１，４−ブタンジオールの生成のための微生物体
本発明は、1,4-ブタンジオール(BDO)を生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含むBDO経路を含む非天然微生物体を提供する。本発明は、また、当該微生物体を使用してBDOを生成する方法を提供する。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
1,4-ブタンジオール(BDO)経路を有する非天然微生物体であって、BDOを生成するための十分な量で発現され、3-ヒドロキシブチリル-CoAデヒドロゲナーゼ、3-ヒドロキシブチリル-CoAデヒドラターゼ、ビニルアセチル-CoAΔ-イソメラーゼ又は4-ヒドロキシブチリル-CoAデヒドラターゼを含むBDO経路酵素をコードする外因性核酸を含む、前記非天然微生物体。
【請求項２】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項1記載の非天然微生物体。
【請求項３】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項1記載の非天然微生物体。
【請求項４】
実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項1記載の非天然微生物体。
【請求項５】
BDOを生成するための方法であって、請求項１記載の非天然微生物体を、BDOを生成するための条件下で、且つ十分な時間にわたって培養することを含む、前記方法。
【請求項６】
前記非天然微生物体が実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項5記載の方法。
【請求項７】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項5記載の方法。
【請求項８】
1,4-ブタンジオール(BDO)を生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、4-アミノ酪酸CoAトランスフェラーゼ、4-アミノブチリル-CoAヒドロラーゼ、4-アミノ酪酸-CoAリガーゼ、4-アミノブチリル-CoAオキシドレダクターゼ(脱アミノ化)、4-アミノブチリル-CoAトランスアミナーゼ又は4-ヒドロキシブチリル-CoAデヒドロゲナーゼを含むBDO経路を有する微生物体を含む非天然微生物体。
【請求項９】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項8記載の非天然微生物体。
【請求項１０】
それぞれがBDO経路酵素をコードする2つの外因性核酸を含む、請求項8記載の非天然微生物体。
【請求項１１】
それぞれがBDO経路酵素をコードする3つの外因性核酸を含む、請求項8記載の非天然微生物体。
【請求項１２】
前記3つの外因性核酸が、4-アミノ酪酸CoAトランスフェラーゼ、4-アミノブチリル-CoAヒドロラーゼ又は4-アミノ酪酸-CoAリガーゼ;4-アミノブチリル-CoAオキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は4-アミノブチリル-CoAトランスアミナーゼ;及び4-ヒドロキシブチリル-CoAデヒドロゲナーゼをコードする、請求項11記載の非天然微生物体。
【請求項１３】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項12記載の非天然微生物体。
【請求項１４】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項8記載の非天然微生物体。
【請求項１５】
実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項8記載の非天然微生物体。
【請求項１６】
BDOを生成するための方法であって、BDOを生成するための条件下で、且つ十分な時間にわたって、BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、4-アミノ酪酸CoAトランスフェラーゼ、4-アミノブチリル-CoAヒドロラーゼ、4-アミノ酪酸-CoAリガーゼ、4-アミノブチリル-CoAオキシドレダクターゼ(脱アミノ化)、4-アミノブチリル-CoAトランスアミナーゼ又は4-ヒドロキシブチリル-CoAデヒドロゲナーゼを含むBDO経路を有する非天然微生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項１７】
前記非天然微生物体が実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項16記載の方法。
【請求項１８】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項16記載の方法。
【請求項１９】
BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、4-アミノ酪酸CoAトランスフェラーゼ、4-アミノブチリル-CoAヒドロラーゼ、4-アミノ酪酸-CoAリガーゼ、4-アミノブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-アミノブチリル-CoAレダクターゼ、4-アミノブタン-1-オールデヒドロゲナーゼ、4-アミノブタン-1-オールオキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は4-アミノブタン-1-オールトランスアミナーゼを含むBDO経路を有する微生物体を含む非天然微生物体。
【請求項２０】
前記BDO経路が、1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項19記載の非天然微生物体。
【請求項２１】
それぞれがBDO経路酵素をコードする2つの外因性核酸を含む、請求項19記載の非天然微生物体。
【請求項２２】
それぞれがBDO経路酵素をコードする3つの外因性核酸を含む、請求項19記載の非天然微生物体。
【請求項２３】
前記3つの外因性核酸が、4-アミノ酪酸CoAトランスフェラーゼ、4-アミノブチリル-CoAヒドロラーゼ又は4-アミノ酪酸-CoAリガーゼ;4-アミノブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成);及び4-アミノブタン-1-オールオキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は4-アミノブタン-1-オールトランスアミナーゼをコードする、請求項22記載の非天然微生物体。
【請求項２４】
前記BDO経路が、1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項23記載の非天然微生物体。
【請求項２５】
それぞれがBDO経路酵素をコードする4つの外因性核酸を含む、請求項19記載の非天然微生物体。
【請求項２６】
前記4つの外因性核酸が、4-アミノ酪酸CoAトランスフェラーゼ、4-アミノブチリル-CoAヒドロラーゼ又は4-アミノ酪酸-CoAリガーゼ;4-アミノブチリル-CoAレダクターゼ;4-アミノブタン-1-オールデヒドロゲナーゼ及び4-アミノブタン-1-オールオキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は4-アミノブタン-1-オールトランスアミナーゼをコードする、請求項25記載の非天然微生物体。
【請求項２７】
前記BDO経路が、1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項26記載の非天然微生物体。
【請求項２８】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項19記載の非天然微生物体。
【請求項２９】
実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項19記載の非天然微生物体。
【請求項３０】
BDOを生成するための方法であって、BDOを生成するための条件下で、且つ十分な時間にわたって、BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、4-アミノ酪酸CoAトランスフェラーゼ、4-アミノブチリル-CoAヒドロラーゼ、4-アミノ酪酸-CoAリガーゼ、4-アミノブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-アミノブチリル-CoAレダクターゼ、4-アミノブタン-1-オールデヒドロゲナーゼ、4-アミノブタン-1-オールオキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は4-アミノブタン-1-オールトランスアミナーゼを含むBDO経路を有する非天然微生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項３１】
前記非天然微生物体が実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項30記載の方法。
【請求項３２】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項30記載の方法。
【請求項３３】
BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、4-アミノ酪酸キナーゼ、4-アミノブチルアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化)、4-アミノブタン-1-オールデヒドロゲナーゼ、4-アミノブタン-1-オールオキシドレダクターゼ(脱アミノ化)、4-アミノブタン-1-オールトランスアミナーゼ、[(4-アミノブタノイル)オキシ]ホスホン酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)、[(4-アミノブタノイル)オキシ]ホスホン酸トランスアミナーゼ、4-ヒドロキシブチリル-リン酸デヒドロゲナーゼ又は4-ヒドロキシブチルアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化)を含むBDO経路を有する微生物体を含む非天然微生物体。
【請求項３４】
前記BDO経路が、1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項33記載の非天然微生物体。
【請求項３５】
それぞれがBDO経路酵素をコードする2つの外因性核酸を含む、請求項33記載の非天然微生物体。
【請求項３６】
