抗真菌化合物の増強
本発明は、ＨＤＡＣ阻害剤が、いかにして抗真菌アゾール化合物と相互作用してかかる化合物の活性を増強するかを、真菌ＨＤＡＣ遺伝子の選択的ノックアウトを有する真菌株を用いて解明するための方法およびモデルを提供する。本発明はさらに、抗真菌剤の、真菌ＨＤＡＣ阻害剤との潜在的相乗作用について試験する方法を提供し、したがって、本発明の方法により同定される抗真菌化合物、およびかかる化合物を用いて真菌感染を処置する方法を提供する。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願
本出願は、２００６年８月１１日出願の米国仮出願第60/822,192号の利益を主張する。上記出願の教示全体を、本出願において参考として援用する。
【背景技術】
【０００２】
発明分野
本発明は、抗真菌薬の開発および真菌感染の処置に関する。より詳しくは、本発明は、真菌ヒストンデアセチラーゼを抗真菌薬活性の増強用の標的として用いる方法に関する。本発明はさらに、ヒストンデアセチラーゼ活性に影響する真菌変異を、抗真菌剤として好適な化合物を同定するために用いることに関する。
【０００３】
関連分野の概要
真核細胞において、核ＤＮＡはヒストンと会合して、クロマチンと呼ばれるコンパクトな複合体を形成する。ヒストンは、一般的に真核生物種を通して保存性が高い塩基性タンパク質のファミリーを構成する。Ｈ２Ａ、Ｈ２Ｂ、Ｈ３およびＨ４と呼ばれるコアヒストンは、会合してタンパク質コアを形成する。ＤＮＡは、このタンパク質コアの周囲に巻き付き、ヒストンの塩基性アミノ酸は、ＤＮＡの負に帯電したリン酸基と相互作用する。ＤＮＡの約１４６個の塩基対は、ヒストンコアの周囲を包囲して、クロマチンの反復構造モチーフであるヌクレオソーム粒子を構成する。
【０００４】
Csordas, Biochem. J., 265: 23-38 (1990)には、ヒストンが、ヒストンアセチルトランスフェラーゼ（ＨＡＴ１）により触媒される反応であるＮ末端リシン残基のε−アミノ基の翻訳後アセチル化を受けることが教示されている。アセチル化により、リシン側鎖の正の電荷が中和され、これは、クロマチン構造に影響すると考えられる。実際に、Taunton et al., Science，272：408-411 (1996)には、クロマチン鋳型への転写因子の接近は、ヒストン高アセチル化により増強されることが教示されている。Taunton et al.（上記）はさらに、低アセチル化ヒストンＨ４の濃縮が、ゲノムの転写に関してサイレントな領域において見出されていることを教示している。
【０００５】
ヒストンアセチル化は可逆的修飾であり、脱アセチル化は、ヒストンデアセチラーゼ（ＨＤＡＣ）と呼ばれる酵素のファミリーにより触媒される。ＨＤＡＣ活性を有するタンパク質をコードする遺伝子配列の分子クローニングにより、一組の異なるＨＤＡＣ酵素アイソフォームの存在が立証された。Yang and Gregoire, Mol. Cell. Biol. 25:2873-2884 (2005)には、系統学的分析および酵母Ｒｐｄ３（reduced potassium dependency 3）、Ｈｄａ１およびＳｉｒ２（silent information regulator 2）に対する配列相同性に基づいて、ＨＤＡＣが異なるクラスに分類されることが教示されている。ヒトにおいては１８種の既知のＨＤＡＣがあり、これらは４つのクラスに分けられる：クラスＩ（ＨＤＡＣ１、−２、−３および−８；Ｒｐｄ３と相同）、クラスＩＩ（ＨＤＡＣ４、−５、−６、−７、−９および−１０；Ｈｄａ１に関連する）、クラスＩＩＩ（Ｓｉｒｔ１、−２、−３、−４、−５、−６および−７；Ｓｉｒ２に類似）ならびにクラスＩＶ（ＨＤＡＣ１１）。クラスＩ、ＩＩおよびＩＶのＨＤＡＣは、亜鉛依存性酵素である。クラスＩＩＩのＨＤＡＣは、ＮＡＤ＋依存性デアセチラーゼである。Saccharomyces cerevisiaeにおいては、１０種の既知のＨＤＡＣがあり、これらは３つのクラスに分けられる：クラスＩ（Ｒｐｄ３、Ｈｏｓ１およびＨｏｓ２）、クラスＩＩ（Ｈｄａ１およびＨｏｓ３）、ならびにクラスＩＩＩ（Ｓｉｒ２および４種のＨｓｔタンパク質（Ｈｓｔ１〜Ｈｓｔ４）、Ｓｉｒ２の相同体）。
【０００６】
これらの個別のＨＤＡＣ酵素がどのような役割を果たすのかは、不明であった。Trojer et al., Nucleic Acids Research, 31(14):3971-3981 (2003)には、ＨｄａＡおよびＲｐｄＡが、糸状菌Aspergillus nidulansの全ＨＤＡＣ活性に対する主要な寄与体であり、ＨｄａＡがＨＤＡＣ活性の主要な部分の主な原因となることが示されている。
【０００７】
既知のＨＤＡＣ阻害剤を用いた研究により、アセチル化と遺伝子発現との間の関連が立証された。多くの研究で、ＨＤＡＣと遺伝子発現との間の関係が試験された。Taunton et al., Science 272:408-411 (1996)には、酵母の転写制御因子に関連するヒトＨＤＡＣが開示されている。Cress et al., J. Cell. Phys. 184:1-16 (2000)には、ヒト癌に関連して、ＨＤＡＣの役割が、転写の補助抑制因子としてのものであることが、開示されている。Ng et al., Trends Biochem. Sci. 25:121-126 (2000)には、転写抑制因子系の広汎な特徴としてのＨＤＡＣが開示されている。Magnaghi-Jaulin et al., Prog. Cell Cycle Res. 4:41-47 (2000)には、細胞サイクル進行に重要な転写補助制御因子としてのＨＤＡＣが開示されている。
【０００８】
真菌ヒストンデアセチラーゼについては多数の研究が報告されている。Giaver et al., Nature 418: 387-191 (2002)には、Saccharomyces cerevisiaeにおいて６種のＨＤＡＣ相同体（ＲＰＤ３、ＨＤＡ１、ＨＯＳ１、ＨＯＳ２、ＨＯＳ３およびＳＩＲ２）が開示されており、これらは互いに高度な配列相同性を共有するが、いずれも酵母の増殖および生存に必須ではない。Bernstein et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97: 13708-13713 (2000)には、酵母細胞における各ＨＤＡＣの役割が捕らえにくことが教示されている。Suka et al., Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. 63: 391-399 (1998)には、ＲＰＤ３ｐが、ヒストンＨ４のリジン１６を除く、コアヒストンＨ３、Ｈ４、Ｈ２ＡおよびＨ２Ｂの全リジン類の脱アセチル化に必要であることが教示されている。しかし、Wu et al., Mol. Cell. 7: 117-126 (2001)には、ＨＤＡ１ｐがヒストンＨ２ＢおよびＨ３を特異的に脱アセチル化することが教示されている。対照的にWang et al., Science 298: 1412-1414 (2002)には、Ｈ３およびＨ４ヒストン尾部におけるリジンを特異的に脱アセチル化する場合に、ＨＯＳ２ｐが主に遺伝子活性化の間に遺伝子のコード領域に結合することが教示されている。Wangらはまた、ＨＯＳ２ｐがゲノム全体の高活性の遺伝子に優先的に会合し、ＰＲＤ３ｐと組み合わさって、抗真菌アゾール類の分子標的である、Ｅｒｇ１１のコード領域を脱アセチル化することを教示する。Rundlett et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93: 14503-14508 (1996)およびTrojer et al., Nucleic Acids Res. 31: 3971-3981 (2003)には、S. cerevisiaeＨＯＳ２が、Candida. albicansおよびAspergillus. fumigatusのＨＯＳ２と高度に相同的であることが示されている。
【０００９】
ＨＤＡＣ活性の阻害剤を記載する多くの他の報告が刊行されている。例えば、Richon et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 95: 3003-3007 (1998)には、Streptomyces hygroscopicusから単離された天然の産物であり、Yoshida et al., J. Biol. Chem. 265: 17174-17179 (1990)およびYoshida et al., Exp. Cell Res. 177: 122-131 (1988)によればヒストンデアセチラーゼ活性を阻害し、Ｇ１およびＧ２期において細胞における細胞サイクル進行を停止させることが示されているトリコスタチンＡ（ＴＳＡ）により、および合成化合物であるスベロイル（suberoyl）アニリドヒドロキサム酸（ＳＡＨＡ）により、ＨＤＡＣ活性が阻害されることが開示されている。Yoshida and Beppu, Exper. Cell Res., 177: 122-131 (1988)には、ＴＳＡが、細胞サイクルのＧ１およびＧ２期においてラット線維芽細胞の停止をもたらすことが教示されており、これは、ＨＤＡＣを細胞サイクル調節において関連づける。実際に、Finnin et al., Nature, 401:188-193 (1999）には、ＴＳＡおよびＳＡＨＡが、マウスにおいて細胞増殖を阻害し、最終分化を誘発し、かつ腫瘍の形成を防止することが教示されている。ＨＤＡＣ阻害剤として作用する化合物の他の非限定的例には、WO 01/38322およびWO 01/70675のものが含まれる。Trojer et al.（上記）には、A. nidulansのＨｄａ１酵素は、ＨＤＡＣ阻害剤ＴＳＡに対して高度に感受性であり、一方、ＨｏｓＢは、ＴＳＡおよび他のＨＤＡＣ阻害剤であるＨＣトキシンの両方に対して高度に耐性であることが教示されている。
【００１０】
Smith and Edlind, Antimicrob. Agents and Chemotherapy，46(11):3532-3539 (2002)では、既知のＨＤＡＣのｐａｎ−阻害剤であるＴＳＡ、アピシジン(apicidin)、酪酸ナトリウムおよびトラポキシン(trapoxin)の、選択された真菌種のアゾール抗真菌剤に対する感受性を増強する能力を試験した。彼らは、ＴＳＡのみがC. albicansの感受性を増強できることを見出した。しかし、必要なＴＳＡの濃度は、哺乳動物細胞に有毒な濃度よりも高かった。ＴＳＡは、Candida glabrataの感受性を増強するとは見出されなかった。同時係属中の出願60/751,703の教示によれば、いくつかのＨＤＡＣ阻害剤は、C. albicans, C. glabrataおよびA. fumigatusに対して抗真菌アゾールを増強する。しかし、アゾール抗真菌剤との相乗作用の正確な分子標的および機構は未知のままである。
【００１１】
抗真菌剤の使用およびこれに対する必要性は広範囲であり、動物および植物における真菌感染症の処置から消毒薬製剤、ヒトに用いるための医薬までの範囲にわたる。現在の抗真菌製剤についての主な問題は、感染した宿主に対するこれらの毒性である。これは、多くの真菌感染が、ＡＩＤＳ、または化学療法もしくは臓器移植からなどの衰弱性疾患に対する有利な二次感染症である場合において、特に重要である。したがって、少なくともヒトおよび他の動物に投与されるべきである抗真菌剤について、治療の指標は、好ましくは、毒性が目的の真菌に選択性であり、宿主に対して毒性でない程度である。
【００１２】
Georgopapadakou, Curr. Opin. Microbiol. 1:547-557 (1998)によれば、カンジダ種およびアスペルギルス種などの日和見種により主に引き起こされる重篤な真菌感染症は、免疫低下状態の患者および他の脆弱な患者において、ますます一般的である。これらは、入院患者、ならびにＨＩＶ、癌および移植患者における罹患率および死亡率の重要な原因である。クリプトコッカス真菌感染症もＡＩＤＳ患者に非常に一般的である。カリニ肺炎は、北米およびヨーロッパのＨＩＶ感染患者における主要な死因となっている。
【００１３】
カンジダによる感染症は、一般的に、真菌膜の主な成分であるエルゴステロール合成における必須の酵素であるラノステロールデメチラーゼを標的とする、抗真菌アゾールで処置される。Kaur et al., Antimicrob. Agents Chemother., 48:1600-1613 (2004)の教示によれば、アゾールは静真菌性であり、これらの使用は、アゾール耐性、特に非アルビカンスのカンジダ種、例えばC. glabrataの出現により損なわれ得る。さらに、アゾール処置の結果、「トレーリング発育(trailing growth)」がもたらされ、生存する真菌細胞は、再発のための元（reservoir）となる。抗真菌アゾールの主な限界は、これらに殺真菌活性が欠如していることであり、これは、重篤な易感染性の患者に共通する、処置の失敗の原因となり得る。
【００１４】
Vonberg and Gastmeier J. Hosp. Infect. 63:246-254 (2006)の教示によれば、A. fumigatusは、死亡率６０〜９０％の生命にかかわる疾患である侵襲性アスペルギルス症（ＩＡ）を引き起こす主なアスペルギルス種であり、侵襲性アスペルギルス症の発生率は、免疫低下患者の数の増大のために、過去２０年において著しく増大している。現在の抗真菌剤は、その乏しいin vivo効能および宿主毒性により、ＩＡの処置においては制限される（Latge, Clinical Microbiol. Rev., 12:310-350 (1999)）。
【００１５】
特に衰弱した患者において、多くの場合致命的である他の真菌感染症は、クリプトコッカス症（Cryptococcus neoformansによる感染症）および接合菌症（接合菌類による感染症）を含む。
現在の抗真菌剤、例えばアゾール類についての欠点には、耐性の発生、薬物−薬物相互作用の可能性および有毒な肝臓への影響の可能性が含まれる。
真菌感染症を処置するための新規な組成物および方法を提供することが、非常に望ましい。また、抗真菌化合物に対する真菌感受性を増強するための組成物および方法を提供することが、非常に望ましい。特に重要なことには、宿主に対しては毒性でなく、病原性の真菌に対しては選択的に毒性であるような組成物および方法を提供することが非常に望ましい。したがって、真菌ＨＤＡＣと抗真菌化合物の相乗作用の正確な分子標的および機構を、さらに理解する必要性が存在する。
【発明の概要】
【００１６】
発明の概要
本発明は、真菌ＨＤＡＣと抗真菌化合物の相乗作用の正確な標的および機構について、新しい見識を提供する。
第１の側面において、本発明は、ＨＤＡＣ阻害剤がいかにして抗真菌剤の活性を増強するかを理解するためのモデルを提供する。この側面によれば、本発明は、真菌ＨＤＡＣ遺伝子の選択的ノックアウトを有する真菌株を提供する。これらの株およびその使用は、真菌ＨＤＡＣ ＨＯＳ２およびその遺伝子産物であるＨｏｓ２の、この点に関する重要性を実証する。
【００１７】
第２の側面において、本発明は、抗真菌剤の活性の増強における、ＨＤＡＣ阻害剤の作用の分子標的を提供する。この側面によれば、本発明は、真菌ＨＤＡＣ遺伝子の選択的突然変異を有する、ヒストンデアセチラーゼ真菌変異株を提供する。これらの株およびその使用は、真菌ＨＤＡＣ ＨＯＳ２のこの点に関する重要性を実証する。この側面により、本発明は、ＨＤＡＣ欠失変異真菌株を提供する。この側面により、本発明はＨＯＳ２欠失変異株を提供する。この側面により、本発明は、抗真菌剤の活性の増強におけるＨＤＡＣ阻害剤の作用のための分子標的としての、ＨＯＳ２および／またはＨｏｓ２を提供する。
【００１８】
第３の側面において、本発明は、ＨＤＡＣ変異真菌株を、化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングするための、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするためのアッセイにおいて用いる方法を提供する。この側面により、本発明は、真菌ＨＤＡＣ遺伝子の選択的ノックアウトを有する真菌株を提供する。これらの株およびその使用は、真菌ＨＤＡＣ ＨＯＳ２およびその遺伝子産物の、この点に関する重要性を実証する。この側面により、本発明は、化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングするための、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするための全細胞アッセイを提供する。この側面により、本発明はまた、高スループットスクリーニングアッセイを提供する。
【００１９】
第４の側面において、本発明は、真菌ＨＤＡＣ遺伝子および／または遺伝子産物を、化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングするための、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするためのアッセイにおいて用いる方法を提供する。この側面により、本発明は、化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングするための、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするための、真菌ＨＤＡＣ遺伝子および／または遺伝子産物を提供する。遺伝子および／または遺伝子産物は、真菌ＨＤＡＣ ＨＯＳ２（遺伝子）およびＨｏｓ２（遺伝子産物）の、この点に関する重要性を実証する。この側面により、本発明はまた、高スループットスクリーニングアッセイを提供する。
【００２０】
第５の側面において、本発明は、抗真菌剤を、真菌ＨＤＡＣ阻害剤との潜在的相乗作用について試験するための方法を提供する。本発明のこの側面により、本発明により提供された試験株は、ＨＯＳ２ノックアウトの、他のＨＤＡＣノックアウトおよび野生型株と比べた相対的感受性を評価する能力を提供する。
したがって、第６の側面において、本発明は、本発明の方法により同定される抗真菌化合物を提供する。この側面により、前記抗真菌化合物を含む組成物もさらに提供される。
【００２１】
第７の側面において、本発明は、真菌の増殖を阻害するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む。
【００２２】
第８の側面において、本発明は、抗真菌化合物の存在下における真菌のトレーリング発育を阻害するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む。
【００２３】
第９の側面において、本発明は、抗真菌化合物に対する真菌の耐性を阻害するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む。
【００２４】
第１０の側面において、本発明は、抗真菌化合物の存在下における真菌の生存を阻害するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む。
【００２５】
第１１の側面において、本発明は、抗真菌化合物の抗真菌活性に抵抗する真菌の能力を、低下させるための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む。
【００２６】
第１２の側面において、本発明は、真菌の、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはＨＯＳ２遺伝子産物もしくはその相同体の活性の阻害により増強される抗真菌化合物に対する感受性を増強するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害することを含む。
【００２７】
第１３の側面において、本発明は、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはＨＯＳ２遺伝子産物もしくはその相同体の活性の阻害により増強される抗真菌化合物の、抗真菌活性を増強するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害することを含む。
【００２８】
第１４の側面において、本発明は、真菌感染を有する生物を治療的に処置するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌感染を有する生物において、真菌ＨＯＳ２もしくはその真菌相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、該生物を、その活性がＨＯＳ２もしくはその真菌相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処置することを含む。
【００２９】
第１５の側面において、本発明は、生物において真菌感染を予防するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、該生物を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処置すること、および該生物を、ＨＯＳ２および／またはＨｏｓ２阻害化合物で処置することを含む。
第１６の側面において、本発明は、Ｈｏｓ２もしくはその相同体、または真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の、阻害剤を提供する。この側面の好ましい態様において、Ｈｏｓ２またはその相同体の阻害剤は、ヒドロキサム酸塩化合物である。
【００３０】
第１７の側面において、本発明は、Ｈｏｓ２を阻害する方法であって、Ｈｏｓ２を阻害剤に接触させることを含む、前記方法を提供する。
第１８の側面において、本発明は、Ｈｏｓ２もしくはその相同体の阻害剤、または真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の阻害剤、および薬学的に許容し得る担体を含む、組成物を提供する。
上記は、単に本発明のいくつかの側面を要約するものであり、本質的に限定することを意図しない。これらの側面ならびに他の側面および態様を、以下にさらに完全に説明する。
【図面の簡単な説明】
【００３１】
【図１】図１は、酵母欠失変異体を生成するために用いる戦略の概略図である。
【図２】図２は、図１に示した戦略の（ａ）成功した実施例および（ｂ）不成功の実施例の結果を示す図である。
【図３】図３は、ＳｃＰＲＤ３欠失変異体がケトコナゾールまたはフルコナゾールに対して高感受性ではないことを示す。
【００３２】
【図４】図４は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体がケトコナゾールに対して高感受性であることを示す。
【図５】図５は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体がイトラコナゾールに対して高感受性であることを示す。
【図６】図６は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体がボリコナゾールに対して高感受性であることを示す。
【図７】図７は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体がフルコナゾールに対して高感受性であることを示す。
【００３３】
【図８】図８は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体がフェンプロピモルフに対して高感受性であることを示す。
【図９】図９は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体がテルビナフィンに対して高感受性ではないことを示す。
【図１０】図１０は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体がアムホテリシンＢに対して高感受性ではないことを示す。
【図１１】図１１は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体が５−フルオロシトシンに対して高感受性ではないことを示す。
【００３４】
【図１２】図１２は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体がニッコーマイシンに対して高感受性ではないことを示す。
【図１３】図１３は、ＳｃＨＯＳ３およびＳｃＨｄａｌ欠失変異体がイトラコナゾールに対して高感受性ではないことを示す。
【図１４】図１４は、組換えＳｃＨｏｓ２ｐの、イトラコナゾールに対するΔｈｏｓ２感受性を補足する能力を示す。
【００３５】
好ましい態様の詳細な説明
本発明は、抗真菌薬の開発に関する。より詳しくは、本発明は、真菌ヒストンデアセチラーゼを抗真菌薬活性の増強用の標的として用いる方法に関する。本発明は、真菌ＨＤＡＣと抗真菌化合物の相乗作用の正確な標的および機構について、新しい見識を提供する。この目的を達成するために、本発明は、ＨＤＡＣ阻害剤がいかにして抗真菌化合物の活性を増強するかを理解するための、真菌ＨＤＡＣ遺伝子の選択的ノックアウトを有する真菌株を用いたモデルを提供する。これらの株およびその使用は、真菌ＨＤＡＣ ＨＯＳ２のこの点に関する重要性を実証する。本発明はさらに、抗真菌剤を、真菌ＨＤＡＣ阻害剤との潜在的相乗作用について試験するための方法を提供し、したがって、本発明の方法により同定される抗真菌化合物を提供する。
【００３６】
本明細書中で言及する特許明細書および科学文献は、当業者に有用な知識を確立する。本明細書中で引用する発行された特許、出願および参考文献を、各々が具体的かつ個々に参考として援用されるものとする場合と同等の程度で、本明細書において参考として援用する。矛盾する場合には、本開示が優先する。
【００３７】
第１の側面において、本発明は、ＨＤＡＣ阻害剤がいかにして抗真菌剤の活性を増強するかを理解するためのモデルを提供する。この側面によれば、本発明は真菌ＨＤＡＣ遺伝子各々の選択的ノックアウトを有する真菌株を提供する。これらの株およびその使用は、真菌ＨＤＡＣ ＨＯＳ２のこの点に関する重要性を実証する。このモデルを提供する真菌株は、ＲＰＤ３、ＨＤＡ１、ＨＯＳ１、ＨＯＳ２、ＨＯＳ３またはＳＩＲ２の単一ノックアウトを有するS. cerevisiae株を含み、これらは好ましくは、本明細書にさらに記載されるようにして調製される。
【００３８】
第２の側面において、本発明は、抗真菌剤の活性の増強におけるＨＤＡＣ阻害剤の作用の、分子標的を提供する。この側面によれば、本発明は、真菌ＨＤＡＣ遺伝子の選択的突然変異を有する、ヒストンデアセチラーゼ真菌変異株を提供する。これらの株およびその使用は、真菌ＨＤＡＣ ＨＯＳ２の、この点に関する重要性を実証する。この側面により、本発明は、ＨＤＡＣ欠失変異真菌株を提供する。この側面により、本発明は、ＨＯＳ２欠失変異株を提供する。この側面により、本発明は、抗真菌剤の活性の増強におけるＨＤＡＣ阻害剤の作用のための分子標的としての、ＨＯＳ２およびまたはＨｏｓ２を提供する。
【００３９】
本発明のこの側面による好ましい態様において、ヒストンデアセチラーゼ真菌変異株は、真菌ＨＤＡＣ遺伝子の発現を阻害または防止する、選択的突然変異を有する。本発明のこの側面による好ましい態様において、選択的突然変異は、阻害されたＨＤＡＣ活性を有する遺伝子産物の発現を提供する。この側面による好ましい態様において、選択的突然変異は、不活性なＨＤＡＣ酵素の発現を提供する。本発明のこの側面による好ましい態様において、ヒストンデアセチラーゼ遺伝子はＨＯＳ２またはその相同体である。本発明のこの側面による好ましい態様において、遺伝子産物はＨｏｓ２またはその相同体である。
【００４０】
本発明のこの側面による好ましい態様において、真菌株はS. cerevisiae真菌株である。本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌株は、他の生物、好ましくは哺乳類、より好ましくはヒトに感染可能な真菌株である。本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌株は病原真菌株である。本発明のこの側面による他の好ましい態様において、病原真菌株は哺乳類病原体、好ましくはヒト病原体である。
【００４１】
この側面による好ましい態様において、真菌株は、S. cerevisiae真菌株、カンジダ種真菌株（好ましくはC. albicans真菌株、C. glabrata真菌株、C. krusei真菌株、C. parapsilosis真菌株、またはC. tropicalis真菌株）、アスペルギルス種真菌株（好ましくはA. fumigatus真菌株、A. niger真菌株、およびA. flavus真菌株）、Cryptococcus neoformans真菌株およびPneumocystis carinii真菌株からなる群から選択される。
【００４２】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（限定することなく、Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含む）、新生カビ（emerging mold）（限定することなく、Pseudallescheria boydii、フサリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含む）、コクシジオイデス種（限定することなく、C. immitisを含む）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、ならびにこの群のそれらの株から選択される。
【００４３】
第３の側面において、本発明は、ＨＤＡＣ変異真菌株を、化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングするための、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするためのアッセイにおいて用いる方法を提供する。この側面により、本発明は、真菌ＨＤＡＣ遺伝子の選択的ノックアウトを有する真菌株を提供する。これらの株およびその使用は、真菌ＨＤＡＣ ＨＯＳ２およびその遺伝子産物の、この点に関する重要性を実証する。この側面により、本発明は、化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングするための、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするための全細胞アッセイを提供する。この側面により、本発明はまた、高スループットスクリーニングアッセイを提供する。
【００４４】
本発明のこの側面による好ましい態様において、方法は、化合物をその抗真菌活性についてスクリーニングすることを含む。好ましい態様において、方法は、ＨＤＡＣ遺伝子もしくはその相同体またはＨＤＡＣ遺伝子産物もしくはその相同体の阻害により増強されるところの潜在的抗真菌活性を有する化合物を同定する。本発明のこの側面による好ましい態様において、方法は、ＨＤＡＣ変異真菌株を提供することを含み、ここで突然変異は、それによりコーディングされるタンパク質の機能の欠失をもたらし、およびＨＤＡＣ変異真菌株を化合物と接触させることを含み、ここで、ＨＤＡＣ変異真菌株の試験化合物に対する感受性が、化合物を、ＨＤＡＣ遺伝子もしくはその相同体またはＨＤＡＣ遺伝子産物もしくはその相同体の阻害により増強されるところの潜在的抗真菌活性を有するものとして、同定する。好ましい態様において、方法はさらに、非ＨＤＡＣ変異真菌株を、好ましくは野生型株を化合物と接触させることを含み、ここで、非ＨＤＡＣ変異株の感受性と比較した、ＨＤＡＣ変異株の感受性が、化合物を、ＨＤＡＣ遺伝子もしくはその相同体またはＨＤＡＣ遺伝子産物もしくはその相同体の阻害により増強されるところの潜在的抗真菌活性を有するものとして同定する。
【００４５】
随意に、潜在的抗真菌活性であって、該活性がＨＤＡＣ遺伝子もしくはその相同体、またはＨＤＡＣ遺伝子産物もしくはその相同体の阻害により増強されるものを有する化合物を同定する方法のステップは、第２ＨＤＡＣ変異真菌株により繰り返すことができる。第２ＨＤＡＣ変異真菌株は第１株と種または属が異なり、第１株の変異遺伝子と相同な遺伝子を有し、該相同遺伝子は、類似の突然変異を有している。
【００４６】
試験化合物に対する感受性は、好ましくは、真菌株の死滅、真菌株の増殖の阻害、真菌株の死滅の代理マーカーの増加、または増殖の代理マーカーの減少を測定することにより得られる。
【００４７】
第４の側面において、本発明は、真菌ＨＤＡＣ遺伝子および／または遺伝子産物を、化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングするための、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするためのアッセイにおいて用いる方法を提供する。この側面により、本発明は、化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングするための、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするための、真菌ＨＤＡＣ遺伝子および／または遺伝子産物を提供する。遺伝子および／または遺伝子産物は、真菌ＨＤＡＣ ＨＯＳ２（遺伝子）およびＨｏｓ２（遺伝子産物）の、この点に関する重要性を実証する。この側面により、本発明はまた、高スループットスクリーニングアッセイを提供する。
【００４８】
本発明のこの側面による好ましい態様において、方法は、化合物をその抗真菌活性についてスクリーニングすること、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングすることを含む。好ましい態様において、方法は、真菌ＨＤＡＣ遺伝子もしくはその相同体、または真菌ＨＤＡＣ遺伝子産物もしくはその相同体を阻害する化合物を同定する。本発明のこの側面による好ましい態様において、方法は、真菌ＨＤＡＣタンパク質もしくはその相同体またはその活性断片を提供すること、およびタンパク質もしくはその相同体またはその活性断片を、化合物と接触させることを含み、ここでタンパク質もしくはその相同体またはその活性断片のＨＤＡＣ活性の阻害は、化合物を、潜在的抗真菌活性を有するか、または抗真菌活性剤の抗真菌活性を増強する能力を有する化合物として同定する。好ましい態様において、真菌ＨＤＡＣタンパク質は、ＨＯＳ２もしくはその相同体またはその活性断片である。好ましい態様において、方法はさらに、非ＨＤＡＣ変異真菌株を、好ましくは野生型株を、化合物と接触させることを含み、ここで非ＨＤＡＣ変異株の感受性は、化合物を潜在的抗真菌活性を有するものとして同定する。好ましい態様において、方法は随意に、非ＨＤＡＣ変異真菌株を、好ましくは野生型株を、化合物および抗真菌剤と接触させることを含み、ここで、抗真菌剤のみの存在下での前記株の感受性と比較した、化合物および抗真菌剤の存在下での前記株の感受性は、化合物を、抗真菌剤の抗真菌活性を増強する能力を有する化合物として同定する。
【００４９】
試験化合物に対する感受性は、好ましくは、真菌株の死滅、真菌株の増殖の阻害、真菌株の死滅もしくは増殖阻害の代理マーカーの増加、または真菌株の増殖の代理マーカーの減少を測定することにより得られる。
【００５０】
随意に、真菌ＨＤＡＣ遺伝子および／または遺伝子産物を、化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングする、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするアッセイにおいて用いる方法のステップは、第２真菌株からのＨＤＡＣ酵素を用いて繰り返すことができる。第２真菌株は、第１株とは種または属が異なり、第１株の酵素に類似した酵素を有する。
【００５１】
第５の側面において、本発明は、抗真菌剤を、真菌ＨＤＡＣ阻害剤との、特にＨＯＳ２の阻害剤もしくはその相同体またはＨｏｓ２もしくはその相同体との、潜在的相乗作用について試験するための方法を提供する。本発明のこの側面により、本発明により提供された試験株は、ＨＯＳ２ノックアウトの、他のＨＤＡＣノックアウトおよび野生型株と比べた相対的感受性を評価する能力を提供する。
【００５２】
本発明のこの側面による好ましい態様において、方法は、ＨＯＳ２ノックアウト真菌株を提供すること、ノックアウト変異株を試験化合物で処理すること、ＨＯＳ２ノックアウト真菌株の試験化合物に対する感受性を決定すること、野生型株、ＲＰＤ３ノックアウト変異株、ＨＤＡ１ノックアウト変異株、ＨＯＳ１ノックアウト変異株、ＨＯＳ３ノックアウト変異株およびＳＩＲ２ノックアウト変異株からなる群から選択される１種または２種以上の対照真菌株を提供すること、１種または２種以上の対照真菌株を試験化合物で処理すること、１種または２種以上の対照株の試験化合物に対する感受性を決定すること、およびＨＯＳ２ノックアウト株の試験化合物に対する感受性を、１種または２種以上の対照株の試験株に対する感受性と比較することを含む。ＨＯＳ２ノックアウト変異株が試験化合物に対して、１種または２種以上の対照株より感受性が高ければ、試験化合物は、ＨＯＳ２阻害剤との相乗作用を有する抗真菌化合物であると考えられる。
【００５３】
試験化合物に対する感受性は、好ましくは、真菌株の死滅、真菌株の増殖の阻害、真菌株の死滅もしくは増殖阻害の代理マーカーの増加、または真菌株の増殖の代理マーカーの減少を測定することにより得られる。
【００５４】
「ノックアウト変異株」の用語は、ＨＤＡＣ遺伝子によりコーディングされるタンパク質の機能の損失をもたらす突然変異を含む、真菌株を意味することを意図する。かかる突然変異は、限定することなく、点突然変異、欠失突然変異、挿入突然変異および逆位（inversion）を含む。かかる突然変異は、ＨＤＡＣ遺伝子またはその相同体によりコーディングされる遺伝子産物の機能の損失をもたらす限り、コーディング領域または非コーディング領域にあってよい。
したがって、第６の側面において、本発明は、本発明の方法により同定される抗真菌化合物を提供する。この側面により、前記抗真菌化合物を含む組成物もさらに提供される。
【００５５】
第７の側面において、本発明は、真菌の増殖を阻害するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む。
