癌性腫瘍は、化学療法剤に対する応答が極めて多様である。現在、投与の間または投与後に、化学療法レジメンに対する腫瘍の応答性のレベルを確実に評価することは難しい。化学療法剤に対する腫瘍の感受性のバイオマーカーはこれまでのところわかっていない。そのようなバイオマーカーは、非応答性の患者の同定を促進し、そしてこのような患者は、他のおそらくより有効なレジメンへと変更される可能性がある。本発明は、化学療法剤に対する腫瘍の応答性を測定するための方法を提供し、本方法において、RNAが化学療法の前、間、および後に患者の腫瘍細胞から単離される。RNAの品質は、キャピラリー電気泳動およびRNA完全性の数値（RIN）の割り当てによって測定することができる。化学療法の間および／または後のRIN値は、腫瘍の応答性レベルに反比例する。腫瘍RINは、化学療法に対する腫瘍応答性の容易にアクセスできるバイオマーカーである。腫瘍RINはまた、化学療法レジメンの有効性を評価するためにも用いられてよい。

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【課題】被検試料中に混入している細菌、特に有胞子好気性細菌を、簡便な操作で、迅速かつ正確に判定することができる細菌検出器具、細菌検出方法および細菌検出キットを提供する。
【解決手段】本発明にかかる細菌検出器具は、対象となる有胞子好気性細菌が属する属または種に特異的な塩基配列に基づくオリゴヌクレオチドが、基板に固定されたマイクロアレイ型の器具である。被検試料から調製したプローブと、上記基板に固定されたオリゴヌクレオチドとのハイブリダイゼーションの成立の有無により、被検試料中の有胞子好気性細菌を簡便、迅速かつ正確に検出・同定することができる。 （もっと読む）

マラリア流行地域における実地診療に貢献できるヒト検体中の特定のプラスモジウム属原虫、および４種のマラリアの有無について、簡便で、迅速な検出・識別法、さらにはマラリア対策支援システム、マラリア感染予防・治療対策システムを提供する。ヒトに感染する４種類のプラスモジウム属原虫が一度に検出可能な属特異的プライマーセット及び４種の原虫種(熱帯熱マラリア原虫、三日熱マラリア原虫、四日熱マラリア原虫、および卵形マラリア原虫)特異的プライマーセットを用いれば、これらの感染の有無を簡便、迅速に検出、識別し得る。 （もっと読む）

【課題】皮膚疾患の原因となる真菌を同定する方法を提供する。
【解決手段】複数種類の真菌に共通する、１８Ｓ、２３ＳリボソーマルＲＮＡ配列、またはＩＴＳ領域に基づくプライマーを用いて、同一条件で同時にＰＣＲ法による核酸増幅処理をした後、各真菌に特異的なプローブを用いて、同一条件で同時にハイブリダイゼーションを行い、各プローブのハイブリダイゼーションの強弱から、各真菌の存在有無を判断する、真菌菌種同定方法。 （もっと読む）

【課題】マルチプレックス化PCR法のバランスをとる方法を提供する。
【解決手段】プライマー制限の代替法として、単一試験管において2以上の時間的に連続するPCR段階を用い、2以上のPCR反応を効果的に分離して、第一の増幅段階および第二の増幅段階中、第一のプライマーセットによる第一のアンプリコン産生、および第二のプライマーセットによる第二のアンプリコン産生の相対率を変調する。手術中診断および予後において、例えば前哨（sentinel）リンパ節における癌胎児抗原（CEA）の発現レベルを決定することによって、悪性食道腺癌を診断する際に、特定の使用を見出す、迅速RT-PCR法もまた、提供する。 （もっと読む）

病原体から単離されるリボソームからのタンパク質翻訳に基づく、病原体を同定するための方法及び装置を提供する。
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【課題】食品より抽出したDNAについて、広範囲の動物群由来DNAの検出方法を提供する。
【解決手段】特定の塩基配列を有するプライマーを用いて、PCR法により棘皮動物、節足動物、軟体動物及び脊椎動物からなる動物群DNAを増幅させることができる。また、該塩基配列を有するプライマーを用いることで、さらに環形動物を加えた動物群DNAを増幅させることができる。この増幅産物であるDNA断片を電気泳動あるいは、融解曲線分析によって上記動物由来のDNAの存在を確認する。 （もっと読む）

