セルロース物質分解のための組成物
本発明は、セルロース含有物質を分解又は変換するためのセルロース分解性タンパク質組成物、並びに当該組成物を作製及び使用する方法に関する。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
繊維状真菌宿主細胞であって、（ａ）セルロース分解性増強活性を有する天然型又は異種接合型ポリペプチドをコードする第一ポリヌクレオチド；（ｂ）天然型又は異種接合型ベータ−グルコシダーゼをコードする第二ポリヌクレオチド；及び（ｃ）天然型又は異種接合型のセルロース分解性酵素で、以下のトリコデルマ・リーゼイ（Trichoderma reesei）セロビオヒドロラーゼＩ（ＣＥＬ７Ａ）、トリコデルマ・リーゼイセロビオヒドロラーゼII（ＣＥＬ６Ａ)、及びトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＩ（ＣＥＬ７Ｂ）並びにその相同分子種又は変異体からなる群から選択される１以上（複数）のセルロース分解性酵素をコードする、１以上（複数）の第三ポリヌクレオチド、を含んでなる宿主細胞。
【請求項２】
前記セルロース分解性増強活性を有するポリペプチドが以下の、
（ａ）［ＩＬＭＶ］−Ｐ−Ｘ（４,５）−Ｇ−Ｘ−Ｙ−［ＩＬＭＶ］−Ｘ−Ｒ−Ｘ−［ＥＱ］−Ｘ（４）−［ＨＮＱ］及び［ＦＷ］−［ＴＦ］−Ｋ−［ＡＩＶ］（式中、Ｘが任意のアミノ酸、Ｘ（４,５）が４又は５の隣接位置での任意のアミノ酸、及びＸ（４）が４の隣接位置での任意のアミノ酸である）を含んでなる、セルロース分解性増強活性を有するポリペプチド、及び
（ｂ）［ＩＬＭＶ］−Ｐ−ｘ（４,５）−Ｇ−ｘ−Ｙ−［ＩＬＭＶ］−ｘ−Ｒ−ｘ−［ＥＱ］−ｘ（３）−Ａ−［ＨＮＱ］（式中、ｘが任意のアミノ酸、ｘ（４,５）が４又は５の隣接位置での任意のアミノ酸、及びＸ（３）が３の隣接位置での任意のアミノ酸である）を含んでなる、セルロース分解性増強活性を有するポリペプチドからなる群から選択され、
ここで、［ＩＬＭＶ］−Ｐ−Ｘ（４,５）−Ｇ−Ｘ−Ｙ−［ＩＬＭＶ］−Ｘ−Ｒ−Ｘ−［ＥＱ］−Ｘ（４）−［ＨＮＱ］及び［ＦＷ］−［ＴＦ］−Ｋ−［ＡＩＶ］を含んでなるセルロース分解性増強活性を有するポリペプチドは、
Ｈ−Ｘ（１,２）−Ｇ−Ｐ−Ｘ（３）−［ＹＷ］−［ＡＩＬＭＶ］、
［ＥＱ］−Ｘ−Ｙ−Ｘ（２）−Ｃ−Ｘ−［ＥＨＱＮ］−［ＦＩＬＶ］−Ｘ−［ＩＬＶ］、又は
Ｈ−Ｘ（１,２）−Ｇ−Ｐ−Ｘ（３）−［ＹＷ］−［ＡＩＬＭＶ］及び［ＥＱ］−Ｘ−Ｙ−Ｘ（２）−Ｃ−Ｘ−［ＥＨＱＮ］−［ＦＩＬＶ］−Ｘ−［ＩＬＶ］（式中、Ｘは任意のアミノ酸、Ｘ（１,２）は１又は２の隣接位置での任意のアミノ酸、Ｘ（３）は３の隣接位置での任意のアミノ酸、及びＸ（２）は２の隣接位置での任意のアミノ酸である）を任意にさらに含んでなる、請求項１に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項３】
前記セルロース分解性増強活性を有するポリペプチドが以下の、
（ａ）配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、又は配列番号１０、配列番号１２、又は配列番号１４の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（i）配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、もしくは配列番号１３の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号１、配列番号３、配列番号５、もしくは配列番号１１の成熟ポリペプチドコード配列に含有されるｃＤＮＡ配列、又は配列番号７、配列番号９、もしくは配列番号１３の成熟ポリペプチドコード配列を含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズする、ポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、又は配列番号１３の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するヌクレオチド配列を含んでなるポリペプチドヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｄ）配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、又は配列番号１０、配列番号１２、又は配列番号１４の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の、置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、及び
（ｅ）配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、又は配列番号１０、配列番号１２、又は配列番号１４の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、セルロース分解性増強活性を有するポリペプチド、又はセルロース分解性増強活性を有するその断片、
からなる群から選択される、請求項１に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項４】
ベータ−グルコシダーゼがベータ−グリコシダーゼ融合タンパク質である、請求項１に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項５】
ベータ−グリコシダーゼ融合タンパク質が、（ａ）シグナルペプチドを含んでなる第一アミノ酸配列、（ｂ）少なくともエンドグルカナーゼの触媒ドメインを含んでなる第二アミノ酸配列、及び（ｃ）少なくともベータ−グルコシダーゼの触媒ドメインを含んでなる第三アミノ酸配列を含んでなり、ここで、第一アミノ酸配列のＣ末端は第二アミノ酸配列のＮ末端にインフレームで結合し、第二アミノ酸配列のＣ末端は第三アミノ酸配列のＮ末端にインフレームで結合する、請求項４に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項６】
ベータグルコシダーゼ融合タンパク質が、配列番号１０３又は配列番号１０５を含んでなるか、前記配列からなる、請求項５に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項７】
トリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼＩ（ＣＥＬ７Ａ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号５２の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号５１の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号５１の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、もしくはそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号５１の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号５２の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項１に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項８】
トリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼＩ（ＣＥＬ７Ａ）が配列番号５２の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項１に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項９】
トリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼII（ＣＥＬ６Ａ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号５４の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号５３の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号５３の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、もしくはそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号５３の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号５４の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項１に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項１０】
トリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼII（ＣＥＬ６Ａ）が配列番号５４の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項１に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項１１】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼI（ＣＥＬ７Ｂ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号５６の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号５５の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号５５の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、もしくはそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号５５の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号５６の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項１に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項１２】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼI（ＣＥＬ７Ｂ）が、配列番号５６の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項１に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項１３】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼII（ＣＥＬ５Ａ）、トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼIII（ＣＥＬ１２Ａ）、及びトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＶ（ＣＥＬ４５Ａ）、並びにこれらの相同分子種又は変異体からなる群から選択されるセルロース分解性酵素をコードする、１以上（複数）の第四ポリヌクレオチドをさらに含んでなる、請求項１〜１２のいずれか１項に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項１４】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼII（ＣＥＬ５Ａ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号５８の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号５７の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号５７の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、もしくはそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号５７の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号５８の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項１３に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項１５】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼII（ＣＥＬ５Ａ）が、配列番号５８の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項１３に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項１６】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼIII（ＣＥＬ１２Ａ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号６０の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号５９の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号５９の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、もしくはそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号５９の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号６０の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項１３に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項１７】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼIII（ＣＥＬ１２Ａ）が、配列番号６０の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項１３に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項１８】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＶ（ＣＥＬ４５Ａ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号６２の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号６１の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号６１の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、もしくはそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズする、ポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号６１の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号６２の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項１３に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項１９】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＶ（ＣＥＬ４５Ａ）が、配列番号６１の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項１３に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項２０】
配列番号８のセルロース分解性増強活性を有するポリペプチドの成熟ポリペプチド、配列番号１０６のベータ−グルコシダーゼ融合タンパク質、配列番号５２のトリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼＩ（ＣＥＬ７Ａ）の成熟ポリペプチド、配列番号５４のトリコデルマ・リーゼイセロビオヒドロラーゼII（ＣＥＬ６Ａ) の成熟ポリペプチド、及び配列番号５６のトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＩ（ＣＥＬ７Ｂ）の成熟ポリペプチドを含んでなる、セルロース分解性タンパク質組成物を作製する、請求項１に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項２１】
配列番号５８のトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼII（ＣＥＬ５Ａ）、配列番号６２のトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＶ（ＣＥＬ４５Ａ）、及び配列番号６０のトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼIII（ＣＥＬ１２Ａ）からなる群から選択される、１以上（複数）の酵素をさらに作製する、請求項１〜２０のいずれか１項に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項２２】
配列番号６４のチエラビア・テレストリス（Thielavia terrestris）・セロビオヒドロラーゼの成熟ポリペプチドをさらに産生する、請求項１〜２１のいずれか１項に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項２３】
セルロース分解性タンパク質組成物を作製する方法であって、（ａ）請求項１〜２２のいずれか１項に記載の宿主細胞を、ポリペプチドの作製に適する条件下で培養すること、及び（ｂ）ポリペプチドを回収することを含んでなる方法。
【請求項２４】
請求項２３の方法により得られるセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項２５】
セルロース分解性タンパク質組成物であって、（ａ）セルロース分解性増強活性を有するポリペプチド、（ｂ）ベータ−グルコシダーゼ、及び（ｃ）トリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼＩ（ＣＥＬ７Ａ）、トリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼII（ＣＥＬ６Ａ)、及びトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＩ（ＣＥＬ７Ｂ）、並びにそれらの相同分子種又は変異体からなる群から選択される１以上（複数）のセルロース分解性酵素、を含んでなる組成物。
