本発明は、ＥＧＦＲ−ＲＰ、ＴＲＡ１、ＭＦＧＥ８、ＴＮＦＳＦ１３およびＺＦＰ２３６の各遺伝子などの遺伝子のアップレギュレーション、サイレンシングおよび／またはダウンレギュレーションにより標的遺伝子発現を操作することによって癌を治療する方法に関する。この方法は、タンパク質、ペプチドおよび遺伝子療法薬物理学療法のための標的ＩＣＴ１０３０として検証された遺伝子の発現を増強することによる；または抗体、小分子およびその他の阻害剤薬物理学療法について検証されたＩＣＴ１０２４、ＩＣＴ１０２５、ＩＣＴ１０３１およびＩＣＴ１００３などの標的をサイレンシングおよび／またはダウンレギュレーションするＲＮＡ干渉による、癌の治療および／または腫瘍増殖の阻害に有用である。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＩＣＴ１０３０ペプチドの望ましくない活性または発現に関連する哺乳類の疾病を治療するための方法であって、ＩＣＴ１０３０ペプチドまたは遺伝子と相互作用し、哺乳類の組織に導入されたときにＩＣＴ１０３０の発現または活性を増強し得る組成物を適用することを含んでなる、方法。
【請求項２】
前記疾病が癌または前癌増殖である、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記組織が乳房組織、結腸組織、前立腺組織、皮膚組織、骨組織、耳下腺組織、膵臓組織、腎臓組織、子宮頚組織、リンパ節組織、または卵巣組織である、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記組成物が核酸である、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記核酸がデコイ分子、デコイＤＮＡ、二本鎖ＤＮＡ、一本鎖ＤＮＡ、複合化ＤＮＡ、封入ＤＮＡ、ウイルスＤＮＡ、プラスミドＤＮＡ、裸のＲＮＡ、封入ＲＮＡ、ウイルスＲＮＡ、二本鎖ＲＮＡ、標的ＩＣＴＥ１０３０遺伝子の発現を増強し得る分子、またはそれらの組合せである、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
前記核酸分子が実質的に二本鎖であり、約１００塩基対以下の長さである、請求項４に記載の方法。
【請求項７】
前記核酸組成物が、ｓｉＲＮＡ、ＲＮＡｉもしくはｓｈＲＮＡ、またはｓｉＲＮＡ、ＲＮＡｉもしくはｓｈＲＮＡをコードし得る核酸分子を含んでなるものである、請求項４に記載の方法。
【請求項８】
前記核酸組成物がｓｉＲＮＡ、ＲＮＡｉまたはｓｈＲＮＡをコードし得る核酸分子であり、その核酸分子がプラスミド、コスミド、バクテリオファージ、またはウイルスベクターである、請求項４に記載の方法。
【請求項９】
前記ベクターがレトロウイルスベクターまたはアデノウイルスベクターである、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
前記核酸組成物がｓｉＲＮＡ、ＲＮＡｉ、およびｓｈＲＮＡからなる群から選択される少なくとも１種の分子を含んでなり、その分子が哺乳類において標的ＩＣＴＥ１０３０遺伝子の発現を増強するものである、請求項４に記載の方法。
【請求項１１】
哺乳類がヒトである、請求項１に記載の方法。
【請求項１２】
前記核酸が標的ＩＣＴＥ１０３０遺伝子コード核酸と三重らせんを形成するものである、請求項４に記載の方法。
【請求項１３】
前記標的ＩＣＴ１０３０遺伝子が、
（ａ）配列番号２で示されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
（ｂ）配列番号１または配列番号３で示されるポリヌクレオチド、および
（ｃ）（ａ）または（ｂ）のポリヌクレオチドと少なくとも約９０％の配列同一性を有するポリヌクレオチド
からなる群から選択されるポリヌクレオチドを含んでなるものである、請求項１に記載の方法。
【請求項１４】
前記標的ＩＣＴ１０３０遺伝子が、配列番号１または配列番号３と少なくとも約９０％の配列同一性を有するポリヌクレオチドを含んでなるものである、請求項１に記載の方法。
【請求項１５】
