細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤での処置のためのバイオマーカーとしてのｐ５３野生型
提供されるのは、癌のような増殖性疾患の治療剤、特に細胞毒性因子、特にＤＮＡの完全性を損なうかもしくは完全性に影響する細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤の感受性の測定のためのバイオマーカーである。
【発明の詳細な説明】
【発明の詳細な説明】
【０００１】
本発明は、癌のような増殖性疾患の治療剤、特に細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤に対する感受性を測定するためのバイオマーカーに関する。
【０００２】
多くのｍＴＯＲ阻害剤は強力な抗増殖性特性を有し、それにより、それらは特に固形腫瘍、とりわけ進行した固形腫瘍の、癌化学療法として有用である。ｍＴＯＲ阻害剤はまた、例えばＷＯ０２／６６０１９に記載の通り、処置の効果をさらに改善するために、または副作用を軽減するために、ある種の細胞毒性因子と組み合わせて使用されている。しかしながらｍＴＯＲ阻害剤を基礎とする組み合わせ治療のより標的化した使用の必要性がまだ存在し、それは、このような組み合わせ剤での処置に応答しそうである患者の同定を必要とする。従って、患者における良性または悪性増殖性疾患、例えば腫瘍の、細胞毒性因子と併用したｍＴＯＲ阻害剤に対する応答の予測ができる、例えば臨床試験において有用なバイオマーカーの必要性がある。
【０００３】
本発明により、驚くべきことに、野生型ｐ５３腫瘍抑制遺伝子(他の態様で、Ｐ５３遺伝子としても既知)の存在が、ｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子の組み合わせでの処置に対する増殖性疾患の感受性を予測する、バイオマーカーとして有用であることが判明した。特に、ヒト癌細胞系における野生型ｐ５３遺伝子の存在が、ＤＮＡの完全性を損なうかもしくは完全性に影響する細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤での処置に由来する細胞死滅／プログラム細胞死／アポトーシスの増加とよく相関することが判明した。故に、細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤は、野生型ｐ５３を保持する癌細胞の処置に使用したとき、おそらく、より著しい抗増殖性／殺細胞効果を示す。ｐ５３タンパク質(ＴＰ５３遺伝子によりコード)は、哺乳動物における細胞サイクル停止、老化、分化およびプログラム細胞死／アポトーシスの制御において主要な役割を有する、腫瘍抑制因子である。特に、ｐ５３経路は、ストレス(例えばＤＮＡ損傷、発癌性ストレス、低酸素、生存シグナルの欠損)に曝された哺乳類細胞における細胞サイクル停止および／またはアポトーシスを誘発する。ＴＰ５３における変異はヒト癌のほぼ半分で起こり、ｐ５３応答を誘発する能力が、多くの癌細胞で損なわれている(Vousden and Lu, Nature Reviews, 2002,2: 594-604)。ヒトｐ５３の配列(ｍＲＮＡ[コード配列；１１８２ヌクレオチド]およびタンパク質[３９３アミノ酸])は、GenBank accession numbers NM 000546またはP04637の下に入手可能である。ヒトＴＰ５３遺伝子の完全配列は、GenBank accession number U94788の下に入手可能である。
【０００４】
従って、本発明は、異常増殖の傾向がある細胞における野生型ｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子の存在の決定に基づく。
【０００５】
本発明は、一つの局面において、細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤での処置に対する増殖性疾患の感受性を測定するためのバイオマーカーとしての野生型ｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子の存在(その存在は、ｐ５３[ＴＰ５３]遺伝子の不在、欠損もしくは欠失または変異ｐ５３[ＴＰ５３]遺伝子の存在と対立する)の利用を提供する。
【０００６】
ここで、野生型ｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子は、イントロンおよびエクソンだけでなく、イントロンおよびエクソン、特に５’から最も５’−のエクソンに関連した、および、物理的に近い制御領域をも意味する。それは、例えば天然遺伝子の全長ＤＮＡ配列と、それが野生型ｐ５３タンパク質またはその機能的等価物、例えばその細胞アポトーシス誘発特性を保持した機能的ｐ５３タンパク質を発現する限り、所望によりヌクレオチド置換(逆位を含む)、コドンの挿入および欠失を含む。逆に言えば、ｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子の不在、欠損、欠失または変異は、ｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子発現の喪失または、例えばもはや細胞アポトーシス誘発特性を保持しない変異ｐ５３タンパク質の発現をもたらす変異遺伝子の発現をもたらす、遺伝的および後成的変化、例えば増幅、メチル化、多型、ヌクレオチド変異、欠失、逆位または転座およびヘテロ接合性欠失(ＬＯＨ)を意味する。
【０００７】
さらなる局面において、本発明は、対象における増殖性疾患の細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤での処置に対する感受性を測定する方法であって、該対象由来のサンプルにおけるｐ５３(ＴＰ５３)状態(野生型対変異体もしくは欠損／不在)を測定する方法を提供する。
【０００８】
他の局面において、本発明は、増殖性疾患を有する対象を細胞毒性因子と併用したｍＴＯＲ阻害剤での処置のために選択する方法であって、上記方法により各対象における増殖性疾患の組み合わせ処置に対する感受性を測定し、そして、野生型ｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子を保持する対象を該組み合わせ処置のために選択することを含む方法。
【０００９】
本明細書で使用する“ｍＴＯＲ阻害剤”なる用語は、ラパマイシン(シロリムス)またはその誘導体を含むが、これに限定されない。ラパマイシンは、ストレプトマイセス・ヒグロスコピカスにより産生されるマクロライド系抗生物質である。ラパマイシンの適当な誘導体は、例えば式Ａ
【化１】
〔式中、
Ｒ１ａａはＣＨ３またはＣ３−６アルキニルであり、
Ｒ２ａａはＨまたは−ＣＨ２−ＣＨ２−ＯＨ、３−ヒドロキシ−２−(ヒドロキシメチル)−２−メチル−プロパノイルまたはテトラゾリルであり、そして
Ｘａａは＝Ｏ、(Ｈ,Ｈ)または(Ｈ,ＯＨ)である。
ただし、Ｘａａが＝Ｏであり、そしてＲ１ａａがＣＨ３であるとき、Ｒ２ａａはＨ以外である。〕
の化合物、またはＲ２ａａが−ＣＨ２−ＣＨ２−ＯＨであるとき、そのプロドラッグ、例えばその生理学的に加水分解可能なエーテルを含む。
【００１０】
式Ａの化合物は、例えばＷＯ９４／０９０１０、ＷＯ９５／１６６９１、ＷＯ９６／４１８０７、ＵＳＰ５,３６２,７１８またはＷＯ９９／１５５３０に記載され、これらは引用により本明細書に包含する。それらは、これらの引用文献に記載の通りにまたは記載の方法に準じて製造できる。
【００１１】
式Ｉの代表的ラパマイシン誘導体は、例えば３２−デオキソラパマイシン、１６−ペント−２−イニルオキシ−３２−デオキソラパマイシン、１６−ペント−２−イニルオキシ−３２(ＳまたはＲ)−ジヒドロ−ラパマイシン、１６−ペント−２−イニルオキシ−３２(ＳまたはＲ)−ジヒドロ−４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)−ラパマイシン、４０−[３−ヒドロキシ−２−(ヒドロキシメチル)−２−メチルプロパノエート]−ラパマイシン(別名ＣＣＩ７７９)または４０−エピ−(テトラゾリル)−ラパマイシン(別名ＡＢＴ５７８)である。好ましい化合物は、例えばＷＯ９４／０９０１０の実施例８に記載の通りの４０−０−(２−ヒドロキシエチル)−ラパマイシン、またはＷＯ９６／４１８０７に記載の通りの３２−デオキソラパマイシンもしくは１６−ペント−２−イニルオキシ−３２(Ｓ)−ジヒドロ−ラパマイシンである。ラパマイシン誘導体はまた、例えばＷＯ９８／０２４４１およびＷＯ０１／１４３８７に記載の通りの、いわゆるラパログ、例えばＡＰ２３５７３、ＡＰ２３４６４、ＡＰ２３６７５またはＡＰ２３８４１も含み得る。ラパマイシン誘導体のさらなる例は、ＴＡＦＡ−９３(ラパマイシンプロドラッグ)、バイオリムス−７またはバイオリムス−９の名前の下に記載されているものである。
【００１２】
特許出願または科学文献の引用が記載されている各場合、化合物に関する課題を、本明細書に引用により包含する。包含されるのは同様に、それらの中に開示されている、その薬学的に許容される塩、対応するラセミ体、ジアステレオ異性体、エナンチオマー、互変異性体ならびに、存在するとき、上記の化合物の結晶修飾体、例えば溶媒和物、水和物および多形である。本発明の組み合わせ剤において活性成分として使用する化合物は、各々引用文献に記載の通り製造および投与できる。
【００１３】
本明細書で使用する“細胞毒性因子”なる用語は、細胞構造および機能にとって危険である因子、例えばＤＮＡの完全性を損なうかもしくは完全性に影響し、最終的に細胞死の原因となり得る因子、例えば抗新生物剤、例えば微小管活性化剤またはとりわけＤＮＡを損傷させる薬剤、例えば抗新生物代謝拮抗剤、白金化合物、アルキル化剤またはトポイソメラーゼＩもしくはII阻害剤である。“細胞毒性因子”なる用語はまたＤＮＡ損傷をもたらす放射線照射治療、例えば電離放射線、例えば放射活性ヨウ素も含む。このような放射線照射治療はまた細胞毒性因子治療と組み合わせ得る。“細胞毒性因子”なる用語はまた、１個、２個またはそれ以上の細胞毒性因子も含み、それは“カクテル”療法の形で投与され得る。
【００１４】
本明細書で使用する“トポイソメラーゼＩ阻害剤”は、トポテカン、イリノテカン、ギマテカン(gimatecan)、９−ニトロカンプトテシンおよび巨大分子カンプトテシン結合ＰＮＵ−１６６１４８(ＷＯ９９／１７８０４における化合物Ａ１)を含むが、これらに限定されない。イリノテカンは、例えば、商品名CAMPTOSARＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。トポテカンは、例えば、商品名HYCAMTINＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。
【００１５】
本明細書で使用する“トポイソメラーゼII阻害剤”なる用語は、ドキソルビシン(リポソーム製剤、例えばCAELYXＴＭを含む)、ダウノルビシン、エピルビシン、イダルビシンおよびネモルビシン(nemorubicin)のようなアントラサイクリン類、アントラキノン類ミトキサントロンおよびロソキサントロン、およびポドフィロトキシン類エトポシドおよびテニポシドを含むが、これらに限定されない。エトポシドは、例えば、商品名ETOPOPHOSＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。テニポシドは、例えば、商品名VM 26-BRISTOLTMの下、例えば、市販の形で投与できる。ドキソルビシンは、例えば、商品名ADRIBLASTINＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。エピルビシンは、例えば、商品名FARMORUBICINＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。イダルビシンは、例えば、商品名ZAVEDOSＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。ミトキサントロンは、例えば、商品名NOVANTRONＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。
【００１６】
