ＴＳ１０Ｑ２３．３と称する腫瘍抑制因子
【課題】ＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子に関連する癌の診断および治療方法の提供。
【解決手段】該腫瘍抑制因子をコードする特定のアミノ酸配列を有する、単離ポリペプチド。腫瘍抑制因子に免疫学的に結合するモノクローナル抗体。該モノクローナル抗体を産生するハイブリドーマ細胞。腫瘍抑制因子またはそのアレル変異体または突然変異体をコードする領域を含む単離核酸またはその相補体。腫瘍抑制因子の発現を測定する工程を含む、癌の診断方法。腫瘍細胞による該腫瘍抑制因子の取り込みが可能となる条件下で接触させる工程を含む、癌の治療方法。
【解決手段】該腫瘍抑制因子をコードする特定のアミノ酸配列を有する、単離ポリペプチド。腫瘍抑制因子に免疫学的に結合するモノクローナル抗体。該モノクローナル抗体を産生するハイブリドーマ細胞。腫瘍抑制因子またはそのアレル変異体または突然変異体をコードする領域を含む単離核酸またはその相補体。腫瘍抑制因子の発現を測定する工程を含む、癌の診断方法。腫瘍細胞による該腫瘍抑制因子の取り込みが可能となる条件下で接触させる工程を含む、癌の治療方法。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子をコードする単離ポリペプチド。
【請求項２】
該腫瘍抑制因子が図７に示すアミノ酸配列を有する、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項３】
該腫瘍抑制因子が図９に示すアミノ酸配列を有する、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項４】
ＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子の約１０〜約５０の連続残基を有する単離ペプチド。
【請求項５】
担体分子にコンジュゲートした、請求項４に記載のペプチド。
【請求項６】
該担体分子がＫＬＨおよびＢＳＡよりなる群から選ばれる、請求項５に記載のペプチド。
【請求項７】
該腫瘍抑制因子が図７に示すアミノ酸配列を有する、請求項４に記載のペプチド。
【請求項８】
該腫瘍抑制因子が図９に示すアミノ酸配列を有する、請求項４に記載のペプチド。
【請求項９】
ＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子に免疫学的に結合するモノクローナル抗体。
【請求項１０】
他のヒトポリペプチドには免疫学的に結合しない、請求項９に記載のモノクローナル抗体。
【請求項１１】
非ヒトＴＳ１０ｑ２３.３には結合するがヒトＴＳ１０ｑ２３.３には結合しない、請求項９に記載のモノクローナル抗体。
【請求項１２】
検出可能な標識をさらに含む、請求項９に記載のモノクローナル抗体。
【請求項１３】
該標識が、蛍光標識、化学発光標識、放射性標識および酵素よりなる群から選ばれる、請求項１２に記載のモノクローナル抗体。
【請求項１４】
ＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子に免疫学的に結合するモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマ細胞。
【請求項１５】
該抗体が他のヒトポリペプチドには免疫学的に結合しない、請求項１４に記載のハイブリドーマ細胞。
【請求項１６】
該抗体が非ヒトＴＳ１０ｑ２３.３には結合するがヒトＴＳ１０ｑ２３.３には結合しない、請求項１４に記載のハイブリドーマ細胞。
【請求項１７】
その抗体がＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子に免疫学的に結合する、ポリクローナル抗血清。
【請求項１８】
ヒト、マウスまたはイヌ以外の動物由来のものである、請求項１７に記載の抗血清。
【請求項１９】
ＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子またはそのアレル変異体または突然変異体をコードする領域を含む単離核酸またはその相補体。
【請求項２０】
該腫瘍抑制因子コード領域が、マウス、イヌおよびヒトよりなる群から選ばれる、請求項１９に記載の核酸。
【請求項２１】
該腫瘍抑制因子コード領域がヒトからのものである、請求項２０に記載の核酸。
【請求項２２】
該突然変異体が、欠失突然変異体、挿入突然変異体、フレームシフト突然変異体、ナンセンス突然変異体、ミスセンス突然変異体またはスプライス突然変異体である、請求項１９に記載の核酸。
【請求項２３】
該腫瘍抑制因子が図９に示すアミノ酸配列を有する、請求項２２に記載の核酸。
【請求項２４】
該腫瘍抑制因子が図９に示すアミノ酸配列を有する、請求項２２に記載の核酸。
【請求項２５】
該腫瘍抑制因子が図９に示すアミノ酸配列を有する、請求項２３に記載の核酸。
【請求項２６】
図９に示すコード配列またはその相補体を含む、請求項２４に記載の核酸。
【請求項２７】
図９に示すコード配列またはその相補体を含む、請求項２５に記載の核酸。
【請求項２８】
ゲノムＤＮＡ、相補的ＤＮＡおよびＲＮＡよりなる群から選ばれる、請求項２１に記載の核酸。
【請求項２９】
相補的ＤＮＡであり、該腫瘍抑制因子をコードする該領域またはその相補体に作動可能に連結したプロモーターをさらに含む、請求項２８に記載の核酸。
