特定の態様において、本発明は、骨成長を促進するため、骨密度および骨強度を増大させるための組成物および方法を提供する。特定の実施形態において、本発明は、ＡＬＫ３−Ｆｃ融合タンパク質を含むＡＬＫ３ポリペプチドを提供する。本発明は、可溶性形態のＡＬＫ３が、ＢＭＰ−ＡＬＫ３シグナル伝達のインヒビターとして作用し、骨密度の増大、骨成長、および骨強度の増大をインビボで促進することを明らかにする。いずれの特定の機構にも束縛されることは望ましくないが、可溶性形態のＡＬＫ３は、ＢＭＰ２および／またはＢＭＰ４、ならびにおそらくは、ＡＬＫ３を通じてシグナルを伝達する他のリガンドを阻害することによりこの作用を達成すると考えられる。

【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
（関連出願）
本出願は、２００９年３月３０日に出願された米国仮出願番号６１／２１１，５５７、２０１０年２月１９日に出願された同６１／３０６，３３１、２０１０年３月１６日に出願された同６１／３１４，５５６の利益を主張する。上記で言及した出願の全ての教示は、参照によって本明細書に援用される。
【背景技術】
【０００２】
（発明の背景）
骨粗鬆症から骨折までの範囲に及ぶ骨の障害は、有効な医薬品がほとんどない一連の病理学的状態を示す。その代わりに、処置は、固定化、運動、および食事の変更を含む、物理的介入ならびに行動的介入に重点が置かれている。様々な骨障害を処置するために骨成長を促進し、骨密度を増大させる治療薬を有することが有益である。
【０００３】
骨成長と石灰化は、２つのタイプの細胞（破骨細胞と骨芽細胞）の活性に依存するが、軟骨細胞と血管系の細胞もまた、これらのプロセスの重要な局面に関与している。発育上、骨の形成は２つの機構（軟骨内骨化と膜性骨化）を通じて起こる。前者は長手方向の骨の形成に関与しており、後者は、位相的扁平骨（例えば、頭蓋骨）の形成に関与している。軟骨内骨化には、骨芽細胞、破骨細胞、血管系の形成と、その後の石灰化の鋳型となる、成長板の軟骨性の構造の連続的な形成と分解が必要である。膜性骨化の間に、骨が結合組織において直接形成される。いずれのプロセスにも、骨芽細胞の浸潤とそれに続くマトリックスの堆積が必要である。
【０００４】
骨折と骨の他の構造的破壊は、少なくとも外見上は、軟骨組織の形成とそれに続く石灰化を含む、一連の発育上の骨形成事象と似ているプロセスにより治癒する。骨折の治癒のプロセスは２つの方法で起こり得る。直接または第１の骨の治癒は、仮骨形成を伴わずに起こる。間接または第２の骨の治癒は、仮骨の前駆段階を伴って起こる。骨折の第１の治癒には、近接している破壊部を超えた力学的連続性の再形成が含まれる。適切な条件下で、破壊の周囲の骨吸収細胞は、トンネル吸収反応（ｔｕｎｎｅｌｌｉｎｇ ｒｅｓｏｒｐｔｉｖｅ ｒｅｓｐｏｎｓｅ）を示し、血管の進入とそれに続く治癒のための経路を確立する。骨の第２の治癒は、炎症、軟性仮骨の形成、仮骨の石灰化、および仮骨リモデリングのプロセスに続く。炎症段階では、血腫および出血の形成が、損傷の部位での骨膜および骨内膜の血管の破壊により生じる。炎症細胞がその領域に入り込む。軟性仮骨形成の段階では、上記細胞が新しい血管、線維芽細胞、細胞内物質、および支持細胞を産生し、骨折した断片の間の空間に肉芽組織を形成する。破壊部を超えた臨床的結合が、線維性組織または軟骨組織（軟性仮骨）により確立される。骨芽細胞が形成され、軟性仮骨の石灰化を媒介し、これはその後、層板骨にとって替わられ、正常なリモデリングプロセスに供される。
【０００５】
骨折と骨構造の他の物理的な破壊に加えて、骨ミネラル含量および骨量の減少は、多岐にわたる条件により起こり得、深刻な医学的問題を生じる場合がある。骨量の変化は、個人の生涯にわたり比較的予測可能な方法で起こる。およそ３０歳までは、男性および女性の骨は両方とも、軟骨内成長板の長さの成長と放射状の成長により最大量にまで成長する。（骨梁骨（例えば、椎骨および骨盤のような扁平骨）については）およそ３０歳以降、そして（皮質骨（例えば、四肢に見られる長骨）については）４０歳以降は、男性および女性のいずれにおいてもゆっくりとした骨の減少が起こる。女性では、実質的な骨の減少の最終段階がまた、おそらくは閉経後のエストロゲンの不足が原因で起こる。この段階の間に、女性は皮質骨から骨量のさらに１０％を、そして骨梁区画からはさらに２５％を失う可能性がある。進行性の骨の減少が骨粗鬆症のような病理学的状態を生じるかどうかは、個人の最初の骨量と、悪化しつつある状態が存在するかどうかに大きく依存する。
【０００６】
骨の減少は、時折、正常な骨のリモデリングプロセスの不均衡として特徴づけられる。健康な骨は、常にリモデリングに供されている。リモデリングは、破骨細胞による骨の吸収とともに開始する。その後、吸収された骨は、新しい骨組織によって置き換えられ、これは、骨芽細胞によるコラーゲンの形成とそれに続くカルシウム沈着を特徴とする。健康な個体では、吸収と形成の速度は平衡状態にある。骨粗鬆症は、吸収側へのシフトを特徴とする慢性の進行性の状態であり、骨量および骨石灰化の全体的な減少を生じる。ヒトにおいては、骨粗鬆症の前に、臨床的骨減少症（若年成人の骨についての平均値から下に１標準偏差を超え、２．５標準偏差を超えない、骨ミネラル密度）が起こる。世界中では、およそ７５００万人に骨粗鬆症のリスクがある。
【０００７】
したがって、破骨細胞の活性と骨芽細胞の活性との間での平衡を制御するための方法が、骨折および他の骨の損傷の治癒を促進するため、ならびに骨量および骨石灰化の減少と関係がある、骨粗鬆症のような障害の処置に有用であり得る。
【０００８】
骨粗鬆症に関しては、ビタミンＫ、または高用量の食事性カルシウムとともに、エストロゲン、カルシトニン、オステオカルシンが全て、治療的介入として使用される。骨粗鬆症のための他の治療的アプローチとしては、ビスホスホネート、副甲状腺ホルモン、カルシウム模倣物（calcimimetic）、スタチン、アナボリックステロイド、ランタンおよびストロンチウム塩、ならびにフッ化ナトリウムが挙げられる。しかし、このような治療薬には、多くの場合、望ましくない副作用が伴う。
【０００９】
骨の減少はまた、多くのがんの重大な合併症でもあり、腫瘍の骨への転移、破骨細胞の活性化、または化学療法の処置の効果によっても引き起こされ得る。特に、乳がんの処置に広く使用されている抗エストロゲン療法は、顕著な骨の減少を引き起こす可能性がある。
【００１０】
骨形成不全症のような他の骨の障害は、遺伝的、発生上の、栄養に関する、または他の病理および欠損症により生じ得る。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【００１１】
したがって、骨成長と石灰化を促進するための組成物および方法を提供することが、本開示の目的である。
【課題を解決するための手段】
【００１２】
（発明の概要）
本開示は、その一部において、ＡＬＫ３アンタゴニスト活性またはＢＭＰアンタゴニスト活性を有している分子（「ＡＬＫ３アンタゴニスト」および「ＢＭＰアンタゴニスト」）を、骨密度を増大させるため、骨成長を促進するため、および／または骨強度を増大させるために使用できることを明らかにする。この観察は、文献および臨床経験の大半が、多くのＢＭＰ、特に、ＢＭＰ２、ＢＭＰ４、およびＢＭＰ７が、骨の形成の強力な刺激因子であることを示していることを考えると、特に驚くべきことである。本開示は、可溶性形態のＡＬＫ３が、ＢＭＰ−ＡＬＫ３シグナル伝達のインヒビターとして作用し、骨密度の増大、骨成長、および骨強度の増大をインビボで促進することを明らかにする。いずれの特定の機構にも束縛されることは望ましくないが、可溶性形態のＡＬＫ３は、ＢＭＰ２および／またはＢＭＰ４、ならびにおそらくは、ＡＬＫ３を通じてシグナルを伝達する他のリガンドを阻害することによりこの作用を達成すると考えられる。したがって、本開示は、ＢＭＰ−ＡＬＫ３シグナル伝達経路のアンタゴニストを、骨密度を増大させるため、および骨成長を促進するために使用できることを確立する。可溶性のＡＬＫ３は、ＢＭＰ拮抗作用に加えて、またはＢＭＰ拮抗作用以外の機構により骨に影響を及ぼす可能性があるが、それにもかかわらず、本開示は、望ましい治療薬が、ＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニスト活性に基づいて選択され得ることを明らかにする。したがって、特定の実施形態においては、本開示は、低い骨密度または低い骨強度と関係がある障害（例えば、骨粗鬆症）を処置するため、あるいは、骨成長の必要がある患者において（例えば、骨折患者において）骨成長を促進するために、ＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニスト（例えば、ＢＭＰ結合性ＡＬＫ３ポリペプチド、抗ＢＭＰ抗体、抗ＡＬＫ３抗体、ＢＭＰ標的化またはＡＬＫ３標的化低分子およびアプタマー、ならびにＢＭＰおよびＡＬＫ３の発現を低下させる核酸を含む）を使用する方法を提供する。さらなる実施形態においては、本開示は、有利な特性を持ち、そして適切なＢＭＰ２またはＢＭＰ４結合を保持している短縮型のＡＬＫ３ポリペプチド（例えば、ＡＬＫ３−Ｆｃポリペプチド）を同定する。
【００１３】
特定の態様において、本開示は、ＢＭＰ２および／またはＢＭＰ４に結合する可溶性ＡＬＫ３ポリペプチドを含有しているポリペプチドを提供する。この可溶性ＡＬＫ３ポリペプチドは、さらなるリガンドにもまた結合し得る。ＡＬＫ３ポリペプチドは、ＢＭＰ結合性ＡＬＫ３ポリペプチドおよび薬学的に許容され得るキャリアを含有している薬学的調製物として処方され得る。好ましくは、ＢＭＰ結合性ＡＬＫ３ポリペプチドは、１マイクロモル未満、または１００ナノモル、１０ナノモル、もしくは１ナノモル未満のＫ_ＤでＢＭＰ２および／またはＢＭＰ４に結合する。上記組成物は、サイズ排除クロマトグラフィーにより評価した場合に他のポリペプチド成分に関して少なくとも９５％純粋であることが好ましく、上記組成物が、少なくとも９８％純粋であることがさらに好ましい。そのような調製物において使用されるＢＭＰ結合性ＡＬＫ３ポリペプチドは、本明細書中に開示するもののいずれかであり得、例えば、配列番号３、７、１１、１４、２０、２２、２３、２５、２６、２８、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３６、３８、３９、４０、もしくは４１から選択されるアミノ酸配列を有しているポリペプチド、または、配列番号３、７、１１、１４、２０、２２、２３、２５、２６、２８、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３６、３８、３９、４０、もしくは４１から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％または９９％同一であるアミノ酸配列を有しているポリペプチドであり、これは、配列番号３の１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、もしくは２５個を超えないアミノ酸のＮ末端および／またはＣ末端短縮を含み、状況に応じてリンカーで、もしくはリンカーを伴わずにＦｃ融合タンパク質に融合させられている。特に、本開示は、ＡＬＫ３ ＥＣＤ部分のＮ末端に０個〜７個のアミノ酸の短縮があり、ＡＬＫ３ ＥＣＤ部分のＣ末端に０個〜１２個のアミノ酸の短縮があるＡＬＫ３ポリペプチドを提供する（これにより、配列番号３のアミノ酸８〜１１７に対応する機能部分と、配列番号３の８〜１１７のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、または９９％同一であるタンパク質を含有しているポリペプチドを説明する）。特に、ヒトＡＬＫ３とマウスＡＬＫ３は、細胞外ドメインにおいてアミノ酸配列レベルで９７％〜９８％の同一性を有し、ヒトタンパク質またはマウスタンパク質由来のそのようなドメインを含有しているタンパク質が、インビトロおよびインビボで類似する活性を示すことを本明細書中で示す。ＢＭＰ結合性ＡＬＫ３ポリペプチドには、天然のＡＬＫ３ポリペプチドの機能的断片（例えば、配列番号１または３から選択される配列の少なくとも１０個、２０個、または３０個のアミノ酸を含有しているもの）が含まれ得る。驚くべきことに、本明細書中で示すように、ＡＬＫ３細胞外ドメインのＣ末端領域にアミノ酸の欠失を含むＡＬＫ３タンパク質は、ＢＭＰ２およびＢＭＰ４に対する活性を保持しているが、他のリガンド（例えば、ＢＭＰ６およびＢＭＰ７）に対する活性は低下しており、リガンド選択性において改善が得られ、これは、臨床開発または商品化における予期せぬオフターゲット効果を小さくするために一般的に望ましい。このような改変体は、配列番号３のＣ末端から６個もしくは７個を超えない、１２個を超えない、または２４個を超えないアミノ酸の欠失を含み得る。状況に応じて、Ｃ末端が短縮された形態は、Ｎ末端の１個、２個、３個、４個、５個、６個、または７個を超えないアミノ酸も短縮され得る。ＡＬＫ３タンパク質の上記バリエーションは、ＡＬＫ３−Ｆｃ融合タンパク質に含まれ得る。ＡＬＫ３−Ｆｃ融合タンパク質は、本明細書中で開示する任意のリンカー（配列ＧＧＧまたはＴＧＧＧまたはＳＧＧＧを有しているリンカーを含む）と（あるいは、リンカーを全く含まない）、ヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、またはＩｇＧ４、あるいは他の哺乳動物の免疫グロブリンに由来するＦｃ部分とを含み得る。
【００１４】
可溶性のＢＭＰ結合性ＡＬＫ３ポリペプチドは、天然に存在しているＡＬＫ３ポリペプチドと比較して、アミノ酸配列の中に（例えば、リガンド結合ドメインの中）に、１個、２個、５個、またはそれ以上の変更を含み得る。アミノ酸配列中の変更は、例えば、哺乳動物、昆虫、もしくは他の真核生物の細胞の中で産生される場合には、ポリペプチドのグリコシル化を変更し得、あるいは、天然に存在しているＡＬＫ３ポリペプチドと比較して、ポリペプチドのタンパク質分解による切断を変更する可能性がある。
【００１５】
ＢＭＰ結合性ＡＬＫ３ポリペプチドは、１つのドメインとしてのＡＬＫ３ポリペプチド（例えば、ＡＬＫ３のリガンド結合部分）と、望ましい特性（例えば、改善された薬物動態、より容易な精製、特定の組織に対する標的化など）を提供する１つまたは複数のさらなるドメインとを有する融合タンパク質であり得る。例えば、融合タンパク質の１つのドメインは、インビボでの安定性、インビボでの半減期、取り込み／投与、組織局在性もしくは組織分布、タンパク質複合体の形成、融合タンパク質の多量体化、および／または精製の１つあるいは複数を増強し得る。ＢＭＰ結合性ＡＬＫ３融合タンパク質は、免疫グロブリンＦｃドメイン（野生型もしくは変異体）または血清アルブミン、あるいは、改善された薬物動態、改善された溶解度、または改善された安定性のような望ましい特性を提供する他のポリペプチド部分を含み得る。好ましい実施形態においては、ＡＬＫ３−Ｆｃ融合体は、Ｆｃドメインと細胞外ＡＬＫ３ドメインとの間に配置された比較的構造化されていないリンカーを含む。この構造化されていないリンカーは、ＡＬＫ３の細胞外ドメインのＣ末端に対応する場合があり、また、これは、１個、２個、３個、４個、もしくは５個のアミノ酸の人工的な配列、または比較的自由な二次構造の５個〜１５個、２０個、３０個、５０個、もしくはそれ以上の長さのアミノ酸、あるいは両方の混合物である場合もある。リンカーには、グリシン残基とプロリン残基が多く含まれ得、例えば、スレオニン／セリンとグリシンの単一配列、あるいは、スレオニン／セリンおよび／もしくはグリシンの反復配列（例えば、ＧＧＧ、ＧＧＧＧ、ＴＧ_４、ＳＧ_４、ＴＧ_３、またはＳＧ_３のシングレット（ｓｉｎｇｌｅｔ）もしくは反復）が含まれ得る。融合タンパク質には、精製配列（例えば、エピトープタグ、ＦＬＡＧタグ、ポリヒスチジン配列、およびＧＳＴ融合物）が含まれ得る。状況に応じて、可溶性ＡＬＫ３ポリペプチドには、以下から選択される１つまたは複数の修飾されたアミノ酸残基が含まれる：グリコシル化アミノ酸、ＰＥＧ化アミノ酸、ファルネシル化アミノ酸、アセチル化アミノ酸、ビオチニル化アミノ酸、脂質部分結合体化アミノ酸、および有機誘導化剤結合体化アミノ酸。薬学的調製物にはまた、骨の障害を処置するために使用される化合物のような、１つまたは複数のさらなる化合物が含まれる場合がある。薬学的調製物が、実質的には発熱物質を含まないことが好ましい。一般的には、患者における好ましくない免疫応答の可能性を小さくするために、ＡＬＫ３タンパク質の天然のグリコシル化を適切に媒介する哺乳動物細胞系の中でＡＬＫ３タンパク質を発現させることが好ましい。ヒト細胞系およびＣＨＯ細胞系はすでにうまく活用されており、ならびに、他の一般的な哺乳動物発現系が有用であると期待される。
【００１６】
特定の態様では、本開示は、可溶性のＢＭＰ結合性ＡＬＫ３ポリペプチドをコードする核酸を提供する。単離されたポリヌクレオチドには、上記に記載したような、可溶性のＢＭＰ結合性ＡＬＫ３ポリペプチドのコード配列が含まれ得る。例えば、単離された核酸には、ＡＬＫ３の細胞外ドメイン（例えば、リガンド結合ドメイン）をコードする配列と、ＡＬＫ３の膜貫通ドメインおよび／または細胞質ドメインの一部または全体をコードする配列が含まれ得るが、停止コドンについては、膜貫通ドメインもしくは細胞質ドメインの中に配置されているか、または細胞外ドメインと膜貫通ドメインもしくは細胞質ドメインとの間に配置されている。例えば、単離されたポリヌクレオチドには、全長のＡＬＫ３ポリヌクレオチド配列（例えば、配列番号２もしくは４）または部分的に短縮されたバージョンが含まれ得る。上記単離されたポリヌクレオチドにはさらに、３’末端の前少なくとも６００個のヌクレオチドにおいて転写終結コドンが含まれているか、そうでなければ、
ポリヌクレオチドの翻訳により、全長のＡＬＫ３の短縮された部分に対して状況に応じて融合させられた細胞外ドメインが生じるように配置された転写終結コドンが含まれている。好ましい核酸配列は、配列番号１２、１３、１５、１６、１９、２１、２４、２７、３２、または３７、およびそのような核酸またはその相補物に対してストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズする核酸である。本明細書中で開示する核酸は、発現のためのプロモーターに対して作動可能であるように連結させることができ、本開示は、そのような組換えポリヌクレオチドで形質転換された細胞を提供する。細胞は、ＣＨＯ細胞のような哺乳動物細胞であることが好ましい。
【００１７】
特定の態様においては、本開示は、可溶性のＢＭＰ結合性ＡＬＫ３ポリペプチドを作製するための方法を提供する。そのような方法には、適切な細胞（例えば、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞）の中で本明細書中に開示する核酸（例えば、配列番号２、４、１２、１３、１５、１６、１９、２１、２４、２７、３２、または３７）のいずれかを発現させる工程が含まれ得る。そのような方法には、ａ）可溶性ＡＬＫ３ポリペプチドの発現に適している条件下で細胞を培養する工程（ここで、上記細胞は可溶性ＡＬＫ３発現構築物で形質転換されている）；およびｂ）そのように発現させた可溶性ＡＬＫ３ポリペプチドを収集する工程が含まれ得る。可溶性ＡＬＫ３ポリペプチドは、粗画分、部分的に精製された画分、または高度に精製された画分として収集することができる。精製は、例えば、以下の１つ、２つ、もしくは３つ、またはそれ以上を任意の順序で含む一連の精製工程により行うことができる：プロテインＡクロマトグラフィー、陰イオン交換クロマトグラフィー（例えば、Ｑセファロース）、疎水性相互作用クロマトグラフィー（例えば、フェニルセファロース）、サイズ排除クロマトグラフィー、および陽イオン交換クロマトグラフィー。
【００１８】
特定の態様においては、本明細書中に開示するＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニスト（例えば、可溶性のＢＭＰ結合性ＡＬＫ３ポリペプチド）を、被験体において骨成長を促進するかまたは骨密度を増大させるための方法において使用することができる。特定の実施形態においては、本開示は、処置の必要がある患者において、低い骨密度と関係がある障害を処置するため、または骨成長を促進するための方法を提供する。１つの方法には、投与の必要がある被験体に対して有効量のＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニストを投与する工程が含まれ得る。特定の態様においては、本開示は、本明細書中に記載するような障害または状態の処置のための医薬品を作製するためのＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニストの使用を提供する。
【００１９】
特定の態様においては、本開示は、骨の成長または石灰化の増進を刺激する物質を同定するための方法を提供する。上記方法には、ａ）ＢＭＰまたはＡＬＫ３ポリペプチドのリガンド結合ドメインに結合する試験物質を同定する工程；およびｂ）骨の成長または石灰化に対する上記物質の効果を評価する工程が含まれる。
【図面の簡単な説明】
【００２０】
【図１】図１は、ヒトＡＬＫ３前駆体の天然のアミノ酸配列を示す（配列番号１）。ＡＬＫ３の細胞外ドメイン（残基２４〜１５２）に下線をつける。
【図２】図２は、ヒトＡＬＫ３前駆体をコードする天然のヌクレオチド配列を示す（配列番号２）。ＡＬＫ３の細胞外ドメインをコードする配列（ヌクレオチド７０〜４５６）に下線をつける。
【図３】図３は、ヒトＡＬＫ３の細胞外ドメインの天然のアミノ酸配列を示す（配列番号３）。
【図４】図４は、ヒトＡＬＫ３の細胞外ドメインをコードする天然のヌクレオチド配列を示す（配列番号４）。
【図５】図５は、ヒトＩｇＧ１のＦｃドメインの天然のアミノ酸配列を示す（配列番号５）。
【図６】図６は、ヒトＩｇＧ１のＦｃドメインをコードする天然のヌクレオチド配列を示す（配列番号６）。
【図７】図７は、リーダーの無いｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃのアミノ酸配列を示す（配列番号７）。ヒトＡＬＫ３の細胞外ドメイン（配列番号３）に下線をつけ、ＴＧＧＧリンカー配列は太字体とする。
【図８】図８は、ＴＰＡリーダーを持つｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃの全長のアミノ酸配列を示す（配列番号１１）。ヒトＡＬＫ３の細胞外ドメイン（配列番号３）に下線をつけ、ＴＧＧＧリンカー配列は太字体とする。
【図９−１】図９は、ＴＰＡリーダーを持つｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃをコードするヌクレオチド配列を示す。配列番号１２はコード鎖に対応し、配列番号１３はアンチコード鎖に対応する。ヒトＡＬＫ３の細胞外ドメインをコードする配列（配列番号４）に下線をつける。
【図９−２】図９は、ＴＰＡリーダーを持つｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃをコードするヌクレオチド配列を示す。配列番号１２はコード鎖に対応し、配列番号１３はアンチコード鎖に対応する。ヒトＡＬＫ３の細胞外ドメインをコードする配列（配列番号４）に下線をつける。
【図１０】図１０は、ＴＰＡリーダーを持つｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃの全長のアミノ酸配列を示す（配列番号１４）。ヒトＡＬＫ３の細胞外ドメイン（配列番号３）に下線をつけ、ＴＧＧＧリンカー配列は太字体とする。
【図１１−１】図１１は、ＴＰＡリーダーを持つｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃをコードするヌクレオチド配列を示す。配列番号１５はコード鎖に対応し、配列番号１６はアンチコード鎖に対応する。ヒトＡＬＫ３の細胞外ドメインをコードする配列（配列番号４）に下線をつける。
【図１１−２】図１１は、ＴＰＡリーダーを持つｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃをコードするヌクレオチド配列を示す。配列番号１５はコード鎖に対応し、配列番号１６はアンチコード鎖に対応する。ヒトＡＬＫ３の細胞外ドメインをコードする配列（配列番号４）に下線をつける。
【図１２】図１２は、雌性マウスにおける全身の骨ミネラル密度に対するｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置の効果を示す。測定は、二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）によって行った。データは、平均（１つのグループあたりｎ＝８）±ＳＥＭである。＊，対応のないｔ検定によりビヒクルに対してＰ＜０．０５。ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、処置の３１日後および４２日後に全身の骨密度を有意に増大させた。
【図１３】図１３は、雌性マウスにおける椎骨の骨ミネラル密度に対するｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置の効果を示す。第４および第５腰椎（Ｌ４、Ｌ５）を含む領域の測定を、ＤＥＸＡによって行った。データは、平均（１つのグループあたりｎ＝８）±ＳＥＭである。＊＊、対応のないｔ検定によりビヒクルに対してＰ＜０．００５。ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、処置の３１日後および４２日後に椎骨の骨密度を有意に増大させた。
