サイトカインレセプターＺＡＬＰＨＡ１１
【課題】新規ポリペプチドの提供。
【解決手段】新奇なポリペプチド、ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、および関連する組成物と方法を、新奇なサイトカイン受容体であるにザルファル１について開示する。このポリペプチドは、インビトロおよびインビボの造血細胞、リンパ系細胞、および骨髄細胞の増殖および／または成長を刺激する配位子の検出方法において用いられる。配位子と結合する受容体ポリペプチドはまた、インビトロおよびインビボの配位子の活性を阻止するために用いることができる。ザルファル１をコードするポリペプチドは１６番染色体に位置し、ヒトの病気の状態と関係しているゲノム領域を同定するために用いることができる。
【解決手段】新奇なポリペプチド、ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、および関連する組成物と方法を、新奇なサイトカイン受容体であるにザルファル１について開示する。このポリペプチドは、インビトロおよびインビボの造血細胞、リンパ系細胞、および骨髄細胞の増殖および／または成長を刺激する配位子の検出方法において用いられる。配位子と結合する受容体ポリペプチドはまた、インビトロおよびインビボの配位子の活性を阻止するために用いることができる。ザルファル１をコードするポリペプチドは１６番染色体に位置し、ヒトの病気の状態と関係しているゲノム領域を同定するために用いることができる。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２５５（Ｌｅｕ）のアミノ酸配列、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２５６（Ｌｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
（ｄ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、および
（ｅ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号１（Ｍｅｔ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
からなる群から選択されたアミノ酸配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸残基の配列を含むｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドをコードする単離されたポリヌクレオチドであって、前記アミノ酸の同一性のパーセントがＦＡＳＴＡプログラムを用い、ｋｔｕｐ＝１、ギャップオープニングペナルティ＝１０、ギャップエクステンションペナルティ＝１、置換マトリックス＝ＢＬＯＳＵＭ６２とし、他のパラメーターをデフォルトとして設定して決められる、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項２】
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４に示される１番ヌクレオチドから１６１４番ヌクレオチドまでのポリヌクレオチド配列、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に示される１２６番ヌクレオチドから７７９番ヌクレオチドまでのポリヌクレオチド配列、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に示される１２６番ヌクレオチドから８３３番ヌクレオチドまでのポリヌクレオチド配列、
（ｄ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に示される８３４番ヌクレオチドから１６８２番ヌクレオチドまでのポリヌクレオチド配列、
（ｅ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に示される１２６番ヌクレオチドから１６８２番ヌクレオチドまでのポリヌクレオチド配列、および
（ｆ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に示される６９番ヌクレオチドから１６８２番ヌクレオチドまでのポリヌクレオチド配列、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドの配列を含む単離されたポリヌクレオチド。
【請求項３】
ｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドが、
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２５５（Ｌｅｕ）のアミノ酸配列、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２５６（Ｌｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
（ｄ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、および
（ｅ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号１（Ｍｅｔ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
からなる群から選択されたアミノ酸残基の配列を含む、請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項４】
ｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドが、
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）から２５５番アミノ酸番号２５５（Ｌｅｕ）のアミノ酸配列、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２５６（Ｌｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
（ｄ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、および
（ｅ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号１（Ｍｅｔ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
からなる群から選択されたアミノ酸残基の配列からなる、請求項３に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項５】
ポリペプチドがさらにＷＳＷＳＸドメインを含む、請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項６】
