栽培用植物および家畜化動物中のポリヌクレオチドおよびポリペプチド配列における進化的に有意の変化を同定するための方法
【課題】栽培品種化（家畜化）植物または動物における商業的にもしくは審美的に価値のある形質を制御するポリヌクレオチドを同定する方法を提供することが本発明の課題である。
【解決手段】本発明は、栽培品種化（家畜化）植物または動物における商業的にもしくは審美的に重要な形質に関連することもあり得るポリヌクレオチドおよびポリペプチド配列を同定するための方法を提供する。当該方法は、進化的に有意の変化および進化的に中立の変化を同定するために、当該栽培化生物およびその祖先からの相同遺伝子の比較を用いる。このように同定された配列は、栽培化生物またはそれらの祖先における商業的にもしくは審美的に望ましい形質を増強するのに役立つことも可能である。
【解決手段】本発明は、栽培品種化（家畜化）植物または動物における商業的にもしくは審美的に重要な形質に関連することもあり得るポリヌクレオチドおよびポリペプチド配列を同定するための方法を提供する。当該方法は、進化的に有意の変化および進化的に中立の変化を同定するために、当該栽培化生物およびその祖先からの相同遺伝子の比較を用いる。このように同定された配列は、栽培化生物またはそれらの祖先における商業的にもしくは審美的に望ましい形質を増強するのに役立つことも可能である。
Notice: Undefined index: DEJ in /mnt/www/gzt_disp.php on line 298
【特許請求の範囲】
【請求項１】
栽培品種化（家畜化）生物のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列であって、野生祖先と比較した当該栽培品種化（家畜化）生物における収量の増加と関連するまたは関連するのではないかと思われる前記ポリペプチド、を同定するための方法であって、
ａ）当該栽培品種化（家畜化）生物のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を、当該野生祖先のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列に比較する工程；そして
ｂ）当該野生祖先における対応する配列と比較した場合、進化的に有意なヌクレオチド変化を含む当該栽培品種化（家畜化）生物におけるポリヌクレオチド配列を選択し、当該栽培品種化（家畜化）生物のポリヌクレオチド配列を同定する工程：
を含む、前記方法。
【請求項２】
収量の改良と関連する前記ポリペプチドがＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリペプチドである、請求項１の方法。
【請求項３】
ａ）植物細胞を、当該細胞に天然には存在しないＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリヌクレオチドに由来し、ポリペプチドをコードし、且つトランスジェニックタンパク質の発現に効果的に使用可能なプロモーターに機能可能に連結された異種ＤＮＡセグメントを含むようにトランスフェクトする工程；
ｂ）場合により、当該細胞をそこからトランスジェニック植物が再生される条件下で成育させ、そして維持する工程；および
ｃ）場合により、当該ＤＮＡが発現される条件下で前記トランスジェニック植物を成育させて、当該植物中のＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリペプチドの総量を増加させる工程：
を含む、トランスフェクト植物細胞またはトランスジェニック植物の製造方法。
【請求項４】
前記異種ＤＮＡセグメントを含む前記トランスジェニック植物の子孫の以降の世代を得、そして成育させ、当該異種ＤＮＡセグメントを発現させる工程をさらに含む、請求項３の方法。
【請求項５】
ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリペプチドをコードする異種ＤＮＡを含む、植物細胞。
【請求項６】
請求項５のトランスジェニック植物細胞を含むトランスジェニック植物の増殖用の材料。
【請求項７】
植物組織中で発現するＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリペプチドをコードする異種ＤＮＡを含む、トランスジェニック植物。
【請求項８】
植物組織中でＥＧ３０７またはＥＧ１１１７遺伝子をコードするポリヌクレオチドに機能可能に連結されているプロモーターを含む、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項９】
ポリヌクレオチドが組み替え体ポリヌクレオチドである、請求項８の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１０】
プロモーターがＥＧ３０７またはＥＧ１１１７遺伝子に天然に存在するプロモーターである、請求項８の方法。
【請求項１１】
トランスフェクトされた細胞の製造方法であって、
ａ）栽培化植物の祖先中の進化的に有意なＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリヌクレオチドまたは栽培化植物中の相当するポリヌクレオチドを同定する工程；
ｂ）当該ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリヌクレオチドを使って、転写または翻訳調節エレメント、エンハンサー、イントロンまたは他の５’または３’フランキング配列であってもよい非ポリペプチドコード配列を同定する工程；
ｃ）リポータータンパク質をコードするポリヌクレオチドに機能可能に連結されている当該非ポリペプチドコード配列を含む構築体を組み立てる工程；そして
ｄ）宿主細胞中へ当該構築体をトランスフェクトする工程：
を含む、前記方法。
【請求項１２】
請求項１１の方法により製造されたトランスフェクト細胞。
【請求項１３】
宿主細胞が植物細胞であり、当該細胞をそこからトランスジェニック植物が再生される条件下で増殖させ、そして維持する工程をさらに含む、請求項１１の方法を含む、トランスジェニック植物の製造方法。
【請求項１４】
請求項１２の方法により製造されたトランスジェニック植物。
【請求項１５】
進化的に有意なＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリヌクレオチドの非ポリペプチドコード領域の機能を調整する作用物質を同定する方法であって、請求項１１のトランスフェクト宿主細胞を少なくとも１つの候補作用物質と接触させ、リポーターポリヌクレオチドの転写または翻訳を調整する能力により作用物質を同定する、ことを含む前記方法。
【請求項１６】
請求項１５の方法により同定された作用物質。
【請求項１７】
進化的に有意なＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリヌクレオチドの非ポリペプチドコード領域の機能を調整する作用物質を同定する方法であって、請求項１３のトランスジェニック植物を少なくとも１つの候補作用物質と接触させ、リポーターポリヌクレオチドの転写または翻訳を調整するその能力により作用物質を同定する、ことを含む前記方法。
【請求項１８】
請求項１７の方法により同定された作用物質。
【請求項１９】
