ＩＬ−１３要素及びＴ細胞エピトープを含む免疫原組成物並びにその治療上の使用
本発明は、単離された免疫原並びにIL−13の中和により治療可能な疾患、例えばCOPD、喘息および、花粉症、接触アレルギー、アトピー性皮膚炎などのアトピー性障害の治療におけるこれらの使用に関する。特に本発明は、IL−13の天然型のまたは突然変異型のアミノ酸配列と、IL−13配列に挿入もしくは結合された、またはキャリアーポリペプチド中に存在する外来Tヘルパーエピトープとを含む免疫原を用いた哺乳動物のワクチン接種によって、IL−13に対する免疫応答を生じさせることによる、IL−13の生物学的効果の中和に関する。また本発明は、本発明の免疫原をコードするポリヌクレオチド配列を含むDNAワクチンも提供する。本発明はさらに、そのような免疫原を含む医薬組成物、医療へのそれらの使用、およびそれらを製造する方法に関する。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、単離された免疫原、並びにIL−13の中和により治療可能な疾患、例えばCOPD、喘息および、花粉症、接触アレルギー、アトピー性皮膚炎などのアトピー性疾患の治療におけるそれらの使用に関する。最も好ましくは、免疫原は喘息の治療に使用される。特に本発明は、IL−13の天然型のまたは突然変異型のアミノ酸配列と、IL−13配列に挿入もしくは結合された、またはキャリアーポリペプチド中に存在する外来Tヘルパーエピトープとを含む免疫原を用いた哺乳動物のワクチン接種によって、IL−13に対する免疫応答を生じさせることによる、IL−13の生物学的効果の中和に関する。また本発明は、本発明の免疫原をコードするポリヌクレオチド配列を含むDNAワクチンも提供する。本発明はさらに、そのような免疫原を含む医薬組成物、医療へのそれらの使用、およびそれらを製造する方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
COPDは呼吸器管疾患を指す包括的な用語であり、喘息に類似した症状を示し、同一薬により治療される。COPDは慢性、進行性、かつ大部分は回復不能な気流閉塞により特徴付けられる。該疾患の経過に対する個体の寄与は知られていないが、この症例の原因の90％は喫煙であると考えられている。症状には、咳、慢性気管支炎、息切れ、および呼吸器充血が含まれる。最終的にこの疾患は重篤な身体障害および死を招く。
【０００３】
喘息は慢性的肺疾患であり、下気道の炎症を原因とし、再発性の呼吸障害により特徴付けられる。患者の気道は症状がない時でさえ、常にある程度鋭敏でありかつ腫れているかまたは炎症を起こしている。炎症は気道を狭め、肺の内外の空気の流れを減少させ、呼吸困難にし、喘鳴、胸苦しさおよび咳に導く。喘息はアレルゲン（例えばチリダニ、花粉、カビ）、刺激原（例えば煙、蒸気、強力な臭気）、呼吸器感染、運動および乾燥した天候に対する高感受性が誘因となる。そのような誘因は気道を刺激し、気道の内層はなおさら炎症することで腫れあがり、そして粘液が気道を塞ぎ、呼吸が困難かつ圧迫状態になるまで気道の周りの筋肉が締め付けられ、喘息の症状が現れる。
【０００４】
アトピー性疾患は、遺伝性でありかつしばしば同時に起こる疾患群を指し、喘息および花粉症、アトピー性皮膚炎などのアレルギーを含む。アトピー性皮膚炎は、皮膚に影響する慢性疾患である。アトピー性皮膚炎において、皮膚は極端に痒みを生じ、炎症し、発赤し、腫れあがり、ひび割れ、滲出し、痂皮化し、そして皮がむける。アトピー性皮膚炎はほとんどの場合乳児および幼い子供に影響するが、青年期まで続くかまたは後年になって初めて現れる可能性がある。ほとんどの場合、病状の再燃または発赤と呼ばれる疾患が悪化する期間と、それに続く寛解と呼ばれる皮膚が完全に改善または治癒する期間が存在する。アトピー性皮膚炎を有する多くの子供は、彼らが年をとる際に疾患の永久的な寛解を経験するが、彼らの皮膚は多くの場合、乾燥し、かつ刺激を受け易いままである。環境的要因は、アトピー性疾患の形質を遺伝した個体の生活において、常にアトピー性皮膚炎の症状をもたらし得る。アトピー性皮膚炎はしばしば「湿疹」と称され、多くのタイプの皮膚炎に対する一般的用語である。アトピー性皮膚炎は、多くのタイプの湿疹の最も共通するものである。いくつかは非常に似通った症状を有する。
【０００５】
皮膚がアトピー性皮膚炎に冒される仕方は、ひっ掻きの種類と、それによる皮膚感染症によって変化し得る。この疾患を有する一部の人は、赤く皮がむけた皮膚を発症し、皮膚における免疫系が非常に活性化されている。他の者は頻繁に掻きそして擦る結果として、厚く堅い皮膚を発症する。この状態を苔癬化と呼ぶ。さらに他の者は皮膚上に丘疹、または小さく隆起したこぶを発症する。丘疹は掻かれると、口が開き（擦傷）そして痂皮化し、感染し得る。
【０００６】
多くの要因または条件がアトピー性皮膚炎の症状を悪化させる可能性があり、すでに皮膚で過剰活性な免疫系をさらに誘発し、掻痒周期を悪化させ、皮膚へのダメージが増加する。これらの悪化要因は2つの主要なカテゴリー：刺激原（羊毛または合成繊維、目が粗い若しくは肌に合わない衣類、石鹸および洗剤、一部の香水および化粧品、塩素、鉱油、一部の溶媒、埃または砂など）とアレルゲン（花粉、犬または猫のふけ、およびチリダニアレルゲンなど）に分類することができる。情動的要因および一部の感染もアトピー性皮膚炎に影響し得る。
【０００７】
アトピー性皮膚炎による発赤が生じた場合、いくつかの手段を症状の治療に用いることができる。局所的なクリームとしてコルチコステロイドが最も頻繁に使用される治療剤であるが、全身投与も一部の重い症例の場合に使用されている。時には市販の製剤が用いられるが、多くの場合、医師はより強力なコルチコステロイドのクリームまたは軟膏を薦めるであろう。共通して推薦されるコルチコステイドの一例はプレドニソンである。局所的なコルチコイドの繰返しまたは長期にわたる使用の副作用には、皮膚の薄化、感染、（子供における）成長抑制、および皮膚上の張り線（stretch marks）が含まれ得る。皮膚感染を治療する抗生物質は、軟膏中で直接皮膚に塗布し得るが、通常は口から摂取する場合がより効果的である。紫外線AまたはB光波、あるいは両方を同時に用いる光線療法（光による治療）は、ある程度の年のいった子供（12歳以上）および成人における皮膚炎を穏やかに和らげるための治療に効果的であり得る。成人において、シクロスポリンなどの免疫抑制剤も、他のあらゆる療法形態による対応に失敗している重症のアトピー皮膚炎の治療に用いられている。シクロスポリンの副作用は高血圧、吐気、嘔吐、腎機能障害、頭痛、刺痛もしくはしびれ、および癌や感染の可能な危険性の増加を含み得る。
【０００８】
したがって不満足な医療に対するニーズと治療に存在する副作用のために、一般にアトピー性疾患の代替的な治療のニーズ、および特に喘息およびアトピー性皮膚炎の治療のためのニーズがある。
【０００９】
IL−13はIL−4と密接に関連するTh2型サイトカインである。近年の多くの論文で、推進的な病理学において、アレルゲン性喘息のオボアルブミンモデルにおけるIL−13の役割が規定されている(Wills-Karpら, 1998, Science 282:2258-2261； Grunigら, 1998, Science 282:2261-2263)。この研究の中で、オボアルブミンに予め感作されたマウスに、IL−13と結合し、かつ中和する可溶性IL−13レセプターを注射した。処置群において、アセチルコリンチャレンジに対する気道過敏症を減少させた。組織分析は、処置されたマウスがコントロール中に見られる杯状細胞の化生（metaplasia）を回復したことを示した。補完的な実験においては、肺のIL−13レベルは、トランスジェニックマウス中で過剰発現させることによって、または野生型マウスの気管にタンパク質を注入することによって高められた。いずれの設定においても、気道過敏症、好酸球の浸潤および粘液産生の増加が見られた(Zhuら, 1999, J.Clin.Invest. 103:779-788)。
【００１０】
成熟型ヒトIL−13の配列を配列番号１に記載し、また図1に示す。
【００１１】
成熟型マウスIL−13の配列を配列番号2に記載し、また図2に示す。
【００１２】
数種の哺乳動物種およびヒト以外の霊長類由来のIL−13の配列を図3および図4（配列番号3〜9）に示す。
【００１３】
モノクローナル抗体の産生、投与および寛容に関連する種々の問題の結果から、ワクチン接種により、患者自身の免疫系に、適切な特異性を有する内因性の抗体を作るように指示する方法に注目が増している。しかし、哺乳動物は、血清中に存在する自己タンパク質に対する高力価の抗体を一般的に有しておらず、これはその免疫系がそれらの形成を妨げる恒常性機構を含むからである。抗体の「寛容」メカニズムの重要性は、骨格筋のニコチン性アセチルコリンレセプターに対する自己抗体が脱力感および疲労を引き起こす重症筋無力症などの疾患によって説明される（Drachman, 1994, N Engl J Med 330:1797-1810）。
【００１４】
多くの技術が自己抗原に対する「寛容」を破壊する目的で構築されている。1つの技術は、自己タンパク質（またはそれに由来するペプチド）をキーホールリンペットヘモシアニン（keyhole limpet haemocyanin）などの高免疫原性キャリアータンパク質に化学的に交差結合することを含む(「Antibodies: A laboratory manual」 Harlow, E and Lane D. 1988. Cold Spring Harbor Press)。
【００１５】
キャリアータンパク質技術の変形は、キャリアータンパク質（例えばB型肝炎コアタンパク質）と自己タンパク質（「免疫原性ペプチドのキャリアーとしてのB型肝炎ウイルスのコア抗原（The core antigen of hepatitis B virus as a carrier for immunogenic peptide）」，Biological Chemistry. 380(3):277-83, 1999）の両方を含む融合タンパク質をコードする遺伝子の構築を含む。融合遺伝子は核酸ワクチンの一部として直接的に投与されてもよい。あるいは、該遺伝子は、適当な宿主細胞中でin vitroで発現されてもよく、遺伝子産物は精製され、その後、アジュバントとともにまたはアジュバントなしで、慣用のワクチンとして送達される。
【００１６】
別の手法がDalumと共同研究者により記載されており、ここでは単一のMHCクラスIIによって制限されたエピトープを標的分子に挿入する。彼らはユビキチン(Dalumら, 1996, J Immunol 157:4796-4804; Dalumら, 1997, Mol Immunol 34:1113-1120)およびサイトカインTNF(Dalumら, 1999, Nature Biotech 17:666-669)に対する抗体を誘導するためのこの方法の使用を実証した。その結果、全てのT細胞ヘルプは、この単一エピトープまたは接合部配列のいずれかから生じるはずである。そのような手法はEP 0 752 886 B1, WO 95/05849、およびWO 00/65058でも記載されている。
【００１７】
一部にワクチン接種を包含する、数種のサイトカインの中和のための治療法が公知である。WO 00/65058は、サイトカインIL−5の機能をダウンレギュレートする方法、および喘息の治療におけるその使用を記載する。この研究において、IL−5配列が、いくつかの技術によりそれを免疫原性にさせるよう改変され、その中に、IL−5のＢ細胞エピトープを維持しつつ、外来のＴ細胞エピトープが補充されたIL−5免疫原の記載がある。WO 01/62287は、潜在的抗原の長いリスト中に、アレルギーまたは喘息ワクチンの使用のためのIL−13を開示している。WO 00/06937はワクチン抗原として使用するために機能的に不活性化されたサイトカイン誘導体を開示している。キメラIL−13免疫原は、同時係属の特許出願WO 02/070711に開示されている。
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【００１８】
喘息に対する改良された免疫療法および中和する抗IL−13免疫応答を引き出す改良された免疫原が提供されることに対するニーズが依然として存在する。
【課題を解決するための手段】
【００１９】
本発明は、改変された「自己」のIL−13免疫原であって、該IL−13免疫原が外来のT細胞ヘルパーエピトープを含むように改変されている上記免疫原を含む医薬組成物を提供する。医薬組成物は好ましくはヒトの治療において使用され、そしてこの組成物中のIL−13配列は、ヒト配列、またはヒトIL−13を認識する免疫応答を生じさせることが可能な他の配列であり、T細胞ヘルパーエピトープはヒト自己タンパク質について「外来」である。好ましくはTヘルパーエピトープも別の種由来の別のIL−13配列について外来である。しかし、動物用の医薬品を除外せず、例えばイヌまたは他の獣医学種の医薬品は、ヒトワクチンについて上述したものと類似した様式で作製され得る。
【００２０】
本発明の組成物は、IL−13要素およびT細胞ヘルプを提供するための付加的要素を含む。
【発明を実施するための最良の形態】
【００２１】
IL-13要素
最も広い形態のIL−13要素とは、IL−13の生物学的作用を認識し、かつ中和する免疫応答を推進することが可能な全ての配列である。好ましくは、該IL−13はヒトIL−13である。
【００２２】
本発明のこの関連において、IL−13の完全な配列、またはその機能的に同等のフラグメントを用いてもよい。したがって、本文中でのIL−13の参照は、完全配列、その断片または末端切断型を含み得る。
【００２３】
IL−13要素は、天然のIL−13配列またはその突然変異型を含むことができる。したがって、IL−13配列は、例えば天然ヒトIL−13またはその断片であり得る。
【００２４】
本発明の別の一実施形態において、免疫原はキメラIL−13配列を含み、該キメラIL−13配列には、1以上のヒト配列アミノ酸を、別の哺乳動物種由来のIL−13配列内の同じ位置で見られる同等のアミノ酸に取り替えるための置換突然変異が含まれる。ヒトワクチンの免疫原に関し、キメラ配列の目的は、免疫原とヒト天然IL−13との間でアミノ酸配列の多様性を最大にすることであるが、2種の組成間で最大限の形状およびコンホーメーションの相同性は維持される。キメラ免疫原は、表面に露出しないと予想される領域でみられるアミノ酸の置換によってこれを達成する。最も好ましくは、このアミノ酸は、他の哺乳動物種由来のIL−13配列内での同等の位置でみられるアミノ酸配列で置換される。この方法において、配列の多様性は、免疫原の全体的な形状/立体構造への最小の変化により達成される。
【００２５】
本発明の一態様において、αへリックス領域に関連する領域中の置換突然変異を含み、該置換はヒトアミノ酸を、異なる哺乳動物種のIL−13配列内の同一位置に現れるアミノ酸で置換することを含む、ヒトIL−13免疫原が提供される。
【００２６】
最も好ましくは、IL−13配列内の複数の部位で置換突然変異が存在し、ここで少なくとも2以上の突然変異部位が、ヒト以外の異なる哺乳動物種からのアミノ酸を含む置換、より好ましくは、ヒト以外の異なる3以上の哺乳動物種からのアミノ酸を含む置換、および最も好ましくは、ヒト以外の異なる4以上の哺乳動物種からのアミノ酸を含む置換を含む。
【００２７】
好ましくは、置換は、異種間の高保存領域：3PVP, 12ELIEEL, 19NITQ, 28LCN, 32SMVWS, 50SL, 60AI, 64TQ, 87DTKIEVA, 99LL, 106LF、の少なくとも6ヶ所では生じない。
【００２８】
本発明の免疫原の好適なIL−13要素は、天然ヒトIL−13と類似するコンホーメーション形を有するヒトキメラIL−13配列であり、ヒトに投与された際にその免疫原性を高めるために十分なアミノ酸配列の多様性を有しており、該キメラIL−13免疫原が、
(a) 以下のαへリックス領域：
PSTALRELIEELVNIT、MYCAALESLI、KTQRMLSGFまたはAQFVKDLLLHLKKLFRE、の少なくとも2ヶ所に置換突然変異を含む、
(b) 以下の異種間の高保存領域、3PVP, 12ELIEEL, 19NITQ, 28LCN, 32SMVWS, 50SL, 60AI, 64TQ, 87DTKIEVA, 99LL, 106LF、の少なくとも6ヶ所を非突然変異形態で含む、および
(c) 場合により、残りのアミノ酸のいずれかに突然変異を含む、
（ここで、工程a、bまたはcで行われた全ての置換が構造保存置換である）ヒトIL−13の配列を有することを特徴とする。
【００２９】
列挙されたアミノ酸に対する数字の接頭辞は、成熟型ヒトIL−13アミノ酸配列の位置番号を指し、第１の残基「G」に番号2を割り付ける。
【００３０】
上述のキメラIL−13要素の工程(a)に関し、好ましくは少なくとも２ヶ所、より好ましくは少なくとも３ヶ所、そして最も好ましくは４ヵ所全てのαへリックス領域が、少なくとも１の置換突然変異を含む。工程(b)に関し、前記領域の好ましくは少なくとも７ヶ所、より好ましくは少なくとも８ヶ所、より好ましくは少なくとも９ヶ所、より好ましくは少なくとも10ヶ所、そして最も好ましくは11ヵ所全ての領域が突然変異されていない。
【００３１】
好ましくは、上述のキメラIL−13要素におけるそれらの置換または突然変異の50％以上が、ヒト以外のIL−13配列内の同等位置からのアミノ酸を含む。より好ましくは、置換の60、70または80％以上が、ヒト以外の哺乳動物のIL−13配列内の同等位置からのアミノ酸を含む。最も好ましくは、置換または突然変異の各々が、ヒト以外の哺乳動物のIL−13配列内の同等位置からのアミノ酸を含む。
【００３２】
さらにキメラヒトIL−13要素に関し、好ましくはそれらの置換または突然変異の50％以上が、立体構造中のαへリックスであると予想されるヒトIL−13の領域内で生じる。より好ましくは、該置換または突然変異の60、70または80％以上が、立体構造中のαへリックスであると予想されるヒトIL−13の領域内で生じる。最も好ましくは、置換または突然変異の各々が、立体構造中のαへリックスであると予想されるヒトIL−13の領域内で生じる。
【００３３】
さらにキメラヒトIL−13要素に関し、好ましくは該ヒトIL−13配列が２〜20個の置換、より好ましくは6〜15個の置換、そして最も好ましくは13個の置換を含む。
【００３４】
ヒトIL−13ワクチンの場合、IL−13免疫原はオーソロガスなIL−13配列（マウスのIL−13配列など）を基礎とすることができ、該マウスのB細胞エピトープ（表面に露出した領域）は、同等のヒト配列に置換される。この実施形態において、マウスの「主鎖（backbone）」は、外来のT細胞エピトープ、さらにキメラ配列の末端または配列内のいずれかに付加される補足的で雑多な（promiscuous）T細胞エピトープ（P2またはP30など）を提供する。
【００３５】
好適なキメラヒトIL−13免疫原は、ヒトIL−13の配列を含み、そのアミノ酸配列は、ヒト以外の種のIL−13配列内の同等位置、すなわち8T, 11R, 18V, 49E, 62K, 66M, 69G, 84H, 97K, 101L, 105K, 109E, 111Rの13ヶ所の少なくとも6ヶ所、に存在するアミノ酸の特性を示す置換または保存的置換を含む。最も好ましくは、そのようなキメラヒトIL−13免疫原は以下の置換の少なくとも6個、好ましくは全てを含む。
【００３６】
【００３７】
これらの列挙された置換のそれぞれを含むキメラIL−13は、好適なIL−13要素（免疫原1、配列番号10）であり、図5に示されている。別の非常に好ましいIL−13要素は免疫原11（配列番号20、図15参照）、免疫原12（配列番号21、図16参照）および免疫原13（配列番号22、図17参照）である。
【００３８】
IL−13要素は、場合により、免疫原の生物学的活性を破壊する突然変異をさらに含んでいてもよい。以下の置換はヒトIL−13の生物活性を不活性化するのに用いることができる：E 12からI, SまたはY； E12からK； R 65からD；S 68からD； R 108からD。
【００３９】
本発明の特定の態様において、天然IL−13配列の免疫原性フラグメントは、B型肝炎コア粒子における免疫原性ペプチドの提示、または上述のキメラ免疫原との関連において使用されうる。これらの関連において、ヒトIL−13配列の免疫原フラグメントは、好ましくはヒトIL−13配列中にB細胞エピトープを、好ましくは下記の短い配列：
GPVPPSTA
ITQNQKAPLCNGSMVWSINLTAGM
INVSGCS
FCPHKVSAGQFSSLHVRDT
LHLKKLFREGRFN
の少なくとも1以上を含む。
【００４０】
本発明のポリペプチドは、例えばアミノ酸の置換、挿入または欠失などの突然変異により、所望の性質（精製を容易にするまたは免疫原性を増加するシーケンスタグの付加など）を付加するために、あるいは所望でない性質（受容体における望ましくない作動活性など）もしくは膜貫通ドメインを除去するために、さらに改変されてもよい。特に本発明はポリヒスチジンタグなど精製を容易にする融合パートナーまたは発現を高めるGST発現パートナーを具体的に意図している。好適なタグまたは発現パートナーは、IL−13分子のC末端と融合されるヒトIgG1の免疫グロブリンFCである。
【００４１】
生物種間の高い保存性レベルのために突然変異されないままの領域を除き、他の突然変異はIL−13配列中で生じてもよい。好ましくはそのような突然変異は保存的置換である。「保存的置換（conservative substitution）」は、アミノ酸が、ペプチド化学の分野の当業者が実質的に未変化のポリペプチドの二次構造およびヒドロパシー特性(hydropathic nature)を予想し得るような、類似の性質を有する他のアミノ酸に置換されるものをいう。
【００４２】
例えば、特定のアミノ酸は、タンパク質構造中で、例えば抗体の抗原結合領域または基質分子上の結合部位などの構造との相互作用的な結合能の認知され得る欠失を伴わない他のアミノ酸によって置換されてもよい。そのタンパク質の生物学的な機能活性を規定するのはタンパク質の相互作用能および性質であるため、特定のアミノ酸配列の置換は、タンパク質配列中、およびもちろんその根底にあるDNAコード配列中で作ることができ、それでもなお類似の性質を有するタンパク質を獲得させる。したがって、多様な変化を、開示される組成物のペプチド配列、またはそれらの生物学的有用性または活性の認知され得る欠失を伴わない該ペプチドをコードする対応するDNA配列中に作製し得ることが意図される。
【００４３】
そのような変化を作製する場合、アミノ酸のヒドロパシー指数（hydropathic index）が考慮されてもよい。タンパク質に相互作用的な生物学的機能を与える場合、アミノ酸のヒドロパシー指数の重要性は当業界で一般によく理解されている(KyteおよびDoolittle、1982、参照により本明細書中に組み入れる)。アミノ酸の相対的なヒドロパシー特性が、得られるタンパク質の二次構造に寄与し、次にその二次構造によって、別の分子、例えば酵素、基質、レセプター、DNA、抗体、抗原などと該タンパク質との相互作用を規定することが受け入れられている。各アミノ酸は、その疎水度および電荷特性に基づくヒドロパシー指数が割り付けられている(Kyte およびDoolittle, 1982)。それらの値は：イソロイシン（＋4.5）；バリン（＋4.2）；ロイシン（＋3.8）；フェニルアラニン（＋2.8）；システイン/シスチン（＋2.5）；メチオニン（＋1.9）；アラニン（＋1.8）；グリシン（−0.4）；トレオニン（−0.7）；セリン（−0.8）；トリプトファン（−0.9）；チロシン（−1.3）；プロリン（−1.6）；ヒスチジン（−3.2）；グルタミン酸（−3.5）；グルタミン（−3.5）；アスパラギン酸（−3.5）；アスパラギン（−3.5）；リシン（−3.9）；およびアルギニン（−4.5）である。
【００４４】
特定のアミノ酸が、類似するヒドロパシー指数またはスコアを有する他のアミノ酸によって置換され、その結果類似する生物学的活性を有するタンパク質が生じる、すなわち、生物学的に同等機能のタンパク質が依然として得られることは当業界で公知である。そのような変化を作る場合、そのヒドロパシー指数が±２以内であるアミノ酸の置換が好ましく、±1以内のアミノ酸の置換が特に好ましく、そして±0.5以内のアミノ酸の置換がなお一層特に好ましい。同類のアミノ酸の置換が親水性に基づいて効果的にされ得ることも当業界で理解されている。米国特許4,554,101（特にその全体を参照により本明細書中に組み入れる）は、その隣接するアミノ酸の親水性によって支配されるタンパク質の局所的な最大平均親水性は、そのタンパク質の生物学的性質と相関することを述べている。
【００４５】
米国特許4,554,101で詳述されているように、以下の親水性値がアミノ酸残基に対して割り付けられている：アルギニン（＋3.0）；リシン（＋3.0）；アスパラギン酸（＋3.0±1）；グルタミン酸（＋3.0±1）；セリン（＋3.0）；アスパラギン（＋0.2）；グルタミン（＋0.2）；グリシン（0）；トレオニン（−0.4）；プロリン（−0.5±1）；アラニン（−0.5）；ヒスチジン（−0.5）；システイン（−1.0）；メチオニン（−1.3）；バリン（−1.5）；ロイシン（−1.8）；イソロイシン（−1.8）；チロシン（−2.3）；フェニルアラニン（−2.5）；トリプトファン（−3.4）。アミノ酸を類似する親水値を有する他のアミノ酸に置換することができ、そしてなおも生物学的同等物、特に、免疫原的に同等なタンパク質を得ることは理解されている。そのような変化において、その親水性値が±2以内のアミノ酸の置換が好ましく、±1以内のアミノ酸の置換が特に好ましく、±0.5以内のアミノ酸の置換がなお一層特に好ましい。
【００４６】
上で概説したように、アミノ酸置換はそれゆえ、アミノ酸側鎖の置換基の相対的類似性、例えばそれらの疎水性、親水性、電荷、サイズなどに基づくのが一般的である。前述の様々な特性を考慮に入れた例示的な置換は当業者によく知られており、これには、アルギニンとリシン；グルタミン酸とアスパラギン酸；セリンとトレオニン；グルタミンとアスパラギン；ならびにバリンとロイシンとイソロイシンが含まれる。これらは好適な保存的置換である。
【００４７】
アミノ酸置換はさらに、残基の極性、電荷、溶解性、疎水性、親水性および/または両親媒性質の類似性に基づいて行われてもよい。例えば負電荷のアミノ酸にはアスパラギン酸およびグルタミン酸が含まれ、正電荷のアミノ酸にはリシンおよびアルギニンが含まれ、そして類似する親水性値を有する非電荷の極性頭部基（polar head group）を有するアミノ酸にはロイシンとイソロイシンとバリン；グリシンとアラニン；アスパラギンとグルタミン；およびセリンとトレオニンとフェニルアラニンとチロシンが含まれる。保存的変化を示し得る他のアミノ酸グループには、(1)ala, pro, gly, glu, asp, gln, asn, ser, thr；(2)cys, ser, tyr, thr；(3) val, ile, leu, met, ala, phe；(4)lys, arg, his；および(5)phe, tyr, trp, hisが含まれる。
【００４８】
T細胞ヘルプを付与する要素
外来T細胞ヘルプを付与する要素は、本発明の免疫原を作製するためにIL−13要素に結合される。最も好ましいT細胞ヘルパーエピトープは、ヒト配列に対して外来であり、さらにヒト以外の哺乳動物由来のいずれのIL−13配列についても外来である。好ましくは、使用されるT細胞ヘルパーエピトープは小さいものであり、かつ合成、組換えもしくは分子生物学的手段による、IL−13配列の内部または末端での付加または置換事象によってIL−13配列に付加される。代替的に、T細胞ヘルパーエピトープは、IL−13ポリペプチドと、T細胞ヘルパーエピトープを含むキャリアータンパク質との化学的結合によって付加されてもよい。IL−13配列、またはその機能的に同等なフラグメントは、融合タンパク質内でT細胞ヘルパーエピトープと結合していてもよく、ここでその2つは、例えばIL−13配列を取り込むB型肝炎コアタンパク質のように、ともに組換え的に製造される。
【００４９】
小さなT細胞ヘルパーエピトープが使用される本発明の態様において、「外来のT細胞ヘルパーエピトープ」または「T細胞エピトープ」は、MHC II分子と結合し、動物種内でT細胞を刺激することができるペプチドである。好適な外来T細胞エピトープは雑多な(promiscuous)エピトープ、すなわち動物種または集団中で複数の異なるMHCクラスII分子と結合するエピトープである(Panina-Bordignonら, Eur.J.Immunol. 1989, 19:2237-2242；Reeceら, J.Immunol. 1993, 151:6175-6184; WO 95/07707)。
【００５０】
本発明の免疫原が複雑な非近交系のヒト集団において臨床的に効果的であるために、数種の外来T細胞エピトープを含ませることが有利であり得る。雑多なエピトープはこれと同様の効果を達成する別の方法であってもよく、これには破傷風トキソイド（例えばP2とP30エピトープ）、ジフテリアトキソイド、インフルエンザウイルスのヘムアグルチニン(HA)およびP.falciparumのCS抗原由来のものなどの天然のヒトT細胞エピトープが含まれる。本発明に用いるための最も好適なT細胞エピトープは、破傷風トキソイド由来のP2とP30である。
【００５１】
多くの雑多なT細胞エピトープは文献に記載されており、これにはWO 98/23635； Southwoodら, 1998 J. Immunol., 160: 3363-3373； Sinigagliaら, 1988, Nature, 336: 778-780； Rammenseeら, 1995, Immunogenetics, 41: 4, 178-228； Chiczら, 1993, J. Exp. Med., 178:27-47； Hammerら, 1993, Cell 74:197-203；および Falkら, 1994, Immunogenetics, 39: 230-242が含まれる。雑多なT細胞エピトープは、「PADRE」(WO 95/07707)などの人工配列でもあり得る。
【００５２】
異種T細胞エピトープ(heterologous T-cell epitope)は、好ましくは、ヒト体内で多くの個体が発現しているMHC II分子の1以上と結合するエピトープ群から選択される。例えば、特に意図されているエピトープは破傷風トキソイド由来のP2またはP30エピトープである（Panina - Bordignon Eur. J. Immunol 19 (12), 2237 (1989)）。好適な実施形態において、異種T細胞エピトープは破傷風トキシン由来のP2またはP30エピトープである。
【００５３】
P2エピトープは、QYIKANSKFIGITE配列を有し、破傷風トキシンのアミノ酸830〜843に対応する。
【００５４】
P30エピトープ（破傷風トキシンの残基947〜967）はFNNFTVSFWLRVPKVSASHLE配列を有する。FNNFTV配列は場合によっては欠失されてもよい。普遍的な別のTエピトープはPlasmodium falciparumに由来するスポロゾイト周囲蛋白、特にDIEKKIAKMEKASSVFNVVNS配列を有する378〜398領域、に由来し得る(Alexander J, (1994) Immunity 1 (9), p 751-761)。
【００５５】
別のエピトープは、残基288〜302でLSEIKGVIVHRLEGV配列を有する麻疹ウイルスの融合タンパクに由来する(Partidos CD, 1990, J. Gen. Virol 71(9) 2099-2105)。
【００５６】
さらに別のエピトープはB型肝炎ウイルスの表面抗原、特にFFLLTRILTIPQSLD配列を有するアミノ酸に由来する。
【００５７】
別のエピトープの組はジフテリア毒素に由来する。それらのペプチドの４ヵ所（アミノ酸271〜290、321〜340、331〜350、351〜370）は、該毒素のB断片のTドメイン内に位置し、そして残る2つはRドメイン(411〜430、431〜450)内に位置する。
