組合せ抗体ライブラリー及びその使用
ヒト生殖細胞系セグメントから組合せ抗体ライブラリーを生成する方法を提供する。また、ＶＬ鎖をコードする生殖細胞系セグメントから集められた核酸分子のライブラリー及びＶＨ鎖をコードする核酸分子ライブラリー及び得られた抗体ライブラリーも提供する。前記ライブラリーは、アドレス可能なライブラリーとして提供される。標的タンパク質の抗原に対する抗体ライブラリーをスクリーニングする方法及び同定又は選択される抗体を提供する。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
ｉ）各ＶＬ鎖が、ＶＫ及びＪＫヒト生殖細胞系セグメント又はその縮重コドン、或いはＶλ及びＪλヒト生殖細胞系セグメント又はその縮重コドンを含む核酸分子によりコードされ、それによって前記セグメントはインフレームで連結されて、
ｉｉ）各ＶＨ鎖が、ヒトＶＨ及びヒトＪＨ生殖細胞系セグメント並びにＶＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメントの間のあらゆるヌクレオチド配列を含む核酸分子によりコードされ、それによって前記セグメントはインフレームで連結され、
ａ）抗原結合部位を形成するため、各メンバー抗体が可変軽（ＶＬ）鎖及び可変重（ＶＨ）鎖又はその十分な部分を含み、並びに
ｂ）ヒト組み合わせ抗体ライブラリーは、少なくとも凡その或いは５０又は１００又はそれ以上の異なるメンバーを含む、
複数の抗体を含有する前記ライブラリー。
【請求項２】
ＶＨ生殖細胞系セグメント、ＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列及びＶＨ鎖をコードする核酸分子のＪＨ生殖細胞系セグメントは、ＶＨセグメントが、ＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列へ５’で、それはＪＨセグメントへ５’であるよう連結され、並びにＶＬ鎖をコードする核酸分子のＶκ及びＪκ又はＶλ及びＪλ生殖細胞系セグメントは、Ｖκセグメントが、Ｊκセグメントへ５’であり、又はＶλセグメントがＪλセグメントへ５’であるよう連結される、請求項１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３】
ＶＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメントの間のヌクレオチド配列が、５、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００のヌクレオチド長において、又は凡そ５、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００のヌクレオチド長である、請求項１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４】
ＶＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント間のヌクレオチド配列がペプチド模倣物をコードする、請求項１−３のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５】
ｉ）各ＶＬ鎖が、Ｖκ及びＪκヒト生殖細胞系セグメント又はその縮重コドン、或いはＶλ及びＪλヒト生殖細胞系セグメント又はその縮重コドンを含む核酸分子によってコードされ、それによって前記セグメントはインフレームで連結されて、
ｉｉ）各ＶＨ鎖は、ＶＨ、ＤＨ及びＪＨヒト生殖細胞系セグメント又ははその縮重コドンを含む核酸分子によってコードされ、それによって前記セグメントはインフレームで連結される、
ａ）抗原結合部位を形成するため、各メンバー抗体が、修飾可変軽（ＶＬ）鎖及び／又は修飾可変重（ＶＨ）鎖或いはその十分な部分を含み、並びに
ｂ）ＶＬ鎖及び／又はＶＨ鎖が、アミノ酸をＣＤＲへ置換又は挿入することにより修飾される、
複数の抗体を含有するヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６】
ＣＤＲが、ＣＤＲＨ１、ＣＤＲＨ２、ＣＤＲＨ３、ＣＤＲＬ１、ＣＤＲＬ２及びＣＤＲＬ３から選択される、請求項５に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７】
ＣＤＲがＣＤＲＨ３である、請求項６に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８】
挿入又は置換されるアミノ酸がペプチド模倣物に対応する、請求項５−７のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項９】
ペプチド模倣物が、ＴＰＯ、ＥＰＯ、Ｇ−ＣＳＦ、ＩＬ−５、ヒト脳ナトリウム利尿ペプチド（ｈＢＮＰ−３２）、エキセンディン４、ＧＬＰ−１、ＧＬＰ−２、グルカゴン、ＰＡＣＡＰ−３８、ＣＤ２０９Ｌ、ＴＮＦ、ＶＥＧＦ、ＭＭＰ阻害剤又はＣＴＬＡ−４ペプチド模倣物から選択される、請求項４又は請求項８に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項１０】
ペプチド模倣物が、更に、カルボキシ及び／又はＮ−末端においてフランキング配列を含む、請求項４又は請求項５に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項１１】
フランキング配列がグリシン又はプロリンである、請求項６に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項１２】
ペプチド模倣部物が、配列識別番号：８９１、９８７−１０１４から選択されるアミノ酸配列を有する、請求項４−７のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項１３】
ＶＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント間のヌクレオチド配列が、ヒトＤＨセグメント又はその縮重コドンをである、請求項１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項１４】
ｉ）各ＶＬ鎖が、Ｖκ及びＪκヒト生殖細胞系セグメント又はその縮重コドン、或いはＶλ及びＪλヒト生殖細胞系セグメント又はその縮重コドンを含む核酸分子によりコードされ、それによって前記セグメントはインフレームで連結されて、
ｉｉ）各ＶＨ鎖が、ＶＨ、ＤＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント含む核酸分子によりコードされ、それによって前記セグメントはインフレームで連結される、
ａ）抗原結合部位を形成するため、各メンバー抗体が、可変軽（ＶＬ）鎖及び可変重（ＶＨ）鎖或いはその十分な部分を含み、並びに
ｂ）ヒト組合せ抗体ライブラリーが、少なくとも大体の或いは５０又は１００又はそれ以上の異なるメンバーを含む、
複数の抗体を含有する前記ライブラリー。
【請求項１５】
アドレス可能なライブラリーである、請求項１−１４に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項１６】
各アドレス内の抗体が同じ抗体で、他の全てのアドレスの抗体とは異なる、請求項１５に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項１７】
ＶＨ鎖をコードする核酸分子のＶＨ、ＤＨ及びＪＨセグメントは、ＶＨセグメントがＤＨセグメントへ５’で、それはＪＨセグメントへ５’であるよう連結され、並びにＶＬ鎖をコードする核酸分子のＶκ及びＪκ又はＶλ及びＪλ生殖細胞系セグメントは、ＶκセグメントがＪκセグメントへ５’で、或いはＶλセグメントがＪλセグメントへ５’であるよう連結される、請求項１３−１６に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項１８】
複数の核酸分子がＶＨ鎖をコードし、複数の核酸分子がＶＬ鎖をコードして、並びにＶＨ鎖及びＶＬ鎖をコードする複数の核酸分子は、少なくとも大体或いは５０又は１００の異なる抗体を生成するのに十分である、請求項１−１７のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項１９】
全て又は一部の生殖細胞系ＶＨセグメントは、全て又は一部の生殖細胞系ＪＨセグメントと連結される全て又は一部のＤＨセグメントと連結され、ＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子を生成し、及び全て又は一部の生殖系Ｖκセグメントは、全て又は一部の生殖細胞系Ｊκセグメントと連結され、若しくは全て又は一部の生殖細胞系Ｖλセグメントは、全て又は一部の生殖細胞系Ｊλセグメントに連結され、ＶＬ鎖をコードする複数の核酸分子を生成する、請求項１８に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２０】
ＶＨ生殖細胞系列セグメントが、ＩＧＨＶ１、ＩＧＨＶ２、ＩＧＨＶ３、ＩＧＨＶ４、ＩＧＨＶ５、ＩＧＨＶ６及びＩＧＨＶ７並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１−１９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２１】
ＶＨが配列識別番号１０−２３８のいずれかから選択される、請求項２０に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２２】
ＤＨセグメントが、ＩＧＨＤ１、ＩＧＨＤ２、ＩＧＨＤ３、ＩＧＨＤ４、ＩＧＨＤ５、ＩＧＨＤ６及びＩＧＨＤ７並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項９−２１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２３】
ＤＨが配列識別番号：２３９−２７２のいずれかから選択される、請求項２２に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２４】
ＪＨが、ＩＧＨＪ１、ＩＧＨＪ２、ＩＧＨＪ３、ＩＧＨＪ４、ＩＧＨＪ５及びＩＧＨＪ６並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１−２３のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２５】
ＪＨが配列識別番号：２７３−２８５のいずれかから選択される、請求項２４に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２６】
ＶＨの配列が、ＶＨ鎖のリーディングフレームを維持するためＶ−Ｄ結合部で追加又は除去される１つのヌクレオチドを有する、請求項１−２５のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２７】
ＶＨヌクレオチド配列の３’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項２６に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２８】
ヌクレオチドが、ＶＨとＤＨの間でヌクレオチドを追加するＶＨヌクレオチド配列の３’末端で挿入される、請求項２７に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２９】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項２８に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３０】
ＤＨ配列が、ＶＨ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｄ結合部及び／又はＤ−Ｊ結合部で挿入及び欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項１−２９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３１】
ヌクレオチドの挿入又は欠失が、ＤＨの親水性を最大化するため選択される、請求項３０に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３２】
ＤＨの５’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項３０又は請求項３１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３３】
ＤＨの３’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項３０−３２のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３４】
ヌクレオチドが、ＤＨ及びＪＨであるヌクレオチドを追加するため、ＤＨ配列の３’末端で挿入される、請求項３０−３２のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３５】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項３４に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３６】
ＪＨの配列が、ＶＨ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｄ−Ｊ結合部で挿入又は欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項１−３５のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３７】
ヌクレオチドの挿入又は欠失が、ＪＨのリーディングフレームを維持するため選択される、請求項３１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３８】
ＪＨの５’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項３１又は請求項３２に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３９】
ＪＨの３’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項２０−３３のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４０】
Ｖκが、ＩＧＫＶ１、ＩＧＫＶ２、ＩＧＫＶ３、ＩＧＫＶ４、ＩＧＫＶ５及びＩＧＫＶ６並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１−３９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４１】
Ｖκが、配列識別番号：２８６−３５５及び８６８のいずれかから選択される、請求項４０に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４２】
Ｊκが、ＩＧＫＪ１、ＩＧＫＪ２、ＩＧＫＪ３、ＩＧＫＪ４及びＩＧＫＪ５並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１−４１のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４３】
Ｊκが、配列識別番号：３５６−３６４のいずれかから選択される、請求項４２に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４４】
Ｖκの配列が、ＶＬ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｊ結合部で挿入又は欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項１−４３のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４５】
Ｖκヌクレオチド配列の３’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項４４に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４６】
ヌクレオチドが、ＶκとＪκの間でヌクレオチドを追加するため、Ｖκヌクレオチド配列の３’末端で挿入される、請求項４４に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４７】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項４６に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４８】
Ｊκの配列が、ＶＬ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｊ結合部で挿入または欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項１−４７のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４９】
ヌクレオチドの挿入又は欠失が、Ｊκのリーディングフレームを維持するため選択される、請求項４８に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５０】
Ｊκの５’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項４８又は請求項４９に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５１】
Ｖλが、ＩＧＬＶ１、ＩＧＬＶ２、ＩＧＬＶ３、ＩＧＬＶ４、ＩＧＬＶ５、ＩＧＬＶ６、ＩＧＬＶ７、ＩＧＬＶ８、ＩＧＬＶ９、ＩＧＬＶ１０及びＩＧＬＶ１１並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１−３９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５２】
Ｖλが、配列識別番号：３６５−４４１のいずれかから選択される、請求項５１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５３】
Ｊλが、ＩＧＬＪ１、ＩＧＬＪ２、ＩＧＬＪ３、ＩＧＬＪ４、ＩＧＬＪ５、ＩＧＬＪ６及びＩＧＬＪ７並びに遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１−３９、５１及び５２のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５４】
Ｊλが、配列識別番号：４４２−４５１のいずれかから選択される、請求項５３に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５５】
Ｖλの配列が、ＶＬ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｊ結合部で挿入又は欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項１−３４及び５１−５４のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５６】
Ｖλヌクレオチド配列の３’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項５５のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５７】
ヌクレオチドが、ＶλとＪλの間でヌクレオチドを追加するため、Ｖλヌクレオチド配列の３’末端で挿入される、請求項５５に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５８】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項５７に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５９】
Ｊλの配列が、ＶＬ鎖のリーティングフレームを維持するため、Ｖ−Ｊ結合部で挿入又は欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項１−３９及び５１−５８のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６０】
ヌクレオチドの挿入又は欠失が、Ｊλのリーディングフレームを維持するため選択される、請求項５９に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６１】
Ｊλの５’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項５４又は請求項５５に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６２】
ＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子が、配列の類似性又は相違性、遺伝子ファミリー、長さ、構成、ＣＤＲ長さ又は構成、種類、機能性、特異性、群又は亜群に基づいて選択される一部の生殖細胞系セグメントから生成される、請求項１−６１のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６３】
ＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子が、ＣＤＲに基づいて選択される一部の生殖細胞系セグメントから生成され、前記ＣＤＲはＣＤＲ３である、請求項６２に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６４】
ＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子が、遺伝子ファミリーに基づいて選択され、それによって各ＶＨ、ＤＨ及び／又はＪＨ遺伝子ファミリーからの生殖細胞系セグメントが選択され、若しくは一部のＶＨ、ＤＨ及び／又はＪＨ遺伝子ファミリーからの１つの生殖細胞系セグメントが選択される、請求項６２に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６５】
ＶＨ遺伝子ファミリーが、ＩＧＨＶ１−１８、ＩＧＨＶ１−２、ＩＧＨＶ１−２４、ＩＧＨＶ１−３、ＩＧＨＶ１−４５、ＩＧＨＶ１−４６、ＩＧＨＶ１−５８、ＩＧＨＶ１−６９、ＩＧＨＶ１−８、ＩＧＨＶ２−２６、ＩＧＨＶ２−５、ＩＧＨＶ２−７０、ＩＧＨＶ３−１１、ＩＧＨＶ３−１３、ＩＧＨＶ３−１５、ＩＧＨＶ３−１６、ＩＧＨＶ３−２０、ＩＧＨＶ３−２１、ＩＧＨＶ３−２３、ＩＧＨＶ３−３０、ＩＧＨＶ３−３３、ＩＧＨＶ３−３５、ＩＧＨＶ３−３８、ＩＧＨＶ３−４３、ＩＧＨＶ３−４８、ＩＧＨＶ３−４９、ＩＧＨＶ３−５３、ＩＧＨＶ３−６４、ＩＧＨＶ３−６６、ＩＧＨＶ３−７、ＩＧＨＶ３−７２、ＩＧＨＶ３−７３、ＩＧＨＶ３−７４、ＩＧＨＶ３−９、ＩＧＨＶ４−２８、ＩＧＨＶ４−３１、ＩＧＨＶ４−３４、ＩＧＨＶ４−３９、ＩＧＨＶ４−４、ＩＧＨＶ４−５９、ＩＧＨＶ４−６１、ＩＧＨＶ５−５１、ＩＧＨＶ６−１及びＩＧＨＶ７−８１から選択され、ＤＨ遺伝子ファミリーが、ＩＧＨＤ１−１、ＩＧＨＤ１−１４、ＩＧＨＤ１−２０、ＩＧＨＤ１−２６、ＩＧＨＤ１−７、ＩＧＨＤ２−１５、ＩＧＨＤ２−２、ＩＧＨＤ２−２１、ＩＧＨＤ２−８、ＩＧＨＤ３−１０、ＩＧＨＤ３−１６、ＩＧＨＤ３−２２、ＩＧＨＤ３−３、ＩＧＨＤ３−９、ＩＧＨＤ４−１１、ＩＧＨＤ４−１７、ＩＧＨＤ４−２３、ＩＧＨＤ４−４、ＩＧＨＤ５−１２、ＩＧＨＤ５−１８、ＩＧＨＤ５−２４、ＩＧＨＤ５−５、ＩＧＨＤ６−１３、ＩＧＨＤ６−１９、ＩＧＨＤ６−２５、ＩＧＨＤ６−６及びＩＧＨＤ７−２７から選択され、並びに
ＪＨ遺伝子ファミリーが、ＩＧＨＪ１、ＩＧＨＪ２、ＩＧＨＪ３、ＩＧＨＪ４、ＩＧＨＪ５及びＩＧＨＪ６から選択される、請求項６４に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６６】
ＶＬ鎖をコードする複数の核酸分子が、配列の類似性又は相違性、遺伝子ファミリー、長さ、構成、ＣＤＲ長さ又は構成、種類、機能性、特異性、群又は亜群に基づいて選択される一部の生殖細胞系セグメントから生成される、請求項１−６５のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６７】
ＶＬ鎖をコードする複数の核酸分子が、ＣＤＲに基づいて選択される一部の生殖細胞系セグメントから生成され、前記ＣＤＲはＣＤＲ３である、請求項６６に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６８】
ＶＨ鎖でコードする複数の核酸分子が、遺伝子ファミリーに基づいて選択され、それによって、各々のＶκ及び／又はＪκ若しくはＶλ及び／又はＪλ遺伝子ファミリーからの１つの生殖細胞系セグメントが選択され、或いは一部のＶκ及び／又はＪκ若しくはＶλ及び／或いはＪλ遺伝子ファミリーからの１つの生殖細胞系セグメントが選択される、請求項６６に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６９】
Ｖκ遺伝子ファミリーが、ＩＧＫＶ１−１２、ＩＧＫＶ１−１２、ＩＧＫＶ１−１６、ＩＧＫＶ１−１７、ＩＧＫＶ１−２７、ＩＧＫＶ１−３３、ＩＧＫＶ１−３７、ＩＧＫＶ１−３９、ＩＧＫＶ１−５、ＩＧＫＶ１−６、ＩＧＫＶ１−８、ＩＧＫＶ１−９、ＩＧＫＶ１−ＮＬ１、ＩＧＫＶ１／ＯＲ２、ＩＧＫＶ１Ｄ−１２、ＩＧＫＶ１Ｄ−１３、ＩＧＫＶ１Ｄ−１６、ＩＧＫＶ１−Ｄ−１７、ＩＧＫＶ１Ｄ−３３、ＩＧＫＶ１Ｄ−３７、ＩＧＫＶ１Ｄ−３９、ＩＧＫＶ１Ｄ−４２、ＩＧＫＶ１Ｄ−４３、ＩＧＫＶ１Ｄ−８、ＩＧＫＶ２−２４、ＩＧＫＶ２−２８、ＩＧＫＶ２−２９、ＩＧＫＶ２−３０、ＩＧＫＶ２−３０、ＩＧＫＶ２−４０、ＩＧＫＶ２Ｄ−２４、ＩＧＫＶ２Ｄ−２６、ＩＧＫＶ２Ｄ−２８、ＩＧＫＶ２Ｄ−２９、ＩＧＫＶ２−Ｄ−３０、ＩＧＫＶ２Ｄ−４０、ＩＧＫＶ３−１１、ＩＧＫＶ３−１５、ＩＧＫＶ３−２０、ＩＧＫＶ３−７、ＩＧＫＶ３−ＮＬ１、ＩＧＶ３−ＮＬ２、ＩＧＫＶ３−ＮＬ３、ＩＧＫＶ３−ＮＬ４、ＩＧＫＶ３−ＮＬ５、ＩＧＫＶ３／ＯＲ２−２６８、ＩＧＫＶ３Ｄ−１１、ＩＧＫＶ３Ｄ−１５、ＩＧＫＶ３Ｄ−２０、ｉＧＫＶ３Ｄ−７、ＩＧＫＶ４−１、ＩＧＫＶ５−２、ＩＧＫＶ６−２１、ＩＧＫＶ６Ｄ−２１、ＩＧＫＶ６Ｄ−４１、及びＩＧＫＶ１−３から選択され、
Ｊκ遺伝子ファミリーが、ＩＧＫＪ１、ＩＧＫＪ２、ＩＧＫＪ３、ＩＧＫＪ４及びＩＧＫＪ５から選択され、Ｖλ遺伝子ファミリーが、ＩＧＬＶ１−３６、ＩＧＬＶ１−４０、ＩＧＬＶ１−４１、ＩＣＬＶ１−４４、ＩＧＬＶ１−４７、ＩＧＬＶ１−５０、ＩＧＬＶ１−５１、ＩＧＬＶ１０−５４、ＩＧＬＶ１１−５５、ＩＧＬＶ２−１１、ＩＧＬＶ２−１４、ＩＧＬＶ２−１８、ＩＧＬＶ２−２３、ＩＧＬＶ２−３３、ＩＧＬＶ２−８、ＩＧＬＶ３−１、ＩＧＬＶ３−１０、ＩＧＬＶ３−１２、ＩＧＬＶ３−１６、ＩＧＬＶ３−１９、ＩＧＬＶ３−２１、ＩＧＬＶ３−２２、ＩＧＬＶ３−２５、ＩＧＬＶ３−２７、ＩＧＬＶ３−３２、ＩＧＬＶ３−９、ＩＧＬＶ４−３、ＩＧＬＶ４−６０、ＩＧＬＶ４−６９、ＩＧＬＶ５−３７、ＩＧＬＶ５−３９、ＩＧＬＶ５−４５、ＩＧＬＶ５−８、ＩＧＬＶ５−５２、ＩＧＬＶ６−５７、ＩＧＬＶ７−４３、ＩＧＬＶ７−４６、ＩＧＬＶ８−６１、ＩＧＬＶ８−６１及びＩＧＬＶ９−４９から選択され、並びに
Ｊλ遺伝子ファミリーが、ＩＧＬＪ１、ＩＧＬＪ２、ＩＧＬＪ４、ＩＧＬＪ５、ＩＧＬＪ６及びＩＧＬＪ７から選択される、請求項６８に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７０】
ＶＨ鎖をコードする核酸分子が、停止コドン及び／又は制限酵素部位を除去するため修飾される、請求項１−６９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７１】
ＶＬ鎖をコードする核酸分子が、停止コドン及び／又は制限酵素部位を除去するため修飾される、請求項１−６９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７２】
ＶＨ鎖をコードする核酸分子が、配列識別番号：１０５９−１４１０のいずれか、若しくはその一部、及びＶＬ鎖をコードする核酸分子が、配列識別番号：１４１１−１４２２、１４２４−１４３９及び１４４１−１４７１のいずれか、若しくはその一部から選択される、請求項１−７１のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７３】
ＶＨ鎖が、配列番号：１４７５−１８２６のいずれか、又はその一部から選択されるアミノ酸配列を有し、及びＶＬ鎖が、配列番号：１８２７−１８３８、１８４０−１８５５及び１８５７−１８８８又はその一部から選択されるアミノ酸配列を有する、請求項１−７２のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７４】
ライブラリーの各メンバー抗体が、重鎖及び軽鎖の会合を可能にするのに十分な全て又は一部の定常領域を更に含む、請求項１−７３のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７５】
ライブラリーの各メンバー抗体が、完全長抗体から、或いは抗原結合部位を形成するのに十分なそのフラグメント又は部分から選択される、請求項１−７４のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７６】
フラグメント又はその部分が、Ｆａｂ、Ｆａｂ′、Ｆ（ａｂ’）２、単一鎖Ｆｖｓ（ｓｃＦｖ）、Ｆｖ、ｄｓＦｖ、二重特異性抗体、Ｆｄ及びＦｄ’フラグメント、Ｆａｂフラグメント、Ｆｄフラグメント、ｓｃＦｖフラグメント及びｓｃＦａｂフラグメントから選択される、請求項７５に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７７】
ライブラリーの各メンバー抗体がＦａｂである、請求項１−７６のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７８】