【請求項２６】
セルロース分解性増強活性を有するポリペプチドが、以下の、
（ａ）［ＩＬＭＶ］−Ｐ−Ｘ（４,５）−Ｇ−Ｘ−Ｙ−［ＩＬＭＶ］−Ｘ−Ｒ−Ｘ−［ＥＱ］−Ｘ（４）−［ＨＮＱ］及び［ＦＷ］−［ＴＦ］−Ｋ−［ＡＩＶ］（式中、Ｘが任意のアミノ酸、Ｘ（４,５）が４又は５の隣接位置での任意のアミノ酸、及びＸ（４）が４の隣接位置での任意のアミノ酸である）を含んでなる、セルロース分解性増強活性を有するポリペプチド、及び
（ｂ）［ＩＬＭＶ］−Ｐ−ｘ（４,５）−Ｇ−ｘ−Ｙ−［ＩＬＭＶ］−ｘ−Ｒ−ｘ−［ＥＱ］−ｘ（３）−Ａ−［ＨＮＱ］（式中、ｘが任意のアミノ酸、ｘ（４,５）が４又は５の隣接位置での任意のアミノ酸、及びＸ（３）が３の隣接位置での任意のアミノ酸である）を含んでなる、セルロース分解性増強活性を有するポリペプチドからなる群から選択され、
ここで、［ＩＬＭＶ］−Ｐ−Ｘ（４,５）−Ｇ−Ｘ−Ｙ−［ＩＬＭＶ］−Ｘ−Ｒ−Ｘ−［ＥＱ］−Ｘ（４）−［ＨＮＱ］及び［ＦＷ］−［ＴＦ］−Ｋ−［ＡＩＶ］を含んでなるセルロース分解性増強活性を有するポリペプチドは、
Ｈ−Ｘ（１,２）−Ｇ−Ｐ−Ｘ（３）−［ＹＷ］−［ＡＩＬＭＶ］、
［ＥＱ］−Ｘ−Ｙ−Ｘ（２）−Ｃ−Ｘ−［ＥＨＱＮ］−［ＦＩＬＶ］−Ｘ−［ＩＬＶ］、又は
Ｈ−Ｘ（１,２）−Ｇ−Ｐ−Ｘ（３）−［ＹＷ］−［ＡＩＬＭＶ］及び［ＥＱ］−Ｘ−Ｙ−Ｘ（２）−Ｃ−Ｘ−［ＥＨＱＮ］−［ＦＩＬＶ］−Ｘ−［ＩＬＶ］（式中、Ｘは任意のアミノ酸、Ｘ（１,２）は１又は２の隣接位置での任意のアミノ酸、Ｘ（３）は３の隣接位置での任意のアミノ酸、及びＸ（２）は２の隣接位置での任意のアミノ酸である）を任意にさらに含んでなる、請求項２５に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項２７】
セルロース分解性増強活性を有するポリペプチドが、以下の、
（ａ）配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、又は配列番号１０、配列番号１２、又は配列番号１４の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（i）配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、もしくは配列番号１３の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号１、配列番号３、配列番号５、もしくは配列番号１１の成熟ポリペプチドコード配列に含有されるｃＤＮＡ配列、又は配列番号７、配列番号９、もしくは配列番号１３の成熟ポリペプチドコード配列を含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、又は配列番号１３の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するヌクレオチド配列を含んでなるポリペプチドヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｄ）配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、又は配列番号１０、配列番号１２、又は配列番号１４の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の、置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、及び
（ｅ）配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、又は配列番号１０、配列番号１２、又は配列番号１４の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、セルロース分解性増強活性を有するポリペプチド、又はセルロース分解性増強活性を有するその断片、
からなる群から選択される、請求項２５に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項２８】
ベータ−グルコシダーゼがベータ−グルコシダーゼ融合タンパク質である、請求項２５に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項２９】
ベータ−グリコシダーゼ融合タンパク質が、（ａ）シグナルペプチドを含んでなる第一アミノ酸配列、（ｂ）少なくともエンドグルカナーゼの触媒ドメインを含んでなる第二アミノ酸配列、及び（ｃ）少なくともベータ−グルコシダーゼの触媒ドメインを含んでなる第三アミノ酸配列を含んでなり、ここで、第一アミノ酸配列のＣ末端は第二アミノ酸配列のＮ末端にインフレームで結合し、第二アミノ酸配列のＣ末端は第三アミノ酸配列のＮ末端にインフレームで結合する、請求項２８に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項３０】
ベータ−グルコシダーゼ融合タンパク質が、配列番号１０３又は配列番号１０５を含んでなるか、前記配列からなる、請求項２９に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項３１】
トリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼＩ（ＣＥＬ７Ａ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号５２の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号５１の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号５１の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、もしくはそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号５１の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号５２の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項２５に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項３２】
トリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼＩ（ＣＥＬ７Ａ）が配列番号５２の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項２５に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項３３】
トリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼII（ＣＥＬ６Ａ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号５４の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号５３の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号５３の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、もしくはそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号５３の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号５４の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項２５に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項３４】
トリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼII（ＣＥＬ６Ａ）が配列番号５４の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項２５に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項３５】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼI（ＣＥＬ７Ｂ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号５６の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号５５の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号５５の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、もしくはそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号５５の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号５６の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項２５に