ダイオキシン結合材料及びダイオキシンの検出又は定量方法
本発明の主な目的は、安価で、作製が容易な物質を用いてダイオキシンを簡易に検出又は定量及びダイオキシンを取得することに関する技術を提供することである。本発明のダイオキシン結合ペプチドは、ダイオキシンに対して高い選択性を有するため、夾雑物質を含む被験物質中のダイオキシンを検出又は定量をすることができる。また、本発明のダイオキシン結合ペプチドによれば、夾雑物質が含まれる被験物質からダイオキシンを選択的に取得することが可能であり、ダイオキシンの定量、分析の簡便な前処理にも利用できる。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
本発明は、ダイオキシン類に親和性を有するオリゴペプチド、複合ペプチド及びオリゴペプチド複合体、ならびにこれらを結合した担体に関する。また、本発明は、該オリゴペプチド、複合ペプチド、オリゴペプチド複合体を用いてダイオキシンを検出又は定量する方法及びダイオキシンを取得する方法に関する。
【背景技術】
近年、様々な化学物質による環境汚染が深刻化しつつあり、生体への影響が懸念されている。中でもダイオキシンには、発癌性、免疫毒性、生殖毒性、催奇形性等の毒性があるため、汚染の状況を正確に測定、評価することが求められている。
従来、ガスクロマトグラフィー質量分析計を用いてダイオキシンを分析する方法が公定法として使用されてきたが、コストが高く、前処理等の操作は煩雑で多大な労力を要し、さらに分析時間も長いため、迅速な対応が困難であった。そこで、迅速、簡便、安価で高感度な分析法の開発が急務となっている。
このような要求に応えることの出来る有力な技術として、生体機能を活用する手法が開発されつつある。生物学的手法を用いた検出方法の代表的なものとして、抗体を標的物質に対する認識素子として利用する方法が数多く開発されており（前田昌子、イムノアッセイ−ロザリン・ヤローの功績−、ぶんせき、１９９９、８３９−８４３）、実用化もなされている（牛山正志、イムノアッセイによる環境試料の分析、ぶんせき、１９９８、７３６−７４７；中田昌伸、大川秀郎、モノクローナル抗体を用いた農薬のイムノアッセイ、ぶんせき、１９９９、４９２−５００）。
しかしながら、抗体には、作製に長期間を要する、コストが高い、また低分子化学物質や毒性の高い物質の抗体を取得するのが困難であるといった問題点がある。
さらに、土壌や焼却灰などの環境サンプルには、夾雑物質が多く含まれ、ダイオキシンの検出、化学分析に悪影響を与える。そのため、一般的にソックスレー抽出などの前処理が行われ、多大な時間と労力を要する。夾雑物質が含まれるサンプルから、ダイオキシンのみを選択的に結合させ、取得することができれば、ダイオキシン定量、分析の簡便な前処理方法として有効である。また、ダイオキシンで汚染された土壌、工場排水又は河川の浄化等の観点からも、ダイオキシンを取得する方法は有効である。
本発明の主な目的は、安価で、作製が容易な物質を用いてダイオキシンを簡易に検出又は定量及びダイオキシンを取得することに関する技術を提供することである。
【発明の開示】
本発明は、以下のダイオキシンを認識するオリゴペプチド、複合オリゴペプチド及びオリゴペプチド複合体、ならびにこれらを結合させた担体を提供する。また、本発明は、該オリゴペプチドを使用して特定のダイオキシンを検出又は定量する方法及びダイオキシンを取得する方法を提供する。
項１．下記式（Ｉ）：
［Ａ１は、環状基を持つ側鎖を有する疎水性アミノ酸残基であり、Ａ２は、脂肪族炭化水素基又は芳香族炭化水素基を有する疎水性アミノ酸残基を示す。ｎは、０又は１である。Ｘはアミノ酸残基を表す。］で表されるオリゴペプチド。
項２．２以上の式（Ｉ）に記載されるオリゴペプチド繰り返し単位を、必要に応じてスペーサーを介して連結してなる複合ペプチド。
項３．項１に記載されるオリゴペプチドのＣ末端に、リンカーを結合させてなるオリゴペプチド複合体。
項４．Ａ１が下記式（ＩＩ）：
［Ｒ１は、環状基を表す。Ｚは、水素原子、アルキル基又はアシル基を表す。］で表される、項１に記載されるオリゴペプチド。
項５．Ａ１が、フェニルアラニン、１−ナフチルアラニン又はシクロヘキシルアラニンである項１に記載されるオリゴペプチド。
項６．Ａ２が下記式（ＩＩＩ）：
［Ｒ２は、アルキル基又はアリール基である。］で表される項１に記載されるオリゴペプチド。
項７．Ａ２が、バリン、ノルバリン、ロイシン又はフェニルグリシンである項１に記載されるオリゴペプチド。
項８．Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｉｌｅである、項１に記載されるオリゴペプチド。
項９．Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｖａｌである、項１に記載されるオリゴペプチド。
項１０．Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｐｈｇである、項１に記載されるオリゴペプチド（式中Ｐｈｇは、フェニルグリシン残基を示す）。
項１１．ダイオキシンの検出又は定量のための項１〜１０のいずれかに記載されるオリゴペプチド、複合ペプチド又はオリゴペプチド複合体の使用。
項１２．項１〜１０のいずれかに記載されるオリゴペプチド、複合ペプチド又はオリゴペプチド複合体を担体に結合したペプチド固定化担体。
項１３．担体がビーズである項１２に記載のペプチド固定化担体。
項１４．以下の工程
（１）項１２に記載されるペプチド固定化担体に、ダイオキシンを含み得る被験試料と標識化ダミーを接触させる工程、
（２）前記工程（１）において得られた担体と結合した標識化ダミーの量に基づいて、ダイオキシンを検出又は定量する工程
を含むダイオキシンの検出又は定量方法。
項１５．標識化ダミーが、ＮＢＤ標識３，４−ジクロロフェノールである項１４に記載される方法。
項１６．以下の工程
（１）項１２に記載されるペプチド固定化担体に、ダイオキシンを含む被験試料を接触させ、該担体にダイオキシンを結合させる工程、
（２）前記工程（１）において得られた該担体に結合したダイオキシンを、溶媒を用いて担体から分離する工程
を含むダイオキシンを取得する方法。
本明細書において、ダイオキシン類はポリ塩化ジベンゾパラダイオキシン（ＰＣＤＤｓ）、ポリ塩化ジベンゾフラン（ＰＣＤＦｓ）およびコプラナーＰＣＢ（ｃｏｐｌａｎａｒ ＰＣＢｓ）を示し、単にダイオキシンと表記する場合もダイオキシン類を示す。
また、本明細書において、一般式（Ｉ）のオリゴペプチド、項２の複合ペプチド及び項３オリゴペプチド複合体を合わせて、“ダイオキシン結合ペプチド”と略すことがある。
本発明者らは、コンビナトリアルケミストリーの手法を用いて、ペプチドライブラリーを作製し、これをスクリーニングすることによってダイオキシンに対して結合性を有するペプチド配列を見いだした。
［ダイオキシン結合ペプチド］
本発明者らは、前記ペプチドライブラリーをコンビナトリアルケミストリーの代表的な手法であるスプリット＆プール合成法（コンビナトリアルケミストリー入門から応用までコンビナトリアルケミストリー研究会編，化学同人，９７／４）によって作製し、ペプチド固相合成用ビーズに結合してスクリーニングを行った（Ｗ．Ｃ．Ｃｈａｎ ａｎｄ Ｐ．Ｄ．Ｗｈｉｔｅ，ｉｎ Ｗ．Ｃ．Ｃｈａｎ Ｐ．Ｄ．Ｗｈｉｔｅ（Ｅｄ．），Ｆｍｏｃ Ｓｏｌｉｄ Ｐｈａｓｅ Ｐｅｐｔｉｄｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ：Ａ ＰｒａｃｔｉｃａｌＡｐｐｒｏａｃｈ，Ｏｘｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，２０００，ｐ４１）。
本発明のダイオキシンを結合するオリゴペプチドは、固相合成法、液相合成法等の常法によって製造することができる。また、該オリゴペプチドを担体（例えばビーズ等）に結合させて使用することもでき、その場合には、固定化の手間を省くため、あらかじめ担体上で固相合成を行うことが好ましい。
本発明に係るオリゴペプチドの好ましい実施態様であるＤＢ１はＮ末端側から、フェニルアラニン、ロイシン、アスパラギン酸、グルタミン、イソロイシン（Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｉｌｅ；配列番号２）、で構成され、ＤＢ２はＮ末端側からフェニルアラニン、ロイシン、アスパラギン酸、グルタミン、バリン（Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｖａｌ：配列番号３）で構成される。また、Ｎ末端側からフェニルアラニン、ロイシン、アスパラギン酸、グルタミン、フェニルグリシン（本明細書においては、Ｐｈｇで表される）で構成されるオリゴペプチド（Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｐｈｇ：配列番号２２）は、３０％ジオキサン溶媒中において、２，３，７，８−ＴｅＣＤＤ（２，３，７，８−Ｔｅｔｒａｃｈｌｏｒｏｄｉｂｅｎｚｏ−ｐ−ｄｉｏｘｉｎ）に対してＤＢ２よりもさらに約１０倍程度感度が高く、ダイオキシンの検出、定量又は取得に好適である。
式（Ｉ）中Ａ１で示されるアミノ酸としては、下記式（ＩＩ）で表されるものを使用することができる。
式（ＩＩ）中Ｒ１で表される環状基は、芳香族炭化水素又は脂環式炭化水素のいずれでもよく、芳香族炭化水素としてフェニル、トルイル、キシレニル、ナフチル等があげられ、脂環式炭化水素として、Ｃ３〜Ｃ８の脂環式炭化水素基、例えばシクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、シクロオクチル等があげられ、好ましくは、シクロペンチル又はシクロヘキシルである。
芳香族炭化水素又は脂環式炭化水素には、置換基を導入することが可能であり、置換基を有しないものを使用してもよい。置換基としては、メチル基、エチル基等のアルキル基、メトキシ基、アミノ基、メトキシカルボニル基、ニトリル基（ＣＮ）、及びフッ素、塩素、臭素、ヨウ素等のハロゲンがあげられる。これらの置換基を１〜３個有することができるが、１個であることが好ましい。
また、一般式（ＩＩ）中Ｚは、水素原子；メチル基、エチル基等のアルキル基；アセチル基等のアシル基であり、好ましくは、水素原子（Ｈ）である。
Ａ１としては、好ましくはフェニルアラニン、１−ナフチルアラニン、シクロヘキシルアラニン等があげられる。
また、式（ＩＩ）のＺで表されるアシル基として、天然アミノ酸、非天然アミノ酸又は２以上連結した基（例えば、ペプチド等）を付加することも可能である。天然アミノ酸としては、アスパラギン、セリン、アスパラギン酸、グルタミン、グルタミン酸、トレオニン、アルギニン、ヒスチジン、グリシン、リシン、チロシン、トリプトファン、システイン、メチオニン、プロリン、フェニルアラニン、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン等があげられ、非天然アミノ酸としては、βアラニン、γアミノ酪酸、δアミノペンタン酸、εアミノヘキサン酸等があげられる。