【００５８】
PVFAGANYAAWAVNVAQVI
VHHNTEEIVAQSIALSSLMV
QSIALSSLMVAQAIPLVGEL
VDIGFAAYNFVESIINLFQV
QGESGHDIKITAENTPLPIA
GVLLPTIPGKLDVNKSKTHI
(Raju R., Navaneetham D., Okita D., Diethelm-Okita B., McCormick D., Conti-Fine B. M. (1995) Eur. J. Immunol. 25: 3207-14)。
【００５９】
T細胞ヘルプを与えるために特に好適な要素は、PCT/EP03/06096で開示される「CPC」（clyta-P2-clyta）と称される融合パートナーである。
【００６０】
最も好適な外来T細胞ヘルパーエピトープは、宿主免疫系により耐性でない点、およびそれらが別種（ワクチン接種を受けたものでない）由来のあらゆるIL−13配列に由来するまたはそれから選択される配列ではない点で「外来」である。
【００６１】
天然の自己IL−13が免疫原性キャリアーを有するTヘルパーエピトープと結合される本発明の態様において、その結合は当業界で周知の方法で実施され得る。したがって、例えば直接的な共有結合については、カルボジイミド、グルタルアルデヒドまたはＮ−[γ−マレイミドブチリルオキシ]サクシンイミドエステルを利用すること、CDAPおよびSPDPなどの市販の共通のヘテロ二官能性リンカー（heterobifunctional linker）（製造業者の説明書を用いる）を利用することが可能である。結合反応後、免疫原は透析法、ゲル濾過法、分画法などの手段によって容易に単離および精製される。
【００６２】
本発明の免疫原中で使用されるキャリアーのタイプは、当業者に容易に分かるであろう。本発明中で使用され得る限定的でないキャリアーのリストは、キーホールリンペットヘモシアニン（KLH）、ウシ血清アルブミン（BSA）などの血清アルブミン、破傷風もしくはジフテリア毒素（TTおよびDT）などの細菌性の不活性化毒素、またはその組換え断片（例えば、TTのC断片のドメイン1、DTのトランスロケーションドメイン）、あるいはツベルクリンの精製タンパク質誘導体（PPD）を含む。代替的にIL−13はリポソーム担体(liposome carriers)と直接コンジュゲートされてもよく、T細胞ヘルプを付与することが可能な免疫原をさらに含んでもよい。IL13対キャリアー分子の好適な比は1：1〜20：1（IL−13：キャリアー）程度であり、そして各キャリアーは3〜15個のIL−13分子を保持することが好ましい。
【００６３】
本発明の一実施形態において、好適なキャリアーはHaemophilus influenzae（EP 0 594 610 B1）由来のタンパク質Dである。タンパク質DはHaemophilus influenzae由来のIgD−結合性タンパク質でありForsgrenがその特許を受けている（WO91/18926、認可EP 0 594 610 B1）。いくつかの状況において、例えば、組換え免疫原発現系においては、タンパク質Dの断片、例えばタンパク質Dの3分の1（タンパク質DのN末端の100〜110アミノ酸を含む（GB 9717953.5））を用いるのが望ましいかもしれない。
【００６４】
IL−13またはその免疫原フラグメントを提供する別の好適な方法は、組換え融合分子に関係する。例えばEP 0 421 635 Bは、ウイルス様粒子中で外来ペプチド配列を提供するためのキメラヘパドナウイルスのコア抗原粒子の使用を記載する。したがって、本発明の免疫原は、B型肝炎コア抗原からなるキメラ粒子中に提供されるIL−13を含んでもよい。さらに、組換え融合タンパク質はIL−13、およびインフルエンザウイルスのNS1などのキャリアータンパク質を含んでもよい。本発明の一部を形成する組換え的に発現される全てのタンパク質において、前記免疫原をコードする核酸も本発明の一態様を形成する。
【００６５】
好適な免疫原
上述の節において、好適なIL−13要素の定義、およびT細胞ヘルプを付与する要素が説明されている。本発明の組成物について、本明細書はT細胞ヘルプを付与する要素の節からの個々の好適な各要素とIL−13要素の節からの個々の好適な各要素との組合せを開示することを意図する。特に好適な組合せは、免疫原1，11，12または13と、キャリアータンパク質もしくは雑多なT細胞ヘルパーエピトープとの組合せである。好適なキャリアータンパク質または雑多なT細胞ヘルパーエピトープはタンパク質D、CPC、P2またはP30を含む。
【００６６】
好適な免疫原を形成するための開示する要素の特に好適な組合せを下記に列挙する。
【００６７】
IL−13要素が天然ヒトIL−13であり、そしてT細胞ヘルプを付与する要素が雑多なT細胞エピトープである場合、好適な例は免疫原2（図6、配列番号11参照）を含む。この免疫原2にはタンパク質内に挿入されたP30（下線）を有するヒトIL−13が含まれる（ヒトIL−13のαへリックスCとDの間がループ領域に置換される）。
【００６８】
免疫原3（図7、配列番号12）はN末端でP30を有するヒトIL−13免疫原である。
【００６９】
免疫原4（図8、配列番号13）は、タンパク質内に挿入されたp30を有するマウスIL−13であり（マウスIL−13のαへリックスCとDの間のループ領域に置換される）、これはIL−13自己ワクチンのマウス版の一例である。p30領域は下線部である。
【００７０】
免疫原5（図9、配列番号14）はN末端にp30を有するマウスIL−13である。これはIL−13自己ワクチンのマウス版の一例である。p30領域は下線部であり、また成熟マウスのIL−13タンパク質配列のN末端に位置する。
【００７１】
IL−13要素がキメラIL−13免疫原として提供される特定の例は、免疫原6（図10、配列番号15）を含む。これはワクチンのキメラ形態のマウス版の一例であり、N末端に付加されたP30を有し、マウスB細胞の表面に露出したエピトープに移植された「ヒト主鎖」配列が存在する。
【００７２】
別の好適な免疫原は、ヒトキメラ免疫原IL−13「免疫原1」（配列番号10）を基礎とする。例えば、免疫原1は好適には、N末端にキャリアー「CPC」が融合され、免疫原7（配列番号16、図11参照）を形成する、または免疫原8（配列番号17、図12参照）について、N末端にタンパク質Dが融合される（タンパク質D融合領域はH.influenzaeタンパク質Dを含むアミノ酸S20〜T127に対応する（注、タンパク質DをコードするこのDNA配列は最適化されたコドンである））；またはN末端にP30が融合され、免疫原9（配列番号18、図13参照）を生じる。免疫原9は好適には、あらゆるIL−13の生物学的活性を妨げるためのE121突然変異をさらに含み、免疫原10（配列番号19、図14参照）を与える。
【００７３】
免疫原１〜10について示されるタンパク質およびDNAの配列は、細胞からの産生物の分泌を行うために要求されるシグナル配列のアミノ酸またはDNA配列を除いて示されている。したがって、好適には、前記配列はさらに、シグナル配列をさらに伴って提供される。DNAワクチンにおいて、シグナル配列はT細胞エピトープを含む非ヒト由来の配列であって、T細胞ヘルプをさらに付与するものであるのが特に好ましい。開示された好適な配列のいずれも、産生または精製を容易にする、例えば免疫グロブリンFc、6Hisなどの他の分子と融合した免疫原を発現するために有用であり得るため、終止コドンを有さない。
【００７４】
本明細書中で用いられる付番方式は、「GPVPP」におけるGが残基2を指し、そして残りのアミノ酸はそれに応じて番号が付される点で、IL−13の分野における通常の慣習に準拠している。
【００７５】
ワクチンを設計する方法
本発明の重要な態様において、IL−13活性の中和による治療を受けやすい疾患に罹患しているかあるいは罹り易い個体を治療するためのワクチンを設計する方法が提供される。そのような疾患には、COPD、喘息並びに花粉症、接触アレルギーおよびアトピー性皮膚炎などのアトピー性疾患が含まれる。
【００７６】
本明細書に開示する方法は、2つの主要な工程：1.キメラIL−13免疫原を設計すること、および2.あらゆるヒト自己エピトープについて外来であり、かつあらゆる哺乳動物のIL−13配列についても外来であるT細胞エピトープの供与源をIL−13免疫原に結合させること、を含む。
【００７７】
本背景において、当該方法は、
(a)ヒトIL−13の配列を取得し、αへリックス構造を形成すると予想される領域を同定すること、および
(b)ヒトIL−13の前記αへリックス領域内の配列を突然変異させることにより、保存的置換であるまたは異なる種のIL−13配列内の同等位置に見られるアミノ酸で、ヒト配列由来のアミノ酸を置換すること、および
(c)あらゆるヒトの自己エピトープについて外来であり、かつあらゆる哺乳動物のIL−13配列についても外来であるT細胞エピトープの供与源を結合または挿入すること、
を含む。
【００７８】
一般的原則として、当該方法の目的は免疫原と天然のヒトIL−13との間の最大限の配列多様性を有するキメラ配列を設計することであるが、2つの組成物間で最大限の形状及びコンホーメーションの相同性は維持される。キメラ免疫原は、表面から覆われると予想される領域において見られるアミノ酸を置換することによってこれを達成する。最も好ましくは、アミノ酸は別の哺乳動物種に由来するIL−13配列内の同等位置に見られるアミノ酸で置換される。この方法では、配列多様性は免疫原の全体的な形状/立体構造への最小の変化により達成される。
【００７９】
従って、キメラIL−13免疫原を設計する好ましい方法は、以下の工程を含む。
【００８０】
1．他の種由来のIL13配列を共に収集し、ClustalまたはPileupなどのツールを用いてアラインメントすること、
2．コレクションにわたって本質的に不変な位置内の突然変異を避けること(特に、3PVP, 12ELIEEL, 19NITQ, 28LCN, 32SMVWS, 50SL, 60AI, 64TQ, 87DTKIEVA, 99LL, 106LF)、
3．残りの配列では、へリックス領域(PSTALRELIEELVNIT、MYCAALESLI、KTQRMLSGF、AQFVKDLLLHLKKLFRE)において生じる突然変異を付与すること、
4．場合において、3または4において特定されていない領域が突然変異を含むこと、
5．突然変異は、他の種のIL13分子においてオーソロガスな位置で生じる残基または化学的に保存されるものを考慮することによって選択される。
【００８１】
分子モデリングは、立体衝突などによる全体的な分子の形状に影響を及ぼす可能性の低い特に有利な置換を選択するために使用し得る。
【００８２】
従って、天然のヒトIL−13と類似するコンホーメーション形を有し、その配列中にヒトに投与した際にその免疫原性を高めるために十分なアミノ酸配列の多様性を有しているヒトキメラIL−13免疫原の製造方法が提供され、該方法は以下の工程：
(a) ヒトIL−13の配列を取得すること、および以下のαへリックス領域：PSTALRELIEELVNIT, MYCAALESLI, KTQRMLSGFまたはAQFVKDLLLHLKKLFRE、
の少なくとも2ヶ所で、少なくとも１の置換突然変異を行うこと、
(b) 以下の異種間の高保存領域3PVP, 12ELIEEL, 19NITQ, 28LCN, 32SMVWS, 50SL, 60AI, 64TQ, 87DTKIEVA, 99LL, 106LFの少なくとも6ヶ所を維持すること、
(c) 場合により、残りのいずれかのアミノ酸を突然変異すること、および
(d) あらゆるヒト自己エピトープについて外来であり、かつあらゆる哺乳動物IL−13配列についても外来であるT細胞エピトープの供給源を結合すること、
を含み、工程a、bまたはcで行われた全ての置換が構造的保存置換であることを特徴とする。
【００８３】
工程(a)について、好ましくは少なくとも2ヶ所、より好ましくは少なくとも3ヶ所および最も好ましくは4ヵ所全てのαへリックス領域が少なくとも１の置換突然変異を含む。工程(b)について、好ましくは少なくとも7ヶ所、より好ましくは少なくとも8ヶ所、より好ましくは少なくとも9ヶ所、より好ましくは少なくとも10ヵ所、そして最も好ましくは11ヶ所の領域全てが突然変異されていない。
【００８４】
あるいは、天然のヒトIL−13と類似するコンホーメーション形を有し、その配列中にヒトに投与した際にその免疫原性を高めるために十分なアミノ酸配列の多様性を有しているヒトキメラIL−13免疫原の製造方法であって、該方法が、以下の工程、
(a)異なる種由来のIL−13アミノ酸配列をアラインメントさせること、
(b)高変異領域および高保存領域を同定すること、
(c)ヒトIL−13の配列を取得し、該配列を該高変異領域中で突然変異させることにより、保存的置換であるまたは異なる種のIL−13配列内の同等位置に見られるアミノ酸で、ヒト配列由来のアミノ酸を置換すること、および
(d)あらゆるヒトの自己エピトープについて外来であり、かつあらゆる哺乳動物のIL−13配列についても外来であるT細胞エピトープの供与源を結合することを含む、上記方法が提供される。
【００８５】
本発明の関連した態様においては、また、ヒトキメラIL−13免疫原の製造方法であって、以下の工程、
(a)異なる種由来のIL−13アミノ酸配列をアラインメントさせること、
(b)高変異領域および高保存領域を同定すること、
(c)ヒトIL−13の配列を取得し、該配列を該高保存領域中で突然変異させることにより、保存的置換であるまたは異なる種のIL−13配列内の同等位置に見られるアミノ酸で、ヒト配列由来のアミノ酸を置換すること、および
(d)あらゆるヒトの自己エピトープについて外来であり、かつあらゆる哺乳動物のIL−13配列についても外来であるT細胞エピトープの供与源を結合することを含む、上記方法が提供される。
【００８６】
これらの方法のすべてにおいて、好ましくはそれらの置換または突然変異の50％以上が、ヒト以外のIL−13配列内の同等位置からのアミノ酸を含む。より好ましくは、置換の60、70または80％以上が、ヒト以外の哺乳動物のIL−13配列内の同等位置からのアミノ酸配列を含む。最も好ましくは、置換または突然変異の各々が、ヒト以外の哺乳動物のIL−13配列内の同等位置からのアミノ酸を有する。
【００８７】
さらにヒトキメラ免疫原を設計する方法について、好ましくはこれらの置換または突然変異の50％以上が、立体構造中αへリックスであると予想されるヒトIL−13領域で生じる。より好ましくは置換または突然変異の60、70または80％以上が、立体構造中αへリックスであると予想されるヒトIL−13の領域で生じる。最も好ましくは、置換または突然変異の各々が、立体構造中αへリックスであると予想されるヒトIL−13の領域内で生じる。
【００８８】
さらにヒトキメラ免疫原を設計する方法について、好ましくは、免疫原は2〜20個の置換を含み、より好ましくは6〜15個の置換、そして最も好ましくは13個の置換を含む。
【００８９】
最も好ましくは、上述したそれらの方法のすべてにおいて、IL−13配列内の複数の位置で置換突然変異が存在し、少なくとも2以上の突然変異部位が、ヒト以外の異なる哺乳動物種から選択されるアミノ酸を含む置換、より好ましくはヒト以外の異なる3以上の哺乳動物種から選択されるアミノ酸を含む置換、そして最も好ましくはヒト以外の異なる4以上の哺乳動物種から選択されるアミノ酸を含む置換を含む。
【００９０】
本発明は、また、上記方法のいずれかからも誘導することができる免疫原であって、ワクチンのための適切な手法で製剤化された場合に、ワクチン接種を受けたヒトにおいて免疫原性である、上記免疫原を提供する。
【００９１】
本発明によるポリペプチドの好結果の設計は、例えば適当なワクチン接種計画において、本文中で得られたポリペプチドを投与すること、およびタンパク質に結合することが可能な抗体が誘導されることを観察することによって確認することができる。この結合は、組換えタンパク質または精製された天然タンパク質を用いたELISA法の使用、または感受性細胞または組織に及ぼすタンパク質の効果を試験するバイオアッセイにより評価されてもよい。特に好都合な評価法は、無傷の宿主中でタンパク質の活性と因果的に関連する現象を観察し、そして本発明の方法によって誘導された抗体の存在がその現象をモジュレートするか否かを決定することである。したがって本発明のタンパク質は、天然タンパク質の起源となった種において、天然抗原に対する抗体を生じさせることが可能である。
【００９２】
最も好結果の設計は本明細書の実施例2に記載されるような実験で使用することができ、ワクチン接種を受けた個体の少なくとも50％で、ED100を超える抗IL−13中和免疫応答を誘導する。
【００９３】
ワクチン製剤
本発明のワクチン製剤は、タンパク質に基づくワクチンの形態であってよく、多くの場合にはアジュバントと共に製剤化することができ、あるいはワクチンはDNAもしくはポリヌクレオチドワクチンの形態を取ることができる。
【００９４】
本発明のポリペプチド免疫原は、本発明のポリヌクレオチドによってコードされ得る。当業者であれば、遺伝コードを適用することによってポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの配列を容易に決定することができるだろう。一度、必要とされる核酸配列が決定されると、所望の配列を有するポリヌクレオチドは実施例に記載するように産生することができる。当業者であれば、プライマー及びPCR条件などの必要な任意のパラメーターを容易に適応させることができるだろう。また、当業者であれば、遺伝コードの縮重に起因して、本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドが潜在的には2以上存在することが理解されるだろう。また、本発明のポリヌクレオチドは分泌シグナルペプチドをコードする領域を含み得る。
【００９５】
本発明のポリヌクレオチドは、典型的にはRNA(例えば、mRNA)またはDNA(例えば、ゲノムDNA、cDNAもしくは合成DNA)である。好ましくは、ポリヌクレオチドはDNAであり、特に好ましくはcDNAである。
【００９６】
さらに本発明は、本発明のポリヌクレオチドを含む、核酸構築物の発現ベクターを提供する。その上、核酸構築物は適切なイニシエーター、プロモーター、エンハンサー、および例えば哺乳動物細胞内でのタンパク質発現を可能にするために必要とする場合があり、正しい配向で配置されるポリアデニル化シグナルなどの他のエレメントを含むだろう。
【００９７】
プロモーターは、真核生物プロモーター(例えば、CD68プロモーター、Gal1、Gal10またはNMT1プロモーター)、原核生物プロモーター(例えば、Tac、TrcまたはLac)またはウイルスプロモーター(例えば、サイトメガロウイルスプロモーター、SV40プロモーター、ポリヘドリンプロモーター、P10プロモーターまたは呼吸器合胞体ウイルスLTRプロモーター)であってよい。好ましくは、プロモーターはウイルスプロモーターである。プロモーターが場合によりHCMV IE遺伝子由来のエキソン1を含むサイトメガロウイルス前初期プロモーターである場合が、特に好ましい。
【００９８】
転写調節エレメントには、エンハンサー(例えば、B型肝炎表面抗原3'非翻訳領域、CMVエンハンサー)、イントロン(例えば、CD68イントロンまたはCMVイントロンA)または調節領域(例えば、CMV 5'非翻訳領域)が含まれ得る。
【００９９】
ポリヌクレオチドは、好ましくは核酸構築物上のプロモーターに機能的に連結されることで、当該構築物が哺乳動物細胞に挿入された場合に、ポリヌクレオチドが発現されてコードされるポリペプチドを産生するようにする。
【０１００】
核酸構築物主鎖はRNAまたはDNAであってよく、例えばプラスミドDNA、ウイルスDNA、細菌DNA、細菌人工染色体DNA、酵母人工染色体DNA、合成DNAであってよい。また、核酸構築物が人工核酸(例えば、ホスホロチオエートRNAまたはDNA)であることも可能である。好ましくは、構築物はDNAである。構築物がプラスミドDNAである場合が特に好ましい。
【０１０１】
さらに、本発明は、本発明の発現ベクターを含む宿主細胞を提供する。そのような細胞としては、哺乳動物細胞または例えばバキュロウイルス発現系を用いた昆虫細胞などの一過性または好ましくは安定した高等真核細胞系、酵母などの下等真核細胞、あるいは細菌細胞などの原核細胞が挙げられる。本発明のポリペプチドをコードするベクターの挿入によって改変し得る細胞の例としては、特に哺乳動物細胞のHEK293T、CHO、HeLa、NS0およびCOS細胞が挙げられる。選択する好ましい細胞系は、安定しているだけなく、ポリペプチドの成熟グリコシル化を可能にするものであろう。発現は、形質転換卵母細胞において達成し得る。本発明のポリペプチドは、ヒト以外のトランスジェニック動物(好ましくはマウス)の細胞に発現させてもよく、またはより大きな哺乳動物(例えば、ヤギ、ヒツジおよびウシ)のミルクに発現させてもよい。本発明のポリペプチドを発現するヒト以外のトランスジェニック動物は、本発明の範囲内に含まれる。また、本発明のポリペプチドはアフリカツメガエル(Xenopus laevis)卵母細胞において発現させてもよい。
【０１０２】
また、本発明は、場合により薬学的に許容される担体、好ましくは薬学的に許容される賦形剤(例えば、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)、生理食塩水、デキストロース、水、グリセロール、エタノール、リポソームまたはこれらの組合せ)と共に組合わせた、本発明のポリヌクレオチドもしくは核酸構築物またはポリペプチドの治療上有効な量を含む、医薬組成物またはワクチン組成物を含む。あるいは、ワクチン組成物は、金属ビーズ(好ましくは金ビーズ)上に製剤化された本発明の核酸構築物の治療上有効な量を含み得る。また、本発明のワクチン組成物は、例えばある実施形態ではイミキモド(imiquimod)、ツカレソル(tucaresol)またはアルミニウム塩などのアジュバントを含んでもよい。
【０１０３】
好ましくは、アジュバントは本発明の免疫原と同時に投与され、好ましい実施形態では一緒に製剤化される。本発明によって意図されるそのようなアジュバント剤としては、合成イミダゾキノリン、例えばイミキモド[S-26308, R-837](Harrisonら, 「Reduction of recurrent HSV disease using imiquimod alone or combined with a glycoprotein vaccine」, Vaccine 19: 1820-1826, (2001));およびレシキモド(resiquimod)[S-28463, R-848](Vasilakosら, 「Adjuvant activites of immune response modifier R-848: Comparison with CpG ODN」, Cellular immunology 204: 64-74 (2000))、抗原提示細胞およびT細胞表面上に構成的に発現されるカルボニルおよびアミンのシッフ塩基、例えばツカレソル(Rhodes, J.ら 「Therapeutic potentiation of the immune system by costimulatory Schiff-base-forming drugs」, Nature 377: 71-75 (1995))、サイトカイン、ケモカインおよび共刺激分子、Th1インデューサー、例えばインターフェロンγ、IL−2、IL−12、IL−15およびIL−18、Th2インデューサー、例えば、IL−4、IL−5、IL−6、IL−10、および他のケモカインおよび共刺激遺伝子、例えばMCP−1、MIP−1α、MIP−1β、RANTES、TCA−3、CD80、CD86およびCD40L、他の免疫賦活性標的化リガンド、例えばCTLA−4およびL−セレクチン、アポトーシス刺激タンパク質およびペプチド、例えばFas、(49)、合成脂質に基づくアジュバント、例えばバクスフェクチン(vaxfectin)(Reyesら, 「Vaxfectin enhances antigen specific antibody titres and maintains Th1 type immune responses to plasmid DNA immunization」, Vaccine 19: 3778-3786)、スクアレン、α−トコフェロール、ポリソルベート80、DOPCおよびコレステロール、エンドトキシン、[LPS](Beutler, B., 「Endotoxin, Toll-like receptor 4, and the afferent limb of innate immunity」, Current Opinion in Microbiology 3: 23-30 (2000))；CpGオリゴヌクレオチドおよびジヌクレオチド(Sato, Y.ら,「Immunostimulatory DNA sequences necessary for effective intradermal gene immunization」, Science 273 (5273): 352-354 (1996). Hemmi, H.ら, 「A Toll-like receptor recognizes bacterial DNA」, Nature 408: 740-745, (2000)）およびTh1誘導性サイトカインを産生するためにToll受容体を誘発する他の潜在的なリガンド、例えば合成マイコバクテリウムリポタンパク質、マイコバクテリウムタンパク質p19、ペプチドグリカン、テイコ酸(teichoic acid)、およびリピドAが挙げられるが、この列挙は必ずしも完全ではなく、他の薬剤を除外するものではない。
【０１０４】
優先的にTh1型応答を引き起こすための特定の好ましいアジュバントとしては、例えば、リピドA誘導体、例えばモノホスホリルリピドA、または好ましくは3−O−脱アシル化(3-de-O-acylated)モノホスホリルリピドAが挙げられる。MPL(登録商標)アジュバントは、Corixa Corporation (Seattle, WA;例えば米国特許第4,436,727号;第4,877,611号;第4,866,034号および第4,912,094号参照)から入手可能である。CpG含有オリゴヌクレオチド(CpGジヌクレオチドが非メチル化されているもの)は、また優先的にTh1応答を誘導する。そのようなオリゴヌクレオチドは周知であり、例えば、WO 96/02555、WO 99/33488並びに米国特許第6,008,200号および第5,856,462号に記載されている。また、免疫賦活性DNA配列は、例えばSatoら, Science 273:352, 1996に記載されている。他の好ましいアジュバントには、サポニン(例えば、Quil A)またはその誘導体が含まれ、QS21およびQS7(Aquila Biopharmaceuticals Inc., Framingham, MA); エスシン(Escin); ジギトニン(Digitonin);またはカスミソウ(Gypsophila)もしくはキノア(Chenopodium quinoa)のサポニンが挙げられる。
【０１０５】
特にアジュバントは、(WO96102555)に開示されるような免疫賦活性CpGオリゴヌクレオチドを含む。典型的な免疫賦活性オリゴヌクレオチドは長さが8〜100塩基であり、そして一般式X1CpGX2を含み、ここでX1とX2はヌクレオチド塩基であり、CとGは非メチル化されている。
【０１０６】
本発明のワクチンの利用のための好適なオリゴヌクレオチドは、好ましくは2以上のジヌクレオチドCpGモチーフを含み、該モチーフは好ましくは少なくとも3、より好ましくは少なくとも6以上のヌクレオチドで分離されている。本発明のオリゴヌクレオチドは典型的にはデオキシヌクレオチドである。好適な実施形態において、オリゴヌクレオチド中のインターヌクレオチド(internucleotide)はホスホロジチオエートであり、さらに好ましくはホスホロチオエート結合であるが、ホスホジエステル結合および他のインターヌクレオチド結合は本発明の範囲内であり、これには混在するインターヌクレオチド結合、例えばホスホロチオエート/ホスホジエステルの混在を含むオリゴヌクレオチドが含まれる。オリゴヌクレオチドを安定させる別のインターヌクレオチド結合が用いられてもよい。ホスホロチオエートオリゴヌクレオチドまたはホスホロジチオエートを産生する方法は、US5,666,153, US5,278,302およびWO95/26204に記載されている。
【０１０７】
好適なオリゴヌクレオチドの例は以下の配列を有する。該配列は好適には、ホスホロチオエート改変型のインターヌクレオチド結合を含む。
オリゴ1: TCC ATG ACG TTC CTG ACG TT (CpG 1826)
オリゴ2: TCT CCC AGC GTG CGC CAT (CpG 1758)
オリゴ3: ACC GAT GAC GTC GCC GGT GAC GGC ACC ACG
オリゴ4: TCG TCG TTT TGT CGT TTT GTC GTT (CpG 2006)
オリゴ5: TCC ATG ACG TTC CTG ATG CT (CpG 1668)
【０１０８】
代替的CpGオリゴヌクレオチドは、重要でない欠失または重要でない付加を有する上述の好適配列を含んでもよい。
【０１０９】
本発明に使用されるCpGオリゴヌクレオチドは、当業界で既知のいかなる方法（例えばEP 468520）により合成されてもよい。そのようなオリゴヌクレオチドは自動合成機を用いて都合よく合成されてもよい。マウスにおいて使用される、CpGオリゴヌクレオチド含有アジュバント製剤は、商品名「ImmunEasy」としてQiagenから購入することができる。好ましくは、アジュバントは、約1：1の重量/重量比で水酸化アルミニウムに吸着させたオリゴ1、2、3、4または5として規定されるCpGの1つである。オリゴ4は、ヒトにおける使用に好ましい。
【０１１０】
好ましくは、CpGは、WO 00/62800およびWO 00/09159(これら双方の内容は参照により本明細書に組み入れる)に記載されるQS21などのサポニンと組合わせる。
【０１１１】
治療方法
本発明はアトピー性疾患の新規治療法を提供し、これにはワクチン接種を受けた個体において、IL−13に対する免疫応答を生じさせることが可能な免疫原が含まれる。特に注目すべきは、本発明は、COPD、喘息またはアトピー性皮膚炎に罹患しているあるいはかかり易い個体を治療する方法を提供し、該治療法は、本発明によるワクチンを該個体に投与すること、およびそれによって該個体の血清中で中和する抗IL−13免疫応答を引き起こすこと、およびそれによりCOPD、喘息またはアトピー性皮膚炎の症状を改善または排除することを含む。
【０１１２】
さらに本発明は、喘息治療のための医薬の製造における本発明の免疫原の使用を提供する。さらに、治療を必要とする個体に、本明細書に記載される医薬組成物またはワクチンを投与することを含む喘息の治療方法を提供する。
【０１１３】
好ましくは、医薬組成物はIL−13に対して免疫応答を引き起こすワクチンである。引き起こされる免疫応答は、好ましくは抗体応答であり、最も好ましくはIL−13中和抗体応答である。
【０１１４】
また、本発明は以下のものを提供する：
本発明のポリヌクレオチドを含み、かつ本発明のポリペプチドを発現することが可能な発現ベクター；
本発明の発現ベクターを含む宿主細胞；
本発明のポリペプチドを産生する方法であって、ポリペプチドの発現が得られ、当該ポリペプチドを単離することに好適な条件下で本発明の宿主細胞を維持することを含む、上記方法：
本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドおよび薬学的に許容される担体を含むワクチン組成物。
【０１１５】
本発明の治療方法は喘息の治療方法を提供し、該治療方法は以下の1以上の臨床的効果を含む：
1．気道過敏性(AHR)の減少
2．粘液高分泌および杯状細胞化生の減少
3．気道の上皮下繊維症の減少
4．好酸球レベルの減少
