癌における新規の治療標的
本発明は癌、特にリンパ腫の検出、診断および治療における使用のための新規の配列に関する。本発明は発現が癌に関連する癌関連（ＣＡ）ポリヌクレオチド配列を提供する。本発明は細胞表面に存在し、癌に対する新しい治療標的となる癌に関連するＣＡポリペプチドを提供する。本発明はさらに癌の検出のための診断用組成物および方法を提供する。本発明はＣＡポリペプチドに特異的なモノクローナルおよびポリクローナル抗体を提供する。本発明はまた癌のスクリーニング、防止および治療のための、診断用ツールおよび治療用組成物および方法を提供する。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
癌関連（ＣＡ）核酸を検出するための核酸アレイであって、表１〜１２４に示す下記ポリヌクレオチド配列番号：
【数１】
またはその相補体からなる群から選択される配列の少なくとも１０連続ヌクレオチドを各々が含む、少なくとも２つの核酸プローブ、
を含む、核酸アレイ。
【請求項２】
少なくとも１５連続ヌクレオチドを含む、請求項１に記載のマイクロアレイ。
【請求項３】
少なくとも２０連続ヌクレオチドを含む、請求項１に記載のマイクロアレイ。
【請求項４】
ペプチドアレイであって、表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数２】
のポリヌクレオチド配列またはその相補体からなる群から選択されるＣＡ配列のオープンリーディングフレーム内に各々がコードされた少なくとも２つの単離されたポリペプチドを含む、ペプチドアレイ。
【請求項５】
前記ポリペプチドが、表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数３−１】
【数３−２】
からなる群から選択されるポリヌクレオチドによりコードされるアミノ酸配列を含む、請求項４に記載のペプチドアレイ。
【請求項６】
前記ポリペプチドが、表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数４−１】
【数４−２】
からなる群から選択されるペプチドによりコードされるアミノ酸配列を含む、請求項４に記載のペプチドアレイ。
【請求項７】
前記ポリペプチドが、表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数５−１】
【数５−２】
からなる群から選択されるＣＡポリペプチドのアミノ酸配列のエピトープのアミノ酸配列を含む、請求項４に記載のペプチドアレイ。
【請求項８】
前記ポリペプチドが細胞表面で発現され、そしてＣＡタンパク質が下記配列番号：
【数６−１】
【数６−２】
からなる群から選択される、請求項４に記載のペプチドアレイ。
【請求項９】
請求項４に記載の前記ペプチドアレイのポリペプチドに結合する、化合物。
【請求項１０】
前記化合物が化学的に合成される、請求項９に記載の化合物。
【請求項１１】
前記化合物が天然に存在する、請求項９に記載の化合物。
【請求項１２】
請求項４〜８のいずれか１項に記載のポリペプチドによりコードされるアミノ酸配列を含むポリペプチドに結合する、単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項１３】
前記抗体またはそのフラグメントが固体支持体に連結されている、請求項１２に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項１４】
前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項１２に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項１５】
前記抗体がポリクローナル抗体である、請求項１２に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項１６】
前記抗体またはそのフラグメントが、さらに検出可能な標識を含む、請求項１２に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項１７】
以下の工程：（ｉ）前記ポリペプチドまたはその抗原結合フラグメントを含む組成物で宿主動物を免疫化する工程、および（ｉｉ）該抗原に対する抗体またはその抗原結合フラグメントを発現する該宿主から細胞を収集する工程、を包含する方法により製造される、請求項４〜８のいずれかに記載のポリペプチドに結合する単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項１８】
前記モノクローナル抗体が前記ＣＡタンパク質の細胞外ドメインに結合する、請求項１４に記載のモノクローナル抗体。
【請求項１９】
