細胞の未分化状態マーカーならびに幹細胞の分離および調製のための組成物および方法
ある細胞、特に組織幹細胞を含む未分化細胞が多能性または未分化性を有するかどうかのマーカーとして使用することができる遺伝子が提供される。本発明は、Ｓｔｍ１遺伝子を含むＳｔｍという、多能性を有する場合であれば未分化状態に特異的に発現する遺伝子を発見し本発明を完成するに至った。したがって、本発明は細胞の分化状態を判定するキットであって、（ａ）Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物に特異的に反応する因子；および（ｂ）該Ｓｔｍ遺伝子が該細胞において発現しているかどうかを確認するための手段、を備える、キットを提供する。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体もしくは対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子。
【請求項２】
少なくとも１０の連続するヌクレオチド長を有する、請求項１に記載の核酸分子。
【請求項３】
配列番号１、３、５または２９において、配列番号７もしくは９またはそれに対応するＳｔｍ２の核酸配列の対応する配列と相違する配列を少なくとも１つの位置において有する、請求項１に記載の核酸分子。
【請求項４】
前記相違する配列を有する部分は、制限酵素で消化され得る、請求項３に記載の核酸分子。
【請求項５】
配列番号１、３、５または２９に示される配列を含む、請求項１に記載の核酸分子。
【請求項６】
（ａ）配列番号３に記載の塩基配列の１０３７位〜１６０７位もしくは２４４位〜１１２６位またはそれらに対応する位置の塩基配列、あるいはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）（ａ）のポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｃ）（ａ）〜（ｂ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子。
【請求項７】
請求項１に記載の核酸分子に対して特異的な因子。
【請求項８】
配列番号７もしくは９に示される配列を有し、またはそれに対応するＳｔｍ２遺伝子の核酸分子に対しては特異的な反応しない、請求項７に記載の因子。
【請求項９】
前記因子は、核酸分子、ポリペプチド、脂質、糖鎖、有機低分子およびそれらの複合分子からなる群より選択される、請求項７に記載の因子。
【請求項１０】
前記因子は、少なくとも８の連続するヌクレオチド長を有する核酸分子である、請求項７に記載の因子。
【請求項１１】
前記因子は、核酸分子であり、プライマーとして使用される、請求項７に記載の因子。
【請求項１２】
前記因子は、プローブとして使用される、請求項７に記載の因子。
【請求項１３】
前記因子は、標識されているかまたは標識され得る、請求項７に記載の因子。
【請求項１４】
前記標識は、蛍光、リン光、化学発光、放射能、酵素基質反応および抗原抗体反応からなる群より選択される技法を利用する、請求項１３に記載の因子。
【請求項１５】
（ａ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントからなる、ポリペプチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド；
（ｃ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体によってコードされる、ポリペプチド；
（ｄ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列の種相同体である、ポリペプチド；または
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のいずれか１つのポリペプチドに対する同一性が少なくとも７０％であるアミノ酸配列を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド、
を含む、
ポリペプチド。
【請求項１６】
少なくとも３の連続するアミノ酸配列を有する、請求項１５に記載のポリペプチド。
【請求項１７】
配列番号２、４、６または３０において、配列番号８もしくは１０またはそれに対応するＳｔｍ２のアミノ酸配列の対応する配列と相違する配列を少なくとも１つの位置において有する、請求項１５に記載のポリペプチド。
【請求項１８】
前記相違する配列を有する部分は、制限酵素で消化され得る、請求項１７に記載のポリペプチド。
【請求項１９】
（ａ）配列番号４に記載のアミノ酸配列の１５７位〜２１８位（ホメオドメイン）、２６１位〜３０１位（Ｗリッチ領域）もしくは３９９位〜４５５位（Ｂ２反復配列領域）またはそれに対応する位置のアミノ酸配列、またはそのフラグメントからなる、ポリペプチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド；または
（ｃ）（ａ）〜（ｂ）のいずれか１つのポリペプチドに対する同一性が少なくとも７０％であるアミノ酸配列を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド、
を含む、
ポリペプチド。
【請求項２０】
請求項１５に記載の核酸分子に対して特異的に結合する、因子。
【請求項２１】
前記因子は、核酸分子、ポリペプチド、脂質、糖鎖、有機低分子およびそれらの複合分子からなる群より選択される、請求項２０に記載の因子。
【請求項２２】
前記因子は、抗体またはその誘導体である、請求項２０に記載の因子。
【請求項２３】
前記因子は、プローブとして使用される、請求項２０に記載の因子。
【請求項２４】
前記因子は、標識されているかまたは標識され得る、請求項２０に記載の因子。
【請求項２５】
前記標識は、蛍光、リン光、化学発光、放射能、酵素基質反応および抗原抗体反応からなる群より選択される技法を利用する、請求項２４に記載の因子。
