タンパク質精製におけるウイルス除去の改良方法
本発明は、タンパク質精製の分野に関する。特に本発明は、前濾過工程における内毒素除去と陽イオン交換媒体の併用により、ウイルスフィルターの濾過能力を増大するための方法に関する。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、タンパク質精製の分野からである。特に本発明は、前濾過工程における内毒素除去と陽イオン交換媒体の併用により、ウイルスフィルターの濾過能力を増大するための方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
哺乳類細胞株は、適正タンパク質フォールディングおよび翻訳後修飾、例えばグリコシル化に関するそれらの能力のために、組換えタンパク質治療薬の産生のための第一選択肢になっている（Chu and Robinson Current Opinion in Biotechnology 12:180 ‐ 187, 2001）。しかしながら、これらの細胞株は、レトロウイルス様粒子を含有し（Lieber et al. Science 182:56 ‐ 59, 1973； Lubiniecki et al. Dev Biol Stand 70:187 ‐ 191, 1989）、潜在的アデノウイルス汚染の危険を有する（Garnick, Dev Biol Stand. Basel: Karger 93:21 ‐ 29, 1998）ことも知られている。組換えタンパク質薬剤を製造するバイオ製薬産業は良好な安全記録を有するが、一方、血液ならびに血漿由来の血液製品によるウイルス感染が過去に発生している（Brown, Dev. Biol. Stand. 81, 1993； Thomas, Lancet 343:1583-1584, 1994）。組換えタンパク質産生中のウイルス汚染の危険を軽減するために、下流精製工程は、内因性および外因性ウイルスを除去する工程段階を包含するよう設計される。ウイルス不活性化か工程供給流からのウイルス除去のいずれかを提供するいくつかの工程段階の組合せにより、適切なウイルス排除が得られる。ウイルス不活性化は低ｐＨでのインキュベーション、熱処理および洗剤といったような技法を用いて達成されるが、一方、ウイルス除去は、典型的には、クロマトグラフィーおよび濾過を用いて実施される（Curtis et al., Biotechnology and Bioengineering 84(2):179 ‐ 186, 2003）。
【０００３】
実効電荷のような物理化学的特性に基づいてウイルスを除去するクロマトグラフィー媒体と違って、ウイルス濾過はサイズ排除によりウイルスを除去し、したがってより強力な技法と考えられる。今までのところ、哺乳類細胞培養由来のバイオ治療薬の下流精製中のウイルス濾過の使用は、６０ｎｍ未満の公称孔サイズを有する高処理量膜の欠如のために、レトロウイルス（直径８０〜１００ｎｍ）の除去に限定されている。
【０００４】
膜技術の近年の進歩は、２０ｎｍの公称孔サイズを有する高処理量膜の製造を可能にした。これらのウイルスフィルターは、パルボウイルス（直径１８〜２６ｎｍ）に対して保持性であり、１６０ｋＤ（約８ｎｍ）という大きさであるタンパク質、例えばモノクローナル抗体（ｍＡｂ）の通過を可能にする。
【０００５】
パルボウイルスフィルターに伴う高選択性および高処理量は、微細孔基材上に薄い保持膜を成型することにより達成される。薄い保持層は、タンパク質およびウイルスの非常に精密な分離を可能にするものの、それは、工程供給流中の不純物による付着を受け易くもあり、フィルター能力および流量が低下する。ウイルスフィルターの汚損は、タンパク質凝集物および変性タンパク質のような夾雑物のせいである。BohonakとZydney(Bohonak and Zydney, Journal of Membrane Science 254(1-2):71-79, 2005)は、フィルター能力の損失がケーク形成または孔遮断のためであり得る、ということを示した。他の近年の報告（Bolton et al., Biotechnol. Appl. Biochem. 43:55-63, 2006; Levy et al., Filtration in the Biopharamaceutical Industry. (Meltzer, T.H. and Jornitz, M.W., eds.) pp. 619-646, Marcel Dekker, New York, 1998）は、フィルター汚損を孔壁への不純物の吸着のせいであると考えた。いくつかの出版物（Bolton et al., Biotechnology and Applied Biochemistry 42:133-142, 2005；Hirasaki et al., Polymer Journal 26(11):1244-1256, 1994；Omar and Kempf, Transfusion 42(8):1005-1010, 2002）は、フィルター能力の低減または孔の閉塞がウイルス保持を数桁減少して、ユニット操作の頑健性に影響を及ぼし得る、ということも実証している。
【０００６】
したがって多数の近年の研究は、工程供給流からの汚損物を除去して、ウイルスフィルター汚損を最小限にし、そして高能力、高処理量および頑健なウイルス保持を保証するための前置フィルターの特定に集中してきた。Bolton等（Bolton et al. 2006）は、前置フィルターとしていくつかの膜を試験することを含む徹底的な研究を実施して、前置フィルターとしてＶｉｒｅｓｏｌｖｅ（商標）深層フィルターを用いることにより、正常流動パルボウイルス（ＮＦＰ）膜の能力を、ほとんど一桁増大することが可能である、ということを実証した。Brown等(Brown et al. 2008, Use of Charged Membranes to Identify Soluble Protein Foulants in order to Facilitate Parvovirus Filtration. IBC’s 20th Antibody Development and Production, San Diego, CA)は、パルボウイルス保持フィルターに対する前置フィルターとしての強力な陽イオン交換膜吸着装置を評価して、ウイルスフィルターの能力が１１の異なるｍＡｂ流に関して数倍増大され得る、ということを示した。陽イオン交換膜吸着装置は競合的吸着により供給流から大分子量（約６００−１５００ｋＤ）タンパク質凝集物を除去して、ウイルスフィルターが詰まらないようにする、と本著者等は仮定した。米国特許第７，１１８，６７５号(Siwak等)は、タンパク質溶液からタンパク質凝集物を除去してウイルスフィルターの汚損を防止するために電荷修正膜を利用する工程を記載する。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００７】
本発明は、少なくとも一部は、パルボウイルスフィルターの汚損が文献に記述されたもの以外の不純物のためであり得るし、ウイルス濾過能力を改良するためにはより包括的な前濾過解決策が必要とされる、という実験知見に基づいている。したがって、本発明は、文献に記述される最良の前濾過アプローチ（陽イオン交換膜吸着装置）より大幅に良好に機能する新規の前濾過解決策を提供する。
【０００８】
一態様では、本発明は、タンパク質精製中のウイルスフィルターの濾過能力の改良方法であって、精製されるべきタンパク質を含む組成物を、いずれかの順序で、陽イオン交換ステップおよび内毒素除去ステップに付した後、上記ウイルスフィルターに通すことを包含する方法に関する。
【０００９】
一実施形態では、ウイルスフィルターの孔サイズは直径約１５〜約１００ｎｍである。
【００１０】
別の実施形態では、ウイルスフィルターの孔サイズは直径約１５〜約３０ｎｍである。
【００１１】
さらに別の実施形態では、ウイルスフィルターの孔サイズは約２０ｎｍである。
【００１２】
さらなる実施形態では、除去されるべきウイルスはパルボウイルスである。
【００１３】
さらなる実施形態では、パルボウイルスの直径は約１８〜約２６ｎｍである。
【００１４】
異なる一実施形態では、タンパク質は抗体または抗体断片、例えば組換えＤＮＡ技術により産生される抗体またはその断片である。
【００１５】
別の実施形態では、抗体は治療用抗体である。
【００１６】
さらに別の実施形態では、組換え抗体または抗体断片は哺乳動物宿主細胞、例えばチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞中で産生される。
【００１７】
さらなる実施形態では、精製されるべきタンパク質を含む組成物は、先ず陽イオン交換ステップに、その後、内毒素除去ステップに付された後に、ウイルス濾過される。
【００１８】
さらなる実施形態では、精製されるべきタンパク質を含む組成物は、先ず内毒素除去ステップに、その後、陽イオン交換ステップに付された後に、ウイルス濾過される。
【００１９】
別の実施形態では、精製されるべきタンパク質を含む組成物は、単一モジュールで２つの媒体を一緒に保持することにより、陽イオン交換ステップおよび内毒素除去ステップに同時に付された後に、ウイルス濾過される。
【００２０】
さらに別の実施形態では、内毒素除去ステップ直後にウイルス濾過がなされる。
【００２１】
さらなる実施形態では、陽イオン交換ステップ直後にウイルス濾過がなされる。
【００２２】
異なる一実施形態では、ウイルス濾過はｐＨ約４〜約１０で実施される。
【００２３】
別の実施形態では、精製されるべき組成物中のタンパク質濃度は約１〜４０ｇ／Ｌである。
【００２４】
さらに別の実施形態では、精製されるべき抗体は、ＨＥＲ１（ＥＧＦＲ）、ＨＥＲ２、ＨＥＲ３、ＨＥＲ４、ＶＥＧＦ、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ１１ａ、ＣＤ１１ｂ、ＣＤ１１ｃ、ＣＤ１８、ＩＣＡＭ、ＶＬＡ−４、ＶＣＡＭ、ＩＬ−１７Ａおよび／またはＦ、ＩｇＥ、ＤＲ５、ＣＤ４０、Ａｐｏ２Ｌ／ＴＲＡＩＬ、ＥＧＦＬ７、ＮＲＰ１、有糸分裂活性化プロテインキナーゼ（ＭＡＰＫ）およびＤ因子からなる群から選択される１つ以上の抗原に対するものである。
【００２５】
さらなる実施形態では、抗体は、抗エストロゲン受容体抗体、抗プロゲステロン受容体抗体、抗ｐ５３抗体、抗カテプシンＤ抗体、抗Ｂｃｌ−２抗体、抗Ｅ−カドヘリン抗体、抗ＣＡ１２５抗体、抗ＣＡ１５−３抗体、抗ＣＡ１９−９抗体、抗ｃ−ｅｒｂＢ−２抗体、抗Ｐ−糖タンパク質抗体、抗ＣＥＡ抗体、抗網膜芽細胞腫タンパク質抗体、抗ｒａｓ腫瘍性タンパク質抗体、抗ルイスＸ抗体、抗Ｋｉ−６７抗体、抗ＰＣＮＡ抗体、抗ＣＤ３抗体、抗ＣＤ４抗体、抗ＣＤ５抗体、抗ＣＤ７抗体、抗ＣＤ８抗体、抗ＣＤ９／ｐ２４抗体、抗ＣＤ１０抗体、抗ＣＤ１１ｃ抗体、抗ＣＤ１３抗体、抗ＣＤ１４抗体、抗ＣＤ１５抗体、抗ＣＤ１９抗体、抗ＣＤ２３抗体、抗ＣＤ３０抗体、抗ＣＤ３１抗体、抗ＣＤ３３抗体、抗ＣＤ３４抗体、抗ＣＤ３５抗体、抗ＣＤ３８抗体、抗ＣＤ４１抗体、抗ＬＣＡ／ＣＤ４５抗体、抗ＣＤ４５ＲＯ抗体、抗ＣＤ４５ＲＡ抗体、抗ＣＤ３９抗体、抗ＣＤ１００抗体、抗ＣＤ９５／Ｆａｓ抗体、抗ＣＤ９９抗体、抗ＣＤ１０６抗体、抗ユビキチン抗体、抗ＣＤ７１抗体、抗ｃ−ｍｙｃ抗体、抗サイトケラチン抗体、抗ビメンチン抗体、抗ＨＰＶタンパク質抗体、抗カッパ軽鎖抗体、抗ラムダ軽鎖抗体、抗メラノソーム抗体、抗前立腺特異的抗原抗体、抗Ｓ−１００抗体、抗タウ抗原抗体、抗フィブリン抗体、抗ケラチン抗体および抗Ｔｎ−抗原抗体からなる群から選択される。
【図面の簡単な説明】
【００２６】
【図１】ウイルス濾過試験のために用いられる実験準備の模式図である。
【図２】Ｖｉｒｅｓｏｌｖｅ Ｐｒｏパルボウイルス保持フィルターの能力に及ぼす滅菌および深層フィルターの作用を示す図である。ｐＨ５．５および伝導度８．５ｍＳ／ｃｍで、実験を実施した。ｍＡｂ濃度は約１３ｇ／Ｌであった。
【図３ａ】Ｖｉｒｅｓｏｌｖｅ Ｐｒｏパルボウイルスフィルターの能力に及ぼす前置フィルターとしての陽イオン交換および内毒素除去膜吸着装置の作用を示す図である。ＭＡｂ１に関してそれぞれｐＨ５．０および６．５で、３（ａ）および３（ｂ）のデータを得た。
【図３ｂ】Ｖｉｒｅｓｏｌｖｅ Ｐｒｏパルボウイルスフィルターの能力に及ぼす前置フィルターとしての陽イオン交換および内毒素除去膜吸着装置の作用を示す図である。ＭＡｂ１に関してそれぞれｐＨ５．０および６．５で、３（ａ）および３（ｂ）のデータを得た。
【図４ａ】ＭＡｂ１に関するＶｉｒｅｓｏｌｖｅ Ｐｒｏパルボウイルス保持フィルターの能力に及ぼす陽イオン交換および内毒素除去膜吸着装置の両方を含有する新規の前濾過列の作用を示す図である。それぞれｐＨ５．０および６．５で、４（ａ）および４（ｂ）のデータを得た。
【図４ｂ】ＭＡｂ１に関するＶｉｒｅｓｏｌｖｅ Ｐｒｏパルボウイルス保持フィルターの能力に及ぼす陽イオン交換および内毒素除去膜吸着装置の両方を含有する新規の前濾過列の作用を示す図である。それぞれｐＨ５．０および６．５で、４（ａ）および４（ｂ）のデータを得た。
【図５】ＭＡｂ２に関するパルボウイルス保持フィルターの能力に及ぼす、陽イオン交換前濾過媒体と比較した場合の、陽イオン交換および内毒素除去膜吸着装置の両方を含有する新規の前濾過列の作用を示す図である。
【発明を実施するための形態】
【００２７】
Ｉ． 定義
「タンパク質」とは、その鎖長が高レベルの三次および／または四次構造を作り出すのに十分であるアミノ酸の配列を意味する。したがって、タンパク質は、同様にアミノ酸ベースの分子ではあるがこのような構造を有さない「ペプチド」と区別される。典型的には、本明細書中で用いるためのタンパク質は、少なくとも約１５〜２０ｋＤ、好ましくは少なくとも約２０ｋＤの分子量を有する。
【００２８】
本明細書中の定義内に包含されるタンパク質の例としては、哺乳類タンパク質、例えば、ＣＤ４、インテグリンおよびそれらのサブユニット、例えばベータ７、成長ホルモン、例えばヒト成長ホルモンおよびウシ成長ホルモン；成長ホルモン放出因子；上皮小体ホルモン；甲状腺刺激ホルモン；リポタンパク質；α−１−抗トリプシン；インスリンＡ−鎖；インスリンＢ−鎖；プロインスリン；濾胞刺激ホルモン；カルシトニン；黄体形成ホルモン；グルカゴン；凝固因子、例えばＶＩＩＩＣ因子、ＩＸ因子、組織因子およびフォン・ウィルブランド因子；抗凝固因子、例えばプロテインＣ；心房ナトリウム利尿因子；肺界面活性剤；プラスミノーゲン活性化剤、例えばウロキナーゼまたは組織型プラスミノーゲン活性化剤（ｔ−ＰＡ、例えばアクチベース（登録商標）、ＴＮＫアーゼ（登録商標）、レテベース（登録商標））；ボンバジン；トロンビン；腫瘍壊死因子αおよびβ；エンケファリナーゼ；ＲＡＮＴＥＳ（ｒｅｇｕｌａｔｅｄ ｏｎ ａｃｔｉｖａｔｉｏｎ ｎｏｒｍａｌｌｙ Ｔ−Ｃｅｌｌ ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ ａｎｄ ｓｅｃｒｅｔｅｄ（活性化時に調節され、正常Ｔ細胞により発現され、分泌される））；ヒトマクロファージ炎症タンパク質（ＭＩＰ−１−α）；血清アルブミン、例えばヒト血清アルブミン；ミュラー抑制物質；マウスゴナドトロピン関連ペプチド；ＤＮアーゼ；インヒビン；アクチビン；血管内皮成長因子（ＶＥＧＦ）；ＩｇＥ、ホルモンまたは成長因子のための受容体；インテグリン；プロテインＡまたはＤ；リウマチ因子；神経栄養因子、例えば骨由来神経栄養因子（ＢＤＮＦ）、ニューロトロフィン−３、−４、−５または−６（ＮＴ−３、ＮＴ−４、ＮＴ−５またはＮＴ−６）、あるいは神経成長因子、例えばＮＧＦ−β；血小板由来成長因子（ＰＤＧＦ）；繊維芽細胞成長因子、例えばａＦＧＦおよびｂＦＧＦ；上皮細胞成長因子（ＥＧＦ）；形質転換成長因子（ＴＧＦ）、例えばＴＧＦ−αおよびＴＧＦ−β、例えばＴＧＦ−β１、ＴＧＦ−β２、ＴＧＦ−β３、ＴＧＦ−β４またはＴＧＦ−β５；インスリン様成長因子ＩおよびＩＩ（ＩＧＦ−ＩおよびＩＧＦ−ＩＩ）；ｄｅｓ（１−３）−ＩＧＦ−Ｉ（脳ＩＧＦ−Ｉ）；インスリン様成長因子結合タンパク質；その他のＣＤタンパク質、例えばＣＤ３、ＣＤ８、ＣＤ１９およびＣＤ２０；エリスロポエチン（ＥＰＯ）；トロンボポエチン（ＴＰＯ）；骨誘導因子；免疫毒素；骨形態形成タンパク質（ＢＭＰ）；インターフェロン、例えばインターフェロンα、βおよびγ；コロニー刺激因子（ＣＳＦ）、例えばＭ−ＣＳＦ、ＧＭ−ＣＳＦおよびＧ−ＣＳＦ；インターロイキン（ＩＬ）、例えばＩＬ−１〜ＩＬ−１０；スーパーオキシドジスムターゼ；Ｔ−細胞受容体；表面膜タンパク質；崩壊促進因子（ＤＡＦ）；ウイルス抗原、例えばＡＩＤＳエンベロープの一部；輸送タンパク質；ホーミング受容体；アドレッシン；調節タンパク質；インテグリン、例えばＣＤ１１ａ、ＣＤ１１ｂ、ＣＤ１１ｃ、ＣＤ１８、ＩＣＡＭ、ＶＬＡ−４およびＶＣＡＭ；腫瘍関連抗原、例えばＨＥＲ１（ＥＧＦＲ）、ＨＥＲ２、ＨＥＲ３またはＨＥＲ４受容体；アポ２Ｌ／ＴＲＡＩＬ、そして上記ポリペプチドのいずれかの断片；ならびに上記タンパク質のいずれかと結合するイムノアドヘシンおよび抗体；そして上記タンパク質のいずれかの生物学的に活性な断片または変異体が挙げられる。
【００２９】
具体的には、本明細書中で定義される「タンパク質」の定義内に含まれるのは、治療用抗体およびイムノアドヘシン、例えば以下の抗原のうちの１つ以上に対する抗体であるが、これらに限定されない：ＨＥＲ１（ＥＧＦＲ）、ＨＥＲ２、ＨＥＲ３、ＨＥＲ４、ＶＥＧＦ、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ１１ａ、ＣＤ１１ｂ、ＣＤ１１ｃ、ＣＤ１８、ａｎ ＩＣＡＭ、ＶＬＡ−４、ＶＣＡＭ、IＬ−１７Ａおよび／またはＦ、ＩｇＥ、ＤＲ５、ＣＤ４０、アポ２Ｌ／ＴＲＡＩＬ、ＥＧＦＬ７、ＮＲＰ１、有糸分裂活性化プロテインキナーゼ（ＭＡＰＫ）およびＤ因子、ならびにその断片。
【００３０】
他の抗体の例としては以下から選択されるものが挙げられるが、これらに限定されない：抗エストロゲン受容体抗体、抗プロゲステロン受容体抗体、抗ｐ５３抗体、抗カテプシンＤ抗体、抗Ｂｃｌ−２抗体、抗Ｅ−カドヘリン抗体、抗ＣＡ１２５抗体、抗ＣＡ１５−３抗体、抗ＣＡ１９−９抗体、抗ｃ−ｅｒｂＢ−２抗体、抗Ｐ−糖タンパク質抗体、抗ＣＥＡ抗体、抗網膜芽細胞腫タンパク質抗体、抗ｒａｓ腫瘍性タンパク質抗体、抗ルイスＸ抗体、抗Ｋｉ−６７抗体、抗ＰＣＮＡ抗体、抗ＣＤ３抗体、抗ＣＤ４抗体、抗ＣＤ５抗体、抗ＣＤ７抗体、抗ＣＤ８抗体、抗ＣＤ９／ｐ２４抗体、抗ＣＤ１０抗体、抗ＣＤ１１ｃ抗体、抗ＣＤ１３抗体、抗ＣＤ１４抗体、抗ＣＤ１５抗体、抗ＣＤ１９抗体、抗ＣＤ２３抗体、抗ＣＤ３０抗体、抗ＣＤ３１抗体、抗ＣＤ３３抗体、抗ＣＤ３４抗体、抗ＣＤ３５抗体、抗ＣＤ３８抗体、抗ＣＤ４１抗体、抗ＬＣＡ／ＣＤ４５抗体、抗ＣＤ４５ＲＯ抗体、抗ＣＤ４５ＲＡ抗体、抗ＣＤ３９抗体、抗ＣＤ１００抗体、抗ＣＤ９５／Ｆａｓ抗体、抗ＣＤ９９抗体、抗ＣＤ１０６抗体、抗ユビキチン抗体、抗ＣＤ７１抗体、抗ｃ−ｍｙｃ抗体、抗サイトケラチン抗体、抗ビメンチン抗体、抗ＨＰＶタンパク質抗体、抗カッパ軽鎖抗体、抗ラムダ軽鎖抗体、抗メラノソーム抗体、抗前立腺特異的抗原抗体、抗Ｓ−１００抗体、抗タウ抗原抗体、抗フィブリン抗体、抗ケラチン抗体および抗Ｔｎ−抗原抗体。
【００３１】
「単離」タンパク質、例えば抗体は、その天然環境の構成成分から同定され、分離され、および／または回収されたものである。その天然環境の夾雑構成成分は、抗体のようなタンパク質に関する診断的または治療的使用を妨害するであろう物質であり、例としては、酵素、ホルモン、およびその他のタンパク質様または非タンパク質様溶質が挙げられ得る。好ましい実施形態では、タンパク質、例えば抗体は、（１）ローリー法により決定して、９５重量％より高い値に、最も好ましくは９９重量％より高い値に、（２）スピニングカップシーケネーターの使用によりＮ末端または内部アミノ酸配列の少なくとも１５残基を得るのに十分な程度に、あるいは（３）クーマシーブルー、好ましくは銀染色を用いて、還元または非還元条件下で、ＳＤＳ−ＰＡＧＥにより均質に精製される。
【００３２】
タンパク質は、好ましくは本質的に純粋であり、望ましくは本質的に均質である（すなわち、夾雑タンパク質を含有しない）。「本質的に純粋な」タンパク質とは、組成物の総重量に基づいて少なくとも約９０重量％、好ましくは少なくとも約９５重量％のタンパク質を含む組成物を意味する。
【００３３】
「本質的に均質な」タンパク質は、組成物の総重量に基づいて、少なくとも約９９重量％のタンパク質を含む組成物を意味する。
【００３４】
「抗体」という用語は、最も広い意味で用いられ、具体的には、モノクローナル抗体（例えば、免疫グロブリンＦｃ領域を有する全長抗体）、多エピトープ特異性を有する抗体組成物、二重特異性抗体、ダイアボディおよび一本鎖分子、ならびに抗体断片（例えば、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）２およびＦｖ）を包含する。
【００３５】
基本的４鎖抗体単位は、２つの同一軽（Ｌ）鎖および２つの同一重（Ｈ）鎖で構成されるヘテロ四量体糖タンパク質である。ＩｇＭ抗体は、Ｊ鎖と呼ばれる付加的ポリペプチドを伴った５つの基本へテロ四量体単位からなり、１０の抗原結合部位を含有するが、一方、ＩｇＡ抗体は２〜５つの基本４鎖単位からなり、これは重合して、Ｊ鎖と組合せて多価集合体を形成し得る。ＩｇＧの場合、４鎖単位は、一般的に約１５０，０００ダルトンである。各Ｌ鎖は１つの共有ジスルフィド結合によりＨ鎖と連結されるが、一方、２つのＨ鎖は、Ｈ鎖アイソタイプに依存して、１つ以上のジスルフィド結合により互いに連結される。ＨおよびＬ鎖は、各々、規則的な間隔の鎖内ジスルフィド架橋も有する。各Ｈ鎖は、Ｎ末端に可変ドメイン（ＶＨ）と、その後にαおよびγ鎖の各々では３つの定常ドメイン（ＣＨ）ならびにμおよびεアイソタイプでは４つのＣＨドメインを有する。各Ｌ鎖は、Ｎ末端に可変ドメイン（ＶＬ）と、その後にその他端に定常ドメインを有する。ＶＬはＶＨとともに整列され、そしてＣＬは重鎖の最初の定常ドメイン（ＣＨ１）と整列される。特定のアミノ酸残基が、軽鎖および重鎖可変ドメイン間の界面を形成すると考えられる。ＶＨおよびＶＬの対合は一緒になって、単一の抗原結合部位を形成する。異なるクラスの抗体の構造および特性に関しては、例えば、Basic and Clinical Immunology, 8th Edition, Daniel P. Sties, Abba I. Terr and Tristram G. Parsolw (eds), Appleton & Lange, Norwalk, CT, 1994, page 71 and Chapter 6を参照されたい。
【００３６】
任意の脊椎動物種からのＬ鎖は、それらの定常ドメインのアミノ酸配列に基づいて、カッパおよびラムダと呼ばれる２つの明白に異なる型のうちの１つに割り当てられ得る。それらの重鎖の定常ドメイン（ＣＨ）のアミノ酸配列によって、免疫グロブリンは異なるクラスまたはアイソタイプに割り当てられ得る。それぞれα、δ、ε、γおよびμと呼ばれる重鎖を有する５つのクラスの免疫グロブリンすなわちＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧおよびＩｇＭがある。γおよびμクラスは、ＣＨ配列および機能の相対的に小さな差に基づいてさらにサブクラスに分けられ、例えばヒトは、以下のサブクラスを発現する：ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１およびＩｇＡ２。
【００３７】
「可変」という用語は、可変ドメインのあるセグメントが抗体の間の配列で広範囲に異なる、という事実を指す。Ｖドメインは抗原結合を媒介し、特定抗体の、その特定抗原に関する特異性を限定する。しかしながら、変異性は、可変ドメインの全スパンを通して均一に分布しない。その代わりに、Ｖ領域は、各々約９〜１２アミノ酸残基長である「超可変領域」と呼ばれ、時として「相補性決定領域」（ＣＤＲ）と呼ばれ非常に高い変異性を有する短い領域により分離される約１５〜３０アミノ酸残基のフレームワーク領域（ＦＲ）と呼ばれる比較的不変のストレッチから成る。自然の重鎖および軽鎖の可変ドメインは各々、４つのＦＲ（大部分はβシート立体配置をとり、３つの超可変領域により連結される）を含み、これは、βシート構造を連結し、いくつかの場合には、その一部を構成するループを形成する。各鎖中の超可変領域は、ＦＲにより密に接近して一緒に保持され、そして他の鎖からの超可変領域とともに、抗体の抗原結合部位の形成に寄与する（Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991)参照）。定常ドメインは、抗体と抗原の結合に直接関与しないが、抗体依存性細胞性細胞毒性（ＡＤＣＣ）の関与といったような種々のエフェクター機能を示す。
【００３８】
「超可変領域」（「相補性決定領域」またはＣＤＲとしても既知である）という用語は、本明細書中で用いる場合、抗原結合部位を形成し、抗原特異性の主な決定因子である免疫グロブリンのＶ領域ドメイン内にある（通常は、非常に高い配列変異性を有する３または４つの短い領域）抗体のアミノ酸残基を指す。ＣＤＲ残基を特定するためには、少なくとも２つの方法がある：（１）交差種配列変異性に基づいたアプローチ（すなわち、Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest (National Institute of Health, Bethesda, MS 1991）；ならびに（２）抗原−抗体複合体の結晶学的研究に基づいたアプローチ（Chothia, C. et al., J. Mol. Biol. 196: 901-917 (1987)）。しかしながら、２つの残基特定技法が重複の領域を限定するがしかし同一領域を限定しない限り、それらはハイブリッドＣＤＲを限定するために組合され得る。
【００３９】
