末端に連結された二環糖部分を有する、ギャップ化オリゴマー化合物
本発明は、二環ヌクレオシド、およびこうしたヌクレオシドを少なくとも１つ含むオリゴマー化合物に関する。これらのオリゴマー化合物は、典型的には、非修飾オリゴマー化合物に比較して、増進した結合親和性およびヌクレアーゼ抵抗特性を有する。該オリゴマー化合物は、例えば研究目的および療法目的に有用である。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
構造：
Ｔ１−（Ｎｕ１−Ｌ１）ｎ１−（Ｎｕ２−Ｌ２）ｎ２−（Ｎｕ３−Ｌ３）ｎ３−Ｔ２
式中：
各Ｎｕ１およびＮｕ３は、独立に、高親和性修飾ヌクレオシドであり、ここで、Ｎｕ１およびＮｕ３の少なくとも一方が、４’−ＣＨ２−Ｏ−２’架橋または４’−（ＣＨ２）２−Ｏ−２’架橋を含む、二環糖修飾ヌクレオシドである；
各Ｎｕ２は２’−デオキシヌクレオシドであり；
各Ｌ１、Ｌ２およびＬ３は、独立に、ヌクレオシド間連結基であり；
各Ｔ１およびＴ２は、独立に、Ｈ、ヒドロキシ保護基、場合によって連結されるコンジュゲート基、または固体支持体への共有結合であり；
ｎ１は１〜約６であり；
ｎ２は１１〜約１８であり；そして
ｎ３は２〜約６である
を含むオリゴマー化合物。
【請求項２】
高親和性修飾ヌクレオシドの各々が、独立に、二環糖修飾ヌクレオシド、２’−Ｏ−（ＣＨ２）２−Ｏ−ＣＨ３修飾ヌクレオシド、２’−Ｆ修飾ヌクレオシド、または２’−Ｏ−ＣＨ２−Ｃ（＝Ｏ）−ＮＲ１Ｒ２修飾ヌクレオシドである、ここで各Ｒ１およびＲ２は、独立に、Ｈ、窒素保護基、置換または非置換Ｃ１−Ｃ１０アルキル、置換または非置換Ｃ２−Ｃ１０アルケニル、置換または非置換Ｃ２−Ｃ１０アルキニルである、ここで置換は、ＯＲ３、ＳＲ３、ＮＨ３＋、ＮＲ３Ｒ４、グアニジノまたはアシルである、ここでアシルは酸アミドまたはエステルであるか、あるいはＲ１およびＲ２が一緒に窒素保護基であるか、またはＮおよびＯから選択されるさらなるヘテロ原子を場合によって含む環構造において、Ｒ１およびＲ２が連結されている、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項３】
二環糖修飾ヌクレオシドの各々が、独立に、４’−ＣＨ２−Ｏ−２’架橋または４’−（ＣＨ２）２−Ｏ−２’架橋を有する、請求項２のオリゴマー化合物。
【請求項４】
各Ｒ１およびＲ２が、独立に、Ｈ、窒素保護基、またはＣ１−Ｃ１０アルキルである、請求項２のオリゴマー化合物。
【請求項５】
Ｔ１がＨまたはヒドロキシル保護基である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項６】
Ｔ２がＨまたはヒドロキシル保護基である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項７】
ヒドロキシル保護基の各々が、独立に、４，４’−ジメトキシトリチル、モノメトキシトリチル、９−フェニルキサンテン−９−イル、９−（ｐ−メトキシフェニル）キサンテン−９−イル、ｔ−ブチル、ｔ−ブトキシメチル、メトキシメチル、テトラヒドロピラニル、１−エトキシエチル、１−（２−クロロエトキシ）エチル、２−トリメチルシリルエチル、ｐ−クロロフェニル、２，４−ジニトロフェニル、ベンジル、２，６−ジクロロベンジル、ジフェニルメチル、ｐ，ｐ−ジニトロベンズヒドリル、ｐ−ニトロベンジル、トリフェニルメチル、トリメチルシリル、トリエチルシリル、ｔ−ブチルジメチルシリル、ｔ−ブチルジフェニルシリル、トリフェニルシリル、ベンゾイルホルメート、アセチル、クロロアセチル、トリクロロアセチル、トリフルオロアセチル、ピバロイル、ベンゾイル、ｐ−フェニルベンゾイル、メシル、トシル、４，４’，４”−トリス−（ベンジルオキシ）トリチル、４，４’，４”−トリス−（４，５−ジクロロフタルイミド）トリチル、４，４’，４”−トリス（レブリニルオキシ）トリチル、３−（イミダゾリルメチル）−４，４’−ジメトキシトリチル、４−デシルオキシトリチル、４−ヘキサデシルオキシトリチル、９−（４−オクタデシルオキシフェニル）キサンテン−９−イル、１，１−ビス−（４−メトキシフェニル）−１’−ピレニルメチル、ｐ−フェニルアゾフェニルオキシカルボニル、９−フルオレニル−メトキシカルボニル、２，４−ジニトロフェニルエトキシカルボニル、４−（メチルチオメトキシ）ブチリル、２−（メチルチオメトキシメチル）−ベンゾイル、２−（イソプロピルチオメトキシメチル）ベンゾイル、２−（２，４−ジニトロベンゼンスルフェニルオキシメチル）ベンゾイル、またはレブリニル基である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項８】
Ｔ１およびＴ２の一方が、支持体への共有結合である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項９】
支持体が、調節孔ガラス、オキサリル調節孔ガラス、シリカ含有粒子、ポリスチレンのポリマー、ポリスチレンのコポリマー、スチレンおよびジビニルベンゼンのコポリマー、ジメチルアクリルアミドおよびＮ，Ｎ’−ビスアクリロイルエチレンジアミンのコポリマー、可溶性支持体、またはＰＥＰＳである、請求項８のオリゴマー化合物。
