Ｒｅｔに対して活性な化合物，ならびにそのような化合物を使用する方法が記載される。また，Ｘ線結晶学を用いて決定されたＲｅｔ代替物の結晶構造も記載される。そのようなＲｅｔ代替物の結晶および構造情報は，例えば，分子スキャフォールドを同定するために，Ｒｅｔに結合しこれを調節するリガンドを開発するために，および既知のリカンドに基づいて改良されたリガンドを同定するために用いることができる。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の化学構造：
【化１】

［式中，
Ｒ²は，−ＣＨ₂−任意に置換されていてもよいアリール，−ＣＨ₂−任意に置換されていてもよいヘテロアリール，−Ｃ（Ｏ）−任意に置換されていてもよいアリール，−Ｃ（Ｏ）−任意に置換されていてもよいヘテロアリール，−Ｓ−任意に置換されていてもよいアリール，−Ｓ−任意に置換されていてもよいヘテロアリール，−Ｓ（Ｏ）₂−任意に置換されていてもよいアリール，および−Ｓ（Ｏ）₂−任意に置換されていてもよいヘテロアリールからなる群より選択され；および
Ｒ⁴は，任意に置換されていてもよいアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，−Ｏ−任意に置換されていてもよいアルキル，−Ｏ−任意に置換されていてもよいアリール，−Ｏ−任意に置換されていてもよいヘテロアリール，−ＮＨ−任意に置換されていてもよいアルキル，−ＮＨ−任意に置換されていてもよいアリール，および−ＮＨ−任意に置換されていてもよいヘテロアリールからなる群より選択される］
を有する化合物。
【請求項２】
Ｒ⁴が，任意に置換されていてもよいアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，および任意に置換されていてもよいヘテロアリールからなる群より選択される，請求項１記載の化合物。
【請求項３】
前記化合物が表１に挙げられる化合物である，請求項１記載の化合物。
【請求項４】
請求項１，２または３のいずれかに記載の化合物；および
薬学的に許容しうる担体，
を含む医薬組成物。
【請求項５】
Ｒｅｔの調節が治療上の利益を与える疾病または状態に罹患しているかまたはそのリスクを有する患者を治療する方法であって，前記患者に，請求項１，２または３のいずれかに記載の化合物の化学構造を有するＲｅｔ調節剤を投与することを含む方法。
【請求項６】
前記化合物がヒトへの投与について認可されている，請求項５記載の方法。
【請求項７】
前記疾病または状態がＲｅｔ媒介性疾病または状態である，請求項５記載の方法。
【請求項８】
前記疾病または状態が，多発性内分泌腺腫症ＩＩＡ型（ＭＥＮ２Ａ），多発性内分泌腺腫症ＩＩＢ型（ＭＥＮ２Ｂ），ヒルシュスプルング疾病（ＨＳＣＲ；神経節細胞欠損性巨大結腸），または骨髄性甲状腺癌腫（ＭＴＣ），家族性骨髄性甲状腺癌腫（ＦＭＴＣ），および乳頭状甲状腺癌腫（ＰＴＣ）からなる群より選択される，請求項５記載の方法。
【請求項９】
請求項１，２または３のいずれかに記載の化合物を含む医薬組成物または請求項４記載の
医薬組成物を含むキット。
【請求項１０】
さらに，前記組成物がヒトへの投与について認可されたものであることを示す文書を含む，請求項９記載のキット。
【請求項１１】
前記組成物が，多発性内分泌腺腫症ＩＩＡ型（ＭＥＮ２Ａ），多発性内分泌腺腫症ＩＩＢ型（ＭＥＮ２Ｂ），ヒルシュスプルング疾病（ＨＳＣＲ；神経節細胞欠損性巨大結腸），または骨髄性甲状腺癌腫（ＭＴＣ），家族性骨髄性甲状腺癌腫（ＦＭＴＣ），および乳頭状甲状腺癌腫（ＰＴＣ）からなる群より選択される適応症について認可されている，請求項１０記載のキット。
【請求項１２】
Ｒｅｔに対して活性を有する改良された調節剤を開発する方法であって，
式Ｉの複数の試験化合物のいずれかが，Ｒｅｔに対して活性を有する参照化合物と比較して，１またはそれ以上の所望の薬理学的特性の改良を与えるか否かを判定し；そして
前記所望の薬理学的特性の改良を有する化合物が存在すればこれを選択し，このことにより，改良された調節剤を提供し；
ここで，式Ｉは，
【化２】

式Ｉ
［式中，
Ｒ¹およびＲ⁵は，独立して，水素，ハロ，ヒドロキシ，任意に置換されていてもよいアルコキシル，任意に置換されていてもよいチオアルコキシ，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキル，−Ｃ（Ｘ）ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，−Ｃ（Ｘ）Ｒ²⁰，または−ＮＲ²²Ｒ²³であり；