前記標的ＩＣＴ１０３０遺伝子が、配列番号２で示されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドと少なくとも約９０％の配列同一性を有するポリヌクレオチドを含んでなるものである、請求項１に記載の方法。
【請求項１６】
前記標的ＩＣＴ１０３０遺伝子が、配列番号２で示されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドと少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリヌクレオチドを含んでなるものである、請求項１に記載の方法。
【請求項１７】
前記標的ＩＣＴ１０３０遺伝子が、配列番号２で示されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドと少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリヌクレオチドを含んでなるものである、請求項１に記載の方法。
【請求項１８】
前記核酸分子が実質的に二本鎖であり、約１００塩基対以下の長さである、請求項１３に記載の方法。
【請求項１９】
前記核酸組成物が、ｓｉＲＮＡ、ＲＮＡｉもしくはｓｈＲＮＡ、またはｓｉＲＮＡ、ＲＮＡｉもしくはｓｈＲＮＡをコードし得る核酸分子を含んでなるものである、請求項１３に記載の方法。
【請求項２０】
前記核酸組成物がｓｉＲＮＡ、ＲＮＡｉまたはｓｈＲＮＡをコードし得る核酸分子であり、その核酸分子がプラスミド、コスミド、バクテリオファージ、またはウイルスベクターである、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
前記ベクターがレトロウイルスベクターまたはアデノウイルスベクターである、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
核酸をそれを必要とする患者に投与する方法であって、その核酸分子が裸のオリゴヌクレオチドまたはベクターの形態で送達され、その核酸が標的ＩＣＴ１０３０遺伝子と相互作用する、方法。
【請求項２３】
前記核酸がベクターとして送達され、そのベクターがプラスミド、コスミド、バクテリオファージ、またはウイルスである、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
前記ベクターがレトロウイルスまたはアデノウイルスに基づくベクターである、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
前記核酸が哺乳類細胞における標的ＩＣＴ１０３０遺伝子発現を増強する、請求項２２に記載の方法。
【請求項２６】
前記細胞がヒト細胞である、請求項２２に記載の方法。
【請求項２７】
前記組成物が、配列番号２で示されるＩＣＴ１０３０ポリペプチド、または配列番号２のポリペプチドと少なくとも９０％の配列同一性およびＩＣＴ１０３０ポリペプチドの生物活性を有するポリペプチドである、請求項１に記載の方法。
【請求項２８】
前記組成物が、配列番号２で示されるＩＣＴ１０３０ポリペプチド、または配列番号２のポリペプチドと少なくとも９０％の配列同一性を有するポリペプチドに特異的な抗体である、請求項１に記載の方法。
【請求項２９】
哺乳類組織において癌または前癌増殖を阻害するための方法であって、その組織を、標的ＩＣＴ１０３０と相互作用するエンハンサーと接触させ、それにより標的ＩＣＴ１０３０の発現または活性を増強することを含んでなる、方法。
【請求項３０】
前記組織が乳房組織、結腸組織、前立腺組織、皮膚組織、骨組織、耳下腺組織、膵臓組織、腎臓組織、子宮頚組織、リンパ節組織、または卵巣組織である、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
前記組成物がｓｉＲＮＡ、ＲＮＡｉ、およびｓｈＲＮＡからなる群から選択される核酸を含んでなり、その分子が哺乳類において標的ＩＣＴ１０３０遺伝子の発現を増強する、請求項２９に記載の方法。
【請求項３２】
前記哺乳類がヒトである、請求項２９に記載の方法。
【請求項３３】