「モノクローナル抗体」という用語は、本明細書中で用いる場合、実質的に均一な抗体の集団から得られる抗体を指し、すなわち集団を構成する個々の抗体は、少量で存在し得る可能性のある天然突然変異を除いて、同一である。モノクローナル抗体は高度に特異的であり、単一の抗原部位に向けられる。さらに、典型的には異なる複数の決定因子（エピトープ）に対して向けられる複数の異なる抗体を含む慣用的（ポリクローナル）抗体調製物とは異なり、各モノクローナル抗体は抗原上の単一決定因子に対して向けられる。それらの特異性のほかに、モノクローナル抗体は、それらが、他の免疫グロブリンによって夾雑されないハイブリドーマ培養により合成されるという点で有益である。「モノクローナル」という修飾語は、抗体の実質的に均質な集団から得られるという抗体の特質を示し、任意の特定方法による抗体の産生を要するよう意図されない。例えば、本発明に従って用いられるべきモノクローナル抗体は、Kohler et al., Nature, 256: 495 (1975)により最初に記載されたハイブリドーマ法により作製され得るし、あるいは組換えＤＮＡ法（例えば米国特許第４，８１６，５６７号参照）により作製され得る。「モノクローナル抗体」は、例えばClackson et al., Nature, 352:624-628 (1991)およびMarks et al., J. Mol. Biol., 222:581-597 (1991)に記載された技法を用いて、ファージ抗体ライブラリーからも単離され得る。
【００４０】
本明細書中のモノクローナル抗体は、具体的には、重鎖および／または軽鎖の一部が、特定の種に由来するかあるいは特定の抗体クラスまたはサブクラスに属している抗体中の対応する配列と同一であるかまたは相同であるが、一方、鎖（単数または複数）の残りの部分が別の種に由来するかあるいは別の抗体クラスまたはサブクラスに属する抗体中の対応する配列と同一であるかまたは相同である「キメラ」抗体（免疫グロブリン）、ならびに（所望の生物学的活性を示す限りは）このような抗体の断片を包含する（米国特許第４，８１６，５６７号；Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81:6851-6855 (1984)）。
【００４１】
「無傷」抗体は、抗原結合部位、ならびにＣＬ、そして少なくとも長鎖ドメインＣＨ１、ＣＨ２およびＣＨ３を含むものである。
【００４２】
「抗体断片」は、無傷抗体の一部分、好ましくは無傷抗体の抗原結合および／または可変領域を含む。抗体断片の例としては、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２およびＦｖ断片；ダイアボディ；線状抗体（米国特許第５，６４１，８７０号、実施例２；Zapata et al., Protein Eng. 8(10): 1057-1062 [1995]参照）；抗体断片から形成される一本鎖抗体分子および多重特異性抗体が挙げられる。
【００４３】
抗体のパパイン消化は、「Ｆａｂ」断片と呼ばれる２つの同一の抗原結合断片、ならびに残余「Ｆｃ」断片（この名称は容易に結晶化する能力を反映している）を産生した。Ｆａｂ断片は、Ｈ鎖の可変領域ドメイン（ＶＨ）および１つの重鎖の第一定常ドメイン（ＣＨ１）を伴う完全Ｌ鎖から成る。各Ｆａb断片は、抗原結合に関して一価であり、すなわち、それは単一の抗原結合部位を有する。抗体のペプシン処理は、単一大型Ｆ（ａｂ’）２断片を生じるが、これは、異なる抗原結合活性を有する２つのジスルフィド結合Ｆａｂ断片におおよそ対応し、依然として抗原に架橋し得る。Ｆａｂ’断片は、抗体ヒンジ領域からの１つ以上のシステインを含めてＣＨ１ドメインのカルボキシ末端に２〜３の付加的残基を有することでＦａｂ断片と異なる。Ｆａｂ’−ＳＨは、定常ドメインのシステイン残基（単数または複数）が遊離チオール基を有するＦａｂ’に関する本明細書中での呼称である。Ｆ（ａｂ’）２抗体断片は、元来、それらの間にヒンジシステインを有するＦａｂ’断片の対として産生された。抗体断片の他の化学的カップリングも既知である。
【００４４】
Ｆｃ断片は、ジスルフィドにより一緒に保持された両Ｈ鎖のカルボキシ末端部分を含む。抗体のエフェクター機能は、ある型の細胞上に見出されるＦｃ受容体（ＦｃＲ）によっても認識される領域であるＦｃ領域中の配列により決定される。
【００４５】
「Ｆｖ」は、完全な抗原認識および結合部位を含有する最小の抗体断片である。この断片は、堅く、非共有的に会合した１つの重鎖および１つの軽鎖可変領域ドメインの二量体からなる。これら２つのドメインのフォールディングから、抗原結合のためのアミノ酸残基に寄与し、抗体に抗原特異性を付与する６つの超可変ループ（各々ＨおよびＬ鎖からの３つのループ）を生じる。しかしながら、単一可変ドメイン（または抗原に特異的な３つのＣＤＲのみを含むＦｖの半分）でさえ、完全結合部位より低い親和性ではあるが、抗原を認識し、結合する能力を有する。
【００４６】
「一本鎖Ｆｖ」（「ｓＦｖ」または「ｓｃＦｖ」とも略される）は、単一ポリペプチド鎖に連結されるＶＨおよびＶＬ抗体ドメインを含む抗体断片である。好ましくは、ｓＦｖポリペプチドはさらに、ＶＨおよびＶＬドメイン間にポリペプチドリンカーを含み、これは、抗原結合のために望ましい構造をｓＦｖに形成させる。ｓＦｖの考察に関しては、Pluckthun in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113, Rosenburg and Moore eds., Springer-Verlag, New York, pp. 269-315 (1994)を参照されたい。
【００４７】
「ダイアボディ」という用語は、鎖内対合ではなくＶドメインの鎖間対合が達成され、それにより二価断片、すなわち２つの抗原結合部位を有する断片を生じるよう、ＶＨおよびＶＬドメイン間に短いリンカー（約５〜１０残基）を有するｓＦｖ断片（前段落参照）を構築することにより調製される小抗体断片を指す。二重特異性ダイアボディは、２つの抗体のＶＨおよびＶＬドメインが異なるポリペプチド鎖上に存在する２つの「交差」ｓＦｖ断片のヘテロ二量体である。ダイアボディは、例えばＥＰ ４０４，０９７；ＷＯ ９３／１１１６１；Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 6444-6448 (1993)により詳細に記載されている。
【００４８】
当該分子標的または抗原と「結合する」抗体は、抗体が抗原を発現する細胞を標的化するのに有用であるよう十分な親和性でその抗原と結合し得るものである。
【００４９】
特定のポリペプチドまたは特定ポリペプチド上のエピトープ「に特異的に結合する」かまたはそれに「特異的」である抗体は、任意の他のポリペプチドまたはポリペプチドエピトープと実質的に結合することなく、特定のポリペプチドまたは特定ポリペプチド上のエピトープと結合するものである。このような実施形態では、これらの他のポリペプチドまたはポリペプチドエピトープへの抗体の結合の程度は、標的ポリペプチドまたはエピトープとの結合と比較して、蛍光活性化細胞選別（ＦＡＣＳ）分析または放射性免疫沈降法（ＲＩＡ）により確定して、１０％未満である。
【００５０】
「ヒト化」型の非ヒト（例えばネズミ）抗体は、非ヒト免疫グロブリン由来の最小配列を含有する大部分はヒト配列のキメラ免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖またはその断片（例えば、Ｆｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２または抗体の他の抗原結合配列）である。ほとんどの部分に関して、ヒト化抗体はヒト免疫グロブリン（レシピエント抗体）であって、この場合、レシピエントの超可変領域（ＣＤＲも）からの残基が、所望の特異性、親和性および能力を有するマウス、ラットまたはウサギのような非ヒト種（ドナー抗体）の超可変領域からの残基により置き換えられる。いくつかの場合、ヒト免疫グロブリンのＦｖフレームワーク領域（ＦＲ）残基は、対応する非ヒト残基により置き換えられる。さらに、「ヒト化抗体」は、本明細書中で用いる場合、レシピエント抗体でもドナー抗体でも見出されない残基も含み得る。これらの修飾は、抗体性能をさらに精巧にし、最適化するためになされる。ヒト化抗体は、最適には、免疫グロブリン定常領域（Ｆｃ）の少なくとも一部、典型的にはヒト免疫グロブリンの少なくとも一部も含む。さらなる詳細に関しては、Jones et al., Nature, 321:522-525 (1986)； Reichmann et al., Nature, 332:323-329 (1988)；およびPresta, Curr. Op. Struct. Biol., 2:593-596 (1992)参照。
【００５１】
抗体「エフェクター機能」は、抗体のＦｃ領域（ネイティブ配列Ｆｃ領域またはアミノ酸配列変異体Ｆｃ領域）に帰することができる生物学的活性を指し、抗体アイソタイプに伴って変わる。抗体エフェクター機能の例としては、以下のものが挙げられる：Ｃ１ｑ結合および補体依存性細胞傷害性；Ｆｃ受容体結合；抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性（ＡＤＣＣ）；食作用；細胞表面受容体（例えばＢ細胞受容体）の下方調節；およびＢ細胞活性化。
【００５２】
「抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性」またはＡＤＣＣは、ある細胞傷害性細胞（例えば、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、好中球及びマクロファージ）上に存在するＦｃ受容体（ＦｃＲ）上に結合される分泌Ｉｇがこれらの細胞傷害性エフェクター細胞を抗原保有標的細胞に特異的に結合させ、その後標的細胞を細胞毒素で殺害させる細胞傷害性の一形態を指す。抗体は、細胞傷害性細胞を「武装し」、この機序による標的細胞の殺害のために必要とされる。ＡＤＣＣを媒介するための主要細胞であるＮＫ細胞はＦｃγＲＩＩＩのみを発現するが、一方、単球はＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩおよびＦｃγＲＩＩＩを発現する。造血細胞におけるＦｃ発現は、Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol. 9: 457-92 (1991)の464ページの表３に要約されている。当該分子のＡＤＣＣ活性を査定するために、例えば米国特許第５，５００，３６２号または第５，８２１，３３７号に記載されたようなin vitroＡＣＤＤ検定が実施され得る。このような検定のための有用なエフェクター細胞としては、末梢血単核球（ＰＢＭＣ）およびナチュラルキラー（ＮＫ）細胞が挙げられる。代替的には、または付加的には、当該分子のＡＤＣＣ活性は、in vivoで、例えばClynes et al., PNAS USA 95:652-656 (1998)に開示されたような動物モデルで査定され得る。
【００５３】
「Ｆｃ受容体」または「ＦｃＲ」は、抗体のＦｃ領域と結合する受容体を示す。好ましいＦｃＲは、自然配列のヒトＦｃＲである。さらに、好ましいＦｃＲは、ＩｇＧ抗体と結合するものであり（ガンマ受容体）、そしてＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩおよびＦｃγＲＩＩＩサブクラス、例えば対立遺伝子変異体の受容体、ならびに代替的にはこれらの受容体のスプライス化型を包含し、ＦｃγＲＩＩ受容体はＦｃγＲＩＩＡ（「活性化受容体」）およびＦｃγＲＩＩＢ（「抑制受容体」）を包含し、これらは主にその細胞質ドメインで異なる類似のアミノ酸配列を有する。活性化受容体ＦｃγＲＩＩＡは、その細胞質ドメインに免疫受容体チロシンベースの活性化モチーフ（ＩＴＡＭ）を含有する。抑制受容体ＦｃγＲＩＩＢは、その細胞質ドメインに免疫受容体チロシンベースの抑制モチーフ（ＩＴＩＭ）を含有する（M. Daeron, Annu. Rev. Immunol. 15:203-234 (1997)参照）。ＦｃＲは、Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol. 9: 457-92 (1991)；Capel et al., Immunomethods 4: 25-34 (1994)；およびde Haas et al., J. Lab. Clin. Med. 126: 330-41 (1995)で考察されている。他のＦｃＲ、例えば将来同定されるべきものは、本明細書中の「ＦｃＲ」という用語に包含される。当該用語は、胎児への母体ＩｇＧの運搬に関与する新生児受容体であるＦｃＲｎも包含する（Guyer et al., J. Immunol. 117: 587 (1976)およびKim et al., J. Immunol. 24: 249 (1994)）。
【００５４】
「ヒトエフェクター細胞」は、１つ以上のＦｃＲを発現し、エフェクター機能を行う白血球である。好ましくは、細胞は少なくともＦｃγＲＩＩＩを発現し、ＡＤＣＣエフェクター機能を行う。ＡＤＣＣを媒介するヒト白血球の例としては、末梢血単核球（ＰＢＭＣ）、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、単球、細胞傷害性Ｔ細胞および好中球が挙げられるが、ＰＢＭＣおよびＭＮＫ細胞が好ましい。エフェクター細胞は、ネイティブ供給源、例えば血液から単離され得る。
【００５５】
「補体依存性細胞傷害性」または「ＣＤＣ」は、補体の存在下での標的細胞の溶解を指す。古典的補体経路の活性化は、補体系の第一成分（Ｃ１ｑ）と、それらのコグネイト抗原に結合される（適切なサブクラスの）抗体への結合により開始される。補体活性化を査定するために、例えばGazzano-Santoro et al., J. Immunol. Methods 202: 163 (1996)に記載されたようなＣＤＣ検定が実施され得る。
【００５６】
「共役体」、「共役された」および「共役」という用語は、任意のおよび全ての型の共有または非共有結合を指し、例としては、直接的遺伝的または化学的融合、リンカーまたは架橋剤を介したカップリング、ならびに、例えばロイシンジッパーを用いる非共有的会合が挙げられるが、これらに限定されない。抗体共役体は、抗体または抗体断片に結合される別の存在物、例えば細胞傷害性化合物、薬剤、組成物、化合物、放射性元素または検出可能標識を有する。
【００５７】
「処置」は、治療的処置および予防的または防止的手段の両方を指す。処置を必要とするものとしては、既に障害を有するもの、ならびに障害が防止されるべきであるものが挙げられる。
【００５８】
処置の目的のための「哺乳動物」は、哺乳動物として分類される任意の動物、例えばヒト、非ヒト高等霊長類、家畜および農場動物、ならびに動物園、スポーツまたはペット動物、例えばイヌ、ウマ、ウサギ、ウシ、ブタ、ハムスター、マウス、ネコ等を指す。好ましくは、哺乳動物はヒトである。
【００５９】
「障害」は、タンパク質を用いた処置から利益を得るであろう任意の症状である。この例としては、慢性および急性の障害または疾患、例えば哺乳動物を当該障害に罹り易くする病理学的状態が挙げられる。
【００６０】
「治療的有効量」は、特定の障害の測定可能な改善または防止をもたらすのに必要とされる少なくとも最小濃度である。既知のタンパク質の治療的有効量は当該技術分野で周知であるが、将来発見される下記のタンパク質の有効量は、十分に、当業者、例えば普通の医者の技術の範囲内である標準技法により決定され得る。
【００６１】
ＩＩ． 本発明の実行方法
Ａ． タンパク質の調製
本発明によれば、タンパク質は、組換えＤＮＡ技術により、すなわち、当該技術分野で周知であるように、タンパク質をコードする核酸を含有するベクターで形質転換またはトランスフェクトされた細胞を培養することにより、産生される。
【００６２】
組換え的手段によるタンパク質の調製は、発現またはクローニングベクターを用いて適切な宿主細胞をトランスフェクトするかまたは形質転換して、プロモーターを誘導し、形質転換体を選択しまたは所望の配列をコードする遺伝子を増幅するために適切である場合には修飾された従来の栄養培地中で培養することにより、成し遂げられ得る。培養条件、例えば培地、温度、ｐＨ等は、過度の実験をせずとも当業者が選択し得る。概して、細胞培養の生産性を最大にするための原理、プロトコールおよび実行技術は、Mammalian Cell Biotechnology: A Practical Approach, M. Butler, Ed. (IRL Press, 1991)およびSambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, New York: Cold Spring Harbor Pressに見出され得る。トランスフェクションの方法は当業者には既知であり、例としては、ＣａＰＯ４およびＣａＣｌ２トランスフェクション、電気穿孔、マイクロインジェクション等が挙げられる。適切な技法は、Sambrook et al.（上記）にも記載されている。付加的トランスフェクション技法は、Shaw et al., Gene 23: 315 (1983)；ＷＯ ８９／０５８５９；Graham et al., Virology 52: 456-457 (1978)および米国特許第４，３９９，２１６号に記載されている。
【００６３】
所望のタンパク質をコードする核酸は、クローニングまたは発現のために複製可能なベクター中に挿入され得る。適切なベクターは公的に入手可能であり、プラスミド、コスミド、ウイルス粒子またはファージの形態をとり得る。適切な核酸配列は、種々の手法によりベクター中に挿入され得る。概して、ＤＮＡは、当該技術分野で既知の技法を用いて、適切な制限エンドヌクレアーゼ部位（単数または複数）に挿入される。ベクター構成成分としては、一般的に、シグナル配列、複製の起点、１つ以上のマーカー遺伝子、ならびにエンハンサー要素、プロモーターおよび転写終止配列のうちの１つ以上が挙げられるが、これらに限定されない。これらの構成成分のうちの１つ以上を含有する適切なベクターの構築は、当業者に既知である標準ライゲーション技法を用いる。
【００６４】
培地からまたは宿主細胞溶解物から、タンパク質の形態が回収され得る。膜結合された場合、それは、適切な界面活性剤を用いて、または酵素的切断により、膜から放出され得る。発現のために用いられる細胞は、種々の物理的または化学的手段、例えば凍結解凍周期、音波処理、機械的崩壊または細胞溶解剤によっても崩壊され得る。
【００６５】
タンパク質の精製は、当該技術分野で既知の任意の適切な技法により、例えばイオン交換カラム上での分別、エタノール沈降、逆相ＨＰＬＣ、シリカまたは陽イオン交換樹脂（例えばＤＥＡＥ）上でのクロマトグラフィー、クロマトフォーカシング、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ、硫酸アンモニウム沈降、ＩｇＧのような夾雑物を除去するためのプロテインＡセファロースカラム（例えばセファデックス（登録商標）Ｇ−７５）を用いるゲル濾過、ならびにエピトープタグ化形態を結合するための金属キレートカラムにより達成し得る。
【００６６】
Ｂ． 抗体調製
本発明のある実施形態では、好ましいタンパク質は抗体である。抗体、例えばポリクローナル、モノクローナル、ヒト化、二重特異性およびヘテロ接合抗体の産生のための技法を以下に示す。
【００６７】
（ｉ）ポリクローナル抗体
ポリクローナル抗体は、一般的に、関連抗原およびアジュバントの多数回皮下（ｓｃ）または腹腔内（ｉｐ）注射により、動物中で産生される。免疫化されるべき種において免疫原性であるタンパク質、例えばキーホールリンペットヘモシアニン、血清アルブミン、ウシサイログロブリンまたはダイズトリプシン阻害剤と関連抗原とを共役することは有用であり得る。用いられ得るアジュバントの例としては、フロイント完全アジュバントおよびＭＰＬ−ＴＤＭアジュバント（モノホスホリル脂質Ａ、合成トレハロースジコリノミコラート）が挙げられる。当業者は、過度の実験をせずとも、免疫化プロトコールを選択し得る。
【００６８】
１ヵ月後、元の量の１／５〜１／１０のフロイント完全アジュバント中のペプチドまたは共役体を用いて、多数部位に皮下注射することにより、動物は追加免疫される。７〜１４日後、動物は採血され、抗体力価に関して血清が検定される。力価がプラトーになるまで、動物は追加免疫される。好ましくは、動物は、同一抗原であるが、しかし異なるタンパク質と共役された、および／または異なる架橋試薬を介して共役された共役体を用いて、追加免疫される。共役体は、タンパク質融合物として組換え細胞培養中で作製され得る。さらにまた、凝集剤、例えば明礬が適切に用いられて、免疫応答を増強する。
【００６９】
（ｉｉ）モノクローナル抗体
モノクローナル抗体は、実質的に均質の抗体の集団から得られ、すなわち集団を構成する個々の抗体は、少量で存在し得る可能性のある天然突然変異を除いて、同一である。したがって、「モノクローナル」という修飾語は、別個の抗体の混合物ではないという抗体の特質を示す。
【００７０】
例えば、モノクローナル抗体は、Kohler et al., Nature, 256: 495 (1975)により最初に記載されたハイブリドーマ法を用いて作製され得るし、あるいは組換えＤＮＡ法（米国特許第４，８１６，５６７号）により作製され得る。
【００７１】
ハイブリドーマ法では、マウスまたは他の適切な宿主動物、例えばハムスターが、本明細書中で上に記載されたように免疫化されて、免疫化のために用いられるタンパク質と特異的に結合する抗体を産生するかまたは産生することができるリンパ球を引き出す。代替的には、リンパ球はin vitroで免疫化され得る。次いで、適切な融合剤、例えばポリエチレングリコールを用いてリンパ球は骨髄腫細胞と融合されて、ハイブリドーマ細胞を形成する（Goding, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice, pp.59-103 (Academic Press, 1986)）。
【００７２】
免疫化剤は、典型的には、処方されるべきタンパク質を含む。一般的には、ヒト起源の細胞が所望される場合、末梢血リンパ球（「ＰＢＬ」）が用いられ、あるいは非ヒト哺乳動物起源が所望される場合には脾臓細胞またはリンパ節細胞が用いられる。次いで、適切な融合剤、例えばポリエチレングリコールを用いてリンパ球は不死化細胞株と融合されて、ハイブリドーマ細胞を形成する（Goding, Monoclonal antibodies: Principles and Practice, Academic Press (1986), pp. 59-103）。不死化細胞株は、通常は、形質転換化哺乳類細胞、特に齧歯類、ウシおよびヒト起源の骨髄腫細胞である。通常、ラットまたはマウス骨髄腫細胞株が用いられる。このように調製されたハイブリドーマ細胞は、好ましくは、非融合化親骨髄腫細胞の増殖または生存を抑制する１つ以上の物質を含有する適切な培地中で播種され、増殖される。例えば、親骨髄腫細胞が酵素ヒポキサンチン・グアニン・ホスホリボシルトランスフェラーゼ（ＨＧＰＲＴまたはＨＰＲＴ）を欠く場合、ハイブリドーマのための培地は、典型的には、ヒポキサンチン、アミノプテリンおよびチミジンを含み（ＨＡＴ培地）、これらの物質がＨＧＰＲＴ欠損細胞の増殖を防止する。
【００７３】
好ましい骨髄腫細胞は、効率的に融合し、選択された抗体産生細胞による抗体の安定した高レベル産生を支持し、そしてＨＡＴ培地のような培地に対して感受性であるものである。これらの中で、好ましい骨髄腫細胞株は、ネズミ骨髄腫株、例えばサルク研究所の細胞配布センター（Salk Institute Cell Distribution Center, San Diego, California USA）から入手可能なＭＯＰＣ−２１およびＭＰＣ−１１マウス腫瘍、ならびにアメリカ培養細胞系統保存機関（American Type Culture Collection, Rockville, Maryland USA）から入手可能なＳＰ−２細胞由来のものである。ヒト骨髄腫およびマウス−ヒトへテロ骨髄腫細胞株も、ヒトモノクローナル抗体の産生に関して記載されている（Kozbor, J. Immunol., 133:3001 (1984); Brodeur et al., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, pp. 51-63 (Marcel Dekker, Inc., New York, 1987)）。
【００７４】
ハイブリドーマ細胞が増殖中である培地は、抗原に対して向けられるモノクローナル抗体の産生に関して検定される。好ましくは、ハイブリドーマ細胞により産生されるモノクローナル抗体の結合特異性は、免疫沈降法により、またはin vitro結合検定、例えばラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）若しくは酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）により確定される。
【００７５】
モノクローナル抗体の結合親和性は、例えば、Munson et al., Anal. Biochem., 107:220 (1980)のスカッチャード分析により確定され得る。
【００７６】
所望の特異性、親和性および／または活性を有する抗体を産生するハイブリドーマ細胞が特定された後、限定希釈手順によりクローンはサブクローン化され、標準方法により増殖され得る（Goding、上記）。この目的のための適切な培地としては、例えばＤ−ＭＥＭまたはＲＰＭＩ−１６４０培地が挙げられる。さらに、ハイブリドーマ細胞は、動物中で腹水腫瘍としてin vivoで増殖され得る。
【００７７】
免疫化剤は、典型的には、抗体が結合するエピトープタンパク質を含む。一般的には、ヒト起源の細胞が所望される場合、末梢血リンパ球（「ＰＢＬ」）が用いられ、あるいは非ヒト哺乳動物起源が所望される場合には脾臓細胞またはリンパ節細胞が用いられる。次いで、適切な融合剤、例えばポリエチレングリコールを用いてリンパ球は不死化細胞株と融合されて、ハイブリドーマ細胞を形成する（Goding, Monoclonal antibodies: Principles and Practice, Academic Press (1986), pp. 59-103）。
【００７８】