【請求項１０】
各Ｌ１、Ｌ２およびＬ３が、独立に、ホスホジエステル、ホスホロチオエート、キラル・ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホトリエステル、アミノアルキルホスホトリエステル、メチルホスホネート、アルキルホスホネート、５’−アルキレンホスホネート、キラル・ホスホネート、ホスフィネート、ホスホロアミデート、３’−アミノホスホロアミデート、アミノアルキルホスホロアミデート、チオノホスホロアミデート、チオノアルキルホスホネート、チオノアルキルホスホトリエステル、セレノホスフェート、またはボラノホスフェートである、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項１１】
各Ｌ１、Ｌ２およびＬ３が、独立に、ホスホジエステルまたはホスホロチオエート・ヌクレオシド間連結基である、請求項１０のオリゴマー化合物。
【請求項１２】
各Ｌ１、Ｌ２およびＬ３が、ホスホジエステル・ヌクレオシド間連結基である、請求項１０のオリゴマー化合物。
【請求項１３】
各Ｌ１、Ｌ２およびＬ３が、独立に、シロキサン、スルフィド、スルホキシド、スルホン、ホルムアセチル、チオホルムアセチル、メチレンホルムアセチル、チオホルムアセチル、スルファメート、メチレンイミノ、メチレンヒドラジノ、スルホネート、スルホンアミド、またはアミドである、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項１４】
ヌクレオシド間連結基が、独立に、−ＣＨ２−ＮＨ−Ｏ−ＣＨ２−、−ＣＨ２−Ｎ（ＣＨ３）−Ｏ−ＣＨ２−または−ＣＨ２−Ｏ−Ｎ（ＣＨ３）−ＣＨ２−、−ＣＨ２−Ｎ（ＣＨ３）−Ｎ（ＣＨ３）−ＣＨ２−、または−Ｏ−Ｎ（ＣＨ３）−ＣＨ２−ＣＨ２−である、請求項１３のオリゴマー化合物。
【請求項１５】
各ヌクレオシドが、独立に、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、ウラシル、５−メチルシトシン、５−ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、２−アミノアデニン、アデニンおよびグアニンのアルキル誘導体、２−チオウラシル、２−チオチミン、２−チオシトシン、５−ハロウラシル、５−ハロシトシン、５−プロピニルウラシル、５−プロピニルシトシン、６−アゾウラシル、６−アゾシトシン、６−アゾチミン、５−ウラシル（シュードウラシル）、４−チオウラシル、８−置換アデニン類およびグアニン類、５−置換ウラシル類およびシトシン類、７−メチルグアニン、７−メチルアデニン、８−アザグアニン、８−アザアデニン、７−デアザグアニン、７−デアザアデニン、３−デアザグアニン、または３−デアザアデニンである複素環塩基部分を含む、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項１６】
ｎ１が１〜約５である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項１７】
ｎ１が１〜約３である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項１８】
ｎ１が２〜約３である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項１９】
ｎ３が２〜約５である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項２０】
ｎ３が２〜約３である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項２１】
ｎ２が１２〜約１８である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項２２】
ｎ２が１２〜約１６である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項２３】
ｎ２が１４〜約１６である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項２４】
ｎ１、ｎ２およびｎ３の合計が１４〜約３０である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項２５】
ｎ１、ｎ２およびｎ３の合計が１４〜２４である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項２６】
ｎ１、ｎ２およびｎ３の合計が１４〜２１である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項２７】
ｎ１、ｎ２およびｎ３の合計が１６〜２１である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項２８】
ｎ１が１〜約３であり、ｎ２が１２または１３であり、そしてｎ３が２または３である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項２９】