それぞれがBDO経路酵素をコードする3つの外因性核酸を含む、請求項33記載の非天然微生物体。
【請求項３７】
それぞれがBDO経路酵素をコードする4つの外因性核酸を含む、請求項33記載の非天然微生物体。
【請求項３８】
前記4つの外因性核酸が、4-アミノ酪酸キナーゼ;4-アミノブチルアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化);4-アミノブタン-1-オールデヒドロゲナーゼ;及び4-アミノブタン-1-オールオキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は4-アミノブタン-1-オールトランスアミナーゼをコードする、請求項37記載の非天然微生物体。
【請求項３９】
前記BDO経路が、1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項38記載の非天然微生物体。
【請求項４０】
前記4つの外因性核酸が、4-アミノ酪酸キナーゼ;[(4-アミノブタノリル)オキシ]ホスホン酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は[(4-アミノブタノイル)オキシ]ホスホン酸トランスアミナーゼ;4-ヒドロキシブチリル-リン酸デヒドロゲナーゼ;及び4-ヒドロキシブチルアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化)をコードする、請求項37記載の非天然微生物体。
【請求項４１】
前記BDO経路が、1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項40記載の非天然微生物体。
【請求項４２】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項33記載の非天然微生物体。
【請求項４３】
実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項33記載の非天然微生物体。
【請求項４４】
BDOを生成するための方法であって、BDOを生成するための条件下で、且つ十分な時間にわたって、BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、4-アミノ酪酸キナーゼ、4-アミノブチルアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化)、4-アミノブタン-1-オールデヒドロゲナーゼ、4-アミノブタン-1-オールオキシドレダクターゼ(脱アミノ化)、4-アミノブタン-1-オールトランスアミナーゼ、[(4-アミノブタノイル)オキシ]ホスホン酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)、[(4-アミノブタノイル)オキシ]ホスホン酸トランスアミナーゼ、4-ヒドロキシブチリル-リン酸デヒドロゲナーゼ又は4-ヒドロキシブチルアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化)を含むBDO経路を有する非天然微生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項４５】
前記非天然微生物体が実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項44記載の方法。
【請求項４６】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項44記載の方法。
【請求項４７】
BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、アルファ-ケトグルタル酸5-キナーゼ、2,5-ジオキソペンタン酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化)、2,5-ジオキソペンタン酸レダクターゼ、アルファ-ケトグルタル酸CoAトランスフェラーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAヒドロラーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAリガーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAレダクターゼ、5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼ又は5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)を含むBDO経路を有する微生物体を含む非天然微生物体。
【請求項４８】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項47記載の非天然微生物体。
【請求項４９】
それぞれがBDO経路酵素をコードする2つの外因性核酸を含む、請求項47記載の非天然微生物体。
【請求項５０】
それぞれがBDO経路酵素をコードする3つの外因性核酸を含む、請求項47記載の非天然微生物体。
【請求項５１】
前記3つの外因性核酸が、アルファ-ケトグルタル酸CoAトランスフェラーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAヒドロラーゼ又はアルファ-ケトグルタリル-CoAリガーゼ;アルファ-ケトグルタリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成);及び5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼをコードする、請求項50記載の非天然微生物体。
【請求項５２】
前記BDO経路が、1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項51記載の非天然微生物体。
【請求項５３】
前記3つの外因性核酸が、アルファ-ケトグルタル酸CoAトランスフェラーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAヒドロラーゼ又はアルファ-ケトグルタリル-CoAリガーゼ;アルファ-ケトグルタリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成);及び5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)をコードする、請求項50記載の非天然微生物体。
【請求項５４】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項53記載の非天然微生物体。
【請求項５５】
それぞれがBDO経路酵素をコードする4つの外因性核酸を含む、請求項47記載の非天然微生物体。
【請求項５６】
前記4つの外因性核酸が、アルファ-ケトグルタル酸5-キナーゼ;2,5-ジオキソペンタン酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化);2,5-ジオキソペンタン酸レダクターゼ;及び5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼをコードする、請求項55記載の非天然微生物体。
【請求項５７】
前記BDO経路が、1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項56記載の非天然微生物体。
【請求項５８】
前記4つの外因性核酸が、アルファ-ケトグルタル酸5-キナーゼ;2,5-ジオキソペンタン酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化);2,5-ジオキソペンタン酸レダクターゼ;及び5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)をコードする、請求項55記載の非天然微生物体。
【請求項５９】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項58記載の非天然微生物体。
【請求項６０】
前記4つの外因性核酸が、アルファ-ケトグルタル酸CoAトランスフェラーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAヒドロラーゼ又はアルファ-ケトグルタリル-CoAリガーゼ;アルファ-ケトグルタリル-CoAレダクターゼ;5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ;及び5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼをコードする、請求項55記載の非天然微生物体。
【請求項６１】
前記BDO経路が、1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項60記載の非天然微生物体。
【請求項６２】
前記4つの外因性核酸が、アルファ-ケトグルタル酸CoAトランスフェラーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAヒドロラーゼ又はアルファ-ケトグルタリル-CoAリガーゼ;アルファ-ケトグルタリル-CoAレダクターゼ;5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ;及び5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)をコードする、請求項55記載の非天然微生物体。
【請求項６３】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項60記載の非天然微生物体。
【請求項６４】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項47記載の非天然微生物体。
【請求項６５】
実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項47記載の非天然微生物体。
【請求項６６】
