本発明は、冠動脈心疾患そして特に、狭窄およびＭＩに関連する遺伝的多型、ならびに薬物処置に対する応答の発見に基づく。特に、本発明は、多型を含む核酸分子、このような核酸分子によってコードされる改変体タンパク質、多型核酸分子およびタンパク質を検出するための試薬、ならびに核酸およびタンパク質を用いる方法、ならびにこれらの検出のための試薬の使用方法に関する。本発明は、新規のＳＮＰ、このようなＳＮＰの固有の組み合わせ、ならびにＣＨＤそして特に狭窄およびＭＩに関係するＳＮＰのハプロタイプの同定に関する。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＣＨＤを発症する危険性の変化を有する個体を同定するための方法であって、該方法は、該個体の核酸における配列番号１〜配列番号６７および配列番号１３５〜配列番号５０４のヌクレオチド配列のいずれか１つにおいて一塩基多型（ＳＮＰ）を検出する工程を包含し、該ＳＮＰが表１および表２にそれぞれ示されるとおりであり、該ＳＮＰの存在が、該個体におけるＭＩの危険性の変化と関連する、方法。
【請求項２】
前記危険性の変化が、上昇した危険性である、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記危険性の変化が、低下した危険性である、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
請求項１に記載の方法であって、対立遺伝子特異的プローブハイブリダイゼーション、対立遺伝子特異的プライマー伸長、対立遺伝子特異的増幅、配列決定、５’ヌクレアーゼ消化、分子ビーコンアッセイ、オリゴヌクレオチドライゲーションアッセイ、サイズ分析、および一本鎖立体配座多型からなる群より選択されるプロセスにより検出が実施される、方法。
【請求項５】
少なくとも８個の連続したヌクレオチドを含む単離された核酸分子であって、ここで、該ヌクレオチドの１つが、配列番号１〜配列番号６７および配列番号１３５〜配列番号５０４のヌクレオチド配列のいずれか１つ、またはその相補体より選択される一塩基多型（ＳＮＰ）であり、該ＳＮＰが表１および表２にそれぞれ示されるとおりである、核酸分子。
【請求項６】
配列番号６８〜配列番号１３４におけるアミノ酸配列のいずれか１つをコードする、単離された核酸分子。
【請求項７】
配列番号６８〜配列番号１３４からなるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチド。
【請求項８】
請求項７に記載のポリペプチド、またはその抗原結合フラグメントに特異的に結合する、抗体。
【請求項９】
配列番号１〜配列番号６７および配列番号１３５〜配列番号５０４のヌクレオチド配列のいずれか１つ、またはその相補体より選択される一塩基多型（ＳＮＰ）を含む増幅されたポリヌクレオチドであって、該増幅されたポリヌクレオチドは、約１６ヌクレオチドと約１，０００ヌクレオチドとの間の長さである、増幅されたポリヌクレオチド。
【請求項１０】
前記ヌクレオチド配列が、配列番号１〜配列番号６７および配列番号１３５〜配列番号５０４のヌクレオチド配列のいずれか１つを含み、前記ＳＮＰが、表１および表２にそれぞれ示されるとおりである、請求項９に記載の増幅されたポリヌクレオチド。
【請求項１１】
配列番号１〜配列番号６７および配列番号１３５〜配列番号５０４のヌクレオチド配列のいずれか１つにおける一塩基多型（ＳＮＰ）を含む核酸分子に特異的にハイブリダイズする単離されたポリヌクレオチドであって、該ＳＮＰが、表１および表２にそれぞれ示されるとおりである、ポリヌクレオチド。
【請求項１２】
８ヌクレオチド〜７０ヌクレオチドの長さである、請求項１１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１３】
対立遺伝子特異的プローブである、請求項１１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１４】
対立遺伝子特異的プライマーである、請求項１１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１５】
前記ポリヌクレオチドが、表３に示されるプライマー配列（配列番号５０５〜配列番号７８３）からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含む、請求項１１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１６】
核酸中の一塩基多型（ＳＮＰ）を検出するためのキットであって、該キットが、請求項１１に記載のポリヌクレオチド、緩衝剤、および酵素を備える、キット。
【請求項１７】
改変体ポリペプチドを検出する方法であって、該方法は、試薬を、試験サンプル中の配列番号１〜配列番号６７および配列番号１３５〜配列番号５０４のヌクレオチド配列のいずれか１つにおける一塩基多型（ＳＮＰ）を含むヌクレオチド配列によってコードされる改変体ポリペプチドと接触させる工程であって、該ＳＮＰが、表１および表２にそれぞれ示されるとおりである、工程、ならびに該試薬の該ポリペプチドに対する結合を検出する工程を包含する、方法。
【請求項１８】
ＭＩを治療的または予防的に処置するのに有用な因子を同定するための方法であって、該方法は、請求項７に記載のポリペプチドと候補因子とを、該ポリペプチドと該候補因子との間での結合複合体の形成を可能にする条件下で接触させる工程、および該結合複合体の形成を検出する工程を包含し、該複合体の存在が該因子を同定する、方法。
【請求項１９】
ＭＩの処置を受ける必要のある個体を同定するための方法であって、該方法は、該個体由来のサンプルにおいて配列番号１〜配列番号６７および配列番号１３５〜配列番号５０４の核酸配列のいずれか１つにおける一塩基多型（ＳＮＰ）を検出する工程であって、該ＳＮＰが表１および表２にそれぞれ示されるとおりである、工程、ならびに該個体を治療因子で処置する工程を包含する、方法。
【請求項２０】
前記治療因子がスタチンである、請求項１９に記載の方法。

【図１】

【公表番号】特表２００９−５２３４０５（Ｐ２００９−５２３４０５Ａ）
【公表日】平成２１年６月２５日（２００９．６．２５）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００８−５０１０５６（Ｐ２００８−５０１０５６）
【出願日】平成１８年３月１３日（２００６．３．１３）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００６／００９０１６
【国際公開番号】ＷＯ２００６／０９９３６５
【国際公開日】平成１８年９月２１日（２００６．９．２１）
【出願人】（５０３３０６４７８）アプレラ　コーポレイション (4)
【Ｆターム（参考）】