簡単でより小型で安価なシステムが必要であるのは明らかである。
【０００８】
したがって、より小さなサンプルおよび試薬容積しか必要としないサイトメトリーを開発するために、近年の微小流体技術が用いられた（例えば、Ａｌｔｅｎｄｏｒｆ，Ｅ．ら、（１９９７）、Ｓｅｎｓ．Ａｃｔｕａｔ．１，５３１−５３４、Ｈｕｈ，Ｄ．ら（２００５）Ｐｈｙｓｉｏｌ．Ｍｅａｓ．２６，Ｒ７３−Ｒ９８、Ｄｉｔｔｒｉｃｈ，Ｐ．Ｓ、およびＭａｎｚ，Ａ．（２００５）Ａｎａｌ．Ｂｉｏａｎａｌ．Ｃｈｅｍ．３８２，１７７１−１７８２を参照されたい）。これらの努力に基づく分析機器は従来の装置よりも小さく、より携帯性がある。
【０００９】
そのような小型化されたフローサイトメトリーの例は、国際公開第０２／１０７１３号に記載される。この装置はそれぞれサンプル流体受容器および流体を支持する貯蔵器に結合された不正確な流体駆動器を用いる、閉ループフィードバック経路によって制御され、したがって、より小型の機器設定が可能である。
【００１０】
また、フローサイトメトリーを使用する替わりに、対象の粒子に特定の分子マーカー（すなわち標識）を用いることによって、所与のサンプル中の粒子の存在および／または数を間接的に求めることが可能であり、そのサンプル中のコピー数が粒子の数に相関する。現在、そのような分析を行うには、例えば、ＥＬＩＳＡに基づく分析（例えば、Ｋａｎｎａｎｇａｌ，Ｒ．ら、（２００１）Ｃｌｉｎ．Ｄｉａｇｎ．Ｌａｂ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．８，１２８６−１２８８参照）、ならびに、被覆された常磁性ビーズ（例えば、Ｃａｒｅｌｌａ，Ａ．Ｙ．ら、（１９９５）Ｃｌｉｎ．Ｄｉａｇｎ．Ｌａｂ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２，６２３−６２５参照）または被覆されたラテックスビーズ（例えば、Ｂａｌａｋｒｉｓｈｎａｎ，Ｐ．ら、（２００４）Ｊ．Ａｃｑｕｉｒ．Ｉｍｍｕｎｅ Ｄｅｆｉｃ．Ｓｙｎｄｒ．３６，１００６−１０１０参照）の使用を含む顕微鏡に基づく方法などの異なる手法が可能である。さらに、特に標識を付けた粒子を、顕微鏡光学系を用いてそれらを画像形成する前に膜上に捕捉することも可能である（Ｒｏｄｒｉｇｕｅｚ，Ｗ．Ｒ．ら、（２００５）ＰＬＯＳ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ ２，ｅ１８２，６６３−６７２）。
【００１１】
粒子を計数する他の種類の分析装置は、国際公開第２００５／００８２２６号に記載されている。装置は、染料で標識を付けた分析すべき粒子を含むサンプルチップの部分領域に光を投射する光源と、直前に撮影された領域に隣接するある領域が光の入射点に移動するように、チップの位置を所定時間間隔ごとにそれぞれ対物レンズおよび光源に対して所定の距離移動させるための移動器とを含む。したがって、サンプルチップ上の部分領域は連続的に撮影される。各部分領域中の粒子数が計数され、数学的に処理されてサンプル中の粒子の総数が計算される。
【００１２】
さらに、米国特許出願第２００６／００２４７５６号は磁気的に標識を付けた目標粒子または細胞の検出のための小型画像形成サイトメトリー装置に関する。その目的のために、分析すべき生物サンプル中に存在するすべての細胞は蛍光で標識が付けられるが、強磁性ビーズに結合した単クローン抗体を用いて目標細胞だけが磁気的に標識が付けられる。標識を付けられたサンプルはチャンバまたはキュベット中で２つの楔形状の磁石の間に置いて、キュベットの観察表面上で磁気的に標識を付けた細胞を選択的に動かす。ＬＥＤが細胞を照明し、ＣＣＤカメラが目標細胞によって放射される蛍光の画像を捕捉する。デジタル画像分析は元のサンプルの目標細胞濃度に相関し得る表面上の細胞の計数を提供する。
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【００１３】
しかし、これらの上述の全ての装置および方法は比較的複雑な検出技術を必要とし、これは初期コストおよび必要な分析機器の保守の両方とも高価になり、高度に訓練を受けた人を必要とする。これは従来のシステムを通常の医療、「ベッド脇」試験、または遠隔地での実施には不適切である。
【００１４】
したがって、上述の制約を克服する、サンプル中の１つ以上の粒子を定性的および／または定量的に検出するための分析装置が必要である。詳細には、所与の粒子が少量（すなわち少数）であっても、高感度だけでなく実施が容易でコスト効率良く検出可能な装置が必要である。
【００１５】
さらに、迅速に信頼性高く所与のサンプル中の１種以上の粒子の存在を検出し、および／または量を正確に測定するための、そのような分析装置を用いる対応方法が必要である。詳細には、「現場」で、すなわち、分析すべきサンプルの収集の間、または直後に実施することのできる方法が必要である。
【００１６】
したがって、本発明の目的はそのような分析装置ならびにそれを用いる対応方法を提供することである。
【課題を解決するための手段】
【００１７】
第１の態様において、本発明は粒子の定性的および／または定量的検出に関し、第１表面と第１表面に対向して配置された第２表面の間のチャンバ本体内に形成された反応チャンバと、１つ以上の転位器（ｄｉｓｐｌａｃｅｒ）とを含み、第１表面と第２表面の間の距離は、第１表面および／または第２表面の表面領域の少なくとも１つ以上の部分で１つ以上の転位器によって変化可能である。
【００１８】
１つ以上の転位器は第１表面および／または第２表面に一体化された部分（「転位構造」）とすることができ、または第１表面および／または第２表面に対向して配置された内蔵式（ｓｅｌｆ−ｃｏｎｔａｉｎｅｄ）本体（「転位体」）とすることができる。１つ以上の転位器は弾性的に変形可能な材料から作ることができる。好ましい実施形態において、装置は２つの転位器を含み、同じ表面または異なる表面のいずれかに対向して配置することができる。
【００１９】
第１表面および／または第２表面の少なくとも一部分は透明な材料から作られるのが好ましい。さらに、第１表面および／または第２表面の少なくとも１つ以上の部分は弾性的に変形可能であるのが好ましい。少なくとも１つ以上の弾性的に変形可能な部分が１つ以上の転位器に対向して配置されるのが特に好ましい。少なくとも１つ以上の弾性的に変形可能部分は、検出が行われる表面領域とは異なることができる。
【００２０】
いくつかの実施形態において、本発明の装置は反応チャンバが弾性的に変形されたとき、反応チャンバの容積を本質的に一定に保つことを可能にする１つ以上の手段をさらに含む。１つ以上の手段は反応チャンバの側面境界を定める弾性側壁を含むのが好ましい。
【００２１】
さらに他の態様において、本発明は少なくとも２つの部分を含むシステムに関し、少なくとも２つの部分の各々が第１表面と第１表面に対向して位置する第２表面の間のチャンバ本体内に形成された反応チャンバと、１つ以上の転位器とを含み、第１表面と第２表面の間の距離は第１表面および／または第２表面の表面領域の少なくとも１つ以上の部分で１つ以上の転位器によって変化可能であり、少なくとも２つの部分の反応チャンバは互いに連通する。
【００２２】
反応チャンバ、第１表面、第２表面および／またはシステムの一部分である少なくとも１つの転位器は、本発明の装置で述べたようにして形成することができる。
【００２３】
一実施形態において、システムは、反応チャンバが弾性的に変形されたとき反応チャンバの容積を本質的に一定に保つことを可能にする１つ以上の手段をさらに含む。１つ以上の手段は反応チャンバの側面境界を定める弾性側壁を含むのが好ましい。
【００２４】
他の実施形態において、システムは検出システムをさらに含む。
【００２５】
システムは少なくとも２つの装置の反応チャンバの各々に連通するサンプル導入通路と、場合によって、２つ以上の反応チャンバ間に過渡的な流体連通を可能にする１つ以上の手段を含むのが特に好ましい。
【００２６】
さらに他の態様において、本発明は粒子の定性的および／または定量的検出方法に関し、検出される１種以上の粒子を含むと思われるサンプルを反応チャンバ中に配置すること、反応チャンバ内のサンプルの少なくとも一部を１つ以上の転位器によって転位すること、１種以上の粒子の存在および／または数を示す値を検出／判定することを含む。
【００２７】
分析すべきサンプルは生物サンプルであり、検出すべき１種以上の粒子は、原核生物細胞、真核生物細胞、およびウイルス粒子からなる群より選択されるのが好ましい。
【００２８】
好ましい実施形態において、サンプルを反応チャンバ内に配置することはこのサンプルを本発明による装置の反応チャンバ中に導入することを含む。
【００２９】
サンプルの少なくとも一部は、第１表面および／または第２表面の表面領域の１つ以上の部分で第１表面および／または第２表面へ１つ以上の転位器の少なくとも１つで圧力を加えることによって、好ましくは第１表面と第２表面の間の距離を変化させ、特に好ましくは縮小させることによって、転位することが好ましい。
【００３０】
本発明の方法の好ましい実施形態において、サンプルの少なくとも一部を転位した後に、縮小した距離は続いて再び拡大される。この距離の縮小および続く再拡大は繰り返し行うことができる。検出は第１表面と第２表面間の距離が縮小された後に行われるのが好ましい。
【００３１】
一実施形態において、本発明の方法は、複数の粒子を含むサンプルを反応チャンバ中に配置することと、反応チャンバ内のこの複数の粒子の部分集合を１つ以上の転位器によって転位することと、反応チャンバ内に転位された粒子の部分集合の数を示す１つ以上の値を求めることと、場合によって、検出の間に得た１つ以上の値から反応チャンバ中の複数の粒子の総数を計算することとを含む。
【００３２】
いくつかの実施形態において、方法は、検出を行う前に、各々１つ以上の検出可能な部分を含む１つ以上の薬剤を反応チャンバ中に配置／導入することをさらに含む。１つ以上の薬剤は核酸、ペプチド、プロテインドメイン、プロテイン、炭水化物、低分子量化学化合物、およびその類似品および／または混合物からなる群より選択され、検出すべき１つ以上の粒子に結合親和性を有する。
【００３３】
さらに他の態様において、本発明は、サンプルの複数の粒子を検出チャンバ内に配置することと、複数の粒子の適切な部分集合だけが残るように、複数の粒子のいくつかを検出チャンバから転位することと、複数の粒子の部分集合の粒子を光学的に検出することと、検出された粒子に基づいて、粒子の部分集合の粒子数を示す値を求めることとを含む方法に関する。
【００３４】
一実施形態において、方法は、適切な部分集合の粒子数を示す値に基づいてサンプル中の粒子の数または存在量の数を示す値を求めることをさらに含む。場合によって、この測定はさらに検出チャンバの検出容積のサイズに基づく。
【００３５】
好ましい実施形態において、方法はさらに、サンプルの複数の粒子を検出チャンバ内に配置して複数の粒子のいくつかを検出チャンバから転位するステップを繰り返すステップをＮＲ回繰り返すことを含み、いずれの場合にも、複数の粒子の適切な部分集合だけが残るようにされ、ＮＲ≧２の場合、ＮＲ繰り返し数のＮＤについては、複数粒子の部分集合の粒子を光学的に検出すること、および検出された粒子に基づいて、粒子の適切な部分集合の粒子数を示す値を求めることを含み、ＮＤ≧ＮＲである。
【００３６】
本発明の方法のさらに他の好ましい実施形態において、配置と転位のステップをＮＲ回繰り返すことは、ＮＲ回の繰り返しごとに、転位された複数粒子の少なくともいくつかを検出チャンバに再導入することを含む。
【００３７】
本発明の他の好ましい実施形態において、複数粒子のいくつかを転位することは、検出チャンバ容積の減少、すなわち、チャンバの第１壁と第２壁間の距離の縮小を含むことができる。
【００３８】
さらに他の実施形態において、本発明の方法は、サンプルの複数粒子を検出チャンバ内に配置すること、複数粒子の適切な部分集合だけが残るように複数粒子のいくつかを検出チャンバから転位すること、複数粒子の部分集合の粒子を光学的に検出すること、および粒子の部分集合中の目標粒子の存在を求めることを含む。
【００３９】
他の実施形態において、本発明の方法は、サンプルの第１の複数の粒子を検出チャンバ内に配置すること、検出チャンバの容積を減少させること、検出チャンバ内の粒子を光学的に検出すること、および検出された粒子に基づいて、検出チャンバ内に存在する粒子の数を示す値を求めること、検出チャンバの容積を増加させること、サンプルの第２の複数の粒子を検出チャンバ内に配置すること、検出チャンバの容積を減少させること、および検出された粒子に基づいて、検出チャンバ内に存在する粒子の数を示す値を求めることを含む。
【００４０】
さらに他の態様において、本発明は、複数の粒子を含むサンプルを受容するように構成された検出チャンバと、複数粒子の適切な部分集合だけが残るように検出チャンバから複数粒子のいくつかを転位するように構成されたアクチュエータと、粒子の部分集合の粒子を検出するように構成された検出器と、検出された粒子に基づいて、粒子の適切な部分集合の粒子数を示す値を求めるように構成されたプロセッサとを含む装置に関する。
【００４１】
装置は、アクチュエータを操作して、転位された複数粒子の少なくともいくつかを検出チャンバに再導入し、続いて、複数粒子の第２の適切な部分集合だけが残るように複数粒子のいくつかを検出チャンバから転位するように構成され、プロセッサは検出器を操作して第２の適切な部分集合の粒子を検出し、検出された粒子に基づいて粒子の第２の適切な部分集合の粒子の数を示す値を求めるように構成されるのが好ましい。
【００４２】
装置は、検出チャンバから転位された粒子を受容することのできる貯蔵器をさらに含み、その粒子から検出チャンバへ再導入することができる。
【００４３】
一実施形態において、プロセッサは検出された粒子に基づいて、粒子の部分集合の粒子中に目標粒子の存在を測定するように構成することができる。
【発明を実施するための最良の形態】
【００４４】
第１の態様において、本発明は粒子の定性的および／または定量的検出のための装置に関し、
（ａ）第１表面と第２表面の間のチャンバ本体内に形成され、第２表面が第１表面に対向して配置された反応チャンバと、
（ｂ）１つ以上の転位器と、を含み、
第１表面と第２表面の間の距離は、第１表面および／または第２表面の表面領域の少なくとも１つ以上の部分で１つ以上の転位器によって変化可能である。
【００４５】
本発明の範囲内において、「反応チャンバ」（本明細書において「反応空間」または「検出チャンバ」、または「チャンバ」とも呼ばれる）は第１表面と第２表面の間のチャンバ本体内に形成される空間を指す。反応チャンバは任意の基本的形状、例えば、円形、楕円形、正方形、矩形とすることができる。本発明の好ましい反応チャンバは、立方形または円筒形の三次元形状を有する。特に好ましい反応チャンバは（毛管）チャンネルとして構成される。場合によって、反応チャンバは、テーパーの付いた部分を含むことができる。例えば、反応チャンバは中央領域から一方または両方の終端領域へテーパーを付けることができる。反応チャンバは側壁によって側面境界が定められる。第２表面は第１表面に対向して、または実質的に対向して配置される。第１および第２表面は互いに平行または実質的に平行に配置される。
【００４６】
第１表面と第２表面間の距離は、反応チャンバに面する装置の第１表面の側と反応チャンバに面する第２表面の側の間の距離で画定され、反応チャンバの厚さとも呼ばれる。本発明によれば、反応チャンバの厚さは通常最大１ｃｍ、好ましくは最大５ｍｍ、特に好ましくは最大３ｍｍ、最も好ましくは最大１ｍｍである。
【００４７】
本発明のいくつかの実施形態において、反応チャンバは毛管間隙として設計され、これは第１表面と第２表面の間に働く毛管力によって充填することができる。通常、毛管間隙は最大１ｍｍ、好ましくは最大７５０μｍ、特に好ましくは最大５００μｍの厚さを有する。本発明の好ましい実施形態において、毛管間隙は３００μｍの厚さを有し、厚さ２００μｍがさらに好ましく、厚さ１５０μｍが特に好ましい。
【００４８】