前記モノクローナル抗体がヒト癌細胞株の少なくとも１つに結合する、請求項１４に記載のモノクローナル抗体。
【請求項２０】
前記モノクローナル抗体が下記工程：
（ａ）該モノクローナル抗体を生産することができるハイブリドーマを提供する工程；および、
（ｂ）該ハイブリドーマによる該モノクローナル抗体の生産を提供する条件下でハイブリドーマを培養する工程、
を包含するプロセスにより製造される、請求項１４に記載のモノクローナル抗体。
【請求項２１】
請求項１４に記載のモノクローナル抗体を生産する、ハイブリドーマ。
【請求項２２】
前記抗体がヒト化抗体である、請求項１２に記載の抗体。
【請求項２３】
前記ＣＡＰが癌細胞表面では発現されるが正常細胞表面ではされない、請求項１２に記載の抗体。
【請求項２４】
前記ＣＡＰが正常細胞表面と比較して癌細胞表面において差示的に発現される、請求項１２に記載の抗体。
【請求項２５】
前記抗体が治療薬剤に連結される、請求項１２または１４に記載の抗体。
【請求項２６】
請求項１２に記載の抗体および薬学的に受容可能な賦形剤を含む、薬学的組成物。
【請求項２７】
請求項２５に記載の抗体および薬学的に受容可能な賦形剤を含む、薬学的組成物。
【請求項２８】
請求項１２に記載の抗体を含む、癌細胞を検出するためのキット。
【請求項２９】
請求項１４に記載のモノクローナル抗体を含む、癌細胞を検出するためのキット。
【請求項３０】
下記工程：
請求項１２または１４のいずれかに記載の抗体に個体由来の細胞を接触させる工程；
および、癌細胞由来のＣＡＰと該抗体の複合体を検出する工程、
を包含する個体における癌細胞の存在または非存在を検出するための方法であって、ここで、該複合体の検出が、該個体における癌細胞の存在と相関している上記方法。
【請求項３１】
個体における癌細胞の成育を抑制するための方法であって、該方法が請求項２６または２７のいずれかに記載の薬学的組成物の有効量を該個体に投与する工程を包含する、方法。
【請求項３２】
個体における癌細胞に対して治療薬剤を送達するための方法であって、該方法が請求項２６または２７のいずれかに記載の薬学的組成物の有効量を該個体に投与する工程を包含する、方法。
【請求項３３】
試験サンプル中の癌の存在を診断するためのキットであって、該キットが表１〜１２４に記載の下記配列番号：
【数７】
のポリヌクレオチド配列またはその相補体からなる群から選択されるＣＡポリヌクレオチド配列の少なくとも２つに選択的にハイブリダイズする、少なくとも２つのポリヌクレオチドを含む、キット。
【請求項３４】
試験サンプル中の癌の存在を診断するためのキットであって、該キットが表１〜１２４に記載の下記配列番号：
【数８】
のポリヌクレオチド配列、そのフラグメントまたはその相補体からなる群から選択されるＣＡポリヌクレオチド配列の少なくとも２つに選択的にハイブリダイズする、少なくとも２つのポリヌクレオチドを含む、キット。
【請求項３５】
表１〜１２４に記載の下記配列番号：
【数９】
のポリヌクレオチド配列またはその相補体からなる群から選択されるＣＡポリヌクレオチド配列の少なくとも２つを含む、ポリヌクレオチドまたはそのフラグメントを含む、電子ライブラリ。
【請求項３６】
表１〜１２４に記載の下記配列番号：
【数１０−１】
【数１０−２】
のポリヌクレオチド配列からなる群から選択されるＣＡポリヌクレオチド配列の少なくとも２つを含む、ポリヌクレオチドまたはそのフラグメントを含む、電子ライブラリ。
【請求項３７】
表１〜１２４に記載の下記配列番号：
【数１１−１】
【数１１−２】
のポリペプチド配列からなる群から選択されるＣＡポリペプチド配列の少なくとも２つを含む、ポリペプチドまたはそのフラグメントを含む、電子ライブラリ。
【請求項３８】
下記工程：
（ａ）表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数１２】
の配列からなる群から選択される核酸配列またはそのフラグメントによりコードされる癌関連（ＣＡ）遺伝子を発現する細胞を提供する工程；
（ｂ）抗癌薬物候補に癌細胞由来の組織サンプルを接触させる工程；および、
（ｃ）該組織サンプル中のＣＡポリヌクレオチドの発現に対する該抗癌薬物候補の作用をモニタリングする工程、
を包含する、抗癌活性をスクリーニングするための方法。
【請求項３９】
請求項３８に記載の抗癌活性をスクリーニングするための方法であって、ここで、前記ＣＡ遺伝子が表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数１３−１】
【数１３−２】
の配列からなる群から選択される核酸配列の少なくとも１つを含む、方法。
【請求項４０】
請求項３８に記載の抗癌活性をスクリーニングするための方法であって、さらに下記工程：
