２つ以上のリガンドを含む多リガンド捕捉剤、ならびに関連組成物、方法および系を記載する。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
そのそれぞれが標的と特異的に結合し、かつ他方と結合的に識別可能であり、
多リガンド捕捉剤が標的と結合した際に２つ以上のリガンドのそれぞれが標的と特異的に結合するように、多リガンド捕捉剤中で配置されている
互いに共有結合した２つ以上のリガンドを含む、標的に対する多リガンド捕捉剤。
【請求項２】
２つ以上のリガンドのうちの少なくとも１つが少なくとも１つの他のリガンドに非関連および／または標的に非関連である、請求項１に記載の多リガンド捕捉剤。
【請求項３】
２つ以上のリガンドが同一または異なる化学性質のものである、請求項１または２に記載の多リガンド捕捉剤。
【請求項４】
２つ以上のリガンドが、ペプチド、ポリペプチド、ポリヌクレオチド、および小分子からなる群から独立して選択される、請求項１から３のいずれか一項に記載の多リガンド捕捉剤。
【請求項５】
２つ以上のリガンドのうちの１つまたは複数が、それぞれ３〜１００個の単量体を含むペプチドである、請求項４に記載の多リガンド捕捉剤。
【請求項６】
１０個までのリガンドを含む、請求項１から５のいずれか一項に記載の多リガンド捕捉剤。
【請求項７】
２つ以上のリガンドが直鎖状多リガンド捕捉剤を提供するように配置されている、請求項１から６のいずれか一項に記載の多リガンド捕捉剤。
【請求項８】
２つ以上のリガンドが分枝状多リガンド捕捉剤を提供するように配置されている、請求項１から６のいずれか一項に記載の多リガンド捕捉剤。
【請求項９】
捕捉剤に所望の化学活性または生物活性を提供する追加の分子または官能基をさらに含む、請求項１から８のいずれか一項に記載の多リガンド捕捉剤。
【請求項１０】
所望の化学活性または生物活性が溶解度、安定性、生体利用度、免疫原性、検出性、および反応性である、請求項９に記載の多リガンド。
【請求項１１】
追加の分子または官能基が親水性化合物、疎水性化合物、担体または標識である、請求項９または１０に記載の多リガンド捕捉剤。
【請求項１２】
共有結合しており、
単離されている場合に第１のリガンドが標的と結合することができ、
単離されている場合に第２のリガンドが標的と結合することができ、
標的とのその結合において結合的に識別可能である
第１のリガンドおよび第２のリガンドを含む、
標的と特異的に結合することができ、
標的と結合する場合は第１のリガンドおよび第２のリガンドがどちらも標的と接触する
多リガンド捕捉剤。
【請求項１３】
第３のリガンドをさらに含み、第３のリガンドは第１および第２のリガンドと共有結合しており、多リガンド捕捉剤が標的と結合する場合は第３のリガンドは標的と接触する、請求項１２に記載の多リガンド捕捉剤。
【請求項１４】
第４のリガンドをさらに含み、第４のリガンドは第１、第２、および第３のリガンドと共有結合しており、多リガンド捕捉剤が標的と結合する場合は第４のリガンドは標的と接触する、請求項１３に記載の多リガンド捕捉剤。
【請求項１５】
複数の候補リガンドから、対応する結合部位で標的と特異的に結合することができる候補リガンドを選択するステップを含み、
結合部位が、それぞれの部位上に結合したそれぞれの、リガンドの互いの間での共有結合を可能にするように配置されている
、標的に対する多リガンド捕捉剤の２つ以上のリガンドを多リガンドて提供する方法。
【請求項１６】
複数の候補リガンドが、別のリガンドに非関連および／または標的に非関連である少なくとも１つの候補リガンドを含む、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
選択を、標的と結合した候補リガンド間の共有結合の形成を可能にする時間かつ条件下で複数の候補リガンドを標的と接触させることによって行ない、共有結合の形成が標的によって触媒される、請求項１５または１６に記載の方法。
【請求項１８】
候補リガンドが、標的またはその一部分と結合できることが当初は知られていない化合物を含む、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
標的と接触させる前または後に所望の特長が導入されるように候補リガンドを修飾する、請求項１７または１８に記載の方法。
【請求項２０】
リガンド上に提示される官能基によってリガンド間の共有結合が行なわれて、２つの個別のリガンドと標的が結合した際に、官能基が反応して共有結合が形成される、請求項１７から１９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１】
複数の候補リガンドが、第１の複数の候補リガンドおよび第２の複数の候補リガンドを含み、
選択を、
標的を第１の複数の候補リガンドと接触させて、標的と特異的に結合し、標的によって触媒される反応において対応する第２の官能基と特異的に結合することができる第１の官能基を提示するアンカーリガンドを選択するステップと、