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項３６】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼI（ＣＥＬ７Ｂ）が、配列番号５６の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項２５に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項３７】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼII（ＣＥＬ５Ａ）、トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼIII（ＣＥＬ１２Ａ）、及びトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＶ（ＣＥＬ４５Ａ）、並びにこれらの相同分子種又は変異体からなる群から選択されるセルロース分解性酵素をコードする、１以上（複数）の第四ポリヌクレオチドをさらに含んでなる、請求項２５〜３６のいずれか１項に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項３８】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼII（ＣＥＬ５Ａ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号５８の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号５７の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号５７の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、又はそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号５７の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号５８の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項３７に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項３９】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼII（ＣＥＬ５Ａ）が、配列番号５８の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項３７に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項４０】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼIII（ＣＥＬ１２Ａ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号６０の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号５９の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号５９の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、又はそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号５９の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号６０の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項３７に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項４１】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼIII（ＣＥＬ１２Ａ）が、配列番号６０の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項３７に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項４２】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＶ（ＣＥＬ４５Ａ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号６２の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号６１の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号６１の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、又はそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号６１の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号６２の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項３７に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項４３】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＶ（ＣＥＬ４５Ａ）が、配列番号６１の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項３７に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項４４】
配列番号８のセルロース分解性増強活性を有するポリペプチドの成熟ポリペプチド、配列番号１０６のベータ−グルコシダーゼ融合タンパク質、配列番号５２のトリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼＩ（ＣＥＬ７Ａ）の成熟ポリペプチド、配列番号５４のトリコデルマ・リーゼイセロビオヒドロラーゼII（ＣＥＬ６Ａ)の成熟ポリペプチド、及び配列番号５６のトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＩ（ＣＥＬ７Ｂ）の成熟ポリペプチドを含んでなる、請求項２５に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項４５】
配列番号５８のトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼII（ＣＥＬ５Ａ）、配列番号６２のトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＶ（ＣＥＬ４５Ａ）、及び配列番号６０のトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼIII（ＣＥＬ１２Ａ）からなる群から選択される、１以上（複数）の酵素をさらに含んでなる、請求項２５〜４４のいずれか１項に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項４６】
配列番号６４のチエラビア・テレストリス・セロビオヒドロラーゼの成熟ポリペプチドをさらに含んでなる、請求項２５〜４５のいずれか１項に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項４７】
セルロール含有物質を分解又は変換する方法であって、請求項２５〜４６のいずれか１項に記載のセルロース分解性タンパク質組成物の有効量でセルロース含有物質を処理することを含んでなる方法。
【請求項４８】
ヘミセルラーゼ、エステラーゼ、プロテアーゼ、ラッカーゼ、ペルオキシダーゼ、又はこれらの混合物からなる群から選択される１以上（複数）の酵素の有効量で、セルロース含有物質を処理することをさらに含んでなる、請求項４７に記載の方法。
【請求項４９】
分解したセルロース含有物質を回収することを含んでなる、請求項４７又は４８に記載の方法。
【請求項５０】
発酵物質を作製する方法であって、（ａ）請求項２５〜４６のいずれか１項に記載のセルロース分解性タンパク質の有効量で、セルロース含有物質を糖化すること、（ｂ）発酵物質を作製する１以上（複数）の発酵微生物で、ステップ（ａ）の糖化セルロース含有物質を発酵させること、及び（ｃ）当該発酵からの発酵物質を回収すること、を含んでなる方法。
【請求項５１】
ヘミセルラーゼ、エステラーゼ、プロテアーゼ、ラッカーゼ、ペルオキシダーゼ、又はこれらの混合物からなる群から選択される１以上（複数）の酵素の有効量でセルロース含有物質を処理することをさらに含んでなる、請求項５０に記載の方法。
【請求項１】
繊維状真菌宿主細胞であって、（ａ）セルロース分解性増強活性を有する天然型又は異種接合型ポリペプチドをコードする第一ポリヌクレオチド；（ｂ）天然型又は異種接合型ベータ−グルコシダーゼをコードする第二ポリヌクレオチド；及び（ｃ）天然型又は異種接合型のセルロース分解性酵素で、以下のトリコデルマ・リーゼイ（Trichoderma reesei）セロビオヒドロラーゼＩ（ＣＥＬ７Ａ）、トリコデルマ・リーゼイセロビオヒドロラーゼII（ＣＥＬ６Ａ)、及びトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＩ（ＣＥＬ７Ｂ）並びにその相同分子種又は変異体からなる群から選択される１以上（複数）のセルロース分解性酵素をコードする、１以上（複数）の第三ポリヌクレオチド、を含んでなる宿主細胞。
