敗血症治療のための組み換え活性化ヒトタンパク質Ｃを生成する方法
本発明は、活性化タンパク質Ｃ生成の組み換え法に関する。本発明は、組み換え活性化ヒトタンパク質Ｃの構築、形質転換、発現、精製、および生成方法に関する。目的の遺伝子に関連した制御要素を含むＤＮＡ構築物が、開示される。目的の核酸配列はコドン最適化され、適切な哺乳類の宿主細胞における発現が可能になる。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、活性化タンパク質Ｃ生成の組み換え法に関する。本発明は、組み換え活性化ヒトタンパク質Ｃの構築、形質転換、発現、精製、および生成方法に関する。目的の遺伝子に関連した制御要素を含むＤＮＡ構築物が、開示される。目的の核酸配列はコドン最適化され、適切な哺乳類の宿主細胞における発現が可能になる。
【背景技術】
【０００２】
Ｘｉｇｒｉｓ（ドロトレコギンα）は、ヒト活性化タンパク質Ｃ（Ｈｕｍａｎ Ａｃｔｉｖａｔｅｄ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｃ ）の組み換え体である。これは、ヒト血漿由来活性化タンパク質Ｃと同じアミノ酸配列があるセリンプロテアーゼである。活性化タンパク質Ｃは感染に対する全身性反応の重要な修飾因子であり、抗血栓、線維素溶解促進、および抗炎症特性を有する。（活性化）ドロトレコギンαは分子量およそ５５ｋＤの糖タンパク質である。タンパク質Ｃの前駆体型は、（成熟タンパク質には存在しない）プレプロリーダーペプチド、９個のＧｌａ残基のγ−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）領域、短いらせん疎水性アミノ酸スタック、２つの表皮性成長因子（ＥＧＦ）様領域、軽鎖および重鎖間の結合ペプチド、活性化ペプチド、およびその中で触媒三つ組み残基（Ｃａｔａｌｙｔｉｃ ｔｒｉａｄ）がＨｉｓ−２１１、Ａｓｐ−２５７、およびＳｅｒ−３６０に位置するトリプシン様ＳＰ領域を含有する。ＥＧＦ領域の主な機能は、タンパク質−タンパク質間またはタンパク質−細胞間相互作用を提供することである。ＥＧＦモチーフ中に存在する残基はまた、異なる活性化因子および基質と機能的に反応することが示された。さらに連結らせん（Ｃｏｎｎｅｃｔｉｎｇ ｈｅｌｉｘ）は、神経保護の役割を果たすことが想定される、ＥＧＦ−Ｉ領域へのカルシウムイオン結合の配位に関与する残基を有する。
【０００３】
翻訳後修飾は、ジペプチドＬｙｓ−１５６−Ａｒｇ−１５７を除去し、その結果一本鎖形態がジスルフィド結合によって二本鎖分子結合に転換する。酵素前駆体ＰＣの８０％はこの形態である。またアミノ末端のＧｌａ領域中のグルタミン酸残基のカルボキシル化と、ＥＧＦ−Ｉ領域中のＡｓｐ残基のヒドロキシル化およびグリコシル化は、その他の翻訳後現象である。ＲｈＡＰＣおよびヒト血漿由来ＡＰＣは、同一のグリコシル化部位を有するが、グリコシル化構造中にはいくつかの差異が存在する。ヒトＡＰＣは４つのアスパラギン結合Ｎ−グリコシル化部位を有する。ヒトＡＰＣはその他の血漿タンパク質と比べて、５倍多いシアル酸を有する。
【０００４】
ヒトＡＰＣは、４つのアスパラギン結合Ｎ−グリコシル化部位を有する。ヒトＡＰＣはその他の血漿タンパク質と比べて、５倍多いフコースおよび２倍多いシアル酸を有する。活性化タンパク質Ｃは、第Ｖａ因子および第ＶＩＩＩａ因子を阻害することで作用する。生体外データは、活性化タンパク質Ｃがプラスミノーゲン活性化因子阻害物質−１（ＰＡＩ−１）を阻害して、活性化トロンビン−活性化可能な線維素溶解阻害物質の産生を制限するその能力を通じて、間接的な線維素溶解促進性活性を有することを示唆する。さらに生体外データは、活性化タンパク質Ｃが、単球によるヒト腫瘍壊死因子生成の阻害、白血球のセレクチンへの接着阻害、および毛細血管内皮細胞におけるトロンビン誘導性炎症性反応の制限によって、抗炎症効果を発揮するかもしれないことを示唆する。
【０００５】
より高等な真核生物系における、組み換えタンパク質発現のためのいくつかの方法について述べる。ＣＨＯ−Ｋ１、ＨＥＫ２９３（およびそれらの変異型）の細胞発現系は、今や哺乳類タンパク質発現のための、一般的に好まれる主要な系として確立されている。概要を述べる手順は、組み換えヒトドロトレコギンαをコードする新規合成核酸配列を、発現に適切な哺乳類宿主中に形質移入するのに適する。
【０００６】
以下で概要を述べる手順は、生物活性の、組み換え可溶性組み換え活性化ヒトタンパク質Ｃの生成に適する。本プロトコルは、タンパク質を発酵培地中に分泌する、不活性ヒトタンパク質Ｃ酵素原の相補的ＤＮＡを有する確立されたヒト細胞系を利用する。ヒトタンパク質Ｃは、αトロンビン、トリプシン、ラッセルクサリヘビ蛇毒Ｘ因子活性化因子またはトロンビンとトロンボモジュリンとの混合物による切断によって酵素的に活性化されて、活性化タンパク質Ｃが得られ、引き続いて精製される。しかしこれらの活性化手順は、汚染のリスクおよびより高い生産コストを伴う。本研究は、細胞結合型プロテアーゼの組み込みによって、活性化タンパク質Ｃの組み換え細胞からの直接の生成を目指す。
