癌を処置および診断するための組成物および方法
本発明は、癌を特徴付け、処置し、かつ診断するための組成物および方法に関する。特に、本発明は、癌幹細胞プロファイルを提供するだけでなく、癌の診断、特徴付け、予後、および処置、ならびに特に充実性腫瘍幹細胞の標的化に有用な新規な幹細胞性癌マーカーを提供する。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
上皮起源の腫瘍から得られた、癌幹細胞の単離された集団であって、該集団が、少なくとも75%の癌幹細胞および25%未満の非腫瘍形成性腫瘍細胞を含み、該癌幹細胞が、
腫瘍形成性であり；かつ
非腫瘍形成性腫瘍細胞に比べて上昇したレベルのPTGFRN、CD166、CD164、CD82、TGFBR1、MET、EFNB2、ITGA6、TDGF1、HBEGF、ABCC4、ABCD3、TDE2、ITGB1、TNFRSF21、CD81、CD9、KIAA1324、CEACAM6、FZD6、FZD7、BMPR1A、JAG1、ITGAV、NOTCH2、SOX4、HES1、HES6、ATOH1、CDH1、EPHB2、MYB、MYC、SOX9、PCGF1、PCGF4、PCGF5、ALDH1A1、およびSTRAPの一つもしくは複数、または低下したレベルのTCF4もしくはVIMの一方もしくは両方を発現する、集団。
【請求項２】
癌幹細胞がCD44+である、請求項1記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項３】
癌幹細胞が上皮特異性抗原(ESA)をさらに発現する、請求項1記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項４】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項1記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項５】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項1記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項６】
上皮起源の腫瘍から得られた、癌幹細胞の濃縮された集団であって、該集団が、癌幹細胞および非腫瘍形成性腫瘍細胞を含み、該癌幹細胞が、
未分画非腫瘍形成性腫瘍細胞に比べて少なくとも2倍濃縮されており；
腫瘍形成性であり；かつ
非腫瘍形成性腫瘍細胞に比べて上昇したレベルのPTGFRN、CD166、CD164、CD82、TGFBR1、MET、EFNB2、ITGA6、TDGF1、HBEGF、ABCC4、ABCD3、TDE2、ITGB1、TNFRSF21、CD81、CD9、KIAA1324、CEACAM6、FZD6、FZD7、BMPR1A、JAG1、ITGAV、NOTCH2、SOX4、HES1、HES6、ATOH1、CDH1、EPHB2、MYB、MYC、SOX9、PCGF1、PCGF4、PCGF5、ALDH1A1、およびSTRAPの一つもしくは複数、または低下したレベルのTCF4もしくはVIMの一方もしくは両方を発現する、集団。
【請求項７】
癌幹細胞がCD44+である、請求項6記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項８】
癌幹細胞が上皮特異性抗原(ESA)をさらに発現する、請求項6記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項９】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項6記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項１０】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項6記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項１１】
(a) 上皮起源の腫瘍から、腫瘍細胞の解離した混合物を得る工程；
(b) 該混合物をCD44およびESAに対する試薬に接触させることにより、腫瘍細胞の該混合物を少なくとも75%の癌幹細胞および25%またはそれ以下の非腫瘍形成性腫瘍細胞を含む第1画分と、癌幹細胞の枯渇した腫瘍細胞の第2画分とに分離する工程；ならびに
(c) 第1宿主動物への連続注射によって該第1画分が腫瘍形成性であり、第2宿主動物への連続注射によって該第2画分が非腫瘍形成性であることを実証する工程
を含む、少なくとも75%が腫瘍形成性幹細胞であり、25%またはそれ以下が非腫瘍形成性腫瘍細胞である、癌幹細胞および非腫瘍形成性腫瘍細胞を含む細胞組成物を、腫瘍から得るための方法。
【請求項１２】
分離する工程が、フローサイトメトリー、蛍光活性化細胞選別(FACS)、パニング、アフィニティークロマトグラフィー、または磁気選択により行われる、請求項11記載の方法。
【請求項１３】
分離する工程が、蛍光活性化細胞選別装置(FACS)分析により行われる、請求項11記載の方法。
【請求項１４】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項11記載の方法。
【請求項１５】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項11記載の方法。
【請求項１６】
(a) 上皮起源の腫瘍から、腫瘍細胞の解離した混合物を得る工程；
(b) 腫瘍細胞の該混合物をCD44およびESAに対する試薬に接触させる工程；