【請求項３０】
該腫瘍抑制因子をコードする該領域に作動可能に連結したポリアデニル化シグナルをさらに含む、請求項２９に記載の核酸。
【請求項３１】
複製起点をさらに含む、請求項３０に記載の核酸。
【請求項３２】
レトロウイルス、アデノウイルス、ヘルペスウイルス、ワクシニアウイルスおよびアデノ関連ウイルスよりなる群から選ばれたウイルスベクターである、請求項３１に記載の核酸。
【請求項３３】
ウイルス粒子中にパッケージングされている、請求項３２に記載の核酸。
【請求項３４】
リポソーム中にパッケージングされている、請求項３１に記載の核酸。
【請求項３５】
サイズが、約１２１２塩基、約１５００塩基、約２０００塩基、約３５００塩基、約５０００塩基、約１０,０００塩基、約１５,０００塩基、約２０,０００塩基、約２５,０００塩基、約３０,０００塩基、約３５,０００塩基、約４０,０００塩基、約４５,０００塩基、約５０,０００塩基、約７５,０００塩基および約１００,０００塩基よりなる群から選ばれる、請求項２１に記載の核酸。
【請求項３６】
ＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子をコードする核酸またはその相補体の約１０〜約５０の連続塩基からなる単離オリゴヌクレオチド。
【請求項３７】
該腫瘍抑制因子がマウスのものである、請求項３６に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項３８】
該腫瘍抑制因子がヒトのものである、請求項３６に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項３９】
該核酸が図９のコード領域である、請求項３７に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項４０】
該核酸が図９のコード領域である、請求項３８に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項４１】
長さが約１５塩基である、請求項３６に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項４２】
長さが約１７塩基である、請求項３６に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項４３】
長さが約２０塩基である、請求項３６に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項４４】
長さが約２５塩基である、請求項３６に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項４５】
長さが約５０塩基である、請求項３６に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項４６】
(i)患者から試料を採取し、ついで
(ii)該試料の細胞中での機能性のＴＳ１０ｑ２３.３腫瘍抑制因子の発現を測定する
工程を含む、癌の診断方法。
【請求項４７】
該癌が、脳癌、肺癌、肝臓癌、脾臓癌、腎臓癌、リンパ節癌、小腸癌、膵臓癌、血球癌、結腸癌、胃癌、乳癌、子宮内膜癌、前立腺癌、精巣癌、卵巣癌、皮膚癌、頭頚癌、食道癌、骨髄癌および血液癌よりなる群から選ばれる、請求項４６に記載の方法。
【請求項４８】
該癌が前立腺癌または乳癌である、請求項４７に記載の方法。
【請求項４９】
該癌が脳癌である、請求項４７に記載の方法。
【請求項５０】
該脳癌が神経膠腫である、請求項４９に記載の方法。
【請求項５１】
該試料が組織試料または流体試料である、請求項４６に記載の方法。
【請求項５２】
該測定が、該試料からの核酸をアッセイすることを含む、請求項４６に記載の方法。
【請求項５３】
該試料を、該核酸を増幅するのに適した条件に供することをさらに含む、請求項５２に記載の方法。
【請求項５４】
該測定が、該試料をＴＳ１０ｑ２３.３に免疫学的に結合する抗体と接触させることをさらに含む、請求項４６に記載の方法。
【請求項５５】
該試料のタンパク質をＥＬＩＳＡに供することをさらに含む、請求項５４に記載の方法。
【請求項５６】
ＴＳ１０ｑ２３.３の発現を非癌試料中でのＴＳ１０ｑ２３.３の発現と比較する工程をさらに含む、請求項４６に記載の方法。
【請求項５７】
該比較が、ＴＳ１０ｑ２３.３の発現レベルを評価することを含む、請求項５６に記載の方法。
【請求項５８】
該比較が、ＴＳ１０ｑ２３.３遺伝子、タンパク質または転写物の構造を評価することを含む、請求項５６に記載の方法。
【請求項５９】
該評価が、シークエンシング、野性型オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーション、変異体オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーション、ＳＳＣＰ、ＰＣＲおよびＲＮアーゼ検出よりなる群から選ばれる、請求項５８に記載の方法。
【請求項６０】
該評価が野性型または変異体オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションであり、該オリゴヌクレオチドがチップまたはウエハー上のアレイとして配置される、請求項５９に記載の方法。
【請求項６１】
