回転異性体ライブラリーおよびその使用方法が提供される。
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【課題】ヒト骨格筋細胞を含むヒト細胞の生理学的機能を決定するための、コンピューター内モデルを提供すること。
【解決手段】このモデルは、複数のＨｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ反応を示すデータ構造、複数のＨｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ反応の束縛セット、およびＨｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ生理学的機能を予測可能な反応を介して流束の分布を決定するためのコマンドを、含む。本発明のモデルは、関連の遺伝子を特徴付ける情報を含む遺伝子データベースを、さらに含み得る。調節されたＨｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ反応は、本発明のモデルにおいて、調節反応に関する可変束縛を含むことによって、表され得る。本発明は、本発明のモデルを使用してコンピューター内Ｈｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ生理学的機能を作製するための方法を、さらに提供する。 （もっと読む）

【課題】典型的な既知のモチーフが存在する場合にはペプチド性リガンド候補配列の予測を行うことができたが、典型的でないモチーフを持つ場合には、検索からもれる可能性があった。ＧＰＣＲペプチド性リガンド候補配列を高い感度で予測することを目的とする。
【解決手段】ペプチドリガンドが前駆体から切り出されるための切断部位の予測において、文字列のみならず切断部位領域に存在することが予測されるアミノ酸の出現確率、切断部位領域の構造情報など手がかりにして、より信頼性の高いリガンド候補配列を予測する方法。 （もっと読む）

【課題】容易に医薬品の催奇形性を含む医薬品の安全性に関する情報が、文書情報に限定されず、化学物質の化学構造情報を相互に関連づけることによってユーザーの情報提供と収集を機能させる化学構造の類似度を定量的に評価するためのアルゴリズムの提供。
【解決手段】催奇形性既知の医薬品分子Ｘと催奇形性未知の一般化学物質分子Ｙの結合行列をそれぞれ作成するステップと、原子コード配列及び隣接原子情報配列の比較ステップと、分子Ｙ中の原子の番号の入れ替えをするステップと、最初に戻って再処理するステップとから構成されることにより、分子Ｙと予めＤＢ中に格納されている全ての分子Ｘについて類似度算出を行い、類似度の高い順に分子Ｙに関する医薬品安全性評価をスコア化して提供する。 （もっと読む）

【課題】情報抽出群集化システム及びその方法を提供する。
【解決手段】本発明に係る情報抽出群集化システムは、複数の群集化基準を階層別に再構成するか、または群集化基準に加重値を付与して新たな群集化基準を設計する群集化基準設計部と、新たな群集化基準によって入力データから該当特徴を抽出する入力データ処理部と、抽出された特徴を群集化する群集化演算部とを備えることを特徴とする。これにより、ユーザが所望する基準によって多様な群集化を行うことができる。 （もっと読む）

工業的な生産、研究、または開発を行う方法。該方法は、コンピュータによって実行される、化学種の各々に対して少なくとも１つの概念的セグメントを決定することにより、少なくとも２つの化学種の混合物の少なくとも１つの物理的特性をモデル化するステップを有する。化学種の各々に対して少なくとも１つの概念的セグメントを決定する該ステップは、各概念的セグメントの同一性および等価な数を定義することを含んでいる。 （もっと読む）

【課題】化合物の探知、回収、および同定のための分子タグ化システムを提供すること。
【解決手段】本発明は、オリゴヌクレオチドタグの使用により分子の種類または亜集団を探知、同定、および／または分類するための方法および物質を提供する。二本鎖ＤＮＡを固相支持体に結合させる方法；集団中のポリヌクレオチドにオリゴヌクレオチドタグを結合させる方法；固相支持体およびオリゴヌクレオチドタグ相補物の均一な集団を含む、組成物；微粒子の混合物を含む組成物；微粒子に結合している複数のｃＤＮＡを含むｃＤＮＡライブラリー；微粒子に結合している複数のゲノムＤＮＡフラグメントのライブラリーを含むゲノムＤＮＡフラグメントのライブラリー；オリゴヌクレオチドタグのレパートリー；が、開示される。 （もっと読む）

本発明は一般的に、生物学的に関連するデータスペースを迅速かつ効率的に検索する方法に関する。さらに詳細には、本発明は、所望の特性を有する生体分子を同定する方法、または、複雑な生体分子ライブラリもしくはこのようなライブラリのセットから、このような特性を獲得するために最も適切である方法を包含する。本発明はまた、配列活性関係をモデリングする方法を提供する。この方法の多くはコンピューターで実行されるので、本発明はさらに、これらの方法を行うためのデジタルシステムおよびソフトウェアを提供する。
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本発明は、組合せ人工受容体を利用するセンサーおよびセンサーシステムに関する。本発明の具体例は、電磁（例えば、光学）および電気化学センサーにおいて、コンビナトーリアル人工受容体を使用する。

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生物システムの状態のプロファイルを作製するための方法およびシステムが開示される。このプロファイルは、複数のデータセット間の類似性、相違、および／または相関の識別に基づく。このデータセットは、１つ以上の生体分子成分のタイプ、１つ以上の生物学的サンプルのタイプ、および／または１つ以上の測定のタイプから算出される。本発明の１つの局面において、生物システムの状態（例えば、疾患状態）のプロファイルを作製するために、複雑な生物学的サンプルに関する複数の測定が実施される。その後、相関分析およびネットワークモデリングと組み合わせた、遺伝子、遺伝子転写物、タンパク質、および／または代謝産物についての包括的なプロファイリングが、システムレベルでの生物システムへの洞察を提供する。
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