“微小管活性化剤”なる用語は、タキサン類、例えばパクリタキセルおよびドセタキセル、ビンカアルカロイド、例えば、ビンブラスチン、とりわけビンブラスチンスルフェート、ビンクリスチン、とりわけビンクリスチンスルフェート、およびビノレルビン、ディスコデルモライドならびにエポチロンおよびその誘導体、例えばエポチロンＢもしくはその誘導体を含む、微小管安定化および微小管脱安定化剤を含むが、これらに限定されない。パクリタキセルは、例えばその市販の形、例えばTAXOLＴＭで投与し得る。ドセタキセルは、例えば、商品名TAXOTEREＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。ビンブラスチンスルフェートは、例えば、商品名VINBLASTIN R.P.TMの下、例えば、市販の形で投与できる。ビンクリスチンスルフェートは、例えば、商品名FARMISTINＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。ディスコデルモライドは、例えば、ＵＳ５,０１０,０９９に記載の通りに得ることができる。
【００１７】
本明細書で使用する“アルキル化剤”は、シクロホスファミド、イフォスファミド、メルファランまたはニトロソウレア(BCNUまたはGliadelＴＭ)を含むが、これらに限定されない。シクロホスファミドは、例えば、商品名CYCLOSTINＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。イフォスファミドは、例えば、商品名HOLOXANＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。
【００１８】
“抗新生物代謝拮抗剤”なる用語は、５−フルオロウラシル、テガフール、カペシタビン、クラドリビン、シタリビン(cytaribine)、フルダラビンホスフェート、フルオロウリジン、ゲムシタビン、６−メルカプトプリン、ヒドロキシウレア、メトトレキサート、エダトレキサートおよびこのような化合物の塩、およびさらにＺＤ１６９４(RALTITREXEDＴＭ)、ＬＹ２３１５１４(ALIMTAＴＭ)、ＬＹ２６４６１８(LOMOTREXOLＴＭ)およびＯＧＴ７１９を含むが、これらに限定されない。カペシタビンは、例えば、商品名XELODAＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。ゲムシタビンは、例えば、商品名GEMZARＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。
【００１９】
本明細書で使用する“白金化合物”は、カルボプラチン、シスプラチンおよびオキサリプラチンを含むが、これらに限定されない。カルボプラチンは、例えば、商品名CARBOPLATＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。オキサリプラチンは、例えば、商品名ELOXATINＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。
【００２０】
増殖性疾患は、良性または悪性増殖性疾患、例えば良性前立腺肥大、または新生物疾患、好ましくは悪性増殖性疾患、例えば癌、例えば腫瘍および／または転移巣(どこに位置していても)、例えば脳および他の中枢神経系腫瘍(例えば髄膜、脳、脊髄、脳神経および中枢神経系の他の部分の腫瘍、例えば膠芽細胞腫または髄質芽腫(medulla blastoma))；頭頚部癌；乳房腫瘍；循環器系腫瘍(例えば心臓、縦隔および胸膜、および他の胸腔内臓器、血管腫瘍および血管組織関連腫瘍)；排泄系腫瘍(例えば腎臓、腎盂、尿管、膀胱、他のおよび非特異的泌尿器)；胃腸管腫瘍(例えば食道、胃、小腸、結腸、結腸直腸、直腸Ｓ状部、直腸、肛門および肛門管)、肝臓および肝内胆管、胆嚢、胆管の他のおよび非特異的部位、膵臓、その他および消化器が関与する腫瘍；頭頚部；口腔(唇、舌、歯肉、口腔底、口蓋、および口の他の部位、耳下腺、および唾液腺の他の部位、扁桃、中咽頭、上咽頭、梨状陥凹、下咽頭、ならびに唇、口腔および咽頭における他の部位)；生殖器系腫瘍(例えば陰門、膣、子宮頸部、子宮体、子宮、卵巣、および女性生殖器に関連する他の部位、胎盤、陰茎、前立腺、精巣、および男性生殖器に関連する他の部位)；呼吸器腫瘍(例えば鼻腔および中耳、副洞、喉頭、気管、気管支および肺、例えば小細胞肺癌または非小細胞性肺癌)；骨格系腫瘍(例えば骨および肢の関節軟骨、骨関節軟骨および他の部位)；皮膚腫瘍(例えば皮膚の悪性黒色腫、非黒色腫皮膚癌、皮膚の基底細胞癌腫、皮膚の扁平上皮細胞癌腫、中皮腫、カポジ肉腫)；および末梢神経および自律神経系、結合および軟部組織、後腹膜および腹膜、眼および付属器、甲状腺、副腎および他の内分泌腺および関連構造を含む他の組織が関連する腫瘍、リンパ節の続発性および不特定悪性新生物、呼吸および消化系の続発性悪性新生物ならびに他の部位の続発性悪性新生物、血液およびリンパ系の腫瘍(例えばホジキン病、非ホジキンリンパ腫、バーキットリンパ腫、ＡＩＤＳ関連リンパ腫、悪性免疫増殖性疾患、多発性骨髄腫および悪性血漿細胞新生物、リンパ性白血病、急性または慢性骨髄性白血病、急性または慢性リンパ球性白血病、単球性白血病、特定細胞系の他の白血病、非特定細胞系の白血病、リンパの他のおよび不特定悪性新生物、造血性および関連組織、例えばびまん性大細胞リンパ腫、Ｔ細胞リンパ腫または皮膚Ｔ細胞リンパ腫)を含む。骨髄性癌は、例えば急性または慢性骨髄性白血病を含む。
【００２１】
前記および後記で腫瘍、腫瘍疾患、癌腫または癌が記載されているとき、また原発臓器もしくは組織におけるおよび／または全ての他の位置における転移巣も、腫瘍および／または転移巣の位置にかかわらず、それに代えてまたはそれに加えて意味する。
【００２２】
細胞毒性因子なる用語は、リンパまたは骨髄性癌の場合、例えばブスルファン、シタラビン、６−チオグアニン、フルダラビン、ヒドロキシウレア、プロカルバジン、ブレオマイシンまたはメトトレキサートでもあり得る。トポイソメラーゼII阻害剤、例えばダウノルビシンまたはイダルビシンまたは、特に、ＰＤＧＦＲまたはｃ−ＡｂＩファミリーメンバーおよびそれらの遺伝子融合産物の活性を標的とし、減少させ、または阻害する化合物、例えばイマチニブ、ファルネシルトランスフェラーゼ阻害剤、Ａｒａ−Ｃ、ＶＰ−１６、テニポシド、ミトキサントロン、カルボプラチンまたはミドスタウリンが、リンパまたは骨髄性癌の場合の細胞毒性因子として好ましい。
【００２３】
本発明の方法によって、このような増殖性疾患を有する対象を、ｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子の組み合わせ処置に対するそれらの感受性を予測するためにスクリーニングできる。該方法は、インビトロで、例えば該対象由来の生物学的組織サンプルで行い得る。該サンプルは、例えば組織、細胞系、血漿もしくは血清、細胞または細胞融解物、好ましくは腫瘍組織のような、哺乳類身体から単離された、任意の生物学的材料であり得る。
【００２４】
ｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子の状態を、該生物学的サンプルにおいて、例えば遺伝的および後成的変化についてのＤＮＡ分析、例えば増幅、メチル化、多型、ヌクレオチド変異(例えばコドン１７５Ａｒｇ、２４５Ｇｌｙ、２４８Ａｒｇ、２４９Ａｒｇ、２７３Ａｒｇ、２８２Ａｒｇおよびその他の変異)、ヌクレオチド欠失、逆位および／または翻訳およびヘテロ接合性欠失(ＬＯＨ)についてのＤＮＡ走査に基づく何らかの技術的手段によりアッセイする。ｐ５３(ＴＰ５３)状態を、生物学的サンプルにおいて、例えばノーザンブロッティングまたはＲＴ−ＰＣＲの技術を使用した、例えばＲＮＡ発現に基づく、または例えばイムノアッセイ、免疫沈降および電気泳動アッセイを含むウェスタンブロッティング、免疫組織化学またはＥＬＩＳＡの技術を使用した、例えばタンパク質発現／修飾に基づく何らかの技術的手段によりアッセイする。
【００２５】
例えば、ｐ５３タンパク質またはリン酸化(例えばＳｅｒ４６のリン酸化)、ユビキチン化もしくはアセチル化のようなｐ５３翻訳後修飾に特異的な抗体を、標準イムノアッセイ形態に使用して、ｐ５３タンパク質／リン酸化／ユビキチン化／アセチル化レベルを測定する。例えばモノクローナルまたはポリクローナル抗体を使用した、ＥＬＩＳＡ(酵素結合免疫吸着測定法)型アッセイ、免疫沈降型アッセイ、慣用のウェスタンブロッティングアッセイおよび免疫組織化学アッセイもまた、バイオマーカーとしてのｐ５３タンパク質／翻訳後修飾のレベルの測定に利用される。
【００２６】
ｐ５３タンパク質／翻訳後修飾に特異的なポリクローナルおよびモノクローナル抗体は、既知の免疫化法により産生するか、または、商業的に入手可能である(例えばSanta Cruz Biotechnology Inc catalogue #sc6253)。
【００２７】
ｐ５３状態はまた、二次元(２−Ｄ)ゲル電気泳動により測定できる。２−Ｄゲル電気泳動は当分野で既知であり、第一次元に沿った等電点電気泳動(ＩＥＦ)、続く第二次元に沿ったＳＤＳ−ＰＡＧＥ(ドデシル硫酸ナトリウム−ポリアクリルアミドゲル電気泳動)を含む。得られる電気泳動図を、例えば、抗体を使用した免疫ブロット分析により、分析する。
【００２８】
本発明は、故に、上記の方法でｐ５３(ＴＰ５３)状態を測定することを含む、増殖性疾患を有する患者を、それらのｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子の組み合わせ処置に対する感受性を予測するためにスクリーニングする方法を提供する。
【００２９】
さらなる局面において、本発明は、処置を必要とする対象における増殖性疾患の処置法であって、該対象由来のサンプルにおけるｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子の状態またはｐ５３発現および／または翻訳後修飾レベルを上記の方法で測定し、該対象を細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤で処置することを含む、方法を提供する。
【００３０】
別の態様において、本発明は、処置を必要とする対象における細胞毒性因子または、細胞毒性因子の活性を増強するまたは細胞毒性因子に対する耐性を克服する方法であって、該対象由来のサンプルにおけるｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子／発現を上記の方法で測定し、該対象に治療的有効量のｍＴＯＲ阻害剤を、該細胞毒性因子と同時にまたは連続的に投与することを含む、方法を提供する。
【００３１】
対象の特定の組織、例えば腫瘍組織サンプル中のｐ５３(ＴＰ５３)状態を、対照サンプル、例えば該疾患を有しない対照由来の正常組織サンプル、または同じ対照由来の正常(すなわち非腫瘍)組織由来のサンプルと比較すればよい。細胞毒性因子と併用したｍＴＯＲ阻害剤の使用が指示されるｐ５３(ＴＰ５３)野生型状態レベルは、ｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子の組み合わせの優れた治療的効果(すなわち抗増殖性および／また増加した殺細胞効果)の指標である。
【００３２】
さらに、本方法は、各患者に対する個々に最適化された治療のための、細胞毒性因子および／またはｍＴＯＲ阻害剤の適切な投与量の選択の助けとして使用できる。患者におけるｐ５３野生型状態のレベルに依存して、組み合わせの活性成分の低用量を使用できる；例えば、投与量がしばしば少ないだけでなく、少ない頻度で投与でき、または、望ましくない増殖を制御しながら、副作用の発生を減少させるために使用できる。この状況について考慮すべき因子は、処置している特定の状態、処置している特定の哺乳類、個々の患者の臨床状態、活性化合物の送達部位、活性化合物の特定のタイプ、投与法、投与のスケジュール、疾患の重症度ならびに医者に既知の他の因子を含む。
【００３３】
本明細書で使用する“組み合わせ処置”または“と組み合わせた”または“と併用した”などの用語は、選択したｍＴＯＲ阻害剤および細胞毒性因子を単一患者に投与することを含み、該薬剤を必ずしも同じ投与経路でまたは同時に投与するものではない処置レジメンを含むことを意図する。例えば、ｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子を患者に別々の物として同時に、一緒にまたは具体的時間制限なしに連続的に投与してよく、ここで、このような投与は体内で２成分の治療的有効レベルを提供する。
【００３４】
組み合わせの各活性成分の投与すべき治療的有効量は、上記の通りの斟酌により支配され、該疾患を予防、軽減または処置するのに必要な最少量である。このような量は、好ましくは、宿主に対して毒性であるか、または、宿主に感染に対する著しい危険性を与える量より少ない。
【００３５】
ｍＴＯＲ阻害剤の適当な投与量は、例えばＷＯ０２／６６０１９に記載の通りであり、例えば１回量または分割用量として、または、断続的に例えば１週間に１回で、１日あたりｐ.ｏ.で約０.１から３０mg、例えば約０.０５から２０mg活性成分の桁の投与割合である。ラパマイシンまたはその誘導体、例えば式Ａの化合物は、任意の慣用の経路で、特に経腸的に、例えば経口で、例えば錠剤、カプセル、飲溶液の形で、または非経腸的に、例えば、約０.１％から約９９.９％、好ましくは約１％から約６０％の活性成分を含む、例えば注射用溶液または懸濁液の形で投与できる。
