タキサンに基づく薬物療法に対する悪性腫瘍の応答予測に有用な遺伝子変化
本発明は、悪性腫瘍、例えば、乳癌、卵巣癌、胃癌、大腸癌、食道癌、間葉癌、膀胱癌または非小細胞肺癌の、診断、予後、予測、予防および治療における補助のための新規組成物、方法および使用を提供する。乳癌患者の乳房組織において染色体性に増幅される遺伝子が開示される。さらに、タキサン耐性、タキサンによる利益または有害なタキサン反応に関連し、治療決定を行うための補助として利用できる染色体性に増幅される遺伝子および増幅されない遺伝子が開示される。
Notice: Undefined index: DEJ in /mnt/www/gzt_disp.php on line 298
【特許請求の範囲】
【請求項１】
１以上のマーカーの検出による癌治療に対する応答の予測または悪性腫瘍の診断または予後判断のための方法であって、該マーカーが表1に挙げる遺伝子およびその断片またはゲノム核酸配列であることを特徴とする方法。
【請求項２】
表1からの細胞発生バンドの隣接遺伝子が含められる請求項1の方法であって、該隣接遺伝子が表1の遺伝子と連関していることを特徴とする方法。
【請求項３】
治療が、タキサンに基づく治療、抗体治療、抗ホルモン治療、抗成長因子治療、アントラサイクリンに基づく治療、プラチナ塩に基づく治療またはその他の癌に対する治療である、請求項1および2の方法。
【請求項４】
少なくとも１つのマーカーの検出による悪性腫瘍の予測、診断または予後判断方法であって、マーカーが以下から選択されることを特徴とする方法:
a)表1の少なくとも１つの配列または表3からのそれぞれのプライマーおよびプローブ配列を含むポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチドアナログ;
b)(a)において特定したポリヌクレオチドにストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、表1のそれぞれの配列について特定したものと同じ生理機能を示すポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチドアナログ;
c) (a)および(b)において特定したポリヌクレオチドとは遺伝コードの発生により異なる配列であり、表1のそれぞれの 配列について特定したものと同じ生理機能を示すポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチドアナログ;
d) (a)〜(c) において特定したポリヌクレオチド配列の特定の断片、誘導体または対立遺伝子変異を表すポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチドアナログ;
e) (a)〜(d) において特定したポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチドアナログ配列によってコードされる精製ポリペプチド。
【請求項５】
悪性腫瘍が、乳癌、卵巣癌、胃癌、大腸癌、食道癌、間葉癌、膀胱癌、頭頸部癌、膵臓癌、前立腺癌、または非小細胞肺癌である、請求項1〜4のいずれかの方法。
【請求項６】
１以上の染色体領域のコピー数が定量的 PCRによって検出されることを特徴とする、 染色体変化の検出方法。
【請求項７】
検出方法が、PCR、アレイ、ビーズまたは配列決定方法の使用を含む、請求項1〜6のいずれかの方法。
【請求項８】
マーカーがVNTR、SNP、RFLPまたはSTSである少なくとも１つのマーカーの検出による悪性腫瘍の予測、診断または予後判断方法であって、マーカーが増幅により悪性腫瘍において変化する１つの染色体領域に位置し、マーカーが同じ個体の癌および非癌組織または生物学的サンプルにおいて検出されることを特徴とする方法。
【請求項９】
変化した染色体領域に位置する遺伝子によってコードされる個々のmRNAの相対的存在量が検出されることを特徴とする、染色体変化の検出方法。
【請求項１０】
マーカーが医学的または臨床的パラメーターとアルゴリズムにおいて組み合わされる、請求項 1〜9のいずれかの方法。
【請求項１１】
マーカーが、表 2に挙げられる遺伝子およびその断片またはゲノム核酸配列であって、表1に挙げられる遺伝子およびその断片またはゲノム核酸配列と組み合わされたもの(複数マーカー)である、請求項1〜10のいずれかの方法。
【請求項１２】
マーカーがホルマリン固定およびパラフィン包埋組織から検出される、請求項1〜11のいずれかの方法。
【請求項１３】
請求項1〜12のいずれかの方法を行うための診断用キット。
【請求項１】
１以上のマーカーの検出による癌治療に対する応答の予測または悪性腫瘍の診断または予後判断のための方法であって、該マーカーが表1に挙げる遺伝子およびその断片またはゲノム核酸配列であることを特徴とする方法。
【請求項２】
表1からの細胞発生バンドの隣接遺伝子が含められる請求項1の方法であって、該隣接遺伝子が表1の遺伝子と連関していることを特徴とする方法。
【請求項３】
