心血管状態の薬理ゲノミクス治療のための方法およびシステム
遺伝的変異の、個体中のロスタフロキシンに関連する生物活性への影響に基づく方法およびシステムが本明細書で提供される。特に、ＫＣＮＳ３、ＴＨＳＤ７Ａ、ＦＡＭ４６Ａ、ＬＯＣ３８９９７０、ＨＬＡ−ＧおよびＴＴＣ２９からなる群から選択される遺伝子ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の、遺伝子間または遺伝子内領域中の１つまたは複数の多型のロスタフロキシンに対する個体応答への同定された影響に基づく、組成物、方法およびシステムが本明細書に記載される。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
本開示は、その各開示全体が参照により本明細書に組み込まれている、２００９年１０月１９日出願の「心血管状態の薬理ゲノミクス治療のための方法およびシステム」と題された米国仮特許出願Ｓ／Ｎ６１／２５３０２０号および２００９年１１月２５日出願の「心血管状態の薬理ゲノミクス治療のための方法およびシステム」と題された欧州特許出願Ｓ／Ｎ０９１７７１１１．３号に関連し、その優先権を主張する。
【０００２】
本開示は、本明細書でロスタフロキシンとして総括して示される、１７β−（３−フリル）−５β−アンドロスタン−３β，１４β，１７α−トリオールおよびその誘導体により形成されるクラスの化合物に関する。
【背景技術】
【０００３】
ロスタフロキシンは、個体中で生物活性を有することが知られている化合物である。特に、ロスタフロキシンは、個体の心血管系に対して活性であることが示されており、動脈性高血圧、ならびにそれだけに限定されないが、心不全、冠動脈心疾患（ＣＨＤ）、脳卒中および腎不全を含む関連器官合併症などの心血管障害の治療のために開発中である。
【０００４】
より具体的には、ロスタフロキシンは、血圧、ならびにそれだけではないが、ウアバインまたはＡＤＤ１、ＡＤＤ２、ＡＤＤ３などの細胞骨格のアデュシンをコードする遺伝子の遺伝的変異により引き起こされるＮａ−ＫポンプおよびＳｒｃにおける変化を正常化する化合物であることが示された。
【０００５】
さらに、ロスタフロキシンは、過度のタンパク尿、糸球体硬化症および腎不全を引き起こす有足細胞タンパク質における変化を正常化し、動脈切開および血管形成後の動脈狭窄を引き起こす生物学的過程（新生内膜形成および陰性リモデリング）に拮抗することができることが示された。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００６】
本明細書では、いくつかの実施形態において、遺伝的変異の、ロスタフロキシンに対する個体の応答への影響に基づくロスタフロキシンの治療および／または分析への使用を可能にする、方法およびシステムが提供される。
【０００７】
特に、ＫＣＮＳ３、ＴＨＳＤ７Ａ、ＦＡＭ４６Ａ、ＬＯＣ３８９９７０、ＨＬＡ−ＧおよびＴＴＣ２９からなる群から選択される遺伝子ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の、遺伝子間または遺伝子内領域中の１つまたは複数の多型のロスタフロキシンに対する個体応答への同定された影響に基づく、組成物、方法およびシステムが本明細書に記載される。前記領域は、ヒトにおける心血管状態、遺伝的素因または薬物応答と多少なりとも相関することが以前は知られていなかった。
【０００８】
より具体的には、本明細書に記載の組成物、方法およびシステムは、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される１つまたは複数の多型（本明細書ではコアＳＮＰとも呼ばれる）、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の、ロスタフロキシンに対する個体応答への同定された影響に基づく。
【０００９】
第１の態様によると、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の保有者となるよう選択された個体の心血管状態の治療または予防に使用するためのロスタフロキシンが記載されている。一実施形態では、個体の心血管状態を治療または予防する方法が記載されている。本方法は、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の保有者であることが決定された前記個体にロスタフロキシンを投与または処方するステップを含む。
【００１０】
第２の態様によると、０．００５ｍｇ／日〜５ｍｇ／日の用量の医薬品として使用するためのロスタフロキシンが記載されている。特に、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５の少なくとも１つ、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異を含む遺伝子型を有するよう選択された個体を治療するための、０．００５ｍｇ／日〜５ｍｇ／日の用量のロスタフロキシンの使用が記載される。特に、一実施形態では、ロスタフロキシンにより個体を治療する方法が記載される。本方法は、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５の少なくとも１つ、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異を含む遺伝子型を有することが決定された個体に、０．０５ｍｇ／日〜５ｍｇ／日、特に０．０５ｍｇ／日〜０．５ｍｇ／日の用量のロスタフロキシンを投与または処方するステップを含む。
【００１１】
第３の態様によると、個体のためのロスタフロキシンによる治療を評価する方法およびシステムが開示される。本方法は、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異についての情報を個体配列中で検出するステップと、検出された配列情報に基づいて個体におけるロスタフロキシンによる治療を決定するステップとを含む。特に、配列情報は、個体の単離ＤＮＡサンプルまたは配列情報を提供するのに適した個体の他の単離サンプル中から検出することができる。本システムは、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異のためのプローブと；０．００５ｍｇ〜５ｍｇ／ｋｇ、特に０．００５ｍｇ／日〜０．５ｍｇ／日の用量のロスタフロキシンおよび薬学的に許容される媒体を含む医薬組成物とを含む。
【００１２】
第４の態様によると、個体中のロスタフロキシンに対する応答を予測する方法およびシステムが開示される。本方法は、ＫＣＮＳ３、ＴＨＳＤ７Ａ、ＦＡＭ４６Ａ、ＬＯＣ３８９９７０、ＨＬＡ−ＧおよびＴＴＣ２９からなる群から選択される遺伝子の遺伝子間または遺伝子内領域についての個体の遺伝子型を検出するステップと、検出された遺伝子型を、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型を含む、ロスタフロキシンに対する既知の応答に関連する以前に同定された遺伝子型と比較するステップとを含む。本システムは、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型のためのプローブと、プローブハイブリダイゼーションの結果および以前に同定された遺伝子型を関連付けるルックアップテーブルとを含む。特に、遺伝子型の検出は、個体の単離ＤＮＡサンプルまたは遺伝子型に関する情報を提供するのに適した個体の他の単離サンプルから行うことができる。本方法およびシステムでは、個体中で同定された遺伝子型がロスタフロキシン応答と関連する同一の遺伝子型である場合、ロスタフロキシンに対する個体の応答は、既知の応答であると予測される。
【００１３】
第５の態様によると、ＫＣＮＳ３、ＴＨＳＤ７Ａ、ＦＡＭ４６Ａ、ＬＯＣ３８９９７０、ＨＬＡ−ＧおよびＴＴＣ２９からなる群から選択される遺伝子の遺伝子間または遺伝子内領域中の一塩基多型（ＳＮＰ）を検出する方法およびシステムが開示される。特に、遺伝子型の検出は、個体の単離ＤＮＡサンプルまたは遺伝子型に関する情報を提供するのに適した個体の他の単離サンプルから行うことができる。本システムは、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９および配列番号１１のヌクレオチド配列のいずれか１つにおける一塩基多型（ＳＮＰ）を含む核酸分子と特異的にハイブリダイズする単離ポリヌクレオチドと、緩衝液と、酵素とを含む。本方法は、ＫＣＮＳ３、ＴＨＳＤ７Ａ、ＦＡＭ４６Ａ、ＬＯＣ３８９９７０、ＨＬＡ−ＧおよびＴＴＣ２９からなる群から選択される遺伝子の遺伝子間または遺伝子内領域を含むゲノムフラグメントを、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９および配列番号１１からのヌクレオチド配列の少なくとも１つまたはこれらの一部のための一塩基特異的プローブと接触させるステップを含む。特に、接触は、個体の単離ゲノムフラグメントまたはゲノムフラグメントに関する情報を提供するのに適した個体の他の単離サンプルに行うことができる。
【００１４】
第６の態様によると、ヌクレオチドの１つが配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０および配列番号１２中のヌクレオチド配列のいずれか１つ、またはそれらの相補配列から選択される一塩基多型（ＳＮＰ）である、少なくとも約１００個の隣接ヌクレオチドを含む単離核酸分子が開示される。
【００１５】
第７の態様によると、心血管状態を治療的または予防的に処理するのに有用な薬剤を同定する方法およびシステムが開示される。
【００１６】
本方法は、候補薬剤を用意するステップと、候補薬剤を、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異を保有する個体に投与するステップと、前記候補薬剤に対する個体応答を検出するステップとを含む。
【００１７】
本明細書に記載の方法およびシステムは、いくつかの実施形態において、心血管状態、特に、高血圧の治療の成功率を、現在の３０〜４０％から約８０％まで増加させることを可能にする。
【００１８】
本明細書に記載の方法およびシステムは、いくつかの実施形態において、未治療個体における、心血管状態、特に、高血圧の治療の成功率を増加させることを可能にする。
【００１９】
本明細書に記載の方法およびシステムは、いくつかの実施形態において、レスポンダー個体を選択し、有効用量および結果として考えられる望ましくない副作用を減少させることにより、利用可能な治療と比較して有害事象および副作用の割合を減少させるために使用することができる。
【００２０】
本明細書に記載の方法およびシステムは、個体中のロスタフロキシンの任意の活性に関連する医学的、診断的、化粧用および薬理学的適用などの任意の適用に関連して適用することができる。
【００２１】
本開示の１つまたは複数の実施形態の詳細は、添付の図面および以下の説明で示される。他の特徴、目的および利点は、説明および図面から、ならびに特許請求の範囲から明らかとなろう。
【００２２】
本明細書に組み込まれており、その一部を構成する添付の図面は、本開示の１つまたは複数の実施形態を説明し、詳細な説明および実施例と共に、本開示の原理および実施を説明するのに役立つ。
【図面の簡単な説明】
【００２３】
【図１】ロスタフロキシンおよびプラセボで処理した個体に対して行った遺伝的記述分析に関連して検出されたガウス分布を示す図である。特に、パネルＡは、ロスタフロキシンおよびプラセボ、すなわち両者（全患者）による処理の５週間後の個体における血圧変化（ＤＳＢＰ５＿０）の分布を説明する図を示す。パネルＢは、ロスタフロキシン（ロスタフロキシン）による処理の５週間後の個体における血圧変化（ＤＳＢＰ５＿０）の分布を説明する図を示す。パネルＣは、プラセボ（プラセボ）による処理の５週間後の個体における血圧変化（ＤＳＢＰ５＿０）の分布を説明する図を示す。
【図２】ロスタフロキシンで処理した個体に対して行った遺伝的記述分析に関連して検出されたガウス分布を示す図である。特に、三分位値に細分した図１Ｂに示すロスタフロキシンによる処理の５週間後の血圧変化（ＤＳＢＰ５＿０）の分布を説明する図である。
【図３】ロスタフロキシンで処理した個体に対して行った遺伝的記述分析に関連して行った統計解析の結果を示す図である。特に、個体間の遺伝的関連性を説明するために、１９３人の患者についてのＥｉｇｅｎｓｏｆｔの主成分分析の変動の上位２軸（ＰＣＡ１およびＰＣＡ２）を示す図である。各点は、個体を表す。プロットにおいて、ゼロ付近に分布する個体の軽い不均一なクラスター形成が検出可能である。
【図４】プラセボおよび本明細書に開示のいくつかの実施形態によるＳＮＰの治療についてのＧＸＥ関連結果の結果を説明する図である。パネルＡでは、プロットのＹ軸は、有意なＰ値（−ｌｏｇＰ値）を表し、Ｘ軸は、ゲノム中の位置を表す。各点は、ＳＮＰを表し、特に、赤い点は、有意なＰ値（Ｐ＜１０−４）を有するＳＮＰを表す。パネルＢは、実測Ｐ値対ＧＸＴ関連検定によりもたらされた期待Ｐ値の分布の比較を示す（Ｑ−Ｑプロット）。分布の尾部における膨張は、真陽性関連を表す。
【図５】本開示のいくつかの実施形態によるロスタフロキシンについてのＳＮＰの相互作用の遺伝子型の選択のためのステップを説明する図である。特に、示されているように、ロスタフロキシンおよびプラセボで処理した個体における血圧変化（ＤＳＢＰ５＿０）に関して、ｒｓ８８９９とｒｓ４６７８の異なる遺伝子型間の相互作用をそれぞれ報告する図である。
【図６】本明細書に開示のいくつかの実施形態によるロスタフロキシンに対する応答に影響を及ぼす遺伝子型を選択するために行われる代表的な単変量解析を示す図である。
【図７】１つの仮定のＳＮＰの異なる遺伝子型とロスタフロキシンおよびプラセボによる血圧変化（ＤＳＢＰ５＿０）の間の代表的な相互作用を説明する図である。
【図８】本明細書に記載のいくつかの実施形態による遺伝子プロファイルに関する代表的なデータの概要を示す図である。
【図９】本明細書に記載のいくつかの実施形態による血管、腎臓および神経調節に関連する選択された遺伝子の概要を示す図である。
【図１０】伝統的アプローチおよび薬理ゲノミクスアプローチの有効性ならびに安全性に関するデータを示す図である。
【発明を実施するための形態】
【００２４】
本明細書では、遺伝的変異の、個体中のロスタフロキシンに関連する生物活性への影響に基づく方法およびシステムが提供される。
【００２５】
特に、本明細書で提供される方法およびシステムは、ＫＣＮＳ３、ＴＨＳＤ７Ａ、ＦＡＭ４６Ａ、ＬＯＣ３８９９７０、ＨＬＡ−ＧおよびＴＴＣ２９からなる群から選択される遺伝子ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の、遺伝子間または遺伝子内領域中の多型に基づく。
【００２６】
より具体的には、本明細書に記載の組成物、方法およびシステムは、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される１つまたは複数の多型、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の、ロスタフロキシンに対する個体応答への同定された影響に基づく。
【００２７】
本明細書で使用する「遺伝的変異」または「多型」という表現は、個体の集団における遺伝的多様性を示し、特に、ＤＮＡまたは染色体の領域の変化した状態である。代表的な多型は、ＶＮＴＲ（タンデム反復数、ミニサテライトおよびマイクロサテライトとしても知られている）、塩基対置換、塩基対挿入、塩基対欠失、核型における変化（異数性、倍数性）および染色体再配列（欠失、転座、逆位）を含む。
【００２８】
本明細書で使用する「ロスタフロキシン」という用語は、１７β−（３−フリル）−５β−アンドロスタン−３β，１４β，１７α−トリオールおよびその誘導体により形成されるクラスの化合物のいずれか１つを示す。より具体的には、ロスタフロキシン化合物は、式Ｉの化合物を含む。
【化１】
（Ｉ）
式中、記号
【化２】
は、１７位の置換基がαまたはβ立体配置を有し得ることを意味し；記号
【化３】
は、一重結合または二重結合を表し；３位の
【化４】
が二重結合である場合、Ｙは酸素またはグアニジノイミノであり；３位の
【化５】
が一重結合であり、αまたはβ立体配置を有し得る場合、Ｙは水素、ＯＲ４またはＳＲ４であり；
Ｒは、未置換もしくは置換３−フリルまたは４−ピリダジニル基であり；
Ｒ１は、水素；メチル；エチルまたはＯＨもしくはＮＲ５Ｒ６により置換されたｎ−プロピルであり；
Ｒ２は、水素である、またはＲ３と共にオキシラン環の結合であり；
Ｒ３は、水素である、またはＲ２と共にオキシラン環の結合であり；
Ｒ４は、水素；メチル；Ｃ２〜Ｃ６アルキルまたはＣ３〜Ｃ６アルケニルまたはＣ２〜Ｃ６アシルであり、これらのアルキル、アルケニルおよびアシル基は、未置換である、あるいは第四級アンモニウム基または１個もしくは複数のＯＲ７、ＮＲ８Ｒ９、ホルミル、アミジノ、グアニジノイミノにより、またはＮＲ８Ｒ９およびヒドロキシにより置換されており；
Ｒ５、Ｒ６は、独立に、水素；メチル；未置換または１個のＮＲ１０Ｒ１１もしくはＮＲ１０Ｒ１１およびヒドロキシにより置換されたＣ２〜Ｃ６アルキルである、またはＲ５およびＲ６は、窒素原子と共に、任意選択により、酸素または硫黄または窒素から選択される別のヘテロ原子を含む、未置換もしくは置換の飽和または不飽和ペンタ−あるいはヘキサ−モノ複素環を形成し；
Ｒ７は、水素、メチルまたはＣ２〜Ｃ４アルキルであり、このアルキルは、未置換である、あるいは１個もしくは複数のＮＲ１０Ｒ１１により、またはＮＲ１０Ｒ１１およびヒドロキシにより置換されており；
Ｒ８、Ｒ９は、独立に、水素；メチル；Ｃ２〜Ｃ６アルキルまたはＣ３〜Ｃ６アルケニルであり、これらのアルキルおよびアルケニル基は、未置換である、または１個もしくは複数のＮＲ１０Ｒ１１またはＮＲ１０Ｒ１１およびヒドロキシにより置換されている、またはＲ８およびＲ９は、窒素原子と共に、任意選択により、酸素または硫黄または窒素から選択される別のヘテロ原子を含む、未置換もしくは置換の飽和または不飽和ペンタ−あるいはヘキサ−モノ複素環を形成し、またはＲ８は水素でありＲ９はアミジノであり；
Ｒ１０、Ｒ１１は、独立に、水素、Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり、またはＲ１０およびＲ１１は、窒素原子と共に、飽和もしくは不飽和ペンタ−またはヘキサ−モノ複素環を形成する。
【００２９】
特に、本明細書で使用するロスタフロキシンという用語は、式（Ｉ）の化合物の全ての可能な立体異性体、特にＺおよびＥ異性体、光学異性体およびこれらの混合物、ならびに代謝産物および代謝前駆物質を含む。
【００３０】
本明細書で使用する「誘導体」という用語は、式（Ｉ）の化合物に関連する生物活性の少なくとも１つを保持する、化学修飾された式（Ｉ）の化合物を示す。化学修飾には、例えば、アルキル、アシル、ヒドロキシまたはアミノ基による水素の置換、および当業者により同定可能な追加の修飾が含まれ得る。
【００３１】
米国特許第５５９１７３４号、Ｂｉａｎｃｈｉ等、２００３およびＱｕａｄｒｉ等、１９９７［Ｒｅｆ．４、５］ならびにロスタフロキシン化合物の合成および生物活性について記載している関連補足情報（それぞれ、その全体が参照により本明細書に組み込まれている）も参照される。
【００３２】
ロスタフロキシンに関連する追加の生物活性は、その全体が参照により本明細書に組み込まれている、Ｆｅｒｒａｒｉ Ｐ．等、１９９８［Ｒｅｆ．６］に記載されている。
【００３３】
ロスタフロキシンに関連して本明細書で使用する「生物活性」という表現は、生体に対するロスタフロキシンのもしくはロスタフロキシンに関する任意の効果の質または状態を示す。ロスタフロキシンの生物活性には、それだけに限定されないが、ウアバイン高血圧効果の選択的阻害、ウアバインにより引き起こされるＮａ−ＫポンプおよびＳｒｃにおける変化の正常化、ならびに内因性ウアバインレベルの付随する増加とＮａ−ＫポンプおよびＳｒｃにおける変化により持続される高血圧の形態の正常化が含まれる。特に、ロスタフロキシンの生物活性には、アデュシンまたは内因性ウアバインの合成および輸送に関与する他の酵素をコードする遺伝子の遺伝的変異に関連する高血圧効果の選択的拮抗作用、アデュシン遺伝的変異により引き起こされるＮａ−ＫポンプおよびＳｒｃにおける変化の正常化［Ｒｅｆ．１、２、３］、ならびにアデュシン遺伝的変異とＮａ−ＫポンプおよびＳｒｃにおける変化の付随する効果により持続される高血圧の形態の正常化が含まれる。ロスタフロキシンの生物活性には、それだけに限定されないが、過度のタンパク尿、糸球体硬化症および腎不全を引き起こす有足細胞タンパク質の変化の正常化、ならびに動脈切開および血管形成後の動脈狭窄を引き起こす生物学的過程の拮抗作用、ならびに本開示を読めば当業者により同定可能な追加の活性が含まれる。
【００３４】
本開示に記載されるように、ロスタフロキシンに関連する生物活性は、個体中の遺伝的変異により影響されるので、いくつかの実施形態では、ロスタフロキシンによる治療は、遺伝的変異を示していない個体で誘発される生物活性と比較して、増強した生物活性をもたらす。
【００３５】
さらに、ロスタフロキシン活性は用量依存的であるので、本明細書に記載の方法およびシステムは、いくつかの実施形態で、考えられる副作用を対応して減少させながら遺伝的変異を保有する個体へのロスタフロキシンの有効な投与を可能にする。
【００３６】
個体中のロスタフロキシンに関連する検出可能な生物活性は、ロスタフロキシンに対する個体の応答を定義する。生物活性は、当業者により同定可能な方法および技術により検出することができ、それには、それだけに限定されないが、生物活性に関連するバイオマーカーの検出、ならびにバイタルサインおよび特に個体の血圧に関連した個体中の生物活性に関連する他の臨床情報の検出が含まれる。
【００３７】
本開示のいくつかの実施形態では、本開示による遺伝的変異を保有する個体へのロスタフロキシンの投与が、個体中のロスタフロキシンに対する改善された応答をもたらす。
【００３８】
特に、本開示の意味における「改善された応答」は、個体中で検出されるロスタフロキシンの増強された活性を示し、それは、いくつかの実施形態で、高血圧の予防、血圧の低下、血圧の正常化、ならびに高血圧に関連する心血管、腎臓、血管、眼および神経の損傷または合併症の予防を含む。特に、改善された応答は、いくつかの実施形態で、治療開始前に個体で測定した血圧と比較して約２３ｍｍＨｇ〜約１２ｍｍＨｇの平均オフィス収縮期血圧低下により定義することができる。
【００３９】
いくつかの実施形態では、改善された応答は、それぞれ治療開始前に個体で測定した血圧と比較して少なくとも約１５ｍｍＨｇおよび約９ｍｍＨｇの個体のオフィス収縮期血圧および／または夜間血圧の平均的低下により定義することができる。また、いくつかの実施形態では、改善された応答は、ヒドロクロロチアジド（ＨＣＴＺ）またはロサルタンなどの他の降圧薬の投与後に個体で検出される対応する平均的低下よりも有意に大きい（例えば、４０％以上大きい）オフィス収縮期血圧および／または夜間血圧の平均的低下により定義することができる。
【００４０】
血圧に関連して本明細書で使用する「平均的低下」または「平均的降下」という用語は、検出すべき血圧（例えば、夜間血圧またはオフィス血圧）を考慮して医学的ガイドラインにしたがって決定した所定量の時間で個体に行った血圧測定のセットの中央値または期待値の基準である低下を示す。平均的低下を計算するための血圧測定の中心傾向の測定として使用することができる測定の特定のタイミングおよび記述統計は、本開示を読めば当業者により同定可能である。
【００４１】
本明細書で使用する「オフィス血圧」という用語は、血圧計、電子ＢＰレコーダーまたは当業者により同定可能な追加の機器などの適当な機器により、外来で医師によって測定される血圧レベルを示す。
【００４２】
本明細書で使用する「夜間血圧」という用語は、特にＨｏｌｔｅｒ法による電子血圧レコーダーまたは当業者により同定可能な追加の機器などの適当な機器により、夜間、典型的には午後１２時〜午前６時に記録される血圧レベルを示す。
【００４３】
本明細書で使用する「ヒドロクロロチアジド」という用語は、腎臓が水を保持する能力を阻害することにより作用し、式６−クロロ−１，１−ジオキソ−３，４−ジヒドロ−２Ｈ−１，２，４−ベンゾチアジアジン−７−スルホンアミドを有するチアジドクラスの第一選択利尿薬を示す。
【００４４】
本明細書で使用する「ロサルタン」という用語は、式（２−ブチル−４−クロロ−１−｛［２’−（１Ｈ−テトラゾール−５−イル）ビフェニル−４−イル］メチル｝−１Ｈ−イミダゾール−５−イル）メタノールを有する、主として高血圧を治療するために使用されるアンジオテンシンＩＩ受容体拮抗薬を示す。
【００４５】
本開示によると、ロスタフロキシンに対する個体の応答は、特定の遺伝的変異により、特に、個体の遺伝子型において検出可能な一塩基多型により影響される。本明細書で使用する「一塩基多型」または「ＳＮＰ」という用語は、点突然変異とも呼ばれる単一の塩基対置換により形成される遺伝的変異を示す。本開示によると、ＳＮＰまたは点突然変異は、遺伝子の遺伝子内領域（例えば、遺伝子のイントロンまたはエキソン領域）、または遺伝子に隣接し、典型的には、調節機能を有するもしくは未知の機能を有するゲノム領域から構成されている遺伝子間領域に位置することができる。
【００４６】
本明細書で使用する「個体」という用語は、高等動物、特に、哺乳動物などの脊椎動物、より具体的にはヒトなどの一個の生物学的生物体を示す。
【００４７】
本明細書で使用する「遺伝子型」という用語は、考えられる遺伝的変異の各々についての相同染色体上に位置する対立遺伝子の組み合わせを示す。特に、本開示において、特定の遺伝子または位置についての遺伝子型１（ｇ１）は、その特定の遺伝子または位置についてのホモ接合性のより低頻度の遺伝子型との関連を示し、特定の遺伝子または位置についての遺伝子型２（ｇ２）は、その特定の遺伝子または位置についてのホモ接合性遺伝子型との関連を示し、特定の遺伝子または位置についての遺伝子型３（ｇ３）は、その特定の遺伝子または位置についてのホモ接合性のより高頻度の遺伝子型との関連を示す。
【００４８】
いくつかの実施形態では、個体中のロスタフロキシン活性に影響を及ぼす遺伝的変異は、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つのＳＮＰ（本明細書では「コアＳＮＰ」とも示される）、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異を含む。コアＳＮＰならびに他のＳＮＰは、本明細書において、通常、国立生物工学情報センター（ＮＣＢＩ）により確立されたｄｂＳＮＰ ｒｓＩＤ識別子を使用して示され、例えば、本出願の出願日におけるhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/で入手可能である。本明細書で使用する「連鎖不平衝」という表現は、必ずしも同一染色体上ではない、２つ以上の遺伝子座の対立遺伝子の非ランダムな関係を示し、対立遺伝子または遺伝子マーカーのいくつかの組み合わせが、頻度に基づいて対立遺伝子からのハプロタイプのランダム形成から期待されるよりも集団においてより高頻度またはより低頻度で起こる状態に関する。異なる遺伝子座の多型間の非ランダムな関係は、連鎖不平衝（ＬＤ）の程度により測定される。本開示中に示される連鎖不平衝における遺伝的変異は、０．９〜１に及ぶ連鎖不平衝の程度ｒ２を有し、本開示を読めばＧｅｎＢａｎｋソースを使用して当業者により同定可能であり得る。
【００４９】
いくつかの実施形態では、遺伝的変異の、ロスタフロキシンに対する個体の応答への影響が、本明細書に記載のロスタフロキシン治療を実施または評価するための方法において考慮される。本明細書で使用する「治療」、「治療上の」、「治療上」および関連する用語は、個体の状態の治療または予防のまたはそれに関連する項目を示し、特に、ロスタフロキシンに言及する場合には、個体中のロスタフロキシンに関連する任意の生物活性に関連する状態の治療もしくは予防のまたはそれに関連する項目を示す。
【００５０】
本明細書で使用する「状態」という用語は、通常、完全な物理的、精神的およびおそらくは社会的幸福の状態と関連する個体の（全体としてまたはその部分の１つもしくは複数の）物理的状態に一致しない、個体の（全体としてまたはその部分の１つもしくは複数の）体の物理的状態を示す。本明細書に記載の状態は、それだけに限定されないが、障害および疾患を含み、ここでは「障害」という用語は、体またはその部分のいずれかの機能的異常に関連する、生きている個体の状態を示し、「疾患」という用語は、体またはその部分のいずれかの正常な機能を損ない、徴候および症状を識別することにより典型的に示される、生きている個体の状態を示す。代表的な状態には、それだけに限定されないが、傷害、能力障害、障害（精神的および物理的障害を含む）、症候群、感染症、個体の逸脱行動、ならびに個体の体またはその部分の構造および機能の非定型変異が含まれる。
【００５１】
２つの項目に関連して本明細書で使用する「関連する」という表現は、第１項目の発生に第２項目の発生が伴うような２つの項目間の関係を示し、それだけに限定されないが、因果関係および徴候／症状−疾患関係を含む。
【００５２】
個体中のロスタフロキシンに関連する生物活性に関連する状態には、それだけに限定されないが、心血管状態（例えば、原発性高血圧を含む高血圧、心肥大、血管抵抗増加および動脈再狭窄）、腎不全、糸球体硬化症、タンパク尿、多発性嚢胞腎、網膜障害、脳血管障害、メニエール症候群、認知障害、双極性障害、および心不全、脳卒中、虚血、網膜障害などの原発性高血圧に関連する心血管系合併症、および当業者により同定可能な追加の状態が含まれる。
【００５３】
「原発性高血圧」という表現は、産業化社会の成人集団の２５〜３０％に影響を及ぼす臨床状態を示し、その心臓、脳および腎臓の合併症を通して、健康負担および医療費の大部分の原因であり、血圧のレベルおよび当業者により同定可能な関連する血管、網膜の合併症の存在に基づく高血圧のグレードＩ、ＩＩ、ＩＩＩ、ＩＶを含む。
【００５４】
本明細書で使用する「治療」という用語は、診療の一部としての、または医学的にもしくは外科的に状態を扱う任意の活動を示す。本明細書で使用する「予防」という用語は、個体の状態から死亡率または罹患率の負担を減少させる任意の活動を示す。これは、一次、二次および三次予防レベルで行われる。ここでは、ａ）一次予防は、疾患の進行を回避し；ｂ）二次予防活動は、疾患の早期治療を目標とし、それによって疾患の進行および症状の出現を防止するための介入の機会を増加させ；そして、ｃ）三次予防は、機能を回復させ、疾患に関連する合併症を減少させることにより、既に確定した疾患の負の影響を減少させる。
【００５５】
特に、いくつかの実施形態では、個体の遺伝子型のＳＮＰに関する情報が、個体の心血管状態を治療または予防する方法として使用される。これらの実施形態では、ロスタフロキシンが、コアＳＮＰ ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型、またはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の保有者であることが決定された個体に投与または処方される。
【００５６】
特に、いくつかの実施形態では、コアＳＮＰの１つまたは複数を保有する個体は、個体中のロスタフロキシンに対する改善された応答を示し、これは、実施例の節で広く説明するように、少なくとも１５ｍｍＨｇのプラセボによる処理に関して治療後に測定される個体の血圧の平均的低下により形成される定量的表現型（ＤＳＢＰ５＿０）に基づいて計算することができる。
【００５７】
いくつかの実施形態では、定量的表現型ＤＳＢＰ５＿０に基づいて、コアＳＮＰの１つまたは複数を保有する個体は、未治療患者において、ＨＣＴＺまたはロサルタンなどの他の降圧薬により得られる平均的血圧降下よりも、約４０％以上、特に約４０％〜５０％以上であるロスタフロキシンにより得られる平均的血圧降下（治療前の値と比較して有意な）の大きさにより定義される改善された応答を示す。
【００５８】
いくつかの実施形態では、コアＳＮＰの１つまたは複数を保有する個体は、個体中のロスタフロキシンに対する改善された応答性を示し、これは、実施例の節で広く説明するように、少なくとも９ｍｍＨｇのプラセボによる処理に関して治療後に測定される個体の夜間血圧における平均的低下により形成される定量的表現型（ＤＳＢＰ５＿０）に基づいて計算することができる。
【００５９】
さらに、ＤＳＢＰ５＿０は、実施例の節で報告される統計的および実験的解析の定量的表現型であるので、血圧の平均的降下により定義されるロスタフロキシンに対する改善された応答は、バイオマーカーまたは血圧測定以外の臨床情報を使用して検出可能なロスタフロキシンに関連する任意の生物活性により定義される任意の改善された応答を代表すると考えられる。そのため、バイオマーカーまたは血圧測定以外の臨床情報を使用して検出可能なロスタフロキシンの生物活性により定義される改善された応答は、本開示の範囲内に含まれ、当業者により同定可能である。
【００６０】
本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態では、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、以下のコアＳＮＰの１つまたは複数を保有する個体にロスタフロキシンを投与または処方することにより達成される：６番染色体の位置１８０７９８９８中のヌクレオチドＣまたはＴ（ｒｓ２３４５０８８）、７番染色体の位置１１７５３６１７中のヌクレオチドＣまたはＴ（ｒｓ１６８７７１８２）、６番染色体の位置８２５６０５１１中のヌクレオチドＧまたはＡ（ｒｓ１６８９３５２２）、１０番染色体の位置５７０７８４８０中のヌクレオチドＧまたはＡ（ｒｓ２４６１９１１）、６番染色体の位置２９９２８５６５中のヌクレオチドＣまたはＴ（ｒｓ５０１３０９３）、および４番染色体の位置１４８２４４３８０中のヌクレオチドＴまたはＧ（ｒｓ１２５１３３７５）。
【００６１】
本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態では、ロスタフロキシンは、単独でまたは互いに組み合わせた、以下の遺伝子型の少なくとも１つの保有者である個体に投与または処方される：ｒｓ２３４５０８８については遺伝子型ＴＴまたは遺伝子型１、ｒｓ１６８７７１８２については遺伝子型Ｃ／Ｔまたは遺伝子型２、ｒｓ１６８９３５２２については遺伝子型ＡＡまたは遺伝子型１、ｒｓ２４６１９１１については遺伝子型ＡＡまたは遺伝子型１、ｒｓ５０１３０９３については遺伝子型ＴＴまたは遺伝子型１、およびｒｓ１２５１３３７５については遺伝子型ＴＴまたは遺伝子型１。
【００６２】
特に、単独でまたは互いに組み合わせた上記ＳＮＰのいずれかについての少なくとも１つの関連遺伝子型の存在は、用量または遺伝子型の組み合わせにしたがって、２３〜１２ｍｍＨｇに及ぶ個体のＤＳＢＮＰ５＿０平均的収縮期血圧低下に関連する（プロファイルは実施例の節を参照されたい）。
【００６３】
いくつかの実施形態では、コアＳＮＰの１つもしくは複数および／またはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異は、個体中のロスタフロキシンに対する応答にも影響を及ぼし、実施例の節で詳細に記載するＣＡＮＤ１、ＣＡＮＤ２およびＧＷＳとして同定されるＳＮＰにより例示される１つまたは複数の追加の遺伝的変異と関連し得る。特に、個体中のロスタフロキシンに対する応答に影響を及ぼす追加の遺伝的変異は、アデュシン発現ならびに内因性ウアバイン（ＥＯ）合成および輸送に直接的または間接的に関与する遺伝子の群を含む。これらの遺伝子には、それだけに限定されないが、ＡＤＤ１、ＡＤＤ２、ＡＤＤ３、ＬＳＳ、ＣＹＰ１１Ａ１、ＨＳＤ３Ｂ１−２、ＳＬＣＯ４Ｃ１、ＭＤＲ１および関連する多型などのＣＡＮＤ１遺伝子が含まれる。
【００６４】
本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態では、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、単独のまたはコアＳＮＰ：ｒｓ４９６１、ｒｓ４９８４、ｒｓ３７３１５６６、ｒｓ９１４２４７およびｒｓ１０４５６４２と組み合わせた以下の追加の関連ＣＡＮＤ１ ＳＮＰの、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の少なくとも１つを保有する個体への、ロスタフロキシンの投与または処方と関連して検出される。
【００６５】
特に、本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態では、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、単独のまたはコアＳＮＰについての遺伝子型：ｒｓ４９６１についてはＧＴ、ｒｓ４９８４についてはＣＴ、ｒｓ３７３１５６６についてはＡＧ、ｒｓ９１４２４７についてはＧＡおよびｒｓ１０４５６４２についてはＴＣと組み合わせた以下のＣＡＮＤ１遺伝子型の少なくとも１つの保有者である個体へのロスタフロキシンの投与または処方と関連して検出される。特に、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、ｒｓ９１４２４７についてのＣＡＮＤ１遺伝子型ＡＡの保有者である個体へのロスタフロキシンの投与または処方と関連して検出される。
【００６６】
本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態では、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、単独のまたはコアＳＮＰ：ｒｓ２４２０９３、ｒｓ１９９６３９６、ｒｓ１０５０３８０６、ｒｓ１３２５１７８０、ｒｓ１７４３０７０６、ｒｓ１０１０２０２４、ｒｓ５２６３０２、ｒｓ５４４１０４、ｒｓ３１０２０８７、ｒｓ５１８３、ｒｓ３７７２６２７、ｒｓ２２７６７３６、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ３７４１５５９、ｒｓ２２１７３４２、ｒｓ１０９２７８８８、ｒｓ６６０４９０９、ｒｓ９４５４０３、ｒｓ７１１７３１４、ｒｓ１０７９０２１２、ｒｓ１１２１６５９８、ｒｓ９１０６８２、ｒｓ１３２１８３１６、ｒｓ４３０９４８３、ｒｓ１３２８０３０７、ｒｓ４７３９０３７、ｒｓ１７５９６７７４、ｒｓ２７２８１０８、ｒｓ１７７８６４５６、ｒｓ７６９６３０４、ｒｓ２７２５２２２、ｒｓ１７１９９５６５、ｒｓ２７５８１５２、ｒｓ１０５７２９３、ｒｓ１６９６０７１２、ｒｓ７５９３５９、ｒｓ４０４２１４、ｒｓ１００５２１３、ｒｓ１７０２５４５３、ｒｓ２１１０９２３、ｒｓ１４２８５７１、ｒｓ４３５４０４、ｒｓ１２９０８７８７、ｒｓ１１６４７７２７、ｒｓ８８００５４およびｒｓ１１０６４５８４と組み合わせた以下の追加の関連ＣＡＮＤ２ ＳＮＰの、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の少なくとも１つを保有する個体への、ロスタフロキシンの投与または処方と関連して検出される。
【００６７】
本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態では、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、単独のまたはコアＳＮＰ：ｒｓ１２９９６１８６、ｒｓ９８９３３７２、ｒｓ７２１６３３１、ｒｓ７５２１６６８、ｒｓ１８８３３４、ｒｓ４９９８６６２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ６４５７１１０、ｒｓ３８９３４６４、ｒｓ２５１７７１８、ｒｓ１３６２１２６、ｒｓ５０１３０９３、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ６７１８２８２、ｒｓ７２１２０７、ｒｓ２５５５５００、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ８１７９６５４、ｒｓ１９０１１３９、ｒｓ２４２７８３２、ｒｓ９３６１８６３、ｒｓ１９９８３９４、ｇａ００１６１９、ｒｓ２２７５５３１、ｒｓ７４８１４０、ｒｓ４７１０５９２、ｒｓ２７４３９５１、ｒｓ１０１５９５６９、ｒｓ３０８７８１６、ｒｓ１０４９３９４０、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ２３２６９１２、ｒｓ１１１０４４６、ｒｓ１２５１３３７５、ｒｓ１７４１４９５４と組み合わせた以下の追加の関連ＧＷＳ ＳＮＰの、あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の少なくとも１つを保有する個体への、ロスタフロキシンの投与または処方と関連して検出される。
【００６８】
本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態では、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、単独のまたはコアＳＮＰ：Ｒｓ４９６１、Ｒｓ４９８４、Ｒｓ１０９２３８３５、Ｒｓ９４７１３０、Ｒｓ９１４２４７、Ｒｓ１０４５６４２、Ｒｓ８８００５４、Ｒｓ１０５０２９３３、Ｒｓ２１３１１２７、Ｒｓ４３０９４８３およびＲｓ４７３９０３７と組み合わせた以下の追加の関連ＳＮＰの、あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異少なくとも１つを保有する個体への、ロスタフロキシンの投与または処方と関連して検出される。
【００６９】
より具体的には、本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態では、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、単独でまたはコアＳＮＰ：Ｒｓ４９６１についてはヌクレオチドＧもしくはＴ、Ｒｓ４９８４についてはヌクレオチドＧもしくはＡ、Ｒｓ１０９２３８３５についてはヌクレオチドＡもしくはＴ、Ｒｓ９４７１３０についてはヌクレオチドＣもしくはＴ、Ｒｓ９１４２４７についてはヌクレオチドＡもしくはＧ、Ｒｓ１０４５６４２についてはヌクレオチドＣもしくはＴ、Ｒｓ８８００５４についてはヌクレオチドＣもしくはＴ、Ｒｓ１０５０２９３３についてはヌクレオチドＣもしくはＴ、Ｒｓ２１３１１２７についてはヌクレオチドＣもしくはＴ、Ｒｓ４３０９４８３についてはヌクレオチドＣもしくはＡおよびＲｓ４７３９０３７についてはヌクレオチドＧもしくはＡと組み合わせて、以下の追加の関連ＳＮＰの少なくとも１つを保有する個体への、ロスタフロキシンの投与または処方により達成される。
【００７０】
より具体的には、本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態では、ロスタフロキシンは、単独のまたはコアＳＮＰについての遺伝子型：Ｒｓ４９６１については遺伝子型ＧＴもしくは遺伝子型ＴＴ、Ｒｓ４９８４については遺伝子型ＣＣ、Ｒｓ１０９２３８３５については遺伝子型ＡＴもしくは遺伝子型ＴＴ、Ｒｓ９４７１３０については遺伝子型ＧＧ、Ｒｓ９１４２４７については遺伝子型ＡＡ、Ｒｓ１０４５６４２については遺伝子型ＴＴ、Ｒｓ８８００５４については遺伝子型ＡＧもしくは遺伝子型ＧＧ、Ｒｓ１０５０２９３３については遺伝子型ＣＴ、Ｒｓ２１３１１２７については遺伝子型ＣＣ、Ｒｓ４３０９４８３については遺伝子型ＡＡおよびＲｓ４７３９０３７については遺伝子型ＧＡと組み合わせた以下の遺伝子型の少なくとも１つの保有者である個体に、投与または処方される。
【００７１】
特に、いくつかの実施形態では、ロスタフロキシンにより個体を治療する方法が記載されている。本方法は、個体に、０．００５ｍｇ／日〜５ｍｇ／日、好ましくは０．０１ｍｇ／日〜１．５ｍｇ／日、最も好ましくは０．０５ｍｇ／日〜０．５ｍｇ／日の用量のロスタフロキシンを投与または処方するステップを含む。
【００７２】
特に、いくつかの実施形態では、本明細書に記載の遺伝的変異を保有する個体のサブセットにおいて、より低用量（０．０５ｍｇ／日；０．１５ｍｇ／日；０．５ｍｇ／日など）が、高用量（１．５ｍｇ／日；５．０ｍｇ／日）よりも収縮期血圧を低下させるのに効率的であり、高用量により誘導される−１２ｍｍＨｇと比較して、約１８ｍｍＨｇの収縮期血圧の平均的低下を有し得る。
【００７３】
特に、いくつかの実施形態では、コアＳＮＰから選択される少なくとも１つの多型を含む以前同定された遺伝子型を保有する高血圧個体で、０．０５〜０．５ｍｇ／日を含むロスタフロキシンの用量は、−１２〜−３４ｍｍＨｇに及ぶ血圧降下をもたらし、１．５ｍｇ／日〜５ｍｇ／日を含む用量は、−０．６〜−２３ｍｍＨｇに及ぶ血圧降下をもたらす。
【００７４】
したがって、いくつかの実施形態では、全コアＳＮＰを保有する個体で、低用量が、高用量（−１５ｍｍＨｇ平均）に対してより大きい応答をもたらす（−２３ｍｍＨｇ平均）。
【００７５】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の遺伝的変異を保有する個体は、ロスタフロキシンによる治療後、ロスタフロキシン治療前に検出された血圧と比較して少なくとも１０％の血圧の低下を示す。