【図１４】図１４は、雌性マウスにおける皮質骨の厚みに対するｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置の効果を示す。右の近位脛骨（ｐｒｏｘｉｍａｌ ｔｉｂｉａ）の測定を、マイクロコンピュータ断層撮影法（マイクロＣＴ）によって行った。データは平均であり（１つのグループあたりｎ＝８）、エラーバーは、±２倍ＳＥＭを示す。＊＊、対応のないｔ検定によりビヒクルに対してＰ＜０．００５。ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、６週間の処置後に皮質骨の厚みを有意に増大させた。
【図１５】図１５は、雌性マウスにおける骨梁骨体積に対するｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置の効果を示す。右の近位脛骨の測定をマイクロＣＴによって行った。データは平均であり（１つのグループあたりｎ＝８）、エラーバーは±２倍ＳＥＭを示す。＊＊＊、対応のないｔ検定により処置前のベースラインまたはビヒクルに対してＰ＜０．００１。ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、４週間の処置後に骨梁骨の割合を２倍超にした。
【図１６】図１６は、雌性マウスにおける平均の骨梁の厚みに対するｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置の効果を示す。右の近位脛骨の測定をマイクロＣＴによって行った。データはグループの平均であり（１つのグループあたりｎ＝８）、エラーバーは±２倍ＳＥＭを示す。＊＊＊、対応のないｔ検定により処置前のベースラインまたはビヒクルに対してＰ＜０．００１。ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、４週間の処置後に骨梁の厚みを有意に増大させた。
【図１７】図１７は、雌性マウスにおける骨梁骨の微細構造に対する４週間のｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置の効果を示す。近位脛骨の骨梁骨の代表的な三次元画像をマイクロＣＴによって作製した。スケールバー＝３００μｍ。
【図１８】図１８は、骨の形成を刺激する目的のためにＢＭＰ−ＡＬＫ３シグナル伝達軸（ｓｉｇｎａｌｉｎｇ ａｘｉｓ）によるシグナル伝達を妨害するための、本明細書中に開示する３つのアプローチの例を示す。Ａ：ＡＬＫ３−Ｆｃ。Ｂ：選択されるＢＭＰリガンド（単数または複数）に対する抗体。Ｃ：ＡＬＫ３の細胞外ドメインのリガンド結合領域に対する抗体。「ＢＭＰ２」を、ＢＭＰが、ＢＭＰ２、ＢＭＰ４、またはＡＬＫ３についての別の高親和性リガンドであり得ることを説明するために使用する。
【図１９】図１９は、雌性マウスにおける最大骨荷重に対する６週間のｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置の効果を示す。大腿骨の片側分析を、Ｉｎｓｔｒｏｎ機械式検査デバイスを用いてエキソビボで行った。ニュートン（Ｎ）でのデータは平均（１つのグループあたりｎ＝８）±ＳＥＭである。＊＊、ビヒクルに対してＰ＜０．０１。ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、最大骨荷重を３０％増加させた。
【図２０】図２０は、雌性マウスにおける骨の剛性に対する６週間のｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置の効果を示す。大腿骨の片側分析を、Ｉｎｓｔｒｏｎ機械式検査デバイスを用いてエキソビボで行った。１ｍｍあたりのニュートン（Ｎ）でのデータは、平均（１つのグループあたりｎ＝８）±ＳＥＭである。＊、ビヒクルに対してＰ＜０．０５。ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、骨の剛性を１４％増大させた。
【図２１】図２１は、雌性マウスにおける骨を破損させるためのエネルギーに対する、６週間のｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置の効果を示す。大腿骨の片側分析を、Ｉｎｓｔｒｏｎ機械式検査デバイスを用いてエキソビボで行った。ミリジュール（ｍＪ）でのデータは、平均（１つのグループあたりｎ＝８）±ＳＥＭである。＊、ビヒクルに対してＰ＜０．０５。ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、破損させるためのエネルギーを３２％増大させた。
【図２２】図２２は、確立された骨減少症のＯＶＸマウスモデルにおける骨梁骨体積に対するｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置の効果を示す。近位脛骨の測定をマイクロＣＴによって行った。データは平均（１つのグループあたりｎ＝７〜８）であり、エラーバーは±２ＳＥＭを示す。＊、ＯＶＸ＋ビヒクルに対してＰ＜０．０５。投与前は、ＯＶＸマウスは、偽手術されたマウスと比較して骨梁骨体積が少なかった。ＯＶＸ対照と比較すると、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、処置の２８日目および５６日目で、骨体積を有意に増大させた。
【図２３】図２３は、骨減少症のＯＶＸマウスモデルにおける皮質骨の厚みに対するｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置の効果を示す。皮質骨の測定をマイクロＣＴによって行った。データは平均（１つのグループあたりｎ＝７〜８）であり、エラーバーは、±２ＳＥＭを示す。＊、ＯＶＸ＋ビヒクルに対してＰ＜０．０５。ＯＶＸ対照と比較すると、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、処置の５６日目に、皮質の厚みを有意に増大させた。
【図２４】図２４は、骨減少症のＯＶＸマウスモデルにおける骨内膜の周囲に対するｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置の効果を示す。脛骨骨幹部（ｔｉｂｉａｌ ｓｈａｆｔ）の測定をマイクロＣＴによって行った。データは平均であり（１つのグループあたりｎ＝７〜８）、エラーバーは、±２ＳＥＭを示す。＊、ＯＶＸ＋ビヒクルに対してＰ＜０．０５。ＯＶＸ対照と比較すると、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、処置の５６日目に骨内膜の周囲を有意に減少させ、これにより皮質骨の成長のさらなる証拠を提供する。
【図２５】図２５は、ＤＥＸＡにより決定した、骨減少症のＯＶＸマウスモデルにおける全身の骨ミネラル密度に対するｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置の効果を示す。データは、平均（１つのグループあたりｎ＝７〜８）±ＳＥＭである。＊、ＯＶＸ＋ビヒクルに対してＰ＜０．０５。ＯＶＸ対照と比較すると、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、処置の１４日目、２８日目、４２日目、および５６日目に、全身の骨密度を有意に増大させた。
【図２６】図２６は、骨減少症のＯＶＸマウスモデルにおける椎骨の骨ミネラル密度に対するｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置の効果を示す。腰椎（椎骨Ｌ１〜Ｌ６）の分析をＤＥＸＡによって行った。データは平均（１つのグループあたりｎ＝７〜８）±ＳＥＭである。＊、ＯＶＸ＋ビヒクルに対してＰ＜０．０５。ＯＶＸ対照と比較すると、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、処置の１４日目、２８日目、４２日目、および５６日目に椎骨の骨密度を有意に増大させた。
【図２７】図２７は、ＤＥＸＡにより決定した、骨減少症のＯＶＸマウスモデルにおける大腿骨−脛骨の骨ミネラル密度に対するｍＡＬＫ３−ｍＦｃでの処置の効果を示す。大腿骨と近位脛骨全体の分析をＤＥＸＡによって行った。データは、平均（１つのグループあたりｎ＝７〜８）±ＳＥＭである。＊、ＯＶＸ＋ビヒクルに対してＰ＜０．０５。ＯＶＸ対照と比較すると、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、処置の２８日目、４２日目、および５６日目に、大腿骨−脛骨の骨密度を有意に増大させた。
【図２８】図２８は、骨減少症のＯＶＸマウスモデルにおける椎骨の骨微細構造に対する５６日間のｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃの効果を示す。腰椎（Ｌ５）中の骨梁骨の代表的な三次元画像を、マイクロＣＴによってエキソビボで作製した。スケールバー＝３００μｍ。
【図２９】図２９は、組織形態測定により遠位大腿骨において評価した、雌性マウスにおける骨体積に対するｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃの効果を示す。データは平均±ＳＥＭである。１つの時点あたり１グループあたりｎ＝６。＊＊、対応する時点でのビヒクルに対してＰ＜０．０１。ビヒクルと比較して、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、全ての時点で骨体積を有意に増大させた。
【図３０】図３０は、組織形態測定により遠位大腿骨において評価した、雌性マウスにおける骨の形成速度に対するｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃの効果を示す。データは平均±ＳＥＭである。１つの時点あたり１グループあたりｎ＝６。＊＊＊、対応する時点でのビヒクルに対してＰ＜０．００１。ビヒクルと比較して、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、処置の２８日目に骨の形成速度を有意に増大させた。これにより、同化作用による骨の形成の証拠を提供する。
【図３１】図３１は、組織形態測定により遠位大腿骨において評価した、雌性マウスにおける骨石灰化表面に対するｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃの効果を示す。データは、平均±ＳＥＭである。１つの時点あたり１グループあたりｎ＝６。＊＊、対応する時点でのビヒクルに対してＰ＜０．０１；＊、対応する時点でのビヒクルに対してＰ＜０．０５。ビヒクルと比較して、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、処置の１４日目および２８日目に、石灰化表面を有意に増大させ、これにより、同化作用による骨の形成のさらなる証拠を提供する。
【図３２】図３２は、組織形態測定により遠位大腿骨において評価した、雌性マウスにおける破骨細胞表面に対するｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃの効果を示す。データは、平均±ＳＥＭである。１つの時点あたり１グループあたりｎ＝６。＊＊、対応する時点でのビヒクルに対してＰ＜０．０１。ビヒクルと比較して、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、処置の２８日目に破骨細胞表面を有意に減少させ、これにより、抗吸収性の骨の形成の証拠を提供する。
【図３３】図３３は、Ｌｕｍｉｎｅｘ ｘＭＡＰ（登録商標）アッセイにより決定した、雌性マウスにおけるＲＡＮＫＬ（核因子−κＢリガンドの活性化受容体）の血清レベルに対するｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃの効果を示す。データは、平均±ＳＥＭである。１つの時点あたり１グループあたりｎ＝６。＊＊、対応する時点でのビヒクルに対してＰ＜０．０１；＊、対応する時点でのビヒクルに対してＰ＜０．０５。ビヒクルと比較して、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、全ての時点で循環しているＲＡＮＫＬレベルを有意に低下させた。
【図３４】図３４は、Ｌｕｍｉｎｅｘ ｘＭＡＰ（登録商標）アッセイによって決定した、雌性マウスにおける血清オステオプロテゲリン（ＯＰＧ）レベルに対するｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃの効果を示す。データは、平均±ＳＥＭである。１つの時点あたり１グループあたりｎ＝６。＊＊、対応する時点でのビヒクルに対してＰ＜０．０１；＊、対応する時点でのビヒクルに対してＰ＜０．０５。ビヒクルと比較して、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、処置の２８日目および４２日目に、循環しているＯＰＧレベルを有意に増大させた。
【図３５】図３５は、リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ−ＰＣＲ）によって評価した、雌性マウスの大腿骨と脛骨におけるスクレロスチンｍＲＮＡレベルに対するｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃの効果を示す。データは、平均±ＳＥＭである。＊＊＊、対応する時点でのビヒクルに対してＰ＜０．００１；＊、対応する時点でのビヒクルに対してＰ＜０．０５。ビヒクルと比較して、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、処置の２日目、７日目、および２８日目に、スクレロスチンｍＲＮＡレベルを有意に低下させた。
【図３６】図３６は、雌性マウスにおける骨体積に対するｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃの効果を示す。骨体積を、０日目（ベースライン）にマイクロＣＴにより近位脛骨において評価し、４２日目に（エキソビボ）もまた評価した。データは、平均±ＳＥＭである。１つのグループあたりｎ＝６。＊＊＊、ビヒクルに対してＰ＜０．００１。実験の過程全体にわたり、骨体積は、ビヒクルで処置した対照においては２０％近く減少したが、ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃで処置した場合には８０％を上回って増加した。
【発明を実施するための形態】
【００２１】
（発明の詳細な説明）
（１．概要）
本開示は、その一部において、ＢＭＰ−ＡＬＫ３シグナル伝達経路のインヒビター（例えば、ＡＬＫ３−Ｆｃタンパク質）が動物において骨の形成を促進するという驚くべき結果を明らかにする。ＡＬＫ３は、トランスホーミング増殖因子β（ＴＧＦ−β）／骨形態形成タンパク質（ＢＭＰ）スーパーファミリーのメンバーの受容体である。ＴＧＦ−β／ＢＭＰスーパーファミリーには、共通する配列エレメントと構造的モチーフを共有する様々な成長因子が含まれる。これらのタンパク質は、脊椎動物と無脊椎動物のいずれにおいても、多種多様な細胞のタイプに対して生物学的効果を発揮することが知られている。このスーパーファミリーのメンバーは、パターン形成および組織特異化において胚発生の間に重要な機能を果たし、様々な分化のプロセス（脂質生成、筋形成、軟骨形成、心臓発生、造血、神経発生、および上皮細胞分化を含む）に影響を及ぼし得る。ＴＧＦ−βファミリーのメンバーの活性を操作することにより、しばしば、生物において有意な生理学的変化を起こすことが可能である。例えば、Piedmontese牛品種およびBelgian Blue牛品種は、筋肉量の顕著な増加を引き起こすＧＤＦ８（ミオスタチンとも呼ばれる）遺伝子の機能喪失型変異を有する。Ｇｒｏｂｅｔら、Ｎａｔ Ｇｅｎｅｔ．１９９７，１７（１）：７１−４。さらに、ヒトでは、ＧＤＦ８の不活性な対立遺伝子は、筋肉量の増加、報告によれば、例外的な強さと関係がある。Ｓｃｈｕｅｌｋｅら、Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ ２００４，３５０：２６８２−８。
【００２２】
ＴＧＦ−βシグナルは、リガンド刺激に際して、下流のＳｍａｄタンパク質をリン酸化し、活性化するＩ型およびＩＩ型のセリン／スレオニンキナーゼ受容体のヘテロマー複合体により媒介される（Ｍａｓｓａｇｕｅ，２０００，Ｎａｔ．Ｒｅｖ．Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ．１：１６９−１７８）。これらのＩ型およびＩＩ型受容体は、システインを多く含む領域を持つリガンド結合性細胞外ドメイン、膜貫通ドメイン、および予想されるセリン／スレオニン特異性を持つ細胞質ドメインからなる膜貫通タンパク質である。Ｉ型受容体はシグナル伝達に不可欠であり、ＩＩ型受容体はリガンド結合と、Ｉ型受容体の発現に必要である。Ｉ型およびＩＩ型のアクチビン受容体は、リガンド結合後に安定な複合体を形成し、ＩＩ型受容体によるＩ型受容体のリン酸化を生じる。
【００２３】
アクチビン受容体様キナーゼ−３（ＡＬＫ３）は、ＢＭＰファミリーの複数のリガンドの効果を媒介するＩ型受容体であり、骨形態形成タンパク質受容体、ＩＡ型（ＢＭＰＲ１Ａ）、またはアクチビンＡ受容体、ＩＩ型様キナーゼ（ＡＣＶＲＬＫ）としても知られている。遍在する組織発現を持ついくつかのＩ型受容体とは異なり、ＡＬＫ３は、より特異化された機能性と一致する制限された発現パターンを示す（ｔｅｎ Ｄｉｊｋｅ，１９９３，Ｏｎｃｏｇｅｎｅ ８：２８７９−２８８７）。ＡＬＫ３は、一般的には、ＢＭＰ２、ＢＭＰ４、ＢＭＰ７、およびＢＭＰファミリーの他のメンバーについての高親和性受容体と理解されている。ＢＭＰ２とＢＭＰ７は、骨芽細胞の分化の強力な刺激因子であり、現在、脊椎固定および特定の偽関節骨折において骨の形成を誘導するために臨床的に使用されている。ＡＬＫ３は、骨芽細胞においてＢＭＰ２およびＢＭＰ４のシグナル伝達を媒介する際の重要な受容体と考えられている（Ｌａｖｅｒｙら、２００８，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２８３：２０９４８−２０９５８）。ホモ接合型ＡＬＫ３ノックアウトマウスは、胚形成初期（９．５日）に死亡する。しかし、骨芽細胞中のＡＬＫ３の条件的破壊を持つ成体マウスは骨量の増加を示したが、新しく形成した骨が組織崩壊の証拠を示したことが最近報告された（Ｋａｍｉｙａ，２００８，Ｊ．Ｂｏｎｅ Ｍｉｎｅｒ．Ｒｅｓ．２３：２００７−２０１７；Ｋａｍｉｙａ，２００８，Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ １３５：３８０１−３８１１）。この知見は、臨床的使用における骨構築物質としてのＢＭＰ２とＢＭＰ７（ＡＬＫ３のリガンド）の有効性と驚くほどの対照をなす。
【００２４】
本明細書中で示すように、ＢＭＰ２およびＢＭＰ４に対する結合において実質的な優先傾向を示す可溶性ＡＬＫ３ポリペプチド（ＡＬＫ３−Ｆｃ）が、インビボで骨成長を促進するため、および骨密度を増大させるために有効である。いずれの特定の機構にも束縛されることは望ましくないが、これらの研究において使用した特定の可溶性ＡＬＫ３構築物が示した極めて強いＢＭＰ２およびＢＭＰ４結合（ピコモルの解離定数）を考えると、ＡＬＫ３の効果は、ＢＭＰのアンタゴニスト効果により主に起こると予想される。機構とは無関係に、本明細書中に示すデータから、ＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニストが正常なマウスにおいて骨密度を増大させることが明らかである。驚くべきことに、ＡＬＫ３−Ｆｃでの処置により生じた骨は、ＡＬＫ３条件的ノックアウトマウスにおいて観察されるタイプの組織崩壊の証拠を示さない。骨は動的組織であり、骨を生成し、石灰化を刺激する因子（主に、骨芽細胞）と、骨を破壊し、脱灰する因子（主に、破骨細胞）の平衡状態に応じて成長または小さくなり、そして密度が増大または低下することに留意しなければならない。骨成長と石灰化は、生産性因子を増加させることにより、破壊性の因子を減少させることにより、またはそれらの両方により増大させることができる。用語「骨成長を促進する」および「骨の石灰化を増大させる」は、骨における観察可能な物理的変化をいい、骨に変化が起こる機構に対して変化をもたらさないと意図される。
【００２５】
本明細書中に記載した研究において使用した骨成長／密度についてのマウスモデルは、ヒトにおける効能の高度な予測であると考えられ、したがって、本開示は、ヒトにおいて骨成長を促進するため、および骨密度を増大させるために、ＡＬＫ３ポリペプチドならびに他のＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニストを使用するための方法を提供する。ＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニストとしては、例えば、ＢＭＰに結合する可溶性ＡＬＫ３ポリペプチド、ＢＭＰに結合し、ＡＬＫ３結合を破壊する抗体、ＡＬＫ３に結合し、ＢＭＰ結合を破壊する抗体、ＢＭＰ結合またはＡＬＫ３結合について選択された非抗体タンパク質（例えば、そのようなタンパク質の例、およびそれらの設計および選択のための方法については、ＷＯ／２００２／０８８１７１、ＷＯ／２００６／０５５６８９、ＷＯ／２００２／０３２９２５、ＷＯ／２００５／０３７９８９、ＵＳ２００３／０１３３９３９、およびＵＳ２００５／０２３８６４６を参照のこと）、ＢＭＰ結合またはＡＬＫ３結合について選択された無作為ペプチド（多くの場合は、Ｆｃドメインに付加されている）が挙げられる。ＢＭＰ結合活性またはＡＬＫ３結合活性を持つ２つの異なるタンパク質（または他の部分）（特に、Ｉ型（例えば、可溶性Ｉ型アクチビン受容体）およびＩＩ型（例えば、可溶性ＩＩ型アクチビン受容体）結合部位をそれぞれブロックするＢＭＰバインダー）を、二官能性結合分子を作製するために互いに連結させることができる。ＢＭＰ−ＡＬＫ３シグナル伝達軸を阻害する核酸アプタマー、低分子、および他の物質もまた考えられる。さらに、ＢＭＰまたは特に、ＡＬＫ３の発現を阻害する核酸（例えば、アンチセンス分子、ｓｉＲＮＡ、またはリボザイム）を、ＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニストとして使用することができる。
【００２６】
本明細書中で使用する用語は、一般的には、本発明の状況において、およびそれぞれの用語が使用される具体的な状況において、当該分野におけるそれらの通常の意味を有する。特定の用語を、本発明の組成物および方法、ならびにそれらを作製、使用するための方法を記載することにおいて、実施者にさらなるガイダンスを提供するために、以下または本明細書中の別の場所で議論する。任意の使用される用語の範囲または意味は、その用語が使用される特定の状況から明らかである。
【００２７】
「約」および「およそ」は、一般的には、測定の性質または精度を考慮して、測定した量について許容され得る誤差の程度を意味するものとする。典型的には、例示的な誤差の程度は、提供する値または値の範囲の２０パーセント（％）以内、好ましくは１０％以内であり、より好ましくは、５％以内である。
【００２８】
あるいは、および特に生物学的系において、用語「約」および「およそ」は、提供する値の一桁以内、好ましくは５倍以内、そしてより好ましくは２倍以内の値を意味し得る。本明細書中に提供する数量は、特に明記しない限りはおおよそであり、用語「約」または「およそ」が、明らかに記載されていない場合も推定され得ることを意味する。
【００２９】
本発明の方法には、互いに配列を比較する（１つまたは複数の変異体（配列改変体）に対して野生型配列を比較することを含む）工程が含まれ得る。このような比較には、典型的には、ポリマー配列の（例えば、当該分野で周知の配列アラインメントプログラムおよび／またはアルゴリズム（例えば、いくつかを挙げると、ＢＬＡＳＴ、ＦＡＳＴＡ、およびＭＥＧＡＬＩＧＮ）を使用する）アラインメントが含まれる。そのようなアラインメントにおいて、変異が残基の挿入または欠失を含む場合は、配列アライメントには、残基が挿入されていないかまたは残基が欠失しているポリマー配列中に「ギャップ」（典型的には、ダッシュ記号または「Ａ」で表す）を導入することを当業者は容易に理解することができる。
【００３０】
「相同」は、その文法上の形態および綴りのバリエーションの全てにおいて、同じ生物種のスーパーファミリーに由来するタンパク質、ならびに異なる生物種に由来する相同タンパク質を含む、「共通の進化の起源」を持つ２つのタンパク質間の関係をいう。このようなタンパク質（およびそれらをコードする核酸）は、パーセント同一性に関するか、または特定の残基もしくはモチーフおよび保存された位置の存在によるかを問わず、それらの配列類似性に反映される配列相同性を有する。
【００３１】
用語「配列類似性」は、その文法上の形態の全てにおいて、核酸またはアミノ酸配列間の同一性または一致の程度をいう。核酸またはアミノ酸配列は、共通の進化の起源を共有している場合も、また共有しない場合もある。
【００３２】
しかし、一般的慣習および本出願においては、用語「相同」が、「高度に」のような副詞で修飾される場合には、配列類似性を意味し得、共通の進化の起源と関係がある場合も、また関係がない場合もある。
【００３３】
（２．ＡＬＫ３ポリペプチド）
特定の態様においては、本発明はＡＬＫ３ポリペプチドに関する。本明細書中で使用する場合は、用語「ＡＬＫ３」は、変異誘発または他の修飾によりそのようなＡＬＫ３タンパク質から誘導された任意の種および改変体に由来する、アクチビン受容体様キナーゼ３（ＡＬＫ３）［ＩＡ型骨形態形成タンパク質受容体（ＢＭＰＲ１Ａ）、またはアクチビンＡ受容体、ＩＩ型様キナーゼ（ＡＣＶＲＬＫ）とも呼ばれる］タンパク質のファミリーをいう。本明細書中でのＡＬＫ３の言及は、現在同定されている形態のいずれか１つの言及であると理解される。ＡＬＫ３ファミリーのメンバーは、一般的には、システインを多く含む領域を持つリガンド結合性細胞外ドメイン、膜貫通ドメイン、および予想されるセリン／スレオニンキナーゼ活性を持つ細胞質ドメインから構成される膜貫通タンパク質である。