【０００７】
このようなプロテアーゼは細胞質または細胞小器官中、または細胞膜中に位置することができ、分泌中にまたは分泌直後にタンパク質を切断できる。したがって真核生物宿主細胞、すなわちＨＥＫ２９３からの分泌時に直接組み換え活性化タンパク質Ｃを生成する戦略が用いられている。
【０００８】
組み換え酵素は、高い死亡リスクを有する、重度の敗血症（すなわち急性臓器不全と関連する敗血症）の成人患者の死亡率低下における使用に適応される。
【０００９】
配列一覧
配列番号１：活性化タンパク質Ｃのヌクレオチド配列
配列番号２：活性化タンパク質Ｃのコドン最適化された配列
【発明の開示】
【課題を解決するための手段】
【００１０】
目的の遺伝子発現を可能にする、目的の遺伝子と関連する制御要素を含むＤＮＡ構築物が開示される。本発明のさらに別の態様は、哺乳類細胞中での新規合成核酸の発現を可能にする、前記核酸のコドン最適化である。コドン最適化配列は、発現に適切な哺乳類細胞系中に形質転換される。
【実施例】
【００１１】
実施例Ｉ：
（活性化）組み換えヒトタンパク質Ｃ発現のための哺乳類発現ベクターの設計は、４つのＮ結合グリコシル化部位に対応するために改変され、市販されるベクター（例えばインビトロジェン社（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）のｐｃＤＮＡまたはＢＤバイオサイエンス社（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）のｐＩＲＥＳ）に基づき、以下の特性を含む。
（ａ）天然シグナルペプチドを含むヒトタンパク質ＣのｃＤＮＡ挿入のための複数クローニング部位。
（ｂ）発現ベクターの設計はまた、蛍光支援細胞選別を使用した、高度に発現する形質移入体の迅速なスクリーニングを可能にする、非依存性（バイシストロニック）ＩＲＥＳを介在して共発現した緑色蛍光タンパク質にも対応する。
【００１２】
融合構築物の合成：
新規アプローチ：
ｒｈＡＰＣ ｃＤＮＡ構築物のコード領域合成に関する新規アプローチが探求されて、使用される特定の哺乳類細胞に関するより良いコドン最適化を確実にした。合成ｃＤＮＡ構築物の設計はまた、以下の特性を含む。
○効率的な翻訳を確実にする、コザック共通配列（ＧＣＣＡＣＣ）とそれに続く開始コドン（ＡＴＧ）
○所望の発現ベクター中にクローニングするためのｃＤＮＡの５’および３’末端の適切な制限部位
【００１３】
ヒト活性化タンパク質Ｃを配列するヌクレオチドは、配列番号１で表されている。ｒｈＡＰＣのコードＤＮＡ配列中のコドンは、コドン最適化過程の一部として改変され、ＣＨＯ Ｋ１およびＨＥＫ ２９３などの哺乳類細胞系における最適の組み換えタンパク質発現を確実にする。コドン最適化核酸配列は、配列番号２で記載される。
【００１４】
核酸配列の最適化配列は、配列番号２で記載される。
【００１５】
コドン最適化後のドロトレコギンαまたはＸｉｇｒｉｓをコードするＤＮＡヌクレオチド配列の非最適化およびコドン最適化バージョンのペアワイズ（Ｐａｉｒ−ｗｉｓｅ）配列比較を図１に示す。
【００１６】
実施例２：
ドロトレコギンα（ＤＲＯＴ）ｃＤＮＡのｐｃＤＮＡ３．１Ｄ／Ｖ５−ＨＩＳ哺乳類細胞特異的発現ベクター中へのサブクローニング
上記に示すように、自動化ＤＮＡ配列決定による、新規合成ｃＤＮＡ分子（ＤＲＯＴおよびＤＲＯＴ−Ｏｐｔ）の信頼性の検証に引き続いて、ＤＲＯＴを哺乳類細胞特異的発現ベクターｐｃＤＮＡ３．１Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ中にサブクローニングして、形質移入の用意ができた構築物を発生させた。使用手順の詳細を下に示す。
【００１７】
Ａ．試薬および酵素：
１．キアゲン（ＱＩＡＧＥＮ）ゲル抽出キットおよびＰＣＲ精製キット
２．インビトロジェンｐｃＤＮＡ３．１Ｄ／Ｖ５−ＨｉｓベクターＤＮＡ
【００１８】
【表１】
【００１９】
Ｂ．ベクターおよび挿入断片の制限消化：
手順
以下のＤＮＡサンプルおよび制限酵素を使用した。
【表２】
【００２０】
制限酵素消化反応：
【表３】
【００２１】
反応を混合し、遠沈して３７℃で２時間インキュベートした。制限消化をアガロースゲル電気泳動法によって分析した。予期された消化パターンが見られた。約１４００ｂｐの遺伝子断片フォールアウト（ｆａｌｌ ｏｕｔ）（反応２）、およびベクターでは約５．５ｋｂのベクター骨格断片（反応１）が見られた。キアゲンゲル抽出キットを使用したゲル抽出により、約１４００ｂｐのＤＲＯＴ挿入断片、および約５．５ｋｂの消化済ベクターｐｃＤＮＡ３．１Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ断片を精製した。１μｌの精製挿入断片およびベクター断片を１％アガロースゲル上でチェックした。