【００７６】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の遺伝的変異を保有する個体は、ロスタフロキシンによる治療後、それぞれ少なくとも約１５ｍｍＨｇおよび約９ｍｍＨｇの個体のオフィス血圧および／または夜間血圧の平均的低下を示す。
【００７７】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の遺伝的変異を保有する個体は、収縮期血圧については１４０ｍｍＨｇ未満および拡張期血圧については９０ｍｍＨｇ未満の血圧の正常化を示す。
【００７８】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の遺伝的変異を保有する個体は、ロスタフロキシンによる治療後、ＨＣＴＺまたはロサルタンにより得られる平均的血圧低下よりも約４０％高い平均的血圧低下を示す（実施例２参照）。
【００７９】
本明細書に記載の方法およびシステムにおいて、ロスタフロキシンは、患者に個々に投与されるよう構成された組成物であってよく、および／またはそれは他の薬剤、薬物またはホルモンと組み合わせて投与されてもよい。特に、いくつかの実施形態では、医薬品は、治療用薬剤の投与に適した担体から選択される、薬学的に許容される担体も含むことができる。薬学的に許容される担体についての徹底的な議論は、その全体が参照により本明細書に組み込まれている、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ（Ｍａｃｋ Ｐｕｂ．Ｃｏ．、Ｎ．Ｊ．１９９１）で入手可能である。
【００８０】
治療用組成物中の薬学的に許容される担体は、水、食塩水、グリセロールおよびエタノールなどの液体をさらに含むことができる。さらに、湿潤剤または乳化剤、ｐＨ緩衝剤などの補助剤がこのような組成物中に存在してもよい。このような担体は、個体による摂取のために、医薬組成物が、錠剤、丸剤、糖衣錠、カプセル剤、液剤、ゲル、シロップ、スラリー、懸濁液などとして製剤化されるのを可能にする。
【００８１】
ロスタフロキシンを含む医薬品は、それだけに限定されないが、経口、静脈内、筋肉内、動脈内、脊髄内、髄腔内、心室内、経皮内適用、皮下、腹腔内、鼻腔内、経腸、局所、舌下、直腸手段、または外科手術後の患部組織に局所的に、を含む任意の数の経路によって、本明細書に記載の方法で投与することができる。本発明の化合物はまた、徐放性マトリックス中に組み込まれている場合でさえ、ステントに適用（コーティング）することができる。
【００８２】
いくつかの実施形態では、コアＳＮＰの少なくとも１つおよび／またはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異を保有する個体におけるロスタフロキシンの投与に伴う治療および予防の点から期待される治療効果には、それだけに限定されないが、心肥大および心不全、心虚血、血管反応性増加、血管硬化、血管厚さ増加、腎肥大、腎不全、糸球体硬化症、タンパク尿、脳血管損傷、脳卒中、認知障害、網膜障害の予防または減少が含まれ得る。上記障害の全ては、血圧の病的増加（高血圧のグレードＩＩＩおよびＩＶ）の直接的または間接的結果として生じるものであり、単独であるいは互いに組み合わせて、ＣＡＮＤ１ ＳＮＰ、ＣＡＮＤ２ ＳＮＰ、選択されたＧＷＳ ＳＮＰおよび／またはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異と組み合わせてコアＳＮＰを保有する個体において、ロスタフロキシンにより正常化されるので、このような効果が期待される。さらに、ロスタフロキシンが腎臓のナトリウム再吸収の増加およびＳｒｃシグナル伝達経路の活性化などの高血圧のいくつかの機構に拮抗する能力のために、高血圧によって直接的に引き起こされるもの以外の器官損傷を本治療により予防することができる。例えば、ＡＤＤ１ Ｔｒｐ４６０遺伝的変異体を保有する個体は、同じレベルの血圧で、Ｇｌｙ４６０ ＡＤＤ１変異体の保有者よりも高い心血管系合併症の発生率を示す。また、高い血漿ウアバインレベルを有する高血圧個体は、同様の血圧レベルであるが低いウアバイン血漿レベルを有する個体よりも高い心血管系合併症率を示す。選択されたコアＳＮＰの少なくとも１つを保有する個体におけるロスタフロキシン後の血圧降下の増加の正確な機構は知られていないが、これらの機構は、ロスタフロキシンによる分子標的の命中によって誘引される機構に関連するに違いない。結果として、コアＳＮＰ遺伝子型の少なくとも１つを保有する個体において、ロスタフロキシンにより誘導される血圧降下に関連する利点を超える利点が期待される。
【００８３】
いくつかの実施形態では、コアＳＮＰの少なくとも１つを保有する個体において、０．０５〜０．１５ｍｇ／日に及ぶロスタフロキシンの用量（低用量）が、１．５〜５ｍｇ／日に及ぶもの（高用量）などのより高用量よりも大きい血圧降下を誘導することが期待される。特に、低用量は、約２３ｍｍＨｇの平均的血圧降下をもたらすことが期待される一方で、高用量は、約１５ｍｍＨｇの平均的血圧降下をもたらすことが期待される。さらに、コアＳＮＰの少なくとも１つを保有する個体において、これらの用量のロスタフロキシンは、それだけではないが、心肥大、心不全、血管抵抗増加、腎不全、糸球体硬化症、タンパク尿、多発性嚢胞腎、網膜障害、脳血管障害、メニエール症候群、認知障害、双極性障害などの高血圧に関連する心血管系合併症の進行を防止することが期待される。
【００８４】
いくつかの実施形態では、コアＳＮＰの少なくとも１つを保有する個体へのロスタフロキシン治療は、５μｇ〜５００００μｇ、好ましくは１０μｇ〜１５０００μｇ、最も好ましくは５０μｇ〜５００μｇに及ぶ１日当たりのμｇの用量で行うことができる。
【００８５】
本用量によると、０．０５〜０．５０ｍｇ／日（低用量）に及ぶ低用量は、１．５〜５ｍｇ／日（高用量）に及ぶ高用量と比較して、血圧降下の点で、より高い（＋５０％）応答をもたらす。さらに、低用量は、高用量と比較して適切に高い夜間血圧の降下をもたらす。
【００８６】
いくつかの実施形態では、互いに組み合わせておよび／またはＣＡＮＤ１、２およびＧＷＳＡ ＳＮＰに含まれるものなどの他の関連ＳＮＰと組み合わせて、コアＳＮＰの少なくとも１つを保有する個体へのロスタフロキシンの投与において（プロファイル８および９、実施例２参照）、ロスタフロキシンは、約８〜約２２．５ｍｍＨｇに及ぶ平均的血圧低下を誘導することが期待される。
【００８７】
いくつかの実施形態では、互いに組み合わせて、ならびにＣＡＮＤ１、ＣＡＮＤ２およびＧＷＳ ＳＮＰに含まれるものなどの他の関連ＳＮＰと関連して、コアＳＮＰの少なくとも１つを保有する個体へのロスタフロキシンの投与において（プロファイル８および９、実施例２参照）、ロスタフロキシンは、２３ｍｍＨｇのオフィス（収縮期、日周性）血圧および約９ｍｍＨｇの夜間血圧の平均的血圧降下を誘導することが期待される。
【００８８】
いくつかの実施形態では、単独でまたは互いにもしくは追加の関連ＳＮＰと組み合わせてコアＳＮＰの少なくとも１つを保有する個体へのロスタフロキシンの投与は、ロサルタンまたはヒドロクロロチアジドなどの他の降圧薬に対する個体の応答と比較すると、ロスタフロキシンに対する改善された応答をもたらす。特に、単独でまたは互いに（もしくは追加の関連ＳＮＰと）組み合わせてコアＳＮＰの少なくとも１つを保有する個体へのロスタフロキシンの投与は、未治療患者において、ロサルタンまたはＨＣＴＺそれぞれによりもたらされるよりも少なくとも４０％高い血圧降下をもたらすことが期待される（実施例２参照）。
【００８９】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の治療を評価する方法は、コアＳＮＰ：ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ５０１３０９３、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ１２５１３３７５、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２３４５０８８からなる群から選択される少なくとも１つの多型に関して配列情報を得るステップを含み、前記情報は、個体におけるロスタフロキシンの有効性を予測する。
【００９０】
いくつかの実施形態では、それだけに限定されないが、ｒｓ４９６１（ＡＤＤ１）、ｒｓ４９８４（ＡＤＤ２）、ｒｓ３７３１５６６（ＡＤＤ３）、ｒｓ９１４２４７（ＬＳＳ２）、ｒｓ１０４５６４２（ＭＤＲ２）、ｒｓ１０５０２９３３、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ４３０９４８３、ｒｓ４７３９０３７および本開示を読めば当業者により同定可能な追加のＳＮＰ（プロファイル８〜９からの追加のＳＮＰ：ｒｓ１０９２３８３５（ＨＳＤ１８）、ｒｓ９４７１３０（ＨＳＤ１９）、ｒｓ８８００５４（ＷＮＫ１））を含む、ＣＡＮＤ１遺伝子、ＣＡＮＤ２遺伝子および／またはＧＷＳ遺伝子のＳＮＰなどのロスタフロキシンに対する応答に影響を及ぼす追加の関連遺伝的変異についての配列情報も得ることができる。
【００９１】
いくつかの実施形態では、配列情報は、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９および配列番号１１の配列の少なくとも１つを含み、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、それぞれ配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０および配列番号１２などの対応する検出された配列情報により予測することができる。
【００９２】
より具体的には、配列情報が、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９および配列番号１１の配列の少なくとも１つを含む実施形態では、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、配列番号１については配列番号１３および１４、配列番号３については配列番号１５および１６、配列番号５については配列番号１７および１８、配列番号７については配列番号１９および２０、配列番号９については配列番号２１および２２ならびに配列番号１１については配列番号２３および２４を含む対応する検出された対立遺伝子配列情報により予測することができる。
【００９３】
いくつかの実施形態では、本方法は、ｒｓ４９６１、ｒｓ４９８４、ｒｓ１０９２３８３５、ｒｓ９４７１３０、ｒｓ９１４２４７、ｒｓ１０４５６４２、ｒｓ８８００５４、ｒｓ１０５０２９３３、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ４３０９４８３およびｒｓ４７３９０３７からなる群から選択される少なくとも１つの多型についての配列情報を得るステップを含む。特に、いくつかの実施形態では、追加の関連配列情報は、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３および配列番号４５をさらに含み、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、それぞれ配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４および配列番号４６などの対応する検出された配列情報により予測することができる。
【００９４】
より具体的には、配列情報が、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３および配列番号４５の配列の少なくとも１つを含む実施形態では、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、配列番号２５については配列番号４７および４８、配列番号２７については配列番号４９および５０、配列番号２９については配列番号５１および５２、配列番号３１については配列番号５３および５４、配列番号３３については配列番号５５および５６、配列番号３５については配列番号５７および５８、配列番号３７については配列番号５９および６０、配列番号３９については配列番号６１および６２、配列番号４１については配列番号６３および６４、配列番号４３については配列番号６５および６６ならびに配列番号４５については配列番号６７および６８を含む対応する検出された対立遺伝子配列情報により予測することができる。
【００９５】
特に、配列情報は、遺伝子型解析：ＩＬＬＵＭＩＮＡ製のＧｅｎＣｈｉｐまたは当業者により同定可能な追加の方法およびシステムを使用して得ることができる。いくつかの実施形態では、本明細書に開示されるロスタフロキシン治療を評価する方法は、以下の実施例８で列挙する配列番号３５〜配列番号５８のプライマーなどの、コアＳＮＰ配列情報またはその一部のためのプローブを含むシステムによって行うことができる。
【００９６】
いくつかの実施形態では、ロスタフロキシンによる治療を評価するための方法は、コーカサス人だけでなくアフリカ人、アジア人またはアフリカ系アメリカ人も含む種々の民族性の、少なくとも１８歳の、男性または女性であり、好ましくは、それだけに限定されないが、原発性高血圧のグレードＩまたはＩＩであり、未治療または１種のみの薬物もしくはわずか２種の降圧薬しか含まない１配合錠による治療を受けており、重症もしくは悪性高血圧または二次性高血圧（腎動脈疾患の病歴を含む）でなく、関連状態およびわずか２種の追加の心血管危険因子もなく、ロスタフロキシンの吸収もしくは肝クリアランスに影響し得る胃腸系の手術または疾患がなく、ロスタフロキシン投与の少なくとも６ヶ月前からいかなる他の治験薬による治療も受けていない高血圧患者の選択を含む。患者は、欧州高血圧学会および欧州心臓病学会の２００３年のガイドラインにしたがって治療することができる［Ｒｅｆ．７］。
【００９７】
血圧は、従来の自由行動下血圧測定に関する欧州高血圧学会の勧告にしたがって、自由行動条件下で監視することができる［Ｒｅｆ．８］。血圧の測定は、オシロメトリックレコーダーまたは他の任意の有効な携帯型レコーダーもしくは血圧計を使用して行うことができる。血圧は、患者が座位で少なくとも５分間安静にした後で、腕で監視すべきである。患者の遺伝子型は、上腕静脈で採取した血液サンプルで測定することができる。ＤＮＡを、標準的手順［Ｒｅｆ．９］にしたがって、またはカスタムキットの使用により（例えば、ＰｒｏｍｅｇａゲノムＤＮＡ精製Ｃａｔ Ａ２３６０またはＱｉａｇｅｎ ＰＡＸｇｅｎｅ Ｂｌｏｏｄ ＤＮＡキット）血液から抽出し、保管し、選択されたヌクレアーゼ検出アッセイ（例えば、対立遺伝子識別のためのオンデマンドＡＢＩアッセイ）を使用して目的のＳＮＰの遺伝子型分類をする。いくつかの実施形態では、配列情報は、当業者に同定可能な方法を使用して得ることができる。
【００９８】
コアＳＮＰの少なくとも１つ、特に、本明細書に記載の選択された遺伝子型を、単独で、あるいは互いに関連して、ならびに／あるいはＣＡＮＤ１、ＣＡＮＤ２およびＧＷＳ ＳＮＰに属する追加の関連ＳＮＰ、特に本明細書に記載の選択された遺伝子型と関連して保有する、および／または関連する配列情報を有する個体を、１日１回、経口経路により、０．０５〜５ｍｇ／日に及ぶ用量で、好ましくは午前７時と午前９時の間の午前中に、定義される医薬組成物で物質を投与することによって、ロスタフロキシンで治療する。治療は、少なくとも５週間から患者の一生涯まで続き得る。
【００９９】
いくつかの実施形態では、遺伝的変異のロスタフロキシン活性への影響が、個体中のロスタフロキシンに対する応答を予測する方法の基礎を形成する。本方法は、ＫＣＮＳ３、ＴＨＳＤ７Ａ、ＦＡＭ４６Ａ、ＬＯＣ３８９９７０、ＨＬＡ−ＧおよびＴＴＣ２９からなる群から選択される遺伝子の遺伝子間または遺伝子内領域についての個体の遺伝子型を検出するステップと、検出された遺伝子型を、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型を含むロスタフロキシンに対する既知の応答に関連する以前に同定された遺伝子型と比較するステップとを含む。
【０１００】
本明細書で使用する「検出する」または「検出」および「検出可能な」という用語は、それだけに限定されないが、組織サンプル、反応混合物、分子複合体および基質を含む限られた空間の一部における、化合物、配列もしくは遺伝子型の存在、現存または現状の決定を示す。検出は、化合物の数量の測定（定量化とも呼ばれる）に言及する、関連するまたはこれを含む場合には、「定量的」であり、それだけに限定されないが、化合物の量または割合を決定するよう設計された任意の分析を含む。検出は、定量化されていない別の標的またはシグナルに対する相対的存在量の点から、化合物の質または種類の同定に言及する、関連するまたはこれを含む場合には、「定性的」である。
【０１０１】
遺伝子型の検出は、当業者により同定可能ないくつかの技術にしたがって行うことができる。一般に、単一ＳＮＰ解析の方法は、ＰＣＲ−ＲＦＬＰ解析、ＤＮＡシークエンシング、Ｔａｑｍａｎアッセイ、動的ＰＣＲである。ＣＡＮＤ１ ＳＮＰ（実施例３）およびＡＤＤ１、ＡＤＤ２、ＨＳＤ１８、ＨＳＤ１９、ＬＳＳ２、ＭＤＲ２、ＷＮＫ遺伝子（実施例４）を遺伝子型分類するために、本報告では、この方法の１つであるＴａｑｍａｎアッセイ（オンデマンド解析ならびにＡＢＩ製のカスタムＭＧＢプローブおよびプライマー設計）を使用した。
【０１０２】
複数ＳＮＰ解析のアッセイは、いくつかの市販のプラットフォームおよび各チップについて可変数の遺伝子（何百〜何百万）を有する入手可能なまたはカスタムＧｅｎｅ−Ｃｈｉｐを利用する。本開示では、ＨｕｍａｎＨａｐ １Ｍ Ｄｕｏ ｃｈｉｐ ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ Ｂｅａｄｓ ＣｈｉｐおよびＩｌｌｕｍｉｎａ Ｉｎｆｉｎｉｕｍ ＩＩ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙを使用して、実施例４（ｒｓ１０５０２９３３、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ４３０９４８３、ｒｓ４７３９０３７）ならびに実施例５および６において、ＳＮＰを遺伝子型分類した。
【０１０３】
本方法では、個体中で検出された遺伝子型がロスタフロキシン応答に関連する同一遺伝子型である場合、ロスタフロキシンに対する個体の応答は、既知の応答であると予測される。ロスタフロキシンに関連して本明細書で使用する「応答」という用語は、個体へのロスタフロキシンの投与に関連する個体の状態の任意の作用または変化の事実を示す。個体中のロスタフロキシンに対する代表的な応答は、臨床的に関連する血圧降下を含む。特に、プラセボにより引き起こされるよりも有意に高く、特に、少なくとも治療前の血圧値の１０％と等しい血圧降下、または収縮期血圧については１４０ｍｍＨｇ以下もしくは拡張期血圧については９０ｍｍＨｇ以下の血圧値をもたらすことができる。いくつかの実施形態では、本方法は、例えば、個体の単離ＤＮＡ中で、ＡＤＤ１、ＡＤＤ２、ＡＤＤ３、ＣＹＰ１１Ａ１、ＨＳＤ３Ｂ１、ＬＳＳ、ＡＢＣＢ１／ＭＤＲ１、ＳＬＣＯ４Ｃからなる群から選択される遺伝子の遺伝子間または遺伝子内領域についての個体の遺伝子型を検出するステップと、検出された遺伝子型を、ｒｓ４９６１、ｒｓ４９８４、ｒｓ３７３１５６６、ｒｓ９１４２４７、ｒｓ１０４５６４２および／またはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異からなる群から選択される少なくとも１つの多型を含む、既知のロスタフロキシン応答に関連する以前に同定された遺伝子型と比較するステップとをさらに含むことができる。いくつかの実施形態では、本方法は、ＡＣＴＮ１、ＡＤＲＡ１Ａ、ＡＧＴＲ１、ＡＱＰ２、ＡＴＰ１Ａ３、ＣＬＣＮＫＡ、ＣＬＣＮＫＢ、ＦＸＹＤ２、ＦＸＹＤ６、ＦＹＮ、ＮＥＤＤ４Ｌ、ＮＫＡＩＮ３、ＰＫＤ１、ＰＫＤ２、ＳＣＮＮ１Ｂ、ＳＧＫ１、ＳＬＣ１２Ａ１、ＳＬＣ８Ａ１、ＴＪＰ１、ＵＭＯＤおよびＷＮＫ１からなる群から選択される遺伝子の遺伝子間または遺伝子内領域についての個体の遺伝子型を検出するステップと、検出された遺伝子型を、ｒｓ２４２０９３、ｒｓ１９９６３９６、ｒｓ１０５０３８０６、ｒｓ１３２５１７８０、ｒｓ１７４３０７０６、ｒｓ１０１０２０２４、ｒｓ５２６３０２、ｒｓ５４４１０４、ｒｓ３１０２０８７、ｒｓ５１８３、ｒｓ３７７２６２７、ｒｓ２２７６７３６、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ３７４１５５９、ｒｓ２２１７３４２、ｒｓ１０９２７８８８、ｒｓ６６０４９０９、ｒｓ９４５４０３、ｒｓ７１１７３１４、ｒｓ１０７９０２１２、ｒｓ１１２１６５９８、ｒｓ９１０６８２、ｒｓ１３２１８３１６、ｒｓ４３０９４８３、ｒｓ１３２８０３０７、ｒｓ４７３９０３７、ｒｓ１７５９６７７４、ｒｓ２７２８１０８、ｒｓ１７７８６４５６、ｒｓ７６９６３０４、ｒｓ２７２５２２２、ｒｓ１７１９９５６５、ｒｓ２７５８１５２、ｒｓ１０５７２９３、ｒｓ１６９６０７１２、ｒｓ７５９３５９、ｒｓ４０４２１４、ｒｓ１００５２１３、ｒｓ１７０２５４５３、ｒｓ２１１０９２３、ｒｓ１４２８５７１、ｒｓ４３５４０４、ｒｓ１２９０８７８７、ｒｓ１１６４７７２７、ｒｓ８８００５４およびｒｓ１１０６４５８４ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異からなる群から選択される少なくとも１つの多型を含む、既知のロスタフロキシン応答に関連する以前に同定された遺伝子型と比較するステップとをさらに含むことができる。いくつかの実施形態では、本方法は、ＡＲＬ５Ａ、ＡＴＰ２Ａ３、ＣＯＸ１０、ＤＰＨ５、ＦＡＩＭ３、ＦＡＭ４６Ａ、ＨＣＧ９、ＨＬＡ−Ａ、ＨＬＡ−Ｆ、ＨＬＡ−Ｇ、ＫＣＮＳ３、ＬＯＣ１３１６９１、ＬＯＣ３８９１７４、ＬＯＣ３８９９７０、ＬＯＣ６４２７２７、ＬＯＣ６４４１９２、ＬＯＣ６４９４５８、ＬＯＣ７２８３６０、ＬＯＣ７２８３１６、ＰＩＧＲ、ＲＣＡＤＨ５、ＲＰ３−３７７Ｈ１４．５、ＳＨ３ＰＸＤ２Ａ、ＳＬＣ３０Ａ７、ＴＨＳＤ７Ａ、ＴＭＥＭ２００Ａ、ＴＲＩＭ３１、ＴＴＣ２９およびＶＣＡＭ１からなる群から選択される遺伝子の遺伝子間または遺伝子内領域についての個体の遺伝子型を検出するステップと、検出された遺伝子型を、ｒｓ１２９９６１８６、ｒｓ９８９３３７２、ｒｓ７２１６３３１、ｒｓ７５２１６６８、ｒｓ１８８３３４、ｒｓ４９９８６６２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ６４５７１１０、ｒｓ３８９３４６４、ｒｓ２５１７７１８、ｒｓ１３６２１２６、ｒｓ５０１３０９３、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ６７１８２８２、ｒｓ７２１２０７、ｒｓ２５５５５００、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ８１７９６５４、ｒｓ１９０１１３９、ｒｓ２４２７８３２、ｒｓ９３６１８６３、ｒｓ１９９８３９４、ｇａ００１６１９、ｒｓ２２７５５３１、ｒｓ７４８１４０、ｒｓ４７１０５９２、ｒｓ２７４３９５１、ｒｓ１０１５９５６９、ｒｓ３０８７８１６、ｒｓ１０４９３９４０、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ２３２６９１２、ｒｓ１１１０４４６、ｒｓ１２５１３３７５およびｒｓ１７４１４９５４ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異からなる群から選択される少なくとも１つの多型を含む、既知のロスタフロキシン応答に関連する以前に同定された遺伝子型と比較するステップとをさらに含むことができる。
【０１０４】
いくつかの実施形態では、本明細書に開示されるロスタフロキシンに対する応答を予測する方法は、患者をレスポンダーおよび非レスポンダーに分類するために１回だけ適用される、遺伝子型分類ための第１成分と、１日５０〜５００γに及ぶ用量でロスタフロキシンおよび薬学的に許容される担体を含む組成物とを含むシステムによって行うことができる。
【０１０５】
いくつかの実施形態では、ロスタフロキシンに対する個体の応答を予測するシステムは、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型のためのプローブと、プローブハイブリダイゼーションの結果および以前に同定された遺伝子型を関連付けるルックアップテーブルとを含むことができる。
【０１０６】
これらの実施形態のいくつかでは、プローブは、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０および配列番号１２からなる群から選択される少なくとも１個の単離ポリヌクレオチド、または配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０もしくは配列番号１２に相補的な配列と特異的にハイブリダイズすることができるそのフラグメントを含む。
【０１０７】
これらの実施形態のいくつかでは、本システムは、ｒｓ４９６１、ｒｓ４９８４、ｒｓｒｓ１０９２３８３５、ｒｓ９４７１３０、ｒｓ９１４２４７、ｒｓ１０４５６４２、ｒｓ８８００５４、ｒｓ１０５０２９３３、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ４３０９４８３およびｒｓ４７３９０３７からなる群から選択される少なくとも１つの多型のためのプローブをさらに含むことができる。
【０１０８】
特に、プローブは、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４および配列番号４６からなる群から選択される少なくとも１個の単離ポリヌクレオチド、または配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４もしくは配列番号４６に相補的な配列と特異的にハイブリダイズすることができるそのフレグメントを含むことができる。いくつかの実施形態では、プローブは、配列番号３５〜配列番号５８からなる群から選択される配列を有することができる。
【０１０９】
いくつかの実施形態では、本システムは、血液サンプル採取用のチューブ、ゲノムＤＮＡ抽出、ＤＮＡ増幅用の緩衝液（例えば、プライマー、緩衝液および／またはｄＮＴＰ酵素）、および当業者により同定可能な追加の成分を含むことができる。
【０１１０】
いくつかの実施形態では、単一ＳＮＰ解析のために以下を含むいくつかの手順を使用することができる：ａ）ＡＢＩ製のＰｒｅ−Ｄｅｓｉｇｎｅｄ ＳＮＰアッセイまたはカスタムＳＮＰ Ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ Ａｓｓａｙ、およびデータ解析のためのリアルタイムＰＣＲシステムを使用した、対立遺伝子特異的ＭＧＢプローブによるリアルタイムＰＣＲ ＳＮＰ遺伝子型分類；ｂ）普遍的なエネルギー移動プライマー（Ａｍｐｌｉｆｌｕｏｒ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ）およびデータ解析のためのリアルタイムＰＣＲシステムを使用した対立遺伝子特異的ＰＣＲ ＳＮＰ；ｃ）ＰＣＲ−ＲＦＬＰ解析およびアガロースゲル検出；ｄ）動的ＰＣＲ；ならびにｅ）ダイレクトシークエンシング。単一ＳＮＰ解析を行うのに適した追加の手順は、当業者により同定可能であり、さらに詳細には論じない。
【０１１１】
いくつかの実施形態では、本システムは、ＩＬＬＵＭＩＮＡ、ＡＦＦＩＭＥＴＲＩＸもしくはＡＢＩまたは他の専門会社製の遺伝子チップ（マイクロアレイ）のカスタムサービスを含むことができる。発明者等の目的のために単一遺伝子チップ中に含むべきＳＮＰの数は比較的少ない（２０〜３０）だろう。特定の遺伝子チップを集めるための主成分は５つの主要なプロセスに基づく：ＤＮＡ精製、特異的なプライマーミックスを使用した精製ＤＮＡのＰＣＲ増幅；増幅した産物のフラグメンテーションおよびラベリング；増幅した産物のマイクロアレイとのハイブリダイゼーションおよび結合した産物の染色、マイクロアレイのスキャニングおよび解析。
【０１１２】
いくつかの実施形態では、遺伝的変異のロスタフロキシン活性への影響は、ロスタフロキシンに対する改善された応答を有する個体を同定する方法の基礎を形成する。本方法は、個体の遺伝子間または遺伝子内領域中の配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９および配列番号１１のヌクレオチド配列のいずれか１つにおける一塩基多型（ＳＮＰ）を検出するステップを含み、ここでは、コアＳＮＰの存在は、前記個体中のロスタフロキシンに対する改善された応答と相関する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の追加の関連ＳＮＰを、ロスタフロキシンに対する改善された応答を有する個体を同定する方法で検出することもできる。
【０１１３】
いくつかの実施形態では、遺伝的変異のロスタフロキシン活性への影響は、心血管状態を有する個体中のロスタフロキシンに対する治療応答を改善する方法の基礎を形成する。本方法は、コアＳＮＰの少なくとも１つおよび／またはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の保有者であることが決定された前記個体にロスタフロキシンを投与するステップを含む。
【０１１４】
いくつかの実施形態では、遺伝的変異のロスタフロキシン活性への影響は、ロスタフロキシンにより個体を治療する方法の基礎を形成する。本方法は、コアＳＮＰの存在を示す情報、および場合により、個体中のロスタフロキシン応答に影響を及ぼす追加のＳＮＰに関する情報を得るステップと、０．００５ｍｇ〜５０ｍｇ、好ましくは０．０１ｍｇ〜１５ｍｇ、最も好ましくは０．０５ｍｇ〜５ｍｇに及ぶ用量で、改善された応答に関連する遺伝子型を有する個体のためにロスタフロキシンを投与するステップとを含む。
【０１１５】
いくつかの実施形態では、遺伝的変異のロスタフロキシン活性への影響は、心血管状態を有する個体を治療する方法の基礎を形成する。本方法は、少なくとも１つのコアＳＮＰおよび／またはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の保有者である患者に有効量のロスタフロキシンを投与または処方するステップを含む。
【０１１６】
いくつかの実施形態では、心血管状態は高血圧であり、個体を治療する方法は、
ａ）高血圧を患う個体から核酸サンプルを得るステップと；
ｂ）前記核酸サンプル中の、本明細書に記載のコアＳＮＰからなる群から選択される多型の１つまたは複数の存在を決定するステップと；
ｃ）薬学的活性量のロスタフロキシンを、本明細書に記載のコアＳＮＰからなる群から選択される少なくとも１つの多型を有することが示された患者に投与するステップと
により行うことができる。
【０１１７】
本明細書に開示される個体を治療する方法において、ロスタフロキシンは、典型的には、医薬組成物の形態で投与される。このような組成物は、医薬分野で周知の方法で調製することができ、少なくとも１つの活性化合物および媒体を含む。本明細書で使用する「媒体」という用語は、通常、有効成分として組成物中に含まれるロスタフロキシン化合物のための溶媒、担体、結合剤、賦形剤または添加剤として作用する種々の媒体のいずれかを示す。当業者は、医薬組成物を製剤化するのに適した全種類のこのような溶媒、担体、賦形剤または添加剤化合物を知っている。
【０１１８】
ロスタフロキシンは、従来使用されている補助剤、担体、賦形剤または添加剤と共に、医薬組成物およびその単一用量の形態にすることができ、このような形態において、全て経口で使用するための錠剤もしくは充填カプセル剤などの固体、溶液、懸濁液、乳濁液、エリキシル剤などの液体、または同液体で満たされたカプセル剤として、あるいは非経口用（皮下使用を含む）の滅菌注射溶液の形態で使用することができる。このような医薬組成物およびその単一剤形は、追加の活性化合物もしくは有効成分を含むまたは含まないで、従来の割合で成分を含んでよく、このような単一剤形は、使用される所期の日用量範囲と釣り合った任意の適当な有効量の有効成分を含んでよい。
【０１１９】
いくつかの実施形態では、ロスタフロキシンは、「薬学的有効量」で投与される。実際に投与される化合物の量は、典型的には、治療する状態、選択される投与経路、薬物の組み合わせ、個々の患者の年齢、体重および応答、患者の症状の重症度などを含む関連する状況に照らして、医師によって決定される。一般的に、有効用量は、１日当たりの単回投与として０．００５ｍｇ〜５０ｍｇ、好ましくは０．０１ｍｇ〜１５ｍｇ、最も好ましくは０．０５ｍｇ〜５ｍｇである。
【０１２０】
組成物は、単独で患者に投与してもよいし、他の薬剤、薬物またはホルモンと組み合わせて投与してもよい。患者に投与される組成物の有効用量は、０．０５ｍｇ〜５ｍｇ／日に及ぶ。
【０１２１】
所期の送達経路に応じて、ロスタフロキシンは、好ましくは非経口、局所用または経口組成物として、より好ましくは経口製剤として製剤化される。経口投与用組成物は、バルク溶液もしくは懸濁液、またはバルク粉末の形態をとり得る。しかしながら、より一般的には、正確な投薬を促進するために組成物は単位剤形で提供される。「単位剤形」という用語は、ヒト被験体および他の哺乳動物のための単一の用量として適当な物理的に分離した単位を指し、各単位は、適当な医薬添加剤と組み合わせて、所望の治療効果をもたらすよう計算された所定の量の活性物質を含む。典型的な単位剤形は、液体組成物の詰替用の予め計量されたアンプルもしくは注射器、または個体組成物の場合には丸剤、錠剤、カプセル剤などを含む。このような組成物中で、本発明の化合物は、通常、微量成分であり（約０．１〜約５０重量％、好ましくは約１〜約４０重量％）、残りは、所望の投与形態を形成するのに役立つ種々の媒体または担体および加工助剤である。
【０１２２】
投薬治療は、単回投与スケジュールであっても複数回投与スケジュールであってもよい。
【０１２３】
経口投与に適した液体形態は、緩衝液、懸濁化剤および分散化剤、着色剤、香味剤などを含む適当な水性または非水性媒体を含んでよい。
【０１２４】
固体形態は、例えば、以下の成分または同様の性質の化合物のいずれかを含んでよい：結晶セルロース、アカシア、トラガカントゴム、ゼラチンまたはポリビニルピロリドンなどの結合剤；デンプンまたは乳糖などの添加剤；アルギン酸、プリモゲル（Ｐｒｉｍｏｇｅｌ）またはジャガイモデンプンもしくはコーンスターチなどの崩壊剤；ステアリン酸マグネシウム、タルク、ポリエチレングリコールまたはシリカなどの潤滑剤；コロイド性二酸化ケイ素などの滑剤；ショ糖またはサッカリンなどの甘味剤；あるいはペパーミント、サリチル酸メチルまたはオレンジ香料などの香味剤。錠剤は、医薬実務の分野の当業者に周知の方法にしたがってコーティングしてよい。
【０１２５】
非経口組成物は、典型的には、注射用滅菌生理食塩水もしくはリン酸緩衝生理食塩水、または当技術分野で既知の他の注射用担体に基づく。上記のように、このような組成物中の式Ｉの化合物は、典型的には、微量成分であり、しばしば０．０５〜１０重量％に及び、残りは注射用担体などである。
【０１２６】
ロスタフロキシンはまた、徐放性形態でまたは徐放性薬物送達システムから投与することができる。代表的な徐放性物質の記載は、組み込まれたＲｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ中の物質中にも見出すことができる。
【０１２７】
経口投与組成物または非経口組成物のための上記成分は、代表的なものに過ぎない。さらなる物質ならびに加工技術などは、その全体が参照により本明細書に組み込まれている、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、第２０版、２０００、Ｍａｒｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏｍｐａｎｙ、Ｅａｓｔｏｎ、Ｐｅｎｎｓｙｌｖａｎｉａの第５部に述べられている。
【０１２８】
いくつかの実施形態では、少なくとも１００個の隣接ヌクレオチドを含む単離核酸分子が開示されており、ここでは、ヌクレオチドの１つは、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９および配列番号１１の核酸配列、またはこれら相補配列のいずれか１つにおいて選択される一塩基多型（ＳＮＰ）である。
【０１２９】
いくつかの実施形態では、遺伝的変異のロスタフロキシン活性への影響は、心血管状態を治療的にまたは予防的に処理するのに有用な薬剤を同定する方法の基礎を形成する。
【０１３０】
本方法は、候補薬剤を用意するステップと、候補薬剤を、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３、ｒｓ１２５１３３７５またはそれらとの連鎖不平衝における多型からなる群から選択される少なくとも１つの多型を保有する個体に投与するステップと、前記候補薬剤に対する個体応答を検出するステップとを含む。
【０１３１】
いくつかの実施形態では、候補薬剤は、本明細書に示されるＣＡＮＤ１、ＣＡＮＤ２およびＧＷＳ ＳＮＰの１つまたは複数も保有する個体に投与される。
【０１３２】
いくつかの実施形態では、本方法は、高血圧患者を選択し、個体におけるロスタフロキシンによる治療を評価するために使用される手順にしたがって測定および検出を行うことによって行うことができる。これらの実施形態のいくつかでは、個体におけるロスタフロキシン治療の評価は、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型に関して配列情報を得ることによって行うことができ、ここでは、情報は個体中のロスタフロキシンの有効性を予測する。
【０１３３】
これらの実施形態のいくつかでは、配列情報は、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９および配列番号１１の配列の少なくとも１つを含み、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０および配列番号１２からなる群から選択される少なくとも１つの対応する検出された配列情報により予測することができる。
【０１３４】
これらの実施形態のいくつかでは、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、配列番号１については配列番号１３および１４、配列番号３については配列番号１５および１６、配列番号５については配列番号１７および１８、配列番号７については配列番号１９および２０、配列番号９については配列番号２１および２２ならびに配列番号１１については配列番号２３および２４からなる群から選択される少なくとも１つの対応する検出された対立遺伝子配列情報により予測することができる。
【０１３５】
これらの実施形態のいくつかでは、評価方法は、ｒｓ４９６１、ｒｓ４９８４、ｒｓ１０９２３８３５、ｒｓ９４７１３０、ｒｓ９１４２４７、ｒｓ１０４５６４２、ｒｓ８８００５４、ｒｓ１０５０２９３３、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ４３０９４８３およびｒｓ４７３９０３７からなる群から選択される少なくとも１つの多型についての配列情報を得るステップをさらに含むことができる。特に、配列情報は、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３および配列番号４５の配列の少なくとも１つを含むことができる。これらの配列情報について、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４および配列番号４６からなる群から選択される少なくとも１つの対応する検出された配列情報により予測することができる。
【０１３６】
これらの実施形態のいくつかでは、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、配列番号２５については配列番号４７および４８、配列番号２７については配列番号４９および５０、配列番号２９については配列番号５１および５２、配列番号３１については配列番号５３および５４、配列番号３３については配列番号５５および５６、配列番号３５については配列番号５７および５８、配列番号３７については配列番号５９および６０、配列番号３９については配列番号６１および６２、配列番号４１については配列番号６３および６４、配列番号４３については配列番号６５および６６ならびに配列番号４５については配列番号６７および６８からなる群から選択される少なくとも１つの対応する検出された対立遺伝子配列情報により予測することができる。
【０１３７】
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される心血管状態を治療的または予防的に処理するのに有用な薬剤を同定する方法は、本明細書に記載の関連遺伝的変異を検出及び同定するのに適した成分を含むシステムによって行うことができる。
【０１３８】
いくつかの実施形態では、ＫＣＮＳ３、ＴＨＳＤ７Ａ、ＦＡＭ４６Ａ、ＬＯＣ３８９９７０、ＨＬＡ−ＧおよびＴＴＣ２９からなる群から選択される遺伝子の遺伝子間または遺伝子内領域中の一塩基多型（ＳＮＰ）を検出するシステムが開示される。本システムは、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１のヌクレオチド配列のいずれか１つにおける一塩基多型（ＳＮＰ）を含む核酸分子と特異的にハイブリダイズする単離ポリヌクレオチドと、核酸分子のための緩衝液（ハイブリダイゼーションおよび／またはポリメリゼーション緩衝液など）の少なくとも１つと、ＳＮＰの検出のために核酸配列と組み合わせて使用するための酵素とを含む。特に、酵素は、調査する遺伝子間および／または遺伝子内領域の１つまたは複数のためのポリメラーゼ連鎖反応を触媒することができるポリメラーゼであり得る。
【０１３９】
本明細書で使用するハイブリダイゼーションという用語は、核酸の２本以上の相補鎖間の非共有結合性、配列特異的相互作用を確立して、二本鎖の場合には二重鎖と呼ばれる単一ハイブリッドにするプロセスを示す。特異的ハイブリダイゼーションは、特異的な配列−配列相互作用をもたらすハイブリダーゼーションである。ある分子と別の分子との結合に関連して本明細書で使用する「特異的」、「特異的に」または「特異性」という表現は、その分子と別の分子間の認識、接触および安定な複合体の形成を指し、他の分子についてはその分子の各々と別の分子の間の認識、接触および安定な複合体の形成は実質的にほとんどないか全くない。ポリヌクレオチドの配列に関連して本明細書で使用する「特異的」という用語は、相補的な配列である単一ポリヌクレオチドとの配列の特有の会合を指す。
【０１４０】
本明細書で使用する「ポリメラーゼ連鎖反応」という用語は、単一または数コピーの核酸の一部を数桁に増幅させて、数千から数百万の特定のＤＮＡ配列のコピーを生み出す任意の適当な技術を示す。本方法は、核酸溶融のための反応の加熱および冷却ならびに核酸の酵素的複製の繰り返しのサイクルからなる熱サイクルによる。
【０１４１】
いくつかの実施形態では、本システムはまた、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３および配列番号４５のヌクレオチド配列のいずれか１つにおける一塩基多型（ＳＮＰ）を含む核酸分子と特異的にハイブリダイズする単離ポリヌクレオチドを含むことができる。本明細書に開示されるシステムは、部品のキットの形態で提供することができる。部品のキットにおいて、プローブ、医薬組成物、および他の成分、および基質は、独立してキットに含まれる。特に、プローブは、１つまたは複数の組成物中に含まれてよく、各プローブは、適当な媒体、担体または補助剤と共に組成物中に含まれてよい。
【０１４２】
いくつかの実施形態では、緩衝液、酵素および適当な容器をキットの追加の成分としてさらに提供することができる。追加の成分は、ラベル（放射性同位体、蛍光団、化学発光色素、発色団、酵素、酵素基質、酵素補因子、酵素阻害剤、色素、金属イオン、ナノ粒子、金属ゾル、リガンド（ビオチン、アビジン、ストレプトアビジンまたはハプテンなど）などの検出することができる分子）、マイクロ流体チップ、標準試料、および本開示を読めば当業者により同定可能な追加の成分を含むことができる。特に、キットの成分は、本明細書に開示される方法を行うために、適当な説明書および他の必要な試薬と共に提供することができる。キットは、通常は、別々の容器中に組成物を含む。アッセイを行うための、説明書、例えば、紙またはテープもしくはＣＤ−ＲＯＭなどの電子サポート上の、書面説明書または音声説明書が、通常、キットに含まれる。キットはまた、使用する特定の方法に応じて、他の包装された試薬および物質（すなわち、洗浄緩衝液など）を含むことができる。
【０１４３】
組成物の適当な担体剤または補助剤の同定、ならびにキットの一般的製造および包装に関するさらなる詳細は、本開示を読めば当業者により同定可能である。
【０１４４】
以下の節では、本開示は、本開示の範囲を限定するとみなされると解釈されないいくつかの実施例によって説明される。
実施例
【０１４５】