不死化細胞株は、通常は、形質転換化哺乳類細胞、特に齧歯類、ウシおよびヒト起源の骨髄腫細胞である。通常、ラットまたはマウス骨髄腫細胞株が用いられる。ハイブリドーマ細胞は、好ましくは、非融合化不死化細胞の増殖または生存を抑制する１つ以上の物質を含有する適切な培地中で培養され得る。例えば、親細胞が酵素ヒポキサンチン・グアニン・ホスホリボシルトランスフェラーゼ（ＨＧＰＲＴまたはＨＰＲＴ）を欠く場合、ハイブリドーマのための培地は、典型的には、ヒポキサンチン、アミノプテリンおよびチミジンを含み（ＨＡＴ培地）、これらの物質がＨＧＰＲＴ欠損細胞の増殖を防止する。
【００７９】
好ましい不死化細胞株は、効率的に融合し、選択された抗体産生細胞による抗体の安定した高レベル発現を支持し、そしてＨＡＴ培地のような培地に対して感受性であるものである。さらに好ましい不死化細胞株はネズミ骨髄腫株で、これは、例えばサルク研究所の細胞配布センター（Salk Institute Cell Distribution Center, San Diego, California USA）ならびにアメリカ培養細胞系統保存機関（American Type Culture Collection, Rockville, Maryland）から入手可能である。ヒト骨髄腫およびマウス−ヒトへテロ骨髄腫細胞株も、ヒトモノクローナル抗体の産生に関して記載されている（Kozbor, J. Immunol., 133:3001 (1984); Brodeur et al., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, Marcel Dekker, Inc., New York, (1987) pp. 51-63）。
【００８０】
ハイブリドーマ細胞が培養される培地は、次に、処方されるべきタンパク質に対して向けられるモノクローナル抗体の存在に関して検定され得る。好ましくは、ハイブリドーマ細胞により産生されるモノクローナル抗体の結合特異性は、免疫沈降法により、またはin vitro結合検定、例えばラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）若しくは酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）により確定される。このような技法および検定は、当該技術分野で既知である。モノクローナル抗体の結合親和性は、例えば、Munson et al., Anal. Biochem., 107:220 (1980)のスカッチャード分析により確定され得る。
【００８１】
所望のハイブリドーマ細胞が特定された後、限定希釈手順によりクローンはサブクローン化され、標準方法により増殖され得る（Goding、上記）。この目的のための適切な培地としては、例えばダルベッコの変法イーグル培地およびＲＰＭＩ−１６４０培地が挙げられる。代替的には、ハイブリドーマ細胞は、動物中で腹水腫瘍としてin vivoで増殖され得る。
【００８２】
サブクローンにより分泌されるモノクローナル抗体は、従来の免疫グロブリン精製手法、例えばプロテインＡ−セファロース、ヒドロキシルアパタイトクロマトグラフィー、ゲル電気泳動、透析またはアフィニティークロマトグラフィーにより、培地、腹水または血清から適切に分離される。
【００８３】
モノクローナル抗体をコードするＤＮＡは、従来の手法を用いて（例えば、ネズミ抗体の重鎖および軽鎖をコードする遺伝子と特異的に結合し得るオリゴヌクレオチドプローブを用いることにより）、容易に単離され、配列決定される。ハイブリドーマ細胞は、このようなＤＮＡの好ましい供給源として役立つ。一旦単離されると、ＤＮＡは発現ベクター中に置かれ、これは次に、そうでなければ免疫グロブリンタンパク質を産生しない宿主細胞、例えば大腸菌細胞、サルＣＯＳ細胞、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞または骨髄腫細胞中にトランスフェクトされて、組換え宿主細胞中のモノクローナル抗体が合成される。抗体をコードするＤＮＡの細菌中での組換え発現に関する考察論文としては、Skerra et al., Curr. Opinion in Immunol., 5:256-262 (1993)およびPluckthun, Immunol. Revs. 130:151-188 (1992)が挙げられる。
【００８４】
さらなる実施形態では、抗体は、McCafferty et al., Nature, 348:552-554 (1990)に記載された技法を用いて生成される抗体ファージライブラリーから単離され得る。Clackson et al., Nature, 352:624-628 (1991)およびMarks et al., J. Mol. Biol., 222:581-597 (1991)は、ファージライブラリーを用いて、それぞれネズミおよびヒト抗体の単離を記載する。その後の出版物は、鎖シャッフリングによる高親和性（ｎＭ範囲）ヒト抗体の産生（Marks et al., Bio/Technology, 10:779-783 (1992)）、ならびに非常に大きいファージライブラリーを構築するための一戦略としての組合せ感染およびin vivo組換え（Waterhouse et al., Nuc. Acids. Res., 21:2265-2266 (1993)）を記載する。したがって、これらの技法は、モノクローナル抗体の単離のための伝統的モノクローナル抗体ハイブリドーマ技法に対する実行可能な代替物である。
【００８５】
ＤＮＡは、さらにまた、相同ネズミ配列の代わりに、例えばヒト重鎖および軽鎖定常ドメインにのコード配列で置換することにより（米国特許第４，８１６，５６７号；Morrison, et al., Proc. Natl Acad. Sci. USA, 81:6851 (1984)）、あるいは非免疫グロブリンポリペプチドのコード配列の全部または一部を免疫グロブリンコード配列と共有結合することにより、修飾され得る。
【００８６】
典型的には、このような非免疫グロブリンポリペプチドは抗体の定常ドメインの代わりに置換されるか、あるいはそれらは抗体の１つの抗原結合部位の可変ドメインの代わりに置換されて、抗原に対する特異性を有する１つの結合部位および異なる抗原に対する特異性を有する別の抗原結合部位を含むキメラ二価抗体を作製する。
【００８７】
キメラまたはハイブリッド抗体は、架橋剤を含めた、合成タンパク質化学で既知の方法を用いて、in vitroでも調製され得る。例えば、免疫毒素は、ジスルフィド交換反応を用いることにより、あるいはチオエーテル結合を形成することにより、構築され得る。この目的のための適切な試薬の例としては、イミノチオラートおよびメチル−４−メルカプトブチルイミダートが挙げられる。
【００８８】
（ｉｉｉ）ヒト化およびヒト抗体
本処方方法に供せられる抗体はさらに、ヒト化またはヒト抗体を含み得る。ヒト化型の非ヒト（例えばネズミ）抗体は、キメラ免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖またはその断片（例えば、Ｆｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２または抗体の他の抗原結合亜配列）であり、これは、非ヒト免疫グロブリン由来の最小配列を含有する。ヒト化抗体としてはヒト免疫グロブリン（レシピエント抗体）が挙げられるが、この場合、レシピエントの相補性決定領域（ＣＤＲ）からの残基が、所望の特異性、親和性および能力を有するマウス、ラットまたはウサギのような非ヒト種（ドナー抗体）のＣＤＲからの残基により置き換えられる。いくつかの場合、ヒト免疫グロブリンのＦｖフレームワーク残基は、対応する非ヒト残基により置き換えられる。ヒト化抗体は、レシピエント抗体にも、あるいは移入ＣＤＲまたはフレームワーク配列中にも見出されない残基も含み得る。概して、ヒト化抗体は、少なくとも１つ、典型的には２つの可変ドメインの実質的に全てを含み、この場合、ＣＤＲ領域の全てまたは実質的に全てが非ヒト免疫グロブリンのものに対応し、そしてＦＲ領域のうちの全てまたは実質的に全てがヒト免疫グロブリンコンセンサス配列のものに対応する。ヒト化抗体は、最適には、免疫グロブリン定常領域（Ｆｃ）の少なくとも一部、典型的にはヒト免疫グロブリンの少なくとも一部も含む（Jones et al., Nature, 321:522-525 (1986)； Reichmann et al., Nature, 332:323-329 (1988)；およびPresta, Curr. Op. Struct. Biol., 2:593-596 (1992)）。
【００８９】
非ヒト抗体をヒト化するための方法は、当該技術分野で周知である。一般的には、ヒト化抗体は、非ヒトである供給源からそれに導入される１つ以上のアミノ酸残基を有する。これらの非ヒトアミノ酸残基は、しばしば、「移入」残基と呼ばれ、これは典型的には、「移入」可変ドメインから得られる。ヒト化は、本質的にはWinter and co-workers, Jones et al., Nature 321:522-525 (1986)；Riechmann et al., Nature 332:323-327 (1988)；Verhoeyen et al., Science 239:1534-1536 (1988)の方法に従って、あるいは齧歯類ＣＤＲ（複数）またはＣＤＲ配列をヒト抗体の対応する配列に替えて置換することにより、実施され得る。したがって、このような「ヒト化」抗体はキメラ抗体であり（米国特許第４，８１６，５６７号）、この場合、実質的に無傷より少ないヒト可変ドメインが、非ヒト種からの対応する配列により置換されている。実際、ヒト化抗体は典型的には、いくつかのＣＤＲ残基およびおそらくはいくつかのＦＲ残基が齧歯類抗体における類似部位からの残基により置換されるヒト抗体である。
【００９０】
ヒト化抗体の作製に用いられるべきヒト可変ドメインの選択は、軽鎖も重鎖も、抗原性を低減するために非常に重要である。いわゆる「最良適合」法によれば、齧歯類抗体の可変ドメインの配列は、既知のヒト可変ドメイン配列の全ライブラリーに対してスクリーニングされる。齧歯類の配列に最も近いヒト配列が、次いで、ヒト化抗体のためのヒトフレームワーク（ＦＲ）として受容される（Sims et al., J. Immunol., 151:2296 (1993)；Chothia et al., J. Mol. Biol., 196:901 (1987)）。別の方法は、軽鎖または重鎖の特定の亜群の全てのヒト抗体のコンセンサス配列由来の特定のフレームワークを用いる。同一フレームワークが、いくつかの異なるヒト化抗体のために用いられ得る（Carter et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89:4285 (1992)；Presta et al., J. Immnol., 151:2623 (1993)）。
【００９１】
さらに、抗原に対する高親和性およびその他の好都合な生物学的特性を保持しつつ抗体がヒト化されることは重要である。この目標を達成するために、好ましい方法によれば、ヒト化抗体は、親配列および種々の概念的ヒト化生成物の、親およびヒト化配列の三次元モデルを用いた分析により、調製される。三次元免疫グロブリンモデルは、一般的に入手可能であり、当業者によく知られている。選択された候補免疫グロブリン配列の考え得る三次元立体配座構造を、例示し、表示するコンピュータープログラムが利用可能である。これらの表示の精査により、候補免疫グロブリン配列の機能における残基の考え得る役割の分析、すなわち、その抗原と結合する候補免疫グロブリンの能力に影響を及ぼす残基の分析が可能になる。このようにして、所望の抗体特性、例えば標的抗原（単数または複数）に対する親和性増大が達成されるよう、ＦＲ残基がレシピエントおよび移入配列から選択され、組合され得る。概して、ＣＤＲ残基は、直接的に且つほぼ実質的に、抗原結合に影響を及ぼすのに関与する。
【００９２】
代替的には、ここでは、免疫化に際して、内因性免疫グロブリン産生の非存在下で、ヒト抗体の完全レパートリーを産生し得るトランスジェニック動物（例えばマウス）を作製することが可能である。例えば、キメラおよび生殖系列突然変異体マウスにおける抗体重鎖連結領域（ＪＨ）遺伝子の同型接合的欠失は内因性抗体産生の完全抑制を生じる、ということが記載されている。このような生殖系列変異体マウスにおけるヒト生殖系列免疫グロブリン遺伝子アレイの移入は、抗原投与時にヒト抗体の産生を生じる。例えば、Jakobovits et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:2551 (1993)；Jakobovits et al., Nature, 362:255-258 (1993)；Bruggermann et al., Year in Immuno., 7:33 (1993)参照。ヒト抗体は、ファージ表示ライブラリーからも得られる(Hoogenboom et al., J. Mol. Biol., 227:381 (1991)；Marks et al., J. Mol. Biol., 222:581-597 (1991))。
【００９３】
ヒト抗体は、当該技術分野で既知の種々の技法、例えばファージ表示ライブラリーを用いても産生され得る（Hoogenboom and Winter, J. Mol. Biol. 227: 381 (1991)；Marks et al., J. Mol. Biol. 222: 581 (1991)）。Cole等およびBoerner等の技法も、ヒトモノクローナル抗体の調製のために利用可能である（Cole et al., Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, p. 77 (1985)およびBoerner et al., J. Immunol. 147(1): 86-95 (1991)）。同様に、ヒト抗体は、トランスジェニック動物、例えばマウス中にヒト免疫グロブリン遺伝子座を導入することにより作製され得るが、この場合、内因性免疫グロブリン遺伝子は部分的にまたは完全に不活性化されている。抗原投与時に、ヒト抗体産生が観察され、これは、遺伝子再配列、アセンブリーおよび抗体レパートリーを含めて全ての点で、ヒトにおいて観察されるものと非常によく似ている。このアプローチは、例えば米国特許第５，５４５，８０７号；第５，５４５，８０６号、第５，５６９，８２５号、第５，６２５，１２６号、第５，６３３，４２５号、第５，６６１，０１６に、ならびに以下の科学出版物：Marks et al., Bio/Technology 10: 779-783 (1992)；Lonberg et al., Nature 368: 856-859 (1994)；Morrison, Nature 368: 812-13 (1994)；Fishwild et al., Nature Biotechnology 14: 845-51 (1996)；Neuberger, Nature Biotechnology 14: 826 (1996)およびLonberg and Huszar, Intern. Rev. Immunol. 13: 65-93 (1995)に記載されている。
【００９４】
（ｉｖ）抗体依存性酵素媒介性プロドラッグ療法（ＡＤＥＰＴ）
本発明の抗体は、プロドラッグ（例えば、ペプチジル化学療法薬、ＷＯ８１／０１１４５参照）を活性抗癌薬に転化するプロドラッグ活性化酵素と共役させることにより、ＡＤＥＰＴにも用いられ得る（例えばＷＯ８８／０７３７８および米国特許第４，９７５，２７８号参照）。
【００９５】
ＡＤＥＰＴのために有用な免疫複合体の酵素構成成分としては、それをそのより活性な細胞傷害性形態に転化するような方法で、プロドラッグに作用し得る任意の酵素が挙げられる。
【００９６】
本発明の方法に有用である酵素としては、グリコシダーゼ、グルコースオキシダーゼ、ヒトライソザイム、ヒトグルクロニダーゼ、アルカリ性ホスファターゼ（ホスフェート含有プロドラッグを遊離薬剤に転化するために有用）；アリールスルファターゼ（スルフェート含有プロドラッグを遊離薬剤に転化するために有用）；シトシンデアミナーゼ（非毒性５−フルオロシトシンを抗癌薬５−フルオロウラシルに転化するために有用）；プロテアーゼ、例えばセラチアプロテアーゼ、サーモリシン、サブチリシン、カルボキシペプチダーゼ（例えば、カルボキシペプチダーゼＧ２およびカルボキシペプチダーゼＡ）ならびにカテプシン（例えばカテプシンＢおよびＬ）（ペプチド含有プロドラッグを遊離薬剤に転化するために有用）；Ｄ−アラニルカルボキシペプチダーゼ（Ｄ−アミノ酸置換基を含有するプロドラッグを転化するために有用）；炭水化物切断酵素、例えばβ−ガラクトシダーゼおよびノイラミニダーゼ（グリコシル化プロドラッグを遊離薬剤に転化するために有用）；β−ラクタマーゼ（β−ラクタムで誘導体化された薬剤を遊離薬剤に転化するために有用）；ならびにペニシリンアミダーゼ、例えばペニシリンＶアミダーゼまたはペニシリンＧアミダーゼ（それぞれ、フェノキシアセチルまたはフェニルアセチル基を用いてそれらのアミン窒素で誘導体化された薬剤を遊離薬剤に転化するために有用）が挙げられるが、これらに限定されない。代替的には、「アブザイム」としても当該技術分野で既知である酵素活性を有する抗体を用いて、本発明のプロドラッグを遊離活性薬剤に転化し得る（例えばMassey, Nature 328: 457-458 (1987)参照）。抗体−アブザイム共役体は、腫瘍細胞集団へのアブザイムの送達のために本明細書中に記載されたように調製され得る。
【００９７】
この発明の酵素は、上記のヘテロ二機能性架橋剤の使用といったような当該技術分野で周知の技法により、抗ＩＬ−１７または抗ＬＩＦ抗体に共有結合され得る。代替的には、本発明の酵素の少なくとも機能的活性部分に連結される本発明の抗体の少なくとも抗原結合領域を含む融合タンパク質は、当該技術分野で周知の組換えＤＮＡ技術を用いて構築され得る（例えばNeuberger et al., Nature 312: 604-608 (1984)参照）。
【００９８】
（ｉｖ）二重特異性および多重特異性抗体
二重特異性抗体（ＢｓＡｂ）は、少なくとも２つの異なるエピトープに対する結合特異性を有する抗体である。このような抗体は、全長抗体または抗体断片に由来することができる（例えば、Ｆ（ａｂ’）２二重特異性抗体）。
【００９９】
二重特異性抗体の作製方法は、当該技術分野で既知である。全長二重特異性抗体の伝統的産生は、２つの免疫グロブリン重鎖−軽鎖対の同時発現に基づいており、この場合、２つの鎖は異なる特異性を有する（Millstein et al., Nature, 305:537-539 (1983)）。免疫グロブリン重鎖および軽鎖の無作為な取り合わせのために、これらのハイブリドーマ（クアドローマ）は１０の異なる抗体分子の可能性のある混合物を生じ、そのうちの１つだけが正しい二重特異性構造を有する。正しい分子の精製（これは通常はアフィニティークロマトグラフィー段階により実行される）はかなり面倒であり、生成物収率は低い。類似の手法は、ＷＯ ９３／０８８２９に、ならびにTraunecker et al., EMBO J., 10:3655-3659 (1991)に開示されている。
【０１００】
所望の結合特異性を有する抗体可変ドメイン（抗体−抗原結合部位）は、免疫グロブリン定常ドメイン配列と融合され得る。融合物は、好ましくは、免疫グロブリン重鎖定常ドメインを有し、ヒンジ、ＣＨ２およびＣＨ３領域の少なくとも一部を含む。融合物の少なくとも１つに存在する軽鎖結合に必要な部位を含有する第一重鎖定常領域（ＣＨ１）を有することが好ましい。免疫グロブリン重鎖融合物、そして所望により、免疫グロブリン軽鎖をコードするＤＮＡは、別個の発現ベクター中に挿入され、適切な宿主生物体中に同時トランスフェクトされる。二重特異性抗体の生成についてのさらなる詳細に関しては、例えばSuresh et al., Methods in Enzymology 121: 210 (1986)を参照されたい。
【０１０１】
異なるアプローチによれば、所望の結合特異性を有する抗体可変ドメイン（抗体−抗原結合部位）は、免疫グロブリン定常ドメイン配列と融合され得る。融合物は、好ましくは、免疫グロブリン重鎖定常ドメインを有し、ヒンジ、ＣＨ２およびＣＨ３領域の少なくとも一部を含む。融合物の少なくとも１つに存在する軽鎖結合に必要な部位を含有する第一重鎖定常領域（ＣＨ１）を有することが好ましい。免疫グロブリン重鎖融合物、そして所望により、免疫グロブリン軽鎖をコードするＤＮＡは、別個の発現ベクター中に挿入され、適切な宿主生物体中に同時トランスフェクトされる。これにより、構築に用いられる不等比の３つのポリペプチド鎖が最適収率を提供する場合の実施形態において、３つのポリペプチド断片の相互比率を調整するに際して、大きな柔軟性が提供される。しかしながら、等比での少なくとも２つのポリペプチド鎖の発現が高収率を生じる場合、またはその比率が特別な意味を有さない場合、１つの発現ベクター中に２つまたは３つ全てのポリペプチド鎖に関するコード配列を挿入することが可能である。
【０１０２】
ＷＯ９６／２７０１１に記載された別のアプローチによれば、一対の抗体分子間の界面は、組換え細胞培養から回収されるヘテロ二量体のパーセンテージを最大にするよう操作され得る。好ましい界面は、抗体定常ドメインのＣＨ３領域の少なくとも一部を含む。この方法では、第一抗体分子の界面からの１つ以上の小アミノ酸側鎖が、より大きな側鎖（例えばチロシンまたはトリプトファン）に置き替えられる。大型アミノ酸側鎖をより小さなもの（例えばアラニンまたはトレオニン）に置き換えることにより、大型側鎖（単数または複数）と同一のまたは類似のサイズを有する補償「キャビティ」が第二抗体分子の界面上に作製される。これは、ホモ二量体のような他の望ましくない最終産物に対したヘテロ二量体の収率増大のための機序を提供する。
【０１０３】
このアプローチの好ましい実施形態では、二重特異性抗体は、一方のアームにおける第一結合特異性を有するハイブリッド免疫グロブリン重鎖、ならびに他方のアームにおける（第二結合特異性を提供する）ハイブリッド免疫グロブリン重鎖−軽鎖対で構成される。この不斉構造は、二重特異性分子の半分だけにおける免疫グロブリン軽鎖の存在が分離の容易な方法を提供するので、所望の二重特異性化合物を望ましくない免疫グロブリン鎖組合せ物から分離するのを促す、ということが判明した。このアプローチは、ＷＯ９４／０４６９０（１９９４年３月３日公開）に開示されている。二重特異性抗体の生成についてのさらなる詳細に関しては、例えばSuresh et al., Methods in Enzymology, 121:210 (1986)参照。
【０１０４】
二重特異性抗体には、架橋または「異型接合」抗体が含まれる。例えば、異型接合体中の抗体の一方はアビジンと結合され、他方はビオチンと結合され得る。このような抗体は、例えば、望ましくない細胞を標的として免疫系細胞を向けるために（米国特許第４，６７６，９８０号）、そしてＨＩＶ感染の治療のために（ＷＯ９１／００３６０、ＷＯ９２／２００３７３）提案されている。異型接合抗体は、任意の便利な架橋方法を用いて作製され得る。適切な架橋剤は当該技術分野で周知であり、多数の架橋技法とともに米国特許第４，６７６，９８０号に開示されている。
【０１０５】
抗体断片から二重特異性抗体を生成するための技法も、文献に記載されている。必ずしも二重特異性でない二価抗体断片の産生のために、以下の技法も用いられ得る。例えば大腸菌から回収されるＦａｂ’断片は、in vitroで化学的に結合されて、二価抗体を形成し得る（Shalaby et al., J. Exp. Med., 175:217-225 (1992)参照）。
【０１０６】
二重特異性抗体は、全長抗体または抗体断片として調製され得る（例えばＦ（ａｂ’）２二重特異性抗体）。抗体断片から二重特異性抗体を生成するための技法は、文献に記載されている。例えば、二重特異性抗体は、化学的連結を用いて調製され得る。Brennan et al., Science 229: 81 (1985)は、無傷抗体がタンパク質分解的に切断されて、Ｆ（ａｂ’）２断片を生成する手法を記載する。これらの断片は、ジチオール錯化剤亜ヒ酸ナトリウムの存在下で還元されて、隣接ジチオールを安定化し、分子間ジスルフィド形成を防止する。生成されたＦａｂ’断片は次に、チオニトロベンゾエート（ＴＮＢ）誘導体に変換される。次いで、Ｆａｂ’−ＴＮＢ誘導体のうちの１つは、Ｆａｂ’−ＴＮＢ誘導体に再変換されて、二重特異性抗体を形成する。産生された二重特異性抗体は、酵素の選択的固定化のための作用物質として用いられ得る。
【０１０７】
Ｆａｂ’断片は、大腸菌から直接回収され、化学的に結合されて、二重特異性抗体を形成し得る。Shalaby et al., J. Exp. Med. 175: 217-225 (1992)は、完全ヒト化二重特異性抗体Ｆ（ａｂ’）２分子の産生を記載する。各Ｆａｂ’断片は、大腸菌から別々に分泌されて、in vitroでの支持された化学結合に付されて、二重特異性抗体を形成した。このように形成された二重特異性抗体は、ＥｒｂＢ２受容体を過剰発現する細胞および正常ヒトＴ細胞に結合し、ヒト乳房腫瘍標的に対するヒト細胞傷害性リンパ球の溶解活性を誘発し得た。
【０１０８】
組換え細胞培養から直接的に二価抗体断片を作製し、単離するための種々の技法も、記載されている。例えば、二価へテロ二量体は、ロイシンジッパーを用いて産生されている（Kostelny et al., J. Immunol., 148(5):1547-1553 (1992)）。ＦｏｓおよびＪｕｎタンパク質からのロイシンジッパーペプチドは、遺伝子融合により２つの異なる抗体のＦａｂ’部分と連結された。抗体ホモ二量体は、ヒンジ領域で還元されて、単量体を形成し、次いで、再酸化されて、抗体へテロ二量体を形成した。Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90: 6444-6448 (1993)により記載された「ダイアボディ」技法は、二重特異性／二価抗体断片を作製するための代替的機序を提供している。断片は、同一鎖上の２つのドメイン間の対合を可能にするには短すぎるリンカーにより軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）と連結される重鎖可変ドメイン（ＶＨ）を含む。したがって、１つの断片のＶＨおよびＶＬドメインは、別の断片の相補的ＶＬおよびＶＨドメインと対合させられ、それにより２つの抗原結合部位を形成する。一本鎖Ｆｖ（ｓＦｖ）二量体の使用により二重特異性／二価抗体断片を作製するための別の戦略も報告されている（Gruber et al., J. Immunol., 152:5368 (1994)参照）。
