結合構築体およびその使用方法
本発明は、抗原、カウンターレセプターなどのような同族構造、野生型ＩｇＧ、ＩＧＡまたはＩｇＥヒンジ−作用領域、すなわち、ＩｇＥ ＣＨ２、領域ペプチド、または０、１または２のシステイン残基を有する変異体ＩｇＧＩヒンジ領域ポリペプチドのための結合ドメイン、および免疫グロブリンＣＨ２およびＣＨ３ドメインを特徴とし、かつジスルフィド−結合マルチマーを形成するそれらの能力が弱められたポリペプチドとして支配的に起こりつつ、ＡＤＣＣおよび／またはＣＤＣが可能である新規な結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質に関する。該融合タンパク質は高発現レベルで組換えにより生産することができる。また、融合タンパク質の細胞表面形態、および融合タンパク質およびそのような融合タンパク質をコードするポリヌクレオチドの免疫治療適用を含めた、関連組成物および方法も提供される。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、以下：
ｉ）標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチドであって、該結合ドメインポリペプチドは重鎖可変領域を含み、該重鎖可変領域は１以上のアミノ酸残基においてアミノ酸置換または失欠を含む、ポリペプチド；
ｉｉ）該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド；および
ｉｉｉ）該第二のポリペプチドに結合したＮ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチド、
を含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも１つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項２】
前記結合ドメインポリペプチドが単鎖Ｆｖである、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項３】
前記重鎖可変領域における１以上のアミノ酸置換または失欠が、該失欠または置換のないタンパク質に対して該タンパク質の発現または安定性を増加させるのに有効である、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項４】
前記結合ドメインポリペプチドが、免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項５】
さらに、第二の標的分子に結合することができる第二の結合ドメインポリペプチドを含み、該第二の結合ドメインポリペプチドが免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む請求項４に記載のタンパク質。
【請求項６】
前記第一の標的分子および前記第二の標的分子が異なる、請求項５に記載のタンパク質。
【請求項７】
前記第一の標的分子および前記第二の標的分子が同一である、請求項５に記載のタンパク質。
【請求項８】
前記結合ドメインポリペプチドが、前記重鎖可変領域における位置９、１０、１１、１２、１０８、１１０、１１２に１以上のアミノ酸置換を含む単鎖Ｆｖである、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項９】
前記結合ドメインポリペプチドが、前記重鎖可変領域における位置１１にアミノ酸置換を含む単鎖Ｆｖである、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項１０】
前記単鎖Ｆｖ重鎖可変領域の１１の位置におけるアミノ酸に代えて置換したアミノ酸がセリン、スレオニン、システイン、チロシン、アスパラギン、グルタミン、アスパラギン酸、グルタミン酸、リシン、アルギニンおよびヒスチジンから選択される、請求項９に記載のタンパク質。
【請求項１１】
前記単鎖Ｆｖ重鎖可変領域の位置１１のロイシンがセリン以外のアミノ酸で置き換えられた請求項９に記載のタンパク質。
【請求項１２】
ロイシンが位置１１においてセリンによって置き換えられ、前記タンパク質が抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性および補体固定が可能であって、標的細胞の数を減少させる前記標的分子に結合することができる、請求項９に記載のタンパク質。
【請求項１３】
ロイシンが位置１１においてデス−ロイシンによって置き換えられた請求項９に記載のタンパク質。
【請求項１４】
位置１１においてアミノ酸置換を有しない前記タンパク質に対して増加した組換え発現または安定性を有する、請求項１２に記載のタンパク質。
【請求項１５】
位置１１においてアミノ酸置換を有する前記タンパク質の発現が、位置１１において置換が無い該タンパク質よりも１０〜１００倍大きい、請求項１４に記載のタンパク質。
【請求項１６】
前記発現が哺乳動物細胞におけるものである、請求項１４記載のタンパク質。
【請求項１７】
前記結合ドメインポリペプチドが単鎖Ｆｖであって、該単鎖Ｆｖの重鎖可変領域の位置１１におけるアミノ酸が失欠されている、請求項１記載のタンパク質。
【請求項１８】
前記結合ドメインポリペプチドが単鎖Ｆｖであって、該結合ドメインポリペプチドが軽鎖可変領域を含み、ここで、該軽鎖可変領域がアミノ酸位置１２、８０、８１、８３、１０５、１０６および１０７の１以上においてアミノ酸失欠または置換を有す１に記載のタンパク質。
【請求項１９】
位置１０６におけるアミノ酸が置換または失欠されている、請求項１８に記載のタンパク質。
【請求項２０】
前記結合ドメインポリペプチドが腫瘍抗原に結合する、請求項２記載のタンパク質。
【請求項２１】
前記結合ドメインポリペプチドが免疫エフェクター細胞上の抗原に結合する、請求項２に記載のタンパク質。
【請求項２２】
前記結合ドメインポリペプチドが癌細胞抗原に結合する、請求項２に記載のタンパク質。
【請求項２３】
前記癌細胞抗原が表面抗原である、請求項２２に記載のタンパク質。
【請求項２４】
前記癌細胞抗原が細胞内抗原である、請求項２２に記載のタンパク質。
【請求項２５】
前記結合ドメインポリペプチドがＢ細胞抗原に結合する、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項２６】
前記Ｂ細胞抗原がＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３７、ＣＤ４０、ＣＤ８０、およびＣＤ８６から選択される、請求項２５に記載のタンパク質。
【請求項２７】
前記単鎖ＦｖがＢ細胞抗原に結合する、請求項２に記載のタンパク質。
【請求項２８】
前記Ｂ細胞抗原がＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３７、ＣＤ４０、ＣＤ８０、およびＣＤ８６から選択される、請求項２７に記載のタンパク質。
【請求項２９】
前記単鎖ＦｖがＨＤ３７単鎖Ｆｖ、２Ｈ７単鎖Ｆｖ、Ｇ２８−１単鎖Ｆｖ、および４．４．２２０単鎖Ｆｖから選択される、請求項２８に記載のタンパク質。
【請求項３０】
前記単鎖ＦｖがＨＤ３７単鎖Ｆｖ、２Ｈ７単鎖Ｆｖ、Ｇ２８−１単鎖Ｆｖ、ＦＣ２−２、ＵＣＨＬ−１、５Ｂ９、Ｌ６，１０Ａ８、２ｅ１２、４０．２．３６、Ｇ１９−４、１Ｄ８、および４．４．２２０単鎖Ｆｖから選択される、請求項２に記載のタンパク質。
【請求項３１】
前記結合ドメインポリペプチドがＢ細胞分化抗原に結合するｓｃＦｖである、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項３２】
前記Ｂ細胞抗原がＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３７、およびＣＤ４０から選択される、請求項３１に記載のタンパク質。
【請求項３３】
前記結合ドメインポリペプチドがＣＤ２、ＣＤ３、ＣＤ４、ＣＤ５、ＣＤ６、ＣＤ８、ＣＤ１０、ＣＤ１１ｂ、ＣＤ１４、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２１、ＣＤ２２、ＣＤ２３、ＣＤ２４、ＣＤ２５、ＣＤ２８、ＣＤ３０、ＣＤ３７、ＣＤ４０、ＣＤ４３、ＣＤ５０（ＩＣＡＭ３）、ＣＤ５４（ＩＣＡＭ１）、ＣＤ５６、ＣＤ６９、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＣＤ１３４（ＯＸ４０）、ＣＤ１３７（４１ＢＢ）、ＣＤ１５２（ＣＴＬＡ−４）、ＣＤ１５３（ＣＤ３０リガンド）、ＣＤ１５４（ＣＤ４０リガンド）、ＩＣＯＳ、Ｌ６、Ｂ７−Ｈ１、およびＨＬＡクラスＩＩから選択される標的に結合する、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項３４】
前記タンパク質が該タンパク質の２以上を含む複合体を形成することができる、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項３５】
前記複合体がダイマーである、請求項３４に記載のタンパク質。
【請求項３６】
前記タンパク質がモノマーである、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項３７】
薬物、トキシン、免疫調節因子、ポリペプチドエフェクター、同位体、標識、またはエフェクター部位にカップリングした請求項１に記載のタンパク質。
【請求項３８】
前記少なくとも免疫学的活性が抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、補体固定、アポトーシスの誘導、１以上の生物学的に活性なシグナルの誘導、１以上の免疫エフェクター細胞の誘導、細胞分化の活性化、細胞活性化、１以上の生物学的に活性な分子の放出、および感染性因子、またはトキシンの中和から選択される、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項３９】
前記免疫学的活性が抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、補体固定、アポトーシスの誘導、１以上の生物学的に活性なシグナルの誘導、１以上の免疫エフェクター細胞の誘導、細胞分化の活性化、細胞活性化、１以上の生物学的に活性な分子の放出、および感染性因子またはトキシンの中和から選択される２つの免疫学的活性を含む請求項３８に記載のタンパク質。
【請求項４０】
タンパク質キナーゼ、タンパク質ホスファターゼ、Ｇ−タンパク質、環状ヌクレオチドまたは他の第二メッセンジャー、イオンチャネル、および分泌経路成分から選択される１以上の分子の活性化または阻害による生物学的に活性なシグナルを誘導することができるか、またはＮＫ細胞、単球、マクロファージ、Ｂ細胞、Ｔ細胞、肥満細胞、好中球、好酸球、および好塩基球から選択される１以上の免疫エフェクター細胞を誘導できる、請求項３８に記載のタンパク質。
【請求項４１】
１以上の免疫エフェクター細胞の前記誘導が、抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、または１以上の生物学的に活性な分子の放出に導く請求項４０に記載のタンパク質。
【請求項４２】
細胞活性化が可能であり、ここで、該活性化は細胞転写活性の変化を導く、請求項３８に記載のタンパク質。
【請求項４３】
前記細胞転写活性が増加される、請求項４２に記載のタンパク質。
【請求項４４】
前記細胞転写活性が減少される、請求項４２に記載のタンパク質。
【請求項４５】
前記１以上の生物学的に活性な分子がプロテアーゼである、請求項３８に記載のタンパク質。
【請求項４６】
前記１以上の生物学的に活性な分子がサイトカインである、請求項３８に記載のタンパク質。
【請求項４７】
前記サイトカインがモノカイン、リンホカイン、ケモカイン、成長因子、コロニー刺激因子、インターフェロン、およびインターロイキンから選択される、請求項４６に記載のタンパク質。
【請求項４８】
感染性因子の中和が可能であり、ここで、該感染性因子が細菌、ウイルス、寄生体または真菌である、請求項３８に記載のタンパク質。
【請求項４９】
トキシンの中和が可能であり、ここで、該トキシンがエンドトキシンおよびエキソトキシンから選択される、請求項３８に記載のタンパク質。
【請求項５０】
トキシンの中和が可能であり、ここで、該トキシンが炭疽トキシン、コレラトキシン、ジフテリアトキシン、百日咳トキシン、Ｅ．ｃｏｌｉ熱−不安定トキシンＬＴ、Ｅ．ｃｏｌｉ熱安定性トキシンＳＴ、シガトキシン、ＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓエンドトキシンＡ、ボツリヌストキシン、破傷風トキシン、Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ ＡＣトキシン、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ａｎｔｈｒａｃｉｓ ＥＦから選択されるエキソトキシンである、請求項３８に記載のタンパク質。
【請求項５１】
トキシンの中和が可能であり、ここで、該トキシンがサキシトキシン、テトロドトキシン、キノコトキシン、アフラトキシン、ピロリジジンアルカロイド、ファイトヘマグルチニン、およびグラヤノトキシンから選択されるエンドトキシンである、請求項３８に記載のタンパク質。
【請求項５２】
前記タンパク質が細胞内標的に結合して、細胞機能に影響する、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項５３】
前記結合ドメインポリペプチドが結合ドメインリンカーによって前記重鎖可変領域に結合した軽鎖可変領域を含み、ここで、該結合ドメインリンカーが配列Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｓｅｒを有する１以上のペプチドを含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項５４】
３つのＧｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｓｅｒペプチドを含む請求項５３に記載のタンパク質。
【請求項５５】
前記結合ドメインポリペプチドが、ヒト、マウス、ラット、ブタ、およびサルから選択される種から得られる野生型または遺伝子操作された免疫グロブリン可変領域を含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項５６】
前記結合ドメインポリペプチドがヒト化免疫グロブリン可変領域を含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項５７】
前記Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖ＩｇＧ ＣＨ３定常領域ポリペプチドに結合したＩｇＧ ＣＨ２定常領域ポリペプチドを含む、請求項２に記載のタンパク質。
【請求項５８】
前記Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖ＩｇＧ ＣＨ３定常領域ポリペプチドに結合したＩｇＧ ＣＨ２定常領域ポリペプチドから本質的になる、請求項２に記載のタンパク質。
【請求項５９】
前記Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖ＩｇＧ ＣＨ３定常領域ポリペプチドに結合したＩｇＧ ＣＨ２定常領域ポリペプチドを含む請求項２に記載のタンパク質。
【請求項６０】
前記Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖ＩｇＧ ＣＨ３定常領域ポリペプチドに結合したＩｇＧ ＣＨ２定常領域ポリペプチドから本質的になる、請求項２に記載のタンパク質。
【請求項６１】
前記結合ドメインポリペプチドが、ヒト定常領域の少なくとも部分を含む単鎖Ｆｖである、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項６２】
前記結合ドメインポリペプチドが、ヒト定常領域の少なくとも部分を含む単鎖Ｆｖである、請求項２に記載のタンパク質。
【請求項６３】
前記連結領域が、ヒトヒンジまたはその部分、ヒトＩｇＧヒンジまたはその部分、ヒトＩｇＡヒンジまたはその部分、ヒトＩｇＥヒンジまたはその部分、ラクダヒンジ領域またはその部分、ＩｇＧ１ラマヒンジ領域またはその部分、テンジクザメヒンジ領域またはその部分、およびギンザメヒンジ領域またはその部分から選択される天然に生じるヒンジ領域を含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項６４】
前記連結領域がヒトＩｇＥヒンジまたはその部分を含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項６５】
前記連結領域が、０または１いずれかのシステイン残基を有するヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３またはＩｇＧ４ヒンジ領域を含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項６６】
前記連結領域が、０と２との間のシステイン残基を有するヒトＩｇＧＡヒンジ領域を含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項６７】
前記連結領域が野生型ヒトＩｇＧ１免疫グロブリンヒンジ領域を含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項６８】
前記連結領域がグリコシル化部位を含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項６９】
前記連結領域が、ジスルフィド結合を形成できるシステイン残基を有しない請求項１に記載のタンパク質。
【請求項７０】
前記連結領域が１つのシステイン残基を有する、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項７１】
前記連結領域が、わずか１つのシステイン残基を含む、変異した野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項７２】
前記連結領域が、前記タンパク質が低下した二量体化する能力を有するように改変された請求項１に記載のタンパク質。
【請求項７３】
前記連結領域が３つのシステイン残基および１つのプロリン残基を含み、ここで、該システイン残基の１以上が失欠または置換され、かつ該プロリン残基が置換または失欠されている、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項７４】
前記連結領域が、第一、第二および第三のシステイン残基を含む変異した野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含み、ここで、該第一のシステイン残基は該第二のシステインに対してＮ−末端側であり、かつ該第二のシステインは該第三のシステインに対してＮ−末端側であり、ここで、該第一のシステイン残基は置換または失欠されている、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項７５】
前記野生型ヒンジ領域ポリペプチドがヒトＩｇＧ１からのものである、請求項７４に記載のタンパク質。
【請求項７６】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、以下：
ｉ）標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチドであって、該結合ドメインポリペプチドは、位置９、１０、１１、１２、１０８、１１０、１１２において１以上のアミノ酸失欠または置換を含む重鎖可変領域を含む、ポリペプチド；
ｉｉ）該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド；および
ｉｉｉ）該第二のポリペプチドに結合したＮ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも１つの免疫学的活性が可能であり、該タンパク質は、アミノ酸の失欠または置換を有しない該タンパク質に対して増大した組換え体発現または安定性を有する、タンパク質。
【請求項７７】
天然に生じない単鎖Ｆｖタンパク質であって、該タンパク質は、以下：
ｉ）標的細胞上の標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチドであって、該結合ドメインポリペプチドは重鎖可変領域を含み、ここで、該重鎖可変領域の第一のフレームワーク領域における位置１１において、ロイシンは失欠しているかまたは別のアミノ酸で置換されている、ポリペプチド；
ｉｉ）該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド；および
ｉｉｉ）該第二のポリペプチドに結合したＮ―末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は、（１）該標的分子に結合することができ、（２）抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性および補体固定が可能であり、および（３）標的細胞の数を減少させることができる、タンパク質。
【請求項７８】
さらに、前記重鎖可変領域の第一のフレームワーク領域において、位置１０のアミノ酸の置換または失欠を含む、請求項７７に記載のタンパク質。
【請求項７９】
位置１１の前記アミノ酸置換が、前記失欠または置換が無い単鎖Ｆｖタンパク質に対して該単鎖Ｆｖタンパク質の発現または安定性を増加させるのに有効である、請求項７７に記載のタンパク質。
【請求項８０】
前記残基のナンバリングが、ＫａｂａｔによるＥＵ指数である、請求項７７に記載のタンパク質。
【請求項８１】
前記連結領域がプロリン、および第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、該第一のシステイン残基は該第二のシステインに対してＮ−末端側にあって、該第二のシステインは該第三のシステインに対してＮ−末端側にあり、該第三のシステイン残基は該プロリン残基に対してＮ−末端側にある、請求項７７に記載のタンパク質。
【請求項８２】
前記連結領域がＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含む、請求項７７に記載のタンパク質。
【請求項８３】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記第二のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基は連結領域におけるセリンによって置き換えられ、かつ前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項８４】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、前記連結領域はマウスＩｇＡヒンジまたはその部分を含み、かつ前記重鎖定常領域はマウスＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３が、該ＩｇＡ重鎖定常領域がＪ鎖ポリペプチドと会合できないようにする４つのアミノ酸における失欠または置換を含む、請求項８２に記載のタンパク質。
【請求項８５】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域における前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、該連結領域における前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、リシンが該ＣＨ２領域における位置３２２のセリンによって置き換えられた、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項８６】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、リシンが該ＣＨ２領域における位置３２２のセリンによって置き換えられた、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項８７】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域における位置３３１のセリンによって置き換えられた請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項８８】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンが該ＣＨ２領域における位置３３１のセリンによって置き換えられた、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項８９】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置きかえられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、スレオニンが該ＣＨ２領域における位置２５６のアスパラギンによって置き換えられた請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項９０】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からの２Ｈ７単鎖Ｆｖ ＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ２ドメインにおいて、アルギニンは位置２５５のグルタミンによって置き換えられ、スレオニンは位置２５６のアスパラギンによって置き換えられ、プロリンは位置２５７のアラニンによって置き換えられ、およびグルタミン酸は位置２５８のリシンによって置き換えられた、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項９１】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、リシンは該ＣＨ２領域における位置２９０のグルタミンによって置き換えられた、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項９２】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、アラニンは該ＣＨ２領域における位置３３９のプロリンによって置き換えられた請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項９３】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項９４】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項９５】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第二のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項９６】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一および第二のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からおＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項９７】
前記単鎖タンパク質がＦＣ２−２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項９８】
前記単鎖タンパク質がＵＣＨＬ−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項９９】
前記単鎖タンパク質が５Ｂ９ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項１００】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項１０１】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項１０２】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項１０３】
前記単鎖タンパク質が連結領域を含むＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、該重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項１０４】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項１０５】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はマウスＩｇＡヒンジ領域を含み、前記重鎖定常領域はマウスＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、該ＣＨ３は、該ＩｇＡ重鎖定常領域をＪ鎖ポリペプチドと会合できなくする４つのアミノ酸における失欠または置換を含む、請求項８２に記載のタンパク質。
【請求項１０６】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はヒトＩｇＡヒンジ領域を含み、前記重鎖定常領域はヒトＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３は、ＩｇＡ重鎖定常領域をＪ鎖ポリペプチドと会合できなくする４つのアミノ酸における失欠または置換を含む請求項８２に記載のタンパク質。
