説明

最適化Fc変異体

本発明は、最適化Fc変異体、それらの生成方法、最適化Fc変異体を含むFcポリペプチド、および最適化Fc変異体の使用方法に関する。


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【特許請求の範囲】
【請求項1】
ヒトFcポリペプチド(配列番号:1)のFc変異体を含むタンパク質であって、当該変異体が、ヒトFcポリペプチドと比較して変更されたFcリガンドへの結合を示し、当該変異体が:
Vb(221)−Vb(222)−Vb(223)−Vb(224)−Vb(225)−Fx(226)−Vb(227)−Vb(228)−Fx(229)−Vb(230)−Vb(231)−Vb(232)−Vb(233)−Vb(234)−Vb(235)−Vb(236)−Vb(237)−Vb(238)−Vb(239)−Vb(240)−Vb(241)−Fx(242)−Vb(243)−Vb(244)−Vb(245)−Vb(246)−Vb(247)−Fx(248)−Vb(249)−Fx(250−254)−Vb(255)−Fx(256−257)−Vb(258)−Fx(259)−Vb(260)−Fx(261)−Vb(262)−Vb(263)−Vb(264)−Vb(265)−Vb(266)−Vb(267)−Vb(268)−Vb(269)−Vb(270)−Vb(271)−Vb(272)−Vb(273)−Vb(274)−Vb(275)−Vb(276)−Fx(277)−Vb(278)−Fx(279)−Vb(280)−Vb(281)−Vb(282)−Vb(283)−Vb(284)−Vb(285)−Vb(286)−Fx(287)−Vb(288)−Fx(289)−Vb(290)−Vb(291)−Vb(292)−Vb(293)−Vb(294)−Vb(295)−Vb(296)−Vb(297)−Vb(298)−Vb(299)−Vb(300)−Vb(301)−Vb(302)−Vb(303)−Vb(304)−Vb(305)−Fx(306−312)−Vb(313)−Fx(314−316)−Vb(317)−Vb(318)−Fx(319)−Vb(320)−Fx(321)−Vb(322)−Vb(323)−Vb(324)−Vb(325)−Vb(326)−Vb(327)−Vb(328)−Vb(329)−Vb(330)−Vb(331)−Vb(332)−Vb(333)−Vb(334)−Vb(335)−Vb(336)−Vb(337);
式中、Vb(221)は、D、KおよびY;
Vb(222)は、K、EおよびYからなる群から選択され;
Vb(223)は、T、EおよびKからなる群から選択され;
Vb(224)は、H、EおよびYからなる群から選択され;
Vb(225)は、T、E、KおよびWからなる群から選択され;
Fx(226)は、Cであり;
Vb(227)は、P、E、G、K、Yからなる群から選択され
Vb(228)は、P、E、G、K、Yからなる群から選択され
Fx(229)は、Cであり;
Vb(230)は、P、A、E、GおよびYからなる群から選択され;
Vb(231)は、A、E、G、K、PおよびYからなる群から選択され;
Vb(232)は、P、E、G、KおよびYからなる群から選択され;
Vb(233)は、A、D、F、G、H、I、K、L、M、N、Q、R、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(234)は、L、A、D、E、F、G、H、I、K、M、N、P、Q、R、S、T、V、W、Yからなる群から選択され
Vb(235)は、L、A、D、E、F、G、H、I、K、M、N、P、Q、R、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(236)は、G、A、D、E、F、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(237)は、G、D、E、F、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(238)は、P、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、Q、R、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(239)は、S、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、T、V、W、Yからなる群から選択され
Vb(240)は、V、A、I、M、Tからなる群から選択され;
Vb(241)は、F、D、E、L、R、S、W、Yからなる群から選択され
Fx(242)は、Lであり;
Vb(243)は、F、E、H、L、Q、R、W、Yからなる群から選択され;
Vb(244)は、P、Hからなる群から選択され;
Vb(245)は、P、Aからなる群から選択され;
Vb(246)は、K、D、E、H、Yからなる群から選択され;
Vb(247)は、P、G、Vからなる群から選択され
Fx(248)は、Kであり;
Vb(249)は、D、H、Q、Yからなる群から選択され;
Fx(250−254)は、配列−(T−L−M−I−S)−であり、
Vb(255)は、R、E、Yからなる群から選択され;
Fx(256−257)は、配列−(T−P)−であり;
Vb(258)は、E、H、S、Yからなる群から選択され;
Fx(259)は、Vであり;
Vb(260)は、T、D、E、H、Yからなる群から選択され;
Fx(261)は、Cであり;
Vb(262)は、V、A、E、F、I、Tからなる群から選択され;
Vb(263)は、V、A、I、M、Tからなる群から選択され;
Vb(264)は、V、A、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、WおよびYからなる群から選択され;
Vb(265)は、D、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(266)は、V、A、I、M、Tからなる群から選択され;
Vb(267)は、S、D、E、F、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(268)は、H、D、E、F、G、I、K、L、M、N、P、Q、R、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(269)は、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、R、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(270)は、D、F、G、H、I、L、M、P、Q、R、S、T、W、Yからなる群から選択され;
Vb(271)は、A、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、Q、R、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(272)は、E、D、F、G、H、I、K、L、M、P、R、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(273)は、V、Iからなる群から選択され;
Vb(274)は、K、D、E、F、G、H、L、M、N、P、R、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(275)は、F、L、Wからなる群から選択され;
Vb(276)は、N、D、E、F、G、H、I、L、M、P、R、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Fx(277)は、Wであり;
Vb(278)は、Y、D、E、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、Wからなる群から選択され;