【請求項２６】
請求項１に記載の核酸分子を含む、発現カセット。
【請求項２７】
請求項１に記載の核酸分子を含む、ベクター。
【請求項２８】
前記核酸分子に作動可能に連結された制御配列をさらに含む、請求項２７に記載のベクター。
【請求項２９】
前記制御配列は、前記核酸分子の発現を誘導する、請求項２８に記載のベクター。
【請求項３０】
選択マーカーをコードする配列をさらに含む、請求項２８に記載のベクター。
【請求項３１】
請求項１に記載の核酸分子を含む、細胞。
【請求項３２】
請求項１に記載の核酸分子が発現されるように含まれる、細胞。
【請求項３３】
請求項１に記載の核酸分子が発現可能に含まれ、かつ、所望のゲノム配列を有する、細胞。
【請求項３４】
請求項１に記載の核酸分子を含む、動物組織。
【請求項３５】
請求項１に記載の核酸分子を含む、動物。
【請求項３６】
請求項１に記載の核酸分子を含む細胞が濃縮された、組成物。
【請求項３７】
Ｓｔｍ遺伝子のプロモーター部分の配列を含む、核酸分子。
【請求項３８】
請求項３７に記載の核酸分子を含む、ベクター。
【請求項３９】
選択マーカーをコードする配列をさらに含む、請求項１８に記載のベクター。
【請求項４０】
請求項３７に記載の核酸分子を含む、細胞。
【請求項４１】
請求項３７に記載の核酸分子を含む、動物組織。
【請求項４２】
請求項３７に記載の核酸分子を含む、動物。
【請求項４３】
請求項３７に記載の核酸分子を含む細胞が濃縮された、組成物。
【請求項４４】
細胞の未分化状態を判定するための組成物であって、該組成物は、Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物に特異的に反応する因子を含む、組成物。
【請求項４５】
前記Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物は、
（Ａ）（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子；あるいは
（Ｂ）（ａ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントからなる、ポリペプチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントにおいて、１以上のアミノ酸が置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド、；
（ｃ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体によってコードされる、ポリペプチド；
（ｄ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列の種相同体である、ポリペプチド；または
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のいずれか１つのポリペプチドに対する同一性が少なくとも７０％であるアミノ酸配列を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド、
を含む、
ポリペプチド、である、請求項４４に記載の組成物。
【請求項４６】
前記細胞は、幹細胞である、請求項４４に記載の組成物。
【請求項４７】
前記細胞は、胚性幹細胞、多能性幹細胞、単能性幹細胞、および組織幹細胞を含む、請求項４４に記載の組成物。
【請求項４８】
前記細胞は、神経幹細胞、性腺幹細胞、造血幹細胞、表皮幹細胞および間充組織幹細胞からなる群より選択される組織幹細胞を含む、請求項４４に記載の組成物。
【請求項４９】
前記細胞は、遺伝子改変されたものかまたは遺伝子改変されていないものである、請求項４４に記載の組成物。
【請求項５０】
細胞の未分化状態を判定する方法であって、
（Ｉ）判定されるべき細胞を提供する工程；
（ＩＩ）Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物に特異的に反応する因子を、該細胞に接触させる工程；および
（ＩＩＩ）該因子と該Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物との特異的反応を検出することによって、該Ｓｔｍ遺伝子が該細胞において発現しているかどうかを確認する工程、
を包含し、ここで、該細胞における該Ｓｔｍ遺伝子の発現は、細胞が未分化状態にあることを示す、方法。
【請求項５１】
前記未分化状態は、全能性を含む、請求項５０に記載の方法。
【請求項５２】
前記Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物は、
（Ａ）（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子；あるいは
（Ｂ）（ａ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントからなる、ポリペプチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントにおいて、１以上のアミノ酸が置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド；
（ｃ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体によってコードされる、ポリペプチド；
（ｄ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列の種相同体である、ポリペプチド；または
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のいずれか１つのポリペプチドに対する同一性が少なくとも７０％であるアミノ酸配列を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド、