【請求項１０７】
前記単鎖タンパク質がＨＤ３７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項１０８】
前記単鎖タンパク質がＬ６単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣ３ドメインを含む請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項１０９】
天然に生じない単鎖Ｆｖタンパク質であって、該タンパク質は、以下：
ｉ）標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチドであって、該結合ドメインポリペプチドは、重鎖可変領域を含み、ここで、該重鎖可変領域の第一のフレームワーク領域において、ロイシンが位置１１のセリンのよって置き換えられ；ここで、該タンパク質は、該アミノ酸置換を有しないタンパク質に対して哺乳動物細胞において増加した発現または安定性を有する、ポリペプチド；
ｉｉ）該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド；および
ｉｉｉ）該第二のポリペプチドに結合したＮ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチド、
を含み、ここで、該天然に生じない単鎖Ｆｖタンパク質は少なくとも１つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項１１０】
天然に生じない単鎖Ｆｖタンパク質であって、該タンパク質は、以下：
ｉ）標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチド、該結合ドメインポリペプチドは、重鎖可変領域を含み、ここで、該重鎖可変領域の第一のフレームワーク領域において、ロイシンは位置１１のセリンによって置き換えられ；および
ｉｉ）該第二のポリペプチドに結合したＮ−末端が縮重されたＩｇＥ免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第二のポリペプチド、
を含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも１つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項１１１】
位置１１の前記アミノ酸置換が、前記失欠または置換がない単鎖Ｆｖタンパク質に対して該単鎖Ｆｖタンパク質の発現または安定性を増加させるのに有効である、請求項１１０に記載のタンパク質。
【請求項１１２】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、かつ前記重鎖定常領域がＩｇＥからのＣＨ２、ＣＨ３およびＣＨ４ドメインを含む、請求項１１０に記載のタンパク質。
【請求項１１３】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、かつ前記重鎖定常領域がマウスＩｇＥからのＣＨ２、ＣＨ３およびＣＨ４ドメインを含む、請求項１１０に記載のタンパク質。
【請求項１１４】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記重鎖定常領域がマウスＩｇＥからのＣＨ２、ＣＨ３およびＣＨ４ドメインを含む、請求項１１０に記載のタンパク質。
【請求項１１５】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記重鎖定常領域がヒトＩｇＥからのＣＨ２、ＣＨ３およびＣＨ４ドメインを含む、請求項１１０に記載のタンパク質。
【請求項１１６】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、標的分子に結合できる結合ドメインポリペプチドを含む第一のポリペプチド、該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド、該第二のポリペプチドに結合したＮ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、ここで、該連結領域は第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、該第一のシステイン残基は該第二のシステイン残基に対してＮ−末端側にあり、かつ該第二のシステインは該第三のシステインに対してＮ−末端側にあり、ここで、該第二および第三のシステイン残基の一方または両方は置換または失欠されており、そしてここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも１つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項１１７】
前記結合ドメインポリペプチドが単鎖Ｆｖである、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１１８】
前記結合ドメインポリペプチドが、免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１１９】
さらに、第二の標的分子に結合できる第二の結合ドメインポリペプチドを含み、該第二の結合ドメインポリペプチドは、免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む、請求項１１８に記載のタンパク質。
【請求項１２０】
前記結合ドメインポリペプチドが重鎖可変領域を含む単鎖Ｆｖであり、ここで、該重鎖可変領域はアミノ酸位置９、１０、１１、１２、１０８、１１０、１１２の１以上においてアミノ酸の失欠または置換を有する、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１２１】
前記結合ドメインポリペプチドが軽鎖可変領域を含む単鎖Ｆｖであり、ここで、該軽鎖可変領域はアミノ酸位置１２、８０、８１、８３、１０５、１０６および１０７の１以上においてアミノ酸の失欠または置換を有する、請求項１１７に記載のタンパク質。
【請求項１２２】
前記結合ドメインポリペプチドが重鎖可変領域を含む単鎖Ｆｖであり、ここで、該重鎖可変領域はアミノ酸位置１１においてアミノ酸置換を有する、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１２３】
前記単鎖Ｆｖ重鎖可変領域の位置１１におけるアミノ酸がセリン、スレオニン、システイン、チロシン、アスパラギン、グルタミン、アスパラギン酸、グルタミン酸、リシン、アルギニンおよびヒスチジンから選択される、請求項１２２に記載のタンパク質。
【請求項１２４】
前記単鎖Ｆｖ重鎖可変領域の位置１１のアミノ酸に代えて置換したアミノ酸がセリン、スレオニン、システイン、チロシン、アスパラギンおよびグルタミンから選択される、請求項１２２に記載のタンパク質。
【請求項１２５】
ロイシンが位置１１においてセリンによって置き換えられた請求項１２２に記載のタンパク質。
【請求項１２６】
ロイシンが位置１１においてデス−ロイシンによって置き換えられた、請求項１２２に記載のタンパク質。
【請求項１２７】
前記結合ドメインポリペプチドが単鎖Ｆｖであって、該単鎖Ｆｖの重鎖可変領域の位置１１のアミノ酸が失欠されている、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１２８】
ロイシンが位置１０６においてセリンによって置き換えられた、請求項１２１に記載のタンパク質。
【請求項１２９】
前記結合ドメインポリペプチドが腫瘍抗原に結合する、請求項１１７に記載のタンパク質。
【請求項１３０】
前記結合ドメインポリペプチドが免疫エフェクター細胞上の抗原に結合する、請求項１１７に記載のタンパク質。
【請求項１３１】
前記結合ドメインポリペプチドが癌細胞抗原に結合する、請求項１１７に記載のタンパク質。
【請求項１３２】
前記癌細胞抗原が表面抗原である、請求項１３１に記載のタンパク質。
【請求項１３３】
前記癌細胞抗原が細胞内抗原である、請求項１３１に記載のタンパク質。
【請求項１３４】
前記結合ドメインポリペプチドがＢ細胞抗原に結合する、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１３５】
前記Ｂ細胞抗原がＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３７、ＣＤ４０、ＣＤ８０、およびＣＤ８６から選択される、請求項１３５に記載のタンパク質。
【請求項１３６】
前記単鎖ＦｖがＢ細胞抗原に結合する、請求項１１７に記載のタンパク質。
【請求項１３７】
前記Ｂ細胞抗原がＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３７、ＣＤ４０、ＣＤ８０、およびＣＤ８６から選択される、請求項１３６に記載のタンパク質。
【請求項１３８】
前記単鎖ＦｖがＨＤ３７単鎖Ｆｖ、２Ｈ７単鎖Ｆｖ、Ｇ２８−１単鎖Ｆｖ、および４．４．２２０単鎖Ｆｖから選択される、請求項１３７に記載のタンパク質。
【請求項１３９】
前記単鎖ＦｖがＨＤ３７単鎖Ｆｖ、２Ｈ７単鎖Ｆｖ、Ｇ２８−１単鎖Ｆｖ、ＦＣ２−２、ＵＣＨＬ−１、５Ｂ９、Ｌ６、１０Ａ８、２ｅ１２、４０．２．３６、Ｇ１９−４、１Ｄ８、および４．４．２２０単鎖Ｆｖから選択される、請求項１１７に記載のタンパク質。
【請求項１４０】
前記結合ドメインポリペプチドが、Ｂ細胞分化抗原に結合するｓｃＦｖである、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１４１】
前記Ｂ細胞抗原がＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３７、およびＣＤ４０から選択される、請求項１３６に記載のタンパク質。
【請求項１４２】
前記結合ドメインポリペプチドがＣＤ２、ＣＤ３、ＣＤ４、ＣＤ５、ＣＤ６、ＣＤ８、ＣＤ１０、ＣＤ１１ｂ、ＣＤ１４、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２１、ＣＤ２２、ＣＤ２３、ＣＤ２４、ＣＤ２５、ＣＤ２８、ＣＤ３０、ＣＤ３７、ＣＤ４０、ＣＤ４３、ＣＤ５０（ＩＣＡＭ３）、ＣＤ５４（ＩＣＡＭ１）、ＣＤ５６、ＣＤ６９、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＣＤ１３４（ＯＸ４０）、ＣＤ１３７（４１ＢＢ）、ＣＤ１５２（ＣＴＬＡ−４）、ＣＤ１５３（ＣＤ３０リガンド）、ＣＤ１５４（ＣＤ４０リガンド）、ＩＣＯＳ、Ｌ６、Ｂ７−Ｈ１、およびＨＬＡクラスＩＩから選択される標的に結合する、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１４３】
前記タンパク質が該タンパク質の２以上を含む複合体を形成することができる、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１４４】
前記複合体がダイマーである、請求項１４３に記載のタンパク質。
【請求項１４５】
前記タンパク質がモノマーである、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１４６】
薬物、トキシン、免疫調節因子、ポリペプチドエフェクター、同位体、標識、またはエフェクター部分にカップリングした、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１４７】
前記免疫学的活性が抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、補体固定、アポトーシスの誘導、１以上の生物学的に活性なシグナルの誘導、１以上の免疫エフェクター細胞の誘導、細胞分化の活性化、細胞活性化、１以上の生物学的に活性な分子の放出、および感染性因子またはトキシンの中和から選択される、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１４８】
タンパク質キナーゼ、タンパク質ホスファターゼ、Ｇ−タンパク質、環状ヌクレオチドまたは他の第二メッセンジャー、イオンチャネル、および分泌経路成分から選択される１以上の分子の活性化または阻害によって生物学的に活性なシグナルを誘導することができる、請求項１４７に記載のタンパク質。
【請求項１４９】
ＮＫ細胞、単球、マクロファージ、Ｂ細胞、Ｔ細胞、肥満細胞、好中球、好酸球、および好塩基球から選択される１以上の免疫エフェクター細胞を誘導することができる、請求項１４７に記載のタンパク質。
【請求項１５０】
１以上の免疫エフェクター細胞の該誘導が、抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性または１以上の生物学的に活性な分子の放出を導く請求項１４９に記載のタンパク質。
【請求項１５１】
細胞活性化が可能であり、ここで、該活性化は細胞転写活性の変化を導く、請求項１４７に記載のタンパク質。
【請求項１５２】
前記細胞転写活性が増加される、請求項１５１に記載のタンパク質。
【請求項１５３】
前記細胞転写活性が減少される、請求項１５１に記載のタンパク質。
【請求項１５４】
前記１以上の生物学的に活性な分子がプロテアーゼである、請求項１４７に記載のタンパク質。
【請求項１５５】
前記１以上の生物学的に活性な分子がサイトカインである、請求項１４７に記載のタンパク質。
【請求項１５６】
前記サイトカインがモノカイン、リンホカイン、ケモカイン、成長因子、コロニー刺激因子、インターフェロン、およびインターロイキンから選択される、請求項１５５に記載のタンパク質。
【請求項１５７】
感染性因子の中和が可能であり、ここで、該感染性因子が細菌、ウイルス、寄生体、または真菌である、請求項１４７に記載のタンパク質。
【請求項１５８】
トキシンの中和が可能であり、ここで、該トキシンがエンドトキシンおよびエキソトキシンから選択される、請求項１４７に記載のタンパク質。
【請求項１５９】
トキシンの中和が可能であり、ここで、該トキシンが炭疽トキシン、コレラトキシン、ジフテリアトキシン、百日咳トキシン、Ｅ．ｃｏｌｉ熱−不安定トキシンＬＴ、Ｅ．ｃｏｌｉ熱安定性トキシンＳＴ、シガトキシン、ＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓエンドトキシンＡ、ボツリヌストキシン、破傷風トキシン、Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ ＡＣトキシン、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ａｎｔｈｒａｃｉｓ ＥＦから選択されるエキソトキシンである、請求項１４７に記載のタンパク質。
【請求項１６０】
トキシンの中和が可能であり、ここで、該トキシンがサキシトキシン、テトロドトキシン、キノコトキシン、アフラトキシン、ピロリジジンアルカロイド、ファイトヘマグルチニン、およびグラヤノトキシンから選択されるエンドトキシンである、請求項１４７に記載のタンパク質。
【請求項１６１】
前記結合ドメインポリペプチドが、結合ドメインリンカーによって前記重鎖可変領域に結合した軽鎖可変領域を含み、ここで、該結合ドメインリンカーが配列Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｓｅｒを有する１以上のペプチドを含む、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１６２】
３つのＧｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｓｅｒペプチドを含む、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１６３】
前記結合ドメインポリペプチドがヒト、マウス、ラット、ブタおよびサルから選択される種から得られた野生型または遺伝子操作された免疫グロブリン可変領域を含む、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１６４】
前記タンパク質が細胞内標的に結合して、細胞機能を行うことができる、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１６５】
前記Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖ＩｇＧ ＣＨ３定常領域ポリペプチドに結合したＩｇＧ ＣＨ２定常領域ポリペプチドを含む、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１６６】
前記免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが機能的に活性なＣＨ１ドメインが無い、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１６７】
前記Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖ＩｇＧ ＣＨ３定常領域ポリペプチドから本質的になる、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１６８】
ヒト定常領域の少なくとも一部を含む請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１６９】
前記連結領域がヒトヒンジまたはその部分、ヒトＩｇＧヒンジまたはその部分、ヒトＩｇＡヒンジまたはその部分、ヒトＩｇＥヒンジまたはその部分、ラクダヒンジ領域またはその部分、ＩｇＧ１ラマヒンジ領域またはその部分、テンジクザメヒンジ領域またはその部分、およびギンザメヒンジ領域またはその部分から選択される天然に生じるヒンジ領域を含む、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１７０】
前記連結領域がヒトＩｇＥヒンジまたはその部分を含む請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１７１】
前記連結領域が、０または１のシステイン残基を有するヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３またはＩｇＧ４ヒンジ領域を含む請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１７２】
前記連結領域が、０と２との間のシステイン残基を有するヒトＩｇＧＡヒンジ領域を含む、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１７３】
前記連結領域が野生型ヒトＩｇＧ１免疫グロブリンヒンジ領域を含む、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１７４】
前記連結領域がグリコシル化部位を含む、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１７５】
前記連結領域が、ジスルフィド結合を形成することができるシステイン残基を有しない、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１７６】
前記連結領域が１つのシステイン残基を有する、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１７７】
前記連結領域が、わずか１つのシステイン残基を含む変異した野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含む、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１７８】
前記連結領域が、該タンパク質が低下した二量体化する能力を有するように変更された、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１７９】
前記連結領域がプロリンおよび第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、該第一のシステイン残基は該第二のシステインに対してＮ−末端側にあって、該第二のシステインは該第三のシステインに対してＮ−末端側にあり、該第三のシステイン残基が該プロリン残基に対してＮ−末端側にある、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１８０】
前記単鎖タンパク質がＣＴＬＡ−４単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２ドメインにおいて位置２３８におけるセリンによって置き換えられた請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１８１】
前記単鎖タンパク質がＣＴＬＡ−４単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、かつ該重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１８２】
前記単鎖タンパク質がＦＣ２−２単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１８３】
前記単鎖タンパク質がＵＣＨＬ−１単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１８４】
前記単鎖タンパク質が５Ｂ９単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１８５】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ ｓｃＦｖ単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域においては、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１８６】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１８７】
前記単鎖タンパク質が、連結領域を含む２Ｈ７単鎖Ｆｖを含み、ここで、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、フェニルアラニンは該ＣＨ３領域において位置４０５のチロシンによって置き換えられた、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１８８】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、フェニルアラニンは該ＣＨ３領域において位置４０５のアラニンによって置き換えられる、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１８９】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、チロシンは該ＣＨ３領域において位置４０７のアラニンによって置き換えられた請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１９０】
約７５ｋＤａの見掛けの分子量を有する、請求項１８９に記載のタンパク質。
【請求項１９１】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３領域において、フェニルアラニンは位置４０５のアラニンによって置き換えられ、かつチロシンは位置４０７のアラニンによって置き換えられた、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１９２】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１９３】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１９４】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一および第二のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１９５】
前記単鎖タンパク質が連結領域を含む２Ｈ７単鎖Ｆｖを含み、ここで、前記第二のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１９６】
前記単鎖タンパク質が連結領域を含む２Ｈ７単鎖Ｆｖを含み、ここで、前記第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１９７】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一のシステイン残基がセリンによって置き換えられ、ここで、前記重鎖定常領域は２Ｈ７単鎖Ｆｖ ＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１９８】
前記単鎖タンパク質がＨＤ３７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつプロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１９９】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、かつ前記重鎖定常領域がラマＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３定常領域ポリペプチドを含む請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２００】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、かつ前記重鎖定常領域がラマＩｇＧ２からのＣＨ２およびＣＨ３定常領域ポリペプチドを含む請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２０１】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、かつ前記重鎖定常領域がラマＩｇＧ３からのＣＨ２およびＣＨ３定常領域ポリペプチドを含む請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２０２】
前記単鎖タンパク質がＣＤ−１６−６単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられた、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２０３】
前記単鎖タンパク質がＣＤ−１６レセプター結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基がセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられた、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２０４】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、ここで、該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２０５】
前記単鎖タンパク質が１０Ａ８ ｓｃＦｖ単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、ここで、該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２０６】
前記単鎖タンパク質が４０．２．３６ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、ここで、該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および脂肪質テイルドメインを含むポリペプチドに結合された、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２０７】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、ここで、該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２０８】
前記単鎖タンパク質がＧ１９−４ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、ここで、該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２０９】