本発明は、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａの種特異的検出のための組成物、方法及びキットを提供する。本発明の一態様によれば、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ転写媒介性増幅アッセイ用組成物が提供される。この組成物は、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３ｓ ｒＲＮＡ参照配列（受託番号Ｖ００３３１）の塩基約７２５〜８２５に対応するＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ ２３ｓ ｒＲＮＡの領域中の配列の相補配列を標的にするＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドと、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３ｓ ｒＲＮＡの塩基約８４５〜９５０に対応するＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ ２３ｓ ｒＲＮＡの領域中の配列を標的にする非Ｔ７プライマーオリゴヌクレオチドとを含む。
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【課題】ノープリウス幼生期及びキプリス幼生期のアカフジツボを簡易に検出・定量する。
【解決手段】被験試料に対し特定の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含むアカフジツボ検出用プライマーセットを用いてＰＣＲを行い、被験試料の遺伝子増幅が生じたか否かにより被験試料にアカフジツボ幼生が存在していたか否かを判定する。また、アカフジツボ幼生個体数が既知の複数の試料それぞれに対し上記プライマーセットを用いてリアルタイムＰＣＲを行うことによりアカフジツボ幼生個体数とＣｔ値との関係を調べて予め作成された検量線を作成し、被験試料に対し上記プライマーセットを用いてリアルタイムＰＣＲを行うことにより得られる被験試料のＣｔ値から被験試料中のアカフジツボ幼生個体数の定量を行う。 （もっと読む）

ｐｒｅＱ_１リボスイッチは、抗生物質および他の小分子療法の標的である。ｐｒｅＱ_１リボスイッチおよびその一部を使用して、ＲＮＡ分子ならびに他のエレメントおよび分子の発現または機能を調節することができる。ｐｒｅＱ_１リボスイッチおよびその一部を、例えば、化合物を同定または検出するための種々の他の方法で使用することができる。化合物を使用して、ｐｒｅＱ_１リボスイッチを刺激、活性化、阻害、および／または不活化することができる。ｐｒｅＱ_１リボスイッチおよびその一部のみおよび他の核酸と組み合わせて、種々の構築物およびＲＮＡ分子で使用することができ、核酸によってコードすることができる。 （もっと読む）

【課題】テレフタル酸含有廃水処理において微生物を検出または定量するためのプライマーセット、それを用いた微生物量のモニタリング方法およびメタン発酵効率を評価する方法を提供すること。
【解決手段】テレフタル酸含有廃水処理において、特定の３種類の微生物を検出または定量するための３組のプライマーセットが提供され、これらのプライマーを用いて、上記微生物の１６Ｓ ｒＤＮＡ量を測定してモニタリングを行い、メタン発酵効率を評価する。 （もっと読む）

【課題】子実体の形態によらない、毒きのこ（クサウラベニタケ及びドクササコ）の迅速かつ特異的な検出法の開発が望まれていた。
【解決手段】毒きのこ（クサウラベニタケ (Entoloma rhodopolius)及びドクササコ （Clitocybe acromelalga））のリボソームＲＮＡ遺伝子の一部を含むＤＮＡ、クサウラベニタケ又はドクササコに特異的な配列を有するＤＮＡプライマー及びプローブ、それらを用いたＰＣＲ法、ＤＮＡマイクロアレイなどの遺伝子関連技術を用いることで、子実体の形態によらない、迅速かつ特異的な毒きのこの検出法を提供する。 （もっと読む）

