本発明は、NIPA-1タンパク質およびNIPA-1タンパク質をコードする核酸に関する。本発明は更に、病態に関連したNIPA-I多型および変異を検出するアッセイに加え、NIPA-1タンパク質のリガンドおよびモジュレーターをスクリーニングする方法を提供する。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
試料中のNIPA-1遺伝子配列変異の存在または非存在を検出することを含む、遺伝性痙性対麻痺の存在または非存在の診断法。
【請求項２】
遺伝子配列変異が、NIPA-1遺伝子のコード領域内にある、請求項1記載の方法。
【請求項３】
遺伝子配列変異が、159位でのCからGへの変化である、請求項2記載の方法。
【請求項４】
多型が、159位でのCからGへの変化との連鎖不均衡にある、請求項1記載の方法。
【請求項５】
検出が、試料からの核酸におけるNIPA-1コード配列変異を検出することを含む、請求項1記載の方法。
【請求項６】
試料がDNAである、請求項5記載の方法。
【請求項７】
試料がRNAである、請求項5記載の方法。
【請求項８】
検出が、多型タンパク質を検出することを含む、請求項1記載の方法。
【請求項９】
多型タンパク質の検出が、抗体によって生じる、請求項8記載の方法。
【請求項１０】
多型タンパク質が、45位でのトレオニンからアルギニンへのアミノ酸変化を含む、請求項8記載の方法。
【請求項１１】
SEQ ID NO:4からなる群より選択されるタンパク質をコードする、単離および精製された核酸配列を含有する組成物。
【請求項１２】
配列が異種プロモーターに機能的に連結されている、請求項11記載の組成物。
【請求項１３】
配列がベクター内に含まれている、請求項11記載の組成物。
【請求項１４】
ベクターが宿主細胞内にある、請求項13記載の組成物。
【請求項１５】
SEQ ID NO:2の断片およびSEQ ID NO:2と少なくとも80％同一であり、かつ159位にCからGへの変化を含むそれらの変種を含有する組成物。
【請求項１６】
断片がSEQ ID NO:2と少なくとも90％同一である、請求項15記載の組成物。
【請求項１７】
断片がSEQ ID NO:2と少なくとも95％同一である、請求項16記載の組成物。
【請求項１８】
以下の工程を含む、NIPA-1の変種を作製する方法：
a)SEQ ID NO:1および2からなる群より選択される核酸配列を提供する工程；
b)該核酸配列の変異を誘発する工程；および
c)該変種をNIPA-1活性についてスクリーニングする工程。
【請求項１９】
以下の工程を含む、化合物のNIPA-1活性を変更する能力についてスクリーニングする方法：
a)i)NIPA-1の少なくとも一部を含むポリペプチド配列；
ii)1つまたは複数の被験化合物を提供する工程；
b)任意の順番で、NIPA-1の少なくとも一部を含む該ポリペプチド配列、および1つまたは複数の該被験化合物を、該ポリペプチド配列および該被験化合物が相互作用するような条件下で混合する工程；ならびに
c)NIPA-1活性を測定する工程。
【請求項２０】
以下の工程を含む、遺伝性痙性対麻痺の治療に有用な薬剤を同定する方法：
a.i.NIPA-1ポリペプチドを含む標的細胞；
ii.候補薬剤を提供する工程；および
b.該標的細胞を該候補薬剤に曝す工程；
c.該標的細胞の該NIPA-1ポリペプチドの活性を測定する工程；
d.該NIPA-1ポリペプチド活性を阻害する候補薬剤を選択する工程。
【請求項２１】
以下の工程を含む、遺伝性痙性対麻痺の治療に有用な医薬品を同定する方法：
a.i.NIPA-1ポリペプチドを含む標的細胞；
ii.候補薬剤を提供する工程；および
b.該標的細胞を該候補薬剤へ曝す工程；
c.該標的細胞の該NIPA-1ポリペプチド活性を測定する工程；
d.該NIPA-1ポリペプチド活性を阻害する候補薬剤を選択する工程。
【請求項２２】
NIPA-1遺伝子の遺伝子配列変異をコードする異種配列を含む、トランスジェニック非ヒト哺乳動物。
【請求項２３】
以下の工程を含む、その多型がHSPに関連しているNIPA-1遺伝子における多型の存在または非存在を検出する方法：
a)NIPA-1遺伝子中の少なくとも1つの多型についてNIPA-1遺伝子を含有する核酸被験試料を分析する工程；
b)工程a)の被験試料の分析結果と、野生型NIPA-1遺伝子を含む対照核酸試料の分析結果とを比較する工程；および
c)被験試料のNIPA-1遺伝子におけるHSPに関連した少なくとも1つの多型の存在または非存在を決定する工程。
【請求項２４】
核酸試料がDNAおよびRNAからなる群より選択される、請求項23記載の方法。
【請求項２５】
NIPA-1遺伝子がSEQ ID NO:1またはSEQ ID NO:2を含む、請求項23記載の方法。