【００３６】
トポテカンは、ヒトに約１から５mg／ｍ２日で変化する範囲の投与量で投与し得る。イリノテカンは、ヒトに約５０から３５０mg／ｍ２日で変化する範囲の投与量で投与し得る。
【００３７】
パクリタキセルは、ヒトに約５０から３００mg／ｍ２日で変化する範囲の投与量で投与し得る。ドセタキセルは、ヒトに約２５から１００mg／ｍ２日で変化する範囲の投与量で投与し得る。
【００３８】
シクロホスファミドは、ヒトに約５０から１５００mg／ｍ２日で変化する範囲の投与量で投与し得る。メルファランは、ヒトに約０.５から１０mg／ｍ２日で変化する範囲の投与量で投与し得る。
【００３９】
５−フルオロウラシルは、ヒトに約５０から１０００mg／ｍ２日で変化する範囲の投与量、例えば５００mg／ｍ２日で投与し得る。カペシタビンは、ヒトに約１０から１０００mg／ｍ２日で変化する範囲の投与量で投与し得る。ゲムシタビンヒドロクロライドは、ヒトに約１０００mg／ｍ２／週で変化する範囲の投与量で投与し得る。
【００４０】
カルボプラチンは、ヒトに約４週間毎に約２００から４００mg／ｍ２で変化する範囲の投与量で投与し得る。シスプラチンは、ヒトに約３週間毎に約２５から７５mg／ｍ２で変化する範囲の投与量で投与し得る。オキサリプラチンは、ヒトに２週間毎に約５０から８５mg／ｍ２で変化する範囲の投与量で投与し得る。
【００４１】
イマチニブは、ヒトに約２.５から８５０mg／日、より好ましくは５から６００mg／日および最も好ましくは２０から３００mg／日の範囲の投与量で投与できる。
【００４２】
本発明に記載の方法において使用する好ましい組み合わせは、例えばラパマイシン、４０−[３−ヒドロキシ−２−(ヒドロキシメチル)−２−メチルプロパノエート]−ラパマイシンまたは４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンと、ゲムシタビンまたはシスプラチンのような細胞毒性因子の組み合わせである。本発明の方法において使用すべき別の組み合わせは、例えば上記の通りの、相乗的用量のｍＴＯＲ阻害剤と、細胞毒性因子、例えばゲムシタビンまたはシスプラチンの組み合わせである。
【００４３】
好ましくはＴＰ５３はヒト遺伝子である。
好ましくは本発明の方法は、ｐ５３(ＴＰ５３)野生型状態を提示する腫瘍細胞上で行う。
【００４４】
さらなる態様において、ｐ５３(ＴＰ５３)野生型細胞における、細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤での処置に由来する増加した細胞死滅／プログラム細胞死／アポトーシスは、以後ｐ２１と呼ぶ、ｐ２１Ｗａｆ１／Ｃｉｐ１(ＣＤＫＮ１Ａ、ＷＡＦ１、ＣＩＰ１、ＳＤＩ１、ＣＡＰ２０、ＭＤＡ−６、ｐ２１としての既知)タンパク質発現の細胞毒性誘発上方制御の強い減弱化と相関する。
【００４５】
ｐ２１はサイクリンキナーゼ“阻害剤”のｃｉｐ／ｋｉｐファミリーのメンバーであり、それは、細胞サイクル進行の許可ならびにアポトーシスの予防に役割を有する。本発明の状況において、ｐ２１の、活性化ｐ５３に応答して、ストレスシグナル、例えばＤＮＡ損傷に応答して細胞増殖を阻止する機能は十分確立されている。実際、増加したｐ２１タンパク質発現が、このようなストレスを受けた細胞の生存を可能にする、例えば細胞がＤＮＡ修復過程を完了することを可能にすると仮定されている。故に、細胞毒性物での処置に応答した、増加したｐ２１発現の減弱化は、細胞死滅／プログラム細胞死／アポトーシスを促進し得る(Weiss, Cancer Cell, 2003,4: 425-429)。ヒトｐ２１の配列(ｍＲＮＡ[コード配列：４９５ヌクレオチド]およびタンパク質生成物[１６４アミノ酸])は、GenBank accession number NM 000389、NM 078467またはAAH01935の下に入手可能である。ヒトｐ２１遺伝子の完全配列は、GenBank accession number NM 078467の下に入手可能である。
【００４６】
さらに、癌患者の幾分かは増加した合計またはサイトソル腫瘍ｐ２１発現を有し、これは悪い予後および化学療法に対する乏しい応答と関連している(Weiss, supra)。癌患者における基底のｐ２１発現の評価は、患者を、例えば１個以上の細胞毒性因子および所望により放射線療法と組み合わせたｍＴＯＲ治療に基づく具体的化学療法処置について選択することを可能にし得る。
【００４７】
従って、本発明は、さらに下記を提供する：
ｉ. 対象における細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤での処置に対する増殖性疾患の感受性または応答を測定するためのバイオマーカーとしてのｐ２１の使用；
【００４８】
ii. 増殖性疾患を有する対象を細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤での処置のために選択する方法であって、各対象における増殖性疾患の細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤での処置に対する感受性を測定し、増加した基底ｐ２１発現を示す対象を組み合わせ処置のために選択することを含む、方法；
【００４９】
iii. 対象における増殖性疾患の細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤に対する感受性または応答を測定する方法であって、該対象由来のサンプルにおけるｐ２１発現レベルを細胞毒性因子単独およびｍＴＯＲ阻害剤との組み合わせでの処置の前および／または後に測定することを含む、方法；
【００５０】
iv. 細胞毒性因子で処置している対象における、該細胞毒性因子の活性を増強するまたは細胞毒性因子に対する耐性に打ち勝つ方法であって、
−上記の方法により、該対象由来のサンプルにおけるｐ２１発現レベルを測定し、
− ｐ２１発現が細胞毒性因子投与後に上方制御されているとき、該対象に治療的有効量のｍＴＯＲ阻害剤を細胞毒性因子と組み合わせて投与し、
− ｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子の組み合わせ処置後の該対象由来の新規サンプルにおけるｐ２１発現を再び測定し、そして
− ｐ２１発現が下方制御されているとき、該対象を、細胞毒性因子と同時にまたは連続的に、ｍＴＯＲ阻害剤でさらに処置する
ことを含む、方法。
【００５１】
既に上記の通り、ｐ２１タンパク質レベルはｐ５３について上記の通りに測定できる；しかしながら、ｐ５３に特異的な抗体を使用する代わりに、例えば市販の(例えばOncogene Research products, Clone EA10, catalogue #OP64)、ｐ２１に特異的な抗体、例えばモノクローナルまたはポリクローナル抗体を使用することは理解されるべきである。
【００５２】
対象の特定の組織、例えば腫瘍組織サンプルにおいて見られたレベルを、対照サンプル、例えば該疾患を有しない対照由来の正常組織サンプル、または同じ対照由来の正常(すなわち非腫瘍)組織由来のサンプルと比較し得る。ｐ２１発現の欠損または誘発の減弱化(細胞毒性因子単独で観察される誘発と比較して、細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤の組み合わせで処置したときの)は、細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤の優れた治療的効果(すなわち抗増殖性／殺細胞効果)の指標である。細胞毒性因子によるｐ２１発現誘発のおよび／またはｍＴＯＲ阻害剤によるｐ２１発現レベルに対する逆転効果の評価は、また、例えば、細胞毒性用量を減少させるための、細胞毒性因子の用量の調整にも有用であり得る。
【００５３】
記載の実施例は、本発明を何ら限定することなく、説明する。
【００５４】
実施例１
ｐ５３(ＴＰ５３)野生型ヒト腺癌Ａ５４９(ＣＣＬ−１８５)腫瘍細胞(American Type Culture Collection, Rockville, MD., USA)を、９６ウェルプレートに２×１０３細胞／１００μl／ウェルの密度で播種し、２４時間、３７℃および５％ＣＯ２でインキュベートする。細胞を、最適濃度以下のゲムシタビン(例えば５から１７.５nM)と、２０nM ４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンまたは媒体対照ＤＭＳＯのいずれかとの組み合わせでさらに７２時間インキュベートする。ＹＯ−ＰＲＯ色素(ＹＯ−ＰＲＯＲ−１アイオダイド[４９１／５０９]、cat #Y3603, Molecular Probes)を細胞に添加し、Cytofluor II蛍光プレートリーダーを使用して細胞死または細胞毒性を、そして、細胞溶解後、相対的細胞増殖を測定する。このアッセイにおいて、ｍＴＯＲ阻害剤、例えば４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンは、最適濃度以下のゲムシタビンの殺細胞効果の統計学的有意な増強をもたらす(ｐ＜０.０５；Tukey検定を伴うANOVA)。同様の結果が、ヒト肺腺癌Ａ５４９以外のｐ５３(ＰＴ５３)野生型細胞系、例えばヒトＭＣＦ７乳癌腫細胞(HTB-22; American Type Culture Collection)を使用したときに、得られる。
【００５５】
ｐ５３(ＴＰ５３)変異／欠損腫瘍細胞系、例えばＰＣ３Ｍヒト前立腺癌腫細胞(０.８×１０３細胞／１００μlの密度で播種)またはＭＤＡ−ＭＢ２３１ヒト乳癌腫細胞(２×１０３細胞／１００μlの密度で播種；HTB-26; American Type Culture Collection)を使用する以外、この方法を繰り返す。ｐ５３(ＴＰ５３)変異／欠損細胞系において、著しいまたは一貫した細胞死の増強は見られない。
【００５６】
Ａ５４９細胞を、０.１×１０６細胞／１０ml／１０cmプレートの密度で播種し、２４時間、３７℃および５％ＣＯ２でインキュベートする。細胞を、最適濃度以下のゲムシタビン(例えば５から１２.５nM)と、２０nM ４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンまたは媒体対照ＤＭＳＯのいずれかとの組み合わせでさらに７２時間インキュベートする。５０μg 総タンパク質に対応する細胞抽出物を、８％ＳＤＳ−ＰＡＧＥ電気泳動により分離し、免疫ブロット分析を、ポリ(ＡＤＰ−リボース)ポリメラーゼ(ＰＡＲＰ)に対して惹起させたウサギポリクローナル抗体(Cell Signalling Technology catalogue #9542)を使用して行う。このアッセイにおいて、ｍＴＯＲ阻害剤、例えば４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンの存在は、最適濃度以下のゲムシタビンで、増加したＰＡＲＰ開裂(アポトーシスのマーカー)をもたらす(同じ濃度のゲムシタビンまたはｍＴＯＲ阻害剤単独と比較して)。これは、ｐ５３(ＴＰ５３)野生型Ａ５４９細胞において、ｍＴＯＲ阻害剤の存在が、最適濃度以下のゲムシタビンでの高いレベルの細胞死をもたらすとの上記結果を確認する。
【００５７】
実施例２
ｐ５３(ＴＰ５３)野生型ヒト肺腺癌Ａ５４９細胞を、９６ウェルプレート中５×１０３細胞／１００μl／ウェルの密度で播種し、２４時間、３７℃および５％ＣＯ２でインキュベートする。細胞を、最適濃度以下のシスプラチン(例えば３から１０μg／ml)と、２０ nM ４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンまたは媒体対照ＤＭＳＯのいずれかとの組み合わせでさらに２４時間インキュベートする。ＹＯ−ＰＲＯ(登録商標)アッセイを上記の通り行い、細胞死または細胞毒性を、そして、細胞溶解後、相対的細胞増殖を測定する。このアッセイにおいて、ｍＴＯＲ阻害剤、例えば４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンは、最適濃度以下のシスプラチンの殺細胞効果の統計学的有意な増強をもたらす(ｐ＜０.０５；Tukey検定を伴うANOVA)。二元配置ＡＮＯＶＡを使用した続く分析は、ＲＡＤ００１とシスプラチンの間の相互作用が非常に有意であることを示した(ｐ＜０.００１)。上記と同様の結果が、ヒト肺腺癌Ａ５４９以外のｐ５３(ＰＴ５３)野生型細胞系、例えばヒトＭＣＦ７乳癌腫細胞を使用したときに、得られる。後者の場合、化合物とのインキュベーションは３０時間である。
【００５８】