リポータータンパク質をコードするポリヌクレオチドに機能可能に連結された、進化的に有意なＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリヌクレオチドからのプロモーター、エンハンサーもしくはイントロンのポリヌクレオチド、またはそれらの任意の組み合わせを含む構築体でトランスフェクトされた宿主細胞を含む、トランスフェクトされた宿主細胞。
【請求項２０】
収量を調整することが可能な作用物質を同定する方法であって、少なくとも１つの候補作用物質を、ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７遺伝子を含む植物または細胞に接触させ、収量を調整するその能力により作用物質を同定することを含む、前記方法。
【請求項２１】
前記植物または細胞が、ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７をコードするポリヌクレオチドおよびその遺伝子でトランスフェクトされる、請求項２０の方法。
【請求項２２】
請求項２０の方法に従って同定された作用物質。
【請求項２３】
同定された作用物質が、当該ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの機能を調整することによって収量を調整する、請求項２０の方法。
【請求項２４】
同定された作用物質が、当該ポリペプチドの機能を調整することによって収量を調整する、請求項２０の方法。
【請求項２５】
植物における収量増加をもたらす方法であって、
ａ）ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７が植物細胞中で発現される、ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリペプチドをコードする異種ＤＮＡをもつトランスフェクト植物細胞を製造する工程；そして
ｂ）ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７トランスジーンが当該トランスジェニック植物中で発現される、トランスフェクト植物細胞からトランスジェニック植物を成育させる工程：
を含む、前記方法。
【請求項２６】
トランスジーンが、当該トランスジーンの発現制御に適した調節配列の制御下にある、請求項２５の方法。
【請求項２７】
ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリペプチドの製造方法であって、
ａ）発現のために細胞中に配置された、ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドでトランスフェクトされた前記細胞を提供する工程；
ｂ）当該ポリヌクレオチドを発現するための条件下で当該トランスフェクト細胞を培養する工程；そして
ｃ）当該ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリペプチドを単離する工程：
を含む、前記方法。
【請求項２８】
ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７遺伝子をコードする異種ＤＮＡが、当該ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７遺伝子の構成的発現をもたらすプロモーターの制御下にある、請求項２５の方法。
【請求項２９】
ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７遺伝子をコードする前記異種ＤＮＡが、当該ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７遺伝子の制御可能な発現をもたらすプロモーターの制御下にある、請求項２５の方法。
【請求項３０】
ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７遺伝子が、組織特異的または細胞型特異的プロモーターを用いて、または、化学シグナルまたは作用物質のような外部シグナルまたは作用物質の導入により活性化されるプロモーターを用いて発現される、請求項２９の方法。
【請求項３１】
収量関連遺伝子またはその断片を植物細胞から単離する方法であって、
ａ）植物細胞ポリヌクレオチドの試料を提供する工程；
ｂ）ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７遺伝子の保存領域に配列相同性をもつオリゴヌクレオチドのペアを提供する工程；
ｃ）オリゴヌクレオチドの当該ペアを、ポリメラーゼ連鎖反応仲介ポリヌクレオチド増幅に適した条件下で当該植物細胞ポリヌクレオチド試料に結合させる工程；そして
ｄ）増幅された収量関連ポリヌクレオチドまたはその断片を単離する工程：
を含む、前記方法。
【請求項３２】
請求項３１の方法により単離された、植物収量関連ポリヌクレオチド。
【請求項３３】
収量関連ポリヌクレオチドを単離する方法であって、
ａ）ゲノム植物細胞ＤＮＡおよび組み替え体植物細胞ライブラリーポリヌクレオチドより成る群から選択されたポリヌクレオチドの調製物を提供する工程；
ｂ）当該調製物を、５０％またはそれより大きい配列同一性をもつポリヌクレオチドの検出をもたらすハイブリッド形成条件下で、ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７オリゴヌクレオチドと接触させる工程；そして
ｃ）当該ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７オリゴヌクレオチドとの会合により収量関連ポリヌクレオチドを単離する工程：
を含む、前記方法。
【請求項３４】
ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７オリゴヌクレオチドが検出可能に標識され、そして当該検出可能標識との会合により収量関連遺伝子が単離される、請求項３３の方法。
【請求項３５】
前記ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７オリゴヌクレオチドが少なくとも長さ１２ヌクレオチドである、請求項３３の方法。
【請求項３６】
ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７オリゴヌクレオチドが少なくとも長さ３０ヌクレオチドである、請求項３３の方法。
【請求項３７】
植物の収量関連遺伝子を同定する方法であって、
ａ）植物組織試料を提供する工程；
ｂ）当該植物組織試料中へ候補植物収量関連遺伝子を導入する工程；
ｃ）当該植物組織試料内で当該候補植物収量関連遺伝子を発現させる工程；そして
ｄ）応答の変化が植物収量関連遺伝子を同定する、収量応答の変化を当該植物組織試料が示すかどうかを決定する工程：
を含む、前記方法。
【請求項３８】
請求項３７の方法に従って単離された、植物収量関連遺伝子。
【請求項３９】
ａ）配列番号９２、配列番号９３、配列番号９４、配列番号９６、配列番号９７、および配列番号９８より成る群から選択されたポリヌクレオチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチド：
より成る群から選択された単離ポリヌクレオチド。
【請求項４０】
