新規なグリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼ（ＧＡＴ）遺伝子
グリホセートのアセチル化を触媒できる蛋白質および他の構造的に関連する蛋白質を含めた新規な蛋白質がここに提供される。また、これらの蛋白質をコードすることができる新規なポリヌクレオチド、これらの新規な蛋白質および／またはポリヌクレオチドの１つ以上を含む組成物、これらの新規な化合物を含む組換え細胞およびトランスジェニック植物、新規な化合物に関連する多様化方法、および該化合物を用いる方法も提供される。本明細書中で提供される新規な方法および化合物のいくつかを用いて、植物のような生物をグリホセートに対して抵抗性とすることができる。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
単離されたポリヌクレオチドまたは組み換えポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチドは、以下：
（ａ）ＢＬＯＳＵＭ６２行列、ギャップ存在ペナルティ１１、およびギャップ伸長ペナルティ１を使用して、配列番号３００、配列番号４４５および配列番号４５７からなる群より選択される配列と最適に整列させて、少なくとも４６０の類似性スコアを出し得るアミノ配列をコードするヌクレオチド配列であって、
ここで、該アミノ酸配列は、以下：
（ｉ）１８位および３８位に、Ｚ５アミノ酸残基；
（ｉｉ）６２位に、Ｚ１アミノ酸残基；
（ｉｉｉ）１２４位に、Ｚ６アミノ酸残基；および
（ｉｖ）１４４位に、Ｚ２アミノ酸残基、
からなる群より選択される少なくとも１つの制限に適合する、１つ以上のアミノ酸残基を含有し、
ここで：
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、ＭおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ２は、Ｆ、ＷおよびＹからなる群より選択されるアミノ酸残基であり、
Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸残基であり、
Ｚ６は、Ｃ、ＧおよびＰからなる群より選択されるアミノ酸残基である、
ヌクレオチド配列；または、
（ｂ）その相補的ヌクレオチド配列、
を含む、単離されたポリヌクレオチドまたは組み換えポリヌクレオチド。
【請求項２】
請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列中のアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）２位、４位、１５位、１９位、２６位、２８位、３１位、４５位、５１位、５４位、８６位、９０位、９１位、９７位、１０３位、１０５位、１０６位、１１４位、１２３位、１２９位、１３９位、および／または１４５位において、該アミノ酸残基は、Ｂ１である；および
（ｂ）３位、５位、８位、１０位、１１位、１４位、１７位、２４位、２７位、３２位、３７位、４７位、４８位、４９位、５２位、５７位、５８位、６１位、６３位、６８位、６９位、７９位、８０位、８２位、８３位、８９位、９２位、１００位、１０１位、１０４位、１１９位、１２０位、１２５位、１２６位、１２８位、１３１位、および／または１４３位において、該アミノ酸残基は、Ｂ２である；
に適合し、ここでＢ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、Ｙ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そしてＢ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項３】
請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、以下の制限：
（ａ）２位、４位、１５位、１９位、２６位、２８位、５１位、５４位、８６位、９０位、９１位、９７位、１０３位、１０５位、１０６位、１１４位、１２９位、１３９位、および／または１４５位において、該アミノ酸残基はＺ１である；
（ｂ）３１位および／または４５位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｃ）８位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｄ）８９位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ６である；
（ｅ）８２位、９２位、１０１位および／または１２０位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｆ）３位、１１位、２７位および／または７９位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｇ）１８位において、該アミノ酸残基はＺ４またはＺ５である；
（ｈ）１２３位において、該アミノ酸残基はＺ１またはＺ２である；
（ｉ）１２位、３３位、３５位、３９位、５３位、５９位、１１２位、１３２位、１３５位、１４０位および／または１４６位において、該アミノ酸残基はＺ１またはＺ３である；
（ｊ）３０位において、該アミノ酸残基はＺ１である；
（ｋ）６位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
（ｌ）８１位において、該アミノ酸残基はＺ２またはＺ４である；
（ｍ）１１３位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｎ）１３８位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｏ）１４２位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｐ）５７位および／または１２６位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ４である；；
（ｑ）５位、１７位および６１位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｒ）２４位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｓ）１０４位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｔ）５２位および／または６９位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｕ）１４位および／または１１９位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｖ）１０位、３２位、６３位および／または８３位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｗ）４８位および／または８０位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
（ｘ）４０位において、該アミノ酸残基はＺ１またはＺ２である；
（ｙ）９６位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ５である；
（ｚ）６５位において、該アミノ酸残基はＺ３、Ｚ４またはＺ６である；
（ａａ）８４位および／または１１５位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ａｂ）９３位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ａｃ）１３０位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ａｄ）５８位において、該アミノ酸残基はＺ３、Ｚ４またはＺ６である；
（ａｅ）４７位において、該アミノ酸残基はＺ４またはＺ６である；
（ａｆ）４９位および／または１００位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ４である；
（ａｇ）６８位において、該アミノ酸残基はＺ４またはＺ５である；
（ａｈ）１４３位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ａｉ）１３１位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ａｊ）１２５位および／または１２８位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ａｋ）６７位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ４である；
（ａｌ）６０位において、該アミノ酸残基はＺ５である；および
（ａｍ）３７位において、該アミノ酸残基はＺ４またはＺ６である；
に適合し、ここで
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ２は、Ｆ、Ｗ、およびＹからなる群より選択されるアミノ酸であり；
Ｚ３は、Ｎ、Ｑ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるアミノ酸であり；
Ｚ４は、Ｒ、Ｈ、およびＫからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；そして
Ｚ６は、Ｃ、Ｇ、およびＰからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項４】
請求項３に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで（ａ）〜（ａｍ）に特定される位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、（ａ）〜（ａｍ）において特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項５】
請求項１〜４のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであっって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、１３位、２０位、３６位、４２位、４６位、５０位、５６位、６４位、７０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１０７位、１１０位、１１７位、１１８位、１２１位および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＢ１である；および
（ｂ）１６位、２１位、２２位、２３位、２５位、２９位、３４位、４１位、４３位、４４位、５５位、６６位、７１位、７３位、７４位、７７位、８５位、８７位、８８位、９５位、９９位、１０２位、１０８位、１０９位、１１１位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＢ２である；
に適合し、ここでＢ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、Ｙ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そして
Ｂ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項６】
請求項１〜４のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、１３位、２０位、４２位、４６位、５０位、５６位、６４位、７０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１０７位、１１０位、１１７位、１１８位、１２１位および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＢ１である；および
（ｂ）１６位、２１位、２２位、２３位、２５位、２９位、３４位、３６位、４１位、４３位、４４位、５５位、６６位、７１位、７３位、７４位、７７位、８５位、８７位、８８位、９５位、９９位、１０２位、１０８位、１０９位、１１１位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位、および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＢ２である；
に適合し、ここで
Ｂ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、Ｙ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そして
Ｂ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項７】
請求項１〜４のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％は、以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、２０位、４２位、５０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１１０位、１２１位、および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＺ１である；
（ｂ）１３位、４６位、５６位、７０位、１０７位、１１７位、および／または１１８位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｃ）２３位、５５位、７１位、７７位、８８位、および／または１０９位において、該アミノ酸残基はＺ３であり；
（ｄ）１６位、２１位、４１位、７３位、８５位、９９位、および／または１１１位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｅ）３４位および／または９５位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｆ）２２位、２５位、２９位、４３位、４４位、６６位、７４位、８７位、１０２位、１０８位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位、および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
に適合し、ここで
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ２は、Ｆ、Ｗ、およびＹからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ３は、Ｎ、Ｑ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ４は、Ｒ、Ｈ、およびＫからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸であり；そしてＺ６は、Ｃ、Ｇ、およびＰからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項８】
請求項７に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、３６位において、Ｚ１およびＺ３からなる群より選択されるアミノ酸残基を含む、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項９】
請求項７または８に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、６４位において、Ｚ１およびＺ２からなる群より選択されるアミノ酸残基を含む、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１０】
請求項１〜９のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、以下の制限：
（ａ）２位において、該アミノ酸残基はＩまたはＬである；
（ｂ）３位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｃ）４位において、該アミノ酸残基はＶまたはＩである；
（ｄ）５位において、該アミノ酸残基はＫである；
（ｅ）６位において、該アミノ酸残基はＰである；
（ｆ）８位において、該アミノ酸残基はＮである；
（ｇ）１０位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｈ）１１位において、該アミノ酸残基はＤまたはＥである；
（ｉ）１２位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｊ）１４位において、該アミノ酸残基はＥまたはＤである；
（ｋ）１５において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｌ）１７位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｍ）１８位において、該アミノ酸残基は、Ｒ、ＥまたはＫである；
（ｎ）１９位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ｏ）２４位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ｐ）２６位において、該アミノ酸残基は、Ｍ、Ｌ、ＶまたはＩである；
（ｑ）２７位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｒ）２８位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＶである；
（ｓ）３０位において、該アミノ酸残基はＭである；
（ｔ）３１位において、該アミノ酸残基は、ＹまたはＦである；
（ｕ）３２位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ｖ）３３位において、該アミノ酸残基は、ＴまたはＳである；
（ｗ）３５位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｘ）３７位において、該アミノ酸残基は、Ｒ、Ｇ、ＥまたはＱである；
（ｙ）３９位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＳである；
（ｚ）４０位において、該アミノ酸残基は、ＦまたはＬである；
（ａａ）４５位において、該アミノ酸残基は、ＹまたはＦである；
（ａｂ）４７位において、該アミノ酸残基は、ＲまたはＧである；
（ａｃ）４８位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ａｄ）４９位において、該アミノ酸残基は、Ｋ、Ｒ、またはＱである；
（ａｅ）５１位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ａｆ）５２位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ａｇ）５３位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ａｈ）５４位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｉ）５７位において、該アミノ酸残基は、ＨまたはＮである；
（ａｊ）５８位において、該アミノ酸残基は、Ｑ、Ｋ、ＲまたはＰである；
（ａｋ）５９位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｌ）６０位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ａｍ）６１位において、該アミノ酸残基は、ＨまたはＲである；
（ａｎ）６３位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ａｏ）６５位において、該アミノ酸残基は、Ｅ、ＰまたはＱである；
（ａｐ）６７位において、該アミノ酸残基は、ＱまたはＲである；
（ａｑ）６８位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＥである；
（ａｒ）６９位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ａｓ）７９位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ａｔ）８０位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ａｕ）８１位において、該アミノ酸残基は、Ｙ、ＨまたはＦである；
（ａｖ）８２位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ａｗ）８３位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ａｘ）８４位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ａｙ）８６位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｚ）８９位において、該アミノ酸残基は、Ｇ、ＴまたはＳである；
（ｂａ）９０位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｂｂ）９１位において、該アミノ酸残基は、Ｌ、ＩまたはＶである；
（ｂｃ）９２位において、該アミノ酸残基は、ＲまたはＫである；
（ｂｄ）９３位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｂｅ）９６位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＱである；
（ｂｆ）９７位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｂｇ）１００位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＮである；
（ｂｈ）１０１位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｉ）１０３位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＶである；
（ｂｊ）１０４位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｂｋ）１０５位において、該アミノ酸残基は、Ｍ、ＬまたはＩである；
（ｂｌ）１０６位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｂｍ）１１２位において、該アミノ酸残基は、ＴまたはＡである；
（ｂｎ）１１３位において、該アミノ酸残基は、ＳまたはＴである；
（ｂｏ）１１４位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ｂｐ）１１５位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ｂｑ）１１９位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｒ）１２０位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｓ）１２３位において、該アミノ酸残基は、ＦまたはＬである；
（ｂｔ）１２５位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｂｕ）１２６位において、該アミノ酸残基は、ＱまたはＨである；
（ｂｖ）１２８位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ｂｗ）１２９位において、該アミノ酸残基は、ＶまたはＩである；
（ｂｘ）１３０位において、該アミノ酸残基はＦである；
（ｂｙ）１３１位において、該アミノ酸残基は、ＤまたはＥである；
（ｂｚ）１３２位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｃａ）１３５位において、該アミノ酸残基はＶである；
（ｃｂ）１３８位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｃｃ）１３９位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｃｄ）１４０位において、該アミノ酸残基は、ＬまたはＭである；
（ｃｅ）１４２位において、該アミノ酸残基はＹである；
（ｃｆ）１４３位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｃｇ）１４５位において、該アミノ酸残基は、ＬまたはＩである；そして
（ｃｈ）１４６位において、該アミノ酸残基はＴである、
に適合する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１１】
請求項１０に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで（ａ）〜（ｃｈ）において特定される位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、（ａ）〜（ｃｈ）に特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１２】
請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％は、以下の制限：
（ａ）９位、７６位、９４位および１１０位において、該アミノ酸残基Ａである；
（ｂ）２９位および１０８位において、該アミノ酸残基はＣである；
（ｃ）３４位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｄ）９５位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｅ）５６位において、該アミノ酸残基はＦである；
（ｆ）４３位、４４位、６６位、７４位、８７位、１０２位、１１６位、１２２位、１２７位および１３６位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ｇ）４１位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｈ）７位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｉ）８５位において、該アミノ酸残基はＫである；
（ｊ）２０位、４２位、５０位、７８位および１２１位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｋ）１位および１４１位において、該アミノ酸残基はＭである；
（ｌ）２３位および１０９位において、該アミノ酸残基はＮである；
（ｍ）２２位、２５位、１３３位、１３４位および１３７位において、該アミノ酸残基はＰである；
（ｎ）７１位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ｏ）１６位、２１位、７３位、９９および１１１位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ｐ）５５位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ｑ）７７位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｒ）１０７位において、該アミノ酸残基はＷである；および
（ｓ）１３位、４６位、７０位および１１８位において、該アミノ酸残基はＹである、
に適合する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１３】
請求項１〜１２のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下：
（ａ）３６位において、該アミノ酸残基は、Ｍ、Ｌ、またはＴである；
（ｂ）７２位において、該アミノ酸残基は、ＬまたはＩである；
（ｃ）７５位において、該アミノ酸残基は、ＭまたはＶである；
（ｄ）６４位において、該アミノ酸残基は、Ｌ、Ｉ、またはＦである；
（ｅ）８８位において、該アミノ酸残基は、ＴまたはＳである；
（ｆ）１１７位において、該アミノ酸残基は、ＹまたはＦである、
からなる群より選択される、アミノ酸残基を含む、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１４】
請求項１〜１３のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下：
（ａ）１４位において、該アミノ酸残基は、Ｄである；
（ｂ）１８位において、該アミノ酸残基は、Ｅである；
（ｃ）２６位において、該アミノ酸残基は、ＭまたはＶである；
（ｅ）３０位において、該アミノ酸残基は、Ｉである；
（ｆ）３２位において、該アミノ酸残基は、Ｄである；
（ｇ）３６位において、該アミノ酸残基は、ＭまたはＴである；
（ｉ）３７位において、該アミノ酸残基は、Ｃである；
（ｊ）３８位において、該アミノ酸残基は、Ｄである；
（ｊ）５３位において、該アミノ酸残基は、Ｖである；
（ｋ）５８位において、該アミノ酸残基は、Ｒである；
（ｌ）６１位において、該アミノ酸残基は、Ｒである；
（ｍ）６２位において、該アミノ酸残基は、Ｌである；
（ｎ）６４位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＦである；
（ｏ）６５位において、該アミノ酸残基は、Ｐである；
（ｐ）７２位において、該アミノ酸残基は、Ｉである；
（ｑ）７５位において、該アミノ酸残基は、Ｖである；
（ｒ）８８位において、該アミノ酸残基は、Ｔである；
（ｓ）８９位において、該アミノ酸残基は、Ｇである；
（ｔ）９１位において、該アミノ酸残基は、Ｌである；
（ｕ）９８位において、該アミノ酸残基は、Ｉである；
（ｖ）１０５位において、該アミノ酸残基は、Ｉである；
（ｗ）１１２位において、該アミノ酸残基は、Ａである；
（ｘ）１２４位において、該アミノ酸残基は、ＧまたはＣである；
（ｙ）１２８位において、該アミノ酸残基は、Ｄである；
（ｚ）１４０位において、該アミノ酸残基は、Ｍである；
（ａａ）１４３位において、該アミノ酸残基は、Ｒである；および
（ａｂ）１４４位において、該アミノ酸残基は、Ｗである；
からなる群より選択される１以上のアミノ酸残基を含む、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１５】
請求項１４に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで（ａ）〜（ａｂ）において特定される位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、（ａ）〜（ａｂ）において特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１６】
請求項１〜１５のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下：
（ａ）４１位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｂ）１３８位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｃ）３４位において、該アミノ酸残基はＮである；および
（ｄ）５５位において、該アミノ酸残基はＳである、
からなる群より選択される１以上のアミノ酸残基を含む、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１７】
単離されたポリヌクレオチドまたは組み換えポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチドは、以下：
（ａ）配列番号５７７と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｂ）配列番号５７８と少なくとも９７％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｃ）配列番号６２１と少なくとも９７％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｄ）配列番号５７９と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｅ）配列番号６０２と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｆ）配列番号６９７と少なくとも９５％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｇ）配列番号７２１と少なくとも９６％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｈ）配列番号６１３と少なくとも９７％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｉ）配列番号６７７と少なくとも８９％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｊ）配列番号５８４と少なくとも９６％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｋ）配列番号７０７と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｌ）配列番号６１６と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｍ）配列番号６１２と少なくとも９６％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｎ）配列番号５９０と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｏ）（ａ）〜（ｎ）の任意の１つと相補的なヌクレオチド配列、
からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含有する、単離されたポリヌクレオチドまたは組み換えポリヌクレオチド。
【請求項１８】
請求項１７に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下：
（ｉ）１８および３８位において、Ｚ５アミノ酸残基；
（ｉｉ）６２位において、Ｚ１アミノ酸残基；
（ｉｉｉ）１２４位において、Ｚ６アミノ酸残基；および
（ｉｖ）１４４位において、Ｚ２アミノ酸残基、
からなる群より選択される１以上のアミノ酸残基を含み、ここで：
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ２は、Ｆ、Ｗ、およびＹからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ６は、Ｃ、Ｇ、およびＰからなる群より選択されるアミノ酸残基である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１９】
請求項１７に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）２位、４位、１５位、１９位、２６位、２８位、３１位、４５位、５１位、５４位、８６位、９０位、９１位、９７位、１０３位、１０５位、１０６位、１１４位、１２３位、１２９位、１３９位、および／または１４５位において、該アミノ酸残基はＢ１である；および
（ｂ）３位、５位、８位、１０位、１１位、１４位、１７位、２４位、２７位、３２位、３７位、４７位、４８位、４９位、５２位、５７位、５８位、６１位、６３位、６８位、６９位、７９位、８０位、８２位、８３位、８９位、９２位、１００位、１０１位、１０４位、１１９位、１２０位、１２５位、１２６位、１２８位、１３１位、および／または１４３位において、該アミノ酸残基はＢ２である；
に適合し、ここで：
Ｂ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、ＹおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そして
Ｂ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、ＳおよびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項２０】
請求項１７に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、以下の制限：
（ａ）２位、４位、１５位、１９位、２６位、２８位、５１位、５４位、８６位、９０位、９１位、９７位、１０３位、１０５位、１０６位、１１４位、１２９位、１３９位、および／または１４５位において、該アミノ酸残基は、Ｚ１である；
（ｂ）３１位および／または４５位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｃ）８位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｄ）８９位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３またはＺ６である；
（ｅ）８２位、９２位、１０１位および／または１２０位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｆ）３位、１１位、２７位および／または７９位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｇ）１８位において、該アミノ酸残基は、Ｚ４またはＺ５である；
（ｈ）１２３位において、該アミノ酸残基は、Ｚ１またはＺ２である；
（ｉ）１２位、３３位、３５位、３９位、５３位、５９位、１１２位、１３２位、１３５位、１４０位、および／または１４６位において、該アミノ酸残基は、Ｚ１またはＺ３である；
（ｊ）３０位において、該アミノ酸残基はＺ１である；
（ｋ）６位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
（１）８１位において、該アミノ酸残基は、Ｚ２またはＺ４である；
（ｍ）１１３位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｎ）１３８位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｏ）１４２位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｐ）５７位および／または１２６位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３またはＺ４である；
（ｑ）５位、１７位、および６１位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｒ）２４位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｓ）１０４位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｔ）５２位および／または６９位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｕ）１４位および／または１１９位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｖ）１０位、３２位、６３位、および／または８３位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｗ）４８位および／または８０位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
