ＧＤＮＦＲと配列類似性を有する新規ポリペプチド及びこれをコードする核酸
【課題】ＧＤＮＦＲに対して配列類似性を有する新規なポリペプチド及びそれらのポリペプチドをコードしている核酸分子の提供。
【解決手段】グリア細胞株由来神経栄養因子レセプター(ＧＤＮＦＲ)と配列類似性を有する新規なＰＲＯ３４１２８ポリペプチド、その核酸配列、および、核酸配列を含んでなるベクター及び宿主細胞。異種性ポリペプチド配列と融合されたキメラポリペプチド分子、および、本ポリペプチドに結合する抗体、並びにポリペプチドを製造するための方法。
【解決手段】グリア細胞株由来神経栄養因子レセプター(ＧＤＮＦＲ)と配列類似性を有する新規なＰＲＯ３４１２８ポリペプチド、その核酸配列、および、核酸配列を含んでなるベクター及び宿主細胞。異種性ポリペプチド配列と融合されたキメラポリペプチド分子、および、本ポリペプチドに結合する抗体、並びにポリペプチドを製造するための方法。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
(ａ)図２(配列番号：２)の約１〜約３９４のアミノ酸残基の配列を含んでなるＰＲＯ３４１２８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は(ｂ)(ａ)のＤＮＡ分子の相補鎖に対して、少なくとも約８０％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子。
【請求項２】
図１(配列番号：１)の約８８〜約１２６９のヌクレオチド位置の配列を含んでなる、請求項１に記載の単離された核酸分子。
【請求項３】
図１(配列番号：１)のヌクレオチド配列を含んでなる、請求項１に記載の単離された核酸分子。
【請求項４】
図２(配列番号：２)の約１〜約３９４のアミノ酸残基の配列をコードするヌクレオチド配列を含んでなる、請求項１に記載の単離された核酸分子。
【請求項５】
(ａ)ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ-２９８５(ＤＮＡ１９４９１７-３０４４)で、２００１年１月３０日にＡＴＣＣに寄託されたヒトタンパク質ｃＤＮＡによりコードされる同じ成熟ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は(ｂ)(ａ)のＤＮＡ分子の相補鎖に対して、少なくとも約８０％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子。
【請求項６】
ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ-２９８５(ＤＮＡ１９４９１７-３０４４)で、２００１年１月３０日にＡＴＣＣに寄託されたヒトタンパク質ｃＤＮＡによりコードされる同じ成熟ポリペプチドをコードするＤＮＡを含んでなる、請求項５に記載の単離された核酸分子。
【請求項７】
(ａ)ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ-２９８５(ＤＮＡ１９４９１７-３０４４)で、２００１年１月３０日にＡＴＣＣに寄託されたヒトタンパク質ｃＤＮＡの完全長ポリペプチドコード配列、又は(ｂ)(ａ)のコード配列の相補鎖に対して、少なくとも約８０％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子。
【請求項８】
ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ-２９８５(ＤＮＡ１９４９１７-３０４４)で、２００１年１月３０日にＡＴＣＣに寄託されたヒトタンパク質ｃＤＮＡの完全長ポリペプチドコード配列を含んでなる、請求項７に記載の単離された核酸分子。
【請求項９】
図２(配列番号：２)のアミノ酸１〜約３９４をコードする核酸配列の相補鎖に対してハイブリダイズするＤＮＡを含んでなるＰＲＯ３４１２８ポリペプチドをコードする単離された核酸分子。
【請求項１０】
図２(配列番号：２)のアミノ酸１〜約３９４をコードする核酸が、図１(配列番号：１)のヌクレオチド８８〜約１２６９を含んでなる、請求項９に記載の単離された核酸分子。
【請求項１１】
ハイブリダイゼーションがストリンジェントなハイブリダイゼーション及び洗浄条件下で生じる、請求項９に記載の単離された核酸分子。
【請求項１２】
少なくとも約７０７ヌクレオチドを含み、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下、試験ＤＮＡ分子を、(ａ)図２(配列番号：２)の１〜約３９４のアミノ酸残基の配列を含んでなるＰＲＯ３４１２８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は(ｂ)(ａ)のＤＮＡ分子の相補鎖とハイブリダイゼーションさせ、試験ＤＮＡ分子を単離することにより作製される、単離された核酸分子。
