癌における新規な組成物および方法
本発明は、癌、特にリンパ腫の検出、診断、および治療で使用するための新規の配列に関する。本発明は、その発現が癌に関連する癌関連（ＣＡ）ポリヌクレオチド配列を提供する。本発明は、癌に対する新規の治療標的を提示する癌に関連するＣＡポリペプチドを提供する。本発明は、さらに、癌の診断用組成物および癌の検出方法を提供する。本発明は、ＣＡポリペプチドに特異的なモノクローナル抗体およびポリクローナル抗体を提供する。本発明はまた、診断ツールおよび治療組成物ならびに癌をスクリーニングし、防止し、治療する方法を提供する。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
細胞中の癌関連（ＣＡ）遺伝子の発現を阻害する方法であって、ＣＡ遺伝子を発現する細胞を、前記細胞中のＣＡ遺伝子の発現を阻害するのに十分な量で、表１〜４６に示す配列番号
【数１】
のポリヌクレオチド配列に対応する癌関連（ＣＡ）ｍＲＮＡとハイブリッド形成することができるヌクレオチド配列を含む核酸分子と接触させる工程を含む、方法。
【請求項２】
前記ＣＡ遺伝子の発現が、コントロールと比較して、少なくとも５０％阻害される、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記癌が、乳癌、リンパ腫、白血病、または癌腫である、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記癌が乳腺癌である、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記核酸分子が二本鎖ＲＮＡである、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記核酸分子がアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはｓｉＲＮＡである、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記二本鎖ＲＮＡが、トランスフェクション、エレクトロポレーション、および微量注入からなる群から選択される方法による前記細胞への短い干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）の導入によって得られる、請求項５に記載の方法。
【請求項８】
前記二本鎖ＲＮＡが、発現ベクターによる前記細胞への短い干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）の導入によって得られる、請求項５に記載の方法。
【請求項９】
抗癌活性をスクリーニングする方法であって、候補抗癌薬の存在下と非存在下とで、表１〜４６に示す配列番号
【数２】
の配列からなる群から選択される核酸配列によってコードされる癌関連（ＣＡ）遺伝子のサンプル中の発現を比較する工程を含み、前記候補抗癌薬の非存在下でのＣＡ遺伝子の発現と比較してＣＡ遺伝子の発現を阻害する候補抗癌薬を抗癌薬と同定する、方法。
【請求項１０】
前記サンプルが患者の組織サンプルである、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記ＣＡ遺伝子が、表１〜４６に示す配列番号
【数３】
の配列からなる群から選択される少なくとも１つの核酸配列を含む、請求項９に記載の抗癌活性をスクリーニングする方法。
【請求項１２】
前記薬物候補が転写物のインヒビターであり、さらに、前記核酸配列が、表１〜４６に示す配列番号
【数４】
からなる群から選択される、請求項１１に記載の抗癌活性をスクリーニングする方法。
【請求項１３】
癌の検出方法であって、候補抗癌薬の存在下と非存在下とで、表１〜４６に示す配列番号
【数５】
の配列からなる群から選択される核酸配列によってコードされる癌関連タンパク質（ＣＡＰ）レベルを比較する工程を含み、前記候補抗癌薬の非存在下でのＣＡＰ遺伝子レベルと比較してＣＡＰレベルを減少させる候補抗癌薬を抗癌薬と同定する、方法。
【請求項１４】
癌の検出方法であって、候補抗癌薬の存在下での癌関連タンパク質（ＣＡＰ）の１つまたは複数の活性と候補抗癌薬の非存在下でのＣＡＰ活性とを比較する工程を含み、前記ＣＡＰが、表１〜４６に示す配列番号
【数６】
からなる群から選択されるアミノ酸配列またはそのフラグメントを含み、前記候補抗癌薬の非存在下でのＣＡＰ活性と比較してＣＡＰ活性を調整する候補抗癌薬を抗癌薬と同定する、方法。
【請求項１５】
前記ＣＡＰ活性が、Ｇタンパク質共役受容体活性、ヌクレオチド結合活性、核酸結合活性、カルシウム結合タンパク質活性、アポトーシス、細胞周期調節活性、クロマチンタンパク質転写因子活性、輸送タンパク質活性、シグナル伝達活性、核受容体活性、成長因子活性、タンパク質キナーゼ活性、タンパク質ホスホリラーゼ活性、ペプチダーゼ活性、電子伝達活性、チオレドキシン活性、セマフォリン活性、シグナル伝達、および運動性からなる群から選択される、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
患者の癌を検出する方法であって、
（ａ）患者サンプル中の表１〜４６に示す配列番号
【数７】
からなる群から選択される抗原性ポリペプチドまたはその抗原性フラグメントに対する抗体レベルを検出する工程と、