Ｒ²，Ｒ³，およびＲ⁴は，独立して，水素，ハロ，ヒドロキシ，任意に置換されていてもよいアルコキシル，任意に置換されていてもよいチオアルコキシ，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，または任意に置換されていてもよいヘテロアラルキル，−Ｃ（Ｘ）Ｒ²⁰，−Ｃ（Ｘ）ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，−Ｓ（Ｏ）₂ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，−ＮＲ²²Ｒ²³，または−Ｓ（Ｏ）_nＲ²¹であり；
Ｒ¹⁶およびＲ¹⁷は，独立して，水素，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラ
ルキルであるか，またはＲ¹⁶およびＲ¹⁷は，一緒になって，５−７員の炭素環または複素環を形成し；
Ｒ²⁰は，ヒドロキシル，任意に置換されていてもよい低級アルコキシ，任意に置換されていてもよいアミン，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，または任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであり；
Ｒ²¹は，水素，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよいアミン，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであり；
Ｒ²²およびＲ²³は，独立して，水素，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキル，−Ｃ（Ｘ）Ｒ²⁰，−Ｃ（Ｘ）ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，または−Ｓ（Ｏ）₂Ｒ²¹であり；
Ｒ²⁴は，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，または任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであり；および
ｎ＝０，１，または２である］
であることを特徴とする方法。
【請求項１３】
前記所望の薬理学的特性が，ＦＧＦＲ１に対するより少なくとも１０倍高いＲｅｔに対する活性である，請求項１２記載の方法。
【請求項１４】
前記所望の特性が，０．１０μＭより低いＩＣ５０である，請求項１２記載の方法。
【請求項１５】
前記参照化合物が式Ｉの化合物である，請求項１２記載の方法。
【請求項１６】
前記改良された調節剤の少なくとも１つの誘導体を試験化合物として使用して，前記判定および選択を繰り返す，請求項１２記載の方法。
【請求項１７】
Ｒｅｔに結合するリガンドを開発する方法であって，
ＲｅｔまたはＲｅｔ代替物の結合部位に結合する１またはそれ以上の化合物を分子スキャフォールドとして同定し；
Ｒｅｔ代替物との共結晶中の少なくとも１つの分子スキャフォールドの配向を判定し；そして
改変したときに分子スキャフォールドとＲｅｔとの間の結合親和性または結合特性またはその両方が変化する，前記分子スキャフォールドの化学構造を同定し；そして
分子スキャフォールドの化学構造の１またはそれ以上が改変されているリガンドを合成して，変化した結合親和性または結合特異性またはその両方でＲｅｔに結合するリガンドを提供する，
ことを含む方法。
【請求項１８】
前記分子スキャフォールドが弱く結合する化合物である，請求項１７記載の方法。
【請求項１９】
前記分子スキャフォールドが複数のキナーゼに結合する，請求項１７記載の方法。
【請求項２０】
前記分子スキャフォールドが式Ｉのコア構造を含み，式Ｉは，
【化３】

式Ｉ
［式中，
Ｒ¹およびＲ⁵は，独立して，水素，ハロ，ヒドロキシ，任意に置換されていてもよいアルコキシル，任意に置換されていてもよいチオアルコキシ，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキル，−Ｃ（Ｘ）ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，−Ｃ（Ｘ）Ｒ²⁰，または−ＮＲ²²Ｒ²³であり；
Ｒ²，Ｒ³，およびＲ⁴は，独立して，水素，ハロ，ヒドロキシ，任意に置換されていてもよいアルコキシル，任意に置換されていてもよいチオアルコキシ，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，または任意に置換されていてもよいヘテロアラルキル，−Ｃ（Ｘ）Ｒ²⁰，−Ｃ（Ｘ）ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，−Ｓ（Ｏ）₂ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，−ＮＲ²²Ｒ²³，または−Ｓ（Ｏ）_nＲ²¹であり；
Ｒ¹⁶およびＲ¹⁷は，独立して，水素，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであるかまたはＲ¹⁶およびＲ¹⁷は，一緒になって，５−７員の炭素環または複素環を形成し；
