バイオディーゼル燃料を生成するための改良された方法
本発明は、ディーゼルサイクルエンジンにおける可燃物または燃料として好適な脂肪酸エステルの混合物を取得するための方法であって、ａ）炭素源としてグリセリンを用いた油性微生物の使用により、乾燥重量で２０％に等しいかそれを超えるトリグリセリド含有量を有する微生物バイオマスを取得する工程と、ｂ）工程ａ）で取得したバイオマスに含有されるトリグリセリドを、脂肪酸エステルの混合物に変換する工程とを含んでなる方法に関する。本発明はまた、前記油性微生物、その選択方法、およびそれから得られるポリヌクレオチドに関する。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、微生物由来の油から、ディーゼルサイクルエンジン用燃料を得るための方法、および前記油を生成する微生物に関する。本発明はまた、前記油性微生物、その選択方法およびそれから得られるポリヌクレオチドに向けられたものである。
【背景技術】
【０００２】
現在のバイオディーゼル燃料生成は、植物起源（ヒマワリ、ナタネ、ヤシおよび他の種）のトリグリセリドを低分子量アルコール（メタノール、エタノール）でトランスエステル化（またはアルコール分解）することにより、脂肪酸メチル／エチルエステルおよびグリセリンを生成することを基礎としている。エステル化反応はどのようなアルコールを用いても実現可能であるが、事実上、メタノールおよびエタノールのみがこの方法に使用される（ＥＰ５２３７６７）。メチルアルコールは、コストが低く、かつ、いかなる低酸性油との反応をも可能にする物理化学的特性を有するために最も使用されている。
【０００３】
バイオディーゼル燃料の生成は、トリグリセリドおよびアルコールを１０／１の重量比で組み合わせて行われる。従って、１トンの油から開始すると、およそ１トンのバイオディーゼルと約１００ｋｇの粗グリセリンが得られる。
【０００４】
７０％〜８５％の純度を有する粗グリセリンは、コンディショニング工程によって精製することができ、この工程では、中和工程に加えて、９０％〜９５％に達するまでその濃度を高める目的で蒸発が行われる。最終的に、この濃縮生成物をカラムに通して精製することによって高純度グリセリンが得られる。高純度グリセリンの行き先は、主に医薬および美容産業である。しかしながら、年間５０％を超えるバイオディーゼル燃料市場の近年の成長により、グリセリンの世界市場が飽和している。公的組織が定めた、バイオ燃料を現在の燃料に代えて使用するという目的が果たされ、世界市場で粗グリセリンの余剰が生じれば、この状況は近い将来悪化するであろう。この状況において、精製によるその商業的回収は、バイオディーゼル植物に対する最も魅力的な解決策ではないようである。なぜならば、精製プロセスは費用が高すぎて、飽和した市場では競合できないからである。この状況から、環境の観点からは難点があるにもかかわらず、燃料としてのその使用可能性など、他の応用が考慮され始めている。
【０００５】
更に、大半が油性種子または植物油からバイオディーゼル燃料を生成する現在の方法は、生成費用の５０％〜６０％を占めるこれら原料の費用に大きく左右される。使用済み油または別の種類の脂肪を使用すれば原料費用は低減し得るが、この方法は、これらの油を精製するための一連の追加工程を必要とする。従って、バイオディーゼル燃料のコストを低減するための新たな方策、特に、工程数を減らし、収率を向上させ、かつ、あまり高価でない原料を使用する方策を探求することが必要である。
【０００６】
近年、非食用油の使用がバイオディーゼルを生成するための代替として提案されており、特に、ナンヨウアブラギリ（Ｊａｔｒｏｐａ ｃｕｒｃａｓ）、クロヨナ（Ｐｏｎｇａｍｉａ ｐｉｎｎａｔａ）またはインディアン・バターツリー（Ｍａｄｈｕｃａ ｉｎｄｉｃａ）種子（Ｓｈａｈら，Ｅｎｅｒｇｙ ｆｕｅｌｓ，２００４，１８，１５４−１５９；Ｋａｒｍｅｅ ＳＫら，２００５，Ｂｉｏｒｅｓｏｕｒｃｅ Ｔｅｃｈｎｏｌ．，９６，１４２５−１４２９；Ｇｈａｄｇｅ ＳＶら，Ｂｉｏｒｅｓｏｕｒｃｅ Ｔｅｃｈｎｏｌ. ，２００６，９７，３７９−３８４）由来の油が挙げられる。しかしながら、これら代替物は、気候条件または地理的条件のために、全ての国で実現可能というわけではない。
【０００７】
現在、油性の耕地作物または高油含有量の木質植物からのトリグリセリドの生成は、年間約１２０，０００，０００トンである。バイオディーゼル燃料市場の成長予測が実現すると、これらトリグリセリドの供給は極限状態になり、食物供給や伝統的な油脂化学産業を脅かすことさえあり得る。この種の穀物をより多く生産するには、広大な耕地が必要であるが、この状況は多くの地域においては不可能である。
【０００８】
従って、バイオディーゼル産業は、他の経路、特に、連続して機能することができ、かつ、広大な耕地面積を必要としない経路によって得られるトリグリセリドの代替資源を必要としている。
【０００９】
微生物からの脂質の生成は、長年の研究対象であった。菌類、酵母類および藻類の中には、代謝的ストレス期間中、最大で７０％を超えるそれらのバイオマスを脂質の形態で細胞内に蓄積する能力を有するものもあり（Ｒａｔｌｅｄｇｅ Ｃ，Ａｃｔａ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，１９９１，１１，４２９−４３８）、故に、植物種子で起こるのと同様であり、それらは油性微生物と呼ばれている（Ｒａｔｌｅｄｇｅ，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｅ，２００４，８６，８０７−８１５）。
【００１０】
ロドトルラ（Ｒｈｏｄｏｔｏｒｕｌａ）属、ロドスポリジウム（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ）属、ヤロウイア（Ｙａｒｒｏｗｉａ）属、クリプトコッカス（Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）属、デバリオマイセス（Ｄｅｂａｒｙｏｍｙｃｅｓ）属、カンジダ（Ｃａｎｄｉｄａ）属またはリポマイセス（Ｌｙｐｏｍｙｃｅｓ）属に属する酵母類およびクロレラ（Ｃｈｌｏｒｅｌｌａ）属の微小藻類の中には、例えば、ナタネやダイズのような植物油に存在するものと酷似しているＣ１６およびＣ１８系の脂肪酸（パルミチン酸、ステアリン酸、オレイン酸など）のプロファイルを含むトリグリセリドを蓄積するものもある。従って、これら微生物由来の油（微生物起源の油、ＳＣＯ）は、ＥＮ １４２１４規格に示される規格を満たすので、バイオディーゼル燃料を生成するために潜在的に使用することができる。
【００１１】
微生物によって生成される脂質からのバイオディーゼル燃料生成に関する情報はほとんどない。近年、微小藻類クロレラ・スターキー（Ｃｈｏｒｅｌｌａ ｓｔａｒｋｅｙ）を使用する方法（Ｂｉｏｒｅｓｏｕｒｃｅ Ｔｅｃｈｎｏｌ．，２００６，９７，８４１−８４６）および酵母類を用いた別の方法（Ｊ．Ｃｈｅｍ．Ｔｅｃｈｎｏｌ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，２００７，８２，７７５−７８０）が記載されている。しかしながら、いずれの場合も、使用原料がグルコースであったので、当該方法の経済収支は実現可能ではない。
【００１２】
農業食品、森林または産業セクターの産業プロセスから生じる有機副産物／廃棄物は、微生物または酵素を使用することによって、より付加価値が高い化合物を生成するための原料として使用することができる。バイオディーゼル産業由来の粗グリセリンは、これら副産物の中に含まれる。
【００１３】
これら従来の文献に基づくと、方策的、経済的および技術的な観点から、以下の問題を解決するバイオディーゼル燃料産業における改良方法を開発する必要がある：
−粗グリセリンの大量な余剰によって発生する問題；
−高い費用または広大な耕地面積を必要とする原料を使用するという課題。
【発明の概要】
【００１４】
本発明者らは、炭素源としてのグリセリンからバイオディーゼル燃料を生成するための新規方法であって、確立されている方法と同様の収率を達成しながら、生成物の品質および生成プロセスコストを改善する方法を開発した。この方法は、具体的には、高トリグリセリド含有量の微生物バイオマスから、ディーゼル型エンジン用可燃物または燃料として好適な脂肪酸エステルの混合物を取得することを可能にする。
【００１５】
したがって、本発明の第一態様は、
ａ）炭素源としてグリセリンを用いた油性微生物の使用により、乾燥重量で２０％に等しいかそれを超えるトリグリセリド含有量を有する微生物バイオマスを取得する工程と、
ｂ）工程ａ）で取得したバイオマスに含有されるトリグリセリドを、脂肪酸エステルの混合物に変換する工程とを含んでなる、バイオディーゼル燃料を取得するための方法に向けられる。
【００１６】
特定の実施形態において、工程ａ）で取得した微生物バイオマスは、それが含有するトリグリセリドの分離に付され、次いで、工程ｂ）により脂肪酸エステルの混合物に変換される。
【００１７】
特定の実施形態において、工程ａ）では、乾燥重量で２０％〜７０％のトリグリセリド含有量を有する微生物バイオマスが得られる。
【００１８】
本発明の別の特定の実施形態において、脂肪酸エステルの混合物を取得する前に、油性植物種子を微生物バイオマスに添加する。
【００１９】
本発明は、また、
ａ）炭素源としてグリセリンを用いた油性微生物の使用により、乾燥重量で２０％に等しいかそれを超えるトリグリセリド含有量を有する微生物バイオマスを取得する工程と、
ｂ）場合により、前記微生物バイオマスからトリグリセリドを分離する工程と、
ｃ）工程ａ）で取得したバイオマスに含有されるトリグリセリド、または、工程ｂ）で分離したトリグリセリドを、酸媒体中でのアルコール分解により脂肪酸エステルの混合物に変換することによって、脂肪酸エステルを含む相と、グリセリンおよび細胞残留物を含む別の相とを得る工程と、
ｄ）工程ｃ）で得られた、脂肪酸エステルを含む相と、グリセリンおよび細胞残留物を含む相とを分離する第一分離工程と、
ｅ）工程ｄ）で分離した脂肪酸エステルを含む相を中和することによって、脂肪酸エステルを含む相と、水およびアルコール残留物を含む相とが得られる工程と、
ｆ）工程ｅ）で得られた、脂肪酸エステルを含む相と、水およびアルコール残留物を含む相とを分離する第二分離工程と、
ｇ）工程ｆ）で分離した脂肪酸エステルを含む相を精製する工程と、
を含んでなる、バイオディーゼル燃料を取得するための方法に向けられる。
【００２０】
更なる態様において、本発明は、炭素源としてグリセリンを使用してトリグリセリドを蓄積することができる油性微生物に向けられる。
【００２１】
本発明の別の更なる態様は、唯一の炭素源としてグリセリンを使用してトリグリセリドを蓄積することができる油性微生物を選択するための方法であって、
（ｉ）唯一の炭素源としてのグリセリン中で増殖可能な株を取得する工程と、
（ｉｉ）工程（ｉ）のトリグリセリド生成株を選択する工程と
を含んでなる方法に関する。
【発明を実施するための形態】
【００２２】