大体或いは５０、１０２、１０３、１０４、２ｘ１０４、３ｘ１０４、４ｘ１０４、５ｘ１０４、６ｘ１０４、７ｘ１０４、８ｘ１０４、９ｘ１０４、１０５、１０６、１０７、１０８、１０９又はそれ以上の異なるメンバーを含む、請求項１−７７のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７９】
１０３、２ｘ１０３、３ｘ１０３、４ｘ１０３、５ｘ１０３、６ｘ１０３、７ｘ１０３、８ｘ１０３、９ｘ１０３、１０４、２ｘ１０４、３ｘ１０４、４ｘ１０４、５ｘ１０４、６ｘ１０４、７ｘ１０４、８ｘ１０４、９ｘ１０４又はそれ以上の異なるメンバーを含む、請求項１−７８のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８０】
アドレス可能な抗体が、空間アレイで配列される、請求項１−７９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８１】
空間アレイがマルチウェルプレートであり、前記プレートの個々の位置が様々な抗体メンバーに対応する、請求項８０に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８２】
様々な抗体メンバーが、プレートのウェルの表面に固定化される、請求項８１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８３】
様々な抗体メンバーが溶液中に存在する、請求項７６に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８４】
アドレス可能な抗体が、固体支持体に付着される、請求項１−７９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８５】
固体支持体が、フィルター、チップ、スライド、ビード又はセルロースで、及び様々な抗体メンバーが、その表面に固定化される、請求項８４に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８６】
固体支持体がＢｉａｃｏｒｅチップである、請求項８５に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８７】
抗体が同定可能に標識化される、請求項８０−８６のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８８】
標識が、有色、発色性、発光性、化学的、蛍光性又は電子的である、請求項８７に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８９】
各ＶＬ鎖が、インフレームで連結されるＶκ及びＪκヒト生殖細胞系セグメント又はＶλ及びＪλヒト生殖細胞系セグメントを含む核酸分子によってコードされ、並びに各アドレス内の核酸分子が同じで、他の全てのアドレスの核酸分子とは異なる、可変の軽（ＶＬ）鎖をコードする複数のアドレス可能な核酸分子を含む核酸分子のライブラリー。
【請求項９０】
ＶＬ鎖をコードする核酸分子のＶκ及びＪκ又はＶλ及びＪλ生殖細胞系セグメントは、ＶκセグメントがＪκセグメントへ５’で、ＶλセグメントがＪλセグメントへ５’であるよう連結される、請求項８９に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項９１】
全て又は一部の生殖細胞系Ｖκセグメントが、全て又は一部の生殖細胞系Ｊκセグメントと連結され、或いは全て又は一部の生殖細胞系Ｖλセグメントが全て又は一部の生殖細胞系Ｊλセグメントに連結され、ＶＬ鎖をコードする複数の核酸分子を生成する、請求項９０に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項９２】
Ｖκが、ＩＧＫＶ１、ＩＧＫＶ２、ＩＧＫＶ３、ＩＧＫＶ４、ＩＧＫＶ５及びＩＧＫＶ６並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項８９−９１のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項９３】
Ｖκが、配列識別番号：２８６−３５５及び８６８のいずれかから選択される、請求項９２に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項９４】
Ｖκの配列が、ＶＬ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｊ結合部で挿入又は欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項８９−９３のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項９５】
Ｖκヌクレオチド配列の３’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項９４に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項９６】
ヌクレオチドが、ＶκとＪκの間でヌクレオチドを追加するため、Ｖκヌクレオチド配列の３’末端で挿入される、請求項９４に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項９７】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項９６に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項９８】
Ｊκが、ＩＧＫＪ１、ＩＧＫＪ２、ＩＧＫＪ３、ＩＧＫＪ４及びＩＧＫＪ５並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項８９−９７のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項９９】
Ｊκが、配列識別番号：３５６−３６４のいずれかから選択される、請求項９８に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１００】
Ｊκの配列が、ＶＬ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｊ結合部で挿入又は欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項８９−９９のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１０１】
ヌクレオチドの挿入又は欠失が、Ｊκリーディングフレームを維持するため選択される、請求項１００に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１０２】
Ｊκの５’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項１００又は請求項１０１に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１０３】
Ｖλが、ＩＧＬＶ１、ＩＧＬＶ２、ＩＧＬＶ３、ＩＧＬＶ４、ＩＧＬＶ５、ＩＧＬＶ６、ＩＧＬＶ７、ＩＧＬＶ８、ＩＧＬＶ９、ＩＧＬＶ１０及びＩＧＬＶ１１並びにその遺伝子及び対立遺伝子の中から選択される、請求項８９−９１のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１０４】
Ｖλが、配列識別番号：３６５−４４１のいずれかから選択される、請求項９８に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１０５】
Ｖλの配列が、ＶＬ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｊ結合部で挿入又は欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項８９−９１及び１０３−１０４のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１０６】
Ｖλのヌクレオチド配列の３’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項１０５に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１０７】
ヌクレオチドが、ＶλとＪλの間でヌクレオチドを追加するため、Ｖλヌクレオチド配列の３’末端で挿入される、請求項１０５に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１０８】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項１０７に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１０９】
Ｊλが、ＩＧＬＪ１、ＩＧＬＪ２、ＩＧＬＪ３、ＩＧＬＪ４、ＩＧＬＪ５、ＩＧＬＪ６及びＩＧＬＪ７並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項８９−９１及び１０５−１０８のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１１０】
Ｊλが、配列識別番号：４４２−４５１のいずれかから選択される、請求項１０９に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１１１】
Ｊλの配列が、ＶＬ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｊ結合部で挿入又は欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項８９−９１及び１０５−１１０のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１１２】
ヌクレオチドの挿入又は欠失が、Ｊλのリーディングフレームを維持するため選択される、請求項１１１に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１１３】
Ｊλの５’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項１１１又は請求項１０７に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１１４】
ＶＬ鎖をコードする複数の核酸分子が、配列の類似性又は相違性、遺伝子ファミリー、長さ、構成、ＣＤＲ長さ又は構成、種類、機能性、特異性、群、亜群に基づいて選択される一部の生殖細胞系セグメントから生成される、請求項８９−１１３のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１１５】
ＶＬ鎖をコードする複数の核酸分子が、ＣＤＲに基づいて選択される一部の生殖細胞系セグメントから生成され、前記ＣＤＲはＣＤＲ３である、請求項１１４に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１１６】
ＶＬ鎖をコードする複数の核酸分子が、遺伝子ファミリーに基づいて選択され、それによって、各々のＶκ及び／又はＪκ若しくはＶλ及び／又はＪλ遺伝子ファミリーからの１つの生殖細胞系セグメントが選択され、或いは一部のＶκ及び／又はＪκ若しくはＶλ及び／又はＪλ遺伝子ファミリーからの１つの生殖細胞系セグメントが選択される、請求項６６に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１１７】
Ｖκ遺伝子ファミリーが、ＩＧＫＶ１−１２、ＩＧＫＶ１−１２、ＩＧＫＶ１−１６、ＩＧＫＶ１−１７、ＩＧＫＶ１−２７、ＩＧＫＶ１−３３、ＩＧＫＶ１−３７、ＩＧＫＶ１−３９、ＩＧＫＶ１−５、ＩＧＫＶ１−６、ＩＧＫＶ１−８、ＩＧＫＶ１−９、ＩＧＫＶ１−ＮＬ１、ＩＧＫＶ１／ＯＲ２、ＩＧＫＶ１Ｄ−１２、ＩＧＫＶ１Ｄ−１３、ＩＧＫＶ１Ｄ−１６、ＩＧＫＶ１−Ｄ−１７、ＩＧＫＶ１Ｄ−３３、ＩＧＫＶ１Ｄ−３７、ＩＧＫＶ１Ｄ−３９、ＩＧＫＶ１Ｄ−４２、ＩＧＫＶ１Ｄ−４３、ＩＧＫＶ１Ｄ−８、ＩＧＫＶ２−２４、ＩＧＫＶ２−２８、ＩＧＫＶ２−２９、ＩＧＫＶ２−３０、ＩＧＫＶ２−３０、ＩＧＫＶ２−４０、ＩＧＫＶ２Ｄ−２４、ＩＧＫＶ２Ｄ−２６、ＩＧＫＶ２Ｄ−２８、ＩＧＫＶ２Ｄ−２９、ＩＧＫＶ２−Ｄ−３０、ＩＧＫＶ２Ｄ−４０、ＩＧＫＶ３−１１、ＩＧＫＶ３−１５、ＩＧＫＶ３−２０、ＩＧＫＶ３−７、ＩＧＫＶ３−ＮＬ１、ＩＧＶ３−ＮＬ２、ＩＧＫＶ３−ＮＬ３、ＩＧＫＶ３−ＮＬ４、ＩＧＫＶ３−ＮＬ５、ＩＧＫＶ３／ＯＲ２−２６８、ＩＧＫＶ３Ｄ−１１、ＩＧＫＶ３Ｄ−１５、ＩＧＫＶ３Ｄ−２０、ｉＧＫＶ３Ｄ−７、ＩＧＫＶ４−１、ＩＧＫＶ５−２、ＩＧＫＶ６−２１、ＩＧＫＶ６Ｄ−２１、ＩＧＫＶ６Ｄ−４１、及びＩＧＫＶ１−３９から選択され、
Ｊκ遺伝子ファミリーが、ＩＧＫＪ１、ＩＧＫＪ２、ＩＧＫＪ３、ＩＧＫＪ４及びＩＧＫＪ５から選択され、
Ｖλ遺伝子ファミリーが、ＩＧＬＶ１−３６、ＩＧＬＶ１−４０、ＩＧＬＶ１−４１、ＩＧＬＶ１−４４、ＩＧＬＶ１−４７、ＩＧＬＶ１−５０、ＩＧＬＶ１−５１、ＩＧＬＶ１０−５４、ＩＧＬＶ１１−５５、ＩＧＬＶ２−１１、ＩＧＬＶ２−１４、ＩＧＬＶ２−１８、ＩＧＬＶ２−２３、ＩＧＬＶ２−３３、ＩＧＬＶ２−８、ＩＧＬＶ３−１、ＩＧＬＶ３−１０、ＩＧＬＶ３−１２、ＩＧＬＶ３−１６、ＩＧＬＶ３−１９、ＩＧＬＶ３−２１、ＩＧＬＶ３−２２、ＩＧＬＶ３−２５、ＩＧＬＶ３−２７、ＩＧＬＶ３−３２、ＩＧＬＶ３−９、ＩＧＬＶ４−３、ＩＧＬＶ４−６０、ＩＧＬＶ４−６９、ＩＧＬＶ５−３７、ＩＧＬＶ５−３９、ＩＧＬＶ５−４５、ＩＧＬＶ５−８、ＩＧＬＶ５−５２、ＩＧＬＶ６−５７、ＩＧＬＶ７−４３、ＩＧＬＶ７−４６、ＩＧＬＶ８−６１、ＩＧＬＶ８−６１及びＩＧＬＶ９−４９から選択され、並びに
Ｊλ遺伝子ファミリーが、ＩＧＬＪ１、ＩＧＬＪ２、ＩＧＬＪ４、ＩＧＬＪ５、ＩＧＬＪ６及びＩＧＬＪ７から選択される、請求項１１６に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１１８】
ＶＬ鎖をコードする核酸分子が、停止コドン及び／又は制限酵素部位を除去するため修飾される、請求項８９−１１７のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１１９】
ＶＨ鎖をコードする核酸分子が、配列識別番号：１４１１−１４２２、１４２４−１４３９及び１４１１−１４７１のいずれか、若しくはその一部から選択される、請求項８９−１１８のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１２０】
ライブラリーの各ベクターが様々な核酸分子を含む、請求項８９−１１９にのいずれかに記載の核酸分子を含有するアドレス可能なベクターのライブラリー。
【請求項１２１】
ライブラリーの各細胞が様々なベクターを含む、請求項１２０のベクターを含有するアドレス可能な細胞のライブラリー。
【請求項１２２】
各ＶＨ鎖が、インフレームで連結されるＶＨ、ＤＨ及びＪＨヒト生殖細胞系セグメントを含む核酸分子によりコードされ、及び
各アドレス内の核酸分子は同じで、他の全てのアドレスの核酸分子とは異なる、可変の重（ＶＨ）鎖をコードする複数のアドレス可能な核酸分子を含む核酸分子のライブラリー。
【請求項１２３】
ＶＨ鎖をコードする核酸分子のＶＨ、ＤＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメントは、ＶＨセグメントが、ＤＨセグメントへ５’で、それはＪＨセグメントへ５’であるよう連結される、請求項１２２に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１２４】
全て又は一部の生殖細胞系ＶＨセグメントが、全て又は一部の生殖細胞系ＪＨセグメントと連結される全て又は一部の生殖細胞系ＤＨセグメントと連結され、ＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子を生成する、請求項１２３に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１２５】
ＶＨが、ＩＧＨＶ１、ＩＧＨＶ２、ＩＧＨＶ３、ＩＧＨＶ４、ＩＧＨＶ５、ＩＧＨＶ６及びＩＧＨＶ７並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１２２−１２４のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１２６】
ＶＨが、配列識別番号：１０−２３８のいずれかから選択される、請求項１２５に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１２７】
ＶＨの配列が、ＶＨ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｄ結合部で追加又は除去される１つのヌクレオチドを有する、請求項１２２−１２６のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１２８】
ＶＨヌクレオチド配列の３’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項１２７に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１２９】
ヌクレオチドが、ＶＨ及びＤＨの間でヌクレオチドを追加するため、ＶＨヌクレオチド配列の３’末端で挿入される、請求項１２７に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１３０】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項１２９に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１３１】
ＤＨが、ＩＧＨＤ１、ＩＧＨＤ２、ＩＧＨＤ３、ＩＧＨＤ４、ＩＧＨＤ５、ＩＧＨＤ６及びＩＧＨＤ７並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１２２−１３０のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１３２】
ＤＨが、配列識別番号：２３９−２７２のいずれかから選択される、請求項１３１に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１３３】
ＤＨの配列が、ＶＨ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｄ結合部及び／又はＤ−Ｊ結合部で挿入又は欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項１２２−１３２のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１３４】
ヌクレオチドの挿入又は欠失が、ＤＨの親水性を最大化するため選択される、請求項１３３に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１３５】
ＤＨの５’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項１３３又は請求項１３４に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１３６】
ＤＨの３’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項１３３−１３５のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１３７】
ヌクレオチドが、ＤＨ配列の３’末端で挿入され、ＤＨ及びＪＨであるヌクレオチドを追加する、請求項１３３−１３６のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１３８】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項１３７に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１３９】
ＪＨが、ＩＧＨＪ１、ＩＧＨＪ２、ＩＧＨＪ３、ＩＧＨＪ４、ＩＧＨＪ５及びＩＧＨＪ６並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１２２−１３９のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１４０】
ＪＨが、配列認識番号：２７３−２８５のいずれかから選択される、請求項１３９に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１４１】
ＪＨ配列が、ＶＨ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｄ−Ｊ結合部で挿入又は欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項１２２−１４０のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１４２】
ヌクレオチドの挿入又は欠失が、ＪＨのリーディングフレームを維持するために選択される、請求項１４１に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１４３】
ＪＨの５’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項１４１又は請求項１４２に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１４４】
ＪＨの３’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項１４１−１４３のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１４５】
ＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子が、配列の類似性又は相違性、遺伝子ファミリー、長さ、構成、ＣＤＲ長さ又は構成、種類、機能性、特異性、群又は亜群に基づいて選択される一部の生殖細胞系セグメントから生成される、請求項１２２−１４５のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１４６】
ＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子が、ＣＤＲに基づいて選択される一部の生殖細胞系セグメントから生成され、前記ＣＤＲはＣＤＲ３である、請求項１４５に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１４７】
遺伝子ファミリーに基づいて選択されるＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子が選択され、それによってＶＨ、ＤＨ及び／又はＪＨの各遺伝子ファミリーからの１つの生殖細胞系セグメントが選択され、或いは一部のＶＨ、ＤＨ及び／又はＪＨの遺伝子ファミリーからの１つの生殖細胞系セグメントが選択される、請求項１４５に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１４８】
ＶＨ遺伝子ファミリーは、ＩＧＨＶ１−１８、ＩＧＨＶ１−２、ＩＧＨＶ１−２４、ＩＧＨＶ１−３、ＩＧＨＶ１−４５、ＩＧＨＶ１−４６、ＩＧＨＶ１−５８、ＩＧＨＶ１−６９、ＩＧＨＶ１−８、ＩＧＨＶ２−２６、ＩＧＨＶ２−５、ＩＧＨＶ２−７０、ＩＧＨＶ３−１１、ＩＧＨＶ３−１３、ＩＧＨＶ３−１５、ＩＧＨＶ３−１６、ＩＧＨＶ３−２０、ＩＧＨＶ３−２１、ＩＧＨＶ３−２３、ＩＧＨＶ３−３０、ＩＧＨＶ３−３３、ＩＧＨＶ３−３５、ＩＧＨＶ３−３８、ＩＧＨＶ３−４３、ＩＧＨＶ３−４８、ＩＧＨＶ３−４９、ＩＧＨＶ３−５３、ＩＧＨＶ３−６４、ＩＧＨＶ３−６６、ＩＧＨＶ３−７、ＩＧＨＶ３−７２、ＩＧＨＶ３−７３、ＩＧＨＶ３−７４、ＩＧＨＶ３−９、ＩＧＨＶ４−２８、ＩＧＨＶ４−３１、ＩＧＨＶ４−３４、ＩＧＨＶ４−３９、ＩＧＨＶ４４、ＩＧＨＶ４−５９、ＩＧＨＶ４−６１、ＩＧＨＶ５−５１、ＩＧＨＶ６−１及びＩＧＨＶ７−８１から選択され、
ＤＨ遺伝子ファミリーは、ＩＧＨＤ１−１、ＩＧＨＤ１−１４、ＩＧＨＤ１−２０、ＩＧＨＤ１−２６、ＩＧＨＤ１−７、ＩＧＨＤ２−１５、ＩＧＨＤ２−２、ＩＧＨＤ２−２１、ＩＧＨＤ２−８、ＩＧＨＤ３−１０、ＩＧＨＤ３−１６、ＩＧＨＤ３−２２、ＩＧＨＤ３−３、ＩＧＨＤ３−９、ＩＧＨＤ４−１１、ＩＧＨＤ４−１７、ＩＧＨＤ４−２３、ＩＧＨＤ４−４、ＩＧＨＤ５−１２、ＩＧＨＤ５−１８、ＩＧＨＤ５−２４、ＩＧＨＤ５−５、ＩＧＨＤ６−１３、ＩＧＨＤ６−１９、ＩＧＨＤ６−２５、ＩＧＨＤ６−６及びＩＧＨＤ７−２７から選択され、並びに
ＪＨ遺伝子ファミリーは、ＩＧＨＪ１、ＩＧＨＪ２、ＩＧＨＪ３、ＩＧＨＪ４、ＩＧＨＪ５及びＩＧＨＪ６から選択される、請求項１４７に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１４９】
ＶＨ鎖をコードする核酸分子が、停止コドン及び／又は制限酵素部位を除去するため修飾される、請求項１２２−１４９のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１５０】
ＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子が、配列番号：１０５９−１４１０又はその一部のいずれかから選択される、請求項１２２−１４９のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１５１】
ライブラリーの各ベクターが様々な核酸分子を含む、請求項１２２−１５０のいずれかに記載の核酸分子を含有するアドレス可能なベクターのライブラリー。
【請求項１５２】
ライブラリーの各細胞が様々なベクターを含有する、請求項１５１に記載のベクターを含むアドレス可能な細胞のライブラリー。
【請求項１５３】
各ＶＬ鎖が、インフレームで連結されるＶκ及びＪκヒト生殖細胞系セグメント又はＶλ及びＪλ生殖細胞系セグメントを含む核酸分子によってコードされ、
各ＶＨ鎖が、ＶＨ、ＤＨ及びＪＨヒト生殖細胞系セグメントを含む核酸分子によってコードされ、
各位置が、ＶＨ鎖をコードする核酸分子及びＶＬ鎖をコードする核酸分子を含み、並びに
各アドレス内のＶＨ核酸分子及びＶＬ核酸分子の組合せが、他の全てのアドレスの核酸分子の組み合せとは異なる、
可変軽（ＶＬ）鎖をコードする複数のアドレス可能な核酸分子及び可変重（ＶＨ）鎖をコードする複数のアドレス可能な核酸分子を含む核酸分子のライブラリー。
【請求項１５４】
ａ）ＶＨ鎖又をコードする核酸分子の配列又はその部分を生成するＶＨ、ＤＨ及びＪＨヒト生殖細胞系セグメント又はその部分をインフレームで組み合わせることと、
ｂ）ＶＨ鎖をコードする核酸分子の配列又はその部分を生成するＶκ及びＪκヒト生殖細胞系セグメント又はそぼ部分、或いはＶλ及びＪλ生殖細胞系セグメント又はその部分をインフレームで組み合わせることと、
段階ａ）及びｂ）において、ＶＨ、ＤＨ、ＪＨ、Ｖκ、Ｊκ、Ｖλ又はＪλの各部分が、十分な抗原結合部位を形成するＶＨ又はＶＬ又はその部分を含む抗体又はその部分を産生するのに十分であり、
ｃ）複数の異なる核酸分子の配列を生成するため、段階ａ）及びｂ）を数回繰り返すことと、
ｄ）第一のライブラリーが、ＶＨ鎖又はその部分をコードする核酸分子を含み、並びに第二のライブラリーが、ＶＬ鎖又はその部分をコードする核酸分子を含む２つのライブラリーを作るため核酸分子を合成することと、
ｅ）各細胞が、細胞ライブラリーの他の全ての細胞からのＶＨ及びＶＬの様々な組合せをコードする核酸分子を含む、第一のライブラリー及び第二のライブラリーからの核酸分子を細胞に導入し、これを数回繰り返して細胞のライブラリーを作ることと、並びに
ｆ）ライブラリーの各抗体又はその部分が、様々な組合せのＶＨ及びＶＬ鎖又はその十分な部分を含み、ライブラリーの他の全ての抗体又はその部分から抗原結合部位を形成し、複数の抗体又はその部分を産生して、各細胞の抗体又はその部分を発現する細胞を成長させることとを含む、ヒト組合せ抗体ライブラリーを産生する方法。
【請求項１５５】
段階ｄ）において、第一のアドレス指定された核酸ライブラリー及び第二のアドレス指定されたライブラリーを生成する、合成された核酸配列が個々にアドレス指定され、
段階ｅ）において、細胞がアドレス指定され、各位置が、細胞のアドレス指定されたライブラリーにおける他の全部の細胞から、様々な組合せのＶＨ及びＶＬをコードする核酸分子を含有する細胞を含み、並びに
段階ｆ）において、複数の抗体又はその部分がアドレス指定され、ライブラリーのそれぞれの位置における抗体又はその部分が同じ抗体で、他のそれぞれの位置及び他の全ての位置でこれらは異なり、並びに
抗体又はその部分の同定が、そのアドレスによって知られる、ライブラリーがアドレス可能なライブラリーである、請求項１５４に記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１５６】
段階ａ）において、ＶＨ鎖をコードする核酸分子のＶＨ、ＤＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント又はその部分が、ＶＨセグメントは、ＤＨへ５’で、それはＪＨセグメントへ５’であるよう組み合わされ、並びに
段階ｂ）において、ＶＬ鎖をコードする核酸分子のＶκ及びＪκ又はＶλ及びＪλ生殖細胞系セグメント又はその部分が、ＶκセグメントはＪκセグメントに５’で、或いはＶλセグメントはＪλセグメントへ５’であるよう連結される、
請求項１５４又は請求項１５５に記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１５７】
段階ａ）−ｂ）が、アルゴリズムを実行するようコンピュータプログラムされることによって行われる、請求項１５４−１５６のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１５８】
段階ａ）が、
ｉ）ＶＨ、ＤＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント又はその部分を選択することと、
ｉｉ）ＤＨ生殖細胞系セグメントの親水性を最大化するため、１つ又はそれ以上の核酸の挿入又は欠失でＶＨ及び／又はＤＨの生殖細胞系配列を修飾することによるＶ−Ｄ結合部を生成することと、
ｉｉｉ）ＪＨのリーディングフレームを維持するため、１つ又はそれ以上の核酸の挿入又は欠失でＤＨ及び／又はＪＨの生殖細胞系配列を修飾することによるＤ−Ｊ結合部を生成することと、