ａ）配列番号１００、配列番号１０１、配列番号１０３、配列番号１０４、配列番号１０６、配列番号１０７、配列番号１０９、配列番号１１０、配列番号１１２、配列番号１１３、配列番号１１４、配列番号１１６、および配列番号１１７より成る群から選択されたポリヌクレオチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチド：
より成る群から選択された単離ポリヌクレオチド。
【請求項４１】
ａ）配列番号１１９、配列番号１２０、配列番号１２１、配列番号１２２、配列番号１２３、配列番号１２４、配列番号１２５、配列番号１２７、配列番号１２８、配列番号１２９、配列番号１３０、配列番号１３１、配列番号１３３、配列番号１３５、配列番号１３６、配列番号１３７、配列番号１３８、配列番号１４０、配列番号１４１、配列番号１４２、配列番号１４４、配列番号１４５、配列番号１４６、配列番号１４７、配列番号１４９、配列番号１５０、配列番号１５１、配列番号１５２、配列番号１５４、および配列番号１５５より成る群から選択されたポリヌクレオチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチド：
より成る群から選択された単離ポリヌクレオチド。
【請求項４２】
ａ）配列番号１５７、配列番号１５８、配列番号１６０、配列番号１６１、配列番号１６２、配列番号１６３、配列番号１６５、配列番号１６６、配列番号１６７、および配列番号１６８より成る群から選択されたポリヌクレオチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチド：
より成る群から選択された単離ポリヌクレオチド。
【請求項４３】
ａ）配列番号９２、配列番号９３、配列番号９４、配列番号９６、配列番号９７、および配列番号９８より成る群から選択されたポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチド：
より成る群から選択された単離ポリペプチド。
【請求項４４】
ａ）配列番号１００、配列番号１０１、配列番号１０３、配列番号１０４、配列番号１０６、配列番号１０７、配列番号１０９、配列番号１１０、配列番号１１２、配列番号１１３、配列番号１１４、配列番号１１６、および配列番号１１７より成る群から選択されたポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチド：
より成る群から選択された単離ポリペプチド。
【請求項４５】
ａ）配列番号１１９、配列番号１２０、配列番号１２１、配列番号１２２、配列番号１２３、配列番号１２４、配列番号１２５、配列番号１２７、配列番号１２８、配列番号１２９、配列番号１３０、配列番号１３１、配列番号１３３、配列番号１３５、配列番号１３６、配列番号１３７、配列番号１３８、配列番号１４０、配列番号１４１、配列番号１４２、配列番号１４４、配列番号１４５、配列番号１４６、配列番号１４７、配列番号１４９、配列番号１５０、配列番号１５１、配列番号１５２、配列番号１５４、および配列番号１５５より成る群から選択されたポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチド：
より成る群から選択された単離ポリペプチド。
【請求項４６】
ａ）配列番号１５７、配列番号１５８、配列番号１６０、配列番号１６１、配列番号１６２、配列番号１６３、配列番号１６５、配列番号１６６、配列番号１６７、および配列番号１６８より成る群から選択されたポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチド：
より成る群から選択された単離ポリペプチド。
【請求項４７】
野生祖先または栽培化生物において、当該野生祖先または栽培化生物の経済的生産性亢進と関連する、または関連するのではないかと思われるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を同定するための方法であって、
ａ）当該野生祖先および当該栽培化生物のポリペプチドコードヌクレオチド配列を比較する工程；そして
ｂ）それぞれ、当該野生祖先または栽培化生物における対応する配列と比較した場合、進化的に中立のまたは正の進化的に有意なヌクレオチド変化を含む当該栽培化生物または野生祖先のいずれかにおけるポリヌクレオチド配列を選択し、それにより経済的生産性亢進と関連するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを同定する工程：
を含む、前記方法。
【請求項４８】
栽培化生物の野生祖先のポリペプチドであって、当該栽培化生物に比べて当該野生祖先において独特で亢進または変更されたストレス抵抗性形質と関連する前記ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を同定するための方法であって、
ａ）当該野生祖先のポリペプチドコードヌクレオチド配列に、当該栽培化生物のポリペプチドコードヌクレオチド配列を比較すること；そして
ｂ）当該栽培化生物における対応する配列と比較した場合、進化的に中立なヌクレオチド変化を含む当該野生祖先におけるポリヌクレオチド配列を選択することにより、当該野生祖先のポリヌクレオチド配列を同定する：
工程を含む、前記方法。
【請求項４９】
栽培化生物が、メイズ、コメ（イネ）、トマト、ポテトおよびその祖先がわかっている他の栽培化植物より成る群から選択された植物である、請求項４８の方法。
【請求項５０】
栽培化生物がメイズであり、そして前記野生祖先がテオシンテである、請求項４９の方法。
【請求項５１】
栽培化生物のタンパク質コードヌクレオチド配列がｃＤＮＡに相当する、請求項４８の方法。
【請求項５２】
ヌクレオチド変化が非同義置換である、請求項４８の方法。
【請求項５３】
栽培化生物が植物であり、そして前記ストレス抵抗性形質が、乾燥抵抗性、疾病抵抗性、有害生物抵抗性、高塩濃度抵抗性、および商業的に関心のある他のストレス抵抗性形質より成る群から選択される、請求項４８の方法。
【請求項５４】
栽培化生物の野生祖先におけるストレス抵抗性形質を調整することが可能な作用物質を同定する方法であって、少なくとも１つの候補作用物質を、請求項４８で同定されたポリヌクレオチド配列を発現する野生祖先もしくは栽培化生物、または、細胞もしくはトランスジェニック生物と接触させ、そして当該ポリヌクレオチドの機能または同定されたポリヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチドの機能を調整する能力により作用物質を同定することを含む前記方法。
【請求項５５】
請求項５４の作用物質を投与することによって、栽培化生物の野生祖先におけるストレス抵抗性を調整する方法。
【請求項５６】
請求項４８の野生祖先ストレス抵抗性ポリヌクレオチド配列に相当する、栽培化生物におけるポリヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチド配列に対する作用物質を同定する方法であって、少なくとも１つの候補作用物質を、当該ポリヌクレオチド配列を発現する栽培化生物もしくは祖先生物、または、細胞もしくはトランスジェニック生物と接触させ、そして、当該ポリペプチドの機能を調整する能力により作用物質が同定されることを含む前記方法。
【請求項５７】