【０１０９】
２より大きい価数を有する抗体が意図される。例えば、三重特異性抗体が調製され得る（Tutt et al., J. Immunol. 147: 60 (1991)）。
【０１１０】
例示的二重特異性抗体は、所与の分子上の２つの異なるエピトープに結合し得る。代替的には、特定タンパク質を発現する細胞に細胞防御機序を集中させるために、抗タンパク質アームが、白血球上のトリガー分子、例えばＴ細胞受容体分子（例えばＣＤ２、ＣＤ３、ＣＤ２８またはＢ７）、あるいはＩｇＧのためのＦｃ受容体（ＦｃγＲ）、例えばＦｃγＲＩ（ＣＤ６４）、ＦｃγＲＩＩ（ＣＤ３２）およびＦｃγＲＩＩＩ（ＣＤ１６）に結合するアームと組合せされ得る。二重特異性抗体は、特定タンパク質を発現する細胞に細胞傷害剤を局在化するためにも用いられ得る。このような抗体は、タンパク質結合アーム、ならびに細胞傷害剤または放射性核種キレート剤、例えばＥＯＴＵＢＥ、ＤＰＴＡ、ＤＯＴＡまたはＴＥＴＡと結合するアームを保有する。別の当該二重特異性抗体は、当該タンパク質と結合し、さらに、組織因子（ＴＦ）と結合する。
【０１１１】
（ｖ）異型接合抗体
異型接合抗体も、本発明の範囲内である。異型接合抗体は、２つの共有結合された抗体で構成される。このような抗体は、例えば、免疫系細胞を望ましくない細胞にその標的として向けるために（米国特許第４，６７６，９８０号）、そしてＨＩＶ感染の治療のために（ＷＯ９１／００３６０、ＷＯ９２／２００３７３およびＥＰ ０３０８９）提案されている。抗体は、合成タンパク質化学において既知の方法、例えば架橋剤を伴う方法を用いて、in vitroで調製され得る、ということが意図される。例えば、免疫毒素は、ジスルフィド交換反応を用いることにより、あるいはチオエーテル結合を形成することにより、構築され得る。この目的のための適切な試薬の例としては、イミノチオラートおよびメチル−４−メルカプトブチルイミド、ならびに例えば米国特許第４，６７６，９８０号に開示されたものが挙げられる。
【０１１２】
Ｃ． 抗体を含めたタンパク質の精製
標的ポリペプチドがヒト起源の細胞以外の組換え細胞中で発現される場合、標的ポリペプチドはヒト起源のタンパク質またはポリペプチドを完全に含有しない。しかしながら、標的ポリペプチドに関して実質的に均質である調製物を得るためには、組換え細胞タンパク質またはポリペプチドから標的ポリペプチドを精製する必要がある。第一段階として、培地または溶解物は、典型的には、粒状細胞破砕屑を除去するために遠心分離される。次いで、膜および可溶性タンパク質分画が分離される。次に、標的ポリペプチドが膜結合されるか否かによって、可溶性タンパク質分画から、ならびに培養溶解物の膜分画から、標的ポリペプチドが精製され得る。以下の手順は、適切な精製手順の例である：免疫親和性またはイオン交換カラム上での分別；エタノール沈降；逆相ＨＰＬＣ；シリカ上、または陽イオン交換樹脂、例えばＤＥＡＥ上でのクロマトグラフィー；クロマトフォーカシング；ＳＤＳ−ＰＡＧＥ、硫酸アンモニウム沈降；例えばセファデックス（登録商標）Ｇ−７５を用いるゲル濾過；ならびにＩｇＧのような夾雑物を除去するためのプロテインＡセファロースカラム。
【０１１３】
モノクローナル抗体（ＭＡｂ）を現在製造しているほとんどの会社が、生成物捕捉のためのプロテインＡアフィニティークロマトグラフィーと、その後の、負荷電夾雑物、例えば宿主細胞タンパク質（ＨＣＰ）、内毒素、宿主ＤＮＡおよび浸出プロテインＡを抽出するためのフロースルー方式の陰イオン交換クロマトグラフィー、次いで、残留ＨＣＰおよび生成物集合体を含めた正荷電夾雑物種を除去するための保持方式での陽イオン交換クロマトグラフィーまたは疎水性相互作用クロマトグラフィー（ＨＩＣ）を含む３カラムプラットホームアプローチを用いる。
【０１１４】
タンパク質溶液中に存在し得るウイルスは、タンパク質それ自体より大きい。したがって、ウイルスは、濾過により、サイズに従ってタンパク質から除去され得る、と推定される。
【０１１５】
ウイルス濾過は、典型的には約６０ｎｍの公称孔サイズを有する高処理量膜を用いて、より大きな、例えばレトロウイルス（直径８０〜１００ｎｍ）を除去し得る。公称孔サイズ２０ｎｍの高処理量膜も市販されているため、濾過により、より小さなウイルス、例えばパルボウイルス（直径１８〜２６ｎｍ）を除去することが可能であり、一方、１６０ｋＤ（約８ｎｍ）といった大きさであるタンパク質、例えばモノクローナル抗体の通過を可能にする。本発明は主に、より小さな孔サイズのウイルス除去フィルターを用いて、典型的にはこのような小型ウイルスの濾過に伴う問題を解決するために意図される。
【０１１６】
典型的には、ウイルス濾過段階は、所与の下流工程におけるいくつかのポイントのいずれか１つで実行され得る。例えば、典型的モノクローナル抗体精製工程では、ウイルス濾過は低ｐＨのウイルス不活性化段階後に、あるいは中間カラムクロマトグラフィー段階後に、あるいは最終のカラムクロマトグラフィー段階の後に行なわれ得る。
【０１１７】
本発明によれば、ウイルス濾過ユニット操作は、下流工程の任意のステージで実行され得る。モノクローナル抗体の下流加工処理中のウイルス濾過は、典型的には、アフィニティークロマトグラフィー段階（捕捉段階）およびイオン交換精製段階（最終精製段階）後に実施される。
【０１１８】
本明細書中に開示される実験で用いられる実験の設定が、図１に例示されている。しかしながら、本発明はそのように限定されるというわけではないことが強調される。当該技術分野で周知の他の構成も適切であり、本発明の方法に用いられ得る。
【０１１９】
平行流ウイルス濾過では、タンパク質溶液は、通常は、保持側面上に一定速度の流れで周囲に押出される。ウイルス除去フィルターにわたって生じる差圧は、タンパク質溶液を、フィルターを通して浸透させ、一方、ウイルスは保持側面に保持される。
【０１２０】
いわゆる「垂直流」または「デッドエンド」ウイルス濾過の場合、平行ウイルス濾過に用いられるのと同じウイルスフィルターが用いられ得るが、しかし周辺機器および操作手順は、平行流ウイルス濾過の場合よりかなり簡単で且つ安価である。したがって、原則として、「垂直流」濾過は、濾過の前に圧力容器中に高分子含有溶液を配置した後、圧力源、適切には窒素（気体）または空気の助けで溶液に圧力をかけてウイルス除去フィルターを通過させることを包含する。代替的には、ポンプを保持側面に用いて、既定の流量でウイルス除去フィルターを通して液体を濾過し得る。
【０１２１】
フィルターの微細度は、一般的に、孔サイズとして、あるいはフィルターにより分子が止められる（いわゆるカットオフ）およその分子量（相対分子量）として普通は表される。
【０１２２】
ウイルスフィルターは当該技術分野で既知であり、とりわけ、Millipore（Massachusetts, USA）およびAsahi Chemical Industry Co., Ltd.（日本）により供給される。適切なパルボウイルス保持フィルターとしては、Ｖｉｒｅｓｏｌｖｅ（登録商標）Ｐｒｏ(Millipore Corp., Billerica, MA)が挙げられる。Ｖｉｒｅｓｏｌｖｅ（登録商標）Ｐｒｏ膜は、非対称二重膜構造を有し、ポリエーテルスルホン（ＰＥＳ）製である。膜構造は、２０ｎｍより大きいサイズのウイルスを保持する一方で、１８０ｋＤａ未満の分子量のタンパク質は膜を透過させるよう設計されている。タンパク質溶液から小型ウイルス、例えばパルボウイルスを除去するのに適した他のフィルターとしては、Ｎｏｖａｓｉｐ（商標）ＤＶ２０およびＤＶ５０ウイルス除去フィルターカプセル(Pall Corp., East Hills, NY)、Ｖｉｒｏｓａｒｔ（登録商標）ＣＰＶ、Ｐｌａｎｏｖａ ２０Ｎ(Asahi Kasei)およびＢｉｏＥＸ(Asahi Kasei)が挙げられる。Ｎｏｖａｓｉｐ ＤＶ２０等級カプセルフィルターはＵｌｔｉｐｏｒ ＶＦ等級ＤＶ２０等級襞付膜カートリッジを利用して、パルボウイルスならびに２０ｎｍという小さい他のウイルスを５〜１０リットルまでのタンパク質溶液から除去する。Ｎｏｖａｓｉｐ ＤＶ５０等級カプセルフィルターはＵｌｔｉｐｏｒ ＶＦ ＤＶ５０等級Ｕｌｔｉｐｌｅａｔ（登録商標）膜カートリッジを組入れて、４０〜５０ｎｍ以上のウイルスを除去する。Ｎｏｖａｓｉｐ Ｕｌｔｉｐｏｒ ＶＦカプセルフィルターは、非無菌で供給され、ガンマ線照射もされ得る。Ｖｉｒｏｓａｒｔ（登録商標）ＣＰＶは二重層ポリエーテルスルホン不斉膜を利用し、４ｌｏｇより大きいパルボウイルスおよび６ｌｏｇのレトロウイルスを保持する。
【０１２３】
供給溶液の前濾過は、フィルター性能に劇的な影響を及ぼし得る。前濾過は、典型的には、ウイルスフィルターの汚損をもたらし得る、例えばタンパク質凝集物、ＤＮＡおよびその他の微量物質等の不純物および夾雑物を除去することを目標とする。
【０１２４】
本発明によれば、ウイルスフィルターの効力の顕著な増強が、陽イオン交換および内毒素除去媒体の両方の使用を含む前濾過段階により達成され得る。この文脈において、「媒体（単数）」または「媒体（複数）」という用語は、それぞれ陽イオン交換および内毒素除去段階を実施するためのいかなる手段をも包含するために用いられる。したがって、「陽イオン交換媒体」という用語は、具体的には、陽イオン交換樹脂、マトリックス、吸収装置等を包含するが、これらに限定されない。「内毒素除去媒体」という用語は、任意の正荷電膜表面、例えばクロマトグラフィー内毒素除去媒体、内毒素親和性除去媒体等を包含するが、これらに限定されない。
【０１２５】
本発明の前濾過段階で用いるのに適した陽イオン交換媒体としては、Ｍｕｓｔａｎｇ（登録商標）Ｓ、Ｓａｒｔｏｂｉｎｄ（登録商標）Ｓ、Ｖｉｒｅｓｏｌｖｅ（登録商標）Ｓｈｉｅｌｄ、ＳＰＦＦ、ＳＰＸＬ、Ｃａｐｔｏ（登録商標）Ｓ、Ｐｏｒｏｓ（登録商標）５０ＨＳ、Ｆｒａｃｔｏｇｅｌ（登録商標）Ｓ、Ｈｙｐｅｒｃｅｌ（登録商標）Ｄ等（これらは市販されている）が挙げられるが、これらに限定されない。
【０１２６】
本発明の前濾過段階で用いるのに適した内毒素除去媒体としては、Ｍｕｓｔａｎｇ（登録商標）Ｅ、Ｍｕｓｔａｎｇ（登録商標）Ｑ、Ｓａｒｔｏｂｉｎｄ（登録商標）Ｑ、Ｃｈｒｏｍａｓｏｒｂ（登録商標）、Ｐｏｓｓｉｄｙｎｅ（登録商標）、Ｃａｐｔｏ（登録商標）Ｑ、ＱＳＦＦ、Ｐｏｒｏｓ（登録商標）Ｑ、Ｆｒａｃｔｏｇｅｌ（登録商標）Ｑ等（これらは市販されている）が挙げられるが、これらに限定されない。
【０１２７】
前濾過段階は、例えば、製造過程クロマトグラフィープールを採用して、内毒素除去および陽イオン交換媒体ならびにパルボウイルスフィルターを含む濾過列上でプールを処理することにより、実施され得る。内毒素除去および陽イオン交換媒体は、前濾過段階として作用し、パルボウイルスフィルターの能力は濾過列中の２つの段階の順序とは無関係である。濾過列は、単一段階として連続して作動し得るし、あるいはそれは、異なるユニット操作として操作され得る。例えば一実施形態では、クロマトグラフィープールが内毒素除去媒体上で先ず処理されて、収集されたプールは次に、陽イオン交換媒体上で処理され、その後のプールがパルボウイルスフィルターで濾過される。上記のように、工程配列において陽イオン交換媒体および内毒素除去媒体を適用する順番は、パルボウイルス濾過能力に影響しない。工程は、広範なｐＨ範囲に亘って、例えばｐＨ４〜１０の範囲で操作することができ、最適フィルター能力は標的不純物プロファイルおよび生成物属性に左右される。同様に、タンパク質濃度は、広範囲に亘って、例えば１〜４０ｇ／Ｌで変わり得るが、パルボウイルスフィルターの質量処理量を限定しない。
【０１２８】
本発明は、以下の実施例を参照することによりさらに理解されるであろう。しかしながらそれらは、本発明の範囲を限定するものではない。本開示全体を通しての引例は全て、その記載内容が参照により本明細書中に組入れられる。
【実施例】
【０１２９】
材料および方法
１． タンパク質溶液
モノクローナル抗体の下流処理中のウイルス濾過はアフィニティークロマトグラフィー（捕捉段階）およびイオン交換段階（最終精製段階）の後に実施されるため、濾過実験は全て、商業的に適した製造過程でイオン交換（陽イオンまたは陰イオン交換）クロマトグラフィープールを用いて実施した。陽イオン交換ならびに陰イオン交換プールのｍＡｂ濃度およびプール伝導度は、それぞれ１０ｍｇ／ｍｌおよび１０ｍＳ／ｃｍならびに８ｍｇ／ｍｌおよび４ｍｓ／ｃｍであった。新鮮な供給原料（製造２４時間以内）を用いて、あるいは製造後−７０℃で冷凍し、使用前に４〜８℃で解凍した供給原料を用いて、濾過実験を実施した。新鮮な供給原料または凍結解凍供給原料を用いて得られた結果において、有意差は観察されなかった。タンパク質濃度は、ＵＶ−ｖｉｓ分光測光計（ＮａｎｏＤｒｏｐ ＮＤ−１０００、NanoDrop Technologies, Wilmington, DE）を用いて確定し、吸光度は２８０ｎｍで測定した。
【０１３０】
２． 膜
Ｖｉｒｅｓｏｌｖｅ（登録商標）Ｐｒｏ(Millipore Corp., Billerica, MA)パルボウイルス保持フィルターを用いて、濾過実験を実施した。Ｖｉｒｅｓｏｌｖｅ（登録商標）Ｐｒｏ膜は、非対称二重層構造を有し、ポリエーテルスルホン（ＰＥＳ）製である。膜構造は、２０ｎｍより大きいサイズのウイルスを保持し、一方、１８０ｋＤａ未満の分子量のタンパク質は膜を透過させるよう設計されている。この試験で評価したＶｉｒｅｓｏｌｖｅ（登録商標）Ｐｒｏのための前置フィルターは、Ｖｉｒｅｓｏｌｖｅ（登録商標）Ｏｐｔｉｓｃａｌｅ ４０深層フィルター(Millipore Corp., Billerica, MA)、Ｆｌｕｏｒｏｄｙｎｅ ＥＸ Ｍｉｎｉ ０．２ μｍ滅菌フィルター(Pall Corp., East Hills, NY)およびＭｕｓｔａｎｇ（登録商標）ファミリーからの膜吸収装置(Pall Corp., East Hills, NY)を包含した。膜吸収装置は、完全封入Acrodisc（登録商標）ユニットで売主から入手した。表１は、この試験に用いた前置フィルター全ての重要な特性（官能基、床容積、孔サイズ等）を要約する。
【表１】
【０１３１】
３． 実験の設定
図１に示した特別仕様の装置を用いて、濾過実験を実施した。負荷物質、すなわち製造過程ｍＡｂプールを負荷レザバー中に入れて、異なる組合せの前置フィルターおよび市販パルボウイルスフィルターからなる濾過列を通して濾過した。全ての濾過実験において、一定濾過流量（Ｐmax）法を用いた。圧力変換器を各フィルターの上流に配置し、ＭｉｌｌｉｄａｑまたはＮｅｔｄａｑシステムと連結して、差圧データを時間または質量処理量の一関数として記録した。パルボウイルスフィルターからの濾液をレザバー中に収集し、これを負荷セル上に保持して、質量処理量を時間の一関数として記録した。
【０１３２】
結果および考察
哺乳動物細胞培養中で発現されるｍＡｂの下流精製は、典型的には、第一段階として遠心分離および深層濾過を利用して、細胞および細胞破砕屑を除去し、その後、ｍＡｂ捕捉および宿主細胞タンパク質（ＨＣＰ）の除去のためにアフィニティークロマトグラフィー処理し、その後、陽イオン交換クロマトグラフィー、ウイルス濾過および陰イオン交換クロマトグラフィー処理して、不純物、例えば凝集物、ウイルス、浸出プロテインＡおよびＨＣＰをさらに除去する。この試験におけるほとんどの実験を、陽イオン交換プールを用いて実施し、陽イオン交換クロマトグラフィーは第二クロマトグラフィー段階であった。
【０１３３】
図２は、異なる前置フィルターを用いて治療用ｍＡｂ供給流を２００Ｌ／ｍ２／時間の一定流量でＶｉｒｅｓｏｌｖｅ Ｐｒｏに通した差圧に関する実験データを示す。Ｘ軸は、ウイルスフィルター１平方メートル当たりの負荷されたｍＡｂの質量を表す。Ｙ軸は、ウイルスフィルターを通した差圧を質量処理量の関数として表す。深層フィルターが、滅菌フィルターと比較して、ウイルス濾過能力の数桁の大きさの増大を提供する、ということをデータは明白に示している。Bolton等(Bolton et al. Appl. Biochem. 43:55-63, 2006)が、ＮＦＰパルボウイルス保持フィルター(Millipore Corp.) に対する前置フィルターとしてのＶｉｒｅｓｏｌｖｅ Ｐｒｅｆｉｌｔｅｒ（商標）（深層フィルター媒体）の効果を、ポリクローナルＩｇＧ溶液を用いて評価した際に、同様の観察が成された。能力の増大は、疎水性相互作用のための汚損物（変性タンパク質）の選択的吸着に起因すると、著者等は考えた。
【０１３４】
深層フィルターは伝統的に、細胞培養流体の清澄化のために首尾よく用いられてきたが、しかし、例えば、パルボウイルス保持フィルターに対する前置フィルターとして、捕捉段階の下流に用いられる場合、特に考慮すべきかなりの数の限界が存在する。
（ａ）深層フィルターは基材安定性でなく、取り付け後の工程列の衛生を妨げ、開放型処理および汚染微生物増殖の可能性を生じる。
（ｂ）深層フィルターの組成は重要構成成分として珪藻土を含み、これは、典型的には食品等級であり、品質の問題を提示する。
（ｃ）珪藻土は一般的に、自然（十分に定義された化学的工程を欠く）から供給され、したがってロット毎の変動を示し得る。
（ｄ）深層フィルターは、金属、β−グリカンおよびその他の不純物を濾し出す傾向もあり、下流操作に伴って、この掃去が実証され、確認される必要がある。
【０１３５】
深層フィルターの下流のユニット操作は濾出し物の適切な掃去を提供するよう設計されなければならないので、これらの制限が工程開発に大きな重荷となる。しかしながら、濾出し物掃去の必要条件が満たされた場合でも、主要構成成分は自然から供給される、すなわち、それらは十分に定義された化学合成工程を欠くので、深層フィルターの特定ロットは、工程が清掃可能であるものより有意に高い濾出し物を有し得る、と懸念される理由がある。
【０１３６】
したがって、これらの制限を示さない前置フィルターの開発に、高い関心がもたれてきた。上記のように、Brown等 (Brown et al. IBC’s 20th Antibody Development and Production, San Diego, CA , 2008) は、近年、強力な負荷電イオン交換剤であるＭｕｓｔａｎｇ Ｓが、前置フィルターとして用いた場合、パルボウイルス保持フィルターの能力を数倍増大し得ることを示した。したがって、Ｖｉｒｅｓｏｌｖｅ（登録商標）Ｐｒｏに対する異なる前濾過媒体の作用を評価するために、実験を実行した。ｐＨ５．０および６．５での実験データを、図３（ａ）および（ｂ）に示す。データは、陽イオン交換媒体がｐＨ５．０で内毒素除去吸着剤をわずかに上回る利点を示したが、しかしその利点はｐＨ６．５で消失したことを示す。両媒体の全体的能力は、滅菌フィルターを用いたものより高かった（図２）；が、しかし、製造規模でのユニット操作を首尾よく実行するのに要する能力には有意に足りなかった。
【０１３７】
陽イオン交換および内毒素除去媒体の両方が２つの異なる汚損物を除去し得、その両方が汚損物を濾過し得る、という仮説に基づいて、イオン交換および内毒素除去媒体の両方を含む新規の前濾過列を用いて、実験を設計した。実験結果を、図４（ａ）および（ｂ）に示す（それぞれ、ｐＨ５．０およびｐＨ６．５）。２つの媒体の組合せは媒体それ自体の各々より有意に良好である、ということをデータは明白に示している。例えば、ｐＨ５．０では、陽イオン交換および内毒素除去媒体の組合せは、２０ｐｓａの差圧で、一桁より大きな能力改善を提供する。同様の傾向がｐＨ６．５でも観察されたが、しかし全体的能力はｐＨ５．０で得たものより低かった。それは、ｐＨが低いほど不純物はより強固に除去されるためであると思われる。
【０１３８】
ＭＡｂ2での実験結果を、図５に示す。図４のデータと一致して、内毒素除去媒体および陽イオン交換媒体の両方を含有する新規の前濾過列は能力を大幅に増大したが、これは、内毒素除去媒体および陽イオン交換媒体が相乗的に作用して、２つの異なる種類の汚損物を除去することを示唆する。
【０１３９】
結論
従来の研究は大多数が、パルボウイルス保持フィルターの能力を増大するための前置フィルターとして、深層フィルターまたは陽イオン交換膜吸着剤を使用することに集中していた。深層フィルターはウイルス濾過能力を増大するための強固な機序を提供するが、しかし濾出し物のようなそれらに伴う制限が、下流精製列における特定ステージへのそれらの適用を限定する。陽イオン交換膜吸着剤はいくつかのモノクローナル抗体（ｍＡｂ）供給流に関するパルボウイルスフィルター能力を増大し得るが、しかしそれらはこの試験のデータで分かるように普遍的に適用可能であるというわけでなく、これは、多数の汚損物が存在し得る、これはパルボウイルス除去フィルターの性能をさらに改良するために対処する必要があることを示唆している。
【０１４０】
本発明は、上記の実験結果により実証されるように、２つの態様を強調する。すなわち、（１）内毒素除去媒体それ自体は、前濾過のために用いた場合、パルボウイルスフィルターの能力を有効に増大し得る。そして（２）内毒素除去および陽イオン交換媒体を前濾過列で連結すると、パルボウイルス濾過能力を数倍増大することができ、原料コストを低下させて、製造規模でのウイルス濾過の成功裏の操作を促す。
【技術分野】
【０００１】
本発明は、タンパク質精製の分野からである。特に本発明は、前濾過工程における内毒素除去と陽イオン交換媒体の併用により、ウイルスフィルターの濾過能力を増大するための方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
哺乳類細胞株は、適正タンパク質フォールディングおよび翻訳後修飾、例えばグリコシル化に関するそれらの能力のために、組換えタンパク質治療薬の産生のための第一選択肢になっている（Chu and Robinson Current Opinion in Biotechnology 12:180 ‐ 187, 2001）。しかしながら、これらの細胞株は、レトロウイルス様粒子を含有し（Lieber et al. Science 182:56 ‐ 59, 1973； Lubiniecki et al. Dev Biol Stand 70:187 ‐ 191, 1989）、潜在的アデノウイルス汚染の危険を有する（Garnick, Dev Biol Stand. Basel: Karger 93:21 ‐ 29, 1998）ことも知られている。組換えタンパク質薬剤を製造するバイオ製薬産業は良好な安全記録を有するが、一方、血液ならびに血漿由来の血液製品によるウイルス感染が過去に発生している（Brown, Dev. Biol. Stand. 81, 1993； Thomas, Lancet 343:1583-1584, 1994）。組換えタンパク質産生中のウイルス汚染の危険を軽減するために、下流精製工程は、内因性および外因性ウイルスを除去する工程段階を包含するよう設計される。ウイルス不活性化か工程供給流からのウイルス除去のいずれかを提供するいくつかの工程段階の組合せにより、適切なウイルス排除が得られる。ウイルス不活性化は低ｐＨでのインキュベーション、熱処理および洗剤といったような技法を用いて達成されるが、一方、ウイルス除去は、典型的には、クロマトグラフィーおよび濾過を用いて実施される（Curtis et al., Biotechnology and Bioengineering 84(2):179 ‐ 186, 2003）。
【０００３】
実効電荷のような物理化学的特性に基づいてウイルスを除去するクロマトグラフィー媒体と違って、ウイルス濾過はサイズ排除によりウイルスを除去し、したがってより強力な技法と考えられる。今までのところ、哺乳類細胞培養由来のバイオ治療薬の下流精製中のウイルス濾過の使用は、６０ｎｍ未満の公称孔サイズを有する高処理量膜の欠如のために、レトロウイルス（直径８０〜１００ｎｍ）の除去に限定されている。
【０００４】
膜技術の近年の進歩は、２０ｎｍの公称孔サイズを有する高処理量膜の製造を可能にした。これらのウイルスフィルターは、パルボウイルス（直径１８〜２６ｎｍ）に対して保持性であり、１６０ｋＤ（約８ｎｍ）という大きさであるタンパク質、例えばモノクローナル抗体（ｍＡｂ）の通過を可能にする。
【０００５】
パルボウイルスフィルターに伴う高選択性および高処理量は、微細孔基材上に薄い保持膜を成型することにより達成される。薄い保持層は、タンパク質およびウイルスの非常に精密な分離を可能にするものの、それは、工程供給流中の不純物による付着を受け易くもあり、フィルター能力および流量が低下する。ウイルスフィルターの汚損は、タンパク質凝集物および変性タンパク質のような夾雑物のせいである。BohonakとZydney(Bohonak and Zydney, Journal of Membrane Science 254(1-2):71-79, 2005)は、フィルター能力の損失がケーク形成または孔遮断のためであり得る、ということを示した。他の近年の報告（Bolton et al., Biotechnol. Appl. Biochem. 43:55-63, 2006; Levy et al., Filtration in the Biopharamaceutical Industry. (Meltzer, T.H. and Jornitz, M.W., eds.) pp. 619-646, Marcel Dekker, New York, 1998）は、フィルター汚損を孔壁への不純物の吸着のせいであると考えた。いくつかの出版物（Bolton et al., Biotechnology and Applied Biochemistry 42:133-142, 2005；Hirasaki et al., Polymer Journal 26(11):1244-1256, 1994；Omar and Kempf, Transfusion 42(8):1005-1010, 2002）は、フィルター能力の低減または孔の閉塞がウイルス保持を数桁減少して、ユニット操作の頑健性に影響を及ぼし得る、ということも実証している。
【０００６】