ｐ５３(ＴＰ５３)変異／欠損腫瘍細胞系、例えばＰＣ３Ｍ(３×１０３細胞／１００μlの密度で播種)またはＤＵ１４５(５×１０３細胞／１００μlの密度で播種：ＨＴＢ−８１；American Type Culture Collection)を使用する以外、この方法を繰り返す。この場合、化合物とのインキュベーションはＤＵ１４５については２２時間またはＰＣ３Ｍについては３０時間である。ｐ５３(ＴＰ５３)変異／欠損細胞系において、著しいまたは一貫した細胞死の増強は見られない。
【００５９】
Ａ５４９細胞を、０.１×１０６細胞／１０ml／１０cmプレートの密度で播種し、２４時間、３７℃および５％ＣＯ２でインキュベートする。細胞を、最適濃度以下のシスプラチン(例えば０.５から４μg／ml)と、２０nM ４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンまたは媒体対照ＤＭＳＯのいずれかとの組み合わせでさらに２４時間インキュベートする。５０μg 総タンパク質に対応する細胞抽出物を、８％ＳＤＳ−ＰＡＧＥ電気泳動により分離し、免疫ブロット分析を、ポリ(ＡＤＰ−リボース)ポリメラーゼ(ＰＡＲＰ)およびｐ５３に対して惹起させたウサギポリクローナル抗体を使用して行う。このアッセイにおいて、ｍＴＯＲ阻害剤、例えば４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンの存在は、最適濃度以下のシスプラチンで、増加したＰＡＲＰ開裂(アポトーシスのマーカー)をもたらす(同じ濃度のシスプラチンまたはｍＴＯＲ阻害剤単独と比較して)。これは、ｐ５３(ＴＰ５３)野生型Ａ５４９細胞において、ｍＴＯＲ阻害剤の存在が、最適濃度以下のシスプラチンでの高いレベルの細胞死をもたらすとの上記結果を確認する。
【００６０】
ｐ５３(ＴＰ５３)状態は、例えば、対象における腫瘍の、ｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子の組み合わせに対する感受性の予測となる。ｐ５３状態は、ｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子の組み合わせに対する応答の可能性を予測するために、上記の通り腫瘍組織から得たＤＮＡ、ＲＮＡまたはタンパク質を使用して評価できる。
【００６１】
実施例３
ｐ５３(ＴＰ５３)野生型Ａ５４９およびＭＣＦ７細胞を、各々０.３×１０６および０.４×１０６細胞／４ml／６cmプレートの密度で播種し、２４時間、３７℃および５％ＣＯ２でインキュベートする。細胞を、最適濃度以下のシスプラチン(例えば０.５から４μg／ml)と、２０nM ４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンまたは媒体対照ＤＭＳＯのいずれかとの組み合わせでさらに各々２４時間および３０時間インキュベートする。３０μg 総タンパク質に対応する細胞抽出物を、１５％ＳＤＳ−ＰＡＧＥ電気泳動により分離し、免疫ブロット分析を、ｐ２１に対して惹起させたマウスモノクローナル抗体(Oncogene Research Products, Clone EA10, catalogue #OP64)を使用して行う。両方の細胞系において、シスプラチン単独は、用量依存的方法で増加したｐ２１タンパク質発現を誘発する。著しくは、ｍＴＯＲ阻害剤、例えば４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンの存在が、ｐ２１タンパク質発現のシスプラチン誘発上方制御を減弱する。対照的に、ｐ５３制御アポトーシス促進性タンパク質である、Ｂａｘタンパク質発現は、薬剤単独または組み合わせのいずれでも影響を受けない。このアッセイにおいて、細胞毒性誘発ｐ２１タンパク質発現は、ｍＴＯＲ阻害剤の存在により阻害する。これは、シスプラチンとｍＴＯＲ阻害剤の組み合わせで観察される、増加した細胞死滅／アポトーシス応答の説明を提供する。
【００６２】
実施例４
ｐ５３(ＴＰ５３)野生型Ａ５４９細胞を、０.１×１０６細胞／５ml／６cmプレートの密度で播種し、２４時間、３７℃および５％ＣＯ２でインキュベートする。細胞をトランスフェクトしないままか、または、ヒトｐ５３(Accession number: NM000546; 標的配列: 5'-GCA TCT TAT CCG AGT GGA A-3')をターゲティングするもしくはＬａｃＺ(Accession number: M55068; 標的配列: 5'-GCG GCT GCC GGA ATT TAC CTT-3')コントロールｓｉＲＮＡのいずれか１００nM ｓｉＲＮＡで、オリゴフェクタミン(Invitrogen, Cat # 12252-011)を使用して一過性にトランスフェクトする。３０時間インキュベーション後、細胞を増加した濃度のシスプラチン(例えば０.５から６μg／ml)と、さらに２４時間インキュベートする。３０μg(ｐ２１)および５０μg(ｐ５３およびＰＡＲＰ)総タンパク質に対応する細胞抽出物を、１５％(ｐ２１)および１０％(ｐ５３およびＰＡＲＰ)ＳＤＳ−ＰＡＧＥ電気泳動で分離し、免疫ブロット分析を、各々ｐ２１およびｐ５３／ＰＡＲＰに対して惹起させたマウスモノクローナルおよびウサギポリクローナル抗体を使用して行う。トランスフェクトしていないまたはＬａｃＺ ｓｉＲＮＡコントロールでトランスフェクトした細胞のシスプラチン処置は、ｐ５３およびｐ２１タンパク質発現を濃度依存的方法で誘発し、高濃度シスプラチン(２から６μg／ml)ではＰＡＲＰ開裂(アポトーシスのマーカー)の証拠を伴う。著しくは、シスプラチン誘発ｐ５３タンパク質発現の減弱化が、ｐ５３ ｓｉＲＮＡでトランスフェクトした細胞で起こり、それは、ｐ２１発現の劇的減弱化、ＰＡＲＰ開裂および細胞生存能の損失と相関する。ｐ５３発現、ｐ２１発現およびＰＡＲＰ開裂に対する同様の効果が、２種の他のヒトｐ５３(標的配列：5'-GGA AGA CTC CAG TGG TAA T-3'および5'-GAT ATT GAA CAA TGG TTC A-3')をターゲティングするｓｉＲＮＡでも観察される。これらのデータは、シスプラチンおよびｍＴＯＲ阻害剤組み合わせで観察される増加した細胞死滅／アポトーシス応答が、ｐ５３依存性機構を介して顕在化することを直接確認する。
【００６３】
実施例５
ｐ５３(ＴＰ５３)野生型Ａ５４９細胞を、０.１×１０６細胞／５ml／６cmプレートの密度で播種し、２４時間、３７℃および５％ＣＯ２でインキュベートする。細胞トランスフェクトしないままか、または、ｐ２１(Accession number: NM000389; 標的配列: 5'-GTG GAC AGC GAG CAG CTG A-3')またはＬａｃＺ(上記の通り)コントロールｓｉＲＮＡのいずれか１００nM ｓｉＲＮＡで、オリゴフェクタミン(Invitrogen, Cat # 12252-011)を使用して一過性にトランスフェクトする。３０時間インキュベーション後、細胞を、最適濃度以下のシスプラチン(例えば１から２μg／ml)でさらに２４時間インキュベーションする。３０μg(ｐ２１)および５０μg(ＰＡＲＰ)総タンパク質に対応する細胞抽出物を、各々１５および１０％ＳＤＳ−ＰＡＧＥ電気泳動で分離し、免疫ブロット分析を、各々ｐ２１およびＰＡＲＰに対して惹起させたマウスモノクローナルおよびウサギポリクローナル抗体を使用して行う。トランスフェクトしていないまたはＬａｃＺ ｓｉＲＮＡコントロールでトランスフェクトした細胞のシスプラチン処置は、濃度依存的方法でｐ２１タンパク質発現を誘発し、ＰＡＲＰ開裂(アポトーシスのマーカー)の証拠はほとんどない。著しくは、シスプラチン誘発ｐ２１タンパク質発現の減弱化が、ｐ２１ ｓｉＲＮＡでトランスフェクトした細胞で起こり、それは、ＰＡＲＰ開裂の劇的誘発と相関する。これらのデータは、細胞毒性誘発ｐ２１タンパク質発現の減弱化が、シスプラチンおよびｍＴＯＲ阻害剤組み合わせで観察される増加した細胞死滅／アポトーシス応答の原因であることを直接確認する。
【発明の詳細な説明】
【０００１】
本発明は、癌のような増殖性疾患の治療剤、特に細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤に対する感受性を測定するためのバイオマーカーに関する。
【０００２】
多くのｍＴＯＲ阻害剤は強力な抗増殖性特性を有し、それにより、それらは特に固形腫瘍、とりわけ進行した固形腫瘍の、癌化学療法として有用である。ｍＴＯＲ阻害剤はまた、例えばＷＯ０２／６６０１９に記載の通り、処置の効果をさらに改善するために、または副作用を軽減するために、ある種の細胞毒性因子と組み合わせて使用されている。しかしながらｍＴＯＲ阻害剤を基礎とする組み合わせ治療のより標的化した使用の必要性がまだ存在し、それは、このような組み合わせ剤での処置に応答しそうである患者の同定を必要とする。従って、患者における良性または悪性増殖性疾患、例えば腫瘍の、細胞毒性因子と併用したｍＴＯＲ阻害剤に対する応答の予測ができる、例えば臨床試験において有用なバイオマーカーの必要性がある。
【０００３】
本発明により、驚くべきことに、野生型ｐ５３腫瘍抑制遺伝子(他の態様で、Ｐ５３遺伝子としても既知)の存在が、ｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子の組み合わせでの処置に対する増殖性疾患の感受性を予測する、バイオマーカーとして有用であることが判明した。特に、ヒト癌細胞系における野生型ｐ５３遺伝子の存在が、ＤＮＡの完全性を損なうかもしくは完全性に影響する細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤での処置に由来する細胞死滅／プログラム細胞死／アポトーシスの増加とよく相関することが判明した。故に、細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤は、野生型ｐ５３を保持する癌細胞の処置に使用したとき、おそらく、より著しい抗増殖性／殺細胞効果を示す。ｐ５３タンパク質(ＴＰ５３遺伝子によりコード)は、哺乳動物における細胞サイクル停止、老化、分化およびプログラム細胞死／アポトーシスの制御において主要な役割を有する、腫瘍抑制因子である。特に、ｐ５３経路は、ストレス(例えばＤＮＡ損傷、発癌性ストレス、低酸素、生存シグナルの欠損)に曝された哺乳類細胞における細胞サイクル停止および／またはアポトーシスを誘発する。ＴＰ５３における変異はヒト癌のほぼ半分で起こり、ｐ５３応答を誘発する能力が、多くの癌細胞で損なわれている(Vousden and Lu, Nature Reviews, 2002,2: 594-604)。ヒトｐ５３の配列(ｍＲＮＡ[コード配列；１１８２ヌクレオチド]およびタンパク質[３９３アミノ酸])は、GenBank accession numbers NM 000546またはP04637の下に入手可能である。ヒトＴＰ５３遺伝子の完全配列は、GenBank accession number U94788の下に入手可能である。
【０００４】
従って、本発明は、異常増殖の傾向がある細胞における野生型ｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子の存在の決定に基づく。
【０００５】
本発明は、一つの局面において、細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤での処置に対する増殖性疾患の感受性を測定するためのバイオマーカーとしての野生型ｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子の存在(その存在は、ｐ５３[ＴＰ５３]遺伝子の不在、欠損もしくは欠失または変異ｐ５３[ＴＰ５３]遺伝子の存在と対立する)の利用を提供する。
【０００６】
ここで、野生型ｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子は、イントロンおよびエクソンだけでなく、イントロンおよびエクソン、特に５’から最も５’−のエクソンに関連した、および、物理的に近い制御領域をも意味する。それは、例えば天然遺伝子の全長ＤＮＡ配列と、それが野生型ｐ５３タンパク質またはその機能的等価物、例えばその細胞アポトーシス誘発特性を保持した機能的ｐ５３タンパク質を発現する限り、所望によりヌクレオチド置換(逆位を含む)、コドンの挿入および欠失を含む。逆に言えば、ｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子の不在、欠損、欠失または変異は、ｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子発現の喪失または、例えばもはや細胞アポトーシス誘発特性を保持しない変異ｐ５３タンパク質の発現をもたらす変異遺伝子の発現をもたらす、遺伝的および後成的変化、例えば増幅、メチル化、多型、ヌクレオチド変異、欠失、逆位または転座およびヘテロ接合性欠失(ＬＯＨ)を意味する。
