ＨＣＶ治療に対する持続性反応を予測するためのバイオマーカー
本発明は、薬理学的治療に対するＣ型肝炎ウイルスに感染した患者の反応を予測するために有用であるバイオマーカーに関する。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、薬理学的治療に対するＣ型肝炎に感染した患者の反応を予測するために有用であるバイオマーカーに関する。
【背景技術】
【０００２】
Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）は、重要な健康上の問題であり、そして世界中の慢性肝疾患の主要な原因である（Ｂｏｙｅｒ，Ｎ．ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｈｅｐａｔｏｌ．２０００ ３２：９８−１１２）。ＨＣＶに感染した患者は、肝臓の硬変症及びその後の肝細胞の細胞腫を発症する危険性があり、そして従って、ＨＣＶは、肝臓移植の重要な徴候である。
【０００３】
世界保健機関によれば、世界中に２億人以上の感染した個体がおり、少なくとも３ないし４百万人のヒトが毎年感染している。感染した場合、約２０％のヒトはウイルスを一掃するが、しかし残りのヒトはその生涯にわたってＨＣＶを内部に持つことができる。慢性的に感染した個体の１０ないし２０パーセントは、最終的に肝臓を破壊する硬変症又は癌を発症する。ウイルス性疾病は、汚染した血液及び血液産物、汚染した注射針によって非経口的に、又は性的に、そして垂直的に、感染した母親又は保菌母親からその子孫に伝染される。組換えインターフェロン−α単独、又はヌクレオシド類似のリバビリンとの組合せによる免疫療法に限定されるＨＣＶ感染に対する現時点の治療は、耐性が急速に発生するために、臨床的利益は制約される。慢性のＨＣＶ感染と有効に戦う改良された療法剤に対する緊急な必要性が存在する。
【０００４】
ＨＣＶは、ｆｌａｖｉｖｉｒｕｓｅｓ、ｐｅｓｔｉｖｉｒｕｓｅｓ、及びＣ型肝炎ウイルスを含むｈｅｐａｃｉｖｉｒｕｓｅｓ属を含むＦｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅウイルスのファミリーの一員として分類される（Ｒｉｃｅ，Ｃ．Ｍ．，Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ：Ｔｈｅ ｖｉｒｕｓｅｓ ａｎｄ ｔｈｅｉｒ ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ，ｉｎ：Ｆｉｅｌｄｓ Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，Ｅｄｉｔｏｒｓ：Ｆｉｅｌｄｓ，Ｂ．Ｎ．，Ｋｎｉｐｅ，Ｄ．Ｍ．，ａｎｄ Ｈｏｗｌｅｙ，Ｐ．Ｍ．，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ−Ｒａｖｅｎ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ，Ｐａ．，Ｃｈａｐｔｅｒ ３０，９３１−９５９，１９９６）。ＨＣＶは、概略９．４ｋｂのプラスセンスの一本鎖ＲＮＡゲノムを含有するエンベロープ付きウイルスである。ウイルスのゲノムは、５’−非翻訳領域（ＵＴＲ）、概略３０１１個のアミノ酸のポリタンパク質前駆体をコードする長いオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）、及び短い３’ＵＴＲからなる。５’ＵＴＲは、ＨＣＶゲノムの最も高度に保存された部分であり、そしてポリタンパク質翻訳の開始及び制御のために重要である。
【０００５】
ＨＣＶの遺伝子分析は、そのＤＮＡ配列中に＞３０％の分岐を示す６個の主要な遺伝子型を確認している。それぞれの遺伝子型は、ヌクレオチド配列中に２０−２５％の分岐を示す一連の更に密接に関連するサブタイプを含有する（Ｓｉｍｍｏｎｄｓ，Ｐ．２００４ Ｊ．Ｇｅｎ．Ｖｉｒｏｌ．８５：３１７３−８８）。３０種より多いサブタイプが識別されている。米国において、感染した個体の概略７０％が、１ａ及び１ｂ型の感染を有する。１ｂ型は、アジアにおいて最も蔓延しているサブタイプである（Ｘ．Ｆｏｒｎｓ ａｎｄ Ｊ．Ｂｕｋｈ，Ｃｌｉｎｉｃｓ ｉｎ Ｌｉｖｅｒ Ｄｉｓｅａｓｅ １９９９ ３：６９３−７１６；Ｊ．Ｂｕｋｈ ｅｔ ａｌ．，Ｓｅｍｉｎ．Ｌｉｖ．Ｄｉｓ．１９９５ １５：４１−６３）。不幸にも、１型の感染は、２型又は３型遺伝子型のいずれかよりも療法に対して耐性である（Ｎ．Ｎ．Ｚｅｉｎ，Ｃｌｉｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｒｅｖ．，２０００ １３：２２３−２３５）。
【０００６】
ペスチウイルス及び肝炎ウイルスのＯＲＦの非構造タンパク質部分の遺伝的構造及びポリタンパク質プロセッシングは、非常に類似している。これらのプラス鎖のＲＮＡウイルスは、ウイルス複製のために必要な全てのウイルスのタンパク質をコードする一つの大きいＯＲＦを保有する。これらのタンパク質は、細胞及びウイルスによりコードされたプロテイナーゼの両方によって翻訳時及び翻訳後加工されて、成熟したウイルスタンパク質を得るポリタンパク質として発現する。ウイルスのゲノムＲＮＡの複製に責任のあるウイルスタンパク質は、ほぼカルボキシ末端に位置する。ＯＲＦの三分の二は、非構造（ＮＳ）タンパク質と呼ばれる。ペスチウイルス及び肝炎ウイルスの両方において、成熟した非構造（ＮＳ）タンパク質は、非構造タンパク質コード領域のアミノ末端からＯＲＦのカルボキシ末端への配列順序で、ｐ７、ＮＳ２、ＮＳ３、ＮＳ４Ａ、ＮＳ４Ｂ、ＮＳ５Ａ、及びＮＳ５Ｂからなる。
【０００７】
ペスチウイルス及び肝炎ウイルスのＮＳタンパク質は、特異的タンパク質機能の特徴である配列ドメインを共有する。例えば、両方のグループのウイルスのＮＳ３タンパク質は、セリンプロテイナーゼ及びヘリカーゼの特徴であるアミノ酸配列モチーフを保有する（Ｇｏｒｂａｌｅｎｙａ ｅｔ ａｌ．Ｎａｔｕｒｅ １９８８ ３３３：２２；Ｂａｚａｎ ａｎｄ Ｆｌｅｔｔｅｒｉｃｋ Ｖｉｒｏｌｏｇｙ １９８９ １７１：６３７−６３９；Ｇｏｒｂａｌｅｎｙａ ｅｔ ａｌ．Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｒｅｓ．１９８９ １７．３８８９−３８９７）。同様に、ペスチウイルス及び肝炎ウイルスのＮＳ５Ｂタンパク質は、ＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼの特徴であるモチーフを有する（Ｋｏｏｎｉｎ，Ｅ．Ｖ．ａｎｄ Ｄｏｌｊａ，Ｖ．Ｖ．Ｃｒｉｔ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｍｏｌｅｃ．Ｂｉｏｌ．１９９３ ２８：３７５−４３０）。
【０００８】
ウイルスの生活環におけるペスチウイルス及び肝炎ウイルスのＮＳタンパク質の実際の役割及び機能は、直接的に類似である。両方の場合において、ＮＳ３セリンプロテイナーゼは、ＯＲＦ中のその位置の下流のポリタンパク質前駆体の全てのタンパク質分解加工に対して責任がある（Ｗｉｓｋｅｒｃｈｅｎ ａｎｄ Ｃｏｌｌｅｔｔ Ｖｉｒｏｌｏｇｙ １９９１ １８４：３４１−３５０；Ｂａｒｔｅｎｓｃｈｌａｇｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９３ ６７：３８３５−３８４４；Ｅｃｋａｒｔ ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍ．１９９３ １９２：３９９−４０６；Ｇｒａｋｏｕｉ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９３ ６７：２８３２−２８４３；Ｇｒａｋｏｕｉ ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ １９９３ ９０：１０５８３−１０５８７；Ｉｌｉｊｉｋａｔａ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９３ ６７：４６６５−４６７５；Ｔｏｍｅ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９３ ６７：４０１７−４０２６）。両方の場合におけるＮＳ４Ａタンパク質は、ＮＳ３セリンプロテアーゼと共に補助因子として作用する（Ｂａｒｔｅｎｓｃｈｌａｇｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９４ ６８：５０４５−５０５５；Ｆａｉｌｌａ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９４ ６８：３７５３−３７６０；Ｘｕ ｅｔ ａｌ．Ｊ Ｖｉｒｏｌ．１９９７ ７１：５３ １２−５３２２）。両方のウイルスのＮＳ３タンパク質は、更にヘリカーゼとしても作用する（Ｋｉｍ ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍ．１９９５ ２１５：１６０−１６６；Ｊｉｎ ａｎｄ Ｐｅｔｅｒｓｏｎ Ａｒｃｈ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．１９９５，３２３：４７−５３；Ｗａｒｒｅｎｅｒ ａｎｄ Ｃｏｌｌｅｔｔ Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９５ ６９：１７２０−１７２６）。最後に、ペスチウイルス及び肝炎ウイルスのＮＳ５Ｂタンパク質は、予測されたＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼ活性を有する（Ｂｅｈｒｅｎｓ ｅｔ ａｌ．ＥＭＢＯ １９９６ １５：１２−２２；Ｌｅｃｈｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９７ ７１：８４１６−８４２８；Ｙｕａｎ ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍ．１９９７ ２３２：２３１−２３５；Ｈａｇｅｄｏｒｎ，ＰＣＴ ＷＯ９７／１２０３３；Ｚｈｏｎｇ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９８ ７２：９３６５−９３６９）。
【０００９】
現時点において、ＨＣＶ感染の治療のために現時点で使用可能な制約された数の認可された療法が存在する。ＨＣＶを治療するための新しい及び既存の治療方法並びにＨＣＶのＮＳ５Ｂポリメラーゼの阻害は：Ｒ．Ｇ．Ｇｉｓｈ，Ｓｅｍ．Ｌｉｖｅｒ．Ｄｉｓ．，１９９９ １９：５；Ｄｉ Ｂｅｓｃｅｇｌｉｅ，Ａ．Ｍ．ａｎｄ Ｂａｃｏｎ，Ｂ．Ｒ．，Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ａｍｅｒｉｃａｎ，Ｏｃｔｏｂｅｒ：１９９９ ８０−８５；Ｇ．Ｌａｋｅ−Ｂａｋａａｒ，Ｃｕｒｒｅｎｔ ａｎｄ Ｆｕｔｕｒｅ Ｔｈｅｒａｐｙ ｆｏｒ Ｃｈｒｏｎｉｃ Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ Ｖｉｒｕｓ Ｌｉｖｅｒ Ｄｉｓｅａｓｅ，Ｃｕｒｒ．Ｄｒｕｇ Ｔａｒｇ．Ｉｎｆｅｃｔ Ｄｉｓ．２００３ ３（３）：２４７−２５３；Ｐ．Ｈｏｆｆｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，Ｒｅｃｅｎｔ ｐａｔｅｎｔｓ ｏｎ ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ ｔｈｅｒａｐｙ ｆｏｒ ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ（１９９９−２００２），Ｅｘｐ．Ｏｐｉｎ．Ｔｈｅｒ．Ｐａｔｅｎｔｓ ２００３ １３（１１）：１７０７−１７２３；Ｆ．Ｆ．Ｐｏｏｒｄａｄ ｅｔ ａｌ．Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｓ ｉｎ Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｔｈｅｒａｐｙ ｄｕｒｉｎｇ ２０００−２００２，Ｅｘｐ．Ｏｐｉｎ．Ｅｍｅｒｇｉｎｇ Ｄｒｕｇｓ ２００３ ８（１）：９−２５；Ｍ．Ｐ．Ｗａｌｋｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｍｉｓｉｎｇ Ｃａｎｄｉｄａｔｅｓ ｆｏｒ ｔｈｅ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｏｆ ｃｈｒｏｎｉｃ ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ，Ｅｘｐ．Ｏｐｉｎ．Ｉｎｖｅｓｔｉｇ．Ｄｒｕｇｓ ２００３ １２（８）：１２６９−１２８０；Ｓ．−Ｌ．Ｔａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ：Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｓｔａｔｕｓ ａｎｄ Ｅｍｅｒｇｉｎｇ Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ，Ｎａｔｕｒｅ Ｒｅｖ．Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖ．２００２ １：８６７−８８１；Ｒ．Ｄｅ Ｆｒａｎｃｅｓｃｏ ｅｔ ａｌ．Ａｐｐｒｏａｃｈｉｎｇ ａ ｎｅｗ ｅｒａ ｆｏｒ ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ ｔｈｅｒａｐｙ：ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ ｏｆ ｔｈｅ ＮＳ３−４Ａ ｓｅｒｉｎｅ ｐｒｏｔｅａｓｅ ａｎｄ ｔｈｅ ＮＳ５Ｂ ＲＮＡ−ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ＲＮＡ ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ，Ａｎｔｉｖｉｒａｌ Ｒｅｓ．２００３ ５８：１−１６；Ｑ．Ｍ．Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ．Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ ｅｎｃｏｄｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎｓ：ｔａｒｇｅｔｓ ｆｏｒ ａｎｔｉｖｉｒａｌ ｔｈｅｒａｐｙ， Ｄｒｕｇｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｆｕｔｕｒｅ ２０００ ２５（９）：９３３−８−９４４；Ｊ．Ａ．Ｗｕ ａｎｄ Ｚ．Ｈｏｎｇ，Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ ＮＳ５Ｂ−Ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ＲＮＡ Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ ｆｏｒ Ａｎｔｉ−ＨＣＶ Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒａｐｙ Ｃｕｒ．Ｄｒｕｇ Ｔａｒｇ．−Ｉｎｆ．Ｄｉｓ．２００３ ３：０７−２１９によって考察されている。現在、開発過程の各種の段階にある化合物を引用する考察は、その全てが本明細書中に参考文献として援用される。
【００１０】
【化１】
【００１１】
リバビリン（１ａ；１−（（２Ｒ，３Ｒ，４Ｓ，５Ｒ）−３，４−ジヒドロキシ−５−ヒドロキシメチル−テトラヒドロ−フラン−２−イル）−１Ｈ−［１，２，４］トリアゾール−３−カルボン酸アミド；ビラゾール（登録商標））は、合成の非インターフェロン誘導性の広い薬効範囲の抗ウイルス性ヌクレオシド類似体である。リバビリンは、Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅを含む幾つかのＤＮＡ及びＲＮＡウイルスに対するｉｎ ｖｉｔｒｏの活性を有する（Ｇａｒｙ Ｌ．Ｄａｖｉｓ，Ｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌｏｇｙ ２０００ １１８：Ｓ１０４−Ｓ１１４）。単剤療法において、リバビリンは、４０％の患者において血清のアミノトランスフェラーゼのレベルを正常まで減少するが、しかしＨＣＶ−ＲＮＡの血清レベルは低下しない。リバビリンは、更に有意な毒性を示し、そして貧血を誘発することが知られている。リバビリンは、イノシン一リン酸デヒドロゲナーゼの阻害剤である。リバビリンは、ＨＣＶに対する単剤療法において認可されていないが、しかしこの化合物は、インターフェロンα−２ａ及びインターフェロンα−２ｂとの組合せ療法において認可されている。ビラミジン（Ｖｉｒａｍｉｄｉｎｅ）１ｂは、肝細胞中で１ａに転換されるプロドラッグである。
【００１２】
インターフェロン（ＩＦＮ）は、殆ど１０年間、慢性の肝炎の治療のために使用可能であった。ＩＦＮは、ウイルス感染に反応して免疫細胞によって製造される糖タンパク質である。二つの別個の種類のインターフェロンが認識されている：１型は、幾つかのインターフェロンアルファ及び一つのインターフェロンβを含み、２型は、インターフェロンγを含む。１型インターフェロンは、主として感染した細胞によって製造され、そして近隣の細胞を新規な感染から保護する。ＩＦＮは、ＨＣＶを含む多くのウイルスのウイルス複製を阻害し、そしてＣ型肝炎感染に対する単独治療剤として使用された場合、ＩＦＮは、血清のＨＣＶ−ＲＮＡを検出不可能なレベルまで抑制する。更に、ＩＦＮは、血清のアミノトランスフェラーゼレベルを正常化する。不幸にも、ＩＦＮの効果は一次的である。療法の中止は、７０％の再発率をもたらし、そして僅か１０−１５％が、正常な血清アラニントランスフェラーゼレベルを伴う持続性ウイルス陰性化を示す（Ｌ−Ｂ．Ｄａｖｉｓ，ｓｕｐｒａ）。
【００１３】
初期のＩＦＮ療法の一つの制約は、血液からのタンパク質の急速な排除であった。ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）によるＩＦＮの化学的誘導は、実質的に改良された薬物動態学的特性を持つタンパク質をもたらしている。ペガシス（登録商標）は、抱合体のインターフェロンα−２ａ及び４０ｋＤの分枝鎖のモノ−メトキシＰＥＧであり、ペグ−イントロン（登録商標）は、インターフェロンα−２ｂ及び１２ｋＤのモノ−メトキシＰＥＧの抱合体である（Ｂ．Ａ．Ｌｕｘｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｃｌｉｎ．Ｔｈｅｒａｐ．２００２ ２４（９）：１３６３１３８３；Ａ．Ｋｏｚｌｏｗｓｋｉ ａｎｄ Ｊ．Ｍ．Ｈａｒｒｉｓ，Ｊ．Ｃｏｎｔｒｏｌ．Ｒｅｌｅａｓｅ，２００１ ７２：２１７−２２４）。
【００１４】
インターフェロンα−２ａ及びインターフェロンα−２ｂは、現時点でＨＣＶの治療のための単剤療法として認可されている。ロフェロン−Ａ（登録商標）（Ｒｏｃｈｅ）は、インターフェロンα−２ａの組換え形態である。ペガシス（登録商標）（Ｒｏｃｈｅ）は、インターフェロンα−２ａのペグ化（即ちポリエチレングリコールで改変された）形態である。イントロン−Ａ（登録商標）（Ｓｃｈｅｒｉｎｇ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ）は、インターフェロンα−２ｂの組換え形態であり、そしてペグ−イントロン（登録商標）（Ｓｃｈｅｒｉｎｇ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ）は、インターフェロンα−２ｂのペグ化形態である。
【００１５】
インターフェロンα、並びにインターフェロンβ、γ、τ及びωの他の形態は、現時点においてＨＣＶの治療のための臨床開発中である。例えば、ＩｎｔｅｒＭｕｎｅによるＩｎｆｅｒｇｅｎ（登録商標）（インターフェロンアルファコン（ａｌｆａｃｏｎ）−１）、ＶｉｒａｇｅｎによるＯｍｎｉｆｅｒｏｎ（登録商標）（天然のインターフェロン）、Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｏｍｅ ＳｃｉｅｎｃｅｓによるＡｌｂｕｆｅｒｏｎ（登録商標）、Ａｒｅｓ−ＳｅｒｏｎｏによるＲｅｂｉｆ（登録商標）（インターフェロンβ−１ａ）、ＢｉｏＭｅｄｉｃｉｎｅによるオメガインターフェロン、Ａｍａｒｉｌｌｏ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓによる経口インターフェロンアルファ、ＢＭＳ／Ｚｙｍｏｇｅｎｅｔｉｃｓによるペグ化インターフェロンλ１／ＩＬ−２９及びＩｎｔｅｒＭｕｎｅによるインターフェロンγ、インターフェロンτ、及びインターフェロンγ−１ｂは、開発中である。
【００１６】
リバビリン及びインターフェロン−αによるＨＣＶの組合せ療法は、現時点で最適な療法である。組合せたリバビリン及びＰｅｇ（下記）は、５４−５６％の患者において持続性ウイルス陰性化（ＳＶＲ）をもたらす。ＳＶＲは、２型及び３型ＨＣＶに対して８０％に近づく（上掲Ｗａｌｋｅｒ）。不幸なことに、この組み合わせは、更に臨床的挑戦を中止させる副作用を生じる。鬱病、風邪様症状及び皮膚の反応が、皮下のＩＦＮ−αに伴い、そして溶血性貧血が、リバビリンによる持続治療に伴う。
【００１７】
抗ＨＣＶ治療剤としての薬物の開発のための、制約されるものではないが、ＮＳ２−ＮＳ３自己プロテアーゼ、Ｎ３プロテアーゼ、Ｎ３ヘリカーゼ及びＮＳ５Ｂポリメラーゼを含む多くの潜在的分子標的がいまや確認されている。ＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼは、一本鎖プラスセンスのＲＮＡゲノムの複製のために絶対的に必須であり、そしてこの酵素は、医薬品化学者中で有意な興味を誘発している。
【００１８】
ＮＳ５Ｂポリメラーゼのヌクレオシド阻害剤は、連鎖停止をもたらす非天然の基質又はポリメラーゼに結合するヌクレオチドと競合する競合阻害剤のいずれかとして作用することができる。ある種のＮＳ５Ｂポリメラーゼヌクレオシドの阻害剤が、以下の出願公開中に開示され、これらの全ては全体として本明細書中に参考文献として援用される。
【００１９】
【化２】
【００２０】
２００１年１１月２９日に公開されたＷＯ０１ ９０１２１において、Ｊ．−Ｐ．Ｓｏｍｍａｄｏｓｓｉ及びＰ．Ｌａｃｏｌｌａは、式２及び３の１’−アルキル−及び２’−アルキルヌクレオシドの抗−ＨＣＶポリメラーゼ活性を開示し、そして例示している。２００１年１２月６日に公開されたＷＯ０１／９２２８２において、Ｊ．−Ｐ．Ｓｏｍｍａｄｏｓｓｉ及びＰ．Ｌａｃｏｌｌａは、式２、及び３の１’−アルキル−及び２’−アルキルヌクレオシドによりＦｌａｖｉｖｉｒｕｓｅｓ及びＰｅｓｔｉｖｉｒｕｓｅｓの治療を開示し、そして例示している。２００３年４月３日に公開されたＷＯ０３／０２６６７５において、Ｇ．Ｇｏｓｓｅｌｉｎは、Ｆｌａｖｉｖｉｒｕｓｅｓ及びＰｅｓｔｉｖｉｒｕｓｅｓを治療するための４’−アルキルヌクレオシド４を開示している。
【００２１】
２００４年１月８日に公開されたＷＯ２００４００３０００において、Ｊ．−Ｐ．Ｓｏｍｍａｄｏｓｓｉ ｅｔ ａｌ．は、１’−、２’−、３’−及び４’−置換されたβ−Ｄ及びβ−Ｌヌクレオシドの２’−及び３’プロドラッグを開示している。２００４年１月８日に公開されたＷＯ２００４／００２４２２において、Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ感染の治療のための２’−Ｃ−メチル−３’−Ｏ−バリンエステルリボフラネシルシチジン。Ｉｄｅｎｉｘは、シチジン類似体２（Ｂ＝シトシン）のバリンエステル５であると信じられる関連する化合物ＮＭ２８３に対する臨床試験を報告している。２００４年１月８日に公開されたＷＯ２００４／００２９９９において、Ｊ．−Ｐ．Ｓｏｍｍａｄｏｓｓｉ ｅｔ ａｌ．は、ＨＣＶ感染を含むフラビウイルス感染の治療のための１’、２’、３’、又は４’分枝のヌクレオシドの一連の２’、又は３’プロドラッグを開示している。
【００２２】
２００４年６月３日に公開されたＷＯ２００４／０４６３３１において、Ｊ．−Ｐ．Ｓｏｍｍａｄｏｓｓｉ ｅｔ ａｌ．は、２’−分枝ヌクレオシド及びＦｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ変異を開示している。２００３年４月３日に公開されたＷＯ０３／０２６５８９ において、Ｇ．Ｇｏｓｓｅｌｉｎ ｅｔ ａｌ．は、４’−改変ヌクレオシドを使用するＣ型肝炎ウイルスを治療する方法を開示している。２００５年２月３日に公開されたＷＯ２００５００９４１８において、Ｒ．Ｓｔｏｒｅｒ ｅｔ ａｌ．は、ＨＣＶを含むＦｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅによって起こされた疾病の治療のためのプリンヌクレオシド類似体を開示している。
【００２３】