【００５６】
この側面による好ましい態様において、真菌は、S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis cariniiからなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００５７】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００５８】
本発明のこの側面による好ましい態様において、抗真菌化合物は、エルゴステロール合成を阻害する化合物である。他の好ましい態様において、抗真菌化合物は、抗真菌アゾール化合物である。好ましいアゾールは、イミダゾールおよびトリアゾールを含む。より好ましいアゾールは、限定はされないが、ケトコナゾール、イトラコナゾール、フルコナゾール、ボリコナゾール、ポサコナゾール、ラブコナゾール、またはミコナゾールを含む。他の好ましい態様において、化合物はフェンプロピモルフである。
【００５９】
第８の側面において、本発明は、抗真菌化合物の存在下における真菌のトレーリング発育を阻害するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む。
【００６０】
この側面による好ましい態様において、真菌は、S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis cariniiからなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００６１】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００６２】
本発明のこの側面による好ましい態様において、抗真菌化合物は、エルゴステロール合成を阻害する化合物である。他の好ましい態様において、抗真菌化合物は、抗真菌アゾール化合物である。好ましいアゾールは、イミダゾールおよびトリアゾールを含む。より好ましいアゾールは、限定はされないが、ケトコナゾール、イトラコナゾール、フルコナゾール、ボリコナゾール、ポサコナゾール、ラブコナゾール、またはミコナゾールを含む。他の好ましい態様において、化合物はフェンプロピモルフである。
【００６３】
第９の側面において、本発明は、抗真菌化合物に対する真菌の耐性を阻害するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む。
【００６４】
この側面による好ましい態様において、真菌は、S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis cariniiからなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００６５】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００６６】
本発明のこの側面による好ましい態様において、抗真菌化合物は、エルゴステロール合成を阻害する化合物である。他の好ましい態様において、抗真菌化合物は、抗真菌アゾール化合物である。好ましいアゾールは、イミダゾールおよびトリアゾールを含む。より好ましいアゾールは、限定はされないが、ケトコナゾール、イトラコナゾール、フルコナゾール、ボリコナゾール、ポサコナゾール、ラブコナゾール、またはミコナゾールを含む。他の好ましい態様において、化合物はフェンプロピモルフである。
【００６７】
第１０の側面において、本発明は、抗真菌化合物の存在下における真菌の生存を阻害するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む。
【００６８】
この側面による好ましい態様において、真菌は、S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis cariniiからなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００６９】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００７０】
本発明のこの側面による好ましい態様において、抗真菌化合物は、エルゴステロール合成を阻害する化合物である。他の好ましい態様において、抗真菌化合物は、抗真菌アゾール化合物である。好ましいアゾールは、イミダゾールおよびトリアゾールを含む。より好ましいアゾールは、限定はされないが、ケトコナゾール、イトラコナゾール、フルコナゾール、ボリコナゾール、ポサコナゾール、ラブコナゾール、またはミコナゾールを含む。他の好ましい態様において、化合物はフェンプロピモルフである。
【００７１】
第１１の側面において、本発明は、抗真菌化合物の抗真菌活性に抵抗する、真菌の能力を低下させるための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む。
【００７２】
この側面による好ましい態様において、真菌は、S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis cariniiからなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００７３】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００７４】
本発明のこの側面による好ましい態様において、抗真菌化合物は、エルゴステロール合成を阻害する化合物である。他の好ましい態様において、抗真菌化合物は、抗真菌アゾール化合物である。好ましいアゾールは、イミダゾールおよびトリアゾールを含む。より好ましいアゾールは、限定はされないが、ケトコナゾール、イトラコナゾール、フルコナゾール、ボリコナゾール、ポサコナゾール、ラブコナゾール、またはミコナゾールを含む。他の好ましい態様において、化合物はフェンプロピモルフである。
【００７５】
第１２の側面において、本発明は、真菌の、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはＨＯＳ２遺伝子産物もしくはその相同体の活性の阻害により増強される抗真菌化合物に対する感受性を増強するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害することを含む。
【００７６】
この側面による好ましい態様において、真菌は、S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis cariniiからなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００７７】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００７８】
本発明のこの側面による好ましい態様において、抗真菌化合物は、エルゴステロール合成を阻害する化合物である。他の好ましい態様において、抗真菌化合物は、抗真菌アゾール化合物である。好ましいアゾールは、イミダゾールおよびトリアゾールを含む。より好ましいアゾールは、限定はされないが、ケトコナゾール、イトラコナゾール、フルコナゾール、ボリコナゾール、ポサコナゾール、ラブコナゾール、またはミコナゾールを含む。他の好ましい態様において、化合物はフェンプロピモルフである。
【００７９】
第１３の側面において、本発明は、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはＨＯＳ２遺伝子産物もしくはその相同体の活性の阻害により増強される抗真菌化合物の、抗真菌活性を増強するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害することを含む。
【００８０】
この側面による好ましい態様において、真菌は、S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis cariniiからなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００８１】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００８２】
本発明のこの側面による好ましい態様において、抗真菌化合物は、エルゴステロール合成を阻害する化合物である。他の好ましい態様において、抗真菌化合物は、抗真菌アゾール化合物である。好ましいアゾールは、イミダゾールおよびトリアゾールを含む。より好ましいアゾールは、限定はされないが、ケトコナゾール、イトラコナゾール、フルコナゾール、ボリコナゾール、ポサコナゾール、ラブコナゾール、またはミコナゾールを含む。他の好ましい態様において、化合物はフェンプロピモルフである。
【００８３】
第１４の側面において、本発明は、真菌感染を有する生物を治療的に処置するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌感染を有する生物において、真菌ＨＯＳ２もしくはその真菌相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、該生物を、その活性がＨＯＳ２もしくはその真菌相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処置することを含む。
【００８４】
この側面による好ましい態様において、真菌は、S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis cariniiからなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００８５】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００８６】
本発明のこの側面による好ましい態様において、抗真菌化合物は、エルゴステロール合成を阻害する化合物である。他の好ましい態様において、抗真菌化合物は、抗真菌アゾール化合物である。好ましいアゾールは、イミダゾールおよびトリアゾールを含む。より好ましいアゾールは、限定はされないが、ケトコナゾール、イトラコナゾール、フルコナゾール、ボリコナゾール、ポサコナゾール、ラブコナゾール、またはミコナゾールを含む。他の好ましい態様において、化合物はフェンプロピモルフである。
【００８７】
この側面による好ましい態様において、生物は植物または動物であり、好ましくは哺乳動物であり、さらに好ましくはヒトである。本発明のこの側面による好ましい態様において、真菌ＨＯＳ２もしくはその真菌相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害することは、ＨＤＡＣの阻害剤を、これを必要とする生物に投与することを含む。
【００８８】
第１５の側面において、本発明は、生物において真菌感染を予防するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、該生物を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処置すること、および該生物を、ＨＯＳ２および／またはＨｏｓ２阻害化合物で処置することを含む。
【００８９】
この側面による好ましい態様において、真菌は、S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis cariniiからなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００９０】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００９１】
本発明のこの側面による好ましい態様において、抗真菌化合物は、エルゴステロール合成を阻害する化合物である。他の好ましい態様において、抗真菌化合物は、抗真菌アゾール化合物である。好ましいアゾールは、イミダゾールおよびトリアゾールを含む。より好ましいアゾールは、限定はされないが、ケトコナゾール、イトラコナゾール、フルコナゾール、ボリコナゾール、ポサコナゾール、ラブコナゾール、またはミコナゾールを含む。他の好ましい態様において、化合物はフェンプロピモルフである。
【００９２】
第１６の側面において、本発明は、Ｈｏｓ２の阻害剤を提供する。この側面の好ましい態様において、阻害剤はヒドロキサム酸塩化合物である。
【００９３】
第１７の側面において、本発明は、Ｈｏｓ２をＨｏｓ２の阻害剤に接触させることを含む、Ｈｏｓ２を阻害する方法を提供する。この側面の好ましい態様において、Ｈｏｓ２は細胞中にあり、方法は、細胞を阻害剤と接触させることを含む。他の好ましい態様において、細胞は、他の生物（好ましくは哺乳動物または植物、さらに好ましくはヒト）の中または上にある真菌細胞であり、方法は、Ｈｏｓ２の阻害剤を他の生物に投与することを含む。本発明のこの側面の好ましい態様において、Ｈｏｓ２の阻害剤は、本明細書に記載の化合物である。
【００９４】
この側面による好ましい態様において、真菌は、S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis cariniiからなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００９５】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００９６】
本発明による好ましい態様において、ＨＤＡＣ阻害剤は、ＨＤＡＣ遺伝子発現の阻害剤である。本発明による他の好ましい態様において、ＨＤＡＣ阻害剤は、ＨＤＡＣ遺伝子産物の、より好ましくは酵素の活性の阻害剤である。
【００９７】
意外にも、ＨＯＳ２欠失変異体は、各々がラノステロール１４ａ−デメチラーゼ（Ｅｒｇ１１）を標的とする抗真菌アゾールである、イトラコナゾール、ケトコナゾール、フルコナゾールおよびボリコナゾールに対して高感受性を示した。しかし、エルゴステロール生合成経路に作用しない抗真菌剤、例えばアムホテリシンＢ、５−フルオロシトシンおよびニッコーマイシンに対しては高感受性を示さなかった。したがって、ある好ましい態様において、本発明のこの側面による試験化合物は、エルゴステロール生合成経路に作用する化合物を含む。
【００９８】
機能性ＨＯＳ２の不在が抗真菌化合物の活性を増強するとの発見は、さらに、抗真菌化合物の増強剤を同定する方法を提供する。方法は、真菌株に試験化合物を投与すること、試験化合物がＨＯＳ２の発現を阻害するかどうかを決定すること、および、試験化合物がＨＯＳ２を阻害した場合に、試験化合物を抗真菌化合物の増強剤として同定することを含む。
【００９９】
抗真菌化合物は、これが、上記の方法によってＨＯＳ２阻害剤との相乗作用を有する化合物として同定されるか、または同定され得る場合に、ＨＯＳ２発現の阻害またはＨｏｓ２活性の阻害により増強されると考えられる。
本発明において、以下の用語を次に定義する。本明細書に具体的に開示されていない他の全ての定義は、同時係属出願60/751,703に記載されているものと同様とする。
【０１００】
本明細書中「化学式（Ａ）、化学式（Ｂ）等で表される化合物」（または言い換えると、「本発明の化合物」など）の言及は、他の指示がない限り、そのＮ−オキシド、水和物、溶媒和物、薬学的に許容し得る塩、プロドラッグおよび複合体、ならびにそのラセミ混合物およびスケールミック（scalemic）混合物、ジアステレオマー、エナンチオマーおよび互変異性体への言及を含むと理解される。
【０１０１】
単純化のために、化学的部分を、主に１価の化学的部分（例えばアルキル、アリールなど）として全体を通して定義および言及する。しかし、このような用語はまた、当業者には明らかな適切な構造的状況の下で、対応する多価の部分を示すためにも用いられる。例えば、「アルキル」部分が一般に１価の基（例えばＣＨ３−ＣＨ２−）を指す一方、ある特定の状況においては、２価の結合部分を「アルキル」とすることができ、この場合においては、当業者は、アルキルが２価のラジカル（例えば−ＣＨ２−ＣＨ２−）であり、これは、用語「アルキレン」と同意義であると理解する。（同様に、２価の部分が必要であり、「アリール」であると述べられている状況においては、当業者は、用語「アリール」は、対応する２価の部分であるアリーレンを表すことを理解する）。すべての原子は、結合の形成についてこれらの通常の原子価の数を有すると理解される（即ち、炭素については４、Ｎについては３、Ｏについては２、およびＳについてはＳの酸化状態に依存して２、４または６）。時々、部分を、例えば、（Ａ）ａ−Ｂ−であり、式中ａは０または１である、と定義してもよい。このような例において、ａが０である場合には、当該部分はＢ−であり、ａが１である場合には、当該部分はＡ−Ｂ−である。また、ここに開示された多数の部分は、複数の互変異性形態で存在してもよく、これらは全て、任意の与えられた互変異性構造により包含されることが意図される。
【０１０２】
単純化のために、「Ｃｎ〜Ｃｍ」ヘテロシクリルまたは「Ｃｎ〜Ｃｍ」ヘテロアリールへの言及は、「ｎ個」〜「ｍ個」の環原子を有し、ここで「ｎ」および「ｍ」は整数であるヘテロシクリルまたはヘテロアリールを意味する。したがって、例えば、Ｃ５〜Ｃ６ヘテロシクリルは、少なくとも１個のヘテロ原子を有する５員環または６員環であり、ピロリジニル（Ｃ５）およびピペリジニル（Ｃ６）を含む；Ｃ６ヘテロアリールは、例えばピリジルおよびピリミジルを含む。
【０１０３】
用語「ヒドロカルビル」は、直鎖、分枝、または環式アルキル、アルケニル、またはアルキニルを指し、各々は本明細書に定義された通りである。「Ｃ０」ヒドロカルビルは、共有結合を指すために用いられる。したがって「Ｃ０〜Ｃ３−ヒドロカルビル」は、共有結合、メチル、エチル、エテニル、エチニル、プロピル、プロペニル、プロピニル、およびシクロプロピルを含む。
用語「脂肪族」は、飽和および不飽和両方の、直鎖または分枝脂肪族炭化水素を意味することが意図される。当業者が理解するように、本明細書において「脂肪族」は、限定することなく、アルキル、アルケニルまたはアルキニル部分を含むことが意図される。
【０１０４】
用語「アルキル」は、１〜１２個の炭素原子、好ましくは１〜８個の炭素原子、より好ましくは１〜６個の炭素原子を有する直鎖または分枝の脂肪族基を意味することを意図する。他の好ましいアルキル基は、２〜１２個の炭素原子、好ましくは２〜８個の炭素原子、より好ましくは２〜６個の炭素原子を有する。好ましいアルキル基として、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、イソブチル、ｓｅｃ−ブチル、ｔｅｒｔ−ブチル、ペンチル、ヘキシルなどが挙げられるがこれらに限定されない。「Ｃ０」アルキル（「Ｃ０〜Ｃ３アルキル」におけるもののように）は、共有結合である。
【０１０５】
用語「アルケニル」は、２〜１２個の炭素原子、好ましくは２〜８個の炭素原子、より好ましくは２〜６個の炭素原子を有する、１つまたは２つ以上の炭素−炭素二重結合を有する不飽和の直鎖または分枝の脂肪族基を意味することを意図する。好ましいアルケニル基として、エテニル、プロペニル、ブテニル、ペンテニルおよびヘキセニルが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１０６】
用語「アルキニル」は、２〜１２個の炭素原子、好ましくは２〜８個の炭素原子、より好ましくは２〜６個の炭素原子を有する、１つまたは２つ以上の炭素−炭素三重結合を有する不飽和の直鎖または分枝の脂肪族基を意味することを意図する。好ましいアルキニル基として、エチニル、プロピニル、ブチニル、ペンチニルおよびヘキシニルが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１０７】
本明細書中で用いられる場合、用語「アルキレン」、「アルケニレン」または「アルキニレン」は、それぞれ、２つの他の化学的基の間に位置してこれらを結合させる作用を奏する、上記で定義したアルキル、アルケニルまたはアルキニル基を意味することを意図する。好ましいアルキレン基として、メチレン、エチレン、プロピレンおよびブチレンが挙げられるが、これらに限定されない。好ましいアルケニレン基として、エテニレン、プロペニレンおよびブテニレンが挙げられるが、これらに限定されない。好ましいアルキニレン基として、エチニレン、プロピニレンおよびブチニレンが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１０８】
本明細書で用いられる用語「アゾリル」は、５員環の飽和または不飽和の複素環基であって、窒素、硫黄および酸素からなる群から選択した２個または３個以上のヘテロ原子を環原子として含み、少なくとも１個のヘテロ原子は窒素原子である、前記の基を意味することを意図する。好ましいアゾリル基として、随意に置換されたイミダゾリル、オキサゾリル、チアゾリル、ピラゾリル、イソオキサゾリル、イソチアゾリル、１，３，４−チアジアゾリル、１，２，４−チアジアゾリル、１，２，４−オキサジアゾリル、および１，３，４−オキサジアゾリルが挙げられるが、これらに限定されない。
本明細書で用いられる用語「炭素環」は、シクロアルキルまたはアリール部分を意味することを意図する。用語「炭素環」はまた、少なくとも１つの炭素−炭素二重結合を有するシクロアルケニル部分を含む。
【０１０９】
用語「シクロアルキル」は、約３〜１５個の炭素を有する、好ましくは３〜１２個の炭素、好ましくは３〜８個の炭素、より好ましくは３〜６個の炭素、およびさらになお好ましくは５または６個の炭素を有する、飽和または不飽和の単環式、二環式、三環式または多環式炭化水素基を意味することを意図する。特定の好ましい態様において、シクロアルキル基は、アリール、ヘテロアリールまたは複素環基に融合している。好ましいシクロアルキル基として、シクロペンテン−２−エノン、シクロペンテン−２−エノール、シクロヘクス−２−エノン、シクロヘクス−２−エノール、シクロプロピル、シクロブチル、シクロブテニル、シクロペンチル、シクロペンテニル、シクロヘキシル、シクロヘキセニル、シクロヘプチルおよびシクロオクチル等が挙げられるが、これらに限定されない。
【０１１０】
用語「ヘテロアルキル」は、飽和または不飽和の直鎖または分枝脂肪族基であって、この基中、１または２個以上の炭素原子が独立して、Ｏ、Ｓ、Ｎ、Ｎ−アルキル、−Ｓ（Ｏ）−、−Ｓ（Ｏ）２−、−Ｓ（Ｏ）２ＮＨ−、または−ＮＨＳ（Ｏ）２−からなる群から選択される部分により置換されているものを意味することを意図する。
用語「アリール」は、単環式、二環式、三環式または多環式芳香族部分、好ましくはＣ６〜Ｃ１４芳香族部分であって、好ましくは１〜３個の芳香族環を含むものを意味することを意図する。好ましくは、アリール基はＣ６〜Ｃ１０アリール基、より好ましくはＣ６アリール基である。好ましいアリール基としては、フェニル、ナフチル、アントラセニルおよびフルオレニルが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１１１】
用語「アラルキル」または「アリールアルキル」は、アルキル基に共有結合したアリール基を含む基を意味することを意図する。アラルキル基が「随意に置換されている」と記載されている場合は、これは、アリールまたはアルキル部分のどちらかまたは両方が、独立して随意に置換されているかまたは非置換であることが意図される。好ましくは、アラルキル基は（Ｃ１〜Ｃ６）アルク（Ｃ６〜Ｃ１０）アリールであり、ベンジル、フェネチル、およびナフチルメチルを含むが、これらに限定されない。単純化のために、「アリールアルキル」として記述されている場合は、この用語、およびこれに関連する用語は、化合物中の基の順序が「アリール−アルキル」であることを示すことが意図される。同様に、「アルキル−アリール」は、化合物中の基の順序が「アルキル−アリール」であることを示すことが意図される。
【０１１２】
用語「ヘテロシクリル」、「複素環式」または「複素環」は、約３〜約１４個の原子を有し、ここで１個または２個以上の原子が、独立して、Ｎ、ＯおよびＳからなる群から選択される単環式、二環式または多環式構造である基を意味することを意図する。環状構造は、飽和、不飽和または部分的に不飽和であってもよい。特定の好ましい態様において、複素環基は非芳香族であり、この場合の基は、ヘテロシクロアルキルとしても知られている。特定の好ましい態様において、複素環基は、架橋複素環基（例えば、メチレン、エチレンまたはプロピレン架橋を有する二環式部分）である。二環式または多環式構造において、１つまたは２つ以上の環は、芳香族であってもよい；例えば、二環式複素環の１つの環または三環式複素環の１つもしくは２つの環は、インダンおよび９，１０−ジヒドロアントラセンにおけるように、芳香族であってもよい。好ましい複素環基として、エポキシ、アジリジニル、テトラヒドロフラニル、ピロリジニル、ピペリジニル、ピペラジニル、チアゾリジニル、オキサゾリジニル、オキサゾリジノニルおよびモルホリノが挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの好ましい態様において、複素環基は、アリール、ヘテロアリールまたはシクロアルキル基に融合している。かかる融合複素環の例として、テトラヒドロキノリンおよびジヒドロベンゾフランが挙げられるが、これらに限定されない。この用語の範囲から特に除外されるのは、環のＯまたはＳ原子が別のＯまたはＳ原子に隣接している化合物である。
【０１１３】
特定の好ましい態様において、複素環基は、ヘテロアリール基である。本明細書中で用いる場合、用語「ヘテロアリール」は、５〜１８個の環原子、好ましくは５〜１４個の環原子、さらに好ましくは５個、６個、９個または１０個の環原子を有する、好ましくは、環状配列中に共有された６個、１０個または１４個のパイ電子を有する、および炭素原子に加えて、Ｎ、ＯおよびＳからなる群から選択される１個または２個以上のヘテロ原子を有する、単環式、二環式、三環式または多環式基を意味することを意図する。用語「ヘテロアリール」はまた、窒素含有ヘテロアリール基の１つのＮ−オキシド誘導体（または、ヘテロアリール基が、１個より多いＮ−オキシド誘導体が形成できるように１個より多い窒素を含有している場合には、複数のＮ−オキシド誘導体）も包含することを意図する。例えば、ヘテロアリール基は、ピリミジニル、ピリジニル、ベンズイミダゾリル、チエニル、ベンゾチアゾリル、ベンゾフラニルおよびインドリニルであってもよい。好ましいヘテロアリール基として、チエニル、ベンゾチエニル、フリル、ベンゾフリル、ジベンゾフリル、ピロリル、イミダゾリル、ピラゾリル、ピリジル、ピラジニル、ピリミジニル、インドリル、キノリル、イソキノリル、キノキサリニル、テトラゾリル、オキサゾリル、チアゾリル、イソオキサゾリル、ベンゾ［ｂ］チエニル、ナフタ［２，３−ｂ］チアントレニル、ザンテニル（zanthenyl）、キノリル、ベンゾチアゾリル、ベンズイミダゾリル、ベータ−カルボリニルおよびペリミジニルが挙げられるが、これらに限定されない。ヘテロアリール基のＮ−オキシド誘導体の例としては、ピリジルＮ−オキシド、ピラジニルＮ−オキシド、ピリミジニルＮ−オキシド、ピリダジニルＮ−オキシド、トリアジニルＮ−オキシド、イソキノリルＮ−オキシド、およびキノリルＮ−オキシドが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１１４】
用語「アリーレン」、「ヘテロアリーレン」または「ヘテロシクリレン」はそれぞれ、上に定義されているように、２個の他の化学基の間に位置してこれを結合するよう作用する、アリール、ヘテロアリールまたはヘテロシクリル基を意味することが意図される。
複素脂環式基は特に、非芳香族複素環式基を指す。複素脂環式は不飽和を含んでもよいが、芳香族ではない。
【０１１５】
ヘテロシクリルアルキル基は、ヘテロシクリルが親構造に、アルキレン、アルキリデン、またはアルキリジン基の１つを介して結合している残基を指す。例としては、（４−メチルピペラジン−１−イル）メチル、（モルホリン−４−イル）メチル、（ピリジン−４−イル）メチル、２−（オキサゾリン−２−イル）エチル、４−（４−メチルピペラジン−１−イル）−２−ブテニルなどが挙げられる。ヘテロシクリルアルキルが「随意に置換されている」と記載される場合は、ヘテロシクリルおよび、ヘテロシクリルアルキル基のアルキレン、アルキリデン、またはアルキリジン残基部分の両方が、随意に置換されていてもよい。「低級ヘテロシクリルアルキル」は、基の「アルキル」部分が１〜６個の炭素を有するヘテロシクリルアルキルを指す。
ヘテロアリシクリルアルキル基は特に、基のヘテロシクリル部分が非芳香族である、ヘテロシクリルアルキルを指す。
【０１１６】
好ましいヘテロシクリルおよびヘテロアリールとして、アゼピニル、アゼチジニル、アクリジニル、アゾシニル(azocinyl)、ベンジドリル（benzidolyl）、ベンズイミダゾリル、ベンゾフラニル、ベンゾフラザニル、ベンゾフリル、ベンゾチオフラニル、ベンゾチオフェニル、ベンゾオキサゾリル、ベンゾチアゾリル、ベンゾチエニル、ベンズトリアゾリル、ベンズテトラゾリル、ベンズイソキサゾリル、ベンズイソチアゾリル、ベンズイミダゾリニル、ベンゾオキサゾリル、ベンゾオキサジアゾリル、ベンゾピラニル、カルバゾリル、４ａＨ−カルバゾリル、カルボリニル、クロマニル、クロメニル、シンノリニル、クマリニル、デカヒドロキノリニル、ジベンゾフリル、１，３−ジオキソラン、２Ｈ，６Ｈ−１，５，２−ジチアジニル、ジヒドロフロ［２，３−ｂ］テトラヒドロフラン、ジヒドロイソインドリル、ジヒドロキナゾリニル（例えば３，４−ジヒドロ−４−オキソ−キナゾリニル）、フラニル、フロピリジニル（例えばフロ［２，３−ｃ］ピリジニル、フロ［３，２−ｂ］ピリジニルまたはフロ［２，３−ｂ］ピリジニル）、フリル、フラザニル、ヘキサヒドロジアゼピニル、イミダゾリジニル、イミダゾリニル、イミダゾリル、インダゾリル、１Ｈ−インダゾリル、インドレニル、インドリニル、インドリジニル、インドリル、３Ｈ−インドリル、イソベンゾフラニル、イソクロマニル、イソインダゾリル、イソインドリニル、イソインドリル、イソキノリル、イソキノリニル、イソチアゾリジニル、イソチアゾリル、イソキサゾリニル、イソキサゾリル、メチレンジオキシフェニル、モルホリニル、ナフチリジニル、オクタヒドロイソキノリニル、オキサジアゾリル、１，２，３−オキサジアゾリル、１，２，４−オキサジアゾリル、１，２，５−オキサジアゾリル、１，３，４−オキサジアゾリル、オキサゾリジニル、オキサゾリル、オキサゾリジニル、オキセタニル、２−オキソアゼピニル、２−オキソピペラジニル、２−オキソピペリジニル、２−オキソピロロジニル、ピリミジニル、フェナントリジニル、フェナントロリニル、フェナジニル、フェノチアジニル、フェノキサチイニル、フェノキサジニル、フタラジニル、ピペラジニル、ピペリジニル、ピペリドニル、４−ピペリドニル、ピペロニル、プテリジニル、プリニル、ピラニル、ピラジニル、ピラゾリジニル、ピラゾリニル、ピラゾリル、ピリダジニル、ピリドオキサゾール、ピリドイミダゾール、ピリドチアゾール、ピリジニル、ピリジル、ピリミジニル、ピロリジニル、ピロリニル、ピロロピリジル、２Ｈ−ピロリル、ピロリル、キナゾリニル、キノリル、キノリニル、４Ｈ−キノリジニル、キノキサリニル、キヌクリジニル、テトラヒドロ−１，１−ジオキソチエニル、テトラヒドロフラニル、テトラヒドロフリル、テトラヒドロイソキノリニル、テトラヒドロキノリニル、テトラヒドロピラニル、テトラゾリル、チアゾリジニル、６Ｈ−１，２，５−チアジアジニル、チアジアゾリル（例えば１，２，３−チアジアゾリル、１，２，４−チアジアゾリル、１，２，５−チアジアゾリル、１，３，４−チアジアゾリル）、チアモルホリニル、チアモルホリニルスルホキシド、チアモルホリニルスルホン、チアントレニル、チアゾリル、チエニル、チエノチアゾリル、チエノオキサゾリル、チエノイミダゾリル、チオフェニル、トリアジニル、トリアジニルアゼピニル、トリアゾリル（例えば１，２，３−トリアゾリル、１，２，４−トリアゾリル、１，２，５−トリアゾリル、１，３，４−トリアゾリル）、およびキサンテニルが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１１７】
本明細書で用いられる「ハロヒドロカルビル」は、ヒドロカルビル部分であって、ここで１個〜全ての水素が、独立して選択されるハロにより置き換えられているものである。
【０１１８】
本明細書中で用いる場合、他に述べない限り、部分（例えばアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロシクリルなど）を「随意に置換されている」と記載する場合には、これは、当該基が、随意に、１〜４、好ましくは１〜３、より好ましくは１または２の、独立して選択された非水素置換基を有することを意味する。好適な置換基として、ハロ、ヒドロキシ、オキソ（例えば、オキソで置換されている環の−ＣＨ−は、−Ｃ（Ｏ）−である）、ニトロ、ハロヒドロカルビル、ヒドロカルビル、アルキル、シクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、ヘテロアリール、アラルキル、アルコキシ、アリールオキシ、アミノ、アシルアミノ、アルキルカルバモイル、アリールカルバモイル、アミノアルキル、アシル、カルボキシ、ヒドロキシアルキル、アルカンスルホニル、アレーンスルホニル、アルカンスルホンアミド、アレーンスルホンアミド、アラルキルスルホンアミド、アルキルカルボニル、アシルオキシ、シアノおよびウレイド基が挙げられるが、これらに限定されない。これら自体がさらに置換されない（他に特に述べない限り）好ましい置換基は、以下のものである：
【０１１９】
（ａ）ハロ、ヒドロキシ、シアノ、オキソ、カルボキシ、ホルミル、ニトロ、アミノ、アミジノ、グアニジノ、
（ｂ）Ｃ１〜Ｃ５アルキルまたはアルケニルまたはアリールアルキル イミノ、カルバモイル、アジド、カルボキサミド、メルカプト、ヒドロキシ、ヒドロキシアルキル、アルキルアリール、アリールアルキル、Ｃ１〜Ｃ８アルキル、Ｃ１〜Ｃ８アルケニル、Ｃ１〜Ｃ８アルコキシ、Ｃ１〜Ｃ８アルキルアミノ、Ｃ１〜Ｃ８アルコキシカルボニル、アリールオキシカルボニル、Ｃ２〜Ｃ８アシル、−Ｃ（Ｏ）−Ｎ（Ｒ３０）−アルキル−シクロアルキル、−Ｃ（Ｏ）−Ｎ（Ｒ３０）−アルキル−ヘテロシクリル、−Ｃ（Ｏ）−Ｎ（Ｒ３０）−アルキル−アリール、−Ｃ（Ｏ）−Ｎ（Ｒ３０）−アルキル−ヘテロアリール、−Ｃ（Ｏ）−シクロアルキル、−Ｃ（Ｏ）−ヘテロシクリル、−Ｃ（Ｏ）−アリール、−Ｃ（Ｏ）−ヘテロアリール、Ｃ２〜Ｃ８アシルアミノ、Ｃ１〜Ｃ８アルキルチオ、アリールアルキルチオ、アリールチオ、Ｃ１〜Ｃ８アルキルスルフィニル、アリールアルキルスルフィニル、アリールスルフィニル、Ｃ１〜Ｃ８アルキルスルホニル、アリールアルキルスルホニル、アリールスルホニル、Ｃ０〜Ｃ６ Ｎ−アルキルカルバモイル、Ｃ２〜Ｃ１５Ｎ，Ｎ−ジアルキルカルバモイル、Ｃ３〜Ｃ７シクロアルキル、アロイル、アリールオキシ、アリールアルキルエーテル、アリール、シクロアルキルまたは複素環または別のアリール環に融合したアリール、Ｃ３〜Ｃ７複素環、Ｃ５〜Ｃ１５ヘテロアリール、またはシクロアルキル、ヘテロシクリルもしくはアリールに融合したかもしくはスピロ融合した（spiro-fused）これらの環のすべて、ここで前記の各々はさらに、上記（ａ）において列挙した１つまたは２つ以上の部分で随意に置換されている；および
【０１２０】
（ｃ）−（ＣＲ３２Ｒ３３）ｓ−ＮＲ３０Ｒ３１、式中ｓは０（この場合において、窒素は、置換されている部分に直接結合している）〜６であり、Ｒ３２およびＲ３３は、各々独立して、水素、ハロ、ヒドロキシルまたはＣ１〜Ｃ４アルキルであり、Ｒ３０およびＲ３１は、各々独立して水素、シアノ、オキソ、ヒドロキシル、Ｃ１〜Ｃ８アルキル、Ｃ１〜Ｃ８ヘテロアルキル、Ｃ１〜Ｃ８アルケニル、カルボキサミド、Ｃ１〜Ｃ３アルキルカルボキサミド、カルボキサミド−Ｃ１〜Ｃ３アルキル、アミジノ、Ｃ２〜Ｃ８ヒドロキシアルキル、Ｃ１〜Ｃ３アルキルアリール、アリール−Ｃ１〜Ｃ３アルキル、Ｃ１〜Ｃ３アルキルヘテロアリール、ヘテロアリール−Ｃ１〜Ｃ３アルキル、Ｃ１〜Ｃ３アルキルヘテロシクリル、ヘテロシクリル−Ｃ１〜Ｃ３アルキル、Ｃ１〜Ｃ３アルキルシクロアルキル、シクロアルキル−Ｃ１〜Ｃ３アルキル、Ｃ２〜Ｃ８アルコキシ、Ｃ２〜Ｃ８アルコキシ−Ｃ１〜Ｃ４アルキル、Ｃ１〜Ｃ８アルコキシカルボニル、アリールオキシカルボニル、アリール−Ｃ１〜Ｃ３アルコキシカルボニル、ヘテロアリールオキシカルボニル、ヘテロアリール−Ｃ１〜Ｃ３アルコキシカルボニル、Ｃ１〜Ｃ８アシル、Ｃ０〜Ｃ８アルキル−カルボニル、アリール−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−カルボニル、ヘテロアリール−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−カルボニル、シクロアルキル−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−カルボニル、ヘテロシクリル−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−カルボニル、Ｃ０〜Ｃ８アルキル−ＮＨ−カルボニル、アリール−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−ＮＨ−カルボニル、ヘテロアリール−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−ＮＨ−カルボニル、シクロアルキル−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−ＮＨ−カルボニル、ヘテロシクリル−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−ＮＨ−カルボニル、シクロアルキル−Ｓ（Ｏ）２−、ヘテロシクリル−Ｓ（Ｏ）２−、アリール−Ｓ（Ｏ）２−、ヘテロアリール−Ｓ（Ｏ）２−、Ｃ０〜Ｃ８アルキル−Ｏ−カルボニル、アリール−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−Ｏ−カルボニル、ヘテロアリール−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−Ｏ−カルボニル、シクロアルキル−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−Ｏ−カルボニル、ヘテロシクリル−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−Ｏ−カルボニル、Ｃ１〜Ｃ８アルキルスルホニル、アリールアルキルスルホニル、アリールスルホニル、ヘテロアリールアルキルスルホニル、ヘテロアリールスルホニル、Ｃ１〜Ｃ８アルキル−ＮＨ−スルホニル、アリールアルキル−ＮＨ−スルホニル、アリール−ＮＨ−スルホニル、ヘテロアリールアルキル−ＮＨ−スルホニル、ヘテロアリール−ＮＨ−スルホニルアロイル、アリール、シクロアルキル、ヘテロシクリル、ヘテロアリール、アリール−Ｃ１〜Ｃ３アルキル−、シクロアルキル−Ｃ１〜Ｃ３アルキル−、ヘテロシクリル−Ｃ１〜Ｃ３アルキル−、ヘテロアリール−Ｃ１〜Ｃ３アルキル−または保護基であり、ここで、前記の各々は、さらに随意に上記（ａ）において列挙した１つまたは２つ以上の部分で置換されており；または