式（Ｉ）中Ａ２で示されるアミノ酸としては、下記式（ＩＩＩ）で表されるものを使用することができる。
式（ＩＩＩ）中Ｒ２として、脂肪族炭化水素基（例えば、ｓｅｃ−ブチル基、イソプロピル基、プロピル基、イソブチル基等）、芳香族炭化水素基（例えば、フェニル基、ナフチル基等）を使用することが好ましい。芳香族炭化水素又は脂肪族炭化水素には、置換基を導入することが可能であり、置換基を有しないものを使用してもよい。置換基としては、メチル基、エチル基等のアルキル基、メトキシ基、アミノ基、メトキシカルボニル基、ニトリル基（ＣＮ）、及びフッ素、塩素、臭素、ヨウ素等のハロゲンがあげられる。これらの置換基を１〜３個有することができるが、１個であることが好ましい。
本発明の好ましい実施態様において、Ａ２としては、バリン、ノルバリン、ロイシン及びフェニルグリシン等があげられる。
（Ｉ）式中、Ｘとしては、アスパラギン、セリン、アスパラギン酸、グルタミン、グルタミン酸、トレオニン、アルギニン、ヒスチジン、グリシン、リシン、チロシン、トリプトファン、システイン、メチオニン、プロリン、フェニルアラニン、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン等の天然アミノ酸又はβアラニン、γアミノ酪酸、δアミノペンタン酸、εアミノヘキサン酸等、アミド結合に含まれるアミノ基がα炭素に結合していない非天然アミノ酸があげられ、非天然アミノ酸であることが望ましい。また、ｎは、０又は１であり、好ましくは０である。
本発明に係るオリゴペプチドは、Ｎ末端から２残基目がロイシン、３残基目がアスパラギン酸、４残基目がグルタミンのオリゴペプチドが最も好ましい。さらに、これらのオリゴペプチドは、Ｌ体のみで構成されたものの方が、高いダイオキシン結合能を有するため好ましい。
本発明に係るオリゴペプチドは、様々な形状の担体に結合して用いられる。担体としてビーズ、繊維、シート等を用いることができ、各担体は種々の形状をとることができる。例えば本発明の好ましい実施態様の１つにおいて、直径１〜３５０μｍ、好ましくは直径１０〜１５０μｍの大きさであって、置換率０．１〜１．０ｍｍｏｌ／ｇ程度、好ましくは置換率０．２〜０．３ｍｍｏｌ／ｇ程度のポリスチレン等の疎水性ポリマーが好ましく用いられる。この様な担体としては、ビーズが特に好ましい。
本発明のダイオキシン結合ペプチドを担体に結合させる実施形態として、一般式（Ｉ）に示される本発明のダイオキシン結合ペプチドのＮ末端又はＣ末端を直接担体に結合させる形態と、スペーサーを介して結合させる形態の両方が包含される。スペーサーとしては、ポリエチレンオキサイド鎖等からなるものがあげられる。本発明のダイオキシン結合ペプチド固定化担体としては、オリゴペプチドがスペーサーを介してそのＣ末端で担体に結合しているものが好ましい。
本発明の他の実施形態として、式（Ｉ）で表されるオリゴペプチドのＣ末端に、さらにリンカーを結合させてオリゴペプチド複合体とすることもできる。リンカーとしては、ダイオキシンの結合を妨げないものであれば特に限定されず、例えば、アミノ酸、ペプチド、単糖、二糖、多糖、ポリエーテル、担体、スペーサー及び担体等があげられる。担体、スペーサーは、上記に例示されるものを使用できる。
また、式（Ｉ）で表されるオリゴペプチドを繰り返し単位とし、該繰り返し単位を２つ以上連結させて複合ペプチドとして用いることができる。このとき、繰り返し単位の連結をスペーサーを介して行ってもよく、２つ以上のオリゴペプチドを直接結合してもよい。スペーサーとしては、ダイオキシンの結合を妨げないものであれば特に限定されず、例えば、ポリエチレンオキサイド鎖があげられる。また、該複合ペプチドを、さらに上記に例示される担体に結合させることができる。
本発明のダイオキシン結合ペプチドによって検出又は定量されるダイオキシン類には、毒性等価係数を有するポリ塩化ジベンゾパラダイオキシン（ＰＣＤＤｓ）、ポリ塩化ジベンゾフラン（ＰＣＤＦｓ）およびコプラナーＰＣＢ（ｃｏｐｌａｎａｒ ＰＣＢｓ）が含まれる（図７参照）。毒性等価係数を有するダイオキシン類としては、例えば、２，３，７，８−ＴｈＣＤＤ、１，２，３，７，８−ＰｅＣＤＤ、１，２，３，４，６，７，８−ＨｐＣＤＤ、１，２，３，４，６，７，８，９−ＯＣＤＤ、１，２，３，４，７，８−ＨｘＣＤＤ、１，２，３，６，７，８−ＨｘＣＤＤ、１，２，３，７，８，９−ＨｘＣＤＤ、１，２，３，４，６，８，９−ＯＣＤＤ等のＰＣＤＤｓ、２，３，７，８−ＴＣＤＦ、２，３，４，７，８−ＰｅＣＤＦ等のＰＣＤＦｓ等があげられる。また、ｃｏｐｌａｎａｒ ＰＣＢｓとしては、３，３’４，４’５−ＰｅＣＢ等があげられる。本発明のダイオキシン結合ペプチドによって、これらのダイオキシンを網羅的に検出することが可能である。これら以外の毒性等価係数を有するダイオキシン類について検出又は定量を行う場合は、本発明のダイオキシン結合ペプチドによって検出又は定量できるダイオキシンの量に基づいて検量線を作成し、濃度を推定することができる。
本発明の検出又は定量方法が適用される被験物には、ダイオキシンの検出又は定量の対象であれば特に限定されず、大気、土壌、焼却灰、海水や河川等の水試料、血液、尿、唾液、母乳等の生体試料等があげられる。被験物には、必要に応じて適宜、希釈、抽出、溶出、濾過等の前処理を行い、本発明の検出又は定量方法を適用することができる。
［ダイオキシンの検出又は定量方法］
本発明のダイオキシン結合ペプチドを用いたダイオキシンの検出又は定量方法は、以下の工程、
（１）本発明のダイオキシン結合ペプチドを担体に結合したペプチド固定化担体に、ダイオキシンを含み得る被験試料と標識化ダミーを接触させる工程、
（２）前記工程（１）において得られた担体と結合した標識化ダミーの量に基づいて、ダイオキシンを検出又は定量する工程
を含むダイオキシンの検出又は定量方法。
を含むものである。
本発明においてダイオキシンの定量とは、被験試料中のダイオキシンの濃度を計測することを意味する。また、検出は、標識化ダミーによるシグナルの有無によってダイオキシンの存在の有無を判断することを指す。
本発明において標識化ダミーとは、標識物質によって標識されたダイオキシンのダミー化合物であって、該化合物が、本発明のダイオキシン結合ペプチドに対して結合能を有するものを指す。また、標識化ダミーは、その結合力が本発明のダイオキシン結合ペプチドに対するダイオキシン類の結合力に比べて同等又はそれ以下であり、ダイオキシン類に類似する化合物及び毒性等価係数を有さないダイオキシンよりも結合力が強いものを指す。
この様な標識化されるダミー化合物としては、３，４−ジクロロフェノール、３，４−ジブロムフェノール、３，４，５−トリクロロフェノール、２，３，４−トリクロロフェノール等を使用することができる。また、ダイオキシンの誘導体を使用することもできる。
上記標識化されるダミー化合物は、通常使用される様々な方法で標識化され得る。例えば、蛍光物質、放射性同位元素、酵素等で標識化することができ、あるいは金コロイド又は着色ラテックスなどの色素で標識することも可能であるが、標識物質は、標識化されるダミー化合物の本発明のダイオキシン結合ペプチドに対する結合力を妨げないものであることが好ましい。
蛍光物質としては、ＮＢＤ、ＦＩＴＣ、ＮＤＡ、ＯＰＡ、ＲＴＩＣ、ＤＴＡＦ等があげられる。３，４−ジクロロフェノールに対しては、ＮＢＤ又はこれに類似の構造を有する蛍光物質を用いることが好ましい。
放射性同位元素としては、３２Ｐ、３Ｈ、３５Ｓ、１２５Ｉ、１４Ｃ等を使用することができる。
酵素としては、ペルオキシダーゼ、グルコースオキシダーゼ、チロシナーゼ、酸性ホスファターゼ、アルカリ性ホスファターゼ、β−Ｄ−ガラクトシダーゼ等を使用することができる。また、酵素で標識する場合、標識化される化合物と酵素の間に、当業者によって通常使用される従来公知のスペーサーを介して結合させても良い。
上記の酵素を使用した場合、酵素に反応して発色する基質として、発色基質、蛍光基質又は発光基質があげられる。
発色基質としては、例えばペルオキシダーゼ用に過酸化水素と組み合わせた２，２’−アジノービス（ＡＢＴＳ）、３，３’，５，５’−テトラメチルベンチジン（ＴＭＢ）、ジアミノベンチジン（ＤＡＢ）、又はアルカリホスファターゼ用に５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリルリン酸（ＢＣＩＰ）等があげられる。
蛍光基質としては、例えばアルカリホスファターゼ用に、４−メチルウムベリフェニル−ホスフェート（４ＭＵＰ）、又はβ−Ｄ−ガラクトシダーゼ用に４−メチルウムベリフェニル−β−Ｄ−ガラクトシド（４ＭＵＧ）等があげられる。
発光基質としては、例えばアルカリホスファターゼ用に、３−（２’−スピロアダマンタン）−４−メトキシ−４−（３”−ホスフォリルオキシ）フェニル１−１，２−ジオキセタン・２ナトリウム塩（ＡＭＰＰＤ）、β−Ｄ−ガラクトシダーゼ用に、３−（２’−スピロアダマンタン）−４−メトキシ−４−（３”−β−Ｄ−ガラクトピラノシル）フェニル１−１，２−ジオキセタン（ＡＭＧＰＤ）、ペルオキシダーゼ用に、過酸化水素と組み合わせたルミノール、又はイソルミノールがあげられる。
これらの基質は、被験試料と反応させる前に標識化ダミーに反応させることができ、又は溶媒中にて被験試料と反応させる際に加えることができる。
色素としては、金コロイド粒子等の金属コロイド粒子、スダンブルー、スダンレッドＩＶ、スダンＩＩＩ、オイルオレンジ、キニザリングリーン等に代表される染料、顔料等でラテックス粒子を着色した着色ラテックス粒子等を使用することができる。
本発明のダイオキシン検出又は定量方法を、ＮＢＤで蛍光標識した３，４−ジクロロフェノール（ＮＢＤ標識ジクロロフェノール）を標識化ダミーとして用いた場合について説明するが、これは単なる例示であって、他の標識化ダミーを用いた場合も、以下に記載される３，４−ジクロロフェノールの例を参考に、当業者であれば必要に応じて適切に条件を変更して実施することが可能である。
ガラスバイアル等に溶媒を満たし、その中で本発明のダイオキシン結合ペプチドにＮＢＤ標識ジクロロフェノールを結合させておき、蛍光発光によって識別できるようにしておく。その後、ＮＢＤ標識ジクロロフェノールが結合した本発明のダイオキシン結合ペプチドとダイオキシンを含み得る被験試料を混合する。ダイオキシンは、３，４−ジクロロフェノールと同等の結合力を有する。このため、３，４−ジクロロフェノールに対して、競合的にダイオキシンが本発明のダイオキシン結合ペプチドに結合する。標識されたＮＢＤ標識ジクロロフェノールが本発明のダイオキシン結合ペプチドから解離することで蛍光が消光し、被験試料中にダイオキシンが存在することがわかる（図２参照）。
本発明の検出又は定量方法において、オリゴペプチド、標識化ダミー及びダイオキシンを含み得る被験試料を混合する順序は、特に限定されない。従って、ダイオキシンを含み得る被験試料と本発明のダイオキシン結合ペプチドを先に混合し、その後標識化ダミーを混合してもよく、又は全てを同時に混合してもよい。