前記単鎖タンパク質がＧ１９−４ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、前記ＣＤ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２１０】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２１１】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域においては、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、および該ＣＨ３ドメインはｍＦＡＤＤ膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２１２】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはｍＦＡＤＤ膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２１３】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはｍｃａｓｐ３膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２１４】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該Ｃ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、および該ＣＨ３ドメインはｍｃａｓｐ３膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２１５】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはｍｃａｓｐ８膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２１６】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、および該ＣＨ３ドメインはｍｃａｓｐ８膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２１７】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、前記ＣＨ３ドメインはｈｃａｓｐ３膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２１８】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、および該ＣＨ３ドメインはｈｃａｓｐ３膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２１９】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３はｈｃａｓｐ８膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合された請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２２０】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、および該ＣＨ３ドメインはｈｃａｓｐ８膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２２１】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２２２】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、および該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２２３】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ ｓｃＦｖハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２２４】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、かつ該ＣＨ３ドメインはｍＦＡＤＤ膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２２５】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはｍＦＡＤＤ膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２２６】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、該重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはｍｃａｓｐ３膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２２７】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、および該ＣＨ３ドメインはｍｃａｓｐ３膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２２８】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはｍｃａｓｐ８膜貫通および細胞質ドメインを含むポリペプチドに結合された請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２２９】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、および該ＣＨ３ドメインはｍｃａｓｐ８膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２３０】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはｈｃａｓｐ３膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２３１】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、およびＣＨ３ドメインはｈｃａｓｐ３膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２３２】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはｈｃａｓｐ８膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２３３】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、および該ＣＨ３ドメインはｈｃａｓｐ８膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２３４】
前記単鎖タンパク質がＬ６単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２３５】
前記単鎖タンパク質が連結領域を含むＧ２８−１単鎖Ｆｖを含み、ここで、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、ここで、前記重鎖定常領域はＧ２８−１単鎖Ｆｖ ＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２３６】
被験体において標的細胞集団を減少させる方法であって、該方法は、以下：
ａ）標的細胞集団を、該標的細胞集団内の細胞に結合する第一のタンパク質またはペプチドで処理し、次いで、
ｂ）ｉ）Ｆｃレセプターに結合する、ｉｉ）標的細胞のアポトーシスを誘導する、またはｉｉｉ）補体を固定する、の少なくとも１つが可能である第二のタンパク質またはポリペプチドで該標的細胞集団を処理する工程を包含し、ここで、該第一のタンパク質またはペプチド分子は該第二のタンパク質またはペプチド分子に直接結合し、または所望により、該第一のタンパク質またはペプチド分子および該第二のタンパク質またはペプチド分子は第三のタンパク質またはペプチド分子によって連結され、ここで、該タンパク質分子は抗体、ＴＮＦファミリーまたはＴＮＦレセプターファミリーのメンバーではなく、細菌トキシン、細胞傷害性薬物、または放射性同位体と結合体化しない、約１５０ｋＤ未満であるタンパク質の治療有効量を被験体に投与する工程を包含する、方法。
【請求項２３７】
被験体において標的細胞集団を減少させる方法であって、該方法は、以下：
ａ）標的細胞集団を、該標的細胞集団内の細胞に結合する第一のタンパク質またはペプチドで処理し、次いで、
ｂ）ｉ）Ｆｃレセプターに結合する、ｉｉ）標的細胞のアポトーシスを誘導する、またはｉｉｉ）補体を固定する、の少なくとも１つが可能である第二のタンパク質またはポリペプチドで該標的細胞集団を処理する工程から本質的になり、ここで、該第一のタンパク質またはペプチド分子は該第二のタンパク質またはペプチド分子に直接結合し、または所望により、該第一のタンパク質またはペプチド分子および該第二のタンパク質またはペプチド分子は第三のタンパク質またはペプチド分子によって連結され、ここで、該タンパク質分子は抗体、ＴＮＦファミリーまたはＴＮＦレセプターファミリーのメンバーではなく、細菌トキシン、細胞傷害性薬物、または放射性同位体と結合体化しない、約１５０ｋＤ未満であるタンパク質の治療有効量を被験体に投与する工程を包含する、方法。
【請求項２３８】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、以下：
ｉ）標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチドであって、該結合ドメインポリペプチドは１以上のアミノ酸の欠失または置換を含む軽鎖可変領域を含む、ポリペプチド；
ｉｉ）該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド；および
ｉｉｉ）該第二のポリペプチドに結合したＮ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチド、
を含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも１つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項２３９】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、以下：
ｉ）標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチドであって、該結合ドメインポリペプチドは、位置１２、８０、８１、８３、１０５、１０６および１０７において１以上のアミノ酸の欠失または置換を含む軽鎖可変領域を含み；
ｉｉ）該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド；および
ｉｉｉ）該第二のポリペプチドに結合したＮ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチド、
を含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも１つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項２４０】
前記軽鎖可変領域における１以上のアミノ酸の置換または欠失は、該欠失または置換が無いタンパク質に対して該タンパク質の発現または安定性を増加させるのに有効である、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２４１】
前記結合ドメインポリペプチドが単鎖Ｆｖである、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２４２】
前記結合ドメインポリペプチドが免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２４３】
さらに、第二の標的分子に結合することができる第二の結合ドメインポリペプチドを含み、該第二の結合ドメインポリペプチドは免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む請求項２４２に記載のタンパク質。
【請求項２４４】
前記結合ドメインポリペプチドが単鎖Ｆｖであって、該単鎖Ｆｖの前記軽鎖可変領域が位置１０６においてアミノ酸の欠失または置換を有する、請求項２４１に記載のタンパク質。
【請求項２４５】
前記結合ドメインポリペプチドが単鎖Ｆｖであって、該単鎖Ｆｖの重鎖可変領域の位置１０６のアミノ酸が欠失されている、請求項２４１に記載のタンパク質。
【請求項２４６】
前記結合ドメインポリペプチドが単鎖Ｆｖであって、該単鎖Ｆｖの前記軽鎖可変領域が位置１０６にアミノ酸置換を有する、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２４７】
ロイシンが１０６の位置においてセリンによって置き換えられた請求項２４４に記載のタンパク質。
【請求項２４８】
ロイシンが１０６の位置においてデス−ロイシンによって置き換えられた請求項２４４に記載のタンパク質。
【請求項２４９】
前記単鎖Ｆｖ軽鎖可変領域の位置１０６のアミノ酸に代えて置き換えたアミノ酸がセリン、スレオニン、システイン、チロシン、アスパラギン、グルタミン、アスパラギン酸、グルタミン酸、リシン、アルギニンおよびヒスチジンから選択される、請求項２４４に記載のタンパク質。
【請求項２５０】
前記結合ドメインポリペプチドが重鎖可変領域を含む単鎖Ｆｖであり、ここで、前記重鎖可変領域がアミノ酸位置１１にアミノ酸置換を有する、請求項２４４に記載のタンパク質。
【請求項２５１】
前記結合ドメインポリペプチドが腫瘍抗原に結合する、請求項２４１に記載のタンパク質。
【請求項２５２】
前記結合ドメインポリペプチドが免疫エフェクター細胞上の抗原に結合する、請求項２４１に記載のタンパク質。
【請求項２５３】
前記結合ドメインポリペプチドが癌細胞抗原に結合する、請求項２４１に記載のタンパク質。
【請求項２５４】
前記癌細胞抗原が表面抗原である、請求項２５３に記載のタンパク質。
【請求項２５５】
前記癌細胞抗原が細胞内抗原である、請求項２５３に記載のタンパク質。
【請求項２５６】
前記結合ドメインポリペプチドがＢ細胞抗原に結合する、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２５７】
前記Ｂ細胞抗原がＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３７、ＣＤ４０、ＣＤ８０およびＣＤ８６から選択される、請求項２５６に記載のタンパク質。
【請求項２５８】
前記単鎖ＦｖがＢ細胞抗原に結合する、請求項２４１に記載のタンパク質。
【請求項２５９】
前記Ｂ細胞抗原がＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３７、ＣＤ４０、ＣＤ８０、およびＣＤ８６から選択される、請求項２５８に記載のタンパク質。
【請求項２６０】
前記単鎖ＦｖがＨＤ３７単鎖Ｆｖ、２Ｈ７単鎖Ｆｖ、Ｇ２８−１単鎖Ｆｖ、および４．４．２２０単鎖Ｆｖから選択される、請求項２５９に記載のタンパク質。
【請求項２６１】
前記結合ドメインポリペプチドが、Ｂ細胞分化抗原に結合するｓｃＦｖである、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２６２】
前記Ｂ細胞抗原がＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３７およびＣＤ４０から選択される、請求項２６１に記載のタンパク質。
【請求項２６３】
前記結合ドメインポリペプチドがＣＤ２、ＣＤ３、ＣＤ４、ＣＤ５、ＣＤ６、ＣＤ８、ＣＤ１０、ＣＤ１１ｂ、ＣＤ１４、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２１、ＣＤ２２、ＣＤ２３、ＣＤ２４、ＣＤ２５、ＣＤ２８、ＣＤ３０、ＣＤ３７、ＣＤ４０、ＣＤ４３、ＣＤ５０（ＩＣＡＭ３）、ＣＤ５４（ＩＣＡＭ１）、ＣＤ５６、ＣＤ６９、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＣＤ１３４（ＯＸ４０）、ＣＤ１３７（４１ＢＢ）、ＣＤ１５２（ＣＴＬＡ−４）、ＣＤ１５３（ＣＤ３０リガンド）、ＣＤ１５４（ＣＤ４０リガンド）、ＩＣＯＳ、Ｌ６、Ｂ７−Ｈ１、およびＨＬＡクラスＩＩから選択される標的に結合する、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２６４】
前記タンパク質が該タンパク質の２以上を含む複合体を形成することができる、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２６５】
前記複合体がダイマーである、請求項２６４に記載のタンパク質。
【請求項２６６】
前記タンパク質がモノマーである、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２６７】
前記免疫学的活性が抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、補体固定、アポトーシスの誘導、１以上の生物学的に活性なシグナルの誘導、１以上の免疫エフェクター細胞の誘導、細胞分化の活性化、細胞活性化、１以上の生物学的に活性な分子の放出、および感染性因子またはトキシンの中和から選択される、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２６８】
タンパク質キナーゼ、タンパク質ホスファターゼ、Ｇ−タンパク質、環状ヌクレオチドまたは他の第二メッセンジャー、イオンチャネルおよび分泌経路成分から選択される１以上の分子の活性化または阻害によって生物学的に活性なシグナルを誘導することができる、請求項２６７に記載のタンパク質。
【請求項２６９】
ＮＫ細胞、単球、マクロファージ、Ｂ細胞、Ｔ細胞、肥満細胞、好中球、好酸球、および好塩基球から選択される１以上の免疫エフェクター細胞を誘導することができる、請求項２６７に記載のタンパク質。
【請求項２７０】
１以上の免疫エフェクター細胞の該誘導が抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性または１以上の生物学的に活性な分子の放出を導く請求項２６７に記載のタンパク質。
【請求項２７１】
細胞活性化が可能であり、ここで、該活性化が細胞転写活性の変化を導く請求項２６７に記載のタンパク質。
【請求項２７２】
前記細胞転写活性が増加される、請求項２７１に記載のタンパク質。
【請求項２７３】
前記細胞転写活性が減少される、請求項２７１に記載のタンパク質。
【請求項２７４】
前記１以上の生物学的に活性な分子がプロテアーゼである、請求項２６７に記載のタンパク質。
【請求項２７５】
前記１以上の生物学的に活性な分子がサイトカインである、請求項２６７に記載のタンパク質。
【請求項２７６】
前記サイトカインがモノカイン、リンホカイン、ケモカイン、成長因子、コロニー刺激因子、インターフェロン、およびインターロイキンから選択される、請求項２７５に記載のタンパク質。
【請求項２７７】
感染性因子の中和が可能であり、該感染性因子が細菌、ウイルス、寄生体または真菌である、請求項２６７に記載のタンパク質。
【請求項２７８】
トキシンの中和が可能であり、ここで、該トキシンがエンドトキシンおよびエキソトキシンから選択される、請求項２６７に記載のタンパク質。
【請求項２７９】
トキシンの中和が可能であり、ここで、該トキシンが炭疽トキシン、コレラトキシン、ジフテリアトキシン、百日咳トキシン、Ｅ．ｃｏｌｉ熱−不安定トキシンＬＴ、Ｅ．ｃｏｌｉ熱安定性トキシンＳＴ、シガトキシン、ＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓエンドトキシンＡ、ボツリヌストキシン、破傷風トキシン、Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ ＡＣトキシン、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ａｎｔｈｒａｃｉｓ ＥＦから選択されるエキソトキシンである、請求項２６７に記載のタンパク質。
【請求項２８０】
トキシンの中和が可能であり、ここで、該トキシンがサキシトキシン、テトロドトキシン、キノコトキシン、アフラトキシン、ピロリジジンアルカロイド、ファイトヘマグルチニン、およびグラヤノトキシンから選択されるエンドトキシンである、請求項２６７に記載のタンパク質。
【請求項２８１】
前記タンパク質が細胞内標的に結合して、細胞機能に影響する、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２８２】
前記Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが免疫グロブリン重鎖ＩｇＧ ＧＨ３定常領域ポリペプチドに結合したＩｇＧ ＣＨ２定常領域ポリペプチドを含む請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２８３】
前記Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖ＩｇＧ ＧＨ３定常領域ポリペプチドに結合したＩｇＧ ＣＨ２定常領域ポリペプチドから本質的になる、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２８４】
ヒト定常領域の少なくとも一部を含む請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２８５】
前記連結領域が、ヒトヒンジまたはその部分、ヒトＩｇＧヒンジまたはその部分、ヒトＩｇＡヒンジまたはその部分、ヒトＩｇＥヒンジまたはその部分、ラクダヒンジ領域またはその部分、ＩｇＧ１ラマヒンジ領域またはその部分、テンジクザメヒンジ領域またはその部分、ギンザメヒンジ領域またはその部分から選択される天然に生じるヒンジ領域を含む請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２８６】
前記連結領域がヒトＩｇＥヒンジまたはその部分を含む請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２８７】
前記連結領域が０または１のシステイン残基いずれかを有するヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３またはＩｇＧ４ヒンジ領域を含む請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２８８】
前記連結領域が０と２との間のシステイン残基を有するヒトＩｇＧＡヒンジ領域を含む請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２８９】
前記連結領域が野生型ヒトＩｇＧ１免疫グロブリンヒンジ領域を含む請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２９０】
前記連結領域がグリコシル化部位を含む請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２９１】
前記連結領域が、ジスルフィド結合を形成することができるシステイン残基を有しない請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２９２】
前記連結領域が１つのシステイン残基を有する、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２９３】
前記連結領域が、１以下のシステイン残基を含む変異した野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド含む請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２９４】
前記連結領域が、該タンパク質が低下した二量体化する能力を有するように変更された請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２９５】
前記連結領域がプロリンおよび第一、第二および第三のシステイン残基を含み、ここで、該第一のシステイン残基は該第二のシステインに対してＮ−末端側にあり、かつ第二のシステインは該第三のシステインに対してＮ−末端側にあり、該第三のシステイン残基は該プロリン残基に対してＮ−末端側にある、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２９６】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを含む第一のポリペプチド、該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド、該連結領域はＩｇＡヒンジ領域の少なくとも一部を含み、該第二のポリペプチドに結合したＮ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも１つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項２９７】
前記結合ドメインポリペプチドが免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項２９８】
さらに、第二の標的分子に結合することができる第二の結合ドメインポリペプチドを含み、該第二の結合ドメインポリペプチドは免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む請求項２９７に記載のタンパク質。
【請求項２９９】
前記連結領域がＩｇＡヒンジ領域の少なくとも一部から本質的になる、請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３００】
前記連結領域がＩｇＡヒンジ領域から本質的になる、請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３０１】
少なくとも約７０ｋＤａの見掛けの分子量を有するタンパク質として発現される、請求項３００に記載のタンパク質。
【請求項３０２】
約７０ｋＤａと約７００ｋＤａとの間の見掛けの分子量を有するタンパク質として発現される、請求項３００に記載のタンパク質。
【請求項３０３】
前記連結領域が１０と５０との間のアミノ酸を含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３０４】
前記連結領域が修飾されたヒトＩｇＡ免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３０５】
前記連結領域が唯１つのシステイン残基を有する、請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３０６】
前記連結領域が２つのシステイン残基を有する、請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３０７】
第三のポリペプチドにおける該Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドがＩｇＡ免疫グロブリン重鎖定常領域を含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３０８】
ＩｇＡ免疫グロブリン重鎖定常領域からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項３０７に記載のタンパク質。
【請求項３０９】
前記ＩｇＡ ＣＨ３定常領域ドメインが、ＩｇＡ重鎖定常領域をＪ鎖ポリペプチドと会合できなくする１以上のアミノ酸における置換または欠失を含む請求項３０８に記載のタンパク質。
【請求項３１０】
前記ＩｇＡ重鎖定常領域がＪ鎖ポリペプチドと会合することができる、請求項３０８に記載のタンパク質。
【請求項３１１】
前記ＩｇＡ ＣＨ３領域ドメインが４と２と０の間のアミノ酸における欠失を含む請求項３０９に記載のタンパク質。
【請求項３１２】
前記ＩｇＡ領域ドメインが４つのアミノ酸の欠失を含む請求項３０９に記載のタンパク質。
【請求項３１３】
前記ＩｇＡ領域ドメインが２０のアミノ酸の欠失を含む請求項３０９に記載のタンパク質。
【請求項３１４】
前記単鎖タンパク質がＬ６単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含み、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３１５】
前記単鎖タンパク質がＬ６ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含み、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３１６】
前記単鎖タンパク質がＣＴＬＡ−４ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含み、前記重鎖定常領域はマウスＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３１７】