【０１２１】
Ｒ３０およびＲ３１は、これらが結合しているＮと一緒になって、ヘテロシクリルまたはヘテロアリールを形成し、この各々は、随意に、上記（ａ）からなる群から選択された１〜３個の置換基、保護基、および（Ｘ３０−Ｙ３１−）で置換されており、ここで、前記ヘテロシクリルはまた、架橋されていてもよく（メチレン、エチレンまたはプロピレン架橋を有する二環式部分を形成する）；ここで、
【０１２２】
Ｘ３０は、Ｈ、Ｃ１〜Ｃ８アルキル、Ｃ２〜Ｃ８アルケニル−、Ｃ２〜Ｃ８アルキニル−、−Ｃ０〜Ｃ３アルキル−Ｃ２−Ｃ８アルケニル−Ｃ０〜Ｃ３アルキル、Ｃ０〜Ｃ３アルキル−Ｃ２〜Ｃ８アルキニル−Ｃ０〜Ｃ３アルキル、Ｃ０〜Ｃ３アルキル−Ｏ−Ｃ０〜Ｃ３アルキル−、ＨＯ−Ｃ０〜Ｃ３アルキル−、Ｃ０〜Ｃ４アルキル−Ｎ（Ｒ３０）−Ｃ０〜Ｃ３アルキル−、Ｎ（Ｒ３０）（Ｒ３１）−Ｃ０〜Ｃ３アルキル−、Ｎ（Ｒ３０）（Ｒ３１）−Ｃ０〜Ｃ３アルケニル−、Ｎ（Ｒ３０）（Ｒ３１）−Ｃ０〜Ｃ３アルキニル−、（Ｎ（Ｒ３０）（Ｒ３１））２−Ｃ＝Ｎ−、Ｃ０〜Ｃ３アルキル−Ｓ（Ｏ）０〜２−Ｃ０〜Ｃ３アルキル−、ＣＦ３−Ｃ０〜Ｃ３アルキル−、Ｃ１〜Ｃ８ヘテロアルキル、アリール、シクロアルキル、ヘテロシクリル、ヘテロアリール、アリール−Ｃ１〜Ｃ３アルキル−、シクロアルキル−Ｃ１〜Ｃ３アルキル−、ヘテロシクリル−Ｃ１〜Ｃ３アルキル−、ヘテロアリール−Ｃ１〜Ｃ３アルキル−、Ｎ（Ｒ３０）（Ｒ３１）−ヘテロシクリル−Ｃ１〜Ｃ３アルキル−からなる群から選択され、ここで、アリール、シクロアルキル、ヘテロアリールおよびヘテロシクリルは、随意に、（ａ）からの１〜３個の置換基で置換されており；またＹ３１は、直接結合、−Ｏ−、−Ｎ（Ｒ３０）−、−Ｃ（Ｏ）−、−Ｏ−Ｃ（Ｏ）−、−Ｃ（Ｏ）−Ｏ−、−Ｎ（Ｒ３０）−Ｃ（Ｏ）−、−Ｃ（Ｏ）−Ｎ（Ｒ３０）−、−Ｎ（Ｒ３０）−Ｃ（Ｓ）−、−Ｃ（Ｓ）−Ｎ（Ｒ３０）−、−Ｎ（Ｒ３０）−Ｃ（Ｏ）−Ｎ（Ｒ３１）−、−Ｎ（Ｒ３０）−Ｃ（ＮＲ３０）−Ｎ（Ｒ３１）−、−Ｎ（Ｒ３０）−Ｃ（ＮＲ３１）−、−Ｃ（ＮＲ３１）−Ｎ（Ｒ３０）、−Ｎ（Ｒ３０）−Ｃ（Ｓ）−Ｎ（Ｒ３１）−、−Ｎ（Ｒ３０）−Ｃ（Ｏ）−Ｏ−、−Ｏ−Ｃ（Ｏ）−Ｎ（Ｒ３１）−、−Ｎ（Ｒ３０）−Ｃ（Ｓ）−Ｏ−、−Ｏ−Ｃ（Ｓ）−Ｎ（Ｒ３１）−、−Ｓ（Ｏ）０〜２−、−ＳＯ２Ｎ（Ｒ３１）−、−Ｎ（Ｒ３１）−ＳＯ２−および−Ｎ（Ｒ３０）−ＳＯ２Ｎ（Ｒ３１）−からなる群から選択される。
【０１２３】
置換されている部分とは、その中の１つまたは２つ以上の（好ましくは１〜４、好ましくは１〜３、およびさらに好ましくは１または２の）水素が独立して他の化学置換基により置き換えられているものである。非限定的な例としては、置換フェニルは、２−フルオロフェニル、３，４−ジクロロフェニル、３−クロロ−４−フルオロ−フェニル、２−フルオロ−３−プロピルフェニルを含む。別の非限定的な例としては、置換ｎ−オクチルは、２，４−ジメチル−５−エチル−オクチルおよび３−シクロペンチル−オクチルを含む。この定義に含まれるのは、酸素で置換されてカルボニル−ＣＯ−を形成する、メチレン（−ＣＨ２−）である。
【０１２４】
フェニル、チオフェニルまたはピリジニルなどの環構造の隣接する原子に結合した２つの随意の置換基がある場合には、当該置換基は、これらが結合している原子と一緒に、随意に１個、２個または３個のヘテロ環原子を有する５員環または６員環シクロアルキルまたは複素環を形成する。
【０１２５】
好ましい態様においては、ヒドロカルビル、ヘテロアルキル、複素環および／またはアリール基などの基は、非置換である。
他の好ましい態様においては、ヒドロカルビル、ヘテロアルキル、複素環および／またはアリール基などの基は、１つ〜４つの（好ましくは１〜３、およびさらに好ましくは１または２の）独立して選択される基により、置換されている。
【０１２６】
アルキル基上の好ましい置換基としては、限定することなく、ヒドロキシル、ハロゲン（例えば１つのハロゲン置換基または複数のハロ置換基；後者の場合は、−ＣＦ３基、またはＣｌ３を有するアルキル基などの基）、オキソ、シアノ、ニトロ、アルキル、シクロアルキル、アルケニル、シクロアルケニル、アルキニル、複素環、アリール、−ＯＲａ、−ＳＲａ、−Ｓ（＝Ｏ）Ｒｅ、−Ｓ（＝Ｏ）２Ｒｅ、−Ｐ（＝Ｏ）２Ｒｅ、−Ｓ（＝Ｏ）２ＯＲｅ、−Ｐ（＝Ｏ）２ＯＲｅ、−ＮＲｂＲｃ、−ＮＲｂＳ（＝Ｏ）２Ｒｅ、−ＮＲｂＰ（＝Ｏ）２Ｒｅ、−Ｓ（＝Ｏ）２ＮＲｂＲｃ、−Ｐ（＝Ｏ）２ＮＲｂＲｃ、−Ｃ（＝Ｏ）ＯＲｅ、−Ｃ（＝Ｏ）Ｒａ、−Ｃ（＝Ｏ）ＮＲｂＲｃ、−ＯＣ（＝Ｏ）Ｒａ、−ＯＣ（＝Ｏ）ＮＲｂＲｃ、−ＮＲｂＣ（＝Ｏ）Ｒｅ、−ＮＲｄＣ（＝Ｏ）ＮＲｂＲｃ、−ＮＲｄＳ（＝Ｏ）２ＮＲｂＲｃ、−ＮＲｄＰ（＝Ｏ）２ＮＲｂＲｃ、−ＮＲｂＣ（＝Ｏ）Ｒａまたは−ＮＲｂＰ（＝Ｏ）２Ｒｅが挙げられ、これらの式中、Ｒａは、水素、アルキル、シクロアルキル、アルケニル、シクロアルケニル、アルキニル、複素環またはアリールであり；Ｒｂ、ＲｃおよびＲｄは独立して、水素、アルキル、シクロアルキル、複素環またはアリールであるか、または前記ＲｂおよびＲｃはそれらが結合しているＮと共に、随意に複素環を形成し；およびＲｅは、アルキル、シクロアルキル、アルケニル、シクロアルケニル、アルキニル、複素環またはアリールである。前記の例示の置換基において、アルキル、シクロアルキル、アルケニル、アルキニル、シクロアルケニル、複素環およびアリールなどの基はそれら自体が、随意に置換されていてもよい。
【０１２７】
アルケニルおよびアルキニル基上の好ましい置換基としては、限定することなく、アルキルまたは置換アルキル、および好ましいアルキル置換基として列挙された基が挙げられる。
シクロアルキル基上の好ましい置換基としては、限定することなく、ニトロ、シアノ、アルキルまたは置換アルキル、および好ましいアルキル置換基として列挙された基が挙げられる。その他の好ましい置換基としては、限定することなく、スピロ結合置換基または融合環置換基、好ましくはスピロ結合シクロアルキル、スピロ結合シクロアルケニル、スピロ結合複素環（ヘテロアリールを除く）、融合シクロアルキル、融合シクロアルケニル、融合複素環、または融合アリールが挙げられ、ここで前記のシクロアルキル、シクロアルケニル、複素環およびアリール置換基は、それら自体が随意に置換されていることができる。
【０１２８】
シクロアルケニル基上の好ましい置換基としては、限定することなく、ニトロ、シアノ、アルキルまたは置換アルキル、および好ましいアルキル置換基として列挙された基が挙げられる。その他の好ましい置換基としては、限定することなく、スピロ結合置換基または融合環置換基、特にスピロ結合シクロアルキル、スピロ結合シクロアルケニル、スピロ結合複素環（ヘテロアリールを除く）、融合シクロアルキル、融合シクロアルケニル、融合複素環、または融合アリールが挙げられ、ここで前記のシクロアルキル、シクロアルケニル、複素環およびアリール置換基は、それら自体が随意に置換されていることができる。
【０１２９】
アリール基上の好ましい置換基としては、限定することなく、ニトロ、シクロアルキルまたは置換シクロアルキル、シクロアルケニルまたは置換シクロアルケニル、シアノ、アルキルまたは置換アルキル、および好ましいアルキル置換基として上に列挙された基が挙げられる。その他の好ましい置換基としては、限定することなく、融合環基、特に融合シクロアルキル、融合シクロアルケニル、融合複素環、または融合アリールが挙げられ、ここで前記のシクロアルキル、シクロアルケニル、複素環およびアリール置換基は、それら自体が随意に置換されていることができる。アリール基（非限定的例としてはフェニル）上のさらに他の好ましい置換基としては、限定することなく、ハロアルキルおよび好ましいアルキル置換基として列挙された基が挙げられる。
【０１３０】
複素環基上の好ましい置換基としては、限定することなく、シクロアルキル、置換シクロアルキル、シクロアルケニル、置換シクロアルケニル、ニトロ、オキソ（すなわち＝Ｏ）、シアノ、アルキル、置換アルキル、および好ましいアルキル置換基として列挙された基が挙げられる。複素環基上のその他の好ましい置換基としては、限定することなく、任意の利用可能な１または２以上の結合点におけるスピロ結合置換基または融合環基が挙げられ、さらに好ましくは、スピロ結合シクロアルキル、スピロ結合シクロアルケニル、スピロ結合複素環（ヘテロアリールを除く）、融合シクロアルキル、融合シクロアルケニル、融合複素環、および融合アリールが挙げられ、ここで前記のシクロアルキル、シクロアルケニル、複素環およびアリール置換基は、それら自体が随意に置換されていることができる。
【０１３１】
ある好ましい態様において、複素環基は、１または２以上の位置において炭素、窒素および／または硫黄上で置換されている。炭素上の好ましい置換基としては、好ましいアルキル置換基として列挙された基を含む。窒素上の好ましい置換基としては、アルキル、アリール、アラルキル、アルキルカルボニル、アルキルスルホニル、アリールカルボニル、アリールスルホニル、アルコキシカルボニルまたはアラルコキシカルボニルが挙げられるが、これらには限定されない。硫黄上の好ましい置換基としては、オキソおよびＣ１〜６アルキルが挙げられるが、これらには限定されない。ある好ましい態様において、窒素および硫黄へテロ原子は独立して随意に酸化されていてもよく、および窒素ヘテロ原子は、独立して随意に四級化されていてもよい。
【０１３２】
アリール、ヘテロアリール、シクロアルキルおよびヘテロシクリルなどの環式基上の特に好ましい置換基としては、ハロゲン、アルコキシおよびアルキルが挙げられる。
アルキル基上の特に好ましい置換基としては、ハロゲンおよびヒドロキシが挙げられる。
【０１３３】
本明細書で用いる用語「ハロゲン」または「ハロ」は、塩素、臭素、フッ素またはヨウ素を指す。本明細書で用いる場合、用語「アシル」は、アルキルカルボニルまたはアリールカルボニル置換基を指す。用語「アシルアミノ」は、窒素原子に結合したアミド基を指す（すなわちＲ−ＣＯ−ＮＨ−）。用語「カルバモイル」は、カルボニル炭素原子に結合したアミド基を指す（すなわちＮＨ２−ＣＯ−）。アシルアミノまたはカルバモイル置換基の窒素原子は、追加して随意に置換されている。用語「スルホンアミド」は、硫黄または窒素原子のどちらかが結合したスルホンアミド置換基を指す。用語「アミノ」は、ＮＨ２、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アリールアミノ、および環式アミノ基を含むことを意味する。本明細書で用いる用語「ウレイド」は、置換または非置換の尿素部分を指す。
【０１３４】
本明細書で用いる用語「基」は、１個または２個以上の対になっていない電子を含む化学部分を指す。
随意の置換基を「１または２以上の」群から選択する場合、この定義は、全ての置換基が特定の群の１つから選択されるか、または置換基が２もしくは３以上の特定の群から選択されることを含む。
【０１３５】
さらに、環状部分（即ちシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、ヘテロアリール）上の置換基には、もとの環状部分に融合して二環式または三環式融合環系を形成する５〜６員単環および９〜１４員二環部分が含まれる。環状部分上の置換基にはまた、共有結合によりもとの環状部分に結合して二環式または三環式の二環系（bi-ring system）を形成する５〜６員単環および９〜１４員二環部分が含まれる。例えば、随意に置換されているフェニルには、以下のものが含まれるが、これらには限定されない：
【化１】
【０１３６】
飽和または不飽和の３〜８員炭素環は、好ましくは４〜７員、さらに好ましくは５または６員の、飽和または不飽和の炭素環である。飽和または不飽和の３〜８員炭素環の例としては、フェニル、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、およびシクロヘプチルが挙げられる。
【０１３７】
飽和または不飽和の３〜８員複素環は、酸素、窒素および硫黄原子から選択される、少なくとも１個のヘテロ原子を含む。飽和または不飽和の３〜８員複素環は、好ましくは、１または２個のヘテロ原子と、炭素原子である残りの環構成原子とを含む。飽和または不飽和の３〜８員複素環は、好ましくは飽和または不飽和の４〜７員複素環、さらに好ましくは飽和または不飽和の５または６員複素環である。飽和または不飽和の３〜８員複素環基の例としては、チエニル、ピリジル、１，２，３−トリアゾリル、イミダゾリル、イソオキサゾリル（isoxazolyl）、ピラゾリル、ピペラジニル、ピペラジノ、ピペリジル、ピペリジノ、モルホリニル、モルホリノ、ホモピペラジニル、ホモピペラジノ、チオモルホリニル、チオモルホリノ、テトラヒドロピロリル、およびアゼパニルが挙げられる。
【０１３８】
飽和または不飽和のカルボン酸基および複素環基は、他の飽和または複素環基と濃縮されて、二環式基を、好ましくは飽和または不飽和９〜１２員二環式炭素環または複素環基を形成することができる。二環式基には、ナフチル、キノリル、１，２，３，４−テトラヒドロキノリル、１，４−ベンゾオキサニル、インダニル、インドリル、および１，２，３，４−テトラヒドロナフチルが含まれる。
炭素環または複素環基が２つのＣ１〜Ｃ６アルキル基で置換されている場合、２つのアルキル基は一緒に組み合わさってアルキレン鎖を、好ましくはＣ１〜Ｃ３アルキレン鎖を形成してよい。この架橋構造を有する炭素環または複素環基には、ビシクロ［２．２．２］オクタニルおよびノルボルナニル（norbornanyl）が含まれる。
【０１３９】
１つの側面において、本発明は、Ｈｏｓ２、その活性断片およびその相同体の阻害剤である化合物であって、式（Ａ）：
Ｃｙ１−Ｌ１−Ａｒ１−Ｙ１−Ｃ（Ｏ）−ＮＨ−Ｚ１ （Ａ）
式中、
Ｃｙ１は、−Ｈ、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、またはヘテロシクリルであり、これらのすべては随意に置換されていてもよく；
Ｌ１は、−（ＣＨ２）ｍ−Ｗ−であり、式中ｍは０、１、２、３または４であり、およびＷは、−Ｃ（Ｏ）ＮＨ−、−Ｓ（Ｏ）２ＮＨ−、−ＮＨＣ（Ｏ）−、−ＮＨＳ（Ｏ）２−、および−ＮＨ−Ｃ（Ｏ）−ＮＨ−からなる群から選択され；
Ａｒ１はアリーレンであり、ここで該アリーレンは随意に、追加して置換されてもよく、および随意に、アリールもしくはヘテロアリール環に、または飽和もしくは部分不飽和シクロアルキルもしくは複素環に融合してもよく、これらのすべては随意に置換されていてもよく；
Ｙ１は、化学結合または直鎖もしくは分枝鎖飽和アルキレンであり、ここで該アルキレンは随意に置換されていてもよく；
Ｚ１は、アニリニル、ピリジル、チアジアゾリル、ここでこれらの各々は随意に置換されており、および−Ｏ−Ｍ、ここでＭは、Ｈまたは薬学的に許容され得るカチオンである、からなる群から選択される、
を有する化合物、およびそのＮ−オキシド、水和物、溶媒和物、薬学的に許容し得る塩、プロドラッグまたは複合体、ならびにこれらのラセミ混合物およびスケールミック混合物、ジアステレオマーおよびエナンチオマーを提供する。
【０１４０】
式（Ａ）で表される化合物の好ましい態様において、Ｌ１が−Ｃ（Ｏ）ＮＨ−であり、Ｙ１が−（ＣＨ２）ｎであってｎは１、２または３であり、かつＺ１が−Ｏ−Ｍである場合、Ｃｙ１はアミノフェニル、ジメチルアミノフェニル、またはヒドロキシフェニルではない。
式（Ａ）で表される化合物の他の好ましい態様において、Ｌ１が−Ｃ（Ｏ）ＮＨ−であり、かつＺ１がピリジルである場合、Ｃｙ１は置換インドリニルではない。
【０１４１】
ある好ましい態様において、Ｃｙ１はＣ６〜Ｃ１４アリール、より好ましくはＣ６〜Ｃ１０アリール、および最も好ましくはフェニルまたはナフチルであり、これらのすべては随意に置換されていてもよい。ある別の好ましい態様において、Ｃｙ１はヘテロアリールである。いくつかの好ましい態様において、ヘテロアリール基は、チエニル、ベンゾチエニル、フリル、ベンゾフリル、キノリル、イソキノリル、およびチアゾリルからなる群から選択され、これらのすべては随意に置換されていてもよい。ある特に好ましい態様において、Ｃｙ１は、フェニル、ナフチル、チエニル、ベンゾチエニル、およびキノリルからなる群から選択され、これらのすべては随意に置換されていてもよい。ある別の好ましい態様において、Ｃｙ１は、フェニル、ピリジンまたはインドールであり、より好ましくはフェニルまたはインドールである。ある好ましい態様において、Ｃｙ１は、トリハロアルキル（好ましくはトリフルオロアルキル）、ハロゲン、ＣＮ、アミジン、スルホン、アルキルスルホン、イミデートおよびアルキルイミデートからなる群から選択される１または２以上の置換基で置換されている。ある好ましい態様において、Ｃｙ１は、トリハロアルキル（好ましくはトリフルオロアルキル）、ハロゲン、ＣＮ、アミジン、スルホン、アルキルスルホン、イミデートおよびアルキルイミデートからからなる群から選択される、好ましくはトリハロアルキル（好ましくはトリフルオロアルキル）およびハロゲンからなる群から選択される、１または２以上の置換基で置換されたフェニルである。
【０１４２】
好ましい態様において、Ｌ１は−（ＣＨ２）ｍ−Ｗ−であり、式中ｍは０、１、２、３または４であり、およびＷは、−Ｃ（Ｏ）ＮＨ−、−Ｓ（Ｏ）２ＮＨ−、−ＮＨＣ（Ｏ）−、−ＮＨＳ（Ｏ）２−、および−ＮＨ−Ｃ（Ｏ）−ＮＨ−からなる群から選択される。好ましくは、ｍは０、１、または２であり、より好ましくは０または１である。
好ましくは、Ａｒ１はＣ６〜Ｃ１４アリーレン、より好ましくはＣ６〜Ｃ１０アリーレンであり、これらのすべてはさらに置換されていてもよい。ある好ましい態様において、Ａｒ１はフェニレン、好ましくは４−フェニレンである。いくつかの好ましい態様において、フェニレンはアリールまたはヘテロアリール環に融合するか、または飽和もしくは部分不飽和シクロアルキルもしくは複素環に融合しており、これらの全てもまた随意に置換されていてよい。
【０１４３】
好ましい態様においては、Ｙ１は化学結合または直鎖もしくは分枝鎖アルキレンであり、ここで該アルキレンは随意に置換されていてもよい。いくつかの好ましい態様においては、Ｙ１は化学結合であり、基−Ｃ（Ｏ）ＮＨ−Ｚは直接Ａｒ１に結合する。いくつかの他の好ましい態様においては、Ｙ１はアルキレンであり、好ましくは飽和アルキレンである。好ましくは、飽和アルキレンは、Ｃ１〜Ｃ８アルキレン、より好ましくはＣ１〜Ｃ６アルキレン、さらにより好ましくはＣ１〜Ｃ３アルキレン、そしてなおより好ましくはＣ１〜Ｃ２アルキレンであり、これらは随意に置換されていてもよい。いくつかの特に好ましい態様において、Ｙ１はメチレンである。
【０１４４】
置換アルキル、アリール、ヘテロシクリル、およびヘテロアリール基は、１または２以上の、好ましくは１〜約３の、より好ましくは１または２の置換基を有し、これらは好ましくは以下からなる群から選択される：Ｃ１〜Ｃ６アルキル、好ましくはＣ１〜Ｃ４アルキル；ハロ、好ましくはＣｌ、Ｂｒ、またはＦ；ハロアルキル、好ましくは（ハロ）１〜５（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、より好ましくは（ハロ）１〜５（Ｃ１〜Ｃ３）アルキル、および最も好ましくはＣＦ３；Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、好ましくはメトキシ、エトキシ、またはベンジルオキシ；Ｃ６〜Ｃ１０アルールオキシ、好ましくはフェノキシ；Ｃ１〜Ｃ６アルコキシカルボニル、好ましくはＣ１〜Ｃ３アルコキシカルボニル、最も好ましくはカルボメトキシまたはカルボエトキシ；Ｃ６〜Ｃ１０アリール、好ましくはフェニル；（Ｃ６〜Ｃ１０）アル（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、好ましくは（Ｃ６〜Ｃ１０）アル（Ｃ１〜Ｃ３）アルキル、より好ましくはベンジル、ナフチルメチルまたはフェネチル；ヒドロキシ（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、好ましくはヒドロキシ（Ｃ１〜Ｃ３）アルキル、より好ましくはヒドロキシメチル；アミノ（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、好ましくはアミノ（Ｃ１〜Ｃ３）アルキル、より好ましくはアミノメチル；（Ｃ１〜Ｃ６）アルキルアミノ、好ましくはメチルアミノ、エチルアミノ、またはプロピルアミノ；ジ−（Ｃ１〜Ｃ６）アルキルアミノ、好ましくはジメチルアミノまたはジエチルアミノ；（Ｃ１〜Ｃ６）アルキルカルバモイル、
【０１４５】
好ましくはメチルカルバモイル、ジメチルカルバモイル、またはベンジルカルバモイル；（Ｃ６〜Ｃ１０）アリールカルバモイル、好ましくはフェニルカルバモイル；（Ｃ１〜Ｃ６）アルカンアシルアミノ、好ましくはアセチルアミノ；（Ｃ１〜Ｃ６）アレーンアシルアミノ、好ましくはベンゾイルアミノ；（Ｃ１〜Ｃ６）アルカンスルホニル、好ましくはメタンスルホニル；（Ｃ１〜Ｃ６）アルカンスルホンアミド、好ましくはメタンスルホンアミド；（Ｃ６〜Ｃ１０）アレーンスルホニル、好ましくはベンゼンスルホニルまたはトルエンスルホニル；（Ｃ６〜Ｃ１０）アレーンスルホンアミド、好ましくはベンゼンスルホニルまたはトルエンスルホニル；（Ｃ６〜Ｃ１０）アル（Ｃ１〜Ｃ６）アルキルスルホンアミド、好ましくはベンジルスルホンアミド；Ｃ１〜Ｃ６アルキルカルボニル、好ましくはＣ１〜Ｃ３アルキルカルボニル、より好ましくはアセチル；（Ｃ１〜Ｃ６）アシルオキシ、好ましくはアセトキシ；シアノ；アミノ；カルボキシ；ヒドロキシ；ウレイド；およびニトロ。アルキル、シクロアルキル、またはヘテロシクリル基の１または２個以上の炭素原子もまた、随意にオキソ基により置換されていてもよい。
【０１４６】
いくつかの特に好ましい態様において、Ｃｙ１はフェニル、ナフチル、チエニル、ベンゾチエニル、またはキノリル部分であって、これは非置換であるか、または、Ｃ１〜Ｃ４アルキル、Ｃ１〜Ｃ４ハロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、（Ｃ６〜Ｃ１０）アル（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、ハロ、ニトロ、ヒドロキシ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシカルボニル、カルボキシ、およびアミノからなる群から独立して選択される１つまたは２つの置換基により置換されている。
【０１４７】
他の側面において、本発明は、Ｈｏｓ２、その活性断片およびその相同体の阻害剤である化合物であって、式（Ｂ）：
Ｃｙ２−Ｌ２−Ａｒ２−Ｙ２−Ｃ（Ｏ）ＮＨ−Ｚ２ （Ｂ）
式中、
Ｃｙ２は、Ｈ、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、またはヘテロシクリルであり、Ｃｙ２が（スピロシクロアルキル）ヘテロシクリルではない場合には、これらのすべては随意に置換されていてもよく；
Ｌ２は、Ｃ１〜Ｃ６飽和アルキレンまたはＣ２〜Ｃ６アルケニレンであって、ここでアルキレンまたはアルケニレンは、随意に置換されていてもよく、およびここでアルキレンの１または２個の炭素原子は随意に、Ｏ；ＮＲ’、ここでＲ’はアルキル、アシルもしくは水素であり；Ｓ；Ｓ（Ｏ）；またはＳ（Ｏ）２、からなる群から独立して選択されるヘテロ原子部分により置き換えられており；
Ａｒ２はアリーレンであり、ここで該アリーレンは随意に、追加して置換されてもよく、および随意に、アリールもしくはヘテロアリール環に、または飽和もしくは部分不飽和シクロアルキルもしくは複素環に融合していてもよく、これらのすべては随意に置換されていてもよく；および
Ｙ２は、化学結合または直鎖もしくは分枝鎖飽和アルキレンであり、アルキレンが、式−Ｃ（Ｏ）Ｒで表され式中Ｒはα−アミノアシル部分を含む置換基により置換されていない場合、随意に置換されていてもよく；
Ｚ２は、アニリニル、ピリジル、チアジアゾリル、ここでこれらの各々は随意に置換されており、および−Ｏ−Ｍ、ここでＭは、Ｈまたは薬学的に許容され得るカチオンである、からなる群から選択される、
で表される化合物、およびそのＮ−オキシド、水和物、溶媒和物、薬学的に許容し得る塩、プロドラッグまたは複合体、ならびにこれらのラセミ混合物およびスケールミック混合物、ジアステレオマーおよびエナンチオマーを提供する。
【０１４８】
式（Ｂ）で表される化合物の好ましい態様において、Ｃｙ２が結合している炭素原子がオキソ置換されている場合は、Ｃｙ２およびＺ２は両方ともがピリジルではない。
【０１４９】
本発明のこの側面によるＣｙ２、Ａｒ２およびＺ２の好ましい置換基は、式（Ａ）に対して上に定義したものと同じである。Ｙ２の好ましい置換基は、Ｙ１に対して上に定義したものと同じである。いくつかの好ましい態様において、Ｌ２は、飽和Ｃ１〜Ｃ８アルキレン、より好ましくはＣ１〜Ｃ６アルキレン、さらにより好ましくはＣ１〜Ｃ４アルキレンであって、これらの基のすべては随意に置換されていてもよい。いくつかの他の好ましい態様において、Ｌ２は、飽和Ｃ２〜Ｃ８アルケニレン、より好ましくはＣ２〜Ｃ６アルケニレン、さらにより好ましくはＣ２〜Ｃ４アルケニレンであって、これらの基のすべては随意に置換されていてもよい。アルキレンまたはアルケニレン基は、１または２以上の炭素位置において、上に列挙した好ましい置換基のリストから好ましくは選択された置換基により、置換されていてよい。さらに好ましくは、Ｌ２は、１または２以上の炭素位置において、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、アミノ、オキソ、ヒドロキシ、Ｃ１〜Ｃ４アルコキシ、およびＣ６〜Ｃ１０アリールオキシからなる群から独立して選択された置換基により置換されている。いくつかの特に好ましい態様において、アルキレンまたはアルケニレン基は、１または２個のオキソまたはヒドロキシ基により置換されている。
【０１５０】
いくつかの好ましい態様において、Ｌ２は、Ｃ１〜Ｃ６飽和アルキレンであって、ここで飽和アルキレンの炭素原子の１つは、Ｏ；ＮＲ’、ここでＲ’はアルキル、アシルまたは水素であり；Ｓ；Ｓ（Ｏ）；またはＳ（Ｏ）２、からなる群から選択されるヘテロ原子部分により置き換えられている。好ましくは、Ｃｙ２に隣接する炭素原子は、ヘテロ原子部分により置き換えられている。いくつかの特に好ましい態様において、Ｌ２は、−Ｓ−（ＣＨ２）２−、−Ｓ（Ｏ）−（ＣＨ２）２−、−Ｓ（Ｏ）２−（ＣＨ２）２−、−Ｓ−（ＣＨ２）３−、−Ｓ（Ｏ）−（ＣＨ２）３−、および−Ｓ（Ｏ）２−（ＣＨ２）３−からなる群から選択される。
【０１５１】
他の好ましい側面において、本発明は、Ｈｏｓ２、その活性断片およびその相同体の阻害剤である化合物であって、式（Ｃ）：
Ｃｙ３−Ｌ３−Ａｒ３−Ｙ３−Ｃ（Ｏ）ＮＨ−Ｚ３ （Ｃ）
式中、
Ｃｙ３は、−Ｈ、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、またはヘテロシクリルであり、Ｃｙ３が（スピロシクロアルキル）ヘテロシクリルではない場合には、これらのすべては随意に置換されていてもよく；
Ｌ３は、以下からなる群から選択され：
（ａ）−（ＣＨ２）ｍ−Ｗ−、式中、ｍは０、１、２、３または４であり、Ｗは−Ｃ（Ｏ）ＮＨ−、−Ｓ（Ｏ）２ＮＨ−、−ＮＨＣ（Ｏ）−、−ＮＨＳ（Ｏ）２−、および−ＮＨ−Ｃ（Ｏ）−ＮＨ−からなる群から選択される；および
（ｂ）Ｃ１〜Ｃ６アルキレンまたはＣ２〜Ｃ６アルケニレンであって、ここでアルキレンまたはアルケニレンは、随意に置換されていてもよく、およびここでアルキレンの炭素原子の１つは随意に、Ｏ；ＮＲ’、ここでＲ’はアルキル、アシルまたは水素であり；Ｓ；Ｓ（Ｏ）；またはＳ（Ｏ）２により置き換えられていてもよく；
Ａｒ３はアリーレンであり、ここで該アリーレンは随意に、追加して置換されてもよく、および随意に、アリールもしくはヘテロアリール環に、または飽和もしくは部分不飽和シクロアルキルもしくは複素環に融合していてもよく、これらのすべては随意に置換されていてもよく；
Ｙ３は、Ｃ２アルケニレンまたはＣ２アルキニレンであり、ここでアルケニレンの１個または両方の炭素原子は、アルキル、アリール、アルカリル(alkaryl)またはアラルキルにより随意に置換されていてもよく；および
Ｚ３は、アニリニル、ピリジル、チアジアゾリル、ここでこれらの各々は随意に置換されており、および−Ｏ−Ｍ、ここでＭは、Ｈまたは薬学的に許容され得るカチオンである、からなる群から選択される、
で表される化合物、およびそのＮ−オキシド、水和物、溶媒和物、薬学的に許容し得る塩、プロドラッグまたは複合体、ならびにこれらのラセミ混合物およびスケールミック混合物、ジアステレオマーおよびエナンチオマーを提供する。
【０１５２】
式（Ｃ）で表される化合物の好ましい態様において、Ｃｙ３が不飽和フェニルである場合、Ａｒ３はフェニルではなく、ここでＬ３およびＹ３は互いにオルトまたはメタに配置されている。
本発明のこの側面によるＣｙ３、Ａｒ３およびＺ３の好ましい置換基は、式（Ａ）に対して上に定義したものと同じである。
【０１５３】
本発明の１つの側面の好ましい態様において、本発明は、化合物を、好ましくはUS 10/880,444に記載のヒドロキサム酸塩をベースとする化合物であってＨｏｓ２を阻害するのに有用な前記化合物を提供し、この文献は参照としてその全体が本明細書に組み込まれる。
【０１５４】
第１の側面の好ましい態様において、本発明は、Ｈｏｓ２、その活性断片およびその相同体を阻害するのに有用である、ヒドロキサム酸塩をベースとする化合物、好ましくは式（Ｄ）：
【化２】
【０１５５】
式中、
Ｒは、アルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリールまたはヘテロシクリル、好ましくはシクロアルキル、アリール、ヘテロアリールまたはヘテロシクリルであり、これらのすべては随意に置換されていてもよく；
ｘは、０〜５の整数であり、ここで、長さｘの鎖は随意に置換されており、およびここで、長さｘの鎖の１個または２個の炭素原子は、随意にヘテロ原子で置換されており；
ｎは、０〜２の整数であり；および
Ｙは、Ｈおよび複素環基からなる群から選択され；および
フェニレンは随意に置換されている、
で表される化合物、およびそのＮ−オキシド、水和物、溶媒和物、薬学的に許容し得る塩、プロドラッグまたは複合体、ならびにこれらのラセミ混合物およびスケールミック混合物、ジアステレオマーおよびエナンチオマーを包含する。
【０１５６】
式（Ｄ）で表される化合物の好ましい態様において、ｘが４の場合ｎは２ではなく、ｘが３の場合ｎは３ではない。
【０１５７】
本発明の化合物の好ましい態様において、Ｒは、随意に、１つまたは２つ以上、好ましくは１つ〜約３つ、より好ましくは１つまたは２つの置換基を有し、これは、好ましくは、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、好ましくはＣ１〜Ｃ４アルキル；ハロ、好ましくはＣｌ、ＢｒまたはＦ；ハロアルキル、好ましくは（ハロ）１〜５（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、より好ましくは（ハロ）１〜５（Ｃ１〜Ｃ３）アルキル、および最も好ましくはＣＦ３；Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、好ましくはメトキシ、エトキシまたはベンジルオキシ；Ｃ６〜Ｃ１０アリールオキシ、好ましくはフェノキシ；Ｃ１〜Ｃ６アルコキシカルボニル、好ましくはＣ１〜Ｃ３アルコキシカルボニル、最も好ましくはカルボメトキシまたはカルボエトキシ；Ｃ６〜Ｃ１０アリール、好ましくはフェニル；（Ｃ６〜Ｃ１０）アル（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、好ましくは（Ｃ６〜Ｃ１０）アル（Ｃ１〜Ｃ３）アルキル、より好ましくはベンジル、ナフチルメチルまたはフェネチル；ヒドロキシ（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、好ましくはヒドロキシ（Ｃ１〜Ｃ３）アルキル、より好ましくはヒドロキシメチル；アミノ（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、好ましくはアミノ（Ｃ１〜Ｃ３）アルキル、より好ましくはアミノメチル；（Ｃ１〜Ｃ６）アルキルアミノ、好ましくはメチルアミノ、エチルアミノまたはプロピルアミノ；ジ（Ｃ１〜Ｃ６）アルキルアミノ、好ましくはジメチルアミノまたはジエチルアミノ；（Ｃ１〜Ｃ６）アルキルカルバモイル、好ましくはメチルカルバモイル、ジメチルカルバモイルまたはベンジルカルバモイル；（Ｃ６〜Ｃ１０）アリールカルバモイル、好ましくはフェニルカルバモイル；（Ｃ１〜Ｃ６）アルカンアシルアミノ、好ましくはアセチルアミノ；（Ｃ６〜Ｃ１０）アレーンアシルアミノ、好ましくはベンゾイルアミノ；（Ｃ１〜Ｃ６）アルカンスルホニル、好ましくはメタンスルホニル；（Ｃ１〜Ｃ６）アルカンスルホンアミド、好ましくはメタンスルホンアミド；（Ｃ６〜Ｃ１０）アレーンスルホニル、好ましくはベンゼンスルホニルまたはトルエンスルホニル；（Ｃ６〜Ｃ１０）アレーンスルホンアミド、好ましくはベンゼンスルホニルまたはトルエンスルホニル；（Ｃ６〜Ｃ１０）アル（Ｃ１〜Ｃ６）アルキルスルホンアミド、好ましくはベンジルスルホンアミド；Ｃ１〜Ｃ６アルキルカルボニル、好ましくはＣ１〜Ｃ３アルキルカルボニル、より好ましくはアセチル；（Ｃ１〜Ｃ６）アシルオキシ、好ましくはアセトキシ；シアノ；アミノ；カルボキシ；ヒドロキシ；ウレイド；ニトロおよびオキソからなる群から選択される。
【０１５８】
本発明の化合物の他の好ましい態様において、Ｒは、非置換であるか、またはＣ１〜Ｃ４アルキル、Ｃ１〜Ｃ４ハロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、（Ｃ６〜Ｃ１０）アル（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、ハロ、ニトロ、ヒドロキシ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシカルボニル、カルボキシおよびアミノからなる群から独立して選択された１つまたは２つの置換基により置換されている。
本発明の化合物の好ましい態様において、Ｒは、フェニル、ピリジンまたはインドール、より好ましくはフェニルまたはインドール、より好ましくはフェニルである。
【０１５９】
本発明の化合物の好ましい態様において、Ｒは、アルキル、アルケニル、アルキニル、トリハロアルキル、ハロゲン、ＣＮ、アミジン、アルキルアミジン、スルホン、アルキルスルホン、イミデートおよびアルキルイミデートからなる群から独立して選択された１つまたは２つ以上の置換基で置換されている。
【０１６０】
本発明の化合物の好ましい態様において、Ｒは、フェニルまたはインドールであり、アルキル、アルケニル、アルキニル、トリハロアルキル、ハロゲン、ＣＮ、アミジン、アルキルアミジン、スルホン、アルキルスルホン、イミデートおよびアルキルイミデートからなる群から独立して選択された１つまたは２つ以上の置換基、より好ましくはアルキル、アルケニル、アルキニル、トリハロアルキルおよびハロゲンからなる群から独立して選択された１つまたは２つ以上の置換基で置換されている。
【０１６１】
本発明の化合物の好ましい態様において、ｘは、２〜４、より好ましくは３〜４の整数である。
本発明の化合物の好ましい態様において、ｎは、１〜２の整数、より好ましくは１である。
本発明の化合物の好ましい態様において、ＹはＨである。
本発明の化合物の好ましい態様において、長さｘの鎖の１個の炭素原子は、ヘテロ原子、好ましくはＳで置換されている。
【０１６２】
本明細書を通して、１つまたは２つ以上の化学置換基の好ましい態様が同定されている。好ましい態様の組合せもまた好ましい。
本発明の化合物の好ましい態様において、化合物は、
【化３】
からなる群、およびそのＮ−オキシド、水和物、溶媒和物、薬学的に許容し得る塩、プロドラッグまたは複合体、ならびにこれらのラセミ混合物およびスケールミック混合物、ジアステレオマーおよびエナンチオマーから選択される。
【０１６３】
本発明の化合物の好ましい態様において、化合物は、
【化４】
からなる群、およびそのＮ−オキシド、水和物、溶媒和物、薬学的に許容し得る塩、プロドラッグまたは複合体、ならびにこれらのラセミ混合物およびスケールミック混合物、ジアステレオマーおよびエナンチオマーから選択される。
【０１６４】
本発明の化合物の好ましい態様において、化合物は、
【化５】
およびそのＮ−オキシド、水和物、溶媒和物、薬学的に許容し得る塩、プロドラッグまたは複合体、ならびにこれらのラセミ混合物およびスケールミック混合物、ジアステレオマーおよびエナンチオマーである。
【０１６５】
本発明はさらに、本明細書に記載の化合物の、Ｈｏｓ２、その活性断片およびその相同体を阻害するための使用を提供する。
式（Ａ）〜式（Ｄ）で表される化合物は、Ｈｏｓ２、その活性断片およびその相同体を阻害するのに有用であるため、これらはＨｏｓ２を試験する研究ツールとして有用である。
【０１６６】
用語ＲＰＤ３、ＨＤＡ１、ＨＯＳ１、ＨＯＳ２、ＨＯＳ３およびＳＩＲ２は、当分野において知られている遺伝子を指し、以下における遺伝子を含む：S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis carinii、およびこの群のそれらの株、ならびに任意の他の真菌およびそれらの株（限定することなく、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種および Paecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種、および皮膚糸状菌、およびこの群のそれらの株を含む）、ならびにこれらのすべての相同体。
