【課題】膀胱癌、乳癌、結腸癌、腎臓癌、肺癌、卵巣癌および膵臓癌についての診断的、予後的、予防的および／または治療的な標的の提供。
【解決手段】新規遺伝子０１９３Ｐ１Ｅ１Ｂ（１９３Ｐ１Ｅ１Ｂとも称される）およびそのコードタンパク質、ならびにその改変体。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号３のアミノ酸配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む単離ないし精製１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質。
【請求項２】
配列番号３のアミノ酸配列を含む、請求項１に記載の単離ないし精製タンパク質。
【請求項３】
生理学的に受容可能なキャリアをさらに含む、請求項１又は２に記載の単離ないし精製タンパク質。
【請求項４】
請求項１又は２に記載の単離ないし精製タンパク質に特異的に結合する、単離ないし精製抗体又はそのフラグメント。
【請求項５】
前記抗体は、モノクローナル抗体である、請求項４に記載の抗体またはそのフラグメント。
【請求項６】
前記抗体又はそのフラグメントは、検出可能なマーカーで標識されている、請求項４又は５に記載の抗体またはそのフラグメント。
【請求項７】
前記抗体又はそのフラグメントは、ヒト抗体、ヒト化抗体またはキメラ抗体である、請求項４に記載の抗体またはそのフラグメント。
【請求項８】
請求項４に記載の抗体を産生する非ヒトトランスジェニック動物。
【請求項９】
請求項５に記載の抗体を産生するハイブリドーマ。
【請求項１０】
１又は２以上のモチーフ保有サブ配列を含み、該モチーフは表ＸＩＸ又はＸＸのモチーフを含む、請求項１に記載の単離又は組換えタンパク質。
【請求項１１】
請求項５に記載のモノクローナル抗体をコードするポリヌクレオチドを含むベクター。
【請求項１２】
１９３Ｐ１Ｅ１Ｂを発現する細胞に剤を送達する方法における使用のために細胞傷害剤又は治療剤に結合される、請求項４に記載の抗体又はそのフラグメント。
【請求項１３】
請求項１又は２に記載の１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
【請求項１４】
前記単離又は組換え１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質の免疫反応性エピトープを含む組成物であって、該エピトープはＣＴＬポリペプチドエピトープを含む、但し、該エピトープは該１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質のアミノ酸配列全体ではない、組成物。
【請求項１５】
前記ＣＴＬポリペプチドは、表Ｖ〜ＸＶＩＩＩ、ＸＸＶＩ、又はＸＸＶＩＩから選択されるポリペプチドを含む、請求項１４に記載の組成物。
【請求項１６】
請求項１４に記載のＣＴＬエピトープをコードするポリヌクレオチド。
【請求項１７】
請求項１３に記載のポリヌクレオチドに相補的であるポリヌクレオチドを含む組成物。
【請求項１８】
請求項１３に記載のポリヌクレオチドに相補的であるポリヌクレオチドを含む組成物。
【請求項１９】
当該抗体又はそのフラグメントの何れかが配列番号３のアミノ酸配列を含む１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質又はその変異体に特異的に結合する抗体又はそのフラグメントであって、該１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質を発現する癌細胞の増殖を阻害する方法において使用するための抗体又はそのフラグメント。
【請求項２０】
前記抗体又はそのフラグメントはベクターによってコードされる、請求項１９に記載の抗体又はそのフラグメント。
【請求項２１】
１９３Ｐ１Ｅ１Ｂを発現する癌細胞の増殖を阻害する方法において使用するための請求項１に記載の１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質。
【請求項２２】
１９３Ｐ１Ｅ１Ｂを発現する細胞の増殖を阻害する方法において使用するための請求項１３に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
【請求項２３】
１９３Ｐ１Ｅ１Ｂを発現する癌細胞の増殖を阻害する方法において使用するための請求項１３に記載のポリヌクレオチドに相補的なアンチセンスポリヌクレオチド。
【請求項２４】
１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質に向けられた哺乳動物免疫応答を生じる方法において使用するための、配列番号３のアミノ酸配列を含む１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質又はその変異体をコードするヌクレオチド。
【請求項２５】
前記配列番号３のアミノ酸配列を含む１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質は、少なくとも１つのＴ細胞エピトープ又は少なくとも１つのＢ細胞エピトープを含み、それによって、該Ｔ細胞及びＢ細胞が活性化される、請求項２４に記載のヌクレオチド。
【請求項２６】
前記免疫応答は、前記１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質に特異的に結合する抗体を生成する活性化Ｂ細胞を含む、請求項２４に記載のヌクレオチド。
【請求項２７】
前記免疫応答は、細胞傷害性Ｔ細胞（ＣＴＬ）の活性化を含み、それによって、該活性化ＣＴＬが前記１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質を発現する自己細胞を殺傷する、請求項２４に記載のヌクレオチド。