他の特許出願は、Ｃ型肝炎ウイルス感染を治療するためのある種のヌクレオシド類似体の使用を開示している。２００１年５月１０日公開のＷＯ０１／３２１５３において、Ｒ．Ｓｔｏｒｅｒは、ウイルス性疾病を治療するためのヌクレオシド誘導体を開示している。２００１年８月２３日公開のＷＯ０１／６０３１５において、Ｈ．Ｉｓｍａｉｌｉ ｅｔ ａｌ．は、ヌクレオシド化合物によるフラビウイルス感染の治療又は予防の方法を開示している。２００２年３月７日に公開されたＷＯ０２／１８４０４において、Ｒ．Ｄｅｖｏｓ ｅｔ ａｌ．は、ＨＣＶウイルスを治療するための４’−置換ヌクレオチドを開示している。２００１年１０月２５日に公開されたＷＯ０１／７９２４６において、Ｋ．Ａ．Ｗａｔａｎａｂｅは、ウイルス性疾病の治療のための２’−又は３’−ヒドロキシメチルヌクレオシド化合物を開示している。２００２年４月２５日公開のＷＯ０２／３２９２０及び２００２年６月２０日に公開されたＷＯ０２／４８１６５において、Ｌ．Ｓｔｕｙｖｅｒ ｅｔ ａｌ．は、ウイルス性疾病の治療のためのヌクレオシド化合を開示している。
【００２４】
【化３】
【００２５】
２００３年１２月２４日に公開されたＷＯ０３／１０５７７０において、Ｂ．Ｂｈａｔ ｅｔ ａｌ．は、ＨＣＶ感染の治療のために有用である一連のカルボキシヌクレオシド誘導体を開示している。２００３年１月２２日に公開されたＷＯ２００４／００７５１２において、Ｂ．Ｂｈａｔ ｅｔ ａｌ．は、ＲＮＡ−依存性ＲＮＡウイルスポリメラーゼを阻害するヌクレオシド化合物を開示している。この公開中で開示されているヌクレオシドは、主として２’−メチル−２’−ヒドロキシ置換のヌクレオシドである。２００２ 年７月２５日に公開されたＷＯ２００２／０５７４２５において、Ｓ．Ｓ．Ｃａｒｒｏｌｌ ｅｔ ａｌ．は、ＲＮＡ−依存性ウイルスポリメラーゼの阻害剤であるヌクレオシド誘導体を開示している。２００２年７月２５日に公開されたＷＯ０２／０５７２８７において、Ｓ．Ｓ．Ｃａｒｒｏｌｌ ｅｔ ａｌ．は、塩基が所望により置換されていてもよい７Ｈ−ピロロ［２，３−ｄ］ピリミジンラジカル６である関連する２α−メチル及び２β−メチルリボース誘導体を開示している。同一出願は、３β−メチルヌクレオシドの一つの例を開示している。Ｓ．Ｓ．Ｃａｒｒｏｌｌ ｅｔ ａｌ．（Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２００３ ２７８（１４）：１１９７９−１１９８４）は、２’−Ｏ−メチルシチジン（６ａ）によるＨＣＶポリメラーゼの阻害を開示している。２００４年１月２９日に公開されたＷＯ２００４／００９０２０において、Ｄ．Ｂ．Ｏｌｓｅｎ ｅｔ ａｌ．は、ＲＮＡ依存性ＲＮＡウイルスポリメラーゼの阻害剤としての一連のチオヌクレオシド誘導体を開示している。
【００２６】
“２’−フルオロヌクレオシド”の表題のＥｍｏｒｙ大学へのＰＣＴ公開第ＷＯ９９／４３６９１は、ＨＣＶを治療するためのある種の２’−フルオロヌクレオシドの使用を開示している。“２’−フルオロヌクレオシド”の表題のＥｍｏｒｙ大学への米国特許第６，３４８，５８７号は、Ｂ型肝炎、ＨＣＶ、ＨＩＶ及び異常な細胞増殖の治療のために有用な２’−フルオロヌクレオシドのファミリーを開示している。２’−フルオロ置換基の両方の立体配置が開示されている。
【００２７】
Ｅｌｄｒｕｐ ｅｔ ａｌ．（Ｏｒａｌ Ｓｅｓｓｉｏｎ Ｖ，Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ Ｖｉｒｕｓ，Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ；１６ｔｈ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｏｎｆｅｒｅｎｃｅ ｏｎ Ａｎｔｉｖｉｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ（Ａｐｒ．２７，２００３，Ｓａｖａｎｎａｈ，Ｇａ．））は、ＨＣＶの阻害のための２’−改変ヌクレオシドの構造活性の関係を記載している。
【００２８】
Ｂｈａｔ ｅｔ ａｌ．（Ｏｒａｌ Ｓｅｓｓｉｏｎ Ｖ，Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ Ｖｉｒｕｓ，Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ；１６ｔｈ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｏｎｆｅｒｅｎｃｅ ｏｎ Ａｎｔｉｖｉｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ（Ａｐｒ．２７，２００３，Ｓａｖａｎｎａｈ，Ｇａ．）；ｐ Ａ７５）は、ＨＣＶのＲＮＡ複製の可能性のある阻害剤としてのヌクレオシド誘導体の合成及び薬物動力学的特性を記載している。著者は、２’−改変ヌクレオシドが、細胞ベースのレプリコンアッセイにおける強力な阻害活性を証明することを報告している。
【００２９】
Ｏｌｓｅｎ ｅｔ ａｌ．（Ｏｒａｌ Ｓｅｓｓｉｏｎ Ｖ，Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ Ｖｉｒｕｓ，Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ；１６ｔｈ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｏｎｆｅｒｅｎｃｅ ｏｎ Ａｎｔｉｖｉｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ（Ａｐｒ．２７，２００３，Ｓａｖａｎｎａｈ，Ｇａ．）ｐ Ａ７６）は、更にＨＣＶのＲＮＡ複製における２’−改変ヌクレオシドの効果を記載している。
【００３０】
非ヌクレオシドのＨＣＶのＮＳ５Ｂ阻害剤の幾つかの群が記載され、そして本明細書中に参考文献としてその全てが援用され、それらは以下を含む：ベンゾイミダゾール（Ｈ．Ｈａｓｈｉｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０１／４７８３３， Ｈ．Ｈａｓｈｉｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０３／０００２５４，Ｐ．Ｌ．Ｂｅａｕｌｉｅｕ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０３／０２０２４０Ａ２；Ｐ．Ｌ．Ｂｅａｕｌｉｅｕ ｅｔ ａｌ．ＵＳ６，４４８，２８１Ｂ１；Ｐ．Ｌ．Ｂｅａｕｌｉｅｕ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０３／００７９４５Ａ１）；インドール、（Ｐ．Ｌ．Ｂｅａｕｌｉｅｕ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０３／００１０１４１Ａ２；ベンゾチアジアジン、例えば７、（Ｄ．Ｄｈａｎａｋ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０１／８５１７２Ａ１；Ｄ．Ｄｈａｎａｋ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０３／０３７２６２Ａ２；Ｋ．Ｊ．Ｄｕｆｆｙ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０３／０９９８０１Ａ１，Ｄ．Ｃｈａｉｅｔ ａｌ．ＷＯ２００４０５２３１２，Ｄ．Ｃｈａｉ ｅｔ ａｌ．ＷＯ２００４０５２３１３，Ｄ．Ｃｈａｉ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０２／０９８４２４，Ｊ．Ｋ．Ｐｒａｔｔ ｅｔ ａｌ．ＷＯ２００４／０４１８１８Ａ１；Ｊ．Ｋ．Ｐｒａｔｔ ｅｔ ａｌ．ＷＯ２００４／０８７５７７Ａ１）、チオフェン、例えば８、（Ｃ．Ｋ．Ｃｈａｎ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０２／１００８５１）；
【００３１】
【化４】
【００３２】
ベンゾチオフェン（Ｄ．Ｃ．Ｙｏｕｎｇ ａｎｄ Ｔ．Ｒ．Ｂａｉｌｅｙ ＷＯ００／１８２３１）；β−ケトピルビン酸（Ｓ．Ａｔｔａｍｕｒａ ｅｔ ａｌ．米国特許第６，４９２，４２３Ｂ１号，Ａ．Ａｔｔａｍｕｒａ ｅｔ ａｌ．ＷＯ００／０６５２９）；ピリミジン（Ｃ．Ｇａｒｄｅｌｌｉ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０２／０６２４６Ａ１）；ピリミジンジオン（Ｔ．Ｒ．Ｂａｉｌｅｙ ａｎｄ Ｄ．Ｃ．Ｙｏｕｎｇ ＷＯ００／１３７０８）；トリアジン（Ｋ．−Ｈ．Ｃｈｕｎｇ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０２／０７９１８７Ａ１）； ローダミン誘導体（Ｔ．Ｒ．Ｂａｉｌｅｙ ａｎｄ Ｄ．Ｃ．Ｙｏｕｎｇ ＷＯ００／１０５７３，Ｊ．Ｃ．Ｊｅａｎ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０１／７７０９１Ａ２）；２，４−ジオキソピラン（Ｒ．Ａ．Ｌｏｖｅ ｅｔ ａｌ．欧州特許第２５６６２８Ａ２号）；フェニルアラニン誘導体（Ｍ．Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２００３ ２７８：２４８９−２４９５）。
【００３３】
ヌクレオシド誘導体は、しばしば強力な抗ウイルス性（例えば、ＨＩＶ、ＨＣＶ、単純ヘルペス、ＣＭＶ）及び抗癌性化学療法剤である。不幸にも、これらの実際的使用は、二つの因子によってしばしば制約される。第一に、不良な薬物動態学的特性は、しばしば腸からのヌクレオシドの吸収を、そしてヌクレオシド誘導体の細胞内濃度を制約し、そして第２に、最適以下の物理的特性は、活性成分の供給を促進するために使用することができる処方の選択肢を制限する。
【００３４】
Ａｌｂｅｒｔは、固有の生物学的活性に欠けるが、しかし活性な薬物物質への代謝的転換が可能である化合物を記載するためにプロドラッグの用語を導入した（Ａ．Ａｌｂｅｒｔ，Ｓｅｌｅｃｔｉｖｅ Ｔｏｘｉｃｉｔｙ，Ｃｈａｐｍａｎ ａｎｄ Ｈａｌｌ，Ｌｏｎｄｏｎ，１９５１）。プロドラッグは、最近再考察されている（Ｐ．Ｅｔｔｍａｙｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｅｄ Ｃｈｅｍ．２００４ ４７（１０）：２３９３−２４０４；Ｋ．Ｂｅａｕｍｏｎｔ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒ．Ｄｒｕｇ Ｍｅｔａｂ．２００３ ４：４６１−４８５；Ｈ．Ｂｕｎｄｇａａｒｄ，Ｄｅｓｉｇｎ ｏｆ Ｐｒｏｄｒｕｇｓ：Ｂｉｏｒｅｖｅｒｓｉｂｌｅ ｄｅｒｉｖａｔｉｖｅｓ ｆｏｒ ｖａｒｉｏｕｓ ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ｇｒｏｕｐｓ ａｎｄ ｃｈｅｍｉｃａｌ ｅｎｔｉｔｉｅｓ ｉｎ Ｄｅｓｉｇｎ ｏｆ Ｐｒｏｄｒｕｇｓ，Ｈ．Ｂｕｎｄｇａａｒｄ ｅｄ）Ｅｌｓｅｖｉｅｒ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，Ａｍｅｒｓｔｅｒｄａｍ １９８５；Ｇ．Ｍ．Ｐａｕｌｅｔｔｉ ｅｔ ａｌ．Ａｄｖ．Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖ．Ｒｅｖ．１９９７ ２７：２３５−２５６；Ｒ．Ｊ．Ｊｏｎｅｓ ａｎｄ Ｎ．Ｂｉｓｃｈｏｆｂｅｒｇｅｒ，Ａｎｔｉｖｉｒａｌ Ｒｅｓ．１９９５ ２７；１−１５及びＣ．Ｒ．Ｗａｇｎｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｄ．Ｒｅｓ．Ｒｅｖ．２０００ ２０：４１７−４５）。代謝的転換は、特異的酵素、しばしばヒドロラーゼによって触媒されるが、活性化合物は、更に非特異的化学過程によって発生することもできる。
【００３５】
医薬的に受容可能なプロドラッグは、代謝されて、例えば宿主内で加水分解又は酸化されて、本発明の化合物を形成する化合物を指す。生物変換は、毒物学的責任を伴う断片の形成を回避しなければならない。プロドラッグの典型的な例は、活性化合物の官能性分子に連結する生物学的に不安定な保護基を有する化合物を含む。糖分子のヒドロキシ基（単数又は複数）のアルキル化、アシル化又は他の親油性改変は、プロヌクレオチドの設計において使用されている。これらのプロヌクレオチドは、ｉｎ ｖｉｖｏで加水分解又は脱アルキルされて、活性化合物を発生することができる。
【００３６】
経口の生体利用率をしばしば制約する因子は、消化管からの吸収並びに腸壁及び肝臓による初回通過の排出である。ＧＩ管を通る経細胞吸収の最適化は、ゼロより大きいＤ（７．４）を必要とする。然しながら、分配係数の最適化は、成功を確約しない。プロドラッグは、腸細胞中の活性な排出輸送を回避しなければならないことがあり得る。腸細胞中の細胞内代謝は、代謝産物の腸の管腔へ戻る排出ポンプによる受動輸送又は能動輸送をもたらすことができる。プロドラッグは、更に標的細胞又は受容体に到達する前に、血液中の好ましくない生体内変換に耐性でなければならない。
【００３７】
仮想のプロドラッグは、分子中に存在する化学的官能基に基づき、時に合理的に設計することができるが、活性化合物の化学的改変は、親化合物には非存在の好ましくない物理的、化学的及び生物学的特性を示すことができる完全に新しい分子の実体を製造する。代謝産物の確認試験に対する法的な要求事項は、多数の経路が複数の代謝産物に導く場合、難題をもたらす。従って、プロドラッグの確認試験は、不確定な、そして困難な課題であるままである。更に、潜在的なプロドラッグの薬物動態学的特性を評価することは、困難であり、そして高価な努力である。動物モデルからの薬物動態学的結果をヒトに外挿することは、困難であり得る。
【００３８】
最近、Ｃ型肝炎ウイルスの遺伝子型１（ＨＣＶ−１）又は遺伝子型４（ＨＣＶ−４）に感染した患者において、患者のＨＣＶのＲＮＡレベルが、治療後２週間程度の短期間に検出不可能となる場合、インターフェロンアルファ、リバビリン及びＨＣＶポリメラーゼ阻害剤（三剤併用療法）を含む治療に対する有益な反応を、予測することができることが発見された。２週目の急速ウイルス陰性化（ＲＶＲ２）を示し、そして三剤併用療法の治療の終了における持続性ウイルス陰性化（ＳＶＲ）を達成する患者間の相関は、共同所有される２００８年１２月１８日に出願された米国特許出願ＵＳＳＮ６１／１３８，５８５中に開示され、これは、本明細書中にその全てが参考文献として援用される。
【先行技術文献】
【特許文献】
【００３９】
【特許文献１】ＷＯ９７／１２０３３；
【特許文献２】ＷＯ０１ ９０１２１；
【特許文献３】ＷＯ０１／９２２８２；
【特許文献４】ＷＯ０３／０２６６７５；
【特許文献５】ＷＯ２００４００３０００；
【特許文献６】ＷＯ２００４／００２４２２；
【特許文献７】ＷＯ２００４／００２９９９；
【特許文献８】ＷＯ２００４／０４６３３１；
【特許文献９】ＷＯ０３／０２６５８９；
【特許文献１０】ＷＯ２００５００９４１８；
【特許文献１１】ＷＯ０１／３２１５３；
【特許文献１２】ＷＯ０１／６０３１５；
【特許文献１３】ＷＯ０２／１８４０４；
【特許文献１４】ＷＯ０１／７９２４６；
【特許文献１５】ＷＯ０２／３２９２０；
【特許文献１６】ＷＯ０２／４８１６５；
【特許文献１７】ＷＯ０３／１０５７７０；
【特許文献１８】ＷＯ２００４／００７５１２；
【特許文献１９】ＷＯ２００２／０５７４２５；
【特許文献２０】ＷＯ０２／０５７２８７；
【特許文献２１】ＷＯ２００４／００９０２０；
【特許文献２２】ＷＯ９９／４３６９１；
【特許文献２３】米国特許第６，３４８，５８７号；
【特許文献２４】ＷＯ０１／４７８３３；
【特許文献２５】ＷＯ０３／０００２５４；
【特許文献２６】ＷＯ０３／０２０２４０Ａ２；
【特許文献２７】米国特許６，４４８，２８１Ｂ１号；
【特許文献２８】ＷＯ０３／００７９４５Ａ１；
【特許文献２９】ＷＯ０３／００１０１４１Ａ２；
【特許文献３０】ＷＯ０１／８５１７２Ａ１；
【特許文献３１】ＷＯ０３／０３７２６２Ａ２；
【特許文献３２】ＷＯ０３／０９９８０１Ａ１；
【特許文献３３】ＷＯ２００４０５２３１２；
【特許文献３４】ＷＯ２００４０５２３１３；
【特許文献３５】ＷＯ０２／０９８４２４；
【特許文献３６】ＷＯ２００４／０４１８１８Ａ１；
【特許文献３７】ＷＯ２００４／０８７５７７Ａ１；
【特許文献３８】ＷＯ０２／１００８５１；
【特許文献３９】ＷＯ００／１８２３１；
【特許文献４０】米国特許第６，４９２，４２３Ｂ１号；
【特許文献４１】ＷＯ００／０６５２９；
【特許文献４２】ＷＯ０２／０６２４６Ａ１；
【特許文献４３】ＷＯ００／１３７０８；
【特許文献４４】ＷＯ０２／０７９１８７Ａ１；
【特許文献４５】ＷＯ００／１０５７３；
【特許文献４６】ＷＯ０１／７７０９１Ａ２；
【特許文献４７】欧州特許第２５６６２８Ａ２号；
【特許文献４８】米国特許出願ＵＳＳＮ６１／１３８，５８５。
【非特許文献】
【００４０】
【非特許文献１】Ｂｏｙｅｒ，Ｎ．ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｈｅｐａｔｏｌ．２０００ ３２：９８−１１２；
【非特許文献２】Ｒｉｃｅ，Ｃ．Ｍ．，Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ：Ｔｈｅ ｖｉｒｕｓｅｓ ａｎｄ ｔｈｅｉｒ ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ，ｉｎ：Ｆｉｅｌｄｓ Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，Ｅｄｉｔｏｒｓ：Ｆｉｅｌｄｓ，Ｂ．Ｎ．，Ｋｎｉｐｅ，Ｄ．Ｍ．，ａｎｄ Ｈｏｗｌｅｙ，Ｐ．Ｍ．，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ−Ｒａｖｅｎ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ，Ｐａ．，Ｃｈａｐｔｅｒ ３０，９３１−９５９，１９９６；
【非特許文献３】Ｓｉｍｍｏｎｄｓ，Ｐ．２００４ Ｊ．Ｇｅｎ．Ｖｉｒｏｌ．８５：３１７３−８８；
【非特許文献４】Ｘ．Ｆｏｒｎｓ ａｎｄ Ｊ．Ｂｕｋｈ，Ｃｌｉｎｉｃｓ ｉｎ Ｌｉｖｅｒ Ｄｉｓｅａｓｅ １９９９ ３：６９３−７１６；
【非特許文献５】Ｊ．Ｂｕｋｈ ｅｔ ａｌ．，Ｓｅｍｉｎ．Ｌｉｖ．Ｄｉｓ．１９９５ １５：４１−６３；
【非特許文献６】Ｎ．Ｎ．Ｚｅｉｎ，Ｃｌｉｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｒｅｖ．，２０００ １３：２２３−２３５；
【非特許文献８】Ｇｏｒｂａｌｅｎｙａ ｅｔ ａｌ．Ｎａｔｕｒｅ １９８８ ３３３：２２；Ｂａｚａｎ ａｎｄ Ｆｌｅｔｔｅｒｉｃｋ Ｖｉｒｏｌｏｇｙ １９８９ １７１：６３７−６３９；
【非特許文献９】Ｇｏｒｂａｌｅｎｙａ ｅｔ ａｌ．Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｒｅｓ．１９８９ １７．３８８９−３８９７；
【非特許文献１０】Ｋｏｏｎｉｎ，Ｅ．Ｖ．ａｎｄ Ｄｏｌｊａ，Ｖ．Ｖ．Ｃｒｉｔ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｍｏｌｅｃ．Ｂｉｏｌ．１９９３ ２８：３７５−４３０；
【非特許文献１１】Ｗｉｓｋｅｒｃｈｅｎ ａｎｄ Ｃｏｌｌｅｔｔ Ｖｉｒｏｌｏｇｙ １９９１ １８４：３４１−３５０；
【非特許文献１２】Ｂａｒｔｅｎｓｃｈｌａｇｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９３ ６７：３８３５−３８４４；
【非特許文献１３】Ｅｃｋａｒｔ ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍ．１９９３ １９２：３９９−４０６；
【非特許文献１４】Ｇｒａｋｏｕｉ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９３ ６７：２８３２−２８４３；
【非特許文献１５】Ｇｒａｋｏｕｉ ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ １９９３ ９０：１０５８３−１０５８７；
【非特許文献１６】Ｉｌｉｊｉｋａｔａ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９３ ６７：４６６５−４６７５；
【非特許文献１７】Ｔｏｍｅ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９３ ６７：４０１７−４０２６；
【非特許文献１８】Ｂａｒｔｅｎｓｃｈｌａｇｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９４ ６８：５０４５−５０５５；
【非特許文献１９】Ｆａｉｌｌａ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９４ ６８：３７５３−３７６０；
【非特許文献２０】Ｘｕ ｅｔ ａｌ．Ｊ Ｖｉｒｏｌ．１９９７ ７１：５３ １２−５３２２；
【非特許文献２１】Ｋｉｍ ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍ．１９９５ ２１５：１６０−１６６；
【非特許文献２２】Ｊｉｎ ａｎｄ Ｐｅｔｅｒｓｏｎ Ａｒｃｈ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．１９９５，３２３：４７−５３；
【非特許文献２３】Ｗａｒｒｅｎｅｒ ａｎｄ Ｃｏｌｌｅｔｔ Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９５ ６９：１７２０−１７２６；
【非特許文献２４】Ｂｅｈｒｅｎｓ ｅｔ ａｌ．ＥＭＢＯ １９９６ １５：１２−２２；
【非特許文献２５】Ｌｅｃｈｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９７ ７１：８４１６−８４２８；
【非特許文献２６】Ｙｕａｎ ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍ．１９９７ ２３２：２３１−２３５；
【非特許文献２７】Ｚｈｏｎｇ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９８ ７２：９３６５−９３６９；
【非特許文献２８】Ｒ．Ｇ．Ｇｉｓｈ，Ｓｅｍ．Ｌｉｖｅｒ．Ｄｉｓ．，１９９９ １９：５；
【非特許文献２９】Ｄｉ Ｂｅｓｃｅｇｌｉｅ，Ａ．Ｍ．ａｎｄ Ｂａｃｏｎ，Ｂ．Ｒ．，Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ａｍｅｒｉｃａｎ，Ｏｃｔｏｂｅｒ：１９９９ ８０−８５；
【非特許文献３０】Ｇ．Ｌａｋｅ−Ｂａｋａａｒ，Ｃｕｒｒｅｎｔ ａｎｄ Ｆｕｔｕｒｅ Ｔｈｅｒａｐｙ ｆｏｒ Ｃｈｒｏｎｉｃ Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ Ｖｉｒｕｓ Ｌｉｖｅｒ Ｄｉｓｅａｓｅ，Ｃｕｒｒ．Ｄｒｕｇ Ｔａｒｇ．Ｉｎｆｅｃｔ Ｄｉｓ．２００３ ３（３）：２４７−２５３；
【非特許文献３１】Ｐ．Ｈｏｆｆｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，Ｒｅｃｅｎｔ ｐａｔｅｎｔｓ ｏｎ ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ ｔｈｅｒａｐｙ ｆｏｒ ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ（１９９９−２００２），Ｅｘｐ．Ｏｐｉｎ．Ｔｈｅｒ．Ｐａｔｅｎｔｓ ２００３ １３（１１）：１７０７−１７２３；
【非特許文献３２】Ｆ．Ｆ．Ｐｏｏｒｄａｄ ｅｔ ａｌ．Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｓ ｉｎ Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｔｈｅｒａｐｙ ｄｕｒｉｎｇ ２０００−２００２，Ｅｘｐ．Ｏｐｉｎ．Ｅｍｅｒｇｉｎｇ Ｄｒｕｇｓ ２００３ ８（１）：９−２５；
【非特許文献３３】Ｍ．Ｐ．Ｗａｌｋｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｍｉｓｉｎｇ Ｃａｎｄｉｄａｔｅｓ ｆｏｒ ｔｈｅ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｏｆ ｃｈｒｏｎｉｃ ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ，Ｅｘｐ．Ｏｐｉｎ．Ｉｎｖｅｓｔｉｇ．Ｄｒｕｇｓ ２００３ １２（８）：１２６９−１２８０；
【非特許文献３４】Ｓ．−Ｌ．Ｔａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ：Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｓｔａｔｕｓ ａｎｄ Ｅｍｅｒｇｉｎｇ Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ，Ｎａｔｕｒｅ Ｒｅｖ．Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖ．２００２ １：８６７−８８１；