（ｄ）前記薬剤候補の非存在下の発現レベルを該薬剤候補の存在下の発現レベルと比較する工程、
を包含する、方法。
【請求項４１】
請求項３８に記載の抗癌活性をスクリーニングするための方法であって、ここで、前記薬物候補が転写阻害剤であり、そしてさらに、前記核酸配列が表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数１４−１】
【数１４−２】
からなる群から選択される、方法。
【請求項４２】
試験細胞サンプル中のポリペプチドの発現に関連する癌を検出するための方法であって、下記工程：
（ｉ）表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数１５−１】
【数１５−２】
またはそのフラグメントからなる群から選択されるポリペプチドの少なくとも１つの発現レベルを検出する工程；および、
（ｉｉ）該試験サンプル中のポリペプチドの発現レベルを、正常細胞サンプル中のポリペプチドの発現レベルと比較する工程であって、ここで該正常細胞中のポリペプチド発現レベルに対して改変された該試験細胞サンプル中のポリペプチド発現レベルは、該試験細胞サンプル中の癌の存在を示すものである工程、
を包含する、方法。
【請求項４３】
試験細胞サンプル中のポリペプチドの発現に関連する癌を検出するための方法であって、下記工程：
（ｉ）表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数１６】
またはそのフラグメントからなる群から選択されるポリペプチドの少なくとも１つの活性レベルを検出する工程であって、ここで該活性は表１〜１２４に記載したポリペプチドの活性の少なくとも１つに相当するものである工程；および、
（ｉｉ）該試験サンプル中のポリペプチドの活性レベルを、正常細胞サンプル中のポリペプチドの活性レベルと比較する工程であって、ここで該正常細胞中のポリペプチド活性レベルに対して改変された該試験細胞サンプル中のポリペプチド活性レベルは、該試験細胞サンプル中の癌の存在を示すものである工程、
を包含する、方法。
【請求項４４】
試験血清サンプル中の抗体の存在に関連する癌を検出するための方法であって、下記工程：
（ｉ）表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数１７−１】
【数１７−２】
またはその抗原性フラグメントからなる群から選択される抗原性ポリペプチドに対する抗体のレベルを検出する工程；および、
（ｉｉ）該試験サンプル中の該抗体のレベルをコントロールサンプル中の該抗体のレベルと比較する工程であって、ここで、該コントロールサンプル中の抗体のレベルに対して改変された該試験サンプル中の抗体レベルは、該試験血清サンプル中の癌の存在を示すものである工程、
を包含する、方法。
【請求項４５】
ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）の活性を調節することができる生物活性剤のスクリーニングのための方法であって、ここで、該ＣＡＰが表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数１８−１】
【数１８−２】
のポリヌクレオチド配列からなる群から選択される核酸配列を含む核酸によりコードされ、該方法は下記工程：
ａ）該ＣＡＰと候補生物活性剤を組み合わせる工程；および、
ｂ）該ＣＡＰの生物活性に対する候補薬剤の作用を測定する工程、
を包含する、方法。
【請求項４６】
前記生物活性剤が前記ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）の発現に影響する、請求項４５に記載の生物活性剤のスクリーニング方法。
【請求項４７】
前記生物活性剤が前記ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）の活性に影響し、該活性が表１〜１２４に記載の活性から選択される、請求項４５に記載の生物活性剤のスクリーニング方法。
【請求項４８】
前記生物活性剤が腫瘍抑制剤、低密度リポタンパク質レセプター、Ｇタンパク質共役レセプター、アポトーシスインヒビター、イオン輸送、カルシウム結合、細胞接着、シグナル伝達、タンパク質キナーゼレセプターおよびシグナル導入からなる群から選択される活性の調節因子である、請求項４５に記載の生物活性剤のスクリーニング方法。
【請求項４９】
癌を診断するための方法であって、下記工程：
ａ）第１の個体の第１の組織型における表１〜１２４に示されるヒトゲノム配列およびｍＲＮＡ配列からなる群から選択される核酸配列を含む遺伝子の１つ以上の発現を測定する工程；および、
ｂ）該第１の個体の第２の正常組織型または第２の未罹患個体に由来する該遺伝子の発現を比較する工程であって、ここで該発現の差は該第１の個体が癌を有することを示すものである工程、