ｎ１が３であり、ｎ２が１２であり、そしてｎ３が３である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項３０】
ｎ１が１〜約３であり、ｎ２が１４または１５であり、そしてｎ３が２または３である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項３１】
ｎ１が２であり、ｎ２が１４であり、そしてｎ３が２である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項３２】
ｎ１が１〜約３であり、ｎ２が１６または１７であり、そしてｎ３が２または３である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項３３】
ｎ１が２であり、ｎ２が１６であり、そしてｎ３が２である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項３４】
少なくとも１つのＮｕ１ヌクレオシドおよび少なくとも１つのＮｕ３ヌクレオシドがＬＮＡまたはＥＮＡである、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項３５】
最も５’末端または最も３’末端の親和性修飾ヌクレオシドの少なくとも一方がＬＮＡまたはＥＮＡである、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項３６】
遺伝子発現を阻害する方法であって、１以上の細胞、組織、または動物と、請求項１のオリゴマー化合物を接触させることを含む、前記方法。
【請求項３７】
構造：
【化１】
式中：
各Ｂｘは複素環塩基部分であり；
各Ｘは、独立に、ＯまたはＳであり；
Ｔ１およびＴ２は、各々、独立に、Ｈ、ヒドロキシ保護基、場合によって連結されるコンジュゲート基、または固体支持体への共有結合であり；
各ｍは、独立に、１または２であり；
ｎａは１〜約６であり；
ｎｂは１１〜約１８であり；そして
ｎｃは２〜約６である
を含むオリゴマー化合物。
【請求項３８】
各ｍが１である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項３９】
各ｍが２である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項４０】
Ｔ１およびＴ２の少なくとも一方が、Ｈまたはヒドロキシル保護基である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項４１】
ヒドロキシル保護基の各々が、独立に、４，４’−ジメトキシトリチル、モノメトキシトリチル、９−フェニルキサンテン−９−イル、９−（ｐ−メトキシフェニル）キサンテン−９−イル、ｔ−ブチル、ｔ−ブトキシメチル、メトキシメチル、テトラヒドロピラニル、１−エトキシエチル、１−（２−クロロエトキシ）エチル、２−トリメチルシリルエチル、ｐ−クロロフェニル、２，４−ジニトロフェニル、ベンジル、２，６−ジクロロベンジル、ジフェニルメチル、ｐ，ｐ−ジニトロベンズヒドリル、ｐ−ニトロベンジル、トリフェニルメチル、トリメチルシリル、トリエチルシリル、ｔ−ブチルジメチルシリル、ｔ−ブチルジフェニルシリル、トリフェニルシリル、ベンゾイルホルメート、アセチル、クロロアセチル、トリクロロアセチル、トリフルオロアセチル、ピバロイル、ベンゾイル、ｐ−フェニルベンゾイル、メシル、トシル、４，４’，４”−トリス−（ベンジルオキシ）トリチル、４，４’，４”−トリス−（４，５−ジクロロフタルイミド）トリチル、４，４’，４”−トリス（レブリニルオキシ）トリチル、３−（イミダゾリルメチル）−４，４’−ジメトキシトリチル、４−デシルオキシトリチル、４−ヘキサデシルオキシトリチル、９−（４−オクタデシルオキシフェニル）キサンテン−９−イル、１，１−ビス−（４−メトキシフェニル）−１’−ピレニルメチル、ｐ−フェニルアゾフェニルオキシカルボニル、９−フルオレニル−メトキシカルボニル、２，４−ジニトロフェニルエトキシカルボニル、４−（メチルチオメトキシ）ブチリル、２−（メチルチオメトキシメチル）−ベンゾイル、２−（イソプロピルチオメトキシメチル）ベンゾイル、２−（２，４−ジニトロベンゼンスルフェニルオキシメチル）ベンゾイル、またはレブリニル基である、請求項４０のオリゴマー化合物。
【請求項４２】
Ｔ１およびＴ２の一方が、支持体への共有結合である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項４３】
支持体が、調節孔ガラス、オキサリル調節孔ガラス、シリカ含有粒子、ポリスチレンのポリマー、ポリスチレンのコポリマー、スチレンおよびジビニルベンゼンのコポリマー、ジメチルアクリルアミドおよびＮ，Ｎ’−ビスアクリロイルエチレンジアミンのコポリマー、可溶性支持体、またはＰＥＰＳである、請求項４２のオリゴマー化合物。
【請求項４４】
各Ｌ１、Ｌ２およびＬ３が、独立に、ホスホジエステルまたはホスホロチオエート・ヌクレオシド間連結基である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項４５】
