T7RNAポリメラーゼ融合蛋白質
【課題】T7RNAポリメラーゼと異種蛋白質を融合してなる融合蛋白質、該融合蛋白質を精製する方法、及び該融合蛋白質から異種蛋白質を製造する方法を提供する。
【解決手段】T7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、直接に、または1残基以上のアミノ酸を介して、異種蛋白質を融合したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質は、シバクロンブルー固定化樹脂を用いて簡便に精製でき、さらに、プロテアーゼを用いて位置特異的に加水分解し、所望の異種蛋白質を製造することができる。
【解決手段】T7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、直接に、または1残基以上のアミノ酸を介して、異種蛋白質を融合したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質は、シバクロンブルー固定化樹脂を用いて簡便に精製でき、さらに、プロテアーゼを用いて位置特異的に加水分解し、所望の異種蛋白質を製造することができる。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
本発明は、T7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、直接に、または1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを介して、異種蛋白質が融合したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質並びに当該T7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドに関する。また本発明は、当該ポリヌクレオチドを有し、かつ、それを発現して本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を生産することができるEscherichia属の細菌、並びに当該Escherichia属の細菌を使用する本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質の製造法に関する。さらに本発明は、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をプロテアーゼで加水分解することを特徴とする異種蛋白質の製造法に関する。
【背景技術】
【0002】
大腸菌(Escherichia coli)を用いた蛋白質生産において、宿主である大腸菌とは異種の生物等に由来する外来の蛋白質、いわゆる異種蛋白質を生産させた場合に、生産された異種蛋白質は菌体内に蓄積され封入体を形成することが多い。封入体を形成した異種蛋白質は、その存在状態故に生物学的あるいは生化学的に不活性であるため、活性型の蛋白質を得るためには、可溶化、再生の操作がさらに必要となる。
【0003】
これらの問題を解決するため、異種蛋白質に大腸菌菌体内で可溶性蛋白質として発現する蛋白質を融合させて発現する方法が知られている。異種蛋白質に融合させる蛋白質としては、T7ファージの10B配列のC末端部位からなるSolubility enhancement tag(SET)やGB1ドメイン、ユビキチン、Small ubiqutin−related modifer(SUMO)、チオレドキシン(TRX)、グルタチオン−S−トランスフェラーゼ(GST)、マルトース結合蛋白質(MBP)、N−utilization substance A(Nus A)を用いた融合発現(非特許文献1)やカルボキシル末端が欠損したシャペロニンを用いた融合発現(特許文献1)が知られている。
【0004】
バクテリオファージであるT7ファージに由来するRNAポリメラーゼであるT7RNAポリメラーゼを、異種蛋白質に融合させて発現させた例に関しては、T7RNAポリメラーゼを酵母内で機能させる目的で、酵母GAL4蛋白質をT7RNAポリメラーゼのアミノ末端に融合させた発現させた例が知られている(非特許文献2)。なおGAL4蛋白質自体は大腸菌菌体内でも機能を有する蛋白質として発現することが知られている。
【0005】
一方、これまでにT7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に脊椎動物由来のポリペプチドや、脊椎動物由来のポリペプチドを連結した融合蛋白質を可溶性の蛋白質として発現させた例はない。
【0006】
また、T7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に脊椎動物由来のポリペプチドや、脊椎動物由来のポリペプチドの1残基以上のアミノ酸を、他のアミノ酸に置換、及び/又は欠失、及び/又は付加したポリペプチドを連結した融合蛋白質を可溶性の蛋白質として発現させた例はない。
【0007】
またシバクロンブルー(CibacronBlue)を固定化した樹脂が、T7RNAポリメラーゼの精製に利用できることが知られている(非特許文献3)が、T7RNAポリメラーゼが融合した蛋白質の精製に利用した例はない。
【先行技術文献】
【特許文献】
【0008】
【特許文献1】特開2004−321141号公報
【特許文献2】特開2009−136153号公報
【非特許文献】
【0009】
【非特許文献1】加藤 淳ら,生物物理,Vol.48,185−189(2008)
【非特許文献2】Ostrander E.A.ら.Science,249,1261−1265(1990)
【非特許文献3】Das M.ら,Preparative Biochemistry and Biotechnology,28,339−348(1998)
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【0010】
本発明の目的は、宿主に対して異種の蛋白質を、可溶化や再生の操作を必要としない可溶性の蛋白質として発現させるための融合蛋白質として有用なT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質、該T7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を純度よく製造する方法、該T7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を位置特異的に加水分解して異種蛋白質を純度よく簡便に製造する方法を提供することにある。
【課題を解決するための手段】
【0011】
本発明者らは上記課題を解決するために鋭意検討した結果、T7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、場合によってはリンカーを介して異種蛋白質を連結したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質が、大腸菌の細胞質中に可溶性蛋白質として発現すること、またその融合蛋白質の性質が、融合蛋白質及び融合蛋白質から異種蛋白質を精製するときに有利であることを見出し、本発明を完成させた。
【0012】
すなわち本発明は、配列番号1で示したT7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、直接に、または1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを介して、異種蛋白質が融合したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質に関するものである。異種蛋白質は、当該蛋白質の全長を指すこともあれば、その一部である機能を有するポリペプチドを指すこともある。
【0013】
また、本発明は、配列番号1で示したT7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、直接に、または1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを介して、脊椎動物由来のポリペプチドが融合したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質、あるいは配列番号1で示したT7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、直接に、または1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを介して、脊椎動物由来のポリペプチドの1残基以上のアミノ酸を、他のアミノ酸に置換、及び/又は欠失、及び/又は付加したポリペプチドが融合したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質に関するものである。
【0014】
また、本発明は配列番号1で示したT7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、直接に、または1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを介して、配列番号2で示したヒトエリスロポエチンレセプターの1位から225位からなるポリペプチド、配列番号3で示したヒトエリスロポエチンの1位から166位からなるポリペプチド、配列番号4で示したヒトFcγRIの1位から274位からなるポリペプチド、あるいは配列番号5で示したヒト成長ホルモンレセプターの1位から238位からなるポリペプチドを融合したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質に関するものである。
【0015】
また、本発明は配列番号1で示したT7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、直接に、または1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを介して、配列番号2で示したヒトエリスロポエチンレセプターの1位から225位からなるポリペプチド、配列番号3で示したヒトエリスロポエチンの1位から166位からなるポリペプチド、配列番号4で示したヒトFcγRIの1位から274位からなるポリペプチド、あるいは配列番号5で示したヒト成長ホルモンレセプターの1位から238位からなるポリペプチドの、1残基以上のアミノ酸を、他のアミノ酸に置換、及び/又は欠失、及び/又は付加したポリペプチドを融合したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質に関するものである。
【0016】
また、本発明は、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドと、そのポリヌクレオチドを発現し、該融合蛋白質を生産するEscherichia属の細菌に関するものである。
【0017】
また、本発明は、本発明のEscherichia属の細菌を使用するT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質の製造法に関するものである。
【0018】
さらに、本発明はT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を1種類以上のプロテアーゼで加水分解することを特徴とする異種蛋白質の製造法に関するものである。
【0019】
また、本発明は、シバクロンブルー固定化樹脂を用いることを特徴とするT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質の製造法に関するものである。
【0020】
また、本発明は本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を加水分解して生じた異種蛋白質を、シバクロンブルー固定化樹脂を用いて分離することを特徴とする異種蛋白質の製造法に関するものであり、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をプロテアーゼで加水分解して生じた異種蛋白質を、シバクロンブルー固定化樹脂を用いて分離することを特徴とする異種蛋白質の製造法に関するものである。
【発明の効果】
【0021】
本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を用いれば、目的の異種蛋白質を、例えば、大腸菌を用いて、可溶性の融合蛋白質として製造することができる。本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質は、シバクロンブルー固定化樹脂を用いて精製することも可能である。特に、目的の異種蛋白質を、例えばプロテアーゼによって位置特異的な加水分解が可能なリンカーを介してT7RNAポリメラーゼに連結した本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質は、所望の位置でT7RNAポリメラーゼを切除することにより、目的の異種蛋白質を効率よく製造することができる。
【図面の簡単な説明】
【0022】
【図1】T7RNAポリメラーゼ、ヒトエリスロポエチンレセプター(hEPOR)、実施例1、2及び3のEPObpf40、実施例4及び5のEPObpf40H、実施例12のEPObpf50、実施例6、7、8及び9のEPObpf50H、及び、実施例13及び14のEPObpf60Hの一次構造の模式図
【図2】T7RNAポリメラーゼ、ヒトエリスロポエチンレセプター(hEPOR)、 実施例1、4及び6のEPObpf2H、ヒトエリスロポエチン(hEPO)、実施例16のEPOf2の一次構造の模式図
【図3】実施例1で調製したプラスミドの模式図
【図4】実施例3のEPObpf40のSDS−PAGEの結果を示す図
【図5】実施例4で調製したプラスミドの模式図
【図6】実施例5のEPObpf40HのSDS−PAGEの結果を示す図
【図7】実施例6で調製したプラスミドの模式図
【図8】実施例7のEPObpf50HのSDS−PAGEの結果を示す図
【図9】実施例10のEPObpHのSDS−PAGEの結果を示す図
【図10】実施例10のEPObpHのウエスタンブロッティングの結果を示す図
【図11】実施例12で調製したプラスミドの模式図
【図12】実施例13で調製したプラスミドの模式図
【図13】実施例14のEPObpf60HのSDS−PAGEの結果を示す図
【図14】T7RNAポリメラーゼ、ヒトエリスロポエチン(hEPO)、実施例16、17及び18のEPOf60の一次構造の模式図
【図15】実施例16で調製したプラスミドの模式図
【図16】実施例17のEPOf60のSDS−PAGEの結果を示す図
【図17】実施例18のEPOf60のウエスタンブロッティングの結果を示す図
【図18】実施例19のT7RNAポリメラーゼ、FcγRI及びFcBPf51Hの一次構造の模式図
【図19】実施例19で調製したプラスミドの模式図
【図20】実施例20のFcBPf51HのSDS−PAGEの結果を示す図
【図21】実施例21のエンテロキナーゼを用いて加水分解したFcBPf51Hのウエスタンブロッティングの結果を示す図
【図22】実施例21のエンテロキナーゼを用いて加水分解したFcBPf51Hのエンザイムイムノアッセイの結果を示す図
【図23】実施例22のT7RNAポリメラーゼ、hGHR及びhGHbpf51Hの一次構造の模式図
【図24】実施例22で調製したプラスミドの模式図
【図25】実施例23のhGHbpf51Hのエンザイムイムノアッセイの結果を示す図
【発明を実施するための形態】
【0023】
本発明に関わる配列番号1に示したT7RNAポリメラーゼと直接、あるいは、1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを介して融合する異種蛋白質は、大腸菌(Escherichia coli)に対して異種の生物等に由来する外来の蛋白質を挙げることができ、具体的には、脊椎動物である哺乳類、鳥類、爬虫類、両性類、魚類に由来するポリペプチドを例示することができる。
【0024】
さらに具体的には、異種蛋白質としては、成長ホルモン、エリスロポエチン、インターロイキン−2(IL−2)、インターロイキン−3(IL−3)、インターロイキン−4(IL−4)、インターロイキン−5(IL−5)、インターロイキン−6(IL−6)、インターロイキン−7(IL−7)、インターロイキン−9(IL−9)、インターロイキン−10(IL−10)、インターロイキン−11(IL−11)、インターロイキン−12(IL−12)のサブユニットp35、インターロイキン−13(IL−13)、インターロイキン−15(IL−15)、顆粒球コロニー刺激因子(G−CSF)、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)、毛様体神経栄養因子(CNTF)、カルジオトロフィン−1(CT−1)、白血球阻害因子(LIF)、オンコスタチンM(OSM)、インターフェロンα(IFNα)、インターフェロンβ(IFNβ)、インターフェロンγ(IFNγ)、腫瘍壊死因子α(TNFα)、腫瘍壊死因子β(TNFβ)、レプチン、プロラクチンなどのポリペプチド、あるいは、それらのポリペプチドの各レセプターの細胞外ドメインなどの、脊椎動物に由来するポリペプチドが例示できる。
【0025】
また、FcγRI(CD64)、FcγRIIa(CD32A)、FcγRIIb(CD32B)、FcγRIIIa(CD16A)、FcγRIIIb(CD16B)、FcεRI、FcεRII(CD23)、FcαRI(CD89)、Fcα/μR、FcRn、ポリメリックIgレセプターなどの抗体レセプターの細胞外ドメイン、細胞接着分子(カドヘリン、インテグリン、セレクチンなど)の細胞外ドメイン、抗体のH鎖やL鎖などの、脊椎動物に由来するポリペプチドが例示できる。また脊椎動物に由来する、酵素、オリゴマー酵素の構成要素であるポリペプチド、酵素阻害蛋白質、膜結合型酵素の可溶性ドメインなどのポリペプチドが例示できる。
【0026】
また本発明で用いる異種蛋白質は、例えば上記のような、脊椎動物に由来するポリペプチドに加えて、当該ポリペプチドに対して以下の(ア)から(ウ)から選択される一以上の変異を加えたものであって、当該異種蛋白質の活性、例えば酵素活性や結合活性などを有するものであっても良い。
(ア)上記ポリペプチドを構成するアミノ酸残基の配列中の一残基以上のアミノ酸を欠失したもの
(イ)上記ポリペプチドを構成するアミノ酸残基の配列中の一残基以上のアミノ酸を他のアミノ酸に置換したもの
(ウ)上記ポリペプチドを構成するアミノ酸残基の配列について、一残基以上のアミノ酸を付加したもの。
【0027】
異種蛋白質のカルボキシル末端には、例えばポリヒスチジン、S−ペプチド、あるいはc−mycペプチドなどの付加配列を連結してもよい。
【0028】
異種蛋白質をコードしたポリヌクレオチドは、公知の方法により調製できる。例えば目的の異種蛋白質をコードしたポリヌクレオチドは、公知の情報を利用してオリゴヌクレオチドからなるプライマーセットを作製し、目的の異種蛋白質をコードしたポリヌクレオチドを含んだ、市販のcDNAやcDNAライブラリー、あるいは、公知の方法で調製したcDNAを鋳型としてポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行い、目的のポリヌクレオチドを増幅して調製すればよい。
【0029】
PCRによるポリヌクレオチドの増幅反応は、例えば、PrimeSTAR HS DNA Polymerase(商品名、タカラバイオ社製)を利用することができ、付属のプロトコールに従って実験的に、目的のポリヌクレオチドが増幅する条件を探せばよい。例えば付属の緩衝液を用いた反応溶液中で、例えば、0.01U/μL PrimeSTAR HS DNA Polymerase、0.2mM dNTP、反応に使用するプライマーの濃度は、最大0.3μM、鋳型となるプラスミドDNA0.2〜20pg/mLで反応を検討すればよい。反応の温度と時間は、例えば、98℃で10秒間、55℃で5秒間、ついで72℃で、増幅したいDNAの塩基対の数に0.06を乗じた秒数の時間を、1サイクルとして、25サイクルから30サイクルの反応をおこなえばよい。また反応サイクルにおいて55℃で5秒間の設定を、56℃から72℃の間のいずれかの温度に設定して、増幅したいDNAが得られる温度を実験的に定めてもよい。
【0030】
PCRによるポリヌクレオチドの増幅反応は公知の方法に基づいて行えばよく、上述の方法に限定されない。
【0031】
また上述の調製方法で調製したポリヌクレオチドを鋳型に、アミノ酸の置換、及び/又は欠失、及び/又は付加するように設計したプライマーセットを用いてPCRで増幅を行なう、またはエラープローンPCRにて増幅を行なうことで、1残基以上のアミノ酸の置換、及び/又は欠失、及び/又は付加された、異種蛋白質をコードしたポリヌクレオチドを調製することができる。
【0032】
PCRで増幅した目的のDNAは、そのDNAを含んだPCR反応液を、例えば、アガロース電気泳動したのち、そのゲルを臭化エチジウムで染色し、例えば波長302nmあるいは波長312nmの紫外線を照射して目的のDNAを検出して、目的のDNAを含んだ部分のゲルを切り出し、そこから、DNAを精製すればよい。DNAの精製は、市販のキットを利用して精製すればよく、例えば、MERmaid Kit(商品名、Qbiogene社)やDNA Purification Kit,15,UltraClean(商品名、MO Bio Laboratories社)を精製したいDNAの長さに応じて利用すればよい。DNAの検出方法や精製の方法はこれらに限定されるものではない。
【0033】
本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を遺伝子工学的に製造するために用いるポリヌクレオチドは、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドであればよく、当業者であれば公知の方法により調製することができる。
【0034】
ポリヌクレオチドの調製法の一例としてはPCRを利用した方法がある。例えばT7ファージからT7ファージDNAを調製して、それを鋳型に用いて、適当なオリゴヌクレオチドからなるフォワードプライマーとリバースプライマーでPCRを行ってポリヌクレオチドを得ることができる。例えばT7ファージからT7ファージDNAを調製して、それを鋳型に用いて、適当なオリゴヌクレオチドからなるフォワードプライマーとリバースプライマーでPCRを行って所望のポリヌクレオチドを得ることができる。PCRに用いるフォワードプライマーとリバースプライマーは、例えばGenBank accession No.NP_041960に登録されているT7RNAポリメラーゼの塩基配列を参考にして作製すればよい。
【0035】
次に、例えば、下記の(A)から(F)をひとつの反応溶液中にて反応させるPCRを行うことで、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドを調製することができる。
【0036】
すなわち、PCRで増幅して得たT7RNAポリメラーゼをコードした塩基配列からなるポリヌクレオチドとその相補鎖からなる二本鎖ポリヌクレオチド(A)、連結させようとする異種蛋白質をコードした塩基からなるポリヌクレオチドとその相補鎖からなる二本鎖ポリヌクレオチド(B)、T7RNAポリメラーゼの1位メチオニンから数アミノ酸をコードしたオリゴヌクレオチドのフォワードプライマー(C)、T7RNAポリメラーゼの883位アラニンから数残基上流までのアミノ酸と、例えば、それに連結させようとする異種蛋白質のアミノ末端から数残基下流までの数アミノ酸の両者に跨る部分をコードしたオリゴヌクレオチドに相補的なオリゴヌクレオチドのリバースプライマー(D)、5’端側が(D)の5’端側と相補的な配列であり、その配列がコードした異種蛋白質のアミノ末端部分に続く配列のアミノ酸をコードしたオリゴヌクレオチド、すなわち、(D)と(B)の相補鎖側の、両者に跨る部分をコードしたオリゴヌクレオチドのフォワードプライマー(E)及び、T7RNAポリメラーゼと連結させようとする異種蛋白質の、例えば、カルボキシル末端を含んだカルボキシル末端側の数アミノ酸をコードしたオリゴヌクレオチドに相補的なオリゴヌクレオチドのリバースプライマー(F)をひとつの反応溶液中にて反応させるPCRを行うことで、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドを調製することができる。
【0037】
またT7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを介して、異種蛋白質が融合した本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドは、先述の(D)のプライマーの代わりに、T7RNAポリメラーゼに由来するカルボキシル末端と異種蛋白質のアミノ末端をコードしたポリヌクレオチドの間に1残基以上のアミノ酸をコードしたポリヌクレオチドに相補的なオリゴヌクレオチドのリバースプライマー(G)を用いれば調製することができる。