前記単鎖タンパク質がＣＴＬＡ−４ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含み、前記重鎖定常領域はマウスＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、かつＣＨ３は、ＩｇＡ重鎖定常領域がＪ鎖ポリペプチドを会合できなくする４つのアミノ酸における欠失または置換を含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３１８】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含み、前記重鎖定常領域はマウスＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３１９】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、前記連結領域はＩｇＡヒンジまたはその部分を含み、かつ前記重鎖定常領域はＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３は、ＩｇＡ重鎖定常領域がＪ鎖ポリペプチドと会合できなくする１８のアミノ酸における欠失または置換を含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３２０】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、前記連結領域はＩｇＡヒンジまたはその部分を含み、かつ前記重鎖定常領域はＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３は、ＩｇＡ重鎖定常領域がＪ鎖ポリペプチドと会合できなくする４つのアミノ酸における欠失または置換を含み、かつ該ＣＨ３ドメインは、ＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３２１】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、前記連結領域はＩｇＡヒンジまたはその部分を含み、前記重鎖定常領域はＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３は、ＩｇＡ重鎖定常領域がＪ鎖ポリペプチドと会合できなくする４つのアミノ酸における欠失または置換を含み、かつ該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３２２】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、前記連結領域はＩｇＡヒンジまたはその部分を含み、前記重鎖定常領域はＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３は、ＩｇＡ重鎖定常領域がＪ鎖ポリペプチドと会合できなくする４つのアミノ酸における欠失または置換を含み、かつ該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３２３】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含み、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３２４】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含み、該重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３２５】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含み、前記重鎖定常領域はＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３は、該ＩｇＡ重鎖定常領域をＪ鎖ポリペプチドと会合できなくする４つのアミノ酸における欠失または置換を含み、および該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３２６】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含み、前記重鎖定常領域はＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＩｇＡ重鎖定常領域はＪ鎖ポリペプチドと会合できる、請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３２７】
前記単鎖タンパク質がＨＤ３７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含み、前記重鎖定常領域はＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３２８】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、以下：
ｉ）標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを含む第一のポリペプチド、および
ｉｉ）該第二のポリペプチドに結合したＩｇＥ免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドの少なくとも一部を含む第二のポリペプチドを含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも１つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項３２９】
前記結合ドメインポリペプチドが非−ＩｇＥ可変領域を含む請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３３０】
前記結合ドメインポリペプチドがＨＤ３７単鎖Ｆｖ、２Ｈ７単鎖Ｆｖ、Ｇ２８−１単鎖Ｆｖ、ＦＣ２−２、ＵＣＨＬ−１、５Ｂ９、Ｌ６、１０Ａ８、２ｅ１２、４０．２．３６、Ｇ１９−４、１Ｄ８、および４．４．２２０単鎖Ｆｖから選択される単鎖Ｆｖである、請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３３１】
前記結合ドメインポリペプチドが免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３３２】
さらに、第二の標的分子に結合することができる第二の結合ドメインポリペプチド含み、該第二の結合ドメインポリペプチドは免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む請求項３３１に記載のタンパク質。
【請求項３３３】
前記免疫グロブリン軽鎖および重鎖がＩｇＧ免疫グロブリン軽鎖および重鎖またはそれらの部分を含む請求項３３２に記載のタンパク質。
【請求項３３４】
前記結合ドメインポリペプチドがＩｇＧ免疫グロブリン可変領域の少なくとも部分を含む請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３３５】
前記ＩｇＧ可変領域が重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む請求項３３４に記載のタンパク質。
【請求項３３６】
ＩｇＥに特異的なＦｃレセプターに結合することができる、請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３３７】
ＩｇＥ可変鎖領域を有しない請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３３８】
前記結合ドメインがＩｇＧ免疫グロブリン軽鎖領域およびＩｇＧ免疫グロブリン軽鎖および重鎖領域から本質的になる、請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３３９】
前記ＩｇＥ免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドがＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３４０】
前記ＩｇＥ免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドがＣＨ２、ＣＨ３およびＣＨ４ドメインを含む請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３４１】
前記結合ドメインポリペプチドが重鎖可変領域を含む単鎖Ｆｖであり、ここで、該重鎖可変領域がアミノ酸位置１１においてアミノ酸置換を有する、請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３４２】
前記単鎖タンパク質がＨＤ３７単鎖Ｆｖ、２Ｈ７単鎖Ｆｖ、Ｇ２８−１単鎖Ｆｖ、および４．４．２２０単鎖Ｆｖから選択される単鎖Ｆｖである、請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３４３】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖ＦｖまたはＧ２８−１単鎖Ｆｖを含む単鎖Ｆｖである、請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３４４】
被験体における標的細胞集団を減少させる方法であって、該方法は、該被験体に、治療有効量の天然に生じない単鎖タンパク質を投与する工程を包含し、ここで、該タンパク質は結合ドメインポリペプチドを含む第一のポリペプチドであって、該結合ドメインポリペプチドはＩｇＧ可変領域の少なくとも部分を含み、かつ標的分子に結合することができる、ポリペプチド、該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド、該第二のポリペプチドに結合したＩｇＥ免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質が少なくとも１つの免疫学的活性が可能である、方法。
【請求項３４５】
前記タンパク質が患者の血流に投与される、請求項３４４に記載の方法。
【請求項３４６】
前記タンパク質の投与の結果として、単球が活性化されるが、肥満細胞は活性化されない請求項３４４に記載の方法。
【請求項３４７】
前記タンパク質が投与されるか、またはヒスタミン放出ブロッカーと共に投与される、請求項３４４に記載の方法。
【請求項３４８】
動物において細胞を枯渇させる方法であって、該方法は、修飾されたＩｇＥタンパク質を動物の血流に投与する工程を包含する、方法。
【請求項３４９】
前記修飾されたＩｇＥタンパク質が投与されるか、またはヒスタミン放出ブロッカーと共に投与される、請求項３４８に記載の方法。
【請求項３５０】
前記連結領域がＩｇＧヒンジまたはその部分を含み、かつ前記重鎖定常領域がＩｇＥ由来であって、ＣＨ２ドメインを含まないＣＨ３およびＣＨ４ドメインを含む請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３５１】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２からの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、かつ前記重鎖定常領域がＩｇＥ ＣＨ２、ＣＨ３、およびＣＨ４ドメインを含み、ここで、該重鎖定常領域はＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合された請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３５２】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、以下：
ｉ）標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチド；
ｉｉ）該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチドであって、該連結領域は３つのシステイン残基および１つのプロリン残基を含み、ここで、該システイン残基の１以上は欠失または置換される、ポリペプチド；および
ｉｉｉ）該第二のポリペプチドに結合したＮ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチド、
を含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも１つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項３５３】
前記連結領域が第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、該第一のシステイン残基は該第二のシステインに対してＮ−末端側にあり、かつ該第二のシステインは該第三のシステインに対してＮ−末端側にあり、ここで、該第一のシステイン残基は置換または欠失されておらず、ここで、該第二および第三のシステインは置換または欠失されている、請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３５４】
前記第二および第三のシステイン残基が別のアミノ酸によって置換された請求項３５３に記載のタンパク質。
【請求項３５５】
前記第二および第三のシステイン残基がセリン残基によって置換された請求項３５４に記載のタンパク質。
【請求項３５６】
約７５ｋＤａの見掛けの分子量を有する同種タンパク質として発現される、請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３５７】
前記連結領域が第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、該第一のシステイン残基は該第二のシステインに対してＮ−末端側にあり、かつ該第二のシステインは該第三のシステインに対してＮ−末端側にあり、ここで、該第一のシステイン残基は置換または欠失されている、請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３５８】
前記連結領域中の前記第二および第三のシステイン残基が置換または欠失されていない請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３５９】
前記連結領域が第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、該第一のシステイン残基は該第二のシステインに対してＮ−末端側にあり、かつ該第二のシステインは該第三のシステインに対してＮ−末端側にあり、ここで、該第二のシステイン残基は置換または欠失されている、請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３６０】
前記連結領域における前記第一および第三のシステイン残基が置換または欠失されていない請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３６１】
前記連結領域が第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、該第一のシステイン残基は該第二のシステインに対してＮ−末端側にあり、かつ該第煮のシステイン残基は該第三のシステイン残基に対してＮ−末端側にあり、ここで、該第三のシステイン残基は置換または欠失されている、請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３６２】
前記連結領域における前記第一および第二のシステイン残基が置換または欠失されていない請求項１０に記載のタンパク質。
【請求項３６３】
前記連結領域が５と６５との間のアミノ酸を含む請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３６４】
前記連結領域が１０と５０との間のアミノ酸を含む請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３６５】
前記連結領域が１５と３５との間のアミノ酸を含む請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３６６】
前記連結領域が少なくとも５つの連続ヒンジ領域アミノ酸を含む請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３６７】
前記連結領域が少なくとも１０の連続ヒンジ領域アミノ酸を含む請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３６８】
前記連結領域が少なくとも１５の連続ヒンジ領域アミノ酸を含む請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３６９】
前記第二および第三のシステインがセリン残基によって置き換えられ、かつ前記連結領域がＩｇＧ１ヒンジ領域の少なくとも部分を含む請求項３５３に記載のタンパク質。
【請求項３７０】
前記連結領域がＩｇＧ１ヒンジ領域の少なくとも５つの連続アミノ酸を含む請求項３６９に記載のタンパク質。
【請求項３７１】
前記第二および第三のシステインがセリン残基によって置き換えられ、かつ前記連結領域がＩｇＧ２ヒンジ領域の少なくとも部分を含む請求項３５３に記載のタンパク質。
【請求項３７２】
前記連結領域がＩｇＧ２ヒンジ領域の少なくとも５つの連続アミノ酸を含む請求項３７１に記載のタンパク質。
【請求項３７３】
前記第二および第三のシステイン残基がセリン残基によって置き換えられ、かつ前記連結領域がＩｇＧ３ヒンジ領域の少なくとも部分を含む請求項３５３に記載のタンパク質。
【請求項３７４】
前記連結領域がＩｇＧ３ヒンジ領域の少なくとも５つの連続アミノ酸を含む請求項３７３に記載のタンパク質。
【請求項３７５】
前記第二および第三のシステイン残基がセリン残基によって置き換えられ、かつ前記連結領域がＩｇＧ４ヒンジ領域の少なくとも部分を含む請求項３５３に記載のタンパク質。
【請求項３７６】
前記連結領域がＩｇＧ４ヒンジ領域の少なくとも５つの連続アミノ酸を含む請求項３７５に記載のタンパク質。
【請求項３７７】
前記第二および第三のシステイン残基が置換または欠失されており、かつ前記プロリン残基が置換または欠失されており、ここで、前記重鎖定常領域ポリペプチドはＣＨ３ドメインを含み、ここで、チロシンは位置４０７のアラニンによって置換され、ここで、該タンパク質は約７５ｋＤａの見掛けの分子量を有する、請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３７８】
前記第一および第三のシステイン残基が置換または欠失されており、および前記プロリン残基が置換または欠失されており、ここで、前記重鎖定常領域ポリペプチドはＣＨ３ドメインを含み、ここで、チロシンは位置４０７においてアラニンによって置換されており、ここで、該タンパク質は約７５ｋＤａの見掛けの分子量を有する、請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３７９】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、標的分子に結合することができる、結合ドメインポリペプチド含む第一のポリペプチド、該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド、該第二のポリペプチドに結合したＮ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、ここで、該連結領域は第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、該第一のシステイン残基は該第二のシステインに対してＮ−末端側にあり、かつ該第二のシステインは該第三のシステインに対してＮ−末端側にあり、ここで、該第二および第三のシステイン残基の一方または双方は置換または欠失されており、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも一つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項３８０】
前記連結領域が修飾されたヒトＩｇＧ１免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含む請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３８１】
前記連結領域が唯１つのシステイン残基を有する、請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３８２】
前記連結領域が修飾されたヒトＩｇＧ１免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド含む請求項３８１に記載のタンパク質。
【請求項３８３】
前記Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖ＩｇＧ ＣＨ３定常領域ポリペプチドに結合したＩｇＧ ＣＨ２定常領域ポリペプチドを含む請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３８４】
前記Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖ＩｇＧ ＣＨ３定常領域ポリペプチドに結合したＩｇＧ ＣＨ２定常領域ポリペプチドから本質的になる、請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３８５】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを含む第一のポリペプチド、該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド、免疫グロブリン重鎖ＣＨ２定常領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖ＣＨ３定常領域ポリペプチド含む第三のポリペプチドを含み、ここで、該ＣＨ３定常領域ポリペプチドは該タンパク質の２つが一緒に会合して非共有結合ダイマーを形成するのを阻害する１以上のアミノ酸置換または欠失を含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも一つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項３８６】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを含む第一のポリペプチド、該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド、免疫グロブリン重鎖ＣＨ２定常領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖ＣＨ３定常領域ポリペプチドを含み、ここで、該ＣＨ３定常領域ポリペプチドは位置４０５および４０７において１以上のアミノ酸の置換または欠失を含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも一つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項３８７】
位置４０５および位置４０７においてアミノ酸置換を含む請求項２５２または２５３に記載のタンパク質。
【請求項３８８】
フェニルアラニンが位置４０５においてアラニンで置き換えられ、チロシンが位置４０７においてアラニンで置換された請求項３８７に記載のタンパク質。
【請求項３８９】
約４０ｋＤａと約５０ｋＤａとの間の見掛けの分子量を有する、請求項３８７に記載のタンパク質。
【請求項３９０】
アゴニストまたはアンタゴニストの生物学的活性を有する、請求項３８７に記載のタンパク質。
【請求項３９１】
アンタゴニストの生物学的活性を有する、請求項３９０に記載のタンパク質。
【請求項３９２】
位置４０５および４０７における唯１つのアミノ酸が置換された請求項３８７に記載のタンパク質。
【請求項３９３】
約７０ｋＤａと約８０ｋＤａとの間の見掛けの分子量を有する、請求項３９２に記載のタンパク質。
【請求項３９４】
フェニルアラニンが位置４０５においてアラニンによって置き換えられた請求項３８７に記載のタンパク質。
【請求項３９５】
フェニルアラニンが位置４０５においてチロシンによって置き換えられた請求項３８７に記載のタンパク質。
【請求項３９６】
チロシンが位置４０７においてアラニンによって置き換えられた請求項３８６に記載のタンパク質。
【請求項３９７】
位置４０５および位置４０７においてアミノ酸置換を含む請求項３８６に記載のタンパク質。
【請求項３９８】
フェニルアラニンが位置４０５においてアラニンによって置き換えられ、かつチロシンが位置４０７においてアラニンによって置き換えられた請求項３９３に記載のタンパク質。
【請求項３９９】
請求項１、８、９、１２、１８、３０、および１１２〜１０９のいずれか１項に記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
【請求項４００】
請求項１１６、１２０、１２１、および１８０〜２３５のいずれか１項に記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
【請求項４０１】
請求項２３８、２３９、２９６、３２８、３５２、３５３、３８５および３８６いずれか１項に記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
【請求項４０２】
細胞中の前記ポリヌクレオチドの発現を増強するプロモーターまたは他の配列に操作可能に連結した請求項３９９〜４０１のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項４０３】
請求項３９９〜４０１のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドを含有する細胞。
【請求項４０４】
請求項１、８、９、１２、１８、３０、および１１２〜１０９のいずれか１項に記載のタンパク質を発現することができる組換えベクター。
【請求項４０５】
請求項１１６、１２０、１２１および１８０〜２３５のいずれか１項に記載のタンパク質を発現させることができる組換えベクター。
【請求項４０６】
前記タンパク質が発現される条件下で請求項１、８、９、１２、１８、３０および１１２〜１０９のいずれか１項に記載のタンパク質を発現する方法。
【請求項４０７】
前記タンパク質が発現される条件下で請求項１１６、１２０、１２１、および１８０〜２３５のいずれか１項に記載のタンパク質を発現する方法。
【請求項４０８】
前記タンパク質が発現される条件下で請求項２３８、２３９、２９６、３２８、３５２、３５３、３８５、および３８６のいずれか１項に記載のタンパク質を発現する方法。
【請求項４０９】
１以上のさらなる治療化合物と組み合わせた請求項２３８、２３９、２９６、３２８、３５２、３５３、３８５および３８６のいずれか１項に記載のタンパク質を含む組成物。
【請求項４１０】
被験体を処置する方法であって、該方法は、該被験体に、請求項２３８、２３９、２９６、３２８、３５２、３５３、３８５および３８６のいずれか１項に記載の１以上の第一の化合物を投与する工程、第一の化合物と組み合わせて該被験体に第二の化合物を投与または同時投与する工程を包含し、ここで、該処置は疾患、病気または望ましくない状態を処置または予防するのに有効である、方法。
【請求項４１１】
前記第二の化合物が化学療法化合物、治療薬物、脈管形成インヒビター、ステロイド、Ｂ−細胞アクチベーター、Ｔ−細胞アクチベーター、コロニー刺激因子、腫瘍壊死因子、インターフェロン、抗体、本発明の結合構築体、遺伝子治療、レチノイド、外科的手法、アルキル化剤、ヌクレオチドアナログ、トポイソメラーゼＩＩ、ＶＥＧＦ、ＩＦＮ−アルファ、ＤＭＡＲ剤、インターロイキン−１、グルココルチコイド、ｐ３８インヒビター、インターロイキン−４、インターロイキン−６、インターロイキン−２、インターロイキン−１２、ＩＦＮ−γ、ＧＭ−ＣＳＦ、Ｇ−ＣＳＦ、Ｍ−ＣＳＦ、抗−ＣＴＬＡ−４、Ｂｃｌ−２アンチセンス、ビタミンＡ、抗−ＣＤ１９、抗−ＣＤ２０、抗−ＣＤ２２、抗−ＣＤ２８または抗−ＣＤ３から選択される、請求項４１０に記載の方法。
【請求項４１２】
組換え分子を表示する方法であって、該分子は天然または遺伝子操作された免疫グロブリン重鎖可変領域を含み、その改良は該重鎖可変領域における位置９、１０、１１、１２、１０８、１１０、および１１２に対応する１以上のアミノ酸残基において１以上の突然変異、置換、改変および／または欠失を含む免疫グロブリン重鎖領域を含む、方法。
【請求項４１３】
天然に生じない単鎖抗原結合タンパク質であって、該タンパク質は、
【数１】
【数２】
【数３】
から選択された式を有するタンパク質を有する、タンパク質。
【請求項１】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、以下：
ｉ）標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチドであって、該結合ドメインポリペプチドは重鎖可変領域を含み、該重鎖可変領域は１以上のアミノ酸残基においてアミノ酸置換または失欠を含む、ポリペプチド；
ｉｉ）該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド；および
ｉｉｉ）該第二のポリペプチドに結合したＮ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチド、
を含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも１つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項２】
前記結合ドメインポリペプチドが単鎖Ｆｖである、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項３】
前記重鎖可変領域における１以上のアミノ酸置換または失欠が、該失欠または置換のないタンパク質に対して該タンパク質の発現または安定性を増加させるのに有効である、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項４】