請求項５６の作用物質を投与することによって、栽培化生物におけるストレス抵抗性を調整する方法。
【請求項５８】
栽培化生物の野生祖先のポリペプチドコードポリヌクレオチド配列における進化的に中立な変化を同定するための方法であって、
ａ）野生祖先のポリペプチドコードポリヌクレオチド配列を栽培化生物の対応配列と比較する工程；そして
ｂ）当該野生祖先の対応配列に比べて、進化的に中立なヌクレオチド変化を含む当該栽培化生物におけるポリヌクレオチド配列を選択し、そして当該ポリヌクレオチドが栽培化生物の野生祖先におけるストレス抵抗性形質と関連しており、それにより当該ポリヌクレオチド中の進化的中立変化が同定される工程：
を含む、前記方法。
【請求項５９】
栽培化生物が、メイズ、コメ（イネ）、トマト、ポテトおよびその祖先がわかっている他の栽培化植物より成る群から選択された植物である、請求項５８の方法。
【請求項６０】
栽培化生物がメイズであり、そして前記野生祖先がテオシンテである、請求項５８の方法。
【請求項６１】
栽培化生物のタンパク質コードヌクレオチド配列がｃＤＮＡに相当する、請求項５８の方法。
【請求項６２】
ヌクレオチド変化が非同義置換である、請求項５８の方法。
【請求項６３】
栽培化生物が植物であり、そして関連形質が、乾燥抵抗性、疾病抵抗性、有害生物抵抗性、高塩濃度抵抗性、および商業的に関心のある他のストレス抵抗性形質より成る群から選択される、請求項５８の方法。
【請求項６４】
栽培化生物の野生祖先のポリペプチドコードヌクレオチド配列と当該栽培化生物からのポリペプチドコード配列との間の大規模配列比較のための方法であって、ここで当該野生祖先生物ポリペプチドは、栽培化生物に比べて野生祖先において独特で、亢進または変更されているストレス抵抗性形質を付与する、または付与するのではないかと思われ、
ａ）野生祖先配列を、栽培化生物からの対応配列と、配列相同性に従って整列させる工程；そして
ｂ）それぞれ、野生祖先または栽培化生物からの相同配列に比較して、栽培化生物配列または野生祖先配列内に何らかのヌクレオチド変化を同定する工程：
を含む、前記方法。
【請求項６５】
栽培化生物が、メイズ、コメ（イネ）、トマト、およびその祖先がわかっている他の栽培化植物より成る群から選択された植物である、請求項６４の方法。
【請求項６６】
栽培化生物がメイズであり、そして野生祖先がテオシンテである、請求項６５の方法。
【請求項６７】
栽培化種のタンパク質コードヌクレオチド配列がｃＤＮＡに相当する、請求項６４の方法。
【請求項６８】
進化的に中立のヌクレオチド変化を、栽培化生物の野生祖先において独特で、亢進または変更されているストレス抵抗性形質に相関させるための方法であって、
ａ）請求項４８に従ってヌクレオチド配列を同定する工程：そして
ｂ）当該栽培化生物または祖先生物で同定された配列の存否の機能効果を分析する工程：
を含む、前記方法。
【請求項６９】
トランスフェクト植物細胞またはトランスジェニック植物を製造するための方法であって、
ａ）請求項４８の野生祖先のストレス抵抗性ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを、トランスジェニックタンパク質の発現に有効に使うことができるプロモーターに機能可能に連結されて含むように植物細胞を形質転換する工程；
ｂ）場合により、当該細胞をそこからトランスジェニック植物が再生される条件下で増殖させ、そして維持する工程：
を含む、前記方法。
【請求項７０】
請求項６９の方法により製造されたトランスフェクト細胞。
【請求項７１】
請求項６９の方法により製造されたトランスジェニック植物。
【請求項７２】
ａ）配列番号１、配列番号９１、配列番号２、配列番号４、配列番号５、配列番号７、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１５、および配列番号１７、および配列番号１８より成る群から選択されたポリヌクレオチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチド：
より成る群から選択された単離ポリヌクレオチド。
【請求項７３】
ａ）配列番号２０、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２４、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２８、配列番号２９および、配列番号９０より成る群から選択されたポリヌクレオチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチド：
より成る群から選択された単離ポリヌクレオチド。
【請求項７４】
ａ）配列番号３３、配列番号３４、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４１、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４５、配列番号４６、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５０、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５４、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５８、配列番号６０、配列番号６２、配列番号６３、および配列番号６４より成る群から選択されたポリヌクレオチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチド：
より成る群から選択された単離ポリヌクレオチド。
【請求項７５】
ａ）配列番号６６、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７０、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７４、配列番号７５、配列番号７７、配列番号５９、および配列番号７８より成る群から選択されたポリヌクレオチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチド：
より成る群から選択された単離ポリヌクレオチド。
【請求項７６】
ａ）配列番号８０、配列番号８１、および配列番号８２より成る群から選択されたポリヌクレオチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチド：
より成る群から選択された単離ポリヌクレオチド。
【請求項７７】
ａ）配列番号８４および配列番号８５より成る群から選択されたポリヌクレオチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチド：
より成る群から選択された単離ポリヌクレオチド。
【請求項７８】
ａ）配列番号１、配列番号９１、配列番号２、配列番号４、配列番号５、配列番号７、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１５、および配列番号１７、および配列番号１８より成る群から選択されたポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチド：
より成る群から選択された単離ポリペプチド。
【請求項１】