5．吸入コルチコステロイド（ICS）の使用の必要性の減少もIL−13自己ワクチンの使用による治療成功の特徴である。
【０１１６】
本発明の組成物は、予防および治療の両方に使用され得る。本発明は、医療への使用のための、本発明のポリペプチドおよびポリヌクレオチドを提供する。本発明はさらに、アレルギー、喘息およびCOPDなどの呼吸器疾患、寄生虫感染関連疾患、繊維症または肝硬変の治療のための医薬の製造における、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドの使用を提供する。
【０１１７】
本発明はまた、本発明のワクチン組成物の有効量を患者に投与すること、およびワクチン組成物に対する免疫応答を引き起こすことを含むワクチン接種方法を提供する。
【０１１８】
本発明はまた、アレルギー、呼吸器疾患、寄生虫感染関連疾患、繊維症および肝硬変などの、IL−13が仲介する疾患に対する哺乳動物のワクチン接種における使用のための、本明細書中に記載のワクチン組成物を提供する。したがってIL−13に対する中和応答を指令することが可能なワクチン組成物は、ヒトにおける喘息、特にアレルギー性喘息の治療に有用な療法を構成し得る。また、特定の寄生虫感染関連疾患（Brombacher,2000 Bioessays 22:646-656）ならびに、慢性閉塞性肺疾患（COPD）および肝硬変などの繊維症におけるIL−13産生と関連する疾患(Chiaramonteら,1999,J Clin Inv 104:777-785)の治療も応用例として含まれる。
【０１１９】
本発明の治療法は、アトピー性皮膚炎の治療方法を提供し、該治療方法は以下の1以上の臨床的効果を含む：
1．皮膚刺激の減少
2．痒みおよびひっ掻きの減少
3．従来の治療の必要性の減少
4．適用可能であれば、局所的なコルチコステイドの使用の必要性の減少。理想的なIL−13自己ワクチンは、潜在的にICSステロイド治療を不必要にさせることができるが、有益な結果として、ICSの「使用頻度」または「必要服用量」の減少も予想される。
【０１２０】
また本発明は、IL−13が仲介する疾患、それに関連したいずれの症状または疾患を治療または予防する方法であって、本発明のタンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、または医薬組成物の有効量を投与することを含む、上記方法を提供する。医薬組成物の投与は、例えば「初回−追加免疫」(prime-boost)治療ワクチン計画において1以上の個別用量の形態を採ることができる。特定の場合において、「初回（prime）」ワクチン接種は、本発明のポリヌクレオチド、好ましくはプラスミド誘導性ベクター内に組み込まれたポリヌクレオチドの粒子仲介DNA送達を介して行ってもよく、また「追加免疫」は、同一のポリヌクレオチド配列を含む組換えウイルスベクターの投与によるか、またはアジュバント中のタンパク質を用いた追加免疫であってもよい。逆に、初回免疫はウイルスベクター、またはアジュバント中で一般的に製剤化されるタンパク質製剤を用い、追加免疫は本発明のDNAワクチンを用いてもよい。
【０１２１】
本発明は、宿主内で、本発明のワクチンの投与によって、抗自己IL−13抗体応答を生じさせる方法を提供する。
【０１２２】
本発明のワクチン組成物は、多様な方法、例えば口や鼻などの粘膜；肺、筋肉内、皮下または皮内経路を介して投与されてもよい。抗原がタンパク質を主成分とするワクチンとして投与されるべき場合、ワクチンは一般的にはアジュバントとともに製剤化され、また凍結乾燥され、そして使用前に注射用に水中に再懸濁される。そのような組成物は、好ましくは等張性で、注射可能な組成物、例えば滅菌した水性分散液として個体に投与されて得る。そのような組成物は一般的に筋肉内に投与されるが、別の投与経路も可能である。
【０１２３】
皮内投与のための一技術には粒子衝撃（これは「遺伝子銃（gene gun）」技術としても知られ、米国特許第5371015号に記載されている）を含む。タンパク質は糖とともに製剤化され、小粒子を形成し、それらが患者の表面（例えば皮膚）に浸透することを可能とすべく、例えば高圧下で投射装置による発射方法により十分なスピードに加速される。（本発明の核酸ワクチン構築物およびタンパク質糖粒子で被覆した粒子は、本発明の範囲内にあり、そのような粒子を充填した装置も同様である)。受容者に対して核酸構築物または当該構築物を含有する組成物を直接投与する他の方法としては、超音波、電気刺激、エレクトロポレーション、およびUS-5,697,901に記載されるマイクロシーディング(microseeding)が挙げられる。
【０１２４】
また本発明の核酸構築物は、遺伝子治療に有用な特殊化した送達ベクターの手段によって投与してもよい。遺伝子治療方法は、例えばVermeら, Nature 1997, 389:239-242によって考察されている。ウイルス系及び非ウイルス系の双方を使用することができる。ウイルスに基づく系としては、レトロウイルス、レンチウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヘルペスウイルス及びワクシニアウイルスに基づく系が挙げられる。非ウイルスに基づく系としては、核酸の直接投与およびリポソームに基づく系が挙げられる。例えば、ベクターをリポソームによって、またはポリラクチドコグリコリド(polylactide co-glycolide：PLG)粒子内に封入してもよい。また、本発明の核酸構築物は形質転換宿主細胞の手段によって投与してもよい。そのような細胞としては、被験者から回収した細胞が挙げられる。核酸ワクチン構築物をin vitroでそのような細胞に導入し、その後、形質転換細胞を被験者に戻すことができる。本発明の核酸構築物は、細胞に既に存在する核酸に相同組換え事象によって組み込むことができる。望ましい場合には、形質転換細胞をin vitroで成長させ、結果として得られた細胞の1以上を本発明において使用してもよい。細胞は、公知の外科的または顕微手術的技法(例えば、移植、マイクロインジェクションなど)によって患者の適切な部位に提供することができる。好適な細胞としては、樹状細胞が挙げられる。
【０１２５】
送達されるワクチン組成物の量は、免疫される哺乳類の種および体重、治療され/防御される病気の状態の性質、採用されるワクチン接種プロトコル（すなわち、単回投与対反復投与）、投与経路、ならびに選択されるアジュバント化合物の効能および用量に応じて有意に変化する。それらの可変性に基づいて、医師または獣医師は適切な投与量を容易に決定することができるが、投与量が0.5〜5μg/ｋｇの核酸構築物またはそれらを含む組成物であるのは、例えばワクチンが核酸である場合である。特に、投与量は投与経路に応じて変化し得る。例えば、金ビーズによる皮内投与を用いる場合、合計投与量は好ましくは1μg〜10ngであり、特に好ましくは合計投与量は10μｇ〜1nｇである。核酸構築物が直接投与される場合、合計投与量は一般的に高くなり、例えば50μg〜1mg以上である。上述の投与量は平均的な場合の例示である。
【０１２６】
タンパク質ワクチンにおいて、各ワクチン投与におけるタンパク質の量は、一般的なワクチンにおいて、かなり有害な副作用伴わずに免疫保護応答を誘導する量として選択される。そのような量は、どの特異的免疫原が採用されるか、およびそれがどのように提供されるかに応じて変化し得る。一般的に、各投与に1〜1000μg、好ましくは1〜500μg、好ましくは1〜100μg、最も好ましくは1〜50μgのタンパク質が含まれることが予想される。特定のワクチンの最適な量は、ワクチン接種を受けた被験者における適当な免疫応答の観察を含む標準調査によって確認することが可能である。最初のワクチン接種に続いて、被験者は、十分な間隔で、1または複数の追加免疫(booster immunization)を受けてもよい。そのようなワクチン製剤は初回免疫または追加免疫ワクチン接種計画のいずれかであってもよく、例えば、経皮的、皮下的または筋肉内経路を介した全身性の投与、あるいは、例えば鼻腔内または経口経路などを介した粘膜表面に塗布されてもよい。
【０１２７】
より高いまたはより低い投与量の範囲が正当である個別的な例ももちろんあり得るし、そのような例も本発明の範囲内である。
【０１２８】
ワクチン組成物は1回きりの方式でまたは繰返し投与されることも可能であり、例えば1〜7回、好ましくは1〜4回、約１日〜約18ヶ月の間隔で、好ましくは1ヶ月の間隔で投与され得る。これは場合により、患者の寿命に至る期間まで、1〜12ヶ月の通常の間隔で定期的に投与され続けてもよい。一実施形態において、患者は初回―追加免疫計画において異なる形態の抗原を受け取る。したがって、例えば抗原がDNAを主成分とするワクチンとして最初に投与され、その後続いてタンパク質アジュバントを主成分とする製剤として投与され得る。しかしながら、またしてもこの治療計画は、関係する動物の大きさおよび種、投与される核酸ワクチンおよび/またはタンパク質組成物の量、投与経路、使用される全てのアジュバント化合物の効能および用量、および熟練した獣医師または医療従事者に明らかであろう他の要素に応じて有意に変化し得る。
【０１２９】
本明細書中の用語「含む」および「含有する」、または「含むこと」、「含んでなる」、「含有すること」、「含有してなる」などのその変形は、全てを包含するように、すなわちそれらの用語の使用が特に詳述されていない整数または要素を含むことができることを意味するように、また「からなる」と読むことができる排他的意味としても解釈されるべきである。
【０１３０】
本明細書中に記載の通り、本発明は単離されたポリペプチドおよび単離されたポリヌクレオチドに関する。本発明に関わる「単離された」という用語は、少なくなくともある程度まで精製された、または例えば組換え法もしくは機械的合成により合成的に産生された限りにおいて、天然状態でないポリペプチドまたはポリヌクレオチドを意味することを意図する。したがって、「単離された」という用語は、細胞、細胞懸濁液もしくは細胞断片、タンパク質、ペプチド、発現ベクター、有機もしくは無機溶媒、または適切な場合には別の物質などの、別の生物学的または非生物学的物質と組み合わされたポリペプチドまたはポリヌクレオチドの可能性を含むが、ポリヌクレオチドが天然に見出される状態である場合を除外する。
【０１３１】
本発明は、限定的でない以下の実施例で例証される。
【実施例】
【０１３２】
実施例１ 方法
下記の方法について、以下の命名を適用：
1．タンパク質へ挿入された（マウスIL−13のαへリックスCとDの間のループ領域中に置換されている）破傷風毒素のp30エピトープを有するマウスIL−13（mIL−13）と呼ばれる構築物は、mIL13p30CDと称する。
【０１３３】
2．N末端にp30を有するマウスIL−13と呼ばれる構築物は、mIL13p30と称する。
【０１３４】
3．N末端にp30を有するよう設計される新規なキメラ化IL−13と呼ばれる構築物は、cIL13newと称する。
【０１３５】
IL−13サブクローニング/改変：
CDループ内に挿入された破傷風毒素由来のp30エピトープを含むmIL−13をコードする遺伝子（mIL13CD）を合成により調製した。合成遺伝子は5'KpnI制限部位と3'BamHI制限部位を含む。この断片をその後、DHFRをコードするpCDNのKpnIとBamHI制限部位の間にサブクローニングした（Aiyerら、1994）。得られた中間体をその後、FC融合体の挿入により改変した。部位特異的挿入突然変異誘発を、IL−13の終止コドンの前の3'末端コード配列中にフレームを一致させてヒトIgG1FCを正確に挿入するのに用いた（Geisserら、2001）。これは2つの工程で行った。1．IgG1FCは、以下のプライマーセット（正方向：5'..CAACTGTTTCGCCACGGCCCCTTCCTGGAGGTCCTGTTCGGTGGACCAGGATCCGAGCCCAAATCGGCCGAC...3'および逆方向： 5' ...CTAGGTAGTTGGTAACCGTTAACGG...3'）を用い、KOD校正ポリメラーゼ（Novagen）により触媒されるPCR反応において、cDNA鋳型であるpCDN−FCから増幅した。2．得られたPCR産物をゲル精製し、その250ngを、QuickChangeキット（Stratagene）、50ngのmIL−13 CD−p CDNおよび2.5UのPfuTurboを用いる、部位特異的突然変異誘発反応における標的断片として用いた。突然変異誘発プロトコルは95℃で30秒、55℃で30秒、そして68℃で16分の18サイクルからなる。突然変異誘発プロトコルの終了後に、反応液は10UのDpnIにより消化され、天然のメチル化された野生型の鋳型DNAを除去した。最終消化反応液の1μlを、100μlのエピキュリアン化学的コンピテント大腸菌(E.coli)細胞（Epicurian chemically competent E.coli cells）(Stratagene)を形質転換するのに用いた。組換えクローンを制限消化により選別し、そしてポジティブクローン配列をIL−13正方向プライマーおよびpCDN逆方向プライマーを用いて、FC領域にわたり完全に確認した。最終のプラスミド、pCDNmIL13CDFCは、FC除去のためのPreScissionプロテアーゼ開裂部位により分けられるC末端FC融合体をコードする。転写はCMVプロモーターの制御下でなされる。インサートの完全な配列を図18に示す（配列番号23）。
【０１３６】
pCDNmIL13p30FCを、pCDNmIL13CDFCについて上述したのと全く同じ方法で構築し、これはmIL13CD合成遺伝子を、p30エピトープがCDループ内に存在する代わりに成熟タンパク質のN末端に存在するものと置換する。同一の正方向および逆方向プライマーを使用し、FC領域をpCDNmIL13p30内に部位特異的に挿入するための標的断片を生成した。インサートの完全な配列を図19に示す（配列番号24）。
【０１３７】
pCDNcIL13newFCは、cIL13new分子をコードする合成遺伝子および以下の正方向プライマー(5'..AACCTGTTTCGCCGCGGCCCCTTCCTGGAGGTCCTGTTCGGTGGACCAGGATCCGAGCCCAAATCGGCCGAC...3', (配列番号25))および上述と同じ逆方向プライマーを用いて構築し、FC領域をpCDNcIL13newに部位特異的に挿入するための標的断片を生成した。インサートの完全な配列を図20に示す(配列番号26)。
【０１３８】
pCDNIL13oldFCは、マウスキメラIL−13による、pCDNmIL13CDFC内のmIL13CDの部位特異的置換により構築した（WO 02/070711参照）。部位特異的置換は部位特異的挿入のために記載される通りに実施した。cIL13は、以下のプライマー(正方向： 5'...GTGTCTCTCCCTCTGACCCTTAGG...3' (配列番号27) および逆方向： 5'...CAGTTGCTTTGTGTAGCTGAGCAG...3' (配列番号28)を用いて、6His−cIL13からPCR増幅し、pCDNmIL13内に置換するためのターゲティング断片を生成した。これにより、5'末端にコードされるIL−13シグナル配列および3'末端にコードされるPreScission−FC領域の正確な融合体を生じる。インサートの完全な配列を図21に示す（配列番号29）。
【０１３９】
図18〜21の全てにおいて、二重下線部のアミノ酸残基は、分泌シグナル配列（宿主細胞からの発現および分泌中に除去される）を示し、一重下線部の残基はPrecissionプロテアーゼ部位を、およびイタリックの残基はFc融合パートナーを示している。
【０１４０】
安定なCHO E1Aクローンの生成：
プラスミドはDHFRネガティブな、E1A発現系（CHO E1A, ACC317）中で安定に発現する。細胞を低温のリン酸緩衝スクロース中で１x107細胞/mlで再懸濁し、Gene Pulser Cuvetteに移し、そしてGenePulser（Biorad）中で、400ボルトおよび25μFdで、15μgのNotI線状化プラスミドを用いてエレクトロポレートした。エレクトロポレートされた細胞は、ウェルあたり2.5ｘ103の生細胞を、１Xヌクレオシドを含む完全培地中、96ウェルプレート中で平板培養した。48時間後、培地をヌクレオシドを欠く新鮮な培地に交換した。細胞をその後ヌクレオシド欠如下で3〜4週間にわたり選別した。ポジティブクローンを、Origen analyzer（IGEN）上でFC−電気化学発光検出のプロトコル（Yangら、1994）を用いて、ならし培地からのFC発現を監視することにより96ウェルプレートから選別した。ポジティブ細胞系をヌクレオシドが除かれた完全培地で数リットルの量にした。発酵は34℃で10〜11日実施した。FC精製のため、ならし培地を回収し、調製物中0.2μMを滅菌濾過した。
【０１４１】
精製：
マウスIL13CD/Fcは、ProSep−A高性能樹脂（Bioprocessing Limited）上で、CHO培地から捕獲した。マウスIL13CD/Fcを、ProSep−A樹脂から0.1MグリシンpH=3.0を用いて溶出し、１M HEPES pH=7.6を用いて中和し、そして25ｍMリン酸ナトリウム、0.15M 塩化ナトリウムｐH＝７(Spectra/Por(登録商標)7メンブレン，MWCO:8000)に対して透析した。全収量は3.8リットルCHO培地から644mgのマウスIL13CD/Fcであった。別のIL13/Fc融合タンパク質を同様に調製した。
【０１４２】
ワクチン接種調査に使用する前に、これらの分子のFc部分をPrecissionプロテアーゼを用いて切り離し、除去した。得られたワクチン調製物はプレーンテキスト（すなわち下線もイタリックもない）による図18〜21中に示されるアミノ酸残基を本質的に含む。
【０１４３】
参考文献：
Aiyer, N, Baker, E, Wu, H-L, Nambi, P, Edwards, RM, Trill, JJ, Ellis, C, Bergsma, DJ. (1994)： Human AT1 receptor is a single copy gene： characterization in a stable cell line. Molecular and Cellular Biochemistry 131：75-86.
Geiser, M, Cebe, R, Drewello, D, および Schmitz, R (2001)： Integration of PCR Fragments at Any Specific Site within Cloning Vectors without the Use of Restriction Enzymes and DNA Ligase. Biotechniques 31： 88-92.
Yang, H, Leland, JK, Yost, D, Massey, RJ (1994)： Electrochemiluminescence： A new diagnostic and research tool. Biotechnology, 12：193-194.
【０１４４】
実施例２ マウス喘息モデルにおける抗IL−13ワクチンの効能
マウス喘息モデル
オボアルブミンチャレンジマウス喘息モデルは、in vivoで喘息の治療の効能を評価するのに日常的に用いられている。マウスは7日ごとに与えられる2回のオボアルブミンの腹腔内投与により免疫感作され、オボアルブミンに対してマウスを免疫感作する。喘息の表現型は、その後、3回のオボアルブミンの鼻腔内投与により生成可能である。このプロトコルの対象となるマウスは、スパスモゲン５HTに対する高レベルの気道過敏性、肺の炎症（その多くは、肺組織および気管支肺胞洗浄液の著しい好酸球増加を示す）、ならびに大量の肺気道上皮の杯状細胞化生（および粘液高分泌に関連する）を示す。この表現型はヒトの喘息患者においてみられる表現型を模倣する（類似したマウス喘息モデルはScience 1998 vol 282, pp：2258−2261および2261−2263に記載されている）。このモデルはWO 02/070711にも記載されている。
【０１４５】
抗IL−13ワクチン治療
2種類の抗IL−13ワクチン治療の効能について、オボアルブミンチャレンジマウス喘息モデル、すなわちオボアルブミンに対して予め免疫感作されたマウス（Sigma UK Ltd, Poole, Dorset）において評価した。どちらもWO 02/070711に開示されるマウスキメラIL−13分子を主要成分とし、GSTとの融合タンパク質として発現されおよび精製される。該融合タンパク質は本明細書中でgst−cIL13を指す。
【０１４６】
1．ワクチン1 ＝ gst−cIL13 ＋ 「ImmunEasy」アジュバント（Qiagen,Cat.No.303101）。
【０１４７】
2．ワクチン2＝gst−cIL13 ＋ 10μgの3−脱O−アシル化モノホスホリルリピドA（３D−MPL）と10μｇのＱＳ21サポニンとを組合せてコレステロールを含むリポソーム(EP0822831B1, SmithKline Beecham Biologicals S.A.参照)。
【０１４８】
ネガティブコントロールワクチン治療群も含まれる。
【０１４９】
3．ワクチン1のネガティブコントロール＝gst ＋ 「ImmunEasy」アジュバント。
【０１５０】
4．ワクチン2のネガティブコントロール＝gst ＋ 10μgの3−脱O−アシル化モノホスホリルリピドA（３D−MPL）と10μｇのＱＳ21サポニンとを組合せてコレステロールを含むリポソーム(EP0822831B1, SmithKline Beecham Biologicals S.A.参照)。
【０１５１】
オボアルブミンを用いた感作後に、マウスを4種のワクチン投与で免疫し、これは12週間にわたり、4週間毎に各ワクチン投与を与えることにより達成した。マウスをその後、オボアルブミンを用いてチャレンジし、喘息表現型を評価した。
【０１５２】
効能調査における他のコントロール治療群
Ａ．デキサメサゾン(Sigma UK Ltd, Poole, Dorset)は、このマウス喘息モデルにおいて、日常的に使用される最良のステロイド治療剤である。オボアルブミンチャレンジの間、腹腔内経路を介してマウスに1.5ｍｇ/kgのデキサメサゾンを3回投与した。
【０１５３】
Ｂ．抗マウスIL13ポリクローナル抗体（社内でかつてウサギで作られたプロテインＡで精製した試薬）を、このマウス喘息モデルにポジティブコントロール治療剤として受動投与した。このマウス喘息モデルにおいて、完全な抗IL13誘導効果を生じさせるために予め示される抗体投与量を、オボアルブミンチャレンジの間に投与した（＝２x105の終点力価を有するストック0.5mlの3回投与、更なる詳細についてはWO02/070711 A1参照）。
【０１５４】
Ｃ．このモデルが生成する最大表現型は、ネガティブコントロール治療群において生理食塩水を用いることにより樹立された(Fresenius Kabi, Warrington, UK)。マウスに、オボアルブミンチャレンジの間、鼻腔内経路により生理食塩水を3回与えた。生理食塩水治療はこのモデルにおいて効力を示さず、したがって最もひどい喘息の表現型を生じた。
【０１５５】
Ｄ．喘息モデルの表現型と「喘息が誘導されない表現型」との比較のための基準線として、１つの処理群をオボアルブミンで免疫感作したのみで、オボアルブミンチャレンジ投与を与えなかった。これらのマウスは通常の肺の生理機能を示した。
【０１５６】
抗IL−13ワクチン、または抗IL−13ポリクローナル抗体の受動投与、を用いて免疫されたマウスにおいて生じる血清IL13中和能
マウス喘息モデルの最後にワクチンまたは抗IL13ポリクローナル抗体の受動投与により治療されたマウスは、WO02/070711に記載されるマウスIL13誘導TF−1細胞増殖アッセイを用いてIL13中和能について分析される血清サンプルを有していた。この分析により、ND50と称する中和測定値が得られ、これはTF−1細胞増殖アッセイにおいて、5ng/mlのマウスIL13の生物活性を50％まで減少することが可能なマウス血清の最大希釈度を表している。
【０１５７】
本発明者らの先のデータは、抗IL13中和抗体の受動投与を用いたこのマウス喘息モデルにおける最大効能は、ほぼ1/476の血清ND50値と相関することも証明した。本発明者らがED100と称する中和の臨界レベル（100％の効能を与えるのに必要な有効中和投与量）は、一般的にこのレベルに対する血清中和能を発現する。例えば、1/952のND50を有する血清サンプルは2.0ｘED100の中和能を有するということである。1/238のND50を有するサンプルは0.5xED100の中和能を有し得る。
【０１５８】
この実験による血清IL13中和能のデータは図22に示されており、ED100の倍数としてプロットされている。
【０１５９】
キメラIL13ワクチンにより治療された、または抗IL13ポリクローナル抗体を受動的に投与された、全てのマウスは、1ｘED100を超える血清中和を引き起こした。したがって、これらの治療群中のマウスは、喘息モデルにおいて、抗IL13により推進される利益の全てを受け得ることが予測された。
【０１６０】
気道過敏性（AHR）データ
吸入されるスパスモゲンに対する用量反応曲線は、気管支収縮性刺激に対する気道の応答を決定するのに用いられる。これらの曲線は2つの主要な成分からなる。
1．高感受性−用量反応曲線（DRC）における左方シフト
2．高反応性−プラトー反応におけるDRC勾配の増加および/または損失
【０１６１】
これらの成分はともに一般用語である「気管支または気道過敏性」（BHRまたはAHR）を引き起こし、これらは典型的に「気管収縮性刺激に応じた気管の狭小化の容易さおよび度合いの増加」として定義される。
【０１６２】
AHRは５HTスパスモゲンの投与による意識のあるマウスのチャレンジ、そしてその後呼吸の流れと容量パラメータに対する影響を、全身プレチスモグラフィー装置（Buxco, Sharon, CT）を用いて測定した。この分析からの好適な読み出しパラメータは、高められたポーズ（enhanced pause：PENH）の測定である。図23は、3mg/mlの５THスパスモゲン濃度について、PENHの曲線下面積をプロットすることにより得られたこの実験からのAHRデータを示す。データポイントは示された治療群についての平均および標準誤差である。
【０１６３】
ワクチン治療および抗IL13ポリクローナル抗体の受動投与のいずれも、AHRのレベルを低下している点でデキサメサゾンと同じくらい効果的であった。ネガティブコントロールのワクチン治療はAHRを減少しなかった。
【０１６４】
肺の炎症データ
肺の炎症細胞含量を気管支肺胞洗浄（BAL）液において評価した。好酸球、マクロファージ、リンパ球、好中球の平均数は、受けた治療に対してプロットした（図24）。
【０１６５】
ワクチン治療および抗IL13ポリクローナル抗体の受動投与のいずれも、BAL液中の好酸球のレベルを低下している点でデキサメサゾンと同じくらい効果的であった。面白いことに、ネガティブコントロール治療gst＋「ImmunEasy」もBALの好酸球のレベルを効果的に減少するように思われた。これはおそらくpro-Th1活性を有する免疫調節化合物であることが知られている「ImmunEasy」アジュバント中のCpG成分の活性に起因するだろう。
【０１６６】
杯状細胞化生および粘液高分泌データ
粘液を含む杯状細胞は、通常マウスの気道上皮中に有意な頻度で存在しない。この喘息モデルにおいて、オボアルブミンによる感作およびチャレンジの後、気道上皮は、上皮層の化生のために粘液を含む杯状細胞で密に充填されるようになる。
【０１６７】
固定の後、各動物由来の肺の代表サンプルをパラフィン組織学のため処理した。切片を5μに切断し、気道杯状細胞の組織病理学評価のために、αアミラーゼ(Sigma UK Ltd, Poole, Dorset)による前消化とともにABPAS(Alcian blue periodic acid Schiff’s reagent, BDH-Merck)で染色した(Propath UK Ltdによる準備組織学, Hereford, UK)。
【０１６８】
ABPASにより染色された肺切片を、下記に示す６ポイント半定量的評点システム（6-point semi-quantitative scoring system）を用いて、杯状細胞数について評点付けした。結果を図２５に示す。
【０１６９】
杯状細胞の評点システム
スコア 観測
０ 杯状細胞なし
１ 非常に少数の杯状細胞
２ 低い数の杯状細胞
３ 中位の数の杯状細胞
４ 多数の杯状細胞
５ 非常に多量の杯状細胞
【０１７０】
評点システムは線形ではないこと、そして２または３のスコア間の差は上皮中に存在する杯状細胞数に関連して非常に大きいことに注目すべきである。
【０１７１】
治療群の何匹かについての代表的な切片を、図26A，（gst−cIL13＋「ImmunEasy」）；図26B（gst−「ImmunEasy」）；図27A（gst−cIL13＋10μgの3−脱O−アシル化モノホスホリルリピドA（３D−MPL）と10μgのQS21サポニンを組合わせてコレステロールを含むリポソーム(EP0822831B1, SmithKline Beecham Biologicals S.A.参照)）；図28（デキサメサゾン）；図29（最大喘息表現型）に示す。
【０１７２】
ワクチン治療および抗IL13ポリクローナル抗体による受動投与のいずれも気道上皮における粘液含有杯状細胞の数を劇的に減少させた。全ての抗IL13治療についての杯状細胞の減少は、生理食塩水（最大表現型）治療群に対して非常に大きい（p＜0.01）。ネガティブコントロールのワクチンは効果を有さなかった。デキサメサゾン治療は、本調査において杯状細胞化成（GCM）に対しほとんど有効でなかった。
【０１７３】
まとめ
抗IL13ワクチン治療は、マウス喘息モデルにおいて、喘息表現型の阻止に非常に効果的であった。抗IL13ワクチンは、AHRおよび好酸球増加症の治療についてデキサメサゾンと同じくらい効果的であり、杯状細胞化生および粘液高分泌の治療についてはデキサメサゾンより優れていた。
【０１７４】
実施例３ 杯状細胞化成と血清IL13中和能のレベルとの相関
抗IL13ワクチンにより免疫した数匹の動物は、1.0ｘED100より小さなレベルで血清IL13の中和を達成した。これらの動物が何らかの識別可能な利益（ED100は最大利益であると定義されていることを心に留めておく）を得ているか否かを決定するため、それらの動物もオボアルブミンでチャレンジし、GCMの度合いを決定した。以下のデータは、杯状細胞化生スコアと、ワクチンにより誘導される血清中のIL13中和能のレベルとの間の関係を示している。
【０１７５】
杯状細胞についての評点システム
スコア 観測
０ 杯状細胞なし
１ 非常に少数の杯状細胞
２ 低い数の杯状細胞
３ 中位の数の杯状細胞
４ 多数の杯状細胞
５ 非常に多量の杯状細胞
【０１７６】
杯状細胞データを下記の表１および図３０に示す。
【表１】
【０１７７】
1ｘED100より小さい血清IL13中和能を生じさせたマウスのみをこの分析に含めた。その理由は、定義により、1ｘED100と同等またはこれより過剰な血清IL13能を有する動物は、杯状細胞化生を抑制する点で最大効能を得るからである。
【０１７８】
データは、血清IL13中和能のレベルと杯状細胞化生の重傷度との間に相関があることを示す(Ｒ2＝0.52)。IL13の中和レベルが高いほど、杯状細胞化生の重傷度は低い。
【０１７９】
実施例３のデータとともにこれらのデータは、喘息の表現型に対する抗IL13治療の効能の強力な予測因子としてのED100測定値の使用を有効付ける。
【０１８０】
いずれのワクチン、抗体、可溶性レセプターまたは他のIL13中和治療も以下のように評価することができる。
【０１８１】
1．IL13中和治療を患者に所望の投与量および頻度で与える。
【０１８２】
2．血清サンプルを得る。
【０１８３】
3．TF1増殖アッセイなどのIL13バイオアッセイにおいて、血清サンプル、およびその希釈物を分析することにより、血清サンプルのIL13のND50を決定する。バイオアッセイは、５nｇ/mlのマウスIL13の特定の効果の50％を阻害させる最大の血清希釈度を決定することが可能であるように選択される。ヒトIL13を対象とする治療のため、TF1バイオアッセイは依然として使用されるが、刺激性サイトカインは、3〜6ｎｇ/mlの範囲の濃度で使用されるヒトIL13であろう。