【００２２】
ゲル精製され制限消化されたＤＲＯＴのｃＤＮＡおよびｐｃＤＮＡ３．１Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓの断片を図２に示す。
【００２３】
実施例３．
Ｃ．ｐｃＤＮＡ３．１Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ骨格とＤＲＯＴ ｃＤＮＡとのライゲーション：
消化され精製されたベクターおよび挿入断片断片のＤＮＡ濃度を推定し（上の図７参照）、ライゲーションを次のとおり設定した。
【表４】
【００２４】
反応を穏やかに撹拌し、遠沈して室温で２〜３時間インキュベートした。ＤＨ１０コンピテント細胞をライゲーション反応で形質転換した。
【００２５】
アンピシリンを含有するＬＢ寒天プレート上に得られたコロニーを選別して、単離プラスミドＤＮＡの制限消化分析によって確認した。
【００２６】
実施例４：
Ｄ．ｐｃＤＮＡ３．１ＤＲＯＴ−／Ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓの推定上のクローンの制限消化分析
アンピシリンを含有するＬＢ寒天プレート上に得られたコロニーから、プラスミドＤＮＡを個別に精製し、単離されたプラスミドＤＮＡの制限消化分析によって、所望のｃＤＮＡ挿入断片の存在を確認した。ＡＶＣ１ＰｐｃＤＮＡ３．１Ｄ／ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓの推定上のクローンの制限消化分析を図に示す。
【００２７】
下の図９に示すように、ｐｃＤＮＡ３．１−ＤＲＯＴ−Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓを含有するいくつかの推定上のクローンの制限消化後に得られた結果に従って、所望の制限パターンを示すクローンのいくつかをＡＶＣＩＰ−Ｘｉｇｒｉｓ ｃＤＮＡを内的に切断して可変サイズ断片を発生させる制限酵素を使用した、さらなる制限消化分析のために選択した。
【００２８】
ｐｃＤＮＡ３．１−ＤＲＯＴ ｃＤＮＡを内的に切断する酵素を使用したＡＶＣｉＰｐｃＤＮＡ３，ｉＤ／Ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓクローンの制限消化分析
制限地図分析のために選択されたほとんどのｐｃＤＮＡ３．１−ＤＲＯＴ Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓクローンは、既知の内的制限部位の出現率に基づいて予期された断片サイズを生じたので、これらのクローンをＤＮＡ配列決定分析によってさらに確認した。
【００２９】
実施例５：
新規合成ｃＤＮＡ分子の信頼性の検証
商業サービス提供元から供給された新規合成ｃＤＮＡ分子の信頼性の検証は、自動化ＤＮＡ配列決定によって行われた。
【００３０】
Ｅ．選択されたｐｃＤＮＡ３．１−ＤＲＯＴ Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ／ＸｉｇｒｉｓクローンのＤＮＡ配列決定による確認
制限地図分析の結果として選択されたｐｃＤＮＡ３．１−ＤＲＯＴ Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓクローンを自動化ＤＮＡ配列決定によってさらに確認した。
【００３１】
【表５】
【００３２】
ｐｃＤＮＡ３．１−ＤＲＯＴ Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓクローンはテンプレート配列との同一性を示した。
【００３３】
ＤＲＯＴのマップを図８に図示する。組み換え発現構築物は新規合成ｐｃＤＮＡ３．１−を使用して作られた。
【００３４】
実施例６
ｒｈＡＰＣ融合構築物の維持および増殖：
ｒｈＡＰＣをコードするｃＤＮＡ構築物の維持および増殖は、インビトロジェン社のトップ１０（Ｔｏｐ １０）などの標準細菌細胞系中で行った。
【００３５】
実施例７．
５．ＨＥＫ２９３細胞における組み換えタンパク質の一過性／安定発現および上清の生成：
ａ）ｒｈＡＰＣ構築物の一過性／安定発現は、ＦＤＡが産業上の利用のために認可する主要な哺乳類細胞系である、剪断ヒトアデノウィルスタイプ５（ＡＤ５）ＤＮＡで形質転換されたヒト胎生期腎細胞（ＨＥＫ２９３）を使用して行った。一過性発現は、構築物発現をチェックして、少量の組み換えタンパク質を迅速に得るのに有用である。
【００３６】
ｂ）代案としては、個々のクローンを得る必要なしに、迅速に、高度発現を示す多数の細胞の選択を可能にするプロトコルである。引き続いて標準的手順を使用して、所望のｒｈＡＰＣタンパク質の安定した高度の発現を示すＨＥＫ２９３細胞が開発された。