アンカーリガンドを標的と接触させ、それによりアンカーリガンド標的複合体を提供するステップと、
アンカーリガンド標的複合体を第２の複数の候補リガンドと接触させるステップと、
アンカーリガンド標的複合体と特異的に結合し、アンカーリガンドと共有結合する第２の複数の候補リガンドの候補リガンドを選択し、それにより多リガンドを提供するステップと
によって行なう、請求項１７から２０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２】
アンカーリガンドの選択を、
標的と特異的に結合する候補リガンドを選択するステップと、
標的によって触媒される反応において対応する第２の官能基と特異的に結合することができる第１の官能基が導入されるように選択した候補リガンドを修飾し、それにより前記第１の官能基を提示するアンカーリガンドを提供するステップと
によって行なう、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
第１および第２の複数の候補リガンドが全体でまたは部分的に同一または異なる、請求項２１または２２に記載の方法。
【請求項２４】
追加のリガンドを多リガンドに付加するために多リガンドをアンカーリガンドとして用いて選択を繰り返す、請求項２１から２３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５】
標的に対する高次多リガンド捕捉剤の結合親和性がアンカーリガンドの結合親和性よりも少なくとも１０^２高くなるまで選択を繰り返す、請求項２１から２４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６】
標的に対する高次多リガンド捕捉剤の結合親和性がアンカーリガンドの結合親和性よりも少なくとも１０^１０高くなるまで選択を繰り返す、請求項２１から２４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７】
多リガンド捕捉剤と標的の結合の解離定数が１０^−５Ｍ以下となるまで選択を繰り返す、請求項２１から２４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８】
多リガンド捕捉剤と標的の結合の解離定数が１０^−１６Ｍ以下となるまで選択を繰り返す、請求項２１から２４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９】
選択を繰り返し、１回または複数回の選択の反復において同一または異なる複数の候補リガンドを第２の複数の候補リガンドとして用いる、請求項２１から２８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０】
選択を繰り返し、１回または複数回の選択の反復において同一または異なる官能基を第１のおよび／または第２の官能基として用いる、請求項２１から２９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１】
２つ以上のリガンドがペプチドまたはポリペプチドである、請求項２１から３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２】
多リガンド捕捉剤がポリペプチドによって形成されるタンパク質捕捉剤であり、ポリペプチドを合成するために行なう、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
修飾したアンカーリガンドを第１の複数の候補リガンドおよび標的と接触させるステップであって、修飾したアンカーリガンドが、標的によって触媒される反応において候補リガンドのうちの１つまたは複数と共有結合しており、それにより１つまたは複数の多リガンド捕捉剤が形成され、多リガンド捕捉剤のそれぞれが、修飾したアンカーリガンドおよび候補リガンドのうちの１つを含むステップを含み、
アンカーリガンドが標的と結合することができ、修飾したアンカーリガンドが第１の官能基を含、第１の官能基が対応する第２の官能基と特異的に反応することができ、候補リガンドのそれぞれが第２の官能基を含む、
多リガンド捕捉剤を作製する方法。
【請求項３４】
（ｉ）対応する第４の官能基と特異的に反応することができる第３の官能基を含むように多リガンド捕捉剤のうちの１つを修飾するステップと、
（ｉｉ）修飾された多リガンド捕捉剤を第２の複数の候補リガンドおよび標的と接触させるステップであって、修飾された多リガンド捕捉剤が標的によって触媒される反応において候補リガンドのうちの１つまたは複数と共有結合し、それにより１つまたは複数の高次多リガンド捕捉剤が形成されるステップと
をさらに含み、
高次多リガンド捕捉剤のそれぞれが、修飾された多リガンド捕捉剤および候補リガンドのうちの１つを含み、
第２の複数の捕捉リガンド中の候補リガンドのそれぞれが第４の官能基を含む
、請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