Ｒ²⁰は，ヒドロキシル，任意に置換されていてもよい低級アルコキシ，任意に置換されていてもよいアミン，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，または任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであり；
Ｒ²¹は，水素，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよいアミン，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていても
よいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであり；
Ｒ²²およびＲ²³は，独立して，水素，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキル，−Ｃ（Ｘ）Ｒ²⁰，−Ｃ（Ｘ）ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，または−Ｓ（Ｏ）₂Ｒ²¹であり；
Ｒ²⁴は，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，または任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであり；および
ｎ＝０，１，または２である］
である，請求項１７記載の方法。
【請求項２１】
Ｒｅｔに特異的なリガンドを開発する方法であって，
複数のチロシンキナーゼに結合する化合物を同定し；そして
前記化合物の誘導体がＲｅｔに対して前記化合物より高い特異性を有するか否かを判定する，
ことを含む方法。
【請求項２２】
前記化合物が，前記複数のチロシンキナーゼのいずれかに対する結合より少なくとも１０倍高い親和性でＲｅｔに結合する，請求項２１記載の方法。
【請求項２３】
前記化合物が，少なくとも１つの保存Ｒｅｔ活性部位残基と相互作用する，請求項２２記載の方法。
【請求項２４】
前記化合物が前記複数のチロシンキナーゼと弱く結合する，請求項２１記載の方法。
【請求項２５】
前記複数のチロシンキナーゼがＲｅｔおよびＦＧＦＲ１を含む，請求項２１記載の方法。
【請求項２６】
前記複数のチロシンキナーゼが，Ｒｅｔ，ＦＧＦＲ１，ＦＧＦＲ２，ＦＧＦＲ３，およびＦＧＦＲ４を含む，請求項２１記載の方法。
【請求項２７】
前記化合物が，式Ｉのコア構造を含み，式Ｉは，
【化４】

式Ｉ
［式中，
Ｒ¹およびＲ⁵は，独立して，水素，ハロ，ヒドロキシ，任意に置換されていてもよいアルコキシル，任意に置換されていてもよいチオアルコキシ，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていても
よいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキル，−Ｃ（Ｘ）ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，−Ｃ（Ｘ）Ｒ²⁰，または−ＮＲ²²Ｒ²³であり；
Ｒ²，Ｒ³，およびＲ⁴は，独立して，水素，ハロ，ヒドロキシ，任意に置換されていてもよいアルコキシル，任意に置換されていてもよいチオアルコキシ，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，または任意に置換されていてもよいヘテロアラルキル，−Ｃ（Ｘ）Ｒ²⁰，−Ｃ（Ｘ）ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，−Ｓ（Ｏ）₂ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，−ＮＲ²²Ｒ²³，または−Ｓ（Ｏ）_nＲ²¹であり；
Ｒ¹⁶およびＲ¹⁷は，独立して，水素，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであるか，またはＲ¹⁶およびＲ¹⁷は，一緒になって，５−７員の炭素環または複素環を形成し；
Ｒ²⁰は，ヒドロキシル，任意に置換されていてもよい低級アルコキシ，任意に置換されていてもよいアミン，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，または任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであり；
Ｒ²¹は，水素，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよいアミン，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであり；
