【課題】ＨＣＶ感染の治療を最適化、および、フラビウイルス科ウイルス感染を治療するための２’−分枝ヌクレオシド、特に２’−分枝ピリミジンヌクレオシドの最適な投与の提供。
【解決手段】治療が必要なヒトに、フラビウイルス科ウイルスにおけるＲＮＡポリメラーゼ領域のドメインＢの高保存コンセンサス配列ＸＲＸＳＧＸＸＸＴにおいてセリンから別のアミノ酸への変化をもたらすヌクレオチドの突然変異以外の位置で、突然変異を直接または間接的に誘発する１つ以上の薬物および／またはこうした突然変異に関係する１つ以上の薬物と併用または交代で、２’−分枝ヌクレオシドまたはその医薬適合性の塩、エステルもしくはプロドラッグを投与することを含む、フラビウイルス科ウイルス感染を治療するための方法。フラビウイルス科ウイルスの突然変異株の検出方法およびこの治療方法も包含する。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
Ｃ型肝炎ウイルスゲノムの第８４４３位ヌクレオチドにおけるＧからＣへの突然変異の存在を検出することを含む、Ｃ型肝炎ウイルスに感染した宿主におけるウイルス耐性を特定する方法。
【請求項２】
ウイルス耐性が２’−分枝ヌクレオシドに対するものである、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
ウイルス耐性が２’−Ｃ−メチル−分枝ヌクレオシドに対するものである、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
ウイルス耐性の特定が、宿主の血液をアッセイして野生型から突然変異Ｃ型肝炎ウイルスへの血清変換を試験することを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
ウイルス耐性の特定が、宿主からのウイルス培養サンプルからのウイルスプラーク成長の表現型分析を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
表現型分析が、
（ｉ）宿主からウイルス培養サンプルを得ること；
（ｉｉ）サンプルを培養して、前記サンプルと野生型ウイルスの間でプラーク成長を比較すること；および
（ｉｉｉ）前記サンプルのプラーク成長が、野生型ウイルスのプラーク成長よりも小さいかどうかを判定すること、
を含む、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
ウイルス耐性の特定が、ウイルスの複製適性の判定を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
ウイルスの複製適性の判定が、
（ｉ）宿主からウイルス培養サンプルを得ること；
（ｉｉ）サンプルウイルスの複製適性を判定すること；および
（ｉｉｉ）サンプルウイルスの複製適性が野生型の複製適性よりも低いかどうかを判定すること、
を含む、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
ウイルス耐性の特定が、
（ｉ）Ｃ型肝炎ウイルスの核酸配列を含むサンプルを、Ｃ型肝炎ウイルスのＲＮＡポリメラーゼ領域のドメインＢの高保存コンセンサス配列ＸＲＸＳＧＸＸＸＴ内においてセリンをコードするコドンに相補的な配列を有する検出可能なオリゴヌクレオチドプローブと接触させること；
（ｉｉ）前記プローブを前記配列にハイブリダイズさせること；および
（ｉｉｉ）前記プローブの前記配列へのハイブリダイゼーションを検出すること、
を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
段階（ｉ）のオリゴヌクレオチドプローブが、Ｃ型肝炎ウイルスのＲＮＡポリメラーゼ領域の第８４４３位ヌクレオチドでシチジンを特定するよう設計されている、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
薬物耐性のＣ型肝炎ウイルスを特定するアレイであって、Ｃ型肝炎ウイルスのＲＮＡポリメラーゼ領域のドメインＢの高保存コンセンサス配列ＸＲＸＳＧＸＸＸＴ内においてセリンをコードするコドンに相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドプローブを含む、アレイ。
【請求項１２】
オリゴヌクレオチドプローブが、Ｃ型肝炎ウイルスのＲＮＡポリメラーゼ領域の第８４４３位ヌクレオチドでシチジンを特定するよう設計されている、請求項１１に記載のアレイ。
【請求項１３】
Ｃ型肝炎ウイルスに感染した宿主におけるウイルス耐性を特定するキットであって、
（ｉ）Ｃ型肝炎ウイルスのＲＮＡポリメラーゼ領域のドメインＢの高保存コンセンサス配列ＸＲＸＳＧＸＸＸＴ内においてセリンをコードするコドンに相補的なオリゴヌクレオチド；
（ｉｉ）前記オリゴヌクレオチドの３’末端からの核酸の重合に必要とされる材料；および
（ｉｉｉ）オリゴヌクレオチドプライマー伸長産物の存在を判定する手段、
を含むキット。
【請求項１４】
オリゴヌクレオチドプローブが、Ｃ型肝炎ウイルスのＲＮＡポリメラーゼ領域の第８４４３位ヌクレオチドでシチジンを特定するよう設計されている、請求項１３に記載のキット。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【図６】

【図７】

【図８】

【図９】

【図１０】

【図１１】

【公開番号】特開２０１１−２４５７８（Ｐ２０１１−２４５７８Ａ）
【公開日】平成２３年２月１０日（２０１１．２．１０）
【国際特許分類】
【外国語出願】
【出願番号】特願２０１０−１６７４６５（Ｐ２０１０−１６７４６５）
【出願日】平成２２年７月２６日（２０１０．７．２６）
【分割の表示】特願２００４−５５３８２３（Ｐ２００４−５５３８２３）の分割
【原出願日】平成１５年１１月１７日（２００３．１１．１７）
【出願人】（５０２４２３８０８）イデニクス（ケイマン）リミテツド (16)
【出願人】（５０５１７７１５１）ウニベルシタ・デツリ・ストウデイ・デイ・カリアリ (2)
【Ｆターム（参考）】