【非特許文献３５】Ｒ．Ｄｅ Ｆｒａｎｃｅｓｃｏ ｅｔ ａｌ．Ａｐｐｒｏａｃｈｉｎｇ ａ ｎｅｗ ｅｒａ ｆｏｒ ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ ｔｈｅｒａｐｙ：ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ ｏｆ ｔｈｅ ＮＳ３−４Ａ ｓｅｒｉｎｅ ｐｒｏｔｅａｓｅ ａｎｄ ｔｈｅ ＮＳ５Ｂ ＲＮＡ−ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ＲＮＡ ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ，Ａｎｔｉｖｉｒａｌ Ｒｅｓ．２００３ ５８：１−１６；
【非特許文献３６】Ｑ．Ｍ．Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ．Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ ｅｎｃｏｄｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎｓ：ｔａｒｇｅｔｓ ｆｏｒ ａｎｔｉｖｉｒａｌ ｔｈｅｒａｐｙ， Ｄｒｕｇｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｆｕｔｕｒｅ ２０００ ２５（９）：９３３−８−９４４；
【非特許文献３７】Ｊ．Ａ．Ｗｕ ａｎｄ Ｚ．Ｈｏｎｇ，Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ ＮＳ５Ｂ−Ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ＲＮＡ Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ ｆｏｒ Ａｎｔｉ−ＨＣＶ Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒａｐｙ Ｃｕｒ．Ｄｒｕｇ Ｔａｒｇ．−Ｉｎｆ．Ｄｉｓ．２００３ ３：０７−２１９；
【非特許文献３８】Ｇａｒｙ Ｌ．Ｄａｖｉｓ，Ｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌｏｇｙ ２０００ １１８：Ｓ１０４−Ｓ１１４；
【非特許文献３９】Ｂ．Ａ．Ｌｕｘｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｃｌｉｎ．Ｔｈｅｒａｐ．２００２ ２４（９）：１３６３１３８３；
【非特許文献４０】Ａ．Ｋｏｚｌｏｗｓｋｉ ａｎｄ Ｊ．Ｍ．Ｈａｒｒｉｓ，Ｊ．Ｃｏｎｔｒｏｌ．Ｒｅｌｅａｓｅ，２００１ ７２：２１７−２２４；
【非特許文献４１】Ｓ．Ｓ．Ｃａｒｒｏｌｌ ｅｔ ａｌ．（Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２００３ ２７８（１４）：１１９７９−１１９８４）；
【非特許文献４２】Ｅｌｄｒｕｐ ｅｔ ａｌ．（Ｏｒａｌ Ｓｅｓｓｉｏｎ Ｖ，Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ Ｖｉｒｕｓ，Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ；１６ｔｈ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｏｎｆｅｒｅｎｃｅ ｏｎ Ａｎｔｉｖｉｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ（Ａｐｒ．２７，２００３，Ｓａｖａｎｎａｈ，Ｇａ．））；
【非特許文献４３】Ｂｈａｔ ｅｔ ａｌ．（Ｏｒａｌ Ｓｅｓｓｉｏｎ Ｖ，Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ Ｖｉｒｕｓ，Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ；１６ｔｈ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｏｎｆｅｒｅｎｃｅ ｏｎ Ａｎｔｉｖｉｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ（Ａｐｒ．２７，２００３，Ｓａｖａｎｎａｈ，Ｇａ．）；ｐ Ａ７５）；
【非特許文献４４】Ｏｌｓｅｎ ｅｔ ａｌ．（Ｏｒａｌ Ｓｅｓｓｉｏｎ Ｖ，Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ Ｖｉｒｕｓ，Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ；１６ｔｈ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｏｎｆｅｒｅｎｃｅ ｏｎ Ａｎｔｉｖｉｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ（Ａｐｒ．２７，２００３，Ｓａｖａｎｎａｈ，Ｇａ．）ｐ Ａ７６）；
【非特許文献４５】Ｍ．Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２００３ ２７８：２４８９−２４９５；
【非特許文献４６】Ａ．Ａｌｂｅｒｔ，Ｓｅｌｅｃｔｉｖｅ Ｔｏｘｉｃｉｔｙ，Ｃｈａｐｍａｎ ａｎｄ Ｈａｌｌ，Ｌｏｎｄｏｎ，１９５１；
【非特許文献４７】Ｐ．Ｅｔｔｍａｙｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｅｄ Ｃｈｅｍ．２００４ ４７（１０）：２３９３−２４０４；
【非特許文献４８】Ｋ．Ｂｅａｕｍｏｎｔ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒ．Ｄｒｕｇ Ｍｅｔａｂ．２００３ ４：４６１−４８５；
【非特許文献４９】Ｈ．Ｂｕｎｄｇａａｒｄ，Ｄｅｓｉｇｎ ｏｆ Ｐｒｏｄｒｕｇｓ：Ｂｉｏｒｅｖｅｒｓｉｂｌｅ ｄｅｒｉｖａｔｉｖｅｓ ｆｏｒ ｖａｒｉｏｕｓ ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ｇｒｏｕｐｓ ａｎｄ ｃｈｅｍｉｃａｌ ｅｎｔｉｔｉｅｓ ｉｎ Ｄｅｓｉｇｎ ｏｆ Ｐｒｏｄｒｕｇｓ，Ｈ．Ｂｕｎｄｇａａｒｄ ｅｄ）Ｅｌｓｅｖｉｅｒ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，Ａｍｅｒｓｔｅｒｄａｍ １９８５；
【非特許文献５０】Ｇ．Ｍ．Ｐａｕｌｅｔｔｉ ｅｔ ａｌ．Ａｄｖ．Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖ．Ｒｅｖ．１９９７ ２７：２３５−２５６；
【非特許文献５１】Ｒ．Ｊ．Ｊｏｎｅｓ ａｎｄ Ｎ．Ｂｉｓｃｈｏｆｂｅｒｇｅｒ，Ａｎｔｉｖｉｒａｌ Ｒｅｓ．１９９５ ２７；１−１５；
【非特許文献５２】Ｃ．Ｒ．Ｗａｇｎｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｄ．Ｒｅｓ．Ｒｅｖ．２０００ ２０：４１７−４５。
【発明の概要】
【００４１】
本発明は、ペグ化ＩＦＮ及びリバビリンとの組合せにおけるＨＣＶのＲＮＡポリメラーゼ阻害剤の三剤併用療法の治療を受けているＣ型肝炎ウイルスの遺伝子型１（ＨＣＶ−１）又は遺伝子型４のＨＣＶ（ＨＣＶ−４）に感染した患者において、ある種のバイオマーカーは、ＲＶＲ２を達成しつつある患者を予測することができ、これは、次に、治療の終了時の持続性ウイルス陰性化を示す患者のプラスの前兆であることの発見に基づく。
【００４２】
一つの態様において、本発明は、ＨＣＶ−１又はＨＣＶ−４に感染したヒトの患者が、インターフェロン、リバビリン及びＨＣＶのＮＳ５Ｂポリメラーゼ阻害剤による治療に対してＲＶＲ２を達成するものであることを予測するための：
（ｉ）前記治療に先だって（治療前）前記患者からの試料を得て、
（ｉｉ）前記試料中のＭＤＣ、エオタキシン、ＩＬ１０、ＴＡＲＣ、及びＭＣＰ１からなる群から選択される少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを決定し、そして
（ｉｉｉ）前記試料中の少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを、前記治療に対してＲＶＲ２を達成しなかった患者の集団の治療前の試料に由来する少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを代表する参照値と比較することを含んでなる方法を提供し；
ここにおいて、前記試料中の少なくとも一つのタンパク質の統計的に有意に高い発現レベルは、前記患者が前記治療に対してＲＶＲ２を達成するものであることの指標である。
【００４３】
もう一つの態様において、本発明は、ＨＣＶ−１又はＨＣＶ−４に感染したヒトの患者が、インターフェロン、リバビリン及びＨＣＶのＮＳ５Ｂポリメラーゼ阻害剤による治療に対してＲＶＲ２を達成するものであることを予測するための：
（ｉ）前記治療の１週間後（治療後１週目）に前記患者からの試料を得て、
（ｉｉ）前記試料中のＴＲＡＩＬ及びＩＬ１２ｐ７０からなる群から選択される少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを決定し、そして
（ｉｉｉ）前記試料中の少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを、前記治療に対してＲＶＲ２を達成しなかった患者の集団の治療後１週目の試料に由来する少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを代表する参照値と比較することを含んでなる方法を提供し；
ここにおいて、前記試料中の少なくとも一つのタンパク質の統計的に有意に高い発現レベルは、前記患者が、前記治療に対してＲＶＲ２を達成するものであることの指標である。
【００４４】
なおもう一つの態様において、本発明は、ＨＣＶ−１又はＨＣＶ−４に感染したヒトの患者が、インターフェロン、リバビリン及びＨＣＶのＮＳ５Ｂポリメラーゼ阻害剤による治療に対してＲＶＲ２を達成するものであることを予測するための：
（ｉ）前記治療に先だって（治療前）前記患者からの試料を得て、
（ｉｉ）前記試料中のＴＧＦベータ１、ＭＩＰ１ｂ、ＴＲＡＩＬ、及びＭＤＣからなる群から選択される少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを決定し、
（ｉｉｉ）前記治療の１週間後（治療後１週目）に前記患者からの試料を得て、
（ｉｖ）前記試料中のＴＧＦベータ１、ＭＩＰ１ｂ、ＴＲＡＩＬ、及びＭＤＣからなる群から選択される少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを決定し、
（ｖ）前記患者からの治療前試料及び前記患者からの治療後１週目の試料間の、少なくとも一つのタンパク質の発現レベルの差を決定し、
（ｖｉ）前記少なくとも一つのタンパク質の発現レベルの差を、前記治療に対してＲＶＲ２を達成しなかった患者の集団の、治療前の試料及び治療後１週目の試料に由来する少なくとも一つのタンパク質の発現レベルの差を代表する参照値と比較することを含んでなる方法を提供し；
ここにおいて、少なくとも一つのタンパク質の発現レベルの差の統計的に有意な変化は、前記患者が、前記治療に対してＲＶＲ２を達成するものであることの指標である。
【図面の簡単な説明】
【００４５】
【図１】図１は、ＲＯ４５８８１６１に対する、第ＩＩ期臨床試験の研究の設計を示す。
【図２】図２は、１５００ｍｇのＲＯ４５８８１６１、１８０μｇのペガシス、及びリバビリンの三剤併用療法治療を受けた、３１人のＣ群の患者のＲＶＲ２及びＳＶＲ治療の反応を示す。
【図３Ａ】図３は、０週目におけるタンパク質の発現レベル（ｐｇ／ｍｌで）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。以下：
【００４６】
【化５】
【００４７】
は、平均値であり、そして以下：
【００４８】
【化６】
【００４９】
は、中央値である。■として示した異常値は、平均及び中央値の決定に含まれなかった。
【図３Ｂ】図３は、０週目におけるタンパク質の発現レベル（ｐｇ／ｍｌで）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。
【図３Ｃ】図３は、０週目におけるタンパク質の発現レベル（ｐｇ／ｍｌで）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。
【図３Ｄ】図３は、０週目におけるタンパク質の発現レベル（ｐｇ／ｍｌで）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。
【図３Ｅ】図３は、０週目におけるタンパク質の発現レベル（ｐｇ／ｍｌで）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。
【図３Ｆ】図３は、０週目におけるタンパク質の発現レベル（ｐｇ／ｍｌで）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。
【図４Ａ】図４は、１週目におけるタンパク質の発現レベル（ｐｇ／ｍｌ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図４Ｂ】図４は、１週目におけるタンパク質の発現レベル（ｐｇ／ｍｌ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図４Ｃ】図４は、１週目におけるタンパク質の発現レベル（ｐｇ／ｍｌ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図５Ａ】図５は、０週目及び１週目間のタンパク質の発現レベルの差（Δｐｇ／ｍｌ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図５Ｂ】図５は、０週目及び１週目間のタンパク質の発現レベルの差（Δｐｇ／ｍｌ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図５Ｃ】図５は、０週目及び１週目間のタンパク質の発現レベルの差（Δｐｇ／ｍｌ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図５Ｄ】図５は、０週目及び１週目間のタンパク質の発現レベルの差（Δｐｇ／ｍｌ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図５Ｅ】図５は、０週目及び１週目間のタンパク質の発現レベルの差（Δｐｇ／ｍｌ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図５Ｆ】図５は、０週目及び１週目間のタンパク質の発現レベルの差（Δｐｇ／ｍｌ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図５Ｇ】図５は、０週目及び１週目間のタンパク質の発現レベルの差（Δｐｇ／ｍｌ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図５Ｈ】図５は、０週目及び１週目間のタンパク質の発現レベルの差（Δｐｇ／ｍ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図６】図６は、それぞれの方法を、１５００回のシミュレーションで使用して重要な変数として選択された頻度（パーセントによって表示）、その訓練誤差率、及び試験誤差率を含む、ＳＶＲに伴うタンパク質の治療前の発現レベルを確認するための四つの分析方法の性能を示す。
【発明を実施するための形態】
【００５０】
用語、治療に対する “反応”は、一つの薬剤又は複数の薬剤の投与に対する所望の反応である。
用語、治療に対する “持続性ウイルス陰性化（Ｓｕｓｔａｉｎｅｄ Ｖｉｒｏｌｏｇｉｃ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ）”（“ＳＶＲ”）及び“完全陰性化（Ｃｏｍｐｌｅｔｅ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ）”（“ＣＲ”）は、本明細書中で互換的に使用され、そして治療の終了時及び治療の終了後２４週目の両方で、感染した患者の試料中のＲＴ−ＰＣＲにより検出可能なＨＣＶのＲＮＡの非存在（＜１５ＩＵ／ｍＬ）を指す。
【００５１】
用語、治療に対する “ウイルス非陰性化（Ｖｉｒｏｌｏｇｉｃ Ｎｏｎ−Ｒｅｓｐｏｎｓｅ）”（“ＶＮＲ”）及び“非陰性化（Ｎｏ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ）”（“ＮＲ”）は、本明細書中で互換的に使用され、そして治療を通して、そして治療の終了時の、感染した患者の試料中のＲＴ−ＰＣＲにより検出可能なＨＣＶのＲＮＡの存在（≧１５ＩＵ／ｍＬ）を指す。
【００５２】
“２週目の急速ウイルス陰性化（Ｒａｐｉｄ Ｖｉｒｏｌｏｇｉｃ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ−２ Ｗｅｅｋｓ（“ＲＶＲ２”）は、２週間の治療後、感染した患者の試料中のＲＴ−ＰＣＲにより検出可能なＨＣＶのＲＮＡ（＜１５ＩＵ／ｍＬ）の非存在を指す。
【００５３】
用語“試料”又は“生物学的試料”は、制約されるものではないが、例えば組織生検、血漿、血清、全血、髄液、リンパ液、皮膚の外部分泌物、呼吸器、腸及び尿生殖器管、涙、唾液、乳汁、血液細胞、腫瘍、器官を含む個体から単離された組織又は流体の試料を指す。更に含まれるものは、ｉｎ ｖｉｔｒｏの細胞培養成分（制約されるものではないが、培養培地中の細胞の増殖から得られる培養上清、推定的にウイルスに感染した細胞、組換え細胞、及び細胞の成分を含む）の試料である。
【００５４】
用語“発現レベルを代表する参照値”は、三剤療法の治療に対してウイルス非陰性化を示すＨＣＶ患者の集団中の試料に由来するマーカータンパク質の平均発現レベルの推定値を指す。
【００５５】
用語“統計的に有意”は、本明細書中で使用される場合、得られた結果が規定された確率のレベルにおける偶然変動のためである可能性がないことを意味し、そして本明細書中で使用される場合、０．０５に等しいか又はそれより少ない有意性のレベル（ｐ≦０．０５）を、或いは１００中の５に等しいか又はそれより小さい誤差の確率を意味する。
【００５６】
用語“インターフェロン”は、ウイルスの複製及び細胞増殖を阻害し、そして免疫反応を変更する高度に相同性の種特異的タンパク質のファミリーを指す。典型的な適したインターフェロンは、制約されるものではないが、Ｓｃｈｅｒｉｎｇ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｋｅｎｉｌｗｏｒｔｈ，Ｎ．Ｊ．から入手可能なイントロン（登録商標）Ａインターフェロンのような組換えインターフェロンアルファ−２ｂ、Ｈｏｆｆｍａｎｎ−Ｌａ Ｒｏｃｈｅ，Ｎｕｔｌｅｙ，Ｎ．Ｊ．から入手可能なロフェロン（登録商標）−Ａインターフェロンのような組換えインターフェロンアルファ−２ａ、Ｂｏｅｈｒｉｎｇｅｒ Ｉｎｇｅｌｈｅｉｍ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ，Ｉｎｃ．，Ｒｉｄｇｅｆｉｅｌｄ，Ｃｏｎｎ．から入手可能なベロフォア（Ｂｅｒｏｆｏｒ）（登録商標）アルファ２インターフェロンのような組換えインターフェロンアルファ−２Ｃ、日本の住友から入手可能なスミフェロン（登録商標）又はＧｌａｘｏ−Ｗｅｌｌｃｏｍｅ Ｌｔｄ．，Ｌｏｎｄｏｎ，Ｇｒｅａｔ Ｂｒｉｔａｉｎから入手可能なウェルフェロン（Ｗｅｌｌｆｅｒｏｎ）（登録商標）インターフェロンアルファ−ｎ１（ＩＮＳ）のような精製された天然のアルファインターフェロンのブレンドであるインターフェロンアルファ−ｎ１、或いは米国特許第４，８９７，４７１号及び４，６９５，６２３号（特にその実施例７、８又は９）に記載されているもの、及びＡｍｇｅｎ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗｂｕｒｙ Ｐａｒｋ，Ｃａｌｉｆ．から入手可能な特異的製品のようなコンセンサスアルファインターフェロン、或いはＩｎｔｅｒｆｅｒｏｎ Ｓｃｉｅｎｃｅｓによって製造され、そしてＰｕｒｄｕｅ Ｆｒｅｄｅｒｉｃｋ Ｃｏ．，Ｎｏｒｗａｌｋ，Ｃｏｎｎ．からアルフェロン（Ａｌｆｅｒｏｎ）の商標で入手可能な天然のアルファインターフェロンの混合物であるインターフェロンアルファ−ｎ３を含む。“インターフェロン”は、現時点でＨＣＶの治療のための臨床開発中である、他の形態のインターフェロンアルファ、並びにインターフェロンベータ、ガンマ、タウ、オメガ及びラムダを含むことができる。例えば、ＩｎｔｅｒＭｕｎｅによるインファーゲン（Ｉｎｆｅｒｇｅｎ）（登録商標）（インターフェロンアルファコン−１）、Ｖｉｒａｇｅｎによるオムニフェロン（Ｏｍｎｉｆｅｒｏｎ）（登録商標）（天然のインターフェロン）、Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｏｍｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓによるアルブフェロン（Ａｌｂｕｆｅｒｏｎ）（登録商標）（アルブミンインターフェロンアルファ２ｂ）、Ａｒｅｓ−Ｓｅｒｏｎｏによるレビフ（Ｒｅｂｉｆ）（登録商標）（インターフェロンベータ−１ａ）、ＢｉｏＭｅｄｉｃｉｎｅによるオメガインターフェロン、Ａｍａｒｉｌｌｏ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓによる経口インターフェロンアルファ、並びにＩｎｔｅｒＭｕｎｅによるインターフェロンγ、インターフェロンτ及びインターフェロンγ−１ｂ、並びにＧｌｙｃｏｆｅｒｏｎＴＭ（グリコールで操作されたコンセンサスインターフェロン）。インターフェロンは、以下に定義するようなペグ化インターフェロンを含むことができる。
【００５７】
用語“ペグ化インターフェロン”、“ペグ化インターフェロンアルファ”及び“ペグインターフェロン”は、本明細書中で互換的に使用され、そしてインターフェロンアルファ、好ましくはインターフェロンアルファ−２ａ及びアルファ−２ｂのポリエチレングリコールで改変された抱合体を意味する。典型的な適したペグ化インターフェロンアルファは、制約されるものではないが、ペガシス（登録商標）及びペグ−イントロン（登録商標）を含む。ペグ化インターフェロンの他の形態は、ＺｙｍｏＧｅｎｅｔｉｃｓ及びＢｒｉｓｔｏｌ−Ｍｙｅｒｓ ＳｑｕｉｂｂによるＰＥＧ−インターフェロンラムダを含むことができる。
【００５８】
用語“リバビリン”は、化合物、１−（（２Ｒ，３Ｒ，４Ｓ，５Ｒ）−３，４−ジヒドロキシ−５−ヒドロキシメチル−テトラヒドロ−フラン−２−イル）−１Ｈ−［１，２，４］トリアゾール−３−カルボン酸アミドを指し、これは、合成の非インターフェロン誘導の、広い薬効範囲の抗ウイルス性ヌクレオシド類似体であり、そしてビラゾール（登録商標）及びコペガス（登録商標）の名称で入手可能である。
【００５９】
用語“ＲＯ４５８８１６１”は、本明細書中で使用される場合、医薬的に受容可能な酸付加塩を含む化合物、イソ酪酸（２Ｒ，３Ｓ，４Ｒ，５Ｒ）−５−（４−アミノ−２−オキソ−２Ｈ−ピリミジン−１−イル）−２−アジド−３，４−ビス−イソブチリルオキシ−テトラヒドロ−フラン−２−イルメチルエステルを指し、そして本明細書中に参考文献として全てが援用されるＰ．Ｊ．Ｐｏｃｋｒｏｓ ｅｔ ａｌ．，Ｈｅｐａｔｏｌｏｇｙ，２００８，４８：３８５−３９７中に開示されているとおりの用語“Ｒ１６２６”と互換的に使用される。
【００６０】
用語“ＲＯ５０２４０４８”は、本明細書中で使用される場合、医薬的に受容可能な酸付加塩を含む化合物、イソ酪酸（２Ｒ，３Ｒ，４Ｒ，５Ｒ）−５−（４−アミノ−２−オキソ−２Ｈ−ピリミジン−１−イル）−４−フルオロ−３−イソブチリルオキシ−４−メチル−テトラヒドロ−フラン−２−イルメチルエステルを指し、そして本明細書中に参考文献として全てが援用されるＳ．Ａｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂ Ａｇｅｎｔｓ Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒ．，２００８ ５２（１２）：４３５６−４３６９中に開示されているとおりの用語“Ｒ７１２８”と互換的に使用される。
【００６１】
用語“概略２週目”は、２週間又は１４日間、プラスマイナス１ないし２日の時間を指す。
用語“ＣＤ３０”は、サイトカイン受容体ＣＤ３０を指し、これは、更に腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーのメンバー８、又はＴＮＦＲＳＦ８としても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿００１２３４に開示されている。
【００６２】
用語“ＭＩＧ”は、ガンマ−インターフェロン由来モノカイン又はガンマインターフェロンによって誘導されたモノカインを指し、そしてこれは、更にケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）リガンド９又はＣＸＣＬ９としても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿００２４０７に開示されている。
【００６３】
用語“ＴＡＲＣ”は、胸腺および活性化制御ケモカインを指し、これは、更にケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド１７又はＣＣＬ１７としても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿００２９７８に開示されている。