(c) 該試薬への癌幹細胞の結合により癌幹細胞の第1画分と、結腸癌幹細胞の枯渇した結腸腫瘍細胞の第2画分とを選択する工程；ならびに
(d) 宿主動物への該結腸腫瘍幹細胞の連続注射によって該第1画分が腫瘍形成性であり、宿主動物への連続注射によって該第2画分が非腫瘍形成性であることを実証する工程
を含む、上皮起源の腫瘍から癌幹細胞の集団を濃縮するための方法であって、濃縮された集団が、75%の癌幹細胞および25%またはそれ以下の非腫瘍形成性腫瘍細胞を含む、方法。
【請求項１７】
選択する工程が、フローサイトメトリー、蛍光活性化細胞選別(FACS)、パニング、アフィニティークロマトグラフィー、または磁気選択により行われる、請求項16記載の方法。
【請求項１８】
選択する工程が、蛍光活性化細胞選別装置(FACS)分析により行われる、請求項16記載の方法。
【請求項１９】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項16記載の方法。
【請求項２０】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項16記載の方法。
【請求項２１】
上皮起源の腫瘍から得られた、癌幹細胞の単離された集団であって、該集団が、少なくとも75%の癌幹細胞および25%未満の腫瘍細胞を含み、
該癌幹細胞が、
腫瘍形成性であり；
CD44+であり；かつ
上昇したレベルのALDH活性を示し；ならびに
該腫瘍細胞が非腫瘍形成性である、集団。
【請求項２２】
結腸癌幹細胞が上皮特異性抗原(ESA)をさらに発現する、請求項21記載の結腸癌幹細胞の単離された集団。
【請求項２３】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項21記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項２４】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項21記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項２５】
上皮起源の腫瘍から得られた、癌幹細胞の濃縮された集団であって、該集団が癌幹細胞および腫瘍細胞を含み、
結腸癌幹細胞が、
未分画腫瘍細胞に比べて少なくとも2倍濃縮されており；
腫瘍形成性であり；
CD44+であり；かつ
上昇したレベルのALDH活性を示し；ならびに
腫瘍細胞が非腫瘍形成性である、集団。
【請求項２６】
結腸癌幹細胞が上皮特異性抗原(ESA)をさらに発現する、請求項25記載の結腸癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項２７】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項25記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項２８】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項25記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項２９】
(a) 対象から生物学的試料を得る工程；
(b) 該試料の細胞を解離させる工程；
(c) 該解離した細胞を、CD44と結合する第1試薬およびCD166と結合する第2試薬に接触させる工程；ならびに
(d) 第1および第2試薬に結合する癌幹細胞を検出する工程
を含む、癌を有すると疑われる対象における癌幹細胞の存在を同定する方法。
【請求項３０】
第1または第2試薬が抗体である、請求項29記載の方法。
【請求項３１】
検出工程が、フローサイトメトリー、蛍光活性化細胞選別、パニング、アフィニティーカラム分離、または磁気選択により行われる、請求項29記載の方法。
【請求項３２】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項29記載の方法。
【請求項３３】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項29記載の方法。
【請求項３４】
(a) 対象から生物学的試料を得る工程；
(b) 該試料の細胞を解離させる工程；
(c) 該解離した細胞を、CD44と結合する第1試薬およびALDH活性を検出する第2試薬に接触させる工程；ならびに
(d) 第1試薬に結合し、増加したALDH活性を示す癌幹細胞を検出する工程
を含む、癌を有すると疑われる対象における癌幹細胞の存在を同定する方法。
【請求項３５】
第1試薬が抗体である、請求項34記載の方法。
【請求項３６】
検出工程が、フローサイトメトリー、蛍光活性化細胞選別、パニング、アフィニティーカラム分離、または磁気選択により行われる、請求項34記載の方法。
【請求項３７】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項34記載の方法。
【請求項３８】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項34記載の方法。
【請求項３９】
上皮起源の腫瘍から得られた、癌幹細胞の単離された集団であって、該集団が、少なくとも75%の癌幹細胞および25%未満の腫瘍細胞を含み、
該癌幹細胞が、
腫瘍形成性であり；
CD44+であり；かつ
上昇したレベルのCD49f活性を示し；ならびに
該腫瘍細胞が非腫瘍形成性である、集団。
【請求項４０】