【００３７】
ＦＤＡ規定に従って、手順全体を通じて、血清含有培地とは対照的に、シグマ・アルドリッチ社（Ｓｉｇｍａ Ａｌｄｒｉｃｈ）の化学合成培地を使用した、改善された培養技術が使用された。
【００３８】
実施例８．
精製手順の最適化：
上述の推奨される機能性／結合アッセイに従った、再現可能な生物活性の確立に引き続いて、収率を最大化するように、精製手順を最適化する努力がなされる。
【００３９】
したがって精製工程は、以下の下流過程を含んでなる。
ａ．通常および接線流濾過手順を使用した初期浄化および濃縮。
ｂ．限外濾過／透析濾過（接線流濾過に基づく）。
ｃ．クロモステップ（Ｃｈｒｏｍｏｓｔｅｐ）−Ｉ：活性化タンパク質Ｃ重鎖上の活性化部位に対するモノクローナル抗体、またはヒトタンパク質Ｃ軽鎖のγカルボキシグルタミン酸領域に対するカルシウム依存抗体を使用した親和クロマトグラフィー。
ｄ．クロモステップ−ＩＩ：ＥＭＤフラクトゲル（ｆｒａｃｔｏｇｅｌ）を使用した陰イオン交換クロマトグラフィー。
ｅ．クロモステップ−ＩＩＩ：ＤＮＡおよび宿主細胞タンパク質の除去のためのセルファインサルフェート（ｃｅｌｌｕｆｉｎｅ ｓｕｌｆａｔｅ）などの通過ベースの陰イオン交換体。
ｆ．ウイルス除去および無菌濾過。
ｇ．内毒素除去。
ｈ．定式化（Ｆｏｒｍｕｌａｔｉｏｎ）。
【図面の簡単な説明】
【００４０】
【図１】ドロトレコギンαまたはＸｉｇｒｉｓをコードするＤＮＡヌクレオチド配列の非最適化およびコドン最適化バージョンのペアワイズ配列比較である。
【図２】ＤＲＯＴ ｃＤＮＡ、およびｐｃＤＮＡ３．１Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓのゲル精製された制限消化断片である。
【図３】ＡＶＣＩＰｐｃＤＮＡ３．１Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓの推定上のクローンの制限消化分析である。
【図４】ｐｃＤＮＡ３．１−ＤＲＯＴ ｃＤＮＡを内的に切断する酵素を使用した、ＡＶＣＩＰｐｃＤＮＡ３．１Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓクローンの制限消化分析である。
【図５】新規合成されたｐｃＤＮＡ３．１−ＤＲＯＴ（ｓｙｎｔｈｅｔｉｃＸｉｇｒｉｓ）と確立されたＸｉｇｒｉｓ遺伝子配列との配列比較である。
【図６】新規合成されたｐｃＤＮＡ３．１−ＤＲＯＴ−Ｏｐｔ（ｓｙｎｔｈｅｔｉｃ＿Ｘｉｇｒｉｓ−Ｏｐｔ）と、確立されたＸｉｇｒｉｓ−Ｏｐｔ遺伝子配列との配列比較である。
【図７】ｐｃＤＮＡ３．１ＤＲＯＴ−／Ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓ ｃＤＮＡクローン＃４と確立されたＸｉｇｒｉｓ遺伝子配列との配列比較である。
【図８】ｐｃＤＮＡ３．１−ＤＲＯＴ−Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓの構築図である。
【技術分野】
【０００１】
本発明は、活性化タンパク質Ｃ生成の組み換え法に関する。本発明は、組み換え活性化ヒトタンパク質Ｃの構築、形質転換、発現、精製、および生成方法に関する。目的の遺伝子に関連した制御要素を含むＤＮＡ構築物が、開示される。目的の核酸配列はコドン最適化され、適切な哺乳類の宿主細胞における発現が可能になる。
【背景技術】
【０００２】
Ｘｉｇｒｉｓ（ドロトレコギンα）は、ヒト活性化タンパク質Ｃ（Ｈｕｍａｎ Ａｃｔｉｖａｔｅｄ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｃ ）の組み換え体である。これは、ヒト血漿由来活性化タンパク質Ｃと同じアミノ酸配列があるセリンプロテアーゼである。活性化タンパク質Ｃは感染に対する全身性反応の重要な修飾因子であり、抗血栓、線維素溶解促進、および抗炎症特性を有する。（活性化）ドロトレコギンαは分子量およそ５５ｋＤの糖タンパク質である。タンパク質Ｃの前駆体型は、（成熟タンパク質には存在しない）プレプロリーダーペプチド、９個のＧｌａ残基のγ−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）領域、短いらせん疎水性アミノ酸スタック、２つの表皮性成長因子（ＥＧＦ）様領域、軽鎖および重鎖間の結合ペプチド、活性化ペプチド、およびその中で触媒三つ組み残基（Ｃａｔａｌｙｔｉｃ ｔｒｉａｄ）がＨｉｓ−２１１、Ａｓｐ−２５７、およびＳｅｒ−３６０に位置するトリプシン様ＳＰ領域を含有する。ＥＧＦ領域の主な機能は、タンパク質−タンパク質間またはタンパク質−細胞間相互作用を提供することである。ＥＧＦモチーフ中に存在する残基はまた、異なる活性化因子および基質と機能的に反応することが示された。さらに連結らせん（Ｃｏｎｎｅｃｔｉｎｇ ｈｅｌｉｘ）は、神経保護の役割を果たすことが想定される、ＥＧＦ−Ｉ領域へのカルシウムイオン結合の配位に関与する残基を有する。