．腫瘍細胞をＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子と、該腫瘍細胞による該腫瘍抑制因子の取り込みが可能となる条件下で接触させる工程を含む、腫瘍細胞の表現型を変化させる方法。
【請求項６２】
該腫瘍細胞が、脳組織、肺組織、肝臓組織、脾臓組織、腎臓組織、リンパ節組織、小腸組織、血球組織、膵臓組織、結腸組織、胃組織、乳房組織、子宮内膜組織、前立腺組織、精巣組織、卵巣組織、皮膚組織、頭頚組織、食道組織、骨髄組織および血液組織よりなる群から選ばれた組織からのものである、請求項６１に記載の方法。
【請求項６３】
表現型が、増殖、移転、接触阻害、ソフトアガー増殖および細胞周期よりなる群から選ばれる、請求項６１に記載の方法。
【請求項６４】
該腫瘍抑制因子がリポソーム中に内包されている、請求項６１に記載の方法。
【請求項６５】
腫瘍細胞を、(i)ＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子をコードする核酸、および(ii)該腫瘍抑制因子をコードする領域に作動可能に連結された、該腫瘍細胞中で活性なプロモーターと、該腫瘍細胞による該核酸の取り込みが可能となる条件下で接触させる工程を含む、腫瘍細胞の表現型を変化させる方法。
【請求項６６】
該腫瘍細胞が、脳組織、肺組織、肝臓組織、脾臓組織、腎臓組織、リンパ節組織、小腸組織、血球組織、膵臓組織、結腸組織、胃組織、乳房組織、子宮内膜組織、前立腺組織、精巣組織、卵巣組織、皮膚組織、頭頚組織、食道組織、骨髄組織および血液組織よりなる群から選ばれた組織からのものである、請求項６４に記載の方法。
【請求項６７】
表現型が、増殖、移転、接触阻害、ソフトアガー増殖および細胞周期よりなる群から選ばれる、請求項６５に記載の方法。
【請求項６８】
該核酸がリポソーム中に内包されている、請求項６５に記載の方法。
【請求項６９】
該核酸が、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ関連ウイルス、ワクシニアウイルスおよびヘルペスウイルスよりなる群から選ばれたウイルスベクターである、請求項６５に記載の方法。
【請求項７０】
該核酸がウイルス粒子中に内包されている、請求項６９に記載の方法。
【請求項７１】
患者内の腫瘍細胞をＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子と、該腫瘍細胞による該腫瘍抑制因子の取り込みが可能となる条件下で接触させる工程を含む、癌の治療方法。
【請求項７２】
該腫瘍細胞が、脳組織、肺組織、肝臓組織、脾臓組織、腎臓組織、リンパ節組織、小腸組織、血球組織、膵臓組織、結腸組織、胃組織、乳房組織、子宮内膜組織、前立腺組織、精巣組織、卵巣組織、皮膚組織、頭頚組織、食道組織、骨髄組織および血液組織よりなる群から選ばれた組織からのものである、請求項７１に記載の方法。
【請求項７３】
該患者がヒトである、請求項７１に記載の方法。
【請求項７４】
患者内の腫瘍細胞を、(i)ＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子をコードする核酸、および(ii)該腫瘍抑制因子をコードする領域に作動可能に連結された、該腫瘍細胞中で活性なプロモーターと、該腫瘍細胞による該核酸の取り込みが可能となる条件下で接触させる工程を含む、癌の治療方法。
【請求項７５】
該腫瘍細胞が、脳組織、肺組織、肝臓組織、脾臓組織、腎臓組織、リンパ節組織、小腸組織、血球組織、膵臓組織、結腸組織、胃組織、乳房組織、子宮内膜組織、前立腺組織、精巣組織、卵巣組織、皮膚組織、頭頚組織、食道組織、骨髄組織および血液組織よりなる群から選ばれた組織からのものである、請求項７４に記載の方法。
【請求項７６】
該患者がヒトである、請求項７４に記載の方法。
【請求項７７】
ＴＳ１０ｑ２３.３をコードする遺伝子の両コピーが他の遺伝子で中断または置換されているトランスジェニック哺乳動物。
【請求項７８】
(i)患者から試料を採取し、ついで
(ii)該試料の細胞中での機能性のＴＳ１０ｑ２３.３腫瘍抑制因子の発現を測定する
工程を含む、癌のステージの決定方法。
【請求項７９】
該癌が脳癌であり、該ステージが低度と神経膠腫との間で識別される、請求項７８に記載の方法。
【請求項８０】
該測定が、該試料中のＴＳ１０ｑ２３.３核酸またはポリペプチドをアッセイすることを含む、請求項７８に記載の方法。
【請求項８１】
(i)患者から試料を採取し、ついで
(ii)該試料の細胞中での機能性のＴＳ１０ｑ２３.３腫瘍抑制因子の発現を測定する
工程を含む、腫瘍の転移の予測方法。
【請求項８２】
該癌が転移性および非転移性として識別される、請求項８１に記載の方法。
【請求項８３】
該測定が、該試料中のＴＳ１０ｑ２３.３核酸またはポリペプチドをアッセイすることを含む、請求項８１に記載の方法。
【請求項８４】
抗腫瘍活性の候補物質のスクリーニング方法であって、
(i) 機能性のＴＳ１０ｑ２３.３ポリペプチドを欠く細胞を用意し、
(ii)該細胞を該候補物質と接触させ、ついで
(iii)該細胞に対する該候補物質の作用を決定する
工程を含む方法。
【請求項８５】
該細胞が腫瘍細胞である、請求項８４に記載の方法。
【請求項８６】
該腫瘍細胞がＴＳ１０ｑ２３.３のコード領域中に変異を有する、請求項８５に記載の方法。
【請求項８７】
該変異が、欠失突然変異体、挿入突然変異体、フレームシフト突然変異体、ナンセンス突然変異体、ミスセンス突然変異体またはスプライス突然変異体である、請求項８６に記載の方法。