を含む、
ポリペプチドを含む、請求項５０に記載の方法。
【請求項５３】
さらに、他の幹細胞マーカーが発現しているかどうかを確認する工程を包含する、請求項５０に記載の方法。
【請求項５４】
前記他の幹細胞マーカーは、Ｏｃｔ３／４を含む、請求項５３に記載の方法。
【請求項５５】
前記Ｓｔｍ遺伝子は、Ｓｔｍ１遺伝子を含む、請求項５０に記載の方法。
【請求項５６】
前記Ｓｔｍ１遺伝子は、配列番号１、３、５または２９に示される配列を含む、請求項５５に記載の方法。
【請求項５７】
未分化状態の細胞を調製する方法であって、
（Ｉ）未分化状態の細胞を含むかまたは含むと予測されるサンプルを提供する工程；
（ＩＩ）Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物に特異的に反応する因子を、該サンプルに接触させる工程；
（ＩＩＩ）該Ｓｔｍ遺伝子が該サンプル中の細胞において発現しているかどうかを確認する工程；および
（ＩＶ）該Ｓｔｍ遺伝子が発現している細胞を分離または濃縮する工程、
を包含する、方法。
【請求項５８】
前記未分化状態は、全能性を含む、請求項５７に記載の方法。
【請求項５９】
前記Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物は、
（Ａ）（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子；あるいは
（Ｂ）（ａ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントからなる、ポリペプチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントにおいて、１以上のアミノ酸が置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド；
（ｃ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体によってコードされる、ポリペプチド；
（ｄ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列の種相同体である、ポリペプチド；または
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のいずれか１つのポリペプチドに対する同一性が少なくとも７０％であるアミノ酸配列を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド、
を含む、
ポリペプチドを含む、請求項５７に記載の方法。
【請求項６０】
未分化状態の細胞を調製する方法であって、
（Ｉ）細胞を提供する工程；および
（ＩＩ）該細胞中のＳｔｍ遺伝子の発現を誘導する工程、
を包含する、方法。
【請求項６１】
前記未分化状態は、全能性を含む、請求項６０に記載の方法。
【請求項６２】
前記Ｓｔｍ遺伝子は、
（Ａ）（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子を含む、請求項６０に記載の方法。
【請求項６３】
未分化状態の細胞を分離および／または増殖および／または濃縮する方法であって、
（Ｉ）細胞を提供する工程；
（ＩＩ）該細胞にＳｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子プロモーターを導入する工程；および
（ＩＩＩ）該Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子プロモーターを発現する細胞を選択する工程、
を包含する、方法。
【請求項６４】
前記未分化状態は、全能性である、請求項６３に記載の方法。
【請求項６５】
前記Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子プロモーターは、
（Ａ）（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子；あるいは
（Ｂ）Ｓｔｍ１遺伝子のプロモーター部分の配列を含む、請求項６３に記載の方法。
【請求項６６】
細胞の分化状態を判定するキットであって、
（ａ）Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物に特異的に反応する因子；および
（ｂ）該Ｓｔｍ遺伝子が該細胞において発現しているかどうかを確認するための手段、
を備える、キット。
【請求項６７】
前記分化状態は、多能性である、請求項６６に記載の方法。
【請求項６８】
前記分化状態は、全能性である、請求項６６に記載の方法。
【請求項６９】
前記Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物は、
（Ａ）（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子；あるいは
（Ｂ）（ａ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントからなる、ポリペプチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントにおいて、１以上のアミノ酸が置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド；
（ｃ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体によってコードされる、ポリペプチド；
（ｄ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列の種相同体である、ポリペプチド；または
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のいずれか１つのポリペプチドに対する同一性が少なくとも７０％であるアミノ酸配列を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド、