【０１６７】
野生型株は、機能するＲＰＤ３、ＨＤＡ１、ＨＯＳ１、ＨＯＳ２、ＨＯＳ３およびＳＩＲ２遺伝子活性を有する真菌株を指す。
用語ＲＰＤ３ノックアウト変異株、ＨＤＡ１ノックアウト変異株、ＨＯＳ１ノックアウト変異株、ＨＯＳ２ノックアウト変異株、ＨＯＳ３ノックアウト変異株およびＳＩＲ２ノックアウト変異株は、それぞれ、ＲＰＤ３、ＨＤＡ１、ＨＯＳ１、ＨＯＳ２、ＨＯＳ３またはＳＩＲ２遺伝子が機能しない真菌株を指す。
【０１６８】
用語「薬学的に許容し得る担体」は、細胞、細胞培養物、組織試料または身体中の生物システムと適合性であり、活性成分（１種または２種以上）の生物学的活性の有効性に干渉しない、無毒性の物質を意味することを意図する。したがって、本発明の組成物は、阻害剤および抗真菌剤に加えて、希釈剤、賦形剤、充填剤、塩、緩衝剤、安定剤、可溶化剤および／または当該分野において周知の他の物質を含んでいてもよい。薬学的に許容し得る処方の製剤の例は、例えば、Remington’s Pharmaceutical Sciences, 第１８版、A. Gennaro編、Mack Publishing Co., Easton, PA, 1990に記載されている。
当然のことながら、担体の特性は、特定の適用に対する投与経路に依存する。
【０１６９】
用語「薬学的に許容し得る塩」は、上で同定された化合物の所望の生物学的活性を維持し、望ましくない毒性作用を最小に示すかまたは全く示さない塩を意味することを意図する。このような塩の例には、無機酸（例えば塩酸、臭化水素酸、硫酸、リン酸、硝酸など）により生成される酸付加塩、ならびに有機酸、例えば酢酸、シュウ酸、酒石酸、コハク酸、リンゴ酸、アスコルビン酸、安息香酸、タンニン酸、パモン酸、アルギン酸、ポリグルタミン酸、ナフタレンスルホン酸、ナフタレンジスルホン酸およびポリガラクツロン酸により生成される塩が含まれるが、これらには限定されない。当該化合物はまた、当業者に知られている薬学的に許容し得る第四級塩の形態であってもよく、特に、式−ＮＲ＋Ｚ−で表される第四級アンモニウム塩を含み、式中Ｒは水素、アルキルまたはベンジルであり、Ｚは対イオンであり、塩化物、臭化物、ヨウ化物、−Ｏ−アルキル、トルエンスルホン酸、メチルスルホン酸、スルホン酸、リン酸またはカルボン酸（例えば安息香酸、コハク酸、酢酸、グリコール酸、マレイン酸、リンゴ酸、クエン酸、酒石酸、アスコルビン酸、安息香酸、ケイ皮酸、マンデル酸、ベンジル酸およびジフェニル酢酸)を含む。本明細書中で用いる場合、用語「塩」はまた、例えばアルカリ金属またはアルカリ土類金属との錯体を包含することを意味する。
【０１７０】
本発明の組成物の活性化合物は、薬学的に許容し得る担体中に、組成物を投与する個体に対して重大な有毒な効果を生じずに有効な所望の量を送達するのに十分な量で含まれる。
【０１７１】
用語「相同体」は、当分野で用いられる一般名であり、参照配列に対して高度の配列関連性を有するポリヌクレオチドまたはポリペプチド配列を意味することを意図する。かかる関連性は、当業者による決定に従って２つの配列間の同一性および／または類似性の程度を決定することにより、定量化することができる。この一般名に含められるのは、用語「オルソログ」および「パラログ」である。「オルソログ」は、他の種のポリヌクレオチドまたはポリペプチドに機能的に等価である、ポリヌクレオチドまたはポリペプチドを指す。「パラログ」は、機能的に類似である、同じ種内のポリヌクレオチドまたはポリペプチドを指す。
【０１７２】
用語「同一性」は、配列を比較することにより決定される、２もしくは３以上のポリペプチド配列間、または２もしくは３以上のポリヌクレオチド配列間の関係を意味することを意図する。一般に、同一性は、２つのポリヌクレオチドまたは２つのポリペプチド配列の、比較される配列の長さにわたる、それぞれヌクレオチド対ヌクレオチドまたはアミノ酸対アミノ酸の正確な一致を指す。
【０１７３】
正確に一致しない配列については、「％同一性」を決定してもよい。一般に、比較する２つの配列を整列させて、配列間の最大相関を得る。これには、片方または両方の配列中に「ギャップ」を挿入して、整列の度合いを強化してもよい。％同一性は、比較する各配列の全長にわたって決定することもでき（いわゆるグローバルアライメント）、これは同一または非常によく似た長さの配列に特に好適であり、または、より短い、規定の長さにわたって決定することもでき（いわゆるローカルアライメント）、これは異なる長さの配列に対してより好適である。
【０１７４】
用語「類似性」はさらに、２つのポリペプチド配列間の関係のより高度な測度を意味することを意図している。一般に「類似性」は、残基対残基ベースでの２本のポリペプチド鎖のアミノ酸の間の比較であって、（同一性を）比較する配列それぞれから１つずつとった残基対の間の正確な一致だけでなく、正確な一致がない場合には、進化的ベースで、１つの残基が他に対する置換となり得るかどうかをも考慮したものである。この確度は、関連する「スコア」を有し、これから２つの配列の「％類似性」が決定できる。
【０１７５】
ポリペプチド配列に対して、保守的な置換は、配列中のある位置における１つのアミノ酸を、同じクラスの他のアミノ酸（例えば、疎水性、電荷、ｐＫまたは他の立体配座的または化学的特性を共有するアミノ酸、例えばレクチンに対するバリン、リジンに対するアルギニン）で置換すること、または、ポリペプチドの生物活性を破壊する程にはポリペプチドの立体配座もしくは折りたたみを変えない配列の位置における、１または２以上の非保守的なアミノ酸の置換、欠失、または挿入からなる。「保守的な置換」の例は、１つの非極性（疎水性）残基、例えばイソロイシン、バリン、ロイシンまたはメチオニンを、他のもので置換すること；１つの極性（親水性）残基を他のもので置換すること、例えばアルギニンとリジンの間、グルタミンとアルパラギンの間、スレオニンとセリンの間；１つの塩基性残基、例えばリジン、アルギニンまたはヒスチジンを他のもので置換すること；または１つの酸性残基、例えばアスパラギン酸またはグルタミン酸を他のもので置換すること；または化学的に誘導体化された残基を、非誘導体化残基の代わりに用いること；を含み、ただし、ポリペプチドは必要な生物活性を示すものとする。
【０１７６】
２または３以上の配列の同一性および類似性を比較するための方法は、当分野でよく知られている；例えば、ＢＬＡＳＴファミリープログラム（Altschul S F et al., J Mol Biol, 215, 403-410,1990, Altschul S F et al., Nucleic Acids Res., 25:389-3402, 1997、全米バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）Bethesda, Md., USAより入手可能であり、またＮＣＢＩのホームページhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/を通してアクセス可能）などである。
【０１７７】
したがって本発明は、サッカロマイセス・セレヴィシエ（Saccharomyces cerevisiae）ＨＯＳ２遺伝子およびＨｏｓ２タンパク質の相同体も包含し、ここで相同な遺伝子およびタンパク質の源は任意の他の真菌種であることができ、例えばカンジダおよびアスペルギルス、および本明細書に記載されているように他の種およびそれらの株を含むが、これらに限定されない。真菌種の間、例えばサッカロマイセスとカンジダの間で、遺伝子相同体は実質的な配列の類似性を有し、例えば、少なくとも５０％の配列同一性、少なくとも７５％の配列同一性、通常少なくとも９０％の配列同一性、さらに通常は少なくとも９０％の配列同一性を、ヌクレオチド配列間に有する。
【０１７８】
Ｈｏｓ２タンパク質相同体は、サッカロマイセス・セレヴィシエＨｏｓ２タンパク質に対して、少なくとも約３５％の、好ましくは少なくとも約４０％の、より好ましくは少なくとも約６０％の、さらにより好ましくは少なくとも約８０％の、さらに好ましくは少なくとも約９０％の、さらにより好ましくは少なくとも約９５％の、アミノ酸配列同一性を有するタンパク質を意味する。
本発明はまた、Ｈｏｓ２ポリペプチドの対立遺伝子多型およびこれをコーディングする核酸も包含する；これはすなわち、アミノ酸またはヌクレオチド配列間の差が遺伝的多型（集団内での個体間の対立遺伝子変異）に起因している、かかるポリペプチドおよび核酸の天然の代替形態である。天然および人工的に生じるＨＯＳ変異体もまた、本発明に包含される。
【０１７９】
本発明のＨＯＳ２の相同体および対立遺伝子は、例えば、当業者に知られた従来技術により同定することができる。例えば、S. cerevisiaeＨＯＳ２のCandida glabrata相同体は、ＨＯＳ２をコーディングするポリヌクレオチドから好適なプローブまたはプライマーを作製し、好適な核酸源を、例えばC. glabrataｃＤＮＡライブラリなどの所望の種からスクリーニングし、陽性のクローンを選択することにより、単離および同定することができる。したがって本発明の１つの側面は、Ｈｏｓ２相同体ポリペプチドをコーディングし、ＨＯＳ２をコーディングする核酸領域に対応する核酸の配列を含む核酸分子とストリンジェントな条件化でハイブリッド形成する、核酸配列である。本明細書で用いる場合、用語「ストリンジェントな条件」とは、当分野で精通のパラメータを指す。
【０１８０】
用語「抗真菌剤」は、真菌細胞の増殖、生存能力および／または複製を阻害するかまたは防止することができる物質を意味することを意図する。好ましい抗真菌剤は、動物または植物における真菌感染を防止するかまたは処置することができるものである。好ましい抗真菌剤は、広範囲の抗真菌剤である。しかし、抗真菌剤はまた、真菌の１種または２種以上の特定の種に特異的であってもよい。
【０１８１】
用語「ヒストンデアセチラーゼ阻害剤」および「ヒストンデアセチラーゼの阻害剤」は、ヒストンデアセチラーゼと相互作用し、この酵素活性を阻害することができる化合物を意味することを意図する。「ヒストンデアセチラーゼの酵素活性を阻害する」とは、ヒストンデアセチラーゼがアセチル基を、ヒストンを含むがこれに限定されないタンパク質から除去する能力を、低下させることを意味する。いくつかの好ましい態様において、かかるヒストンデアセチラーゼ活性の低下は、少なくとも約５０％、より好ましくは少なくとも約７５％、なおより好ましくは少なくとも約９０％である。他の好ましい態様において、ヒストンデアセチラーゼ活性は、少なくとも９５％、またより好ましくは少なくとも９９％低下する。本発明のいくつかの好ましい態様において、ヒストンデアセチラーゼはＨｏｓ２またはその相同体である。
【０１８２】
ヒストンデアセチラーゼ阻害剤は、ヒストンデアセチラーゼの活性における低下をもたらす任意の分子であってもよい。これには、タンパク質、ペプチド、抗体およびその活性断片、ＤＮＡ分子（アンチセンスを含む）、ＲＮＡ分子（ＲＮＡｉおよびアンチセンスを含む）ならびに小分子が含まれる。
【０１８３】
好ましくは、このような阻害は特異的であり、即ちヒストンデアセチラーゼ阻害剤は、ヒストンデアセチラーゼが他の無関連の生物学的効果を生じるのに必要な阻害剤の濃度より低い濃度で、ヒストンを含むがこれに限定されないタンパク質からアセチル基を除去する能力を低下させる。好ましくは、ヒストンデアセチラーゼ阻害活性に必要な阻害剤の濃度は、無関連の生物学的効果を生じるのに必要な濃度よりも、少なくとも２倍低く、より好ましくは少なくとも５倍低く、さらにより好ましくは少なくとも１０倍低く、最も好ましくは少なくとも２０倍低い。
【０１８４】
本発明の好ましい態様において、ヒストンデアセチラーゼ阻害剤は、全ての特異的ヒストンデアセチラーゼアイソフォームより少ない、１種または２種以上のヒストンデアセチラーゼアイソフォームを阻害する。好ましいヒストンデアセチラーゼアイソフォームは、クラスＩおよびクラスＩＩ酵素を含む。特異的ＨＤＡＣとしては、Ｒｐｄ３、Ｈｏｓ１、Ｈｏｓ２、Ｈｄａ１、Ｈｏｓ３、Ｓｉｒ２およびＨｓｔタンパク質、ならびのそれらの相同体が挙げられるが、これに限定されない。本発明の好ましい態様において、ヒストンデアセチラーゼ阻害剤はＨｏｓ２を阻害する。
【０１８５】
用語「ヒストンデアセチラーゼ遺伝子阻害剤」および「ヒストンデアセチラーゼ遺伝子発現の阻害剤」は、ヒストンデアセチラーゼをコーディングする核酸と、またはヒストンデアセチラーゼ活性を有するタンパク質をコーディングする核酸と相互作用することができて、効率的ヒストンデアセチラーゼ活性を有する産物を発現する、該核酸の能力を阻害することができる化合物を意味することを意図する。発現の阻害は、転写および／または翻訳のレベルにおけるものであってよい。いくつかの好ましい態様において、かかる発現の低下は、少なくとも約５０％、より好ましくは少なくとも約７５％、なおより好ましくは少なくとも約９０％である。他の好ましい態様において、発現は、少なくとも９５％、またより好ましくは少なくとも９９％低下する。本発明のいくつかの好ましい態様において、核酸はＨＯＳ２またはその相同体をコーディングする。
【０１８６】
ヒストンデアセチラーゼ遺伝子阻害剤は、効率的ヒストンデアセチラーゼ活性を有する産物の発現における低下をもたらす任意の分子であってもよい。これには、タンパク質、ペプチド、抗体およびその活性断片、ＤＮＡ分子（アンチセンスを含む）、ＲＮＡ分子（ＲＮＡｉおよびアンチセンスを含む）ならびに小分子が含まれる。
【０１８７】
好ましくは、このような阻害は特異的であり、即ちヒストンデアセチラーゼ遺伝子阻害剤は、他の無関連の生物学的効果を生じるのに必要な阻害剤の濃度より低い濃度で、効率的ヒストンデアセチラーゼ活性を有する産物を発現する能力を低下させる。好ましくは、阻害活性に必要な阻害剤の濃度は、無関連の生物学的効果を生じるのに必要な濃度よりも、少なくとも２倍低く、より好ましくは少なくとも５倍低く、さらにより好ましくは少なくとも１０倍低く、最も好ましくは少なくとも２０倍低い。
【０１８８】
用語「阻害有効量」は、真菌ＨＤＡＣ活性の、好ましくは細胞内での真菌ＨＤＡＣ活性の、阻害を引き起こすのに十分な投与量を表すことを意味し、ここで細胞は多細胞生物内に存在することができる。真菌は、植物または哺乳動物、好ましくはヒトに感染することができ、したがって、植物または哺乳動物の内部および／または上に位置することができる。真菌が多細胞生物内または上にある場合、本発明のこの側面による方法は、該生物に、本発明の化合物または組成物を投与することを含む。投与は任意の経路であってよく、非経口、経口、舌下、経皮的、局所的、鼻腔内、気管内、静脈内または直腸内を含むが、これらに限定されない。ある特に好ましい態様において、本発明の組成物を、病院の設備において静脈内投与する。特定の他の好ましい態様において、投与は、好ましくは経口経路によるものであってもよい。
【０１８９】
本明細書中で用いる用語「治療的有効量」は、患者に投与された場合に、所望の治療的効果を引き出す、本発明の化合物の量である。治療的効果は、処置される疾患および望まれる結果に依存する。したがって、治療的効果は、疾患状態の処置であることができる。さらに、治療的効果は、Ｈｏｓ２活性の阻害またはＨＯＳ２発現の阻害であることができる。「治療的有効量」を構成する本発明の化合物の量は、化合物、疾患状態およびその重篤度、処置されるべき患者の年齢などに依存して変化する。治療的有効量は、当業者により常習的に決定することができる。
【０１９０】
本発明の目的のために本明細書中で用いる場合、用語「患者」には、ヒトおよび他の動物、特に哺乳動物、ならびに他の生物が含まれる。したがって、本発明の化合物、組成物および方法は、ヒト療法と獣医学的用途との両方に適用可能である。好ましい態様において、患者は哺乳動物であり、最も好ましい態様において、患者はヒトである。
【０１９１】
本明細書中で用いる場合、用語「処置する」、「処置」などは、動物における疾患状態の処置を包含し、この疾患状態は、以下の少なくとも１つを含む：（ｉ）特に、動物が疾患状態に対する素因はあるが、未だ罹患しているとは診断されていない場合に、動物において疾患状態が発生するのを防止すること；（ｉｉ）疾患状態を阻害すること、即ちその進行を部分的または完全に停止させること；（ｉｉｉ）疾患状態を軽減すること、即ち疾患状態の症状の後退をもたらすこと、または疾患の症状を改善すること；および（ｉｖ）疾患状態の逆転または後退、好ましくは疾患の消失または治癒。本発明の好ましい態様において、動物は、哺乳動物、好ましくは霊長類、より好ましくはヒトである。当該分野において知られているように、全身対局所的送達、年齢、体重、全体的な健康状態、性別、食事、投与の時間、薬物の相互作用および状態の重篤度についての調整が必要であり得て、当業者による常習的な実験で決定することができる。
【０１９２】
本発明の好ましい態様において、ヒストンデアセチラーゼ阻害剤は、全ての特異的ヒストンデアセチラーゼアイソフォームより少ない、１種または２種以上のヒストンデアセチラーゼアイソフォームを阻害する。好ましいヒストンデアセチラーゼアイソフォームは、クラスＩおよびクラスＩＩ酵素に対する遺伝子を含む。特異的ＨＤＡＣ遺伝子としては、ＲＰＤ３、ＨＯＳ１、ＨＯＳ２、ＨＤＡ１、ＨＯＳ３、ＳＩＲ２およびＨＳＴ遺伝子、ならびのそれらの相同体が挙げられるが、これに限定されない。本発明の好ましい態様において、ヒストンデアセチラーゼはＨＯＳ２を阻害する。
【０１９３】
本発明は、純粋に哺乳動物への用途には限定されず、例えば農業および水産用途を包含し、例えば哺乳動物、魚類および植物の真菌感染の処置のための方法を含む。Smith and Edlind（上記）には、ＴＳＡが、エルゴステロール生合成経路がアリルアミンおよびアゾールのそれに従う農業用殺真菌剤であるモルホリン、フェンプロピモルフ（fenpropimorph）の最小阻害濃度を低下させたことが示されている。
【０１９４】
本発明は、以下の例を参照することによりさらに容易に理解されるが、これらは、本発明の範囲を限定するのではなく、本発明を例示するために示される。
【０１９５】
例１
酵母ＨＤＡＣ欠失株の生成
ＰＣＲ生成欠失戦略を用いて、各酵母の開始コドンから終止コドンまでのオープン・リーディング・フレームを、ＫａｎＭＸモジュールおよび２つのユニークな２０マー分子バーコードで系統的に置き換えた（Wach et al., Yeast 10: 1793-1808 (1994)参照）。この戦略および可能性のある結果を、それぞれ図１および図２に示す。タグの存在は、高密度のオリゴヌクレオチドアレイへのハイブリッド形成を介して検出することができ、これにより個々の株の増殖表現型が平行して解析できる。ＨＯＳ２欠失「カセット」を、２つの連続ＰＣＲ反応を用いて構成した。
【０１９６】
最初の増幅において、７４ｂｐのＵＰＴＡＧ
【化６】
プライマーを用いて、酵母ＲＰＤ３ヘテロ接合変異体（ＡＴＣＣより購入）から抽出したゲノムＤＮＡから、ＫａｎＭＸ遺伝子を増幅した；この変異体は、ＫａｎＭＸ発現が酵母に対してジェネティシン（Ｇ４１８）の優先選択を与えるｋａｎＭＸ４のＤＮＡを含む。これらのプライマーは以下からなる：ＯＲＦの５’または３’端（それぞれ開始コドンと終止コドンに直接隣接および遠位にある）のどちらかの横に位置する（５’：３’）：１８ｂｐのゲノム配列；全てのゲノム破壊に共通する１８および１７ｂｐの配列（U1: 5'-GATGTCCACGAGGTCTCT-3'またはD1: 5'-CGGTGTCGGTCTCGTAG-3'）；それぞれＫａｎＭＸカセットに相同性の、２０ｂｐのユニーク配列（「分子バーコード」ＴＡＧ）ならびに１８および１９ｂｐの配列（U2: 5'- CGTACGCTGCAGGTCGAC-3'またはD2: 5'-ATCGATGAATTCGAGCTCG -3'）。ＰＣＲは次のパラメータを用いて実施した：９４℃で３分間の変性；９４℃で３０秒間、５０℃で３０秒間、７２℃で２．５分間、３５サイクル；次に７２℃で１０分間の伸長（extension）。
【０１９７】
第２のＰＣＲ反応において、２つのＯＲＦ特異的４５マープライマー（UP_45およびDOWN_45）
【化７】
を用いて、ＯＲＦ特異的相同体を４５ｂｐに延長し、遺伝子破壊用カセットの有糸分裂組換えの間の標的特異性を増加させた。ＰＣＲは上記のようにして実施した。
【０１９８】
標準のリチウム−酢酸形質転換プロトコル（Gietz and Woods, Methods in Enzymology 350: 87-96 (2002)参照）を用いて、遺伝子破壊用カセットをハプロイド酵母細胞（BY4742: MATa his3D1 leu2D0 lys2D0 ura3D0）に導入した。
他のＨＤＡＣ欠失変異体は、同様の戦略に従い、それぞれ次のプライマーを用いて調製した。
【０１９９】
【化８】
【０２００】
【化９】
【０２０１】
例２
欠失変異株の抗真菌化合物感受性
標準の連続希釈技術を用いて、酵母欠失株の、種々の抗真菌剤に対する感受性を決定した。図３は、ＳｃＲＰＤ３欠失変異体が、ケトコナゾールまたはフルコナゾールに対して高感受性ではないことを示す。図４は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体が、ケトコナゾールに対して高感受性であることを示す。図５は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体が、イトラコナゾールに対して高感受性であることを示す。図６は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体が、ボリコナゾールに対して高感受性であることを示す。図７は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体が、フルコナゾールに対して高感受性であることを示す。図８は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体が、フェンプロピモルフに対して高感受性であることを示す。図９は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体が、テルビナジンに対して高感受性ではないことを示す。図１０は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体が、アムホテリシンＢに対して高感受性ではないことを示す。図１１は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体が、５−フルオロシトシンに対して高感受性ではないことを示す。図１２は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体が、ニッコーマイシンに対して高感受性ではないことを示す。図１３は、ＳｃＨＯＳ３およびＳｃＨｄａｌ欠失変異体が、イトラコナゾールに対して高感受性ではないことを示す。ＳｃＨＯＳ３およびＳｃＨｄａｌ欠失変異体はまた、他のアゾール類に対しても高感受性ではなかった（データ示さず）。
【０２０２】
組換えＨｉｓ６Ｖ５−タグＨｏｓ２ｐのS. cerevisiaeからの構成および発現
S. cerevisiaeからＹＧＬ１９４Ｃ／ＨＯＳ２をコーディングするＯＲＦ（終止コドンの上流１〜４５２残基）を、ＢＹ４７４２株（ATCC201389）から単離したゲノムＤＮＡおよび次のプライマーを用いて、ＴａｑＤＮＡポリメラーゼ（Invitrogen）でＰＣＲ増幅した：
【化１０】
ＰＣＲ増幅は次のようにして行った：９４℃で２分間の変性、続いてタッチアップＰＣＲ（９４℃で１分間の変性、４５〜５３℃で１分間のハイブリッド形成、この間各サイクル間で１．５分間に３℃の増加あり、７２℃での増幅）、続いて９４℃で１分間の変性、５３℃で１分間のハイブリッド形成、および７２℃で１．５分間の増幅を３０サイクル。〜１．４ｋｂのＰＣＲ産物をゲル精製し、ｐＹＥＳ２．１／Ｖ５−Ｈｉｓ−ＴＯＰＯベクターＴＯＰＯへのクローニングおよび続くＴＯＰ１０ One Shot Chemically Competent E. coliへの形質転換に用いたが、これはｐＹＥＳ２．１ＴＯＰＯ ＴＡ発現キット（Invitrogen, cat. #K4150-01）を製造業者の指示に従って用いて行った。ＨＯＳ２．Ｖ５−Ｈｉｓ６インサートの存在を形質転換物内でＰＣＲにより解析したが、これには、プライマーＭＹＧ１２１３およびＭＹＧ１２１２を、ｐＹＥＳ２．１ＴＯＰＯ ＴＡ発現キットと共に提供されるプライマーV5-Cterm-ReverseおよびGAL1-Forwardとそれぞれ一緒に用いて行った。２つの細菌クローン（ｐＹＥＳ２．１．ＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６＃２および＃７）から単離されたプラスミドｐＹＥＳ２．１．ＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６を用いて、S. cerevisiaeＢＹ４７４２（MATα his3delta1 leu2delta0 lys2delta0 ura3delta0, ATCC 201389）株およびΔｈｏｓ２同系遺伝子欠質株（社内で生成）を、S.c. EasyComp 形質転換キット（Invitrogen, cat. #5050-01）を製造業者の指示に従って用いて形質転換した。形質転換に用いた各プラスミドに対し、全細胞抽出物を、ＢＹ４７４２／ｐＹＥＳ２．１．ＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６およびΔｈｏｓ２／ｐＹＥＳ２．１．ＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６の３種類の個別のクローンから調製し、組換えＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６タンパク質の発現について、抗Ｖ５−ＨＲＰ抗体（Invitrogen, cat. #R961-25）を用いガラクトースによる２４時間の誘発に続いて試験した。ＢＹ４７４２／ｐＹＥＳ２．１．ＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６＃７およびΔｈｏｓ２／ｐＹＥＳ２．１．ＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６＃７株は、さらなる試験のために保持した。
【０２０３】
組換えＨｏｓ２タンパク質の誘発および精製
Ｈｏｓ２ｐ．Ｖ５Ｈｉｓ６発現のガラクトースによる誘発を、グルコースまたはラフィノースのどちらかを炭素源として用いて行い（pYES2.1 TOPO TA Expression Kit Manual, Invitrogen, cat. # K4150-01）、細胞溶解物を、ガラクトースの存在下または不在下で増殖させたＢＹ４７４２／ｐＹＥＳ２．１．ＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６＃７およびΔｈｏｓ２／ｐＹＥＳ２．１．ＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６＃７株から生成したスフェロプラストから調製した。スフェロプラストは、ＹＥＰＤ（ＢＹ４７４２、Δｈｏｓ２）、ＳＣ−ＵＲＡ＋２％グルコースもしくはラフィノース、またはＳＣ−ＵＲＡ＋１％グルコースもしくはラフィノース＋１％ガラクトース（ＢＹ４７４２／ｐＹＥＳ２．１．ＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６＃７およびΔｈｏｓ２／ｐＹＥＳ２．１．ＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６＃７）中で増殖させた細胞から、Franzusoff et al. (1991)によるリチケース（liticase）法を用いて調製した。Ｈｏｓ２ｐＶ５Ｈｉｓ６を含むかまたは含まない断片の収集は、ＩＭＡＣによりHis GraviTrap Affinity Columns（GE Healthcare cat. # 11-033-99）を用いて行った。結合緩衝液は製造業者の推薦に従い、一方、３種類の異なる溶出緩衝液は順番に用いた：２０ｍＭリン酸ナトリウム＋５００ｍＭのＮａＣｌ＋１００ｍＭ、２５０ｍＭまたは５００ｍＭのイミダゾール、ｐＨ７．４。断片はさらに、ＰＤ−１０（GE Healthcare, cat. # 17-0851-01）およびＮＡＰ−５脱塩カラム（GE Healthcare, cat. # 17-0853-02）を用いて脱塩した。１００、２５０または５００ｍＭのイミダゾールを含有する３種類の異なる緩衝液で溶出し、脱塩した断片を、ＨＤＡＣ活性についてアッセイした（以下を参照）。高い内因性ＨＤＡＣ活性を含む対応する断片（２０ｍＭリン酸ナトリウム＋５００ｍＭのＮａＣｌ＋２５０ｍＭイミダゾール）のみを、さらなる試験のために保持した。
【０２０４】
ＨＤＡＣアッセイ
組換えＨｏｓ２ｐ．Ｖ５Ｈｉｓ６を含む断片を、ＨＤＡＣ阻害剤（０〜２０μｇ／ｍｌ）の存在下または不在下で２時間インキュベートした。ガラクトース誘発に続いて発現した組換えＨｏｓ２ｐ．Ｖ５Ｈｉｓ６と特異的に関連するＨＤＡＣ活性は、次の仮定のもとで決定した。
ＦｌｕｏHos2p.V5His6 specific = Ｆｌｕｏ+galactose−Ｆｌｕｏ-galactose
式中、
Ｆｌｕｏ+galactose＝Ｈｏｓ２ｐ．Ｖ５Ｈｉｓ６と共に精製された全ＨＤＡＣに関連するＨＤＡＣ活性
Ｆｌｕｏ+glucose＝Ｈｏｓ２ｐ．Ｖ５Ｈｉｓ６不在で精製された全ＨＤＡＣに関連するＨＤＡＣ活性
【０２０５】
阻害アッセイの結果を表１にまとめる。表に見られるように、精製されたＨｏｓ２タンパク質は、５ｕｇ／ｍｌの化合物４により、６０％より多く阻害された。
【表１】
【０２０６】
組換えＳｃＨｏｓ２タンパク質はイトラコナゾールに対するＨｏｓ２欠失変異体の感受性の克服を支援する
最小阻害濃度（ＭＩＣ）試験を、酵母試験に対するＣＬＳＩ Ｍ２７−Ａ２法にしたがって、２％ラフィノースまたは１％ラフィノースのどちらか＋１％ガラクトースを炭素源として含む、ＣＳＭ−ＵＲＡ培地（完全合成培地からウラシルを引いたもの）を用いて行った。イトラコナゾール濃度は、０．０１〜１０μｇ／ｍｌの範囲であった。ＣＳＭ−ＵＲＡ＋２％ラフィノース、またはＣＳＭ−ＵＲＡ＋１％ラフィノース＋１％ガラクトース中で増殖したログ相の細胞を、５×１０３細胞／ｍｌで播種した。イトラコナゾールのＭＩＣ８０は、３０℃で７２時間後に決定した。
【０２０７】
図１４に示すように、ＷＴ／ＳｃＨＯＳ２とΔｈｏｓ２／ＳｃＨＯＳ２との間には、イトラコナゾールに対する感受性について、ラフィノースの存在下で増殖した場合には４倍の感受性の差があったが、Ｈｏｓ２の発現がガラクトースにより誘発された場合には、感受性の差は２倍であった。
【０２０８】
本発明を、この特定の態様に関連させて記載したが、これは、さらに改変することが可能であり、本出願は、一般的に本発明の原理に従い、本発明が関連する分野内の既知または一般的な実施内にあり、本明細書において前に述べた本質的な特徴に対して適用され得、添付した特許請求の範囲内にある、本開示からの逸脱を含む、本発明のすべての変化、使用または適合を包含することを意図することが、理解される。
【技術分野】
【０００１】
関連出願
本出願は、２００６年８月１１日出願の米国仮出願第60/822,192号の利益を主張する。上記出願の教示全体を、本出願において参考として援用する。
【背景技術】
【０００２】
発明分野
本発明は、抗真菌薬の開発および真菌感染の処置に関する。より詳しくは、本発明は、真菌ヒストンデアセチラーゼを抗真菌薬活性の増強用の標的として用いる方法に関する。本発明はさらに、ヒストンデアセチラーゼ活性に影響する真菌変異を、抗真菌剤として好適な化合物を同定するために用いることに関する。
【０００３】
関連分野の概要
真核細胞において、核ＤＮＡはヒストンと会合して、クロマチンと呼ばれるコンパクトな複合体を形成する。ヒストンは、一般的に真核生物種を通して保存性が高い塩基性タンパク質のファミリーを構成する。Ｈ２Ａ、Ｈ２Ｂ、Ｈ３およびＨ４と呼ばれるコアヒストンは、会合してタンパク質コアを形成する。ＤＮＡは、このタンパク質コアの周囲に巻き付き、ヒストンの塩基性アミノ酸は、ＤＮＡの負に帯電したリン酸基と相互作用する。ＤＮＡの約１４６個の塩基対は、ヒストンコアの周囲を包囲して、クロマチンの反復構造モチーフであるヌクレオソーム粒子を構成する。
【０００４】
Csordas, Biochem. J., 265: 23-38 (1990)には、ヒストンが、ヒストンアセチルトランスフェラーゼ（ＨＡＴ１）により触媒される反応であるＮ末端リシン残基のε−アミノ基の翻訳後アセチル化を受けることが教示されている。アセチル化により、リシン側鎖の正の電荷が中和され、これは、クロマチン構造に影響すると考えられる。実際に、Taunton et al., Science，272：408-411 (1996)には、クロマチン鋳型への転写因子の接近は、ヒストン高アセチル化により増強されることが教示されている。Taunton et al.（上記）はさらに、低アセチル化ヒストンＨ４の濃縮が、ゲノムの転写に関してサイレントな領域において見出されていることを教示している。
【０００５】
ヒストンアセチル化は可逆的修飾であり、脱アセチル化は、ヒストンデアセチラーゼ（ＨＤＡＣ）と呼ばれる酵素のファミリーにより触媒される。ＨＤＡＣ活性を有するタンパク質をコードする遺伝子配列の分子クローニングにより、一組の異なるＨＤＡＣ酵素アイソフォームの存在が立証された。Yang and Gregoire, Mol. Cell. Biol. 25:2873-2884 (2005)には、系統学的分析および酵母Ｒｐｄ３（reduced potassium dependency 3）、Ｈｄａ１およびＳｉｒ２（silent information regulator 2）に対する配列相同性に基づいて、ＨＤＡＣが異なるクラスに分類されることが教示されている。ヒトにおいては１８種の既知のＨＤＡＣがあり、これらは４つのクラスに分けられる：クラスＩ（ＨＤＡＣ１、−２、−３および−８；Ｒｐｄ３と相同）、クラスＩＩ（ＨＤＡＣ４、−５、−６、−７、−９および−１０；Ｈｄａ１に関連する）、クラスＩＩＩ（Ｓｉｒｔ１、−２、−３、−４、−５、−６および−７；Ｓｉｒ２に類似）ならびにクラスＩＶ（ＨＤＡＣ１１）。クラスＩ、ＩＩおよびＩＶのＨＤＡＣは、亜鉛依存性酵素である。クラスＩＩＩのＨＤＡＣは、ＮＡＤ＋依存性デアセチラーゼである。Saccharomyces cerevisiaeにおいては、１０種の既知のＨＤＡＣがあり、これらは３つのクラスに分けられる：クラスＩ（Ｒｐｄ３、Ｈｏｓ１およびＨｏｓ２）、クラスＩＩ（Ｈｄａ１およびＨｏｓ３）、ならびにクラスＩＩＩ（Ｓｉｒ２および４種のＨｓｔタンパク質（Ｈｓｔ１〜Ｈｓｔ４）、Ｓｉｒ２の相同体）。
【０００６】
これらの個別のＨＤＡＣ酵素がどのような役割を果たすのかは、不明であった。Trojer et al., Nucleic Acids Research, 31(14):3971-3981 (2003)には、ＨｄａＡおよびＲｐｄＡが、糸状菌Aspergillus nidulansの全ＨＤＡＣ活性に対する主要な寄与体であり、ＨｄａＡがＨＤＡＣ活性の主要な部分の主な原因となることが示されている。
【０００７】
既知のＨＤＡＣ阻害剤を用いた研究により、アセチル化と遺伝子発現との間の関連が立証された。多くの研究で、ＨＤＡＣと遺伝子発現との間の関係が試験された。Taunton et al., Science 272:408-411 (1996)には、酵母の転写制御因子に関連するヒトＨＤＡＣが開示されている。Cress et al., J. Cell. Phys. 184:1-16 (2000)には、ヒト癌に関連して、ＨＤＡＣの役割が、転写の補助抑制因子としてのものであることが、開示されている。Ng et al., Trends Biochem. Sci. 25:121-126 (2000)には、転写抑制因子系の広汎な特徴としてのＨＤＡＣが開示されている。Magnaghi-Jaulin et al., Prog. Cell Cycle Res. 4:41-47 (2000)には、細胞サイクル進行に重要な転写補助制御因子としてのＨＤＡＣが開示されている。
【０００８】
真菌ヒストンデアセチラーゼについては多数の研究が報告されている。Giaver et al., Nature 418: 387-191 (2002)には、Saccharomyces cerevisiaeにおいて６種のＨＤＡＣ相同体（ＲＰＤ３、ＨＤＡ１、ＨＯＳ１、ＨＯＳ２、ＨＯＳ３およびＳＩＲ２）が開示されており、これらは互いに高度な配列相同性を共有するが、いずれも酵母の増殖および生存に必須ではない。Bernstein et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97: 13708-13713 (2000)には、酵母細胞における各ＨＤＡＣの役割が捕らえにくことが教示されている。Suka et al., Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. 63: 391-399 (1998)には、ＲＰＤ３ｐが、ヒストンＨ４のリジン１６を除く、コアヒストンＨ３、Ｈ４、Ｈ２ＡおよびＨ２Ｂの全リジン類の脱アセチル化に必要であることが教示されている。しかし、Wu et al., Mol. Cell. 7: 117-126 (2001)には、ＨＤＡ１ｐがヒストンＨ２ＢおよびＨ３を特異的に脱アセチル化することが教示されている。対照的にWang et al., Science 298: 1412-1414 (2002)には、Ｈ３およびＨ４ヒストン尾部におけるリジンを特異的に脱アセチル化する場合に、ＨＯＳ２ｐが主に遺伝子活性化の間に遺伝子のコード領域に結合することが教示されている。Wangらはまた、ＨＯＳ２ｐがゲノム全体の高活性の遺伝子に優先的に会合し、ＰＲＤ３ｐと組み合わさって、抗真菌アゾール類の分子標的である、Ｅｒｇ１１のコード領域を脱アセチル化することを教示する。Rundlett et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93: 14503-14508 (1996)およびTrojer et al., Nucleic Acids Res. 31: 3971-3981 (2003)には、S. cerevisiaeＨＯＳ２が、Candida. albicansおよびAspergillus. fumigatusのＨＯＳ２と高度に相同的であることが示されている。