【０１８４】
4．得られたND50値を1/476で割り、ED100倍数を得る。
【０１８５】
5．この倍数が1以上の場合、IL13中和治療は喘息表現型において最大効能を有することが期待される。
【０１８６】
6．倍数が1.0よりかなり小さい場合、例えば0.2以下の場合、有意な効能は期待されない。
【０１８７】
7．倍数がこれらの範囲の間にある場合、いくらかの効能を見出しうるが、最適ではなく、治療の改善が望まれることを示す。
【０１８８】
上記の工程は、最大効能についての投与量の選択を導くために使用されてもよい。薬剤の最初の投与回数後、血清IL13の中和能が少なくとも1.0ｘED100と同等レベルに達していない場合、更なる投与を与え、このレベルに至る中和能を生じさせる。
【０１８９】
実施例４ 種々のアジュバントと組合せた抗IL13タンパク質ワクチンの免疫原性
追加の雑多なＴ細胞エピトープP30を含むあるいは含まない、数種の異なるアジュバントと組合せたgst−cIL13免疫原の免疫原性を研究するための調査を行った。
【０１９０】
gst−cIL13タンパク質の免疫原性調査
BalbCマウスを、初回免疫としてアジュバント中の100μｇのgst−cIL13を免疫し、これに続き追加免疫としてアジュバント中の50μｇのgst−cIL13を免疫した。
【０１９１】
免疫は4週間に1回を基準として行い、各免疫の2週間後、（血清サンプルにおいて、これらの抗体により生じたIL13中和能のレベルをモニターするため）マウスから血清サンプルを得た。gst−cIL13免疫原は異なる4種のアジュバントと組み合わせた。
【０１９２】
グループＡ 水酸化アルミニウムに吸着させたCpG−2006
グループＢ CpG−1826
グループＣ CFA 初回/IFA 追加免疫
グループＤ 水酸化アルミニウム
【０１９３】
CpG−2006とCpG−1826は非メチル化ＣＧジヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチドであり、免疫賦活活性を有するとして文献公知である。CFA/IFAはそれぞれ完全なおよび不完全なフロイントアジュバントを示す。
【０１９４】
血清サンプル中でこれらの抗体により生じるIL13中和能は、マウスILバイオアッセイ（TF−1細胞増殖アッセイ）において測定した。下記の表は99日目の4種の免疫後の結果（ED100の倍数として表示）を示す。このデータを図31にもグラフで示す。この図、およびそれに続く同様の図において、各ドットは、1匹の動物について1つの血清IL13中和測定値を示す。その血清中和能がアッセイの感度閾値より小さい（＜0.2xED100）動物はプロットされていない。
【０１９５】
【０１９６】
gst−cIL13タンパク質と組み合わせたアジュバントＡ(水酸化アルミニウム上に吸着させたCpG(2006))は、抗IL13中和抗体応答を引き起こす点で最も効果的であった。抗IL13中和抗体応答は、アルムまたはCFA/IFAアジュバントのいずれかと組合せたgst−cIL13により治療されたマウスについては検出されなかった。
【０１９７】
P30−cIL13タンパク質
調査1
この調査のため、IL13ワクチンの異なる形態を使用した。これはＮ末端に破傷風毒素由来のp30エピトープを含む別のキメラIL13分子である。これはプラスミドpCDNcIL13newFC（図20）によりコードされ、ワクチン調査のため実施例1に記載されるように調製した。完全に加工された分子は以下の記載中p30−cIL13と称する。
【０１９８】
5匹のCD−1マウスを、初回免疫としてアジュバント中の40μｇのp30−cIL13で免疫し、これに続き追加免疫としてアジュバント中の40μｇのp30−cIL13で免疫した。免疫は4週間に1回を基準として行い、各免疫の2週間後（存在する抗マウスIL13抗体のレベル、および血清サンプル中でこれらの抗体により生じたIL13中和能をモニターするため）マウスから血清サンプルを得た。ネガティブコントロールとして、3匹の免疫されていないCD−1マウス由来の血清サンプルも分析した。
【０１９９】
グループ アジュバント
Ａ ImmuneasyTM(Qiagen Corp.から購入)
Ｂ 10μｇの3−Ｏ−脱アシル化モノホスホリルリピドＡ(3D−MPL)および10μｇのQS21サポニンを組合わせてコレステロールを含むリポソーム(EP0822831B1, SmithKline Beecham Biologicals S.A.参照)
Ｃ 免疫なし
【０２００】
抗マウスIL13抗体レベル（血清サンプルの1/100希釈中）はELISAにより測定した。下記の表は63日目の3種の免疫の結果(490nmでの吸光度として表示)を示す。このデータは図32にもグラフで示されており、各棒は単一マウスについてのデータを示す。
【０２０１】
【０２０２】
p30−cIL13タンパク質と組合されるアジュバントはともに、CD−1マウスにおいて抗IL13抗体応答を引き起こすことができた。
【０２０３】
血清サンプル中でこれらの抗体により生じたIL13中和能を、マウスIL13バイオアッセイ(TF−1細胞増殖アッセイ)において測定した。下記の表は63日目の3種の免疫の結果（ED100の倍数として表示）を示す。このデータは図33にもグラフで示されている。
【０２０４】
【０２０５】
p30−cIL13タンパク質と組合されるアジュバントＢは、抗IL13中和抗体応答を生じる点で最も効果的であり、5匹のうち4匹のマウスが1ｘED100を超す強力な抗IL13中和抗体応答を生じさせた。比較において、ImmunEasyアジュバント（アジュバントＡ）と組合せたp30−cIL13タンパク質により治療したとき、1匹のマウスのみが抗IL13中和抗体応答を引き起こした。
【０２０６】
調査2
3D−MPLとQS21を含む油乳剤アジュバントを有するp30−cIL13タンパク質
5匹のCD−1マウスを、初回免疫としてアジュバント中の40μｇのp30−cIL13で免疫し、続いて追加免疫としてアジュバント中の40μｇのp30−cIL13で免疫した。免疫は4週間に1回を基準として行い、各免疫の2週間後（存在する抗マウスIL13抗体のレベル、および血清サンプル中でこれらの抗体により生じたIL13中和能をモニターするため）マウスから血清サンプルを得た。ネガティブコントロールとして、3匹の免疫されていないCD−1マウス由来の血清サンプルも分析した。
【０２０７】
グループ アジュバント
Ａ ImmunEasyTM
Ｂ 水中油型乳剤((油相；１：１v/v スクアレン：アルファトコフェロール混合物、コレステロール＋TWEENTM界面活性剤)＋10μｇ 3D−MPLと10μｇ QS21)(さらなる詳細についてはWO 99/11241(SB62c'として記載)参照)
Ｃ 免疫なし
【０２０８】
抗マウスIL13抗体レベル（血清サンプルの1/100希釈液中）をELISAにより測定した。下記の表は63日目の3種の免疫後についての結果(490nmでの吸光度として表示)を示す。このデータを図34にもグラフで示す。
【０２０９】
【０２１０】
p30−cIL13タンパク質と組合されるアジュバントはともに、CD−1マウスにおける抗IL13抗体応答を生じさせることができた。
【０２１１】
血清サンプル中でこれらの抗体により生じたIL13中和能を、マウスIL13バイオアッセイ(TF−1細胞増殖アッセイ)において測定した。下記の表は63日目の3種の免疫後の結果（ED100の倍数として表示）を示す。このデータを図35にもグラフで示す。
【０２１２】
【０２１３】
p30−cIL13タンパク質と組合されるアジュバントＢは、抗IL13中和抗体応答を生じさせる点で最も効果的であり、5匹のうち4匹のマウスが1ｘED100を超す強力な抗IL13中和抗体応答を生じさせた。比較において、ImmunEasyアジュバント（グループＡ）と組合せたp30−cIL13により治療したとき、1匹のマウスのみが抗IL13中和抗体応答を引き起こした。
【０２１４】
調査3
油乳剤アジュバント（免疫賦活性剤を含まない）を有するp30−cIL13タンパク質
5匹のCD−1マウスを、初回免疫としてアジュバント中の40μｇのp30−cIL13により免疫し、続いて追加免疫としてアジュバント中の40μｇのp30−cIL13により免疫した。免疫は4週間に1回を基準として行い、各免疫の2週間後（存在する抗マウスIL13抗体のレベル、および血清サンプル中でこれらの抗体により生じたIL13中和能をモニターするため）マウスから血清サンプルを得た。ネガティブコントロールとして、3種の免疫されていないCD−1マウス由来の血清サンプルも分析した。
【０２１５】
グループ アジュバント
Ａ ImmunEasyTM
Ｂ 水中油型乳剤(油相；1：1 v/v スクアレン：アルファトコフェロール混合物、コレステロール＋TWEEN80TM界面活性剤)(詳細についてはWO9517210参照)
Ｃ 免疫なし
【０２１６】
抗マウスIL13抗体レベル(血清サンプルの1/100希釈液中)をELISAにより測定した。下記の表は63日目の3種の免疫後の結果(490nmでの吸光度として表示)を示している。このデータは図36にもグラフで示されており、各棒グラフは単一マウスについてのデータを示す。
【０２１７】
【０２１８】
p30−cIL13タンパク質と組合せたアジュバントはともに、CD−1マウスにおける抗IL13抗体応答を引き起こすことができた。
【０２１９】
血清サンプル中でこれらの抗体により生じたIL13中和能は、マウスIL13バイオアッセイ(TF−1細胞増殖アッセイ)において測定した。下記の表は63日目の3種の免疫後についての結果（ED100の倍数として表示）を示す。このデータを図37にもグラフで示す。
【０２２０】
【０２２１】
p30−cIL13タンパク質と組合せたアジュバントＢは、抗IL13中和抗体応答を生じさせる点で最も効果的であり、5匹中2匹のマウスで抗IL13中和抗体応答を引き起こした。比較すると、ImmunEasyアジュバント（アジュバントＡ）と組合せたp30−cIL13タンパク質で治療した場合、1匹のマウスのみが抗IL13中和抗体応答を生じさせた。
【０２２２】
まとめ
異系交配CD−1マウス系統において免疫応答を増大させるP30免疫原の能力は、この免疫原の使用が単一の免疫学的背景に限定されるものではなく、P30の有利な効果はまた異系交配のヒト臨床的設定においても得られるはずであることを示唆する点で有意である。
【図面の簡単な説明】
【０２２３】
【図１】図1は、成熟型ヒトIL−13の配列を示す。
【図２】図2は、成熟型マウスIL−13の配列を示す。
【図３】図3は、数種の哺乳動物種のIL−13の配列を示す。
【図４】図4は、ヒト以外の霊長類のIL−13の配列を示す。
【図５】図5は、免疫原1（配列番号10）の配列を示す。
【図６】図6は、免疫原2（配列番号11）の配列を示す。
【図７】図7は、免疫原3（配列番号12）の配列を示す。
【図８】図8は、免疫原4（配列番号13）の配列を示す。
【図９】図9は、免疫原5（配列番号14）の配列を示す。
【図１０】図10は、免疫原6（配列番号15）の配列を示す。
【図１１】図11は、免疫原7（配列番号16）の配列を示す。
【図１２】図12は、免疫原8（配列番号17）の配列を示す。
【図１３】図13は、免疫原9（配列番号18）の配列を示す。
【図１４】図14は、免疫原10（配列番号19）の配列を示す。
【図１５】図15は、免疫原11（配列番号20）の配列を示す。
【図１６】図16は、免疫原12（配列番号21）の配列を示す。
【図１７】図17は、免疫原13（配列番号22）の配列を示す。
【図１８−１】図18−1は、プラスミドpCDNmIL13CDFCのインサートの完全な配列（配列番号23）を示す。
【図１８−２】図18−2は、プラスミドpCDNmIL13CDFCのインサートの完全な配列（配列番号23）を示す。
【図１９−１】図19−1は、プラスミドpCDNmIL13p30FCのインサートの完全な配列（配列番号24）を示す。
【図１９−２】図19−2は、プラスミドpCDNmIL13p30FCのインサートの完全な配列（配列番号24）を示す。
【図２０−１】図20−1は、プラスミドpCDNcIL13newFCのインサートの完全な配列（配列番号26）を示す。
【図２０−２】図20−2は、プラスミドpCDNcIL13newFCのインサートの完全な配列（配列番号26）を示す。
【図２１−１】図21−1は、プラスミドpCDNIL13oldFCのインサートの完全な配列（配列番号29）を示す。
【図２１−２】図21−2は、プラスミドpCDNIL13oldFCのインサートの完全な配列（配列番号29）を示す。
【図２２】図22は、ワクチン処理および抗IL13の受動的投与により処理されたマウス喘息モデルにおいて生じた平均血清IL13中和能を示す。
【図２３】図23は、3mg/mlの５THスパスモゲン濃度の投与によるマウス喘息モデルのチャレンジ後、受けた治療ごとに得られたAHRデータの結果を示す。
【図２４】図24は、マウス喘息モデルにおける受けた治療ごとの効果を、BAL液中の示差細胞計数データとして示す。
【図２５】図25は、マウス喘息モデルにおける受けた治療ごとの効果を、杯状細胞評点で示す。
【図２６Ａ−Ｂ】図26Aはgst−cIL13＋「ImmunEasy」、図26Bはgst＋「ImmunEasy」による治療の代表的な杯状細胞切片を示す。
【図２７Ａ−Ｂ】図27Aはgst−cIL13＋リポソーム＋３D−MPL＋QS21、図27Bはgst＋リポソーム＋3D−MPL＋QS21による治療の代表的な杯状細胞切片を示す。
【図２８】図28はデキサメサゾンによる治療の代表的な杯状細胞切片を示す。
【図２９】図29は最大喘息性表現型の代表的な杯状細胞切片を示す。
【図３０】図30は、杯状細胞化生スコアと、ワクチンにより誘導される血清中のIL13中和能のレベルとの間の関係を示す。
【図３１】図31は、種々のアジュバントがgst−cIL13の免疫原性に及ぼす効果をED100の倍数として表示する。
【図３２】図32は、種々のアジュバントがp30−cIL13の免疫原性に及ぼす効果を、抗マウスIL13抗体レベルとして表示する。
【図３３】図33は、種々のアジュバントがp30−cIL13の免疫原性に及ぼす効果を、ED100の倍数として表示する。
【図３４】図34は、種々のアジュバントがp30−cIL13の免疫原性に及ぼす効果を、抗マウスIL13抗体レベルとして表示する。
【図３５】図35は、種々のアジュバントがp30−cIL13の免疫原性に及ぼす効果を、ED100の倍数として表示する。
【図３６】図36は、種々のアジュバントがp30−cIL13の免疫原性に及ぼす効果を、抗マウスIL13抗体レベルとして表示する。
【図３７】図37は、種々のアジュバントがp30−cIL13の免疫原性に及ぼす効果を、ED100の倍数として表示する。
【技術分野】
【０００１】
本発明は、単離された免疫原、並びにIL−13の中和により治療可能な疾患、例えばCOPD、喘息および、花粉症、接触アレルギー、アトピー性皮膚炎などのアトピー性疾患の治療におけるそれらの使用に関する。最も好ましくは、免疫原は喘息の治療に使用される。特に本発明は、IL−13の天然型のまたは突然変異型のアミノ酸配列と、IL−13配列に挿入もしくは結合された、またはキャリアーポリペプチド中に存在する外来Tヘルパーエピトープとを含む免疫原を用いた哺乳動物のワクチン接種によって、IL−13に対する免疫応答を生じさせることによる、IL−13の生物学的効果の中和に関する。また本発明は、本発明の免疫原をコードするポリヌクレオチド配列を含むDNAワクチンも提供する。本発明はさらに、そのような免疫原を含む医薬組成物、医療へのそれらの使用、およびそれらを製造する方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
COPDは呼吸器管疾患を指す包括的な用語であり、喘息に類似した症状を示し、同一薬により治療される。COPDは慢性、進行性、かつ大部分は回復不能な気流閉塞により特徴付けられる。該疾患の経過に対する個体の寄与は知られていないが、この症例の原因の90％は喫煙であると考えられている。症状には、咳、慢性気管支炎、息切れ、および呼吸器充血が含まれる。最終的にこの疾患は重篤な身体障害および死を招く。
【０００３】
喘息は慢性的肺疾患であり、下気道の炎症を原因とし、再発性の呼吸障害により特徴付けられる。患者の気道は症状がない時でさえ、常にある程度鋭敏でありかつ腫れているかまたは炎症を起こしている。炎症は気道を狭め、肺の内外の空気の流れを減少させ、呼吸困難にし、喘鳴、胸苦しさおよび咳に導く。喘息はアレルゲン（例えばチリダニ、花粉、カビ）、刺激原（例えば煙、蒸気、強力な臭気）、呼吸器感染、運動および乾燥した天候に対する高感受性が誘因となる。そのような誘因は気道を刺激し、気道の内層はなおさら炎症することで腫れあがり、そして粘液が気道を塞ぎ、呼吸が困難かつ圧迫状態になるまで気道の周りの筋肉が締め付けられ、喘息の症状が現れる。
【０００４】
アトピー性疾患は、遺伝性でありかつしばしば同時に起こる疾患群を指し、喘息および花粉症、アトピー性皮膚炎などのアレルギーを含む。アトピー性皮膚炎は、皮膚に影響する慢性疾患である。アトピー性皮膚炎において、皮膚は極端に痒みを生じ、炎症し、発赤し、腫れあがり、ひび割れ、滲出し、痂皮化し、そして皮がむける。アトピー性皮膚炎はほとんどの場合乳児および幼い子供に影響するが、青年期まで続くかまたは後年になって初めて現れる可能性がある。ほとんどの場合、病状の再燃または発赤と呼ばれる疾患が悪化する期間と、それに続く寛解と呼ばれる皮膚が完全に改善または治癒する期間が存在する。アトピー性皮膚炎を有する多くの子供は、彼らが年をとる際に疾患の永久的な寛解を経験するが、彼らの皮膚は多くの場合、乾燥し、かつ刺激を受け易いままである。環境的要因は、アトピー性疾患の形質を遺伝した個体の生活において、常にアトピー性皮膚炎の症状をもたらし得る。アトピー性皮膚炎はしばしば「湿疹」と称され、多くのタイプの皮膚炎に対する一般的用語である。アトピー性皮膚炎は、多くのタイプの湿疹の最も共通するものである。いくつかは非常に似通った症状を有する。
【０００５】
皮膚がアトピー性皮膚炎に冒される仕方は、ひっ掻きの種類と、それによる皮膚感染症によって変化し得る。この疾患を有する一部の人は、赤く皮がむけた皮膚を発症し、皮膚における免疫系が非常に活性化されている。他の者は頻繁に掻きそして擦る結果として、厚く堅い皮膚を発症する。この状態を苔癬化と呼ぶ。さらに他の者は皮膚上に丘疹、または小さく隆起したこぶを発症する。丘疹は掻かれると、口が開き（擦傷）そして痂皮化し、感染し得る。
【０００６】
多くの要因または条件がアトピー性皮膚炎の症状を悪化させる可能性があり、すでに皮膚で過剰活性な免疫系をさらに誘発し、掻痒周期を悪化させ、皮膚へのダメージが増加する。これらの悪化要因は2つの主要なカテゴリー：刺激原（羊毛または合成繊維、目が粗い若しくは肌に合わない衣類、石鹸および洗剤、一部の香水および化粧品、塩素、鉱油、一部の溶媒、埃または砂など）とアレルゲン（花粉、犬または猫のふけ、およびチリダニアレルゲンなど）に分類することができる。情動的要因および一部の感染もアトピー性皮膚炎に影響し得る。
【０００７】
アトピー性皮膚炎による発赤が生じた場合、いくつかの手段を症状の治療に用いることができる。局所的なクリームとしてコルチコステロイドが最も頻繁に使用される治療剤であるが、全身投与も一部の重い症例の場合に使用されている。時には市販の製剤が用いられるが、多くの場合、医師はより強力なコルチコステロイドのクリームまたは軟膏を薦めるであろう。共通して推薦されるコルチコステイドの一例はプレドニソンである。局所的なコルチコイドの繰返しまたは長期にわたる使用の副作用には、皮膚の薄化、感染、（子供における）成長抑制、および皮膚上の張り線（stretch marks）が含まれ得る。皮膚感染を治療する抗生物質は、軟膏中で直接皮膚に塗布し得るが、通常は口から摂取する場合がより効果的である。紫外線AまたはB光波、あるいは両方を同時に用いる光線療法（光による治療）は、ある程度の年のいった子供（12歳以上）および成人における皮膚炎を穏やかに和らげるための治療に効果的であり得る。成人において、シクロスポリンなどの免疫抑制剤も、他のあらゆる療法形態による対応に失敗している重症のアトピー皮膚炎の治療に用いられている。シクロスポリンの副作用は高血圧、吐気、嘔吐、腎機能障害、頭痛、刺痛もしくはしびれ、および癌や感染の可能な危険性の増加を含み得る。
【０００８】
したがって不満足な医療に対するニーズと治療に存在する副作用のために、一般にアトピー性疾患の代替的な治療のニーズ、および特に喘息およびアトピー性皮膚炎の治療のためのニーズがある。
【０００９】
IL−13はIL−4と密接に関連するTh2型サイトカインである。近年の多くの論文で、推進的な病理学において、アレルゲン性喘息のオボアルブミンモデルにおけるIL−13の役割が規定されている(Wills-Karpら, 1998, Science 282:2258-2261； Grunigら, 1998, Science 282:2261-2263)。この研究の中で、オボアルブミンに予め感作されたマウスに、IL−13と結合し、かつ中和する可溶性IL−13レセプターを注射した。処置群において、アセチルコリンチャレンジに対する気道過敏症を減少させた。組織分析は、処置されたマウスがコントロール中に見られる杯状細胞の化生（metaplasia）を回復したことを示した。補完的な実験においては、肺のIL−13レベルは、トランスジェニックマウス中で過剰発現させることによって、または野生型マウスの気管にタンパク質を注入することによって高められた。いずれの設定においても、気道過敏症、好酸球の浸潤および粘液産生の増加が見られた(Zhuら, 1999, J.Clin.Invest. 103:779-788)。
【００１０】
成熟型ヒトIL−13の配列を配列番号１に記載し、また図1に示す。
【００１１】
成熟型マウスIL−13の配列を配列番号2に記載し、また図2に示す。
【００１２】
数種の哺乳動物種およびヒト以外の霊長類由来のIL−13の配列を図3および図4（配列番号3〜9）に示す。
【００１３】
モノクローナル抗体の産生、投与および寛容に関連する種々の問題の結果から、ワクチン接種により、患者自身の免疫系に、適切な特異性を有する内因性の抗体を作るように指示する方法に注目が増している。しかし、哺乳動物は、血清中に存在する自己タンパク質に対する高力価の抗体を一般的に有しておらず、これはその免疫系がそれらの形成を妨げる恒常性機構を含むからである。抗体の「寛容」メカニズムの重要性は、骨格筋のニコチン性アセチルコリンレセプターに対する自己抗体が脱力感および疲労を引き起こす重症筋無力症などの疾患によって説明される（Drachman, 1994, N Engl J Med 330:1797-1810）。
【００１４】
多くの技術が自己抗原に対する「寛容」を破壊する目的で構築されている。1つの技術は、自己タンパク質（またはそれに由来するペプチド）をキーホールリンペットヘモシアニン（keyhole limpet haemocyanin）などの高免疫原性キャリアータンパク質に化学的に交差結合することを含む(「Antibodies: A laboratory manual」 Harlow, E and Lane D. 1988. Cold Spring Harbor Press)。
【００１５】
キャリアータンパク質技術の変形は、キャリアータンパク質（例えばB型肝炎コアタンパク質）と自己タンパク質（「免疫原性ペプチドのキャリアーとしてのB型肝炎ウイルスのコア抗原（The core antigen of hepatitis B virus as a carrier for immunogenic peptide）」，Biological Chemistry. 380(3):277-83, 1999）の両方を含む融合タンパク質をコードする遺伝子の構築を含む。融合遺伝子は核酸ワクチンの一部として直接的に投与されてもよい。あるいは、該遺伝子は、適当な宿主細胞中でin vitroで発現されてもよく、遺伝子産物は精製され、その後、アジュバントとともにまたはアジュバントなしで、慣用のワクチンとして送達される。
【００１６】
別の手法がDalumと共同研究者により記載されており、ここでは単一のMHCクラスIIによって制限されたエピトープを標的分子に挿入する。彼らはユビキチン(Dalumら, 1996, J Immunol 157:4796-4804; Dalumら, 1997, Mol Immunol 34:1113-1120)およびサイトカインTNF(Dalumら, 1999, Nature Biotech 17:666-669)に対する抗体を誘導するためのこの方法の使用を実証した。その結果、全てのT細胞ヘルプは、この単一エピトープまたは接合部配列のいずれかから生じるはずである。そのような手法はEP 0 752 886 B1, WO 95/05849、およびWO 00/65058でも記載されている。
【００１７】
一部にワクチン接種を包含する、数種のサイトカインの中和のための治療法が公知である。WO 00/65058は、サイトカインIL−5の機能をダウンレギュレートする方法、および喘息の治療におけるその使用を記載する。この研究において、IL−5配列が、いくつかの技術によりそれを免疫原性にさせるよう改変され、その中に、IL−5のＢ細胞エピトープを維持しつつ、外来のＴ細胞エピトープが補充されたIL−5免疫原の記載がある。WO 01/62287は、潜在的抗原の長いリスト中に、アレルギーまたは喘息ワクチンの使用のためのIL−13を開示している。WO 00/06937はワクチン抗原として使用するために機能的に不活性化されたサイトカイン誘導体を開示している。キメラIL−13免疫原は、同時係属の特許出願WO 02/070711に開示されている。
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【００１８】
喘息に対する改良された免疫療法および中和する抗IL−13免疫応答を引き出す改良された免疫原が提供されることに対するニーズが依然として存在する。
【課題を解決するための手段】
【００１９】
本発明は、改変された「自己」のIL−13免疫原であって、該IL−13免疫原が外来のT細胞ヘルパーエピトープを含むように改変されている上記免疫原を含む医薬組成物を提供する。医薬組成物は好ましくはヒトの治療において使用され、そしてこの組成物中のIL−13配列は、ヒト配列、またはヒトIL−13を認識する免疫応答を生じさせることが可能な他の配列であり、T細胞ヘルパーエピトープはヒト自己タンパク質について「外来」である。好ましくはTヘルパーエピトープも別の種由来の別のIL−13配列について外来である。しかし、動物用の医薬品を除外せず、例えばイヌまたは他の獣医学種の医薬品は、ヒトワクチンについて上述したものと類似した様式で作製され得る。
【００２０】
本発明の組成物は、IL−13要素およびT細胞ヘルプを提供するための付加的要素を含む。
【発明を実施するための最良の形態】
【００２１】
IL-13要素
最も広い形態のIL−13要素とは、IL−13の生物学的作用を認識し、かつ中和する免疫応答を推進することが可能な全ての配列である。好ましくは、該IL−13はヒトIL−13である。
【００２２】
本発明のこの関連において、IL−13の完全な配列、またはその機能的に同等のフラグメントを用いてもよい。したがって、本文中でのIL−13の参照は、完全配列、その断片または末端切断型を含み得る。
【００２３】
IL−13要素は、天然のIL−13配列またはその突然変異型を含むことができる。したがって、IL−13配列は、例えば天然ヒトIL−13またはその断片であり得る。
【００２４】
本発明の別の一実施形態において、免疫原はキメラIL−13配列を含み、該キメラIL−13配列には、1以上のヒト配列アミノ酸を、別の哺乳動物種由来のIL−13配列内の同じ位置で見られる同等のアミノ酸に取り替えるための置換突然変異が含まれる。ヒトワクチンの免疫原に関し、キメラ配列の目的は、免疫原とヒト天然IL−13との間でアミノ酸配列の多様性を最大にすることであるが、2種の組成間で最大限の形状およびコンホーメーションの相同性は維持される。キメラ免疫原は、表面に露出しないと予想される領域でみられるアミノ酸の置換によってこれを達成する。最も好ましくは、このアミノ酸は、他の哺乳動物種由来のIL−13配列内での同等の位置でみられるアミノ酸配列で置換される。この方法において、配列の多様性は、免疫原の全体的な形状/立体構造への最小の変化により達成される。
【００２５】
本発明の一態様において、αへリックス領域に関連する領域中の置換突然変異を含み、該置換はヒトアミノ酸を、異なる哺乳動物種のIL−13配列内の同一位置に現れるアミノ酸で置換することを含む、ヒトIL−13免疫原が提供される。
【００２６】
最も好ましくは、IL−13配列内の複数の部位で置換突然変異が存在し、ここで少なくとも2以上の突然変異部位が、ヒト以外の異なる哺乳動物種からのアミノ酸を含む置換、より好ましくは、ヒト以外の異なる3以上の哺乳動物種からのアミノ酸を含む置換、および最も好ましくは、ヒト以外の異なる4以上の哺乳動物種からのアミノ酸を含む置換を含む。
【００２７】
好ましくは、置換は、異種間の高保存領域：3PVP, 12ELIEEL, 19NITQ, 28LCN, 32SMVWS, 50SL, 60AI, 64TQ, 87DTKIEVA, 99LL, 106LF、の少なくとも6ヶ所では生じない。
【００２８】
本発明の免疫原の好適なIL−13要素は、天然ヒトIL−13と類似するコンホーメーション形を有するヒトキメラIL−13配列であり、ヒトに投与された際にその免疫原性を高めるために十分なアミノ酸配列の多様性を有しており、該キメラIL−13免疫原が、
(a) 以下のαへリックス領域：
PSTALRELIEELVNIT、MYCAALESLI、KTQRMLSGFまたはAQFVKDLLLHLKKLFRE、の少なくとも2ヶ所に置換突然変異を含む、
(b) 以下の異種間の高保存領域、3PVP, 12ELIEEL, 19NITQ, 28LCN, 32SMVWS, 50SL, 60AI, 64TQ, 87DTKIEVA, 99LL, 106LF、の少なくとも6ヶ所を非突然変異形態で含む、および
(c) 場合により、残りのアミノ酸のいずれかに突然変異を含む、
（ここで、工程a、bまたはcで行われた全ての置換が構造保存置換である）ヒトIL−13の配列を有することを特徴とする。
【００２９】
列挙されたアミノ酸に対する数字の接頭辞は、成熟型ヒトIL−13アミノ酸配列の位置番号を指し、第１の残基「G」に番号2を割り付ける。
【００３０】
上述のキメラIL−13要素の工程(a)に関し、好ましくは少なくとも２ヶ所、より好ましくは少なくとも３ヶ所、そして最も好ましくは４ヵ所全てのαへリックス領域が、少なくとも１の置換突然変異を含む。工程(b)に関し、前記領域の好ましくは少なくとも７ヶ所、より好ましくは少なくとも８ヶ所、より好ましくは少なくとも９ヶ所、より好ましくは少なくとも10ヶ所、そして最も好ましくは11ヵ所全ての領域が突然変異されていない。
【００３１】
好ましくは、上述のキメラIL−13要素におけるそれらの置換または突然変異の50％以上が、ヒト以外のIL−13配列内の同等位置からのアミノ酸を含む。より好ましくは、置換の60、70または80％以上が、ヒト以外の哺乳動物のIL−13配列内の同等位置からのアミノ酸を含む。最も好ましくは、置換または突然変異の各々が、ヒト以外の哺乳動物のIL−13配列内の同等位置からのアミノ酸を含む。
【００３２】
さらにキメラヒトIL−13要素に関し、好ましくはそれらの置換または突然変異の50％以上が、立体構造中のαへリックスであると予想されるヒトIL−13の領域内で生じる。より好ましくは、該置換または突然変異の60、70または80％以上が、立体構造中のαへリックスであると予想されるヒトIL−13の領域内で生じる。最も好ましくは、置換または突然変異の各々が、立体構造中のαへリックスであると予想されるヒトIL−13の領域内で生じる。
【００３３】