（ｂ）前記患者サンプル中の抗体レベルとコントロールサンプル中の抗体レベルとを比較する工程とを含み、前記コントロールサンプル中の抗体レベルと比較した前記患者サンプル中の抗体レベルの変化が、前記患者における癌の存在の指標である
、方法。
【請求項１７】
ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）の生物活性を調整することができる生体活性薬をスクリーニングする方法であって、前記ＣＡＰは、表１〜４６に示す配列番号
【数８】
のポリヌクレオチド配列からなる群から選択される核酸配列を含む核酸によってコードされ、該方法は、候補生体活性薬の存在下でのＣＡＰの生物活性と候補生体活性薬の非存在下でのＣＡＰの生物活性とを比較する工程を含み、前記候補生体活性薬の非存在下でのＣＡＰの生物活性と比較してＣＡＰ生物活性を調整する候補活性剤を、ＣＡＰ生物活性を調整することができる生体活性薬と同定する
、方法。
【請求項１８】
前記生体活性薬が、ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）の発現を調整する、請求項１７に記載の生体活性薬をスクリーニングする方法。
【請求項１９】
前記生体活性薬が、ＣＡＰ発現を阻害する、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
前記生体活性薬が、有機低分子、抗体、またはペプチドである、請求項３６に記載の方法。
【請求項２１】
前記活性が、Ｇタンパク質共役受容体活性、ヌクレオチド結合活性、核酸結合活性、カルシウム結合タンパク質活性、アポトーシス、細胞周期調節活性、クロマチンタンパク質転写因子活性、輸送タンパク質活性、シグナル伝達活性、核受容体活性、成長因子活性、タンパク質キナーゼ活性、タンパク質ホスホリラーゼ活性、ペプチダーゼ活性、電子伝達活性、チオレドキシン活性、セマフォリン活性、シグナル伝達、および運動性からなる群から選択される、請求項１７に記載のスクリーニング方法。
【請求項２２】
癌の診断方法であって、
ａ）第１の個体の第１の組織型において、表１〜４６に記載の配列群から選択される核酸配列を含む１つまたは複数の遺伝子の発現を決定する工程と、
ｂ）前記第１の個体由来の第２の正常な組織型または第２の罹患していない個体由来の該遺伝子の発現を比較する工程を含み、
前記発現の相違が、前記第１の個体が癌であるか癌に罹患しやすいことを示す
、方法。
【請求項２３】
癌の治療方法であって、ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）のインヒビターを患者に投与する工程を含み、前記ＣＡＰが、表１〜４６に記載のヒト核酸配列からなる群から選択される核酸配列を含む核酸によってコードされる、方法。
【請求項２４】
前記癌が、リンパ腫、白血病、または癌腫である、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
前記癌が乳腺癌である、請求項２３に記載の方法。
【請求項２６】
前記ＣＡＰインヒビターがＣＡＰに結合する、請求項２３に記載の癌の治療方法。
【請求項２７】
サンプル中の癌の存在を診断するためのキットであって、前記キットが少なくとも２つのポリヌクレオチドを含み、それぞれの前記ポリヌクレオチドが、表１〜４６に示す配列番号
【数９】
のポリヌクレオチド配列からなる群から選択されるヌクレオチド配列またはその相補物を含むポリヌクレオチドと選択的にハイブリッド形成する、キット。
【請求項２８】
サンプル中の癌の存在を診断するためのキットであって、前記キットが少なくとも２つのポリヌクレオチドを含み、それぞれの前記ポリヌクレオチドが、表１〜４６に示す配列番号
【数１０】
のポリヌクレオチド配列からなる群から選択されるヌクレオチド配列、そのフラグメント、またはその相補物を含むポリヌクレオチドと選択的にハイブリッド形成する、キット。
【請求項２９】
表１〜４６に示す配列番号
【数１１】
のポリヌクレオチド配列またはその相補物からなる群から選択される少なくとも２つの配列の少なくとも１０個の連続したヌクレオチドをそれぞれが含む少なくとも２つの核酸プローブを含む癌関連（ＣＡ）核酸を検出するための核酸アレイ。
【請求項３０】
前記プローブが、少なくとも１５個の連続するヌクレオチドを含む、請求項２９に記載の核酸アレイ。
【請求項３１】
前記プローブが、少なくとも２０個の連続するヌクレオチドを含む、請求項２９に記載の核酸アレイ。
【請求項３２】
少なくとも２つの単離ポリペプチドを含むペプチドアレイであって、それぞれの前記単離ポリペプチドが、表１〜４６に示す配列番号
【数１２】
からなる群から選択されるＣＡ配列またはその相補物のオープンリーディングフレーム内でコードされる、ペプチドアレイ。
【請求項３３】
それぞれの前記ポリペプチドが、表１〜４６に示す配列番号
【数１３】
からなる群から選択されるポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列を含む、請求項３２に記載のペプチドアレイ。
【請求項３４】
それぞれの前記ポリペプチドが、表１〜４６に示す配列番号
【数１４】
からなる群から選択されるポリペプチドによってコードされるアミノ酸配列を含む、請求項３２に記載のペプチドアレイ。