【０００３】
翻訳後修飾は、ジペプチドＬｙｓ−１５６−Ａｒｇ−１５７を除去し、その結果一本鎖形態がジスルフィド結合によって二本鎖分子結合に転換する。酵素前駆体ＰＣの８０％はこの形態である。またアミノ末端のＧｌａ領域中のグルタミン酸残基のカルボキシル化と、ＥＧＦ−Ｉ領域中のＡｓｐ残基のヒドロキシル化およびグリコシル化は、その他の翻訳後現象である。ＲｈＡＰＣおよびヒト血漿由来ＡＰＣは、同一のグリコシル化部位を有するが、グリコシル化構造中にはいくつかの差異が存在する。ヒトＡＰＣは４つのアスパラギン結合Ｎ−グリコシル化部位を有する。ヒトＡＰＣはその他の血漿タンパク質と比べて、５倍多いシアル酸を有する。
【０００４】
ヒトＡＰＣは、４つのアスパラギン結合Ｎ−グリコシル化部位を有する。ヒトＡＰＣはその他の血漿タンパク質と比べて、５倍多いフコースおよび２倍多いシアル酸を有する。活性化タンパク質Ｃは、第Ｖａ因子および第ＶＩＩＩａ因子を阻害することで作用する。生体外データは、活性化タンパク質Ｃがプラスミノーゲン活性化因子阻害物質−１（ＰＡＩ−１）を阻害して、活性化トロンビン−活性化可能な線維素溶解阻害物質の産生を制限するその能力を通じて、間接的な線維素溶解促進性活性を有することを示唆する。さらに生体外データは、活性化タンパク質Ｃが、単球によるヒト腫瘍壊死因子生成の阻害、白血球のセレクチンへの接着阻害、および毛細血管内皮細胞におけるトロンビン誘導性炎症性反応の制限によって、抗炎症効果を発揮するかもしれないことを示唆する。
【０００５】
より高等な真核生物系における、組み換えタンパク質発現のためのいくつかの方法について述べる。ＣＨＯ−Ｋ１、ＨＥＫ２９３（およびそれらの変異型）の細胞発現系は、今や哺乳類タンパク質発現のための、一般的に好まれる主要な系として確立されている。概要を述べる手順は、組み換えヒトドロトレコギンαをコードする新規合成核酸配列を、発現に適切な哺乳類宿主中に形質移入するのに適する。
【０００６】
以下で概要を述べる手順は、生物活性の、組み換え可溶性組み換え活性化ヒトタンパク質Ｃの生成に適する。本プロトコルは、タンパク質を発酵培地中に分泌する、不活性ヒトタンパク質Ｃ酵素原の相補的ＤＮＡを有する確立されたヒト細胞系を利用する。ヒトタンパク質Ｃは、αトロンビン、トリプシン、ラッセルクサリヘビ蛇毒Ｘ因子活性化因子またはトロンビンとトロンボモジュリンとの混合物による切断によって酵素的に活性化されて、活性化タンパク質Ｃが得られ、引き続いて精製される。しかしこれらの活性化手順は、汚染のリスクおよびより高い生産コストを伴う。本研究は、細胞結合型プロテアーゼの組み込みによって、活性化タンパク質Ｃの組み換え細胞からの直接の生成を目指す。
【０００７】
このようなプロテアーゼは細胞質または細胞小器官中、または細胞膜中に位置することができ、分泌中にまたは分泌直後にタンパク質を切断できる。したがって真核生物宿主細胞、すなわちＨＥＫ２９３からの分泌時に直接組み換え活性化タンパク質Ｃを生成する戦略が用いられている。
【０００８】
組み換え酵素は、高い死亡リスクを有する、重度の敗血症（すなわち急性臓器不全と関連する敗血症）の成人患者の死亡率低下における使用に適応される。
【０００９】
配列一覧
配列番号１：活性化タンパク質Ｃのヌクレオチド配列
配列番号２：活性化タンパク質Ｃのコドン最適化された配列
【発明の開示】
【課題を解決するための手段】
【００１０】
目的の遺伝子発現を可能にする、目的の遺伝子と関連する制御要素を含むＤＮＡ構築物が開示される。本発明のさらに別の態様は、哺乳類細胞中での新規合成核酸の発現を可能にする、前記核酸のコドン最適化である。コドン最適化配列は、発現に適切な哺乳類細胞系中に形質転換される。
【実施例】
【００１１】
実施例Ｉ：
（活性化）組み換えヒトタンパク質Ｃ発現のための哺乳類発現ベクターの設計は、４つのＮ結合グリコシル化部位に対応するために改変され、市販されるベクター（例えばインビトロジェン社（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）のｐｃＤＮＡまたはＢＤバイオサイエンス社（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）のｐＩＲＥＳ）に基づき、以下の特性を含む。
（ａ）天然シグナルペプチドを含むヒトタンパク質ＣのｃＤＮＡ挿入のための複数クローニング部位。
（ｂ）発現ベクターの設計はまた、蛍光支援細胞選別を使用した、高度に発現する形質移入体の迅速なスクリーニングを可能にする、非依存性（バイシストロニック）ＩＲＥＳを介在して共発現した緑色蛍光タンパク質にも対応する。
【００１２】
融合構築物の合成：
新規アプローチ：