さらにキメラヒトIL−13要素に関し、好ましくは該ヒトIL−13配列が２〜20個の置換、より好ましくは6〜15個の置換、そして最も好ましくは13個の置換を含む。
【００３４】
ヒトIL−13ワクチンの場合、IL−13免疫原はオーソロガスなIL−13配列（マウスのIL−13配列など）を基礎とすることができ、該マウスのB細胞エピトープ（表面に露出した領域）は、同等のヒト配列に置換される。この実施形態において、マウスの「主鎖（backbone）」は、外来のT細胞エピトープ、さらにキメラ配列の末端または配列内のいずれかに付加される補足的で雑多な（promiscuous）T細胞エピトープ（P2またはP30など）を提供する。
【００３５】
好適なキメラヒトIL−13免疫原は、ヒトIL−13の配列を含み、そのアミノ酸配列は、ヒト以外の種のIL−13配列内の同等位置、すなわち8T, 11R, 18V, 49E, 62K, 66M, 69G, 84H, 97K, 101L, 105K, 109E, 111Rの13ヶ所の少なくとも6ヶ所、に存在するアミノ酸の特性を示す置換または保存的置換を含む。最も好ましくは、そのようなキメラヒトIL−13免疫原は以下の置換の少なくとも6個、好ましくは全てを含む。
【００３６】
【００３７】
これらの列挙された置換のそれぞれを含むキメラIL−13は、好適なIL−13要素（免疫原1、配列番号10）であり、図5に示されている。別の非常に好ましいIL−13要素は免疫原11（配列番号20、図15参照）、免疫原12（配列番号21、図16参照）および免疫原13（配列番号22、図17参照）である。
【００３８】
IL−13要素は、場合により、免疫原の生物学的活性を破壊する突然変異をさらに含んでいてもよい。以下の置換はヒトIL−13の生物活性を不活性化するのに用いることができる：E 12からI, SまたはY； E12からK； R 65からD；S 68からD； R 108からD。
【００３９】
本発明の特定の態様において、天然IL−13配列の免疫原性フラグメントは、B型肝炎コア粒子における免疫原性ペプチドの提示、または上述のキメラ免疫原との関連において使用されうる。これらの関連において、ヒトIL−13配列の免疫原フラグメントは、好ましくはヒトIL−13配列中にB細胞エピトープを、好ましくは下記の短い配列：
GPVPPSTA
ITQNQKAPLCNGSMVWSINLTAGM
INVSGCS
FCPHKVSAGQFSSLHVRDT
LHLKKLFREGRFN
の少なくとも1以上を含む。
【００４０】
本発明のポリペプチドは、例えばアミノ酸の置換、挿入または欠失などの突然変異により、所望の性質（精製を容易にするまたは免疫原性を増加するシーケンスタグの付加など）を付加するために、あるいは所望でない性質（受容体における望ましくない作動活性など）もしくは膜貫通ドメインを除去するために、さらに改変されてもよい。特に本発明はポリヒスチジンタグなど精製を容易にする融合パートナーまたは発現を高めるGST発現パートナーを具体的に意図している。好適なタグまたは発現パートナーは、IL−13分子のC末端と融合されるヒトIgG1の免疫グロブリンFCである。
【００４１】
生物種間の高い保存性レベルのために突然変異されないままの領域を除き、他の突然変異はIL−13配列中で生じてもよい。好ましくはそのような突然変異は保存的置換である。「保存的置換（conservative substitution）」は、アミノ酸が、ペプチド化学の分野の当業者が実質的に未変化のポリペプチドの二次構造およびヒドロパシー特性(hydropathic nature)を予想し得るような、類似の性質を有する他のアミノ酸に置換されるものをいう。
【００４２】
例えば、特定のアミノ酸は、タンパク質構造中で、例えば抗体の抗原結合領域または基質分子上の結合部位などの構造との相互作用的な結合能の認知され得る欠失を伴わない他のアミノ酸によって置換されてもよい。そのタンパク質の生物学的な機能活性を規定するのはタンパク質の相互作用能および性質であるため、特定のアミノ酸配列の置換は、タンパク質配列中、およびもちろんその根底にあるDNAコード配列中で作ることができ、それでもなお類似の性質を有するタンパク質を獲得させる。したがって、多様な変化を、開示される組成物のペプチド配列、またはそれらの生物学的有用性または活性の認知され得る欠失を伴わない該ペプチドをコードする対応するDNA配列中に作製し得ることが意図される。
【００４３】
そのような変化を作製する場合、アミノ酸のヒドロパシー指数（hydropathic index）が考慮されてもよい。タンパク質に相互作用的な生物学的機能を与える場合、アミノ酸のヒドロパシー指数の重要性は当業界で一般によく理解されている(KyteおよびDoolittle、1982、参照により本明細書中に組み入れる)。アミノ酸の相対的なヒドロパシー特性が、得られるタンパク質の二次構造に寄与し、次にその二次構造によって、別の分子、例えば酵素、基質、レセプター、DNA、抗体、抗原などと該タンパク質との相互作用を規定することが受け入れられている。各アミノ酸は、その疎水度および電荷特性に基づくヒドロパシー指数が割り付けられている(Kyte およびDoolittle, 1982)。それらの値は：イソロイシン（＋4.5）；バリン（＋4.2）；ロイシン（＋3.8）；フェニルアラニン（＋2.8）；システイン/シスチン（＋2.5）；メチオニン（＋1.9）；アラニン（＋1.8）；グリシン（−0.4）；トレオニン（−0.7）；セリン（−0.8）；トリプトファン（−0.9）；チロシン（−1.3）；プロリン（−1.6）；ヒスチジン（−3.2）；グルタミン酸（−3.5）；グルタミン（−3.5）；アスパラギン酸（−3.5）；アスパラギン（−3.5）；リシン（−3.9）；およびアルギニン（−4.5）である。
【００４４】
特定のアミノ酸が、類似するヒドロパシー指数またはスコアを有する他のアミノ酸によって置換され、その結果類似する生物学的活性を有するタンパク質が生じる、すなわち、生物学的に同等機能のタンパク質が依然として得られることは当業界で公知である。そのような変化を作る場合、そのヒドロパシー指数が±２以内であるアミノ酸の置換が好ましく、±1以内のアミノ酸の置換が特に好ましく、そして±0.5以内のアミノ酸の置換がなお一層特に好ましい。同類のアミノ酸の置換が親水性に基づいて効果的にされ得ることも当業界で理解されている。米国特許4,554,101（特にその全体を参照により本明細書中に組み入れる）は、その隣接するアミノ酸の親水性によって支配されるタンパク質の局所的な最大平均親水性は、そのタンパク質の生物学的性質と相関することを述べている。
【００４５】
米国特許4,554,101で詳述されているように、以下の親水性値がアミノ酸残基に対して割り付けられている：アルギニン（＋3.0）；リシン（＋3.0）；アスパラギン酸（＋3.0±1）；グルタミン酸（＋3.0±1）；セリン（＋3.0）；アスパラギン（＋0.2）；グルタミン（＋0.2）；グリシン（0）；トレオニン（−0.4）；プロリン（−0.5±1）；アラニン（−0.5）；ヒスチジン（−0.5）；システイン（−1.0）；メチオニン（−1.3）；バリン（−1.5）；ロイシン（−1.8）；イソロイシン（−1.8）；チロシン（−2.3）；フェニルアラニン（−2.5）；トリプトファン（−3.4）。アミノ酸を類似する親水値を有する他のアミノ酸に置換することができ、そしてなおも生物学的同等物、特に、免疫原的に同等なタンパク質を得ることは理解されている。そのような変化において、その親水性値が±2以内のアミノ酸の置換が好ましく、±1以内のアミノ酸の置換が特に好ましく、±0.5以内のアミノ酸の置換がなお一層特に好ましい。
【００４６】
上で概説したように、アミノ酸置換はそれゆえ、アミノ酸側鎖の置換基の相対的類似性、例えばそれらの疎水性、親水性、電荷、サイズなどに基づくのが一般的である。前述の様々な特性を考慮に入れた例示的な置換は当業者によく知られており、これには、アルギニンとリシン；グルタミン酸とアスパラギン酸；セリンとトレオニン；グルタミンとアスパラギン；ならびにバリンとロイシンとイソロイシンが含まれる。これらは好適な保存的置換である。
【００４７】
アミノ酸置換はさらに、残基の極性、電荷、溶解性、疎水性、親水性および/または両親媒性質の類似性に基づいて行われてもよい。例えば負電荷のアミノ酸にはアスパラギン酸およびグルタミン酸が含まれ、正電荷のアミノ酸にはリシンおよびアルギニンが含まれ、そして類似する親水性値を有する非電荷の極性頭部基（polar head group）を有するアミノ酸にはロイシンとイソロイシンとバリン；グリシンとアラニン；アスパラギンとグルタミン；およびセリンとトレオニンとフェニルアラニンとチロシンが含まれる。保存的変化を示し得る他のアミノ酸グループには、(1)ala, pro, gly, glu, asp, gln, asn, ser, thr；(2)cys, ser, tyr, thr；(3) val, ile, leu, met, ala, phe；(4)lys, arg, his；および(5)phe, tyr, trp, hisが含まれる。
【００４８】
T細胞ヘルプを付与する要素
外来T細胞ヘルプを付与する要素は、本発明の免疫原を作製するためにIL−13要素に結合される。最も好ましいT細胞ヘルパーエピトープは、ヒト配列に対して外来であり、さらにヒト以外の哺乳動物由来のいずれのIL−13配列についても外来である。好ましくは、使用されるT細胞ヘルパーエピトープは小さいものであり、かつ合成、組換えもしくは分子生物学的手段による、IL−13配列の内部または末端での付加または置換事象によってIL−13配列に付加される。代替的に、T細胞ヘルパーエピトープは、IL−13ポリペプチドと、T細胞ヘルパーエピトープを含むキャリアータンパク質との化学的結合によって付加されてもよい。IL−13配列、またはその機能的に同等なフラグメントは、融合タンパク質内でT細胞ヘルパーエピトープと結合していてもよく、ここでその2つは、例えばIL−13配列を取り込むB型肝炎コアタンパク質のように、ともに組換え的に製造される。
【００４９】
小さなT細胞ヘルパーエピトープが使用される本発明の態様において、「外来のT細胞ヘルパーエピトープ」または「T細胞エピトープ」は、MHC II分子と結合し、動物種内でT細胞を刺激することができるペプチドである。好適な外来T細胞エピトープは雑多な(promiscuous)エピトープ、すなわち動物種または集団中で複数の異なるMHCクラスII分子と結合するエピトープである(Panina-Bordignonら, Eur.J.Immunol. 1989, 19:2237-2242；Reeceら, J.Immunol. 1993, 151:6175-6184; WO 95/07707)。
【００５０】
本発明の免疫原が複雑な非近交系のヒト集団において臨床的に効果的であるために、数種の外来T細胞エピトープを含ませることが有利であり得る。雑多なエピトープはこれと同様の効果を達成する別の方法であってもよく、これには破傷風トキソイド（例えばP2とP30エピトープ）、ジフテリアトキソイド、インフルエンザウイルスのヘムアグルチニン(HA)およびP.falciparumのCS抗原由来のものなどの天然のヒトT細胞エピトープが含まれる。本発明に用いるための最も好適なT細胞エピトープは、破傷風トキソイド由来のP2とP30である。
【００５１】
多くの雑多なT細胞エピトープは文献に記載されており、これにはWO 98/23635； Southwoodら, 1998 J. Immunol., 160: 3363-3373； Sinigagliaら, 1988, Nature, 336: 778-780； Rammenseeら, 1995, Immunogenetics, 41: 4, 178-228； Chiczら, 1993, J. Exp. Med., 178:27-47； Hammerら, 1993, Cell 74:197-203；および Falkら, 1994, Immunogenetics, 39: 230-242が含まれる。雑多なT細胞エピトープは、「PADRE」(WO 95/07707)などの人工配列でもあり得る。
【００５２】
異種T細胞エピトープ(heterologous T-cell epitope)は、好ましくは、ヒト体内で多くの個体が発現しているMHC II分子の1以上と結合するエピトープ群から選択される。例えば、特に意図されているエピトープは破傷風トキソイド由来のP2またはP30エピトープである（Panina - Bordignon Eur. J. Immunol 19 (12), 2237 (1989)）。好適な実施形態において、異種T細胞エピトープは破傷風トキシン由来のP2またはP30エピトープである。
【００５３】
P2エピトープは、QYIKANSKFIGITE配列を有し、破傷風トキシンのアミノ酸830〜843に対応する。
【００５４】
P30エピトープ（破傷風トキシンの残基947〜967）はFNNFTVSFWLRVPKVSASHLE配列を有する。FNNFTV配列は場合によっては欠失されてもよい。普遍的な別のTエピトープはPlasmodium falciparumに由来するスポロゾイト周囲蛋白、特にDIEKKIAKMEKASSVFNVVNS配列を有する378〜398領域、に由来し得る(Alexander J, (1994) Immunity 1 (9), p 751-761)。
【００５５】
別のエピトープは、残基288〜302でLSEIKGVIVHRLEGV配列を有する麻疹ウイルスの融合タンパクに由来する(Partidos CD, 1990, J. Gen. Virol 71(9) 2099-2105)。
【００５６】
さらに別のエピトープはB型肝炎ウイルスの表面抗原、特にFFLLTRILTIPQSLD配列を有するアミノ酸に由来する。
【００５７】
別のエピトープの組はジフテリア毒素に由来する。それらのペプチドの４ヵ所（アミノ酸271〜290、321〜340、331〜350、351〜370）は、該毒素のB断片のTドメイン内に位置し、そして残る2つはRドメイン(411〜430、431〜450)内に位置する。
【００５８】
PVFAGANYAAWAVNVAQVI
VHHNTEEIVAQSIALSSLMV
QSIALSSLMVAQAIPLVGEL
VDIGFAAYNFVESIINLFQV
QGESGHDIKITAENTPLPIA
GVLLPTIPGKLDVNKSKTHI
(Raju R., Navaneetham D., Okita D., Diethelm-Okita B., McCormick D., Conti-Fine B. M. (1995) Eur. J. Immunol. 25: 3207-14)。
【００５９】
T細胞ヘルプを与えるために特に好適な要素は、PCT/EP03/06096で開示される「CPC」（clyta-P2-clyta）と称される融合パートナーである。
【００６０】
最も好適な外来T細胞ヘルパーエピトープは、宿主免疫系により耐性でない点、およびそれらが別種（ワクチン接種を受けたものでない）由来のあらゆるIL−13配列に由来するまたはそれから選択される配列ではない点で「外来」である。
【００６１】
天然の自己IL−13が免疫原性キャリアーを有するTヘルパーエピトープと結合される本発明の態様において、その結合は当業界で周知の方法で実施され得る。したがって、例えば直接的な共有結合については、カルボジイミド、グルタルアルデヒドまたはＮ−[γ−マレイミドブチリルオキシ]サクシンイミドエステルを利用すること、CDAPおよびSPDPなどの市販の共通のヘテロ二官能性リンカー（heterobifunctional linker）（製造業者の説明書を用いる）を利用することが可能である。結合反応後、免疫原は透析法、ゲル濾過法、分画法などの手段によって容易に単離および精製される。
【００６２】
本発明の免疫原中で使用されるキャリアーのタイプは、当業者に容易に分かるであろう。本発明中で使用され得る限定的でないキャリアーのリストは、キーホールリンペットヘモシアニン（KLH）、ウシ血清アルブミン（BSA）などの血清アルブミン、破傷風もしくはジフテリア毒素（TTおよびDT）などの細菌性の不活性化毒素、またはその組換え断片（例えば、TTのC断片のドメイン1、DTのトランスロケーションドメイン）、あるいはツベルクリンの精製タンパク質誘導体（PPD）を含む。代替的にIL−13はリポソーム担体(liposome carriers)と直接コンジュゲートされてもよく、T細胞ヘルプを付与することが可能な免疫原をさらに含んでもよい。IL13対キャリアー分子の好適な比は1：1〜20：1（IL−13：キャリアー）程度であり、そして各キャリアーは3〜15個のIL−13分子を保持することが好ましい。
【００６３】
本発明の一実施形態において、好適なキャリアーはHaemophilus influenzae（EP 0 594 610 B1）由来のタンパク質Dである。タンパク質DはHaemophilus influenzae由来のIgD−結合性タンパク質でありForsgrenがその特許を受けている（WO91/18926、認可EP 0 594 610 B1）。いくつかの状況において、例えば、組換え免疫原発現系においては、タンパク質Dの断片、例えばタンパク質Dの3分の1（タンパク質DのN末端の100〜110アミノ酸を含む（GB 9717953.5））を用いるのが望ましいかもしれない。
【００６４】
IL−13またはその免疫原フラグメントを提供する別の好適な方法は、組換え融合分子に関係する。例えばEP 0 421 635 Bは、ウイルス様粒子中で外来ペプチド配列を提供するためのキメラヘパドナウイルスのコア抗原粒子の使用を記載する。したがって、本発明の免疫原は、B型肝炎コア抗原からなるキメラ粒子中に提供されるIL−13を含んでもよい。さらに、組換え融合タンパク質はIL−13、およびインフルエンザウイルスのNS1などのキャリアータンパク質を含んでもよい。本発明の一部を形成する組換え的に発現される全てのタンパク質において、前記免疫原をコードする核酸も本発明の一態様を形成する。
【００６５】
好適な免疫原
上述の節において、好適なIL−13要素の定義、およびT細胞ヘルプを付与する要素が説明されている。本発明の組成物について、本明細書はT細胞ヘルプを付与する要素の節からの個々の好適な各要素とIL−13要素の節からの個々の好適な各要素との組合せを開示することを意図する。特に好適な組合せは、免疫原1，11，12または13と、キャリアータンパク質もしくは雑多なT細胞ヘルパーエピトープとの組合せである。好適なキャリアータンパク質または雑多なT細胞ヘルパーエピトープはタンパク質D、CPC、P2またはP30を含む。
【００６６】
好適な免疫原を形成するための開示する要素の特に好適な組合せを下記に列挙する。
【００６７】
IL−13要素が天然ヒトIL−13であり、そしてT細胞ヘルプを付与する要素が雑多なT細胞エピトープである場合、好適な例は免疫原2（図6、配列番号11参照）を含む。この免疫原2にはタンパク質内に挿入されたP30（下線）を有するヒトIL−13が含まれる（ヒトIL−13のαへリックスCとDの間がループ領域に置換される）。
【００６８】
免疫原3（図7、配列番号12）はN末端でP30を有するヒトIL−13免疫原である。
【００６９】
免疫原4（図8、配列番号13）は、タンパク質内に挿入されたp30を有するマウスIL−13であり（マウスIL−13のαへリックスCとDの間のループ領域に置換される）、これはIL−13自己ワクチンのマウス版の一例である。p30領域は下線部である。
【００７０】
免疫原5（図9、配列番号14）はN末端にp30を有するマウスIL−13である。これはIL−13自己ワクチンのマウス版の一例である。p30領域は下線部であり、また成熟マウスのIL−13タンパク質配列のN末端に位置する。
【００７１】
IL−13要素がキメラIL−13免疫原として提供される特定の例は、免疫原6（図10、配列番号15）を含む。これはワクチンのキメラ形態のマウス版の一例であり、N末端に付加されたP30を有し、マウスB細胞の表面に露出したエピトープに移植された「ヒト主鎖」配列が存在する。
【００７２】
別の好適な免疫原は、ヒトキメラ免疫原IL−13「免疫原1」（配列番号10）を基礎とする。例えば、免疫原1は好適には、N末端にキャリアー「CPC」が融合され、免疫原7（配列番号16、図11参照）を形成する、または免疫原8（配列番号17、図12参照）について、N末端にタンパク質Dが融合される（タンパク質D融合領域はH.influenzaeタンパク質Dを含むアミノ酸S20〜T127に対応する（注、タンパク質DをコードするこのDNA配列は最適化されたコドンである））；またはN末端にP30が融合され、免疫原9（配列番号18、図13参照）を生じる。免疫原9は好適には、あらゆるIL−13の生物学的活性を妨げるためのE121突然変異をさらに含み、免疫原10（配列番号19、図14参照）を与える。
【００７３】
免疫原１〜10について示されるタンパク質およびDNAの配列は、細胞からの産生物の分泌を行うために要求されるシグナル配列のアミノ酸またはDNA配列を除いて示されている。したがって、好適には、前記配列はさらに、シグナル配列をさらに伴って提供される。DNAワクチンにおいて、シグナル配列はT細胞エピトープを含む非ヒト由来の配列であって、T細胞ヘルプをさらに付与するものであるのが特に好ましい。開示された好適な配列のいずれも、産生または精製を容易にする、例えば免疫グロブリンFc、6Hisなどの他の分子と融合した免疫原を発現するために有用であり得るため、終止コドンを有さない。
【００７４】
本明細書中で用いられる付番方式は、「GPVPP」におけるGが残基2を指し、そして残りのアミノ酸はそれに応じて番号が付される点で、IL−13の分野における通常の慣習に準拠している。
【００７５】
ワクチンを設計する方法
本発明の重要な態様において、IL−13活性の中和による治療を受けやすい疾患に罹患しているかあるいは罹り易い個体を治療するためのワクチンを設計する方法が提供される。そのような疾患には、COPD、喘息並びに花粉症、接触アレルギーおよびアトピー性皮膚炎などのアトピー性疾患が含まれる。
【００７６】
本明細書に開示する方法は、2つの主要な工程：1.キメラIL−13免疫原を設計すること、および2.あらゆるヒト自己エピトープについて外来であり、かつあらゆる哺乳動物のIL−13配列についても外来であるT細胞エピトープの供与源をIL−13免疫原に結合させること、を含む。
【００７７】
本背景において、当該方法は、
(a)ヒトIL−13の配列を取得し、αへリックス構造を形成すると予想される領域を同定すること、および
(b)ヒトIL−13の前記αへリックス領域内の配列を突然変異させることにより、保存的置換であるまたは異なる種のIL−13配列内の同等位置に見られるアミノ酸で、ヒト配列由来のアミノ酸を置換すること、および
(c)あらゆるヒトの自己エピトープについて外来であり、かつあらゆる哺乳動物のIL−13配列についても外来であるT細胞エピトープの供与源を結合または挿入すること、
を含む。
【００７８】
一般的原則として、当該方法の目的は免疫原と天然のヒトIL−13との間の最大限の配列多様性を有するキメラ配列を設計することであるが、2つの組成物間で最大限の形状及びコンホーメーションの相同性は維持される。キメラ免疫原は、表面から覆われると予想される領域において見られるアミノ酸を置換することによってこれを達成する。最も好ましくは、アミノ酸は別の哺乳動物種に由来するIL−13配列内の同等位置に見られるアミノ酸で置換される。この方法では、配列多様性は免疫原の全体的な形状/立体構造への最小の変化により達成される。
【００７９】
従って、キメラIL−13免疫原を設計する好ましい方法は、以下の工程を含む。
【００８０】
1．他の種由来のIL13配列を共に収集し、ClustalまたはPileupなどのツールを用いてアラインメントすること、
2．コレクションにわたって本質的に不変な位置内の突然変異を避けること(特に、3PVP, 12ELIEEL, 19NITQ, 28LCN, 32SMVWS, 50SL, 60AI, 64TQ, 87DTKIEVA, 99LL, 106LF)、
3．残りの配列では、へリックス領域(PSTALRELIEELVNIT、MYCAALESLI、KTQRMLSGF、AQFVKDLLLHLKKLFRE)において生じる突然変異を付与すること、
4．場合において、3または4において特定されていない領域が突然変異を含むこと、
5．突然変異は、他の種のIL13分子においてオーソロガスな位置で生じる残基または化学的に保存されるものを考慮することによって選択される。
【００８１】
分子モデリングは、立体衝突などによる全体的な分子の形状に影響を及ぼす可能性の低い特に有利な置換を選択するために使用し得る。
【００８２】
従って、天然のヒトIL−13と類似するコンホーメーション形を有し、その配列中にヒトに投与した際にその免疫原性を高めるために十分なアミノ酸配列の多様性を有しているヒトキメラIL−13免疫原の製造方法が提供され、該方法は以下の工程：
(a) ヒトIL−13の配列を取得すること、および以下のαへリックス領域：PSTALRELIEELVNIT, MYCAALESLI, KTQRMLSGFまたはAQFVKDLLLHLKKLFRE、
の少なくとも2ヶ所で、少なくとも１の置換突然変異を行うこと、
(b) 以下の異種間の高保存領域3PVP, 12ELIEEL, 19NITQ, 28LCN, 32SMVWS, 50SL, 60AI, 64TQ, 87DTKIEVA, 99LL, 106LFの少なくとも6ヶ所を維持すること、
(c) 場合により、残りのいずれかのアミノ酸を突然変異すること、および
(d) あらゆるヒト自己エピトープについて外来であり、かつあらゆる哺乳動物IL−13配列についても外来であるT細胞エピトープの供給源を結合すること、
を含み、工程a、bまたはcで行われた全ての置換が構造的保存置換であることを特徴とする。
【００８３】
工程(a)について、好ましくは少なくとも2ヶ所、より好ましくは少なくとも3ヶ所および最も好ましくは4ヵ所全てのαへリックス領域が少なくとも１の置換突然変異を含む。工程(b)について、好ましくは少なくとも7ヶ所、より好ましくは少なくとも8ヶ所、より好ましくは少なくとも9ヶ所、より好ましくは少なくとも10ヵ所、そして最も好ましくは11ヶ所の領域全てが突然変異されていない。
【００８４】
あるいは、天然のヒトIL−13と類似するコンホーメーション形を有し、その配列中にヒトに投与した際にその免疫原性を高めるために十分なアミノ酸配列の多様性を有しているヒトキメラIL−13免疫原の製造方法であって、該方法が、以下の工程、
(a)異なる種由来のIL−13アミノ酸配列をアラインメントさせること、
(b)高変異領域および高保存領域を同定すること、
(c)ヒトIL−13の配列を取得し、該配列を該高変異領域中で突然変異させることにより、保存的置換であるまたは異なる種のIL−13配列内の同等位置に見られるアミノ酸で、ヒト配列由来のアミノ酸を置換すること、および
(d)あらゆるヒトの自己エピトープについて外来であり、かつあらゆる哺乳動物のIL−13配列についても外来であるT細胞エピトープの供与源を結合することを含む、上記方法が提供される。
【００８５】
本発明の関連した態様においては、また、ヒトキメラIL−13免疫原の製造方法であって、以下の工程、
(a)異なる種由来のIL−13アミノ酸配列をアラインメントさせること、
(b)高変異領域および高保存領域を同定すること、
(c)ヒトIL−13の配列を取得し、該配列を該高保存領域中で突然変異させることにより、保存的置換であるまたは異なる種のIL−13配列内の同等位置に見られるアミノ酸で、ヒト配列由来のアミノ酸を置換すること、および
(d)あらゆるヒトの自己エピトープについて外来であり、かつあらゆる哺乳動物のIL−13配列についても外来であるT細胞エピトープの供与源を結合することを含む、上記方法が提供される。
【００８６】
これらの方法のすべてにおいて、好ましくはそれらの置換または突然変異の50％以上が、ヒト以外のIL−13配列内の同等位置からのアミノ酸を含む。より好ましくは、置換の60、70または80％以上が、ヒト以外の哺乳動物のIL−13配列内の同等位置からのアミノ酸配列を含む。最も好ましくは、置換または突然変異の各々が、ヒト以外の哺乳動物のIL−13配列内の同等位置からのアミノ酸を有する。
【００８７】
さらにヒトキメラ免疫原を設計する方法について、好ましくはこれらの置換または突然変異の50％以上が、立体構造中αへリックスであると予想されるヒトIL−13領域で生じる。より好ましくは置換または突然変異の60、70または80％以上が、立体構造中αへリックスであると予想されるヒトIL−13の領域で生じる。最も好ましくは、置換または突然変異の各々が、立体構造中αへリックスであると予想されるヒトIL−13の領域内で生じる。
【００８８】
さらにヒトキメラ免疫原を設計する方法について、好ましくは、免疫原は2〜20個の置換を含み、より好ましくは6〜15個の置換、そして最も好ましくは13個の置換を含む。
【００８９】
最も好ましくは、上述したそれらの方法のすべてにおいて、IL−13配列内の複数の位置で置換突然変異が存在し、少なくとも2以上の突然変異部位が、ヒト以外の異なる哺乳動物種から選択されるアミノ酸を含む置換、より好ましくはヒト以外の異なる3以上の哺乳動物種から選択されるアミノ酸を含む置換、そして最も好ましくはヒト以外の異なる4以上の哺乳動物種から選択されるアミノ酸を含む置換を含む。
【００９０】
本発明は、また、上記方法のいずれかからも誘導することができる免疫原であって、ワクチンのための適切な手法で製剤化された場合に、ワクチン接種を受けたヒトにおいて免疫原性である、上記免疫原を提供する。
【００９１】
本発明によるポリペプチドの好結果の設計は、例えば適当なワクチン接種計画において、本文中で得られたポリペプチドを投与すること、およびタンパク質に結合することが可能な抗体が誘導されることを観察することによって確認することができる。この結合は、組換えタンパク質または精製された天然タンパク質を用いたELISA法の使用、または感受性細胞または組織に及ぼすタンパク質の効果を試験するバイオアッセイにより評価されてもよい。特に好都合な評価法は、無傷の宿主中でタンパク質の活性と因果的に関連する現象を観察し、そして本発明の方法によって誘導された抗体の存在がその現象をモジュレートするか否かを決定することである。したがって本発明のタンパク質は、天然タンパク質の起源となった種において、天然抗原に対する抗体を生じさせることが可能である。
【００９２】
最も好結果の設計は本明細書の実施例2に記載されるような実験で使用することができ、ワクチン接種を受けた個体の少なくとも50％で、ED100を超える抗IL−13中和免疫応答を誘導する。
【００９３】
ワクチン製剤
本発明のワクチン製剤は、タンパク質に基づくワクチンの形態であってよく、多くの場合にはアジュバントと共に製剤化することができ、あるいはワクチンはDNAもしくはポリヌクレオチドワクチンの形態を取ることができる。
【００９４】
本発明のポリペプチド免疫原は、本発明のポリヌクレオチドによってコードされ得る。当業者であれば、遺伝コードを適用することによってポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの配列を容易に決定することができるだろう。一度、必要とされる核酸配列が決定されると、所望の配列を有するポリヌクレオチドは実施例に記載するように産生することができる。当業者であれば、プライマー及びPCR条件などの必要な任意のパラメーターを容易に適応させることができるだろう。また、当業者であれば、遺伝コードの縮重に起因して、本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドが潜在的には2以上存在することが理解されるだろう。また、本発明のポリヌクレオチドは分泌シグナルペプチドをコードする領域を含み得る。
【００９５】
本発明のポリヌクレオチドは、典型的にはRNA(例えば、mRNA)またはDNA(例えば、ゲノムDNA、cDNAもしくは合成DNA)である。好ましくは、ポリヌクレオチドはDNAであり、特に好ましくはcDNAである。
【００９６】