ポリペプチドがさらにトランスメンブレンドメインを含む、請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項７】
トランスメンブレンドメインがＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２の２３８番（Ｌｅｕ）から２５５番（Ｌｅｕ）の残基からなる、請求項６に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項８】
ポリペプチドがさらに細胞内ドメインを含む、請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項９】
細胞内ドメインがＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２の２５６番（Ｌｙｓ）から５３８番（Ｓｅｒ）の残基からなる、請求項８に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１０】
細胞内ドメインがさらにＢｏｘＩおよびＢｏｘＩＩ部位を含む、請求項９に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１１】
ポリペプチドがさらにアフィニティータグを含む、請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１２】
作用可能式に結合した下記の要素：
転写プロモーターと、
ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列を有するｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドをコードするＤＮＡセグメントと、
転写ターミネーターとを含む発現ベクターであって、前記プロモーターがＤＮＡセグメントと作用可能式に結合し、前記ＤＮＡセグメントが転写ターミネーターと作用可能式に結合している、発現ベクター。
【請求項１３】
さらにＤＮＡセグメントと作用可能式に結合した分泌シグナル配列を含む、請求項１２に記載の発現ベクター。
【請求項１４】
請求項１２に記載の発現ベクターを含む培養細胞であって、前記細胞が前記ＤＮＡセグメントによりコードされるポリペプチドを発現する、培養細胞。
【請求項１５】
転写プロモーターと、
ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列を有するｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドをコードするＤＮＡセグメントと、
転写ターミネーターとを含む発現ベクターであって、前記プロモーターとＤＮＡセグメントとターミネーターが作用可能式に結合している、発現ベクター。
【請求項１６】
さらにＤＮＡセグメントと作用可能式に結合した分泌シグナル配列を含む、請求項１５に記載の発現ベクター。
【請求項１７】
ポリペプチドがさらにＤＮＡセグメントと作用可能式に結合したトランスメンブレンドメインを含む、請求項１５に記載の発現ベクター。
【請求項１８】
トランスメンブレンドメインがＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２の２３８番（Ｌｅｕ）から２５５番（Ｌｅｕ）の残基を含む、請求項１７に記載の発現ベクター。
【請求項１９】
ポリペプチドがさらにＤＮＡセグメントと作用可能式に結合した細胞内ドメインを含む、請求項１５に記載の発現ベクター。
【請求項２０】
細胞内ドメインがＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２の２５６番（Ｌｙｓ）から５３８番（Ｓｅｒ）の残基からなる、請求項１９に記載の発現ベクター。
【請求項２１】
請求項１５に記載の発現ベクターの導入された培養細胞であって、前記細胞がＤＮＡセグメントによりコードされる可溶性の受容体ポリペプチドを発現する、培養細胞。
【請求項２２】
細胞が増殖のために外因的に供給された造血増殖因子に依存している、請求項２１に記載の細胞。
【請求項２３】
融合タンパク質をコードするＤＮＡ構築体であって、前記ＤＮＡ構築体が、
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号１（Ｍｅｔ）からアミノ酸番号１９（Ｇｌｙ）のアミノ酸配列、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２５５（Ｌｅｕ）のアミノ酸配列、
（ｄ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸２３８（Ｌｅｕ）からアミノ酸番号２５５（Ｌｅｕ）のアミノ酸配列、
（ｅ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２３８（Ｌｅｕ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列
（ｆ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２５６（Ｌｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、および
（ｇ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、からなる群から選択されたアミノ酸残基の配列を有するポリペプチドをコードする第一ＤＮＡセグメントと、
追加のポリペプチドをコードする少なくとも１個の別のＤＮＡセグメントとを含む構築体であって、
前記第一ＤＮＡセグメントおよび別のＤＮＡセグメントがイン・フレームで結合し、かつ前記第一ＤＮＡセグメントおよび別のＤＮＡセグメントが融合タンパク質をコードする、ＤＮＡ構築体。
【請求項２４】
作用可能式に結合した下記の要素：
転写プロモーターと、
請求項２３に記載の融合タンパク質をコードするＤＮＡ構築体と、
転写ターミネーターとを含む発現ベクターであって、前記プロモーターがＤＮＡ構築物と作用可能式に結合し、前記ＤＮＡセ構築体が転写ターミネーターと作用可能式に結合している、発現ベクター。
【請求項２５】
請求項２４に記載の発現ベクターを含む培養細胞であって、前記細胞がＤＮＡ構築体によりコードされるポリペプチドを発現する、培養細胞。
【請求項２６】
請求項２５に記載の細胞を培養することと、前記細胞により生成したポリペプチドを単離することを含む融合タンパク質の製造方法。
【請求項２７】
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）から２５５番アミノ酸番号２５５（Ｌｅｕ）のアミノ酸配列、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２５６（Ｌｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
（ｄ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、および