ｉｖ）ＶＨ鎖をコードする核酸分子の配列を生成するため、得られたＶＨ、ＤＨ及びＪＨを組み合わせることとを含む、請求項１５４−１５７のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１５９】
Ｖ−Ｄ結合部が、ＤＨの５’末端からヌクレオチドを欠失することによって生成される、請求項１５８に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１６０】
Ｖ−Ｄ結合部が、ＶＨの３’末端からヌクレオチドを欠失することによって生成される、請求項１５８に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１６１】
Ｖ−Ｄ結合部が、ＤＨの５’末端でヌクレオチドを挿入することによって生成される、請求項１５８に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１６２】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項１６１に記載の方法
【請求項１６３】
Ｄ−Ｊ結合部が、ＪＨの５’末端からヌクレオチドを欠失することにより生成される、請求項１５８に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１６４】
Ｄ−Ｊ結合部が、ＤＨの３’末端からヌクレオチドを欠失することにより生成される、請求項１５８に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１６５】
Ｄ−Ｊ結合部が、ＤＨの５’末端でヌクレオチドを挿入することにより生成される、請求項１５８に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１６６】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項１６５に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１６７】
段階ｂ）が、
ｉ）Ｖκ及びＪκ又はＶλ及びＪλ生殖細胞系セグメント又はその部分を選択することと、
ｉｉ）Ｊκのリーディングフレームを維持するため、１つ又はそれ以上のヌクレオチドの挿入又は欠失でＶκ又はＪκの生殖細胞系配列を修飾することにより、或いはＪλのリーディングフレームを維持するため、１つ又はそれ以上のヌクレオチドの挿入又は欠失でＶλ又はＪλの生殖細胞系配列を修飾することにより、Ｖ−Ｊ結合部を生成することと、並びに
ｉｉｉ）ＶＬ鎖をコードする核酸分子の配列を生成するため、得られたＶκ及びＪκ又はＶλ及びＪλを組み合わせることとを含む、請求項１５４−１５７のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１６８】
Ｖ−Ｊ結合部が、Ｊκ又はＪλの５’末端からヌクレオチドを欠失することにより生成される、請求項１６７に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１６９】
Ｖ−Ｊ結合部が、Ｖκ又はＶλの３’末端からヌクレオチドを欠失することにより生成される、請求項１６７に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１７０】
Ｖ−Ｊ結合部が、Ｊκ又はＪλの５’末端でヌクレオチドを挿入することにより生成される、請求項１６７に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１７１】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項１７０に記載の方法。
【請求項１７２】
段階ａ）を数回繰り返すことが、
Ｎ１、Ｎ２及びＮ３は、全て又は一部のＶＨ、ＤＨ又はＪＨ生殖細胞系セグメントであり得る多数の生殖細胞系セグメントであり、並びに
Ｎ１、Ｎ２及びＮ３が、同じ又は異なり得て、
Ｎ１の異なるＶＨ生殖細胞系セグメントを選択することと、
Ｎ２の異なるＤＨ生殖細胞系セグメントを選択することと、
Ｎ３の異なるＪＨ生殖細胞系セグメントを選択することとを含み、並びに
ＶＨ鎖をコードするＮ１ｘＮ２ｘＮ３の異なる核酸配列を生成するため、全ての可能なＶＨ、ＤＨ及びＪＨの組合せを組合せる、請求項１５４−１７１のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１７３】
ＶＨ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部のＩＧＨＶ１、ＩＧＨＶ２、ＩＧＨＶ３、ＩＧＨＶ４、ＩＧＨＶ５、ＩＧＨＶ６及びＩＧＨＶ７並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１５７−１７２のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１７４】
ＶＨ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部の配列識別番号：１０−２３８から選択される、請求項１７３に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１７５】
ＤＨ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部のＩＧＨＤ１、ＩＧＨＤ２、ＩＧＨＤ３、ＩＧＨＤ４、ＩＧＨＤ５、ＩＧＨＤ６及びＩＧＨＤ７並びにその遺伝子又はその対立遺伝子から選択される、請求項１５７−１７２のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１７６】
ＤＨ生殖細胞系セグメントが、配列識別番号：２３９−２７２のいずれかから選択される、請求項１７５に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１７７】
ＪＨ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部のＩＧＨＪ１、ＩＧＨＪ２、ＩＧＨＪ３、ＩＧＨＪ４、ＩＧＨＪ５及びＩＧＨＪ６並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１５７−１７２のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１７８】
ＪＨ生殖細胞系セグメントが、配列識別番号：２７３−２８５のいずれかから選択される、請求項１７７に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１７９】
一部の生殖細胞系セグメントが、配列の類似性又は相違性、遺伝子ファミリー、長さ、構成、ＣＤＲ長さ又は構成、種類、機能性、特異性、群又は亜群に基づいて選択される、請求項１７２−１７８のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項１８０】
一部の生殖細胞系セグメントが遺伝子ファミリーに基づいて選択される、請求項１７９に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリー。
【請求項１８１】
ＶＨ遺伝子ファミリーが、ＩＧＨＶ１−１８、ＩＧＨＶ１−２、ＩＧＨＶ１−２４、ＩＧＨＶ１−３、ＩＧＨＶ１−４５、ＩＧＨＶ１−４６、ＩＧＨＶ１−５８、ＩＧＨＶＩ−６９、ＩＧＨＶ１−８、ＩＧＨＶ２−２６、ＩＧＨＶ２−５、ＩＧＨＶ２−７０、ＩＧＨＶ３−１１、ＩＧＨＶ３−１３、ＩＧＨＶ３−１５、ＩＧＨＶ３−１６、ＩＧＨＶ３−２０、ＩＧＨＶ３−２１、ＩＧＨＶ３−２３、ＩＧＨＶ３−３０、ＩＧＨＶ３−３３、ＩＧＨＶ３−３５、ＩＧＨＶ３−３８、ＩＧＨＶ３−４３、ＩＧＨＶ３−４８、ＩＧＨＶ３−４９、ＩＧＨＶ３−５３、ＩＧＨＶ３−６４、ＩＧＨＶ３−６６、ＩＧＨＶ３−７、ＩＧＨＶ３−７２、ＩＧＨＶ３−７３、ＩＧＨＶ３−７４、ＩＧＨＶ３−９、ＩＧＨＶ４−２８、ＩＧＨＶ４−３１、ＩＧＨＶ４−３４、ＩＧＨＶ４−３９、ＩＧＨＶ４−４、ＩＧＨＶ４−５９、ＩＧＨＶ４−６１、ＩＧＨＶ５−５１、ＩＧＨＶ６−１及びＩＧＨＶ７−８１から選択され、
ＤＨ遺伝子ファミリーが、ＩＧＨＤ１−１、ＩＧＨＤ１−１４、ＩＧＨＤ１−２０、ＩＧＨＤ１−２６、ＩＧＨＤ１−７、ＩＧＨＤ２−１５、ＩＧＨＤ２−２、ＩＧＨＤ２−２１、ＩＧＨＤ２−８、ＩＧＨＤ３−１０、ＩＧＨＤ３−１６、ＩＧＨＤ３−２２、ＩＧＨＤ３−３、ＩＧＨＤ３−９、ＩＧＨＤ４−１１、ＩＧＨＤ４−１７、ＩＧＨＤ４−２３、ＩＧＨＤ４−４、ＩＧＨＤ５−１２、ＩＧＨＤ５−１８、ＩＧＨＤ５−２４、ＩＧＨＤ５−５、ＩＧＨＤ６−１３、ＩＧＨＤ６−１９、ＩＧＨＤ６−２５、ＩＧＨＤ６−６及びＩＧＨＤ７−２７から選択され、並びに
ＪＨ遺伝子ファミリーが、ＩＧＨＪ１、ＩＧＨＪ２、ＩＧＨＪ３、ＩＧＨＪ４、ＩＧＨＪ５及びＩＧＨＪ６から選択され、
各々のＶＨ、ＤＨ及び／又はＪＨ遺伝子ファミリーから１つの生殖細胞系セグメントが選択され、
一部のＶＨ、ＤＨ及び／又はＪＨ遺伝子ファミリーから１つの生殖細胞系セグメント或いは一部のＶＨ、ＤＨ及び／又はＪＨ遺伝子から１つの生殖細胞系セグメントが選択される、請求項１８０に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリー。
【請求項１８２】
段階ｂ）を数回繰り返すことが、
Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３及びＮ４が、全て又は一部のＶλ、Ｊλ、Ｖκ、Ｊκ生殖細胞系セグメントになり得る生殖細胞系セグメントの数であり、並びに
Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３及びＮ４が、同じ又は異なり得て、
Ｎ１（数）の異なるＶλ生殖細胞系セグメントを選択すること及びＮ２の異なるＪλ生殖細胞系セグメントを選択することと、又は
Ｎ３の異なるＶκ生殖細胞系セグメントを選択すること及びＮ４の異なるＪκ生殖細胞系セグメントを選択することと、並びに
ＶＬ鎖をコードするＮ１ｘＮ２の異なる核酸分子を生成するため、全ての可能なＶλ又はＪλの組み合わせを組み合わせ、或いはＶＬ鎖をコードするＮ３ｘＮ４の異なる核酸分子を生成するため、全ての可能なＶκ及びＪκを組み合わせることとを含む、請求項１５４−１７１のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１８３】
Ｖλ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部のＩＧＬＶ１、ＩＧＬＶ２、ＩＧＬＶ３、ＩＧＬＶ４、ＩＧＬＶ５、ＩＧＬＶ６、ＩＧＬＶ７、ＩＧＬＶ８、ＩＧＬＶ９、ＩＧＬＶ１０及びＩＧＬＶ１１並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１５７−１７１及び１８２のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１８４】
Ｖλ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部の配列識別番号：３６５−４４１から選択される、請求項１８３に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１８５】
Ｊλ生殖細胞系セグメントが、ＩＧＬＪ１、ＩＧＬＪ２、ＩＧＬＪ３、ＩＧＬＪ４、ＩＧＬＪ５、ＩＧＬＪ６及びＩＧＬＪ７並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１５７−１７１及び請求項１８２のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１８６】
Ｊλ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部の配列識別番号：４４２−４５１から選択される、請求項１８５に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１８７】
Ｖκ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部のＩＧＫＶ１、ＩＧＫＶ２、ＩＧＫＶ３、ＩＧＫＶ４、ＩＧＫＶ５及びＩＧＫＶ６並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１５７−１７１及び１８２のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１８８】
Ｖκ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部の配列識別番号：２８３−３５５及び８６８から選択される、請求項１８７に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１８９】
Ｊκ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部のＩＧＫＪ１、ＩＧＫＪ２、ＩＧＫＪ３、ＩＧＫＪ４及びＩＧＫＪ５並びにその遺伝子又は対立遺伝子から選択される、請求項１５７−１７１及び１８２のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１９０】
Ｊκ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部の配列識別番号：３５６−３６４から選択される、請求項１８９に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１９１】
一部の生殖細胞系セグメントが、配列の類似性又は相違性、遺伝子ファミリー、長さ、組成、ＣＤＲ長さ又は組成、種類、機能性、特異性、群又は亜群に基づいて選択される、請求項１８２−１９０のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１９２】
Ｖκ遺伝子ファミリーが、ＩＧＫＶ１−１２、ＩＧＫＶ１−１２、ＩＧＫＶ１−１６、ＩＧＫＶ１−１７、ＩＧＫＶ１−２７、ＩＧＫＶ１−３３、ＩＧＫＶ１−３７、ＩＧＫＶ１−３９、ＩＧＫＶ１−５、ＩＧＫＶ１−６、ＩＧＫＶ１−８、ＩＧＫＶ１−９、ＩＧＫＶ１−ＮＬ１、ＩＧＫＶ１／ＯＲ２、ＩＧＫＶ１Ｄ−１２、ＩＧＫＶ１Ｄ−１３、ＩＧＫＶ１Ｄ−１６、ＩＧＫＶ１−Ｄ−１７、ＩＧＫＶ１Ｄ−３３、ＩＧＫＶ１Ｄ−３７、ＩＧＫＶ１Ｄ−３９、ＩＧＫＶ１Ｄ−４２、ＩＧＫＶ１Ｄ−４３、ＩＧＫＶ１Ｄ−８、ＩＧＫＶ２−２４、ＩＧＫＶ２−２８、ＩＧＫＶ２−２９、ＩＧＫＶ２−３０、ＩＧＫＶ２−３０、ＩＧＫＶ２−４０、ＩＧＫＶ２Ｄ−２４、ＩＧＫＶ２Ｄ−２６、ＩＧＫＶ２Ｄ−２８、ＩＧＫＶ２Ｄ−２９、ＩＧＫＶ２−Ｄ−３０、ＩＧＫＶ２Ｄ−４０、ＩＧＫＶ３−１１、ＩＧＫＶ３−１５、ＩＧＫＶ３−２０、ＩＧＫＶ３−７、ＩＧＫＶ３−ＮＬ１、ＩＧＶ３−ＮＬ２、ＩＧＫＶ３−ＮＬ３、ＩＧＫＶ３−ＮＬ４、ＩＧＫＶ３−ＮＬ５、ＩＧＫＶ３／ＯＲ２−２６８、ＩＧＫＶ３Ｄ−１１、ＩＧＫＶ３Ｄ−１５、ＩＧＫＶ３Ｄ−２０、ＩＧＫＶ３Ｄ−７、ＩＧＫＶ４−１、ＩＧＫＶ５−２、ＩＧＫＶ６−２１、ＩＧＫＶ６Ｄ−２１、ＩＧＫＶ６Ｄ−４１及びＩＧＫＶ１−３９から選択され、
Ｊκ遺伝子ファミリーが、ＩＧＫＪ１、ＩＧＫＪ２、ＩＧＫＪ３、ＩＧＫＪ４及びＩＧＫＪ５から選択され、
Ｖλ遺伝子ファミリーが、ＩＧＬＶ１−３６、ＩＧＬＶ１−４０、ＩＧＬＶ１−４１、ＩＧＬＶ１−４４、ＩＧＬＶ１−４７、ＩＧＬＶ１−５０、ＩＧＬＶ１−５１、ＩＧＬＶ１０−５４、ＩＧＬＶ１１−５５、ＩＧＬＶ２−１１、ＩＧＬＶ２−１４、ＩＧＬＶ２−１８、ＩＧＬＶ２−２３、ＩＧＬＶ２−３３、ＩＧＬＶ２−８、ＩＧＬＶ３−１、ＩＧＬＶ３−１０、ＩＧＬＶ３−１２、ＩＧＬＶ３−１６、ＩＧＬＶ３−１９、ＩＧＬＶ３−２１、ＩＧＬＶ３−２２、ＩＧＬＶ３−２５、ＩＧＬＶ３−２７、ＩＧＬＶ３−３２、ＩＧＬＶ３−９、ＩＧＬＶ４−３、ＩＧＬＶ４−６０、ＩＧＬＶ４−６９、ＩＧＬＶ５−３７、ＩＧＬＶ５−３９、ＩＧＬＶ５−４５、ＩＧＬＶ５−８、ＩＧＬＶ５−５２、ＩＧＬＶ６−５７、ＩＧＬＶ７−４３、ＩＧＬＶ７−４６、ＩＧＬＶ８−６１、ＩＧＬＶ８−６１及びＩＧＬＶ９−４９から選択され、並びに
Ｊλ遺伝子ファミリーが、ＩＧＬＪ１、ＩＧＬＪ２、ＩＧＬＪ４、ＩＧＬＪ５、ＩＧＬＪ６及びＩＧＬＪ７から選択される、各Ｖκ及び／又はＪκ或いはＶλ及び／又はＪλ遺伝子ファミリーからの１つの生殖細胞セグメントが選択され、或いは一部のＶκ及び／又はＪκ若しくはＶλ及び／又はＪλ遺伝子ファミリーからの１つの生殖細胞系セグメントが選択され、生殖細胞系セグメントが、遺伝子ファミリーに基づいて選択される、請求項１９１に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１９３】
生殖細胞系セグメントが、ユーザ作成のデータベースで示される、請求項１５４−１９２のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１９４】
データベースのＪＨ、Ｊκ及びＪλ生殖細胞系セグメントの配列が、それらの正しいリーディングフレームで示される、請求項１９３に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１９５】
更に、段階ａ）及び／又は段階ｂ）において、あらゆる停止コドンを除去することにより、ＶＨ鎖又はその部分及び／又はＶＬ鎖又はその部分をコードする核酸分子を修飾することを含む、請求項１５４−１９４のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１９６】
停止コドンＴＡＡが、ＴＡＴに修飾され、停止コドンＴＡＧがＴＡＴに修飾され、及び停止コドンＴＧＡがＴＣＡに修飾される、請求項１９５に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１９７】
段階ａ）及び／又は段階ｂ）において、あらゆる制限酵素部位を除去することにより、ＶＨ鎖をコードする核酸分子又はその部分及び／若しくはＶＬ鎖をコードする核酸分子又はその部分を修飾することを更に含む、請求項１５４−１９６のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１９８】
制限酵素部位が、大腸菌Ｋ１２でコドン使用を最大にするため修飾される、請求項１９７に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１９９】
ＶＨ鎖をコードする複数の異なる核酸分子間及び核酸分子中における配列の類似性並びに／又はＶＬ鎖をコードする複数の異なる核酸分子間又は核酸分子中における配列の類似性を決定することを更に含む、請求項１５４−１９８のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２００】
配列の類似性に基づいて、最も類似する又は最も異なるＶＨ鎖をコードする一部の核酸配列及び／又はＶＬ鎖をコードする一部の核酸配列を選択する、請求項１９９に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２０１】
ライブラリーの合成された核酸配列がベクターで含まれる、請求項１５４−２００のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２０２】
ベクターが、更に、重鎖及び軽鎖の会合を可能にするのに十分な全て又は一部の定常領域を含む、請求項２０１に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２０３】
細胞が原核細胞又は真核細胞である、請求項１５４−２０２のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２０４】
細胞が大腸菌細胞である、請求項１５４−２０３のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２０５】
アドレス指定された細胞が、空間アレイで配列される、請求項１５５−２０４のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２０６】
空間アレイが、マルチウェルプレートであり、前記プレートの個々の位置が、細胞のアドレス指定されたライブラリーで、他の全ての細胞から様々な組合せのＶＨ及びＶＬをコードする核酸分子を含む細胞に対応する、請求項２０５に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２０７】
発現される抗体が、完全長の抗体、又は抗原結合部位を形成するのに十分なフラグメントまたはその部分である、請求項１５４−２０６のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２０８】
発現される抗体がＦａｂである、請求項１５４−２０６のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２０９】
抗体又はその部分を更に精製する、請求項１５４−２０８のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２１０】
ライブラリーの精製された抗体又はその部分が、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％の純度である、請求項２０９に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２１１】
精製された抗体又はその部分がアドレス指定され、並びに
各アドレス内の抗体が同じ抗体であり及び他の全てのアドレスの抗体とは異なる、請求項２０９又は請求項２１０に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２１２】
請求項１５４−２１１のいずれかに記載の方法によって生成される、ヒト組み合わせ抗体ライブラリー。
【請求項２１３】
ＶＨ鎖が、配列識別番号：１４７５−１８２６又はその一部のいずれかから選択されるアミノ酸配列を有し、並びにＶＬ鎖が、配列識別番号：１８２７−１８３８、１８４０−１８５５及び１８５７−１８８８又はその一部のいずれかから選択されるアミノ酸配列を有する、請求項２１２に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリー。
【請求項２１４】
ａ）請求項１−８８、２１２又は２１３のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを提供することと、
ｂ）前記ライブラリーの抗体又はその一部を標的タンパク質と接触することと、
ｃ）抗体又はその部分の標的タンパク質との結合及び／若しくは抗体又はその部分が標的タンパク質の機能的活性を調節するかどうかを評価することと、並びに
ｄ）標的タンパク質に結合する及び／若しくは標的タンパク質の活性を調節する抗体又はその部分を同定し、同定された抗体又はその部分がＨＩＴであることとを含む、
標的タンパク質に対する結合又は活性のヒト組み合わせ抗体ライブラリーをスクリーニングする方法。
【請求項２１５】
ヒト組み合わせ抗体ライブラリーが、アドレス可能なライブラリーで、ＨＩＴの同定がそのアドレスによって知られるよう、接触はアドレス可能なアレイで行われる、請求項２１４に記載の方法。
【請求項２１６】
標的タンパク質が、膜結合性タンパク質、細胞表面受容体（ＣＳＲ）又はＣＳＲリガンドである、請求項２１４及び請求項２１５に記載の方法。
【請求項２１７】
膜結合性タンパク質又はＣＳＲが、サイトカイン受容体、受容体キナーゼ、受容体ホスファターゼ、細胞間相互作用に関与する受容体、及び細胞接着分子から選択される、請求項２１６に記載の方法。
【請求項２１８】
標的タンパク質が、ＶＥＧＦＲ−１、ＶＥＧＦＲ−２、ＶＥＧＦＲ−３、癌細胞表皮増殖因子受容体（ＥＧＦＲ）、ＥｒｂＢ−２、ＥｒｂＢ−３、ＩＧＦ−Ｒ１、Ｃ−Ｍｅｔ、ＴＮＦ−Ｒ１、ＴＮＦ−Ｒ２、ＢＴＬＡ、ＨＶＥＭ、ＬＴ−βＲ、ＣＤ２０、ＣＤ３、ＣＤ２５、ＮＯＴＣＨ、ＤＬＬ４、Ｇ−ＣＳＦ−Ｒ、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ、ＥＰＯ−Ｒ、カドヘリン、インテグリン、ＣＤ５２及びＣＤ４４、ＶＥＧＦ−Ａ、ＶＥＧＦ−Ｂ、ＶＥＧＦ−Ｃ、ＶＥＧＦ−Ｄ、ＰＩＧＦ、ＥＧＦ、ＨＧＦ、ＴＮＦ−α、ＬＩＧＨＴ、リンフォトキシン（ＬＴ）、ＩｇＥ、Ｇ−ＣＳＦ、ＧＭ−ＣＳＦ及びＥＰＯから選択される、請求項２１４−２１７のいずれかに記載の方法。
【請求項２１９】
抗体又はその部分の標的タンパク質への結合を評価することを含む、請求項２１３−２１８のいずれかに記載の方法。
【請求項２２０】
抗体又はその部分が、標的タンパク質の機能的活性を調節するかどうか評価することを含む、請求項２１３−２１８に記載の方法。
【請求項２２１】
機能的活性が、細胞増殖、リンパ種のアポトーシス、走化性、癌細胞の浸潤、マトリゲル、内皮増殖、管形成及びシグナル伝達から選択される、請求項２２０に記載の方法。
【請求項２２２】
結合が細胞で評価され、及び／又は機能的活性が細胞ベースのアッセイで評価され、及び細胞が標的タンパク質を発現する、請求項２１４−２２１のいずれかに記載の方法。
【請求項２２３】
細胞が、一時的又は安定的に標的タンパク質をコードする核酸分子で発現される、請求項２２２に記載の方法。
【請求項２２４】
第二のライブラリーが、
ａ）同定されるＨＩＴの生殖細胞系セグメントとの配列類似性によって関連付けられるＶＨ、ＤＨ及びＪＨヒト生殖細胞系セグメントを選択し、並びに様々なＶＨ鎖又はその部分を各々コードする複数の核酸分子の配列を生成するため、全ての可能なＶＨ、ＤＨ及びＪＨヒト生殖細胞系セグメント又はその部分をインフレームで組合せることと、
ｂ）同定されるＨＩＴの生殖細胞系セグメントとの配列類似性によって関連付けられるＶκ及びＪκ又はＶλ及びＶλヒト生殖細胞系セグメントを選択し、並びに様々なＶＬ鎖又はその部分を各々コードする複数の核酸分子の配列を生成するため、全ての可能なＶκ及びＪκヒト生殖細胞系セグメント又はその部分、或いは全ての可能なＶλ及びＪλ生殖細胞系セグメント又はその部分をインフレームで組合せることと、
段階ａ）及びｂ）において、ＶＨ、ＤＨ、ＪＨ、Ｖκ、Ｊκ、Ｖλ又はＪλの各部分が、抗原に結合するのに十分であるＶＨ又はＶＬ若しくはその部分を含む抗体を産生するのに十分であり、
ｃ）第一のライブラリーが、ＶＨ鎖又はその部分をコードする核酸分子を含み、並びに第二のライブラリーが、ＶＬ鎖又はその部分をコードする核酸分子を含む、二つのライブラリーを産生する核酸分子を合成することと、
ｄ）各細胞が、細胞のライブラリーにおける他の全ての細胞とは異なるＶＨ及びＶＬの組合せをコードする核酸分子を含む、第一のライブラリー及び第二のライブラリーからの核酸分子を前記細胞に導入し、細胞のライブラリーを産生するためこれを数回繰り返すことと、並びに
ｅ）ライブラリー内の抗体又はその部分が、ライブラリー内の他の全ての抗体又はその部分から抗原結合部位を形成するため、ＶＨ及びＶＬ鎖又はその十分な部分の異なる組合せを含む、複数の抗体又はその部分を産生して、各細胞で抗体を発現する細胞を成長させることと、
ｆ）第二のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成するため、抗体又はその部分を更に精製し、ライブラリー内の抗体又はその部分を標的タンパク質と接触して、抗体又はその部分と標的タンパク質との結合及び／又は抗体又はその部分が標的タンパク質の機能的活性を調節するかどうかを評価し、並びに標的タンパク質に結合する、及び／若しくは同定される抗体又はその部分が更にＨＩＴである標的タンパク質の活性を調節する、抗体又はその部分を同定することとを含む方法によって生成される、同定されたＨＩＴに基づいて第二の組合せ抗体ライブラリーを提供することを更に含む、請求項２１４−２２３のいずれかに記載の方法。
【請求項２２５】
配列類似性が、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又はそれ以上、或いは約６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又はそれ以上である、請求項２２４に記載の方法。
【請求項２２６】
第二のライブラリーが、
ａ）同定されたＨＩＴをコードする核酸分子で含有されるのと同じＶＨ、ＤＨ又はＪＨヒト生殖細胞系セグメントを含むＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子を選択することと、
ｂ）同定されたＨＩＴをコードする核酸分子で含有されるのと同じＶκ及びＪκ又はＶλ及びＪλヒト生殖細胞系セグメントを含むＶＬ鎖をコードする複数の核酸分子を選択することと、
ｃ）ＶＨをコードする複数の核酸分子からの核酸分子及びＶＬをコードする複数の核酸分子からの核酸分子を細胞に導入し、各細胞が、細胞ライブラリーの他の全ての細胞からＶＨ及びＶＬの様々な組合せをコードする核酸分子を含む、細胞ライブラリーを産生するため、これを数回繰り返すことと、並びに
ｄ）ライブラリーの他の全ての抗体又はその部分から抗原結合部位を形成するため、ライブラリーの各抗体又はその部分が、ＶＨ及びＶＬ鎖又はその十分な部分の様々な組合せを含む複数の抗体又はその部分を産生する、各細胞の抗体を発現するため細胞を成長させることと、並びに
ｅ）ライブラリーの抗体又はその部分を標的タンパク質と接触する抗体又はその部分を更に精製し、抗体又はその部分を標的タンパク質と結合して、及び／若しくは抗体又はその部分が標的タンパク質の機能的活性を調節するかどうかを評価し、並びに標的タンパク質に結合し、及び／若しくは同定された抗体又はその部分が更にＨＩＴである標的タンパク質の活性を調節する、抗体又はその部分を同定することとを含む方法により生成される、同定されたＨＩＴに基づいて第二の組合せ抗体ライブラリーを提供することを更に含む、請求項２１４−２２３のいずれかに記載の方法。
【請求項２２７】
第二のヒト組合せライブラリーが、アドレス可能なライブラリーで、それによって、精製された抗体又はその部分はアドレス指定され、各アドレス内の精製された抗体は同じ抗体で、他の全てのアドレスの抗体とは異なり、接触はアドレス可能なアレイで行われ、並びに更なるＨＩＴの同定がそのアドレスによって知られる、請求項２２４−２２６のいずれかに記載の方法。
【請求項２２８】
第二の組合せ抗体ライブラリーの各抗体メンバー又はその部分が、一次配列の１つ又はそれ以上のアミノ酸変異によって同定された「ＨＩＴ」と異なり、第二のライブラリーが、複数の抗体又はその部分を産生するため、アミノ酸変異を「ＨＩＴ」に導入することによって生成される同定されたＨＩＴに基づいて第二の組合せ抗体ライブラリーを提供することと、ライブラリーの抗体又はその部分の標的タンパク質と接触することと、抗体又はその部分の標的タンパク質との結合、及び／或いは抗体又はその部分が標的タンパク質の機能的活性を調節するかどうかを評価することと、並びに標的タンパク質に結合し、及び／若しくは同定された抗体又はその部分が、更にＨＩＴである標的タンパク質の活性を調節する抗体又はその部分を同定することとを更に含む、請求項２１４−２２３のいずれかに記載の方法。