遺伝的変異の、ロスタフロキシンに対する個体応答への影響を確認するために、薬理ゲノミクス研究を行った。薬理ゲノミクス研究のためのサンプルは、［Ｒｅｆ．１０、１１、１２］に記載の手順にしたがって、Ｈｕｍａｎ１Ｍ Ｄｕｏ ＣＨＩＰ ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ Ｂｅａｄ Ｃｈｉｐを使用して、Ｉｌｌｕｍｉｎａ製のＨｕｍａｎ１Ｍアレイで遺伝子型分類した３４２人の個体からなった。［Ｒｅｆ１３］中のような人口統計学を使用して、第１期間（５週間）に、個体中で、１６９人にプラセボ処理を投与し、１７３人に活性薬物（ロスタフロキシン）を投与した。特に、患者を、５週間、以下のロスタフロキシンの経口用量：０．０５、０．１５、０．５、１．５または５ｍｇ／日の１つにランダム化した。クロスオーバーデザインにおいて、各用量をプラセボと比較しなければならなかった。以前の研究は１ヶ月の洗い出しでは不十分であることを示したので［Ｒｅｆ．１４〜３０］、以前治療を受けなかった（ＮＰＴ）１９３人の患者を、以前治療を受けた１４９人と別に分析した。
【０１４６】
個体の上記サンプルについて、遺伝的関連解析を行い、試験した個体の表現型を、個体中で検出されたＳＮＰと関連づけた。選択した目的の表現型は血圧応答であった。検出のために選択したＳＮＰは、個体の常染色体上の１１１１１７０個のＳＮＰであった。
【０１４７】
目的の表現型が定量的変数（ＱＴ）であり、目的の表現型の分布に影響を及ぼす変数（因子）がＳＮＰ、治療（プラセボ、ロスタフロキシン）およびＳＮＰ＊治療相互作用である定量的遺伝子関連設計にしたがって、遺伝子解析を行った。
【０１４８】
特に、統計解析のために選択した定量的表現型は、第１治療期間の最後でのオフィス収縮期血圧（ＳＢＰ）（ＳＢＰ＿５）と１ヶ月の導入期間（ｒｕｎ−ｉｎ）後のベースラインでのオフィス収縮期血圧（ＳＢＰ＿０）の間のｍｍＨｇの差とし、本明細書ではＤＳＢＰ５＿０とも称される。次いで、選択されたＱＴ表現型および目的の表現型の分布に影響を及ぼす他の因子を、以下でさらに詳細に説明するように、以下の定量的形質相互作用検定
表現型＝ＳＮＰ＋治療＋ＳＮＰ＊治療相互
にしたがって、解析した。
【０１４９】
遺伝的関連を行うため、記述統計分析および推測統計分析を行った。
【０１５０】
記述統計分析を行って、データの主要パラメータを最初に要約および記載し、質的管理を行った。
【０１５１】
表１は、分析を行う際に出願人等により選択された統計的処理、パラメータおよび閾値ならびにそこからの成果において得られた結果を要約している。
【表１】
【０１５２】
行った遺伝的記述分析の結果も、表２ならびに図１、２および３でさらに詳細に説明する。
【表２】
【０１５３】
特に、表２には、全サンプルならびにプラセボおよびロスタフロキシンで処理した患者についてのＤＳＢＰ５＿０の記述統計が列挙されている。かなり控えめなＳＢＰの基礎レベルは、プラセボ群を含めるために要求される、「軽度の」高血圧（ＳＢＰ範囲１４０〜１７９ｍｍＨｇ）の患者を採用した点から説明することができる。表２に要約される結果の図解は、合計、治療およびプラセボにおけるＤＳＢＰ５＿０分布を示す図１に示されている。
【０１５４】
ＮＰＴ群については、残りの個体の合計遺伝子型分類率は９９．６７％であった；６０７１個のＳＮＰは欠測率検定に失敗し（コールレート＜９０％）、２５８１４８個のＳＮＰはＭＡＦ＜０．０５であった。頻度および遺伝子型分類の刈り込み後、８４８３４０個のＳＮＰが、０．０５のＭＡＦ閾値を使用した選別後に残った（データ不掲載）。
【０１５５】
上記を考慮して、出願人等は、二項表現型変数、ロスタフロキシンに対する応答−非応答を生み出すために、ＤＳＢＰ５＿０の分布の最低三分位点に関連して（−１１．７ｍｍＨｇ、すなわち、９９人の患者の中の３３人）、ＱＴ ＤＳＢＰ５＿０≦１１．７ｍｍＨｇのカットオフ値を選択した。ＤＳＢＰ５＿０閾値選択は、結果の統計的および臨床的関連性の両方を示すパラメータをもたらすよう行った。
【０１５６】
選択されたＱＴ閾値を示す記述統計分析の結果の図表現を図２に示す。
【０１５７】
図３は、変動の上位軸を使用して検出される試験個体間の遺伝的関連性を説明しており、ゼロ付近に分布する個体の軽い不均一なクラスター形成を示している。集団層別化の評価（および補正）は、系統的な祖先の差異の存在による偽陽性および偽陰性の有意な関連を避けることに関連している。
【０１５８】
次いで、処理（プラセボまたは活性薬物）に対する異なる応答と有意に関連するＳＮＰを検出するために計算されたＱＴを使用して、推測統計分析を行った。
【表３】
【０１５９】
表３は、記述統計的処理の結果を考慮して、出願人等により選択された統計的処理、閾値及び分析を要約している。
【０１６０】
特に、単変量解析に関して、ＳＮＰが一つずつ検討される単一点解析を行った。行われた定量的形質相互作用検定（Ｇ＊Ｅ、Ｇｅｎｅ＊ Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔ）は、
表現型＝ＳＮＰ＋治療＋ＳＮＰ＊治療
として関連を評価し、ここでは、主作用「治療」は、遺伝成分を考慮することなく、臨床試験それ自体を検定することに相当するので、解析の重点はＳＮＰ＊治療成分に、すなわち、主作用よりもむしろ相互作用にあった。主作用「ＳＮＰ」は、治療によって誘導される修正を考慮することなく、血圧の変動に影響を及ぼすＳＮＰを探す。相互作用効果（Ｇ＊Ｔ）のみが、どのＳＮＰ（Ｇ＝遺伝子）が、活性薬物またはプラセボのいずれかを投与された被験体におけるＳＢＰに影響を及ぼすかを評価する（Ｔ＝治療）。
【０１６１】
上位ＳＮＰのリストを形成することができる最も有意な関連を選別するために、ｐ＜１０−４の閾値を選択した。特に、出願人等は、「保守的な」Ｐ値（偽陰性に対して）を意図的に選択して、あまり有意でない結果をふるい落とした［Ｒｅｆ．３４、３５］。さらに、少なくとも２つの統計プログラム（ｐｌｉｎｋおよびｓｔａｔａ）を使用して、全ての潜在的に正の関連が意味のあることが確認された。上記アプローチにしたがって行われた単変量解析の結果を、図４に示す（以下の実施例６も参照）。
【０１６２】
推論相互作用分析に関して、観察されたＱＴ表現型ＤＳＢＰ５＿０の変動が、共に検討した複数のＳＮＰの連合効果に依存するかどうかを確かめるために種々の遺伝子間の相互作用を試験した。
【０１６３】
特に、次いで、ＳｔａｔａＳＥ９．２で実施されたように、単一線形回帰モデルを使用して、ロスタフロキシン／プラセボ内の、ＳＮＰの第１セット（ＳＮＰ１）およびＳＮＰの第２セットの（ＳＮＰ２）の限界効果に加えて、ＳＮＰ１とＳＮＰ２の間の相互作用効果（ＳＮＰ１＊ＳＮＰ２＊ｔｈｅｒ）について試験した。
【０１６４】
ＳＮＰセットは、ＳＮＰが検出された遺伝子、および選択したものの表現型（血圧の変動）の原因として同定された機構への遺伝子の関与可能性を考慮して確立した。
【０１６５】
従属変数としてＤＳＢＰ５＿０および独立変数として有意な候補ＳＮＰを使用して、プラセボおよびロスタフロキシンにおいて、ＳＴＡＴＡソフトウェアを使用して、Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ ＡＮＯＶＡ解析を行うことによって、プラセボと比較してロスタフロキシンに対する最大応答を有する遺伝子型を同定するために、これらのＳＮＰをさらに選択した。
【０１６６】
特に、プラセボと比較してロスタフロキシンに対する最大応答を有する２つのＳＮＰの間の相互作用の遺伝子型を選択するために、出願人等は、従属変数としてＤＳＢＰ５＿０および独立変数としてＳＮＰ間の相互作用を使用して、プラセボおよびロスタフロキシンにおいて、ＡＮＯＶＡ統計を行った。出願人等は、図５にこの処理の例を報告している：ｒｓ８８９９とｒｓ４６７８の間の相互作用。治療群で最大の著しい減衰をもたらし、プラセボ群ではもたらさないので、出願人等は、ｒｓ８８９９の遺伝子型ＡＡとｒｓ４６７８の遺伝子型ＢＢの間の相互作用を選択した。
【０１６７】
本調査の成果において、出願人等は、図５のｒｓ８８９９およびｒｓ４６７８の例などの、ロスタフロキシンでＱＴ表現型ＤＳＢＰ５＿０の著しい減衰を有し、プラセボ群では有さないＳＮＰの相互作用の遺伝子型を選択した。
【０１６８】
全ての遺伝子解析は、プログラムパッケージｇＰＬＩＮＫ［Ｒｅｆ．３３］を使用して行った。Ｅｉｇｅｎｓｏｆｔパッケージ（Ｌｉｎａｘプラットフォームについてバージョン２．０、Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ、Ｈａｒｖａｒｄ Ｍｅｄｉｃａｌ Ｓｃｈｏｏｌ、Ｂｏｓｔｏｎ、ＵＳＡ）を使用した主成分分析。ＥｉｇｅｎｓｏｆｔパッケージのＧｅｎｏｍｉｃ Ｃｏｎｔｒｏｌ（ＧＣ）を使用して、ゲノム膨張因子λを計算した。統計的遺伝子解析を完成させるため、および純粋な統計的遺伝学アプローチを超えたこれら全ての解析のために、プログラムＳｔａｔａＳＥ９．２を使用した。当業者は、本開示を読めば、統計解析の追加の詳細全てを同定することができるだろう。
【０１６９】
記述統計分析および推論統計分析後に、有意なＳＮＰの可能な最小のセットを使用して、活性治療に対するレスポンダーと非レスポンダー（ＮＲ）とを識別するために、遺伝子型分類プロファイルも作成した。この場合、「遺伝子プロファイル」は、単一ＳＮＰまたはその相互作用における遺伝子型の線形結合である。
【０１７０】
プロファイルを作成するために、各ＳＮＰについての異なる遺伝子型を変数とみなし、特に、より低頻度のホモ接合体遺伝子型を遺伝子型１（ｇ１）として同定し、ヘテロ接合体遺伝子型を遺伝子型２（ｇ２）として同定し、より高頻度のホモ接合体遺伝子型を（ｇ３）として同定した。
【０１７１】
したがって、例えば、因子としてＳＮＰ１のｇ１（成分１）、ＳＮＰのｇ２（成分２）およびＳＮＰ３のｇ１とＳＮＰ４のｇ２との相互作用（成分３）を有するような遺伝子プロファイルを構築した。プロファイルは、任意の数の成分を有することができる。
【０１７２】
少なくとも１つの成分が有意に関連する遺伝子型（例えば、前の例におけるＳＮＰ１のｇ１）を提供する場合には、任意の所与のプロファイルは１に等しいとコードされ、そうでなければプロファイルは０とコードされる。次いで、全被験体を、定義された患者のサブセットを特徴付けるのを可能にするプロファイルへの適合に応じて、０または１として分類する。
【０１７３】
次いで、［Ｒｅｆ．３６、３７］に記載されているものなどの手順に対して行われるロジスティック回帰を使用して、異なるプロファイルが被験体をＲまたはＮＲに分類する予測能力、すなわちロスタフロキシンについてのＲとＮＲとを識別する遺伝子型プロファイルを見出す能力を試験した。
【０１７４】
遺伝子プロファイルを評価するために出願人等によって選択されたパラメータは、オッズ比（ＯＲ）であり、これは、ＦＤＡガイドライン［Ｒｅｆ．３８］によると、薬理ゲノミクス試験の成績の情報を与えると考えられるパラメータの１つである。特に、ＦＤＡガイドラインによると、ＯＲは、プラセボではなく薬物に対するレスポンダー患者間の異なる遺伝子プロファイルによる識別の程度を評価するための臨床的に関連するパラメータである。
【０１７５】
ＯＲ値は、定義された遺伝子プロファイルにより、試験陽性患者（レスポンダー）のオッズと試験陰性患者（非レスポンダー）のオッズの比を示す。オッズ比は、以下のように陽性予測値（ＰＰＶ）および陰性予測値（ＮＰＶ）を組み合わせる：ＰＰＶ×ＮＰＶ／［（１００−ＰＮＶ）×（１００−ＮＰＶ）］。予測値（陽性または陰性のいずれか）は、目的の臨床状態（すなわち、定義された遺伝子プロファイルによる薬物に対する応答）を有する陽性または陰性の試験結果を有する患者の比率を表す。言い換えれば、ＯＲは、試験に対してレスポンダーである（ＰＰＶ）または非レスポンダーである（ＮＰＶ）確率である。１のオッズ比は、試験が、情報価値がないことを示し、したがって、オッズ比が高いほど、試験の予測力は高い。
【０１７６】
上記研究の結果に基づき、出願人等は、ロスタフロキシンの効果を検出するために選択された定量的表現型に有意に影響を及ぼすいくつかのＳＮＰおよび関連する遺伝子型プロファイルを同定した。
【０１７７】
特に、驚くべきことに、血圧に影響を及ぼす経路に以前は関連づけられていなかった遺伝子中に位置するいくつかのコアＳＮＰが、以下の実施例に示すようにロスタフロキシンの効果を増強する著しい能力を示した。
実施例１：コアＳＮＰは、ロスタフロキシンに対する個体の応答に影響を及ぼす
【０１７８】
上記研究の成果において、ある群のＳＮＰが、ロスタフロキシンに対する個体の応答に有意に影響を及ぼすものとして同定され、本明細書ではコアＳＮＰとも称される。本明細書に記載のコアＳＮＰの主要な特徴を、表４に示す。
【表４】
【０１７９】
ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５のコアＳＮＰは、上記統計解析の成果で、ロスタフロキシンに対する血圧応答に関連する有意なＳＮＰの最小のセットとしてゲノムワイド関連解析（ＧＷＡＳ）で同定された、ヒトゲノム中の染色体上の正確な位置は分かっているが、現時点では機能は未知である、新しく同定された一塩基多型である。
【０１８０】
特に、これらのＳＮＰは、Ｓｅｎｔｒｉｘ ＢｅａｄＣｈｉｐプラットフォームに基づく全ゲノム遺伝子型分類（ＷＧＧ）［Ｒｅｆ．１０］にしたがって行われた試験個体の全ゲノムの遺伝子型分類の後に同定された。より具体的には、ＷＧＧを、Ｈｕｍａｎ１Ｍ Ｄｕｏ ＣＨＩＰ−Ｉｎｆｉｎｉｕｍ ＩＩ Ａｓｓａｙを使用して行い、当業者により同定可能な記載の手順、および例えば、［Ｒｅｆ．１０、１１、１２］にさらに詳細に記載される手順にしたがって、非制限的遺伝子座選択を通して、患者の全ゲノムに沿って１００万個のＳＮＰにわたって調べた。
【０１８１】
遺伝子型分類の成果で検出されたＳＮＰを、最初に単変量解析に供し、次いで、上で説明したようにロスタフロキシンに対する最大応答を有するＳＮＰ遺伝子型を選択するためのさらなる解析に供した。
【０１８２】
特に、プラセボと比較してロスタフロキシンに対する最大応答を有する遺伝子型を選択するために、出願人等は、従属変数としてＤＳＢＰ５＿０および独立変数として有意なＳＮＰを使用してプラセボおよびロスタフロキシンにおいてＡＮＯＶＡ統計解析（一元配置）を行った。
【０１８３】
行った解析を図６に例示するが、ここでは、プラセボ（ｐ＝０．０４５）よりも治療群（ｐ＝０．００２）でより大きいＳＮＰ遺伝子型ｇ１、ｇ２およびｇ３における有意な表現型分散に関するＳＮＰ ｒｓ２４６１９１１についての解析が示されている。
【０１８４】
ＳＮＰ ｒｓ２４６１９１１の３つの遺伝子型ｇ１、ｇ２およびｇ３についてのＤＳＢＰ５＿０値の変動は、ロスタフロキシンおよびプラセボ群を比較するＳＮＰ ｒｓ２４６１９１１の３つの遺伝子型についてのＤＳＢＰ５＿０値のプロットを示す図７にも示されている。図７の説明から、遺伝子型１では、ロスタフロキシンにより血圧が明確に低下している一方で、プラセボでは血圧が控えめに増加していることが明確である。逆に、遺伝子型３では、プラセボによる血圧降下はより大きいように見える。重要なことは、明らかに従うこれらの遺伝子型によるプラセボおよびロスタフロキシンによる血圧応答における変化の方向ならびに逆の傾向である。これは分析することが可能であり、発明者等は、その特定のＳＮＰについて、モデルおよびロスタフロキシンとプラセボの間の相互作用の統計的有意性を確立することができる。適当な統計解析は、相互作用の有意性をもたらす（この有意性は、モデルの有意性が０．０５未満の場合にのみ認められる）。相互作用についてのＰ値を、Ｐ−ＧＸＥとして表４に示す。
【０１８５】
同様のアプローチを適用して他のコアＳＮＰを解析および選択した結果、本調査の成果で、出願人等は、図７の例ｒｓ２４６１９１１のような、ロスタフロキシンではＱＴ表現型ＤＳＢＰ５＿０の著しい減衰を有するが、プラセボ群では有さないＳＮＰの遺伝子型を選択した。
【０１８６】
コアＳＮＰを有し、ロスタフロキシンで処理した個体（治療）対コアＳＮＰを有し、プラセボで処理した個体（プラセボ）におけるＤＳＢＰ５＿０に関するデータの概要を表５に示す。
【表５】
【０１８７】
特に、表５のデータは、ＱＴ表現型ＤＳＢＰ５＿０に有意に関連するＳＮＰを選択するために、従属変数としてＤＳＢＰ５＿０および独立変数としてＳＮＰを使用して、段階的線形回帰を使用して得た。
実施例２：コアＳＮＰを含む遺伝子プロファイルは、ロスタフロキシンに対する個体応答に影響を及ぼす。
【０１８８】
ＳＮＰの同定後、出願人等は、実施例１のコアＳＮＰを含む遺伝子プロファイルの予測能力を調査した。遺伝子プロファイルの構築を支持する理論的根拠は、所与のＳＮＰの表現型効果はまた、第１ＳＮＰに関連するタンパク質と相互作用するタンパク質をコードする遺伝子上に持つ他のＳＮＰの面で評価されなければならないという確立した概念による（遺伝的ネットワーク）。この意味で、ネットワーク解析はまた、遺伝的エピスタシスの概念を意味する［Ｒｅｆ．３９］。実際、２つの遺伝子座の対立遺伝子は、同一被験体中で同時に発生するので、これらの対立遺伝子を別々に解析すると検出可能な効果を有さないが、一緒に分析すると表現型的に関連し得る。
【０１８９】
出願人等は、予測モデルとして、従属変数が二面性表現型（ＲまたはＮＲ）であり、独立変数が特定のプロファイルであるロジスティック回帰を使用して、治療群のみにおいてコアＳＮＰを含む遺伝子プロファイルが、治療に対するレスポンダーと非レスポンダーとを識別することができるかどうかを評価した。次いで、出願人等は、予測パラメータ（オッズ比、ＰＰＶ、ＮＰＶ）を計算するモデルの長所を評価した。
【０１９０】
実施例１の全コアＳＮＰを含む遺伝子プロファイルに関連する代表的データを図８に示す。特に、図８は、ＦＤＡガイドライン［Ｒｅｆ．３８］によると、薬理ゲノミクス試験の成績の情報を与えると考えられるパラメータである、コアＳＮＰを含むプロファイルについてのオッズ比（ＯＲ）および予測値（Ｐ値）に関するデータを示す。
【０１９１】
特に、ＯＲ値は、定義された遺伝子プロファイルにより、試験陽性患者（レスポンダー）のオッズと試験陰性患者（非レスポンダー）のオッズの比を示す。特に、オッズ比は、以下のように陽性予測値（ＰＰＶ）および陰性予測値（ＮＰＶ）を組み合わせる：ＰＰＶ×ＮＰＶ／［（１００−ＰＮＶ）×（１００−ＮＰＶ）］。言い換えれば、ＯＲは、試験に対してレスポンダーである（ＰＰＶ）または非レスポンダーである（ＮＰＶ）確率である。１のオッズ比は、試験が、情報価値がないことを示し、したがって、オッズ比が高いほど、試験の予測力は高い。Ｐ値（陽性または陰性のいずれか）は、目的の臨床状態（すなわち、定義された遺伝子プロファイルによる薬物に対する応答）を有する陽性または陰性の試験結果を有する患者の比率を表す。
【０１９２】
Ｐ値パラメータはｚスコアに基づいて計算され、これはＯＲの有意性を示す。ｚスコアパラメータは、Ｉｎ（ＯＲ）／標準誤差（ＩｎＯＲ）を示す。ＯＲが微小から１であり、したがってプロファイルが薬物に対する応答を予測することができない場合には、ｚスコアは負の値を有する。これに対して、ＯＲ＞１であり、したがってプロファイルが薬物に対する応答を予測することができる場合には、ｚスコアは正の値を有する。ｚスコアが高い場合には、分散がより小さいためにＯＲはより有意である。
【０１９３】
上記パラメータ中で、オッズ比（ＯＲ）は、プラセボではなくロスタフロキシンに対するレスポンダー患者間の異なる遺伝子プロファイルによる識別の程度の評価に臨床的に関連すると考えられる［Ｒｅｆ．３８］。
【０１９４】
プロファイルに列挙されたコアＳＮＰの１つまたは複数のＳＮＰを含む患者からのデータを検討して、図８に要約する全コアＳＮＰを含むプロファイル（プロファイル４）に関連するデータを得た。判定基準は、単一の特有のプロファイル中の少なくとも１つのＳＮＰを保有する患者の包含を通常支持する２つの因子の発生により正当化される：ｉ）ＳＮＰの強力な予測力およびｉｉ）当のＳＮＰに関連する一般的なもっともらしい生物学的機構。特に、ＳＮＰの予測力は、ＯＲおよび当業者により同定可能な方法にしたがって正確に分類された患者から評価することができる。対応するパラメータは、プロファイル４を有する患者について７９．８％である「正確な」値である（図８参照）。この値は、１００人の患者の中の８０人の患者において、プロファイルが、患者をレスポンダーおよび非レスポンダーへ正しく分類することを示している。
【０１９５】
上記結果を考慮して、コアＳＮＰが臨床的関連によりロスタフロキシンの薬理活性に影響を及ぼすと結論づけることが可能である。特に、臨床的関連は、薬物（ロスタフロキシン）とプラセボの間の血圧降下の差異の大きさが原因であり、ロスタフロキシンでは２３〜１５ｍｍＨｇに及ぶ一方で、文献によると、この差異はＡＲＢでは４〜６ｍｍＨｇに及ぶ。
【０１９６】
２つの別々の研究で得られたプロファイル４を保有する患者の予備データは、ロスタフロキシンで得られる血圧降下が、入手可能な降圧薬中で検出される血圧降下よりも４０％超大きいことを示している（図８、底部参照）。特に、プロファイル４を保有する個体は、ＨＣＴＺで−１２．３±１．５ｍｍＨｇ、ロサルタンで−１１．３±１．７およびロスタフロキシンで−１８．７４±１．８ｍｍＨｇの血圧変化を示しており；プロファイル８を保有する個体は、ＨＣＴＺで−１１．３±１．２ｍｍＨｇ、ロサルタンで−１１．６±１．３ｍｍＨｇおよびロスタフロキシンで−１５．２±１．５ｍｍＨｇの血圧低下を示しており；プロファイル９を保有する個体は、ＨＣＴＺで−１１．９±１．２ｍｍＨｇ、ロサルタンで−１１．４±１．４ｍｍＨｇおよびロスタフロキシンで−１５．２±１．５ｍｍＨｇの血圧低下を示している。
実施例３：関連ＳＮＰと共にコアＳＮＰを含む遺伝子プロファイルはロスタフロキシンに対する応答に影響を及ぼす
【０１９７】
コアＳＮＰと上記薬理ゲノミクス研究中で同定された追加のＳＮＰの相互作用を分析し、予測モデルとしてロジスティック回帰を使用して治療に対するＲとＮＲとを識別するのに適した追加の遺伝子プロファイルの可能な同定を検証した。
【０１９８】
特に、実施例２のコアＳＮＰプロファイル（プロファイル４）を、研究中に同定された追加の関連ＳＮＰと組み合わせた。
【０１９９】
関連ＳＮＰは、本明細書の文脈において、ロスタフロキシンに対するレスポンダーと非レスポンダーとを識別するのに適したＳＮＰを示す。
【０２００】
特に、以下の３つのグループの遺伝子で、関連ＳＮＰを最初に調査した：ａ）本明細書でＣＡＮＤ１としても示される、ロスタフロキシンの作用機構に直接関与している遺伝子（アデュシンおよびＥＯ遺伝子など−実施例４参照）；ｂ）本明細書でＣＡＮＤ２としても示される、高血圧の発達および／または高血圧に関連する器官損傷に関与し得る遺伝子（ＷＮＫなど−実施例５参照）；ならびに本明細書でＧＷＳとしても示される、全ゲノム解析を行うことにより同定された遺伝子（ＨＬＡ−Ａなど、実施例６参照）。
【０２０１】
特に、選択された遺伝子を遺伝子型分類することにより、これらの遺伝子中のＳＮＰを最初に同定した。次いで、検出されたＳＮＰを実施例４〜６でさらに示す記述分析および推測分析に供することにより、関連ＳＮＰを選択した。次いで、このように同定された関連ＳＮＰを実施例２のプロファイル４のコアＳＮＰと共に遺伝子プロファイルにグループ化した。
【０２０２】
結果は、図８に示されるように、コアＳＮＰおよび関連ＳＮＰを含む遺伝子プロファイルが、ロスタフロキシンレスポンダーと非レスポンダーとを識別するのになお一層有効であることを示している。
【０２０３】
特に、図８の要約で、コアＳＮＰ（プロファイル４）ならびに追加のＣＡＮＤ１、ＣＡＮＤ２および／またはＧＷＳ ＳＮＰにより形成される追加のプロファイルについて検出されるＯＲおよびＰ値およびＤＳＢＰ５＿０も示される（特に、図８のプロファイル８およびプロファイル９参照）。図８のデータの解析から、追加のＳＮＰをプロファイルに含めることにより、ＯＲ値および「正確な」値は、プロファイル４の値に対して増加するように見える（図８のプロファイル８およびプロファイル９参照）。また、これらのＳＮＰの包含は、プロファイル４の総母集団の２６％からプロファイル９の総母集団の４４％まで標的集団の大きさの増加を決定する。
【０２０４】
手引きの目的で本明細書において提供され、限定することを意図していない、コアＳＮＰと図８に示される追加のＳＮＰの間の相乗効果の可能な説明は、高血圧などの複合疾患の根底にある同一遺伝的ネットワーク中の当のＳＮＰの包含である。出願人等によって得られた実験的証拠は、これらのＳＮＰが、遺伝的ネットワーク中の他の遺伝子（血圧に影響を及ぼす経路に既に関連付けられているＣＡＮＤ１またはＣＡＮＤ２など−実施例４および５参照）を妨げるもしくは調節することができる、または先天的に選択された候補のリスト（プロファイル８および９と比較してプロファイル４を参照）とは無関係であり得る他の遺伝子に影響を及ぼすことができるという結論を支持する。
【０２０５】
したがって、本明細書で報告するデータの可能な説明は、コアＳＮＰ（プロファイル４）の識別能力は、ＧＷＳ、コアＳＮＰ、ＣＡＮＤ１、ＣＡＮＤ２および遺伝的ネットワークに含まれる追加の未知のＳＮＰの効果を組み合わせる／統合する同一遺伝的ネットワーク中の包含のために、ＣＡＮＤ１およびＣＡＮＤ２により増加させられるということである。
【０２０６】
識別能力の増加、およびプロファイル４からプロファイル９へ移すことにより達成されたプロファイルに含まれる選択される患者の大きさの増加は、ネットワーク概念を支持する。
【０２０７】
図８のプロファイル８および９に含まれる追加の関連遺伝子についての特定の遺伝子型を、以下の表６および表７にさらに記載する。
【表６】
【表７】
【０２０８】
上記結果を考慮して、追加のＳＮＰと共にプロファイルに含まれるコアＳＮＰは、臨床的関連によりロスタフロキシンの薬理活性に影響を及ぼし、それはコアＳＮＰ単独の活性よりもはるかに高くなり得ると結論づけることが可能である。
実施例４：ロスタフロキシンに対する応答に影響を及ぼす関連ＳＮＰ：ＣＡＮＤ１遺伝子
【０２０９】
出願人等は、ロスタフロキシンに対するレスポンダーを同定する実施例１のコアＳＮＰも含む遺伝子プロファイルへの追加の関連ＳＮＰの包含を調査した。
【０２１０】
第１の一連の実験において、ロスタフロキシンの作用の機構に直接関与する遺伝子（本明細書でＣＡＮＤ１遺伝子とも称される）のＳＮＰを調査した。
【０２１１】
特に、調査したＣＡＮＤ１遺伝子は、アデュシンサブユニットをコードする遺伝子（ＡＤＤ１、ＡＤＤ２、ＡＤＤ３）、ならびにＥＯ合成および代謝に関与する遺伝子（ＣＹＰ１１Ａ１、ＨＳＤ３Ｂ１、ＬＳＳ、ＡＢＣＢ１／ＭＤＲ１およびＳＬＣＯ４Ｃ１）を含んでいた。調査した遺伝子の特徴の概要を表８に報告する。
【表８】
【０２１２】
特に、表８は、選択されたＣＡＮＤ１遺伝子および関連する染色体の位置、遺伝子記号および遺伝子名を示す。
【０２１３】
表８の各ＣＡＮＤ１遺伝子について、Ｔａｑｍａｎアッセイ（オンデマンドアッセイまたはＡＢＩ製のプローブおよびプライマー設計を使用したカスタムＭＧＢ）によるＳＮＰ：単一ＳＮＰ解析を使用して、ＳＮＰを検出した。
【０２１４】
検出されたＳＮＰを、単変量解析に供し、研究のために選択したＱＴ表現型ＤＳＢＰ５＿０の検出された変動に基づいて、関連ＣＡＮＤ１ ＳＮＰを選択した。
【０２１５】
代表的な関連ＣＡＮＤ１ ＳＮＰを、関連するＧＸＴ関連結果と共に表９および表１０に報告する。有意なｐ＿ＧＸＴは、処理（ロスタフロキシン／プラセボ）に対する有意なＤＳＢＰ５＿０の異なる応答を示している。
【表９】
【表１０】
【０２１６】
特に、表９は、関連する遺伝子記号、染色体の位置、染色体上の位置、遺伝子上の位置およびＰ値と共に選択された代表的なＣＡＮＤ１ ＳＮＰの単変量解析の結果を示している。
【０２１７】
ＨＳＤ３Ｂ１遺伝子についての２つの関連ＳＮＰ（ＨＳＤ１８およびＨＳＤ１９）を、表６に詳細に記載し、その関連を表７に記載する。
【０２１８】
表１０では、関連ＳＮＰ ｒｓ９１４２４７のデータを報告する。
【０２１９】
遺伝子およびアデュシンの詳細な説明中で説明するように、表９に含まれる遺伝子は、アデュシンならびにＥＯ合成および輸送に関与する酵素をコードすることが示唆されているものである。「インビトロ」でピコモル濃度または動物中でナノモル用量のロスタフロキシンは、野生のアデュシンの効果を阻害することなく、変異型アデュシンまたはウアバインのＮａ−ＫポンプおよびｃＳｒｃへの影響を選択的に修正することができる。
実施例５：ロスタフロキシンに対する応答に影響を及ぼす関連ＳＮＰ：ＣＡＮＤ２遺伝子
【０２２０】
第２の一連の実験において、高血圧の発達および／または高血圧に関連する器官損傷に関与し得る遺伝子（本明細書でＣＡＮＤ２遺伝子とも称される）のＳＮＰを調査した。
【０２２１】
特に、病態生理学的に関連する遺伝子のより大きいセットを、ＣＡＮＤ２遺伝子として選択した。選択判定基準は、主として、ＲＡＡ酵素および受容体をコードする遺伝子、腎臓のナトリウム再吸収を調節するイオンチャネルおよび輸送体の種々のファミリー、アドレナリン受容体、有足細胞タンパク質ならびに転写因子を含んでいた。得られた遺伝子のセットを図９の図解に要約する。
【０２２２】
特に、図９において、関連染色体の位置、遺伝子記号および遺伝子名と共に選択された候補遺伝子ＣＡＮＤ２を示す。
【０２２３】
これらの遺伝子に関する追加の情報は、本開示を読めば当業者により同定可能である。
【０２２４】
図９の表の各ＣＡＮＤ２遺伝子について、ロスタフロキシンに対する血圧応答へのこれらの遺伝子の影響を評価するための候補遺伝子内の変異の評価をもたらすことができるＳＮＰをゲノム中およびＩｌｌｕｍｉｎａチップ中に存在するＴａｇ ＳＮＰを使用して検出した。
【０２２５】
検出されたＳＮＰを、単変量解析に供し、コアＳＮＰの選択に関して説明したのと同じ方法論により、１．７８＊１０Ｅ−４（ｒＳ７１１７３１４）から５＊１０Ｅ−２（ｒｓ９４５４０３）に及ぶＰ値ＧＸＴを有するＳＮＰのみを選択した。候補遺伝子を扱う場合、発明者等は、候補遺伝子の選択を支持する以前のデータを考慮して、ｐ＜０．０００１の代わりにｐ＜０．０５のみを閾値として使用した。
【０２２６】
特に、検出されたＱＴ表現型ＤＳＢＰ５＿０の変動に基づいて、関連ＣＡＮＤ２ ＳＮＰを選択した。
【０２２７】
関連するＧＸＴ関連結果と共に、代表的なＣＡＮＤ２ ＳＮＰを表１１に報告する。有意なｐ＿ＧＸＥは、処理（ロスタフロキシン／プラセボ）に対する有意なＤＳＢＰ５＿０の異なる応答を示している。
【表１１】
【０２２８】
特に、表１１では、プラセボおよび治療についてのＧＸＴ関連結果が示されている。有意なｐ＿ＧＸＴは、処理（ロスタフロキシン／プラセボ）に対する有意なＤＳＢＰ５＿０の異なる応答を示している。
実施例６：ロスタフロキシンに対する応答に影響を及ぼす関連ＳＮＰ：ＧＷＳ遺伝子
【０２２９】
第３の一連の実験において、全ゲノム解析で検出された遺伝子（本明細書でＧＷＳ遺伝子とも称される）のＳＮＰも調査した。
【０２３０】
［Ｒｅｆ．１０、１１、１２］に記載の手順にしたがって、Ｈｕｍａｎ１Ｍ Ｄｕｏ ＣＨＩＰ ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ Ｂｅａｄ Ｃｈｉｐを使用して、Ｉｌｌｕｍｉｎａ製のＨｕｍａｎ１ＭアレイでゲノムＳＮＰを遺伝子型分類した。特に、染色体ＸおよびＹのＳＮＰならびにＸの偽常染色体領域のＳＮＰ（ＸＹ）は考慮しなかったので、全体で、１１１１１９０個（合計の９２．６６％）のＳＮＰを解析した。
【０２３１】
検出されたＳＮＰを、実施例の節で記載した方法論にしたがって、関連ＳＮＰを同定するためのアプローチで単変量解析に供した。
【０２３２】
ＧＷＳ遺伝子についての単変量解析（定量的形質相互作用−ＧｘＥ）の結果を図４に示すが、これは、ｐ＜１０−４の確立された閾値未満のＰ値を有する１０７個のＳＮＰを有する１９３人のＮＰＴ患者からのサンプル中で遺伝子型分類された８４８３４０個のＳＮＰについての結果を点として示している。
【０２３３】
次いで、関連に関与する特定のゲノム領域の役割を明確にすることを目的とした同定された１０７個のＳＮＰの詳細なアノテーションを行った。このＧＷＡＳから同定された１０７個の上位ＳＮＰを、これらのゲノム位置によって実際に示す：７個はコード領域、４個は３’ＵＴＲ、３０個はイントロンおよび６６個は遺伝子間領域。最後に言及したグループ中で、いくつかのＳＮＰは遺伝子領域と近位にあり、関連プロモーター中に局在化し得る一方で、他のいくつかは、砂漠領域中と考えられるほどアノテーション済み遺伝子から遠くにある。
【０２３４】
そのため、プロファイル４（単一上位ＳＮＰ）に含まれる上位ＳＮＰおよびプロファイル５（上位ＳＮＰと相互作用）についてのみ、より詳細なアノテーションを行い、発明者等は、その大多数がイントロンＳＮＰの最小のセットを有する遺伝子間変異体であることを認めた。これら変異体の全ては、導入部−１．３段落で既に言及されているように、いわゆる「ジャンクＤＮＡ」領域に属しており［Ｒｅｆ．４０］、したがって、真核生物における配列の進化的革新のための豊富な基質を表している。
【０２３５】
徹底的なアノテーションのためにとる手順は、以下を考慮した：ｉ．ＭＡＦ＞５％を示すＳＮＰ；ｉｉ．異なるデータベース（ＮＣＢＩ Ｅｎｔｒｅｚ Ｇｅｎｅ、ＨａｐＭａｐ、Ｅｎｓｅｍｂｌ）の助けを借りたより最近のマッピング；ｉｉｉ．遺伝子領域または機能的領域中の考えられる位置による、その間の完全なまたは強力なＬＤ中のＳＮＰのグループからの選択；ｉｖ．ＰｕｂＭｅｄ解析；ｖ．公開されているｍｉＲＮＡ配列および関連ゲノム標的のアノテーション。
【０２３６】
遺伝子内ＳＮＰについて、出願人等は、コード変異体またはスプライシング変異体を認めなかったが、発明者等は、その機能が多くの場合未知の遺伝子中に位置する一般的なイントロン多型を同定した。２つの上位ＳＮＰ（ｒｓ３８９３４６４およびｒｓ５０１３０９３）は、６番染色体上の主要組織適合性複合体クラスＩ領域、いくつかの遺伝子を含む広範囲で高ＬＤの特有の領域中に位置していた。この場合、正確な遺伝子アノテーションはより複雑であり、含まれる遺伝子の発現および機能パターン調査が、正しい領域を規定するのに役立った。ＳＮＰは、特に３’ＵＴＲについてのｍｉＲＮＡ標的組成物にも異なる影響を及ぼすことができるので、全上位ＳＮＰを異なるデータベースで（www.patrocles.org、microrna.sanger.ac.uk、www.microrna.org）実質的に試験したが、いかなる興味深い結果も得られなかった。出願人等はまた、完全な前駆体配列またはまさに成熟ｍｉＲＮＡに対する検索を検討した。しかしながら、シグナルのソースのさらなる遺伝的局在化なしでの、予測のための薬物応答のマーカー同定は、ＧＷＡ研究のための十分なエンドポイントであろう。
【０２３７】
上記特徴付けの後、従属変数としてＤＳＢＰ５＿０および独立変数として１０７個の有意なＳＮＰを使用して、プラセボおよびロスタフロキシンにおいて、ＳＴＡＴＡソフトウェアを使用して、統計的ＡＮＯＶＡ解析を行うことにより、プラセボと比較したロスタフロキシンに対する最大応答を有する遺伝子型を同定するために、最初の１０７個のＧＷＳ ＳＮＰをさらに選択した。さらにこの解析と共に、上記ＳＮＰの遺伝子型の関連性も解析した。
【０２３８】
このアプローチにより、最終的に、治療でＤＳＢＰ５＿０が減衰するが、プラセボ群では減衰しない、わずか３５個のＳＮＰ（およびその関連遺伝子型）を選択して、関連ＧＷＳとみなした。関連ＧＷＳのリストを表１２に要約する。
【表１２】
【０２３９】
実施例７：コアＳＮＰとの連鎖不平衝における遺伝的変異
たとえプロファイル４、８および９に含まれるＤＮＡ変異がレスポンダー患者の予測に強力な遺伝的力を有するとしても、それらは、最良の識別能力を有する全ての遺伝的変異性を消耗しない。連鎖不平衝の概念によると、ＤＮＡ変異（タグＳＮＰ）は、タグＳＮＰに照らしてみて、同様にまたは類似して変異を分類することができる可変数のプロキシＳＮＰにより一般的に表すことができる。そのため、いくつかの追加の遺伝的変異が、本明細書に記載の方法およびシステムの範囲に含まれる。ロスタフロキシンの生物活性に影響を及ぼすＳＮＰとの連鎖不平衝における代表的な遺伝的変異を表１３に列挙する。
【表１３】
【０２４０】
表１３に列挙する遺伝的変異は、ヨーロッパ人母集団の遺伝子データに関する代表的な遺伝子地図から得られる上記各コアＳＮＰまたは候補ＳＮＰについての対応するプロキシＳＮＰである。ＨａｐＭａｐ Ｐｒｏｊｅｃｔにより得られる情報は、発明者等にヨーロッパ人母集団におけるプロキシＳＮＰの最良の適用範囲をもたらす。ヨーロッパ人母集団および／または他の母集団についての連鎖不平衝における遺伝的変異に関する追加の情報源は、当業者により同定可能なソースを通して検索することができ、これには、例えば、発明者等の母集団のＩｌｌｕｍｉｎａ ＢｅａｄＣｈｉｐ １Ｍｉｌｌｉｏｎ遺伝子型データが含まれる。ＨａｐＭａｐなどのソースを参照する場合、本開示の意味において、全ての関連遺伝的変異の完全なリストアップを確保するためにソースリリースに関して連続的な更新が必要とされる。
実施例８：コアＳＮＰおよびロスタフロキシンに対する応答に影響を及ぼす追加のＳＮＰに関する配列情報
【０２４１】
本開示のいくつかの実施形態では、ロスタフロキシンに対する個体応答に影響を及ぼすいくつかの遺伝的変異についての配列情報の検出に基づいて、治療を評価することができる。コアＳＮＰおよび関連する選択された遺伝子型に関する配列情報を表１４および１５に報告する。
【表１４】
【表１５】
【０２４２】
ロスタフロキシンに対する応答に影響を及ぼす代表的な追加のＳＮＰおよび関連する選択された遺伝子型についての配列情報を表１６および１７に報告する。
【表１６】
【表１７】
【０２４３】
本明細書に記載の方法およびシステムにおいて配列情報を検出するために使用するのに適した代表的なプローブを表１８に列挙する。
【表１８】
【０２４４】
本明細書で例示する方法およびシステムのいくつかは、その遺伝的特徴（ＳＮＰ）による患者のサブセットの選択を提案することにより、ロスタフロキシンの非薬理ゲノミクス治療用途の特定の制限を克服することができる。特に、当のＳＮＰは、単独で、または高血圧および器官合併症をもたらす機構に関与し、またロスタフロキシンが命中する他のＳＮＰ（ＣＡＮＤ１、ＣＡＮＤ２）と組み合わせて、ロスタフロキシンに対する血圧応答の基礎となる（コアＳＮＰ）ように見える。
【０２４５】
特に、コアＳＮＰ、およびＣＡＮＤ１またはＣＡＮＤ２ ＳＮＰの両者は、目的の２つの表現型：ａ）選択薬物に対する応答、ｂ）高血圧およびその器官合併症の発達、に貢献する。さらに、実用的見地から、両グループのＳＮＰは、レスポンダーと非レスポンダーの間の識別に貢献する。
【０２４６】
この知見は、正しい患者のための正しい薬物を発見するため、および（今まで動物モデルで研究された）疾患のネットワーク概念をヒト患者に適用することを目標とした新しいラインの研究を開くための探求における２つの重要な意味を有し得る。
【０２４７】
動物モデルにおける多遺伝子性多因子的疾患の研究の結果は、現在のパラダイム：「１つの遺伝子分子変化（または１つの遺伝子変異体またはＳＮＰ）」、「１つの病態生理学的機構」および「１つの臨床的症状または疾患」を機構の遺伝的環境ネットワークのより広い概念のために放棄すべきであるということを示唆している。疾患は、このネットワークの攪乱から生じ得る。次いで、この攪乱は新規な「原因」治療のための標的となり得る。動物モデルにおいて発展中のこの新しい概念は、その異常が目的の疾患を誘引し得る特定の組織または器官が入手不可能であるために、ヒトに容易に適用できない。
【０２４８】
本明細書に記載の方法を、初めて、ヒトに対するこの戦略に適用する。実際、遺伝的攪乱（２つのグループのＳＮＰによって定義される）と機能的攪乱（非常に強力な選択的降圧薬、ロスタフロキシンに対する血圧応答として測定される）の組み合わせは、ヨーロッパ人のみの二千万人である臨床的に関連のある患者のサブセット（約２５％）における高血圧とその器官合併症の基礎となる特有の遺伝的ネットワークの同定への新しいアプローチを現実化する。
【０２４９】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法およびシステムは、プロファイル中の個々の患者の遺伝的異質性、および目的の遺伝子のエピスタシスを扱う。遺伝的異質性およびエピスタシスは、多遺伝子性多因子的疾患における所与の遺伝的機構の因果関係を示すために克服すべき２つの主要な問題である。遺伝的異質性という用語は、同じ表現型（生化学的、生理学的または症状）は、異なる遺伝的機構によってもたらされ得ることを示している。エピスタシスという用語は、同じ遺伝子変異体の効果が、目的の遺伝子から遠く離れた遺伝子から生じる別の変異体によって調節され得る（鈍らせられるまたは拡大される）ことを示している。
【０２５０】
これら２つのよく受け入れられた遺伝的現象は、ヒト疾患または治療に対する応答の基礎となる機構を研究するために遺伝学を適用しようとする試み全てを妨げる。
【０２５１】
例えば、所与のホルモン（特定のウアバイン）またはタンパク質（特定のアデュシン）が疾患（特定の高血圧における）を引き起こすのに関与していると仮定するならば、そのホルモンの合成、輸送または排出に関与する遺伝的経路も、その決定組織レベルおよびその生物学的効果の決定に関与していることを認めなければならない。
【０２５２】
類似して、その特定のタンパク質の細胞機能の調節に関与するタンパク質をコードする全ての遺伝子を考察すべきである。当然、これらの生化学的経路の各々は、個々の患者の遺伝的背景によって異なって影響され得る。
【０２５３】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法およびシステムにおいて、プロファイルの種々のＳＮＰを関連づける一般的な知見は、ａ）ロスタフロキシンに対する血圧応答に関連するＳＮＰの能力（コアＳＮＰ）；およびｂ）前臨床研究においてロスタフロキシンの活性に影響を及ぼし、高血圧およびその器官合併症の基礎となる生化学的経路に関連するＳＮＰの能力（ＣＡＮＤ１およびＣＡＮＤ２ ＳＮＰ）である。現在の高血圧治療に対する本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態の実用的優位性は、患者の２５％における（試行錯誤期間の減少による）より早い血圧調節の達成、現在の戦略の３０〜４０％に対して、レスポンダーおよび非レスポンダーを分類する８５％の確率、ならびにロスタフロキシンについての試験結果によって、および最も重要なことには、動物における活性投薬とＮＯＡＥＬ（最大無毒性量）投薬の間のロスタフロキシン投薬のはるかに広い間隔（ロスタフロキシンでは少なくとも１００．０００時間であるが利用可能な薬物ではわずか２０〜５０時間である）によって示されるような、治療個体における良好な耐容性および生活の質を含む。さらに、本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態は、ロスタフロキシンによって影響される機構と本明細書に記載のいくつかの方法およびシステムにより選択される患者のサブセットにおける器官損傷の基礎となる機構の間の同一性から、器官合併症の予測可能な効率的予防に関連し得る。
【０２５４】
この予測可能な増加した効率は、現在の戦略に対して３つの明確な意味を有する：ａ）ただの危険因子であり、不安な臨床症状をもたらす疾患ではない高血圧の治療に従うよう患者を納得させるより強力な合理性（または論拠）をもたらす。ｂ）反対に、高血圧それ自体が高程度の障害をもたらし得る心血管系合併症を経験している患者のために負担を減少する。ｃ）高血圧治療が、医療費の最も重要な原因である心血管系合併症および腎合併症を発達させるより大きな危険性にさらされている患者のサブセットに集中されるので、医療費を減少させる。
【０２５５】
最終的に、プロファイル４を有する選択された患者のサブセットにおいて、ロスタフロキシンにより得られる血圧降下の大きさは、ＨＣＴＺまたはロサルタンにより得られるものよりも約４０％大きい。この差は、種々の降圧薬間で今まで検出されたものよりもはるかに大きい。
【０２５６】
一般に、本明細書に記載の方法およびシステムは、いくつかの実施形態において、高血圧などの心血管状態の治療における改善を可能にする。現時点では、未治療高血圧患者のわずか３０〜４０％が、臨床的に断固とした血圧降下による治療に応答する。これは、医師の欲求不満を生み出し、治療の複数の変更を必要とし、患者のコンプライアンスを低下させる。結果として、大半の患者は十分に治療されず、これが高血圧に関連する器官合併症の予防を制限する。本明細書に記載の方法およびシステムは、患者の８５％までロスタフロキシン治療に対するレスポンダーとしての正確な分類を可能にし、したがって、動的治療を見出す負担を減少させる。いくつかの実施形態の第１の改善は、安全性に関する：選択された患者におけるロスタフロキシンの有効用量は、非常に低く、それは５０〜５００μｇ／日に及び得る。関連動物モデルにおける有効用量は、０．１〜１００μｇ／ｋｇである一方で、動物においていかなる効果ももたらさない最大耐量（ＮＯＡＥＬ）は、１００ｍｇ／ｋｇである。これは、動物におけるロスタフロキシンの活性用量と最大耐量の間の間隔が、この間隔が２０〜５０時間に及ぶ利用可能な降圧薬治療と比較すると、１００．０００時間よりも長いことを意味する。新しい降圧薬治療の有効性および安全性に関する、特に伝統的な治療的アプローチと薬理ゲノミクスアプローチとを比較したいくつかのデータを図１０に報告する。
【０２５７】
要するに、本明細書に記載の方法およびシステム（遺伝子型分類＋ロスタフロキシン）は、高い安全性とより正確な抗高血圧活性の予測を組み合わせて、その機構がロスタフロキシンによって暗示される心血管系合併症の高程度の予防を予測する。
【０２５８】
選択されたコアＳＮＰの少なくとも１つを保有する個体における、ロスタフロキシン後の血圧降下の増加の正確な機構は不明であるが、それらは、ロスタフロキシンによる分子標的命中によって誘引される機構と関連すると予想される。結果として、ロスタフロキシンによって誘導される血圧降下に関連する利点を超える利点が、本プロファイルに含まれるコアＳＮＰ遺伝子型を保有する個体で期待される。