Ｒ²²およびＲ²³は，独立して，水素，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキル，−Ｃ（Ｘ）Ｒ²⁰，−Ｃ（Ｘ）ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，または−Ｓ（Ｏ）₂Ｒ²¹であり；
Ｒ²⁴は，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，または任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであり；および
ｎ＝０，１，または２である］
である，請求項２１記載の方法。
【請求項２８】
Ｒｅｔ代替物の結晶を得る方法であって，Ｒｅｔ代替物蛋白質を５−２０ｍｇ／ｍｌで，１０−２０％のＰＥＧ３３５０，０．１ＭのＨｅｐｅｓ（ｐＨ６．５），０．２Ｍの（ＮＨ₄）₂ＳＯ₄，１０％のエチレングリコール，４℃と実質的に同等の結晶化条件に供することを含む方法。
【請求項２９】
さらに，前記結晶化条件を最適化することを含む，請求項２８記載の方法。
【請求項３０】
前記Ｒｅｔ代替物がＦＧＦＲ１に由来するものであり，およびＲｅｔ代替物２中に存在するアミノ酸置換を含む，請求項２８記載の方法。
【請求項３１】
Ｒｅｔ代替物とＲｅｔ結合化合物との共結晶。
【請求項３２】
前記結合化合物が，少なくとも１つの保存Ｒｅｔ活性部位残基と相互作用する，請求項３１記載の共結晶。
【請求項３３】
前記結合化合物が式Ｉの化合物であり，式Ｉは，
【化５】

式Ｉ
［式中，
Ｒ¹およびＲ⁵は，独立して，水素，ハロ，ヒドロキシ，任意に置換されていてもよいアルコキシル，任意に置換されていてもよいチオアルコキシ，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキル，−Ｃ（Ｘ）ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，−Ｃ（Ｘ）Ｒ²⁰，または−ＮＲ²²Ｒ²³であり；
Ｒ²，Ｒ³，およびＲ⁴は，独立して，水素，ハロ，ヒドロキシ，任意に置換されていてもよいアルコキシル，任意に置換されていてもよいチオアルコキシ，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，または任意に置換されていてもよいヘテロアラルキル，−Ｃ（Ｘ）Ｒ²⁰，−Ｃ（Ｘ）ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，−Ｓ（Ｏ）₂ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，−ＮＲ²²Ｒ²³，または−Ｓ（Ｏ）_nＲ²¹であり；
Ｒ¹⁶およびＲ¹⁷は，独立して，水素，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであるか，またはＲ¹⁶およびＲ¹⁷は，一緒になって，５−７員の炭素環または複素環を形成し；
Ｒ²⁰は，ヒドロキシル，任意に置換されていてもよい低級アルコキシ，任意に置換されていてもよいアミン，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，または任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであ
り；
Ｒ²¹は，水素，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよいアミン，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであり；
Ｒ²²およびＲ²³は，独立して，水素，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキル，−Ｃ（Ｘ）Ｒ²⁰，−Ｃ（Ｘ）ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，または−Ｓ（Ｏ）₂Ｒ²¹であり；
Ｒ²⁴は，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，または任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであり；および
ｎ＝０，１，または２である］
である，請求項３１記載の共結晶。
【請求項３４】
前記共結晶が，Ｘ線ビーム中で使用するのに適したものである，請求項３１記載の共結晶。
【請求項３５】
前記結合化合物が式Ｉの化合物のコア構造を含む，請求項３３記載の共結晶。
【請求項３６】
キナーゼの構造を決定する方法であって，表３，４，および５のいずれかに記載の原子座標の表示を含むＲｅｔ代替物構造の電気的表示からホモロジーモデルを作成することを含む方法。
【請求項３７】
前記作成が，
Ｒｅｔと前記キナーゼとの間の保存アミノ酸残基を同定し；