各Ｌ１、Ｌ２およびＬ３が、ホスホジエステル・ヌクレオシド間連結基である、請求項４４のオリゴマー化合物。
【請求項４６】
各Ｂｘが、独立に、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、ウラシル、５−メチルシトシン、５−ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、２−アミノアデニン、アデニンおよびグアニンのアルキル誘導体、２−チオウラシル、２−チオチミン、２−チオシトシン、５−ハロウラシル、５−ハロシトシン、５−プロピニルウラシル、５−プロピニルシトシン、６−アゾウラシル、６−アゾシトシン、６−アゾチミン、５−ウラシル（シュードウラシル）、４−チオウラシル、８−置換アデニン類およびグアニン類、５−置換ウラシル類およびシトシン類、７−メチルグアニン、７−メチルアデニン、８−アザグアニン、８−アザアデニン、７−デアザグアニン、７−デアザアデニン、３−デアザグアニン、または３−デアザアデニンである、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項４７】
ｎａが１〜約５である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項４８】
ｎａが１〜約３である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項４９】
ｎａが２〜約３である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項５０】
ｎｃが２〜約５である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項５１】
ｎｃが２〜約３である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項５２】
ｎｂが１２〜約１８である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項５３】
ｎｂが１２〜約１６である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項５４】
ｎｂが１４〜約１６である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項５５】
ｎａ、ｎｂおよびｎｃの合計が１４〜約３０である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項５６】
ｎａ、ｎｂおよびｎｃの合計が１４〜２４である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項５７】
ｎａ、ｎｂおよびｎｃの合計が１４〜２１である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項５８】
ｎａ、ｎｂおよびｎｃの合計が１６〜２１である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項５９】
ｎａが１〜約３であり、ｎｂが１２または１３であり、そしてｎｃが２または３である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項６０】
ｎａが３であり、ｎｂが１２であり、そしてｎｃが３である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項６１】
ｎａが１〜約３であり、ｎｂが１４または１５であり、そしてｎｃが２または３である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項６２】
ｎａが２であり、ｎｂが１４であり、そしてｎｃが２である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項６３】
ｎａが１〜約３であり、ｎｂが１６または１７であり、そしてｎｃが２または３である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項６４】
ｎａが２であり、ｎｂが１６であり、そしてｎｃが２である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項６５】
遺伝子発現を阻害する方法であって、１以上の細胞、組織、または動物と、請求項３７のオリゴマー化合物を接触させることを含む、前記方法。
【請求項１】
構造：
Ｔ１−（Ｎｕ１−Ｌ１）ｎ１−（Ｎｕ２−Ｌ２）ｎ２−（Ｎｕ３−Ｌ３）ｎ３−Ｔ２
式中：
各Ｎｕ１およびＮｕ３は、独立に、高親和性修飾ヌクレオシドであり、ここで、Ｎｕ１およびＮｕ３の少なくとも一方が、４’−ＣＨ２−Ｏ−２’架橋または４’−（ＣＨ２）２−Ｏ−２’架橋を含む、二環糖修飾ヌクレオシドである；
各Ｎｕ２は２’−デオキシヌクレオシドであり；
各Ｌ１、Ｌ２およびＬ３は、独立に、ヌクレオシド間連結基であり；
各Ｔ１およびＴ２は、独立に、Ｈ、ヒドロキシ保護基、場合によって連結されるコンジュゲート基、または固体支持体への共有結合であり；