本発明による分析装置において、第１表面と第２表面の間の距離は可変である。好ましい実施形態において、距離は０ｍｍ〜１ｍｍの範囲で可変である。第１表面と第２表面の間の距離のさらに好ましい下限は、５０μｍ〜２００μｍの範囲である。さらに好ましい上限は０．３ｍｍ〜０．５ｍｍの範囲である。
【００４９】
本明細書に用いられる用語「転位器」または「アクチュエータ」は、第１表面および／または第２表面の表面領域の少なくとも１つ以上の部分で第１表面と第２表面の間の距離が変化する際に、本発明の装置の反応チャンバ内、または反応チャンバの少なくとも１つ以上の部分内の溶液を転位するのに適した手段を指す。言い換えれば、本発明の転位器は、第１表面および／または第２表面、または互いに対してその少なくとも１つ以上の部分の縦の動きを可能にする手段であると定義することもできる。本明細書に用いられる用語「表面領域の少なくとも１つ以上の部分」は、転位器による第１表面と第２表面の間の距離の変化が必ずしも第１表面および／または第２表面の表面領域全体に起きる（すなわち、この表面の一方または両方の全体が互いに対して縦に動く）必要はなく、この表面の一方または両方の表面領域の少なくとも一部に局部的に制限され得る（すなわち、それぞれの表面の表面領域のこれらの１つ以上の部分だけが互いに対して縦に動き、それぞれの表面の表面領域の１つ以上の残りの部分の距離は実質的に一定に保たれる）と理解すべきである。本発明の好ましい実施形態において、特に好ましくはこの表面の一方または両方の少なくとも一部に圧力を加えることによって、第１表面および／または第２表面の間の距離は縮小される。
【００５０】
本発明による転位器は第１表面または第２表面の一体化された部分を構成することができ（本明細書において、「転位構造」とも呼ばれる）、または反応チャンバの外側に配置された独立の、すなわち内蔵式の本体（本明細書において「転位体」とも呼ばれる）を有することができる。転位器が転位構造、すなわち、第１表面または第２表面の一体化された部分として提供される場合、反応チャンバの内側に延在する凸状体として設計することができる。そのような凸状体は、本発明の方法を実施するとき反応チャンバ内の溶液の転位を起こさせるのに適した任意の形状を有することができる。そのような凸形状は、特に、窪み、隆起、バックル、およびふくらみを含み、ふくらみが好ましい。第１表面または第２表面の一体化された部分としての性質により、そのような転位構造はそれぞれの表面の残りまたは少なくともその一部と同じ材料から作ることができる。
【００５１】
本発明の他の実施形態において、転位器は第１表面または第２表面に一体化されないが、この表面のいずれか一方に対向して配置された独立の転位体を構成し、転位器は反応チャンバから離れて面するそれぞれの表面の側に配置される。いくつかの実施形態において、転位器は反応チャンバのそれぞれの表面に直角に配置される。そのような転位体は、本発明中で用いられるとき、反応チャンバ内の溶液の転位を起こさせるのに適した任意の形状を有することができる。そのような転位体の例は、特に、ヒトの指、棒、ピン、プランジャー、スパイク、サオ、タペット、およびステンシルを含み、最後の２つが特に好ましい。
【００５２】
本発明の範囲内で、装置は１つ以上の転位器を含むことができ、その全ては第１表面および／または第２表面の一体化された部分とすることができ、または転位体とすることができる。しかし、本発明の装置は少なくとも１つの転位体およびこの表面の１つに一体化された少なくとも１つの転位構造とすることも可能である。本発明の好ましい実施形態において、装置は２つの転位器を含む。他の実施形態において、装置は少なくとも３つの、少なくとも４つの、少なくとも８つの、または少なくとも１２の転位器を含む。
【００５３】
本発明の装置の転位器の全ては、第１表面または第２表面のいずれかに一体化されおよび／または対向して配置することができる。替わりに、装置は、この表面の両方に一体化されおよび／または配置された少なくとも２つの転位器を含むことも可能である。本発明の好ましい実施形態において、装置は第１表面および／または第２表面に対向して配置された単独の転位体型である少なくとも２つの転位器を含む。特に好ましい実施形態において、装置は２つの転位器を含み、両方の転位器は第１表面および／または第２表面のいずれかに対向して配置される。他の特に好ましい実施形態において、装置は同様に２つの転位器を含むが、１つの転位器は第１表面に対向して配置され、他の転位器は第２表面に対向して配置される。第３の好ましい実施形態において、異なる表面に対向して配置された２つの転位器は互いに対向して配置される。
【００５４】
転位器は、好ましくは第１表面および／または第２表面に、この表面間の距離に変化（すなわち、縮小）を起こさせる圧力を加えることによって、反応チャンバ内の溶液に少なくとも部分的な転位を起こさせるのに適した任意の材料から作ることができる。典型的に、転位器は非晶質材料から作られる。本明細書に用いられる用語「非晶質材料」は、原子の長い範囲で位置の規則性のない固体、すなわち、非結晶質材料を指す。そのような非晶質材料は中でも、酸化アルミニウムセラミックなどのセラミック材料、ボロフロートガラスなどのガラス、シリコーン、およびポリスチレンまたはポリテトラフロオロエチレン（Ｔｅｆｌｏｎ（登録商標））などの合成ポリマーを含む。場合によって、非晶質材料は光学的に透明、すなわち、光透過性とすることができる。適切な透明材料の例は、中でも、ガラスまたは窓ガラス、ボロフロートガラス、石英ガラス、トパーズガラス、サファイアガラスなどのガラス状材料、ならびにポリメチルメタクリレート、ポリカーボネート、ポリスチレン、またはアクリルなどの合成ポリマーを含む。本発明の装置が１つ以上の転位器を含む場合、それらの全ては同じ材料から作ることができ、またはそれらの少なくとも１つは異なる材料から作ることができる。
【００５５】
本発明の好ましい実施形態において、１つ以上の転位器の少なくとも１つは弾性的に変形可能な材料、すなわち、変形された後に、さらに外部操作を行うことなく独立に少なくとも実質的にその元の形状に復元する材料からつくることができる。場合によって、本発明によるそのような弾性的に変形可能な材料は、生物学的／化学的に不活性であり（すなわち、化学試薬および／または生物学的試薬に対して反応性がないか非常に低い）、光学的に透明および／または非自己蛍光であることがさらに好ましい。そのような材料の例は、中でも、シリコーンエラストマー、ポリウレタン、リン酸トリエチル、アクリル樹脂、およびアクリル酸塩、を含み、シリコーンエラストマーが特に好ましい。シリコンエラストマーは主として架橋したシリコーンポリマーから構成される。これらのポリマーは化学式［Ｒ２ＳｉＯ］ｎのＳｉ−Ｏ−主鎖を有し、式中、Ｒはメチル、エチル、フェニルなどの有機側基を表し、２つ以上のポリマーを架橋するのに使用することができる。Ｓｉ−Ｏ−主鎖の長さ、側基、架橋を変化させることによって、シリコーンは広範囲の特性および組成物で合成することができる。それらは液体からゲル、ゴム、硬質プラスチックへ矛盾なく変化することができる。最も一般的な種類は線状ポリジメチルシロキサンである。シリコーン材料の他の群はシリコーン樹脂に基づき、これは分岐およびカゴ状オリゴシロキサンによって形成される。特に好ましい実施形態において、弾性的に変形可能な材料は、シリコーンゴムおよびシリコーン油からなる群より選択される。さらに適切な材料は、パラゴム樹（Ｈｅｖｅａ ｂｒａｓｉｌｉｅｎｓｉｓ）から抽出される天然ゴム、ならびに例えば、イソプレン、（２−メチル−１，３−ブタジエン）、２−クロロ−１，３−ブタジエン、および架橋のための少量パーセントのイソプレンを備えるメチル−プロペンを含み、さまざまなモノマーの重合によって作ることのできるさらに他の合成ゴム（通常合成ゴムと呼ばれる）を含む。適切な合成ゴムの例は、中でも、スチレン−ブタジエンゴム、アクリロニトリル−ブタジエンゴム、ウレタンゴム、ポリエステルゴム、クロロプレンゴム、ブチルゴム、エピクロロヒドリンゴム、およびフォスファゼンゴムを含む。
【００５６】
本発明のいくつかの実施形態において、第１表面および／または第２表面は検出が行われる表面領域、すなわち検出領域（本明細書において「検出ゾーン」と呼ばれる）を含む。すなわち、分析すべき１種以上の粒子の定性的および／または定量的検出は、この表面の一方または両方のいずれかの個別の表面領域に限定され、例えば、粒子の検出および／または計数は、多分に、用いられる検出システムの空間的制約のため、第１表面および／または第２表面の中央部分だけで行うことが可能である。第１表面および／または第２表面の検出領域によって制限される反応チャンバの区画の容積は、定量的分析を可能にするために知られていることが好ましい。本発明のいくつかの実施形態において、第１表面と第２表面間の「検出領域」は、反応チャンバの中央に配置されるのが好ましい毛管間隙として設計され、この領域の表面間の距離は、場合によって反応チャンバの残りの部分の距離よりも短くすることができる。
【００５７】
本発明の他の実施形態において、第１表面および／または第２表面の少なくとも１つ以上の部分は弾性的に変形可能である。すなわち、それぞれの表面の１つ以上の部分は弾性的に変形可能な材料、例えば、１つ以上の転位器に関して上述した弾性膜から作られる。本発明による特に好ましい弾性膜はシリコーンゴムから作られる。したがって、一実施形態において、第１表面および／または第２表面の表面領域全体が弾性的に変形可能な材料から作ることができる。本発明の一実施形態において、反応チャンバ全体、すなわち、第１表面、第２表面、および側壁は弾性的に変形可能である。第１表面および／または第２表面の少なくとも１つ以上の弾性的に変化可能な部分は１つ以上の転位器に対向して配置されることが好ましい。したがって、転位器に対向して配置された本発明の装置の表面領域全体は弾性的に変形可能とすることができる。しかし、転位器に対向して配置されたそのような表面領域の少なくとも１つが弾性的に変形可能ではないことも可能である。本発明の好ましい実施形態において、第１表面および／または第２表面の少なくとも１つ以上の弾性的に変形可能な部分は検出が行われるそれぞれの表面領域とは異なる。
【００５８】
本発明によれば、第１表面および第２表面は同じ材料または異なる材料から作ることができる。さらに、第１表面および／または第２表面は、それぞれの表面領域の残りとは異なる材料から作られた表面領域を含むことも可能である。例えば、第１表面および／または第２表面の中央、場合によって矩形（ｒｅｃｔａｎｇｕｌａｒ）の表面領域などの１つの表面領域（すなわち、「窓」）が、透明材料から作られ、それぞれの表面領域（すなわち、「境界」）の残りが不透明材料から作られる。そのような透明な材料の「窓」は検出が行われる表面領域内に配置されることが好ましい。
【００５９】
本発明による装置の第１表面および／または第２表面の少なくとも一部は非晶質材料から作ることができる。本明細書に用いられる用語「非晶質材料」は、原子の長い範囲で位置の規則性のない固体、すなわち、非結晶質材料を指す。そのような非晶質材料の例は、中でも、酸化アルミニウムセラミックなどのセラミック材料、ボロフロートガラスなどのガラス、シリコーン、およびポリスチレンまたはポリテトラフロオロエチレン（Ｔｅｆｌｏｎ（登録商標））などの合成ポリマーを含む。
【００６０】
本発明の好ましい実施形態において、第１表面および／または第２表面の少なくとも一部は透明材料、すなわち、光透過性材料から作られる。適切な透明材料の例は、中でも、ガラスまたは窓ガラス、ボロフロートガラス、石英ガラス、トパーズガラス、サファイアガラスなどのガラス状材料、ならびにポリメチルメタクリレート、ポリカーボネート、ポリスチレン、またはアクリルなどの合成ポリマーを含む。
【００６１】
本発明による装置は、反応チャンバの第１表面および／または第２表面上に配設されたマイクロアレイ（本明細書において「アレイ」または「アレイ素子」とも呼ばれる）をさらに含むことができる。本明細書に用いられる「マイクロアレイ」は、支持体（「サブストレート」とも呼ばれる）上の捕捉分子（例えば、１種以上のプローブ分子または物質ライブラリー）が画定された空間的配置（レイアウト）を指し、マイクロアレイ内の各分子の位置は個別に求められる。マイクロアレイは特定のパターンに配置することのできる画定された部位または所定の領域、すなわち、いわゆるアレイ素子またはアレイ点を含むことが好ましく、各アレイ素子は１種の捕捉分子だけを含むことが好ましい。支持体上の捕捉分子の配置は共有反応または非共有反応によって生成することができる。マイクロアレイのための適切なサブストレートは、中でも顕微鏡スライド、ウェハ、またはセラミック材料を含む。しかし、捕捉分子は第１表面および／または第２表面上に直接不動化することもできる。
【００６２】
本発明による装置は、第１表面と第２表面の間の距離が縮小されるとき、反応チャンバの容積を本質的に一定に保つことの可能な１つ以上の手段をさらに含むことができる。すなわち、補償ゾーン（または「貯蔵器」）が提供され、この表面間の距離が縮小されるとき、第１表面と第２表面の間の反応チャンバ中に存在する任意の液体材料を転位することができる。本明細書に用いられる用語「本質的に一定」は、第１表面と第２表面の間の距離が縮小される際に、「圧縮された」状態の反応チャンバの容積が「圧縮されない」状態の元の容積と正確に同じではないことを理解すべきである。「圧縮された」状態の反応チャンバの容積は、「圧縮されない」状態の少なくとも９０％であることが好ましく、少なくとも９５％であることが特に好ましい。本発明のいくつかの実施形態において、検出可能な部位（すなわち、標識）または緩衝剤を含む薬剤など、本発明の方法を実施するために必要な任意の試薬は、好ましくは乾燥した形（例えば、粉体、顆粒またはペレットなど凍結乾燥された形）で補償ゾーンまたは貯蔵器に提供される。
【００６３】
これは弾性材料から作られた側壁によって側面境界が定められた反応チャンバを提供することによって達成されることが好ましい。本発明によれば、１つ以上の側面側壁は弾性材料から作ることができる。特に好ましい弾性材料はシリコーンゴムである。
【００６４】
いくつかの実施形態において、本発明の装置は、チャンバ本体をさらに含む。本明細書に用いられる用語「チャンバ本体」は、反応チャンバを取り囲む固体本体を指すものと理解すべきであり、第１表面、第２表面、および側面側壁によって形成される。
【００６５】
第１表面、第２表面、および１つ以上の側面側壁はチャンバ本体の一体化された部分とすることができる。すなわち、チャンバ本体の一体化された部分であるそれぞれの表面はチャンバ本体と同じ材料から作ることができる。替わりに、１つ以上の第１表面、第２表面、および／または１つ以上の側面側壁は、それぞれ、チャンバ本体とは他の材料から作ることができる。したがって、本発明の範囲内で、反応チャンバを画定する４つの表面全てを同じ材料から作ること、２つまたは３つの表面は同じ材料から作られるが、残りの表面は異なる材料から作られ、または各表面が異なる材料から作ることが可能である。
【００６６】
反応チャンバの境界を定める第１表面および／または第２表面および／または１つ以上の側面側壁は、１つ以上の開口部をさらに含むことができ、これらは閉止可能および／または封止可能であり、分析すべきサンプル、ならびに、場合によって、本発明の方法の実施に必要とされる任意の追加の試薬、検出薬剤などを直接導入するために用いることができる。替わりに、そのような開口部は、中でも、充填ユニット、処理ユニット、温度制御ユニット、特定の（すなわち、複雑な）検出ユニット、および廃棄物容器など、チャンバ本体の一体化された部分として設計されなかった、装置の任意の追加（補足）のモジュールを取り付けるために用いることもできる。反応チャンバと１つ以上のそのような追加のモジュールの間の接続は、中でも、剛性または可撓性チューブ、ノズル、カニューレ、針などの１つ以上を用いることによって達成することができ、これらは、反応チャンバおよび追加のモジュールに、それぞれ、中でも、圧入（「ルアーシステム」とも呼ばれる）またはツイストオン固定（「ルアーロックシステム」とも呼ばれる）によって取り付けることができ、ツイストオン固定が好ましい。両方のシステムは当分野で十分に確立されており、市場で入手可能である。
【００６７】