【請求項３５】
それぞれの前記ポリペプチドが、表１〜４６に示す配列番号
【数１５】
からなる群から選択されるＣＡポリペプチドのアミノ酸配列のエピトープのアミノ酸配列を含む、請求項３２に記載のペプチドアレイ。
【請求項３６】
表１〜４６に示す配列番号
【数１６】
からなる群から選択される配列と少なくとも９５％相同なヌクレオチド配列を含む単離核酸分子。
【請求項３７】
前記ヌクレオチド配列が、表１〜４６に示す配列番号
【数１７】
からなる群から選択される配列と少なくとも９８％相同である、請求項３６に記載の単離核酸分子。
【請求項３８】
表１〜４６に示す配列番号
【数１８】
からなる群から選択される配列と少なくとも９５％相同なアミノ酸配列を含む単離ポリペプチド。
【請求項３９】
前記アミノ酸配列が、表１〜４６に示す配列番号
【数１９】
からなる群から選択される配列と少なくとも９８％相同である、請求項３８に記載の単離ポリペプチド。
【請求項４０】
請求項３８に記載のポリペプチドに結合する単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項４１】
前記抗体またはそのフラグメントが前記固体支持体に結合している、請求項４０に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項４２】
前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項４０に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項４３】
前記抗体がポリクローナル抗体である、請求項４０に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項４４】
前記抗体またはそのフラグメントが検出可能な標識をさらに含む、請求項４０に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項４５】
請求項４０に記載のポリペプチドに結合する化合物。
【請求項４６】
前記化合物が化学合成される、請求項４５に記載の化合物。
【請求項４７】
前記化合物が天然に存在する、請求項４５に記載の化合物。
【請求項４８】
個体における癌細胞の有無を検出する方法であって、前記個体由来のサンプルと請求項４０に記載の抗体とを接触させる工程と、前記サンプル由来の癌関連タンパク質（ＣＡＰ）と抗体との複合体を検出する工程と、前記複合体の検出が、前記個体における癌細胞の存在の指標である、方法。
【請求項４９】
前記抗体が検出可能に標識されている、請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】
（ａ）宿主動物を、前記ポリペプチドまたはその抗原結合フラグメントを含む組成物で免疫化する工程と、
（ｂ）抗原に対する抗体またはその抗原結合フラグメントを発現する前記宿主から細胞を回収する工程と
を含む方法によって調製される、請求項４０に記載のポリペプチドに結合する単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項５１】
前記モノクローナル抗体を、
（ａ）前記モノクローナル抗体を産生することができるハイブリドーマを準備する工程と、
（ｂ）前記ハイブリドーマによってモノクローナル抗体が産生される条件下で前記ハイブリドーマを培養する工程と含む過程によって調製される、請求項４３に記載のモノクローナル抗体。
【請求項５２】
請求項４３に記載のモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマ。
【請求項５３】
前記抗体がヒト化抗体である、請求項４０に記載の抗体。
【請求項５４】
請求項４０に記載の抗体を含む癌細胞を検出する方法。
【請求項５５】
前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項５４に記載のキット。
【請求項５６】
表１〜４６に示す配列番号
【数２０】
のポリヌクレオチド配列またはその相補物からなる群から選択される少なくとも２つのＣＡポリヌクレオチド配列またはそのフラグメントを含む電子ライブラリー。
【請求項５７】
配列番号
【数２１】
のポリヌクレオチド配列からなる群から選択される少なくとも２つのＣＡポリヌクレオチド配列またはそのフラグメントを含む電子ライブラリー。
【請求項５８】
表１〜４６に示す配列番号
【数２２】
のポリペプチド配列からなる群から選択される少なくとも２つのＣＡポリペプチド配列またはそのフラグメントを含む電子ライブラリー。
【請求項１】
細胞中の癌関連（ＣＡ）遺伝子の発現を阻害する方法であって、ＣＡ遺伝子を発現する細胞を、前記細胞中のＣＡ遺伝子の発現を阻害するのに十分な量で、表１〜４６に示す配列番号
【数１】
のポリヌクレオチド配列に対応する癌関連（ＣＡ）ｍＲＮＡとハイブリッド形成することができるヌクレオチド配列を含む核酸分子と接触させる工程を含む、方法。
【請求項２】