【０２５９】
上記実施例は、当業者に、本開示の方法およびシステムの実施形態の作り方および使い方の完全な開示および説明を与えるために提供されるものであり、発明者等が開示とみなすものの範囲を限定することを意図していない。当業者に自明の、開示を実施するための上記様式の修正は、以下の特許請求の範囲の範囲内であることが意図されている。本明細書中で言及される全ての特許および刊行物は、本開示が属する技術分野の当業者の技術水準を示している。本開示中に引用される全ての参考文献は、あたかも各参考文献が個々にその全体が参照により本明細書に組み込まれたのと同程度に、参照により組み込まれる。
【０２６０】
この結果、背景技術、発明の概要、詳細な説明および実施例中に引用される各文書（特許、特許出願、雑誌掲載論文、要約、実験マニュアル、本または他の開示を含む）の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。
【０２６１】
本開示は、特定の組成物または生物学的システムに限定されず、それは当然変化することができることを理解すべきである。本明細書で使用する専門用語は、特定の実施形態を説明するためのものに過ぎず、限定を意図していないことも理解すべきである。本明細書および添付の特許請求の範囲で使用するように、単数形「ａ」、「ａｎ」および「ｔｈｅ」は、文脈が明らかにそうではないと指示しない限り、複数の指示対象を含む。「複数」という用語は、文脈が明らかにそうではないと指示しない限り、２つ以上の指示対象を含む。特に定義しない限り、本明細書で使用する技術用語および科学用語は全て、本開示が属する技術分野の当業者によって一般的に理解されているのと同じ意味を有する。
【０２６２】
本明細書に記載の方法および材料と類似または同等の種々の方法および材料は、本明細書に記載の適当な材料および方法の特定の例を試験するために実際に使用することができ、当業者により同定可能である。
【０２６３】
本開示のいくつかの実施形態を記載してきた。それでも、本開示の精神および範囲を逸脱することなく、種々の修正を行うことができることが理解されよう。したがって、他の実施形態は、以下の特許請求の範囲の範囲内である。
参考文献
【０２６４】
［１］Ｆｅｒｒａｒｉ Ｐ、Ｆｅｒｒａｎｄｉ Ｍ、Ｔｒｉｐｏｄｉ Ｇ、Ｔｏｒｉｅｌｌｉ Ｌ、Ｐａｄｏａｎｉ Ｇ、Ｍｉｎｏｔｔｉ Ｅ。ＰＳＴ ２２３８：ａ ｎｅｗ ａｎｔｉｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｃｏｍｐｏｕｎｄ ｔｈａｔ ｍｏｄｕｌａｔｅｓ Ｎａ，Ｋ−ＡＴＰａｓｅ ｉｎ ｇｅｎｅｔｉｃ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ Ｊ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｅｘｐ．Ｔｈｅｒ．、１９９９；２８８：１０７４〜１０８３。
［２］Ｆｅｒｒａｒｉ Ｐ、Ｆｅｒｒａｎｄｉ Ｍ、Ｖａｌｅｎｔｉｎｉ Ｇ、Ｂｉａｎｃｈｉ Ｇ。Ｒｏｓｔａｆｕｒｏｘｉｎ：ａｎ ｏｕａｂａｉｎ ａｎｔａｇｏｎｉｓｔ ｔｈａｔ ｃｏｒｒｅｃｔｓ ｒｅｎａｌ ａｎｄ ｖａｓｃｕｌａｒ Ｎａ＋−Ｋ＋− ＡＴＰａｓｅ ａｌｔｅｒａｔｉｏｎｓ ｉｎ ｏｕａｂａｉｎ ａｎｄ ａｄｄｕｃｉｎ−ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ．Ａｍ Ｊ Ｐｈｙｓｉｏｌ．Ｒｅｇｕｌ Ｉｎｔｅｇｒ Ｃｏｍｐ Ｐｈｙｓｉｏｌ ２００６；２９０：５２９〜５３５。
［３］Ｆｅｒｒａｒｉ Ｐ、Ｆｅｒｒａｎｄｉ Ｍ、Ｔｏｒｉｅｌｌｉ Ｌ、Ｔｒｉｐｏｄｉ Ｇ、Ｍｅｌｌｏｎｉ Ｐ、Ｂｉａｎｃｈｉ Ｇ。ＰＳＴ２２３８：ａ ｎｅｗ ａｎｔｉｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｃｏｍｐｏｕｎｄ ｔｈａｔ ｍｏｄｕｌａｔｅｓ Ｎａ，Ｋ−ＡＴＰａｓｅ ａｎｄ ａｎｔａｇｏｎｉｚｅｓ ｔｈｅ ｐｒｅｓｓｏｒ ｅｆｆｅｃｔ ｏｆ ＯＬＦ．Ｃａｒｄｉｏｖａｓｃ Ｄｒｕｇ Ｒｅｖ １９９９；１７：３９〜５７。
［４］Ｂｉａｎｃｈｉ Ｇ．等、Ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ ２００３年５月；４（３）：２７９〜９６。
［５］Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．、１９９７；４０（１１）；１５６１〜１５６４。
［６］Ｆｅｒｒａｒｉ Ｐ等。ＪＰＥＴ １９９８；２８５：８３〜９４。
［７］２００３ Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ｓｏｃｉｅｔｙ ｏｆ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ−Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ｓｏｃｉｅｔｙ ｏｆ Ｃａｒｄｉｏｌｏｇｙ ｇｕｉｄｅｌｉｎｅｓ ｆｏｒ ｔｈｅ ｍａｎａｇｅｍｅｎｔ ｏｆ ａｒｔｅｒｉａｌ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ。Ｇｕｉｄｅｌｉｎｅｓ Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ。２１（６）：１０１１〜１０５３、２００３年６月。
［８］Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ｓｏｃｉｅｔｙ ｏｆ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ Ｗｏｒｋｉｎｇ Ｇｒｏｕｐ ｏｎ Ｂｌｏｏｄ Ｐｒｅｓｓｕｒｅ Ｍｏｎｉｔｏｒｉｎｇを代表してＯ’Ｂｒｉｅｎ，Ｅｏｉｎ；Ａｓｍａｒ，Ｒｏｌａｎｄ；Ｂｅｉｌｉｎ，Ｌａｗｒｉｅ；Ｉｍａｉ，Ｙｕｔａｋａ；Ｍａｌｌｉｏｎ，Ｊｅａｎ−Ｍｉｃｈｅｌ；Ｍａｎｃｉａ，Ｇｉｕｓｅｐｐｅ；Ｍｅｎｇｄｅｎ，Ｔｈｏｍａｓ；Ｍｙｅｒｓ，Ｍａｒｔｉｎ；Ｐａｄｆｉｅｌｄ，Ｐａｕｌ；Ｐａｌａｔｉｎｉ，Ｐａｏｌｏ；Ｐａｒａｔｉ，Ｇｉａｎｆｒａｎｃｏ；Ｐｉｃｋｅｒｉｎｇ，Ｔｈｏｍａｓ；Ｒｅｄｏｎ，Ｊｏｓｅｐ；Ｓｔａｅｓｓｅｎ，Ｊａｎ；Ｓｔｅｒｇｉｏｕ，Ｇｅｏｒｇｅ；Ｖｅｒｄｅｃｃｈｉａ，Ｐａｏｌｏ。Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ｓｏｃｉｅｔｙ ｏｆ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ ｒｅｃｏｍｍｅｎｄａｔｉｏｎ ｆｏｒ ｃｏｎｖｅｎｔｉｏｎａｌ，ａｍｂｕｌａｔｏｒｙ ａｎｄ ｈｏｍｅ ｂｌｏｏｄ ｐｒｅｓｓｕｒｅ ｍｅａｓｕｒｅｍｅｎｔ。Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ。２１（５）：８２１〜８４８、２００３年５月。
［９］Ｓａｍｂｒｏｏｋ Ｊ、Ｒｕｓｓｅｌｌ ＤＷ。Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｃｌｏｎｉｎｇ、Ａ ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｍａｎｕａｌ。（Ｃｈａｐｔｅｒ６）。Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ ２００１。
［１０］Ｓｔｅｅｍｅｒｓ ＦＪ、Ｇｕｎｄｅｒｓｏｎ ＫＬ。Ｉｌｌｕｍｉｎａ Ｉｎｃ．Ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ ２００５；６：７７７〜７８２。
［１１］Ｐｈａｓｅ Ｉ ＨａｐＭａｐ、２００５。Ｔｈｅ ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ ＨａｐＭａｐ Ｃｏｎｓｏｒｔｉｕｍ。Ａ Ｈａｐｌｏｔｙｐｅ Ｍａｐ ｏｆ Ｔｈｅ Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｏｍｅ ２００５；４３７：１２９９〜１３２０。
［１２］Ｐｈａｓｅ ＩＩ ＨａｐＭａｐ、２００７。Ｔｈｅ ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ ＨａｐＭａｐ Ｃｏｎｓｏｒｔｉｕｍ、Ａ ｓｅｃｏｎｄ ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ ｈｕｍａｎ ｈａｐｌｏｔｙｐｅ ｍａｐ ｏｆ ｏｖｅｒ ３．１ ｍｉｌｌｉｏｎ ＳＮＰｓ。Ｎａｔｕｒｅ ２００７；４４９：８５１〜８６１。
［１３］Ｒｅｐｏｒｔ Ｖａｌｅｎｔｉｎｉ。
［１４］Ｐａｇｅ ＩＨ、Ｄｕｓｔａｎ ＨＰ。Ｐｅｒｓｉｓｔｅｎｃｅ ｏｆ ｎｏｒｍａｌ ｂｌｏｏｄ ｐｒｅｓｓｕｒｅ ａｆｔｅｒ ｄｉｓｃｏｎｔｉｎｕｉｎｇ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｉｎ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｐａｔｉｅｎｔｓ。Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ １９６２；２５：４３３〜４３６。
［１５］Ｆｌｅｔｃｈｅｒ ＡＥ、Ｆｒａｎｋｓ ＰＪ、Ｂｕｌｐｉｔｔ ＣＪ。Ｔｈｅ ｅｆｆｅｃｔ ｏｆ ｗｉｔｈｄｒａｗｉｎｇ ａｎｔｉｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｔｈｅｒａｐｙ：ａ ｒｅｖｉｅｗ。Ｊ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓ １９８８；６：４３１〜４３６。
［１６］Ｖｅｔｅｒａｎｓ Ａｄｍｉｎｉｓｔｒａｔｉｏｎ Ｃｏｏｐｅｒａｔｉｖｅ Ｓｔｕｄｙ Ｇｒｏｕｐ ｏｎ Ａｎｔｉｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ Ａｇｅｎｔ。Ｒｅｔｕｒｎ ｏｆ ｅｌｅｖａｔｅｄ ｂｌｏｏｄ ｐｒｅｓｓｕｒｅ ａｆｔｅｒ ｗｉｔｈｄｒａｗａｌ ｏｆ ａｎｔｉｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｄｒｕｇｓ。Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ １９７５；５１：１１０７〜１１１３。
［１７］Ｌｅｖｉｎｓｏｎ ＰＤ、Ｋｈａｔｒｉ Ｉｍ、Ｆｒｅｉｓ ＥＤ。Ｐｅｒｓｉｓｔｅｎｃｅ ｏｆ ｎｏｒｍａｌ ｂｌｏｏｄ ｐｒｅｓｓｕｒｅ ａｆｔｅｒ ｗｉｔｈｄｒａｗａｌ ｏｆ ｄｒｕｇ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｉｎ ｍｉｌｄ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ。Ａｒｃｈ Ｉｎｔ Ｍｅｄ １９８２；１４２：２２６５〜２２６８。
［１８］Ｎｅｌｓｏｎ ＭＲ、Ｒｅｉｄ ＣＭ、Ｋｒｕｍ Ｈ、Ｒｙａｎ Ｐ、Ｗｉｎｇ ＬＭＨ、ＭｃＮｅｉｌ ＪＪ。Ｓｈｏｒｔ−ｔｅｒｍ ｐｒｅｄｉｃｔｏｒｓ ｏｆ ｍａｉｎｔｅｎａｎｃｅ ｏｆ ｎｏｒｍｏｔｅｎｓｉｏｎ ａｆｔｅｒ ｗｉｔｈｄｒａｗａｌ ｏｆ ａｎｔｉｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｄｒｕｇｓ ｉｎ ｔｈｅ ｓｅｃｏｎｄ Ａｕｓｔｒａｌｉａｎ ｎａｔｉｏｎａｌ ｂｌｏｏｄ ｐｒｅｓｓｕｒｅ ｓｔｕｄｙ／ＡＮＢＰ２）。Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｊｏｕｒｎａｌ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓ ２００３；１６：３９〜４５。
［１９］Ｔａｋａｔａ Ｙ、Ｙｏｓｈｉｚｕｍｉ Ｔ、Ｉｔｏ Ｙ、Ｕｅｎｏ Ｍ、Ｔｓｕｋａｓｈｉｍａ Ａ、Ｉｗａｓｅ Ｍ等。Ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ ｏｆ ｗｉｔｈｄｒａｗｉｎｇ ａｎｔｉｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｔｈｅｒａｐｙ ｂｅｔｗｅｅｎ ｄｉｕｒｅｔｉｃｓ ａｎｄ ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ ｃｏｎｖｅｒｔｉｎｇ ｅｎｚｙｍｅ ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ ｉｎ ｅｓｓｅｎｔｉａｌ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅｓ。Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｈｅａｒｔ Ｊｏｕｒｎａｌ １９９２；１２４：１５７４〜１５８０。
［２０］Ｂｌａｕｆｏｘ ＭＤ、Ｌａｎｇｆｏｒｄ ＨＧ、Ｏｂｅｒｍａｎ Ａ、Ｈａｗｋｉｎｓ ＣＭ、Ｗａｓｓｅｒｔｈｅｉｌ−Ｓｍｏｌｌｅｒ Ｓ、Ｃｕｔｔｅｒ ＧＲ。Ｅｆｆｅｃｔ ｏｆ ｄｉｅｔａｒｙ ｃｈａｎｇｅ ｏｎ ｔｈｅ ｒｅｔｕｒｎ ｏｆ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ ａｆｔｅｒ ｗｉｔｈｄｒａｗａｌ ｏｆ ｐｒｏｌｏｎｇｅｄ ａｎｔｉｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｔｈｅｒａｐｙ（ＤＩＳＨ）。Ｊ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓ １９８４；２（ｓｕｐｐｌ３）：１７９〜１８１。
［２１］Ｈｏ ＧＹＦ、Ｂｌａｕｆｏｘ ＭＤ、Ｗａｓｓｅｒｔｈｅｉｌ−Ｓｍｏｌｌｅｒ Ｓ、Ｏｂｅｒｍａｎ Ａ、Ｌａｎｇｆｏｒｄ ＨＧ。Ｐｌａｓｍａ ｒｅｎｉｎ ｐｒｅｄｉｃｔｓ ｓｕｃｃｅｓｓ ｏｆ ａｎｔｉｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｄｒｕｇ ｗｉｔｈｄｒａｗａｌ。Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｊｏｕｒｎａｌ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓ １９９４；７：６７９〜６８４。
［２２］Ｓｗａｒｔ Ｓ、Ｂｉｎｇ ＲＦ、Ｓｗａｌｅｓ ＪＤ、Ｔｈｕｒｓｔｏｎ Ｈ。Ｐｌａｓｍａ ｒｅｎｉｎ ｉｎ ｌｏｎｇ−ｔｅｒｍ ｄｉｕｒｅｔｉｃ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｏｆ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ：ｅｆｆｅｃｔ ｏｆ ｄｉｓｃｏｎｔｉｎｕａｔｉｏｎ ａｎｄ ｒｅｓｔａｒｔｉｎｇ ｔｈｅｒａｐｙ。Ｃｌｉｎ Ｓｃｉ １９８２；６３：１２１〜１２５。
［２３］Ｆａｇｅｒｂｅｒｇ Ｂ、Ｗｉｋｓｔｒａｎｄ Ｊ、Ｂｅｒｇｌｕｎｄ Ｇ、Ｈａｒｔｆｏｒｄ Ｍ、Ｌｊｕｎｇｍａｎ Ｓ、Ｗｅｎｄｅｌｈａｇ Ｉ。Ｗｉｔｈｄｒａｗａｌ ｏｆ ａｎｔｉｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｄｒｕｇ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ：ｔｉｍｅ−ｃｏｕｒｓｅ ｆｏｒ ｒｅｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ ａｎｄ ｅｆｆｅｃｔｓ ｕｐｏｎ ｌｅｆｔ ｖｅｎｔｒｉｃｕｌａｒ ｍａｓｓ。Ｊ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓ １９９２；１０：５８７〜５９３。
［２４］Ｚａｎｃｈｅｔｔｉ Ａ、Ｍａｎｃｉａ Ｇ。Ｔｈｅ ｄｉｌｅｍｍａ ｏｆ ｐｌａｃｅｂｏ ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ ｓｔｕｄｉｅｓ：ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ ｅｖｉｄｅｎｃｅ，ｇｕｉｄｅｌｉｎｅｓ，ｅｔｈｉｃｓ ａｎｄ ｒｅｇｕｌａｔｏｒｙ ｒｅｃｏｍｍｅｎｄａｔｉｏｎｓ。Ｊ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓ ２００９；２７：１〜２。
［２５］Ｆａｒｑｕｈａｒｓｏｎ ＣＡＪ、Ｓｔｒｕｔｈｅｒｓ ＡＤ。Ｇｒａｄｕａｌ ｒｅａｃｔｉｖａｔｉｏｎ ｏｖｅｒ ｔｉｍｅ ｏｆ ｖａｓｃｕｌａｒ ｔｉｓｓｕｅ ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ Ｉ ｔｏ ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ ＩＩ ｃｏｎｖｅｒｓｉｏｎ ｄｕｒｉｎｇ ｃｈｒｏｎｉｃ ｌｉｓｉｎｏｐｒｉｌ ｔｈｅｒａｐｙ ｉｎ ｃｈｒｏｎｉｃ ｈｅａｒｔ ｆａｉｌｕｒｅ。Ｊ Ａｍ Ｃｏｌｌ Ｃａｒｄｉｏｌ ２００２；３９：７６７〜７７５。
［２６］Ｃｈｅｖｉｌｌａｒｄ Ｃ、Ｂｒｏｗｎ ＮＬ、Ｊｏｕｑｕｅｙ Ｓ、Ｍａｔｈｉｅｕ ＭＮ、Ｌａｌｉｂｅｒｔｅ Ｆ、Ｈａｍｏｎ Ｇ。Ｃａｒｄｉｏｖａｓｃｕｌａｒ ａｃｔｉｏｎｓ ａｎｄ ｔｉｓｓｕｅ−ｃｏｎｖｅｒｔｉｎｇ ｅｎｚｙｍｅ ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｙ ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｆ ｃｈｒｏｎｉｃ ｅｎａｌａｐｒｉｌ ａｎｄ ｔｒａｎｄｏｌａｐｒｉｌ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｏｆ ｓｐｏｎｔａｎｅｏｕｓｌｙ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｒａｔｓ。Ｊ Ｃａｒｄｉｏｖａｓｃ Ｐｈａｒａｍｃｏｌ １９８９；１４：２９７〜３０１。
［２７］Ｕｎｇｅｒ Ｔ、Ｇａｎｔｅｎ Ｄ、Ｌａｎｇ ＲＥ、Ｓｃｈｏｌｋｅｎｓ Ａ。Ｐｅｒｓｉｓｔｅｎｔ ｔｉｓｓｕｅ ｃｏｎｖｅｒｔｉｎｇ ｅｎｚｙｍｅ ｉｎｈｉｂｉｔｉｏｎ ｆｏｌｌｏｗｉｎｇ ｃｈｒｏｎｉｃ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｗｉｔｈ Ｈｏｅ４９８ ａｎｄ ＭＫ４２１ ｉｎ ｓｐｏｎｔａｎｅｏｕｓｌｙ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｒａｔｓ。Ｊ Ｃａｒｄｉｏｖａｓｃ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ １９８５；７：３６〜４１。
［２８］Ｐａｕｌｌ ＪＲＡ、Ｗｉｄｄｏｐ ＲＥ。Ｐｅｒｓｉｓｔｅｎｔ ｃａｒｄｉｏｖａｓｃｕｌａｒ ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｆ ｃｈｒｏｎｉｃ ｒｅｎｉｎ−ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ ｓｙｓｔｅｍ ｉｎｈｉｂｉｔｉｏｎ ｆｏｌｌｏｗｉｎｇ ｗｉｔｈｄｒａｗａｌ ｉｎ ａｄｕｌｔ ｓｐｏｎｔａｎｅｏｕｓｌｙ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｒａｔｓ。Ｊ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓ ２００１；１９：１３９３〜１４０２。
［２９］Ｇｕｅｒｒｅｒｏ ＥＩ、Ａｒｄａｎａｚ Ｎ、Ｓｅｖｉｌｌａ ＭＡ、Ａｒｅｖａｌｏ ＭＡ、Ｍｏｎｔｅｒｏ ＭＪ。Ｃａｒｄｉｏｖａｓｃｕｌａｒ ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｆ ｒｅｂｉｖｏｌｏｌ ｉｎ ｓｐｏｎｔａｎｅｏｕｓｌｙ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｒａｔｓ ｐｅｒｓｉｓｔ ａｆｔｅｒ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｗｉｔｈｄｒａｗａｌ。Ｊ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓ ２００６；２４：１５１〜１５８。
［３０］Ｄｕｋａｃｚ ＳＡＷ、Ａｄａｍｓ ＭＡ、Ｋｌｉｎｅ ＲＬ。Ｔｈｅ ｐｅｒｓｉｓｔｅｎｔ ｅｆｆｅｃｔ ｏｆ ｌｏｎｇ−ｔｅｒｍ ｅｎａｌａｐｒｉｌ ｏｎ ｐｒｅｓｓｕｒｅ ｎａｔｒｉｕｒｅｓｉｓ ｉｎ ｓｐｏｎｔａｎｅｏｕｓｌｙ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｒａｔｓ。Ａｍ Ｊ Ｐｈｙｓｉｏｌ Ｒｅｎａｌ Ｐｈｙｓｉｏｌ １９９７；２７３ ｏ ４２：Ｆ１０４〜Ｆ１１２。
［３１］Ｗｉｇｇｉｎｔｏｎ ＪＥ、Ｃｕｔｌｅｒ ＤＪ、Ａｂｅｃａｓｉｓ ＧＲ。Ａ ｎｏｔｅ ｏｎ ｅｘａｃｔ ｔｅｓｔｓ ｏｆ Ｈａｒｄｙ−Ｗｅｉｎｂｅｒｇ ｅｑｕｉｌｉｂｒｉｕｍ。Ａｍ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ。２００５；７６：８８７〜８９３。
［３２］Ｄｅｖｌｉｎ Ｂ、Ｂａｃａｎｕ Ｂ、Ｒｏｅｄｅｒ Ｋ：Ｇｅｎｏｍｉｃ Ｃｏｎｔｒｏｌ ｉｎ ｔｈｅ Ｅｘｔｒｅｍｅ。Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ ２００４；３６：１１２９〜１１３０。
［３３］Ｐｕｒｃｅｌｌ Ｓ、Ｎｅａｌｅ Ｂ、Ｔｏｄｄ−Ｂｒｏｗｎ Ｋ、Ｔｈｏｍａｓ Ｌ、Ｆｅｒｒｅｉｒａ ＭＡ、Ｂｅｎｄｅｒ Ｄ。Ａ Ｔｏｏｌ Ｓｅｔ ｆｏｒ Ｗｈｏｌｅ−Ｇｅｎｏｍｅ Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ ａｎｄ Ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ−Ｂａｓｅｄ Ｌｉｎｋａｇｅ Ａｎａｌｙｓｅｓ。Ａｍ．Ｊ．Ｈｕｍ Ｇｅｎ ２００７；８１：５５９〜５７５。
［３４］Ｔｈｅ Ｗｅｌｌｃｏｍｅ Ｔｒｕｓｔ Ｃａｓｅ Ｃｏｎｔｒｏｌ Ｃｏｎｓｏｒｔｉｕｍ。Ｇｅｎｏｍｅ−ｗｉｄｅ ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ ｓｔｕｄｙ ｏｆ １４，０００ ｃａｓｅｓ ｏｆ ｓｅｖｅｎ ｃｏｍｍｏｎ ｄｉｓｅａｓｅｓ ａｎｄ ３，０００ ｓｈａｒｅｄ ｃｏｎｔｒｏｌｓ。Ｎａｔｕｒｅ ２００７；４４７：６６１〜６７８。
［３５］Ｐｏｔｋｉｎ Ｓ、Ｔｕｒｎｅｒ Ｊ、Ｇｕｆｆａｎｔｉ Ｇ、Ｌａｋａｔｏｓ Ａ、Ｔｏｒｒｉ Ｆ、Ｋｅａｔｏｒ ＤＢ、Ｍａｃｃｉａｒｄｉ Ｆ。Ｇｅｎｏｍｅ−ｗｉｄｅ Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ ｆｏｒ Ｄｉｓｃｏｖｅｒｉｎｇ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｉｎｆｌｕｅｎｃｅｓ ｏｎ Ｃｏｇｎｉｔｉｏｎ ａｎｄ Ｃｏｇｎｉｔｉｖｅ Ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ：Ｍｅｔｈｏｄｏｌｏｇｉｃａｌ Ｃｏｎｓｉｄｅｒａｔｉｏｎ。Ｓｕｂｍｉｔｔｅｄ ｔｏ Ｃｏｇｎｉｔｉｖｅ Ｐｈｙｃｈｉａｔｒｙ Ｃｏｇｎ Ｎｅｕｒｏｐｈｙｃｈｉａｔｒｙ。２００９；１４（４〜５）：３９１〜４１８。
［３６］Ａｇｒｅｓｔｉ Ａ。１９８４。Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｏｒｄｉｎａｌ Ｃａｔｅｇｏｒｉｃａｌ Ｄａｔａ−Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ：Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ,Ｉｎｃ．
［３７］Ｒｅｓｓｏｍ ＨＷ、Ｖａｒｇｈｅｓｅ ＲＳ、Ｚｈａｎｇ Ｚ、Ｘｕａｎ Ｊ、Ｃｌａｒｋｅ Ｒ。Ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ ａｌｇｏｒｉｔｈｍｓ ｆｏｒ ｐｈｅｎｏｔｙｐｅ ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ ｉｎ ｇｅｎｏｍｉｃｓ ａｎｄ ｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ。Ｆｒｏｎｔ Ｂｉｏｓｃｉ。２００８；１；１３：６９１〜７０８。
［３８］Ｇｕｉｄａｎｃｅ ｆｏｒ Ｉｎｄｕｓｔｒｙ：Ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ ｄａｔａ ｓｕｂｍｉｓｓｉｏｎ；ＦＤＡ ｒｅｐｏｒｔ、２００５年３月；http://www.fda.gov/cder/guidance/index.htm）。
［３９］Ｐｈｉｌｌｉｐｓ ＰＣ。Ｅｐｉｓｔａｓｉｓ ｔｈｅ ｅｓｓｅｎｔｉａｌ ｒｏｌｅ ｏｆ ｇｅｎｅ ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ ｉｎ ｔｈｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎｄ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ ｇｅｎｅｔｉｃ ｓｙｓｔｅｍｓ。Ｎａｒ Ｒｅｖ Ｇｅｎｅｔ ２００８；９：８５５〜８６７。
［４０］Ｐｈｅａｓａｎｔ Ｍ、Ｍａｔｔｉｃｋ ＪＳ。Ｒａｉｓｉｎｇ ｔｈｅ ｅｓｔｉｍａｔｅ ｏｆ ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ｈｕｍａｎ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ。Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓ。２００７年９月；１７（９）：１２４５〜５３。
【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
本開示は、その各開示全体が参照により本明細書に組み込まれている、２００９年１０月１９日出願の「心血管状態の薬理ゲノミクス治療のための方法およびシステム」と題された米国仮特許出願Ｓ／Ｎ６１／２５３０２０号および２００９年１１月２５日出願の「心血管状態の薬理ゲノミクス治療のための方法およびシステム」と題された欧州特許出願Ｓ／Ｎ０９１７７１１１．３号に関連し、その優先権を主張する。
【０００２】
本開示は、本明細書でロスタフロキシンとして総括して示される、１７β−（３−フリル）−５β−アンドロスタン−３β，１４β，１７α−トリオールおよびその誘導体により形成されるクラスの化合物に関する。
【背景技術】
【０００３】
ロスタフロキシンは、個体中で生物活性を有することが知られている化合物である。特に、ロスタフロキシンは、個体の心血管系に対して活性であることが示されており、動脈性高血圧、ならびにそれだけに限定されないが、心不全、冠動脈心疾患（ＣＨＤ）、脳卒中および腎不全を含む関連器官合併症などの心血管障害の治療のために開発中である。
【０００４】
より具体的には、ロスタフロキシンは、血圧、ならびにそれだけではないが、ウアバインまたはＡＤＤ１、ＡＤＤ２、ＡＤＤ３などの細胞骨格のアデュシンをコードする遺伝子の遺伝的変異により引き起こされるＮａ−ＫポンプおよびＳｒｃにおける変化を正常化する化合物であることが示された。
【０００５】
さらに、ロスタフロキシンは、過度のタンパク尿、糸球体硬化症および腎不全を引き起こす有足細胞タンパク質における変化を正常化し、動脈切開および血管形成後の動脈狭窄を引き起こす生物学的過程（新生内膜形成および陰性リモデリング）に拮抗することができることが示された。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００６】
本明細書では、いくつかの実施形態において、遺伝的変異の、ロスタフロキシンに対する個体の応答への影響に基づくロスタフロキシンの治療および／または分析への使用を可能にする、方法およびシステムが提供される。
【０００７】
特に、ＫＣＮＳ３、ＴＨＳＤ７Ａ、ＦＡＭ４６Ａ、ＬＯＣ３８９９７０、ＨＬＡ−ＧおよびＴＴＣ２９からなる群から選択される遺伝子ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の、遺伝子間または遺伝子内領域中の１つまたは複数の多型のロスタフロキシンに対する個体応答への同定された影響に基づく、組成物、方法およびシステムが本明細書に記載される。前記領域は、ヒトにおける心血管状態、遺伝的素因または薬物応答と多少なりとも相関することが以前は知られていなかった。
【０００８】
より具体的には、本明細書に記載の組成物、方法およびシステムは、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される１つまたは複数の多型（本明細書ではコアＳＮＰとも呼ばれる）、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の、ロスタフロキシンに対する個体応答への同定された影響に基づく。
【０００９】
第１の態様によると、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の保有者となるよう選択された個体の心血管状態の治療または予防に使用するためのロスタフロキシンが記載されている。一実施形態では、個体の心血管状態を治療または予防する方法が記載されている。本方法は、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の保有者であることが決定された前記個体にロスタフロキシンを投与または処方するステップを含む。
【００１０】
第２の態様によると、０．００５ｍｇ／日〜５ｍｇ／日の用量の医薬品として使用するためのロスタフロキシンが記載されている。特に、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５の少なくとも１つ、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異を含む遺伝子型を有するよう選択された個体を治療するための、０．００５ｍｇ／日〜５ｍｇ／日の用量のロスタフロキシンの使用が記載される。特に、一実施形態では、ロスタフロキシンにより個体を治療する方法が記載される。本方法は、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５の少なくとも１つ、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異を含む遺伝子型を有することが決定された個体に、０．０５ｍｇ／日〜５ｍｇ／日、特に０．０５ｍｇ／日〜０．５ｍｇ／日の用量のロスタフロキシンを投与または処方するステップを含む。
【００１１】
第３の態様によると、個体のためのロスタフロキシンによる治療を評価する方法およびシステムが開示される。本方法は、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異についての情報を個体配列中で検出するステップと、検出された配列情報に基づいて個体におけるロスタフロキシンによる治療を決定するステップとを含む。特に、配列情報は、個体の単離ＤＮＡサンプルまたは配列情報を提供するのに適した個体の他の単離サンプル中から検出することができる。本システムは、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異のためのプローブと；０．００５ｍｇ〜５ｍｇ／ｋｇ、特に０．００５ｍｇ／日〜０．５ｍｇ／日の用量のロスタフロキシンおよび薬学的に許容される媒体を含む医薬組成物とを含む。
【００１２】
第４の態様によると、個体中のロスタフロキシンに対する応答を予測する方法およびシステムが開示される。本方法は、ＫＣＮＳ３、ＴＨＳＤ７Ａ、ＦＡＭ４６Ａ、ＬＯＣ３８９９７０、ＨＬＡ−ＧおよびＴＴＣ２９からなる群から選択される遺伝子の遺伝子間または遺伝子内領域についての個体の遺伝子型を検出するステップと、検出された遺伝子型を、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型を含む、ロスタフロキシンに対する既知の応答に関連する以前に同定された遺伝子型と比較するステップとを含む。本システムは、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型のためのプローブと、プローブハイブリダイゼーションの結果および以前に同定された遺伝子型を関連付けるルックアップテーブルとを含む。特に、遺伝子型の検出は、個体の単離ＤＮＡサンプルまたは遺伝子型に関する情報を提供するのに適した個体の他の単離サンプルから行うことができる。本方法およびシステムでは、個体中で同定された遺伝子型がロスタフロキシン応答と関連する同一の遺伝子型である場合、ロスタフロキシンに対する個体の応答は、既知の応答であると予測される。
【００１３】
第５の態様によると、ＫＣＮＳ３、ＴＨＳＤ７Ａ、ＦＡＭ４６Ａ、ＬＯＣ３８９９７０、ＨＬＡ−ＧおよびＴＴＣ２９からなる群から選択される遺伝子の遺伝子間または遺伝子内領域中の一塩基多型（ＳＮＰ）を検出する方法およびシステムが開示される。特に、遺伝子型の検出は、個体の単離ＤＮＡサンプルまたは遺伝子型に関する情報を提供するのに適した個体の他の単離サンプルから行うことができる。本システムは、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９および配列番号１１のヌクレオチド配列のいずれか１つにおける一塩基多型（ＳＮＰ）を含む核酸分子と特異的にハイブリダイズする単離ポリヌクレオチドと、緩衝液と、酵素とを含む。本方法は、ＫＣＮＳ３、ＴＨＳＤ７Ａ、ＦＡＭ４６Ａ、ＬＯＣ３８９９７０、ＨＬＡ−ＧおよびＴＴＣ２９からなる群から選択される遺伝子の遺伝子間または遺伝子内領域を含むゲノムフラグメントを、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９および配列番号１１からのヌクレオチド配列の少なくとも１つまたはこれらの一部のための一塩基特異的プローブと接触させるステップを含む。特に、接触は、個体の単離ゲノムフラグメントまたはゲノムフラグメントに関する情報を提供するのに適した個体の他の単離サンプルに行うことができる。
【００１４】
第６の態様によると、ヌクレオチドの１つが配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０および配列番号１２中のヌクレオチド配列のいずれか１つ、またはそれらの相補配列から選択される一塩基多型（ＳＮＰ）である、少なくとも約１００個の隣接ヌクレオチドを含む単離核酸分子が開示される。
【００１５】
第７の態様によると、心血管状態を治療的または予防的に処理するのに有用な薬剤を同定する方法およびシステムが開示される。
【００１６】
本方法は、候補薬剤を用意するステップと、候補薬剤を、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異を保有する個体に投与するステップと、前記候補薬剤に対する個体応答を検出するステップとを含む。
【００１７】
本明細書に記載の方法およびシステムは、いくつかの実施形態において、心血管状態、特に、高血圧の治療の成功率を、現在の３０〜４０％から約８０％まで増加させることを可能にする。
【００１８】
本明細書に記載の方法およびシステムは、いくつかの実施形態において、未治療個体における、心血管状態、特に、高血圧の治療の成功率を増加させることを可能にする。
【００１９】
本明細書に記載の方法およびシステムは、いくつかの実施形態において、レスポンダー個体を選択し、有効用量および結果として考えられる望ましくない副作用を減少させることにより、利用可能な治療と比較して有害事象および副作用の割合を減少させるために使用することができる。
【００２０】
本明細書に記載の方法およびシステムは、個体中のロスタフロキシンの任意の活性に関連する医学的、診断的、化粧用および薬理学的適用などの任意の適用に関連して適用することができる。
【００２１】
本開示の１つまたは複数の実施形態の詳細は、添付の図面および以下の説明で示される。他の特徴、目的および利点は、説明および図面から、ならびに特許請求の範囲から明らかとなろう。
【００２２】
本明細書に組み込まれており、その一部を構成する添付の図面は、本開示の１つまたは複数の実施形態を説明し、詳細な説明および実施例と共に、本開示の原理および実施を説明するのに役立つ。
【図面の簡単な説明】
【００２３】
【図１】ロスタフロキシンおよびプラセボで処理した個体に対して行った遺伝的記述分析に関連して検出されたガウス分布を示す図である。特に、パネルＡは、ロスタフロキシンおよびプラセボ、すなわち両者（全患者）による処理の５週間後の個体における血圧変化（ＤＳＢＰ５＿０）の分布を説明する図を示す。パネルＢは、ロスタフロキシン（ロスタフロキシン）による処理の５週間後の個体における血圧変化（ＤＳＢＰ５＿０）の分布を説明する図を示す。パネルＣは、プラセボ（プラセボ）による処理の５週間後の個体における血圧変化（ＤＳＢＰ５＿０）の分布を説明する図を示す。
【図２】ロスタフロキシンで処理した個体に対して行った遺伝的記述分析に関連して検出されたガウス分布を示す図である。特に、三分位値に細分した図１Ｂに示すロスタフロキシンによる処理の５週間後の血圧変化（ＤＳＢＰ５＿０）の分布を説明する図である。
【図３】ロスタフロキシンで処理した個体に対して行った遺伝的記述分析に関連して行った統計解析の結果を示す図である。特に、個体間の遺伝的関連性を説明するために、１９３人の患者についてのＥｉｇｅｎｓｏｆｔの主成分分析の変動の上位２軸（ＰＣＡ１およびＰＣＡ２）を示す図である。各点は、個体を表す。プロットにおいて、ゼロ付近に分布する個体の軽い不均一なクラスター形成が検出可能である。
【図４】プラセボおよび本明細書に開示のいくつかの実施形態によるＳＮＰの治療についてのＧＸＥ関連結果の結果を説明する図である。パネルＡでは、プロットのＹ軸は、有意なＰ値（−ｌｏｇＰ値）を表し、Ｘ軸は、ゲノム中の位置を表す。各点は、ＳＮＰを表し、特に、赤い点は、有意なＰ値（Ｐ＜１０−４）を有するＳＮＰを表す。パネルＢは、実測Ｐ値対ＧＸＴ関連検定によりもたらされた期待Ｐ値の分布の比較を示す（Ｑ−Ｑプロット）。分布の尾部における膨張は、真陽性関連を表す。
【図５】本開示のいくつかの実施形態によるロスタフロキシンについてのＳＮＰの相互作用の遺伝子型の選択のためのステップを説明する図である。特に、示されているように、ロスタフロキシンおよびプラセボで処理した個体における血圧変化（ＤＳＢＰ５＿０）に関して、ｒｓ８８９９とｒｓ４６７８の異なる遺伝子型間の相互作用をそれぞれ報告する図である。
【図６】本明細書に開示のいくつかの実施形態によるロスタフロキシンに対する応答に影響を及ぼす遺伝子型を選択するために行われる代表的な単変量解析を示す図である。
【図７】１つの仮定のＳＮＰの異なる遺伝子型とロスタフロキシンおよびプラセボによる血圧変化（ＤＳＢＰ５＿０）の間の代表的な相互作用を説明する図である。
【図８】本明細書に記載のいくつかの実施形態による遺伝子プロファイルに関する代表的なデータの概要を示す図である。
【図９】本明細書に記載のいくつかの実施形態による血管、腎臓および神経調節に関連する選択された遺伝子の概要を示す図である。
【図１０】伝統的アプローチおよび薬理ゲノミクスアプローチの有効性ならびに安全性に関するデータを示す図である。
【発明を実施するための形態】
【００２４】
本明細書では、遺伝的変異の、個体中のロスタフロキシンに関連する生物活性への影響に基づく方法およびシステムが提供される。
【００２５】
特に、本明細書で提供される方法およびシステムは、ＫＣＮＳ３、ＴＨＳＤ７Ａ、ＦＡＭ４６Ａ、ＬＯＣ３８９９７０、ＨＬＡ−ＧおよびＴＴＣ２９からなる群から選択される遺伝子ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の、遺伝子間または遺伝子内領域中の多型に基づく。
【００２６】
より具体的には、本明細書に記載の組成物、方法およびシステムは、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される１つまたは複数の多型、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の、ロスタフロキシンに対する個体応答への同定された影響に基づく。
【００２７】
本明細書で使用する「遺伝的変異」または「多型」という表現は、個体の集団における遺伝的多様性を示し、特に、ＤＮＡまたは染色体の領域の変化した状態である。代表的な多型は、ＶＮＴＲ（タンデム反復数、ミニサテライトおよびマイクロサテライトとしても知られている）、塩基対置換、塩基対挿入、塩基対欠失、核型における変化（異数性、倍数性）および染色体再配列（欠失、転座、逆位）を含む。
【００２８】
本明細書で使用する「ロスタフロキシン」という用語は、１７β−（３−フリル）−５β−アンドロスタン−３β，１４β，１７α−トリオールおよびその誘導体により形成されるクラスの化合物のいずれか１つを示す。より具体的には、ロスタフロキシン化合物は、式Ｉの化合物を含む。
【化１】
（Ｉ）
式中、記号
【化２】
は、１７位の置換基がαまたはβ立体配置を有し得ることを意味し；記号
【化３】
は、一重結合または二重結合を表し；３位の
【化４】
が二重結合である場合、Ｙは酸素またはグアニジノイミノであり；３位の
【化５】
が一重結合であり、αまたはβ立体配置を有し得る場合、Ｙは水素、ＯＲ４またはＳＲ４であり；
Ｒは、未置換もしくは置換３−フリルまたは４−ピリダジニル基であり；
Ｒ１は、水素；メチル；エチルまたはＯＨもしくはＮＲ５Ｒ６により置換されたｎ−プロピルであり；
Ｒ２は、水素である、またはＲ３と共にオキシラン環の結合であり；
Ｒ３は、水素である、またはＲ２と共にオキシラン環の結合であり；
Ｒ４は、水素；メチル；Ｃ２〜Ｃ６アルキルまたはＣ３〜Ｃ６アルケニルまたはＣ２〜Ｃ６アシルであり、これらのアルキル、アルケニルおよびアシル基は、未置換である、あるいは第四級アンモニウム基または１個もしくは複数のＯＲ７、ＮＲ８Ｒ９、ホルミル、アミジノ、グアニジノイミノにより、またはＮＲ８Ｒ９およびヒドロキシにより置換されており；
Ｒ５、Ｒ６は、独立に、水素；メチル；未置換または１個のＮＲ１０Ｒ１１もしくはＮＲ１０Ｒ１１およびヒドロキシにより置換されたＣ２〜Ｃ６アルキルである、またはＲ５およびＲ６は、窒素原子と共に、任意選択により、酸素または硫黄または窒素から選択される別のヘテロ原子を含む、未置換もしくは置換の飽和または不飽和ペンタ−あるいはヘキサ−モノ複素環を形成し；
Ｒ７は、水素、メチルまたはＣ２〜Ｃ４アルキルであり、このアルキルは、未置換である、あるいは１個もしくは複数のＮＲ１０Ｒ１１により、またはＮＲ１０Ｒ１１およびヒドロキシにより置換されており；
Ｒ８、Ｒ９は、独立に、水素；メチル；Ｃ２〜Ｃ６アルキルまたはＣ３〜Ｃ６アルケニルであり、これらのアルキルおよびアルケニル基は、未置換である、または１個もしくは複数のＮＲ１０Ｒ１１またはＮＲ１０Ｒ１１およびヒドロキシにより置換されている、またはＲ８およびＲ９は、窒素原子と共に、任意選択により、酸素または硫黄または窒素から選択される別のヘテロ原子を含む、未置換もしくは置換の飽和または不飽和ペンタ−あるいはヘキサ−モノ複素環を形成し、またはＲ８は水素でありＲ９はアミジノであり；
Ｒ１０、Ｒ１１は、独立に、水素、Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり、またはＲ１０およびＲ１１は、窒素原子と共に、飽和もしくは不飽和ペンタ−またはヘキサ−モノ複素環を形成する。
【００２９】
特に、本明細書で使用するロスタフロキシンという用語は、式（Ｉ）の化合物の全ての可能な立体異性体、特にＺおよびＥ異性体、光学異性体およびこれらの混合物、ならびに代謝産物および代謝前駆物質を含む。
【００３０】
本明細書で使用する「誘導体」という用語は、式（Ｉ）の化合物に関連する生物活性の少なくとも１つを保持する、化学修飾された式（Ｉ）の化合物を示す。化学修飾には、例えば、アルキル、アシル、ヒドロキシまたはアミノ基による水素の置換、および当業者により同定可能な追加の修飾が含まれ得る。
【００３１】
米国特許第５５９１７３４号、Ｂｉａｎｃｈｉ等、２００３およびＱｕａｄｒｉ等、１９９７［Ｒｅｆ．４、５］ならびにロスタフロキシン化合物の合成および生物活性について記載している関連補足情報（それぞれ、その全体が参照により本明細書に組み込まれている）も参照される。
【００３２】
ロスタフロキシンに関連する追加の生物活性は、その全体が参照により本明細書に組み込まれている、Ｆｅｒｒａｒｉ Ｐ．等、１９９８［Ｒｅｆ．６］に記載されている。
【００３３】