を含む、
ポリペプチドを含む、請求項６６に記載のキット。
【請求項７０】
さらに、他の幹細胞マーカーが発現しているかどうかを確認する手段を備える、請求項６４に記載のキット。
【請求項７１】
前記他の幹細胞マーカーは、Ｏｃｔ３／４を含む、請求項７０に記載のキット。
【請求項７２】
前記Ｓｔｍ遺伝子は、Ｓｔｍ１遺伝子を含む、請求項６６に記載のキット。
【請求項７３】
未分化状態の細胞を調製するためのキットであって、
（Ｉ）Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物に特異的に反応する因子；
（ＩＩ）該Ｓｔｍ遺伝子が該サンプル中の細胞において発現しているかどうかを確認する手段；および
（ＩＩＩ）該Ｓｔｍ遺伝子が発現している細胞を分離または濃縮する手段、
を備える、キット。
【請求項７４】
前記未分化状態は、全能性である、請求項７３に記載のキット。
【請求項７５】
前記Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物は、
（Ａ）（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子；あるいは
（Ｂ）（ａ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントからなる、ポリペプチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントにおいて、１以上のアミノ酸が置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド；
（ｃ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体によってコードされる、ポリペプチド；
（ｄ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列の種相同体である、ポリペプチド；または
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のいずれか１つのポリペプチドに対する同一性が少なくとも７０％であるアミノ酸配列を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド、
を含む、
ポリペプチドを含む、請求項７３に記載のキット。
【請求項７６】
未分化状態の細胞を調製するキットであって、
（Ｉ）細胞中のＳｔｍ遺伝子の発現を誘導する手段、
を備える、キット。
【請求項７７】
前記未分化状態は、全能性である、請求項７６に記載のキット。
【請求項７８】
前記Ｓｔｍ遺伝子は、
（Ａ）（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子を含む、請求項７６に記載のキット。
【請求項７９】
未分化状態の細胞を調製するキットであって、
（Ｉ）制御配列に作動可能に連結されたＳｔｍ遺伝子を含むベクター、
を備える、キット。
【請求項８０】
前記未分化状態は、全能性である、請求項７９に記載のキット。
【請求項８１】
前記Ｓｔｍ遺伝子は、
（Ａ）（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子を含む、請求項７９に記載のキット。
【請求項８２】
未分化状態の細胞を分離および／または増殖および／または濃縮するキットであって、
（Ｉ）Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子プロモーター；
（ＩＩ）細胞に該Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子プロモーターを導入する手段；および
（ＩＩＩ）該Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子プロモーターを発現する細胞を選択する手段、
を包含する、キット。
【請求項８３】
前記未分化状態は、全能性である、請求項８２に記載のキット。
【請求項８４】
前記Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子プロモーターは、
（Ａ）（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子；あるいは
（Ｂ）Ｓｔｍ１遺伝子のプロモーター部分の配列を含む、請求項８２に記載のキット。
【請求項１】
（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体もしくは対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子。
【請求項２】
少なくとも１０の連続するヌクレオチド長を有する、請求項１に記載の核酸分子。
【請求項３】
配列番号１、３、５または２９において、配列番号７もしくは９またはそれに対応するＳｔｍ２の核酸配列の対応する配列と相違する配列を少なくとも１つの位置において有する、請求項１に記載の核酸分子。
【請求項４】
前記相違する配列を有する部分は、制限酵素で消化され得る、請求項３に記載の核酸分子。
【請求項５】
配列番号１、３、５または２９に示される配列を含む、請求項１に記載の核酸分子。
【請求項６】
（ａ）配列番号３に記載の塩基配列の１０３７位〜１６０７位もしくは２４４位〜１１２６位またはそれらに対応する位置の塩基配列、あるいはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）（ａ）のポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｃ）（ａ）〜（ｂ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子。