【0038】
またT7RNAポリメラーゼと連結させようとする異種蛋白質のカルボキシル末端に付加配列を有する本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドは、先述の(F)のプライマーの代わりに、融合させる異種蛋白質のカルボキシル末端を含むカルボキシル末端側の数アミノ酸と、そのカルボキシル末端に付加させる配列をコードしたオリゴヌクレオチドに相補的なオリゴヌクレオチド(H)を用いれば調製することができる。
【0039】
また例えば、(A)、(B)、(C)、(E)、(G)および(H)をひとつの反応溶液中にて反応させるPCRを行うことで、T7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを介して、カルボキシル末端に付加配列を有する異種蛋白質が融合した本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドを調製することができる。
【0040】
また本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドの調製には、例えば特許文献2に記載のT7RNAポリメラーゼ(GenBank accession No.NP_041960)をコードした、プラスミドpTrc99A−T7RPやpCDF2−T7RPを調製して、T7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドを作製するためのPCRの鋳型として利用してもよく、さらには本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドをコードするプラスミドの作製に用いてもよい。
【0041】
またT7RNAポリメラーゼと異種蛋白質の間には、場合によっては1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを挿入してもよい。「1残基以上のアミノ酸からなるリンカー」は、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を可溶性で発現できるリンカーであれば何でもよく、好ましくは1〜50のアミノ酸からなるリンカーを指し、さらに好ましくは、1〜20のアミノ酸から成るリンカーを指す。さらに好ましくは、1〜10のアミノ酸からなるリンカー、又は1若しくは数残基のアミノ酸からなるリンカーを指す。
【0042】
該リンカーには、例えばAsp−Pro配列及び/又はAsn−Gly配列を含んだアミノ酸配列を有するリンカーを用いてもよい。
【0043】
Asp−Pro配列は例えば70% ギ酸水溶液(pH2.5)で、アスパラギン酸(Asp)とプロリン(Pro)の間の結合が加水分解されることが知られている。またAsn−Gly配列は、例えば2M ヒドロキシルアミン水溶液(pH9)で、アスパラギン(Asn)とグリシン(Gly)の間の結合が加水分解されることが知られている。
【0044】
異種蛋白質の分子内にAsp−Pro配列やAsn−Gly配列がある場合には、その箇所のアミノ酸を予め置換しておいてもよい。異種蛋白質の分子内にあるAsp−Pro配列のアスパラギン酸(Asp)は、例えばグルタミン酸(Glu)にアミノ酸置換すればよい。また異種蛋白質の分子内にあるAsn−Gly配列のアスパラギン(Asn)は、例えばグルタミン(Gln)、また例えばアスパラギン酸(Asp)に、アミノ酸置換すればよい。
【0045】
また、本発明に用いるリンカーには、例えば1種類以上のプロテアーゼの基質となるアミノ酸配列(以下、基質アミノ酸配列と称する。)からなるペプチドを用いてもよい。特に、加水分解の位置特異性が高いプロテアーゼは、特定のアミノ酸配列を基質として認識し、特定のペプチド結合を選択的に加水分解することができることから、このようなプロテアーゼの基質アミノ酸配列からなるリンカーを有する本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質は、対応するプロテアーゼで加水分解すれば、T7RNAポリメラーゼと異種蛋白質を所望の位置で切り離すことができる。
【0046】
加水分解の位置特異性が高いプロテアーゼとその基質アミノ酸配列としては、例えば、エンテロキナーゼは4個の連続したアスパラギン酸残基(Asp)の後にリジン残基(Lys)がつながったAsp−Asp−Asp−Asp−Lysのアミノ酸配列を、トロンビンはロイシン残基−バリン残基−プロリン残基−アルギニン残基(Lue−Val−Pro−Arg)のアミノ酸配列を、活性化血液凝固X因子はイソロイシン残基−グルタミン酸残基−グリシン残基−アルギニン残基(Ile−Glu−Gly−Arg)のアミノ酸配列を、ウロキナーゼはプロリン残基−グリシン残基−アルギニン残基(Pro−Gly−Arg)のアミノ酸配列を基質として認識し、それぞれの基質アミノ酸配列のカルボキシル末端側に結合したアミノ酸との間のペプチド結合を選択的に加水分解する。したがってこれらの基質アミノ酸配列のカルボキシル末端側に異種蛋白質のアミノ末端を結合させた場合には、対応するプロテアーゼで加水分解することにより、容易に異種蛋白質を切り出すことができる。
【0047】
また例えば、HRV 3Cプロテアーゼは、ロイシン残基−グルタミン酸残基−バリン残基−ロイシン残基−フェニルアラニン残基−グルタミン残基−グリシン残基−プロリン残基(Leu−Glu−Val−Leu−Phe−Gln−Gly−Pro)からなる基質アミノ酸配列を認識し、その配列のGlnとGlyの間のペプチド結合を位置特異的に加水分解する。したがって、例えばLeu−Glu−Val−Leu−Phe−Gln−Gly−Proからなる基質アミノ酸配列のカルボキシル末端側に異種蛋白質のアミノ末端を結合させた場合には、HRV 3Cプロテアーゼで加水分解することにより、アミノ末端にGly−Proが付加した異種蛋白質が得られるが、本発明はこれらの異種蛋白質も包含するものである。
【0048】
加水分解の位置特異性が高いプロテアーゼとその基質アミノ酸配列の組み合わせは、特にこれらに限定されるものではない。
【0049】
さらに、本発明に用いるリンカーとして、上述の加水分解の位置特異性が高いプロテアーゼの基質アミノ酸配列のアミノ末端側及び/又はカルボキシル末端側に1残基以上のアミノ酸が付加されたアミノ酸配列からなるリンカーを用いてもよく、基質アミノ酸配列の少なくともカルボキシル末端側に1残基以上のアミノ酸が付加されたアミノ酸配列からなるリンカーを用いた場合には、対応するプロテアーゼで加水分解すると、少なくとも1残基以上のアミノ酸がアミノ末端に付加した異種蛋白質が得られるが、本発明はこれらの異種蛋白質も包含するものである。
【0050】
また、複数種類のプロテアーゼの基質となるアミノ酸配列からなるリンカーを用いる場合には、異種蛋白質のアミノ末端に最も近い基質アミノ酸配列を対応するプロテアーゼで加水分解すればよく、その結果、1残基以上のアミノ酸がアミノ末端に付加した異種蛋白質が得られる場合であっても、本発明はこれらの異種蛋白質を包含するものである。
【0051】
基質アミノ酸配列のカルボキシル末端側にプロリンがあると加水分解が起こらない場合があり、使用するプロテアーゼの性質とその基質配列については、公知の文献等で調べてから用いることが望ましい。
【0052】
プロテアーゼを用いた加水分解においては、使用するプロテアーゼ、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質およびそれが加水分解されて生じる異種蛋白質が不溶化を起こさずに、該プロテアーゼが反応するように反応条件等を定めればよい。例えば、反応のpHは5から8、反応温度は4℃から40℃から適宜選ばれた条件で行えばよく、本発明はこれらに限定されない。例えばアスパルティックプロテアーゼ、セリンプロテアーゼ、メタロプロテアーゼ、チオールプロテアーゼ、あるいはそれらのプロテアーゼに分類されるプロテアーゼであり耐熱性を有するプロテアーゼなどを用いる場合にはそれに応じた反応条件を探して用いればよい。
【0053】
また反応溶液への添加物の添加については、塩の種類(例えばナトリウム塩、カリウム塩、マグネシウム塩あるいはカルシウム塩など)とその濃度(例えば0Mから1M)、界面活性剤の種類(例えば、Tween20(商品名)、Tween80(商品名)、Triton X−100(商品名)、n−オクチル−β−D−グルコシド、n−オクチル−β−D−マンノシド、n−デシル−β−D−マンノシドなど)とその濃度(例えば0%から1%)、還元剤の種類(例えばジチオスレイトール、メルカプトエタノール、グルタチオンなど)とその濃度(0mMから10mM)、変性剤の種類(例えば尿素、塩酸グアニジンなど)とその濃度(0Mから2M)など、あるいはそれらの組み合わせを、位置特異的な加水分解に使用するプロテアーゼ、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質およびそれが位置特異的な加水分解されて生じる異種蛋白質が不溶化を起こさずに該プロテアーゼが反応するように定めればよい。
【0054】
さらに具体的には、特異性が高いプロテアーゼとして、例えば、エンテロキナーゼを用いる場合には、Asp−Asp−Asp−Asp−Lysのアミノ酸配列からなるリンカーを有する、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質(すなわちエンテロキナーゼの基質となる本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質)を、例えば、0.02M〜0.1Mの濃度のトリス塩酸緩衝液(pH8.0)の溶液中で反応させればよい。また反応を行う溶液には、0.001M〜0.02M塩化カルシウム、及び/又は、1M以下の濃度の塩化ナトリウム、より好ましくは0.3M以下の濃度の塩化ナトリウム、及び/又は、界面活性剤、例えばTween20(商品名)を0.01%〜0.2%濃度加えることもできる。
【0055】
反応温度は4℃〜40℃から適宜選ばれた温度で、反応時間は数分間〜数日間から適宜選ばれた時間で、エンテロキナーゼの基質となる本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質の蛋白質濃度とエンテロキナーゼの蛋白質濃度の比は、例えば、1:10から1:10000で行えばよい。
【0056】
さらに、例えばニッケルキレート樹脂にアフィニティーがあるポリヒスチジン、S−プロテインにアフィニティーがあるS−ペプチド、あるいはc−myc抗体にアフィニティーがあるc−mycペプチドなどのアフィニティーリガンドをリンカーにしてもよい。
【0057】
T7RNAポリメラーゼと異種蛋白質を連結するリンカーは、上記のような複数種類のリンカーを組み合わせて用いてもよい。
【0058】
本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドは、通常の遺伝子工学の分野で使用される相応のプラスミドを用いれば種々の宿主で発現することが可能であるが、取扱い易さ、培養の容易性、高密度培養の可否、更には遺伝子操作における宿主/ベクター系が整備されている細菌、中でもエシェリヒア(Escherichia)属細菌である大腸菌(Escherichia coli)が好ましい。
【0059】
本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を発現するためのプラスミドは、例えばpTrc99a(GenBank Accession No.U13872)、pSTV28(商品名、(株)タカラバイオ社製)、pCDF−1b、pRSF−1b(以上は、商品名、メルク(株)社製)等のプラスミドを例示できる。
【0060】
本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を発現するためのプラスミドで形質転換させる大腸菌としては、E.coli JM109、E.coli HB101、E.coli BLR(DE3)などの菌株が例示できるが、本発明はこれらに限定されない。また本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を発現するためのプラスミドで形質転換する前の大腸菌が薬剤耐性を有する大腸菌である場合には、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を発現するためのプラスミド上の薬剤耐性マーカー遺伝子は、宿主となる大腸菌の薬剤耐性とは異なるものを選択すればよい。またT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質の発現にT7プロモーターを利用したプラスミドを使用する場合には、例えば、E.coli BLR(DE3)のようにT7RNAポリメラーゼの遺伝子をもち、それを発現する大腸菌を宿主にすればよい。
【0061】
形質転換した大腸菌はプラスミドにコードされている薬剤耐性マーカー遺伝子に対応する薬剤を加えた寒天培地で培養して選別すればよい。
【0062】
本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドを組み込んだ発現用プラスミドで形質転換した大腸菌は、宿主に用いた大腸菌を培養するための公知の培地、例えばLB培地や2xYT培地に、T7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドを組み込んだ発現用プラスミド上の薬剤マーカー遺伝子に対応する薬剤を添加して培養すればよい。培養温度は15℃から37℃で実験的に定めればよい。本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドを組み込んだ発現用プラスミドで形質転換した大腸菌に、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を可溶性の蛋白質として発現させるためには、15℃〜37℃から適宜選ばれた温度、好ましくは25℃〜30℃から適宜選ばれた温度で培養を行うとよい。
【0063】
本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質は、それをコードしたポリヌクレオチドを組み込んだ発現用プラスミドで形質転換した大腸菌を適切に培養して、増殖させ、必要に応じて適当な誘導剤を培地に加えて遺伝子発現を誘導しながら更に培養した後、その菌を集菌して凍結融解、リゾチーム消化処理、超音波処理あるいはそれらの組み合わせにより、菌を破砕すれば、可溶性画分に得ることができる。
【0064】
可溶性画分に含まれる本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質は、イオン交換クロマトグラフィーやゲルろ過クロマトグラフィー用いて精製することができる。
【0065】
また例えば、S−ペプチドタグを付加したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質であればS−プロテインを固定化した担体、例えば、S−プロテインアガロース(商品名、メルク社製)を用いて精製できる。
【0066】
またポリヒスチジンからなるいわゆるヒスチジンタグが付加したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質の場合には、ニッケルイオンやコバルトイオンなどの金属イオンをキレートした樹脂、例えばHis・Bind Resin(商品名、メルク社製)、Chelating Sepharose Fast Flow(商品名、GEヘルスケア バイオサイエンス社製)などを用いて精製することができる。
【0067】
また本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質は、シバクロンブルー(Cibacron Blue)をリガンドとして固定化した樹脂(シバクロンブルー固定化樹脂と称する)に吸着させることができる。シバクロンブルーには、Cibacron Blue F3G−A[12236−82−7]やCibacron Blue 3G−A[84116−13−2]がある。
【0068】
本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質のシバクロンブルー固定化樹脂への吸着は、ポリヌクレオチドの共存下では妨害されることから、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質の溶液にポリヌクレオチドが混在する場合には予めポリヌクレオチドを除いておくことが望ましい。
【0069】
例えばポリヌクレオチドを含んでいる本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質溶液のポリヌクレオチドは、塩類の共存下でポリエチレンイミンを添加することで沈殿させることができる。このとき加える塩類は、ポリエチレンイミンへのT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質の吸着、及びポリエチレンイミンとの共沈を防ぐことができればよい。加える塩類は、例えば塩化ナトリウム、塩化カリウムあるいは硫安が例示でき、使用する濃度、及び、使用するポリエチレンイミンの濃度は、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質が不溶化しない条件を実験して定めればよい。例えば塩濃度0.1Mから0.5M、ポリエチレンイミン濃度0.1%から1%で検討すればよい。
【0070】
例えばT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を含んだ大腸菌破砕液で、菌密度 O.D.600が約36の菌懸濁液から調製した破砕液の場合、0.2Mの硫安存在下でポリエチレンイミンを濃度1mg/mLになるようを加えて、氷冷下で、30分間から60分間インキュベーションしたのちに、遠心分離して沈殿を除けばよい。
【0071】
除核酸の方法はこれに限定されず、公知のいかなる方法を利用してもよい。
【0072】
本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を吸着するシバクロンブルー固定化樹脂としてはTOYOPEARL AF−Blue HC−650M(商品名、東ソ−社)やBlue Sepharose 6 Fast Flow(商品名、GEヘルスケア社)が例示できる。
【0073】
本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質で、T7RNAポリメラーゼと異種蛋白質との間に位置特異的な加水分解が可能な配列、例えば、プロテアーゼの基質アミノ配列を有する場合には、対応するプロテアーゼで加水分解したのちに、シバクロンブルー固定化樹脂を用いて精製を行えばよい。T7RNAポリメラーゼを含んだポリペプチドはシバクロンブルー固定化樹脂に吸着するため、この樹脂に吸着しない異種蛋白質を、T7RNAポリメラーゼを含んだポリペプチドや、未消化の融合蛋白質と分離することができる。
【0074】
例えばエンテロキナーゼの基質となるアミノ酸配列である、Asp−Asp−Asp−Asp−Lys配列をリンカーにもつ本発明の融合蛋白質の場合には、その融合蛋白質を、エンテロキナーゼを用いて、カルボキシル末端側にAsp−Asp−Asp−Asp−Lys配列を有するT7RNAポリメラーゼと、異種蛋白質とに加水分解したのちに、例えば、TOYOPEARL AF−Blue HC−650M(商品名、東ソ−社)を用いて精製を行えばよい。このとき、T7RNAポリメラーゼを含んだポリペプチドはTOYOPEARL AF−Blue HC−650Mに吸着する。異種蛋白質が樹脂に吸着した場合であっても、0Mから2M塩化ナトリウムの塩濃度勾配で溶出を行って、カルボキシル末端側にAsp−Asp−Asp−Asp−Lys配列を有するT7RNAポリメラーゼとの分離を検討して、分離可能であれば精製に採用すればよい。
【0075】
また、例えばAsp−Asp−Asp−Asp−Lys配列をリンカーにもち、異種蛋白質のカルボキシル末端にポリヒスチジンタグを付加した本発明の融合蛋白質であれば、エンテロキナーゼを用いて加水分解したのち、シバクロンブルー固定化樹脂で精製し、さらに、例えばニッケルキレート樹脂を用いた精製を行えば、カルボキシル末端にポリヒスチジンタグが付加した異種蛋白質を精製することができる。
【0076】
また必要があればリンカーの加水分解に用いたプロテアーゼに結合する、プロテアーゼインヒビターあるいは抗体を、固定化した樹脂を利用して、使用したプロテアーゼを除去してもよい。
【0077】
また融合した異種蛋白質に対する抗体やアフィニティーリガンドを固定化した樹脂があればそれを利用して異種蛋白質を精製してもよい。
また上記の精製方法を組み合わせて行ってもよい。
【0078】
以下に本発明を更に詳細に説明するために実施例を示すが、これら実施例は本発明の一例を示すものであり、本発明はこれらの実施例に限定されるものではない。
【実施例】
【0079】
実施例1 プラスミドpCDF20−EPObpf40の作製
T7RNAポリメラーゼ(配列番号1)のカルボキシル末端に、ヒトエリスロポエチンレセプター(配列番号2)の1位から225位までからなるポリペプチドを連結した融合蛋白質(EPObpf40、配列番号7、図1参照)をコードしたポリヌクレオチド(配列番号8)をコードした、プラスミドpCDF20−EPObpf40(図3)を作製した。
【0080】
まず特許文献2に記載のプラスミドpCDF2−T7RPを制限酵素XbaIで消化して得た5.9kbpの直鎖DNAを、DNA Blunting Kit(商品名、タカラバイオ社製)を用いてDNAの末端を平滑化したのち、DNAリガーゼを用いてライゲーションして環化して、制限酵素XbaIサイトを含まない、5.9kbpのプラスミドpCDF20−T7RPを作製した。そのプラスミドを鋳型にして、配列番号11と配列番号12のプライマーをプライマーセットにしてPCRを行い、0.1kbpのDNA(DNA−1と称する)を得た。
【0081】
プラスミドpCDF20−T7RPを制限酵素BlnIで消化後、ウシ小腸アルカリホスファターゼで脱リン酸化処理して得られた直鎖状DNAを、さらに制限酵素MfeIで消化して、5.8kbpのDNA(DNA−2と称する)を得た。一方、ヒトエリスロポエチンレセプターcDNAをコードしたプラスミド(OriGene社製、品番SC125440)を鋳型にして、配列番号13と配列番号14のプライマーセットを用いてPCRを行い、0.7kbpのDNAを合成し、そのDNAを制限酵素MfeIとXbaIで二重消化して得た0.7kbpのDNA(DNA−3と称する)を得た。
【0082】
得られたDNA−2とDNA−3を、DNAリガーゼを用いてライゲーションして環化させ、プラスミドpCDF20−EPObpf2Hを調製した。
【0083】
プラスミドpCDF20−EPObpf2Hは、T7RNAポリメラーゼの1位メチオニンから859位アスパラギン酸までのアミノ酸配列に続き、Asp−Asp−Asp−Lysの4残基を介して、配列番号2に示したヒトエリスロポエチンレセプターの1位アラニンから225位アスパラギン酸までと、それに続けて6個のヒスチジンを連結した融合蛋白質(EPObpf2H、配列番号9、図2参照)をコードしたポリヌクレオチド(配列番号10)をコードしたプラスミドである。
【0084】
そのpCDF2DF20−EPObpf2HとDNA−1(0.1kbp)のセットを鋳型にして、配列番号11と配列番号13のプライマーをプライマーセットにしてPCRを行い、0.8kbpのDNAを得た。そのDNAを制限酵素MfeI、ついで制限酵素XbaIで消化して0.8kbpのDNA(DNA−4と称する)を得た。
【0085】
そのDNA−4を、プラスミドpCDF20−T7RPを制限酵素BlnI消化後、ウシ小腸アルカリホスファターゼで脱リン酸化処理して得られた直鎖状DNAを、さらに制限酵素MfeIで消化して得た5.8kbpのDNA(DNA−5と称する)と、ライゲーションして環化させ、プラスミドを調製した。
【0086】
そのプラスミドにより大腸菌HB101を形質転換し、50μg/mL カルベニシリンナトリウム、5g/L 酵母エキス、10g/L トリプトン及び10g/L 塩化ナトリウムを含む20g/L 寒天の固体培地(LB/Carb寒天培地と称する)で培養して、目的のプラスミドを有する大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf40を得た。
【0087】
実施例2 融合蛋白質EPObpf40の調製
大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf40を、50mg/L カルベニシリンナトリウム、10g/L 酵母エキス、16g/L トリプトン、5g/L 塩化ナトリウムを含む培地(2xYT/Carb培地と称する)に植菌して25℃で16時間培養して、菌密度(O.D.600)が6.8の培養液、0.12Lを得た。
【0088】