本発明のダイオキシン検出又は定量方法の一例として、ダイオキシンを含み得る被験試料（図１中▲２▼）及び１μＭの標識化ダミー（図１▲１▼のＮＢＤ標識ジクロロフェノール）各１μＬに対し、ペプチド固定化担体（図１中▲３▼のダイオキシン結合ペプチドビーズ）３個程度を、２０〜３０％１，４−ジオキサンを含む１０ｍＭリン酸緩衝液（ｐＨ８）１ｍＬ中にて反応させた後、標識化ダミーの量を検出又は定量する方法があげられる（図１参照）。
また、本発明のペプチド固定化担体（例えば、ビーズ等）をカラムに充填しておき、前記被験試料をカラムに通すことで担体と接触させる方法をとることも可能であるが、これに限定されない。
ビーズの形態である本発明のペプチド固定化担体を測定に用いた場合、例えば、ダイオキシンを含み得る被験試料及び１μＭの標識化ダミー各１ｍＬに対し、置換率０．１〜１０ｍｍｏｌ／ｇ、粒径１０〜１５０μｍのビーズであれば、１〜１５個程度、好ましくは１〜１０個程度使用することが好ましい。また、該ビーズ上に、１００〜３００μｍｏｌ／ｇ程度のペプチドが合成されていることが望ましい。
ダイオキシン検出又は定量に使用される本発明のダイオキシン結合ペプチド、標識物質、標識化される化合物の種類及びスペーサーの種類の組み合わせは、特に限定されないが、例えば、配列番号３に示されるＤＢ２のオリゴペプチドを使用して、ダイオキシンを検出又は定量する場合、ポリエチレンオキサイド鎖からなるスペーサーを介してビーズ上でＤＢ２オリゴペプチドを固相合成したものを用いることが好ましく、標識化ダミーとしてＮＢＤで標識された３，４−ジクロロフェノールを使用することができる。
また、溶媒としては、１，４−ジオキサンをはじめとする有機溶媒を使用することができ、例えば１，３−ジオキサン、ジメチルホルムアミド、Ｎ−メチルピロリドン等があげられる。例えば、１，４−ジオキサンを用いた場合、１，４−ジオキサンを１０〜５０％程度、好ましくは２０〜３０％程度含むリン酸緩衝溶液を使用できる。
標識化ダミーの検出又は定量方法は、特に限定されないが、蛍光標識又は色素染色によって染色した場合等は、顕微鏡画像を記録して行うことができる。他の標識物質を用いた場合は、それぞれに適した方法で測定すればよい。蛍光物質で標識した場合には、蛍光測定装置等を用いて上清中に存在する結合できなかった標識体の蛍光量を測定することによって標識化ダミーの量を検出又は定量することもできる。
このとき、濃度既知サンプルを用いて検量線を設定することにより、ダイオキシンを定量することができる。また、本発明の実施例に記載される競合消光の結果（図６）は、ダイオキシン定量における検量線として、オンビーズ蛍光競合消光を用いた定量に利用することができる。定量の際、明らかな競合消光を定量するための染色時間は、１２〜３０時間程度、好ましくは１５〜３０時間程度である。
［ダイオキシンの取得方法］
本発明に係るダイオキシン結合能を有するオリゴペプチドを、ダイオキシンの定量及び分析のための簡便な前処理におけるダイオキシン結合材料として使用することができる。また、ダイオキシンの取得に使用することもできる。
本発明によるダイオキシンの取得は、適当な溶媒にダイオキシンを含み得る被験試料を溶解させ、そこに本発明に係るオリゴペプチドを有する担体を加えて所定時間、室温にてインキュベーションすることにより、該担体にダイオキシンを結合させた後、適当な溶媒を用いてダイオキシンを担体から分離、回収することにより行われる。本発明のダイオキシン結合ペプチドを用いてダイオキシンの取得を行うことで、被験試料からダイオキシンを選択的に除去することが可能である。ダイオキシンの取得は、ガスクロマトグラフィー質量分析計で溶液中の残存量を測定することによって、確認が可能である。
ダイオキシンの取得において、ダイオキシンをペプチド固定化担体から分離するための溶媒としては、１，４−ジオキサンをはじめとする有機溶媒を使用することができ、例えば１，３−ジオキサン、ジメチルホルムアミド、Ｎ−メチルピロリドン等があげられる。ペプチド固定化担体からダイオキシンを分離するために使用する溶媒の濃度は、５０〜１００％程度、好ましくは８０〜１００％程度、より好ましくは１００％程度である。
一例として、３０％１，４−ジオキサンを含む１０ｍＭリン酸緩衝液（ｐＨ８）を用いて調製したダイオキシンを含み得る被験試料溶液１００μＬをガラスバイアルに用意し、この溶液に、本発明のペプチド固定化担体としてダイオキシン結合ビーズ１００個程度を加え、１０時間、室温にて穏やかに振とうさせながらインキュベーションすることによって、ダイオキシンを該ビーズに結合させる方法があげられる。
ダイオキシンの取得にペプチド固定化担体としてビーズを用いた場合、３０％１，４−ジオキサンを含む１０ｍＭリン酸緩衝液（ｐＨ８）を用いて調製したダイオキシンを含み得る被験試料溶液１００μｌに対し、置換率０．１〜１０ｍｍｏｌ／ｇ、粒径１〜１５０μｍのビーズであれば、ダイオキシン結合ビーズの使用数は、５０〜５００個程度、好ましくは５０〜３００個程度使用することが好ましい。また、該ビーズ上に１００〜３００μｍｏｌ／ｇ程度のダイオキシン結合ペプチドが合成されていることが望ましい。
該ビーズと被験試料を含む溶液をインキュベーションする時間は、５〜２０時間程度、好ましくは１０時間程度である。
また、本発明に係るダイオキシン結合ペプチドを、ダイオキシンの定量及び分析の前処理に使用することもできる。ダイオキシン結合ペプチドを用いて前処理を行うことにより、夾雑物質を含む被験試料からダイオキシンを分離することができ、後の定量及び分析の操作に対する夾雑物質の影響を防ぐことができる。また、被験試料中のダイオキシンの有無を、簡易に確認することができる。
本発明のダイオキシン結合ペプチドは、ダイオキシンに対して高い選択性を有するため、夾雑物質を含む被験物質中のダイオキシンを検出又は定量をすることができる。また、本発明のダイオキシン結合ペプチドによれば、夾雑物質が含まれる被験物質からダイオキシンを選択的に取得することが可能であり、ダイオキシンの定量、分析の簡便な前処理にも利用できる。
本発明のダイオキシン結合ペプチドは、ペプチド化学合成法によって作製でき、従来よりもコストを低くすることができる。さらに、本発明のダイオキシン結合ペプチドを使用する場合、前処理等の必要がなく、迅速かつ簡便にダイオキシンの検出又は定量を行うことが可能である。
【図面の簡単な説明】
図１：図１は、ダイオキシン検出又は定量の工程を示す。
図２：図２は、ダイオキシン結合ペプチドのスクリーニングの工程を示す。
図３：図３は、ＮＢＤ標識ジクロロフェノール、２，３，７，−ＴｒｉＣＤＤ及び２，３，７，８−ＴｅＣＤＤの構造を示す。
図４：図４は、蛍光染色されたダイオキシン結合ビーズの蛍光顕微鏡画像を示す。図中、円形のものが蛍光染色されたダイオキシン結合ビーズである。
図５：図５は、配列番号３に示されるＤＢ２ペプチドのオンビーズ競合消光試験の結果を示す。表中、円形のものが蛍光染色されたダイオキシン結合ビーズである。
図６：図６は、３０％１，４−ジオキサンを含む溶媒中で行った、配列番号３に示されるＤＢ２ペプチドのオンビーズ競合消光試験の結果を示す。ビーズの蛍光強度をグラフ（Ａ）、ビーズの消光率をグラフ（Ｂ）に表す。図中の●は２，３，７，８−ＴｅＣＤＤ、○は２，３，７−ＴｒｉＣＤＤの試験結果を示す。
図７：図７は、ダイオキシン濃度と蛍光染色及び競合消光にかかる時間の関係をグラフに表す。２，３，７−ＴｒｉＣＤＤ濃度は１０ｎＭである。図中の●は１０ｎＭ ＮＢＤ標識ジクロロフェノール、▲は５ｎＭ ＮＢＤ標識ジクロロフェノール、■は１ｎＭ ＮＢＤ標識ジクロロフェノール、ＮＢＤ標識ジクロロフェノールのみを実線、上記濃度で２，３，７−ＴｒｉＣＤＤを混合したものを破線で示す。
図８：図８は、アミノ酸置換体ライブラリの置換アミノ酸側鎖構造を示す。
図９：図９は、アミノ酸置換体ライブラリのＮＢＤ標識ジクロロフェノールによる染色度合いをグラフに表す。
図１０：図１０は、１残基置換体についてダイオキシン結合能をオンビーズ競合消光法により評価した結果を示す。１Ｃｈａは配列番号５、５Ｐｈｇは配列番号２２、５Ｌｅｕは配列番号２３、５Ｎｖａは配列番号２４のペプチドである。
図１１：図１１は、オンビーズ競合消光法により特異性を評価した際に用いた、被験試料の構造を示す。
図１２：図１２は、３０％１，４−ジオキサン溶媒で、配列番号３に示されるＤＢ２ペプチドと同等もしくはそれ以上の２，３，７，８−ＴｅＣＤＤ検出性能の認められた置換体及び配列番号２に示されるＤＢ１ペプチドを用いたオンビーズ競合消光試験法による結合特異性試験の結果を示す。１Ｃｈａは配列番号５、５Ｐｈｇは配列番号２２、５Ｌｅｕは配列番号２３、５Ｎｖａは配列番号２４のペプチドである。グラフの横軸は、蛍光強度の減少値を表す。
【発明を実施するための最良の形態】
以下、実施例を挙げて本発明を詳細に説明するが、本発明はこれらの実施例に限定されない。
実施例１．ダイオキシン結合オリゴペプチドの取得
ペプチドライブラリーは、コンビナトリアルケミストリーの代表的な手法の１つであるスプリット＆プール合成法を用いて、ペプチド固相合成用ビーズで構築したものを使用した。本方法により、ビーズ１つにつき１種類の配列のペプチドが合成される。スクリーニングは図２に示すように、２段階で行い、１次スクリーニングではダイオキシンと類似した構造を有する３，４−ジクロロフェノールを蛍光物質ＮＢＤで標識した複合体（図３）を用い、蛍光染色されるペプチドビーズの選択を行った。２次スクリーニングでは蛍光標識ジクロロフェノールにより染色されたペプチドビーズの中から、２，３，７−トリクロロダイベンゾダイオキシンの競合により蛍光消光するペプチドビーズ、すなわちダイオキシンに親和性のあるペプチドビーズを選択した。
スクリーニングには、５アミノ酸残基のペプチドの全配列組合せの数に等しい約２５０万個のペプチドビーズを用いた。１次スクリーニングは、４ｎＭ ＮＢＤ標識ジクロロフェノールを含むスクリーニング用溶媒（２０％１，４−ジオキサンを含む１０ｍＭリン酸緩衝液（ｐＨ８））中で行った。まず、上記の緩衝液２０ｍＬとペプチドビーズ約５０ｍｇを混合し、シャーレ中で、室温にて緩やかに振とうしながら一晩インキュベートした。蛍光顕微鏡で観察し、蛍光染色されたペプチドビーズをマイクロピペットにより分取した。このペプチドビーズを５０％もしくは１００％１，４−ジオキサンの入ったマイクロテストチューブへ移した後、室温にて一晩インキュベートし、５０％もしくは１００％１，４−ジオキサンで洗浄を行った。洗浄が不可能な、ＮＢＤ標識ジクロロフェノールが非特異的に吸着したペプチドビーズは除外した。洗浄可能であったペプチドビーズを１ｎＭ ＮＢＤ標識ジクロロフェノールで再染色した。蛍光強度測定のために、蛍光顕微鏡画像をデジタルカメラで記録した（図４）。