結腸癌幹細胞が上皮特異性抗原(ESA)をさらに発現する、請求項39記載の結腸癌幹細胞の単離された集団。
【請求項４１】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項39記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項４２】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項39記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項４３】
上皮起源の腫瘍から得られた、癌幹細胞の濃縮された集団であって、該集団が癌幹細胞および腫瘍細胞を含み、
結腸癌幹細胞が、
未分画腫瘍細胞に比べて少なくとも2倍濃縮されており；
腫瘍形成性であり；
CD44+であり；かつ
上昇したレベルのCD49f活性を示し；ならびに
腫瘍細胞が非腫瘍形成性である、集団。
【請求項４４】
結腸癌幹細胞が上皮特異性抗原(ESA)をさらに発現する、請求項43記載の結腸癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項４５】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項43記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項４６】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項43記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項４７】
(a) 対象から生物学的試料を得る工程；
(b) 該試料の細胞を解離させる工程；
(c) 該解離した細胞を、CD44と結合する第1試薬およびCD49fと結合する第2試薬に接触させる工程；ならびに
(d) 第1および第2試薬に結合する癌幹細胞を検出する工程
を含む、癌を有すると疑われる対象における癌幹細胞の存在を同定する方法。
【請求項４８】
第1または第2試薬が抗体である、請求項47記載の方法。
【請求項４９】
検出工程が、フローサイトメトリー、蛍光活性化細胞選別、パニング、アフィニティーカラム分離、または磁気選択により行われる、請求項47記載の方法。
【請求項５０】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項47記載の方法。
【請求項５１】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項47記載の方法。
【請求項５２】
上皮起源の腫瘍から得られた、癌幹細胞の単離された集団であって、該集団が、少なくとも75%の癌幹細胞および25%未満の腫瘍細胞を含み、
該癌幹細胞が、
腫瘍形成性であり；
CD44+であり；かつ
上昇したレベルのCD59活性を示し；ならびに
該腫瘍細胞が非腫瘍形成性である、集団。
【請求項５３】
結腸癌幹細胞が上皮特異性抗原(ESA)をさらに発現する、請求項52記載の結腸癌幹細胞の単離された集団。
【請求項５４】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項52記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項５５】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項52記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項５６】
上皮起源の腫瘍から得られた、癌幹細胞の濃縮された集団であって、該集団が癌幹細胞および腫瘍細胞を含み、
結腸癌幹細胞が、
未分画腫瘍細胞に比べて少なくとも2倍濃縮されており；
腫瘍形成性であり；
CD44+であり；かつ
上昇したレベルのCD59活性を示し；ならびに
腫瘍細胞が非腫瘍形成性である、集団。
【請求項５７】
結腸癌幹細胞が上皮特異性抗原(ESA)をさらに発現する、請求項56記載の結腸癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項５８】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項56記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項５９】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項56記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項６０】
(a) 対象から生物学的試料を得る工程；
(b) 該試料の細胞を解離させる工程；
(c) 該解離した細胞を、CD44と結合する第1試薬およびCD59と結合する第2試薬に接触させる工程；ならびに
(d) 第1および第2試薬に結合する癌幹細胞を検出する工程
を含む、癌を有すると疑われる対象における癌幹細胞の存在を同定する方法。
【請求項６１】
第1または第2試薬が抗体である、請求項60記載の方法。
【請求項６２】
検出工程が、フローサイトメトリー、蛍光活性化細胞選別、パニング、アフィニティーカラム分離、または磁気選択により行われる、請求項60記載の方法。
【請求項６３】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項60記載の方法。
【請求項６４】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項60記載の方法。