その培養液から大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf40を、遠心分離して集菌したのち、0.001M エチレンジアミン四酢酸(EDTA)を含む0.05Mトリス塩酸緩衝液(pH8.0)に懸濁したのち、遠心分離して菌を洗浄後、菌密度(O.D.600)の値がおよそ36になるように、0.1mg/mL 卵白リゾチーム、0.0001M 4−(アミノエチル)ベンゼンスルオニルフルオリド、0.0001M フェニルメタンスルオニルフルオリド、1%(V/V) ジメチルスルホキシド及び0.001M EDTAを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)に、菌を懸濁した。その懸濁液を0℃で1時間インキュベーションしたのち、1/500容量の0.5M ジチオスレイトールを混合して、−80℃で凍結した。それを解凍後、超音波破砕機に供したのち、破砕して得た液を遠心分離して可溶性画分を得た。
【0089】
実施例3 シバクロンブルー固定化樹脂を用いた融合蛋白質EPObpf40の精製
実施例2と同様にして得られた可溶性画分をカートリッジフィルター(ポアサイズ0.2μm)で滅菌ろ過したのち、そのろ液に1/10容量の0.22M 硫安水溶液を混合し、その混合液の1/50容量の50mg/mL ポリエチレンイミン水溶液を混合した。それを0℃で1時間インキュベーションしたのち、遠心分離して不溶化した核酸を除去して可溶性画分を得て、それを0.3M 塩化ナトリウムを含む0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)(平衡化緩衝液1と称する)中で4℃、一晩透析した。透析後に遠心分離をして可溶性画分を得て、それを滅菌ろ過してろ液22.7mLを得た。
【0090】
その溶液の20mLを平衡化緩衝液1で平衡化したTOYOPEARL AF−Blue HC−650M樹脂を4mL充填したカラムにロードした。その樹脂を、平衡化緩衝液1を1回あたり8mLロードして3回洗浄したのち、2M 塩化ナトリウムを含む0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)で吸着画分を溶出し、フラクションサイズ2mLで分取した。
【0091】
得られた画分のそれぞれを等容量の20mg/mL ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)、40mg/mL 2−メルカプトエタノール、570mg/mL グリセリン及び1mg/mL ブロモフェノールブルーを含む0.25M トリス塩酸緩衝液(pH6.8)(SDSサンプル緩衝液と称する)を加えて98℃で5分間加熱してSDS化したのち、SDS−ポリアクリルアミド電気泳動(SDS−PAGE)で分析した。
【0092】
図4は、レーン1と14に分子量マーカー蛋白質(上から順に175kDa、80kDa、58kDa、46kDa、30kDa、25kDa)、大腸菌HB101/pCDF20−T7RP(実施例1参照)のライセート(レーン2;サイズ比較試料)、TOYOPEARL AF−Blue HC−650M樹脂による分画前の試料(レーン3)、樹脂を素通りした画分(レーン4)、樹脂を洗浄して得た画分(レーン5、6及び7)、樹脂に吸着した画分を溶出して得た画分(溶出した順に、レーン8から13)を電気泳動したのち、Coomasie Brilliant Blue R−250で染色(CBB染色と称する)して蛋白質を検出した結果である。
【0093】
図4のレーン9と10にアローヘッド(黒三角)が指し示すEPObpf40(分子量124kDa)が検出され、TOYOPEARL AF−Blue HC−650M樹脂に吸着したことがわかる。
【0094】
得られた画分の蛋白質濃度をγ−グロブリンを標準蛋白質に用いて、プロテインアッセイ(商品名、バイオラッド社)で比色定量した結果、分画した試料全量159mg(100%)に対して、樹脂を素通りした画分と樹脂を洗浄して得た画分を合わせた量の不純蛋白質87mg(55%)を除去した、EPObpf40を含んだ画分35mg(22%)を得ることができた。
【0095】
実施例4 プラスミドpCDF20−EPObpf40Hの作製
T7RNAポリメラーゼ(配列番号1)のカルボキシル末端にヒトエリスロポエチンレセプター(配列番号2)の1位から225位までからなるポリペプチドを連結し、それに続けて6個のヒスチジンを連結した融合蛋白質をコードした配列(EPObpf40H、配列番号15、図1参照)からなるポリヌクレオチド(配列番号16)をコードした、プラスミドpCDF20−EPObpf40H(図5)を作製した。
【0096】
プラスミドpCDF20−EPObpf2Hと実施例1のDNA−1(0.1kbp)のセットを鋳型にして、配列番号11と配列番号17のプライマーをプライマーセットにしてPCRを行い、0.8kbpのDNAを得た。そのDNAを制限酵素MfeI、ついで制限酵素BlnIで消化して0.8kbpのDNA(DNA−6と称する)を得た。ついでDNA−6を実施例1のDNA−5とライゲーションして環化させ、プラスミドを調製した。
【0097】
そのプラスミドにより大腸菌HB101を形質転換し、LB/Carb寒天培地で培養して、目的のプラスミドを有する大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf40Hを得た。
【0098】
実施例5 融合蛋白質EPObpf40Hの精製
実施例2と同様にして大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf40Hを培養し菌密度(O.D.600)が6.6の培養液、0.12Lを得た。その培養液から得た大腸菌から、実施例2と同様にして、可溶性画分を得た。
【0099】
その可溶性画分(EPObpf40Hを含んでいる画分)を、カートリッジフィルター(ポアサイズ0.2μm)で滅菌ろ過したのち、1/10容量の0.22M 硫安水溶液を混合したのち、その混合液の1/49容量の50mg/mL ポリエチレンイミン水溶液を混合した。それを0℃で1時間インキュベーションしたのち、遠心分離して可溶性画分を得た。それを0.3M 塩化ナトリウムを含んだ0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)中で、4℃で一晩透析したのち、1/19容量の1M イミダゾール水溶液を添加した。その溶液を0.05M イミダゾール及び0.3M 塩化ナトリウムを含んだ0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)(平衡化緩衝液2と称する)で平衡化したニッケルキレート樹脂(His・Bind Resin、商品名、メルク社製)を2mL充填したカラムにロードしたのち、5mLの平衡化緩衝液2をロードして樹脂を洗い込み、素通り画分としてプールした。その樹脂をさらに15mLの平衡化緩衝液2を ロードして洗浄したのち、0.2M イミダゾール及び0.3M 塩化ナトリウムを含んだ0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)で、フラクションサイズ1mLで吸着画分を溶出して分取した。
【0100】
図6は、レーン1と11は分子量マーカー蛋白質、ニッケルキレート樹脂による分画前の試料(レーン2)、樹脂を素通りした画分(レーン3)、樹脂を洗浄して得た画分(レーン4)、樹脂に吸着した画分を溶出して得た画分(溶出した順に、レーン5から10)を電気泳動したのち、CBB染色をして蛋白質を検出した結果である。EPObpf40Hはレーン6から9に検出され、レーン2の試料に比べて精製されたことがわかる。
【0101】
ニッケルキレート樹脂に吸着したEPObpf40H(分子量124kDa)の画分の蛋白質濃度は、γ−グロブリンを標準蛋白質に用いてプロテインアッセイで比色定量した。
【0102】
本実施例で得られたEPObpf40Hは2.0mgであった。
【0103】
実施例6 プラスミドpCDF20−EPObpf50Hの作製
T7RNAポリメラーゼ(配列番号1)のカルボキシル末端に、Gly−Asp−Asp−Asp−Asp−Lysの6残基を介して、ヒトエリスロポエチンレセプター(配列番号2)の1位から225位までからなるポリペプチドを連結し、それに続けて6個のヒスチジンを連結した融合蛋白質(EPObpf50H、配列番号18、図1参照)をコードしたポリヌクレオチド(配列番号19)をコードした、プラスミドpCDF20−EPObpf50H(図7)を作製した。
【0104】
プラスミドpCDF20−T7RPを鋳型にして、配列番号11と配列番号20のプライマーをプライマーセットにしてPCRを行い0.1kbpのDNA(DNA−7と称する)を得た。
【0105】
プラスミドpCDF20−EPObpf2Hを鋳型にして、配列番号17のプライマーと上記DNA−7をプライマーセットとして用いてPCRを行い、0.8kbpのDNAを得た。そのDNAを制限酵素MfeI、ついで制限酵素BlnIで消化して0.8kbpのDNA(DNA−8と称する)を得た。
【0106】
DNA−8を実施例1のDNA−5とライゲーションして環化させ、プラスミドを調製した。
【0107】
そのプラスミドにより大腸菌HB101を形質転換し、LB/Carb寒天培地で培養して、目的のプラスミドを有する大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf50Hを得た。
【0108】
実施例7 融合蛋白質EPObpf50Hの精製
実施例2と同様にして大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf50Hを培養し菌密度(O.D.600)が6.6の培養液、0.12Lを得た。その培養液から得た大腸菌から、実施例2と同様にして、ただし、ジチオスレイトールは使用せずに可溶性画分を得た。
【0109】
その可溶性画分(EPObpf50Hを含んでいる画分)を、実施例5と同様にしてニッケルキレート樹脂を用いて精製した。
【0110】
図8のレーン1と11は分子量マーカー蛋白質、ニッケルキレート樹脂による分画前の試料(レーン2)、樹脂を素通りした画分(レーン3)、樹脂を洗浄して得た画分(レーン4)、樹脂に吸着した画分を溶出して得た画分(溶出した順に、レーン5から10)を電気泳動したのち、CBB染色をして蛋白質を検出した結果であり、図中のアローヘッドが指し示すレーン6と7に電気泳動した画分がEPObpf50Hを多く含んでいた。
【0111】
ニッケルキレート樹脂に吸着したEPObpf50H(分子量125kDa)の画分の蛋白質濃度をγ−グロブリンを標準蛋白質に用いてプロテインアッセイで比色定量した。
【0112】
本実施例で得られたEPObpf50Hは1mgであった。
【0113】
実施例8 エンテロキナーゼによる融合蛋白質EPObpf50Hの加水分解
実施例7と同様にして得られた可溶性画分(EPObpf50Hを含んでいる画分)をカートリッジフィルター(ポアサイズ0.2μm)で滅菌ろ過したのち、そのろ液9mLにエンテロキナーゼ(Enterokinase,light chain、商品名、NEW ENGLAND BioLabs社)36ngを加えて、25℃で18時間インキュベーションした。
【0114】
実施例9 EPObpHの精製
融合蛋白質EPObpf50Hをエンテロキナーゼで加水分解し、すなわち配列番号18の889位と890位の間で加水分解して生じた、配列番号18の890位から1120位の配列からなるポリペプチド、すなわち、ヒトエリスロポエチンレセプターの1位アラニンから225位グルタミン酸にヒスチジン6残基が付加したポリペプチド(EPObpHと称する)を以下のように精製した。
【0115】
実施例8のエンテロキナーゼを加えてインキュベーションした可溶性画分に、1/10容量の0.22M 硫安水溶液を混合したのち、その混合液の1/50容量の50mg/mL ポリエチレンイミン水溶液を混合した。それを0℃で1時間インキュベーションしたのち、遠心分離して不溶化した核酸を除去して可溶性画分を得て、それを平衡化緩衝液1中で4℃、一晩透析した。その透析後に遠心分離をして可溶性画分を得た。
【0116】
その可溶性画分9mLを平衡化緩衝液1で平衡化したTOYOPEARL AF−Blue HC−650M樹脂を1.8mL充填したカラムにロードし、カラム非吸着画分を得た。その画分の総蛋白質量は17.2mgであった。
【0117】
そのカラム非吸着画分に1/19容量の1M イミダゾール水溶液を添加したのち、平衡化緩衝液2で平衡化したニッケルキレート樹脂(His・Bind Resin)を2mL充填したカラムにロードした。その樹脂を、平衡化緩衝液2を10mLロードして洗浄したのち、0.2M イミダゾール及び0.3M 塩化ナトリウムを含む0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)で吸着画分を溶出し、フラクションサイズ1mLで分取した。
【0118】
実施例10 EPObpHの分析
実施例9で得た画分をSDS−PAGEに供したのち、10%(V/V) メタノールを含んだ0.01M シクロヘキシルアミノプロピパンスルホン酸(CAPS)−水酸化ナトリウム緩衝液(pH11)(CAPS緩衝液と称する)中で電気泳動して、PVDF膜に転写した。その膜を0.15M 塩化ナトリウム及び0.5mg/mL Tween20を含んだ0.05M トリス塩酸緩衝液(pH7.5)(TBS−Tと称する)で調製した5mg/mL ウシ血清アルブミン溶液(BSA/TBS−T溶液と称する)でブロッキングしたのち、ウエスタンブロッティングを行い、抗ヒトエリスロポエチンレセプター抗体を用いて検出した。
【0119】
ウエスタンブロッティングの手順はまずブロッキングした膜を、1μg/mL マウス抗ヒトエリスロポエチン抗体を含むBSA/TBS−T溶液中に浸漬して、室温で1時間振とうしたのち、TBS―Tで洗浄して、B/F分離した。次にその膜を濃度が1μg/mLの、西洋わさびペルオキシダーゼ(HRP)標識されたヤギ抗マウスIgG(H+L)抗体を含むBSA/TBS−T溶液中に浸漬して、室温で1時間振とうしたのち、B/F分離した。次にその膜に結合したHRP標識ヤギ抗マウスIgG(H+L)抗体のHRP活性を、0.1% 過酸化水素及び5mM 4−クロロナフトール含む24.3mMクエン酸−51.4mMリン酸水素二ナトリウム緩衝液(pH5)を基質溶液として用いて室温で20分間呈色反応を行って、EPObpf50HおよびEPObpHの検出を行った。
【0120】
図9はSDS−PAGE、図10はウエスタンブロッティングの結果である。
【0121】
それぞれのレーン1と15は分子量マーカー蛋白質、レーン2は、エンテロキナーゼ処理前の可溶性画分、レーン3はエンテロキナーゼ処理後の可溶性画分、TOYOPEARL AF−Blue HC−650M樹脂のカラム非吸着画分(レーン4)、実施例3と同様に洗浄して得られた全画分(レーン5)、及び実施例3と同様に得られた吸着した画分(溶出順にレーン6から9)、ニッケルキレート樹脂にロードした画分(レーン10;レーン4と同じ画分)、ニッケルキレート樹脂のカラム非吸着画分(レーン11)及び吸着した画分(溶出順にレーン12から14)であり、図9と10の結果からレーン13と14に精製されたEPObpHがあることがわかる。
【0122】
蛋白質濃度をγ−グロブリンを標準蛋白質に用いて、プロテインアッセイで比色定量した結果、得られたEPObpHは0.29mgであった。
【0123】
実施例11 EPObpH結合樹脂へのヒトエリスロポエチンの吸着
大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf50Hを培養し菌密度(O.D.600)が5.3の培養液、0.5Lから得た菌から、実施例9と同様にしてEPObpHの画分(総蛋白質量1mg)を得た。そのEPObpHの溶液(2.8mL)を0.2M イミダゾール及び0.3M 塩化ナトリウムを含む0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)で平衡化したTOYOPEARL AF−Blue HC−650M樹脂を0.2mL充填したカラムにロードし、カラム非吸着画分にEPObpHは0.4mgを得た。
【0124】
そのEPObpH(0.24mg)溶液の緩衝液組成を、0.05M イミダゾール及び0.3M 塩化ナトリウムを含む0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)に調整したのち、ニッケルキレート樹脂を0.1mL充填したカラムにロードした。その樹脂を、20mLの平衡化緩衝液2で洗浄した。その樹脂に0.25mg/mLに調製したCHO細胞由来リコンビナント・ヒトエリスロポエチン(メルク社製)を0.2mLロードしたのち、同組成の緩衝液10mLで樹脂を洗浄した。そののち、8M 尿素、0.2Mイミダゾール及び0.3M 塩化ナトリウムを含む0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)、5mLで溶出を行った。カラムへの通液は流速を0.1mL/minで行った。
【0125】
なお同様の操作を、EPObpHを結合していない樹脂を用いて行った場合にはCHO細胞由来リコンビナント・ヒトエリスロポエチンは樹脂に吸着しなかった。
【0126】
EPObpHを結合した樹脂を用いて得られたフラクション(分画サイズ1mL)は、エンザイムイムノアッセイを行って分析した。
【0127】
エンザイムイムノアッセイは、96穴イムノプレートに4μg/mLウサギ抗エリスロポエチンポリクローナル抗体を、0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)を1ウエルあたり100μL加えて、4℃で18時間インキュベーションしたのち、TBS−TでリンスしてB/F分離し、ついでBSA/TBS−Tを1ウエルあたり200μL加えて、30℃で2時間インキュベーションしてブロッキングしてから行った。
【0128】
ブロッキングしたプレートはTBS−TでリンスしてB/F分離したのち、BSA/TBS−Tで希釈して調製した試料を1ウエルあたり100μL加えて、30℃で1時間インキュベーションしたのち、B/F分離した。次いで0.8μg/mLビオチン標識抗エリスロポエチンモノクローナル抗体を1ウエルあたり100μL加えて、30℃で1時間インキュベーションしたのち、B/F分離し、さらに0.6μg/mL HRP標識ストレプトアビジンを1ウエルあたり100μL加えて、30℃で30分間インキュベーションした。
【0129】
それをB/F分離したのち、TMB Microwell Peroxidase Substrate(2−Component System)(製品名、Kirkegaard & Perry Laboratories社)を1ウエルあたり100μL加えて37℃で20分間反応し、それに1Mリン酸水溶液を1ウエルあたり50μL加えて反応停止後、波長450nmの吸光度(O.D.450)を測定した。
【0130】
分析の結果、EPObpHを結合した樹脂を素通りした画分にCHO細胞由来リコンビナント・ヒトエリスロポエチンは約35μg検出されたが、8M 尿素、0.2M イミダゾール及び0.3M 塩化ナトリウムを含む0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)で溶出した画分に約15μgが検出され、樹脂上のEPObpHにCHO細胞由来リコンビナント・ヒトエリスロポエチンが吸着したことがわかった。
【0131】
実施例12 プラスミドpCDF20−EPObpf50の作製
T7RNAポリメラーゼ(配列番号1)のカルボキシル末端に、Gly−Asp−Asp−Asp−Asp−Lysの6残基を介して、ヒトエリスロポエチンレセプター(配列番号2)の1位から225位までからなるポリペプチドを連結した融合蛋白質(EPObpf50、配列番号21、図1参照)をコードしたポリヌクレオチド(配列番号22)をコードした、プラスミドpCDF20−EPObpf50(図11)を作製した。
【0132】
プラスミドpCDF20−EPObpf50Hを、制限酵素MfeIついでEcoRVで消化し0.4kbpのDNA(DNA−9と称する)得た。
【0133】
一方プラスミドpCDF20−EPObpf40を、制限酵素MfeIついでEcoRVで消化して6.2kbpのDNA(DNA−10と称する)を得た。
【0134】
DNA−9を上記のDNA−10とライゲーションして環化させ、プラスミドを調製した。
【0135】
そのプラスミドにより大腸菌HB101を形質転換し、LB/Carb寒天培地で培養して、目的のプラスミドを有する大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf50を得た。
【0136】
実施例13 プラスミドpCDF20−EPObpf60Hの作製
T7RNAポリメラーゼ(配列番号1)のカルボキシル末端に、Gly−Ser−Pro−Gly−Argの5残基を介してヒトエリスロポエチンレセプター(配列番号2)の1位から225位までからなるポリペプチドを連結し、それに続けて6個のヒスチジンを連結した融合蛋白質(EPObpf60H、配列番号23、図1参照)をコードしたポリヌクレオチド(配列番号24)をコードした、プラスミドpCDF20−EPObpf60H(図12)を作製した。
【0137】
まず実施例6のプラスミドpCDF20−EPObp50Hを鋳型にして、配列番号17と配列番号25のプライマーをプライマーセットにしてPCRを行い、0.7kbpのDNAを得た。そのDNAを制限酵素BamHIで消化して0.7kbpのDNA(DNA−11と称する)を得た。
【0138】
一方、プラスミドpCDF20−T7RPを鋳型にして、配列番号11と配列番号26のプライマーをプライマーセットにしてPCRを行い、0.1kbpのDNAを得た。そのDNAを制限酵素BamHIで消化して0.1kbpのDNA(DNA−12と称する)を得た。
【0139】
DNA−11とDNA−12をライゲーションしたのち、配列番号11と配列番号17のプライマーをプライマーセットにしてPCRを行い、0.8kbpのDNAを得た。そのDNAを制限酵素MfeI、ついで制限酵素BlnIで消化して0.8kbpのDNA(DNA−13)を得た。
【0140】
DNA−13を実施例1のDNA−5とライゲーションして環化させ、プラスミドを調製した。
【0141】
そのプラスミドにより大腸菌HB101を形質転換し、LB/Carb寒天培地で培養して、目的のプラスミドpCDF20−EPObpf60Hを有する大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf60Hを得た。
【0142】
実施例14 融合蛋白質EPObpf60Hの発現
大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf60Hを2xYT/Carb培地に植菌して、30℃で一晩、培養した。その培養液を2つに分け、その一方に濃度が0.1mMになるようにIPTGを添加し、それぞれを25℃で2時間培養した。
【0143】
得られた菌体を0.001M EDTAを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)でリンスしたのち、同組成の緩衝液にO.D.600が10になるように再懸濁し、同容量のSDSサンプル緩衝液を加えて98℃で5分間加熱してSDS化したのち、SDS−PAGEで分析した。
【0144】
図13のレーン1は分子量マーカー蛋白質、EPObpf50H(比較試料、レーン2、IPTGなし)、EPObpf50H(比較試料、レーン3、IPTGあり)、EPObpf60H(レーン4、IPTGなし)、EPObpf60H(レーン5、IPTGあり)であり、レーン4と5にEPObpf60H(125kDa)がIPTGの添加の有無によらず発現していることがわかる。
【0145】
実施例15 融合蛋白質EPObpf60Hの精製
実施例2と同様にして大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf60Hを培養し菌密度(O.D.600)が4.8の培養液、約1Lを得た。
その培養液から得た大腸菌(湿菌体重量4.6g)から、実施例2と同様にして、可溶性画分を得た。
その可溶画分を平衡化緩衝液1中で、4℃で一晩透析したのち、イミダゾールを終濃度0.05Mになるように添加した。
その溶液(EPObpf60Hの溶液)を2回にわけて、以下のように精製した。
平衡化緩衝液2(実施例5参照)で平衡化したニッケルキレート樹脂(His・Bind Resin、商品名、メルク社製)10mLを充填したカラムに、EPObpf60Hの溶液をロードしたのち、50mLの平衡化緩衝液2で洗浄したのち、0.2M イミダゾール及び0.3M塩化ナトリウムを含む0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)で、フラクションサイズ5mLで吸着画分を溶出して分取した。
吸着画分の蛋白質濃度をγ−グロブリンを標準蛋白質に用いて、プロテインアッセイで比色定量した結果、得られたEPObpf60Hの合計量は68.8mgであった。
【0146】
実施例16 プラスミドpCDF20−EPOf60の作製