【請求項８８】
該決定が、該候補物質の存在下での該細胞の１またはそれ以上の特性を該候補物質の不在下での該細胞の特性と比較することを含む、請求項８４に記載の方法。
【請求項８９】
該特性が、ＴＳ１０ｑ２３.３発現、ホスファターゼ活性、増殖、転移、接触阻害、ソフトアガー増殖、細胞周期制御、腫瘍形成、腫瘍進行および組織浸潤よりなる群から選ばれる、請求項８８に記載の方法。
【請求項９０】
該候補物質が化学療法剤または放射線療法剤である、請求項８４に記載の方法。
【請求項９１】
該候補物質が小分子ライブラリーから選ばれる、請求項８４に記載の方法。
【請求項９２】
該細胞をインビトロで接触させる、請求項８４に記載の方法。
【請求項９３】
該細胞をインビボで接触させる、請求項８４に記載の方法。
【請求項９４】
抗キナーゼ活性の候補物質のスクリーニング方法であって、
(i) 少なくとも１のチロシンキナーゼ部位を含むＴＳ１０ｑ２３.３ポリペプチドを有する細胞を用意し、
(ii)該細胞を該候補物質と接触させ、ついで
(iii)該部位のリン酸化に対する該候補物質の作用を決定する
工程を含む方法。
【請求項９５】
該決定が、該候補物質の存在下での該細胞の１またはそれ以上の特性を該候補物質の不在下での該細胞の特性と比較することを含む、請求項９４に記載の方法。
【請求項９６】
該特性が、ＴＳ１０ｑ２３.３のリン酸化状態、ＴＳ１０ｑ２３.３発現、ホスファターゼ活性、増殖、転移、接触阻害、ソフトアガー増殖、細胞周期制御、腫瘍形成、腫瘍進行および組織浸潤よりなる群から選ばれる、請求項９５に記載の方法。
【請求項９７】
該候補物質が化学療法剤または放射線療法剤である、請求項９４に記載の方法。
【請求項９８】
該候補物質が小分子ライブラリーから選ばれる、請求項９４に記載の方法。
【請求項９９】
該細胞をインビトロで接触させる、請求項９４に記載の方法。
【請求項１００】
該細胞をインビボで接触させる、請求項９４に記載の方法。
【請求項１０１】
該突然変異体がスプライス突然変異体である、請求項２２に記載の核酸。
【請求項１０２】
該スプライス突然変異体がエクソンＣ中に突然変異を有する、請求項１０１に記載の核酸。
【請求項１０３】
該スプライス突然変異の結果、エクソンＣのスプライスジャンクションの位置＋１でＧからＴに変化する、請求項１０２に記載の核酸。
【請求項１０４】
該スプライス突然変異体がエクソンＨ中に突然変異を有する、請求項１０１に記載の核酸。
【請求項１０５】
該スプライス突然変異の結果、エクソンＨのスプライスジャンクションの位置＋１でＧからＴに変化する、請求項１０４に記載の核酸。
【請求項１０６】
該突然変異体が挿入突然変異体である、請求項２２に記載の核酸。
【請求項１０７】
該挿入突然変異がエクソンＨ中に存在する、請求項１０６に記載の核酸。
【請求項１０８】
該挿入突然変異がエクソンＧの位置９８でのＴＴの２塩基対付加である、請求項１０７に記載の核酸。
【請求項１０９】
該突然変異体がフレームシフト突然変異体である、請求項２２に記載の核酸。
【請求項１１０】
該フレームシフト突然変異がエクソンＧ中に存在する、請求項１０９に記載の核酸。
【請求項１１１】
該突然変異体がミスセンス突然変異体である、請求項２２に記載の核酸。
【請求項１１２】
該ミスセンス突然変異がエクソンＢ中に存在する、請求項１１１に記載の核酸。
【請求項１１３】
該突然変異の結果、エクソンＢの位置４６でＴからＧに変化する、請求項１１２に記載の核酸。
【請求項１１４】
該突然変異の結果、腫瘍抑制因子中でＬＥＵからＡＲＧに変化する、請求項１１３に記載の核酸。
【請求項１１５】
該突然変異の結果、エクソンＢの位置２８でＧからＡに変化する、請求項１１２に記載の核酸。
【請求項１１６】
該突然変異の結果、腫瘍抑制因子中でＧＬＹからＧＬＵに変化する、請求項１１５に記載の核酸。
【請求項１１７】
該突然変異体がナンセンス突然変異体である、請求項２２に記載の核酸。
【請求項１１８】
該ナンセンス突然変異がエクソンＨ中に存在する、請求項１１７に記載の核酸。
【請求項１１９】
該突然変異の結果、エクソンＨの位置２０２でＣからＴに変化する、請求項１１７に記載の核酸。
【請求項１２０】
該突然変異が神経膠腫細胞中で生じたものである、請求項２２に記載の核酸。
【請求項１２１】
該突然変異が前立腺細胞中で生じたものである、請求項２２に記載の核酸。
【請求項１２２】
該突然変異が乳房細胞中で生じたものである、請求項２２に記載の核酸。
【請求項１２３】
該突然変異がエクソンＡ中の欠失である、請求項１２１に記載の核酸。
【請求項１２４】
該突然変異がエクソンＡの位置１６および１７でのＡＡの欠失である、請求項１２３に記載の核酸。
【請求項１２５】
該突然変異がエクソンＢ中の位置５３でのＣからＴへの変化である、請求項１２１に記載の核酸。
【請求項１】
ＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子をコードする単離ポリペプチド。
【請求項２】
該腫瘍抑制因子が図７に示すアミノ酸配列を有する、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項３】
該腫瘍抑制因子が図９に示すアミノ酸配列を有する、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項４】
ＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子の約１０〜約５０の連続残基を有する単離ペプチド。
【請求項５】
担体分子にコンジュゲートした、請求項４に記載のペプチド。
【請求項６】
該担体分子がＫＬＨおよびＢＳＡよりなる群から選ばれる、請求項５に記載のペプチド。
【請求項７】
該腫瘍抑制因子が図７に示すアミノ酸配列を有する、請求項４に記載のペプチド。
【請求項８】
該腫瘍抑制因子が図９に示すアミノ酸配列を有する、請求項４に記載のペプチド。
【請求項９】
ＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子に免疫学的に結合するモノクローナル抗体。
【請求項１０】
他のヒトポリペプチドには免疫学的に結合しない、請求項９に記載のモノクローナル抗体。
【請求項１１】
非ヒトＴＳ１０ｑ２３.３には結合するがヒトＴＳ１０ｑ２３.３には結合しない、請求項９に記載のモノクローナル抗体。
【請求項１２】
検出可能な標識をさらに含む、請求項９に記載のモノクローナル抗体。
【請求項１３】
該標識が、蛍光標識、化学発光標識、放射性標識および酵素よりなる群から選ばれる、請求項１２に記載のモノクローナル抗体。
【請求項１４】
ＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子に免疫学的に結合するモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマ細胞。
【請求項１５】
該抗体が他のヒトポリペプチドには免疫学的に結合しない、請求項１４に記載のハイブリドーマ細胞。
【請求項１６】
該抗体が非ヒトＴＳ１０ｑ２３.３には結合するがヒトＴＳ１０ｑ２３.３には結合しない、請求項１４に記載のハイブリドーマ細胞。
【請求項１７】
その抗体がＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子に免疫学的に結合する、ポリクローナル抗血清。
【請求項１８】
ヒト、マウスまたはイヌ以外の動物由来のものである、請求項１７に記載の抗血清。
【請求項１９】
ＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子またはそのアレル変異体または突然変異体をコードする領域を含む単離核酸またはその相補体。
【請求項２０】
該腫瘍抑制因子コード領域が、マウス、イヌおよびヒトよりなる群から選ばれる、請求項１９に記載の核酸。
【請求項２１】
該腫瘍抑制因子コード領域がヒトからのものである、請求項２０に記載の核酸。
【請求項２２】
該突然変異体が、欠失突然変異体、挿入突然変異体、フレームシフト突然変異体、ナンセンス突然変異体、ミスセンス突然変異体またはスプライス突然変異体である、請求項１９に記載の核酸。
【請求項２３】
該腫瘍抑制因子が図９に示すアミノ酸配列を有する、請求項２２に記載の核酸。
【請求項２４】
該腫瘍抑制因子が図９に示すアミノ酸配列を有する、請求項２２に記載の核酸。
【請求項２５】
該腫瘍抑制因子が図９に示すアミノ酸配列を有する、請求項２３に記載の核酸。
【請求項２６】
図９に示すコード配列またはその相補体を含む、請求項２４に記載の核酸。
【請求項２７】
図９に示すコード配列またはその相補体を含む、請求項２５に記載の核酸。
【請求項２８】
ゲノムＤＮＡ、相補的ＤＮＡおよびＲＮＡよりなる群から選ばれる、請求項２１に記載の核酸。
【請求項２９】
相補的ＤＮＡであり、該腫瘍抑制因子をコードする該領域またはその相補体に作動可能に連結したプロモーターをさらに含む、請求項２８に記載の核酸。
【請求項３０】
該腫瘍抑制因子をコードする該領域に作動可能に連結したポリアデニル化シグナルをさらに含む、請求項２９に記載の核酸。
【請求項３１】
複製起点をさらに含む、請求項３０に記載の核酸。
【請求項３２】
レトロウイルス、アデノウイルス、ヘルペスウイルス、ワクシニアウイルスおよびアデノ関連ウイルスよりなる群から選ばれたウイルスベクターである、請求項３１に記載の核酸。
【請求項３３】
ウイルス粒子中にパッケージングされている、請求項３２に記載の核酸。
【請求項３４】
リポソーム中にパッケージングされている、請求項３１に記載の核酸。
【請求項３５】
サイズが、約１２１２塩基、約１５００塩基、約２０００塩基、約３５００塩基、約５０００塩基、約１０,０００塩基、約１５,０００塩基、約２０,０００塩基、約２５,０００塩基、約３０,０００塩基、約３５,０００塩基、約４０,０００塩基、約４５,０００塩基、約５０,０００塩基、約７５,０００塩基および約１００,０００塩基よりなる群から選ばれる、請求項２１に記載の核酸。
【請求項３６】
ＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子をコードする核酸またはその相補体の約１０〜約５０の連続塩基からなる単離オリゴヌクレオチド。
【請求項３７】
該腫瘍抑制因子がマウスのものである、請求項３６に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項３８】
該腫瘍抑制因子がヒトのものである、請求項３６に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項３９】