【請求項２】
前記セルロース分解性増強活性を有するポリペプチドが以下の、
（ａ）［ＩＬＭＶ］−Ｐ−Ｘ（４,５）−Ｇ−Ｘ−Ｙ−［ＩＬＭＶ］−Ｘ−Ｒ−Ｘ−［ＥＱ］−Ｘ（４）−［ＨＮＱ］及び［ＦＷ］−［ＴＦ］−Ｋ−［ＡＩＶ］（式中、Ｘが任意のアミノ酸、Ｘ（４,５）が４又は５の隣接位置での任意のアミノ酸、及びＸ（４）が４の隣接位置での任意のアミノ酸である）を含んでなる、セルロース分解性増強活性を有するポリペプチド、及び
（ｂ）［ＩＬＭＶ］−Ｐ−ｘ（４,５）−Ｇ−ｘ−Ｙ−［ＩＬＭＶ］−ｘ−Ｒ−ｘ−［ＥＱ］−ｘ（３）−Ａ−［ＨＮＱ］（式中、ｘが任意のアミノ酸、ｘ（４,５）が４又は５の隣接位置での任意のアミノ酸、及びＸ（３）が３の隣接位置での任意のアミノ酸である）を含んでなる、セルロース分解性増強活性を有するポリペプチドからなる群から選択され、
ここで、［ＩＬＭＶ］−Ｐ−Ｘ（４,５）−Ｇ−Ｘ−Ｙ−［ＩＬＭＶ］−Ｘ−Ｒ−Ｘ−［ＥＱ］−Ｘ（４）−［ＨＮＱ］及び［ＦＷ］−［ＴＦ］−Ｋ−［ＡＩＶ］を含んでなるセルロース分解性増強活性を有するポリペプチドは、
Ｈ−Ｘ（１,２）−Ｇ−Ｐ−Ｘ（３）−［ＹＷ］−［ＡＩＬＭＶ］、
［ＥＱ］−Ｘ−Ｙ−Ｘ（２）−Ｃ−Ｘ−［ＥＨＱＮ］−［ＦＩＬＶ］−Ｘ−［ＩＬＶ］、又は
Ｈ−Ｘ（１,２）−Ｇ−Ｐ−Ｘ（３）−［ＹＷ］−［ＡＩＬＭＶ］及び［ＥＱ］−Ｘ−Ｙ−Ｘ（２）−Ｃ−Ｘ−［ＥＨＱＮ］−［ＦＩＬＶ］−Ｘ−［ＩＬＶ］（式中、Ｘは任意のアミノ酸、Ｘ（１,２）は１又は２の隣接位置での任意のアミノ酸、Ｘ（３）は３の隣接位置での任意のアミノ酸、及びＸ（２）は２の隣接位置での任意のアミノ酸である）を任意にさらに含んでなる、請求項１に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項３】
前記セルロース分解性増強活性を有するポリペプチドが以下の、
（ａ）配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、又は配列番号１０、配列番号１２、又は配列番号１４の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（i）配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、もしくは配列番号１３の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号１、配列番号３、配列番号５、もしくは配列番号１１の成熟ポリペプチドコード配列に含有されるｃＤＮＡ配列、又は配列番号７、配列番号９、もしくは配列番号１３の成熟ポリペプチドコード配列を含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズする、ポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、又は配列番号１３の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するヌクレオチド配列を含んでなるポリペプチドヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｄ）配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、又は配列番号１０、配列番号１２、又は配列番号１４の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の、置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、及び
（ｅ）配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、又は配列番号１０、配列番号１２、又は配列番号１４の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、セルロース分解性増強活性を有するポリペプチド、又はセルロース分解性増強活性を有するその断片、
からなる群から選択される、請求項１に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項４】
ベータ−グルコシダーゼがベータ−グリコシダーゼ融合タンパク質である、請求項１に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項５】
ベータ−グリコシダーゼ融合タンパク質が、（ａ）シグナルペプチドを含んでなる第一アミノ酸配列、（ｂ）少なくともエンドグルカナーゼの触媒ドメインを含んでなる第二アミノ酸配列、及び（ｃ）少なくともベータ−グルコシダーゼの触媒ドメインを含んでなる第三アミノ酸配列を含んでなり、ここで、第一アミノ酸配列のＣ末端は第二アミノ酸配列のＮ末端にインフレームで結合し、第二アミノ酸配列のＣ末端は第三アミノ酸配列のＮ末端にインフレームで結合する、請求項４に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項６】
ベータグルコシダーゼ融合タンパク質が、配列番号１０３又は配列番号１０５を含んでなるか、前記配列からなる、請求項５に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項７】
トリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼＩ（ＣＥＬ７Ａ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号５２の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号５１の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号５１の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、もしくはそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号５１の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号５２の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項１に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項８】
トリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼＩ（ＣＥＬ７Ａ）が配列番号５２の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項１に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項９】
トリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼII（ＣＥＬ６Ａ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号５４の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号５３の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号５３の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、もしくはそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号５３の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号５４の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項１に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項１０】
トリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼII（ＣＥＬ６Ａ）が配列番号５４の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項１に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項１１】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼI（ＣＥＬ７Ｂ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号５６の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号５５の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号５５の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、もしくはそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号５５の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号５６の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項１に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