１ｎＭ ＮＢＤ標識ジクロロフェノール及び、１０ｎＭ又は１００ｎＭの２，３，７−トリクロロジベンゾ−ｐ−ジオキシン（２，３，７−ＴｒｉＣＤＤ）を含むスクリーニング用溶媒１ｍＬに上記洗浄可能なペプチドビーズを投入した。室温にて緩やかに振とうしながら、一晩インキュベートした後、ガラス製シャーレに移して蛍光顕微鏡画像を記録した。上記の試験で記録した画像と比較し、消光するビーズを選択した。図５に示すようにＮＢＤ標識ジクロロフェノール（１ｎＭ）に対して１０倍当量（１０ｎＭ）の２，３，７−ＴｒｉＣＤＤ競合条件において２個のペプチドビーズで消光が認められた。図５中のＲｅｆｅｒｅｎｃｅとは、一次スクリーニングにおいて蛍光染色されないと判断したビーズである。選択したビーズ上のペプチドのアミノ酸配列は、プロテインシーケンサーを用いて決定した。その結果、１０ｎＭ ２，３，７−ＴｒｉＣＤＤ競合で消光の確認されたダイオキシン結合ペプチドビーズのアミノ酸配列は、Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｉｌｅ及びＰｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｖａｌであることが判明し、それぞれＰｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−ＩｌｅをＤＢ１、Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−ＶａｌをＤＢ２とした。
実施例２．ダイオキシン結合ペプチドの結合能力の評価
ダイオキシン結合ペプチドビーズを用いて、ペプチドのダイオキシン結合能力を親和性及び特異性の観点から評価した。
［オンビーズ競合消光法］
４ｎＭ ＮＢＤ標識ジクロロフェノール及び０〜１００ｎＭの被検物質を含むスクリーニング溶媒１ｍＬをガラス製バイアル内で調製し、そこへダイオキシン結合ペプチドビーズ３個を投入した。緩やかに振とうしながら、室温にて一晩インキュベートした後、蛍光顕微鏡画像を記録した。記録した画像から各ビーズの平均輝度を算出した。平均輝度の算出は、画像解析・計測ソフトＩｍａｇｅ−Ｐｒｏ Ｐｌｕｓ（プラネトロン）を用いて行った。ダイオキシンと競合結合が起こる場合、濃度に依存してビーズの蛍光強度（平均輝度）が減少する。このビーズの消光現象により、ダイオキシン濃度を測定する方法を“オンビーズ競合消光法”と命名した。
ＤＢ２ペプチドについて、オンビーズ競合消光法により、ダイオキシンとの親和性を評価した。図６は、３０％の１，４−ジオキサンを含む溶媒中で試験した結果である。ダイオキシン濃度と平均輝度の関係プロットしたものが、図６Ａである。このように競合結合に特徴的な右肩下がりのシグモイドカーブが得られる。これを競合ＥＬＩＳＡ法で一般的に用いられる経験式である４係数のｌｏｇｉｓｔｉｃ曲線の式ｙ＝（ａ−ｄ）／（１＋（ｘ／ｃ）ｂ）＋ｄを用いてフィッティングを行ってある（酵素免疫測定法（第３版）石川栄治著、医学書院）。２，３，７−ＴｒｉＣＤＤ、２，３，７，８−ＴｅＣＤＤともに濃度依存的な消光が認められ、３０％１，４−ジオキサン条件において、１ｎＭ（約０．３ｎｇ／ｍＬ）の２，３，７，８−ＴｅＣＤＤの検出が可能であることが示された。
また、図６Ｂに平均輝度の値から各ビーズの消光率をプロットしたグラフを示す。消光率は下記の式により算出した。消光率の値により、被検物質との親和性を評価した。
上記の結果を用いて、ＤＢ２ペプチドの結合定数を算出した。以下に示されるレセプター・リガンドの１：１結合の理論式に基づくフィッティングを行った。
Ｙ＝（（Ｙｍａｘ／２ｅ−９）＊（１／２）＊（（２ｅ−９＋Ｘ＊１ｅ−９＋１／Ｋａ）−（（２ｅ−９＋Ｘ＊１ｅ−９＋１／Ｋａ）∧２−４＊２ｅ−９＊Ｘ＊１ｅ−９）∧０．５））−Ｙｍｉｎ
Ｋａ（結合定数）＝１０９（２，３，７，８−ＴｅＣＤＤ）、１０８（２，３，７−ＴｒｉＣＤＤ）
Ｙｍａｘ（消光率の最大値）＝０．２５（２，３，７，８−ＴｅＣＤＤ）、０．２５（２，３，７−ＴｒｉＣＤＤ）
Ｙｍｉｎ（消光率の最小値）＝−０．０１（２，３，７，８−ＴｅＣＤＤ）、−０．０２（２，３，７−ＴｒｉＣＤＤ）
上記初期値でフィッティングを行った結果、２，３，７，８−ＴｅＣＤＤで１．７×１０９Ｍ−１、２，３，７−ＴｒｉＣＤＤで２．０×１０８Ｍ−１であり、高い親和性が示された。
実施例３．オンビーズ競合消光法によるダイオキシン検出方法
濃度既知サンプル（１μＬ）を１μＭのＮＢＤ標識ジクロロフェノール（１μＬ）及びダイオキシン結合ペプチドビーズ（３個）と共に２０〜３０％１，４−ジオキサンを含む１０ｍＭリン酸緩衝液（ｐＨ８）１ｍＬ中にて反応させた後、ビーズの蛍光顕微画像を記録し、検量線を設定した。
次に、被験物を標識化ジクロロフェノール及びダイオキシン結合ビーズと反応させ、得られた結果を検量線と比較することで被験物中のダイオキシン濃度を求めた。
図６に示す競合消光の結果は、ダイオキシン検出における検量線であると考えることができ、オンビーズ蛍光競合消光を用いた検出に利用出来る。
図７に、染色にかかる時間を示した。１０ｎＭの２，３，７−ＴｒｉＣＤＤに対して１〜１０ｎＭのＮＢＤ標識ジクロロフェノールの競合させた結果、明らかな消光を検出するには１５時間以上のインキュベーションが必要であることが示された。
実施例４．ダイオキシン結合ペプチドの配列の解析
取得されたオリゴペプチドに対して、各アミノ酸の重要性を評価し、配列の最適化を行うために、図８に示す１アミノ酸置換体ライブラリ２１種を構築した。置換アミノ酸は、オリジナルアミノ酸の特徴に類似したものを非天然アミノ酸も含めて使用した。この２１種にＤＢ１及びＤＢ２を加えた２３種類のペプチドを用いてＮＢＤ標識ジクロロフェノールによる染色、ダイオキシン結合による消光を指標とし、評価を行った。ＤＢ１及びＤＢ２以外の２１種類のアミノ酸置換体の全配列は、表１に示される。表１のアミノ酸配列は、配列表において表中の対応する配列番号で示される。
図９に示すように、アラニンをはじめとする全ての試験アミノ酸置換体において、全く蛍光染色出来ないことから、２，３，４残基目のアミノ酸ロイシン、アスパラギン酸、グルタミンが結合に重要な役割を担っていることが分かった。３０％１，４−ジオキサン条件では、１残基目のフェニルアラニンは、１−ナフチルアラニン、シクロヘキシルアラニンに変更が可能であった。５残基目のバリン又はイソロイシンは、ロイシン、フェニルグリシンに変更可能であった。３０％１，４−ジオキサン条件では５残基目はノルバリンでも変更が可能であった。
実施例５．四塩素化ダイオキシン検出に適した配列
３０％１，４−ジオキサン溶媒条件で実施例２に記載のオンビーズ競合消光法による試験を行ったところ、１残基目であるＮ末端アミノ酸をシクロヘキシルアラニン（配列番号５）に置換したペプチド、５残基目をフェニルグリシン（配列番号２２：５Ｐｈｇ）、ロイシン（配列番号２３：５Ｌｅｕ）、ノルバリン（配列番号２４：５Ｎｖａ）に置換したペプチドでは、ＤＢ２ペプチド（配列番号３）と同等又はそれ以上の染色輝度が確認された（図１０）。これら、計４種類の１残基置換体についてダイオキシン結合能をオンビーズ競合消光法により評価した結果、５Ｐｈｇ（配列番号２２）では、０．１５ｎＭ（０．０５ｎｇ／ｍＬ）の２，３，７，８−ＴｅＣＤＤを検出可能であることが明らかとなり、検出感度はＤＢ２に対して約１０倍向上した。
実施例６．置換体の結合特異性の変化
オンビーズ競合消光法により、ＤＢ２ペプチドの特異性を評価した。評価に使用した被検物質の構造を図１１に示した。
３０％ジオキサン溶媒で、ＤＢ２と同等もしくはそれ以上の２，３，７，８−ＴｅＣＤＤ検出性能の認められた４種の置換体（配列番号５、２２、２３及び２４）とＤＢ１（配列番号２）を用いて、オンビーズ競合消光試験により結合特異性を評価した。被検物質は、ダイオキシン類異性体及びその他の物質、計２０物質とし、被検物質添加時の蛍光強度から被検物質なしの最大蛍光強度を差し引いた「蛍光強度変化量」を示した（図１２）。蛍光強度の変化量が大きいほど、その物質に対する親和性が高いことを示している。置換体は、ＤＢ２と同様に、毒性等価係数（ＴＥＦ）を有するダイオキシン類のみならず、アミノ酸置換による結合特異性の変化が認められた。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【技術分野】
本発明は、ダイオキシン類に親和性を有するオリゴペプチド、複合ペプチド及びオリゴペプチド複合体、ならびにこれらを結合した担体に関する。また、本発明は、該オリゴペプチド、複合ペプチド、オリゴペプチド複合体を用いてダイオキシンを検出又は定量する方法及びダイオキシンを取得する方法に関する。
【背景技術】
近年、様々な化学物質による環境汚染が深刻化しつつあり、生体への影響が懸念されている。中でもダイオキシンには、発癌性、免疫毒性、生殖毒性、催奇形性等の毒性があるため、汚染の状況を正確に測定、評価することが求められている。
従来、ガスクロマトグラフィー質量分析計を用いてダイオキシンを分析する方法が公定法として使用されてきたが、コストが高く、前処理等の操作は煩雑で多大な労力を要し、さらに分析時間も長いため、迅速な対応が困難であった。そこで、迅速、簡便、安価で高感度な分析法の開発が急務となっている。
このような要求に応えることの出来る有力な技術として、生体機能を活用する手法が開発されつつある。生物学的手法を用いた検出方法の代表的なものとして、抗体を標的物質に対する認識素子として利用する方法が数多く開発されており（前田昌子、イムノアッセイ−ロザリン・ヤローの功績−、ぶんせき、１９９９、８３９−８４３）、実用化もなされている（牛山正志、イムノアッセイによる環境試料の分析、ぶんせき、１９９８、７３６−７４７；中田昌伸、大川秀郎、モノクローナル抗体を用いた農薬のイムノアッセイ、ぶんせき、１９９９、４９２−５００）。
しかしながら、抗体には、作製に長期間を要する、コストが高い、また低分子化学物質や毒性の高い物質の抗体を取得するのが困難であるといった問題点がある。
さらに、土壌や焼却灰などの環境サンプルには、夾雑物質が多く含まれ、ダイオキシンの検出、化学分析に悪影響を与える。そのため、一般的にソックスレー抽出などの前処理が行われ、多大な時間と労力を要する。夾雑物質が含まれるサンプルから、ダイオキシンのみを選択的に結合させ、取得することができれば、ダイオキシン定量、分析の簡便な前処理方法として有効である。また、ダイオキシンで汚染された土壌、工場排水又は河川の浄化等の観点からも、ダイオキシンを取得する方法は有効である。
本発明の主な目的は、安価で、作製が容易な物質を用いてダイオキシンを簡易に検出又は定量及びダイオキシンを取得することに関する技術を提供することである。
【発明の開示】
本発明は、以下のダイオキシンを認識するオリゴペプチド、複合オリゴペプチド及びオリゴペプチド複合体、ならびにこれらを結合させた担体を提供する。また、本発明は、該オリゴペプチドを使用して特定のダイオキシンを検出又は定量する方法及びダイオキシンを取得する方法を提供する。
項１．下記式（Ｉ）：
［Ａ１は、環状基を持つ側鎖を有する疎水性アミノ酸残基であり、Ａ２は、脂肪族炭化水素基又は芳香族炭化水素基を有する疎水性アミノ酸残基を示す。ｎは、０又は１である。Ｘはアミノ酸残基を表す。］で表されるオリゴペプチド。
項２．２以上の式（Ｉ）に記載されるオリゴペプチド繰り返し単位を、必要に応じてスペーサーを介して連結してなる複合ペプチド。
項３．項１に記載されるオリゴペプチドのＣ末端に、リンカーを結合させてなるオリゴペプチド複合体。
項４．Ａ１が下記式（ＩＩ）：
［Ｒ１は、環状基を表す。Ｚは、水素原子、アルキル基又はアシル基を表す。］で表される、項１に記載されるオリゴペプチド。