【請求項２８】
前記免疫応答は、ヘルパーＴ細胞（ＨＴＬ）の活性化を含み、それによって、該活性化ＨＴＬが、細胞傷害性Ｔ細胞の細胞傷害活性又はＢ細胞の抗体産生活性を促進するサイトカインを分泌する、請求項２４に記載のヌクレオチド。
【請求項２９】
１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質に向けられた哺乳動物免疫応答を生じる方法において使用するための、配列番号３のアミノ酸配列を含む１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質又はその変異体。
【請求項３０】
前記配列番号３のアミノ酸配列を含む１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質又はその変異体は、少なくとも１つのＴ細胞エピトープ又は少なくとも１つのＢ細胞エピトープを含み、それによって、該Ｔ細胞及びＢ細胞が活性化される、請求項２９に記載のタンパク質。
【請求項３１】
前記免疫応答は、前記１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質に特異的に結合する抗体を生成する活性化Ｂ細胞を含む、請求項２９に記載のタンパク質。
【請求項３２】
前記免疫応答は、細胞傷害性Ｔ細胞（ＣＴＬ）の活性化を含み、それによって、該活性化ＣＴＬが前記１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質を発現する自己細胞を殺傷する、請求項２９に記載のヌクレオチド。
【請求項３３】
前記免疫応答は、ヘルパーＴ細胞（ＨＴＬ）の活性化を含み、それによって、該活性化ＨＴＬが、細胞傷害性Ｔ細胞の細胞傷害活性又はＢ細胞の抗体産生活性を促進するサイトカインを分泌する、請求項２９に記載のタンパク質。
【請求項３４】
癌を有しているかまたは癌を有する疑いのある患者由来の生物学的サンプル中の１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質の存在を検出するための方法であって、該方法は：
前記サンプルを、配列番号３のアミノ酸配列を含むタンパク質又はその変異体に特異的に結合する抗体又はそのフラグメントと接触させる工程；および
前記抗体又はそのフラグメントと前記１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質を含む複合体の形成及び／又は存在を検出する工程、
を含む方法。
【請求項３５】
生物学的サンプル中の１９３Ｐ１Ｅ１Ｂポリヌクレオチドの存在を検出するための方法であって、該方法は：
前記サンプルを、配列番号１の核酸配列を含むポリヌクレオチド全体と少なくとも９０％同一であるポリヌクレオチドに高緊縮条件下で特異的にハイブリダイズするポリヌクレオチドプローブと接触させる工程；および
前記サンプル中において、前記プローブと前記１９３Ｐ１Ｅ１Ｂポリヌクレオチドとのハイブリダイゼーションにより形成されるハイブリダイゼーション複合体の存在を検出する、ここに、ハイブリダイゼーション複合体の存在は該サンプル中における１９３Ｐ１Ｅ１Ｂポリヌクレオチドの存在を示す、工程、
を含む方法。
【請求項３６】
正常サンプルに対する癌を有しているかまたは癌を有する疑いのある患者由来の生物学的サンプル中の１９３Ｐ１Ｅ１Ｂ遺伝子産物の発現レベル（発現量）をモニタリングするための方法であって、該方法は：
癌を有しているかまたは癌を有する疑いのある患者由来の生物学的サンプル中の細胞によって発現される１９３Ｐ１Ｅ１Ｂ遺伝子産物のレベルを決定する工程；
正常サンプル中の細胞によって発現される１９３Ｐ１Ｅ１Ｂ遺伝子産物のレベルを決定する工程；
前記生物学的サンプルにおいて決定された１９３Ｐ１Ｅ１Ｂ遺伝子産物の前記レベルを、前記対応する正常サンプルにおいて決定された１９３Ｐ１Ｅ１Ｂ遺伝子産物の前記レベルと比較する、ここに、前記１９３Ｐ１Ｅ１Ｂ遺伝子産物は１９３Ｐ１Ｅ１Ｂ ｍＲＮＡ又は配列番号３のアミノ酸配列と少なくとも９０％同一である１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質を含む、工程、
を含む方法。
【請求項３７】
前記正常サンプルに対する前記生物学的サンプル中における上昇した１９３Ｐ１Ｅ１Ｂ ｍＲＮＡレベル又は上昇した１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質レベルを含む上昇した遺伝子産物の存在は、該生物学的サンプル中の癌の存在を示す、請求項３６に記載の方法。
【請求項３８】
前記癌は、膀胱、乳房、結腸、腎臓、肺、卵巣、膵臓、前立腺及び精巣から選択される組織中で生じる、請求項３６に記載の方法。
【請求項３９】
配列番号５のアミノ酸配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１に記載の変異体。
【請求項４０】
配列番号７のアミノ酸配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１に記載の変異体。
【請求項４１】
配列番号９のアミノ酸配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１に記載の変異体。
【請求項４２】
配列番号１１のアミノ酸配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１に記載の変異体。
【請求項４３】
配列番号１３のアミノ酸配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１に記載の変異体。
【請求項４４】
配列番号３のアミノ酸配列全体と少なくとも９０％相同である単離又は組換えタンパク質を含む１９３Ｐ１Ｅ１Ｂタンパク質。

