【課題】Ｍｙｃｏｐｌａｓｍａ由来核酸に存在する標的配列の増幅用オリゴヌクレオチドセットの提供。
【解決手段】増幅条件下でＭｙｃｏｐｌａｓｍａ由来核酸に存在する標的配列の増幅用オリゴヌクレオチドのセット。４０塩基長までの第１オリゴヌクレオチド（特定の配列からなる群から選択される塩基配列に対して少なくとも８０％相同な塩基配列を有する第１標的結合領域を含む）ならびに４０塩基長までの第２オリゴヌクレオチド（特定の配列からなる群から選択される塩基配列に対して少なくとも８０％相同な塩基配列を有する第２標的結合領域を含む）を含む。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
増幅条件下で、Ｍｙｃｏｐｌａｓｍａ由来の核酸に存在する標的配列を増幅するのに用いるオリゴヌクレオチドのセットであって、該セットは、以下：
４０塩基長までの第１オリゴヌクレオチドであって、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３、配列番号２４、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７および配列番号２８からなる群から選択される塩基配列に対して少なくとも８０％相同な塩基配列を有する第１標的結合領域を含む、第１オリゴヌクレオチド；ならびに
４０塩基長までの第２オリゴヌクレオチドであって、配列番号２９、配列番号３０、配列番号３１、配列番号３２、配列番号３３、配列番号３４、配列番号３５、配列番号３６、配列番号３７、配列番号３８、配列番号３９および配列番号４０からなる群から選択される塩基配列に対して少なくとも８０％相同な塩基配列を有する第２標的結合領域を含むオリゴヌクレオチド、
を含み、ここで、該第１オリゴヌクレオチドおよび該第２オリゴヌクレオチドの少なくとも１つは、ＲＮＡポリメラーゼによって認識されるかまたはＲＮＡポリメラーゼによる開始もしくは伸長を亢進する、５’配列を必要に応じて含む、
オリゴヌクレオチドのセット。
【請求項２】
請求項１に記載のオリゴヌクレオチドのセットであって、
前記第１標的結合領域の塩基配列が、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３または配列番号２４の塩基配列に対して少なくとも８０％相同であり、かつ
前記第２標的結合領域の塩基配列が、配列番号２９、配列番号３０、配列番号３１または配列番号３２の塩基配列に対して少なくとも８０％相同である、
オリゴヌクレオチドのセット。
【請求項３】
請求項１に記載のオリゴヌクレオチドのセットであって、
前記第１標的結合領域の塩基配列が、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３または配列番号２４の塩基配列に対して少なくとも８０％相同であり、かつ
前記第２標的結合領域の塩基配列が、配列番号３３、配列番号３４、配列番号３５または配列番号３６の塩基配列に対して少なくとも８０％相同である、
オリゴヌクレオチドのセット。
【請求項４】
請求項１に記載のオリゴヌクレオチドのセットであって、
前記第１標的結合領域の塩基配列が、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３または配列番号２４の塩基配列に対して少なくとも８０％相同であり、かつ
前記第２標的結合領域の塩基配列が、配列番号３７、配列番号３８、配列番号３９または配列番号４０の塩基配列に対して少なくとも８０％相同である、
オリゴヌクレオチドのセット。
【請求項５】
請求項１に記載のオリゴヌクレオチドのセットであって、前記第１標的結合領域の塩基配列が、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７または配列番号２８の塩基配列に対して少なくとも８０％相同であり、かつ
前記第２標的結合領域の塩基配列が、配列番号２９、配列番号３０、配列番号３１または配列番号３２の塩基配列に対して少なくとも８０％相同である、オリゴヌクレオチドのセット。
【請求項６】
請求項１に記載のオリゴヌクレオチドのセットであって、
前記第１標的結合領域の塩基配列が、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７または配列番号２８の塩基配列に対して少なくとも８０％相同であり、かつ
前記第２標的結合領域の塩基配列が、配列番号３３、配列番号３４、配列番号３５または配列番号３６の塩基配列に対して少なくとも８０％相同である、
オリゴヌクレオチドのセット。
【請求項７】
請求項１に記載のオリゴヌクレオチドのセットであって、
前記第１標的結合領域の塩基配列が、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７または配列番号２８の塩基配列に対して少なくとも８０％相同であり、かつ
前記第２標的結合領域の塩基配列が、配列番号３７、配列番号３８、配列番号３９または配列番号４０の塩基配列に対して少なくとも８０％相同である、
オリゴヌクレオチドのセット。
【請求項８】
請求項１に記載のオリゴヌクレオチドのセットであって、
前記第１オリゴヌクレオチドおよび第２オリゴヌクレオチドのどちらも、前記条件下でＭｙｃｏｐｌａｓｍａに由来する核酸と安定なハイブリッドを形成する能力がある塩基配列を、該第１標的結合領域または第２標的結合領域と重複した状態でも、該第１標的結合領域または第２標的結合領域に加えた状態でも含まない、
オリゴヌクレオチドのセット。
【請求項９】
請求項８に記載のオリゴヌクレオチドのセットであって、
前記第１標的結合領域の塩基配列が、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３または配列番号２４の塩基配列に対して少なくとも９０％相同であり、かつ
前記第２標的結合領域の塩基配列が、配列番号２９、配列番号３０、配列番号３１または配列番号３２の塩基配列に対して少なくとも９０％相同である、
オリゴヌクレオチドのセット。
【請求項１０】
請求項９に記載のオリゴヌクレオチドのセットであって、前記第１標的結合領域の塩基配列が、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３または配列番号２４の塩基配列に対して完全に相同であり、かつ