ロスタフロキシンに関連して本明細書で使用する「生物活性」という表現は、生体に対するロスタフロキシンのもしくはロスタフロキシンに関する任意の効果の質または状態を示す。ロスタフロキシンの生物活性には、それだけに限定されないが、ウアバイン高血圧効果の選択的阻害、ウアバインにより引き起こされるＮａ−ＫポンプおよびＳｒｃにおける変化の正常化、ならびに内因性ウアバインレベルの付随する増加とＮａ−ＫポンプおよびＳｒｃにおける変化により持続される高血圧の形態の正常化が含まれる。特に、ロスタフロキシンの生物活性には、アデュシンまたは内因性ウアバインの合成および輸送に関与する他の酵素をコードする遺伝子の遺伝的変異に関連する高血圧効果の選択的拮抗作用、アデュシン遺伝的変異により引き起こされるＮａ−ＫポンプおよびＳｒｃにおける変化の正常化［Ｒｅｆ．１、２、３］、ならびにアデュシン遺伝的変異とＮａ−ＫポンプおよびＳｒｃにおける変化の付随する効果により持続される高血圧の形態の正常化が含まれる。ロスタフロキシンの生物活性には、それだけに限定されないが、過度のタンパク尿、糸球体硬化症および腎不全を引き起こす有足細胞タンパク質の変化の正常化、ならびに動脈切開および血管形成後の動脈狭窄を引き起こす生物学的過程の拮抗作用、ならびに本開示を読めば当業者により同定可能な追加の活性が含まれる。
【００３４】
本開示に記載されるように、ロスタフロキシンに関連する生物活性は、個体中の遺伝的変異により影響されるので、いくつかの実施形態では、ロスタフロキシンによる治療は、遺伝的変異を示していない個体で誘発される生物活性と比較して、増強した生物活性をもたらす。
【００３５】
さらに、ロスタフロキシン活性は用量依存的であるので、本明細書に記載の方法およびシステムは、いくつかの実施形態で、考えられる副作用を対応して減少させながら遺伝的変異を保有する個体へのロスタフロキシンの有効な投与を可能にする。
【００３６】
個体中のロスタフロキシンに関連する検出可能な生物活性は、ロスタフロキシンに対する個体の応答を定義する。生物活性は、当業者により同定可能な方法および技術により検出することができ、それには、それだけに限定されないが、生物活性に関連するバイオマーカーの検出、ならびにバイタルサインおよび特に個体の血圧に関連した個体中の生物活性に関連する他の臨床情報の検出が含まれる。
【００３７】
本開示のいくつかの実施形態では、本開示による遺伝的変異を保有する個体へのロスタフロキシンの投与が、個体中のロスタフロキシンに対する改善された応答をもたらす。
【００３８】
特に、本開示の意味における「改善された応答」は、個体中で検出されるロスタフロキシンの増強された活性を示し、それは、いくつかの実施形態で、高血圧の予防、血圧の低下、血圧の正常化、ならびに高血圧に関連する心血管、腎臓、血管、眼および神経の損傷または合併症の予防を含む。特に、改善された応答は、いくつかの実施形態で、治療開始前に個体で測定した血圧と比較して約２３ｍｍＨｇ〜約１２ｍｍＨｇの平均オフィス収縮期血圧低下により定義することができる。
【００３９】
いくつかの実施形態では、改善された応答は、それぞれ治療開始前に個体で測定した血圧と比較して少なくとも約１５ｍｍＨｇおよび約９ｍｍＨｇの個体のオフィス収縮期血圧および／または夜間血圧の平均的低下により定義することができる。また、いくつかの実施形態では、改善された応答は、ヒドロクロロチアジド（ＨＣＴＺ）またはロサルタンなどの他の降圧薬の投与後に個体で検出される対応する平均的低下よりも有意に大きい（例えば、４０％以上大きい）オフィス収縮期血圧および／または夜間血圧の平均的低下により定義することができる。
【００４０】
血圧に関連して本明細書で使用する「平均的低下」または「平均的降下」という用語は、検出すべき血圧（例えば、夜間血圧またはオフィス血圧）を考慮して医学的ガイドラインにしたがって決定した所定量の時間で個体に行った血圧測定のセットの中央値または期待値の基準である低下を示す。平均的低下を計算するための血圧測定の中心傾向の測定として使用することができる測定の特定のタイミングおよび記述統計は、本開示を読めば当業者により同定可能である。
【００４１】
本明細書で使用する「オフィス血圧」という用語は、血圧計、電子ＢＰレコーダーまたは当業者により同定可能な追加の機器などの適当な機器により、外来で医師によって測定される血圧レベルを示す。
【００４２】
本明細書で使用する「夜間血圧」という用語は、特にＨｏｌｔｅｒ法による電子血圧レコーダーまたは当業者により同定可能な追加の機器などの適当な機器により、夜間、典型的には午後１２時〜午前６時に記録される血圧レベルを示す。
【００４３】
本明細書で使用する「ヒドロクロロチアジド」という用語は、腎臓が水を保持する能力を阻害することにより作用し、式６−クロロ−１，１−ジオキソ−３，４−ジヒドロ−２Ｈ−１，２，４−ベンゾチアジアジン−７−スルホンアミドを有するチアジドクラスの第一選択利尿薬を示す。
【００４４】
本明細書で使用する「ロサルタン」という用語は、式（２−ブチル−４−クロロ−１−｛［２’−（１Ｈ−テトラゾール−５−イル）ビフェニル−４−イル］メチル｝−１Ｈ−イミダゾール−５−イル）メタノールを有する、主として高血圧を治療するために使用されるアンジオテンシンＩＩ受容体拮抗薬を示す。
【００４５】
本開示によると、ロスタフロキシンに対する個体の応答は、特定の遺伝的変異により、特に、個体の遺伝子型において検出可能な一塩基多型により影響される。本明細書で使用する「一塩基多型」または「ＳＮＰ」という用語は、点突然変異とも呼ばれる単一の塩基対置換により形成される遺伝的変異を示す。本開示によると、ＳＮＰまたは点突然変異は、遺伝子の遺伝子内領域（例えば、遺伝子のイントロンまたはエキソン領域）、または遺伝子に隣接し、典型的には、調節機能を有するもしくは未知の機能を有するゲノム領域から構成されている遺伝子間領域に位置することができる。
【００４６】
本明細書で使用する「個体」という用語は、高等動物、特に、哺乳動物などの脊椎動物、より具体的にはヒトなどの一個の生物学的生物体を示す。
【００４７】
本明細書で使用する「遺伝子型」という用語は、考えられる遺伝的変異の各々についての相同染色体上に位置する対立遺伝子の組み合わせを示す。特に、本開示において、特定の遺伝子または位置についての遺伝子型１（ｇ１）は、その特定の遺伝子または位置についてのホモ接合性のより低頻度の遺伝子型との関連を示し、特定の遺伝子または位置についての遺伝子型２（ｇ２）は、その特定の遺伝子または位置についてのホモ接合性遺伝子型との関連を示し、特定の遺伝子または位置についての遺伝子型３（ｇ３）は、その特定の遺伝子または位置についてのホモ接合性のより高頻度の遺伝子型との関連を示す。
【００４８】
いくつかの実施形態では、個体中のロスタフロキシン活性に影響を及ぼす遺伝的変異は、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つのＳＮＰ（本明細書では「コアＳＮＰ」とも示される）、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異を含む。コアＳＮＰならびに他のＳＮＰは、本明細書において、通常、国立生物工学情報センター（ＮＣＢＩ）により確立されたｄｂＳＮＰ ｒｓＩＤ識別子を使用して示され、例えば、本出願の出願日におけるhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/で入手可能である。本明細書で使用する「連鎖不平衝」という表現は、必ずしも同一染色体上ではない、２つ以上の遺伝子座の対立遺伝子の非ランダムな関係を示し、対立遺伝子または遺伝子マーカーのいくつかの組み合わせが、頻度に基づいて対立遺伝子からのハプロタイプのランダム形成から期待されるよりも集団においてより高頻度またはより低頻度で起こる状態に関する。異なる遺伝子座の多型間の非ランダムな関係は、連鎖不平衝（ＬＤ）の程度により測定される。本開示中に示される連鎖不平衝における遺伝的変異は、０．９〜１に及ぶ連鎖不平衝の程度ｒ２を有し、本開示を読めばＧｅｎＢａｎｋソースを使用して当業者により同定可能であり得る。
【００４９】
いくつかの実施形態では、遺伝的変異の、ロスタフロキシンに対する個体の応答への影響が、本明細書に記載のロスタフロキシン治療を実施または評価するための方法において考慮される。本明細書で使用する「治療」、「治療上の」、「治療上」および関連する用語は、個体の状態の治療または予防のまたはそれに関連する項目を示し、特に、ロスタフロキシンに言及する場合には、個体中のロスタフロキシンに関連する任意の生物活性に関連する状態の治療もしくは予防のまたはそれに関連する項目を示す。
【００５０】
本明細書で使用する「状態」という用語は、通常、完全な物理的、精神的およびおそらくは社会的幸福の状態と関連する個体の（全体としてまたはその部分の１つもしくは複数の）物理的状態に一致しない、個体の（全体としてまたはその部分の１つもしくは複数の）体の物理的状態を示す。本明細書に記載の状態は、それだけに限定されないが、障害および疾患を含み、ここでは「障害」という用語は、体またはその部分のいずれかの機能的異常に関連する、生きている個体の状態を示し、「疾患」という用語は、体またはその部分のいずれかの正常な機能を損ない、徴候および症状を識別することにより典型的に示される、生きている個体の状態を示す。代表的な状態には、それだけに限定されないが、傷害、能力障害、障害（精神的および物理的障害を含む）、症候群、感染症、個体の逸脱行動、ならびに個体の体またはその部分の構造および機能の非定型変異が含まれる。
【００５１】
２つの項目に関連して本明細書で使用する「関連する」という表現は、第１項目の発生に第２項目の発生が伴うような２つの項目間の関係を示し、それだけに限定されないが、因果関係および徴候／症状−疾患関係を含む。
【００５２】
個体中のロスタフロキシンに関連する生物活性に関連する状態には、それだけに限定されないが、心血管状態（例えば、原発性高血圧を含む高血圧、心肥大、血管抵抗増加および動脈再狭窄）、腎不全、糸球体硬化症、タンパク尿、多発性嚢胞腎、網膜障害、脳血管障害、メニエール症候群、認知障害、双極性障害、および心不全、脳卒中、虚血、網膜障害などの原発性高血圧に関連する心血管系合併症、および当業者により同定可能な追加の状態が含まれる。
【００５３】
「原発性高血圧」という表現は、産業化社会の成人集団の２５〜３０％に影響を及ぼす臨床状態を示し、その心臓、脳および腎臓の合併症を通して、健康負担および医療費の大部分の原因であり、血圧のレベルおよび当業者により同定可能な関連する血管、網膜の合併症の存在に基づく高血圧のグレードＩ、ＩＩ、ＩＩＩ、ＩＶを含む。
【００５４】
本明細書で使用する「治療」という用語は、診療の一部としての、または医学的にもしくは外科的に状態を扱う任意の活動を示す。本明細書で使用する「予防」という用語は、個体の状態から死亡率または罹患率の負担を減少させる任意の活動を示す。これは、一次、二次および三次予防レベルで行われる。ここでは、ａ）一次予防は、疾患の進行を回避し；ｂ）二次予防活動は、疾患の早期治療を目標とし、それによって疾患の進行および症状の出現を防止するための介入の機会を増加させ；そして、ｃ）三次予防は、機能を回復させ、疾患に関連する合併症を減少させることにより、既に確定した疾患の負の影響を減少させる。
【００５５】
特に、いくつかの実施形態では、個体の遺伝子型のＳＮＰに関する情報が、個体の心血管状態を治療または予防する方法として使用される。これらの実施形態では、ロスタフロキシンが、コアＳＮＰ ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型、またはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の保有者であることが決定された個体に投与または処方される。
【００５６】
特に、いくつかの実施形態では、コアＳＮＰの１つまたは複数を保有する個体は、個体中のロスタフロキシンに対する改善された応答を示し、これは、実施例の節で広く説明するように、少なくとも１５ｍｍＨｇのプラセボによる処理に関して治療後に測定される個体の血圧の平均的低下により形成される定量的表現型（ＤＳＢＰ５＿０）に基づいて計算することができる。
【００５７】
いくつかの実施形態では、定量的表現型ＤＳＢＰ５＿０に基づいて、コアＳＮＰの１つまたは複数を保有する個体は、未治療患者において、ＨＣＴＺまたはロサルタンなどの他の降圧薬により得られる平均的血圧降下よりも、約４０％以上、特に約４０％〜５０％以上であるロスタフロキシンにより得られる平均的血圧降下（治療前の値と比較して有意な）の大きさにより定義される改善された応答を示す。
【００５８】
いくつかの実施形態では、コアＳＮＰの１つまたは複数を保有する個体は、個体中のロスタフロキシンに対する改善された応答性を示し、これは、実施例の節で広く説明するように、少なくとも９ｍｍＨｇのプラセボによる処理に関して治療後に測定される個体の夜間血圧における平均的低下により形成される定量的表現型（ＤＳＢＰ５＿０）に基づいて計算することができる。
【００５９】
さらに、ＤＳＢＰ５＿０は、実施例の節で報告される統計的および実験的解析の定量的表現型であるので、血圧の平均的降下により定義されるロスタフロキシンに対する改善された応答は、バイオマーカーまたは血圧測定以外の臨床情報を使用して検出可能なロスタフロキシンに関連する任意の生物活性により定義される任意の改善された応答を代表すると考えられる。そのため、バイオマーカーまたは血圧測定以外の臨床情報を使用して検出可能なロスタフロキシンの生物活性により定義される改善された応答は、本開示の範囲内に含まれ、当業者により同定可能である。
【００６０】
本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態では、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、以下のコアＳＮＰの１つまたは複数を保有する個体にロスタフロキシンを投与または処方することにより達成される：６番染色体の位置１８０７９８９８中のヌクレオチドＣまたはＴ（ｒｓ２３４５０８８）、７番染色体の位置１１７５３６１７中のヌクレオチドＣまたはＴ（ｒｓ１６８７７１８２）、６番染色体の位置８２５６０５１１中のヌクレオチドＧまたはＡ（ｒｓ１６８９３５２２）、１０番染色体の位置５７０７８４８０中のヌクレオチドＧまたはＡ（ｒｓ２４６１９１１）、６番染色体の位置２９９２８５６５中のヌクレオチドＣまたはＴ（ｒｓ５０１３０９３）、および４番染色体の位置１４８２４４３８０中のヌクレオチドＴまたはＧ（ｒｓ１２５１３３７５）。
【００６１】
本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態では、ロスタフロキシンは、単独でまたは互いに組み合わせた、以下の遺伝子型の少なくとも１つの保有者である個体に投与または処方される：ｒｓ２３４５０８８については遺伝子型ＴＴまたは遺伝子型１、ｒｓ１６８７７１８２については遺伝子型Ｃ／Ｔまたは遺伝子型２、ｒｓ１６８９３５２２については遺伝子型ＡＡまたは遺伝子型１、ｒｓ２４６１９１１については遺伝子型ＡＡまたは遺伝子型１、ｒｓ５０１３０９３については遺伝子型ＴＴまたは遺伝子型１、およびｒｓ１２５１３３７５については遺伝子型ＴＴまたは遺伝子型１。
【００６２】
特に、単独でまたは互いに組み合わせた上記ＳＮＰのいずれかについての少なくとも１つの関連遺伝子型の存在は、用量または遺伝子型の組み合わせにしたがって、２３〜１２ｍｍＨｇに及ぶ個体のＤＳＢＮＰ５＿０平均的収縮期血圧低下に関連する（プロファイルは実施例の節を参照されたい）。
【００６３】
いくつかの実施形態では、コアＳＮＰの１つもしくは複数および／またはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異は、個体中のロスタフロキシンに対する応答にも影響を及ぼし、実施例の節で詳細に記載するＣＡＮＤ１、ＣＡＮＤ２およびＧＷＳとして同定されるＳＮＰにより例示される１つまたは複数の追加の遺伝的変異と関連し得る。特に、個体中のロスタフロキシンに対する応答に影響を及ぼす追加の遺伝的変異は、アデュシン発現ならびに内因性ウアバイン（ＥＯ）合成および輸送に直接的または間接的に関与する遺伝子の群を含む。これらの遺伝子には、それだけに限定されないが、ＡＤＤ１、ＡＤＤ２、ＡＤＤ３、ＬＳＳ、ＣＹＰ１１Ａ１、ＨＳＤ３Ｂ１−２、ＳＬＣＯ４Ｃ１、ＭＤＲ１および関連する多型などのＣＡＮＤ１遺伝子が含まれる。
【００６４】
本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態では、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、単独のまたはコアＳＮＰ：ｒｓ４９６１、ｒｓ４９８４、ｒｓ３７３１５６６、ｒｓ９１４２４７およびｒｓ１０４５６４２と組み合わせた以下の追加の関連ＣＡＮＤ１ ＳＮＰの、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の少なくとも１つを保有する個体への、ロスタフロキシンの投与または処方と関連して検出される。
【００６５】
特に、本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態では、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、単独のまたはコアＳＮＰについての遺伝子型：ｒｓ４９６１についてはＧＴ、ｒｓ４９８４についてはＣＴ、ｒｓ３７３１５６６についてはＡＧ、ｒｓ９１４２４７についてはＧＡおよびｒｓ１０４５６４２についてはＴＣと組み合わせた以下のＣＡＮＤ１遺伝子型の少なくとも１つの保有者である個体へのロスタフロキシンの投与または処方と関連して検出される。特に、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、ｒｓ９１４２４７についてのＣＡＮＤ１遺伝子型ＡＡの保有者である個体へのロスタフロキシンの投与または処方と関連して検出される。
【００６６】
本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態では、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、単独のまたはコアＳＮＰ：ｒｓ２４２０９３、ｒｓ１９９６３９６、ｒｓ１０５０３８０６、ｒｓ１３２５１７８０、ｒｓ１７４３０７０６、ｒｓ１０１０２０２４、ｒｓ５２６３０２、ｒｓ５４４１０４、ｒｓ３１０２０８７、ｒｓ５１８３、ｒｓ３７７２６２７、ｒｓ２２７６７３６、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ３７４１５５９、ｒｓ２２１７３４２、ｒｓ１０９２７８８８、ｒｓ６６０４９０９、ｒｓ９４５４０３、ｒｓ７１１７３１４、ｒｓ１０７９０２１２、ｒｓ１１２１６５９８、ｒｓ９１０６８２、ｒｓ１３２１８３１６、ｒｓ４３０９４８３、ｒｓ１３２８０３０７、ｒｓ４７３９０３７、ｒｓ１７５９６７７４、ｒｓ２７２８１０８、ｒｓ１７７８６４５６、ｒｓ７６９６３０４、ｒｓ２７２５２２２、ｒｓ１７１９９５６５、ｒｓ２７５８１５２、ｒｓ１０５７２９３、ｒｓ１６９６０７１２、ｒｓ７５９３５９、ｒｓ４０４２１４、ｒｓ１００５２１３、ｒｓ１７０２５４５３、ｒｓ２１１０９２３、ｒｓ１４２８５７１、ｒｓ４３５４０４、ｒｓ１２９０８７８７、ｒｓ１１６４７７２７、ｒｓ８８００５４およびｒｓ１１０６４５８４と組み合わせた以下の追加の関連ＣＡＮＤ２ ＳＮＰの、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の少なくとも１つを保有する個体への、ロスタフロキシンの投与または処方と関連して検出される。
【００６７】
本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態では、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、単独のまたはコアＳＮＰ：ｒｓ１２９９６１８６、ｒｓ９８９３３７２、ｒｓ７２１６３３１、ｒｓ７５２１６６８、ｒｓ１８８３３４、ｒｓ４９９８６６２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ６４５７１１０、ｒｓ３８９３４６４、ｒｓ２５１７７１８、ｒｓ１３６２１２６、ｒｓ５０１３０９３、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ６７１８２８２、ｒｓ７２１２０７、ｒｓ２５５５５００、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ８１７９６５４、ｒｓ１９０１１３９、ｒｓ２４２７８３２、ｒｓ９３６１８６３、ｒｓ１９９８３９４、ｇａ００１６１９、ｒｓ２２７５５３１、ｒｓ７４８１４０、ｒｓ４７１０５９２、ｒｓ２７４３９５１、ｒｓ１０１５９５６９、ｒｓ３０８７８１６、ｒｓ１０４９３９４０、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ２３２６９１２、ｒｓ１１１０４４６、ｒｓ１２５１３３７５、ｒｓ１７４１４９５４と組み合わせた以下の追加の関連ＧＷＳ ＳＮＰの、あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の少なくとも１つを保有する個体への、ロスタフロキシンの投与または処方と関連して検出される。
【００６８】
本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態では、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、単独のまたはコアＳＮＰ：Ｒｓ４９６１、Ｒｓ４９８４、Ｒｓ１０９２３８３５、Ｒｓ９４７１３０、Ｒｓ９１４２４７、Ｒｓ１０４５６４２、Ｒｓ８８００５４、Ｒｓ１０５０２９３３、Ｒｓ２１３１１２７、Ｒｓ４３０９４８３およびＲｓ４７３９０３７と組み合わせた以下の追加の関連ＳＮＰの、あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異少なくとも１つを保有する個体への、ロスタフロキシンの投与または処方と関連して検出される。
【００６９】
より具体的には、本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態では、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、単独でまたはコアＳＮＰ：Ｒｓ４９６１についてはヌクレオチドＧもしくはＴ、Ｒｓ４９８４についてはヌクレオチドＧもしくはＡ、Ｒｓ１０９２３８３５についてはヌクレオチドＡもしくはＴ、Ｒｓ９４７１３０についてはヌクレオチドＣもしくはＴ、Ｒｓ９１４２４７についてはヌクレオチドＡもしくはＧ、Ｒｓ１０４５６４２についてはヌクレオチドＣもしくはＴ、Ｒｓ８８００５４についてはヌクレオチドＣもしくはＴ、Ｒｓ１０５０２９３３についてはヌクレオチドＣもしくはＴ、Ｒｓ２１３１１２７についてはヌクレオチドＣもしくはＴ、Ｒｓ４３０９４８３についてはヌクレオチドＣもしくはＡおよびＲｓ４７３９０３７についてはヌクレオチドＧもしくはＡと組み合わせて、以下の追加の関連ＳＮＰの少なくとも１つを保有する個体への、ロスタフロキシンの投与または処方により達成される。
【００７０】
より具体的には、本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態では、ロスタフロキシンは、単独のまたはコアＳＮＰについての遺伝子型：Ｒｓ４９６１については遺伝子型ＧＴもしくは遺伝子型ＴＴ、Ｒｓ４９８４については遺伝子型ＣＣ、Ｒｓ１０９２３８３５については遺伝子型ＡＴもしくは遺伝子型ＴＴ、Ｒｓ９４７１３０については遺伝子型ＧＧ、Ｒｓ９１４２４７については遺伝子型ＡＡ、Ｒｓ１０４５６４２については遺伝子型ＴＴ、Ｒｓ８８００５４については遺伝子型ＡＧもしくは遺伝子型ＧＧ、Ｒｓ１０５０２９３３については遺伝子型ＣＴ、Ｒｓ２１３１１２７については遺伝子型ＣＣ、Ｒｓ４３０９４８３については遺伝子型ＡＡおよびＲｓ４７３９０３７については遺伝子型ＧＡと組み合わせた以下の遺伝子型の少なくとも１つの保有者である個体に、投与または処方される。
【００７１】
特に、いくつかの実施形態では、ロスタフロキシンにより個体を治療する方法が記載されている。本方法は、個体に、０．００５ｍｇ／日〜５ｍｇ／日、好ましくは０．０１ｍｇ／日〜１．５ｍｇ／日、最も好ましくは０．０５ｍｇ／日〜０．５ｍｇ／日の用量のロスタフロキシンを投与または処方するステップを含む。
【００７２】
特に、いくつかの実施形態では、本明細書に記載の遺伝的変異を保有する個体のサブセットにおいて、より低用量（０．０５ｍｇ／日；０．１５ｍｇ／日；０．５ｍｇ／日など）が、高用量（１．５ｍｇ／日；５．０ｍｇ／日）よりも収縮期血圧を低下させるのに効率的であり、高用量により誘導される−１２ｍｍＨｇと比較して、約１８ｍｍＨｇの収縮期血圧の平均的低下を有し得る。
【００７３】
特に、いくつかの実施形態では、コアＳＮＰから選択される少なくとも１つの多型を含む以前同定された遺伝子型を保有する高血圧個体で、０．０５〜０．５ｍｇ／日を含むロスタフロキシンの用量は、−１２〜−３４ｍｍＨｇに及ぶ血圧降下をもたらし、１．５ｍｇ／日〜５ｍｇ／日を含む用量は、−０．６〜−２３ｍｍＨｇに及ぶ血圧降下をもたらす。
【００７４】
したがって、いくつかの実施形態では、全コアＳＮＰを保有する個体で、低用量が、高用量（−１５ｍｍＨｇ平均）に対してより大きい応答をもたらす（−２３ｍｍＨｇ平均）。
【００７５】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の遺伝的変異を保有する個体は、ロスタフロキシンによる治療後、ロスタフロキシン治療前に検出された血圧と比較して少なくとも１０％の血圧の低下を示す。
【００７６】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の遺伝的変異を保有する個体は、ロスタフロキシンによる治療後、それぞれ少なくとも約１５ｍｍＨｇおよび約９ｍｍＨｇの個体のオフィス血圧および／または夜間血圧の平均的低下を示す。
【００７７】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の遺伝的変異を保有する個体は、収縮期血圧については１４０ｍｍＨｇ未満および拡張期血圧については９０ｍｍＨｇ未満の血圧の正常化を示す。
【００７８】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の遺伝的変異を保有する個体は、ロスタフロキシンによる治療後、ＨＣＴＺまたはロサルタンにより得られる平均的血圧低下よりも約４０％高い平均的血圧低下を示す（実施例２参照）。
【００７９】
本明細書に記載の方法およびシステムにおいて、ロスタフロキシンは、患者に個々に投与されるよう構成された組成物であってよく、および／またはそれは他の薬剤、薬物またはホルモンと組み合わせて投与されてもよい。特に、いくつかの実施形態では、医薬品は、治療用薬剤の投与に適した担体から選択される、薬学的に許容される担体も含むことができる。薬学的に許容される担体についての徹底的な議論は、その全体が参照により本明細書に組み込まれている、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ（Ｍａｃｋ Ｐｕｂ．Ｃｏ．、Ｎ．Ｊ．１９９１）で入手可能である。
【００８０】
治療用組成物中の薬学的に許容される担体は、水、食塩水、グリセロールおよびエタノールなどの液体をさらに含むことができる。さらに、湿潤剤または乳化剤、ｐＨ緩衝剤などの補助剤がこのような組成物中に存在してもよい。このような担体は、個体による摂取のために、医薬組成物が、錠剤、丸剤、糖衣錠、カプセル剤、液剤、ゲル、シロップ、スラリー、懸濁液などとして製剤化されるのを可能にする。
【００８１】
ロスタフロキシンを含む医薬品は、それだけに限定されないが、経口、静脈内、筋肉内、動脈内、脊髄内、髄腔内、心室内、経皮内適用、皮下、腹腔内、鼻腔内、経腸、局所、舌下、直腸手段、または外科手術後の患部組織に局所的に、を含む任意の数の経路によって、本明細書に記載の方法で投与することができる。本発明の化合物はまた、徐放性マトリックス中に組み込まれている場合でさえ、ステントに適用（コーティング）することができる。
【００８２】
いくつかの実施形態では、コアＳＮＰの少なくとも１つおよび／またはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異を保有する個体におけるロスタフロキシンの投与に伴う治療および予防の点から期待される治療効果には、それだけに限定されないが、心肥大および心不全、心虚血、血管反応性増加、血管硬化、血管厚さ増加、腎肥大、腎不全、糸球体硬化症、タンパク尿、脳血管損傷、脳卒中、認知障害、網膜障害の予防または減少が含まれ得る。上記障害の全ては、血圧の病的増加（高血圧のグレードＩＩＩおよびＩＶ）の直接的または間接的結果として生じるものであり、単独であるいは互いに組み合わせて、ＣＡＮＤ１ ＳＮＰ、ＣＡＮＤ２ ＳＮＰ、選択されたＧＷＳ ＳＮＰおよび／またはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異と組み合わせてコアＳＮＰを保有する個体において、ロスタフロキシンにより正常化されるので、このような効果が期待される。さらに、ロスタフロキシンが腎臓のナトリウム再吸収の増加およびＳｒｃシグナル伝達経路の活性化などの高血圧のいくつかの機構に拮抗する能力のために、高血圧によって直接的に引き起こされるもの以外の器官損傷を本治療により予防することができる。例えば、ＡＤＤ１ Ｔｒｐ４６０遺伝的変異体を保有する個体は、同じレベルの血圧で、Ｇｌｙ４６０ ＡＤＤ１変異体の保有者よりも高い心血管系合併症の発生率を示す。また、高い血漿ウアバインレベルを有する高血圧個体は、同様の血圧レベルであるが低いウアバイン血漿レベルを有する個体よりも高い心血管系合併症率を示す。選択されたコアＳＮＰの少なくとも１つを保有する個体におけるロスタフロキシン後の血圧降下の増加の正確な機構は知られていないが、これらの機構は、ロスタフロキシンによる分子標的の命中によって誘引される機構に関連するに違いない。結果として、コアＳＮＰ遺伝子型の少なくとも１つを保有する個体において、ロスタフロキシンにより誘導される血圧降下に関連する利点を超える利点が期待される。
【００８３】
いくつかの実施形態では、コアＳＮＰの少なくとも１つを保有する個体において、０．０５〜０．１５ｍｇ／日に及ぶロスタフロキシンの用量（低用量）が、１．５〜５ｍｇ／日に及ぶもの（高用量）などのより高用量よりも大きい血圧降下を誘導することが期待される。特に、低用量は、約２３ｍｍＨｇの平均的血圧降下をもたらすことが期待される一方で、高用量は、約１５ｍｍＨｇの平均的血圧降下をもたらすことが期待される。さらに、コアＳＮＰの少なくとも１つを保有する個体において、これらの用量のロスタフロキシンは、それだけではないが、心肥大、心不全、血管抵抗増加、腎不全、糸球体硬化症、タンパク尿、多発性嚢胞腎、網膜障害、脳血管障害、メニエール症候群、認知障害、双極性障害などの高血圧に関連する心血管系合併症の進行を防止することが期待される。
【００８４】
いくつかの実施形態では、コアＳＮＰの少なくとも１つを保有する個体へのロスタフロキシン治療は、５μｇ〜５００００μｇ、好ましくは１０μｇ〜１５０００μｇ、最も好ましくは５０μｇ〜５００μｇに及ぶ１日当たりのμｇの用量で行うことができる。
【００８５】
本用量によると、０．０５〜０．５０ｍｇ／日（低用量）に及ぶ低用量は、１．５〜５ｍｇ／日（高用量）に及ぶ高用量と比較して、血圧降下の点で、より高い（＋５０％）応答をもたらす。さらに、低用量は、高用量と比較して適切に高い夜間血圧の降下をもたらす。
【００８６】
いくつかの実施形態では、互いに組み合わせておよび／またはＣＡＮＤ１、２およびＧＷＳＡ ＳＮＰに含まれるものなどの他の関連ＳＮＰと組み合わせて、コアＳＮＰの少なくとも１つを保有する個体へのロスタフロキシンの投与において（プロファイル８および９、実施例２参照）、ロスタフロキシンは、約８〜約２２．５ｍｍＨｇに及ぶ平均的血圧低下を誘導することが期待される。
【００８７】
いくつかの実施形態では、互いに組み合わせて、ならびにＣＡＮＤ１、ＣＡＮＤ２およびＧＷＳ ＳＮＰに含まれるものなどの他の関連ＳＮＰと関連して、コアＳＮＰの少なくとも１つを保有する個体へのロスタフロキシンの投与において（プロファイル８および９、実施例２参照）、ロスタフロキシンは、２３ｍｍＨｇのオフィス（収縮期、日周性）血圧および約９ｍｍＨｇの夜間血圧の平均的血圧降下を誘導することが期待される。
【００８８】
いくつかの実施形態では、単独でまたは互いにもしくは追加の関連ＳＮＰと組み合わせてコアＳＮＰの少なくとも１つを保有する個体へのロスタフロキシンの投与は、ロサルタンまたはヒドロクロロチアジドなどの他の降圧薬に対する個体の応答と比較すると、ロスタフロキシンに対する改善された応答をもたらす。特に、単独でまたは互いに（もしくは追加の関連ＳＮＰと）組み合わせてコアＳＮＰの少なくとも１つを保有する個体へのロスタフロキシンの投与は、未治療患者において、ロサルタンまたはＨＣＴＺそれぞれによりもたらされるよりも少なくとも４０％高い血圧降下をもたらすことが期待される（実施例２参照）。
【００８９】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の治療を評価する方法は、コアＳＮＰ：ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ５０１３０９３、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ１２５１３３７５、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２３４５０８８からなる群から選択される少なくとも１つの多型に関して配列情報を得るステップを含み、前記情報は、個体におけるロスタフロキシンの有効性を予測する。
【００９０】
いくつかの実施形態では、それだけに限定されないが、ｒｓ４９６１（ＡＤＤ１）、ｒｓ４９８４（ＡＤＤ２）、ｒｓ３７３１５６６（ＡＤＤ３）、ｒｓ９１４２４７（ＬＳＳ２）、ｒｓ１０４５６４２（ＭＤＲ２）、ｒｓ１０５０２９３３、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ４３０９４８３、ｒｓ４７３９０３７および本開示を読めば当業者により同定可能な追加のＳＮＰ（プロファイル８〜９からの追加のＳＮＰ：ｒｓ１０９２３８３５（ＨＳＤ１８）、ｒｓ９４７１３０（ＨＳＤ１９）、ｒｓ８８００５４（ＷＮＫ１））を含む、ＣＡＮＤ１遺伝子、ＣＡＮＤ２遺伝子および／またはＧＷＳ遺伝子のＳＮＰなどのロスタフロキシンに対する応答に影響を及ぼす追加の関連遺伝的変異についての配列情報も得ることができる。
【００９１】
いくつかの実施形態では、配列情報は、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９および配列番号１１の配列の少なくとも１つを含み、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、それぞれ配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０および配列番号１２などの対応する検出された配列情報により予測することができる。
【００９２】
より具体的には、配列情報が、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９および配列番号１１の配列の少なくとも１つを含む実施形態では、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、配列番号１については配列番号１３および１４、配列番号３については配列番号１５および１６、配列番号５については配列番号１７および１８、配列番号７については配列番号１９および２０、配列番号９については配列番号２１および２２ならびに配列番号１１については配列番号２３および２４を含む対応する検出された対立遺伝子配列情報により予測することができる。
【００９３】
いくつかの実施形態では、本方法は、ｒｓ４９６１、ｒｓ４９８４、ｒｓ１０９２３８３５、ｒｓ９４７１３０、ｒｓ９１４２４７、ｒｓ１０４５６４２、ｒｓ８８００５４、ｒｓ１０５０２９３３、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ４３０９４８３およびｒｓ４７３９０３７からなる群から選択される少なくとも１つの多型についての配列情報を得るステップを含む。特に、いくつかの実施形態では、追加の関連配列情報は、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３および配列番号４５をさらに含み、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、それぞれ配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４および配列番号４６などの対応する検出された配列情報により予測することができる。
【００９４】
より具体的には、配列情報が、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３および配列番号４５の配列の少なくとも１つを含む実施形態では、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、配列番号２５については配列番号４７および４８、配列番号２７については配列番号４９および５０、配列番号２９については配列番号５１および５２、配列番号３１については配列番号５３および５４、配列番号３３については配列番号５５および５６、配列番号３５については配列番号５７および５８、配列番号３７については配列番号５９および６０、配列番号３９については配列番号６１および６２、配列番号４１については配列番号６３および６４、配列番号４３については配列番号６５および６６ならびに配列番号４５については配列番号６７および６８を含む対応する検出された対立遺伝子配列情報により予測することができる。
【００９５】
特に、配列情報は、遺伝子型解析：ＩＬＬＵＭＩＮＡ製のＧｅｎＣｈｉｐまたは当業者により同定可能な追加の方法およびシステムを使用して得ることができる。いくつかの実施形態では、本明細書に開示されるロスタフロキシン治療を評価する方法は、以下の実施例８で列挙する配列番号３５〜配列番号５８のプライマーなどの、コアＳＮＰ配列情報またはその一部のためのプローブを含むシステムによって行うことができる。
【００９６】
いくつかの実施形態では、ロスタフロキシンによる治療を評価するための方法は、コーカサス人だけでなくアフリカ人、アジア人またはアフリカ系アメリカ人も含む種々の民族性の、少なくとも１８歳の、男性または女性であり、好ましくは、それだけに限定されないが、原発性高血圧のグレードＩまたはＩＩであり、未治療または１種のみの薬物もしくはわずか２種の降圧薬しか含まない１配合錠による治療を受けており、重症もしくは悪性高血圧または二次性高血圧（腎動脈疾患の病歴を含む）でなく、関連状態およびわずか２種の追加の心血管危険因子もなく、ロスタフロキシンの吸収もしくは肝クリアランスに影響し得る胃腸系の手術または疾患がなく、ロスタフロキシン投与の少なくとも６ヶ月前からいかなる他の治験薬による治療も受けていない高血圧患者の選択を含む。患者は、欧州高血圧学会および欧州心臓病学会の２００３年のガイドラインにしたがって治療することができる［Ｒｅｆ．７］。
【００９７】
血圧は、従来の自由行動下血圧測定に関する欧州高血圧学会の勧告にしたがって、自由行動条件下で監視することができる［Ｒｅｆ．８］。血圧の測定は、オシロメトリックレコーダーまたは他の任意の有効な携帯型レコーダーもしくは血圧計を使用して行うことができる。血圧は、患者が座位で少なくとも５分間安静にした後で、腕で監視すべきである。患者の遺伝子型は、上腕静脈で採取した血液サンプルで測定することができる。ＤＮＡを、標準的手順［Ｒｅｆ．９］にしたがって、またはカスタムキットの使用により（例えば、ＰｒｏｍｅｇａゲノムＤＮＡ精製Ｃａｔ Ａ２３６０またはＱｉａｇｅｎ ＰＡＸｇｅｎｅ Ｂｌｏｏｄ ＤＮＡキット）血液から抽出し、保管し、選択されたヌクレアーゼ検出アッセイ（例えば、対立遺伝子識別のためのオンデマンドＡＢＩアッセイ）を使用して目的のＳＮＰの遺伝子型分類をする。いくつかの実施形態では、配列情報は、当業者に同定可能な方法を使用して得ることができる。
【００９８】
コアＳＮＰの少なくとも１つ、特に、本明細書に記載の選択された遺伝子型を、単独で、あるいは互いに関連して、ならびに／あるいはＣＡＮＤ１、ＣＡＮＤ２およびＧＷＳ ＳＮＰに属する追加の関連ＳＮＰ、特に本明細書に記載の選択された遺伝子型と関連して保有する、および／または関連する配列情報を有する個体を、１日１回、経口経路により、０．０５〜５ｍｇ／日に及ぶ用量で、好ましくは午前７時と午前９時の間の午前中に、定義される医薬組成物で物質を投与することによって、ロスタフロキシンで治療する。治療は、少なくとも５週間から患者の一生涯まで続き得る。
【００９９】
いくつかの実施形態では、遺伝的変異のロスタフロキシン活性への影響が、個体中のロスタフロキシンに対する応答を予測する方法の基礎を形成する。本方法は、ＫＣＮＳ３、ＴＨＳＤ７Ａ、ＦＡＭ４６Ａ、ＬＯＣ３８９９７０、ＨＬＡ−ＧおよびＴＴＣ２９からなる群から選択される遺伝子の遺伝子間または遺伝子内領域についての個体の遺伝子型を検出するステップと、検出された遺伝子型を、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型を含むロスタフロキシンに対する既知の応答に関連する以前に同定された遺伝子型と比較するステップとを含む。
【０１００】
本明細書で使用する「検出する」または「検出」および「検出可能な」という用語は、それだけに限定されないが、組織サンプル、反応混合物、分子複合体および基質を含む限られた空間の一部における、化合物、配列もしくは遺伝子型の存在、現存または現状の決定を示す。検出は、化合物の数量の測定（定量化とも呼ばれる）に言及する、関連するまたはこれを含む場合には、「定量的」であり、それだけに限定されないが、化合物の量または割合を決定するよう設計された任意の分析を含む。検出は、定量化されていない別の標的またはシグナルに対する相対的存在量の点から、化合物の質または種類の同定に言及する、関連するまたはこれを含む場合には、「定性的」である。
【０１０１】
遺伝子型の検出は、当業者により同定可能ないくつかの技術にしたがって行うことができる。一般に、単一ＳＮＰ解析の方法は、ＰＣＲ−ＲＦＬＰ解析、ＤＮＡシークエンシング、Ｔａｑｍａｎアッセイ、動的ＰＣＲである。ＣＡＮＤ１ ＳＮＰ（実施例３）およびＡＤＤ１、ＡＤＤ２、ＨＳＤ１８、ＨＳＤ１９、ＬＳＳ２、ＭＤＲ２、ＷＮＫ遺伝子（実施例４）を遺伝子型分類するために、本報告では、この方法の１つであるＴａｑｍａｎアッセイ（オンデマンド解析ならびにＡＢＩ製のカスタムＭＧＢプローブおよびプライマー設計）を使用した。
【０１０２】
複数ＳＮＰ解析のアッセイは、いくつかの市販のプラットフォームおよび各チップについて可変数の遺伝子（何百〜何百万）を有する入手可能なまたはカスタムＧｅｎｅ−Ｃｈｉｐを利用する。本開示では、ＨｕｍａｎＨａｐ １Ｍ Ｄｕｏ ｃｈｉｐ ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ Ｂｅａｄｓ ＣｈｉｐおよびＩｌｌｕｍｉｎａ Ｉｎｆｉｎｉｕｍ ＩＩ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙを使用して、実施例４（ｒｓ１０５０２９３３、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ４３０９４８３、ｒｓ４７３９０３７）ならびに実施例５および６において、ＳＮＰを遺伝子型分類した。
【０１０３】