【課題】ヒトおよび動物の感染症起因菌の迅速な同定のために、選択した６２菌種を対象として、目的とする各細菌の16S rRNA遺伝子配列を、効率よく増幅することのできるプライマー、またはプライマーセットを提供する。
【解決手段】Staphylococcus属、Streptococcus属、Enterococcus属、Pseudomonas属等の、各細菌の16S rRNA遺伝子中の、特定の塩基配列を含む、細菌ゲノム増幅反応用プライマー、およびそのセット。さらに、それらを含む細菌同定用キット、および該キットを用いる細菌検出方法。 （もっと読む）

【課題】塩化ビニルを分解する能力を有する微生物を、簡便に検出することのできる方法の提供。
【解決手段】塩素化エチレン分解細菌 Dehalococcoidesの、特定の塩基配列を有する１６ｓ ｒＤＮＡの一部を鋳型としてＰＣＲを行ない、その産物の融解曲線分析を行う工程を有する、該細菌の塩化ビニル分解能の判定方法及び上記ＰＣＲプライマー用オリゴヌクレオチドを含む判定用キット。更に土壌等の試料に上記方法を適用する汚染土壌等浄化手段の決定方法。 （もっと読む）

【課題】正常なＰＣＲ反応系や後工程へ影響を与えることなくＰＣＲ反応の阻害要因を排除して、初期標的核酸量が稀少な場合でも増幅効率の高いＰＣＲ増幅方法を提供すること。
【解決手段】標的核酸を増幅するためのＰＣＲ方法であって、前記標的核酸を鋳型とするＰＣＲ反応を補助核酸の存在下で行い、前記補助核酸が、前記標的核酸及びプライマーと相補性及び相同性を有さないことを特徴とする標的核酸増幅方法。 （もっと読む）

【課題】被験試料中のナイセリア属に属する細菌（淋菌、髄膜炎菌）の検出を可能とする、前記細菌の核酸を増幅するのに有用なオリゴヌクレオチドを提供する。
【解決手段】特定の配列を有する増幅オリゴヌクレオチド、および核酸増幅条件下で、ナイセリア属細菌に由来する核酸と前記オリゴヌクレオチドとの間に形成される核酸ハイブリッドを含む組成物、および特定の配列を有し、ＲＮＡポリメラーゼにより認識されるかまたはＲＮＡポリメラーゼによる開始または伸長を促進する５’配列を随意に含む２つのオリゴヌクレオチドを含むキット。 （もっと読む）

【課題】病原性細菌の種または属による分類を目的に、株を問わず同じ属の菌であれば一括検出が可能で、かつ、他の属の菌種の細菌は区別して検出できるような、アシネトバクター属菌の遺伝子を検出するための、核酸プローブを提供する。
【解決手段】感染症起炎菌であるアシネトバクター属菌の遺伝子を検出するための、特定の配列ならびにそれらの相補配列のいずれか１つ、あるいはその２以上の組み合わせをプローブとして使用する。 （もっと読む）

本発明は、蛍光インサイチューハイブリダイゼーション及びチップ技術のための核酸標識に関する。 （もっと読む）

【課題】食品を汚染する可能性のある種々の細菌群について、特定の種や株に限定されることなく、包括的に菌叢の評価を実施するための簡便かつ迅速な方法を提供することを目的とする。
【解決手段】コリネバクテリウム属細菌、ミクロコッカス属細菌、ロイコノストック属細菌、腸内細菌科細菌、シュードモナス属細菌、バチルス属細菌およびスタフィロコッカス属細菌を特異的に検出するためのプライマーを用いた、食品中における菌叢の評価方法。 （もっと読む）

【課題】環境汚染物質、特に石油あるいは石油中の多環芳香族炭化水素を有効に分解無害化するための手段を提供して汚染環境を浄化する。また、汚染環境のモニタリング、評価等を簡便迅速に行うための手段を提供する。
【解決手段】Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ属に属する新規微生物を単離し、該微生物を用いて上記環境汚染物質を分解、浄化する。また、該新種微生物の１６Ｓ ｒＤＮＡ／ＲＮＡから調製したプローブを用いて 環境汚染物質分解能を有する細菌の検出・定量を簡便迅速に行うとともに、汚染環境のモニタリング、評価を行う。 （もっと読む）