（ｘ）４０位において、該アミノ酸残基は、Ｚ１またはＺ２である；
（ｙ）９６位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３またはＺ５である；
（ｚ）６５位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３、Ｚ４、またはＺ６である；
（ａａ）８４位および／または１１５位において、該アミノ酸残基 ｉｓ Ｚ３である；
（ａｂ）９３位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ａｃ）１３０位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ａｄ）５８位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３、Ｚ４またはＺ６である；
（ａｅ）４７位において、該アミノ酸残基は、Ｚ４またはＺ６である；
（ａｆ）４９位および／または１００位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３またはＺ４である；
（ａｇ）６８位において、該アミノ酸残基は、Ｚ４またはＺ５である；
（ａｈ）１４３位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ａｉ）１３１位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ａｊ）１２５位および／または１２８位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ａｋ）６７位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ４である；
（ａｌ）６０位において、該アミノ酸残基はＺ５である；および
（ａｍ）３７位において、該アミノ酸残基はＺ４またはＺ６である；
に適合し、ここで
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、ＭおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ２は、Ｆ、ＷおよびＹからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ３は、Ｎ、Ｑ、ＳおよびＴからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ４は、Ｒ、ＨおよびＫからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸であり；そしてＺ６は、Ｃ、Ｇ、およびＰからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項２１】
請求項２０に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで（ａ）〜（ａｍ）において特定される位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、（ａ）〜（ａｍ）において特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項２２】
請求項１７〜２１のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、１３位、２０位、３６位、４２位、４６位、５０位、５６位、６４位、７０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１０７位、１１０位、１１７位、１１８位、１２１位および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＢ１である；および
（ｂ）１６位、２１位、２２位、２３位、２５位、２９位、３４位、４１位、４３位、４４位、５５位、６６位、７１位、７３位、７４位、７７位、８５位、８７位、８８位、９５位、９９位、１０２位、１０８位、１０９位、１１１位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位、および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＢ２である；
に適合し、ここで
Ｂ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、ＹおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そして
Ｂ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、ＳおよびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項２３】
請求項１７〜２２のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、１３位、２０位、４２位、４６位、５０位、５６位、６４位、７０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１０７位、１１０位、１１７位、１１８位、１２１位、および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＢ１である；および
（ｂ）１６位、２１位、２２位、２３位、２５位、２９位、３４位、３６位、４１位、４３位、４４位、５５位、６６位、７１位、７３位、７４位、７７位、８５位、８７位、８８位、９５位、９９位、１０２位、１０８位、１０９位、１１１位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＢ２である；
に適合し、ここで
Ｂ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、ＹおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そして
Ｂ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、ＳおよびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項２４】
請求項１７〜２２のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、２０位、４２位、５０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１１０位、１２１位および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＺ１である；
（ｂ）１３位、４６位、５６位、７０位、１０７位、１１７位、および／または１１８位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｃ）２３位、５５位、７１位、７７位、８８位、および／または１０９位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｄ）１６位、２１位、４１位、７３位、８５位、９９位、および／または１１１位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｅ）３４位および／または９５位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｆ）２２位、２５位、２９位、４３位、４４位、６６位、７４位、８７位、１０２位、１０８位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位、および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
に適合し、ここで
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、ＭおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ２は、Ｆ、ＷおよびＹからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ３は、Ｎ、Ｑ、ＳおよびＴからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ４は、Ｒ、ＨおよびＫからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸であり；そしてＺ６は、Ｃ、ＧおよびＰからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項２５】
請求項２４に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、３６位において、Ｚ１およびＺ３からなる群より選択されるアミノ酸残基を含む、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項２６】
請求項２４または２５に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、６４位において、Ｚ１およびＺ２からなる群より選択されるアミノ酸残基を含む、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項２７】
請求項１７〜２６のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、以下の制限：
（ａ）２位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＬである；
（ｂ）３位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｃ）４位において、該アミノ酸残基は、ＶまたはＩである；
（ｄ）５位において、該アミノ酸残基はＫである；
（ｅ）６位において、該アミノ酸残基はＰである；
（ｆ）８位において、該アミノ酸残基はＮである；
（ｇ）１０位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｈ）１１位において、該アミノ酸残基は、ＤまたはＥである；
（ｉ）１２位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｊ）１４位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ｋ）１５位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｌ）１７位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｍ）１８位において、該アミノ酸残基は、Ｒ、ＥまたはＫである；
（ｎ）１９位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ｏ）２４位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ｐ）２６位において、該アミノ酸残基は、Ｍ、ＬＶまたはＩである；
（ｑ）２７位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｒ）２８位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＶである；
（ｓ）３０位において、該アミノ酸残基はＭである；
（ｔ）３１位において、該アミノ酸残基は、ＹまたはＦである；
（ｕ）３２位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ｖ）３３位において、該アミノ酸残基は、ＴまたはＳである；
（ｗ）３５位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｘ）３７位において、該アミノ酸残基は、Ｒ、Ｇ、ＥまたはＱである；
（ｙ）３９位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＳである；
（ｚ）４０位において、該アミノ酸残基は、ＦまたはＬである；
（ａａ）４５位において、該アミノ酸残基は、ＹまたはＦである；
（ａｂ）４７位において、該アミノ酸残基は、ＲまたはＧである；
（ａｃ）４８位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ａｄ）４９位において、該アミノ酸残基は、Ｋ、Ｒ、またはＱである；
（ａｅ）５１位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ａｆ）５２位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ａｇ）５３位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ａｈ）５４位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｉ）５７位において、該アミノ酸残基は、ＨまたはＮである；
（ａｊ）５８位において、該アミノ酸残基は、Ｑ、Ｋ、ＲまたはＰである；
（ａｋ）５９位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｌ）６０位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ａｍ）６１位において、該アミノ酸残基は、ＨまたはＲである；
（ａｎ）６３位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ａｏ）６５位において、該アミノ酸残基は、Ｅ、ＰまたはＱである；
（ａｐ）６７位において、該アミノ酸残基は、ＱまたはＲである；
（ａｑ）６８位において ｔｈｅ アミノ酸残基は、ＫまたはＥである；
（ａｒ）６９位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ａｓ）７９位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ａｔ）８０位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ａｕ）８１位において、該アミノ酸残基は、Ｙ、ＨまたはＦである；
（ａｖ）８２位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ａｗ）８３位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ａｘ）８４位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ａｙ）８６位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｚ）８９位において、該アミノ酸残基は、Ｇ、ＴまたはＳである；
（ｂａ）９０位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｂｂ）９１位において、該アミノ酸残基は、Ｌ、ＩまたはＶである；
（ｂｃ）９２位において、該アミノ酸残基は、ＲまたはＫである；
（ｂｄ）９３位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｂｅ）９６位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＱである；
（ｂｆ）９７位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｂｇ）１００位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＮである；
（ｂｈ）１０１位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｉ）１０３位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＶである；
（ｂｊ）１０４位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｂｋ）１０５位において、該アミノ酸残基は、Ｍ、ＬまたはＩである；
（ｂｌ）１０６位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｂｍ）１１２位において、該アミノ酸残基は、ＴまたはＡである；
（ｂｎ）１１３位において、該アミノ酸残基は、ＳまたはＴである；
（ｂｏ）１１４位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ｂｐ）１１５位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ｂｑ）１１９位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｒ）１２０位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｓ）１２３位において、該アミノ酸残基は、ＦまたはＬである；
（ｂｔ）１２５位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｂｕ）１２６位において、該アミノ酸残基は、ＱまたはＨである；
（ｂｖ）位１２８において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ｂｗ）１２９位において、該アミノ酸残基はＶまたはＩである；
（ｂｘ）１３０位において、該アミノ酸残基はＦである；
（ｂｙ）１３１位において、該アミノ酸残基は、ＤまたはＥである；
（ｂｚ）１３２位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｃａ）１３５位において、該アミノ酸残基はＶである；
（ｃｂ）１３８位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｃｃ）１３９位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｃｄ）１４０位において、該アミノ酸残基は、ＬまたはＭである；
（ｃｅ）１４２位において、該アミノ酸残基はＹである；
（ｃｆ）１４３位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｃｇ）１４５位において、該アミノ酸残基は、ＬまたはＩである；および
（ｃｈ）１４６位において、該アミノ酸残基はＴである、
に適合する、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項２８】
請求項２７に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで（ａ）〜（ｃｈ）において特定される位置に対応するアミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％は、（ａ）〜（ｃｈ）において特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項２９】
請求項１７に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、以下の制限：
（ａ）９位、７６位、９４位、および１１０位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ｂ）２９位および１０８位において、該アミノ酸残基はＣである；
（ｃ）３４位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｄ）９５位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｅ）５６位において、該アミノ酸残基はＦである；
（ｆ）４３位、４４位、６６位、７４位、８７位、１０２位、１１６位、１２２位、１２７位および１３６位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ｇ）４１位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｈ）７位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｉ）８５位において、該アミノ酸残基はＫである；
（ｊ）２０位、４２位、５０位、７８位および１２１位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｋ）１位および１４１位において、該アミノ酸残基はＭである；
（ｌ）２３位および１０９位において、該アミノ酸残基はＮである；
（ｍ）２２位、２５位、１３３位、１３４位および１３７位において、該アミノ酸残基はＰである；
（ｎ）７１位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ｏ）１６位、２１位、７３位、９９位および１１１位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ｐ）５５位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ｑ）７７位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｒ）１０７位において、該アミノ酸残基はＷである；および
（ｓ）１３位、４６位、７０位および１１８位において、該アミノ酸残基はＹである、
に適合する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項３０】
請求項１〜２９のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下からなる群より選択される１以上のアミノ酸残基：
（ａ）１４位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｂ）１８位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｃ）２６位において、該アミノ酸残基はＭまたはＶである；
（ｅ）３０位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｆ）３２位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｇ）３６位において、該アミノ酸残基はＭまたはＴである；
（ｉ）３７位において、該アミノ酸残基はＣである；
（ｊ）３８位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｊ）５３位において、該アミノ酸残基はＶである；
（ｋ）５８位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ｌ）６１位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ｍ）６２位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｎ）６４位において、該アミノ酸残基はＩまたはＦである；
（ｏ）６５位において、該アミノ酸残基はＰである；
（ｐ）７２位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｑ）７５位において、該アミノ酸残基はＶである；
（ｒ）８８位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｓ）８９位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ｔ）９１位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｕ）９８位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｖ）１０５位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｗ）１１２位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ｘ）１２４位において、該アミノ酸残基はＧまたはＣである；
（ｙ）１２８位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｚ）１４０位において、該アミノ酸残基はＭである；
（ａａ）１４３位において、該アミノ酸残基はＲである；および
（ａｂ）１４４位において、該アミノ酸残基はＷである、
を含む、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項３１】
請求項３０に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで（ａ）〜（ａｂ）において特定される位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、（ａ）〜（ａｂ）において特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項３２】
請求項１７〜３１のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下：
（ａ）４１位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｂ）１３８位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｃ）３４位において、該アミノ酸残基はＮである；および
（ｅ）５５位において、該アミノ酸残基はＳである、
からなる群より選択される１以上のアミノ酸残基を含む。
、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項３３】
グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼ活性を有するタンパク質をコードする単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチドは、以下：
【数１】
からなる群より選択される、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項３４】
請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記ポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドは、グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼ活性を有する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項３５】
請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記ポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドは、グリホセートＮ−アシルトランスフェラーゼ活性を有する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項３６】
請求項３４に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記ポリペプチドは、グリホセートについて少なくとも１０ｍＭ−１分−１のｋｃａｔ／Ｋｍでグリホセートのアセチル化を触媒する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項３７】
請求項３４に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記ポリペプチドは、アミノメチルホスホン酸のアセチル化を触媒する、ポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項３８】
請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドを含む、核酸構築物。
【請求項３９】
請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドに作動可能に連結されたプロモーターを含む、請求項３８に記載の核酸構築物であって、ここで該プロモーターは、該ポリヌクレオチドに関して異種であり、前記コードされるポリペプチドの十分な発現を引き起こして、該核酸構築物で形質転換された植物細胞のグリホセート耐性を増強するに有効である、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項４０】
請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドは、選択マーカーとして機能する、請求項３８に記載の核酸構築物。
【請求項４１】
前記構築物はベクターである、請求項３８に記載の核酸構築物。
【請求項４２】
有効なレベルの第２のポリペプチドを発現する細胞または生物に対して検出可能な表現型形質を付与する、該第２のポリペプチドをコードする第２のポリヌクレオチド配列をさらに含む、請求項４１に記載のベクター。
【請求項４３】
前記検出可能な表現型形質は、選択マーカーとして機能する、請求項４２に記載のベクター。
【請求項４４】
前記検出可能な表現型形質は、除草剤耐性および目視可能なマーカーからなる群より選択される、請求項４２に記載のベクター。
【請求項４５】
前記ベクターはＴ−ＤＮＡ配列をさらに含む、請求項４１に記載のベクター。
【請求項４６】
前記単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドは、調節性配列に作動可能に連結される、請求項４１に記載のベクター。
【請求項４７】
前記ベクターは植物形質転換ベクターである、請求項４１に記載のベクター。
【請求項４８】
少なくとも１つの、請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドを含む細胞であって、ここで該ポリヌクレオチドは、該細胞に対して異種である、細胞。
【請求項４９】
前記単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドは、調節性配列に作動可能に連結される、請求項４８に記載の細胞。
【請求項５０】
請求項４１に記載のベクターによって形質導入された、細胞。
【請求項５１】
前記細胞は、トランスジェニック植物細胞である、請求項４９または５０に記載の細胞。
【請求項５２】
前記トランスジェニック植物細胞は、グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼ活性を有する外因性ポリペプチドを発現する、請求項５１に記載のトランスジェニック植物細胞。
【請求項５３】
前記トランスジェニック植物細胞は、グリホセートＮ−アシルトランスフェラーゼ活性を有する外因性ポリペプチドを発現する。請求項５１に記載のトランスジェニック植物細胞。
【請求項５４】
請求項５２の細胞を含む、トランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項５５】
請求項５３に記載の細胞を含む、トランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項５６】
前記植物または植物外植片は、グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼ活性を有するポリペプチドを発現する、請求項５４に記載のトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項５７】
前記植物または植物外植片は、グリホセートＮ−アシルトランスフェラーゼ活性を有するポリペプチドを発現する、請求項５５に記載のトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項５８】
前記植物または植物外植片は、Ｅｌｅｕｓｉｎｅ、Ｌｏｌｌｉｕｍ、Ｂａｍｂｕｓａ、Ｂｒａｓｓｉｃａ、Ｄａｃｔｙｌｉｓ、Ｓｏｒｇｈｕｍ、Ｐｅｎｎｉｓｅｔｕｍ、Ｚｅａ、Ｏｒｙｚａ、Ｔｒｉｔｉｃｕｍ、Ｓｅｃａｌｅ、Ａｖｅｎａ、Ｈｏｒｄｅｕｍ、Ｓａｃｃｈａｒｕｍ、Ｃｏｉｘ、ＧｌｙｃｉｎｅおよびＧｏｓｓｙｐｉｕｍからなる属の群より選択される農作物植物である、請求項５６に記載のトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項５９】
前記植物または植物外植片は、Ｅｌｅｕｓｉｎｅ、Ｌｏｌｌｉｕｍ、Ｂａｍｂｕｓａ、Ｂｒａｓｓｉｃａ、Ｄａｃｔｙｌｉｓ、Ｓｏｒｇｈｕｍ、Ｐｅｎｎｉｓｅｔｕｍ、Ｚｅａ、Ｏｒｙｚａ、Ｔｒｉｔｉｃｕｍ、Ｓｅｃａｌｅ、Ａｖｅｎａ、Ｈｏｒｄｅｕｍ、Ｓａｃｃｈａｒｕｍ、Ｃｏｉｘ、ＧｌｙｃｉｎｅおよびＧｏｓｓｙｐｉｕｍからなる属の群より選択される農作物植物である、請求項５７に記載のトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項６０】
前記植物または植物外植片は、Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓである、請求項５６に記載のトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項６１】
前記植物または植物外植片は、Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓである、請求項５７に記載のトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項６２】
前記植物または植物外植片は、Ｇｏｓｓｙｐｉｕｍである、請求項５６に記載のトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項６３】
前記植物または植物外植片は、Ｇｏｓｓｙｐｉｕｍである、請求項５７に記載のトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項６４】
前記植物または植物外植片は、同じ種、系統または品種の野生型植物と比較して、グリホセートに対する増強された耐性を示す、請求項５６に記載のトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項６５】
前記植物または植物外植片は、同じ種、系統または品種の野生型植物と比較して、グリホセートに対する増強された耐性を示す、請求項５７に記載のトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項６６】
請求項５６に記載の植物によって生成される、種子。
【請求項６７】
請求項５７に記載の植物によって生成される、種子。
【請求項６８】
異種遺伝子を含むトランスジェニック植物であって、該遺伝子は、以下：
【数２】
からなる群より選択され、該遺伝子は、グリホセートについて少なくとも１０ｍＭ−１分−１のｋｃａｔ／Ｋｍを有するグリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼをコードし、ここで該植物は、除草剤適用に起因する有意な収率減少なしで、該異種遺伝子を欠いている同じ植物の生長を阻害するに有効なレベルで適用されるグリホセートに対する耐性を示す、
トランスジェニック植物。
【請求項６９】
前記グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼは、アミノメチルホスホン酸のアセチル化を触媒する、請求項６８に記載のトランスジェニック植物。
【請求項７０】
以下を含む単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって：
（ａ）ＢＬＯＳＵＭ６２行列、ギャップ存在ペナルティ１１、およびギャップ伸長ペナルティ１を使用して、配列番号３００、配列番号４４５および配列番号４５７からなる群より選択される配列と最適に整列させて、少なくとも４６０の類似性スコアを出し得るアミノ配列であって、
ここで、該アミノ酸配列は、以下：
（ｉ）１８位および３８位に、Ｚ５アミノ酸残基；
（ｉｉ）６２位に、Ｚ１アミノ酸残基；
（ｉｉｉ）１２４位に、Ｚ６アミノ酸残基；および
（ｉｖ）１４４位に、Ｚ２アミノ酸残基、
からなる群より選択される少なくとも１つ以上のアミノ酸残基を含有し、
ここで：
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、ＭおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ２は、Ｆ、ＷおよびＹからなる群より選択されるアミノ酸残基であり、
Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸残基であり、
Ｚ６は、Ｃ、ＧおよびＰからなる群より選択されるアミノ酸残基である、
アミノ酸配列；または、
（ｂ）その相補的ヌクレオチド配列、
を含む、単離されたポリペプチドまたは組み換えポリペプチド。
【請求項７１】
請求項１に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列中のアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）２位、４位、１５位、１９位、２６位、２８位、３１位、４５位、５１位、５４位、８６位、９０位、９１位、９７位、１０３位、１０５位、１０６位、１１４位、１２３位、１２９位、１３９位、および／または１４５位において、該アミノ酸残基は、Ｂ１である；および
（ｂ）３位、５位、８位、１０位、１１位、１４位、１７位、２４位、２７位、３２位、３７位、４７位、４８位、４９位、５２位、５７位、５８位、６１位、６３位、６８位、６９位、７９位、８０位、８２位、８３位、８９位、９２位、１００位、１０１位、１０４位、１１９位、１２０位、１２５位、１２６位、１２８位、１３１位、および／または１４３位において、該アミノ酸残基は、Ｂ２である；
に適合し、ここでＢ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、Ｙ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そしてＢ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項７２】
請求項７０に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、以下の制限：
（ａ）２位、４位、１５位、１９位、２６位、２８位、５１位、５４位、８６位、９０位、９１位、９７位、１０３位、１０５位、１０６位、１１４位、１２９位、１３９位、および／または１４５位において、該アミノ酸残基はＺ１である；
（ｂ）３１位および／または４５位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｃ）８位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｄ）８９位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ６である；