項５．Ａ１が、フェニルアラニン、１−ナフチルアラニン又はシクロヘキシルアラニンである項１に記載されるオリゴペプチド。
項６．Ａ２が下記式（ＩＩＩ）：
［Ｒ２は、アルキル基又はアリール基である。］で表される項１に記載されるオリゴペプチド。
項７．Ａ２が、バリン、ノルバリン、ロイシン又はフェニルグリシンである項１に記載されるオリゴペプチド。
項８．Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｉｌｅである、項１に記載されるオリゴペプチド。
項９．Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｖａｌである、項１に記載されるオリゴペプチド。
項１０．Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｐｈｇである、項１に記載されるオリゴペプチド（式中Ｐｈｇは、フェニルグリシン残基を示す）。
項１１．ダイオキシンの検出又は定量のための項１〜１０のいずれかに記載されるオリゴペプチド、複合ペプチド又はオリゴペプチド複合体の使用。
項１２．項１〜１０のいずれかに記載されるオリゴペプチド、複合ペプチド又はオリゴペプチド複合体を担体に結合したペプチド固定化担体。
項１３．担体がビーズである項１２に記載のペプチド固定化担体。
項１４．以下の工程
（１）項１２に記載されるペプチド固定化担体に、ダイオキシンを含み得る被験試料と標識化ダミーを接触させる工程、
（２）前記工程（１）において得られた担体と結合した標識化ダミーの量に基づいて、ダイオキシンを検出又は定量する工程
を含むダイオキシンの検出又は定量方法。
項１５．標識化ダミーが、ＮＢＤ標識３，４−ジクロロフェノールである項１４に記載される方法。
項１６．以下の工程
（１）項１２に記載されるペプチド固定化担体に、ダイオキシンを含む被験試料を接触させ、該担体にダイオキシンを結合させる工程、
（２）前記工程（１）において得られた該担体に結合したダイオキシンを、溶媒を用いて担体から分離する工程
を含むダイオキシンを取得する方法。
本明細書において、ダイオキシン類はポリ塩化ジベンゾパラダイオキシン（ＰＣＤＤｓ）、ポリ塩化ジベンゾフラン（ＰＣＤＦｓ）およびコプラナーＰＣＢ（ｃｏｐｌａｎａｒ ＰＣＢｓ）を示し、単にダイオキシンと表記する場合もダイオキシン類を示す。
また、本明細書において、一般式（Ｉ）のオリゴペプチド、項２の複合ペプチド及び項３オリゴペプチド複合体を合わせて、“ダイオキシン結合ペプチド”と略すことがある。
本発明者らは、コンビナトリアルケミストリーの手法を用いて、ペプチドライブラリーを作製し、これをスクリーニングすることによってダイオキシンに対して結合性を有するペプチド配列を見いだした。
［ダイオキシン結合ペプチド］
本発明者らは、前記ペプチドライブラリーをコンビナトリアルケミストリーの代表的な手法であるスプリット＆プール合成法（コンビナトリアルケミストリー入門から応用までコンビナトリアルケミストリー研究会編，化学同人，９７／４）によって作製し、ペプチド固相合成用ビーズに結合してスクリーニングを行った（Ｗ．Ｃ．Ｃｈａｎ ａｎｄ Ｐ．Ｄ．Ｗｈｉｔｅ，ｉｎ Ｗ．Ｃ．Ｃｈａｎ Ｐ．Ｄ．Ｗｈｉｔｅ（Ｅｄ．），Ｆｍｏｃ Ｓｏｌｉｄ Ｐｈａｓｅ Ｐｅｐｔｉｄｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ：Ａ ＰｒａｃｔｉｃａｌＡｐｐｒｏａｃｈ，Ｏｘｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，２０００，ｐ４１）。
本発明のダイオキシンを結合するオリゴペプチドは、固相合成法、液相合成法等の常法によって製造することができる。また、該オリゴペプチドを担体（例えばビーズ等）に結合させて使用することもでき、その場合には、固定化の手間を省くため、あらかじめ担体上で固相合成を行うことが好ましい。
本発明に係るオリゴペプチドの好ましい実施態様であるＤＢ１はＮ末端側から、フェニルアラニン、ロイシン、アスパラギン酸、グルタミン、イソロイシン（Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｉｌｅ；配列番号２）、で構成され、ＤＢ２はＮ末端側からフェニルアラニン、ロイシン、アスパラギン酸、グルタミン、バリン（Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｖａｌ：配列番号３）で構成される。また、Ｎ末端側からフェニルアラニン、ロイシン、アスパラギン酸、グルタミン、フェニルグリシン（本明細書においては、Ｐｈｇで表される）で構成されるオリゴペプチド（Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｐｈｇ：配列番号２２）は、３０％ジオキサン溶媒中において、２，３，７，８−ＴｅＣＤＤ（２，３，７，８−Ｔｅｔｒａｃｈｌｏｒｏｄｉｂｅｎｚｏ−ｐ−ｄｉｏｘｉｎ）に対してＤＢ２よりもさらに約１０倍程度感度が高く、ダイオキシンの検出、定量又は取得に好適である。
式（Ｉ）中Ａ１で示されるアミノ酸としては、下記式（ＩＩ）で表されるものを使用することができる。
式（ＩＩ）中Ｒ１で表される環状基は、芳香族炭化水素又は脂環式炭化水素のいずれでもよく、芳香族炭化水素としてフェニル、トルイル、キシレニル、ナフチル等があげられ、脂環式炭化水素として、Ｃ３〜Ｃ８の脂環式炭化水素基、例えばシクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、シクロオクチル等があげられ、好ましくは、シクロペンチル又はシクロヘキシルである。
芳香族炭化水素又は脂環式炭化水素には、置換基を導入することが可能であり、置換基を有しないものを使用してもよい。置換基としては、メチル基、エチル基等のアルキル基、メトキシ基、アミノ基、メトキシカルボニル基、ニトリル基（ＣＮ）、及びフッ素、塩素、臭素、ヨウ素等のハロゲンがあげられる。これらの置換基を１〜３個有することができるが、１個であることが好ましい。
また、一般式（ＩＩ）中Ｚは、水素原子；メチル基、エチル基等のアルキル基；アセチル基等のアシル基であり、好ましくは、水素原子（Ｈ）である。
Ａ１としては、好ましくはフェニルアラニン、１−ナフチルアラニン、シクロヘキシルアラニン等があげられる。
また、式（ＩＩ）のＺで表されるアシル基として、天然アミノ酸、非天然アミノ酸又は２以上連結した基（例えば、ペプチド等）を付加することも可能である。天然アミノ酸としては、アスパラギン、セリン、アスパラギン酸、グルタミン、グルタミン酸、トレオニン、アルギニン、ヒスチジン、グリシン、リシン、チロシン、トリプトファン、システイン、メチオニン、プロリン、フェニルアラニン、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン等があげられ、非天然アミノ酸としては、βアラニン、γアミノ酪酸、δアミノペンタン酸、εアミノヘキサン酸等があげられる。
式（Ｉ）中Ａ２で示されるアミノ酸としては、下記式（ＩＩＩ）で表されるものを使用することができる。
式（ＩＩＩ）中Ｒ２として、脂肪族炭化水素基（例えば、ｓｅｃ−ブチル基、イソプロピル基、プロピル基、イソブチル基等）、芳香族炭化水素基（例えば、フェニル基、ナフチル基等）を使用することが好ましい。芳香族炭化水素又は脂肪族炭化水素には、置換基を導入することが可能であり、置換基を有しないものを使用してもよい。置換基としては、メチル基、エチル基等のアルキル基、メトキシ基、アミノ基、メトキシカルボニル基、ニトリル基（ＣＮ）、及びフッ素、塩素、臭素、ヨウ素等のハロゲンがあげられる。これらの置換基を１〜３個有することができるが、１個であることが好ましい。
本発明の好ましい実施態様において、Ａ２としては、バリン、ノルバリン、ロイシン及びフェニルグリシン等があげられる。
（Ｉ）式中、Ｘとしては、アスパラギン、セリン、アスパラギン酸、グルタミン、グルタミン酸、トレオニン、アルギニン、ヒスチジン、グリシン、リシン、チロシン、トリプトファン、システイン、メチオニン、プロリン、フェニルアラニン、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン等の天然アミノ酸又はβアラニン、γアミノ酪酸、δアミノペンタン酸、εアミノヘキサン酸等、アミド結合に含まれるアミノ基がα炭素に結合していない非天然アミノ酸があげられ、非天然アミノ酸であることが望ましい。また、ｎは、０又は１であり、好ましくは０である。
本発明に係るオリゴペプチドは、Ｎ末端から２残基目がロイシン、３残基目がアスパラギン酸、４残基目がグルタミンのオリゴペプチドが最も好ましい。さらに、これらのオリゴペプチドは、Ｌ体のみで構成されたものの方が、高いダイオキシン結合能を有するため好ましい。
本発明に係るオリゴペプチドは、様々な形状の担体に結合して用いられる。担体としてビーズ、繊維、シート等を用いることができ、各担体は種々の形状をとることができる。例えば本発明の好ましい実施態様の１つにおいて、直径１〜３５０μｍ、好ましくは直径１０〜１５０μｍの大きさであって、置換率０．１〜１．０ｍｍｏｌ／ｇ程度、好ましくは置換率０．２〜０．３ｍｍｏｌ／ｇ程度のポリスチレン等の疎水性ポリマーが好ましく用いられる。この様な担体としては、ビーズが特に好ましい。
本発明のダイオキシン結合ペプチドを担体に結合させる実施形態として、一般式（Ｉ）に示される本発明のダイオキシン結合ペプチドのＮ末端又はＣ末端を直接担体に結合させる形態と、スペーサーを介して結合させる形態の両方が包含される。スペーサーとしては、ポリエチレンオキサイド鎖等からなるものがあげられる。本発明のダイオキシン結合ペプチド固定化担体としては、オリゴペプチドがスペーサーを介してそのＣ末端で担体に結合しているものが好ましい。
本発明の他の実施形態として、式（Ｉ）で表されるオリゴペプチドのＣ末端に、さらにリンカーを結合させてオリゴペプチド複合体とすることもできる。リンカーとしては、ダイオキシンの結合を妨げないものであれば特に限定されず、例えば、アミノ酸、ペプチド、単糖、二糖、多糖、ポリエーテル、担体、スペーサー及び担体等があげられる。担体、スペーサーは、上記に例示されるものを使用できる。
また、式（Ｉ）で表されるオリゴペプチドを繰り返し単位とし、該繰り返し単位を２つ以上連結させて複合ペプチドとして用いることができる。このとき、繰り返し単位の連結をスペーサーを介して行ってもよく、２つ以上のオリゴペプチドを直接結合してもよい。スペーサーとしては、ダイオキシンの結合を妨げないものであれば特に限定されず、例えば、ポリエチレンオキサイド鎖があげられる。また、該複合ペプチドを、さらに上記に例示される担体に結合させることができる。