該核酸が図９のコード領域である、請求項３７に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項４０】
該核酸が図９のコード領域である、請求項３８に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項４１】
長さが約１５塩基である、請求項３６に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項４２】
長さが約１７塩基である、請求項３６に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項４３】
長さが約２０塩基である、請求項３６に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項４４】
長さが約２５塩基である、請求項３６に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項４５】
長さが約５０塩基である、請求項３６に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項４６】
(i)患者から試料を採取し、ついで
(ii)該試料の細胞中での機能性のＴＳ１０ｑ２３.３腫瘍抑制因子の発現を測定する
工程を含む、癌の診断方法。
【請求項４７】
該癌が、脳癌、肺癌、肝臓癌、脾臓癌、腎臓癌、リンパ節癌、小腸癌、膵臓癌、血球癌、結腸癌、胃癌、乳癌、子宮内膜癌、前立腺癌、精巣癌、卵巣癌、皮膚癌、頭頚癌、食道癌、骨髄癌および血液癌よりなる群から選ばれる、請求項４６に記載の方法。
【請求項４８】
該癌が前立腺癌または乳癌である、請求項４７に記載の方法。
【請求項４９】
該癌が脳癌である、請求項４７に記載の方法。
【請求項５０】
該脳癌が神経膠腫である、請求項４９に記載の方法。
【請求項５１】
該試料が組織試料または流体試料である、請求項４６に記載の方法。
【請求項５２】
該測定が、該試料からの核酸をアッセイすることを含む、請求項４６に記載の方法。
【請求項５３】
該試料を、該核酸を増幅するのに適した条件に供することをさらに含む、請求項５２に記載の方法。
【請求項５４】
該測定が、該試料をＴＳ１０ｑ２３.３に免疫学的に結合する抗体と接触させることをさらに含む、請求項４６に記載の方法。
【請求項５５】
該試料のタンパク質をＥＬＩＳＡに供することをさらに含む、請求項５４に記載の方法。
【請求項５６】
ＴＳ１０ｑ２３.３の発現を非癌試料中でのＴＳ１０ｑ２３.３の発現と比較する工程をさらに含む、請求項４６に記載の方法。
【請求項５７】
該比較が、ＴＳ１０ｑ２３.３の発現レベルを評価することを含む、請求項５６に記載の方法。
【請求項５８】
該比較が、ＴＳ１０ｑ２３.３遺伝子、タンパク質または転写物の構造を評価することを含む、請求項５６に記載の方法。
【請求項５９】
該評価が、シークエンシング、野性型オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーション、変異体オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーション、ＳＳＣＰ、ＰＣＲおよびＲＮアーゼ検出よりなる群から選ばれる、請求項５８に記載の方法。
【請求項６０】
該評価が野性型または変異体オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションであり、該オリゴヌクレオチドがチップまたはウエハー上のアレイとして配置される、請求項５９に記載の方法。
【請求項６１】
．腫瘍細胞をＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子と、該腫瘍細胞による該腫瘍抑制因子の取り込みが可能となる条件下で接触させる工程を含む、腫瘍細胞の表現型を変化させる方法。
【請求項６２】
該腫瘍細胞が、脳組織、肺組織、肝臓組織、脾臓組織、腎臓組織、リンパ節組織、小腸組織、血球組織、膵臓組織、結腸組織、胃組織、乳房組織、子宮内膜組織、前立腺組織、精巣組織、卵巣組織、皮膚組織、頭頚組織、食道組織、骨髄組織および血液組織よりなる群から選ばれた組織からのものである、請求項６１に記載の方法。
【請求項６３】
表現型が、増殖、移転、接触阻害、ソフトアガー増殖および細胞周期よりなる群から選ばれる、請求項６１に記載の方法。
【請求項６４】
該腫瘍抑制因子がリポソーム中に内包されている、請求項６１に記載の方法。
【請求項６５】
腫瘍細胞を、(i)ＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子をコードする核酸、および(ii)該腫瘍抑制因子をコードする領域に作動可能に連結された、該腫瘍細胞中で活性なプロモーターと、該腫瘍細胞による該核酸の取り込みが可能となる条件下で接触させる工程を含む、腫瘍細胞の表現型を変化させる方法。
【請求項６６】
該腫瘍細胞が、脳組織、肺組織、肝臓組織、脾臓組織、腎臓組織、リンパ節組織、小腸組織、血球組織、膵臓組織、結腸組織、胃組織、乳房組織、子宮内膜組織、前立腺組織、精巣組織、卵巣組織、皮膚組織、頭頚組織、食道組織、骨髄組織および血液組織よりなる群から選ばれた組織からのものである、請求項６４に記載の方法。
【請求項６７】
表現型が、増殖、移転、接触阻害、ソフトアガー増殖および細胞周期よりなる群から選ばれる、請求項６５に記載の方法。
【請求項６８】