【００３４】
用語「ＡＬＫ３ポリペプチド」には、ＡＬＫ３ファミリーメンバーの任意の天然に存在しているポリペプチドを含むポリペプチド、ならびに、有用な活性を保持しているそれらの任意の改変体（変異体、断片、融合体、およびペプチド模倣体（peptidomimetic）形態を含む）が含まれる。例えば、ＡＬＫ３ポリペプチドには、ＡＬＫ３ポリペプチドの配列に対して少なくとも約８０％同一である配列を有している、好ましくは、少なくとも８５％、９０％、９５％、９７％、９９％、またはそれ以上の同一性を有している任意の公知のＡＬＫ３の配列に由来するポリペプチドが含まれる。例えば、本発明のＡＬＫ３ポリペプチドは、ＡＬＫ３タンパク質および／またはＢＭＰに結合し、それらの機能を阻害し得る。好ましくは、ＡＬＫ３ポリペプチドは、骨成長と骨石灰化を促進する。ＡＬＫ３ポリペプチドの例としては、ヒトＡＬＫ３前駆体ポリペプチド（配列番号１）、および可溶性ヒトＡＬＫ３ポリペプチド（例えば、配列番号３、７、１１、１４、２０、２２、２３、２５、２６、２８、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３６、３８、３９、４０、または４１）が挙げられる。
【００３５】
ヒトＡＬＫ３前駆体タンパク質の配列（配列番号１）を図１に示し、ヒトＡＬＫ３前駆体タンパク質をコードする核酸配列（配列番号２；Ｇｅｎｂａｎｋ登録ＮＭ＿００４３２９のヌクレオチド５４９〜２１４４）を図２に示す。可溶性ヒトＡＬＫ３（細胞外）の、プロセシングされたポリペプチド配列（配列番号３）を図３に示し、ヒトＡＬＫ３の細胞外ドメインをコードする核酸配列（配列番号４；Ｇｅｎｂａｎｋ登録ＮＭ＿００４３２９のヌクレオチド６１８〜１００４）を図４に示す。
【００３６】
特定の実施形態においては、本発明は、可溶性ＡＬＫ３ポリペプチドに関する。本明細書中に記載する場合は、用語「可溶性ＡＬＫ３ポリペプチド」は、一般的には、ＡＬＫ３タンパク質の細胞外ドメインを含有しているポリペプチドをいう。本明細書中で使用する場合は、用語「可溶性ＡＬＫ３ポリペプチド」には、ＡＬＫ３タンパク質の任意の天然に存在している細胞外ドメイン、ならびにそれらの任意の改変体（変異体、断片、およびペプチド模倣体形態を含む）が含まれる。ＢＭＰ結合性ＡＬＫ３ポリペプチドは、ＢＭＰ（特に、ＢＭＰ２およびＢＭＰ４）に結合する能力を保持しているものである。好ましくは、ＢＭＰ結合性ＡＬＫ３ポリペプチドは、ＢＭＰに対して、１ｎＭまたはそれ未満の解離定数で結合する。ヒトＡＬＫ３前駆体タンパク質のアミノ酸配列を図１に提供する。ＡＬＫ３タンパク質の細胞外ドメインはＢＭＰに結合し、これは一般的には可溶性である。したがって、可溶性のＢＭＰ結合性ＡＬＫ３ポリペプチドと呼ぶことができる。可溶性のＢＭＰ結合性ＡＬＫ３ポリペプチドの例としては、配列番号３、７、１１、１４、２０、２２、２３、２５、２６、２８、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３６、３８、３９、４０、または４１に説明する可溶性ポリペプチドが挙げられる。配列番号７をＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃと呼び、実施例でさらに記載する。可溶性のＢＭＰ結合性ＡＬＫ３ポリペプチドの他の例には、ＡＬＫ３タンパク質の細胞外ドメインに加えてシグナル配列（例えば、天然のＡＬＫ３リーダー配列（配列番号８）、組織プラスミノーゲン（ｐｌａｍｉｎｏｇｅｎ）活性化因子（ＴＰＡ）リーダー（配列番号９）、またはミツバチメリチンリーダー（配列番号１０））が含まれる。配列番号１１に説明するＡＬＫ３−ｈＦｃポリペプチドは、ＴＰＡリーダーを使用する。
【００３７】
ＡＬＫ３ポリペプチドの機能的に活性な断片は、ＡＬＫ３ポリペプチドをコードする核酸の対応する断片から組換えにより産生したポリペプチドをスクリーニングすることにより得ることができる。加えて、断片は、従来のメリフィールド固相ｆ−Ｍｏｃまたはｔ−Ｂｏｃ化学のような、当該分野で公知の技術を使用して化学合成することもできる。断片は、（組換えにより、または化学合成により）産生することができ、ＡＬＫ３タンパク質またはＢＭＰにより媒介されるシグナル伝達のアンタゴニスト（インヒビター）として機能し得るそのようなペプチジル断片を同定するために試験することができる。
【００３８】
ＡＬＫ３ポリペプチドの機能的に活性な改変体は、ＡＬＫ３ポリペプチドをコードする対応する変異誘発した核酸から組換えにより産生された修飾されたポリペプチドのライブラリーをスクリーニングすることにより得ることができる。改変体を産生させ、ＡＬＫ３タンパク質またはＢＭＰにより媒介されるシグナル伝達のアンタゴニスト（インヒビター）として機能し得るものを同定するために試験することができる。特定の実施形態においては、ＡＬＫ３ポリペプチドの機能的改変体は、配列番号３、７、１１、１４、２０、２２、２３、２５、２６、２８、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３６、３８、３９、４０、または４１より選択されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％同一であるアミノ酸配列を含む。特定の場合には、機能的改変体は、配列番号３、７、１１、１４、２０、２２、２３、２５、２６、２８、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３６、３８、３９、４０、または４１より選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、または１００％同一であるアミノ酸配列を有する。
【００３９】
機能的改変体は、治療効能の増強または安定性（例えば、エキソビボの貯蔵寿命およびインビボのタンパク質分解に対する抵抗性）のような目的のために、ＡＬＫ３ポリペプチドの構造を修飾することにより生成され得る。ＢＭＰ結合を保持するよう選択する場合は、そのような修飾されたＡＬＫ３ポリペプチドは、天然に存在しているＡＬＫ３ポリペプチドの機能的等価物と見なされる。修飾されたＡＬＫ３ポリペプチドは、例えば、アミノ酸の置換、欠失、または付加によっても産生することができる。例えば、ロイシンのイソロイシンまたはバリンでの単独の置き換え、アスパラギン酸のグルタミン酸での単独の置き換え、スレオニンのセリンでの単独の置き換え、またはアミノ酸の構造的に関連するアミノ酸での同様の置き換え（例えば、保存的変異）は、得られる分子の生物学的活性に対して大きな影響をもたらさないと予想することは合理的である。保存的置き換えは、それらの側鎖と関連しているアミノ酸のファミリー内で行なわれるものである。ＡＬＫ３ポリペプチドのアミノ酸配列の変化が機能的ホモログをもたらすかどうかは、改変体ＡＬＫ３ポリペプチドの、細胞において野生型ＡＬＫ３ポリペプチドと同様の様式で応答を生じる能力を評価することにより、容易に決定することができる。
【００４０】
特定の実施形態においては、本発明は、ポリペプチドのグリコシル化を変更するための、ＡＬＫ３ポリペプチドの特定の変異を意図する。このような変異は、Ｏ結合グリコシル化部位またはＮ結合グリコシル化部位のような、１つまたは複数のグリコシル化部位を導入あるいは排除するように選択され得る。アスパラギン結合グリコシル化認識部位は一般に、適切な細胞性グリコシル化酵素によって特異的に認識されるトリペプチド配列、アスパラギン−Ｘ−スレオニン（またはアスパラギン−Ｘ−セリン）（ここで、「Ｘ」は任意のアミノ酸である）を含む。変更はまた、（Ｏ結合グリコシル化部位のための）野生型ＡＬＫ３ポリペプチドの配列に対する１つもしくは複数のセリンまたはスレオニン残基の付加、あるいはそれらによる置換によって作製され得る。グリコシル化認識部位の第１位もしくは第３位のアミノ酸位置の一方または両方での様々なアミノ酸置換または欠失（および／または第２位のアミノ酸の欠失）により、改変されたトリペプチド配列で非グリコシル化が生じる。ＡＬＫ３ポリペプチド上の炭水化物部分の数を増加させる別の手段は、ＡＬＫ３ポリペプチドへのグリコシドの化学的または酵素的カップリングによる。使用するカップリング様式に応じて、糖（単数または複数）を、（ａ）アルギニンおよびヒスチジン；（ｂ）遊離のカルボキシル基；（ｃ）遊離のスルフヒドリル基（例えば、システインのスルフヒドリル基）；（ｄ）遊離ヒドロキシル基（例えば、セリン、スレオニン、またはヒロドキシプロリンのヒドロキシル基）；（ｅ）芳香族残基（例えば、フェニルアラニン、チロシン、またはトリプトファンの芳香族残基）；あるいは、（ｆ）グルタミンのアミド基に結合させることができる。これらの方法は、引用により本明細書に組み入れられる、１９８７年９月１１日に公開されたＷＯ８７／０５３３０、およびＡｐｌｉｎおよびＷｒｉｓｔｏｎ（１９８１）ＣＲＣ Ｃｒｉｔ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．，ｐｐ．２５９−３０６に記載されている。ＡＬＫ３ポリペプチド上に存在する１つまたは複数の炭水化物部分の除去は、化学的および／または酵素的に達成され得る。化学的脱グリコシル化は、例えば、化合物トリフルオロメタンスルホン酸または等価な化合物へのＡＬＫ３ポリペプチドの曝露が含まれ得る。この処理により、アミノ酸配列を完全なままに残しつつ、連結糖（Ｎ−アセチルグルコサミンまたはＮ−アセチルガラクトサミン）を除くほとんどまたは全ての糖の切断が生じる。化学的脱グリコシル化はさらに、Ｈａｋｉｍｕｄｄｉｎら（１９８７）Ａｒｃｈ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．２５９：５２、およびＥｄｇｅら（１９８１）Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｅｈｍ．１１８：１３１により記載されている。ＡＬＫ３ポリペプチド上の炭水化物部分の酵素的切断は、Ｔｈｏｔａｋｕｒａら（１９８７）Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．１３８：３５０に記載されているように、様々なエンドグリコシダーゼおよびエキソグリコシダーゼの使用により達成され得る。哺乳動物、酵母、昆虫、および植物細胞は全て、ペプチドのアミノ酸配列による影響を受ける可能性がある異なるグリコシル化パターンを導入し得るので、ＡＬＫ３ポリペプチドの配列は、使用する発現系のタイプに応じて適切に調節することができる。一般的には、ヒトにおいて使用するためのＡＬＫ３タンパク質は、ＨＥＫ２９３またはＣＨＯ細胞系のような、適切なグリコシル化を提供する哺乳動物細胞系中で発現させられるが、他の哺乳動物発現細胞系、グリコシル化酵素が操作された酵母細胞系、および昆虫細胞も同様に有用であると予想される。
【００４１】
本開示はさらに、ＡＬＫ３ポリペプチドの変異体、特にコンビナトリアル変異体のセット、ならびに、短縮変異体を作製する方法を意図する。機能的改変体配列を同定するためには、コンビナトリアル変異体のプールが特に有用である。そのようなコンビナトリアルライブラリーをスクリーニングする目的は、例えば、アゴニストもしくはアンタゴニストのいずれかとして作用し得るか、または代わりに、全体として新規の活性を保有するＡＬＫ３ポリペプチド改変体を作製することであり得る。様々なスクリーニングアッセイを以下に提供する。そのようなアッセイを使用して改変体を評価することができる。例えば、ＡＬＫ３ポリペプチド改変体は、ＡＬＫ３リガンドに結合する能力、ＡＬＫ３リガンドのＡＬＫ３ポリペプチドに対する結合を妨げる能力、またはＡＬＫ３リガンドによって引き起こされるシグナル伝達を妨害する能力に関してスクリーニングされ得る。
【００４２】
ＡＬＫ３ポリペプチドまたはその改変体の活性は、細胞に基づくアッセイまたはインビボアッセイにおいても試験することができる。例えば、骨生成または骨破壊に関与する遺伝子の発現に対するＡＬＫ３ポリペプチド改変体の効果をアッセイすることができる。これは、必要に応じて、１つまたは複数の組換えＡＬＫ３リガンドタンパク質（例えば、ＢＭＰ２またはＢＭＰ４）の存在下で実施され得、細胞は、ＡＬＫ３ポリペプチドおよび／またはその改変体を産生するよう、そして、状況に応じて、ＡＬＫ３リガンドを産生するように、トランスフェクトされ得る。同様に、ＡＬＫ３ポリペプチドはマウスまたはその他の動物に投与され得、密度または体積のような１つまたは複数の骨の特性が評価され得る。骨折の治癒速度も評価することができる。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）は、動物において骨密度を評価するための、十分に確立されている非侵襲的定量的技術である。ヒトにおいては、中央ＤＥＸＡシステムを、脊椎および骨盤において骨密度を評価するために使用することができる。これらは、全体の骨密度の最適な予測法である。末梢ＤＥＸＡシステムは、例えば、手、手首、足首、および足の骨を含む末梢骨において骨密度を評価するために使用することができる。ＣＡＴスキャンを含む伝統的なＸ線画像システムは、骨成長および骨折の治癒を評価するために使用することができる。骨の機械的強度もまた評価することができる。
【００４３】
天然に存在しているＡＬＫ３ポリペプチドに比べて選択的な、または一般に高い効力を有するコンビナトリアルに由来する改変体が作製され得る。同様に、変異誘発は、対応する野生型ＡＬＫ３ポリペプチドとは劇的に異なる細胞内半減期を有する改変体を生じる可能性がある。例えば、変更されたタンパク質を、天然のＡＬＫ３ポリペプチドの破壊または別の方法での不活化を生じるタンパク質分解または他の細胞性のプロセスに対して、より安定にするか、あるいはより不安定にすることができる。そのような改変体、およびそれらをコードする遺伝子は、ＡＬＫ３ポリペプチドの半減期を調節することによりＡＬＫ３ポリペプチドのレベルを変更するために利用することができる。例えば、短い半減期は、より一過性の生物学的効果をもたらすことができ、患者体内の組換えＡＬＫ３ポリペプチドレベルのより厳密な制御を可能にすることができる。Ｆｃ融合タンパク質においては、タンパク質の半減期を変更するために、リンカー（存在する場合は）および／またはＦｃ部分において、変異を生じさせることができる。
【００４４】
それぞれが潜在的ＡＬＫ３ポリペプチド配列の少なくとも一部を含むポリペプチドのライブラリーをコードする遺伝子の縮重ライブラリーにより、コンビナトリアルライブラリーを産生することができる。例えば、潜在的ＡＬＫ３ポリペプチドのヌクレオチド配列の縮重セットを、個々のポリペプチドとして、または代わりに、より大きな融合タンパク質のセットとして（例えば、ファージディスプレイ用に）発現させることができるように、合成オリゴヌクレオチドの混合物を遺伝子配列に酵素により連結させることができる。
【００４５】
潜在的ホモログのライブラリーを縮重オリゴヌクレオチド配列から作製することができる多くの方法が存在する。縮重遺伝子配列の化学合成を自動ＤＮＡ合成装置で行い、次いでこの合成遺伝子を発現用の適当なベクターに連結させることができる。縮重オリゴヌクレオチドの合成は、当該分野で周知である（例えば、Ｎａｒａｎｇ，ＳＡ（１９８３）Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ ３９：３；Ｉｔａｋｕｒａら、（１９８１）Ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ ＤＮＡ，Ｐｒｏｃ．３ｒｄ Ｃｌｅｖｅｌａｎｄ Ｓｙｍｐｏｓ．Ｍａｃｒｏｍｏｌｅｃｕｌｅｓ，ＡＧ Ｗａｌｔｏｎ編，Ａｍｓｔｅｒｄａｍ：Ｅｌｓｅｖｉｅｒ ｐｐ２７３−２８９；Ｉｔａｋｕｒａら、（１９８４）Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．５３：３２３；Ｉｔａｋｕｒａら、（１９８４）Ｓｃｉｅｎｃｅ １９８：１０５６；Ｉｋｅら、（１９８３）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｒｅｓ．１１：４７７を参照のこと）。他のタンパク質の特定方向への進化に、このような技術が利用されている（例えば、Ｓｃｏｔｔら、（１９９０）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４９：３８６−３９０；Ｒｏｂｅｒｔｓら、（１９９２）ＰＮＡＳ ＵＳＡ ８９：２４２９−２４３３；Ｄｅｖｌｉｎら、（１９９０）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４９：４０４−４０６；Ｃｗｉｒｌａら、（１９９０）ＰＮＡＳ ＵＳＡ ８７：６３７８−６３８２；ならびに米国特許第５，２２３，４０９号、同第５，１９８，３４６号、および同第５，０９６，８１５号を参照のこと）。
【００４６】
あるいは、他の形態の変異誘発法を利用して、コンビナトリアルライブラリーを作製することができる。例えば、アラニンスキャニング変異誘発法などを使用して（Ｒｕｆら、（１９９４）Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ３３：１５６５−１５７２；Ｗａｎｇら、（１９９４）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６９：３０９５−３０９９；Ｂａｌｉｎｔら、（１９９３）Ｇｅｎｅ １３７：１０９−１１８；Ｇｒｏｄｂｅｒｇら、（１９９３）Ｅｕｒ．Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．２１８：５９７−６０１；Ｎａｇａｓｈｉｍａら、（１９９３）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６８：２８８８−２８９２；Ｌｏｗｍａｎら、（１９９１）Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ３０：１０８３２−１０８３８；およびＣｕｎｎｉｎｇｈａｍら、（１９８９）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４４：１０８１−１０８５）、リンカースキャニング変異誘発法により（Ｇｕｓｔｉｎら、（１９９３）Ｖｉｒｏｌｏｇｙ １９３：６５３−６６０；Ｂｒｏｗｎら、（１９９２）Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ．１２：２６４４−２６５２；ＭｃＫｎｉｇｈｔら、（１９８２）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２３２：３１６）；飽和変異誘発法により（Ｍｅｙｅｒｓら、（１９８６）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２３２：６１３）；ＰＣＲ変異誘発法により（Ｌｅｕｎｇら、（１９８９）Ｍｅｔｈｏｄ Ｃｅｌｌ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ １：１１−１９）；または化学的変異誘発法などを含むランダム変異誘発法により（Ｍｉｌｌｅｒら、（１９９２）Ａ Ｓｈｏｒｔ Ｃｏｕｒｓｅ ｉｎ Ｂａｃｔｅｒｉａｌ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，ＣＳＨＬ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ；およびＧｒｅｅｎｅｒら、（１９９４）Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ ｉｎ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ７：３２−３４）、ＡＬＫ３ポリペプチド改変体を生成し、スクリーニングによりライブラリーから単離することができる。短縮型（生理活性型）のＡＬＫ３ポリペプチドを同定するためには、リンカースキャニング変異誘発法が、特に組み合わせ設定において魅力的な方法である。
【００４７】
点変異および短縮により作製したコンビナトリアルライブラリーの遺伝子産物をスクリーニングするため、およびさらには特定の特性を有している遺伝子産物に関してｃＤＮＡライブラリーをスクリーニングするための多様な技術は、当該分野で公知である。このような技術は、一般的には、ＡＬＫ３ポリペプチドのコンビナトリアル変異誘発により作製した遺伝子ライブラリーの迅速なスクリーニングに適応させることができる。大きな遺伝子ライブラリーのスクリーニングに最も広く用いられている技術は、典型的には、遺伝子ライブラリーを複製可能な発現ベクターにクローニングする工程、適切な細胞を、得られたベクターのライブラリーで形質転換する工程、および、所望される活性の検出により、検出された産物の遺伝子をコードするベクターを比較的容易に単離できるような条件下で、コンビナトリアル遺伝子を発現させる工程を含む。好ましいアッセイとしては、ＢＭＰ結合アッセイおよびＢＭＰ媒介性細胞シグナル伝達のアッセイが挙げられる。
【００４８】
特定の実施形態においては、本発明のＡＬＫ３ポリペプチドには、ＡＬＫ３ポリペプチド中に天然に存在する翻訳後修飾に加えて、さらなる、翻訳後修飾が含まれ得る。そのような修飾としては、アセチル化、カルボキシル化、グリコシル化、リン酸化、脂質化、およびアシル化が挙げられるが、これらに限定されない。結果として、改変されたＡＬＫ３ポリペプチドは、ポリエチレングリコール、脂質、多糖または単糖、およびリン酸のような、アミノ酸以外の要素を含み得る。そのようなアミノ酸以外の要素がＡＬＫ３ポリペプチドの機能に対して及ぼす影響は、他のＡＬＫ３ポリペプチド改変体について本明細書中に記載するように試験することができる。ＡＬＫ３ポリペプチドが、細胞内で新生型のＡＬＫ３ポリペプチドの切断によって産生される場合は、翻訳後プロセシングもまた、タンパク質の正確な折りたたみおよび／または機能に重要であり得る。様々な細胞（例えば、ＣＨＯ、ＨｅＬａ、ＭＤＣＫ、２９３、ＷＩ３８、ＮＩＨ−３Ｔ３、またはＨＥＫ２９３）は、特定の細胞機構およびそのような翻訳後活性のための特徴的な機構を有しており、ＡＬＫ３ポリペプチドの正確な修飾およびプロセシングを確実にするために選択され得る。
【００４９】
特定の態様においては、ＡＬＫ３ポリペプチドの機能的改変体または改変形態は、ＡＬＫ３ポリペプチドの少なくとも一部と、１つまたは複数の融合ドメインとを有している融合タンパク質を含む。このような融合ドメインの周知の例としては、ポリヒスチジン、Ｇｌｕ−Ｇｌｕ、グルタチオンＳトランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、チオレドキシン、プロテインＡ、プロテインＧ、免疫グロブリン重鎖定常領域（Ｆｃ）、マルトース結合タンパク質（ＭＢＰ）、またはヒト血清アルブミンが挙げられるが、これらに限定されない。融合ドメインは、所望する特性を付与するように選択することができる。例えば、いくつかの融合ドメインは、アフィニティークロマトグラフィーによる融合タンパク質の単離に特に有用である。アフィニティー精製を目的とする場合には、アフィニティークロマトグラフィーのための関連したマトリックス（例えば、グルタチオン、アミラーゼ、およびニッケルまたはコバルト結合体化樹脂）を使用する。このようなマトリックスの多くは「キット」の形態で入手することができ、例えば、Ｐｈａｒｍａｃｉａ ＧＳＴ精製システム、および（ＨＩＳ_６）融合パートナーとともに使用する場合に有用であるＱＩＡｅｘｐｒｅｓｓ^ＴＭシステム（Ｑｉａｇｅｎ）がある。別の例として、融合ドメインを、ＡＬＫ３ポリペプチドの検出が容易になるよう選択することができる。そのような検出ドメインの例としては、様々な蛍光タンパク質（例えば、ＧＦＰ）、ならびに、特異的抗体を利用することができる通常短いペプチド配列である「エピトープタグ」が挙げられる。特異的モノクローナル抗体を容易に利用することができる周知のエピトープタグとしては、ＦＬＡＧ、インフルエンザウイルスヘマグルチニン（ＨＡ）、およびｃ−ｍｙｃタグが挙げられる。いくつかの場合には、融合ドメインは、関連するプロテアーゼが融合タンパク質を部分的に消化し、それによって、融合タンパク質から組換えタンパク質を遊離させることを可能にする、第Ｘａ因子またはトロンビンのようなプロテアーゼ切断部位を有する。次いで、遊離したタンパク質を、その後のクロマトグラフィーによる分離によって融合ドメインから単離することができる。特定の好ましい実施形態においては、ＡＬＫ３ポリペプチドを、インビボでＡＬＫ３ポリペプチドを安定化させるドメイン（「安定化」ドメイン）に融合させる。「安定化」は、これが破壊の減少によるのか、腎臓によるクリアランスの減少によるのか、または他の薬物動態学効果によるのかにかかわらず、血清半減期を延長させるあらゆるものを意味する。免疫グロブリンのＦｃ部分との融合は、広範なタンパク質に対して所望する薬物動態学的特性を付与することが知られている。同様に、ヒト血清アルブミンへの融合によっても所望の特性を付与することができる。選択することができる他のタイプの融合ドメインとしては、多量体化（例えば、二量体化、四量体化）ドメインおよび（所望する場合は、骨成長または筋肉の成長のさらなる刺激のような、さらなる生物学的機能を付与する）機能的ドメインが挙げられる。
【００５０】
具体例として、本発明は、Ｆｃドメインに融合させられた、ＡＬＫ３の可溶性細胞外ドメインを含む融合タンパク質を提供する（例えば、図５の配列番号５）。Ｆｃドメインの例を以下に示す。
【００５１】
【化１】