【００６４】
用語“ＴＦＧβ１”、“ＴＧＦベータ１”は、トランスフォーミング増殖因子ベータ１（β１）と呼ばれ、そのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿０００６５１に開示されている。
【００６５】
用語“ＳＤＦ１ｂ”又は“ＳＤＦ−１ｂ”は、ストロマ細胞由来因子１ベータを指し、これは、更にケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）リガンド１２又はＣＸＣＬ１２としても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿０００６００に開示されている。
【００６６】
用語“エオタキシン−２”は、好酸球走化タンパク質２を指し、これは、更にケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド２４又はＣＣＬ２４としても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿０００２９８２に開示されている。
【００６７】
用語“ＴＲＡＩＬ”は、ＴＮＦ関連アポトーシス誘導リガンドを指し、これは、更に腫瘍壊死因子（リガンド）スーパーファミリーのメンバー１０、又はＴＮＦＳＦ１０、及びＡｐｏ−２Ｌとしても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿００３８０１に開示されている。
【００６８】
用語“ＨＣＣ−４”又は“ＨＣＣ４”は、ヒトβ（ＣＣ）ケモカインＣＣ−４を指し、これは、更にモノタクチン（Ｍｏｎｏｔａｃｔｉｎ）−１及びケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド１６としても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿００４５８１に開示されている。
【００６９】
用語“ＭＩＰ１ｂ”又はＭＩＰ−１ｂ”は、マクロファージ炎症性タンパク質１−ベータを指し、これは、更にケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド４又はＣＣＬ４、及びリンパ球活性化遺伝子１としても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿００２９７５に開示されている。
【００７０】
用語“ＴＮＦＲＩＩ”又は“ＴＮＦ−ＲＩＩ”は、腫瘍壊死因子受容体２を指し、これは、更にｐ７５腫瘍壊死因子受容体（ｐ７５ＴＮＦＲ）及び腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーのメンバー１Ｂ又はＴＮＦＲＳＦ１Ｂとしても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿００１０５７に開示されている。
【００７１】
用語“ＩＴＡＣ”又は“Ｉ−ＴＡＣ”は、インターフェロン誘導性Ｔ−細胞アルファ化学誘引物質を指し、これは、更にインターフェロン−ガンマ誘導タンパク質９又はＩＰ９、及びケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）リガンド１１又はＣＸＣＬ１１としても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿００５４００に開示されている。
【００７２】
用語“ＩＬ２Ｒ”又は“ＩＬ−２Ｒ”は、そのヒトタンパク質の配列がGenBank寄託番号ＮＰ＿０００４０８に開示されているインターロイキン２受容体アルファ（ＩＬ−２ＲＡ）、そのヒトタンパク質の配列がGenBank寄託番号ＮＰ＿０００８６９に開示されているインターロイキン２受容体ベータ（ＩＬ−２ＲＢ）、及び更に普通のサイトカイン受容体ガンマ鎖としても知られ、そのヒトタンパク質の配列がGenBank寄託番号ＮＰ＿０００１９７に開示されているインターロイキン２受容体ガンマ（ＩＬ−２Ｒγ）間の、ヘテロ三量体からなるインターロイキン２受容体の高親和性の形態を指す。
【００７３】
用語“ＩＬ−１６”又は“ＩＬ１６”は、インターロイキン１６を指し、これは、更にリンパ球走化性因子又はＬＣＦとしても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿００４５０４に開示されている。
【００７４】
用語“ＩＰ１０”又は“ＩＰ−１０”は、１０ｋＤａのインターフェロン−ガンマ誘導タンパク質を指し、これは、更にケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）リガンド１０又はＣＸＣＬ１０としても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿００１５５６に開示されている。
【００７５】
慢性のＣ型肝炎を持つ患者に対する現時点の推奨される第一線の治療は、１又は４の遺伝子型ウイルスを保有する患者において４８週間、２又は３の遺伝子型ウイルスを保有する患者において２４週間のリバビリンと組合せたペグ化インターフェロンアルファである。リバビリンとの組合せ治療は、一回又はそれより多いインターフェロンアルファの療法の課程後に再発した患者、並びに以前に治療したことがない患者におけるインターフェロンアルファの単剤療法より有効であることが見いだされた。然しながら、リバビリンは、催奇性及び発癌性を含む重要な副作用を示す。更に、リバビリンは、概略１０ないし２０％の患者においてリバビリン療法の投与量の減少又は中断を必要とする溶血性貧血を起こし、これは、赤血球中のリバビリン三リン酸の蓄積に関係があり得る。従って、治療費及び有害事象を減少するために、有効性を損なうことなく、治療を、短時間に調整することが望ましい。
【００７６】
多くの研究は、４週目の急速ウイルス陰性化（ＲＶＲ）が、ペグインターフェロン／リバビリン（ｒｉｂａｖａｒｉｎ）を使用する治療に対する持続性ウイルス陰性化（ＳＶＲ）のかなり信頼できる前兆であることを示している。幾つかの研究は、ＲＶＲを達成したＨＣＶ−１の患者間で、ＳＶＲの比率は、２４週及び４８週のペグインターフェロン／リバビリン（ｒｉｂｏｖａｒｉｎ）治療間で匹敵することを示し（Ｄ．Ｍ．Ｊｅｎｓｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｈｅｐａｔｏｌｏｇｙ，２００６，４３：９５４−９６０；Ｓ．Ｚｅｕｚｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｈｅｐａｔｏｌ．２００６，４４：９７−１０３；Ａ．Ｍａｎｇｉａ ｅｔ ａｌ．，Ｈｅｐａｔｏｌｏｇｙ，２００８，４７：４３−５０）、一方、他の者は、ＲＶＲが達成されたとしても、２４週間のペグ化インターフェロン／リバビリンが、４８週間の治療に対して劣ることをＨＣＶ−１の患者において証明している（Ｍ．−Ｌ．Ｙｕ ｅｔ ａｌ．，Ｈｅｐａｔｏｌｏｇｙ，２００８，４７：１８８４−１８９３）。
【実施例】
【００７７】
実施例
ＲＯ４５８８１６１に関連する第ＩＩ相臨床試験
これは、継続中の、第２Ａ相の多施設における無作為化二重盲検（ＲＯ４５８８１６１及びリバビリンは二重盲検であり、そしてペガシスは非盲検であった）の実薬対照並行群間試験であった。３５日のスクリーニング期間（試験薬物の最初の投与に対する最初のスクリーニング評価からの時間）が、試験の治療部分に先行した（図１）。それぞれの患者のＨＣＶ遺伝子型及びＨＣＶのＲＮＡの力価を、スクリーニング期間中に確認し、そしてＨＣＶ−１遺伝子型及びＨＣＶのＲＮＡの力価≧５０，０００ＩＵ／ｍＬを持つ治療未経験の患者のみを登録に適格とした。
【００７８】
年齢１８ないし６６歳間の１０７人の男性及び女性を研究に登録した。患者を四つの治療群に無作為に分けた：
・Ａ群／二剤併用１５００［ＲＯ４５８８１６１を経口で一日２回１５００ｍｇ＋ペガシスを皮下で週１回１８０μｇ］４週間−２１人の患者、
・Ｂ群／二剤併用３０００［ＲＯ４５８８１６１を経口で一日２回３０００ｍｇ＋ペガシスを皮下で週１回１８０μｇ］４週間−３４人の患者、
・Ｃ群／三剤併用１５００［ＲＯ４５８８１６１を経口で一日２回１５００ｍｇ＋ペガシスを皮下で週１回１８０μｇ＋リバビリンを経口で毎日１０００ｍｇ（＜７５ｋｇ）、又は１２００ｍｇ（≧７５ｋｇ）］４週間−３１人の患者又は
・Ｄ群／標準治療（ＳＯＣ）［ペガシスを皮下で週１回１８０μｇ＋リバビリンを経口で毎日１０００ｍｇ（＜７５ｋｇ）、又は１２００ｍｇ（≧７５ｋｇ）］４週間−２１人の患者。
【００７９】
合計１０７人の患者から、３人の患者が無作為化されたにもかかわらず、研究医薬の一回の投与を受けなかったために、１０４人からのデータを分析のために評価した。１０４人の患者の中で、合計それぞれ４３、４、及び５人の、ＲＯ４５８８１６１、ペガシス、及びリバビリン治療を安全上の理由から早期に辞退した患者がいた。
【００８０】
全ての的確な判断基準に合致した患者を、リバビリンを伴い又は伴わずにペガシスと組合せたＲＯ４５８８１６１を、或いはＳＯＣを４週間受けるために無作為化した。
少なくとも１回の研究医薬の投与を受けた全ての患者は、全体で４８週間の治療を完結するために、非盲検のペガシス１８０μｇを皮下で週１回（ｑｗ）、及びリバビリン１０００ｍｇ（＜７５ｋｇ）又は１２００ｍｇ（≧７５ｋｇ）を経口で一日１回（ｑｄ）受け続けるものであった。
【００８１】
無作為化は、ＰＫの下位群（疎ＰＫ対密ＰＫ）によって次の治療群に２：３：３：２の比で階層化（Ａ群／二剤併用１５００ 〜２０、Ｂ群／二剤併用３０００ 〜３０、Ｃ群／三剤併用１５００ 〜３０、Ｄ群／ＳＯＣ 〜２０）された。
【００８２】
全ての患者は、８週目に、即ち実験的薬物組合せの最後の投与後４週目に、安全経過観察訪問を受けた。患者は、この４週目の安全経過観察訪問を、その標準の介護療法による治療中に受けた。完全な４８週の療法の課程を完了した患者は、続いて２４週間の事後治療を完了した。
【００８３】
薬力学的分析は、慢性の遺伝子型１のＨＣＶウイルス感染を持つ治療未経験の患者における、血清のウイルス負荷、及び個々の臨床訪問におけるウイルス反応、並びにリバビリンを伴う又は伴わないペガシスと混合して与えられたＲＯ４５８８１６１による抗ウイルス耐性の発生の評価を含んでいた。ウイルスの反応は、Ｒｏｃｈｅ ＣＯＢＡＳ ＴａｑＭａｎ ＨＣＶ試験によって測定されるような検出不可能なＨＣＶのＲＮＡ（＜１５ＩＵ／ｍＬ）を持つ患者のパーセントとして定義された。薬力学的データは、一覧表、統計的概要（平均、中央値、標準誤差、平均の信頼区間、範囲、変動係数、反応を伴う患者の比率、及び比率に対する信頼区間を含む）及び時間に対する平均のプロットによって与えられた。
【００８４】
各種の治療計画に対する反応を予測するタンパク質バイオマーカーを確認するために、血漿試料を、治療前（０週目の時点）及び治療後１週間（１週目の時点）でそれぞれの患者から収集し、そして各種のサイトカイン及びケモカインの発現レベルを、Ａｕｓｈｏｎ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ（Ｂｉｌｌｅｒｉｃａ，ＭＡ）から入手可能な、特別注文によるＳｅａｒｃｈＬｉｇｈｔ ５５−多重サンドイッチ−ＥＬＩＳＡ装置を使用して、Ｍｏｏｄｙ，Ｍ．Ｄ．ｅｔ ａｌ．，“Ａｒｒａｙ−Ｂａｓｅｄ ＥＬＩＳＡｓ ｆｏｒ Ｈｉｇｈ−Ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｈｕｍａｎ Ｃｙｔｏｋｉｎｅｓ”，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ，２００１，３１（１）：１８６−１９４（これは本明細書中に参考文献としてその全てが援用される）に記載されているプロトコルによって試験した。５５−多重アッセイで試験されたヒトのサイトカイン及びケモカインを表１に収載する。
【００８５】
【表１】
【００８６】
血漿ウイルス負荷の、投与量及び時間依存性の減少が、ＲＯ４５８８１６１、ペガサス及びリバビリンによる治療後に観察された。ＨＣＶのＲＮＡの低下は、最初の投与後の最初の評価（７２時間）という早期に観察された。全てのＲＯ４５８８１６１含有群は、４週目に、基線からの全てＳＯＣによる２．４ｌｏｇ１０より大きい、≧３．６ｌｏｇ１０平均ＨＣＶのＲＮＡ（ＩＵ／ｍＬ）の減少、を有していた。
【００８７】
二剤併用１５００及び二剤併用３０００は、マイナス０．９ｌｏｇ１０ＩＵ／ｍＬウイルス濃度における平均の変化の差を伴う投与量依存性の減少（−３．６対−４．５）を明らかにした。二剤併用１５００及び三剤併用１５００（同一投与量のＲＯ４５８８１６１及びペガシス、しかしリバビリンを伴う）と比較した場合、差は、マイナス１．６ｌｏｇ１０ＩＵ／ｍＬにおいてなお更に大きい（−５．２対−３．６）。更にＳＯＣ及び三剤併用１５００（同一投与量のペガシス及びリバビリン、しかしＲＯ４５８８１６１を伴う）を比較した場合、差は、マイナス２．８ｌｏｇ１０ＩＵ／ｍＬにおいて最も顕著である（−５．２対−２．４）。更に、三剤併用１５００及び二剤併用１５００間、並びに三剤併用１５００及びＳＯＣ間の９５％信頼区間は、全て非重複であり、二剤併用１５００及びＳＯＣに対する三剤併用１５００の優れた抗ウイルス効果を示していた。
【００８８】
三剤併用療法を受けている３１人の群のＣ型患者の治療結果を、図２にグラフとして示す。２週間の治療において検出不可能なＨＣＶのＲＮＡを示すことが可能であった（即ちＲＶＲ２）１３人の患者の内の１１人は、２４週間の治療完了後ＳＶＲを達成することが可能であった。対照的に、ＲＶＲ２を示さなかった１８人の患者の内、７人のみがＳＶＲを達成した。
【００８９】
ＳＶＲを達成した患者からの治療前血漿試料中の５５種のケモカイン及びサイトカインのそれぞれの発現レベルを、ＳＶＲを達成しなかった患者からの治療前血漿試料中のこれらのタンパク質の発現レベルと、Ｗｉｌｃｏｘｏｎの順位和検定（ノンパラメトリック法）を使用して比較した。同様に、ＳＶＲ患者からの治療後１週目の試料中のタンパク質の発現レベルを、非−ＳＶＲ患者からの治療後１週目の試料中のタンパク質発現レベルと比較した。更に、０週目試料及び１週目試料間のそれぞれのタンパク質の発現レベルの差（デルタ）を試験し、そしてＳＶＲ患者及び非−ＳＶＲ患者間で比較した。統計的に有意な差は、０．０５の臨界レベルと考えた。分析は、Ｓｐｏｔｆｉｒｅプログラム（Ｓｐｏｔｆｉｒｅ ＤｅｃｉｓｉｏｎＳｉｔｅ ｖｅｒｓｉｏｎ ９．１．１，２００８，ＴＩＢＣＯ，Ｓｏｍｅｒｖｉｌｌｅ，ＭＡ）で実行した。０週目、１週目におけるＳＶＲ及び非−ＳＶＲ間の発現レベルの統計的に有意な差、並びに０週目−１週目の差（デルタ）を示すタンパク質を表２に示す。三つの試験時点に対するこれらのタンパク質のそれぞれの発現レベルのデータを、図３、４及び５にグラフとして示す。
【００９０】
【表２】
【００９１】
先に記載した単変量解析に加えて、多変量解析を実行した。交差検定戦略を、２／３の患者を訓練データの組とし、そして１／３の患者を試験データの組として無作為に選択することによって適用した。次いで１５００回のシミュレーションを、以下に記載する四つの方法で実行した：
方法１．最良の一つの変数を選択
方法２．多変量ロジスティック回帰分析モデルのための二つまでの最良の変数を選択
方法３．サポートベクターマシーン（ＳＶＭ）のための最良の二つの変数を選択
方法４．ランダムフォレストのための最良の五つの変数を選択。
【００９２】
これらの四つの方法の性能（１５００回のシミュレーションで、それぞれの方法を使用して重要な変数として選択された頻度、その訓練誤差率、及び試験誤差率を含む）を、図６に示す。ＩＰ１０及びＭＩＧの両方は、多変量ロジスティック回帰分析、ＳＶＭ及びランダムフォレスト法を使用する１５００回のシミュレーションの４０％以上において重要な変数として選択された。多重ロジスティック回帰分析法は、１９％の訓練誤差率及び３９％の試験誤差率をもたらすことによって他の三つの方法より良好に遂行するように見受けられる。全ての多変量解析は、Ｇｅｎｔｌｅｍａｎ，Ｒ．ｅｔ ａｌ．ｅｄｓ，Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ａｎｄ Ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ Ｂｉｏｌｏｇｙ Ｓｏｌｕｔｉｏｎｓ Ｕｓｉｎｇ Ｒ ａｎｄ Ｂｉｏｃｏｎｄｕｃｔｏｒ，２００５，Ｓｐｒｉｎｇｅｒ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ中に記載されているとおりのＲプログラムで実行した。
【００９３】
多変量解析は、タンパク質、ＩＰ１０、ＣＤ３０、ＴＧＦβ１及びＭＩＧのミリリットル当たりのピコグラム（ｐｇ／ｍｌ）の基線（即ち治療前）発現レベルを測定することによって、ＨＣＶ−１又はＨＣＶ−４に感染した患者が、三剤併用療法の治療後のＳＶＲを達成するものである可能性を予測するために使用することができる、多変量ロジスティック回帰分析式の構築を可能にした。式は：ＳＶＲスコア＝−４７．４−１．１×ｌｏｇ２ＩＰ１０＋３．１×ｌｏｇ２ＣＤ３０＋１．４×ｌｏｇ２ＴＧＦβ１＋０．５×ｌｏｇ２ＭＩＧであり、ここで、０．５に等しいか又はそれより大きいＳＶＲスコアは、患者が三剤併用療法の治療に対してＳＶＲを達成するものであることを示し、そして一方、０．５より小さいＳＶＲスコアは、患者がこのような治療に対してＳＶＲを達成しないものであることを示すものであった。
【技術分野】
【０００１】
本発明は、薬理学的治療に対するＣ型肝炎に感染した患者の反応を予測するために有用であるバイオマーカーに関する。
【背景技術】
【０００２】
Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）は、重要な健康上の問題であり、そして世界中の慢性肝疾患の主要な原因である（Ｂｏｙｅｒ，Ｎ．ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｈｅｐａｔｏｌ．２０００ ３２：９８−１１２）。ＨＣＶに感染した患者は、肝臓の硬変症及びその後の肝細胞の細胞腫を発症する危険性があり、そして従って、ＨＣＶは、肝臓移植の重要な徴候である。
【０００３】
世界保健機関によれば、世界中に２億人以上の感染した個体がおり、少なくとも３ないし４百万人のヒトが毎年感染している。感染した場合、約２０％のヒトはウイルスを一掃するが、しかし残りのヒトはその生涯にわたってＨＣＶを内部に持つことができる。慢性的に感染した個体の１０ないし２０パーセントは、最終的に肝臓を破壊する硬変症又は癌を発症する。ウイルス性疾病は、汚染した血液及び血液産物、汚染した注射針によって非経口的に、又は性的に、そして垂直的に、感染した母親又は保菌母親からその子孫に伝染される。組換えインターフェロン−α単独、又はヌクレオシド類似のリバビリンとの組合せによる免疫療法に限定されるＨＣＶ感染に対する現時点の治療は、耐性が急速に発生するために、臨床的利益は制約される。慢性のＨＣＶ感染と有効に戦う改良された療法剤に対する緊急な必要性が存在する。
【０００４】
ＨＣＶは、ｆｌａｖｉｖｉｒｕｓｅｓ、ｐｅｓｔｉｖｉｒｕｓｅｓ、及びＣ型肝炎ウイルスを含むｈｅｐａｃｉｖｉｒｕｓｅｓ属を含むＦｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅウイルスのファミリーの一員として分類される（Ｒｉｃｅ，Ｃ．Ｍ．，Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ：Ｔｈｅ ｖｉｒｕｓｅｓ ａｎｄ ｔｈｅｉｒ ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ，ｉｎ：Ｆｉｅｌｄｓ Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，Ｅｄｉｔｏｒｓ：Ｆｉｅｌｄｓ，Ｂ．Ｎ．，Ｋｎｉｐｅ，Ｄ．Ｍ．，ａｎｄ Ｈｏｗｌｅｙ，Ｐ．Ｍ．，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ−Ｒａｖｅｎ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ，Ｐａ．，Ｃｈａｐｔｅｒ ３０，９３１−９５９，１９９６）。ＨＣＶは、概略９．４ｋｂのプラスセンスの一本鎖ＲＮＡゲノムを含有するエンベロープ付きウイルスである。ウイルスのゲノムは、５’−非翻訳領域（ＵＴＲ）、概略３０１１個のアミノ酸のポリタンパク質前駆体をコードする長いオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）、及び短い３’ＵＴＲからなる。５’ＵＴＲは、ＨＣＶゲノムの最も高度に保存された部分であり、そしてポリタンパク質翻訳の開始及び制御のために重要である。
【０００５】
ＨＣＶの遺伝子分析は、そのＤＮＡ配列中に＞３０％の分岐を示す６個の主要な遺伝子型を確認している。それぞれの遺伝子型は、ヌクレオチド配列中に２０−２５％の分岐を示す一連の更に密接に関連するサブタイプを含有する（Ｓｉｍｍｏｎｄｓ，Ｐ．２００４ Ｊ．Ｇｅｎ．Ｖｉｒｏｌ．８５：３１７３−８８）。３０種より多いサブタイプが識別されている。米国において、感染した個体の概略７０％が、１ａ及び１ｂ型の感染を有する。１ｂ型は、アジアにおいて最も蔓延しているサブタイプである（Ｘ．Ｆｏｒｎｓ ａｎｄ Ｊ．Ｂｕｋｈ，Ｃｌｉｎｉｃｓ ｉｎ Ｌｉｖｅｒ Ｄｉｓｅａｓｅ １９９９ ３：６９３−７１６；Ｊ．Ｂｕｋｈ ｅｔ ａｌ．，Ｓｅｍｉｎ．Ｌｉｖ．Ｄｉｓ．１９９５ １５：４１−６３）。不幸にも、１型の感染は、２型又は３型遺伝子型のいずれかよりも療法に対して耐性である（Ｎ．Ｎ．Ｚｅｉｎ，Ｃｌｉｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｒｅｖ．，２０００ １３：２２３−２３５）。
【０００６】
ペスチウイルス及び肝炎ウイルスのＯＲＦの非構造タンパク質部分の遺伝的構造及びポリタンパク質プロセッシングは、非常に類似している。これらのプラス鎖のＲＮＡウイルスは、ウイルス複製のために必要な全てのウイルスのタンパク質をコードする一つの大きいＯＲＦを保有する。これらのタンパク質は、細胞及びウイルスによりコードされたプロテイナーゼの両方によって翻訳時及び翻訳後加工されて、成熟したウイルスタンパク質を得るポリタンパク質として発現する。ウイルスのゲノムＲＮＡの複製に責任のあるウイルスタンパク質は、ほぼカルボキシ末端に位置する。ＯＲＦの三分の二は、非構造（ＮＳ）タンパク質と呼ばれる。ペスチウイルス及び肝炎ウイルスの両方において、成熟した非構造（ＮＳ）タンパク質は、非構造タンパク質コード領域のアミノ末端からＯＲＦのカルボキシ末端への配列順序で、ｐ７、ＮＳ２、ＮＳ３、ＮＳ４Ａ、ＮＳ４Ｂ、ＮＳ５Ａ、及びＮＳ５Ｂからなる。
【０００７】
ペスチウイルス及び肝炎ウイルスのＮＳタンパク質は、特異的タンパク質機能の特徴である配列ドメインを共有する。例えば、両方のグループのウイルスのＮＳ３タンパク質は、セリンプロテイナーゼ及びヘリカーゼの特徴であるアミノ酸配列モチーフを保有する（Ｇｏｒｂａｌｅｎｙａ ｅｔ ａｌ．Ｎａｔｕｒｅ １９８８ ３３３：２２；Ｂａｚａｎ ａｎｄ Ｆｌｅｔｔｅｒｉｃｋ Ｖｉｒｏｌｏｇｙ １９８９ １７１：６３７−６３９；Ｇｏｒｂａｌｅｎｙａ ｅｔ ａｌ．Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｒｅｓ．１９８９ １７．３８８９−３８９７）。同様に、ペスチウイルス及び肝炎ウイルスのＮＳ５Ｂタンパク質は、ＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼの特徴であるモチーフを有する（Ｋｏｏｎｉｎ，Ｅ．Ｖ．ａｎｄ Ｄｏｌｊａ，Ｖ．Ｖ．Ｃｒｉｔ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｍｏｌｅｃ．Ｂｉｏｌ．１９９３ ２８：３７５−４３０）。
【０００８】