（ｅ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号１（Ｍｅｔ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
からなる群から選択されたアミノ酸配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸残基の配列を含む単離されたポリペプチドであって、前記アミノ酸の同一性のパーセントがＦＡＳＴＡプログラムを用い、ｋｔｕｐ＝１、ギャップオープニングペナルティ＝１０、ギャップエクステンションペナルティ＝１、置換マトリックス＝ＢＬＯＳＵＭ６２とし、他のパラメーターをデフォルトとして設定して決められる、単離されたポリペプチド。
【請求項２８】
請求項２７に記載の単離されたポリペプチドであって、前記ポリペプチドが、
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２５５（Ｌｅｕ）のアミノ酸配列、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２５６（Ｌｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
（ｄ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、および
（ｅ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号１（Ｍｅｔ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
からなる群から選択されたアミノ酸残基の配列を含む、単離されたポリペプチド。
【請求項２９】
請求項２７に記載の単離されたポリペプチドであって、アミノ酸残基の配列が、
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２５５（Ｌｅｕ）のアミノ酸配列、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２５６（Ｌｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
（ｄ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、および
（ｅ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号１（Ｍｅｔ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
からなる群から選択されたアミノ酸残基の配列からなる、単離されたポリペプチド。
【請求項３０】
ポリペプチドがさらにＷＳＷＳＸモチーフを含む、請求項２７に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項３１】
ポリペプチドがさらにトランスメンブレンドメインを含む、請求項２７に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項３２】
トランスメンブレンドメインがＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２の２３８番（Ｌｅｕ）から２５５番（Ｌｅｕ）の残基からなる、請求項３１に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項３３】
ポリペプチドがさらに細胞内ドメインを含む、請求項２７に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項３４】
細胞内ドメインがＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２の２５６番（Ｌｙｓ）から５３８番（Ｓｅｒ）の残基を含む、請求項３３に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項３５】
細胞内ドメインがさらにＢｏｘＩおよびＢｏｘＩＩ部位を含む、請求項３４に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項３６】
請求項１５に記載の細胞を培養すること、および前記細胞により生成したｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドを単離することを含むｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドの製造方法。
【請求項３７】
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列、
からなる群から選択されたアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチドであって、前記ポリペプチドが造血受容体と通常結合しているトランスメンブレンドメインおよび細胞内ドメインを実質上含まない、単離されたポリペプチド。
【請求項３８】
さらにアフィニティータグを含む、請求項３７に記載のポリペプチド。
【請求項３９】
請求項２１に記載の細胞を培養すること、および前記細胞により生成したｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドを単離することを含むｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドの製造方法。
【請求項４０】
ｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドに対する抗体の製造方法であって、
（ａ）９から５１９個のアミノ酸からなるポリペプチドであって、前記ポリペプチドがＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２中のアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸の連続配列からなるポリペプチド、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のアミノ酸番号１０１（Ｌｅｕ）からアミノ酸番号１２２（Ｇｌｙ）のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
（ｄ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のアミノ酸番号１４１（Ａｓｎ）からアミノ酸番号１７４（Ａｌａ）のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
（ｅ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のアミノ酸番号１９３（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２６１（Ｖａｌ）のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