本方法では、個体中で検出された遺伝子型がロスタフロキシン応答に関連する同一遺伝子型である場合、ロスタフロキシンに対する個体の応答は、既知の応答であると予測される。ロスタフロキシンに関連して本明細書で使用する「応答」という用語は、個体へのロスタフロキシンの投与に関連する個体の状態の任意の作用または変化の事実を示す。個体中のロスタフロキシンに対する代表的な応答は、臨床的に関連する血圧降下を含む。特に、プラセボにより引き起こされるよりも有意に高く、特に、少なくとも治療前の血圧値の１０％と等しい血圧降下、または収縮期血圧については１４０ｍｍＨｇ以下もしくは拡張期血圧については９０ｍｍＨｇ以下の血圧値をもたらすことができる。いくつかの実施形態では、本方法は、例えば、個体の単離ＤＮＡ中で、ＡＤＤ１、ＡＤＤ２、ＡＤＤ３、ＣＹＰ１１Ａ１、ＨＳＤ３Ｂ１、ＬＳＳ、ＡＢＣＢ１／ＭＤＲ１、ＳＬＣＯ４Ｃからなる群から選択される遺伝子の遺伝子間または遺伝子内領域についての個体の遺伝子型を検出するステップと、検出された遺伝子型を、ｒｓ４９６１、ｒｓ４９８４、ｒｓ３７３１５６６、ｒｓ９１４２４７、ｒｓ１０４５６４２および／またはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異からなる群から選択される少なくとも１つの多型を含む、既知のロスタフロキシン応答に関連する以前に同定された遺伝子型と比較するステップとをさらに含むことができる。いくつかの実施形態では、本方法は、ＡＣＴＮ１、ＡＤＲＡ１Ａ、ＡＧＴＲ１、ＡＱＰ２、ＡＴＰ１Ａ３、ＣＬＣＮＫＡ、ＣＬＣＮＫＢ、ＦＸＹＤ２、ＦＸＹＤ６、ＦＹＮ、ＮＥＤＤ４Ｌ、ＮＫＡＩＮ３、ＰＫＤ１、ＰＫＤ２、ＳＣＮＮ１Ｂ、ＳＧＫ１、ＳＬＣ１２Ａ１、ＳＬＣ８Ａ１、ＴＪＰ１、ＵＭＯＤおよびＷＮＫ１からなる群から選択される遺伝子の遺伝子間または遺伝子内領域についての個体の遺伝子型を検出するステップと、検出された遺伝子型を、ｒｓ２４２０９３、ｒｓ１９９６３９６、ｒｓ１０５０３８０６、ｒｓ１３２５１７８０、ｒｓ１７４３０７０６、ｒｓ１０１０２０２４、ｒｓ５２６３０２、ｒｓ５４４１０４、ｒｓ３１０２０８７、ｒｓ５１８３、ｒｓ３７７２６２７、ｒｓ２２７６７３６、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ３７４１５５９、ｒｓ２２１７３４２、ｒｓ１０９２７８８８、ｒｓ６６０４９０９、ｒｓ９４５４０３、ｒｓ７１１７３１４、ｒｓ１０７９０２１２、ｒｓ１１２１６５９８、ｒｓ９１０６８２、ｒｓ１３２１８３１６、ｒｓ４３０９４８３、ｒｓ１３２８０３０７、ｒｓ４７３９０３７、ｒｓ１７５９６７７４、ｒｓ２７２８１０８、ｒｓ１７７８６４５６、ｒｓ７６９６３０４、ｒｓ２７２５２２２、ｒｓ１７１９９５６５、ｒｓ２７５８１５２、ｒｓ１０５７２９３、ｒｓ１６９６０７１２、ｒｓ７５９３５９、ｒｓ４０４２１４、ｒｓ１００５２１３、ｒｓ１７０２５４５３、ｒｓ２１１０９２３、ｒｓ１４２８５７１、ｒｓ４３５４０４、ｒｓ１２９０８７８７、ｒｓ１１６４７７２７、ｒｓ８８００５４およびｒｓ１１０６４５８４ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異からなる群から選択される少なくとも１つの多型を含む、既知のロスタフロキシン応答に関連する以前に同定された遺伝子型と比較するステップとをさらに含むことができる。いくつかの実施形態では、本方法は、ＡＲＬ５Ａ、ＡＴＰ２Ａ３、ＣＯＸ１０、ＤＰＨ５、ＦＡＩＭ３、ＦＡＭ４６Ａ、ＨＣＧ９、ＨＬＡ−Ａ、ＨＬＡ−Ｆ、ＨＬＡ−Ｇ、ＫＣＮＳ３、ＬＯＣ１３１６９１、ＬＯＣ３８９１７４、ＬＯＣ３８９９７０、ＬＯＣ６４２７２７、ＬＯＣ６４４１９２、ＬＯＣ６４９４５８、ＬＯＣ７２８３６０、ＬＯＣ７２８３１６、ＰＩＧＲ、ＲＣＡＤＨ５、ＲＰ３−３７７Ｈ１４．５、ＳＨ３ＰＸＤ２Ａ、ＳＬＣ３０Ａ７、ＴＨＳＤ７Ａ、ＴＭＥＭ２００Ａ、ＴＲＩＭ３１、ＴＴＣ２９およびＶＣＡＭ１からなる群から選択される遺伝子の遺伝子間または遺伝子内領域についての個体の遺伝子型を検出するステップと、検出された遺伝子型を、ｒｓ１２９９６１８６、ｒｓ９８９３３７２、ｒｓ７２１６３３１、ｒｓ７５２１６６８、ｒｓ１８８３３４、ｒｓ４９９８６６２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ６４５７１１０、ｒｓ３８９３４６４、ｒｓ２５１７７１８、ｒｓ１３６２１２６、ｒｓ５０１３０９３、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ６７１８２８２、ｒｓ７２１２０７、ｒｓ２５５５５００、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ８１７９６５４、ｒｓ１９０１１３９、ｒｓ２４２７８３２、ｒｓ９３６１８６３、ｒｓ１９９８３９４、ｇａ００１６１９、ｒｓ２２７５５３１、ｒｓ７４８１４０、ｒｓ４７１０５９２、ｒｓ２７４３９５１、ｒｓ１０１５９５６９、ｒｓ３０８７８１６、ｒｓ１０４９３９４０、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ２３２６９１２、ｒｓ１１１０４４６、ｒｓ１２５１３３７５およびｒｓ１７４１４９５４ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異からなる群から選択される少なくとも１つの多型を含む、既知のロスタフロキシン応答に関連する以前に同定された遺伝子型と比較するステップとをさらに含むことができる。
【０１０４】
いくつかの実施形態では、本明細書に開示されるロスタフロキシンに対する応答を予測する方法は、患者をレスポンダーおよび非レスポンダーに分類するために１回だけ適用される、遺伝子型分類ための第１成分と、１日５０〜５００γに及ぶ用量でロスタフロキシンおよび薬学的に許容される担体を含む組成物とを含むシステムによって行うことができる。
【０１０５】
いくつかの実施形態では、ロスタフロキシンに対する個体の応答を予測するシステムは、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型のためのプローブと、プローブハイブリダイゼーションの結果および以前に同定された遺伝子型を関連付けるルックアップテーブルとを含むことができる。
【０１０６】
これらの実施形態のいくつかでは、プローブは、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０および配列番号１２からなる群から選択される少なくとも１個の単離ポリヌクレオチド、または配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０もしくは配列番号１２に相補的な配列と特異的にハイブリダイズすることができるそのフラグメントを含む。
【０１０７】
これらの実施形態のいくつかでは、本システムは、ｒｓ４９６１、ｒｓ４９８４、ｒｓｒｓ１０９２３８３５、ｒｓ９４７１３０、ｒｓ９１４２４７、ｒｓ１０４５６４２、ｒｓ８８００５４、ｒｓ１０５０２９３３、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ４３０９４８３およびｒｓ４７３９０３７からなる群から選択される少なくとも１つの多型のためのプローブをさらに含むことができる。
【０１０８】
特に、プローブは、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４および配列番号４６からなる群から選択される少なくとも１個の単離ポリヌクレオチド、または配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４もしくは配列番号４６に相補的な配列と特異的にハイブリダイズすることができるそのフレグメントを含むことができる。いくつかの実施形態では、プローブは、配列番号３５〜配列番号５８からなる群から選択される配列を有することができる。
【０１０９】
いくつかの実施形態では、本システムは、血液サンプル採取用のチューブ、ゲノムＤＮＡ抽出、ＤＮＡ増幅用の緩衝液（例えば、プライマー、緩衝液および／またはｄＮＴＰ酵素）、および当業者により同定可能な追加の成分を含むことができる。
【０１１０】
いくつかの実施形態では、単一ＳＮＰ解析のために以下を含むいくつかの手順を使用することができる：ａ）ＡＢＩ製のＰｒｅ−Ｄｅｓｉｇｎｅｄ ＳＮＰアッセイまたはカスタムＳＮＰ Ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ Ａｓｓａｙ、およびデータ解析のためのリアルタイムＰＣＲシステムを使用した、対立遺伝子特異的ＭＧＢプローブによるリアルタイムＰＣＲ ＳＮＰ遺伝子型分類；ｂ）普遍的なエネルギー移動プライマー（Ａｍｐｌｉｆｌｕｏｒ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ）およびデータ解析のためのリアルタイムＰＣＲシステムを使用した対立遺伝子特異的ＰＣＲ ＳＮＰ；ｃ）ＰＣＲ−ＲＦＬＰ解析およびアガロースゲル検出；ｄ）動的ＰＣＲ；ならびにｅ）ダイレクトシークエンシング。単一ＳＮＰ解析を行うのに適した追加の手順は、当業者により同定可能であり、さらに詳細には論じない。
【０１１１】
いくつかの実施形態では、本システムは、ＩＬＬＵＭＩＮＡ、ＡＦＦＩＭＥＴＲＩＸもしくはＡＢＩまたは他の専門会社製の遺伝子チップ（マイクロアレイ）のカスタムサービスを含むことができる。発明者等の目的のために単一遺伝子チップ中に含むべきＳＮＰの数は比較的少ない（２０〜３０）だろう。特定の遺伝子チップを集めるための主成分は５つの主要なプロセスに基づく：ＤＮＡ精製、特異的なプライマーミックスを使用した精製ＤＮＡのＰＣＲ増幅；増幅した産物のフラグメンテーションおよびラベリング；増幅した産物のマイクロアレイとのハイブリダイゼーションおよび結合した産物の染色、マイクロアレイのスキャニングおよび解析。
【０１１２】
いくつかの実施形態では、遺伝的変異のロスタフロキシン活性への影響は、ロスタフロキシンに対する改善された応答を有する個体を同定する方法の基礎を形成する。本方法は、個体の遺伝子間または遺伝子内領域中の配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９および配列番号１１のヌクレオチド配列のいずれか１つにおける一塩基多型（ＳＮＰ）を検出するステップを含み、ここでは、コアＳＮＰの存在は、前記個体中のロスタフロキシンに対する改善された応答と相関する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の追加の関連ＳＮＰを、ロスタフロキシンに対する改善された応答を有する個体を同定する方法で検出することもできる。
【０１１３】
いくつかの実施形態では、遺伝的変異のロスタフロキシン活性への影響は、心血管状態を有する個体中のロスタフロキシンに対する治療応答を改善する方法の基礎を形成する。本方法は、コアＳＮＰの少なくとも１つおよび／またはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の保有者であることが決定された前記個体にロスタフロキシンを投与するステップを含む。
【０１１４】
いくつかの実施形態では、遺伝的変異のロスタフロキシン活性への影響は、ロスタフロキシンにより個体を治療する方法の基礎を形成する。本方法は、コアＳＮＰの存在を示す情報、および場合により、個体中のロスタフロキシン応答に影響を及ぼす追加のＳＮＰに関する情報を得るステップと、０．００５ｍｇ〜５０ｍｇ、好ましくは０．０１ｍｇ〜１５ｍｇ、最も好ましくは０．０５ｍｇ〜５ｍｇに及ぶ用量で、改善された応答に関連する遺伝子型を有する個体のためにロスタフロキシンを投与するステップとを含む。
【０１１５】
いくつかの実施形態では、遺伝的変異のロスタフロキシン活性への影響は、心血管状態を有する個体を治療する方法の基礎を形成する。本方法は、少なくとも１つのコアＳＮＰおよび／またはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の保有者である患者に有効量のロスタフロキシンを投与または処方するステップを含む。
【０１１６】
いくつかの実施形態では、心血管状態は高血圧であり、個体を治療する方法は、
ａ）高血圧を患う個体から核酸サンプルを得るステップと；
ｂ）前記核酸サンプル中の、本明細書に記載のコアＳＮＰからなる群から選択される多型の１つまたは複数の存在を決定するステップと；
ｃ）薬学的活性量のロスタフロキシンを、本明細書に記載のコアＳＮＰからなる群から選択される少なくとも１つの多型を有することが示された患者に投与するステップと
により行うことができる。
【０１１７】
本明細書に開示される個体を治療する方法において、ロスタフロキシンは、典型的には、医薬組成物の形態で投与される。このような組成物は、医薬分野で周知の方法で調製することができ、少なくとも１つの活性化合物および媒体を含む。本明細書で使用する「媒体」という用語は、通常、有効成分として組成物中に含まれるロスタフロキシン化合物のための溶媒、担体、結合剤、賦形剤または添加剤として作用する種々の媒体のいずれかを示す。当業者は、医薬組成物を製剤化するのに適した全種類のこのような溶媒、担体、賦形剤または添加剤化合物を知っている。
【０１１８】
ロスタフロキシンは、従来使用されている補助剤、担体、賦形剤または添加剤と共に、医薬組成物およびその単一用量の形態にすることができ、このような形態において、全て経口で使用するための錠剤もしくは充填カプセル剤などの固体、溶液、懸濁液、乳濁液、エリキシル剤などの液体、または同液体で満たされたカプセル剤として、あるいは非経口用（皮下使用を含む）の滅菌注射溶液の形態で使用することができる。このような医薬組成物およびその単一剤形は、追加の活性化合物もしくは有効成分を含むまたは含まないで、従来の割合で成分を含んでよく、このような単一剤形は、使用される所期の日用量範囲と釣り合った任意の適当な有効量の有効成分を含んでよい。
【０１１９】
いくつかの実施形態では、ロスタフロキシンは、「薬学的有効量」で投与される。実際に投与される化合物の量は、典型的には、治療する状態、選択される投与経路、薬物の組み合わせ、個々の患者の年齢、体重および応答、患者の症状の重症度などを含む関連する状況に照らして、医師によって決定される。一般的に、有効用量は、１日当たりの単回投与として０．００５ｍｇ〜５０ｍｇ、好ましくは０．０１ｍｇ〜１５ｍｇ、最も好ましくは０．０５ｍｇ〜５ｍｇである。
【０１２０】
組成物は、単独で患者に投与してもよいし、他の薬剤、薬物またはホルモンと組み合わせて投与してもよい。患者に投与される組成物の有効用量は、０．０５ｍｇ〜５ｍｇ／日に及ぶ。
【０１２１】
所期の送達経路に応じて、ロスタフロキシンは、好ましくは非経口、局所用または経口組成物として、より好ましくは経口製剤として製剤化される。経口投与用組成物は、バルク溶液もしくは懸濁液、またはバルク粉末の形態をとり得る。しかしながら、より一般的には、正確な投薬を促進するために組成物は単位剤形で提供される。「単位剤形」という用語は、ヒト被験体および他の哺乳動物のための単一の用量として適当な物理的に分離した単位を指し、各単位は、適当な医薬添加剤と組み合わせて、所望の治療効果をもたらすよう計算された所定の量の活性物質を含む。典型的な単位剤形は、液体組成物の詰替用の予め計量されたアンプルもしくは注射器、または個体組成物の場合には丸剤、錠剤、カプセル剤などを含む。このような組成物中で、本発明の化合物は、通常、微量成分であり（約０．１〜約５０重量％、好ましくは約１〜約４０重量％）、残りは、所望の投与形態を形成するのに役立つ種々の媒体または担体および加工助剤である。
【０１２２】
投薬治療は、単回投与スケジュールであっても複数回投与スケジュールであってもよい。
【０１２３】
経口投与に適した液体形態は、緩衝液、懸濁化剤および分散化剤、着色剤、香味剤などを含む適当な水性または非水性媒体を含んでよい。
【０１２４】
固体形態は、例えば、以下の成分または同様の性質の化合物のいずれかを含んでよい：結晶セルロース、アカシア、トラガカントゴム、ゼラチンまたはポリビニルピロリドンなどの結合剤；デンプンまたは乳糖などの添加剤；アルギン酸、プリモゲル（Ｐｒｉｍｏｇｅｌ）またはジャガイモデンプンもしくはコーンスターチなどの崩壊剤；ステアリン酸マグネシウム、タルク、ポリエチレングリコールまたはシリカなどの潤滑剤；コロイド性二酸化ケイ素などの滑剤；ショ糖またはサッカリンなどの甘味剤；あるいはペパーミント、サリチル酸メチルまたはオレンジ香料などの香味剤。錠剤は、医薬実務の分野の当業者に周知の方法にしたがってコーティングしてよい。
【０１２５】
非経口組成物は、典型的には、注射用滅菌生理食塩水もしくはリン酸緩衝生理食塩水、または当技術分野で既知の他の注射用担体に基づく。上記のように、このような組成物中の式Ｉの化合物は、典型的には、微量成分であり、しばしば０．０５〜１０重量％に及び、残りは注射用担体などである。
【０１２６】
ロスタフロキシンはまた、徐放性形態でまたは徐放性薬物送達システムから投与することができる。代表的な徐放性物質の記載は、組み込まれたＲｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ中の物質中にも見出すことができる。
【０１２７】
経口投与組成物または非経口組成物のための上記成分は、代表的なものに過ぎない。さらなる物質ならびに加工技術などは、その全体が参照により本明細書に組み込まれている、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、第２０版、２０００、Ｍａｒｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏｍｐａｎｙ、Ｅａｓｔｏｎ、Ｐｅｎｎｓｙｌｖａｎｉａの第５部に述べられている。
【０１２８】
いくつかの実施形態では、少なくとも１００個の隣接ヌクレオチドを含む単離核酸分子が開示されており、ここでは、ヌクレオチドの１つは、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９および配列番号１１の核酸配列、またはこれら相補配列のいずれか１つにおいて選択される一塩基多型（ＳＮＰ）である。
【０１２９】
いくつかの実施形態では、遺伝的変異のロスタフロキシン活性への影響は、心血管状態を治療的にまたは予防的に処理するのに有用な薬剤を同定する方法の基礎を形成する。
【０１３０】
本方法は、候補薬剤を用意するステップと、候補薬剤を、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３、ｒｓ１２５１３３７５またはそれらとの連鎖不平衝における多型からなる群から選択される少なくとも１つの多型を保有する個体に投与するステップと、前記候補薬剤に対する個体応答を検出するステップとを含む。
【０１３１】
いくつかの実施形態では、候補薬剤は、本明細書に示されるＣＡＮＤ１、ＣＡＮＤ２およびＧＷＳ ＳＮＰの１つまたは複数も保有する個体に投与される。
【０１３２】
いくつかの実施形態では、本方法は、高血圧患者を選択し、個体におけるロスタフロキシンによる治療を評価するために使用される手順にしたがって測定および検出を行うことによって行うことができる。これらの実施形態のいくつかでは、個体におけるロスタフロキシン治療の評価は、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型に関して配列情報を得ることによって行うことができ、ここでは、情報は個体中のロスタフロキシンの有効性を予測する。
【０１３３】
これらの実施形態のいくつかでは、配列情報は、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９および配列番号１１の配列の少なくとも１つを含み、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０および配列番号１２からなる群から選択される少なくとも１つの対応する検出された配列情報により予測することができる。
【０１３４】
これらの実施形態のいくつかでは、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、配列番号１については配列番号１３および１４、配列番号３については配列番号１５および１６、配列番号５については配列番号１７および１８、配列番号７については配列番号１９および２０、配列番号９については配列番号２１および２２ならびに配列番号１１については配列番号２３および２４からなる群から選択される少なくとも１つの対応する検出された対立遺伝子配列情報により予測することができる。
【０１３５】
これらの実施形態のいくつかでは、評価方法は、ｒｓ４９６１、ｒｓ４９８４、ｒｓ１０９２３８３５、ｒｓ９４７１３０、ｒｓ９１４２４７、ｒｓ１０４５６４２、ｒｓ８８００５４、ｒｓ１０５０２９３３、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ４３０９４８３およびｒｓ４７３９０３７からなる群から選択される少なくとも１つの多型についての配列情報を得るステップをさらに含むことができる。特に、配列情報は、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３および配列番号４５の配列の少なくとも１つを含むことができる。これらの配列情報について、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４および配列番号４６からなる群から選択される少なくとも１つの対応する検出された配列情報により予測することができる。
【０１３６】
これらの実施形態のいくつかでは、ロスタフロキシンに対する改善された応答は、配列番号２５については配列番号４７および４８、配列番号２７については配列番号４９および５０、配列番号２９については配列番号５１および５２、配列番号３１については配列番号５３および５４、配列番号３３については配列番号５５および５６、配列番号３５については配列番号５７および５８、配列番号３７については配列番号５９および６０、配列番号３９については配列番号６１および６２、配列番号４１については配列番号６３および６４、配列番号４３については配列番号６５および６６ならびに配列番号４５については配列番号６７および６８からなる群から選択される少なくとも１つの対応する検出された対立遺伝子配列情報により予測することができる。
【０１３７】
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される心血管状態を治療的または予防的に処理するのに有用な薬剤を同定する方法は、本明細書に記載の関連遺伝的変異を検出及び同定するのに適した成分を含むシステムによって行うことができる。
【０１３８】
いくつかの実施形態では、ＫＣＮＳ３、ＴＨＳＤ７Ａ、ＦＡＭ４６Ａ、ＬＯＣ３８９９７０、ＨＬＡ−ＧおよびＴＴＣ２９からなる群から選択される遺伝子の遺伝子間または遺伝子内領域中の一塩基多型（ＳＮＰ）を検出するシステムが開示される。本システムは、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１のヌクレオチド配列のいずれか１つにおける一塩基多型（ＳＮＰ）を含む核酸分子と特異的にハイブリダイズする単離ポリヌクレオチドと、核酸分子のための緩衝液（ハイブリダイゼーションおよび／またはポリメリゼーション緩衝液など）の少なくとも１つと、ＳＮＰの検出のために核酸配列と組み合わせて使用するための酵素とを含む。特に、酵素は、調査する遺伝子間および／または遺伝子内領域の１つまたは複数のためのポリメラーゼ連鎖反応を触媒することができるポリメラーゼであり得る。
【０１３９】
本明細書で使用するハイブリダイゼーションという用語は、核酸の２本以上の相補鎖間の非共有結合性、配列特異的相互作用を確立して、二本鎖の場合には二重鎖と呼ばれる単一ハイブリッドにするプロセスを示す。特異的ハイブリダイゼーションは、特異的な配列−配列相互作用をもたらすハイブリダーゼーションである。ある分子と別の分子との結合に関連して本明細書で使用する「特異的」、「特異的に」または「特異性」という表現は、その分子と別の分子間の認識、接触および安定な複合体の形成を指し、他の分子についてはその分子の各々と別の分子の間の認識、接触および安定な複合体の形成は実質的にほとんどないか全くない。ポリヌクレオチドの配列に関連して本明細書で使用する「特異的」という用語は、相補的な配列である単一ポリヌクレオチドとの配列の特有の会合を指す。
【０１４０】
本明細書で使用する「ポリメラーゼ連鎖反応」という用語は、単一または数コピーの核酸の一部を数桁に増幅させて、数千から数百万の特定のＤＮＡ配列のコピーを生み出す任意の適当な技術を示す。本方法は、核酸溶融のための反応の加熱および冷却ならびに核酸の酵素的複製の繰り返しのサイクルからなる熱サイクルによる。
【０１４１】
いくつかの実施形態では、本システムはまた、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３および配列番号４５のヌクレオチド配列のいずれか１つにおける一塩基多型（ＳＮＰ）を含む核酸分子と特異的にハイブリダイズする単離ポリヌクレオチドを含むことができる。本明細書に開示されるシステムは、部品のキットの形態で提供することができる。部品のキットにおいて、プローブ、医薬組成物、および他の成分、および基質は、独立してキットに含まれる。特に、プローブは、１つまたは複数の組成物中に含まれてよく、各プローブは、適当な媒体、担体または補助剤と共に組成物中に含まれてよい。
【０１４２】
いくつかの実施形態では、緩衝液、酵素および適当な容器をキットの追加の成分としてさらに提供することができる。追加の成分は、ラベル（放射性同位体、蛍光団、化学発光色素、発色団、酵素、酵素基質、酵素補因子、酵素阻害剤、色素、金属イオン、ナノ粒子、金属ゾル、リガンド（ビオチン、アビジン、ストレプトアビジンまたはハプテンなど）などの検出することができる分子）、マイクロ流体チップ、標準試料、および本開示を読めば当業者により同定可能な追加の成分を含むことができる。特に、キットの成分は、本明細書に開示される方法を行うために、適当な説明書および他の必要な試薬と共に提供することができる。キットは、通常は、別々の容器中に組成物を含む。アッセイを行うための、説明書、例えば、紙またはテープもしくはＣＤ−ＲＯＭなどの電子サポート上の、書面説明書または音声説明書が、通常、キットに含まれる。キットはまた、使用する特定の方法に応じて、他の包装された試薬および物質（すなわち、洗浄緩衝液など）を含むことができる。
【０１４３】
組成物の適当な担体剤または補助剤の同定、ならびにキットの一般的製造および包装に関するさらなる詳細は、本開示を読めば当業者により同定可能である。
【０１４４】
以下の節では、本開示は、本開示の範囲を限定するとみなされると解釈されないいくつかの実施例によって説明される。
実施例
【０１４５】
遺伝的変異の、ロスタフロキシンに対する個体応答への影響を確認するために、薬理ゲノミクス研究を行った。薬理ゲノミクス研究のためのサンプルは、［Ｒｅｆ．１０、１１、１２］に記載の手順にしたがって、Ｈｕｍａｎ１Ｍ Ｄｕｏ ＣＨＩＰ ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ Ｂｅａｄ Ｃｈｉｐを使用して、Ｉｌｌｕｍｉｎａ製のＨｕｍａｎ１Ｍアレイで遺伝子型分類した３４２人の個体からなった。［Ｒｅｆ１３］中のような人口統計学を使用して、第１期間（５週間）に、個体中で、１６９人にプラセボ処理を投与し、１７３人に活性薬物（ロスタフロキシン）を投与した。特に、患者を、５週間、以下のロスタフロキシンの経口用量：０．０５、０．１５、０．５、１．５または５ｍｇ／日の１つにランダム化した。クロスオーバーデザインにおいて、各用量をプラセボと比較しなければならなかった。以前の研究は１ヶ月の洗い出しでは不十分であることを示したので［Ｒｅｆ．１４〜３０］、以前治療を受けなかった（ＮＰＴ）１９３人の患者を、以前治療を受けた１４９人と別に分析した。
【０１４６】
個体の上記サンプルについて、遺伝的関連解析を行い、試験した個体の表現型を、個体中で検出されたＳＮＰと関連づけた。選択した目的の表現型は血圧応答であった。検出のために選択したＳＮＰは、個体の常染色体上の１１１１１７０個のＳＮＰであった。
【０１４７】
目的の表現型が定量的変数（ＱＴ）であり、目的の表現型の分布に影響を及ぼす変数（因子）がＳＮＰ、治療（プラセボ、ロスタフロキシン）およびＳＮＰ＊治療相互作用である定量的遺伝子関連設計にしたがって、遺伝子解析を行った。
【０１４８】
特に、統計解析のために選択した定量的表現型は、第１治療期間の最後でのオフィス収縮期血圧（ＳＢＰ）（ＳＢＰ＿５）と１ヶ月の導入期間（ｒｕｎ−ｉｎ）後のベースラインでのオフィス収縮期血圧（ＳＢＰ＿０）の間のｍｍＨｇの差とし、本明細書ではＤＳＢＰ５＿０とも称される。次いで、選択されたＱＴ表現型および目的の表現型の分布に影響を及ぼす他の因子を、以下でさらに詳細に説明するように、以下の定量的形質相互作用検定
表現型＝ＳＮＰ＋治療＋ＳＮＰ＊治療相互
にしたがって、解析した。
【０１４９】
遺伝的関連を行うため、記述統計分析および推測統計分析を行った。
【０１５０】
記述統計分析を行って、データの主要パラメータを最初に要約および記載し、質的管理を行った。
【０１５１】
表１は、分析を行う際に出願人等により選択された統計的処理、パラメータおよび閾値ならびにそこからの成果において得られた結果を要約している。
【表１】
【０１５２】
行った遺伝的記述分析の結果も、表２ならびに図１、２および３でさらに詳細に説明する。
【表２】
【０１５３】
特に、表２には、全サンプルならびにプラセボおよびロスタフロキシンで処理した患者についてのＤＳＢＰ５＿０の記述統計が列挙されている。かなり控えめなＳＢＰの基礎レベルは、プラセボ群を含めるために要求される、「軽度の」高血圧（ＳＢＰ範囲１４０〜１７９ｍｍＨｇ）の患者を採用した点から説明することができる。表２に要約される結果の図解は、合計、治療およびプラセボにおけるＤＳＢＰ５＿０分布を示す図１に示されている。
【０１５４】
ＮＰＴ群については、残りの個体の合計遺伝子型分類率は９９．６７％であった；６０７１個のＳＮＰは欠測率検定に失敗し（コールレート＜９０％）、２５８１４８個のＳＮＰはＭＡＦ＜０．０５であった。頻度および遺伝子型分類の刈り込み後、８４８３４０個のＳＮＰが、０．０５のＭＡＦ閾値を使用した選別後に残った（データ不掲載）。
【０１５５】
上記を考慮して、出願人等は、二項表現型変数、ロスタフロキシンに対する応答−非応答を生み出すために、ＤＳＢＰ５＿０の分布の最低三分位点に関連して（−１１．７ｍｍＨｇ、すなわち、９９人の患者の中の３３人）、ＱＴ ＤＳＢＰ５＿０≦１１．７ｍｍＨｇのカットオフ値を選択した。ＤＳＢＰ５＿０閾値選択は、結果の統計的および臨床的関連性の両方を示すパラメータをもたらすよう行った。
【０１５６】
選択されたＱＴ閾値を示す記述統計分析の結果の図表現を図２に示す。
【０１５７】
図３は、変動の上位軸を使用して検出される試験個体間の遺伝的関連性を説明しており、ゼロ付近に分布する個体の軽い不均一なクラスター形成を示している。集団層別化の評価（および補正）は、系統的な祖先の差異の存在による偽陽性および偽陰性の有意な関連を避けることに関連している。
【０１５８】
次いで、処理（プラセボまたは活性薬物）に対する異なる応答と有意に関連するＳＮＰを検出するために計算されたＱＴを使用して、推測統計分析を行った。
【表３】
【０１５９】
表３は、記述統計的処理の結果を考慮して、出願人等により選択された統計的処理、閾値及び分析を要約している。
【０１６０】
特に、単変量解析に関して、ＳＮＰが一つずつ検討される単一点解析を行った。行われた定量的形質相互作用検定（Ｇ＊Ｅ、Ｇｅｎｅ＊ Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔ）は、
表現型＝ＳＮＰ＋治療＋ＳＮＰ＊治療
として関連を評価し、ここでは、主作用「治療」は、遺伝成分を考慮することなく、臨床試験それ自体を検定することに相当するので、解析の重点はＳＮＰ＊治療成分に、すなわち、主作用よりもむしろ相互作用にあった。主作用「ＳＮＰ」は、治療によって誘導される修正を考慮することなく、血圧の変動に影響を及ぼすＳＮＰを探す。相互作用効果（Ｇ＊Ｔ）のみが、どのＳＮＰ（Ｇ＝遺伝子）が、活性薬物またはプラセボのいずれかを投与された被験体におけるＳＢＰに影響を及ぼすかを評価する（Ｔ＝治療）。
【０１６１】
上位ＳＮＰのリストを形成することができる最も有意な関連を選別するために、ｐ＜１０−４の閾値を選択した。特に、出願人等は、「保守的な」Ｐ値（偽陰性に対して）を意図的に選択して、あまり有意でない結果をふるい落とした［Ｒｅｆ．３４、３５］。さらに、少なくとも２つの統計プログラム（ｐｌｉｎｋおよびｓｔａｔａ）を使用して、全ての潜在的に正の関連が意味のあることが確認された。上記アプローチにしたがって行われた単変量解析の結果を、図４に示す（以下の実施例６も参照）。
【０１６２】
推論相互作用分析に関して、観察されたＱＴ表現型ＤＳＢＰ５＿０の変動が、共に検討した複数のＳＮＰの連合効果に依存するかどうかを確かめるために種々の遺伝子間の相互作用を試験した。
【０１６３】
特に、次いで、ＳｔａｔａＳＥ９．２で実施されたように、単一線形回帰モデルを使用して、ロスタフロキシン／プラセボ内の、ＳＮＰの第１セット（ＳＮＰ１）およびＳＮＰの第２セットの（ＳＮＰ２）の限界効果に加えて、ＳＮＰ１とＳＮＰ２の間の相互作用効果（ＳＮＰ１＊ＳＮＰ２＊ｔｈｅｒ）について試験した。
【０１６４】
ＳＮＰセットは、ＳＮＰが検出された遺伝子、および選択したものの表現型（血圧の変動）の原因として同定された機構への遺伝子の関与可能性を考慮して確立した。
【０１６５】
従属変数としてＤＳＢＰ５＿０および独立変数として有意な候補ＳＮＰを使用して、プラセボおよびロスタフロキシンにおいて、ＳＴＡＴＡソフトウェアを使用して、Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ ＡＮＯＶＡ解析を行うことによって、プラセボと比較してロスタフロキシンに対する最大応答を有する遺伝子型を同定するために、これらのＳＮＰをさらに選択した。
【０１６６】
特に、プラセボと比較してロスタフロキシンに対する最大応答を有する２つのＳＮＰの間の相互作用の遺伝子型を選択するために、出願人等は、従属変数としてＤＳＢＰ５＿０および独立変数としてＳＮＰ間の相互作用を使用して、プラセボおよびロスタフロキシンにおいて、ＡＮＯＶＡ統計を行った。出願人等は、図５にこの処理の例を報告している：ｒｓ８８９９とｒｓ４６７８の間の相互作用。治療群で最大の著しい減衰をもたらし、プラセボ群ではもたらさないので、出願人等は、ｒｓ８８９９の遺伝子型ＡＡとｒｓ４６７８の遺伝子型ＢＢの間の相互作用を選択した。
【０１６７】
本調査の成果において、出願人等は、図５のｒｓ８８９９およびｒｓ４６７８の例などの、ロスタフロキシンでＱＴ表現型ＤＳＢＰ５＿０の著しい減衰を有し、プラセボ群では有さないＳＮＰの相互作用の遺伝子型を選択した。
【０１６８】
全ての遺伝子解析は、プログラムパッケージｇＰＬＩＮＫ［Ｒｅｆ．３３］を使用して行った。Ｅｉｇｅｎｓｏｆｔパッケージ（Ｌｉｎａｘプラットフォームについてバージョン２．０、Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ、Ｈａｒｖａｒｄ Ｍｅｄｉｃａｌ Ｓｃｈｏｏｌ、Ｂｏｓｔｏｎ、ＵＳＡ）を使用した主成分分析。ＥｉｇｅｎｓｏｆｔパッケージのＧｅｎｏｍｉｃ Ｃｏｎｔｒｏｌ（ＧＣ）を使用して、ゲノム膨張因子λを計算した。統計的遺伝子解析を完成させるため、および純粋な統計的遺伝学アプローチを超えたこれら全ての解析のために、プログラムＳｔａｔａＳＥ９．２を使用した。当業者は、本開示を読めば、統計解析の追加の詳細全てを同定することができるだろう。
【０１６９】
記述統計分析および推論統計分析後に、有意なＳＮＰの可能な最小のセットを使用して、活性治療に対するレスポンダーと非レスポンダー（ＮＲ）とを識別するために、遺伝子型分類プロファイルも作成した。この場合、「遺伝子プロファイル」は、単一ＳＮＰまたはその相互作用における遺伝子型の線形結合である。
【０１７０】
プロファイルを作成するために、各ＳＮＰについての異なる遺伝子型を変数とみなし、特に、より低頻度のホモ接合体遺伝子型を遺伝子型１（ｇ１）として同定し、ヘテロ接合体遺伝子型を遺伝子型２（ｇ２）として同定し、より高頻度のホモ接合体遺伝子型を（ｇ３）として同定した。
【０１７１】
したがって、例えば、因子としてＳＮＰ１のｇ１（成分１）、ＳＮＰのｇ２（成分２）およびＳＮＰ３のｇ１とＳＮＰ４のｇ２との相互作用（成分３）を有するような遺伝子プロファイルを構築した。プロファイルは、任意の数の成分を有することができる。
【０１７２】
少なくとも１つの成分が有意に関連する遺伝子型（例えば、前の例におけるＳＮＰ１のｇ１）を提供する場合には、任意の所与のプロファイルは１に等しいとコードされ、そうでなければプロファイルは０とコードされる。次いで、全被験体を、定義された患者のサブセットを特徴付けるのを可能にするプロファイルへの適合に応じて、０または１として分類する。
【０１７３】
次いで、［Ｒｅｆ．３６、３７］に記載されているものなどの手順に対して行われるロジスティック回帰を使用して、異なるプロファイルが被験体をＲまたはＮＲに分類する予測能力、すなわちロスタフロキシンについてのＲとＮＲとを識別する遺伝子型プロファイルを見出す能力を試験した。
【０１７４】
遺伝子プロファイルを評価するために出願人等によって選択されたパラメータは、オッズ比（ＯＲ）であり、これは、ＦＤＡガイドライン［Ｒｅｆ．３８］によると、薬理ゲノミクス試験の成績の情報を与えると考えられるパラメータの１つである。特に、ＦＤＡガイドラインによると、ＯＲは、プラセボではなく薬物に対するレスポンダー患者間の異なる遺伝子プロファイルによる識別の程度を評価するための臨床的に関連するパラメータである。
【０１７５】
ＯＲ値は、定義された遺伝子プロファイルにより、試験陽性患者（レスポンダー）のオッズと試験陰性患者（非レスポンダー）のオッズの比を示す。オッズ比は、以下のように陽性予測値（ＰＰＶ）および陰性予測値（ＮＰＶ）を組み合わせる：ＰＰＶ×ＮＰＶ／［（１００−ＰＮＶ）×（１００−ＮＰＶ）］。予測値（陽性または陰性のいずれか）は、目的の臨床状態（すなわち、定義された遺伝子プロファイルによる薬物に対する応答）を有する陽性または陰性の試験結果を有する患者の比率を表す。言い換えれば、ＯＲは、試験に対してレスポンダーである（ＰＰＶ）または非レスポンダーである（ＮＰＶ）確率である。１のオッズ比は、試験が、情報価値がないことを示し、したがって、オッズ比が高いほど、試験の予測力は高い。
【０１７６】
上記研究の結果に基づき、出願人等は、ロスタフロキシンの効果を検出するために選択された定量的表現型に有意に影響を及ぼすいくつかのＳＮＰおよび関連する遺伝子型プロファイルを同定した。
【０１７７】
特に、驚くべきことに、血圧に影響を及ぼす経路に以前は関連づけられていなかった遺伝子中に位置するいくつかのコアＳＮＰが、以下の実施例に示すようにロスタフロキシンの効果を増強する著しい能力を示した。
実施例１：コアＳＮＰは、ロスタフロキシンに対する個体の応答に影響を及ぼす
【０１７８】
上記研究の成果において、ある群のＳＮＰが、ロスタフロキシンに対する個体の応答に有意に影響を及ぼすものとして同定され、本明細書ではコアＳＮＰとも称される。本明細書に記載のコアＳＮＰの主要な特徴を、表４に示す。
【表４】
【０１７９】
ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５のコアＳＮＰは、上記統計解析の成果で、ロスタフロキシンに対する血圧応答に関連する有意なＳＮＰの最小のセットとしてゲノムワイド関連解析（ＧＷＡＳ）で同定された、ヒトゲノム中の染色体上の正確な位置は分かっているが、現時点では機能は未知である、新しく同定された一塩基多型である。
【０１８０】
特に、これらのＳＮＰは、Ｓｅｎｔｒｉｘ ＢｅａｄＣｈｉｐプラットフォームに基づく全ゲノム遺伝子型分類（ＷＧＧ）［Ｒｅｆ．１０］にしたがって行われた試験個体の全ゲノムの遺伝子型分類の後に同定された。より具体的には、ＷＧＧを、Ｈｕｍａｎ１Ｍ Ｄｕｏ ＣＨＩＰ−Ｉｎｆｉｎｉｕｍ ＩＩ Ａｓｓａｙを使用して行い、当業者により同定可能な記載の手順、および例えば、［Ｒｅｆ．１０、１１、１２］にさらに詳細に記載される手順にしたがって、非制限的遺伝子座選択を通して、患者の全ゲノムに沿って１００万個のＳＮＰにわたって調べた。
【０１８１】
遺伝子型分類の成果で検出されたＳＮＰを、最初に単変量解析に供し、次いで、上で説明したようにロスタフロキシンに対する最大応答を有するＳＮＰ遺伝子型を選択するためのさらなる解析に供した。
【０１８２】
特に、プラセボと比較してロスタフロキシンに対する最大応答を有する遺伝子型を選択するために、出願人等は、従属変数としてＤＳＢＰ５＿０および独立変数として有意なＳＮＰを使用してプラセボおよびロスタフロキシンにおいてＡＮＯＶＡ統計解析（一元配置）を行った。
【０１８３】
行った解析を図６に例示するが、ここでは、プラセボ（ｐ＝０．０４５）よりも治療群（ｐ＝０．００２）でより大きいＳＮＰ遺伝子型ｇ１、ｇ２およびｇ３における有意な表現型分散に関するＳＮＰ ｒｓ２４６１９１１についての解析が示されている。
【０１８４】
ＳＮＰ ｒｓ２４６１９１１の３つの遺伝子型ｇ１、ｇ２およびｇ３についてのＤＳＢＰ５＿０値の変動は、ロスタフロキシンおよびプラセボ群を比較するＳＮＰ ｒｓ２４６１９１１の３つの遺伝子型についてのＤＳＢＰ５＿０値のプロットを示す図７にも示されている。図７の説明から、遺伝子型１では、ロスタフロキシンにより血圧が明確に低下している一方で、プラセボでは血圧が控えめに増加していることが明確である。逆に、遺伝子型３では、プラセボによる血圧降下はより大きいように見える。重要なことは、明らかに従うこれらの遺伝子型によるプラセボおよびロスタフロキシンによる血圧応答における変化の方向ならびに逆の傾向である。これは分析することが可能であり、発明者等は、その特定のＳＮＰについて、モデルおよびロスタフロキシンとプラセボの間の相互作用の統計的有意性を確立することができる。適当な統計解析は、相互作用の有意性をもたらす（この有意性は、モデルの有意性が０．０５未満の場合にのみ認められる）。相互作用についてのＰ値を、Ｐ−ＧＸＥとして表４に示す。
【０１８５】
同様のアプローチを適用して他のコアＳＮＰを解析および選択した結果、本調査の成果で、出願人等は、図７の例ｒｓ２４６１９１１のような、ロスタフロキシンではＱＴ表現型ＤＳＢＰ５＿０の著しい減衰を有するが、プラセボ群では有さないＳＮＰの遺伝子型を選択した。
【０１８６】
コアＳＮＰを有し、ロスタフロキシンで処理した個体（治療）対コアＳＮＰを有し、プラセボで処理した個体（プラセボ）におけるＤＳＢＰ５＿０に関するデータの概要を表５に示す。
【表５】
【０１８７】
特に、表５のデータは、ＱＴ表現型ＤＳＢＰ５＿０に有意に関連するＳＮＰを選択するために、従属変数としてＤＳＢＰ５＿０および独立変数としてＳＮＰを使用して、段階的線形回帰を使用して得た。
実施例２：コアＳＮＰを含む遺伝子プロファイルは、ロスタフロキシンに対する個体応答に影響を及ぼす。
【０１８８】
ＳＮＰの同定後、出願人等は、実施例１のコアＳＮＰを含む遺伝子プロファイルの予測能力を調査した。遺伝子プロファイルの構築を支持する理論的根拠は、所与のＳＮＰの表現型効果はまた、第１ＳＮＰに関連するタンパク質と相互作用するタンパク質をコードする遺伝子上に持つ他のＳＮＰの面で評価されなければならないという確立した概念による（遺伝的ネットワーク）。この意味で、ネットワーク解析はまた、遺伝的エピスタシスの概念を意味する［Ｒｅｆ．３９］。実際、２つの遺伝子座の対立遺伝子は、同一被験体中で同時に発生するので、これらの対立遺伝子を別々に解析すると検出可能な効果を有さないが、一緒に分析すると表現型的に関連し得る。
【０１８９】
出願人等は、予測モデルとして、従属変数が二面性表現型（ＲまたはＮＲ）であり、独立変数が特定のプロファイルであるロジスティック回帰を使用して、治療群のみにおいてコアＳＮＰを含む遺伝子プロファイルが、治療に対するレスポンダーと非レスポンダーとを識別することができるかどうかを評価した。次いで、出願人等は、予測パラメータ（オッズ比、ＰＰＶ、ＮＰＶ）を計算するモデルの長所を評価した。
【０１９０】
実施例１の全コアＳＮＰを含む遺伝子プロファイルに関連する代表的データを図８に示す。特に、図８は、ＦＤＡガイドライン［Ｒｅｆ．３８］によると、薬理ゲノミクス試験の成績の情報を与えると考えられるパラメータである、コアＳＮＰを含むプロファイルについてのオッズ比（ＯＲ）および予測値（Ｐ値）に関するデータを示す。
【０１９１】
特に、ＯＲ値は、定義された遺伝子プロファイルにより、試験陽性患者（レスポンダー）のオッズと試験陰性患者（非レスポンダー）のオッズの比を示す。特に、オッズ比は、以下のように陽性予測値（ＰＰＶ）および陰性予測値（ＮＰＶ）を組み合わせる：ＰＰＶ×ＮＰＶ／［（１００−ＰＮＶ）×（１００−ＮＰＶ）］。言い換えれば、ＯＲは、試験に対してレスポンダーである（ＰＰＶ）または非レスポンダーである（ＮＰＶ）確率である。１のオッズ比は、試験が、情報価値がないことを示し、したがって、オッズ比が高いほど、試験の予測力は高い。Ｐ値（陽性または陰性のいずれか）は、目的の臨床状態（すなわち、定義された遺伝子プロファイルによる薬物に対する応答）を有する陽性または陰性の試験結果を有する患者の比率を表す。
【０１９２】
Ｐ値パラメータはｚスコアに基づいて計算され、これはＯＲの有意性を示す。ｚスコアパラメータは、Ｉｎ（ＯＲ）／標準誤差（ＩｎＯＲ）を示す。ＯＲが微小から１であり、したがってプロファイルが薬物に対する応答を予測することができない場合には、ｚスコアは負の値を有する。これに対して、ＯＲ＞１であり、したがってプロファイルが薬物に対する応答を予測することができる場合には、ｚスコアは正の値を有する。ｚスコアが高い場合には、分散がより小さいためにＯＲはより有意である。
【０１９３】
上記パラメータ中で、オッズ比（ＯＲ）は、プラセボではなくロスタフロキシンに対するレスポンダー患者間の異なる遺伝子プロファイルによる識別の程度の評価に臨床的に関連すると考えられる［Ｒｅｆ．３８］。
【０１９４】
プロファイルに列挙されたコアＳＮＰの１つまたは複数のＳＮＰを含む患者からのデータを検討して、図８に要約する全コアＳＮＰを含むプロファイル（プロファイル４）に関連するデータを得た。判定基準は、単一の特有のプロファイル中の少なくとも１つのＳＮＰを保有する患者の包含を通常支持する２つの因子の発生により正当化される：ｉ）ＳＮＰの強力な予測力およびｉｉ）当のＳＮＰに関連する一般的なもっともらしい生物学的機構。特に、ＳＮＰの予測力は、ＯＲおよび当業者により同定可能な方法にしたがって正確に分類された患者から評価することができる。対応するパラメータは、プロファイル４を有する患者について７９．８％である「正確な」値である（図８参照）。この値は、１００人の患者の中の８０人の患者において、プロファイルが、患者をレスポンダーおよび非レスポンダーへ正しく分類することを示している。