ｎ１は１〜約６であり；
ｎ２は１１〜約１８であり；そして
ｎ３は２〜約６である
を含むオリゴマー化合物。
【請求項２】
高親和性修飾ヌクレオシドの各々が、独立に、二環糖修飾ヌクレオシド、２’−Ｏ−（ＣＨ２）２−Ｏ−ＣＨ３修飾ヌクレオシド、２’−Ｆ修飾ヌクレオシド、または２’−Ｏ−ＣＨ２−Ｃ（＝Ｏ）−ＮＲ１Ｒ２修飾ヌクレオシドである、ここで各Ｒ１およびＲ２は、独立に、Ｈ、窒素保護基、置換または非置換Ｃ１−Ｃ１０アルキル、置換または非置換Ｃ２−Ｃ１０アルケニル、置換または非置換Ｃ２−Ｃ１０アルキニルである、ここで置換は、ＯＲ３、ＳＲ３、ＮＨ３＋、ＮＲ３Ｒ４、グアニジノまたはアシルである、ここでアシルは酸アミドまたはエステルであるか、あるいはＲ１およびＲ２が一緒に窒素保護基であるか、またはＮおよびＯから選択されるさらなるヘテロ原子を場合によって含む環構造において、Ｒ１およびＲ２が連結されている、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項３】
二環糖修飾ヌクレオシドの各々が、独立に、４’−ＣＨ２−Ｏ−２’架橋または４’−（ＣＨ２）２−Ｏ−２’架橋を有する、請求項２のオリゴマー化合物。
【請求項４】
各Ｒ１およびＲ２が、独立に、Ｈ、窒素保護基、またはＣ１−Ｃ１０アルキルである、請求項２のオリゴマー化合物。
【請求項５】
Ｔ１がＨまたはヒドロキシル保護基である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項６】
Ｔ２がＨまたはヒドロキシル保護基である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項７】
ヒドロキシル保護基の各々が、独立に、４，４’−ジメトキシトリチル、モノメトキシトリチル、９−フェニルキサンテン−９−イル、９−（ｐ−メトキシフェニル）キサンテン−９−イル、ｔ−ブチル、ｔ−ブトキシメチル、メトキシメチル、テトラヒドロピラニル、１−エトキシエチル、１−（２−クロロエトキシ）エチル、２−トリメチルシリルエチル、ｐ−クロロフェニル、２，４−ジニトロフェニル、ベンジル、２，６−ジクロロベンジル、ジフェニルメチル、ｐ，ｐ−ジニトロベンズヒドリル、ｐ−ニトロベンジル、トリフェニルメチル、トリメチルシリル、トリエチルシリル、ｔ−ブチルジメチルシリル、ｔ−ブチルジフェニルシリル、トリフェニルシリル、ベンゾイルホルメート、アセチル、クロロアセチル、トリクロロアセチル、トリフルオロアセチル、ピバロイル、ベンゾイル、ｐ−フェニルベンゾイル、メシル、トシル、４，４’，４”−トリス−（ベンジルオキシ）トリチル、４，４’，４”−トリス−（４，５−ジクロロフタルイミド）トリチル、４，４’，４”−トリス（レブリニルオキシ）トリチル、３−（イミダゾリルメチル）−４，４’−ジメトキシトリチル、４−デシルオキシトリチル、４−ヘキサデシルオキシトリチル、９−（４−オクタデシルオキシフェニル）キサンテン−９−イル、１，１−ビス−（４−メトキシフェニル）−１’−ピレニルメチル、ｐ−フェニルアゾフェニルオキシカルボニル、９−フルオレニル−メトキシカルボニル、２，４−ジニトロフェニルエトキシカルボニル、４−（メチルチオメトキシ）ブチリル、２−（メチルチオメトキシメチル）−ベンゾイル、２−（イソプロピルチオメトキシメチル）ベンゾイル、２−（２，４−ジニトロベンゼンスルフェニルオキシメチル）ベンゾイル、またはレブリニル基である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項８】
Ｔ１およびＴ２の一方が、支持体への共有結合である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項９】
支持体が、調節孔ガラス、オキサリル調節孔ガラス、シリカ含有粒子、ポリスチレンのポリマー、ポリスチレンのコポリマー、スチレンおよびジビニルベンゼンのコポリマー、ジメチルアクリルアミドおよびＮ，Ｎ’−ビスアクリロイルエチレンジアミンのコポリマー、可溶性支持体、またはＰＥＰＳである、請求項８のオリゴマー化合物。
【請求項１０】
各Ｌ１、Ｌ２およびＬ３が、独立に、ホスホジエステル、ホスホロチオエート、キラル・ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホトリエステル、アミノアルキルホスホトリエステル、メチルホスホネート、アルキルホスホネート、５’−アルキレンホスホネート、キラル・ホスホネート、ホスフィネート、ホスホロアミデート、３’−アミノホスホロアミデート、アミノアルキルホスホロアミデート、チオノホスホロアミデート、チオノアルキルホスホネート、チオノアルキルホスホトリエステル、セレノホスフェート、またはボラノホスフェートである、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項１１】
各Ｌ１、Ｌ２およびＬ３が、独立に、ホスホジエステルまたはホスホロチオエート・ヌクレオシド間連結基である、請求項１０のオリゴマー化合物。
【請求項１２】
各Ｌ１、Ｌ２およびＬ３が、ホスホジエステル・ヌクレオシド間連結基である、請求項１０のオリゴマー化合物。
