【課題】分析物の検出、定量及び増幅用の新規な組成物および方法を得る。
【解決手段】分析物の核酸アレイおよびライブラリーをこのような組成物および方法に有用に組入れる。ユニバーサルディテクションエレメントおよびシグナル伝達体などを使用して分析物を検出し、必要であるか所望する場合、更に定量する。ターゲット分析物の増幅もまた、本発明の組成物および方法によってもたらされる。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
ライブラリーにおける意図する複数の核酸を検出もしくは定量する方法であって、
（ａ）（ｉ）意図する前記核酸に相補的な核酸のアレイであって、前記核酸が多孔質もしくは非多孔質固体支持体に直接的もしくは間接的に固定化もしくは直接的もしくは間接的に不動化される核酸のアレイと、
（ｉｉ）検出もしくは定量化しようとする意図する核酸を含む可能性のある核酸分析物のライブラリーであって、意図する前記核酸のそれぞれは少なくとも１種の内在性のユニバーサルディテクションターゲット（ＵＤＴ）を含むライブラリーと、
（ｉｉｉ）シグナルを直接的もしくは間接的に発生するユニバーサルディテクションエレメント（ＵＤＥ）とを提供し、
（ｂ）前記ライブラリー（ｉｉ）を核酸の前記アレイ（ｉ）とハイブリダイズさせて、意図する前記核酸が存在する場合にはハイブリッドを形成し、
（ｃ）前記ＵＤＥを前記ＵＤＴと接触させて、前記アレイに結合した複合体を形成し、
（ｄ）前記アレイに結合したＵＤＥから発生するシグナルの量を検出もしくは測定することにより、前記複数の意図する核酸を検出もしくは定量する方法。
【請求項２】
前記核酸アレイがＤＮＡ、ＲＮＡ、ＤＮＡ類似物、ＲＮＡ類似物およびＰＮＡよりなる群から選択される請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記核酸もしくは類似物が糖部分、燐酸塩部分もしくは塩基部分のいずれか１つで改変される請求項２に記載の方法。
【請求項４】
前記多孔質固体支持体がポリアクリルアミドおよびアガロースよりなる群から選択される請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記非多孔質固体支持体がガラスもしくはプラスチックからなる請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記固体支持体が透過性、半透過性、遮光性又は反射性である請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記核酸が、化学リンカーもしくは結合アームにより前記固体支持体に間接的に固定化もしくは間接的に不動化される請求項１に記載の方法。
【請求項８】
前記分析物のライブラリーが器官、組織および細胞よりなる群から選択された生物資源から得られる請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記分析物がゲノムＤＮＡ、エピソームＤＮＡ、スプライスしていないＲＮＡ、ｍＲＮＡ、ｒＲＮＡ、ｓｎＲＮＡもしくは前記の任意の組合せよりなる群から選択される請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
前記内在性のＵＤＴが３′ポリＡセグメント、５′キャップ、２次的構造、コンセンサス配列あるいは前記の任意の組合せよりなる群から選択される請求項１に記載の方法。
【請求項１１】
前記コンセンサス配列がポリＡ付加のためのシグナル配列、スプライスエレメント、マルチコピーの繰返しあるいは前記の任意の組合せよりなる群から選択される請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記ＵＤＥが核酸、核酸類似物、ＰＮＡ、ポリペプチド、多糖類、合成ポリマーあるいは前記の任意の組合せよりなる群から選択される請求項１に記載の方法。
【請求項１３】
前記ＵＤＥの直接的シグナル発生が蛍光性化合物、燐光性化合物、化学蛍光性化合物、キレート性化合物、電子高密度化合物、磁性化合物、挿入化合物、エネルギー伝達化合物および前記の任意の組合せよりなる群から選択される請求項１に記載の方法。
【請求項１４】
前記ＵＤＥの間接的シグナル発生が抗体、抗原、ハプテン、受容体、ホルモン、リガンド、酵素であって前記酵素が蛍光反応、発色性反応もしくは化学蛍光性反応である反応を触媒する酵素、および前記の任意の組合せよりなる群から選択される請求項１に記載の方法。
【請求項１５】
１回もしくはそれ以上の洗浄工程を含む請求項１に記載の方法。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【図６】

【図７】

【図８】

【図９】

【図１０】

【図１１】

【図１２】

【図１３】

【図１４】

【図１５】

【図１６】

【図１７】

【図１８】

【図１９】

【図２０】

【図２１】

【図２２】

【図２３】

【図２４】

【図２５】

【図２６】

【図２７】

【図２８】

【図２９】

【図３０】

【図３１】

【図３２】

【図３３】

【公開番号】特開２００９−１１２３１７（Ｐ２００９−１１２３１７Ａ）
【公開日】平成２１年５月２８日（２００９．５．２８）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００９−５０２７３（Ｐ２００９−５０２７３）
【出願日】平成２１年３月４日（２００９．３．４）
【分割の表示】特願２００２−１９２７７１（Ｐ２００２−１９２７７１）の分割
【原出願日】平成１４年７月１日（２００２．７．１）
【出願人】（５０２２３７３５３）エンゾー　ライフ　サイエンセズ　インコーポレイテッド (3)
【Ｆターム（参考）】