【０００９】
ＨＤＡＣ活性の阻害剤を記載する多くの他の報告が刊行されている。例えば、Richon et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 95: 3003-3007 (1998)には、Streptomyces hygroscopicusから単離された天然の産物であり、Yoshida et al., J. Biol. Chem. 265: 17174-17179 (1990)およびYoshida et al., Exp. Cell Res. 177: 122-131 (1988)によればヒストンデアセチラーゼ活性を阻害し、Ｇ１およびＧ２期において細胞における細胞サイクル進行を停止させることが示されているトリコスタチンＡ（ＴＳＡ）により、および合成化合物であるスベロイル（suberoyl）アニリドヒドロキサム酸（ＳＡＨＡ）により、ＨＤＡＣ活性が阻害されることが開示されている。Yoshida and Beppu, Exper. Cell Res., 177: 122-131 (1988)には、ＴＳＡが、細胞サイクルのＧ１およびＧ２期においてラット線維芽細胞の停止をもたらすことが教示されており、これは、ＨＤＡＣを細胞サイクル調節において関連づける。実際に、Finnin et al., Nature, 401:188-193 (1999）には、ＴＳＡおよびＳＡＨＡが、マウスにおいて細胞増殖を阻害し、最終分化を誘発し、かつ腫瘍の形成を防止することが教示されている。ＨＤＡＣ阻害剤として作用する化合物の他の非限定的例には、WO 01/38322およびWO 01/70675のものが含まれる。Trojer et al.（上記）には、A. nidulansのＨｄａ１酵素は、ＨＤＡＣ阻害剤ＴＳＡに対して高度に感受性であり、一方、ＨｏｓＢは、ＴＳＡおよび他のＨＤＡＣ阻害剤であるＨＣトキシンの両方に対して高度に耐性であることが教示されている。
【００１０】
Smith and Edlind, Antimicrob. Agents and Chemotherapy，46(11):3532-3539 (2002)では、既知のＨＤＡＣのｐａｎ−阻害剤であるＴＳＡ、アピシジン(apicidin)、酪酸ナトリウムおよびトラポキシン(trapoxin)の、選択された真菌種のアゾール抗真菌剤に対する感受性を増強する能力を試験した。彼らは、ＴＳＡのみがC. albicansの感受性を増強できることを見出した。しかし、必要なＴＳＡの濃度は、哺乳動物細胞に有毒な濃度よりも高かった。ＴＳＡは、Candida glabrataの感受性を増強するとは見出されなかった。同時係属中の出願60/751,703の教示によれば、いくつかのＨＤＡＣ阻害剤は、C. albicans, C. glabrataおよびA. fumigatusに対して抗真菌アゾールを増強する。しかし、アゾール抗真菌剤との相乗作用の正確な分子標的および機構は未知のままである。
【００１１】
抗真菌剤の使用およびこれに対する必要性は広範囲であり、動物および植物における真菌感染症の処置から消毒薬製剤、ヒトに用いるための医薬までの範囲にわたる。現在の抗真菌製剤についての主な問題は、感染した宿主に対するこれらの毒性である。これは、多くの真菌感染が、ＡＩＤＳ、または化学療法もしくは臓器移植からなどの衰弱性疾患に対する有利な二次感染症である場合において、特に重要である。したがって、少なくともヒトおよび他の動物に投与されるべきである抗真菌剤について、治療の指標は、好ましくは、毒性が目的の真菌に選択性であり、宿主に対して毒性でない程度である。
【００１２】
Georgopapadakou, Curr. Opin. Microbiol. 1:547-557 (1998)によれば、カンジダ種およびアスペルギルス種などの日和見種により主に引き起こされる重篤な真菌感染症は、免疫低下状態の患者および他の脆弱な患者において、ますます一般的である。これらは、入院患者、ならびにＨＩＶ、癌および移植患者における罹患率および死亡率の重要な原因である。クリプトコッカス真菌感染症もＡＩＤＳ患者に非常に一般的である。カリニ肺炎は、北米およびヨーロッパのＨＩＶ感染患者における主要な死因となっている。
【００１３】
カンジダによる感染症は、一般的に、真菌膜の主な成分であるエルゴステロール合成における必須の酵素であるラノステロールデメチラーゼを標的とする、抗真菌アゾールで処置される。Kaur et al., Antimicrob. Agents Chemother., 48:1600-1613 (2004)の教示によれば、アゾールは静真菌性であり、これらの使用は、アゾール耐性、特に非アルビカンスのカンジダ種、例えばC. glabrataの出現により損なわれ得る。さらに、アゾール処置の結果、「トレーリング発育(trailing growth)」がもたらされ、生存する真菌細胞は、再発のための元（reservoir）となる。抗真菌アゾールの主な限界は、これらに殺真菌活性が欠如していることであり、これは、重篤な易感染性の患者に共通する、処置の失敗の原因となり得る。
【００１４】
Vonberg and Gastmeier J. Hosp. Infect. 63:246-254 (2006)の教示によれば、A. fumigatusは、死亡率６０〜９０％の生命にかかわる疾患である侵襲性アスペルギルス症（ＩＡ）を引き起こす主なアスペルギルス種であり、侵襲性アスペルギルス症の発生率は、免疫低下患者の数の増大のために、過去２０年において著しく増大している。現在の抗真菌剤は、その乏しいin vivo効能および宿主毒性により、ＩＡの処置においては制限される（Latge, Clinical Microbiol. Rev., 12:310-350 (1999)）。
【００１５】
特に衰弱した患者において、多くの場合致命的である他の真菌感染症は、クリプトコッカス症（Cryptococcus neoformansによる感染症）および接合菌症（接合菌類による感染症）を含む。
現在の抗真菌剤、例えばアゾール類についての欠点には、耐性の発生、薬物−薬物相互作用の可能性および有毒な肝臓への影響の可能性が含まれる。
真菌感染症を処置するための新規な組成物および方法を提供することが、非常に望ましい。また、抗真菌化合物に対する真菌感受性を増強するための組成物および方法を提供することが、非常に望ましい。特に重要なことには、宿主に対しては毒性でなく、病原性の真菌に対しては選択的に毒性であるような組成物および方法を提供することが非常に望ましい。したがって、真菌ＨＤＡＣと抗真菌化合物の相乗作用の正確な分子標的および機構を、さらに理解する必要性が存在する。
【発明の概要】
【００１６】
発明の概要
本発明は、真菌ＨＤＡＣと抗真菌化合物の相乗作用の正確な標的および機構について、新しい見識を提供する。
第１の側面において、本発明は、ＨＤＡＣ阻害剤がいかにして抗真菌剤の活性を増強するかを理解するためのモデルを提供する。この側面によれば、本発明は、真菌ＨＤＡＣ遺伝子の選択的ノックアウトを有する真菌株を提供する。これらの株およびその使用は、真菌ＨＤＡＣ ＨＯＳ２およびその遺伝子産物であるＨｏｓ２の、この点に関する重要性を実証する。
【００１７】
第２の側面において、本発明は、抗真菌剤の活性の増強における、ＨＤＡＣ阻害剤の作用の分子標的を提供する。この側面によれば、本発明は、真菌ＨＤＡＣ遺伝子の選択的突然変異を有する、ヒストンデアセチラーゼ真菌変異株を提供する。これらの株およびその使用は、真菌ＨＤＡＣ ＨＯＳ２のこの点に関する重要性を実証する。この側面により、本発明は、ＨＤＡＣ欠失変異真菌株を提供する。この側面により、本発明はＨＯＳ２欠失変異株を提供する。この側面により、本発明は、抗真菌剤の活性の増強におけるＨＤＡＣ阻害剤の作用のための分子標的としての、ＨＯＳ２および／またはＨｏｓ２を提供する。
【００１８】
第３の側面において、本発明は、ＨＤＡＣ変異真菌株を、化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングするための、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするためのアッセイにおいて用いる方法を提供する。この側面により、本発明は、真菌ＨＤＡＣ遺伝子の選択的ノックアウトを有する真菌株を提供する。これらの株およびその使用は、真菌ＨＤＡＣ ＨＯＳ２およびその遺伝子産物の、この点に関する重要性を実証する。この側面により、本発明は、化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングするための、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするための全細胞アッセイを提供する。この側面により、本発明はまた、高スループットスクリーニングアッセイを提供する。
【００１９】
第４の側面において、本発明は、真菌ＨＤＡＣ遺伝子および／または遺伝子産物を、化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングするための、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするためのアッセイにおいて用いる方法を提供する。この側面により、本発明は、化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングするための、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするための、真菌ＨＤＡＣ遺伝子および／または遺伝子産物を提供する。遺伝子および／または遺伝子産物は、真菌ＨＤＡＣ ＨＯＳ２（遺伝子）およびＨｏｓ２（遺伝子産物）の、この点に関する重要性を実証する。この側面により、本発明はまた、高スループットスクリーニングアッセイを提供する。
【００２０】
第５の側面において、本発明は、抗真菌剤を、真菌ＨＤＡＣ阻害剤との潜在的相乗作用について試験するための方法を提供する。本発明のこの側面により、本発明により提供された試験株は、ＨＯＳ２ノックアウトの、他のＨＤＡＣノックアウトおよび野生型株と比べた相対的感受性を評価する能力を提供する。
したがって、第６の側面において、本発明は、本発明の方法により同定される抗真菌化合物を提供する。この側面により、前記抗真菌化合物を含む組成物もさらに提供される。
【００２１】
第７の側面において、本発明は、真菌の増殖を阻害するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む。
【００２２】
第８の側面において、本発明は、抗真菌化合物の存在下における真菌のトレーリング発育を阻害するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む。
【００２３】
第９の側面において、本発明は、抗真菌化合物に対する真菌の耐性を阻害するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む。
【００２４】
第１０の側面において、本発明は、抗真菌化合物の存在下における真菌の生存を阻害するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む。
【００２５】
第１１の側面において、本発明は、抗真菌化合物の抗真菌活性に抵抗する真菌の能力を、低下させるための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む。
【００２６】
第１２の側面において、本発明は、真菌の、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはＨＯＳ２遺伝子産物もしくはその相同体の活性の阻害により増強される抗真菌化合物に対する感受性を増強するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害することを含む。
【００２７】
第１３の側面において、本発明は、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはＨＯＳ２遺伝子産物もしくはその相同体の活性の阻害により増強される抗真菌化合物の、抗真菌活性を増強するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害することを含む。
【００２８】
第１４の側面において、本発明は、真菌感染を有する生物を治療的に処置するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌感染を有する生物において、真菌ＨＯＳ２もしくはその真菌相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、該生物を、その活性がＨＯＳ２もしくはその真菌相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処置することを含む。
【００２９】
第１５の側面において、本発明は、生物において真菌感染を予防するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、該生物を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処置すること、および該生物を、ＨＯＳ２および／またはＨｏｓ２阻害化合物で処置することを含む。
第１６の側面において、本発明は、Ｈｏｓ２もしくはその相同体、または真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の、阻害剤を提供する。この側面の好ましい態様において、Ｈｏｓ２またはその相同体の阻害剤は、ヒドロキサム酸塩化合物である。
【００３０】
第１７の側面において、本発明は、Ｈｏｓ２を阻害する方法であって、Ｈｏｓ２を阻害剤に接触させることを含む、前記方法を提供する。
第１８の側面において、本発明は、Ｈｏｓ２もしくはその相同体の阻害剤、または真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の阻害剤、および薬学的に許容し得る担体を含む、組成物を提供する。
上記は、単に本発明のいくつかの側面を要約するものであり、本質的に限定することを意図しない。これらの側面ならびに他の側面および態様を、以下にさらに完全に説明する。
【図面の簡単な説明】
【００３１】
【図１】図１は、酵母欠失変異体を生成するために用いる戦略の概略図である。
【図２】図２は、図１に示した戦略の（ａ）成功した実施例および（ｂ）不成功の実施例の結果を示す図である。
【図３】図３は、ＳｃＰＲＤ３欠失変異体がケトコナゾールまたはフルコナゾールに対して高感受性ではないことを示す。
【００３２】
【図４】図４は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体がケトコナゾールに対して高感受性であることを示す。
【図５】図５は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体がイトラコナゾールに対して高感受性であることを示す。
【図６】図６は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体がボリコナゾールに対して高感受性であることを示す。
【図７】図７は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体がフルコナゾールに対して高感受性であることを示す。
【００３３】
【図８】図８は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体がフェンプロピモルフに対して高感受性であることを示す。
【図９】図９は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体がテルビナフィンに対して高感受性ではないことを示す。
【図１０】図１０は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体がアムホテリシンＢに対して高感受性ではないことを示す。
【図１１】図１１は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体が５−フルオロシトシンに対して高感受性ではないことを示す。
【００３４】
【図１２】図１２は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体がニッコーマイシンに対して高感受性ではないことを示す。
【図１３】図１３は、ＳｃＨＯＳ３およびＳｃＨｄａｌ欠失変異体がイトラコナゾールに対して高感受性ではないことを示す。
【図１４】図１４は、組換えＳｃＨｏｓ２ｐの、イトラコナゾールに対するΔｈｏｓ２感受性を補足する能力を示す。
【００３５】
好ましい態様の詳細な説明
本発明は、抗真菌薬の開発に関する。より詳しくは、本発明は、真菌ヒストンデアセチラーゼを抗真菌薬活性の増強用の標的として用いる方法に関する。本発明は、真菌ＨＤＡＣと抗真菌化合物の相乗作用の正確な標的および機構について、新しい見識を提供する。この目的を達成するために、本発明は、ＨＤＡＣ阻害剤がいかにして抗真菌化合物の活性を増強するかを理解するための、真菌ＨＤＡＣ遺伝子の選択的ノックアウトを有する真菌株を用いたモデルを提供する。これらの株およびその使用は、真菌ＨＤＡＣ ＨＯＳ２のこの点に関する重要性を実証する。本発明はさらに、抗真菌剤を、真菌ＨＤＡＣ阻害剤との潜在的相乗作用について試験するための方法を提供し、したがって、本発明の方法により同定される抗真菌化合物を提供する。
【００３６】
本明細書中で言及する特許明細書および科学文献は、当業者に有用な知識を確立する。本明細書中で引用する発行された特許、出願および参考文献を、各々が具体的かつ個々に参考として援用されるものとする場合と同等の程度で、本明細書において参考として援用する。矛盾する場合には、本開示が優先する。
【００３７】
第１の側面において、本発明は、ＨＤＡＣ阻害剤がいかにして抗真菌剤の活性を増強するかを理解するためのモデルを提供する。この側面によれば、本発明は真菌ＨＤＡＣ遺伝子各々の選択的ノックアウトを有する真菌株を提供する。これらの株およびその使用は、真菌ＨＤＡＣ ＨＯＳ２のこの点に関する重要性を実証する。このモデルを提供する真菌株は、ＲＰＤ３、ＨＤＡ１、ＨＯＳ１、ＨＯＳ２、ＨＯＳ３またはＳＩＲ２の単一ノックアウトを有するS. cerevisiae株を含み、これらは好ましくは、本明細書にさらに記載されるようにして調製される。
【００３８】
第２の側面において、本発明は、抗真菌剤の活性の増強におけるＨＤＡＣ阻害剤の作用の、分子標的を提供する。この側面によれば、本発明は、真菌ＨＤＡＣ遺伝子の選択的突然変異を有する、ヒストンデアセチラーゼ真菌変異株を提供する。これらの株およびその使用は、真菌ＨＤＡＣ ＨＯＳ２の、この点に関する重要性を実証する。この側面により、本発明は、ＨＤＡＣ欠失変異真菌株を提供する。この側面により、本発明は、ＨＯＳ２欠失変異株を提供する。この側面により、本発明は、抗真菌剤の活性の増強におけるＨＤＡＣ阻害剤の作用のための分子標的としての、ＨＯＳ２およびまたはＨｏｓ２を提供する。
【００３９】
本発明のこの側面による好ましい態様において、ヒストンデアセチラーゼ真菌変異株は、真菌ＨＤＡＣ遺伝子の発現を阻害または防止する、選択的突然変異を有する。本発明のこの側面による好ましい態様において、選択的突然変異は、阻害されたＨＤＡＣ活性を有する遺伝子産物の発現を提供する。この側面による好ましい態様において、選択的突然変異は、不活性なＨＤＡＣ酵素の発現を提供する。本発明のこの側面による好ましい態様において、ヒストンデアセチラーゼ遺伝子はＨＯＳ２またはその相同体である。本発明のこの側面による好ましい態様において、遺伝子産物はＨｏｓ２またはその相同体である。
【００４０】
本発明のこの側面による好ましい態様において、真菌株はS. cerevisiae真菌株である。本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌株は、他の生物、好ましくは哺乳類、より好ましくはヒトに感染可能な真菌株である。本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌株は病原真菌株である。本発明のこの側面による他の好ましい態様において、病原真菌株は哺乳類病原体、好ましくはヒト病原体である。
【００４１】
この側面による好ましい態様において、真菌株は、S. cerevisiae真菌株、カンジダ種真菌株（好ましくはC. albicans真菌株、C. glabrata真菌株、C. krusei真菌株、C. parapsilosis真菌株、またはC. tropicalis真菌株）、アスペルギルス種真菌株（好ましくはA. fumigatus真菌株、A. niger真菌株、およびA. flavus真菌株）、Cryptococcus neoformans真菌株およびPneumocystis carinii真菌株からなる群から選択される。
【００４２】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（限定することなく、Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含む）、新生カビ（emerging mold）（限定することなく、Pseudallescheria boydii、フサリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含む）、コクシジオイデス種（限定することなく、C. immitisを含む）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、ならびにこの群のそれらの株から選択される。
【００４３】
第３の側面において、本発明は、ＨＤＡＣ変異真菌株を、化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングするための、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするためのアッセイにおいて用いる方法を提供する。この側面により、本発明は、真菌ＨＤＡＣ遺伝子の選択的ノックアウトを有する真菌株を提供する。これらの株およびその使用は、真菌ＨＤＡＣ ＨＯＳ２およびその遺伝子産物の、この点に関する重要性を実証する。この側面により、本発明は、化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングするための、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするための全細胞アッセイを提供する。この側面により、本発明はまた、高スループットスクリーニングアッセイを提供する。
【００４４】
本発明のこの側面による好ましい態様において、方法は、化合物をその抗真菌活性についてスクリーニングすることを含む。好ましい態様において、方法は、ＨＤＡＣ遺伝子もしくはその相同体またはＨＤＡＣ遺伝子産物もしくはその相同体の阻害により増強されるところの潜在的抗真菌活性を有する化合物を同定する。本発明のこの側面による好ましい態様において、方法は、ＨＤＡＣ変異真菌株を提供することを含み、ここで突然変異は、それによりコーディングされるタンパク質の機能の欠失をもたらし、およびＨＤＡＣ変異真菌株を化合物と接触させることを含み、ここで、ＨＤＡＣ変異真菌株の試験化合物に対する感受性が、化合物を、ＨＤＡＣ遺伝子もしくはその相同体またはＨＤＡＣ遺伝子産物もしくはその相同体の阻害により増強されるところの潜在的抗真菌活性を有するものとして、同定する。好ましい態様において、方法はさらに、非ＨＤＡＣ変異真菌株を、好ましくは野生型株を化合物と接触させることを含み、ここで、非ＨＤＡＣ変異株の感受性と比較した、ＨＤＡＣ変異株の感受性が、化合物を、ＨＤＡＣ遺伝子もしくはその相同体またはＨＤＡＣ遺伝子産物もしくはその相同体の阻害により増強されるところの潜在的抗真菌活性を有するものとして同定する。
【００４５】
随意に、潜在的抗真菌活性であって、該活性がＨＤＡＣ遺伝子もしくはその相同体、またはＨＤＡＣ遺伝子産物もしくはその相同体の阻害により増強されるものを有する化合物を同定する方法のステップは、第２ＨＤＡＣ変異真菌株により繰り返すことができる。第２ＨＤＡＣ変異真菌株は第１株と種または属が異なり、第１株の変異遺伝子と相同な遺伝子を有し、該相同遺伝子は、類似の突然変異を有している。
【００４６】
試験化合物に対する感受性は、好ましくは、真菌株の死滅、真菌株の増殖の阻害、真菌株の死滅の代理マーカーの増加、または増殖の代理マーカーの減少を測定することにより得られる。
【００４７】
第４の側面において、本発明は、真菌ＨＤＡＣ遺伝子および／または遺伝子産物を、化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングするための、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするためのアッセイにおいて用いる方法を提供する。この側面により、本発明は、化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングするための、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするための、真菌ＨＤＡＣ遺伝子および／または遺伝子産物を提供する。遺伝子および／または遺伝子産物は、真菌ＨＤＡＣ ＨＯＳ２（遺伝子）およびＨｏｓ２（遺伝子産物）の、この点に関する重要性を実証する。この側面により、本発明はまた、高スループットスクリーニングアッセイを提供する。
【００４８】
本発明のこの側面による好ましい態様において、方法は、化合物をその抗真菌活性についてスクリーニングすること、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングすることを含む。好ましい態様において、方法は、真菌ＨＤＡＣ遺伝子もしくはその相同体、または真菌ＨＤＡＣ遺伝子産物もしくはその相同体を阻害する化合物を同定する。本発明のこの側面による好ましい態様において、方法は、真菌ＨＤＡＣタンパク質もしくはその相同体またはその活性断片を提供すること、およびタンパク質もしくはその相同体またはその活性断片を、化合物と接触させることを含み、ここでタンパク質もしくはその相同体またはその活性断片のＨＤＡＣ活性の阻害は、化合物を、潜在的抗真菌活性を有するか、または抗真菌活性剤の抗真菌活性を増強する能力を有する化合物として同定する。好ましい態様において、真菌ＨＤＡＣタンパク質は、ＨＯＳ２もしくはその相同体またはその活性断片である。好ましい態様において、方法はさらに、非ＨＤＡＣ変異真菌株を、好ましくは野生型株を、化合物と接触させることを含み、ここで非ＨＤＡＣ変異株の感受性は、化合物を潜在的抗真菌活性を有するものとして同定する。好ましい態様において、方法は随意に、非ＨＤＡＣ変異真菌株を、好ましくは野生型株を、化合物および抗真菌剤と接触させることを含み、ここで、抗真菌剤のみの存在下での前記株の感受性と比較した、化合物および抗真菌剤の存在下での前記株の感受性は、化合物を、抗真菌剤の抗真菌活性を増強する能力を有する化合物として同定する。
【００４９】
試験化合物に対する感受性は、好ましくは、真菌株の死滅、真菌株の増殖の阻害、真菌株の死滅もしくは増殖阻害の代理マーカーの増加、または真菌株の増殖の代理マーカーの減少を測定することにより得られる。
【００５０】
随意に、真菌ＨＤＡＣ遺伝子および／または遺伝子産物を、化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングする、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするアッセイにおいて用いる方法のステップは、第２真菌株からのＨＤＡＣ酵素を用いて繰り返すことができる。第２真菌株は、第１株とは種または属が異なり、第１株の酵素に類似した酵素を有する。
【００５１】
第５の側面において、本発明は、抗真菌剤を、真菌ＨＤＡＣ阻害剤との、特にＨＯＳ２の阻害剤もしくはその相同体またはＨｏｓ２もしくはその相同体との、潜在的相乗作用について試験するための方法を提供する。本発明のこの側面により、本発明により提供された試験株は、ＨＯＳ２ノックアウトの、他のＨＤＡＣノックアウトおよび野生型株と比べた相対的感受性を評価する能力を提供する。
【００５２】
本発明のこの側面による好ましい態様において、方法は、ＨＯＳ２ノックアウト真菌株を提供すること、ノックアウト変異株を試験化合物で処理すること、ＨＯＳ２ノックアウト真菌株の試験化合物に対する感受性を決定すること、野生型株、ＲＰＤ３ノックアウト変異株、ＨＤＡ１ノックアウト変異株、ＨＯＳ１ノックアウト変異株、ＨＯＳ３ノックアウト変異株およびＳＩＲ２ノックアウト変異株からなる群から選択される１種または２種以上の対照真菌株を提供すること、１種または２種以上の対照真菌株を試験化合物で処理すること、１種または２種以上の対照株の試験化合物に対する感受性を決定すること、およびＨＯＳ２ノックアウト株の試験化合物に対する感受性を、１種または２種以上の対照株の試験株に対する感受性と比較することを含む。ＨＯＳ２ノックアウト変異株が試験化合物に対して、１種または２種以上の対照株より感受性が高ければ、試験化合物は、ＨＯＳ２阻害剤との相乗作用を有する抗真菌化合物であると考えられる。
【００５３】
試験化合物に対する感受性は、好ましくは、真菌株の死滅、真菌株の増殖の阻害、真菌株の死滅もしくは増殖阻害の代理マーカーの増加、または真菌株の増殖の代理マーカーの減少を測定することにより得られる。
【００５４】
「ノックアウト変異株」の用語は、ＨＤＡＣ遺伝子によりコーディングされるタンパク質の機能の損失をもたらす突然変異を含む、真菌株を意味することを意図する。かかる突然変異は、限定することなく、点突然変異、欠失突然変異、挿入突然変異および逆位（inversion）を含む。かかる突然変異は、ＨＤＡＣ遺伝子またはその相同体によりコーディングされる遺伝子産物の機能の損失をもたらす限り、コーディング領域または非コーディング領域にあってよい。
したがって、第６の側面において、本発明は、本発明の方法により同定される抗真菌化合物を提供する。この側面により、前記抗真菌化合物を含む組成物もさらに提供される。
【００５５】
第７の側面において、本発明は、真菌の増殖を阻害するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む。
【００５６】
この側面による好ましい態様において、真菌は、S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis cariniiからなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００５７】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００５８】
本発明のこの側面による好ましい態様において、抗真菌化合物は、エルゴステロール合成を阻害する化合物である。他の好ましい態様において、抗真菌化合物は、抗真菌アゾール化合物である。好ましいアゾールは、イミダゾールおよびトリアゾールを含む。より好ましいアゾールは、限定はされないが、ケトコナゾール、イトラコナゾール、フルコナゾール、ボリコナゾール、ポサコナゾール、ラブコナゾール、またはミコナゾールを含む。他の好ましい態様において、化合物はフェンプロピモルフである。
【００５９】
第８の側面において、本発明は、抗真菌化合物の存在下における真菌のトレーリング発育を阻害するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む。
【００６０】
この側面による好ましい態様において、真菌は、S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis cariniiからなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００６１】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００６２】
本発明のこの側面による好ましい態様において、抗真菌化合物は、エルゴステロール合成を阻害する化合物である。他の好ましい態様において、抗真菌化合物は、抗真菌アゾール化合物である。好ましいアゾールは、イミダゾールおよびトリアゾールを含む。より好ましいアゾールは、限定はされないが、ケトコナゾール、イトラコナゾール、フルコナゾール、ボリコナゾール、ポサコナゾール、ラブコナゾール、またはミコナゾールを含む。他の好ましい態様において、化合物はフェンプロピモルフである。
【００６３】
第９の側面において、本発明は、抗真菌化合物に対する真菌の耐性を阻害するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む。
【００６４】
この側面による好ましい態様において、真菌は、S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis cariniiからなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００６５】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００６６】
本発明のこの側面による好ましい態様において、抗真菌化合物は、エルゴステロール合成を阻害する化合物である。他の好ましい態様において、抗真菌化合物は、抗真菌アゾール化合物である。好ましいアゾールは、イミダゾールおよびトリアゾールを含む。より好ましいアゾールは、限定はされないが、ケトコナゾール、イトラコナゾール、フルコナゾール、ボリコナゾール、ポサコナゾール、ラブコナゾール、またはミコナゾールを含む。他の好ましい態様において、化合物はフェンプロピモルフである。
【００６７】
第１０の側面において、本発明は、抗真菌化合物の存在下における真菌の生存を阻害するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む。
【００６８】
この側面による好ましい態様において、真菌は、S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis cariniiからなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００６９】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００７０】
本発明のこの側面による好ましい態様において、抗真菌化合物は、エルゴステロール合成を阻害する化合物である。他の好ましい態様において、抗真菌化合物は、抗真菌アゾール化合物である。好ましいアゾールは、イミダゾールおよびトリアゾールを含む。より好ましいアゾールは、限定はされないが、ケトコナゾール、イトラコナゾール、フルコナゾール、ボリコナゾール、ポサコナゾール、ラブコナゾール、またはミコナゾールを含む。他の好ましい態様において、化合物はフェンプロピモルフである。
【００７１】
第１１の側面において、本発明は、抗真菌化合物の抗真菌活性に抵抗する、真菌の能力を低下させるための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む。
【００７２】
この側面による好ましい態様において、真菌は、S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis cariniiからなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００７３】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００７４】
本発明のこの側面による好ましい態様において、抗真菌化合物は、エルゴステロール合成を阻害する化合物である。他の好ましい態様において、抗真菌化合物は、抗真菌アゾール化合物である。好ましいアゾールは、イミダゾールおよびトリアゾールを含む。より好ましいアゾールは、限定はされないが、ケトコナゾール、イトラコナゾール、フルコナゾール、ボリコナゾール、ポサコナゾール、ラブコナゾール、またはミコナゾールを含む。他の好ましい態様において、化合物はフェンプロピモルフである。
【００７５】
第１２の側面において、本発明は、真菌の、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはＨＯＳ２遺伝子産物もしくはその相同体の活性の阻害により増強される抗真菌化合物に対する感受性を増強するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害することを含む。
【００７６】
この側面による好ましい態様において、真菌は、S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis cariniiからなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００７７】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００７８】
本発明のこの側面による好ましい態様において、抗真菌化合物は、エルゴステロール合成を阻害する化合物である。他の好ましい態様において、抗真菌化合物は、抗真菌アゾール化合物である。好ましいアゾールは、イミダゾールおよびトリアゾールを含む。より好ましいアゾールは、限定はされないが、ケトコナゾール、イトラコナゾール、フルコナゾール、ボリコナゾール、ポサコナゾール、ラブコナゾール、またはミコナゾールを含む。他の好ましい態様において、化合物はフェンプロピモルフである。
【００７９】
第１３の側面において、本発明は、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはＨＯＳ２遺伝子産物もしくはその相同体の活性の阻害により増強される抗真菌化合物の、抗真菌活性を増強するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害することを含む。