したがって多数の近年の研究は、工程供給流からの汚損物を除去して、ウイルスフィルター汚損を最小限にし、そして高能力、高処理量および頑健なウイルス保持を保証するための前置フィルターの特定に集中してきた。Bolton等（Bolton et al. 2006）は、前置フィルターとしていくつかの膜を試験することを含む徹底的な研究を実施して、前置フィルターとしてＶｉｒｅｓｏｌｖｅ（商標）深層フィルターを用いることにより、正常流動パルボウイルス（ＮＦＰ）膜の能力を、ほとんど一桁増大することが可能である、ということを実証した。Brown等(Brown et al. 2008, Use of Charged Membranes to Identify Soluble Protein Foulants in order to Facilitate Parvovirus Filtration. IBC’s 20th Antibody Development and Production, San Diego, CA)は、パルボウイルス保持フィルターに対する前置フィルターとしての強力な陽イオン交換膜吸着装置を評価して、ウイルスフィルターの能力が１１の異なるｍＡｂ流に関して数倍増大され得る、ということを示した。陽イオン交換膜吸着装置は競合的吸着により供給流から大分子量（約６００−１５００ｋＤ）タンパク質凝集物を除去して、ウイルスフィルターが詰まらないようにする、と本著者等は仮定した。米国特許第７，１１８，６７５号(Siwak等)は、タンパク質溶液からタンパク質凝集物を除去してウイルスフィルターの汚損を防止するために電荷修正膜を利用する工程を記載する。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００７】
本発明は、少なくとも一部は、パルボウイルスフィルターの汚損が文献に記述されたもの以外の不純物のためであり得るし、ウイルス濾過能力を改良するためにはより包括的な前濾過解決策が必要とされる、という実験知見に基づいている。したがって、本発明は、文献に記述される最良の前濾過アプローチ（陽イオン交換膜吸着装置）より大幅に良好に機能する新規の前濾過解決策を提供する。
【０００８】
一態様では、本発明は、タンパク質精製中のウイルスフィルターの濾過能力の改良方法であって、精製されるべきタンパク質を含む組成物を、いずれかの順序で、陽イオン交換ステップおよび内毒素除去ステップに付した後、上記ウイルスフィルターに通すことを包含する方法に関する。
【０００９】
一実施形態では、ウイルスフィルターの孔サイズは直径約１５〜約１００ｎｍである。
【００１０】
別の実施形態では、ウイルスフィルターの孔サイズは直径約１５〜約３０ｎｍである。
【００１１】
さらに別の実施形態では、ウイルスフィルターの孔サイズは約２０ｎｍである。
【００１２】
さらなる実施形態では、除去されるべきウイルスはパルボウイルスである。
【００１３】
さらなる実施形態では、パルボウイルスの直径は約１８〜約２６ｎｍである。
【００１４】
異なる一実施形態では、タンパク質は抗体または抗体断片、例えば組換えＤＮＡ技術により産生される抗体またはその断片である。
【００１５】
別の実施形態では、抗体は治療用抗体である。
【００１６】
さらに別の実施形態では、組換え抗体または抗体断片は哺乳動物宿主細胞、例えばチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞中で産生される。
【００１７】
さらなる実施形態では、精製されるべきタンパク質を含む組成物は、先ず陽イオン交換ステップに、その後、内毒素除去ステップに付された後に、ウイルス濾過される。
【００１８】
さらなる実施形態では、精製されるべきタンパク質を含む組成物は、先ず内毒素除去ステップに、その後、陽イオン交換ステップに付された後に、ウイルス濾過される。
【００１９】
別の実施形態では、精製されるべきタンパク質を含む組成物は、単一モジュールで２つの媒体を一緒に保持することにより、陽イオン交換ステップおよび内毒素除去ステップに同時に付された後に、ウイルス濾過される。
【００２０】
さらに別の実施形態では、内毒素除去ステップ直後にウイルス濾過がなされる。
【００２１】
さらなる実施形態では、陽イオン交換ステップ直後にウイルス濾過がなされる。
【００２２】
異なる一実施形態では、ウイルス濾過はｐＨ約４〜約１０で実施される。
【００２３】
別の実施形態では、精製されるべき組成物中のタンパク質濃度は約１〜４０ｇ／Ｌである。
【００２４】
さらに別の実施形態では、精製されるべき抗体は、ＨＥＲ１（ＥＧＦＲ）、ＨＥＲ２、ＨＥＲ３、ＨＥＲ４、ＶＥＧＦ、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ１１ａ、ＣＤ１１ｂ、ＣＤ１１ｃ、ＣＤ１８、ＩＣＡＭ、ＶＬＡ−４、ＶＣＡＭ、ＩＬ−１７Ａおよび／またはＦ、ＩｇＥ、ＤＲ５、ＣＤ４０、Ａｐｏ２Ｌ／ＴＲＡＩＬ、ＥＧＦＬ７、ＮＲＰ１、有糸分裂活性化プロテインキナーゼ（ＭＡＰＫ）およびＤ因子からなる群から選択される１つ以上の抗原に対するものである。
【００２５】
さらなる実施形態では、抗体は、抗エストロゲン受容体抗体、抗プロゲステロン受容体抗体、抗ｐ５３抗体、抗カテプシンＤ抗体、抗Ｂｃｌ−２抗体、抗Ｅ−カドヘリン抗体、抗ＣＡ１２５抗体、抗ＣＡ１５−３抗体、抗ＣＡ１９−９抗体、抗ｃ−ｅｒｂＢ−２抗体、抗Ｐ−糖タンパク質抗体、抗ＣＥＡ抗体、抗網膜芽細胞腫タンパク質抗体、抗ｒａｓ腫瘍性タンパク質抗体、抗ルイスＸ抗体、抗Ｋｉ−６７抗体、抗ＰＣＮＡ抗体、抗ＣＤ３抗体、抗ＣＤ４抗体、抗ＣＤ５抗体、抗ＣＤ７抗体、抗ＣＤ８抗体、抗ＣＤ９／ｐ２４抗体、抗ＣＤ１０抗体、抗ＣＤ１１ｃ抗体、抗ＣＤ１３抗体、抗ＣＤ１４抗体、抗ＣＤ１５抗体、抗ＣＤ１９抗体、抗ＣＤ２３抗体、抗ＣＤ３０抗体、抗ＣＤ３１抗体、抗ＣＤ３３抗体、抗ＣＤ３４抗体、抗ＣＤ３５抗体、抗ＣＤ３８抗体、抗ＣＤ４１抗体、抗ＬＣＡ／ＣＤ４５抗体、抗ＣＤ４５ＲＯ抗体、抗ＣＤ４５ＲＡ抗体、抗ＣＤ３９抗体、抗ＣＤ１００抗体、抗ＣＤ９５／Ｆａｓ抗体、抗ＣＤ９９抗体、抗ＣＤ１０６抗体、抗ユビキチン抗体、抗ＣＤ７１抗体、抗ｃ−ｍｙｃ抗体、抗サイトケラチン抗体、抗ビメンチン抗体、抗ＨＰＶタンパク質抗体、抗カッパ軽鎖抗体、抗ラムダ軽鎖抗体、抗メラノソーム抗体、抗前立腺特異的抗原抗体、抗Ｓ−１００抗体、抗タウ抗原抗体、抗フィブリン抗体、抗ケラチン抗体および抗Ｔｎ−抗原抗体からなる群から選択される。
【図面の簡単な説明】
【００２６】
【図１】ウイルス濾過試験のために用いられる実験準備の模式図である。
【図２】Ｖｉｒｅｓｏｌｖｅ Ｐｒｏパルボウイルス保持フィルターの能力に及ぼす滅菌および深層フィルターの作用を示す図である。ｐＨ５．５および伝導度８．５ｍＳ／ｃｍで、実験を実施した。ｍＡｂ濃度は約１３ｇ／Ｌであった。
【図３ａ】Ｖｉｒｅｓｏｌｖｅ Ｐｒｏパルボウイルスフィルターの能力に及ぼす前置フィルターとしての陽イオン交換および内毒素除去膜吸着装置の作用を示す図である。ＭＡｂ１に関してそれぞれｐＨ５．０および６．５で、３（ａ）および３（ｂ）のデータを得た。
【図３ｂ】Ｖｉｒｅｓｏｌｖｅ Ｐｒｏパルボウイルスフィルターの能力に及ぼす前置フィルターとしての陽イオン交換および内毒素除去膜吸着装置の作用を示す図である。ＭＡｂ１に関してそれぞれｐＨ５．０および６．５で、３（ａ）および３（ｂ）のデータを得た。
【図４ａ】ＭＡｂ１に関するＶｉｒｅｓｏｌｖｅ Ｐｒｏパルボウイルス保持フィルターの能力に及ぼす陽イオン交換および内毒素除去膜吸着装置の両方を含有する新規の前濾過列の作用を示す図である。それぞれｐＨ５．０および６．５で、４（ａ）および４（ｂ）のデータを得た。
【図４ｂ】ＭＡｂ１に関するＶｉｒｅｓｏｌｖｅ Ｐｒｏパルボウイルス保持フィルターの能力に及ぼす陽イオン交換および内毒素除去膜吸着装置の両方を含有する新規の前濾過列の作用を示す図である。それぞれｐＨ５．０および６．５で、４（ａ）および４（ｂ）のデータを得た。
【図５】ＭＡｂ２に関するパルボウイルス保持フィルターの能力に及ぼす、陽イオン交換前濾過媒体と比較した場合の、陽イオン交換および内毒素除去膜吸着装置の両方を含有する新規の前濾過列の作用を示す図である。
【発明を実施するための形態】
【００２７】
Ｉ． 定義
「タンパク質」とは、その鎖長が高レベルの三次および／または四次構造を作り出すのに十分であるアミノ酸の配列を意味する。したがって、タンパク質は、同様にアミノ酸ベースの分子ではあるがこのような構造を有さない「ペプチド」と区別される。典型的には、本明細書中で用いるためのタンパク質は、少なくとも約１５〜２０ｋＤ、好ましくは少なくとも約２０ｋＤの分子量を有する。
【００２８】
本明細書中の定義内に包含されるタンパク質の例としては、哺乳類タンパク質、例えば、ＣＤ４、インテグリンおよびそれらのサブユニット、例えばベータ７、成長ホルモン、例えばヒト成長ホルモンおよびウシ成長ホルモン；成長ホルモン放出因子；上皮小体ホルモン；甲状腺刺激ホルモン；リポタンパク質；α−１−抗トリプシン；インスリンＡ−鎖；インスリンＢ−鎖；プロインスリン；濾胞刺激ホルモン；カルシトニン；黄体形成ホルモン；グルカゴン；凝固因子、例えばＶＩＩＩＣ因子、ＩＸ因子、組織因子およびフォン・ウィルブランド因子；抗凝固因子、例えばプロテインＣ；心房ナトリウム利尿因子；肺界面活性剤；プラスミノーゲン活性化剤、例えばウロキナーゼまたは組織型プラスミノーゲン活性化剤（ｔ−ＰＡ、例えばアクチベース（登録商標）、ＴＮＫアーゼ（登録商標）、レテベース（登録商標））；ボンバジン；トロンビン；腫瘍壊死因子αおよびβ；エンケファリナーゼ；ＲＡＮＴＥＳ（ｒｅｇｕｌａｔｅｄ ｏｎ ａｃｔｉｖａｔｉｏｎ ｎｏｒｍａｌｌｙ Ｔ−Ｃｅｌｌ ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ ａｎｄ ｓｅｃｒｅｔｅｄ（活性化時に調節され、正常Ｔ細胞により発現され、分泌される））；ヒトマクロファージ炎症タンパク質（ＭＩＰ−１−α）；血清アルブミン、例えばヒト血清アルブミン；ミュラー抑制物質；マウスゴナドトロピン関連ペプチド；ＤＮアーゼ；インヒビン；アクチビン；血管内皮成長因子（ＶＥＧＦ）；ＩｇＥ、ホルモンまたは成長因子のための受容体；インテグリン；プロテインＡまたはＤ；リウマチ因子；神経栄養因子、例えば骨由来神経栄養因子（ＢＤＮＦ）、ニューロトロフィン−３、−４、−５または−６（ＮＴ−３、ＮＴ−４、ＮＴ−５またはＮＴ−６）、あるいは神経成長因子、例えばＮＧＦ−β；血小板由来成長因子（ＰＤＧＦ）；繊維芽細胞成長因子、例えばａＦＧＦおよびｂＦＧＦ；上皮細胞成長因子（ＥＧＦ）；形質転換成長因子（ＴＧＦ）、例えばＴＧＦ−αおよびＴＧＦ−β、例えばＴＧＦ−β１、ＴＧＦ−β２、ＴＧＦ−β３、ＴＧＦ−β４またはＴＧＦ−β５；インスリン様成長因子ＩおよびＩＩ（ＩＧＦ−ＩおよびＩＧＦ−ＩＩ）；ｄｅｓ（１−３）−ＩＧＦ−Ｉ（脳ＩＧＦ−Ｉ）；インスリン様成長因子結合タンパク質；その他のＣＤタンパク質、例えばＣＤ３、ＣＤ８、ＣＤ１９およびＣＤ２０；エリスロポエチン（ＥＰＯ）；トロンボポエチン（ＴＰＯ）；骨誘導因子；免疫毒素；骨形態形成タンパク質（ＢＭＰ）；インターフェロン、例えばインターフェロンα、βおよびγ；コロニー刺激因子（ＣＳＦ）、例えばＭ−ＣＳＦ、ＧＭ−ＣＳＦおよびＧ−ＣＳＦ；インターロイキン（ＩＬ）、例えばＩＬ−１〜ＩＬ−１０；スーパーオキシドジスムターゼ；Ｔ−細胞受容体；表面膜タンパク質；崩壊促進因子（ＤＡＦ）；ウイルス抗原、例えばＡＩＤＳエンベロープの一部；輸送タンパク質；ホーミング受容体；アドレッシン；調節タンパク質；インテグリン、例えばＣＤ１１ａ、ＣＤ１１ｂ、ＣＤ１１ｃ、ＣＤ１８、ＩＣＡＭ、ＶＬＡ−４およびＶＣＡＭ；腫瘍関連抗原、例えばＨＥＲ１（ＥＧＦＲ）、ＨＥＲ２、ＨＥＲ３またはＨＥＲ４受容体；アポ２Ｌ／ＴＲＡＩＬ、そして上記ポリペプチドのいずれかの断片；ならびに上記タンパク質のいずれかと結合するイムノアドヘシンおよび抗体；そして上記タンパク質のいずれかの生物学的に活性な断片または変異体が挙げられる。
【００２９】
具体的には、本明細書中で定義される「タンパク質」の定義内に含まれるのは、治療用抗体およびイムノアドヘシン、例えば以下の抗原のうちの１つ以上に対する抗体であるが、これらに限定されない：ＨＥＲ１（ＥＧＦＲ）、ＨＥＲ２、ＨＥＲ３、ＨＥＲ４、ＶＥＧＦ、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ１１ａ、ＣＤ１１ｂ、ＣＤ１１ｃ、ＣＤ１８、ａｎ ＩＣＡＭ、ＶＬＡ−４、ＶＣＡＭ、IＬ−１７Ａおよび／またはＦ、ＩｇＥ、ＤＲ５、ＣＤ４０、アポ２Ｌ／ＴＲＡＩＬ、ＥＧＦＬ７、ＮＲＰ１、有糸分裂活性化プロテインキナーゼ（ＭＡＰＫ）およびＤ因子、ならびにその断片。
【００３０】
他の抗体の例としては以下から選択されるものが挙げられるが、これらに限定されない：抗エストロゲン受容体抗体、抗プロゲステロン受容体抗体、抗ｐ５３抗体、抗カテプシンＤ抗体、抗Ｂｃｌ−２抗体、抗Ｅ−カドヘリン抗体、抗ＣＡ１２５抗体、抗ＣＡ１５−３抗体、抗ＣＡ１９−９抗体、抗ｃ−ｅｒｂＢ−２抗体、抗Ｐ−糖タンパク質抗体、抗ＣＥＡ抗体、抗網膜芽細胞腫タンパク質抗体、抗ｒａｓ腫瘍性タンパク質抗体、抗ルイスＸ抗体、抗Ｋｉ−６７抗体、抗ＰＣＮＡ抗体、抗ＣＤ３抗体、抗ＣＤ４抗体、抗ＣＤ５抗体、抗ＣＤ７抗体、抗ＣＤ８抗体、抗ＣＤ９／ｐ２４抗体、抗ＣＤ１０抗体、抗ＣＤ１１ｃ抗体、抗ＣＤ１３抗体、抗ＣＤ１４抗体、抗ＣＤ１５抗体、抗ＣＤ１９抗体、抗ＣＤ２３抗体、抗ＣＤ３０抗体、抗ＣＤ３１抗体、抗ＣＤ３３抗体、抗ＣＤ３４抗体、抗ＣＤ３５抗体、抗ＣＤ３８抗体、抗ＣＤ４１抗体、抗ＬＣＡ／ＣＤ４５抗体、抗ＣＤ４５ＲＯ抗体、抗ＣＤ４５ＲＡ抗体、抗ＣＤ３９抗体、抗ＣＤ１００抗体、抗ＣＤ９５／Ｆａｓ抗体、抗ＣＤ９９抗体、抗ＣＤ１０６抗体、抗ユビキチン抗体、抗ＣＤ７１抗体、抗ｃ−ｍｙｃ抗体、抗サイトケラチン抗体、抗ビメンチン抗体、抗ＨＰＶタンパク質抗体、抗カッパ軽鎖抗体、抗ラムダ軽鎖抗体、抗メラノソーム抗体、抗前立腺特異的抗原抗体、抗Ｓ−１００抗体、抗タウ抗原抗体、抗フィブリン抗体、抗ケラチン抗体および抗Ｔｎ−抗原抗体。
【００３１】
「単離」タンパク質、例えば抗体は、その天然環境の構成成分から同定され、分離され、および／または回収されたものである。その天然環境の夾雑構成成分は、抗体のようなタンパク質に関する診断的または治療的使用を妨害するであろう物質であり、例としては、酵素、ホルモン、およびその他のタンパク質様または非タンパク質様溶質が挙げられ得る。好ましい実施形態では、タンパク質、例えば抗体は、（１）ローリー法により決定して、９５重量％より高い値に、最も好ましくは９９重量％より高い値に、（２）スピニングカップシーケネーターの使用によりＮ末端または内部アミノ酸配列の少なくとも１５残基を得るのに十分な程度に、あるいは（３）クーマシーブルー、好ましくは銀染色を用いて、還元または非還元条件下で、ＳＤＳ−ＰＡＧＥにより均質に精製される。
【００３２】
タンパク質は、好ましくは本質的に純粋であり、望ましくは本質的に均質である（すなわち、夾雑タンパク質を含有しない）。「本質的に純粋な」タンパク質とは、組成物の総重量に基づいて少なくとも約９０重量％、好ましくは少なくとも約９５重量％のタンパク質を含む組成物を意味する。
【００３３】
「本質的に均質な」タンパク質は、組成物の総重量に基づいて、少なくとも約９９重量％のタンパク質を含む組成物を意味する。
【００３４】
「抗体」という用語は、最も広い意味で用いられ、具体的には、モノクローナル抗体（例えば、免疫グロブリンＦｃ領域を有する全長抗体）、多エピトープ特異性を有する抗体組成物、二重特異性抗体、ダイアボディおよび一本鎖分子、ならびに抗体断片（例えば、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）２およびＦｖ）を包含する。
【００３５】
基本的４鎖抗体単位は、２つの同一軽（Ｌ）鎖および２つの同一重（Ｈ）鎖で構成されるヘテロ四量体糖タンパク質である。ＩｇＭ抗体は、Ｊ鎖と呼ばれる付加的ポリペプチドを伴った５つの基本へテロ四量体単位からなり、１０の抗原結合部位を含有するが、一方、ＩｇＡ抗体は２〜５つの基本４鎖単位からなり、これは重合して、Ｊ鎖と組合せて多価集合体を形成し得る。ＩｇＧの場合、４鎖単位は、一般的に約１５０，０００ダルトンである。各Ｌ鎖は１つの共有ジスルフィド結合によりＨ鎖と連結されるが、一方、２つのＨ鎖は、Ｈ鎖アイソタイプに依存して、１つ以上のジスルフィド結合により互いに連結される。ＨおよびＬ鎖は、各々、規則的な間隔の鎖内ジスルフィド架橋も有する。各Ｈ鎖は、Ｎ末端に可変ドメイン（ＶＨ）と、その後にαおよびγ鎖の各々では３つの定常ドメイン（ＣＨ）ならびにμおよびεアイソタイプでは４つのＣＨドメインを有する。各Ｌ鎖は、Ｎ末端に可変ドメイン（ＶＬ）と、その後にその他端に定常ドメインを有する。ＶＬはＶＨとともに整列され、そしてＣＬは重鎖の最初の定常ドメイン（ＣＨ１）と整列される。特定のアミノ酸残基が、軽鎖および重鎖可変ドメイン間の界面を形成すると考えられる。ＶＨおよびＶＬの対合は一緒になって、単一の抗原結合部位を形成する。異なるクラスの抗体の構造および特性に関しては、例えば、Basic and Clinical Immunology, 8th Edition, Daniel P. Sties, Abba I. Terr and Tristram G. Parsolw (eds), Appleton & Lange, Norwalk, CT, 1994, page 71 and Chapter 6を参照されたい。
【００３６】
任意の脊椎動物種からのＬ鎖は、それらの定常ドメインのアミノ酸配列に基づいて、カッパおよびラムダと呼ばれる２つの明白に異なる型のうちの１つに割り当てられ得る。それらの重鎖の定常ドメイン（ＣＨ）のアミノ酸配列によって、免疫グロブリンは異なるクラスまたはアイソタイプに割り当てられ得る。それぞれα、δ、ε、γおよびμと呼ばれる重鎖を有する５つのクラスの免疫グロブリンすなわちＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧおよびＩｇＭがある。γおよびμクラスは、ＣＨ配列および機能の相対的に小さな差に基づいてさらにサブクラスに分けられ、例えばヒトは、以下のサブクラスを発現する：ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１およびＩｇＡ２。
【００３７】
「可変」という用語は、可変ドメインのあるセグメントが抗体の間の配列で広範囲に異なる、という事実を指す。Ｖドメインは抗原結合を媒介し、特定抗体の、その特定抗原に関する特異性を限定する。しかしながら、変異性は、可変ドメインの全スパンを通して均一に分布しない。その代わりに、Ｖ領域は、各々約９〜１２アミノ酸残基長である「超可変領域」と呼ばれ、時として「相補性決定領域」（ＣＤＲ）と呼ばれ非常に高い変異性を有する短い領域により分離される約１５〜３０アミノ酸残基のフレームワーク領域（ＦＲ）と呼ばれる比較的不変のストレッチから成る。自然の重鎖および軽鎖の可変ドメインは各々、４つのＦＲ（大部分はβシート立体配置をとり、３つの超可変領域により連結される）を含み、これは、βシート構造を連結し、いくつかの場合には、その一部を構成するループを形成する。各鎖中の超可変領域は、ＦＲにより密に接近して一緒に保持され、そして他の鎖からの超可変領域とともに、抗体の抗原結合部位の形成に寄与する（Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991)参照）。定常ドメインは、抗体と抗原の結合に直接関与しないが、抗体依存性細胞性細胞毒性（ＡＤＣＣ）の関与といったような種々のエフェクター機能を示す。
【００３８】
「超可変領域」（「相補性決定領域」またはＣＤＲとしても既知である）という用語は、本明細書中で用いる場合、抗原結合部位を形成し、抗原特異性の主な決定因子である免疫グロブリンのＶ領域ドメイン内にある（通常は、非常に高い配列変異性を有する３または４つの短い領域）抗体のアミノ酸残基を指す。ＣＤＲ残基を特定するためには、少なくとも２つの方法がある：（１）交差種配列変異性に基づいたアプローチ（すなわち、Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest (National Institute of Health, Bethesda, MS 1991）；ならびに（２）抗原−抗体複合体の結晶学的研究に基づいたアプローチ（Chothia, C. et al., J. Mol. Biol. 196: 901-917 (1987)）。しかしながら、２つの残基特定技法が重複の領域を限定するがしかし同一領域を限定しない限り、それらはハイブリッドＣＤＲを限定するために組合され得る。
【００３９】
「モノクローナル抗体」という用語は、本明細書中で用いる場合、実質的に均一な抗体の集団から得られる抗体を指し、すなわち集団を構成する個々の抗体は、少量で存在し得る可能性のある天然突然変異を除いて、同一である。モノクローナル抗体は高度に特異的であり、単一の抗原部位に向けられる。さらに、典型的には異なる複数の決定因子（エピトープ）に対して向けられる複数の異なる抗体を含む慣用的（ポリクローナル）抗体調製物とは異なり、各モノクローナル抗体は抗原上の単一決定因子に対して向けられる。それらの特異性のほかに、モノクローナル抗体は、それらが、他の免疫グロブリンによって夾雑されないハイブリドーマ培養により合成されるという点で有益である。「モノクローナル」という修飾語は、抗体の実質的に均質な集団から得られるという抗体の特質を示し、任意の特定方法による抗体の産生を要するよう意図されない。例えば、本発明に従って用いられるべきモノクローナル抗体は、Kohler et al., Nature, 256: 495 (1975)により最初に記載されたハイブリドーマ法により作製され得るし、あるいは組換えＤＮＡ法（例えば米国特許第４，８１６，５６７号参照）により作製され得る。「モノクローナル抗体」は、例えばClackson et al., Nature, 352:624-628 (1991)およびMarks et al., J. Mol. Biol., 222:581-597 (1991)に記載された技法を用いて、ファージ抗体ライブラリーからも単離され得る。
【００４０】
本明細書中のモノクローナル抗体は、具体的には、重鎖および／または軽鎖の一部が、特定の種に由来するかあるいは特定の抗体クラスまたはサブクラスに属している抗体中の対応する配列と同一であるかまたは相同であるが、一方、鎖（単数または複数）の残りの部分が別の種に由来するかあるいは別の抗体クラスまたはサブクラスに属する抗体中の対応する配列と同一であるかまたは相同である「キメラ」抗体（免疫グロブリン）、ならびに（所望の生物学的活性を示す限りは）このような抗体の断片を包含する（米国特許第４，８１６，５６７号；Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81:6851-6855 (1984)）。
【００４１】
「無傷」抗体は、抗原結合部位、ならびにＣＬ、そして少なくとも長鎖ドメインＣＨ１、ＣＨ２およびＣＨ３を含むものである。
【００４２】
「抗体断片」は、無傷抗体の一部分、好ましくは無傷抗体の抗原結合および／または可変領域を含む。抗体断片の例としては、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２およびＦｖ断片；ダイアボディ；線状抗体（米国特許第５，６４１，８７０号、実施例２；Zapata et al., Protein Eng. 8(10): 1057-1062 [1995]参照）；抗体断片から形成される一本鎖抗体分子および多重特異性抗体が挙げられる。
【００４３】
抗体のパパイン消化は、「Ｆａｂ」断片と呼ばれる２つの同一の抗原結合断片、ならびに残余「Ｆｃ」断片（この名称は容易に結晶化する能力を反映している）を産生した。Ｆａｂ断片は、Ｈ鎖の可変領域ドメイン（ＶＨ）および１つの重鎖の第一定常ドメイン（ＣＨ１）を伴う完全Ｌ鎖から成る。各Ｆａb断片は、抗原結合に関して一価であり、すなわち、それは単一の抗原結合部位を有する。抗体のペプシン処理は、単一大型Ｆ（ａｂ’）２断片を生じるが、これは、異なる抗原結合活性を有する２つのジスルフィド結合Ｆａｂ断片におおよそ対応し、依然として抗原に架橋し得る。Ｆａｂ’断片は、抗体ヒンジ領域からの１つ以上のシステインを含めてＣＨ１ドメインのカルボキシ末端に２〜３の付加的残基を有することでＦａｂ断片と異なる。Ｆａｂ’−ＳＨは、定常ドメインのシステイン残基（単数または複数）が遊離チオール基を有するＦａｂ’に関する本明細書中での呼称である。Ｆ（ａｂ’）２抗体断片は、元来、それらの間にヒンジシステインを有するＦａｂ’断片の対として産生された。抗体断片の他の化学的カップリングも既知である。
【００４４】
Ｆｃ断片は、ジスルフィドにより一緒に保持された両Ｈ鎖のカルボキシ末端部分を含む。抗体のエフェクター機能は、ある型の細胞上に見出されるＦｃ受容体（ＦｃＲ）によっても認識される領域であるＦｃ領域中の配列により決定される。
【００４５】
「Ｆｖ」は、完全な抗原認識および結合部位を含有する最小の抗体断片である。この断片は、堅く、非共有的に会合した１つの重鎖および１つの軽鎖可変領域ドメインの二量体からなる。これら２つのドメインのフォールディングから、抗原結合のためのアミノ酸残基に寄与し、抗体に抗原特異性を付与する６つの超可変ループ（各々ＨおよびＬ鎖からの３つのループ）を生じる。しかしながら、単一可変ドメイン（または抗原に特異的な３つのＣＤＲのみを含むＦｖの半分）でさえ、完全結合部位より低い親和性ではあるが、抗原を認識し、結合する能力を有する。
【００４６】
「一本鎖Ｆｖ」（「ｓＦｖ」または「ｓｃＦｖ」とも略される）は、単一ポリペプチド鎖に連結されるＶＨおよびＶＬ抗体ドメインを含む抗体断片である。好ましくは、ｓＦｖポリペプチドはさらに、ＶＨおよびＶＬドメイン間にポリペプチドリンカーを含み、これは、抗原結合のために望ましい構造をｓＦｖに形成させる。ｓＦｖの考察に関しては、Pluckthun in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113, Rosenburg and Moore eds., Springer-Verlag, New York, pp. 269-315 (1994)を参照されたい。
【００４７】