【請求項７】
請求項１に記載の核酸分子に対して特異的な因子。
【請求項８】
配列番号７もしくは９に示される配列を有し、またはそれに対応するＳｔｍ２遺伝子の核酸分子に対しては特異的な反応しない、請求項７に記載の因子。
【請求項９】
前記因子は、核酸分子、ポリペプチド、脂質、糖鎖、有機低分子およびそれらの複合分子からなる群より選択される、請求項７に記載の因子。
【請求項１０】
前記因子は、少なくとも８の連続するヌクレオチド長を有する核酸分子である、請求項７に記載の因子。
【請求項１１】
前記因子は、核酸分子であり、プライマーとして使用される、請求項７に記載の因子。
【請求項１２】
前記因子は、プローブとして使用される、請求項７に記載の因子。
【請求項１３】
前記因子は、標識されているかまたは標識され得る、請求項７に記載の因子。
【請求項１４】
前記標識は、蛍光、リン光、化学発光、放射能、酵素基質反応および抗原抗体反応からなる群より選択される技法を利用する、請求項１３に記載の因子。
【請求項１５】
（ａ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントからなる、ポリペプチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド；
（ｃ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体によってコードされる、ポリペプチド；
（ｄ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列の種相同体である、ポリペプチド；または
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のいずれか１つのポリペプチドに対する同一性が少なくとも７０％であるアミノ酸配列を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド、
を含む、
ポリペプチド。
【請求項１６】
少なくとも３の連続するアミノ酸配列を有する、請求項１５に記載のポリペプチド。
【請求項１７】
配列番号２、４、６または３０において、配列番号８もしくは１０またはそれに対応するＳｔｍ２のアミノ酸配列の対応する配列と相違する配列を少なくとも１つの位置において有する、請求項１５に記載のポリペプチド。
【請求項１８】
前記相違する配列を有する部分は、制限酵素で消化され得る、請求項１７に記載のポリペプチド。
【請求項１９】
（ａ）配列番号４に記載のアミノ酸配列の１５７位〜２１８位（ホメオドメイン）、２６１位〜３０１位（Ｗリッチ領域）もしくは３９９位〜４５５位（Ｂ２反復配列領域）またはそれに対応する位置のアミノ酸配列、またはそのフラグメントからなる、ポリペプチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド；または
（ｃ）（ａ）〜（ｂ）のいずれか１つのポリペプチドに対する同一性が少なくとも７０％であるアミノ酸配列を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド、
を含む、
ポリペプチド。
【請求項２０】
請求項１５に記載の核酸分子に対して特異的に結合する、因子。
【請求項２１】
前記因子は、核酸分子、ポリペプチド、脂質、糖鎖、有機低分子およびそれらの複合分子からなる群より選択される、請求項２０に記載の因子。
【請求項２２】
前記因子は、抗体またはその誘導体である、請求項２０に記載の因子。
【請求項２３】
前記因子は、プローブとして使用される、請求項２０に記載の因子。
【請求項２４】
前記因子は、標識されているかまたは標識され得る、請求項２０に記載の因子。
【請求項２５】
前記標識は、蛍光、リン光、化学発光、放射能、酵素基質反応および抗原抗体反応からなる群より選択される技法を利用する、請求項２４に記載の因子。
【請求項２６】
請求項１に記載の核酸分子を含む、発現カセット。
【請求項２７】
請求項１に記載の核酸分子を含む、ベクター。
【請求項２８】
前記核酸分子に作動可能に連結された制御配列をさらに含む、請求項２７に記載のベクター。
【請求項２９】
前記制御配列は、前記核酸分子の発現を誘導する、請求項２８に記載のベクター。
【請求項３０】
選択マーカーをコードする配列をさらに含む、請求項２８に記載のベクター。
【請求項３１】
請求項１に記載の核酸分子を含む、細胞。
【請求項３２】
請求項１に記載の核酸分子が発現されるように含まれる、細胞。
【請求項３３】
請求項１に記載の核酸分子が発現可能に含まれ、かつ、所望のゲノム配列を有する、細胞。
【請求項３４】
請求項１に記載の核酸分子を含む、動物組織。
【請求項３５】
請求項１に記載の核酸分子を含む、動物。
【請求項３６】
請求項１に記載の核酸分子を含む細胞が濃縮された、組成物。
【請求項３７】
Ｓｔｍ遺伝子のプロモーター部分の配列を含む、核酸分子。
【請求項３８】
請求項３７に記載の核酸分子を含む、ベクター。
【請求項３９】
選択マーカーをコードする配列をさらに含む、請求項１８に記載のベクター。
【請求項４０】
請求項３７に記載の核酸分子を含む、細胞。
【請求項４１】
請求項３７に記載の核酸分子を含む、動物組織。
【請求項４２】
請求項３７に記載の核酸分子を含む、動物。
【請求項４３】
請求項３７に記載の核酸分子を含む細胞が濃縮された、組成物。
【請求項４４】
細胞の未分化状態を判定するための組成物であって、該組成物は、Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物に特異的に反応する因子を含む、組成物。
【請求項４５】
前記Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物は、
（Ａ）（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子；あるいは