【請求項６５】
癌幹細胞が、非腫瘍形成性腫瘍細胞に比べて上昇したレベルのPTGFRN、CD166、CD164、CD82、TGFBR1、MET、EFNB2、ITGA6、TDGF1、HBEGF、ABCC4、ABCD3、TDE2、ITGB1、TNFRSF21、CD81、CD9、KIAA1324、CEACAM6、FZD6、FZD7、BMPR1A、JAG1、ITGAV、NOTCH2、SOX4、HES6の一つまたは複数を発現する、請求項1記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項６６】
癌幹細胞が、非腫瘍形成性腫瘍細胞に比べて上昇したレベルのHES1、ATOH1、CDH1、EPHB2、MYB、MYC、SOX9、およびSTRAPの一つもしくは複数、または低下したレベルのTCF4もしくはVIMの一方もしくは両方を発現する、請求項1記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項６７】
癌幹細胞が、非腫瘍形成性腫瘍細胞に比べて上昇したレベルのPTGFRN、CD166、CD164、CD82、TGFBR1、MET、EFNB2、ITGA6、TDGF1、HBEGF、ABCC4、ABCD3、TDE2、ITGB1、TNFRSF21、CD81、CD9、KIAA1324、CEACAM6、FZD6、FZD7、BMPR1A、JAG1、ITGAV、NOTCH2、SOX4、HES6の一つまたは複数を発現する、請求項6記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項６８】
癌幹細胞が、非腫瘍形成性腫瘍細胞に比べて上昇したレベルのHES1、ATOH1、CDH1、EPHB2、MYB、MYC、SOX9、およびSTRAPの一つもしくは複数、または低下したレベルのTCF4もしくはVIMの一方もしくは両方を発現する、請求項6記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項１】
上皮起源の腫瘍から得られた、癌幹細胞の単離された集団であって、該集団が、少なくとも75%の癌幹細胞および25%未満の非腫瘍形成性腫瘍細胞を含み、該癌幹細胞が、
腫瘍形成性であり；かつ
非腫瘍形成性腫瘍細胞に比べて上昇したレベルのPTGFRN、CD166、CD164、CD82、TGFBR1、MET、EFNB2、ITGA6、TDGF1、HBEGF、ABCC4、ABCD3、TDE2、ITGB1、TNFRSF21、CD81、CD9、KIAA1324、CEACAM6、FZD6、FZD7、BMPR1A、JAG1、ITGAV、NOTCH2、SOX4、HES1、HES6、ATOH1、CDH1、EPHB2、MYB、MYC、SOX9、PCGF1、PCGF4、PCGF5、ALDH1A1、およびSTRAPの一つもしくは複数、または低下したレベルのTCF4もしくはVIMの一方もしくは両方を発現する、集団。
【請求項２】
癌幹細胞がCD44+である、請求項1記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項３】
癌幹細胞が上皮特異性抗原(ESA)をさらに発現する、請求項1記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項４】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項1記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項５】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項1記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項６】
上皮起源の腫瘍から得られた、癌幹細胞の濃縮された集団であって、該集団が、癌幹細胞および非腫瘍形成性腫瘍細胞を含み、該癌幹細胞が、
未分画非腫瘍形成性腫瘍細胞に比べて少なくとも2倍濃縮されており；
腫瘍形成性であり；かつ
非腫瘍形成性腫瘍細胞に比べて上昇したレベルのPTGFRN、CD166、CD164、CD82、TGFBR1、MET、EFNB2、ITGA6、TDGF1、HBEGF、ABCC4、ABCD3、TDE2、ITGB1、TNFRSF21、CD81、CD9、KIAA1324、CEACAM6、FZD6、FZD7、BMPR1A、JAG1、ITGAV、NOTCH2、SOX4、HES1、HES6、ATOH1、CDH1、EPHB2、MYB、MYC、SOX9、PCGF1、PCGF4、PCGF5、ALDH1A1、およびSTRAPの一つもしくは複数、または低下したレベルのTCF4もしくはVIMの一方もしくは両方を発現する、集団。
【請求項７】
癌幹細胞がCD44+である、請求項6記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項８】
癌幹細胞が上皮特異性抗原(ESA)をさらに発現する、請求項6記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項９】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項6記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項１０】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項6記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項１１】