BDOを生成するための方法であって、BDOを生成するための条件下で、且つ十分な時間にわたって、BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、アルファ-ケトグルタル酸5-キナーゼ、2,5-ジオキソペンタン酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化)、2,5-ジオキソペンタン酸レダクターゼ、アルファ-ケトグルタル酸CoAトランスフェラーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAヒドロラーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAリガーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAレダクターゼ、5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼ又は5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)を含むBDO経路を有する非天然微生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項６７】
前記非天然微生物体が実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項66記載の方法。
【請求項６８】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項66記載の方法。
【請求項６９】
BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、グルタミン酸CoAトランスフェラーゼ、グルタミル-CoAヒドロラーゼ、グルタミル-CoAリガーゼ、グルタミン酸5-キナーゼ、グルタミン酸-5-セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化)、グルタミル-CoAレダクターゼ、グルタミン酸-5-セミアルデヒドデヒドレダクターゼ、グルタミル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)、2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸トランスアミナーゼ、5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼ、5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)を含むBDO経路を有する微生物体を含む非天然微生物体。
【請求項７０】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項69記載の非天然微生物体。
【請求項７１】
それぞれがBDO経路酵素をコードする2つの外因性核酸を含む、請求項69記載の非天然微生物体。
【請求項７２】
それぞれがBDO経路酵素をコードする3つの外因性核酸を含む、請求項69記載の非天然微生物体。
【請求項７３】
それぞれがBDO経路酵素をコードする4つの外因性核酸を含む、請求69記載の非天然微生物体。
【請求項７４】
前記4つの外因性核酸が、グルタミン酸CoAトランスフェラーゼ、グルタミル-CoAヒドロラーゼ又はグルタミル-CoAリガーゼ;グルタミル-CoAレダクターゼ(アルコール形成);2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸トランスアミナーゼ;及び5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼ又は5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)をコードする、請求項73記載の非天然微生物体。
【請求項７５】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項74記載の非天然微生物体。
【請求項７６】
前記4つの外因性核酸が、グルタミン酸5-キナーゼ;グルタミン酸-5-セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化);2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸トランスアミナーゼ;及び5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼ又は5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)をコードする、請求項73記載の非天然微生物体。
【請求項７７】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項76記載の非天然微生物体。
【請求項７８】
それぞれがBDO経路酵素をコードする5つの外因性核酸を含む、請求69記載の非天然微生物体。
【請求項７９】
前記5つの外因性核酸が、グルタミン酸CoAトランスフェラーゼ、グルタミル-CoAヒドロラーゼ又はグルタミル-CoAリガーゼ;グルタミル-CoAレダクターゼ;グルタミン酸-5-セミアルデヒドレダクターゼ;2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸トランスアミナーゼ;及び5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼ又は5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)をコードする、請求項78記載の非天然微生物体。
【請求項８０】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項79記載の非天然微生物体。
【請求項８１】
前記5つの外因性核酸が、グルタミン酸5-キナーゼ;グルタミン酸-5-セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化);グルタミン酸-5-セミアルデヒドレダクターゼ;2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸トランスアミナーゼ;及び5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼ又は5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)をコードする、請求項78記載の非天然微生物体。
【請求項８２】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項81記載の非天然微生物体。
【請求項８３】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項69記載の非天然微生物体。
【請求項８４】
実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項69記載の非天然微生物体。
【請求項８５】
BDOを生成するための方法であって、BDOを生成するための条件下で、且つ十分な時間にわたって、BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、グルタミン酸CoAトランスフェラーゼ、グルタミル-CoAヒドロラーゼ、グルタミル-CoAリガーゼ、グルタミン酸5-キナーゼ、グルタミン酸-5-セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化)、グルタミル-CoAレダクターゼ、グルタミン酸-5-セミアルデヒドデヒドレダクターゼ、グルタミル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)、2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸トランスアミナーゼ、5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼ、5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)を含むBDO経路を有する非天然微生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項８６】
前記非天然微生物体が実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項85記載の方法。
【請求項８７】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項85記載の方法。
【請求項８８】
BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、ホモセリンデアミナーゼ、ホモセリンCoAトランスフェラーゼ、ホモセリン-CoAヒドロラーゼ、ホモセリン-CoAリガーゼ、ホモセリン-CoAデアミナーゼ、4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAトランスフェラーゼ、4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAヒドロラーゼ、4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAリガーゼ、4-ヒドロキシブタ-2-エン酸レダクターゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAトランスフェラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAヒドロラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAリガーゼ又は4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAレダクターゼを含むBDO経路を有する微生物体を含む非天然微生物体。
【請求項８９】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項88記載の非天然微生物体。
【請求項９０】
それぞれがBDO経路酵素をコードする2つの外因性核酸を含む、請求88記載の非天然微生物体。
【請求項９１】
それぞれがBDO経路酵素をコードする3つの外因性核酸を含む、請求88記載の非天然微生物体。
【請求項９２】
前記3つの外因性核酸が、ホモセリンデアミナーゼ;4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAトランスフェラーゼ、4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAヒドラーゼ、4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAリガーゼ;4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAレダクターゼをコードする請求項91記載の非天然微生物体。