前記Ｒｅｔ代替物構造中の複数の保存アミノ酸の原子座標を前記キナーゼの対応するアミノ酸に移動させて，前記キナーゼの概略構造を提供し；そして
前記キナーゼ中の残部のアミノ酸残基の構造の電気的表示を用いて前記キナーゼの残部を表す構造を構築する，
ことを含む，請求項３６記載の方法。
【請求項３８】
さらに，前記ホモロジーモデルを前記キナーゼの１またはそれ以上の結晶からの低い解像度のｘ線回折データと適合させることを含む，請求項３７記載の方法。
【請求項３９】
表３，４，および５のいずれかに示される保存残基の座標を利用する，請求項３７記載の方法。
【請求項４０】
ＲｅｔまたはＲｅｔ代替物の結合部位と結合化合物との共結晶構造の電気的表示であって，ここで，前記結晶構造は前記ＲｅｔまたはＲｅｔ代替物の結合部位の原子に対応する原子座標の表示を含む電気的表示。
【請求項４１】
前記結合化合物が，式Ｉ，
【化６】

式Ｉ
［式中，
Ｒ¹およびＲ⁵は，独立して，水素，ハロ，ヒドロキシ，任意に置換されていてもよいアルコキシル，任意に置換されていてもよいチオアルコキシ，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキル，−Ｃ（Ｘ）ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，−Ｃ（Ｘ）Ｒ²⁰，または−ＮＲ²²Ｒ²³であり；
Ｒ²，Ｒ³，およびＲ⁴は，独立して，水素，ハロ，ヒドロキシ，任意に置換されていてもよいアルコキシル，任意に置換されていてもよいチオアルコキシ，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，または任意に置換されていてもよいヘテロアラルキル，−Ｃ（Ｘ）Ｒ²⁰，−Ｃ（Ｘ）ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，−Ｓ（Ｏ）₂ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，−ＮＲ²²Ｒ²³，または−Ｓ（Ｏ）_nＲ²¹であり；
Ｒ¹⁶およびＲ¹⁷は，独立して，水素，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであるか，またはＲ¹⁶およびＲ¹⁷は，一緒になって，５−７員の炭素環または複素環を形成し；
Ｒ²⁰は，ヒドロキシル，任意に置換されていてもよい低級アルコキシ，任意に置換されていてもよいアミン，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，または任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであり；
Ｒ²¹は，水素，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよいアミン，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであり；
Ｒ²²およびＲ²³は，独立して，水素，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロア
ルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキル，−Ｃ（Ｘ）Ｒ²⁰，−Ｃ（Ｘ）ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，または−Ｓ（Ｏ）₂Ｒ²¹であり；
Ｒ²⁴は，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，または任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであり；および
ｎ＝０，１，または２である］
の化合物である，請求項４０記載の電気的表示。
【請求項４２】
概略図を含む，請求項４０記載の電気的表示。
【請求項４３】
Ｒｅｔのアミノ酸配列を含むＲｅｔ代替物結合部位の原子座標を用いる，請求項４０記載の電気的表示。
【請求項４４】
前記Ｒｅｔ代替物が，キナーゼドメインから本質的になる，請求項４０記載の電気的表示。
【請求項４５】
前記結合化合物が，請求項４１記載の式Ｉのコア構造とは異なるコア構造を含む，請求項４０記載の電気的表示。
【請求項４６】
結合部位の表面輪郭を含む，請求項４０記載の電気的表示。
【請求項４７】
複数の保存アミノ酸残基の結合特性の表示を含む，請求項４０記載の電気的表示。
【請求項４８】
生物学的薬剤を開発する方法であって，
Ｒｅｔ代替物の結晶構造を分析し；そして
前記生物学的薬剤を形成するための少なくとも１つのサブ構造を同定する，
ことを含む方法。
【請求項４９】
前記サブ構造はＲｅｔエピトープを含み，および前記方法はさらに，前記エピトープに対する抗体を開発することを含む，請求項４８記載の方法。