さらに本発明は、本発明のポリヌクレオチドを含む、核酸構築物の発現ベクターを提供する。その上、核酸構築物は適切なイニシエーター、プロモーター、エンハンサー、および例えば哺乳動物細胞内でのタンパク質発現を可能にするために必要とする場合があり、正しい配向で配置されるポリアデニル化シグナルなどの他のエレメントを含むだろう。
【００９７】
プロモーターは、真核生物プロモーター(例えば、CD68プロモーター、Gal1、Gal10またはNMT1プロモーター)、原核生物プロモーター(例えば、Tac、TrcまたはLac)またはウイルスプロモーター(例えば、サイトメガロウイルスプロモーター、SV40プロモーター、ポリヘドリンプロモーター、P10プロモーターまたは呼吸器合胞体ウイルスLTRプロモーター)であってよい。好ましくは、プロモーターはウイルスプロモーターである。プロモーターが場合によりHCMV IE遺伝子由来のエキソン1を含むサイトメガロウイルス前初期プロモーターである場合が、特に好ましい。
【００９８】
転写調節エレメントには、エンハンサー(例えば、B型肝炎表面抗原3'非翻訳領域、CMVエンハンサー)、イントロン(例えば、CD68イントロンまたはCMVイントロンA)または調節領域(例えば、CMV 5'非翻訳領域)が含まれ得る。
【００９９】
ポリヌクレオチドは、好ましくは核酸構築物上のプロモーターに機能的に連結されることで、当該構築物が哺乳動物細胞に挿入された場合に、ポリヌクレオチドが発現されてコードされるポリペプチドを産生するようにする。
【０１００】
核酸構築物主鎖はRNAまたはDNAであってよく、例えばプラスミドDNA、ウイルスDNA、細菌DNA、細菌人工染色体DNA、酵母人工染色体DNA、合成DNAであってよい。また、核酸構築物が人工核酸(例えば、ホスホロチオエートRNAまたはDNA)であることも可能である。好ましくは、構築物はDNAである。構築物がプラスミドDNAである場合が特に好ましい。
【０１０１】
さらに、本発明は、本発明の発現ベクターを含む宿主細胞を提供する。そのような細胞としては、哺乳動物細胞または例えばバキュロウイルス発現系を用いた昆虫細胞などの一過性または好ましくは安定した高等真核細胞系、酵母などの下等真核細胞、あるいは細菌細胞などの原核細胞が挙げられる。本発明のポリペプチドをコードするベクターの挿入によって改変し得る細胞の例としては、特に哺乳動物細胞のHEK293T、CHO、HeLa、NS0およびCOS細胞が挙げられる。選択する好ましい細胞系は、安定しているだけなく、ポリペプチドの成熟グリコシル化を可能にするものであろう。発現は、形質転換卵母細胞において達成し得る。本発明のポリペプチドは、ヒト以外のトランスジェニック動物(好ましくはマウス)の細胞に発現させてもよく、またはより大きな哺乳動物(例えば、ヤギ、ヒツジおよびウシ)のミルクに発現させてもよい。本発明のポリペプチドを発現するヒト以外のトランスジェニック動物は、本発明の範囲内に含まれる。また、本発明のポリペプチドはアフリカツメガエル(Xenopus laevis)卵母細胞において発現させてもよい。
【０１０２】
また、本発明は、場合により薬学的に許容される担体、好ましくは薬学的に許容される賦形剤(例えば、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)、生理食塩水、デキストロース、水、グリセロール、エタノール、リポソームまたはこれらの組合せ)と共に組合わせた、本発明のポリヌクレオチドもしくは核酸構築物またはポリペプチドの治療上有効な量を含む、医薬組成物またはワクチン組成物を含む。あるいは、ワクチン組成物は、金属ビーズ(好ましくは金ビーズ)上に製剤化された本発明の核酸構築物の治療上有効な量を含み得る。また、本発明のワクチン組成物は、例えばある実施形態ではイミキモド(imiquimod)、ツカレソル(tucaresol)またはアルミニウム塩などのアジュバントを含んでもよい。
【０１０３】
好ましくは、アジュバントは本発明の免疫原と同時に投与され、好ましい実施形態では一緒に製剤化される。本発明によって意図されるそのようなアジュバント剤としては、合成イミダゾキノリン、例えばイミキモド[S-26308, R-837](Harrisonら, 「Reduction of recurrent HSV disease using imiquimod alone or combined with a glycoprotein vaccine」, Vaccine 19: 1820-1826, (2001));およびレシキモド(resiquimod)[S-28463, R-848](Vasilakosら, 「Adjuvant activites of immune response modifier R-848: Comparison with CpG ODN」, Cellular immunology 204: 64-74 (2000))、抗原提示細胞およびT細胞表面上に構成的に発現されるカルボニルおよびアミンのシッフ塩基、例えばツカレソル(Rhodes, J.ら 「Therapeutic potentiation of the immune system by costimulatory Schiff-base-forming drugs」, Nature 377: 71-75 (1995))、サイトカイン、ケモカインおよび共刺激分子、Th1インデューサー、例えばインターフェロンγ、IL−2、IL−12、IL−15およびIL−18、Th2インデューサー、例えば、IL−4、IL−5、IL−6、IL−10、および他のケモカインおよび共刺激遺伝子、例えばMCP−1、MIP−1α、MIP−1β、RANTES、TCA−3、CD80、CD86およびCD40L、他の免疫賦活性標的化リガンド、例えばCTLA−4およびL−セレクチン、アポトーシス刺激タンパク質およびペプチド、例えばFas、(49)、合成脂質に基づくアジュバント、例えばバクスフェクチン(vaxfectin)(Reyesら, 「Vaxfectin enhances antigen specific antibody titres and maintains Th1 type immune responses to plasmid DNA immunization」, Vaccine 19: 3778-3786)、スクアレン、α−トコフェロール、ポリソルベート80、DOPCおよびコレステロール、エンドトキシン、[LPS](Beutler, B., 「Endotoxin, Toll-like receptor 4, and the afferent limb of innate immunity」, Current Opinion in Microbiology 3: 23-30 (2000))；CpGオリゴヌクレオチドおよびジヌクレオチド(Sato, Y.ら,「Immunostimulatory DNA sequences necessary for effective intradermal gene immunization」, Science 273 (5273): 352-354 (1996). Hemmi, H.ら, 「A Toll-like receptor recognizes bacterial DNA」, Nature 408: 740-745, (2000)）およびTh1誘導性サイトカインを産生するためにToll受容体を誘発する他の潜在的なリガンド、例えば合成マイコバクテリウムリポタンパク質、マイコバクテリウムタンパク質p19、ペプチドグリカン、テイコ酸(teichoic acid)、およびリピドAが挙げられるが、この列挙は必ずしも完全ではなく、他の薬剤を除外するものではない。
【０１０４】
優先的にTh1型応答を引き起こすための特定の好ましいアジュバントとしては、例えば、リピドA誘導体、例えばモノホスホリルリピドA、または好ましくは3−O−脱アシル化(3-de-O-acylated)モノホスホリルリピドAが挙げられる。MPL(登録商標)アジュバントは、Corixa Corporation (Seattle, WA;例えば米国特許第4,436,727号;第4,877,611号;第4,866,034号および第4,912,094号参照)から入手可能である。CpG含有オリゴヌクレオチド(CpGジヌクレオチドが非メチル化されているもの)は、また優先的にTh1応答を誘導する。そのようなオリゴヌクレオチドは周知であり、例えば、WO 96/02555、WO 99/33488並びに米国特許第6,008,200号および第5,856,462号に記載されている。また、免疫賦活性DNA配列は、例えばSatoら, Science 273:352, 1996に記載されている。他の好ましいアジュバントには、サポニン(例えば、Quil A)またはその誘導体が含まれ、QS21およびQS7(Aquila Biopharmaceuticals Inc., Framingham, MA); エスシン(Escin); ジギトニン(Digitonin);またはカスミソウ(Gypsophila)もしくはキノア(Chenopodium quinoa)のサポニンが挙げられる。
【０１０５】
特にアジュバントは、(WO96102555)に開示されるような免疫賦活性CpGオリゴヌクレオチドを含む。典型的な免疫賦活性オリゴヌクレオチドは長さが8〜100塩基であり、そして一般式X1CpGX2を含み、ここでX1とX2はヌクレオチド塩基であり、CとGは非メチル化されている。
【０１０６】
本発明のワクチンの利用のための好適なオリゴヌクレオチドは、好ましくは2以上のジヌクレオチドCpGモチーフを含み、該モチーフは好ましくは少なくとも3、より好ましくは少なくとも6以上のヌクレオチドで分離されている。本発明のオリゴヌクレオチドは典型的にはデオキシヌクレオチドである。好適な実施形態において、オリゴヌクレオチド中のインターヌクレオチド(internucleotide)はホスホロジチオエートであり、さらに好ましくはホスホロチオエート結合であるが、ホスホジエステル結合および他のインターヌクレオチド結合は本発明の範囲内であり、これには混在するインターヌクレオチド結合、例えばホスホロチオエート/ホスホジエステルの混在を含むオリゴヌクレオチドが含まれる。オリゴヌクレオチドを安定させる別のインターヌクレオチド結合が用いられてもよい。ホスホロチオエートオリゴヌクレオチドまたはホスホロジチオエートを産生する方法は、US5,666,153, US5,278,302およびWO95/26204に記載されている。
【０１０７】
好適なオリゴヌクレオチドの例は以下の配列を有する。該配列は好適には、ホスホロチオエート改変型のインターヌクレオチド結合を含む。
オリゴ1: TCC ATG ACG TTC CTG ACG TT (CpG 1826)
オリゴ2: TCT CCC AGC GTG CGC CAT (CpG 1758)
オリゴ3: ACC GAT GAC GTC GCC GGT GAC GGC ACC ACG
オリゴ4: TCG TCG TTT TGT CGT TTT GTC GTT (CpG 2006)
オリゴ5: TCC ATG ACG TTC CTG ATG CT (CpG 1668)
【０１０８】
代替的CpGオリゴヌクレオチドは、重要でない欠失または重要でない付加を有する上述の好適配列を含んでもよい。
【０１０９】
本発明に使用されるCpGオリゴヌクレオチドは、当業界で既知のいかなる方法（例えばEP 468520）により合成されてもよい。そのようなオリゴヌクレオチドは自動合成機を用いて都合よく合成されてもよい。マウスにおいて使用される、CpGオリゴヌクレオチド含有アジュバント製剤は、商品名「ImmunEasy」としてQiagenから購入することができる。好ましくは、アジュバントは、約1：1の重量/重量比で水酸化アルミニウムに吸着させたオリゴ1、2、3、4または5として規定されるCpGの1つである。オリゴ4は、ヒトにおける使用に好ましい。
【０１１０】
好ましくは、CpGは、WO 00/62800およびWO 00/09159(これら双方の内容は参照により本明細書に組み入れる)に記載されるQS21などのサポニンと組合わせる。
【０１１１】
治療方法
本発明はアトピー性疾患の新規治療法を提供し、これにはワクチン接種を受けた個体において、IL−13に対する免疫応答を生じさせることが可能な免疫原が含まれる。特に注目すべきは、本発明は、COPD、喘息またはアトピー性皮膚炎に罹患しているあるいはかかり易い個体を治療する方法を提供し、該治療法は、本発明によるワクチンを該個体に投与すること、およびそれによって該個体の血清中で中和する抗IL−13免疫応答を引き起こすこと、およびそれによりCOPD、喘息またはアトピー性皮膚炎の症状を改善または排除することを含む。
【０１１２】
さらに本発明は、喘息治療のための医薬の製造における本発明の免疫原の使用を提供する。さらに、治療を必要とする個体に、本明細書に記載される医薬組成物またはワクチンを投与することを含む喘息の治療方法を提供する。
【０１１３】
好ましくは、医薬組成物はIL−13に対して免疫応答を引き起こすワクチンである。引き起こされる免疫応答は、好ましくは抗体応答であり、最も好ましくはIL−13中和抗体応答である。
【０１１４】
また、本発明は以下のものを提供する：
本発明のポリヌクレオチドを含み、かつ本発明のポリペプチドを発現することが可能な発現ベクター；
本発明の発現ベクターを含む宿主細胞；
本発明のポリペプチドを産生する方法であって、ポリペプチドの発現が得られ、当該ポリペプチドを単離することに好適な条件下で本発明の宿主細胞を維持することを含む、上記方法：
本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドおよび薬学的に許容される担体を含むワクチン組成物。
【０１１５】
本発明の治療方法は喘息の治療方法を提供し、該治療方法は以下の1以上の臨床的効果を含む：
1．気道過敏性(AHR)の減少
2．粘液高分泌および杯状細胞化生の減少
3．気道の上皮下繊維症の減少
4．好酸球レベルの減少
5．吸入コルチコステロイド（ICS）の使用の必要性の減少もIL−13自己ワクチンの使用による治療成功の特徴である。
【０１１６】
本発明の組成物は、予防および治療の両方に使用され得る。本発明は、医療への使用のための、本発明のポリペプチドおよびポリヌクレオチドを提供する。本発明はさらに、アレルギー、喘息およびCOPDなどの呼吸器疾患、寄生虫感染関連疾患、繊維症または肝硬変の治療のための医薬の製造における、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドの使用を提供する。
【０１１７】
本発明はまた、本発明のワクチン組成物の有効量を患者に投与すること、およびワクチン組成物に対する免疫応答を引き起こすことを含むワクチン接種方法を提供する。
【０１１８】
本発明はまた、アレルギー、呼吸器疾患、寄生虫感染関連疾患、繊維症および肝硬変などの、IL−13が仲介する疾患に対する哺乳動物のワクチン接種における使用のための、本明細書中に記載のワクチン組成物を提供する。したがってIL−13に対する中和応答を指令することが可能なワクチン組成物は、ヒトにおける喘息、特にアレルギー性喘息の治療に有用な療法を構成し得る。また、特定の寄生虫感染関連疾患（Brombacher,2000 Bioessays 22:646-656）ならびに、慢性閉塞性肺疾患（COPD）および肝硬変などの繊維症におけるIL−13産生と関連する疾患(Chiaramonteら,1999,J Clin Inv 104:777-785)の治療も応用例として含まれる。
【０１１９】
本発明の治療法は、アトピー性皮膚炎の治療方法を提供し、該治療方法は以下の1以上の臨床的効果を含む：
1．皮膚刺激の減少
2．痒みおよびひっ掻きの減少
3．従来の治療の必要性の減少
4．適用可能であれば、局所的なコルチコステイドの使用の必要性の減少。理想的なIL−13自己ワクチンは、潜在的にICSステロイド治療を不必要にさせることができるが、有益な結果として、ICSの「使用頻度」または「必要服用量」の減少も予想される。
【０１２０】
また本発明は、IL−13が仲介する疾患、それに関連したいずれの症状または疾患を治療または予防する方法であって、本発明のタンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、または医薬組成物の有効量を投与することを含む、上記方法を提供する。医薬組成物の投与は、例えば「初回−追加免疫」(prime-boost)治療ワクチン計画において1以上の個別用量の形態を採ることができる。特定の場合において、「初回（prime）」ワクチン接種は、本発明のポリヌクレオチド、好ましくはプラスミド誘導性ベクター内に組み込まれたポリヌクレオチドの粒子仲介DNA送達を介して行ってもよく、また「追加免疫」は、同一のポリヌクレオチド配列を含む組換えウイルスベクターの投与によるか、またはアジュバント中のタンパク質を用いた追加免疫であってもよい。逆に、初回免疫はウイルスベクター、またはアジュバント中で一般的に製剤化されるタンパク質製剤を用い、追加免疫は本発明のDNAワクチンを用いてもよい。
【０１２１】
本発明は、宿主内で、本発明のワクチンの投与によって、抗自己IL−13抗体応答を生じさせる方法を提供する。
【０１２２】
本発明のワクチン組成物は、多様な方法、例えば口や鼻などの粘膜；肺、筋肉内、皮下または皮内経路を介して投与されてもよい。抗原がタンパク質を主成分とするワクチンとして投与されるべき場合、ワクチンは一般的にはアジュバントとともに製剤化され、また凍結乾燥され、そして使用前に注射用に水中に再懸濁される。そのような組成物は、好ましくは等張性で、注射可能な組成物、例えば滅菌した水性分散液として個体に投与されて得る。そのような組成物は一般的に筋肉内に投与されるが、別の投与経路も可能である。
【０１２３】
皮内投与のための一技術には粒子衝撃（これは「遺伝子銃（gene gun）」技術としても知られ、米国特許第5371015号に記載されている）を含む。タンパク質は糖とともに製剤化され、小粒子を形成し、それらが患者の表面（例えば皮膚）に浸透することを可能とすべく、例えば高圧下で投射装置による発射方法により十分なスピードに加速される。（本発明の核酸ワクチン構築物およびタンパク質糖粒子で被覆した粒子は、本発明の範囲内にあり、そのような粒子を充填した装置も同様である)。受容者に対して核酸構築物または当該構築物を含有する組成物を直接投与する他の方法としては、超音波、電気刺激、エレクトロポレーション、およびUS-5,697,901に記載されるマイクロシーディング(microseeding)が挙げられる。
【０１２４】
また本発明の核酸構築物は、遺伝子治療に有用な特殊化した送達ベクターの手段によって投与してもよい。遺伝子治療方法は、例えばVermeら, Nature 1997, 389:239-242によって考察されている。ウイルス系及び非ウイルス系の双方を使用することができる。ウイルスに基づく系としては、レトロウイルス、レンチウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヘルペスウイルス及びワクシニアウイルスに基づく系が挙げられる。非ウイルスに基づく系としては、核酸の直接投与およびリポソームに基づく系が挙げられる。例えば、ベクターをリポソームによって、またはポリラクチドコグリコリド(polylactide co-glycolide：PLG)粒子内に封入してもよい。また、本発明の核酸構築物は形質転換宿主細胞の手段によって投与してもよい。そのような細胞としては、被験者から回収した細胞が挙げられる。核酸ワクチン構築物をin vitroでそのような細胞に導入し、その後、形質転換細胞を被験者に戻すことができる。本発明の核酸構築物は、細胞に既に存在する核酸に相同組換え事象によって組み込むことができる。望ましい場合には、形質転換細胞をin vitroで成長させ、結果として得られた細胞の1以上を本発明において使用してもよい。細胞は、公知の外科的または顕微手術的技法(例えば、移植、マイクロインジェクションなど)によって患者の適切な部位に提供することができる。好適な細胞としては、樹状細胞が挙げられる。
【０１２５】
送達されるワクチン組成物の量は、免疫される哺乳類の種および体重、治療され/防御される病気の状態の性質、採用されるワクチン接種プロトコル（すなわち、単回投与対反復投与）、投与経路、ならびに選択されるアジュバント化合物の効能および用量に応じて有意に変化する。それらの可変性に基づいて、医師または獣医師は適切な投与量を容易に決定することができるが、投与量が0.5〜5μg/ｋｇの核酸構築物またはそれらを含む組成物であるのは、例えばワクチンが核酸である場合である。特に、投与量は投与経路に応じて変化し得る。例えば、金ビーズによる皮内投与を用いる場合、合計投与量は好ましくは1μg〜10ngであり、特に好ましくは合計投与量は10μｇ〜1nｇである。核酸構築物が直接投与される場合、合計投与量は一般的に高くなり、例えば50μg〜1mg以上である。上述の投与量は平均的な場合の例示である。
【０１２６】
タンパク質ワクチンにおいて、各ワクチン投与におけるタンパク質の量は、一般的なワクチンにおいて、かなり有害な副作用伴わずに免疫保護応答を誘導する量として選択される。そのような量は、どの特異的免疫原が採用されるか、およびそれがどのように提供されるかに応じて変化し得る。一般的に、各投与に1〜1000μg、好ましくは1〜500μg、好ましくは1〜100μg、最も好ましくは1〜50μgのタンパク質が含まれることが予想される。特定のワクチンの最適な量は、ワクチン接種を受けた被験者における適当な免疫応答の観察を含む標準調査によって確認することが可能である。最初のワクチン接種に続いて、被験者は、十分な間隔で、1または複数の追加免疫(booster immunization)を受けてもよい。そのようなワクチン製剤は初回免疫または追加免疫ワクチン接種計画のいずれかであってもよく、例えば、経皮的、皮下的または筋肉内経路を介した全身性の投与、あるいは、例えば鼻腔内または経口経路などを介した粘膜表面に塗布されてもよい。
【０１２７】
より高いまたはより低い投与量の範囲が正当である個別的な例ももちろんあり得るし、そのような例も本発明の範囲内である。
【０１２８】
ワクチン組成物は1回きりの方式でまたは繰返し投与されることも可能であり、例えば1〜7回、好ましくは1〜4回、約１日〜約18ヶ月の間隔で、好ましくは1ヶ月の間隔で投与され得る。これは場合により、患者の寿命に至る期間まで、1〜12ヶ月の通常の間隔で定期的に投与され続けてもよい。一実施形態において、患者は初回―追加免疫計画において異なる形態の抗原を受け取る。したがって、例えば抗原がDNAを主成分とするワクチンとして最初に投与され、その後続いてタンパク質アジュバントを主成分とする製剤として投与され得る。しかしながら、またしてもこの治療計画は、関係する動物の大きさおよび種、投与される核酸ワクチンおよび/またはタンパク質組成物の量、投与経路、使用される全てのアジュバント化合物の効能および用量、および熟練した獣医師または医療従事者に明らかであろう他の要素に応じて有意に変化し得る。
【０１２９】
本明細書中の用語「含む」および「含有する」、または「含むこと」、「含んでなる」、「含有すること」、「含有してなる」などのその変形は、全てを包含するように、すなわちそれらの用語の使用が特に詳述されていない整数または要素を含むことができることを意味するように、また「からなる」と読むことができる排他的意味としても解釈されるべきである。
【０１３０】
本明細書中に記載の通り、本発明は単離されたポリペプチドおよび単離されたポリヌクレオチドに関する。本発明に関わる「単離された」という用語は、少なくなくともある程度まで精製された、または例えば組換え法もしくは機械的合成により合成的に産生された限りにおいて、天然状態でないポリペプチドまたはポリヌクレオチドを意味することを意図する。したがって、「単離された」という用語は、細胞、細胞懸濁液もしくは細胞断片、タンパク質、ペプチド、発現ベクター、有機もしくは無機溶媒、または適切な場合には別の物質などの、別の生物学的または非生物学的物質と組み合わされたポリペプチドまたはポリヌクレオチドの可能性を含むが、ポリヌクレオチドが天然に見出される状態である場合を除外する。
【０１３１】
本発明は、限定的でない以下の実施例で例証される。
【実施例】
【０１３２】
実施例１ 方法
下記の方法について、以下の命名を適用：
1．タンパク質へ挿入された（マウスIL−13のαへリックスCとDの間のループ領域中に置換されている）破傷風毒素のp30エピトープを有するマウスIL−13（mIL−13）と呼ばれる構築物は、mIL13p30CDと称する。
【０１３３】
2．N末端にp30を有するマウスIL−13と呼ばれる構築物は、mIL13p30と称する。
【０１３４】
3．N末端にp30を有するよう設計される新規なキメラ化IL−13と呼ばれる構築物は、cIL13newと称する。
【０１３５】
IL−13サブクローニング/改変：
CDループ内に挿入された破傷風毒素由来のp30エピトープを含むmIL−13をコードする遺伝子（mIL13CD）を合成により調製した。合成遺伝子は5'KpnI制限部位と3'BamHI制限部位を含む。この断片をその後、DHFRをコードするpCDNのKpnIとBamHI制限部位の間にサブクローニングした（Aiyerら、1994）。得られた中間体をその後、FC融合体の挿入により改変した。部位特異的挿入突然変異誘発を、IL−13の終止コドンの前の3'末端コード配列中にフレームを一致させてヒトIgG1FCを正確に挿入するのに用いた（Geisserら、2001）。これは2つの工程で行った。1．IgG1FCは、以下のプライマーセット（正方向：5'..CAACTGTTTCGCCACGGCCCCTTCCTGGAGGTCCTGTTCGGTGGACCAGGATCCGAGCCCAAATCGGCCGAC...3'および逆方向： 5' ...CTAGGTAGTTGGTAACCGTTAACGG...3'）を用い、KOD校正ポリメラーゼ（Novagen）により触媒されるPCR反応において、cDNA鋳型であるpCDN−FCから増幅した。2．得られたPCR産物をゲル精製し、その250ngを、QuickChangeキット（Stratagene）、50ngのmIL−13 CD−p CDNおよび2.5UのPfuTurboを用いる、部位特異的突然変異誘発反応における標的断片として用いた。突然変異誘発プロトコルは95℃で30秒、55℃で30秒、そして68℃で16分の18サイクルからなる。突然変異誘発プロトコルの終了後に、反応液は10UのDpnIにより消化され、天然のメチル化された野生型の鋳型DNAを除去した。最終消化反応液の1μlを、100μlのエピキュリアン化学的コンピテント大腸菌(E.coli)細胞（Epicurian chemically competent E.coli cells）(Stratagene)を形質転換するのに用いた。組換えクローンを制限消化により選別し、そしてポジティブクローン配列をIL−13正方向プライマーおよびpCDN逆方向プライマーを用いて、FC領域にわたり完全に確認した。最終のプラスミド、pCDNmIL13CDFCは、FC除去のためのPreScissionプロテアーゼ開裂部位により分けられるC末端FC融合体をコードする。転写はCMVプロモーターの制御下でなされる。インサートの完全な配列を図18に示す（配列番号23）。
【０１３６】
pCDNmIL13p30FCを、pCDNmIL13CDFCについて上述したのと全く同じ方法で構築し、これはmIL13CD合成遺伝子を、p30エピトープがCDループ内に存在する代わりに成熟タンパク質のN末端に存在するものと置換する。同一の正方向および逆方向プライマーを使用し、FC領域をpCDNmIL13p30内に部位特異的に挿入するための標的断片を生成した。インサートの完全な配列を図19に示す（配列番号24）。
【０１３７】
pCDNcIL13newFCは、cIL13new分子をコードする合成遺伝子および以下の正方向プライマー(5'..AACCTGTTTCGCCGCGGCCCCTTCCTGGAGGTCCTGTTCGGTGGACCAGGATCCGAGCCCAAATCGGCCGAC...3', (配列番号25))および上述と同じ逆方向プライマーを用いて構築し、FC領域をpCDNcIL13newに部位特異的に挿入するための標的断片を生成した。インサートの完全な配列を図20に示す(配列番号26)。
【０１３８】
pCDNIL13oldFCは、マウスキメラIL−13による、pCDNmIL13CDFC内のmIL13CDの部位特異的置換により構築した（WO 02/070711参照）。部位特異的置換は部位特異的挿入のために記載される通りに実施した。cIL13は、以下のプライマー(正方向： 5'...GTGTCTCTCCCTCTGACCCTTAGG...3' (配列番号27) および逆方向： 5'...CAGTTGCTTTGTGTAGCTGAGCAG...3' (配列番号28)を用いて、6His−cIL13からPCR増幅し、pCDNmIL13内に置換するためのターゲティング断片を生成した。これにより、5'末端にコードされるIL−13シグナル配列および3'末端にコードされるPreScission−FC領域の正確な融合体を生じる。インサートの完全な配列を図21に示す（配列番号29）。
【０１３９】
図18〜21の全てにおいて、二重下線部のアミノ酸残基は、分泌シグナル配列（宿主細胞からの発現および分泌中に除去される）を示し、一重下線部の残基はPrecissionプロテアーゼ部位を、およびイタリックの残基はFc融合パートナーを示している。
【０１４０】
安定なCHO E1Aクローンの生成：
プラスミドはDHFRネガティブな、E1A発現系（CHO E1A, ACC317）中で安定に発現する。細胞を低温のリン酸緩衝スクロース中で１x107細胞/mlで再懸濁し、Gene Pulser Cuvetteに移し、そしてGenePulser（Biorad）中で、400ボルトおよび25μFdで、15μgのNotI線状化プラスミドを用いてエレクトロポレートした。エレクトロポレートされた細胞は、ウェルあたり2.5ｘ103の生細胞を、１Xヌクレオシドを含む完全培地中、96ウェルプレート中で平板培養した。48時間後、培地をヌクレオシドを欠く新鮮な培地に交換した。細胞をその後ヌクレオシド欠如下で3〜4週間にわたり選別した。ポジティブクローンを、Origen analyzer（IGEN）上でFC−電気化学発光検出のプロトコル（Yangら、1994）を用いて、ならし培地からのFC発現を監視することにより96ウェルプレートから選別した。ポジティブ細胞系をヌクレオシドが除かれた完全培地で数リットルの量にした。発酵は34℃で10〜11日実施した。FC精製のため、ならし培地を回収し、調製物中0.2μMを滅菌濾過した。
【０１４１】
精製：
マウスIL13CD/Fcは、ProSep−A高性能樹脂（Bioprocessing Limited）上で、CHO培地から捕獲した。マウスIL13CD/Fcを、ProSep−A樹脂から0.1MグリシンpH=3.0を用いて溶出し、１M HEPES pH=7.6を用いて中和し、そして25ｍMリン酸ナトリウム、0.15M 塩化ナトリウムｐH＝７(Spectra/Por(登録商標)7メンブレン，MWCO:8000)に対して透析した。全収量は3.8リットルCHO培地から644mgのマウスIL13CD/Fcであった。別のIL13/Fc融合タンパク質を同様に調製した。
【０１４２】
ワクチン接種調査に使用する前に、これらの分子のFc部分をPrecissionプロテアーゼを用いて切り離し、除去した。得られたワクチン調製物はプレーンテキスト（すなわち下線もイタリックもない）による図18〜21中に示されるアミノ酸残基を本質的に含む。
【０１４３】
参考文献：
Aiyer, N, Baker, E, Wu, H-L, Nambi, P, Edwards, RM, Trill, JJ, Ellis, C, Bergsma, DJ. (1994)： Human AT1 receptor is a single copy gene： characterization in a stable cell line. Molecular and Cellular Biochemistry 131：75-86.