本発明のダイオキシン結合ペプチドによって検出又は定量されるダイオキシン類には、毒性等価係数を有するポリ塩化ジベンゾパラダイオキシン（ＰＣＤＤｓ）、ポリ塩化ジベンゾフラン（ＰＣＤＦｓ）およびコプラナーＰＣＢ（ｃｏｐｌａｎａｒ ＰＣＢｓ）が含まれる（図７参照）。毒性等価係数を有するダイオキシン類としては、例えば、２，３，７，８−ＴｈＣＤＤ、１，２，３，７，８−ＰｅＣＤＤ、１，２，３，４，６，７，８−ＨｐＣＤＤ、１，２，３，４，６，７，８，９−ＯＣＤＤ、１，２，３，４，７，８−ＨｘＣＤＤ、１，２，３，６，７，８−ＨｘＣＤＤ、１，２，３，７，８，９−ＨｘＣＤＤ、１，２，３，４，６，８，９−ＯＣＤＤ等のＰＣＤＤｓ、２，３，７，８−ＴＣＤＦ、２，３，４，７，８−ＰｅＣＤＦ等のＰＣＤＦｓ等があげられる。また、ｃｏｐｌａｎａｒ ＰＣＢｓとしては、３，３’４，４’５−ＰｅＣＢ等があげられる。本発明のダイオキシン結合ペプチドによって、これらのダイオキシンを網羅的に検出することが可能である。これら以外の毒性等価係数を有するダイオキシン類について検出又は定量を行う場合は、本発明のダイオキシン結合ペプチドによって検出又は定量できるダイオキシンの量に基づいて検量線を作成し、濃度を推定することができる。
本発明の検出又は定量方法が適用される被験物には、ダイオキシンの検出又は定量の対象であれば特に限定されず、大気、土壌、焼却灰、海水や河川等の水試料、血液、尿、唾液、母乳等の生体試料等があげられる。被験物には、必要に応じて適宜、希釈、抽出、溶出、濾過等の前処理を行い、本発明の検出又は定量方法を適用することができる。
［ダイオキシンの検出又は定量方法］
本発明のダイオキシン結合ペプチドを用いたダイオキシンの検出又は定量方法は、以下の工程、
（１）本発明のダイオキシン結合ペプチドを担体に結合したペプチド固定化担体に、ダイオキシンを含み得る被験試料と標識化ダミーを接触させる工程、
（２）前記工程（１）において得られた担体と結合した標識化ダミーの量に基づいて、ダイオキシンを検出又は定量する工程
を含むダイオキシンの検出又は定量方法。
を含むものである。
本発明においてダイオキシンの定量とは、被験試料中のダイオキシンの濃度を計測することを意味する。また、検出は、標識化ダミーによるシグナルの有無によってダイオキシンの存在の有無を判断することを指す。
本発明において標識化ダミーとは、標識物質によって標識されたダイオキシンのダミー化合物であって、該化合物が、本発明のダイオキシン結合ペプチドに対して結合能を有するものを指す。また、標識化ダミーは、その結合力が本発明のダイオキシン結合ペプチドに対するダイオキシン類の結合力に比べて同等又はそれ以下であり、ダイオキシン類に類似する化合物及び毒性等価係数を有さないダイオキシンよりも結合力が強いものを指す。
この様な標識化されるダミー化合物としては、３，４−ジクロロフェノール、３，４−ジブロムフェノール、３，４，５−トリクロロフェノール、２，３，４−トリクロロフェノール等を使用することができる。また、ダイオキシンの誘導体を使用することもできる。
上記標識化されるダミー化合物は、通常使用される様々な方法で標識化され得る。例えば、蛍光物質、放射性同位元素、酵素等で標識化することができ、あるいは金コロイド又は着色ラテックスなどの色素で標識することも可能であるが、標識物質は、標識化されるダミー化合物の本発明のダイオキシン結合ペプチドに対する結合力を妨げないものであることが好ましい。
蛍光物質としては、ＮＢＤ、ＦＩＴＣ、ＮＤＡ、ＯＰＡ、ＲＴＩＣ、ＤＴＡＦ等があげられる。３，４−ジクロロフェノールに対しては、ＮＢＤ又はこれに類似の構造を有する蛍光物質を用いることが好ましい。
放射性同位元素としては、３２Ｐ、３Ｈ、３５Ｓ、１２５Ｉ、１４Ｃ等を使用することができる。
酵素としては、ペルオキシダーゼ、グルコースオキシダーゼ、チロシナーゼ、酸性ホスファターゼ、アルカリ性ホスファターゼ、β−Ｄ−ガラクトシダーゼ等を使用することができる。また、酵素で標識する場合、標識化される化合物と酵素の間に、当業者によって通常使用される従来公知のスペーサーを介して結合させても良い。
上記の酵素を使用した場合、酵素に反応して発色する基質として、発色基質、蛍光基質又は発光基質があげられる。
発色基質としては、例えばペルオキシダーゼ用に過酸化水素と組み合わせた２，２’−アジノービス（ＡＢＴＳ）、３，３’，５，５’−テトラメチルベンチジン（ＴＭＢ）、ジアミノベンチジン（ＤＡＢ）、又はアルカリホスファターゼ用に５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリルリン酸（ＢＣＩＰ）等があげられる。
蛍光基質としては、例えばアルカリホスファターゼ用に、４−メチルウムベリフェニル−ホスフェート（４ＭＵＰ）、又はβ−Ｄ−ガラクトシダーゼ用に４−メチルウムベリフェニル−β−Ｄ−ガラクトシド（４ＭＵＧ）等があげられる。
発光基質としては、例えばアルカリホスファターゼ用に、３−（２’−スピロアダマンタン）−４−メトキシ−４−（３”−ホスフォリルオキシ）フェニル１−１，２−ジオキセタン・２ナトリウム塩（ＡＭＰＰＤ）、β−Ｄ−ガラクトシダーゼ用に、３−（２’−スピロアダマンタン）−４−メトキシ−４−（３”−β−Ｄ−ガラクトピラノシル）フェニル１−１，２−ジオキセタン（ＡＭＧＰＤ）、ペルオキシダーゼ用に、過酸化水素と組み合わせたルミノール、又はイソルミノールがあげられる。
これらの基質は、被験試料と反応させる前に標識化ダミーに反応させることができ、又は溶媒中にて被験試料と反応させる際に加えることができる。
色素としては、金コロイド粒子等の金属コロイド粒子、スダンブルー、スダンレッドＩＶ、スダンＩＩＩ、オイルオレンジ、キニザリングリーン等に代表される染料、顔料等でラテックス粒子を着色した着色ラテックス粒子等を使用することができる。
本発明のダイオキシン検出又は定量方法を、ＮＢＤで蛍光標識した３，４−ジクロロフェノール（ＮＢＤ標識ジクロロフェノール）を標識化ダミーとして用いた場合について説明するが、これは単なる例示であって、他の標識化ダミーを用いた場合も、以下に記載される３，４−ジクロロフェノールの例を参考に、当業者であれば必要に応じて適切に条件を変更して実施することが可能である。
ガラスバイアル等に溶媒を満たし、その中で本発明のダイオキシン結合ペプチドにＮＢＤ標識ジクロロフェノールを結合させておき、蛍光発光によって識別できるようにしておく。その後、ＮＢＤ標識ジクロロフェノールが結合した本発明のダイオキシン結合ペプチドとダイオキシンを含み得る被験試料を混合する。ダイオキシンは、３，４−ジクロロフェノールと同等の結合力を有する。このため、３，４−ジクロロフェノールに対して、競合的にダイオキシンが本発明のダイオキシン結合ペプチドに結合する。標識されたＮＢＤ標識ジクロロフェノールが本発明のダイオキシン結合ペプチドから解離することで蛍光が消光し、被験試料中にダイオキシンが存在することがわかる（図２参照）。
本発明の検出又は定量方法において、オリゴペプチド、標識化ダミー及びダイオキシンを含み得る被験試料を混合する順序は、特に限定されない。従って、ダイオキシンを含み得る被験試料と本発明のダイオキシン結合ペプチドを先に混合し、その後標識化ダミーを混合してもよく、又は全てを同時に混合してもよい。
本発明のダイオキシン検出又は定量方法の一例として、ダイオキシンを含み得る被験試料（図１中▲２▼）及び１μＭの標識化ダミー（図１▲１▼のＮＢＤ標識ジクロロフェノール）各１μＬに対し、ペプチド固定化担体（図１中▲３▼のダイオキシン結合ペプチドビーズ）３個程度を、２０〜３０％１，４−ジオキサンを含む１０ｍＭリン酸緩衝液（ｐＨ８）１ｍＬ中にて反応させた後、標識化ダミーの量を検出又は定量する方法があげられる（図１参照）。
また、本発明のペプチド固定化担体（例えば、ビーズ等）をカラムに充填しておき、前記被験試料をカラムに通すことで担体と接触させる方法をとることも可能であるが、これに限定されない。
ビーズの形態である本発明のペプチド固定化担体を測定に用いた場合、例えば、ダイオキシンを含み得る被験試料及び１μＭの標識化ダミー各１ｍＬに対し、置換率０．１〜１０ｍｍｏｌ／ｇ、粒径１０〜１５０μｍのビーズであれば、１〜１５個程度、好ましくは１〜１０個程度使用することが好ましい。また、該ビーズ上に、１００〜３００μｍｏｌ／ｇ程度のペプチドが合成されていることが望ましい。
ダイオキシン検出又は定量に使用される本発明のダイオキシン結合ペプチド、標識物質、標識化される化合物の種類及びスペーサーの種類の組み合わせは、特に限定されないが、例えば、配列番号３に示されるＤＢ２のオリゴペプチドを使用して、ダイオキシンを検出又は定量する場合、ポリエチレンオキサイド鎖からなるスペーサーを介してビーズ上でＤＢ２オリゴペプチドを固相合成したものを用いることが好ましく、標識化ダミーとしてＮＢＤで標識された３，４−ジクロロフェノールを使用することができる。
また、溶媒としては、１，４−ジオキサンをはじめとする有機溶媒を使用することができ、例えば１，３−ジオキサン、ジメチルホルムアミド、Ｎ−メチルピロリドン等があげられる。例えば、１，４−ジオキサンを用いた場合、１，４−ジオキサンを１０〜５０％程度、好ましくは２０〜３０％程度含むリン酸緩衝溶液を使用できる。
標識化ダミーの検出又は定量方法は、特に限定されないが、蛍光標識又は色素染色によって染色した場合等は、顕微鏡画像を記録して行うことができる。他の標識物質を用いた場合は、それぞれに適した方法で測定すればよい。蛍光物質で標識した場合には、蛍光測定装置等を用いて上清中に存在する結合できなかった標識体の蛍光量を測定することによって標識化ダミーの量を検出又は定量することもできる。
このとき、濃度既知サンプルを用いて検量線を設定することにより、ダイオキシンを定量することができる。また、本発明の実施例に記載される競合消光の結果（図６）は、ダイオキシン定量における検量線として、オンビーズ蛍光競合消光を用いた定量に利用することができる。定量の際、明らかな競合消光を定量するための染色時間は、１２〜３０時間程度、好ましくは１５〜３０時間程度である。
［ダイオキシンの取得方法］
本発明に係るダイオキシン結合能を有するオリゴペプチドを、ダイオキシンの定量及び分析のための簡便な前処理におけるダイオキシン結合材料として使用することができる。また、ダイオキシンの取得に使用することもできる。
本発明によるダイオキシンの取得は、適当な溶媒にダイオキシンを含み得る被験試料を溶解させ、そこに本発明に係るオリゴペプチドを有する担体を加えて所定時間、室温にてインキュベーションすることにより、該担体にダイオキシンを結合させた後、適当な溶媒を用いてダイオキシンを担体から分離、回収することにより行われる。本発明のダイオキシン結合ペプチドを用いてダイオキシンの取得を行うことで、被験試料からダイオキシンを選択的に除去することが可能である。ダイオキシンの取得は、ガスクロマトグラフィー質量分析計で溶液中の残存量を測定することによって、確認が可能である。
ダイオキシンの取得において、ダイオキシンをペプチド固定化担体から分離するための溶媒としては、１，４−ジオキサンをはじめとする有機溶媒を使用することができ、例えば１，３−ジオキサン、ジメチルホルムアミド、Ｎ−メチルピロリドン等があげられる。ペプチド固定化担体からダイオキシンを分離するために使用する溶媒の濃度は、５０〜１００％程度、好ましくは８０〜１００％程度、より好ましくは１００％程度である。