【図１】

【図２Ａ−１】

【図２Ａ−２】

【図２Ｂ−１】

【図２Ｂ−２】

【図２Ｂ−３】

【図２Ｃ−１】

【図２Ｃ−２】

【図２Ｃ−３】

【図２Ｄ−１】

【図２Ｄ−２】

【図２Ｅ−１】

【図２Ｅ−２】

【図２Ｆ−１】

【図２Ｆ−２】

【図２Ｆ−３】

【図２Ｇ−１】

【図２Ｇ−２】

【図２Ｇ−３】

【図２Ｈ−１】

【図２Ｈ−２】

【図２Ｉ−１】

【図２Ｉ−２】

【図２Ｊ−１】

【図２Ｊ−２】

【図２Ｊ−３】

【図２Ｋ−１】

【図２Ｋ−２】

【図２Ｌ−１】

【図２Ｌ−２】

【図２Ｍ−１】

【図２Ｍ−２】

【図２Ｍ−３】

【図３Ａ】

【図３Ｂ】

【図３Ｃ】

【図３Ｄ】

【図３Ｅ】

【図３Ｆ】

【図３Ｇ】

【図３Ｈ】

【図４−１】

【図４−２】

【図４−３】

【図４−４】

【図５】

【図６】

【図７】

【図８】

【図９】

【図１０−１】

【図１０−２】

【図１１】

【図１２】

【図１３】

【図１４Ａ】

【図１４Ｂ】

【図１４Ｃ】

【図１５】

【図１６】

【図１７】

【図１８】

【図１９】

【図２０】

【図２１】

【図２２】

【公開番号】特開２０１０−１１０３２５（Ｐ２０１０−１１０３２５Ａ）
【公開日】平成２２年５月２０日（２０１０．５．２０）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００９−２７７０２０（Ｐ２００９−２７７０２０）
【出願日】平成２１年１２月４日（２００９．１２．４）
【分割の表示】特願２００３−５５１２７７（Ｐ２００３−５５１２７７）の分割
【原出願日】平成１４年１２月６日（２００２．１２．６）
【出願人】（５００５５３６５９）アジェンシス，インコーポレイテッド (35)
【Ｆターム（参考）】