ｒｈＡＰＣ ｃＤＮＡ構築物のコード領域合成に関する新規アプローチが探求されて、使用される特定の哺乳類細胞に関するより良いコドン最適化を確実にした。合成ｃＤＮＡ構築物の設計はまた、以下の特性を含む。
○効率的な翻訳を確実にする、コザック共通配列（ＧＣＣＡＣＣ）とそれに続く開始コドン（ＡＴＧ）
○所望の発現ベクター中にクローニングするためのｃＤＮＡの５’および３’末端の適切な制限部位
【００１３】
ヒト活性化タンパク質Ｃを配列するヌクレオチドは、配列番号１で表されている。ｒｈＡＰＣのコードＤＮＡ配列中のコドンは、コドン最適化過程の一部として改変され、ＣＨＯ Ｋ１およびＨＥＫ ２９３などの哺乳類細胞系における最適の組み換えタンパク質発現を確実にする。コドン最適化核酸配列は、配列番号２で記載される。
【００１４】
核酸配列の最適化配列は、配列番号２で記載される。
【００１５】
コドン最適化後のドロトレコギンαまたはＸｉｇｒｉｓをコードするＤＮＡヌクレオチド配列の非最適化およびコドン最適化バージョンのペアワイズ（Ｐａｉｒ−ｗｉｓｅ）配列比較を図１に示す。
【００１６】
実施例２：
ドロトレコギンα（ＤＲＯＴ）ｃＤＮＡのｐｃＤＮＡ３．１Ｄ／Ｖ５−ＨＩＳ哺乳類細胞特異的発現ベクター中へのサブクローニング
上記に示すように、自動化ＤＮＡ配列決定による、新規合成ｃＤＮＡ分子（ＤＲＯＴおよびＤＲＯＴ−Ｏｐｔ）の信頼性の検証に引き続いて、ＤＲＯＴを哺乳類細胞特異的発現ベクターｐｃＤＮＡ３．１Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ中にサブクローニングして、形質移入の用意ができた構築物を発生させた。使用手順の詳細を下に示す。
【００１７】
Ａ．試薬および酵素：
１．キアゲン（ＱＩＡＧＥＮ）ゲル抽出キットおよびＰＣＲ精製キット
２．インビトロジェンｐｃＤＮＡ３．１Ｄ／Ｖ５−ＨｉｓベクターＤＮＡ
【００１８】
【表１】
【００１９】
Ｂ．ベクターおよび挿入断片の制限消化：
手順
以下のＤＮＡサンプルおよび制限酵素を使用した。
【表２】
【００２０】
制限酵素消化反応：
【表３】
【００２１】
反応を混合し、遠沈して３７℃で２時間インキュベートした。制限消化をアガロースゲル電気泳動法によって分析した。予期された消化パターンが見られた。約１４００ｂｐの遺伝子断片フォールアウト（ｆａｌｌ ｏｕｔ）（反応２）、およびベクターでは約５．５ｋｂのベクター骨格断片（反応１）が見られた。キアゲンゲル抽出キットを使用したゲル抽出により、約１４００ｂｐのＤＲＯＴ挿入断片、および約５．５ｋｂの消化済ベクターｐｃＤＮＡ３．１Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ断片を精製した。１μｌの精製挿入断片およびベクター断片を１％アガロースゲル上でチェックした。
【００２２】
ゲル精製され制限消化されたＤＲＯＴのｃＤＮＡおよびｐｃＤＮＡ３．１Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓの断片を図２に示す。
【００２３】
実施例３．
Ｃ．ｐｃＤＮＡ３．１Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ骨格とＤＲＯＴ ｃＤＮＡとのライゲーション：
消化され精製されたベクターおよび挿入断片断片のＤＮＡ濃度を推定し（上の図７参照）、ライゲーションを次のとおり設定した。
【表４】
【００２４】
反応を穏やかに撹拌し、遠沈して室温で２〜３時間インキュベートした。ＤＨ１０コンピテント細胞をライゲーション反応で形質転換した。
【００２５】
アンピシリンを含有するＬＢ寒天プレート上に得られたコロニーを選別して、単離プラスミドＤＮＡの制限消化分析によって確認した。
【００２６】
実施例４：
Ｄ．ｐｃＤＮＡ３．１ＤＲＯＴ−／Ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓの推定上のクローンの制限消化分析
アンピシリンを含有するＬＢ寒天プレート上に得られたコロニーから、プラスミドＤＮＡを個別に精製し、単離されたプラスミドＤＮＡの制限消化分析によって、所望のｃＤＮＡ挿入断片の存在を確認した。ＡＶＣ１ＰｐｃＤＮＡ３．１Ｄ／ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓの推定上のクローンの制限消化分析を図に示す。
【００２７】
下の図９に示すように、ｐｃＤＮＡ３．１−ＤＲＯＴ−Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓを含有するいくつかの推定上のクローンの制限消化後に得られた結果に従って、所望の制限パターンを示すクローンのいくつかをＡＶＣＩＰ−Ｘｉｇｒｉｓ ｃＤＮＡを内的に切断して可変サイズ断片を発生させる制限酵素を使用した、さらなる制限消化分析のために選択した。