（ｅ）８２位、９２位、１０１位および／または１２０位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｆ）３位、１１位、２７位および／または７９位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｇ）１８位において、該アミノ酸残基はＺ４またはＺ５である；
（ｈ）１２３位において、該アミノ酸残基はＺ１またはＺ２である；
（ｉ）１２位、３３位、３５位、３９位、５３位、５９位、１１２位、１３２位、１３５位、１４０位および／または１４６位において、該アミノ酸残基はＺ１またはＺ３である；
（ｊ）３０位において、該アミノ酸残基はＺ１である；
（ｋ）６位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
（ｌ）８１位において、該アミノ酸残基はＺ２またはＺ４である；
（ｍ）１１３位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｎ）１３８位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｏ）１４２位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｐ）５７位および／または１２６位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ４である；；
（ｑ）５位、１７位および６１位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｒ）２４位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｓ）１０４位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｔ）５２位および／または６９位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｕ）１４位および／または１１９位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｖ）１０位、３２位、６３位および／または８３位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｗ）４８位および／または８０位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
（ｘ）４０位において、該アミノ酸残基はＺ１またはＺ２である；
（ｙ）９６位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ５である；
（ｚ）６５位において、該アミノ酸残基はＺ３、Ｚ４またはＺ６である；
（ａａ）８４位および／または１１５位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ａｂ）９３位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ａｃ）１３０位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ａｄ）５８位において、該アミノ酸残基はＺ３、Ｚ４またはＺ６である；
（ａｅ）４７位において、該アミノ酸残基はＺ４またはＺ６である；
（ａｆ）４９位および／または１００位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ４である；
（ａｇ）６８位において、該アミノ酸残基はＺ４またはＺ５である；
（ａｈ）１４３位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ａｉ）１３１位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ａｊ）１２５位および／または１２８位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ａｋ）６７位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ４である；
（ａｌ）６０位において、該アミノ酸残基はＺ５である；および
（ａｍ）３７位において、該アミノ酸残基はＺ４またはＺ６である；
に適合し、ここで
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ２は、Ｆ、Ｗ、およびＹからなる群より選択されるアミノ酸であり；
Ｚ３は、Ｎ、Ｑ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるアミノ酸であり；
Ｚ４は、Ｒ、Ｈ、およびＫからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；そして
Ｚ６は、Ｃ、Ｇ、およびＰからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項７３】
請求項７２に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで（ａ）〜（ａｍ）に特定される位置において対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、（ａ）〜（ａｍ）において特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項７４】
請求項７０〜７３のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、１３位、２０位、３６位、４２位、４６位、５０位、５６位、６４位、７０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１０７位、１１０位、１１７位、１１８位、１２１位および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＢ１である；および
（ｂ）１６位、２１位、２２位、２３位、２５位、２９位、３４位、４１位、４３位、４４位、５５位、６６位、７１位、７３位、７４位、７７位、８５位、８７位、８８位、９５位、９９位、１０２位、１０８位、１０９位、１１１位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＢ２である；
に適合し、ここでＢ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、Ｙ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そして
Ｂ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項７５】
請求項７０〜７３のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、１３位、２０位、４２位、４６位、５０位、５６位、６４位、７０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１０７位、１１０位、１１７位、１１８位、１２１位および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＢ１である；および
（ｂ）１６位、２１位、２２位、２３位、２５位、２９位、３４位、３６位、４１位、４３位、４４位、５５位、６６位、７１位、７３位、７４位、７７位、８５位、８７位、８８位、９５位、９９位、１０２位、１０８位、１０９位、１１１位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位、および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＢ２である；
に適合し、ここで
Ｂ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、Ｙ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そして
Ｂ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項７６】
請求項７９〜７３のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％は、以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、２０位、４２位、５０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１１０位、１２１位、および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＺ１である；
（ｂ）１３位、４６位、５６位、７０位、１０７位、１１７位、および／または１１８位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｃ）２３位、５５位、７１位、７７位、８８位、および／または１０９位において、該アミノ酸残基はＺ３であり；
（ｄ）１６位、２１位、４１位、７３位、８５位、９９位、および／または１１１位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｅ）３４位および／または９５位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｆ）２２位、２５位、２９位、４３位、４４位、６６位、７４位、８７位、１０２位、１０８位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位、および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
に適合し、ここで
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ２は、Ｆ、Ｗ、およびＹからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ３は、Ｎ、Ｑ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ４は、Ｒ、Ｈ、およびＫからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸であり；そしてＺ６は、Ｃ、Ｇ、およびＰからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項７７】
請求項７６に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、３６位において、Ｚ１およびＺ３からなる群より選択されるアミノ酸残基を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項７８】
請求項７６または７７に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、６４位において、Ｚ１およびＺ２からなる群より選択されるアミノ酸残基を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項７９】
請求項７０〜７８のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、以下の制限：
（ａ）２位において、該アミノ酸残基はＩまたはＬである；
（ｂ）３位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｃ）４位において、該アミノ酸残基はＶまたはＩである；
（ｄ）５位において、該アミノ酸残基はＫである；
（ｅ）６位において、該アミノ酸残基はＰである；
（ｆ）８位において、該アミノ酸残基はＮである；
（ｇ）１０位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｈ）１１位において、該アミノ酸残基はＤまたはＥである；
（ｉ）１２位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｊ）１４位において、該アミノ酸残基はＥまたはＤである；
（ｋ）１５において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｌ）１７位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｍ）１８位において、該アミノ酸残基は、Ｒ、ＥまたはＫである；
（ｎ）１９位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ｏ）２４位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ｐ）２６位において、該アミノ酸残基は、Ｍ、Ｌ、ＶまたはＩである；
（ｑ）２７位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｒ）２８位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＶである；
（ｓ）３０位において、該アミノ酸残基はＭである；
（ｔ）３１位において、該アミノ酸残基は、ＹまたはＦである；
（ｕ）３２位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ｖ）３３位において、該アミノ酸残基は、ＴまたはＳである；
（ｗ）３５位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｘ）３７位において、該アミノ酸残基は、Ｒ、Ｇ、ＥまたはＱである；
（ｙ）３９位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＳである；
（ｚ）４０位において、該アミノ酸残基は、ＦまたはＬである；
（ａａ）４５位において、該アミノ酸残基は、ＹまたはＦである；
（ａｂ）４７位において、該アミノ酸残基は、ＲまたはＧである；
（ａｃ）４８位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ａｄ）４９位において、該アミノ酸残基は、Ｋ、Ｒ、またはＱである；
（ａｅ）５１位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ａｆ）５２位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ａｇ）５３位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ａｈ）５４位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｉ）５７位において、該アミノ酸残基は、ＨまたはＮである；
（ａｊ）５８位において、該アミノ酸残基は、Ｑ、Ｋ、ＲまたはＰである；
（ａｋ）５９位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｌ）６０位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ａｍ）６１位において、該アミノ酸残基は、ＨまたはＲである；
（ａｎ）６３位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ａｏ）６５位において、該アミノ酸残基は、Ｅ、ＰまたはＱである；
（ａｐ）６７位において、該アミノ酸残基は、ＱまたはＲである；
（ａｑ）６８位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＥである；
（ａｒ）６９位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ａｓ）７９位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ａｔ）８０位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ａｕ）８１位において、該アミノ酸残基は、Ｙ、ＨまたはＦである；
（ａｖ）８２位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ａｗ）８３位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ａｘ）８４位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ａｙ）８６位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｚ）８９位において、該アミノ酸残基は、Ｇ、ＴまたはＳである；
（ｂａ）９０位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｂｂ）９１位において、該アミノ酸残基は、Ｌ、ＩまたはＶである；
（ｂｃ）９２位において、該アミノ酸残基は、ＲまたはＫである；
（ｂｄ）９３位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｂｅ）９６位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＱである；
（ｂｆ）９７位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｂｇ）１００位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＮである；
（ｂｈ）１０１位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｉ）１０３位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＶである；
（ｂｊ）１０４位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｂｋ）１０５位において、該アミノ酸残基は、Ｍ、ＬまたはＩである；
（ｂｌ）１０６位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｂｍ）１１２位において、該アミノ酸残基は、ＴまたはＡである；
（ｂｎ）１１３位において、該アミノ酸残基は、ＳまたはＴである；
（ｂｏ）１１４位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ｂｐ）１１５位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ｂｑ）１１９位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｒ）１２０位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｓ）１２３位において、該アミノ酸残基は、ＦまたはＬである；
（ｂｔ）１２５位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｂｕ）１２６位において、該アミノ酸残基は、ＱまたはＨである；
（ｂｖ）１２８位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ｂｗ）１２９位において、該アミノ酸残基は、ＶまたはＩである；
（ｂｘ）１３０位において、該アミノ酸残基はＦである；
（ｂｙ）１３１位において、該アミノ酸残基は、ＤまたはＥである；
（ｂｚ）１３２位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｃａ）１３５位において、該アミノ酸残基はＶである；
（ｃｂ）１３８位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｃｃ）１３９位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｃｄ）１４０位において、該アミノ酸残基は、ＬまたはＭである；
（ｃｅ）１４２位において、該アミノ酸残基はＹである；
（ｃｆ）１４３位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｃｇ）１４５位において、該アミノ酸残基は、ＬまたはＩである；そして
（ｃｈ）１４６位において、該アミノ酸残基はＴである、
に適合する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項８０】
請求項１０に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで（ａ）〜（ｃｈ）において特定される位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、（ａ）〜（ｃｈ）に特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項８１】
請求項７０に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％は、以下の制限：
（ａ）９位、７６位、９４位および１１０位において、該アミノ酸残基Ａである；
（ｂ）２９位および１０８位において、該アミノ酸残基はＣである；
（ｃ）３４位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｄ）９５位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｅ）５６位において、該アミノ酸残基はＦである；
（ｆ）４３位、４４位、６６位、７４位、８７位、１０２位、１１６位、１２２位、１２７位および１３６位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ｇ）４１位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｈ）７位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｉ）８５位において、該アミノ酸残基はＫである；
（ｊ）２０位、４２位、５０位、７８位および１２１位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｋ）１位および１４１位において、該アミノ酸残基はＭである；
（ｌ）２３位および１０９位において、該アミノ酸残基はＮである；
（ｍ）２２位、２５位、１３３位、１３４位および１３７位において、該アミノ酸残基はＰである；
（ｎ）７１位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ｏ）１６位、２１位、７３位、９９および１１１位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ｐ）５５位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ｑ）７７位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｒ）１０７位において、該アミノ酸残基はＷである；および
（ｓ）１３位、４６位、７０位および１１８位において、該アミノ酸残基はＹである、
に適合する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項８２】
請求項７０〜８１のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下：
（ａ）３６位において、該アミノ酸残基は、Ｍ、Ｌ、またはＴである；
（ｂ）７２位において、該アミノ酸残基は、ＬまたはＩである；
（ｃ）７５位において、該アミノ酸残基は、ＭまたはＶである；
（ｄ）６４位において、該アミノ酸残基は、Ｌ、Ｉ、またはＦである；
（ｅ）８８位において、該アミノ酸残基は、ＴまたはＳである；
（ｆ）１１７位において、該アミノ酸残基は、ＹまたはＦである、
からなる群より選択される、アミノ酸残基を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項８３】
請求項７０〜８３のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下：
（ａ）１４位において、該アミノ酸残基は、Ｄである；
（ｂ）１８位において、該アミノ酸残基は、Ｅである；
（ｃ）２６位において、該アミノ酸残基は、ＭまたはＶである；
（ｅ）３０位において、該アミノ酸残基は、Ｉである；
（ｆ）３２位において、該アミノ酸残基は、Ｄである；
（ｇ）３６位において、該アミノ酸残基は、ＭまたはＴである；
（ｉ）３７位において、該アミノ酸残基は、Ｃである；
（ｊ）３８位において、該アミノ酸残基は、Ｄである；
（ｊ）５３位において、該アミノ酸残基は、Ｖである；
（ｋ）５８位において、該アミノ酸残基は、Ｒである；
（ｌ）６１位において、該アミノ酸残基は、Ｒである；
（ｍ）６２位において、該アミノ酸残基は、Ｌである；
（ｎ）６４位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＦである；
（ｏ）６５位において、該アミノ酸残基は、Ｐである；
（ｐ）７２位において、該アミノ酸残基は、Ｉである；
（ｑ）７５位において、該アミノ酸残基は、Ｖである；
（ｒ）８８位において、該アミノ酸残基は、Ｔである；
（ｓ）８９位において、該アミノ酸残基は、Ｇである；
（ｔ）９１位において、該アミノ酸残基は、Ｌである；
（ｕ）９８位において、該アミノ酸残基は、Ｉである；
（ｖ）１０５位において、該アミノ酸残基は、Ｉである；
（ｗ）１１２位において、該アミノ酸残基は、Ａである；
（ｘ）１２４位において、該アミノ酸残基は、ＧまたはＣである；
（ｙ）１２８位において、該アミノ酸残基は、Ｄである；
（ｚ）１４０位において、該アミノ酸残基は、Ｍである；
（ａａ）１４３位において、該アミノ酸残基は、Ｒである；および
（ａｂ）１４４位において、該アミノ酸残基は、Ｗである；
からなる群より選択される１以上のアミノ酸残基を含む、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項８４】
請求項８３に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで（ａ）〜（ａｂ）において特定される位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、（ａ）〜（ａｂ）において特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項８５】
請求項７０〜８４のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下：
（ａ）４１位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｂ）１３８位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｃ）３４位において、該アミノ酸残基はＮである；および
（ｄ）５５位において、該アミノ酸残基はＳである、
からなる群より選択される１以上のアミノ酸残基を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項８６】
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、該ポリペプチドは、以下：
（ａ）配列番号５７７と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列；
（ｂ）配列番号５７８と少なくとも９７％同一なアミノ酸配列；
（ｃ）配列番号６２１と少なくとも９７％同一なアミノ酸配列；
（ｄ）配列番号５７９と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列；
（ｅ）配列番号６０２と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列；
（ｆ）配列番号６９７と少なくとも９５％同一なアミノ酸配列；
（ｇ）配列番号７２１と少なくとも９６％同一なアミノ酸配列；
（ｈ）配列番号６１３と少なくとも９７％同一なアミノ酸配列；
（ｉ）配列番号６７７と少なくとも８９％同一なアミノ酸配列；
（ｊ）配列番号５８４と少なくとも９６％同一なアミノ酸配列；
（ｋ）配列番号７０７と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列；
（ｌ）配列番号６１６と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列；
（ｍ）配列番号６１２と少なくとも９６％同一なアミノ酸配列；
（ｎ）配列番号５９０と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列；
（ｏ）（ａ）〜（ｎ）の任意の１つと相補的なアミノ酸配列、
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項８７】
請求項８６に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下：
（ｉ）１８および３８位において、Ｚ５アミノ酸残基；
（ｉｉ）６２位において、Ｚ１アミノ酸残基；
（ｉｉｉ）１２４位において、Ｚ６アミノ酸残基；および
（ｉｖ）１４４位において、Ｚ２アミノ酸残基、
からなる群より選択される１以上のアミノ酸残基を含み、ここで：
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ２は、Ｆ、Ｗ、およびＹからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ６は、Ｃ、Ｇ、およびＰからなる群より選択されるアミノ酸残基である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項８８】
請求項８６に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）２位、４位、１５位、１９位、２６位、２８位、３１位、４５位、５１位、５４位、８６位、９０位、９１位、９７位、１０３位、１０５位、１０６位、１１４位、１２３位、１２９位、１３９位、および／または１４５位において、該アミノ酸残基はＢ１である；および
（ｂ）３位、５位、８位、１０位、１１位、１４位、１７位、２４位、２７位、３２位、３７位、４７位、４８位、４９位、５２位、５７位、５８位、６１位、６３位、６８位、６９位、７９位、８０位、８２位、８３位、８９位、９２位、１００位、１０１位、１０４位、１１９位、１２０位、１２５位、１２６位、１２８位、１３１位、および／または１４３位において、該アミノ酸残基はＢ２である；
に適合し、ここで：
Ｂ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、ＹおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そして
Ｂ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、ＳおよびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項８９】
請求項８６に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、以下の制限：
（ａ）２位、４位、１５位、１９位、２６位、２８位、５１位、５４位、８６位、９０位、９１位、９７位、１０３位、１０５位、１０６位、１１４位、１２９位、１３９位、および／または１４５位において、該アミノ酸残基は、Ｚ１である；
（ｂ）３１位および／または４５位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｃ）８位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｄ）８９位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３またはＺ６である；
（ｅ）８２位、９２位、１０１位および／または１２０位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｆ）３位、１１位、２７位および／または７９位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｇ）１８位において、該アミノ酸残基は、Ｚ４またはＺ５である；
（ｈ）１２３位において、該アミノ酸残基は、Ｚ１またはＺ２である；
（ｉ）１２位、３３位、３５位、３９位、５３位、５９位、１１２位、１３２位、１３５位、１４０位、および／または１４６位において、該アミノ酸残基は、Ｚ１またはＺ３である；
（ｊ）３０位において、該アミノ酸残基はＺ１である；
（ｋ）６位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
（１）８１位において、該アミノ酸残基は、Ｚ２またはＺ４である；
（ｍ）１１３位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｎ）１３８位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｏ）１４２位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｐ）５７位および／または１２６位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３またはＺ４である；
（ｑ）５位、１７位、および６１位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｒ）２４位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｓ）１０４位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｔ）５２位および／または６９位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｕ）１４位および／または１１９位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｖ）１０位、３２位、６３位、および／または８３位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｗ）４８位および／または８０位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
（ｘ）４０位において、該アミノ酸残基は、Ｚ１またはＺ２である；
（ｙ）９６位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３またはＺ５である；
（ｚ）６５位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３、Ｚ４、またはＺ６である；
（ａａ）８４位および／または１１５位において、該アミノ酸残基 ｉｓ Ｚ３である；
（ａｂ）９３位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ａｃ）１３０位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ａｄ）５８位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３、Ｚ４またはＺ６である；
（ａｅ）４７位において、該アミノ酸残基は、Ｚ４またはＺ６である；
（ａｆ）４９位および／または１００位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３またはＺ４である；
（ａｇ）６８位において、該アミノ酸残基は、Ｚ４またはＺ５である；
（ａｈ）１４３位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ａｉ）１３１位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ａｊ）１２５位および／または１２８位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ａｋ）６７位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ４である；
（ａｌ）６０位において、該アミノ酸残基はＺ５である；および
（ａｍ）３７位において、該アミノ酸残基はＺ４またはＺ６である；
に適合し、ここで
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、ＭおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ２は、Ｆ、ＷおよびＹからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ３は、Ｎ、Ｑ、ＳおよびＴからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ４は、Ｒ、ＨおよびＫからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸であり；そしてＺ６は、Ｃ、Ｇ、およびＰからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項９０】
請求項８９に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで（ａ）〜（ａｍ）において特定される位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、（ａ）〜（ａｍ）において特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項９１】
請求項８６〜９０のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、１３位、２０位、３６位、４２位、４６位、５０位、５６位、６４位、７０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１０７位、１１０位、１１７位、１１８位、１２１位および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＢ１である；および
（ｂ）１６位、２１位、２２位、２３位、２５位、２９位、３４位、４１位、４３位、４４位、５５位、６６位、７１位、７３位、７４位、７７位、８５位、８７位、８８位、９５位、９９位、１０２位、１０８位、１０９位、１１１位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位、および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＢ２である；
に適合し、ここで
Ｂ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、ＹおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そして
Ｂ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、ＳおよびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項９２】