を包含する、方法。
【請求項５０】
癌を治療するための方法であって、該方法は、ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）のインヒビターを患者に投与する工程を包含し、ここで、該ＣＡＰが表１〜１２４のヒト核酸配列からなる群から選択される核酸配列を含む核酸によりコードされる、方法。
【請求項５１】
前記ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）のインヒビターが、前記ＣＡタンパク質に結合する、請求項５０に記載の癌を治療するための方法。
【請求項５２】
下記工程：
ＣＡ遺伝子を発現する細胞を、ＲＮＡ干渉を示すのに十分な量の、表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数１９−１】
【数１９−２】
のポリヌクレオチド配列に相当する癌関連（ＣＡ）ｍＲＮＡにハイブリダイズできる配列を含む２本鎖ＲＮＡに接触させる工程；および、
該細胞における該ＣＡ遺伝子の発現を阻害する工程、
を包含する、細胞における癌関連（ＣＡ）遺伝子の発現を阻害するための方法。
【請求項５３】
トランスフェクション、エレクロトポレーションおよびマイクロインジェクションからなる群から選択される方法により細胞内に低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）を導入することにより２本鎖ＲＮＡが提供される、請求項５２に記載の方法。
【請求項５４】
発現ベクターにより前記細胞内に低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）を導入することにより前記２本鎖ＲＮＡが提供される、請求項５２に記載の方法。
【請求項５５】
請求項３８、３９、４０、４１、４５、４６、４７および４８の何れかに記載の方法に従って同定される、抗癌薬物候補。
【請求項１】
癌関連（ＣＡ）核酸を検出するための核酸アレイであって、表１〜１２４に示す下記ポリヌクレオチド配列番号：
【数１】
またはその相補体からなる群から選択される配列の少なくとも１０連続ヌクレオチドを各々が含む、少なくとも２つの核酸プローブ、
を含む、核酸アレイ。
【請求項２】
少なくとも１５連続ヌクレオチドを含む、請求項１に記載のマイクロアレイ。
【請求項３】
少なくとも２０連続ヌクレオチドを含む、請求項１に記載のマイクロアレイ。
【請求項４】
ペプチドアレイであって、表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数２】
のポリヌクレオチド配列またはその相補体からなる群から選択されるＣＡ配列のオープンリーディングフレーム内に各々がコードされた少なくとも２つの単離されたポリペプチドを含む、ペプチドアレイ。
【請求項５】
前記ポリペプチドが、表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数３−１】
【数３−２】
からなる群から選択されるポリヌクレオチドによりコードされるアミノ酸配列を含む、請求項４に記載のペプチドアレイ。
【請求項６】
前記ポリペプチドが、表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数４−１】
【数４−２】
からなる群から選択されるペプチドによりコードされるアミノ酸配列を含む、請求項４に記載のペプチドアレイ。
【請求項７】
前記ポリペプチドが、表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数５−１】
【数５−２】
からなる群から選択されるＣＡポリペプチドのアミノ酸配列のエピトープのアミノ酸配列を含む、請求項４に記載のペプチドアレイ。
【請求項８】
前記ポリペプチドが細胞表面で発現され、そしてＣＡタンパク質が下記配列番号：
【数６−１】
【数６−２】
からなる群から選択される、請求項４に記載のペプチドアレイ。
【請求項９】
請求項４に記載の前記ペプチドアレイのポリペプチドに結合する、化合物。
【請求項１０】
前記化合物が化学的に合成される、請求項９に記載の化合物。
【請求項１１】
前記化合物が天然に存在する、請求項９に記載の化合物。
【請求項１２】
請求項４〜８のいずれか１項に記載のポリペプチドによりコードされるアミノ酸配列を含むポリペプチドに結合する、単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項１３】
前記抗体またはそのフラグメントが固体支持体に連結されている、請求項１２に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項１４】