（Ｂ）（ａ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントからなる、ポリペプチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントにおいて、１以上のアミノ酸が置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド、；
（ｃ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体によってコードされる、ポリペプチド；
（ｄ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列の種相同体である、ポリペプチド；または
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のいずれか１つのポリペプチドに対する同一性が少なくとも７０％であるアミノ酸配列を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド、
を含む、
ポリペプチド、である、請求項４４に記載の組成物。
【請求項４６】
前記細胞は、幹細胞である、請求項４４に記載の組成物。
【請求項４７】
前記細胞は、胚性幹細胞、多能性幹細胞、単能性幹細胞、および組織幹細胞を含む、請求項４４に記載の組成物。
【請求項４８】
前記細胞は、神経幹細胞、性腺幹細胞、造血幹細胞、表皮幹細胞および間充組織幹細胞からなる群より選択される組織幹細胞を含む、請求項４４に記載の組成物。
【請求項４９】
前記細胞は、遺伝子改変されたものかまたは遺伝子改変されていないものである、請求項４４に記載の組成物。
【請求項５０】
細胞の未分化状態を判定する方法であって、
（Ｉ）判定されるべき細胞を提供する工程；
（ＩＩ）Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物に特異的に反応する因子を、該細胞に接触させる工程；および
（ＩＩＩ）該因子と該Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物との特異的反応を検出することによって、該Ｓｔｍ遺伝子が該細胞において発現しているかどうかを確認する工程、
を包含し、ここで、該細胞における該Ｓｔｍ遺伝子の発現は、細胞が未分化状態にあることを示す、方法。
【請求項５１】
前記未分化状態は、全能性を含む、請求項５０に記載の方法。
【請求項５２】
前記Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物は、
（Ａ）（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子；あるいは
（Ｂ）（ａ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントからなる、ポリペプチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントにおいて、１以上のアミノ酸が置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド；
（ｃ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体によってコードされる、ポリペプチド；
（ｄ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列の種相同体である、ポリペプチド；または
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のいずれか１つのポリペプチドに対する同一性が少なくとも７０％であるアミノ酸配列を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド、
を含む、
ポリペプチドを含む、請求項５０に記載の方法。
【請求項５３】
さらに、他の幹細胞マーカーが発現しているかどうかを確認する工程を包含する、請求項５０に記載の方法。
【請求項５４】
前記他の幹細胞マーカーは、Ｏｃｔ３／４を含む、請求項５３に記載の方法。
【請求項５５】
前記Ｓｔｍ遺伝子は、Ｓｔｍ１遺伝子を含む、請求項５０に記載の方法。
【請求項５６】
前記Ｓｔｍ１遺伝子は、配列番号１、３、５または２９に示される配列を含む、請求項５５に記載の方法。
【請求項５７】
未分化状態の細胞を調製する方法であって、
（Ｉ）未分化状態の細胞を含むかまたは含むと予測されるサンプルを提供する工程；
（ＩＩ）Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物に特異的に反応する因子を、該サンプルに接触させる工程；
（ＩＩＩ）該Ｓｔｍ遺伝子が該サンプル中の細胞において発現しているかどうかを確認する工程；および
（ＩＶ）該Ｓｔｍ遺伝子が発現している細胞を分離または濃縮する工程、
を包含する、方法。
【請求項５８】
前記未分化状態は、全能性を含む、請求項５７に記載の方法。
【請求項５９】
前記Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物は、
（Ａ）（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子；あるいは
（Ｂ）（ａ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントからなる、ポリペプチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントにおいて、１以上のアミノ酸が置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド；
（ｃ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体によってコードされる、ポリペプチド；