【請求項２２９】
アミノ酸変異が、同定されたＨＩＴの相補性決定領域（ＣＤＲ）においてである、請求項２２８に記載の方法。
【請求項２３０】
「ＨＩＴ」が、標的タンパク質に対し最適化される結合親和性を有すること及び／又はこの方法の以前の反復で、前回の「ＨＩＴ」と比較して標的タンパク質に対し最適化される活性を有することが更に同定されるまで反復的に繰り返される、請求項２２４−２２９のいずれかに記載の方法。
【請求項２３１】
前記方法が、
（ａ）利用可能な全ヒト抗体生殖細胞系セグメント（ＶＨ、ＤＨ、ＪＨ、Ｖκ、Ｊκ、Ｖλ及びＪλ）のユーザ作成のコンピュータによるデータベースを評価することと、
（ｂ）重鎖（５’−ＶＨ−ＤＨ−ＪＨ−３’）をコードする可能な組み換えされた完全長のあらゆる核酸配列の集まりを生成するためアルゴリズムを適用することと、
（ｃ）カッパ軽鎖（５’−Ｖκ−Ｊκ−３’）をコードする可能な組み換えされた全長のあらゆる核酸配列及び／又はラムダ軽鎖（５’−Ｖλ−Ｊλ−３’）をコードする可能な組み換えされた完全長の全核酸配列の集まりを生成するためアルゴリズムを適用することと、
（ｄ）得られた核酸配列がインフレームであるよう、（ｂ）の核酸配列のＶ−Ｄ及び／又はＤ−Ｊ結合部において並びに（ｃ）の核酸配列のＶ−Ｊ結合部ににおいてヌクレオチドを修飾するためアルゴリズムを適用することと、
（ｅ）不注意に生成されたあらゆる停止コドンを除去するため、（ｄ）の核酸配列を修飾することと、
（ｆ）各々の組み換えられた核酸配列をアドレス可能な構成の固有の位置に割り当てることと、並びに
（ｇ）各々の組み換えられた核酸配列のアドレスを識別する出力ファイルを生成することとの段階を含む、ヒト生殖細胞系セグメントを組合せるの方法を実行するためのコンピュータデバイスによって実行できるコンピュータ読み取り可能な指示を含む、コンピュータシステム又はコンピュータ読み取り可能な媒体。
【請求項２３２】
前記方法が、
（ｈ）段階（ｅ）の後、制限酵素によって認識される配列を含む組み換えられた核酸配列の５’及び３’末端においてヌクレオチドを追加することと、
（ｉ）制限酵素によって認識される内部ヌクレオチドを除去するため、ヌクレオチド置換によって組み換えされた核酸配列を修飾することとの段階を更に含む、請求項２３１に記載のコンピューターシステム又はコンピュータ読み取り可能な媒体。
【請求項２３３】
前記方法が、細菌発現のコドン使用を最適化する組み換えの核酸配列を修飾することを更に含む、請求項２３１又は請求項２３２に記載のコンピューターシステム又はコンピュータ読み取り可能な媒体。
【請求項２３４】
段階（ｆ）の前に、前記方法が、配列の類似性又は相違性に基づいて、組み換えされた核酸配列のライブラリーからの組み換えの核酸配列を選択し、及び選択された配列が、段階（ｆ）で割り当てられる、請求項２３１−２３３のいずれかに記載のコンピューターシステム又はコンピュータ読み取り可能な媒体。
【請求項２３５】
組合せヒト生殖細胞系セグメントの方法が、
（ａ）利用可能な全てのヒト抗体生殖細胞系セグメント（ＶＨ、ＤＨ、ＪＨ、ＶκＪκ、Ｖλ及びＪλ）のユーザ作成のコンピュータによるデータベースにアクセスすることと、
（ｂ）重鎖（５’−ＶＨ−ＤＨ−ＪＨ−３’）をコードする可能なあらゆる組み換えの完全長核酸配列の集まりを生成するため、アルゴリズムを適用することと、
（ｃ）カッパ軽鎖（５’−Ｖκ−Ｊκ−３’）をコードする可能なあらゆる組み換えの完全長核酸配列及び／又はラムダ軽鎖（５’−Ｖλ−Ｊλ−３’）をコードする可能なあらゆる組み換えの完全長核酸配列の集まりを生成するため、アルゴリズムを適用することと、
（ｄ）得られた核酸配列がインフレームであるよう、（ｂ）の核酸配列のＶ−Ｄ及び／又はＤ−Ｊ結合部で、並びに（ｃ）の核酸配列のＶ−Ｊ結合部でヌクレオチドを修飾するため、アルゴリズムを適用することと、
（ｅ）不注意に生成されたあらゆる停止コドンを除去するため、（ｄ）の核酸配列を修飾することと、
（ｆ）各々の組み換えされた核酸配列をアドレス可能な構成の固有の位置へ割り当てることと、
（ｇ）各々の組み換えれた核酸配列のアドレスを識別する出力ファイルを生成することとの段階を含む、コンピュータデバイスによる組合せヒト生殖細胞系セグメントの方法を行うコンピュータ読み込み可能な指示の実行を含む方法。
【請求項２３６】
重鎖をコードする、カッパ軽鎖をコードする、及び／又はラムダ軽鎖をコードする組み換えの核酸配列、又は重鎖をコードする、カッパ軽鎖をコードする、及び／又はラムダ軽鎖をコードする一部の組み換えの核酸配列を合成することを更に含む、請求項２３５に記載の方法。
【請求項２３７】
ａ）各メンバー抗体が、抗原結合部位を形成するため、可変の軽（ＶＬ）鎖及び可変の重（ＶＨ）鎖又はその十分な部分を含み、
ｉ）各ＶＬ鎖が、Ｖκ及びＪκヒト生殖細胞系セグメント又はその縮重コドン又はその修飾された形態、或いは、Ｖλ及びＪλヒト生殖細胞系セグメント又はその縮重コドン又はその修飾された形態を含む核酸分子によりコードされ、それによって前記セグメントがインフレームで連結され、
ｉｉ）各ＶＨ鎖は、ヒトＶＨ及びヒトＶＨ生殖細胞系セグメント又はその縮重コドン又はその修飾された形態並びにＶＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント間のあらゆるヌクレオチド配列を含む核酸分子によりコードされ、それによって前記セグメントがインフレームで連結され、
ｂ）ライブラリーは、少なくとも大体或いは５０又は１００又はそれ以上の異なるメンバーを含む、複数の抗体から成るヒト組み換え抗体ライブラリー。
【請求項２３８】
ＶＨ鎖をコードする核酸の、ＶＨ生殖細胞系セグメント、ＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列及びＪＨ生殖細胞系セグメントは、ＶＨセグメントが、ＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列へ５’であり、それはＪＨセグメントへ５’であるよう、直接的又は間接的に連結され、並びに、ＶＬ鎖をコードする核酸分子のＶκ及びＪκ又はＶλ及びＪλ生殖細胞系セグメントは、ＶκセグメントがＪκセグメントへ５’で、又はＶλセグメントがＪλセグメントへ５’であるよう、直接的又は間接的に連結される、請求項２３７に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２３９】
ＶＨ及びＪＨの間のヌクレオチド配列並びにＪＨ生殖細胞系が、Ｄ−Ｊ結合部でペプチドリンカーにより間接的に連結される、請求項２３８に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２４０】
ペプチドリンカーがＳＹである、請求項２３９に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２４１】
ＶＨ生殖細胞系セグメントが、ＩＧＨＶ３−２３＊０１又はその縮重コドンである、請求項２３７−２４０のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２４２】
ＶＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント間のヌクレオチド配列が、ＤＨ生殖細胞系セグメント又はその縮重コドンであり又は反転ＤＨ生殖細胞系セグメントである、請求項２３７−２４１のいずれかに記載のヒト組合せ抗体。
【請求項２４３】
ＤＨ生殖細胞系セグメントが、配列識別番号：２３９−２７２のいずれかから選択される、請求項２４２に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２４４】
反転ＤＨ生殖細胞系セグメントが、配列識別番号：３４６２−３４８８のいずれかから選択される、請求項２４２に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２４５】
ＤＨ生殖細胞系セグメント又は反転ＤＨ生殖細胞系セグメントが、ＶＨ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｄ又はＤ−Ｊ結合部で追加又は除去される１つ又はそれ以上のヌクレオチドを有する、請求項２３７−２４４のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２４６】
ＪＨ生殖細胞系セグメントが、１つ又はそれ以上のヌクレオチド修飾を含む、請求項２３７−２４５のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２４７】
修飾されたＪＨ生殖細胞系セグメントが、配列識別番号：３４５０−３４５５のいずれかにで示すヌクレオチド配列を有する、請求項２４６に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２４８】
ＶＨ鎖をコードする核酸分子が、配列識別番号：２０７０−２７５９又はその一部のいずれかから選択され、並びにＶＬをコードする核酸分子が、配列識別番号：１４１１−１４２２、１４２４−１４３９及び１４４１−１４７１又はその一部のいずれかから選択される、請求項２３７−２４７のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２４９】
ＶＨ鎖が、配列識別番号：２７６０−３４４９又はその一部のいずれかから選択されるアミノ酸配列を有し、並びにＶＬ鎖が、配列識別番号：１８２７−１８３８、１８４０−１８５５及び１８５７−１８８８又はその一部のいずれかから選択されるアミノ酸配列を有する、請求項２３７−２４８のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２５０】
ライブラリーの各メンバー抗体が、重鎖及び軽鎖の会合を可能にするのに十分な全て又は一部の定常領域を更に含む、請求項２３７−２４９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２５１】
ライブラリーの各メンバー抗体が、抗原結合部位を形成するのに十分な完全長抗体或いはフラグメント又はその部分から選択される、請求項２３７−２５０のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２５２】
フラグメント又はその部分が、Ｆａｂ、Ｆａｂ′、Ｆ（ａｂ’）２、単一鎖Ｆｖｓ（ｓｃＦｖ）、Ｆｖ、ｄｓＦｖ、二重特異性抗体、Ｆｄ及びＦｄ’フラグメント、Ｆａｂフラグメント、Ｆｄフラグメント、ｓｃＦｖフラグメント及びｓｃＦａｂフラグメントから選択される、請求項２５１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２５３】
ライブラリーの各メンバー抗体がＦａｂである、請求項２３７−２５２のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２５４】
大体の又は５０、１０２、１０３、１０４、２ｘ１０４、３ｘ１０４、４ｘ１０４、５ｘ１０４、６ｘ１０４、７ｘ１０４、８ｘ１０４、９ｘ１０４、１０５、１０６、１０７、１０８、１０９又はそれ以上の異なるメンバーを含む、請求項２３７−２５３のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２５５】
１０３、２ｘ１０３、３ｘ１０３、４ｘ１０３、５ｘ１０３、６ｘ１０３、７ｘ１０３、８ｘ１０３、９ｘ１０３、１０４、２ｘ１０４、３ｘ１０４、４ｘ１０４、５ｘ１０４、６ｘ１０４、７ｘ１０４、８ｘ１０４、９ｘ１０４又はそれ以上の異なるメンバーを含む、請求項２３７−２５４のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２５６】
抗体ライブラリーがアドレス可能である、請求項２３７−２５５のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２５７】
各ＶＨ鎖が、インフレームで連結される、ヒトＶＨ及びヒトＪＨ生殖細胞系セグメント又はその縮重コドン又はその修飾形態並びにＶＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント間のあらゆるヌクレオチド配列を含む核酸分子によってコードされ、並びに各アドレス内の核酸分子は同じで、他の全てのアドレスにおける核酸分子とは異なる、可変の重（ＶＨ）鎖をコードする複数のアドレス可能な核酸分子を含む、核酸分子ライブラリー。
【請求項２５８】
ＶＨ鎖をコードする核酸分子のＶＨ生殖細胞セグメント、ＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列、ＪＨ生殖細胞系セグメントは、ＶＨセグメントが、ＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列は５’で、それはＪＨセグメントへ５’であるよう、直接的又は間接的に連結される、請求項２５７に記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２５９】
ＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列及びＪＨ生殖細胞系セグメントが、Ｄ−Ｊ結合部でペプチドリンカーをコードするヌクレオチドによって間接的に連結される、請求項２５７又は請求項２５８に記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２６０】
ヌクレオチドがＳＹであるペプチドリンカーをコードする、請求項２５９に記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２６１】
ＶＨ生殖細胞系セグメントが、ＩＧＨＶ３−２３＊０１又はその縮重コドンである、請求項２５７−２６０のいずれかに記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２６２】
ＶＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント間のヌクレオチド配列が、ＤＨ生殖細胞系セグメント又はその縮重コドンであり、或いは反転ＤＨ生殖細胞系セグメントである、請求項２５７−２６１のいずれかに記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２６３】
ＤＨ生殖細胞系セグメントが、配列識別番号：２３９−２７２のいずれかから選択される、請求項２５７−２６２のいずれかに記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２６４】
反転ＤＨ生殖細は胞系セグメントが、配列識別番号：３４６２−３４８８のいずれかから選択される、請求項２５７−２６３のいずれかに記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２６５】
ＤＨ生殖細胞系セグメント又は反転ＤＨ生殖細胞系セグメントが、ＶＨ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｄ又はＤ−Ｊ結合部で追加又は除去される１つ又はそれ以上のヌクレオチドを有する、請求項２５７−２６４のいずれかに記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２６６】
ＪＨ生殖細胞系セグメントが、１つ又はそれ以上のヌクレオチド修飾体を含む、請求項２５７−２６５のいずれかに記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２６７】
修飾されたＪＨ生殖細胞系セグメントが、配列識別番号：３４５０−３４５５のいずれかで示されるヌクレオチド配列を有する、請求項２６６に記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２６８】
配列識別番号：２０７０−２７５９又はその一部のいずれかから選択されるＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子を含む、請求項２５７−２６７のいずれかに記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２６９】
ライブラリーの各ベクターが、異なる核酸分子を含む、請求項２５７−２６８のいずれかに記載の核酸分子から成る、アドレス可能ベクターのライブラリー。
【請求項２７０】
ライブラリーの各細胞が、様々なベクターを含有し、請求項２６９に記載のベクターを含む、アドレス可能な細胞のライブラリー。
【請求項２７１】
ａ） ヒトＶＨ及びヒトＪＨ生殖細胞系セグメント又はその部分、その縮重コドン又はその修飾形態、並びにＶＨ鎖又はその部分をコードする核酸分子配列を生成するため、インフレームでＶＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント間のあらゆるヌクレオチド配列を組合せることと、
ｂ） ＶＬ鎖又はその部分をコードする核酸分子配列を生成するため、Ｖκ及びＪκヒト生殖細胞系セグメント又はその部分、その縮重コドン又はその修飾形態、或いはＶλ及びＪλ生殖細胞系セグメント又はその部分、その縮重コドン又はその修飾形態をインフレームで組合せることと、
段階ａ）及びｂ）において、ＶＨの各部分、ＶＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント間のあらゆるヌクレオチド配列、ＪＨ、Ｖκ、Ｊκ、Ｖλ又はＪλが、十分な抗原結合部位を形成するＶＨ又はＶＬ又はその部分を含む抗体又はその部分を産生するのに十分であり、並びに、
セグメントは、ＶＨ生殖細胞系セグメント、ＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列及びＶＨ鎖をコードする核酸分子のＪＨ生殖細胞系セグメントが、直接的又は間接的に連結されるよう直接的又は間接的に組合わされ、ＶＨセグメントは、ＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列へ５’で、それはＪＨセグメントへ５’であり、
ｃ） 複数の様々な核酸分子配列を生成するため、段階ａ）及びｂ）を数回繰り返すことと、
ｄ） 第一のライブラリーが、ＶＨ鎖又はその部分をコードする核酸分子を含み、及び第二のライブラリーが、ＶＬ鎖又はその部分をコードする核酸分子を含む、２つのアドレス可能なライブラリーを生成することと、
ｅ） 第一のライブラリー及び第二のライブラリーからの核酸分子をアドレス指定された細胞に導入し、各細胞が、細胞ライブラリーの他の全ての細胞からＶＨ及びＶＬの様々な組合せをコードする核酸分子を含む、アドレス指定された細胞のライブラリーを生成するため、これを数回繰り返すことと、並びに
ｆ） ライブラリーの各抗体又はその部分が、ライブラリーの他の全ての抗体又はその部分から抗原結合部位を形成するため、ＶＨ及びＶＬ鎖の様々な組合せ又はその十分な部分を含み、
複数の抗体又はその部分がアドレス指定され、並びに
各位置における抗体又はその部分が同じ抗体で、他のそれぞれの位置及びあらゆる位置の抗体とは異なり、抗体又はその部分の同定は、そのアドレスで知られる、複数の抗体又はその部分を産生する、各細胞の抗体又はその部分を発現する細胞を成長させることとを含む、ヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２７２】
ＶＨ及びＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列、並びに／又はＶＨ及びＪＨの間のヌクレオチド配列及びＪＨ生殖細胞系セグメントが、Ｖ−Ｄ及び／又はＤ−Ｊ結合部でペプチドリンカーをコードするヌクレオチドによって間接的に連結される、請求項２７１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２７３】
ＶＨ及びＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列、並びに／又はＶＨＪＨの間のヌクレオチド配列及びＪＨ生殖細胞系セグメントが、停止コドンを除去するために修飾される、請求項２７１又は請求項２７２に記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２７４】
ＶＨ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部の配列識別番号：１０−２３８から選択される、或いはその部分、その縮重コドン又はその修飾形態である、請求項２７１−２７３に記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２７５】
ＶＨ生殖細胞系セグメントが、ＩＧＨＶ３−２３＊０１又はその部分、その縮重コドンまたはその修飾形態である、請求項２７４に記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２７６】
ＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列が、ＤＨ生殖細胞系セグメント又はその縮重コドン或いは反転ＤＨ生殖細胞系セグメントである、請求項２７１−２７５のいずれかに記載のヒト組合せライブラリーを生成する方法。
【請求項２７７】
ＤＨ生殖細胞系セグメントが、配列識別番号：２３９−２７２又はその部分、その縮重コドン又はその修飾形態のいずれかから選択され、或いはその反転ＤＨ生殖細胞系セグメントである、請求項２７１−２７６のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２７８】
反転ＤＨ生殖細胞系セグメントは、配列識別番号：３４６２−３４８８のいずれかから選択される、請求項２７１−２７７のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２７９】
ＤＨ生殖細胞系セグメント又は反転ＤＨ生殖細胞系セグメントが、ＶＨ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｄ又はＤ−Ｊ結合部で追加又は除去される１つ又はそれ以上のヌクレオチドを有する、請求項２７１−２７８のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２８０】
ＪＨ生殖細胞系セグメントが、配列識別番号：２７３−２８５から選択される、或いはその部分、その縮重コドン又はその修飾形態である、請求項２７１−２７９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２８１】
ＪＨ生殖細胞系セグメントが、１つ又はそれ以上のヌクレオチド修飾体を含む、請求項２８０に記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２８２】
修飾されたＪＨ生殖細胞系セグメントが、配列識別番号：３４５０−３４５５のいずれかで示されるヌクレオチド配列を有する、請求項２８１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２８３】
Ｖλ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部の配列識別番号：３６５−４４１又はその部分から選択される、或いはその部分、その縮重コドン又はその修飾形態である、請求項２７１−２８２のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２８４】
Ｊλ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部の配列識別番号：４４２−４５１から選択される、或いはその部分、その縮重コドン又はその修飾形態である、請求項２７１−２８３のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２８５】
Ｖκ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部の配列識別番号：２８６−３５５及び８６８から選択される、或いはその部分、その縮重コドン又はその修飾形態である、請求項２７１−２８４のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２８６】
Ｊκ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部の配列識別番号：３５６−３６４から選択される、或いはその部分、その縮重コドン又はその修飾形態である、請求項２７１−２８５のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２８７】
第一のライブラリーのＶＨ鎖又はその部分をコードする核酸分子が、発現ベクターで含有され、そこで各核酸分子は、別の発現ベクターで含有され、並びに、第二のライブラリーのＶＨ鎖又はその部分をコードする核酸分子が、発現ベクターで含有され、そこで核酸分子は、別の発現ベクターで含有される、請求項２７１−２８６のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２８８】
ベクターが、更に、重鎖及び軽鎖の会合を可能にするのに十分な全て又は一部の定常領域を含む、請求項２８７に記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２８９】
細胞が、原核細胞又は真核細胞である、請求項２７１−２８８のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２９０】
細胞が大腸菌細胞である、請求項２７１−２８９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２９１】
アドレス指定された細胞が、空間アレイで配列される、請求項２７１−２９０のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２９２】
空間アレイが、マルチウェルプレートであり、前記プレートの個々の位置が、アドレス指定された細胞のライブラリーで他の全ての細胞から様々な組合せのＶＨ及びＶＬをコードする核酸分子を含む細胞に対応する、請求項２９１に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２９３】
発現される抗体が、完全長の抗体、又は抗原結合部位を形成するのに十分なフラグメントまたはその部分である、請求項２７１−２９２のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２９４】
発現される抗体がＦａｂである、請求項３２７１−２９３のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２９５】
抗体又はその部分を更に精製する、請求項２７１−２９４のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２９６】
ライブラリーにおける精製された抗体又はその部分が、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％の純度である、請求項２９５に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２９７】
請求項２７１−２９６のいずれかに記載の方法によって産生されるヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２９８】
ａ）請求項２３７−２５６又は請求項２９７のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを提供することと、
ｂ）前記ライブラリーの抗体又はその部分を細胞又は標的タンパク質と接触することと、
ｃ）細胞又は標的タンパク質と抗体又はその部分の結合及び／或いは抗体又はその部分が細胞又は標的タンパク質の機能的活性を調節するかどうかを評価することと、並びに
ｄ）細胞又は標的タンパク質に結合する及び／或いは細胞又は標的タンパク質の活性を調節する抗体又はその部分を同定し、そこで同定された抗体又はその部分がＨＩＴであることとを含む、結合又は標的タンパク質に対する活性のヒト組み合わせ抗体ライブラリーをスクリーニングする方法。
【請求項２９９】
ヒト組み合わせ抗体ライブラリーが、アドレス可能なライブラリーで、ＨＩＴの同定がそのアドレスによって知られるよう、接触がアドレス可能なアレイで行われる、請求項２９８に記載の方法。
【請求項３００】
標的タンパク質が、膜結合性タンパク質、細胞表面受容体（ＣＳＲ）又はＣＳＲリガンドである、請求項２９８又は請求項２９９に記載の方法。
【請求項３０１】
膜結合性タンパク質又はＣＳＲが、サイトカイン受容体、受容体キナーゼ、受容体ホスファターゼ、細胞間相互作用に関与する受容体、及び細胞接着分子から選択される、請求項３００に記載の方法。
【請求項３０２】
標的タンパク質が、ＶＥＧＦＲ−１、ＶＥＧＦＲ−２、ＶＥＧＦＲ−３、癌細胞表皮増殖因子受容体（ＥＧＦＲ）、ＥｒｂＢ−２、ＥｒｂＢ−３、ＩＧＦ−Ｒ１、Ｃ−Ｍｅｔ、ＴＮＦ−Ｒ１、ＴＮＦ−Ｒ２、ＢＴＬＡ、ＨＶＥＭ、ＬＴ−βＲ、ＣＤ２０、ＣＤ３、ＣＤ２５、ＮＯＴＣＨ、ＤＬＬ４、Ｇ−ＣＳＦ−Ｒ、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ、ＥＰＯ−Ｒ、カドヘリン、インテグリン、ＣＤ５２及びＣＤ４４、ＶＥＧＦ−Ａ、ＶＥＧＦ−Ｂ、ＶＥＧＦ−Ｃ、ＶＥＧＦ−Ｄ、ＰＩＧＦ、ＥＧＦ、ＨＧＦ、ＴＮＦ−α、ＬＩＧＨＴ、リンフォトキシン（ＬＴ）、ＩｇＥ、Ｇ−ＣＳＦ、ＧＭ−ＣＳＦ及びＥＰＯから選択される、請求項２９８−３０１のいずれかに記載の方法。
【請求項３０３】
抗体又はその部分の標的タンパク質又は細胞への結合を評価することを含む、請求項２９８−３０２のいずれかに記載の方法。
【請求項３０４】
抗体又はその部分が、細胞又は標的タンパク質の機能的活性を調節するかどうか評価することを含む、請求項２９８−３０３に記載の方法。
【請求項３０５】
機能的活性が、細胞増殖、リンパ種のアポトーシス、走化性、癌細胞の浸潤、マトリゲル、内皮増殖、管形成及びシグナル伝達から選択される、請求項３０４に記載の方法。
【請求項１】
ｉ）各ＶＬ鎖が、ＶＫ及びＪＫヒト生殖細胞系セグメント又はその縮重コドン、或いはＶλ及びＪλヒト生殖細胞系セグメント又はその縮重コドンを含む核酸分子によりコードされ、それによって前記セグメントはインフレームで連結されて、