【００２８】
ｐｃＤＮＡ３．１−ＤＲＯＴ ｃＤＮＡを内的に切断する酵素を使用したＡＶＣｉＰｐｃＤＮＡ３，ｉＤ／Ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓクローンの制限消化分析
制限地図分析のために選択されたほとんどのｐｃＤＮＡ３．１−ＤＲＯＴ Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓクローンは、既知の内的制限部位の出現率に基づいて予期された断片サイズを生じたので、これらのクローンをＤＮＡ配列決定分析によってさらに確認した。
【００２９】
実施例５：
新規合成ｃＤＮＡ分子の信頼性の検証
商業サービス提供元から供給された新規合成ｃＤＮＡ分子の信頼性の検証は、自動化ＤＮＡ配列決定によって行われた。
【００３０】
Ｅ．選択されたｐｃＤＮＡ３．１−ＤＲＯＴ Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ／ＸｉｇｒｉｓクローンのＤＮＡ配列決定による確認
制限地図分析の結果として選択されたｐｃＤＮＡ３．１−ＤＲＯＴ Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓクローンを自動化ＤＮＡ配列決定によってさらに確認した。
【００３１】
【表５】
【００３２】
ｐｃＤＮＡ３．１−ＤＲＯＴ Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓクローンはテンプレート配列との同一性を示した。
【００３３】
ＤＲＯＴのマップを図８に図示する。組み換え発現構築物は新規合成ｐｃＤＮＡ３．１−を使用して作られた。
【００３４】
実施例６
ｒｈＡＰＣ融合構築物の維持および増殖：
ｒｈＡＰＣをコードするｃＤＮＡ構築物の維持および増殖は、インビトロジェン社のトップ１０（Ｔｏｐ １０）などの標準細菌細胞系中で行った。
【００３５】
実施例７．
５．ＨＥＫ２９３細胞における組み換えタンパク質の一過性／安定発現および上清の生成：
ａ）ｒｈＡＰＣ構築物の一過性／安定発現は、ＦＤＡが産業上の利用のために認可する主要な哺乳類細胞系である、剪断ヒトアデノウィルスタイプ５（ＡＤ５）ＤＮＡで形質転換されたヒト胎生期腎細胞（ＨＥＫ２９３）を使用して行った。一過性発現は、構築物発現をチェックして、少量の組み換えタンパク質を迅速に得るのに有用である。
【００３６】
ｂ）代案としては、個々のクローンを得る必要なしに、迅速に、高度発現を示す多数の細胞の選択を可能にするプロトコルである。引き続いて標準的手順を使用して、所望のｒｈＡＰＣタンパク質の安定した高度の発現を示すＨＥＫ２９３細胞が開発された。
【００３７】
ＦＤＡ規定に従って、手順全体を通じて、血清含有培地とは対照的に、シグマ・アルドリッチ社（Ｓｉｇｍａ Ａｌｄｒｉｃｈ）の化学合成培地を使用した、改善された培養技術が使用された。
【００３８】
実施例８．
精製手順の最適化：
上述の推奨される機能性／結合アッセイに従った、再現可能な生物活性の確立に引き続いて、収率を最大化するように、精製手順を最適化する努力がなされる。
【００３９】
したがって精製工程は、以下の下流過程を含んでなる。
ａ．通常および接線流濾過手順を使用した初期浄化および濃縮。
ｂ．限外濾過／透析濾過（接線流濾過に基づく）。
ｃ．クロモステップ（Ｃｈｒｏｍｏｓｔｅｐ）−Ｉ：活性化タンパク質Ｃ重鎖上の活性化部位に対するモノクローナル抗体、またはヒトタンパク質Ｃ軽鎖のγカルボキシグルタミン酸領域に対するカルシウム依存抗体を使用した親和クロマトグラフィー。
ｄ．クロモステップ−ＩＩ：ＥＭＤフラクトゲル（ｆｒａｃｔｏｇｅｌ）を使用した陰イオン交換クロマトグラフィー。
ｅ．クロモステップ−ＩＩＩ：ＤＮＡおよび宿主細胞タンパク質の除去のためのセルファインサルフェート（ｃｅｌｌｕｆｉｎｅ ｓｕｌｆａｔｅ）などの通過ベースの陰イオン交換体。
ｆ．ウイルス除去および無菌濾過。
ｇ．内毒素除去。
ｈ．定式化（Ｆｏｒｍｕｌａｔｉｏｎ）。
【図面の簡単な説明】
【００４０】
【図１】ドロトレコギンαまたはＸｉｇｒｉｓをコードするＤＮＡヌクレオチド配列の非最適化およびコドン最適化バージョンのペアワイズ配列比較である。
【図２】ＤＲＯＴ ｃＤＮＡ、およびｐｃＤＮＡ３．１Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓのゲル精製された制限消化断片である。
【図３】ＡＶＣＩＰｐｃＤＮＡ３．１Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓの推定上のクローンの制限消化分析である。
【図４】ｐｃＤＮＡ３．１−ＤＲＯＴ ｃＤＮＡを内的に切断する酵素を使用した、ＡＶＣＩＰｐｃＤＮＡ３．１Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓクローンの制限消化分析である。