【請求項５０】
前記サブ構造は，変更されたＲｅｔ活性を与えると予測される変異部位を含み，および前記方法はさらに，Ｒｅｔ中の前記部位に変異を作成し，このことにより改変されたＲｅｔを与えることを含む，請求項４８記載の方法。
【請求項５１】
前記サブ構造は，別の成分を付着させるための付着点を含む，請求項４８記載の方法。
【請求項５２】
前記別の成分は，ペプチド，ポリペプチド，固相材料，リンカー，および標識からなる群より選択される，請求項５１記載の方法。
【請求項５３】
さらに前記別の成分を付着させることを含む，請求項５１記載の方法。
【請求項５４】
潜在的Ｒｅｔ結合化合物を同定する方法であって，化合物の少なくとも１つの電気的表示を，結合化合物と複合体形成したＲｅｔ代替物の構造のＲｅｔまたはＲｅｔ代替物結合部位の電気的表示と適合させることを含む方法。
【請求項５５】
ＲｅｔまたはＲｅｔ代替物結合部位の前記電気的表示が，表１−３のいずれかに記載される原子構造座標により規定される，請求項５４記載の方法。
【請求項５６】
ＲｅｔまたはＲｅｔ代替物と複合体形成した前記化合物のコンピュータ表示を除去し，コンピュータデータベースからの化合物のコンピュータ表示をＲｅｔまたはＲｅｔ代替物の活性部位のコンピュータ表示と適合させ；そして
望ましい幾何学的適合およびエネルギー的に望ましい相補的相互作用に基づいて，前記活性部位と最もよく適合する化合物を潜在的結合化合物として同定する，
ことを含む，請求項５４記載の方法。
【請求項５７】
ＲｅｔまたはＲｅｔ代替物と複合体形成した前記化合物のコンピュータ表示を，１またはそれ以上の化学基の欠失または付加またはその両方により改変し；
コンピュータデータベースからの化合物のコンピュータ表示をＲｅｔまたはＲｅｔ代替物の活性部位のコンピュータ表示と適合させ；そして
望ましい幾何学的適合およびエネルギー的に望ましい相補的相互作用に基づいて，前記活性部位と最もよく適合する化合物を潜在的結合化合物として同定する，
ことを含む，請求項５４記載の方法。
【請求項５８】
ＲｅｔまたはＲｅｔ代替物と複合体形成した化合物のコンピュータ表示を除去し；そして化合物検索コンピュータプログラムを用いて前記化合物と構造的類似性を有する化合物についてデータベースを検索するか，または，化合物構築コンピュータプログラムを用いて前記化合物の一部を類似の化学構造で置き換える，
ことを含む，請求項５４記載の方法。
【請求項５９】
Ｒｅｔ代替物と複合体形成した前記化合物が式Ｉの化合物であり，式Ｉは，
【化７】

式Ｉ
［式中，
Ｒ¹およびＲ⁵は，独立して，水素，ハロ，ヒドロキシ，任意に置換されていてもよいアルコキシル，任意に置換されていてもよいチオアルコキシ，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキル，−Ｃ（Ｘ）ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，−Ｃ（Ｘ）Ｒ²⁰，または−ＮＲ²²Ｒ²³であり；
Ｒ²，Ｒ³，およびＲ⁴は，独立して，水素，ハロ，ヒドロキシ，任意に置換されていてもよいアルコキシル，任意に置換されていてもよいチオアルコキシ，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，または任意に置換されていてもよいヘテロアラルキル，−Ｃ（Ｘ）Ｒ²⁰，−Ｃ（Ｘ）ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，−Ｓ（Ｏ）₂ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，−ＮＲ²²Ｒ²³，または−Ｓ（Ｏ）_nＲ²¹であり；
Ｒ¹⁶およびＲ¹⁷は，独立して，水素，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に
置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであるか，またはＲ¹⁶およびＲ¹⁷は，一緒になって，５−７員の炭素環または複素環を形成し；
Ｒ²⁰は，ヒドロキシル，任意に置換されていてもよい低級アルコキシ，任意に置換されていてもよいアミン，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，または任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであり；
Ｒ²¹は，水素，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよいアミン，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであり；