【０１９５】
上記結果を考慮して、コアＳＮＰが臨床的関連によりロスタフロキシンの薬理活性に影響を及ぼすと結論づけることが可能である。特に、臨床的関連は、薬物（ロスタフロキシン）とプラセボの間の血圧降下の差異の大きさが原因であり、ロスタフロキシンでは２３〜１５ｍｍＨｇに及ぶ一方で、文献によると、この差異はＡＲＢでは４〜６ｍｍＨｇに及ぶ。
【０１９６】
２つの別々の研究で得られたプロファイル４を保有する患者の予備データは、ロスタフロキシンで得られる血圧降下が、入手可能な降圧薬中で検出される血圧降下よりも４０％超大きいことを示している（図８、底部参照）。特に、プロファイル４を保有する個体は、ＨＣＴＺで−１２．３±１．５ｍｍＨｇ、ロサルタンで−１１．３±１．７およびロスタフロキシンで−１８．７４±１．８ｍｍＨｇの血圧変化を示しており；プロファイル８を保有する個体は、ＨＣＴＺで−１１．３±１．２ｍｍＨｇ、ロサルタンで−１１．６±１．３ｍｍＨｇおよびロスタフロキシンで−１５．２±１．５ｍｍＨｇの血圧低下を示しており；プロファイル９を保有する個体は、ＨＣＴＺで−１１．９±１．２ｍｍＨｇ、ロサルタンで−１１．４±１．４ｍｍＨｇおよびロスタフロキシンで−１５．２±１．５ｍｍＨｇの血圧低下を示している。
実施例３：関連ＳＮＰと共にコアＳＮＰを含む遺伝子プロファイルはロスタフロキシンに対する応答に影響を及ぼす
【０１９７】
コアＳＮＰと上記薬理ゲノミクス研究中で同定された追加のＳＮＰの相互作用を分析し、予測モデルとしてロジスティック回帰を使用して治療に対するＲとＮＲとを識別するのに適した追加の遺伝子プロファイルの可能な同定を検証した。
【０１９８】
特に、実施例２のコアＳＮＰプロファイル（プロファイル４）を、研究中に同定された追加の関連ＳＮＰと組み合わせた。
【０１９９】
関連ＳＮＰは、本明細書の文脈において、ロスタフロキシンに対するレスポンダーと非レスポンダーとを識別するのに適したＳＮＰを示す。
【０２００】
特に、以下の３つのグループの遺伝子で、関連ＳＮＰを最初に調査した：ａ）本明細書でＣＡＮＤ１としても示される、ロスタフロキシンの作用機構に直接関与している遺伝子（アデュシンおよびＥＯ遺伝子など−実施例４参照）；ｂ）本明細書でＣＡＮＤ２としても示される、高血圧の発達および／または高血圧に関連する器官損傷に関与し得る遺伝子（ＷＮＫなど−実施例５参照）；ならびに本明細書でＧＷＳとしても示される、全ゲノム解析を行うことにより同定された遺伝子（ＨＬＡ−Ａなど、実施例６参照）。
【０２０１】
特に、選択された遺伝子を遺伝子型分類することにより、これらの遺伝子中のＳＮＰを最初に同定した。次いで、検出されたＳＮＰを実施例４〜６でさらに示す記述分析および推測分析に供することにより、関連ＳＮＰを選択した。次いで、このように同定された関連ＳＮＰを実施例２のプロファイル４のコアＳＮＰと共に遺伝子プロファイルにグループ化した。
【０２０２】
結果は、図８に示されるように、コアＳＮＰおよび関連ＳＮＰを含む遺伝子プロファイルが、ロスタフロキシンレスポンダーと非レスポンダーとを識別するのになお一層有効であることを示している。
【０２０３】
特に、図８の要約で、コアＳＮＰ（プロファイル４）ならびに追加のＣＡＮＤ１、ＣＡＮＤ２および／またはＧＷＳ ＳＮＰにより形成される追加のプロファイルについて検出されるＯＲおよびＰ値およびＤＳＢＰ５＿０も示される（特に、図８のプロファイル８およびプロファイル９参照）。図８のデータの解析から、追加のＳＮＰをプロファイルに含めることにより、ＯＲ値および「正確な」値は、プロファイル４の値に対して増加するように見える（図８のプロファイル８およびプロファイル９参照）。また、これらのＳＮＰの包含は、プロファイル４の総母集団の２６％からプロファイル９の総母集団の４４％まで標的集団の大きさの増加を決定する。
【０２０４】
手引きの目的で本明細書において提供され、限定することを意図していない、コアＳＮＰと図８に示される追加のＳＮＰの間の相乗効果の可能な説明は、高血圧などの複合疾患の根底にある同一遺伝的ネットワーク中の当のＳＮＰの包含である。出願人等によって得られた実験的証拠は、これらのＳＮＰが、遺伝的ネットワーク中の他の遺伝子（血圧に影響を及ぼす経路に既に関連付けられているＣＡＮＤ１またはＣＡＮＤ２など−実施例４および５参照）を妨げるもしくは調節することができる、または先天的に選択された候補のリスト（プロファイル８および９と比較してプロファイル４を参照）とは無関係であり得る他の遺伝子に影響を及ぼすことができるという結論を支持する。
【０２０５】
したがって、本明細書で報告するデータの可能な説明は、コアＳＮＰ（プロファイル４）の識別能力は、ＧＷＳ、コアＳＮＰ、ＣＡＮＤ１、ＣＡＮＤ２および遺伝的ネットワークに含まれる追加の未知のＳＮＰの効果を組み合わせる／統合する同一遺伝的ネットワーク中の包含のために、ＣＡＮＤ１およびＣＡＮＤ２により増加させられるということである。
【０２０６】
識別能力の増加、およびプロファイル４からプロファイル９へ移すことにより達成されたプロファイルに含まれる選択される患者の大きさの増加は、ネットワーク概念を支持する。
【０２０７】
図８のプロファイル８および９に含まれる追加の関連遺伝子についての特定の遺伝子型を、以下の表６および表７にさらに記載する。
【表６】
【表７】
【０２０８】
上記結果を考慮して、追加のＳＮＰと共にプロファイルに含まれるコアＳＮＰは、臨床的関連によりロスタフロキシンの薬理活性に影響を及ぼし、それはコアＳＮＰ単独の活性よりもはるかに高くなり得ると結論づけることが可能である。
実施例４：ロスタフロキシンに対する応答に影響を及ぼす関連ＳＮＰ：ＣＡＮＤ１遺伝子
【０２０９】
出願人等は、ロスタフロキシンに対するレスポンダーを同定する実施例１のコアＳＮＰも含む遺伝子プロファイルへの追加の関連ＳＮＰの包含を調査した。
【０２１０】
第１の一連の実験において、ロスタフロキシンの作用の機構に直接関与する遺伝子（本明細書でＣＡＮＤ１遺伝子とも称される）のＳＮＰを調査した。
【０２１１】
特に、調査したＣＡＮＤ１遺伝子は、アデュシンサブユニットをコードする遺伝子（ＡＤＤ１、ＡＤＤ２、ＡＤＤ３）、ならびにＥＯ合成および代謝に関与する遺伝子（ＣＹＰ１１Ａ１、ＨＳＤ３Ｂ１、ＬＳＳ、ＡＢＣＢ１／ＭＤＲ１およびＳＬＣＯ４Ｃ１）を含んでいた。調査した遺伝子の特徴の概要を表８に報告する。
【表８】
【０２１２】
特に、表８は、選択されたＣＡＮＤ１遺伝子および関連する染色体の位置、遺伝子記号および遺伝子名を示す。
【０２１３】
表８の各ＣＡＮＤ１遺伝子について、Ｔａｑｍａｎアッセイ（オンデマンドアッセイまたはＡＢＩ製のプローブおよびプライマー設計を使用したカスタムＭＧＢ）によるＳＮＰ：単一ＳＮＰ解析を使用して、ＳＮＰを検出した。
【０２１４】
検出されたＳＮＰを、単変量解析に供し、研究のために選択したＱＴ表現型ＤＳＢＰ５＿０の検出された変動に基づいて、関連ＣＡＮＤ１ ＳＮＰを選択した。
【０２１５】
代表的な関連ＣＡＮＤ１ ＳＮＰを、関連するＧＸＴ関連結果と共に表９および表１０に報告する。有意なｐ＿ＧＸＴは、処理（ロスタフロキシン／プラセボ）に対する有意なＤＳＢＰ５＿０の異なる応答を示している。
【表９】
【表１０】
【０２１６】
特に、表９は、関連する遺伝子記号、染色体の位置、染色体上の位置、遺伝子上の位置およびＰ値と共に選択された代表的なＣＡＮＤ１ ＳＮＰの単変量解析の結果を示している。
【０２１７】
ＨＳＤ３Ｂ１遺伝子についての２つの関連ＳＮＰ（ＨＳＤ１８およびＨＳＤ１９）を、表６に詳細に記載し、その関連を表７に記載する。
【０２１８】
表１０では、関連ＳＮＰ ｒｓ９１４２４７のデータを報告する。
【０２１９】
遺伝子およびアデュシンの詳細な説明中で説明するように、表９に含まれる遺伝子は、アデュシンならびにＥＯ合成および輸送に関与する酵素をコードすることが示唆されているものである。「インビトロ」でピコモル濃度または動物中でナノモル用量のロスタフロキシンは、野生のアデュシンの効果を阻害することなく、変異型アデュシンまたはウアバインのＮａ−ＫポンプおよびｃＳｒｃへの影響を選択的に修正することができる。
実施例５：ロスタフロキシンに対する応答に影響を及ぼす関連ＳＮＰ：ＣＡＮＤ２遺伝子
【０２２０】
第２の一連の実験において、高血圧の発達および／または高血圧に関連する器官損傷に関与し得る遺伝子（本明細書でＣＡＮＤ２遺伝子とも称される）のＳＮＰを調査した。
【０２２１】
特に、病態生理学的に関連する遺伝子のより大きいセットを、ＣＡＮＤ２遺伝子として選択した。選択判定基準は、主として、ＲＡＡ酵素および受容体をコードする遺伝子、腎臓のナトリウム再吸収を調節するイオンチャネルおよび輸送体の種々のファミリー、アドレナリン受容体、有足細胞タンパク質ならびに転写因子を含んでいた。得られた遺伝子のセットを図９の図解に要約する。
【０２２２】
特に、図９において、関連染色体の位置、遺伝子記号および遺伝子名と共に選択された候補遺伝子ＣＡＮＤ２を示す。
【０２２３】
これらの遺伝子に関する追加の情報は、本開示を読めば当業者により同定可能である。
【０２２４】
図９の表の各ＣＡＮＤ２遺伝子について、ロスタフロキシンに対する血圧応答へのこれらの遺伝子の影響を評価するための候補遺伝子内の変異の評価をもたらすことができるＳＮＰをゲノム中およびＩｌｌｕｍｉｎａチップ中に存在するＴａｇ ＳＮＰを使用して検出した。
【０２２５】
検出されたＳＮＰを、単変量解析に供し、コアＳＮＰの選択に関して説明したのと同じ方法論により、１．７８＊１０Ｅ−４（ｒＳ７１１７３１４）から５＊１０Ｅ−２（ｒｓ９４５４０３）に及ぶＰ値ＧＸＴを有するＳＮＰのみを選択した。候補遺伝子を扱う場合、発明者等は、候補遺伝子の選択を支持する以前のデータを考慮して、ｐ＜０．０００１の代わりにｐ＜０．０５のみを閾値として使用した。
【０２２６】
特に、検出されたＱＴ表現型ＤＳＢＰ５＿０の変動に基づいて、関連ＣＡＮＤ２ ＳＮＰを選択した。
【０２２７】
関連するＧＸＴ関連結果と共に、代表的なＣＡＮＤ２ ＳＮＰを表１１に報告する。有意なｐ＿ＧＸＥは、処理（ロスタフロキシン／プラセボ）に対する有意なＤＳＢＰ５＿０の異なる応答を示している。
【表１１】
【０２２８】
特に、表１１では、プラセボおよび治療についてのＧＸＴ関連結果が示されている。有意なｐ＿ＧＸＴは、処理（ロスタフロキシン／プラセボ）に対する有意なＤＳＢＰ５＿０の異なる応答を示している。
実施例６：ロスタフロキシンに対する応答に影響を及ぼす関連ＳＮＰ：ＧＷＳ遺伝子
【０２２９】
第３の一連の実験において、全ゲノム解析で検出された遺伝子（本明細書でＧＷＳ遺伝子とも称される）のＳＮＰも調査した。
【０２３０】
［Ｒｅｆ．１０、１１、１２］に記載の手順にしたがって、Ｈｕｍａｎ１Ｍ Ｄｕｏ ＣＨＩＰ ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ Ｂｅａｄ Ｃｈｉｐを使用して、Ｉｌｌｕｍｉｎａ製のＨｕｍａｎ１ＭアレイでゲノムＳＮＰを遺伝子型分類した。特に、染色体ＸおよびＹのＳＮＰならびにＸの偽常染色体領域のＳＮＰ（ＸＹ）は考慮しなかったので、全体で、１１１１１９０個（合計の９２．６６％）のＳＮＰを解析した。
【０２３１】
検出されたＳＮＰを、実施例の節で記載した方法論にしたがって、関連ＳＮＰを同定するためのアプローチで単変量解析に供した。
【０２３２】
ＧＷＳ遺伝子についての単変量解析（定量的形質相互作用−ＧｘＥ）の結果を図４に示すが、これは、ｐ＜１０−４の確立された閾値未満のＰ値を有する１０７個のＳＮＰを有する１９３人のＮＰＴ患者からのサンプル中で遺伝子型分類された８４８３４０個のＳＮＰについての結果を点として示している。
【０２３３】
次いで、関連に関与する特定のゲノム領域の役割を明確にすることを目的とした同定された１０７個のＳＮＰの詳細なアノテーションを行った。このＧＷＡＳから同定された１０７個の上位ＳＮＰを、これらのゲノム位置によって実際に示す：７個はコード領域、４個は３’ＵＴＲ、３０個はイントロンおよび６６個は遺伝子間領域。最後に言及したグループ中で、いくつかのＳＮＰは遺伝子領域と近位にあり、関連プロモーター中に局在化し得る一方で、他のいくつかは、砂漠領域中と考えられるほどアノテーション済み遺伝子から遠くにある。
【０２３４】
そのため、プロファイル４（単一上位ＳＮＰ）に含まれる上位ＳＮＰおよびプロファイル５（上位ＳＮＰと相互作用）についてのみ、より詳細なアノテーションを行い、発明者等は、その大多数がイントロンＳＮＰの最小のセットを有する遺伝子間変異体であることを認めた。これら変異体の全ては、導入部−１．３段落で既に言及されているように、いわゆる「ジャンクＤＮＡ」領域に属しており［Ｒｅｆ．４０］、したがって、真核生物における配列の進化的革新のための豊富な基質を表している。
【０２３５】
徹底的なアノテーションのためにとる手順は、以下を考慮した：ｉ．ＭＡＦ＞５％を示すＳＮＰ；ｉｉ．異なるデータベース（ＮＣＢＩ Ｅｎｔｒｅｚ Ｇｅｎｅ、ＨａｐＭａｐ、Ｅｎｓｅｍｂｌ）の助けを借りたより最近のマッピング；ｉｉｉ．遺伝子領域または機能的領域中の考えられる位置による、その間の完全なまたは強力なＬＤ中のＳＮＰのグループからの選択；ｉｖ．ＰｕｂＭｅｄ解析；ｖ．公開されているｍｉＲＮＡ配列および関連ゲノム標的のアノテーション。
【０２３６】
遺伝子内ＳＮＰについて、出願人等は、コード変異体またはスプライシング変異体を認めなかったが、発明者等は、その機能が多くの場合未知の遺伝子中に位置する一般的なイントロン多型を同定した。２つの上位ＳＮＰ（ｒｓ３８９３４６４およびｒｓ５０１３０９３）は、６番染色体上の主要組織適合性複合体クラスＩ領域、いくつかの遺伝子を含む広範囲で高ＬＤの特有の領域中に位置していた。この場合、正確な遺伝子アノテーションはより複雑であり、含まれる遺伝子の発現および機能パターン調査が、正しい領域を規定するのに役立った。ＳＮＰは、特に３’ＵＴＲについてのｍｉＲＮＡ標的組成物にも異なる影響を及ぼすことができるので、全上位ＳＮＰを異なるデータベースで（www.patrocles.org、microrna.sanger.ac.uk、www.microrna.org）実質的に試験したが、いかなる興味深い結果も得られなかった。出願人等はまた、完全な前駆体配列またはまさに成熟ｍｉＲＮＡに対する検索を検討した。しかしながら、シグナルのソースのさらなる遺伝的局在化なしでの、予測のための薬物応答のマーカー同定は、ＧＷＡ研究のための十分なエンドポイントであろう。
【０２３７】
上記特徴付けの後、従属変数としてＤＳＢＰ５＿０および独立変数として１０７個の有意なＳＮＰを使用して、プラセボおよびロスタフロキシンにおいて、ＳＴＡＴＡソフトウェアを使用して、統計的ＡＮＯＶＡ解析を行うことにより、プラセボと比較したロスタフロキシンに対する最大応答を有する遺伝子型を同定するために、最初の１０７個のＧＷＳ ＳＮＰをさらに選択した。さらにこの解析と共に、上記ＳＮＰの遺伝子型の関連性も解析した。
【０２３８】
このアプローチにより、最終的に、治療でＤＳＢＰ５＿０が減衰するが、プラセボ群では減衰しない、わずか３５個のＳＮＰ（およびその関連遺伝子型）を選択して、関連ＧＷＳとみなした。関連ＧＷＳのリストを表１２に要約する。
【表１２】
【０２３９】
実施例７：コアＳＮＰとの連鎖不平衝における遺伝的変異
たとえプロファイル４、８および９に含まれるＤＮＡ変異がレスポンダー患者の予測に強力な遺伝的力を有するとしても、それらは、最良の識別能力を有する全ての遺伝的変異性を消耗しない。連鎖不平衝の概念によると、ＤＮＡ変異（タグＳＮＰ）は、タグＳＮＰに照らしてみて、同様にまたは類似して変異を分類することができる可変数のプロキシＳＮＰにより一般的に表すことができる。そのため、いくつかの追加の遺伝的変異が、本明細書に記載の方法およびシステムの範囲に含まれる。ロスタフロキシンの生物活性に影響を及ぼすＳＮＰとの連鎖不平衝における代表的な遺伝的変異を表１３に列挙する。
【表１３】
【０２４０】
表１３に列挙する遺伝的変異は、ヨーロッパ人母集団の遺伝子データに関する代表的な遺伝子地図から得られる上記各コアＳＮＰまたは候補ＳＮＰについての対応するプロキシＳＮＰである。ＨａｐＭａｐ Ｐｒｏｊｅｃｔにより得られる情報は、発明者等にヨーロッパ人母集団におけるプロキシＳＮＰの最良の適用範囲をもたらす。ヨーロッパ人母集団および／または他の母集団についての連鎖不平衝における遺伝的変異に関する追加の情報源は、当業者により同定可能なソースを通して検索することができ、これには、例えば、発明者等の母集団のＩｌｌｕｍｉｎａ ＢｅａｄＣｈｉｐ １Ｍｉｌｌｉｏｎ遺伝子型データが含まれる。ＨａｐＭａｐなどのソースを参照する場合、本開示の意味において、全ての関連遺伝的変異の完全なリストアップを確保するためにソースリリースに関して連続的な更新が必要とされる。
実施例８：コアＳＮＰおよびロスタフロキシンに対する応答に影響を及ぼす追加のＳＮＰに関する配列情報
【０２４１】
本開示のいくつかの実施形態では、ロスタフロキシンに対する個体応答に影響を及ぼすいくつかの遺伝的変異についての配列情報の検出に基づいて、治療を評価することができる。コアＳＮＰおよび関連する選択された遺伝子型に関する配列情報を表１４および１５に報告する。
【表１４】
【表１５】
【０２４２】
ロスタフロキシンに対する応答に影響を及ぼす代表的な追加のＳＮＰおよび関連する選択された遺伝子型についての配列情報を表１６および１７に報告する。
【表１６】
【表１７】
【０２４３】
本明細書に記載の方法およびシステムにおいて配列情報を検出するために使用するのに適した代表的なプローブを表１８に列挙する。
【表１８】
【０２４４】
本明細書で例示する方法およびシステムのいくつかは、その遺伝的特徴（ＳＮＰ）による患者のサブセットの選択を提案することにより、ロスタフロキシンの非薬理ゲノミクス治療用途の特定の制限を克服することができる。特に、当のＳＮＰは、単独で、または高血圧および器官合併症をもたらす機構に関与し、またロスタフロキシンが命中する他のＳＮＰ（ＣＡＮＤ１、ＣＡＮＤ２）と組み合わせて、ロスタフロキシンに対する血圧応答の基礎となる（コアＳＮＰ）ように見える。
【０２４５】
特に、コアＳＮＰ、およびＣＡＮＤ１またはＣＡＮＤ２ ＳＮＰの両者は、目的の２つの表現型：ａ）選択薬物に対する応答、ｂ）高血圧およびその器官合併症の発達、に貢献する。さらに、実用的見地から、両グループのＳＮＰは、レスポンダーと非レスポンダーの間の識別に貢献する。
【０２４６】
この知見は、正しい患者のための正しい薬物を発見するため、および（今まで動物モデルで研究された）疾患のネットワーク概念をヒト患者に適用することを目標とした新しいラインの研究を開くための探求における２つの重要な意味を有し得る。
【０２４７】
動物モデルにおける多遺伝子性多因子的疾患の研究の結果は、現在のパラダイム：「１つの遺伝子分子変化（または１つの遺伝子変異体またはＳＮＰ）」、「１つの病態生理学的機構」および「１つの臨床的症状または疾患」を機構の遺伝的環境ネットワークのより広い概念のために放棄すべきであるということを示唆している。疾患は、このネットワークの攪乱から生じ得る。次いで、この攪乱は新規な「原因」治療のための標的となり得る。動物モデルにおいて発展中のこの新しい概念は、その異常が目的の疾患を誘引し得る特定の組織または器官が入手不可能であるために、ヒトに容易に適用できない。
【０２４８】
本明細書に記載の方法を、初めて、ヒトに対するこの戦略に適用する。実際、遺伝的攪乱（２つのグループのＳＮＰによって定義される）と機能的攪乱（非常に強力な選択的降圧薬、ロスタフロキシンに対する血圧応答として測定される）の組み合わせは、ヨーロッパ人のみの二千万人である臨床的に関連のある患者のサブセット（約２５％）における高血圧とその器官合併症の基礎となる特有の遺伝的ネットワークの同定への新しいアプローチを現実化する。
【０２４９】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法およびシステムは、プロファイル中の個々の患者の遺伝的異質性、および目的の遺伝子のエピスタシスを扱う。遺伝的異質性およびエピスタシスは、多遺伝子性多因子的疾患における所与の遺伝的機構の因果関係を示すために克服すべき２つの主要な問題である。遺伝的異質性という用語は、同じ表現型（生化学的、生理学的または症状）は、異なる遺伝的機構によってもたらされ得ることを示している。エピスタシスという用語は、同じ遺伝子変異体の効果が、目的の遺伝子から遠く離れた遺伝子から生じる別の変異体によって調節され得る（鈍らせられるまたは拡大される）ことを示している。
【０２５０】
これら２つのよく受け入れられた遺伝的現象は、ヒト疾患または治療に対する応答の基礎となる機構を研究するために遺伝学を適用しようとする試み全てを妨げる。
【０２５１】
例えば、所与のホルモン（特定のウアバイン）またはタンパク質（特定のアデュシン）が疾患（特定の高血圧における）を引き起こすのに関与していると仮定するならば、そのホルモンの合成、輸送または排出に関与する遺伝的経路も、その決定組織レベルおよびその生物学的効果の決定に関与していることを認めなければならない。
【０２５２】
類似して、その特定のタンパク質の細胞機能の調節に関与するタンパク質をコードする全ての遺伝子を考察すべきである。当然、これらの生化学的経路の各々は、個々の患者の遺伝的背景によって異なって影響され得る。
【０２５３】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法およびシステムにおいて、プロファイルの種々のＳＮＰを関連づける一般的な知見は、ａ）ロスタフロキシンに対する血圧応答に関連するＳＮＰの能力（コアＳＮＰ）；およびｂ）前臨床研究においてロスタフロキシンの活性に影響を及ぼし、高血圧およびその器官合併症の基礎となる生化学的経路に関連するＳＮＰの能力（ＣＡＮＤ１およびＣＡＮＤ２ ＳＮＰ）である。現在の高血圧治療に対する本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態の実用的優位性は、患者の２５％における（試行錯誤期間の減少による）より早い血圧調節の達成、現在の戦略の３０〜４０％に対して、レスポンダーおよび非レスポンダーを分類する８５％の確率、ならびにロスタフロキシンについての試験結果によって、および最も重要なことには、動物における活性投薬とＮＯＡＥＬ（最大無毒性量）投薬の間のロスタフロキシン投薬のはるかに広い間隔（ロスタフロキシンでは少なくとも１００．０００時間であるが利用可能な薬物ではわずか２０〜５０時間である）によって示されるような、治療個体における良好な耐容性および生活の質を含む。さらに、本明細書に記載の方法およびシステムのいくつかの実施形態は、ロスタフロキシンによって影響される機構と本明細書に記載のいくつかの方法およびシステムにより選択される患者のサブセットにおける器官損傷の基礎となる機構の間の同一性から、器官合併症の予測可能な効率的予防に関連し得る。
【０２５４】
この予測可能な増加した効率は、現在の戦略に対して３つの明確な意味を有する：ａ）ただの危険因子であり、不安な臨床症状をもたらす疾患ではない高血圧の治療に従うよう患者を納得させるより強力な合理性（または論拠）をもたらす。ｂ）反対に、高血圧それ自体が高程度の障害をもたらし得る心血管系合併症を経験している患者のために負担を減少する。ｃ）高血圧治療が、医療費の最も重要な原因である心血管系合併症および腎合併症を発達させるより大きな危険性にさらされている患者のサブセットに集中されるので、医療費を減少させる。
【０２５５】
最終的に、プロファイル４を有する選択された患者のサブセットにおいて、ロスタフロキシンにより得られる血圧降下の大きさは、ＨＣＴＺまたはロサルタンにより得られるものよりも約４０％大きい。この差は、種々の降圧薬間で今まで検出されたものよりもはるかに大きい。
【０２５６】
一般に、本明細書に記載の方法およびシステムは、いくつかの実施形態において、高血圧などの心血管状態の治療における改善を可能にする。現時点では、未治療高血圧患者のわずか３０〜４０％が、臨床的に断固とした血圧降下による治療に応答する。これは、医師の欲求不満を生み出し、治療の複数の変更を必要とし、患者のコンプライアンスを低下させる。結果として、大半の患者は十分に治療されず、これが高血圧に関連する器官合併症の予防を制限する。本明細書に記載の方法およびシステムは、患者の８５％までロスタフロキシン治療に対するレスポンダーとしての正確な分類を可能にし、したがって、動的治療を見出す負担を減少させる。いくつかの実施形態の第１の改善は、安全性に関する：選択された患者におけるロスタフロキシンの有効用量は、非常に低く、それは５０〜５００μｇ／日に及び得る。関連動物モデルにおける有効用量は、０．１〜１００μｇ／ｋｇである一方で、動物においていかなる効果ももたらさない最大耐量（ＮＯＡＥＬ）は、１００ｍｇ／ｋｇである。これは、動物におけるロスタフロキシンの活性用量と最大耐量の間の間隔が、この間隔が２０〜５０時間に及ぶ利用可能な降圧薬治療と比較すると、１００．０００時間よりも長いことを意味する。新しい降圧薬治療の有効性および安全性に関する、特に伝統的な治療的アプローチと薬理ゲノミクスアプローチとを比較したいくつかのデータを図１０に報告する。
【０２５７】
要するに、本明細書に記載の方法およびシステム（遺伝子型分類＋ロスタフロキシン）は、高い安全性とより正確な抗高血圧活性の予測を組み合わせて、その機構がロスタフロキシンによって暗示される心血管系合併症の高程度の予防を予測する。
【０２５８】
選択されたコアＳＮＰの少なくとも１つを保有する個体における、ロスタフロキシン後の血圧降下の増加の正確な機構は不明であるが、それらは、ロスタフロキシンによる分子標的命中によって誘引される機構と関連すると予想される。結果として、ロスタフロキシンによって誘導される血圧降下に関連する利点を超える利点が、本プロファイルに含まれるコアＳＮＰ遺伝子型を保有する個体で期待される。
【０２５９】
上記実施例は、当業者に、本開示の方法およびシステムの実施形態の作り方および使い方の完全な開示および説明を与えるために提供されるものであり、発明者等が開示とみなすものの範囲を限定することを意図していない。当業者に自明の、開示を実施するための上記様式の修正は、以下の特許請求の範囲の範囲内であることが意図されている。本明細書中で言及される全ての特許および刊行物は、本開示が属する技術分野の当業者の技術水準を示している。本開示中に引用される全ての参考文献は、あたかも各参考文献が個々にその全体が参照により本明細書に組み込まれたのと同程度に、参照により組み込まれる。
【０２６０】
この結果、背景技術、発明の概要、詳細な説明および実施例中に引用される各文書（特許、特許出願、雑誌掲載論文、要約、実験マニュアル、本または他の開示を含む）の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。
【０２６１】
本開示は、特定の組成物または生物学的システムに限定されず、それは当然変化することができることを理解すべきである。本明細書で使用する専門用語は、特定の実施形態を説明するためのものに過ぎず、限定を意図していないことも理解すべきである。本明細書および添付の特許請求の範囲で使用するように、単数形「ａ」、「ａｎ」および「ｔｈｅ」は、文脈が明らかにそうではないと指示しない限り、複数の指示対象を含む。「複数」という用語は、文脈が明らかにそうではないと指示しない限り、２つ以上の指示対象を含む。特に定義しない限り、本明細書で使用する技術用語および科学用語は全て、本開示が属する技術分野の当業者によって一般的に理解されているのと同じ意味を有する。
【０２６２】
本明細書に記載の方法および材料と類似または同等の種々の方法および材料は、本明細書に記載の適当な材料および方法の特定の例を試験するために実際に使用することができ、当業者により同定可能である。
【０２６３】
本開示のいくつかの実施形態を記載してきた。それでも、本開示の精神および範囲を逸脱することなく、種々の修正を行うことができることが理解されよう。したがって、他の実施形態は、以下の特許請求の範囲の範囲内である。
参考文献
【０２６４】
［１］Ｆｅｒｒａｒｉ Ｐ、Ｆｅｒｒａｎｄｉ Ｍ、Ｔｒｉｐｏｄｉ Ｇ、Ｔｏｒｉｅｌｌｉ Ｌ、Ｐａｄｏａｎｉ Ｇ、Ｍｉｎｏｔｔｉ Ｅ。ＰＳＴ ２２３８：ａ ｎｅｗ ａｎｔｉｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｃｏｍｐｏｕｎｄ ｔｈａｔ ｍｏｄｕｌａｔｅｓ Ｎａ，Ｋ−ＡＴＰａｓｅ ｉｎ ｇｅｎｅｔｉｃ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ Ｊ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｅｘｐ．Ｔｈｅｒ．、１９９９；２８８：１０７４〜１０８３。
［２］Ｆｅｒｒａｒｉ Ｐ、Ｆｅｒｒａｎｄｉ Ｍ、Ｖａｌｅｎｔｉｎｉ Ｇ、Ｂｉａｎｃｈｉ Ｇ。Ｒｏｓｔａｆｕｒｏｘｉｎ：ａｎ ｏｕａｂａｉｎ ａｎｔａｇｏｎｉｓｔ ｔｈａｔ ｃｏｒｒｅｃｔｓ ｒｅｎａｌ ａｎｄ ｖａｓｃｕｌａｒ Ｎａ＋−Ｋ＋− ＡＴＰａｓｅ ａｌｔｅｒａｔｉｏｎｓ ｉｎ ｏｕａｂａｉｎ ａｎｄ ａｄｄｕｃｉｎ−ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ．Ａｍ Ｊ Ｐｈｙｓｉｏｌ．Ｒｅｇｕｌ Ｉｎｔｅｇｒ Ｃｏｍｐ Ｐｈｙｓｉｏｌ ２００６；２９０：５２９〜５３５。
［３］Ｆｅｒｒａｒｉ Ｐ、Ｆｅｒｒａｎｄｉ Ｍ、Ｔｏｒｉｅｌｌｉ Ｌ、Ｔｒｉｐｏｄｉ Ｇ、Ｍｅｌｌｏｎｉ Ｐ、Ｂｉａｎｃｈｉ Ｇ。ＰＳＴ２２３８：ａ ｎｅｗ ａｎｔｉｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｃｏｍｐｏｕｎｄ ｔｈａｔ ｍｏｄｕｌａｔｅｓ Ｎａ，Ｋ−ＡＴＰａｓｅ ａｎｄ ａｎｔａｇｏｎｉｚｅｓ ｔｈｅ ｐｒｅｓｓｏｒ ｅｆｆｅｃｔ ｏｆ ＯＬＦ．Ｃａｒｄｉｏｖａｓｃ Ｄｒｕｇ Ｒｅｖ １９９９；１７：３９〜５７。
［４］Ｂｉａｎｃｈｉ Ｇ．等、Ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ ２００３年５月；４（３）：２７９〜９６。
［５］Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．、１９９７；４０（１１）；１５６１〜１５６４。
［６］Ｆｅｒｒａｒｉ Ｐ等。ＪＰＥＴ １９９８；２８５：８３〜９４。
［７］２００３ Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ｓｏｃｉｅｔｙ ｏｆ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ−Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ｓｏｃｉｅｔｙ ｏｆ Ｃａｒｄｉｏｌｏｇｙ ｇｕｉｄｅｌｉｎｅｓ ｆｏｒ ｔｈｅ ｍａｎａｇｅｍｅｎｔ ｏｆ ａｒｔｅｒｉａｌ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ。Ｇｕｉｄｅｌｉｎｅｓ Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ。２１（６）：１０１１〜１０５３、２００３年６月。
［８］Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ｓｏｃｉｅｔｙ ｏｆ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ Ｗｏｒｋｉｎｇ Ｇｒｏｕｐ ｏｎ Ｂｌｏｏｄ Ｐｒｅｓｓｕｒｅ Ｍｏｎｉｔｏｒｉｎｇを代表してＯ’Ｂｒｉｅｎ，Ｅｏｉｎ；Ａｓｍａｒ，Ｒｏｌａｎｄ；Ｂｅｉｌｉｎ，Ｌａｗｒｉｅ；Ｉｍａｉ，Ｙｕｔａｋａ；Ｍａｌｌｉｏｎ，Ｊｅａｎ−Ｍｉｃｈｅｌ；Ｍａｎｃｉａ，Ｇｉｕｓｅｐｐｅ；Ｍｅｎｇｄｅｎ，Ｔｈｏｍａｓ；Ｍｙｅｒｓ，Ｍａｒｔｉｎ；Ｐａｄｆｉｅｌｄ，Ｐａｕｌ；Ｐａｌａｔｉｎｉ，Ｐａｏｌｏ；Ｐａｒａｔｉ，Ｇｉａｎｆｒａｎｃｏ；Ｐｉｃｋｅｒｉｎｇ，Ｔｈｏｍａｓ；Ｒｅｄｏｎ，Ｊｏｓｅｐ；Ｓｔａｅｓｓｅｎ，Ｊａｎ；Ｓｔｅｒｇｉｏｕ，Ｇｅｏｒｇｅ；Ｖｅｒｄｅｃｃｈｉａ，Ｐａｏｌｏ。Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ｓｏｃｉｅｔｙ ｏｆ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ ｒｅｃｏｍｍｅｎｄａｔｉｏｎ ｆｏｒ ｃｏｎｖｅｎｔｉｏｎａｌ，ａｍｂｕｌａｔｏｒｙ ａｎｄ ｈｏｍｅ ｂｌｏｏｄ ｐｒｅｓｓｕｒｅ ｍｅａｓｕｒｅｍｅｎｔ。Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ。２１（５）：８２１〜８４８、２００３年５月。
［９］Ｓａｍｂｒｏｏｋ Ｊ、Ｒｕｓｓｅｌｌ ＤＷ。Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｃｌｏｎｉｎｇ、Ａ ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｍａｎｕａｌ。（Ｃｈａｐｔｅｒ６）。Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ ２００１。
［１０］Ｓｔｅｅｍｅｒｓ ＦＪ、Ｇｕｎｄｅｒｓｏｎ ＫＬ。Ｉｌｌｕｍｉｎａ Ｉｎｃ．Ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ ２００５；６：７７７〜７８２。
［１１］Ｐｈａｓｅ Ｉ ＨａｐＭａｐ、２００５。Ｔｈｅ ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ ＨａｐＭａｐ Ｃｏｎｓｏｒｔｉｕｍ。Ａ Ｈａｐｌｏｔｙｐｅ Ｍａｐ ｏｆ Ｔｈｅ Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｏｍｅ ２００５；４３７：１２９９〜１３２０。
［１２］Ｐｈａｓｅ ＩＩ ＨａｐＭａｐ、２００７。Ｔｈｅ ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ ＨａｐＭａｐ Ｃｏｎｓｏｒｔｉｕｍ、Ａ ｓｅｃｏｎｄ ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ ｈｕｍａｎ ｈａｐｌｏｔｙｐｅ ｍａｐ ｏｆ ｏｖｅｒ ３．１ ｍｉｌｌｉｏｎ ＳＮＰｓ。Ｎａｔｕｒｅ ２００７；４４９：８５１〜８６１。
［１３］Ｒｅｐｏｒｔ Ｖａｌｅｎｔｉｎｉ。
［１４］Ｐａｇｅ ＩＨ、Ｄｕｓｔａｎ ＨＰ。Ｐｅｒｓｉｓｔｅｎｃｅ ｏｆ ｎｏｒｍａｌ ｂｌｏｏｄ ｐｒｅｓｓｕｒｅ ａｆｔｅｒ ｄｉｓｃｏｎｔｉｎｕｉｎｇ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｉｎ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｐａｔｉｅｎｔｓ。Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ １９６２；２５：４３３〜４３６。
［１５］Ｆｌｅｔｃｈｅｒ ＡＥ、Ｆｒａｎｋｓ ＰＪ、Ｂｕｌｐｉｔｔ ＣＪ。Ｔｈｅ ｅｆｆｅｃｔ ｏｆ ｗｉｔｈｄｒａｗｉｎｇ ａｎｔｉｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｔｈｅｒａｐｙ：ａ ｒｅｖｉｅｗ。Ｊ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓ １９８８；６：４３１〜４３６。
［１６］Ｖｅｔｅｒａｎｓ Ａｄｍｉｎｉｓｔｒａｔｉｏｎ Ｃｏｏｐｅｒａｔｉｖｅ Ｓｔｕｄｙ Ｇｒｏｕｐ ｏｎ Ａｎｔｉｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ Ａｇｅｎｔ。Ｒｅｔｕｒｎ ｏｆ ｅｌｅｖａｔｅｄ ｂｌｏｏｄ ｐｒｅｓｓｕｒｅ ａｆｔｅｒ ｗｉｔｈｄｒａｗａｌ ｏｆ ａｎｔｉｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｄｒｕｇｓ。Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ １９７５；５１：１１０７〜１１１３。
［１７］Ｌｅｖｉｎｓｏｎ ＰＤ、Ｋｈａｔｒｉ Ｉｍ、Ｆｒｅｉｓ ＥＤ。Ｐｅｒｓｉｓｔｅｎｃｅ ｏｆ ｎｏｒｍａｌ ｂｌｏｏｄ ｐｒｅｓｓｕｒｅ ａｆｔｅｒ ｗｉｔｈｄｒａｗａｌ ｏｆ ｄｒｕｇ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｉｎ ｍｉｌｄ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ。Ａｒｃｈ Ｉｎｔ Ｍｅｄ １９８２；１４２：２２６５〜２２６８。
［１８］Ｎｅｌｓｏｎ ＭＲ、Ｒｅｉｄ ＣＭ、Ｋｒｕｍ Ｈ、Ｒｙａｎ Ｐ、Ｗｉｎｇ ＬＭＨ、ＭｃＮｅｉｌ ＪＪ。Ｓｈｏｒｔ−ｔｅｒｍ ｐｒｅｄｉｃｔｏｒｓ ｏｆ ｍａｉｎｔｅｎａｎｃｅ ｏｆ ｎｏｒｍｏｔｅｎｓｉｏｎ ａｆｔｅｒ ｗｉｔｈｄｒａｗａｌ ｏｆ ａｎｔｉｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｄｒｕｇｓ ｉｎ ｔｈｅ ｓｅｃｏｎｄ Ａｕｓｔｒａｌｉａｎ ｎａｔｉｏｎａｌ ｂｌｏｏｄ ｐｒｅｓｓｕｒｅ ｓｔｕｄｙ／ＡＮＢＰ２）。Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｊｏｕｒｎａｌ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓ ２００３；１６：３９〜４５。
［１９］Ｔａｋａｔａ Ｙ、Ｙｏｓｈｉｚｕｍｉ Ｔ、Ｉｔｏ Ｙ、Ｕｅｎｏ Ｍ、Ｔｓｕｋａｓｈｉｍａ Ａ、Ｉｗａｓｅ Ｍ等。Ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ ｏｆ ｗｉｔｈｄｒａｗｉｎｇ ａｎｔｉｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｔｈｅｒａｐｙ ｂｅｔｗｅｅｎ ｄｉｕｒｅｔｉｃｓ ａｎｄ ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ ｃｏｎｖｅｒｔｉｎｇ ｅｎｚｙｍｅ ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ ｉｎ ｅｓｓｅｎｔｉａｌ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅｓ。Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｈｅａｒｔ Ｊｏｕｒｎａｌ １９９２；１２４：１５７４〜１５８０。
［２０］Ｂｌａｕｆｏｘ ＭＤ、Ｌａｎｇｆｏｒｄ ＨＧ、Ｏｂｅｒｍａｎ Ａ、Ｈａｗｋｉｎｓ ＣＭ、Ｗａｓｓｅｒｔｈｅｉｌ−Ｓｍｏｌｌｅｒ Ｓ、Ｃｕｔｔｅｒ ＧＲ。Ｅｆｆｅｃｔ ｏｆ ｄｉｅｔａｒｙ ｃｈａｎｇｅ ｏｎ ｔｈｅ ｒｅｔｕｒｎ ｏｆ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ ａｆｔｅｒ ｗｉｔｈｄｒａｗａｌ ｏｆ ｐｒｏｌｏｎｇｅｄ ａｎｔｉｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｔｈｅｒａｐｙ（ＤＩＳＨ）。Ｊ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓ １９８４；２（ｓｕｐｐｌ３）：１７９〜１８１。
［２１］Ｈｏ ＧＹＦ、Ｂｌａｕｆｏｘ ＭＤ、Ｗａｓｓｅｒｔｈｅｉｌ−Ｓｍｏｌｌｅｒ Ｓ、Ｏｂｅｒｍａｎ Ａ、Ｌａｎｇｆｏｒｄ ＨＧ。Ｐｌａｓｍａ ｒｅｎｉｎ ｐｒｅｄｉｃｔｓ ｓｕｃｃｅｓｓ ｏｆ ａｎｔｉｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｄｒｕｇ ｗｉｔｈｄｒａｗａｌ。Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｊｏｕｒｎａｌ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓ １９９４；７：６７９〜６８４。
［２２］Ｓｗａｒｔ Ｓ、Ｂｉｎｇ ＲＦ、Ｓｗａｌｅｓ ＪＤ、Ｔｈｕｒｓｔｏｎ Ｈ。Ｐｌａｓｍａ ｒｅｎｉｎ ｉｎ ｌｏｎｇ−ｔｅｒｍ ｄｉｕｒｅｔｉｃ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｏｆ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ：ｅｆｆｅｃｔ ｏｆ ｄｉｓｃｏｎｔｉｎｕａｔｉｏｎ ａｎｄ ｒｅｓｔａｒｔｉｎｇ ｔｈｅｒａｐｙ。Ｃｌｉｎ Ｓｃｉ １９８２；６３：１２１〜１２５。
［２３］Ｆａｇｅｒｂｅｒｇ Ｂ、Ｗｉｋｓｔｒａｎｄ Ｊ、Ｂｅｒｇｌｕｎｄ Ｇ、Ｈａｒｔｆｏｒｄ Ｍ、Ｌｊｕｎｇｍａｎ Ｓ、Ｗｅｎｄｅｌｈａｇ Ｉ。Ｗｉｔｈｄｒａｗａｌ ｏｆ ａｎｔｉｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｄｒｕｇ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ：ｔｉｍｅ−ｃｏｕｒｓｅ ｆｏｒ ｒｅｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ ａｎｄ ｅｆｆｅｃｔｓ ｕｐｏｎ ｌｅｆｔ ｖｅｎｔｒｉｃｕｌａｒ ｍａｓｓ。Ｊ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓ １９９２；１０：５８７〜５９３。
［２４］Ｚａｎｃｈｅｔｔｉ Ａ、Ｍａｎｃｉａ Ｇ。Ｔｈｅ ｄｉｌｅｍｍａ ｏｆ ｐｌａｃｅｂｏ ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ ｓｔｕｄｉｅｓ：ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ ｅｖｉｄｅｎｃｅ，ｇｕｉｄｅｌｉｎｅｓ，ｅｔｈｉｃｓ ａｎｄ ｒｅｇｕｌａｔｏｒｙ ｒｅｃｏｍｍｅｎｄａｔｉｏｎｓ。Ｊ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓ ２００９；２７：１〜２。
［２５］Ｆａｒｑｕｈａｒｓｏｎ ＣＡＪ、Ｓｔｒｕｔｈｅｒｓ ＡＤ。Ｇｒａｄｕａｌ ｒｅａｃｔｉｖａｔｉｏｎ ｏｖｅｒ ｔｉｍｅ ｏｆ ｖａｓｃｕｌａｒ ｔｉｓｓｕｅ ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ Ｉ ｔｏ ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ ＩＩ ｃｏｎｖｅｒｓｉｏｎ ｄｕｒｉｎｇ ｃｈｒｏｎｉｃ ｌｉｓｉｎｏｐｒｉｌ ｔｈｅｒａｐｙ ｉｎ ｃｈｒｏｎｉｃ ｈｅａｒｔ ｆａｉｌｕｒｅ。Ｊ Ａｍ Ｃｏｌｌ Ｃａｒｄｉｏｌ ２００２；３９：７６７〜７７５。
［２６］Ｃｈｅｖｉｌｌａｒｄ Ｃ、Ｂｒｏｗｎ ＮＬ、Ｊｏｕｑｕｅｙ Ｓ、Ｍａｔｈｉｅｕ ＭＮ、Ｌａｌｉｂｅｒｔｅ Ｆ、Ｈａｍｏｎ Ｇ。Ｃａｒｄｉｏｖａｓｃｕｌａｒ ａｃｔｉｏｎｓ ａｎｄ ｔｉｓｓｕｅ−ｃｏｎｖｅｒｔｉｎｇ ｅｎｚｙｍｅ ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｙ ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｆ ｃｈｒｏｎｉｃ ｅｎａｌａｐｒｉｌ ａｎｄ ｔｒａｎｄｏｌａｐｒｉｌ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｏｆ ｓｐｏｎｔａｎｅｏｕｓｌｙ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｒａｔｓ。Ｊ Ｃａｒｄｉｏｖａｓｃ Ｐｈａｒａｍｃｏｌ １９８９；１４：２９７〜３０１。
［２７］Ｕｎｇｅｒ Ｔ、Ｇａｎｔｅｎ Ｄ、Ｌａｎｇ ＲＥ、Ｓｃｈｏｌｋｅｎｓ Ａ。Ｐｅｒｓｉｓｔｅｎｔ ｔｉｓｓｕｅ ｃｏｎｖｅｒｔｉｎｇ ｅｎｚｙｍｅ ｉｎｈｉｂｉｔｉｏｎ ｆｏｌｌｏｗｉｎｇ ｃｈｒｏｎｉｃ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｗｉｔｈ Ｈｏｅ４９８ ａｎｄ ＭＫ４２１ ｉｎ ｓｐｏｎｔａｎｅｏｕｓｌｙ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｒａｔｓ。Ｊ Ｃａｒｄｉｏｖａｓｃ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ １９８５；７：３６〜４１。
［２８］Ｐａｕｌｌ ＪＲＡ、Ｗｉｄｄｏｐ ＲＥ。Ｐｅｒｓｉｓｔｅｎｔ ｃａｒｄｉｏｖａｓｃｕｌａｒ ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｆ ｃｈｒｏｎｉｃ ｒｅｎｉｎ−ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ ｓｙｓｔｅｍ ｉｎｈｉｂｉｔｉｏｎ ｆｏｌｌｏｗｉｎｇ ｗｉｔｈｄｒａｗａｌ ｉｎ ａｄｕｌｔ ｓｐｏｎｔａｎｅｏｕｓｌｙ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｒａｔｓ。Ｊ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓ ２００１；１９：１３９３〜１４０２。