本発明において、用語「バイオマス」または「微生物バイオマス」は、培養培地中で増殖させた微生物の一連の細胞を指す。
【００２３】
バイオディーゼル燃料は、バイオ燃料、すなわち再生可能燃料であり、ＡＳＴＭ（米国材料試験協会）仕様によれば、植物油または動物性脂肪などの再生可能脂質由来の長鎖脂肪酸（８個以上の炭素を有する）のモノアルキルエステルであって、圧縮点火エンジン（ディーゼルエンジン）で使用されるものとして記載されている。本発明にあっては、この油は先に定義した微生物バイオマスから得られる。
【００２４】
本発明において、「油性微生物」は、代謝的負荷期間中に脂質を細胞内に蓄積する能力を有する酵母、糸状菌または微小藻類に関する（ロドトルラ（Ｒｈｏｄｏｔｏｒｕｌａ）、ロドスポリジウム、ヤロウイア（Ｙａｒｒｏｗｉａ）、クリプトコッカス（Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、デバリオマイセス（Ｄｅｂａｒｙｏｍｙｃｅｓ）、カンジダ（Ｃａｎｄｉｄａ）、リポマイセス（Ｌｙｐｏｍｙｃｅｓ）またはクロレラ（Ｃｈｌｏｒｅｌｌａ））。
【００２５】
第一態様において、本発明は、
ａ）炭素源としてグリセリンを用いた油性微生物の使用により、乾燥重量で２０％に等しいかそれを超えるトリグリセリド含有量を有する微生物バイオマスを取得する工程と、
ｂ）工程ａ）で取得したバイオマスに含有されるトリグリセリドを、脂肪酸エステルの混合物に変換する工程とを含んでなる、バイオディーゼル燃料を取得するための方法に向けられる。
【００２６】
特定の実施形態において、工程ａ）で取得した微生物バイオマスは、それが含有するトリグリセリドの分離に付され、次いで、脂肪酸エステルの混合物に変換される。この分離は、好ましくは抽出を含んでなる。
【００２７】
工程ａ）において微生物バイオマスを取得するための方法は、トリグリセリド含有量が乾燥重量で２０％に等しくなるかそれを超えるまで、フラスコまたはバイオリアクター内で油性微生物を培養することを含んでなる。
【００２８】
特定の実施形態において、微生物は、一定の攪拌下、１８℃〜３０℃、好ましくは２３℃〜３０℃の温度で、２〜５日間培養される。細胞内のトリグリセリド量が最大に達したら、収集の目的のために通常使用される方法のいずれか、例えば、濾過または遠心分離などによって細胞を収集する。
【００２９】
特定の実施形態において、バイオマスにおいて到達されるトリグリセリド含有量は、乾燥重量の２０％〜７０％である。
【００３０】
本発明の好ましい実施形態において、バイオマスを生成するために使用される微生物は酵母である。更に好ましい実施形態において、酵母は、ロドスポリジウム（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ）属であり、ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００６およびロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００７株が特に好ましい。
【００３１】
微生物は、炭素源としてグリセリンが存在する培養培地中で増殖され、このグリセリンは、同培地中に存在する窒素源に対して過剰であり、後者は、酵母抽出物、ペプトン、トウモロコシ浸出液、尿素、グルタミン酸ナトリウムまたは無機窒素源（例えば、様々なアンモニウム塩）であり得るが、これらに限定されない。
【００３２】
グリセリンに加えて、他の炭素源が培養培地中に存在していてもよく、他の炭素源として例えば、グルコース、モラス、スクロース、フルクトース、デンプンまたは脂肪酸などが挙げられるが、これらに限定されない。本発明の特定の実施形態によれば、グリセリンが発酵培地中で炭素源として使用され、好ましくは、使用する全炭水化物の７０％〜１００％の量で使用される。経済的な理由から、使用するグリセリンは、粗グリセリン、すなわち、およそ７０％〜８５％の純度を有するものであるのが好ましい。
【００３３】
本発明の別の特定の実施形態において、本発明による方法は、脂肪酸エステルの混合物を取得する前の工程として、工程ａ）で取得した微生物バイオマスに、油性植物種子を添加することを更に含んでなる。好適な植物種子は、ヒマワリ、ナタネ、ヤシ、ダイズ、カブ（turnip rape）またはココナツ種子などである。
【００３４】
そして次に、工程ａ）で取得した微生物バイオマスに含有されるトリグリセリドを直接的にアルコール分解するか、または、微生物バイオマスから分離したトリグリセリドをアルコール分解することによって、脂肪酸エステルの混合物が調製される。この反応では、速度および最終収率を向上させるために触媒を使用することができる。アルコール分解は、酸媒体中で行われるのが好ましく、すなわち、酸を触媒として使用する。酸性化は、硫酸、塩酸またはリン酸などが挙げられるが、必ずしもこれらに限定されないいずれかの酸を使用することによって行うことができる。当該反応で使用するアルコールは、好ましくは、バイオマスに対して重量で５倍〜４０倍、より好ましくは１０倍〜３０倍を超える。特定実施形態において、当該反応は、４０℃〜７０℃、好ましくは５０℃〜７０℃の温度で、２０〜３６時間、一定に攪拌して進行させる。また、好ましくは、バイオマスのアルコール分解は、１、２、３または４個の炭素を有するアルコールを用いて行われる。更に好ましくは、アルコールはメタノールまたはエタノールであり、メタノールがより好ましいアルコールである。
【００３５】
先に示した均一な酸型触媒に加え、本発明の他の実施形態では、不均一な酸触媒（例えば、ゼオライト、スルホン酸樹脂、ＳＯ４／ＺｒＯ２、ＷＯ３／ＺｒＯ２）、不均一な塩基性触媒（例えば、ＭｇＯ、ＣａＯ、Ｎａ／ＮａＯＨ／Ａｌ２Ｏ3）、均一な塩基性触媒（例えば、ＫＯＨ、ＮａＯＨ）または酵素触媒（リパーゼ、例えば、カンジダ（Ｃａｎｄｉｄａ）、ペニシリウム（Ｐｅｎｉｃｉｌｌｉｕｍ）、シュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ））が使用される。
【００３６】
本発明は、また、
ａ）炭素源としてグリセリンを用いた油性微生物の使用により、乾燥重量で２０％に等しいかそれを超えるトリグリセリド含有量を有する微生物バイオマスを取得する工程と、
ｂ）場合によって、前記微生物バイオマスからトリグリセリドを分離する工程と、
ｃ）工程ａ）で取得したバイオマスに含有されるトリグリセリド、または、工程ｂ）で分離したトリグリセリドを、酸媒体中でのアルコール分解により脂肪酸エステルの混合物に変換することによって、脂肪酸エステルを含む相と、グリセリンおよび細胞残留物を含む別の相とが得られる工程と、
ｄ）工程ｃ）で得られた、脂肪酸エステルを含む相と、グリセリンおよび細胞残留物を含む相との第一の分離工程と、
ｅ）工程ｄ）で分離した脂肪酸エステルを含む相を中和することによって、脂肪酸エステルを含む相と、水およびアルコール残留物を含む相とが得られる工程と、
ｆ）工程ｅ）で得られた、脂肪酸エステルを含む相と、水およびアルコール残留物を含む相との第二の分離工程と、
ｇ）工程ｆ）で分離した脂肪酸エステルを含む相を精製する工程と
を含んでなる、バイオディーゼル燃料を取得するための方法を目的とする。
【００３７】
工程ａ）、ｂ）、およびｃ）は、上述と同様に実施される。
【００３８】
本発明の特定の実施形態において、相分離工程ｄ）は、遠心分離法によって行われる。
【００３９】
脂肪酸エステルを含む相を中和する工程ｅ）は、過剰なアルコールおよび適切な場合には過剰な酸を除去するのに役立つ。中和は、好適には、例えば、水酸化ナトリウム、水酸化カリウムまたは水酸化アンモニウムなどの弱塩基の溶液を、好ましくは工程ｄ）で分離した脂肪酸エステルを含む相の量の体積で１／３〜１／１０の範囲にある一定量の水に添加することによって行われる。本発明の特定の実施形態において、前記中和は、いくつかの工程、例えば、添加する水に対して０．０５重量％〜０．３重量％の塩基濃度を使用する第一工程および添加する水に対して０．０１重量％〜０．１重量％を使用する第二工程で行うことができる。
【００４０】
特定の実施形態において、この中和工程の間、エマルションの形成を防ぐために、約１５分〜６０分間、調節された速度で機械的な攪拌が行われる。
【００４１】
特定の実施形態において、工程ｆ）における第二の相分離は、重力デカンテーションによって行われ、水およびアルコール残留物によって形成される相と、脂肪酸エステルを含有する相とが得られる。
【００４２】
前記エステルは、エバポレーター内の水およびアルコール残留物を除去することによって精製することができる。少量の水およびアルコール（メタノールまたはエタノールであることが多い）の蒸発は、プロセスのエネルギー需要を低下させる。その理由は、蒸発に必要な温度は、エステル精製中にエステルを蒸留するために使用する温度よりも低いからである。
【００４３】
このようにして取得したバイオディーゼル燃料は、規格１４２１４で定めた含水量よりも高ければ、再循環させることができる。
油性微生物
【００４４】
先に示したように、バイオディーゼル燃料を取得するための方法は、炭素源としてグリセリンを用いる油性微生物の使用を含んでなる。従って、更なる態様において、本発明は、炭素源としてグリセリンを使用してトリグリセリドを蓄積することができる油性微生物に向けられる。
【００４５】
別の特定の実施形態において、この微生物は、乾燥重量で２０％に等しいかそれを超える、好ましくは２０％〜７０％のトリグリセリド含有量を蓄積することができる。
【００４６】
本発明において、油性微生物は、酵母、糸状菌または微小藻類であり得る。本発明の好ましい実施形態において、微生物は酵母である。更に好ましい実施形態において、酵母は、ロドスポリジウム（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ）属であり、ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００６およびロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００７株が特に好ましい。
【００４７】
本発明の微生物の国際寄託機関は、スペイン培養細胞系統保存機関（Ｃｏｌｅｃｃｉｏｎ Ｅｓｐａｎｏｌａ ｄｅ Ｃｕｌｔｉｖｏｓ Ｔｉｐｏ−ＣＥＣＴ）である。
【００４８】
別の更なる態様において、本発明は、唯一の炭素源としてグリセリンを使用してトリグリセリドを蓄積することができる油性微生物を選択するための方法であって、
（ｉ）唯一の炭素源としてグリセリンを含む培養培地中で増殖可能な株を取得する工程と、
（ｉｉ）工程（ｉ）のトリグリセリド生成株を選択する工程と
を含んでなる方法を提供する。
【００４９】