ＩＣＴ１０３１、ＩＣＴ１０２４、ＩＣＴ１０２５、またはＩＣＴ１００３ペプチドの望ましくない発現または活性に関連する哺乳類の疾病を治療するための方法であって、ＩＣＴ１０３１、ＩＣＴ１０２４、ＩＣＴ１０２５、またはＩＣＴ１００３のペプチドまたはＤＮＡもしくはＲＮＡと相互作用する阻害剤を含有する組成物を適用することを含んでなり、その組成物が、哺乳類の組織に導入されたときにＩＣＴ１０３１、ＩＣＴ１０２４、ＩＣＴ１０２５、またはＩＣＴ１００３ペプチドの発現または活性を低下させ得るものである、方法。
【請求項３４】
前記疾病が癌または前癌増殖である、請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
前記組織が乳房組織、結腸組織、前立腺組織、皮膚組織、骨組織、耳下腺組織、膵臓組織、腎臓組織、子宮頚組織、リンパ節組織、または卵巣組織である、請求項３３に記載の方法。
【請求項３６】
前記組成物が核酸である、請求項３３に記載の方法。
【請求項３７】
前記阻害剤がｓｉＲＮＡ、ＲＮＡｉ、ｓｈＲＮＡ、アンチセンスＲＮＡ、アンチセンスＤＮＡ、デコイ分子、デコイＤＮＡ、二本鎖ＤＮＡ、一本鎖ＤＮＡ、複合化ＤＮＡ、封入ＤＮＡ、ウイルスＤＮＡ、プラスミドＤＮＡ、裸のＲＮＡ、封入ＲＮＡ、ウイルスＲＮＡ、二本鎖ＲＮＡ、ＲＮＡ干渉を生じ得る分子、またはそれらの組合せである、請求項３６に記載の方法。
【請求項３８】
前記核酸分子が実質的に二本鎖であり、約１００塩基対以下の長さである、請求項３６に記載の方法。
【請求項３９】
前記核酸組成物が、ｓｉＲＮＡ、ＲＮＡｉもしくはｓｈＲＮＡ、またはｓｉＲＮＡ、ＲＮＡｉもしくはｓｈＲＮＡをコードし得る核酸分子を含んでなるものである、請求項３８に記載の方法。
【請求項４０】
前記核酸組成物がｓｉＲＮＡ、ＲＮＡｉもしくはｓｈＲＮＡをコードし得る核酸分子であり、その核酸分子がプラスミド、コスミド、バクテリオファージ、またはウイルスベクターである、請求項３９に記載の方法。
【請求項４１】
前記ベクターがレトロウイルスベクターまたはアデノウイルスベクターである、請求項４０に記載の方法。
【請求項４２】
前記核酸組成物がｓｉＲＮＡ、ＲＮＡｉ、およびｓｈＲＮＡからなる群から選択される少なくとも１種の分子を含んでなり、その分子が哺乳類において標的ＩＣＴ１０３１、ＩＣＴ１０２４、ＩＣＴ１０２５、またはＩＣＴ１００３遺伝子の転写後サイレンシングを起こすものである、請求項３６に記載の方法。
【請求項４３】
前記哺乳類がヒトである、請求項３３に記載の方法。
【請求項４４】
前記阻害剤が標的ＩＣＴ１０３１コード核酸と三重らせんを形成するものである、請求項３６に記載の方法。
【請求項４５】
前記標的ＩＣＴ１０３１遺伝子が、
（ａ）配列番号５で示されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
（ｂ）配列番号４で示されるポリヌクレオチド、および
（ｃ）（ａ）または（ｂ）のポリヌクレオチドと少なくとも約９０％の配列同一性を有するポリヌクレオチド
からなる群から選択されるポリヌクレオチドを含んでなるものである、請求項３３に記載の方法。
【請求項４６】
前記標的ＩＣＴ１０３１遺伝子が、配列番号５で示されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドと少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリヌクレオチドを含んでなるものである、請求項４５に記載の方法。
【請求項４７】
前記標的ＩＣＴ１０３１遺伝子が、配列番号４で示されるポリヌクレオチドと少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリヌクレオチドを含んでなるものである、請求項４５に記載の方法。
【請求項４８】
前記標的ＩＣＴ１００３遺伝子が、
（ａ）配列番号７で示されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
（ｂ）配列番号６または配列番号８で示されるポリヌクレオチド、および
（ｃ）（ａ）または（ｂ）のポリヌクレオチドと少なくとも約９０％の配列同一性を有するポリヌクレオチド
からなる群から選択されるポリヌクレオチドを含んでなるものである、請求項３３に記載の方法。
【請求項４９】
