本発明は、インスリン様成長因子I受容体（IGF-IR）および他の重要なタンパク質に結合する画期的タンパク質を提供する。本発明は、医薬調製物中の画期的タンパク質およびそれらタンパク質の誘導体、ならびに診断、研究および治療的応用におけるそれらの使用にも関係する。さらに本発明は、それらのタンパク質を含む細胞、それらのタンパク質をコードするポリヌクレオチドまたはそのフラグメント、および上記画期的タンパク質をコードするポリヌクレオチドを含むベクターに関する。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
第10フィブロネクチンタイプIII（¹⁰Fn3）ドメインを含むポリペプチドであって、¹⁰Fn3ドメインが（i）ループAB；ループBC；ループCD；ループDE；ループEF；およびループFGを含み；（ii）ヒト¹⁰Fn3ドメインの対応するループの配列と比較して変化したアミノ酸配列を持つループBC、DE、およびFGから選択される少なくとも一つのループを持ち；かつ（iii）ヒトIGF-IRを約1μM以下の解離定数で結合するポリペプチド。
【請求項２】
¹⁰Fn3ドメインがヒトIGF-IRを約10nM以下の解離定数で結合する、請求項1のポリペプチド。
【請求項３】
ループBCおよびループFGがヒト¹⁰Fn3ドメインの対応するループの配列と比較して変化したアミノ酸配列を持つ、請求項1のポリペプチド。
【請求項４】
¹⁰Fn3ドメインが配列番号2〜125、184〜203、または226のいずれか一つのアミノ酸配列を含む、請求項1のポリペプチド。
【請求項５】
ポリオキシアルキレン部分、ヒト血清アルブミン結合タンパク質、シアル酸、ヒト血清アルブミン、トランスフェリン、およびFcフラグメントから選択される1つ以上の薬物動態（PK）部分をさらに含む、請求項1のポリペプチド。
【請求項６】
PK部分がポリオキシアルキレン部分であり、前記ポリオキシアルキレン部分がポリエチレングリコールである、請求項5のポリペプチド。
【請求項７】
約50kD未満の抗体部分；リポカリンの誘導体；テトラネクチンの誘導体；アビマー；アンキリンの誘導体、および第2の第10フィブロネクチンタイプIII（¹⁰Fn3）ドメインから選択される第2ドメインをさらに含み、第2ドメインはヒトタンパク質を結合し、第2の¹⁰Fn3ドメインは（i）ループAB；ループBC；ループCD；ループDE；およびループFGを含み；（ii）ヒト¹⁰Fn3ドメインの対応するループの配列と比較してランダム化されたアミノ酸配列を持つループBC、DE、およびFGから選択される少なくとも一つのループを持ち、かつ（iii）ヒト¹⁰Fn3ドメインによって結合されないヒトタンパク質を約10nM以下の解離定数で結合する、請求項1のポリペプチド。
【請求項８】
第2ドメインが第2の¹⁰Fn3ドメインであり、配列番号2〜125、184〜203、または226のいずれか一つのアミノ酸配列を含む、請求項7のポリペプチド。
【請求項９】
第2ドメインがヒトIGF-IRを結合する、請求項7のポリペプチド。
【請求項１０】
第2ドメインがヒトVEGFR2を結合する、請求項7のポリペプチド。
【請求項１１】
第2ドメインが第2の¹⁰Fn3ドメインであり、配列番号126〜183のいずれか一つのアミノ酸配列を含む、請求項7のポリペプチド。
【請求項１２】
¹⁰Fn3ドメインと第2ドメインとが少なくとも一つのジスルフィド結合、ペプチド結合、ポリペプチド、ポリマー糖、またはポリエチレングリコール部分によって作動的に連結される、請求項7のポリペプチド。
【請求項１３】
前記ポリペプチドがIGF-IRへのIGF-IまたはIGF-IIの結合を阻害し、細胞ベースのアッセイにおいてIC50未満の濃度でヒトIGF-IRを活性化しない、上記請求項のいずれか一項のポリペプチド。
【請求項１４】
前記¹⁰Fn3ドメインが、a）それぞれがヒト¹⁰Fn3ドメインコード配列とは異なる候補第10フィブロネクチンタイプIII（¹⁰Fn3）ドメイン配列を含む候補RNA分子の集団（前記RNA分子は、それぞれが前記候補¹⁰Fn3ドメインコード配列に作動的に連結された翻訳開始配列および開始コドンを含み、かつそれぞれがその3'末端で核酸-ピューロマイシンリンカーに作動的に連結されている）を作製するステップ；b）前記候補¹⁰Fn3ドメインコード配列をインビトロ翻訳して候補RNA-¹⁰Fn3融合物の集団を産生させるステップ；c）候補RNA-Fn3融合物の前記集団をIGF-IRと接触させるステップ；およびd）IGF-IRに対する結合アフィニティーまたは特異性が、IGF-IRに対する前記ヒト¹⁰Fn3の結合アフィニティーまたは特異性と比較して、変化しているタンパク質部分を持つRNA-¹⁰Fn3融合物を選択するステップを含む方法によって選択される、請求項1のポリペプチド。
【請求項１５】
上記請求項のいずれか一項に記載のポリペプチドを含む薬学的に許容できる組成物であって、本質的にエンドトキシンフリーである組成物。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【図６】

【図７】

【図８】

【図９】

【図１０】

【図１１】

【図１２】

【図１３】

【図１４】

【図１５−１】

【図１５−２】

【図１６】

【図１７】

【図１８】

【図１９】

【図２０】

【図２１】

【図２２】

【図２３】

【図２４】

【図２５】

【図２６】

【図２７】

【図２８】

【図２９】

【図３０−１】

【図３０−２】

【図３０−３】

【図３０−４】

【図３０−５】

【図３０−６】

【図３０−７】

【図３０−８】

【図３０−９】

【公表番号】特表２０１０−５１０３１５（Ｐ２０１０−５１０３１５Ａ）
【公表日】平成２２年４月２日（２０１０．４．２）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００９−５３８４１０（Ｐ２００９−５３８４１０）
【出願日】平成１９年１１月２１日（２００７．１１．２１）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００７／０２４３１６
【国際公開番号】ＷＯ２００８／０６６７５２
【国際公開日】平成２０年６月５日（２００８．６．５）
【出願人】（５０９１４４３７３）アドネクサス・ア・ブリストル−マイヤーズ・スクイブ・アール・アンド・ディ・カンパニー (1)
【氏名又は名称原語表記】ＡＤＮＥＸＵＳ，Ａ　ＢＲＩＳＴＯＬ−ＭＹＥＲＳ　ＳＱＵＩＢＢ　Ｒ＆Ｄ　ＣＯＭＰＡＮＹ
【Ｆターム（参考）】