工程（ｉ）において、株を選択するために、当該技術分野で既知のいずれのグリセリン培養培地を使用することができ、例えば、ロドトルラ（Ｒｈｏｄｏｔｏｒｕｌａ）、ロドスポリジウム（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ）、ヤロウイア（Ｙａｒｒｏｗｉａ）、クリプトコッカス（Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、デバリオマイセス（Ｄｅｂａｒｙｏｍｙｃｅｓ）、カンジダ（Ｃａｎｄｉｄａ）もしくはリポマイセス（Ｌｙｐｏｍｙｃｅｓ）、またはクロレラ（Ｃｈｌｏｒｅｌｌａ）である。グリセリン培養培地は、好ましくは、ＭＭＧ培地（１ｌにつき：アミノ酸を含まない酵母窒素ベース（ＹＮＢ）６．７ｇ；粗グリセリン４７ｇ；クロラムフェニコール（５０μｇ／ｍＬ）を補充）を含む。
【００５０】
工程（ｉｉ）において、トリグリセリド生成株の選択は、ナイルレッド（Ｎｉｌｅ ｒｅｄ）などによる染色を用いたサンプリング、およびその後の蛍光分析によって行うことができる。
【００５１】
本発明において規定される酵母株は、リボソームＤＮＡサブユニット２６ＳのＤ１／Ｄ２領域およびサブユニット１８Ｓから２６Ｓまでの間に位置する全ＩＴＳ領域の断片に相当するヌクレオチド配列により同定されている。
【００５２】
従って、別の態様では、本発明は、ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００６のリボソームＤＮＡサブユニット２６ＳのＤ１／Ｄ２領域に相当する、配列番号１に示す配列を有することを特徴とするポリヌクレオチドに関する。
【００５３】
別の態様では、本発明は、ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００６のサブユニット１８Ｓから２６Ｓまでの間に位置する全ＩＴＳ領域に相当する、配列番号２に示す配列を有することを特徴とするポリヌクレオチドに関する。
【００５４】
別の態様では、本発明は、ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００７のリボソームＤＮＡサブユニット２６ＳのＤ１／Ｄ２領域に相当する、配列番号３に示す配列を有することを特徴とするポリヌクレオチドに関する。
【００５５】
別の態様では、本発明は、ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００７のサブユニット１８Ｓから２６Ｓまでの間に位置する全ＩＴＳ領域に相当する、配列番号４に示す配列を有することを特徴とするポリヌクレオチドに関する。
【００５６】
当業者が理解するように、本発明のポリヌクレオチドは、ロドスポリジウム（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ）属の他種を同定するために、プローブとして使用するか、または、それからプライマーもしくはプローブを設計するために使用することができる。
【実施例】
【００５７】
１．唯一の炭素源としての粗グリセリン中で増殖可能な微生物の選択
リオ・ティント（Ｒｉｏ Ｔｉｎｔｏ）（ウエルバ（Ｈｕｅｌｖａ））の川岸で採取した土壌サンプルから、これらの微生物を２つの方策によって単離した。試験管に入れた１ｇのサンプルに１０ｍＬの食塩水を添加し、１０分間激しく攪拌した。この懸濁液から、食塩水による１：１０連続希釈液を調製し、ＹＰＧ培地（１リットルにつき：酵母抽出物１０ｇ；細菌ペプトン２０ｇ；粗グリセリン４７ｇ；クロラムフェニコール（５０μｇ／ｍＬ）を補充）を含有するプレートに０．１ｍＬを播種して、細菌増殖を阻害した。プレートを、２８℃で４〜５日間インキュベートし、ＭＭＧ培地（１リットルにつき：アミノ酸を含まない酵母窒素ベース（ＹＮＢ）６．７ｇ；粗グリセリン４７ｇ；クロラムフェニコール（５０μｇ／ｍＬ）を補充））を含有するプレートに、増殖したコロニーを移した。プレートを、２８℃で５〜７日間インキュベートした。
【００５８】
第二の方策では、サンプルの一部分を滅菌乳鉢内で粉砕し、その１ｇを、ローズベンガル（５０μｇ／ｍＬ）およびクロラムフェニコール（５０μｇ／ｍＬ）を補充したＭＭＧ培地５０ｍＬを含有するフラスコに添加した。フラスコを２８℃、２５０ｒｐｍにて２４時間インキュベートした。次いで、この培養物０．５ｍＬを、８％粗グリセリンを有するＭＭＧを含有する別のフラスコに移し、同条件下でインキュベートした。このプロセスを、１２％粗グリセリンを含有するＭＭＧ培地を使用して、再度繰り返した。８％〜１２％グリセリンを含有する培養物から、ＭＭＧ培地を有するプレートに希釈液を播種した。これらを２８℃で７日間インキュベートした。
【００５９】
これら２つの方法により、ＹＰＧ培地中４７０個のコロニーが得られ、その中からＭＭＧにおいて増殖可能な２３０個を選択した。
【００６０】
２．唯一の炭素源としての粗グリセリン中で増殖し、かつ、トリグリセリドを蓄積することができる微生物の選択
トリグリセリドを蓄積する能力を、ナイルレッド染色を用いたサンプリングによって分析した（Ｋｉｍｕｒａ Ｋら，２００４，Ｊ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ，５６，３３１−３３８）。
【００６１】
９６ウェルプレートにおいて、２８℃、２５０ｒｐｍで７２時間、培養物をＭＭＧ培地中で小規模に（１ｍＬ）増殖させた。この後、０．５ｍＬの培養物を採取し、同容量のＰＢＳ緩衝液（１０ｍＭのリン酸カリウム緩衝液、０．１５Ｍ ＫＣｌ、ｐＨ７．０）で希釈した。０．０１ｍＬのナイルレッド溶液（０．５μＬｇ／ｍＬ）をこの懸濁液０．４ｍＬに添加し、混合物を室温で５分間インキュベートし、０．１ｍＬをマイクロタイタープレートに移し、蛍光をプレートリーダーにて６００ｎｍで測定した。１２個の培養物が、対照として使用した株ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＢＳ１４よりも大きな蛍光測定値を示し、これらを使用可能なトリグリセリドプロデューサーとして選択した。これら１２個の株および対照を３組（in triplicate）、５０ｍＬのＭＥＭ培地（１リットルにつき：粗グリセリン４７ｇ；酵母抽出物１．５ｇ；一カリウムリン酸塩０．７５ｇ；硝酸アンモニウム０．２８ｇ；ＣａＣｌ・２Ｈ２Ｏ ０．４ｇ；およびＭｇＳＯ４・７２Ｈ２Ｏ ０．４ｇ、濃ＨＣｌでｐＨ５に調節）を含有するフラスコ内で、２８℃、２５０ｒｐｍにて９６時間培養した。遠心分離によって細胞を収集し、２つのチューブを水切りし、５０℃のオーブンで２４時間乾燥させて、乾燥重量を測定した。他方のチューブを濾紙上で水切りし、０．７５ｍＬの水酸化アンモニウムを含有する水５ｍＬに細胞を再懸濁した。懸濁液を穏やかに攪拌し、１５分間、６０℃〜７０℃の槽内でインキュベートした。それを冷却し、５ｍＬのエタノールを加え、激しく攪拌した。次いで、１２．５ｍＬのエチルエーテルを加え、短時間攪拌し、同容量の石油エーテルを加えた。混合物を遠心分離によって分離し、有機相を平底球形フラスコへ取り除いた。有機相をロータリーエバポレーター内で蒸発乾燥させ、１０２℃のオーブン内にフラスコを導入した後、一定重量を得た。
【００６２】
この重量測定により、それらの乾燥重量の２５．３％および２７．２％をトリグリセリド物質の形態で蓄積することができる２つの株が同定された。いずれも、リボソームＤＮＡサブユニット２６ＳのＤ１／Ｄ２領域およびサブユニット１８Ｓから２６Ｓまでの間に位置する全ＩＴＳ（内部転写スペーサー）領域の断片を配列決定することにより、２つの異なるロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）株として同定され、また、既存のデータベースに寄託されたこの種の配列に対して差異を示した。いずれの株も、ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）０３７６（ＣＥＣＴ番号１３００６）およびロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）０７７０（ＣＥＣＴ番号１３００７）としてスペイン培養細胞系統保存機関に寄託されたものである。
【００６３】
リボソームＤＮＡサブユニット２８Ｓに相当するＤ１／Ｄ２領域を増幅するために、配列番号５および配列番号７の配列を有するオリゴヌクレオチドが使用されている。同様に、サブユニット１８Ｓから２６Ｓまでの間に位置する全ＩＴＳ領域を、配列番号６および配列番号８の配列を有するオリゴヌクレオチドを使用して増幅した。
【００６４】
別の態様において、本発明は、配列番号５に示す配列を有することを特徴とするオリゴヌクレオチドに関する。
【００６５】
別の態様において、本発明は、配列番号６に示す配列を有することを特徴とするオリゴヌクレオチドに関する。
【００６６】
別の態様において、本発明は、配列番号７に示す配列を有することを特徴とするオリゴヌクレオチドに関する。
【００６７】
別の態様において、本発明は、配列番号８に示す配列を有することを特徴とするオリゴヌクレオチドに関する。
【００６８】
３．唯一の炭素源としての粗グリセリン中で増殖し、かつ、トリグリセリドを蓄積することができる微生物の発酵によるバイオディーゼル燃料の生成
固体ＹＰＧ培地（１リットルを基準とする組成：酵母抽出物１０ｇ；細菌ペプトン２０ｇ；粗グリセリン４７ｇ；寒天２０ｇ）中で増殖させたロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ１３００７細胞を用いて、同培地５０ｍＬに植菌した。オービタルシェーカー内で２４時間インキュベートした（２００ｒｐｍ、２８℃）後、この培養物２５ｍＬを、２５０ｍＬのＹＰＧを含有する１リットルフラスコに移した。オービタルシェーカー内で、細胞を再度２４時間インキュベートした（２００ｒｐｍ、２８℃）。次いで、１５０ｍＬのこの培養物を、１．３５ｌのＭＥＭ培地を含有する発酵器に移した。この培地は、（１ｌを基準として）粗グリセリン４７ｇ、酵母抽出物１．５ｇ、一カリウムリン酸塩０．７５ｇ、硝酸アンモニウム０．２８ｇ、ＣａＣｌ・２Ｈ２Ｏ ０．４ｇおよびＭｇＳＯ４・７２Ｈ２Ｏ ０．４ｇ（濃ＨＣｌでｐＨ５に調節）からなる。
【００６９】
発酵器を２８℃で維持し、２５０ｒｐｍで攪拌を維持することにより、溶解酸素の濃度を２０％以上に維持した。７２時間後、発酵器中のバイオマスの濃度は２４．４ｇ／Ｌであり、細胞内トリグリセリド含有量は５２．３％であった。存在する脂肪酸の組成をガスクロマトグラフィーによって分析すると、多数成分としてパルミチン酸（２４％）、ステアリン酸（８％）、オレイン酸（５５％）およびリノール酸（２％）が認められた。
【００７０】
遠心分離によって細胞を採取し、５０℃で８時間乾燥させた。
【００７１】
コンデンサーを備えた丸底フラスコに、１０ｇのバイオマス（５．２ｇのトリグリセリド）および１００ｍＬの酸メタノール溶液を添加した。懸濁液を、大気圧下で激しく攪拌しながら６０℃で２０時間加熱した。反応が終了したら、攪拌を停止し、遠心分離によって混合物を分離した。２つの相が得られた：メチルエステルおよびメタノールを過剰に含有する軽量相、ならびに、グリセリン、メタノール残留物、触媒および塩により形成される重量相。
【００７２】