前記結合ドメインポリペプチドが、免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項５】
さらに、第二の標的分子に結合することができる第二の結合ドメインポリペプチドを含み、該第二の結合ドメインポリペプチドが免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む請求項４に記載のタンパク質。
【請求項６】
前記第一の標的分子および前記第二の標的分子が異なる、請求項５に記載のタンパク質。
【請求項７】
前記第一の標的分子および前記第二の標的分子が同一である、請求項５に記載のタンパク質。
【請求項８】
前記結合ドメインポリペプチドが、前記重鎖可変領域における位置９、１０、１１、１２、１０８、１１０、１１２に１以上のアミノ酸置換を含む単鎖Ｆｖである、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項９】
前記結合ドメインポリペプチドが、前記重鎖可変領域における位置１１にアミノ酸置換を含む単鎖Ｆｖである、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項１０】
前記単鎖Ｆｖ重鎖可変領域の１１の位置におけるアミノ酸に代えて置換したアミノ酸がセリン、スレオニン、システイン、チロシン、アスパラギン、グルタミン、アスパラギン酸、グルタミン酸、リシン、アルギニンおよびヒスチジンから選択される、請求項９に記載のタンパク質。
【請求項１１】
前記単鎖Ｆｖ重鎖可変領域の位置１１のロイシンがセリン以外のアミノ酸で置き換えられた請求項９に記載のタンパク質。
【請求項１２】
ロイシンが位置１１においてセリンによって置き換えられ、前記タンパク質が抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性および補体固定が可能であって、標的細胞の数を減少させる前記標的分子に結合することができる、請求項９に記載のタンパク質。
【請求項１３】
ロイシンが位置１１においてデス−ロイシンによって置き換えられた請求項９に記載のタンパク質。
【請求項１４】
位置１１においてアミノ酸置換を有しない前記タンパク質に対して増加した組換え発現または安定性を有する、請求項１２に記載のタンパク質。
【請求項１５】
位置１１においてアミノ酸置換を有する前記タンパク質の発現が、位置１１において置換が無い該タンパク質よりも１０〜１００倍大きい、請求項１４に記載のタンパク質。
【請求項１６】
前記発現が哺乳動物細胞におけるものである、請求項１４記載のタンパク質。
【請求項１７】
前記結合ドメインポリペプチドが単鎖Ｆｖであって、該単鎖Ｆｖの重鎖可変領域の位置１１におけるアミノ酸が失欠されている、請求項１記載のタンパク質。
【請求項１８】
前記結合ドメインポリペプチドが単鎖Ｆｖであって、該結合ドメインポリペプチドが軽鎖可変領域を含み、ここで、該軽鎖可変領域がアミノ酸位置１２、８０、８１、８３、１０５、１０６および１０７の１以上においてアミノ酸失欠または置換を有す１に記載のタンパク質。
【請求項１９】
位置１０６におけるアミノ酸が置換または失欠されている、請求項１８に記載のタンパク質。
【請求項２０】
前記結合ドメインポリペプチドが腫瘍抗原に結合する、請求項２記載のタンパク質。
【請求項２１】
前記結合ドメインポリペプチドが免疫エフェクター細胞上の抗原に結合する、請求項２に記載のタンパク質。
【請求項２２】
前記結合ドメインポリペプチドが癌細胞抗原に結合する、請求項２に記載のタンパク質。
【請求項２３】
前記癌細胞抗原が表面抗原である、請求項２２に記載のタンパク質。
【請求項２４】
前記癌細胞抗原が細胞内抗原である、請求項２２に記載のタンパク質。
【請求項２５】
前記結合ドメインポリペプチドがＢ細胞抗原に結合する、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項２６】
前記Ｂ細胞抗原がＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３７、ＣＤ４０、ＣＤ８０、およびＣＤ８６から選択される、請求項２５に記載のタンパク質。
【請求項２７】
前記単鎖ＦｖがＢ細胞抗原に結合する、請求項２に記載のタンパク質。
【請求項２８】
前記Ｂ細胞抗原がＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３７、ＣＤ４０、ＣＤ８０、およびＣＤ８６から選択される、請求項２７に記載のタンパク質。
【請求項２９】
前記単鎖ＦｖがＨＤ３７単鎖Ｆｖ、２Ｈ７単鎖Ｆｖ、Ｇ２８−１単鎖Ｆｖ、および４．４．２２０単鎖Ｆｖから選択される、請求項２８に記載のタンパク質。
【請求項３０】
前記単鎖ＦｖがＨＤ３７単鎖Ｆｖ、２Ｈ７単鎖Ｆｖ、Ｇ２８−１単鎖Ｆｖ、ＦＣ２−２、ＵＣＨＬ−１、５Ｂ９、Ｌ６，１０Ａ８、２ｅ１２、４０．２．３６、Ｇ１９−４、１Ｄ８、および４．４．２２０単鎖Ｆｖから選択される、請求項２に記載のタンパク質。
【請求項３１】
前記結合ドメインポリペプチドがＢ細胞分化抗原に結合するｓｃＦｖである、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項３２】
前記Ｂ細胞抗原がＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３７、およびＣＤ４０から選択される、請求項３１に記載のタンパク質。
【請求項３３】
前記結合ドメインポリペプチドがＣＤ２、ＣＤ３、ＣＤ４、ＣＤ５、ＣＤ６、ＣＤ８、ＣＤ１０、ＣＤ１１ｂ、ＣＤ１４、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２１、ＣＤ２２、ＣＤ２３、ＣＤ２４、ＣＤ２５、ＣＤ２８、ＣＤ３０、ＣＤ３７、ＣＤ４０、ＣＤ４３、ＣＤ５０（ＩＣＡＭ３）、ＣＤ５４（ＩＣＡＭ１）、ＣＤ５６、ＣＤ６９、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＣＤ１３４（ＯＸ４０）、ＣＤ１３７（４１ＢＢ）、ＣＤ１５２（ＣＴＬＡ−４）、ＣＤ１５３（ＣＤ３０リガンド）、ＣＤ１５４（ＣＤ４０リガンド）、ＩＣＯＳ、Ｌ６、Ｂ７−Ｈ１、およびＨＬＡクラスＩＩから選択される標的に結合する、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項３４】
前記タンパク質が該タンパク質の２以上を含む複合体を形成することができる、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項３５】
前記複合体がダイマーである、請求項３４に記載のタンパク質。
【請求項３６】
前記タンパク質がモノマーである、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項３７】
薬物、トキシン、免疫調節因子、ポリペプチドエフェクター、同位体、標識、またはエフェクター部位にカップリングした請求項１に記載のタンパク質。
【請求項３８】
前記少なくとも免疫学的活性が抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、補体固定、アポトーシスの誘導、１以上の生物学的に活性なシグナルの誘導、１以上の免疫エフェクター細胞の誘導、細胞分化の活性化、細胞活性化、１以上の生物学的に活性な分子の放出、および感染性因子、またはトキシンの中和から選択される、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項３９】
前記免疫学的活性が抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、補体固定、アポトーシスの誘導、１以上の生物学的に活性なシグナルの誘導、１以上の免疫エフェクター細胞の誘導、細胞分化の活性化、細胞活性化、１以上の生物学的に活性な分子の放出、および感染性因子またはトキシンの中和から選択される２つの免疫学的活性を含む請求項３８に記載のタンパク質。
【請求項４０】
タンパク質キナーゼ、タンパク質ホスファターゼ、Ｇ−タンパク質、環状ヌクレオチドまたは他の第二メッセンジャー、イオンチャネル、および分泌経路成分から選択される１以上の分子の活性化または阻害による生物学的に活性なシグナルを誘導することができるか、またはＮＫ細胞、単球、マクロファージ、Ｂ細胞、Ｔ細胞、肥満細胞、好中球、好酸球、および好塩基球から選択される１以上の免疫エフェクター細胞を誘導できる、請求項３８に記載のタンパク質。
【請求項４１】
１以上の免疫エフェクター細胞の前記誘導が、抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、または１以上の生物学的に活性な分子の放出に導く請求項４０に記載のタンパク質。
【請求項４２】
細胞活性化が可能であり、ここで、該活性化は細胞転写活性の変化を導く、請求項３８に記載のタンパク質。
【請求項４３】
前記細胞転写活性が増加される、請求項４２に記載のタンパク質。
【請求項４４】
前記細胞転写活性が減少される、請求項４２に記載のタンパク質。
【請求項４５】
前記１以上の生物学的に活性な分子がプロテアーゼである、請求項３８に記載のタンパク質。
【請求項４６】
前記１以上の生物学的に活性な分子がサイトカインである、請求項３８に記載のタンパク質。
【請求項４７】
前記サイトカインがモノカイン、リンホカイン、ケモカイン、成長因子、コロニー刺激因子、インターフェロン、およびインターロイキンから選択される、請求項４６に記載のタンパク質。
【請求項４８】
感染性因子の中和が可能であり、ここで、該感染性因子が細菌、ウイルス、寄生体または真菌である、請求項３８に記載のタンパク質。
【請求項４９】
トキシンの中和が可能であり、ここで、該トキシンがエンドトキシンおよびエキソトキシンから選択される、請求項３８に記載のタンパク質。
【請求項５０】
トキシンの中和が可能であり、ここで、該トキシンが炭疽トキシン、コレラトキシン、ジフテリアトキシン、百日咳トキシン、Ｅ．ｃｏｌｉ熱−不安定トキシンＬＴ、Ｅ．ｃｏｌｉ熱安定性トキシンＳＴ、シガトキシン、ＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓエンドトキシンＡ、ボツリヌストキシン、破傷風トキシン、Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ ＡＣトキシン、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ａｎｔｈｒａｃｉｓ ＥＦから選択されるエキソトキシンである、請求項３８に記載のタンパク質。
【請求項５１】
トキシンの中和が可能であり、ここで、該トキシンがサキシトキシン、テトロドトキシン、キノコトキシン、アフラトキシン、ピロリジジンアルカロイド、ファイトヘマグルチニン、およびグラヤノトキシンから選択されるエンドトキシンである、請求項３８に記載のタンパク質。
【請求項５２】
前記タンパク質が細胞内標的に結合して、細胞機能に影響する、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項５３】
前記結合ドメインポリペプチドが結合ドメインリンカーによって前記重鎖可変領域に結合した軽鎖可変領域を含み、ここで、該結合ドメインリンカーが配列Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｓｅｒを有する１以上のペプチドを含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項５４】
３つのＧｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｓｅｒペプチドを含む請求項５３に記載のタンパク質。
【請求項５５】
前記結合ドメインポリペプチドが、ヒト、マウス、ラット、ブタ、およびサルから選択される種から得られる野生型または遺伝子操作された免疫グロブリン可変領域を含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項５６】
前記結合ドメインポリペプチドがヒト化免疫グロブリン可変領域を含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項５７】
前記Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖ＩｇＧ ＣＨ３定常領域ポリペプチドに結合したＩｇＧ ＣＨ２定常領域ポリペプチドを含む、請求項２に記載のタンパク質。
【請求項５８】
前記Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖ＩｇＧ ＣＨ３定常領域ポリペプチドに結合したＩｇＧ ＣＨ２定常領域ポリペプチドから本質的になる、請求項２に記載のタンパク質。
【請求項５９】
前記Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖ＩｇＧ ＣＨ３定常領域ポリペプチドに結合したＩｇＧ ＣＨ２定常領域ポリペプチドを含む請求項２に記載のタンパク質。
【請求項６０】
前記Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖ＩｇＧ ＣＨ３定常領域ポリペプチドに結合したＩｇＧ ＣＨ２定常領域ポリペプチドから本質的になる、請求項２に記載のタンパク質。
【請求項６１】
前記結合ドメインポリペプチドが、ヒト定常領域の少なくとも部分を含む単鎖Ｆｖである、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項６２】
前記結合ドメインポリペプチドが、ヒト定常領域の少なくとも部分を含む単鎖Ｆｖである、請求項２に記載のタンパク質。
【請求項６３】
前記連結領域が、ヒトヒンジまたはその部分、ヒトＩｇＧヒンジまたはその部分、ヒトＩｇＡヒンジまたはその部分、ヒトＩｇＥヒンジまたはその部分、ラクダヒンジ領域またはその部分、ＩｇＧ１ラマヒンジ領域またはその部分、テンジクザメヒンジ領域またはその部分、およびギンザメヒンジ領域またはその部分から選択される天然に生じるヒンジ領域を含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項６４】
前記連結領域がヒトＩｇＥヒンジまたはその部分を含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項６５】
前記連結領域が、０または１いずれかのシステイン残基を有するヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３またはＩｇＧ４ヒンジ領域を含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項６６】
前記連結領域が、０と２との間のシステイン残基を有するヒトＩｇＧＡヒンジ領域を含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項６７】
前記連結領域が野生型ヒトＩｇＧ１免疫グロブリンヒンジ領域を含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項６８】
前記連結領域がグリコシル化部位を含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項６９】
前記連結領域が、ジスルフィド結合を形成できるシステイン残基を有しない請求項１に記載のタンパク質。
【請求項７０】
前記連結領域が１つのシステイン残基を有する、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項７１】
前記連結領域が、わずか１つのシステイン残基を含む、変異した野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含む請求項１に記載のタンパク質。
【請求項７２】
前記連結領域が、前記タンパク質が低下した二量体化する能力を有するように改変された請求項１に記載のタンパク質。
【請求項７３】
前記連結領域が３つのシステイン残基および１つのプロリン残基を含み、ここで、該システイン残基の１以上が失欠または置換され、かつ該プロリン残基が置換または失欠されている、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項７４】
前記連結領域が、第一、第二および第三のシステイン残基を含む変異した野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含み、ここで、該第一のシステイン残基は該第二のシステインに対してＮ−末端側であり、かつ該第二のシステインは該第三のシステインに対してＮ−末端側であり、ここで、該第一のシステイン残基は置換または失欠されている、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項７５】
前記野生型ヒンジ領域ポリペプチドがヒトＩｇＧ１からのものである、請求項７４に記載のタンパク質。
【請求項７６】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、以下：
ｉ）標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチドであって、該結合ドメインポリペプチドは、位置９、１０、１１、１２、１０８、１１０、１１２において１以上のアミノ酸失欠または置換を含む重鎖可変領域を含む、ポリペプチド；
ｉｉ）該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド；および
ｉｉｉ）該第二のポリペプチドに結合したＮ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも１つの免疫学的活性が可能であり、該タンパク質は、アミノ酸の失欠または置換を有しない該タンパク質に対して増大した組換え体発現または安定性を有する、タンパク質。
【請求項７７】
天然に生じない単鎖Ｆｖタンパク質であって、該タンパク質は、以下：
ｉ）標的細胞上の標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチドであって、該結合ドメインポリペプチドは重鎖可変領域を含み、ここで、該重鎖可変領域の第一のフレームワーク領域における位置１１において、ロイシンは失欠しているかまたは別のアミノ酸で置換されている、ポリペプチド；
ｉｉ）該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド；および
ｉｉｉ）該第二のポリペプチドに結合したＮ―末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は、（１）該標的分子に結合することができ、（２）抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性および補体固定が可能であり、および（３）標的細胞の数を減少させることができる、タンパク質。
【請求項７８】
さらに、前記重鎖可変領域の第一のフレームワーク領域において、位置１０のアミノ酸の置換または失欠を含む、請求項７７に記載のタンパク質。
【請求項７９】
位置１１の前記アミノ酸置換が、前記失欠または置換が無い単鎖Ｆｖタンパク質に対して該単鎖Ｆｖタンパク質の発現または安定性を増加させるのに有効である、請求項７７に記載のタンパク質。
【請求項８０】
前記残基のナンバリングが、ＫａｂａｔによるＥＵ指数である、請求項７７に記載のタンパク質。
【請求項８１】
前記連結領域がプロリン、および第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、該第一のシステイン残基は該第二のシステインに対してＮ−末端側にあって、該第二のシステインは該第三のシステインに対してＮ−末端側にあり、該第三のシステイン残基は該プロリン残基に対してＮ−末端側にある、請求項７７に記載のタンパク質。
【請求項８２】
前記連結領域がＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含む、請求項７７に記載のタンパク質。
【請求項８３】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記第二のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基は連結領域におけるセリンによって置き換えられ、かつ前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項８４】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、前記連結領域はマウスＩｇＡヒンジまたはその部分を含み、かつ前記重鎖定常領域はマウスＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３が、該ＩｇＡ重鎖定常領域がＪ鎖ポリペプチドと会合できないようにする４つのアミノ酸における失欠または置換を含む、請求項８２に記載のタンパク質。
【請求項８５】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域における前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、該連結領域における前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、リシンが該ＣＨ２領域における位置３２２のセリンによって置き換えられた、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項８６】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、リシンが該ＣＨ２領域における位置３２２のセリンによって置き換えられた、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項８７】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域における位置３３１のセリンによって置き換えられた請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項８８】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンが該ＣＨ２領域における位置３３１のセリンによって置き換えられた、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項８９】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置きかえられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、スレオニンが該ＣＨ２領域における位置２５６のアスパラギンによって置き換えられた請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項９０】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からの２Ｈ７単鎖Ｆｖ ＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ２ドメインにおいて、アルギニンは位置２５５のグルタミンによって置き換えられ、スレオニンは位置２５６のアスパラギンによって置き換えられ、プロリンは位置２５７のアラニンによって置き換えられ、およびグルタミン酸は位置２５８のリシンによって置き換えられた、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項９１】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、リシンは該ＣＨ２領域における位置２９０のグルタミンによって置き換えられた、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項９２】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、アラニンは該ＣＨ２領域における位置３３９のプロリンによって置き換えられた請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項９３】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項９４】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項９５】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第二のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項９６】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一および第二のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からおＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項９７】
前記単鎖タンパク質がＦＣ２−２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項９８】
前記単鎖タンパク質がＵＣＨＬ−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項９９】
前記単鎖タンパク質が５Ｂ９ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項１００】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項１０１】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項１０２】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項１０３】
前記単鎖タンパク質が連結領域を含むＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、該重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項１０４】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項１０５】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はマウスＩｇＡヒンジ領域を含み、前記重鎖定常領域はマウスＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、該ＣＨ３は、該ＩｇＡ重鎖定常領域をＪ鎖ポリペプチドと会合できなくする４つのアミノ酸における失欠または置換を含む、請求項８２に記載のタンパク質。
【請求項１０６】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はヒトＩｇＡヒンジ領域を含み、前記重鎖定常領域はヒトＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３は、ＩｇＡ重鎖定常領域をＪ鎖ポリペプチドと会合できなくする４つのアミノ酸における失欠または置換を含む請求項８２に記載のタンパク質。
【請求項１０７】
前記単鎖タンパク質がＨＤ３７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項１０８】
前記単鎖タンパク質がＬ６単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣ３ドメインを含む請求項８１に記載のタンパク質。
【請求項１０９】
天然に生じない単鎖Ｆｖタンパク質であって、該タンパク質は、以下：
ｉ）標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチドであって、該結合ドメインポリペプチドは、重鎖可変領域を含み、ここで、該重鎖可変領域の第一のフレームワーク領域において、ロイシンが位置１１のセリンのよって置き換えられ；ここで、該タンパク質は、該アミノ酸置換を有しないタンパク質に対して哺乳動物細胞において増加した発現または安定性を有する、ポリペプチド；
ｉｉ）該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド；および
ｉｉｉ）該第二のポリペプチドに結合したＮ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチド、
を含み、ここで、該天然に生じない単鎖Ｆｖタンパク質は少なくとも１つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項１１０】
天然に生じない単鎖Ｆｖタンパク質であって、該タンパク質は、以下：
ｉ）標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチド、該結合ドメインポリペプチドは、重鎖可変領域を含み、ここで、該重鎖可変領域の第一のフレームワーク領域において、ロイシンは位置１１のセリンによって置き換えられ；および
ｉｉ）該第二のポリペプチドに結合したＮ−末端が縮重されたＩｇＥ免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第二のポリペプチド、