チャンバ本体は少なくとも部分的に非晶質材料、特に透明材料から作られることが好ましい。適切な材料は、中でもガラス、Ｍａｃｒｏｌｏｎ（商標）、ナイロン、ポリメチルメタクリレート、Ｔｅｆｌｏｎ（登録商標）などの合成材料、および高級鋼、アルミニウム、ブラスなどの金属を含む。いくつかの実施形態において、チャンバ本体は導電性材料から作られ、５〜３０％の炭素繊維を有するポリアミド、５〜３０％の炭素繊維を有するポリカーボネート、２〜２０％のステンレス鋼繊維を有するポリアミド、および５〜４０％の炭素繊維を有するポリフェニレンスルフィドからなる群より選択されることが好ましい。
【００６８】
本発明による装置は典型的に単独（すなわち、個別の）本体として操作される。しかし、１つのサンプルを並行して複数の分析を行うために、２つ以上のそのような装置を分離した反応チャンバを含む複式（ｍｕｌｔｉｐａｒｔ）システムに組み立てることも可能であり、上述の装置は複式システムの一部またはユニットまたは本体に相当する。したがって、さらに他の態様において、本発明は、少なくとも２つの部分を含み、この少なくとも２つの部分の各々が第１表面と第１表面に対向して配置された第２表面の間のチャンバ本体内に形成された反応チャンバと、１つ以上の転位器とを含むステムに関し、第１表面と第２表面の間の距離は、第１表面および／または第２表面の表面領域の少なくとも１つ以上の部分で１つ以上の転位器によって変化可能である。システムの少なくとも２つの部分の反応チャンバは互いに連通することができる。
【００６９】
本明細書に用いられる用語「互いに連通する」は、共通のサンプル導入通路などの追加の手段による、個別の反応チャンバ、充填ユニット、処理ユニットなどの間の直接または間接的なあらゆる相互接続を指す。しかし、本明細書に用いられる用語は、サンプルを導入した後、反応チャンバが互いに恒久的に流体連通していることを必ずしも意味しない。
【００７０】
好ましい実施形態において、システムは、少なくとも２つの装置の反応チャンバの各々と連通するサンプル導入通路をさらに含む。サンプル導入通路（本明細書において、「サンプル充填ゾーン」または「サンプル領域」とも呼ばれる）は、上述のように、分析すべきサンプルを導入するための１つ以上の閉止可能（ｌｏｃｋａｂｌｅ）なおよび／または封止可能な開口部を含むことができる。サンプル導入通路は、それぞれの反応チャンバがそこから分岐するチャンバとして構成することができる。サンプル導入通路と反応チャンバを接続する開口部は、同様に閉止可能および／または封止可能とすることができる。特に、サンプルをそのような複式システムの分離した反応チャンバに導入した後、さまざまな試薬（捕捉分子、標識など）を含む異なる反応チャンバからのサンプル溶液の混合を招き、したがって並行して実施すべき複数の個別の分析物の適切な検出を妨げる反応チャンバから共通のサンプル導入通路への液体の逆流を防止することが好ましい。
【００７１】
したがって、本発明のさらに他の好ましい実施形態において、システムは少なくとも２つの反応チャンバ間の過渡的な流体連通を可能にする１つ以上の手段をさらに含む。サンプル導入通路から分離した反応チャンバへ逆方向ではなく一方向流体連通だけが可能であることが特に好ましい。これはサンプル導入通路と反応チャンバ間の接続に、反応チャンバからのサンプルの逆流を防止する一方向弁を提供することによって達成されることが好ましい。
【００７２】
本発明の好ましい実施形態において、装置は反応チャンバに接続された検出システムをさらに含む。検出システムは、第１表面および／または第２表面に対向して配置されるのが好ましく、場合によって検出が行われる特定の表面領域に配置される。
【００７３】
適切な検出システムの選択は、場合によって検出に用いられる追加の薬剤（例えば、染料または標識）の存在または検出すべき粒子の種類など、いくつかのパラメーターによる。さまざまな光学的および非光学的検出システムは当分野では十分確立されている。本発明で用いることのできる検出システムの一般的な説明は、例えば、Ｌｏｔｔｓｐｅｉｃｈ，Ｆ．、およびＺｏｒｂａｓ Ｈ．（１９９８）、Ｂｉｏａｎａｌｙｔｉｋ，Ｓｐｅｋｔｒｕｍ Ａｋａｄｅｍｉｓｃｈｅｒ Ｖｅｒｌａｇ，Ｈｅｉｄｅｌｂｅｒｇ／Ｂｅｒｌｉｎ，Ｇｅｒｍａｎｙ、特に２３．３章および２３．４章に見ることができる。
【００７４】
本発明の好ましい実施形態において、検出システムは光学的検出システムである。一般に、本発明による方法の実施は、複雑な設備の使用を必要とせず、好ましくは蛍光、光学吸収、共鳴伝導などのパラメーターの測定に基づく簡単な検出システムを含む。
【００７５】
本発明による特に好ましい実施形態は、濁度計、比濁計（概観するには、例えば、Ｔｉｆｆａｎｙ，Ｏ．（１９８６）Ｆｌｕｏｒｏｍｅｔｒｙ，ｎｅｐｈｅｌｏｍｅｔｒｙ，ａｎｄ ｔｕｒｂｉｄｉｍｅｔｒｙ，ｉｎ Ｔｉｅｔｚ，Ｎ．Ｏ．（ｅｄ．）Ｔｅｘｔｂｏｏｋ ｏｆ Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ．ＷＢ Ｓａｕｎｄｅｒｓ Ｃｏ．，Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ，ＰＡ，ｐｐ．７８−９７参照）などの吸収測定に基づき、これは当分野において確立された光度計装置で達成することができる。両方の方法は、それぞれ光の透過または散乱の際のこの濁度効果の測定に基づいて溶液中の「曇り」または濁度の測定を可能にする。液体の濁度はその中に懸濁する粒子の存在によって起きる。光のビームが濁ったサンプルを通過すると、その強度が低下する。濁度計は非散乱光、すなわち、粒子の濁った溶液を透過する光の測定を指し、標準的な光度計を用いて行うことができる。他方、比濁計は、（側面）散乱光の測定である。この技術は、検出器が入射光ビームに対して所定角度で設定される特別な装置が必要である。
【００７６】
また、フルオロフォアで標識を付けたスペクトル的に励起された粒子の蛍光強度の比較に基づく検出システムは、本発明で好ましく用いられる。蛍光は、特定の波長の光で励起されたとき、特性的な吸収および放射挙動を起こすそれら自体の光を放射する特定分子の能力である。特に、蛍光信号の定量的検出は、蛍光顕微鏡の改良された方法によって行われる（概観するには、Ｌｉｃｈｔｍａｎ，Ｊ．Ｗ．，ａｎｄ Ｃｏｎｃｈｅｌｌｏ，Ｊ．Ａ．（２００５）Ｎａｔｕｒｅ Ｍｅｔｈｏｄｓ ２，９１０−９１９；Ｚｉｍｍｅｒｍａｎｎ，Ｔ．（２００５）Ａｄｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｅｎｇ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．９５，２４５−２６５を参照されたい）。それによって、それぞれ光吸収および光放射から得られる信号は１つ以上のフィルタおよび／または二色性結晶（ｄｉｃｈｒｏｉｔｅｓ）によって分離され、適切な検出器上に画像が形成される。データ解析はデジタル画像処理によって行われる。
【００７７】
画像処理は当分野によく知られているいくつかのソフトウェアパッケージ（Ｍａｔｈｅｍａｔｉｃａ Ｄｉｇｉｔａｌ Ｉｍａｇｅ Ｐｒｏｃｅｓｓｉｎｇ，ＥＩＫＯＮＡ、またはＩｍａｇｅ−ＰＲＯなど）で達成することができる。本発明は、反応チャンバからいかなる溶液の除去および／または転位（ｒｅｐｌａｃｅｍｅｎｔ）もしないで実施する（すなわち、検出は任意の拘束されない標識の存在中で実施され、不特定の信号バックグラウンドを発生させる）ことを意図するので、バックグラウンドノイズの補正を効率的かつ正確に可能にする画像処理ソフトウェアを使用することが好ましい。特定の信号の検出は信号の強度の相違を測定することによるだけではなく、やはり検出すべき粒子の形状によって決定される検出すべき信号の「形状」などの追加のパラメーターを同時に考慮することによって達成されることが特に好ましい。例えば、蛍光抗体で標識を付けた円形状の細胞などの円形粒子は、光学的検出中に記録された画像中の「円形信号」をもたらす。そのような目的に適した好ましいソフトウェアはＩｃｏｎｏｃｌｕｓｔソフトウェア（Ｃｌｏｎｄｉａｇ Ｃｈｉｐ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ ＧｍｂＨ，Ｊｅｎａ，Ｇｅｒｍａｎｙ）である。
【００７８】
本発明に用いることのできる他の光学検出システムは、共焦点蛍光顕微鏡とすることができ、対象物は点光源によってレンズの焦点面で照明される。点光源、対象物、および点光検出器は光学的な共役面に配置されることが重要である。そのような共焦点システムの例は、例えば、Ｄｉａｓｐｒｏ，Ａ．（２００２）Ｃｏｎｆｏｃａｌ ａｎｄ ２−ｐｈｏｔｏｎ−ｍｉｃｒｏｓｃｏｐｙ：Ｆｏｕｎｄａｔｉｏｎｓ，Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ ａｎｄ Ａｄｖａｎｃｅｓ，Ｗｉｌｅｙ−Ｌｉｓｓ，Ｈｏｂｒｏｋｅｎ，ＮＪに詳細が記載されている。本発明の蛍光光学システムは、自動焦点ではなく、例えば固定焦点の蛍光顕微鏡であるのが特に好ましい。
【００７９】
本発明による代替の装置において、分析物の電気化学的検出を行う手段は、例えば、第１表面および／または第２表面に接続された電極による酸化還元電位の変化の測定（例えば、Ｚｈｕ，Ｘ．ら（２００４）Ｌａｂ Ｃｈｉｐ．４，５８１−５８７参照）またはサイクリックボルトメトリー（例えば、Ｌｉｕ，Ｊ．ら（２００５）Ａｎａｌ．Ｃｈｅｍ．７７、２７５６−２７６１；およびＷａｎｇ，Ｊ．（２００３）Ａｎａｌ．Ｃｈｅｍ．７５，３９４１−３９４５参照）によって提供される。さらに、電気的検出を行う手段は、例えば、インピーダンス測定によって提供することも可能である（例えば、Ｒａｄｋｅ，Ｓ．Ｍ．ら（２００５）Ｂｉｏｓｅｎｓ．Ｂｉｏｅｌｅｃｔｒｏｎ．２０，１６６２−１６６７参照）。
【００８０】
典型的に、本発明による装置およびシステムは内蔵式である。すなわち、分析の実施中に必ずしもサンプルおよび／または反応チャンバ中のいかなる他の試薬の取り出しおよび／または転位を必要としない。したがって、本発明による装置およびシステムの好ましい実施形態はサンプル入口を含むが出口を含まない。
【００８１】
さらに他の態様において、本発明は、
（ａ）検出すべき１種以上の粒子を含むと思われるサンプルを反応チャンバ中に配置することと、
（ｂ）反応チャンバ内のサンプルの少なくとも一部を１つ以上の転位器によって転位することと、
（ｃ）１種以上の粒子の存在および／または数を示す値を検出／判定することとを含む、粒子の定性的および／または定量的検出の方法を提供する。
【００８２】
本発明の好ましい実施形態において、「サンプルを反応チャンバに配置する」は、このサンプルを上述の本発明の装置またはシステムの反応チャンバ中に導入することを含む。
【００８３】
本発明のさらに他の特に好ましい実施形態において、方法は、
（ａ）複数の粒子を含むサンプルを反応チャンバ中に配置することと、
（ｂ）反応チャンバ内のこの複数の粒子の部分集合を１つ以上の転位器によって転位することと、
（ｃ）ステップ（ｂ）で転位された粒子の部分集合の数を示す１つ以上の値を測定することとを含む。
場合によって、方法は、
（ｄ）ステップ（ｃ）で得られた１つ以上の値から、反応チャンバ中の複数の粒子の総数を計算することをさらに含む。
【００８４】
本発明のいくつかの実施形態において、ステップ（ｃ）の定量的検出／判定は、サンプル中の１種以上の粒子の計数、例えば、生物学的サンプルの細胞の計数を含む。
【００８５】
本明細書に用いられる用語「サンプル」は、本発明による装置を用いて分析され、検出すべき１種以上の粒子を含むと思われる液体を指す。分析すべきサンプルは生物学的サンプルであることが好ましい。本発明を用いて分析することのできる液体サンプルの例は、中でも、有機および無機化学溶液、飲料水、下水、全血液、血漿、血清、尿、唾液、サルビアまたは髄液などのヒトまたはヒト以外の体液、動物からの細胞抽出物、植物または組織培養物、原核生物細胞および真核生物細胞懸濁物、ファージ製剤などを含む。サンプルは、希釈剤、溶剤、または場合によって反応チャンバ中へ導入（配置）する前にサンプルの精製および／または処理から得ることのできる緩衝剤などの１つ以上の追加の薬剤をさらに含むことができる。
【００８６】
分析すべきサンプルは本発明を実施するとき、検出すべき１種以上の粒子を含むことができる。本明細書に用いられる用語「粒子」は、本発明の方法を実施することによってその検出が可能な、特定の結合挙動および／または特有の反応性を有する任意のものを指す。したがって、用語「粒子」は、文字通り細胞またはウイルスなどの「真の」粒子であると解釈されるだけでなく、検出すべき分子、特に、核酸、タンパク質、脂質、および炭水化物などの（生物学的）巨大分子、ならびに分析すべきサンプルに存在しまたは加えられたあらゆる（合成）粒子に対して結合親和性を有する類似物および／またはその混合物を含むものと理解すべきである。
【００８７】
用語「粒子」に伴って本明細書に用いられる用語「種」は、特定の種類の粒子、すなわち、例えば特定の種類の細胞または特定のファージを指す。したがって、用語「１種以上の」は１つ以上の異なる種類の細胞など、１つ以上の異なる種類の粒子を指す。
【００８８】
本発明による「真の」粒子は、天然ならびに合成粒子を含む。そのような天然粒子の例は、中でも、原核生物細胞（例えば、大腸菌または枯草層などのバクテリア細胞）、真核生物細胞（例えば、サッカロマイセスセレヴィシエなどのイースト細胞、Ｓｆ９またはＨｉｇｈ５細胞などの昆虫細胞、ＨｅＬａまたはＣｏｓ細胞などの不動化細胞ライン、および哺乳動物血液細胞などの一次細胞）またはウイルス（例えば、Ｍ１３またはＴ７ファージなどのファージ粒子）を含む。合成粒子の例は、中でも、場合によって本発明によって検出すべき１種以上の分子でコーティングされた（常磁性）ポリスチレンビーズおよびラテックスビーズ、特に核酸、タンパク質、脂質、または炭水化物など１種以上の（生物学的）巨大分子を含む。
【００８９】
分析すべきサンプルは、第１表面、第２表面および／または１つ以上の側面側壁に存在する閉止可能および／または封止可能な１つ以上の開口部を経由して、反応チャンバ中に直接導入することができる。サンプルは、場合によって追加の試薬と一緒に、適切な圧力発生手段、例えば、ピペット、注射器、または例えば、処理装置の機能ユニットとすることのできる自動化ユニットを用いて反応チャンバ中に移動することができる。替わりに、例えば、反応チャンバを画定する任意の表面に存在する開口部の１つにサンプルを隣接させて配置することによって、外部操作なしで毛管力によってサンプルを反応チャンバ中に導入することもできる。
【００９０】
本発明の方法の特定の実施形態において、サンプルは１つ以上の転位器を操作することによって発生した負の圧力によって反応チャンバ中に導入される。この実施形態において、最初に、すなわち、サンプルを加える前に、反応チャンバの少なくとも１つ以上の部分の第１表面と第２表面間の距離、または言い換えれば、第１表面および／または第２表面の表面領域の少なくとも１つ以上の部分の距離は、１つ以上の転位器によって第１および／または第２表面に向かって圧力を加えることによって縮小する。距離はゼロまたはほとんどゼロの値に向かって縮小することが好ましい。次いで、この縮小した距離は、転位器を再設定することによって（すなわち、それを後方向に動かすことによって）好ましくは初期の値まで再び拡大され、したがって反応チャンバ内に負の圧力が発生し、したがって、サンプルは反応チャンバ中に導入される。
【００９１】
本発明の方法は、方法を実施する間、反応チャンバ中のサンプルおよび／または他のいかなる試薬の除去および／または転位を必要とせずに行うことが意図される。特に、例えば、用いられる検出方法の信号対ノイズ比を向上させるために、そのような除去／転位に必要な水洗または洗浄ステップを必要としないことは本発明の方法の利点である。しかし、いくつかの用途は、対象粒子のさらに他の検出を可能にするために、反応チャンバ中への追加の試薬、例えば任意の標識を含む１つ以上の薬剤の導入を必要とする。そのような追加の溶液も、上述のように、サンプルの導入前、またはサンプルと同時に、またはサンプルが反応チャンバ中に導入された後に直接反応チャンバ中に導入することができる。好ましい実施形態において、追加の試薬は特に粉、顆粒、またはペレットなどの凍結乾燥／乾燥形状でサンプルを加える前に装置内（例えば、補償ゾーン中）に提供される。