【請求項１３】
(ａ)又は(ｂ)に対して少なくとも約８０％の配列同一性を有する、請求項１２に記載の単離された核酸分子。
【請求項１４】
請求項１に記載の核酸分子を含んでなるベクター。
【請求項１５】
前記核酸分子がベクターで形質転換した宿主細胞により認識されるコントロール配列に作用可能に関連した請求項１４に記載のベクター。
【請求項１６】
受託番号ＰＴＡ-２９８５(ＤＮＡ１９４９１７-３０４４)でＡＴＣＣに寄託された核酸分子。
【請求項１７】
請求項１４に記載のベクターを含んでなる宿主細胞。
【請求項１８】
前記細胞がＣＨＯ細胞である請求項１７に記載の宿主細胞。
【請求項１９】
前記細胞が大腸菌である請求項１７に記載の宿主細胞。
【請求項２０】
前記細胞が酵母細胞である請求項１７に記載の宿主細胞。
【請求項２１】
ＰＲＯ３４１２８ポリペプチドの生産方法であって、前記ＰＲＯ３４１２８ポリペプチドの発現に適した条件下で、請求項１７に記載の宿主細胞を培養し、細胞培養物から前記ＰＲＯ３４１２８ポリペプチドを回収することを含んでなる方法。
【請求項２２】
図２(配列番号：２)の約１〜約３９４のアミノ酸残基の配列に対して少なくとも約８０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる単離されたＰＲＯ３４１２８ポリペプチド。
【請求項２３】
図２(配列番号：２)のアミノ酸残基１〜約３９４を含んでなる、請求項２２に記載の単離されたＰＲＯ３４１２８ポリペプチド。
【請求項２４】
ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ-２９８５(ＤＮＡ１９４９１７-３０４４)として、２００１年１月３０日にＡＴＣＣに寄託されたベクターのｃＤＮＡ挿入物によりコードされるポリペプチドに対して、少なくとも約８０％の配列同一性を有する単離されたＰＲＯ３４１２８ポリペプチド。
【請求項２５】
ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ-２９８５(ＤＮＡ１９４９１７-３０４４)として、２００１年１月３０日にＡＴＣＣに寄託されたベクターのｃＤＮＡ挿入物によりコードされた、請求項２４に記載の単離されたＰＲＯ３４１２８ポリペプチド。
【請求項２６】
図２(配列番号：２)の１〜約３９４のアミノ酸残基の配列、又は抗ＰＲＯ３４１２８抗体への結合部位を提供するのに十分なその断片を含んでなる単離されたＰＲＯ３４１２８ポリペプチド。
【請求項２７】
(ｉ)ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下、試験ＤＮＡ分子を、(ａ)図２(配列番号：２)の１〜約３９４のアミノ酸残基の配列を含んでなるＰＲＯ３４１２８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は(ｂ)(ａ)のＤＮＡ分子の相補鎖とハイブリダイゼーションさせ、(ｉｉ)前記ポリペプチドの発現に適した条件下で、前記試験ＤＮＡ分子を含んでなる宿主細胞を培養し、(ｉｉｉ)細胞培養物から前記ポリペプチドを回収することにより生産される単離されたポリペプチド。
【請求項２８】
前記試験ＤＮＡが(ａ)又は(ｂ)に対して少なくとも約８０％の配列同一性を有する、請求項２７に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項２９】
異種性アミノ酸配列に融合したＰＲＯ３４１２８ポリペプチドを含んでなるキメラ分子。
【請求項３０】
前記異種性アミノ酸配列がエピトープタグ配列である請求項２９に記載のキメラ分子。
【請求項３１】
前記異種性アミノ酸配列が免疫グロブリンのＦｃ領域である請求項２９に記載のキメラ分子。
【請求項３２】
ＰＲＯ３４１２８ポリペプチドに特異的に結合する抗体。
【請求項３３】
前記抗体がモノクローナル抗体である請求項３２に記載の抗体。
【請求項３４】
前記抗体がヒト化抗体である請求項３２に記載の抗体。
【請求項３５】
前記抗体が抗体断片である請求項３２に記載の抗体。
【請求項３６】
ＰＲＯ３４１２８ポリペプチドに対するアゴニスト。
【請求項３７】
ＰＲＯ３４１２８ポリペプチドに対するアンタゴニスト。
【請求項３８】
製薬的に許容可能な担体と混合せしめられて、(ａ)ＰＲＯ３４１２８ポリペプチド、(ｂ)ＰＲＯ３４１２８ポリペプチドに対するアゴニスト、(ｃ)ＰＲＯ３４１２８ポリペプチドに対するアンタゴニスト、又は(ｄ)抗ＰＲＯ３４１２８抗体を含有してなる物質の組成物。