（ｆ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のアミノ酸番号５１（Ｔｒｐ）からアミノ酸番号６１（Ｇｌｕ）のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
（ｇ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のアミノ酸番号１３６（Ｉｌｅ）からアミノ酸番号１４３（Ｇｌｕ）のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
（ｈ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のアミノ酸番号１８７（Ｐｒｏ）からアミノ酸番号１９５（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
（ｉ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のアミノ酸番号２２３（Ｐｈｅ）からアミノ酸番号２３２（Ｇｌｕ）のアミノ酸配列からなるポリペプチド、および
（ｊ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のアミノ酸番号３６０（Ｇｌｕ）からアミノ酸番号３６８（Ａｓｐ）のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
からなる群から選択されたポリペプチドであって、動物中の免疫応答を誘発して抗体を生成させるポリペプチドを動物に接種すること、および
前記動物から抗体を単離することを含む、方法。
【請求項４１】
ｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドと特異的に結合する請求項４０の方法により製造された抗体。
【請求項４２】
抗体がモノクローナル抗体である、請求項４１に記載の抗体。
【請求項４３】
請求項２７に記載のポリペプチドと特異的に結合する抗体。
【請求項４４】
請求項１５に記載の発現ベクターの導入された細胞の培養であって、前記細胞が試験試料の存在および不在下でＤＮＡセグメントによりコードされるｚａｌｐｈａ１１タンパク質を発現させる培養を行なうことと、
試験試料の存在および不在下で生物学的または生化学的検定によりｚａｌｐｈａ１１の活性レベルを比較することと、
前記比較から試験試料中のｚａｌｐｈａ１１の活性の活性調節因子の存在を決定することを含む、試験試料中でｚａｌｐｈａ１１タンパク質活性の活性調節因子の存在を検出する方法。
【請求項４５】
試験試料と、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されたアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列を含むポリペプチドとを接触させること、および
ポリペプチドと試料中のリガンドとの結合を検出することを含む、試験試料内のｚａｌｐｈａ１１受容体のリガンドの検出方法。
【請求項４６】
ポリペプチドがさらにトランスメンブレンドメインおよび細胞内ドメインを含む、請求項４５に記載の方法。
【請求項４７】
ポリペプチドが培養した細胞内で結合された膜であり、かつ検出のステップが培養した細胞中の生物学的応答の測定を含む、請求項４５に記載の方法。
【請求項４８】
生物学的応答が細胞の増殖またはリポーター遺伝子の転写の活性化である、請求項４７に記載の方法。
【請求項４９】
ポリペプチドを固体の担体上で固定化する、請求項４５に記載の方法。
【請求項１】
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２５５（Ｌｅｕ）のアミノ酸配列、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２５６（Ｌｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
（ｄ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、および
（ｅ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号１（Ｍｅｔ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
からなる群から選択されたアミノ酸配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸残基の配列を含むｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドをコードする単離されたポリヌクレオチドであって、前記アミノ酸の同一性のパーセントがＦＡＳＴＡプログラムを用い、ｋｔｕｐ＝１、ギャップオープニングペナルティ＝１０、ギャップエクステンションペナルティ＝１、置換マトリックス＝ＢＬＯＳＵＭ６２とし、他のパラメーターをデフォルトとして設定して決められる、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項２】
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４に示される１番ヌクレオチドから１６１４番ヌクレオチドまでのポリヌクレオチド配列、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に示される１２６番ヌクレオチドから７７９番ヌクレオチドまでのポリヌクレオチド配列、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に示される１２６番ヌクレオチドから８３３番ヌクレオチドまでのポリヌクレオチド配列、
（ｄ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に示される８３４番ヌクレオチドから１６８２番ヌクレオチドまでのポリヌクレオチド配列、
（ｅ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に示される１２６番ヌクレオチドから１６８２番ヌクレオチドまでのポリヌクレオチド配列、および
（ｆ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に示される６９番ヌクレオチドから１６８２番ヌクレオチドまでのポリヌクレオチド配列、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドの配列を含む単離されたポリヌクレオチド。
【請求項３】
ｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドが、
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２５５（Ｌｅｕ）のアミノ酸配列、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２５６（Ｌｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