一例として、３０％１，４−ジオキサンを含む１０ｍＭリン酸緩衝液（ｐＨ８）を用いて調製したダイオキシンを含み得る被験試料溶液１００μＬをガラスバイアルに用意し、この溶液に、本発明のペプチド固定化担体としてダイオキシン結合ビーズ１００個程度を加え、１０時間、室温にて穏やかに振とうさせながらインキュベーションすることによって、ダイオキシンを該ビーズに結合させる方法があげられる。
ダイオキシンの取得にペプチド固定化担体としてビーズを用いた場合、３０％１，４−ジオキサンを含む１０ｍＭリン酸緩衝液（ｐＨ８）を用いて調製したダイオキシンを含み得る被験試料溶液１００μｌに対し、置換率０．１〜１０ｍｍｏｌ／ｇ、粒径１〜１５０μｍのビーズであれば、ダイオキシン結合ビーズの使用数は、５０〜５００個程度、好ましくは５０〜３００個程度使用することが好ましい。また、該ビーズ上に１００〜３００μｍｏｌ／ｇ程度のダイオキシン結合ペプチドが合成されていることが望ましい。
該ビーズと被験試料を含む溶液をインキュベーションする時間は、５〜２０時間程度、好ましくは１０時間程度である。
また、本発明に係るダイオキシン結合ペプチドを、ダイオキシンの定量及び分析の前処理に使用することもできる。ダイオキシン結合ペプチドを用いて前処理を行うことにより、夾雑物質を含む被験試料からダイオキシンを分離することができ、後の定量及び分析の操作に対する夾雑物質の影響を防ぐことができる。また、被験試料中のダイオキシンの有無を、簡易に確認することができる。
本発明のダイオキシン結合ペプチドは、ダイオキシンに対して高い選択性を有するため、夾雑物質を含む被験物質中のダイオキシンを検出又は定量をすることができる。また、本発明のダイオキシン結合ペプチドによれば、夾雑物質が含まれる被験物質からダイオキシンを選択的に取得することが可能であり、ダイオキシンの定量、分析の簡便な前処理にも利用できる。
本発明のダイオキシン結合ペプチドは、ペプチド化学合成法によって作製でき、従来よりもコストを低くすることができる。さらに、本発明のダイオキシン結合ペプチドを使用する場合、前処理等の必要がなく、迅速かつ簡便にダイオキシンの検出又は定量を行うことが可能である。
【図面の簡単な説明】
図１：図１は、ダイオキシン検出又は定量の工程を示す。
図２：図２は、ダイオキシン結合ペプチドのスクリーニングの工程を示す。
図３：図３は、ＮＢＤ標識ジクロロフェノール、２，３，７，−ＴｒｉＣＤＤ及び２，３，７，８−ＴｅＣＤＤの構造を示す。
図４：図４は、蛍光染色されたダイオキシン結合ビーズの蛍光顕微鏡画像を示す。図中、円形のものが蛍光染色されたダイオキシン結合ビーズである。
図５：図５は、配列番号３に示されるＤＢ２ペプチドのオンビーズ競合消光試験の結果を示す。表中、円形のものが蛍光染色されたダイオキシン結合ビーズである。
図６：図６は、３０％１，４−ジオキサンを含む溶媒中で行った、配列番号３に示されるＤＢ２ペプチドのオンビーズ競合消光試験の結果を示す。ビーズの蛍光強度をグラフ（Ａ）、ビーズの消光率をグラフ（Ｂ）に表す。図中の●は２，３，７，８−ＴｅＣＤＤ、○は２，３，７−ＴｒｉＣＤＤの試験結果を示す。
図７：図７は、ダイオキシン濃度と蛍光染色及び競合消光にかかる時間の関係をグラフに表す。２，３，７−ＴｒｉＣＤＤ濃度は１０ｎＭである。図中の●は１０ｎＭ ＮＢＤ標識ジクロロフェノール、▲は５ｎＭ ＮＢＤ標識ジクロロフェノール、■は１ｎＭ ＮＢＤ標識ジクロロフェノール、ＮＢＤ標識ジクロロフェノールのみを実線、上記濃度で２，３，７−ＴｒｉＣＤＤを混合したものを破線で示す。
図８：図８は、アミノ酸置換体ライブラリの置換アミノ酸側鎖構造を示す。
図９：図９は、アミノ酸置換体ライブラリのＮＢＤ標識ジクロロフェノールによる染色度合いをグラフに表す。
図１０：図１０は、１残基置換体についてダイオキシン結合能をオンビーズ競合消光法により評価した結果を示す。１Ｃｈａは配列番号５、５Ｐｈｇは配列番号２２、５Ｌｅｕは配列番号２３、５Ｎｖａは配列番号２４のペプチドである。
図１１：図１１は、オンビーズ競合消光法により特異性を評価した際に用いた、被験試料の構造を示す。
図１２：図１２は、３０％１，４−ジオキサン溶媒で、配列番号３に示されるＤＢ２ペプチドと同等もしくはそれ以上の２，３，７，８−ＴｅＣＤＤ検出性能の認められた置換体及び配列番号２に示されるＤＢ１ペプチドを用いたオンビーズ競合消光試験法による結合特異性試験の結果を示す。１Ｃｈａは配列番号５、５Ｐｈｇは配列番号２２、５Ｌｅｕは配列番号２３、５Ｎｖａは配列番号２４のペプチドである。グラフの横軸は、蛍光強度の減少値を表す。
【発明を実施するための最良の形態】
以下、実施例を挙げて本発明を詳細に説明するが、本発明はこれらの実施例に限定されない。
実施例１．ダイオキシン結合オリゴペプチドの取得
ペプチドライブラリーは、コンビナトリアルケミストリーの代表的な手法の１つであるスプリット＆プール合成法を用いて、ペプチド固相合成用ビーズで構築したものを使用した。本方法により、ビーズ１つにつき１種類の配列のペプチドが合成される。スクリーニングは図２に示すように、２段階で行い、１次スクリーニングではダイオキシンと類似した構造を有する３，４−ジクロロフェノールを蛍光物質ＮＢＤで標識した複合体（図３）を用い、蛍光染色されるペプチドビーズの選択を行った。２次スクリーニングでは蛍光標識ジクロロフェノールにより染色されたペプチドビーズの中から、２，３，７−トリクロロダイベンゾダイオキシンの競合により蛍光消光するペプチドビーズ、すなわちダイオキシンに親和性のあるペプチドビーズを選択した。
スクリーニングには、５アミノ酸残基のペプチドの全配列組合せの数に等しい約２５０万個のペプチドビーズを用いた。１次スクリーニングは、４ｎＭ ＮＢＤ標識ジクロロフェノールを含むスクリーニング用溶媒（２０％１，４−ジオキサンを含む１０ｍＭリン酸緩衝液（ｐＨ８））中で行った。まず、上記の緩衝液２０ｍＬとペプチドビーズ約５０ｍｇを混合し、シャーレ中で、室温にて緩やかに振とうしながら一晩インキュベートした。蛍光顕微鏡で観察し、蛍光染色されたペプチドビーズをマイクロピペットにより分取した。このペプチドビーズを５０％もしくは１００％１，４−ジオキサンの入ったマイクロテストチューブへ移した後、室温にて一晩インキュベートし、５０％もしくは１００％１，４−ジオキサンで洗浄を行った。洗浄が不可能な、ＮＢＤ標識ジクロロフェノールが非特異的に吸着したペプチドビーズは除外した。洗浄可能であったペプチドビーズを１ｎＭ ＮＢＤ標識ジクロロフェノールで再染色した。蛍光強度測定のために、蛍光顕微鏡画像をデジタルカメラで記録した（図４）。
１ｎＭ ＮＢＤ標識ジクロロフェノール及び、１０ｎＭ又は１００ｎＭの２，３，７−トリクロロジベンゾ−ｐ−ジオキシン（２，３，７−ＴｒｉＣＤＤ）を含むスクリーニング用溶媒１ｍＬに上記洗浄可能なペプチドビーズを投入した。室温にて緩やかに振とうしながら、一晩インキュベートした後、ガラス製シャーレに移して蛍光顕微鏡画像を記録した。上記の試験で記録した画像と比較し、消光するビーズを選択した。図５に示すようにＮＢＤ標識ジクロロフェノール（１ｎＭ）に対して１０倍当量（１０ｎＭ）の２，３，７−ＴｒｉＣＤＤ競合条件において２個のペプチドビーズで消光が認められた。図５中のＲｅｆｅｒｅｎｃｅとは、一次スクリーニングにおいて蛍光染色されないと判断したビーズである。選択したビーズ上のペプチドのアミノ酸配列は、プロテインシーケンサーを用いて決定した。その結果、１０ｎＭ ２，３，７−ＴｒｉＣＤＤ競合で消光の確認されたダイオキシン結合ペプチドビーズのアミノ酸配列は、Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｉｌｅ及びＰｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｖａｌであることが判明し、それぞれＰｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−ＩｌｅをＤＢ１、Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−ＶａｌをＤＢ２とした。
実施例２．ダイオキシン結合ペプチドの結合能力の評価
ダイオキシン結合ペプチドビーズを用いて、ペプチドのダイオキシン結合能力を親和性及び特異性の観点から評価した。
［オンビーズ競合消光法］
４ｎＭ ＮＢＤ標識ジクロロフェノール及び０〜１００ｎＭの被検物質を含むスクリーニング溶媒１ｍＬをガラス製バイアル内で調製し、そこへダイオキシン結合ペプチドビーズ３個を投入した。緩やかに振とうしながら、室温にて一晩インキュベートした後、蛍光顕微鏡画像を記録した。記録した画像から各ビーズの平均輝度を算出した。平均輝度の算出は、画像解析・計測ソフトＩｍａｇｅ−Ｐｒｏ Ｐｌｕｓ（プラネトロン）を用いて行った。ダイオキシンと競合結合が起こる場合、濃度に依存してビーズの蛍光強度（平均輝度）が減少する。このビーズの消光現象により、ダイオキシン濃度を測定する方法を“オンビーズ競合消光法”と命名した。
ＤＢ２ペプチドについて、オンビーズ競合消光法により、ダイオキシンとの親和性を評価した。図６は、３０％の１，４−ジオキサンを含む溶媒中で試験した結果である。ダイオキシン濃度と平均輝度の関係プロットしたものが、図６Ａである。このように競合結合に特徴的な右肩下がりのシグモイドカーブが得られる。これを競合ＥＬＩＳＡ法で一般的に用いられる経験式である４係数のｌｏｇｉｓｔｉｃ曲線の式ｙ＝（ａ−ｄ）／（１＋（ｘ／ｃ）ｂ）＋ｄを用いてフィッティングを行ってある（酵素免疫測定法（第３版）石川栄治著、医学書院）。２，３，７−ＴｒｉＣＤＤ、２，３，７，８−ＴｅＣＤＤともに濃度依存的な消光が認められ、３０％１，４−ジオキサン条件において、１ｎＭ（約０．３ｎｇ／ｍＬ）の２，３，７，８−ＴｅＣＤＤの検出が可能であることが示された。
また、図６Ｂに平均輝度の値から各ビーズの消光率をプロットしたグラフを示す。消光率は下記の式により算出した。消光率の値により、被検物質との親和性を評価した。
上記の結果を用いて、ＤＢ２ペプチドの結合定数を算出した。以下に示されるレセプター・リガンドの１：１結合の理論式に基づくフィッティングを行った。
Ｙ＝（（Ｙｍａｘ／２ｅ−９）＊（１／２）＊（（２ｅ−９＋Ｘ＊１ｅ−９＋１／Ｋａ）−（（２ｅ−９＋Ｘ＊１ｅ−９＋１／Ｋａ）∧２−４＊２ｅ−９＊Ｘ＊１ｅ−９）∧０．５））−Ｙｍｉｎ
Ｋａ（結合定数）＝１０９（２，３，７，８−ＴｅＣＤＤ）、１０８（２，３，７−ＴｒｉＣＤＤ）
Ｙｍａｘ（消光率の最大値）＝０．２５（２，３，７，８−ＴｅＣＤＤ）、０．２５（２，３，７−ＴｒｉＣＤＤ）
Ｙｍｉｎ（消光率の最小値）＝−０．０１（２，３，７，８−ＴｅＣＤＤ）、−０．０２（２，３，７−ＴｒｉＣＤＤ）
上記初期値でフィッティングを行った結果、２，３，７，８−ＴｅＣＤＤで１．７×１０９Ｍ−１、２，３，７−ＴｒｉＣＤＤで２．０×１０８Ｍ−１であり、高い親和性が示された。
実施例３．オンビーズ競合消光法によるダイオキシン検出方法
濃度既知サンプル（１μＬ）を１μＭのＮＢＤ標識ジクロロフェノール（１μＬ）及びダイオキシン結合ペプチドビーズ（３個）と共に２０〜３０％１，４−ジオキサンを含む１０ｍＭリン酸緩衝液（ｐＨ８）１ｍＬ中にて反応させた後、ビーズの蛍光顕微画像を記録し、検量線を設定した。