前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項１２に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項１５】
前記抗体がポリクローナル抗体である、請求項１２に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項１６】
前記抗体またはそのフラグメントが、さらに検出可能な標識を含む、請求項１２に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項１７】
以下の工程：（ｉ）前記ポリペプチドまたはその抗原結合フラグメントを含む組成物で宿主動物を免疫化する工程、および（ｉｉ）該抗原に対する抗体またはその抗原結合フラグメントを発現する該宿主から細胞を収集する工程、を包含する方法により製造される、請求項４〜８のいずれかに記載のポリペプチドに結合する単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項１８】
前記モノクローナル抗体が前記ＣＡタンパク質の細胞外ドメインに結合する、請求項１４に記載のモノクローナル抗体。
【請求項１９】
前記モノクローナル抗体がヒト癌細胞株の少なくとも１つに結合する、請求項１４に記載のモノクローナル抗体。
【請求項２０】
前記モノクローナル抗体が下記工程：
（ａ）該モノクローナル抗体を生産することができるハイブリドーマを提供する工程；および、
（ｂ）該ハイブリドーマによる該モノクローナル抗体の生産を提供する条件下でハイブリドーマを培養する工程、
を包含するプロセスにより製造される、請求項１４に記載のモノクローナル抗体。
【請求項２１】
請求項１４に記載のモノクローナル抗体を生産する、ハイブリドーマ。
【請求項２２】
前記抗体がヒト化抗体である、請求項１２に記載の抗体。
【請求項２３】
前記ＣＡＰが癌細胞表面では発現されるが正常細胞表面ではされない、請求項１２に記載の抗体。
【請求項２４】
前記ＣＡＰが正常細胞表面と比較して癌細胞表面において差示的に発現される、請求項１２に記載の抗体。
【請求項２５】
前記抗体が治療薬剤に連結される、請求項１２または１４に記載の抗体。
【請求項２６】
請求項１２に記載の抗体および薬学的に受容可能な賦形剤を含む、薬学的組成物。
【請求項２７】
請求項２５に記載の抗体および薬学的に受容可能な賦形剤を含む、薬学的組成物。
【請求項２８】
請求項１２に記載の抗体を含む、癌細胞を検出するためのキット。
【請求項２９】
請求項１４に記載のモノクローナル抗体を含む、癌細胞を検出するためのキット。
【請求項３０】
下記工程：
請求項１２または１４のいずれかに記載の抗体に個体由来の細胞を接触させる工程；
および、癌細胞由来のＣＡＰと該抗体の複合体を検出する工程、
を包含する個体における癌細胞の存在または非存在を検出するための方法であって、ここで、該複合体の検出が、該個体における癌細胞の存在と相関している上記方法。
【請求項３１】
個体における癌細胞の成育を抑制するための方法であって、該方法が請求項２６または２７のいずれかに記載の薬学的組成物の有効量を該個体に投与する工程を包含する、方法。
【請求項３２】
個体における癌細胞に対して治療薬剤を送達するための方法であって、該方法が請求項２６または２７のいずれかに記載の薬学的組成物の有効量を該個体に投与する工程を包含する、方法。
【請求項３３】
試験サンプル中の癌の存在を診断するためのキットであって、該キットが表１〜１２４に記載の下記配列番号：
【数７】
のポリヌクレオチド配列またはその相補体からなる群から選択されるＣＡポリヌクレオチド配列の少なくとも２つに選択的にハイブリダイズする、少なくとも２つのポリヌクレオチドを含む、キット。
【請求項３４】
試験サンプル中の癌の存在を診断するためのキットであって、該キットが表１〜１２４に記載の下記配列番号：
【数８】
のポリヌクレオチド配列、そのフラグメントまたはその相補体からなる群から選択されるＣＡポリヌクレオチド配列の少なくとも２つに選択的にハイブリダイズする、少なくとも２つのポリヌクレオチドを含む、キット。
【請求項３５】
表１〜１２４に記載の下記配列番号：
【数９】
のポリヌクレオチド配列またはその相補体からなる群から選択されるＣＡポリヌクレオチド配列の少なくとも２つを含む、ポリヌクレオチドまたはそのフラグメントを含む、電子ライブラリ。
【請求項３６】
表１〜１２４に記載の下記配列番号：
【数１０−１】
【数１０−２】
のポリヌクレオチド配列からなる群から選択されるＣＡポリヌクレオチド配列の少なくとも２つを含む、ポリヌクレオチドまたはそのフラグメントを含む、電子ライブラリ。
【請求項３７】
表１〜１２４に記載の下記配列番号：