前記標的ＩＣＴ１００３遺伝子が、配列番号７で示されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドと少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリヌクレオチドを含んでなるものである、請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】
前記標的ＩＣＴ１００３遺伝子が、配列番号８で示されるポリヌクレオチドと少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリヌクレオチドを含んでなるものである、請求項４８に記載の方法。
【請求項５１】
前記標的ＩＣＴ１０２４遺伝子が、
（ａ）配列番号３７で示されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
（ｂ）配列番号５８、６０、６１、６２、６４、６６、６８または６９で示されるポリヌクレオチド、および
（ｃ）（ａ）または（ｂ）のポリヌクレオチドと少なくとも約９０％の配列同一性を有するポリヌクレオチド
からなる群から選択されるポリヌクレオチドを含んでなるものである、請求項３３に記載の方法。
【請求項５２】
前記標的ＩＣＴ１０２４遺伝子が、配列番号３７で示されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドと少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリヌクレオチドを含んでなるものである、請求項５１に記載の方法。
【請求項５３】
前記標的ＩＣＴ１０２４遺伝子が、配列番号５８、６０、６１、６２、６４、６６、６８または６９で示されるポリヌクレオチドと少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリヌクレオチドを含んでなるものである、請求項５１に記載の方法。
【請求項５４】
前記標的ＩＣＴ１０２５遺伝子が、
（ａ）配列番号７１で示されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
（ｂ）配列番号７０で示されるポリヌクレオチド、および
（ｃ）（ａ）または（ｂ）のポリヌクレオチドと少なくとも約９０％の配列同一性を有するポリヌクレオチド
からなる群から選択されるポリヌクレオチドを含んでなるものである、請求項３３に記載の方法。
【請求項５５】
前記標的ＩＣＴ１０２５遺伝子が、配列番号７０で示されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドと少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリヌクレオチドを含んでなるものである、請求項５４に記載の方法。
【請求項５６】
前記標的ＩＣＴ１０２５遺伝子が、配列番号７１で示されるポリヌクレオチドと少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリヌクレオチドを含んでなるものである、請求項５４に記載の方法。
【請求項５７】
哺乳類組織において癌または前癌増殖を阻害するための方法であって、その組織を、標的ＩＣＴ１０３１、ＩＣＴ１０２４、ＩＣＴ１０２５、またはＩＣＴ１００３のＤＮＡまたはＲＮＡと相互作用する阻害剤と接触させ、それにより標的ＩＣＴ１０３１、ＩＣＴ１０２４、ＩＣＴ１０２５、またはＩＣＴ１００３遺伝子発現を低下させることを含んでなる、方法。
【請求項５８】
前記組織が乳房組織、結腸組織、前立腺組織、皮膚組織、骨組織、耳下腺組織、膵臓組織、腎臓組織、子宮頚組織、リンパ節組織、または卵巣組織である、請求項５７に記載の方法。
【請求項５９】
前記阻害剤がｓｉＲＮＡ、ＲＮＡｉ、ｓｈＲＮＡ、アンチセンスＲＮＡ、アンチセンスＤＮＡ、デコイ分子、デコイＤＮＡ、二本鎖ＤＮＡ、一本鎖ＤＮＡ、複合化ＤＮＡ、封入ＤＮＡ、ウイルスＤＮＡ、プラスミドＤＮＡ、裸のＲＮＡ、封入ＲＮＡ、ウイルスＲＮＡ、二本鎖ＲＮＡ、ＲＮＡ干渉を生じ得る分子、またはそれらの組合せである、請求項５７に記載の方法。
【請求項６０】
前記核酸分子が実質的に二本鎖であり、約１００塩基対以下の長さである、請求項５７に記載の方法。
【請求項６１】