ウイルスの生活環におけるペスチウイルス及び肝炎ウイルスのＮＳタンパク質の実際の役割及び機能は、直接的に類似である。両方の場合において、ＮＳ３セリンプロテイナーゼは、ＯＲＦ中のその位置の下流のポリタンパク質前駆体の全てのタンパク質分解加工に対して責任がある（Ｗｉｓｋｅｒｃｈｅｎ ａｎｄ Ｃｏｌｌｅｔｔ Ｖｉｒｏｌｏｇｙ １９９１ １８４：３４１−３５０；Ｂａｒｔｅｎｓｃｈｌａｇｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９３ ６７：３８３５−３８４４；Ｅｃｋａｒｔ ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍ．１９９３ １９２：３９９−４０６；Ｇｒａｋｏｕｉ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９３ ６７：２８３２−２８４３；Ｇｒａｋｏｕｉ ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ １９９３ ９０：１０５８３−１０５８７；Ｉｌｉｊｉｋａｔａ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９３ ６７：４６６５−４６７５；Ｔｏｍｅ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９３ ６７：４０１７−４０２６）。両方の場合におけるＮＳ４Ａタンパク質は、ＮＳ３セリンプロテアーゼと共に補助因子として作用する（Ｂａｒｔｅｎｓｃｈｌａｇｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９４ ６８：５０４５−５０５５；Ｆａｉｌｌａ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９４ ６８：３７５３−３７６０；Ｘｕ ｅｔ ａｌ．Ｊ Ｖｉｒｏｌ．１９９７ ７１：５３ １２−５３２２）。両方のウイルスのＮＳ３タンパク質は、更にヘリカーゼとしても作用する（Ｋｉｍ ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍ．１９９５ ２１５：１６０−１６６；Ｊｉｎ ａｎｄ Ｐｅｔｅｒｓｏｎ Ａｒｃｈ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．１９９５，３２３：４７−５３；Ｗａｒｒｅｎｅｒ ａｎｄ Ｃｏｌｌｅｔｔ Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９５ ６９：１７２０−１７２６）。最後に、ペスチウイルス及び肝炎ウイルスのＮＳ５Ｂタンパク質は、予測されたＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼ活性を有する（Ｂｅｈｒｅｎｓ ｅｔ ａｌ．ＥＭＢＯ １９９６ １５：１２−２２；Ｌｅｃｈｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９７ ７１：８４１６−８４２８；Ｙｕａｎ ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍ．１９９７ ２３２：２３１−２３５；Ｈａｇｅｄｏｒｎ，ＰＣＴ ＷＯ９７／１２０３３；Ｚｈｏｎｇ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９８ ７２：９３６５−９３６９）。
【０００９】
現時点において、ＨＣＶ感染の治療のために現時点で使用可能な制約された数の認可された療法が存在する。ＨＣＶを治療するための新しい及び既存の治療方法並びにＨＣＶのＮＳ５Ｂポリメラーゼの阻害は：Ｒ．Ｇ．Ｇｉｓｈ，Ｓｅｍ．Ｌｉｖｅｒ．Ｄｉｓ．，１９９９ １９：５；Ｄｉ Ｂｅｓｃｅｇｌｉｅ，Ａ．Ｍ．ａｎｄ Ｂａｃｏｎ，Ｂ．Ｒ．，Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ａｍｅｒｉｃａｎ，Ｏｃｔｏｂｅｒ：１９９９ ８０−８５；Ｇ．Ｌａｋｅ−Ｂａｋａａｒ，Ｃｕｒｒｅｎｔ ａｎｄ Ｆｕｔｕｒｅ Ｔｈｅｒａｐｙ ｆｏｒ Ｃｈｒｏｎｉｃ Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ Ｖｉｒｕｓ Ｌｉｖｅｒ Ｄｉｓｅａｓｅ，Ｃｕｒｒ．Ｄｒｕｇ Ｔａｒｇ．Ｉｎｆｅｃｔ Ｄｉｓ．２００３ ３（３）：２４７−２５３；Ｐ．Ｈｏｆｆｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，Ｒｅｃｅｎｔ ｐａｔｅｎｔｓ ｏｎ ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ ｔｈｅｒａｐｙ ｆｏｒ ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ（１９９９−２００２），Ｅｘｐ．Ｏｐｉｎ．Ｔｈｅｒ．Ｐａｔｅｎｔｓ ２００３ １３（１１）：１７０７−１７２３；Ｆ．Ｆ．Ｐｏｏｒｄａｄ ｅｔ ａｌ．Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｓ ｉｎ Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｔｈｅｒａｐｙ ｄｕｒｉｎｇ ２０００−２００２，Ｅｘｐ．Ｏｐｉｎ．Ｅｍｅｒｇｉｎｇ Ｄｒｕｇｓ ２００３ ８（１）：９−２５；Ｍ．Ｐ．Ｗａｌｋｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｍｉｓｉｎｇ Ｃａｎｄｉｄａｔｅｓ ｆｏｒ ｔｈｅ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｏｆ ｃｈｒｏｎｉｃ ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ，Ｅｘｐ．Ｏｐｉｎ．Ｉｎｖｅｓｔｉｇ．Ｄｒｕｇｓ ２００３ １２（８）：１２６９−１２８０；Ｓ．−Ｌ．Ｔａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ：Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｓｔａｔｕｓ ａｎｄ Ｅｍｅｒｇｉｎｇ Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ，Ｎａｔｕｒｅ Ｒｅｖ．Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖ．２００２ １：８６７−８８１；Ｒ．Ｄｅ Ｆｒａｎｃｅｓｃｏ ｅｔ ａｌ．Ａｐｐｒｏａｃｈｉｎｇ ａ ｎｅｗ ｅｒａ ｆｏｒ ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ ｔｈｅｒａｐｙ：ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ ｏｆ ｔｈｅ ＮＳ３−４Ａ ｓｅｒｉｎｅ ｐｒｏｔｅａｓｅ ａｎｄ ｔｈｅ ＮＳ５Ｂ ＲＮＡ−ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ＲＮＡ ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ，Ａｎｔｉｖｉｒａｌ Ｒｅｓ．２００３ ５８：１−１６；Ｑ．Ｍ．Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ．Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ ｅｎｃｏｄｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎｓ：ｔａｒｇｅｔｓ ｆｏｒ ａｎｔｉｖｉｒａｌ ｔｈｅｒａｐｙ， Ｄｒｕｇｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｆｕｔｕｒｅ ２０００ ２５（９）：９３３−８−９４４；Ｊ．Ａ．Ｗｕ ａｎｄ Ｚ．Ｈｏｎｇ，Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ ＮＳ５Ｂ−Ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ＲＮＡ Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ ｆｏｒ Ａｎｔｉ−ＨＣＶ Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒａｐｙ Ｃｕｒ．Ｄｒｕｇ Ｔａｒｇ．−Ｉｎｆ．Ｄｉｓ．２００３ ３：０７−２１９によって考察されている。現在、開発過程の各種の段階にある化合物を引用する考察は、その全てが本明細書中に参考文献として援用される。
【００１０】
【化１】
【００１１】
リバビリン（１ａ；１−（（２Ｒ，３Ｒ，４Ｓ，５Ｒ）−３，４−ジヒドロキシ−５−ヒドロキシメチル−テトラヒドロ−フラン−２−イル）−１Ｈ−［１，２，４］トリアゾール−３−カルボン酸アミド；ビラゾール（登録商標））は、合成の非インターフェロン誘導性の広い薬効範囲の抗ウイルス性ヌクレオシド類似体である。リバビリンは、Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅを含む幾つかのＤＮＡ及びＲＮＡウイルスに対するｉｎ ｖｉｔｒｏの活性を有する（Ｇａｒｙ Ｌ．Ｄａｖｉｓ，Ｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌｏｇｙ ２０００ １１８：Ｓ１０４−Ｓ１１４）。単剤療法において、リバビリンは、４０％の患者において血清のアミノトランスフェラーゼのレベルを正常まで減少するが、しかしＨＣＶ−ＲＮＡの血清レベルは低下しない。リバビリンは、更に有意な毒性を示し、そして貧血を誘発することが知られている。リバビリンは、イノシン一リン酸デヒドロゲナーゼの阻害剤である。リバビリンは、ＨＣＶに対する単剤療法において認可されていないが、しかしこの化合物は、インターフェロンα−２ａ及びインターフェロンα−２ｂとの組合せ療法において認可されている。ビラミジン（Ｖｉｒａｍｉｄｉｎｅ）１ｂは、肝細胞中で１ａに転換されるプロドラッグである。
【００１２】
インターフェロン（ＩＦＮ）は、殆ど１０年間、慢性の肝炎の治療のために使用可能であった。ＩＦＮは、ウイルス感染に反応して免疫細胞によって製造される糖タンパク質である。二つの別個の種類のインターフェロンが認識されている：１型は、幾つかのインターフェロンアルファ及び一つのインターフェロンβを含み、２型は、インターフェロンγを含む。１型インターフェロンは、主として感染した細胞によって製造され、そして近隣の細胞を新規な感染から保護する。ＩＦＮは、ＨＣＶを含む多くのウイルスのウイルス複製を阻害し、そしてＣ型肝炎感染に対する単独治療剤として使用された場合、ＩＦＮは、血清のＨＣＶ−ＲＮＡを検出不可能なレベルまで抑制する。更に、ＩＦＮは、血清のアミノトランスフェラーゼレベルを正常化する。不幸にも、ＩＦＮの効果は一次的である。療法の中止は、７０％の再発率をもたらし、そして僅か１０−１５％が、正常な血清アラニントランスフェラーゼレベルを伴う持続性ウイルス陰性化を示す（Ｌ−Ｂ．Ｄａｖｉｓ，ｓｕｐｒａ）。
【００１３】
初期のＩＦＮ療法の一つの制約は、血液からのタンパク質の急速な排除であった。ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）によるＩＦＮの化学的誘導は、実質的に改良された薬物動態学的特性を持つタンパク質をもたらしている。ペガシス（登録商標）は、抱合体のインターフェロンα−２ａ及び４０ｋＤの分枝鎖のモノ−メトキシＰＥＧであり、ペグ−イントロン（登録商標）は、インターフェロンα−２ｂ及び１２ｋＤのモノ−メトキシＰＥＧの抱合体である（Ｂ．Ａ．Ｌｕｘｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｃｌｉｎ．Ｔｈｅｒａｐ．２００２ ２４（９）：１３６３１３８３；Ａ．Ｋｏｚｌｏｗｓｋｉ ａｎｄ Ｊ．Ｍ．Ｈａｒｒｉｓ，Ｊ．Ｃｏｎｔｒｏｌ．Ｒｅｌｅａｓｅ，２００１ ７２：２１７−２２４）。
【００１４】
インターフェロンα−２ａ及びインターフェロンα−２ｂは、現時点でＨＣＶの治療のための単剤療法として認可されている。ロフェロン−Ａ（登録商標）（Ｒｏｃｈｅ）は、インターフェロンα−２ａの組換え形態である。ペガシス（登録商標）（Ｒｏｃｈｅ）は、インターフェロンα−２ａのペグ化（即ちポリエチレングリコールで改変された）形態である。イントロン−Ａ（登録商標）（Ｓｃｈｅｒｉｎｇ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ）は、インターフェロンα−２ｂの組換え形態であり、そしてペグ−イントロン（登録商標）（Ｓｃｈｅｒｉｎｇ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ）は、インターフェロンα−２ｂのペグ化形態である。
【００１５】
インターフェロンα、並びにインターフェロンβ、γ、τ及びωの他の形態は、現時点においてＨＣＶの治療のための臨床開発中である。例えば、ＩｎｔｅｒＭｕｎｅによるＩｎｆｅｒｇｅｎ（登録商標）（インターフェロンアルファコン（ａｌｆａｃｏｎ）−１）、ＶｉｒａｇｅｎによるＯｍｎｉｆｅｒｏｎ（登録商標）（天然のインターフェロン）、Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｏｍｅ ＳｃｉｅｎｃｅｓによるＡｌｂｕｆｅｒｏｎ（登録商標）、Ａｒｅｓ−ＳｅｒｏｎｏによるＲｅｂｉｆ（登録商標）（インターフェロンβ−１ａ）、ＢｉｏＭｅｄｉｃｉｎｅによるオメガインターフェロン、Ａｍａｒｉｌｌｏ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓによる経口インターフェロンアルファ、ＢＭＳ／Ｚｙｍｏｇｅｎｅｔｉｃｓによるペグ化インターフェロンλ１／ＩＬ−２９及びＩｎｔｅｒＭｕｎｅによるインターフェロンγ、インターフェロンτ、及びインターフェロンγ−１ｂは、開発中である。
【００１６】
リバビリン及びインターフェロン−αによるＨＣＶの組合せ療法は、現時点で最適な療法である。組合せたリバビリン及びＰｅｇ（下記）は、５４−５６％の患者において持続性ウイルス陰性化（ＳＶＲ）をもたらす。ＳＶＲは、２型及び３型ＨＣＶに対して８０％に近づく（上掲Ｗａｌｋｅｒ）。不幸なことに、この組み合わせは、更に臨床的挑戦を中止させる副作用を生じる。鬱病、風邪様症状及び皮膚の反応が、皮下のＩＦＮ−αに伴い、そして溶血性貧血が、リバビリンによる持続治療に伴う。
【００１７】
抗ＨＣＶ治療剤としての薬物の開発のための、制約されるものではないが、ＮＳ２−ＮＳ３自己プロテアーゼ、Ｎ３プロテアーゼ、Ｎ３ヘリカーゼ及びＮＳ５Ｂポリメラーゼを含む多くの潜在的分子標的がいまや確認されている。ＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼは、一本鎖プラスセンスのＲＮＡゲノムの複製のために絶対的に必須であり、そしてこの酵素は、医薬品化学者中で有意な興味を誘発している。
【００１８】
ＮＳ５Ｂポリメラーゼのヌクレオシド阻害剤は、連鎖停止をもたらす非天然の基質又はポリメラーゼに結合するヌクレオチドと競合する競合阻害剤のいずれかとして作用することができる。ある種のＮＳ５Ｂポリメラーゼヌクレオシドの阻害剤が、以下の出願公開中に開示され、これらの全ては全体として本明細書中に参考文献として援用される。
【００１９】
【化２】
【００２０】
２００１年１１月２９日に公開されたＷＯ０１ ９０１２１において、Ｊ．−Ｐ．Ｓｏｍｍａｄｏｓｓｉ及びＰ．Ｌａｃｏｌｌａは、式２及び３の１’−アルキル−及び２’−アルキルヌクレオシドの抗−ＨＣＶポリメラーゼ活性を開示し、そして例示している。２００１年１２月６日に公開されたＷＯ０１／９２２８２において、Ｊ．−Ｐ．Ｓｏｍｍａｄｏｓｓｉ及びＰ．Ｌａｃｏｌｌａは、式２、及び３の１’−アルキル−及び２’−アルキルヌクレオシドによりＦｌａｖｉｖｉｒｕｓｅｓ及びＰｅｓｔｉｖｉｒｕｓｅｓの治療を開示し、そして例示している。２００３年４月３日に公開されたＷＯ０３／０２６６７５において、Ｇ．Ｇｏｓｓｅｌｉｎは、Ｆｌａｖｉｖｉｒｕｓｅｓ及びＰｅｓｔｉｖｉｒｕｓｅｓを治療するための４’−アルキルヌクレオシド４を開示している。
【００２１】
２００４年１月８日に公開されたＷＯ２００４００３０００において、Ｊ．−Ｐ．Ｓｏｍｍａｄｏｓｓｉ ｅｔ ａｌ．は、１’−、２’−、３’−及び４’−置換されたβ−Ｄ及びβ−Ｌヌクレオシドの２’−及び３’プロドラッグを開示している。２００４年１月８日に公開されたＷＯ２００４／００２４２２において、Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ感染の治療のための２’−Ｃ−メチル−３’−Ｏ−バリンエステルリボフラネシルシチジン。Ｉｄｅｎｉｘは、シチジン類似体２（Ｂ＝シトシン）のバリンエステル５であると信じられる関連する化合物ＮＭ２８３に対する臨床試験を報告している。２００４年１月８日に公開されたＷＯ２００４／００２９９９において、Ｊ．−Ｐ．Ｓｏｍｍａｄｏｓｓｉ ｅｔ ａｌ．は、ＨＣＶ感染を含むフラビウイルス感染の治療のための１’、２’、３’、又は４’分枝のヌクレオシドの一連の２’、又は３’プロドラッグを開示している。
【００２２】
２００４年６月３日に公開されたＷＯ２００４／０４６３３１において、Ｊ．−Ｐ．Ｓｏｍｍａｄｏｓｓｉ ｅｔ ａｌ．は、２’−分枝ヌクレオシド及びＦｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ変異を開示している。２００３年４月３日に公開されたＷＯ０３／０２６５８９ において、Ｇ．Ｇｏｓｓｅｌｉｎ ｅｔ ａｌ．は、４’−改変ヌクレオシドを使用するＣ型肝炎ウイルスを治療する方法を開示している。２００５年２月３日に公開されたＷＯ２００５００９４１８において、Ｒ．Ｓｔｏｒｅｒ ｅｔ ａｌ．は、ＨＣＶを含むＦｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅによって起こされた疾病の治療のためのプリンヌクレオシド類似体を開示している。
【００２３】
他の特許出願は、Ｃ型肝炎ウイルス感染を治療するためのある種のヌクレオシド類似体の使用を開示している。２００１年５月１０日公開のＷＯ０１／３２１５３において、Ｒ．Ｓｔｏｒｅｒは、ウイルス性疾病を治療するためのヌクレオシド誘導体を開示している。２００１年８月２３日公開のＷＯ０１／６０３１５において、Ｈ．Ｉｓｍａｉｌｉ ｅｔ ａｌ．は、ヌクレオシド化合物によるフラビウイルス感染の治療又は予防の方法を開示している。２００２年３月７日に公開されたＷＯ０２／１８４０４において、Ｒ．Ｄｅｖｏｓ ｅｔ ａｌ．は、ＨＣＶウイルスを治療するための４’−置換ヌクレオチドを開示している。２００１年１０月２５日に公開されたＷＯ０１／７９２４６において、Ｋ．Ａ．Ｗａｔａｎａｂｅは、ウイルス性疾病の治療のための２’−又は３’−ヒドロキシメチルヌクレオシド化合物を開示している。２００２年４月２５日公開のＷＯ０２／３２９２０及び２００２年６月２０日に公開されたＷＯ０２／４８１６５において、Ｌ．Ｓｔｕｙｖｅｒ ｅｔ ａｌ．は、ウイルス性疾病の治療のためのヌクレオシド化合を開示している。
【００２４】
【化３】
【００２５】
２００３年１２月２４日に公開されたＷＯ０３／１０５７７０において、Ｂ．Ｂｈａｔ ｅｔ ａｌ．は、ＨＣＶ感染の治療のために有用である一連のカルボキシヌクレオシド誘導体を開示している。２００３年１月２２日に公開されたＷＯ２００４／００７５１２において、Ｂ．Ｂｈａｔ ｅｔ ａｌ．は、ＲＮＡ−依存性ＲＮＡウイルスポリメラーゼを阻害するヌクレオシド化合物を開示している。この公開中で開示されているヌクレオシドは、主として２’−メチル−２’−ヒドロキシ置換のヌクレオシドである。２００２ 年７月２５日に公開されたＷＯ２００２／０５７４２５において、Ｓ．Ｓ．Ｃａｒｒｏｌｌ ｅｔ ａｌ．は、ＲＮＡ−依存性ウイルスポリメラーゼの阻害剤であるヌクレオシド誘導体を開示している。２００２年７月２５日に公開されたＷＯ０２／０５７２８７において、Ｓ．Ｓ．Ｃａｒｒｏｌｌ ｅｔ ａｌ．は、塩基が所望により置換されていてもよい７Ｈ−ピロロ［２，３−ｄ］ピリミジンラジカル６である関連する２α−メチル及び２β−メチルリボース誘導体を開示している。同一出願は、３β−メチルヌクレオシドの一つの例を開示している。Ｓ．Ｓ．Ｃａｒｒｏｌｌ ｅｔ ａｌ．（Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２００３ ２７８（１４）：１１９７９−１１９８４）は、２’−Ｏ−メチルシチジン（６ａ）によるＨＣＶポリメラーゼの阻害を開示している。２００４年１月２９日に公開されたＷＯ２００４／００９０２０において、Ｄ．Ｂ．Ｏｌｓｅｎ ｅｔ ａｌ．は、ＲＮＡ依存性ＲＮＡウイルスポリメラーゼの阻害剤としての一連のチオヌクレオシド誘導体を開示している。
【００２６】
“２’−フルオロヌクレオシド”の表題のＥｍｏｒｙ大学へのＰＣＴ公開第ＷＯ９９／４３６９１は、ＨＣＶを治療するためのある種の２’−フルオロヌクレオシドの使用を開示している。“２’−フルオロヌクレオシド”の表題のＥｍｏｒｙ大学への米国特許第６，３４８，５８７号は、Ｂ型肝炎、ＨＣＶ、ＨＩＶ及び異常な細胞増殖の治療のために有用な２’−フルオロヌクレオシドのファミリーを開示している。２’−フルオロ置換基の両方の立体配置が開示されている。
【００２７】
Ｅｌｄｒｕｐ ｅｔ ａｌ．（Ｏｒａｌ Ｓｅｓｓｉｏｎ Ｖ，Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ Ｖｉｒｕｓ，Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ；１６ｔｈ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｏｎｆｅｒｅｎｃｅ ｏｎ Ａｎｔｉｖｉｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ（Ａｐｒ．２７，２００３，Ｓａｖａｎｎａｈ，Ｇａ．））は、ＨＣＶの阻害のための２’−改変ヌクレオシドの構造活性の関係を記載している。
【００２８】
Ｂｈａｔ ｅｔ ａｌ．（Ｏｒａｌ Ｓｅｓｓｉｏｎ Ｖ，Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ Ｖｉｒｕｓ，Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ；１６ｔｈ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｏｎｆｅｒｅｎｃｅ ｏｎ Ａｎｔｉｖｉｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ（Ａｐｒ．２７，２００３，Ｓａｖａｎｎａｈ，Ｇａ．）；ｐ Ａ７５）は、ＨＣＶのＲＮＡ複製の可能性のある阻害剤としてのヌクレオシド誘導体の合成及び薬物動力学的特性を記載している。著者は、２’−改変ヌクレオシドが、細胞ベースのレプリコンアッセイにおける強力な阻害活性を証明することを報告している。
【００２９】
Ｏｌｓｅｎ ｅｔ ａｌ．（Ｏｒａｌ Ｓｅｓｓｉｏｎ Ｖ，Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ Ｖｉｒｕｓ，Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ；１６ｔｈ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｏｎｆｅｒｅｎｃｅ ｏｎ Ａｎｔｉｖｉｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ（Ａｐｒ．２７，２００３，Ｓａｖａｎｎａｈ，Ｇａ．）ｐ Ａ７６）は、更にＨＣＶのＲＮＡ複製における２’−改変ヌクレオシドの効果を記載している。
【００３０】
非ヌクレオシドのＨＣＶのＮＳ５Ｂ阻害剤の幾つかの群が記載され、そして本明細書中に参考文献としてその全てが援用され、それらは以下を含む：ベンゾイミダゾール（Ｈ．Ｈａｓｈｉｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０１／４７８３３， Ｈ．Ｈａｓｈｉｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０３／０００２５４，Ｐ．Ｌ．Ｂｅａｕｌｉｅｕ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０３／０２０２４０Ａ２；Ｐ．Ｌ．Ｂｅａｕｌｉｅｕ ｅｔ ａｌ．ＵＳ６，４４８，２８１Ｂ１；Ｐ．Ｌ．Ｂｅａｕｌｉｅｕ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０３／００７９４５Ａ１）；インドール、（Ｐ．Ｌ．Ｂｅａｕｌｉｅｕ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０３／００１０１４１Ａ２；ベンゾチアジアジン、例えば７、（Ｄ．Ｄｈａｎａｋ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０１／８５１７２Ａ１；Ｄ．Ｄｈａｎａｋ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０３／０３７２６２Ａ２；Ｋ．Ｊ．Ｄｕｆｆｙ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０３／０９９８０１Ａ１，Ｄ．Ｃｈａｉｅｔ ａｌ．ＷＯ２００４０５２３１２，Ｄ．Ｃｈａｉ ｅｔ ａｌ．ＷＯ２００４０５２３１３，Ｄ．Ｃｈａｉ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０２／０９８４２４，Ｊ．Ｋ．Ｐｒａｔｔ ｅｔ ａｌ．ＷＯ２００４／０４１８１８Ａ１；Ｊ．Ｋ．Ｐｒａｔｔ ｅｔ ａｌ．ＷＯ２００４／０８７５７７Ａ１）、チオフェン、例えば８、（Ｃ．Ｋ．Ｃｈａｎ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０２／１００８５１）；
【００３１】
【化４】
【００３２】