【請求項３９】
(ａ)Ｘが図２(配列番号：２)の３４７〜３７７の任意のアミノ酸である、図２(配列番号：２)のアミノ酸１〜ＸをコードするＤＮＡ分子、又は(ｂ)(ａ)のＤＮＡ分子の相補鎖に対して少なくとも約８０％の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含んでなる単離された核酸分子。
【請求項４０】
(ａ)Ｘが図２(配列番号：２)の３４７〜３７７の任意のアミノ酸である、図２(配列番号：２)のアミノ酸１〜Ｘをコードするヌクレオチド配列、又は(ｂ)(ａ)のヌクレオチド配列の相補鎖を含んでなる、請求項３９に記載の単離された核酸。
【請求項４１】
(ａ)Ｘが図２(配列番号：２)の３４７〜３７７の任意のアミノ酸である、図２(配列番号：２)の約１〜Ｘのアミノ酸残基の配列と比較した場合に、少なくとも約８０％ポジティブのスコアとなるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列、又は(ｂ)(ａ)のヌクレオチド配列の相補鎖を含んでなる単離された核酸分子。
【請求項４２】
Ｘが図２(配列番号：２)の３４７〜３７７の任意のアミノ酸である、図２(配列番号：２)のアミノ酸１〜Ｘに対して少なくとも約８０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる単離された可溶性ＰＲＯ３４１２８ポリペプチド。
【請求項４３】
Ｘが図２(配列番号：２)の３４７〜３７７の任意のアミノ酸である、図２(配列番号：２)のアミノ酸１〜Ｘを含んでなる、請求項４２に記載の単離された可溶性ＰＲＯ３４１２８ポリペプチド。
【請求項４４】
Ｘが図２(配列番号：２)の３４７〜３７７の任意のアミノ酸である、図２(配列番号：２)のアミノ酸１〜Ｘのアミノ酸配列と比較した場合に、少なくとも約８０％ポジティブのスコアとなるアミノ酸配列を含んでなる単離された可溶性ＰＲＯ３４１２８ポリペプチド。
【請求項１】
(ａ)図２(配列番号：２)の約１〜約３９４のアミノ酸残基の配列を含んでなるＰＲＯ３４１２８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は(ｂ)(ａ)のＤＮＡ分子の相補鎖に対して、少なくとも約８０％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子。
【請求項２】
図１(配列番号：１)の約８８〜約１２６９のヌクレオチド位置の配列を含んでなる、請求項１に記載の単離された核酸分子。
【請求項３】
図１(配列番号：１)のヌクレオチド配列を含んでなる、請求項１に記載の単離された核酸分子。
【請求項４】
図２(配列番号：２)の約１〜約３９４のアミノ酸残基の配列をコードするヌクレオチド配列を含んでなる、請求項１に記載の単離された核酸分子。
【請求項５】
(ａ)ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ-２９８５(ＤＮＡ１９４９１７-３０４４)で、２００１年１月３０日にＡＴＣＣに寄託されたヒトタンパク質ｃＤＮＡによりコードされる同じ成熟ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は(ｂ)(ａ)のＤＮＡ分子の相補鎖に対して、少なくとも約８０％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子。
【請求項６】
ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ-２９８５(ＤＮＡ１９４９１７-３０４４)で、２００１年１月３０日にＡＴＣＣに寄託されたヒトタンパク質ｃＤＮＡによりコードされる同じ成熟ポリペプチドをコードするＤＮＡを含んでなる、請求項５に記載の単離された核酸分子。
【請求項７】
(ａ)ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ-２９８５(ＤＮＡ１９４９１７-３０４４)で、２００１年１月３０日にＡＴＣＣに寄託されたヒトタンパク質ｃＤＮＡの完全長ポリペプチドコード配列、又は(ｂ)(ａ)のコード配列の相補鎖に対して、少なくとも約８０％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子。
【請求項８】
ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ-２９８５(ＤＮＡ１９４９１７-３０４４)で、２００１年１月３０日にＡＴＣＣに寄託されたヒトタンパク質ｃＤＮＡの完全長ポリペプチドコード配列を含んでなる、請求項７に記載の単離された核酸分子。