を含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも１つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項１１１】
位置１１の前記アミノ酸置換が、前記失欠または置換がない単鎖Ｆｖタンパク質に対して該単鎖Ｆｖタンパク質の発現または安定性を増加させるのに有効である、請求項１１０に記載のタンパク質。
【請求項１１２】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、かつ前記重鎖定常領域がＩｇＥからのＣＨ２、ＣＨ３およびＣＨ４ドメインを含む、請求項１１０に記載のタンパク質。
【請求項１１３】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、かつ前記重鎖定常領域がマウスＩｇＥからのＣＨ２、ＣＨ３およびＣＨ４ドメインを含む、請求項１１０に記載のタンパク質。
【請求項１１４】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記重鎖定常領域がマウスＩｇＥからのＣＨ２、ＣＨ３およびＣＨ４ドメインを含む、請求項１１０に記載のタンパク質。
【請求項１１５】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記重鎖定常領域がヒトＩｇＥからのＣＨ２、ＣＨ３およびＣＨ４ドメインを含む、請求項１１０に記載のタンパク質。
【請求項１１６】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、標的分子に結合できる結合ドメインポリペプチドを含む第一のポリペプチド、該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド、該第二のポリペプチドに結合したＮ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、ここで、該連結領域は第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、該第一のシステイン残基は該第二のシステイン残基に対してＮ−末端側にあり、かつ該第二のシステインは該第三のシステインに対してＮ−末端側にあり、ここで、該第二および第三のシステイン残基の一方または両方は置換または失欠されており、そしてここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも１つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項１１７】
前記結合ドメインポリペプチドが単鎖Ｆｖである、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１１８】
前記結合ドメインポリペプチドが、免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１１９】
さらに、第二の標的分子に結合できる第二の結合ドメインポリペプチドを含み、該第二の結合ドメインポリペプチドは、免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む、請求項１１８に記載のタンパク質。
【請求項１２０】
前記結合ドメインポリペプチドが重鎖可変領域を含む単鎖Ｆｖであり、ここで、該重鎖可変領域はアミノ酸位置９、１０、１１、１２、１０８、１１０、１１２の１以上においてアミノ酸の失欠または置換を有する、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１２１】
前記結合ドメインポリペプチドが軽鎖可変領域を含む単鎖Ｆｖであり、ここで、該軽鎖可変領域はアミノ酸位置１２、８０、８１、８３、１０５、１０６および１０７の１以上においてアミノ酸の失欠または置換を有する、請求項１１７に記載のタンパク質。
【請求項１２２】
前記結合ドメインポリペプチドが重鎖可変領域を含む単鎖Ｆｖであり、ここで、該重鎖可変領域はアミノ酸位置１１においてアミノ酸置換を有する、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１２３】
前記単鎖Ｆｖ重鎖可変領域の位置１１におけるアミノ酸がセリン、スレオニン、システイン、チロシン、アスパラギン、グルタミン、アスパラギン酸、グルタミン酸、リシン、アルギニンおよびヒスチジンから選択される、請求項１２２に記載のタンパク質。
【請求項１２４】
前記単鎖Ｆｖ重鎖可変領域の位置１１のアミノ酸に代えて置換したアミノ酸がセリン、スレオニン、システイン、チロシン、アスパラギンおよびグルタミンから選択される、請求項１２２に記載のタンパク質。
【請求項１２５】
ロイシンが位置１１においてセリンによって置き換えられた請求項１２２に記載のタンパク質。
【請求項１２６】
ロイシンが位置１１においてデス−ロイシンによって置き換えられた、請求項１２２に記載のタンパク質。
【請求項１２７】
前記結合ドメインポリペプチドが単鎖Ｆｖであって、該単鎖Ｆｖの重鎖可変領域の位置１１のアミノ酸が失欠されている、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１２８】
ロイシンが位置１０６においてセリンによって置き換えられた、請求項１２１に記載のタンパク質。
【請求項１２９】
前記結合ドメインポリペプチドが腫瘍抗原に結合する、請求項１１７に記載のタンパク質。
【請求項１３０】
前記結合ドメインポリペプチドが免疫エフェクター細胞上の抗原に結合する、請求項１１７に記載のタンパク質。
【請求項１３１】
前記結合ドメインポリペプチドが癌細胞抗原に結合する、請求項１１７に記載のタンパク質。
【請求項１３２】
前記癌細胞抗原が表面抗原である、請求項１３１に記載のタンパク質。
【請求項１３３】
前記癌細胞抗原が細胞内抗原である、請求項１３１に記載のタンパク質。
【請求項１３４】
前記結合ドメインポリペプチドがＢ細胞抗原に結合する、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１３５】
前記Ｂ細胞抗原がＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３７、ＣＤ４０、ＣＤ８０、およびＣＤ８６から選択される、請求項１３５に記載のタンパク質。
【請求項１３６】
前記単鎖ＦｖがＢ細胞抗原に結合する、請求項１１７に記載のタンパク質。
【請求項１３７】
前記Ｂ細胞抗原がＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３７、ＣＤ４０、ＣＤ８０、およびＣＤ８６から選択される、請求項１３６に記載のタンパク質。
【請求項１３８】
前記単鎖ＦｖがＨＤ３７単鎖Ｆｖ、２Ｈ７単鎖Ｆｖ、Ｇ２８−１単鎖Ｆｖ、および４．４．２２０単鎖Ｆｖから選択される、請求項１３７に記載のタンパク質。
【請求項１３９】
前記単鎖ＦｖがＨＤ３７単鎖Ｆｖ、２Ｈ７単鎖Ｆｖ、Ｇ２８−１単鎖Ｆｖ、ＦＣ２−２、ＵＣＨＬ−１、５Ｂ９、Ｌ６、１０Ａ８、２ｅ１２、４０．２．３６、Ｇ１９−４、１Ｄ８、および４．４．２２０単鎖Ｆｖから選択される、請求項１１７に記載のタンパク質。
【請求項１４０】
前記結合ドメインポリペプチドが、Ｂ細胞分化抗原に結合するｓｃＦｖである、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１４１】
前記Ｂ細胞抗原がＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３７、およびＣＤ４０から選択される、請求項１３６に記載のタンパク質。
【請求項１４２】
前記結合ドメインポリペプチドがＣＤ２、ＣＤ３、ＣＤ４、ＣＤ５、ＣＤ６、ＣＤ８、ＣＤ１０、ＣＤ１１ｂ、ＣＤ１４、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２１、ＣＤ２２、ＣＤ２３、ＣＤ２４、ＣＤ２５、ＣＤ２８、ＣＤ３０、ＣＤ３７、ＣＤ４０、ＣＤ４３、ＣＤ５０（ＩＣＡＭ３）、ＣＤ５４（ＩＣＡＭ１）、ＣＤ５６、ＣＤ６９、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＣＤ１３４（ＯＸ４０）、ＣＤ１３７（４１ＢＢ）、ＣＤ１５２（ＣＴＬＡ−４）、ＣＤ１５３（ＣＤ３０リガンド）、ＣＤ１５４（ＣＤ４０リガンド）、ＩＣＯＳ、Ｌ６、Ｂ７−Ｈ１、およびＨＬＡクラスＩＩから選択される標的に結合する、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１４３】
前記タンパク質が該タンパク質の２以上を含む複合体を形成することができる、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１４４】
前記複合体がダイマーである、請求項１４３に記載のタンパク質。
【請求項１４５】
前記タンパク質がモノマーである、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１４６】
薬物、トキシン、免疫調節因子、ポリペプチドエフェクター、同位体、標識、またはエフェクター部分にカップリングした、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１４７】
前記免疫学的活性が抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、補体固定、アポトーシスの誘導、１以上の生物学的に活性なシグナルの誘導、１以上の免疫エフェクター細胞の誘導、細胞分化の活性化、細胞活性化、１以上の生物学的に活性な分子の放出、および感染性因子またはトキシンの中和から選択される、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１４８】
タンパク質キナーゼ、タンパク質ホスファターゼ、Ｇ−タンパク質、環状ヌクレオチドまたは他の第二メッセンジャー、イオンチャネル、および分泌経路成分から選択される１以上の分子の活性化または阻害によって生物学的に活性なシグナルを誘導することができる、請求項１４７に記載のタンパク質。
【請求項１４９】
ＮＫ細胞、単球、マクロファージ、Ｂ細胞、Ｔ細胞、肥満細胞、好中球、好酸球、および好塩基球から選択される１以上の免疫エフェクター細胞を誘導することができる、請求項１４７に記載のタンパク質。
【請求項１５０】
１以上の免疫エフェクター細胞の該誘導が、抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性または１以上の生物学的に活性な分子の放出を導く請求項１４９に記載のタンパク質。
【請求項１５１】
細胞活性化が可能であり、ここで、該活性化は細胞転写活性の変化を導く、請求項１４７に記載のタンパク質。
【請求項１５２】
前記細胞転写活性が増加される、請求項１５１に記載のタンパク質。
【請求項１５３】
前記細胞転写活性が減少される、請求項１５１に記載のタンパク質。
【請求項１５４】
前記１以上の生物学的に活性な分子がプロテアーゼである、請求項１４７に記載のタンパク質。
【請求項１５５】
前記１以上の生物学的に活性な分子がサイトカインである、請求項１４７に記載のタンパク質。
【請求項１５６】
前記サイトカインがモノカイン、リンホカイン、ケモカイン、成長因子、コロニー刺激因子、インターフェロン、およびインターロイキンから選択される、請求項１５５に記載のタンパク質。
【請求項１５７】
感染性因子の中和が可能であり、ここで、該感染性因子が細菌、ウイルス、寄生体、または真菌である、請求項１４７に記載のタンパク質。
【請求項１５８】
トキシンの中和が可能であり、ここで、該トキシンがエンドトキシンおよびエキソトキシンから選択される、請求項１４７に記載のタンパク質。
【請求項１５９】
トキシンの中和が可能であり、ここで、該トキシンが炭疽トキシン、コレラトキシン、ジフテリアトキシン、百日咳トキシン、Ｅ．ｃｏｌｉ熱−不安定トキシンＬＴ、Ｅ．ｃｏｌｉ熱安定性トキシンＳＴ、シガトキシン、ＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓエンドトキシンＡ、ボツリヌストキシン、破傷風トキシン、Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ ＡＣトキシン、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ａｎｔｈｒａｃｉｓ ＥＦから選択されるエキソトキシンである、請求項１４７に記載のタンパク質。
【請求項１６０】
トキシンの中和が可能であり、ここで、該トキシンがサキシトキシン、テトロドトキシン、キノコトキシン、アフラトキシン、ピロリジジンアルカロイド、ファイトヘマグルチニン、およびグラヤノトキシンから選択されるエンドトキシンである、請求項１４７に記載のタンパク質。
【請求項１６１】
前記結合ドメインポリペプチドが、結合ドメインリンカーによって前記重鎖可変領域に結合した軽鎖可変領域を含み、ここで、該結合ドメインリンカーが配列Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｓｅｒを有する１以上のペプチドを含む、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１６２】
３つのＧｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｓｅｒペプチドを含む、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１６３】
前記結合ドメインポリペプチドがヒト、マウス、ラット、ブタおよびサルから選択される種から得られた野生型または遺伝子操作された免疫グロブリン可変領域を含む、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１６４】
前記タンパク質が細胞内標的に結合して、細胞機能を行うことができる、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１６５】
前記Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖ＩｇＧ ＣＨ３定常領域ポリペプチドに結合したＩｇＧ ＣＨ２定常領域ポリペプチドを含む、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１６６】
前記免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが機能的に活性なＣＨ１ドメインが無い、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１６７】
前記Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖ＩｇＧ ＣＨ３定常領域ポリペプチドから本質的になる、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１６８】
ヒト定常領域の少なくとも一部を含む請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１６９】
前記連結領域がヒトヒンジまたはその部分、ヒトＩｇＧヒンジまたはその部分、ヒトＩｇＡヒンジまたはその部分、ヒトＩｇＥヒンジまたはその部分、ラクダヒンジ領域またはその部分、ＩｇＧ１ラマヒンジ領域またはその部分、テンジクザメヒンジ領域またはその部分、およびギンザメヒンジ領域またはその部分から選択される天然に生じるヒンジ領域を含む、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１７０】
前記連結領域がヒトＩｇＥヒンジまたはその部分を含む請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１７１】
前記連結領域が、０または１のシステイン残基を有するヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３またはＩｇＧ４ヒンジ領域を含む請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１７２】
前記連結領域が、０と２との間のシステイン残基を有するヒトＩｇＧＡヒンジ領域を含む、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１７３】
前記連結領域が野生型ヒトＩｇＧ１免疫グロブリンヒンジ領域を含む、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１７４】
前記連結領域がグリコシル化部位を含む、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１７５】
前記連結領域が、ジスルフィド結合を形成することができるシステイン残基を有しない、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１７６】
前記連結領域が１つのシステイン残基を有する、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１７７】
前記連結領域が、わずか１つのシステイン残基を含む変異した野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含む、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１７８】
前記連結領域が、該タンパク質が低下した二量体化する能力を有するように変更された、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１７９】
前記連結領域がプロリンおよび第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、該第一のシステイン残基は該第二のシステインに対してＮ−末端側にあって、該第二のシステインは該第三のシステインに対してＮ−末端側にあり、該第三のシステイン残基が該プロリン残基に対してＮ−末端側にある、請求項１１６に記載のタンパク質。
【請求項１８０】
前記単鎖タンパク質がＣＴＬＡ−４単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２ドメインにおいて位置２３８におけるセリンによって置き換えられた請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１８１】
前記単鎖タンパク質がＣＴＬＡ−４単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、かつ該重鎖定常領域がＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１８２】
前記単鎖タンパク質がＦＣ２−２単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１８３】
前記単鎖タンパク質がＵＣＨＬ−１単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１８４】
前記単鎖タンパク質が５Ｂ９単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１８５】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ ｓｃＦｖ単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域においては、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１８６】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１８７】
前記単鎖タンパク質が、連結領域を含む２Ｈ７単鎖Ｆｖを含み、ここで、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、フェニルアラニンは該ＣＨ３領域において位置４０５のチロシンによって置き換えられた、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１８８】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、フェニルアラニンは該ＣＨ３領域において位置４０５のアラニンによって置き換えられる、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１８９】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、チロシンは該ＣＨ３領域において位置４０７のアラニンによって置き換えられた請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１９０】
約７５ｋＤａの見掛けの分子量を有する、請求項１８９に記載のタンパク質。
【請求項１９１】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３領域において、フェニルアラニンは位置４０５のアラニンによって置き換えられ、かつチロシンは位置４０７のアラニンによって置き換えられた、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１９２】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１９３】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１９４】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一および第二のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１９５】
前記単鎖タンパク質が連結領域を含む２Ｈ７単鎖Ｆｖを含み、ここで、前記第二のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１９６】
前記単鎖タンパク質が連結領域を含む２Ｈ７単鎖Ｆｖを含み、ここで、前記第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１９７】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一のシステイン残基がセリンによって置き換えられ、ここで、前記重鎖定常領域は２Ｈ７単鎖Ｆｖ ＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１９８】
前記単鎖タンパク質がＨＤ３７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつプロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項１９９】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、かつ前記重鎖定常領域がラマＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３定常領域ポリペプチドを含む請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２００】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、かつ前記重鎖定常領域がラマＩｇＧ２からのＣＨ２およびＣＨ３定常領域ポリペプチドを含む請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２０１】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、かつ前記重鎖定常領域がラマＩｇＧ３からのＣＨ２およびＣＨ３定常領域ポリペプチドを含む請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２０２】
前記単鎖タンパク質がＣＤ−１６−６単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられた、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２０３】
前記単鎖タンパク質がＣＤ−１６レセプター結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基がセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられた、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２０４】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、ここで、該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２０５】
前記単鎖タンパク質が１０Ａ８ ｓｃＦｖ単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二、および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、ここで、該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２０６】
前記単鎖タンパク質が４０．２．３６ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、ここで、該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および脂肪質テイルドメインを含むポリペプチドに結合された、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２０７】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、ここで、該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した、請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２０８】
前記単鎖タンパク質がＧ１９−４ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、ここで、該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２０９】