該核酸がリポソーム中に内包されている、請求項６５に記載の方法。
【請求項６９】
該核酸が、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ関連ウイルス、ワクシニアウイルスおよびヘルペスウイルスよりなる群から選ばれたウイルスベクターである、請求項６５に記載の方法。
【請求項７０】
該核酸がウイルス粒子中に内包されている、請求項６９に記載の方法。
【請求項７１】
患者内の腫瘍細胞をＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子と、該腫瘍細胞による該腫瘍抑制因子の取り込みが可能となる条件下で接触させる工程を含む、癌の治療方法。
【請求項７２】
該腫瘍細胞が、脳組織、肺組織、肝臓組織、脾臓組織、腎臓組織、リンパ節組織、小腸組織、血球組織、膵臓組織、結腸組織、胃組織、乳房組織、子宮内膜組織、前立腺組織、精巣組織、卵巣組織、皮膚組織、頭頚組織、食道組織、骨髄組織および血液組織よりなる群から選ばれた組織からのものである、請求項７１に記載の方法。
【請求項７３】
該患者がヒトである、請求項７１に記載の方法。
【請求項７４】
患者内の腫瘍細胞を、(i)ＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子をコードする核酸、および(ii)該腫瘍抑制因子をコードする領域に作動可能に連結された、該腫瘍細胞中で活性なプロモーターと、該腫瘍細胞による該核酸の取り込みが可能となる条件下で接触させる工程を含む、癌の治療方法。
【請求項７５】
該腫瘍細胞が、脳組織、肺組織、肝臓組織、脾臓組織、腎臓組織、リンパ節組織、小腸組織、血球組織、膵臓組織、結腸組織、胃組織、乳房組織、子宮内膜組織、前立腺組織、精巣組織、卵巣組織、皮膚組織、頭頚組織、食道組織、骨髄組織および血液組織よりなる群から選ばれた組織からのものである、請求項７４に記載の方法。
【請求項７６】
該患者がヒトである、請求項７４に記載の方法。
【請求項７７】
ＴＳ１０ｑ２３.３をコードする遺伝子の両コピーが他の遺伝子で中断または置換されているトランスジェニック哺乳動物。
【請求項７８】
(i)患者から試料を採取し、ついで
(ii)該試料の細胞中での機能性のＴＳ１０ｑ２３.３腫瘍抑制因子の発現を測定する
工程を含む、癌のステージの決定方法。
【請求項７９】
該癌が脳癌であり、該ステージが低度と神経膠腫との間で識別される、請求項７８に記載の方法。
【請求項８０】
該測定が、該試料中のＴＳ１０ｑ２３.３核酸またはポリペプチドをアッセイすることを含む、請求項７８に記載の方法。
【請求項８１】
(i)患者から試料を採取し、ついで
(ii)該試料の細胞中での機能性のＴＳ１０ｑ２３.３腫瘍抑制因子の発現を測定する
工程を含む、腫瘍の転移の予測方法。
【請求項８２】
該癌が転移性および非転移性として識別される、請求項８１に記載の方法。
【請求項８３】
該測定が、該試料中のＴＳ１０ｑ２３.３核酸またはポリペプチドをアッセイすることを含む、請求項８１に記載の方法。
【請求項８４】
抗腫瘍活性の候補物質のスクリーニング方法であって、
(i) 機能性のＴＳ１０ｑ２３.３ポリペプチドを欠く細胞を用意し、
(ii)該細胞を該候補物質と接触させ、ついで
(iii)該細胞に対する該候補物質の作用を決定する
工程を含む方法。
【請求項８５】
該細胞が腫瘍細胞である、請求項８４に記載の方法。
【請求項８６】
該腫瘍細胞がＴＳ１０ｑ２３.３のコード領域中に変異を有する、請求項８５に記載の方法。
【請求項８７】
該変異が、欠失突然変異体、挿入突然変異体、フレームシフト突然変異体、ナンセンス突然変異体、ミスセンス突然変異体またはスプライス突然変異体である、請求項８６に記載の方法。
【請求項８８】
該決定が、該候補物質の存在下での該細胞の１またはそれ以上の特性を該候補物質の不在下での該細胞の特性と比較することを含む、請求項８４に記載の方法。
【請求項８９】
該特性が、ＴＳ１０ｑ２３.３発現、ホスファターゼ活性、増殖、転移、接触阻害、ソフトアガー増殖、細胞周期制御、腫瘍形成、腫瘍進行および組織浸潤よりなる群から選ばれる、請求項８８に記載の方法。
【請求項９０】
該候補物質が化学療法剤または放射線療法剤である、請求項８４に記載の方法。
【請求項９１】
該候補物質が小分子ライブラリーから選ばれる、請求項８４に記載の方法。
【請求項９２】
該細胞をインビトロで接触させる、請求項８４に記載の方法。
【請求項９３】
該細胞をインビボで接触させる、請求項８４に記載の方法。
【請求項９４】
抗キナーゼ活性の候補物質のスクリーニング方法であって、
(i) 少なくとも１のチロシンキナーゼ部位を含むＴＳ１０ｑ２３.３ポリペプチドを有する細胞を用意し、
(ii)該細胞を該候補物質と接触させ、ついで
(iii)該部位のリン酸化に対する該候補物質の作用を決定する
工程を含む方法。
【請求項９５】
該決定が、該候補物質の存在下での該細胞の１またはそれ以上の特性を該候補物質の不在下での該細胞の特性と比較することを含む、請求項９４に記載の方法。
【請求項９６】
該特性が、ＴＳ１０ｑ２３.３のリン酸化状態、ＴＳ１０ｑ２３.３発現、ホスファターゼ活性、増殖、転移、接触阻害、ソフトアガー増殖、細胞周期制御、腫瘍形成、腫瘍進行および組織浸潤よりなる群から選ばれる、請求項９５に記載の方法。
【請求項９７】
該候補物質が化学療法剤または放射線療法剤である、請求項９４に記載の方法。
【請求項９８】