添加した水に対して０．１重量％の濃度で水酸化ナトリウムを含有するアルカリ水で２回洗浄することにより、軽量相の精製を行った。各洗浄において、有機相および水性相が良好な分離を達成するまでデカントさせた。水性相を除去し、メチルエステルを収集して、真空流下膜式エバポレーター中、１００ｍｂａｒの絶対圧力および１２０℃の温度での蒸発によって、メタノールおよび水残留物を除去した。得られた最終量は、メチルエステル５．０９ｇであった。これは９８％の収率を表す。
【００７３】
このようにして得られたメチルエステルは、この種の燃料に関する欧州規格１４２１４の仕様に準拠したディーゼルエンジンにおける自動車燃料としての使用に好適である（表１を参照）。
【００７４】
メチルエステル混合物燃料としてのＳＣＯの特性
【表１】
【００７５】
４．油性種子およびバイオマスの混合物からのバイオディーゼル燃料の取得
先の例に記載した方法に従って得られた、細胞内トリグリセリド含有量が５３．４％であるロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ１３００６バイオマスを、ヒマワリ種子と、９０／１０、８０／２０および７５／２５（種／バイオマス）の比で混合した。プレス（油圧搾機ＸＰ１００（アルバン・ブランチ（Ａｌｂａｎ Ｂｌａｎｃｈ）））を使用した押出によって脂肪を抽出した。トランスエステル化を行うため、０．２７ｌのメタノールと３ｇの水酸化ナトリウムを混合することによって、触媒（ナトリウムメトキシド）を調製した。油をリアクター内で秤量し、一定に攪拌しながら５０℃に達するまで加熱した。次いで、触媒を添加し、反応を６０分間進行させた。この後、攪拌を停止し、遠心分離によって相を分離した。先の例に示す工程に従って、メチルエステルを精製した。様々な種子：バイオマス比で行った試験において達成された収率は９８％よりも大きかった。
【００７６】
得られたバイオディーゼル燃料の分析は、ヒマワリ種子のみを使用した場合に得られたのと実質的に同様の結果を示し、パラメーターは規格ＥＮ１４２１４が規定した要件を満たしている。
【００７７】
５．油性バイオマスから抽出した油からのバイオディーゼル燃料の取得
５３．７％の脂肪を含有するロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００６株細胞１０ｇを、２０ｍＬの脱塩水に再懸濁した。次いで、２．５ｍＬの２５％水酸化アンモニウム溶液を添加し、穏やかに攪拌し、６０℃の槽で１５分間インキュベートした。混合物を冷却し、１０ｍＬのエタノールを添加し、激しく攪拌した。４０ｍＬのエチルエーテルを添加し、再び攪拌し、次いで、４０ｍＬの石油エーテルを加え、再び攪拌した。混合物を６，０００ｒｐｍで遠心分離し、軽量（有機）相を、先に秤量した平底球形フラスコに分離した。いずれの場合にも半分の容量を用いて抽出を繰り返し、抽出した脂肪を同一の平底球形フラスコ内で混合した。存在し得るエタノールまたは水残留物を除去するために、フラスコを１時間窒素流に供した。得られたトリグリセリドの量は５．１２ｇであった。
【００７８】
先の例に記載した方法に従ってトランスエステル化を行い、９８．７％の収率に達した。得られたバイオディーゼル燃料の分析は、規格ＥＮ１４２１４が要求する全てのパラメーターを満たしている。
【技術分野】
【０００１】
本発明は、微生物由来の油から、ディーゼルサイクルエンジン用燃料を得るための方法、および前記油を生成する微生物に関する。本発明はまた、前記油性微生物、その選択方法およびそれから得られるポリヌクレオチドに向けられたものである。
【背景技術】
【０００２】
現在のバイオディーゼル燃料生成は、植物起源（ヒマワリ、ナタネ、ヤシおよび他の種）のトリグリセリドを低分子量アルコール（メタノール、エタノール）でトランスエステル化（またはアルコール分解）することにより、脂肪酸メチル／エチルエステルおよびグリセリンを生成することを基礎としている。エステル化反応はどのようなアルコールを用いても実現可能であるが、事実上、メタノールおよびエタノールのみがこの方法に使用される（ＥＰ５２３７６７）。メチルアルコールは、コストが低く、かつ、いかなる低酸性油との反応をも可能にする物理化学的特性を有するために最も使用されている。
【０００３】
バイオディーゼル燃料の生成は、トリグリセリドおよびアルコールを１０／１の重量比で組み合わせて行われる。従って、１トンの油から開始すると、およそ１トンのバイオディーゼルと約１００ｋｇの粗グリセリンが得られる。
【０００４】
７０％〜８５％の純度を有する粗グリセリンは、コンディショニング工程によって精製することができ、この工程では、中和工程に加えて、９０％〜９５％に達するまでその濃度を高める目的で蒸発が行われる。最終的に、この濃縮生成物をカラムに通して精製することによって高純度グリセリンが得られる。高純度グリセリンの行き先は、主に医薬および美容産業である。しかしながら、年間５０％を超えるバイオディーゼル燃料市場の近年の成長により、グリセリンの世界市場が飽和している。公的組織が定めた、バイオ燃料を現在の燃料に代えて使用するという目的が果たされ、世界市場で粗グリセリンの余剰が生じれば、この状況は近い将来悪化するであろう。この状況において、精製によるその商業的回収は、バイオディーゼル植物に対する最も魅力的な解決策ではないようである。なぜならば、精製プロセスは費用が高すぎて、飽和した市場では競合できないからである。この状況から、環境の観点からは難点があるにもかかわらず、燃料としてのその使用可能性など、他の応用が考慮され始めている。
【０００５】
更に、大半が油性種子または植物油からバイオディーゼル燃料を生成する現在の方法は、生成費用の５０％〜６０％を占めるこれら原料の費用に大きく左右される。使用済み油または別の種類の脂肪を使用すれば原料費用は低減し得るが、この方法は、これらの油を精製するための一連の追加工程を必要とする。従って、バイオディーゼル燃料のコストを低減するための新たな方策、特に、工程数を減らし、収率を向上させ、かつ、あまり高価でない原料を使用する方策を探求することが必要である。
【０００６】
近年、非食用油の使用がバイオディーゼルを生成するための代替として提案されており、特に、ナンヨウアブラギリ（Ｊａｔｒｏｐａ ｃｕｒｃａｓ）、クロヨナ（Ｐｏｎｇａｍｉａ ｐｉｎｎａｔａ）またはインディアン・バターツリー（Ｍａｄｈｕｃａ ｉｎｄｉｃａ）種子（Ｓｈａｈら，Ｅｎｅｒｇｙ ｆｕｅｌｓ，２００４，１８，１５４−１５９；Ｋａｒｍｅｅ ＳＫら，２００５，Ｂｉｏｒｅｓｏｕｒｃｅ Ｔｅｃｈｎｏｌ．，９６，１４２５−１４２９；Ｇｈａｄｇｅ ＳＶら，Ｂｉｏｒｅｓｏｕｒｃｅ Ｔｅｃｈｎｏｌ. ，２００６，９７，３７９−３８４）由来の油が挙げられる。しかしながら、これら代替物は、気候条件または地理的条件のために、全ての国で実現可能というわけではない。
【０００７】
現在、油性の耕地作物または高油含有量の木質植物からのトリグリセリドの生成は、年間約１２０，０００，０００トンである。バイオディーゼル燃料市場の成長予測が実現すると、これらトリグリセリドの供給は極限状態になり、食物供給や伝統的な油脂化学産業を脅かすことさえあり得る。この種の穀物をより多く生産するには、広大な耕地が必要であるが、この状況は多くの地域においては不可能である。
【０００８】
従って、バイオディーゼル産業は、他の経路、特に、連続して機能することができ、かつ、広大な耕地面積を必要としない経路によって得られるトリグリセリドの代替資源を必要としている。
【０００９】
微生物からの脂質の生成は、長年の研究対象であった。菌類、酵母類および藻類の中には、代謝的ストレス期間中、最大で７０％を超えるそれらのバイオマスを脂質の形態で細胞内に蓄積する能力を有するものもあり（Ｒａｔｌｅｄｇｅ Ｃ，Ａｃｔａ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，１９９１，１１，４２９−４３８）、故に、植物種子で起こるのと同様であり、それらは油性微生物と呼ばれている（Ｒａｔｌｅｄｇｅ，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｅ，２００４，８６，８０７−８１５）。
【００１０】
ロドトルラ（Ｒｈｏｄｏｔｏｒｕｌａ）属、ロドスポリジウム（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ）属、ヤロウイア（Ｙａｒｒｏｗｉａ）属、クリプトコッカス（Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）属、デバリオマイセス（Ｄｅｂａｒｙｏｍｙｃｅｓ）属、カンジダ（Ｃａｎｄｉｄａ）属またはリポマイセス（Ｌｙｐｏｍｙｃｅｓ）属に属する酵母類およびクロレラ（Ｃｈｌｏｒｅｌｌａ）属の微小藻類の中には、例えば、ナタネやダイズのような植物油に存在するものと酷似しているＣ１６およびＣ１８系の脂肪酸（パルミチン酸、ステアリン酸、オレイン酸など）のプロファイルを含むトリグリセリドを蓄積するものもある。従って、これら微生物由来の油（微生物起源の油、ＳＣＯ）は、ＥＮ １４２１４規格に示される規格を満たすので、バイオディーゼル燃料を生成するために潜在的に使用することができる。
【００１１】
微生物によって生成される脂質からのバイオディーゼル燃料生成に関する情報はほとんどない。近年、微小藻類クロレラ・スターキー（Ｃｈｏｒｅｌｌａ ｓｔａｒｋｅｙ）を使用する方法（Ｂｉｏｒｅｓｏｕｒｃｅ Ｔｅｃｈｎｏｌ．，２００６，９７，８４１−８４６）および酵母類を用いた別の方法（Ｊ．Ｃｈｅｍ．Ｔｅｃｈｎｏｌ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，２００７，８２，７７５−７８０）が記載されている。しかしながら、いずれの場合も、使用原料がグルコースであったので、当該方法の経済収支は実現可能ではない。
【００１２】
農業食品、森林または産業セクターの産業プロセスから生じる有機副産物／廃棄物は、微生物または酵素を使用することによって、より付加価値が高い化合物を生成するための原料として使用することができる。バイオディーゼル産業由来の粗グリセリンは、これら副産物の中に含まれる。
【００１３】
これら従来の文献に基づくと、方策的、経済的および技術的な観点から、以下の問題を解決するバイオディーゼル燃料産業における改良方法を開発する必要がある：
−粗グリセリンの大量な余剰によって発生する問題；
−高い費用または広大な耕地面積を必要とする原料を使用するという課題。
【発明の概要】
【００１４】
本発明者らは、炭素源としてのグリセリンからバイオディーゼル燃料を生成するための新規方法であって、確立されている方法と同様の収率を達成しながら、生成物の品質および生成プロセスコストを改善する方法を開発した。この方法は、具体的には、高トリグリセリド含有量の微生物バイオマスから、ディーゼル型エンジン用可燃物または燃料として好適な脂肪酸エステルの混合物を取得することを可能にする。
【００１５】
したがって、本発明の第一態様は、
ａ）炭素源としてグリセリンを用いた油性微生物の使用により、乾燥重量で２０％に等しいかそれを超えるトリグリセリド含有量を有する微生物バイオマスを取得する工程と、