【図５】新規合成されたｐｃＤＮＡ３．１−ＤＲＯＴ（ｓｙｎｔｈｅｔｉｃＸｉｇｒｉｓ）と確立されたＸｉｇｒｉｓ遺伝子配列との配列比較である。
【図６】新規合成されたｐｃＤＮＡ３．１−ＤＲＯＴ−Ｏｐｔ（ｓｙｎｔｈｅｔｉｃ＿Ｘｉｇｒｉｓ−Ｏｐｔ）と、確立されたＸｉｇｒｉｓ−Ｏｐｔ遺伝子配列との配列比較である。
【図７】ｐｃＤＮＡ３．１ＤＲＯＴ−／Ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓ ｃＤＮＡクローン＃４と確立されたＸｉｇｒｉｓ遺伝子配列との配列比較である。
【図８】ｐｃＤＮＡ３．１−ＤＲＯＴ−Ｄ／Ｖ５−Ｈｉｓ／Ｘｉｇｒｉｓの構築図である。
【特許請求の範囲】
【請求項１】
宿主細胞を、配列番号２の核酸配列でコードされるタンパク質をコードする合成ＤＮＡ配列で形質転換する工程と、
前記生成物を前記宿主細胞またはその生育培地から単離する工程と、
を含む、生体内で生物学的に活性な活性化ヒトタンパク質Ｃ生成物を調製する方法。
【請求項２】
前記活性化ヒトタンパク質Ｃをコードするコドン最適化核酸配列が配列番号３で記載される、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記宿主細胞が哺乳類細胞である、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記宿主細胞が好ましくはＨＥＫ２９３株から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
宿主細胞を図８のベクター構築物で形質転換する工程と、
前記生成物を前記宿主細胞またはその生育培地から単離する工程と、
を含む、生体内で生物学的に活性なヒト組み換え活性化タンパク質Ｃ生成物を調製する方法。
【請求項６】
前記ベクターが哺乳類細胞特異的発現ベクターであり、最も好ましくは図８で記載されるベクターである、請求項１に記載の方法。
【請求項１】
宿主細胞を、配列番号２の核酸配列でコードされるタンパク質をコードする合成ＤＮＡ配列で形質転換する工程と、
前記生成物を前記宿主細胞またはその生育培地から単離する工程と、
を含む、生体内で生物学的に活性な活性化ヒトタンパク質Ｃ生成物を調製する方法。
【請求項２】
前記活性化ヒトタンパク質Ｃをコードするコドン最適化核酸配列が配列番号３で記載される、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記宿主細胞が哺乳類細胞である、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記宿主細胞が好ましくはＨＥＫ２９３株から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
宿主細胞を図８のベクター構築物で形質転換する工程と、
前記生成物を前記宿主細胞またはその生育培地から単離する工程と、
を含む、生体内で生物学的に活性なヒト組み換え活性化タンパク質Ｃ生成物を調製する方法。
【請求項６】
前記ベクターが哺乳類細胞特異的発現ベクターであり、最も好ましくは図８で記載されるベクターである、請求項１に記載の方法。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【公表番号】特表２００９−５０２１１８（Ｐ２００９−５０２１１８Ａ）
【公表日】平成２１年１月２９日（２００９．１．２９）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００８−５１２９４４（Ｐ２００８−５１２９４４）
【出願日】平成１８年５月２４日（２００６．５．２４）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＩＢ２００６／００１３５９
【国際公開番号】ＷＯ２００６／１２６０７０
【国際公開日】平成１８年１１月３０日（２００６．１１．３０）
【出願人】（５０２３０９５１３）アベスタゲン リミテッド (6)
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２１年１月２９日（２００９．１．２９）
【国際特許分類】
【出願日】平成１８年５月２４日（２００６．５．２４）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＩＢ２００６／００１３５９
【国際公開番号】ＷＯ２００６／１２６０７０
【国際公開日】平成１８年１１月３０日（２００６．１１．３０）
【出願人】（５０２３０９５１３）アベスタゲン リミテッド (6)
【Ｆターム（参考）】
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