【請求項９】
図２(配列番号：２)のアミノ酸１〜約３９４をコードする核酸配列の相補鎖に対してハイブリダイズするＤＮＡを含んでなるＰＲＯ３４１２８ポリペプチドをコードする単離された核酸分子。
【請求項１０】
図２(配列番号：２)のアミノ酸１〜約３９４をコードする核酸が、図１(配列番号：１)のヌクレオチド８８〜約１２６９を含んでなる、請求項９に記載の単離された核酸分子。
【請求項１１】
ハイブリダイゼーションがストリンジェントなハイブリダイゼーション及び洗浄条件下で生じる、請求項９に記載の単離された核酸分子。
【請求項１２】
少なくとも約７０７ヌクレオチドを含み、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下、試験ＤＮＡ分子を、(ａ)図２(配列番号：２)の１〜約３９４のアミノ酸残基の配列を含んでなるＰＲＯ３４１２８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は(ｂ)(ａ)のＤＮＡ分子の相補鎖とハイブリダイゼーションさせ、試験ＤＮＡ分子を単離することにより作製される、単離された核酸分子。
【請求項１３】
(ａ)又は(ｂ)に対して少なくとも約８０％の配列同一性を有する、請求項１２に記載の単離された核酸分子。
【請求項１４】
請求項１に記載の核酸分子を含んでなるベクター。
【請求項１５】
前記核酸分子がベクターで形質転換した宿主細胞により認識されるコントロール配列に作用可能に関連した請求項１４に記載のベクター。
【請求項１６】
受託番号ＰＴＡ-２９８５(ＤＮＡ１９４９１７-３０４４)でＡＴＣＣに寄託された核酸分子。
【請求項１７】
請求項１４に記載のベクターを含んでなる宿主細胞。
【請求項１８】
前記細胞がＣＨＯ細胞である請求項１７に記載の宿主細胞。
【請求項１９】
前記細胞が大腸菌である請求項１７に記載の宿主細胞。
【請求項２０】
前記細胞が酵母細胞である請求項１７に記載の宿主細胞。
【請求項２１】
ＰＲＯ３４１２８ポリペプチドの生産方法であって、前記ＰＲＯ３４１２８ポリペプチドの発現に適した条件下で、請求項１７に記載の宿主細胞を培養し、細胞培養物から前記ＰＲＯ３４１２８ポリペプチドを回収することを含んでなる方法。
【請求項２２】
図２(配列番号：２)の約１〜約３９４のアミノ酸残基の配列に対して少なくとも約８０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる単離されたＰＲＯ３４１２８ポリペプチド。
【請求項２３】
図２(配列番号：２)のアミノ酸残基１〜約３９４を含んでなる、請求項２２に記載の単離されたＰＲＯ３４１２８ポリペプチド。
【請求項２４】
ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ-２９８５(ＤＮＡ１９４９１７-３０４４)として、２００１年１月３０日にＡＴＣＣに寄託されたベクターのｃＤＮＡ挿入物によりコードされるポリペプチドに対して、少なくとも約８０％の配列同一性を有する単離されたＰＲＯ３４１２８ポリペプチド。
【請求項２５】
ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ-２９８５(ＤＮＡ１９４９１７-３０４４)として、２００１年１月３０日にＡＴＣＣに寄託されたベクターのｃＤＮＡ挿入物によりコードされた、請求項２４に記載の単離されたＰＲＯ３４１２８ポリペプチド。
【請求項２６】
図２(配列番号：２)の１〜約３９４のアミノ酸残基の配列、又は抗ＰＲＯ３４１２８抗体への結合部位を提供するのに十分なその断片を含んでなる単離されたＰＲＯ３４１２８ポリペプチド。
【請求項２７】
(ｉ)ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下、試験ＤＮＡ分子を、(ａ)図２(配列番号：２)の１〜約３９４のアミノ酸残基の配列を含んでなるＰＲＯ３４１２８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は(ｂ)(ａ)のＤＮＡ分子の相補鎖とハイブリダイゼーションさせ、(ｉｉ)前記ポリペプチドの発現に適した条件下で、前記試験ＤＮＡ分子を含んでなる宿主細胞を培養し、(ｉｉｉ)細胞培養物から前記ポリペプチドを回収することにより生産される単離されたポリペプチド。
【請求項２８】
前記試験ＤＮＡが(ａ)又は(ｂ)に対して少なくとも約８０％の配列同一性を有する、請求項２７に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項２９】