【００９２】
替わりに、分析すべきサンプル、および場合によってさらに他の試薬の導入は１つ以上の充填ユニットによって間接的に可能である。
【００９３】
本発明の範囲内で、「充填ユニット」は、本発明の装置の一体化された部分、または充填するための反応チャンバにそれを取り付けて、使用後に取り外すことのできる分離した部分として設計することのできる反応チャンバの充填手段を意味する。本発明で分析すべき液体サンプルを保持することができ、反応チャンバに（可逆的に）接続することのできる任意の容器を充填ユニットとして用いることができる。反応チャンバと充填ユニット間の接続は、中でも、管、ノズル、カニューレ、針など、既に上述した手段によって達成することができる。所与のサンプルは、反応チャンバへの直接導入について上述したように同様に充填ユニットの１つ以上の閉止可能および／または封止可能な開口部中に導入することができる。
【００９４】
特定の実施形態において、装置の反応チャンバに充填ユニットを接続するために１つ以上のカニューレが用いられる。用いられるカニューレは反応チャンバに含まれる１つ以上の開口部の閉止および／または封止を貫通する。本発明に用いられる好ましいカニューレは、高級鋼または合成ポリマーから作られ、通常０．０５ｍｍ〜２ｍｍの直径を有する。好ましくは、２つのカニューレが配置され、１つがサンプルを反応チャンバ中に導入するために用いられ、他の１つは過剰のガス状材料および／または余剰の液体を反応チャンバから取り出すために用いられる（詳細の説明は、その関連内容が本明細書に完全に参照されている国際公開第０１／０２０９４号を参照されたい）。
【００９５】
充填ユニットは一体化された、または取り外し可能な分離した廃棄物容器を含むことができ、反応チャンバからの余剰媒体を取り出す働きをする。場合によって、廃棄物容器は、さらに可逆的または非可逆的に余剰物質と結合するガス状、液体、中でも、セルロース、フィルタ材料、およびシリカゲルなどの固体充填媒体を含む。さらに、廃棄物容器は１つ以上の空気孔を含むことができ、または、廃棄物容器への余剰材料の移動を向上するためにその内部に真空を与えることができる。
【００９６】
充填ユニットは、充填ユニットが反応チャンバのそれぞれの取り付け部位に正確に嵌合する、すなわち、充填ユニットが反応チャンバに対して正確に配置され、閉止可能および／または封止可能な開口部などの好ましい部位で、１つ以上のカニューレ、ノズルなどによって充填ユニットを反応チャンバに接続することを可能にする機械的手段をさらに含むことができる。そのような機械的手段は、中でも、特別に設計されたスナップ固定具またはスプリング固定具を含む。機械的手段は、サンプル、および場合によって任意の試薬を反応チャンバ中へ導入した後、充填ユニットの取り外しが可能であることが好ましい。
【００９７】
本発明の一つの利点は、１０μｌ未満の容積のサンプルを分析できることである。典型的に、サンプル容積は１〜１，０００μｌ、好ましくは１〜１００μｌ、さらに好ましくは１〜２５μｌ、最も好ましくは１〜５μｌの範囲である。
【００９８】
本発明の装置および方法は、水洗および洗浄ステップの実施を必要とせずに所与のサンプル中の任意の粒子の定性的および／または定量的検出が可能なように特別に設計されるので、分析すべきサンプルは他に精製を必要とせずに反応チャンバに導入することができる。しかし、場合によって、例えばさらに他の検出を妨害する可能性のあるあらゆる原料汚染物を除去するために、少なくとも部分的にサンプルを精製することが好ましい。そのようなサンプルの（部分的な）精製は異なる方法によって、例えば、それを反応チャンバへ導入する前にサンプルを濾過することによって達成することができる。
【００９９】
さらに、本発明の装置の反応チャンバ全体へのサンプルの拡散を妨げる比較的高い粘度のため、分析すべきサンプルの希釈が必要であり得る。サンプルの拡散はサンプルに希釈剤を加えることによって容易に達成することができる。適切な希釈剤の例は、中でも、水、有機および無機溶媒、リン酸緩衝食塩水などを含む。希釈剤はサンプルを装置へ導入する前に加えることができ、または上述のように、充填ユニットおよび／または反応チャンバに直接加えることができる。
【０１００】
サンプルおよび場合によって任意の追加の試薬を反応チャンバに導入した後、または１つ以上の充填ユニットから反応チャンバ中に移動した後、場合によってサンプルは反応チャンバ中で所与の時間インキュベートして反応空間全体に適切に拡散させることができる。典型的に、インキュベーション期間は１秒〜３０分間、好ましくは１０秒〜１５分間、特に好ましくは３０秒〜１０分間の範囲である。
【０１０１】
いくつかの好ましい実施形態において、本発明による方法は、ステップ（ｂ）を行う前に、各々１つ以上の検出可能な部分を含む１つ以上の薬剤を装置の反応チャンバ中へ導入することをさらに含む。すなわち、１つ以上の検出可能な部分を含む薬剤はサンプルを導入する前、または上述のように、サンプルが直接または充填ユニットを経由して導入された後に、サンプルと同時に反応チャンバ中に導入することができる。
【０１０２】
本明細書に用いられる用語「１つ以上の検出可能な部分を含む薬剤」は、化学的、物理的または酵母反応中に、直接または間接的に検出可能な化合物または信号を発生する１つ以上の適切な化学物質または酵素（すなわち、１つ以上の「部分」）を含む任意の化合物を指す。したがって、そのような薬剤は、この粒子との相互作用の形成可能性によって、１種以上の対象粒子の検出に必要であり、または検出を容易にする。
【０１０３】
本明細書に用いられる用語は、検出可能なマーカー（「標識」とも呼ばれる）ならびに１つ以上のそのような検出可能なマーカーに結合した任意の化合物などの両方を含むものと理解すべきである。
【０１０４】
好ましい実施形態において、１つ以上の薬剤は、核酸、ペプチド、プロテインドメイン、プロテイン、炭水化物、低分子量化学化合物、およびその類似品および／または混合物からなる群より選択される。
【０１０５】
本発明で用いることのできる核酸の例は、デオキシリボ核酸（ＤＮＡ）またはリボ核酸（ＲＮＡ）などの天然核酸、ならびに、中でも、ペプチド核酸（ＰＮＡ）または固定核酸（ＬＮＡ）などの核酸類似物を含む。天然核酸の特定な例は、ゲノムＤＮＡまたはｃＤＮＡ分子などのＤＮＡ配列、ならびにｈｎＲＮＡまたはｍＲＮＡ分子などのＲＮＡ配列、またはその逆補完核酸配列を含む。そのような核酸は任意の長さとすることができ、単一ストランドまたは二重ストランド分子のいずれかとすることができ、単一ストランド分子が好ましい。典型的に、本発明に用いられるそのような核酸は長さ１０〜１０００ベース、好ましくは１５〜５００ベース、さらに好ましくは２０〜１００ベース、特に好ましくは２０〜４０ベースである。
【０１０６】
本発明による薬剤として用いることのできるペプチド、プロテインドメイン、またはプロテインは、天然、ならびに例えば、組み換えＤＮＡ技術によってまたは化学合成によって人工的に設計された分子を含む。そのようなプロテイン系分子の設計および調製の方法は、当分野に十分確立されている（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ，Ｊ．ら（１９８９）Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ，Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，２ｎｄ ｅｄ．，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹを参照されたい）。典型的に、本発明のペプチド薬剤は長さ２〜２００アミノ酸、好ましくは２〜１００アミノ酸、さらに好ましくは５〜５０アミノ酸、特に好ましくは１０〜２５アミノ酸である。
【０１０７】
本明細書に用いられる用語「プロテインドメイン」は、リガンド結合または触媒活性などを示す特定の機能に関して定義されるポリペプチド配列の一部を指す。そのようなプロテインドメインの好ましい例は、中でも、抗体のファブフラグメント、Ｇ−プロテイン結合受容体、受容体チロシンキナーゼまたは核受容体などの細胞受容体のリガンド結合ドメイン、およびレクチンの炭水化物結合ドメインである。
【０１０８】
本発明の薬剤として使用できる炭水化物の例は、グルコースまたはフルクトースなどの単糖、ラクトースまたはスクロースなどの二糖、ならびに少糖およびデンプンなどの多糖を含み、単糖が好ましい。
【０１０９】
本明細書に用いられる用語「低分子量化学化合物」は、少なくとも２つの炭素原子であるが好ましくは７つ以下の回転可能な炭素結合を含み、分子量が１００〜２，０００ダルトンの範囲、好ましくは１００〜１，０００ダルトンの範囲であり、場合によって１つまたは２つの金属原子を有する、好ましくは有機分子の分子を指す。そのような分子の例は、中でも、イミダゾール、インドール、イソキサゾール、オキサゾール、ピリジン、ピリミジン、およびチアゾールを含む。
【０１１０】
本発明により使用することのできる検出可能なマーカーまたは標識は、化学的、物理的または酵母反応中に、直接または間接的に検出可能な化合物または信号を発生する任意の化合物を含む。標識は、中でも、酵母標識、着色標識、蛍光標識、発色標識、ルミネセント標識、放射能標識、ハプテン、ビオチン、金属錯体、金属、およびコロイド状金から選択し得ることが好ましく、蛍光標識が特に好ましい。これらの全ての種類の標識は当分野に十分確立されている。そのような標識によって媒介される物理反応の好ましい例は、放射能標識を用いるとき、Ｘ線の照射または励起または放射の際の蛍光または燐光放射である。アルカリ性リン酸塩、セイヨウワサビペルオキシダーゼ、β−ガラクトシダーゼ、およびβ−ラクタマーゼは酵母標識の例であり、発色反応生成物の形成を触媒反応させ、本発明に用いることができる。好ましい酵母標識は、特に３−アミノ−９−エチルカルバゾール、４−クロロ−１−ナフトール、３，３’−ジアミノベンジジン、および３，３’，５，５’−テトラメチル−ベンジジンからなる群より選択される物質と共にセイヨウワサビペルオキシダーゼであり、３，３’，５，５’−テトラメチル−ベンジジンは特に好ましい。
【０１１１】
本発明の好ましい実施形態において、１つ以上の検出可能な部分を含む１つ以上の薬剤は１種以上の検出すべき粒子に直接結合し、本発明において、そのような結合は典型的に「全体として」の粒子ではなく、この粒子の表面上の１種以上の特定分子、好ましくは核酸またはプロテインなどの巨大分子に起きることに留意されたい。そのような「表面分子」は、細胞の表面に天然に生成する分子（例えば、Ｇ−プロテイン結合受容体または特別の炭水化物部分などの細胞表面受容体）とすることができ、または例えば、ビオチン／アビジン結合によって常磁性ビーズに結合した核酸分子（「捕捉分子」または「分子プローブ」とも呼ばれる）を粒子の表面に人工的に被覆することができる。標識反応、すなわち、１つ以上の検出可能な部分を本発明の薬剤に付着させることは、本発明の装置の外側で、すなわち、サンプルを導入する前に行うことができ、または装置の中で直接行うことができ、場合によって既に上で述べた充填ユニット中で行うことができる。標識付与は当分野でよく知られている方法によって達成することができる（例えば、上述のＳａｍｂｒｏｏｋ，Ｊ．ら、およびＬｏｔｔｓｐｅｉｃｈ，Ｆ．、および上述のＺｏｒｂａｓ Ｈ．参照）。
【０１１２】
各々１つ以上の検出可能な部分を含む１つ以上の薬剤は、それらが結合する特定な「表面分子」（またはそれらの粒子）に結合親和性を有することが好ましい。そのような薬剤の例は、中でも、抗体ならびにそのフラグメント（例えば、ファブフラグメント）、抗体状分子（例えば、アンチカリン）およびＤＮＡ−またはＲＮＡ−結合プロテインならびにそのフラグメントを含む。本発明に用いるべき適切な抗体または抗体フラグメントは、検出すべき特定の分析物に対して発生する一次抗体、および一次抗体が発生した動物種の免疫グロブリンＧに対して発生する二次抗体の両方を含む。標識付与は薬剤を上述の１つ以上の検出可能なマーカーに結合させることによって達成される。
【０１１３】
他の好ましい実子形態において、各々１つ以上の検出可能な部分を含む１つ以上の薬剤、および検出すべき粒子上の「表面分子」（またはそれらの粒子）は、反応チャンバ中に存在する間に互いに分子相互作用を行うことが可能である。最終的に、これらの分子相互作用は適切な検出方法を用いて検出される。
【０１１４】
場合によって任意の追加の試薬と一緒に、反応チャンバ中へサンプルを導入した後、サンプルの少なくとも一部は１つ以上の転位器によって反応チャンバ内に転位される。本明細書に用いられる用語「転位される」は、第１表面と第２表面の間の距離を、第１表面および／または第２表面の表面領域の少なくとも１つ以上の部分で、好ましくは、この表面の１つまたは両方のいずれかまたはその少なくとも１つ以上の部分に圧力を加えることによって１つ以上の転位器によって変化させること、好ましくは縮小させることによって、サンプルが反応チャンバ内を動かされると理解すべきである。したがって、この表面の表面領域全体を通して第１表面と第２表面間の距離を変化させること、または反応チャンバの一終端部など表面領域の一部だけの距離を変化させること、または、反応チャンバの両終端部などの表面領域の少なくとも２つの個別部分で第１表面と第２表面の間の距離を変化させること、はいずれも本発明の範囲内である。
【０１１５】
第１表面と第２表面間の距離の変化、好ましくは縮小は、第１表面および／または第２表面を１つ以上の転位器によって互いに対して縦に動かすことによって達成される。本明細書に用いられる用語「縦の動き」は、装置の表面の１つまたは両表面のそれらのそれぞれの表面領域に垂直または実質的に垂直の動きを指し、したがって、それらの間の距離の変化をもたらす。第１表面と第２表面間の距離の変化は、２つの表面のいずれか１つをいずれかの方向に縦に動かすこと、または両方の表面を同時に反対方向に動かすことによって達成することができる。したがって、装置の第１表面と第２表面間の距離の縮小は、第１表面またはその少なくとも１つ以上の部分を第２表面に向かって動かすこと、第２表面またはその少なくとも１つ以上の部分を第１表面に向かって動かすこと、または両方の表面またはそれぞれその少なくとも１つ以上の部分を互いに向かって動かすことによって達成することができる。逆に、装置の第１表面と第２表面間の距離の拡大は、第１表面を第２表面から離すように動かすこと、第２表面を第１表面から離すように動かすこと、または両方の表面を互いに離すように動かすことのいずれかによって達成することができる。この１つ以上の転位器によって、圧力および／または吸引を１つの表面または両方の表面に加えることによって第１表面と第２表面間の距離を変化させることが特に好ましい。本発明の範囲内で、所与の装置中に存在するすべての転位器によって、またはその少なくとも１つだけを使用して他の少なくとも１つの転位器は使用せずに、圧力および／または吸引を同時に加えることが可能である。したがって、例えば、２つの転位器を含む本発明の装置において、反応チャンバ内のサンプルを転位するために、両方の転位器によって、またはその１つだけで第１表面および／または第２表面の少なくとも一部に圧力および／または吸引を同時に加えることが可能である。
【０１１６】
したがって、上で定義した異なる種類の転位器の観点から、第１表面と第２表面（以降において、用語「第１表面」および／または「第２表面」はそれぞれの表面領域の少なくとも一部も指すことを理解すべきである）の間の距離の変化、好ましくは縮小に関する異なるモードが考えられ、最終的に反応チャンバ内のサンプルの少なくとも一部の転位がもたらされる。
【０１１７】