（ｄ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列の種相同体である、ポリペプチド；または
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のいずれか１つのポリペプチドに対する同一性が少なくとも７０％であるアミノ酸配列を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド、
を含む、
ポリペプチドを含む、請求項５７に記載の方法。
【請求項６０】
未分化状態の細胞を調製する方法であって、
（Ｉ）細胞を提供する工程；および
（ＩＩ）該細胞中のＳｔｍ遺伝子の発現を誘導する工程、
を包含する、方法。
【請求項６１】
前記未分化状態は、全能性を含む、請求項６０に記載の方法。
【請求項６２】
前記Ｓｔｍ遺伝子は、
（Ａ）（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子を含む、請求項６０に記載の方法。
【請求項６３】
未分化状態の細胞を分離および／または増殖および／または濃縮する方法であって、
（Ｉ）細胞を提供する工程；
（ＩＩ）該細胞にＳｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子プロモーターを導入する工程；および
（ＩＩＩ）該Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子プロモーターを発現する細胞を選択する工程、
を包含する、方法。
【請求項６４】
前記未分化状態は、全能性である、請求項６３に記載の方法。
【請求項６５】
前記Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子プロモーターは、
（Ａ）（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子；あるいは
（Ｂ）Ｓｔｍ１遺伝子のプロモーター部分の配列を含む、請求項６３に記載の方法。
【請求項６６】
細胞の分化状態を判定するキットであって、
（ａ）Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物に特異的に反応する因子；および
（ｂ）該Ｓｔｍ遺伝子が該細胞において発現しているかどうかを確認するための手段、
を備える、キット。
【請求項６７】
前記分化状態は、多能性である、請求項６６に記載の方法。
【請求項６８】
前記分化状態は、全能性である、請求項６６に記載の方法。
【請求項６９】
前記Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物は、
（Ａ）（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子；あるいは
（Ｂ）（ａ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントからなる、ポリペプチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントにおいて、１以上のアミノ酸が置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド；
（ｃ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体によってコードされる、ポリペプチド；
（ｄ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列の種相同体である、ポリペプチド；または
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のいずれか１つのポリペプチドに対する同一性が少なくとも７０％であるアミノ酸配列を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド、
を含む、
ポリペプチドを含む、請求項６６に記載のキット。
【請求項７０】
さらに、他の幹細胞マーカーが発現しているかどうかを確認する手段を備える、請求項６４に記載のキット。
【請求項７１】
前記他の幹細胞マーカーは、Ｏｃｔ３／４を含む、請求項７０に記載のキット。
【請求項７２】
前記Ｓｔｍ遺伝子は、Ｓｔｍ１遺伝子を含む、請求項６６に記載のキット。
【請求項７３】
未分化状態の細胞を調製するためのキットであって、
（Ｉ）Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物に特異的に反応する因子；
（ＩＩ）該Ｓｔｍ遺伝子が該サンプル中の細胞において発現しているかどうかを確認する手段；および
（ＩＩＩ）該Ｓｔｍ遺伝子が発現している細胞を分離または濃縮する手段、
を備える、キット。
【請求項７４】
前記未分化状態は、全能性である、請求項７３に記載のキット。
【請求項７５】
前記Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子産物は、
（Ａ）（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子；あるいは
（Ｂ）（ａ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントからなる、ポリペプチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントにおいて、１以上のアミノ酸が置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド；
（ｃ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体によってコードされる、ポリペプチド；
（ｄ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列の種相同体である、ポリペプチド；または