(a) 上皮起源の腫瘍から、腫瘍細胞の解離した混合物を得る工程；
(b) 該混合物をCD44およびESAに対する試薬に接触させることにより、腫瘍細胞の該混合物を少なくとも75%の癌幹細胞および25%またはそれ以下の非腫瘍形成性腫瘍細胞を含む第1画分と、癌幹細胞の枯渇した腫瘍細胞の第2画分とに分離する工程；ならびに
(c) 第1宿主動物への連続注射によって該第1画分が腫瘍形成性であり、第2宿主動物への連続注射によって該第2画分が非腫瘍形成性であることを実証する工程
を含む、少なくとも75%が腫瘍形成性幹細胞であり、25%またはそれ以下が非腫瘍形成性腫瘍細胞である、癌幹細胞および非腫瘍形成性腫瘍細胞を含む細胞組成物を、腫瘍から得るための方法。
【請求項１２】
分離する工程が、フローサイトメトリー、蛍光活性化細胞選別(FACS)、パニング、アフィニティークロマトグラフィー、または磁気選択により行われる、請求項11記載の方法。
【請求項１３】
分離する工程が、蛍光活性化細胞選別装置(FACS)分析により行われる、請求項11記載の方法。
【請求項１４】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項11記載の方法。
【請求項１５】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項11記載の方法。
【請求項１６】
(a) 上皮起源の腫瘍から、腫瘍細胞の解離した混合物を得る工程；
(b) 腫瘍細胞の該混合物をCD44およびESAに対する試薬に接触させる工程；
(c) 該試薬への癌幹細胞の結合により癌幹細胞の第1画分と、結腸癌幹細胞の枯渇した結腸腫瘍細胞の第2画分とを選択する工程；ならびに
(d) 宿主動物への該結腸腫瘍幹細胞の連続注射によって該第1画分が腫瘍形成性であり、宿主動物への連続注射によって該第2画分が非腫瘍形成性であることを実証する工程
を含む、上皮起源の腫瘍から癌幹細胞の集団を濃縮するための方法であって、濃縮された集団が、75%の癌幹細胞および25%またはそれ以下の非腫瘍形成性腫瘍細胞を含む、方法。
【請求項１７】
選択する工程が、フローサイトメトリー、蛍光活性化細胞選別(FACS)、パニング、アフィニティークロマトグラフィー、または磁気選択により行われる、請求項16記載の方法。
【請求項１８】
選択する工程が、蛍光活性化細胞選別装置(FACS)分析により行われる、請求項16記載の方法。
【請求項１９】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項16記載の方法。
【請求項２０】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項16記載の方法。
【請求項２１】
上皮起源の腫瘍から得られた、癌幹細胞の単離された集団であって、該集団が、少なくとも75%の癌幹細胞および25%未満の腫瘍細胞を含み、
該癌幹細胞が、
腫瘍形成性であり；
CD44+であり；かつ
上昇したレベルのALDH活性を示し；ならびに
該腫瘍細胞が非腫瘍形成性である、集団。
【請求項２２】
結腸癌幹細胞が上皮特異性抗原(ESA)をさらに発現する、請求項21記載の結腸癌幹細胞の単離された集団。
【請求項２３】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項21記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項２４】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項21記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項２５】
上皮起源の腫瘍から得られた、癌幹細胞の濃縮された集団であって、該集団が癌幹細胞および腫瘍細胞を含み、
結腸癌幹細胞が、
未分画腫瘍細胞に比べて少なくとも2倍濃縮されており；
腫瘍形成性であり；
CD44+であり；かつ
上昇したレベルのALDH活性を示し；ならびに
腫瘍細胞が非腫瘍形成性である、集団。
【請求項２６】
結腸癌幹細胞が上皮特異性抗原(ESA)をさらに発現する、請求項25記載の結腸癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項２７】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項25記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項２８】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項25記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項２９】
(a) 対象から生物学的試料を得る工程；
(b) 該試料の細胞を解離させる工程；
(c) 該解離した細胞を、CD44と結合する第1試薬およびCD166と結合する第2試薬に接触させる工程；ならびに
(d) 第1および第2試薬に結合する癌幹細胞を検出する工程
を含む、癌を有すると疑われる対象における癌幹細胞の存在を同定する方法。
【請求項３０】
第1または第2試薬が抗体である、請求項29記載の方法。
【請求項３１】
検出工程が、フローサイトメトリー、蛍光活性化細胞選別、パニング、アフィニティーカラム分離、または磁気選択により行われる、請求項29記載の方法。