治療が、タキサンに基づく治療、抗体治療、抗ホルモン治療、抗成長因子治療、アントラサイクリンに基づく治療、プラチナ塩に基づく治療またはその他の癌に対する治療である、請求項1および2の方法。
【請求項４】
少なくとも１つのマーカーの検出による悪性腫瘍の予測、診断または予後判断方法であって、マーカーが以下から選択されることを特徴とする方法:
a)表1の少なくとも１つの配列または表3からのそれぞれのプライマーおよびプローブ配列を含むポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチドアナログ;
b)(a)において特定したポリヌクレオチドにストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、表1のそれぞれの配列について特定したものと同じ生理機能を示すポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチドアナログ;
c) (a)および(b)において特定したポリヌクレオチドとは遺伝コードの発生により異なる配列であり、表1のそれぞれの 配列について特定したものと同じ生理機能を示すポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチドアナログ;
d) (a)〜(c) において特定したポリヌクレオチド配列の特定の断片、誘導体または対立遺伝子変異を表すポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチドアナログ;
e) (a)〜(d) において特定したポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチドアナログ配列によってコードされる精製ポリペプチド。
【請求項５】
悪性腫瘍が、乳癌、卵巣癌、胃癌、大腸癌、食道癌、間葉癌、膀胱癌、頭頸部癌、膵臓癌、前立腺癌、または非小細胞肺癌である、請求項1〜4のいずれかの方法。
【請求項６】
１以上の染色体領域のコピー数が定量的 PCRによって検出されることを特徴とする、 染色体変化の検出方法。
【請求項７】
検出方法が、PCR、アレイ、ビーズまたは配列決定方法の使用を含む、請求項1〜6のいずれかの方法。
【請求項８】
マーカーがVNTR、SNP、RFLPまたはSTSである少なくとも１つのマーカーの検出による悪性腫瘍の予測、診断または予後判断方法であって、マーカーが増幅により悪性腫瘍において変化する１つの染色体領域に位置し、マーカーが同じ個体の癌および非癌組織または生物学的サンプルにおいて検出されることを特徴とする方法。
【請求項９】
変化した染色体領域に位置する遺伝子によってコードされる個々のmRNAの相対的存在量が検出されることを特徴とする、染色体変化の検出方法。
【請求項１０】
マーカーが医学的または臨床的パラメーターとアルゴリズムにおいて組み合わされる、請求項 1〜9のいずれかの方法。
【請求項１１】
マーカーが、表 2に挙げられる遺伝子およびその断片またはゲノム核酸配列であって、表1に挙げられる遺伝子およびその断片またはゲノム核酸配列と組み合わされたもの(複数マーカー)である、請求項1〜10のいずれかの方法。
【請求項１２】
マーカーがホルマリン固定およびパラフィン包埋組織から検出される、請求項1〜11のいずれかの方法。
【請求項１３】
請求項1〜12のいずれかの方法を行うための診断用キット。
【図３】
【公表番号】特表２００８−５２４９８６（Ｐ２００８−５２４９８６Ａ）
【公表日】平成２０年７月１７日（２００８．７．１７）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００７−５４４８１３（Ｐ２００７−５４４８１３）
【出願日】平成１７年１２月８日（２００５．１２．８）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＥＰ２００５／０１３１４１
【国際公開番号】ＷＯ２００６／０６１２１６
【国際公開日】平成１８年６月１５日（２００６．６．１５）
【公序良俗違反の表示】
（特許庁注：以下のものは登録商標）
１．Ｌｉｎｕｘ
【出願人】（５０３４１２１４８）バイエル・ヘルスケア・アクチェンゲゼルシャフト (206)
【氏名又は名称原語表記】Ｂａｙｅｒ ＨｅａｌｔｈＣａｒｅ ＡＧ
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２０年７月１７日（２００８．７．１７）
【国際特許分類】
【出願日】平成１７年１２月８日（２００５．１２．８）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＥＰ２００５／０１３１４１
【国際公開番号】ＷＯ２００６／０６１２１６
【国際公開日】平成１８年６月１５日（２００６．６．１５）
【公序良俗違反の表示】
（特許庁注：以下のものは登録商標）
１．Ｌｉｎｕｘ
【出願人】（５０３４１２１４８）バイエル・ヘルスケア・アクチェンゲゼルシャフト (206)
【氏名又は名称原語表記】Ｂａｙｅｒ ＨｅａｌｔｈＣａｒｅ ＡＧ
【Ｆターム（参考）】
[ Back to top ]