異種性アミノ酸配列に融合したＰＲＯ３４１２８ポリペプチドを含んでなるキメラ分子。
【請求項３０】
前記異種性アミノ酸配列がエピトープタグ配列である請求項２９に記載のキメラ分子。
【請求項３１】
前記異種性アミノ酸配列が免疫グロブリンのＦｃ領域である請求項２９に記載のキメラ分子。
【請求項３２】
ＰＲＯ３４１２８ポリペプチドに特異的に結合する抗体。
【請求項３３】
前記抗体がモノクローナル抗体である請求項３２に記載の抗体。
【請求項３４】
前記抗体がヒト化抗体である請求項３２に記載の抗体。
【請求項３５】
前記抗体が抗体断片である請求項３２に記載の抗体。
【請求項３６】
ＰＲＯ３４１２８ポリペプチドに対するアゴニスト。
【請求項３７】
ＰＲＯ３４１２８ポリペプチドに対するアンタゴニスト。
【請求項３８】
製薬的に許容可能な担体と混合せしめられて、(ａ)ＰＲＯ３４１２８ポリペプチド、(ｂ)ＰＲＯ３４１２８ポリペプチドに対するアゴニスト、(ｃ)ＰＲＯ３４１２８ポリペプチドに対するアンタゴニスト、又は(ｄ)抗ＰＲＯ３４１２８抗体を含有してなる物質の組成物。
【請求項３９】
(ａ)Ｘが図２(配列番号：２)の３４７〜３７７の任意のアミノ酸である、図２(配列番号：２)のアミノ酸１〜ＸをコードするＤＮＡ分子、又は(ｂ)(ａ)のＤＮＡ分子の相補鎖に対して少なくとも約８０％の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含んでなる単離された核酸分子。
【請求項４０】
(ａ)Ｘが図２(配列番号：２)の３４７〜３７７の任意のアミノ酸である、図２(配列番号：２)のアミノ酸１〜Ｘをコードするヌクレオチド配列、又は(ｂ)(ａ)のヌクレオチド配列の相補鎖を含んでなる、請求項３９に記載の単離された核酸。
【請求項４１】
(ａ)Ｘが図２(配列番号：２)の３４７〜３７７の任意のアミノ酸である、図２(配列番号：２)の約１〜Ｘのアミノ酸残基の配列と比較した場合に、少なくとも約８０％ポジティブのスコアとなるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列、又は(ｂ)(ａ)のヌクレオチド配列の相補鎖を含んでなる単離された核酸分子。
【請求項４２】
Ｘが図２(配列番号：２)の３４７〜３７７の任意のアミノ酸である、図２(配列番号：２)のアミノ酸１〜Ｘに対して少なくとも約８０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる単離された可溶性ＰＲＯ３４１２８ポリペプチド。
【請求項４３】
Ｘが図２(配列番号：２)の３４７〜３７７の任意のアミノ酸である、図２(配列番号：２)のアミノ酸１〜Ｘを含んでなる、請求項４２に記載の単離された可溶性ＰＲＯ３４１２８ポリペプチド。
【請求項４４】
Ｘが図２(配列番号：２)の３４７〜３７７の任意のアミノ酸である、図２(配列番号：２)のアミノ酸１〜Ｘのアミノ酸配列と比較した場合に、少なくとも約８０％ポジティブのスコアとなるアミノ酸配列を含んでなる単離された可溶性ＰＲＯ３４１２８ポリペプチド。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【公開番号】特開２００９−２１９４９２（Ｐ２００９−２１９４９２Ａ）
【公開日】平成２１年１０月１日（２００９．１０．１）
【国際特許分類】
【外国語出願】
【出願番号】特願２００９−６６４６９（Ｐ２００９−６６４６９）
【出願日】平成２１年３月１８日（２００９．３．１８）
【分割の表示】特願２００３−５７４７７６（Ｐ２００３−５７４７７６）の分割
【原出願日】平成１５年２月１８日（２００３．２．１８）
【公序良俗違反の表示】
（特許庁注：以下のものは登録商標）
１．ＵＮＩＸ
【出願人】（５９６１６８３１７）ジェネンテック・インコーポレーテッド (372)
【氏名又は名称原語表記】ＧＥＮＥＮＴＥＣＨ，ＩＮＣ．
【Ｆターム（参考）】
【公開日】平成２１年１０月１日（２００９．１０．１）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００９−６６４６９（Ｐ２００９−６６４６９）
【出願日】平成２１年３月１８日（２００９．３．１８）
【分割の表示】特願２００３−５７４７７６（Ｐ２００３−５７４７７６）の分割
【原出願日】平成１５年２月１８日（２００３．２．１８）
【公序良俗違反の表示】
（特許庁注：以下のものは登録商標）
１．ＵＮＩＸ
【出願人】（５９６１６８３１７）ジェネンテック・インコーポレーテッド (372)
【氏名又は名称原語表記】ＧＥＮＥＮＴＥＣＨ，ＩＮＣ．
【Ｆターム（参考）】
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