【数１１−１】
【数１１−２】
のポリペプチド配列からなる群から選択されるＣＡポリペプチド配列の少なくとも２つを含む、ポリペプチドまたはそのフラグメントを含む、電子ライブラリ。
【請求項３８】
下記工程：
（ａ）表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数１２】
の配列からなる群から選択される核酸配列またはそのフラグメントによりコードされる癌関連（ＣＡ）遺伝子を発現する細胞を提供する工程；
（ｂ）抗癌薬物候補に癌細胞由来の組織サンプルを接触させる工程；および、
（ｃ）該組織サンプル中のＣＡポリヌクレオチドの発現に対する該抗癌薬物候補の作用をモニタリングする工程、
を包含する、抗癌活性をスクリーニングするための方法。
【請求項３９】
請求項３８に記載の抗癌活性をスクリーニングするための方法であって、ここで、前記ＣＡ遺伝子が表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数１３−１】
【数１３−２】
の配列からなる群から選択される核酸配列の少なくとも１つを含む、方法。
【請求項４０】
請求項３８に記載の抗癌活性をスクリーニングするための方法であって、さらに下記工程：
（ｄ）前記薬剤候補の非存在下の発現レベルを該薬剤候補の存在下の発現レベルと比較する工程、
を包含する、方法。
【請求項４１】
請求項３８に記載の抗癌活性をスクリーニングするための方法であって、ここで、前記薬物候補が転写阻害剤であり、そしてさらに、前記核酸配列が表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数１４−１】
【数１４−２】
からなる群から選択される、方法。
【請求項４２】
試験細胞サンプル中のポリペプチドの発現に関連する癌を検出するための方法であって、下記工程：
（ｉ）表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数１５−１】
【数１５−２】
またはそのフラグメントからなる群から選択されるポリペプチドの少なくとも１つの発現レベルを検出する工程；および、
（ｉｉ）該試験サンプル中のポリペプチドの発現レベルを、正常細胞サンプル中のポリペプチドの発現レベルと比較する工程であって、ここで該正常細胞中のポリペプチド発現レベルに対して改変された該試験細胞サンプル中のポリペプチド発現レベルは、該試験細胞サンプル中の癌の存在を示すものである工程、
を包含する、方法。
【請求項４３】
試験細胞サンプル中のポリペプチドの発現に関連する癌を検出するための方法であって、下記工程：
（ｉ）表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数１６】
またはそのフラグメントからなる群から選択されるポリペプチドの少なくとも１つの活性レベルを検出する工程であって、ここで該活性は表１〜１２４に記載したポリペプチドの活性の少なくとも１つに相当するものである工程；および、
（ｉｉ）該試験サンプル中のポリペプチドの活性レベルを、正常細胞サンプル中のポリペプチドの活性レベルと比較する工程であって、ここで該正常細胞中のポリペプチド活性レベルに対して改変された該試験細胞サンプル中のポリペプチド活性レベルは、該試験細胞サンプル中の癌の存在を示すものである工程、
を包含する、方法。
【請求項４４】
試験血清サンプル中の抗体の存在に関連する癌を検出するための方法であって、下記工程：
（ｉ）表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数１７−１】
【数１７−２】
またはその抗原性フラグメントからなる群から選択される抗原性ポリペプチドに対する抗体のレベルを検出する工程；および、
（ｉｉ）該試験サンプル中の該抗体のレベルをコントロールサンプル中の該抗体のレベルと比較する工程であって、ここで、該コントロールサンプル中の抗体のレベルに対して改変された該試験サンプル中の抗体レベルは、該試験血清サンプル中の癌の存在を示すものである工程、
を包含する、方法。
【請求項４５】
ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）の活性を調節することができる生物活性剤のスクリーニングのための方法であって、ここで、該ＣＡＰが表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数１８−１】
【数１８−２】
のポリヌクレオチド配列からなる群から選択される核酸配列を含む核酸によりコードされ、該方法は下記工程：
ａ）該ＣＡＰと候補生物活性剤を組み合わせる工程；および、
ｂ）該ＣＡＰの生物活性に対する候補薬剤の作用を測定する工程、
を包含する、方法。
【請求項４６】