Geiser, M, Cebe, R, Drewello, D, および Schmitz, R (2001)： Integration of PCR Fragments at Any Specific Site within Cloning Vectors without the Use of Restriction Enzymes and DNA Ligase. Biotechniques 31： 88-92.
Yang, H, Leland, JK, Yost, D, Massey, RJ (1994)： Electrochemiluminescence： A new diagnostic and research tool. Biotechnology, 12：193-194.
【０１４４】
実施例２ マウス喘息モデルにおける抗IL−13ワクチンの効能
マウス喘息モデル
オボアルブミンチャレンジマウス喘息モデルは、in vivoで喘息の治療の効能を評価するのに日常的に用いられている。マウスは7日ごとに与えられる2回のオボアルブミンの腹腔内投与により免疫感作され、オボアルブミンに対してマウスを免疫感作する。喘息の表現型は、その後、3回のオボアルブミンの鼻腔内投与により生成可能である。このプロトコルの対象となるマウスは、スパスモゲン５HTに対する高レベルの気道過敏性、肺の炎症（その多くは、肺組織および気管支肺胞洗浄液の著しい好酸球増加を示す）、ならびに大量の肺気道上皮の杯状細胞化生（および粘液高分泌に関連する）を示す。この表現型はヒトの喘息患者においてみられる表現型を模倣する（類似したマウス喘息モデルはScience 1998 vol 282, pp：2258−2261および2261−2263に記載されている）。このモデルはWO 02/070711にも記載されている。
【０１４５】
抗IL−13ワクチン治療
2種類の抗IL−13ワクチン治療の効能について、オボアルブミンチャレンジマウス喘息モデル、すなわちオボアルブミンに対して予め免疫感作されたマウス（Sigma UK Ltd, Poole, Dorset）において評価した。どちらもWO 02/070711に開示されるマウスキメラIL−13分子を主要成分とし、GSTとの融合タンパク質として発現されおよび精製される。該融合タンパク質は本明細書中でgst−cIL13を指す。
【０１４６】
1．ワクチン1 ＝ gst−cIL13 ＋ 「ImmunEasy」アジュバント（Qiagen,Cat.No.303101）。
【０１４７】
2．ワクチン2＝gst−cIL13 ＋ 10μgの3−脱O−アシル化モノホスホリルリピドA（３D−MPL）と10μｇのＱＳ21サポニンとを組合せてコレステロールを含むリポソーム(EP0822831B1, SmithKline Beecham Biologicals S.A.参照)。
【０１４８】
ネガティブコントロールワクチン治療群も含まれる。
【０１４９】
3．ワクチン1のネガティブコントロール＝gst ＋ 「ImmunEasy」アジュバント。
【０１５０】
4．ワクチン2のネガティブコントロール＝gst ＋ 10μgの3−脱O−アシル化モノホスホリルリピドA（３D−MPL）と10μｇのＱＳ21サポニンとを組合せてコレステロールを含むリポソーム(EP0822831B1, SmithKline Beecham Biologicals S.A.参照)。
【０１５１】
オボアルブミンを用いた感作後に、マウスを4種のワクチン投与で免疫し、これは12週間にわたり、4週間毎に各ワクチン投与を与えることにより達成した。マウスをその後、オボアルブミンを用いてチャレンジし、喘息表現型を評価した。
【０１５２】
効能調査における他のコントロール治療群
Ａ．デキサメサゾン(Sigma UK Ltd, Poole, Dorset)は、このマウス喘息モデルにおいて、日常的に使用される最良のステロイド治療剤である。オボアルブミンチャレンジの間、腹腔内経路を介してマウスに1.5ｍｇ/kgのデキサメサゾンを3回投与した。
【０１５３】
Ｂ．抗マウスIL13ポリクローナル抗体（社内でかつてウサギで作られたプロテインＡで精製した試薬）を、このマウス喘息モデルにポジティブコントロール治療剤として受動投与した。このマウス喘息モデルにおいて、完全な抗IL13誘導効果を生じさせるために予め示される抗体投与量を、オボアルブミンチャレンジの間に投与した（＝２x105の終点力価を有するストック0.5mlの3回投与、更なる詳細についてはWO02/070711 A1参照）。
【０１５４】
Ｃ．このモデルが生成する最大表現型は、ネガティブコントロール治療群において生理食塩水を用いることにより樹立された(Fresenius Kabi, Warrington, UK)。マウスに、オボアルブミンチャレンジの間、鼻腔内経路により生理食塩水を3回与えた。生理食塩水治療はこのモデルにおいて効力を示さず、したがって最もひどい喘息の表現型を生じた。
【０１５５】
Ｄ．喘息モデルの表現型と「喘息が誘導されない表現型」との比較のための基準線として、１つの処理群をオボアルブミンで免疫感作したのみで、オボアルブミンチャレンジ投与を与えなかった。これらのマウスは通常の肺の生理機能を示した。
【０１５６】
抗IL−13ワクチン、または抗IL−13ポリクローナル抗体の受動投与、を用いて免疫されたマウスにおいて生じる血清IL13中和能
マウス喘息モデルの最後にワクチンまたは抗IL13ポリクローナル抗体の受動投与により治療されたマウスは、WO02/070711に記載されるマウスIL13誘導TF−1細胞増殖アッセイを用いてIL13中和能について分析される血清サンプルを有していた。この分析により、ND50と称する中和測定値が得られ、これはTF−1細胞増殖アッセイにおいて、5ng/mlのマウスIL13の生物活性を50％まで減少することが可能なマウス血清の最大希釈度を表している。
【０１５７】
本発明者らの先のデータは、抗IL13中和抗体の受動投与を用いたこのマウス喘息モデルにおける最大効能は、ほぼ1/476の血清ND50値と相関することも証明した。本発明者らがED100と称する中和の臨界レベル（100％の効能を与えるのに必要な有効中和投与量）は、一般的にこのレベルに対する血清中和能を発現する。例えば、1/952のND50を有する血清サンプルは2.0ｘED100の中和能を有するということである。1/238のND50を有するサンプルは0.5xED100の中和能を有し得る。
【０１５８】
この実験による血清IL13中和能のデータは図22に示されており、ED100の倍数としてプロットされている。
【０１５９】
キメラIL13ワクチンにより治療された、または抗IL13ポリクローナル抗体を受動的に投与された、全てのマウスは、1ｘED100を超える血清中和を引き起こした。したがって、これらの治療群中のマウスは、喘息モデルにおいて、抗IL13により推進される利益の全てを受け得ることが予測された。
【０１６０】
気道過敏性（AHR）データ
吸入されるスパスモゲンに対する用量反応曲線は、気管支収縮性刺激に対する気道の応答を決定するのに用いられる。これらの曲線は2つの主要な成分からなる。
1．高感受性−用量反応曲線（DRC）における左方シフト
2．高反応性−プラトー反応におけるDRC勾配の増加および/または損失
【０１６１】
これらの成分はともに一般用語である「気管支または気道過敏性」（BHRまたはAHR）を引き起こし、これらは典型的に「気管収縮性刺激に応じた気管の狭小化の容易さおよび度合いの増加」として定義される。
【０１６２】
AHRは５HTスパスモゲンの投与による意識のあるマウスのチャレンジ、そしてその後呼吸の流れと容量パラメータに対する影響を、全身プレチスモグラフィー装置（Buxco, Sharon, CT）を用いて測定した。この分析からの好適な読み出しパラメータは、高められたポーズ（enhanced pause：PENH）の測定である。図23は、3mg/mlの５THスパスモゲン濃度について、PENHの曲線下面積をプロットすることにより得られたこの実験からのAHRデータを示す。データポイントは示された治療群についての平均および標準誤差である。
【０１６３】
ワクチン治療および抗IL13ポリクローナル抗体の受動投与のいずれも、AHRのレベルを低下している点でデキサメサゾンと同じくらい効果的であった。ネガティブコントロールのワクチン治療はAHRを減少しなかった。
【０１６４】
肺の炎症データ
肺の炎症細胞含量を気管支肺胞洗浄（BAL）液において評価した。好酸球、マクロファージ、リンパ球、好中球の平均数は、受けた治療に対してプロットした（図24）。
【０１６５】
ワクチン治療および抗IL13ポリクローナル抗体の受動投与のいずれも、BAL液中の好酸球のレベルを低下している点でデキサメサゾンと同じくらい効果的であった。面白いことに、ネガティブコントロール治療gst＋「ImmunEasy」もBALの好酸球のレベルを効果的に減少するように思われた。これはおそらくpro-Th1活性を有する免疫調節化合物であることが知られている「ImmunEasy」アジュバント中のCpG成分の活性に起因するだろう。
【０１６６】
杯状細胞化生および粘液高分泌データ
粘液を含む杯状細胞は、通常マウスの気道上皮中に有意な頻度で存在しない。この喘息モデルにおいて、オボアルブミンによる感作およびチャレンジの後、気道上皮は、上皮層の化生のために粘液を含む杯状細胞で密に充填されるようになる。
【０１６７】
固定の後、各動物由来の肺の代表サンプルをパラフィン組織学のため処理した。切片を5μに切断し、気道杯状細胞の組織病理学評価のために、αアミラーゼ(Sigma UK Ltd, Poole, Dorset)による前消化とともにABPAS(Alcian blue periodic acid Schiff’s reagent, BDH-Merck)で染色した(Propath UK Ltdによる準備組織学, Hereford, UK)。
【０１６８】
ABPASにより染色された肺切片を、下記に示す６ポイント半定量的評点システム（6-point semi-quantitative scoring system）を用いて、杯状細胞数について評点付けした。結果を図２５に示す。
【０１６９】
杯状細胞の評点システム
スコア 観測
０ 杯状細胞なし
１ 非常に少数の杯状細胞
２ 低い数の杯状細胞
３ 中位の数の杯状細胞
４ 多数の杯状細胞
５ 非常に多量の杯状細胞
【０１７０】
評点システムは線形ではないこと、そして２または３のスコア間の差は上皮中に存在する杯状細胞数に関連して非常に大きいことに注目すべきである。
【０１７１】
治療群の何匹かについての代表的な切片を、図26A，（gst−cIL13＋「ImmunEasy」）；図26B（gst−「ImmunEasy」）；図27A（gst−cIL13＋10μgの3−脱O−アシル化モノホスホリルリピドA（３D−MPL）と10μgのQS21サポニンを組合わせてコレステロールを含むリポソーム(EP0822831B1, SmithKline Beecham Biologicals S.A.参照)）；図28（デキサメサゾン）；図29（最大喘息表現型）に示す。
【０１７２】
ワクチン治療および抗IL13ポリクローナル抗体による受動投与のいずれも気道上皮における粘液含有杯状細胞の数を劇的に減少させた。全ての抗IL13治療についての杯状細胞の減少は、生理食塩水（最大表現型）治療群に対して非常に大きい（p＜0.01）。ネガティブコントロールのワクチンは効果を有さなかった。デキサメサゾン治療は、本調査において杯状細胞化成（GCM）に対しほとんど有効でなかった。
【０１７３】
まとめ
抗IL13ワクチン治療は、マウス喘息モデルにおいて、喘息表現型の阻止に非常に効果的であった。抗IL13ワクチンは、AHRおよび好酸球増加症の治療についてデキサメサゾンと同じくらい効果的であり、杯状細胞化生および粘液高分泌の治療についてはデキサメサゾンより優れていた。
【０１７４】
実施例３ 杯状細胞化成と血清IL13中和能のレベルとの相関
抗IL13ワクチンにより免疫した数匹の動物は、1.0ｘED100より小さなレベルで血清IL13の中和を達成した。これらの動物が何らかの識別可能な利益（ED100は最大利益であると定義されていることを心に留めておく）を得ているか否かを決定するため、それらの動物もオボアルブミンでチャレンジし、GCMの度合いを決定した。以下のデータは、杯状細胞化生スコアと、ワクチンにより誘導される血清中のIL13中和能のレベルとの間の関係を示している。
【０１７５】
杯状細胞についての評点システム
スコア 観測
０ 杯状細胞なし
１ 非常に少数の杯状細胞
２ 低い数の杯状細胞
３ 中位の数の杯状細胞
４ 多数の杯状細胞
５ 非常に多量の杯状細胞
【０１７６】
杯状細胞データを下記の表１および図３０に示す。
【表１】
【０１７７】
1ｘED100より小さい血清IL13中和能を生じさせたマウスのみをこの分析に含めた。その理由は、定義により、1ｘED100と同等またはこれより過剰な血清IL13能を有する動物は、杯状細胞化生を抑制する点で最大効能を得るからである。
【０１７８】
データは、血清IL13中和能のレベルと杯状細胞化生の重傷度との間に相関があることを示す(Ｒ2＝0.52)。IL13の中和レベルが高いほど、杯状細胞化生の重傷度は低い。
【０１７９】
実施例３のデータとともにこれらのデータは、喘息の表現型に対する抗IL13治療の効能の強力な予測因子としてのED100測定値の使用を有効付ける。
【０１８０】
いずれのワクチン、抗体、可溶性レセプターまたは他のIL13中和治療も以下のように評価することができる。
【０１８１】
1．IL13中和治療を患者に所望の投与量および頻度で与える。
【０１８２】
2．血清サンプルを得る。
【０１８３】
3．TF1増殖アッセイなどのIL13バイオアッセイにおいて、血清サンプル、およびその希釈物を分析することにより、血清サンプルのIL13のND50を決定する。バイオアッセイは、５nｇ/mlのマウスIL13の特定の効果の50％を阻害させる最大の血清希釈度を決定することが可能であるように選択される。ヒトIL13を対象とする治療のため、TF1バイオアッセイは依然として使用されるが、刺激性サイトカインは、3〜6ｎｇ/mlの範囲の濃度で使用されるヒトIL13であろう。
【０１８４】
4．得られたND50値を1/476で割り、ED100倍数を得る。
【０１８５】
5．この倍数が1以上の場合、IL13中和治療は喘息表現型において最大効能を有することが期待される。
【０１８６】
6．倍数が1.0よりかなり小さい場合、例えば0.2以下の場合、有意な効能は期待されない。
【０１８７】
7．倍数がこれらの範囲の間にある場合、いくらかの効能を見出しうるが、最適ではなく、治療の改善が望まれることを示す。
【０１８８】
上記の工程は、最大効能についての投与量の選択を導くために使用されてもよい。薬剤の最初の投与回数後、血清IL13の中和能が少なくとも1.0ｘED100と同等レベルに達していない場合、更なる投与を与え、このレベルに至る中和能を生じさせる。
【０１８９】
実施例４ 種々のアジュバントと組合せた抗IL13タンパク質ワクチンの免疫原性
追加の雑多なＴ細胞エピトープP30を含むあるいは含まない、数種の異なるアジュバントと組合せたgst−cIL13免疫原の免疫原性を研究するための調査を行った。
【０１９０】
gst−cIL13タンパク質の免疫原性調査
BalbCマウスを、初回免疫としてアジュバント中の100μｇのgst−cIL13を免疫し、これに続き追加免疫としてアジュバント中の50μｇのgst−cIL13を免疫した。
【０１９１】
免疫は4週間に1回を基準として行い、各免疫の2週間後、（血清サンプルにおいて、これらの抗体により生じたIL13中和能のレベルをモニターするため）マウスから血清サンプルを得た。gst−cIL13免疫原は異なる4種のアジュバントと組み合わせた。
【０１９２】
グループＡ 水酸化アルミニウムに吸着させたCpG−2006
グループＢ CpG−1826
グループＣ CFA 初回/IFA 追加免疫
グループＤ 水酸化アルミニウム
【０１９３】
CpG−2006とCpG−1826は非メチル化ＣＧジヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチドであり、免疫賦活活性を有するとして文献公知である。CFA/IFAはそれぞれ完全なおよび不完全なフロイントアジュバントを示す。
【０１９４】
血清サンプル中でこれらの抗体により生じるIL13中和能は、マウスILバイオアッセイ（TF−1細胞増殖アッセイ）において測定した。下記の表は99日目の4種の免疫後の結果（ED100の倍数として表示）を示す。このデータを図31にもグラフで示す。この図、およびそれに続く同様の図において、各ドットは、1匹の動物について1つの血清IL13中和測定値を示す。その血清中和能がアッセイの感度閾値より小さい（＜0.2xED100）動物はプロットされていない。
【０１９５】
【０１９６】
gst−cIL13タンパク質と組み合わせたアジュバントＡ(水酸化アルミニウム上に吸着させたCpG(2006))は、抗IL13中和抗体応答を引き起こす点で最も効果的であった。抗IL13中和抗体応答は、アルムまたはCFA/IFAアジュバントのいずれかと組合せたgst−cIL13により治療されたマウスについては検出されなかった。
【０１９７】
P30−cIL13タンパク質
調査1
この調査のため、IL13ワクチンの異なる形態を使用した。これはＮ末端に破傷風毒素由来のp30エピトープを含む別のキメラIL13分子である。これはプラスミドpCDNcIL13newFC（図20）によりコードされ、ワクチン調査のため実施例1に記載されるように調製した。完全に加工された分子は以下の記載中p30−cIL13と称する。
【０１９８】
5匹のCD−1マウスを、初回免疫としてアジュバント中の40μｇのp30−cIL13で免疫し、これに続き追加免疫としてアジュバント中の40μｇのp30−cIL13で免疫した。免疫は4週間に1回を基準として行い、各免疫の2週間後（存在する抗マウスIL13抗体のレベル、および血清サンプル中でこれらの抗体により生じたIL13中和能をモニターするため）マウスから血清サンプルを得た。ネガティブコントロールとして、3匹の免疫されていないCD−1マウス由来の血清サンプルも分析した。
【０１９９】
グループ アジュバント
Ａ ImmuneasyTM(Qiagen Corp.から購入)
Ｂ 10μｇの3−Ｏ−脱アシル化モノホスホリルリピドＡ(3D−MPL)および10μｇのQS21サポニンを組合わせてコレステロールを含むリポソーム(EP0822831B1, SmithKline Beecham Biologicals S.A.参照)
Ｃ 免疫なし
【０２００】
抗マウスIL13抗体レベル（血清サンプルの1/100希釈中）はELISAにより測定した。下記の表は63日目の3種の免疫の結果(490nmでの吸光度として表示)を示す。このデータは図32にもグラフで示されており、各棒は単一マウスについてのデータを示す。
【０２０１】
【０２０２】
p30−cIL13タンパク質と組合されるアジュバントはともに、CD−1マウスにおいて抗IL13抗体応答を引き起こすことができた。
【０２０３】
血清サンプル中でこれらの抗体により生じたIL13中和能を、マウスIL13バイオアッセイ(TF−1細胞増殖アッセイ)において測定した。下記の表は63日目の3種の免疫の結果（ED100の倍数として表示）を示す。このデータは図33にもグラフで示されている。
【０２０４】
【０２０５】
p30−cIL13タンパク質と組合されるアジュバントＢは、抗IL13中和抗体応答を生じる点で最も効果的であり、5匹のうち4匹のマウスが1ｘED100を超す強力な抗IL13中和抗体応答を生じさせた。比較において、ImmunEasyアジュバント（アジュバントＡ）と組合せたp30−cIL13タンパク質により治療したとき、1匹のマウスのみが抗IL13中和抗体応答を引き起こした。
【０２０６】
調査2
3D−MPLとQS21を含む油乳剤アジュバントを有するp30−cIL13タンパク質
5匹のCD−1マウスを、初回免疫としてアジュバント中の40μｇのp30−cIL13で免疫し、続いて追加免疫としてアジュバント中の40μｇのp30−cIL13で免疫した。免疫は4週間に1回を基準として行い、各免疫の2週間後（存在する抗マウスIL13抗体のレベル、および血清サンプル中でこれらの抗体により生じたIL13中和能をモニターするため）マウスから血清サンプルを得た。ネガティブコントロールとして、3匹の免疫されていないCD−1マウス由来の血清サンプルも分析した。
【０２０７】
グループ アジュバント
Ａ ImmunEasyTM
Ｂ 水中油型乳剤((油相；１：１v/v スクアレン：アルファトコフェロール混合物、コレステロール＋TWEENTM界面活性剤)＋10μｇ 3D−MPLと10μｇ QS21)(さらなる詳細についてはWO 99/11241(SB62c'として記載)参照)
Ｃ 免疫なし
【０２０８】
抗マウスIL13抗体レベル（血清サンプルの1/100希釈液中）をELISAにより測定した。下記の表は63日目の3種の免疫後についての結果(490nmでの吸光度として表示)を示す。このデータを図34にもグラフで示す。
【０２０９】
【０２１０】
p30−cIL13タンパク質と組合されるアジュバントはともに、CD−1マウスにおける抗IL13抗体応答を生じさせることができた。
【０２１１】
血清サンプル中でこれらの抗体により生じたIL13中和能を、マウスIL13バイオアッセイ(TF−1細胞増殖アッセイ)において測定した。下記の表は63日目の3種の免疫後の結果（ED100の倍数として表示）を示す。このデータを図35にもグラフで示す。
【０２１２】
【０２１３】
p30−cIL13タンパク質と組合されるアジュバントＢは、抗IL13中和抗体応答を生じさせる点で最も効果的であり、5匹のうち4匹のマウスが1ｘED100を超す強力な抗IL13中和抗体応答を生じさせた。比較において、ImmunEasyアジュバント（グループＡ）と組合せたp30−cIL13により治療したとき、1匹のマウスのみが抗IL13中和抗体応答を引き起こした。
【０２１４】
調査3
油乳剤アジュバント（免疫賦活性剤を含まない）を有するp30−cIL13タンパク質
5匹のCD−1マウスを、初回免疫としてアジュバント中の40μｇのp30−cIL13により免疫し、続いて追加免疫としてアジュバント中の40μｇのp30−cIL13により免疫した。免疫は4週間に1回を基準として行い、各免疫の2週間後（存在する抗マウスIL13抗体のレベル、および血清サンプル中でこれらの抗体により生じたIL13中和能をモニターするため）マウスから血清サンプルを得た。ネガティブコントロールとして、3種の免疫されていないCD−1マウス由来の血清サンプルも分析した。
【０２１５】
グループ アジュバント
Ａ ImmunEasyTM
Ｂ 水中油型乳剤(油相；1：1 v/v スクアレン：アルファトコフェロール混合物、コレステロール＋TWEEN80TM界面活性剤)(詳細についてはWO9517210参照)
Ｃ 免疫なし
【０２１６】
抗マウスIL13抗体レベル(血清サンプルの1/100希釈液中)をELISAにより測定した。下記の表は63日目の3種の免疫後の結果(490nmでの吸光度として表示)を示している。このデータは図36にもグラフで示されており、各棒グラフは単一マウスについてのデータを示す。
【０２１７】
【０２１８】
p30−cIL13タンパク質と組合せたアジュバントはともに、CD−1マウスにおける抗IL13抗体応答を引き起こすことができた。
【０２１９】
血清サンプル中でこれらの抗体により生じたIL13中和能は、マウスIL13バイオアッセイ(TF−1細胞増殖アッセイ)において測定した。下記の表は63日目の3種の免疫後についての結果（ED100の倍数として表示）を示す。このデータを図37にもグラフで示す。
【０２２０】
【０２２１】
p30−cIL13タンパク質と組合せたアジュバントＢは、抗IL13中和抗体応答を生じさせる点で最も効果的であり、5匹中2匹のマウスで抗IL13中和抗体応答を引き起こした。比較すると、ImmunEasyアジュバント（アジュバントＡ）と組合せたp30−cIL13タンパク質で治療した場合、1匹のマウスのみが抗IL13中和抗体応答を生じさせた。
【０２２２】
まとめ
異系交配CD−1マウス系統において免疫応答を増大させるP30免疫原の能力は、この免疫原の使用が単一の免疫学的背景に限定されるものではなく、P30の有利な効果はまた異系交配のヒト臨床的設定においても得られるはずであることを示唆する点で有意である。
【図面の簡単な説明】
【０２２３】
【図１】図1は、成熟型ヒトIL−13の配列を示す。
【図２】図2は、成熟型マウスIL−13の配列を示す。
【図３】図3は、数種の哺乳動物種のIL−13の配列を示す。
【図４】図4は、ヒト以外の霊長類のIL−13の配列を示す。
【図５】図5は、免疫原1（配列番号10）の配列を示す。
【図６】図6は、免疫原2（配列番号11）の配列を示す。
【図７】図7は、免疫原3（配列番号12）の配列を示す。
【図８】図8は、免疫原4（配列番号13）の配列を示す。
【図９】図9は、免疫原5（配列番号14）の配列を示す。
【図１０】図10は、免疫原6（配列番号15）の配列を示す。
【図１１】図11は、免疫原7（配列番号16）の配列を示す。
【図１２】図12は、免疫原8（配列番号17）の配列を示す。
【図１３】図13は、免疫原9（配列番号18）の配列を示す。
【図１４】図14は、免疫原10（配列番号19）の配列を示す。
【図１５】図15は、免疫原11（配列番号20）の配列を示す。
【図１６】図16は、免疫原12（配列番号21）の配列を示す。
【図１７】図17は、免疫原13（配列番号22）の配列を示す。
【図１８−１】図18−1は、プラスミドpCDNmIL13CDFCのインサートの完全な配列（配列番号23）を示す。
【図１８−２】図18−2は、プラスミドpCDNmIL13CDFCのインサートの完全な配列（配列番号23）を示す。
【図１９−１】図19−1は、プラスミドpCDNmIL13p30FCのインサートの完全な配列（配列番号24）を示す。
【図１９−２】図19−2は、プラスミドpCDNmIL13p30FCのインサートの完全な配列（配列番号24）を示す。
【図２０−１】図20−1は、プラスミドpCDNcIL13newFCのインサートの完全な配列（配列番号26）を示す。
【図２０−２】図20−2は、プラスミドpCDNcIL13newFCのインサートの完全な配列（配列番号26）を示す。