第１に、転位器がこの表面間の距離を縮小するための第１表面または第２表面の一体化された部分（例えば、反応チャンバの内部に延在する凸状体として設計された転位構造）を構成する場合、転位構造を含むそれぞれの表面を対向側の表面に向かって縦に動かすこと、対向表面を転位構造を含む表面に向かって縦に動かすこと、または両方の表面を互いに対して縦に動かすことが可能である。場合によって、「一体化された」転位構造に対向する表面もそれぞれの（すなわち、反対側の）位置に転位器を含み、同様に表面に一体化することも、または以下に説明するように操作される、転位体とすることができる。それぞれの表面の縦の動きは、転位体型の１つ以上の転位器またはこの表面の縦の動きを可能にする１つ以上の追加の手段によって達成することができる。そのような手段は装置の第１表面および／または第２表面に一体化または取り付けることができ、または独立の本体を含むことができる。いくつかの実施形態において、１つ以上の手段は人間の指、棒、ピン、タペット、およびネジからなる群より選択される。装置が自動化処理システムに一体化されるならば、反応チャンバに接続されたスタンプまたはプランジャーなどの１つ以上の手段を用いて第１表面および／または第２表面に圧力を加えることができる。表面に圧力を加えるための他の手段は、単に人間の手でそれらを互いに押し圧することである。
【０１１８】
第２に、転位器がこの表面の間の距離を縮小させるための転位体の形で存在する場合、この転位器を表面に向かって動かすことによって、それに対向して転位器が配置されたそれぞれの表面に圧力を加えることができ、表面領域の少なくともこの部分は場合によって弾性的に変形可能な材料から作ることができる。転位器によるそれぞれの表面の（弾性的な）変形、すなわち、表面の縦方向の「動き」は、第１表面と第２表面間の距離の縮小をもたらす。場合によって、第２転位器は反応チャンバの他の「側」の上述の転位体に対向して配置することができる。この第２転位器はそれぞれの表面に一体化された転位構造、またはそれに対向して配置された他の転位体のいずれかとすることができる。第２転位器の縦の動きは第１転位器とは逆方向に起きる。
【０１１９】
反応チャンバの第１表面と第２表面間の距離を表面領域の少なくとも１つ以上の部分で縮小させることは、距離が縮小したそれぞれの部位で同時に（空間的に制限された）反応空間が減少する。したがって、分析すべきサンプルは少なくとも部分的にこれらの部位から連続的に転位され、反応チャンバ内を、好ましくは補償ゾーンへ「動かされ」、反応チャンバの容積を本質的に一定に保つ。
【０１２０】
第１表面と第２表面間の少なくとも１つ以上の部分で距離が縮小された後、以下に説明するように、直ちに検出を行うことが可能である。
【０１２１】
本明細書に用いられる用語「１種以上の粒子の存在および／または数を示す値を検出／判定する」は、サンプル中の所与の粒子の定性的および／または定量的測定を可能にする導電性、酸化還元電位、蛍光強度または生物発光などのパラメーターの測定を指す。本発明の範囲内で、これらのパラメーターの１つだけを測定することができるが、１つ以上のパラメーター（例えば、導電性および適切な標識によって発生した蛍光信号の強度）を同時にまたは連続的に測定することも可能である。
【０１２２】
検出は上述のように、第１表面および／または第２表面の検出領域間に配置された反応チャンバの部分で行われるのが好ましい。反応チャンバのこの部分は「検出ゾーン」とも呼ばれる。定量的測定、すなわち、粒子の計数については、それぞれ容積の知られた反応チャンバおよび検出ゾーンを含む装置を用いることが好ましい。
【０１２３】
しかし、本方法のこの段階で、反応チャンバの第１表面と第２表面の少なくとも１つ以上の部分間の距離を再拡大させることが好ましい。反応チャンバの第１表面と第２表面の間の元の距離、すなわち、縮小前の距離を再現することが特に好ましい。これは、少なくとも１つの転位構造の縦の動き、および場合によってこの表面の逆方向の縦の動きを可能にする上述の手段の縦の動きによって、すなわち、それぞれの表面または表面領域への圧力印加を停止することによって、達成することができる。場合によって、第１転位器による圧力を加えることによって所与の表面領域で縮小された第１表面と第２表面の間の距離の再拡大は、第２転位器による圧力を加えて他の表面領域の距離を縮小させることによって改善することができる。両方の転位器は、同じ表面に対向して、すなわち、第１表面または第２表面のいずれか、または異なる表面に対向して配置することのできる転位体であることが好ましい。第１表面および／または第２表面の少なくとも１つ以上の表面領域で２つの表面間の距離を再拡大することは、同時に２つの表面間の（場合によって空間的に制限された）反応空間の増加をもたらす。さらに、好ましくは与えられた補償ゾーン中の反応空間内の転位されたサンプルは、逆方向に拡散して戻る。したがって、上述のように、第１表面および／または第２表面の表面領域の異なる部位に配置された、反対方向に操作される少なくとも２つの転位器を用いることによって、反応チャンバ内のサンプルの連続的な転位、したがって混合を達成することができる。
【０１２４】
本発明の特に好ましい実施形態において、後続の第１表面と第２表面の少なくとも１つ以上の部分間の距離の縮小と再拡大は、少なくとも２回繰り返される。第１表面と第２表面の少なくとも１つ以上の部分間の距離が２つ以上の連続的な「圧縮／弛緩サイクル」の間に縮小される大きさは、同じであることが好ましい。すなわち、装置の圧縮された状態の２つの表面間の距離は一定に保たれる。しかし、第１表面と第２表面の少なくとも１つ以上の部分間の距離が２つ以上の連続的な「圧縮／弛緩サイクル」の間に縮小される大きさは、例えば、サイクル数を増加させて大きさを拡大させることによって変化させることも可能である。続いてこの距離の縮小と再拡大は、サンプルが反応チャンバ内に均一に配分されるまで、すなわち、平衡状態が確立されるまで繰り返され、これはサンプル中の粒子の計数など定量的分析の信頼性にとって重要である。したがって、反応チャンバの特定の「検出ゾーン」内で検出を行うとき、（反応チャンバ全体ならびに「検出ゾーン」の容積が知られているならば）この領域内で繰り返された検出ステップの平均値を求めることによって反応チャンバ全体内の粒子の実際の数の正確な測定値が得られる。実施することのできる縮小と再拡大のサイクル数は実施者の考えによる。典型的に、サイクル数は２〜２０００の範囲、好ましくは１０〜１５００の範囲、さらに好ましくは５０〜１０００の範囲、特に好ましくは１００〜５００の範囲である。
【０１２５】
本発明によれば、１種以上の粒子の存在および／または数を示す値の検出／判定は反応チャンバの第１表面と第２表面間の距離の縮小と再拡大の各サイクルの後に行うことができるが、検出はこの距離が縮小された後に行うことが好ましい。しかし、検出を数回繰り返し、例えば、２回目または５回目の縮小／再拡大サイクルごとの後に繰り返すことも可能である。さらに、最後の縮小／再拡大サイクルの完了の後に１度だけ検出を実施することも可能である。好ましい実施形態において、検出は各縮小／再拡大サイクルの後に行われる。本発明の他の好ましい実施形態において、検出は、定量的分析がサンプル中に存在している１種以上の粒子の総数を示すことのできる測定値としてそれまでに行われた検出ステップで得られた結果の平均値を求めることをさらに含む。例えば、２回目の縮小／再拡大サイクルの後、それぞれ１回目および２回目の縮小／拡大サイクルの後に得られた結果の平均値が計算され、３回目の縮小／再拡大サイクルの後、それぞれ１回目、２回目、３回目の縮小／拡大サイクルの後に得られた結果の平均値が計算され、以降繰り返される。検出の１つ以上のサイクルで得られたデータは、当業者には知られている適切なコンピュータソフトウェアを用いて解析し、数学的に処理されて粒子の存在の測定および／または数の計算を行うことができる。
【０１２６】
検出すべき特定の種類ならびに用いられる検出可能なマーカーの性質に応じて検出は様々な方法によって行うことができ、それらの全ては当分野に確立されている（例えば、上述のＡｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．ら、Ｃｏｌｉｇａｎ、Ｊ．Ｅ．ら（２０００）Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，Ｈｏｂｏｋｅｎ，Ｎ．Ｊ；および上述のＬｏｔｔｓｐｅｉｃｈ，Ｆ．，および上述のＺｏｒｂａｓ．Ｈ．参照）。
【０１２７】
したがって、本発明による方法の実施は、一般に複雑なまたは嵩高の装置を必要とせず、好ましくは蛍光、光学吸収、共鳴伝導などのパラメーターの測定に基づく簡単な検出システムを含む。本発明による特に好ましい検出システムは、既に上で述べたように、濁度計、比濁計などの吸収測定に基づき、これは当分野に確立された光度計装置で達成することができる。それらの簡単さにかかわらず、これらの方法はサンプル中の１種以上の所与の粒子の存在だけでなく、その数の正確な判定を可能にする（概観するには、例えば、Ｔｉｅｔｚ，Ｎ．Ｏ．（ｅｄ）．Ｔｅｘｔｂｏｏｋ ｏｆ Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ．ＷＢ Ｓａｕｎｄｅｒｓ Ｃｏ．，Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ，ＰＡ，ｐｐ．７８−９７参照）。
【０１２８】
さらに特に好ましい検出システムは、落射蛍光または暗視野蛍光顕微鏡などの蛍光信号を測定する「古典的な」方法に基づく（例えば、Ｌａｋｏｗｉｃｚ，Ｊ．Ｒ．（１９９９）Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ ｏｆ Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ Ｓｐｅｃｔｒｏｓｃｏｐｙ，２ｎｄ ｅｄ．，Ｐｌｅｎｕｍ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏｒｐ．，ＮＹに概説される）。
【０１２９】
本発明に用いることのできるさらに他の蛍光検出方法は、中でも、全内部蛍光顕微鏡（例えば、Ａｘｅｌｒｏｄ，Ｄ．（１９９９）Ｓｕｒｆａｃｅ ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ ｍｉｃｒｏｓｃｏｐｙ ｗｉｔｈ ｅｖａｎｅｓｃｅｎｔ ｉｌｌｕｍｉｎａｔｉｏｎ，ｉｎ：Ｌａｃｅｙ，Ａ．（ｅｄ）Ｌｉｇｈｔ Ｍｉｃｒｏｓｃｏｐｙ ｉｎ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｏｘｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，３９９−４２３参照）、蛍光寿命画像形成顕微鏡（例えば、Ｄｏｗｌｉｎｇ，Ｋ．ら（１９９９）Ｊ．Ｍｏｄ．Ｏｐｔｉｃｓ ４６，１９９−２０９参照）、蛍光共鳴エネルギー移動（例えば、Ｐｅｒｉａｓａｍｙ，Ａ．（２００１）Ｊ．Ｂｉｏｍｅｄ．Ｏｐｔｉｃｓ ６，２８７−２９１）、生物蛍光共鳴エネルギー移動（例えば、Ｗｉｌｓｏｎ，Ｔ．，ａｎｄ Ｈａｓｔｉｎｇｓ，Ｊ．Ｗ．（１９９８）Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｃｅｌｌ Ｄｅｖ．Ｂｉｏｌ．１４，１９７−２３０参照）、蛍光相関分光（例えば、Ｈｅｓｓ，Ｓ．Ｔ．ら（２００２）Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ４１，６９７−７０５参照）を含む。
【０１３０】
上述の検出システムの代替は、例えば、国際公開第００／１２７５９号、第００／２５１１３号、第９６／２７０２５号に記載されている白色光設定、例えば、米国特許第５，３２４，６３３号、米国特許第６，０２７，８８０号、米国特許第５，５８５，６３９号、および国際公開第００／１２７５９号に記載されている共焦システム、例えば、米国特許第５，７６０，９５０号に記載されているＮｉｐｋｏｗディスクに基づく共焦励起システム、例えば、国際公開第９９／２７１４０号に記載されている微小光学系を用いる大規模集積蛍光検出システム、例えば、国際公開第００／１２７５９号に記載されているレーザー走査システムを含む。そのような従来の検出システムを用いる検出方法の全体的な説明は例えば、米国特許第５，３２４，６３３号に見ることができる。
【０１３１】
さらに、上で既に説明したように、例えば、第１表面および／または第２表面に接続された電極による酸化還元電位変化を測定することによって（例えば、Ｚｈｕ，Ｘ．ら（２００４）Ｌａｂ．Ｃｈｉｐ．４，５８１−５８７参照）、またはサイクリックボルトメトリーによって（例えば、Ｌｉｕ，Ｊ．ら（２００５）Ａｎａｌ．Ｃｈｅｍ．７７，２７５６−２７６１およびＷａｎｇ，Ｊ．（２００３）Ａｎａｌ．Ｃｈｅｍ．７５，３９４１−３９４５参照）、電気化学的検出方法を用いることができる。さらに、電気的検出方法は、例えば、インピーダンス測定によって用いることができる（例えば、Ｒａｄｋｅ，Ｓ．Ｍ．ら（２００５）Ｂｉｏｓｅｎｓ．Ｂｉｏｅｌｅｃｔｒｏｎ．２０，１６６２−１６６７参照）。また、検出は、例えば、Ｚ．Ｇｕｔｔｅｎｂｅｒｇら（２００５）Ｌａｂ．Ｃｈｉｐ．５，３０８−３１７に記載された音響表面波の検出手段によって達成することができる。
【０１３２】
本発明の特定の実施形態において、検出はＦＲＥＴまたはＢＲＥＴを用いて行われ、これは、目標分子が多孔質マトリックス上に不動化された捕捉分子に結合した際に蛍光信号だけが発生するように、それぞれ蛍光または生物発光停止対が形成されることに基づく。また、ＦＲＥＴの使用も例えば、Ｌｉｕ，Ｂ．ら（２００５）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ １０２、５８９−５９３、およびＳｚｏｌｌｏｓｉ，Ｊ．ら（２００２）Ｊ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．８２，２５１−２６６に記載されている。ＢＲＥＴの使用は、例えば、Ｐｒｉｎｚ，Ａ．ら（２００６）Ｃｈｅｍｂｉｏｃｈｅｍ．７，１００７−１０１２、およびＸｕ，Ｙ．ら（１９９９）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ９６，１５１−１５６に詳細が説明されている。
【０１３３】
本発明は、単に本発明の特定の実施形態を例示するためであり本発明の範囲を制限するものとは解釈されない以下の図面および実施例によってさらに説明される。
【０１３４】
図１は、本発明による分析装置の概略の断面図を示す。装置の反応チャンバは第１表面、第２表面、ならびに側面側壁によって画定され、第２表面の少なくとも中央領域は弾性的に変形可能な材料から作られる。装置は、第２表面に対向して配置された転位体の形の転位器をさらに含む。第１表面と第２表面の間の距離は、転位器によって第２表面に圧力を加えることによって変化可能である。反応チャンバは、チャンバ本体内に配置されて封止される。光学検出システムは反応チャンバの第１表面に対向して配置される。
【０１３５】
図２は転位体の形の２つの転位器を含む装置を用いる本発明の分析の概略図である。これらの転位器の１つは、第１表面に対向して配置され、他の１つは装置の第２表面に対向して配置される。さらに、転位器は、それらが互いに対向して位置するように配置される。第１表面および第２表面は、少なくとも転位器に対向して配置されたそれぞれの表面領域が弾性的に変形可能な材料から作られる。複数の粒子を含むサンプルは、特定種の粒子に対して結合親和性のある標識と一緒に反応チャンバ内に配置されている。２つの転位器で第１表面および第２表面に圧力を加えることによって、この表面間の距離は反応チャンバの中央部で縮小され、したがって、反応チャンバ内（好ましくは、補償ゾーン（図示せず））のサンプルは少なくとも部分的な転位が行われる。さらに、２つの表面間の距離を縮小することによって「間隔」が形成され、それらの存在および／または数を示す値を記録することによって特別に標識を付けられた粒子の検出が行われる。その後、２つの転位器をその元の位置に再設定することによって（すなわち、表面への圧力印加を停止することによって）、表面間の距離を再拡大することが好ましい。したがって、転位されたサンプルは「戻され」、再び距離を縮小する前に反応チャンバ全体に再分配される。「検出ゾーン」内で行われた繰り返し検出ステップ中に得られた結果の平均値を求めることによって、（反応チャンバならびに「検出ゾーン」の容積が知られているならば）反応チャンバ全体内の検出すべき標識を付けた粒子の正確な総数の測定値が得られる。