ベンゾチオフェン（Ｄ．Ｃ．Ｙｏｕｎｇ ａｎｄ Ｔ．Ｒ．Ｂａｉｌｅｙ ＷＯ００／１８２３１）；β−ケトピルビン酸（Ｓ．Ａｔｔａｍｕｒａ ｅｔ ａｌ．米国特許第６，４９２，４２３Ｂ１号，Ａ．Ａｔｔａｍｕｒａ ｅｔ ａｌ．ＷＯ００／０６５２９）；ピリミジン（Ｃ．Ｇａｒｄｅｌｌｉ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０２／０６２４６Ａ１）；ピリミジンジオン（Ｔ．Ｒ．Ｂａｉｌｅｙ ａｎｄ Ｄ．Ｃ．Ｙｏｕｎｇ ＷＯ００／１３７０８）；トリアジン（Ｋ．−Ｈ．Ｃｈｕｎｇ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０２／０７９１８７Ａ１）； ローダミン誘導体（Ｔ．Ｒ．Ｂａｉｌｅｙ ａｎｄ Ｄ．Ｃ．Ｙｏｕｎｇ ＷＯ００／１０５７３，Ｊ．Ｃ．Ｊｅａｎ ｅｔ ａｌ．ＷＯ０１／７７０９１Ａ２）；２，４−ジオキソピラン（Ｒ．Ａ．Ｌｏｖｅ ｅｔ ａｌ．欧州特許第２５６６２８Ａ２号）；フェニルアラニン誘導体（Ｍ．Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２００３ ２７８：２４８９−２４９５）。
【００３３】
ヌクレオシド誘導体は、しばしば強力な抗ウイルス性（例えば、ＨＩＶ、ＨＣＶ、単純ヘルペス、ＣＭＶ）及び抗癌性化学療法剤である。不幸にも、これらの実際的使用は、二つの因子によってしばしば制約される。第一に、不良な薬物動態学的特性は、しばしば腸からのヌクレオシドの吸収を、そしてヌクレオシド誘導体の細胞内濃度を制約し、そして第２に、最適以下の物理的特性は、活性成分の供給を促進するために使用することができる処方の選択肢を制限する。
【００３４】
Ａｌｂｅｒｔは、固有の生物学的活性に欠けるが、しかし活性な薬物物質への代謝的転換が可能である化合物を記載するためにプロドラッグの用語を導入した（Ａ．Ａｌｂｅｒｔ，Ｓｅｌｅｃｔｉｖｅ Ｔｏｘｉｃｉｔｙ，Ｃｈａｐｍａｎ ａｎｄ Ｈａｌｌ，Ｌｏｎｄｏｎ，１９５１）。プロドラッグは、最近再考察されている（Ｐ．Ｅｔｔｍａｙｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｅｄ Ｃｈｅｍ．２００４ ４７（１０）：２３９３−２４０４；Ｋ．Ｂｅａｕｍｏｎｔ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒ．Ｄｒｕｇ Ｍｅｔａｂ．２００３ ４：４６１−４８５；Ｈ．Ｂｕｎｄｇａａｒｄ，Ｄｅｓｉｇｎ ｏｆ Ｐｒｏｄｒｕｇｓ：Ｂｉｏｒｅｖｅｒｓｉｂｌｅ ｄｅｒｉｖａｔｉｖｅｓ ｆｏｒ ｖａｒｉｏｕｓ ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ｇｒｏｕｐｓ ａｎｄ ｃｈｅｍｉｃａｌ ｅｎｔｉｔｉｅｓ ｉｎ Ｄｅｓｉｇｎ ｏｆ Ｐｒｏｄｒｕｇｓ，Ｈ．Ｂｕｎｄｇａａｒｄ ｅｄ）Ｅｌｓｅｖｉｅｒ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，Ａｍｅｒｓｔｅｒｄａｍ １９８５；Ｇ．Ｍ．Ｐａｕｌｅｔｔｉ ｅｔ ａｌ．Ａｄｖ．Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖ．Ｒｅｖ．１９９７ ２７：２３５−２５６；Ｒ．Ｊ．Ｊｏｎｅｓ ａｎｄ Ｎ．Ｂｉｓｃｈｏｆｂｅｒｇｅｒ，Ａｎｔｉｖｉｒａｌ Ｒｅｓ．１９９５ ２７；１−１５及びＣ．Ｒ．Ｗａｇｎｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｄ．Ｒｅｓ．Ｒｅｖ．２０００ ２０：４１７−４５）。代謝的転換は、特異的酵素、しばしばヒドロラーゼによって触媒されるが、活性化合物は、更に非特異的化学過程によって発生することもできる。
【００３５】
医薬的に受容可能なプロドラッグは、代謝されて、例えば宿主内で加水分解又は酸化されて、本発明の化合物を形成する化合物を指す。生物変換は、毒物学的責任を伴う断片の形成を回避しなければならない。プロドラッグの典型的な例は、活性化合物の官能性分子に連結する生物学的に不安定な保護基を有する化合物を含む。糖分子のヒドロキシ基（単数又は複数）のアルキル化、アシル化又は他の親油性改変は、プロヌクレオチドの設計において使用されている。これらのプロヌクレオチドは、ｉｎ ｖｉｖｏで加水分解又は脱アルキルされて、活性化合物を発生することができる。
【００３６】
経口の生体利用率をしばしば制約する因子は、消化管からの吸収並びに腸壁及び肝臓による初回通過の排出である。ＧＩ管を通る経細胞吸収の最適化は、ゼロより大きいＤ（７．４）を必要とする。然しながら、分配係数の最適化は、成功を確約しない。プロドラッグは、腸細胞中の活性な排出輸送を回避しなければならないことがあり得る。腸細胞中の細胞内代謝は、代謝産物の腸の管腔へ戻る排出ポンプによる受動輸送又は能動輸送をもたらすことができる。プロドラッグは、更に標的細胞又は受容体に到達する前に、血液中の好ましくない生体内変換に耐性でなければならない。
【００３７】
仮想のプロドラッグは、分子中に存在する化学的官能基に基づき、時に合理的に設計することができるが、活性化合物の化学的改変は、親化合物には非存在の好ましくない物理的、化学的及び生物学的特性を示すことができる完全に新しい分子の実体を製造する。代謝産物の確認試験に対する法的な要求事項は、多数の経路が複数の代謝産物に導く場合、難題をもたらす。従って、プロドラッグの確認試験は、不確定な、そして困難な課題であるままである。更に、潜在的なプロドラッグの薬物動態学的特性を評価することは、困難であり、そして高価な努力である。動物モデルからの薬物動態学的結果をヒトに外挿することは、困難であり得る。
【００３８】
最近、Ｃ型肝炎ウイルスの遺伝子型１（ＨＣＶ−１）又は遺伝子型４（ＨＣＶ−４）に感染した患者において、患者のＨＣＶのＲＮＡレベルが、治療後２週間程度の短期間に検出不可能となる場合、インターフェロンアルファ、リバビリン及びＨＣＶポリメラーゼ阻害剤（三剤併用療法）を含む治療に対する有益な反応を、予測することができることが発見された。２週目の急速ウイルス陰性化（ＲＶＲ２）を示し、そして三剤併用療法の治療の終了における持続性ウイルス陰性化（ＳＶＲ）を達成する患者間の相関は、共同所有される２００８年１２月１８日に出願された米国特許出願ＵＳＳＮ６１／１３８，５８５中に開示され、これは、本明細書中にその全てが参考文献として援用される。
【先行技術文献】
【特許文献】
【００３９】
【特許文献１】ＷＯ９７／１２０３３；
【特許文献２】ＷＯ０１ ９０１２１；
【特許文献３】ＷＯ０１／９２２８２；
【特許文献４】ＷＯ０３／０２６６７５；
【特許文献５】ＷＯ２００４００３０００；
【特許文献６】ＷＯ２００４／００２４２２；
【特許文献７】ＷＯ２００４／００２９９９；
【特許文献８】ＷＯ２００４／０４６３３１；
【特許文献９】ＷＯ０３／０２６５８９；
【特許文献１０】ＷＯ２００５００９４１８；
【特許文献１１】ＷＯ０１／３２１５３；
【特許文献１２】ＷＯ０１／６０３１５；
【特許文献１３】ＷＯ０２／１８４０４；
【特許文献１４】ＷＯ０１／７９２４６；
【特許文献１５】ＷＯ０２／３２９２０；
【特許文献１６】ＷＯ０２／４８１６５；
【特許文献１７】ＷＯ０３／１０５７７０；
【特許文献１８】ＷＯ２００４／００７５１２；
【特許文献１９】ＷＯ２００２／０５７４２５；
【特許文献２０】ＷＯ０２／０５７２８７；
【特許文献２１】ＷＯ２００４／００９０２０；
【特許文献２２】ＷＯ９９／４３６９１；
【特許文献２３】米国特許第６，３４８，５８７号；
【特許文献２４】ＷＯ０１／４７８３３；
【特許文献２５】ＷＯ０３／０００２５４；
【特許文献２６】ＷＯ０３／０２０２４０Ａ２；
【特許文献２７】米国特許６，４４８，２８１Ｂ１号；
【特許文献２８】ＷＯ０３／００７９４５Ａ１；
【特許文献２９】ＷＯ０３／００１０１４１Ａ２；
【特許文献３０】ＷＯ０１／８５１７２Ａ１；
【特許文献３１】ＷＯ０３／０３７２６２Ａ２；
【特許文献３２】ＷＯ０３／０９９８０１Ａ１；
【特許文献３３】ＷＯ２００４０５２３１２；
【特許文献３４】ＷＯ２００４０５２３１３；
【特許文献３５】ＷＯ０２／０９８４２４；
【特許文献３６】ＷＯ２００４／０４１８１８Ａ１；
【特許文献３７】ＷＯ２００４／０８７５７７Ａ１；
【特許文献３８】ＷＯ０２／１００８５１；
【特許文献３９】ＷＯ００／１８２３１；
【特許文献４０】米国特許第６，４９２，４２３Ｂ１号；
【特許文献４１】ＷＯ００／０６５２９；
【特許文献４２】ＷＯ０２／０６２４６Ａ１；
【特許文献４３】ＷＯ００／１３７０８；
【特許文献４４】ＷＯ０２／０７９１８７Ａ１；
【特許文献４５】ＷＯ００／１０５７３；
【特許文献４６】ＷＯ０１／７７０９１Ａ２；
【特許文献４７】欧州特許第２５６６２８Ａ２号；
【特許文献４８】米国特許出願ＵＳＳＮ６１／１３８，５８５。
【非特許文献】
【００４０】
【非特許文献１】Ｂｏｙｅｒ，Ｎ．ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｈｅｐａｔｏｌ．２０００ ３２：９８−１１２；
【非特許文献２】Ｒｉｃｅ，Ｃ．Ｍ．，Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ：Ｔｈｅ ｖｉｒｕｓｅｓ ａｎｄ ｔｈｅｉｒ ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ，ｉｎ：Ｆｉｅｌｄｓ Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，Ｅｄｉｔｏｒｓ：Ｆｉｅｌｄｓ，Ｂ．Ｎ．，Ｋｎｉｐｅ，Ｄ．Ｍ．，ａｎｄ Ｈｏｗｌｅｙ，Ｐ．Ｍ．，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ−Ｒａｖｅｎ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ，Ｐａ．，Ｃｈａｐｔｅｒ ３０，９３１−９５９，１９９６；
【非特許文献３】Ｓｉｍｍｏｎｄｓ，Ｐ．２００４ Ｊ．Ｇｅｎ．Ｖｉｒｏｌ．８５：３１７３−８８；
【非特許文献４】Ｘ．Ｆｏｒｎｓ ａｎｄ Ｊ．Ｂｕｋｈ，Ｃｌｉｎｉｃｓ ｉｎ Ｌｉｖｅｒ Ｄｉｓｅａｓｅ １９９９ ３：６９３−７１６；
【非特許文献５】Ｊ．Ｂｕｋｈ ｅｔ ａｌ．，Ｓｅｍｉｎ．Ｌｉｖ．Ｄｉｓ．１９９５ １５：４１−６３；
【非特許文献６】Ｎ．Ｎ．Ｚｅｉｎ，Ｃｌｉｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｒｅｖ．，２０００ １３：２２３−２３５；
【非特許文献８】Ｇｏｒｂａｌｅｎｙａ ｅｔ ａｌ．Ｎａｔｕｒｅ １９８８ ３３３：２２；Ｂａｚａｎ ａｎｄ Ｆｌｅｔｔｅｒｉｃｋ Ｖｉｒｏｌｏｇｙ １９８９ １７１：６３７−６３９；
【非特許文献９】Ｇｏｒｂａｌｅｎｙａ ｅｔ ａｌ．Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｒｅｓ．１９８９ １７．３８８９−３８９７；
【非特許文献１０】Ｋｏｏｎｉｎ，Ｅ．Ｖ．ａｎｄ Ｄｏｌｊａ，Ｖ．Ｖ．Ｃｒｉｔ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｍｏｌｅｃ．Ｂｉｏｌ．１９９３ ２８：３７５−４３０；
【非特許文献１１】Ｗｉｓｋｅｒｃｈｅｎ ａｎｄ Ｃｏｌｌｅｔｔ Ｖｉｒｏｌｏｇｙ １９９１ １８４：３４１−３５０；
【非特許文献１２】Ｂａｒｔｅｎｓｃｈｌａｇｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９３ ６７：３８３５−３８４４；
【非特許文献１３】Ｅｃｋａｒｔ ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍ．１９９３ １９２：３９９−４０６；
【非特許文献１４】Ｇｒａｋｏｕｉ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９３ ６７：２８３２−２８４３；
【非特許文献１５】Ｇｒａｋｏｕｉ ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ １９９３ ９０：１０５８３−１０５８７；
【非特許文献１６】Ｉｌｉｊｉｋａｔａ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９３ ６７：４６６５−４６７５；
【非特許文献１７】Ｔｏｍｅ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９３ ６７：４０１７−４０２６；
【非特許文献１８】Ｂａｒｔｅｎｓｃｈｌａｇｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９４ ６８：５０４５−５０５５；
【非特許文献１９】Ｆａｉｌｌａ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９４ ６８：３７５３−３７６０；
【非特許文献２０】Ｘｕ ｅｔ ａｌ．Ｊ Ｖｉｒｏｌ．１９９７ ７１：５３ １２−５３２２；
【非特許文献２１】Ｋｉｍ ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍ．１９９５ ２１５：１６０−１６６；
【非特許文献２２】Ｊｉｎ ａｎｄ Ｐｅｔｅｒｓｏｎ Ａｒｃｈ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．１９９５，３２３：４７−５３；
【非特許文献２３】Ｗａｒｒｅｎｅｒ ａｎｄ Ｃｏｌｌｅｔｔ Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９５ ６９：１７２０−１７２６；
【非特許文献２４】Ｂｅｈｒｅｎｓ ｅｔ ａｌ．ＥＭＢＯ １９９６ １５：１２−２２；
【非特許文献２５】Ｌｅｃｈｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９７ ７１：８４１６−８４２８；
【非特許文献２６】Ｙｕａｎ ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍ．１９９７ ２３２：２３１−２３５；
【非特許文献２７】Ｚｈｏｎｇ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．１９９８ ７２：９３６５−９３６９；
【非特許文献２８】Ｒ．Ｇ．Ｇｉｓｈ，Ｓｅｍ．Ｌｉｖｅｒ．Ｄｉｓ．，１９９９ １９：５；
【非特許文献２９】Ｄｉ Ｂｅｓｃｅｇｌｉｅ，Ａ．Ｍ．ａｎｄ Ｂａｃｏｎ，Ｂ．Ｒ．，Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ａｍｅｒｉｃａｎ，Ｏｃｔｏｂｅｒ：１９９９ ８０−８５；
【非特許文献３０】Ｇ．Ｌａｋｅ−Ｂａｋａａｒ，Ｃｕｒｒｅｎｔ ａｎｄ Ｆｕｔｕｒｅ Ｔｈｅｒａｐｙ ｆｏｒ Ｃｈｒｏｎｉｃ Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ Ｖｉｒｕｓ Ｌｉｖｅｒ Ｄｉｓｅａｓｅ，Ｃｕｒｒ．Ｄｒｕｇ Ｔａｒｇ．Ｉｎｆｅｃｔ Ｄｉｓ．２００３ ３（３）：２４７−２５３；
【非特許文献３１】Ｐ．Ｈｏｆｆｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，Ｒｅｃｅｎｔ ｐａｔｅｎｔｓ ｏｎ ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ ｔｈｅｒａｐｙ ｆｏｒ ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ（１９９９−２００２），Ｅｘｐ．Ｏｐｉｎ．Ｔｈｅｒ．Ｐａｔｅｎｔｓ ２００３ １３（１１）：１７０７−１７２３；
【非特許文献３２】Ｆ．Ｆ．Ｐｏｏｒｄａｄ ｅｔ ａｌ．Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｓ ｉｎ Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｔｈｅｒａｐｙ ｄｕｒｉｎｇ ２０００−２００２，Ｅｘｐ．Ｏｐｉｎ．Ｅｍｅｒｇｉｎｇ Ｄｒｕｇｓ ２００３ ８（１）：９−２５；
【非特許文献３３】Ｍ．Ｐ．Ｗａｌｋｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｍｉｓｉｎｇ Ｃａｎｄｉｄａｔｅｓ ｆｏｒ ｔｈｅ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｏｆ ｃｈｒｏｎｉｃ ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ，Ｅｘｐ．Ｏｐｉｎ．Ｉｎｖｅｓｔｉｇ．Ｄｒｕｇｓ ２００３ １２（８）：１２６９−１２８０；
【非特許文献３４】Ｓ．−Ｌ．Ｔａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ：Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｓｔａｔｕｓ ａｎｄ Ｅｍｅｒｇｉｎｇ Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ，Ｎａｔｕｒｅ Ｒｅｖ．Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖ．２００２ １：８６７−８８１；
【非特許文献３５】Ｒ．Ｄｅ Ｆｒａｎｃｅｓｃｏ ｅｔ ａｌ．Ａｐｐｒｏａｃｈｉｎｇ ａ ｎｅｗ ｅｒａ ｆｏｒ ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ ｔｈｅｒａｐｙ：ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ ｏｆ ｔｈｅ ＮＳ３−４Ａ ｓｅｒｉｎｅ ｐｒｏｔｅａｓｅ ａｎｄ ｔｈｅ ＮＳ５Ｂ ＲＮＡ−ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ＲＮＡ ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ，Ａｎｔｉｖｉｒａｌ Ｒｅｓ．２００３ ５８：１−１６；
【非特許文献３６】Ｑ．Ｍ．Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ．Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ ｖｉｒｕｓ ｅｎｃｏｄｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎｓ：ｔａｒｇｅｔｓ ｆｏｒ ａｎｔｉｖｉｒａｌ ｔｈｅｒａｐｙ， Ｄｒｕｇｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｆｕｔｕｒｅ ２０００ ２５（９）：９３３−８−９４４；
【非特許文献３７】Ｊ．Ａ．Ｗｕ ａｎｄ Ｚ．Ｈｏｎｇ，Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ ＮＳ５Ｂ−Ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ＲＮＡ Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ ｆｏｒ Ａｎｔｉ−ＨＣＶ Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒａｐｙ Ｃｕｒ．Ｄｒｕｇ Ｔａｒｇ．−Ｉｎｆ．Ｄｉｓ．２００３ ３：０７−２１９；
【非特許文献３８】Ｇａｒｙ Ｌ．Ｄａｖｉｓ，Ｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌｏｇｙ ２０００ １１８：Ｓ１０４−Ｓ１１４；
【非特許文献３９】Ｂ．Ａ．Ｌｕｘｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｃｌｉｎ．Ｔｈｅｒａｐ．２００２ ２４（９）：１３６３１３８３；
【非特許文献４０】Ａ．Ｋｏｚｌｏｗｓｋｉ ａｎｄ Ｊ．Ｍ．Ｈａｒｒｉｓ，Ｊ．Ｃｏｎｔｒｏｌ．Ｒｅｌｅａｓｅ，２００１ ７２：２１７−２２４；
【非特許文献４１】Ｓ．Ｓ．Ｃａｒｒｏｌｌ ｅｔ ａｌ．（Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２００３ ２７８（１４）：１１９７９−１１９８４）；
【非特許文献４２】Ｅｌｄｒｕｐ ｅｔ ａｌ．（Ｏｒａｌ Ｓｅｓｓｉｏｎ Ｖ，Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ Ｖｉｒｕｓ，Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ；１６ｔｈ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｏｎｆｅｒｅｎｃｅ ｏｎ Ａｎｔｉｖｉｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ（Ａｐｒ．２７，２００３，Ｓａｖａｎｎａｈ，Ｇａ．））；
【非特許文献４３】Ｂｈａｔ ｅｔ ａｌ．（Ｏｒａｌ Ｓｅｓｓｉｏｎ Ｖ，Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ Ｖｉｒｕｓ，Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ；１６ｔｈ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｏｎｆｅｒｅｎｃｅ ｏｎ Ａｎｔｉｖｉｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ（Ａｐｒ．２７，２００３，Ｓａｖａｎｎａｈ，Ｇａ．）；ｐ Ａ７５）；
【非特許文献４４】Ｏｌｓｅｎ ｅｔ ａｌ．（Ｏｒａｌ Ｓｅｓｓｉｏｎ Ｖ，Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ Ｃ Ｖｉｒｕｓ，Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ；１６ｔｈ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｏｎｆｅｒｅｎｃｅ ｏｎ Ａｎｔｉｖｉｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ（Ａｐｒ．２７，２００３，Ｓａｖａｎｎａｈ，Ｇａ．）ｐ Ａ７６）；
【非特許文献４５】Ｍ．Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２００３ ２７８：２４８９−２４９５；
【非特許文献４６】Ａ．Ａｌｂｅｒｔ，Ｓｅｌｅｃｔｉｖｅ Ｔｏｘｉｃｉｔｙ，Ｃｈａｐｍａｎ ａｎｄ Ｈａｌｌ，Ｌｏｎｄｏｎ，１９５１；
【非特許文献４７】Ｐ．Ｅｔｔｍａｙｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｅｄ Ｃｈｅｍ．２００４ ４７（１０）：２３９３−２４０４；
【非特許文献４８】Ｋ．Ｂｅａｕｍｏｎｔ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒ．Ｄｒｕｇ Ｍｅｔａｂ．２００３ ４：４６１−４８５；
【非特許文献４９】Ｈ．Ｂｕｎｄｇａａｒｄ，Ｄｅｓｉｇｎ ｏｆ Ｐｒｏｄｒｕｇｓ：Ｂｉｏｒｅｖｅｒｓｉｂｌｅ ｄｅｒｉｖａｔｉｖｅｓ ｆｏｒ ｖａｒｉｏｕｓ ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ｇｒｏｕｐｓ ａｎｄ ｃｈｅｍｉｃａｌ ｅｎｔｉｔｉｅｓ ｉｎ Ｄｅｓｉｇｎ ｏｆ Ｐｒｏｄｒｕｇｓ，Ｈ．Ｂｕｎｄｇａａｒｄ ｅｄ）Ｅｌｓｅｖｉｅｒ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，Ａｍｅｒｓｔｅｒｄａｍ １９８５；
【非特許文献５０】Ｇ．Ｍ．Ｐａｕｌｅｔｔｉ ｅｔ ａｌ．Ａｄｖ．Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖ．Ｒｅｖ．１９９７ ２７：２３５−２５６；
【非特許文献５１】Ｒ．Ｊ．Ｊｏｎｅｓ ａｎｄ Ｎ．Ｂｉｓｃｈｏｆｂｅｒｇｅｒ，Ａｎｔｉｖｉｒａｌ Ｒｅｓ．１９９５ ２７；１−１５；
【非特許文献５２】Ｃ．Ｒ．Ｗａｇｎｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｄ．Ｒｅｓ．Ｒｅｖ．２０００ ２０：４１７−４５。
【発明の概要】
【００４１】
本発明は、ペグ化ＩＦＮ及びリバビリンとの組合せにおけるＨＣＶのＲＮＡポリメラーゼ阻害剤の三剤併用療法の治療を受けているＣ型肝炎ウイルスの遺伝子型１（ＨＣＶ−１）又は遺伝子型４のＨＣＶ（ＨＣＶ−４）に感染した患者において、ある種のバイオマーカーは、ＲＶＲ２を達成しつつある患者を予測することができ、これは、次に、治療の終了時の持続性ウイルス陰性化を示す患者のプラスの前兆であることの発見に基づく。
【００４２】
一つの態様において、本発明は、ＨＣＶ−１又はＨＣＶ−４に感染したヒトの患者が、インターフェロン、リバビリン及びＨＣＶのＮＳ５Ｂポリメラーゼ阻害剤による治療に対してＲＶＲ２を達成するものであることを予測するための：
（ｉ）前記治療に先だって（治療前）前記患者からの試料を得て、
（ｉｉ）前記試料中のＭＤＣ、エオタキシン、ＩＬ１０、ＴＡＲＣ、及びＭＣＰ１からなる群から選択される少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを決定し、そして
（ｉｉｉ）前記試料中の少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを、前記治療に対してＲＶＲ２を達成しなかった患者の集団の治療前の試料に由来する少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを代表する参照値と比較することを含んでなる方法を提供し；