【００８０】
この側面による好ましい態様において、真菌は、S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis cariniiからなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００８１】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００８２】
本発明のこの側面による好ましい態様において、抗真菌化合物は、エルゴステロール合成を阻害する化合物である。他の好ましい態様において、抗真菌化合物は、抗真菌アゾール化合物である。好ましいアゾールは、イミダゾールおよびトリアゾールを含む。より好ましいアゾールは、限定はされないが、ケトコナゾール、イトラコナゾール、フルコナゾール、ボリコナゾール、ポサコナゾール、ラブコナゾール、またはミコナゾールを含む。他の好ましい態様において、化合物はフェンプロピモルフである。
【００８３】
第１４の側面において、本発明は、真菌感染を有する生物を治療的に処置するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、真菌感染を有する生物において、真菌ＨＯＳ２もしくはその真菌相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、該生物を、その活性がＨＯＳ２もしくはその真菌相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処置することを含む。
【００８４】
この側面による好ましい態様において、真菌は、S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis cariniiからなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００８５】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００８６】
本発明のこの側面による好ましい態様において、抗真菌化合物は、エルゴステロール合成を阻害する化合物である。他の好ましい態様において、抗真菌化合物は、抗真菌アゾール化合物である。好ましいアゾールは、イミダゾールおよびトリアゾールを含む。より好ましいアゾールは、限定はされないが、ケトコナゾール、イトラコナゾール、フルコナゾール、ボリコナゾール、ポサコナゾール、ラブコナゾール、またはミコナゾールを含む。他の好ましい態様において、化合物はフェンプロピモルフである。
【００８７】
この側面による好ましい態様において、生物は植物または動物であり、好ましくは哺乳動物であり、さらに好ましくはヒトである。本発明のこの側面による好ましい態様において、真菌ＨＯＳ２もしくはその真菌相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害することは、ＨＤＡＣの阻害剤を、これを必要とする生物に投与することを含む。
【００８８】
第１５の側面において、本発明は、生物において真菌感染を予防するための方法を提供する。本発明のこの側面による方法は、該生物を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処置すること、および該生物を、ＨＯＳ２および／またはＨｏｓ２阻害化合物で処置することを含む。
【００８９】
この側面による好ましい態様において、真菌は、S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis cariniiからなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００９０】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００９１】
本発明のこの側面による好ましい態様において、抗真菌化合物は、エルゴステロール合成を阻害する化合物である。他の好ましい態様において、抗真菌化合物は、抗真菌アゾール化合物である。好ましいアゾールは、イミダゾールおよびトリアゾールを含む。より好ましいアゾールは、限定はされないが、ケトコナゾール、イトラコナゾール、フルコナゾール、ボリコナゾール、ポサコナゾール、ラブコナゾール、またはミコナゾールを含む。他の好ましい態様において、化合物はフェンプロピモルフである。
【００９２】
第１６の側面において、本発明は、Ｈｏｓ２の阻害剤を提供する。この側面の好ましい態様において、阻害剤はヒドロキサム酸塩化合物である。
【００９３】
第１７の側面において、本発明は、Ｈｏｓ２をＨｏｓ２の阻害剤に接触させることを含む、Ｈｏｓ２を阻害する方法を提供する。この側面の好ましい態様において、Ｈｏｓ２は細胞中にあり、方法は、細胞を阻害剤と接触させることを含む。他の好ましい態様において、細胞は、他の生物（好ましくは哺乳動物または植物、さらに好ましくはヒト）の中または上にある真菌細胞であり、方法は、Ｈｏｓ２の阻害剤を他の生物に投与することを含む。本発明のこの側面の好ましい態様において、Ｈｏｓ２の阻害剤は、本明細書に記載の化合物である。
【００９４】
この側面による好ましい態様において、真菌は、S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis cariniiからなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００９５】
本発明のこの側面による他の好ましい態様において、真菌は、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種およびPaecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種および皮膚糸状菌からなる群、およびこの群のそれらの株から選択される。
【００９６】
本発明による好ましい態様において、ＨＤＡＣ阻害剤は、ＨＤＡＣ遺伝子発現の阻害剤である。本発明による他の好ましい態様において、ＨＤＡＣ阻害剤は、ＨＤＡＣ遺伝子産物の、より好ましくは酵素の活性の阻害剤である。
【００９７】
意外にも、ＨＯＳ２欠失変異体は、各々がラノステロール１４ａ−デメチラーゼ（Ｅｒｇ１１）を標的とする抗真菌アゾールである、イトラコナゾール、ケトコナゾール、フルコナゾールおよびボリコナゾールに対して高感受性を示した。しかし、エルゴステロール生合成経路に作用しない抗真菌剤、例えばアムホテリシンＢ、５−フルオロシトシンおよびニッコーマイシンに対しては高感受性を示さなかった。したがって、ある好ましい態様において、本発明のこの側面による試験化合物は、エルゴステロール生合成経路に作用する化合物を含む。
【００９８】
機能性ＨＯＳ２の不在が抗真菌化合物の活性を増強するとの発見は、さらに、抗真菌化合物の増強剤を同定する方法を提供する。方法は、真菌株に試験化合物を投与すること、試験化合物がＨＯＳ２の発現を阻害するかどうかを決定すること、および、試験化合物がＨＯＳ２を阻害した場合に、試験化合物を抗真菌化合物の増強剤として同定することを含む。
【００９９】
抗真菌化合物は、これが、上記の方法によってＨＯＳ２阻害剤との相乗作用を有する化合物として同定されるか、または同定され得る場合に、ＨＯＳ２発現の阻害またはＨｏｓ２活性の阻害により増強されると考えられる。
本発明において、以下の用語を次に定義する。本明細書に具体的に開示されていない他の全ての定義は、同時係属出願60/751,703に記載されているものと同様とする。
【０１００】
本明細書中「化学式（Ａ）、化学式（Ｂ）等で表される化合物」（または言い換えると、「本発明の化合物」など）の言及は、他の指示がない限り、そのＮ−オキシド、水和物、溶媒和物、薬学的に許容し得る塩、プロドラッグおよび複合体、ならびにそのラセミ混合物およびスケールミック（scalemic）混合物、ジアステレオマー、エナンチオマーおよび互変異性体への言及を含むと理解される。
【０１０１】
単純化のために、化学的部分を、主に１価の化学的部分（例えばアルキル、アリールなど）として全体を通して定義および言及する。しかし、このような用語はまた、当業者には明らかな適切な構造的状況の下で、対応する多価の部分を示すためにも用いられる。例えば、「アルキル」部分が一般に１価の基（例えばＣＨ３−ＣＨ２−）を指す一方、ある特定の状況においては、２価の結合部分を「アルキル」とすることができ、この場合においては、当業者は、アルキルが２価のラジカル（例えば−ＣＨ２−ＣＨ２−）であり、これは、用語「アルキレン」と同意義であると理解する。（同様に、２価の部分が必要であり、「アリール」であると述べられている状況においては、当業者は、用語「アリール」は、対応する２価の部分であるアリーレンを表すことを理解する）。すべての原子は、結合の形成についてこれらの通常の原子価の数を有すると理解される（即ち、炭素については４、Ｎについては３、Ｏについては２、およびＳについてはＳの酸化状態に依存して２、４または６）。時々、部分を、例えば、（Ａ）ａ−Ｂ−であり、式中ａは０または１である、と定義してもよい。このような例において、ａが０である場合には、当該部分はＢ−であり、ａが１である場合には、当該部分はＡ−Ｂ−である。また、ここに開示された多数の部分は、複数の互変異性形態で存在してもよく、これらは全て、任意の与えられた互変異性構造により包含されることが意図される。
【０１０２】
単純化のために、「Ｃｎ〜Ｃｍ」ヘテロシクリルまたは「Ｃｎ〜Ｃｍ」ヘテロアリールへの言及は、「ｎ個」〜「ｍ個」の環原子を有し、ここで「ｎ」および「ｍ」は整数であるヘテロシクリルまたはヘテロアリールを意味する。したがって、例えば、Ｃ５〜Ｃ６ヘテロシクリルは、少なくとも１個のヘテロ原子を有する５員環または６員環であり、ピロリジニル（Ｃ５）およびピペリジニル（Ｃ６）を含む；Ｃ６ヘテロアリールは、例えばピリジルおよびピリミジルを含む。
【０１０３】
用語「ヒドロカルビル」は、直鎖、分枝、または環式アルキル、アルケニル、またはアルキニルを指し、各々は本明細書に定義された通りである。「Ｃ０」ヒドロカルビルは、共有結合を指すために用いられる。したがって「Ｃ０〜Ｃ３−ヒドロカルビル」は、共有結合、メチル、エチル、エテニル、エチニル、プロピル、プロペニル、プロピニル、およびシクロプロピルを含む。
用語「脂肪族」は、飽和および不飽和両方の、直鎖または分枝脂肪族炭化水素を意味することが意図される。当業者が理解するように、本明細書において「脂肪族」は、限定することなく、アルキル、アルケニルまたはアルキニル部分を含むことが意図される。
【０１０４】
用語「アルキル」は、１〜１２個の炭素原子、好ましくは１〜８個の炭素原子、より好ましくは１〜６個の炭素原子を有する直鎖または分枝の脂肪族基を意味することを意図する。他の好ましいアルキル基は、２〜１２個の炭素原子、好ましくは２〜８個の炭素原子、より好ましくは２〜６個の炭素原子を有する。好ましいアルキル基として、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、イソブチル、ｓｅｃ−ブチル、ｔｅｒｔ−ブチル、ペンチル、ヘキシルなどが挙げられるがこれらに限定されない。「Ｃ０」アルキル（「Ｃ０〜Ｃ３アルキル」におけるもののように）は、共有結合である。
【０１０５】
用語「アルケニル」は、２〜１２個の炭素原子、好ましくは２〜８個の炭素原子、より好ましくは２〜６個の炭素原子を有する、１つまたは２つ以上の炭素−炭素二重結合を有する不飽和の直鎖または分枝の脂肪族基を意味することを意図する。好ましいアルケニル基として、エテニル、プロペニル、ブテニル、ペンテニルおよびヘキセニルが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１０６】
用語「アルキニル」は、２〜１２個の炭素原子、好ましくは２〜８個の炭素原子、より好ましくは２〜６個の炭素原子を有する、１つまたは２つ以上の炭素−炭素三重結合を有する不飽和の直鎖または分枝の脂肪族基を意味することを意図する。好ましいアルキニル基として、エチニル、プロピニル、ブチニル、ペンチニルおよびヘキシニルが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１０７】
本明細書中で用いられる場合、用語「アルキレン」、「アルケニレン」または「アルキニレン」は、それぞれ、２つの他の化学的基の間に位置してこれらを結合させる作用を奏する、上記で定義したアルキル、アルケニルまたはアルキニル基を意味することを意図する。好ましいアルキレン基として、メチレン、エチレン、プロピレンおよびブチレンが挙げられるが、これらに限定されない。好ましいアルケニレン基として、エテニレン、プロペニレンおよびブテニレンが挙げられるが、これらに限定されない。好ましいアルキニレン基として、エチニレン、プロピニレンおよびブチニレンが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１０８】
本明細書で用いられる用語「アゾリル」は、５員環の飽和または不飽和の複素環基であって、窒素、硫黄および酸素からなる群から選択した２個または３個以上のヘテロ原子を環原子として含み、少なくとも１個のヘテロ原子は窒素原子である、前記の基を意味することを意図する。好ましいアゾリル基として、随意に置換されたイミダゾリル、オキサゾリル、チアゾリル、ピラゾリル、イソオキサゾリル、イソチアゾリル、１，３，４−チアジアゾリル、１，２，４−チアジアゾリル、１，２，４−オキサジアゾリル、および１，３，４−オキサジアゾリルが挙げられるが、これらに限定されない。
本明細書で用いられる用語「炭素環」は、シクロアルキルまたはアリール部分を意味することを意図する。用語「炭素環」はまた、少なくとも１つの炭素−炭素二重結合を有するシクロアルケニル部分を含む。
【０１０９】
用語「シクロアルキル」は、約３〜１５個の炭素を有する、好ましくは３〜１２個の炭素、好ましくは３〜８個の炭素、より好ましくは３〜６個の炭素、およびさらになお好ましくは５または６個の炭素を有する、飽和または不飽和の単環式、二環式、三環式または多環式炭化水素基を意味することを意図する。特定の好ましい態様において、シクロアルキル基は、アリール、ヘテロアリールまたは複素環基に融合している。好ましいシクロアルキル基として、シクロペンテン−２−エノン、シクロペンテン−２−エノール、シクロヘクス−２−エノン、シクロヘクス−２−エノール、シクロプロピル、シクロブチル、シクロブテニル、シクロペンチル、シクロペンテニル、シクロヘキシル、シクロヘキセニル、シクロヘプチルおよびシクロオクチル等が挙げられるが、これらに限定されない。
【０１１０】
用語「ヘテロアルキル」は、飽和または不飽和の直鎖または分枝脂肪族基であって、この基中、１または２個以上の炭素原子が独立して、Ｏ、Ｓ、Ｎ、Ｎ−アルキル、−Ｓ（Ｏ）−、−Ｓ（Ｏ）２−、−Ｓ（Ｏ）２ＮＨ−、または−ＮＨＳ（Ｏ）２−からなる群から選択される部分により置換されているものを意味することを意図する。
用語「アリール」は、単環式、二環式、三環式または多環式芳香族部分、好ましくはＣ６〜Ｃ１４芳香族部分であって、好ましくは１〜３個の芳香族環を含むものを意味することを意図する。好ましくは、アリール基はＣ６〜Ｃ１０アリール基、より好ましくはＣ６アリール基である。好ましいアリール基としては、フェニル、ナフチル、アントラセニルおよびフルオレニルが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１１１】
用語「アラルキル」または「アリールアルキル」は、アルキル基に共有結合したアリール基を含む基を意味することを意図する。アラルキル基が「随意に置換されている」と記載されている場合は、これは、アリールまたはアルキル部分のどちらかまたは両方が、独立して随意に置換されているかまたは非置換であることが意図される。好ましくは、アラルキル基は（Ｃ１〜Ｃ６）アルク（Ｃ６〜Ｃ１０）アリールであり、ベンジル、フェネチル、およびナフチルメチルを含むが、これらに限定されない。単純化のために、「アリールアルキル」として記述されている場合は、この用語、およびこれに関連する用語は、化合物中の基の順序が「アリール−アルキル」であることを示すことが意図される。同様に、「アルキル−アリール」は、化合物中の基の順序が「アルキル−アリール」であることを示すことが意図される。
【０１１２】
用語「ヘテロシクリル」、「複素環式」または「複素環」は、約３〜約１４個の原子を有し、ここで１個または２個以上の原子が、独立して、Ｎ、ＯおよびＳからなる群から選択される単環式、二環式または多環式構造である基を意味することを意図する。環状構造は、飽和、不飽和または部分的に不飽和であってもよい。特定の好ましい態様において、複素環基は非芳香族であり、この場合の基は、ヘテロシクロアルキルとしても知られている。特定の好ましい態様において、複素環基は、架橋複素環基（例えば、メチレン、エチレンまたはプロピレン架橋を有する二環式部分）である。二環式または多環式構造において、１つまたは２つ以上の環は、芳香族であってもよい；例えば、二環式複素環の１つの環または三環式複素環の１つもしくは２つの環は、インダンおよび９，１０−ジヒドロアントラセンにおけるように、芳香族であってもよい。好ましい複素環基として、エポキシ、アジリジニル、テトラヒドロフラニル、ピロリジニル、ピペリジニル、ピペラジニル、チアゾリジニル、オキサゾリジニル、オキサゾリジノニルおよびモルホリノが挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの好ましい態様において、複素環基は、アリール、ヘテロアリールまたはシクロアルキル基に融合している。かかる融合複素環の例として、テトラヒドロキノリンおよびジヒドロベンゾフランが挙げられるが、これらに限定されない。この用語の範囲から特に除外されるのは、環のＯまたはＳ原子が別のＯまたはＳ原子に隣接している化合物である。
【０１１３】
特定の好ましい態様において、複素環基は、ヘテロアリール基である。本明細書中で用いる場合、用語「ヘテロアリール」は、５〜１８個の環原子、好ましくは５〜１４個の環原子、さらに好ましくは５個、６個、９個または１０個の環原子を有する、好ましくは、環状配列中に共有された６個、１０個または１４個のパイ電子を有する、および炭素原子に加えて、Ｎ、ＯおよびＳからなる群から選択される１個または２個以上のヘテロ原子を有する、単環式、二環式、三環式または多環式基を意味することを意図する。用語「ヘテロアリール」はまた、窒素含有ヘテロアリール基の１つのＮ−オキシド誘導体（または、ヘテロアリール基が、１個より多いＮ−オキシド誘導体が形成できるように１個より多い窒素を含有している場合には、複数のＮ−オキシド誘導体）も包含することを意図する。例えば、ヘテロアリール基は、ピリミジニル、ピリジニル、ベンズイミダゾリル、チエニル、ベンゾチアゾリル、ベンゾフラニルおよびインドリニルであってもよい。好ましいヘテロアリール基として、チエニル、ベンゾチエニル、フリル、ベンゾフリル、ジベンゾフリル、ピロリル、イミダゾリル、ピラゾリル、ピリジル、ピラジニル、ピリミジニル、インドリル、キノリル、イソキノリル、キノキサリニル、テトラゾリル、オキサゾリル、チアゾリル、イソオキサゾリル、ベンゾ［ｂ］チエニル、ナフタ［２，３−ｂ］チアントレニル、ザンテニル（zanthenyl）、キノリル、ベンゾチアゾリル、ベンズイミダゾリル、ベータ−カルボリニルおよびペリミジニルが挙げられるが、これらに限定されない。ヘテロアリール基のＮ−オキシド誘導体の例としては、ピリジルＮ−オキシド、ピラジニルＮ−オキシド、ピリミジニルＮ−オキシド、ピリダジニルＮ−オキシド、トリアジニルＮ−オキシド、イソキノリルＮ−オキシド、およびキノリルＮ−オキシドが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１１４】
用語「アリーレン」、「ヘテロアリーレン」または「ヘテロシクリレン」はそれぞれ、上に定義されているように、２個の他の化学基の間に位置してこれを結合するよう作用する、アリール、ヘテロアリールまたはヘテロシクリル基を意味することが意図される。
複素脂環式基は特に、非芳香族複素環式基を指す。複素脂環式は不飽和を含んでもよいが、芳香族ではない。
【０１１５】
ヘテロシクリルアルキル基は、ヘテロシクリルが親構造に、アルキレン、アルキリデン、またはアルキリジン基の１つを介して結合している残基を指す。例としては、（４−メチルピペラジン−１−イル）メチル、（モルホリン−４−イル）メチル、（ピリジン−４−イル）メチル、２−（オキサゾリン−２−イル）エチル、４−（４−メチルピペラジン−１−イル）−２−ブテニルなどが挙げられる。ヘテロシクリルアルキルが「随意に置換されている」と記載される場合は、ヘテロシクリルおよび、ヘテロシクリルアルキル基のアルキレン、アルキリデン、またはアルキリジン残基部分の両方が、随意に置換されていてもよい。「低級ヘテロシクリルアルキル」は、基の「アルキル」部分が１〜６個の炭素を有するヘテロシクリルアルキルを指す。
ヘテロアリシクリルアルキル基は特に、基のヘテロシクリル部分が非芳香族である、ヘテロシクリルアルキルを指す。
【０１１６】
好ましいヘテロシクリルおよびヘテロアリールとして、アゼピニル、アゼチジニル、アクリジニル、アゾシニル(azocinyl)、ベンジドリル（benzidolyl）、ベンズイミダゾリル、ベンゾフラニル、ベンゾフラザニル、ベンゾフリル、ベンゾチオフラニル、ベンゾチオフェニル、ベンゾオキサゾリル、ベンゾチアゾリル、ベンゾチエニル、ベンズトリアゾリル、ベンズテトラゾリル、ベンズイソキサゾリル、ベンズイソチアゾリル、ベンズイミダゾリニル、ベンゾオキサゾリル、ベンゾオキサジアゾリル、ベンゾピラニル、カルバゾリル、４ａＨ−カルバゾリル、カルボリニル、クロマニル、クロメニル、シンノリニル、クマリニル、デカヒドロキノリニル、ジベンゾフリル、１，３−ジオキソラン、２Ｈ，６Ｈ−１，５，２−ジチアジニル、ジヒドロフロ［２，３−ｂ］テトラヒドロフラン、ジヒドロイソインドリル、ジヒドロキナゾリニル（例えば３，４−ジヒドロ−４−オキソ−キナゾリニル）、フラニル、フロピリジニル（例えばフロ［２，３−ｃ］ピリジニル、フロ［３，２−ｂ］ピリジニルまたはフロ［２，３−ｂ］ピリジニル）、フリル、フラザニル、ヘキサヒドロジアゼピニル、イミダゾリジニル、イミダゾリニル、イミダゾリル、インダゾリル、１Ｈ−インダゾリル、インドレニル、インドリニル、インドリジニル、インドリル、３Ｈ−インドリル、イソベンゾフラニル、イソクロマニル、イソインダゾリル、イソインドリニル、イソインドリル、イソキノリル、イソキノリニル、イソチアゾリジニル、イソチアゾリル、イソキサゾリニル、イソキサゾリル、メチレンジオキシフェニル、モルホリニル、ナフチリジニル、オクタヒドロイソキノリニル、オキサジアゾリル、１，２，３−オキサジアゾリル、１，２，４−オキサジアゾリル、１，２，５−オキサジアゾリル、１，３，４−オキサジアゾリル、オキサゾリジニル、オキサゾリル、オキサゾリジニル、オキセタニル、２−オキソアゼピニル、２−オキソピペラジニル、２−オキソピペリジニル、２−オキソピロロジニル、ピリミジニル、フェナントリジニル、フェナントロリニル、フェナジニル、フェノチアジニル、フェノキサチイニル、フェノキサジニル、フタラジニル、ピペラジニル、ピペリジニル、ピペリドニル、４−ピペリドニル、ピペロニル、プテリジニル、プリニル、ピラニル、ピラジニル、ピラゾリジニル、ピラゾリニル、ピラゾリル、ピリダジニル、ピリドオキサゾール、ピリドイミダゾール、ピリドチアゾール、ピリジニル、ピリジル、ピリミジニル、ピロリジニル、ピロリニル、ピロロピリジル、２Ｈ−ピロリル、ピロリル、キナゾリニル、キノリル、キノリニル、４Ｈ−キノリジニル、キノキサリニル、キヌクリジニル、テトラヒドロ−１，１−ジオキソチエニル、テトラヒドロフラニル、テトラヒドロフリル、テトラヒドロイソキノリニル、テトラヒドロキノリニル、テトラヒドロピラニル、テトラゾリル、チアゾリジニル、６Ｈ−１，２，５−チアジアジニル、チアジアゾリル（例えば１，２，３−チアジアゾリル、１，２，４−チアジアゾリル、１，２，５−チアジアゾリル、１，３，４−チアジアゾリル）、チアモルホリニル、チアモルホリニルスルホキシド、チアモルホリニルスルホン、チアントレニル、チアゾリル、チエニル、チエノチアゾリル、チエノオキサゾリル、チエノイミダゾリル、チオフェニル、トリアジニル、トリアジニルアゼピニル、トリアゾリル（例えば１，２，３−トリアゾリル、１，２，４−トリアゾリル、１，２，５−トリアゾリル、１，３，４−トリアゾリル）、およびキサンテニルが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１１７】
本明細書で用いられる「ハロヒドロカルビル」は、ヒドロカルビル部分であって、ここで１個〜全ての水素が、独立して選択されるハロにより置き換えられているものである。
【０１１８】
本明細書中で用いる場合、他に述べない限り、部分（例えばアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロシクリルなど）を「随意に置換されている」と記載する場合には、これは、当該基が、随意に、１〜４、好ましくは１〜３、より好ましくは１または２の、独立して選択された非水素置換基を有することを意味する。好適な置換基として、ハロ、ヒドロキシ、オキソ（例えば、オキソで置換されている環の−ＣＨ−は、−Ｃ（Ｏ）−である）、ニトロ、ハロヒドロカルビル、ヒドロカルビル、アルキル、シクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、ヘテロアリール、アラルキル、アルコキシ、アリールオキシ、アミノ、アシルアミノ、アルキルカルバモイル、アリールカルバモイル、アミノアルキル、アシル、カルボキシ、ヒドロキシアルキル、アルカンスルホニル、アレーンスルホニル、アルカンスルホンアミド、アレーンスルホンアミド、アラルキルスルホンアミド、アルキルカルボニル、アシルオキシ、シアノおよびウレイド基が挙げられるが、これらに限定されない。これら自体がさらに置換されない（他に特に述べない限り）好ましい置換基は、以下のものである：
【０１１９】
（ａ）ハロ、ヒドロキシ、シアノ、オキソ、カルボキシ、ホルミル、ニトロ、アミノ、アミジノ、グアニジノ、
（ｂ）Ｃ１〜Ｃ５アルキルまたはアルケニルまたはアリールアルキル イミノ、カルバモイル、アジド、カルボキサミド、メルカプト、ヒドロキシ、ヒドロキシアルキル、アルキルアリール、アリールアルキル、Ｃ１〜Ｃ８アルキル、Ｃ１〜Ｃ８アルケニル、Ｃ１〜Ｃ８アルコキシ、Ｃ１〜Ｃ８アルキルアミノ、Ｃ１〜Ｃ８アルコキシカルボニル、アリールオキシカルボニル、Ｃ２〜Ｃ８アシル、−Ｃ（Ｏ）−Ｎ（Ｒ３０）−アルキル−シクロアルキル、−Ｃ（Ｏ）−Ｎ（Ｒ３０）−アルキル−ヘテロシクリル、−Ｃ（Ｏ）−Ｎ（Ｒ３０）−アルキル−アリール、−Ｃ（Ｏ）−Ｎ（Ｒ３０）−アルキル−ヘテロアリール、−Ｃ（Ｏ）−シクロアルキル、−Ｃ（Ｏ）−ヘテロシクリル、−Ｃ（Ｏ）−アリール、−Ｃ（Ｏ）−ヘテロアリール、Ｃ２〜Ｃ８アシルアミノ、Ｃ１〜Ｃ８アルキルチオ、アリールアルキルチオ、アリールチオ、Ｃ１〜Ｃ８アルキルスルフィニル、アリールアルキルスルフィニル、アリールスルフィニル、Ｃ１〜Ｃ８アルキルスルホニル、アリールアルキルスルホニル、アリールスルホニル、Ｃ０〜Ｃ６ Ｎ−アルキルカルバモイル、Ｃ２〜Ｃ１５Ｎ，Ｎ−ジアルキルカルバモイル、Ｃ３〜Ｃ７シクロアルキル、アロイル、アリールオキシ、アリールアルキルエーテル、アリール、シクロアルキルまたは複素環または別のアリール環に融合したアリール、Ｃ３〜Ｃ７複素環、Ｃ５〜Ｃ１５ヘテロアリール、またはシクロアルキル、ヘテロシクリルもしくはアリールに融合したかもしくはスピロ融合した（spiro-fused）これらの環のすべて、ここで前記の各々はさらに、上記（ａ）において列挙した１つまたは２つ以上の部分で随意に置換されている；および
【０１２０】
（ｃ）−（ＣＲ３２Ｒ３３）ｓ−ＮＲ３０Ｒ３１、式中ｓは０（この場合において、窒素は、置換されている部分に直接結合している）〜６であり、Ｒ３２およびＲ３３は、各々独立して、水素、ハロ、ヒドロキシルまたはＣ１〜Ｃ４アルキルであり、Ｒ３０およびＲ３１は、各々独立して水素、シアノ、オキソ、ヒドロキシル、Ｃ１〜Ｃ８アルキル、Ｃ１〜Ｃ８ヘテロアルキル、Ｃ１〜Ｃ８アルケニル、カルボキサミド、Ｃ１〜Ｃ３アルキルカルボキサミド、カルボキサミド−Ｃ１〜Ｃ３アルキル、アミジノ、Ｃ２〜Ｃ８ヒドロキシアルキル、Ｃ１〜Ｃ３アルキルアリール、アリール−Ｃ１〜Ｃ３アルキル、Ｃ１〜Ｃ３アルキルヘテロアリール、ヘテロアリール−Ｃ１〜Ｃ３アルキル、Ｃ１〜Ｃ３アルキルヘテロシクリル、ヘテロシクリル−Ｃ１〜Ｃ３アルキル、Ｃ１〜Ｃ３アルキルシクロアルキル、シクロアルキル−Ｃ１〜Ｃ３アルキル、Ｃ２〜Ｃ８アルコキシ、Ｃ２〜Ｃ８アルコキシ−Ｃ１〜Ｃ４アルキル、Ｃ１〜Ｃ８アルコキシカルボニル、アリールオキシカルボニル、アリール−Ｃ１〜Ｃ３アルコキシカルボニル、ヘテロアリールオキシカルボニル、ヘテロアリール−Ｃ１〜Ｃ３アルコキシカルボニル、Ｃ１〜Ｃ８アシル、Ｃ０〜Ｃ８アルキル−カルボニル、アリール−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−カルボニル、ヘテロアリール−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−カルボニル、シクロアルキル−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−カルボニル、ヘテロシクリル−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−カルボニル、Ｃ０〜Ｃ８アルキル−ＮＨ−カルボニル、アリール−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−ＮＨ−カルボニル、ヘテロアリール−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−ＮＨ−カルボニル、シクロアルキル−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−ＮＨ−カルボニル、ヘテロシクリル−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−ＮＨ−カルボニル、シクロアルキル−Ｓ（Ｏ）２−、ヘテロシクリル−Ｓ（Ｏ）２−、アリール−Ｓ（Ｏ）２−、ヘテロアリール−Ｓ（Ｏ）２−、Ｃ０〜Ｃ８アルキル−Ｏ−カルボニル、アリール−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−Ｏ−カルボニル、ヘテロアリール−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−Ｏ−カルボニル、シクロアルキル−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−Ｏ−カルボニル、ヘテロシクリル−Ｃ０〜Ｃ８アルキル−Ｏ−カルボニル、Ｃ１〜Ｃ８アルキルスルホニル、アリールアルキルスルホニル、アリールスルホニル、ヘテロアリールアルキルスルホニル、ヘテロアリールスルホニル、Ｃ１〜Ｃ８アルキル−ＮＨ−スルホニル、アリールアルキル−ＮＨ−スルホニル、アリール−ＮＨ−スルホニル、ヘテロアリールアルキル−ＮＨ−スルホニル、ヘテロアリール−ＮＨ−スルホニルアロイル、アリール、シクロアルキル、ヘテロシクリル、ヘテロアリール、アリール−Ｃ１〜Ｃ３アルキル−、シクロアルキル−Ｃ１〜Ｃ３アルキル−、ヘテロシクリル−Ｃ１〜Ｃ３アルキル−、ヘテロアリール−Ｃ１〜Ｃ３アルキル−または保護基であり、ここで、前記の各々は、さらに随意に上記（ａ）において列挙した１つまたは２つ以上の部分で置換されており；または
【０１２１】
Ｒ３０およびＲ３１は、これらが結合しているＮと一緒になって、ヘテロシクリルまたはヘテロアリールを形成し、この各々は、随意に、上記（ａ）からなる群から選択された１〜３個の置換基、保護基、および（Ｘ３０−Ｙ３１−）で置換されており、ここで、前記ヘテロシクリルはまた、架橋されていてもよく（メチレン、エチレンまたはプロピレン架橋を有する二環式部分を形成する）；ここで、
【０１２２】
Ｘ３０は、Ｈ、Ｃ１〜Ｃ８アルキル、Ｃ２〜Ｃ８アルケニル−、Ｃ２〜Ｃ８アルキニル−、−Ｃ０〜Ｃ３アルキル−Ｃ２−Ｃ８アルケニル−Ｃ０〜Ｃ３アルキル、Ｃ０〜Ｃ３アルキル−Ｃ２〜Ｃ８アルキニル−Ｃ０〜Ｃ３アルキル、Ｃ０〜Ｃ３アルキル−Ｏ−Ｃ０〜Ｃ３アルキル−、ＨＯ−Ｃ０〜Ｃ３アルキル−、Ｃ０〜Ｃ４アルキル−Ｎ（Ｒ３０）−Ｃ０〜Ｃ３アルキル−、Ｎ（Ｒ３０）（Ｒ３１）−Ｃ０〜Ｃ３アルキル−、Ｎ（Ｒ３０）（Ｒ３１）−Ｃ０〜Ｃ３アルケニル−、Ｎ（Ｒ３０）（Ｒ３１）−Ｃ０〜Ｃ３アルキニル−、（Ｎ（Ｒ３０）（Ｒ３１））２−Ｃ＝Ｎ−、Ｃ０〜Ｃ３アルキル−Ｓ（Ｏ）０〜２−Ｃ０〜Ｃ３アルキル−、ＣＦ３−Ｃ０〜Ｃ３アルキル−、Ｃ１〜Ｃ８ヘテロアルキル、アリール、シクロアルキル、ヘテロシクリル、ヘテロアリール、アリール−Ｃ１〜Ｃ３アルキル−、シクロアルキル−Ｃ１〜Ｃ３アルキル−、ヘテロシクリル−Ｃ１〜Ｃ３アルキル−、ヘテロアリール−Ｃ１〜Ｃ３アルキル−、Ｎ（Ｒ３０）（Ｒ３１）−ヘテロシクリル−Ｃ１〜Ｃ３アルキル−からなる群から選択され、ここで、アリール、シクロアルキル、ヘテロアリールおよびヘテロシクリルは、随意に、（ａ）からの１〜３個の置換基で置換されており；またＹ３１は、直接結合、−Ｏ−、−Ｎ（Ｒ３０）−、−Ｃ（Ｏ）−、−Ｏ−Ｃ（Ｏ）−、−Ｃ（Ｏ）−Ｏ−、−Ｎ（Ｒ３０）−Ｃ（Ｏ）−、−Ｃ（Ｏ）−Ｎ（Ｒ３０）−、−Ｎ（Ｒ３０）−Ｃ（Ｓ）−、−Ｃ（Ｓ）−Ｎ（Ｒ３０）−、−Ｎ（Ｒ３０）−Ｃ（Ｏ）−Ｎ（Ｒ３１）−、−Ｎ（Ｒ３０）−Ｃ（ＮＲ３０）−Ｎ（Ｒ３１）−、−Ｎ（Ｒ３０）−Ｃ（ＮＲ３１）−、−Ｃ（ＮＲ３１）−Ｎ（Ｒ３０）、−Ｎ（Ｒ３０）−Ｃ（Ｓ）−Ｎ（Ｒ３１）−、−Ｎ（Ｒ３０）−Ｃ（Ｏ）−Ｏ−、−Ｏ−Ｃ（Ｏ）−Ｎ（Ｒ３１）−、−Ｎ（Ｒ３０）−Ｃ（Ｓ）−Ｏ−、−Ｏ−Ｃ（Ｓ）−Ｎ（Ｒ３１）−、−Ｓ（Ｏ）０〜２−、−ＳＯ２Ｎ（Ｒ３１）−、−Ｎ（Ｒ３１）−ＳＯ２−および−Ｎ（Ｒ３０）−ＳＯ２Ｎ（Ｒ３１）−からなる群から選択される。
【０１２３】
置換されている部分とは、その中の１つまたは２つ以上の（好ましくは１〜４、好ましくは１〜３、およびさらに好ましくは１または２の）水素が独立して他の化学置換基により置き換えられているものである。非限定的な例としては、置換フェニルは、２−フルオロフェニル、３，４−ジクロロフェニル、３−クロロ−４−フルオロ−フェニル、２−フルオロ−３−プロピルフェニルを含む。別の非限定的な例としては、置換ｎ−オクチルは、２，４−ジメチル−５−エチル−オクチルおよび３−シクロペンチル−オクチルを含む。この定義に含まれるのは、酸素で置換されてカルボニル−ＣＯ−を形成する、メチレン（−ＣＨ２−）である。
【０１２４】
フェニル、チオフェニルまたはピリジニルなどの環構造の隣接する原子に結合した２つの随意の置換基がある場合には、当該置換基は、これらが結合している原子と一緒に、随意に１個、２個または３個のヘテロ環原子を有する５員環または６員環シクロアルキルまたは複素環を形成する。
【０１２５】
好ましい態様においては、ヒドロカルビル、ヘテロアルキル、複素環および／またはアリール基などの基は、非置換である。
他の好ましい態様においては、ヒドロカルビル、ヘテロアルキル、複素環および／またはアリール基などの基は、１つ〜４つの（好ましくは１〜３、およびさらに好ましくは１または２の）独立して選択される基により、置換されている。
【０１２６】
アルキル基上の好ましい置換基としては、限定することなく、ヒドロキシル、ハロゲン（例えば１つのハロゲン置換基または複数のハロ置換基；後者の場合は、−ＣＦ３基、またはＣｌ３を有するアルキル基などの基）、オキソ、シアノ、ニトロ、アルキル、シクロアルキル、アルケニル、シクロアルケニル、アルキニル、複素環、アリール、−ＯＲａ、−ＳＲａ、−Ｓ（＝Ｏ）Ｒｅ、−Ｓ（＝Ｏ）２Ｒｅ、−Ｐ（＝Ｏ）２Ｒｅ、−Ｓ（＝Ｏ）２ＯＲｅ、−Ｐ（＝Ｏ）２ＯＲｅ、−ＮＲｂＲｃ、−ＮＲｂＳ（＝Ｏ）２Ｒｅ、−ＮＲｂＰ（＝Ｏ）２Ｒｅ、−Ｓ（＝Ｏ）２ＮＲｂＲｃ、−Ｐ（＝Ｏ）２ＮＲｂＲｃ、−Ｃ（＝Ｏ）ＯＲｅ、−Ｃ（＝Ｏ）Ｒａ、−Ｃ（＝Ｏ）ＮＲｂＲｃ、−ＯＣ（＝Ｏ）Ｒａ、−ＯＣ（＝Ｏ）ＮＲｂＲｃ、−ＮＲｂＣ（＝Ｏ）Ｒｅ、−ＮＲｄＣ（＝Ｏ）ＮＲｂＲｃ、−ＮＲｄＳ（＝Ｏ）２ＮＲｂＲｃ、−ＮＲｄＰ（＝Ｏ）２ＮＲｂＲｃ、−ＮＲｂＣ（＝Ｏ）Ｒａまたは−ＮＲｂＰ（＝Ｏ）２Ｒｅが挙げられ、これらの式中、Ｒａは、水素、アルキル、シクロアルキル、アルケニル、シクロアルケニル、アルキニル、複素環またはアリールであり；Ｒｂ、ＲｃおよびＲｄは独立して、水素、アルキル、シクロアルキル、複素環またはアリールであるか、または前記ＲｂおよびＲｃはそれらが結合しているＮと共に、随意に複素環を形成し；およびＲｅは、アルキル、シクロアルキル、アルケニル、シクロアルケニル、アルキニル、複素環またはアリールである。前記の例示の置換基において、アルキル、シクロアルキル、アルケニル、アルキニル、シクロアルケニル、複素環およびアリールなどの基はそれら自体が、随意に置換されていてもよい。
【０１２７】
アルケニルおよびアルキニル基上の好ましい置換基としては、限定することなく、アルキルまたは置換アルキル、および好ましいアルキル置換基として列挙された基が挙げられる。
シクロアルキル基上の好ましい置換基としては、限定することなく、ニトロ、シアノ、アルキルまたは置換アルキル、および好ましいアルキル置換基として列挙された基が挙げられる。その他の好ましい置換基としては、限定することなく、スピロ結合置換基または融合環置換基、好ましくはスピロ結合シクロアルキル、スピロ結合シクロアルケニル、スピロ結合複素環（ヘテロアリールを除く）、融合シクロアルキル、融合シクロアルケニル、融合複素環、または融合アリールが挙げられ、ここで前記のシクロアルキル、シクロアルケニル、複素環およびアリール置換基は、それら自体が随意に置換されていることができる。
【０１２８】
シクロアルケニル基上の好ましい置換基としては、限定することなく、ニトロ、シアノ、アルキルまたは置換アルキル、および好ましいアルキル置換基として列挙された基が挙げられる。その他の好ましい置換基としては、限定することなく、スピロ結合置換基または融合環置換基、特にスピロ結合シクロアルキル、スピロ結合シクロアルケニル、スピロ結合複素環（ヘテロアリールを除く）、融合シクロアルキル、融合シクロアルケニル、融合複素環、または融合アリールが挙げられ、ここで前記のシクロアルキル、シクロアルケニル、複素環およびアリール置換基は、それら自体が随意に置換されていることができる。