（ｄ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、および
（ｅ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号１（Ｍｅｔ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
からなる群から選択されたアミノ酸残基の配列を含む、請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項４】
ｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドが、
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）から２５５番アミノ酸番号２５５（Ｌｅｕ）のアミノ酸配列、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２５６（Ｌｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
（ｄ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、および
（ｅ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号１（Ｍｅｔ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
からなる群から選択されたアミノ酸残基の配列からなる、請求項３に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項５】
ポリペプチドがさらにＷＳＷＳＸドメインを含む、請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項６】
ポリペプチドがさらにトランスメンブレンドメインを含む、請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項７】
トランスメンブレンドメインがＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２の２３８番（Ｌｅｕ）から２５５番（Ｌｅｕ）の残基からなる、請求項６に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項８】
ポリペプチドがさらに細胞内ドメインを含む、請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項９】
細胞内ドメインがＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２の２５６番（Ｌｙｓ）から５３８番（Ｓｅｒ）の残基からなる、請求項８に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１０】
細胞内ドメインがさらにＢｏｘＩおよびＢｏｘＩＩ部位を含む、請求項９に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１１】
ポリペプチドがさらにアフィニティータグを含む、請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１２】
作用可能式に結合した下記の要素：
転写プロモーターと、
ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列を有するｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドをコードするＤＮＡセグメントと、
転写ターミネーターとを含む発現ベクターであって、前記プロモーターがＤＮＡセグメントと作用可能式に結合し、前記ＤＮＡセグメントが転写ターミネーターと作用可能式に結合している、発現ベクター。
【請求項１３】
さらにＤＮＡセグメントと作用可能式に結合した分泌シグナル配列を含む、請求項１２に記載の発現ベクター。
【請求項１４】
請求項１２に記載の発現ベクターを含む培養細胞であって、前記細胞が前記ＤＮＡセグメントによりコードされるポリペプチドを発現する、培養細胞。
【請求項１５】
転写プロモーターと、
ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列を有するｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドをコードするＤＮＡセグメントと、
転写ターミネーターとを含む発現ベクターであって、前記プロモーターとＤＮＡセグメントとターミネーターが作用可能式に結合している、発現ベクター。
【請求項１６】
さらにＤＮＡセグメントと作用可能式に結合した分泌シグナル配列を含む、請求項１５に記載の発現ベクター。
【請求項１７】
ポリペプチドがさらにＤＮＡセグメントと作用可能式に結合したトランスメンブレンドメインを含む、請求項１５に記載の発現ベクター。
【請求項１８】
トランスメンブレンドメインがＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２の２３８番（Ｌｅｕ）から２５５番（Ｌｅｕ）の残基を含む、請求項１７に記載の発現ベクター。
【請求項１９】
ポリペプチドがさらにＤＮＡセグメントと作用可能式に結合した細胞内ドメインを含む、請求項１５に記載の発現ベクター。
【請求項２０】
細胞内ドメインがＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２の２５６番（Ｌｙｓ）から５３８番（Ｓｅｒ）の残基からなる、請求項１９に記載の発現ベクター。
【請求項２１】
請求項１５に記載の発現ベクターの導入された培養細胞であって、前記細胞がＤＮＡセグメントによりコードされる可溶性の受容体ポリペプチドを発現する、培養細胞。
【請求項２２】
細胞が増殖のために外因的に供給された造血増殖因子に依存している、請求項２１に記載の細胞。
【請求項２３】
融合タンパク質をコードするＤＮＡ構築体であって、前記ＤＮＡ構築体が、
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号１（Ｍｅｔ）からアミノ酸番号１９（Ｇｌｙ）のアミノ酸配列、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２５５（Ｌｅｕ）のアミノ酸配列、
（ｄ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸２３８（Ｌｅｕ）からアミノ酸番号２５５（Ｌｅｕ）のアミノ酸配列、
（ｅ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２３８（Ｌｅｕ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列
（ｆ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２５６（Ｌｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、および
