【課題】癌（特に肺癌）の治療および診断のための組成物および方法を提供する。
【解決手段】１つ以上の肺腫瘍ポリペプチド、その免疫原性部分、このようなポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、このようなポリペプチドを発現する抗原提示細胞、そしてこのようなポリペプチドを発現する細胞に特異的なＴ細胞を含む組成物、及び該組成物を用いた疾患（特に肺癌）の診断、予防および／または処置方法を提供する。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
動物において免疫応答を誘導する方法であって、以下の工程：
ａ）肺癌腫ポリヌクレオチドの免疫原性部分を少なくともコードするポリヌクレオチドを含む組成物を提供する工程であって、該ポリヌクレオチドは、配列番号３４７と少なくとも９０％の同一性を有する、工程；
ｂ）該ポリヌクレオチドを投与する、工程；および
ｃ）それによって動物において免疫応答を誘導する工程、
を包含する、方法。
【請求項２】
請求項１に記載の方法であって、前記組成物は、生理学的に受容可能なキャリアまたはアジュバンドからなる群から選択される成分をさらに含む、方法。
【請求項３】
前記肺癌腫ポリヌクレオチドが、ウイルスベースの送達系によって送達される、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記ウイルスベースの送達系が、アデノウイルスである、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
前記誘導される免疫応答が、ＣＤ４＋Ｔヘルパー応答である、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記誘導される免疫応答が、ＣＤ８＋細胞傷害性Ｔリンパ球応答である、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記誘導される免疫応答が、ＣＤ４＋Ｔヘルパー免疫応答およびＣＤ８＋細胞傷害性Ｔリンパ球免疫応答の両方である、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
単離されたポリヌクレオチドであって、以下：
（ａ）配列番号３５１、３５３、３５８、３６２、３６４、３６６、３６８、３７０〜３７５、４２０、４２４、４２８、４３１、４３４、４４２、４４７、４５０および４６７で提供される配列；
（ｂ）配列番号３５１、３５３、３５８、３６２、３６４、３６６、３６８、３７０〜３７５、４２０、４２４、４２８、４３１、４３４、４４２、４４７、４５０および４６７で提供される配列の相補体；
（ｃ）配列番号３５１、３５３、３５８、３６２、３６４、３６６、３６８、３７０〜３７５、４２０、４２４、４２８、４３１、４３４、４４２、４４７、４５０および４６７で提供される配列の少なくとも１０個連続した残基からなる配列。
（ｄ）高度にストリンジェントな条件下において配列番号３５１、３５３、３５８、３６２、３６４、３６６、３６８、３７０〜３７５、４２０、４２４、４２８、４３１、４３４、４４２、４４７、４５０および４６７で提供される配列にハイブリダイズする配列；
（ｅ）配列番号３５１、３５３、３５８、３６２、３６４、３６６、３６８、３７０〜３７５、４２０、４２４、４２８、４３１、４３４、４４２、４４７、４５０および４６７の配列と少なくとも７５％の同一性を有する配列；
（ｆ）配列番号３５１、３５３、３５８、３６２、３６４、３６６、３６８、３７０〜３７５、４２０、４２４、４２８、４３１、４３４、４４２、４４７、４５０および４６７の配列と少なくとも９０％の同一性を有する配列；
（ｇ）配列番号３５１、３５３、３５８、３６２、３６４、３６６、３６８、３７０〜３７５、４２０、４２４、４２８、４３１、４３４、４４２、４４７、４５０および４６７で提供される配列の変性改変体、
からなる群から選択される配列を含む、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項９】
単離されたポリペプチドであって、以下：
（ａ）配列番号３５２、３５４、３５７、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７６〜３８２、３８７〜４１９、４２３、４２７、４３０、４３３、４４１、４４３、４４６、４４９、４５１〜４６６および４６９で提供される配列のいずれか１つのアミノ酸配列を有するポリペプチドと少なくとも９０％の同一性を有する配列；
（ｂ）請求項８に記載のポリヌクレオチドによってコードされる配列；
（ｃ）請求項８に記載のポリヌクレオチドによってコードされる配列と少なくとも７０％の同一性を有する配列；および
（ｄ）請求項８に記載のポリヌクレオチドによってコードされる配列と少なくとも９０％の同一性を有する配列、
からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチド。
【請求項１０】
発現制御配列に作動可能に連結される請求項８に記載のポリヌクレオチドを含む、発現ベクター。
【請求項１１】
請求項１０に記載の発現ベクターで形質転換またはトランスフェクトされる、宿主細胞。
【請求項１２】
請求項９に記載のポリペプチドに特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項１３】
患者における癌の存在を検出する方法であって、以下の工程：
（ａ）該患者から生物学的サンプルを得る工程；
（ｂ）該生物学的サンプルと請求項９に記載のポリペプチドに結合する結合因子とを接触させる工程；
（ｃ）該結合因子に結合するポリペプチドの量をサンプル中で検出する工程；および
（ｄ）予想されるカットオフ値とポリペプチドの量を比較し、それによって患者における癌の存在を決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項１４】
請求項９に記載の少なくとも１つのポリペプチドを含む、融合タンパク質。
【請求項１５】
前記融合タンパク質が、配列番号３５２、３５４、４２３、４２７、４３０および４３３で提供される配列からなる群から選択される、請求項１４に記載の融合タンパク質。
【請求項１６】
高度にストリンジェントな条件下において配列番号３５１、３５３、３５８、３６２、３６４、３６６、３６８、３７０〜３７５、４２０、４２４、４２８、４３１、４３４、４４２、４４７、４５０および４６７で示される配列にハイブリダイズする、オリゴヌクレオチド。
【請求項１７】
腫瘍タンパク質に特異的なＴ細胞を刺激し、そして／または増殖する方法であって、該方法は、Ｔ細胞の刺激および／または増殖を可能にするのに十分な条件および時間において、以下：
（ａ）請求項９に記載のポリペプチド；
（ｂ）請求項８に記載のポリヌクレオチド；および
（ｃ）請求項８に記載のポリヌクレオチドを発現する抗原提示細胞
からなる群から選択される、少なくとも１つの成分とＴ細胞とを接触させる工程を包含する、方法。
【請求項１８】
請求項１７に記載の方法に従って調製されるＴ細胞を含む、単離されたＴ細胞集団。
【請求項１９】
生理学的に受容可能なキャリアおよび免疫賦活薬からなる群から選択される第１の成分および以下：
（ａ）請求項９に記載のポリペプチド；
（ｂ）請求項８に記載のポリヌクレオチド；
（ｃ）請求項１２に記載の抗体；
（ｄ）請求項１４に記載の融合タンパク質；
（ｅ）請求項１８に記載のＴ細胞集団；および
（ｆ）請求項９に記載のポリペプチドを発現する抗原提示細胞
からなる群から選択される第２の要素を含む、組成物。
【請求項２０】
請求項１９に記載の組成物を患者に投与する工程を包含する、患者において免疫応答を刺激する、方法。
【請求項２１】
請求項１９に記載の組成物を患者に投与する工程を包含する、患者において肺癌を処置する方法。
【請求項２２】
患者における癌の存在を決定する方法であって、以下の工程：
（ａ）該患者から生物学的サンプルを得る工程；
（ｂ）該生物学的サンプルと請求項９に記載のオリゴヌクレオチドとを接触させる工程；
（ｃ）オリゴヌクレオチドにハイブリダイズするポリヌクレオチドの量を、該サンプル中で検出する工程；および
（ｄ）オリゴヌクレオチドにハイブリダイズするポリヌクレオチドの量を、予想されるカットオフ値と比較し、それによって患者における癌の存在を検出する工程、
を包含する、方法。
【請求項２３】
請求項１６に記載の少なくとも１つのオリゴヌクレオチドを含む、診断キット。
【請求項２４】
請求項１２に記載の少なくとも１つの抗体および検出試薬を含む診断キットであって、該検出試薬は、レセプター群を含む、キット。
【請求項２５】
患者において肺癌を処置する方法であって、該方法は以下の工程：
（ａ）以下：（ｉ）請求項９に記載のポリペプチド；（ｉｉ）請求項８に記載のポリヌクレオチド；および（ｉｉｉ）Ｔ細胞が増殖するような、請求項９に記載のポリペプチドを発現する抗原提示細胞、からなる群から選択される少なくとも１つの成分とともに患者から単離されるＣＤ４＋Ｔ細胞および／またはＣＤ８＋Ｔ細胞をインキュベートする工程；
（ｂ）有効量の増殖されたＴ細胞を患者に投与し、それによって患者における癌の発達を阻害する工程、
を包含する、方法。

【公開番号】特開２００８−１７８４１３（Ｐ２００８−１７８４１３Ａ）
【公開日】平成２０年８月７日（２００８．８．７）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００８−２７４８１（Ｐ２００８−２７４８１）
【出願日】平成２０年２月７日（２００８．２．７）
【分割の表示】特願２００２−５４９１１６（Ｐ２００２−５４９１１６）の分割
【原出願日】平成１３年１１月３０日（２００１．１１．３０）
【出願人】（３９７０６９３２９）コリクサ　コーポレイション (38)
【Ｆターム（参考）】