ｉｉ）各ＶＨ鎖が、ヒトＶＨ及びヒトＪＨ生殖細胞系セグメント並びにＶＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメントの間のあらゆるヌクレオチド配列を含む核酸分子によりコードされ、それによって前記セグメントはインフレームで連結され、
ａ）抗原結合部位を形成するため、各メンバー抗体が可変軽（ＶＬ）鎖及び可変重（ＶＨ）鎖又はその十分な部分を含み、並びに
ｂ）ヒト組み合わせ抗体ライブラリーは、少なくとも凡その或いは５０又は１００又はそれ以上の異なるメンバーを含む、
複数の抗体を含有する前記ライブラリー。
【請求項２】
ＶＨ生殖細胞系セグメント、ＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列及びＶＨ鎖をコードする核酸分子のＪＨ生殖細胞系セグメントは、ＶＨセグメントが、ＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列へ５’で、それはＪＨセグメントへ５’であるよう連結され、並びにＶＬ鎖をコードする核酸分子のＶκ及びＪκ又はＶλ及びＪλ生殖細胞系セグメントは、Ｖκセグメントが、Ｊκセグメントへ５’であり、又はＶλセグメントがＪλセグメントへ５’であるよう連結される、請求項１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３】
ＶＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメントの間のヌクレオチド配列が、５、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００のヌクレオチド長において、又は凡そ５、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００のヌクレオチド長である、請求項１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４】
ＶＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント間のヌクレオチド配列がペプチド模倣物をコードする、請求項１−３のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５】
ｉ）各ＶＬ鎖が、Ｖκ及びＪκヒト生殖細胞系セグメント又はその縮重コドン、或いはＶλ及びＪλヒト生殖細胞系セグメント又はその縮重コドンを含む核酸分子によってコードされ、それによって前記セグメントはインフレームで連結されて、
ｉｉ）各ＶＨ鎖は、ＶＨ、ＤＨ及びＪＨヒト生殖細胞系セグメント又ははその縮重コドンを含む核酸分子によってコードされ、それによって前記セグメントはインフレームで連結される、
ａ）抗原結合部位を形成するため、各メンバー抗体が、修飾可変軽（ＶＬ）鎖及び／又は修飾可変重（ＶＨ）鎖或いはその十分な部分を含み、並びに
ｂ）ＶＬ鎖及び／又はＶＨ鎖が、アミノ酸をＣＤＲへ置換又は挿入することにより修飾される、
複数の抗体を含有するヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６】
ＣＤＲが、ＣＤＲＨ１、ＣＤＲＨ２、ＣＤＲＨ３、ＣＤＲＬ１、ＣＤＲＬ２及びＣＤＲＬ３から選択される、請求項５に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７】
ＣＤＲがＣＤＲＨ３である、請求項６に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８】
挿入又は置換されるアミノ酸がペプチド模倣物に対応する、請求項５−７のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項９】
ペプチド模倣物が、ＴＰＯ、ＥＰＯ、Ｇ−ＣＳＦ、ＩＬ−５、ヒト脳ナトリウム利尿ペプチド（ｈＢＮＰ−３２）、エキセンディン４、ＧＬＰ−１、ＧＬＰ−２、グルカゴン、ＰＡＣＡＰ−３８、ＣＤ２０９Ｌ、ＴＮＦ、ＶＥＧＦ、ＭＭＰ阻害剤又はＣＴＬＡ−４ペプチド模倣物から選択される、請求項４又は請求項８に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項１０】
ペプチド模倣物が、更に、カルボキシ及び／又はＮ−末端においてフランキング配列を含む、請求項４又は請求項５に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項１１】
フランキング配列がグリシン又はプロリンである、請求項６に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項１２】
ペプチド模倣部物が、配列識別番号：８９１、９８７−１０１４から選択されるアミノ酸配列を有する、請求項４−７のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項１３】
ＶＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント間のヌクレオチド配列が、ヒトＤＨセグメント又はその縮重コドンをである、請求項１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項１４】
ｉ）各ＶＬ鎖が、Ｖκ及びＪκヒト生殖細胞系セグメント又はその縮重コドン、或いはＶλ及びＪλヒト生殖細胞系セグメント又はその縮重コドンを含む核酸分子によりコードされ、それによって前記セグメントはインフレームで連結されて、
ｉｉ）各ＶＨ鎖が、ＶＨ、ＤＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント含む核酸分子によりコードされ、それによって前記セグメントはインフレームで連結される、
ａ）抗原結合部位を形成するため、各メンバー抗体が、可変軽（ＶＬ）鎖及び可変重（ＶＨ）鎖或いはその十分な部分を含み、並びに
ｂ）ヒト組合せ抗体ライブラリーが、少なくとも大体の或いは５０又は１００又はそれ以上の異なるメンバーを含む、
複数の抗体を含有する前記ライブラリー。
【請求項１５】
アドレス可能なライブラリーである、請求項１−１４に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項１６】
各アドレス内の抗体が同じ抗体で、他の全てのアドレスの抗体とは異なる、請求項１５に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項１７】
ＶＨ鎖をコードする核酸分子のＶＨ、ＤＨ及びＪＨセグメントは、ＶＨセグメントがＤＨセグメントへ５’で、それはＪＨセグメントへ５’であるよう連結され、並びにＶＬ鎖をコードする核酸分子のＶκ及びＪκ又はＶλ及びＪλ生殖細胞系セグメントは、ＶκセグメントがＪκセグメントへ５’で、或いはＶλセグメントがＪλセグメントへ５’であるよう連結される、請求項１３−１６に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項１８】
複数の核酸分子がＶＨ鎖をコードし、複数の核酸分子がＶＬ鎖をコードして、並びにＶＨ鎖及びＶＬ鎖をコードする複数の核酸分子は、少なくとも大体或いは５０又は１００の異なる抗体を生成するのに十分である、請求項１−１７のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項１９】
全て又は一部の生殖細胞系ＶＨセグメントは、全て又は一部の生殖細胞系ＪＨセグメントと連結される全て又は一部のＤＨセグメントと連結され、ＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子を生成し、及び全て又は一部の生殖系Ｖκセグメントは、全て又は一部の生殖細胞系Ｊκセグメントと連結され、若しくは全て又は一部の生殖細胞系Ｖλセグメントは、全て又は一部の生殖細胞系Ｊλセグメントに連結され、ＶＬ鎖をコードする複数の核酸分子を生成する、請求項１８に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２０】
ＶＨ生殖細胞系列セグメントが、ＩＧＨＶ１、ＩＧＨＶ２、ＩＧＨＶ３、ＩＧＨＶ４、ＩＧＨＶ５、ＩＧＨＶ６及びＩＧＨＶ７並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１−１９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２１】
ＶＨが配列識別番号１０−２３８のいずれかから選択される、請求項２０に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２２】
ＤＨセグメントが、ＩＧＨＤ１、ＩＧＨＤ２、ＩＧＨＤ３、ＩＧＨＤ４、ＩＧＨＤ５、ＩＧＨＤ６及びＩＧＨＤ７並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項９−２１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２３】
ＤＨが配列識別番号：２３９−２７２のいずれかから選択される、請求項２２に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２４】
ＪＨが、ＩＧＨＪ１、ＩＧＨＪ２、ＩＧＨＪ３、ＩＧＨＪ４、ＩＧＨＪ５及びＩＧＨＪ６並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１−２３のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２５】
ＪＨが配列識別番号：２７３−２８５のいずれかから選択される、請求項２４に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２６】
ＶＨの配列が、ＶＨ鎖のリーディングフレームを維持するためＶ−Ｄ結合部で追加又は除去される１つのヌクレオチドを有する、請求項１−２５のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２７】
ＶＨヌクレオチド配列の３’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項２６に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２８】
ヌクレオチドが、ＶＨとＤＨの間でヌクレオチドを追加するＶＨヌクレオチド配列の３’末端で挿入される、請求項２７に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２９】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項２８に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３０】
ＤＨ配列が、ＶＨ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｄ結合部及び／又はＤ−Ｊ結合部で挿入及び欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項１−２９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３１】
ヌクレオチドの挿入又は欠失が、ＤＨの親水性を最大化するため選択される、請求項３０に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３２】
ＤＨの５’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項３０又は請求項３１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３３】
ＤＨの３’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項３０−３２のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３４】
ヌクレオチドが、ＤＨ及びＪＨであるヌクレオチドを追加するため、ＤＨ配列の３’末端で挿入される、請求項３０−３２のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３５】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項３４に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３６】
ＪＨの配列が、ＶＨ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｄ−Ｊ結合部で挿入又は欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項１−３５のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３７】
ヌクレオチドの挿入又は欠失が、ＪＨのリーディングフレームを維持するため選択される、請求項３１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３８】
ＪＨの５’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項３１又は請求項３２に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項３９】
ＪＨの３’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項２０−３３のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４０】
Ｖκが、ＩＧＫＶ１、ＩＧＫＶ２、ＩＧＫＶ３、ＩＧＫＶ４、ＩＧＫＶ５及びＩＧＫＶ６並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１−３９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４１】
Ｖκが、配列識別番号：２８６−３５５及び８６８のいずれかから選択される、請求項４０に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４２】
Ｊκが、ＩＧＫＪ１、ＩＧＫＪ２、ＩＧＫＪ３、ＩＧＫＪ４及びＩＧＫＪ５並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１−４１のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４３】
Ｊκが、配列識別番号：３５６−３６４のいずれかから選択される、請求項４２に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４４】
Ｖκの配列が、ＶＬ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｊ結合部で挿入又は欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項１−４３のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４５】
Ｖκヌクレオチド配列の３’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項４４に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４６】
ヌクレオチドが、ＶκとＪκの間でヌクレオチドを追加するため、Ｖκヌクレオチド配列の３’末端で挿入される、請求項４４に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４７】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項４６に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４８】
Ｊκの配列が、ＶＬ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｊ結合部で挿入または欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項１−４７のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項４９】
ヌクレオチドの挿入又は欠失が、Ｊκのリーディングフレームを維持するため選択される、請求項４８に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５０】
Ｊκの５’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項４８又は請求項４９に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５１】
Ｖλが、ＩＧＬＶ１、ＩＧＬＶ２、ＩＧＬＶ３、ＩＧＬＶ４、ＩＧＬＶ５、ＩＧＬＶ６、ＩＧＬＶ７、ＩＧＬＶ８、ＩＧＬＶ９、ＩＧＬＶ１０及びＩＧＬＶ１１並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１−３９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５２】
Ｖλが、配列識別番号：３６５−４４１のいずれかから選択される、請求項５１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５３】
Ｊλが、ＩＧＬＪ１、ＩＧＬＪ２、ＩＧＬＪ３、ＩＧＬＪ４、ＩＧＬＪ５、ＩＧＬＪ６及びＩＧＬＪ７並びに遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１−３９、５１及び５２のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５４】
Ｊλが、配列識別番号：４４２−４５１のいずれかから選択される、請求項５３に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５５】
Ｖλの配列が、ＶＬ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｊ結合部で挿入又は欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項１−３４及び５１−５４のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５６】
Ｖλヌクレオチド配列の３’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項５５のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５７】
ヌクレオチドが、ＶλとＪλの間でヌクレオチドを追加するため、Ｖλヌクレオチド配列の３’末端で挿入される、請求項５５に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５８】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項５７に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項５９】
Ｊλの配列が、ＶＬ鎖のリーティングフレームを維持するため、Ｖ−Ｊ結合部で挿入又は欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項１−３９及び５１−５８のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６０】
ヌクレオチドの挿入又は欠失が、Ｊλのリーディングフレームを維持するため選択される、請求項５９に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６１】
Ｊλの５’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項５４又は請求項５５に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６２】
ＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子が、配列の類似性又は相違性、遺伝子ファミリー、長さ、構成、ＣＤＲ長さ又は構成、種類、機能性、特異性、群又は亜群に基づいて選択される一部の生殖細胞系セグメントから生成される、請求項１−６１のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６３】
ＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子が、ＣＤＲに基づいて選択される一部の生殖細胞系セグメントから生成され、前記ＣＤＲはＣＤＲ３である、請求項６２に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６４】
ＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子が、遺伝子ファミリーに基づいて選択され、それによって各ＶＨ、ＤＨ及び／又はＪＨ遺伝子ファミリーからの生殖細胞系セグメントが選択され、若しくは一部のＶＨ、ＤＨ及び／又はＪＨ遺伝子ファミリーからの１つの生殖細胞系セグメントが選択される、請求項６２に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６５】
ＶＨ遺伝子ファミリーが、ＩＧＨＶ１−１８、ＩＧＨＶ１−２、ＩＧＨＶ１−２４、ＩＧＨＶ１−３、ＩＧＨＶ１−４５、ＩＧＨＶ１−４６、ＩＧＨＶ１−５８、ＩＧＨＶ１−６９、ＩＧＨＶ１−８、ＩＧＨＶ２−２６、ＩＧＨＶ２−５、ＩＧＨＶ２−７０、ＩＧＨＶ３−１１、ＩＧＨＶ３−１３、ＩＧＨＶ３−１５、ＩＧＨＶ３−１６、ＩＧＨＶ３−２０、ＩＧＨＶ３−２１、ＩＧＨＶ３−２３、ＩＧＨＶ３−３０、ＩＧＨＶ３−３３、ＩＧＨＶ３−３５、ＩＧＨＶ３−３８、ＩＧＨＶ３−４３、ＩＧＨＶ３−４８、ＩＧＨＶ３−４９、ＩＧＨＶ３−５３、ＩＧＨＶ３−６４、ＩＧＨＶ３−６６、ＩＧＨＶ３−７、ＩＧＨＶ３−７２、ＩＧＨＶ３−７３、ＩＧＨＶ３−７４、ＩＧＨＶ３−９、ＩＧＨＶ４−２８、ＩＧＨＶ４−３１、ＩＧＨＶ４−３４、ＩＧＨＶ４−３９、ＩＧＨＶ４−４、ＩＧＨＶ４−５９、ＩＧＨＶ４−６１、ＩＧＨＶ５−５１、ＩＧＨＶ６−１及びＩＧＨＶ７−８１から選択され、ＤＨ遺伝子ファミリーが、ＩＧＨＤ１−１、ＩＧＨＤ１−１４、ＩＧＨＤ１−２０、ＩＧＨＤ１−２６、ＩＧＨＤ１−７、ＩＧＨＤ２−１５、ＩＧＨＤ２−２、ＩＧＨＤ２−２１、ＩＧＨＤ２−８、ＩＧＨＤ３−１０、ＩＧＨＤ３−１６、ＩＧＨＤ３−２２、ＩＧＨＤ３−３、ＩＧＨＤ３−９、ＩＧＨＤ４−１１、ＩＧＨＤ４−１７、ＩＧＨＤ４−２３、ＩＧＨＤ４−４、ＩＧＨＤ５−１２、ＩＧＨＤ５−１８、ＩＧＨＤ５−２４、ＩＧＨＤ５−５、ＩＧＨＤ６−１３、ＩＧＨＤ６−１９、ＩＧＨＤ６−２５、ＩＧＨＤ６−６及びＩＧＨＤ７−２７から選択され、並びに
ＪＨ遺伝子ファミリーが、ＩＧＨＪ１、ＩＧＨＪ２、ＩＧＨＪ３、ＩＧＨＪ４、ＩＧＨＪ５及びＩＧＨＪ６から選択される、請求項６４に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６６】
ＶＬ鎖をコードする複数の核酸分子が、配列の類似性又は相違性、遺伝子ファミリー、長さ、構成、ＣＤＲ長さ又は構成、種類、機能性、特異性、群又は亜群に基づいて選択される一部の生殖細胞系セグメントから生成される、請求項１−６５のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６７】
ＶＬ鎖をコードする複数の核酸分子が、ＣＤＲに基づいて選択される一部の生殖細胞系セグメントから生成され、前記ＣＤＲはＣＤＲ３である、請求項６６に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６８】
ＶＨ鎖でコードする複数の核酸分子が、遺伝子ファミリーに基づいて選択され、それによって、各々のＶκ及び／又はＪκ若しくはＶλ及び／又はＪλ遺伝子ファミリーからの１つの生殖細胞系セグメントが選択され、或いは一部のＶκ及び／又はＪκ若しくはＶλ及び／或いはＪλ遺伝子ファミリーからの１つの生殖細胞系セグメントが選択される、請求項６６に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項６９】
Ｖκ遺伝子ファミリーが、ＩＧＫＶ１−１２、ＩＧＫＶ１−１２、ＩＧＫＶ１−１６、ＩＧＫＶ１−１７、ＩＧＫＶ１−２７、ＩＧＫＶ１−３３、ＩＧＫＶ１−３７、ＩＧＫＶ１−３９、ＩＧＫＶ１−５、ＩＧＫＶ１−６、ＩＧＫＶ１−８、ＩＧＫＶ１−９、ＩＧＫＶ１−ＮＬ１、ＩＧＫＶ１／ＯＲ２、ＩＧＫＶ１Ｄ−１２、ＩＧＫＶ１Ｄ−１３、ＩＧＫＶ１Ｄ−１６、ＩＧＫＶ１−Ｄ−１７、ＩＧＫＶ１Ｄ−３３、ＩＧＫＶ１Ｄ−３７、ＩＧＫＶ１Ｄ−３９、ＩＧＫＶ１Ｄ−４２、ＩＧＫＶ１Ｄ−４３、ＩＧＫＶ１Ｄ−８、ＩＧＫＶ２−２４、ＩＧＫＶ２−２８、ＩＧＫＶ２−２９、ＩＧＫＶ２−３０、ＩＧＫＶ２−３０、ＩＧＫＶ２−４０、ＩＧＫＶ２Ｄ−２４、ＩＧＫＶ２Ｄ−２６、ＩＧＫＶ２Ｄ−２８、ＩＧＫＶ２Ｄ−２９、ＩＧＫＶ２−Ｄ−３０、ＩＧＫＶ２Ｄ−４０、ＩＧＫＶ３−１１、ＩＧＫＶ３−１５、ＩＧＫＶ３−２０、ＩＧＫＶ３−７、ＩＧＫＶ３−ＮＬ１、ＩＧＶ３−ＮＬ２、ＩＧＫＶ３−ＮＬ３、ＩＧＫＶ３−ＮＬ４、ＩＧＫＶ３−ＮＬ５、ＩＧＫＶ３／ＯＲ２−２６８、ＩＧＫＶ３Ｄ−１１、ＩＧＫＶ３Ｄ−１５、ＩＧＫＶ３Ｄ−２０、ｉＧＫＶ３Ｄ−７、ＩＧＫＶ４−１、ＩＧＫＶ５−２、ＩＧＫＶ６−２１、ＩＧＫＶ６Ｄ−２１、ＩＧＫＶ６Ｄ−４１、及びＩＧＫＶ１−３から選択され、
Ｊκ遺伝子ファミリーが、ＩＧＫＪ１、ＩＧＫＪ２、ＩＧＫＪ３、ＩＧＫＪ４及びＩＧＫＪ５から選択され、Ｖλ遺伝子ファミリーが、ＩＧＬＶ１−３６、ＩＧＬＶ１−４０、ＩＧＬＶ１−４１、ＩＣＬＶ１−４４、ＩＧＬＶ１−４７、ＩＧＬＶ１−５０、ＩＧＬＶ１−５１、ＩＧＬＶ１０−５４、ＩＧＬＶ１１−５５、ＩＧＬＶ２−１１、ＩＧＬＶ２−１４、ＩＧＬＶ２−１８、ＩＧＬＶ２−２３、ＩＧＬＶ２−３３、ＩＧＬＶ２−８、ＩＧＬＶ３−１、ＩＧＬＶ３−１０、ＩＧＬＶ３−１２、ＩＧＬＶ３−１６、ＩＧＬＶ３−１９、ＩＧＬＶ３−２１、ＩＧＬＶ３−２２、ＩＧＬＶ３−２５、ＩＧＬＶ３−２７、ＩＧＬＶ３−３２、ＩＧＬＶ３−９、ＩＧＬＶ４−３、ＩＧＬＶ４−６０、ＩＧＬＶ４−６９、ＩＧＬＶ５−３７、ＩＧＬＶ５−３９、ＩＧＬＶ５−４５、ＩＧＬＶ５−８、ＩＧＬＶ５−５２、ＩＧＬＶ６−５７、ＩＧＬＶ７−４３、ＩＧＬＶ７−４６、ＩＧＬＶ８−６１、ＩＧＬＶ８−６１及びＩＧＬＶ９−４９から選択され、並びに
Ｊλ遺伝子ファミリーが、ＩＧＬＪ１、ＩＧＬＪ２、ＩＧＬＪ４、ＩＧＬＪ５、ＩＧＬＪ６及びＩＧＬＪ７から選択される、請求項６８に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７０】
ＶＨ鎖をコードする核酸分子が、停止コドン及び／又は制限酵素部位を除去するため修飾される、請求項１−６９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７１】
ＶＬ鎖をコードする核酸分子が、停止コドン及び／又は制限酵素部位を除去するため修飾される、請求項１−６９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７２】
ＶＨ鎖をコードする核酸分子が、配列識別番号：１０５９−１４１０のいずれか、若しくはその一部、及びＶＬ鎖をコードする核酸分子が、配列識別番号：１４１１−１４２２、１４２４−１４３９及び１４４１−１４７１のいずれか、若しくはその一部から選択される、請求項１−７１のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７３】
ＶＨ鎖が、配列番号：１４７５−１８２６のいずれか、又はその一部から選択されるアミノ酸配列を有し、及びＶＬ鎖が、配列番号：１８２７−１８３８、１８４０−１８５５及び１８５７−１８８８又はその一部から選択されるアミノ酸配列を有する、請求項１−７２のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７４】
ライブラリーの各メンバー抗体が、重鎖及び軽鎖の会合を可能にするのに十分な全て又は一部の定常領域を更に含む、請求項１−７３のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７５】
ライブラリーの各メンバー抗体が、完全長抗体から、或いは抗原結合部位を形成するのに十分なそのフラグメント又は部分から選択される、請求項１−７４のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７６】
フラグメント又はその部分が、Ｆａｂ、Ｆａｂ′、Ｆ（ａｂ’）２、単一鎖Ｆｖｓ（ｓｃＦｖ）、Ｆｖ、ｄｓＦｖ、二重特異性抗体、Ｆｄ及びＦｄ’フラグメント、Ｆａｂフラグメント、Ｆｄフラグメント、ｓｃＦｖフラグメント及びｓｃＦａｂフラグメントから選択される、請求項７５に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７７】
ライブラリーの各メンバー抗体がＦａｂである、請求項１−７６のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７８】
大体或いは５０、１０２、１０３、１０４、２ｘ１０４、３ｘ１０４、４ｘ１０４、５ｘ１０４、６ｘ１０４、７ｘ１０４、８ｘ１０４、９ｘ１０４、１０５、１０６、１０７、１０８、１０９又はそれ以上の異なるメンバーを含む、請求項１−７７のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項７９】
１０３、２ｘ１０３、３ｘ１０３、４ｘ１０３、５ｘ１０３、６ｘ１０３、７ｘ１０３、８ｘ１０３、９ｘ１０３、１０４、２ｘ１０４、３ｘ１０４、４ｘ１０４、５ｘ１０４、６ｘ１０４、７ｘ１０４、８ｘ１０４、９ｘ１０４又はそれ以上の異なるメンバーを含む、請求項１−７８のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８０】
アドレス可能な抗体が、空間アレイで配列される、請求項１−７９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８１】