栽培品種化（家畜化）生物のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列であって、野生祖先と比較した当該栽培品種化（家畜化）生物における収量の増加と関連するまたは関連するのではないかと思われる前記ポリペプチド、を同定するための方法であって、
ａ）当該栽培品種化（家畜化）生物のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を、当該野生祖先のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列に比較する工程；そして
ｂ）当該野生祖先における対応する配列と比較した場合、進化的に有意なヌクレオチド変化を含む当該栽培品種化（家畜化）生物におけるポリヌクレオチド配列を選択し、当該栽培品種化（家畜化）生物のポリヌクレオチド配列を同定する工程：
を含む、前記方法。
【請求項２】
収量の改良と関連する前記ポリペプチドがＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリペプチドである、請求項１の方法。
【請求項３】
ａ）植物細胞を、当該細胞に天然には存在しないＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリヌクレオチドに由来し、ポリペプチドをコードし、且つトランスジェニックタンパク質の発現に効果的に使用可能なプロモーターに機能可能に連結された異種ＤＮＡセグメントを含むようにトランスフェクトする工程；
ｂ）場合により、当該細胞をそこからトランスジェニック植物が再生される条件下で成育させ、そして維持する工程；および
ｃ）場合により、当該ＤＮＡが発現される条件下で前記トランスジェニック植物を成育させて、当該植物中のＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリペプチドの総量を増加させる工程：
を含む、トランスフェクト植物細胞またはトランスジェニック植物の製造方法。
【請求項４】
前記異種ＤＮＡセグメントを含む前記トランスジェニック植物の子孫の以降の世代を得、そして成育させ、当該異種ＤＮＡセグメントを発現させる工程をさらに含む、請求項３の方法。
【請求項５】
ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリペプチドをコードする異種ＤＮＡを含む、植物細胞。
【請求項６】
請求項５のトランスジェニック植物細胞を含むトランスジェニック植物の増殖用の材料。
【請求項７】
植物組織中で発現するＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリペプチドをコードする異種ＤＮＡを含む、トランスジェニック植物。
【請求項８】
植物組織中でＥＧ３０７またはＥＧ１１１７遺伝子をコードするポリヌクレオチドに機能可能に連結されているプロモーターを含む、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項９】
ポリヌクレオチドが組み替え体ポリヌクレオチドである、請求項８の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１０】
プロモーターがＥＧ３０７またはＥＧ１１１７遺伝子に天然に存在するプロモーターである、請求項８の方法。
【請求項１１】
トランスフェクトされた細胞の製造方法であって、
ａ）栽培化植物の祖先中の進化的に有意なＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリヌクレオチドまたは栽培化植物中の相当するポリヌクレオチドを同定する工程；
ｂ）当該ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリヌクレオチドを使って、転写または翻訳調節エレメント、エンハンサー、イントロンまたは他の５’または３’フランキング配列であってもよい非ポリペプチドコード配列を同定する工程；
ｃ）リポータータンパク質をコードするポリヌクレオチドに機能可能に連結されている当該非ポリペプチドコード配列を含む構築体を組み立てる工程；そして
ｄ）宿主細胞中へ当該構築体をトランスフェクトする工程：
を含む、前記方法。
【請求項１２】
請求項１１の方法により製造されたトランスフェクト細胞。
【請求項１３】
宿主細胞が植物細胞であり、当該細胞をそこからトランスジェニック植物が再生される条件下で増殖させ、そして維持する工程をさらに含む、請求項１１の方法を含む、トランスジェニック植物の製造方法。
【請求項１４】
請求項１２の方法により製造されたトランスジェニック植物。
【請求項１５】
進化的に有意なＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリヌクレオチドの非ポリペプチドコード領域の機能を調整する作用物質を同定する方法であって、請求項１１のトランスフェクト宿主細胞を少なくとも１つの候補作用物質と接触させ、リポーターポリヌクレオチドの転写または翻訳を調整する能力により作用物質を同定する、ことを含む前記方法。
【請求項１６】
請求項１５の方法により同定された作用物質。
【請求項１７】
進化的に有意なＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリヌクレオチドの非ポリペプチドコード領域の機能を調整する作用物質を同定する方法であって、請求項１３のトランスジェニック植物を少なくとも１つの候補作用物質と接触させ、リポーターポリヌクレオチドの転写または翻訳を調整するその能力により作用物質を同定する、ことを含む前記方法。
【請求項１８】
請求項１７の方法により同定された作用物質。
【請求項１９】
リポータータンパク質をコードするポリヌクレオチドに機能可能に連結された、進化的に有意なＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリヌクレオチドからのプロモーター、エンハンサーもしくはイントロンのポリヌクレオチド、またはそれらの任意の組み合わせを含む構築体でトランスフェクトされた宿主細胞を含む、トランスフェクトされた宿主細胞。
【請求項２０】
収量を調整することが可能な作用物質を同定する方法であって、少なくとも１つの候補作用物質を、ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７遺伝子を含む植物または細胞に接触させ、収量を調整するその能力により作用物質を同定することを含む、前記方法。
【請求項２１】
前記植物または細胞が、ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７をコードするポリヌクレオチドおよびその遺伝子でトランスフェクトされる、請求項２０の方法。
【請求項２２】
請求項２０の方法に従って同定された作用物質。
【請求項２３】
同定された作用物質が、当該ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの機能を調整することによって収量を調整する、請求項２０の方法。
【請求項２４】
同定された作用物質が、当該ポリペプチドの機能を調整することによって収量を調整する、請求項２０の方法。
【請求項２５】
植物における収量増加をもたらす方法であって、
