癌の治療および診断のための組成物および方法
本発明は、癌の治療、特徴付け、および診断のための組成物ならびに方法に関する。具体的には、本発明は、充実性腫瘍幹細胞に関連する遺伝子発現プロファイル、ならびに充実性腫瘍幹細胞の診断、特徴付け、および治療に有用な新規の幹細胞癌マーカーを提供する。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
a）被験体から組織試料を提供する工程、および
b）該組織試料における充実性腫瘍幹細胞の有無が測定されるような条件下で表4〜8の少なくとも一つの幹細胞癌マーカーを該組織試料において検出する工程
を含む、充実性腫瘍幹細胞を検出するための方法。
【請求項２】
検出工程が、少なくとも一つの幹細胞癌マーカーの発現レベルを測定する工程を含む、請求項1記載の方法。
【請求項３】
検出工程が、少なくとも一つの幹細胞癌マーカーのmRNA発現を検出する工程を含む、請求項1記載の方法。
【請求項４】
検出工程が、少なくとも一つの幹細胞癌マーカーのポリペプチド発現を検出する工程を含む、請求項1記載の方法。
【請求項５】
被験体がヒトの被験体を含む、請求項1記載の方法。
【請求項６】
組織試料が腫瘍組織を含む、請求項1記載の方法。
【請求項７】
被験体に予後を提供する工程C）をさらに含む、請求項1記載の方法。
【請求項８】
少なくとも一つの幹細胞癌マーカーが表8に由来する、請求項1記載の方法。
【請求項９】
少なくとも一つの幹細胞癌マーカーが、Bmi-1、eed、easyh1、easyh2、rnf2、yy1、smarcA3、smarcA5、smarcD3、smarcE1、mllt3、FZD1、FZD2、FZD3、FZD4、FZD6、FZD7、FZD8、FZD9、FZD10、WNT2、WNT2B、WNT3、WNT5A、WNT10B、WNT16、AXIN1、BCL9、MYC、および(TCF4)からなる群より選択される、請求項1記載の方法。
【請求項１０】
表4〜8に示される少なくとも一つの幹細胞癌マーカーに対する少なくとも一つの薬剤を含む、生物学的有効量の組成物と充実性腫瘍の細胞とを接触させる工程を含む、充実性腫瘍の大きさを縮小する方法。
【請求項１１】
生物学的有効量が、充実性腫瘍において充実性腫瘍幹細胞の細胞死を惹起するまたは増殖を阻害するのに十分な量である、請求項10記載の方法。
【請求項１２】
少なくとも一つの薬剤が抗体、ペプチド、または小分子である、請求項10記載の方法。
【請求項１３】
抗体、ペプチドまたは小分子が、少なくとも一つの幹細胞癌マーカーの細胞外ドメインに向けられたものである、請求項12記載の方法。
【請求項１４】
少なくとも一つの幹細胞癌マーカーが、Bmi-1、eed、easyh1、easyh2、rnf2、yy1、smarcA3、smarcA5、smarcD3、smarcE1、mllt3、FZD1、FZD2、FZD3、FZD4、FZD6、FZD7、FZD8、FZD9、FZD10、WNT2、WNT2B、WNT3、WNT5A、WNT10B、WNT16、AXIN1、BCL9、MYC、および(TCF4)からなる群より選択される、請求項10記載の方法。
【請求項１５】
表4〜8に示される少なくとも一つの幹細胞癌マーカーに対する少なくとも一つの薬剤を含む生物学的有効量の組成物と充実性腫瘍幹細胞とを接触させる工程を含む、充実性腫瘍幹細胞を死滅させる方法または該細胞の増殖を阻害する方法。
【請求項１６】
接触後に充実性腫瘍幹細胞の死または増殖予防を確認する工程をさらに含む、請求項15記載の方法。
【請求項１７】
細胞死がアポトーシスである、請求項16記載の方法。
【請求項１８】
少なくとも一つの幹細胞癌マーカーが、Bmi-1、eed、easyh1、easyh2、rnf2、yy1、smarcA3、smarcA5、smarcD3、smarcE1、mllt3、FZD1、FZD2、FZD3、FZD4、FZD6、FZD7、FZD8、FZD9、FZD10、WNT2、WNT2B、WNT3、WNT5A、WNT10B、WNT16、AXIN1、BCL9、MYC、および(TCF4)からなる群より選択される、請求項15記載の方法。
【請求項１９】
充実性腫瘍幹細胞が細胞表面マーカーCD44、ESA、またはB38.1を発現する、請求項15記載の方法。
【請求項２０】
癌細胞におけるβ-カテニンの局在性が主に核または主に細胞質であると決定されるように、癌細胞におけるβ-カテニンの存在を検出する工程を含む、腫瘍原性と非腫瘍原性の癌細胞を識別する方法。
【請求項２１】
β-カテニンの局在性が主に核である場合に癌細胞を腫瘍原性と同定する工程、またはβ-カテニンの局在性が主に細胞質である場合に癌細胞を非腫瘍原性と同定する工程をさらに含む、請求項20記載の方法。
【請求項１】
a）被験体から組織試料を提供する工程、および
b）該組織試料における充実性腫瘍幹細胞の有無が測定されるような条件下で表4〜8の少なくとも一つの幹細胞癌マーカーを該組織試料において検出する工程
を含む、充実性腫瘍幹細胞を検出するための方法。
【請求項２】
検出工程が、少なくとも一つの幹細胞癌マーカーの発現レベルを測定する工程を含む、請求項1記載の方法。
【請求項３】
検出工程が、少なくとも一つの幹細胞癌マーカーのmRNA発現を検出する工程を含む、請求項1記載の方法。
【請求項４】
検出工程が、少なくとも一つの幹細胞癌マーカーのポリペプチド発現を検出する工程を含む、請求項1記載の方法。
【請求項５】
被験体がヒトの被験体を含む、請求項1記載の方法。
【請求項６】
組織試料が腫瘍組織を含む、請求項1記載の方法。