状況に応じて、Ｆｃドメインは、Ａｓｐ−２６５、リジン３２２、およびＡｓｎ−４３４のような残基に、１つまたは複数の変異を有する。特定の場合には、これらの変異（例えば、Ａｓｐ−２６５変異）の１つまたは複数を有している変異体Ｆｃドメインは、野生型Ｆｃドメインと比較して、Ｆｃγ受容体に結合する能力が低い。他の場合においては、これらの変異の１つまたは複数（例えば、Ａｓｎ−４３４変異）を有している変異体Ｆｃドメインは、野生型Ｆｃドメインと比較して、ＭＨＣクラスＩ関連Ｆｃ受容体（ＦｃＲＮ）に結合する能力が高い。
【００５２】
融合タンパク質の様々な要素を、所望する機能性と合致する任意の様式でアレンジすることができることが理解される。例えば、ＡＬＫ３ポリペプチドを異種ドメインに対してＣ末端側に配置することができ、またその代わりに、異種ドメインを、ＡＬＫ３ポリペプチドに対してＣ末端側に配置することもできる。ＡＬＫ３ポリペプチドドメインおよび異種ドメインは融合タンパク質内で必ずしも隣接している必要はなく、さらなるドメインまたはアミノ酸配列を、いずれかのドメインのＣ末端もしくはＮ末端側に、またはそれらのドメインの間に含めることも可能である。
【００５３】
特定の実施形態においては、本発明のＡＬＫ３ポリペプチドは、ＡＬＫ３ポリペプチドを安定化させることができる１つまたは複数の修飾を含む。例えば、そのような修飾は、ＡＬＫ３ポリペプチドのインビトロでの半減期を延ばすか、ＡＬＫ３ポリペプチドの循環半減期を延ばすか、またはＡＬＫ３ポリペプチドのタンパク質分解を減少させる。そのような安定化修飾としては、融合タンパク質（例えば、ＡＬＫ３ポリペプチドと安定化ドメインとを含む融合タンパク質を含む）、グリコシル化部位の修飾（例えば、ＡＬＫ３ポリペプチドに対するグリコシル化部位の付加を含む）、および炭水化物部分の修飾（例えば、ＡＬＫ３ポリペプチドからの炭水化物部分の除去を含む）が挙げられるが、これらに限定されない。融合タンパク質の場合は、ＡＬＫ３ポリペプチドを、ＩｇＧ分子のような安定化ドメイン（例えば、Ｆｃドメイン）に融合させる。本明細書で使用する場合は、用語「安定化ドメイン」は、融合タンパク質の場合のような融合ドメイン（例えば、Ｆｃ）をいうだけではなく、これには、炭水化物部分のような非タンパク質性修飾またはポリエチレングリコールのような非タンパク質性ポリマーも含まれる。
【００５４】
特定の実施形態においては、本発明は、他のタンパク質から単離されたか、そうでなければ他のタンパク質を実質的に含まない、単離された形態および／または精製された形態のＡＬＫ３ポリペプチドを利用できるようにする。ＡＬＫ３ポリペプチドは、一般的には、組換え核酸からの発現により産生される。
【００５５】
（３．ＡＬＫ３ポリペプチドをコードする核酸）
特定の態様においては、本発明は、（本明細書中に開示する断片、機能的改変体、および融合タンパク質を含む）ＡＬＫ３ポリペプチド（例えば、可溶性ＡＬＫ３ポリペプチド）のいずれかをコードする単離された核酸および／または組換え核酸を提供する。例えば、配列番号２は天然に存在しているヒトＡＬＫ３前駆体ポリペプチドをコードし、一方、配列番号４は、ＡＬＫ３のプロセッシングされた細胞外ドメインをコードする。本発明の核酸は、一本鎖であっても、また二本鎖であってもよい。そのような核酸は、ＤＮＡ分子である場合も、また、ＲＮＡ分子である場合もある。これらの核酸は、例えば、ＡＬＫ３ポリペプチドを作製するための方法において、または直接的な治療薬として（例えば、遺伝子治療アプローチにおいて）使用することができる。
【００５６】
特定の態様においては、ＡＬＫ３ポリペプチドをコードする本発明の核酸は、配列番号２または配列番号４の改変体である核酸を含むことがさらに理解される。改変体ヌクレオチド配列は、対立遺伝子改変体のような、１つまたは複数のヌクレオチドの置換、付加、または欠失によって異なる配列を含む。
【００５７】
特定の実施形態において、本発明は、配列番号２、４、１２、１３、１５、１６、１９、２１、２４、２７、３２、または３７に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、または１００％同一である、単離された核酸配列または組換え核酸配列を提供する。当業者であれば、配列番号２、４、１２、１３、１５、１６、１９、２１、２４、２７、３２、または３７に相補的な核酸配列、ならびに、配列番号２、４、１２、１３、１５、１６、１９、２１、２４、２７、３２、または３７の改変体もまた、本発明の範囲に含まれることを理解する。さらなる実施形態においては、本発明の核酸配列を単離することができ、本発明の核酸は組換え体であり得、および／または、異種ヌクレオチド配列と融合させることができ、また、ＤＮＡライブラリー中に存在させることもできる。
【００５８】
他の実施形態においては、本発明の核酸はまた、配列番号２、４、１２、１３、１５、１６、１９、２１、２４、２７、３２、または３７に示されるヌクレオチド配列に対して高ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列、配列番号２、４、１２、１３、１５、１６、１９、２１、２４、２７、３２、または３７の相補配列、あるいはそれらの断片を含む。上記で議論したように、当業者であれば、ＤＮＡハイブリダイゼーションを促進する適切なストリンジェンシー条件は変更できることを容易に理解する。当業者は、ＤＮＡハイブリダイゼーションを促進する適切なストリンジェンシー条件は変更できることを容易に理解する。例えば、約４５℃で６．０×塩化ナトリウム／クエン酸ナトリウム（ＳＳＣ）でハイブリダイゼーションを行い、続いて、５０℃で２．０×ＳＳＣで洗浄を行うことができる。例えば、洗浄工程の塩濃度は、５０℃で約２．０×ＳＳＣの低ストリンジェンシーから、５０℃で約０．２×ＳＳＣの高ストリンジェンシーまでから選択することができる。加えて、洗浄工程の温度は、室温、約２２℃での低ストリンジェンシー条件から、約６５℃での高ストリンジェンシー条件まで上げることができる。温度と塩の両方を変更することも可能であり、また、その他の変数を変更して温度または塩濃度を一定に保つこともできる。１つの態様において、本発明は、室温で６×ＳＳＣ、およびその後の室温で２×ＳＳＣでの洗浄という低ストリンジェンシー条件でハイブリダイズする核酸を提供する。
【００５９】
遺伝子コードの縮重が原因で配列番号２、４、１２、１３、１５、１６、１９、２１、２４、２７、３２、または３７に示した核酸とは異なる単離された核酸もまた、本発明の範囲内である。例えば、多くのアミノ酸は２つ以上のトリプレットにより指定される。同じアミノ酸を特定するコドン、または同義コドン（例えば、ＣＡＵとＣＡＣはヒスチジンの同義コドンである）は、タンパク質のアミノ酸配列には影響を及ぼさない「サイレント」変異を生じ得る。しかし、本発明のタンパク質のアミノ酸配列に変化をもたらすＤＮＡ配列多型が、哺乳動物細胞間に存在すると考えられる。当業者であれば、特定のタンパク質をコードする核酸の１つまたは複数のヌクレオチド（ヌクレオチドの約３％〜５％まで）におけるこれらのバリエーションが、天然の対立遺伝子のバリエーションに起因して、所与の種の個体間に存在し得ることを認識する。任意の、および全てのそのようなヌクレオチドのバリエーションおよび生じるアミノ酸多型も、本発明の範囲内である。
【００６０】
特定の実施形態においては、本発明の組換え核酸を、発現構築物中の１つまたは複数の調節ヌクレオチド配列に作動可能であるように連結することができる。調節ヌクレオチド配列は、一般的には、発現に使用する宿主細胞に適している。様々な宿主細胞に関して、多数のタイプの適切な発現ベクターおよび適切な調節配列が当技術分野で公知である。典型的には、上記１つまたは複数の調節ヌクレオチド配列には、プロモーター配列、リーダー配列またはシグナル配列、リボソーム結合部位、転写開始配列および転写終結配列、翻訳開始配列および翻訳終結配列、ならびにエンハンサーまたは活性化因子配列が含まれ得るが、これらに限定されない。当該分野で公知である構成的プロモーターまたは誘導性プロモーターが、本発明によって意図される。プロモーターは天然に存在しているプロモーター、または２つ以上のプロモーターのエレメントを組み合わせたハイブリッドプロモーターのいずれであってもよい。発現構築物はプラスミドのようにエピソーム上において細胞内に存在する場合があり、また、発現構築物が染色体内に挿入される場合もある。好ましい実施形態においては、発現ベクターは、形質転換された宿主細胞の選択を可能にする選択マーカー遺伝子を含む。選択マーカー遺伝子は当該分野で周知であり、使用する宿主細胞に応じて変わる。
【００６１】
本発明の特定の態様において、本発明の核酸は、少なくとも１つの調節配列に対して作動可能であるように連結させられたＡＬＫ３ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む発現ベクターとして提供される。調節配列は当該分野で認識されており、ＡＬＫ３ポリペプチドの発現を指示するように選択される。したがって、用語、調節配列には、プロモーター、エンハンサー、および他の発現制御エレメントが含まれる。例示的な調節配列は、Ｇｏｅｄｄｅｌ；Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ：Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ（１９９０）に記載されている。例えば、作動可能であるように連結させるとＤＮＡ配列の発現を制御する多岐にわたる発現制御配列のいずれかを、これらのベクターにおいて使用して、ＡＬＫ３ポリペプチドをコードするＤＮＡ配列を発現させることができる。そのような有用な発現制御配列としては、例えば、ＳＶ４０の初期および後期プロモーター、ｔｅｔプロモーター、アデノウイルスまたはサイトメガロウイルスの前初期プロモーター、ＲＳＶプロモーター、ｌａｃ系、ｔｒｐ系、ＴＡＣ系またはＴＲＣ系、発現がＴ７ ＲＮＡポリメラーゼにより方向付けられるＴ７プロモーター、ファージλの主要なオペレーターおよびプロモーター領域、ｆｄコートタンパク質の制御領域、３−ホスホグリセリン酸キナーゼまたは他の解糖酵素のプロモーター、酸性ホスファターゼのプロモーター（例えば、Ｐｈｏ５）、酵母α−接合因子のプロモーター、バキュロウイルス系の多角体プロモーター、および原核生物細胞もしくは真核生物細胞またはそれらのウイルスの遺伝子発現を制御することが公知の他の配列、ならびにそれらの種々の組み合わせが挙げられる。発現ベクターの設計は、形質転換しようとする宿主細胞の選択、および／または発現が所望されるタンパク質のタイプのような要因に依存し得ることが理解されるものとする。さらに、ベクターのコピー数、そのコピー数を制御する能力、およびそのベクターによってコードされる、抗生物質マーカーのような任意の他のタンパク質の発現もまた考慮すべきである。
【００６２】
本発明の組換え核酸は、クローニングした遺伝子またはその一部を、原核生物細胞、真核生物細胞（酵母、トリ、昆虫、または哺乳動物）のいずれか、またはその両方での発現に適しているベクター中に連結することによって作製することができる。組換えＡＬＫ３ポリペプチドの産生のための発現ビヒクルとしては、プラスミドおよび他のベクターが挙げられる。適しているベクターとして、例えば、大腸菌のような原核生物細胞中での発現については、以下のタイプのプラスミドが挙げられる：ｐＢＲ３２２由来プラスミド、ｐＥＭＢＬ由来プラスミド、ｐＥＸ由来プラスミド、ｐＢＴａｃ由来プラスミド、およびｐＵＣ由来プラスミド。
【００６３】
いくつかの哺乳動物発現ベクターは、細菌中でのベクターの増幅を容易にするための原核生物配列と、真核生物細胞中で発現される１つまたは複数の真核生物転写単位の両方を含む。ｐｃＤＮＡＩ／ａｍｐ、ｐｃＤＮＡＩ／ｎｅｏ、ｐＲｃ／ＣＭＶ、ｐＳＶ２ｇｐｔ、ｐＳＶ２ｎｅｏ、ｐＳＶ２−ｄｈｆｒ、ｐＴｋ２、ｐＲＳＶｎｅｏ、ｐＭＳＧ、ｐＳＶＴ７、ｐｋｏ−ｎｅｏ、およびｐＨｙｇ由来のベクターが、真核細胞のトランスフェクションに適している哺乳動物発現ベクターの例である。これらベクターのいくつかは、原核生物細胞および真核生物細胞の両方において複製および薬物耐性選択を容易にするために、ｐＢＲ３２２のような細菌プラスミドに由来する配列を用いて修飾される。あるいは、ウシパピローマウイルス（ＢＰＶ−１）またはエプスタイン・バー・ウイルス（ｐＨＥＢｏ、ｐＲＥＰ由来、およびｐ２０５）のようなウイルスの誘導体を、真核細胞中でのタンパク質の一過性発現に使用することができる。他のウイルス（レトロウイルスを含む）発現系の例は、下記の遺伝子治療送達系の説明の中に見ることができる。プラスミドの調製および宿主生物の形質転換において用いられる様々な方法は、当該分野で周知である。原核生物細胞と真核生物細胞の両方に適している他の発現系、ならびに一般的な組換え手順については、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，第３版，Ｓａｍｂｒｏｏｋ，Ｆｒｉｔｓｃｈ ａｎｄ Ｍａｎｉａｔｉｓ編（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，２００１）を参照のこと。いくつかの場合には、バキュロウイルス発現系の使用により、組換えポリペプチドを発現させることが望ましいと考えられる。そのようなバキュロウイルス発現系の例としては、ｐＶＬ由来ベクター（例えば、ｐＶＬ１３９２、ｐＶＬ１３９３、およびｐＶＬ９４１）、ｐＡｃＵＷ由来ベクター（例えば、ｐＡｃＵＷ１）、およびｐＢｌｕｅＢａｃ由来ベクター（例えば、β−ｇａｌを含有しているｐＢｌｕｅＢａｃ ＩＩＩ）が挙げられる。
【００６４】
好ましい実施形態においては、Ｐｃｍｖ−Ｓｃｒｉｐｔベクター（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ，Ｌａ Ｊｏｌｌａ，Ｃａｌｉｆ．）、ｐｃＤＮＡ４ベクター（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｃａｒｌｓｂａｄ，Ｃａｌｉｆ．）、およびｐＣＩ−ｎｅｏベクター（Ｐｒｏｍｅｇａ，Ｍａｄｉｓｏｎ，Ｗｉｓｃ．）のようなベクターが、ＣＨＯ細胞中で本ＡＬＫ３ポリペプチドが産生されるように設計される。明らかであるように、本発明の遺伝子構築物を使用して、例えば、精製を目的として融合タンパク質または改変体タンパク質を含むタンパク質が産生されるように、培養において増殖させた細胞の中で本発明のＡＬＫ３ポリペプチドを発現させることができる。
【００６５】
本開示はまた、本発明のＡＬＫ３ポリペプチドの１つまたは複数のコード配列（例えば、配列番号２、４、１２、１３、１５、１６、１９、２１、２４、２７、３２、または３７）を含む組換え遺伝子をトランスフェクトした宿主細胞に関する。宿主細胞は、任意の原核生物細胞である場合も、真核生物細胞である場合もある。例えば、本発明のＡＬＫ３ポリペプチドは、大腸菌のような細菌細胞、昆虫細胞（例えば、バキュロウイルス発現系を使用する）、酵母、または哺乳動物細胞の中で発現させることができる。他の適している宿主細胞は当業者に公知である。
【００６６】
したがって、本発明は、さらに、本発明のＡＬＫ３ポリペプチドを産生する方法に関する。例えば、ＡＬＫ３ポリペプチドをコードする発現ベクターをトランスフェクトした宿主細胞を、ＡＬＫ３ポリペプチドの発現が起こることを可能にする適切な条件の下で培養することができる。ＡＬＫ３ポリペプチドが分泌され得、ＡＬＫ３ポリペプチドを、ＡＬＫ３ポリペプチドを含有している細胞と培地の混合物から単離することができる。あるいは、ＡＬＫ３ポリペプチドは、細胞質または膜画分に保持される場合があり、細胞が採集され、溶解させられ、タンパク質が単離され得る。細胞培養物には、宿主細胞、培地、およびその他の副産物が含まれる。細胞培養に適している培地は当該分野で周知である。本発明のＡＬＫ３ポリペプチドは、イオン交換クロマトグラフィー、ゲル濾過クロマトグラフィー、限外濾過、電気泳動、ＡＬＫ３ポリペプチドの特定のエピトープに特異的な抗体を用いたイムノアフィニティー精製、およびＡＬＫ３ポリペプチドと融合させられたドメインに結合する物質を用いたアフィニティー精製（例えば、プロテインＡカラムをＡＬＫ３−Ｆｃ融合体を精製するために使用することができる）を含む、タンパク質を精製するための当該分野で公知の技術を使用して、細胞培養培地、宿主細胞、またはそれらの両方から単離することができる。好ましい実施形態においては、ＡＬＫ３ポリペプチドは、その精製を容易にするドメインを含有している融合タンパク質である。好ましい実施形態においては、精製は、例えば、以下のうちの三つ以上を任意の順序で含む一連のカラムクロマトグラフィー工程により達成される：プロテインＡクロマトグラフィー、Ｑセファロースクロマトグラフィー、フェニルセファロースクロマトグラフィー、サイズ排除クロマトグラフィー、および陽イオン交換クロマトグラフィー。精製は、ウイルスの濾過および緩衝液交換により完了し得る。本明細書中で明らかにするように、ＡＬＫ３−ｈＦｃタンパク質は、サイズ排除クロマトグラフィーにより決定されるような＞９８％の純度、およびＳＤＳ ＰＡＧＥにより決定されるような＞９５％の純度にまで精製した。このレベルの純度は、マウスにおける骨に対する望ましい効果、ならびにマウス、ラット、およびヒト以外の霊長類において許容され得る安全性プロフィールを達成するのに十分であった。
【００６７】
別の実施形態においては、組換えＡＬＫ３ポリペプチドの所望する部分のＮ末端の、ポリ−（Ｈｉｓ）／エンテロキナーゼ切断部位配列のような精製リーダー配列をコードする融合遺伝子によって、Ｎｉ^２＋金属樹脂を使用したアフィニティークロマトグラフィーによる、発現された融合タンパク質の精製が可能となり得る。その後、エンテロキナーゼでの処理により精製リーダー配列を除去し、精製されたＡＬＫ３ポリペプチドを提供することができる（例えば、Ｈｏｃｈｕｌｉら、（１９８７）Ｊ．Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈｙ ４１１：１７７；およびＪａｎｋｎｅｃｈｔら、ＰＮＡＳ ＵＳＡ ８８：８９７２を参照のこと）。
【００６８】
融合遺伝子を作製するための技術は周知である。原則的には、異なるポリペプチド配列をコードする様々なＤＮＡ断片の連結は、連結のための平滑末端または付着末端、適切な末端を得るための制限酵素消化、必要に応じた付着末端のフィルイン（filling-in）、望ましくない結合を回避するためのアルカリホスファターゼ処理、および酵素による連結を使用する、従来の技法に従って行われる。別の実施形態においては、融合遺伝子は、自動ＤＮＡ合成装置を含む従来技術により合成することができる。あるいは、２つの連続する遺伝子断片の間に相補的な突出を生じるアンカープライマーを用いて遺伝子断片のＰＣＲ増幅を行うことができ、その後アニーリングさせて、キメラ遺伝子配列を作製することもできる（例えば、Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ａｕｓｕｂｅｌら編、Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ：１９９２を参照のこと）。
【００６９】
（４．代替的なＢＭＰおよびＡＬＫ３のアンタゴニスト）
本明細書中に示すデータは、ＢＭＰ−ＡＬＫ３シグナル伝達のアンタゴニストを骨成長および骨石灰化を促進するために使用できることを明らかにする。可溶性ＡＬＫ３ポリペプチド、特に、ＡＬＫ３−Ｆｃが好ましいアンタゴニストであり、そのようなアンタゴニストはＢＭＰ拮抗作用以外の機構を通じて骨に影響を及ぼす可能性があるが（例えば、ＢＭＰ阻害は、ある薬剤の、ＴＧＦ−βスーパーファミリーの他のメンバーをおそらく含むある範囲の分子の活性を阻害する傾向の指標となり得、そのような集合的な阻害は骨に対する望ましい効果に通じる可能性がある）、抗ＢＭＰ（例えば、ＢＭＰ２またはＢＭＰ４）抗体、抗ＡＬＫ３抗体、ＡＬＫ３、ＢＭＰ２、もしくはＢＭＰ４の産生を阻害するアンチセンス、ＲＮＡｉ、またはリボザイム核酸、ならびに、ＢＭＰまたはＡＬＫ３の他のインヒビター、特に、ＢＭＰ−ＡＬＫ３結合を崩壊させるものを含む、他のタイプのＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニストも有用であると予想される。
【００７０】
ＡＬＫ３ポリペプチド（例えば、可溶性ＡＬＫ３ポリペプチド）と特異的反応性がある抗体、ＡＬＫ３ポリペプチドと競争的にリガンドに結合するか、そうでなければＡＬＫ３により媒介されるシグナル伝達を阻害する抗体が、ＡＬＫ３ポリペプチド活性のアンタゴニストとして使用され得る。同様に、ＢＭＰポリペプチドと特異的反応性がある抗体、ＡＬＫ３結合を崩壊させる抗体を、アンタゴニストとして使用できる場合がある。
【００７１】
ＡＬＫ３ポリペプチドまたはＢＭＰポリペプチド由来の免疫原を使用することにより、抗タンパク質／抗ペプチド抗血清またはモノクローナル抗体を標準的なプロトコールにより作製することができる（例えば、Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ編、Ｈａｒｌｏｗ ａｎｄ Ｌａｎｅ（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｐｒｅｓｓ：１９８８）を参照のこと）。哺乳動物（例えば、マウス、ハムスター、またはウサギ）を、ＡＬＫ３ポリペプチドの免疫原性形態、抗体応答を誘発することができる抗原性断片、または融合タンパク質で免疫化することができる。タンパク質またはペプチドに免疫原性を付与する技術としては、キャリアへの結合体化または当該分野で周知の他の技法が挙げられる。ＡＬＫ３またはＢＭＰポリペプチドの免疫原性部分を、アジュバントの存在下で投与することができる。免疫化の進行は、血漿または血清中の抗体力価を検出することによりモニターすることができる。抗原として免疫原を用いて、標準的なＥＬＩＳＡまたは他の免疫アッセイを使用して、抗体レベルを評価することができる。
【００７２】
ＡＬＫ３ポリペプチドの抗原性調製物で動物を免疫化した後、抗血清を得ることができ、必要に応じて、血清からポリクローナル抗体を単離することができる。モノクローナル抗体を得るためには、免疫化した動物から抗体を産生する細胞（リンパ球）を採取し、標準的な体細胞融合手順により骨髄腫細胞のような不死化細胞と融合させて、ハイブリドーマ細胞を生じさせことができる。このような技術は当該分野で周知であり、これには、例えばハイブリドーマ技術（Ｋｏｈｌｅｒ ａｎｄ Ｍｉｌｓｔｅｉｎ，（１９７５）Ｎａｔｕｒｅ，２５６：４９５−４９７により最初に開発された）、ヒトＢ細胞ハイブリドーマ技術（Ｋｏｚｂａｒら、（１９８３）Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ Ｔｏｄａｙ，４：７２）、およびヒトモノクローナル抗体を得るためのＥＢＶ−ハイブリドーマ技術（Ｃｏｌｅら、（１９８５）Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ａｎｄ Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒａｐｙ，Ａｌａｎ Ｒ．Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．ｐｐ．７７−９６）が含まれる。ハイブリドーマ細胞は、ＡＬＫ３ポリペプチドと特異的に反応する抗体の産生について免疫化学的にスクリーニングすることができ、このようなハイブリドーマ細胞を含む培養物からモノクローナル抗体を単離することができる。
【００７３】
用語「抗体」は、本明細書中で使用する場合は、本発明のポリペプチドと特異的に反応するその断片もまた含むことを意図する。抗体は従来技術を使用して断片化することができ、それらの断片を、抗体全体について上記に記載した様式と同じ様式で有用性に関してスクリーニングすることができる。例えば、Ｆ（ａｂ）_２断片は、抗体をペプシンで処理することにより作製することができる。得られたＦ（ａｂ）_２断片をジスルフィド架橋を還元するように処理して、Ｆａｂ断片を得ることができる。本発明の抗体は、抗体の少なくとも１つのＣＤＲ領域によって付与されたＡＬＫ３またはＢＭＰポリペプチドに対しての親和性を有している、二重特異性、一本鎖、キメラ、ヒト化、および完全ヒト分子を含むようにさらに意図される。抗体は、これに結合させられた、検出することができる標識（例えば、標識は、放射性同位体、蛍光化合物、酵素、または酵素補因子であり得る）をさらに含む場合がある。
【００７４】
特定の実施形態においては、抗体は組換え抗体である。この用語には、ＣＤＲグラフト抗体またはキメラ抗体、ライブラリーから選択された抗体ドメインから組み立てられたヒトまたは他の抗体、単鎖抗体、および単一ドメイン抗体（例えば、ヒトＶ_Ｈタンパク質またはラクダＶ_ＨＨタンパク質）を含む、分子生物学の技術により一部が作製された任意の抗体が含まれる。特定の実施形態においては、本発明の抗体はモノクローナル抗体であり、特定の実施形態においては、本発明は、新規の抗体を作製するために利用できる方法をもたらす。例えば、ＡＬＫ３ポリペプチドまたはＢＭＰポリペプチドに特異的に結合するモノクローナル抗体を作製するための方法は、検出可能な免疫応答を刺激するために有効な量の抗原ポリペプチドを含む免疫原性組成物をマウスに投与する工程、このマウスから抗体を産生する細胞（例えば、脾臓由来の細胞）を得、抗体を産生するハイブリドーマを得るために抗体を産生する細胞を骨髄腫細胞と融合させる工程、および抗原に特異的に結合するモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマを同定するために、抗体を産生するハイブリドーマを試験する工程を含み得る。得られれば、ハイブリドーマを、細胞培養において、状況に応じて、ハイブリドーマに由来する細胞が抗原に特異的に結合するモノクローナル抗体を産生する培養条件で、増殖させることができる。モノクローナル抗体は、細胞培養物から精製することができる。
【００７５】
「〜と特異的に反応する」は、抗体に関して使用する場合は、当該分野で一般的に理解されているように、抗体が、目的の抗原（例えば、ＡＬＫ３ポリペプチド）と目的のものではない他の抗原との間で十分に選択的であること、抗体が、少なくとも、特定のタイプの生物学的試料中の目的の抗原の存在の検出に有用であることを意味するように意図される。治療用途のような、この抗体を利用する特定の方法においては、より高度な結合特異性が所望される場合がある。モノクローナル抗体は、一般には、（ポリクローナル抗体と比較して）所望する抗原と交差反応性ポリペプチドとを効果的に識別するより強い傾向を有する。抗体：抗原の相互作用の特異性に影響を及ぼす１つの特徴は、抗体の抗原に対する親和性である。所望する特異性は様々な親和性の範囲で達成され得るが、一般には、好ましい抗体は、約１０^−６、１０^−７、１０^−８、１０^−９、またはそれ未満の親和性（解離定数）を有する。ＢＭＰとＡＬＫ３との間での極めて緊密な結合を考えると、抗ＢＭＰ抗体または抗ＡＬＫ３抗体の中和は、一般的に、１０^−９またはそれ未満の解離定数を有すると予想される。