【０１３６】
図３は、装置の２つの終端領域において同じ表面（下の「第１表面」とも呼ばれる）に対向して配置された転位体の形の２つの転位器を含む装置を用いる本発明の代替の分析の概略図である。反応チャンバの中央部分は所定の容積を有する毛管間隙として構成される。２つの転位器に対向して配置された第１表面のそれぞれの表面領域は、弾性的に変形可能な材料から作られる。複数の粒子を含むサンプルは、特定種の粒子に結合親和性のある標識と一緒に反応チャンバ内に配置されている。第１転位器によって反応チャンバの１つの終端領域で第１表面に圧力を加えることによって、第１表面と第２表面の間の距離は反応チャンバのこの部分で縮小され、他の終端領域に向かって反応チャンバ内のサンプルの転位が起きる。続いて、他の終端領域に配置されたそれぞれの第２転位器は転位された液体によってその元の位置に押し戻され、反応チャンバのこの部分で第１表面と第２表面の間の距離の拡大がもたらされる。サンプルの転位は、検出が行われる毛管間隙内の反応チャンバに存在する標識を付けた粒子の個別部分集合の配置をもたらす。続いて、第２転位器によって第１表面に圧力を加えることによって、サンプルは「戻り方向に」反応チャンバ内に転位され、毛管間隙内の標識を付けた粒子の他の個別部分集合の配置をもたらす。したがって、反対方向に操作される２つの転位器を用いることによって、反応チャンバ内のサンプルの連続的な転位、したがって混合も達成される。「検出ゾーン」内で行われた繰り返し検出ステップ中に得られた結果の平均値を求めることによって、（反応チャンバの容積が知られているならば）反応チャンバ全体内の検出すべき標識を付けた粒子の正確な総数を計算することができる。
【０１３７】
図４は、本発明の装置とシステムならびにその対応する動作モードの特定の実施形態を示す。図４Ａ（頂部図）は第１表面と第２表面によって画定されたチャンネルとして構成され、補償ゾーンまたは貯蔵器の一端部へ達する単一装置または部分を概略的に示す。貯蔵器の少なくとも一部は弾性的に変形可能な材料から作られる。この貯蔵器領域内に、好ましくは乾燥した形で試薬（緩衝剤または標識）を提供することができる。転位器は貯蔵器（図示せず）の１つの表面に対向して配置される。装置の対向端部にサンプル導入通路（すなわち、サンプル充填ゾーン）が提供される。チャンネルは特定の検出領域（すなわち、検出ゾーン）を含む。そのような装置または部分の少なくとも２つは、分離した反応チャンバを含む複数部分のシステムに組み立てて、１つのサンプルに複数の並行分析を行うことができる。それぞれの反応チャンバは共通のサンプル導入通路によって互いに連通する。図４Ａ（中間および底部図）は、それぞれ２つおよび３つの装置を含むそのような複数部分システムの２つの例示的実施形態を示す。図４Ｂは、ユニットが（単一装置または複数システムの部分のいずれかとして）どのように操作されるかを概略的に図示する。上部図はその初期状態の装置の断面図である。特定の検出領域を包含するチャンネルは、剛性の第１表面（ハッチング部）と弾性的に変形可能な材料（「皮膜」）から作られた第２表面によって境界が定められる。転位器（「ステンシル」）は貯蔵器の第２表面に向かって押し圧され、第１表面と第２表面の間のこの表面領域の距離は、好ましくはゼロまたはゼロに近い値に縮小される。１滴の液体サンプルがサンプル導入通路に置かれ、転位器の解放（すなわち、逆方向の動きによって）から得られる負の圧力によって反応チャンバ中に導入され、したがって、貯蔵器の弛緩がもたらされる（図４Ｂ、中間図）。最終的に転位器は再び貯蔵器の第２表面に向かって押し圧される。このようにして、２つの表面間のこの表面領域の距離がもう１回縮小することによって、サンプルは反応チャンバ内に少なくとも部分的に配置される。したがって、貯蔵器の連続的な圧縮と弛緩の繰り返しによって１種以上の粒子の検出が行われる前にサンプルの攪拌／混合を達成することができる（図４Ｂ、下部図）。
【０１３８】
図５は、ヒトの血液中のＣＤ４＋細胞の数を判定するための本発明による分析結果を示す。ヒトの血液中のＣＤ４＋細胞サンプルは、ＣＤ３ＣＤ４キットを用い、製造者（ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｈｅｉｄｅｌｂｅｒｇ，Ｇｅｒｍａｎｙ）の使用説明書に従って抗ＣＤ４＋フィコエリスリン共役モノクローナル抗体で標識を付けた。血液サンプルは５００細胞／μｌ未満の濃度に希釈し、ポリジメチルシロキサンから作られた毛管チャンネルとして構成された反応チャンバ中で分析した。反応チャンバは約２μｌの総容積を有した。サンプルを毛管力によって反応チャンバ中に導入した後、反応チャンバの１つの表面にタペットによって圧力を加えることによって攪拌し、サンプルを部分的に転位した。このようにしてサンプルの転位を１０回繰り返した。標識を付けた細胞を、１０倍対物レンズ（画像視野１７２７×１３８５μｍ）とＦｌ−ＦＩＴＣフィルタ（Ｚｅｉｓｓ（登録商標） ＃０９）を備える顕微鏡（Ａｋｉｏｓｋｏｐ；Ｃａｒｌ Ｚｅｉｓｓ ＧｍｂＨ，Ｊｅｎａ，Ｇｅｒｍａｎｙ）を用いる光学検出によって分析した。露出時間は２５００ｍｓであった。検出は５〜７回繰り返した。代表的な顕微鏡画像を示す。サンプル中のＣＤ４＋細胞の数は適切なコンピュータソフトウェアパッケージ（ＮＩＨ Ｉｍａｇｅ推奨の公開ドメインＪａｖａ（登録商標）画像処理プログラム、イメージ Ｊ ソフトウェア バージョン１．７１）を用いて、個々の測定で得られた細胞数の平均値を計算することによって求めた。画像視野、したがって「検出ゾーン」の容積ならびに反応チャンバの容積は知られており、ＣＤ４＋細胞／サンプルμｌの濃度を計算することができた。
【０１３９】
図６は、フローサイトメトリーによって得られたヒトの血液中のＣＤ４＋細胞数と本発明による分析の比較をそれぞれ示す。ヒトの血液サンプルのＣＤ４＋細胞は、図５に説明したように標識を付けた。サンプルはＧｕａｖａ（登録商標） ＰＣＡフローサイトメーター（Ｇｕａｖａ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｉｎｃ．，Ｈａｙｗａｒｄ，ＣＡ，ＵＳＡ；励起波長５３２ｎｍ、放射波長：５８０〜５８３ｎｍ）を用いて、製造者の使用説明書に従い、ならびに図５に説明した本発明の分析によって分析した。結果は５〜７測定の平均値±ＳＥＭであり、１μｌ血液中のＣＤ４＋細胞の数として表わされる。
【０１４０】
（実施例１）
ヒトの血液中のＣＤ４＋細胞の存在の判定
ヒトの血液サンプルのＣＤ４＋細胞は、ＣＤ３ＣＤ４キットを用い、製造者（ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｈｅｉｄｅｌｂｅｒｇ，Ｇｅｒｍａｎｙ）の使用説明書に従って抗ＣＤ４＋フィコエリスリン共役モノクローナル抗体（ＣＤ４−ＰＥ）で標識を付けた。簡単に、１０μｌの血液を２μｌのＣＤ４−ＰＥ（１：２５に希釈した原溶液）と２μｌ ２０ｍＭのＥＤＴＡに混合した。次いで、混合物を暗所で１５分間インキュベートした。
【０１４１】
血液サンプルは５００細胞／μｌの濃度に希釈し（高濃度は装置の適切な取り扱いを妨げる）、ポリジメチルシロキサン、すなわち、弾性的に変形可能な材料から作られた、毛管チャンネルとして構成された反応チャンバ中で分析した。反応チャンバは２．０４８ｍｍ×０．０４ｍｍ×２４ｍｍのサイズであり、したがって、約２μｌの総容積を有する。
【０１４２】
サンプルを導入するために、２．５μｌの希釈した血液サンプルをチャンネルの開口部に隣接させて置き、他に外部から操作することなく、毛管力によって導入した。その後、タペット（またはピンセット）で反応チャンバの１つの表面に圧力を加えることによって反応チャンバを攪拌し、サンプルの部分的な転位を起こさせた。このようなサンプルの転位を１０回繰り返した。
【０１４３】
次いで、標識を付けた細胞を、１０倍対物レンズ（画像視野１７２７×１３８５μｍ）とＦｌ−ＦＩＴＣフィルタ（Ｚｅｉｓｓ（登録商標） ＃０９）を備える顕微鏡（Ａｋｉｏｓｋｏｐ；Ｃａｒｌ Ｚｅｉｓｓ ＧｍｂＨ，Ｊｅｎａ，Ｇｅｒｍａｎｙ）を用いる光学検出によって分析した。露出時間は２５００ｍｓであった。検出は、５〜７回繰り返された。代表的な顕微鏡画像を図５に示す。
【０１４４】
サンプル中のＣＤ４＋細胞の数は、適切なコンピュータソフトウェアパッケージ（ＮＩＨ Ｉｍａｇｅ推奨の公開ドメインＪａｖａ（登録商標）画像処理プログラム、イメージ Ｊ ソフトウェア バージョン１．７１）を用いて、個々の測定で得られた細胞数の平均値を計算することによって求めた。画像視野、したがって「検出ゾーン」の容積ならびに反応チャンバの容積は知られており、ＣＤ４＋細胞／μｌサンプルの濃度を計算することができた。
【０１４５】
（実施例２）
ヒトの血液中のＣＤ４＋細胞の数を測定するためのフローサイトメトリーと本発明の分析の比較
本発明の分析が定量的分析に適しているかどうかを試験するため、ヒトの血液中のＣＤ４＋細胞数の測定について従来のフローサイトメトリーと比較した。ヒトの血液サンプル中のＣＤ４＋細胞を実施例１で説明したようにして標識を付けた。サンプルはＧｕａｖａ（登録商標） ＰＣＡフローサイトメーター（Ｇｕａｖａ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｉｎｃ．，Ｈａｙｗａｒｄ，ＣＡ，ＵＳＡ；励起波長５３２ｎｍ、放射波長：５８０〜５８３ｎｍ）を用いて、製造者の使用説明書に従い、ならびに実施例１に説明した本発明の分析によって分析した。結果は図６に示され、５〜７測定の平均値±ＳＥＭで表わされる。結果は、１μｌ血液中のＣＤ４＋細胞の数として表わされる。
【０１４６】
２つの方法について得られた平均値ならびにそれぞれのパーセントの差を以下の表にまとめる。
【表１】
【０１４７】
見ることができるように、実施した９つの独立分析中の５つの中で２つの方法の間の変化は５％未満であり、３つの場合１０％未満である。分析Ｎｏ．６だけはより高い約３０％の変化が得られたが、この場合２つの分析が並行して、すなわち同一の血液サンプルで実施されなかったことによるものである。しかし、他の結果は本発明の方法が生物サンプル中の粒子の定量的検出に適していることを明らかに示している。
【０１４８】
本明細書に図示した本発明は、本明細書で特別に説明されなかった要素または複数の要素、制限または複数の制限なしに適切に実施することができる。したがって、例えば、用語「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」、「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」、「包含する（ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ）」等は拡張して制限なく解釈すべきである。さらに、本明細書に用いられた用語および表現は説明用語として非制限的に用いられ、そのような用語および表現を用いる上で、示され説明された特徴のいかなる等価またはその部分を排除する意図は存在せず、特許請求された本発明の範囲内でさまざまな修正を加えることが可能であるものと理解される。したがって、本発明は好ましい実施形態および任意選択的な特徴によって特別に開示されたが、本明細書に開示されそこで実施される本発明の修正および変更は当業者であれば容易に到達することができ、そのような修正および変更は本発明の範囲内であると考えられるものと理解すべきである。
【０１４９】
本明細書において本発明は広く一般的に説明した。一般的な開示範囲内のより狭い種群および亜群の各々も本発明の部分を形成する。これは、削除された材料が特に本明細書に記載されているかどうかにかかわらず、いかなる主題も種から取り除かないという条件で、または制限なしで、本発明の一般的な説明を含む。
【０１５０】
他の実施形態は以下の特許請求の範囲内である。さらに、本発明の特徴または態様はマーカッシュグループに関して説明され、当業者であれば、本発明は、説明されるマーカッシュグループの個別メンバーまたは部分メンバーに関してもそれによって説明されることを理解する。
【図面の簡単な説明】
【０１５１】
【図１】光学検出システムを含む本発明の分析装置の概略断面図である。
【図２】装置の異なる側に互いに対向して配置された２つの転位器を含む装置を用いる本発明の分析の概略図である。
【図３】装置の同じ側の異なる位置に配置された２つの転位器を含む装置を用いる本発明の分析の概略図である。
【図４Ａ】本発明の分析装置または本発明の分析システムの特定の実施形態を示す図である。
【図４Ｂ】本発明の分析装置または本発明の分析システムの操作モードの特定の実施形態を示す図である。
【図５】ヒトの血液中のＣＤ４＋細胞の数を求めるための本発明による分析の結果を示す図である。
【図６】フローサイトメトリーによって得られたヒトの血液中のＣＤ４＋細胞数の比較および本発明による分析を示す図である。
【特許請求の範囲】
【請求項１】
粒子の定性的および／または定量的検出のための装置であって、
（ａ）第１表面と第２表面の間のチャンバ本体内に形成され、第２表面が第１表面に対向して配置された反応チャンバと、
（ｂ）１つ以上の転位器とを含み、
第１表面と第２表面の間の距離が第１表面および／または第２表面の表面領域の少なくとも１つ以上の部分で１つ以上の転位器によって変化可能である、装置。
【請求項２】
１つ以上の転位器が第１表面および／または第２表面に対向して配置される、請求項１に記載の装置。
【請求項３】
２つの転位器を含む、請求項１または２に記載の装置。
【請求項４】
両方の転位器が第１表面または第２表面のいずれかに対向して配置される、請求項３に記載の装置。
【請求項５】
１つの転位器が第１表面に対向して配置され、他の転位器が第２表面に対向して配置される、請求項３に記載の装置。
【請求項６】
２つの転位器が互いに対向して配置される、請求項５に記載の装置。
【請求項７】
１つ以上の転位器が弾性的に変形可能な材料から作られる、請求項１から６のいずれか一項に記載の装置。
【請求項８】
弾性的に変形可能な材料がシリコーンゴムおよびシリコーン油からなる群より選択される、請求項７に記載の装置。
【請求項９】
第１表面および／または第２表面が、検出を行う表面領域を含む、請求項１から８のいずれか一項に記載の装置。
【請求項１０】
第１表面および／または第２表面の少なくとも１つ以上の部分が弾性的に変形可能である、請求項１から９のいずれか一項に記載の装置。
【請求項１１】
少なくとも１つ以上の弾性的に変形可能な部分が１つ以上の転位器に対向して配置される、請求項１０に記載の装置。
【請求項１２】
少なくとも１つ以上の弾性的に変形可能な部分が、検出を行う表面領域と異なる、請求項１０または１１に記載の装置。
【請求項１３】
第１表面および／または第２表面の少なくとも１つの部分が非晶質材料から作られる、請求項１から１２のいずれか一項に記載の装置。
【請求項１４】
非晶質材料が透明材料である、請求項１３に記載の装置。
【請求項１５】
第１表面と第２表面間の距離が０ｍｍ〜１ｍｍの範囲で可変である、請求項１から１４のいずれか一項に記載の装置。
【請求項１６】
反応チャンバが弾性的に変形可能であるとき、反応チャンバの容積を本質的に一定に保つことを可能にする１つ以上の手段をさらに含む、請求項１から１５のいずれか一項に記載の装置。
【請求項１７】
１つ以上の手段が反応チャンバの側面境界を定める弾性側壁である、請求項１６に記載の装置。
【請求項１８】
検出システムをさらに含む、請求項１から１７のいずれか一項に記載の装置。
【請求項１９】
検出システムが光学システムである、請求項１８に記載の装置。
【請求項２０】
少なくとも２つの部分を含むシステムであって、少なくとも２つの部分の各々が、
（ａ）第１表面と第２表面の間のチャンバ本体内に形成され、第２表面が第１表面に対向して配置された反応チャンバと、
（ｂ）１つ以上の転位器とを含み、
第１表面と第２表面の間の距離が第１表面および／または第２表面の表面領域の少なくとも１つ以上の部分で１つ以上の転位器によって変化可能であり、少なくとも２つの部分の反応チャンバが互いに連通する、システム。