【０００７】
さらなる局面において、本発明は、対象における増殖性疾患の細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤での処置に対する感受性を測定する方法であって、該対象由来のサンプルにおけるｐ５３(ＴＰ５３)状態(野生型対変異体もしくは欠損／不在)を測定する方法を提供する。
【０００８】
他の局面において、本発明は、増殖性疾患を有する対象を細胞毒性因子と併用したｍＴＯＲ阻害剤での処置のために選択する方法であって、上記方法により各対象における増殖性疾患の組み合わせ処置に対する感受性を測定し、そして、野生型ｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子を保持する対象を該組み合わせ処置のために選択することを含む方法。
【０００９】
本明細書で使用する“ｍＴＯＲ阻害剤”なる用語は、ラパマイシン(シロリムス)またはその誘導体を含むが、これに限定されない。ラパマイシンは、ストレプトマイセス・ヒグロスコピカスにより産生されるマクロライド系抗生物質である。ラパマイシンの適当な誘導体は、例えば式Ａ
【化１】
〔式中、
Ｒ１ａａはＣＨ３またはＣ３−６アルキニルであり、
Ｒ２ａａはＨまたは−ＣＨ２−ＣＨ２−ＯＨ、３−ヒドロキシ−２−(ヒドロキシメチル)−２−メチル−プロパノイルまたはテトラゾリルであり、そして
Ｘａａは＝Ｏ、(Ｈ,Ｈ)または(Ｈ,ＯＨ)である。
ただし、Ｘａａが＝Ｏであり、そしてＲ１ａａがＣＨ３であるとき、Ｒ２ａａはＨ以外である。〕
の化合物、またはＲ２ａａが−ＣＨ２−ＣＨ２−ＯＨであるとき、そのプロドラッグ、例えばその生理学的に加水分解可能なエーテルを含む。
【００１０】
式Ａの化合物は、例えばＷＯ９４／０９０１０、ＷＯ９５／１６６９１、ＷＯ９６／４１８０７、ＵＳＰ５,３６２,７１８またはＷＯ９９／１５５３０に記載され、これらは引用により本明細書に包含する。それらは、これらの引用文献に記載の通りにまたは記載の方法に準じて製造できる。
【００１１】
式Ｉの代表的ラパマイシン誘導体は、例えば３２−デオキソラパマイシン、１６−ペント−２−イニルオキシ−３２−デオキソラパマイシン、１６−ペント−２−イニルオキシ−３２(ＳまたはＲ)−ジヒドロ−ラパマイシン、１６−ペント−２−イニルオキシ−３２(ＳまたはＲ)−ジヒドロ−４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)−ラパマイシン、４０−[３−ヒドロキシ−２−(ヒドロキシメチル)−２−メチルプロパノエート]−ラパマイシン(別名ＣＣＩ７７９)または４０−エピ−(テトラゾリル)−ラパマイシン(別名ＡＢＴ５７８)である。好ましい化合物は、例えばＷＯ９４／０９０１０の実施例８に記載の通りの４０−０−(２−ヒドロキシエチル)−ラパマイシン、またはＷＯ９６／４１８０７に記載の通りの３２−デオキソラパマイシンもしくは１６−ペント−２−イニルオキシ−３２(Ｓ)−ジヒドロ−ラパマイシンである。ラパマイシン誘導体はまた、例えばＷＯ９８／０２４４１およびＷＯ０１／１４３８７に記載の通りの、いわゆるラパログ、例えばＡＰ２３５７３、ＡＰ２３４６４、ＡＰ２３６７５またはＡＰ２３８４１も含み得る。ラパマイシン誘導体のさらなる例は、ＴＡＦＡ−９３(ラパマイシンプロドラッグ)、バイオリムス−７またはバイオリムス−９の名前の下に記載されているものである。
【００１２】
特許出願または科学文献の引用が記載されている各場合、化合物に関する課題を、本明細書に引用により包含する。包含されるのは同様に、それらの中に開示されている、その薬学的に許容される塩、対応するラセミ体、ジアステレオ異性体、エナンチオマー、互変異性体ならびに、存在するとき、上記の化合物の結晶修飾体、例えば溶媒和物、水和物および多形である。本発明の組み合わせ剤において活性成分として使用する化合物は、各々引用文献に記載の通り製造および投与できる。
【００１３】
本明細書で使用する“細胞毒性因子”なる用語は、細胞構造および機能にとって危険である因子、例えばＤＮＡの完全性を損なうかもしくは完全性に影響し、最終的に細胞死の原因となり得る因子、例えば抗新生物剤、例えば微小管活性化剤またはとりわけＤＮＡを損傷させる薬剤、例えば抗新生物代謝拮抗剤、白金化合物、アルキル化剤またはトポイソメラーゼＩもしくはII阻害剤である。“細胞毒性因子”なる用語はまたＤＮＡ損傷をもたらす放射線照射治療、例えば電離放射線、例えば放射活性ヨウ素も含む。このような放射線照射治療はまた細胞毒性因子治療と組み合わせ得る。“細胞毒性因子”なる用語はまた、１個、２個またはそれ以上の細胞毒性因子も含み、それは“カクテル”療法の形で投与され得る。
【００１４】
本明細書で使用する“トポイソメラーゼＩ阻害剤”は、トポテカン、イリノテカン、ギマテカン(gimatecan)、９−ニトロカンプトテシンおよび巨大分子カンプトテシン結合ＰＮＵ−１６６１４８(ＷＯ９９／１７８０４における化合物Ａ１)を含むが、これらに限定されない。イリノテカンは、例えば、商品名CAMPTOSARＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。トポテカンは、例えば、商品名HYCAMTINＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。
【００１５】
本明細書で使用する“トポイソメラーゼII阻害剤”なる用語は、ドキソルビシン(リポソーム製剤、例えばCAELYXＴＭを含む)、ダウノルビシン、エピルビシン、イダルビシンおよびネモルビシン(nemorubicin)のようなアントラサイクリン類、アントラキノン類ミトキサントロンおよびロソキサントロン、およびポドフィロトキシン類エトポシドおよびテニポシドを含むが、これらに限定されない。エトポシドは、例えば、商品名ETOPOPHOSＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。テニポシドは、例えば、商品名VM 26-BRISTOLTMの下、例えば、市販の形で投与できる。ドキソルビシンは、例えば、商品名ADRIBLASTINＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。エピルビシンは、例えば、商品名FARMORUBICINＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。イダルビシンは、例えば、商品名ZAVEDOSＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。ミトキサントロンは、例えば、商品名NOVANTRONＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。
【００１６】
“微小管活性化剤”なる用語は、タキサン類、例えばパクリタキセルおよびドセタキセル、ビンカアルカロイド、例えば、ビンブラスチン、とりわけビンブラスチンスルフェート、ビンクリスチン、とりわけビンクリスチンスルフェート、およびビノレルビン、ディスコデルモライドならびにエポチロンおよびその誘導体、例えばエポチロンＢもしくはその誘導体を含む、微小管安定化および微小管脱安定化剤を含むが、これらに限定されない。パクリタキセルは、例えばその市販の形、例えばTAXOLＴＭで投与し得る。ドセタキセルは、例えば、商品名TAXOTEREＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。ビンブラスチンスルフェートは、例えば、商品名VINBLASTIN R.P.TMの下、例えば、市販の形で投与できる。ビンクリスチンスルフェートは、例えば、商品名FARMISTINＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。ディスコデルモライドは、例えば、ＵＳ５,０１０,０９９に記載の通りに得ることができる。
【００１７】
本明細書で使用する“アルキル化剤”は、シクロホスファミド、イフォスファミド、メルファランまたはニトロソウレア(BCNUまたはGliadelＴＭ)を含むが、これらに限定されない。シクロホスファミドは、例えば、商品名CYCLOSTINＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。イフォスファミドは、例えば、商品名HOLOXANＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。
【００１８】
“抗新生物代謝拮抗剤”なる用語は、５−フルオロウラシル、テガフール、カペシタビン、クラドリビン、シタリビン(cytaribine)、フルダラビンホスフェート、フルオロウリジン、ゲムシタビン、６−メルカプトプリン、ヒドロキシウレア、メトトレキサート、エダトレキサートおよびこのような化合物の塩、およびさらにＺＤ１６９４(RALTITREXEDＴＭ)、ＬＹ２３１５１４(ALIMTAＴＭ)、ＬＹ２６４６１８(LOMOTREXOLＴＭ)およびＯＧＴ７１９を含むが、これらに限定されない。カペシタビンは、例えば、商品名XELODAＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。ゲムシタビンは、例えば、商品名GEMZARＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。
【００１９】
本明細書で使用する“白金化合物”は、カルボプラチン、シスプラチンおよびオキサリプラチンを含むが、これらに限定されない。カルボプラチンは、例えば、商品名CARBOPLATＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。オキサリプラチンは、例えば、商品名ELOXATINＴＭの下、例えば、市販の形で投与できる。
【００２０】
増殖性疾患は、良性または悪性増殖性疾患、例えば良性前立腺肥大、または新生物疾患、好ましくは悪性増殖性疾患、例えば癌、例えば腫瘍および／または転移巣(どこに位置していても)、例えば脳および他の中枢神経系腫瘍(例えば髄膜、脳、脊髄、脳神経および中枢神経系の他の部分の腫瘍、例えば膠芽細胞腫または髄質芽腫(medulla blastoma))；頭頚部癌；乳房腫瘍；循環器系腫瘍(例えば心臓、縦隔および胸膜、および他の胸腔内臓器、血管腫瘍および血管組織関連腫瘍)；排泄系腫瘍(例えば腎臓、腎盂、尿管、膀胱、他のおよび非特異的泌尿器)；胃腸管腫瘍(例えば食道、胃、小腸、結腸、結腸直腸、直腸Ｓ状部、直腸、肛門および肛門管)、肝臓および肝内胆管、胆嚢、胆管の他のおよび非特異的部位、膵臓、その他および消化器が関与する腫瘍；頭頚部；口腔(唇、舌、歯肉、口腔底、口蓋、および口の他の部位、耳下腺、および唾液腺の他の部位、扁桃、中咽頭、上咽頭、梨状陥凹、下咽頭、ならびに唇、口腔および咽頭における他の部位)；生殖器系腫瘍(例えば陰門、膣、子宮頸部、子宮体、子宮、卵巣、および女性生殖器に関連する他の部位、胎盤、陰茎、前立腺、精巣、および男性生殖器に関連する他の部位)；呼吸器腫瘍(例えば鼻腔および中耳、副洞、喉頭、気管、気管支および肺、例えば小細胞肺癌または非小細胞性肺癌)；骨格系腫瘍(例えば骨および肢の関節軟骨、骨関節軟骨および他の部位)；皮膚腫瘍(例えば皮膚の悪性黒色腫、非黒色腫皮膚癌、皮膚の基底細胞癌腫、皮膚の扁平上皮細胞癌腫、中皮腫、カポジ肉腫)；および末梢神経および自律神経系、結合および軟部組織、後腹膜および腹膜、眼および付属器、甲状腺、副腎および他の内分泌腺および関連構造を含む他の組織が関連する腫瘍、リンパ節の続発性および不特定悪性新生物、呼吸および消化系の続発性悪性新生物ならびに他の部位の続発性悪性新生物、血液およびリンパ系の腫瘍(例えばホジキン病、非ホジキンリンパ腫、バーキットリンパ腫、ＡＩＤＳ関連リンパ腫、悪性免疫増殖性疾患、多発性骨髄腫および悪性血漿細胞新生物、リンパ性白血病、急性または慢性骨髄性白血病、急性または慢性リンパ球性白血病、単球性白血病、特定細胞系の他の白血病、非特定細胞系の白血病、リンパの他のおよび不特定悪性新生物、造血性および関連組織、例えばびまん性大細胞リンパ腫、Ｔ細胞リンパ腫または皮膚Ｔ細胞リンパ腫)を含む。骨髄性癌は、例えば急性または慢性骨髄性白血病を含む。
【００２１】
前記および後記で腫瘍、腫瘍疾患、癌腫または癌が記載されているとき、また原発臓器もしくは組織におけるおよび／または全ての他の位置における転移巣も、腫瘍および／または転移巣の位置にかかわらず、それに代えてまたはそれに加えて意味する。
【００２２】