前記生物活性剤が前記ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）の発現に影響する、請求項４５に記載の生物活性剤のスクリーニング方法。
【請求項４７】
前記生物活性剤が前記ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）の活性に影響し、該活性が表１〜１２４に記載の活性から選択される、請求項４５に記載の生物活性剤のスクリーニング方法。
【請求項４８】
前記生物活性剤が腫瘍抑制剤、低密度リポタンパク質レセプター、Ｇタンパク質共役レセプター、アポトーシスインヒビター、イオン輸送、カルシウム結合、細胞接着、シグナル伝達、タンパク質キナーゼレセプターおよびシグナル導入からなる群から選択される活性の調節因子である、請求項４５に記載の生物活性剤のスクリーニング方法。
【請求項４９】
癌を診断するための方法であって、下記工程：
ａ）第１の個体の第１の組織型における表１〜１２４に示されるヒトゲノム配列およびｍＲＮＡ配列からなる群から選択される核酸配列を含む遺伝子の１つ以上の発現を測定する工程；および、
ｂ）該第１の個体の第２の正常組織型または第２の未罹患個体に由来する該遺伝子の発現を比較する工程であって、ここで該発現の差は該第１の個体が癌を有することを示すものである工程、
を包含する、方法。
【請求項５０】
癌を治療するための方法であって、該方法は、ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）のインヒビターを患者に投与する工程を包含し、ここで、該ＣＡＰが表１〜１２４のヒト核酸配列からなる群から選択される核酸配列を含む核酸によりコードされる、方法。
【請求項５１】
前記ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）のインヒビターが、前記ＣＡタンパク質に結合する、請求項５０に記載の癌を治療するための方法。
【請求項５２】
下記工程：
ＣＡ遺伝子を発現する細胞を、ＲＮＡ干渉を示すのに十分な量の、表１〜１２４に示す下記配列番号：
【数１９−１】
【数１９−２】
のポリヌクレオチド配列に相当する癌関連（ＣＡ）ｍＲＮＡにハイブリダイズできる配列を含む２本鎖ＲＮＡに接触させる工程；および、
該細胞における該ＣＡ遺伝子の発現を阻害する工程、
を包含する、細胞における癌関連（ＣＡ）遺伝子の発現を阻害するための方法。
【請求項５３】
トランスフェクション、エレクロトポレーションおよびマイクロインジェクションからなる群から選択される方法により細胞内に低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）を導入することにより２本鎖ＲＮＡが提供される、請求項５２に記載の方法。
【請求項５４】
発現ベクターにより前記細胞内に低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）を導入することにより前記２本鎖ＲＮＡが提供される、請求項５２に記載の方法。
【請求項５５】
請求項３８、３９、４０、４１、４５、４６、４７および４８の何れかに記載の方法に従って同定される、抗癌薬物候補。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図２】
【図３】
【図４】
【公表番号】特表２００９−５１９００２（Ｐ２００９−５１９００２Ａ）
【公表日】平成２１年５月１４日（２００９．５．１４）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００６−５２８２８６（Ｐ２００６−５２８２８６）
【出願日】平成１６年９月２３日（２００４．９．２３）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００４／０３１６１７
【国際公開番号】ＷＯ２００５／０３１００１
【国際公開日】平成１７年４月７日（２００５．４．７）
【出願人】（５９１０７６８１１）カイロン コーポレイション (265)
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２１年５月１４日（２００９．５．１４）
【国際特許分類】
【出願日】平成１６年９月２３日（２００４．９．２３）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００４／０３１６１７
【国際公開番号】ＷＯ２００５／０３１００１
【国際公開日】平成１７年４月７日（２００５．４．７）
【出願人】（５９１０７６８１１）カイロン コーポレイション (265)
【Ｆターム（参考）】
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