【請求項２６】
核酸試料が分析前に増幅される、請求項23記載の方法。
【請求項２７】
多型がNIPA-1遺伝子のコード領域にある、請求項23記載の方法。
【請求項２８】
多型が、SEQ ID NO:1を含むNIPA-1遺伝子の59位のCからGへの変化である、請求項23記載の方法。
【請求項２９】
分析が、配列分析；断片多型アッセイ；ハイブリダイゼーションアッセイおよびコンピュータに基づくデータ解析からなる群より選択される、請求項23記載の方法。
【請求項３０】
以下の工程を含む、NIPA-1遺伝子中のHSPに関連している多型の存在または非存在を検出する方法：
a)NIPA-1遺伝子を含有する核酸試料と、オリゴヌクレオチドプライマー対とを、試料中に含まれる核酸とプライマー対とのハイブリダイゼーションを可能にする条件下で接触させる工程であって、ここでプライマーは、NIPA-1遺伝子の対象となる領域を特異的に増幅する工程；
b)NIPA-1遺伝子の対象となる領域を増幅し、増幅された核酸を作製する工程；および
c)NIPA-1遺伝子の159位の多型の存在または非存在を検出し、HSPに関連したNIPa-1遺伝子中の多型の存在を検出する工程。
【請求項３１】
HSPに関連する多型について遺伝子を分析することを含む、個体から得たNIPA-1遺伝子を含む核酸被験試料を分析することを含む、個体にHSP発症のリスクがあるかどうかを決定する方法。
【請求項３２】
核酸試料がDNAおよびRNAからなる群より選択される、請求項31記載の方法。
【請求項３３】
NIPA-1遺伝子がSEQ ID NO:1またはSEQ ID NO:2を含む、請求項31記載の方法。
【請求項３４】
核酸試料が分析前に増幅される、請求項31記載の方法。
【請求項３５】
多型が、NIPA-1遺伝子のコード領域にある、請求項31記載の方法。
【請求項３６】
多型がSEQ ID NO:1を含むNIPA-1遺伝子の159位のCからGへの変化である、請求項31記載の方法。
【請求項３７】
分析が、配列分析；断片多型アッセイ；ハイブリダイゼーションアッセイおよびコンピュータに基づくデータ解析からなる群より選択される、請求項31記載の方法。
【請求項３８】
以下の工程を含む、NIPA-1遺伝子の多型に関連する個体におけるHSPの存在または非存在を検出する方法：
a)NIPA-1遺伝子の少なくとも1つの多型について、個体から得たNIPA-1遺伝子を含む核酸被験試料を分析する工程；
b)工程a)の被験試料の分析結果と、野生型NIPA-1遺伝子を含む対照核酸試料の分析結果とを比較する工程；および
c)被験試料のNIPA-1遺伝子におけるHSPに関連した少なくとも1つの多型の存在または非存在を決定する工程であって、ここでHSPに関連した多型の存在が、個体がHSPを有することの指標であり、多型の非存在が、個体がHSPを有さないことの指標である工程。
【請求項３９】
核酸試料がDNAおよびRNAからなる群より選択される、請求項38記載の方法。
【請求項４０】
NIPA-1遺伝子がSEQ ID NO:1またはSEQ ID NO:2を含む、請求項38記載の方法。
【請求項４１】
核酸試料が分析前に増幅される、請求項38記載の方法。
【請求項４２】
多型がNIPA-1遺伝子のコード領域にある、請求項38記載の方法。
【請求項４３】
多型がSEQ ID NO:1を含むNIPA-1遺伝子の159位のCからGへの変化である、請求項38記載の方法。
【請求項４４】
分析が、配列分析；断片多型アッセイ；ハイブリダイゼーションアッセイおよびコンピュータに基づくデータ解析からなる群より選択される、請求項38記載の方法。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【図６】

【図７】

【図８】

【図９】

【図１０】

【図１１】

【図１２】

【図１３】

【公表番号】特表２００７−５１７４９４（Ｐ２００７−５１７４９４Ａ）
【公表日】平成１９年７月５日（２００７．７．５）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００６−５２４０７３（Ｐ２００６−５２４０７３）
【出願日】平成１６年８月１９日（２００４．８．１９）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００４／０２７０６１
【国際公開番号】ＷＯ２００５／０１８４３１
【国際公開日】平成１７年３月３日（２００５．３．３）
【出願人】（５０５０５３８４４）ザ　リージェンツ　オブ　ザ　ユニバーシティ　オブ　ミシガン (16)
【出願人】（５０４０７４７１０）ザ　トラスティーズ　オブ　ザ　ユニバーシティ　オブ　ペンシルバニア (20)
【Ｆターム（参考）】