本発明は、アルツハイマー病に関連する遺伝子多型の発見に基づく。特に、本発明は、多型を含む核酸分子、このような核酸分子によってコードされる改変タンパク質、多型核酸分子および多型タンパク質を検出するための試薬、ならびに核酸分子およびタンパク質を用いる方法、ならびにこれらの検出のための試薬の使用方法に関する。特に、本発明は、ヒトゲノムにおける特定の一塩基多型（ＳＮＰ）、ならびにアルツハイマー病および関係する病理とのそれらの関連に関する。正常個体に対しての、アルツハイマー病患者集団における対立遺伝子頻度の違いに基づいて、本明細書において開示される天然に存在するＳＮＰは、診断試薬の設計および治療剤の開発のため、ならびに疾患関連性解析および連鎖解析のための標的として、使用され得る。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
アルツハイマー病を発症する危険性が変更された個体を同定する方法であって、該方法は、該個体の核酸において、１以上の一塩基多型（ＳＮＰ）の対立遺伝子の存在または非存在を検出する工程を包含し、該ＳＮＰは、配列番号１１〜１５および２０〜３１のヌクレオチド配列のいずれか１つから選択され、該対立遺伝子の存在または非存在が、該個体のアルツハイマー病を発症する危険性と相関する、方法。
【請求項２】
前記ＳＮＰが、配列番号１１、配列番号１３、配列番号２０、配列番号２１、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７、および配列番号２８からなるヌクレオチド配列の群より選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
請求項１に記載の方法であって、該方法は、前記個体の前記核酸を検出試薬と接触させる工程、および、特定のＳＮＰ位置においてヌクレオチドが存在するかしないかを決定する工程を包含する、方法。
【請求項４】
前記核酸が、前記個体の血球から調製される、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
前記検出試薬が、ポリヌクレオチドプローブである、請求項３に記載の方法。
【請求項６】
前記プローブの３’末端が、前記核酸における前記ＳＮＰにハイブリダイズする、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
前記プローブが、レポーター色素で標識される、請求項５に記載の方法。
【請求項８】
核酸分子において一塩基多型（ＳＮＰ）を検出する方法であって、該方法は、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、配列番号１〜５および１１〜３１のヌクレオチド配列のいずれか１つにおけるＳＮＰに特異的にハイブリダイズする試薬と、試験サンプルとを接触させる工程、ならびにハイブリダイズした二重鎖の形成を検出する工程、を包含する、方法。
【請求項９】
請求項８に記載の方法であって、以下：対立遺伝子特異的プローブハイブリダイゼーション、対立遺伝子特異的プライマー伸長、対立遺伝子特異的増幅、配列決定、５’ヌクレアーゼ消化、分子ビーコンアッセイ、オリゴヌクレオチドライゲーションアッセイ、サイズ分析、および一本鎖立体配座多型からなる群より選択されるプロセスにより検出が実施される、方法。
【請求項１０】
アルツハイマー病を発症する危険性が変更された個体を同定する方法であって、該方法は、該個体の核酸において、多型の存在または非存在を検出する工程を包含し、該多型は、配列番号１１〜１５および２０〜３１のヌクレオチド配列のいずれか１つにおけるＳＮＰとの連鎖不平衡の状態にあり、該多型の存在または非存在は、該個体のアルツハイマー病を発症する危険性と相関する、方法。
【請求項１１】
前記ＳＮＰが、配列番号１１、配列番号１３、配列番号２０、配列番号２１、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７、および配列番号２８からなるヌクレオチド配列の群より選択される、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
ＳＮＰ含有核酸分子によりコードされる改変タンパク質を検出するための試薬であって、該試薬は、別の核酸分子によりコードされるタンパク質と比較して、該改変タンパク質に選択的に結合し、該ＳＮＰ含有核酸分子は、配列番号１１〜１５および２０〜３１のヌクレオチド配列のいずれか１つにおけるＳＮＰを含む、試薬。
【請求項１３】
前記試薬が、抗体、抗体フラグメント、アプタマー、ペプチド、リガンド、または、低分子化合物である、請求項１２に記載の試薬。
【請求項１４】
前記試薬が、レポーター色素または画像化剤で標識される、請求項１３に記載の試薬。
【請求項１５】
請求項１２に記載の試薬と、緩衝液とを含む、キット。
【請求項１６】
配列番号１〜５および１１〜３１のヌクレオチド配列のいずれか１つから選択される一塩基多型（ＳＮＰ）を含む増幅されたポリヌクレオチドまたはその相補体であって、該増幅されたポリヌクレオチドは、約１６ヌクレオチドと約１，０００ヌクレオチドとの間の長さである、増幅されたポリヌクレオチド。
【請求項１７】
前記ヌクレオチド配列が、配列番号１〜５および１１〜３１のヌクレオチド配列のいずれか１つを含む、請求項１６に記載の増幅されたポリヌクレオチド。
【請求項１８】
配列番号１〜５および１１〜３１におけるヌクレオチド配列のいずれか１つにおける一塩基多型（ＳＮＰ）を含む核酸分子に特異的にハイブリダイズする、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１９】
８ヌクレオチド〜７０ヌクレオチドの長さである、請求項１８に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２０】
対立遺伝子特異的なプローブである、請求項１８に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２１】
対立遺伝子特異的なプライマーである、請求項１８に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２２】
核酸において一塩基多型（ＳＮＰ）を検出するためのキットであって、請求項１８に記載のポリヌクレオチドと、緩衝液と、酵素とを含む、キット。
【請求項２３】
配列番号６〜１０からなるアミノ酸配列の群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチド。
【請求項２４】
請求項２３に記載の単離されたポリペプチドであって、該ポリペプチドは、配列番号６〜１０からなるアミノ酸配列の群より選択されるアミノ酸配列を有する、単離されたポリペプチド。
【請求項２５】
請求項２３に記載のポリペプチドに選択的に結合する、抗体。
【請求項２６】
アルツハイマー病を治療的もしくは予防的に処置する際に有用な因子を同定するための方法であって、該方法は、候補因子に請求項２４に記載のポリペプチドを、該ポリペプチドと該候補因子との間で結合複合体を形成させるために適切な条件下で接触させる工程、ならびに該結合複合体の形成を検出する工程を包含し、ここで、該複合体の存在が、該因子を同定する、方法。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【公表番号】特表２００９−５２８０２３（Ｐ２００９−５２８０２３Ａ）
【公表日】平成２１年８月６日（２００９．８．６）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００８−５３７９２０（Ｐ２００８−５３７９２０）
【出願日】平成１８年１０月２６日（２００６．１０．２６）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００６／０４１６６９
【国際公開番号】ＷＯ２００７／０５０７０５
【国際公開日】平成１９年５月３日（２００７．５．３）
【出願人】（５０８３５６０６５）セレラ　コーポレーション (11)
【Ｆターム（参考）】