ここにおいて、前記試料中の少なくとも一つのタンパク質の統計的に有意に高い発現レベルは、前記患者が前記治療に対してＲＶＲ２を達成するものであることの指標である。
【００４３】
もう一つの態様において、本発明は、ＨＣＶ−１又はＨＣＶ−４に感染したヒトの患者が、インターフェロン、リバビリン及びＨＣＶのＮＳ５Ｂポリメラーゼ阻害剤による治療に対してＲＶＲ２を達成するものであることを予測するための：
（ｉ）前記治療の１週間後（治療後１週目）に前記患者からの試料を得て、
（ｉｉ）前記試料中のＴＲＡＩＬ及びＩＬ１２ｐ７０からなる群から選択される少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを決定し、そして
（ｉｉｉ）前記試料中の少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを、前記治療に対してＲＶＲ２を達成しなかった患者の集団の治療後１週目の試料に由来する少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを代表する参照値と比較することを含んでなる方法を提供し；
ここにおいて、前記試料中の少なくとも一つのタンパク質の統計的に有意に高い発現レベルは、前記患者が、前記治療に対してＲＶＲ２を達成するものであることの指標である。
【００４４】
なおもう一つの態様において、本発明は、ＨＣＶ−１又はＨＣＶ−４に感染したヒトの患者が、インターフェロン、リバビリン及びＨＣＶのＮＳ５Ｂポリメラーゼ阻害剤による治療に対してＲＶＲ２を達成するものであることを予測するための：
（ｉ）前記治療に先だって（治療前）前記患者からの試料を得て、
（ｉｉ）前記試料中のＴＧＦベータ１、ＭＩＰ１ｂ、ＴＲＡＩＬ、及びＭＤＣからなる群から選択される少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを決定し、
（ｉｉｉ）前記治療の１週間後（治療後１週目）に前記患者からの試料を得て、
（ｉｖ）前記試料中のＴＧＦベータ１、ＭＩＰ１ｂ、ＴＲＡＩＬ、及びＭＤＣからなる群から選択される少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを決定し、
（ｖ）前記患者からの治療前試料及び前記患者からの治療後１週目の試料間の、少なくとも一つのタンパク質の発現レベルの差を決定し、
（ｖｉ）前記少なくとも一つのタンパク質の発現レベルの差を、前記治療に対してＲＶＲ２を達成しなかった患者の集団の、治療前の試料及び治療後１週目の試料に由来する少なくとも一つのタンパク質の発現レベルの差を代表する参照値と比較することを含んでなる方法を提供し；
ここにおいて、少なくとも一つのタンパク質の発現レベルの差の統計的に有意な変化は、前記患者が、前記治療に対してＲＶＲ２を達成するものであることの指標である。
【図面の簡単な説明】
【００４５】
【図１】図１は、ＲＯ４５８８１６１に対する、第ＩＩ期臨床試験の研究の設計を示す。
【図２】図２は、１５００ｍｇのＲＯ４５８８１６１、１８０μｇのペガシス、及びリバビリンの三剤併用療法治療を受けた、３１人のＣ群の患者のＲＶＲ２及びＳＶＲ治療の反応を示す。
【図３Ａ】図３は、０週目におけるタンパク質の発現レベル（ｐｇ／ｍｌで）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。以下：
【００４６】
【化５】
【００４７】
は、平均値であり、そして以下：
【００４８】
【化６】
【００４９】
は、中央値である。■として示した異常値は、平均及び中央値の決定に含まれなかった。
【図３Ｂ】図３は、０週目におけるタンパク質の発現レベル（ｐｇ／ｍｌで）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。
【図３Ｃ】図３は、０週目におけるタンパク質の発現レベル（ｐｇ／ｍｌで）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。
【図３Ｄ】図３は、０週目におけるタンパク質の発現レベル（ｐｇ／ｍｌで）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。
【図３Ｅ】図３は、０週目におけるタンパク質の発現レベル（ｐｇ／ｍｌで）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。
【図３Ｆ】図３は、０週目におけるタンパク質の発現レベル（ｐｇ／ｍｌで）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。
【図４Ａ】図４は、１週目におけるタンパク質の発現レベル（ｐｇ／ｍｌ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図４Ｂ】図４は、１週目におけるタンパク質の発現レベル（ｐｇ／ｍｌ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図４Ｃ】図４は、１週目におけるタンパク質の発現レベル（ｐｇ／ｍｌ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図５Ａ】図５は、０週目及び１週目間のタンパク質の発現レベルの差（Δｐｇ／ｍｌ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図５Ｂ】図５は、０週目及び１週目間のタンパク質の発現レベルの差（Δｐｇ／ｍｌ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図５Ｃ】図５は、０週目及び１週目間のタンパク質の発現レベルの差（Δｐｇ／ｍｌ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図５Ｄ】図５は、０週目及び１週目間のタンパク質の発現レベルの差（Δｐｇ／ｍｌ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図５Ｅ】図５は、０週目及び１週目間のタンパク質の発現レベルの差（Δｐｇ／ｍｌ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図５Ｆ】図５は、０週目及び１週目間のタンパク質の発現レベルの差（Δｐｇ／ｍｌ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図５Ｇ】図５は、０週目及び１週目間のタンパク質の発現レベルの差（Δｐｇ／ｍｌ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図５Ｈ】図５は、０週目及び１週目間のタンパク質の発現レベルの差（Δｐｇ／ｍ）を示し、これは、ＳＶＲを達成した患者（“１”によって示す）及びＳＶＲを達成しなかった患者（“０”によって示す）間の有意な差（ｐ≦０．０５）を示す。記号は、図３と同じ意味を有する。
【図６】図６は、それぞれの方法を、１５００回のシミュレーションで使用して重要な変数として選択された頻度（パーセントによって表示）、その訓練誤差率、及び試験誤差率を含む、ＳＶＲに伴うタンパク質の治療前の発現レベルを確認するための四つの分析方法の性能を示す。
【発明を実施するための形態】
【００５０】
用語、治療に対する “反応”は、一つの薬剤又は複数の薬剤の投与に対する所望の反応である。
用語、治療に対する “持続性ウイルス陰性化（Ｓｕｓｔａｉｎｅｄ Ｖｉｒｏｌｏｇｉｃ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ）”（“ＳＶＲ”）及び“完全陰性化（Ｃｏｍｐｌｅｔｅ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ）”（“ＣＲ”）は、本明細書中で互換的に使用され、そして治療の終了時及び治療の終了後２４週目の両方で、感染した患者の試料中のＲＴ−ＰＣＲにより検出可能なＨＣＶのＲＮＡの非存在（＜１５ＩＵ／ｍＬ）を指す。
【００５１】
用語、治療に対する “ウイルス非陰性化（Ｖｉｒｏｌｏｇｉｃ Ｎｏｎ−Ｒｅｓｐｏｎｓｅ）”（“ＶＮＲ”）及び“非陰性化（Ｎｏ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ）”（“ＮＲ”）は、本明細書中で互換的に使用され、そして治療を通して、そして治療の終了時の、感染した患者の試料中のＲＴ−ＰＣＲにより検出可能なＨＣＶのＲＮＡの存在（≧１５ＩＵ／ｍＬ）を指す。
【００５２】
“２週目の急速ウイルス陰性化（Ｒａｐｉｄ Ｖｉｒｏｌｏｇｉｃ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ−２ Ｗｅｅｋｓ（“ＲＶＲ２”）は、２週間の治療後、感染した患者の試料中のＲＴ−ＰＣＲにより検出可能なＨＣＶのＲＮＡ（＜１５ＩＵ／ｍＬ）の非存在を指す。
【００５３】
用語“試料”又は“生物学的試料”は、制約されるものではないが、例えば組織生検、血漿、血清、全血、髄液、リンパ液、皮膚の外部分泌物、呼吸器、腸及び尿生殖器管、涙、唾液、乳汁、血液細胞、腫瘍、器官を含む個体から単離された組織又は流体の試料を指す。更に含まれるものは、ｉｎ ｖｉｔｒｏの細胞培養成分（制約されるものではないが、培養培地中の細胞の増殖から得られる培養上清、推定的にウイルスに感染した細胞、組換え細胞、及び細胞の成分を含む）の試料である。
【００５４】
用語“発現レベルを代表する参照値”は、三剤療法の治療に対してウイルス非陰性化を示すＨＣＶ患者の集団中の試料に由来するマーカータンパク質の平均発現レベルの推定値を指す。
【００５５】
用語“統計的に有意”は、本明細書中で使用される場合、得られた結果が規定された確率のレベルにおける偶然変動のためである可能性がないことを意味し、そして本明細書中で使用される場合、０．０５に等しいか又はそれより少ない有意性のレベル（ｐ≦０．０５）を、或いは１００中の５に等しいか又はそれより小さい誤差の確率を意味する。
【００５６】
用語“インターフェロン”は、ウイルスの複製及び細胞増殖を阻害し、そして免疫反応を変更する高度に相同性の種特異的タンパク質のファミリーを指す。典型的な適したインターフェロンは、制約されるものではないが、Ｓｃｈｅｒｉｎｇ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｋｅｎｉｌｗｏｒｔｈ，Ｎ．Ｊ．から入手可能なイントロン（登録商標）Ａインターフェロンのような組換えインターフェロンアルファ−２ｂ、Ｈｏｆｆｍａｎｎ−Ｌａ Ｒｏｃｈｅ，Ｎｕｔｌｅｙ，Ｎ．Ｊ．から入手可能なロフェロン（登録商標）−Ａインターフェロンのような組換えインターフェロンアルファ−２ａ、Ｂｏｅｈｒｉｎｇｅｒ Ｉｎｇｅｌｈｅｉｍ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ，Ｉｎｃ．，Ｒｉｄｇｅｆｉｅｌｄ，Ｃｏｎｎ．から入手可能なベロフォア（Ｂｅｒｏｆｏｒ）（登録商標）アルファ２インターフェロンのような組換えインターフェロンアルファ−２Ｃ、日本の住友から入手可能なスミフェロン（登録商標）又はＧｌａｘｏ−Ｗｅｌｌｃｏｍｅ Ｌｔｄ．，Ｌｏｎｄｏｎ，Ｇｒｅａｔ Ｂｒｉｔａｉｎから入手可能なウェルフェロン（Ｗｅｌｌｆｅｒｏｎ）（登録商標）インターフェロンアルファ−ｎ１（ＩＮＳ）のような精製された天然のアルファインターフェロンのブレンドであるインターフェロンアルファ−ｎ１、或いは米国特許第４，８９７，４７１号及び４，６９５，６２３号（特にその実施例７、８又は９）に記載されているもの、及びＡｍｇｅｎ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗｂｕｒｙ Ｐａｒｋ，Ｃａｌｉｆ．から入手可能な特異的製品のようなコンセンサスアルファインターフェロン、或いはＩｎｔｅｒｆｅｒｏｎ Ｓｃｉｅｎｃｅｓによって製造され、そしてＰｕｒｄｕｅ Ｆｒｅｄｅｒｉｃｋ Ｃｏ．，Ｎｏｒｗａｌｋ，Ｃｏｎｎ．からアルフェロン（Ａｌｆｅｒｏｎ）の商標で入手可能な天然のアルファインターフェロンの混合物であるインターフェロンアルファ−ｎ３を含む。“インターフェロン”は、現時点でＨＣＶの治療のための臨床開発中である、他の形態のインターフェロンアルファ、並びにインターフェロンベータ、ガンマ、タウ、オメガ及びラムダを含むことができる。例えば、ＩｎｔｅｒＭｕｎｅによるインファーゲン（Ｉｎｆｅｒｇｅｎ）（登録商標）（インターフェロンアルファコン−１）、Ｖｉｒａｇｅｎによるオムニフェロン（Ｏｍｎｉｆｅｒｏｎ）（登録商標）（天然のインターフェロン）、Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｏｍｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓによるアルブフェロン（Ａｌｂｕｆｅｒｏｎ）（登録商標）（アルブミンインターフェロンアルファ２ｂ）、Ａｒｅｓ−Ｓｅｒｏｎｏによるレビフ（Ｒｅｂｉｆ）（登録商標）（インターフェロンベータ−１ａ）、ＢｉｏＭｅｄｉｃｉｎｅによるオメガインターフェロン、Ａｍａｒｉｌｌｏ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓによる経口インターフェロンアルファ、並びにＩｎｔｅｒＭｕｎｅによるインターフェロンγ、インターフェロンτ及びインターフェロンγ−１ｂ、並びにＧｌｙｃｏｆｅｒｏｎＴＭ（グリコールで操作されたコンセンサスインターフェロン）。インターフェロンは、以下に定義するようなペグ化インターフェロンを含むことができる。
【００５７】
用語“ペグ化インターフェロン”、“ペグ化インターフェロンアルファ”及び“ペグインターフェロン”は、本明細書中で互換的に使用され、そしてインターフェロンアルファ、好ましくはインターフェロンアルファ−２ａ及びアルファ−２ｂのポリエチレングリコールで改変された抱合体を意味する。典型的な適したペグ化インターフェロンアルファは、制約されるものではないが、ペガシス（登録商標）及びペグ−イントロン（登録商標）を含む。ペグ化インターフェロンの他の形態は、ＺｙｍｏＧｅｎｅｔｉｃｓ及びＢｒｉｓｔｏｌ−Ｍｙｅｒｓ ＳｑｕｉｂｂによるＰＥＧ−インターフェロンラムダを含むことができる。
【００５８】
用語“リバビリン”は、化合物、１−（（２Ｒ，３Ｒ，４Ｓ，５Ｒ）−３，４−ジヒドロキシ−５−ヒドロキシメチル−テトラヒドロ−フラン−２−イル）−１Ｈ−［１，２，４］トリアゾール−３−カルボン酸アミドを指し、これは、合成の非インターフェロン誘導の、広い薬効範囲の抗ウイルス性ヌクレオシド類似体であり、そしてビラゾール（登録商標）及びコペガス（登録商標）の名称で入手可能である。
【００５９】
用語“ＲＯ４５８８１６１”は、本明細書中で使用される場合、医薬的に受容可能な酸付加塩を含む化合物、イソ酪酸（２Ｒ，３Ｓ，４Ｒ，５Ｒ）−５−（４−アミノ−２−オキソ−２Ｈ−ピリミジン−１−イル）−２−アジド−３，４−ビス−イソブチリルオキシ−テトラヒドロ−フラン−２−イルメチルエステルを指し、そして本明細書中に参考文献として全てが援用されるＰ．Ｊ．Ｐｏｃｋｒｏｓ ｅｔ ａｌ．，Ｈｅｐａｔｏｌｏｇｙ，２００８，４８：３８５−３９７中に開示されているとおりの用語“Ｒ１６２６”と互換的に使用される。
【００６０】
用語“ＲＯ５０２４０４８”は、本明細書中で使用される場合、医薬的に受容可能な酸付加塩を含む化合物、イソ酪酸（２Ｒ，３Ｒ，４Ｒ，５Ｒ）−５−（４−アミノ−２−オキソ−２Ｈ−ピリミジン−１−イル）−４−フルオロ−３−イソブチリルオキシ−４−メチル−テトラヒドロ−フラン−２−イルメチルエステルを指し、そして本明細書中に参考文献として全てが援用されるＳ．Ａｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂ Ａｇｅｎｔｓ Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒ．，２００８ ５２（１２）：４３５６−４３６９中に開示されているとおりの用語“Ｒ７１２８”と互換的に使用される。
【００６１】
用語“概略２週目”は、２週間又は１４日間、プラスマイナス１ないし２日の時間を指す。
用語“ＣＤ３０”は、サイトカイン受容体ＣＤ３０を指し、これは、更に腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーのメンバー８、又はＴＮＦＲＳＦ８としても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿００１２３４に開示されている。
【００６２】
用語“ＭＩＧ”は、ガンマ−インターフェロン由来モノカイン又はガンマインターフェロンによって誘導されたモノカインを指し、そしてこれは、更にケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）リガンド９又はＣＸＣＬ９としても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿００２４０７に開示されている。
【００６３】
用語“ＴＡＲＣ”は、胸腺および活性化制御ケモカインを指し、これは、更にケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド１７又はＣＣＬ１７としても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿００２９７８に開示されている。
【００６４】
用語“ＴＦＧβ１”、“ＴＧＦベータ１”は、トランスフォーミング増殖因子ベータ１（β１）と呼ばれ、そのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿０００６５１に開示されている。
【００６５】
用語“ＳＤＦ１ｂ”又は“ＳＤＦ−１ｂ”は、ストロマ細胞由来因子１ベータを指し、これは、更にケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）リガンド１２又はＣＸＣＬ１２としても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿０００６００に開示されている。
【００６６】
用語“エオタキシン−２”は、好酸球走化タンパク質２を指し、これは、更にケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド２４又はＣＣＬ２４としても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿０００２９８２に開示されている。
【００６７】
用語“ＴＲＡＩＬ”は、ＴＮＦ関連アポトーシス誘導リガンドを指し、これは、更に腫瘍壊死因子（リガンド）スーパーファミリーのメンバー１０、又はＴＮＦＳＦ１０、及びＡｐｏ−２Ｌとしても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿００３８０１に開示されている。
【００６８】
用語“ＨＣＣ−４”又は“ＨＣＣ４”は、ヒトβ（ＣＣ）ケモカインＣＣ−４を指し、これは、更にモノタクチン（Ｍｏｎｏｔａｃｔｉｎ）−１及びケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド１６としても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿００４５８１に開示されている。
【００６９】
用語“ＭＩＰ１ｂ”又はＭＩＰ−１ｂ”は、マクロファージ炎症性タンパク質１−ベータを指し、これは、更にケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド４又はＣＣＬ４、及びリンパ球活性化遺伝子１としても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿００２９７５に開示されている。
【００７０】
用語“ＴＮＦＲＩＩ”又は“ＴＮＦ−ＲＩＩ”は、腫瘍壊死因子受容体２を指し、これは、更にｐ７５腫瘍壊死因子受容体（ｐ７５ＴＮＦＲ）及び腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーのメンバー１Ｂ又はＴＮＦＲＳＦ１Ｂとしても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿００１０５７に開示されている。
【００７１】
用語“ＩＴＡＣ”又は“Ｉ−ＴＡＣ”は、インターフェロン誘導性Ｔ−細胞アルファ化学誘引物質を指し、これは、更にインターフェロン−ガンマ誘導タンパク質９又はＩＰ９、及びケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）リガンド１１又はＣＸＣＬ１１としても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿００５４００に開示されている。
【００７２】
用語“ＩＬ２Ｒ”又は“ＩＬ−２Ｒ”は、そのヒトタンパク質の配列がGenBank寄託番号ＮＰ＿０００４０８に開示されているインターロイキン２受容体アルファ（ＩＬ−２ＲＡ）、そのヒトタンパク質の配列がGenBank寄託番号ＮＰ＿０００８６９に開示されているインターロイキン２受容体ベータ（ＩＬ−２ＲＢ）、及び更に普通のサイトカイン受容体ガンマ鎖としても知られ、そのヒトタンパク質の配列がGenBank寄託番号ＮＰ＿０００１９７に開示されているインターロイキン２受容体ガンマ（ＩＬ−２Ｒγ）間の、ヘテロ三量体からなるインターロイキン２受容体の高親和性の形態を指す。
【００７３】
用語“ＩＬ−１６”又は“ＩＬ１６”は、インターロイキン１６を指し、これは、更にリンパ球走化性因子又はＬＣＦとしても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿００４５０４に開示されている。
【００７４】
用語“ＩＰ１０”又は“ＩＰ−１０”は、１０ｋＤａのインターフェロン−ガンマ誘導タンパク質を指し、これは、更にケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）リガンド１０又はＣＸＣＬ１０としても知られ、そしてそのヒトタンパク質の配列は、GenBank寄託番号ＮＰ＿００１５５６に開示されている。
【００７５】
慢性のＣ型肝炎を持つ患者に対する現時点の推奨される第一線の治療は、１又は４の遺伝子型ウイルスを保有する患者において４８週間、２又は３の遺伝子型ウイルスを保有する患者において２４週間のリバビリンと組合せたペグ化インターフェロンアルファである。リバビリンとの組合せ治療は、一回又はそれより多いインターフェロンアルファの療法の課程後に再発した患者、並びに以前に治療したことがない患者におけるインターフェロンアルファの単剤療法より有効であることが見いだされた。然しながら、リバビリンは、催奇性及び発癌性を含む重要な副作用を示す。更に、リバビリンは、概略１０ないし２０％の患者においてリバビリン療法の投与量の減少又は中断を必要とする溶血性貧血を起こし、これは、赤血球中のリバビリン三リン酸の蓄積に関係があり得る。従って、治療費及び有害事象を減少するために、有効性を損なうことなく、治療を、短時間に調整することが望ましい。
【００７６】
多くの研究は、４週目の急速ウイルス陰性化（ＲＶＲ）が、ペグインターフェロン／リバビリン（ｒｉｂａｖａｒｉｎ）を使用する治療に対する持続性ウイルス陰性化（ＳＶＲ）のかなり信頼できる前兆であることを示している。幾つかの研究は、ＲＶＲを達成したＨＣＶ−１の患者間で、ＳＶＲの比率は、２４週及び４８週のペグインターフェロン／リバビリン（ｒｉｂｏｖａｒｉｎ）治療間で匹敵することを示し（Ｄ．Ｍ．Ｊｅｎｓｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｈｅｐａｔｏｌｏｇｙ，２００６，４３：９５４−９６０；Ｓ．Ｚｅｕｚｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｈｅｐａｔｏｌ．２００６，４４：９７−１０３；Ａ．Ｍａｎｇｉａ ｅｔ ａｌ．，Ｈｅｐａｔｏｌｏｇｙ，２００８，４７：４３−５０）、一方、他の者は、ＲＶＲが達成されたとしても、２４週間のペグ化インターフェロン／リバビリンが、４８週間の治療に対して劣ることをＨＣＶ−１の患者において証明している（Ｍ．−Ｌ．Ｙｕ ｅｔ ａｌ．，Ｈｅｐａｔｏｌｏｇｙ，２００８，４７：１８８４−１８９３）。
【実施例】
【００７７】
実施例
ＲＯ４５８８１６１に関連する第ＩＩ相臨床試験
これは、継続中の、第２Ａ相の多施設における無作為化二重盲検（ＲＯ４５８８１６１及びリバビリンは二重盲検であり、そしてペガシスは非盲検であった）の実薬対照並行群間試験であった。３５日のスクリーニング期間（試験薬物の最初の投与に対する最初のスクリーニング評価からの時間）が、試験の治療部分に先行した（図１）。それぞれの患者のＨＣＶ遺伝子型及びＨＣＶのＲＮＡの力価を、スクリーニング期間中に確認し、そしてＨＣＶ−１遺伝子型及びＨＣＶのＲＮＡの力価≧５０，０００ＩＵ／ｍＬを持つ治療未経験の患者のみを登録に適格とした。
【００７８】
年齢１８ないし６６歳間の１０７人の男性及び女性を研究に登録した。患者を四つの治療群に無作為に分けた：
・Ａ群／二剤併用１５００［ＲＯ４５８８１６１を経口で一日２回１５００ｍｇ＋ペガシスを皮下で週１回１８０μｇ］４週間−２１人の患者、
・Ｂ群／二剤併用３０００［ＲＯ４５８８１６１を経口で一日２回３０００ｍｇ＋ペガシスを皮下で週１回１８０μｇ］４週間−３４人の患者、