ａ）ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７が植物細胞中で発現される、ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリペプチドをコードする異種ＤＮＡをもつトランスフェクト植物細胞を製造する工程；そして
ｂ）ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７トランスジーンが当該トランスジェニック植物中で発現される、トランスフェクト植物細胞からトランスジェニック植物を成育させる工程：
を含む、前記方法。
【請求項２６】
トランスジーンが、当該トランスジーンの発現制御に適した調節配列の制御下にある、請求項２５の方法。
【請求項２７】
ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリペプチドの製造方法であって、
ａ）発現のために細胞中に配置された、ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドでトランスフェクトされた前記細胞を提供する工程；
ｂ）当該ポリヌクレオチドを発現するための条件下で当該トランスフェクト細胞を培養する工程；そして
ｃ）当該ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７ポリペプチドを単離する工程：
を含む、前記方法。
【請求項２８】
ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７遺伝子をコードする異種ＤＮＡが、当該ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７遺伝子の構成的発現をもたらすプロモーターの制御下にある、請求項２５の方法。
【請求項２９】
ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７遺伝子をコードする前記異種ＤＮＡが、当該ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７遺伝子の制御可能な発現をもたらすプロモーターの制御下にある、請求項２５の方法。
【請求項３０】
ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７遺伝子が、組織特異的または細胞型特異的プロモーターを用いて、または、化学シグナルまたは作用物質のような外部シグナルまたは作用物質の導入により活性化されるプロモーターを用いて発現される、請求項２９の方法。
【請求項３１】
収量関連遺伝子またはその断片を植物細胞から単離する方法であって、
ａ）植物細胞ポリヌクレオチドの試料を提供する工程；
ｂ）ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７遺伝子の保存領域に配列相同性をもつオリゴヌクレオチドのペアを提供する工程；
ｃ）オリゴヌクレオチドの当該ペアを、ポリメラーゼ連鎖反応仲介ポリヌクレオチド増幅に適した条件下で当該植物細胞ポリヌクレオチド試料に結合させる工程；そして
ｄ）増幅された収量関連ポリヌクレオチドまたはその断片を単離する工程：
を含む、前記方法。
【請求項３２】
請求項３１の方法により単離された、植物収量関連ポリヌクレオチド。
【請求項３３】
収量関連ポリヌクレオチドを単離する方法であって、
ａ）ゲノム植物細胞ＤＮＡおよび組み替え体植物細胞ライブラリーポリヌクレオチドより成る群から選択されたポリヌクレオチドの調製物を提供する工程；
ｂ）当該調製物を、５０％またはそれより大きい配列同一性をもつポリヌクレオチドの検出をもたらすハイブリッド形成条件下で、ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７オリゴヌクレオチドと接触させる工程；そして
ｃ）当該ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７オリゴヌクレオチドとの会合により収量関連ポリヌクレオチドを単離する工程：
を含む、前記方法。
【請求項３４】
ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７オリゴヌクレオチドが検出可能に標識され、そして当該検出可能標識との会合により収量関連遺伝子が単離される、請求項３３の方法。
【請求項３５】
前記ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７オリゴヌクレオチドが少なくとも長さ１２ヌクレオチドである、請求項３３の方法。
【請求項３６】
ＥＧ３０７またはＥＧ１１１７オリゴヌクレオチドが少なくとも長さ３０ヌクレオチドである、請求項３３の方法。
【請求項３７】
植物の収量関連遺伝子を同定する方法であって、
ａ）植物組織試料を提供する工程；
ｂ）当該植物組織試料中へ候補植物収量関連遺伝子を導入する工程；
ｃ）当該植物組織試料内で当該候補植物収量関連遺伝子を発現させる工程；そして
ｄ）応答の変化が植物収量関連遺伝子を同定する、収量応答の変化を当該植物組織試料が示すかどうかを決定する工程：
を含む、前記方法。
【請求項３８】
請求項３７の方法に従って単離された、植物収量関連遺伝子。
【請求項３９】
ａ）配列番号９２、配列番号９３、配列番号９４、配列番号９６、配列番号９７、および配列番号９８より成る群から選択されたポリヌクレオチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチド：
より成る群から選択された単離ポリヌクレオチド。
【請求項４０】
ａ）配列番号１００、配列番号１０１、配列番号１０３、配列番号１０４、配列番号１０６、配列番号１０７、配列番号１０９、配列番号１１０、配列番号１１２、配列番号１１３、配列番号１１４、配列番号１１６、および配列番号１１７より成る群から選択されたポリヌクレオチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチド：
より成る群から選択された単離ポリヌクレオチド。
【請求項４１】
ａ）配列番号１１９、配列番号１２０、配列番号１２１、配列番号１２２、配列番号１２３、配列番号１２４、配列番号１２５、配列番号１２７、配列番号１２８、配列番号１２９、配列番号１３０、配列番号１３１、配列番号１３３、配列番号１３５、配列番号１３６、配列番号１３７、配列番号１３８、配列番号１４０、配列番号１４１、配列番号１４２、配列番号１４４、配列番号１４５、配列番号１４６、配列番号１４７、配列番号１４９、配列番号１５０、配列番号１５１、配列番号１５２、配列番号１５４、および配列番号１５５より成る群から選択されたポリヌクレオチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチド：
より成る群から選択された単離ポリヌクレオチド。
【請求項４２】
ａ）配列番号１５７、配列番号１５８、配列番号１６０、配列番号１６１、配列番号１６２、配列番号１６３、配列番号１６５、配列番号１６６、配列番号１６７、および配列番号１６８より成る群から選択されたポリヌクレオチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチド：