請求項８６〜９１のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、１３位、２０位、４２位、４６位、５０位、５６位、６４位、７０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１０７位、１１０位、１１７位、１１８位、１２１位、および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＢ１である；および
（ｂ）１６位、２１位、２２位、２３位、２５位、２９位、３４位、３６位、４１位、４３位、４４位、５５位、６６位、７１位、７３位、７４位、７７位、８５位、８７位、８８位、９５位、９９位、１０２位、１０８位、１０９位、１１１位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＢ２である；
に適合し、ここで
Ｂ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、ＹおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そして
Ｂ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、ＳおよびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項９３】
請求項８６〜９１のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、２０位、４２位、５０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１１０位、１２１位および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＺ１である；
（ｂ）１３位、４６位、５６位、７０位、１０７位、１１７位、および／または１１８位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｃ）２３位、５５位、７１位、７７位、８８位、および／または１０９位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｄ）１６位、２１位、４１位、７３位、８５位、９９位、および／または１１１位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｅ）３４位および／または９５位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｆ）２２位、２５位、２９位、４３位、４４位、６６位、７４位、８７位、１０２位、１０８位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位、および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
に適合し、ここで
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、ＭおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ２は、Ｆ、ＷおよびＹからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ３は、Ｎ、Ｑ、ＳおよびＴからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ４は、Ｒ、ＨおよびＫからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸であり；そしてＺ６は、Ｃ、ＧおよびＰからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項９４】
請求項９３に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、３６位において、Ｚ１およびＺ３からなる群より選択されるアミノ酸残基を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項９５】
請求項９３または９４に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、６４位において、Ｚ１およびＺ２からなる群より選択されるアミノ酸残基を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項９６】
請求項８６〜９５のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、以下の制限：
（ａ）２位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＬである；
（ｂ）３位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｃ）４位において、該アミノ酸残基は、ＶまたはＩである；
（ｄ）５位において、該アミノ酸残基はＫである；
（ｅ）６位において、該アミノ酸残基はＰである；
（ｆ）８位において、該アミノ酸残基はＮである；
（ｇ）１０位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｈ）１１位において、該アミノ酸残基は、ＤまたはＥである；
（ｉ）１２位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｊ）１４位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ｋ）１５位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｌ）１７位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｍ）１８位において、該アミノ酸残基は、Ｒ、ＥまたはＫである；
（ｎ）１９位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ｏ）２４位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ｐ）２６位において、該アミノ酸残基は、Ｍ、ＬＶまたはＩである；
（ｑ）２７位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｒ）２８位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＶである；
（ｓ）３０位において、該アミノ酸残基はＭである；
（ｔ）３１位において、該アミノ酸残基は、ＹまたはＦである；
（ｕ）３２位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ｖ）３３位において、該アミノ酸残基は、ＴまたはＳである；
（ｗ）３５位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｘ）３７位において、該アミノ酸残基は、Ｒ、Ｇ、ＥまたはＱである；
（ｙ）３９位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＳである；
（ｚ）４０位において、該アミノ酸残基は、ＦまたはＬである；
（ａａ）４５位において、該アミノ酸残基は、ＹまたはＦである；
（ａｂ）４７位において、該アミノ酸残基は、ＲまたはＧである；
（ａｃ）４８位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ａｄ）４９位において、該アミノ酸残基は、Ｋ、Ｒ、またはＱである；
（ａｅ）５１位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ａｆ）５２位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ａｇ）５３位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ａｈ）５４位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｉ）５７位において、該アミノ酸残基は、ＨまたはＮである；
（ａｊ）５８位において、該アミノ酸残基は、Ｑ、Ｋ、ＲまたはＰである；
（ａｋ）５９位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｌ）６０位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ａｍ）６１位において、該アミノ酸残基は、ＨまたはＲである；
（ａｎ）６３位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ａｏ）６５位において、該アミノ酸残基は、Ｅ、ＰまたはＱである；
（ａｐ）６７位において、該アミノ酸残基は、ＱまたはＲである；
（ａｑ）６８位において ｔｈｅ アミノ酸残基は、ＫまたはＥである；
（ａｒ）６９位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ａｓ）７９位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ａｔ）８０位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ａｕ）８１位において、該アミノ酸残基は、Ｙ、ＨまたはＦである；
（ａｖ）８２位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ａｗ）８３位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ａｘ）８４位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ａｙ）８６位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｚ）８９位において、該アミノ酸残基は、Ｇ、ＴまたはＳである；
（ｂａ）９０位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｂｂ）９１位において、該アミノ酸残基は、Ｌ、ＩまたはＶである；
（ｂｃ）９２位において、該アミノ酸残基は、ＲまたはＫである；
（ｂｄ）９３位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｂｅ）９６位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＱである；
（ｂｆ）９７位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｂｇ）１００位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＮである；
（ｂｈ）１０１位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｉ）１０３位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＶである；
（ｂｊ）１０４位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｂｋ）１０５位において、該アミノ酸残基は、Ｍ、ＬまたはＩである；
（ｂｌ）１０６位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｂｍ）１１２位において、該アミノ酸残基は、ＴまたはＡである；
（ｂｎ）１１３位において、該アミノ酸残基は、ＳまたはＴである；
（ｂｏ）１１４位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ｂｐ）１１５位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ｂｑ）１１９位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｒ）１２０位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｓ）１２３位において、該アミノ酸残基は、ＦまたはＬである；
（ｂｔ）１２５位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｂｕ）１２６位において、該アミノ酸残基は、ＱまたはＨである；
（ｂｖ）位１２８において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ｂｗ）１２９位において、該アミノ酸残基はＶまたはＩである；
（ｂｘ）１３０位において、該アミノ酸残基はＦである；
（ｂｙ）１３１位において、該アミノ酸残基は、ＤまたはＥである；
（ｂｚ）１３２位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｃａ）１３５位において、該アミノ酸残基はＶである；
（ｃｂ）１３８位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｃｃ）１３９位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｃｄ）１４０位において、該アミノ酸残基は、ＬまたはＭである；
（ｃｅ）１４２位において、該アミノ酸残基はＹである；
（ｃｆ）１４３位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｃｇ）１４５位において、該アミノ酸残基は、ＬまたはＩである；および
（ｃｈ）１４６位において、該アミノ酸残基はＴである、
に適合する、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項９７】
請求項９６に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで（ａ）〜（ｃｈ）において特定される位置に対応するアミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％は、（ａ）〜（ｃｈ）において特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項９８】
請求項８６に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、以下の制限：
（ａ）９位、７６位、９４位、および１１０位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ｂ）２９位および１０８位において、該アミノ酸残基はＣである；
（ｃ）３４位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｄ）９５位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｅ）５６位において、該アミノ酸残基はＦである；
（ｆ）４３位、４４位、６６位、７４位、８７位、１０２位、１１６位、１２２位、１２７位および１３６位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ｇ）４１位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｈ）７位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｉ）８５位において、該アミノ酸残基はＫである；
（ｊ）２０位、４２位、５０位、７８位および１２１位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｋ）１位および１４１位において、該アミノ酸残基はＭである；
（ｌ）２３位および１０９位において、該アミノ酸残基はＮである；
（ｍ）２２位、２５位、１３３位、１３４位および１３７位において、該アミノ酸残基はＰである；
（ｎ）７１位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ｏ）１６位、２１位、７３位、９９位および１１１位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ｐ）５５位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ｑ）７７位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｒ）１０７位において、該アミノ酸残基はＷである；および
（ｓ）１３位、４６位、７０位および１１８位において、該アミノ酸残基はＹである、
に適合する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項９９】
請求項７０〜９８のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下からなる群より選択される１以上のアミノ酸残基：
（ａ）１４位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｂ）１８位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｃ）２６位において、該アミノ酸残基はＭまたはＶである；
（ｅ）３０位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｆ）３２位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｇ）３６位において、該アミノ酸残基はＭまたはＴである；
（ｉ）３７位において、該アミノ酸残基はＣである；
（ｊ）３８位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｊ）５３位において、該アミノ酸残基はＶである；
（ｋ）５８位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ｌ）６１位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ｍ）６２位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｎ）６４位において、該アミノ酸残基はＩまたはＦである；
（ｏ）６５位において、該アミノ酸残基はＰである；
（ｐ）７２位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｑ）７５位において、該アミノ酸残基はＶである；
（ｒ）８８位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｓ）８９位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ｔ）９１位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｕ）９８位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｖ）１０５位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｗ）１１２位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ｘ）１２４位において、該アミノ酸残基はＧまたはＣである；
（ｙ）１２８位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｚ）１４０位において、該アミノ酸残基はＭである；
（ａａ）１４３位において、該アミノ酸残基はＲである；および
（ａｂ）１４４位において、該アミノ酸残基はＷである、
を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項１００】
請求項９９に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで（ａ）〜（ａｂ）において特定される位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、（ａ）〜（ａｂ）において特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項１０１】
請求項８６〜１００のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下：
（ａ）４１位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｂ）１３８位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｃ）３４位において、該アミノ酸残基はＮである；および
（ｅ）５５位において、該アミノ酸残基はＳである、
からなる群より選択される１以上のアミノ酸残基を含む。
、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項１０２】
請求項６９に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで該ポリペプチドは、グリホセートについて少なくとも１０ｍＭ−１分−１のｋｃａｔ／Ｋｍでグリホセートのアセチル化を触媒する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項１０３】
請求項１０２に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで該ポリペプチドは、グリホセートについて少なくとも１００ｍＭ−１分−１のｋｃａｔ／Ｋｍでグリホセートのアセチル化を触媒する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項１０４】
請求項１０３に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで該ポリペプチドは、アミノメチルホスホン酸のアセチル化を触媒する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項１０５】
ＧＡＴ活性を有するポリペプチドであって、該ポリペプチドは、以下：
【数３】
からなる群より選択され、該ポリペプチドは、以下
（ａ）少なくとも約２ｍＭ以下のグリホセートについてのＫｍ；
（ｂ）少なくとも約２００μＭ以下のアセチルＣｏＡについてのＫｍ；および
（ｃ）少なくとも約６／分に等しいｋｃａｔ、
により特徴づけられる、ポリペプチド。
【請求項１０６】
グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼ活性を有するタンパク質をコードする単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、該ポリヌクレオチドは、以下：
【数４】
からなる群より選択される、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項１０７】
グリホセート耐性のトランスジェニック植物または植物細胞を生産する方法であって、該方法は：
（ａ）植物または植物細胞を、グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼをコードするポリヌクレオチドで形質転換する工程であって、該ポリヌクレオチドは、以下：
【数５】
からなる群より選択される、工程、
（ｂ）該形質転換した植物細胞から、必要に応じてトランスジェニック植物を再生する工程、
を包含する、方法。
【請求項１０８】
核酸構築物を含む植物または植物細胞を選択するための方法であって、該方法は、以下：
（ａ）核酸構築物を含むトランスジェニック植物または植物細胞を提供する工程であって、ここで該核酸構築物は、グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼをコードするヌクレオチド配列を含み、該ヌクレオチド配列は、以下：
【数６】
からなる群より選択される、工程、
（ｂ）該トランスジェニック植物または植物細胞を、グリホセートの存在下で、該グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼが有効なレベルで発現される条件下で生長させ、それにより、該植物または植物細胞が、該核酸構築物を含んでいない場合に生長したときより早く、該トランスジェニック植物または植物細胞が、認識できる速度で生長する、工程、
を包含する、方法。
【請求項１０９】
農作物を含む圃場で雑草を選択的に制御するための方法であって、該方法は、以下：
（ａ）グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼをコードする遺伝子での形質転換の結果としてグリホセート耐性である農作物の種子または植物を、該圃場に植える工程であって、該遺伝子は、以下：
【数７】
からなる群より選択される、工程、
（ｂ）該圃場における農作物および雑草に、該農作物に重大な影響を及ぼすことなく該雑草を制御するに十分な量のグリホセートを適用する工程、
を包含する、方法。
【請求項１１０】
前記農作物は、綿実、トウモロコシ、またはダイズである、請求項１０９に記載の方法。
【請求項１１１】
グリホセートに対する増強された耐性を有するトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片であって、ここで該植物または植物外植片は、グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼ活性を有するポリペプチドを発現し、該ポリペプチドは、以下：
【数８】
からなる群より選択され；そして少なくとも１つのポリペプチドは、さらなる機構によってグリホセート耐性を与える、トランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項１１２】
トランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片であって、ここで該植物または植物外植片は、グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼ活性を有するポリペプチドを発現し、該ポリペプチドは、以下：
【数９】
からなる群より選択され、少なくとも１つのポリペプチドは、さらなる除草剤に対する耐性を与える、トランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項１１３】
グリホセートに対する増強された耐性を有するトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片であって、ここで該植物または植物外植片は、グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼ活性を有するポリペプチドを発現し、該ポリペプチドは、以下：
【数１０】
からなる群より選択され、少なくとも１つのポリペプチドは、さらなる機構によってグリホセート耐性を与え、少なくとも１つのポリペプチドは、さらなる除草剤に対する耐性を与える、トランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項１１４】
農作物を含む圃場において雑草を制御するための方法であって、該方法は、以下：
（ａ）グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼをコードする遺伝子で形質転換された農作物の種子または植物を、圃場に植える工程であって、該遺伝子は、以下：
【数１１】
からなる群より選択され、少なくとも１つの遺伝子は、さらなる機構によってグリホセート耐性を与えるポリペプチドをコードする、工程；および
（ｂ）該圃場における農作物および雑草に、該農作物に重大な影響を及ぼすことなく該圃場における雑草の生長を阻害するに十分なグリホセートの有効な散布を適用する工程、
を包含する、方法。
【請求項１１５】
農作物を含む圃場における雑草を選択的に制御するための方法であって、該方法は、以下：
（ａ）グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼをコードする遺伝子で形質転換された農作物の種子または植物を、圃場に植える工程であって、該遺伝子は、以下：
【数１２】
からなる群より選択され；少なくとも１つの遺伝子は、さらなる除草剤に対する耐性を与えるポリペプチドをコードする、工程；
（ｂ）該農作物に重大な影響を及ぼすことなく、該圃場における雑草の生長を阻害するに十分であるグリホセートおよびさらなる除草剤の同時のまたは経時的な時間差的散布を、該圃場における農作物および雑草に、適用する工程、
を包含する、方法。
【請求項１１６】
農作物を含む圃場における雑草を選択的に制御するための方法であって、該方法は、以下：
（ａ）グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼをコードする遺伝子で形質転換された農作物の種子または植物を、圃場に植える工程であって、該遺伝子は、以下：
【数１３】
からなる群より選択され；少なくとも１つの遺伝子は、さらなる機構によりグリホセート耐性を与えるポリペプチドをコードし、少なくとも１つの遺伝子は、さらなる除草剤に対する耐性を与えるポリペプチドをコードする、工程；
（ｂ）該農作物に重大な影響を及ぼすことなく、該圃場における雑草の生長を阻害するに十分であるグリホセートおよびさらなる除草剤の同時のまたは経時的な時間差的散布を、該圃場における農作物および雑草に、適用する工程、
を包含する、方法。
【請求項１１７】
以下からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含む単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド：
（ａ）配列番号９１９に対して少なくとも９６％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｂ）配列番号９２９に対して少なくとも９７％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｃ）配列番号８４７に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｄ）配列番号８５１に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｅ）配列番号８５３に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｆ）配列番号８５５に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｇ）配列番号８５７に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｈ）配列番号８６１に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｉ）配列番号８７１に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｊ）配列番号８７５に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｋ）配列番号８８１に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｌ）配列番号８８５に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｍ）配列番号８８７に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｎ）配列番号８８９に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｏ）配列番号８９３に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｐ）配列番号８９７に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｑ）配列番号８９９に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｒ）配列番号９０９に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｓ）配列番号９１１に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｔ）配列番号８３７に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｕ）配列番号８４１に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｖ）配列番号８６５に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｗ）配列番号８６９に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；および
（ｘ）配列番号８７９に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列。
【請求項１１８】
配列番号９２９に対して少なくとも９５％同一であり、配列番号９２９の３３位に対応するアミノ酸位置においてＧｌｙ残基またはＡｓｎ残基を含む、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を含む、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１１９】
グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼ活性を有するポリペプチドをコードする、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチドは、以下：
【数１４】
からなる群より選択される、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１２０】
以下からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド：
（ａ）配列番号９１９に対して少なくとも９６％同一であるアミノ酸配列；
（ｂ）配列番号９２９に対して少なくとも９７％同一であるアミノ酸配列；
（ｃ）配列番号８４７に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｄ）配列番号８５１に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｅ）配列番号８５３に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｆ）配列番号８５５に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｇ）配列番号８５７に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｈ）配列番号８６１に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｉ）配列番号８７１に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｊ）配列番号８７５に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｋ）配列番号８８１に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｌ）配列番号８８５に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｍ）配列番号８８７に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｎ）配列番号８８９に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｏ）配列番号８９３に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｐ）配列番号８９７に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｑ）配列番号８９９に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｒ）配列番号９０９に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｓ）配列番号９１１に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｔ）配列番号８３７に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列；
（ｕ）配列番号８４１に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列；
（ｖ）配列番号８６５に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列；
（ｗ）配列番号８６９に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列；および
（ｘ）配列番号８７９に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列。
【請求項１２１】
配列番号９２９に対して少なくとも９５％同一であり、配列番号９２９の３３位に対応するアミノ酸位置においてＧｌｙ残基またはＡｓｎ残基を含むアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項１２２】
以下：
【数１５】
からなる群より選択されるアミノ酸配列の残基２〜１４６を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１２３】
以下：
【数１６】
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１２４】
植物または植物細胞におけるポリヌクレオチドの発現を増大する方法であって、該方法は、以下：
（ａ）ＢＬＯＳＵＭ６２行列、ギャップ存在ペナルティ１１、およびギャップ伸長ペナルティ１を使用して、配列番号３００、配列番号４４５および配列番号４５７からなる群より選択される配列と最適に整列させて、少なくとも４６０の類似性スコアを出し得るアミノ配列を含むポリペプチドコードする核酸配列を含む第１のポリヌクレオチドを得る工程であって、該核酸配列
は、開始メチオニンＡＴＧコドンを含む、工程；
（ｂ）該開始メチオニンＡＴＧコドンのすぐ下流であってかつ隣接させて、該核酸配列に１つまたは２つのＧＣＧコドンまたはＧＣＴコドンを挿入して、改変ポリヌクレオチドを得る工程；および
（ｃ）該改変ポリヌクレオチドで該植物または植物細胞を形質転換する工程であって、ここで該改変ポリヌクレオチドで形質転換された植物または植物細胞は、該第１のポリヌクレオチドで形質転換された植物または植物細胞と比較して、大量のコードされたポリヌクレオチドを蓄積する、工程、
を包含する、方法。
【請求項１２５】
植物において頻繁には利用されない核酸配列における１以上のコドンを同定する工程、および植物において頻繁には利用されない該コドンを、植物においてより頻繁に利用される同じアミノ酸をコードするコドンに代わって使用する工程をさらに包含する、請求項１２４に記載の方法。
【請求項１】
