対象が、正常ＩＣＶと比較してシアル酸に対する低下した結合を有するＩＣＶバリアントを持っているかどうかを判定することによって、免疫調節剤で治療されている対象を含む対象が、ＰＭＬのリスクがあるかどうかを判定するための方法および組成物を提示する。さらに、ＰＭＬと関連し、ＰＭＬに感受性がある対象、ＰＭＬ（例えば、初期段階のＰＭＬ）を患う対象、または免疫抑制治療に応答してＰＭＬを発症するリスクがある対象を特定するためのアッセイの基準として使用することができる、ＪＣＶ−ＶＰ１配列変異の組み合わせを提供する。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
アミノ酸残基１２２の置換を含むバリアントＪＣＶ ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候について、対象からの生体試料を調査することを含み、
前記対象は、前記試料が、前記少なくとも１つの兆候を含む場合、ＰＭＬに対する感受性が増加していると判定される、方法。
【請求項２】
アミノ酸残基２および６６のうちの少なくとも１つの置換を含むバリアントＪＣＶ ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候について、前記生体試料を調査することをさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記試料は、アミノ酸残基２、６６、および１２２のうちの少なくとも１つの置換を有するバリアントＪＣＶ ＶＰ１カプシドタンパク質のそれぞれの、少なくとも１つの兆候を検出することが可能なアッセイを用いて調査され、前記対象は、前記試料が、前記バリアントＪＣＶ ＶＰ１カプシドタンパク質のうちの少なくとも１つの少なくとも１つの兆候を含む場合、ＰＭＬに対する感受性が増加していると判定される、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
アミノ酸断片５０〜５１、５４〜５５、および１２３〜１２５のうちの１つまたはそれ以上の欠失を含むバリアントＪＣＶ ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候について、前記生体試料を調査することをさらに含む、請求項１〜３のいずれかに記載の方法。
【請求項５】
前記試料は、アミノ酸断片５０〜５１、５４〜５５、および１２３〜１２５のうちの少なくとも１つの欠失を有するバリアントＪＣＶ ＶＰ１カプシドタンパク質のそれぞれの、少なくとも１つの兆候を検出することが可能なアッセイを用いて調査され、前記対象は、前記試料が、前記バリアントＪＣＶ ＶＰ１カプシドタンパク質のうちの少なくとも１つの少なくとも１つの兆候を含む場合、ＰＭＬに対する感受性が増加していると判定される、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
低シアル酸結合を有する疑いがあるバリアントＪＣＶ ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候について、前記生体試料を調査することをさらに含む、請求項１〜５のいずれかに記載の方法。
【請求項７】
アミノ酸残基５５、６０、２６５、２６７、および２６９のうちの少なくとも１つの置換を含むバリアントＪＣＶ ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候について、前記生体試料を調査することをさらに含む、請求項１〜６のいずれかに記載の方法。
【請求項８】
前記試料は、アミノ酸残基５５、６０、２６５、２６７、および２６９のうちの少なくとも１つの置換を有するバリアントＪＣＶ ＶＰ１カプシドタンパク質のそれぞれの、少なくとも１つの兆候を検出することが可能なアッセイを用いて調査され、前記対象は、前記試料が、前記バリアントＪＣＶ ＶＰ１カプシドタンパク質のうちの少なくとも１つの少なくとも１つの兆候を含む場合、ＰＭＬに対する感受性が増加していると判定される、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
前記生体試料は、血液試料である、請求項１〜８のいずれかに記載の方法。
【請求項１０】
前記生体試料は、ＣＳＦ試料である、請求項１〜９のいずれかに記載の方法。
【請求項１１】
前記生体試料は、尿試料である、請求項１〜１０のいずれかに記載の方法。
【請求項１２】
前記対象は、野生型ＪＣＶに以前に感染したことがあることが知られている、請求項１〜１１のいずれかに記載の方法。
【請求項１３】
前記対象からの新しい生体試料が、毎年少なくとも２回、少なくとも１つのバリアントＪＣＶ ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候について調査される、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
バリアントＪＣＶ ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候の検出を用いて、前記対象が免疫抑制治療に不適当であることを特定する、請求項１〜１３のいずれかに記載の方法。
【請求項１５】
バリアントＪＣＶ ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候の検出を用いて、前記対象に対する免疫抑制治療の修正を勧告する、請求項１〜１４のいずれかに記載の方法。
【請求項１６】
バリアントＪＣＶ ＶＰ１カプシドタンパク質の兆候の不在を用いて、前記対象が免疫抑制治療に適していることを特定する、請求項１〜１５のいずれかに記載の方法。
【請求項１７】
バリアントＪＣＶ ＶＰ１カプシドタンパク質の兆候の不在を用いて、前記対象が継続して行う免疫抑制治療に適していることを特定する、請求項１〜１６のいずれかに記載の方法。
【請求項１８】
前記生体試料は、バリアントＪＣＶ ＶＰ１カプシドタンパク質に対して特異的な抗体の存在について調査される、請求項１〜１７のいずれかに記載の方法。
【請求項１９】
生体試料は、バリアントＪＣＶ ＶＰ１カプシドタンパク質の存在について調査される、請求項１〜１８のいずれかに記載の方法。
【請求項２０】
前記生体試料は、バリアントＪＣＶ ＶＰ１カプシドタンパク質の存在について調査される、請求項１〜１９のいずれかに記載の方法。
【請求項２１】
前記生体試料は、バリアントＪＣＶ ＶＰ１カプシドタンパク質をコードする核酸配列の存在について調査される、請求項１〜２０のいずれかに記載の方法。
【請求項２２】
前記生体試料は、ＥＬＩＳＡに基づく分析を用いて調査される、請求項１９または２０に記載の方法。

【図１】

【図２】

【図４Ｂ】

【図５Ａ】

【図５Ｂ】

【図２０Ａ】

【図２０Ｂ】

【図３−１】

【図３−２】

【図３−３】

【図３−４】

【図３−５】

【図３−６】

【図３−７】

【図３−８】

【図４Ａ】

【図６】

【図７】

【図８】

【図９】

【図１０】

【図１１】

【図１２】

【図１３】

【図１４】

【図１５】

【図１６】

【図１７】

【図１８】

【図１９】

【図２１】

【公表番号】特表２０１２−５１７０１７（Ｐ２０１２−５１７０１７Ａ）
【公表日】平成２４年７月２６日（２０１２．７．２６）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１１−５４９１６３（Ｐ２０１１−５４９１６３）
【出願日】平成２２年２月５日（２０１０．２．５）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２０１０／０００３４２
【国際公開番号】ＷＯ２０１０／０９０７５７
【国際公開日】平成２２年８月１２日（２０１０．８．１２）
【出願人】（５９２２２１５２８）バイオジェン・アイデック・エムエイ・インコーポレイテッド (224)
【Ｆターム（参考）】