ｂ）工程ａ）で取得したバイオマスに含有されるトリグリセリドを、脂肪酸エステルの混合物に変換する工程とを含んでなる、バイオディーゼル燃料を取得するための方法に向けられる。
【００１６】
特定の実施形態において、工程ａ）で取得した微生物バイオマスは、それが含有するトリグリセリドの分離に付され、次いで、工程ｂ）により脂肪酸エステルの混合物に変換される。
【００１７】
特定の実施形態において、工程ａ）では、乾燥重量で２０％〜７０％のトリグリセリド含有量を有する微生物バイオマスが得られる。
【００１８】
本発明の別の特定の実施形態において、脂肪酸エステルの混合物を取得する前に、油性植物種子を微生物バイオマスに添加する。
【００１９】
本発明は、また、
ａ）炭素源としてグリセリンを用いた油性微生物の使用により、乾燥重量で２０％に等しいかそれを超えるトリグリセリド含有量を有する微生物バイオマスを取得する工程と、
ｂ）場合により、前記微生物バイオマスからトリグリセリドを分離する工程と、
ｃ）工程ａ）で取得したバイオマスに含有されるトリグリセリド、または、工程ｂ）で分離したトリグリセリドを、酸媒体中でのアルコール分解により脂肪酸エステルの混合物に変換することによって、脂肪酸エステルを含む相と、グリセリンおよび細胞残留物を含む別の相とを得る工程と、
ｄ）工程ｃ）で得られた、脂肪酸エステルを含む相と、グリセリンおよび細胞残留物を含む相とを分離する第一分離工程と、
ｅ）工程ｄ）で分離した脂肪酸エステルを含む相を中和することによって、脂肪酸エステルを含む相と、水およびアルコール残留物を含む相とが得られる工程と、
ｆ）工程ｅ）で得られた、脂肪酸エステルを含む相と、水およびアルコール残留物を含む相とを分離する第二分離工程と、
ｇ）工程ｆ）で分離した脂肪酸エステルを含む相を精製する工程と、
を含んでなる、バイオディーゼル燃料を取得するための方法に向けられる。
【００２０】
更なる態様において、本発明は、炭素源としてグリセリンを使用してトリグリセリドを蓄積することができる油性微生物に向けられる。
【００２１】
本発明の別の更なる態様は、唯一の炭素源としてグリセリンを使用してトリグリセリドを蓄積することができる油性微生物を選択するための方法であって、
（ｉ）唯一の炭素源としてのグリセリン中で増殖可能な株を取得する工程と、
（ｉｉ）工程（ｉ）のトリグリセリド生成株を選択する工程と
を含んでなる方法に関する。
【発明を実施するための形態】
【００２２】
本発明において、用語「バイオマス」または「微生物バイオマス」は、培養培地中で増殖させた微生物の一連の細胞を指す。
【００２３】
バイオディーゼル燃料は、バイオ燃料、すなわち再生可能燃料であり、ＡＳＴＭ（米国材料試験協会）仕様によれば、植物油または動物性脂肪などの再生可能脂質由来の長鎖脂肪酸（８個以上の炭素を有する）のモノアルキルエステルであって、圧縮点火エンジン（ディーゼルエンジン）で使用されるものとして記載されている。本発明にあっては、この油は先に定義した微生物バイオマスから得られる。
【００２４】
本発明において、「油性微生物」は、代謝的負荷期間中に脂質を細胞内に蓄積する能力を有する酵母、糸状菌または微小藻類に関する（ロドトルラ（Ｒｈｏｄｏｔｏｒｕｌａ）、ロドスポリジウム、ヤロウイア（Ｙａｒｒｏｗｉａ）、クリプトコッカス（Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、デバリオマイセス（Ｄｅｂａｒｙｏｍｙｃｅｓ）、カンジダ（Ｃａｎｄｉｄａ）、リポマイセス（Ｌｙｐｏｍｙｃｅｓ）またはクロレラ（Ｃｈｌｏｒｅｌｌａ））。
【００２５】
第一態様において、本発明は、
ａ）炭素源としてグリセリンを用いた油性微生物の使用により、乾燥重量で２０％に等しいかそれを超えるトリグリセリド含有量を有する微生物バイオマスを取得する工程と、
ｂ）工程ａ）で取得したバイオマスに含有されるトリグリセリドを、脂肪酸エステルの混合物に変換する工程とを含んでなる、バイオディーゼル燃料を取得するための方法に向けられる。
【００２６】
特定の実施形態において、工程ａ）で取得した微生物バイオマスは、それが含有するトリグリセリドの分離に付され、次いで、脂肪酸エステルの混合物に変換される。この分離は、好ましくは抽出を含んでなる。
【００２７】
工程ａ）において微生物バイオマスを取得するための方法は、トリグリセリド含有量が乾燥重量で２０％に等しくなるかそれを超えるまで、フラスコまたはバイオリアクター内で油性微生物を培養することを含んでなる。
【００２８】
特定の実施形態において、微生物は、一定の攪拌下、１８℃〜３０℃、好ましくは２３℃〜３０℃の温度で、２〜５日間培養される。細胞内のトリグリセリド量が最大に達したら、収集の目的のために通常使用される方法のいずれか、例えば、濾過または遠心分離などによって細胞を収集する。
【００２９】
特定の実施形態において、バイオマスにおいて到達されるトリグリセリド含有量は、乾燥重量の２０％〜７０％である。
【００３０】
本発明の好ましい実施形態において、バイオマスを生成するために使用される微生物は酵母である。更に好ましい実施形態において、酵母は、ロドスポリジウム（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ）属であり、ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００６およびロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００７株が特に好ましい。
【００３１】
微生物は、炭素源としてグリセリンが存在する培養培地中で増殖され、このグリセリンは、同培地中に存在する窒素源に対して過剰であり、後者は、酵母抽出物、ペプトン、トウモロコシ浸出液、尿素、グルタミン酸ナトリウムまたは無機窒素源（例えば、様々なアンモニウム塩）であり得るが、これらに限定されない。
【００３２】
グリセリンに加えて、他の炭素源が培養培地中に存在していてもよく、他の炭素源として例えば、グルコース、モラス、スクロース、フルクトース、デンプンまたは脂肪酸などが挙げられるが、これらに限定されない。本発明の特定の実施形態によれば、グリセリンが発酵培地中で炭素源として使用され、好ましくは、使用する全炭水化物の７０％〜１００％の量で使用される。経済的な理由から、使用するグリセリンは、粗グリセリン、すなわち、およそ７０％〜８５％の純度を有するものであるのが好ましい。
【００３３】
本発明の別の特定の実施形態において、本発明による方法は、脂肪酸エステルの混合物を取得する前の工程として、工程ａ）で取得した微生物バイオマスに、油性植物種子を添加することを更に含んでなる。好適な植物種子は、ヒマワリ、ナタネ、ヤシ、ダイズ、カブ（turnip rape）またはココナツ種子などである。
【００３４】
そして次に、工程ａ）で取得した微生物バイオマスに含有されるトリグリセリドを直接的にアルコール分解するか、または、微生物バイオマスから分離したトリグリセリドをアルコール分解することによって、脂肪酸エステルの混合物が調製される。この反応では、速度および最終収率を向上させるために触媒を使用することができる。アルコール分解は、酸媒体中で行われるのが好ましく、すなわち、酸を触媒として使用する。酸性化は、硫酸、塩酸またはリン酸などが挙げられるが、必ずしもこれらに限定されないいずれかの酸を使用することによって行うことができる。当該反応で使用するアルコールは、好ましくは、バイオマスに対して重量で５倍〜４０倍、より好ましくは１０倍〜３０倍を超える。特定実施形態において、当該反応は、４０℃〜７０℃、好ましくは５０℃〜７０℃の温度で、２０〜３６時間、一定に攪拌して進行させる。また、好ましくは、バイオマスのアルコール分解は、１、２、３または４個の炭素を有するアルコールを用いて行われる。更に好ましくは、アルコールはメタノールまたはエタノールであり、メタノールがより好ましいアルコールである。
【００３５】
先に示した均一な酸型触媒に加え、本発明の他の実施形態では、不均一な酸触媒（例えば、ゼオライト、スルホン酸樹脂、ＳＯ４／ＺｒＯ２、ＷＯ３／ＺｒＯ２）、不均一な塩基性触媒（例えば、ＭｇＯ、ＣａＯ、Ｎａ／ＮａＯＨ／Ａｌ２Ｏ3）、均一な塩基性触媒（例えば、ＫＯＨ、ＮａＯＨ）または酵素触媒（リパーゼ、例えば、カンジダ（Ｃａｎｄｉｄａ）、ペニシリウム（Ｐｅｎｉｃｉｌｌｉｕｍ）、シュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ））が使用される。
【００３６】
本発明は、また、
ａ）炭素源としてグリセリンを用いた油性微生物の使用により、乾燥重量で２０％に等しいかそれを超えるトリグリセリド含有量を有する微生物バイオマスを取得する工程と、
ｂ）場合によって、前記微生物バイオマスからトリグリセリドを分離する工程と、
ｃ）工程ａ）で取得したバイオマスに含有されるトリグリセリド、または、工程ｂ）で分離したトリグリセリドを、酸媒体中でのアルコール分解により脂肪酸エステルの混合物に変換することによって、脂肪酸エステルを含む相と、グリセリンおよび細胞残留物を含む別の相とが得られる工程と、
ｄ）工程ｃ）で得られた、脂肪酸エステルを含む相と、グリセリンおよび細胞残留物を含む相との第一の分離工程と、
ｅ）工程ｄ）で分離した脂肪酸エステルを含む相を中和することによって、脂肪酸エステルを含む相と、水およびアルコール残留物を含む相とが得られる工程と、
ｆ）工程ｅ）で得られた、脂肪酸エステルを含む相と、水およびアルコール残留物を含む相との第二の分離工程と、
ｇ）工程ｆ）で分離した脂肪酸エステルを含む相を精製する工程と
を含んでなる、バイオディーゼル燃料を取得するための方法を目的とする。
【００３７】
工程ａ）、ｂ）、およびｃ）は、上述と同様に実施される。
【００３８】
本発明の特定の実施形態において、相分離工程ｄ）は、遠心分離法によって行われる。
【００３９】
脂肪酸エステルを含む相を中和する工程ｅ）は、過剰なアルコールおよび適切な場合には過剰な酸を除去するのに役立つ。中和は、好適には、例えば、水酸化ナトリウム、水酸化カリウムまたは水酸化アンモニウムなどの弱塩基の溶液を、好ましくは工程ｄ）で分離した脂肪酸エステルを含む相の量の体積で１／３〜１／１０の範囲にある一定量の水に添加することによって行われる。本発明の特定の実施形態において、前記中和は、いくつかの工程、例えば、添加する水に対して０．０５重量％〜０．３重量％の塩基濃度を使用する第一工程および添加する水に対して０．０１重量％〜０．１重量％を使用する第二工程で行うことができる。
【００４０】
特定の実施形態において、この中和工程の間、エマルションの形成を防ぐために、約１５分〜６０分間、調節された速度で機械的な攪拌が行われる。
【００４１】
特定の実施形態において、工程ｆ）における第二の相分離は、重力デカンテーションによって行われ、水およびアルコール残留物によって形成される相と、脂肪酸エステルを含有する相とが得られる。
【００４２】