前記核酸組成物が、ｓｉＲＮＡ、ＲＮＡｉもしくはｓｈＲＮＡ、またはｓｉＲＮＡ、ＲＮＡｉもしくはｓｈＲＮＡをコードし得る核酸分子を含んでなるものである、請求項５７に記載の方法。
【請求項６２】
前記核酸組成物がｓｉＲＮＡ、ＲＮＡｉまたはｓｈＲＮＡをコードし得る核酸分子であり、その核酸分子がプラスミド、コスミド、バクテリオファージ、またはウイルスベクターである、請求項５７に記載の方法。
【請求項６３】
前記ベクターがレトロウイルスベクターまたはアデノウイルスベクターである、請求項６２に記載の方法。
【請求項６４】
前記核酸組成物がｓｉＲＮＡ、ＲＮＡｉ、およびｓｈＲＮＡからなる群から選択される少なくとも１種の分子を含んでなり、その分子が哺乳類において標的ＩＣＴ１０３１、ＩＣＴ１０２４、ＩＣＴ１０２５、またはＩＣＴ１００３遺伝子の転写後サイレンシングを起こすものである、請求項５７に記載の方法。
【請求項６５】
前記哺乳類がヒトである、請求項５７に記載の方法。
【請求項６６】
前記阻害剤が標的ＩＣＴ１０３１、ＩＣＴ１０２４、ＩＣＴ１０２５、またはＩＣＴ１００３コード核酸と三重らせんを形成するものである、請求項５７に記載の方法。
【請求項６７】
ｓｉＲＮＡをそれを必要とする患者に投与する方法であって、そのｓｉＲＮＡ分子が裸のオリゴヌクレオチドまたはベクターの形態で送達され、そのｓｉＲＮＡが標的ＩＣＴ１０３１、ＩＣＴ１０２４、ＩＣＴ１０２５、もしくはＩＣＴ１００３遺伝子、または標的ＩＣＴ１０３１、ＩＣＴ１０２４、ＩＣＴ１０２５、もしくはＩＣＴ１００３のｍＲＮＡ転写物と相互作用する、方法。
【請求項６８】
前記ｓｉＲＮＡがベクターとして送達され、そのベクターがプラスミド、コスミド、バクテリオファージ、またはウイルスである、請求項６７に記載の方法。
【請求項６９】
前記ベクターがレトロウイルスまたはアデノウイルスに基づくベクターである、請求項６８に記載の方法。
【請求項７０】
ベクターをそれを必要とする患者に投与することにより標的ＩＣＴ１０３１、ＩＣＴ１０２４、ＩＣＴ１０２５、またはＩＣＴ１００３遺伝子のin vivo発現を遮断する方法であって、そのベクターが標的ＩＣＴ１０３１、ＩＣＴ１０２４、ＩＣＴ１０２５、またはＩＣＴ１００３のｓｉＲＮＡを含むものである、方法。
【請求項７１】
前記ｓｉＲＮＡが標的ＩＣＴ１０３１、ＩＣＴ１０２４、ＩＣＴ１０２５、またはＩＣＴ１００３遺伝子発現と干渉するものである、請求項７０に記載の方法。
【請求項７２】
前記ｓｉＲＮＡが、哺乳類細胞において標的ＩＣＴ１０３１、ＩＣＴ１０２４、ＩＣＴ１０２５、またはＩＣＴ１００３遺伝子の転写後サイレンシングを起こすものである、請求項７１に記載の方法。
【請求項７３】
前記細胞がヒト細胞である、請求項７２に記載の方法。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【図６】

【図７】

【図８】

【図９】

【図１０】

【図１１】

【図１２】

【図１３】

【図１４】

【図１５】

【図１６】

【図１７】

【図１８】

【図１９】

【図２０】

【図２１】

【図２２】

【図２３】

【図２４】

【図２５】






【図２６】






【図２７】





【図２８】






【図２９】






【図３０】






【図３１】





【図３２】





【図５２】


【図５３】

【図５４】

【図５５】

【図５６】

【図５７】

【公表番号】特表２００７−５２５４４７（Ｐ２００７−５２５４４７Ａ）
【公表日】平成１９年９月６日（２００７．９．６）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００６−５０９５９０（Ｐ２００６−５０９５９０）
【出願日】平成１６年４月１日（２００４．４．１）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００４／０１００５９
【国際公開番号】ＷＯ２００４／０８９２８４
【国際公開日】平成１６年１０月２１日（２００４．１０．２１）
【出願人】（５０４１７５５１２）イントラディグム、コーポレイション (1)
【氏名又は名称原語表記】ＩＮＴＲＡＤＩＧＭ　ＣＯＲＰＯＲＡＴＩＯＮ
【Ｆターム（参考）】