項１２】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼI（ＣＥＬ７Ｂ）が、配列番号５６の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項１に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項１３】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼII（ＣＥＬ５Ａ）、トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼIII（ＣＥＬ１２Ａ）、及びトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＶ（ＣＥＬ４５Ａ）、並びにこれらの相同分子種又は変異体からなる群から選択されるセルロース分解性酵素をコードする、１以上（複数）の第四ポリヌクレオチドをさらに含んでなる、請求項１〜１２のいずれか１項に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項１４】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼII（ＣＥＬ５Ａ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号５８の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号５７の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号５７の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、もしくはそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号５７の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号５８の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項１３に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項１５】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼII（ＣＥＬ５Ａ）が、配列番号５８の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項１３に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項１６】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼIII（ＣＥＬ１２Ａ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号６０の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号５９の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号５９の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、もしくはそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号５９の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号６０の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項１３に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項１７】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼIII（ＣＥＬ１２Ａ）が、配列番号６０の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項１３に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項１８】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＶ（ＣＥＬ４５Ａ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号６２の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号６１の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号６１の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、もしくはそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズする、ポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号６１の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号６２の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項１３に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項１９】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＶ（ＣＥＬ４５Ａ）が、配列番号６１の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項１３に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項２０】
配列番号８のセルロース分解性増強活性を有するポリペプチドの成熟ポリペプチド、配列番号１０６のベータ−グルコシダーゼ融合タンパク質、配列番号５２のトリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼＩ（ＣＥＬ７Ａ）の成熟ポリペプチド、配列番号５４のトリコデルマ・リーゼイセロビオヒドロラーゼII（ＣＥＬ６Ａ) の成熟ポリペプチド、及び配列番号５６のトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＩ（ＣＥＬ７Ｂ）の成熟ポリペプチドを含んでなる、セルロース分解性タンパク質組成物を作製する、請求項１に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項２１】
配列番号５８のトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼII（ＣＥＬ５Ａ）、配列番号６２のトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＶ（ＣＥＬ４５Ａ）、及び配列番号６０のトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼIII（ＣＥＬ１２Ａ）からなる群から選択される、１以上（複数）の酵素をさらに作製する、請求項１〜２０のいずれか１項に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項２２】
配列番号６４のチエラビア・テレストリス（Thielavia terrestris）・セロビオヒドロラーゼの成熟ポリペプチドをさらに産生する、請求項１〜２１のいずれか１項に記載の繊維状真菌宿主細胞。
【請求項２３】
セルロース分解性タンパク質組成物を作製する方法であって、（ａ）請求項１〜２２のいずれか１項に記載の宿主細胞を、ポリペプチドの作製に適する条件下で培養すること、及び（ｂ）ポリペプチドを回収することを含んでなる方法。
【請求項２４】
請求項２３の方法により得られるセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項２５】
セルロース分解性タンパク質組成物であって、（ａ）セルロース分解性増強活性を有するポリペプチド、（ｂ）ベータ−グルコシダーゼ、及び（ｃ）トリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼＩ（ＣＥＬ７Ａ）、トリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼII（ＣＥＬ６Ａ)、及びトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＩ（ＣＥＬ７Ｂ）、並びにそれらの相同分子種又は変異体からなる群から選択される１以上（複数）のセルロース分解性酵素、を含んでなる組成物。
【請求項２６】
セルロース分解性増強活性を有するポリペプチドが、以下の、
（ａ）［ＩＬＭＶ］−Ｐ−Ｘ（４,５）−Ｇ−Ｘ−Ｙ−［ＩＬＭＶ］−Ｘ−Ｒ−Ｘ−［ＥＱ］−Ｘ（４）−［ＨＮＱ］及び［ＦＷ］−［ＴＦ］−Ｋ−［ＡＩＶ］（式中、Ｘが任意のアミノ酸、Ｘ（４,５）が４又は５の隣接位置での任意のアミノ酸、及びＸ（４）が４の隣接位置での任意のアミノ酸である）を含んでなる、セルロース分解性増強活性を有するポリペプチド、及び
（ｂ）［ＩＬＭＶ］−Ｐ−ｘ（４,５）−Ｇ−ｘ−Ｙ−［ＩＬＭＶ］−ｘ−Ｒ−ｘ−［ＥＱ］−ｘ（３）−Ａ−［ＨＮＱ］（式中、ｘが任意のアミノ酸、ｘ（４,５）が４又は５の隣接位置での任意のアミノ酸、及びＸ（３）が３の隣接位置での任意のアミノ酸である）を含んでなる、セルロース分解性増強活性を有するポリペプチドからなる群から選択され、