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のいずれか１つのポリペプチドに対する同一性が少なくとも７０％であるアミノ酸配列を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド、
を含む、
ポリペプチドを含む、請求項７３に記載のキット。
【請求項７６】
未分化状態の細胞を調製するキットであって、
（Ｉ）細胞中のＳｔｍ遺伝子の発現を誘導する手段、
を備える、キット。
【請求項７７】
前記未分化状態は、全能性である、請求項７６に記載のキット。
【請求項７８】
前記Ｓｔｍ遺伝子は、
（Ａ）（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子を含む、請求項７６に記載のキット。
【請求項７９】
未分化状態の細胞を調製するキットであって、
（Ｉ）制御配列に作動可能に連結されたＳｔｍ遺伝子を含むベクター、
を備える、キット。
【請求項８０】
前記未分化状態は、全能性である、請求項７９に記載のキット。
【請求項８１】
前記Ｓｔｍ遺伝子は、
（Ａ）（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子を含む、請求項７９に記載のキット。
【請求項８２】
未分化状態の細胞を分離および／または増殖および／または濃縮するキットであって、
（Ｉ）Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子プロモーター；
（ＩＩ）細胞に該Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子プロモーターを導入する手段；および
（ＩＩＩ）該Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子プロモーターを発現する細胞を選択する手段、
を包含する、キット。
【請求項８３】
前記未分化状態は、全能性である、請求項８２に記載のキット。
【請求項８４】
前記Ｓｔｍ遺伝子またはＳｔｍ遺伝子プロモーターは、
（Ａ）（ａ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸が、置換、付加および欠失からなる群より選択される１つの変異を有する改変体ポリペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号１、３、５または２９に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号２、４、６または３０に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドの種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；または
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか１つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一性が少なくとも７０％である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
を含む、
核酸分子；あるいは
（Ｂ）Ｓｔｍ１遺伝子のプロモーター部分の配列を含む、請求項８２に記載のキット。
【図７】
【図１Ａ】
【図１Ｂ】
【図１Ｃ】
【図１Ｄ】
【図２Ｂ】
【図２Ｃ】
【図２Ｄ】
【図２Ｅ】
【図２Ｆ】
【図２Ｇ】
【図２Ｈ】
【図２Ｊ】
【図２Ｋ】
【図２Ｏ】
【図３Ａ】
【図４Ａ】
【図４Ｂ】
【図４Ｄ】
【図４Ｅ】
【図５Ａ】
【図５Ｂ】
【図５Ｃ】
【図６】
【図８Ａ】
【図８Ｂ】
【図８Ｃ】
【図１Ａ】
【図１Ｂ】
【図１Ｃ】
【図１Ｄ】
【図２Ｂ】
【図２Ｃ】
【図２Ｄ】
【図２Ｅ】
【図２Ｆ】
【図２Ｇ】
【図２Ｈ】
【図２Ｊ】
【図２Ｋ】
【図２Ｏ】
【図３Ａ】
【図４Ａ】
【図４Ｂ】
【図４Ｄ】
【図４Ｅ】
【図５Ａ】
【図５Ｂ】
【図５Ｃ】
【図６】
【図８Ａ】
【図８Ｂ】
【図８Ｃ】
【公表番号】特表２００６−５２１７９２（Ｐ２００６−５２１７９２Ａ）
【公表日】平成１８年９月２８日（２００６．９．２８）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００６−５０２６６８（Ｐ２００６−５０２６６８）
【出願日】平成１６年２月１２日（２００４．２．１２）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＪＰ２００４／００１５２０
【国際公開番号】ＷＯ２００４／０７２２２６
【国際公開日】平成１６年８月２６日（２００４．８．２６）
【出願人】（５０４１３２２７２）国立大学法人京都大学 (1,269)
【出願人】（５０３３４１６７５）株式会社リプロセル (13)
【出願人】（５０３０６０８８０）
【出願人】（５０３０６０９０５）
【出願人】（５０３０６００６４）
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成１８年９月２８日（２００６．９．２８）
【国際特許分類】
【出願日】平成１６年２月１２日（２００４．２．１２）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＪＰ２００４／００１５２０
【国際公開番号】ＷＯ２００４／０７２２２６
【国際公開日】平成１６年８月２６日（２００４．８．２６）
【出願人】（５０４１３２２７２）国立大学法人京都大学 (1,269)
【出願人】（５０３３４１６７５）株式会社リプロセル (13)
【出願人】（５０３０６０８８０）
【出願人】（５０３０６０９０５）
【出願人】（５０３０６００６４）
【Ｆターム（参考）】
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