単離されたポリヌクレオチドまたは組み換えポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチドは、以下：
（ａ）ＢＬＯＳＵＭ６２行列、ギャップ存在ペナルティ１１、およびギャップ伸長ペナルティ１を使用して、配列番号３００、配列番号４４５および配列番号４５７からなる群より選択される配列と最適に整列させて、少なくとも４６０の類似性スコアを出し得るアミノ配列をコードするヌクレオチド配列であって、
ここで、該アミノ酸配列は、以下：
（ｉ）１８位および３８位に、Ｚ５アミノ酸残基；
（ｉｉ）６２位に、Ｚ１アミノ酸残基；
（ｉｉｉ）１２４位に、Ｚ６アミノ酸残基；および
（ｉｖ）１４４位に、Ｚ２アミノ酸残基、
からなる群より選択される少なくとも１つの制限に適合する、１つ以上のアミノ酸残基を含有し、
ここで：
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、ＭおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ２は、Ｆ、ＷおよびＹからなる群より選択されるアミノ酸残基であり、
Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸残基であり、
Ｚ６は、Ｃ、ＧおよびＰからなる群より選択されるアミノ酸残基である、
ヌクレオチド配列；または、
（ｂ）その相補的ヌクレオチド配列、
を含む、単離されたポリヌクレオチドまたは組み換えポリヌクレオチド。
【請求項２】
請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列中のアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）２位、４位、１５位、１９位、２６位、２８位、３１位、４５位、５１位、５４位、８６位、９０位、９１位、９７位、１０３位、１０５位、１０６位、１１４位、１２３位、１２９位、１３９位、および／または１４５位において、該アミノ酸残基は、Ｂ１である；および
（ｂ）３位、５位、８位、１０位、１１位、１４位、１７位、２４位、２７位、３２位、３７位、４７位、４８位、４９位、５２位、５７位、５８位、６１位、６３位、６８位、６９位、７９位、８０位、８２位、８３位、８９位、９２位、１００位、１０１位、１０４位、１１９位、１２０位、１２５位、１２６位、１２８位、１３１位、および／または１４３位において、該アミノ酸残基は、Ｂ２である；
に適合し、ここでＢ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、Ｙ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そしてＢ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項３】
請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、以下の制限：
（ａ）２位、４位、１５位、１９位、２６位、２８位、５１位、５４位、８６位、９０位、９１位、９７位、１０３位、１０５位、１０６位、１１４位、１２９位、１３９位、および／または１４５位において、該アミノ酸残基はＺ１である；
（ｂ）３１位および／または４５位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｃ）８位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｄ）８９位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ６である；
（ｅ）８２位、９２位、１０１位および／または１２０位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｆ）３位、１１位、２７位および／または７９位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｇ）１８位において、該アミノ酸残基はＺ４またはＺ５である；
（ｈ）１２３位において、該アミノ酸残基はＺ１またはＺ２である；
（ｉ）１２位、３３位、３５位、３９位、５３位、５９位、１１２位、１３２位、１３５位、１４０位および／または１４６位において、該アミノ酸残基はＺ１またはＺ３である；
（ｊ）３０位において、該アミノ酸残基はＺ１である；
（ｋ）６位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
（ｌ）８１位において、該アミノ酸残基はＺ２またはＺ４である；
（ｍ）１１３位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｎ）１３８位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｏ）１４２位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｐ）５７位および／または１２６位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ４である；；
（ｑ）５位、１７位および６１位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｒ）２４位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｓ）１０４位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｔ）５２位および／または６９位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｕ）１４位および／または１１９位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｖ）１０位、３２位、６３位および／または８３位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｗ）４８位および／または８０位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
（ｘ）４０位において、該アミノ酸残基はＺ１またはＺ２である；
（ｙ）９６位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ５である；
（ｚ）６５位において、該アミノ酸残基はＺ３、Ｚ４またはＺ６である；
（ａａ）８４位および／または１１５位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ａｂ）９３位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ａｃ）１３０位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ａｄ）５８位において、該アミノ酸残基はＺ３、Ｚ４またはＺ６である；
（ａｅ）４７位において、該アミノ酸残基はＺ４またはＺ６である；
（ａｆ）４９位および／または１００位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ４である；
（ａｇ）６８位において、該アミノ酸残基はＺ４またはＺ５である；
（ａｈ）１４３位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ａｉ）１３１位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ａｊ）１２５位および／または１２８位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ａｋ）６７位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ４である；
（ａｌ）６０位において、該アミノ酸残基はＺ５である；および
（ａｍ）３７位において、該アミノ酸残基はＺ４またはＺ６である；
に適合し、ここで
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ２は、Ｆ、Ｗ、およびＹからなる群より選択されるアミノ酸であり；
Ｚ３は、Ｎ、Ｑ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるアミノ酸であり；
Ｚ４は、Ｒ、Ｈ、およびＫからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；そして
Ｚ６は、Ｃ、Ｇ、およびＰからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項４】
請求項３に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで（ａ）〜（ａｍ）に特定される位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、（ａ）〜（ａｍ）において特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項５】
請求項１〜４のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであっって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、１３位、２０位、３６位、４２位、４６位、５０位、５６位、６４位、７０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１０７位、１１０位、１１７位、１１８位、１２１位および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＢ１である；および
（ｂ）１６位、２１位、２２位、２３位、２５位、２９位、３４位、４１位、４３位、４４位、５５位、６６位、７１位、７３位、７４位、７７位、８５位、８７位、８８位、９５位、９９位、１０２位、１０８位、１０９位、１１１位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＢ２である；
に適合し、ここでＢ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、Ｙ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そして
Ｂ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項６】
請求項１〜４のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、１３位、２０位、４２位、４６位、５０位、５６位、６４位、７０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１０７位、１１０位、１１７位、１１８位、１２１位および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＢ１である；および
（ｂ）１６位、２１位、２２位、２３位、２５位、２９位、３４位、３６位、４１位、４３位、４４位、５５位、６６位、７１位、７３位、７４位、７７位、８５位、８７位、８８位、９５位、９９位、１０２位、１０８位、１０９位、１１１位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位、および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＢ２である；
に適合し、ここで
Ｂ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、Ｙ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そして
Ｂ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項７】
請求項１〜４のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％は、以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、２０位、４２位、５０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１１０位、１２１位、および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＺ１である；
（ｂ）１３位、４６位、５６位、７０位、１０７位、１１７位、および／または１１８位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｃ）２３位、５５位、７１位、７７位、８８位、および／または１０９位において、該アミノ酸残基はＺ３であり；
（ｄ）１６位、２１位、４１位、７３位、８５位、９９位、および／または１１１位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｅ）３４位および／または９５位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｆ）２２位、２５位、２９位、４３位、４４位、６６位、７４位、８７位、１０２位、１０８位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位、および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
に適合し、ここで
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ２は、Ｆ、Ｗ、およびＹからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ３は、Ｎ、Ｑ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ４は、Ｒ、Ｈ、およびＫからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸であり；そしてＺ６は、Ｃ、Ｇ、およびＰからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項８】
請求項７に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、３６位において、Ｚ１およびＺ３からなる群より選択されるアミノ酸残基を含む、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項９】
請求項７または８に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、６４位において、Ｚ１およびＺ２からなる群より選択されるアミノ酸残基を含む、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１０】
請求項１〜９のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、以下の制限：
（ａ）２位において、該アミノ酸残基はＩまたはＬである；
（ｂ）３位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｃ）４位において、該アミノ酸残基はＶまたはＩである；
（ｄ）５位において、該アミノ酸残基はＫである；
（ｅ）６位において、該アミノ酸残基はＰである；
（ｆ）８位において、該アミノ酸残基はＮである；
（ｇ）１０位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｈ）１１位において、該アミノ酸残基はＤまたはＥである；
（ｉ）１２位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｊ）１４位において、該アミノ酸残基はＥまたはＤである；
（ｋ）１５において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｌ）１７位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｍ）１８位において、該アミノ酸残基は、Ｒ、ＥまたはＫである；
（ｎ）１９位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ｏ）２４位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ｐ）２６位において、該アミノ酸残基は、Ｍ、Ｌ、ＶまたはＩである；
（ｑ）２７位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｒ）２８位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＶである；
（ｓ）３０位において、該アミノ酸残基はＭである；
（ｔ）３１位において、該アミノ酸残基は、ＹまたはＦである；
（ｕ）３２位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ｖ）３３位において、該アミノ酸残基は、ＴまたはＳである；
（ｗ）３５位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｘ）３７位において、該アミノ酸残基は、Ｒ、Ｇ、ＥまたはＱである；
（ｙ）３９位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＳである；
（ｚ）４０位において、該アミノ酸残基は、ＦまたはＬである；
（ａａ）４５位において、該アミノ酸残基は、ＹまたはＦである；
（ａｂ）４７位において、該アミノ酸残基は、ＲまたはＧである；
（ａｃ）４８位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ａｄ）４９位において、該アミノ酸残基は、Ｋ、Ｒ、またはＱである；
（ａｅ）５１位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ａｆ）５２位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ａｇ）５３位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ａｈ）５４位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｉ）５７位において、該アミノ酸残基は、ＨまたはＮである；
（ａｊ）５８位において、該アミノ酸残基は、Ｑ、Ｋ、ＲまたはＰである；
（ａｋ）５９位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｌ）６０位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ａｍ）６１位において、該アミノ酸残基は、ＨまたはＲである；
（ａｎ）６３位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ａｏ）６５位において、該アミノ酸残基は、Ｅ、ＰまたはＱである；
（ａｐ）６７位において、該アミノ酸残基は、ＱまたはＲである；
（ａｑ）６８位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＥである；
（ａｒ）６９位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ａｓ）７９位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ａｔ）８０位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ａｕ）８１位において、該アミノ酸残基は、Ｙ、ＨまたはＦである；
（ａｖ）８２位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ａｗ）８３位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ａｘ）８４位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ａｙ）８６位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｚ）８９位において、該アミノ酸残基は、Ｇ、ＴまたはＳである；
（ｂａ）９０位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｂｂ）９１位において、該アミノ酸残基は、Ｌ、ＩまたはＶである；
（ｂｃ）９２位において、該アミノ酸残基は、ＲまたはＫである；
（ｂｄ）９３位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｂｅ）９６位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＱである；
（ｂｆ）９７位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｂｇ）１００位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＮである；
（ｂｈ）１０１位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｉ）１０３位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＶである；
（ｂｊ）１０４位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｂｋ）１０５位において、該アミノ酸残基は、Ｍ、ＬまたはＩである；
（ｂｌ）１０６位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｂｍ）１１２位において、該アミノ酸残基は、ＴまたはＡである；
（ｂｎ）１１３位において、該アミノ酸残基は、ＳまたはＴである；
（ｂｏ）１１４位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ｂｐ）１１５位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ｂｑ）１１９位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｒ）１２０位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｓ）１２３位において、該アミノ酸残基は、ＦまたはＬである；
（ｂｔ）１２５位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｂｕ）１２６位において、該アミノ酸残基は、ＱまたはＨである；
（ｂｖ）１２８位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ｂｗ）１２９位において、該アミノ酸残基は、ＶまたはＩである；
（ｂｘ）１３０位において、該アミノ酸残基はＦである；
（ｂｙ）１３１位において、該アミノ酸残基は、ＤまたはＥである；
（ｂｚ）１３２位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｃａ）１３５位において、該アミノ酸残基はＶである；
（ｃｂ）１３８位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｃｃ）１３９位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｃｄ）１４０位において、該アミノ酸残基は、ＬまたはＭである；
（ｃｅ）１４２位において、該アミノ酸残基はＹである；
（ｃｆ）１４３位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｃｇ）１４５位において、該アミノ酸残基は、ＬまたはＩである；そして
（ｃｈ）１４６位において、該アミノ酸残基はＴである、
に適合する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１１】
請求項１０に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで（ａ）〜（ｃｈ）において特定される位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、（ａ）〜（ｃｈ）に特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１２】
請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％は、以下の制限：
（ａ）９位、７６位、９４位および１１０位において、該アミノ酸残基Ａである；
（ｂ）２９位および１０８位において、該アミノ酸残基はＣである；
（ｃ）３４位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｄ）９５位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｅ）５６位において、該アミノ酸残基はＦである；
（ｆ）４３位、４４位、６６位、７４位、８７位、１０２位、１１６位、１２２位、１２７位および１３６位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ｇ）４１位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｈ）７位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｉ）８５位において、該アミノ酸残基はＫである；
（ｊ）２０位、４２位、５０位、７８位および１２１位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｋ）１位および１４１位において、該アミノ酸残基はＭである；
（ｌ）２３位および１０９位において、該アミノ酸残基はＮである；
（ｍ）２２位、２５位、１３３位、１３４位および１３７位において、該アミノ酸残基はＰである；
（ｎ）７１位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ｏ）１６位、２１位、７３位、９９および１１１位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ｐ）５５位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ｑ）７７位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｒ）１０７位において、該アミノ酸残基はＷである；および
（ｓ）１３位、４６位、７０位および１１８位において、該アミノ酸残基はＹである、
に適合する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１３】
請求項１〜１２のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下：
（ａ）３６位において、該アミノ酸残基は、Ｍ、Ｌ、またはＴである；
（ｂ）７２位において、該アミノ酸残基は、ＬまたはＩである；
（ｃ）７５位において、該アミノ酸残基は、ＭまたはＶである；
（ｄ）６４位において、該アミノ酸残基は、Ｌ、Ｉ、またはＦである；
（ｅ）８８位において、該アミノ酸残基は、ＴまたはＳである；
（ｆ）１１７位において、該アミノ酸残基は、ＹまたはＦである、
からなる群より選択される、アミノ酸残基を含む、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１４】
請求項１〜１３のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下：
（ａ）１４位において、該アミノ酸残基は、Ｄである；
（ｂ）１８位において、該アミノ酸残基は、Ｅである；
（ｃ）２６位において、該アミノ酸残基は、ＭまたはＶである；
（ｅ）３０位において、該アミノ酸残基は、Ｉである；
（ｆ）３２位において、該アミノ酸残基は、Ｄである；
（ｇ）３６位において、該アミノ酸残基は、ＭまたはＴである；
（ｉ）３７位において、該アミノ酸残基は、Ｃである；
（ｊ）３８位において、該アミノ酸残基は、Ｄである；
（ｊ）５３位において、該アミノ酸残基は、Ｖである；
（ｋ）５８位において、該アミノ酸残基は、Ｒである；
（ｌ）６１位において、該アミノ酸残基は、Ｒである；
（ｍ）６２位において、該アミノ酸残基は、Ｌである；
（ｎ）６４位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＦである；
（ｏ）６５位において、該アミノ酸残基は、Ｐである；
（ｐ）７２位において、該アミノ酸残基は、Ｉである；
（ｑ）７５位において、該アミノ酸残基は、Ｖである；
（ｒ）８８位において、該アミノ酸残基は、Ｔである；
（ｓ）８９位において、該アミノ酸残基は、Ｇである；
（ｔ）９１位において、該アミノ酸残基は、Ｌである；
（ｕ）９８位において、該アミノ酸残基は、Ｉである；
（ｖ）１０５位において、該アミノ酸残基は、Ｉである；
（ｗ）１１２位において、該アミノ酸残基は、Ａである；
（ｘ）１２４位において、該アミノ酸残基は、ＧまたはＣである；
（ｙ）１２８位において、該アミノ酸残基は、Ｄである；
（ｚ）１４０位において、該アミノ酸残基は、Ｍである；
（ａａ）１４３位において、該アミノ酸残基は、Ｒである；および
（ａｂ）１４４位において、該アミノ酸残基は、Ｗである；
からなる群より選択される１以上のアミノ酸残基を含む、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１５】
請求項１４に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで（ａ）〜（ａｂ）において特定される位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、（ａ）〜（ａｂ）において特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１６】
請求項１〜１５のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下：
（ａ）４１位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｂ）１３８位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｃ）３４位において、該アミノ酸残基はＮである；および
（ｄ）５５位において、該アミノ酸残基はＳである、
からなる群より選択される１以上のアミノ酸残基を含む、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１７】
単離されたポリヌクレオチドまたは組み換えポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチドは、以下：
（ａ）配列番号５７７と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｂ）配列番号５７８と少なくとも９７％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｃ）配列番号６２１と少なくとも９７％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｄ）配列番号５７９と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｅ）配列番号６０２と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｆ）配列番号６９７と少なくとも９５％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｇ）配列番号７２１と少なくとも９６％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｈ）配列番号６１３と少なくとも９７％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｉ）配列番号６７７と少なくとも８９％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｊ）配列番号５８４と少なくとも９６％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｋ）配列番号７０７と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｌ）配列番号６１６と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｍ）配列番号６１２と少なくとも９６％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｎ）配列番号５９０と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列をコードする、ヌクレオチド配列；
（ｏ）（ａ）〜（ｎ）の任意の１つと相補的なヌクレオチド配列、
からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含有する、単離されたポリヌクレオチドまたは組み換えポリヌクレオチド。
【請求項１８】
請求項１７に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下：
（ｉ）１８および３８位において、Ｚ５アミノ酸残基；
（ｉｉ）６２位において、Ｚ１アミノ酸残基；
（ｉｉｉ）１２４位において、Ｚ６アミノ酸残基；および
（ｉｖ）１４４位において、Ｚ２アミノ酸残基、
からなる群より選択される１以上のアミノ酸残基を含み、ここで：
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ２は、Ｆ、Ｗ、およびＹからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ６は、Ｃ、Ｇ、およびＰからなる群より選択されるアミノ酸残基である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１９】
請求項１７に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）２位、４位、１５位、１９位、２６位、２８位、３１位、４５位、５１位、５４位、８６位、９０位、９１位、９７位、１０３位、１０５位、１０６位、１１４位、１２３位、１２９位、１３９位、および／または１４５位において、該アミノ酸残基はＢ１である；および
（ｂ）３位、５位、８位、１０位、１１位、１４位、１７位、２４位、２７位、３２位、３７位、４７位、４８位、４９位、５２位、５７位、５８位、６１位、６３位、６８位、６９位、７９位、８０位、８２位、８３位、８９位、９２位、１００位、１０１位、１０４位、１１９位、１２０位、１２５位、１２６位、１２８位、１３１位、および／または１４３位において、該アミノ酸残基はＢ２である；
に適合し、ここで：
Ｂ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、ＹおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そして
Ｂ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、ＳおよびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項２０】
請求項１７に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、以下の制限：
（ａ）２位、４位、１５位、１９位、２６位、２８位、５１位、５４位、８６位、９０位、９１位、９７位、１０３位、１０５位、１０６位、１１４位、１２９位、１３９位、および／または１４５位において、該アミノ酸残基は、Ｚ１である；
（ｂ）３１位および／または４５位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｃ）８位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｄ）８９位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３またはＺ６である；
（ｅ）８２位、９２位、１０１位および／または１２０位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｆ）３位、１１位、２７位および／または７９位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｇ）１８位において、該アミノ酸残基は、Ｚ４またはＺ５である；
（ｈ）１２３位において、該アミノ酸残基は、Ｚ１またはＺ２である；
（ｉ）１２位、３３位、３５位、３９位、５３位、５９位、１１２位、１３２位、１３５位、１４０位、および／または１４６位において、該アミノ酸残基は、Ｚ１またはＺ３である；
（ｊ）３０位において、該アミノ酸残基はＺ１である；
（ｋ）６位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
（１）８１位において、該アミノ酸残基は、Ｚ２またはＺ４である；
（ｍ）１１３位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｎ）１３８位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｏ）１４２位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｐ）５７位および／または１２６位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３またはＺ４である；
（ｑ）５位、１７位、および６１位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｒ）２４位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｓ）１０４位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｔ）５２位および／または６９位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｕ）１４位および／または１１９位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｖ）１０位、３２位、６３位、および／または８３位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｗ）４８位および／または８０位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
（ｘ）４０位において、該アミノ酸残基は、Ｚ１またはＺ２である；
（ｙ）９６位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３またはＺ５である；
（ｚ）６５位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３、Ｚ４、またはＺ６である；
（ａａ）８４位および／または１１５位において、該アミノ酸残基 ｉｓ Ｚ３である；