前記エステルは、エバポレーター内の水およびアルコール残留物を除去することによって精製することができる。少量の水およびアルコール（メタノールまたはエタノールであることが多い）の蒸発は、プロセスのエネルギー需要を低下させる。その理由は、蒸発に必要な温度は、エステル精製中にエステルを蒸留するために使用する温度よりも低いからである。
【００４３】
このようにして取得したバイオディーゼル燃料は、規格１４２１４で定めた含水量よりも高ければ、再循環させることができる。
油性微生物
【００４４】
先に示したように、バイオディーゼル燃料を取得するための方法は、炭素源としてグリセリンを用いる油性微生物の使用を含んでなる。従って、更なる態様において、本発明は、炭素源としてグリセリンを使用してトリグリセリドを蓄積することができる油性微生物に向けられる。
【００４５】
別の特定の実施形態において、この微生物は、乾燥重量で２０％に等しいかそれを超える、好ましくは２０％〜７０％のトリグリセリド含有量を蓄積することができる。
【００４６】
本発明において、油性微生物は、酵母、糸状菌または微小藻類であり得る。本発明の好ましい実施形態において、微生物は酵母である。更に好ましい実施形態において、酵母は、ロドスポリジウム（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ）属であり、ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００６およびロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００７株が特に好ましい。
【００４７】
本発明の微生物の国際寄託機関は、スペイン培養細胞系統保存機関（Ｃｏｌｅｃｃｉｏｎ Ｅｓｐａｎｏｌａ ｄｅ Ｃｕｌｔｉｖｏｓ Ｔｉｐｏ−ＣＥＣＴ）である。
【００４８】
別の更なる態様において、本発明は、唯一の炭素源としてグリセリンを使用してトリグリセリドを蓄積することができる油性微生物を選択するための方法であって、
（ｉ）唯一の炭素源としてグリセリンを含む培養培地中で増殖可能な株を取得する工程と、
（ｉｉ）工程（ｉ）のトリグリセリド生成株を選択する工程と
を含んでなる方法を提供する。
【００４９】
工程（ｉ）において、株を選択するために、当該技術分野で既知のいずれのグリセリン培養培地を使用することができ、例えば、ロドトルラ（Ｒｈｏｄｏｔｏｒｕｌａ）、ロドスポリジウム（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ）、ヤロウイア（Ｙａｒｒｏｗｉａ）、クリプトコッカス（Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、デバリオマイセス（Ｄｅｂａｒｙｏｍｙｃｅｓ）、カンジダ（Ｃａｎｄｉｄａ）もしくはリポマイセス（Ｌｙｐｏｍｙｃｅｓ）、またはクロレラ（Ｃｈｌｏｒｅｌｌａ）である。グリセリン培養培地は、好ましくは、ＭＭＧ培地（１ｌにつき：アミノ酸を含まない酵母窒素ベース（ＹＮＢ）６．７ｇ；粗グリセリン４７ｇ；クロラムフェニコール（５０μｇ／ｍＬ）を補充）を含む。
【００５０】
工程（ｉｉ）において、トリグリセリド生成株の選択は、ナイルレッド（Ｎｉｌｅ ｒｅｄ）などによる染色を用いたサンプリング、およびその後の蛍光分析によって行うことができる。
【００５１】
本発明において規定される酵母株は、リボソームＤＮＡサブユニット２６ＳのＤ１／Ｄ２領域およびサブユニット１８Ｓから２６Ｓまでの間に位置する全ＩＴＳ領域の断片に相当するヌクレオチド配列により同定されている。
【００５２】
従って、別の態様では、本発明は、ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００６のリボソームＤＮＡサブユニット２６ＳのＤ１／Ｄ２領域に相当する、配列番号１に示す配列を有することを特徴とするポリヌクレオチドに関する。
【００５３】
別の態様では、本発明は、ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００６のサブユニット１８Ｓから２６Ｓまでの間に位置する全ＩＴＳ領域に相当する、配列番号２に示す配列を有することを特徴とするポリヌクレオチドに関する。
【００５４】
別の態様では、本発明は、ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００７のリボソームＤＮＡサブユニット２６ＳのＤ１／Ｄ２領域に相当する、配列番号３に示す配列を有することを特徴とするポリヌクレオチドに関する。
【００５５】
別の態様では、本発明は、ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００７のサブユニット１８Ｓから２６Ｓまでの間に位置する全ＩＴＳ領域に相当する、配列番号４に示す配列を有することを特徴とするポリヌクレオチドに関する。
【００５６】
当業者が理解するように、本発明のポリヌクレオチドは、ロドスポリジウム（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ）属の他種を同定するために、プローブとして使用するか、または、それからプライマーもしくはプローブを設計するために使用することができる。
【実施例】
【００５７】
１．唯一の炭素源としての粗グリセリン中で増殖可能な微生物の選択
リオ・ティント（Ｒｉｏ Ｔｉｎｔｏ）（ウエルバ（Ｈｕｅｌｖａ））の川岸で採取した土壌サンプルから、これらの微生物を２つの方策によって単離した。試験管に入れた１ｇのサンプルに１０ｍＬの食塩水を添加し、１０分間激しく攪拌した。この懸濁液から、食塩水による１：１０連続希釈液を調製し、ＹＰＧ培地（１リットルにつき：酵母抽出物１０ｇ；細菌ペプトン２０ｇ；粗グリセリン４７ｇ；クロラムフェニコール（５０μｇ／ｍＬ）を補充）を含有するプレートに０．１ｍＬを播種して、細菌増殖を阻害した。プレートを、２８℃で４〜５日間インキュベートし、ＭＭＧ培地（１リットルにつき：アミノ酸を含まない酵母窒素ベース（ＹＮＢ）６．７ｇ；粗グリセリン４７ｇ；クロラムフェニコール（５０μｇ／ｍＬ）を補充））を含有するプレートに、増殖したコロニーを移した。プレートを、２８℃で５〜７日間インキュベートした。
【００５８】
第二の方策では、サンプルの一部分を滅菌乳鉢内で粉砕し、その１ｇを、ローズベンガル（５０μｇ／ｍＬ）およびクロラムフェニコール（５０μｇ／ｍＬ）を補充したＭＭＧ培地５０ｍＬを含有するフラスコに添加した。フラスコを２８℃、２５０ｒｐｍにて２４時間インキュベートした。次いで、この培養物０．５ｍＬを、８％粗グリセリンを有するＭＭＧを含有する別のフラスコに移し、同条件下でインキュベートした。このプロセスを、１２％粗グリセリンを含有するＭＭＧ培地を使用して、再度繰り返した。８％〜１２％グリセリンを含有する培養物から、ＭＭＧ培地を有するプレートに希釈液を播種した。これらを２８℃で７日間インキュベートした。
【００５９】
これら２つの方法により、ＹＰＧ培地中４７０個のコロニーが得られ、その中からＭＭＧにおいて増殖可能な２３０個を選択した。
【００６０】
２．唯一の炭素源としての粗グリセリン中で増殖し、かつ、トリグリセリドを蓄積することができる微生物の選択
トリグリセリドを蓄積する能力を、ナイルレッド染色を用いたサンプリングによって分析した（Ｋｉｍｕｒａ Ｋら，２００４，Ｊ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ，５６，３３１−３３８）。
【００６１】
９６ウェルプレートにおいて、２８℃、２５０ｒｐｍで７２時間、培養物をＭＭＧ培地中で小規模に（１ｍＬ）増殖させた。この後、０．５ｍＬの培養物を採取し、同容量のＰＢＳ緩衝液（１０ｍＭのリン酸カリウム緩衝液、０．１５Ｍ ＫＣｌ、ｐＨ７．０）で希釈した。０．０１ｍＬのナイルレッド溶液（０．５μＬｇ／ｍＬ）をこの懸濁液０．４ｍＬに添加し、混合物を室温で５分間インキュベートし、０．１ｍＬをマイクロタイタープレートに移し、蛍光をプレートリーダーにて６００ｎｍで測定した。１２個の培養物が、対照として使用した株ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＢＳ１４よりも大きな蛍光測定値を示し、これらを使用可能なトリグリセリドプロデューサーとして選択した。これら１２個の株および対照を３組（in triplicate）、５０ｍＬのＭＥＭ培地（１リットルにつき：粗グリセリン４７ｇ；酵母抽出物１．５ｇ；一カリウムリン酸塩０．７５ｇ；硝酸アンモニウム０．２８ｇ；ＣａＣｌ・２Ｈ２Ｏ ０．４ｇ；およびＭｇＳＯ４・７２Ｈ２Ｏ ０．４ｇ、濃ＨＣｌでｐＨ５に調節）を含有するフラスコ内で、２８℃、２５０ｒｐｍにて９６時間培養した。遠心分離によって細胞を収集し、２つのチューブを水切りし、５０℃のオーブンで２４時間乾燥させて、乾燥重量を測定した。他方のチューブを濾紙上で水切りし、０．７５ｍＬの水酸化アンモニウムを含有する水５ｍＬに細胞を再懸濁した。懸濁液を穏やかに攪拌し、１５分間、６０℃〜７０℃の槽内でインキュベートした。それを冷却し、５ｍＬのエタノールを加え、激しく攪拌した。次いで、１２．５ｍＬのエチルエーテルを加え、短時間攪拌し、同容量の石油エーテルを加えた。混合物を遠心分離によって分離し、有機相を平底球形フラスコへ取り除いた。有機相をロータリーエバポレーター内で蒸発乾燥させ、１０２℃のオーブン内にフラスコを導入した後、一定重量を得た。
【００６２】
この重量測定により、それらの乾燥重量の２５．３％および２７．２％をトリグリセリド物質の形態で蓄積することができる２つの株が同定された。いずれも、リボソームＤＮＡサブユニット２６ＳのＤ１／Ｄ２領域およびサブユニット１８Ｓから２６Ｓまでの間に位置する全ＩＴＳ（内部転写スペーサー）領域の断片を配列決定することにより、２つの異なるロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）株として同定され、また、既存のデータベースに寄託されたこの種の配列に対して差異を示した。いずれの株も、ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）０３７６（ＣＥＣＴ番号１３００６）およびロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）０７７０（ＣＥＣＴ番号１３００７）としてスペイン培養細胞系統保存機関に寄託されたものである。
【００６３】
リボソームＤＮＡサブユニット２８Ｓに相当するＤ１／Ｄ２領域を増幅するために、配列番号５および配列番号７の配列を有するオリゴヌクレオチドが使用されている。同様に、サブユニット１８Ｓから２６Ｓまでの間に位置する全ＩＴＳ領域を、配列番号６および配列番号８の配列を有するオリゴヌクレオチドを使用して増幅した。
【００６４】
別の態様において、本発明は、配列番号５に示す配列を有することを特徴とするオリゴヌクレオチドに関する。
【００６５】
別の態様において、本発明は、配列番号６に示す配列を有することを特徴とするオリゴヌクレオチドに関する。