【００７６】
加えて、望ましい抗体を同定するために抗体をスクリーニングするために使用する技術は、得られる抗体の特性に影響を及ぼし得る。例えば、抗体を溶液中の抗原に結合させるために使用する場合は、溶液結合を試験することが望ましい場合がある。抗体と抗原との間での相互作用を試験して、特定の望ましい抗体を同定するためには、様々な技術を利用することができる。そのような技術としては、ＥＬＩＳＡ法、表面プラズモン共鳴結合アッセイ（例えば、Ｂｉａｃｏｒｅ^ＴＭ結合アッセイ、Ｂｉａｃｏｒｅ ＡＢ，Ｕｐｐｓａｌａ，Ｓｗｅｄｅｎ）、サンドイッチアッセイ（例えば、ＩＧＥＮ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ，Ｉｎｃ．，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，Ｍａｒｙｌａｎｄの常磁性ビーズシステム）、ウエスタンブロット法、免疫沈降アッセイ、および免疫組織化学法が挙げられる。
【００７７】
ＢＭＰアンタゴニストまたはＡＬＫ３アンタゴニストである核酸化合物のカテゴリーの例としては、アンチセンス核酸、ＲＮＡｉ構築物、および触媒性核酸構築物が挙げられる。核酸化合物は、一本鎖である場合も、また、二本鎖である場合もある。二本鎖の化合物は、鎖の一方または他方が一本鎖である突出あるいは非相補性の領域を含む場合がある。一本鎖の化合物は、自己相補性領域を含む場合がある。これは、その化合物が、二重ヘリックス構造の領域を持つ、いわゆる「ヘアピン」または「ステムループ」構造を形成することを意味する。核酸化合物は、全長のＡＬＫ３核酸配列またはＢＭＰ核酸配列の１０００ヌクレオチド以下、５００ヌクレオチド以下、２５０ヌクレオチド以下、１００ヌクレオチド以下、または５０、３５、３０、２５、２２、２０、もしくは１８ヌクレオチド以下からなる領域に相補的であるヌクレオチド配列を含み得る。上記相補性領域は、好ましくは、少なくとも８ヌクレオチドであり、状況に応じて、少なくとも１０または少なくとも１５ヌクレオチド、そして状況に応じて、１５ヌクレオチド〜２５ヌクレオチドである。相補性領域は、コード配列部分のような、標的転写物のイントロン、コード配列、または非コード配列の内部に存在し得る。一般的には、核酸化合物は、約８ヌクレオチドまたは塩基対〜約５００ヌクレオチドまたは塩基対の長さを有する。状況に応じて、長さは約１４ヌクレオチド〜約５０ヌクレオチドである。核酸は、ＤＮＡ（特に、アンチセンスとして使用するため）、ＲＮＡ、またはＲＮＡ：ＤＮＡハイブリッドであり得る。いずれの一本鎖も、ＤＮＡおよびＲＮＡの混合物を含む場合があり、ＤＮＡまたはＲＮＡのいずれとしても容易には分類できない修飾された形態を含む場合がある。同様に、二本鎖の化合物は、ＤＮＡ：ＤＮＡ、ＤＮＡ：ＲＮＡ、またはＲＮＡ：ＲＮＡであり得、いずれの一本鎖も、ＤＮＡおよびＲＮＡの混合物を含む場合があり、ＤＮＡまたはＲＮＡのいずれとしても容易には分類できない修飾された形態を含む場合がある。核酸化合物は、骨格（ヌクレオチド間結合を含む天然の核酸中の糖−リン酸部分）または塩基部分（天然の核酸のプリン部分もしくはピリミジン部分）への１つまたは複数の修飾を含む、多様な修飾のうちのいずれかを含む場合がある。アンチセンス核酸化合物は、約１５ヌクレオチド〜３０ヌクレオチドの長さを有することが好ましい。このアンチセンス核酸化合物は、多くの場合、血清中での安定性、細胞中での安定性、または経口送達される化合物の場合には胃、吸入される化合物については肺のような、化合物が送達される可能性が高い場所での安定性のような特徴を改善するために１つまたは複数の修飾を含む。ＲＮＡｉ構築物の場合、標的転写物に相補的である鎖は、一般的には、ＲＮＡまたはその修飾物である。他方の鎖はＲＮＡ、ＤＮＡ、または任意の他のバリエーションであり得る。二本鎖または一本鎖の「ヘアピン」ＲＮＡｉ構築物の二重鎖部分は、好ましくは、１８ヌクレオチド〜４０ヌクレオチド長の長さを有する。状況に応じて、それがダイサー基質となる限りは、約２１ヌクレオチド〜２３ヌクレオチド長の長さを有する。触媒性または酵素性の核酸は、リボザイムまたはＤＮＡ酵素であり得、これには修飾された形態も含まれる場合がある。核酸化合物は、生理学的条件下で、そしてナンセンスまたはセンス制御がほとんどまたは全く効果がない濃度で細胞と接触させると、約５０％、７５％、９０％、またはそれ以上、標的の発現を阻害し得る。核酸化合物の効果を試験するための好ましい濃度は、１、５、および１０マイクロモルである。核酸化合物は、例えば、骨成長および石灰化に対する効果についても試験することができる。
【００７８】
（５．スクリーニングアッセイ）
特定の態様においては、本発明は、ＢＭＰ−ＡＬＫ３シグナル伝達経路のアゴニストまたはアンタゴニストである化合物（物質）を同定するためのＡＬＫ３ポリペプチド（例えば、可溶性ＡＬＫ３ポリペプチド）およびＢＭＰポリペプチドの使用に関する。このスクリーニングを通じて同定した化合物を、インビトロで骨成長または石灰化を調節するそれらの能力を評価するために、試験することができる。状況に応じて、これらの化合物は、インビボで組織増殖を調節するそれらの能力を評価するために、動物モデルにおいてさらに試験することができる。
【００７９】
ＢＭＰおよびＡＬＫ３ポリペプチドを標的化することにより組織増殖を調節するための治療薬のスクリーニングのための多くのアプローチが存在する。特定の実施形態においては、化合物のハイスループットスクリーニングを行い、骨に及ぼすＢＭＰ媒介性またはＡＬＫ３媒介性効果を混乱させる物質を同定することができる。特定の実施形態においては、ＢＭＰに対するＡＬＫ３ポリペプチドの結合を特異的に阻害するかまたは減少させる化合物をスクリーニングし、同定するためのアッセイを行う。あるいは、ＢＭＰに対するＡＬＫ３ポリペプチドの結合を増強する化合物を同定するためにアッセイを用いることができる。さらなる実施形態においては、ＢＭＰポリペプチドまたはＡＬＫ３ポリペプチドと相互作用する能力により化合物を同定することができる。
【００８０】
様々なアッセイ形式が十分であり、本開示に照らして、本明細書中では明確には記載しないものであっても当業者は理解するものとする。本明細書に記載するように、本発明の試験化合物（物質）は、任意のコンビナトリアル化学法によって作製することができる。あるいは、本発明の化合物は、インビボまたはインビトロで合成された天然に存在している生体分子である場合がある。組織増殖の調節因子として作用するそれらの能力について試験しようとする化合物（物質）は、例えば、細菌、酵母、植物、または他の生物によって産生され得るか（例えば、天然の生成物）、化学的に産生され得るか（例えば、ペプチド模倣体を含む低分子）、または組換えによって産生され得る。本発明が意図する試験化合物としては、非ペプチジル有機分子、ペプチド、ポリペプチド、ペプチド模倣体、糖類、ホルモン、および核酸分子が挙げられる。特定の実施形態においては、試験物質は、約２，０００ダルトン未満の分子量を有している有機低分子である。
【００８１】
本発明の試験化合物は、単一の分離した実体として提供することができ、また、コンビナトリアル化学によって作製されるような、より複雑なライブラリーの形態で提供することもできる。これらのライブラリーは、例えば、アルコール、ハロゲン化アルキル、アミン、アミド、エステル、アルデヒド、エーテル、および他のクラスの有機化合物を含み得る。試験化合物の試験システムへの提示は、単離された形態で、または特に最初のスクリーニング工程では化合物の混合物としてのいずれかであり得る。状況に応じて、化合物は他の化合物で状況に応じて誘導体化することができ、化合物の単離を容易にする誘導体基を有し得る。誘導体基の非限定的な例としては、ビオチン、フルオレセイン、ジゴキシゲニン、緑色蛍光タンパク質、同位元素、ポリヒスチジン、磁気ビーズ、グルタチオンＳトランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、光活性化架橋剤、またはこれらの任意の組み合わせが挙げられる。
【００８２】
化合物および天然抽出物のライブラリーを試験する多くの薬物スクリーニングプログラムでは、所定の時間内に調査する化合物の数を最大にするために、ハイスループットアッセイが望ましい。精製したタンパク質または半精製したタンパク質を用いて導くことができるような、無細胞系で行うアッセイは、試験化合物により媒介される分子標的中の変化の迅速な生成および比較的容易な検出が可能になるよう作製できるという点で、「初期」スクリーニングとして好ましい場合が多い。さらに、試験化合物の細胞毒性または生物学的利用可能性の影響は、一般的には、インビトロ系では無視することができ、その代わりに、アッセイは、ＡＬＫ３ポリペプチドとＢＭＰとの間の結合親和性の変化として現われ得る、分子標的に対する薬物の効果に主に焦点が当てられている。
【００８３】
単なる例であるが、本発明の例示的なスクリーニングアッセイでは、目的の化合物を、通常ＢＭＰに結合することができる単離され精製されたＡＬＫ３ポリペプチドと接触させる。次いで、上記化合物とＡＬＫ３ポリペプチドの混合物に対して、ＡＬＫ３リガンドを含む組成物を添加する。ＡＬＫ３／ＢＭＰ複合体の検出および定量化により、ＡＬＫ３ポリペプチドとＢＭＰとの間での複合体形成を阻害する（または増強する）ことに関する化合物の有効性を決定する手段が提供される。化合物の有効性は、様々な濃度の試験化合物を使用して得られたデータから用量反応曲線を作製することにより評価することができる。さらに、対照アッセイを同様に行って、比較のための基準を提供することもできる。例えば、対照アッセイでは、単離され、精製されたＢＭＰを、ＡＬＫ３ポリペプチドを含む組成物に添加し、ＡＬＫ３／ＢＭＰ複合体の形成を試験化合物の非存在下で定量化する。一般に、反応物を混合することができる順序は変更でき、また同時に混合できることが理解される。さらに、精製されたタンパク質の代わりに細胞抽出物および溶解物を使用して、適切な無細胞アッセイ系を提供することも可能である。
【００８４】
ＡＬＫ３ポリペプチドとＢＭＰとの間での複合体形成は、様々な技術により検出することができる。例えば、複合体の形成の調節は、例えば、放射標識された（例えば、^３２Ｐ、^３５Ｓ、^１４Ｃ、または^３Ｈ）、蛍光標識された（例えば、ＦＩＴＣ）、または酵素標識されたＡＬＫ３ポリペプチドまたはＢＭＰのような、検出できるように標識されたタンパク質を使用して、免疫アッセイにより、またはクロマトグラフィー検出により定量化することができる。
【００８５】
特定の実施形態においては、本発明は、ＡＬＫ３ポリペプチドとその結合タンパク質との間での相互作用の程度を直接または間接的のいずれかで測定する際の、蛍光偏光アッセイおよび蛍光共鳴エネルギー移動（ＦＲＥＴ）アッセイの使用を意図する。さらに、他の検出様式（例えば、光導波路（ＰＣＴ出願国際公開公報第９６／２６４３２号および米国特許第５，６７７，１９６号）、表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）、表面荷電センサー、および表面力センサーに基づく検出様式）も、本発明の多くの実施形態と適合する。
【００８６】
さらに、本発明は、ＡＬＫ３ポリペプチドとその結合タンパク質との間での相互作用を破壊するかまたは増強する物質を同定するための、「ツーハイブリッドアッセイ」としても知られている、相互作用捕捉アッセイの使用を意図する。例えば、米国特許第５，２８３，３１７号；Ｚｅｒｖｏｓら（１９９３）Ｃｅｌｌ ７２：２２３−２３２；Ｍａｄｕｒａら（１９９３）Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２６８：１２０４６−１２０５４；Ｂａｒｔｅｌら（１９９３）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ １４：９２０−９２４；およびＩｗａｂｕｃｈｉら（１９９３）Ｏｎｃｏｇｅｎｅ ８：１６９３−１６９６を参照のこと。特定の実施形態においては、本発明は、ＡＬＫ３ポリペプチドとその結合タンパク質との間での相互作用を解離させる化合物（例えば、低分子またはペプチド）を同定するための、逆ツーハイブリッドシステムの使用を意図する。例えば、Ｖｉｄａｌ ａｎｄ Ｌｅｇｒａｉｎ，（１９９９）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ ２７：９１９−２９；Ｖｉｄａｌ ａｎｄ Ｌｅｇｒａｉｎ，（１９９９）Ｔｒｅｎｄｓ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ １７：３７４−８１；ならびに、米国特許第５，５２５，４９０号；同第５，９５５，２８０号；および同第５，９６５，３６８号を参照のこと。
【００８７】
特定の実施形態においては、本発明の化合物は、本発明のＡＬＫ３ポリペプチドまたはＢＭＰポリペプチドと相互作用するそれらの能力により同定される。化合物とＡＬＫ３ポリペプチドまたはＢＭＰポリペプチドとの間での相互作用は、共有結合である場合も、また、非共有結合である場合もある。例えば、そのような相互作用は、インビトロでの生化学的方法（光架橋、放射標識リガンドの結合、およびアフィニティークロマトグラフィーを含む）を使用して、タンパク質レベルで同定することができる（Ｊａｋｏｂｙ ＷＢら、１９７４，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ ４６：１）。特定の場合には、化合物は、ＢＭＰポリペプチドまたはＡＬＫ３ポリペプチドに結合する化合物を検出するためのアッセイのような、１つの機構に基づくアッセイにおいてスクリーニングされ得る。これには、固相または流体相結合事象が含まれ得る。あるいは、ＢＭＰポリペプチドまたはＡＬＫ３ポリペプチドをコードする遺伝子をレポーターシステム（例えば、β−ガラクトシダーゼ、ルシフェラーゼ、または緑色蛍光タンパク質）と共に細胞にトランスフェクトし、好ましくはハイスループットスクリーニングによりライブラリーに対して、またはライブラリーの個々のメンバーを用いてスクリーニングすることができる。他の機構に基づく結合アッセイ（例えば、自由エネルギーの変化を検出する結合アッセイ）を使用する場合もある。結合アッセイは、ウェル、ビーズ、もしくはチップに固定させたか、または固定化抗体に捕獲されたか、またはキャピラリー電気泳動によって分離した標的を用いて行うことができる。結合した化合物は、通常、比色または蛍光または表面プラズモン共鳴を使用して検出することができる。
【００８８】
特定の態様においては、本発明は、骨形成を調節する（刺激するかまたは阻害する）方法および物質、および骨量を増大させるための方法および物質を提供する。したがって、同定された任意の化合物を、インビトロまたはインビボで、細胞あるいは組織全体の中で試験して、骨成長または石灰化を調節するそれらの能力を確認することができる。当該分野で公知の様々な方法を、この目的のために利用することができる。
【００８９】
例えば、ＡＬＫ３ポリペプチドまたはＢＭＰポリペプチド、あるいは試験化合物が骨または軟骨の成長に及ぼす影響は、細胞に基づくアッセイでＭｓｘ２の誘導、または骨芽前駆細胞の骨芽細胞への分化を測定することによって決定することができる（例えば、Ｄａｌｕｉｓｋｉら、Ｎａｔ．Ｇｅｎｅｔ．２００１，２７（１）：８４−８；Ｈｉｎｏら、Ｆｒｏｎｔ Ｂｉｏｓｃｉ．２００４，９：１５２０−９を参照のこと）。細胞に基づくアッセイの別の例は、間葉系前駆細胞および骨芽細胞中で、本発明のＡＬＫ３ポリペプチドまたはＢＭＰポリペプチドと試験化合物の骨形成活性を分析する工程を含む。例えば、ＢＭＰポリペプチドまたはＡＬＫ３ポリペプチドを発現する組換えアデノウイルスを構築して、多能性間葉系前駆細胞Ｃ３Ｈ１０Ｔ１／２細胞、前骨芽細胞Ｃ２Ｃ１２細胞、および骨芽細胞ＴＥ−８５細胞に感染させることができる。次いで、アルカリホスファターゼ、オステオカルシン、およびマトリックス石灰化の誘導を測定することにより、骨形成活性を決定する（例えば、Ｃｈｅｎｇら、Ｊ ｂｏｎｅ Ｊｏｉｎｔ Ｓｕｒｇ Ａｍ．２００３，８５−Ａ（８）：１５４４−５２を参照のこと）。
【００９０】
本発明は、骨または軟骨の成長を測定するためのインビボアッセイも意図する。例えば、Ｎａｍｋｕｎｇ−Ｍａｔｔｈａｉら、Ｂｏｎｅ，２８：８０−８６（２００１）は、骨折後の初期の骨修復を研究する、ラットの骨粗鬆症モデルを開示している。Ｋｕｂｏら、Ｓｔｅｒｏｉｄ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ＆ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，６８：１９７−２０２（１９９９）も、骨折後の後期の骨修復を研究するラットの骨粗鬆症モデルを開示している。Ａｎｄｅｒｓｓｏｎら、Ｊ．Ｅｎｄｏｃｒｉｎｏｌ．１７０：５２９−５３７は、マウスを卵巣切除し、それによりマウスは、実質的な骨ミネラル含量および骨ミネラル密度の喪失を生じ、骨梁骨が骨ミネラル密度のおよそ５０％を失う、マウス骨粗鬆症モデルを記載している。骨密度は、副甲状腺ホルモンのような因子の投与により卵巣切除したマウスにおいて増大させることができる。特定の態様において、本発明は、当該分野で公知の骨折治癒アッセイを利用する。これらのアッセイには、粉砕法（ｆｒａｃｔｕｒｅ ｔｅｃｈｎｉｑｕｅ）、組織学的分析、および生体力学的分析が含まれ、例えば、米国特許第６，５２１，７５０号（これは、骨折を引き起こすため、そして骨折の程度および修復過程を測定するためのその実験プロトコールの開示のために、その全体が引用により組み入れられる）に記載されている。
【００９１】
（６．例示的な治療的使用）
特定の実施形態においては、本発明のＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニスト（例えば、ＡＬＫ３ポリペプチド）は、例えば、損傷（ｂｒｅａｋａｇｅ）によるか、減少によるか、または脱石灰化によるかを問わず、骨の損傷と関係がある疾患または状態を処置または予防するために使用することができる。特定の実施形態においては、本発明は、治療有効量のＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニスト、特に、ＡＬＫ３ポリペプチドを個体に投与することにより、処置または防止の必要がある個体において骨の損傷を処置または防止する方法を提供する。骨吸収と骨形成に対する二重効果の可能性を考えると、そのような化合物は、現在は同化剤（例えば、副甲状腺ホルモンおよびその誘導体）または抗吸収剤（例えば、ビスホスホネート）で処置している広範な疾患に有用である可能性がある。特定の実施形態においては、本発明は、治療有効量のＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニスト、特に、ＡＬＫ３ポリペプチドを個体に投与することにより、骨成長または石灰化の必要がある個体において骨成長または石灰化を促進する方法を提供する。これらの方法は、状況に応じて、動物、より好ましくはヒトの治療的処置および予防的処置を目的とする。特定の実施形態においては、本開示は、低い骨密度または低下した骨強度と関係がある障害の処置のためのＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニスト（特に、可溶性ＡＬＫ３ポリペプチド、およびＢＭＰまたはＡＬＫ３を標的とする中和抗体）の使用を提供する。
【００９２】
本明細書中で使用する場合は、障害または状態を「予防する」治療薬は、統計的な試料において、未処置の対照試料と比較して処置した試料において障害もしくは状態の発生を減少させるか、または未処置の対照試料に比べて障害もしくは状態の一つもしくは複数の症状の開始を遅らせるか、またはそれらの重篤度を低下させる化合物をいう。用語「処置する」は、本明細書において使用する場合は、指定された状態の予防、または確立された状態の寛解もしくは排除を含む。いずれの場合にも、予防または処置は、医師により提供される診断、および治療薬の投与についての意図する結果において見定めることができる。
【００９３】
本開示は、骨および／もしくは軟骨の形成を誘導する、骨の減少を防ぐ、骨石灰化を増大させる、または骨の脱石灰化を防ぐ方法を提供する。例えば、本発明のＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニストは、ヒトおよび他の動物において骨の減少の障害（例えば、骨粗鬆症）を処置する、ならびに骨折および軟骨欠損、または他の骨欠損、損傷、および障害を治癒することにおいて用途を有する。ＡＬＫ３ポリペプチドまたはＢＭＰポリペプチドは、骨粗鬆症の発症に対する防御対策として、無症状性低骨密度と診断される患者において有用であり得る。
【００９４】
１つの特定の実施形態においては、本発明の方法および組成物は、ヒトおよび他の動物での骨折および軟骨欠損の治癒において医学的有用性を見出すことができる。本発明の方法および組成物はまた、閉鎖骨折および開放骨折を減らすことにおいて、ならびにまた、人工関節の定着の改善においても、予防的用途を有する可能性がある。骨形成剤により誘導される新規の骨形成は、先天性の、外傷によって誘導される、または腫瘍切除によって誘発される頭蓋顔面欠損の修復に寄与し、また美容整形手術にも有用である。特定の場合には、本発明のＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニストは、骨形成細胞を誘引する環境を提供する場合があり、骨形成細胞の増殖を刺激する場合があり、また、骨形成細胞の前駆細胞の分化を誘導する場合もある。本発明のＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニストはまた、骨粗鬆症の処置に有用である場合もある。
【００９５】
Ｒｏｓｅｎら（編）Ｐｒｉｍｅｒ ｏｎ ｔｈｅ Ｍｅｔａｂｏｌｉｃ Ｂｏｎｅ Ｄｉｓｅａｓｅｓ ａｎｄ Ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ ｏｆ Ｍｉｎｅｒａｌ Ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ，第７版、Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｓｏｃｉｅｔｙ ｆｏｒ Ｂｏｎｅ ａｎｄ Ｍｉｎｅｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ Ｄ．Ｃ．（引用により本明細書中に組み入れられる）は、ＡＬＫ３−ＢＭＰアンタゴニストでの処置の対象であり得る骨の障害の詳細な議論を提供する。一部のリストを本明細書中に提供する。本発明の方法および組成物は、骨粗鬆症（二次性骨粗鬆症を含む）、副甲状腺機能亢進症、慢性腎疾患骨ミネラル障害、性ホルモン遮断（ｓｅｘ ｈｏｒｍｏｎｅ ｄｅｐｒｉｖａｔｉｏｎ）もしくは性ホルモン除去（ｓｅｘ ｈｏｒｍｏｎｅ ａｂｌａｔｉｏｎ）（例えば、アンドロゲンおよび／またはエストロゲン）、グルココルチコイド処置、リウマチ性関節炎、重度の熱傷、副甲状腺機能亢進症、高カルシウム血症、低カルシウム血症、低リン酸血症、骨軟化症（腫瘍誘導性の骨軟化症を含む）、高リン酸血症、ビタミンＤ欠乏症、副甲状腺機能亢進症（家族性副甲状腺機能亢進症を含む）および偽性副甲状腺機能低下症、腫瘍の骨への転移、腫瘍もしくは化学療法の結果としての骨の減少、骨および骨髄の腫瘍（例えば、多発性骨髄腫）、虚血性骨障害、歯周病および口の骨の減少、クッシング病、パジェット病、甲状腺中毒症、慢性的な下痢状態もしくは吸収障害、尿細管性アシドーシス、または神経性食欲不振症のような、骨の減少を特徴とするか、または骨の減少を引き起こす状態に適用することができる。本発明の方法および組成物は、癒着不能な骨折、別の理由で治癒が遅い骨折、胎児および新生児骨異形成症（例えば、低カルシウム血症、高カルシウム血症、カルシウム受容体欠損、およびビタミンＤ欠乏症）、骨壊死（顎の骨壊死を含む）、および骨形成不全症を含む、骨の形成または治癒の不全を特徴とする状態にも適用することができる。さらに、同化作用による効果により、そのようなアンタゴニストは、骨の損傷または浸食と関係がある骨の痛みを小さくする。抗吸収効果の結果として、そのようなアンタゴニストは、異常な骨の形成（例えば、骨芽細胞性の腫瘍転移（例えば、原発性の前立腺がんまたは乳がんと関係がある）、造骨性骨肉腫、大理石骨病、進行性骨幹部異形成症、骨内膜骨増殖症、骨斑症、およびメロレオストーシスの障害を処置するために有用であり得る。処置できる他の障害としては、線維性異形成および軟骨形成不全症が挙げられる。
【００９６】
上記議論に加えて、以下のプロフィールのいずれかを有している人が、ＡＬＫ３アンタゴニストでの処置の候補であり得る：エストロゲンまたは他のホルモン補充治療を受けていない閉経後の女性；腰部骨折または喫煙の個人歴または母系歴を持つ人；高身長（５フィート７インチ超）であるかまたは痩せ形（１２５ポンド未満）である閉経後の女性；骨の減少と関係がある臨床状態を持つ男性；Ｐｒｅｄｎｉｓｏｎｅ^ＴＭのようなコルチコステロイド、Ｄｉｌａｎｔｉｎ^ＴＭおよび特定のバルビツール酸のような様々な抗発作薬物治療、または高用量の甲状腺補充薬を含む、骨の減少を引き起こすことが知られている薬物治療を使用している人；１型糖尿病、肝疾患、腎疾患、骨粗鬆症の家族歴を有している人；高い骨代謝回転（例えば、尿試料中の過剰のコラーゲン）を有している人；甲状腺機能亢進症のような甲状腺の状態を持つ人；ごく軽度の外傷の後に骨折を経験した人；椎骨骨折のＸ線による証拠または骨粗鬆症の他の兆候を有したことがある人。
【００９７】
骨粗鬆症（一般的に言うと、低い骨密度または骨強度の状態を意味する）は、様々な要因により引き起こされ得るか、または様々な要因と関係があり得る。女性であること、特に、閉経後の女性であること、低体重を有していること、および座位の多い生活様式を送ることは、全て、骨粗鬆症（骨折のリスクに通じる骨ミネラル密度の低下）のリスクファクターである。
【００９８】
骨粗鬆症は、別の障害と関係がある状態として、または特定の薬物の使用によっても起こり得る。薬物または別の医学的状態により生じる骨粗鬆症は、二次性骨粗鬆症として知られている。クッシング病として知られている状態においては、身体が産生した過剰量のコルチゾールが、骨粗鬆症および骨折を生じる。二次性骨粗鬆症と関係がある最も一般的な薬物は、副腎により天然に産生されるホルモンであるコルチゾールと同様に作用する薬物のクラスであるコルチコステロイドである。（甲状腺により産生される）適度なレベルの甲状腺ホルモンが骨格の発達に必要であるが、過剰の甲状腺ホルモンは骨量を徐々に減少させる可能性がある。アルミニウムを含有している制酸剤は、腎臓に問題を持つ人、特に、透析を受けている人が高用量で摂取すると、骨の減少に通じることがある。二次性骨粗鬆症を引き起こす可能性がある他の薬物としては、発作を防ぐために使用されるフェニトイン（Ｄｉｌａｎｔｉｎ）およびバルビツール酸；関節炎のいくつかの形態、がん、および免疫障害のための薬物であるメトトレキセート（Ｒｈｅｕｍａｔｒｅｘ、Ｉｍｍｕｎｅｘ、Ｆｏｌｅｘ ＰＦＳ）；いくつかの自己免疫疾患を処置するため、および臓器移植患者において免疫系を抑制するために使用される薬物であるシクロスポリン（Ｓａｎｄｉｍｍｕｎｅ、Ｎｅｏｒａｌ）；前立腺がんおよび子宮内膜症を処置するために使用される黄体形成ホルモン放出ホルモンアゴニスト（Ｌｕｐｒｏｎ，Ｚｏｌａｄｅｘ）；抗凝血薬であるヘパリン（Ｃａｌｃｉｐａｒｉｎｅ、Ｌｉｑｕａｅｍｉｎ）；ならびに高コレステロールを処置するために使用されるコレスチラミン（Ｑｕｅｓｔｒａｎ）およびコレスチポール（Ｃｏｌｅｓｔｉｄ）が挙げられる。がん治療により生じる骨の減少は、広く認識されており、がん治療による骨の減少（ｃａｎｃｅｒ ｔｈｅｒａｐｙ ｉｎｄｕｃｅｄ ｂｏｎｅ ｌｏｓｓ）（ＣＴＩＢＬ）と呼ばれている。骨転移は、ＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニストでの処置により修正され得る骨内の空洞を生じる可能性がある。