「ダイアボディ」という用語は、鎖内対合ではなくＶドメインの鎖間対合が達成され、それにより二価断片、すなわち２つの抗原結合部位を有する断片を生じるよう、ＶＨおよびＶＬドメイン間に短いリンカー（約５〜１０残基）を有するｓＦｖ断片（前段落参照）を構築することにより調製される小抗体断片を指す。二重特異性ダイアボディは、２つの抗体のＶＨおよびＶＬドメインが異なるポリペプチド鎖上に存在する２つの「交差」ｓＦｖ断片のヘテロ二量体である。ダイアボディは、例えばＥＰ ４０４，０９７；ＷＯ ９３／１１１６１；Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 6444-6448 (1993)により詳細に記載されている。
【００４８】
当該分子標的または抗原と「結合する」抗体は、抗体が抗原を発現する細胞を標的化するのに有用であるよう十分な親和性でその抗原と結合し得るものである。
【００４９】
特定のポリペプチドまたは特定ポリペプチド上のエピトープ「に特異的に結合する」かまたはそれに「特異的」である抗体は、任意の他のポリペプチドまたはポリペプチドエピトープと実質的に結合することなく、特定のポリペプチドまたは特定ポリペプチド上のエピトープと結合するものである。このような実施形態では、これらの他のポリペプチドまたはポリペプチドエピトープへの抗体の結合の程度は、標的ポリペプチドまたはエピトープとの結合と比較して、蛍光活性化細胞選別（ＦＡＣＳ）分析または放射性免疫沈降法（ＲＩＡ）により確定して、１０％未満である。
【００５０】
「ヒト化」型の非ヒト（例えばネズミ）抗体は、非ヒト免疫グロブリン由来の最小配列を含有する大部分はヒト配列のキメラ免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖またはその断片（例えば、Ｆｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２または抗体の他の抗原結合配列）である。ほとんどの部分に関して、ヒト化抗体はヒト免疫グロブリン（レシピエント抗体）であって、この場合、レシピエントの超可変領域（ＣＤＲも）からの残基が、所望の特異性、親和性および能力を有するマウス、ラットまたはウサギのような非ヒト種（ドナー抗体）の超可変領域からの残基により置き換えられる。いくつかの場合、ヒト免疫グロブリンのＦｖフレームワーク領域（ＦＲ）残基は、対応する非ヒト残基により置き換えられる。さらに、「ヒト化抗体」は、本明細書中で用いる場合、レシピエント抗体でもドナー抗体でも見出されない残基も含み得る。これらの修飾は、抗体性能をさらに精巧にし、最適化するためになされる。ヒト化抗体は、最適には、免疫グロブリン定常領域（Ｆｃ）の少なくとも一部、典型的にはヒト免疫グロブリンの少なくとも一部も含む。さらなる詳細に関しては、Jones et al., Nature, 321:522-525 (1986)； Reichmann et al., Nature, 332:323-329 (1988)；およびPresta, Curr. Op. Struct. Biol., 2:593-596 (1992)参照。
【００５１】
抗体「エフェクター機能」は、抗体のＦｃ領域（ネイティブ配列Ｆｃ領域またはアミノ酸配列変異体Ｆｃ領域）に帰することができる生物学的活性を指し、抗体アイソタイプに伴って変わる。抗体エフェクター機能の例としては、以下のものが挙げられる：Ｃ１ｑ結合および補体依存性細胞傷害性；Ｆｃ受容体結合；抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性（ＡＤＣＣ）；食作用；細胞表面受容体（例えばＢ細胞受容体）の下方調節；およびＢ細胞活性化。
【００５２】
「抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性」またはＡＤＣＣは、ある細胞傷害性細胞（例えば、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、好中球及びマクロファージ）上に存在するＦｃ受容体（ＦｃＲ）上に結合される分泌Ｉｇがこれらの細胞傷害性エフェクター細胞を抗原保有標的細胞に特異的に結合させ、その後標的細胞を細胞毒素で殺害させる細胞傷害性の一形態を指す。抗体は、細胞傷害性細胞を「武装し」、この機序による標的細胞の殺害のために必要とされる。ＡＤＣＣを媒介するための主要細胞であるＮＫ細胞はＦｃγＲＩＩＩのみを発現するが、一方、単球はＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩおよびＦｃγＲＩＩＩを発現する。造血細胞におけるＦｃ発現は、Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol. 9: 457-92 (1991)の464ページの表３に要約されている。当該分子のＡＤＣＣ活性を査定するために、例えば米国特許第５，５００，３６２号または第５，８２１，３３７号に記載されたようなin vitroＡＣＤＤ検定が実施され得る。このような検定のための有用なエフェクター細胞としては、末梢血単核球（ＰＢＭＣ）およびナチュラルキラー（ＮＫ）細胞が挙げられる。代替的には、または付加的には、当該分子のＡＤＣＣ活性は、in vivoで、例えばClynes et al., PNAS USA 95:652-656 (1998)に開示されたような動物モデルで査定され得る。
【００５３】
「Ｆｃ受容体」または「ＦｃＲ」は、抗体のＦｃ領域と結合する受容体を示す。好ましいＦｃＲは、自然配列のヒトＦｃＲである。さらに、好ましいＦｃＲは、ＩｇＧ抗体と結合するものであり（ガンマ受容体）、そしてＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩおよびＦｃγＲＩＩＩサブクラス、例えば対立遺伝子変異体の受容体、ならびに代替的にはこれらの受容体のスプライス化型を包含し、ＦｃγＲＩＩ受容体はＦｃγＲＩＩＡ（「活性化受容体」）およびＦｃγＲＩＩＢ（「抑制受容体」）を包含し、これらは主にその細胞質ドメインで異なる類似のアミノ酸配列を有する。活性化受容体ＦｃγＲＩＩＡは、その細胞質ドメインに免疫受容体チロシンベースの活性化モチーフ（ＩＴＡＭ）を含有する。抑制受容体ＦｃγＲＩＩＢは、その細胞質ドメインに免疫受容体チロシンベースの抑制モチーフ（ＩＴＩＭ）を含有する（M. Daeron, Annu. Rev. Immunol. 15:203-234 (1997)参照）。ＦｃＲは、Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol. 9: 457-92 (1991)；Capel et al., Immunomethods 4: 25-34 (1994)；およびde Haas et al., J. Lab. Clin. Med. 126: 330-41 (1995)で考察されている。他のＦｃＲ、例えば将来同定されるべきものは、本明細書中の「ＦｃＲ」という用語に包含される。当該用語は、胎児への母体ＩｇＧの運搬に関与する新生児受容体であるＦｃＲｎも包含する（Guyer et al., J. Immunol. 117: 587 (1976)およびKim et al., J. Immunol. 24: 249 (1994)）。
【００５４】
「ヒトエフェクター細胞」は、１つ以上のＦｃＲを発現し、エフェクター機能を行う白血球である。好ましくは、細胞は少なくともＦｃγＲＩＩＩを発現し、ＡＤＣＣエフェクター機能を行う。ＡＤＣＣを媒介するヒト白血球の例としては、末梢血単核球（ＰＢＭＣ）、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、単球、細胞傷害性Ｔ細胞および好中球が挙げられるが、ＰＢＭＣおよびＭＮＫ細胞が好ましい。エフェクター細胞は、ネイティブ供給源、例えば血液から単離され得る。
【００５５】
「補体依存性細胞傷害性」または「ＣＤＣ」は、補体の存在下での標的細胞の溶解を指す。古典的補体経路の活性化は、補体系の第一成分（Ｃ１ｑ）と、それらのコグネイト抗原に結合される（適切なサブクラスの）抗体への結合により開始される。補体活性化を査定するために、例えばGazzano-Santoro et al., J. Immunol. Methods 202: 163 (1996)に記載されたようなＣＤＣ検定が実施され得る。
【００５６】
「共役体」、「共役された」および「共役」という用語は、任意のおよび全ての型の共有または非共有結合を指し、例としては、直接的遺伝的または化学的融合、リンカーまたは架橋剤を介したカップリング、ならびに、例えばロイシンジッパーを用いる非共有的会合が挙げられるが、これらに限定されない。抗体共役体は、抗体または抗体断片に結合される別の存在物、例えば細胞傷害性化合物、薬剤、組成物、化合物、放射性元素または検出可能標識を有する。
【００５７】
「処置」は、治療的処置および予防的または防止的手段の両方を指す。処置を必要とするものとしては、既に障害を有するもの、ならびに障害が防止されるべきであるものが挙げられる。
【００５８】
処置の目的のための「哺乳動物」は、哺乳動物として分類される任意の動物、例えばヒト、非ヒト高等霊長類、家畜および農場動物、ならびに動物園、スポーツまたはペット動物、例えばイヌ、ウマ、ウサギ、ウシ、ブタ、ハムスター、マウス、ネコ等を指す。好ましくは、哺乳動物はヒトである。
【００５９】
「障害」は、タンパク質を用いた処置から利益を得るであろう任意の症状である。この例としては、慢性および急性の障害または疾患、例えば哺乳動物を当該障害に罹り易くする病理学的状態が挙げられる。
【００６０】
「治療的有効量」は、特定の障害の測定可能な改善または防止をもたらすのに必要とされる少なくとも最小濃度である。既知のタンパク質の治療的有効量は当該技術分野で周知であるが、将来発見される下記のタンパク質の有効量は、十分に、当業者、例えば普通の医者の技術の範囲内である標準技法により決定され得る。
【００６１】
ＩＩ． 本発明の実行方法
Ａ． タンパク質の調製
本発明によれば、タンパク質は、組換えＤＮＡ技術により、すなわち、当該技術分野で周知であるように、タンパク質をコードする核酸を含有するベクターで形質転換またはトランスフェクトされた細胞を培養することにより、産生される。
【００６２】
組換え的手段によるタンパク質の調製は、発現またはクローニングベクターを用いて適切な宿主細胞をトランスフェクトするかまたは形質転換して、プロモーターを誘導し、形質転換体を選択しまたは所望の配列をコードする遺伝子を増幅するために適切である場合には修飾された従来の栄養培地中で培養することにより、成し遂げられ得る。培養条件、例えば培地、温度、ｐＨ等は、過度の実験をせずとも当業者が選択し得る。概して、細胞培養の生産性を最大にするための原理、プロトコールおよび実行技術は、Mammalian Cell Biotechnology: A Practical Approach, M. Butler, Ed. (IRL Press, 1991)およびSambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, New York: Cold Spring Harbor Pressに見出され得る。トランスフェクションの方法は当業者には既知であり、例としては、ＣａＰＯ４およびＣａＣｌ２トランスフェクション、電気穿孔、マイクロインジェクション等が挙げられる。適切な技法は、Sambrook et al.（上記）にも記載されている。付加的トランスフェクション技法は、Shaw et al., Gene 23: 315 (1983)；ＷＯ ８９／０５８５９；Graham et al., Virology 52: 456-457 (1978)および米国特許第４，３９９，２１６号に記載されている。
【００６３】
所望のタンパク質をコードする核酸は、クローニングまたは発現のために複製可能なベクター中に挿入され得る。適切なベクターは公的に入手可能であり、プラスミド、コスミド、ウイルス粒子またはファージの形態をとり得る。適切な核酸配列は、種々の手法によりベクター中に挿入され得る。概して、ＤＮＡは、当該技術分野で既知の技法を用いて、適切な制限エンドヌクレアーゼ部位（単数または複数）に挿入される。ベクター構成成分としては、一般的に、シグナル配列、複製の起点、１つ以上のマーカー遺伝子、ならびにエンハンサー要素、プロモーターおよび転写終止配列のうちの１つ以上が挙げられるが、これらに限定されない。これらの構成成分のうちの１つ以上を含有する適切なベクターの構築は、当業者に既知である標準ライゲーション技法を用いる。
【００６４】
培地からまたは宿主細胞溶解物から、タンパク質の形態が回収され得る。膜結合された場合、それは、適切な界面活性剤を用いて、または酵素的切断により、膜から放出され得る。発現のために用いられる細胞は、種々の物理的または化学的手段、例えば凍結解凍周期、音波処理、機械的崩壊または細胞溶解剤によっても崩壊され得る。
【００６５】
タンパク質の精製は、当該技術分野で既知の任意の適切な技法により、例えばイオン交換カラム上での分別、エタノール沈降、逆相ＨＰＬＣ、シリカまたは陽イオン交換樹脂（例えばＤＥＡＥ）上でのクロマトグラフィー、クロマトフォーカシング、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ、硫酸アンモニウム沈降、ＩｇＧのような夾雑物を除去するためのプロテインＡセファロースカラム（例えばセファデックス（登録商標）Ｇ−７５）を用いるゲル濾過、ならびにエピトープタグ化形態を結合するための金属キレートカラムにより達成し得る。
【００６６】
Ｂ． 抗体調製
本発明のある実施形態では、好ましいタンパク質は抗体である。抗体、例えばポリクローナル、モノクローナル、ヒト化、二重特異性およびヘテロ接合抗体の産生のための技法を以下に示す。
【００６７】
（ｉ）ポリクローナル抗体
ポリクローナル抗体は、一般的に、関連抗原およびアジュバントの多数回皮下（ｓｃ）または腹腔内（ｉｐ）注射により、動物中で産生される。免疫化されるべき種において免疫原性であるタンパク質、例えばキーホールリンペットヘモシアニン、血清アルブミン、ウシサイログロブリンまたはダイズトリプシン阻害剤と関連抗原とを共役することは有用であり得る。用いられ得るアジュバントの例としては、フロイント完全アジュバントおよびＭＰＬ−ＴＤＭアジュバント（モノホスホリル脂質Ａ、合成トレハロースジコリノミコラート）が挙げられる。当業者は、過度の実験をせずとも、免疫化プロトコールを選択し得る。
【００６８】
１ヵ月後、元の量の１／５〜１／１０のフロイント完全アジュバント中のペプチドまたは共役体を用いて、多数部位に皮下注射することにより、動物は追加免疫される。７〜１４日後、動物は採血され、抗体力価に関して血清が検定される。力価がプラトーになるまで、動物は追加免疫される。好ましくは、動物は、同一抗原であるが、しかし異なるタンパク質と共役された、および／または異なる架橋試薬を介して共役された共役体を用いて、追加免疫される。共役体は、タンパク質融合物として組換え細胞培養中で作製され得る。さらにまた、凝集剤、例えば明礬が適切に用いられて、免疫応答を増強する。
【００６９】
（ｉｉ）モノクローナル抗体
モノクローナル抗体は、実質的に均質の抗体の集団から得られ、すなわち集団を構成する個々の抗体は、少量で存在し得る可能性のある天然突然変異を除いて、同一である。したがって、「モノクローナル」という修飾語は、別個の抗体の混合物ではないという抗体の特質を示す。
【００７０】
例えば、モノクローナル抗体は、Kohler et al., Nature, 256: 495 (1975)により最初に記載されたハイブリドーマ法を用いて作製され得るし、あるいは組換えＤＮＡ法（米国特許第４，８１６，５６７号）により作製され得る。
【００７１】
ハイブリドーマ法では、マウスまたは他の適切な宿主動物、例えばハムスターが、本明細書中で上に記載されたように免疫化されて、免疫化のために用いられるタンパク質と特異的に結合する抗体を産生するかまたは産生することができるリンパ球を引き出す。代替的には、リンパ球はin vitroで免疫化され得る。次いで、適切な融合剤、例えばポリエチレングリコールを用いてリンパ球は骨髄腫細胞と融合されて、ハイブリドーマ細胞を形成する（Goding, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice, pp.59-103 (Academic Press, 1986)）。
【００７２】
免疫化剤は、典型的には、処方されるべきタンパク質を含む。一般的には、ヒト起源の細胞が所望される場合、末梢血リンパ球（「ＰＢＬ」）が用いられ、あるいは非ヒト哺乳動物起源が所望される場合には脾臓細胞またはリンパ節細胞が用いられる。次いで、適切な融合剤、例えばポリエチレングリコールを用いてリンパ球は不死化細胞株と融合されて、ハイブリドーマ細胞を形成する（Goding, Monoclonal antibodies: Principles and Practice, Academic Press (1986), pp. 59-103）。不死化細胞株は、通常は、形質転換化哺乳類細胞、特に齧歯類、ウシおよびヒト起源の骨髄腫細胞である。通常、ラットまたはマウス骨髄腫細胞株が用いられる。このように調製されたハイブリドーマ細胞は、好ましくは、非融合化親骨髄腫細胞の増殖または生存を抑制する１つ以上の物質を含有する適切な培地中で播種され、増殖される。例えば、親骨髄腫細胞が酵素ヒポキサンチン・グアニン・ホスホリボシルトランスフェラーゼ（ＨＧＰＲＴまたはＨＰＲＴ）を欠く場合、ハイブリドーマのための培地は、典型的には、ヒポキサンチン、アミノプテリンおよびチミジンを含み（ＨＡＴ培地）、これらの物質がＨＧＰＲＴ欠損細胞の増殖を防止する。
【００７３】
好ましい骨髄腫細胞は、効率的に融合し、選択された抗体産生細胞による抗体の安定した高レベル産生を支持し、そしてＨＡＴ培地のような培地に対して感受性であるものである。これらの中で、好ましい骨髄腫細胞株は、ネズミ骨髄腫株、例えばサルク研究所の細胞配布センター（Salk Institute Cell Distribution Center, San Diego, California USA）から入手可能なＭＯＰＣ−２１およびＭＰＣ−１１マウス腫瘍、ならびにアメリカ培養細胞系統保存機関（American Type Culture Collection, Rockville, Maryland USA）から入手可能なＳＰ−２細胞由来のものである。ヒト骨髄腫およびマウス−ヒトへテロ骨髄腫細胞株も、ヒトモノクローナル抗体の産生に関して記載されている（Kozbor, J. Immunol., 133:3001 (1984); Brodeur et al., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, pp. 51-63 (Marcel Dekker, Inc., New York, 1987)）。
【００７４】
ハイブリドーマ細胞が増殖中である培地は、抗原に対して向けられるモノクローナル抗体の産生に関して検定される。好ましくは、ハイブリドーマ細胞により産生されるモノクローナル抗体の結合特異性は、免疫沈降法により、またはin vitro結合検定、例えばラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）若しくは酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）により確定される。
【００７５】
モノクローナル抗体の結合親和性は、例えば、Munson et al., Anal. Biochem., 107:220 (1980)のスカッチャード分析により確定され得る。
【００７６】
所望の特異性、親和性および／または活性を有する抗体を産生するハイブリドーマ細胞が特定された後、限定希釈手順によりクローンはサブクローン化され、標準方法により増殖され得る（Goding、上記）。この目的のための適切な培地としては、例えばＤ−ＭＥＭまたはＲＰＭＩ−１６４０培地が挙げられる。さらに、ハイブリドーマ細胞は、動物中で腹水腫瘍としてin vivoで増殖され得る。
【００７７】
免疫化剤は、典型的には、抗体が結合するエピトープタンパク質を含む。一般的には、ヒト起源の細胞が所望される場合、末梢血リンパ球（「ＰＢＬ」）が用いられ、あるいは非ヒト哺乳動物起源が所望される場合には脾臓細胞またはリンパ節細胞が用いられる。次いで、適切な融合剤、例えばポリエチレングリコールを用いてリンパ球は不死化細胞株と融合されて、ハイブリドーマ細胞を形成する（Goding, Monoclonal antibodies: Principles and Practice, Academic Press (1986), pp. 59-103）。
【００７８】
不死化細胞株は、通常は、形質転換化哺乳類細胞、特に齧歯類、ウシおよびヒト起源の骨髄腫細胞である。通常、ラットまたはマウス骨髄腫細胞株が用いられる。ハイブリドーマ細胞は、好ましくは、非融合化不死化細胞の増殖または生存を抑制する１つ以上の物質を含有する適切な培地中で培養され得る。例えば、親細胞が酵素ヒポキサンチン・グアニン・ホスホリボシルトランスフェラーゼ（ＨＧＰＲＴまたはＨＰＲＴ）を欠く場合、ハイブリドーマのための培地は、典型的には、ヒポキサンチン、アミノプテリンおよびチミジンを含み（ＨＡＴ培地）、これらの物質がＨＧＰＲＴ欠損細胞の増殖を防止する。
【００７９】
好ましい不死化細胞株は、効率的に融合し、選択された抗体産生細胞による抗体の安定した高レベル発現を支持し、そしてＨＡＴ培地のような培地に対して感受性であるものである。さらに好ましい不死化細胞株はネズミ骨髄腫株で、これは、例えばサルク研究所の細胞配布センター（Salk Institute Cell Distribution Center, San Diego, California USA）ならびにアメリカ培養細胞系統保存機関（American Type Culture Collection, Rockville, Maryland）から入手可能である。ヒト骨髄腫およびマウス−ヒトへテロ骨髄腫細胞株も、ヒトモノクローナル抗体の産生に関して記載されている（Kozbor, J. Immunol., 133:3001 (1984); Brodeur et al., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, Marcel Dekker, Inc., New York, (1987) pp. 51-63）。
【００８０】
ハイブリドーマ細胞が培養される培地は、次に、処方されるべきタンパク質に対して向けられるモノクローナル抗体の存在に関して検定され得る。好ましくは、ハイブリドーマ細胞により産生されるモノクローナル抗体の結合特異性は、免疫沈降法により、またはin vitro結合検定、例えばラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）若しくは酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）により確定される。このような技法および検定は、当該技術分野で既知である。モノクローナル抗体の結合親和性は、例えば、Munson et al., Anal. Biochem., 107:220 (1980)のスカッチャード分析により確定され得る。
【００８１】
所望のハイブリドーマ細胞が特定された後、限定希釈手順によりクローンはサブクローン化され、標準方法により増殖され得る（Goding、上記）。この目的のための適切な培地としては、例えばダルベッコの変法イーグル培地およびＲＰＭＩ−１６４０培地が挙げられる。代替的には、ハイブリドーマ細胞は、動物中で腹水腫瘍としてin vivoで増殖され得る。
【００８２】
サブクローンにより分泌されるモノクローナル抗体は、従来の免疫グロブリン精製手法、例えばプロテインＡ−セファロース、ヒドロキシルアパタイトクロマトグラフィー、ゲル電気泳動、透析またはアフィニティークロマトグラフィーにより、培地、腹水または血清から適切に分離される。
【００８３】
モノクローナル抗体をコードするＤＮＡは、従来の手法を用いて（例えば、ネズミ抗体の重鎖および軽鎖をコードする遺伝子と特異的に結合し得るオリゴヌクレオチドプローブを用いることにより）、容易に単離され、配列決定される。ハイブリドーマ細胞は、このようなＤＮＡの好ましい供給源として役立つ。一旦単離されると、ＤＮＡは発現ベクター中に置かれ、これは次に、そうでなければ免疫グロブリンタンパク質を産生しない宿主細胞、例えば大腸菌細胞、サルＣＯＳ細胞、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞または骨髄腫細胞中にトランスフェクトされて、組換え宿主細胞中のモノクローナル抗体が合成される。抗体をコードするＤＮＡの細菌中での組換え発現に関する考察論文としては、Skerra et al., Curr. Opinion in Immunol., 5:256-262 (1993)およびPluckthun, Immunol. Revs. 130:151-188 (1992)が挙げられる。
【００８４】
さらなる実施形態では、抗体は、McCafferty et al., Nature, 348:552-554 (1990)に記載された技法を用いて生成される抗体ファージライブラリーから単離され得る。Clackson et al., Nature, 352:624-628 (1991)およびMarks et al., J. Mol. Biol., 222:581-597 (1991)は、ファージライブラリーを用いて、それぞれネズミおよびヒト抗体の単離を記載する。その後の出版物は、鎖シャッフリングによる高親和性（ｎＭ範囲）ヒト抗体の産生（Marks et al., Bio/Technology, 10:779-783 (1992)）、ならびに非常に大きいファージライブラリーを構築するための一戦略としての組合せ感染およびin vivo組換え（Waterhouse et al., Nuc. Acids. Res., 21:2265-2266 (1993)）を記載する。したがって、これらの技法は、モノクローナル抗体の単離のための伝統的モノクローナル抗体ハイブリドーマ技法に対する実行可能な代替物である。