【００６６】
別の態様において、本発明は、配列番号７に示す配列を有することを特徴とするオリゴヌクレオチドに関する。
【００６７】
別の態様において、本発明は、配列番号８に示す配列を有することを特徴とするオリゴヌクレオチドに関する。
【００６８】
３．唯一の炭素源としての粗グリセリン中で増殖し、かつ、トリグリセリドを蓄積することができる微生物の発酵によるバイオディーゼル燃料の生成
固体ＹＰＧ培地（１リットルを基準とする組成：酵母抽出物１０ｇ；細菌ペプトン２０ｇ；粗グリセリン４７ｇ；寒天２０ｇ）中で増殖させたロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ１３００７細胞を用いて、同培地５０ｍＬに植菌した。オービタルシェーカー内で２４時間インキュベートした（２００ｒｐｍ、２８℃）後、この培養物２５ｍＬを、２５０ｍＬのＹＰＧを含有する１リットルフラスコに移した。オービタルシェーカー内で、細胞を再度２４時間インキュベートした（２００ｒｐｍ、２８℃）。次いで、１５０ｍＬのこの培養物を、１．３５ｌのＭＥＭ培地を含有する発酵器に移した。この培地は、（１ｌを基準として）粗グリセリン４７ｇ、酵母抽出物１．５ｇ、一カリウムリン酸塩０．７５ｇ、硝酸アンモニウム０．２８ｇ、ＣａＣｌ・２Ｈ２Ｏ ０．４ｇおよびＭｇＳＯ４・７２Ｈ２Ｏ ０．４ｇ（濃ＨＣｌでｐＨ５に調節）からなる。
【００６９】
発酵器を２８℃で維持し、２５０ｒｐｍで攪拌を維持することにより、溶解酸素の濃度を２０％以上に維持した。７２時間後、発酵器中のバイオマスの濃度は２４．４ｇ／Ｌであり、細胞内トリグリセリド含有量は５２．３％であった。存在する脂肪酸の組成をガスクロマトグラフィーによって分析すると、多数成分としてパルミチン酸（２４％）、ステアリン酸（８％）、オレイン酸（５５％）およびリノール酸（２％）が認められた。
【００７０】
遠心分離によって細胞を採取し、５０℃で８時間乾燥させた。
【００７１】
コンデンサーを備えた丸底フラスコに、１０ｇのバイオマス（５．２ｇのトリグリセリド）および１００ｍＬの酸メタノール溶液を添加した。懸濁液を、大気圧下で激しく攪拌しながら６０℃で２０時間加熱した。反応が終了したら、攪拌を停止し、遠心分離によって混合物を分離した。２つの相が得られた：メチルエステルおよびメタノールを過剰に含有する軽量相、ならびに、グリセリン、メタノール残留物、触媒および塩により形成される重量相。
【００７２】
添加した水に対して０．１重量％の濃度で水酸化ナトリウムを含有するアルカリ水で２回洗浄することにより、軽量相の精製を行った。各洗浄において、有機相および水性相が良好な分離を達成するまでデカントさせた。水性相を除去し、メチルエステルを収集して、真空流下膜式エバポレーター中、１００ｍｂａｒの絶対圧力および１２０℃の温度での蒸発によって、メタノールおよび水残留物を除去した。得られた最終量は、メチルエステル５．０９ｇであった。これは９８％の収率を表す。
【００７３】
このようにして得られたメチルエステルは、この種の燃料に関する欧州規格１４２１４の仕様に準拠したディーゼルエンジンにおける自動車燃料としての使用に好適である（表１を参照）。
【００７４】
メチルエステル混合物燃料としてのＳＣＯの特性
【表１】
【００７５】
４．油性種子およびバイオマスの混合物からのバイオディーゼル燃料の取得
先の例に記載した方法に従って得られた、細胞内トリグリセリド含有量が５３．４％であるロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ１３００６バイオマスを、ヒマワリ種子と、９０／１０、８０／２０および７５／２５（種／バイオマス）の比で混合した。プレス（油圧搾機ＸＰ１００（アルバン・ブランチ（Ａｌｂａｎ Ｂｌａｎｃｈ）））を使用した押出によって脂肪を抽出した。トランスエステル化を行うため、０．２７ｌのメタノールと３ｇの水酸化ナトリウムを混合することによって、触媒（ナトリウムメトキシド）を調製した。油をリアクター内で秤量し、一定に攪拌しながら５０℃に達するまで加熱した。次いで、触媒を添加し、反応を６０分間進行させた。この後、攪拌を停止し、遠心分離によって相を分離した。先の例に示す工程に従って、メチルエステルを精製した。様々な種子：バイオマス比で行った試験において達成された収率は９８％よりも大きかった。
【００７６】
得られたバイオディーゼル燃料の分析は、ヒマワリ種子のみを使用した場合に得られたのと実質的に同様の結果を示し、パラメーターは規格ＥＮ１４２１４が規定した要件を満たしている。
【００７７】
５．油性バイオマスから抽出した油からのバイオディーゼル燃料の取得
５３．７％の脂肪を含有するロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００６株細胞１０ｇを、２０ｍＬの脱塩水に再懸濁した。次いで、２．５ｍＬの２５％水酸化アンモニウム溶液を添加し、穏やかに攪拌し、６０℃の槽で１５分間インキュベートした。混合物を冷却し、１０ｍＬのエタノールを添加し、激しく攪拌した。４０ｍＬのエチルエーテルを添加し、再び攪拌し、次いで、４０ｍＬの石油エーテルを加え、再び攪拌した。混合物を６，０００ｒｐｍで遠心分離し、軽量（有機）相を、先に秤量した平底球形フラスコに分離した。いずれの場合にも半分の容量を用いて抽出を繰り返し、抽出した脂肪を同一の平底球形フラスコ内で混合した。存在し得るエタノールまたは水残留物を除去するために、フラスコを１時間窒素流に供した。得られたトリグリセリドの量は５．１２ｇであった。
【００７８】
先の例に記載した方法に従ってトランスエステル化を行い、９８．７％の収率に達した。得られたバイオディーゼル燃料の分析は、規格ＥＮ１４２１４が要求する全てのパラメーターを満たしている。
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ａ）炭素源としてグリセリンを用いた油性微生物の使用により、乾燥重量で２０％に等しいかそれを超えるトリグリセリド含有量を有する微生物バイオマスを取得する工程と、
ｂ）前記工程ａ）で取得したバイオマスを、脂肪酸エステルの混合物に変換する工程とを含んでなる、バイオディーゼル燃料を取得するための方法。
【請求項２】
前記工程ａ）で取得した微生物バイオマスが、工程ｂ）により脂肪酸エステルの混合物に変換される前工程としての、それが含有するトリグリセリドの分離の工程に付される、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記分離が抽出を含んでなる、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
前記微生物バイオマスのトリグリセリド含有量が、乾燥重量で２０％〜７０％である、請求項１〜３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５】
前記微生物が酵母である、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
前記微生物が、ロドスポリジウム（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ）属の酵母である、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
前記微生物が、ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００６である、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
前記微生物が、ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００７である、請求項６に記載の方法。
【請求項９】
前記グリセリンが、前記炭素源の７０％〜１００％を構成する、請求項１〜８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０】
前記工程ａ）で取得したバイオマスを脂肪酸エステルに変換する前の工程として、前記バイオマスに油性植物種子を添加する工程を更に含んでなる、請求項１〜９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
前記工程ｂ）がアルコール分解により行われる、請求項１または２に記載の方法。
【請求項１２】
前記アルコール分解が酸媒体中で行われる、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記アルコール分解が４０℃〜７０℃の温度で行われる、請求項１１または１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記アルコール分解が５０℃〜７０℃の温度で行われる、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記アルコール分解がメタノールまたはエタノールを用いて行われる、請求項１１〜１４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６】
前記アルコール分解がメタノールを用いて行われる、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
ａ）炭素源としてグリセリンを用いた油性微生物の使用により、乾燥重量で２０％に等しいかそれを超えるトリグリセリド含有量を有する微生物バイオマスを取得する工程と、
ｂ）場合により、前記微生物バイオマスからトリグリセリドを分離する工程と、
ｃ）前記工程ａ）で取得したバイオマスに含有されるトリグリセリド、または該工程ｂ）で分離したトリグリセリドを、酸媒体中におけるアルコール分解により脂肪酸エステルの混合物に変換することによって、脂肪酸エステルを含む相と、グリセリンおよび細胞残留物を含む別の相とが得られる工程と、
ｄ）前記工程ｃ）で得られた、脂肪酸エステルを含む相と、グリセリンおよび細胞残留物を含む相とを分離する第一分離工程と、
ｅ）前記工程ｄ）で分離した脂肪酸エステルを含む相を中和することによって、脂肪酸エステルを含む相と、水およびアルコール残留物を含む相とが得られる工程と、
ｆ）前記工程ｅ）で得られた、脂肪酸エステルを含む相と、水およびアルコール残留物を含む相とを分離する第二分離工程と、
ｇ）前記工程ｆ）で分離した脂肪酸エステルを含む相を精製し、炭素源としてグリセリンを用いた油性微生物の使用により、乾燥重量で２０％に等しいかそれを超えるトリグリセリド含有量を有する微生物バイオマスを取得する工程と、
を含んでなる、バイオディーゼルを取得するための方法。
【請求項１８】
炭素源としてグリセリンを使用してトリグリセリドを蓄積することができる、油性微生物。
【請求項１９】
乾燥重量で２０％に等しいかそれを超えるトリグリセリド含有量を蓄積することができる、請求項１８に記載の油性微生物。
【請求項２０】
酵母である、請求項１８または１９に記載の微生物。
【請求項２１】