【０１２９】
アリール基上の好ましい置換基としては、限定することなく、ニトロ、シクロアルキルまたは置換シクロアルキル、シクロアルケニルまたは置換シクロアルケニル、シアノ、アルキルまたは置換アルキル、および好ましいアルキル置換基として上に列挙された基が挙げられる。その他の好ましい置換基としては、限定することなく、融合環基、特に融合シクロアルキル、融合シクロアルケニル、融合複素環、または融合アリールが挙げられ、ここで前記のシクロアルキル、シクロアルケニル、複素環およびアリール置換基は、それら自体が随意に置換されていることができる。アリール基（非限定的例としてはフェニル）上のさらに他の好ましい置換基としては、限定することなく、ハロアルキルおよび好ましいアルキル置換基として列挙された基が挙げられる。
【０１３０】
複素環基上の好ましい置換基としては、限定することなく、シクロアルキル、置換シクロアルキル、シクロアルケニル、置換シクロアルケニル、ニトロ、オキソ（すなわち＝Ｏ）、シアノ、アルキル、置換アルキル、および好ましいアルキル置換基として列挙された基が挙げられる。複素環基上のその他の好ましい置換基としては、限定することなく、任意の利用可能な１または２以上の結合点におけるスピロ結合置換基または融合環基が挙げられ、さらに好ましくは、スピロ結合シクロアルキル、スピロ結合シクロアルケニル、スピロ結合複素環（ヘテロアリールを除く）、融合シクロアルキル、融合シクロアルケニル、融合複素環、および融合アリールが挙げられ、ここで前記のシクロアルキル、シクロアルケニル、複素環およびアリール置換基は、それら自体が随意に置換されていることができる。
【０１３１】
ある好ましい態様において、複素環基は、１または２以上の位置において炭素、窒素および／または硫黄上で置換されている。炭素上の好ましい置換基としては、好ましいアルキル置換基として列挙された基を含む。窒素上の好ましい置換基としては、アルキル、アリール、アラルキル、アルキルカルボニル、アルキルスルホニル、アリールカルボニル、アリールスルホニル、アルコキシカルボニルまたはアラルコキシカルボニルが挙げられるが、これらには限定されない。硫黄上の好ましい置換基としては、オキソおよびＣ１〜６アルキルが挙げられるが、これらには限定されない。ある好ましい態様において、窒素および硫黄へテロ原子は独立して随意に酸化されていてもよく、および窒素ヘテロ原子は、独立して随意に四級化されていてもよい。
【０１３２】
アリール、ヘテロアリール、シクロアルキルおよびヘテロシクリルなどの環式基上の特に好ましい置換基としては、ハロゲン、アルコキシおよびアルキルが挙げられる。
アルキル基上の特に好ましい置換基としては、ハロゲンおよびヒドロキシが挙げられる。
【０１３３】
本明細書で用いる用語「ハロゲン」または「ハロ」は、塩素、臭素、フッ素またはヨウ素を指す。本明細書で用いる場合、用語「アシル」は、アルキルカルボニルまたはアリールカルボニル置換基を指す。用語「アシルアミノ」は、窒素原子に結合したアミド基を指す（すなわちＲ−ＣＯ−ＮＨ−）。用語「カルバモイル」は、カルボニル炭素原子に結合したアミド基を指す（すなわちＮＨ２−ＣＯ−）。アシルアミノまたはカルバモイル置換基の窒素原子は、追加して随意に置換されている。用語「スルホンアミド」は、硫黄または窒素原子のどちらかが結合したスルホンアミド置換基を指す。用語「アミノ」は、ＮＨ２、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アリールアミノ、および環式アミノ基を含むことを意味する。本明細書で用いる用語「ウレイド」は、置換または非置換の尿素部分を指す。
【０１３４】
本明細書で用いる用語「基」は、１個または２個以上の対になっていない電子を含む化学部分を指す。
随意の置換基を「１または２以上の」群から選択する場合、この定義は、全ての置換基が特定の群の１つから選択されるか、または置換基が２もしくは３以上の特定の群から選択されることを含む。
【０１３５】
さらに、環状部分（即ちシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、ヘテロアリール）上の置換基には、もとの環状部分に融合して二環式または三環式融合環系を形成する５〜６員単環および９〜１４員二環部分が含まれる。環状部分上の置換基にはまた、共有結合によりもとの環状部分に結合して二環式または三環式の二環系（bi-ring system）を形成する５〜６員単環および９〜１４員二環部分が含まれる。例えば、随意に置換されているフェニルには、以下のものが含まれるが、これらには限定されない：
【化１】
【０１３６】
飽和または不飽和の３〜８員炭素環は、好ましくは４〜７員、さらに好ましくは５または６員の、飽和または不飽和の炭素環である。飽和または不飽和の３〜８員炭素環の例としては、フェニル、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、およびシクロヘプチルが挙げられる。
【０１３７】
飽和または不飽和の３〜８員複素環は、酸素、窒素および硫黄原子から選択される、少なくとも１個のヘテロ原子を含む。飽和または不飽和の３〜８員複素環は、好ましくは、１または２個のヘテロ原子と、炭素原子である残りの環構成原子とを含む。飽和または不飽和の３〜８員複素環は、好ましくは飽和または不飽和の４〜７員複素環、さらに好ましくは飽和または不飽和の５または６員複素環である。飽和または不飽和の３〜８員複素環基の例としては、チエニル、ピリジル、１，２，３−トリアゾリル、イミダゾリル、イソオキサゾリル（isoxazolyl）、ピラゾリル、ピペラジニル、ピペラジノ、ピペリジル、ピペリジノ、モルホリニル、モルホリノ、ホモピペラジニル、ホモピペラジノ、チオモルホリニル、チオモルホリノ、テトラヒドロピロリル、およびアゼパニルが挙げられる。
【０１３８】
飽和または不飽和のカルボン酸基および複素環基は、他の飽和または複素環基と濃縮されて、二環式基を、好ましくは飽和または不飽和９〜１２員二環式炭素環または複素環基を形成することができる。二環式基には、ナフチル、キノリル、１，２，３，４−テトラヒドロキノリル、１，４−ベンゾオキサニル、インダニル、インドリル、および１，２，３，４−テトラヒドロナフチルが含まれる。
炭素環または複素環基が２つのＣ１〜Ｃ６アルキル基で置換されている場合、２つのアルキル基は一緒に組み合わさってアルキレン鎖を、好ましくはＣ１〜Ｃ３アルキレン鎖を形成してよい。この架橋構造を有する炭素環または複素環基には、ビシクロ［２．２．２］オクタニルおよびノルボルナニル（norbornanyl）が含まれる。
【０１３９】
１つの側面において、本発明は、Ｈｏｓ２、その活性断片およびその相同体の阻害剤である化合物であって、式（Ａ）：
Ｃｙ１−Ｌ１−Ａｒ１−Ｙ１−Ｃ（Ｏ）−ＮＨ−Ｚ１ （Ａ）
式中、
Ｃｙ１は、−Ｈ、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、またはヘテロシクリルであり、これらのすべては随意に置換されていてもよく；
Ｌ１は、−（ＣＨ２）ｍ−Ｗ−であり、式中ｍは０、１、２、３または４であり、およびＷは、−Ｃ（Ｏ）ＮＨ−、−Ｓ（Ｏ）２ＮＨ−、−ＮＨＣ（Ｏ）−、−ＮＨＳ（Ｏ）２−、および−ＮＨ−Ｃ（Ｏ）−ＮＨ−からなる群から選択され；
Ａｒ１はアリーレンであり、ここで該アリーレンは随意に、追加して置換されてもよく、および随意に、アリールもしくはヘテロアリール環に、または飽和もしくは部分不飽和シクロアルキルもしくは複素環に融合してもよく、これらのすべては随意に置換されていてもよく；
Ｙ１は、化学結合または直鎖もしくは分枝鎖飽和アルキレンであり、ここで該アルキレンは随意に置換されていてもよく；
Ｚ１は、アニリニル、ピリジル、チアジアゾリル、ここでこれらの各々は随意に置換されており、および−Ｏ−Ｍ、ここでＭは、Ｈまたは薬学的に許容され得るカチオンである、からなる群から選択される、
を有する化合物、およびそのＮ−オキシド、水和物、溶媒和物、薬学的に許容し得る塩、プロドラッグまたは複合体、ならびにこれらのラセミ混合物およびスケールミック混合物、ジアステレオマーおよびエナンチオマーを提供する。
【０１４０】
式（Ａ）で表される化合物の好ましい態様において、Ｌ１が−Ｃ（Ｏ）ＮＨ−であり、Ｙ１が−（ＣＨ２）ｎであってｎは１、２または３であり、かつＺ１が−Ｏ−Ｍである場合、Ｃｙ１はアミノフェニル、ジメチルアミノフェニル、またはヒドロキシフェニルではない。
式（Ａ）で表される化合物の他の好ましい態様において、Ｌ１が−Ｃ（Ｏ）ＮＨ−であり、かつＺ１がピリジルである場合、Ｃｙ１は置換インドリニルではない。
【０１４１】
ある好ましい態様において、Ｃｙ１はＣ６〜Ｃ１４アリール、より好ましくはＣ６〜Ｃ１０アリール、および最も好ましくはフェニルまたはナフチルであり、これらのすべては随意に置換されていてもよい。ある別の好ましい態様において、Ｃｙ１はヘテロアリールである。いくつかの好ましい態様において、ヘテロアリール基は、チエニル、ベンゾチエニル、フリル、ベンゾフリル、キノリル、イソキノリル、およびチアゾリルからなる群から選択され、これらのすべては随意に置換されていてもよい。ある特に好ましい態様において、Ｃｙ１は、フェニル、ナフチル、チエニル、ベンゾチエニル、およびキノリルからなる群から選択され、これらのすべては随意に置換されていてもよい。ある別の好ましい態様において、Ｃｙ１は、フェニル、ピリジンまたはインドールであり、より好ましくはフェニルまたはインドールである。ある好ましい態様において、Ｃｙ１は、トリハロアルキル（好ましくはトリフルオロアルキル）、ハロゲン、ＣＮ、アミジン、スルホン、アルキルスルホン、イミデートおよびアルキルイミデートからなる群から選択される１または２以上の置換基で置換されている。ある好ましい態様において、Ｃｙ１は、トリハロアルキル（好ましくはトリフルオロアルキル）、ハロゲン、ＣＮ、アミジン、スルホン、アルキルスルホン、イミデートおよびアルキルイミデートからからなる群から選択される、好ましくはトリハロアルキル（好ましくはトリフルオロアルキル）およびハロゲンからなる群から選択される、１または２以上の置換基で置換されたフェニルである。
【０１４２】
好ましい態様において、Ｌ１は−（ＣＨ２）ｍ−Ｗ−であり、式中ｍは０、１、２、３または４であり、およびＷは、−Ｃ（Ｏ）ＮＨ−、−Ｓ（Ｏ）２ＮＨ−、−ＮＨＣ（Ｏ）−、−ＮＨＳ（Ｏ）２−、および−ＮＨ−Ｃ（Ｏ）−ＮＨ−からなる群から選択される。好ましくは、ｍは０、１、または２であり、より好ましくは０または１である。
好ましくは、Ａｒ１はＣ６〜Ｃ１４アリーレン、より好ましくはＣ６〜Ｃ１０アリーレンであり、これらのすべてはさらに置換されていてもよい。ある好ましい態様において、Ａｒ１はフェニレン、好ましくは４−フェニレンである。いくつかの好ましい態様において、フェニレンはアリールまたはヘテロアリール環に融合するか、または飽和もしくは部分不飽和シクロアルキルもしくは複素環に融合しており、これらの全てもまた随意に置換されていてよい。
【０１４３】
好ましい態様においては、Ｙ１は化学結合または直鎖もしくは分枝鎖アルキレンであり、ここで該アルキレンは随意に置換されていてもよい。いくつかの好ましい態様においては、Ｙ１は化学結合であり、基−Ｃ（Ｏ）ＮＨ−Ｚは直接Ａｒ１に結合する。いくつかの他の好ましい態様においては、Ｙ１はアルキレンであり、好ましくは飽和アルキレンである。好ましくは、飽和アルキレンは、Ｃ１〜Ｃ８アルキレン、より好ましくはＣ１〜Ｃ６アルキレン、さらにより好ましくはＣ１〜Ｃ３アルキレン、そしてなおより好ましくはＣ１〜Ｃ２アルキレンであり、これらは随意に置換されていてもよい。いくつかの特に好ましい態様において、Ｙ１はメチレンである。
【０１４４】
置換アルキル、アリール、ヘテロシクリル、およびヘテロアリール基は、１または２以上の、好ましくは１〜約３の、より好ましくは１または２の置換基を有し、これらは好ましくは以下からなる群から選択される：Ｃ１〜Ｃ６アルキル、好ましくはＣ１〜Ｃ４アルキル；ハロ、好ましくはＣｌ、Ｂｒ、またはＦ；ハロアルキル、好ましくは（ハロ）１〜５（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、より好ましくは（ハロ）１〜５（Ｃ１〜Ｃ３）アルキル、および最も好ましくはＣＦ３；Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、好ましくはメトキシ、エトキシ、またはベンジルオキシ；Ｃ６〜Ｃ１０アルールオキシ、好ましくはフェノキシ；Ｃ１〜Ｃ６アルコキシカルボニル、好ましくはＣ１〜Ｃ３アルコキシカルボニル、最も好ましくはカルボメトキシまたはカルボエトキシ；Ｃ６〜Ｃ１０アリール、好ましくはフェニル；（Ｃ６〜Ｃ１０）アル（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、好ましくは（Ｃ６〜Ｃ１０）アル（Ｃ１〜Ｃ３）アルキル、より好ましくはベンジル、ナフチルメチルまたはフェネチル；ヒドロキシ（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、好ましくはヒドロキシ（Ｃ１〜Ｃ３）アルキル、より好ましくはヒドロキシメチル；アミノ（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、好ましくはアミノ（Ｃ１〜Ｃ３）アルキル、より好ましくはアミノメチル；（Ｃ１〜Ｃ６）アルキルアミノ、好ましくはメチルアミノ、エチルアミノ、またはプロピルアミノ；ジ−（Ｃ１〜Ｃ６）アルキルアミノ、好ましくはジメチルアミノまたはジエチルアミノ；（Ｃ１〜Ｃ６）アルキルカルバモイル、
【０１４５】
好ましくはメチルカルバモイル、ジメチルカルバモイル、またはベンジルカルバモイル；（Ｃ６〜Ｃ１０）アリールカルバモイル、好ましくはフェニルカルバモイル；（Ｃ１〜Ｃ６）アルカンアシルアミノ、好ましくはアセチルアミノ；（Ｃ１〜Ｃ６）アレーンアシルアミノ、好ましくはベンゾイルアミノ；（Ｃ１〜Ｃ６）アルカンスルホニル、好ましくはメタンスルホニル；（Ｃ１〜Ｃ６）アルカンスルホンアミド、好ましくはメタンスルホンアミド；（Ｃ６〜Ｃ１０）アレーンスルホニル、好ましくはベンゼンスルホニルまたはトルエンスルホニル；（Ｃ６〜Ｃ１０）アレーンスルホンアミド、好ましくはベンゼンスルホニルまたはトルエンスルホニル；（Ｃ６〜Ｃ１０）アル（Ｃ１〜Ｃ６）アルキルスルホンアミド、好ましくはベンジルスルホンアミド；Ｃ１〜Ｃ６アルキルカルボニル、好ましくはＣ１〜Ｃ３アルキルカルボニル、より好ましくはアセチル；（Ｃ１〜Ｃ６）アシルオキシ、好ましくはアセトキシ；シアノ；アミノ；カルボキシ；ヒドロキシ；ウレイド；およびニトロ。アルキル、シクロアルキル、またはヘテロシクリル基の１または２個以上の炭素原子もまた、随意にオキソ基により置換されていてもよい。
【０１４６】
いくつかの特に好ましい態様において、Ｃｙ１はフェニル、ナフチル、チエニル、ベンゾチエニル、またはキノリル部分であって、これは非置換であるか、または、Ｃ１〜Ｃ４アルキル、Ｃ１〜Ｃ４ハロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、（Ｃ６〜Ｃ１０）アル（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、ハロ、ニトロ、ヒドロキシ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシカルボニル、カルボキシ、およびアミノからなる群から独立して選択される１つまたは２つの置換基により置換されている。
【０１４７】
他の側面において、本発明は、Ｈｏｓ２、その活性断片およびその相同体の阻害剤である化合物であって、式（Ｂ）：
Ｃｙ２−Ｌ２−Ａｒ２−Ｙ２−Ｃ（Ｏ）ＮＨ−Ｚ２ （Ｂ）
式中、
Ｃｙ２は、Ｈ、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、またはヘテロシクリルであり、Ｃｙ２が（スピロシクロアルキル）ヘテロシクリルではない場合には、これらのすべては随意に置換されていてもよく；
Ｌ２は、Ｃ１〜Ｃ６飽和アルキレンまたはＣ２〜Ｃ６アルケニレンであって、ここでアルキレンまたはアルケニレンは、随意に置換されていてもよく、およびここでアルキレンの１または２個の炭素原子は随意に、Ｏ；ＮＲ’、ここでＲ’はアルキル、アシルもしくは水素であり；Ｓ；Ｓ（Ｏ）；またはＳ（Ｏ）２、からなる群から独立して選択されるヘテロ原子部分により置き換えられており；
Ａｒ２はアリーレンであり、ここで該アリーレンは随意に、追加して置換されてもよく、および随意に、アリールもしくはヘテロアリール環に、または飽和もしくは部分不飽和シクロアルキルもしくは複素環に融合していてもよく、これらのすべては随意に置換されていてもよく；および
Ｙ２は、化学結合または直鎖もしくは分枝鎖飽和アルキレンであり、アルキレンが、式−Ｃ（Ｏ）Ｒで表され式中Ｒはα−アミノアシル部分を含む置換基により置換されていない場合、随意に置換されていてもよく；
Ｚ２は、アニリニル、ピリジル、チアジアゾリル、ここでこれらの各々は随意に置換されており、および−Ｏ−Ｍ、ここでＭは、Ｈまたは薬学的に許容され得るカチオンである、からなる群から選択される、
で表される化合物、およびそのＮ−オキシド、水和物、溶媒和物、薬学的に許容し得る塩、プロドラッグまたは複合体、ならびにこれらのラセミ混合物およびスケールミック混合物、ジアステレオマーおよびエナンチオマーを提供する。
【０１４８】
式（Ｂ）で表される化合物の好ましい態様において、Ｃｙ２が結合している炭素原子がオキソ置換されている場合は、Ｃｙ２およびＺ２は両方ともがピリジルではない。
【０１４９】
本発明のこの側面によるＣｙ２、Ａｒ２およびＺ２の好ましい置換基は、式（Ａ）に対して上に定義したものと同じである。Ｙ２の好ましい置換基は、Ｙ１に対して上に定義したものと同じである。いくつかの好ましい態様において、Ｌ２は、飽和Ｃ１〜Ｃ８アルキレン、より好ましくはＣ１〜Ｃ６アルキレン、さらにより好ましくはＣ１〜Ｃ４アルキレンであって、これらの基のすべては随意に置換されていてもよい。いくつかの他の好ましい態様において、Ｌ２は、飽和Ｃ２〜Ｃ８アルケニレン、より好ましくはＣ２〜Ｃ６アルケニレン、さらにより好ましくはＣ２〜Ｃ４アルケニレンであって、これらの基のすべては随意に置換されていてもよい。アルキレンまたはアルケニレン基は、１または２以上の炭素位置において、上に列挙した好ましい置換基のリストから好ましくは選択された置換基により、置換されていてよい。さらに好ましくは、Ｌ２は、１または２以上の炭素位置において、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、アミノ、オキソ、ヒドロキシ、Ｃ１〜Ｃ４アルコキシ、およびＣ６〜Ｃ１０アリールオキシからなる群から独立して選択された置換基により置換されている。いくつかの特に好ましい態様において、アルキレンまたはアルケニレン基は、１または２個のオキソまたはヒドロキシ基により置換されている。
【０１５０】
いくつかの好ましい態様において、Ｌ２は、Ｃ１〜Ｃ６飽和アルキレンであって、ここで飽和アルキレンの炭素原子の１つは、Ｏ；ＮＲ’、ここでＲ’はアルキル、アシルまたは水素であり；Ｓ；Ｓ（Ｏ）；またはＳ（Ｏ）２、からなる群から選択されるヘテロ原子部分により置き換えられている。好ましくは、Ｃｙ２に隣接する炭素原子は、ヘテロ原子部分により置き換えられている。いくつかの特に好ましい態様において、Ｌ２は、−Ｓ−（ＣＨ２）２−、−Ｓ（Ｏ）−（ＣＨ２）２−、−Ｓ（Ｏ）２−（ＣＨ２）２−、−Ｓ−（ＣＨ２）３−、−Ｓ（Ｏ）−（ＣＨ２）３−、および−Ｓ（Ｏ）２−（ＣＨ２）３−からなる群から選択される。
【０１５１】
他の好ましい側面において、本発明は、Ｈｏｓ２、その活性断片およびその相同体の阻害剤である化合物であって、式（Ｃ）：
Ｃｙ３−Ｌ３−Ａｒ３−Ｙ３−Ｃ（Ｏ）ＮＨ−Ｚ３ （Ｃ）
式中、
Ｃｙ３は、−Ｈ、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、またはヘテロシクリルであり、Ｃｙ３が（スピロシクロアルキル）ヘテロシクリルではない場合には、これらのすべては随意に置換されていてもよく；
Ｌ３は、以下からなる群から選択され：
（ａ）−（ＣＨ２）ｍ−Ｗ−、式中、ｍは０、１、２、３または４であり、Ｗは−Ｃ（Ｏ）ＮＨ−、−Ｓ（Ｏ）２ＮＨ−、−ＮＨＣ（Ｏ）−、−ＮＨＳ（Ｏ）２−、および−ＮＨ−Ｃ（Ｏ）−ＮＨ−からなる群から選択される；および
（ｂ）Ｃ１〜Ｃ６アルキレンまたはＣ２〜Ｃ６アルケニレンであって、ここでアルキレンまたはアルケニレンは、随意に置換されていてもよく、およびここでアルキレンの炭素原子の１つは随意に、Ｏ；ＮＲ’、ここでＲ’はアルキル、アシルまたは水素であり；Ｓ；Ｓ（Ｏ）；またはＳ（Ｏ）２により置き換えられていてもよく；
Ａｒ３はアリーレンであり、ここで該アリーレンは随意に、追加して置換されてもよく、および随意に、アリールもしくはヘテロアリール環に、または飽和もしくは部分不飽和シクロアルキルもしくは複素環に融合していてもよく、これらのすべては随意に置換されていてもよく；
Ｙ３は、Ｃ２アルケニレンまたはＣ２アルキニレンであり、ここでアルケニレンの１個または両方の炭素原子は、アルキル、アリール、アルカリル(alkaryl)またはアラルキルにより随意に置換されていてもよく；および
Ｚ３は、アニリニル、ピリジル、チアジアゾリル、ここでこれらの各々は随意に置換されており、および−Ｏ−Ｍ、ここでＭは、Ｈまたは薬学的に許容され得るカチオンである、からなる群から選択される、
で表される化合物、およびそのＮ−オキシド、水和物、溶媒和物、薬学的に許容し得る塩、プロドラッグまたは複合体、ならびにこれらのラセミ混合物およびスケールミック混合物、ジアステレオマーおよびエナンチオマーを提供する。
【０１５２】
式（Ｃ）で表される化合物の好ましい態様において、Ｃｙ３が不飽和フェニルである場合、Ａｒ３はフェニルではなく、ここでＬ３およびＹ３は互いにオルトまたはメタに配置されている。
本発明のこの側面によるＣｙ３、Ａｒ３およびＺ３の好ましい置換基は、式（Ａ）に対して上に定義したものと同じである。
【０１５３】
本発明の１つの側面の好ましい態様において、本発明は、化合物を、好ましくはUS 10/880,444に記載のヒドロキサム酸塩をベースとする化合物であってＨｏｓ２を阻害するのに有用な前記化合物を提供し、この文献は参照としてその全体が本明細書に組み込まれる。
【０１５４】
第１の側面の好ましい態様において、本発明は、Ｈｏｓ２、その活性断片およびその相同体を阻害するのに有用である、ヒドロキサム酸塩をベースとする化合物、好ましくは式（Ｄ）：
【化２】
【０１５５】
式中、
Ｒは、アルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリールまたはヘテロシクリル、好ましくはシクロアルキル、アリール、ヘテロアリールまたはヘテロシクリルであり、これらのすべては随意に置換されていてもよく；
ｘは、０〜５の整数であり、ここで、長さｘの鎖は随意に置換されており、およびここで、長さｘの鎖の１個または２個の炭素原子は、随意にヘテロ原子で置換されており；
ｎは、０〜２の整数であり；および
Ｙは、Ｈおよび複素環基からなる群から選択され；および
フェニレンは随意に置換されている、
で表される化合物、およびそのＮ−オキシド、水和物、溶媒和物、薬学的に許容し得る塩、プロドラッグまたは複合体、ならびにこれらのラセミ混合物およびスケールミック混合物、ジアステレオマーおよびエナンチオマーを包含する。
【０１５６】
式（Ｄ）で表される化合物の好ましい態様において、ｘが４の場合ｎは２ではなく、ｘが３の場合ｎは３ではない。
【０１５７】
本発明の化合物の好ましい態様において、Ｒは、随意に、１つまたは２つ以上、好ましくは１つ〜約３つ、より好ましくは１つまたは２つの置換基を有し、これは、好ましくは、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、好ましくはＣ１〜Ｃ４アルキル；ハロ、好ましくはＣｌ、ＢｒまたはＦ；ハロアルキル、好ましくは（ハロ）１〜５（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、より好ましくは（ハロ）１〜５（Ｃ１〜Ｃ３）アルキル、および最も好ましくはＣＦ３；Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、好ましくはメトキシ、エトキシまたはベンジルオキシ；Ｃ６〜Ｃ１０アリールオキシ、好ましくはフェノキシ；Ｃ１〜Ｃ６アルコキシカルボニル、好ましくはＣ１〜Ｃ３アルコキシカルボニル、最も好ましくはカルボメトキシまたはカルボエトキシ；Ｃ６〜Ｃ１０アリール、好ましくはフェニル；（Ｃ６〜Ｃ１０）アル（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、好ましくは（Ｃ６〜Ｃ１０）アル（Ｃ１〜Ｃ３）アルキル、より好ましくはベンジル、ナフチルメチルまたはフェネチル；ヒドロキシ（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、好ましくはヒドロキシ（Ｃ１〜Ｃ３）アルキル、より好ましくはヒドロキシメチル；アミノ（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、好ましくはアミノ（Ｃ１〜Ｃ３）アルキル、より好ましくはアミノメチル；（Ｃ１〜Ｃ６）アルキルアミノ、好ましくはメチルアミノ、エチルアミノまたはプロピルアミノ；ジ（Ｃ１〜Ｃ６）アルキルアミノ、好ましくはジメチルアミノまたはジエチルアミノ；（Ｃ１〜Ｃ６）アルキルカルバモイル、好ましくはメチルカルバモイル、ジメチルカルバモイルまたはベンジルカルバモイル；（Ｃ６〜Ｃ１０）アリールカルバモイル、好ましくはフェニルカルバモイル；（Ｃ１〜Ｃ６）アルカンアシルアミノ、好ましくはアセチルアミノ；（Ｃ６〜Ｃ１０）アレーンアシルアミノ、好ましくはベンゾイルアミノ；（Ｃ１〜Ｃ６）アルカンスルホニル、好ましくはメタンスルホニル；（Ｃ１〜Ｃ６）アルカンスルホンアミド、好ましくはメタンスルホンアミド；（Ｃ６〜Ｃ１０）アレーンスルホニル、好ましくはベンゼンスルホニルまたはトルエンスルホニル；（Ｃ６〜Ｃ１０）アレーンスルホンアミド、好ましくはベンゼンスルホニルまたはトルエンスルホニル；（Ｃ６〜Ｃ１０）アル（Ｃ１〜Ｃ６）アルキルスルホンアミド、好ましくはベンジルスルホンアミド；Ｃ１〜Ｃ６アルキルカルボニル、好ましくはＣ１〜Ｃ３アルキルカルボニル、より好ましくはアセチル；（Ｃ１〜Ｃ６）アシルオキシ、好ましくはアセトキシ；シアノ；アミノ；カルボキシ；ヒドロキシ；ウレイド；ニトロおよびオキソからなる群から選択される。
【０１５８】
本発明の化合物の他の好ましい態様において、Ｒは、非置換であるか、またはＣ１〜Ｃ４アルキル、Ｃ１〜Ｃ４ハロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、（Ｃ６〜Ｃ１０）アル（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、ハロ、ニトロ、ヒドロキシ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシカルボニル、カルボキシおよびアミノからなる群から独立して選択された１つまたは２つの置換基により置換されている。
本発明の化合物の好ましい態様において、Ｒは、フェニル、ピリジンまたはインドール、より好ましくはフェニルまたはインドール、より好ましくはフェニルである。
【０１５９】
本発明の化合物の好ましい態様において、Ｒは、アルキル、アルケニル、アルキニル、トリハロアルキル、ハロゲン、ＣＮ、アミジン、アルキルアミジン、スルホン、アルキルスルホン、イミデートおよびアルキルイミデートからなる群から独立して選択された１つまたは２つ以上の置換基で置換されている。
【０１６０】
本発明の化合物の好ましい態様において、Ｒは、フェニルまたはインドールであり、アルキル、アルケニル、アルキニル、トリハロアルキル、ハロゲン、ＣＮ、アミジン、アルキルアミジン、スルホン、アルキルスルホン、イミデートおよびアルキルイミデートからなる群から独立して選択された１つまたは２つ以上の置換基、より好ましくはアルキル、アルケニル、アルキニル、トリハロアルキルおよびハロゲンからなる群から独立して選択された１つまたは２つ以上の置換基で置換されている。
【０１６１】
本発明の化合物の好ましい態様において、ｘは、２〜４、より好ましくは３〜４の整数である。
本発明の化合物の好ましい態様において、ｎは、１〜２の整数、より好ましくは１である。
本発明の化合物の好ましい態様において、ＹはＨである。
本発明の化合物の好ましい態様において、長さｘの鎖の１個の炭素原子は、ヘテロ原子、好ましくはＳで置換されている。
【０１６２】
本明細書を通して、１つまたは２つ以上の化学置換基の好ましい態様が同定されている。好ましい態様の組合せもまた好ましい。
本発明の化合物の好ましい態様において、化合物は、
【化３】
からなる群、およびそのＮ−オキシド、水和物、溶媒和物、薬学的に許容し得る塩、プロドラッグまたは複合体、ならびにこれらのラセミ混合物およびスケールミック混合物、ジアステレオマーおよびエナンチオマーから選択される。
【０１６３】
本発明の化合物の好ましい態様において、化合物は、
【化４】
からなる群、およびそのＮ−オキシド、水和物、溶媒和物、薬学的に許容し得る塩、プロドラッグまたは複合体、ならびにこれらのラセミ混合物およびスケールミック混合物、ジアステレオマーおよびエナンチオマーから選択される。
【０１６４】
本発明の化合物の好ましい態様において、化合物は、
【化５】
およびそのＮ−オキシド、水和物、溶媒和物、薬学的に許容し得る塩、プロドラッグまたは複合体、ならびにこれらのラセミ混合物およびスケールミック混合物、ジアステレオマーおよびエナンチオマーである。
【０１６５】
本発明はさらに、本明細書に記載の化合物の、Ｈｏｓ２、その活性断片およびその相同体を阻害するための使用を提供する。
式（Ａ）〜式（Ｄ）で表される化合物は、Ｈｏｓ２、その活性断片およびその相同体を阻害するのに有用であるため、これらはＨｏｓ２を試験する研究ツールとして有用である。
【０１６６】
用語ＲＰＤ３、ＨＤＡ１、ＨＯＳ１、ＨＯＳ２、ＨＯＳ３およびＳＩＲ２は、当分野において知られている遺伝子を指し、以下における遺伝子を含む：S. cerevisiae、カンジダ種（好ましくはC. albicans、C. glabrata、C. krusei、C. parapsilosisおよびC. tropicalis）、アスペルギルス種（好ましくはA. fumigatus、A. terreus、A. nigerおよびA. flavus）、Cryptococcus neoformans、Pneumocystis carinii、およびこの群のそれらの株、ならびに任意の他の真菌およびそれらの株（限定することなく、接合菌類（Rhizopus arrhizusおよびケカビ種を含むがこれに限定されない）、新生カビ（Pseudallescheria boydii、フザリウム種および Paecilomyces lilacinusを含むがこれに限定されない）、コクシジオイデス種（C. immitisを含むがこれに限定されない）、ヒストプラスマ種、トリコスポロン種、および皮膚糸状菌、およびこの群のそれらの株を含む）、ならびにこれらのすべての相同体。
【０１６７】
野生型株は、機能するＲＰＤ３、ＨＤＡ１、ＨＯＳ１、ＨＯＳ２、ＨＯＳ３およびＳＩＲ２遺伝子活性を有する真菌株を指す。
用語ＲＰＤ３ノックアウト変異株、ＨＤＡ１ノックアウト変異株、ＨＯＳ１ノックアウト変異株、ＨＯＳ２ノックアウト変異株、ＨＯＳ３ノックアウト変異株およびＳＩＲ２ノックアウト変異株は、それぞれ、ＲＰＤ３、ＨＤＡ１、ＨＯＳ１、ＨＯＳ２、ＨＯＳ３またはＳＩＲ２遺伝子が機能しない真菌株を指す。
【０１６８】
用語「薬学的に許容し得る担体」は、細胞、細胞培養物、組織試料または身体中の生物システムと適合性であり、活性成分（１種または２種以上）の生物学的活性の有効性に干渉しない、無毒性の物質を意味することを意図する。したがって、本発明の組成物は、阻害剤および抗真菌剤に加えて、希釈剤、賦形剤、充填剤、塩、緩衝剤、安定剤、可溶化剤および／または当該分野において周知の他の物質を含んでいてもよい。薬学的に許容し得る処方の製剤の例は、例えば、Remington’s Pharmaceutical Sciences, 第１８版、A. Gennaro編、Mack Publishing Co., Easton, PA, 1990に記載されている。
当然のことながら、担体の特性は、特定の適用に対する投与経路に依存する。
【０１６９】
用語「薬学的に許容し得る塩」は、上で同定された化合物の所望の生物学的活性を維持し、望ましくない毒性作用を最小に示すかまたは全く示さない塩を意味することを意図する。このような塩の例には、無機酸（例えば塩酸、臭化水素酸、硫酸、リン酸、硝酸など）により生成される酸付加塩、ならびに有機酸、例えば酢酸、シュウ酸、酒石酸、コハク酸、リンゴ酸、アスコルビン酸、安息香酸、タンニン酸、パモン酸、アルギン酸、ポリグルタミン酸、ナフタレンスルホン酸、ナフタレンジスルホン酸およびポリガラクツロン酸により生成される塩が含まれるが、これらには限定されない。当該化合物はまた、当業者に知られている薬学的に許容し得る第四級塩の形態であってもよく、特に、式−ＮＲ＋Ｚ−で表される第四級アンモニウム塩を含み、式中Ｒは水素、アルキルまたはベンジルであり、Ｚは対イオンであり、塩化物、臭化物、ヨウ化物、−Ｏ−アルキル、トルエンスルホン酸、メチルスルホン酸、スルホン酸、リン酸またはカルボン酸（例えば安息香酸、コハク酸、酢酸、グリコール酸、マレイン酸、リンゴ酸、クエン酸、酒石酸、アスコルビン酸、安息香酸、ケイ皮酸、マンデル酸、ベンジル酸およびジフェニル酢酸)を含む。本明細書中で用いる場合、用語「塩」はまた、例えばアルカリ金属またはアルカリ土類金属との錯体を包含することを意味する。
【０１７０】
本発明の組成物の活性化合物は、薬学的に許容し得る担体中に、組成物を投与する個体に対して重大な有毒な効果を生じずに有効な所望の量を送達するのに十分な量で含まれる。
【０１７１】
用語「相同体」は、当分野で用いられる一般名であり、参照配列に対して高度の配列関連性を有するポリヌクレオチドまたはポリペプチド配列を意味することを意図する。かかる関連性は、当業者による決定に従って２つの配列間の同一性および／または類似性の程度を決定することにより、定量化することができる。この一般名に含められるのは、用語「オルソログ」および「パラログ」である。「オルソログ」は、他の種のポリヌクレオチドまたはポリペプチドに機能的に等価である、ポリヌクレオチドまたはポリペプチドを指す。「パラログ」は、機能的に類似である、同じ種内のポリヌクレオチドまたはポリペプチドを指す。
【０１７２】
用語「同一性」は、配列を比較することにより決定される、２もしくは３以上のポリペプチド配列間、または２もしくは３以上のポリヌクレオチド配列間の関係を意味することを意図する。一般に、同一性は、２つのポリヌクレオチドまたは２つのポリペプチド配列の、比較される配列の長さにわたる、それぞれヌクレオチド対ヌクレオチドまたはアミノ酸対アミノ酸の正確な一致を指す。
【０１７３】
正確に一致しない配列については、「％同一性」を決定してもよい。一般に、比較する２つの配列を整列させて、配列間の最大相関を得る。これには、片方または両方の配列中に「ギャップ」を挿入して、整列の度合いを強化してもよい。％同一性は、比較する各配列の全長にわたって決定することもでき（いわゆるグローバルアライメント）、これは同一または非常によく似た長さの配列に特に好適であり、または、より短い、規定の長さにわたって決定することもでき（いわゆるローカルアライメント）、これは異なる長さの配列に対してより好適である。
【０１７４】
用語「類似性」はさらに、２つのポリペプチド配列間の関係のより高度な測度を意味することを意図している。一般に「類似性」は、残基対残基ベースでの２本のポリペプチド鎖のアミノ酸の間の比較であって、（同一性を）比較する配列それぞれから１つずつとった残基対の間の正確な一致だけでなく、正確な一致がない場合には、進化的ベースで、１つの残基が他に対する置換となり得るかどうかをも考慮したものである。この確度は、関連する「スコア」を有し、これから２つの配列の「％類似性」が決定できる。
【０１７５】
ポリペプチド配列に対して、保守的な置換は、配列中のある位置における１つのアミノ酸を、同じクラスの他のアミノ酸（例えば、疎水性、電荷、ｐＫまたは他の立体配座的または化学的特性を共有するアミノ酸、例えばレクチンに対するバリン、リジンに対するアルギニン）で置換すること、または、ポリペプチドの生物活性を破壊する程にはポリペプチドの立体配座もしくは折りたたみを変えない配列の位置における、１または２以上の非保守的なアミノ酸の置換、欠失、または挿入からなる。「保守的な置換」の例は、１つの非極性（疎水性）残基、例えばイソロイシン、バリン、ロイシンまたはメチオニンを、他のもので置換すること；１つの極性（親水性）残基を他のもので置換すること、例えばアルギニンとリジンの間、グルタミンとアルパラギンの間、スレオニンとセリンの間；１つの塩基性残基、例えばリジン、アルギニンまたはヒスチジンを他のもので置換すること；または１つの酸性残基、例えばアスパラギン酸またはグルタミン酸を他のもので置換すること；または化学的に誘導体化された残基を、非誘導体化残基の代わりに用いること；を含み、ただし、ポリペプチドは必要な生物活性を示すものとする。
【０１７６】
２または３以上の配列の同一性および類似性を比較するための方法は、当分野でよく知られている；例えば、ＢＬＡＳＴファミリープログラム（Altschul S F et al., J Mol Biol, 215, 403-410,1990, Altschul S F et al., Nucleic Acids Res., 25:389-3402, 1997、全米バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）Bethesda, Md., USAより入手可能であり、またＮＣＢＩのホームページhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/を通してアクセス可能）などである。
【０１７７】