次に、被験物を標識化ジクロロフェノール及びダイオキシン結合ビーズと反応させ、得られた結果を検量線と比較することで被験物中のダイオキシン濃度を求めた。
図６に示す競合消光の結果は、ダイオキシン検出における検量線であると考えることができ、オンビーズ蛍光競合消光を用いた検出に利用出来る。
図７に、染色にかかる時間を示した。１０ｎＭの２，３，７−ＴｒｉＣＤＤに対して１〜１０ｎＭのＮＢＤ標識ジクロロフェノールの競合させた結果、明らかな消光を検出するには１５時間以上のインキュベーションが必要であることが示された。
実施例４．ダイオキシン結合ペプチドの配列の解析
取得されたオリゴペプチドに対して、各アミノ酸の重要性を評価し、配列の最適化を行うために、図８に示す１アミノ酸置換体ライブラリ２１種を構築した。置換アミノ酸は、オリジナルアミノ酸の特徴に類似したものを非天然アミノ酸も含めて使用した。この２１種にＤＢ１及びＤＢ２を加えた２３種類のペプチドを用いてＮＢＤ標識ジクロロフェノールによる染色、ダイオキシン結合による消光を指標とし、評価を行った。ＤＢ１及びＤＢ２以外の２１種類のアミノ酸置換体の全配列は、表１に示される。表１のアミノ酸配列は、配列表において表中の対応する配列番号で示される。
図９に示すように、アラニンをはじめとする全ての試験アミノ酸置換体において、全く蛍光染色出来ないことから、２，３，４残基目のアミノ酸ロイシン、アスパラギン酸、グルタミンが結合に重要な役割を担っていることが分かった。３０％１，４−ジオキサン条件では、１残基目のフェニルアラニンは、１−ナフチルアラニン、シクロヘキシルアラニンに変更が可能であった。５残基目のバリン又はイソロイシンは、ロイシン、フェニルグリシンに変更可能であった。３０％１，４−ジオキサン条件では５残基目はノルバリンでも変更が可能であった。
実施例５．四塩素化ダイオキシン検出に適した配列
３０％１，４−ジオキサン溶媒条件で実施例２に記載のオンビーズ競合消光法による試験を行ったところ、１残基目であるＮ末端アミノ酸をシクロヘキシルアラニン（配列番号５）に置換したペプチド、５残基目をフェニルグリシン（配列番号２２：５Ｐｈｇ）、ロイシン（配列番号２３：５Ｌｅｕ）、ノルバリン（配列番号２４：５Ｎｖａ）に置換したペプチドでは、ＤＢ２ペプチド（配列番号３）と同等又はそれ以上の染色輝度が確認された（図１０）。これら、計４種類の１残基置換体についてダイオキシン結合能をオンビーズ競合消光法により評価した結果、５Ｐｈｇ（配列番号２２）では、０．１５ｎＭ（０．０５ｎｇ／ｍＬ）の２，３，７，８−ＴｅＣＤＤを検出可能であることが明らかとなり、検出感度はＤＢ２に対して約１０倍向上した。
実施例６．置換体の結合特異性の変化
オンビーズ競合消光法により、ＤＢ２ペプチドの特異性を評価した。評価に使用した被検物質の構造を図１１に示した。
３０％ジオキサン溶媒で、ＤＢ２と同等もしくはそれ以上の２，３，７，８−ＴｅＣＤＤ検出性能の認められた４種の置換体（配列番号５、２２、２３及び２４）とＤＢ１（配列番号２）を用いて、オンビーズ競合消光試験により結合特異性を評価した。被検物質は、ダイオキシン類異性体及びその他の物質、計２０物質とし、被検物質添加時の蛍光強度から被検物質なしの最大蛍光強度を差し引いた「蛍光強度変化量」を示した（図１２）。蛍光強度の変化量が大きいほど、その物質に対する親和性が高いことを示している。置換体は、ＤＢ２と同様に、毒性等価係数（ＴＥＦ）を有するダイオキシン類のみならず、アミノ酸置換による結合特異性の変化が認められた。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
下記式（Ｉ）：
［Ａ１は、環状基を持つ側鎖を有する疎水性アミノ酸残基であり、Ａ２は、脂肪族炭化水素基又は芳香族炭化水素基を有する疎水性アミノ酸残基を示す。ｎは、０又は１である。Ｘはアミノ酸残基を表す。］で表されるオリゴペプチド。
【請求項２】
２以上の式（Ｉ）に記載されるオリゴペプチド繰り返し単位を、必要に応じてスペーサーを介して連結してなる複合ペプチド。
【請求項３】
請求項１に記載されるオリゴペプチドのＣ末端に、リンカーを結合させてなるオリゴペプチド複合体。
【請求項４】
Ａ１が下記式（ＩＩ）：
［Ｒ１は、環状基を表す。Ｚは、水素原子、アルキル基又はアシル基を表す。］で表される、請求項１に記載されるオリゴペプチド。
【請求項５】
Ａ１が、フェニルアラニン、１−ナフチルアラニン又はシクロヘキシルアラニンである請求項１に記載されるオリゴペプチド。
【請求項６】
Ａ２が下記式（ＩＩＩ）：
［Ｒ２は、アルキル基又はアリール基である。］で表される請求項１に記載されるオリゴペプチド。
【請求項７】
Ａ２が、バリン、ノルバリン、ロイシン又はフェニルグリシンである請求項１に記載されるオリゴペプチド。
【請求項８】
Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｉｌｅである、請求項１に記載されるオリゴペプチド。
【請求項９】
Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｖａｌである、請求項１に記載されるオリゴペプチド。
【請求項１０】
Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｐｈｇである、請求項１に記載されるオリゴペプチド（式中Ｐｈｇは、フェニルグリシン残基を示す）。
【請求項１１】
ダイオキシンの検出又は定量のための請求項１〜１０のいずれかに記載されるオリゴペプチド、複合ペプチド又はオリゴペプチド複合体の使用。
【請求項１２】
請求項１〜１０のいずれかに記載されるオリゴペプチド、複合ペプチド又はオリゴペプチド複合体を担体に結合したペプチド固定化担体。
【請求項１３】
担体がビーズである請求項１２に記載のペプチド固定化担体。
【請求項１４】
以下の工程
（１）請求項１２に記載されるペプチド固定化担体に、ダイオキシンを含み得る被験試料と標識化ダミーを接触させる工程、
（２）前記工程（１）において得られた担体と結合した標識化ダミーの量に基づいて、ダイオキシンを検出又は定量する工程
を含むダイオキシンの検出又は定量方法。
【請求項１５】
標識化ダミーが、ＮＢＤ標識３，４−ジクロロフェノールである請求項１４に記載される方法。
【請求項１６】
以下の工程
（１）請求項１２に記載されるペプチド固定化担体に、ダイオキシンを含む被験試料を接触させ、該担体にダイオキシンを結合させる工程、
（２）前記工程（１）において得られた該担体に結合したダイオキシンを、溶媒を用いて担体から分離する工程
を含むダイオキシンを取得する方法。
【請求項１】
下記式（Ｉ）：
［Ａ１は、環状基を持つ側鎖を有する疎水性アミノ酸残基であり、Ａ２は、脂肪族炭化水素基又は芳香族炭化水素基を有する疎水性アミノ酸残基を示す。ｎは、０又は１である。Ｘはアミノ酸残基を表す。］で表されるオリゴペプチド。
【請求項２】
２以上の式（Ｉ）に記載されるオリゴペプチド繰り返し単位を、必要に応じてスペーサーを介して連結してなる複合ペプチド。
【請求項３】
請求項１に記載されるオリゴペプチドのＣ末端に、リンカーを結合させてなるオリゴペプチド複合体。
【請求項４】
Ａ１が下記式（ＩＩ）：
［Ｒ１は、環状基を表す。Ｚは、水素原子、アルキル基又はアシル基を表す。］で表される、請求項１に記載されるオリゴペプチド。
【請求項５】
Ａ１が、フェニルアラニン、１−ナフチルアラニン又はシクロヘキシルアラニンである請求項１に記載されるオリゴペプチド。
【請求項６】
Ａ２が下記式（ＩＩＩ）：
［Ｒ２は、アルキル基又はアリール基である。］で表される請求項１に記載されるオリゴペプチド。
【請求項７】
Ａ２が、バリン、ノルバリン、ロイシン又はフェニルグリシンである請求項１に記載されるオリゴペプチド。
【請求項８】
Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｉｌｅである、請求項１に記載されるオリゴペプチド。
【請求項９】
Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｖａｌである、請求項１に記載されるオリゴペプチド。
【請求項１０】
Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｇｌｎ−Ｐｈｇである、請求項１に記載されるオリゴペプチド（式中Ｐｈｇは、フェニルグリシン残基を示す）。
【請求項１１】
ダイオキシンの検出又は定量のための請求項１〜１０のいずれかに記載されるオリゴペプチド、複合ペプチド又はオリゴペプチド複合体の使用。
【請求項１２】
請求項１〜１０のいずれかに記載されるオリゴペプチド、複合ペプチド又はオリゴペプチド複合体を担体に結合したペプチド固定化担体。
【請求項１３】
担体がビーズである請求項１２に記載のペプチド固定化担体。
【請求項１４】
以下の工程
（１）請求項１２に記載されるペプチド固定化担体に、ダイオキシンを含み得る被験試料と標識化ダミーを接触させる工程、
（２）前記工程（１）において得られた担体と結合した標識化ダミーの量に基づいて、ダイオキシンを検出又は定量する工程
を含むダイオキシンの検出又は定量方法。
【請求項１５】
標識化ダミーが、ＮＢＤ標識３，４−ジクロロフェノールである請求項１４に記載される方法。
【請求項１６】
以下の工程
（１）請求項１２に記載されるペプチド固定化担体に、ダイオキシンを含む被験試料を接触させ、該担体にダイオキシンを結合させる工程、
（２）前記工程（１）において得られた該担体に結合したダイオキシンを、溶媒を用いて担体から分離する工程
を含むダイオキシンを取得する方法。
【国際公開番号】ＷＯ２００５／０３５５５４
【国際公開日】平成１７年４月２１日（２００５．４．２１）
【発行日】平成１９年９月６日（２００７．９．６）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００５−５１４５２２（Ｐ２００５−５１４５２２）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＩＢ２００４／００３２０４
【国際出願日】平成１６年１０月１日（２００４．１０．１）
【出願人】（０００２２３１０４）東和科学株式会社 (9)
【出願人】（３０１０２１５３３）独立行政法人産業技術総合研究所 (6,529)
【Ｆターム（参考）】
【国際公開日】平成１７年４月２１日（２００５．４．２１）
【発行日】平成１９年９月６日（２００７．９．６）
【国際特許分類】
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＩＢ２００４／００３２０４
【国際出願日】平成１６年１０月１日（２００４．１０．１）
【出願人】（０００２２３１０４）東和科学株式会社 (9)
【出願人】（３０１０２１５３３）独立行政法人産業技術総合研究所 (6,529)
【Ｆターム（参考）】
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