【請求項１３】
各Ｌ１、Ｌ２およびＬ３が、独立に、シロキサン、スルフィド、スルホキシド、スルホン、ホルムアセチル、チオホルムアセチル、メチレンホルムアセチル、チオホルムアセチル、スルファメート、メチレンイミノ、メチレンヒドラジノ、スルホネート、スルホンアミド、またはアミドである、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項１４】
ヌクレオシド間連結基が、独立に、−ＣＨ２−ＮＨ−Ｏ−ＣＨ２−、−ＣＨ２−Ｎ（ＣＨ３）−Ｏ−ＣＨ２−または−ＣＨ２−Ｏ−Ｎ（ＣＨ３）−ＣＨ２−、−ＣＨ２−Ｎ（ＣＨ３）−Ｎ（ＣＨ３）−ＣＨ２−、または−Ｏ−Ｎ（ＣＨ３）−ＣＨ２−ＣＨ２−である、請求項１３のオリゴマー化合物。
【請求項１５】
各ヌクレオシドが、独立に、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、ウラシル、５−メチルシトシン、５−ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、２−アミノアデニン、アデニンおよびグアニンのアルキル誘導体、２−チオウラシル、２−チオチミン、２−チオシトシン、５−ハロウラシル、５−ハロシトシン、５−プロピニルウラシル、５−プロピニルシトシン、６−アゾウラシル、６−アゾシトシン、６−アゾチミン、５−ウラシル（シュードウラシル）、４−チオウラシル、８−置換アデニン類およびグアニン類、５−置換ウラシル類およびシトシン類、７−メチルグアニン、７−メチルアデニン、８−アザグアニン、８−アザアデニン、７−デアザグアニン、７−デアザアデニン、３−デアザグアニン、または３−デアザアデニンである複素環塩基部分を含む、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項１６】
ｎ１が１〜約５である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項１７】
ｎ１が１〜約３である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項１８】
ｎ１が２〜約３である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項１９】
ｎ３が２〜約５である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項２０】
ｎ３が２〜約３である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項２１】
ｎ２が１２〜約１８である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項２２】
ｎ２が１２〜約１６である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項２３】
ｎ２が１４〜約１６である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項２４】
ｎ１、ｎ２およびｎ３の合計が１４〜約３０である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項２５】
ｎ１、ｎ２およびｎ３の合計が１４〜２４である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項２６】
ｎ１、ｎ２およびｎ３の合計が１４〜２１である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項２７】
ｎ１、ｎ２およびｎ３の合計が１６〜２１である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項２８】
ｎ１が１〜約３であり、ｎ２が１２または１３であり、そしてｎ３が２または３である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項２９】
ｎ１が３であり、ｎ２が１２であり、そしてｎ３が３である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項３０】
ｎ１が１〜約３であり、ｎ２が１４または１５であり、そしてｎ３が２または３である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項３１】
ｎ１が２であり、ｎ２が１４であり、そしてｎ３が２である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項３２】
ｎ１が１〜約３であり、ｎ２が１６または１７であり、そしてｎ３が２または３である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項３３】
ｎ１が２であり、ｎ２が１６であり、そしてｎ３が２である、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項３４】