T7RNAポリメラーゼ(配列番号1)のカルボキシル末端に、Gly−Ser−Pro−Gly−Argの5残基を介して、エリスロポエチン(配列番号3)を連結した融合蛋白質(EPOf60、配列番号27、図14)をコードしたポリヌクレオチド(配列番号28)をコードした、プラスミドpCDF20−EPOf60(図15)を作製した。
【0147】
まず、配列番号31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47及び48のプライマーセットを用いてPCRで増幅した、0.34kbpのDNAを制限酵素MfeIとPstIで二重消化したDNA(DNA−14と称する)を得た。
【0148】
またプライマー配列番号47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59及び60のプライマーセットを用いてPCRで増幅した、0.25kbpのDNAを制限酵素PstIとBlnIで二重消化したDNA(DNA−15と称する)を得た。実施例1に記載のDNA−5と、DNA−14およびDNA−15を、DNAリガーゼを用いてライゲーションして環化させ、プラスミドpCDF20−EPOf2を作製した。
【0149】
プラスミドpCDF20−EPOf2は、T7RNAポリメラーゼ(配列番号1)の1位メチオニンから859位アスパラギン酸までのアミノ酸配列に続き、Asp−Asp−Asp−Lysの4残基を介して、配列番号3に示したヒトエリスロポエチンの1位アラニンから166位アルギニンまでを連結した融合蛋白質(EPObpf2、配列番号29、図2参照)をコードしたポリヌクレオチド(配列番号30)をコードした、プラスミドである。
【0150】
プラスミドpCDF20−EPOf2鋳型にして、配列番号60と配列番号61のプライマーセットを用いてPCRを行い、0.5kbpのDNAを得て、そのDNAを制限酵素BamHIで消化して0.5kbpのDNA(DNA−16と称する)を得た。
【0151】
実施例13のDNA−12と、DNA−16をライゲーションしたのち、配列番号11と配列番号60のプライマーセットにしてPCRを行い、0.6kbpのDNAを得た。そのDNAを制限酵素MfeI、ついで制限酵素BlnIで消化して0.6kbpのDNA(DNA−17と称する)を得た。
【0152】
DNA−17を実施例1のDNA−5とライゲーションして環化させ、プラスミドを調製した。
【0153】
そのプラスミドにより大腸菌HB101を形質転換し、LB/Carb寒天培地で培養して、目的のプラスミドを有する大腸菌HB101/pCDF20−EPOf60を得た。
【0154】
実施例17 融合蛋白質EPOf60の発現
大腸菌HB101/pCDF20−EPOf60を2xYT/Carb培地に植菌して、30℃で一晩、培養した。その培養液を2つに分け、その一方に濃度が0.1mMになるようにイソプロピル−1−チオ−β−D−ガラクトシド(IPTG)を添加し、それぞれを25℃で2時間培養した。
【0155】
得られた菌体を0.001M EDTAを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)でリンスしたのち、同組成の緩衝液に菌密度がO.D.600で10になるように再懸濁し、同容量のSDSサンプル緩衝液を加えて98℃で5分間加熱してSDS化したのち、SDS−PAGEで分析した。
【0156】
図16のレーン1は分子量マーカー蛋白質、レーン2はEPOf60(IPTGなし)、レーン3はEPOf60(IPTGあり)である。レーン3の矢印が指し示す位置にEPOf60(118kDa)が発現していることがわかった。
【0157】
実施例18 ウロキナーゼによる融合蛋白質EPOf60の加水分解
大腸菌HB101/pCDF20−EPOf60を菌密度がO.D.600で0.2になるように2xYT/Carb培地に植菌して、37℃で3時間培養したのち、0.1mMの濃度になるようにIPTGを加えて、さらに25℃で3時間培養した。
【0158】
得られた菌体を0.001M EDTAを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)でリンスしたのち、0.1mg/mL 卵白リゾチーム、0.001M EDTAを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)にO.D.600が36になるように再懸濁し、氷冷下で1時間インキュベーションしたのち、−80℃に凍結した。それを解凍したのち、超音波破砕し、ついで遠心分離して上清を得た。それをカートリッジフィルター(ポアサイズ0.2μm)で滅菌ろ過して、そのろ液を可溶性画分とした。その可溶性画分200μLに、0.3mg/mL 天然型ウロキナーゼ(特開昭62−143686に記載の天然型プロウロキナーゼ様ポリペプチドを活性化した酵素)あるいは、0.3mg/ml 変異型ウロキナーゼ(特開昭62−143686に記載の変異体(Q135D157)プロウロキナーゼ様ポリペプチドを活性化した酵素)を、50μL加えて、4℃でインキュベーションした。
【0159】
4℃で68時間インキュベーションした液の一部を、それぞれ、SDS−PAGEに供したのち、CAPS緩衝液中で電気泳動して、PVDF膜に転写した。その膜をBSA/TBS−T溶液中でブロッキングしたのち、ウエスタンブロッティング分析を行い、抗ヒトエリスロポエチン抗体を用いて検出した。
【0160】
ウエスタンブロッティングの手順は、まずブロッキングした膜を、0.5μg/mL ビオチン標識マウス抗ヒトエリスロポエチン抗体を含むBSA/TBS−T溶液中に浸漬して、室温で1時間振とうしたのち、TBS−Tで洗浄してB/F分離した。次にその膜を0.6μg/mL 西洋わさびペルオキシダーゼ(HRP)標識ストレプトアビジンを含むBSA/TBS−T溶液中に浸漬して、室温で1時間振とうしたのち、B/F分離した。次にその膜に結合したHRP標識ストレプトアビジンのHRP活性を、0.1% 過酸化水素及び5mM 4−クロロナフトールを含む24.3mM クエン酸−51.4mM リン酸水素二ナトリウム緩衝液(pH5)を基質溶液として用いて室温で20分間呈色反応を行って検出し、エリスロポエチンの検出を行った。
【0161】
図17のレーン1は68時間インキュベーションした大腸菌HB101/pCDF20-EPOf60の可溶性画分(ウロキナーゼなし)、レーン2は天然型ウロキナーゼを加えて68時間インキュベーションした大腸菌HB101/pCDF20-EPOf60の可溶性画分、レーン3は変異型ウロキナーゼを加えて68時間インキュベーションした大腸菌HB101/pCDF20-EPOf60の可溶性画分をそれぞれ分析した結果である。矢印で示した位置にエリスロポエチン(18kDa)が検出された。
【0162】
実施例19 プラスミドpCDF20−FcBPf51Hの作製
T7RNAポリメラーゼ(配列番号1)のカルボキシル末端に、Gly−Ser−Asp−Asp−Asp−Asp−Lysの7残基を介して、抗体レセプター(FcγRI)(配列番号4)の1位から274位までからなるポリペプチドを連結し、それに続けて6個のヒスチジンを連結した融合蛋白質(FcBPf51H、配列番号62、図18)をコードしたポリヌクレオチド(配列番号63)をコードした、プラスミドpCDF20−FcBPf51H(図19)を作製した。
【0163】
まず、第一段階目のPCRを、特開2008−245580に記載のプラスミドpECFcRを鋳型にして、配列番号64と配列番号65のプライマーセットを用いて行い、0.8kbpのDNA(DNA−18と称する)を得た。
【0164】
次に第二段階目のPCRを、プラスミドpECFcRを鋳型にして、DNA−18と配列番号66のプライマーセットを用いて行い、0.9kbpのDNA(DNA−19と称する)を得た。
【0165】
次に第三段階目のPCRを、DNA−19を鋳型にして、配列番号64と配列番号67のプライマーセットを用いて行い、0.9kbpのDNAを得て、それを制限酵素BamHIで消化して0.9kbpのDNA(DNA−20と称する)を得た。
【0166】
そのDNA−20を、プラスミドpCDF20−EPObpf60Hを制限酵素NaeIとBamHIで消化して得た6.1kbpのDNA(DNA−21と称する)とライゲーションして環化させ、プラスミドを調製した。
【0167】
そのプラスミドにより大腸菌JM109を形質転換し、LB/Carb寒天培地で培養して、目的のプラスミドを有する大腸菌JM109/pCDF20−FcBPf51Hを得た。
【0168】
実施例20 FcBPf51Hの調製
大腸菌JM109/pCDF20−FcBPf51Hを2xYT/Carb培地に植菌して28℃で15時間培養して、菌密度(O.D.600)が8.3の培養液、0.12Lを得た。
【0169】
その培養液から大腸菌JM109/pCDF20−FcBPf51Hを、遠心分離して集菌したのち、0.001M EDTAを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)、25mLに懸濁したのち、遠心分離して菌を洗浄した。次にその菌を0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)、25mLで洗浄した。
【0170】
その菌を菌密度(O.D.600)の値がおよそ72になるように、0.2mg/mL 卵白リゾチ−ム、0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)に、菌を懸濁した。その懸濁液を0℃で1時間インキュベーションしたのち、−80℃で凍結した。それを解凍後、超音波破砕機に供したのち、破砕して得た液を遠心分離して可溶性画分を得た。
【0171】
得られた可溶性画分をカートリッジフィルター(ポアサイズ0.2μm)で滅菌ろ過したのち、そのろ液12.4mLに1/59容量の3M イミダゾール(pH6)を混合した。
【0172】
その液の12.4mLを、0.05M イミダゾール及び0.3M 塩化ナトリウムを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)(平衡化緩衝液3と称する)で平衡化したニッケルキレート樹脂(His・Bind Resin、商品名、メルク社製)を4mL充填したカラムにロードしたのち、4mLの平衡化緩衝液3で樹脂を洗い込み、素通り画分としてプールした。その樹脂をさらに16mLの平衡化緩衝液3で洗浄したのち、0.2M イミダゾール及び0.3M 塩化ナトリウムを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)で、フラクションサイズ2mLで吸着画分を溶出して分取し、フラクションは実施例3と同様にしてSDS−PAGEで分析した。
【0173】
図20のレーン1は分子量マーカー蛋白質、レーン2はニッケルキレート樹脂による分画前の可溶性画分、レーン3は素通り画分、レーン4から8は0.2Mイミダゾール及び0.3M 塩化ナトリウムを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)で溶出された画分であり、レーン6の、矢印で示された位置にFcBPf51H(分子量131kDa)が検出された。
【0174】
実施例21 エンテロキナーゼを用いて加水分解したFcBPf51H
実施例20で得たFcBPf51Hを含んだフラクションを、0.2M 塩化ナトリウムを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)中で透析した。透析後のFcBPf51H溶液を、γ−グロブリンを標準蛋白質に用いて、プロテインアッセイ(商品名、バイオラッド社)で比色定量して定めた。そのFcBPf51H溶液(0.24mg/mL)に、1/500容量の1M 塩化カルシウムを加えたのち、それぞれの溶液に含まれる蛋白質量(重量)の1/10000重量のエンテロキナーゼを添加して4℃でインキュベーションした。
【0175】
インキュベート18時間後、64時間後、112時間後に一部をサンプリングし、反応の阻害剤として、1/200容量の0.02M N−α−Tosyl−L−lysine chloromethyl ketone hydrochlorideを混合した。
【0176】
それぞれの溶液の一部はウエスタンブロッティングとエンザイムイムノアッセイで分析した。
【0177】
ウエスタンブロッティングには、HRP標識ウサギanti−6−His(Bethyl社製)を用いた。
【0178】
エンザイムイムノアッセイは、96穴イムノプレートに10μg/mL ヒト免疫グロブリン(ガンマグロブリン)(製品名、財団法人化学及血清療法研究所製)、0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)を1ウエルあたり100μL加えて、4℃で18時間インキュベーションしたのち、TBS−TでリンスしてB/F分離し、ついでBSA/TBS−Tを1ウエルあたり200μL加えて、30℃で2時間ンキュベーションしてブロッキングしてから行った。
【0179】
ブロッキングしたプレートはTBS−TでリンスしてB/F分離したのち、BSA/TBS−Tで希釈して調製した試料を1ウエルあたり100μL加えて、30℃で1時間インキュベーションしたのち、B/F分離し、ついでBSA/TBS−Tで5000倍希釈したHRP標識抗6xHis抗体(Bethyl社製)を1ウエルあたり100μL加えて、30℃で1時間インキュベーションした。それをB/F分離したのち、TMB Microwell Peroxidase Substrate(2−Component System)(製品名、Kirkegaard & Perry Laboratories社)を1ウエルあたり100μL加えて室温で30分間反応し、それに1Mリン酸水溶液を1ウエルあたり50μL加えて反応停止後、波長450nmの吸光度(O.D.450)を測定した。
【0180】
図21のウエスタンブロテッィングのレーン1は分子量マーカー蛋白質であり、レーン2から5の試料はエンテロキナーゼを添加せず、レーン6から8はエンテロキナーゼを添加した試料で、レーン2はインキュベーションする前、レーン3と6はインキュベーション18時間後、レーン4と7はインキュベーション64時間後、レーン5と8はインキュベーション112時間後の試料を分析した結果である。
【0181】
図21に示したようにエンテロキナーゼを加えて112時間の試料(レーン8)にはFcBPf51Hほとんどなくなっていた。またエンテロキナーゼを加えた試料では基質となるアミノ酸配列で加水分解されてT7RNAポリメラーゼの部分が除かれたと考えられる生成物(蛋白質)のバンドを検出した。
【0182】
一方、図22に示したように、エンテロキナーゼを加えずに64時間インキュベーションしたFcBPf51H(64h−)と、エンテロキナーゼを加えずに112時間インキュベーションしたFcBPf51H(112h−)の結果から、融合蛋白質はその濃度に依存してヒトイムノグロブリンに吸着することがわかった。
【0183】
また図22のエンテロキナーゼを加えて64時間インキュベーションしたFcBPf51H(64h+)と、エンテロキナーゼを加えて112時間インキュベーションしたFcBPf51H(112h+)の結果から、エンテロキナーゼで加水分解されT7RNAポリメラーゼの部分が除かれた蛋白質も、濃度に依存してヒトイムノグロブリンに吸着することがわかった。
【0184】
実施例22 プラスミドpCDF20−hGHbpf51Hの作製
T7RNAポリメラーゼ(配列番号1)のカルボキシル末端に、Gly−Ser−Asp−Asp−Asp−Asp−Lysの7残基を介して、ヒト成長ホルモンレセプター(配列番号5)の1位から238位までからなるポリペプチドを連結し、それに続けて6個のヒスチジンを連結した融合蛋白質(hGHbpf51H、配列番号68、図23)をコードしたポリヌクレオチド(配列番号69)をコードした、プラスミドpCDF20−hGHbpf51H(図24)を作製した。
【0185】
まず、第一段階目のPCRを、特願2009−025901に記載のプラスミドpET−hGHbp258を鋳型にして、配列番号70と配列番号71のプライマーセットを用いてPCRを行い、0.7kbpのDNA(DNA−22と称する)を得た。
【0186】
次に第二段階目のPCRを、DNA−22を鋳型にして、配列番号71と配列番号72のプライマーセットを用いて行い、0.8kbpのDNAを得て、それを制限酵素BglIIとBlnIで消化して0.8kbpのDNA(DNA−23と称する)を得た。そのDNA−23を、プラスミドpCDF20−EPObpf60Hを制限酵素BamHIとBlnIで消化して得た5.9kbpのDNAとライゲーションして環化させ、プラスミドを調製した。
【0187】
そのプラスミドにより大腸菌JM109を形質転換し、LB/Carb寒天培地で培養して、目的のプラスミドを有する大腸菌JM109/pCDF20−hGHbpf51Hを得た。
【0188】
実施例23 ヒト成長ホルモンへの融合蛋白質hGHbpf51Hの吸着
大腸菌JM109/pCDF20−hGHbpf51Hを2xYT/Carb培地に植菌して28℃で16時間培養して、菌密度(O.D.600)が4.2の培養液を10mL得た。
【0189】
その培養液から大腸菌JM109/pCDF20−hGHbpf51Hを、遠心分離して集菌した。得られた菌を1mLの0.001M EDTAを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)に懸濁したのち、遠心分離して菌を洗浄した。次にその菌を1mLの0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)で洗浄した。その菌を菌密度(O.D.600)の値が36になるように、0.1mg/mL 卵白リゾチ−ム、0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)に、菌を懸濁した。その懸濁液を0℃で30分間インキュベーションしたのち、−80℃で凍結した。それを解凍後、超音波破砕機に供したのち、破砕して得た液を遠心分離して可溶性画分を得た。
【0190】
その可溶性画分に含まれるhGHbpf51Hがヒト成長ホルモンに吸着することを、エンザイムイムノアッセイを行って調べた。
【0191】
エンザイムイムノアッセイは、96穴イムノプレートに1μg/mL ヒト成長ホルモンを、0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)を1ウエルあたり100μL加えて、4℃で18時間インキュベーションしたのち、TBS−TでリンスしてB/F分離し、ついでBSA/TBS−Tを1ウエルあたり200μL加えて、30℃で2時間インキュベーションしてブロッキングしてから行った。
【0192】
ブロッキングしたプレートはTBS−TでリンスしてB/F分離したのち、BSA/TBS−Tで希釈して調製した試料を1ウエルあたり100μL加えて、30℃で1時間インキュベーションしたのち、B/F分離した。次いで0.5μg/mL マウス抗ヒト成長ホルモンレセプター抗体(IgG2b)を1ウエルあたり100μL加えて、30℃で1時間インキュベーションしたのち、B/F分離し、さらに0.25μg/mL HRP標識ウサギ抗マウスIgG2b抗体を1ウエルあたり100μL加えて、30℃で1時間インキュベーションした。それをB/F分離したのち、TMB Microwell Peroxidase Substrate(2−Component System)(製品名、Kirkegaard & Perry Laboratories社)を1ウエルあたり100μL加えて室温で90秒間反応し、それに1M リン酸水溶液を1ウエルあたり50μL加えて反応停止後、波長450nmの吸光度(O.D.450)を測定した。
【0193】
図25に示したようにhGHbpf51Hの濃度に依存してヒト成長ホルモンに吸着することがわかった。
【技術分野】
【0001】
本発明は、T7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、直接に、または1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを介して、異種蛋白質が融合したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質並びに当該T7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドに関する。また本発明は、当該ポリヌクレオチドを有し、かつ、それを発現して本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を生産することができるEscherichia属の細菌、並びに当該Escherichia属の細菌を使用する本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質の製造法に関する。さらに本発明は、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をプロテアーゼで加水分解することを特徴とする異種蛋白質の製造法に関する。
【背景技術】
【0002】
大腸菌(Escherichia coli)を用いた蛋白質生産において、宿主である大腸菌とは異種の生物等に由来する外来の蛋白質、いわゆる異種蛋白質を生産させた場合に、生産された異種蛋白質は菌体内に蓄積され封入体を形成することが多い。封入体を形成した異種蛋白質は、その存在状態故に生物学的あるいは生化学的に不活性であるため、活性型の蛋白質を得るためには、可溶化、再生の操作がさらに必要となる。
【0003】
これらの問題を解決するため、異種蛋白質に大腸菌菌体内で可溶性蛋白質として発現する蛋白質を融合させて発現する方法が知られている。異種蛋白質に融合させる蛋白質としては、T7ファージの10B配列のC末端部位からなるSolubility enhancement tag(SET)やGB1ドメイン、ユビキチン、Small ubiqutin−related modifer(SUMO)、チオレドキシン(TRX)、グルタチオン−S−トランスフェラーゼ(GST)、マルトース結合蛋白質(MBP)、N−utilization substance A(Nus A)を用いた融合発現(非特許文献1)やカルボキシル末端が欠損したシャペロニンを用いた融合発現(特許文献1)が知られている。
【0004】
バクテリオファージであるT7ファージに由来するRNAポリメラーゼであるT7RNAポリメラーゼを、異種蛋白質に融合させて発現させた例に関しては、T7RNAポリメラーゼを酵母内で機能させる目的で、酵母GAL4蛋白質をT7RNAポリメラーゼのアミノ末端に融合させた発現させた例が知られている(非特許文献2)。なおGAL4蛋白質自体は大腸菌菌体内でも機能を有する蛋白質として発現することが知られている。
【0005】
一方、これまでにT7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に脊椎動物由来のポリペプチドや、脊椎動物由来のポリペプチドを連結した融合蛋白質を可溶性の蛋白質として発現させた例はない。
【0006】
また、T7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に脊椎動物由来のポリペプチドや、脊椎動物由来のポリペプチドの1残基以上のアミノ酸を、他のアミノ酸に置換、及び/又は欠失、及び/又は付加したポリペプチドを連結した融合蛋白質を可溶性の蛋白質として発現させた例はない。
【0007】
またシバクロンブルー(CibacronBlue)を固定化した樹脂が、T7RNAポリメラーゼの精製に利用できることが知られている(非特許文献3)が、T7RNAポリメラーゼが融合した蛋白質の精製に利用した例はない。
【先行技術文献】
【特許文献】
【0008】
【特許文献1】特開2004−321141号公報
【特許文献2】特開2009−136153号公報
【非特許文献】
【0009】
【非特許文献1】加藤 淳ら,生物物理,Vol.48,185−189(2008)
【非特許文献2】Ostrander E.A.ら.Science,249,1261−1265(1990)
【非特許文献3】Das M.ら,Preparative Biochemistry and Biotechnology,28,339−348(1998)
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【0010】
本発明の目的は、宿主に対して異種の蛋白質を、可溶化や再生の操作を必要としない可溶性の蛋白質として発現させるための融合蛋白質として有用なT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質、該T7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を純度よく製造する方法、該T7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を位置特異的に加水分解して異種蛋白質を純度よく簡便に製造する方法を提供することにある。
【課題を解決するための手段】
【0011】