Fx(279)は、Vであり;
Vb(280)は、D、G、K、L、P、Wからなる群から選択され;
Vb(281)は、G、D、E、K、N、P、Q、Yからなる群から選択され;
Vb(282)は、V、E、G、K、P、Yからなる群から選択され;
Vb(283)は、E、G、H、K、L、P、R、Yからなる群から選択され;
Vb(284)は、V、D、E、L、N、Q、T、Yからなる群から選択され;
Vb(285)は、H、D、E、K、Q、W、Yからなる群から選択され;
Vb(286)は、N、E、G、P、Yからなる群から選択され;
Fx(287)は、Aからなる群から選択され;
Vb(288)は、K、D、E、Yからなる群から選択され;
Fx(289)は、Tであり;
Vb(290)は、K、D、H、L、N、Wからなる群から選択され;
Vb(291)は、P、D、E、G、H、I、Q、Tからなる群から選択され;
Vb(292)は、R、D、E、T、Yからなる群から選択され;
Vb(293)は、E、F、G、H、I、L、M、N、P、R、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(294)は、E、F、G、H、I、K、L、M、P、R、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(295)は、Q、D、E、F、G、H、I、M、N、P、R、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(296)は、Y、A、D、E、G、H、I、K、L、M、N、Q、R、S、T、Vからなる群から選択され;
Vb(297)は、N、D、E、F、G、H、I、K、L、M、P、Q、R、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(298)は、S、D、E、F、H、I、K、M、N、Q、R、T、W、Yからなる群から選択され;
Vb(299)は、T、A、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(300)は、Y、A、D、E、G、H、K、M、N、P、Q、R、S、T、V、Wからなる群から選択され;
Vb(301)は、R、D、E、H、Yからなる群から選択され;
Vb(302)は、V、Iからなる群から選択され;
Vb(303)は、V、D、E、Yからなる群から選択され;
Vb(304)は、S、D、H、L、N、Tからなる群から選択され;
Vb(305)は、V、E、T、Yからなる群から選択され;
Fx(306−312)は、−(L−T−V−L−H−Q−D)−であり;
Vb(313)は、W、Fからなる群から選択され;
Fx(314−316)は、−(L−N−G)−であり;
Vb(317)は、K、E、Qからなる群から選択され;
Vb(318)は、E、H、L、Q、R、Yからなる群から選択され;
Fx(319)は、Yであり;
Vb(320)は、K、D、F、G、H、I、L、N、P、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Fx(321)は、Cであり;
Vb(322)は、K、D、F、G、H、I、P、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(323)は、V、Iからなる群から選択され;
Vb(324)は、S、D、F、G、H、I、L、M、P、R、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(325)は、N、A、D、E、F、G、H、I、K、L、M、P、Q、R、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(326)は、K、I、L、P、Tからなる群から選択され;
Vb(327)は、A、D、E、F、H、I、K、L、M、N、P、R、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(328)は、L、A、D、E、F、G、H、I、K、M、N、P、Q、R、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(329)は、P、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、Q、R、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(330)は、A、E、F、G、H、I、L、M、N、P、R、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(331)は、P、D、F、H、I、L、M、Q、R、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(332)は、I、A、D、E、F、H、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(333)は、E、F、H、I、L、M、N、P、T、Yからなる群から選択され;
Vb(334)は、K、F、I、L、P、Tからなる群から選択され;
Vb(335)は、T、D、F、G、H、I、L、M、N、P、R、S、V、W、Yからなる群から選択され;
Vb(336)は、I、E、K、Yからなる群から選択され;
Vb(337)は、S、E、H、Nからなる群から選択される;
を含む式を有し、かつ、当該変異体が、配列番号:1と比較して1個ないし4個のアミノ酸置換を含む、タンパク質。
【請求項2】
当該置換が、G236S、G236A、S239D、S239E、S239N、S239Q、S239T、K246H、T260H、K246Y、D249Y、R255Y、E258Y、V264I、S267E、H268D、H268E、E272Y、E272I、E272H、K274E、G281D、E283L、E283H、S304T、S324G、S324I、K326T、A327D、A330Y、A330L、A330I、I332D、I332E、I332N、I332Q、E333Y、K334TおよびK334Fからなる群から選択され、番号付けはEUインデックスに従うものである、請求項1に記載のタンパク質。
【請求項3】
当該Fc変異体が、S239D/I332E、S239D/G236A、S239D/G236S、S239D/V264I、S239D/H268D、S239D/H268E、S239D/S298A、S239D/K326E、S239D/A330L、S239D/A330Y、S239D/A330I、I332E/V264I、I332E/H268D、I332E/H268E、I332E/S298A、I332E/K326E、I332E/A330L、I332E/A330Y、I332E/A330I、I332E/G236A、I332E/G236S、I332D/V264I、I332D/H268D、I332D/H268E、I332D/S298A、I332D/K326E、I332D/A330L、I332D/A330Y、I332D/A330I、I332D/G236A、I332D/G236S、S239D/K246H/I332E、S239D/V264I/I332E、S239D/S267E/I332E、S239D/H268D/I332E、S239D/H268E/I332E、S239D/S298A/I332E、S239D/S324G/I332E、S239D/S324I/I332E、S239D/K326T/I332E、S239D/K326E/I332E、S239D/K326D/I332E、S239D/A327D/I332E、S239D/A330L/I332E、S239D/A330Y/I332E、S239D/A330I/I332E、S239D/K334T/I332E、S239D/K246H/T260H/I332E、S239D/K246H/H268D/I332E、S239D/