Ｒ²²およびＲ²³は，独立して，水素，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキル，−Ｃ（Ｘ）Ｒ²⁰，−Ｃ（Ｘ）ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，または−Ｓ（Ｏ）₂Ｒ²¹であり；
Ｒ²⁴は，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，または任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであり；および
ｎ＝０，１，または２である］
である，請求項５４記載の方法。
【請求項６０】
前記適合が，前記化合物が保存Ｒｅｔ活性部位残基の１またはそれ以上と相互作用するか否かを判定することを含む，請求項５４記載の方法。
【請求項６１】
Ｒｅｔ結合化合物を付着成分に付着させる方法であって，
キナーゼ結合化合物上の，前記付着成分を付着させるのにエネルギー的に許容しうる部位を同定し；そして
前記化合物またはその誘導体を前記付着成分の前記エネルギー的に許容しうる部位で付着させる，
ことを含む方法。
【請求項６２】
前記付着成分は固相媒体に付着させるためのリンカーであり，および前記方法はさらに，前記エネルギー的に許容しうる部位に付着したリンカーを介して，前記化合物または誘導体を固相媒体に付着させることを含む，請求項６１記載の方法。
【請求項６３】
前記キナーゼが，少なくとも１つの保存Ｒｅｔ活性部位残基とマッチする保存残基を含む，請求項６１記載の方法。
【請求項６４】
前記リンカーが痕跡を残さないリンカーである，請求項６２記載の方法。
【請求項６５】
前記キナーゼ結合化合物またはその誘導体が，前記固相媒体に付着させた前記リンカー上で合成される，請求項６１記載の方法。
【請求項６６】
複数の前記化合物または誘導体がコンビナトリアル合成により合成される，請求項６５記載の方法。
【請求項６７】
前記固相媒体への前記化合物の付着により親和性媒体が得られる，請求項６１記載の方法。
【請求項６８】
前記付着成分が標識を含む，請求項６１記載の方法。
【請求項６９】
前記標識が蛍光団を含む，請求項６８記載の方法。
【請求項７０】
改変された化合物のＲｅｔへの結合についてエネルギー的に許容しうる部位でそれに付着したリンカー成分を有するＲｅｔ結合化合物を含む，改変化合物。
【請求項７１】
前記リンカーが固相に付着されている，請求項７０記載の化合物。
【請求項７２】
前記リンカーがまたは標識を含むかまたはこれに付着されている，請求項７０記載の化合物。
【請求項７３】
前記リンカーが痕跡を残さないリンカーである，請求項７０記載の化合物。
【請求項７４】
Ｒｅｔに結合するリガンドを開発する方法であって，
Ｒｅｔの結合部位に結合する１またはそれ以上の化合物を分子スキャフォールドとして同定し；
ＲｅｔまたはＲｅｔ代替物との共結晶における少なくとも１つの分子スキャフォールドの配向を判定し；
改変したときに分子スキャフォールドとＲｅｔとの間の結合親和性または結合特異性またはその両方が変化する前記分子スキャフォールドの化学構造を同定し；そして
リガンドを合成し，ここで，分子スキャフォールドの化学構造の１またはそれ以上は，変化した結合親和性または結合特異性またはその両方でＲｅｔに結合するリガンドを与えるよう改変されている，
ことを含む方法。
【請求項７５】
前記分子スキャフォールドが弱く結合する化合物である，請求項７４記載の方法。
【請求項７６】
前記分子スキャフォールドが複数のキナーゼに結合する，請求項７４記載の方法。
【請求項７７】
前記分子スキャフォールドが式Ｉのコア構造を含み，式Ｉは，
【化８】

式Ｉ
［式中，
Ｒ¹およびＲ⁵は，独立して，水素，ハロ，ヒドロキシ，任意に置換されていてもよいアルコキシル，任意に置換されていてもよいチオアルコキシ，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキル，−Ｃ（Ｘ）ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，−Ｃ（Ｘ）Ｒ²⁰，または−ＮＲ²²Ｒ²³であり；
Ｒ²，Ｒ³，およびＲ⁴は，独立して，水素，ハロ，ヒドロキシ，任意に置換されていてもよいアルコキシル，任意に置換されていてもよいチオアルコキシ，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，または任意に置換されていてもよいヘテロアラルキル，−Ｃ（Ｘ）Ｒ²⁰，−Ｃ（Ｘ）ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，−Ｓ（Ｏ）₂ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，−ＮＲ²²Ｒ²³，または−Ｓ（Ｏ）_nＲ²¹であり；