【図２１−１】図21−1は、プラスミドpCDNIL13oldFCのインサートの完全な配列（配列番号29）を示す。
【図２１−２】図21−2は、プラスミドpCDNIL13oldFCのインサートの完全な配列（配列番号29）を示す。
【図２２】図22は、ワクチン処理および抗IL13の受動的投与により処理されたマウス喘息モデルにおいて生じた平均血清IL13中和能を示す。
【図２３】図23は、3mg/mlの５THスパスモゲン濃度の投与によるマウス喘息モデルのチャレンジ後、受けた治療ごとに得られたAHRデータの結果を示す。
【図２４】図24は、マウス喘息モデルにおける受けた治療ごとの効果を、BAL液中の示差細胞計数データとして示す。
【図２５】図25は、マウス喘息モデルにおける受けた治療ごとの効果を、杯状細胞評点で示す。
【図２６Ａ−Ｂ】図26Aはgst−cIL13＋「ImmunEasy」、図26Bはgst＋「ImmunEasy」による治療の代表的な杯状細胞切片を示す。
【図２７Ａ−Ｂ】図27Aはgst−cIL13＋リポソーム＋３D−MPL＋QS21、図27Bはgst＋リポソーム＋3D−MPL＋QS21による治療の代表的な杯状細胞切片を示す。
【図２８】図28はデキサメサゾンによる治療の代表的な杯状細胞切片を示す。
【図２９】図29は最大喘息性表現型の代表的な杯状細胞切片を示す。
【図３０】図30は、杯状細胞化生スコアと、ワクチンにより誘導される血清中のIL13中和能のレベルとの間の関係を示す。
【図３１】図31は、種々のアジュバントがgst−cIL13の免疫原性に及ぼす効果をED100の倍数として表示する。
【図３２】図32は、種々のアジュバントがp30−cIL13の免疫原性に及ぼす効果を、抗マウスIL13抗体レベルとして表示する。
【図３３】図33は、種々のアジュバントがp30−cIL13の免疫原性に及ぼす効果を、ED100の倍数として表示する。
【図３４】図34は、種々のアジュバントがp30−cIL13の免疫原性に及ぼす効果を、抗マウスIL13抗体レベルとして表示する。
【図３５】図35は、種々のアジュバントがp30−cIL13の免疫原性に及ぼす効果を、ED100の倍数として表示する。
【図３６】図36は、種々のアジュバントがp30−cIL13の免疫原性に及ぼす効果を、抗マウスIL13抗体レベルとして表示する。
【図３７】図37は、種々のアジュバントがp30−cIL13の免疫原性に及ぼす効果を、ED100の倍数として表示する。
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ヒトIL−13を認識する免疫応答を生じさせることが可能なIL−13要素、および1以上の外来T細胞エピトープを含む、免疫原組成物。
【請求項２】
前記T細胞エピトープが、ヒト自己タンパク質、および別の種由来のIL−13配列の双方について外来である、請求項１に記載の免疫原組成物。
【請求項３】
前記T細胞ヘルパーエピトープが、IL−13配列へ付加された短いペプチド配列であるか、またはキャリアータンパク質中に含まれる、請求項１または２に記載の免疫原組成物。
【請求項４】
前記キャリアータンパク質が、Haemophilus influenzaeのタンパク質DおよびCPC（clyta-P2-clyta）から選択される、請求項３に記載の免疫原組成物。
【請求項５】
前記キャリアータンパク質とIL−13要素が融合タンパク質を形成する、請求項３または４に記載の免疫原組成物。
【請求項６】
短いT細胞エピトープが、合成、組換えまたは分子生物学的手法によるIL−13配列内または末端における付加あるいは置換事象により、IL−13配列に付加されている、請求項３に記載の免疫原組成物。
【請求項７】
前記短いT細胞エピトープが、雑多なエピトープである、請求項６に記載の免疫原組成物。
【請求項８】
前記雑多なエピトープが、破傷風トキソイド由来のP2およびP30から選択される、請求項７に記載の免疫原組成物。
【請求項９】
前記IL−13要素が、完全なヒトIL−13配列またはその機能的に同等なフラグメントを含む、請求項１に記載の免疫原組成物。
【請求項１０】
前記IL−13要素が突然変異形態である、請求項９に記載の免疫原組成物。
【請求項１１】
前記突然変異型のIL−13が、アミノ酸を別の哺乳動物種由来のIL−13配列内の同等位置に見られるアミノ酸で置換することによって形成されたキメラIL−13の形態である、請求項１０に記載の免疫原組成物。
【請求項１２】
前記置換がαへリックス領域と関連する領域中で生じる、請求項１１に記載の免疫原組成物。
【請求項１３】
前記置換が、ヒト以外の異なる1以上の哺乳動物種からのアミノ酸を含む、請求項１１または１２に記載の免疫原組成物。
【請求項１４】
前記IL−13要素が、天然のヒトIL−13と類似するコンホーメーション形を有し、その配列中にヒトに投与した際にその免疫原性を高めるために十分なアミノ酸配列の多様性を有しているヒトキメラIL−13配列であって、キメラIL−13免疫原が、
(a) 以下のαへリックス領域：
PSTALRELIEELVNIT、MYCAALESLI、KTQRMLSGFまたはAQFVKDLLLHLKKLFREの少なくとも2ヶ所での置換突然変異を含む、
(b) 以下の異種間高保存領域、3PVP, 12ELIEEL, 19NITQ, 28LCN, 32SMVWS, 50SL, 60AI, 64TQ, 87DTKIEVA, 99LL, 106LF、の少なくとも6ヶ所を非突然変異形態で含む、および
(c) 場合により、残りのアミノ酸のいずれかに突然変異を含む、
（ここで、工程a、bまたはcで行われた全ての置換が構造的保存置換である）ヒトIL−13の配列を有することを特徴とする、請求項１に記載の免疫原組成物。
【請求項１５】
前記置換または突然変異の50％以上が、非ヒトIL−13配列内の同等位置からのアミノ酸を含む、請求項１４に記載の免疫原組成物。
【請求項１６】
前記置換または突然変異の50％以上が、立体構造中のαへリックスであると予想されるヒトIL−13の領域中で生じる、請求項１４または１５に記載の免疫原組成物。
【請求項１７】
前記免疫原が2〜20の置換を含む、請求項１４〜１６のいずれか１項に記載の免疫原組成物。
【請求項１８】
前記IL−13要素が、非ヒトIL−13配列を基礎とするものであって、該非ヒトIL−13の表面に露出した領域が同等のヒト配列に置換されている、請求項１に記載の免疫原組成物。
【請求項１９】
前記ヒトIL−13のアミノ酸配列が、ヒト以外の種のIL−13配列内の同等位置、すなわち8T, 11R, 18V, 49E, 62K, 66M, 69G, 84H, 97K, 101L, 105K, 109E, 111Rの13ヶ所の少なくとも6ヶ所、に存在するアミノ酸の特性を示す置換または保存的置換を含む、請求項１４に記載の免疫原組成物。
【請求項２０】
下記の置換の少なくとも6つを含む、請求項１９に記載の免疫原組成物。
【請求項２１】
前記IL−13要素が以下の群：免疫原１、免疫原11、免疫原12および免疫原13から選択される、請求項１に記載の免疫原組成物。
【請求項２２】
以下の群：免疫原2、免疫原3、免疫原7、免疫原8、免疫原9および免疫原10から選択される、請求項１に記載の免疫原組成物。
【請求項２３】
前記免疫原の生物活性を破壊する突然変異であって、以下の群：E12からI、SまたはY；E12からK；R65からD；S68からD；R108からD、から選択される突然変異をヒトIL−13要素中にさらに含んでなる、請求項１〜２２のいずれか１項に記載の免疫原組成物。
【請求項２４】
請求項１に記載の免疫原組成物を設計する方法であって、
(a)ヒトIL−13の配列を取得し、αへリックス構造を形成すると予想される領域を同定すること、および
(b)ヒトIL−13の前記αへリックス領域内の配列を突然変異させることにより、保存的置換であるまたは異なる種のIL−13配列内の同等位置に見られるアミノ酸で、ヒト配列由来のアミノ酸を置換すること、および
(c)あらゆるヒトの自己エピトープについて外来であり、かつあらゆる哺乳動物のIL−13配列についても外来であるT細胞エピトープの供与源を結合または挿入することを含む、上記方法。
【請求項２５】
天然のヒトIL−13と類似するコンホーメーション形を有し、その配列中にヒトに投与した際にその免疫原性を高めるために十分なアミノ酸配列の多様性を有しているヒトキメラIL−13免疫原の製造方法であって、該方法が、以下の工程、
(a)ヒトIL−13の配列を取得し、以下のαへリックス領域：PSTALRELIEELVNIT、MYCAALESLI、KTQRMLSGFまたはAQFVKDLLLHLKKLFREの少なくとも2ヶ所で、少なくとも１の置換突然変異を行うこと、
(b)以下の異種間高保存領域、3PVP, 12ELIEEL, 19NITQ, 28LCN, 32SMVWS, 50SL, 60AI, 64TQ, 87DTKIEVA, 99LL, 106LF、の少なくとも６ヵ所を保存すること、
(c)場合により、残りのアミノ酸のいずれかを突然変異させること、および
(d)あらゆるヒトの自己エピトープについて外来であり、かつあらゆる哺乳動物のIL−13配列についても外来であるT細胞エピトープの供与源を結合することを含み、工程a、bまたはcで行われた全ての置換が構造的保存置換であることを特徴とする、上記方法。
【請求項２６】
4ヵ所全てのαへリックス領域が少なくとも1の置換突然変異を含む、請求項２５に記載のヒトキメラIL−13免疫原の製造方法。
【請求項２７】
11ヶ所全ての領域が突然変異されていない、請求項２５に記載のヒトキメラIL−13免疫原の製造方法。
【請求項２８】
天然のヒトIL−13と類似するコンホーメーション形を有し、その配列中にヒトに投与した際にその免疫原性を高めるために十分なアミノ酸配列の多様性を有しているヒトキメラIL−13免疫原の製造方法であって、該方法が、以下の工程、
(a)異なる種由来のIL−13アミノ酸配列をアラインメントすること、
(b)高変異領域および高保存領域を同定すること、
(c)ヒトIL−13の配列を取得し、該配列を該高変異領域中で突然変異させることにより、保存的置換であるまたは異なる種のIL−13配列内の同等位置に見られるアミノ酸で、ヒト配列由来のアミノ酸を置換すること、および
(d)あらゆるヒトの自己エピトープについて外来であり、かつあらゆる哺乳動物のIL−13配列についても外来であるT細胞エピトープの供与源を結合することを含む、上記方法。
【請求項２９】
前記置換または突然変異の50％以上が、ヒト以外の種のIL−13配列内の同等位置からのアミノ酸を含む、請求項２４〜２８のいずれか１項に記載のヒトキメラIL−13免疫原の製造方法。
【請求項３０】
前記置換または突然変異の50％以上が、立体構造中のαへリックスであると予想されるヒトIL−13の領域で生じる、請求項２４〜２８のいずれか１項に記載のヒトキメラIL−13免疫原の製造方法。
【請求項３１】
置換または突然変異が、少なくとも2の非ヒトIL−13配列内の同等位置からのアミノ酸を含む、請求項２４〜２８のいずれか１項に記載のヒトキメラIL−13免疫原の製造方法。
【請求項３２】
前記免疫原が6〜20の置換、および最も好ましくは6〜10の置換を含む、請求項２４〜２８のいずれか１項に記載のヒトキメラIL−13免疫原の製造方法。
【請求項３３】
ワクチンのための適切な手法で製剤化された場合に、前記免疫原がワクチン接種を受けたヒトにおいて免疫原性である、請求項２４〜２８のいずれか１項に記載の方法から誘導することができる免疫原。
【請求項３４】
請求項１〜２３及び３３のいずれか１項に記載の免疫原を含むワクチン。
【請求項３５】
請求項１〜２３及び３３のいずれか１項に記載の免疫原をコードするポリヌクレオチドを含むポリヌクレオチドワクチン。
【請求項３６】
COPD、喘息またはアトピー性皮膚炎に罹患しているあるいは罹り易い個体を治療する方法であって、請求項３４に記載のワクチンを該個体に投与すること、およびそれにより該個体の血清中で中和する抗IL−13免疫応答を引き起こすこと、およびそれによりCOPD、喘息またはアトピー性皮膚炎の症状を改善または排除することを含む、上記方法。
【請求項３７】
以下の臨床的効果、
・気道過敏性（AHR）の減少、
・粘液高分泌および杯状細胞化生の減少、
・気道の上皮下繊維症の減少、
・好酸球レベルの減少、および、
・IL−13自己ワクチンの使用による治療成功の特徴でもある吸入コルチコステロイド（ICS）の使用の必要性の減少、
の1以上を含む、請求項３６に記載の喘息の治療方法。
【請求項３８】
以下の臨床的効果、
・皮膚刺激の減少、
・痒みおよびひっ掻きの減少、
・従来の治療の必要性の減少、および、
・適用可能であれば、局所的なコルチコステロイドの使用の必要性の減少であり、理想的なIL−13自己ワクチンは潜在的にICSステロイド治療を不必要にさせることができるが、有益な結果として、ICSの「使用頻度」または「必要服用量」の減少も予想される、
の1以上を含む、請求項３６に記載のアトピー性皮膚炎の治療方法。
【請求項１】
ヒトIL−13を認識する免疫応答を生じさせることが可能なIL−13要素、および1以上の外来T細胞エピトープを含む、免疫原組成物。
【請求項２】
前記T細胞エピトープが、ヒト自己タンパク質、および別の種由来のIL−13配列の双方について外来である、請求項１に記載の免疫原組成物。
【請求項３】
前記T細胞ヘルパーエピトープが、IL−13配列へ付加された短いペプチド配列であるか、またはキャリアータンパク質中に含まれる、請求項１または２に記載の免疫原組成物。
【請求項４】
前記キャリアータンパク質が、Haemophilus influenzaeのタンパク質DおよびCPC（clyta-P2-clyta）から選択される、請求項３に記載の免疫原組成物。
【請求項５】
前記キャリアータンパク質とIL−13要素が融合タンパク質を形成する、請求項３または４に記載の免疫原組成物。
【請求項６】
短いT細胞エピトープが、合成、組換えまたは分子生物学的手法によるIL−13配列内または末端における付加あるいは置換事象により、IL−13配列に付加されている、請求項３に記載の免疫原組成物。
【請求項７】
前記短いT細胞エピトープが、雑多なエピトープである、請求項６に記載の免疫原組成物。
【請求項８】
前記雑多なエピトープが、破傷風トキソイド由来のP2およびP30から選択される、請求項７に記載の免疫原組成物。
【請求項９】
前記IL−13要素が、完全なヒトIL−13配列またはその機能的に同等なフラグメントを含む、請求項１に記載の免疫原組成物。
【請求項１０】
前記IL−13要素が突然変異形態である、請求項９に記載の免疫原組成物。
【請求項１１】
前記突然変異型のIL−13が、アミノ酸を別の哺乳動物種由来のIL−13配列内の同等位置に見られるアミノ酸で置換することによって形成されたキメラIL−13の形態である、請求項１０に記載の免疫原組成物。
【請求項１２】
前記置換がαへリックス領域と関連する領域中で生じる、請求項１１に記載の免疫原組成物。
【請求項１３】
前記置換が、ヒト以外の異なる1以上の哺乳動物種からのアミノ酸を含む、請求項１１または１２に記載の免疫原組成物。
【請求項１４】
前記IL−13要素が、天然のヒトIL−13と類似するコンホーメーション形を有し、その配列中にヒトに投与した際にその免疫原性を高めるために十分なアミノ酸配列の多様性を有しているヒトキメラIL−13配列であって、キメラIL−13免疫原が、
(a) 以下のαへリックス領域：
PSTALRELIEELVNIT、MYCAALESLI、KTQRMLSGFまたはAQFVKDLLLHLKKLFREの少なくとも2ヶ所での置換突然変異を含む、
(b) 以下の異種間高保存領域、3PVP, 12ELIEEL, 19NITQ, 28LCN, 32SMVWS, 50SL, 60AI, 64TQ, 87DTKIEVA, 99LL, 106LF、の少なくとも6ヶ所を非突然変異形態で含む、および
(c) 場合により、残りのアミノ酸のいずれかに突然変異を含む、
（ここで、工程a、bまたはcで行われた全ての置換が構造的保存置換である）ヒトIL−13の配列を有することを特徴とする、請求項１に記載の免疫原組成物。
【請求項１５】
前記置換または突然変異の50％以上が、非ヒトIL−13配列内の同等位置からのアミノ酸を含む、請求項１４に記載の免疫原組成物。
【請求項１６】
前記置換または突然変異の50％以上が、立体構造中のαへリックスであると予想されるヒトIL−13の領域中で生じる、請求項１４または１５に記載の免疫原組成物。
【請求項１７】
前記免疫原が2〜20の置換を含む、請求項１４〜１６のいずれか１項に記載の免疫原組成物。
【請求項１８】
前記IL−13要素が、非ヒトIL−13配列を基礎とするものであって、該非ヒトIL−13の表面に露出した領域が同等のヒト配列に置換されている、請求項１に記載の免疫原組成物。
【請求項１９】
前記ヒトIL−13のアミノ酸配列が、ヒト以外の種のIL−13配列内の同等位置、すなわち8T, 11R, 18V, 49E, 62K, 66M, 69G, 84H, 97K, 101L, 105K, 109E, 111Rの13ヶ所の少なくとも6ヶ所、に存在するアミノ酸の特性を示す置換または保存的置換を含む、請求項１４に記載の免疫原組成物。
【請求項２０】
下記の置換の少なくとも6つを含む、請求項１９に記載の免疫原組成物。
【請求項２１】
前記IL−13要素が以下の群：免疫原１、免疫原11、免疫原12および免疫原13から選択される、請求項１に記載の免疫原組成物。
【請求項２２】
以下の群：免疫原2、免疫原3、免疫原7、免疫原8、免疫原9および免疫原10から選択される、請求項１に記載の免疫原組成物。
【請求項２３】
前記免疫原の生物活性を破壊する突然変異であって、以下の群：E12からI、SまたはY；E12からK；R65からD；S68からD；R108からD、から選択される突然変異をヒトIL−13要素中にさらに含んでなる、請求項１〜２２のいずれか１項に記載の免疫原組成物。
【請求項２４】
請求項１に記載の免疫原組成物を設計する方法であって、
(a)ヒトIL−13の配列を取得し、αへリックス構造を形成すると予想される領域を同定すること、および
(b)ヒトIL−13の前記αへリックス領域内の配列を突然変異させることにより、保存的置換であるまたは異なる種のIL−13配列内の同等位置に見られるアミノ酸で、ヒト配列由来のアミノ酸を置換すること、および
(c)あらゆるヒトの自己エピトープについて外来であり、かつあらゆる哺乳動物のIL−13配列についても外来であるT細胞エピトープの供与源を結合または挿入することを含む、上記方法。
【請求項２５】
天然のヒトIL−13と類似するコンホーメーション形を有し、その配列中にヒトに投与した際にその免疫原性を高めるために十分なアミノ酸配列の多様性を有しているヒトキメラIL−13免疫原の製造方法であって、該方法が、以下の工程、
(a)ヒトIL−13の配列を取得し、以下のαへリックス領域：PSTALRELIEELVNIT、MYCAALESLI、KTQRMLSGFまたはAQFVKDLLLHLKKLFREの少なくとも2ヶ所で、少なくとも１の置換突然変異を行うこと、
(b)以下の異種間高保存領域、3PVP, 12ELIEEL, 19NITQ, 28LCN, 32SMVWS, 50SL, 60AI, 64TQ, 87DTKIEVA, 99LL, 106LF、の少なくとも６ヵ所を保存すること、
(c)場合により、残りのアミノ酸のいずれかを突然変異させること、および
(d)あらゆるヒトの自己エピトープについて外来であり、かつあらゆる哺乳動物のIL−13配列についても外来であるT細胞エピトープの供与源を結合することを含み、工程a、bまたはcで行われた全ての置換が構造的保存置換であることを特徴とする、上記方法。
【請求項２６】
4ヵ所全てのαへリックス領域が少なくとも1の置換突然変異を含む、請求項２５に記載のヒトキメラIL−13免疫原の製造方法。
【請求項２７】
11ヶ所全ての領域が突然変異されていない、請求項２５に記載のヒトキメラIL−13免疫原の製造方法。
【請求項２８】
天然のヒトIL−13と類似するコンホーメーション形を有し、その配列中にヒトに投与した際にその免疫原性を高めるために十分なアミノ酸配列の多様性を有しているヒトキメラIL−13免疫原の製造方法であって、該方法が、以下の工程、
(a)異なる種由来のIL−13アミノ酸配列をアラインメントすること、
(b)高変異領域および高保存領域を同定すること、
(c)ヒトIL−13の配列を取得し、該配列を該高変異領域中で突然変異させることにより、保存的置換であるまたは異なる種のIL−13配列内の同等位置に見られるアミノ酸で、ヒト配列由来のアミノ酸を置換すること、および
(d)あらゆるヒトの自己エピトープについて外来であり、かつあらゆる哺乳動物のIL−13配列についても外来であるT細胞エピトープの供与源を結合することを含む、上記方法。
【請求項２９】
前記置換または突然変異の50％以上が、ヒト以外の種のIL−13配列内の同等位置からのアミノ酸を含む、請求項２４〜２８のいずれか１項に記載のヒトキメラIL−13免疫原の製造方法。
【請求項３０】
前記置換または突然変異の50％以上が、立体構造中のαへリックスであると予想されるヒトIL−13の領域で生じる、請求項２４〜２８のいずれか１項に記載のヒトキメラIL−13免疫原の製造方法。
【請求項３１】
置換または突然変異が、少なくとも2の非ヒトIL−13配列内の同等位置からのアミノ酸を含む、請求項２４〜２８のいずれか１項に記載のヒトキメラIL−13免疫原の製造方法。
【請求項３２】
前記免疫原が6〜20の置換、および最も好ましくは6〜10の置換を含む、請求項２４〜２８のいずれか１項に記載のヒトキメラIL−13免疫原の製造方法。
【請求項３３】
ワクチンのための適切な手法で製剤化された場合に、前記免疫原がワクチン接種を受けたヒトにおいて免疫原性である、請求項２４〜２８のいずれか１項に記載の方法から誘導することができる免疫原。
【請求項３４】
請求項１〜２３及び３３のいずれか１項に記載の免疫原を含むワクチン。
【請求項３５】
請求項１〜２３及び３３のいずれか１項に記載の免疫原をコードするポリヌクレオチドを含むポリヌクレオチドワクチン。
【請求項３６】
COPD、喘息またはアトピー性皮膚炎に罹患しているあるいは罹り易い個体を治療する方法であって、請求項３４に記載のワクチンを該個体に投与すること、およびそれにより該個体の血清中で中和する抗IL−13免疫応答を引き起こすこと、およびそれによりCOPD、喘息またはアトピー性皮膚炎の症状を改善または排除することを含む、上記方法。
【請求項３７】
以下の臨床的効果、
・気道過敏性（AHR）の減少、
・粘液高分泌および杯状細胞化生の減少、
・気道の上皮下繊維症の減少、
・好酸球レベルの減少、および、
・IL−13自己ワクチンの使用による治療成功の特徴でもある吸入コルチコステロイド（ICS）の使用の必要性の減少、
の1以上を含む、請求項３６に記載の喘息の治療方法。
【請求項３８】
以下の臨床的効果、
・皮膚刺激の減少、
・痒みおよびひっ掻きの減少、
・従来の治療の必要性の減少、および、
・適用可能であれば、局所的なコルチコステロイドの使用の必要性の減少であり、理想的なIL−13自己ワクチンは潜在的にICSステロイド治療を不必要にさせることができるが、有益な結果として、ICSの「使用頻度」または「必要服用量」の減少も予想される、
の1以上を含む、請求項３６に記載のアトピー性皮膚炎の治療方法。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【図１５】
【図１６】
【図１７】
【図１８−１】
【図１８−２】
【図１９−１】
【図１９−２】
【図２０−１】
【図２０−２】
【図２１−１】
【図２１−２】
【図２２】
【図２３】
【図２４】
【図２５】
【図２６Ａ−Ｂ】
【図２７Ａ−Ｂ】
【図２８】
【図２９】
【図３０】
【図３１】
【図３２】
【図３３】
【図３４】
【図３５】
【図３６】
【図３７】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【図１５】
【図１６】
【図１７】
【図１８−１】
【図１８−２】
【図１９−１】
【図１９−２】
【図２０−１】
【図２０−２】
【図２１−１】
【図２１−２】
【図２２】
【図２３】
【図２４】
【図２５】
【図２６Ａ−Ｂ】
【図２７Ａ−Ｂ】
【図２８】
【図２９】
【図３０】
【図３１】
【図３２】
【図３３】
【図３４】
【図３５】
【図３６】
【図３７】
【公表番号】特表２００６−５０３０１７（Ｐ２００６−５０３０１７Ａ）
【公表日】平成１８年１月２６日（２００６．１．２６）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００４−５３２２８４（Ｐ２００４−５３２２８４）
【出願日】平成１５年８月２８日（２００３．８．２８）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＧＢ２００３／００３７０３
【国際公開番号】ＷＯ２００４／０１９９７４
【国際公開日】平成１６年３月１１日（２００４．３．１１）
【出願人】（３９７００９９３４）グラクソ グループ リミテッド (832)
【氏名又は名称原語表記】ＧＬＡＸＯ ＧＲＯＵＰ ＬＩＭＩＴＥＤ
【住所又は居所原語表記】Ｇｌａｘｏ Ｗｅｌｌｃｏｍｅ Ｈｏｕｓｅ，Ｂｅｒｋｅｌｅｙ Ａｖｅｎｕｅ Ｇｒｅｅｎｆｏｒｄ，Ｍｉｄｄｌｅｓｅｘ ＵＢ６ ０ＮＮ，Ｇｒｅａｔ Ｂｒｉｔａｉｎ
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成１８年１月２６日（２００６．１．２６）
【国際特許分類】
【出願日】平成１５年８月２８日（２００３．８．２８）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＧＢ２００３／００３７０３
【国際公開番号】ＷＯ２００４／０１９９７４
【国際公開日】平成１６年３月１１日（２００４．３．１１）
【出願人】（３９７００９９３４）グラクソ グループ リミテッド (832)
【氏名又は名称原語表記】ＧＬＡＸＯ ＧＲＯＵＰ ＬＩＭＩＴＥＤ
【住所又は居所原語表記】Ｇｌａｘｏ Ｗｅｌｌｃｏｍｅ Ｈｏｕｓｅ，Ｂｅｒｋｅｌｅｙ Ａｖｅｎｕｅ Ｇｒｅｅｎｆｏｒｄ，Ｍｉｄｄｌｅｓｅｘ ＵＢ６ ０ＮＮ，Ｇｒｅａｔ Ｂｒｉｔａｉｎ
【Ｆターム（参考）】
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