本発明者らは上記課題を解決するために鋭意検討した結果、T7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、場合によってはリンカーを介して異種蛋白質を連結したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質が、大腸菌の細胞質中に可溶性蛋白質として発現すること、またその融合蛋白質の性質が、融合蛋白質及び融合蛋白質から異種蛋白質を精製するときに有利であることを見出し、本発明を完成させた。
【0012】
すなわち本発明は、配列番号1で示したT7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、直接に、または1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを介して、異種蛋白質が融合したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質に関するものである。異種蛋白質は、当該蛋白質の全長を指すこともあれば、その一部である機能を有するポリペプチドを指すこともある。
【0013】
また、本発明は、配列番号1で示したT7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、直接に、または1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを介して、脊椎動物由来のポリペプチドが融合したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質、あるいは配列番号1で示したT7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、直接に、または1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを介して、脊椎動物由来のポリペプチドの1残基以上のアミノ酸を、他のアミノ酸に置換、及び/又は欠失、及び/又は付加したポリペプチドが融合したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質に関するものである。
【0014】
また、本発明は配列番号1で示したT7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、直接に、または1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを介して、配列番号2で示したヒトエリスロポエチンレセプターの1位から225位からなるポリペプチド、配列番号3で示したヒトエリスロポエチンの1位から166位からなるポリペプチド、配列番号4で示したヒトFcγRIの1位から274位からなるポリペプチド、あるいは配列番号5で示したヒト成長ホルモンレセプターの1位から238位からなるポリペプチドを融合したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質に関するものである。
【0015】
また、本発明は配列番号1で示したT7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、直接に、または1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを介して、配列番号2で示したヒトエリスロポエチンレセプターの1位から225位からなるポリペプチド、配列番号3で示したヒトエリスロポエチンの1位から166位からなるポリペプチド、配列番号4で示したヒトFcγRIの1位から274位からなるポリペプチド、あるいは配列番号5で示したヒト成長ホルモンレセプターの1位から238位からなるポリペプチドの、1残基以上のアミノ酸を、他のアミノ酸に置換、及び/又は欠失、及び/又は付加したポリペプチドを融合したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質に関するものである。
【0016】
また、本発明は、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドと、そのポリヌクレオチドを発現し、該融合蛋白質を生産するEscherichia属の細菌に関するものである。
【0017】
また、本発明は、本発明のEscherichia属の細菌を使用するT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質の製造法に関するものである。
【0018】
さらに、本発明はT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を1種類以上のプロテアーゼで加水分解することを特徴とする異種蛋白質の製造法に関するものである。
【0019】
また、本発明は、シバクロンブルー固定化樹脂を用いることを特徴とするT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質の製造法に関するものである。
【0020】
また、本発明は本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を加水分解して生じた異種蛋白質を、シバクロンブルー固定化樹脂を用いて分離することを特徴とする異種蛋白質の製造法に関するものであり、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をプロテアーゼで加水分解して生じた異種蛋白質を、シバクロンブルー固定化樹脂を用いて分離することを特徴とする異種蛋白質の製造法に関するものである。
【発明の効果】
【0021】
本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を用いれば、目的の異種蛋白質を、例えば、大腸菌を用いて、可溶性の融合蛋白質として製造することができる。本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質は、シバクロンブルー固定化樹脂を用いて精製することも可能である。特に、目的の異種蛋白質を、例えばプロテアーゼによって位置特異的な加水分解が可能なリンカーを介してT7RNAポリメラーゼに連結した本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質は、所望の位置でT7RNAポリメラーゼを切除することにより、目的の異種蛋白質を効率よく製造することができる。
【図面の簡単な説明】
【0022】
【図1】T7RNAポリメラーゼ、ヒトエリスロポエチンレセプター(hEPOR)、実施例1、2及び3のEPObpf40、実施例4及び5のEPObpf40H、実施例12のEPObpf50、実施例6、7、8及び9のEPObpf50H、及び、実施例13及び14のEPObpf60Hの一次構造の模式図
【図2】T7RNAポリメラーゼ、ヒトエリスロポエチンレセプター(hEPOR)、 実施例1、4及び6のEPObpf2H、ヒトエリスロポエチン(hEPO)、実施例16のEPOf2の一次構造の模式図
【図3】実施例1で調製したプラスミドの模式図
【図4】実施例3のEPObpf40のSDS−PAGEの結果を示す図
【図5】実施例4で調製したプラスミドの模式図
【図6】実施例5のEPObpf40HのSDS−PAGEの結果を示す図
【図7】実施例6で調製したプラスミドの模式図
【図8】実施例7のEPObpf50HのSDS−PAGEの結果を示す図
【図9】実施例10のEPObpHのSDS−PAGEの結果を示す図
【図10】実施例10のEPObpHのウエスタンブロッティングの結果を示す図
【図11】実施例12で調製したプラスミドの模式図
【図12】実施例13で調製したプラスミドの模式図
【図13】実施例14のEPObpf60HのSDS−PAGEの結果を示す図
【図14】T7RNAポリメラーゼ、ヒトエリスロポエチン(hEPO)、実施例16、17及び18のEPOf60の一次構造の模式図
【図15】実施例16で調製したプラスミドの模式図
【図16】実施例17のEPOf60のSDS−PAGEの結果を示す図
【図17】実施例18のEPOf60のウエスタンブロッティングの結果を示す図
【図18】実施例19のT7RNAポリメラーゼ、FcγRI及びFcBPf51Hの一次構造の模式図
【図19】実施例19で調製したプラスミドの模式図
【図20】実施例20のFcBPf51HのSDS−PAGEの結果を示す図
【図21】実施例21のエンテロキナーゼを用いて加水分解したFcBPf51Hのウエスタンブロッティングの結果を示す図
【図22】実施例21のエンテロキナーゼを用いて加水分解したFcBPf51Hのエンザイムイムノアッセイの結果を示す図
【図23】実施例22のT7RNAポリメラーゼ、hGHR及びhGHbpf51Hの一次構造の模式図
【図24】実施例22で調製したプラスミドの模式図
【図25】実施例23のhGHbpf51Hのエンザイムイムノアッセイの結果を示す図
【発明を実施するための形態】
【0023】
本発明に関わる配列番号1に示したT7RNAポリメラーゼと直接、あるいは、1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを介して融合する異種蛋白質は、大腸菌(Escherichia coli)に対して異種の生物等に由来する外来の蛋白質を挙げることができ、具体的には、脊椎動物である哺乳類、鳥類、爬虫類、両性類、魚類に由来するポリペプチドを例示することができる。
【0024】
さらに具体的には、異種蛋白質としては、成長ホルモン、エリスロポエチン、インターロイキン−2(IL−2)、インターロイキン−3(IL−3)、インターロイキン−4(IL−4)、インターロイキン−5(IL−5)、インターロイキン−6(IL−6)、インターロイキン−7(IL−7)、インターロイキン−9(IL−9)、インターロイキン−10(IL−10)、インターロイキン−11(IL−11)、インターロイキン−12(IL−12)のサブユニットp35、インターロイキン−13(IL−13)、インターロイキン−15(IL−15)、顆粒球コロニー刺激因子(G−CSF)、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)、毛様体神経栄養因子(CNTF)、カルジオトロフィン−1(CT−1)、白血球阻害因子(LIF)、オンコスタチンM(OSM)、インターフェロンα(IFNα)、インターフェロンβ(IFNβ)、インターフェロンγ(IFNγ)、腫瘍壊死因子α(TNFα)、腫瘍壊死因子β(TNFβ)、レプチン、プロラクチンなどのポリペプチド、あるいは、それらのポリペプチドの各レセプターの細胞外ドメインなどの、脊椎動物に由来するポリペプチドが例示できる。
【0025】
また、FcγRI(CD64)、FcγRIIa(CD32A)、FcγRIIb(CD32B)、FcγRIIIa(CD16A)、FcγRIIIb(CD16B)、FcεRI、FcεRII(CD23)、FcαRI(CD89)、Fcα/μR、FcRn、ポリメリックIgレセプターなどの抗体レセプターの細胞外ドメイン、細胞接着分子(カドヘリン、インテグリン、セレクチンなど)の細胞外ドメイン、抗体のH鎖やL鎖などの、脊椎動物に由来するポリペプチドが例示できる。また脊椎動物に由来する、酵素、オリゴマー酵素の構成要素であるポリペプチド、酵素阻害蛋白質、膜結合型酵素の可溶性ドメインなどのポリペプチドが例示できる。
【0026】
また本発明で用いる異種蛋白質は、例えば上記のような、脊椎動物に由来するポリペプチドに加えて、当該ポリペプチドに対して以下の(ア)から(ウ)から選択される一以上の変異を加えたものであって、当該異種蛋白質の活性、例えば酵素活性や結合活性などを有するものであっても良い。
(ア)上記ポリペプチドを構成するアミノ酸残基の配列中の一残基以上のアミノ酸を欠失したもの
(イ)上記ポリペプチドを構成するアミノ酸残基の配列中の一残基以上のアミノ酸を他のアミノ酸に置換したもの
(ウ)上記ポリペプチドを構成するアミノ酸残基の配列について、一残基以上のアミノ酸を付加したもの。
【0027】
異種蛋白質のカルボキシル末端には、例えばポリヒスチジン、S−ペプチド、あるいはc−mycペプチドなどの付加配列を連結してもよい。
【0028】
異種蛋白質をコードしたポリヌクレオチドは、公知の方法により調製できる。例えば目的の異種蛋白質をコードしたポリヌクレオチドは、公知の情報を利用してオリゴヌクレオチドからなるプライマーセットを作製し、目的の異種蛋白質をコードしたポリヌクレオチドを含んだ、市販のcDNAやcDNAライブラリー、あるいは、公知の方法で調製したcDNAを鋳型としてポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行い、目的のポリヌクレオチドを増幅して調製すればよい。
【0029】
PCRによるポリヌクレオチドの増幅反応は、例えば、PrimeSTAR HS DNA Polymerase(商品名、タカラバイオ社製)を利用することができ、付属のプロトコールに従って実験的に、目的のポリヌクレオチドが増幅する条件を探せばよい。例えば付属の緩衝液を用いた反応溶液中で、例えば、0.01U/μL PrimeSTAR HS DNA Polymerase、0.2mM dNTP、反応に使用するプライマーの濃度は、最大0.3μM、鋳型となるプラスミドDNA0.2〜20pg/mLで反応を検討すればよい。反応の温度と時間は、例えば、98℃で10秒間、55℃で5秒間、ついで72℃で、増幅したいDNAの塩基対の数に0.06を乗じた秒数の時間を、1サイクルとして、25サイクルから30サイクルの反応をおこなえばよい。また反応サイクルにおいて55℃で5秒間の設定を、56℃から72℃の間のいずれかの温度に設定して、増幅したいDNAが得られる温度を実験的に定めてもよい。
【0030】
PCRによるポリヌクレオチドの増幅反応は公知の方法に基づいて行えばよく、上述の方法に限定されない。
【0031】
また上述の調製方法で調製したポリヌクレオチドを鋳型に、アミノ酸の置換、及び/又は欠失、及び/又は付加するように設計したプライマーセットを用いてPCRで増幅を行なう、またはエラープローンPCRにて増幅を行なうことで、1残基以上のアミノ酸の置換、及び/又は欠失、及び/又は付加された、異種蛋白質をコードしたポリヌクレオチドを調製することができる。
【0032】
PCRで増幅した目的のDNAは、そのDNAを含んだPCR反応液を、例えば、アガロース電気泳動したのち、そのゲルを臭化エチジウムで染色し、例えば波長302nmあるいは波長312nmの紫外線を照射して目的のDNAを検出して、目的のDNAを含んだ部分のゲルを切り出し、そこから、DNAを精製すればよい。DNAの精製は、市販のキットを利用して精製すればよく、例えば、MERmaid Kit(商品名、Qbiogene社)やDNA Purification Kit,15,UltraClean(商品名、MO Bio Laboratories社)を精製したいDNAの長さに応じて利用すればよい。DNAの検出方法や精製の方法はこれらに限定されるものではない。
【0033】
本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を遺伝子工学的に製造するために用いるポリヌクレオチドは、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドであればよく、当業者であれば公知の方法により調製することができる。
【0034】
ポリヌクレオチドの調製法の一例としてはPCRを利用した方法がある。例えばT7ファージからT7ファージDNAを調製して、それを鋳型に用いて、適当なオリゴヌクレオチドからなるフォワードプライマーとリバースプライマーでPCRを行ってポリヌクレオチドを得ることができる。例えばT7ファージからT7ファージDNAを調製して、それを鋳型に用いて、適当なオリゴヌクレオチドからなるフォワードプライマーとリバースプライマーでPCRを行って所望のポリヌクレオチドを得ることができる。PCRに用いるフォワードプライマーとリバースプライマーは、例えばGenBank accession No.NP_041960に登録されているT7RNAポリメラーゼの塩基配列を参考にして作製すればよい。
【0035】
次に、例えば、下記の(A)から(F)をひとつの反応溶液中にて反応させるPCRを行うことで、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドを調製することができる。
【0036】
すなわち、PCRで増幅して得たT7RNAポリメラーゼをコードした塩基配列からなるポリヌクレオチドとその相補鎖からなる二本鎖ポリヌクレオチド(A)、連結させようとする異種蛋白質をコードした塩基からなるポリヌクレオチドとその相補鎖からなる二本鎖ポリヌクレオチド(B)、T7RNAポリメラーゼの1位メチオニンから数アミノ酸をコードしたオリゴヌクレオチドのフォワードプライマー(C)、T7RNAポリメラーゼの883位アラニンから数残基上流までのアミノ酸と、例えば、それに連結させようとする異種蛋白質のアミノ末端から数残基下流までの数アミノ酸の両者に跨る部分をコードしたオリゴヌクレオチドに相補的なオリゴヌクレオチドのリバースプライマー(D)、5’端側が(D)の5’端側と相補的な配列であり、その配列がコードした異種蛋白質のアミノ末端部分に続く配列のアミノ酸をコードしたオリゴヌクレオチド、すなわち、(D)と(B)の相補鎖側の、両者に跨る部分をコードしたオリゴヌクレオチドのフォワードプライマー(E)及び、T7RNAポリメラーゼと連結させようとする異種蛋白質の、例えば、カルボキシル末端を含んだカルボキシル末端側の数アミノ酸をコードしたオリゴヌクレオチドに相補的なオリゴヌクレオチドのリバースプライマー(F)をひとつの反応溶液中にて反応させるPCRを行うことで、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドを調製することができる。
【0037】
またT7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを介して、異種蛋白質が融合した本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドは、先述の(D)のプライマーの代わりに、T7RNAポリメラーゼに由来するカルボキシル末端と異種蛋白質のアミノ末端をコードしたポリヌクレオチドの間に1残基以上のアミノ酸をコードしたポリヌクレオチドに相補的なオリゴヌクレオチドのリバースプライマー(G)を用いれば調製することができる。
【0038】
またT7RNAポリメラーゼと連結させようとする異種蛋白質のカルボキシル末端に付加配列を有する本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドは、先述の(F)のプライマーの代わりに、融合させる異種蛋白質のカルボキシル末端を含むカルボキシル末端側の数アミノ酸と、そのカルボキシル末端に付加させる配列をコードしたオリゴヌクレオチドに相補的なオリゴヌクレオチド(H)を用いれば調製することができる。
【0039】
また例えば、(A)、(B)、(C)、(E)、(G)および(H)をひとつの反応溶液中にて反応させるPCRを行うことで、T7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを介して、カルボキシル末端に付加配列を有する異種蛋白質が融合した本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドを調製することができる。
【0040】
また本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドの調製には、例えば特許文献2に記載のT7RNAポリメラーゼ(GenBank accession No.NP_041960)をコードした、プラスミドpTrc99A−T7RPやpCDF2−T7RPを調製して、T7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドを作製するためのPCRの鋳型として利用してもよく、さらには本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドをコードするプラスミドの作製に用いてもよい。
【0041】
またT7RNAポリメラーゼと異種蛋白質の間には、場合によっては1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを挿入してもよい。「1残基以上のアミノ酸からなるリンカー」は、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を可溶性で発現できるリンカーであれば何でもよく、好ましくは1〜50のアミノ酸からなるリンカーを指し、さらに好ましくは、1〜20のアミノ酸から成るリンカーを指す。さらに好ましくは、1〜10のアミノ酸からなるリンカー、又は1若しくは数残基のアミノ酸からなるリンカーを指す。
【0042】
該リンカーには、例えばAsp−Pro配列及び/又はAsn−Gly配列を含んだアミノ酸配列を有するリンカーを用いてもよい。
【0043】
Asp−Pro配列は例えば70% ギ酸水溶液(pH2.5)で、アスパラギン酸(Asp)とプロリン(Pro)の間の結合が加水分解されることが知られている。またAsn−Gly配列は、例えば2M ヒドロキシルアミン水溶液(pH9)で、アスパラギン(Asn)とグリシン(Gly)の間の結合が加水分解されることが知られている。
【0044】
異種蛋白質の分子内にAsp−Pro配列やAsn−Gly配列がある場合には、その箇所のアミノ酸を予め置換しておいてもよい。異種蛋白質の分子内にあるAsp−Pro配列のアスパラギン酸(Asp)は、例えばグルタミン酸(Glu)にアミノ酸置換すればよい。また異種蛋白質の分子内にあるAsn−Gly配列のアスパラギン(Asn)は、例えばグルタミン(Gln)、また例えばアスパラギン酸(Asp)に、アミノ酸置換すればよい。
【0045】
また、本発明に用いるリンカーには、例えば1種類以上のプロテアーゼの基質となるアミノ酸配列(以下、基質アミノ酸配列と称する。)からなるペプチドを用いてもよい。特に、加水分解の位置特異性が高いプロテアーゼは、特定のアミノ酸配列を基質として認識し、特定のペプチド結合を選択的に加水分解することができることから、このようなプロテアーゼの基質アミノ酸配列からなるリンカーを有する本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質は、対応するプロテアーゼで加水分解すれば、T7RNAポリメラーゼと異種蛋白質を所望の位置で切り離すことができる。
【0046】
加水分解の位置特異性が高いプロテアーゼとその基質アミノ酸配列としては、例えば、エンテロキナーゼは4個の連続したアスパラギン酸残基(Asp)の後にリジン残基(Lys)がつながったAsp−Asp−Asp−Asp−Lysのアミノ酸配列を、トロンビンはロイシン残基−バリン残基−プロリン残基−アルギニン残基(Lue−Val−Pro−Arg)のアミノ酸配列を、活性化血液凝固X因子はイソロイシン残基−グルタミン酸残基−グリシン残基−アルギニン残基(Ile−Glu−Gly−Arg)のアミノ酸配列を、ウロキナーゼはプロリン残基−グリシン残基−アルギニン残基(Pro−Gly−Arg)のアミノ酸配列を基質として認識し、それぞれの基質アミノ酸配列のカルボキシル末端側に結合したアミノ酸との間のペプチド結合を選択的に加水分解する。したがってこれらの基質アミノ酸配列のカルボキシル末端側に異種蛋白質のアミノ末端を結合させた場合には、対応するプロテアーゼで加水分解することにより、容易に異種蛋白質を切り出すことができる。
【0047】
また例えば、HRV 3Cプロテアーゼは、ロイシン残基−グルタミン酸残基−バリン残基−ロイシン残基−フェニルアラニン残基−グルタミン残基−グリシン残基−プロリン残基(Leu−Glu−Val−Leu−Phe−Gln−Gly−Pro)からなる基質アミノ酸配列を認識し、その配列のGlnとGlyの間のペプチド結合を位置特異的に加水分解する。したがって、例えばLeu−Glu−Val−Leu−Phe−Gln−Gly−Proからなる基質アミノ酸配列のカルボキシル末端側に異種蛋白質のアミノ末端を結合させた場合には、HRV 3Cプロテアーゼで加水分解することにより、アミノ末端にGly−Proが付加した異種蛋白質が得られるが、本発明はこれらの異種蛋白質も包含するものである。
【0048】
加水分解の位置特異性が高いプロテアーゼとその基質アミノ酸配列の組み合わせは、特にこれらに限定されるものではない。
【0049】
さらに、本発明に用いるリンカーとして、上述の加水分解の位置特異性が高いプロテアーゼの基質アミノ酸配列のアミノ末端側及び/又はカルボキシル末端側に1残基以上のアミノ酸が付加されたアミノ酸配列からなるリンカーを用いてもよく、基質アミノ酸配列の少なくともカルボキシル末端側に1残基以上のアミノ酸が付加されたアミノ酸配列からなるリンカーを用いた場合には、対応するプロテアーゼで加水分解すると、少なくとも1残基以上のアミノ酸がアミノ末端に付加した異種蛋白質が得られるが、本発明はこれらの異種蛋白質も包含するものである。