Ｒ¹⁶およびＲ¹⁷は，独立して，水素，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであるか，またはＲ¹⁶およびＲ¹⁷は，一緒になって，５−７員の炭素環または複素環を形成し；
Ｒ²⁰は，ヒドロキシル，任意に置換されていてもよい低級アルコキシ，任意に置換されていてもよいアミン，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，または任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであり；
Ｒ²¹は，水素，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよいアミン，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであり；
Ｒ²²およびＲ²³は，独立して，水素，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよい低級アルケニル，任意に置換されていてもよい低級アルキニル，任意に置換されていてもよいシクロアルキル，任意に置換されていてもよいヘテロシクロアルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，任意に置換されていてもよいヘテロアラルキル，−Ｃ（Ｘ）Ｒ²⁰，−Ｃ（Ｘ）ＮＲ¹⁶Ｒ¹⁷，または−Ｓ（Ｏ）₂Ｒ²¹であり；
Ｒ²⁴は，任意に置換されていてもよい低級アルキル，任意に置換されていてもよいアリール，任意に置換されていてもよいアラルキル，任意に置換されていてもよいヘテロアリール，または任意に置換されていてもよいヘテロアラルキルであり；および
ｎ＝０，１，または２である］
である，請求項７４記載の方法。
【請求項７８】
Ｒｅｔに特異的なリガンドを開発する方法であって，
複数のキナーゼに結合する化合物を同定し；そして
前記化合物の誘導体がＲｅｔに対して前記化合物より高い特異性を有するか否かを判定する，
ことを含む方法。
【請求項７９】
前記化合物が，前記複数のキナーゼのいずれに対するより少なくとも１０倍高い親和性でＲｅｔに結合する，請求項７８記載の方法。
【請求項８０】
前記化合物が少なくとも１つの保存Ｒｅｔ活性部位残基と相互作用する，請求項７８記載の方法。
【請求項８１】
前記化合物が前記複数のキナーゼに弱く結合する，請求項７８記載の方法。
【請求項８２】
前記複数のキナーゼがＲｅｔおよびＦＧＦＲ１を含む，請求項７８記載の方法。
【請求項８３】
前記複数のキナーゼが，Ｒｅｔ，ＦＧＦＲ１，ＦＧＦＲ２，ＦＧＦＲ３，およびＦＧＦＲ４を含む，請求項７８記載の方法。
【請求項８４】
Ｒｅｔ結合部位原子に対応する原子座標の表示を含む，Ｒｅｔ代替物の結晶構造の電気的表示。
【請求項８５】
概略図を含む，請求項８４記載の電気的表示。
【請求項８６】
前記Ｒｅｔ代替物がＲｅｔ結合部位の配列を含む，請求項８４記載の電気的表示。
【請求項８７】
ＦＧＦＲのアミノ酸を対応するＲｅｔ残基で置き換えることにより導かれる原子座標の組を含む，ＦＧＦＲに基づくＲｅｔのホモロジーモデル。
【請求項８８】
Ｒｅｔキナーゼ結合部位における化合物の結合をモデリングする方法であって，Ｒｅｔ代替物の結合部位における前記化合物の結合をモデリングすることを含む方法。
【請求項８９】
前記Ｒｅｔ代替物は，少なくとも６個の対応するＲｅｔのアミノ酸で置換されているＦＧＦＲの配列を含む，請求項８８記載の方法。
【請求項９０】
少なくとも４個の結合部位アミノ酸残基をＲｅｔ中の対応する部位に存在するアミノ酸で置換することにより改変したＦＧＦＲキナーゼドメイン配列を含む，Ｒｅｔ代替物蛋白質。
【請求項９１】
前記Ｒｅｔ代替物は，Ｒｅｔ代替物１のアミノ酸置換を含む，請求項９０記載のＲｅｔ代替物蛋白質。
【請求項９２】
前記Ｒｅｔ代替物は，Ｒｅｔ代替物２のアミノ酸置換を含む，請求項９０記載のＲｅｔ代替物蛋白質。
【請求項９３】
前記Ｒｅｔ代替物がＲｅｔ結合部位の配列で対応するＦＧＦＲ結合部位の配列を置換することを含む，請求項９２記載のＲｅｔ代替物蛋白質。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【公表番号】特表２００７−５２１３３４（Ｐ２００７−５２１３３４Ａ）
【公表日】平成１９年８月２日（２００７．８．２）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００６−５４５４８１（Ｐ２００６−５４５４８１）
【出願日】平成１６年１２月１７日（２００４．１２．１７）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００４／０４２４７０
【国際公開番号】ＷＯ２００５／０６２７９５
【国際公開日】平成１７年７月１４日（２００５．７．１４）
【出願人】（５０５３２４８８１）プレキシコン，インコーポレーテッド (27)
【Ｆターム（参考）】