接触前にはどの候補リガンドが標的と結合できるかが知られていない、請求項３３または３４に記載の方法。
【請求項３６】
第１の複数および／または第２の複数の候補リガンドが化合物のコンビナトリアルライブラリを含む、請求項３３から３５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７】
化合物のコンビナトリアルライブラリが鎖中で連結されたサブユニットの群の順列を含む化合物を含む、請求項３６に記載の方法。
【請求項３８】
鎖が直鎖状、分枝状、環状、または組合せである、請求項３７に記載の方法。
【請求項３９】
サブユニットの群がアミノ酸、修飾アミノ酸、または組合せを含む、請求項３７または３８に記載の方法。
【請求項４０】
サブユニットの群が１つまたは複数の有機小分子をさらに含む、請求項３９に記載の方法。
【請求項４１】
サブユニットの群中のアミノ酸がアミノ酸の部分組から本質的になる、請求項３９または４０に記載の方法。
【請求項４２】
サブユニットの群中の修飾アミノ酸が修飾アミノ酸の部分組から本質的になる、請求項３９または４０に記載の方法。
【請求項４３】
請求項１から１４のいずれか一項に記載の多リガンド捕捉剤とビヒクルとを含む組成物。
【請求項４４】
ビヒクルが製薬上許容されるビヒクルである、薬剤組成物である請求項４３に記載の組成物。
【請求項４５】
多リガンド捕捉剤と標的の結合を可能にして多リガンド捕捉剤標的複合体を形成させる時間かつ条件下で、標的を請求項１から１４のいずれか一項に記載の多リガンド捕捉剤と接触させるステップと、
多リガンド捕捉剤標的複合体を検出するステップと
を含む、標的を検出する方法。
【請求項４６】
標的と多リガンド捕捉剤との接触および多リガンド捕捉剤標的複合体の検出を単パラメータアッセイまたは複数パラメータアッセイに従って行なう、請求項４５に記載の方法。
【請求項４７】
多リガンド捕捉剤がタンパク質捕捉剤であり、単パラメータアッセイまたは複数パラメータアッセイが標準のタンパク質アッセイである、請求項４６に記載の方法。
【請求項４８】
標的が事前に決定した条件に関連するバイオマーカーである、請求項４５から４７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４９】
請求項１から１４のいずれか一項に記載の多リガンド捕捉剤および多リガンド捕捉剤標的複合体の検出を行なうために必要な少なくとも１つの試薬を含む、標的を検出する系。
【請求項５０】
少なくとも１つの試薬が標識した分子である、請求項４９に記載の系。
【請求項５１】
多リガンド捕捉剤と標的の特異的結合を可能にして多リガンド捕捉剤標的複合体を形成させるための時間かつ条件下で、請求項１から１４のいずれか一項に記載の多リガンド捕捉剤を混合物と接触させるステップと、
タンパク質捕捉剤標的複合体を混合物から分離するステップと
を含む、標的を混合物中の分析物から分離する方法。
【請求項５２】
標的とタンパク質捕捉剤との接触およびタンパク質捕捉剤標的複合体の分離を単パラメータアッセイまたは複数パラメータアッセイに従って行なう、請求項５１に記載の方法。
【請求項５３】
請求項１から１４のいずれか一項に記載の多リガンド捕捉剤および混合物から多リガンド捕捉剤標的複合体を分離するために必要な少なくとも１つの試薬を含む、標的を混合物中の分析物から分離する系。
【請求項５４】
少なくとも１つの複数の候補リガンド、および
１つまたは複数の官能基を前記候補リガンド上に導入するための試薬
を含む、請求項１から１４のいずれか一項に記載の多リガンド捕捉剤を提供する系。
【請求項５５】
標識をさらに含む、請求項５４に記載の系。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【図６】

【図７】

【図８】

【図９】

【図１０】

【図１１】

【図１２】

【図１３】

【図１４】

【図１５】

【図１６】

【図１７】

【図１８】

【図１９】

【図２０】

【図２１】

【図２２】

【図２３】

【図２４】

【図２５】

【図２６】

【図２７Ａ】

【図２７Ｂ】

【図２８Ａ】

【図２８Ｂ】

【図２９】

【図３０】

【図３１】

【図３２】

【図３３】

【図３４】

【図３５】

【図３６】

【図３７】

【図３８】

【公表番号】特表２０１１−５２５１８７（Ｐ２０１１−５２５１８７Ａ）
【公表日】平成２３年９月１５日（２０１１．９．１５）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１１−５１４８０７（Ｐ２０１１−５１４８０７）
【出願日】平成２１年６月１８日（２００９．６．１８）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００９／０４７７９９
【国際公開番号】ＷＯ２００９／１５５４２０
【国際公開日】平成２１年１２月２３日（２００９．１２．２３）
【出願人】（５０８０３２２８４）カリフォルニア　インスティチュート　オブ　テクノロジー (17)
【Ｆターム（参考）】