ここで、［ＩＬＭＶ］−Ｐ−Ｘ（４,５）−Ｇ−Ｘ−Ｙ−［ＩＬＭＶ］−Ｘ−Ｒ−Ｘ−［ＥＱ］−Ｘ（４）−［ＨＮＱ］及び［ＦＷ］−［ＴＦ］−Ｋ−［ＡＩＶ］を含んでなるセルロース分解性増強活性を有するポリペプチドは、
Ｈ−Ｘ（１,２）−Ｇ−Ｐ−Ｘ（３）−［ＹＷ］−［ＡＩＬＭＶ］、
［ＥＱ］−Ｘ−Ｙ−Ｘ（２）−Ｃ−Ｘ−［ＥＨＱＮ］−［ＦＩＬＶ］−Ｘ−［ＩＬＶ］、又は
Ｈ−Ｘ（１,２）−Ｇ−Ｐ−Ｘ（３）−［ＹＷ］−［ＡＩＬＭＶ］及び［ＥＱ］−Ｘ−Ｙ−Ｘ（２）−Ｃ−Ｘ−［ＥＨＱＮ］−［ＦＩＬＶ］−Ｘ−［ＩＬＶ］（式中、Ｘは任意のアミノ酸、Ｘ（１,２）は１又は２の隣接位置での任意のアミノ酸、Ｘ（３）は３の隣接位置での任意のアミノ酸、及びＸ（２）は２の隣接位置での任意のアミノ酸である）を任意にさらに含んでなる、請求項２５に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項２７】
セルロース分解性増強活性を有するポリペプチドが、以下の、
（ａ）配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、又は配列番号１０、配列番号１２、又は配列番号１４の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（i）配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、もしくは配列番号１３の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号１、配列番号３、配列番号５、もしくは配列番号１１の成熟ポリペプチドコード配列に含有されるｃＤＮＡ配列、又は配列番号７、配列番号９、もしくは配列番号１３の成熟ポリペプチドコード配列を含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、又は配列番号１３の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するヌクレオチド配列を含んでなるポリペプチドヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｄ）配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、又は配列番号１０、配列番号１２、又は配列番号１４の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の、置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、及び
（ｅ）配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、又は配列番号１０、配列番号１２、又は配列番号１４の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、セルロース分解性増強活性を有するポリペプチド、又はセルロース分解性増強活性を有するその断片、
からなる群から選択される、請求項２５に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項２８】
ベータ−グルコシダーゼがベータ−グルコシダーゼ融合タンパク質である、請求項２５に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項２９】
ベータ−グリコシダーゼ融合タンパク質が、（ａ）シグナルペプチドを含んでなる第一アミノ酸配列、（ｂ）少なくともエンドグルカナーゼの触媒ドメインを含んでなる第二アミノ酸配列、及び（ｃ）少なくともベータ−グルコシダーゼの触媒ドメインを含んでなる第三アミノ酸配列を含んでなり、ここで、第一アミノ酸配列のＣ末端は第二アミノ酸配列のＮ末端にインフレームで結合し、第二アミノ酸配列のＣ末端は第三アミノ酸配列のＮ末端にインフレームで結合する、請求項２８に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項３０】
ベータ−グルコシダーゼ融合タンパク質が、配列番号１０３又は配列番号１０５を含んでなるか、前記配列からなる、請求項２９に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項３１】
トリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼＩ（ＣＥＬ７Ａ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号５２の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号５１の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号５１の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、もしくはそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号５１の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号５２の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項２５に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項３２】
トリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼＩ（ＣＥＬ７Ａ）が配列番号５２の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項２５に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項３３】
トリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼII（ＣＥＬ６Ａ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号５４の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号５３の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号５３の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、もしくはそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号５３の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号５４の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項２５に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項３４】
トリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼII（ＣＥＬ６Ａ）が配列番号５４の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項２５に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項３５】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼI（ＣＥＬ７Ｂ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号５６の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号５５の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号５５の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、もしくはそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号５５の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号５６の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項２５に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項３６】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼI（ＣＥＬ７Ｂ）が、配列番号５６の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項２５に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項３７】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼII（ＣＥＬ５Ａ）、トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼIII（ＣＥＬ１２Ａ）、及びトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＶ（ＣＥＬ４５Ａ）、並びにこれらの相同分子種又は変異体からなる群から選択されるセルロース分解性酵素をコードする、１以上（複数）の第四ポリヌクレオチドをさらに含んでなる、請求項２５〜３６のいずれか１項に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項３８】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼII（ＣＥＬ５Ａ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号５８の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号５７の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号５７の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、又はそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号５７の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号５８の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項３７に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項３９】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼII（ＣＥＬ５Ａ）が、配列番号５８の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項３７に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項４０】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼIII（ＣＥＬ１２Ａ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号６０の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号５９の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号５９の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、又はそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号５９の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号６０の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項３７に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項４１】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼIII（ＣＥＬ１２Ａ）が、配列番号６０の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項３７に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項４２】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＶ（ＣＥＬ４５Ａ）の相同分子種又は変異体が、以下の、
（ａ）配列番号６２の成熟ポリペプチドと、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、
（ｂ）（ｉ）配列番号６１の成熟ポリペプチドコード配列、（ii）配列番号６１の成熟ポリペプチドコード配列に含まれるｃＤＮＡ、又はそれを含んでなるゲノムＤＮＡ配列、又は（iii）（i）もしくは（ii）の全長相補鎖と、好ましくは少なくとも中ストリンジェンシー条件、より好ましくは少なくとも中高ストリンジェンシー条件、及び最も好ましくは少なくとも高ストリンジェンシー条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、
（ｃ）配列番号６１の成熟ポリペプチドコード配列と、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、最も好ましくは少なくとも９０％、及びさらに最も好ましくは少なくとも９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、及び
（ｄ）配列番号６２の成熟ポリペプチドの１以上（複数）のアミノ酸の置換、削除、及び／又は挿入を含んでなる変異体、
からなる群から選択される、請求項３７に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項４３】
トリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＶ（ＣＥＬ４５Ａ）が、配列番号６１の成熟ポリペプチドを含んでなるか、前記成熟ポリペプチドからなる、請求項３７に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項４４】
配列番号８のセルロース分解性増強活性を有するポリペプチドの成熟ポリペプチド、配列番号１０６のベータ−グルコシダーゼ融合タンパク質、配列番号５２のトリコデルマ・リーゼイ・セロビオヒドロラーゼＩ（ＣＥＬ７Ａ）の成熟ポリペプチド、配列番号５４のトリコデルマ・リーゼイセロビオヒドロラーゼII（ＣＥＬ６Ａ)の成熟ポリペプチド、及び配列番号５６のトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＩ（ＣＥＬ７Ｂ）の成熟ポリペプチドを含んでなる、請求項２５に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項４５】
配列番号５８のトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼII（ＣＥＬ５Ａ）、配列番号６２のトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼＶ（ＣＥＬ４５Ａ）、及び配列番号６０のトリコデルマ・リーゼイ・エンドグルカナーゼIII（ＣＥＬ１２Ａ）からなる群から選択される、１以上（複数）の酵素をさらに含んでなる、請求項２５〜４４のいずれか１項に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項４６】
配列番号６４のチエラビア・テレストリス・セロビオヒドロラーゼの成熟ポリペプチドをさらに含んでなる、請求項２５〜４５のいずれか１項に記載のセルロース分解性タンパク質組成物。
【請求項４７】
セルロール含有物質を分解又は変換する方法であって、請求項２５〜４６のいずれか１項に記載のセルロース分解性タンパク質組成物の有効量でセルロース含有物質を処理することを含んでなる方法。
【請求項４８】
ヘミセルラーゼ、エステラーゼ、プロテアーゼ、ラッカーゼ、ペルオキシダーゼ、又はこれらの混合物からなる群から選択される１以上（複数）の酵素の有効量で、セルロース含有物質を処理することをさらに含んでなる、請求項４７に記載の方法。
【請求項４９】
分解したセルロース含有物質を回収することを含んでなる、請求項４７又は４８に記載の方法。
【請求項５０】
発酵物質を作製する方法であって、（ａ）請求項２５〜４６のいずれか１項に記載のセルロース分解性タンパク質の有効量で、セルロース含有物質を糖化すること、（ｂ）発酵物質を作製する１以上（複数）の発酵微生物で、ステップ（ａ）の糖化セルロース含有物質を発酵させること、及び（ｃ）当該発酵からの発酵物質を回収すること、を含んでなる方法。
【請求項５１】
ヘミセルラーゼ、エステラーゼ、プロテアーゼ、ラッカーゼ、ペルオキシダーゼ、又はこれらの混合物からなる群から選択される１以上（複数）の酵素の有効量でセルロース含有物質を処理することをさらに含んでなる、請求項５０に記載の方法。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【公表番号】特表２０１０−５２８６２４（Ｐ２０１０−５２８６２４Ａ）
【公表日】平成２２年８月２６日（２０１０．８．２６）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１０−５１０５３５（Ｐ２０１０−５１０５３５）
【出願日】平成２０年５月３０日（２００８．５．３０）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００８／０６５４１７
【国際公開番号】ＷＯ２００８／１５１０７９
【国際公開日】平成２０年１２月１１日（２００８．１２．１１）
【出願人】（５００１７５６０２）ノボザイムス，インコーポレイティド (26)
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２２年８月２６日（２０１０．８．２６）
【国際特許分類】
【出願日】平成２０年５月３０日（２００８．５．３０）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００８／０６５４１７
【国際公開番号】ＷＯ２００８／１５１０７９
【国際公開日】平成２０年１２月１１日（２００８．１２．１１）
【出願人】（５００１７５６０２）ノボザイムス，インコーポレイティド (26)
【Ｆターム（参考）】
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