前記第２標的結合領域の塩基配列が、配列番号２９、配列番号３０、配列番号３１または配列番号３２の塩基配列に対して完全に相同である、オリゴヌクレオチドのセット。
【請求項１１】
請求項８に記載のオリゴヌクレオチドのセットであって、
前記第１標的結合領域の塩基配列が、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３または配列番号２４の塩基配列に対して少なくとも９０％相同であり、かつ
前記第２標的結合領域の塩基配列が、配列番号３３、配列番号３４、配列番号３５または配列番号３６の塩基配列に対して少なくとも９０％相同である、
オリゴヌクレオチドのセット。
【請求項１２】
請求項１１に記載のオリゴヌクレオチドのセットであって、
前記第１標的結合領域の塩基配列が、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３または配列番号２４の塩基配列に対して完全に相同であり、かつ
前記第２標的結合領域の塩基配列が、配列番号３３、配列番号３４、配列番号３５または配列番号３６の塩基配列に対して完全に相同である、オリゴヌクレオチドのセット。
【請求項１３】
請求項８に記載のオリゴヌクレオチドのセットであって、
前記第１標的結合領域の塩基配列が、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３または配列番号２４の塩基配列に対して少なくとも９０％相同であり、かつ
前記第２標的結合領域の塩基配列が、配列番号３７、配列番号３８、配列番号３９または配列番号４０の塩基配列に対して少なくとも９０％相同である、
オリゴヌクレオチドのセット。
【請求項１４】
請求項１３に記載のオリゴヌクレオチドのセットであって、
前記第１標的結合領域の塩基配列が、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３または配列番号２４の塩基配列に対して完全に相同であり、かつ
前記第２標的結合領域の塩基配列が、配列番号３７、配列番号３８、配列番号３９または配列番号４０の塩基配列に対して完全に相同である、
オリゴヌクレオチドのセット。
【請求項１５】
請求項８に記載のオリゴヌクレオチドのセットであって、
前記第１標的結合領域の塩基配列が、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７または配列番号２８の塩基配列に対して少なくとも９０％相同であり、かつ
前記第２標的結合領域の塩基配列が、配列番号２９、配列番号３０、配列番号３１または配列番号３２の塩基配列に対して少なくとも９０％相同である、
オリゴヌクレオチドのセット。
【請求項１６】
請求項１５に記載のオリゴヌクレオチドのセットであって、
前記第１標的結合領域の塩基配列が、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７または配列番号２８の塩基配列に対して完全に相同であり、かつ
前記第２標的結合領域の塩基配列が、配列番号２９、配列番号３０、配列番号３１または配列番号３２の塩基配列に対して完全に相同である、
オリゴヌクレオチドのセット。
【請求項１７】
請求項８に記載のオリゴヌクレオチドのセットであって、
前記第１標的結合領域の塩基配列が、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７または配列番号２８の塩基配列に対して少なくとも９０％相同であり、かつ
前記第２標的結合領域の塩基配列が、配列番号３３、配列番号３４、配列番号３５または配列番号３６の塩基配列に対して少なくとも９０％相同である、
オリゴヌクレオチドのセット。
【請求項１８】
請求項１７に記載のオリゴヌクレオチドのセットであって、
前記第１標的結合領域の塩基配列が、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７または配列番号２８の塩基配列に対して完全に相同であり、かつ
前記第２標的結合領域の塩基配列が、配列番号３３、配列番号３４、配列番号３５または配列番号３６の塩基配列に対して完全に相同である、
オリゴヌクレオチドのセット。
【請求項１９】
請求項８に記載のオリゴヌクレオチドのセットであって、
前記第１標的結合領域の塩基配列が、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７または配列番号２８の塩基配列に対して少なくとも９０％相同であり、かつ
前記第２標的結合領域の塩基配列が、配列番号３７、配列番号３８、配列番号３９または配列番号４０の塩基配列に対して少なくとも９０％相同である、
オリゴヌクレオチドのセット。
【請求項２０】
請求項１９に記載のオリゴヌクレオチドのセットであって、
前記第１標的結合領域の塩基配列が、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７または配列番号２８の塩基配列に対して完全に相同であり、かつ
前記第２標的結合領域の塩基配列が、配列番号３７、配列番号３８、配列番号３９または配列番号４０の塩基配列に対して完全に相同である、
オリゴヌクレオチドのセット。
【請求項２１】
前記第２オリゴヌクレオチドが、前記５’配列を含む、請求項１に記載のオリゴヌクレオチドのセット。
【請求項２２】
前記５’配列が、Ｔ７プロモーター配列を含む、請求項２１に記載のオリゴヌクレオチドのセット。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【公開番号】特開２００９−１３６３０１（Ｐ２００９−１３６３０１Ａ）
【公開日】平成２１年６月２５日（２００９．６．２５）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００９−３０５２９（Ｐ２００９−３０５２９）
【出願日】平成２１年２月１２日（２００９．２．１２）
【分割の表示】特願２００５−３１２０４６（Ｐ２００５−３１２０４６）の分割
【原出願日】平成１４年１０月３１日（２００２．１０．３１）
【出願人】（５００５０６５３０）ジェン−プロウブ　インコーポレイテッド (58)
【Ｆターム（参考）】