【請求項９３】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項92記載の非天然微生物体。
【請求項９４】
前記3つの外因性核酸が、ホモセリンCoAトランスフェラーゼ、ホモセリン-CoAヒドロラーゼ又はホモセリンCoAリガーゼ;ホモセリン-CoAデアミナーゼ;及び4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAレダクターゼをコードする、請求項91記載の非天然微生物体。
【請求項９５】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項94記載の非天然微生物体。
【請求項９６】
前記3つの外因性核酸が、ホモセリンデアミナーゼ;4-ヒドロキシブタ-2-エン酸レダクターゼ;及び4-ヒドロキシブチリル-CoAトランスフェラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAヒドロラーゼ又は4-ヒドロキシブチリル-CoAリガーゼをコードする、請求項91記載の非天然微生物体。
【請求項９７】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項96記載の非天然微生物体。
【請求項９８】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項88記載の非天然微生物体。
【請求項９９】
実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項88記載の非天然微生物体。
【請求項１００】
BDOを生成するための方法であって、BDOを生成するための条件下で、且つ十分な時間にわたって、BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、ホモセリンデアミナーゼ、ホモセリンCoAトランスフェラーゼ、ホモセリン-CoAヒドロラーゼ、ホモセリン-CoAリガーゼ、ホモセリン-CoAデアミナーゼ、4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAトランスフェラーゼ、4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAヒドロラーゼ、4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAリガーゼ、4-ヒドロキシブタ-2-エン酸レダクターゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAトランスフェラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAヒドロラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAリガーゼ又は4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAレダクターゼを含むBDO経路を有する非天然微生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項１０１】
前記非天然微生物体が実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項100記載の方法。
【請求項１０２】
前記少なくとも1つの核酸が異種核酸である、請求項100記載の方法。
【請求項１０３】
BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、スクシニル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAヒドロラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAリガーゼ又は4-ヒドロキシブタナールデヒドロゲナーゼ(リン酸化)を含むBDO経路を有する微生物体を含む非天然微生物体。
【請求項１０４】
前記BDO経路が、スクシニル-CoAレダクターゼ、4-ヒドロキシ酪酸デヒドロゲナーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAトランスフェラーゼ、4-ヒドロキシ酪酸キナーゼ、ホスホトランス-4-ヒドロキシブチリラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項103記載の非天然微生物体。
【請求項１０５】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項104記載の非天然微生物体。
【請求項１０６】
実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項104記載の非天然微生物体。
【請求項１０７】
BDOを生成するための方法であって、BDOを生成するための条件下で、且つ十分な時間にわたって、BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、スクシニル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAヒドロラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAリガーゼ又は4-ヒドロキシブタナールデヒドロゲナーゼ(リン酸化)を含むBDO経路を有する非天然微生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項１０８】
前記BDO経路が、スクシニル-CoAレダクターゼ、4-ヒドロキシ酪酸デヒドロゲナーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAトランスフェラーゼ、4-ヒドロキシ酪酸キナーゼ、ホスホトランス-4-ヒドロキシブチリラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項107記載の方法。
【請求項１０９】
前記非天然微生物体が実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項107記載の方法。
【請求項１１０】
前記少なくとも1つの核酸が異種核酸である、請求項107記載の方法。
【請求項１１１】
BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、グルタミン酸デヒドロゲナーゼ、4-アミノ酪酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)、4-アミノ酪酸トランスアミナーゼ、グルタミン酸デカルボキシラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAヒドロラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAリガーゼ又は4-ヒドロキシブタナールデヒドロゲナーゼ(リン酸化)を含むBDO経路を有する微生物体を含む非天然微生物体。
【請求項１１２】
前記BDO経路が、アルファ-ケトグルタル酸デカルボキシラーゼ、4-ヒドロキシ酪酸デヒドロゲナーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAトランスフェラーゼ、4-ヒドロキシ酪酸キナーゼ、ホスホトランス-4-ヒドロキシブチラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項111記載の非天然微生物体。
【請求項１１３】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項111記載の非天然微生物体。
【請求項１１４】
実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項111記載の非天然微生物体。
【請求項１１５】
BDOを生成するための方法であって、BDOを生成するための条件下で、且つ十分な時間にわたって、BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、グルタミン酸デヒドロゲナーゼ、4-アミノ酪酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)、4-アミノ酪酸トランスアミナーゼ、グルタミン酸デカルボキシラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAヒドロラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAリガーゼ又は4-ヒドロキシブタナールデヒドロゲナーゼ(リン酸化)を含むBDO経路を有する非天然微生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項１１６】
前記BDO経路が、アルファ-ケトグルタル酸デカルボキシラーゼ、4-ヒドロキシ酪酸デヒドロゲナーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAトランスフェラーゼ、4-ヒドロキシ酪酸キナーゼ、ホスホトランス-4-ヒドロキシブチラーゼ、4-ヒドロシブチリル-CoAレダクターゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項115記載の方法。
【請求項１１７】
前記非天然微生物体が実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項115記載の方法。
【請求項１１８】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項115記載の方法。
【請求項１】
1,4-ブタンジオール(BDO)経路を有する非天然微生物体であって、BDOを生成するための十分な量で発現され、3-ヒドロキシブチリル-CoAデヒドロゲナーゼ、3-ヒドロキシブチリル-CoAデヒドラターゼ、ビニルアセチル-CoAΔ-イソメラーゼ又は4-ヒドロキシブチリル-CoAデヒドラターゼを含むBDO経路酵素をコードする外因性核酸を含む、前記非天然微生物体。
【請求項２】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項1記載の非天然微生物体。
【請求項３】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項1記載の非天然微生物体。
【請求項４】