［２９］Ｇｕｅｒｒｅｒｏ ＥＩ、Ａｒｄａｎａｚ Ｎ、Ｓｅｖｉｌｌａ ＭＡ、Ａｒｅｖａｌｏ ＭＡ、Ｍｏｎｔｅｒｏ ＭＪ。Ｃａｒｄｉｏｖａｓｃｕｌａｒ ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｆ ｒｅｂｉｖｏｌｏｌ ｉｎ ｓｐｏｎｔａｎｅｏｕｓｌｙ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｒａｔｓ ｐｅｒｓｉｓｔ ａｆｔｅｒ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｗｉｔｈｄｒａｗａｌ。Ｊ Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓ ２００６；２４：１５１〜１５８。
［３０］Ｄｕｋａｃｚ ＳＡＷ、Ａｄａｍｓ ＭＡ、Ｋｌｉｎｅ ＲＬ。Ｔｈｅ ｐｅｒｓｉｓｔｅｎｔ ｅｆｆｅｃｔ ｏｆ ｌｏｎｇ−ｔｅｒｍ ｅｎａｌａｐｒｉｌ ｏｎ ｐｒｅｓｓｕｒｅ ｎａｔｒｉｕｒｅｓｉｓ ｉｎ ｓｐｏｎｔａｎｅｏｕｓｌｙ ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｖｅ ｒａｔｓ。Ａｍ Ｊ Ｐｈｙｓｉｏｌ Ｒｅｎａｌ Ｐｈｙｓｉｏｌ １９９７；２７３ ｏ ４２：Ｆ１０４〜Ｆ１１２。
［３１］Ｗｉｇｇｉｎｔｏｎ ＪＥ、Ｃｕｔｌｅｒ ＤＪ、Ａｂｅｃａｓｉｓ ＧＲ。Ａ ｎｏｔｅ ｏｎ ｅｘａｃｔ ｔｅｓｔｓ ｏｆ Ｈａｒｄｙ−Ｗｅｉｎｂｅｒｇ ｅｑｕｉｌｉｂｒｉｕｍ。Ａｍ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ。２００５；７６：８８７〜８９３。
［３２］Ｄｅｖｌｉｎ Ｂ、Ｂａｃａｎｕ Ｂ、Ｒｏｅｄｅｒ Ｋ：Ｇｅｎｏｍｉｃ Ｃｏｎｔｒｏｌ ｉｎ ｔｈｅ Ｅｘｔｒｅｍｅ。Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ ２００４；３６：１１２９〜１１３０。
［３３］Ｐｕｒｃｅｌｌ Ｓ、Ｎｅａｌｅ Ｂ、Ｔｏｄｄ−Ｂｒｏｗｎ Ｋ、Ｔｈｏｍａｓ Ｌ、Ｆｅｒｒｅｉｒａ ＭＡ、Ｂｅｎｄｅｒ Ｄ。Ａ Ｔｏｏｌ Ｓｅｔ ｆｏｒ Ｗｈｏｌｅ−Ｇｅｎｏｍｅ Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ ａｎｄ Ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ−Ｂａｓｅｄ Ｌｉｎｋａｇｅ Ａｎａｌｙｓｅｓ。Ａｍ．Ｊ．Ｈｕｍ Ｇｅｎ ２００７；８１：５５９〜５７５。
［３４］Ｔｈｅ Ｗｅｌｌｃｏｍｅ Ｔｒｕｓｔ Ｃａｓｅ Ｃｏｎｔｒｏｌ Ｃｏｎｓｏｒｔｉｕｍ。Ｇｅｎｏｍｅ−ｗｉｄｅ ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ ｓｔｕｄｙ ｏｆ １４，０００ ｃａｓｅｓ ｏｆ ｓｅｖｅｎ ｃｏｍｍｏｎ ｄｉｓｅａｓｅｓ ａｎｄ ３，０００ ｓｈａｒｅｄ ｃｏｎｔｒｏｌｓ。Ｎａｔｕｒｅ ２００７；４４７：６６１〜６７８。
［３５］Ｐｏｔｋｉｎ Ｓ、Ｔｕｒｎｅｒ Ｊ、Ｇｕｆｆａｎｔｉ Ｇ、Ｌａｋａｔｏｓ Ａ、Ｔｏｒｒｉ Ｆ、Ｋｅａｔｏｒ ＤＢ、Ｍａｃｃｉａｒｄｉ Ｆ。Ｇｅｎｏｍｅ−ｗｉｄｅ Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ ｆｏｒ Ｄｉｓｃｏｖｅｒｉｎｇ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｉｎｆｌｕｅｎｃｅｓ ｏｎ Ｃｏｇｎｉｔｉｏｎ ａｎｄ Ｃｏｇｎｉｔｉｖｅ Ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ：Ｍｅｔｈｏｄｏｌｏｇｉｃａｌ Ｃｏｎｓｉｄｅｒａｔｉｏｎ。Ｓｕｂｍｉｔｔｅｄ ｔｏ Ｃｏｇｎｉｔｉｖｅ Ｐｈｙｃｈｉａｔｒｙ Ｃｏｇｎ Ｎｅｕｒｏｐｈｙｃｈｉａｔｒｙ。２００９；１４（４〜５）：３９１〜４１８。
［３６］Ａｇｒｅｓｔｉ Ａ。１９８４。Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｏｒｄｉｎａｌ Ｃａｔｅｇｏｒｉｃａｌ Ｄａｔａ−Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ：Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ,Ｉｎｃ．
［３７］Ｒｅｓｓｏｍ ＨＷ、Ｖａｒｇｈｅｓｅ ＲＳ、Ｚｈａｎｇ Ｚ、Ｘｕａｎ Ｊ、Ｃｌａｒｋｅ Ｒ。Ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ ａｌｇｏｒｉｔｈｍｓ ｆｏｒ ｐｈｅｎｏｔｙｐｅ ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ ｉｎ ｇｅｎｏｍｉｃｓ ａｎｄ ｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ。Ｆｒｏｎｔ Ｂｉｏｓｃｉ。２００８；１；１３：６９１〜７０８。
［３８］Ｇｕｉｄａｎｃｅ ｆｏｒ Ｉｎｄｕｓｔｒｙ：Ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ ｄａｔａ ｓｕｂｍｉｓｓｉｏｎ；ＦＤＡ ｒｅｐｏｒｔ、２００５年３月；http://www.fda.gov/cder/guidance/index.htm）。
［３９］Ｐｈｉｌｌｉｐｓ ＰＣ。Ｅｐｉｓｔａｓｉｓ ｔｈｅ ｅｓｓｅｎｔｉａｌ ｒｏｌｅ ｏｆ ｇｅｎｅ ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ ｉｎ ｔｈｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎｄ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ ｇｅｎｅｔｉｃ ｓｙｓｔｅｍｓ。Ｎａｒ Ｒｅｖ Ｇｅｎｅｔ ２００８；９：８５５〜８６７。
［４０］Ｐｈｅａｓａｎｔ Ｍ、Ｍａｔｔｉｃｋ ＪＳ。Ｒａｉｓｉｎｇ ｔｈｅ ｅｓｔｉｍａｔｅ ｏｆ ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ｈｕｍａｎ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ。Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓ。２００７年９月；１７（９）：１２４５〜５３。
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の保有者となるよう選択された個体の心血管状態の治療または予防に使用するためのロスタフロキシン。
【請求項２】
少なくとも１つの多型が、ｒｓ２３４５０８８についてはヌクレオチドＣまたはＴ、ｒｓ１６８７７１８２についてはヌクレオチドＣまたはＴ、ｒｓ１６８９３５２２についてはヌクレオチドＧまたはＡ、ｒｓ２４６１９１１についてはヌクレオチドＧまたはＡ、ｒｓ５０１３０９３についてはヌクレオチドＣまたはＴ、およびｒｓ１２５１３３７５についてはヌクレオチドＴまたはＧからなる群から選択される、請求項１に記載のロスタフロキシン。
【請求項３】
前記個体が、ｒｓ２３４５０８８については遺伝子型ＴＴまたは遺伝子型１、ｒｓ１６８７７１８２については遺伝子型Ｃ／Ｔまたは遺伝子型２、ｒｓ１６８９３５２２については遺伝子型ＡＡまたは遺伝子型１、ｒｓ２４６１９１１については遺伝子型ＡＡまたは遺伝子型１、ｒｓ５０１３０９３については遺伝子型ＴＴまたは遺伝子型１、およびｒｓ１２５１３３７５については遺伝子型ＴＴまたは遺伝子型１からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子型の保有者となるよう選択された、請求項１または２に記載のロスタフロキシン。
【請求項４】
前記個体が、少なくとも１つのＣＡＮＤ１遺伝子、ＣＡＮＤ２遺伝子および／またはＧＷＳ遺伝子における多型の保有者となるよう選択された、請求項１から３のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項５】
前記個体が、ＡＤＤ１、ＡＤＤ２、ＡＤＤ３、ＣＹＰ１１Ａ１、ＨＳＤ３Ｂ１、ＬＳＳ、ＡＢＣＢ／ＭＤＲ１およびＳＬＣＯ４Ｃ１からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子における少なくとも１つの多型の保有者にもなるよう選択された、請求項４に記載のロスタフロキシン。
【請求項６】
前記個体が、ｒｓ４９６１、ｒｓ４９８４、ｒｓ３７３１５６６、ｒｓ９１４２４７およびｒｓ１０４５６４２からなる群から選択される少なくとも１つの一塩基多型ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の保有者となるよう選択された、請求項１から５のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項７】
前記個体が、ｒｓ４９６１についてはＧＴ、ｒｓ４９８４についてはＣＴ、ｒｓ３７３１５６６についてはＡＧ、ｒｓ９１４２４７についてはＧＡおよびｒｓ１０４５６４２についてはＴＣからなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子型の保有者となるよう選択された、請求項１から６のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項８】
前記個体が、ｒｓ９１４２４７について遺伝子型ＡＡの保有者となるよう選択された、請求項１から７のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項９】
前記個体が、ｒｓ２４２０９３、ｒｓ１９９６３９６、ｒｓ１０５０３８０６、ｒｓ１３２５１７８０、ｒｓ１７４３０７０６、ｒｓ１０１０２０２４、ｒｓ５２６３０２、ｒｓ５４４１０４、ｒｓ３１０２０８７、ｒｓ５１８３、ｒｓ３７７２６２７、ｒｓ２２７６７３６、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ３７４１５５９、ｒｓ２２１７３４２、ｒｓ１０９２７８８８、ｒｓ６６０４９０９、ｒｓ９４５４０３、ｒｓ７１１７３１４、ｒｓ１０７９０２１２、ｒｓ１１２１６５９８、ｒｓ９１０６８２、ｒｓ１３２１８３１６、ｒｓ４３０９４８３、ｒｓ１３２８０３０７、ｒｓ４７３９０３７、ｒｓ１７５９６７７４、ｒｓ２７２８１０８、ｒｓ１７７８６４５６、ｒｓ７６９６３０４、ｒｓ２７２５２２２、ｒｓ１７１９９５６５、ｒｓ２７５８１５２、ｒｓ１０５７２９３、ｒｓ１６９６０７１２、ｒｓ７５９３５９、ｒｓ４０４２１４、ｒｓ１００５２１３、ｒｓ１７０２５４５３、ｒｓ２１１０９２３、ｒｓ１４２８５７１、ｒｓ４３５４０４、ｒｓ１２９０８７８７、ｒｓ１１６４７７２７、ｒｓ８８００５４およびｒｓ１１０６４５８４からなる群から選択される少なくとも１つの一塩基多型、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の保有者となるよう選択された、請求項１から８のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項１０】
前記個体が、ｒｓ１２９９６１８６、ｒｓ９８９３３７２、ｒｓ７２１６３３１、ｒｓ７５２１６６８、ｒｓ１８８３３４、ｒｓ４９９８６６２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ６４５７１１０、ｒｓ３８９３４６４、ｒｓ２５１７７１８、ｒｓ１３６２１２６、ｒｓ５０１３０９３、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ６７１８２８２、ｒｓ７２１２０７、ｒｓ２５５５５００、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ８１７９６５４、ｒｓ１９０１１３９、ｒｓ２４２７８３２、ｒｓ９３６１８６３、ｒｓ１９９８３９４、ｇａ００１６１９、ｒｓ２２７５５３１、ｒｓ７４８１４０、ｒｓ４７１０５９２、ｒｓ２７４３９５１、ｒｓ１０１５９５６９、ｒｓ３０８７８１６、ｒｓ１０４９３９４０、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ２３２６９１２、ｒｓ１１１０４４６、ｒｓ１２５１３３７５およびｒｓ１７４１４９５４からなる群から選択される少なくとも１つの一塩基多型、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の保有者となるよう選択された、請求項１から９のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項１１】
前記個体が、ｒｓ４９６１、ｒｓ４９８４、ｒｓ１０９２３８３５、ｒｓ９４７１３０、ｒｓ９１４２４７、ｒｓ１０４５６４２、ｒｓ８８００５４、ｒｓ１０５０２９３３、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ４３０９４８３およびｒｓ４７３９０３７からなる群から選択される少なくとも１つの一塩基多型の保有者となるよう選択された、請求項１から１０のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項１２】
前記個体が、ｒｓ１０４５６４２、ｒｓ１０９２３８３５、ｒｓ９１４２４７、ｒｓ４９６１、ｒｓ９４７１３０、ｒｓ４３０９４８３、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ１０５０２９３３およびｒｓ８８００５４（プロファイル８）からなる群から選択される少なくとも１つの一塩基多型の保有者となるよう選択された、請求項１から１０のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項１３】
前記個体が、ｒｓ１０４５６４２、ｒｓ１０９２３８３５、ｒｓ９１４２４７、ｒｓ９４７１３０、ｒｓ４７３９０３７、ｒｓ４３９０９４８３、ｒｓ４９８４、ｒｓ１０５０２９３３、ｒｓ８８００５４（プロファイル９）からなる群から選択される少なくとも１つの一塩基多型の保有者となるよう選択された、請求項１から１０のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項１４】
前記心血管状態が、高血圧および／またはそれに関連する状態である、請求項１から１３のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項１５】
前記心血管状態が、心肥大、心不全、心不全、心虚血、血管抵抗増加、血管反応性増加、血管硬化、血管厚さ増加、腎肥大、腎不全、糸球体硬化症、タンパク尿、多発性嚢胞腎、網膜障害、脳血管障害、脳血管損傷、脳卒中、メニエール症候群、認知障害、双極性障害の少なくとも１つである、請求項１４に記載のロスタフロキシン。
【請求項１６】
ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５の少なくとも１つ、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異を含む遺伝子型を有するよう選択された個体を治療するために投与される、０．００５ｍｇ／日〜５ｍｇ／日の用量の医薬品として使用するためのロスタフロキシン。
【請求項１７】
ロスタフロキシンによる治療が、ウアバイン高血圧効果の選択的阻害、ウアバインにより引き起こされるＮａ−ＫポンプおよびＳｒｃにおける変化の正常化、内因性ウアバインレベルの付随する増加とＮａ−ＫポンプおよびＳｒｃにおける変化により持続される高血圧の形態の正常化からなる群から選択される少なくとも１つの生物活性を誘発することを目指している、請求項１６に記載のロスタフロキシン。
【請求項１８】
ロスタフロキシンによる治療が、アデュシンまたは内因性ウアバインの合成および輸送に関与する他の酵素をコードする遺伝子の遺伝的変異に関連する高血圧効果の選択的拮抗作用、アデュシン遺伝的変異により引き起こされるＮａ−ＫポンプおよびＳｒｃにおける変化の正常化、ならびにアデュシン遺伝的変異とＮａ−ＫポンプおよびＳｒｃにおける変化の付随する効果により持続される高血圧の形態の正常化からなる群から選択される少なくとも１つの生物活性を誘発することを目指している、請求項１６または１７に記載のロスタフロキシン。
【請求項１９】
前記用量が、０．０５ｍｇ／日〜０．１５ｍｇ／日であり、前記個体へのロスタフロキシンの投与または処方が、約２３ｍｍＨｇの平均的血圧低下をもたらす、請求項１６から１８のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項２０】
前記用量が、１．５ｍｇ／日〜５．０ｍｇ／日であり、前記個体へのロスタフロキシンの投与または処方が、約１５ｍｍＨｇの平均的血圧低下をもたらす、請求項１６から１８のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項２１】
前記用量が、０．０５ｍｇ／日〜１．５ｍｇ／日であり、前記個体へのロスタフロキシンの投与または処方が、平均的夜間血圧低下をもたらす、請求項１６から１８のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項２２】
前記個体が、少なくとも１つのＣＡＮＤ１遺伝子、ＣＡＮＤ２遺伝子および／またはＧＷＳ遺伝子における多型の保有者にもなるよう選択され、前記個体へのロスタフロキシンの投与または処方が、約８〜約２２．５ｍｍＨｇに及ぶ平均的低下をもたらす、請求項１６から１８のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項２３】
少なくとも１つのＣＡＮＤ１遺伝子が、ＡＤＤ１、ＡＤＤ２、ＡＤＤ３、ＬＳＳ、ＭＤＲ１、ＨＳＤ３Ｂ１、ＣＹＰ１１Ａ１およびＳＬＣＯ４Ｃ１からなる群から選択される、請求項２２に記載のロスタフロキシン。
【請求項２４】
少なくとも１つのＣＡＮＤ２遺伝子が、ＡＣＴＮ１、ＡＤＲＡ１Ａ、ＡＧＴＲ１、ＡＱＰ２、ＡＴＰ１Ａ３、ＣＬＣＮＫＡ、ＣＬＣＮＫＢ、ＦＸＹＤ２、ＦＸＹＤ６、ＦＹＮ、ＮＥＤＤ４Ｌ、ＮＫＡＩＮ３、ＰＫＤ１、ＰＫＤ２、ＳＣＮＮ１Ｂ、ＳＧＫ１、ＳＬＣ１２Ａ１、ＳＬＣ８Ａ１、ＴＪＰ１、ＵＭＯＤおよびＷＮＫ１からなる群から選択される、請求項２２または２３に記載のロスタフロキシン。
【請求項２５】
少なくとも１つのＧＷＳ遺伝子が、ＡＲＬ５Ａ、ＡＴＰ２Ａ３、ＣＯＸ１０、ＤＰＨ５、ＦＡＩＭ３、ＦＡＭ４６Ａ、ＨＣＧ９、ＨＬＡ−Ａ、ＨＬＡ−Ｆ、ＨＬＡ−Ｇ、ＫＣＮＳ３、ＬＯＣ１３１６９１、ＬＯＣ３８９１７４、ＬＯＣ３８９９７０、ＬＯＣ６４２７２７、ＬＯＣ６４４１９２、ＬＯＣ６４９４５８、ＬＯＣ７２８３６０、ＬＯＣ７２８３１６、ＰＩＧＲ、ＲＣＡＤＨ５、ＲＰ３−３７７Ｈ１４．５、ＳＨ３ＰＸＤ２Ａ、ＳＬＣ３０Ａ７、ＴＨＳＤ７Ａ、ＴＭＥＭ２００Ａ、ＴＲＩＭ３１、ＴＴＣ２９およびＶＣＡＭ１からなる群から選択される、請求項２２から２４のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項２６】
少なくとも１つのＣＡＮＤ１遺伝子、ＣＡＮＤ２遺伝子およびＧＷＳ遺伝子が、ＭＤＳＲ２、ＨＳＤ１８、ＬＳＳ２、ＨＳＤ１９、ＡＤＤ２、ＷＮＫからなる群から選択される、請求項２３に記載のロスタフロキシン。
【請求項２７】
少なくとも１つのＣＡＮＤ１遺伝子、ＣＡＮＤ２遺伝子および／またはＧＷＳ遺伝子中の前記多型が、一塩基多型である、請求項２２から２６のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項２８】
前記用量が、経口、静脈内、筋肉内、動脈内、脊髄内、髄腔内、心室内、経皮内適用、皮下、腹腔内、鼻腔内、経腸、局所、舌下、直腸手段、または外科手術後の患部組織に局所的に投与される、請求項１６から２７のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項２９】
個体の単離ＤＮＡサンプル中で、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９および配列番号１１のヌクレオチド配列のいずれか１つにおける一塩基多型を検出するステップを含む、ロスタフロキシンに対する改善された応答を有する個体を同定する方法であって、前記ＳＮＰの存在は、前記個体中のロスタフロキシンに対する改善された応答と相関する方法。
【請求項３０】
前記検出される一塩基多型が、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０および配列番号１２からなる群から選択される少なくとも１つの配列、またはそれらの相補配列を含む、単離核酸分子。
【請求項３２】
配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４および配列番号４６からなる群から選択される少なくとも１つの配列、またはそれらの相補配列を含む、単離核酸分子。
【請求項３３】
配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９および配列番号１１のヌクレオチド配列のいずれか１つにおける一塩基多型を含む核酸分子と特異的にハイブリダイズする単離ポリヌクレオチドと；
緩衝液と；
前記核酸中の一塩基多型を検出するために前記単離ポリヌクレオチドと組み合わせて使用するのに適した酵素と
を含む、核酸中の一塩基多型を検出するシステム。
【請求項３４】
前記単離ポリヌクレオチドが、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０および配列番号１２からなる群から選択される少なくとも１つの配列、またはそれらのフラグメントを含む、請求項３３に記載のシステム。
【請求項３５】
配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３および配列番号４５のヌクレオチド配列のいずれか１つにおける一塩基多型を含む核酸分子と特異的にハイブリダイズする単離ポリヌクレオチドをさらに含む、請求項３３または３４に記載のシステム。
【請求項３６】
前記単離ポリヌクレオチドが、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４および配列番号４６からなる群から選択される少なくとも１つの配列、またはそれらのフラグメントを含む、請求項３５に記載のシステム。
【請求項３７】
ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異のためのプローブと；
０．００５ｍｇ〜５ｍｇ／日、特に０．０５〜０．５ｍｇ／日の用量のロスタフロキシンおよび薬学的に許容される媒体を含む医薬組成物と
を含む、個体のためのロスタフロキシン治療を評価するシステム。
【請求項３８】
前記プローブが、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０および配列番号１２からなる群から選択される少なくとも１つの単離ポリヌクレオチド、または配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０もしくは配列番号１２と相補的な配列と特異的にハイブリダイズすることができるそれらのフラグメントを含む、請求項３７に記載のシステム。
【請求項３９】
ｒｓ４９６１、ｒｓ４９８４、ｒｓ１０９２３８３５、ｒｓ９４７１３０、ｒｓ９１４２４７、ｒｓ１０４５６４２、ｒｓ８８００５４、ｒｓ１０５０２９３３、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ４３０９４８３およびｒｓ４７３９０３７からなる群から選択される少なくとも１つの多型のためのプローブをさらに含む、請求項３７または３８に記載のシステム。
【請求項４０】
前記プローブが、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４および配列番号４６からなる群から選択される少なくとも１つの単離ポリヌクレオチド、または配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４もしくは配列番号４６と相補的な配列と特異的にハイブリダイズすることができるそれらのフラグメントを含む、請求項３９に記載のシステム。
【請求項４１】
前記プローブが、配列番号３５〜配列番号５８からなる群から選択される配列を有する、請求項３７から４０のいずれか一項に記載のシステム。
【請求項４２】
配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９および配列番号１１のヌクレオチド配列のいずれか１つにおける一塩基多型を含む核酸分子と特異的にハイブリダイズする単離ポリヌクレオチドと；
緩衝液と；
前記核酸中の一塩基多型を検出するために前記単離ポリヌクレオチドと組み合わせて使用するのに適した酵素と
を含む、ＫＣＮＳ３、ＴＨＳＤ７Ａ、ＦＡＭ４６Ａ、ＬＯＣ３８９９７０、ＨＬＡ−ＧおよびＴＴＣ２９からなる群から選択される遺伝子の遺伝子間または遺伝子内領域中の一塩基多型を検出するシステム。
【請求項１】
ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の保有者となるよう選択された個体の心血管状態の治療または予防に使用するためのロスタフロキシン。
【請求項２】
少なくとも１つの多型が、ｒｓ２３４５０８８についてはヌクレオチドＣまたはＴ、ｒｓ１６８７７１８２についてはヌクレオチドＣまたはＴ、ｒｓ１６８９３５２２についてはヌクレオチドＧまたはＡ、ｒｓ２４６１９１１についてはヌクレオチドＧまたはＡ、ｒｓ５０１３０９３についてはヌクレオチドＣまたはＴ、およびｒｓ１２５１３３７５についてはヌクレオチドＴまたはＧからなる群から選択される、請求項１に記載のロスタフロキシン。
【請求項３】
前記個体が、ｒｓ２３４５０８８については遺伝子型ＴＴまたは遺伝子型１、ｒｓ１６８７７１８２については遺伝子型Ｃ／Ｔまたは遺伝子型２、ｒｓ１６８９３５２２については遺伝子型ＡＡまたは遺伝子型１、ｒｓ２４６１９１１については遺伝子型ＡＡまたは遺伝子型１、ｒｓ５０１３０９３については遺伝子型ＴＴまたは遺伝子型１、およびｒｓ１２５１３３７５については遺伝子型ＴＴまたは遺伝子型１からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子型の保有者となるよう選択された、請求項１または２に記載のロスタフロキシン。
【請求項４】
前記個体が、少なくとも１つのＣＡＮＤ１遺伝子、ＣＡＮＤ２遺伝子および／またはＧＷＳ遺伝子における多型の保有者となるよう選択された、請求項１から３のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項５】
前記個体が、ＡＤＤ１、ＡＤＤ２、ＡＤＤ３、ＣＹＰ１１Ａ１、ＨＳＤ３Ｂ１、ＬＳＳ、ＡＢＣＢ／ＭＤＲ１およびＳＬＣＯ４Ｃ１からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子における少なくとも１つの多型の保有者にもなるよう選択された、請求項４に記載のロスタフロキシン。
【請求項６】
前記個体が、ｒｓ４９６１、ｒｓ４９８４、ｒｓ３７３１５６６、ｒｓ９１４２４７およびｒｓ１０４５６４２からなる群から選択される少なくとも１つの一塩基多型ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の保有者となるよう選択された、請求項１から５のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項７】
前記個体が、ｒｓ４９６１についてはＧＴ、ｒｓ４９８４についてはＣＴ、ｒｓ３７３１５６６についてはＡＧ、ｒｓ９１４２４７についてはＧＡおよびｒｓ１０４５６４２についてはＴＣからなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子型の保有者となるよう選択された、請求項１から６のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項８】
前記個体が、ｒｓ９１４２４７について遺伝子型ＡＡの保有者となるよう選択された、請求項１から７のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項９】
前記個体が、ｒｓ２４２０９３、ｒｓ１９９６３９６、ｒｓ１０５０３８０６、ｒｓ１３２５１７８０、ｒｓ１７４３０７０６、ｒｓ１０１０２０２４、ｒｓ５２６３０２、ｒｓ５４４１０４、ｒｓ３１０２０８７、ｒｓ５１８３、ｒｓ３７７２６２７、ｒｓ２２７６７３６、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ３７４１５５９、ｒｓ２２１７３４２、ｒｓ１０９２７８８８、ｒｓ６６０４９０９、ｒｓ９４５４０３、ｒｓ７１１７３１４、ｒｓ１０７９０２１２、ｒｓ１１２１６５９８、ｒｓ９１０６８２、ｒｓ１３２１８３１６、ｒｓ４３０９４８３、ｒｓ１３２８０３０７、ｒｓ４７３９０３７、ｒｓ１７５９６７７４、ｒｓ２７２８１０８、ｒｓ１７７８６４５６、ｒｓ７６９６３０４、ｒｓ２７２５２２２、ｒｓ１７１９９５６５、ｒｓ２７５８１５２、ｒｓ１０５７２９３、ｒｓ１６９６０７１２、ｒｓ７５９３５９、ｒｓ４０４２１４、ｒｓ１００５２１３、ｒｓ１７０２５４５３、ｒｓ２１１０９２３、ｒｓ１４２８５７１、ｒｓ４３５４０４、ｒｓ１２９０８７８７、ｒｓ１１６４７７２７、ｒｓ８８００５４およびｒｓ１１０６４５８４からなる群から選択される少なくとも１つの一塩基多型、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の保有者となるよう選択された、請求項１から８のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項１０】
前記個体が、ｒｓ１２９９６１８６、ｒｓ９８９３３７２、ｒｓ７２１６３３１、ｒｓ７５２１６６８、ｒｓ１８８３３４、ｒｓ４９９８６６２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ６４５７１１０、ｒｓ３８９３４６４、ｒｓ２５１７７１８、ｒｓ１３６２１２６、ｒｓ５０１３０９３、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ６７１８２８２、ｒｓ７２１２０７、ｒｓ２５５５５００、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ８１７９６５４、ｒｓ１９０１１３９、ｒｓ２４２７８３２、ｒｓ９３６１８６３、ｒｓ１９９８３９４、ｇａ００１６１９、ｒｓ２２７５５３１、ｒｓ７４８１４０、ｒｓ４７１０５９２、ｒｓ２７４３９５１、ｒｓ１０１５９５６９、ｒｓ３０８７８１６、ｒｓ１０４９３９４０、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ２３２６９１２、ｒｓ１１１０４４６、ｒｓ１２５１３３７５およびｒｓ１７４１４９５４からなる群から選択される少なくとも１つの一塩基多型、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異の保有者となるよう選択された、請求項１から９のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項１１】
前記個体が、ｒｓ４９６１、ｒｓ４９８４、ｒｓ１０９２３８３５、ｒｓ９４７１３０、ｒｓ９１４２４７、ｒｓ１０４５６４２、ｒｓ８８００５４、ｒｓ１０５０２９３３、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ４３０９４８３およびｒｓ４７３９０３７からなる群から選択される少なくとも１つの一塩基多型の保有者となるよう選択された、請求項１から１０のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項１２】
前記個体が、ｒｓ１０４５６４２、ｒｓ１０９２３８３５、ｒｓ９１４２４７、ｒｓ４９６１、ｒｓ９４７１３０、ｒｓ４３０９４８３、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ１０５０２９３３およびｒｓ８８００５４（プロファイル８）からなる群から選択される少なくとも１つの一塩基多型の保有者となるよう選択された、請求項１から１０のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項１３】
前記個体が、ｒｓ１０４５６４２、ｒｓ１０９２３８３５、ｒｓ９１４２４７、ｒｓ９４７１３０、ｒｓ４７３９０３７、ｒｓ４３９０９４８３、ｒｓ４９８４、ｒｓ１０５０２９３３、ｒｓ８８００５４（プロファイル９）からなる群から選択される少なくとも１つの一塩基多型の保有者となるよう選択された、請求項１から１０のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項１４】
前記心血管状態が、高血圧および／またはそれに関連する状態である、請求項１から１３のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項１５】
前記心血管状態が、心肥大、心不全、心不全、心虚血、血管抵抗増加、血管反応性増加、血管硬化、血管厚さ増加、腎肥大、腎不全、糸球体硬化症、タンパク尿、多発性嚢胞腎、網膜障害、脳血管障害、脳血管損傷、脳卒中、メニエール症候群、認知障害、双極性障害の少なくとも１つである、請求項１４に記載のロスタフロキシン。
【請求項１６】
ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５の少なくとも１つ、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異を含む遺伝子型を有するよう選択された個体を治療するために投与される、０．００５ｍｇ／日〜５ｍｇ／日の用量の医薬品として使用するためのロスタフロキシン。
【請求項１７】
ロスタフロキシンによる治療が、ウアバイン高血圧効果の選択的阻害、ウアバインにより引き起こされるＮａ−ＫポンプおよびＳｒｃにおける変化の正常化、内因性ウアバインレベルの付随する増加とＮａ−ＫポンプおよびＳｒｃにおける変化により持続される高血圧の形態の正常化からなる群から選択される少なくとも１つの生物活性を誘発することを目指している、請求項１６に記載のロスタフロキシン。
【請求項１８】
ロスタフロキシンによる治療が、アデュシンまたは内因性ウアバインの合成および輸送に関与する他の酵素をコードする遺伝子の遺伝的変異に関連する高血圧効果の選択的拮抗作用、アデュシン遺伝的変異により引き起こされるＮａ−ＫポンプおよびＳｒｃにおける変化の正常化、ならびにアデュシン遺伝的変異とＮａ−ＫポンプおよびＳｒｃにおける変化の付随する効果により持続される高血圧の形態の正常化からなる群から選択される少なくとも１つの生物活性を誘発することを目指している、請求項１６または１７に記載のロスタフロキシン。
【請求項１９】
前記用量が、０．０５ｍｇ／日〜０．１５ｍｇ／日であり、前記個体へのロスタフロキシンの投与または処方が、約２３ｍｍＨｇの平均的血圧低下をもたらす、請求項１６から１８のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項２０】
前記用量が、１．５ｍｇ／日〜５．０ｍｇ／日であり、前記個体へのロスタフロキシンの投与または処方が、約１５ｍｍＨｇの平均的血圧低下をもたらす、請求項１６から１８のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項２１】
前記用量が、０．０５ｍｇ／日〜１．５ｍｇ／日であり、前記個体へのロスタフロキシンの投与または処方が、平均的夜間血圧低下をもたらす、請求項１６から１８のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項２２】
前記個体が、少なくとも１つのＣＡＮＤ１遺伝子、ＣＡＮＤ２遺伝子および／またはＧＷＳ遺伝子における多型の保有者にもなるよう選択され、前記個体へのロスタフロキシンの投与または処方が、約８〜約２２．５ｍｍＨｇに及ぶ平均的低下をもたらす、請求項１６から１８のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項２３】
少なくとも１つのＣＡＮＤ１遺伝子が、ＡＤＤ１、ＡＤＤ２、ＡＤＤ３、ＬＳＳ、ＭＤＲ１、ＨＳＤ３Ｂ１、ＣＹＰ１１Ａ１およびＳＬＣＯ４Ｃ１からなる群から選択される、請求項２２に記載のロスタフロキシン。
【請求項２４】
少なくとも１つのＣＡＮＤ２遺伝子が、ＡＣＴＮ１、ＡＤＲＡ１Ａ、ＡＧＴＲ１、ＡＱＰ２、ＡＴＰ１Ａ３、ＣＬＣＮＫＡ、ＣＬＣＮＫＢ、ＦＸＹＤ２、ＦＸＹＤ６、ＦＹＮ、ＮＥＤＤ４Ｌ、ＮＫＡＩＮ３、ＰＫＤ１、ＰＫＤ２、ＳＣＮＮ１Ｂ、ＳＧＫ１、ＳＬＣ１２Ａ１、ＳＬＣ８Ａ１、ＴＪＰ１、ＵＭＯＤおよびＷＮＫ１からなる群から選択される、請求項２２または２３に記載のロスタフロキシン。
【請求項２５】
少なくとも１つのＧＷＳ遺伝子が、ＡＲＬ５Ａ、ＡＴＰ２Ａ３、ＣＯＸ１０、ＤＰＨ５、ＦＡＩＭ３、ＦＡＭ４６Ａ、ＨＣＧ９、ＨＬＡ−Ａ、ＨＬＡ−Ｆ、ＨＬＡ−Ｇ、ＫＣＮＳ３、ＬＯＣ１３１６９１、ＬＯＣ３８９１７４、ＬＯＣ３８９９７０、ＬＯＣ６４２７２７、ＬＯＣ６４４１９２、ＬＯＣ６４９４５８、ＬＯＣ７２８３６０、ＬＯＣ７２８３１６、ＰＩＧＲ、ＲＣＡＤＨ５、ＲＰ３−３７７Ｈ１４．５、ＳＨ３ＰＸＤ２Ａ、ＳＬＣ３０Ａ７、ＴＨＳＤ７Ａ、ＴＭＥＭ２００Ａ、ＴＲＩＭ３１、ＴＴＣ２９およびＶＣＡＭ１からなる群から選択される、請求項２２から２４のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項２６】
少なくとも１つのＣＡＮＤ１遺伝子、ＣＡＮＤ２遺伝子およびＧＷＳ遺伝子が、ＭＤＳＲ２、ＨＳＤ１８、ＬＳＳ２、ＨＳＤ１９、ＡＤＤ２、ＷＮＫからなる群から選択される、請求項２３に記載のロスタフロキシン。
【請求項２７】
少なくとも１つのＣＡＮＤ１遺伝子、ＣＡＮＤ２遺伝子および／またはＧＷＳ遺伝子中の前記多型が、一塩基多型である、請求項２２から２６のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項２８】
前記用量が、経口、静脈内、筋肉内、動脈内、脊髄内、髄腔内、心室内、経皮内適用、皮下、腹腔内、鼻腔内、経腸、局所、舌下、直腸手段、または外科手術後の患部組織に局所的に投与される、請求項１６から２７のいずれか一項に記載のロスタフロキシン。
【請求項２９】
個体の単離ＤＮＡサンプル中で、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９および配列番号１１のヌクレオチド配列のいずれか１つにおける一塩基多型を検出するステップを含む、ロスタフロキシンに対する改善された応答を有する個体を同定する方法であって、前記ＳＮＰの存在は、前記個体中のロスタフロキシンに対する改善された応答と相関する方法。
【請求項３０】
前記検出される一塩基多型が、ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０および配列番号１２からなる群から選択される少なくとも１つの配列、またはそれらの相補配列を含む、単離核酸分子。
【請求項３２】
配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４および配列番号４６からなる群から選択される少なくとも１つの配列、またはそれらの相補配列を含む、単離核酸分子。
【請求項３３】
配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９および配列番号１１のヌクレオチド配列のいずれか１つにおける一塩基多型を含む核酸分子と特異的にハイブリダイズする単離ポリヌクレオチドと；
緩衝液と；
前記核酸中の一塩基多型を検出するために前記単離ポリヌクレオチドと組み合わせて使用するのに適した酵素と
を含む、核酸中の一塩基多型を検出するシステム。
【請求項３４】
前記単離ポリヌクレオチドが、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０および配列番号１２からなる群から選択される少なくとも１つの配列、またはそれらのフラグメントを含む、請求項３３に記載のシステム。
【請求項３５】
配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３および配列番号４５のヌクレオチド配列のいずれか１つにおける一塩基多型を含む核酸分子と特異的にハイブリダイズする単離ポリヌクレオチドをさらに含む、請求項３３または３４に記載のシステム。
【請求項３６】
前記単離ポリヌクレオチドが、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４および配列番号４６からなる群から選択される少なくとも１つの配列、またはそれらのフラグメントを含む、請求項３５に記載のシステム。
【請求項３７】
ｒｓ２３４５０８８、ｒｓ１６８７７１８２、ｒｓ１６８９３５２２、ｒｓ２４６１９１１、ｒｓ５０１３０９３およびｒｓ１２５１３３７５からなる群から選択される少なくとも１つの多型、ならびに／あるいはそれらとの連鎖不平衝における遺伝的変異のためのプローブと；
０．００５ｍｇ〜５ｍｇ／日、特に０．０５〜０．５ｍｇ／日の用量のロスタフロキシンおよび薬学的に許容される媒体を含む医薬組成物と
を含む、個体のためのロスタフロキシン治療を評価するシステム。
【請求項３８】
前記プローブが、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０および配列番号１２からなる群から選択される少なくとも１つの単離ポリヌクレオチド、または配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０もしくは配列番号１２と相補的な配列と特異的にハイブリダイズすることができるそれらのフラグメントを含む、請求項３７に記載のシステム。
【請求項３９】
ｒｓ４９６１、ｒｓ４９８４、ｒｓ１０９２３８３５、ｒｓ９４７１３０、ｒｓ９１４２４７、ｒｓ１０４５６４２、ｒｓ８８００５４、ｒｓ１０５０２９３３、ｒｓ２１３１１２７、ｒｓ４３０９４８３およびｒｓ４７３９０３７からなる群から選択される少なくとも１つの多型のためのプローブをさらに含む、請求項３７または３８に記載のシステム。
【請求項４０】
前記プローブが、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４および配列番号４６からなる群から選択される少なくとも１つの単離ポリヌクレオチド、または配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４もしくは配列番号４６と相補的な配列と特異的にハイブリダイズすることができるそれらのフラグメントを含む、請求項３９に記載のシステム。
【請求項４１】
前記プローブが、配列番号３５〜配列番号５８からなる群から選択される配列を有する、請求項３７から４０のいずれか一項に記載のシステム。
【請求項４２】
配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９および配列番号１１のヌクレオチド配列のいずれか１つにおける一塩基多型を含む核酸分子と特異的にハイブリダイズする単離ポリヌクレオチドと；
緩衝液と；
前記核酸中の一塩基多型を検出するために前記単離ポリヌクレオチドと組み合わせて使用するのに適した酵素と
を含む、ＫＣＮＳ３、ＴＨＳＤ７Ａ、ＦＡＭ４６Ａ、ＬＯＣ３８９９７０、ＨＬＡ−ＧおよびＴＴＣ２９からなる群から選択される遺伝子の遺伝子間または遺伝子内領域中の一塩基多型を検出するシステム。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【公表番号】特表２０１３−５０８３２９（Ｐ２０１３−５０８３２９Ａ）
【公表日】平成２５年３月７日（２０１３．３．７）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１２−５３４６４２（Ｐ２０１２−５３４６４２）
【出願日】平成２２年１０月１８日（２０１０．１０．１８）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＥＰ２０１０／０６５５８９
【国際公開番号】ＷＯ２０１１／０４８０３３
【国際公開日】平成２３年４月２８日（２０１１．４．２８）
【出願人】（５１２１０３３３２）ロスタクオ・ソシエタ・ペル・アチオニ (1)
【氏名又は名称原語表記】ＲＯＳＴＡＱＵＯ Ｓ．ｐ．Ａ．
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２５年３月７日（２０１３．３．７）
【国際特許分類】
【出願日】平成２２年１０月１８日（２０１０．１０．１８）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＥＰ２０１０／０６５５８９
【国際公開番号】ＷＯ２０１１／０４８０３３
【国際公開日】平成２３年４月２８日（２０１１．４．２８）
【出願人】（５１２１０３３３２）ロスタクオ・ソシエタ・ペル・アチオニ (1)
【氏名又は名称原語表記】ＲＯＳＴＡＱＵＯ Ｓ．ｐ．Ａ．
【Ｆターム（参考）】
[ Back to top ]