脳卒中におけるヒトPDE4D遺伝子が開示される。PDE4D遺伝子内の多型を用いる脳卒中の臨床的経過の予測および治療がまた開示される。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
健康な個体と比較して、脳卒中に対して罹患性である個体においてより頻繁に存在するホスホジエステラーゼ4D遺伝子のリスクのあるハプロタイプについてスクリーニングする工程を含み、リスクのあるハプロタイプが脳卒中のリスクを有意に増大する、個体における脳卒中または脳卒中に対する罹患性を診断する方法。
【請求項２】
有意な増大が少なくとも約20％である請求項１記載の方法。
【請求項３】
有意な増大が少なくとも約1.2のオッズ比として同定される請求項１記載の方法。
【請求項４】
健康な個体（対照）における存在の頻度と比較して、脳卒中に対して罹患性である個体（罹患者）においてより頻繁に存在するホスホジエステラーゼ4D遺伝子のリスクのあるハプロタイプについてスクリーニングする工程を含み、リスクのあるハプロタイプの存在が脳卒中に対する罹患性の指標となる、個体における脳卒中に対する罹患性の診断方法。
【請求項５】
リスクのあるハプロタイプ１が、配列番号：１およびマイクロサテライトマーカーAC0088181-1の対立遺伝子0と比べて、核酸位置142780のGの存在により特徴付けられる請求項４記載の方法。
【請求項６】
リスクのあるハプロタイプ２が、核酸位置：142780、135112、132562、131865、129361、129360、125304、123426、123312、120628、118914、111781、111252、109301、107849、105225、104552、102977、100795、99035、88614、88456、83119、82244、80127、78552におけるGTAACCACGAACTTATTGAATTTGAAの存在により特徴付けられる請求項４記載の方法。
【請求項７】
リスクのあるハプロタイプ３が、配列番号：１と比べて、核酸位置138806、131865、129361、120628、91470のA A C A Aの存在により特徴付けられる請求項４記載の方法。
【請求項８】
ハプロタイプ１または脳卒中罹患性に特異的に相関するPDE4D内または付近のリスクのあるハプロタイプの存在についてスクリーニングする工程を含む請求項４記載の方法。
【請求項９】
ハプロタイプ２または脳卒中罹患性に有意に相関するPDE4D内または付近にハプロタイプの存在についてスクリーニングする請求項４記載の方法。
【請求項１０】
ハプロタイプ３または脳卒中罹患性に有意に相関するPDE4D内または付近のハプロタイプの存在についてスクリーニングする請求項１０記載の方法。
【請求項１１】
前記個体由来の核酸の酵素的増幅を含むホスホジエステラーゼ4D遺伝子のリスクのあるハプロタイプの存在についてスクリーニングする工程が、前記個体からの核酸の酵素増幅を含む請求項４記載の方法。
【請求項１２】
核酸がDNAである請求項１１記載の方法。
【請求項１３】
DNAが哺乳動物である請求項１２記載の方法。
【請求項１４】
DNAがヒトである請求項１３記載の方法。
【請求項１５】
ホスホジエステラーゼ4D遺伝子のリスクのあるハプロタイプの存在についてスクリーニングする工程が：
(a)個体から核酸を含む材料を得ること；
(b)該核酸を増幅する工程；および
(c)該増幅核酸においてリスクのあるハプロタイプの存在または非存在を測定する工程
を含む請求項４記載の方法。
【請求項１６】
リスクのあるハプロタイプの存在が電気泳動分析により行われる請求項１５記載の方法。
【請求項１７】
リスクのあるハプロタイプの存在を測定する工程が制限断片長多型分析により行われる請求項１５記載の方法。
【請求項１８】
リスクのあるハプロタイプの存在を測定する工程が配列分析により行われる請求項１５記載の方法。
【請求項１９】
リスクのあるハプロタイプの存在を測定する工程がハイブリダイゼーション分析により行われる請求項１５記載の方法。
【請求項２０】
リスクのあるハプロタイプを含有するホスホジエステラーゼ4D遺伝子の領域の核酸増幅のためのプライマーを含有してなる、個体における脳卒中に対する罹患性を診断するためのキット。
【請求項２１】
プライマーが、核酸増幅に適切な長さの核酸のセグメント、配列番号：１およびマイクロサテライトマーカーAC0088181-1の対立遺伝子０と比べて核酸位置142780にそれぞれ、単一ヌクレオチド多型を含有してなる請求項２０記載のキット。
【請求項２２】
プライマーが、配列番号：１、ミクロサテライトマーカーAC008818-1の対立遺伝子０と比較して、核酸位置142780、135112、132562、131865、129361、129360、125304、123426、123312、120628、118914、111781、111252、109301、107849、105225、104552、102977、100795、99035、88614、88456、83119、82244、80127、78552の単一ヌクレオチド多型またはミクロサテライトマーカーおよびその組み合わせからなる群より選ばれる、核酸増幅に適切な長さの核酸のセグメントを含有してなる請求項２０記載のキット。