・Ｃ群／三剤併用１５００［ＲＯ４５８８１６１を経口で一日２回１５００ｍｇ＋ペガシスを皮下で週１回１８０μｇ＋リバビリンを経口で毎日１０００ｍｇ（＜７５ｋｇ）、又は１２００ｍｇ（≧７５ｋｇ）］４週間−３１人の患者又は
・Ｄ群／標準治療（ＳＯＣ）［ペガシスを皮下で週１回１８０μｇ＋リバビリンを経口で毎日１０００ｍｇ（＜７５ｋｇ）、又は１２００ｍｇ（≧７５ｋｇ）］４週間−２１人の患者。
【００７９】
合計１０７人の患者から、３人の患者が無作為化されたにもかかわらず、研究医薬の一回の投与を受けなかったために、１０４人からのデータを分析のために評価した。１０４人の患者の中で、合計それぞれ４３、４、及び５人の、ＲＯ４５８８１６１、ペガシス、及びリバビリン治療を安全上の理由から早期に辞退した患者がいた。
【００８０】
全ての的確な判断基準に合致した患者を、リバビリンを伴い又は伴わずにペガシスと組合せたＲＯ４５８８１６１を、或いはＳＯＣを４週間受けるために無作為化した。
少なくとも１回の研究医薬の投与を受けた全ての患者は、全体で４８週間の治療を完結するために、非盲検のペガシス１８０μｇを皮下で週１回（ｑｗ）、及びリバビリン１０００ｍｇ（＜７５ｋｇ）又は１２００ｍｇ（≧７５ｋｇ）を経口で一日１回（ｑｄ）受け続けるものであった。
【００８１】
無作為化は、ＰＫの下位群（疎ＰＫ対密ＰＫ）によって次の治療群に２：３：３：２の比で階層化（Ａ群／二剤併用１５００ 〜２０、Ｂ群／二剤併用３０００ 〜３０、Ｃ群／三剤併用１５００ 〜３０、Ｄ群／ＳＯＣ 〜２０）された。
【００８２】
全ての患者は、８週目に、即ち実験的薬物組合せの最後の投与後４週目に、安全経過観察訪問を受けた。患者は、この４週目の安全経過観察訪問を、その標準の介護療法による治療中に受けた。完全な４８週の療法の課程を完了した患者は、続いて２４週間の事後治療を完了した。
【００８３】
薬力学的分析は、慢性の遺伝子型１のＨＣＶウイルス感染を持つ治療未経験の患者における、血清のウイルス負荷、及び個々の臨床訪問におけるウイルス反応、並びにリバビリンを伴う又は伴わないペガシスと混合して与えられたＲＯ４５８８１６１による抗ウイルス耐性の発生の評価を含んでいた。ウイルスの反応は、Ｒｏｃｈｅ ＣＯＢＡＳ ＴａｑＭａｎ ＨＣＶ試験によって測定されるような検出不可能なＨＣＶのＲＮＡ（＜１５ＩＵ／ｍＬ）を持つ患者のパーセントとして定義された。薬力学的データは、一覧表、統計的概要（平均、中央値、標準誤差、平均の信頼区間、範囲、変動係数、反応を伴う患者の比率、及び比率に対する信頼区間を含む）及び時間に対する平均のプロットによって与えられた。
【００８４】
各種の治療計画に対する反応を予測するタンパク質バイオマーカーを確認するために、血漿試料を、治療前（０週目の時点）及び治療後１週間（１週目の時点）でそれぞれの患者から収集し、そして各種のサイトカイン及びケモカインの発現レベルを、Ａｕｓｈｏｎ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ（Ｂｉｌｌｅｒｉｃａ，ＭＡ）から入手可能な、特別注文によるＳｅａｒｃｈＬｉｇｈｔ ５５−多重サンドイッチ−ＥＬＩＳＡ装置を使用して、Ｍｏｏｄｙ，Ｍ．Ｄ．ｅｔ ａｌ．，“Ａｒｒａｙ−Ｂａｓｅｄ ＥＬＩＳＡｓ ｆｏｒ Ｈｉｇｈ−Ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｈｕｍａｎ Ｃｙｔｏｋｉｎｅｓ”，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ，２００１，３１（１）：１８６−１９４（これは本明細書中に参考文献としてその全てが援用される）に記載されているプロトコルによって試験した。５５−多重アッセイで試験されたヒトのサイトカイン及びケモカインを表１に収載する。
【００８５】
【表１】
【００８６】
血漿ウイルス負荷の、投与量及び時間依存性の減少が、ＲＯ４５８８１６１、ペガサス及びリバビリンによる治療後に観察された。ＨＣＶのＲＮＡの低下は、最初の投与後の最初の評価（７２時間）という早期に観察された。全てのＲＯ４５８８１６１含有群は、４週目に、基線からの全てＳＯＣによる２．４ｌｏｇ１０より大きい、≧３．６ｌｏｇ１０平均ＨＣＶのＲＮＡ（ＩＵ／ｍＬ）の減少、を有していた。
【００８７】
二剤併用１５００及び二剤併用３０００は、マイナス０．９ｌｏｇ１０ＩＵ／ｍＬウイルス濃度における平均の変化の差を伴う投与量依存性の減少（−３．６対−４．５）を明らかにした。二剤併用１５００及び三剤併用１５００（同一投与量のＲＯ４５８８１６１及びペガシス、しかしリバビリンを伴う）と比較した場合、差は、マイナス１．６ｌｏｇ１０ＩＵ／ｍＬにおいてなお更に大きい（−５．２対−３．６）。更にＳＯＣ及び三剤併用１５００（同一投与量のペガシス及びリバビリン、しかしＲＯ４５８８１６１を伴う）を比較した場合、差は、マイナス２．８ｌｏｇ１０ＩＵ／ｍＬにおいて最も顕著である（−５．２対−２．４）。更に、三剤併用１５００及び二剤併用１５００間、並びに三剤併用１５００及びＳＯＣ間の９５％信頼区間は、全て非重複であり、二剤併用１５００及びＳＯＣに対する三剤併用１５００の優れた抗ウイルス効果を示していた。
【００８８】
三剤併用療法を受けている３１人の群のＣ型患者の治療結果を、図２にグラフとして示す。２週間の治療において検出不可能なＨＣＶのＲＮＡを示すことが可能であった（即ちＲＶＲ２）１３人の患者の内の１１人は、２４週間の治療完了後ＳＶＲを達成することが可能であった。対照的に、ＲＶＲ２を示さなかった１８人の患者の内、７人のみがＳＶＲを達成した。
【００８９】
ＳＶＲを達成した患者からの治療前血漿試料中の５５種のケモカイン及びサイトカインのそれぞれの発現レベルを、ＳＶＲを達成しなかった患者からの治療前血漿試料中のこれらのタンパク質の発現レベルと、Ｗｉｌｃｏｘｏｎの順位和検定（ノンパラメトリック法）を使用して比較した。同様に、ＳＶＲ患者からの治療後１週目の試料中のタンパク質の発現レベルを、非−ＳＶＲ患者からの治療後１週目の試料中のタンパク質発現レベルと比較した。更に、０週目試料及び１週目試料間のそれぞれのタンパク質の発現レベルの差（デルタ）を試験し、そしてＳＶＲ患者及び非−ＳＶＲ患者間で比較した。統計的に有意な差は、０．０５の臨界レベルと考えた。分析は、Ｓｐｏｔｆｉｒｅプログラム（Ｓｐｏｔｆｉｒｅ ＤｅｃｉｓｉｏｎＳｉｔｅ ｖｅｒｓｉｏｎ ９．１．１，２００８，ＴＩＢＣＯ，Ｓｏｍｅｒｖｉｌｌｅ，ＭＡ）で実行した。０週目、１週目におけるＳＶＲ及び非−ＳＶＲ間の発現レベルの統計的に有意な差、並びに０週目−１週目の差（デルタ）を示すタンパク質を表２に示す。三つの試験時点に対するこれらのタンパク質のそれぞれの発現レベルのデータを、図３、４及び５にグラフとして示す。
【００９０】
【表２】
【００９１】
先に記載した単変量解析に加えて、多変量解析を実行した。交差検定戦略を、２／３の患者を訓練データの組とし、そして１／３の患者を試験データの組として無作為に選択することによって適用した。次いで１５００回のシミュレーションを、以下に記載する四つの方法で実行した：
方法１．最良の一つの変数を選択
方法２．多変量ロジスティック回帰分析モデルのための二つまでの最良の変数を選択
方法３．サポートベクターマシーン（ＳＶＭ）のための最良の二つの変数を選択
方法４．ランダムフォレストのための最良の五つの変数を選択。
【００９２】
これらの四つの方法の性能（１５００回のシミュレーションで、それぞれの方法を使用して重要な変数として選択された頻度、その訓練誤差率、及び試験誤差率を含む）を、図６に示す。ＩＰ１０及びＭＩＧの両方は、多変量ロジスティック回帰分析、ＳＶＭ及びランダムフォレスト法を使用する１５００回のシミュレーションの４０％以上において重要な変数として選択された。多重ロジスティック回帰分析法は、１９％の訓練誤差率及び３９％の試験誤差率をもたらすことによって他の三つの方法より良好に遂行するように見受けられる。全ての多変量解析は、Ｇｅｎｔｌｅｍａｎ，Ｒ．ｅｔ ａｌ．ｅｄｓ，Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ａｎｄ Ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ Ｂｉｏｌｏｇｙ Ｓｏｌｕｔｉｏｎｓ Ｕｓｉｎｇ Ｒ ａｎｄ Ｂｉｏｃｏｎｄｕｃｔｏｒ，２００５，Ｓｐｒｉｎｇｅｒ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ中に記載されているとおりのＲプログラムで実行した。
【００９３】
多変量解析は、タンパク質、ＩＰ１０、ＣＤ３０、ＴＧＦβ１及びＭＩＧのミリリットル当たりのピコグラム（ｐｇ／ｍｌ）の基線（即ち治療前）発現レベルを測定することによって、ＨＣＶ−１又はＨＣＶ−４に感染した患者が、三剤併用療法の治療後のＳＶＲを達成するものである可能性を予測するために使用することができる、多変量ロジスティック回帰分析式の構築を可能にした。式は：ＳＶＲスコア＝−４７．４−１．１×ｌｏｇ２ＩＰ１０＋３．１×ｌｏｇ２ＣＤ３０＋１．４×ｌｏｇ２ＴＧＦβ１＋０．５×ｌｏｇ２ＭＩＧであり、ここで、０．５に等しいか又はそれより大きいＳＶＲスコアは、患者が三剤併用療法の治療に対してＳＶＲを達成するものであることを示し、そして一方、０．５より小さいＳＶＲスコアは、患者がこのような治療に対してＳＶＲを達成しないものであることを示すものであった。
【特許請求の範囲】
【請求項１】
遺伝子型１のＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ−１）又は遺伝子型４のＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ−４）に感染したヒトの患者が、インターフェロン、リバビリン及びＨＣＶのＮＳ５Ｂポリメラーゼ阻害剤による治療に対して持続性ウイルス陰性化（ＳＶＲ）を達成するものであることを予測するための方法であって：
（ｉ）前記治療に先だって（治療前）前記患者からの試料を得て、
（ｉｉ）前記試料中のＣＤ３０、ＭＩＧ、ＴＡＲＣ、ＴＧＦβ１、ＳＤＦ１ｂ、及びエオタキシン−２からなる群から選択される少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを決定し、そして
（ｉｉｉ）前記試料中の少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを、前記治療に対してＳＶＲを達成しなかった患者の集団の治療前の試料に由来する少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを代表する参照値と比較すること；
を含んでなり、ここにおいて、前記試料中の少なくとも一つのタンパク質の統計的に有意に高い発現レベルは、前記患者が、前記治療に対してＳＶＲを達成するものであることの指標である、前記方法。
【請求項２】
少なくとも二つのタンパク質の発現レベルを決定する、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
少なくとも三つのタンパク質の発現レベルを決定する、請求項１又は２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４】
遺伝子型１のＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ−１）又は遺伝子型４のＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ−４）に感染したヒトの患者が、インターフェロン、リバビリン及びＨＣＶのＮＳ５Ｂポリメラーゼ阻害剤による治療に対して持続性ウイルス陰性化（ＳＶＲ）を達成するものであることを予測するための方法であって：
（ｉ）前記治療の１週間後（治療後１週目）に前記患者からの試料を得て、
（ｉｉ）前記試料中のＣＤ３０、ＴＲＡＩＬ、及びＴＡＲＣからなる群から選択される少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを決定し、そして
（ｉｉｉ）前記試料中の少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを、前記治療に対してＳＶＲを達成しなかった患者の集団の治療後１週目の試料に由来する少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを代表する参照値と比較すること；
を含んでなり、ここにおいて、前記試料中の少なくとも一つのタンパク質の統計的に有意に高い発現レベルは、前記患者が、前記治療に対してＳＶＲを達成するものであることの指標である、前記方法。
【請求項５】
少なくとも二つのタンパク質の発現レベルを決定する、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
少なくとも三つのタンパク質の発現レベルを決定する、請求項４又は５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項７】
遺伝子型１のＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ−１）又は遺伝子型４のＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ−４）に感染したヒトの患者が、インターフェロン、リバビリン及びＨＣＶのＮＳ５Ｂポリメラーゼ阻害剤による治療に対して持続性ウイルス陰性化（ＳＶＲ）を達成するものであることを予測するための方法であって：
（ｉ）前記治療に先だって（治療前）前記患者からの試料を得て、
（ｉｉ）前記試料中のＨＣＣ−４、ＭＩＰ１ｂ、ＳＤＦ１ｂ、ＴＮＦＲＩＩ、ＩＴＡＣ、ＭＩＧ、ＩＬ２Ｒ、及びＩＬ１６からなる群から選択される少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを決定し、
（ｉｉｉ）前記治療の１週間後（治療後１週目）に前記患者からの試料を得て、
（ｉｖ）前記試料中のＨＣＣ−４、ＭＩＰ１ｂ、ＳＤＦ１ｂ、ＴＮＦＲＩＩ、ＩＴＡＣ、ＭＩＧ、ＩＬ２Ｒ、及びＩＬ１６からなる群から選択される少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを決定し、
（ｖ）前記患者からの治療前試料及び前記患者からの治療後１週目の試料間の、少なくとも一つのタンパク質の発現レベルの差を決定し、そして
（ｖｉ）前記少なくとも一つのタンパク質の発現レベルの差を、前記治療に対してＳＶＲを達成しなかった患者の集団の、治療前の試料及び治療後１週目の試料に由来する少なくとも一つのタンパク質の発現レベルの差を代表する参照値と比較すること；
を含んでなり、ここにおいて、少なくとも一つのタンパク質の発現レベルの差の統計的に有意な変化は、前記患者が、前記治療に対してＳＶＲを達成するものであることの指標である、前記方法。
【請求項８】
少なくとも二つのタンパク質の発現レベルの差を決定する、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
少なくとも三つのタンパク質の発現レベルの差を決定する、請求項７又は８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１０】
遺伝子型１のＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ−１）又は遺伝子型４のＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ−４）に感染したヒトの患者が、インターフェロン、リバビリン及びＨＣＶのＮＳ５Ｂポリメラーゼ阻害剤による治療に対して持続性ウイルス陰性化（ＳＶＲ）を達成するものであることを予測するための方法であって：
（ｉ）前記治療に先だって（治療前）前記患者からの試料を得て、
（ｉｉ）前記試料中のＩＰ１０、ＣＤ３０、ＴＧＦβ１及びＭＩＧのミリリットル当たりのピコグラムの発現レベルを決定し、そして式：ＳＶＲスコア＝−４７．４−１．１×ｌｏｇ２ＩＰ１０＋３．１×ｌｏｇ２ＣＤ３０＋１．４×ｌｏｇ２ＴＧＦβ１＋０．５×ｌｏｇ２ＭＩＧを使用すること；
を含んでなり、０．５に等しいか又はそれより大きいＳＶＲスコアは、患者が前記治療に対してＳＶＲを達成することの指標であり、０．５より小さいＳＶＲスコアは、患者がこのような治療に対してＳＶＲを達成しないことの指標である、前記方法。
【請求項１】
遺伝子型１のＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ−１）又は遺伝子型４のＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ−４）に感染したヒトの患者が、インターフェロン、リバビリン及びＨＣＶのＮＳ５Ｂポリメラーゼ阻害剤による治療に対して持続性ウイルス陰性化（ＳＶＲ）を達成するものであることを予測するための方法であって：
（ｉ）前記治療に先だって（治療前）前記患者からの試料を得て、
（ｉｉ）前記試料中のＣＤ３０、ＭＩＧ、ＴＡＲＣ、ＴＧＦβ１、ＳＤＦ１ｂ、及びエオタキシン−２からなる群から選択される少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを決定し、そして
（ｉｉｉ）前記試料中の少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを、前記治療に対してＳＶＲを達成しなかった患者の集団の治療前の試料に由来する少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを代表する参照値と比較すること；
を含んでなり、ここにおいて、前記試料中の少なくとも一つのタンパク質の統計的に有意に高い発現レベルは、前記患者が、前記治療に対してＳＶＲを達成するものであることの指標である、前記方法。
【請求項２】
少なくとも二つのタンパク質の発現レベルを決定する、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
少なくとも三つのタンパク質の発現レベルを決定する、請求項１又は２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４】
遺伝子型１のＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ−１）又は遺伝子型４のＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ−４）に感染したヒトの患者が、インターフェロン、リバビリン及びＨＣＶのＮＳ５Ｂポリメラーゼ阻害剤による治療に対して持続性ウイルス陰性化（ＳＶＲ）を達成するものであることを予測するための方法であって：
（ｉ）前記治療の１週間後（治療後１週目）に前記患者からの試料を得て、
（ｉｉ）前記試料中のＣＤ３０、ＴＲＡＩＬ、及びＴＡＲＣからなる群から選択される少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを決定し、そして
（ｉｉｉ）前記試料中の少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを、前記治療に対してＳＶＲを達成しなかった患者の集団の治療後１週目の試料に由来する少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを代表する参照値と比較すること；
を含んでなり、ここにおいて、前記試料中の少なくとも一つのタンパク質の統計的に有意に高い発現レベルは、前記患者が、前記治療に対してＳＶＲを達成するものであることの指標である、前記方法。
【請求項５】
少なくとも二つのタンパク質の発現レベルを決定する、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
少なくとも三つのタンパク質の発現レベルを決定する、請求項４又は５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項７】
遺伝子型１のＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ−１）又は遺伝子型４のＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ−４）に感染したヒトの患者が、インターフェロン、リバビリン及びＨＣＶのＮＳ５Ｂポリメラーゼ阻害剤による治療に対して持続性ウイルス陰性化（ＳＶＲ）を達成するものであることを予測するための方法であって：
（ｉ）前記治療に先だって（治療前）前記患者からの試料を得て、
（ｉｉ）前記試料中のＨＣＣ−４、ＭＩＰ１ｂ、ＳＤＦ１ｂ、ＴＮＦＲＩＩ、ＩＴＡＣ、ＭＩＧ、ＩＬ２Ｒ、及びＩＬ１６からなる群から選択される少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを決定し、
（ｉｉｉ）前記治療の１週間後（治療後１週目）に前記患者からの試料を得て、
（ｉｖ）前記試料中のＨＣＣ−４、ＭＩＰ１ｂ、ＳＤＦ１ｂ、ＴＮＦＲＩＩ、ＩＴＡＣ、ＭＩＧ、ＩＬ２Ｒ、及びＩＬ１６からなる群から選択される少なくとも一つのタンパク質の発現レベルを決定し、
（ｖ）前記患者からの治療前試料及び前記患者からの治療後１週目の試料間の、少なくとも一つのタンパク質の発現レベルの差を決定し、そして
（ｖｉ）前記少なくとも一つのタンパク質の発現レベルの差を、前記治療に対してＳＶＲを達成しなかった患者の集団の、治療前の試料及び治療後１週目の試料に由来する少なくとも一つのタンパク質の発現レベルの差を代表する参照値と比較すること；
を含んでなり、ここにおいて、少なくとも一つのタンパク質の発現レベルの差の統計的に有意な変化は、前記患者が、前記治療に対してＳＶＲを達成するものであることの指標である、前記方法。
【請求項８】
少なくとも二つのタンパク質の発現レベルの差を決定する、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
少なくとも三つのタンパク質の発現レベルの差を決定する、請求項７又は８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１０】
遺伝子型１のＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ−１）又は遺伝子型４のＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ−４）に感染したヒトの患者が、インターフェロン、リバビリン及びＨＣＶのＮＳ５Ｂポリメラーゼ阻害剤による治療に対して持続性ウイルス陰性化（ＳＶＲ）を達成するものであることを予測するための方法であって：
（ｉ）前記治療に先だって（治療前）前記患者からの試料を得て、
（ｉｉ）前記試料中のＩＰ１０、ＣＤ３０、ＴＧＦβ１及びＭＩＧのミリリットル当たりのピコグラムの発現レベルを決定し、そして式：ＳＶＲスコア＝−４７．４−１．１×ｌｏｇ２ＩＰ１０＋３．１×ｌｏｇ２ＣＤ３０＋１．４×ｌｏｇ２ＴＧＦβ１＋０．５×ｌｏｇ２ＭＩＧを使用すること；
を含んでなり、０．５に等しいか又はそれより大きいＳＶＲスコアは、患者が前記治療に対してＳＶＲを達成することの指標であり、０．５より小さいＳＶＲスコアは、患者がこのような治療に対してＳＶＲを達成しないことの指標である、前記方法。
【図１】
【図２】
【図３Ａ】
【図３Ｂ】
【図３Ｃ】
【図３Ｄ】
【図３Ｅ】
【図３Ｆ】
【図４Ａ】
【図４Ｂ】
【図４Ｃ】
【図５Ａ】
【図５Ｂ】
【図５Ｃ】
【図５Ｄ】
【図５Ｅ】
【図５Ｆ】
【図５Ｇ】
【図５Ｈ】
【図６】
【図２】
【図３Ａ】
【図３Ｂ】
【図３Ｃ】
【図３Ｄ】
【図３Ｅ】
【図３Ｆ】
【図４Ａ】
【図４Ｂ】
【図４Ｃ】
【図５Ａ】
【図５Ｂ】
【図５Ｃ】
【図５Ｄ】
【図５Ｅ】
【図５Ｆ】
【図５Ｇ】
【図５Ｈ】
【図６】
【公表番号】特表２０１３−５１２４２５（Ｐ２０１３−５１２４２５Ａ）
【公表日】平成２５年４月１１日（２０１３．４．１１）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１２−５４０４５０（Ｐ２０１２−５４０４５０）
【出願日】平成２２年１１月２９日（２０１０．１１．２９）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＥＰ２０１０／０６８３７０
【国際公開番号】ＷＯ２０１１／０６７１９５
【国際公開日】平成２３年６月９日（２０１１．６．９）
【出願人】（５９１００３０１３）エフ．ホフマン−ラ ロシュ アーゲー (1,754)
【氏名又は名称原語表記】Ｆ． ＨＯＦＦＭＡＮＮ−ＬＡ ＲＯＣＨＥ ＡＫＴＩＥＮＧＥＳＥＬＬＳＣＨＡＦＴ
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２５年４月１１日（２０１３．４．１１）
【国際特許分類】
【出願日】平成２２年１１月２９日（２０１０．１１．２９）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＥＰ２０１０／０６８３７０
【国際公開番号】ＷＯ２０１１／０６７１９５
【国際公開日】平成２３年６月９日（２０１１．６．９）
【出願人】（５９１００３０１３）エフ．ホフマン−ラ ロシュ アーゲー (1,754)
【氏名又は名称原語表記】Ｆ． ＨＯＦＦＭＡＮＮ−ＬＡ ＲＯＣＨＥ ＡＫＴＩＥＮＧＥＳＥＬＬＳＣＨＡＦＴ
【Ｆターム（参考）】
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