【0050】
また、複数種類のプロテアーゼの基質となるアミノ酸配列からなるリンカーを用いる場合には、異種蛋白質のアミノ末端に最も近い基質アミノ酸配列を対応するプロテアーゼで加水分解すればよく、その結果、1残基以上のアミノ酸がアミノ末端に付加した異種蛋白質が得られる場合であっても、本発明はこれらの異種蛋白質を包含するものである。
【0051】
基質アミノ酸配列のカルボキシル末端側にプロリンがあると加水分解が起こらない場合があり、使用するプロテアーゼの性質とその基質配列については、公知の文献等で調べてから用いることが望ましい。
【0052】
プロテアーゼを用いた加水分解においては、使用するプロテアーゼ、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質およびそれが加水分解されて生じる異種蛋白質が不溶化を起こさずに、該プロテアーゼが反応するように反応条件等を定めればよい。例えば、反応のpHは5から8、反応温度は4℃から40℃から適宜選ばれた条件で行えばよく、本発明はこれらに限定されない。例えばアスパルティックプロテアーゼ、セリンプロテアーゼ、メタロプロテアーゼ、チオールプロテアーゼ、あるいはそれらのプロテアーゼに分類されるプロテアーゼであり耐熱性を有するプロテアーゼなどを用いる場合にはそれに応じた反応条件を探して用いればよい。
【0053】
また反応溶液への添加物の添加については、塩の種類(例えばナトリウム塩、カリウム塩、マグネシウム塩あるいはカルシウム塩など)とその濃度(例えば0Mから1M)、界面活性剤の種類(例えば、Tween20(商品名)、Tween80(商品名)、Triton X−100(商品名)、n−オクチル−β−D−グルコシド、n−オクチル−β−D−マンノシド、n−デシル−β−D−マンノシドなど)とその濃度(例えば0%から1%)、還元剤の種類(例えばジチオスレイトール、メルカプトエタノール、グルタチオンなど)とその濃度(0mMから10mM)、変性剤の種類(例えば尿素、塩酸グアニジンなど)とその濃度(0Mから2M)など、あるいはそれらの組み合わせを、位置特異的な加水分解に使用するプロテアーゼ、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質およびそれが位置特異的な加水分解されて生じる異種蛋白質が不溶化を起こさずに該プロテアーゼが反応するように定めればよい。
【0054】
さらに具体的には、特異性が高いプロテアーゼとして、例えば、エンテロキナーゼを用いる場合には、Asp−Asp−Asp−Asp−Lysのアミノ酸配列からなるリンカーを有する、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質(すなわちエンテロキナーゼの基質となる本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質)を、例えば、0.02M〜0.1Mの濃度のトリス塩酸緩衝液(pH8.0)の溶液中で反応させればよい。また反応を行う溶液には、0.001M〜0.02M塩化カルシウム、及び/又は、1M以下の濃度の塩化ナトリウム、より好ましくは0.3M以下の濃度の塩化ナトリウム、及び/又は、界面活性剤、例えばTween20(商品名)を0.01%〜0.2%濃度加えることもできる。
【0055】
反応温度は4℃〜40℃から適宜選ばれた温度で、反応時間は数分間〜数日間から適宜選ばれた時間で、エンテロキナーゼの基質となる本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質の蛋白質濃度とエンテロキナーゼの蛋白質濃度の比は、例えば、1:10から1:10000で行えばよい。
【0056】
さらに、例えばニッケルキレート樹脂にアフィニティーがあるポリヒスチジン、S−プロテインにアフィニティーがあるS−ペプチド、あるいはc−myc抗体にアフィニティーがあるc−mycペプチドなどのアフィニティーリガンドをリンカーにしてもよい。
【0057】
T7RNAポリメラーゼと異種蛋白質を連結するリンカーは、上記のような複数種類のリンカーを組み合わせて用いてもよい。
【0058】
本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドは、通常の遺伝子工学の分野で使用される相応のプラスミドを用いれば種々の宿主で発現することが可能であるが、取扱い易さ、培養の容易性、高密度培養の可否、更には遺伝子操作における宿主/ベクター系が整備されている細菌、中でもエシェリヒア(Escherichia)属細菌である大腸菌(Escherichia coli)が好ましい。
【0059】
本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を発現するためのプラスミドは、例えばpTrc99a(GenBank Accession No.U13872)、pSTV28(商品名、(株)タカラバイオ社製)、pCDF−1b、pRSF−1b(以上は、商品名、メルク(株)社製)等のプラスミドを例示できる。
【0060】
本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を発現するためのプラスミドで形質転換させる大腸菌としては、E.coli JM109、E.coli HB101、E.coli BLR(DE3)などの菌株が例示できるが、本発明はこれらに限定されない。また本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を発現するためのプラスミドで形質転換する前の大腸菌が薬剤耐性を有する大腸菌である場合には、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を発現するためのプラスミド上の薬剤耐性マーカー遺伝子は、宿主となる大腸菌の薬剤耐性とは異なるものを選択すればよい。またT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質の発現にT7プロモーターを利用したプラスミドを使用する場合には、例えば、E.coli BLR(DE3)のようにT7RNAポリメラーゼの遺伝子をもち、それを発現する大腸菌を宿主にすればよい。
【0061】
形質転換した大腸菌はプラスミドにコードされている薬剤耐性マーカー遺伝子に対応する薬剤を加えた寒天培地で培養して選別すればよい。
【0062】
本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドを組み込んだ発現用プラスミドで形質転換した大腸菌は、宿主に用いた大腸菌を培養するための公知の培地、例えばLB培地や2xYT培地に、T7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドを組み込んだ発現用プラスミド上の薬剤マーカー遺伝子に対応する薬剤を添加して培養すればよい。培養温度は15℃から37℃で実験的に定めればよい。本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチドを組み込んだ発現用プラスミドで形質転換した大腸菌に、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を可溶性の蛋白質として発現させるためには、15℃〜37℃から適宜選ばれた温度、好ましくは25℃〜30℃から適宜選ばれた温度で培養を行うとよい。
【0063】
本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質は、それをコードしたポリヌクレオチドを組み込んだ発現用プラスミドで形質転換した大腸菌を適切に培養して、増殖させ、必要に応じて適当な誘導剤を培地に加えて遺伝子発現を誘導しながら更に培養した後、その菌を集菌して凍結融解、リゾチーム消化処理、超音波処理あるいはそれらの組み合わせにより、菌を破砕すれば、可溶性画分に得ることができる。
【0064】
可溶性画分に含まれる本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質は、イオン交換クロマトグラフィーやゲルろ過クロマトグラフィー用いて精製することができる。
【0065】
また例えば、S−ペプチドタグを付加したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質であればS−プロテインを固定化した担体、例えば、S−プロテインアガロース(商品名、メルク社製)を用いて精製できる。
【0066】
またポリヒスチジンからなるいわゆるヒスチジンタグが付加したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質の場合には、ニッケルイオンやコバルトイオンなどの金属イオンをキレートした樹脂、例えばHis・Bind Resin(商品名、メルク社製)、Chelating Sepharose Fast Flow(商品名、GEヘルスケア バイオサイエンス社製)などを用いて精製することができる。
【0067】
また本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質は、シバクロンブルー(Cibacron Blue)をリガンドとして固定化した樹脂(シバクロンブルー固定化樹脂と称する)に吸着させることができる。シバクロンブルーには、Cibacron Blue F3G−A[12236−82−7]やCibacron Blue 3G−A[84116−13−2]がある。
【0068】
本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質のシバクロンブルー固定化樹脂への吸着は、ポリヌクレオチドの共存下では妨害されることから、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質の溶液にポリヌクレオチドが混在する場合には予めポリヌクレオチドを除いておくことが望ましい。
【0069】
例えばポリヌクレオチドを含んでいる本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質溶液のポリヌクレオチドは、塩類の共存下でポリエチレンイミンを添加することで沈殿させることができる。このとき加える塩類は、ポリエチレンイミンへのT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質の吸着、及びポリエチレンイミンとの共沈を防ぐことができればよい。加える塩類は、例えば塩化ナトリウム、塩化カリウムあるいは硫安が例示でき、使用する濃度、及び、使用するポリエチレンイミンの濃度は、本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質が不溶化しない条件を実験して定めればよい。例えば塩濃度0.1Mから0.5M、ポリエチレンイミン濃度0.1%から1%で検討すればよい。
【0070】
例えばT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を含んだ大腸菌破砕液で、菌密度 O.D.600が約36の菌懸濁液から調製した破砕液の場合、0.2Mの硫安存在下でポリエチレンイミンを濃度1mg/mLになるようを加えて、氷冷下で、30分間から60分間インキュベーションしたのちに、遠心分離して沈殿を除けばよい。
【0071】
除核酸の方法はこれに限定されず、公知のいかなる方法を利用してもよい。
【0072】
本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を吸着するシバクロンブルー固定化樹脂としてはTOYOPEARL AF−Blue HC−650M(商品名、東ソ−社)やBlue Sepharose 6 Fast Flow(商品名、GEヘルスケア社)が例示できる。
【0073】
本発明のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質で、T7RNAポリメラーゼと異種蛋白質との間に位置特異的な加水分解が可能な配列、例えば、プロテアーゼの基質アミノ配列を有する場合には、対応するプロテアーゼで加水分解したのちに、シバクロンブルー固定化樹脂を用いて精製を行えばよい。T7RNAポリメラーゼを含んだポリペプチドはシバクロンブルー固定化樹脂に吸着するため、この樹脂に吸着しない異種蛋白質を、T7RNAポリメラーゼを含んだポリペプチドや、未消化の融合蛋白質と分離することができる。
【0074】
例えばエンテロキナーゼの基質となるアミノ酸配列である、Asp−Asp−Asp−Asp−Lys配列をリンカーにもつ本発明の融合蛋白質の場合には、その融合蛋白質を、エンテロキナーゼを用いて、カルボキシル末端側にAsp−Asp−Asp−Asp−Lys配列を有するT7RNAポリメラーゼと、異種蛋白質とに加水分解したのちに、例えば、TOYOPEARL AF−Blue HC−650M(商品名、東ソ−社)を用いて精製を行えばよい。このとき、T7RNAポリメラーゼを含んだポリペプチドはTOYOPEARL AF−Blue HC−650Mに吸着する。異種蛋白質が樹脂に吸着した場合であっても、0Mから2M塩化ナトリウムの塩濃度勾配で溶出を行って、カルボキシル末端側にAsp−Asp−Asp−Asp−Lys配列を有するT7RNAポリメラーゼとの分離を検討して、分離可能であれば精製に採用すればよい。
【0075】
また、例えばAsp−Asp−Asp−Asp−Lys配列をリンカーにもち、異種蛋白質のカルボキシル末端にポリヒスチジンタグを付加した本発明の融合蛋白質であれば、エンテロキナーゼを用いて加水分解したのち、シバクロンブルー固定化樹脂で精製し、さらに、例えばニッケルキレート樹脂を用いた精製を行えば、カルボキシル末端にポリヒスチジンタグが付加した異種蛋白質を精製することができる。
【0076】
また必要があればリンカーの加水分解に用いたプロテアーゼに結合する、プロテアーゼインヒビターあるいは抗体を、固定化した樹脂を利用して、使用したプロテアーゼを除去してもよい。
【0077】
また融合した異種蛋白質に対する抗体やアフィニティーリガンドを固定化した樹脂があればそれを利用して異種蛋白質を精製してもよい。
また上記の精製方法を組み合わせて行ってもよい。
【0078】
以下に本発明を更に詳細に説明するために実施例を示すが、これら実施例は本発明の一例を示すものであり、本発明はこれらの実施例に限定されるものではない。
【実施例】
【0079】
実施例1 プラスミドpCDF20−EPObpf40の作製
T7RNAポリメラーゼ(配列番号1)のカルボキシル末端に、ヒトエリスロポエチンレセプター(配列番号2)の1位から225位までからなるポリペプチドを連結した融合蛋白質(EPObpf40、配列番号7、図1参照)をコードしたポリヌクレオチド(配列番号8)をコードした、プラスミドpCDF20−EPObpf40(図3)を作製した。
【0080】
まず特許文献2に記載のプラスミドpCDF2−T7RPを制限酵素XbaIで消化して得た5.9kbpの直鎖DNAを、DNA Blunting Kit(商品名、タカラバイオ社製)を用いてDNAの末端を平滑化したのち、DNAリガーゼを用いてライゲーションして環化して、制限酵素XbaIサイトを含まない、5.9kbpのプラスミドpCDF20−T7RPを作製した。そのプラスミドを鋳型にして、配列番号11と配列番号12のプライマーをプライマーセットにしてPCRを行い、0.1kbpのDNA(DNA−1と称する)を得た。
【0081】
プラスミドpCDF20−T7RPを制限酵素BlnIで消化後、ウシ小腸アルカリホスファターゼで脱リン酸化処理して得られた直鎖状DNAを、さらに制限酵素MfeIで消化して、5.8kbpのDNA(DNA−2と称する)を得た。一方、ヒトエリスロポエチンレセプターcDNAをコードしたプラスミド(OriGene社製、品番SC125440)を鋳型にして、配列番号13と配列番号14のプライマーセットを用いてPCRを行い、0.7kbpのDNAを合成し、そのDNAを制限酵素MfeIとXbaIで二重消化して得た0.7kbpのDNA(DNA−3と称する)を得た。
【0082】
得られたDNA−2とDNA−3を、DNAリガーゼを用いてライゲーションして環化させ、プラスミドpCDF20−EPObpf2Hを調製した。
【0083】
プラスミドpCDF20−EPObpf2Hは、T7RNAポリメラーゼの1位メチオニンから859位アスパラギン酸までのアミノ酸配列に続き、Asp−Asp−Asp−Lysの4残基を介して、配列番号2に示したヒトエリスロポエチンレセプターの1位アラニンから225位アスパラギン酸までと、それに続けて6個のヒスチジンを連結した融合蛋白質(EPObpf2H、配列番号9、図2参照)をコードしたポリヌクレオチド(配列番号10)をコードしたプラスミドである。
【0084】
そのpCDF2DF20−EPObpf2HとDNA−1(0.1kbp)のセットを鋳型にして、配列番号11と配列番号13のプライマーをプライマーセットにしてPCRを行い、0.8kbpのDNAを得た。そのDNAを制限酵素MfeI、ついで制限酵素XbaIで消化して0.8kbpのDNA(DNA−4と称する)を得た。
【0085】
そのDNA−4を、プラスミドpCDF20−T7RPを制限酵素BlnI消化後、ウシ小腸アルカリホスファターゼで脱リン酸化処理して得られた直鎖状DNAを、さらに制限酵素MfeIで消化して得た5.8kbpのDNA(DNA−5と称する)と、ライゲーションして環化させ、プラスミドを調製した。
【0086】
そのプラスミドにより大腸菌HB101を形質転換し、50μg/mL カルベニシリンナトリウム、5g/L 酵母エキス、10g/L トリプトン及び10g/L 塩化ナトリウムを含む20g/L 寒天の固体培地(LB/Carb寒天培地と称する)で培養して、目的のプラスミドを有する大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf40を得た。
【0087】
実施例2 融合蛋白質EPObpf40の調製
大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf40を、50mg/L カルベニシリンナトリウム、10g/L 酵母エキス、16g/L トリプトン、5g/L 塩化ナトリウムを含む培地(2xYT/Carb培地と称する)に植菌して25℃で16時間培養して、菌密度(O.D.600)が6.8の培養液、0.12Lを得た。
【0088】
その培養液から大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf40を、遠心分離して集菌したのち、0.001M エチレンジアミン四酢酸(EDTA)を含む0.05Mトリス塩酸緩衝液(pH8.0)に懸濁したのち、遠心分離して菌を洗浄後、菌密度(O.D.600)の値がおよそ36になるように、0.1mg/mL 卵白リゾチーム、0.0001M 4−(アミノエチル)ベンゼンスルオニルフルオリド、0.0001M フェニルメタンスルオニルフルオリド、1%(V/V) ジメチルスルホキシド及び0.001M EDTAを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)に、菌を懸濁した。その懸濁液を0℃で1時間インキュベーションしたのち、1/500容量の0.5M ジチオスレイトールを混合して、−80℃で凍結した。それを解凍後、超音波破砕機に供したのち、破砕して得た液を遠心分離して可溶性画分を得た。
【0089】
実施例3 シバクロンブルー固定化樹脂を用いた融合蛋白質EPObpf40の精製
実施例2と同様にして得られた可溶性画分をカートリッジフィルター(ポアサイズ0.2μm)で滅菌ろ過したのち、そのろ液に1/10容量の0.22M 硫安水溶液を混合し、その混合液の1/50容量の50mg/mL ポリエチレンイミン水溶液を混合した。それを0℃で1時間インキュベーションしたのち、遠心分離して不溶化した核酸を除去して可溶性画分を得て、それを0.3M 塩化ナトリウムを含む0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)(平衡化緩衝液1と称する)中で4℃、一晩透析した。透析後に遠心分離をして可溶性画分を得て、それを滅菌ろ過してろ液22.7mLを得た。
【0090】
その溶液の20mLを平衡化緩衝液1で平衡化したTOYOPEARL AF−Blue HC−650M樹脂を4mL充填したカラムにロードした。その樹脂を、平衡化緩衝液1を1回あたり8mLロードして3回洗浄したのち、2M 塩化ナトリウムを含む0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)で吸着画分を溶出し、フラクションサイズ2mLで分取した。
【0091】
得られた画分のそれぞれを等容量の20mg/mL ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)、40mg/mL 2−メルカプトエタノール、570mg/mL グリセリン及び1mg/mL ブロモフェノールブルーを含む0.25M トリス塩酸緩衝液(pH6.8)(SDSサンプル緩衝液と称する)を加えて98℃で5分間加熱してSDS化したのち、SDS−ポリアクリルアミド電気泳動(SDS−PAGE)で分析した。
【0092】
図4は、レーン1と14に分子量マーカー蛋白質(上から順に175kDa、80kDa、58kDa、46kDa、30kDa、25kDa)、大腸菌HB101/pCDF20−T7RP(実施例1参照)のライセート(レーン2;サイズ比較試料)、TOYOPEARL AF−Blue HC−650M樹脂による分画前の試料(レーン3)、樹脂を素通りした画分(レーン4)、樹脂を洗浄して得た画分(レーン5、6及び7)、樹脂に吸着した画分を溶出して得た画分(溶出した順に、レーン8から13)を電気泳動したのち、Coomasie Brilliant Blue R−250で染色(CBB染色と称する)して蛋白質を検出した結果である。
【0093】
図4のレーン9と10にアローヘッド(黒三角)が指し示すEPObpf40(分子量124kDa)が検出され、TOYOPEARL AF−Blue HC−650M樹脂に吸着したことがわかる。
【0094】
得られた画分の蛋白質濃度をγ−グロブリンを標準蛋白質に用いて、プロテインアッセイ(商品名、バイオラッド社)で比色定量した結果、分画した試料全量159mg(100%)に対して、樹脂を素通りした画分と樹脂を洗浄して得た画分を合わせた量の不純蛋白質87mg(55%)を除去した、EPObpf40を含んだ画分35mg(22%)を得ることができた。
【0095】
実施例4 プラスミドpCDF20−EPObpf40Hの作製
T7RNAポリメラーゼ(配列番号1)のカルボキシル末端にヒトエリスロポエチンレセプター(配列番号2)の1位から225位までからなるポリペプチドを連結し、それに続けて6個のヒスチジンを連結した融合蛋白質をコードした配列(EPObpf40H、配列番号15、図1参照)からなるポリヌクレオチド(配列番号16)をコードした、プラスミドpCDF20−EPObpf40H(図5)を作製した。
【0096】
プラスミドpCDF20−EPObpf2Hと実施例1のDNA−1(0.1kbp)のセットを鋳型にして、配列番号11と配列番号17のプライマーをプライマーセットにしてPCRを行い、0.8kbpのDNAを得た。そのDNAを制限酵素MfeI、ついで制限酵素BlnIで消化して0.8kbpのDNA(DNA−6と称する)を得た。ついでDNA−6を実施例1のDNA−5とライゲーションして環化させ、プラスミドを調製した。
【0097】
そのプラスミドにより大腸菌HB101を形質転換し、LB/Carb寒天培地で培養して、目的のプラスミドを有する大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf40Hを得た。
【0098】
実施例5 融合蛋白質EPObpf40Hの精製
実施例2と同様にして大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf40Hを培養し菌密度(O.D.600)が6.6の培養液、0.12Lを得た。その培養液から得た大腸菌から、実施例2と同様にして、可溶性画分を得た。
【0099】
その可溶性画分(EPObpf40Hを含んでいる画分)を、カートリッジフィルター(ポアサイズ0.2μm)で滅菌ろ過したのち、1/10容量の0.22M 硫安水溶液を混合したのち、その混合液の1/49容量の50mg/mL ポリエチレンイミン水溶液を混合した。それを0℃で1時間インキュベーションしたのち、遠心分離して可溶性画分を得た。それを0.3M 塩化ナトリウムを含んだ0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)中で、4℃で一晩透析したのち、1/19容量の1M イミダゾール水溶液を添加した。その溶液を0.05M イミダゾール及び0.3M 塩化ナトリウムを含んだ0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)(平衡化緩衝液2と称する)で平衡化したニッケルキレート樹脂(His・Bind Resin、商品名、メルク社製)を2mL充填したカラムにロードしたのち、5mLの平衡化緩衝液2をロードして樹脂を洗い込み、素通り画分としてプールした。その樹脂をさらに15mLの平衡化緩衝液2を ロードして洗浄したのち、0.2M イミダゾール及び0.3M 塩化ナトリウムを含んだ0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)で、フラクションサイズ1mLで吸着画分を溶出して分取した。