該候補物質が小分子ライブラリーから選ばれる、請求項９４に記載の方法。
【請求項９９】
該細胞をインビトロで接触させる、請求項９４に記載の方法。
【請求項１００】
該細胞をインビボで接触させる、請求項９４に記載の方法。
【請求項１０１】
該突然変異体がスプライス突然変異体である、請求項２２に記載の核酸。
【請求項１０２】
該スプライス突然変異体がエクソンＣ中に突然変異を有する、請求項１０１に記載の核酸。
【請求項１０３】
該スプライス突然変異の結果、エクソンＣのスプライスジャンクションの位置＋１でＧからＴに変化する、請求項１０２に記載の核酸。
【請求項１０４】
該スプライス突然変異体がエクソンＨ中に突然変異を有する、請求項１０１に記載の核酸。
【請求項１０５】
該スプライス突然変異の結果、エクソンＨのスプライスジャンクションの位置＋１でＧからＴに変化する、請求項１０４に記載の核酸。
【請求項１０６】
該突然変異体が挿入突然変異体である、請求項２２に記載の核酸。
【請求項１０７】
該挿入突然変異がエクソンＨ中に存在する、請求項１０６に記載の核酸。
【請求項１０８】
該挿入突然変異がエクソンＧの位置９８でのＴＴの２塩基対付加である、請求項１０７に記載の核酸。
【請求項１０９】
該突然変異体がフレームシフト突然変異体である、請求項２２に記載の核酸。
【請求項１１０】
該フレームシフト突然変異がエクソンＧ中に存在する、請求項１０９に記載の核酸。
【請求項１１１】
該突然変異体がミスセンス突然変異体である、請求項２２に記載の核酸。
【請求項１１２】
該ミスセンス突然変異がエクソンＢ中に存在する、請求項１１１に記載の核酸。
【請求項１１３】
該突然変異の結果、エクソンＢの位置４６でＴからＧに変化する、請求項１１２に記載の核酸。
【請求項１１４】
該突然変異の結果、腫瘍抑制因子中でＬＥＵからＡＲＧに変化する、請求項１１３に記載の核酸。
【請求項１１５】
該突然変異の結果、エクソンＢの位置２８でＧからＡに変化する、請求項１１２に記載の核酸。
【請求項１１６】
該突然変異の結果、腫瘍抑制因子中でＧＬＹからＧＬＵに変化する、請求項１１５に記載の核酸。
【請求項１１７】
該突然変異体がナンセンス突然変異体である、請求項２２に記載の核酸。
【請求項１１８】
該ナンセンス突然変異がエクソンＨ中に存在する、請求項１１７に記載の核酸。
【請求項１１９】
該突然変異の結果、エクソンＨの位置２０２でＣからＴに変化する、請求項１１７に記載の核酸。
【請求項１２０】
該突然変異が神経膠腫細胞中で生じたものである、請求項２２に記載の核酸。
【請求項１２１】
該突然変異が前立腺細胞中で生じたものである、請求項２２に記載の核酸。
【請求項１２２】
該突然変異が乳房細胞中で生じたものである、請求項２２に記載の核酸。
【請求項１２３】
該突然変異がエクソンＡ中の欠失である、請求項１２１に記載の核酸。
【請求項１２４】
該突然変異がエクソンＡの位置１６および１７でのＡＡの欠失である、請求項１２３に記載の核酸。
【請求項１２５】
該突然変異がエクソンＢ中の位置５３でのＣからＴへの変化である、請求項１２１に記載の核酸。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９−１】
【図９−２】
【図９−３】
【図９−４】
【図９−５】
【図９−６】
【図９−７】
【図９−８】
【図９−９】
【図１０−１】
【図１０−２】
【図１０−３】
【図１０−４】
【図１０−５】
【図１１−１】
【図１１−２】
【図１２−１】
【図１２−２】
【図１２−３】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９−１】
【図９−２】
【図９−３】
【図９−４】
【図９−５】
【図９−６】
【図９−７】
【図９−８】
【図９−９】
【図１０−１】
【図１０−２】
【図１０−３】
【図１０−４】
【図１０−５】
【図１１−１】
【図１１−２】
【図１２−１】
【図１２−２】
【図１２−３】
【公開番号】特開２０１０−２５９４３８（Ｐ２０１０−２５９４３８Ａ）
【公開日】平成２２年１１月１８日（２０１０．１１．１８）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１０−１３９２３０（Ｐ２０１０−１３９２３０）
【出願日】平成２２年６月１８日（２０１０．６．１８）
【分割の表示】特願２００８−１８４１３９（Ｐ２００８−１８４１３９）の分割
【原出願日】平成１０年１月８日（１９９８．１．８）
【出願人】（５０００３９４６３）ボード・オブ・リージエンツ，ザ・ユニバーシテイ・オブ・テキサス・システム (115)
【出願人】（５０００８６５１５）ミリアド・ジェネティックス・インコーポレイテッド (7)
【Ｆターム（参考）】
【公開日】平成２２年１１月１８日（２０１０．１１．１８）
【国際特許分類】
【出願日】平成２２年６月１８日（２０１０．６．１８）
【分割の表示】特願２００８−１８４１３９（Ｐ２００８−１８４１３９）の分割
【原出願日】平成１０年１月８日（１９９８．１．８）
【出願人】（５０００３９４６３）ボード・オブ・リージエンツ，ザ・ユニバーシテイ・オブ・テキサス・システム (115)
【出願人】（５０００８６５１５）ミリアド・ジェネティックス・インコーポレイテッド (7)
【Ｆターム（参考）】
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