より成る群から選択された単離ポリヌクレオチド。
【請求項４３】
ａ）配列番号９２、配列番号９３、配列番号９４、配列番号９６、配列番号９７、および配列番号９８より成る群から選択されたポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチド：
より成る群から選択された単離ポリペプチド。
【請求項４４】
ａ）配列番号１００、配列番号１０１、配列番号１０３、配列番号１０４、配列番号１０６、配列番号１０７、配列番号１０９、配列番号１１０、配列番号１１２、配列番号１１３、配列番号１１４、配列番号１１６、および配列番号１１７より成る群から選択されたポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチド：
より成る群から選択された単離ポリペプチド。
【請求項４５】
ａ）配列番号１１９、配列番号１２０、配列番号１２１、配列番号１２２、配列番号１２３、配列番号１２４、配列番号１２５、配列番号１２７、配列番号１２８、配列番号１２９、配列番号１３０、配列番号１３１、配列番号１３３、配列番号１３５、配列番号１３６、配列番号１３７、配列番号１３８、配列番号１４０、配列番号１４１、配列番号１４２、配列番号１４４、配列番号１４５、配列番号１４６、配列番号１４７、配列番号１４９、配列番号１５０、配列番号１５１、配列番号１５２、配列番号１５４、および配列番号１５５より成る群から選択されたポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチド：
より成る群から選択された単離ポリペプチド。
【請求項４６】
ａ）配列番号１５７、配列番号１５８、配列番号１６０、配列番号１６１、配列番号１６２、配列番号１６３、配列番号１６５、配列番号１６６、配列番号１６７、および配列番号１６８より成る群から選択されたポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチド：
より成る群から選択された単離ポリペプチド。
【請求項４７】
野生祖先または栽培化生物において、当該野生祖先または栽培化生物の経済的生産性亢進と関連する、または関連するのではないかと思われるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を同定するための方法であって、
ａ）当該野生祖先および当該栽培化生物のポリペプチドコードヌクレオチド配列を比較する工程；そして
ｂ）それぞれ、当該野生祖先または栽培化生物における対応する配列と比較した場合、進化的に中立のまたは正の進化的に有意なヌクレオチド変化を含む当該栽培化生物または野生祖先のいずれかにおけるポリヌクレオチド配列を選択し、それにより経済的生産性亢進と関連するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを同定する工程：
を含む、前記方法。
【請求項４８】
栽培化生物の野生祖先のポリペプチドであって、当該栽培化生物に比べて当該野生祖先において独特で亢進または変更されたストレス抵抗性形質と関連する前記ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を同定するための方法であって、
ａ）当該野生祖先のポリペプチドコードヌクレオチド配列に、当該栽培化生物のポリペプチドコードヌクレオチド配列を比較すること；そして
ｂ）当該栽培化生物における対応する配列と比較した場合、進化的に中立なヌクレオチド変化を含む当該野生祖先におけるポリヌクレオチド配列を選択することにより、当該野生祖先のポリヌクレオチド配列を同定する：
工程を含む、前記方法。
【請求項４９】
栽培化生物が、メイズ、コメ（イネ）、トマト、ポテトおよびその祖先がわかっている他の栽培化植物より成る群から選択された植物である、請求項４８の方法。
【請求項５０】
栽培化生物がメイズであり、そして前記野生祖先がテオシンテである、請求項４９の方法。
【請求項５１】
栽培化生物のタンパク質コードヌクレオチド配列がｃＤＮＡに相当する、請求項４８の方法。
【請求項５２】
ヌクレオチド変化が非同義置換である、請求項４８の方法。
【請求項５３】
栽培化生物が植物であり、そして前記ストレス抵抗性形質が、乾燥抵抗性、疾病抵抗性、有害生物抵抗性、高塩濃度抵抗性、および商業的に関心のある他のストレス抵抗性形質より成る群から選択される、請求項４８の方法。
【請求項５４】
栽培化生物の野生祖先におけるストレス抵抗性形質を調整することが可能な作用物質を同定する方法であって、少なくとも１つの候補作用物質を、請求項４８で同定されたポリヌクレオチド配列を発現する野生祖先もしくは栽培化生物、または、細胞もしくはトランスジェニック生物と接触させ、そして当該ポリヌクレオチドの機能または同定されたポリヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチドの機能を調整する能力により作用物質を同定することを含む前記方法。
【請求項５５】
請求項５４の作用物質を投与することによって、栽培化生物の野生祖先におけるストレス抵抗性を調整する方法。
【請求項５６】
請求項４８の野生祖先ストレス抵抗性ポリヌクレオチド配列に相当する、栽培化生物におけるポリヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチド配列に対する作用物質を同定する方法であって、少なくとも１つの候補作用物質を、当該ポリヌクレオチド配列を発現する栽培化生物もしくは祖先生物、または、細胞もしくはトランスジェニック生物と接触させ、そして、当該ポリペプチドの機能を調整する能力により作用物質が同定されることを含む前記方法。
【請求項５７】
請求項５６の作用物質を投与することによって、栽培化生物におけるストレス抵抗性を調整する方法。
【請求項５８】
栽培化生物の野生祖先のポリペプチドコードポリヌクレオチド配列における進化的に中立な変化を同定するための方法であって、
ａ）野生祖先のポリペプチドコードポリヌクレオチド配列を栽培化生物の対応配列と比較する工程；そして
ｂ）当該野生祖先の対応配列に比べて、進化的に中立なヌクレオチド変化を含む当該栽培化生物におけるポリヌクレオチド配列を選択し、そして当該ポリヌクレオチドが栽培化生物の野生祖先におけるストレス抵抗性形質と関連しており、それにより当該ポリヌクレオチド中の進化的中立変化が同定される工程：
を含む、前記方法。
【請求項５９】
栽培化生物が、メイズ、コメ（イネ）、トマト、ポテトおよびその祖先がわかっている他の栽培化植物より成る群から選択された植物である、請求項５８の方法。
【請求項６０】
栽培化生物がメイズであり、そして前記野生祖先がテオシンテである、請求項５８の方法。
【請求項６１】
栽培化生物のタンパク質コードヌクレオチド配列がｃＤＮＡに相当する、請求項５８の方法。
【請求項６２】
ヌクレオチド変化が非同義置換である、請求項５８の方法。
【請求項６３】
栽培化生物が植物であり、そして関連形質が、乾燥抵抗性、疾病抵抗性、有害生物抵抗性、高塩濃度抵抗性、および商業的に関心のある他のストレス抵抗性形質より成る群から選択される、請求項５８の方法。
【請求項６４】
栽培化生物の野生祖先のポリペプチドコードヌクレオチド配列と当該栽培化生物からのポリペプチドコード配列との間の大規模配列比較のための方法であって、ここで当該野生祖先生物ポリペプチドは、栽培化生物に比べて野生祖先において独特で、亢進または変更されているストレス抵抗性形質を付与する、または付与するのではないかと思われ、