【００９９】
状況に応じて、本明細書中に開示するＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニスト、特に、可溶性ＡＬＫ３を、がん患者において使用することができる。特定の腫瘍（例えば、前立腺、乳房、多発性骨髄腫、または副甲状腺機能亢進症を引き起こす任意の腫瘍）を有している患者は、腫瘍による骨の減少、ならびに、骨転移および治療剤による骨の減少について高いリスクを有する。そのような患者は、骨の減少または骨転移の証拠がない場合でも、ＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニストで処置される場合がある。また、患者が、骨の減少または骨転移の証拠についてモニタリングされ、指標がリスクの増大を示唆した場合には、ＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニストで処置される場合もある。一般的には、ＤＥＸＡスキャンが骨密度の変化を評価するために利用され、骨リモデリングの指標が骨転移の可能性を評価するために使用され得る。血清マーカーがモニタリングされ得る。骨特異アルカリホスファターゼ（ＢＳＡＰ）は、骨芽細胞中に存在する酵素である。ＢＳＡＰの血中レベルは、骨転移および骨リモデリングの増加をもたらす他の状態がある患者において増大する。オステオカルシンおよびプロコラーゲンのペプチドも骨形成および骨転移と関係がある。ＢＳＡＰの増加は、前立腺がんにより生じた骨転移を有する患者において検出されており、比較的程度は低いが、乳がんからの骨転移においても検出されている。骨形態形成タンパク質７（ＢＭＰ−７）レベルは、骨に転移した前立腺がんにおいて高いが、膀胱がん、皮膚がん、肝臓がん、または肺がんが原因である骨転移においては高くない。Ｉ型カルボキシ末端テロペプチド（ＩＣＴＰ）は、骨の吸収の間に形成されるコラーゲン中で見られる架橋である。骨は絶えず分解され再形成されるので、ＩＣＴＰは全身で見られるであろう。しかし、骨転移の部位では、そのレベルは正常な骨の領域よりも有意に高いであろう。ＩＣＴＰは、前立腺がん、肺がん、および乳がんが原因である骨転移において高レベルで見られる。別のコラーゲン架橋、Ｉ型Ｎ末端テロペプチド（ＮＴｘ）は、骨代謝回転の間にＩＣＴＰと共に産生される。ＮＴｘの量は、肺がん、前立腺がん、および乳がんを含む多くの様々なタイプのがんにより生じた骨転移において増加する。また、ＮＴｘのレベルは骨転移の進行に伴い増加する。したがって、このマーカーは、転移を検出するためにも、疾患の程度を測定するためにも使用することができる。吸収の他のマーカーとしては、ピリジノリンおよびデオキシピリジノリンが挙げられる。吸収マーカーまたは骨転移マーカーの増加はいずれも、患者におけるＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニスト治療の必要性を示す。
【０１００】
別の実施形態においては、ＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニストを、慢性腎疾患骨ミネラル障害（ＣＫＤ−ＭＢＤ）、相互に関係がある骨格の広範な症候群、心臓血管、および腎疾患により生じる無機質代謝障害を持つ患者において使用することができる。ＣＫＤ−ＭＢＤは、腎性骨形成異常症（ＲＯＤ）と呼ばれることが多い様々な骨格の病理を含み、これは、ＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニストでの処置についての好ましい実施形態である。様々な病原因子の相対的寄与に依存して、ＲＯＤが、骨リモデリングの多様な病原性のパターンとして現われる（Ｈｒｕｓｋａら、２００８，Ｃｈｒｏｎｉｃ ｋｉｄｎｅｙ ｄｉｓｅａｓｅ ｍｉｎｅｒａｌ ｂｏｎｅ ｄｉｓｏｒｄｅｒ（ＣＫＤ−ＭＢＤ）；Ｒｏｓｅｎら（編）Ｐｒｉｍｅｒ ｏｎ ｔｈｅ Ｍｅｔａｂｏｌｉｃ Ｂｏｎｅ Ｄｉｓｅａｓｅｓ ａｎｄ Ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ ｏｆ Ｍｉｎｅｒａｌ Ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ，第７版、Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｓｏｃｉｅｔｙ ｆｏｒ Ｂｏｎｅ ａｎｄ Ｍｉｎｅｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ Ｄ．Ｃ，ｐｐ ３４３−３４９）。この範囲の一方の末端には、活発なリモデリング部位の数が少ないこと、大幅に抑制された骨の形成、および低い骨吸収を特徴とする尿毒症性骨形成異常および低い骨代謝回転を有するＲＯＤがある。他方の極には、副甲状腺機能亢進症、高い骨代謝回転、および線維性骨炎を有するＲＯＤがある。ＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニストが同化作用による効果と抗吸収性の効果の両方を発揮することを考えると、これらの物質は、ＲＯＤの病理範囲にわたる患者に有用であり得る。
【０１０１】
ＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニストは、他の薬学的薬剤と組み合わせて投与され得る。組み合わせた投与は、単一の共処方物（co-formulation）の投与により行われる場合も、同時投与により行われる場合も、また、別々の時点での投与により行われる場合もある。ＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニストは、他の骨活性剤と共に投与される場合に、特に有利である場合がある。患者は、組み合わせて、ＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニストを受容し、カルシウムサプリメント、ビタミンＤ、適切な運動、および／または、いくつかの場合には、他の薬物を摂取することから利益が得られる場合がある。他の薬物の例としては、ビスホスホネート（アレンドロネート、イバンドロネート、およびリセドロネート）、カルシトニン、エストロゲン、副甲状腺ホルモン、ならびにラロキシフェンが挙げられる。ビスホスホネート（アレンドロネート、イバンドロネート、およびリセドロネート）、カルシトニン、エストロゲン、ならびにラロキシフェンは、骨リモデリングサイクルに影響を及ぼし、抗吸収薬として分類される。骨リモデリングは、骨吸収と骨形成の２つの異なる段階からなる。抗吸収薬は、骨リモデリングサイクルの骨吸収部分を遅らせるか、または中止するが、このサイクルの骨成形部分を遅らせることはない。結果として、新たな形成が骨吸収より大きな速度で継続し、骨密度が徐々に高くなり得る。副甲状腺ホルモンの一つの形態であるテリパラチドは、骨リモデリングサイクルにおける骨形成の速度を増加させる。アレンドロネートは、閉経後の骨粗鬆症の予防（１日５ｍｇまたは週１回３５ｍｇ）および処置（１日１０ｍｇまたは週１回７０ｍｇ）の両方について承認されている。アレンドロネートは、骨の減少を少なくし、骨密度を増大させ、脊椎、手首、および腰部の骨折のリスクを低下させる。アレンドロネートは、グルココルチコイド（即ち、プレドニゾンおよびコルチゾン）の長期使用の結果としての男性および女性におけるグルココルチコイド誘導性の骨粗鬆症の処置について、そして男性における骨粗鬆症の処置についても承認されている。アレンドロネート＋ビタミンＤは、閉経後の女性における骨粗鬆症の処置について（週１回７０ｍｇ＋ビタミンＤ）、そして骨粗鬆症を有している男性において骨量を改善するための処置について承認されている。イバンドロネートは、閉経後の骨粗鬆症の予防および処置について承認されている。月１回の錠剤（１５０ｍｇ）として摂取されるイバンドロネートは、毎月同じ日に摂取されるべきである。イバンドロネートは、骨の減少を少なくし、骨密度を増大させ、脊椎骨折のリスクを低下させる。リセドロネートは、閉経後の骨粗鬆症の予防および処置について承認されている。毎日（５ｍｇの用量）または週１回（３５ｍｇの用量またはカルシウムと共に３５ｍｇの用量）摂取されるリセドロネートは、骨の減少を遅らせ、骨密度を増大させ、脊椎および脊椎以外の骨折のリスクを低下させる。リセドロネートもまた、グルココルチコイド（即ち、プレドニゾンまたはコルチゾン）の長期使用により生じるグルココルチコイド誘導性の骨粗鬆症を予防および／または処置するための男性および女性による使用について承認されている。カルシトニンは、カルシウム制御および骨代謝に関与している天然に存在しているホルモンである。閉経後５年を超えた女性において、カルシトニンは骨の減少を遅らせ、脊椎の骨密度を増大させ、骨折に伴う疼痛を軽減し得る。カルシトニンは、脊椎骨折のリスクを低下させる。カルシトニンは、注射剤（毎日５０ＩＵ〜１００ＩＵ）または鼻腔スプレー（毎日２００ＩＵ）として使用することができる。エストロゲン療法（ＥＴ）／ホルモン療法（ＨＴ）は、骨粗鬆症の予防について承認されている。ＥＴは、骨の減少を少なくし、脊椎および腰部の両方において骨密度を増加させ、閉経後の女性における腰部および脊椎の骨折のリスクを低下させることが示されている。ＥＴは、最も一般的には、毎日およそ０．３ｍｇの低用量または毎日およそ０．６２５ｍｇの標準用量を送達する錠剤または皮膚貼付剤の形態で投与され、７０歳以降に開始される場合でも有効である。エストロゲンが単独で摂取される場合は、女性の子宮内層のがん（子宮内膜がん）の発症リスクを増加させる可能性がある。このリスクを排除するために、医療提供者は、完全な子宮を持つ女性にはエストロゲンと組み合わせてホルモンであるプロゲスチンを処方する（ホルモン補充療法、すなわちＨＴ）。ＥＴ／ＨＴは、閉経症状を軽減し、骨の健康に対して有益な効果を有していることが示されている。副作用としては、膣出血、乳房圧痛、気分障害、および胆嚢疾患を挙げることができる。ラロキシフェン、１日６０ｍｇは、閉経後の骨粗鬆症の予防および処置について承認されている。これは、それらの潜在的な短所なしにエストロゲンの有益な効果を提供するために開発された選択的エストロゲン受容体モジュレーター（ＳＥＲＭ）と呼ばれる薬物のクラスに属する。ラロキシフェンは、骨量を増加させ、脊椎骨折のリスクを低下させる。ラロキシフェンが腰部および他の脊椎以外の骨折のリスクを低下させることができることを実証するデータは、未だ得られていない。副甲状腺ホルモンの一つの形態であるテリパラチドは、閉経後の女性および骨折のリスクが高い男性における骨粗鬆症の処置について承認されている。この薬物は、新しい骨の形成を刺激し、骨ミネラル密度を有意に増加させる。閉経後の女性において、脊椎、腰部、足、肋骨、および手首における骨折の減少が認められた。男性においては、骨折の減少は脊椎において認められたが、他の部位での骨折の減少を評価するデータは不十分であった。テリパラチドは最長２４ヶ月、毎日の注射として自己投与される。
【０１０２】
（７．薬学的組成物）
特定の実施形態においては、本発明のＢＭＰ−ＡＬＫ３アンタゴニスト（例えば、ＡＬＫ３ポリペプチド）を、薬学的に許容され得るキャリアとともに処方する。例えば、ＡＬＫ３ポリペプチドは、単独で、または薬学的処方物（治療用組成物）の成分として投与することができる。本発明の化合物は、ヒトの医学または獣医学において使用するための任意の便利な方法での投与のために処方することができる。
【０１０３】
特定の実施形態においては、本発明の治療法には、組成物を全身投与するか、またはインプラントもしくはデバイスとして局所投与する工程が含まれる。投与する場合は、本発明での使用のための治療用組成物は、当然、発熱性物質を含まない生理学的に許容され得る形態である。上記のような組成物中に状況に応じてさらに含めることができるＡＬＫ３アンタゴニスト以外の治療的に有用な物質は、本発明の方法において、本発明の化合物（例えば、ＡＬＫ３ポリペプチド）と同時に投与される場合も、また、連続して投与される場合もある。
【０１０４】
典型的には、ＡＬＫ３アンタゴニストは、非経口的に投与される。非経口投与に適している薬学的組成物には、１つまたは複数の薬学的に許容され得る滅菌された等張性の水性もしくは非水性の溶液、分散物、懸濁物もしくはエマルジョン、または使用の直前に滅菌された注射可能な溶液もしくは分散物になるように再構成することができる滅菌された粉末と組み合わせて、１つまたは複数のＡＬＫ３ポリペプチドが含まれる場合がある。これには、抗酸化物質、緩衝液、静菌剤、処方物を意図するレシピエントの血液と等張性にする溶質、または懸濁化剤もしくは増粘剤を含めることができる。本発明の薬学的組成物において利用することができる適切な水性および非水性のキャリアの例としては、水、エタノール、ポリオール（例えば、グリセロール、プロピレングリコール、ポリエチレングリコールなど）、およびそれらの適切な混合物、植物油（例えば、オリーブ油）、ならびにオレイン酸エチルのような注射可能な有機エステルが挙げられる。適度な流動性は、例えば、レシチンのようなコーティング材料の使用により、分散物の場合には必要とされる粒径の維持により、そして界面活性剤の使用により、維持することができる。
【０１０５】
さらに、組成物は、カプセル化される場合があり、また、標的組織部位（例えば、骨）への送達のための形態で注射される場合もある。特定の実施形態においては、本発明の組成物には、標的組織部位（例えば、骨）に１つまたは複数の治療用化合物（例えば、ＡＬＫ３ポリペプチド）を送達し、発達中の組織のための構造を提供することができ、状況に応じて身体が吸収することができるマトリックスを含めることができる。例えば、マトリックスは、ＡＬＫ３ポリペプチドの徐放を提供し得る。そのようなマトリックスは、他の移植医学的適用のために現在使用されている材料から形成することができる。
【０１０６】
マトリックス材料の選択は、生体適合性、生体分解性、機械的特性、美容上の外観、および界面特性に基づく。本発明の組成物の特定の用途により、適切な処方が決まる。組成物に利用可能なマトリックスは、生体分解性であり化学的に規定された硫酸カルシウム、リン酸三カルシウム、ヒドロキシアパタイト、ポリ乳酸、およびポリ無水物であり得る。他の可能な材料は、生体分解性であり、生物学的に十分定義されたもの、例えば骨または皮膚コラーゲンである。さらなるマトリックスは、純粋なタンパク質または細胞外マトリックス成分からなる。他の可能なマトリックスは、非生体分解性であり化学的に定義されたもの、例えば、焼結ヒドロキシアパタイト、バイオガラス、アルミン酸塩、または他のセラミックスである。マトリックスは、ポリ乳酸およびヒドロキシアパタイトまたはコラーゲンおよびリン酸三カルシウムのように、上記タイプの材料の任意の組み合わせからなり得る。バイオセラミックは、孔径、粒径、粒子の形状、および生体分解性を変更するために、カルシウム−アルミン酸−リン酸のような組成および加工処理を変えることができる。
【０１０７】
特定の実施形態においては、本発明の方法は、例えば、カプセル剤、カシェ剤、丸剤、錠剤、ロゼンジ剤（矯味矯臭基材、通常は、スクロースおよびアカシアまたはトラガカントを使用する）、粉末剤、顆粒剤の形態で、または水性液体もしくは非水液体中の溶液もしくは懸濁物として、または水中油型もしくは油中水型液体エマルジョンとして、またはエリキシル剤もしくはシロップ剤として、またはトローチ剤（不活性な基剤（例えば、ゼラチンおよびグリセリン）またはスクロースおよびアカシアを使用して）として、ならびに／あるいは洗口剤などとして経口投与することができ、それぞれが予め決定された量の物質を有効成分として含む。物質はまた、ボーラス、舐剤、またはペースト剤としても投与され得る。
【０１０８】
経口投与用の固形投薬形態（カプセル剤、錠剤、丸剤、糖衣錠、粉末剤、顆粒剤など）においては、本発明の１種類または複数の治療化合物を、１種類または複数の薬学的に許容され得るキャリアと混合することができる。キャリアは、例えば、クエン酸ナトリウムもしくは第二リン酸カルシウム、および／または以下のうちのいずれかである：（１）充填剤または増量剤（例えば、澱粉、ラクトース、スクロース、グルコース、マンニトール、および／またはケイ酸）；（２）結合剤（例えば、カルボキシメチルセルロース、アルギン酸塩、ゼラチン、ポリビニルピロリドン、スクロース、および／またはアカシア）；（３）保湿剤（例えば、グリセロール）；（４）崩壊剤（例えば、寒天、炭酸カルシウム、ポテトまたはタピオカ澱粉、アルギン酸、特定のケイ酸塩、および炭酸ナトリウム）；（５）溶液遅延剤（例えば、パラフィン）；（６）吸収促進剤（例えば、第四級アンモニウム化合物）；（７）加湿薬（例えば、セチルアルコールおよびグリセロールモノステアレート）；（８）吸収剤（例えば、カオリンおよびベントナイトクレイ）；（９）潤滑剤（例えば、タルク、ステアリン酸カルシウム、ステアリン酸マグネシウム、固形ポリエチレングリコール、ラウリル硫酸ナトリウム、およびそれらの混合物）；ならびに、（１０）着色剤。カプセル剤、錠剤、および丸剤の場合は、薬学的組成物にはまた、緩衝剤も含まれ得る。同様のタイプの固形組成物はまた、ラクトースまたは乳糖、ならびに高分子量ポリエチレングリコールなどの賦形剤を使用して、ソフトおよびハードゼラチンカプセルにおいて充填剤として使用することもできる。
【０１０９】
経口投与用の液体投薬形態としては、薬学的に許容され得るエマルジョン、マイクロエマルジョン、溶液、懸濁物、シロップ剤、およびエリキシル剤が挙げられる。液体投薬形態には、有効成分に加えて、例えば水または他の溶媒のような当該分野で通常使用されている不活性な希釈剤、可溶化剤および乳化剤、例えば、エチルアルコール、イソプロピルアルコール、炭酸エチル、酢酸エチル、ベンジルアルコール、安息香酸ベンジル、プロピレングリコール、１，３−ブチレングリコール、油（特に、綿実油、ラッカセイ油、トウモロコシ油、胚芽油、オリーブ油、ヒマシ油、およびゴマ油）、グリセロール、テトラヒドロフリルアルコール、ポリエチレングリコール、およびソルビタンの脂肪酸エステル、ならびにそれらの混合物が含まれる場合がある。経口組成物にはまた、不活性な希釈剤に加えて、加湿薬、乳化剤および懸濁化剤、甘味剤、矯味矯臭剤、着色剤、香料、および保存剤のようなアジュバントも含まれ得る。
【０１１０】
懸濁物には、活性化合物に加えて、懸濁化剤、例えば、エトキシル化イソステアリルアルコール、ポリオキシエチレンソルビトール、およびソルビタンエステル、微結晶セルロース、メタ水酸化アルミニウム、ベントナイト、寒天、およびトラガカント、ならびにこれらの混合物が含まれる場合がある。
【０１１１】
本発明の組成物にはまた、アジュバント（例えば、保存剤、加湿薬、乳化剤、および分散化剤）が含まれる場合がある。様々な抗菌剤および抗真菌剤（例えば、パラベン、クロロブタノール、ソルビン酸フェノールなど）を含めることにより、微生物の作用の防止を確実にすることができる。等張剤（例えば、糖類、塩化ナトリウムなど）を組成物中に含めることが望ましい場合もある。加えて、吸収を遅延させる物質（例えば、モノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチン）を含めることにより、注射可能な薬学的形態の吸収を延長する場合もある。
【０１１２】
投与レジメンは、本発明の化合物（例えば、ＡＬＫ３ポリペプチド）の作用を変化させる様々な要因を考慮して主治医により決定されることが理解される。様々な要因としては、形成が所望される骨重量、骨密度低下の程度、骨損傷の部位、損傷した骨の状態、患者の年齢、性別、および食習慣、骨の減少を生じ得る任意の疾患の重篤度、投与期間、ならびに他の臨床上の要因が挙げられるが、これらに限定されない。状況に応じて、投与量は、再構成に使用するマトリックスのタイプおよび組成物中の化合物のタイプに応じて変わるであろう。他の公知の増殖因子を最終的な組成物に加えることもまた、投与量に影響を及ぼす場合がある。進行は、例えば、Ｘ線（ＤＥＸＡを含む）、組織形態測定、およびテトラサイクリン標識によって、骨の成長および／または修復を定期的に評価することによりモニターすることができる。
【０１１３】
特定の実施形態においては、本発明はまた、ＡＬＫ３ポリペプチドのインビボでの産生のための遺伝子治療を提供する。このような治療は、ＡＬＫ３ポリヌクレオチド配列を上記に列挙した障害を有している細胞または組織に導入することによって、その治療効果を達成する。ＡＬＫ３ポリヌクレオチド配列の送達は、キメラウイルスのような組換え発現ベクターまたはコロイド分散系を用いて達成することができる。ＡＬＫ３ポリヌクレオチド配列の治療的送達には、標的化リポソームの使用が好ましい。
【０１１４】
本明細書中で教示するような遺伝子治療に利用することができる様々なウイルスベクターとしては、アデノウイルス、ヘルペスウイルス、ワクシニア、または好ましくはレトロウイルスのようなＲＮＡウイルスが挙げられる。好ましくは、レトロウイルスベクターは、マウスまたはトリのレトロウイルスの誘導体である。単一の外来遺伝子を挿入することができるレトロウイルスベクターの例としては、モロニーマウス白血病ウイルス（ＭｏＭｕＬＶ）、ハーベイマウス肉腫ウイルス（ＨａＭｕＳＶ）、マウス乳腺腫瘍ウイルス（ＭｕＭＴＶ）、およびラウス肉腫ウイルス（ＲＳＶ）が挙げられるが、これらに限定されない。多数のさらなるレトロウイルスベクターには、複数の遺伝子を組み込むことができる。これらのベクターは全て、形質導入された細胞を同定し、作製できるように、選択マーカーの遺伝子を導入するかまたは組み込むことができる。レトロウイルスベクターは、例えば、糖、糖脂質、またはタンパク質を結合させることによって標的特異的にすることができる。好ましい標的化は、抗体を使用することにより達成される。当業者は、ＡＬＫ３ポリヌクレオチドを含むレトロウイルスベクターの標的特異的送達を可能にするために、特定のポリヌクレオチド配列をレトロウイルスゲノムに挿入するか、またはウイルスエンベロープに結合させることができることを理解するものとする。１つの好ましい実施形態においては、ベクターは骨または軟骨に標的化される。
【０１１５】
あるいは、組織培養細胞に、レトロウイルス構造遺伝子ｇａｇ、ｐｏｌ、およびｅｎｖをコードするプラスミドを、従来のリン酸カルシウムトランスフェクションによって直接トランスフェクションすることができる。次いで、これらの細胞に、目的の遺伝子を含むベクタープラスミドをトランスフェクトする。得られる細胞は、レトロウイルスベクターを培養培地中に放出する。
【０１１６】
ＡＬＫ３ポリヌクレオチドの別の標的化送達系は、コロイド分散系である。コロイド分散系としては、高分子複合体、ナノカプセル、ミクロスフェア、ビーズ、ならびに脂質に基づく系（水中油型エマルジョン、ミセル、混合ミセル、およびリポソームを含む）が挙げられる。本発明の好ましいコロイド系はリポソームである。リポソームは、インビトロおよびインビボでの送達ビヒクルとして有用である人工的な膜小胞である。ＲＮＡ、ＤＮＡ、および無傷のビリオンをその水性内部にカプセル化し、生物学的に活性な形態で細胞に送達することができる（例えば、Ｆｒａｌｅｙら、Ｔｒｅｎｄｓ Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｓｃｉ．，６：７７，１９８１を参照のこと）。リポソームビヒクルを使用する効率的な遺伝子移入の方法は当該分野で公知であり、例えば、Ｍａｎｎｉｎｏら、Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ，６：６８２，１９８８を参照のこと。リポソームの組成は、通常、ステロイド（特に、コレステロール）と組み合わせた、リン脂質の組み合わせである。他のリン脂質または他の脂質を使用することも可能である。リポソームの物理的特性はｐＨ、イオン強度、および２価の陽イオンの存在に依存する。
【０１１７】
リポソームの生成に有用な脂質の例としては、ホスファチジル化合物、例えば、ホスファチジルグリセロール、ホスファチジルコリン、ホスファチジルセリン、ホスファチジルエタノールアミン、スフィンゴ脂質、セレブロシド、およびガングリオシドが挙げられる。例示的なリン脂質としては、卵ホスファチジルコリン、ジパルミトイルホスファチジルコリン、およびジステアロイルホスファチジルコリンが挙げられる。リポソームの標的化もまた、例えば、臓器特異性、細胞特異性、および細胞小器官特異性に基づいて可能であり、当該分野で公知である。
【実施例】
【０１１８】
（実施例）
ここに本発明を一般的に記載したが、本発明は、以下の実施例を参照することによってより容易に理解されると考えられる。以下の実施例は、本発明の特定の実施形態を単に説明する目的のために含めるものであって、本発明を限定するようには意図しない。
【０１１９】
（実施例１：ＡＬＫ３−Ｆｃ融合タンパク質の作製）
天然のヒトＡＬＫ３のアミノ酸配列と対応するヌクレオチド配列を、図１、２に示す。出願人らは、ヒトＡＬＫ３の細胞外ドメイン（天然の残基２４〜１５２）（図３、４）を最小リンカー（アミノ酸残基ＴＧＧＧを含む）を介してヒトＦｃドメイン（図５、６）とＣ末端で融合させたＡＬＫ３−ｈＦｃ融合タンパク質を設計して、図７に示すタンパク質を得た。以下の３つのリーダー配列を検討した：
（ｉ）天然：ＭＰＱＬＹＩＹＩＲＬＬＧＡＹＬＦＩＩＳＲＶＱＧ（配列番号８）
（ｉｉ）組織プラスミノーゲン活性化因子（ＴＰＡ）：ＭＤＡＭＫＲＧＬＣＣＶＬＬＬＣＧＡＶＦＶＳＰ（配列番号９）
（ｉｉｉ）ミツバチメリチン（ＨＢＭＬ）：ＭＫＦＬＶＮＶＡＬＶＦＭＶＶＹＩＳＹＩＹＡ（配列番号１０）。
【０１２０】
選択したｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃの形態（配列番号１１）は、ＴＰＡリーダーを利用し、図８に示すプロセシングされていないアミノ酸配列を有する。この融合タンパク質をコードするセンスヌクレオチド配列と対応するアンチセンス配列を図９に示す。アミノ酸配列を変化させないＣ→Ｔ置換（下線を付けた）が１１３７位に組み込まれているｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃをコードする代替えのセンスヌクレオチド配列を以下に示す。
【０１２１】
【化２】