細胞毒性因子なる用語は、リンパまたは骨髄性癌の場合、例えばブスルファン、シタラビン、６−チオグアニン、フルダラビン、ヒドロキシウレア、プロカルバジン、ブレオマイシンまたはメトトレキサートでもあり得る。トポイソメラーゼII阻害剤、例えばダウノルビシンまたはイダルビシンまたは、特に、ＰＤＧＦＲまたはｃ−ＡｂＩファミリーメンバーおよびそれらの遺伝子融合産物の活性を標的とし、減少させ、または阻害する化合物、例えばイマチニブ、ファルネシルトランスフェラーゼ阻害剤、Ａｒａ−Ｃ、ＶＰ−１６、テニポシド、ミトキサントロン、カルボプラチンまたはミドスタウリンが、リンパまたは骨髄性癌の場合の細胞毒性因子として好ましい。
【００２３】
本発明の方法によって、このような増殖性疾患を有する対象を、ｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子の組み合わせ処置に対するそれらの感受性を予測するためにスクリーニングできる。該方法は、インビトロで、例えば該対象由来の生物学的組織サンプルで行い得る。該サンプルは、例えば組織、細胞系、血漿もしくは血清、細胞または細胞融解物、好ましくは腫瘍組織のような、哺乳類身体から単離された、任意の生物学的材料であり得る。
【００２４】
ｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子の状態を、該生物学的サンプルにおいて、例えば遺伝的および後成的変化についてのＤＮＡ分析、例えば増幅、メチル化、多型、ヌクレオチド変異(例えばコドン１７５Ａｒｇ、２４５Ｇｌｙ、２４８Ａｒｇ、２４９Ａｒｇ、２７３Ａｒｇ、２８２Ａｒｇおよびその他の変異)、ヌクレオチド欠失、逆位および／または翻訳およびヘテロ接合性欠失(ＬＯＨ)についてのＤＮＡ走査に基づく何らかの技術的手段によりアッセイする。ｐ５３(ＴＰ５３)状態を、生物学的サンプルにおいて、例えばノーザンブロッティングまたはＲＴ−ＰＣＲの技術を使用した、例えばＲＮＡ発現に基づく、または例えばイムノアッセイ、免疫沈降および電気泳動アッセイを含むウェスタンブロッティング、免疫組織化学またはＥＬＩＳＡの技術を使用した、例えばタンパク質発現／修飾に基づく何らかの技術的手段によりアッセイする。
【００２５】
例えば、ｐ５３タンパク質またはリン酸化(例えばＳｅｒ４６のリン酸化)、ユビキチン化もしくはアセチル化のようなｐ５３翻訳後修飾に特異的な抗体を、標準イムノアッセイ形態に使用して、ｐ５３タンパク質／リン酸化／ユビキチン化／アセチル化レベルを測定する。例えばモノクローナルまたはポリクローナル抗体を使用した、ＥＬＩＳＡ(酵素結合免疫吸着測定法)型アッセイ、免疫沈降型アッセイ、慣用のウェスタンブロッティングアッセイおよび免疫組織化学アッセイもまた、バイオマーカーとしてのｐ５３タンパク質／翻訳後修飾のレベルの測定に利用される。
【００２６】
ｐ５３タンパク質／翻訳後修飾に特異的なポリクローナルおよびモノクローナル抗体は、既知の免疫化法により産生するか、または、商業的に入手可能である(例えばSanta Cruz Biotechnology Inc catalogue #sc6253)。
【００２７】
ｐ５３状態はまた、二次元(２−Ｄ)ゲル電気泳動により測定できる。２−Ｄゲル電気泳動は当分野で既知であり、第一次元に沿った等電点電気泳動(ＩＥＦ)、続く第二次元に沿ったＳＤＳ−ＰＡＧＥ(ドデシル硫酸ナトリウム−ポリアクリルアミドゲル電気泳動)を含む。得られる電気泳動図を、例えば、抗体を使用した免疫ブロット分析により、分析する。
【００２８】
本発明は、故に、上記の方法でｐ５３(ＴＰ５３)状態を測定することを含む、増殖性疾患を有する患者を、それらのｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子の組み合わせ処置に対する感受性を予測するためにスクリーニングする方法を提供する。
【００２９】
さらなる局面において、本発明は、処置を必要とする対象における増殖性疾患の処置法であって、該対象由来のサンプルにおけるｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子の状態またはｐ５３発現および／または翻訳後修飾レベルを上記の方法で測定し、該対象を細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤で処置することを含む、方法を提供する。
【００３０】
別の態様において、本発明は、処置を必要とする対象における細胞毒性因子または、細胞毒性因子の活性を増強するまたは細胞毒性因子に対する耐性を克服する方法であって、該対象由来のサンプルにおけるｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子／発現を上記の方法で測定し、該対象に治療的有効量のｍＴＯＲ阻害剤を、該細胞毒性因子と同時にまたは連続的に投与することを含む、方法を提供する。
【００３１】
対象の特定の組織、例えば腫瘍組織サンプル中のｐ５３(ＴＰ５３)状態を、対照サンプル、例えば該疾患を有しない対照由来の正常組織サンプル、または同じ対照由来の正常(すなわち非腫瘍)組織由来のサンプルと比較すればよい。細胞毒性因子と併用したｍＴＯＲ阻害剤の使用が指示されるｐ５３(ＴＰ５３)野生型状態レベルは、ｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子の組み合わせの優れた治療的効果(すなわち抗増殖性および／また増加した殺細胞効果)の指標である。
【００３２】
さらに、本方法は、各患者に対する個々に最適化された治療のための、細胞毒性因子および／またはｍＴＯＲ阻害剤の適切な投与量の選択の助けとして使用できる。患者におけるｐ５３野生型状態のレベルに依存して、組み合わせの活性成分の低用量を使用できる；例えば、投与量がしばしば少ないだけでなく、少ない頻度で投与でき、または、望ましくない増殖を制御しながら、副作用の発生を減少させるために使用できる。この状況について考慮すべき因子は、処置している特定の状態、処置している特定の哺乳類、個々の患者の臨床状態、活性化合物の送達部位、活性化合物の特定のタイプ、投与法、投与のスケジュール、疾患の重症度ならびに医者に既知の他の因子を含む。
【００３３】
本明細書で使用する“組み合わせ処置”または“と組み合わせた”または“と併用した”などの用語は、選択したｍＴＯＲ阻害剤および細胞毒性因子を単一患者に投与することを含み、該薬剤を必ずしも同じ投与経路でまたは同時に投与するものではない処置レジメンを含むことを意図する。例えば、ｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子を患者に別々の物として同時に、一緒にまたは具体的時間制限なしに連続的に投与してよく、ここで、このような投与は体内で２成分の治療的有効レベルを提供する。
【００３４】
組み合わせの各活性成分の投与すべき治療的有効量は、上記の通りの斟酌により支配され、該疾患を予防、軽減または処置するのに必要な最少量である。このような量は、好ましくは、宿主に対して毒性であるか、または、宿主に感染に対する著しい危険性を与える量より少ない。
【００３５】
ｍＴＯＲ阻害剤の適当な投与量は、例えばＷＯ０２／６６０１９に記載の通りであり、例えば１回量または分割用量として、または、断続的に例えば１週間に１回で、１日あたりｐ.ｏ.で約０.１から３０mg、例えば約０.０５から２０mg活性成分の桁の投与割合である。ラパマイシンまたはその誘導体、例えば式Ａの化合物は、任意の慣用の経路で、特に経腸的に、例えば経口で、例えば錠剤、カプセル、飲溶液の形で、または非経腸的に、例えば、約０.１％から約９９.９％、好ましくは約１％から約６０％の活性成分を含む、例えば注射用溶液または懸濁液の形で投与できる。
【００３６】
トポテカンは、ヒトに約１から５mg／ｍ２日で変化する範囲の投与量で投与し得る。イリノテカンは、ヒトに約５０から３５０mg／ｍ２日で変化する範囲の投与量で投与し得る。
【００３７】
パクリタキセルは、ヒトに約５０から３００mg／ｍ２日で変化する範囲の投与量で投与し得る。ドセタキセルは、ヒトに約２５から１００mg／ｍ２日で変化する範囲の投与量で投与し得る。
【００３８】
シクロホスファミドは、ヒトに約５０から１５００mg／ｍ２日で変化する範囲の投与量で投与し得る。メルファランは、ヒトに約０.５から１０mg／ｍ２日で変化する範囲の投与量で投与し得る。
【００３９】
５−フルオロウラシルは、ヒトに約５０から１０００mg／ｍ２日で変化する範囲の投与量、例えば５００mg／ｍ２日で投与し得る。カペシタビンは、ヒトに約１０から１０００mg／ｍ２日で変化する範囲の投与量で投与し得る。ゲムシタビンヒドロクロライドは、ヒトに約１０００mg／ｍ２／週で変化する範囲の投与量で投与し得る。
【００４０】
カルボプラチンは、ヒトに約４週間毎に約２００から４００mg／ｍ２で変化する範囲の投与量で投与し得る。シスプラチンは、ヒトに約３週間毎に約２５から７５mg／ｍ２で変化する範囲の投与量で投与し得る。オキサリプラチンは、ヒトに２週間毎に約５０から８５mg／ｍ２で変化する範囲の投与量で投与し得る。
【００４１】
イマチニブは、ヒトに約２.５から８５０mg／日、より好ましくは５から６００mg／日および最も好ましくは２０から３００mg／日の範囲の投与量で投与できる。
【００４２】
本発明に記載の方法において使用する好ましい組み合わせは、例えばラパマイシン、４０−[３−ヒドロキシ−２−(ヒドロキシメチル)−２−メチルプロパノエート]−ラパマイシンまたは４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンと、ゲムシタビンまたはシスプラチンのような細胞毒性因子の組み合わせである。本発明の方法において使用すべき別の組み合わせは、例えば上記の通りの、相乗的用量のｍＴＯＲ阻害剤と、細胞毒性因子、例えばゲムシタビンまたはシスプラチンの組み合わせである。
【００４３】
好ましくはＴＰ５３はヒト遺伝子である。
好ましくは本発明の方法は、ｐ５３(ＴＰ５３)野生型状態を提示する腫瘍細胞上で行う。
【００４４】
さらなる態様において、ｐ５３(ＴＰ５３)野生型細胞における、細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤での処置に由来する増加した細胞死滅／プログラム細胞死／アポトーシスは、以後ｐ２１と呼ぶ、ｐ２１Ｗａｆ１／Ｃｉｐ１(ＣＤＫＮ１Ａ、ＷＡＦ１、ＣＩＰ１、ＳＤＩ１、ＣＡＰ２０、ＭＤＡ−６、ｐ２１としての既知)タンパク質発現の細胞毒性誘発上方制御の強い減弱化と相関する。
【００４５】
ｐ２１はサイクリンキナーゼ“阻害剤”のｃｉｐ／ｋｉｐファミリーのメンバーであり、それは、細胞サイクル進行の許可ならびにアポトーシスの予防に役割を有する。本発明の状況において、ｐ２１の、活性化ｐ５３に応答して、ストレスシグナル、例えばＤＮＡ損傷に応答して細胞増殖を阻止する機能は十分確立されている。実際、増加したｐ２１タンパク質発現が、このようなストレスを受けた細胞の生存を可能にする、例えば細胞がＤＮＡ修復過程を完了することを可能にすると仮定されている。故に、細胞毒性物での処置に応答した、増加したｐ２１発現の減弱化は、細胞死滅／プログラム細胞死／アポトーシスを促進し得る(Weiss, Cancer Cell, 2003,4: 425-429)。ヒトｐ２１の配列(ｍＲＮＡ[コード配列：４９５ヌクレオチド]およびタンパク質生成物[１６４アミノ酸])は、GenBank accession number NM 000389、NM 078467またはAAH01935の下に入手可能である。ヒトｐ２１遺伝子の完全配列は、GenBank accession number NM 078467の下に入手可能である。
【００４６】
さらに、癌患者の幾分かは増加した合計またはサイトソル腫瘍ｐ２１発現を有し、これは悪い予後および化学療法に対する乏しい応答と関連している(Weiss, supra)。癌患者における基底のｐ２１発現の評価は、患者を、例えば１個以上の細胞毒性因子および所望により放射線療法と組み合わせたｍＴＯＲ治療に基づく具体的化学療法処置について選択することを可能にし得る。
【００４７】
従って、本発明は、さらに下記を提供する：
ｉ. 対象における細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤での処置に対する増殖性疾患の感受性または応答を測定するためのバイオマーカーとしてのｐ２１の使用；
【００４８】
ii. 増殖性疾患を有する対象を細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤での処置のために選択する方法であって、各対象における増殖性疾患の細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤での処置に対する感受性を測定し、増加した基底ｐ２１発現を示す対象を組み合わせ処置のために選択することを含む、方法；
【００４９】