【請求項７】
被験体に予後を提供する工程C）をさらに含む、請求項1記載の方法。
【請求項８】
少なくとも一つの幹細胞癌マーカーが表8に由来する、請求項1記載の方法。
【請求項９】
少なくとも一つの幹細胞癌マーカーが、Bmi-1、eed、easyh1、easyh2、rnf2、yy1、smarcA3、smarcA5、smarcD3、smarcE1、mllt3、FZD1、FZD2、FZD3、FZD4、FZD6、FZD7、FZD8、FZD9、FZD10、WNT2、WNT2B、WNT3、WNT5A、WNT10B、WNT16、AXIN1、BCL9、MYC、および(TCF4)からなる群より選択される、請求項1記載の方法。
【請求項１０】
表4〜8に示される少なくとも一つの幹細胞癌マーカーに対する少なくとも一つの薬剤を含む、生物学的有効量の組成物と充実性腫瘍の細胞とを接触させる工程を含む、充実性腫瘍の大きさを縮小する方法。
【請求項１１】
生物学的有効量が、充実性腫瘍において充実性腫瘍幹細胞の細胞死を惹起するまたは増殖を阻害するのに十分な量である、請求項10記載の方法。
【請求項１２】
少なくとも一つの薬剤が抗体、ペプチド、または小分子である、請求項10記載の方法。
【請求項１３】
抗体、ペプチドまたは小分子が、少なくとも一つの幹細胞癌マーカーの細胞外ドメインに向けられたものである、請求項12記載の方法。
【請求項１４】
少なくとも一つの幹細胞癌マーカーが、Bmi-1、eed、easyh1、easyh2、rnf2、yy1、smarcA3、smarcA5、smarcD3、smarcE1、mllt3、FZD1、FZD2、FZD3、FZD4、FZD6、FZD7、FZD8、FZD9、FZD10、WNT2、WNT2B、WNT3、WNT5A、WNT10B、WNT16、AXIN1、BCL9、MYC、および(TCF4)からなる群より選択される、請求項10記載の方法。
【請求項１５】
表4〜8に示される少なくとも一つの幹細胞癌マーカーに対する少なくとも一つの薬剤を含む生物学的有効量の組成物と充実性腫瘍幹細胞とを接触させる工程を含む、充実性腫瘍幹細胞を死滅させる方法または該細胞の増殖を阻害する方法。
【請求項１６】
接触後に充実性腫瘍幹細胞の死または増殖予防を確認する工程をさらに含む、請求項15記載の方法。
【請求項１７】
細胞死がアポトーシスである、請求項16記載の方法。
【請求項１８】
少なくとも一つの幹細胞癌マーカーが、Bmi-1、eed、easyh1、easyh2、rnf2、yy1、smarcA3、smarcA5、smarcD3、smarcE1、mllt3、FZD1、FZD2、FZD3、FZD4、FZD6、FZD7、FZD8、FZD9、FZD10、WNT2、WNT2B、WNT3、WNT5A、WNT10B、WNT16、AXIN1、BCL9、MYC、および(TCF4)からなる群より選択される、請求項15記載の方法。
【請求項１９】
充実性腫瘍幹細胞が細胞表面マーカーCD44、ESA、またはB38.1を発現する、請求項15記載の方法。
【請求項２０】
癌細胞におけるβ-カテニンの局在性が主に核または主に細胞質であると決定されるように、癌細胞におけるβ-カテニンの存在を検出する工程を含む、腫瘍原性と非腫瘍原性の癌細胞を識別する方法。
【請求項２１】
β-カテニンの局在性が主に核である場合に癌細胞を腫瘍原性と同定する工程、またはβ-カテニンの局在性が主に細胞質である場合に癌細胞を非腫瘍原性と同定する工程をさらに含む、請求項20記載の方法。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【公表番号】特表２００７−５１６６９３（Ｐ２００７−５１６６９３Ａ）
【公表日】平成１９年６月２８日（２００７．６．２８）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００６−５３３６３３（Ｐ２００６−５３３６３３）
【出願日】平成１６年６月９日（２００４．６．９）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００４／０１８２６６
【国際公開番号】ＷＯ２００５／００５６０１
【国際公開日】平成１７年１月２０日（２００５．１．２０）
【出願人】（５９７０３９０７６）ザ・リージェンツ・オブ・ザ・ユニバーシティ・オブ・ミシガン (14)
【氏名又は名称原語表記】ＴＨＥ ＲＥＧＥＮＴＳ ＯＦ ＴＨＥ ＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹ ＯＦ ＭＩＣＨＩＧＡＮ
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成１９年６月２８日（２００７．６．２８）
【国際特許分類】
【出願日】平成１６年６月９日（２００４．６．９）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００４／０１８２６６
【国際公開番号】ＷＯ２００５／００５６０１
【国際公開日】平成１７年１月２０日（２００５．１．２０）
【出願人】（５９７０３９０７６）ザ・リージェンツ・オブ・ザ・ユニバーシティ・オブ・ミシガン (14)
【氏名又は名称原語表記】ＴＨＥ ＲＥＧＥＮＴＳ ＯＦ ＴＨＥ ＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹ ＯＦ ＭＩＣＨＩＧＡＮ
【Ｆターム（参考）】
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