【請求項３２】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項29記載の方法。
【請求項３３】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項29記載の方法。
【請求項３４】
(a) 対象から生物学的試料を得る工程；
(b) 該試料の細胞を解離させる工程；
(c) 該解離した細胞を、CD44と結合する第1試薬およびALDH活性を検出する第2試薬に接触させる工程；ならびに
(d) 第1試薬に結合し、増加したALDH活性を示す癌幹細胞を検出する工程
を含む、癌を有すると疑われる対象における癌幹細胞の存在を同定する方法。
【請求項３５】
第1試薬が抗体である、請求項34記載の方法。
【請求項３６】
検出工程が、フローサイトメトリー、蛍光活性化細胞選別、パニング、アフィニティーカラム分離、または磁気選択により行われる、請求項34記載の方法。
【請求項３７】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項34記載の方法。
【請求項３８】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項34記載の方法。
【請求項３９】
上皮起源の腫瘍から得られた、癌幹細胞の単離された集団であって、該集団が、少なくとも75%の癌幹細胞および25%未満の腫瘍細胞を含み、
該癌幹細胞が、
腫瘍形成性であり；
CD44+であり；かつ
上昇したレベルのCD49f活性を示し；ならびに
該腫瘍細胞が非腫瘍形成性である、集団。
【請求項４０】
結腸癌幹細胞が上皮特異性抗原(ESA)をさらに発現する、請求項39記載の結腸癌幹細胞の単離された集団。
【請求項４１】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項39記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項４２】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項39記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項４３】
上皮起源の腫瘍から得られた、癌幹細胞の濃縮された集団であって、該集団が癌幹細胞および腫瘍細胞を含み、
結腸癌幹細胞が、
未分画腫瘍細胞に比べて少なくとも2倍濃縮されており；
腫瘍形成性であり；
CD44+であり；かつ
上昇したレベルのCD49f活性を示し；ならびに
腫瘍細胞が非腫瘍形成性である、集団。
【請求項４４】
結腸癌幹細胞が上皮特異性抗原(ESA)をさらに発現する、請求項43記載の結腸癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項４５】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項43記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項４６】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項43記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項４７】
(a) 対象から生物学的試料を得る工程；
(b) 該試料の細胞を解離させる工程；
(c) 該解離した細胞を、CD44と結合する第1試薬およびCD49fと結合する第2試薬に接触させる工程；ならびに
(d) 第1および第2試薬に結合する癌幹細胞を検出する工程
を含む、癌を有すると疑われる対象における癌幹細胞の存在を同定する方法。
【請求項４８】
第1または第2試薬が抗体である、請求項47記載の方法。
【請求項４９】
検出工程が、フローサイトメトリー、蛍光活性化細胞選別、パニング、アフィニティーカラム分離、または磁気選択により行われる、請求項47記載の方法。
【請求項５０】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項47記載の方法。
【請求項５１】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項47記載の方法。
【請求項５２】
上皮起源の腫瘍から得られた、癌幹細胞の単離された集団であって、該集団が、少なくとも75%の癌幹細胞および25%未満の腫瘍細胞を含み、
該癌幹細胞が、
腫瘍形成性であり；
CD44+であり；かつ
上昇したレベルのCD59活性を示し；ならびに
該腫瘍細胞が非腫瘍形成性である、集団。
【請求項５３】
結腸癌幹細胞が上皮特異性抗原(ESA)をさらに発現する、請求項52記載の結腸癌幹細胞の単離された集団。
【請求項５４】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項52記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項５５】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項52記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項５６】
上皮起源の腫瘍から得られた、癌幹細胞の濃縮された集団であって、該集団が癌幹細胞および腫瘍細胞を含み、
結腸癌幹細胞が、
未分画腫瘍細胞に比べて少なくとも2倍濃縮されており；
腫瘍形成性であり；
CD44+であり；かつ
上昇したレベルのCD59活性を示し；ならびに