ロドスポリジウム（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ）属の酵母である、請求項２０に記載の微生物。
【請求項２２】
ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００６である、請求項２１に記載の微生物。
【請求項２３】
ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００７である、請求項２１に記載の微生物。
【請求項２４】
唯一の炭素源としてグリセリンを使用してトリグリセリドを蓄積することができる油性微生物を選択するための方法であって、
（ｉ）唯一の炭素源としてグリセリンを含む培養培地中で増殖可能な株を取得する工程と、
（ｉｉ）工程（ｉ）のトリグリセリド生成株を選択する工程と
を含んでなる、方法。
【請求項２５】
工程（ｉ）において、前記培養培地がＭＭＧ培地を含んでなる、請求項２４に記載の方法。
【請求項２６】
工程（ｉｉ）が染色によるサンプリングを含んでなる、請求項２４または２５に記載の方法。
【請求項２７】
工程（ｉｉ）が蛍光分析を含んでなる、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
配列番号１に示される配列を有することを特徴とする、ポリヌクレオチド。
【請求項２９】
配列番号２に示される配列を有することを特徴とする、ポリヌクレオチド。
【請求項３０】
配列番号３に示される配列を有することを特徴とする、ポリヌクレオチド。
【請求項３１】
配列番号４に示される配列を有することを特徴とする、ポリヌクレオチド。
【請求項３２】
配列番号５に示される配列を有することを特徴とする、ポリヌクレオチド。
【請求項３３】
配列番号６に示される配列を有することを特徴とする、ポリヌクレオチド。
【請求項３４】
配列番号７に示される配列を有することを特徴とする、ポリヌクレオチド。
【請求項３５】
配列番号８に示される配列を有することを特徴とする、ポリヌクレオチド。
【請求項１】
ａ）炭素源としてグリセリンを用いた油性微生物の使用により、乾燥重量で２０％に等しいかそれを超えるトリグリセリド含有量を有する微生物バイオマスを取得する工程と、
ｂ）前記工程ａ）で取得したバイオマスを、脂肪酸エステルの混合物に変換する工程とを含んでなる、バイオディーゼル燃料を取得するための方法。
【請求項２】
前記工程ａ）で取得した微生物バイオマスが、工程ｂ）により脂肪酸エステルの混合物に変換される前工程としての、それが含有するトリグリセリドの分離の工程に付される、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記分離が抽出を含んでなる、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
前記微生物バイオマスのトリグリセリド含有量が、乾燥重量で２０％〜７０％である、請求項１〜３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５】
前記微生物が酵母である、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
前記微生物が、ロドスポリジウム（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ）属の酵母である、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
前記微生物が、ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００６である、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
前記微生物が、ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００７である、請求項６に記載の方法。
【請求項９】
前記グリセリンが、前記炭素源の７０％〜１００％を構成する、請求項１〜８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０】
前記工程ａ）で取得したバイオマスを脂肪酸エステルに変換する前の工程として、前記バイオマスに油性植物種子を添加する工程を更に含んでなる、請求項１〜９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
前記工程ｂ）がアルコール分解により行われる、請求項１または２に記載の方法。
【請求項１２】
前記アルコール分解が酸媒体中で行われる、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記アルコール分解が４０℃〜７０℃の温度で行われる、請求項１１または１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記アルコール分解が５０℃〜７０℃の温度で行われる、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記アルコール分解がメタノールまたはエタノールを用いて行われる、請求項１１〜１４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６】
前記アルコール分解がメタノールを用いて行われる、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
ａ）炭素源としてグリセリンを用いた油性微生物の使用により、乾燥重量で２０％に等しいかそれを超えるトリグリセリド含有量を有する微生物バイオマスを取得する工程と、
ｂ）場合により、前記微生物バイオマスからトリグリセリドを分離する工程と、
ｃ）前記工程ａ）で取得したバイオマスに含有されるトリグリセリド、または該工程ｂ）で分離したトリグリセリドを、酸媒体中におけるアルコール分解により脂肪酸エステルの混合物に変換することによって、脂肪酸エステルを含む相と、グリセリンおよび細胞残留物を含む別の相とが得られる工程と、
ｄ）前記工程ｃ）で得られた、脂肪酸エステルを含む相と、グリセリンおよび細胞残留物を含む相とを分離する第一分離工程と、
ｅ）前記工程ｄ）で分離した脂肪酸エステルを含む相を中和することによって、脂肪酸エステルを含む相と、水およびアルコール残留物を含む相とが得られる工程と、
ｆ）前記工程ｅ）で得られた、脂肪酸エステルを含む相と、水およびアルコール残留物を含む相とを分離する第二分離工程と、
ｇ）前記工程ｆ）で分離した脂肪酸エステルを含む相を精製し、炭素源としてグリセリンを用いた油性微生物の使用により、乾燥重量で２０％に等しいかそれを超えるトリグリセリド含有量を有する微生物バイオマスを取得する工程と、
を含んでなる、バイオディーゼルを取得するための方法。
【請求項１８】
炭素源としてグリセリンを使用してトリグリセリドを蓄積することができる、油性微生物。
【請求項１９】
乾燥重量で２０％に等しいかそれを超えるトリグリセリド含有量を蓄積することができる、請求項１８に記載の油性微生物。
【請求項２０】
酵母である、請求項１８または１９に記載の微生物。
【請求項２１】
ロドスポリジウム（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ）属の酵母である、請求項２０に記載の微生物。
【請求項２２】
ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００６である、請求項２１に記載の微生物。
【請求項２３】
ロドスポリジウム・トルロイデス（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｔｏｒｕｌｏｉｄｅｓ）ＣＥＣＴ １３００７である、請求項２１に記載の微生物。
【請求項２４】
唯一の炭素源としてグリセリンを使用してトリグリセリドを蓄積することができる油性微生物を選択するための方法であって、
（ｉ）唯一の炭素源としてグリセリンを含む培養培地中で増殖可能な株を取得する工程と、
（ｉｉ）工程（ｉ）のトリグリセリド生成株を選択する工程と
を含んでなる、方法。
【請求項２５】
工程（ｉ）において、前記培養培地がＭＭＧ培地を含んでなる、請求項２４に記載の方法。
【請求項２６】
工程（ｉｉ）が染色によるサンプリングを含んでなる、請求項２４または２５に記載の方法。
【請求項２７】
工程（ｉｉ）が蛍光分析を含んでなる、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
配列番号１に示される配列を有することを特徴とする、ポリヌクレオチド。
【請求項２９】
配列番号２に示される配列を有することを特徴とする、ポリヌクレオチド。
【請求項３０】
配列番号３に示される配列を有することを特徴とする、ポリヌクレオチド。
【請求項３１】
配列番号４に示される配列を有することを特徴とする、ポリヌクレオチド。
【請求項３２】
配列番号５に示される配列を有することを特徴とする、ポリヌクレオチド。
【請求項３３】
配列番号６に示される配列を有することを特徴とする、ポリヌクレオチド。
【請求項３４】
配列番号７に示される配列を有することを特徴とする、ポリヌクレオチド。
【請求項３５】
配列番号８に示される配列を有することを特徴とする、ポリヌクレオチド。
【公表番号】特表２０１１−５１５０９７（Ｐ２０１１−５１５０９７Ａ）
【公表日】平成２３年５月１９日（２０１１．５．１９）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１１−５０１２５４（Ｐ２０１１−５０１２５４）
【出願日】平成２１年３月２５日（２００９．３．２５）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＥＳ２００９／０００１６７
【国際公開番号】ＷＯ２００９／１１８４３８
【国際公開日】平成２１年１０月１日（２００９．１０．１）
【出願人】（５１０２５５２４４）ニューロン ビオファルマ、ソシエダッド、アノニマ (3)
【氏名又は名称原語表記】ＮＥＵＲＯＮ ＢＩＯＰＨＡＲＭＡ， Ｓ．Ａ．
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２３年５月１９日（２０１１．５．１９）
【国際特許分類】
【出願日】平成２１年３月２５日（２００９．３．２５）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＥＳ２００９／０００１６７
【国際公開番号】ＷＯ２００９／１１８４３８
【国際公開日】平成２１年１０月１日（２００９．１０．１）
【出願人】（５１０２５５２４４）ニューロン ビオファルマ、ソシエダッド、アノニマ (3)
【氏名又は名称原語表記】ＮＥＵＲＯＮ ＢＩＯＰＨＡＲＭＡ， Ｓ．Ａ．
【Ｆターム（参考）】
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