前記単鎖タンパク質がＧ１９−４ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、前記ＣＤ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２１０】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２１１】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域においては、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、および該ＣＨ３ドメインはｍＦＡＤＤ膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２１２】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはｍＦＡＤＤ膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２１３】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはｍｃａｓｐ３膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２１４】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該Ｃ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、および該ＣＨ３ドメインはｍｃａｓｐ３膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２１５】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはｍｃａｓｐ８膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２１６】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、および該ＣＨ３ドメインはｍｃａｓｐ８膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２１７】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、前記ＣＨ３ドメインはｈｃａｓｐ３膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２１８】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、および該ＣＨ３ドメインはｈｃａｓｐ３膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２１９】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３はｈｃａｓｐ８膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合された請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２２０】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、および該ＣＨ３ドメインはｈｃａｓｐ８膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２２１】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２２２】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、および該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２２３】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ ｓｃＦｖハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２２４】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、かつ該ＣＨ３ドメインはｍＦＡＤＤ膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２２５】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはｍＦＡＤＤ膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２２６】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、該重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはｍｃａｓｐ３膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２２７】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、および該ＣＨ３ドメインはｍｃａｓｐ３膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２２８】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはｍｃａｓｐ８膜貫通および細胞質ドメインを含むポリペプチドに結合された請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２２９】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、および該ＣＨ３ドメインはｍｃａｓｐ８膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２３０】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはｈｃａｓｐ３膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２３１】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、およびＣＨ３ドメインはｈｃａｓｐ３膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２３２】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３ドメインはｈｃａｓｐ８膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２３３】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、プロリンは該ＣＨ２領域において位置２３８のセリンによって置き換えられ、および該ＣＨ３ドメインはｈｃａｓｐ８膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２３４】
前記単鎖タンパク質がＬ６単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域において、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２３５】
前記単鎖タンパク質が連結領域を含むＧ２８−１単鎖Ｆｖを含み、ここで、前記第一、第二および第三のシステイン残基はセリンによって置き換えられ、かつ前記プロリン残基はセリンによって置き換えられ、ここで、前記重鎖定常領域はＧ２８−１単鎖Ｆｖ ＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項１７９に記載のタンパク質。
【請求項２３６】
被験体において標的細胞集団を減少させる方法であって、該方法は、以下：
ａ）標的細胞集団を、該標的細胞集団内の細胞に結合する第一のタンパク質またはペプチドで処理し、次いで、
ｂ）ｉ）Ｆｃレセプターに結合する、ｉｉ）標的細胞のアポトーシスを誘導する、またはｉｉｉ）補体を固定する、の少なくとも１つが可能である第二のタンパク質またはポリペプチドで該標的細胞集団を処理する工程を包含し、ここで、該第一のタンパク質またはペプチド分子は該第二のタンパク質またはペプチド分子に直接結合し、または所望により、該第一のタンパク質またはペプチド分子および該第二のタンパク質またはペプチド分子は第三のタンパク質またはペプチド分子によって連結され、ここで、該タンパク質分子は抗体、ＴＮＦファミリーまたはＴＮＦレセプターファミリーのメンバーではなく、細菌トキシン、細胞傷害性薬物、または放射性同位体と結合体化しない、約１５０ｋＤ未満であるタンパク質の治療有効量を被験体に投与する工程を包含する、方法。
【請求項２３７】
被験体において標的細胞集団を減少させる方法であって、該方法は、以下：
ａ）標的細胞集団を、該標的細胞集団内の細胞に結合する第一のタンパク質またはペプチドで処理し、次いで、
ｂ）ｉ）Ｆｃレセプターに結合する、ｉｉ）標的細胞のアポトーシスを誘導する、またはｉｉｉ）補体を固定する、の少なくとも１つが可能である第二のタンパク質またはポリペプチドで該標的細胞集団を処理する工程から本質的になり、ここで、該第一のタンパク質またはペプチド分子は該第二のタンパク質またはペプチド分子に直接結合し、または所望により、該第一のタンパク質またはペプチド分子および該第二のタンパク質またはペプチド分子は第三のタンパク質またはペプチド分子によって連結され、ここで、該タンパク質分子は抗体、ＴＮＦファミリーまたはＴＮＦレセプターファミリーのメンバーではなく、細菌トキシン、細胞傷害性薬物、または放射性同位体と結合体化しない、約１５０ｋＤ未満であるタンパク質の治療有効量を被験体に投与する工程を包含する、方法。
【請求項２３８】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、以下：
ｉ）標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチドであって、該結合ドメインポリペプチドは１以上のアミノ酸の欠失または置換を含む軽鎖可変領域を含む、ポリペプチド；
ｉｉ）該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド；および
ｉｉｉ）該第二のポリペプチドに結合したＮ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチド、
を含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも１つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項２３９】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、以下：
ｉ）標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチドであって、該結合ドメインポリペプチドは、位置１２、８０、８１、８３、１０５、１０６および１０７において１以上のアミノ酸の欠失または置換を含む軽鎖可変領域を含み；
ｉｉ）該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド；および
ｉｉｉ）該第二のポリペプチドに結合したＮ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチド、
を含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも１つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項２４０】
前記軽鎖可変領域における１以上のアミノ酸の置換または欠失は、該欠失または置換が無いタンパク質に対して該タンパク質の発現または安定性を増加させるのに有効である、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２４１】
前記結合ドメインポリペプチドが単鎖Ｆｖである、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２４２】
前記結合ドメインポリペプチドが免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２４３】
さらに、第二の標的分子に結合することができる第二の結合ドメインポリペプチドを含み、該第二の結合ドメインポリペプチドは免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む請求項２４２に記載のタンパク質。
【請求項２４４】
前記結合ドメインポリペプチドが単鎖Ｆｖであって、該単鎖Ｆｖの前記軽鎖可変領域が位置１０６においてアミノ酸の欠失または置換を有する、請求項２４１に記載のタンパク質。
【請求項２４５】
前記結合ドメインポリペプチドが単鎖Ｆｖであって、該単鎖Ｆｖの重鎖可変領域の位置１０６のアミノ酸が欠失されている、請求項２４１に記載のタンパク質。
【請求項２４６】
前記結合ドメインポリペプチドが単鎖Ｆｖであって、該単鎖Ｆｖの前記軽鎖可変領域が位置１０６にアミノ酸置換を有する、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２４７】
ロイシンが１０６の位置においてセリンによって置き換えられた請求項２４４に記載のタンパク質。
【請求項２４８】
ロイシンが１０６の位置においてデス−ロイシンによって置き換えられた請求項２４４に記載のタンパク質。
【請求項２４９】
前記単鎖Ｆｖ軽鎖可変領域の位置１０６のアミノ酸に代えて置き換えたアミノ酸がセリン、スレオニン、システイン、チロシン、アスパラギン、グルタミン、アスパラギン酸、グルタミン酸、リシン、アルギニンおよびヒスチジンから選択される、請求項２４４に記載のタンパク質。
【請求項２５０】
前記結合ドメインポリペプチドが重鎖可変領域を含む単鎖Ｆｖであり、ここで、前記重鎖可変領域がアミノ酸位置１１にアミノ酸置換を有する、請求項２４４に記載のタンパク質。
【請求項２５１】
前記結合ドメインポリペプチドが腫瘍抗原に結合する、請求項２４１に記載のタンパク質。
【請求項２５２】
前記結合ドメインポリペプチドが免疫エフェクター細胞上の抗原に結合する、請求項２４１に記載のタンパク質。
【請求項２５３】
前記結合ドメインポリペプチドが癌細胞抗原に結合する、請求項２４１に記載のタンパク質。
【請求項２５４】
前記癌細胞抗原が表面抗原である、請求項２５３に記載のタンパク質。
【請求項２５５】
前記癌細胞抗原が細胞内抗原である、請求項２５３に記載のタンパク質。
【請求項２５６】
前記結合ドメインポリペプチドがＢ細胞抗原に結合する、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２５７】
前記Ｂ細胞抗原がＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３７、ＣＤ４０、ＣＤ８０およびＣＤ８６から選択される、請求項２５６に記載のタンパク質。
【請求項２５８】
前記単鎖ＦｖがＢ細胞抗原に結合する、請求項２４１に記載のタンパク質。
【請求項２５９】
前記Ｂ細胞抗原がＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３７、ＣＤ４０、ＣＤ８０、およびＣＤ８６から選択される、請求項２５８に記載のタンパク質。
【請求項２６０】
前記単鎖ＦｖがＨＤ３７単鎖Ｆｖ、２Ｈ７単鎖Ｆｖ、Ｇ２８−１単鎖Ｆｖ、および４．４．２２０単鎖Ｆｖから選択される、請求項２５９に記載のタンパク質。
【請求項２６１】
前記結合ドメインポリペプチドが、Ｂ細胞分化抗原に結合するｓｃＦｖである、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２６２】
前記Ｂ細胞抗原がＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３７およびＣＤ４０から選択される、請求項２６１に記載のタンパク質。
【請求項２６３】
前記結合ドメインポリペプチドがＣＤ２、ＣＤ３、ＣＤ４、ＣＤ５、ＣＤ６、ＣＤ８、ＣＤ１０、ＣＤ１１ｂ、ＣＤ１４、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２１、ＣＤ２２、ＣＤ２３、ＣＤ２４、ＣＤ２５、ＣＤ２８、ＣＤ３０、ＣＤ３７、ＣＤ４０、ＣＤ４３、ＣＤ５０（ＩＣＡＭ３）、ＣＤ５４（ＩＣＡＭ１）、ＣＤ５６、ＣＤ６９、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＣＤ１３４（ＯＸ４０）、ＣＤ１３７（４１ＢＢ）、ＣＤ１５２（ＣＴＬＡ−４）、ＣＤ１５３（ＣＤ３０リガンド）、ＣＤ１５４（ＣＤ４０リガンド）、ＩＣＯＳ、Ｌ６、Ｂ７−Ｈ１、およびＨＬＡクラスＩＩから選択される標的に結合する、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２６４】
前記タンパク質が該タンパク質の２以上を含む複合体を形成することができる、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２６５】
前記複合体がダイマーである、請求項２６４に記載のタンパク質。
【請求項２６６】
前記タンパク質がモノマーである、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２６７】
前記免疫学的活性が抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性、補体固定、アポトーシスの誘導、１以上の生物学的に活性なシグナルの誘導、１以上の免疫エフェクター細胞の誘導、細胞分化の活性化、細胞活性化、１以上の生物学的に活性な分子の放出、および感染性因子またはトキシンの中和から選択される、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２６８】
タンパク質キナーゼ、タンパク質ホスファターゼ、Ｇ−タンパク質、環状ヌクレオチドまたは他の第二メッセンジャー、イオンチャネルおよび分泌経路成分から選択される１以上の分子の活性化または阻害によって生物学的に活性なシグナルを誘導することができる、請求項２６７に記載のタンパク質。
【請求項２６９】
ＮＫ細胞、単球、マクロファージ、Ｂ細胞、Ｔ細胞、肥満細胞、好中球、好酸球、および好塩基球から選択される１以上の免疫エフェクター細胞を誘導することができる、請求項２６７に記載のタンパク質。
【請求項２７０】
１以上の免疫エフェクター細胞の該誘導が抗体依存性細胞−媒介細胞傷害性または１以上の生物学的に活性な分子の放出を導く請求項２６７に記載のタンパク質。
【請求項２７１】
細胞活性化が可能であり、ここで、該活性化が細胞転写活性の変化を導く請求項２６７に記載のタンパク質。
【請求項２７２】
前記細胞転写活性が増加される、請求項２７１に記載のタンパク質。
【請求項２７３】
前記細胞転写活性が減少される、請求項２７１に記載のタンパク質。
【請求項２７４】
前記１以上の生物学的に活性な分子がプロテアーゼである、請求項２６７に記載のタンパク質。
【請求項２７５】
前記１以上の生物学的に活性な分子がサイトカインである、請求項２６７に記載のタンパク質。
【請求項２７６】
前記サイトカインがモノカイン、リンホカイン、ケモカイン、成長因子、コロニー刺激因子、インターフェロン、およびインターロイキンから選択される、請求項２７５に記載のタンパク質。
【請求項２７７】
感染性因子の中和が可能であり、該感染性因子が細菌、ウイルス、寄生体または真菌である、請求項２６７に記載のタンパク質。
【請求項２７８】
トキシンの中和が可能であり、ここで、該トキシンがエンドトキシンおよびエキソトキシンから選択される、請求項２６７に記載のタンパク質。
【請求項２７９】
トキシンの中和が可能であり、ここで、該トキシンが炭疽トキシン、コレラトキシン、ジフテリアトキシン、百日咳トキシン、Ｅ．ｃｏｌｉ熱−不安定トキシンＬＴ、Ｅ．ｃｏｌｉ熱安定性トキシンＳＴ、シガトキシン、ＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓエンドトキシンＡ、ボツリヌストキシン、破傷風トキシン、Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ ＡＣトキシン、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ａｎｔｈｒａｃｉｓ ＥＦから選択されるエキソトキシンである、請求項２６７に記載のタンパク質。
【請求項２８０】
トキシンの中和が可能であり、ここで、該トキシンがサキシトキシン、テトロドトキシン、キノコトキシン、アフラトキシン、ピロリジジンアルカロイド、ファイトヘマグルチニン、およびグラヤノトキシンから選択されるエンドトキシンである、請求項２６７に記載のタンパク質。
【請求項２８１】
前記タンパク質が細胞内標的に結合して、細胞機能に影響する、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２８２】
前記Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが免疫グロブリン重鎖ＩｇＧ ＧＨ３定常領域ポリペプチドに結合したＩｇＧ ＣＨ２定常領域ポリペプチドを含む請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２８３】
前記Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖ＩｇＧ ＧＨ３定常領域ポリペプチドに結合したＩｇＧ ＣＨ２定常領域ポリペプチドから本質的になる、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２８４】
ヒト定常領域の少なくとも一部を含む請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２８５】
前記連結領域が、ヒトヒンジまたはその部分、ヒトＩｇＧヒンジまたはその部分、ヒトＩｇＡヒンジまたはその部分、ヒトＩｇＥヒンジまたはその部分、ラクダヒンジ領域またはその部分、ＩｇＧ１ラマヒンジ領域またはその部分、テンジクザメヒンジ領域またはその部分、ギンザメヒンジ領域またはその部分から選択される天然に生じるヒンジ領域を含む請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２８６】
前記連結領域がヒトＩｇＥヒンジまたはその部分を含む請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２８７】
前記連結領域が０または１のシステイン残基いずれかを有するヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３またはＩｇＧ４ヒンジ領域を含む請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２８８】
前記連結領域が０と２との間のシステイン残基を有するヒトＩｇＧＡヒンジ領域を含む請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２８９】
前記連結領域が野生型ヒトＩｇＧ１免疫グロブリンヒンジ領域を含む請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２９０】
前記連結領域がグリコシル化部位を含む請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２９１】
前記連結領域が、ジスルフィド結合を形成することができるシステイン残基を有しない請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２９２】
前記連結領域が１つのシステイン残基を有する、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２９３】
前記連結領域が、１以下のシステイン残基を含む変異した野生型免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド含む請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２９４】
前記連結領域が、該タンパク質が低下した二量体化する能力を有するように変更された請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２９５】
前記連結領域がプロリンおよび第一、第二および第三のシステイン残基を含み、ここで、該第一のシステイン残基は該第二のシステインに対してＮ−末端側にあり、かつ第二のシステインは該第三のシステインに対してＮ−末端側にあり、該第三のシステイン残基は該プロリン残基に対してＮ−末端側にある、請求項２３８に記載のタンパク質。
【請求項２９６】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを含む第一のポリペプチド、該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド、該連結領域はＩｇＡヒンジ領域の少なくとも一部を含み、該第二のポリペプチドに結合したＮ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも１つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項２９７】
前記結合ドメインポリペプチドが免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項２９８】
さらに、第二の標的分子に結合することができる第二の結合ドメインポリペプチドを含み、該第二の結合ドメインポリペプチドは免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む請求項２９７に記載のタンパク質。
【請求項２９９】
前記連結領域がＩｇＡヒンジ領域の少なくとも一部から本質的になる、請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３００】
前記連結領域がＩｇＡヒンジ領域から本質的になる、請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３０１】
少なくとも約７０ｋＤａの見掛けの分子量を有するタンパク質として発現される、請求項３００に記載のタンパク質。
【請求項３０２】
約７０ｋＤａと約７００ｋＤａとの間の見掛けの分子量を有するタンパク質として発現される、請求項３００に記載のタンパク質。
【請求項３０３】
前記連結領域が１０と５０との間のアミノ酸を含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３０４】
前記連結領域が修飾されたヒトＩｇＡ免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３０５】
前記連結領域が唯１つのシステイン残基を有する、請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３０６】
前記連結領域が２つのシステイン残基を有する、請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３０７】
第三のポリペプチドにおける該Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドがＩｇＡ免疫グロブリン重鎖定常領域を含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３０８】
ＩｇＡ免疫グロブリン重鎖定常領域からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項３０７に記載のタンパク質。
【請求項３０９】
前記ＩｇＡ ＣＨ３定常領域ドメインが、ＩｇＡ重鎖定常領域をＪ鎖ポリペプチドと会合できなくする１以上のアミノ酸における置換または欠失を含む請求項３０８に記載のタンパク質。
【請求項３１０】
前記ＩｇＡ重鎖定常領域がＪ鎖ポリペプチドと会合することができる、請求項３０８に記載のタンパク質。
【請求項３１１】
前記ＩｇＡ ＣＨ３領域ドメインが４と２と０の間のアミノ酸における欠失を含む請求項３０９に記載のタンパク質。
【請求項３１２】
前記ＩｇＡ領域ドメインが４つのアミノ酸の欠失を含む請求項３０９に記載のタンパク質。
【請求項３１３】
前記ＩｇＡ領域ドメインが２０のアミノ酸の欠失を含む請求項３０９に記載のタンパク質。
【請求項３１４】
前記単鎖タンパク質がＬ６単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含み、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３１５】
前記単鎖タンパク質がＬ６ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含み、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３１６】
前記単鎖タンパク質がＣＴＬＡ−４ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含み、前記重鎖定常領域はマウスＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３１７】
前記単鎖タンパク質がＣＴＬＡ−４ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含み、前記重鎖定常領域はマウスＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、かつＣＨ３は、ＩｇＡ重鎖定常領域がＪ鎖ポリペプチドを会合できなくする４つのアミノ酸における欠失または置換を含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３１８】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含み、前記重鎖定常領域はマウスＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３１９】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、前記連結領域はＩｇＡヒンジまたはその部分を含み、かつ前記重鎖定常領域はＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３は、ＩｇＡ重鎖定常領域がＪ鎖ポリペプチドと会合できなくする１８のアミノ酸における欠失または置換を含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３２０】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、前記連結領域はＩｇＡヒンジまたはその部分を含み、かつ前記重鎖定常領域はＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３は、ＩｇＡ重鎖定常領域がＪ鎖ポリペプチドと会合できなくする４つのアミノ酸における欠失または置換を含み、かつ該ＣＨ３ドメインは、ＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３２１】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、前記連結領域はＩｇＡヒンジまたはその部分を含み、前記重鎖定常領域はＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３は、ＩｇＡ重鎖定常領域がＪ鎖ポリペプチドと会合できなくする４つのアミノ酸における欠失または置換を含み、かつ該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３２２】
前記単鎖タンパク質が１Ｄ８ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、前記連結領域はＩｇＡヒンジまたはその部分を含み、前記重鎖定常領域はＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３は、ＩｇＡ重鎖定常領域がＪ鎖ポリペプチドと会合できなくする４つのアミノ酸における欠失または置換を含み、かつ該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３２３】