（ａｂ）９３位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ａｃ）１３０位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ａｄ）５８位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３、Ｚ４またはＺ６である；
（ａｅ）４７位において、該アミノ酸残基は、Ｚ４またはＺ６である；
（ａｆ）４９位および／または１００位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３またはＺ４である；
（ａｇ）６８位において、該アミノ酸残基は、Ｚ４またはＺ５である；
（ａｈ）１４３位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ａｉ）１３１位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ａｊ）１２５位および／または１２８位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ａｋ）６７位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ４である；
（ａｌ）６０位において、該アミノ酸残基はＺ５である；および
（ａｍ）３７位において、該アミノ酸残基はＺ４またはＺ６である；
に適合し、ここで
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、ＭおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ２は、Ｆ、ＷおよびＹからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ３は、Ｎ、Ｑ、ＳおよびＴからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ４は、Ｒ、ＨおよびＫからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸であり；そしてＺ６は、Ｃ、Ｇ、およびＰからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項２１】
請求項２０に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで（ａ）〜（ａｍ）において特定される位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、（ａ）〜（ａｍ）において特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項２２】
請求項１７〜２１のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、１３位、２０位、３６位、４２位、４６位、５０位、５６位、６４位、７０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１０７位、１１０位、１１７位、１１８位、１２１位および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＢ１である；および
（ｂ）１６位、２１位、２２位、２３位、２５位、２９位、３４位、４１位、４３位、４４位、５５位、６６位、７１位、７３位、７４位、７７位、８５位、８７位、８８位、９５位、９９位、１０２位、１０８位、１０９位、１１１位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位、および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＢ２である；
に適合し、ここで
Ｂ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、ＹおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そして
Ｂ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、ＳおよびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項２３】
請求項１７〜２２のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、１３位、２０位、４２位、４６位、５０位、５６位、６４位、７０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１０７位、１１０位、１１７位、１１８位、１２１位、および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＢ１である；および
（ｂ）１６位、２１位、２２位、２３位、２５位、２９位、３４位、３６位、４１位、４３位、４４位、５５位、６６位、７１位、７３位、７４位、７７位、８５位、８７位、８８位、９５位、９９位、１０２位、１０８位、１０９位、１１１位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＢ２である；
に適合し、ここで
Ｂ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、ＹおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そして
Ｂ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、ＳおよびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項２４】
請求項１７〜２２のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、２０位、４２位、５０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１１０位、１２１位および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＺ１である；
（ｂ）１３位、４６位、５６位、７０位、１０７位、１１７位、および／または１１８位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｃ）２３位、５５位、７１位、７７位、８８位、および／または１０９位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｄ）１６位、２１位、４１位、７３位、８５位、９９位、および／または１１１位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｅ）３４位および／または９５位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｆ）２２位、２５位、２９位、４３位、４４位、６６位、７４位、８７位、１０２位、１０８位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位、および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
に適合し、ここで
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、ＭおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ２は、Ｆ、ＷおよびＹからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ３は、Ｎ、Ｑ、ＳおよびＴからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ４は、Ｒ、ＨおよびＫからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸であり；そしてＺ６は、Ｃ、ＧおよびＰからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項２５】
請求項２４に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、３６位において、Ｚ１およびＺ３からなる群より選択されるアミノ酸残基を含む、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項２６】
請求項２４または２５に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、６４位において、Ｚ１およびＺ２からなる群より選択されるアミノ酸残基を含む、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項２７】
請求項１７〜２６のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、以下の制限：
（ａ）２位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＬである；
（ｂ）３位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｃ）４位において、該アミノ酸残基は、ＶまたはＩである；
（ｄ）５位において、該アミノ酸残基はＫである；
（ｅ）６位において、該アミノ酸残基はＰである；
（ｆ）８位において、該アミノ酸残基はＮである；
（ｇ）１０位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｈ）１１位において、該アミノ酸残基は、ＤまたはＥである；
（ｉ）１２位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｊ）１４位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ｋ）１５位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｌ）１７位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｍ）１８位において、該アミノ酸残基は、Ｒ、ＥまたはＫである；
（ｎ）１９位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ｏ）２４位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ｐ）２６位において、該アミノ酸残基は、Ｍ、ＬＶまたはＩである；
（ｑ）２７位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｒ）２８位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＶである；
（ｓ）３０位において、該アミノ酸残基はＭである；
（ｔ）３１位において、該アミノ酸残基は、ＹまたはＦである；
（ｕ）３２位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ｖ）３３位において、該アミノ酸残基は、ＴまたはＳである；
（ｗ）３５位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｘ）３７位において、該アミノ酸残基は、Ｒ、Ｇ、ＥまたはＱである；
（ｙ）３９位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＳである；
（ｚ）４０位において、該アミノ酸残基は、ＦまたはＬである；
（ａａ）４５位において、該アミノ酸残基は、ＹまたはＦである；
（ａｂ）４７位において、該アミノ酸残基は、ＲまたはＧである；
（ａｃ）４８位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ａｄ）４９位において、該アミノ酸残基は、Ｋ、Ｒ、またはＱである；
（ａｅ）５１位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ａｆ）５２位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ａｇ）５３位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ａｈ）５４位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｉ）５７位において、該アミノ酸残基は、ＨまたはＮである；
（ａｊ）５８位において、該アミノ酸残基は、Ｑ、Ｋ、ＲまたはＰである；
（ａｋ）５９位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｌ）６０位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ａｍ）６１位において、該アミノ酸残基は、ＨまたはＲである；
（ａｎ）６３位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ａｏ）６５位において、該アミノ酸残基は、Ｅ、ＰまたはＱである；
（ａｐ）６７位において、該アミノ酸残基は、ＱまたはＲである；
（ａｑ）６８位において ｔｈｅ アミノ酸残基は、ＫまたはＥである；
（ａｒ）６９位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ａｓ）７９位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ａｔ）８０位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ａｕ）８１位において、該アミノ酸残基は、Ｙ、ＨまたはＦである；
（ａｖ）８２位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ａｗ）８３位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ａｘ）８４位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ａｙ）８６位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｚ）８９位において、該アミノ酸残基は、Ｇ、ＴまたはＳである；
（ｂａ）９０位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｂｂ）９１位において、該アミノ酸残基は、Ｌ、ＩまたはＶである；
（ｂｃ）９２位において、該アミノ酸残基は、ＲまたはＫである；
（ｂｄ）９３位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｂｅ）９６位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＱである；
（ｂｆ）９７位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｂｇ）１００位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＮである；
（ｂｈ）１０１位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｉ）１０３位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＶである；
（ｂｊ）１０４位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｂｋ）１０５位において、該アミノ酸残基は、Ｍ、ＬまたはＩである；
（ｂｌ）１０６位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｂｍ）１１２位において、該アミノ酸残基は、ＴまたはＡである；
（ｂｎ）１１３位において、該アミノ酸残基は、ＳまたはＴである；
（ｂｏ）１１４位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ｂｐ）１１５位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ｂｑ）１１９位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｒ）１２０位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｓ）１２３位において、該アミノ酸残基は、ＦまたはＬである；
（ｂｔ）１２５位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｂｕ）１２６位において、該アミノ酸残基は、ＱまたはＨである；
（ｂｖ）位１２８において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ｂｗ）１２９位において、該アミノ酸残基はＶまたはＩである；
（ｂｘ）１３０位において、該アミノ酸残基はＦである；
（ｂｙ）１３１位において、該アミノ酸残基は、ＤまたはＥである；
（ｂｚ）１３２位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｃａ）１３５位において、該アミノ酸残基はＶである；
（ｃｂ）１３８位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｃｃ）１３９位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｃｄ）１４０位において、該アミノ酸残基は、ＬまたはＭである；
（ｃｅ）１４２位において、該アミノ酸残基はＹである；
（ｃｆ）１４３位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｃｇ）１４５位において、該アミノ酸残基は、ＬまたはＩである；および
（ｃｈ）１４６位において、該アミノ酸残基はＴである、
に適合する、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項２８】
請求項２７に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで（ａ）〜（ｃｈ）において特定される位置に対応するアミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％は、（ａ）〜（ｃｈ）において特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項２９】
請求項１７に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、以下の制限：
（ａ）９位、７６位、９４位、および１１０位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ｂ）２９位および１０８位において、該アミノ酸残基はＣである；
（ｃ）３４位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｄ）９５位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｅ）５６位において、該アミノ酸残基はＦである；
（ｆ）４３位、４４位、６６位、７４位、８７位、１０２位、１１６位、１２２位、１２７位および１３６位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ｇ）４１位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｈ）７位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｉ）８５位において、該アミノ酸残基はＫである；
（ｊ）２０位、４２位、５０位、７８位および１２１位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｋ）１位および１４１位において、該アミノ酸残基はＭである；
（ｌ）２３位および１０９位において、該アミノ酸残基はＮである；
（ｍ）２２位、２５位、１３３位、１３４位および１３７位において、該アミノ酸残基はＰである；
（ｎ）７１位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ｏ）１６位、２１位、７３位、９９位および１１１位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ｐ）５５位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ｑ）７７位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｒ）１０７位において、該アミノ酸残基はＷである；および
（ｓ）１３位、４６位、７０位および１１８位において、該アミノ酸残基はＹである、
に適合する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項３０】
請求項１〜２９のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下からなる群より選択される１以上のアミノ酸残基：
（ａ）１４位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｂ）１８位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｃ）２６位において、該アミノ酸残基はＭまたはＶである；
（ｅ）３０位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｆ）３２位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｇ）３６位において、該アミノ酸残基はＭまたはＴである；
（ｉ）３７位において、該アミノ酸残基はＣである；
（ｊ）３８位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｊ）５３位において、該アミノ酸残基はＶである；
（ｋ）５８位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ｌ）６１位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ｍ）６２位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｎ）６４位において、該アミノ酸残基はＩまたはＦである；
（ｏ）６５位において、該アミノ酸残基はＰである；
（ｐ）７２位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｑ）７５位において、該アミノ酸残基はＶである；
（ｒ）８８位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｓ）８９位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ｔ）９１位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｕ）９８位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｖ）１０５位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｗ）１１２位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ｘ）１２４位において、該アミノ酸残基はＧまたはＣである；
（ｙ）１２８位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｚ）１４０位において、該アミノ酸残基はＭである；
（ａａ）１４３位において、該アミノ酸残基はＲである；および
（ａｂ）１４４位において、該アミノ酸残基はＷである、
を含む、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項３１】
請求項３０に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで（ａ）〜（ａｂ）において特定される位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、（ａ）〜（ａｂ）において特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項３２】
請求項１７〜３１のいずれかに記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下：
（ａ）４１位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｂ）１３８位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｃ）３４位において、該アミノ酸残基はＮである；および
（ｅ）５５位において、該アミノ酸残基はＳである、
からなる群より選択される１以上のアミノ酸残基を含む。
、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項３３】
グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼ活性を有するタンパク質をコードする単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチドは、以下：
【数１】
からなる群より選択される、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項３４】
請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記ポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドは、グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼ活性を有する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項３５】
請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記ポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドは、グリホセートＮ−アシルトランスフェラーゼ活性を有する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項３６】
請求項３４に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記ポリペプチドは、グリホセートについて少なくとも１０ｍＭ−１分−１のｋｃａｔ／Ｋｍでグリホセートのアセチル化を触媒する、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項３７】
請求項３４に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、ここで前記ポリペプチドは、アミノメチルホスホン酸のアセチル化を触媒する、ポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項３８】
請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドを含む、核酸構築物。
【請求項３９】
請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドに作動可能に連結されたプロモーターを含む、請求項３８に記載の核酸構築物であって、ここで該プロモーターは、該ポリヌクレオチドに関して異種であり、前記コードされるポリペプチドの十分な発現を引き起こして、該核酸構築物で形質転換された植物細胞のグリホセート耐性を増強するに有効である、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項４０】
請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドは、選択マーカーとして機能する、請求項３８に記載の核酸構築物。
【請求項４１】
前記構築物はベクターである、請求項３８に記載の核酸構築物。
【請求項４２】
有効なレベルの第２のポリペプチドを発現する細胞または生物に対して検出可能な表現型形質を付与する、該第２のポリペプチドをコードする第２のポリヌクレオチド配列をさらに含む、請求項４１に記載のベクター。
【請求項４３】
前記検出可能な表現型形質は、選択マーカーとして機能する、請求項４２に記載のベクター。
【請求項４４】
前記検出可能な表現型形質は、除草剤耐性および目視可能なマーカーからなる群より選択される、請求項４２に記載のベクター。
【請求項４５】
前記ベクターはＴ−ＤＮＡ配列をさらに含む、請求項４１に記載のベクター。
【請求項４６】
前記単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドは、調節性配列に作動可能に連結される、請求項４１に記載のベクター。
【請求項４７】
前記ベクターは植物形質転換ベクターである、請求項４１に記載のベクター。
【請求項４８】
少なくとも１つの、請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドを含む細胞であって、ここで該ポリヌクレオチドは、該細胞に対して異種である、細胞。
【請求項４９】
前記単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドは、調節性配列に作動可能に連結される、請求項４８に記載の細胞。
【請求項５０】
請求項４１に記載のベクターによって形質導入された、細胞。
【請求項５１】
前記細胞は、トランスジェニック植物細胞である、請求項４９または５０に記載の細胞。
【請求項５２】
前記トランスジェニック植物細胞は、グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼ活性を有する外因性ポリペプチドを発現する、請求項５１に記載のトランスジェニック植物細胞。
【請求項５３】
前記トランスジェニック植物細胞は、グリホセートＮ−アシルトランスフェラーゼ活性を有する外因性ポリペプチドを発現する。請求項５１に記載のトランスジェニック植物細胞。
【請求項５４】
請求項５２の細胞を含む、トランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項５５】
請求項５３に記載の細胞を含む、トランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項５６】
前記植物または植物外植片は、グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼ活性を有するポリペプチドを発現する、請求項５４に記載のトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項５７】
前記植物または植物外植片は、グリホセートＮ−アシルトランスフェラーゼ活性を有するポリペプチドを発現する、請求項５５に記載のトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項５８】
前記植物または植物外植片は、Ｅｌｅｕｓｉｎｅ、Ｌｏｌｌｉｕｍ、Ｂａｍｂｕｓａ、Ｂｒａｓｓｉｃａ、Ｄａｃｔｙｌｉｓ、Ｓｏｒｇｈｕｍ、Ｐｅｎｎｉｓｅｔｕｍ、Ｚｅａ、Ｏｒｙｚａ、Ｔｒｉｔｉｃｕｍ、Ｓｅｃａｌｅ、Ａｖｅｎａ、Ｈｏｒｄｅｕｍ、Ｓａｃｃｈａｒｕｍ、Ｃｏｉｘ、ＧｌｙｃｉｎｅおよびＧｏｓｓｙｐｉｕｍからなる属の群より選択される農作物植物である、請求項５６に記載のトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項５９】
前記植物または植物外植片は、Ｅｌｅｕｓｉｎｅ、Ｌｏｌｌｉｕｍ、Ｂａｍｂｕｓａ、Ｂｒａｓｓｉｃａ、Ｄａｃｔｙｌｉｓ、Ｓｏｒｇｈｕｍ、Ｐｅｎｎｉｓｅｔｕｍ、Ｚｅａ、Ｏｒｙｚａ、Ｔｒｉｔｉｃｕｍ、Ｓｅｃａｌｅ、Ａｖｅｎａ、Ｈｏｒｄｅｕｍ、Ｓａｃｃｈａｒｕｍ、Ｃｏｉｘ、ＧｌｙｃｉｎｅおよびＧｏｓｓｙｐｉｕｍからなる属の群より選択される農作物植物である、請求項５７に記載のトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項６０】
前記植物または植物外植片は、Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓである、請求項５６に記載のトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項６１】
前記植物または植物外植片は、Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓである、請求項５７に記載のトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項６２】
前記植物または植物外植片は、Ｇｏｓｓｙｐｉｕｍである、請求項５６に記載のトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項６３】
前記植物または植物外植片は、Ｇｏｓｓｙｐｉｕｍである、請求項５７に記載のトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項６４】
前記植物または植物外植片は、同じ種、系統または品種の野生型植物と比較して、グリホセートに対する増強された耐性を示す、請求項５６に記載のトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項６５】
前記植物または植物外植片は、同じ種、系統または品種の野生型植物と比較して、グリホセートに対する増強された耐性を示す、請求項５７に記載のトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項６６】
請求項５６に記載の植物によって生成される、種子。
【請求項６７】
請求項５７に記載の植物によって生成される、種子。
【請求項６８】
異種遺伝子を含むトランスジェニック植物であって、該遺伝子は、以下：
【数２】
からなる群より選択され、該遺伝子は、グリホセートについて少なくとも１０ｍＭ−１分−１のｋｃａｔ／Ｋｍを有するグリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼをコードし、ここで該植物は、除草剤適用に起因する有意な収率減少なしで、該異種遺伝子を欠いている同じ植物の生長を阻害するに有効なレベルで適用されるグリホセートに対する耐性を示す、
トランスジェニック植物。
【請求項６９】
前記グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼは、アミノメチルホスホン酸のアセチル化を触媒する、請求項６８に記載のトランスジェニック植物。
【請求項７０】
以下を含む単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって：
（ａ）ＢＬＯＳＵＭ６２行列、ギャップ存在ペナルティ１１、およびギャップ伸長ペナルティ１を使用して、配列番号３００、配列番号４４５および配列番号４５７からなる群より選択される配列と最適に整列させて、少なくとも４６０の類似性スコアを出し得るアミノ配列であって、
ここで、該アミノ酸配列は、以下：
（ｉ）１８位および３８位に、Ｚ５アミノ酸残基；
（ｉｉ）６２位に、Ｚ１アミノ酸残基；
（ｉｉｉ）１２４位に、Ｚ６アミノ酸残基；および
（ｉｖ）１４４位に、Ｚ２アミノ酸残基、
からなる群より選択される少なくとも１つ以上のアミノ酸残基を含有し、
ここで：
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、ＭおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ２は、Ｆ、ＷおよびＹからなる群より選択されるアミノ酸残基であり、
Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸残基であり、
Ｚ６は、Ｃ、ＧおよびＰからなる群より選択されるアミノ酸残基である、
アミノ酸配列；または、
（ｂ）その相補的ヌクレオチド配列、
を含む、単離されたポリペプチドまたは組み換えポリペプチド。
【請求項７１】
請求項１に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列中のアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）２位、４位、１５位、１９位、２６位、２８位、３１位、４５位、５１位、５４位、８６位、９０位、９１位、９７位、１０３位、１０５位、１０６位、１１４位、１２３位、１２９位、１３９位、および／または１４５位において、該アミノ酸残基は、Ｂ１である；および
（ｂ）３位、５位、８位、１０位、１１位、１４位、１７位、２４位、２７位、３２位、３７位、４７位、４８位、４９位、５２位、５７位、５８位、６１位、６３位、６８位、６９位、７９位、８０位、８２位、８３位、８９位、９２位、１００位、１０１位、１０４位、１１９位、１２０位、１２５位、１２６位、１２８位、１３１位、および／または１４３位において、該アミノ酸残基は、Ｂ２である；
に適合し、ここでＢ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、Ｙ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そしてＢ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項７２】
請求項７０に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、以下の制限：
（ａ）２位、４位、１５位、１９位、２６位、２８位、５１位、５４位、８６位、９０位、９１位、９７位、１０３位、１０５位、１０６位、１１４位、１２９位、１３９位、および／または１４５位において、該アミノ酸残基はＺ１である；
（ｂ）３１位および／または４５位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｃ）８位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｄ）８９位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ６である；
（ｅ）８２位、９２位、１０１位および／または１２０位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｆ）３位、１１位、２７位および／または７９位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｇ）１８位において、該アミノ酸残基はＺ４またはＺ５である；
（ｈ）１２３位において、該アミノ酸残基はＺ１またはＺ２である；
（ｉ）１２位、３３位、３５位、３９位、５３位、５９位、１１２位、１３２位、１３５位、１４０位および／または１４６位において、該アミノ酸残基はＺ１またはＺ３である；
（ｊ）３０位において、該アミノ酸残基はＺ１である；