【０１２２】
【化３】

ＴＰＡリーダーを持ち、マウスＦｃでヒトＦｃを置換したｈＡＬＫ３（２４−１５２）−Ｆｃの改変体を図１０に示す。この改変体をコードするセンスヌクレオチド配列とその対応するアンチセンス配列を図１１に示す。出願人らは、７１位（天然のＡＬＫ３ ＥＣＤ配列中では７０位）にアスパラギンを有しているｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃの１つの形態を構築した。このタンパク質をＣＨＯ細胞系中で発現させ、Ｎ末端配列決定により、Ｎ末端ブロックを持つ１つの主要な種を明らかにし、このことは、配列番号７のタンパク質と一致する天然のグルタミン（Ｑ）残基での開始と、主要ではない１つのＧＡＱＮＬＤＳＭＬＨＧＴＧＭＫの配列（配列番号１７）を示している。出願人らはさらに、天然のＡＬＫ３配列を有しているｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃタンパク質を構築した。マウスＡＬＫ３の細胞外ドメイン（マウス前駆体中の天然の残基２４〜１５２）とマウスＦｃドメインを含む別のＡＬＫ３−Ｆｃ改変体を、同様の方法により作製した。この改変体ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃのアミノ酸配列を以下に示し、ＡＬＫ３ドメインに下線を付けた。
【０１２３】
【化４】

【０１２４】
【化５】

（実施例２．ＡＬＫ３−Ｆｃに対するリガンドの結合）
Ｂｉａｃｏｒｅ^ＴＭ法を使用して、ＢＭＰ／ＧＤＦファミリーの１５を上回るメンバーに対するＡＬＫ３−Ｆｃ融合タンパク質の結合親和性を決定した。ＨＥＫ ２９３細胞由来のｍＡＬＫ３−ｍＦｃは、ｈＢＭＰ２とｈＢＭＰ４に対して高い結合親和性（それぞれ、Ｋ_Ｄ＝２．４３×１０^−９および９．４７×１０^−１０）を示し、さらに、いくつかの他のリガンド（ｈＢＭＰ６およびｈＢＭＰ７を含む）に対しては中程度の結合親和性を示した。ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃも同様の結合プロフィールを示した。具体的には、ＨＥＫ ２９３細胞由来のｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃは、ｈＢＭＰ２およびｈＢＭＰ４に対して、それぞれ６．５３×１０^―１０および１．０２×１０^−９のＫ_Ｄで結合したが、ＣＨＯ細胞由来のｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃは、ｈＢＭＰ２およびｈＢＭＰ４に対して、それぞれ４．５３×１０^−１０および７．０３×１０^−１０のＫ_Ｄで結合した。ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃと同様に、両タイプの細胞に由来するｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃは、他のリガンドの中でも、ｈＢＭＰ６およびｈＢＭＰ７に対して中程度の結合親和性を示した。
【０１２５】
ＢＭＰ２およびＢＭＰ４に対するＡＬＫ３−Ｆｃの全体的な選択性が重要である。いずれの特定の機構にも束縛されることは望ましくないが、出願人らは、これらの結果に基づいて、ＡＬＫ３−Ｆｃが、ＢＭＰ２およびＢＭＰ４に結合し、それによりこれらのリガンドによるシグナル伝達を阻害することにより主にインビボでその効果を発揮するとの仮説を立てる。したがって、ＢＭＰ２および／またはＢＭＰ４に対する抗体もまた骨の形成を刺激すると予想される。あるいは、ＡＬＫ３リガンド結合ドメインに対する抗体が、ＡＬＫ３に媒介されるシグナル伝達をより広く阻害すると予想される。図１８は、骨形成を促進するための、ＢＭＰ２、ＢＭＰ４、および状況に応じたさらなるリガンドによるシグナル伝達を妨害するための本明細書中で提案する３つのアプローチの例を図式的に示す。
【０１２６】
ヒトＡＬＫ３の細胞外ドメイン（ＥＣＤ）の短縮型改変体が組み込まれている一連のＡＬＫ３−Ｆｃタンパク質を作製し、それらのリガンド結合親和性についてｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃと比較した。Ｎ末端の６、１２、２７、または３１アミノ酸の欠失、Ｃ末端の６または１２アミノ酸の欠失を持つＡＬＫ３ ＥＣＤ改変体、および二重短縮型を、ＨＥＫ ２９３細胞中で発現させ、Ｍａｂクロマトグラフィー（プロテインＡカラム）により精製した。Ｂｉａｃｏｒｅ^ＴＭ法を使用して、これらの改変体に対する結合についてＢＭＰ／ＧＤＦ／ＴＧＦβリガンドスーパーファミリーのメンバーをスクリーニングした。
【０１２７】
【表１】

上記に示したように、評価したＣ末端短縮形態は、全長のＡＬＫ３ ＥＣＤと比較して、ＢＭＰ２／ＢＭＰ４に対して類似するかまたは高い結合親和性を示し、一般的には、ＢＭＰ６／ＢＭＰ７に対する結合は減少したが、ＡＬＫ３ＣΔ１２は、全長のＡＬＫ３ ＥＣＤと同様の親和性でＢＭＰ７に対する結合を保持していた。対照的に、Ｎ末端短縮形態は、ＢＭＰ２に対する結合を減少させ、ＢＭＰ４に対する結合をなくす傾向があり、ＢＭＰ６／ＢＭＰ７に対する結合に対して様々な効果を示す。興味深いことに、二重短縮改変体ＡＬＫ３ＮΔ６ＣΔ６は、ＢＭＰ６／ＢＭＰ７に対する結合が検出不可能であることと組み合わせて、全長のＡＬＫ３ ＥＣＤと比較してＢＭＰ２／ＢＭＰ４に対して高い親和性を示す。所望される標的であるＢＭＰ２およびＢＭＰ４に対してより大きな選択性を持つ分子は、これらが患者においてはほとんど「オフターゲット」効果を有さないであろうとの理由から有用である。Ｎ末端配列決定は、Ｎ末端の６アミノ酸の短縮をコードする核酸が、細胞培養物中で発現させると、６アミノ酸の短縮を有しているポリペプチドの集団と、７アミノ酸の短縮を有しているポリペプチドの集団とを生じることを明らかにした。まとめると、これらは、Ｎ末端に７アミノ酸までの短縮を、そしてＣ末端に１２アミノ酸までの短縮を含むｈＡＬＫ３−ｈＦｃポリペプチドは、有用な活性を保持しており、オフターゲットリガンドに対する結合において望ましい驚くべき減少を示すことを示している。したがって、配列番号３の少なくともアミノ酸８〜１１７を含むＡＫＬ３ポリペプチドを、本明細書中に記載する目的のために使用できる。
【０１２８】
リガンド結合特性を使用して、ＣＨＯ細胞由来のｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃタンパク質の質を、ＨＥＫ ２９３細胞由来のｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃタンパク質の質と比較した。Ｂｉａｃｏｒｅ^ＴＭ法により決定した場合は、ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃに対するＢＭＰ２の親和性（Ｋｄ）は、融合タンパク質の供給源によっては異なることはなかった。しかし、ＣＨＯ細胞により作製された活性タンパク質の割合は、それらのそれぞれのＲｍａｘ値に基づくと、ＨＥＫ ２９３細胞により作製された活性タンパク質の割合よりも高かった。Ｒｍａｘは、（ＭＷ_Ａ／ＭＷ_Ｌ）×Ｒ_Ｌ×Ｓ_Ｍ（式中、ＭＷ_Ａは分析物の分子量であり、ＭＷ_Ｌはリガンドの分子量であり、Ｒ_Ｌは、応答単位における固定化レベルであり、Ｓ_Ｍはモル化学量論である）に等しいタンパク質の質の測定値である。ＢＭＰ４結合についての対応する分析は、ＣＨＯ細胞由来のタンパク質が、ＨＥＫ ２９３細胞由来のタンパク質よりも、ＢＭＰ４に対して高い親和性を示したこと（それぞれ、３１４ｐＭ対１０２０ｐＭのＫ_Ｄ）、およびＣＨＯ細胞により作製されたタンパク質についてのＲｍａｘ値が、ＨＥＫ ２９３細胞由来のタンパク質についてのＲｍａｘ値の３倍であることを明らかにし、重ねて、活性タンパク質の高い割合を示した。したがって、ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃタンパク質の供給源としてのＣＨＯ細胞の予想できなかった利点として、ＢＭＰ４に対するタンパク質のより高い結合親和性と、より高いタンパク質の質（Ｒｍａｘ値）により生じると予想されるより大きな生体利用性が挙げられる。
【０１２９】
（実施例３．ｈＡＬＫ３−ｍＦｃはマウスにおいて骨の状態を改善する）
出願人らは、ＡＬＫ３−ｍＦｃの１つのバージョンの、マウスにおいて骨の状態を改善する能力を調べた。１２週齢の雌性Ｃ５７ＢＬ／６マウス（１つのグループあたりｎ＝８）を、１０ｍｇ／ｋｇのｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃまたはビヒクル（Ｔｒｉｓ緩衝化生理食塩水）で、全部で６週間の、週に２回の腹腔内注射によって処置した。ビヒクルと比較して、ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）によって決定すると、３１日目までに全身の骨密度を有意に増大させ、この効果は４２日目の本研究の完了時まで維持された（図１２）。骨密度に対するｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置の同様の効果は、これらの同じ時点で、ＤＥＸＡにより腰椎の局所分析についても観察された（図１３）。加えて、高解像度の脛骨骨幹部および近位脛骨の測定も、マイクロコンピュータ断層撮影法（マイクロＣＴ）により行って、皮質骨および骨梁骨のそれぞれに対するｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃの効果を決定した。ビヒクルと比較すると、ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置は、ｉ）６週までに皮質骨の厚みを（図１４）、ｉｉ）４週までに骨梁骨体積を（図１５）、そしてｉｉｉ）４週までに平均の骨梁の厚み（図１６）を有意に増大させた。近位脛骨全体のマイクロＣＴにより作製した切片の代表的な三次元再構成（図１７）は、骨梁骨微細構造に対するｈＡＬＫ（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置（４週間）の堅調な刺激効果を強調する。重要なことは、ｈＡＬＫ（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置は、研究過程全体にわたり、脂肪分の少ない組織（ｌｅａｎ ｔｉｓｓｕｅ）の量、脂肪量、または赤血球量において有意な変化を生じることはなかった。
【０１３０】
まとめると、上記データは、ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃを、骨ミネラル密度の増大、ならびに、皮質骨および骨梁骨の両方の正味の形成の増大を通じて骨の状態を選択的に改善するためにインビボで使用できることを示している。
【０１３１】
（実施例４．ｈＡＬＫ３−ｍＦｃはマウスにおいて骨強度を高める）
実施例３に記載した実験において、出願人らはまた、骨強度を高めるｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃの能力も調べた。６週間の投与後、大腿骨を収集し、−２０℃で凍結保存した。後に、骨を解凍して室温とし、破壊的４点曲げ試験を、Ｉｎｓｔｒｏｎ機械的試験装置（Ｉｎｓｔｒｏｎ ｍｅｃｈａｎｉｃａｌ ｔｅｓｔｉｎｇ ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔ）（Ｉｎｓｔｒｏｎ ４４６５を改造した５５００）を用いて左大腿骨の中央骨幹について行った。固定した支持体間の間隔は７ｍｍであり、荷重適用の２点間の間隔は２．５ｍｍであった。荷重を、骨が破損するまで３ｍｍ／分の一定の変位速度でかけ、最大荷重、剛性、およびエネルギー吸収のデータを、Ｂｌｕｅｈｉｌｌ ｖ ２．５ソフトウェアで計算した。ビヒクルと比較すると、ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、最大骨荷重を３０％（図１９）、骨の剛性を１４％（図２０）、そして骨が破損するまでのエネルギーを３２％（図２１）、有意に増大させた。これらの知見は、ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置を用いて観察した（実施例３）骨組成物の改良に伴い、骨強度の増大が起こったことを示している。
【０１３２】
（実施例５．骨減少症のＯＶＸマウスモデルの骨に対するｍＡＬＫ３−ｍＦｃの効果）
閉経後の女性におけるエストロゲンの不足は、骨の減少、特に、骨梁骨の減少を促進する。したがって、出願人らは、骨の減少が確立された骨減少症の卵巣切除した（ＯＶＸ）マウスモデルにおいて骨の状態を改善する、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃの能力を調べた。両側ＯＶＸまたは偽手術を行った８週齢の雌性Ｃ５７ＢＬ／６マウスを、その後、８週間の間処置しないまま維持した。８週間の最後に、マイクロＣＴとＤＥＸＡによるベースラインの測定によって、偽処置と比較して、ＯＶＸマウスにおける有意な骨の減少を確認した。最も注目すべきは、マイクロＣＴにより近位脛骨において決定した、骨梁骨体積の４３％の減少（図２２、０日目の時点）であった。その後、マウスを、１０ｍｇ／ｋｇのｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃまたはビヒクル（Ｔｒｉｓ緩衝化生理食塩水）で、８週間の間週に２回のｉｐ注射により処置した。
【０１３３】
ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置は、エストロゲンの不足が続いているにも関わらず、骨梁および皮質骨の両方において改善をもたらした。５６日目の研究の終了時までに、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃで処置したＯＶＸマウスの近位脛骨における骨梁骨体積は、ＯＶＸ対照と比較して２５０％近く、偽性の対照と比較して８０％を上回るほどに増加した（図２２）。ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置によってはまた、皮質の厚みの増大（図２３）と、ＯＶＸ対照と比較した脛骨骨幹部における骨内膜の周囲の減少（図２４）により示されるような、皮質骨の成長も生じた。これらの改善には、骨ミネラル密度の増大が伴った。ＯＶＸ対照と比較すると、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置は、１４日目までに全身の骨ミネラル密度を有意に増大させ（ＤＥＸＡにより決定した）、この改善は、研究の終了時まで維持された（図２５）。ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置についても、同様の効果が、腰椎（図２６）と大腿骨−脛骨（図２７）のミネラル密度に対して観察された。マイクロＣＴ分析による椎骨の骨梁骨の三次元画像（図２８）は、エストロゲンの不足が進行しているにも関わらず、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置に伴う骨の状態の堅調な改善を強調する。これらの知見は、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃが、骨減少症のマウスモデルにおけるエストロゲンの減少（ｗｉｔｈｄｒａｗａｌ）に伴う骨（骨梁骨を含む）の悪化を反転させることができることを示している。骨減少症の状態から、性腺が無傷である対照の骨の量を上回る状態に（図２２〜２４、２８）、および性腺が無傷である対照の骨の質に匹敵する状態（図２５〜２７）に骨を変化させるｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃの能力は、この物質が抗吸収効果のみならず、同化作用の効果も発揮することの証拠である。
【０１３４】
（実施例６．マウスにおける骨の組織形態測定および血清生体マーカーに対するｍＡＬＫ３−ｍＦｃの効果）
別の研究において、出願人らは、組織形態測定および血清の生体マーカーにより評価した、マウスの骨の状態を改善するｍＡＬＫ３−ｍＦｃの能力を調べた。１２週齢の雌性Ｃ５７ＢＬ／６マウスを、１０ｍｇ／ｋｇのｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃまたはビヒクル（Ｔｒｉｓ緩衝化生理食塩水）で、週に２回の腹腔内注射により処置した。マウスのコホートを、骨と血清が収集できるように、処置の１４日後、２８日後、および４２日後に剖検した。蛍光化合物であるカルセイン（２０ｍｇ／ｋｇ）とデメクロサイクリン（２０ｍｇ／ｋｇ）を、動的組織形態測定分析のために、それぞれ、剖検の９日前および２日前にマウスに腹腔内投与した。
【０１３５】
骨を、以下のように組織形態測定のために調製した。剖検時に、右大腿骨を取り外し、大腿骨の遠位４分の１について、脱水、メチルメタクリレートによる浸潤、およびメチルメタクリレートへの包埋からなる組織学的調製を行った。回転式ミクロトームを使用して、４μｍおよび８μｍの厚みの前頭切片のセットを得た。薄い方の切片をＧｏｌｄｎｅｒトリクロームで染色し、これを静的パラメーターの分析に使用した。一方、厚い方の切片は染色しないままマウントし、動的パラメーターの分析に使用した。組織形態測定を、ＯｓｔｅｏＭｅａｓｕｒｅ画像分析ソフトウェアを実行するビデオサブシステムに接続したＮｉｋｏｎ Ｅｃｌｉｐｓｅ Ｅ４０００光学／落射蛍光顕微鏡を用いて、処置について盲検様式で（ｔｒｅａｔｍｅｎｔ−ｂｌｉｎｄ ｍａｎｎｅｒ）行った。
【０１３６】
遠位大腿骨の組織形態測定分析は、ＡＬＫ３−Ｆｃの同化作用による効果と抗吸収効果の両方を明らかにした。ビヒクルと比較すると、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃは、３つの時点全てで、骨体積を最大９０％有意に増大させた（図２９）。重要なことは、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃが、骨の形成速度を１２０％程度増大させ（図３０）、そして骨石灰化表面を１１５％程度増大させた（図３１）ことである。これらの後者のパラメーターは同化作用による骨成長の指標であると考えられるが、同化作用による効果のさらなるマーカーである骨芽細胞表面と類骨表面は、より穏やかなまたは無視できる程度の増大を示した。組織形態測定分析はまた、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃが、２８日目にのみ破骨細胞の表面を有意に減少させた（図３２）ので、一時的な抗吸収性効果の証拠を提供し、同様の効果が浸食面でも観察された。
【０１３７】
骨の状態についての血清の生体マーカーに対するｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置の効果もまた調べた。ＲＡＮＫＬ（核因子−κＢリガンドの受容体活性化因子）は骨芽細胞により産生され、破骨細胞の分化についての重要な活性化因子である。一方、オステオプロテゲリン（ＯＰＧ）は、ＲＡＮＫＬシグナル伝達の内因性インヒビターである。したがって、ＲＡＮＫＬ／ＯＰＧ比は、破骨細胞の活性、骨量、および骨質の重要な決定要素である（Ｂｏｙｃｅら、２００８，Ａｒｃｈ Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｂｉｏｐｈｙｓ ４７３：１３９−１４６）。この実験では、ＲＡＮＫＬおよびＯＰＧの血清濃度を、Ｌｕｍｉｎｅｘ ｘＭＡＰ（登録商標）技術が組み込まれているＭｉｌｌｉｐｏｒｅ製品（ＭＢＮ２Ａ−４１ＫおよびＭＢＮ−４１Ｋ−１ＯＰＧ）で測定した。ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置により、３つの時点全てで、ビヒクルと比較して血清のＲＡＮＫＬレベルは有意に低下し（図３３）、そして２８日目および４２日目に、血清ＯＰＧレベルは有意に増大した（図３４）。これらの結果は、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置が、抗吸収作用を通じて骨の形成を一部刺激することを示している。
【０１３８】
（実施例７．マウスにおけるスクレロスチン遺伝子の発現に対するｍＡＬＫ３−ｍＦｃの効果）
スクレロスチンタンパク質は、骨の形成についての重要なネガティブ調節因子であり、スクレロスチンシグナル伝達の妨害が、インビボで骨に対して同化作用効果を発揮することが報告されている（Ｌｉら、２００９，Ｊ Ｂｏｎｅ Ｍｉｎｅｒ Ｒｅｓ ２４：５７８−５８８）。したがって、出願人らは、インビボでのｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置が、骨におけるスクレロスチン遺伝子の発現を変化させるかどうか、そしてこれにより、スクレロスチンレベルの低下がＡＬＫ３−Ｆｃの骨を再構築する作用の一部を媒介できる可能性があるかどうかを調べた。１２週齢の雌性Ｃ５７ＢＬ／６マウスを、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃまたはビヒクル（ＰＢＳ）で、週に２回の腹腔内注射により処置した。マウスのコホートを、両方の大腿骨と脛骨の収集ができるように、処置の２日後、７日後、１４日後、および２８日後に剖検した。大腿骨と脛骨を分離し、残っている筋肉または結合組織を全て除去した。
【０１３９】
スクレロスチン遺伝子の発現を以下のように分析した。骨を、内部骨髄幹（ｉｎｔｅｒｉｏｒ ｍａｒｒｏｗ ｓｈａｆｔ）を露出させるためにトリミングし、骨髄細胞を、３ｍＬの注射器に取り付けた２１ゲージ針を使用して、滅菌した生理食塩水で洗い流した。それぞれのマウス由来の大腿骨と脛骨を一緒に粉砕し、ＲＮＡを、製造業者の説明書にしたがってＲｉｂｏｐｕｒｅキット（Ａｍｂｉｏｎ）を用いて、得られた粉末から抽出した。骨試料中のＲＮＡの完全性を、製造業者の説明書にしたがってＡｇｉｌｅｎｔ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ ２１００ Ｂｉｏａｎａｌｙｚｅｒ上で行ったＲＮＡ Ｎａｎｏ Ｃｈｉｐｓ（Ａｇｉｌｅｎｔ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）により確認した。ＲＮＡから、ＴａｑＭａｎ ＲＴ試薬（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を使用して逆転写させ、リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）を、スクレロスチンプローブ／プライマーおよびＥｕｋａｒｙｏｔｉｃ １８Ｓ ｒＲＮＡ Ｅｎｄｏｇｅｎｏｕｓ Ｃｏｎｔｒｏｌ（いずれもＡｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓによる）を用いて行った。増幅は、Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ ７３００ Ｓｙｓｔｅｍを用いて行い、結果を２^{”−ΔΔＣｔ}法を使用して分析した。
【０１４０】
ビヒクルと比較して、ｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃでの処置は、調べた４つの時点のうちの３つで、骨のスクレロスチンｍＲＮＡのレベルを有意に低下させた（図３５）。この知見は、スクレロスチンの発現の低下が、骨に対するｍＡＬＫ３（２４−１５２）−ｍＦｃの同化作用効果および／または抗吸収効果に寄与している可能性があることを示している。
【０１４１】
（実施例８．マウスにおける骨の状態に対するｈＡＬＫ３−ｈＦｃの効果）
出願人らは、マウスにおける骨の状態に対するヒト構築物ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃの効果を調べた。１２週齢の雌性Ｃ５７ＢＬ／６マウス（１つのグループあたりｎ＝６）を、１０ｍｇ／ｋｇのｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃまたはビヒクル（Ｔｒｉｓ緩衝化生理食塩水）で、全部で６週間にわたる週に２回の腹腔内注射により処置した。実験の過程全体で、骨梁骨体積は、近位脛骨のマイクロＣＴ分析により決定すると、ビヒクルで処置した対照においてはおよそ２０％減少したが、ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃで処置した場合は８０％を上回って増大した（図３６）。研究結果によると、骨梁数（３４％）および骨梁の厚み（２０％）におけるベースラインからの有意な増大もまた、ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃを用いて観察されたが、ビヒクルを用いた場合には観察されなかった。研究結果によると、ビヒクルと比較して、ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃはＤＥＸＡにより決定すると、全身の骨ミネラル密度を有意に増大させた。ＤＥＸＡによる腰椎（Ｌ１−Ｌ６）の局所分析はまた、ビヒクルと比較した研究結果により、骨ミネラル密度に対するｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃの有意な刺激因子効果（２１％の増大）を明らかにした。
【０１４２】
これらの結果は、ヒト構築物ｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃはマウスにおいて骨の状態を改善することができることを示しているが、げっ歯類におけるその効果の大きさは、免疫応答により鈍ったと予想される。まとめると、上記知見は、ＡＬＫ３−Ｆｃ構築物が、１）身体軸骨格および四肢骨格の両方において、抗吸収作用と同化作用の両方により骨の形成を促進し、２）骨の機械的強度を改善し、そして３）確立された骨減少症のマウスモデルにおいてエストロゲンの不足により誘導された骨の減少を逆転させることを示している。
【０１４３】
（実施例９．例示的なｈＡＬＫ３−ｈＦｃ核酸およびタンパク質）
本実施例は、本明細書中に提供する方法にしたがい、ＣＨＯ細胞中でＡＬＫ３構築物を発現させるために使用した核酸構築物をまとめ、細胞培養物から単離した成熟タンパク質を提供する。
【０１４４】
Ａ．配列番号１９の核酸をＣＨＯ細胞中で発現させ、以下のＡＬＫ３−Ｆｃ種を単離した。
（１）グルタミン（Ｅｄｍａｎ分解によるＮ末端配列決定についてブロックされる傾向がある）で始まるｈＡＬＫ３（２４−１５２）−ｈＦｃ配列を配列番号７に示す。
（２）ｈＡＬＫ３（ＧＡ，２４−１５２）−ｈＦｃ配列を以下に示す（配列番号２０）。これは、リーダー配列由来の最初のグリシン−アラニンを保持している。
【０１４５】
【化６】