空間アレイがマルチウェルプレートであり、前記プレートの個々の位置が様々な抗体メンバーに対応する、請求項８０に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８２】
様々な抗体メンバーが、プレートのウェルの表面に固定化される、請求項８１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８３】
様々な抗体メンバーが溶液中に存在する、請求項７６に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８４】
アドレス可能な抗体が、固体支持体に付着される、請求項１−７９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８５】
固体支持体が、フィルター、チップ、スライド、ビード又はセルロースで、及び様々な抗体メンバーが、その表面に固定化される、請求項８４に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８６】
固体支持体がＢｉａｃｏｒｅチップである、請求項８５に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８７】
抗体が同定可能に標識化される、請求項８０−８６のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８８】
標識が、有色、発色性、発光性、化学的、蛍光性又は電子的である、請求項８７に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項８９】
各ＶＬ鎖が、インフレームで連結されるＶκ及びＪκヒト生殖細胞系セグメント又はＶλ及びＪλヒト生殖細胞系セグメントを含む核酸分子によってコードされ、並びに各アドレス内の核酸分子が同じで、他の全てのアドレスの核酸分子とは異なる、可変の軽（ＶＬ）鎖をコードする複数のアドレス可能な核酸分子を含む核酸分子のライブラリー。
【請求項９０】
ＶＬ鎖をコードする核酸分子のＶκ及びＪκ又はＶλ及びＪλ生殖細胞系セグメントは、ＶκセグメントがＪκセグメントへ５’で、ＶλセグメントがＪλセグメントへ５’であるよう連結される、請求項８９に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項９１】
全て又は一部の生殖細胞系Ｖκセグメントが、全て又は一部の生殖細胞系Ｊκセグメントと連結され、或いは全て又は一部の生殖細胞系Ｖλセグメントが全て又は一部の生殖細胞系Ｊλセグメントに連結され、ＶＬ鎖をコードする複数の核酸分子を生成する、請求項９０に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項９２】
Ｖκが、ＩＧＫＶ１、ＩＧＫＶ２、ＩＧＫＶ３、ＩＧＫＶ４、ＩＧＫＶ５及びＩＧＫＶ６並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項８９−９１のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項９３】
Ｖκが、配列識別番号：２８６−３５５及び８６８のいずれかから選択される、請求項９２に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項９４】
Ｖκの配列が、ＶＬ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｊ結合部で挿入又は欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項８９−９３のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項９５】
Ｖκヌクレオチド配列の３’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項９４に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項９６】
ヌクレオチドが、ＶκとＪκの間でヌクレオチドを追加するため、Ｖκヌクレオチド配列の３’末端で挿入される、請求項９４に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項９７】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項９６に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項９８】
Ｊκが、ＩＧＫＪ１、ＩＧＫＪ２、ＩＧＫＪ３、ＩＧＫＪ４及びＩＧＫＪ５並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項８９−９７のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項９９】
Ｊκが、配列識別番号：３５６−３６４のいずれかから選択される、請求項９８に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１００】
Ｊκの配列が、ＶＬ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｊ結合部で挿入又は欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項８９−９９のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１０１】
ヌクレオチドの挿入又は欠失が、Ｊκリーディングフレームを維持するため選択される、請求項１００に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１０２】
Ｊκの５’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項１００又は請求項１０１に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１０３】
Ｖλが、ＩＧＬＶ１、ＩＧＬＶ２、ＩＧＬＶ３、ＩＧＬＶ４、ＩＧＬＶ５、ＩＧＬＶ６、ＩＧＬＶ７、ＩＧＬＶ８、ＩＧＬＶ９、ＩＧＬＶ１０及びＩＧＬＶ１１並びにその遺伝子及び対立遺伝子の中から選択される、請求項８９−９１のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１０４】
Ｖλが、配列識別番号：３６５−４４１のいずれかから選択される、請求項９８に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１０５】
Ｖλの配列が、ＶＬ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｊ結合部で挿入又は欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項８９−９１及び１０３−１０４のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１０６】
Ｖλのヌクレオチド配列の３’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項１０５に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１０７】
ヌクレオチドが、ＶλとＪλの間でヌクレオチドを追加するため、Ｖλヌクレオチド配列の３’末端で挿入される、請求項１０５に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１０８】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項１０７に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１０９】
Ｊλが、ＩＧＬＪ１、ＩＧＬＪ２、ＩＧＬＪ３、ＩＧＬＪ４、ＩＧＬＪ５、ＩＧＬＪ６及びＩＧＬＪ７並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項８９−９１及び１０５−１０８のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１１０】
Ｊλが、配列識別番号：４４２−４５１のいずれかから選択される、請求項１０９に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１１１】
Ｊλの配列が、ＶＬ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｊ結合部で挿入又は欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項８９−９１及び１０５−１１０のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１１２】
ヌクレオチドの挿入又は欠失が、Ｊλのリーディングフレームを維持するため選択される、請求項１１１に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１１３】
Ｊλの５’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項１１１又は請求項１０７に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１１４】
ＶＬ鎖をコードする複数の核酸分子が、配列の類似性又は相違性、遺伝子ファミリー、長さ、構成、ＣＤＲ長さ又は構成、種類、機能性、特異性、群、亜群に基づいて選択される一部の生殖細胞系セグメントから生成される、請求項８９−１１３のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１１５】
ＶＬ鎖をコードする複数の核酸分子が、ＣＤＲに基づいて選択される一部の生殖細胞系セグメントから生成され、前記ＣＤＲはＣＤＲ３である、請求項１１４に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１１６】
ＶＬ鎖をコードする複数の核酸分子が、遺伝子ファミリーに基づいて選択され、それによって、各々のＶκ及び／又はＪκ若しくはＶλ及び／又はＪλ遺伝子ファミリーからの１つの生殖細胞系セグメントが選択され、或いは一部のＶκ及び／又はＪκ若しくはＶλ及び／又はＪλ遺伝子ファミリーからの１つの生殖細胞系セグメントが選択される、請求項６６に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１１７】
Ｖκ遺伝子ファミリーが、ＩＧＫＶ１−１２、ＩＧＫＶ１−１２、ＩＧＫＶ１−１６、ＩＧＫＶ１−１７、ＩＧＫＶ１−２７、ＩＧＫＶ１−３３、ＩＧＫＶ１−３７、ＩＧＫＶ１−３９、ＩＧＫＶ１−５、ＩＧＫＶ１−６、ＩＧＫＶ１−８、ＩＧＫＶ１−９、ＩＧＫＶ１−ＮＬ１、ＩＧＫＶ１／ＯＲ２、ＩＧＫＶ１Ｄ−１２、ＩＧＫＶ１Ｄ−１３、ＩＧＫＶ１Ｄ−１６、ＩＧＫＶ１−Ｄ−１７、ＩＧＫＶ１Ｄ−３３、ＩＧＫＶ１Ｄ−３７、ＩＧＫＶ１Ｄ−３９、ＩＧＫＶ１Ｄ−４２、ＩＧＫＶ１Ｄ−４３、ＩＧＫＶ１Ｄ−８、ＩＧＫＶ２−２４、ＩＧＫＶ２−２８、ＩＧＫＶ２−２９、ＩＧＫＶ２−３０、ＩＧＫＶ２−３０、ＩＧＫＶ２−４０、ＩＧＫＶ２Ｄ−２４、ＩＧＫＶ２Ｄ−２６、ＩＧＫＶ２Ｄ−２８、ＩＧＫＶ２Ｄ−２９、ＩＧＫＶ２−Ｄ−３０、ＩＧＫＶ２Ｄ−４０、ＩＧＫＶ３−１１、ＩＧＫＶ３−１５、ＩＧＫＶ３−２０、ＩＧＫＶ３−７、ＩＧＫＶ３−ＮＬ１、ＩＧＶ３−ＮＬ２、ＩＧＫＶ３−ＮＬ３、ＩＧＫＶ３−ＮＬ４、ＩＧＫＶ３−ＮＬ５、ＩＧＫＶ３／ＯＲ２−２６８、ＩＧＫＶ３Ｄ−１１、ＩＧＫＶ３Ｄ−１５、ＩＧＫＶ３Ｄ−２０、ｉＧＫＶ３Ｄ−７、ＩＧＫＶ４−１、ＩＧＫＶ５−２、ＩＧＫＶ６−２１、ＩＧＫＶ６Ｄ−２１、ＩＧＫＶ６Ｄ−４１、及びＩＧＫＶ１−３９から選択され、
Ｊκ遺伝子ファミリーが、ＩＧＫＪ１、ＩＧＫＪ２、ＩＧＫＪ３、ＩＧＫＪ４及びＩＧＫＪ５から選択され、
Ｖλ遺伝子ファミリーが、ＩＧＬＶ１−３６、ＩＧＬＶ１−４０、ＩＧＬＶ１−４１、ＩＧＬＶ１−４４、ＩＧＬＶ１−４７、ＩＧＬＶ１−５０、ＩＧＬＶ１−５１、ＩＧＬＶ１０−５４、ＩＧＬＶ１１−５５、ＩＧＬＶ２−１１、ＩＧＬＶ２−１４、ＩＧＬＶ２−１８、ＩＧＬＶ２−２３、ＩＧＬＶ２−３３、ＩＧＬＶ２−８、ＩＧＬＶ３−１、ＩＧＬＶ３−１０、ＩＧＬＶ３−１２、ＩＧＬＶ３−１６、ＩＧＬＶ３−１９、ＩＧＬＶ３−２１、ＩＧＬＶ３−２２、ＩＧＬＶ３−２５、ＩＧＬＶ３−２７、ＩＧＬＶ３−３２、ＩＧＬＶ３−９、ＩＧＬＶ４−３、ＩＧＬＶ４−６０、ＩＧＬＶ４−６９、ＩＧＬＶ５−３７、ＩＧＬＶ５−３９、ＩＧＬＶ５−４５、ＩＧＬＶ５−８、ＩＧＬＶ５−５２、ＩＧＬＶ６−５７、ＩＧＬＶ７−４３、ＩＧＬＶ７−４６、ＩＧＬＶ８−６１、ＩＧＬＶ８−６１及びＩＧＬＶ９−４９から選択され、並びに
Ｊλ遺伝子ファミリーが、ＩＧＬＪ１、ＩＧＬＪ２、ＩＧＬＪ４、ＩＧＬＪ５、ＩＧＬＪ６及びＩＧＬＪ７から選択される、請求項１１６に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１１８】
ＶＬ鎖をコードする核酸分子が、停止コドン及び／又は制限酵素部位を除去するため修飾される、請求項８９−１１７のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１１９】
ＶＨ鎖をコードする核酸分子が、配列識別番号：１４１１−１４２２、１４２４−１４３９及び１４１１−１４７１のいずれか、若しくはその一部から選択される、請求項８９−１１８のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１２０】
ライブラリーの各ベクターが様々な核酸分子を含む、請求項８９−１１９にのいずれかに記載の核酸分子を含有するアドレス可能なベクターのライブラリー。
【請求項１２１】
ライブラリーの各細胞が様々なベクターを含む、請求項１２０のベクターを含有するアドレス可能な細胞のライブラリー。
【請求項１２２】
各ＶＨ鎖が、インフレームで連結されるＶＨ、ＤＨ及びＪＨヒト生殖細胞系セグメントを含む核酸分子によりコードされ、及び
各アドレス内の核酸分子は同じで、他の全てのアドレスの核酸分子とは異なる、可変の重（ＶＨ）鎖をコードする複数のアドレス可能な核酸分子を含む核酸分子のライブラリー。
【請求項１２３】
ＶＨ鎖をコードする核酸分子のＶＨ、ＤＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメントは、ＶＨセグメントが、ＤＨセグメントへ５’で、それはＪＨセグメントへ５’であるよう連結される、請求項１２２に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１２４】
全て又は一部の生殖細胞系ＶＨセグメントが、全て又は一部の生殖細胞系ＪＨセグメントと連結される全て又は一部の生殖細胞系ＤＨセグメントと連結され、ＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子を生成する、請求項１２３に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１２５】
ＶＨが、ＩＧＨＶ１、ＩＧＨＶ２、ＩＧＨＶ３、ＩＧＨＶ４、ＩＧＨＶ５、ＩＧＨＶ６及びＩＧＨＶ７並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１２２−１２４のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１２６】
ＶＨが、配列識別番号：１０−２３８のいずれかから選択される、請求項１２５に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１２７】
ＶＨの配列が、ＶＨ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｄ結合部で追加又は除去される１つのヌクレオチドを有する、請求項１２２−１２６のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１２８】
ＶＨヌクレオチド配列の３’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項１２７に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１２９】
ヌクレオチドが、ＶＨ及びＤＨの間でヌクレオチドを追加するため、ＶＨヌクレオチド配列の３’末端で挿入される、請求項１２７に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１３０】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項１２９に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１３１】
ＤＨが、ＩＧＨＤ１、ＩＧＨＤ２、ＩＧＨＤ３、ＩＧＨＤ４、ＩＧＨＤ５、ＩＧＨＤ６及びＩＧＨＤ７並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１２２−１３０のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１３２】
ＤＨが、配列識別番号：２３９−２７２のいずれかから選択される、請求項１３１に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１３３】
ＤＨの配列が、ＶＨ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｄ結合部及び／又はＤ−Ｊ結合部で挿入又は欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項１２２−１３２のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１３４】
ヌクレオチドの挿入又は欠失が、ＤＨの親水性を最大化するため選択される、請求項１３３に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１３５】
ＤＨの５’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項１３３又は請求項１３４に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１３６】
ＤＨの３’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項１３３−１３５のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１３７】
ヌクレオチドが、ＤＨ配列の３’末端で挿入され、ＤＨ及びＪＨであるヌクレオチドを追加する、請求項１３３−１３６のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１３８】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項１３７に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１３９】
ＪＨが、ＩＧＨＪ１、ＩＧＨＪ２、ＩＧＨＪ３、ＩＧＨＪ４、ＩＧＨＪ５及びＩＧＨＪ６並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１２２−１３９のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１４０】
ＪＨが、配列認識番号：２７３−２８５のいずれかから選択される、請求項１３９に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１４１】
ＪＨ配列が、ＶＨ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｄ−Ｊ結合部で挿入又は欠失される１つのヌクレオチドを有する、請求項１２２−１４０のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１４２】
ヌクレオチドの挿入又は欠失が、ＪＨのリーディングフレームを維持するために選択される、請求項１４１に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１４３】
ＪＨの５’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項１４１又は請求項１４２に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１４４】
ＪＨの３’末端からヌクレオチドが欠失される、請求項１４１−１４３のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１４５】
ＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子が、配列の類似性又は相違性、遺伝子ファミリー、長さ、構成、ＣＤＲ長さ又は構成、種類、機能性、特異性、群又は亜群に基づいて選択される一部の生殖細胞系セグメントから生成される、請求項１２２−１４５のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１４６】
ＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子が、ＣＤＲに基づいて選択される一部の生殖細胞系セグメントから生成され、前記ＣＤＲはＣＤＲ３である、請求項１４５に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１４７】
遺伝子ファミリーに基づいて選択されるＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子が選択され、それによってＶＨ、ＤＨ及び／又はＪＨの各遺伝子ファミリーからの１つの生殖細胞系セグメントが選択され、或いは一部のＶＨ、ＤＨ及び／又はＪＨの遺伝子ファミリーからの１つの生殖細胞系セグメントが選択される、請求項１４５に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１４８】
ＶＨ遺伝子ファミリーは、ＩＧＨＶ１−１８、ＩＧＨＶ１−２、ＩＧＨＶ１−２４、ＩＧＨＶ１−３、ＩＧＨＶ１−４５、ＩＧＨＶ１−４６、ＩＧＨＶ１−５８、ＩＧＨＶ１−６９、ＩＧＨＶ１−８、ＩＧＨＶ２−２６、ＩＧＨＶ２−５、ＩＧＨＶ２−７０、ＩＧＨＶ３−１１、ＩＧＨＶ３−１３、ＩＧＨＶ３−１５、ＩＧＨＶ３−１６、ＩＧＨＶ３−２０、ＩＧＨＶ３−２１、ＩＧＨＶ３−２３、ＩＧＨＶ３−３０、ＩＧＨＶ３−３３、ＩＧＨＶ３−３５、ＩＧＨＶ３−３８、ＩＧＨＶ３−４３、ＩＧＨＶ３−４８、ＩＧＨＶ３−４９、ＩＧＨＶ３−５３、ＩＧＨＶ３−６４、ＩＧＨＶ３−６６、ＩＧＨＶ３−７、ＩＧＨＶ３−７２、ＩＧＨＶ３−７３、ＩＧＨＶ３−７４、ＩＧＨＶ３−９、ＩＧＨＶ４−２８、ＩＧＨＶ４−３１、ＩＧＨＶ４−３４、ＩＧＨＶ４−３９、ＩＧＨＶ４４、ＩＧＨＶ４−５９、ＩＧＨＶ４−６１、ＩＧＨＶ５−５１、ＩＧＨＶ６−１及びＩＧＨＶ７−８１から選択され、
ＤＨ遺伝子ファミリーは、ＩＧＨＤ１−１、ＩＧＨＤ１−１４、ＩＧＨＤ１−２０、ＩＧＨＤ１−２６、ＩＧＨＤ１−７、ＩＧＨＤ２−１５、ＩＧＨＤ２−２、ＩＧＨＤ２−２１、ＩＧＨＤ２−８、ＩＧＨＤ３−１０、ＩＧＨＤ３−１６、ＩＧＨＤ３−２２、ＩＧＨＤ３−３、ＩＧＨＤ３−９、ＩＧＨＤ４−１１、ＩＧＨＤ４−１７、ＩＧＨＤ４−２３、ＩＧＨＤ４−４、ＩＧＨＤ５−１２、ＩＧＨＤ５−１８、ＩＧＨＤ５−２４、ＩＧＨＤ５−５、ＩＧＨＤ６−１３、ＩＧＨＤ６−１９、ＩＧＨＤ６−２５、ＩＧＨＤ６−６及びＩＧＨＤ７−２７から選択され、並びに
ＪＨ遺伝子ファミリーは、ＩＧＨＪ１、ＩＧＨＪ２、ＩＧＨＪ３、ＩＧＨＪ４、ＩＧＨＪ５及びＩＧＨＪ６から選択される、請求項１４７に記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１４９】
ＶＨ鎖をコードする核酸分子が、停止コドン及び／又は制限酵素部位を除去するため修飾される、請求項１２２−１４９のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１５０】
ＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子が、配列番号：１０５９−１４１０又はその一部のいずれかから選択される、請求項１２２−１４９のいずれかに記載の核酸分子のライブラリー。
【請求項１５１】
ライブラリーの各ベクターが様々な核酸分子を含む、請求項１２２−１５０のいずれかに記載の核酸分子を含有するアドレス可能なベクターのライブラリー。
【請求項１５２】
ライブラリーの各細胞が様々なベクターを含有する、請求項１５１に記載のベクターを含むアドレス可能な細胞のライブラリー。
【請求項１５３】
各ＶＬ鎖が、インフレームで連結されるＶκ及びＪκヒト生殖細胞系セグメント又はＶλ及びＪλ生殖細胞系セグメントを含む核酸分子によってコードされ、
各ＶＨ鎖が、ＶＨ、ＤＨ及びＪＨヒト生殖細胞系セグメントを含む核酸分子によってコードされ、
各位置が、ＶＨ鎖をコードする核酸分子及びＶＬ鎖をコードする核酸分子を含み、並びに
各アドレス内のＶＨ核酸分子及びＶＬ核酸分子の組合せが、他の全てのアドレスの核酸分子の組み合せとは異なる、
可変軽（ＶＬ）鎖をコードする複数のアドレス可能な核酸分子及び可変重（ＶＨ）鎖をコードする複数のアドレス可能な核酸分子を含む核酸分子のライブラリー。
【請求項１５４】
ａ）ＶＨ鎖又をコードする核酸分子の配列又はその部分を生成するＶＨ、ＤＨ及びＪＨヒト生殖細胞系セグメント又はその部分をインフレームで組み合わせることと、
ｂ）ＶＨ鎖をコードする核酸分子の配列又はその部分を生成するＶκ及びＪκヒト生殖細胞系セグメント又はそぼ部分、或いはＶλ及びＪλ生殖細胞系セグメント又はその部分をインフレームで組み合わせることと、
段階ａ）及びｂ）において、ＶＨ、ＤＨ、ＪＨ、Ｖκ、Ｊκ、Ｖλ又はＪλの各部分が、十分な抗原結合部位を形成するＶＨ又はＶＬ又はその部分を含む抗体又はその部分を産生するのに十分であり、
ｃ）複数の異なる核酸分子の配列を生成するため、段階ａ）及びｂ）を数回繰り返すことと、
ｄ）第一のライブラリーが、ＶＨ鎖又はその部分をコードする核酸分子を含み、並びに第二のライブラリーが、ＶＬ鎖又はその部分をコードする核酸分子を含む２つのライブラリーを作るため核酸分子を合成することと、
ｅ）各細胞が、細胞ライブラリーの他の全ての細胞からのＶＨ及びＶＬの様々な組合せをコードする核酸分子を含む、第一のライブラリー及び第二のライブラリーからの核酸分子を細胞に導入し、これを数回繰り返して細胞のライブラリーを作ることと、並びに
ｆ）ライブラリーの各抗体又はその部分が、様々な組合せのＶＨ及びＶＬ鎖又はその十分な部分を含み、ライブラリーの他の全ての抗体又はその部分から抗原結合部位を形成し、複数の抗体又はその部分を産生して、各細胞の抗体又はその部分を発現する細胞を成長させることとを含む、ヒト組合せ抗体ライブラリーを産生する方法。
【請求項１５５】
段階ｄ）において、第一のアドレス指定された核酸ライブラリー及び第二のアドレス指定されたライブラリーを生成する、合成された核酸配列が個々にアドレス指定され、
段階ｅ）において、細胞がアドレス指定され、各位置が、細胞のアドレス指定されたライブラリーにおける他の全部の細胞から、様々な組合せのＶＨ及びＶＬをコードする核酸分子を含有する細胞を含み、並びに
段階ｆ）において、複数の抗体又はその部分がアドレス指定され、ライブラリーのそれぞれの位置における抗体又はその部分が同じ抗体で、他のそれぞれの位置及び他の全ての位置でこれらは異なり、並びに
抗体又はその部分の同定が、そのアドレスによって知られる、ライブラリーがアドレス可能なライブラリーである、請求項１５４に記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１５６】
段階ａ）において、ＶＨ鎖をコードする核酸分子のＶＨ、ＤＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント又はその部分が、ＶＨセグメントは、ＤＨへ５’で、それはＪＨセグメントへ５’であるよう組み合わされ、並びに
段階ｂ）において、ＶＬ鎖をコードする核酸分子のＶκ及びＪκ又はＶλ及びＪλ生殖細胞系セグメント又はその部分が、ＶκセグメントはＪκセグメントに５’で、或いはＶλセグメントはＪλセグメントへ５’であるよう連結される、
請求項１５４又は請求項１５５に記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１５７】
段階ａ）−ｂ）が、アルゴリズムを実行するようコンピュータプログラムされることによって行われる、請求項１５４−１５６のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１５８】
段階ａ）が、
ｉ）ＶＨ、ＤＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント又はその部分を選択することと、
ｉｉ）ＤＨ生殖細胞系セグメントの親水性を最大化するため、１つ又はそれ以上の核酸の挿入又は欠失でＶＨ及び／又はＤＨの生殖細胞系配列を修飾することによるＶ−Ｄ結合部を生成することと、
ｉｉｉ）ＪＨのリーディングフレームを維持するため、１つ又はそれ以上の核酸の挿入又は欠失でＤＨ及び／又はＪＨの生殖細胞系配列を修飾することによるＤ−Ｊ結合部を生成することと、
ｉｖ）ＶＨ鎖をコードする核酸分子の配列を生成するため、得られたＶＨ、ＤＨ及びＪＨを組み合わせることとを含む、請求項１５４−１５７のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１５９】
Ｖ−Ｄ結合部が、ＤＨの５’末端からヌクレオチドを欠失することによって生成される、請求項１５８に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１６０】
Ｖ−Ｄ結合部が、ＶＨの３’末端からヌクレオチドを欠失することによって生成される、請求項１５８に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１６１】
Ｖ−Ｄ結合部が、ＤＨの５’末端でヌクレオチドを挿入することによって生成される、請求項１５８に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１６２】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項１６１に記載の方法