【0100】
図6は、レーン1と11は分子量マーカー蛋白質、ニッケルキレート樹脂による分画前の試料(レーン2)、樹脂を素通りした画分(レーン3)、樹脂を洗浄して得た画分(レーン4)、樹脂に吸着した画分を溶出して得た画分(溶出した順に、レーン5から10)を電気泳動したのち、CBB染色をして蛋白質を検出した結果である。EPObpf40Hはレーン6から9に検出され、レーン2の試料に比べて精製されたことがわかる。
【0101】
ニッケルキレート樹脂に吸着したEPObpf40H(分子量124kDa)の画分の蛋白質濃度は、γ−グロブリンを標準蛋白質に用いてプロテインアッセイで比色定量した。
【0102】
本実施例で得られたEPObpf40Hは2.0mgであった。
【0103】
実施例6 プラスミドpCDF20−EPObpf50Hの作製
T7RNAポリメラーゼ(配列番号1)のカルボキシル末端に、Gly−Asp−Asp−Asp−Asp−Lysの6残基を介して、ヒトエリスロポエチンレセプター(配列番号2)の1位から225位までからなるポリペプチドを連結し、それに続けて6個のヒスチジンを連結した融合蛋白質(EPObpf50H、配列番号18、図1参照)をコードしたポリヌクレオチド(配列番号19)をコードした、プラスミドpCDF20−EPObpf50H(図7)を作製した。
【0104】
プラスミドpCDF20−T7RPを鋳型にして、配列番号11と配列番号20のプライマーをプライマーセットにしてPCRを行い0.1kbpのDNA(DNA−7と称する)を得た。
【0105】
プラスミドpCDF20−EPObpf2Hを鋳型にして、配列番号17のプライマーと上記DNA−7をプライマーセットとして用いてPCRを行い、0.8kbpのDNAを得た。そのDNAを制限酵素MfeI、ついで制限酵素BlnIで消化して0.8kbpのDNA(DNA−8と称する)を得た。
【0106】
DNA−8を実施例1のDNA−5とライゲーションして環化させ、プラスミドを調製した。
【0107】
そのプラスミドにより大腸菌HB101を形質転換し、LB/Carb寒天培地で培養して、目的のプラスミドを有する大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf50Hを得た。
【0108】
実施例7 融合蛋白質EPObpf50Hの精製
実施例2と同様にして大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf50Hを培養し菌密度(O.D.600)が6.6の培養液、0.12Lを得た。その培養液から得た大腸菌から、実施例2と同様にして、ただし、ジチオスレイトールは使用せずに可溶性画分を得た。
【0109】
その可溶性画分(EPObpf50Hを含んでいる画分)を、実施例5と同様にしてニッケルキレート樹脂を用いて精製した。
【0110】
図8のレーン1と11は分子量マーカー蛋白質、ニッケルキレート樹脂による分画前の試料(レーン2)、樹脂を素通りした画分(レーン3)、樹脂を洗浄して得た画分(レーン4)、樹脂に吸着した画分を溶出して得た画分(溶出した順に、レーン5から10)を電気泳動したのち、CBB染色をして蛋白質を検出した結果であり、図中のアローヘッドが指し示すレーン6と7に電気泳動した画分がEPObpf50Hを多く含んでいた。
【0111】
ニッケルキレート樹脂に吸着したEPObpf50H(分子量125kDa)の画分の蛋白質濃度をγ−グロブリンを標準蛋白質に用いてプロテインアッセイで比色定量した。
【0112】
本実施例で得られたEPObpf50Hは1mgであった。
【0113】
実施例8 エンテロキナーゼによる融合蛋白質EPObpf50Hの加水分解
実施例7と同様にして得られた可溶性画分(EPObpf50Hを含んでいる画分)をカートリッジフィルター(ポアサイズ0.2μm)で滅菌ろ過したのち、そのろ液9mLにエンテロキナーゼ(Enterokinase,light chain、商品名、NEW ENGLAND BioLabs社)36ngを加えて、25℃で18時間インキュベーションした。
【0114】
実施例9 EPObpHの精製
融合蛋白質EPObpf50Hをエンテロキナーゼで加水分解し、すなわち配列番号18の889位と890位の間で加水分解して生じた、配列番号18の890位から1120位の配列からなるポリペプチド、すなわち、ヒトエリスロポエチンレセプターの1位アラニンから225位グルタミン酸にヒスチジン6残基が付加したポリペプチド(EPObpHと称する)を以下のように精製した。
【0115】
実施例8のエンテロキナーゼを加えてインキュベーションした可溶性画分に、1/10容量の0.22M 硫安水溶液を混合したのち、その混合液の1/50容量の50mg/mL ポリエチレンイミン水溶液を混合した。それを0℃で1時間インキュベーションしたのち、遠心分離して不溶化した核酸を除去して可溶性画分を得て、それを平衡化緩衝液1中で4℃、一晩透析した。その透析後に遠心分離をして可溶性画分を得た。
【0116】
その可溶性画分9mLを平衡化緩衝液1で平衡化したTOYOPEARL AF−Blue HC−650M樹脂を1.8mL充填したカラムにロードし、カラム非吸着画分を得た。その画分の総蛋白質量は17.2mgであった。
【0117】
そのカラム非吸着画分に1/19容量の1M イミダゾール水溶液を添加したのち、平衡化緩衝液2で平衡化したニッケルキレート樹脂(His・Bind Resin)を2mL充填したカラムにロードした。その樹脂を、平衡化緩衝液2を10mLロードして洗浄したのち、0.2M イミダゾール及び0.3M 塩化ナトリウムを含む0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)で吸着画分を溶出し、フラクションサイズ1mLで分取した。
【0118】
実施例10 EPObpHの分析
実施例9で得た画分をSDS−PAGEに供したのち、10%(V/V) メタノールを含んだ0.01M シクロヘキシルアミノプロピパンスルホン酸(CAPS)−水酸化ナトリウム緩衝液(pH11)(CAPS緩衝液と称する)中で電気泳動して、PVDF膜に転写した。その膜を0.15M 塩化ナトリウム及び0.5mg/mL Tween20を含んだ0.05M トリス塩酸緩衝液(pH7.5)(TBS−Tと称する)で調製した5mg/mL ウシ血清アルブミン溶液(BSA/TBS−T溶液と称する)でブロッキングしたのち、ウエスタンブロッティングを行い、抗ヒトエリスロポエチンレセプター抗体を用いて検出した。
【0119】
ウエスタンブロッティングの手順はまずブロッキングした膜を、1μg/mL マウス抗ヒトエリスロポエチン抗体を含むBSA/TBS−T溶液中に浸漬して、室温で1時間振とうしたのち、TBS―Tで洗浄して、B/F分離した。次にその膜を濃度が1μg/mLの、西洋わさびペルオキシダーゼ(HRP)標識されたヤギ抗マウスIgG(H+L)抗体を含むBSA/TBS−T溶液中に浸漬して、室温で1時間振とうしたのち、B/F分離した。次にその膜に結合したHRP標識ヤギ抗マウスIgG(H+L)抗体のHRP活性を、0.1% 過酸化水素及び5mM 4−クロロナフトール含む24.3mMクエン酸−51.4mMリン酸水素二ナトリウム緩衝液(pH5)を基質溶液として用いて室温で20分間呈色反応を行って、EPObpf50HおよびEPObpHの検出を行った。
【0120】
図9はSDS−PAGE、図10はウエスタンブロッティングの結果である。
【0121】
それぞれのレーン1と15は分子量マーカー蛋白質、レーン2は、エンテロキナーゼ処理前の可溶性画分、レーン3はエンテロキナーゼ処理後の可溶性画分、TOYOPEARL AF−Blue HC−650M樹脂のカラム非吸着画分(レーン4)、実施例3と同様に洗浄して得られた全画分(レーン5)、及び実施例3と同様に得られた吸着した画分(溶出順にレーン6から9)、ニッケルキレート樹脂にロードした画分(レーン10;レーン4と同じ画分)、ニッケルキレート樹脂のカラム非吸着画分(レーン11)及び吸着した画分(溶出順にレーン12から14)であり、図9と10の結果からレーン13と14に精製されたEPObpHがあることがわかる。
【0122】
蛋白質濃度をγ−グロブリンを標準蛋白質に用いて、プロテインアッセイで比色定量した結果、得られたEPObpHは0.29mgであった。
【0123】
実施例11 EPObpH結合樹脂へのヒトエリスロポエチンの吸着
大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf50Hを培養し菌密度(O.D.600)が5.3の培養液、0.5Lから得た菌から、実施例9と同様にしてEPObpHの画分(総蛋白質量1mg)を得た。そのEPObpHの溶液(2.8mL)を0.2M イミダゾール及び0.3M 塩化ナトリウムを含む0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)で平衡化したTOYOPEARL AF−Blue HC−650M樹脂を0.2mL充填したカラムにロードし、カラム非吸着画分にEPObpHは0.4mgを得た。
【0124】
そのEPObpH(0.24mg)溶液の緩衝液組成を、0.05M イミダゾール及び0.3M 塩化ナトリウムを含む0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)に調整したのち、ニッケルキレート樹脂を0.1mL充填したカラムにロードした。その樹脂を、20mLの平衡化緩衝液2で洗浄した。その樹脂に0.25mg/mLに調製したCHO細胞由来リコンビナント・ヒトエリスロポエチン(メルク社製)を0.2mLロードしたのち、同組成の緩衝液10mLで樹脂を洗浄した。そののち、8M 尿素、0.2Mイミダゾール及び0.3M 塩化ナトリウムを含む0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)、5mLで溶出を行った。カラムへの通液は流速を0.1mL/minで行った。
【0125】
なお同様の操作を、EPObpHを結合していない樹脂を用いて行った場合にはCHO細胞由来リコンビナント・ヒトエリスロポエチンは樹脂に吸着しなかった。
【0126】
EPObpHを結合した樹脂を用いて得られたフラクション(分画サイズ1mL)は、エンザイムイムノアッセイを行って分析した。
【0127】
エンザイムイムノアッセイは、96穴イムノプレートに4μg/mLウサギ抗エリスロポエチンポリクローナル抗体を、0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)を1ウエルあたり100μL加えて、4℃で18時間インキュベーションしたのち、TBS−TでリンスしてB/F分離し、ついでBSA/TBS−Tを1ウエルあたり200μL加えて、30℃で2時間インキュベーションしてブロッキングしてから行った。
【0128】
ブロッキングしたプレートはTBS−TでリンスしてB/F分離したのち、BSA/TBS−Tで希釈して調製した試料を1ウエルあたり100μL加えて、30℃で1時間インキュベーションしたのち、B/F分離した。次いで0.8μg/mLビオチン標識抗エリスロポエチンモノクローナル抗体を1ウエルあたり100μL加えて、30℃で1時間インキュベーションしたのち、B/F分離し、さらに0.6μg/mL HRP標識ストレプトアビジンを1ウエルあたり100μL加えて、30℃で30分間インキュベーションした。
【0129】
それをB/F分離したのち、TMB Microwell Peroxidase Substrate(2−Component System)(製品名、Kirkegaard & Perry Laboratories社)を1ウエルあたり100μL加えて37℃で20分間反応し、それに1Mリン酸水溶液を1ウエルあたり50μL加えて反応停止後、波長450nmの吸光度(O.D.450)を測定した。
【0130】
分析の結果、EPObpHを結合した樹脂を素通りした画分にCHO細胞由来リコンビナント・ヒトエリスロポエチンは約35μg検出されたが、8M 尿素、0.2M イミダゾール及び0.3M 塩化ナトリウムを含む0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)で溶出した画分に約15μgが検出され、樹脂上のEPObpHにCHO細胞由来リコンビナント・ヒトエリスロポエチンが吸着したことがわかった。
【0131】
実施例12 プラスミドpCDF20−EPObpf50の作製
T7RNAポリメラーゼ(配列番号1)のカルボキシル末端に、Gly−Asp−Asp−Asp−Asp−Lysの6残基を介して、ヒトエリスロポエチンレセプター(配列番号2)の1位から225位までからなるポリペプチドを連結した融合蛋白質(EPObpf50、配列番号21、図1参照)をコードしたポリヌクレオチド(配列番号22)をコードした、プラスミドpCDF20−EPObpf50(図11)を作製した。
【0132】
プラスミドpCDF20−EPObpf50Hを、制限酵素MfeIついでEcoRVで消化し0.4kbpのDNA(DNA−9と称する)得た。
【0133】
一方プラスミドpCDF20−EPObpf40を、制限酵素MfeIついでEcoRVで消化して6.2kbpのDNA(DNA−10と称する)を得た。
【0134】
DNA−9を上記のDNA−10とライゲーションして環化させ、プラスミドを調製した。
【0135】
そのプラスミドにより大腸菌HB101を形質転換し、LB/Carb寒天培地で培養して、目的のプラスミドを有する大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf50を得た。
【0136】
実施例13 プラスミドpCDF20−EPObpf60Hの作製
T7RNAポリメラーゼ(配列番号1)のカルボキシル末端に、Gly−Ser−Pro−Gly−Argの5残基を介してヒトエリスロポエチンレセプター(配列番号2)の1位から225位までからなるポリペプチドを連結し、それに続けて6個のヒスチジンを連結した融合蛋白質(EPObpf60H、配列番号23、図1参照)をコードしたポリヌクレオチド(配列番号24)をコードした、プラスミドpCDF20−EPObpf60H(図12)を作製した。
【0137】
まず実施例6のプラスミドpCDF20−EPObp50Hを鋳型にして、配列番号17と配列番号25のプライマーをプライマーセットにしてPCRを行い、0.7kbpのDNAを得た。そのDNAを制限酵素BamHIで消化して0.7kbpのDNA(DNA−11と称する)を得た。
【0138】
一方、プラスミドpCDF20−T7RPを鋳型にして、配列番号11と配列番号26のプライマーをプライマーセットにしてPCRを行い、0.1kbpのDNAを得た。そのDNAを制限酵素BamHIで消化して0.1kbpのDNA(DNA−12と称する)を得た。
【0139】
DNA−11とDNA−12をライゲーションしたのち、配列番号11と配列番号17のプライマーをプライマーセットにしてPCRを行い、0.8kbpのDNAを得た。そのDNAを制限酵素MfeI、ついで制限酵素BlnIで消化して0.8kbpのDNA(DNA−13)を得た。
【0140】
DNA−13を実施例1のDNA−5とライゲーションして環化させ、プラスミドを調製した。
【0141】
そのプラスミドにより大腸菌HB101を形質転換し、LB/Carb寒天培地で培養して、目的のプラスミドpCDF20−EPObpf60Hを有する大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf60Hを得た。
【0142】
実施例14 融合蛋白質EPObpf60Hの発現
大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf60Hを2xYT/Carb培地に植菌して、30℃で一晩、培養した。その培養液を2つに分け、その一方に濃度が0.1mMになるようにIPTGを添加し、それぞれを25℃で2時間培養した。
【0143】
得られた菌体を0.001M EDTAを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)でリンスしたのち、同組成の緩衝液にO.D.600が10になるように再懸濁し、同容量のSDSサンプル緩衝液を加えて98℃で5分間加熱してSDS化したのち、SDS−PAGEで分析した。
【0144】
図13のレーン1は分子量マーカー蛋白質、EPObpf50H(比較試料、レーン2、IPTGなし)、EPObpf50H(比較試料、レーン3、IPTGあり)、EPObpf60H(レーン4、IPTGなし)、EPObpf60H(レーン5、IPTGあり)であり、レーン4と5にEPObpf60H(125kDa)がIPTGの添加の有無によらず発現していることがわかる。
【0145】
実施例15 融合蛋白質EPObpf60Hの精製
実施例2と同様にして大腸菌HB101/pCDF20−EPObpf60Hを培養し菌密度(O.D.600)が4.8の培養液、約1Lを得た。
その培養液から得た大腸菌(湿菌体重量4.6g)から、実施例2と同様にして、可溶性画分を得た。
その可溶画分を平衡化緩衝液1中で、4℃で一晩透析したのち、イミダゾールを終濃度0.05Mになるように添加した。
その溶液(EPObpf60Hの溶液)を2回にわけて、以下のように精製した。
平衡化緩衝液2(実施例5参照)で平衡化したニッケルキレート樹脂(His・Bind Resin、商品名、メルク社製)10mLを充填したカラムに、EPObpf60Hの溶液をロードしたのち、50mLの平衡化緩衝液2で洗浄したのち、0.2M イミダゾール及び0.3M塩化ナトリウムを含む0.02M リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5)で、フラクションサイズ5mLで吸着画分を溶出して分取した。
吸着画分の蛋白質濃度をγ−グロブリンを標準蛋白質に用いて、プロテインアッセイで比色定量した結果、得られたEPObpf60Hの合計量は68.8mgであった。
【0146】
実施例16 プラスミドpCDF20−EPOf60の作製
T7RNAポリメラーゼ(配列番号1)のカルボキシル末端に、Gly−Ser−Pro−Gly−Argの5残基を介して、エリスロポエチン(配列番号3)を連結した融合蛋白質(EPOf60、配列番号27、図14)をコードしたポリヌクレオチド(配列番号28)をコードした、プラスミドpCDF20−EPOf60(図15)を作製した。
【0147】
まず、配列番号31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47及び48のプライマーセットを用いてPCRで増幅した、0.34kbpのDNAを制限酵素MfeIとPstIで二重消化したDNA(DNA−14と称する)を得た。
【0148】
またプライマー配列番号47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59及び60のプライマーセットを用いてPCRで増幅した、0.25kbpのDNAを制限酵素PstIとBlnIで二重消化したDNA(DNA−15と称する)を得た。実施例1に記載のDNA−5と、DNA−14およびDNA−15を、DNAリガーゼを用いてライゲーションして環化させ、プラスミドpCDF20−EPOf2を作製した。
【0149】
プラスミドpCDF20−EPOf2は、T7RNAポリメラーゼ(配列番号1)の1位メチオニンから859位アスパラギン酸までのアミノ酸配列に続き、Asp−Asp−Asp−Lysの4残基を介して、配列番号3に示したヒトエリスロポエチンの1位アラニンから166位アルギニンまでを連結した融合蛋白質(EPObpf2、配列番号29、図2参照)をコードしたポリヌクレオチド(配列番号30)をコードした、プラスミドである。
【0150】
プラスミドpCDF20−EPOf2鋳型にして、配列番号60と配列番号61のプライマーセットを用いてPCRを行い、0.5kbpのDNAを得て、そのDNAを制限酵素BamHIで消化して0.5kbpのDNA(DNA−16と称する)を得た。
【0151】
実施例13のDNA−12と、DNA−16をライゲーションしたのち、配列番号11と配列番号60のプライマーセットにしてPCRを行い、0.6kbpのDNAを得た。そのDNAを制限酵素MfeI、ついで制限酵素BlnIで消化して0.6kbpのDNA(DNA−17と称する)を得た。
【0152】
DNA−17を実施例1のDNA−5とライゲーションして環化させ、プラスミドを調製した。
【0153】
そのプラスミドにより大腸菌HB101を形質転換し、LB/Carb寒天培地で培養して、目的のプラスミドを有する大腸菌HB101/pCDF20−EPOf60を得た。
【0154】
実施例17 融合蛋白質EPOf60の発現
大腸菌HB101/pCDF20−EPOf60を2xYT/Carb培地に植菌して、30℃で一晩、培養した。その培養液を2つに分け、その一方に濃度が0.1mMになるようにイソプロピル−1−チオ−β−D−ガラクトシド(IPTG)を添加し、それぞれを25℃で2時間培養した。
【0155】
得られた菌体を0.001M EDTAを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)でリンスしたのち、同組成の緩衝液に菌密度がO.D.600で10になるように再懸濁し、同容量のSDSサンプル緩衝液を加えて98℃で5分間加熱してSDS化したのち、SDS−PAGEで分析した。
【0156】
図16のレーン1は分子量マーカー蛋白質、レーン2はEPOf60(IPTGなし)、レーン3はEPOf60(IPTGあり)である。レーン3の矢印が指し示す位置にEPOf60(118kDa)が発現していることがわかった。
【0157】
実施例18 ウロキナーゼによる融合蛋白質EPOf60の加水分解
大腸菌HB101/pCDF20−EPOf60を菌密度がO.D.600で0.2になるように2xYT/Carb培地に植菌して、37℃で3時間培養したのち、0.1mMの濃度になるようにIPTGを加えて、さらに25℃で3時間培養した。
【0158】
得られた菌体を0.001M EDTAを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)でリンスしたのち、0.1mg/mL 卵白リゾチーム、0.001M EDTAを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)にO.D.600が36になるように再懸濁し、氷冷下で1時間インキュベーションしたのち、−80℃に凍結した。それを解凍したのち、超音波破砕し、ついで遠心分離して上清を得た。それをカートリッジフィルター(ポアサイズ0.2μm)で滅菌ろ過して、そのろ液を可溶性画分とした。その可溶性画分200μLに、0.3mg/mL 天然型ウロキナーゼ(特開昭62−143686に記載の天然型プロウロキナーゼ様ポリペプチドを活性化した酵素)あるいは、0.3mg/ml 変異型ウロキナーゼ(特開昭62−143686に記載の変異体(Q135D157)プロウロキナーゼ様ポリペプチドを活性化した酵素)を、50μL加えて、4℃でインキュベーションした。
【0159】
4℃で68時間インキュベーションした液の一部を、それぞれ、SDS−PAGEに供したのち、CAPS緩衝液中で電気泳動して、PVDF膜に転写した。その膜をBSA/TBS−T溶液中でブロッキングしたのち、ウエスタンブロッティング分析を行い、抗ヒトエリスロポエチン抗体を用いて検出した。
【0160】
ウエスタンブロッティングの手順は、まずブロッキングした膜を、0.5μg/mL ビオチン標識マウス抗ヒトエリスロポエチン抗体を含むBSA/TBS−T溶液中に浸漬して、室温で1時間振とうしたのち、TBS−Tで洗浄してB/F分離した。次にその膜を0.6μg/mL 西洋わさびペルオキシダーゼ(HRP)標識ストレプトアビジンを含むBSA/TBS−T溶液中に浸漬して、室温で1時間振とうしたのち、B/F分離した。次にその膜に結合したHRP標識ストレプトアビジンのHRP活性を、0.1% 過酸化水素及び5mM 4−クロロナフトールを含む24.3mM クエン酸−51.4mM リン酸水素二ナトリウム緩衝液(pH5)を基質溶液として用いて室温で20分間呈色反応を行って検出し、エリスロポエチンの検出を行った。
【0161】
図17のレーン1は68時間インキュベーションした大腸菌HB101/pCDF20-EPOf60の可溶性画分(ウロキナーゼなし)、レーン2は天然型ウロキナーゼを加えて68時間インキュベーションした大腸菌HB101/pCDF20-EPOf60の可溶性画分、レーン3は変異型ウロキナーゼを加えて68時間インキュベーションした大腸菌HB101/pCDF20-EPOf60の可溶性画分をそれぞれ分析した結果である。矢印で示した位置にエリスロポエチン(18kDa)が検出された。
【0162】
実施例19 プラスミドpCDF20−FcBPf51Hの作製