少なくとも１つのＮｕ１ヌクレオシドおよび少なくとも１つのＮｕ３ヌクレオシドがＬＮＡまたはＥＮＡである、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項３５】
最も５’末端または最も３’末端の親和性修飾ヌクレオシドの少なくとも一方がＬＮＡまたはＥＮＡである、請求項１のオリゴマー化合物。
【請求項３６】
遺伝子発現を阻害する方法であって、１以上の細胞、組織、または動物と、請求項１のオリゴマー化合物を接触させることを含む、前記方法。
【請求項３７】
構造：
【化１】
式中：
各Ｂｘは複素環塩基部分であり；
各Ｘは、独立に、ＯまたはＳであり；
Ｔ１およびＴ２は、各々、独立に、Ｈ、ヒドロキシ保護基、場合によって連結されるコンジュゲート基、または固体支持体への共有結合であり；
各ｍは、独立に、１または２であり；
ｎａは１〜約６であり；
ｎｂは１１〜約１８であり；そして
ｎｃは２〜約６である
を含むオリゴマー化合物。
【請求項３８】
各ｍが１である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項３９】
各ｍが２である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項４０】
Ｔ１およびＴ２の少なくとも一方が、Ｈまたはヒドロキシル保護基である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項４１】
ヒドロキシル保護基の各々が、独立に、４，４’−ジメトキシトリチル、モノメトキシトリチル、９−フェニルキサンテン−９−イル、９−（ｐ−メトキシフェニル）キサンテン−９−イル、ｔ−ブチル、ｔ−ブトキシメチル、メトキシメチル、テトラヒドロピラニル、１−エトキシエチル、１−（２−クロロエトキシ）エチル、２−トリメチルシリルエチル、ｐ−クロロフェニル、２，４−ジニトロフェニル、ベンジル、２，６−ジクロロベンジル、ジフェニルメチル、ｐ，ｐ−ジニトロベンズヒドリル、ｐ−ニトロベンジル、トリフェニルメチル、トリメチルシリル、トリエチルシリル、ｔ−ブチルジメチルシリル、ｔ−ブチルジフェニルシリル、トリフェニルシリル、ベンゾイルホルメート、アセチル、クロロアセチル、トリクロロアセチル、トリフルオロアセチル、ピバロイル、ベンゾイル、ｐ−フェニルベンゾイル、メシル、トシル、４，４’，４”−トリス−（ベンジルオキシ）トリチル、４，４’，４”−トリス−（４，５−ジクロロフタルイミド）トリチル、４，４’，４”−トリス（レブリニルオキシ）トリチル、３−（イミダゾリルメチル）−４，４’−ジメトキシトリチル、４−デシルオキシトリチル、４−ヘキサデシルオキシトリチル、９−（４−オクタデシルオキシフェニル）キサンテン−９−イル、１，１−ビス−（４−メトキシフェニル）−１’−ピレニルメチル、ｐ−フェニルアゾフェニルオキシカルボニル、９−フルオレニル−メトキシカルボニル、２，４−ジニトロフェニルエトキシカルボニル、４−（メチルチオメトキシ）ブチリル、２−（メチルチオメトキシメチル）−ベンゾイル、２−（イソプロピルチオメトキシメチル）ベンゾイル、２−（２，４−ジニトロベンゼンスルフェニルオキシメチル）ベンゾイル、またはレブリニル基である、請求項４０のオリゴマー化合物。
【請求項４２】
Ｔ１およびＴ２の一方が、支持体への共有結合である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項４３】
支持体が、調節孔ガラス、オキサリル調節孔ガラス、シリカ含有粒子、ポリスチレンのポリマー、ポリスチレンのコポリマー、スチレンおよびジビニルベンゼンのコポリマー、ジメチルアクリルアミドおよびＮ，Ｎ’−ビスアクリロイルエチレンジアミンのコポリマー、可溶性支持体、またはＰＥＰＳである、請求項４２のオリゴマー化合物。
【請求項４４】
各Ｌ１、Ｌ２およびＬ３が、独立に、ホスホジエステルまたはホスホロチオエート・ヌクレオシド間連結基である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項４５】
各Ｌ１、Ｌ２およびＬ３が、ホスホジエステル・ヌクレオシド間連結基である、請求項４４のオリゴマー化合物。
【請求項４６】
各Ｂｘが、独立に、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、ウラシル、５−メチルシトシン、５−ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、２−アミノアデニン、アデニンおよびグアニンのアルキル誘導体、２−チオウラシル、２−チオチミン、２−チオシトシン、５−ハロウラシル、５−ハロシトシン、５−プロピニルウラシル、５−プロピニルシトシン、６−アゾウラシル、６−アゾシトシン、６−アゾチミン、５−ウラシル（シュードウラシル）、４−チオウラシル、８−置換アデニン類およびグアニン類、５−置換ウラシル類およびシトシン類、７−メチルグアニン、７−メチルアデニン、８−アザグアニン、８−アザアデニン、７−デアザグアニン、７−デアザアデニン、３−デアザグアニン、または３−デアザアデニンである、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項４７】