【請求項１６３】
Ｄ−Ｊ結合部が、ＪＨの５’末端からヌクレオチドを欠失することにより生成される、請求項１５８に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１６４】
Ｄ−Ｊ結合部が、ＤＨの３’末端からヌクレオチドを欠失することにより生成される、請求項１５８に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１６５】
Ｄ−Ｊ結合部が、ＤＨの５’末端でヌクレオチドを挿入することにより生成される、請求項１５８に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１６６】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項１６５に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１６７】
段階ｂ）が、
ｉ）Ｖκ及びＪκ又はＶλ及びＪλ生殖細胞系セグメント又はその部分を選択することと、
ｉｉ）Ｊκのリーディングフレームを維持するため、１つ又はそれ以上のヌクレオチドの挿入又は欠失でＶκ又はＪκの生殖細胞系配列を修飾することにより、或いはＪλのリーディングフレームを維持するため、１つ又はそれ以上のヌクレオチドの挿入又は欠失でＶλ又はＪλの生殖細胞系配列を修飾することにより、Ｖ−Ｊ結合部を生成することと、並びに
ｉｉｉ）ＶＬ鎖をコードする核酸分子の配列を生成するため、得られたＶκ及びＪκ又はＶλ及びＪλを組み合わせることとを含む、請求項１５４−１５７のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１６８】
Ｖ−Ｊ結合部が、Ｊκ又はＪλの５’末端からヌクレオチドを欠失することにより生成される、請求項１６７に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１６９】
Ｖ−Ｊ結合部が、Ｖκ又はＶλの３’末端からヌクレオチドを欠失することにより生成される、請求項１６７に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１７０】
Ｖ−Ｊ結合部が、Ｊκ又はＪλの５’末端でヌクレオチドを挿入することにより生成される、請求項１６７に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１７１】
ヌクレオチドがグアニン（Ｇ）である、請求項１７０に記載の方法。
【請求項１７２】
段階ａ）を数回繰り返すことが、
Ｎ１、Ｎ２及びＮ３は、全て又は一部のＶＨ、ＤＨ又はＪＨ生殖細胞系セグメントであり得る多数の生殖細胞系セグメントであり、並びに
Ｎ１、Ｎ２及びＮ３が、同じ又は異なり得て、
Ｎ１の異なるＶＨ生殖細胞系セグメントを選択することと、
Ｎ２の異なるＤＨ生殖細胞系セグメントを選択することと、
Ｎ３の異なるＪＨ生殖細胞系セグメントを選択することとを含み、並びに
ＶＨ鎖をコードするＮ１ｘＮ２ｘＮ３の異なる核酸配列を生成するため、全ての可能なＶＨ、ＤＨ及びＪＨの組合せを組合せる、請求項１５４−１７１のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１７３】
ＶＨ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部のＩＧＨＶ１、ＩＧＨＶ２、ＩＧＨＶ３、ＩＧＨＶ４、ＩＧＨＶ５、ＩＧＨＶ６及びＩＧＨＶ７並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１５７−１７２のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１７４】
ＶＨ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部の配列識別番号：１０−２３８から選択される、請求項１７３に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１７５】
ＤＨ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部のＩＧＨＤ１、ＩＧＨＤ２、ＩＧＨＤ３、ＩＧＨＤ４、ＩＧＨＤ５、ＩＧＨＤ６及びＩＧＨＤ７並びにその遺伝子又はその対立遺伝子から選択される、請求項１５７−１７２のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１７６】
ＤＨ生殖細胞系セグメントが、配列識別番号：２３９−２７２のいずれかから選択される、請求項１７５に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１７７】
ＪＨ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部のＩＧＨＪ１、ＩＧＨＪ２、ＩＧＨＪ３、ＩＧＨＪ４、ＩＧＨＪ５及びＩＧＨＪ６並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１５７−１７２のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１７８】
ＪＨ生殖細胞系セグメントが、配列識別番号：２７３−２８５のいずれかから選択される、請求項１７７に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１７９】
一部の生殖細胞系セグメントが、配列の類似性又は相違性、遺伝子ファミリー、長さ、構成、ＣＤＲ長さ又は構成、種類、機能性、特異性、群又は亜群に基づいて選択される、請求項１７２−１７８のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項１８０】
一部の生殖細胞系セグメントが遺伝子ファミリーに基づいて選択される、請求項１７９に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリー。
【請求項１８１】
ＶＨ遺伝子ファミリーが、ＩＧＨＶ１−１８、ＩＧＨＶ１−２、ＩＧＨＶ１−２４、ＩＧＨＶ１−３、ＩＧＨＶ１−４５、ＩＧＨＶ１−４６、ＩＧＨＶ１−５８、ＩＧＨＶＩ−６９、ＩＧＨＶ１−８、ＩＧＨＶ２−２６、ＩＧＨＶ２−５、ＩＧＨＶ２−７０、ＩＧＨＶ３−１１、ＩＧＨＶ３−１３、ＩＧＨＶ３−１５、ＩＧＨＶ３−１６、ＩＧＨＶ３−２０、ＩＧＨＶ３−２１、ＩＧＨＶ３−２３、ＩＧＨＶ３−３０、ＩＧＨＶ３−３３、ＩＧＨＶ３−３５、ＩＧＨＶ３−３８、ＩＧＨＶ３−４３、ＩＧＨＶ３−４８、ＩＧＨＶ３−４９、ＩＧＨＶ３−５３、ＩＧＨＶ３−６４、ＩＧＨＶ３−６６、ＩＧＨＶ３−７、ＩＧＨＶ３−７２、ＩＧＨＶ３−７３、ＩＧＨＶ３−７４、ＩＧＨＶ３−９、ＩＧＨＶ４−２８、ＩＧＨＶ４−３１、ＩＧＨＶ４−３４、ＩＧＨＶ４−３９、ＩＧＨＶ４−４、ＩＧＨＶ４−５９、ＩＧＨＶ４−６１、ＩＧＨＶ５−５１、ＩＧＨＶ６−１及びＩＧＨＶ７−８１から選択され、
ＤＨ遺伝子ファミリーが、ＩＧＨＤ１−１、ＩＧＨＤ１−１４、ＩＧＨＤ１−２０、ＩＧＨＤ１−２６、ＩＧＨＤ１−７、ＩＧＨＤ２−１５、ＩＧＨＤ２−２、ＩＧＨＤ２−２１、ＩＧＨＤ２−８、ＩＧＨＤ３−１０、ＩＧＨＤ３−１６、ＩＧＨＤ３−２２、ＩＧＨＤ３−３、ＩＧＨＤ３−９、ＩＧＨＤ４−１１、ＩＧＨＤ４−１７、ＩＧＨＤ４−２３、ＩＧＨＤ４−４、ＩＧＨＤ５−１２、ＩＧＨＤ５−１８、ＩＧＨＤ５−２４、ＩＧＨＤ５−５、ＩＧＨＤ６−１３、ＩＧＨＤ６−１９、ＩＧＨＤ６−２５、ＩＧＨＤ６−６及びＩＧＨＤ７−２７から選択され、並びに
ＪＨ遺伝子ファミリーが、ＩＧＨＪ１、ＩＧＨＪ２、ＩＧＨＪ３、ＩＧＨＪ４、ＩＧＨＪ５及びＩＧＨＪ６から選択され、
各々のＶＨ、ＤＨ及び／又はＪＨ遺伝子ファミリーから１つの生殖細胞系セグメントが選択され、
一部のＶＨ、ＤＨ及び／又はＪＨ遺伝子ファミリーから１つの生殖細胞系セグメント或いは一部のＶＨ、ＤＨ及び／又はＪＨ遺伝子から１つの生殖細胞系セグメントが選択される、請求項１８０に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリー。
【請求項１８２】
段階ｂ）を数回繰り返すことが、
Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３及びＮ４が、全て又は一部のＶλ、Ｊλ、Ｖκ、Ｊκ生殖細胞系セグメントになり得る生殖細胞系セグメントの数であり、並びに
Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３及びＮ４が、同じ又は異なり得て、
Ｎ１（数）の異なるＶλ生殖細胞系セグメントを選択すること及びＮ２の異なるＪλ生殖細胞系セグメントを選択することと、又は
Ｎ３の異なるＶκ生殖細胞系セグメントを選択すること及びＮ４の異なるＪκ生殖細胞系セグメントを選択することと、並びに
ＶＬ鎖をコードするＮ１ｘＮ２の異なる核酸分子を生成するため、全ての可能なＶλ又はＪλの組み合わせを組み合わせ、或いはＶＬ鎖をコードするＮ３ｘＮ４の異なる核酸分子を生成するため、全ての可能なＶκ及びＪκを組み合わせることとを含む、請求項１５４−１７１のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１８３】
Ｖλ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部のＩＧＬＶ１、ＩＧＬＶ２、ＩＧＬＶ３、ＩＧＬＶ４、ＩＧＬＶ５、ＩＧＬＶ６、ＩＧＬＶ７、ＩＧＬＶ８、ＩＧＬＶ９、ＩＧＬＶ１０及びＩＧＬＶ１１並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１５７−１７１及び１８２のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１８４】
Ｖλ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部の配列識別番号：３６５−４４１から選択される、請求項１８３に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１８５】
Ｊλ生殖細胞系セグメントが、ＩＧＬＪ１、ＩＧＬＪ２、ＩＧＬＪ３、ＩＧＬＪ４、ＩＧＬＪ５、ＩＧＬＪ６及びＩＧＬＪ７並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１５７−１７１及び請求項１８２のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１８６】
Ｊλ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部の配列識別番号：４４２−４５１から選択される、請求項１８５に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１８７】
Ｖκ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部のＩＧＫＶ１、ＩＧＫＶ２、ＩＧＫＶ３、ＩＧＫＶ４、ＩＧＫＶ５及びＩＧＫＶ６並びにその遺伝子及び対立遺伝子から選択される、請求項１５７−１７１及び１８２のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１８８】
Ｖκ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部の配列識別番号：２８３−３５５及び８６８から選択される、請求項１８７に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１８９】
Ｊκ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部のＩＧＫＪ１、ＩＧＫＪ２、ＩＧＫＪ３、ＩＧＫＪ４及びＩＧＫＪ５並びにその遺伝子又は対立遺伝子から選択される、請求項１５７−１７１及び１８２のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１９０】
Ｊκ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部の配列識別番号：３５６−３６４から選択される、請求項１８９に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１９１】
一部の生殖細胞系セグメントが、配列の類似性又は相違性、遺伝子ファミリー、長さ、組成、ＣＤＲ長さ又は組成、種類、機能性、特異性、群又は亜群に基づいて選択される、請求項１８２−１９０のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１９２】
Ｖκ遺伝子ファミリーが、ＩＧＫＶ１−１２、ＩＧＫＶ１−１２、ＩＧＫＶ１−１６、ＩＧＫＶ１−１７、ＩＧＫＶ１−２７、ＩＧＫＶ１−３３、ＩＧＫＶ１−３７、ＩＧＫＶ１−３９、ＩＧＫＶ１−５、ＩＧＫＶ１−６、ＩＧＫＶ１−８、ＩＧＫＶ１−９、ＩＧＫＶ１−ＮＬ１、ＩＧＫＶ１／ＯＲ２、ＩＧＫＶ１Ｄ−１２、ＩＧＫＶ１Ｄ−１３、ＩＧＫＶ１Ｄ−１６、ＩＧＫＶ１−Ｄ−１７、ＩＧＫＶ１Ｄ−３３、ＩＧＫＶ１Ｄ−３７、ＩＧＫＶ１Ｄ−３９、ＩＧＫＶ１Ｄ−４２、ＩＧＫＶ１Ｄ−４３、ＩＧＫＶ１Ｄ−８、ＩＧＫＶ２−２４、ＩＧＫＶ２−２８、ＩＧＫＶ２−２９、ＩＧＫＶ２−３０、ＩＧＫＶ２−３０、ＩＧＫＶ２−４０、ＩＧＫＶ２Ｄ−２４、ＩＧＫＶ２Ｄ−２６、ＩＧＫＶ２Ｄ−２８、ＩＧＫＶ２Ｄ−２９、ＩＧＫＶ２−Ｄ−３０、ＩＧＫＶ２Ｄ−４０、ＩＧＫＶ３−１１、ＩＧＫＶ３−１５、ＩＧＫＶ３−２０、ＩＧＫＶ３−７、ＩＧＫＶ３−ＮＬ１、ＩＧＶ３−ＮＬ２、ＩＧＫＶ３−ＮＬ３、ＩＧＫＶ３−ＮＬ４、ＩＧＫＶ３−ＮＬ５、ＩＧＫＶ３／ＯＲ２−２６８、ＩＧＫＶ３Ｄ−１１、ＩＧＫＶ３Ｄ−１５、ＩＧＫＶ３Ｄ−２０、ＩＧＫＶ３Ｄ−７、ＩＧＫＶ４−１、ＩＧＫＶ５−２、ＩＧＫＶ６−２１、ＩＧＫＶ６Ｄ−２１、ＩＧＫＶ６Ｄ−４１及びＩＧＫＶ１−３９から選択され、
Ｊκ遺伝子ファミリーが、ＩＧＫＪ１、ＩＧＫＪ２、ＩＧＫＪ３、ＩＧＫＪ４及びＩＧＫＪ５から選択され、
Ｖλ遺伝子ファミリーが、ＩＧＬＶ１−３６、ＩＧＬＶ１−４０、ＩＧＬＶ１−４１、ＩＧＬＶ１−４４、ＩＧＬＶ１−４７、ＩＧＬＶ１−５０、ＩＧＬＶ１−５１、ＩＧＬＶ１０−５４、ＩＧＬＶ１１−５５、ＩＧＬＶ２−１１、ＩＧＬＶ２−１４、ＩＧＬＶ２−１８、ＩＧＬＶ２−２３、ＩＧＬＶ２−３３、ＩＧＬＶ２−８、ＩＧＬＶ３−１、ＩＧＬＶ３−１０、ＩＧＬＶ３−１２、ＩＧＬＶ３−１６、ＩＧＬＶ３−１９、ＩＧＬＶ３−２１、ＩＧＬＶ３−２２、ＩＧＬＶ３−２５、ＩＧＬＶ３−２７、ＩＧＬＶ３−３２、ＩＧＬＶ３−９、ＩＧＬＶ４−３、ＩＧＬＶ４−６０、ＩＧＬＶ４−６９、ＩＧＬＶ５−３７、ＩＧＬＶ５−３９、ＩＧＬＶ５−４５、ＩＧＬＶ５−８、ＩＧＬＶ５−５２、ＩＧＬＶ６−５７、ＩＧＬＶ７−４３、ＩＧＬＶ７−４６、ＩＧＬＶ８−６１、ＩＧＬＶ８−６１及びＩＧＬＶ９−４９から選択され、並びに
Ｊλ遺伝子ファミリーが、ＩＧＬＪ１、ＩＧＬＪ２、ＩＧＬＪ４、ＩＧＬＪ５、ＩＧＬＪ６及びＩＧＬＪ７から選択される、各Ｖκ及び／又はＪκ或いはＶλ及び／又はＪλ遺伝子ファミリーからの１つの生殖細胞セグメントが選択され、或いは一部のＶκ及び／又はＪκ若しくはＶλ及び／又はＪλ遺伝子ファミリーからの１つの生殖細胞系セグメントが選択され、生殖細胞系セグメントが、遺伝子ファミリーに基づいて選択される、請求項１９１に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１９３】
生殖細胞系セグメントが、ユーザ作成のデータベースで示される、請求項１５４−１９２のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１９４】
データベースのＪＨ、Ｊκ及びＪλ生殖細胞系セグメントの配列が、それらの正しいリーディングフレームで示される、請求項１９３に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１９５】
更に、段階ａ）及び／又は段階ｂ）において、あらゆる停止コドンを除去することにより、ＶＨ鎖又はその部分及び／又はＶＬ鎖又はその部分をコードする核酸分子を修飾することを含む、請求項１５４−１９４のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１９６】
停止コドンＴＡＡが、ＴＡＴに修飾され、停止コドンＴＡＧがＴＡＴに修飾され、及び停止コドンＴＧＡがＴＣＡに修飾される、請求項１９５に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１９７】
段階ａ）及び／又は段階ｂ）において、あらゆる制限酵素部位を除去することにより、ＶＨ鎖をコードする核酸分子又はその部分及び／若しくはＶＬ鎖をコードする核酸分子又はその部分を修飾することを更に含む、請求項１５４−１９６のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１９８】
制限酵素部位が、大腸菌Ｋ１２でコドン使用を最大にするため修飾される、請求項１９７に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項１９９】
ＶＨ鎖をコードする複数の異なる核酸分子間及び核酸分子中における配列の類似性並びに／又はＶＬ鎖をコードする複数の異なる核酸分子間又は核酸分子中における配列の類似性を決定することを更に含む、請求項１５４−１９８のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２００】
配列の類似性に基づいて、最も類似する又は最も異なるＶＨ鎖をコードする一部の核酸配列及び／又はＶＬ鎖をコードする一部の核酸配列を選択する、請求項１９９に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２０１】
ライブラリーの合成された核酸配列がベクターで含まれる、請求項１５４−２００のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２０２】
ベクターが、更に、重鎖及び軽鎖の会合を可能にするのに十分な全て又は一部の定常領域を含む、請求項２０１に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２０３】
細胞が原核細胞又は真核細胞である、請求項１５４−２０２のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２０４】
細胞が大腸菌細胞である、請求項１５４−２０３のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２０５】
アドレス指定された細胞が、空間アレイで配列される、請求項１５５−２０４のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２０６】
空間アレイが、マルチウェルプレートであり、前記プレートの個々の位置が、細胞のアドレス指定されたライブラリーで、他の全ての細胞から様々な組合せのＶＨ及びＶＬをコードする核酸分子を含む細胞に対応する、請求項２０５に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２０７】
発現される抗体が、完全長の抗体、又は抗原結合部位を形成するのに十分なフラグメントまたはその部分である、請求項１５４−２０６のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２０８】
発現される抗体がＦａｂである、請求項１５４−２０６のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２０９】
抗体又はその部分を更に精製する、請求項１５４−２０８のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２１０】
ライブラリーの精製された抗体又はその部分が、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％の純度である、請求項２０９に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２１１】
精製された抗体又はその部分がアドレス指定され、並びに
各アドレス内の抗体が同じ抗体であり及び他の全てのアドレスの抗体とは異なる、請求項２０９又は請求項２１０に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２１２】
請求項１５４−２１１のいずれかに記載の方法によって生成される、ヒト組み合わせ抗体ライブラリー。
【請求項２１３】
ＶＨ鎖が、配列識別番号：１４７５−１８２６又はその一部のいずれかから選択されるアミノ酸配列を有し、並びにＶＬ鎖が、配列識別番号：１８２７−１８３８、１８４０−１８５５及び１８５７−１８８８又はその一部のいずれかから選択されるアミノ酸配列を有する、請求項２１２に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリー。
【請求項２１４】
ａ）請求項１−８８、２１２又は２１３のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを提供することと、
ｂ）前記ライブラリーの抗体又はその一部を標的タンパク質と接触することと、
ｃ）抗体又はその部分の標的タンパク質との結合及び／若しくは抗体又はその部分が標的タンパク質の機能的活性を調節するかどうかを評価することと、並びに
ｄ）標的タンパク質に結合する及び／若しくは標的タンパク質の活性を調節する抗体又はその部分を同定し、同定された抗体又はその部分がＨＩＴであることとを含む、
標的タンパク質に対する結合又は活性のヒト組み合わせ抗体ライブラリーをスクリーニングする方法。
【請求項２１５】
ヒト組み合わせ抗体ライブラリーが、アドレス可能なライブラリーで、ＨＩＴの同定がそのアドレスによって知られるよう、接触はアドレス可能なアレイで行われる、請求項２１４に記載の方法。
【請求項２１６】
標的タンパク質が、膜結合性タンパク質、細胞表面受容体（ＣＳＲ）又はＣＳＲリガンドである、請求項２１４及び請求項２１５に記載の方法。
【請求項２１７】
膜結合性タンパク質又はＣＳＲが、サイトカイン受容体、受容体キナーゼ、受容体ホスファターゼ、細胞間相互作用に関与する受容体、及び細胞接着分子から選択される、請求項２１６に記載の方法。
【請求項２１８】
標的タンパク質が、ＶＥＧＦＲ−１、ＶＥＧＦＲ−２、ＶＥＧＦＲ−３、癌細胞表皮増殖因子受容体（ＥＧＦＲ）、ＥｒｂＢ−２、ＥｒｂＢ−３、ＩＧＦ−Ｒ１、Ｃ−Ｍｅｔ、ＴＮＦ−Ｒ１、ＴＮＦ−Ｒ２、ＢＴＬＡ、ＨＶＥＭ、ＬＴ−βＲ、ＣＤ２０、ＣＤ３、ＣＤ２５、ＮＯＴＣＨ、ＤＬＬ４、Ｇ−ＣＳＦ−Ｒ、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ、ＥＰＯ−Ｒ、カドヘリン、インテグリン、ＣＤ５２及びＣＤ４４、ＶＥＧＦ−Ａ、ＶＥＧＦ−Ｂ、ＶＥＧＦ−Ｃ、ＶＥＧＦ−Ｄ、ＰＩＧＦ、ＥＧＦ、ＨＧＦ、ＴＮＦ−α、ＬＩＧＨＴ、リンフォトキシン（ＬＴ）、ＩｇＥ、Ｇ−ＣＳＦ、ＧＭ−ＣＳＦ及びＥＰＯから選択される、請求項２１４−２１７のいずれかに記載の方法。
【請求項２１９】
抗体又はその部分の標的タンパク質への結合を評価することを含む、請求項２１３−２１８のいずれかに記載の方法。
【請求項２２０】
抗体又はその部分が、標的タンパク質の機能的活性を調節するかどうか評価することを含む、請求項２１３−２１８に記載の方法。
【請求項２２１】
機能的活性が、細胞増殖、リンパ種のアポトーシス、走化性、癌細胞の浸潤、マトリゲル、内皮増殖、管形成及びシグナル伝達から選択される、請求項２２０に記載の方法。
【請求項２２２】
結合が細胞で評価され、及び／又は機能的活性が細胞ベースのアッセイで評価され、及び細胞が標的タンパク質を発現する、請求項２１４−２２１のいずれかに記載の方法。
【請求項２２３】
細胞が、一時的又は安定的に標的タンパク質をコードする核酸分子で発現される、請求項２２２に記載の方法。
【請求項２２４】
第二のライブラリーが、
ａ）同定されるＨＩＴの生殖細胞系セグメントとの配列類似性によって関連付けられるＶＨ、ＤＨ及びＪＨヒト生殖細胞系セグメントを選択し、並びに様々なＶＨ鎖又はその部分を各々コードする複数の核酸分子の配列を生成するため、全ての可能なＶＨ、ＤＨ及びＪＨヒト生殖細胞系セグメント又はその部分をインフレームで組合せることと、
ｂ）同定されるＨＩＴの生殖細胞系セグメントとの配列類似性によって関連付けられるＶκ及びＪκ又はＶλ及びＶλヒト生殖細胞系セグメントを選択し、並びに様々なＶＬ鎖又はその部分を各々コードする複数の核酸分子の配列を生成するため、全ての可能なＶκ及びＪκヒト生殖細胞系セグメント又はその部分、或いは全ての可能なＶλ及びＪλ生殖細胞系セグメント又はその部分をインフレームで組合せることと、
段階ａ）及びｂ）において、ＶＨ、ＤＨ、ＪＨ、Ｖκ、Ｊκ、Ｖλ又はＪλの各部分が、抗原に結合するのに十分であるＶＨ又はＶＬ若しくはその部分を含む抗体を産生するのに十分であり、
ｃ）第一のライブラリーが、ＶＨ鎖又はその部分をコードする核酸分子を含み、並びに第二のライブラリーが、ＶＬ鎖又はその部分をコードする核酸分子を含む、二つのライブラリーを産生する核酸分子を合成することと、
ｄ）各細胞が、細胞のライブラリーにおける他の全ての細胞とは異なるＶＨ及びＶＬの組合せをコードする核酸分子を含む、第一のライブラリー及び第二のライブラリーからの核酸分子を前記細胞に導入し、細胞のライブラリーを産生するためこれを数回繰り返すことと、並びに
ｅ）ライブラリー内の抗体又はその部分が、ライブラリー内の他の全ての抗体又はその部分から抗原結合部位を形成するため、ＶＨ及びＶＬ鎖又はその十分な部分の異なる組合せを含む、複数の抗体又はその部分を産生して、各細胞で抗体を発現する細胞を成長させることと、
ｆ）第二のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成するため、抗体又はその部分を更に精製し、ライブラリー内の抗体又はその部分を標的タンパク質と接触して、抗体又はその部分と標的タンパク質との結合及び／又は抗体又はその部分が標的タンパク質の機能的活性を調節するかどうかを評価し、並びに標的タンパク質に結合する、及び／若しくは同定される抗体又はその部分が更にＨＩＴである標的タンパク質の活性を調節する、抗体又はその部分を同定することとを含む方法によって生成される、同定されたＨＩＴに基づいて第二の組合せ抗体ライブラリーを提供することを更に含む、請求項２１４−２２３のいずれかに記載の方法。
【請求項２２５】
配列類似性が、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又はそれ以上、或いは約６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又はそれ以上である、請求項２２４に記載の方法。
【請求項２２６】
第二のライブラリーが、
ａ）同定されたＨＩＴをコードする核酸分子で含有されるのと同じＶＨ、ＤＨ又はＪＨヒト生殖細胞系セグメントを含むＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子を選択することと、
ｂ）同定されたＨＩＴをコードする核酸分子で含有されるのと同じＶκ及びＪκ又はＶλ及びＪλヒト生殖細胞系セグメントを含むＶＬ鎖をコードする複数の核酸分子を選択することと、
ｃ）ＶＨをコードする複数の核酸分子からの核酸分子及びＶＬをコードする複数の核酸分子からの核酸分子を細胞に導入し、各細胞が、細胞ライブラリーの他の全ての細胞からＶＨ及びＶＬの様々な組合せをコードする核酸分子を含む、細胞ライブラリーを産生するため、これを数回繰り返すことと、並びに
ｄ）ライブラリーの他の全ての抗体又はその部分から抗原結合部位を形成するため、ライブラリーの各抗体又はその部分が、ＶＨ及びＶＬ鎖又はその十分な部分の様々な組合せを含む複数の抗体又はその部分を産生する、各細胞の抗体を発現するため細胞を成長させることと、並びに
ｅ）ライブラリーの抗体又はその部分を標的タンパク質と接触する抗体又はその部分を更に精製し、抗体又はその部分を標的タンパク質と結合して、及び／若しくは抗体又はその部分が標的タンパク質の機能的活性を調節するかどうかを評価し、並びに標的タンパク質に結合し、及び／若しくは同定された抗体又はその部分が更にＨＩＴである標的タンパク質の活性を調節する、抗体又はその部分を同定することとを含む方法により生成される、同定されたＨＩＴに基づいて第二の組合せ抗体ライブラリーを提供することを更に含む、請求項２１４−２２３のいずれかに記載の方法。
【請求項２２７】
第二のヒト組合せライブラリーが、アドレス可能なライブラリーで、それによって、精製された抗体又はその部分はアドレス指定され、各アドレス内の精製された抗体は同じ抗体で、他の全てのアドレスの抗体とは異なり、接触はアドレス可能なアレイで行われ、並びに更なるＨＩＴの同定がそのアドレスによって知られる、請求項２２４−２２６のいずれかに記載の方法。
【請求項２２８】
第二の組合せ抗体ライブラリーの各抗体メンバー又はその部分が、一次配列の１つ又はそれ以上のアミノ酸変異によって同定された「ＨＩＴ」と異なり、第二のライブラリーが、複数の抗体又はその部分を産生するため、アミノ酸変異を「ＨＩＴ」に導入することによって生成される同定されたＨＩＴに基づいて第二の組合せ抗体ライブラリーを提供することと、ライブラリーの抗体又はその部分の標的タンパク質と接触することと、抗体又はその部分の標的タンパク質との結合、及び／或いは抗体又はその部分が標的タンパク質の機能的活性を調節するかどうかを評価することと、並びに標的タンパク質に結合し、及び／若しくは同定された抗体又はその部分が、更にＨＩＴである標的タンパク質の活性を調節する抗体又はその部分を同定することとを更に含む、請求項２１４−２２３のいずれかに記載の方法。
【請求項２２９】
アミノ酸変異が、同定されたＨＩＴの相補性決定領域（ＣＤＲ）においてである、請求項２２８に記載の方法。
【請求項２３０】
「ＨＩＴ」が、標的タンパク質に対し最適化される結合親和性を有すること及び／又はこの方法の以前の反復で、前回の「ＨＩＴ」と比較して標的タンパク質に対し最適化される活性を有することが更に同定されるまで反復的に繰り返される、請求項２２４−２２９のいずれかに記載の方法。
【請求項２３１】
前記方法が、
（ａ）利用可能な全ヒト抗体生殖細胞系セグメント（ＶＨ、ＤＨ、ＪＨ、Ｖκ、Ｊκ、Ｖλ及びＪλ）のユーザ作成のコンピュータによるデータベースを評価することと、