実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項1記載の非天然微生物体。
【請求項５】
BDOを生成するための方法であって、請求項１記載の非天然微生物体を、BDOを生成するための条件下で、且つ十分な時間にわたって培養することを含む、前記方法。
【請求項６】
前記非天然微生物体が実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項5記載の方法。
【請求項７】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項5記載の方法。
【請求項８】
1,4-ブタンジオール(BDO)を生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、4-アミノ酪酸CoAトランスフェラーゼ、4-アミノブチリル-CoAヒドロラーゼ、4-アミノ酪酸-CoAリガーゼ、4-アミノブチリル-CoAオキシドレダクターゼ(脱アミノ化)、4-アミノブチリル-CoAトランスアミナーゼ又は4-ヒドロキシブチリル-CoAデヒドロゲナーゼを含むBDO経路を有する微生物体を含む非天然微生物体。
【請求項９】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項8記載の非天然微生物体。
【請求項１０】
それぞれがBDO経路酵素をコードする2つの外因性核酸を含む、請求項8記載の非天然微生物体。
【請求項１１】
それぞれがBDO経路酵素をコードする3つの外因性核酸を含む、請求項8記載の非天然微生物体。
【請求項１２】
前記3つの外因性核酸が、4-アミノ酪酸CoAトランスフェラーゼ、4-アミノブチリル-CoAヒドロラーゼ又は4-アミノ酪酸-CoAリガーゼ;4-アミノブチリル-CoAオキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は4-アミノブチリル-CoAトランスアミナーゼ;及び4-ヒドロキシブチリル-CoAデヒドロゲナーゼをコードする、請求項11記載の非天然微生物体。
【請求項１３】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項12記載の非天然微生物体。
【請求項１４】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項8記載の非天然微生物体。
【請求項１５】
実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項8記載の非天然微生物体。
【請求項１６】
BDOを生成するための方法であって、BDOを生成するための条件下で、且つ十分な時間にわたって、BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、4-アミノ酪酸CoAトランスフェラーゼ、4-アミノブチリル-CoAヒドロラーゼ、4-アミノ酪酸-CoAリガーゼ、4-アミノブチリル-CoAオキシドレダクターゼ(脱アミノ化)、4-アミノブチリル-CoAトランスアミナーゼ又は4-ヒドロキシブチリル-CoAデヒドロゲナーゼを含むBDO経路を有する非天然微生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項１７】
前記非天然微生物体が実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項16記載の方法。
【請求項１８】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項16記載の方法。
【請求項１９】
BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、4-アミノ酪酸CoAトランスフェラーゼ、4-アミノブチリル-CoAヒドロラーゼ、4-アミノ酪酸-CoAリガーゼ、4-アミノブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-アミノブチリル-CoAレダクターゼ、4-アミノブタン-1-オールデヒドロゲナーゼ、4-アミノブタン-1-オールオキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は4-アミノブタン-1-オールトランスアミナーゼを含むBDO経路を有する微生物体を含む非天然微生物体。
【請求項２０】
前記BDO経路が、1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項19記載の非天然微生物体。
【請求項２１】
それぞれがBDO経路酵素をコードする2つの外因性核酸を含む、請求項19記載の非天然微生物体。
【請求項２２】
それぞれがBDO経路酵素をコードする3つの外因性核酸を含む、請求項19記載の非天然微生物体。
【請求項２３】
前記3つの外因性核酸が、4-アミノ酪酸CoAトランスフェラーゼ、4-アミノブチリル-CoAヒドロラーゼ又は4-アミノ酪酸-CoAリガーゼ;4-アミノブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成);及び4-アミノブタン-1-オールオキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は4-アミノブタン-1-オールトランスアミナーゼをコードする、請求項22記載の非天然微生物体。
【請求項２４】
前記BDO経路が、1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項23記載の非天然微生物体。
【請求項２５】
それぞれがBDO経路酵素をコードする4つの外因性核酸を含む、請求項19記載の非天然微生物体。
【請求項２６】
前記4つの外因性核酸が、4-アミノ酪酸CoAトランスフェラーゼ、4-アミノブチリル-CoAヒドロラーゼ又は4-アミノ酪酸-CoAリガーゼ;4-アミノブチリル-CoAレダクターゼ;4-アミノブタン-1-オールデヒドロゲナーゼ及び4-アミノブタン-1-オールオキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は4-アミノブタン-1-オールトランスアミナーゼをコードする、請求項25記載の非天然微生物体。
【請求項２７】
前記BDO経路が、1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項26記載の非天然微生物体。
【請求項２８】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項19記載の非天然微生物体。
【請求項２９】
実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項19記載の非天然微生物体。
【請求項３０】
BDOを生成するための方法であって、BDOを生成するための条件下で、且つ十分な時間にわたって、BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、4-アミノ酪酸CoAトランスフェラーゼ、4-アミノブチリル-CoAヒドロラーゼ、4-アミノ酪酸-CoAリガーゼ、4-アミノブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-アミノブチリル-CoAレダクターゼ、4-アミノブタン-1-オールデヒドロゲナーゼ、4-アミノブタン-1-オールオキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は4-アミノブタン-1-オールトランスアミナーゼを含むBDO経路を有する非天然微生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項３１】
前記非天然微生物体が実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項30記載の方法。
【請求項３２】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項30記載の方法。
【請求項３３】
BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、4-アミノ酪酸キナーゼ、4-アミノブチルアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化)、4-アミノブタン-1-オールデヒドロゲナーゼ、4-アミノブタン-1-オールオキシドレダクターゼ(脱アミノ化)、4-アミノブタン-1-オールトランスアミナーゼ、[(4-アミノブタノイル)オキシ]ホスホン酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)、[(4-アミノブタノイル)オキシ]ホスホン酸トランスアミナーゼ、4-ヒドロキシブチリル-リン酸デヒドロゲナーゼ又は4-ヒドロキシブチルアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化)を含むBDO経路を有する微生物体を含む非天然微生物体。
【請求項３４】
前記BDO経路が、1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項33記載の非天然微生物体。
【請求項３５】
それぞれがBDO経路酵素をコードする2つの外因性核酸を含む、請求項33記載の非天然微生物体。
【請求項３６】
それぞれがBDO経路酵素をコードする3つの外因性核酸を含む、請求項33記載の非天然微生物体。
【請求項３７】
それぞれがBDO経路酵素をコードする4つの外因性核酸を含む、請求項33記載の非天然微生物体。
【請求項３８】
前記4つの外因性核酸が、4-アミノ酪酸キナーゼ;4-アミノブチルアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化);4-アミノブタン-1-オールデヒドロゲナーゼ;及び4-アミノブタン-1-オールオキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は4-アミノブタン-1-オールトランスアミナーゼをコードする、請求項37記載の非天然微生物体。
【請求項３９】
前記BDO経路が、1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項38記載の非天然微生物体。
【請求項４０】
前記4つの外因性核酸が、4-アミノ酪酸キナーゼ;[(4-アミノブタノリル)オキシ]ホスホン酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は[(4-アミノブタノイル)オキシ]ホスホン酸トランスアミナーゼ;4-ヒドロキシブチリル-リン酸デヒドロゲナーゼ;及び4-ヒドロキシブチルアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化)をコードする、請求項37記載の非天然微生物体。