ｎａが１〜約５である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項４８】
ｎａが１〜約３である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項４９】
ｎａが２〜約３である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項５０】
ｎｃが２〜約５である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項５１】
ｎｃが２〜約３である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項５２】
ｎｂが１２〜約１８である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項５３】
ｎｂが１２〜約１６である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項５４】
ｎｂが１４〜約１６である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項５５】
ｎａ、ｎｂおよびｎｃの合計が１４〜約３０である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項５６】
ｎａ、ｎｂおよびｎｃの合計が１４〜２４である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項５７】
ｎａ、ｎｂおよびｎｃの合計が１４〜２１である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項５８】
ｎａ、ｎｂおよびｎｃの合計が１６〜２１である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項５９】
ｎａが１〜約３であり、ｎｂが１２または１３であり、そしてｎｃが２または３である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項６０】
ｎａが３であり、ｎｂが１２であり、そしてｎｃが３である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項６１】
ｎａが１〜約３であり、ｎｂが１４または１５であり、そしてｎｃが２または３である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項６２】
ｎａが２であり、ｎｂが１４であり、そしてｎｃが２である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項６３】
ｎａが１〜約３であり、ｎｂが１６または１７であり、そしてｎｃが２または３である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項６４】
ｎａが２であり、ｎｂが１６であり、そしてｎｃが２である、請求項３７のオリゴマー化合物。
【請求項６５】
遺伝子発現を阻害する方法であって、１以上の細胞、組織、または動物と、請求項３７のオリゴマー化合物を接触させることを含む、前記方法。
【公表番号】特表２００７−５０５１３８（Ｐ２００７−５０５１３８Ａ）
【公表日】平成１９年３月８日（２００７．３．８）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００６−５２６３３０（Ｐ２００６−５２６３３０）
【出願日】平成１６年９月９日（２００４．９．９）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００４／０２９６５０
【国際公開番号】ＷＯ２００５／０２３８２５
【国際公開日】平成１７年３月１７日（２００５．３．１７）
【出願人】（５９５１０４３２３）アイシス・ファーマシューティカルス・インコーポレーテッド (53)
【氏名又は名称原語表記】Ｉｓｉｓ ＰｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓＩｎｃ
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成１９年３月８日（２００７．３．８）
【国際特許分類】
【出願日】平成１６年９月９日（２００４．９．９）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００４／０２９６５０
【国際公開番号】ＷＯ２００５／０２３８２５
【国際公開日】平成１７年３月１７日（２００５．３．１７）
【出願人】（５９５１０４３２３）アイシス・ファーマシューティカルス・インコーポレーテッド (53)
【氏名又は名称原語表記】Ｉｓｉｓ ＰｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓＩｎｃ
【Ｆターム（参考）】
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