ａ）野生祖先配列を、栽培化生物からの対応配列と、配列相同性に従って整列させる工程；そして
ｂ）それぞれ、野生祖先または栽培化生物からの相同配列に比較して、栽培化生物配列または野生祖先配列内に何らかのヌクレオチド変化を同定する工程：
を含む、前記方法。
【請求項６５】
栽培化生物が、メイズ、コメ（イネ）、トマト、およびその祖先がわかっている他の栽培化植物より成る群から選択された植物である、請求項６４の方法。
【請求項６６】
栽培化生物がメイズであり、そして野生祖先がテオシンテである、請求項６５の方法。
【請求項６７】
栽培化種のタンパク質コードヌクレオチド配列がｃＤＮＡに相当する、請求項６４の方法。
【請求項６８】
進化的に中立のヌクレオチド変化を、栽培化生物の野生祖先において独特で、亢進または変更されているストレス抵抗性形質に相関させるための方法であって、
ａ）請求項４８に従ってヌクレオチド配列を同定する工程：そして
ｂ）当該栽培化生物または祖先生物で同定された配列の存否の機能効果を分析する工程：
を含む、前記方法。
【請求項６９】
トランスフェクト植物細胞またはトランスジェニック植物を製造するための方法であって、
ａ）請求項４８の野生祖先のストレス抵抗性ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを、トランスジェニックタンパク質の発現に有効に使うことができるプロモーターに機能可能に連結されて含むように植物細胞を形質転換する工程；
ｂ）場合により、当該細胞をそこからトランスジェニック植物が再生される条件下で増殖させ、そして維持する工程：
を含む、前記方法。
【請求項７０】
請求項６９の方法により製造されたトランスフェクト細胞。
【請求項７１】
請求項６９の方法により製造されたトランスジェニック植物。
【請求項７２】
ａ）配列番号１、配列番号９１、配列番号２、配列番号４、配列番号５、配列番号７、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１５、および配列番号１７、および配列番号１８より成る群から選択されたポリヌクレオチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチド：
より成る群から選択された単離ポリヌクレオチド。
【請求項７３】
ａ）配列番号２０、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２４、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２８、配列番号２９および、配列番号９０より成る群から選択されたポリヌクレオチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチド：
より成る群から選択された単離ポリヌクレオチド。
【請求項７４】
ａ）配列番号３３、配列番号３４、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４１、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４５、配列番号４６、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５０、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５４、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５８、配列番号６０、配列番号６２、配列番号６３、および配列番号６４より成る群から選択されたポリヌクレオチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチド：
より成る群から選択された単離ポリヌクレオチド。
【請求項７５】
ａ）配列番号６６、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７０、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７４、配列番号７５、配列番号７７、配列番号５９、および配列番号７８より成る群から選択されたポリヌクレオチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチド：
より成る群から選択された単離ポリヌクレオチド。
【請求項７６】
ａ）配列番号８０、配列番号８１、および配列番号８２より成る群から選択されたポリヌクレオチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチド：
より成る群から選択された単離ポリヌクレオチド。
【請求項７７】
ａ）配列番号８４および配列番号８５より成る群から選択されたポリヌクレオチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチド：
より成る群から選択された単離ポリヌクレオチド。
【請求項７８】
ａ）配列番号１、配列番号９１、配列番号２、配列番号４、配列番号５、配列番号７、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１５、および配列番号１７、および配列番号１８より成る群から選択されたポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチド；および
ｂ）ａ）のポリヌクレオチドに少なくとも８５％の相同性をもち、そしてそれが実質的にａ）のポリヌクレオチドと同じ収量を与えるポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチド：
より成る群から選択された単離ポリペプチド。
【図１−１】
【図１−２】
【図２】
【図３−１】
【図３−２】
【図４】
【図５】
【図６−１】
【図６−２】
【図７】
【図８】
【図１−２】
【図２】
【図３−１】
【図３−２】
【図４】
【図５】
【図６−１】
【図６−２】
【図７】
【図８】
【公開番号】特開２００９−２９７０３９（Ｐ２００９−２９７０３９Ａ）
【公開日】平成２１年１２月２４日（２００９．１２．２４）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００９−２２３４５７（Ｐ２００９−２２３４５７）
【出願日】平成２１年９月２８日（２００９．９．２８）
【分割の表示】特願２００３−５６２２５０（Ｐ２００３−５６２２５０）の分割
【原出願日】平成１５年１月１６日（２００３．１．１６）
【出願人】（５０１２６５３６４）エボルーショナリー・ジェノミックス・インコーポレーテッド (4)
【Ｆターム（参考）】
【公開日】平成２１年１２月２４日（２００９．１２．２４）
【国際特許分類】
【出願日】平成２１年９月２８日（２００９．９．２８）
【分割の表示】特願２００３−５６２２５０（Ｐ２００３−５６２２５０）の分割
【原出願日】平成１５年１月１６日（２００３．１．１６）
【出願人】（５０１２６５３６４）エボルーショナリー・ジェノミックス・インコーポレーテッド (4)
【Ｆターム（参考）】
[ Back to top ]