【請求項２１】
少なくとも２つの装置の反応チャンバの各々に連通するサンプル導入通路をさらに含む、請求項２０に記載のシステム。
【請求項２２】
少なくとも２つの反応チャンバ間の過渡的な流体連通を可能にする１つ以上の手段をさらに含む、請求項２０または２１に記載のシステム。
【請求項２３】
（ａ）検出すべき１種以上の粒子を含むと思われるサンプルを反応チャンバ中に配置することと、
（ｂ）反応チャンバ内のサンプルの少なくとも一部を１つ以上の転位器によって転位することと、
（ｃ）１種以上の粒子の存在および／または数を示す値を検出／判定することとを含む、粒子の定性的および／または定量的検出方法。
【請求項２４】
サンプルを配置することが、前記サンプルを請求項１から１９のいずれか一項に記載の装置の反応チャンバ、または請求項２０から２２のいずれか一項に記載のシステムの１つ以上の反応チャンバ中に導入することを含む、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
サンプルを導入することが、
（ａ）サンプルを加える前に、１つ以上の転位器によって第１表面と第２表面の間の距離を反応チャンバの少なくとも１つ以上の部分で縮小させることと、
（ｂ）前記縮小された距離を再拡大して、負の圧力によって反応チャンバ中へサンプルを導入させることとを含む、請求項２４に記載の方法。
【請求項２６】
第１表面と第２表面の間の距離を第１表面および／または第２表面の表面領域の少なくとも１つ以上の部分で変化させることによって、サンプルの少なくとも部分が転位される、請求項２３から２５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７】
第１表面と第２表面の間の距離が縮小される、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
１つ以上の転位器の少なくとも１つによって第１表面および／または第２表面に圧力を加えることによって距離が縮小される、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】
サンプルの少なくとも部分を転位した後、縮小された距離が実質的に再拡大される、請求項２６から２８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０】
距離の縮小および後続の再拡大が少なくとも２回繰り返される、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
第１表面と第２表面の間の距離が縮小された後に、ステップ（ｃ）が行われる、請求項２７から３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２】
ステップ（ｃ）が、それまでに行われた検出ステップで得られた結果の平均値を求めることをさらに含む、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
（ａ）複数の粒子を含むサンプルを反応チャンバ中に配置することと、
（ｂ）反応チャンバ内の前記複数粒子の部分集合を１つ以上の転位器によって転位することと、
（ｃ）ステップ（ｂ）で転位された粒子の部分集合の数を示す１つ以上の値を求めることとを含む、請求項２３から３２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３４】
（ｄ）ステップ（ｃ）で得られた１つ以上の値から反応チャンバ中の複数の粒子の総数を計算することをさらに含む、請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
ステップ（ｂ）を行う前に、各々１つ以上の検出可能な部分を含む１つ以上の薬剤を反応チャンバ中に配置／導入することをさらに含む、請求項２３から３４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６】
１つ以上の薬剤が、核酸、ペプチド、プロテインドメイン、プロテイン、炭水化物、低分子量化学化合物、およびその類似品および／または混合物からなる群より選択される、請求項３５に記載の方法。
【請求項３７】
１つ以上の薬剤が検出すべき１つ以上の粒子に結合親和性を有する、請求項３５または３６に記載の方法。
【請求項３８】
１つ以上の薬剤と検出すべき粒子に互いの分子相互作用を行わせ、ステップ（ｃ）において前記分子相互作用が検出される、請求項３５から３７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３９】
サンプルが生物サンプルである、請求項２３から３８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４０】
検出すべき１種以上の粒子が、原核生物細胞、真核生物細胞、およびウイルス粒子からなる群より選択される、請求項２３から３９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４１】
サンプルの複数の粒子を検出チャンバ内に配置することと、
複数の粒子の適切な部分集合だけが残るように、複数の粒子のいくつかを検出チャンバから転位することと、
複数の粒子の部分集合の粒子を光学的に検出することと、
検出された粒子に基づいて、粒子の部分集合の粒子数を示す値を求めることとを含む方法。
【請求項４２】
適切な部分集合の粒子数を示す値に基づいて、サンプル中の粒子の数または存在量を示す値を求めることをさらに含む、請求項４１に記載の方法。
【請求項４３】
サンプル中の粒子の数または存在量を示す値を求めることが、検出チャンバの検出容積のサイズにさらに基づき、部分集合の粒子数を示す値が光学的な検出ステップの際の検出容積に存在する粒子数を示す、請求項４２に記載の方法。
【請求項４４】
サンプルの複数の粒子を検出チャンバ内に配置し、検出チャンバから複数の粒子のいくつかを転位するステップをＮＲ回繰り返すことを含み、いずれの場合にも複数の粒子の適切な部分集合だけが残るようにされ、ＮＲ≧２である、請求項４１に記載の方法。
【請求項４５】
ＮＲ繰り返しの数ＮＤについて、光学的に複数粒子の部分集合の粒子を検出すること、および検出された粒子に基づいて粒子の適切な部分集合の粒子数を示す値を求めることを含み、ＮＤ≧ＮＲである、請求項４４に記載の方法。
【請求項４６】
ＮＤ≧５である、請求項４５に記載の方法。
【請求項４７】
ＮＤ≧１０およびＮＲ≧５である、請求項４６に記載の方法。
【請求項４８】
適切な部分集合の粒子数を示すＮＲ値の数ＮＶに基づいてサンプル中の粒子の数、または存在量を示す値を求めることをさらに含む、請求項４５に記載の方法。
【請求項４９】
ＮＤ≧１０およびＮＲ≧ＮＶ≧５である、請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】
配置と転位のステップをＮＲ回繰り返すことが、ＮＲ回繰り返しごとに転位された複数粒子の少なくともいくつかを検出チャンバに再導入することを含む、請求項４１に記載の方法。
【請求項５１】
検出チャンバに流体連通する貯蔵器内の検出チャンバから転位された粒子を受けとることをさらに含む、請求項５０に記載の方法。
【請求項５２】
受けとることが貯蔵器の壁を拡張することを含む、請求項５１に記載の方法。
【請求項５３】
再導入が、貯蔵器の壁を収縮されることを含む、請求項５２に記載の方法。
【請求項５４】
複数の粒子のいくつかを転位することが検出チャンバの容積を減少させることを含む、請求項５１に記載の方法。
【請求項５５】
検出チャンバの容積を減少させることが、チャンバの第１壁と第２壁間の距離を縮小させることを含む、請求項５４に記載の方法。
【請求項５６】
光学的な検出ステップが第１壁を通過した光を検出することを含む、請求項５５に記載の方法。
【請求項５７】
転位の前に、検出チャンバが初期の容積を有し、転位の後にチャンバが転位された容積を有し、初期容積に対する転位された容積の比が０．２５以下である、請求項５１に記載の方法。
【請求項５８】
比が０．１５以下である、請求項５７に記載の方法。
【請求項５９】
比が０．０５以下である、請求項５７に記載の方法。
【請求項６０】
検出チャンバ内に存在するサンプルの初期の容積を転位する前に、サンプルが液体であり、転位ステップが、検出チャンバから少なくともいくらかの液体サンプルを転位することを含み、転位されたサンプルの容積に対する残るサンプルの容積の比が０．２５以下である、請求項５０に記載の方法。
【請求項６１】
比が０．１５以下である、請求項６０に記載の方法。
【請求項６２】
比が０．０５以下である、請求項６０に記載の方法。
【請求項６３】
再導入ステップが、転位されたサンプルの少なくとも５０％を検出チャンバに再導入することを含む、請求項６０に記載の方法。
【請求項６４】
転位されたサンプルの少なくとも７０％を検出チャンバに再導入することを含む、請求項６３に記載の方法。
【請求項６５】
転位されたサンプルの少なくとも８０％を検出チャンバに再導入することを含む、請求項６３に記載の方法。
【請求項６６】
転位されたサンプルの少なくとも９０％を検出チャンバに再導入することを含む、請求項６３に記載の方法。
【請求項６７】
複数粒子のいくつかを転位することが検出チャンバの容積を減少させることを含む、請求項４１に記載の方法。
【請求項６８】
検出チャンバの容積を減少させることが、チャンバの第１壁と第２壁の間の距離を縮小させることを含む、請求項６７に記載の方法。
【請求項６９】
光学的な検出ステップが、第１表面を通過した光を検出することを含む、請求項６８に記載の方法。
【請求項７０】
転位の前に、検出チャンバが初期の容積を有し、転位の後にチャンバが転位された容積を有し、初期の容積に対する転位された容積の比が０．２５以下である、請求項６７に記載の方法。
【請求項７１】
比が０．１５以下である、請求項７０に記載の方法。
【請求項７２】
比が０．０５以下である、請求項７０に記載の方法。
【請求項７３】
第２部分集合の粒子数を示す値を求めるステップが、部分集合の粒子数を示す値を求めるステップの後に行われる、請求項４１に記載の方法。
【請求項７４】
粒子が細胞である、請求項４１から７３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７５】
サンプルが少なくともいくらかの血液材料を含む、請求項７４に記載の方法。
【請求項７６】
サンプルの複数の粒子を検出チャンバ内に配置することと、
複数の粒子の適切な部分集合だけが残るように、複数の粒子のいくつかを検出チャンバから転位することと、
複数粒子の部分集合の粒子を光学的に検出することと、
粒子の部分集合の中の目標粒子の存在を求めることとを含む方法。
【請求項７７】
検出チャンバ内のサンプルの複数の粒子を配置し、検出チャンバから複数の粒子のいくつかを転位するステップをＮＲ回繰り返すことを含み、いずれの場合にも複数の粒子の適切な部分集合だけが残るようにされ、ＮＲ≧２である、請求項７６に記載の方法。
【請求項７８】
ＮＲ繰り返しの数ＮＤについて、複数粒子の部分集合の粒子を光学的に検出すること、および検出された粒子に基づいて、粒子の部分集合中の目標粒子の存在を求めることを含み、ＮＤ≧ＮＲである、請求項７７に記載の方法。
【請求項７９】
ＮＤ≧５である、請求項７７に記載の方法。
【請求項８０】
ＮＤ≧１０およびＮＲ≧５である、請求項７８に記載の方法。
【請求項８１】
サンプルの第１の複数粒子を検出チャンバ内に配置することと、
検出チャンバの容積を減少させることと、
検出チャンバ内の粒子を光学的に検出することと、
検出された粒子に基づいて検出チャンバ内に存在する粒子数を示す値を求めることと、
検出チャンバの容積を増加させることと、
サンプルの第２の複数粒子を検出チャンバ内に配置することと、
検出チャンバの容積を減少させることと、
検出された粒子に基づいて、検出チャンバ内に存在する粒子数を示す値を求めること、とを含む方法。
【請求項８２】
複数粒子を含むサンプルを受けとるように構成された検出チャンバと、
複数粒子の適切な部分集合だけが残るように検出チャンバから複数粒子のいくつかを転位するように構成されたアクチュエータと、
粒子の部分集合の粒子を検出するように構成された検出器と、
検出された粒子に基づいて、適切な粒子の部分集合の粒子数を示す値を求めるように構成されたプロセッサとを含む装置。
【請求項８３】
装置が、アクチュエータを操作して（ａ）転位された複数の粒子の少なくともいくつかを検出チャンバ中に再導入し、続いて（ｂ）複数粒子の適切な第２部分集合だけが残るように検出チャンバから複数粒子のいくつかを転位するように構成され、プロセッサが、第２の適切な部分集合の粒子を検出するために検出器を操作し、検出された粒子に基づいて粒子の第２の適切な部分集合の粒子数を示す値を求めるように構成される、請求項８２に記載の装置。
【請求項８４】
検出チャンバから転位された粒子を受けとることができ、その粒子から検出チャンバへ再導入することのできる貯蔵器をさらに含む、請求項８３に記載の装置。
【請求項８５】
貯蔵器が膨張可能な壁を含む、請求項８４に記載の装置。
【請求項８６】
プロセッサが、適切な部分集合の粒子数を示す値に基づいてサンプル中の粒子数または存在量を示す値を求めるように構成される、請求項８２に記載の装置。
【請求項８７】
複数の粒子を含むサンプルを受けとるように構成された検出チャンバと、
複数粒子の適切な部分集合だけが残るように検出チャンバから複数粒子のいくつかを転位するように構成されたアクチュエータと、
粒子の部分集合の粒子を検出するように構成された検出器と、
検出された粒子に基づいて、粒子の部分集合の粒子中の目標粒子の存在を測定するように構成されたプロセッサとを含む装置。
【請求項１】
粒子の定性的および／または定量的検出のための装置であって、
（ａ）第１表面と第２表面の間のチャンバ本体内に形成され、第２表面が第１表面に対向して配置された反応チャンバと、
（ｂ）１つ以上の転位器とを含み、
第１表面と第２表面の間の距離が第１表面および／または第２表面の表面領域の少なくとも１つ以上の部分で１つ以上の転位器によって変化可能である、装置。
【請求項２】
１つ以上の転位器が第１表面および／または第２表面に対向して配置される、請求項１に記載の装置。
【請求項３】
２つの転位器を含む、請求項１または２に記載の装置。
【請求項４】
両方の転位器が第１表面または第２表面のいずれかに対向して配置される、請求項３に記載の装置。
【請求項５】
１つの転位器が第１表面に対向して配置され、他の転位器が第２表面に対向して配置される、請求項３に記載の装置。
【請求項６】
２つの転位器が互いに対向して配置される、請求項５に記載の装置。
【請求項７】
１つ以上の転位器が弾性的に変形可能な材料から作られる、請求項１から６のいずれか一項に記載の装置。
【請求項８】
弾性的に変形可能な材料がシリコーンゴムおよびシリコーン油からなる群より選択される、請求項７に記載の装置。
【請求項９】
第１表面および／または第２表面が、検出を行う表面領域を含む、請求項１から８のいずれか一項に記載の装置。
【請求項１０】
第１表面および／または第２表面の少なくとも１つ以上の部分が弾性的に変形可能である、請求項１から９のいずれか一項に記載の装置。
【請求項１１】
少なくとも１つ以上の弾性的に変形可能な部分が１つ以上の転位器に対向して配置される、請求項１０に記載の装置。
【請求項１２】
少なくとも１つ以上の弾性的に変形可能な部分が、検出を行う表面領域と異なる、請求項１０または１１に記載の装置。
【請求項１３】
第１表面および／または第２表面の少なくとも１つの部分が非晶質材料から作られる、請求項１から１２のいずれか一項に記載の装置。
【請求項１４】
非晶質材料が透明材料である、請求項１３に記載の装置。
【請求項１５】
第１表面と第２表面間の距離が０ｍｍ〜１ｍｍの範囲で可変である、請求項１から１４のいずれか一項に記載の装置。
【請求項１６】
反応チャンバが弾性的に変形可能であるとき、反応チャンバの容積を本質的に一定に保つことを可能にする１つ以上の手段をさらに含む、請求項１から１５のいずれか一項に記載の装置。