（ｇ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、からなる群から選択されたアミノ酸残基の配列を有するポリペプチドをコードする第一ＤＮＡセグメントと、
追加のポリペプチドをコードする少なくとも１個の別のＤＮＡセグメントとを含む構築体であって、
前記第一ＤＮＡセグメントおよび別のＤＮＡセグメントがイン・フレームで結合し、かつ前記第一ＤＮＡセグメントおよび別のＤＮＡセグメントが融合タンパク質をコードする、ＤＮＡ構築体。
【請求項２４】
作用可能式に結合した下記の要素：
転写プロモーターと、
請求項２３に記載の融合タンパク質をコードするＤＮＡ構築体と、
転写ターミネーターとを含む発現ベクターであって、前記プロモーターがＤＮＡ構築物と作用可能式に結合し、前記ＤＮＡセ構築体が転写ターミネーターと作用可能式に結合している、発現ベクター。
【請求項２５】
請求項２４に記載の発現ベクターを含む培養細胞であって、前記細胞がＤＮＡ構築体によりコードされるポリペプチドを発現する、培養細胞。
【請求項２６】
請求項２５に記載の細胞を培養することと、前記細胞により生成したポリペプチドを単離することを含む融合タンパク質の製造方法。
【請求項２７】
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）から２５５番アミノ酸番号２５５（Ｌｅｕ）のアミノ酸配列、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２５６（Ｌｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
（ｄ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、および
（ｅ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号１（Ｍｅｔ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
からなる群から選択されたアミノ酸配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸残基の配列を含む単離されたポリペプチドであって、前記アミノ酸の同一性のパーセントがＦＡＳＴＡプログラムを用い、ｋｔｕｐ＝１、ギャップオープニングペナルティ＝１０、ギャップエクステンションペナルティ＝１、置換マトリックス＝ＢＬＯＳＵＭ６２とし、他のパラメーターをデフォルトとして設定して決められる、単離されたポリペプチド。
【請求項２８】
請求項２７に記載の単離されたポリペプチドであって、前記ポリペプチドが、
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２５５（Ｌｅｕ）のアミノ酸配列、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２５６（Ｌｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
（ｄ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、および
（ｅ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号１（Ｍｅｔ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
からなる群から選択されたアミノ酸残基の配列を含む、単離されたポリペプチド。
【請求項２９】
請求項２７に記載の単離されたポリペプチドであって、アミノ酸残基の配列が、
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２５５（Ｌｅｕ）のアミノ酸配列、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２５６（Ｌｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
（ｄ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、および
（ｅ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号１（Ｍｅｔ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列、
からなる群から選択されたアミノ酸残基の配列からなる、単離されたポリペプチド。
【請求項３０】
ポリペプチドがさらにＷＳＷＳＸモチーフを含む、請求項２７に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項３１】
ポリペプチドがさらにトランスメンブレンドメインを含む、請求項２７に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項３２】
トランスメンブレンドメインがＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２の２３８番（Ｌｅｕ）から２５５番（Ｌｅｕ）の残基からなる、請求項３１に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項３３】
ポリペプチドがさらに細胞内ドメインを含む、請求項２７に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項３４】
細胞内ドメインがＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２の２５６番（Ｌｙｓ）から５３８番（Ｓｅｒ）の残基を含む、請求項３３に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項３５】
細胞内ドメインがさらにＢｏｘＩおよびＢｏｘＩＩ部位を含む、請求項３４に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項３６】
請求項１５に記載の細胞を培養すること、および前記細胞により生成したｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドを単離することを含むｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドの製造方法。
【請求項３７】
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されるアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列、
からなる群から選択されたアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチドであって、前記ポリペプチドが造血受容体と通常結合しているトランスメンブレンドメインおよび細胞内ドメインを実質上含まない、単離されたポリペプチド。