前記単鎖タンパク質がＧ２８−１ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含み、前記重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３２４】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含み、該重鎖定常領域はＩｇＧ１からのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３２５】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含み、前記重鎖定常領域はＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＣＨ３は、該ＩｇＡ重鎖定常領域をＪ鎖ポリペプチドと会合できなくする４つのアミノ酸における欠失または置換を含み、および該ＣＨ３ドメインはＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合した請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３２６】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含み、前記重鎖定常領域はＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含み、ここで、該ＩｇＡ重鎖定常領域はＪ鎖ポリペプチドと会合できる、請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３２７】
前記単鎖タンパク質がＨＤ３７ハイブリドーマからの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、ここで、前記連結領域はＩｇＡヒンジ領域またはその部分を含み、前記重鎖定常領域はＩｇＡからのＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項２９６に記載のタンパク質。
【請求項３２８】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、以下：
ｉ）標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを含む第一のポリペプチド、および
ｉｉ）該第二のポリペプチドに結合したＩｇＥ免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドの少なくとも一部を含む第二のポリペプチドを含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも１つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項３２９】
前記結合ドメインポリペプチドが非−ＩｇＥ可変領域を含む請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３３０】
前記結合ドメインポリペプチドがＨＤ３７単鎖Ｆｖ、２Ｈ７単鎖Ｆｖ、Ｇ２８−１単鎖Ｆｖ、ＦＣ２−２、ＵＣＨＬ−１、５Ｂ９、Ｌ６、１０Ａ８、２ｅ１２、４０．２．３６、Ｇ１９−４、１Ｄ８、および４．４．２２０単鎖Ｆｖから選択される単鎖Ｆｖである、請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３３１】
前記結合ドメインポリペプチドが免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３３２】
さらに、第二の標的分子に結合することができる第二の結合ドメインポリペプチド含み、該第二の結合ドメインポリペプチドは免疫グロブリン軽鎖可変領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖可変領域ポリペプチドを含む請求項３３１に記載のタンパク質。
【請求項３３３】
前記免疫グロブリン軽鎖および重鎖がＩｇＧ免疫グロブリン軽鎖および重鎖またはそれらの部分を含む請求項３３２に記載のタンパク質。
【請求項３３４】
前記結合ドメインポリペプチドがＩｇＧ免疫グロブリン可変領域の少なくとも部分を含む請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３３５】
前記ＩｇＧ可変領域が重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む請求項３３４に記載のタンパク質。
【請求項３３６】
ＩｇＥに特異的なＦｃレセプターに結合することができる、請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３３７】
ＩｇＥ可変鎖領域を有しない請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３３８】
前記結合ドメインがＩｇＧ免疫グロブリン軽鎖領域およびＩｇＧ免疫グロブリン軽鎖および重鎖領域から本質的になる、請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３３９】
前記ＩｇＥ免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドがＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３４０】
前記ＩｇＥ免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドがＣＨ２、ＣＨ３およびＣＨ４ドメインを含む請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３４１】
前記結合ドメインポリペプチドが重鎖可変領域を含む単鎖Ｆｖであり、ここで、該重鎖可変領域がアミノ酸位置１１においてアミノ酸置換を有する、請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３４２】
前記単鎖タンパク質がＨＤ３７単鎖Ｆｖ、２Ｈ７単鎖Ｆｖ、Ｇ２８−１単鎖Ｆｖ、および４．４．２２０単鎖Ｆｖから選択される単鎖Ｆｖである、請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３４３】
前記単鎖タンパク質が２Ｈ７単鎖ＦｖまたはＧ２８−１単鎖Ｆｖを含む単鎖Ｆｖである、請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３４４】
被験体における標的細胞集団を減少させる方法であって、該方法は、該被験体に、治療有効量の天然に生じない単鎖タンパク質を投与する工程を包含し、ここで、該タンパク質は結合ドメインポリペプチドを含む第一のポリペプチドであって、該結合ドメインポリペプチドはＩｇＧ可変領域の少なくとも部分を含み、かつ標的分子に結合することができる、ポリペプチド、該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド、該第二のポリペプチドに結合したＩｇＥ免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質が少なくとも１つの免疫学的活性が可能である、方法。
【請求項３４５】
前記タンパク質が患者の血流に投与される、請求項３４４に記載の方法。
【請求項３４６】
前記タンパク質の投与の結果として、単球が活性化されるが、肥満細胞は活性化されない請求項３４４に記載の方法。
【請求項３４７】
前記タンパク質が投与されるか、またはヒスタミン放出ブロッカーと共に投与される、請求項３４４に記載の方法。
【請求項３４８】
動物において細胞を枯渇させる方法であって、該方法は、修飾されたＩｇＥタンパク質を動物の血流に投与する工程を包含する、方法。
【請求項３４９】
前記修飾されたＩｇＥタンパク質が投与されるか、またはヒスタミン放出ブロッカーと共に投与される、請求項３４８に記載の方法。
【請求項３５０】
前記連結領域がＩｇＧヒンジまたはその部分を含み、かつ前記重鎖定常領域がＩｇＥ由来であって、ＣＨ２ドメインを含まないＣＨ３およびＣＨ４ドメインを含む請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３５１】
前記単鎖タンパク質が２ｅ１２からの単鎖Ｆｖ結合ドメインを含み、かつ前記重鎖定常領域がＩｇＥ ＣＨ２、ＣＨ３、およびＣＨ４ドメインを含み、ここで、該重鎖定常領域はＣＤ８０膜貫通および細胞質テイルドメインを含むポリペプチドに結合された請求項３２８に記載のタンパク質。
【請求項３５２】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、以下：
ｉ）標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを有する第一のポリペプチド；
ｉｉ）該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチドであって、該連結領域は３つのシステイン残基および１つのプロリン残基を含み、ここで、該システイン残基の１以上は欠失または置換される、ポリペプチド；および
ｉｉｉ）該第二のポリペプチドに結合したＮ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチド、
を含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも１つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項３５３】
前記連結領域が第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、該第一のシステイン残基は該第二のシステインに対してＮ−末端側にあり、かつ該第二のシステインは該第三のシステインに対してＮ−末端側にあり、ここで、該第一のシステイン残基は置換または欠失されておらず、ここで、該第二および第三のシステインは置換または欠失されている、請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３５４】
前記第二および第三のシステイン残基が別のアミノ酸によって置換された請求項３５３に記載のタンパク質。
【請求項３５５】
前記第二および第三のシステイン残基がセリン残基によって置換された請求項３５４に記載のタンパク質。
【請求項３５６】
約７５ｋＤａの見掛けの分子量を有する同種タンパク質として発現される、請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３５７】
前記連結領域が第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、該第一のシステイン残基は該第二のシステインに対してＮ−末端側にあり、かつ該第二のシステインは該第三のシステインに対してＮ−末端側にあり、ここで、該第一のシステイン残基は置換または欠失されている、請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３５８】
前記連結領域中の前記第二および第三のシステイン残基が置換または欠失されていない請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３５９】
前記連結領域が第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、該第一のシステイン残基は該第二のシステインに対してＮ−末端側にあり、かつ該第二のシステインは該第三のシステインに対してＮ−末端側にあり、ここで、該第二のシステイン残基は置換または欠失されている、請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３６０】
前記連結領域における前記第一および第三のシステイン残基が置換または欠失されていない請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３６１】
前記連結領域が第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、該第一のシステイン残基は該第二のシステインに対してＮ−末端側にあり、かつ該第煮のシステイン残基は該第三のシステイン残基に対してＮ−末端側にあり、ここで、該第三のシステイン残基は置換または欠失されている、請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３６２】
前記連結領域における前記第一および第二のシステイン残基が置換または欠失されていない請求項１０に記載のタンパク質。
【請求項３６３】
前記連結領域が５と６５との間のアミノ酸を含む請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３６４】
前記連結領域が１０と５０との間のアミノ酸を含む請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３６５】
前記連結領域が１５と３５との間のアミノ酸を含む請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３６６】
前記連結領域が少なくとも５つの連続ヒンジ領域アミノ酸を含む請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３６７】
前記連結領域が少なくとも１０の連続ヒンジ領域アミノ酸を含む請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３６８】
前記連結領域が少なくとも１５の連続ヒンジ領域アミノ酸を含む請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３６９】
前記第二および第三のシステインがセリン残基によって置き換えられ、かつ前記連結領域がＩｇＧ１ヒンジ領域の少なくとも部分を含む請求項３５３に記載のタンパク質。
【請求項３７０】
前記連結領域がＩｇＧ１ヒンジ領域の少なくとも５つの連続アミノ酸を含む請求項３６９に記載のタンパク質。
【請求項３７１】
前記第二および第三のシステインがセリン残基によって置き換えられ、かつ前記連結領域がＩｇＧ２ヒンジ領域の少なくとも部分を含む請求項３５３に記載のタンパク質。
【請求項３７２】
前記連結領域がＩｇＧ２ヒンジ領域の少なくとも５つの連続アミノ酸を含む請求項３７１に記載のタンパク質。
【請求項３７３】
前記第二および第三のシステイン残基がセリン残基によって置き換えられ、かつ前記連結領域がＩｇＧ３ヒンジ領域の少なくとも部分を含む請求項３５３に記載のタンパク質。
【請求項３７４】
前記連結領域がＩｇＧ３ヒンジ領域の少なくとも５つの連続アミノ酸を含む請求項３７３に記載のタンパク質。
【請求項３７５】
前記第二および第三のシステイン残基がセリン残基によって置き換えられ、かつ前記連結領域がＩｇＧ４ヒンジ領域の少なくとも部分を含む請求項３５３に記載のタンパク質。
【請求項３７６】
前記連結領域がＩｇＧ４ヒンジ領域の少なくとも５つの連続アミノ酸を含む請求項３７５に記載のタンパク質。
【請求項３７７】
前記第二および第三のシステイン残基が置換または欠失されており、かつ前記プロリン残基が置換または欠失されており、ここで、前記重鎖定常領域ポリペプチドはＣＨ３ドメインを含み、ここで、チロシンは位置４０７のアラニンによって置換され、ここで、該タンパク質は約７５ｋＤａの見掛けの分子量を有する、請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３７８】
前記第一および第三のシステイン残基が置換または欠失されており、および前記プロリン残基が置換または欠失されており、ここで、前記重鎖定常領域ポリペプチドはＣＨ３ドメインを含み、ここで、チロシンは位置４０７においてアラニンによって置換されており、ここで、該タンパク質は約７５ｋＤａの見掛けの分子量を有する、請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３７９】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、標的分子に結合することができる、結合ドメインポリペプチド含む第一のポリペプチド、該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド、該第二のポリペプチドに結合したＮ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含み、ここで、該連結領域は第一、第二、および第三のシステイン残基を含み、ここで、該第一のシステイン残基は該第二のシステインに対してＮ−末端側にあり、かつ該第二のシステインは該第三のシステインに対してＮ−末端側にあり、ここで、該第二および第三のシステイン残基の一方または双方は置換または欠失されており、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも一つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項３８０】
前記連結領域が修飾されたヒトＩｇＧ１免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチドを含む請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３８１】
前記連結領域が唯１つのシステイン残基を有する、請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３８２】
前記連結領域が修飾されたヒトＩｇＧ１免疫グロブリンヒンジ領域ポリペプチド含む請求項３８１に記載のタンパク質。
【請求項３８３】
前記Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖ＩｇＧ ＣＨ３定常領域ポリペプチドに結合したＩｇＧ ＣＨ２定常領域ポリペプチドを含む請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３８４】
前記Ｎ−末端が縮重された免疫グロブリン重鎖定常領域ポリペプチドが、免疫グロブリン重鎖ＩｇＧ ＣＨ３定常領域ポリペプチドに結合したＩｇＧ ＣＨ２定常領域ポリペプチドから本質的になる、請求項３５２に記載のタンパク質。
【請求項３８５】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを含む第一のポリペプチド、該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド、免疫グロブリン重鎖ＣＨ２定常領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖ＣＨ３定常領域ポリペプチド含む第三のポリペプチドを含み、ここで、該ＣＨ３定常領域ポリペプチドは該タンパク質の２つが一緒に会合して非共有結合ダイマーを形成するのを阻害する１以上のアミノ酸置換または欠失を含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも一つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項３８６】
天然に生じない単鎖タンパク質であって、該タンパク質は、標的分子に結合することができる結合ドメインポリペプチドを含む第一のポリペプチド、該第一のポリペプチドに結合した連結領域を含む第二のポリペプチド、免疫グロブリン重鎖ＣＨ２定常領域ポリペプチドおよび免疫グロブリン重鎖ＣＨ３定常領域ポリペプチドを含み、ここで、該ＣＨ３定常領域ポリペプチドは位置４０５および４０７において１以上のアミノ酸の置換または欠失を含み、ここで、該天然に生じない単鎖タンパク質は少なくとも一つの免疫学的活性が可能である、タンパク質。
【請求項３８７】
位置４０５および位置４０７においてアミノ酸置換を含む請求項２５２または２５３に記載のタンパク質。
【請求項３８８】
フェニルアラニンが位置４０５においてアラニンで置き換えられ、チロシンが位置４０７においてアラニンで置換された請求項３８７に記載のタンパク質。
【請求項３８９】
約４０ｋＤａと約５０ｋＤａとの間の見掛けの分子量を有する、請求項３８７に記載のタンパク質。
【請求項３９０】
アゴニストまたはアンタゴニストの生物学的活性を有する、請求項３８７に記載のタンパク質。
【請求項３９１】
アンタゴニストの生物学的活性を有する、請求項３９０に記載のタンパク質。
【請求項３９２】
位置４０５および４０７における唯１つのアミノ酸が置換された請求項３８７に記載のタンパク質。
【請求項３９３】
約７０ｋＤａと約８０ｋＤａとの間の見掛けの分子量を有する、請求項３９２に記載のタンパク質。
【請求項３９４】
フェニルアラニンが位置４０５においてアラニンによって置き換えられた請求項３８７に記載のタンパク質。
【請求項３９５】
フェニルアラニンが位置４０５においてチロシンによって置き換えられた請求項３８７に記載のタンパク質。
【請求項３９６】
チロシンが位置４０７においてアラニンによって置き換えられた請求項３８６に記載のタンパク質。
【請求項３９７】
位置４０５および位置４０７においてアミノ酸置換を含む請求項３８６に記載のタンパク質。
【請求項３９８】
フェニルアラニンが位置４０５においてアラニンによって置き換えられ、かつチロシンが位置４０７においてアラニンによって置き換えられた請求項３９３に記載のタンパク質。
【請求項３９９】
請求項１、８、９、１２、１８、３０、および１１２〜１０９のいずれか１項に記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
【請求項４００】
請求項１１６、１２０、１２１、および１８０〜２３５のいずれか１項に記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
【請求項４０１】
請求項２３８、２３９、２９６、３２８、３５２、３５３、３８５および３８６いずれか１項に記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
【請求項４０２】
細胞中の前記ポリヌクレオチドの発現を増強するプロモーターまたは他の配列に操作可能に連結した請求項３９９〜４０１のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項４０３】
請求項３９９〜４０１のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドを含有する細胞。
【請求項４０４】
請求項１、８、９、１２、１８、３０、および１１２〜１０９のいずれか１項に記載のタンパク質を発現することができる組換えベクター。
【請求項４０５】
請求項１１６、１２０、１２１および１８０〜２３５のいずれか１項に記載のタンパク質を発現させることができる組換えベクター。
【請求項４０６】
前記タンパク質が発現される条件下で請求項１、８、９、１２、１８、３０および１１２〜１０９のいずれか１項に記載のタンパク質を発現する方法。
【請求項４０７】
前記タンパク質が発現される条件下で請求項１１６、１２０、１２１、および１８０〜２３５のいずれか１項に記載のタンパク質を発現する方法。
【請求項４０８】
前記タンパク質が発現される条件下で請求項２３８、２３９、２９６、３２８、３５２、３５３、３８５、および３８６のいずれか１項に記載のタンパク質を発現する方法。
【請求項４０９】
１以上のさらなる治療化合物と組み合わせた請求項２３８、２３９、２９６、３２８、３５２、３５３、３８５および３８６のいずれか１項に記載のタンパク質を含む組成物。
【請求項４１０】
被験体を処置する方法であって、該方法は、該被験体に、請求項２３８、２３９、２９６、３２８、３５２、３５３、３８５および３８６のいずれか１項に記載の１以上の第一の化合物を投与する工程、第一の化合物と組み合わせて該被験体に第二の化合物を投与または同時投与する工程を包含し、ここで、該処置は疾患、病気または望ましくない状態を処置または予防するのに有効である、方法。
【請求項４１１】
前記第二の化合物が化学療法化合物、治療薬物、脈管形成インヒビター、ステロイド、Ｂ−細胞アクチベーター、Ｔ−細胞アクチベーター、コロニー刺激因子、腫瘍壊死因子、インターフェロン、抗体、本発明の結合構築体、遺伝子治療、レチノイド、外科的手法、アルキル化剤、ヌクレオチドアナログ、トポイソメラーゼＩＩ、ＶＥＧＦ、ＩＦＮ−アルファ、ＤＭＡＲ剤、インターロイキン−１、グルココルチコイド、ｐ３８インヒビター、インターロイキン−４、インターロイキン−６、インターロイキン−２、インターロイキン−１２、ＩＦＮ−γ、ＧＭ−ＣＳＦ、Ｇ−ＣＳＦ、Ｍ−ＣＳＦ、抗−ＣＴＬＡ−４、Ｂｃｌ−２アンチセンス、ビタミンＡ、抗−ＣＤ１９、抗−ＣＤ２０、抗−ＣＤ２２、抗−ＣＤ２８または抗−ＣＤ３から選択される、請求項４１０に記載の方法。
【請求項４１２】
組換え分子を表示する方法であって、該分子は天然または遺伝子操作された免疫グロブリン重鎖可変領域を含み、その改良は該重鎖可変領域における位置９、１０、１１、１２、１０８、１１０、および１１２に対応する１以上のアミノ酸残基において１以上の突然変異、置換、改変および／または欠失を含む免疫グロブリン重鎖領域を含む、方法。
【請求項４１３】
天然に生じない単鎖抗原結合タンパク質であって、該タンパク質は、
【数１】
【数２】
【数３】
から選択された式を有するタンパク質を有する、タンパク質。
【図２】
【図３】
【図５】
【図６】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【図１５】
【図１６】
【図１７】
【図１８】
【図１９】
【図２０】
【図２１】
【図２２】
【図２３】
【図２４】
【図２５】
【図２６】
【図２７】
【図２８】
【図２９】
【図３０】
【図３１】
【図３２】
【図３３】
【図３４】
【図３５】
【図３６】
【図３７】
【図３８】
【図３９】
【図４０】
【図４２】
【図４３】
【図４４】
【図４５】
【図４６】
【図４７】
【図４８】
【図４９】
【図５０】
【図５１】
【図５２】
【図５３】
【図５４】
【図５５】
【図５６】
【図５７】
【図５８】
【図５９】
【図６０】
【図６１】
【図６２】
【図６３】
【図６４】
【図６５】
【図６６】
【図６７】
【図６８】
【図６９】
【図７０】
【図７１】
【図７２】
【図７３】
【図７４】
【図７５】
【図７６】
【図７７】
【図７８】
【図７９】
【図８０】
【図８１】
【図８２】
【図８３】
【図８４】
【図３】
【図５】
【図６】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【図１５】
【図１６】
【図１７】
【図１８】
【図１９】
【図２０】
【図２１】
【図２２】
【図２３】
【図２４】
【図２５】
【図２６】
【図２７】
【図２８】
【図２９】
【図３０】
【図３１】
【図３２】
【図３３】
【図３４】
【図３５】
【図３６】
【図３７】
【図３８】
【図３９】
【図４０】
【図４２】
【図４３】
【図４４】
【図４５】
【図４６】
【図４７】
【図４８】
【図４９】
【図５０】
【図５１】
【図５２】
【図５３】
【図５４】
【図５５】
【図５６】
【図５７】
【図５８】
【図５９】
【図６０】
【図６１】
【図６２】
【図６３】
【図６４】
【図６５】
【図６６】
【図６７】
【図６８】
【図６９】
【図７０】
【図７１】
【図７２】
【図７３】
【図７４】
【図７５】
【図７６】
【図７７】
【図７８】
【図７９】
【図８０】
【図８１】
【図８２】
【図８３】
【図８４】
【公表番号】特表２００７−５２８１９４（Ｐ２００７−５２８１９４Ａ）
【公表日】平成１９年１０月１１日（２００７．１０．１１）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００５−５０７９４５（Ｐ２００５−５０７９４５）
【出願日】平成１５年１２月２４日（２００３．１２．２４）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００３／０４１６００
【国際公開番号】ＷＯ２００５／０１７１４８
【国際公開日】平成１７年２月２４日（２００５．２．２４）
【出願人】（５０３２５６４９４）トルビオン・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッド (6)
【氏名又は名称原語表記】ＴＲＵＢＩＯＮ ＰＨＡＲＭＡＣＥＵＴＩＣＡＬＳ， ＩＮＣ．
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成１９年１０月１１日（２００７．１０．１１）
【国際特許分類】
【出願日】平成１５年１２月２４日（２００３．１２．２４）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００３／０４１６００
【国際公開番号】ＷＯ２００５／０１７１４８
【国際公開日】平成１７年２月２４日（２００５．２．２４）
【出願人】（５０３２５６４９４）トルビオン・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッド (6)
【氏名又は名称原語表記】ＴＲＵＢＩＯＮ ＰＨＡＲＭＡＣＥＵＴＩＣＡＬＳ， ＩＮＣ．
【Ｆターム（参考）】
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