【請求項１７】
１つ以上の手段が反応チャンバの側面境界を定める弾性側壁である、請求項１６に記載の装置。
【請求項１８】
検出システムをさらに含む、請求項１から１７のいずれか一項に記載の装置。
【請求項１９】
検出システムが光学システムである、請求項１８に記載の装置。
【請求項２０】
少なくとも２つの部分を含むシステムであって、少なくとも２つの部分の各々が、
（ａ）第１表面と第２表面の間のチャンバ本体内に形成され、第２表面が第１表面に対向して配置された反応チャンバと、
（ｂ）１つ以上の転位器とを含み、
第１表面と第２表面の間の距離が第１表面および／または第２表面の表面領域の少なくとも１つ以上の部分で１つ以上の転位器によって変化可能であり、少なくとも２つの部分の反応チャンバが互いに連通する、システム。
【請求項２１】
少なくとも２つの装置の反応チャンバの各々に連通するサンプル導入通路をさらに含む、請求項２０に記載のシステム。
【請求項２２】
少なくとも２つの反応チャンバ間の過渡的な流体連通を可能にする１つ以上の手段をさらに含む、請求項２０または２１に記載のシステム。
【請求項２３】
（ａ）検出すべき１種以上の粒子を含むと思われるサンプルを反応チャンバ中に配置することと、
（ｂ）反応チャンバ内のサンプルの少なくとも一部を１つ以上の転位器によって転位することと、
（ｃ）１種以上の粒子の存在および／または数を示す値を検出／判定することとを含む、粒子の定性的および／または定量的検出方法。
【請求項２４】
サンプルを配置することが、前記サンプルを請求項１から１９のいずれか一項に記載の装置の反応チャンバ、または請求項２０から２２のいずれか一項に記載のシステムの１つ以上の反応チャンバ中に導入することを含む、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
サンプルを導入することが、
（ａ）サンプルを加える前に、１つ以上の転位器によって第１表面と第２表面の間の距離を反応チャンバの少なくとも１つ以上の部分で縮小させることと、
（ｂ）前記縮小された距離を再拡大して、負の圧力によって反応チャンバ中へサンプルを導入させることとを含む、請求項２４に記載の方法。
【請求項２６】
第１表面と第２表面の間の距離を第１表面および／または第２表面の表面領域の少なくとも１つ以上の部分で変化させることによって、サンプルの少なくとも部分が転位される、請求項２３から２５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７】
第１表面と第２表面の間の距離が縮小される、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
１つ以上の転位器の少なくとも１つによって第１表面および／または第２表面に圧力を加えることによって距離が縮小される、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】
サンプルの少なくとも部分を転位した後、縮小された距離が実質的に再拡大される、請求項２６から２８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０】
距離の縮小および後続の再拡大が少なくとも２回繰り返される、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
第１表面と第２表面の間の距離が縮小された後に、ステップ（ｃ）が行われる、請求項２７から３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２】
ステップ（ｃ）が、それまでに行われた検出ステップで得られた結果の平均値を求めることをさらに含む、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
（ａ）複数の粒子を含むサンプルを反応チャンバ中に配置することと、
（ｂ）反応チャンバ内の前記複数粒子の部分集合を１つ以上の転位器によって転位することと、
（ｃ）ステップ（ｂ）で転位された粒子の部分集合の数を示す１つ以上の値を求めることとを含む、請求項２３から３２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３４】
（ｄ）ステップ（ｃ）で得られた１つ以上の値から反応チャンバ中の複数の粒子の総数を計算することをさらに含む、請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
ステップ（ｂ）を行う前に、各々１つ以上の検出可能な部分を含む１つ以上の薬剤を反応チャンバ中に配置／導入することをさらに含む、請求項２３から３４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６】
１つ以上の薬剤が、核酸、ペプチド、プロテインドメイン、プロテイン、炭水化物、低分子量化学化合物、およびその類似品および／または混合物からなる群より選択される、請求項３５に記載の方法。
【請求項３７】
１つ以上の薬剤が検出すべき１つ以上の粒子に結合親和性を有する、請求項３５または３６に記載の方法。
【請求項３８】
１つ以上の薬剤と検出すべき粒子に互いの分子相互作用を行わせ、ステップ（ｃ）において前記分子相互作用が検出される、請求項３５から３７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３９】
サンプルが生物サンプルである、請求項２３から３８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４０】
検出すべき１種以上の粒子が、原核生物細胞、真核生物細胞、およびウイルス粒子からなる群より選択される、請求項２３から３９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４１】
サンプルの複数の粒子を検出チャンバ内に配置することと、
複数の粒子の適切な部分集合だけが残るように、複数の粒子のいくつかを検出チャンバから転位することと、
複数の粒子の部分集合の粒子を光学的に検出することと、
検出された粒子に基づいて、粒子の部分集合の粒子数を示す値を求めることとを含む方法。
【請求項４２】
適切な部分集合の粒子数を示す値に基づいて、サンプル中の粒子の数または存在量を示す値を求めることをさらに含む、請求項４１に記載の方法。
【請求項４３】
サンプル中の粒子の数または存在量を示す値を求めることが、検出チャンバの検出容積のサイズにさらに基づき、部分集合の粒子数を示す値が光学的な検出ステップの際の検出容積に存在する粒子数を示す、請求項４２に記載の方法。
【請求項４４】
サンプルの複数の粒子を検出チャンバ内に配置し、検出チャンバから複数の粒子のいくつかを転位するステップをＮＲ回繰り返すことを含み、いずれの場合にも複数の粒子の適切な部分集合だけが残るようにされ、ＮＲ≧２である、請求項４１に記載の方法。
【請求項４５】
ＮＲ繰り返しの数ＮＤについて、光学的に複数粒子の部分集合の粒子を検出すること、および検出された粒子に基づいて粒子の適切な部分集合の粒子数を示す値を求めることを含み、ＮＤ≧ＮＲである、請求項４４に記載の方法。
【請求項４６】
ＮＤ≧５である、請求項４５に記載の方法。
【請求項４７】
ＮＤ≧１０およびＮＲ≧５である、請求項４６に記載の方法。
【請求項４８】
適切な部分集合の粒子数を示すＮＲ値の数ＮＶに基づいてサンプル中の粒子の数、または存在量を示す値を求めることをさらに含む、請求項４５に記載の方法。
【請求項４９】
ＮＤ≧１０およびＮＲ≧ＮＶ≧５である、請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】
配置と転位のステップをＮＲ回繰り返すことが、ＮＲ回繰り返しごとに転位された複数粒子の少なくともいくつかを検出チャンバに再導入することを含む、請求項４１に記載の方法。
【請求項５１】
検出チャンバに流体連通する貯蔵器内の検出チャンバから転位された粒子を受けとることをさらに含む、請求項５０に記載の方法。
【請求項５２】
受けとることが貯蔵器の壁を拡張することを含む、請求項５１に記載の方法。
【請求項５３】
再導入が、貯蔵器の壁を収縮されることを含む、請求項５２に記載の方法。
【請求項５４】
複数の粒子のいくつかを転位することが検出チャンバの容積を減少させることを含む、請求項５１に記載の方法。
【請求項５５】
検出チャンバの容積を減少させることが、チャンバの第１壁と第２壁間の距離を縮小させることを含む、請求項５４に記載の方法。
【請求項５６】
光学的な検出ステップが第１壁を通過した光を検出することを含む、請求項５５に記載の方法。
【請求項５７】
転位の前に、検出チャンバが初期の容積を有し、転位の後にチャンバが転位された容積を有し、初期容積に対する転位された容積の比が０．２５以下である、請求項５１に記載の方法。
【請求項５８】
比が０．１５以下である、請求項５７に記載の方法。
【請求項５９】
比が０．０５以下である、請求項５７に記載の方法。
【請求項６０】
検出チャンバ内に存在するサンプルの初期の容積を転位する前に、サンプルが液体であり、転位ステップが、検出チャンバから少なくともいくらかの液体サンプルを転位することを含み、転位されたサンプルの容積に対する残るサンプルの容積の比が０．２５以下である、請求項５０に記載の方法。
【請求項６１】
比が０．１５以下である、請求項６０に記載の方法。
【請求項６２】
比が０．０５以下である、請求項６０に記載の方法。
【請求項６３】
再導入ステップが、転位されたサンプルの少なくとも５０％を検出チャンバに再導入することを含む、請求項６０に記載の方法。
【請求項６４】
転位されたサンプルの少なくとも７０％を検出チャンバに再導入することを含む、請求項６３に記載の方法。
【請求項６５】
転位されたサンプルの少なくとも８０％を検出チャンバに再導入することを含む、請求項６３に記載の方法。
【請求項６６】
転位されたサンプルの少なくとも９０％を検出チャンバに再導入することを含む、請求項６３に記載の方法。
【請求項６７】
複数粒子のいくつかを転位することが検出チャンバの容積を減少させることを含む、請求項４１に記載の方法。
【請求項６８】
検出チャンバの容積を減少させることが、チャンバの第１壁と第２壁の間の距離を縮小させることを含む、請求項６７に記載の方法。
【請求項６９】
光学的な検出ステップが、第１表面を通過した光を検出することを含む、請求項６８に記載の方法。
【請求項７０】
転位の前に、検出チャンバが初期の容積を有し、転位の後にチャンバが転位された容積を有し、初期の容積に対する転位された容積の比が０．２５以下である、請求項６７に記載の方法。
【請求項７１】
比が０．１５以下である、請求項７０に記載の方法。
【請求項７２】
比が０．０５以下である、請求項７０に記載の方法。
【請求項７３】
第２部分集合の粒子数を示す値を求めるステップが、部分集合の粒子数を示す値を求めるステップの後に行われる、請求項４１に記載の方法。
【請求項７４】
粒子が細胞である、請求項４１から７３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７５】
サンプルが少なくともいくらかの血液材料を含む、請求項７４に記載の方法。
【請求項７６】
サンプルの複数の粒子を検出チャンバ内に配置することと、
複数の粒子の適切な部分集合だけが残るように、複数の粒子のいくつかを検出チャンバから転位することと、
複数粒子の部分集合の粒子を光学的に検出することと、
粒子の部分集合の中の目標粒子の存在を求めることとを含む方法。
【請求項７７】
検出チャンバ内のサンプルの複数の粒子を配置し、検出チャンバから複数の粒子のいくつかを転位するステップをＮＲ回繰り返すことを含み、いずれの場合にも複数の粒子の適切な部分集合だけが残るようにされ、ＮＲ≧２である、請求項７６に記載の方法。
【請求項７８】
ＮＲ繰り返しの数ＮＤについて、複数粒子の部分集合の粒子を光学的に検出すること、および検出された粒子に基づいて、粒子の部分集合中の目標粒子の存在を求めることを含み、ＮＤ≧ＮＲである、請求項７７に記載の方法。
【請求項７９】
ＮＤ≧５である、請求項７７に記載の方法。
【請求項８０】
ＮＤ≧１０およびＮＲ≧５である、請求項７８に記載の方法。
【請求項８１】
サンプルの第１の複数粒子を検出チャンバ内に配置することと、
検出チャンバの容積を減少させることと、
検出チャンバ内の粒子を光学的に検出することと、
検出された粒子に基づいて検出チャンバ内に存在する粒子数を示す値を求めることと、
検出チャンバの容積を増加させることと、
サンプルの第２の複数粒子を検出チャンバ内に配置することと、
検出チャンバの容積を減少させることと、
検出された粒子に基づいて、検出チャンバ内に存在する粒子数を示す値を求めること、とを含む方法。
【請求項８２】
複数粒子を含むサンプルを受けとるように構成された検出チャンバと、
複数粒子の適切な部分集合だけが残るように検出チャンバから複数粒子のいくつかを転位するように構成されたアクチュエータと、
粒子の部分集合の粒子を検出するように構成された検出器と、
検出された粒子に基づいて、適切な粒子の部分集合の粒子数を示す値を求めるように構成されたプロセッサとを含む装置。
【請求項８３】
装置が、アクチュエータを操作して（ａ）転位された複数の粒子の少なくともいくつかを検出チャンバ中に再導入し、続いて（ｂ）複数粒子の適切な第２部分集合だけが残るように検出チャンバから複数粒子のいくつかを転位するように構成され、プロセッサが、第２の適切な部分集合の粒子を検出するために検出器を操作し、検出された粒子に基づいて粒子の第２の適切な部分集合の粒子数を示す値を求めるように構成される、請求項８２に記載の装置。
【請求項８４】
検出チャンバから転位された粒子を受けとることができ、その粒子から検出チャンバへ再導入することのできる貯蔵器をさらに含む、請求項８３に記載の装置。
【請求項８５】
貯蔵器が膨張可能な壁を含む、請求項８４に記載の装置。
【請求項８６】
プロセッサが、適切な部分集合の粒子数を示す値に基づいてサンプル中の粒子数または存在量を示す値を求めるように構成される、請求項８２に記載の装置。
【請求項８７】
複数の粒子を含むサンプルを受けとるように構成された検出チャンバと、
複数粒子の適切な部分集合だけが残るように検出チャンバから複数粒子のいくつかを転位するように構成されたアクチュエータと、
粒子の部分集合の粒子を検出するように構成された検出器と、
検出された粒子に基づいて、粒子の部分集合の粒子中の目標粒子の存在を測定するように構成されたプロセッサとを含む装置。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４Ａ】
【図４Ｂ】
【図５】
【図６】
【図２】
【図３】
【図４Ａ】
【図４Ｂ】
【図５】
【図６】
【公表番号】特表２００９−５１５１５５（Ｐ２００９−５１５１５５Ａ）
【公表日】平成２１年４月９日（２００９．４．９）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００８−５３８３６７（Ｐ２００８−５３８３６７）
【出願日】平成１８年１１月６日（２００６．１１．６）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＥＰ２００６／０６８１５３
【国際公開番号】ＷＯ２００７／０５１８６１
【国際公開日】平成１９年５月１０日（２００７．５．１０）
【出願人】（５０８１３５１４９）クロンデイアグ・ゲーエムベーハー (5)
【公表日】平成２１年４月９日（２００９．４．９）
【国際特許分類】
【出願日】平成１８年１１月６日（２００６．１１．６）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＥＰ２００６／０６８１５３
【国際公開番号】ＷＯ２００７／０５１８６１
【国際公開日】平成１９年５月１０日（２００７．５．１０）
【出願人】（５０８１３５１４９）クロンデイアグ・ゲーエムベーハー (5)
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