iii. 対象における増殖性疾患の細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤に対する感受性または応答を測定する方法であって、該対象由来のサンプルにおけるｐ２１発現レベルを細胞毒性因子単独およびｍＴＯＲ阻害剤との組み合わせでの処置の前および／または後に測定することを含む、方法；
【００５０】
iv. 細胞毒性因子で処置している対象における、該細胞毒性因子の活性を増強するまたは細胞毒性因子に対する耐性に打ち勝つ方法であって、
−上記の方法により、該対象由来のサンプルにおけるｐ２１発現レベルを測定し、
− ｐ２１発現が細胞毒性因子投与後に上方制御されているとき、該対象に治療的有効量のｍＴＯＲ阻害剤を細胞毒性因子と組み合わせて投与し、
− ｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子の組み合わせ処置後の該対象由来の新規サンプルにおけるｐ２１発現を再び測定し、そして
− ｐ２１発現が下方制御されているとき、該対象を、細胞毒性因子と同時にまたは連続的に、ｍＴＯＲ阻害剤でさらに処置する
ことを含む、方法。
【００５１】
既に上記の通り、ｐ２１タンパク質レベルはｐ５３について上記の通りに測定できる；しかしながら、ｐ５３に特異的な抗体を使用する代わりに、例えば市販の(例えばOncogene Research products, Clone EA10, catalogue #OP64)、ｐ２１に特異的な抗体、例えばモノクローナルまたはポリクローナル抗体を使用することは理解されるべきである。
【００５２】
対象の特定の組織、例えば腫瘍組織サンプルにおいて見られたレベルを、対照サンプル、例えば該疾患を有しない対照由来の正常組織サンプル、または同じ対照由来の正常(すなわち非腫瘍)組織由来のサンプルと比較し得る。ｐ２１発現の欠損または誘発の減弱化(細胞毒性因子単独で観察される誘発と比較して、細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤の組み合わせで処置したときの)は、細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤の優れた治療的効果(すなわち抗増殖性／殺細胞効果)の指標である。細胞毒性因子によるｐ２１発現誘発のおよび／またはｍＴＯＲ阻害剤によるｐ２１発現レベルに対する逆転効果の評価は、また、例えば、細胞毒性用量を減少させるための、細胞毒性因子の用量の調整にも有用であり得る。
【００５３】
記載の実施例は、本発明を何ら限定することなく、説明する。
【００５４】
実施例１
ｐ５３(ＴＰ５３)野生型ヒト腺癌Ａ５４９(ＣＣＬ−１８５)腫瘍細胞(American Type Culture Collection, Rockville, MD., USA)を、９６ウェルプレートに２×１０３細胞／１００μl／ウェルの密度で播種し、２４時間、３７℃および５％ＣＯ２でインキュベートする。細胞を、最適濃度以下のゲムシタビン(例えば５から１７.５nM)と、２０nM ４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンまたは媒体対照ＤＭＳＯのいずれかとの組み合わせでさらに７２時間インキュベートする。ＹＯ−ＰＲＯ色素(ＹＯ−ＰＲＯＲ−１アイオダイド[４９１／５０９]、cat #Y3603, Molecular Probes)を細胞に添加し、Cytofluor II蛍光プレートリーダーを使用して細胞死または細胞毒性を、そして、細胞溶解後、相対的細胞増殖を測定する。このアッセイにおいて、ｍＴＯＲ阻害剤、例えば４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンは、最適濃度以下のゲムシタビンの殺細胞効果の統計学的有意な増強をもたらす(ｐ＜０.０５；Tukey検定を伴うANOVA)。同様の結果が、ヒト肺腺癌Ａ５４９以外のｐ５３(ＰＴ５３)野生型細胞系、例えばヒトＭＣＦ７乳癌腫細胞(HTB-22; American Type Culture Collection)を使用したときに、得られる。
【００５５】
ｐ５３(ＴＰ５３)変異／欠損腫瘍細胞系、例えばＰＣ３Ｍヒト前立腺癌腫細胞(０.８×１０３細胞／１００μlの密度で播種)またはＭＤＡ−ＭＢ２３１ヒト乳癌腫細胞(２×１０３細胞／１００μlの密度で播種；HTB-26; American Type Culture Collection)を使用する以外、この方法を繰り返す。ｐ５３(ＴＰ５３)変異／欠損細胞系において、著しいまたは一貫した細胞死の増強は見られない。
【００５６】
Ａ５４９細胞を、０.１×１０６細胞／１０ml／１０cmプレートの密度で播種し、２４時間、３７℃および５％ＣＯ２でインキュベートする。細胞を、最適濃度以下のゲムシタビン(例えば５から１２.５nM)と、２０nM ４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンまたは媒体対照ＤＭＳＯのいずれかとの組み合わせでさらに７２時間インキュベートする。５０μg 総タンパク質に対応する細胞抽出物を、８％ＳＤＳ−ＰＡＧＥ電気泳動により分離し、免疫ブロット分析を、ポリ(ＡＤＰ−リボース)ポリメラーゼ(ＰＡＲＰ)に対して惹起させたウサギポリクローナル抗体(Cell Signalling Technology catalogue #9542)を使用して行う。このアッセイにおいて、ｍＴＯＲ阻害剤、例えば４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンの存在は、最適濃度以下のゲムシタビンで、増加したＰＡＲＰ開裂(アポトーシスのマーカー)をもたらす(同じ濃度のゲムシタビンまたはｍＴＯＲ阻害剤単独と比較して)。これは、ｐ５３(ＴＰ５３)野生型Ａ５４９細胞において、ｍＴＯＲ阻害剤の存在が、最適濃度以下のゲムシタビンでの高いレベルの細胞死をもたらすとの上記結果を確認する。
【００５７】
実施例２
ｐ５３(ＴＰ５３)野生型ヒト肺腺癌Ａ５４９細胞を、９６ウェルプレート中５×１０３細胞／１００μl／ウェルの密度で播種し、２４時間、３７℃および５％ＣＯ２でインキュベートする。細胞を、最適濃度以下のシスプラチン(例えば３から１０μg／ml)と、２０ nM ４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンまたは媒体対照ＤＭＳＯのいずれかとの組み合わせでさらに２４時間インキュベートする。ＹＯ−ＰＲＯ(登録商標)アッセイを上記の通り行い、細胞死または細胞毒性を、そして、細胞溶解後、相対的細胞増殖を測定する。このアッセイにおいて、ｍＴＯＲ阻害剤、例えば４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンは、最適濃度以下のシスプラチンの殺細胞効果の統計学的有意な増強をもたらす(ｐ＜０.０５；Tukey検定を伴うANOVA)。二元配置ＡＮＯＶＡを使用した続く分析は、ＲＡＤ００１とシスプラチンの間の相互作用が非常に有意であることを示した(ｐ＜０.００１)。上記と同様の結果が、ヒト肺腺癌Ａ５４９以外のｐ５３(ＰＴ５３)野生型細胞系、例えばヒトＭＣＦ７乳癌腫細胞を使用したときに、得られる。後者の場合、化合物とのインキュベーションは３０時間である。
【００５８】
ｐ５３(ＴＰ５３)変異／欠損腫瘍細胞系、例えばＰＣ３Ｍ(３×１０３細胞／１００μlの密度で播種)またはＤＵ１４５(５×１０３細胞／１００μlの密度で播種：ＨＴＢ−８１；American Type Culture Collection)を使用する以外、この方法を繰り返す。この場合、化合物とのインキュベーションはＤＵ１４５については２２時間またはＰＣ３Ｍについては３０時間である。ｐ５３(ＴＰ５３)変異／欠損細胞系において、著しいまたは一貫した細胞死の増強は見られない。
【００５９】
Ａ５４９細胞を、０.１×１０６細胞／１０ml／１０cmプレートの密度で播種し、２４時間、３７℃および５％ＣＯ２でインキュベートする。細胞を、最適濃度以下のシスプラチン(例えば０.５から４μg／ml)と、２０nM ４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンまたは媒体対照ＤＭＳＯのいずれかとの組み合わせでさらに２４時間インキュベートする。５０μg 総タンパク質に対応する細胞抽出物を、８％ＳＤＳ−ＰＡＧＥ電気泳動により分離し、免疫ブロット分析を、ポリ(ＡＤＰ−リボース)ポリメラーゼ(ＰＡＲＰ)およびｐ５３に対して惹起させたウサギポリクローナル抗体を使用して行う。このアッセイにおいて、ｍＴＯＲ阻害剤、例えば４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンの存在は、最適濃度以下のシスプラチンで、増加したＰＡＲＰ開裂(アポトーシスのマーカー)をもたらす(同じ濃度のシスプラチンまたはｍＴＯＲ阻害剤単独と比較して)。これは、ｐ５３(ＴＰ５３)野生型Ａ５４９細胞において、ｍＴＯＲ阻害剤の存在が、最適濃度以下のシスプラチンでの高いレベルの細胞死をもたらすとの上記結果を確認する。
【００６０】
ｐ５３(ＴＰ５３)状態は、例えば、対象における腫瘍の、ｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子の組み合わせに対する感受性の予測となる。ｐ５３状態は、ｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子の組み合わせに対する応答の可能性を予測するために、上記の通り腫瘍組織から得たＤＮＡ、ＲＮＡまたはタンパク質を使用して評価できる。
【００６１】
実施例３
ｐ５３(ＴＰ５３)野生型Ａ５４９およびＭＣＦ７細胞を、各々０.３×１０６および０.４×１０６細胞／４ml／６cmプレートの密度で播種し、２４時間、３７℃および５％ＣＯ２でインキュベートする。細胞を、最適濃度以下のシスプラチン(例えば０.５から４μg／ml)と、２０nM ４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンまたは媒体対照ＤＭＳＯのいずれかとの組み合わせでさらに各々２４時間および３０時間インキュベートする。３０μg 総タンパク質に対応する細胞抽出物を、１５％ＳＤＳ−ＰＡＧＥ電気泳動により分離し、免疫ブロット分析を、ｐ２１に対して惹起させたマウスモノクローナル抗体(Oncogene Research Products, Clone EA10, catalogue #OP64)を使用して行う。両方の細胞系において、シスプラチン単独は、用量依存的方法で増加したｐ２１タンパク質発現を誘発する。著しくは、ｍＴＯＲ阻害剤、例えば４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシンの存在が、ｐ２１タンパク質発現のシスプラチン誘発上方制御を減弱する。対照的に、ｐ５３制御アポトーシス促進性タンパク質である、Ｂａｘタンパク質発現は、薬剤単独または組み合わせのいずれでも影響を受けない。このアッセイにおいて、細胞毒性誘発ｐ２１タンパク質発現は、ｍＴＯＲ阻害剤の存在により阻害する。これは、シスプラチンとｍＴＯＲ阻害剤の組み合わせで観察される、増加した細胞死滅／アポトーシス応答の説明を提供する。
【００６２】
実施例４
ｐ５３(ＴＰ５３)野生型Ａ５４９細胞を、０.１×１０６細胞／５ml／６cmプレートの密度で播種し、２４時間、３７℃および５％ＣＯ２でインキュベートする。細胞をトランスフェクトしないままか、または、ヒトｐ５３(Accession number: NM000546; 標的配列: 5'-GCA TCT TAT CCG AGT GGA A-3')をターゲティングするもしくはＬａｃＺ(Accession number: M55068; 標的配列: 5'-GCG GCT GCC GGA ATT TAC CTT-3')コントロールｓｉＲＮＡのいずれか１００nM ｓｉＲＮＡで、オリゴフェクタミン(Invitrogen, Cat # 12252-011)を使用して一過性にトランスフェクトする。３０時間インキュベーション後、細胞を増加した濃度のシスプラチン(例えば０.５から６μg／ml)と、さらに２４時間インキュベートする。３０μg(ｐ２１)および５０μg(ｐ５３およびＰＡＲＰ)総タンパク質に対応する細胞抽出物を、１５％(ｐ２１)および１０％(ｐ５３およびＰＡＲＰ)ＳＤＳ−ＰＡＧＥ電気泳動で分離し、免疫ブロット分析を、各々ｐ２１およびｐ５３／ＰＡＲＰに対して惹起させたマウスモノクローナルおよびウサギポリクローナル抗体を使用して行う。トランスフェクトしていないまたはＬａｃＺ ｓｉＲＮＡコントロールでトランスフェクトした細胞のシスプラチン処置は、ｐ５３およびｐ２１タンパク質発現を濃度依存的方法で誘発し、高濃度シスプラチン(２から６μg／ml)ではＰＡＲＰ開裂(アポトーシスのマーカー)の証拠を伴う。著しくは、シスプラチン誘発ｐ５３タンパク質発現の減弱化が、ｐ５３ ｓｉＲＮＡでトランスフェクトした細胞で起こり、それは、ｐ２１発現の劇的減弱化、ＰＡＲＰ開裂および細胞生存能の損失と相関する。ｐ５３発現、ｐ２１発現およびＰＡＲＰ開裂に対する同様の効果が、２種の他のヒトｐ５３(標的配列：5'-GGA AGA CTC CAG TGG TAA T-3'および5'-GAT ATT GAA CAA TGG TTC A-3')をターゲティングするｓｉＲＮＡでも観察される。これらのデータは、シスプラチンおよびｍＴＯＲ阻害剤組み合わせで観察される増加した細胞死滅／アポトーシス応答が、ｐ５３依存性機構を介して顕在化することを直接確認する。