【００８５】
ＤＮＡは、さらにまた、相同ネズミ配列の代わりに、例えばヒト重鎖および軽鎖定常ドメインにのコード配列で置換することにより（米国特許第４，８１６，５６７号；Morrison, et al., Proc. Natl Acad. Sci. USA, 81:6851 (1984)）、あるいは非免疫グロブリンポリペプチドのコード配列の全部または一部を免疫グロブリンコード配列と共有結合することにより、修飾され得る。
【００８６】
典型的には、このような非免疫グロブリンポリペプチドは抗体の定常ドメインの代わりに置換されるか、あるいはそれらは抗体の１つの抗原結合部位の可変ドメインの代わりに置換されて、抗原に対する特異性を有する１つの結合部位および異なる抗原に対する特異性を有する別の抗原結合部位を含むキメラ二価抗体を作製する。
【００８７】
キメラまたはハイブリッド抗体は、架橋剤を含めた、合成タンパク質化学で既知の方法を用いて、in vitroでも調製され得る。例えば、免疫毒素は、ジスルフィド交換反応を用いることにより、あるいはチオエーテル結合を形成することにより、構築され得る。この目的のための適切な試薬の例としては、イミノチオラートおよびメチル−４−メルカプトブチルイミダートが挙げられる。
【００８８】
（ｉｉｉ）ヒト化およびヒト抗体
本処方方法に供せられる抗体はさらに、ヒト化またはヒト抗体を含み得る。ヒト化型の非ヒト（例えばネズミ）抗体は、キメラ免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖またはその断片（例えば、Ｆｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２または抗体の他の抗原結合亜配列）であり、これは、非ヒト免疫グロブリン由来の最小配列を含有する。ヒト化抗体としてはヒト免疫グロブリン（レシピエント抗体）が挙げられるが、この場合、レシピエントの相補性決定領域（ＣＤＲ）からの残基が、所望の特異性、親和性および能力を有するマウス、ラットまたはウサギのような非ヒト種（ドナー抗体）のＣＤＲからの残基により置き換えられる。いくつかの場合、ヒト免疫グロブリンのＦｖフレームワーク残基は、対応する非ヒト残基により置き換えられる。ヒト化抗体は、レシピエント抗体にも、あるいは移入ＣＤＲまたはフレームワーク配列中にも見出されない残基も含み得る。概して、ヒト化抗体は、少なくとも１つ、典型的には２つの可変ドメインの実質的に全てを含み、この場合、ＣＤＲ領域の全てまたは実質的に全てが非ヒト免疫グロブリンのものに対応し、そしてＦＲ領域のうちの全てまたは実質的に全てがヒト免疫グロブリンコンセンサス配列のものに対応する。ヒト化抗体は、最適には、免疫グロブリン定常領域（Ｆｃ）の少なくとも一部、典型的にはヒト免疫グロブリンの少なくとも一部も含む（Jones et al., Nature, 321:522-525 (1986)； Reichmann et al., Nature, 332:323-329 (1988)；およびPresta, Curr. Op. Struct. Biol., 2:593-596 (1992)）。
【００８９】
非ヒト抗体をヒト化するための方法は、当該技術分野で周知である。一般的には、ヒト化抗体は、非ヒトである供給源からそれに導入される１つ以上のアミノ酸残基を有する。これらの非ヒトアミノ酸残基は、しばしば、「移入」残基と呼ばれ、これは典型的には、「移入」可変ドメインから得られる。ヒト化は、本質的にはWinter and co-workers, Jones et al., Nature 321:522-525 (1986)；Riechmann et al., Nature 332:323-327 (1988)；Verhoeyen et al., Science 239:1534-1536 (1988)の方法に従って、あるいは齧歯類ＣＤＲ（複数）またはＣＤＲ配列をヒト抗体の対応する配列に替えて置換することにより、実施され得る。したがって、このような「ヒト化」抗体はキメラ抗体であり（米国特許第４，８１６，５６７号）、この場合、実質的に無傷より少ないヒト可変ドメインが、非ヒト種からの対応する配列により置換されている。実際、ヒト化抗体は典型的には、いくつかのＣＤＲ残基およびおそらくはいくつかのＦＲ残基が齧歯類抗体における類似部位からの残基により置換されるヒト抗体である。
【００９０】
ヒト化抗体の作製に用いられるべきヒト可変ドメインの選択は、軽鎖も重鎖も、抗原性を低減するために非常に重要である。いわゆる「最良適合」法によれば、齧歯類抗体の可変ドメインの配列は、既知のヒト可変ドメイン配列の全ライブラリーに対してスクリーニングされる。齧歯類の配列に最も近いヒト配列が、次いで、ヒト化抗体のためのヒトフレームワーク（ＦＲ）として受容される（Sims et al., J. Immunol., 151:2296 (1993)；Chothia et al., J. Mol. Biol., 196:901 (1987)）。別の方法は、軽鎖または重鎖の特定の亜群の全てのヒト抗体のコンセンサス配列由来の特定のフレームワークを用いる。同一フレームワークが、いくつかの異なるヒト化抗体のために用いられ得る（Carter et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89:4285 (1992)；Presta et al., J. Immnol., 151:2623 (1993)）。
【００９１】
さらに、抗原に対する高親和性およびその他の好都合な生物学的特性を保持しつつ抗体がヒト化されることは重要である。この目標を達成するために、好ましい方法によれば、ヒト化抗体は、親配列および種々の概念的ヒト化生成物の、親およびヒト化配列の三次元モデルを用いた分析により、調製される。三次元免疫グロブリンモデルは、一般的に入手可能であり、当業者によく知られている。選択された候補免疫グロブリン配列の考え得る三次元立体配座構造を、例示し、表示するコンピュータープログラムが利用可能である。これらの表示の精査により、候補免疫グロブリン配列の機能における残基の考え得る役割の分析、すなわち、その抗原と結合する候補免疫グロブリンの能力に影響を及ぼす残基の分析が可能になる。このようにして、所望の抗体特性、例えば標的抗原（単数または複数）に対する親和性増大が達成されるよう、ＦＲ残基がレシピエントおよび移入配列から選択され、組合され得る。概して、ＣＤＲ残基は、直接的に且つほぼ実質的に、抗原結合に影響を及ぼすのに関与する。
【００９２】
代替的には、ここでは、免疫化に際して、内因性免疫グロブリン産生の非存在下で、ヒト抗体の完全レパートリーを産生し得るトランスジェニック動物（例えばマウス）を作製することが可能である。例えば、キメラおよび生殖系列突然変異体マウスにおける抗体重鎖連結領域（ＪＨ）遺伝子の同型接合的欠失は内因性抗体産生の完全抑制を生じる、ということが記載されている。このような生殖系列変異体マウスにおけるヒト生殖系列免疫グロブリン遺伝子アレイの移入は、抗原投与時にヒト抗体の産生を生じる。例えば、Jakobovits et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:2551 (1993)；Jakobovits et al., Nature, 362:255-258 (1993)；Bruggermann et al., Year in Immuno., 7:33 (1993)参照。ヒト抗体は、ファージ表示ライブラリーからも得られる(Hoogenboom et al., J. Mol. Biol., 227:381 (1991)；Marks et al., J. Mol. Biol., 222:581-597 (1991))。
【００９３】
ヒト抗体は、当該技術分野で既知の種々の技法、例えばファージ表示ライブラリーを用いても産生され得る（Hoogenboom and Winter, J. Mol. Biol. 227: 381 (1991)；Marks et al., J. Mol. Biol. 222: 581 (1991)）。Cole等およびBoerner等の技法も、ヒトモノクローナル抗体の調製のために利用可能である（Cole et al., Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, p. 77 (1985)およびBoerner et al., J. Immunol. 147(1): 86-95 (1991)）。同様に、ヒト抗体は、トランスジェニック動物、例えばマウス中にヒト免疫グロブリン遺伝子座を導入することにより作製され得るが、この場合、内因性免疫グロブリン遺伝子は部分的にまたは完全に不活性化されている。抗原投与時に、ヒト抗体産生が観察され、これは、遺伝子再配列、アセンブリーおよび抗体レパートリーを含めて全ての点で、ヒトにおいて観察されるものと非常によく似ている。このアプローチは、例えば米国特許第５，５４５，８０７号；第５，５４５，８０６号、第５，５６９，８２５号、第５，６２５，１２６号、第５，６３３，４２５号、第５，６６１，０１６に、ならびに以下の科学出版物：Marks et al., Bio/Technology 10: 779-783 (1992)；Lonberg et al., Nature 368: 856-859 (1994)；Morrison, Nature 368: 812-13 (1994)；Fishwild et al., Nature Biotechnology 14: 845-51 (1996)；Neuberger, Nature Biotechnology 14: 826 (1996)およびLonberg and Huszar, Intern. Rev. Immunol. 13: 65-93 (1995)に記載されている。
【００９４】
（ｉｖ）抗体依存性酵素媒介性プロドラッグ療法（ＡＤＥＰＴ）
本発明の抗体は、プロドラッグ（例えば、ペプチジル化学療法薬、ＷＯ８１／０１１４５参照）を活性抗癌薬に転化するプロドラッグ活性化酵素と共役させることにより、ＡＤＥＰＴにも用いられ得る（例えばＷＯ８８／０７３７８および米国特許第４，９７５，２７８号参照）。
【００９５】
ＡＤＥＰＴのために有用な免疫複合体の酵素構成成分としては、それをそのより活性な細胞傷害性形態に転化するような方法で、プロドラッグに作用し得る任意の酵素が挙げられる。
【００９６】
本発明の方法に有用である酵素としては、グリコシダーゼ、グルコースオキシダーゼ、ヒトライソザイム、ヒトグルクロニダーゼ、アルカリ性ホスファターゼ（ホスフェート含有プロドラッグを遊離薬剤に転化するために有用）；アリールスルファターゼ（スルフェート含有プロドラッグを遊離薬剤に転化するために有用）；シトシンデアミナーゼ（非毒性５−フルオロシトシンを抗癌薬５−フルオロウラシルに転化するために有用）；プロテアーゼ、例えばセラチアプロテアーゼ、サーモリシン、サブチリシン、カルボキシペプチダーゼ（例えば、カルボキシペプチダーゼＧ２およびカルボキシペプチダーゼＡ）ならびにカテプシン（例えばカテプシンＢおよびＬ）（ペプチド含有プロドラッグを遊離薬剤に転化するために有用）；Ｄ−アラニルカルボキシペプチダーゼ（Ｄ−アミノ酸置換基を含有するプロドラッグを転化するために有用）；炭水化物切断酵素、例えばβ−ガラクトシダーゼおよびノイラミニダーゼ（グリコシル化プロドラッグを遊離薬剤に転化するために有用）；β−ラクタマーゼ（β−ラクタムで誘導体化された薬剤を遊離薬剤に転化するために有用）；ならびにペニシリンアミダーゼ、例えばペニシリンＶアミダーゼまたはペニシリンＧアミダーゼ（それぞれ、フェノキシアセチルまたはフェニルアセチル基を用いてそれらのアミン窒素で誘導体化された薬剤を遊離薬剤に転化するために有用）が挙げられるが、これらに限定されない。代替的には、「アブザイム」としても当該技術分野で既知である酵素活性を有する抗体を用いて、本発明のプロドラッグを遊離活性薬剤に転化し得る（例えばMassey, Nature 328: 457-458 (1987)参照）。抗体−アブザイム共役体は、腫瘍細胞集団へのアブザイムの送達のために本明細書中に記載されたように調製され得る。
【００９７】
この発明の酵素は、上記のヘテロ二機能性架橋剤の使用といったような当該技術分野で周知の技法により、抗ＩＬ−１７または抗ＬＩＦ抗体に共有結合され得る。代替的には、本発明の酵素の少なくとも機能的活性部分に連結される本発明の抗体の少なくとも抗原結合領域を含む融合タンパク質は、当該技術分野で周知の組換えＤＮＡ技術を用いて構築され得る（例えばNeuberger et al., Nature 312: 604-608 (1984)参照）。
【００９８】
（ｉｖ）二重特異性および多重特異性抗体
二重特異性抗体（ＢｓＡｂ）は、少なくとも２つの異なるエピトープに対する結合特異性を有する抗体である。このような抗体は、全長抗体または抗体断片に由来することができる（例えば、Ｆ（ａｂ’）２二重特異性抗体）。
【００９９】
二重特異性抗体の作製方法は、当該技術分野で既知である。全長二重特異性抗体の伝統的産生は、２つの免疫グロブリン重鎖−軽鎖対の同時発現に基づいており、この場合、２つの鎖は異なる特異性を有する（Millstein et al., Nature, 305:537-539 (1983)）。免疫グロブリン重鎖および軽鎖の無作為な取り合わせのために、これらのハイブリドーマ（クアドローマ）は１０の異なる抗体分子の可能性のある混合物を生じ、そのうちの１つだけが正しい二重特異性構造を有する。正しい分子の精製（これは通常はアフィニティークロマトグラフィー段階により実行される）はかなり面倒であり、生成物収率は低い。類似の手法は、ＷＯ ９３／０８８２９に、ならびにTraunecker et al., EMBO J., 10:3655-3659 (1991)に開示されている。
【０１００】
所望の結合特異性を有する抗体可変ドメイン（抗体−抗原結合部位）は、免疫グロブリン定常ドメイン配列と融合され得る。融合物は、好ましくは、免疫グロブリン重鎖定常ドメインを有し、ヒンジ、ＣＨ２およびＣＨ３領域の少なくとも一部を含む。融合物の少なくとも１つに存在する軽鎖結合に必要な部位を含有する第一重鎖定常領域（ＣＨ１）を有することが好ましい。免疫グロブリン重鎖融合物、そして所望により、免疫グロブリン軽鎖をコードするＤＮＡは、別個の発現ベクター中に挿入され、適切な宿主生物体中に同時トランスフェクトされる。二重特異性抗体の生成についてのさらなる詳細に関しては、例えばSuresh et al., Methods in Enzymology 121: 210 (1986)を参照されたい。
【０１０１】
異なるアプローチによれば、所望の結合特異性を有する抗体可変ドメイン（抗体−抗原結合部位）は、免疫グロブリン定常ドメイン配列と融合され得る。融合物は、好ましくは、免疫グロブリン重鎖定常ドメインを有し、ヒンジ、ＣＨ２およびＣＨ３領域の少なくとも一部を含む。融合物の少なくとも１つに存在する軽鎖結合に必要な部位を含有する第一重鎖定常領域（ＣＨ１）を有することが好ましい。免疫グロブリン重鎖融合物、そして所望により、免疫グロブリン軽鎖をコードするＤＮＡは、別個の発現ベクター中に挿入され、適切な宿主生物体中に同時トランスフェクトされる。これにより、構築に用いられる不等比の３つのポリペプチド鎖が最適収率を提供する場合の実施形態において、３つのポリペプチド断片の相互比率を調整するに際して、大きな柔軟性が提供される。しかしながら、等比での少なくとも２つのポリペプチド鎖の発現が高収率を生じる場合、またはその比率が特別な意味を有さない場合、１つの発現ベクター中に２つまたは３つ全てのポリペプチド鎖に関するコード配列を挿入することが可能である。
【０１０２】
ＷＯ９６／２７０１１に記載された別のアプローチによれば、一対の抗体分子間の界面は、組換え細胞培養から回収されるヘテロ二量体のパーセンテージを最大にするよう操作され得る。好ましい界面は、抗体定常ドメインのＣＨ３領域の少なくとも一部を含む。この方法では、第一抗体分子の界面からの１つ以上の小アミノ酸側鎖が、より大きな側鎖（例えばチロシンまたはトリプトファン）に置き替えられる。大型アミノ酸側鎖をより小さなもの（例えばアラニンまたはトレオニン）に置き換えることにより、大型側鎖（単数または複数）と同一のまたは類似のサイズを有する補償「キャビティ」が第二抗体分子の界面上に作製される。これは、ホモ二量体のような他の望ましくない最終産物に対したヘテロ二量体の収率増大のための機序を提供する。
【０１０３】
このアプローチの好ましい実施形態では、二重特異性抗体は、一方のアームにおける第一結合特異性を有するハイブリッド免疫グロブリン重鎖、ならびに他方のアームにおける（第二結合特異性を提供する）ハイブリッド免疫グロブリン重鎖−軽鎖対で構成される。この不斉構造は、二重特異性分子の半分だけにおける免疫グロブリン軽鎖の存在が分離の容易な方法を提供するので、所望の二重特異性化合物を望ましくない免疫グロブリン鎖組合せ物から分離するのを促す、ということが判明した。このアプローチは、ＷＯ９４／０４６９０（１９９４年３月３日公開）に開示されている。二重特異性抗体の生成についてのさらなる詳細に関しては、例えばSuresh et al., Methods in Enzymology, 121:210 (1986)参照。
【０１０４】
二重特異性抗体には、架橋または「異型接合」抗体が含まれる。例えば、異型接合体中の抗体の一方はアビジンと結合され、他方はビオチンと結合され得る。このような抗体は、例えば、望ましくない細胞を標的として免疫系細胞を向けるために（米国特許第４，６７６，９８０号）、そしてＨＩＶ感染の治療のために（ＷＯ９１／００３６０、ＷＯ９２／２００３７３）提案されている。異型接合抗体は、任意の便利な架橋方法を用いて作製され得る。適切な架橋剤は当該技術分野で周知であり、多数の架橋技法とともに米国特許第４，６７６，９８０号に開示されている。
【０１０５】
抗体断片から二重特異性抗体を生成するための技法も、文献に記載されている。必ずしも二重特異性でない二価抗体断片の産生のために、以下の技法も用いられ得る。例えば大腸菌から回収されるＦａｂ’断片は、in vitroで化学的に結合されて、二価抗体を形成し得る（Shalaby et al., J. Exp. Med., 175:217-225 (1992)参照）。
【０１０６】
二重特異性抗体は、全長抗体または抗体断片として調製され得る（例えばＦ（ａｂ’）２二重特異性抗体）。抗体断片から二重特異性抗体を生成するための技法は、文献に記載されている。例えば、二重特異性抗体は、化学的連結を用いて調製され得る。Brennan et al., Science 229: 81 (1985)は、無傷抗体がタンパク質分解的に切断されて、Ｆ（ａｂ’）２断片を生成する手法を記載する。これらの断片は、ジチオール錯化剤亜ヒ酸ナトリウムの存在下で還元されて、隣接ジチオールを安定化し、分子間ジスルフィド形成を防止する。生成されたＦａｂ’断片は次に、チオニトロベンゾエート（ＴＮＢ）誘導体に変換される。次いで、Ｆａｂ’−ＴＮＢ誘導体のうちの１つは、Ｆａｂ’−ＴＮＢ誘導体に再変換されて、二重特異性抗体を形成する。産生された二重特異性抗体は、酵素の選択的固定化のための作用物質として用いられ得る。
【０１０７】
Ｆａｂ’断片は、大腸菌から直接回収され、化学的に結合されて、二重特異性抗体を形成し得る。Shalaby et al., J. Exp. Med. 175: 217-225 (1992)は、完全ヒト化二重特異性抗体Ｆ（ａｂ’）２分子の産生を記載する。各Ｆａｂ’断片は、大腸菌から別々に分泌されて、in vitroでの支持された化学結合に付されて、二重特異性抗体を形成した。このように形成された二重特異性抗体は、ＥｒｂＢ２受容体を過剰発現する細胞および正常ヒトＴ細胞に結合し、ヒト乳房腫瘍標的に対するヒト細胞傷害性リンパ球の溶解活性を誘発し得た。
【０１０８】
組換え細胞培養から直接的に二価抗体断片を作製し、単離するための種々の技法も、記載されている。例えば、二価へテロ二量体は、ロイシンジッパーを用いて産生されている（Kostelny et al., J. Immunol., 148(5):1547-1553 (1992)）。ＦｏｓおよびＪｕｎタンパク質からのロイシンジッパーペプチドは、遺伝子融合により２つの異なる抗体のＦａｂ’部分と連結された。抗体ホモ二量体は、ヒンジ領域で還元されて、単量体を形成し、次いで、再酸化されて、抗体へテロ二量体を形成した。Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90: 6444-6448 (1993)により記載された「ダイアボディ」技法は、二重特異性／二価抗体断片を作製するための代替的機序を提供している。断片は、同一鎖上の２つのドメイン間の対合を可能にするには短すぎるリンカーにより軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）と連結される重鎖可変ドメイン（ＶＨ）を含む。したがって、１つの断片のＶＨおよびＶＬドメインは、別の断片の相補的ＶＬおよびＶＨドメインと対合させられ、それにより２つの抗原結合部位を形成する。一本鎖Ｆｖ（ｓＦｖ）二量体の使用により二重特異性／二価抗体断片を作製するための別の戦略も報告されている（Gruber et al., J. Immunol., 152:5368 (1994)参照）。
【０１０９】
２より大きい価数を有する抗体が意図される。例えば、三重特異性抗体が調製され得る（Tutt et al., J. Immunol. 147: 60 (1991)）。
【０１１０】
例示的二重特異性抗体は、所与の分子上の２つの異なるエピトープに結合し得る。代替的には、特定タンパク質を発現する細胞に細胞防御機序を集中させるために、抗タンパク質アームが、白血球上のトリガー分子、例えばＴ細胞受容体分子（例えばＣＤ２、ＣＤ３、ＣＤ２８またはＢ７）、あるいはＩｇＧのためのＦｃ受容体（ＦｃγＲ）、例えばＦｃγＲＩ（ＣＤ６４）、ＦｃγＲＩＩ（ＣＤ３２）およびＦｃγＲＩＩＩ（ＣＤ１６）に結合するアームと組合せされ得る。二重特異性抗体は、特定タンパク質を発現する細胞に細胞傷害剤を局在化するためにも用いられ得る。このような抗体は、タンパク質結合アーム、ならびに細胞傷害剤または放射性核種キレート剤、例えばＥＯＴＵＢＥ、ＤＰＴＡ、ＤＯＴＡまたはＴＥＴＡと結合するアームを保有する。別の当該二重特異性抗体は、当該タンパク質と結合し、さらに、組織因子（ＴＦ）と結合する。
【０１１１】
（ｖ）異型接合抗体
異型接合抗体も、本発明の範囲内である。異型接合抗体は、２つの共有結合された抗体で構成される。このような抗体は、例えば、免疫系細胞を望ましくない細胞にその標的として向けるために（米国特許第４，６７６，９８０号）、そしてＨＩＶ感染の治療のために（ＷＯ９１／００３６０、ＷＯ９２／２００３７３およびＥＰ ０３０８９）提案されている。抗体は、合成タンパク質化学において既知の方法、例えば架橋剤を伴う方法を用いて、in vitroで調製され得る、ということが意図される。例えば、免疫毒素は、ジスルフィド交換反応を用いることにより、あるいはチオエーテル結合を形成することにより、構築され得る。この目的のための適切な試薬の例としては、イミノチオラートおよびメチル−４−メルカプトブチルイミド、ならびに例えば米国特許第４，６７６，９８０号に開示されたものが挙げられる。
【０１１２】
Ｃ． 抗体を含めたタンパク質の精製
標的ポリペプチドがヒト起源の細胞以外の組換え細胞中で発現される場合、標的ポリペプチドはヒト起源のタンパク質またはポリペプチドを完全に含有しない。しかしながら、標的ポリペプチドに関して実質的に均質である調製物を得るためには、組換え細胞タンパク質またはポリペプチドから標的ポリペプチドを精製する必要がある。第一段階として、培地または溶解物は、典型的には、粒状細胞破砕屑を除去するために遠心分離される。次いで、膜および可溶性タンパク質分画が分離される。次に、標的ポリペプチドが膜結合されるか否かによって、可溶性タンパク質分画から、ならびに培養溶解物の膜分画から、標的ポリペプチドが精製され得る。以下の手順は、適切な精製手順の例である：免疫親和性またはイオン交換カラム上での分別；エタノール沈降；逆相ＨＰＬＣ；シリカ上、または陽イオン交換樹脂、例えばＤＥＡＥ上でのクロマトグラフィー；クロマトフォーカシング；ＳＤＳ−ＰＡＧＥ、硫酸アンモニウム沈降；例えばセファデックス（登録商標）Ｇ−７５を用いるゲル濾過；ならびにＩｇＧのような夾雑物を除去するためのプロテインＡセファロースカラム。
【０１１３】
モノクローナル抗体（ＭＡｂ）を現在製造しているほとんどの会社が、生成物捕捉のためのプロテインＡアフィニティークロマトグラフィーと、その後の、負荷電夾雑物、例えば宿主細胞タンパク質（ＨＣＰ）、内毒素、宿主ＤＮＡおよび浸出プロテインＡを抽出するためのフロースルー方式の陰イオン交換クロマトグラフィー、次いで、残留ＨＣＰおよび生成物集合体を含めた正荷電夾雑物種を除去するための保持方式での陽イオン交換クロマトグラフィーまたは疎水性相互作用クロマトグラフィー（ＨＩＣ）を含む３カラムプラットホームアプローチを用いる。
【０１１４】
タンパク質溶液中に存在し得るウイルスは、タンパク質それ自体より大きい。したがって、ウイルスは、濾過により、サイズに従ってタンパク質から除去され得る、と推定される。
【０１１５】
ウイルス濾過は、典型的には約６０ｎｍの公称孔サイズを有する高処理量膜を用いて、より大きな、例えばレトロウイルス（直径８０〜１００ｎｍ）を除去し得る。公称孔サイズ２０ｎｍの高処理量膜も市販されているため、濾過により、より小さなウイルス、例えばパルボウイルス（直径１８〜２６ｎｍ）を除去することが可能であり、一方、１６０ｋＤ（約８ｎｍ）といった大きさであるタンパク質、例えばモノクローナル抗体の通過を可能にする。本発明は主に、より小さな孔サイズのウイルス除去フィルターを用いて、典型的にはこのような小型ウイルスの濾過に伴う問題を解決するために意図される。
【０１１６】
典型的には、ウイルス濾過段階は、所与の下流工程におけるいくつかのポイントのいずれか１つで実行され得る。例えば、典型的モノクローナル抗体精製工程では、ウイルス濾過は低ｐＨのウイルス不活性化段階後に、あるいは中間カラムクロマトグラフィー段階後に、あるいは最終のカラムクロマトグラフィー段階の後に行なわれ得る。
【０１１７】