（ｂ）重鎖（５’−ＶＨ−ＤＨ−ＪＨ−３’）をコードする可能な組み換えされた完全長のあらゆる核酸配列の集まりを生成するためアルゴリズムを適用することと、
（ｃ）カッパ軽鎖（５’−Ｖκ−Ｊκ−３’）をコードする可能な組み換えされた全長のあらゆる核酸配列及び／又はラムダ軽鎖（５’−Ｖλ−Ｊλ−３’）をコードする可能な組み換えされた完全長の全核酸配列の集まりを生成するためアルゴリズムを適用することと、
（ｄ）得られた核酸配列がインフレームであるよう、（ｂ）の核酸配列のＶ−Ｄ及び／又はＤ−Ｊ結合部において並びに（ｃ）の核酸配列のＶ−Ｊ結合部ににおいてヌクレオチドを修飾するためアルゴリズムを適用することと、
（ｅ）不注意に生成されたあらゆる停止コドンを除去するため、（ｄ）の核酸配列を修飾することと、
（ｆ）各々の組み換えられた核酸配列をアドレス可能な構成の固有の位置に割り当てることと、並びに
（ｇ）各々の組み換えられた核酸配列のアドレスを識別する出力ファイルを生成することとの段階を含む、ヒト生殖細胞系セグメントを組合せるの方法を実行するためのコンピュータデバイスによって実行できるコンピュータ読み取り可能な指示を含む、コンピュータシステム又はコンピュータ読み取り可能な媒体。
【請求項２３２】
前記方法が、
（ｈ）段階（ｅ）の後、制限酵素によって認識される配列を含む組み換えられた核酸配列の５’及び３’末端においてヌクレオチドを追加することと、
（ｉ）制限酵素によって認識される内部ヌクレオチドを除去するため、ヌクレオチド置換によって組み換えされた核酸配列を修飾することとの段階を更に含む、請求項２３１に記載のコンピューターシステム又はコンピュータ読み取り可能な媒体。
【請求項２３３】
前記方法が、細菌発現のコドン使用を最適化する組み換えの核酸配列を修飾することを更に含む、請求項２３１又は請求項２３２に記載のコンピューターシステム又はコンピュータ読み取り可能な媒体。
【請求項２３４】
段階（ｆ）の前に、前記方法が、配列の類似性又は相違性に基づいて、組み換えされた核酸配列のライブラリーからの組み換えの核酸配列を選択し、及び選択された配列が、段階（ｆ）で割り当てられる、請求項２３１−２３３のいずれかに記載のコンピューターシステム又はコンピュータ読み取り可能な媒体。
【請求項２３５】
組合せヒト生殖細胞系セグメントの方法が、
（ａ）利用可能な全てのヒト抗体生殖細胞系セグメント（ＶＨ、ＤＨ、ＪＨ、ＶκＪκ、Ｖλ及びＪλ）のユーザ作成のコンピュータによるデータベースにアクセスすることと、
（ｂ）重鎖（５’−ＶＨ−ＤＨ−ＪＨ−３’）をコードする可能なあらゆる組み換えの完全長核酸配列の集まりを生成するため、アルゴリズムを適用することと、
（ｃ）カッパ軽鎖（５’−Ｖκ−Ｊκ−３’）をコードする可能なあらゆる組み換えの完全長核酸配列及び／又はラムダ軽鎖（５’−Ｖλ−Ｊλ−３’）をコードする可能なあらゆる組み換えの完全長核酸配列の集まりを生成するため、アルゴリズムを適用することと、
（ｄ）得られた核酸配列がインフレームであるよう、（ｂ）の核酸配列のＶ−Ｄ及び／又はＤ−Ｊ結合部で、並びに（ｃ）の核酸配列のＶ−Ｊ結合部でヌクレオチドを修飾するため、アルゴリズムを適用することと、
（ｅ）不注意に生成されたあらゆる停止コドンを除去するため、（ｄ）の核酸配列を修飾することと、
（ｆ）各々の組み換えされた核酸配列をアドレス可能な構成の固有の位置へ割り当てることと、
（ｇ）各々の組み換えれた核酸配列のアドレスを識別する出力ファイルを生成することとの段階を含む、コンピュータデバイスによる組合せヒト生殖細胞系セグメントの方法を行うコンピュータ読み込み可能な指示の実行を含む方法。
【請求項２３６】
重鎖をコードする、カッパ軽鎖をコードする、及び／又はラムダ軽鎖をコードする組み換えの核酸配列、又は重鎖をコードする、カッパ軽鎖をコードする、及び／又はラムダ軽鎖をコードする一部の組み換えの核酸配列を合成することを更に含む、請求項２３５に記載の方法。
【請求項２３７】
ａ）各メンバー抗体が、抗原結合部位を形成するため、可変の軽（ＶＬ）鎖及び可変の重（ＶＨ）鎖又はその十分な部分を含み、
ｉ）各ＶＬ鎖が、Ｖκ及びＪκヒト生殖細胞系セグメント又はその縮重コドン又はその修飾された形態、或いは、Ｖλ及びＪλヒト生殖細胞系セグメント又はその縮重コドン又はその修飾された形態を含む核酸分子によりコードされ、それによって前記セグメントがインフレームで連結され、
ｉｉ）各ＶＨ鎖は、ヒトＶＨ及びヒトＶＨ生殖細胞系セグメント又はその縮重コドン又はその修飾された形態並びにＶＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント間のあらゆるヌクレオチド配列を含む核酸分子によりコードされ、それによって前記セグメントがインフレームで連結され、
ｂ）ライブラリーは、少なくとも大体或いは５０又は１００又はそれ以上の異なるメンバーを含む、複数の抗体から成るヒト組み換え抗体ライブラリー。
【請求項２３８】
ＶＨ鎖をコードする核酸の、ＶＨ生殖細胞系セグメント、ＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列及びＪＨ生殖細胞系セグメントは、ＶＨセグメントが、ＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列へ５’であり、それはＪＨセグメントへ５’であるよう、直接的又は間接的に連結され、並びに、ＶＬ鎖をコードする核酸分子のＶκ及びＪκ又はＶλ及びＪλ生殖細胞系セグメントは、ＶκセグメントがＪκセグメントへ５’で、又はＶλセグメントがＪλセグメントへ５’であるよう、直接的又は間接的に連結される、請求項２３７に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２３９】
ＶＨ及びＪＨの間のヌクレオチド配列並びにＪＨ生殖細胞系が、Ｄ−Ｊ結合部でペプチドリンカーにより間接的に連結される、請求項２３８に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２４０】
ペプチドリンカーがＳＹである、請求項２３９に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２４１】
ＶＨ生殖細胞系セグメントが、ＩＧＨＶ３−２３＊０１又はその縮重コドンである、請求項２３７−２４０のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２４２】
ＶＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント間のヌクレオチド配列が、ＤＨ生殖細胞系セグメント又はその縮重コドンであり又は反転ＤＨ生殖細胞系セグメントである、請求項２３７−２４１のいずれかに記載のヒト組合せ抗体。
【請求項２４３】
ＤＨ生殖細胞系セグメントが、配列識別番号：２３９−２７２のいずれかから選択される、請求項２４２に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２４４】
反転ＤＨ生殖細胞系セグメントが、配列識別番号：３４６２−３４８８のいずれかから選択される、請求項２４２に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２４５】
ＤＨ生殖細胞系セグメント又は反転ＤＨ生殖細胞系セグメントが、ＶＨ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｄ又はＤ−Ｊ結合部で追加又は除去される１つ又はそれ以上のヌクレオチドを有する、請求項２３７−２４４のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２４６】
ＪＨ生殖細胞系セグメントが、１つ又はそれ以上のヌクレオチド修飾を含む、請求項２３７−２４５のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２４７】
修飾されたＪＨ生殖細胞系セグメントが、配列識別番号：３４５０−３４５５のいずれかにで示すヌクレオチド配列を有する、請求項２４６に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２４８】
ＶＨ鎖をコードする核酸分子が、配列識別番号：２０７０−２７５９又はその一部のいずれかから選択され、並びにＶＬをコードする核酸分子が、配列識別番号：１４１１−１４２２、１４２４−１４３９及び１４４１−１４７１又はその一部のいずれかから選択される、請求項２３７−２４７のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２４９】
ＶＨ鎖が、配列識別番号：２７６０−３４４９又はその一部のいずれかから選択されるアミノ酸配列を有し、並びにＶＬ鎖が、配列識別番号：１８２７−１８３８、１８４０−１８５５及び１８５７−１８８８又はその一部のいずれかから選択されるアミノ酸配列を有する、請求項２３７−２４８のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２５０】
ライブラリーの各メンバー抗体が、重鎖及び軽鎖の会合を可能にするのに十分な全て又は一部の定常領域を更に含む、請求項２３７−２４９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２５１】
ライブラリーの各メンバー抗体が、抗原結合部位を形成するのに十分な完全長抗体或いはフラグメント又はその部分から選択される、請求項２３７−２５０のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２５２】
フラグメント又はその部分が、Ｆａｂ、Ｆａｂ′、Ｆ（ａｂ’）２、単一鎖Ｆｖｓ（ｓｃＦｖ）、Ｆｖ、ｄｓＦｖ、二重特異性抗体、Ｆｄ及びＦｄ’フラグメント、Ｆａｂフラグメント、Ｆｄフラグメント、ｓｃＦｖフラグメント及びｓｃＦａｂフラグメントから選択される、請求項２５１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２５３】
ライブラリーの各メンバー抗体がＦａｂである、請求項２３７−２５２のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２５４】
大体の又は５０、１０２、１０３、１０４、２ｘ１０４、３ｘ１０４、４ｘ１０４、５ｘ１０４、６ｘ１０４、７ｘ１０４、８ｘ１０４、９ｘ１０４、１０５、１０６、１０７、１０８、１０９又はそれ以上の異なるメンバーを含む、請求項２３７−２５３のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２５５】
１０３、２ｘ１０３、３ｘ１０３、４ｘ１０３、５ｘ１０３、６ｘ１０３、７ｘ１０３、８ｘ１０３、９ｘ１０３、１０４、２ｘ１０４、３ｘ１０４、４ｘ１０４、５ｘ１０４、６ｘ１０４、７ｘ１０４、８ｘ１０４、９ｘ１０４又はそれ以上の異なるメンバーを含む、請求項２３７−２５４のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２５６】
抗体ライブラリーがアドレス可能である、請求項２３７−２５５のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２５７】
各ＶＨ鎖が、インフレームで連結される、ヒトＶＨ及びヒトＪＨ生殖細胞系セグメント又はその縮重コドン又はその修飾形態並びにＶＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント間のあらゆるヌクレオチド配列を含む核酸分子によってコードされ、並びに各アドレス内の核酸分子は同じで、他の全てのアドレスにおける核酸分子とは異なる、可変の重（ＶＨ）鎖をコードする複数のアドレス可能な核酸分子を含む、核酸分子ライブラリー。
【請求項２５８】
ＶＨ鎖をコードする核酸分子のＶＨ生殖細胞セグメント、ＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列、ＪＨ生殖細胞系セグメントは、ＶＨセグメントが、ＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列は５’で、それはＪＨセグメントへ５’であるよう、直接的又は間接的に連結される、請求項２５７に記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２５９】
ＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列及びＪＨ生殖細胞系セグメントが、Ｄ−Ｊ結合部でペプチドリンカーをコードするヌクレオチドによって間接的に連結される、請求項２５７又は請求項２５８に記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２６０】
ヌクレオチドがＳＹであるペプチドリンカーをコードする、請求項２５９に記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２６１】
ＶＨ生殖細胞系セグメントが、ＩＧＨＶ３−２３＊０１又はその縮重コドンである、請求項２５７−２６０のいずれかに記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２６２】
ＶＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント間のヌクレオチド配列が、ＤＨ生殖細胞系セグメント又はその縮重コドンであり、或いは反転ＤＨ生殖細胞系セグメントである、請求項２５７−２６１のいずれかに記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２６３】
ＤＨ生殖細胞系セグメントが、配列識別番号：２３９−２７２のいずれかから選択される、請求項２５７−２６２のいずれかに記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２６４】
反転ＤＨ生殖細は胞系セグメントが、配列識別番号：３４６２−３４８８のいずれかから選択される、請求項２５７−２６３のいずれかに記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２６５】
ＤＨ生殖細胞系セグメント又は反転ＤＨ生殖細胞系セグメントが、ＶＨ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｄ又はＤ−Ｊ結合部で追加又は除去される１つ又はそれ以上のヌクレオチドを有する、請求項２５７−２６４のいずれかに記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２６６】
ＪＨ生殖細胞系セグメントが、１つ又はそれ以上のヌクレオチド修飾体を含む、請求項２５７−２６５のいずれかに記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２６７】
修飾されたＪＨ生殖細胞系セグメントが、配列識別番号：３４５０−３４５５のいずれかで示されるヌクレオチド配列を有する、請求項２６６に記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２６８】
配列識別番号：２０７０−２７５９又はその一部のいずれかから選択されるＶＨ鎖をコードする複数の核酸分子を含む、請求項２５７−２６７のいずれかに記載の核酸分子ライブラリー。
【請求項２６９】
ライブラリーの各ベクターが、異なる核酸分子を含む、請求項２５７−２６８のいずれかに記載の核酸分子から成る、アドレス可能ベクターのライブラリー。
【請求項２７０】
ライブラリーの各細胞が、様々なベクターを含有し、請求項２６９に記載のベクターを含む、アドレス可能な細胞のライブラリー。
【請求項２７１】
ａ） ヒトＶＨ及びヒトＪＨ生殖細胞系セグメント又はその部分、その縮重コドン又はその修飾形態、並びにＶＨ鎖又はその部分をコードする核酸分子配列を生成するため、インフレームでＶＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント間のあらゆるヌクレオチド配列を組合せることと、
ｂ） ＶＬ鎖又はその部分をコードする核酸分子配列を生成するため、Ｖκ及びＪκヒト生殖細胞系セグメント又はその部分、その縮重コドン又はその修飾形態、或いはＶλ及びＪλ生殖細胞系セグメント又はその部分、その縮重コドン又はその修飾形態をインフレームで組合せることと、
段階ａ）及びｂ）において、ＶＨの各部分、ＶＨ及びＪＨ生殖細胞系セグメント間のあらゆるヌクレオチド配列、ＪＨ、Ｖκ、Ｊκ、Ｖλ又はＪλが、十分な抗原結合部位を形成するＶＨ又はＶＬ又はその部分を含む抗体又はその部分を産生するのに十分であり、並びに、
セグメントは、ＶＨ生殖細胞系セグメント、ＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列及びＶＨ鎖をコードする核酸分子のＪＨ生殖細胞系セグメントが、直接的又は間接的に連結されるよう直接的又は間接的に組合わされ、ＶＨセグメントは、ＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列へ５’で、それはＪＨセグメントへ５’であり、
ｃ） 複数の様々な核酸分子配列を生成するため、段階ａ）及びｂ）を数回繰り返すことと、
ｄ） 第一のライブラリーが、ＶＨ鎖又はその部分をコードする核酸分子を含み、及び第二のライブラリーが、ＶＬ鎖又はその部分をコードする核酸分子を含む、２つのアドレス可能なライブラリーを生成することと、
ｅ） 第一のライブラリー及び第二のライブラリーからの核酸分子をアドレス指定された細胞に導入し、各細胞が、細胞ライブラリーの他の全ての細胞からＶＨ及びＶＬの様々な組合せをコードする核酸分子を含む、アドレス指定された細胞のライブラリーを生成するため、これを数回繰り返すことと、並びに
ｆ） ライブラリーの各抗体又はその部分が、ライブラリーの他の全ての抗体又はその部分から抗原結合部位を形成するため、ＶＨ及びＶＬ鎖の様々な組合せ又はその十分な部分を含み、
複数の抗体又はその部分がアドレス指定され、並びに
各位置における抗体又はその部分が同じ抗体で、他のそれぞれの位置及びあらゆる位置の抗体とは異なり、抗体又はその部分の同定は、そのアドレスで知られる、複数の抗体又はその部分を産生する、各細胞の抗体又はその部分を発現する細胞を成長させることとを含む、ヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２７２】
ＶＨ及びＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列、並びに／又はＶＨ及びＪＨの間のヌクレオチド配列及びＪＨ生殖細胞系セグメントが、Ｖ−Ｄ及び／又はＤ−Ｊ結合部でペプチドリンカーをコードするヌクレオチドによって間接的に連結される、請求項２７１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２７３】
ＶＨ及びＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列、並びに／又はＶＨＪＨの間のヌクレオチド配列及びＪＨ生殖細胞系セグメントが、停止コドンを除去するために修飾される、請求項２７１又は請求項２７２に記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２７４】
ＶＨ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部の配列識別番号：１０−２３８から選択される、或いはその部分、その縮重コドン又はその修飾形態である、請求項２７１−２７３に記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２７５】
ＶＨ生殖細胞系セグメントが、ＩＧＨＶ３−２３＊０１又はその部分、その縮重コドンまたはその修飾形態である、請求項２７４に記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２７６】
ＶＨとＪＨの間のヌクレオチド配列が、ＤＨ生殖細胞系セグメント又はその縮重コドン或いは反転ＤＨ生殖細胞系セグメントである、請求項２７１−２７５のいずれかに記載のヒト組合せライブラリーを生成する方法。
【請求項２７７】
ＤＨ生殖細胞系セグメントが、配列識別番号：２３９−２７２又はその部分、その縮重コドン又はその修飾形態のいずれかから選択され、或いはその反転ＤＨ生殖細胞系セグメントである、請求項２７１−２７６のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２７８】
反転ＤＨ生殖細胞系セグメントは、配列識別番号：３４６２−３４８８のいずれかから選択される、請求項２７１−２７７のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２７９】
ＤＨ生殖細胞系セグメント又は反転ＤＨ生殖細胞系セグメントが、ＶＨ鎖のリーディングフレームを維持するため、Ｖ−Ｄ又はＤ−Ｊ結合部で追加又は除去される１つ又はそれ以上のヌクレオチドを有する、請求項２７１−２７８のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２８０】
ＪＨ生殖細胞系セグメントが、配列識別番号：２７３−２８５から選択される、或いはその部分、その縮重コドン又はその修飾形態である、請求項２７１−２７９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２８１】
ＪＨ生殖細胞系セグメントが、１つ又はそれ以上のヌクレオチド修飾体を含む、請求項２８０に記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２８２】
修飾されたＪＨ生殖細胞系セグメントが、配列識別番号：３４５０−３４５５のいずれかで示されるヌクレオチド配列を有する、請求項２８１に記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２８３】
Ｖλ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部の配列識別番号：３６５−４４１又はその部分から選択される、或いはその部分、その縮重コドン又はその修飾形態である、請求項２７１−２８２のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２８４】
Ｊλ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部の配列識別番号：４４２−４５１から選択される、或いはその部分、その縮重コドン又はその修飾形態である、請求項２７１−２８３のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２８５】
Ｖκ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部の配列識別番号：２８６−３５５及び８６８から選択される、或いはその部分、その縮重コドン又はその修飾形態である、請求項２７１−２８４のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２８６】
Ｊκ生殖細胞系セグメントが、全て又は一部の配列識別番号：３５６−３６４から選択される、或いはその部分、その縮重コドン又はその修飾形態である、請求項２７１−２８５のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２８７】
第一のライブラリーのＶＨ鎖又はその部分をコードする核酸分子が、発現ベクターで含有され、そこで各核酸分子は、別の発現ベクターで含有され、並びに、第二のライブラリーのＶＨ鎖又はその部分をコードする核酸分子が、発現ベクターで含有され、そこで核酸分子は、別の発現ベクターで含有される、請求項２７１−２８６のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２８８】
ベクターが、更に、重鎖及び軽鎖の会合を可能にするのに十分な全て又は一部の定常領域を含む、請求項２８７に記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２８９】
細胞が、原核細胞又は真核細胞である、請求項２７１−２８８のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２９０】
細胞が大腸菌細胞である、請求項２７１−２８９のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２９１】
アドレス指定された細胞が、空間アレイで配列される、請求項２７１−２９０のいずれかに記載のヒト組合せ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２９２】
空間アレイが、マルチウェルプレートであり、前記プレートの個々の位置が、アドレス指定された細胞のライブラリーで他の全ての細胞から様々な組合せのＶＨ及びＶＬをコードする核酸分子を含む細胞に対応する、請求項２９１に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２９３】
発現される抗体が、完全長の抗体、又は抗原結合部位を形成するのに十分なフラグメントまたはその部分である、請求項２７１−２９２のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２９４】
発現される抗体がＦａｂである、請求項３２７１−２９３のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２９５】
抗体又はその部分を更に精製する、請求項２７１−２９４のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２９６】
ライブラリーにおける精製された抗体又はその部分が、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％の純度である、請求項２９５に記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを生成する方法。
【請求項２９７】
請求項２７１−２９６のいずれかに記載の方法によって産生されるヒト組合せ抗体ライブラリー。
【請求項２９８】
ａ）請求項２３７−２５６又は請求項２９７のいずれかに記載のヒト組み合わせ抗体ライブラリーを提供することと、
ｂ）前記ライブラリーの抗体又はその部分を細胞又は標的タンパク質と接触することと、
ｃ）細胞又は標的タンパク質と抗体又はその部分の結合及び／或いは抗体又はその部分が細胞又は標的タンパク質の機能的活性を調節するかどうかを評価することと、並びに
ｄ）細胞又は標的タンパク質に結合する及び／或いは細胞又は標的タンパク質の活性を調節する抗体又はその部分を同定し、そこで同定された抗体又はその部分がＨＩＴであることとを含む、結合又は標的タンパク質に対する活性のヒト組み合わせ抗体ライブラリーをスクリーニングする方法。
【請求項２９９】
ヒト組み合わせ抗体ライブラリーが、アドレス可能なライブラリーで、ＨＩＴの同定がそのアドレスによって知られるよう、接触がアドレス可能なアレイで行われる、請求項２９８に記載の方法。
【請求項３００】
標的タンパク質が、膜結合性タンパク質、細胞表面受容体（ＣＳＲ）又はＣＳＲリガンドである、請求項２９８又は請求項２９９に記載の方法。
【請求項３０１】
膜結合性タンパク質又はＣＳＲが、サイトカイン受容体、受容体キナーゼ、受容体ホスファターゼ、細胞間相互作用に関与する受容体、及び細胞接着分子から選択される、請求項３００に記載の方法。
【請求項３０２】
標的タンパク質が、ＶＥＧＦＲ−１、ＶＥＧＦＲ−２、ＶＥＧＦＲ−３、癌細胞表皮増殖因子受容体（ＥＧＦＲ）、ＥｒｂＢ−２、ＥｒｂＢ−３、ＩＧＦ−Ｒ１、Ｃ−Ｍｅｔ、ＴＮＦ−Ｒ１、ＴＮＦ−Ｒ２、ＢＴＬＡ、ＨＶＥＭ、ＬＴ−βＲ、ＣＤ２０、ＣＤ３、ＣＤ２５、ＮＯＴＣＨ、ＤＬＬ４、Ｇ−ＣＳＦ−Ｒ、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ、ＥＰＯ−Ｒ、カドヘリン、インテグリン、ＣＤ５２及びＣＤ４４、ＶＥＧＦ−Ａ、ＶＥＧＦ−Ｂ、ＶＥＧＦ−Ｃ、ＶＥＧＦ−Ｄ、ＰＩＧＦ、ＥＧＦ、ＨＧＦ、ＴＮＦ−α、ＬＩＧＨＴ、リンフォトキシン（ＬＴ）、ＩｇＥ、Ｇ−ＣＳＦ、ＧＭ−ＣＳＦ及びＥＰＯから選択される、請求項２９８−３０１のいずれかに記載の方法。
【請求項３０３】
抗体又はその部分の標的タンパク質又は細胞への結合を評価することを含む、請求項２９８−３０２のいずれかに記載の方法。
【請求項３０４】
抗体又はその部分が、細胞又は標的タンパク質の機能的活性を調節するかどうか評価することを含む、請求項２９８−３０３に記載の方法。
【請求項３０５】
機能的活性が、細胞増殖、リンパ種のアポトーシス、走化性、癌細胞の浸潤、マトリゲル、内皮増殖、管形成及びシグナル伝達から選択される、請求項３０４に記載の方法。
【図１】
【図２Ａ】
【図２Ｂ】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【図１５】
【図１６】
【図１７】
【図１８】
【図１９】
【図２０】
【図２Ａ】
【図２Ｂ】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【図１５】
【図１６】
【図１７】
【図１８】
【図１９】
【図２０】
【公表番号】特表２０１２−５０８０１６（Ｐ２０１２−５０８０１６Ａ）
【公表日】平成２４年４月５日（２０１２．４．５）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１１−５３５６４９（Ｐ２０１１−５３５６４９）
【出願日】平成２１年１１月４日（２００９．１１．４）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００９／０６３２９９
【国際公開番号】ＷＯ２０１０／０５４００７
【国際公開日】平成２２年５月１４日（２０１０．５．１４）
【出願人】（５１１１１０７０６）ファブラス エルエルシー (3)
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２４年４月５日（２０１２．４．５）
【国際特許分類】
【出願日】平成２１年１１月４日（２００９．１１．４）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００９／０６３２９９
【国際公開番号】ＷＯ２０１０／０５４００７
【国際公開日】平成２２年５月１４日（２０１０．５．１４）
【出願人】（５１１１１０７０６）ファブラス エルエルシー (3)
【Ｆターム（参考）】
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