【請求項４１】
前記BDO経路が、1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項40記載の非天然微生物体。
【請求項４２】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項33記載の非天然微生物体。
【請求項４３】
実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項33記載の非天然微生物体。
【請求項４４】
BDOを生成するための方法であって、BDOを生成するための条件下で、且つ十分な時間にわたって、BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、4-アミノ酪酸キナーゼ、4-アミノブチルアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化)、4-アミノブタン-1-オールデヒドロゲナーゼ、4-アミノブタン-1-オールオキシドレダクターゼ(脱アミノ化)、4-アミノブタン-1-オールトランスアミナーゼ、[(4-アミノブタノイル)オキシ]ホスホン酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)、[(4-アミノブタノイル)オキシ]ホスホン酸トランスアミナーゼ、4-ヒドロキシブチリル-リン酸デヒドロゲナーゼ又は4-ヒドロキシブチルアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化)を含むBDO経路を有する非天然微生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項４５】
前記非天然微生物体が実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項44記載の方法。
【請求項４６】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項44記載の方法。
【請求項４７】
BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、アルファ-ケトグルタル酸5-キナーゼ、2,5-ジオキソペンタン酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化)、2,5-ジオキソペンタン酸レダクターゼ、アルファ-ケトグルタル酸CoAトランスフェラーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAヒドロラーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAリガーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAレダクターゼ、5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼ又は5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)を含むBDO経路を有する微生物体を含む非天然微生物体。
【請求項４８】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項47記載の非天然微生物体。
【請求項４９】
それぞれがBDO経路酵素をコードする2つの外因性核酸を含む、請求項47記載の非天然微生物体。
【請求項５０】
それぞれがBDO経路酵素をコードする3つの外因性核酸を含む、請求項47記載の非天然微生物体。
【請求項５１】
前記3つの外因性核酸が、アルファ-ケトグルタル酸CoAトランスフェラーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAヒドロラーゼ又はアルファ-ケトグルタリル-CoAリガーゼ;アルファ-ケトグルタリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成);及び5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼをコードする、請求項50記載の非天然微生物体。
【請求項５２】
前記BDO経路が、1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項51記載の非天然微生物体。
【請求項５３】
前記3つの外因性核酸が、アルファ-ケトグルタル酸CoAトランスフェラーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAヒドロラーゼ又はアルファ-ケトグルタリル-CoAリガーゼ;アルファ-ケトグルタリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成);及び5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)をコードする、請求項50記載の非天然微生物体。
【請求項５４】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項53記載の非天然微生物体。
【請求項５５】
それぞれがBDO経路酵素をコードする4つの外因性核酸を含む、請求項47記載の非天然微生物体。
【請求項５６】
前記4つの外因性核酸が、アルファ-ケトグルタル酸5-キナーゼ;2,5-ジオキソペンタン酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化);2,5-ジオキソペンタン酸レダクターゼ;及び5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼをコードする、請求項55記載の非天然微生物体。
【請求項５７】
前記BDO経路が、1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項56記載の非天然微生物体。
【請求項５８】
前記4つの外因性核酸が、アルファ-ケトグルタル酸5-キナーゼ;2,5-ジオキソペンタン酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化);2,5-ジオキソペンタン酸レダクターゼ;及び5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)をコードする、請求項55記載の非天然微生物体。
【請求項５９】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項58記載の非天然微生物体。
【請求項６０】
前記4つの外因性核酸が、アルファ-ケトグルタル酸CoAトランスフェラーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAヒドロラーゼ又はアルファ-ケトグルタリル-CoAリガーゼ;アルファ-ケトグルタリル-CoAレダクターゼ;5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ;及び5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼをコードする、請求項55記載の非天然微生物体。
【請求項６１】
前記BDO経路が、1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項60記載の非天然微生物体。
【請求項６２】
前記4つの外因性核酸が、アルファ-ケトグルタル酸CoAトランスフェラーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAヒドロラーゼ又はアルファ-ケトグルタリル-CoAリガーゼ;アルファ-ケトグルタリル-CoAレダクターゼ;5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ;及び5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)をコードする、請求項55記載の非天然微生物体。
【請求項６３】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項60記載の非天然微生物体。
【請求項６４】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項47記載の非天然微生物体。
【請求項６５】
実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項47記載の非天然微生物体。
【請求項６６】
BDOを生成するための方法であって、BDOを生成するための条件下で、且つ十分な時間にわたって、BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、アルファ-ケトグルタル酸5-キナーゼ、2,5-ジオキソペンタン酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化)、2,5-ジオキソペンタン酸レダクターゼ、アルファ-ケトグルタル酸CoAトランスフェラーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAヒドロラーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAリガーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAレダクターゼ、5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ、アルファ-ケトグルタリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼ又は5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)を含むBDO経路を有する非天然微生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項６７】
前記非天然微生物体が実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項66記載の方法。
【請求項６８】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項66記載の方法。
【請求項６９】
BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、グルタミン酸CoAトランスフェラーゼ、グルタミル-CoAヒドロラーゼ、グルタミル-CoAリガーゼ、グルタミン酸5-キナーゼ、グルタミン酸-5-セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化)、グルタミル-CoAレダクターゼ、グルタミン酸-5-セミアルデヒドデヒドレダクターゼ、グルタミル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)、2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸トランスアミナーゼ、5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼ、5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)を含むBDO経路を有する微生物体を含む非天然微生物体。
【請求項７０】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項69記載の非天然微生物体。
【請求項７１】
それぞれがBDO経路酵素をコードする2つの外因性核酸を含む、請求項69記載の非天然微生物体。
【請求項７２】
それぞれがBDO経路酵素をコードする3つの外因性核酸を含む、請求項69記載の非天然微生物体。
【請求項７３】
それぞれがBDO経路酵素をコードする4つの外因性核酸を含む、請求69記載の非天然微生物体。
【請求項７４】
前記4つの外因性核酸が、グルタミン酸CoAトランスフェラーゼ、グルタミル-CoAヒドロラーゼ又はグルタミル-CoAリガーゼ;グルタミル-CoAレダクターゼ(アルコール形成);2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸トランスアミナーゼ;及び5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼ又は5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)をコードする、請求項73記載の非天然微生物体。
【請求項７５】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項74記載の非天然微生物体。
【請求項７６】
前記4つの外因性核酸が、グルタミン酸5-キナーゼ;グルタミン酸-5-セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化);2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸トランスアミナーゼ;及び5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼ又は5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)をコードする、請求項73記載の非天然微生物体。
【請求項７７】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項76記載の非天然微生物体。
【請求項７８】
それぞれがBDO経路酵素をコードする5つの外因性核酸を含む、請求69記載の非天然微生物体。
【請求項７９】
前記5つの外因性核酸が、グルタミン酸CoAトランスフェラーゼ、グルタミル-CoAヒドロラーゼ又はグルタミル-CoAリガーゼ;グルタミル-CoAレダクターゼ;グルタミン酸-5-セミアルデヒドレダクターゼ;2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸トランスアミナーゼ;及び5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼ又は5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)をコードする、請求項78記載の非天然微生物体。
【請求項８０】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項79記載の非天然微生物体。
【請求項８１】
前記5つの外因性核酸が、グルタミン酸5-キナーゼ;グルタミン酸-5-セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化);グルタミン酸-5-セミアルデヒドレダクターゼ;2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)又は2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸トランスアミナーゼ;及び5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼ又は5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)をコードする、請求項78記載の非天然微生物体。
【請求項８２】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項81記載の非天然微生物体。
【請求項８３】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項69記載の非天然微生物体。
【請求項８４】
実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項69記載の非天然微生物体。
【請求項８５】
BDOを生成するための方法であって、BDOを生成するための条件下で、且つ十分な時間にわたって、BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、グルタミン酸CoAトランスフェラーゼ、グルタミル-CoAヒドロラーゼ、グルタミル-CoAリガーゼ、グルタミン酸5-キナーゼ、グルタミン酸-5-セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ(リン酸化)、グルタミル-CoAレダクターゼ、グルタミン酸-5-セミアルデヒドデヒドレダクターゼ、グルタミル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)、2-アミノ-5-ヒドロキシペンタン酸トランスアミナーゼ、5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デカルボキシラーゼ、5-ヒドロキシ-2-オキソペンタン酸デヒドロゲナーゼ(脱カルボキシル化)を含むBDO経路を有する非天然微生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項８６】
前記非天然微生物体が実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項85記載の方法。
【請求項８７】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項85記載の方法。
【請求項８８】
BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、ホモセリンデアミナーゼ、ホモセリンCoAトランスフェラーゼ、ホモセリン-CoAヒドロラーゼ、ホモセリン-CoAリガーゼ、ホモセリン-CoAデアミナーゼ、4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAトランスフェラーゼ、4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAヒドロラーゼ、4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAリガーゼ、4-ヒドロキシブタ-2-エン酸レダクターゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAトランスフェラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAヒドロラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAリガーゼ又は4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAレダクターゼを含むBDO経路を有する微生物体を含む非天然微生物体。
【請求項８９】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項88記載の非天然微生物体。
【請求項９０】
それぞれがBDO経路酵素をコードする2つの外因性核酸を含む、請求88記載の非天然微生物体。
【請求項９１】
それぞれがBDO経路酵素をコードする3つの外因性核酸を含む、請求88記載の非天然微生物体。
【請求項９２】
前記3つの外因性核酸が、ホモセリンデアミナーゼ;4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAトランスフェラーゼ、4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAヒドラーゼ、4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAリガーゼ;4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAレダクターゼをコードする請求項91記載の非天然微生物体。
【請求項９３】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項92記載の非天然微生物体。
【請求項９４】
前記3つの外因性核酸が、ホモセリンCoAトランスフェラーゼ、ホモセリン-CoAヒドロラーゼ又はホモセリンCoAリガーゼ;ホモセリン-CoAデアミナーゼ;及び4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAレダクターゼをコードする、請求項91記載の非天然微生物体。
【請求項９５】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項94記載の非天然微生物体。
【請求項９６】
前記3つの外因性核酸が、ホモセリンデアミナーゼ;4-ヒドロキシブタ-2-エン酸レダクターゼ;及び4-ヒドロキシブチリル-CoAトランスフェラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAヒドロラーゼ又は4-ヒドロキシブチリル-CoAリガーゼをコードする、請求項91記載の非天然微生物体。