したがって本発明は、サッカロマイセス・セレヴィシエ（Saccharomyces cerevisiae）ＨＯＳ２遺伝子およびＨｏｓ２タンパク質の相同体も包含し、ここで相同な遺伝子およびタンパク質の源は任意の他の真菌種であることができ、例えばカンジダおよびアスペルギルス、および本明細書に記載されているように他の種およびそれらの株を含むが、これらに限定されない。真菌種の間、例えばサッカロマイセスとカンジダの間で、遺伝子相同体は実質的な配列の類似性を有し、例えば、少なくとも５０％の配列同一性、少なくとも７５％の配列同一性、通常少なくとも９０％の配列同一性、さらに通常は少なくとも９０％の配列同一性を、ヌクレオチド配列間に有する。
【０１７８】
Ｈｏｓ２タンパク質相同体は、サッカロマイセス・セレヴィシエＨｏｓ２タンパク質に対して、少なくとも約３５％の、好ましくは少なくとも約４０％の、より好ましくは少なくとも約６０％の、さらにより好ましくは少なくとも約８０％の、さらに好ましくは少なくとも約９０％の、さらにより好ましくは少なくとも約９５％の、アミノ酸配列同一性を有するタンパク質を意味する。
本発明はまた、Ｈｏｓ２ポリペプチドの対立遺伝子多型およびこれをコーディングする核酸も包含する；これはすなわち、アミノ酸またはヌクレオチド配列間の差が遺伝的多型（集団内での個体間の対立遺伝子変異）に起因している、かかるポリペプチドおよび核酸の天然の代替形態である。天然および人工的に生じるＨＯＳ変異体もまた、本発明に包含される。
【０１７９】
本発明のＨＯＳ２の相同体および対立遺伝子は、例えば、当業者に知られた従来技術により同定することができる。例えば、S. cerevisiaeＨＯＳ２のCandida glabrata相同体は、ＨＯＳ２をコーディングするポリヌクレオチドから好適なプローブまたはプライマーを作製し、好適な核酸源を、例えばC. glabrataｃＤＮＡライブラリなどの所望の種からスクリーニングし、陽性のクローンを選択することにより、単離および同定することができる。したがって本発明の１つの側面は、Ｈｏｓ２相同体ポリペプチドをコーディングし、ＨＯＳ２をコーディングする核酸領域に対応する核酸の配列を含む核酸分子とストリンジェントな条件化でハイブリッド形成する、核酸配列である。本明細書で用いる場合、用語「ストリンジェントな条件」とは、当分野で精通のパラメータを指す。
【０１８０】
用語「抗真菌剤」は、真菌細胞の増殖、生存能力および／または複製を阻害するかまたは防止することができる物質を意味することを意図する。好ましい抗真菌剤は、動物または植物における真菌感染を防止するかまたは処置することができるものである。好ましい抗真菌剤は、広範囲の抗真菌剤である。しかし、抗真菌剤はまた、真菌の１種または２種以上の特定の種に特異的であってもよい。
【０１８１】
用語「ヒストンデアセチラーゼ阻害剤」および「ヒストンデアセチラーゼの阻害剤」は、ヒストンデアセチラーゼと相互作用し、この酵素活性を阻害することができる化合物を意味することを意図する。「ヒストンデアセチラーゼの酵素活性を阻害する」とは、ヒストンデアセチラーゼがアセチル基を、ヒストンを含むがこれに限定されないタンパク質から除去する能力を、低下させることを意味する。いくつかの好ましい態様において、かかるヒストンデアセチラーゼ活性の低下は、少なくとも約５０％、より好ましくは少なくとも約７５％、なおより好ましくは少なくとも約９０％である。他の好ましい態様において、ヒストンデアセチラーゼ活性は、少なくとも９５％、またより好ましくは少なくとも９９％低下する。本発明のいくつかの好ましい態様において、ヒストンデアセチラーゼはＨｏｓ２またはその相同体である。
【０１８２】
ヒストンデアセチラーゼ阻害剤は、ヒストンデアセチラーゼの活性における低下をもたらす任意の分子であってもよい。これには、タンパク質、ペプチド、抗体およびその活性断片、ＤＮＡ分子（アンチセンスを含む）、ＲＮＡ分子（ＲＮＡｉおよびアンチセンスを含む）ならびに小分子が含まれる。
【０１８３】
好ましくは、このような阻害は特異的であり、即ちヒストンデアセチラーゼ阻害剤は、ヒストンデアセチラーゼが他の無関連の生物学的効果を生じるのに必要な阻害剤の濃度より低い濃度で、ヒストンを含むがこれに限定されないタンパク質からアセチル基を除去する能力を低下させる。好ましくは、ヒストンデアセチラーゼ阻害活性に必要な阻害剤の濃度は、無関連の生物学的効果を生じるのに必要な濃度よりも、少なくとも２倍低く、より好ましくは少なくとも５倍低く、さらにより好ましくは少なくとも１０倍低く、最も好ましくは少なくとも２０倍低い。
【０１８４】
本発明の好ましい態様において、ヒストンデアセチラーゼ阻害剤は、全ての特異的ヒストンデアセチラーゼアイソフォームより少ない、１種または２種以上のヒストンデアセチラーゼアイソフォームを阻害する。好ましいヒストンデアセチラーゼアイソフォームは、クラスＩおよびクラスＩＩ酵素を含む。特異的ＨＤＡＣとしては、Ｒｐｄ３、Ｈｏｓ１、Ｈｏｓ２、Ｈｄａ１、Ｈｏｓ３、Ｓｉｒ２およびＨｓｔタンパク質、ならびのそれらの相同体が挙げられるが、これに限定されない。本発明の好ましい態様において、ヒストンデアセチラーゼ阻害剤はＨｏｓ２を阻害する。
【０１８５】
用語「ヒストンデアセチラーゼ遺伝子阻害剤」および「ヒストンデアセチラーゼ遺伝子発現の阻害剤」は、ヒストンデアセチラーゼをコーディングする核酸と、またはヒストンデアセチラーゼ活性を有するタンパク質をコーディングする核酸と相互作用することができて、効率的ヒストンデアセチラーゼ活性を有する産物を発現する、該核酸の能力を阻害することができる化合物を意味することを意図する。発現の阻害は、転写および／または翻訳のレベルにおけるものであってよい。いくつかの好ましい態様において、かかる発現の低下は、少なくとも約５０％、より好ましくは少なくとも約７５％、なおより好ましくは少なくとも約９０％である。他の好ましい態様において、発現は、少なくとも９５％、またより好ましくは少なくとも９９％低下する。本発明のいくつかの好ましい態様において、核酸はＨＯＳ２またはその相同体をコーディングする。
【０１８６】
ヒストンデアセチラーゼ遺伝子阻害剤は、効率的ヒストンデアセチラーゼ活性を有する産物の発現における低下をもたらす任意の分子であってもよい。これには、タンパク質、ペプチド、抗体およびその活性断片、ＤＮＡ分子（アンチセンスを含む）、ＲＮＡ分子（ＲＮＡｉおよびアンチセンスを含む）ならびに小分子が含まれる。
【０１８７】
好ましくは、このような阻害は特異的であり、即ちヒストンデアセチラーゼ遺伝子阻害剤は、他の無関連の生物学的効果を生じるのに必要な阻害剤の濃度より低い濃度で、効率的ヒストンデアセチラーゼ活性を有する産物を発現する能力を低下させる。好ましくは、阻害活性に必要な阻害剤の濃度は、無関連の生物学的効果を生じるのに必要な濃度よりも、少なくとも２倍低く、より好ましくは少なくとも５倍低く、さらにより好ましくは少なくとも１０倍低く、最も好ましくは少なくとも２０倍低い。
【０１８８】
用語「阻害有効量」は、真菌ＨＤＡＣ活性の、好ましくは細胞内での真菌ＨＤＡＣ活性の、阻害を引き起こすのに十分な投与量を表すことを意味し、ここで細胞は多細胞生物内に存在することができる。真菌は、植物または哺乳動物、好ましくはヒトに感染することができ、したがって、植物または哺乳動物の内部および／または上に位置することができる。真菌が多細胞生物内または上にある場合、本発明のこの側面による方法は、該生物に、本発明の化合物または組成物を投与することを含む。投与は任意の経路であってよく、非経口、経口、舌下、経皮的、局所的、鼻腔内、気管内、静脈内または直腸内を含むが、これらに限定されない。ある特に好ましい態様において、本発明の組成物を、病院の設備において静脈内投与する。特定の他の好ましい態様において、投与は、好ましくは経口経路によるものであってもよい。
【０１８９】
本明細書中で用いる用語「治療的有効量」は、患者に投与された場合に、所望の治療的効果を引き出す、本発明の化合物の量である。治療的効果は、処置される疾患および望まれる結果に依存する。したがって、治療的効果は、疾患状態の処置であることができる。さらに、治療的効果は、Ｈｏｓ２活性の阻害またはＨＯＳ２発現の阻害であることができる。「治療的有効量」を構成する本発明の化合物の量は、化合物、疾患状態およびその重篤度、処置されるべき患者の年齢などに依存して変化する。治療的有効量は、当業者により常習的に決定することができる。
【０１９０】
本発明の目的のために本明細書中で用いる場合、用語「患者」には、ヒトおよび他の動物、特に哺乳動物、ならびに他の生物が含まれる。したがって、本発明の化合物、組成物および方法は、ヒト療法と獣医学的用途との両方に適用可能である。好ましい態様において、患者は哺乳動物であり、最も好ましい態様において、患者はヒトである。
【０１９１】
本明細書中で用いる場合、用語「処置する」、「処置」などは、動物における疾患状態の処置を包含し、この疾患状態は、以下の少なくとも１つを含む：（ｉ）特に、動物が疾患状態に対する素因はあるが、未だ罹患しているとは診断されていない場合に、動物において疾患状態が発生するのを防止すること；（ｉｉ）疾患状態を阻害すること、即ちその進行を部分的または完全に停止させること；（ｉｉｉ）疾患状態を軽減すること、即ち疾患状態の症状の後退をもたらすこと、または疾患の症状を改善すること；および（ｉｖ）疾患状態の逆転または後退、好ましくは疾患の消失または治癒。本発明の好ましい態様において、動物は、哺乳動物、好ましくは霊長類、より好ましくはヒトである。当該分野において知られているように、全身対局所的送達、年齢、体重、全体的な健康状態、性別、食事、投与の時間、薬物の相互作用および状態の重篤度についての調整が必要であり得て、当業者による常習的な実験で決定することができる。
【０１９２】
本発明の好ましい態様において、ヒストンデアセチラーゼ阻害剤は、全ての特異的ヒストンデアセチラーゼアイソフォームより少ない、１種または２種以上のヒストンデアセチラーゼアイソフォームを阻害する。好ましいヒストンデアセチラーゼアイソフォームは、クラスＩおよびクラスＩＩ酵素に対する遺伝子を含む。特異的ＨＤＡＣ遺伝子としては、ＲＰＤ３、ＨＯＳ１、ＨＯＳ２、ＨＤＡ１、ＨＯＳ３、ＳＩＲ２およびＨＳＴ遺伝子、ならびのそれらの相同体が挙げられるが、これに限定されない。本発明の好ましい態様において、ヒストンデアセチラーゼはＨＯＳ２を阻害する。
【０１９３】
本発明は、純粋に哺乳動物への用途には限定されず、例えば農業および水産用途を包含し、例えば哺乳動物、魚類および植物の真菌感染の処置のための方法を含む。Smith and Edlind（上記）には、ＴＳＡが、エルゴステロール生合成経路がアリルアミンおよびアゾールのそれに従う農業用殺真菌剤であるモルホリン、フェンプロピモルフ（fenpropimorph）の最小阻害濃度を低下させたことが示されている。
【０１９４】
本発明は、以下の例を参照することによりさらに容易に理解されるが、これらは、本発明の範囲を限定するのではなく、本発明を例示するために示される。
【０１９５】
例１
酵母ＨＤＡＣ欠失株の生成
ＰＣＲ生成欠失戦略を用いて、各酵母の開始コドンから終止コドンまでのオープン・リーディング・フレームを、ＫａｎＭＸモジュールおよび２つのユニークな２０マー分子バーコードで系統的に置き換えた（Wach et al., Yeast 10: 1793-1808 (1994)参照）。この戦略および可能性のある結果を、それぞれ図１および図２に示す。タグの存在は、高密度のオリゴヌクレオチドアレイへのハイブリッド形成を介して検出することができ、これにより個々の株の増殖表現型が平行して解析できる。ＨＯＳ２欠失「カセット」を、２つの連続ＰＣＲ反応を用いて構成した。
【０１９６】
最初の増幅において、７４ｂｐのＵＰＴＡＧ
【化６】
プライマーを用いて、酵母ＲＰＤ３ヘテロ接合変異体（ＡＴＣＣより購入）から抽出したゲノムＤＮＡから、ＫａｎＭＸ遺伝子を増幅した；この変異体は、ＫａｎＭＸ発現が酵母に対してジェネティシン（Ｇ４１８）の優先選択を与えるｋａｎＭＸ４のＤＮＡを含む。これらのプライマーは以下からなる：ＯＲＦの５’または３’端（それぞれ開始コドンと終止コドンに直接隣接および遠位にある）のどちらかの横に位置する（５’：３’）：１８ｂｐのゲノム配列；全てのゲノム破壊に共通する１８および１７ｂｐの配列（U1: 5'-GATGTCCACGAGGTCTCT-3'またはD1: 5'-CGGTGTCGGTCTCGTAG-3'）；それぞれＫａｎＭＸカセットに相同性の、２０ｂｐのユニーク配列（「分子バーコード」ＴＡＧ）ならびに１８および１９ｂｐの配列（U2: 5'- CGTACGCTGCAGGTCGAC-3'またはD2: 5'-ATCGATGAATTCGAGCTCG -3'）。ＰＣＲは次のパラメータを用いて実施した：９４℃で３分間の変性；９４℃で３０秒間、５０℃で３０秒間、７２℃で２．５分間、３５サイクル；次に７２℃で１０分間の伸長（extension）。
【０１９７】
第２のＰＣＲ反応において、２つのＯＲＦ特異的４５マープライマー（UP_45およびDOWN_45）
【化７】
を用いて、ＯＲＦ特異的相同体を４５ｂｐに延長し、遺伝子破壊用カセットの有糸分裂組換えの間の標的特異性を増加させた。ＰＣＲは上記のようにして実施した。
【０１９８】
標準のリチウム−酢酸形質転換プロトコル（Gietz and Woods, Methods in Enzymology 350: 87-96 (2002)参照）を用いて、遺伝子破壊用カセットをハプロイド酵母細胞（BY4742: MATa his3D1 leu2D0 lys2D0 ura3D0）に導入した。
他のＨＤＡＣ欠失変異体は、同様の戦略に従い、それぞれ次のプライマーを用いて調製した。
【０１９９】
【化８】
【０２００】
【化９】
【０２０１】
例２
欠失変異株の抗真菌化合物感受性
標準の連続希釈技術を用いて、酵母欠失株の、種々の抗真菌剤に対する感受性を決定した。図３は、ＳｃＲＰＤ３欠失変異体が、ケトコナゾールまたはフルコナゾールに対して高感受性ではないことを示す。図４は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体が、ケトコナゾールに対して高感受性であることを示す。図５は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体が、イトラコナゾールに対して高感受性であることを示す。図６は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体が、ボリコナゾールに対して高感受性であることを示す。図７は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体が、フルコナゾールに対して高感受性であることを示す。図８は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体が、フェンプロピモルフに対して高感受性であることを示す。図９は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体が、テルビナジンに対して高感受性ではないことを示す。図１０は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体が、アムホテリシンＢに対して高感受性ではないことを示す。図１１は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体が、５−フルオロシトシンに対して高感受性ではないことを示す。図１２は、ＳｃＨＯＳ２欠失変異体が、ニッコーマイシンに対して高感受性ではないことを示す。図１３は、ＳｃＨＯＳ３およびＳｃＨｄａｌ欠失変異体が、イトラコナゾールに対して高感受性ではないことを示す。ＳｃＨＯＳ３およびＳｃＨｄａｌ欠失変異体はまた、他のアゾール類に対しても高感受性ではなかった（データ示さず）。
【０２０２】
組換えＨｉｓ６Ｖ５−タグＨｏｓ２ｐのS. cerevisiaeからの構成および発現
S. cerevisiaeからＹＧＬ１９４Ｃ／ＨＯＳ２をコーディングするＯＲＦ（終止コドンの上流１〜４５２残基）を、ＢＹ４７４２株（ATCC201389）から単離したゲノムＤＮＡおよび次のプライマーを用いて、ＴａｑＤＮＡポリメラーゼ（Invitrogen）でＰＣＲ増幅した：
【化１０】
ＰＣＲ増幅は次のようにして行った：９４℃で２分間の変性、続いてタッチアップＰＣＲ（９４℃で１分間の変性、４５〜５３℃で１分間のハイブリッド形成、この間各サイクル間で１．５分間に３℃の増加あり、７２℃での増幅）、続いて９４℃で１分間の変性、５３℃で１分間のハイブリッド形成、および７２℃で１．５分間の増幅を３０サイクル。〜１．４ｋｂのＰＣＲ産物をゲル精製し、ｐＹＥＳ２．１／Ｖ５−Ｈｉｓ−ＴＯＰＯベクターＴＯＰＯへのクローニングおよび続くＴＯＰ１０ One Shot Chemically Competent E. coliへの形質転換に用いたが、これはｐＹＥＳ２．１ＴＯＰＯ ＴＡ発現キット（Invitrogen, cat. #K4150-01）を製造業者の指示に従って用いて行った。ＨＯＳ２．Ｖ５−Ｈｉｓ６インサートの存在を形質転換物内でＰＣＲにより解析したが、これには、プライマーＭＹＧ１２１３およびＭＹＧ１２１２を、ｐＹＥＳ２．１ＴＯＰＯ ＴＡ発現キットと共に提供されるプライマーV5-Cterm-ReverseおよびGAL1-Forwardとそれぞれ一緒に用いて行った。２つの細菌クローン（ｐＹＥＳ２．１．ＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６＃２および＃７）から単離されたプラスミドｐＹＥＳ２．１．ＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６を用いて、S. cerevisiaeＢＹ４７４２（MATα his3delta1 leu2delta0 lys2delta0 ura3delta0, ATCC 201389）株およびΔｈｏｓ２同系遺伝子欠質株（社内で生成）を、S.c. EasyComp 形質転換キット（Invitrogen, cat. #5050-01）を製造業者の指示に従って用いて形質転換した。形質転換に用いた各プラスミドに対し、全細胞抽出物を、ＢＹ４７４２／ｐＹＥＳ２．１．ＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６およびΔｈｏｓ２／ｐＹＥＳ２．１．ＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６の３種類の個別のクローンから調製し、組換えＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６タンパク質の発現について、抗Ｖ５−ＨＲＰ抗体（Invitrogen, cat. #R961-25）を用いガラクトースによる２４時間の誘発に続いて試験した。ＢＹ４７４２／ｐＹＥＳ２．１．ＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６＃７およびΔｈｏｓ２／ｐＹＥＳ２．１．ＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６＃７株は、さらなる試験のために保持した。
【０２０３】
組換えＨｏｓ２タンパク質の誘発および精製
Ｈｏｓ２ｐ．Ｖ５Ｈｉｓ６発現のガラクトースによる誘発を、グルコースまたはラフィノースのどちらかを炭素源として用いて行い（pYES2.1 TOPO TA Expression Kit Manual, Invitrogen, cat. # K4150-01）、細胞溶解物を、ガラクトースの存在下または不在下で増殖させたＢＹ４７４２／ｐＹＥＳ２．１．ＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６＃７およびΔｈｏｓ２／ｐＹＥＳ２．１．ＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６＃７株から生成したスフェロプラストから調製した。スフェロプラストは、ＹＥＰＤ（ＢＹ４７４２、Δｈｏｓ２）、ＳＣ−ＵＲＡ＋２％グルコースもしくはラフィノース、またはＳＣ−ＵＲＡ＋１％グルコースもしくはラフィノース＋１％ガラクトース（ＢＹ４７４２／ｐＹＥＳ２．１．ＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６＃７およびΔｈｏｓ２／ｐＹＥＳ２．１．ＨＯＳ２．Ｖ５Ｈｉｓ６＃７）中で増殖させた細胞から、Franzusoff et al. (1991)によるリチケース（liticase）法を用いて調製した。Ｈｏｓ２ｐＶ５Ｈｉｓ６を含むかまたは含まない断片の収集は、ＩＭＡＣによりHis GraviTrap Affinity Columns（GE Healthcare cat. # 11-033-99）を用いて行った。結合緩衝液は製造業者の推薦に従い、一方、３種類の異なる溶出緩衝液は順番に用いた：２０ｍＭリン酸ナトリウム＋５００ｍＭのＮａＣｌ＋１００ｍＭ、２５０ｍＭまたは５００ｍＭのイミダゾール、ｐＨ７．４。断片はさらに、ＰＤ−１０（GE Healthcare, cat. # 17-0851-01）およびＮＡＰ−５脱塩カラム（GE Healthcare, cat. # 17-0853-02）を用いて脱塩した。１００、２５０または５００ｍＭのイミダゾールを含有する３種類の異なる緩衝液で溶出し、脱塩した断片を、ＨＤＡＣ活性についてアッセイした（以下を参照）。高い内因性ＨＤＡＣ活性を含む対応する断片（２０ｍＭリン酸ナトリウム＋５００ｍＭのＮａＣｌ＋２５０ｍＭイミダゾール）のみを、さらなる試験のために保持した。
【０２０４】
ＨＤＡＣアッセイ
組換えＨｏｓ２ｐ．Ｖ５Ｈｉｓ６を含む断片を、ＨＤＡＣ阻害剤（０〜２０μｇ／ｍｌ）の存在下または不在下で２時間インキュベートした。ガラクトース誘発に続いて発現した組換えＨｏｓ２ｐ．Ｖ５Ｈｉｓ６と特異的に関連するＨＤＡＣ活性は、次の仮定のもとで決定した。
ＦｌｕｏHos2p.V5His6 specific = Ｆｌｕｏ+galactose−Ｆｌｕｏ-galactose
式中、
Ｆｌｕｏ+galactose＝Ｈｏｓ２ｐ．Ｖ５Ｈｉｓ６と共に精製された全ＨＤＡＣに関連するＨＤＡＣ活性
Ｆｌｕｏ+glucose＝Ｈｏｓ２ｐ．Ｖ５Ｈｉｓ６不在で精製された全ＨＤＡＣに関連するＨＤＡＣ活性
【０２０５】
阻害アッセイの結果を表１にまとめる。表に見られるように、精製されたＨｏｓ２タンパク質は、５ｕｇ／ｍｌの化合物４により、６０％より多く阻害された。
【表１】
【０２０６】
組換えＳｃＨｏｓ２タンパク質はイトラコナゾールに対するＨｏｓ２欠失変異体の感受性の克服を支援する
最小阻害濃度（ＭＩＣ）試験を、酵母試験に対するＣＬＳＩ Ｍ２７−Ａ２法にしたがって、２％ラフィノースまたは１％ラフィノースのどちらか＋１％ガラクトースを炭素源として含む、ＣＳＭ−ＵＲＡ培地（完全合成培地からウラシルを引いたもの）を用いて行った。イトラコナゾール濃度は、０．０１〜１０μｇ／ｍｌの範囲であった。ＣＳＭ−ＵＲＡ＋２％ラフィノース、またはＣＳＭ−ＵＲＡ＋１％ラフィノース＋１％ガラクトース中で増殖したログ相の細胞を、５×１０３細胞／ｍｌで播種した。イトラコナゾールのＭＩＣ８０は、３０℃で７２時間後に決定した。
【０２０７】
図１４に示すように、ＷＴ／ＳｃＨＯＳ２とΔｈｏｓ２／ＳｃＨＯＳ２との間には、イトラコナゾールに対する感受性について、ラフィノースの存在下で増殖した場合には４倍の感受性の差があったが、Ｈｏｓ２の発現がガラクトースにより誘発された場合には、感受性の差は２倍であった。
【０２０８】
本発明を、この特定の態様に関連させて記載したが、これは、さらに改変することが可能であり、本出願は、一般的に本発明の原理に従い、本発明が関連する分野内の既知または一般的な実施内にあり、本明細書において前に述べた本質的な特徴に対して適用され得、添付した特許請求の範囲内にある、本開示からの逸脱を含む、本発明のすべての変化、使用または適合を包含することを意図することが、理解される。
【特許請求の範囲】
【請求項１】
化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングするための、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするための方法であって、前記方法は、ＨＤＡＣ変異真菌株を提供すること（ここで変異はこれによりコードされるタンパク質の機能の損失をもたらす）および前記ＨＤＡＣ変異真菌株を化合物に接触させることを含み、ここで前記ＨＤＡＣ変異真菌株の前記試験化合物に対する感受性が、前記化合物を潜在的抗真菌活性を有するものとして同定し、前記活性は、ＨＤＡＣ遺伝子もしくはその相同体の、またはＨＤＡＣ遺伝子産物もしくはその相同体の阻害によって増強される、前記方法。
【請求項２】
化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングするための、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするための方法であって、前記方法は、真菌ＨＤＡＣタンパク質もしくはその相同体またはそれらの活性断片を提供すること、および前記タンパク質もしくはその相同体またはそれらの活性断片を化合物と接触させることを含み、ここで前記タンパク質もしくはその相同体またはそれらの活性断片のＨＤＡＣ活性の阻害が、前記化合物を、潜在的抗真菌活性を有するか、または抗真菌剤の抗真菌活性を増強する能力を有するものとして同定する、前記方法。
【請求項３】
抗真菌化合物を、抗真菌ＨＤＡＣ阻害剤との潜在的相乗作用について試験するための方法であって、前記方法は、ＨＯＳ２ノックアウト真菌株を提供すること、ノックアウト変異株を試験化合物で処理すること、ＨＯＳ２ノックアウト真菌株の試験化合物に対する感受性を決定すること、野生型株、ＲＰＤ３ノックアウト変異株、ＨＤＡ１ノックアウト変異株、ＨＯＳ１ノックアウト変異株、ＨＯＳ３ノックアウト変異株およびＳＩＲ２ノックアウト変異株からなる群から選択される１種または２種以上の対照真菌株を提供すること、１種または２種以上の対照真菌株を試験化合物で処理すること、１種または２種以上の対照真菌株の試験株に対する感受性を決定すること、およびＨＯＳ２ノックアウト株の試験化合物に対する感受性を、１種または２種以上の対照真菌株の試験株に対する感受性と比較することを含み、ここで、ＨＯＳ２ノックアウト変異株が試験化合物に対して、１種または２種以上の対照株より感受性が高ければ、試験化合物はＨＯＳ２阻害剤との相乗作用を有する抗真菌化合物であると考えられる、前記方法。
【請求項４】
真菌増殖を阻害するための方法であって、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む、前記方法。
【請求項５】
抗真菌化合物の存在下における真菌のトレーリング発育を阻害するための方法であって、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む、前記方法。
【請求項６】
抗真菌化合物に対する真菌の耐性を阻害するための方法であって、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む、前記方法。
【請求項７】
抗真菌化合物の存在下における真菌の生存を阻害するための方法であって、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む、前記方法。
【請求項８】
抗真菌化合物の抗真菌活性に抵抗する、真菌の能力を低下させるための方法であって、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む、前記方法。
【請求項９】
真菌の、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはＨＯＳ２遺伝子産物もしくはその相同体の活性の阻害により増強される抗真菌化合物に対する感受性を、増強するための方法であって、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害することを含む、前記方法。
【請求項１０】
抗真菌化合物の抗真菌活性を増強するための方法であって、該抗真菌化合物の活性は、ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはＨＯＳ２遺伝子産物もしくはその相同体の活性の阻害により増強されるものであり、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害することを含む、前記方法。
【請求項１１】
真菌感染を有する生物を治療的に処置するための方法であって、真菌感染を有する生物において真菌ＨＯＳ２もしくはその真菌相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および該生物を、その活性がＨＯＳ２もしくはその真菌相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処置することを含む、前記方法。
【請求項１２】
生物において真菌感染を予防するための方法であって、該生物を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処置すること、および該生物を、ＨＯＳ２および／またはＨｏｓ２阻害化合物で予防的に処置することを含む、前記方法。
【請求項１３】
抗真菌化合物の増強剤を同定するための方法であって、真菌株に試験化合物を投与すること、試験化合物がＨＯＳ２またはその相同体の発現を阻害するかどうかを決定すること、および、試験化合物がＨＯＳ２またはその相同体を阻害した場合に、試験化合物を抗真菌化合物の増強剤として同定することを含む、前記方法。
【請求項１４】
Ｈｏｓ２もしくはその相同体、または真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の、阻害剤。
【請求項１５】
請求項１４に記載の阻害剤および薬学的に許容し得る担体を含む、組成物。
【請求項１６】
Ｈｏｓ２またはその相同体を阻害する方法であって、Ｈｏｓ２またはその相同体を、請求項１４に記載の阻害剤と接触させることを含む、前記方法。
【請求項１７】
ＨＯＳ２またはその相同体を阻害する方法であって、ＨＯＳ２またはその相同体を、請求項１４に記載の阻害剤と接触させることを含む、前記方法。
【請求項１８】
Ｈｏｓ２またはその相同体の阻害剤が、ヒドロキサム酸塩化合物である、請求項１４に記載の阻害剤。
【請求項１】
化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングするための、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするための方法であって、前記方法は、ＨＤＡＣ変異真菌株を提供すること（ここで変異はこれによりコードされるタンパク質の機能の損失をもたらす）および前記ＨＤＡＣ変異真菌株を化合物に接触させることを含み、ここで前記ＨＤＡＣ変異真菌株の前記試験化合物に対する感受性が、前記化合物を潜在的抗真菌活性を有するものとして同定し、前記活性は、ＨＤＡＣ遺伝子もしくはその相同体の、またはＨＤＡＣ遺伝子産物もしくはその相同体の阻害によって増強される、前記方法。
【請求項２】
化合物を潜在的抗真菌活性についてスクリーニングするための、および／または抗真菌剤を増強する能力を有する化合物をスクリーニングするための方法であって、前記方法は、真菌ＨＤＡＣタンパク質もしくはその相同体またはそれらの活性断片を提供すること、および前記タンパク質もしくはその相同体またはそれらの活性断片を化合物と接触させることを含み、ここで前記タンパク質もしくはその相同体またはそれらの活性断片のＨＤＡＣ活性の阻害が、前記化合物を、潜在的抗真菌活性を有するか、または抗真菌剤の抗真菌活性を増強する能力を有するものとして同定する、前記方法。
【請求項３】
抗真菌化合物を、抗真菌ＨＤＡＣ阻害剤との潜在的相乗作用について試験するための方法であって、前記方法は、ＨＯＳ２ノックアウト真菌株を提供すること、ノックアウト変異株を試験化合物で処理すること、ＨＯＳ２ノックアウト真菌株の試験化合物に対する感受性を決定すること、野生型株、ＲＰＤ３ノックアウト変異株、ＨＤＡ１ノックアウト変異株、ＨＯＳ１ノックアウト変異株、ＨＯＳ３ノックアウト変異株およびＳＩＲ２ノックアウト変異株からなる群から選択される１種または２種以上の対照真菌株を提供すること、１種または２種以上の対照真菌株を試験化合物で処理すること、１種または２種以上の対照真菌株の試験株に対する感受性を決定すること、およびＨＯＳ２ノックアウト株の試験化合物に対する感受性を、１種または２種以上の対照真菌株の試験株に対する感受性と比較することを含み、ここで、ＨＯＳ２ノックアウト変異株が試験化合物に対して、１種または２種以上の対照株より感受性が高ければ、試験化合物はＨＯＳ２阻害剤との相乗作用を有する抗真菌化合物であると考えられる、前記方法。
【請求項４】
真菌増殖を阻害するための方法であって、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む、前記方法。
【請求項５】
抗真菌化合物の存在下における真菌のトレーリング発育を阻害するための方法であって、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む、前記方法。
【請求項６】
抗真菌化合物に対する真菌の耐性を阻害するための方法であって、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む、前記方法。
【請求項７】
抗真菌化合物の存在下における真菌の生存を阻害するための方法であって、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む、前記方法。
【請求項８】
抗真菌化合物の抗真菌活性に抵抗する、真菌の能力を低下させるための方法であって、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および、真菌を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処理することを含む、前記方法。
【請求項９】
真菌の、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはＨＯＳ２遺伝子産物もしくはその相同体の活性の阻害により増強される抗真菌化合物に対する感受性を、増強するための方法であって、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害することを含む、前記方法。
【請求項１０】
抗真菌化合物の抗真菌活性を増強するための方法であって、該抗真菌化合物の活性は、ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはＨＯＳ２遺伝子産物もしくはその相同体の活性の阻害により増強されるものであり、真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害することを含む、前記方法。
【請求項１１】
真菌感染を有する生物を治療的に処置するための方法であって、真菌感染を有する生物において真菌ＨＯＳ２もしくはその真菌相同体の発現を阻害すること、またはその遺伝子産物の活性を阻害すること、および該生物を、その活性がＨＯＳ２もしくはその真菌相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処置することを含む、前記方法。
【請求項１２】
生物において真菌感染を予防するための方法であって、該生物を、その活性がＨＯＳ２もしくはその相同体の発現の阻害またはその遺伝子産物の活性の阻害により増強される抗真菌化合物で処置すること、および該生物を、ＨＯＳ２および／またはＨｏｓ２阻害化合物で予防的に処置することを含む、前記方法。
【請求項１３】
抗真菌化合物の増強剤を同定するための方法であって、真菌株に試験化合物を投与すること、試験化合物がＨＯＳ２またはその相同体の発現を阻害するかどうかを決定すること、および、試験化合物がＨＯＳ２またはその相同体を阻害した場合に、試験化合物を抗真菌化合物の増強剤として同定することを含む、前記方法。
【請求項１４】
Ｈｏｓ２もしくはその相同体、または真菌ＨＯＳ２もしくはその相同体の、阻害剤。
【請求項１５】
請求項１４に記載の阻害剤および薬学的に許容し得る担体を含む、組成物。
【請求項１６】
Ｈｏｓ２またはその相同体を阻害する方法であって、Ｈｏｓ２またはその相同体を、請求項１４に記載の阻害剤と接触させることを含む、前記方法。
【請求項１７】
ＨＯＳ２またはその相同体を阻害する方法であって、ＨＯＳ２またはその相同体を、請求項１４に記載の阻害剤と接触させることを含む、前記方法。
【請求項１８】
Ｈｏｓ２またはその相同体の阻害剤が、ヒドロキサム酸塩化合物である、請求項１４に記載の阻害剤。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【公表番号】特表２０１０−５０００３３（Ｐ２０１０−５０００３３Ａ）
【公表日】平成２２年１月７日（２０１０．１．７）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００９−５２３９９５（Ｐ２００９−５２３９９５）
【出願日】平成１９年８月９日（２００７．８．９）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００７／０７５５６３
【国際公開番号】ＷＯ２００８／０２１９４４
【国際公開日】平成２０年２月２１日（２００８．２．２１）
【出願人】（５００３０１０２７）メチルジーン インコーポレイテッド (9)
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２２年１月７日（２０１０．１．７）
【国際特許分類】
【出願日】平成１９年８月９日（２００７．８．９）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００７／０７５５６３
【国際公開番号】ＷＯ２００８／０２１９４４
【国際公開日】平成２０年２月２１日（２００８．２．２１）
【出願人】（５００３０１０２７）メチルジーン インコーポレイテッド (9)
【Ｆターム（参考）】
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