【請求項２３】
プライマーが、配列番号：１と比べて、核酸位置138806、131865、129361、120628、91470の核酸位置の単一ヌクレオチド多型からなる群より選ばれる、核酸増幅に適切な長さの核酸のセグメントを含有してなる請求項２０記載のキット。
【請求項２４】
対照と比べて個体におけるPDE4Dイソ型発現レベルを決定する工程を含み、イソ型発現の発現における差異が脳卒中に対する罹患性を示す個体における脳卒中に対する感受性の評価方法。
【請求項２５】
イソ型PDE4D7および／またはPDE4D9発現が測定される請求項２４記載の方法。
【請求項２６】
対照試料中のホスホジエステラーゼ4D遺伝子によりコードされるポリペプチドの発現または組成と比較して、試験試料中のホスホジエステラーゼ4D遺伝子によりコードされるポリペプチドの発現または組成における変化を検出する工程を含み、試験試料中のポリペプチドの発現または組成における変化が脳卒中に対する罹患性を示す、脳卒中に対する感受性の診断方法。
【請求項２７】
ホスホジエステラーゼ4D遺伝子によりコードされるポリペプチドの発現または組成における変化が、対照試料中に発現されたスプライシングバリアントポリペプチドとは異なる試験試料中の試験試料中のスプライシングバリアントポリペプチドの発現を含む請求項２６記載の方法。
【請求項２８】
対照と比較してPDE4Dイソ型レベルを調節することを含み、それにより調節されたイソ型レベルが健康な個体におけるレベルを模倣する、個体における脳卒中の発生を予防する方法。
【請求項２９】
イソ型レベルが、ホスホジエステラーゼ4D遺伝子結合因子、ホスホジエステラーゼ4D遺伝子レセプター、ペプチド模倣物、融合タンパク質、プロドラッグ、抗体またはリボザイムを用いてイソ型の発現を調節することにより調節される請求項２８記載の方法。
【請求項３０】
イソ型レベルがイソ型の発現レベルを遺伝子的に変化させることにより制御される請求項２８記載の方法。
【請求項３１】
イソ型レベルがイソ型の比を変化させることにより調節される請求項２８記載の方法。
【請求項３２】
イソ型PDE4D7および／またはPDE4D9が調節される請求項２８記載の方法。
【請求項３３】
末梢血またはそれに由来する細胞のサンプル中のPDE4Dメッセージまたはタンパク質または酵素活性を測定することにより、RNAまたはタンパク質レベルでの１つ以上のPDE4Dイソ型の発現、またはその酵素活性の調節において治療の有効性をモニターする方法。
【請求項３４】
ホスホジエステラーゼ4D遺伝子における脳卒中のリスクがあるハプロタイプの有無についてスクリーニングする工程を含む、特定の個体における脳卒中予防または処置のための特定の治療の有効性を予測する方法。
【請求項３５】
末梢血またはそれに由来する細胞の試料中のPDE4Dメッセージまたはタンパク質または酵素活性を測定することにより、RNAまたはタンパク質レベルでの１つ以上のPDE4Dイソ型の発現、またはその酵素活性についてスクリーニングする工程を含む、特定の個体における脳卒中予防または処置のための特定の治療の有効性を予測する方法。
【請求項３６】
脳卒中に対して罹患性である個体と比べて、個体により頻繁に存在するホスホジエステラーゼ4D遺伝子における保護的ハプロタイプについてスクリーニングする工程を含み、保護的ハプロタイプが脳卒中のリスクを有意に減少させる、個体における脳卒中に対する低減した、または保護的罹患性の診断方法。
【請求項３７】
保護的ハプロタイプが、配列番号：１およびミクロサテライトマーカーAC0088181-1についての対立遺伝子-8と比べて、142780位のA対立遺伝子により特徴付けられる請求項３６記載の方法。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【図６】

【図７−１】

【図７−２】

【図７−３】

【図７−４】

【図７−５】

【図７−６】

【図７−７】

【図７−８】

【図７−９】

【図７−１０】

【図８−１】

【図８−２】

【図１０】

【図１１】

【図１２】

【図１３】

【公表番号】特表２００６−５０００６８（Ｐ２００６−５０００６８Ａ）
【公表日】平成１８年１月５日（２００６．１．５）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００４−５４０１７３（Ｐ２００４−５４０１７３）
【出願日】平成１５年９月２５日（２００３．９．２５）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００３／０２９９０６
【国際公開番号】ＷＯ２００４／０２８３４１
【国際公開日】平成１６年４月８日（２００４．４．８）
【出願人】（５０２０８３９１２）
【Ｆターム（参考）】