【請求項９７】
前記BDO経路が、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項96記載の非天然微生物体。
【請求項９８】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項88記載の非天然微生物体。
【請求項９９】
実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項88記載の非天然微生物体。
【請求項１００】
BDOを生成するための方法であって、BDOを生成するための条件下で、且つ十分な時間にわたって、BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、ホモセリンデアミナーゼ、ホモセリンCoAトランスフェラーゼ、ホモセリン-CoAヒドロラーゼ、ホモセリン-CoAリガーゼ、ホモセリン-CoAデアミナーゼ、4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAトランスフェラーゼ、4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAヒドロラーゼ、4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAリガーゼ、4-ヒドロキシブタ-2-エン酸レダクターゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAトランスフェラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAヒドロラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAリガーゼ又は4-ヒドロキシブタ-2-エノイル-CoAレダクターゼを含むBDO経路を有する非天然微生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項１０１】
前記非天然微生物体が実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項100記載の方法。
【請求項１０２】
前記少なくとも1つの核酸が異種核酸である、請求項100記載の方法。
【請求項１０３】
BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、スクシニル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAヒドロラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAリガーゼ又は4-ヒドロキシブタナールデヒドロゲナーゼ(リン酸化)を含むBDO経路を有する微生物体を含む非天然微生物体。
【請求項１０４】
前記BDO経路が、スクシニル-CoAレダクターゼ、4-ヒドロキシ酪酸デヒドロゲナーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAトランスフェラーゼ、4-ヒドロキシ酪酸キナーゼ、ホスホトランス-4-ヒドロキシブチリラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項103記載の非天然微生物体。
【請求項１０５】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項104記載の非天然微生物体。
【請求項１０６】
実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項104記載の非天然微生物体。
【請求項１０７】
BDOを生成するための方法であって、BDOを生成するための条件下で、且つ十分な時間にわたって、BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、スクシニル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)、4-ヒドロキシブチリル-CoAヒドロラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAリガーゼ又は4-ヒドロキシブタナールデヒドロゲナーゼ(リン酸化)を含むBDO経路を有する非天然微生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項１０８】
前記BDO経路が、スクシニル-CoAレダクターゼ、4-ヒドロキシ酪酸デヒドロゲナーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAトランスフェラーゼ、4-ヒドロキシ酪酸キナーゼ、ホスホトランス-4-ヒドロキシブチリラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項107記載の方法。
【請求項１０９】
前記非天然微生物体が実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項107記載の方法。
【請求項１１０】
前記少なくとも1つの核酸が異種核酸である、請求項107記載の方法。
【請求項１１１】
BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、グルタミン酸デヒドロゲナーゼ、4-アミノ酪酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)、4-アミノ酪酸トランスアミナーゼ、グルタミン酸デカルボキシラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAヒドロラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAリガーゼ又は4-ヒドロキシブタナールデヒドロゲナーゼ(リン酸化)を含むBDO経路を有する微生物体を含む非天然微生物体。
【請求項１１２】
前記BDO経路が、アルファ-ケトグルタル酸デカルボキシラーゼ、4-ヒドロキシ酪酸デヒドロゲナーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAトランスフェラーゼ、4-ヒドロキシ酪酸キナーゼ、ホスホトランス-4-ヒドロキシブチラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項111記載の非天然微生物体。
【請求項１１３】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項111記載の非天然微生物体。
【請求項１１４】
実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項111記載の非天然微生物体。
【請求項１１５】
BDOを生成するための方法であって、BDOを生成するための条件下で、且つ十分な時間にわたって、BDOを生成するための十分な量で発現されるBDO経路酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を含み、グルタミン酸デヒドロゲナーゼ、4-アミノ酪酸オキシドレダクターゼ(脱アミノ化)、4-アミノ酪酸トランスアミナーゼ、グルタミン酸デカルボキシラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAヒドロラーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAリガーゼ又は4-ヒドロキシブタナールデヒドロゲナーゼ(リン酸化)を含むBDO経路を有する非天然微生物体を培養することを含む、前記方法。
【請求項１１６】
前記BDO経路が、アルファ-ケトグルタル酸デカルボキシラーゼ、4-ヒドロキシ酪酸デヒドロゲナーゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAトランスフェラーゼ、4-ヒドロキシ酪酸キナーゼ、ホスホトランス-4-ヒドロキシブチラーゼ、4-ヒドロシブチリル-CoAレダクターゼ、4-ヒドロキシブチリル-CoAレダクターゼ(アルコール形成)又は1,4-ブタンジオールデヒドロゲナーゼをさらに含む、請求項115記載の方法。
【請求項１１７】
前記非天然微生物体が実質的に嫌気性の培地に存在する、請求項115記載の方法。
【請求項１１８】
前記少なくとも1つの外因性核酸が異種核酸である、請求項115記載の方法。
【図１】
【図２】
【図３ａ−ｃ】
【図４】
【図５】
【図６（ａ）】
【図６（ｂ）】
【図６（ｃ）】
【図６（ｄ）】
【図６（ｅ）】
【図６（ｆ）】
【図６（ｇ）】
【図６（ｈ）】
【図７】
【図８Ａ−Ｂ】
【図９Ａ】
【図９Ｂ−Ｃ】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図２】
【図３ａ−ｃ】
【図４】
【図５】
【図６（ａ）】
【図６（ｂ）】
【図６（ｃ）】
【図６（ｄ）】
【図６（ｅ）】
【図６（ｆ）】
【図６（ｇ）】
【図６（ｈ）】
【図７】
【図８Ａ−Ｂ】
【図９Ａ】
【図９Ｂ−Ｃ】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【公表番号】特表２０１２−５０１６７８（Ｐ２０１２−５０１６７８Ａ）
【公表日】平成２４年１月２６日（２０１２．１．２６）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１１−５２６９４９（Ｐ２０１１−５２６９４９）
【出願日】平成２１年９月９日（２００９．９．９）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００９／０５６４１５
【国際公開番号】ＷＯ２０１０／０３０７１１
【国際公開日】平成２２年３月１８日（２０１０．３．１８）
【出願人】（５１１０６２８１８）ゲノマチカ， インク． (10)
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２４年１月２６日（２０１２．１．２６）
【国際特許分類】
【出願日】平成２１年９月９日（２００９．９．９）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００９／０５６４１５
【国際公開番号】ＷＯ２０１０／０３０７１１
【国際公開日】平成２２年３月１８日（２０１０．３．１８）
【出願人】（５１１０６２８１８）ゲノマチカ， インク． (10)
【Ｆターム（参考）】
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