本発明によれば、ウイルス濾過ユニット操作は、下流工程の任意のステージで実行され得る。モノクローナル抗体の下流加工処理中のウイルス濾過は、典型的には、アフィニティークロマトグラフィー段階（捕捉段階）およびイオン交換精製段階（最終精製段階）後に実施される。
【０１１８】
本明細書中に開示される実験で用いられる実験の設定が、図１に例示されている。しかしながら、本発明はそのように限定されるというわけではないことが強調される。当該技術分野で周知の他の構成も適切であり、本発明の方法に用いられ得る。
【０１１９】
平行流ウイルス濾過では、タンパク質溶液は、通常は、保持側面上に一定速度の流れで周囲に押出される。ウイルス除去フィルターにわたって生じる差圧は、タンパク質溶液を、フィルターを通して浸透させ、一方、ウイルスは保持側面に保持される。
【０１２０】
いわゆる「垂直流」または「デッドエンド」ウイルス濾過の場合、平行ウイルス濾過に用いられるのと同じウイルスフィルターが用いられ得るが、しかし周辺機器および操作手順は、平行流ウイルス濾過の場合よりかなり簡単で且つ安価である。したがって、原則として、「垂直流」濾過は、濾過の前に圧力容器中に高分子含有溶液を配置した後、圧力源、適切には窒素（気体）または空気の助けで溶液に圧力をかけてウイルス除去フィルターを通過させることを包含する。代替的には、ポンプを保持側面に用いて、既定の流量でウイルス除去フィルターを通して液体を濾過し得る。
【０１２１】
フィルターの微細度は、一般的に、孔サイズとして、あるいはフィルターにより分子が止められる（いわゆるカットオフ）およその分子量（相対分子量）として普通は表される。
【０１２２】
ウイルスフィルターは当該技術分野で既知であり、とりわけ、Millipore（Massachusetts, USA）およびAsahi Chemical Industry Co., Ltd.（日本）により供給される。適切なパルボウイルス保持フィルターとしては、Ｖｉｒｅｓｏｌｖｅ（登録商標）Ｐｒｏ(Millipore Corp., Billerica, MA)が挙げられる。Ｖｉｒｅｓｏｌｖｅ（登録商標）Ｐｒｏ膜は、非対称二重膜構造を有し、ポリエーテルスルホン（ＰＥＳ）製である。膜構造は、２０ｎｍより大きいサイズのウイルスを保持する一方で、１８０ｋＤａ未満の分子量のタンパク質は膜を透過させるよう設計されている。タンパク質溶液から小型ウイルス、例えばパルボウイルスを除去するのに適した他のフィルターとしては、Ｎｏｖａｓｉｐ（商標）ＤＶ２０およびＤＶ５０ウイルス除去フィルターカプセル(Pall Corp., East Hills, NY)、Ｖｉｒｏｓａｒｔ（登録商標）ＣＰＶ、Ｐｌａｎｏｖａ ２０Ｎ(Asahi Kasei)およびＢｉｏＥＸ(Asahi Kasei)が挙げられる。Ｎｏｖａｓｉｐ ＤＶ２０等級カプセルフィルターはＵｌｔｉｐｏｒ ＶＦ等級ＤＶ２０等級襞付膜カートリッジを利用して、パルボウイルスならびに２０ｎｍという小さい他のウイルスを５〜１０リットルまでのタンパク質溶液から除去する。Ｎｏｖａｓｉｐ ＤＶ５０等級カプセルフィルターはＵｌｔｉｐｏｒ ＶＦ ＤＶ５０等級Ｕｌｔｉｐｌｅａｔ（登録商標）膜カートリッジを組入れて、４０〜５０ｎｍ以上のウイルスを除去する。Ｎｏｖａｓｉｐ Ｕｌｔｉｐｏｒ ＶＦカプセルフィルターは、非無菌で供給され、ガンマ線照射もされ得る。Ｖｉｒｏｓａｒｔ（登録商標）ＣＰＶは二重層ポリエーテルスルホン不斉膜を利用し、４ｌｏｇより大きいパルボウイルスおよび６ｌｏｇのレトロウイルスを保持する。
【０１２３】
供給溶液の前濾過は、フィルター性能に劇的な影響を及ぼし得る。前濾過は、典型的には、ウイルスフィルターの汚損をもたらし得る、例えばタンパク質凝集物、ＤＮＡおよびその他の微量物質等の不純物および夾雑物を除去することを目標とする。
【０１２４】
本発明によれば、ウイルスフィルターの効力の顕著な増強が、陽イオン交換および内毒素除去媒体の両方の使用を含む前濾過段階により達成され得る。この文脈において、「媒体（単数）」または「媒体（複数）」という用語は、それぞれ陽イオン交換および内毒素除去段階を実施するためのいかなる手段をも包含するために用いられる。したがって、「陽イオン交換媒体」という用語は、具体的には、陽イオン交換樹脂、マトリックス、吸収装置等を包含するが、これらに限定されない。「内毒素除去媒体」という用語は、任意の正荷電膜表面、例えばクロマトグラフィー内毒素除去媒体、内毒素親和性除去媒体等を包含するが、これらに限定されない。
【０１２５】
本発明の前濾過段階で用いるのに適した陽イオン交換媒体としては、Ｍｕｓｔａｎｇ（登録商標）Ｓ、Ｓａｒｔｏｂｉｎｄ（登録商標）Ｓ、Ｖｉｒｅｓｏｌｖｅ（登録商標）Ｓｈｉｅｌｄ、ＳＰＦＦ、ＳＰＸＬ、Ｃａｐｔｏ（登録商標）Ｓ、Ｐｏｒｏｓ（登録商標）５０ＨＳ、Ｆｒａｃｔｏｇｅｌ（登録商標）Ｓ、Ｈｙｐｅｒｃｅｌ（登録商標）Ｄ等（これらは市販されている）が挙げられるが、これらに限定されない。
【０１２６】
本発明の前濾過段階で用いるのに適した内毒素除去媒体としては、Ｍｕｓｔａｎｇ（登録商標）Ｅ、Ｍｕｓｔａｎｇ（登録商標）Ｑ、Ｓａｒｔｏｂｉｎｄ（登録商標）Ｑ、Ｃｈｒｏｍａｓｏｒｂ（登録商標）、Ｐｏｓｓｉｄｙｎｅ（登録商標）、Ｃａｐｔｏ（登録商標）Ｑ、ＱＳＦＦ、Ｐｏｒｏｓ（登録商標）Ｑ、Ｆｒａｃｔｏｇｅｌ（登録商標）Ｑ等（これらは市販されている）が挙げられるが、これらに限定されない。
【０１２７】
前濾過段階は、例えば、製造過程クロマトグラフィープールを採用して、内毒素除去および陽イオン交換媒体ならびにパルボウイルスフィルターを含む濾過列上でプールを処理することにより、実施され得る。内毒素除去および陽イオン交換媒体は、前濾過段階として作用し、パルボウイルスフィルターの能力は濾過列中の２つの段階の順序とは無関係である。濾過列は、単一段階として連続して作動し得るし、あるいはそれは、異なるユニット操作として操作され得る。例えば一実施形態では、クロマトグラフィープールが内毒素除去媒体上で先ず処理されて、収集されたプールは次に、陽イオン交換媒体上で処理され、その後のプールがパルボウイルスフィルターで濾過される。上記のように、工程配列において陽イオン交換媒体および内毒素除去媒体を適用する順番は、パルボウイルス濾過能力に影響しない。工程は、広範なｐＨ範囲に亘って、例えばｐＨ４〜１０の範囲で操作することができ、最適フィルター能力は標的不純物プロファイルおよび生成物属性に左右される。同様に、タンパク質濃度は、広範囲に亘って、例えば１〜４０ｇ／Ｌで変わり得るが、パルボウイルスフィルターの質量処理量を限定しない。
【０１２８】
本発明は、以下の実施例を参照することによりさらに理解されるであろう。しかしながらそれらは、本発明の範囲を限定するものではない。本開示全体を通しての引例は全て、その記載内容が参照により本明細書中に組入れられる。
【実施例】
【０１２９】
材料および方法
１． タンパク質溶液
モノクローナル抗体の下流処理中のウイルス濾過はアフィニティークロマトグラフィー（捕捉段階）およびイオン交換段階（最終精製段階）の後に実施されるため、濾過実験は全て、商業的に適した製造過程でイオン交換（陽イオンまたは陰イオン交換）クロマトグラフィープールを用いて実施した。陽イオン交換ならびに陰イオン交換プールのｍＡｂ濃度およびプール伝導度は、それぞれ１０ｍｇ／ｍｌおよび１０ｍＳ／ｃｍならびに８ｍｇ／ｍｌおよび４ｍｓ／ｃｍであった。新鮮な供給原料（製造２４時間以内）を用いて、あるいは製造後−７０℃で冷凍し、使用前に４〜８℃で解凍した供給原料を用いて、濾過実験を実施した。新鮮な供給原料または凍結解凍供給原料を用いて得られた結果において、有意差は観察されなかった。タンパク質濃度は、ＵＶ−ｖｉｓ分光測光計（ＮａｎｏＤｒｏｐ ＮＤ−１０００、NanoDrop Technologies, Wilmington, DE）を用いて確定し、吸光度は２８０ｎｍで測定した。
【０１３０】
２． 膜
Ｖｉｒｅｓｏｌｖｅ（登録商標）Ｐｒｏ(Millipore Corp., Billerica, MA)パルボウイルス保持フィルターを用いて、濾過実験を実施した。Ｖｉｒｅｓｏｌｖｅ（登録商標）Ｐｒｏ膜は、非対称二重層構造を有し、ポリエーテルスルホン（ＰＥＳ）製である。膜構造は、２０ｎｍより大きいサイズのウイルスを保持し、一方、１８０ｋＤａ未満の分子量のタンパク質は膜を透過させるよう設計されている。この試験で評価したＶｉｒｅｓｏｌｖｅ（登録商標）Ｐｒｏのための前置フィルターは、Ｖｉｒｅｓｏｌｖｅ（登録商標）Ｏｐｔｉｓｃａｌｅ ４０深層フィルター(Millipore Corp., Billerica, MA)、Ｆｌｕｏｒｏｄｙｎｅ ＥＸ Ｍｉｎｉ ０．２ μｍ滅菌フィルター(Pall Corp., East Hills, NY)およびＭｕｓｔａｎｇ（登録商標）ファミリーからの膜吸収装置(Pall Corp., East Hills, NY)を包含した。膜吸収装置は、完全封入Acrodisc（登録商標）ユニットで売主から入手した。表１は、この試験に用いた前置フィルター全ての重要な特性（官能基、床容積、孔サイズ等）を要約する。
【表１】
【０１３１】
３． 実験の設定
図１に示した特別仕様の装置を用いて、濾過実験を実施した。負荷物質、すなわち製造過程ｍＡｂプールを負荷レザバー中に入れて、異なる組合せの前置フィルターおよび市販パルボウイルスフィルターからなる濾過列を通して濾過した。全ての濾過実験において、一定濾過流量（Ｐmax）法を用いた。圧力変換器を各フィルターの上流に配置し、ＭｉｌｌｉｄａｑまたはＮｅｔｄａｑシステムと連結して、差圧データを時間または質量処理量の一関数として記録した。パルボウイルスフィルターからの濾液をレザバー中に収集し、これを負荷セル上に保持して、質量処理量を時間の一関数として記録した。
【０１３２】
結果および考察
哺乳動物細胞培養中で発現されるｍＡｂの下流精製は、典型的には、第一段階として遠心分離および深層濾過を利用して、細胞および細胞破砕屑を除去し、その後、ｍＡｂ捕捉および宿主細胞タンパク質（ＨＣＰ）の除去のためにアフィニティークロマトグラフィー処理し、その後、陽イオン交換クロマトグラフィー、ウイルス濾過および陰イオン交換クロマトグラフィー処理して、不純物、例えば凝集物、ウイルス、浸出プロテインＡおよびＨＣＰをさらに除去する。この試験におけるほとんどの実験を、陽イオン交換プールを用いて実施し、陽イオン交換クロマトグラフィーは第二クロマトグラフィー段階であった。
【０１３３】
図２は、異なる前置フィルターを用いて治療用ｍＡｂ供給流を２００Ｌ／ｍ２／時間の一定流量でＶｉｒｅｓｏｌｖｅ Ｐｒｏに通した差圧に関する実験データを示す。Ｘ軸は、ウイルスフィルター１平方メートル当たりの負荷されたｍＡｂの質量を表す。Ｙ軸は、ウイルスフィルターを通した差圧を質量処理量の関数として表す。深層フィルターが、滅菌フィルターと比較して、ウイルス濾過能力の数桁の大きさの増大を提供する、ということをデータは明白に示している。Bolton等(Bolton et al. Appl. Biochem. 43:55-63, 2006)が、ＮＦＰパルボウイルス保持フィルター(Millipore Corp.) に対する前置フィルターとしてのＶｉｒｅｓｏｌｖｅ Ｐｒｅｆｉｌｔｅｒ（商標）（深層フィルター媒体）の効果を、ポリクローナルＩｇＧ溶液を用いて評価した際に、同様の観察が成された。能力の増大は、疎水性相互作用のための汚損物（変性タンパク質）の選択的吸着に起因すると、著者等は考えた。
【０１３４】
深層フィルターは伝統的に、細胞培養流体の清澄化のために首尾よく用いられてきたが、しかし、例えば、パルボウイルス保持フィルターに対する前置フィルターとして、捕捉段階の下流に用いられる場合、特に考慮すべきかなりの数の限界が存在する。
（ａ）深層フィルターは基材安定性でなく、取り付け後の工程列の衛生を妨げ、開放型処理および汚染微生物増殖の可能性を生じる。
（ｂ）深層フィルターの組成は重要構成成分として珪藻土を含み、これは、典型的には食品等級であり、品質の問題を提示する。
（ｃ）珪藻土は一般的に、自然（十分に定義された化学的工程を欠く）から供給され、したがってロット毎の変動を示し得る。
（ｄ）深層フィルターは、金属、β−グリカンおよびその他の不純物を濾し出す傾向もあり、下流操作に伴って、この掃去が実証され、確認される必要がある。
【０１３５】
深層フィルターの下流のユニット操作は濾出し物の適切な掃去を提供するよう設計されなければならないので、これらの制限が工程開発に大きな重荷となる。しかしながら、濾出し物掃去の必要条件が満たされた場合でも、主要構成成分は自然から供給される、すなわち、それらは十分に定義された化学合成工程を欠くので、深層フィルターの特定ロットは、工程が清掃可能であるものより有意に高い濾出し物を有し得る、と懸念される理由がある。
【０１３６】
したがって、これらの制限を示さない前置フィルターの開発に、高い関心がもたれてきた。上記のように、Brown等 (Brown et al. IBC’s 20th Antibody Development and Production, San Diego, CA , 2008) は、近年、強力な負荷電イオン交換剤であるＭｕｓｔａｎｇ Ｓが、前置フィルターとして用いた場合、パルボウイルス保持フィルターの能力を数倍増大し得ることを示した。したがって、Ｖｉｒｅｓｏｌｖｅ（登録商標）Ｐｒｏに対する異なる前濾過媒体の作用を評価するために、実験を実行した。ｐＨ５．０および６．５での実験データを、図３（ａ）および（ｂ）に示す。データは、陽イオン交換媒体がｐＨ５．０で内毒素除去吸着剤をわずかに上回る利点を示したが、しかしその利点はｐＨ６．５で消失したことを示す。両媒体の全体的能力は、滅菌フィルターを用いたものより高かった（図２）；が、しかし、製造規模でのユニット操作を首尾よく実行するのに要する能力には有意に足りなかった。
【０１３７】
陽イオン交換および内毒素除去媒体の両方が２つの異なる汚損物を除去し得、その両方が汚損物を濾過し得る、という仮説に基づいて、イオン交換および内毒素除去媒体の両方を含む新規の前濾過列を用いて、実験を設計した。実験結果を、図４（ａ）および（ｂ）に示す（それぞれ、ｐＨ５．０およびｐＨ６．５）。２つの媒体の組合せは媒体それ自体の各々より有意に良好である、ということをデータは明白に示している。例えば、ｐＨ５．０では、陽イオン交換および内毒素除去媒体の組合せは、２０ｐｓａの差圧で、一桁より大きな能力改善を提供する。同様の傾向がｐＨ６．５でも観察されたが、しかし全体的能力はｐＨ５．０で得たものより低かった。それは、ｐＨが低いほど不純物はより強固に除去されるためであると思われる。
【０１３８】
ＭＡｂ2での実験結果を、図５に示す。図４のデータと一致して、内毒素除去媒体および陽イオン交換媒体の両方を含有する新規の前濾過列は能力を大幅に増大したが、これは、内毒素除去媒体および陽イオン交換媒体が相乗的に作用して、２つの異なる種類の汚損物を除去することを示唆する。
【０１３９】
結論
従来の研究は大多数が、パルボウイルス保持フィルターの能力を増大するための前置フィルターとして、深層フィルターまたは陽イオン交換膜吸着剤を使用することに集中していた。深層フィルターはウイルス濾過能力を増大するための強固な機序を提供するが、しかし濾出し物のようなそれらに伴う制限が、下流精製列における特定ステージへのそれらの適用を限定する。陽イオン交換膜吸着剤はいくつかのモノクローナル抗体（ｍＡｂ）供給流に関するパルボウイルスフィルター能力を増大し得るが、しかしそれらはこの試験のデータで分かるように普遍的に適用可能であるというわけでなく、これは、多数の汚損物が存在し得る、これはパルボウイルス除去フィルターの性能をさらに改良するために対処する必要があることを示唆している。
【０１４０】
本発明は、上記の実験結果により実証されるように、２つの態様を強調する。すなわち、（１）内毒素除去媒体それ自体は、前濾過のために用いた場合、パルボウイルスフィルターの能力を有効に増大し得る。そして（２）内毒素除去および陽イオン交換媒体を前濾過列で連結すると、パルボウイルス濾過能力を数倍増大することができ、原料コストを低下させて、製造規模でのウイルス濾過の成功裏の操作を促す。
【特許請求の範囲】
【請求項１】
タンパク質精製中のウイルスフィルターの濾過能力の改良方法であって、精製されるべきタンパク質を含む組成物を、同時にまたはいずれかの順序で、陽イオン交換ステップおよび内毒素除去ステップに付した後、前記ウイルスフィルターに通すことを包含する方法。
【請求項２】
前記ウイルスフィルターの孔サイズが直径約１５〜約１００ｎｍである請求項１記載の方法。
【請求項３】
前記ウイルスフィルターの孔サイズが直径約１５〜約３０ｎｍである請求項２記載の方法。
【請求項４】
前記ウイルスフィルターの孔サイズが約２０ｎｍである請求項３記載の方法。
【請求項５】
除去されるべき前記ウイルスがパルボウイルスである請求項３または４記載の方法。
【請求項６】
前記パルボウイルスの直径が約１８〜約２６ｎｍである請求項５記載の方法。
【請求項７】
前記タンパク質が抗体または抗体断片である請求項１記載の方法。
【請求項８】
前記タンパク質が組換え抗体または抗体断片である請求項７記載の方法。
【請求項９】
前記組換え抗体または抗体断片が哺乳動物宿主細胞中で産生される請求項８記載の方法。
【請求項１０】
前記哺乳動物宿主細胞がチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞である請求項９記載の方法。
【請求項１１】
精製されるべき前記タンパク質を含む前記組成物が先ず陽イオン交換ステップに、その後、内毒素除去ステップに付された後に、ウイルス濾過される請求項１記載の方法。
【請求項１２】
精製されるべき前記タンパク質を含む前記組成物が先ず内毒素除去ステップに、その後、陽イオン交換ステップに付された後に、ウイルス濾過される請求項１記載の方法。
【請求項１３】
精製されるべき前記タンパク質を含む前記組成物が内毒素除去ステップおよび陽イオン交換ステップに同時に付された後に、ウイルス濾過される請求項１記載の方法。
【請求項１４】
前記内毒素除去ステップ直後にウイルス濾過される請求項１１記載の方法。
【請求項１５】
前記陽イオン交換ステップ直後にウイルス濾過される請求項１２記載の方法。
【請求項１６】
前記同時の内毒素除去および陽イオン交換ステップ直後にウイルス濾過される請求項１３記載の方法。
【請求項１７】
ウイルス濾過がｐＨ約４〜約１０で実施される請求項１記載の方法。
【請求項１８】
前記組成物中のタンパク質濃度が約１〜４０ｇ／Ｌである請求項１記載の方法。
【請求項１９】
前記抗体が、ＨＥＲ１（ＥＧＦＲ）、ＨＥＲ２、ＨＥＲ３、ＨＥＲ４、ＶＥＧＦ、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ１１ａ、ＣＤ１１ｂ、ＣＤ１１ｃ、ＣＤ１８、ＩＣＡＭ、ＶＬＡ−４、ＶＣＡＭ、ＩＬ−１７Ａおよび／またはＦ、ＩｇＥ、ＤＲ５、ＣＤ４０、Ａｐｏ２Ｌ／ＴＲＡＩＬ、ＥＧＦＬ７、ＮＲＰ１、有糸分裂活性化プロテインキナーゼ（ＭＡＰＫ）およびＤ因子からなる群から選択される１つ以上の抗原に対するものである請求項８記載の方法。
【請求項２０】
前記抗体が、抗エストロゲン受容体抗体、抗プロゲステロン受容体抗体、抗ｐ５３抗体、抗カテプシンＤ抗体、抗Ｂｃｌ−２抗体、抗Ｅ−カドヘリン抗体、抗ＣＡ１２５抗体、抗ＣＡ１５−３抗体、抗ＣＡ１９−９抗体、抗ｃ−ｅｒｂＢ−２抗体、抗Ｐ−糖タンパク質抗体、抗ＣＥＡ抗体、抗網膜芽細胞腫タンパク質抗体、抗ｒａｓ腫瘍性タンパク質抗体、抗ルイスＸ抗体、抗Ｋｉ−６７抗体、抗ＰＣＮＡ抗体、抗ＣＤ３抗体、抗ＣＤ４抗体、抗ＣＤ５抗体、抗ＣＤ７抗体、抗ＣＤ８抗体、抗ＣＤ９／ｐ２４抗体、抗ＣＤ１０抗体、抗ＣＤ１１ｃ抗体、抗ＣＤ１３抗体、抗ＣＤ１４抗体、抗ＣＤ１５抗体、抗ＣＤ１９抗体、抗ＣＤ２３抗体、抗ＣＤ３０抗体、抗ＣＤ３１抗体、抗ＣＤ３３抗体、抗ＣＤ３４抗体、抗ＣＤ３５抗体、抗ＣＤ３８抗体、抗ＣＤ４１抗体、抗ＬＣＡ／ＣＤ４５抗体、抗ＣＤ４５ＲＯ抗体、抗ＣＤ４５ＲＡ抗体、抗ＣＤ３９抗体、抗ＣＤ１００抗体、抗ＣＤ９５／Ｆａｓ抗体、抗ＣＤ９９抗体、抗ＣＤ１０６抗体、抗ユビキチン抗体、抗ＣＤ７１抗体、抗ｃ−ｍｙｃ抗体、抗サイトケラチン抗体、抗ビメンチン抗体、抗ＨＰＶタンパク質抗体、抗カッパ軽鎖抗体、抗ラムダ軽鎖抗体、抗メラノソーム抗体、抗前立腺特異的抗原抗体、抗Ｓ−１００抗体、抗タウ抗原抗体、抗フィブリン抗体、抗ケラチン抗体および抗Ｔｎ−抗原抗体からなる群から選択される請求項８記載の方法。
【請求項１】
タンパク質精製中のウイルスフィルターの濾過能力の改良方法であって、精製されるべきタンパク質を含む組成物を、同時にまたはいずれかの順序で、陽イオン交換ステップおよび内毒素除去ステップに付した後、前記ウイルスフィルターに通すことを包含する方法。
【請求項２】
前記ウイルスフィルターの孔サイズが直径約１５〜約１００ｎｍである請求項１記載の方法。
【請求項３】
前記ウイルスフィルターの孔サイズが直径約１５〜約３０ｎｍである請求項２記載の方法。
【請求項４】
前記ウイルスフィルターの孔サイズが約２０ｎｍである請求項３記載の方法。
【請求項５】
除去されるべき前記ウイルスがパルボウイルスである請求項３または４記載の方法。
【請求項６】
前記パルボウイルスの直径が約１８〜約２６ｎｍである請求項５記載の方法。
【請求項７】
前記タンパク質が抗体または抗体断片である請求項１記載の方法。
【請求項８】
前記タンパク質が組換え抗体または抗体断片である請求項７記載の方法。
【請求項９】
前記組換え抗体または抗体断片が哺乳動物宿主細胞中で産生される請求項８記載の方法。
【請求項１０】
前記哺乳動物宿主細胞がチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞である請求項９記載の方法。
【請求項１１】
精製されるべき前記タンパク質を含む前記組成物が先ず陽イオン交換ステップに、その後、内毒素除去ステップに付された後に、ウイルス濾過される請求項１記載の方法。
【請求項１２】
精製されるべき前記タンパク質を含む前記組成物が先ず内毒素除去ステップに、その後、陽イオン交換ステップに付された後に、ウイルス濾過される請求項１記載の方法。
【請求項１３】
精製されるべき前記タンパク質を含む前記組成物が内毒素除去ステップおよび陽イオン交換ステップに同時に付された後に、ウイルス濾過される請求項１記載の方法。
【請求項１４】
前記内毒素除去ステップ直後にウイルス濾過される請求項１１記載の方法。
【請求項１５】
前記陽イオン交換ステップ直後にウイルス濾過される請求項１２記載の方法。
【請求項１６】
前記同時の内毒素除去および陽イオン交換ステップ直後にウイルス濾過される請求項１３記載の方法。
【請求項１７】
ウイルス濾過がｐＨ約４〜約１０で実施される請求項１記載の方法。
【請求項１８】
前記組成物中のタンパク質濃度が約１〜４０ｇ／Ｌである請求項１記載の方法。
【請求項１９】
前記抗体が、ＨＥＲ１（ＥＧＦＲ）、ＨＥＲ２、ＨＥＲ３、ＨＥＲ４、ＶＥＧＦ、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ１１ａ、ＣＤ１１ｂ、ＣＤ１１ｃ、ＣＤ１８、ＩＣＡＭ、ＶＬＡ−４、ＶＣＡＭ、ＩＬ−１７Ａおよび／またはＦ、ＩｇＥ、ＤＲ５、ＣＤ４０、Ａｐｏ２Ｌ／ＴＲＡＩＬ、ＥＧＦＬ７、ＮＲＰ１、有糸分裂活性化プロテインキナーゼ（ＭＡＰＫ）およびＤ因子からなる群から選択される１つ以上の抗原に対するものである請求項８記載の方法。
【請求項２０】
前記抗体が、抗エストロゲン受容体抗体、抗プロゲステロン受容体抗体、抗ｐ５３抗体、抗カテプシンＤ抗体、抗Ｂｃｌ−２抗体、抗Ｅ−カドヘリン抗体、抗ＣＡ１２５抗体、抗ＣＡ１５−３抗体、抗ＣＡ１９−９抗体、抗ｃ−ｅｒｂＢ−２抗体、抗Ｐ−糖タンパク質抗体、抗ＣＥＡ抗体、抗網膜芽細胞腫タンパク質抗体、抗ｒａｓ腫瘍性タンパク質抗体、抗ルイスＸ抗体、抗Ｋｉ−６７抗体、抗ＰＣＮＡ抗体、抗ＣＤ３抗体、抗ＣＤ４抗体、抗ＣＤ５抗体、抗ＣＤ７抗体、抗ＣＤ８抗体、抗ＣＤ９／ｐ２４抗体、抗ＣＤ１０抗体、抗ＣＤ１１ｃ抗体、抗ＣＤ１３抗体、抗ＣＤ１４抗体、抗ＣＤ１５抗体、抗ＣＤ１９抗体、抗ＣＤ２３抗体、抗ＣＤ３０抗体、抗ＣＤ３１抗体、抗ＣＤ３３抗体、抗ＣＤ３４抗体、抗ＣＤ３５抗体、抗ＣＤ３８抗体、抗ＣＤ４１抗体、抗ＬＣＡ／ＣＤ４５抗体、抗ＣＤ４５ＲＯ抗体、抗ＣＤ４５ＲＡ抗体、抗ＣＤ３９抗体、抗ＣＤ１００抗体、抗ＣＤ９５／Ｆａｓ抗体、抗ＣＤ９９抗体、抗ＣＤ１０６抗体、抗ユビキチン抗体、抗ＣＤ７１抗体、抗ｃ−ｍｙｃ抗体、抗サイトケラチン抗体、抗ビメンチン抗体、抗ＨＰＶタンパク質抗体、抗カッパ軽鎖抗体、抗ラムダ軽鎖抗体、抗メラノソーム抗体、抗前立腺特異的抗原抗体、抗Ｓ−１００抗体、抗タウ抗原抗体、抗フィブリン抗体、抗ケラチン抗体および抗Ｔｎ−抗原抗体からなる群から選択される請求項８記載の方法。
【図１】
【図２】
【図３ａ】
【図３ｂ】
【図４ａ】
【図４ｂ】
【図５】
【図２】
【図３ａ】
【図３ｂ】
【図４ａ】
【図４ｂ】
【図５】
【公表番号】特表２０１３−５０１０７５（Ｐ２０１３−５０１０７５Ａ）
【公表日】平成２５年１月１０日（２０１３．１．１０）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１２−５２３９８３（Ｐ２０１２−５２３９８３）
【出願日】平成２２年８月６日（２０１０．８．６）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２０１０／０４４７６０
【国際公開番号】ＷＯ２０１１／０３１３９７
【国際公開日】平成２３年３月１７日（２０１１．３．１７）
【出願人】（５０９０１２６２５）ジェネンテック， インコーポレイテッド (357)
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２５年１月１０日（２０１３．１．１０）
【国際特許分類】
【出願日】平成２２年８月６日（２０１０．８．６）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２０１０／０４４７６０
【国際公開番号】ＷＯ２０１１／０３１３９７
【国際公開日】平成２３年３月１７日（２０１１．３．１７）
【出願人】（５０９０１２６２５）ジェネンテック， インコーポレイテッド (357)
【Ｆターム（参考）】
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