本発明は、セルロース分解増強活性を有する単離されたポリペプチドと、該ポリペプチドをコードする単離されたポリヌクレオチドとに関する。本発明はまた、該ポリヌクレオチドを含む核酸構築体、ベクター、及び宿主細胞、ならびに該ポリペプチドを製造及び使用するための方法に関する。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下よりなる群から選択されるセルロース分解増強活性を有する単離されたポリペプチド：
（ａ）配列番号２又は配列番号４の成熟ポリペプチドと少なくとも６０％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチド；
（ｂ）少なくとも中程度の厳密性条件下で、（ｉ）配列番号１又は配列番号３の成熟ポリペプチドコード配列と、（ii）配列番号１又は配列番号３の成熟ポリペプチドコード配列中に含まれるｃＤＮＡ配列と、又は（iii）（ｉ）もしくは（ii）の完全長相補鎖と、ハイブリダイズするポリヌクレオチドにコードされるポリペプチド；
（ｃ）配列番号１の成熟ポリペプチドコード配列と少なくとも６０％の同一性を有するヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド；及び
（ｄ）配列番号２又は配列番号４の成熟ポリペプチドの１つ又はそれ以上（数個）のアミノ酸の置換、欠失、及び／又は挿入を含む変種。
【請求項２】
配列番号２又は配列番号４のアミノ酸配列、又はセルロース分解増強活性を有するそのフラグメントを含むか又はこれからなる、請求項１のポリペプチド。
【請求項３】
大腸菌（E. coli）ＮＲＲＬ Ｂ−５００８３に含まれるプラスミドｐＳＭａｉ１９０、又は大腸菌（E. coli）ＮＲＲＬ Ｂ−５００８５に含まれるプラスミドｐＳＭａｉ１９２、に含まれるポリヌクレオチドにコードされる、請求項１のポリペプチド。
【請求項４】
請求項１〜３のいずれかのポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項５】
発現宿主中のポリペプチドの産生を指令する１つ又はそれ以上（数個）の制御配列に機能できる形で結合した、請求項４のポリヌクレオチドを含む核酸構築体。
【請求項６】
請求項５の核酸構築体を含む組換え宿主細胞。
【請求項７】
請求項１〜３のいずれかのポリペプチドを産生する方法であって、（ａ）細胞を培養し（ここでその野生型は、ポリペプチドの産生を促進する条件下でポリペプチドを産生する）、そして（ｂ）ポリペプチドを回収する、ことを含んでなる方法。
【請求項８】
請求項１〜３のいずれかのポリペプチドを産生する方法であって、（ａ）ポリペプチドの産生を促進する条件下で、ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸構築体を含む宿主細胞を培養し、そして（ｂ）ポリペプチドを回収する、ことを含んでなる方法。
【請求項９】
請求項１〜３のいずれかのポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を破壊又は欠失させることを含んでなり、これが親細胞より少ないポリペプチドを産生する変異体を与えることを特徴とする、親細胞の変異体を産生する方法。
【請求項１０】
請求項１〜３のいずれかのポリペプチドを産生する方法であって、（ａ）ポリペプチドの産生を促進する条件下で、ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含むトランスジェニック植物又は植物細胞を培養し、そして（ｂ）ポリペプチドを回収することを含んでなる方法。
【請求項１１】
請求項１〜３のいずれかのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドにより形質転換されたトランスジェニック植物、植物の部分、又は植物細胞。
【請求項１２】
請求項４のポリヌクレオチドのサブ配列を含む２本鎖阻害性ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子であって、ｄｓＲＮＡは場合によりｓｉＲＮＡ又はｍｉＲＮＡ分子であることを特徴とする分子。
【請求項１３】
２本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を細胞に投与するか、又はこれを細胞中で発現することを含んでなる、細胞中のセルロース分解増強活性を有するポリペプチドの発現を阻害する方法であって、ｄｓＲＮＡは、請求項４のポリヌクレオチドのサブ配列を含むことを特徴とする方法。
【請求項１４】
配列番号２のアミノ酸１〜１７又は配列番号４のアミノ酸１〜１５を含むかもしくはこれからなるシグナルペプチドをコードするヌクレオチド配列に、機能できる形で結合したタンパク質をコードする遺伝子を含む核酸構築体であって、遺伝子はヌクレオチド配列に対して異種であることを特徴とする核酸構築体。
【請求項１５】
請求項１４の核酸構築体を含む組換え宿主細胞。
【請求項１６】
（ａ）タンパク質の産生を促進する条件下で、請求項１５の組換え宿主細胞を培養し、そして（ｂ）タンパク質を回収することを含んでなる、タンパク質の産生方法。
【請求項１７】
請求項１〜３のいずれかのセルロース分解増強活性を有するポリペプチドの存在下で、セルロース系材料をセルロース分解酵素組成物で処理することを含んでなる、セルロース系材料を分解又は変換するための方法であって、セルロース分解増強活性を有するポリペプチドの存在が、セルロース分解増強活性を有するポリペプチドが存在しない場合と比較して、セルロース系材料の分解を上昇させることを特徴とする方法。
【請求項１８】
分解されたセルロース系材料を回収することをさらに含む、請求項１７の方法。
【請求項１９】
発酵生成物を製造する方法であって、
（ａ）請求項１〜３のいずれかのセルロース分解増強活性を有するポリペプチドの存在下で、セルロース系材料をセルロース分解酵素組成物で糖化し（ここで、セルロース分解増強活性を有するポリペプチドの存在は、セルロース分解増強活性を有するポリペプチドが存在しない場合と比較して、セルロース系材料の分解を上昇させる）；
（ｂ）工程（ａ）の糖化したセルロース系材料を１つ又はそれ以上の発酵微生物で発酵させて発酵生成物を生成させ、そして
（ｃ）発酵物から発酵生成物を回収する、ことを含んでなる方法。
【請求項２０】
セルロース系材料を１つ又はそれ以上の発酵微生物で発酵させることを含んでなるセルロース系材料の発酵方法であって、ここで、セルロース系材料は、請求項１〜３のいずれかのセルロース分解増強活性を有するポリペプチドの存在下でセルロース分解酵素組成物で加水分解され、セルロース分解増強活性を有するポリペプチドの存在は、セルロース分解増強活性を有するポリペプチドが存在しない場合と比較して、セルロース系材料の加水分解を上昇させる、ことを特徴とする方法。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【図６】

【図７】

【公表番号】特表２０１１−５０７５２５（Ｐ２０１１−５０７５２５Ａ）
【公表日】平成２３年３月１０日（２０１１．３．１０）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１０−５３９７９４（Ｐ２０１０−５３９７９４）
【出願日】平成２０年１２月１８日（２００８．１２．１８）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００８／０８７４０２
【国際公開番号】ＷＯ２００９／０８５９３５
【国際公開日】平成２１年７月９日（２００９．７．９）
【出願人】（５００５８６２９９）ノボザイムス　アクティーゼルスカブ (164)
【Ｆターム（参考）】