（ｋ）６位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
（ｌ）８１位において、該アミノ酸残基はＺ２またはＺ４である；
（ｍ）１１３位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｎ）１３８位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｏ）１４２位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｐ）５７位および／または１２６位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ４である；；
（ｑ）５位、１７位および６１位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｒ）２４位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｓ）１０４位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｔ）５２位および／または６９位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｕ）１４位および／または１１９位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｖ）１０位、３２位、６３位および／または８３位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｗ）４８位および／または８０位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
（ｘ）４０位において、該アミノ酸残基はＺ１またはＺ２である；
（ｙ）９６位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ５である；
（ｚ）６５位において、該アミノ酸残基はＺ３、Ｚ４またはＺ６である；
（ａａ）８４位および／または１１５位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ａｂ）９３位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ａｃ）１３０位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ａｄ）５８位において、該アミノ酸残基はＺ３、Ｚ４またはＺ６である；
（ａｅ）４７位において、該アミノ酸残基はＺ４またはＺ６である；
（ａｆ）４９位および／または１００位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ４である；
（ａｇ）６８位において、該アミノ酸残基はＺ４またはＺ５である；
（ａｈ）１４３位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ａｉ）１３１位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ａｊ）１２５位および／または１２８位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ａｋ）６７位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ４である；
（ａｌ）６０位において、該アミノ酸残基はＺ５である；および
（ａｍ）３７位において、該アミノ酸残基はＺ４またはＺ６である；
に適合し、ここで
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ２は、Ｆ、Ｗ、およびＹからなる群より選択されるアミノ酸であり；
Ｚ３は、Ｎ、Ｑ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるアミノ酸であり；
Ｚ４は、Ｒ、Ｈ、およびＫからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；そして
Ｚ６は、Ｃ、Ｇ、およびＰからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項７３】
請求項７２に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで（ａ）〜（ａｍ）に特定される位置において対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、（ａ）〜（ａｍ）において特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項７４】
請求項７０〜７３のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、１３位、２０位、３６位、４２位、４６位、５０位、５６位、６４位、７０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１０７位、１１０位、１１７位、１１８位、１２１位および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＢ１である；および
（ｂ）１６位、２１位、２２位、２３位、２５位、２９位、３４位、４１位、４３位、４４位、５５位、６６位、７１位、７３位、７４位、７７位、８５位、８７位、８８位、９５位、９９位、１０２位、１０８位、１０９位、１１１位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＢ２である；
に適合し、ここでＢ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、Ｙ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そして
Ｂ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項７５】
請求項７０〜７３のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、１３位、２０位、４２位、４６位、５０位、５６位、６４位、７０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１０７位、１１０位、１１７位、１１８位、１２１位および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＢ１である；および
（ｂ）１６位、２１位、２２位、２３位、２５位、２９位、３４位、３６位、４１位、４３位、４４位、５５位、６６位、７１位、７３位、７４位、７７位、８５位、８７位、８８位、９５位、９９位、１０２位、１０８位、１０９位、１１１位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位、および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＢ２である；
に適合し、ここで
Ｂ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、Ｙ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そして
Ｂ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項７６】
請求項７９〜７３のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％は、以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、２０位、４２位、５０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１１０位、１２１位、および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＺ１である；
（ｂ）１３位、４６位、５６位、７０位、１０７位、１１７位、および／または１１８位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｃ）２３位、５５位、７１位、７７位、８８位、および／または１０９位において、該アミノ酸残基はＺ３であり；
（ｄ）１６位、２１位、４１位、７３位、８５位、９９位、および／または１１１位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｅ）３４位および／または９５位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｆ）２２位、２５位、２９位、４３位、４４位、６６位、７４位、８７位、１０２位、１０８位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位、および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
に適合し、ここで
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ２は、Ｆ、Ｗ、およびＹからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ３は、Ｎ、Ｑ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ４は、Ｒ、Ｈ、およびＫからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸であり；そしてＺ６は、Ｃ、Ｇ、およびＰからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項７７】
請求項７６に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、３６位において、Ｚ１およびＺ３からなる群より選択されるアミノ酸残基を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項７８】
請求項７６または７７に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、６４位において、Ｚ１およびＺ２からなる群より選択されるアミノ酸残基を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項７９】
請求項７０〜７８のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、以下の制限：
（ａ）２位において、該アミノ酸残基はＩまたはＬである；
（ｂ）３位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｃ）４位において、該アミノ酸残基はＶまたはＩである；
（ｄ）５位において、該アミノ酸残基はＫである；
（ｅ）６位において、該アミノ酸残基はＰである；
（ｆ）８位において、該アミノ酸残基はＮである；
（ｇ）１０位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｈ）１１位において、該アミノ酸残基はＤまたはＥである；
（ｉ）１２位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｊ）１４位において、該アミノ酸残基はＥまたはＤである；
（ｋ）１５において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｌ）１７位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｍ）１８位において、該アミノ酸残基は、Ｒ、ＥまたはＫである；
（ｎ）１９位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ｏ）２４位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ｐ）２６位において、該アミノ酸残基は、Ｍ、Ｌ、ＶまたはＩである；
（ｑ）２７位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｒ）２８位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＶである；
（ｓ）３０位において、該アミノ酸残基はＭである；
（ｔ）３１位において、該アミノ酸残基は、ＹまたはＦである；
（ｕ）３２位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ｖ）３３位において、該アミノ酸残基は、ＴまたはＳである；
（ｗ）３５位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｘ）３７位において、該アミノ酸残基は、Ｒ、Ｇ、ＥまたはＱである；
（ｙ）３９位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＳである；
（ｚ）４０位において、該アミノ酸残基は、ＦまたはＬである；
（ａａ）４５位において、該アミノ酸残基は、ＹまたはＦである；
（ａｂ）４７位において、該アミノ酸残基は、ＲまたはＧである；
（ａｃ）４８位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ａｄ）４９位において、該アミノ酸残基は、Ｋ、Ｒ、またはＱである；
（ａｅ）５１位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ａｆ）５２位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ａｇ）５３位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ａｈ）５４位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｉ）５７位において、該アミノ酸残基は、ＨまたはＮである；
（ａｊ）５８位において、該アミノ酸残基は、Ｑ、Ｋ、ＲまたはＰである；
（ａｋ）５９位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｌ）６０位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ａｍ）６１位において、該アミノ酸残基は、ＨまたはＲである；
（ａｎ）６３位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ａｏ）６５位において、該アミノ酸残基は、Ｅ、ＰまたはＱである；
（ａｐ）６７位において、該アミノ酸残基は、ＱまたはＲである；
（ａｑ）６８位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＥである；
（ａｒ）６９位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ａｓ）７９位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ａｔ）８０位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ａｕ）８１位において、該アミノ酸残基は、Ｙ、ＨまたはＦである；
（ａｖ）８２位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ａｗ）８３位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ａｘ）８４位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ａｙ）８６位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｚ）８９位において、該アミノ酸残基は、Ｇ、ＴまたはＳである；
（ｂａ）９０位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｂｂ）９１位において、該アミノ酸残基は、Ｌ、ＩまたはＶである；
（ｂｃ）９２位において、該アミノ酸残基は、ＲまたはＫである；
（ｂｄ）９３位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｂｅ）９６位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＱである；
（ｂｆ）９７位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｂｇ）１００位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＮである；
（ｂｈ）１０１位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｉ）１０３位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＶである；
（ｂｊ）１０４位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｂｋ）１０５位において、該アミノ酸残基は、Ｍ、ＬまたはＩである；
（ｂｌ）１０６位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｂｍ）１１２位において、該アミノ酸残基は、ＴまたはＡである；
（ｂｎ）１１３位において、該アミノ酸残基は、ＳまたはＴである；
（ｂｏ）１１４位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ｂｐ）１１５位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ｂｑ）１１９位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｒ）１２０位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｓ）１２３位において、該アミノ酸残基は、ＦまたはＬである；
（ｂｔ）１２５位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｂｕ）１２６位において、該アミノ酸残基は、ＱまたはＨである；
（ｂｖ）１２８位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ｂｗ）１２９位において、該アミノ酸残基は、ＶまたはＩである；
（ｂｘ）１３０位において、該アミノ酸残基はＦである；
（ｂｙ）１３１位において、該アミノ酸残基は、ＤまたはＥである；
（ｂｚ）１３２位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｃａ）１３５位において、該アミノ酸残基はＶである；
（ｃｂ）１３８位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｃｃ）１３９位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｃｄ）１４０位において、該アミノ酸残基は、ＬまたはＭである；
（ｃｅ）１４２位において、該アミノ酸残基はＹである；
（ｃｆ）１４３位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｃｇ）１４５位において、該アミノ酸残基は、ＬまたはＩである；そして
（ｃｈ）１４６位において、該アミノ酸残基はＴである、
に適合する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項８０】
請求項１０に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで（ａ）〜（ｃｈ）において特定される位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、（ａ）〜（ｃｈ）に特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項８１】
請求項７０に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％は、以下の制限：
（ａ）９位、７６位、９４位および１１０位において、該アミノ酸残基Ａである；
（ｂ）２９位および１０８位において、該アミノ酸残基はＣである；
（ｃ）３４位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｄ）９５位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｅ）５６位において、該アミノ酸残基はＦである；
（ｆ）４３位、４４位、６６位、７４位、８７位、１０２位、１１６位、１２２位、１２７位および１３６位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ｇ）４１位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｈ）７位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｉ）８５位において、該アミノ酸残基はＫである；
（ｊ）２０位、４２位、５０位、７８位および１２１位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｋ）１位および１４１位において、該アミノ酸残基はＭである；
（ｌ）２３位および１０９位において、該アミノ酸残基はＮである；
（ｍ）２２位、２５位、１３３位、１３４位および１３７位において、該アミノ酸残基はＰである；
（ｎ）７１位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ｏ）１６位、２１位、７３位、９９および１１１位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ｐ）５５位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ｑ）７７位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｒ）１０７位において、該アミノ酸残基はＷである；および
（ｓ）１３位、４６位、７０位および１１８位において、該アミノ酸残基はＹである、
に適合する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項８２】
請求項７０〜８１のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下：
（ａ）３６位において、該アミノ酸残基は、Ｍ、Ｌ、またはＴである；
（ｂ）７２位において、該アミノ酸残基は、ＬまたはＩである；
（ｃ）７５位において、該アミノ酸残基は、ＭまたはＶである；
（ｄ）６４位において、該アミノ酸残基は、Ｌ、Ｉ、またはＦである；
（ｅ）８８位において、該アミノ酸残基は、ＴまたはＳである；
（ｆ）１１７位において、該アミノ酸残基は、ＹまたはＦである、
からなる群より選択される、アミノ酸残基を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項８３】
請求項７０〜８３のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下：
（ａ）１４位において、該アミノ酸残基は、Ｄである；
（ｂ）１８位において、該アミノ酸残基は、Ｅである；
（ｃ）２６位において、該アミノ酸残基は、ＭまたはＶである；
（ｅ）３０位において、該アミノ酸残基は、Ｉである；
（ｆ）３２位において、該アミノ酸残基は、Ｄである；
（ｇ）３６位において、該アミノ酸残基は、ＭまたはＴである；
（ｉ）３７位において、該アミノ酸残基は、Ｃである；
（ｊ）３８位において、該アミノ酸残基は、Ｄである；
（ｊ）５３位において、該アミノ酸残基は、Ｖである；
（ｋ）５８位において、該アミノ酸残基は、Ｒである；
（ｌ）６１位において、該アミノ酸残基は、Ｒである；
（ｍ）６２位において、該アミノ酸残基は、Ｌである；
（ｎ）６４位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＦである；
（ｏ）６５位において、該アミノ酸残基は、Ｐである；
（ｐ）７２位において、該アミノ酸残基は、Ｉである；
（ｑ）７５位において、該アミノ酸残基は、Ｖである；
（ｒ）８８位において、該アミノ酸残基は、Ｔである；
（ｓ）８９位において、該アミノ酸残基は、Ｇである；
（ｔ）９１位において、該アミノ酸残基は、Ｌである；
（ｕ）９８位において、該アミノ酸残基は、Ｉである；
（ｖ）１０５位において、該アミノ酸残基は、Ｉである；
（ｗ）１１２位において、該アミノ酸残基は、Ａである；
（ｘ）１２４位において、該アミノ酸残基は、ＧまたはＣである；
（ｙ）１２８位において、該アミノ酸残基は、Ｄである；
（ｚ）１４０位において、該アミノ酸残基は、Ｍである；
（ａａ）１４３位において、該アミノ酸残基は、Ｒである；および
（ａｂ）１４４位において、該アミノ酸残基は、Ｗである；
からなる群より選択される１以上のアミノ酸残基を含む、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項８４】
請求項８３に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで（ａ）〜（ａｂ）において特定される位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、（ａ）〜（ａｂ）において特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項８５】
請求項７０〜８４のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下：
（ａ）４１位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｂ）１３８位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｃ）３４位において、該アミノ酸残基はＮである；および
（ｄ）５５位において、該アミノ酸残基はＳである、
からなる群より選択される１以上のアミノ酸残基を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項８６】
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、該ポリペプチドは、以下：
（ａ）配列番号５７７と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列；
（ｂ）配列番号５７８と少なくとも９７％同一なアミノ酸配列；
（ｃ）配列番号６２１と少なくとも９７％同一なアミノ酸配列；
（ｄ）配列番号５７９と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列；
（ｅ）配列番号６０２と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列；
（ｆ）配列番号６９７と少なくとも９５％同一なアミノ酸配列；
（ｇ）配列番号７２１と少なくとも９６％同一なアミノ酸配列；
（ｈ）配列番号６１３と少なくとも９７％同一なアミノ酸配列；
（ｉ）配列番号６７７と少なくとも８９％同一なアミノ酸配列；
（ｊ）配列番号５８４と少なくとも９６％同一なアミノ酸配列；
（ｋ）配列番号７０７と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列；
（ｌ）配列番号６１６と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列；
（ｍ）配列番号６１２と少なくとも９６％同一なアミノ酸配列；
（ｎ）配列番号５９０と少なくとも９８％同一なアミノ酸配列；
（ｏ）（ａ）〜（ｎ）の任意の１つと相補的なアミノ酸配列、
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項８７】
請求項８６に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下：
（ｉ）１８および３８位において、Ｚ５アミノ酸残基；
（ｉｉ）６２位において、Ｚ１アミノ酸残基；
（ｉｉｉ）１２４位において、Ｚ６アミノ酸残基；および
（ｉｖ）１４４位において、Ｚ２アミノ酸残基、
からなる群より選択される１以上のアミノ酸残基を含み、ここで：
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、およびＶからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ２は、Ｆ、Ｗ、およびＹからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸残基であり；
Ｚ６は、Ｃ、Ｇ、およびＰからなる群より選択されるアミノ酸残基である、
単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項８８】
請求項８６に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）２位、４位、１５位、１９位、２６位、２８位、３１位、４５位、５１位、５４位、８６位、９０位、９１位、９７位、１０３位、１０５位、１０６位、１１４位、１２３位、１２９位、１３９位、および／または１４５位において、該アミノ酸残基はＢ１である；および
（ｂ）３位、５位、８位、１０位、１１位、１４位、１７位、２４位、２７位、３２位、３７位、４７位、４８位、４９位、５２位、５７位、５８位、６１位、６３位、６８位、６９位、７９位、８０位、８２位、８３位、８９位、９２位、１００位、１０１位、１０４位、１１９位、１２０位、１２５位、１２６位、１２８位、１３１位、および／または１４３位において、該アミノ酸残基はＢ２である；
に適合し、ここで：
Ｂ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、ＹおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そして
Ｂ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、ＳおよびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項８９】
請求項８６に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、以下の制限：
（ａ）２位、４位、１５位、１９位、２６位、２８位、５１位、５４位、８６位、９０位、９１位、９７位、１０３位、１０５位、１０６位、１１４位、１２９位、１３９位、および／または１４５位において、該アミノ酸残基は、Ｚ１である；
（ｂ）３１位および／または４５位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｃ）８位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｄ）８９位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３またはＺ６である；
（ｅ）８２位、９２位、１０１位および／または１２０位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｆ）３位、１１位、２７位および／または７９位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｇ）１８位において、該アミノ酸残基は、Ｚ４またはＺ５である；
（ｈ）１２３位において、該アミノ酸残基は、Ｚ１またはＺ２である；
（ｉ）１２位、３３位、３５位、３９位、５３位、５９位、１１２位、１３２位、１３５位、１４０位、および／または１４６位において、該アミノ酸残基は、Ｚ１またはＺ３である；
（ｊ）３０位において、該アミノ酸残基はＺ１である；
（ｋ）６位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
（１）８１位において、該アミノ酸残基は、Ｚ２またはＺ４である；
（ｍ）１１３位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｎ）１３８位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｏ）１４２位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｐ）５７位および／または１２６位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３またはＺ４である；
（ｑ）５位、１７位、および６１位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｒ）２４位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｓ）１０４位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｔ）５２位および／または６９位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｕ）１４位および／または１１９位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｖ）１０位、３２位、６３位、および／または８３位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｗ）４８位および／または８０位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
（ｘ）４０位において、該アミノ酸残基は、Ｚ１またはＺ２である；
（ｙ）９６位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３またはＺ５である；
（ｚ）６５位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３、Ｚ４、またはＺ６である；
（ａａ）８４位および／または１１５位において、該アミノ酸残基 ｉｓ Ｚ３である；
（ａｂ）９３位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ａｃ）１３０位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ａｄ）５８位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３、Ｚ４またはＺ６である；
（ａｅ）４７位において、該アミノ酸残基は、Ｚ４またはＺ６である；
（ａｆ）４９位および／または１００位において、該アミノ酸残基は、Ｚ３またはＺ４である；
（ａｇ）６８位において、該アミノ酸残基は、Ｚ４またはＺ５である；
（ａｈ）１４３位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ａｉ）１３１位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ａｊ）１２５位および／または１２８位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ａｋ）６７位において、該アミノ酸残基はＺ３またはＺ４である；
（ａｌ）６０位において、該アミノ酸残基はＺ５である；および
（ａｍ）３７位において、該アミノ酸残基はＺ４またはＺ６である；
に適合し、ここで
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、ＭおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ２は、Ｆ、ＷおよびＹからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ３は、Ｎ、Ｑ、ＳおよびＴからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ４は、Ｒ、ＨおよびＫからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸であり；そしてＺ６は、Ｃ、Ｇ、およびＰからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項９０】
請求項８９に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで（ａ）〜（ａｍ）において特定される位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、（ａ）〜（ａｍ）において特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項９１】
請求項８６〜９０のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、１３位、２０位、３６位、４２位、４６位、５０位、５６位、６４位、７０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１０７位、１１０位、１１７位、１１８位、１２１位および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＢ１である；および
（ｂ）１６位、２１位、２２位、２３位、２５位、２９位、３４位、４１位、４３位、４４位、５５位、６６位、７１位、７３位、７４位、７７位、８５位、８７位、８８位、９５位、９９位、１０２位、１０８位、１０９位、１１１位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位、および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＢ２である；
に適合し、ここで
Ｂ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、ＹおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そして
Ｂ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、ＳおよびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項９２】
請求項８６〜９１のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、１３位、２０位、４２位、４６位、５０位、５６位、６４位、７０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１０７位、１１０位、１１７位、１１８位、１２１位、および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＢ１である；および
（ｂ）１６位、２１位、２２位、２３位、２５位、２９位、３４位、３６位、４１位、４３位、４４位、５５位、６６位、７１位、７３位、７４位、７７位、８５位、８７位、８８位、９５位、９９位、１０２位、１０８位、１０９位、１１１位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＢ２である；
に適合し、ここで