Ｂ．以下に示すｈＡＬＫ３（２４−１４６）−ｈＦｃをコードする核酸（配列番号２１）をＣＨＯ細胞中で発現させた。
【０１４６】
【化７】

【０１４７】
【化８】

以下のタンパク質種を単離した。
（１）グルタミン（Ｅｄｍａｎ分解によるＮ末端配列決定についてブロックされる傾向がある）で始まるｈＡＬＫ３（２４−１４６）−ｈＦｃを以下に示す（配列番号２２）。
【０１４８】
【化９】

【０１４９】
【化１０】

（２）リーダー配列由来の最初のグリシン−アラニンを保持しているｈＡＬＫ３（ＧＡ，２４−１４６）−ｈＦｃ配列を以下に示す（配列番号２３）。
【０１５０】
【化１１】

Ｃ．以下に示すｈＡＬＫ３（２４−１４０）−ｈＦｃをコードする核酸（配列番号２４）をＣＨＯ細胞中で発現させた。
【０１５１】
【化１２】

【０１５２】
【化１３】

以下のタンパク質種を単離した。
（１）グルタミン（Ｅｄｍａｎ分解によるＮ末端配列決定についてブロックされる傾向がある）で始まるｈＡＬＫ３（２４−１４０）−ｈＦｃを以下に示す（配列番号２５）。
【０１５３】
【化１４】

（２）リーダー配列由来の最初のグリシン−アラニンを保持しているｈＡＬＫ３（ＧＡ，２４−１４０）−ｈＦｃ配列を以下に示す（配列番号２６）。
【０１５４】
【化１５】

Ｄ．以下に示すｈＡＬＫ３（３０−１５２）−ｈＦｃをコードする核酸（配列番号２７）をＣＨＯ細胞中で発現させた。
【０１５５】
【化１６】

【０１５６】
【化１７】

以下のタンパク質種を単離した。
（１）リーダー配列由来の最初のグリシン−アラニンを保持しているｈＡＬＫ３（ＧＡ，３０−１５２）−ｈＦｃを以下に示す（配列番号２８）。
【０１５７】
【化１８】

（２）リーダー配列由来の最初のアラニンを保持しているｈＡＬＫ３（Ａ，３０−１５２）−ｈＦｃを以下に示す（配列番号２９）。
【０１５８】
【化１９】

【０１５９】
【化２０】

（３）リーダーと最初のロイシンが除去され、最初のヒスチジンが残っている（事実上ＮΔ７）、ｈＡＬＫ３（３１−１５２）−ｈＦｃ配列を以下に示す（配列番号３０）。
【０１６０】
【化２１】

（４）以下に示すさらなる種であるｈＡＬＫ３（３０−１５２）−ｈＦｃが予想された（配列番号３１）が、Ｎ末端配列決定によっては同定されなかった。
【０１６１】
【化２２】

Ｅ．以下に示すｈＡＬＫ３（３０−１４６）−ｈＦｃをコードする核酸（配列番号３２）をＣＨＯ細胞中で発現させた。
【０１６２】
【化２３】

【０１６３】
【化２４】

以下のタンパク質を単離した。
（１）リーダー配列由来の最初のグリシン−アラニンを保持しているｈＡＬＫ３（ＧＡ，３０−１４６）−ｈＦｃを以下に示す（配列番号３３）。
【０１６４】
【化２５】

【０１６５】
【化２６】

（２）リーダー配列由来の最初のアラニンを保持しているｈＡＬＫ３（Ａ，３０−１４６）−ｈＦｃを以下に示す（配列番号３４）。
【０１６６】
【化２７】

（３）リーダーと最初のロイシンが除去されており、最初のヒスチジンが残っている（事実上、ＮΔ７ＣΔ６）、ｈＡＬＫ３（３１−１４６）−ｈＦｃ配列を以下に示す（配列番号３５）。
【０１６７】
【化２８】

（４）以下に示すさらなる種であるｈＡＬＫ３（３０−１４６）−ｈＦｃ（配列番号３６）が予想されたが、Ｎ末端配列決定によっては同定されなかった。
【０１６８】
【化２９】

Ｆ．以下に示すｈＡＬＫ３（３０−１４０）−ｈＦｃをコードする核酸（配列番号３７）をＣＨＯ細胞中で発現させることができる。
【０１６９】
【化３０】

【０１７０】
【化３１】

以下のタンパク質種を単離することができる。
（１）リーダー配列由来の最初のグリシン−アラニンを保持しているｈＡＬＫ３（ＧＡ，３０−１４０）−ｈＦｃを以下に示す（配列番号３８）。
【０１７１】
【化３２】

（２）リーダー配列由来の最初のアラニンを保持しているｈＡＬＫ３（Ａ，３０−１４０）−ｈＦｃを以下に示す（配列番号３９）。
【０１７２】
【化３３】

（３）リーダー配列と最初のロイシンが除去されており、最初のヒスチジンが残っている（事実上、ＮΔ７ＣΔ１２）、ｈＡＬＫ３（３１−１４０）−ｈＦｃ配列を以下に示す（配列番号４０）。
【０１７３】
【化３４】

（４）さらなる種であるｈＡＬＫ３（３０−１４０）−ｈＦｃを以下に示す（配列番号４１）。
【０１７４】
【化３５】

（引用による組み込み）
本明細書中で言及した全ての刊行物および特許は、それぞれの個々の刊行物または特許が具体的かつ個別に引用により本明細書中に組み入れらていることが示されているかのように、それらの全体が引用により本明細書中に組み入れられる。
【０１７５】
本発明の事項の具体的な実施形態が議論されてきたが、上記詳細は説明であり、限定ではない。多くのバリエーションが、本明細書の概要および以下の特許請求の範囲を参照して、当業者に明らかであろう。本発明の完全な範囲は、そのようなバリエーションとともに、等価物および詳細についてのそれらの全範囲とともに、特許請求の範囲を参照することにより決定されるべきである。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号７のアミノ酸配列を含むポリペプチド。
【請求項２】
サイズ排除クロマトグラフィーにより決定すると、タンパク質不純物に関して少なくとも９５％純粋である、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項３】
ＢＭＰ２またはＢＭＰ４について１０^−８Ｍを超えない解離定数を示す、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項４】
配列番号７のアミノ酸配列に対して少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチド。
【請求項５】
グリコシル化されている、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項６】
動物において骨形成を刺激するかまたは骨ミネラル密度を増大させる、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項７】
ＣＨＯ細胞中での発現により産生された、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項８】
請求項１に記載のポリペプチドを２つ含むホモ二量体。
【請求項９】
請求項１に記載のポリペプチドを含む薬学的調製物。
【請求項１０】
実質的に発熱物質を含まない、請求項９に記載の薬学的調製物。
【請求項１１】
請求項１に記載のポリペプチドのコード配列を含む、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１２】
配列番号１２の配列を含む、請求項１１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１３】
請求項１１に記載のポリヌクレオチドに対して作動可能であるように連結されたプロモーター配列を含む、組換えポリヌクレオチド。
【請求項１４】
請求項１１に記載の組換えポリヌクレオチドで形質転換した細胞。
【請求項１５】
哺乳動物細胞である、請求項１４に記載の細胞。
【請求項１６】
ＣＨＯ細胞またはヒト細胞である、請求項１５に記載の細胞。
【請求項１７】
ＡＬＫ３ポリペプチドを作製する方法であって：
ａ）可溶性ＡＬＫポリペプチドの発現に適している条件下で細胞を培養する工程であって、ここで、前記細胞は請求項１１に記載の組換えポリヌクレオチドで形質転換されている、工程；および
ｂ）そのように発現させたＢＭＰ結合性ＡＬＫ３ポリペプチドを収集する工程
を含む、方法。
【請求項１８】
骨成長を促進するため、骨密度を増大させるため、または骨強度を高めるための方法であって：
ａ）配列番号３に対して少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
ｂ）配列番号３から選択される少なくとも５０個の連続するアミノ酸を含むポリペプチド；
ｃ）ＢＭＰ２に結合し、ＢＭＰ２とＡＬＫ３との間での相互作用を阻害する抗体；
ｄ）ＢＭＰ４に結合し、ＢＭＰ４とＡＬＫ３との間での相互作用を阻害する抗体；ならびに、
ｅ）ＡＬＫ３に結合し、ＡＬＫ３とＡＬＫ３の１つまたは複数のリガンドとの間での相互作用を阻害する抗体
からなる群より選択される、有効量のＢＭＰアンタゴニストまたはＡＬＫ３アンタゴニストを被験体に投与する工程を含む、方法。
【請求項１９】
前記部（ａ）または（ｂ）のポリペプチドが、以下の特徴：
ｉ）少なくとも１０^−７ＭのＫ_ＤでＡＬＫ３リガンドに対して結合する；および
ｉｉ）細胞中でＡＬＫ３シグナル伝達を阻害する
のうちの１つまたは複数を有する、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
前記ポリペプチドが、ＡＬＫ３ポリペプチドドメインに加えて、インビボでの安定性、インビボでの半減期、取り込み／投与、組織局在性もしくは組織分布、タンパク質複合体の形成、および／または精製のうちの１つまたは複数を増強する１つまたは複数のポリペプチド部分を含む融合タンパク質である、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
前記融合タンパク質が、免疫グロブリンＦｃドメインおよび血清アルブミンからなる群より選択されるポリペプチド部分を含む、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
前記部（ａ）または（ｂ）のポリペプチドが、グリコシル化アミノ酸、ＰＥＧ化アミノ酸、ファルネシル化アミノ酸、アセチル化アミノ酸、ビオチニル化アミノ酸、脂質部分結合体化アミノ酸、および有機誘導化剤結合体化アミノ酸から選択される１つまたは複数の修飾されたアミノ酸残基を含む、請求項１８に記載の方法。
【請求項２３】
骨に関連する障害を処置するための方法であって、投与の必要がある被験体に、有効量のＢＭＰアンタゴニストまたはＡＬＫ３アンタゴニストを投与する工程を含む、方法。
【請求項２４】
前記ＢＭＰアンタゴニストまたはＡＬＫ３アンタゴニストが：
ａ）配列番号３に対して少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
ｂ）配列番号３から選択される少なくとも５０個の連続するアミノ酸を含むポリペプチド；
ｃ）ＢＭＰ２に結合し、ＢＭＰ２とＡＬＫ３との間での相互作用を阻害する抗体；
ｄ）ＢＭＰ４に結合し、ＢＭＰ４とＡＬＫ３との間での相互作用を阻害する抗体；ならびに、
ｅ）ＡＬＫ３に結合し、ＡＬＫ３とＡＬＫ３の１つまたは複数のリガンドとの間での相互作用を阻害する抗体
からなる群より選択される、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
前記部（ａ）または（ｂ）のポリペプチドが、以下の特徴：
ｉ）少なくとも１０^−７ＭのＫ_ＤでＡＬＫ３リガンドに対して結合する；および
ｉｉ）細胞中でＡＬＫ３シグナル伝達を阻害する
のうちの１つまたは複数を有する、請求項２４に記載の方法。
【請求項２６】
前記部（ａ）または（ｂ）のポリペプチドが、ＡＬＫ３ポリペプチドドメインに加えて、インビボでの安定性、インビボでの半減期、取り込み／投与、組織局在性もしくは組織分布、タンパク質複合体の形成、および／または精製のうちの１つまたは複数を増強する１つまたは複数のポリペプチド部分を含む融合タンパク質である、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
前記融合タンパク質が、免疫グロブリンＦｃドメインおよび血清アルブミンからなる群より選択されるポリペプチド部分を含む、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
前記部（ａ）または（ｂ）のポリペプチドが、グリコシル化アミノ酸、ＰＥＧ化アミノ酸、ファルネシル化アミノ酸、アセチル化アミノ酸、ビオチニル化アミノ酸、脂質部分結合体化アミノ酸、および有機誘導化剤結合体化アミノ酸から選択される１つまたは複数の修飾されたアミノ酸残基を含む、請求項２３に記載の方法。
【請求項２９】
前記骨に関連する障害が、原発性骨粗鬆症および二次性骨粗鬆症からなる群より選択される、請求項２３に記載の方法。
【請求項３０】
前記骨に関連する障害が、閉経後の骨粗鬆症、性腺機能低下による骨の減少、腫瘍による骨の減少、がん治療による骨の減少、骨転移、多発性骨髄腫、およびパジェット病からなる群より選択される、請求項２３に記載の方法。
【請求項３１】
第２の骨活性物質を投与する工程をさらに含む、請求項２３に記載の方法。
【請求項３２】
前記骨活性物質が、ビスホスホネート、エストロゲン、選択的エストロゲン受容体調節因子、副甲状腺ホルモン、カルシトニン、カルシウムサプリメント、およびビタミンＤサプリメントからなる群より選択される、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
配列番号１１、１４、２０、２２、２３、２５、２６、２８、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３６、３８、３９、４０、および４１からなる群より選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含む、ポリペプチド。
【請求項３４】
前記アミノ酸配列が、配列番号１１、１４、２０、２２、２３、２５、２６、２８、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３６、３８、３９、４０、および４１からなる群より選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも９７％同一である、請求項３３に記載のポリペプチド。
【請求項３５】
前記アミノ酸配列が、配列番号１１、１４、２０、２２、２３、２５、２６、２８、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３６、３８、３９、４０、および４１からなる群より選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも９８％同一である、請求項３３に記載のポリペプチド。
【請求項３６】
前記アミノ酸配列が、配列番号１１、１４、２０、２２、２３、２５、２６、２８、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３６、３８、３９、４０、および４１からなる群より選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも９９％同一である、請求項３３に記載のポリペプチド。
【請求項３７】
前記アミノ酸配列が、配列番号１１、１４、２０、２２、２３、２５、２６、２８、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３６、３８、３９、４０、および４１からなる群より選択されるアミノ酸配列である、請求項３３に記載のポリペプチド。
【請求項３８】
配列番号１１、１４、２０、２２、２３、２５、２６、２８、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３６、３８、３９、４０、および４１からなる群より選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列からなる、請求項３３に記載のポリペプチド。
【請求項３９】
配列番号１１、１４、２０、２２、２３、２５、２６、２８、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３６、３８、３９、４０、および４１からなる群より選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも９７％同一であるアミノ酸配列からなる、請求項３３に記載のポリペプチド。
【請求項４０】
配列番号１１、１４、２０、２２、２３、２５、２６、２８、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３６、３８、３９、４０、および４１からなる群より選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも９８％同一であるアミノ酸配列からなる、請求項３３に記載のポリペプチド。
【請求項４１】
配列番号１１、１４、２０、２２、２３、２５、２６、２８、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３６、３８、３９、４０、および４１からなる群より選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列からなる、請求項３３に記載のポリペプチド。
【請求項４２】
配列番号１１、１４、２０、２２、２３、２５、２６、２８、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３６、３８、３９、４０、および４１からなる群より選択されるアミノ酸配列からなる、請求項３３に記載のポリペプチド。
【請求項４３】
グリコシル化されている、請求項３３に記載のポリペプチド。
【請求項４４】
動物において骨形成を刺激するかまたは骨ミネラル密度を増大させる、請求項３３に記載のポリペプチド。
【請求項４５】
ＣＨＯ細胞中での発現により産生された、請求項３３に記載のポリペプチド。
【請求項４６】
請求項３３に記載のポリペプチドを２つ含むホモ二量体。
【請求項４７】
請求項３３に記載のポリペプチドまたは請求項４６に記載のホモ二量体、および、薬学的に許容され得る賦形剤を含む、薬学的調製物。
【請求項４８】
実質的に発熱物質を含まない、請求項４７に記載の薬学的調製物。
【請求項４９】
配列番号１２、１５、１９、２１、２４、２７、３２、および３７の任意の核酸の相補物に対して、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする、単離された核酸。
【請求項５０】
請求項４９に記載の単離された核酸配列を含む細胞。
【請求項５１】
ＣＨＯ細胞である、請求項５０に記載の細胞。
【請求項５２】
ヒトＡＬＫ３の細胞外ドメイン由来の第１のアミノ酸配列および異種アミノ酸配列を含むポリペプチドであって、ここで、前記第１のアミノ酸配列は、配列番号１の２５位〜３１位のいずれかで始まり、配列番号１の１４０位〜１５２位のいずれかで終わる配列からなる、ポリペプチド。
【請求項５３】
前記異種アミノ酸配列が抗体の定常ドメインを含む、請求項５２に記載のポリペプチド。
【請求項５４】
前記異種アミノ酸配列がＩｇＧのＦｃドメインを含む、請求項５２に記載のポリペプチド。
【請求項５５】
前記ＩｇＧがヒトＩｇＧ１である、請求項５４に記載のポリペプチド。
【請求項５６】
骨成長を促進するため、骨密度を増大させるため、または骨強度を高めるための方法であって、配列番号３のアミノ酸８〜１１７のアミノ酸配列に対して少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含む有効量のポリペプチドを被験体に投与する工程を含む、方法。
【請求項５７】
前記ポリペプチドが、以下の特徴：
ｉ）少なくとも１０^−７ＭのＫ_ＤでＡＬＫ３リガンドに対して結合する；および
ｉｉ）細胞中でＡＬＫ３シグナル伝達を阻害する
のうちの１つまたは複数を有する、請求項５６に記載の方法。
【請求項５８】
前記ポリペプチドが、ヒトＢＭＰ６と実質的には結合しない、請求項５６に記載の方法。
【請求項５９】
前記ポリペプチドが、ヒトＢＭＰ７と実質的には結合しない、請求項５６に記載の方法。
【請求項６０】
前記ポリペプチドが、ＡＬＫ３ポリペプチドドメインに加えて、インビボでの安定性、インビボでの半減期、取り込み／投与、組織局在性もしくは組織分布、タンパク質複合体の形成、および／または精製のうちの１つまたは複数を増強する１つまたは複数のポリペプチド部分を含む融合タンパク質である、請求項５６に記載の方法。
【請求項６１】
前記融合タンパク質が、免疫グロブリンＦｃドメインおよび血清アルブミンからなる群より選択されるポリペプチド部分を含む、請求項６０に記載の方法。
【請求項６２】
前記ポリペプチドが、グリコシル化アミノ酸、ＰＥＧ化アミノ酸、ファルネシル化アミノ酸、アセチル化アミノ酸、ビオチニル化アミノ酸、脂質部分結合体化アミノ酸、および有機誘導化剤結合体化アミノ酸から選択される１つまたは複数の修飾されたアミノ酸残基を含む、請求項５６に記載の方法。
【請求項６３】
骨に関連する障害を処置するための方法であって、投与の必要がある被験体に、配列番号３のアミノ酸８〜１１７のアミノ酸配列に対して少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含む有効量のポリペプチドを投与する工程を含む、方法。
【請求項６４】
前記部（ａ）または（ｂ）のポリペプチドが、以下の特徴：
ｉ）少なくとも１０^−７ＭのＫ_ＤでＡＬＫ３リガンドに対して結合する；および
ｉｉ）細胞中でＡＬＫ３シグナル伝達を阻害する
のうちの１つまたは複数を有する、請求項６３に記載の方法。
【請求項６５】
前記ポリペプチドが、配列番号３のアミノ酸８〜１１７のアミノ酸配列に対して同一であるアミノ酸配列を含む、請求項６３に記載の方法。
【請求項６６】
前記ポリペプチドが、インビボでの安定性、インビボでの半減期、取り込み／投与、組織局在性もしくは組織分布、タンパク質複合体の形成、および／または精製のうちの１つまたは複数を増強する１つまたは複数のポリペプチド部分を含む融合タンパク質である、請求項６３に記載の方法。
【請求項６７】
前記融合タンパク質が、免疫グロブリンＦｃドメインおよび血清アルブミンからなる群より選択されるポリペプチド部分を含む、請求項６６に記載の方法。
【請求項６８】
前記ポリペプチドが、グリコシル化アミノ酸、ＰＥＧ化アミノ酸、ファルネシル化アミノ酸、アセチル化アミノ酸、ビオチニル化アミノ酸、脂質部分結合体化アミノ酸、および有機誘導化剤結合体化アミノ酸から選択される１つまたは複数の修飾されたアミノ酸残基を含む、請求項６３に記載の方法。
【請求項６９】
前記骨に関連する障害が、原発性骨粗鬆症および二次性骨粗鬆症からなる群より選択される、請求項６３に記載の方法。
【請求項７０】
前記骨に関連する障害が、骨の痛み、閉経後の骨粗鬆症、性腺機能低下による骨の減少、腫瘍による骨の減少、がん治療による骨の減少、骨転移、多発性骨髄腫、およびパジェット病からなる群より選択される、請求項６３に記載の方法。
【請求項７１】
第２の骨活性物質を投与する工程をさらに含む、請求項６３に記載の方法。
【請求項７２】
前記骨活性物質が、ビスホスホネート、エストロゲン、選択的エストロゲン受容体調節因子、副甲状腺ホルモン、カルシトニン、カルシウムサプリメント、およびビタミンＤサプリメントからなる群より選択される、請求項７１に記載の方法。
【請求項７３】
（ａ）ＢＭＰアンタゴニストまたはＡＬＫ３アンタゴニスト；および
（ｂ）第２の骨活性物質
を含む、薬学的調製物。
【請求項７４】
骨成長を促進するか、または骨密度を増大させる物質を同定する方法であって：
ａ）ＡＬＫ３ポリペプチドのリガンド結合ドメインに対して、ＢＭＰアンタゴニストまたはＡＬＫ３アンタゴニストのポリペプチドと競合的に結合する試験物質を同定する工程；および
ｂ）組織の増殖に対する前記物質の効果を評価する工程を含む、方法。
【請求項７５】
骨に関連する障害の処置用の医薬品を作製するための、ＢＭＰアンタゴニストまたはＡＬＫ３アンタゴニストのポリペプチドの使用。
【請求項７６】
骨に関連する障害を予防するための方法であって、投与の必要がある被験体に対して、有効量のＢＭＰアンタゴニストまたはＡＬＫ３アンタゴニストを投与する工程を含む、方法。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【図６】

【図７】

【図８】

【図９−１】

【図９−２】

【図１０】

【図１１−１】

【図１１−２】

【図１２】

【図１３】

【図１４】

【図１５】

【図１６】

【図１７】

【図１８】

【図１９】

【図２０】

【図２１】

【図２２】

【図２３】

【図２４】

【図２５】

【図２６】

【図２７】

【図２８】

【図２９】

【図３０】

【図３１】

【図３２】

【図３３】

【図３４】

【図３５】

【図３６】

【公表番号】特表２０１２−５２２５０７（Ｐ２０１２−５２２５０７Ａ）
【公表日】平成２４年９月２７日（２０１２．９．２７）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１２−５０３６３３（Ｐ２０１２−５０３６３３）
【出願日】平成２２年３月３０日（２０１０．３．３０）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２０１０／０２９２８２
【国際公開番号】ＷＯ２０１０／１１４８６０
【国際公開日】平成２２年１０月７日（２０１０．１０．７）
【出願人】（５０９１２５４７５）アクセルロン　ファーマ，　インコーポレイテッド (21)
【Ｆターム（参考）】