腫瘍細胞が非腫瘍形成性である、集団。
【請求項５７】
結腸癌幹細胞が上皮特異性抗原(ESA)をさらに発現する、請求項56記載の結腸癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項５８】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項56記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項５９】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項56記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項６０】
(a) 対象から生物学的試料を得る工程；
(b) 該試料の細胞を解離させる工程；
(c) 該解離した細胞を、CD44と結合する第1試薬およびCD59と結合する第2試薬に接触させる工程；ならびに
(d) 第1および第2試薬に結合する癌幹細胞を検出する工程
を含む、癌を有すると疑われる対象における癌幹細胞の存在を同定する方法。
【請求項６１】
第1または第2試薬が抗体である、請求項60記載の方法。
【請求項６２】
検出工程が、フローサイトメトリー、蛍光活性化細胞選別、パニング、アフィニティーカラム分離、または磁気選択により行われる、請求項60記載の方法。
【請求項６３】
癌幹細胞が結腸癌幹細胞である、請求項60記載の方法。
【請求項６４】
癌幹細胞が頭頸部癌幹細胞である、請求項60記載の方法。
【請求項６５】
癌幹細胞が、非腫瘍形成性腫瘍細胞に比べて上昇したレベルのPTGFRN、CD166、CD164、CD82、TGFBR1、MET、EFNB2、ITGA6、TDGF1、HBEGF、ABCC4、ABCD3、TDE2、ITGB1、TNFRSF21、CD81、CD9、KIAA1324、CEACAM6、FZD6、FZD7、BMPR1A、JAG1、ITGAV、NOTCH2、SOX4、HES6の一つまたは複数を発現する、請求項1記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項６６】
癌幹細胞が、非腫瘍形成性腫瘍細胞に比べて上昇したレベルのHES1、ATOH1、CDH1、EPHB2、MYB、MYC、SOX9、およびSTRAPの一つもしくは複数、または低下したレベルのTCF4もしくはVIMの一方もしくは両方を発現する、請求項1記載の癌幹細胞の単離された集団。
【請求項６７】
癌幹細胞が、非腫瘍形成性腫瘍細胞に比べて上昇したレベルのPTGFRN、CD166、CD164、CD82、TGFBR1、MET、EFNB2、ITGA6、TDGF1、HBEGF、ABCC4、ABCD3、TDE2、ITGB1、TNFRSF21、CD81、CD9、KIAA1324、CEACAM6、FZD6、FZD7、BMPR1A、JAG1、ITGAV、NOTCH2、SOX4、HES6の一つまたは複数を発現する、請求項6記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【請求項６８】
癌幹細胞が、非腫瘍形成性腫瘍細胞に比べて上昇したレベルのHES1、ATOH1、CDH1、EPHB2、MYB、MYC、SOX9、およびSTRAPの一つもしくは複数、または低下したレベルのTCF4もしくはVIMの一方もしくは両方を発現する、請求項6記載の癌幹細胞の濃縮された集団。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【図１５】
【図１６】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【図１５】
【図１６】
【公表番号】特表２００９−５１３１６１（Ｐ２００９−５１３１６１Ａ）
【公表日】平成２１年４月２日（２００９．４．２）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００８−５３８９７６（Ｐ２００８−５３８９７６）
【出願日】平成１８年１０月３１日（２００６．１０．３１）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００６／０４２５６１
【国際公開番号】ＷＯ２００７／０５３６４８
【国際公開日】平成１９年５月１０日（２００７．５．１０）
【出願人】（５０７２８６９０９）ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ ミシガン (13)
【出願人】（３０８０３１０７２）オンコメッド ファーマシューティカルズ インコーポレイテッド (16)
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２１年４月２日（２００９．４．２）
【国際特許分類】
【出願日】平成１８年１０月３１日（２００６．１０．３１）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００６／０４２５６１
【国際公開番号】ＷＯ２００７／０５３６４８
【国際公開日】平成１９年５月１０日（２００７．５．１０）
【出願人】（５０７２８６９０９）ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ ミシガン (13)
【出願人】（３０８０３１０７２）オンコメッド ファーマシューティカルズ インコーポレイテッド (16)
【Ｆターム（参考）】
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