【請求項３８】
さらにアフィニティータグを含む、請求項３７に記載のポリペプチド。
【請求項３９】
請求項２１に記載の細胞を培養すること、および前記細胞により生成したｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドを単離することを含むｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドの製造方法。
【請求項４０】
ｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドに対する抗体の製造方法であって、
（ａ）９から５１９個のアミノ酸からなるポリペプチドであって、前記ポリペプチドがＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２中のアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号５３８（Ｓｅｒ）のアミノ酸の連続配列からなるポリペプチド、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のアミノ酸番号１０１（Ｌｅｕ）からアミノ酸番号１２２（Ｇｌｙ）のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
（ｄ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のアミノ酸番号１４１（Ａｓｎ）からアミノ酸番号１７４（Ａｌａ）のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
（ｅ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のアミノ酸番号１９３（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２６１（Ｖａｌ）のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
（ｆ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のアミノ酸番号５１（Ｔｒｐ）からアミノ酸番号６１（Ｇｌｕ）のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
（ｇ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のアミノ酸番号１３６（Ｉｌｅ）からアミノ酸番号１４３（Ｇｌｕ）のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
（ｈ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のアミノ酸番号１８７（Ｐｒｏ）からアミノ酸番号１９５（Ｓｅｒ）のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
（ｉ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のアミノ酸番号２２３（Ｐｈｅ）からアミノ酸番号２３２（Ｇｌｕ）のアミノ酸配列からなるポリペプチド、および
（ｊ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のアミノ酸番号３６０（Ｇｌｕ）からアミノ酸番号３６８（Ａｓｐ）のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
からなる群から選択されたポリペプチドであって、動物中の免疫応答を誘発して抗体を生成させるポリペプチドを動物に接種すること、および
前記動物から抗体を単離することを含む、方法。
【請求項４１】
ｚａｌｐｈａ１１ポリペプチドと特異的に結合する請求項４０の方法により製造された抗体。
【請求項４２】
抗体がモノクローナル抗体である、請求項４１に記載の抗体。
【請求項４３】
請求項２７に記載のポリペプチドと特異的に結合する抗体。
【請求項４４】
請求項１５に記載の発現ベクターの導入された細胞の培養であって、前記細胞が試験試料の存在および不在下でＤＮＡセグメントによりコードされるｚａｌｐｈａ１１タンパク質を発現させる培養を行なうことと、
試験試料の存在および不在下で生物学的または生化学的検定によりｚａｌｐｈａ１１の活性レベルを比較することと、
前記比較から試験試料中のｚａｌｐｈａ１１の活性の活性調節因子の存在を決定することを含む、試験試料中でｚａｌｐｈａ１１タンパク質活性の活性調節因子の存在を検出する方法。
【請求項４５】
試験試料と、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示されたアミノ酸番号２０（Ｃｙｓ）からアミノ酸番号２３７（Ｈｉｓ）のアミノ酸配列を含むポリペプチドとを接触させること、および
ポリペプチドと試料中のリガンドとの結合を検出することを含む、試験試料内のｚａｌｐｈａ１１受容体のリガンドの検出方法。
【請求項４６】
ポリペプチドがさらにトランスメンブレンドメインおよび細胞内ドメインを含む、請求項４５に記載の方法。
【請求項４７】
ポリペプチドが培養した細胞内で結合された膜であり、かつ検出のステップが培養した細胞中の生物学的応答の測定を含む、請求項４５に記載の方法。
【請求項４８】
生物学的応答が細胞の増殖またはリポーター遺伝子の転写の活性化である、請求項４７に記載の方法。
【請求項４９】
ポリペプチドを固体の担体上で固定化する、請求項４５に記載の方法。
【図１Ａ】
【図１Ｂ】
【図１Ｃ】
【図１Ｄ】
【図１Ｅ】
【図１Ｆ】
【図１Ｇ】
【図１Ｈ】
【図１Ｉ】
【図１Ｊ】
【図１Ｋ】
【図１Ｌ】
【図２Ａ】
【図２Ｂ】
【図１Ｂ】
【図１Ｃ】
【図１Ｄ】
【図１Ｅ】
【図１Ｆ】
【図１Ｇ】
【図１Ｈ】
【図１Ｉ】
【図１Ｊ】
【図１Ｋ】
【図１Ｌ】
【図２Ａ】
【図２Ｂ】
【公開番号】特開２０１１−１５７００（Ｐ２０１１−１５７００Ａ）
【公開日】平成２３年１月２７日（２０１１．１．２７）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１０−２３２５３４（Ｐ２０１０−２３２５３４）
【出願日】平成２２年１０月１５日（２０１０．１０．１５）
【分割の表示】特願２０００−５７４１４３（Ｐ２０００−５７４１４３）の分割
【原出願日】平成１１年９月２３日（１９９９．９．２３）
【出願人】（５０５２２２６４６）ザイモジェネティクス， インコーポレイテッド (72)
【Ｆターム（参考）】
【公開日】平成２３年１月２７日（２０１１．１．２７）
【国際特許分類】
【出願日】平成２２年１０月１５日（２０１０．１０．１５）
【分割の表示】特願２０００−５７４１４３（Ｐ２０００−５７４１４３）の分割
【原出願日】平成１１年９月２３日（１９９９．９．２３）
【出願人】（５０５２２２６４６）ザイモジェネティクス， インコーポレイテッド (72)
【Ｆターム（参考）】
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