T7RNAポリメラーゼ(配列番号1)のカルボキシル末端に、Gly−Ser−Asp−Asp−Asp−Asp−Lysの7残基を介して、抗体レセプター(FcγRI)(配列番号4)の1位から274位までからなるポリペプチドを連結し、それに続けて6個のヒスチジンを連結した融合蛋白質(FcBPf51H、配列番号62、図18)をコードしたポリヌクレオチド(配列番号63)をコードした、プラスミドpCDF20−FcBPf51H(図19)を作製した。
【0163】
まず、第一段階目のPCRを、特開2008−245580に記載のプラスミドpECFcRを鋳型にして、配列番号64と配列番号65のプライマーセットを用いて行い、0.8kbpのDNA(DNA−18と称する)を得た。
【0164】
次に第二段階目のPCRを、プラスミドpECFcRを鋳型にして、DNA−18と配列番号66のプライマーセットを用いて行い、0.9kbpのDNA(DNA−19と称する)を得た。
【0165】
次に第三段階目のPCRを、DNA−19を鋳型にして、配列番号64と配列番号67のプライマーセットを用いて行い、0.9kbpのDNAを得て、それを制限酵素BamHIで消化して0.9kbpのDNA(DNA−20と称する)を得た。
【0166】
そのDNA−20を、プラスミドpCDF20−EPObpf60Hを制限酵素NaeIとBamHIで消化して得た6.1kbpのDNA(DNA−21と称する)とライゲーションして環化させ、プラスミドを調製した。
【0167】
そのプラスミドにより大腸菌JM109を形質転換し、LB/Carb寒天培地で培養して、目的のプラスミドを有する大腸菌JM109/pCDF20−FcBPf51Hを得た。
【0168】
実施例20 FcBPf51Hの調製
大腸菌JM109/pCDF20−FcBPf51Hを2xYT/Carb培地に植菌して28℃で15時間培養して、菌密度(O.D.600)が8.3の培養液、0.12Lを得た。
【0169】
その培養液から大腸菌JM109/pCDF20−FcBPf51Hを、遠心分離して集菌したのち、0.001M EDTAを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)、25mLに懸濁したのち、遠心分離して菌を洗浄した。次にその菌を0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)、25mLで洗浄した。
【0170】
その菌を菌密度(O.D.600)の値がおよそ72になるように、0.2mg/mL 卵白リゾチ−ム、0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)に、菌を懸濁した。その懸濁液を0℃で1時間インキュベーションしたのち、−80℃で凍結した。それを解凍後、超音波破砕機に供したのち、破砕して得た液を遠心分離して可溶性画分を得た。
【0171】
得られた可溶性画分をカートリッジフィルター(ポアサイズ0.2μm)で滅菌ろ過したのち、そのろ液12.4mLに1/59容量の3M イミダゾール(pH6)を混合した。
【0172】
その液の12.4mLを、0.05M イミダゾール及び0.3M 塩化ナトリウムを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)(平衡化緩衝液3と称する)で平衡化したニッケルキレート樹脂(His・Bind Resin、商品名、メルク社製)を4mL充填したカラムにロードしたのち、4mLの平衡化緩衝液3で樹脂を洗い込み、素通り画分としてプールした。その樹脂をさらに16mLの平衡化緩衝液3で洗浄したのち、0.2M イミダゾール及び0.3M 塩化ナトリウムを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)で、フラクションサイズ2mLで吸着画分を溶出して分取し、フラクションは実施例3と同様にしてSDS−PAGEで分析した。
【0173】
図20のレーン1は分子量マーカー蛋白質、レーン2はニッケルキレート樹脂による分画前の可溶性画分、レーン3は素通り画分、レーン4から8は0.2Mイミダゾール及び0.3M 塩化ナトリウムを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)で溶出された画分であり、レーン6の、矢印で示された位置にFcBPf51H(分子量131kDa)が検出された。
【0174】
実施例21 エンテロキナーゼを用いて加水分解したFcBPf51H
実施例20で得たFcBPf51Hを含んだフラクションを、0.2M 塩化ナトリウムを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)中で透析した。透析後のFcBPf51H溶液を、γ−グロブリンを標準蛋白質に用いて、プロテインアッセイ(商品名、バイオラッド社)で比色定量して定めた。そのFcBPf51H溶液(0.24mg/mL)に、1/500容量の1M 塩化カルシウムを加えたのち、それぞれの溶液に含まれる蛋白質量(重量)の1/10000重量のエンテロキナーゼを添加して4℃でインキュベーションした。
【0175】
インキュベート18時間後、64時間後、112時間後に一部をサンプリングし、反応の阻害剤として、1/200容量の0.02M N−α−Tosyl−L−lysine chloromethyl ketone hydrochlorideを混合した。
【0176】
それぞれの溶液の一部はウエスタンブロッティングとエンザイムイムノアッセイで分析した。
【0177】
ウエスタンブロッティングには、HRP標識ウサギanti−6−His(Bethyl社製)を用いた。
【0178】
エンザイムイムノアッセイは、96穴イムノプレートに10μg/mL ヒト免疫グロブリン(ガンマグロブリン)(製品名、財団法人化学及血清療法研究所製)、0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)を1ウエルあたり100μL加えて、4℃で18時間インキュベーションしたのち、TBS−TでリンスしてB/F分離し、ついでBSA/TBS−Tを1ウエルあたり200μL加えて、30℃で2時間ンキュベーションしてブロッキングしてから行った。
【0179】
ブロッキングしたプレートはTBS−TでリンスしてB/F分離したのち、BSA/TBS−Tで希釈して調製した試料を1ウエルあたり100μL加えて、30℃で1時間インキュベーションしたのち、B/F分離し、ついでBSA/TBS−Tで5000倍希釈したHRP標識抗6xHis抗体(Bethyl社製)を1ウエルあたり100μL加えて、30℃で1時間インキュベーションした。それをB/F分離したのち、TMB Microwell Peroxidase Substrate(2−Component System)(製品名、Kirkegaard & Perry Laboratories社)を1ウエルあたり100μL加えて室温で30分間反応し、それに1Mリン酸水溶液を1ウエルあたり50μL加えて反応停止後、波長450nmの吸光度(O.D.450)を測定した。
【0180】
図21のウエスタンブロテッィングのレーン1は分子量マーカー蛋白質であり、レーン2から5の試料はエンテロキナーゼを添加せず、レーン6から8はエンテロキナーゼを添加した試料で、レーン2はインキュベーションする前、レーン3と6はインキュベーション18時間後、レーン4と7はインキュベーション64時間後、レーン5と8はインキュベーション112時間後の試料を分析した結果である。
【0181】
図21に示したようにエンテロキナーゼを加えて112時間の試料(レーン8)にはFcBPf51Hほとんどなくなっていた。またエンテロキナーゼを加えた試料では基質となるアミノ酸配列で加水分解されてT7RNAポリメラーゼの部分が除かれたと考えられる生成物(蛋白質)のバンドを検出した。
【0182】
一方、図22に示したように、エンテロキナーゼを加えずに64時間インキュベーションしたFcBPf51H(64h−)と、エンテロキナーゼを加えずに112時間インキュベーションしたFcBPf51H(112h−)の結果から、融合蛋白質はその濃度に依存してヒトイムノグロブリンに吸着することがわかった。
【0183】
また図22のエンテロキナーゼを加えて64時間インキュベーションしたFcBPf51H(64h+)と、エンテロキナーゼを加えて112時間インキュベーションしたFcBPf51H(112h+)の結果から、エンテロキナーゼで加水分解されT7RNAポリメラーゼの部分が除かれた蛋白質も、濃度に依存してヒトイムノグロブリンに吸着することがわかった。
【0184】
実施例22 プラスミドpCDF20−hGHbpf51Hの作製
T7RNAポリメラーゼ(配列番号1)のカルボキシル末端に、Gly−Ser−Asp−Asp−Asp−Asp−Lysの7残基を介して、ヒト成長ホルモンレセプター(配列番号5)の1位から238位までからなるポリペプチドを連結し、それに続けて6個のヒスチジンを連結した融合蛋白質(hGHbpf51H、配列番号68、図23)をコードしたポリヌクレオチド(配列番号69)をコードした、プラスミドpCDF20−hGHbpf51H(図24)を作製した。
【0185】
まず、第一段階目のPCRを、特願2009−025901に記載のプラスミドpET−hGHbp258を鋳型にして、配列番号70と配列番号71のプライマーセットを用いてPCRを行い、0.7kbpのDNA(DNA−22と称する)を得た。
【0186】
次に第二段階目のPCRを、DNA−22を鋳型にして、配列番号71と配列番号72のプライマーセットを用いて行い、0.8kbpのDNAを得て、それを制限酵素BglIIとBlnIで消化して0.8kbpのDNA(DNA−23と称する)を得た。そのDNA−23を、プラスミドpCDF20−EPObpf60Hを制限酵素BamHIとBlnIで消化して得た5.9kbpのDNAとライゲーションして環化させ、プラスミドを調製した。
【0187】
そのプラスミドにより大腸菌JM109を形質転換し、LB/Carb寒天培地で培養して、目的のプラスミドを有する大腸菌JM109/pCDF20−hGHbpf51Hを得た。
【0188】
実施例23 ヒト成長ホルモンへの融合蛋白質hGHbpf51Hの吸着
大腸菌JM109/pCDF20−hGHbpf51Hを2xYT/Carb培地に植菌して28℃で16時間培養して、菌密度(O.D.600)が4.2の培養液を10mL得た。
【0189】
その培養液から大腸菌JM109/pCDF20−hGHbpf51Hを、遠心分離して集菌した。得られた菌を1mLの0.001M EDTAを含む0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)に懸濁したのち、遠心分離して菌を洗浄した。次にその菌を1mLの0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)で洗浄した。その菌を菌密度(O.D.600)の値が36になるように、0.1mg/mL 卵白リゾチ−ム、0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)に、菌を懸濁した。その懸濁液を0℃で30分間インキュベーションしたのち、−80℃で凍結した。それを解凍後、超音波破砕機に供したのち、破砕して得た液を遠心分離して可溶性画分を得た。
【0190】
その可溶性画分に含まれるhGHbpf51Hがヒト成長ホルモンに吸着することを、エンザイムイムノアッセイを行って調べた。
【0191】
エンザイムイムノアッセイは、96穴イムノプレートに1μg/mL ヒト成長ホルモンを、0.05M トリス塩酸緩衝液(pH8.0)を1ウエルあたり100μL加えて、4℃で18時間インキュベーションしたのち、TBS−TでリンスしてB/F分離し、ついでBSA/TBS−Tを1ウエルあたり200μL加えて、30℃で2時間インキュベーションしてブロッキングしてから行った。
【0192】
ブロッキングしたプレートはTBS−TでリンスしてB/F分離したのち、BSA/TBS−Tで希釈して調製した試料を1ウエルあたり100μL加えて、30℃で1時間インキュベーションしたのち、B/F分離した。次いで0.5μg/mL マウス抗ヒト成長ホルモンレセプター抗体(IgG2b)を1ウエルあたり100μL加えて、30℃で1時間インキュベーションしたのち、B/F分離し、さらに0.25μg/mL HRP標識ウサギ抗マウスIgG2b抗体を1ウエルあたり100μL加えて、30℃で1時間インキュベーションした。それをB/F分離したのち、TMB Microwell Peroxidase Substrate(2−Component System)(製品名、Kirkegaard & Perry Laboratories社)を1ウエルあたり100μL加えて室温で90秒間反応し、それに1M リン酸水溶液を1ウエルあたり50μL加えて反応停止後、波長450nmの吸光度(O.D.450)を測定した。
【0193】
図25に示したようにhGHbpf51Hの濃度に依存してヒト成長ホルモンに吸着することがわかった。
【特許請求の範囲】
【請求項1】
配列番号1で示したT7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、直接に、または1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを介して、異種蛋白質を融合したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質。
【請求項2】
異種蛋白質が、脊椎動物由来のポリペプチド、あるいは脊椎動物由来のポリペプチドの1残基以上のアミノ酸を、他のアミノ酸に置換、及び/又は欠失、及び/又は付加したポリペプチドであることを特徴とする請求項1に記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質。
【請求項3】
前記異種蛋白質が、蛋白質精製用の付加配列からなるペプチドを含む、請求項1又は2に記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質。
【請求項4】
前記蛋白質精製用の付加配列からなるペプチドが、ポリヒスチジン、S−ペプチド、及びc−mycペプチドからなる群から選ばれる、請求項3に記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質。
【請求項5】
脊椎動物由来のポリペプチドが、配列番号2で示したヒトエリスロポエチンレセプターの1位から225位からなるポリペプチド、配列番号3で示したヒトエリスロポエチン、配列番号4で示したFcγRIの1位から274位からなるポリペプチド又は配列番号5で示したヒト成長ホルモンレセプターの1位から238位からなるポリペプチドのいずれかである請求項1から4のいずれかに記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質。
【請求項6】
リンカーが、1種類以上のプロテアーゼの基質となるアミノ酸配列を有するリンカーであることを特徴とする請求項1から5のいずれかに記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質。
【請求項7】
プロテアーゼが、エンテロキナーゼ、トロンビン、活性化血液凝固X因子、ウロキナーゼ又はHRV 3Cプロテアーゼである請求項6に記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質。
【請求項8】
リンカーが、エンテロキナーゼ、トロンビン、活性化血液凝固X因子、ウロキナーゼ又はHRV 3Cプロテアーゼのいずれかの基質となるアミノ酸配列を有するリンカーであることを特徴とする請求項1から5のいずれかに記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質。
【請求項9】
プロテアーゼの基質となるアミノ酸配列が、Asp−Asp−Asp−Asp−Lys、Lue−Val−Pro−Arg、Ile−Glu−Gly−Arg、Pro−Gly−Arg又はLeu−Glu−Val−Leu−Phe−Gln−Gly−Proである請求項6に記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質。
【請求項10】
リンカーが、Asp−Asp−Asp−Asp−Lys、Lue−Val−Pro−Arg、Ile−Glu−Gly−Arg、Pro−Gly−Arg又はLeu−Glu−Val−Leu−Phe−Gln−Gly−Proのいずれかのアミノ酸配列を有するリンカーであることを特徴とする請求項1から5のいずれかに記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質。
【請求項11】
請求項1から10のいずれかに記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチド。
【請求項12】
請求項1から10のいずれかに記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を生産するEscherichia属の細菌。
【請求項13】
請求項1から10のいずれかに記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をプロテアーゼで加水分解することを特徴とする異種蛋白質の製造方法。
【請求項14】
プロテアーゼがエンテロキナーゼ、トロンビン、活性化血液凝固X因子、ウロキナーゼ又はHRV 3Cプロテアーゼである請求項13に記載の製造方法。
【請求項15】
T7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を、請求項12に記載のEscherichia属の細菌を使用して製造することを特徴とする請求項13または14に記載の異種蛋白質の製造方法。
【請求項16】
シバクロンブルー固定化樹脂を用いることを特徴とする請求項15に記載の製造方法。
【請求項17】
請求項1から10のいずれかに記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質又は請求項1から8のいずれかに記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をプロテアーゼで加水分解して生じた異種蛋白質を、シバクロンブルー固定化樹脂を用いて分離することを特徴とする請求項13〜16のいずれかに記載の異種蛋白質の製造方法。
【請求項1】
配列番号1で示したT7RNAポリメラーゼのカルボキシル末端に、直接に、または1残基以上のアミノ酸からなるリンカーを介して、異種蛋白質を融合したT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質。
【請求項2】
異種蛋白質が、脊椎動物由来のポリペプチド、あるいは脊椎動物由来のポリペプチドの1残基以上のアミノ酸を、他のアミノ酸に置換、及び/又は欠失、及び/又は付加したポリペプチドであることを特徴とする請求項1に記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質。
【請求項3】
前記異種蛋白質が、蛋白質精製用の付加配列からなるペプチドを含む、請求項1又は2に記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質。
【請求項4】
前記蛋白質精製用の付加配列からなるペプチドが、ポリヒスチジン、S−ペプチド、及びc−mycペプチドからなる群から選ばれる、請求項3に記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質。
【請求項5】
脊椎動物由来のポリペプチドが、配列番号2で示したヒトエリスロポエチンレセプターの1位から225位からなるポリペプチド、配列番号3で示したヒトエリスロポエチン、配列番号4で示したFcγRIの1位から274位からなるポリペプチド又は配列番号5で示したヒト成長ホルモンレセプターの1位から238位からなるポリペプチドのいずれかである請求項1から4のいずれかに記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質。
【請求項6】
リンカーが、1種類以上のプロテアーゼの基質となるアミノ酸配列を有するリンカーであることを特徴とする請求項1から5のいずれかに記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質。
【請求項7】
プロテアーゼが、エンテロキナーゼ、トロンビン、活性化血液凝固X因子、ウロキナーゼ又はHRV 3Cプロテアーゼである請求項6に記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質。
【請求項8】
リンカーが、エンテロキナーゼ、トロンビン、活性化血液凝固X因子、ウロキナーゼ又はHRV 3Cプロテアーゼのいずれかの基質となるアミノ酸配列を有するリンカーであることを特徴とする請求項1から5のいずれかに記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質。
【請求項9】
プロテアーゼの基質となるアミノ酸配列が、Asp−Asp−Asp−Asp−Lys、Lue−Val−Pro−Arg、Ile−Glu−Gly−Arg、Pro−Gly−Arg又はLeu−Glu−Val−Leu−Phe−Gln−Gly−Proである請求項6に記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質。
【請求項10】
リンカーが、Asp−Asp−Asp−Asp−Lys、Lue−Val−Pro−Arg、Ile−Glu−Gly−Arg、Pro−Gly−Arg又はLeu−Glu−Val−Leu−Phe−Gln−Gly−Proのいずれかのアミノ酸配列を有するリンカーであることを特徴とする請求項1から5のいずれかに記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質。
【請求項11】
請求項1から10のいずれかに記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をコードしたポリヌクレオチド。
【請求項12】
請求項1から10のいずれかに記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を生産するEscherichia属の細菌。
【請求項13】
請求項1から10のいずれかに記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をプロテアーゼで加水分解することを特徴とする異種蛋白質の製造方法。
【請求項14】
プロテアーゼがエンテロキナーゼ、トロンビン、活性化血液凝固X因子、ウロキナーゼ又はHRV 3Cプロテアーゼである請求項13に記載の製造方法。
【請求項15】
T7RNAポリメラーゼ融合蛋白質を、請求項12に記載のEscherichia属の細菌を使用して製造することを特徴とする請求項13または14に記載の異種蛋白質の製造方法。
【請求項16】
シバクロンブルー固定化樹脂を用いることを特徴とする請求項15に記載の製造方法。
【請求項17】
請求項1から10のいずれかに記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質又は請求項1から8のいずれかに記載のT7RNAポリメラーゼ融合蛋白質をプロテアーゼで加水分解して生じた異種蛋白質を、シバクロンブルー固定化樹脂を用いて分離することを特徴とする請求項13〜16のいずれかに記載の異種蛋白質の製造方法。
【図1】
【図2】
【図3】
【図5】
【図7】
【図11】
【図12】
【図14】
【図15】
【図18】
【図19】
【図22】
【図23】
【図24】
【図25】
【図4】
【図6】
【図8】
【図9】
【図10】
【図13】
【図16】
【図17】
【図20】
【図21】
【図2】
【図3】
【図5】
【図7】
【図11】
【図12】
【図14】
【図15】
【図18】
【図19】
【図22】
【図23】
【図24】
【図25】
【図4】
【図6】
【図8】
【図9】
【図10】
【図13】
【図16】
【図17】
【図20】
【図21】
【公開番号】特開2011−223982(P2011−223982A)
【公開日】平成23年11月10日(2011.11.10)
【国際特許分類】
【出願番号】特願2010−293898(P2010−293898)
【出願日】平成22年12月28日(2010.12.28)
【出願人】(000003300)東ソー株式会社 (1,901)
【出願人】(000173762)公益財団法人相模中央化学研究所 (151)
【Fターム(参考)】
【公開日】平成23年11月10日(2011.11.10)
【国際特許分類】
【出願日】平成22年12月28日(2010.12.28)
【出願人】(000003300)東ソー株式会社 (1,901)
【出願人】(000173762)公益財団法人相模中央化学研究所 (151)
【Fターム(参考)】
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