【００６３】
実施例５
ｐ５３(ＴＰ５３)野生型Ａ５４９細胞を、０.１×１０６細胞／５ml／６cmプレートの密度で播種し、２４時間、３７℃および５％ＣＯ２でインキュベートする。細胞トランスフェクトしないままか、または、ｐ２１(Accession number: NM000389; 標的配列: 5'-GTG GAC AGC GAG CAG CTG A-3')またはＬａｃＺ(上記の通り)コントロールｓｉＲＮＡのいずれか１００nM ｓｉＲＮＡで、オリゴフェクタミン(Invitrogen, Cat # 12252-011)を使用して一過性にトランスフェクトする。３０時間インキュベーション後、細胞を、最適濃度以下のシスプラチン(例えば１から２μg／ml)でさらに２４時間インキュベーションする。３０μg(ｐ２１)および５０μg(ＰＡＲＰ)総タンパク質に対応する細胞抽出物を、各々１５および１０％ＳＤＳ−ＰＡＧＥ電気泳動で分離し、免疫ブロット分析を、各々ｐ２１およびＰＡＲＰに対して惹起させたマウスモノクローナルおよびウサギポリクローナル抗体を使用して行う。トランスフェクトしていないまたはＬａｃＺ ｓｉＲＮＡコントロールでトランスフェクトした細胞のシスプラチン処置は、濃度依存的方法でｐ２１タンパク質発現を誘発し、ＰＡＲＰ開裂(アポトーシスのマーカー)の証拠はほとんどない。著しくは、シスプラチン誘発ｐ２１タンパク質発現の減弱化が、ｐ２１ ｓｉＲＮＡでトランスフェクトした細胞で起こり、それは、ＰＡＲＰ開裂の劇的誘発と相関する。これらのデータは、細胞毒性誘発ｐ２１タンパク質発現の減弱化が、シスプラチンおよびｍＴＯＲ阻害剤組み合わせで観察される増加した細胞死滅／アポトーシス応答の原因であることを直接確認する。
【特許請求の範囲】
【請求項１】
増殖性疾患を有する対象において、細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤での処置に対する該対象の感受性を測定するためのバイオマーカーとしての、ｐ５３(ＴＰ５３)状態の使用。
【請求項２】
ｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子分析およびｐ５３の発現／翻訳後修飾レベルの使用を含む、請求項１記載の使用。
【請求項３】
ｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子の組み合わせ処置に対する、増殖性疾患の感受性を対象において測定する方法であって、該対象由来のサンプルにおけるｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子の状態および／またはｐ５３の発現／翻訳後修飾レベルを測定することを含む、方法。
【請求項４】
増殖性疾患が癌を含む、請求項１から３のいずれかに記載の方法または使用。
【請求項５】
ｐ５３(ＴＰ５３)の遺伝的状態および／またはｐ５３の発現レベルの測定を含む、請求項３から４のいずれかに記載の方法。
【請求項６】
サンプルが対象における腫瘍由来である、請求項３から５のいずれかに記載の方法。
【請求項７】
増殖性疾患を有する対象をｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子の組み合わせ処置のために選択する方法であって、請求項３から６のいずれかに記載の方法により各対象における増殖性疾患の該組み合わせ処置に対する感受性を測定し、野生型ｐ５３(ＴＰ５３)状態を示す対象を組み合わせ処置のために選択することを含む、方法。
【請求項８】
ｍＴＯＲ阻害剤がラパマイシンまたはラパマイシン誘導体を含む、請求項１から７のいずれかに記載の方法または使用。
【請求項９】
ラパマイシン誘導体が４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシン、４０−[３−ヒドロキシ−２−(ヒドロキシメチル)−２−メチルプロパノエート]−ラパマイシンまたは４０−エピ−(テトラゾリル)−ラパマイシンを含む、請求項８記載の方法または使用。
【請求項１０】
細胞毒性因子が抗新生物代謝拮抗剤、白金化合物、アルキル化剤、トポイソメラーゼＩまたはII阻害剤、微小管活性化剤および放射線照射から選択される、請求項１から９のいずれかに記載の方法または使用。
【請求項１１】
対象における細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤での処置に対する増殖性疾患の感受性または応答を測定するためのバイオマーカーとしてのｐ２１の使用。
【請求項１２】
ｐ２１発現のレベルを測定することを含む、請求項１１記載の方法。
【請求項１３】
対象における増殖性疾患の細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤に対する感受性または応答を測定する方法であって、該対象由来のサンプルにおける細胞毒性因子単独での処置後の、および、細胞毒性因子とｍＴＯＲ阻害剤の組み合わせ処置後のｐ２１発現レベルを測定することを含む、方法。
【請求項１４】
細胞毒性因子で処置している対象における、該細胞毒性因子の活性を増強するまたは細胞毒性因子に対する耐性を克服する方法であって、
− 該対象由来のサンプルにおけるｐ２１発現レベルを測定し、
− ｐ２１発現が細胞毒性因子投与後に上方制御されているとき、該対象に治療的有効量のｍＴＯＲ阻害剤を細胞毒性因子と組み合わせて投与し、
− ｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子の組み合わせ処置後の該対象由来の新規サンプルにおけるｐ２１発現を再び測定し、そして
− ｐ２１発現が下方制御されているとき、該対象を、細胞毒性因子と同時にまたは連続的に、ｍＴＯＲ阻害剤でさらに処置する
ことを含む、方法。
【請求項１】
増殖性疾患を有する対象において、細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤での処置に対する該対象の感受性を測定するためのバイオマーカーとしての、ｐ５３(ＴＰ５３)状態の使用。
【請求項２】
ｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子分析およびｐ５３の発現／翻訳後修飾レベルの使用を含む、請求項１記載の使用。
【請求項３】
ｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子の組み合わせ処置に対する、増殖性疾患の感受性を対象において測定する方法であって、該対象由来のサンプルにおけるｐ５３(ＴＰ５３)遺伝子の状態および／またはｐ５３の発現／翻訳後修飾レベルを測定することを含む、方法。
【請求項４】
増殖性疾患が癌を含む、請求項１から３のいずれかに記載の方法または使用。
【請求項５】
ｐ５３(ＴＰ５３)の遺伝的状態および／またはｐ５３の発現レベルの測定を含む、請求項３から４のいずれかに記載の方法。
【請求項６】
サンプルが対象における腫瘍由来である、請求項３から５のいずれかに記載の方法。
【請求項７】
増殖性疾患を有する対象をｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子の組み合わせ処置のために選択する方法であって、請求項３から６のいずれかに記載の方法により各対象における増殖性疾患の該組み合わせ処置に対する感受性を測定し、野生型ｐ５３(ＴＰ５３)状態を示す対象を組み合わせ処置のために選択することを含む、方法。
【請求項８】
ｍＴＯＲ阻害剤がラパマイシンまたはラパマイシン誘導体を含む、請求項１から７のいずれかに記載の方法または使用。
【請求項９】
ラパマイシン誘導体が４０−Ｏ−(２−ヒドロキシエチル)ラパマイシン、４０−[３−ヒドロキシ−２−(ヒドロキシメチル)−２−メチルプロパノエート]−ラパマイシンまたは４０−エピ−(テトラゾリル)−ラパマイシンを含む、請求項８記載の方法または使用。
【請求項１０】
細胞毒性因子が抗新生物代謝拮抗剤、白金化合物、アルキル化剤、トポイソメラーゼＩまたはII阻害剤、微小管活性化剤および放射線照射から選択される、請求項１から９のいずれかに記載の方法または使用。
【請求項１１】
対象における細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤での処置に対する増殖性疾患の感受性または応答を測定するためのバイオマーカーとしてのｐ２１の使用。
【請求項１２】
ｐ２１発現のレベルを測定することを含む、請求項１１記載の方法。
【請求項１３】
対象における増殖性疾患の細胞毒性因子と組み合わせたｍＴＯＲ阻害剤に対する感受性または応答を測定する方法であって、該対象由来のサンプルにおける細胞毒性因子単独での処置後の、および、細胞毒性因子とｍＴＯＲ阻害剤の組み合わせ処置後のｐ２１発現レベルを測定することを含む、方法。
【請求項１４】
細胞毒性因子で処置している対象における、該細胞毒性因子の活性を増強するまたは細胞毒性因子に対する耐性を克服する方法であって、
− 該対象由来のサンプルにおけるｐ２１発現レベルを測定し、
− ｐ２１発現が細胞毒性因子投与後に上方制御されているとき、該対象に治療的有効量のｍＴＯＲ阻害剤を細胞毒性因子と組み合わせて投与し、
− ｍＴＯＲ阻害剤と細胞毒性因子の組み合わせ処置後の該対象由来の新規サンプルにおけるｐ２１発現を再び測定し、そして
− ｐ２１発現が下方制御されているとき、該対象を、細胞毒性因子と同時にまたは連続的に、ｍＴＯＲ阻害剤でさらに処置する
ことを含む、方法。
【公表番号】特表２００７−５２２８１２（Ｐ２００７−５２２８１２Ａ）
【公表日】平成１９年８月１６日（２００７．８．１６）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００６−５５３５６７（Ｐ２００６−５５３５６７）
【出願日】平成１７年２月２２日（２００５．２．２２）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＥＰ２００５／００１８４９
【国際公開番号】ＷＯ２００５／０８０５９３
【国際公開日】平成１７年９月１日（２００５．９．１）
【出願人】（５９７０１１４６３）ノバルティス アクチエンゲゼルシャフト (942)
【出願人】（５０２４０７３３６）ノバルティス・フォルシュングスシュティフトゥング・ツヴァイクニーダーラッスング・フリードリッヒ・ミーシェー・インスティトゥート・フォー・バイオメディカル・リサーチ (19)
【氏名又は名称原語表記】Ｎｏｖａｒｔｉｓ Ｆｏｒｓｃｈｕｎｇｓｓｔｉｆｔｕｎｇ Ｚｗｅｉｇｎｉｅｄｅｒｌａｓｓｕｎｇ Ｆｒｉｅｄｒｉｃｈ Ｍｉｅｓｃｈｅｒ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｆｏｒ Ｂｉｏｍｅｄｉｃａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成１９年８月１６日（２００７．８．１６）
【国際特許分類】
【出願日】平成１７年２月２２日（２００５．２．２２）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＥＰ２００５／００１８４９
【国際公開番号】ＷＯ２００５／０８０５９３
【国際公開日】平成１７年９月１日（２００５．９．１）
【出願人】（５９７０１１４６３）ノバルティス アクチエンゲゼルシャフト (942)
【出願人】（５０２４０７３３６）ノバルティス・フォルシュングスシュティフトゥング・ツヴァイクニーダーラッスング・フリードリッヒ・ミーシェー・インスティトゥート・フォー・バイオメディカル・リサーチ (19)
【氏名又は名称原語表記】Ｎｏｖａｒｔｉｓ Ｆｏｒｓｃｈｕｎｇｓｓｔｉｆｔｕｎｇ Ｚｗｅｉｇｎｉｅｄｅｒｌａｓｓｕｎｇ Ｆｒｉｅｄｒｉｃｈ Ｍｉｅｓｃｈｅｒ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｆｏｒ Ｂｉｏｍｅｄｉｃａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ
【Ｆターム（参考）】
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