Ｂ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｗ、ＹおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；そして
Ｂ２は、Ｒ、Ｎ、Ｄ、Ｃ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｐ、ＳおよびＴからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項９３】
請求項８６〜９１のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％が、以下の制限：
（ａ）１位、７位、９位、２０位、４２位、５０位、７２位、７５位、７６位、７８位、９４位、９８位、１１０位、１２１位および／または１４１位において、該アミノ酸残基はＺ１である；
（ｂ）１３位、４６位、５６位、７０位、１０７位、１１７位、および／または１１８位において、該アミノ酸残基はＺ２である；
（ｃ）２３位、５５位、７１位、７７位、８８位、および／または１０９位において、該アミノ酸残基はＺ３である；
（ｄ）１６位、２１位、４１位、７３位、８５位、９９位、および／または１１１位において、該アミノ酸残基はＺ４である；
（ｅ）３４位および／または９５位において、該アミノ酸残基はＺ５である；
（ｆ）２２位、２５位、２９位、４３位、４４位、６６位、７４位、８７位、１０２位、１０８位、１１６位、１２２位、１２７位、１３３位、１３４位、１３６位、および／または１３７位において、該アミノ酸残基はＺ６である；
に適合し、ここで
Ｚ１は、Ａ、Ｉ、Ｌ、ＭおよびＶからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ２は、Ｆ、ＷおよびＹからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ３は、Ｎ、Ｑ、ＳおよびＴからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ４は、Ｒ、ＨおよびＫからなる群より選択されるアミノ酸であり；Ｚ５は、ＤおよびＥからなる群より選択されるアミノ酸であり；そしてＺ６は、Ｃ、ＧおよびＰからなる群より選択されるアミノ酸である、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項９４】
請求項９３に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、３６位において、Ｚ１およびＺ３からなる群より選択されるアミノ酸残基を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項９５】
請求項９３または９４に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、６４位において、Ｚ１およびＺ２からなる群より選択されるアミノ酸残基を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項９６】
請求項８６〜９５のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、以下の制限：
（ａ）２位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＬである；
（ｂ）３位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｃ）４位において、該アミノ酸残基は、ＶまたはＩである；
（ｄ）５位において、該アミノ酸残基はＫである；
（ｅ）６位において、該アミノ酸残基はＰである；
（ｆ）８位において、該アミノ酸残基はＮである；
（ｇ）１０位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｈ）１１位において、該アミノ酸残基は、ＤまたはＥである；
（ｉ）１２位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｊ）１４位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ｋ）１５位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｌ）１７位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｍ）１８位において、該アミノ酸残基は、Ｒ、ＥまたはＫである；
（ｎ）１９位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ｏ）２４位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ｐ）２６位において、該アミノ酸残基は、Ｍ、ＬＶまたはＩである；
（ｑ）２７位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｒ）２８位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＶである；
（ｓ）３０位において、該アミノ酸残基はＭである；
（ｔ）３１位において、該アミノ酸残基は、ＹまたはＦである；
（ｕ）３２位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ｖ）３３位において、該アミノ酸残基は、ＴまたはＳである；
（ｗ）３５位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｘ）３７位において、該アミノ酸残基は、Ｒ、Ｇ、ＥまたはＱである；
（ｙ）３９位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＳである；
（ｚ）４０位において、該アミノ酸残基は、ＦまたはＬである；
（ａａ）４５位において、該アミノ酸残基は、ＹまたはＦである；
（ａｂ）４７位において、該アミノ酸残基は、ＲまたはＧである；
（ａｃ）４８位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ａｄ）４９位において、該アミノ酸残基は、Ｋ、Ｒ、またはＱである；
（ａｅ）５１位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ａｆ）５２位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ａｇ）５３位において、該アミノ酸残基は、ＩまたはＶである；
（ａｈ）５４位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｉ）５７位において、該アミノ酸残基は、ＨまたはＮである；
（ａｊ）５８位において、該アミノ酸残基は、Ｑ、Ｋ、ＲまたはＰである；
（ａｋ）５９位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｌ）６０位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ａｍ）６１位において、該アミノ酸残基は、ＨまたはＲである；
（ａｎ）６３位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ａｏ）６５位において、該アミノ酸残基は、Ｅ、ＰまたはＱである；
（ａｐ）６７位において、該アミノ酸残基は、ＱまたはＲである；
（ａｑ）６８位において ｔｈｅ アミノ酸残基は、ＫまたはＥである；
（ａｒ）６９位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ａｓ）７９位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ａｔ）８０位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ａｕ）８１位において、該アミノ酸残基は、Ｙ、ＨまたはＦである；
（ａｖ）８２位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ａｗ）８３位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ａｘ）８４位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ａｙ）８６位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ａｚ）８９位において、該アミノ酸残基は、Ｇ、ＴまたはＳである；
（ｂａ）９０位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｂｂ）９１位において、該アミノ酸残基は、Ｌ、ＩまたはＶである；
（ｂｃ）９２位において、該アミノ酸残基は、ＲまたはＫである；
（ｂｄ）９３位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｂｅ）９６位において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＱである；
（ｂｆ）９７位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｂｇ）１００位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＮである；
（ｂｈ）１０１位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｉ）１０３位において、該アミノ酸残基は、ＡまたはＶである；
（ｂｊ）１０４位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｂｋ）１０５位において、該アミノ酸残基は、Ｍ、ＬまたはＩである；
（ｂｌ）１０６位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｂｍ）１１２位において、該アミノ酸残基は、ＴまたはＡである；
（ｂｎ）１１３位において、該アミノ酸残基は、ＳまたはＴである；
（ｂｏ）１１４位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ｂｐ）１１５位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ｂｑ）１１９位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｒ）１２０位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｂｓ）１２３位において、該アミノ酸残基は、ＦまたはＬである；
（ｂｔ）１２５位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｂｕ）１２６位において、該アミノ酸残基は、ＱまたはＨである；
（ｂｖ）位１２８において、該アミノ酸残基は、ＥまたはＤである；
（ｂｗ）１２９位において、該アミノ酸残基はＶまたはＩである；
（ｂｘ）１３０位において、該アミノ酸残基はＦである；
（ｂｙ）１３１位において、該アミノ酸残基は、ＤまたはＥである；
（ｂｚ）１３２位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｃａ）１３５位において、該アミノ酸残基はＶである；
（ｃｂ）１３８位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｃｃ）１３９位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｃｄ）１４０位において、該アミノ酸残基は、ＬまたはＭである；
（ｃｅ）１４２位において、該アミノ酸残基はＹである；
（ｃｆ）１４３位において、該アミノ酸残基は、ＫまたはＲである；
（ｃｇ）１４５位において、該アミノ酸残基は、ＬまたはＩである；および
（ｃｈ）１４６位において、該アミノ酸残基はＴである、
に適合する、
単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項９７】
請求項９６に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで（ａ）〜（ｃｈ）において特定される位置に対応するアミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも９０％は、（ａ）〜（ｃｈ）において特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項９８】
請求項８６に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで以下の位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、以下の制限：
（ａ）９位、７６位、９４位、および１１０位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ｂ）２９位および１０８位において、該アミノ酸残基はＣである；
（ｃ）３４位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｄ）９５位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｅ）５６位において、該アミノ酸残基はＦである；
（ｆ）４３位、４４位、６６位、７４位、８７位、１０２位、１１６位、１２２位、１２７位および１３６位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ｇ）４１位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｈ）７位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｉ）８５位において、該アミノ酸残基はＫである；
（ｊ）２０位、４２位、５０位、７８位および１２１位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｋ）１位および１４１位において、該アミノ酸残基はＭである；
（ｌ）２３位および１０９位において、該アミノ酸残基はＮである；
（ｍ）２２位、２５位、１３３位、１３４位および１３７位において、該アミノ酸残基はＰである；
（ｎ）７１位において、該アミノ酸残基はＱである；
（ｏ）１６位、２１位、７３位、９９位および１１１位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ｐ）５５位において、該アミノ酸残基はＳである；
（ｑ）７７位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｒ）１０７位において、該アミノ酸残基はＷである；および
（ｓ）１３位、４６位、７０位および１１８位において、該アミノ酸残基はＹである、
に適合する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項９９】
請求項７０〜９８のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下からなる群より選択される１以上のアミノ酸残基：
（ａ）１４位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｂ）１８位において、該アミノ酸残基はＥである；
（ｃ）２６位において、該アミノ酸残基はＭまたはＶである；
（ｅ）３０位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｆ）３２位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｇ）３６位において、該アミノ酸残基はＭまたはＴである；
（ｉ）３７位において、該アミノ酸残基はＣである；
（ｊ）３８位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｊ）５３位において、該アミノ酸残基はＶである；
（ｋ）５８位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ｌ）６１位において、該アミノ酸残基はＲである；
（ｍ）６２位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｎ）６４位において、該アミノ酸残基はＩまたはＦである；
（ｏ）６５位において、該アミノ酸残基はＰである；
（ｐ）７２位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｑ）７５位において、該アミノ酸残基はＶである；
（ｒ）８８位において、該アミノ酸残基はＴである；
（ｓ）８９位において、該アミノ酸残基はＧである；
（ｔ）９１位において、該アミノ酸残基はＬである；
（ｕ）９８位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｖ）１０５位において、該アミノ酸残基はＩである；
（ｗ）１１２位において、該アミノ酸残基はＡである；
（ｘ）１２４位において、該アミノ酸残基はＧまたはＣである；
（ｙ）１２８位において、該アミノ酸残基はＤである；
（ｚ）１４０位において、該アミノ酸残基はＭである；
（ａａ）１４３位において、該アミノ酸残基はＲである；および
（ａｂ）１４４位において、該アミノ酸残基はＷである、
を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項１００】
請求項９９に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで（ａ）〜（ａｂ）において特定される位置に対応する前記アミノ酸配列におけるアミノ酸残基のうち、少なくとも８０％が、（ａ）〜（ａｂ）において特定されるアミノ酸残基制限に適合する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項１０１】
請求項８６〜１００のいずれかに記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで前記アミノ酸配列は、以下：
（ａ）４１位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｂ）１３８位において、該アミノ酸残基はＨである；
（ｃ）３４位において、該アミノ酸残基はＮである；および
（ｅ）５５位において、該アミノ酸残基はＳである、
からなる群より選択される１以上のアミノ酸残基を含む。
、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項１０２】
請求項６９に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで該ポリペプチドは、グリホセートについて少なくとも１０ｍＭ−１分−１のｋｃａｔ／Ｋｍでグリホセートのアセチル化を触媒する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項１０３】
請求項１０２に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで該ポリペプチドは、グリホセートについて少なくとも１００ｍＭ−１分−１のｋｃａｔ／Ｋｍでグリホセートのアセチル化を触媒する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項１０４】
請求項１０３に記載の単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、ここで該ポリペプチドは、アミノメチルホスホン酸のアセチル化を触媒する、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項１０５】
ＧＡＴ活性を有するポリペプチドであって、該ポリペプチドは、以下：
【数３】
からなる群より選択され、該ポリペプチドは、以下
（ａ）少なくとも約２ｍＭ以下のグリホセートについてのＫｍ；
（ｂ）少なくとも約２００μＭ以下のアセチルＣｏＡについてのＫｍ；および
（ｃ）少なくとも約６／分に等しいｋｃａｔ、
により特徴づけられる、ポリペプチド。
【請求項１０６】
グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼ活性を有するタンパク質をコードする単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチドであって、該ポリヌクレオチドは、以下：
【数４】
からなる群より選択される、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項１０７】
グリホセート耐性のトランスジェニック植物または植物細胞を生産する方法であって、該方法は：
（ａ）植物または植物細胞を、グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼをコードするポリヌクレオチドで形質転換する工程であって、該ポリヌクレオチドは、以下：
【数５】
からなる群より選択される、工程、
（ｂ）該形質転換した植物細胞から、必要に応じてトランスジェニック植物を再生する工程、
を包含する、方法。
【請求項１０８】
核酸構築物を含む植物または植物細胞を選択するための方法であって、該方法は、以下：
（ａ）核酸構築物を含むトランスジェニック植物または植物細胞を提供する工程であって、ここで該核酸構築物は、グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼをコードするヌクレオチド配列を含み、該ヌクレオチド配列は、以下：
【数６】
からなる群より選択される、工程、
（ｂ）該トランスジェニック植物または植物細胞を、グリホセートの存在下で、該グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼが有効なレベルで発現される条件下で生長させ、それにより、該植物または植物細胞が、該核酸構築物を含んでいない場合に生長したときより早く、該トランスジェニック植物または植物細胞が、認識できる速度で生長する、工程、
を包含する、方法。
【請求項１０９】
農作物を含む圃場で雑草を選択的に制御するための方法であって、該方法は、以下：
（ａ）グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼをコードする遺伝子での形質転換の結果としてグリホセート耐性である農作物の種子または植物を、該圃場に植える工程であって、該遺伝子は、以下：
【数７】
からなる群より選択される、工程、
（ｂ）該圃場における農作物および雑草に、該農作物に重大な影響を及ぼすことなく該雑草を制御するに十分な量のグリホセートを適用する工程、
を包含する、方法。
【請求項１１０】
前記農作物は、綿実、トウモロコシ、またはダイズである、請求項１０９に記載の方法。
【請求項１１１】
グリホセートに対する増強された耐性を有するトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片であって、ここで該植物または植物外植片は、グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼ活性を有するポリペプチドを発現し、該ポリペプチドは、以下：
【数８】
からなる群より選択され；そして少なくとも１つのポリペプチドは、さらなる機構によってグリホセート耐性を与える、トランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項１１２】
トランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片であって、ここで該植物または植物外植片は、グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼ活性を有するポリペプチドを発現し、該ポリペプチドは、以下：
【数９】
からなる群より選択され、少なくとも１つのポリペプチドは、さらなる除草剤に対する耐性を与える、トランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項１１３】
グリホセートに対する増強された耐性を有するトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片であって、ここで該植物または植物外植片は、グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼ活性を有するポリペプチドを発現し、該ポリペプチドは、以下：
【数１０】
からなる群より選択され、少なくとも１つのポリペプチドは、さらなる機構によってグリホセート耐性を与え、少なくとも１つのポリペプチドは、さらなる除草剤に対する耐性を与える、トランスジェニック植物またはトランスジェニック植物外植片。
【請求項１１４】
農作物を含む圃場において雑草を制御するための方法であって、該方法は、以下：
（ａ）グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼをコードする遺伝子で形質転換された農作物の種子または植物を、圃場に植える工程であって、該遺伝子は、以下：
【数１１】
からなる群より選択され、少なくとも１つの遺伝子は、さらなる機構によってグリホセート耐性を与えるポリペプチドをコードする、工程；および
（ｂ）該圃場における農作物および雑草に、該農作物に重大な影響を及ぼすことなく該圃場における雑草の生長を阻害するに十分なグリホセートの有効な散布を適用する工程、
を包含する、方法。
【請求項１１５】
農作物を含む圃場における雑草を選択的に制御するための方法であって、該方法は、以下：
（ａ）グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼをコードする遺伝子で形質転換された農作物の種子または植物を、圃場に植える工程であって、該遺伝子は、以下：
【数１２】
からなる群より選択され；少なくとも１つの遺伝子は、さらなる除草剤に対する耐性を与えるポリペプチドをコードする、工程；
（ｂ）該農作物に重大な影響を及ぼすことなく、該圃場における雑草の生長を阻害するに十分であるグリホセートおよびさらなる除草剤の同時のまたは経時的な時間差的散布を、該圃場における農作物および雑草に、適用する工程、
を包含する、方法。
【請求項１１６】
農作物を含む圃場における雑草を選択的に制御するための方法であって、該方法は、以下：
（ａ）グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼをコードする遺伝子で形質転換された農作物の種子または植物を、圃場に植える工程であって、該遺伝子は、以下：
【数１３】
からなる群より選択され；少なくとも１つの遺伝子は、さらなる機構によりグリホセート耐性を与えるポリペプチドをコードし、少なくとも１つの遺伝子は、さらなる除草剤に対する耐性を与えるポリペプチドをコードする、工程；
（ｂ）該農作物に重大な影響を及ぼすことなく、該圃場における雑草の生長を阻害するに十分であるグリホセートおよびさらなる除草剤の同時のまたは経時的な時間差的散布を、該圃場における農作物および雑草に、適用する工程、
を包含する、方法。
【請求項１１７】
以下からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含む単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド：
（ａ）配列番号９１９に対して少なくとも９６％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｂ）配列番号９２９に対して少なくとも９７％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｃ）配列番号８４７に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｄ）配列番号８５１に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｅ）配列番号８５３に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｆ）配列番号８５５に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｇ）配列番号８５７に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｈ）配列番号８６１に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｉ）配列番号８７１に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｊ）配列番号８７５に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｋ）配列番号８８１に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｌ）配列番号８８５に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｍ）配列番号８８７に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｎ）配列番号８８９に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｏ）配列番号８９３に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｐ）配列番号８９７に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｑ）配列番号８９９に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｒ）配列番号９０９に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｓ）配列番号９１１に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｔ）配列番号８３７に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｕ）配列番号８４１に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｖ）配列番号８６５に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
（ｗ）配列番号８６９に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；および
（ｘ）配列番号８７９に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列。
【請求項１１８】
配列番号９２９に対して少なくとも９５％同一であり、配列番号９２９の３３位に対応するアミノ酸位置においてＧｌｙ残基またはＡｓｎ残基を含む、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を含む、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１１９】
グリホセートＮ−アセチルトランスフェラーゼ活性を有するポリペプチドをコードする、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチドは、以下：
【数１４】
からなる群より選択される、単離されたポリヌクレオチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１２０】
以下からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド：
（ａ）配列番号９１９に対して少なくとも９６％同一であるアミノ酸配列；
（ｂ）配列番号９２９に対して少なくとも９７％同一であるアミノ酸配列；
（ｃ）配列番号８４７に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｄ）配列番号８５１に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｅ）配列番号８５３に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｆ）配列番号８５５に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｇ）配列番号８５７に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｈ）配列番号８６１に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｉ）配列番号８７１に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｊ）配列番号８７５に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｋ）配列番号８８１に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｌ）配列番号８８５に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｍ）配列番号８８７に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｎ）配列番号８８９に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｏ）配列番号８９３に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｐ）配列番号８９７に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｑ）配列番号８９９に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｒ）配列番号９０９に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｓ）配列番号９１１に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列；
（ｔ）配列番号８３７に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列；
（ｕ）配列番号８４１に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列；
（ｖ）配列番号８６５に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列；
（ｗ）配列番号８６９に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列；および
（ｘ）配列番号８７９に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列。
【請求項１２１】
配列番号９２９に対して少なくとも９５％同一であり、配列番号９２９の３３位に対応するアミノ酸位置においてＧｌｙ残基またはＡｓｎ残基を含むアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリペプチド。
【請求項１２２】
以下：
【数１５】
からなる群より選択されるアミノ酸配列の残基２〜１４６を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１２３】
以下：
【数１６】
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドまたは組換えポリヌクレオチド。
【請求項１２４】
植物または植物細胞におけるポリヌクレオチドの発現を増大する方法であって、該方法は、以下：
（ａ）ＢＬＯＳＵＭ６２行列、ギャップ存在ペナルティ１１、およびギャップ伸長ペナルティ１を使用して、配列番号３００、配列番号４４５および配列番号４５７からなる群より選択される配列と最適に整列させて、少なくとも４６０の類似性スコアを出し得るアミノ配列を含むポリペプチドコードする核酸配列を含む第１のポリヌクレオチドを得る工程であって、該核酸配列
は、開始メチオニンＡＴＧコドンを含む、工程；
（ｂ）該開始メチオニンＡＴＧコドンのすぐ下流であってかつ隣接させて、該核酸配列に１つまたは２つのＧＣＧコドンまたはＧＣＴコドンを挿入して、改変ポリヌクレオチドを得る工程；および
（ｃ）該改変ポリヌクレオチドで該植物または植物細胞を形質転換する工程であって、ここで該改変ポリヌクレオチドで形質転換された植物または植物細胞は、該第１のポリヌクレオチドで形質転換された植物または植物細胞と比較して、大量のコードされたポリヌクレオチドを蓄積する、工程、
を包含する、方法。
【請求項１２５】
植物において頻繁には利用されない核酸配列における１以上のコドンを同定する工程、および植物において頻繁には利用されない該コドンを、植物においてより頻繁に利用される同じアミノ酸をコードするコドンに代わって使用する工程をさらに包含する、請求項１２４に記載の方法。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【図１５Ａ】
【図１５Ｂ】
【図１６Ａ】
【図１６Ｂ】
【図１６Ｃ】
【図１７】
【図１８】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【図１５Ａ】
【図１５Ｂ】
【図１６Ａ】
【図１６Ｂ】
【図１６Ｃ】
【図１７】
【図１８】
【公表番号】特表２００７−５００５１４（Ｐ２００７−５００５１４Ａ）
【公表日】平成１９年１月１８日（２００７．１．１８）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００６−５３２４９３（Ｐ２００６−５３２４９３）
【出願日】平成１６年４月２９日（２００４．４．２９）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００４／０１３１４５
【国際公開番号】ＷＯ２００５／０１２５１５
【国際公開日】平成１７年２月１０日（２００５．２．１０）
【出願人】（５００３２２１９２）パイオニア ハイ−ブレッド インターナショナル， インコーポレイテッド (3)
【出願人】（５０２３９０１９７）ヴァーディア，インコーポレイテッド (4)
【出願人】（５０５４００１１８）イー．アイ． デュ ポン デ ヌムール アンド カンパニー (8)
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成１９年１月１８日（２００７．１．１８）
【国際特許分類】
【出願日】平成１６年４月２９日（２００４．４．２９）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００４／０１３１４５
【国際公開番号】ＷＯ２００５／０１２５１５
【国際公開日】平成１７年２月１０日（２００５．２．１０）
【出願人】（５００３２２１９２）パイオニア ハイ−ブレッド インターナショナル， インコーポレイテッド (3)
【出願人】（５０２３９０１９７）ヴァーディア，インコーポレイテッド (4)
【出願人】（５０５４００１１８）イー．アイ． デュ ポン デ ヌムール アンド カンパニー (8)
【Ｆターム（参考）】
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