K246H/H268E/I332E、S239D/H268D/S324G/I332E、S239D/H268E/S324G/I332E、S239D/H268D/K326T/I332E、S239D/H268E/K326T/I332E、S239D/H268D/A330L/I332E、S239D/H268E/A330L/I332E、S239D/H268D/A330Y/I332E、S239D/H268E/A330Y/I332E、S239D/S298A/S267E/I332E、S239D/S298A/H268D/I332E、S239D/S298A/H268E/I332E、S239D/S298A/S324G/I332E、S239D/S298A/S324I/I332E、S239D/S298A/K326T/I332E、S239D/S298A/K326E/I332E、S239D/S298A/A327D/I332E、S239D/S298A/A330L/I332E、S239D/S298A/A330Y/I332E、S239D/K326T/A330Y/I332E、S239D/K326E/A330Y/I332E、S239D/K326T/A330L/I332EおよびS239D/K326E/A330L/I332Eからなる群から選択され、番号付けはEUインデックスに従うものである、請求項2に記載のタンパク質。
【請求項4】
S298A、K326E、K326D、K326A、E333AおよびK334Aからなる群から選択される置換をさらに含み、番号付けはEUインデックスに従うものである、請求項2に記載のタンパク質。
【請求項5】
ヒトFcポリペプチド(配列番号:1)のFc変異体を含むタンパク質であって、当該Fc変異体が、当該親FcポリペプチドのFc領域に少なくとも1個のアミノ酸修飾を含み、当該変異体タンパク質が、1種またはそれ以上のFcリガンドへの結合を、1種またはそれ以上の他のFcリガンドと比べて選択的に増強し、かつ、当該Fc変異体が、234、235、236、267、268、292、293、295、300、324、327、328、330および335からなる群から選択される位置で置換を含み、番号付けはEUインデックスに従うものである、タンパク質。
【請求項6】
当該Fc変異体が、FcγRIIIと比べて、1種またはそれ以上のFcγRIIへの結合を増強する、請求項5に記載のタンパク質。
【請求項7】
当該Fc変異体が、置換G236SまたはG236Aを含む、請求項6に記載のタンパク質。
【請求項8】
当該Fc変異体が、FcγRIIbと比べて、FcγRIIaまたはFcγRIIcへの結合を増強する、請求項5に記載のタンパク質。
【請求項9】
当該Fc変異体が、置換G236SまたはG236Aを含む、請求項8に記載のタンパク質。
【請求項10】
親FcポリペプチドのFc変異体を含むタンパク質であって、当該Fc変異体が、当該親FcポリペプチドのFc領域に少なくとも1個のアミノ酸修飾を含み、当該変異体タンパク質が、1種またはそれ以上のFcリガンドへの結合を低減させ、かつ、当該Fc変異体が、232、234、235、236、237、239、264、265、267、269、270、299、325、328、329および330からなる群から選択される位置で置換を含み、番号付けはEUインデックスに従うものである、タンパク質。
【請求項11】
当該Fc変異体が、位置299または328で置換を含み、番号付けはEUインデックスに従うものである、請求項10に記載のタンパク質。
【請求項12】
当該変異体が、ヒトFcポリペプチドと比較して変更されたFcリガンドへの結合を示す、配列番号:5を含むタンパク質。

【図1】
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【図2】
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【図3a】
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【図3b】
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【図4】
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【図5】
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【図6】
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【図7】
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【図8】
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【図9】
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【図10】
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【図11a】
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【図11b】
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【図12】
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【図13】
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【図14】
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【図15】
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【図16a】
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【図16b】
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【図17a】
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【図17b】
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【図17c】
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【図18】
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【図19】
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【図20a】
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【図20b】
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【図21a】
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【図21b】
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【図21c】
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【図21d】
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【図22a】
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【図22b】
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【図23a】
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【図23b】
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【図24a】
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【図24b】
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【図24c】
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【図25a】
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【図25b】
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【図25c】
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【図26a】
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【図26b】
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【図27】
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【図28】
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【図29a】
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【図29b】
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【図30】
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【図31】
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【図32a】
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【図32b】
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【図32c】
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【図33a】
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【図33b】
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【図33c】
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【図34a】
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【図34b】
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【図34c】
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【図35】
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【図36】
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【図37a】
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【図37b】
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【図38】
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【図39】
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【図40a】
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【図40b】
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【図40c】
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【図41】
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【図41】
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【図41】
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【図41】
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【図41】
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【図41】
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【図41】
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【図41】
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【図41】
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【図41】
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【図41】
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【図41】
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【図41】
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【図41】
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【図41】
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【図41】
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【図41】
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【図41】
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【図41】
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【図42】
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【公表番号】特表2008−505174(P2008−505174A)
【公表日】平成20年2月21日(2008.2.21)
【国際特許分類】
【出願番号】特願2007−520301(P2007−520301)
【出願日】平成17年5月5日(2005.5.5)
【国際出願番号】PCT/US2005/015935
【国際公開番号】WO2006/019447
【国際公開日】平成18年2月23日(2006.2.23)
【出願人】(501154035)ゼンコー・インコーポレイテッド (18)
【氏名又は名称原語表記】XENCOR、 INC.
【Fターム(参考)】