前記ＣＡ遺伝子の発現が、コントロールと比較して、少なくとも５０％阻害される、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記癌が、乳癌、リンパ腫、白血病、または癌腫である、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記癌が乳腺癌である、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記核酸分子が二本鎖ＲＮＡである、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記核酸分子がアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはｓｉＲＮＡである、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記二本鎖ＲＮＡが、トランスフェクション、エレクトロポレーション、および微量注入からなる群から選択される方法による前記細胞への短い干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）の導入によって得られる、請求項５に記載の方法。
【請求項８】
前記二本鎖ＲＮＡが、発現ベクターによる前記細胞への短い干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）の導入によって得られる、請求項５に記載の方法。
【請求項９】
抗癌活性をスクリーニングする方法であって、候補抗癌薬の存在下と非存在下とで、表１〜４６に示す配列番号
【数２】
の配列からなる群から選択される核酸配列によってコードされる癌関連（ＣＡ）遺伝子のサンプル中の発現を比較する工程を含み、前記候補抗癌薬の非存在下でのＣＡ遺伝子の発現と比較してＣＡ遺伝子の発現を阻害する候補抗癌薬を抗癌薬と同定する、方法。
【請求項１０】
前記サンプルが患者の組織サンプルである、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記ＣＡ遺伝子が、表１〜４６に示す配列番号
【数３】
の配列からなる群から選択される少なくとも１つの核酸配列を含む、請求項９に記載の抗癌活性をスクリーニングする方法。
【請求項１２】
前記薬物候補が転写物のインヒビターであり、さらに、前記核酸配列が、表１〜４６に示す配列番号
【数４】
からなる群から選択される、請求項１１に記載の抗癌活性をスクリーニングする方法。
【請求項１３】
癌の検出方法であって、候補抗癌薬の存在下と非存在下とで、表１〜４６に示す配列番号
【数５】
の配列からなる群から選択される核酸配列によってコードされる癌関連タンパク質（ＣＡＰ）レベルを比較する工程を含み、前記候補抗癌薬の非存在下でのＣＡＰ遺伝子レベルと比較してＣＡＰレベルを減少させる候補抗癌薬を抗癌薬と同定する、方法。
【請求項１４】
癌の検出方法であって、候補抗癌薬の存在下での癌関連タンパク質（ＣＡＰ）の１つまたは複数の活性と候補抗癌薬の非存在下でのＣＡＰ活性とを比較する工程を含み、前記ＣＡＰが、表１〜４６に示す配列番号
【数６】
からなる群から選択されるアミノ酸配列またはそのフラグメントを含み、前記候補抗癌薬の非存在下でのＣＡＰ活性と比較してＣＡＰ活性を調整する候補抗癌薬を抗癌薬と同定する、方法。
【請求項１５】
前記ＣＡＰ活性が、Ｇタンパク質共役受容体活性、ヌクレオチド結合活性、核酸結合活性、カルシウム結合タンパク質活性、アポトーシス、細胞周期調節活性、クロマチンタンパク質転写因子活性、輸送タンパク質活性、シグナル伝達活性、核受容体活性、成長因子活性、タンパク質キナーゼ活性、タンパク質ホスホリラーゼ活性、ペプチダーゼ活性、電子伝達活性、チオレドキシン活性、セマフォリン活性、シグナル伝達、および運動性からなる群から選択される、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
患者の癌を検出する方法であって、
（ａ）患者サンプル中の表１〜４６に示す配列番号
【数７】
からなる群から選択される抗原性ポリペプチドまたはその抗原性フラグメントに対する抗体レベルを検出する工程と、
（ｂ）前記患者サンプル中の抗体レベルとコントロールサンプル中の抗体レベルとを比較する工程とを含み、前記コントロールサンプル中の抗体レベルと比較した前記患者サンプル中の抗体レベルの変化が、前記患者における癌の存在の指標である
、方法。
【請求項１７】
ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）の生物活性を調整することができる生体活性薬をスクリーニングする方法であって、前記ＣＡＰは、表１〜４６に示す配列番号
【数８】
のポリヌクレオチド配列からなる群から選択される核酸配列を含む核酸によってコードされ、該方法は、候補生体活性薬の存在下でのＣＡＰの生物活性と候補生体活性薬の非存在下でのＣＡＰの生物活性とを比較する工程を含み、前記候補生体活性薬の非存在下でのＣＡＰの生物活性と比較してＣＡＰ生物活性を調整する候補活性剤を、ＣＡＰ生物活性を調整することができる生体活性薬と同定する
、方法。
【請求項１８】
前記生体活性薬が、ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）の発現を調整する、請求項１７に記載の生体活性薬をスクリーニングする方法。
【請求項１９】
前記生体活性薬が、ＣＡＰ発現を阻害する、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
前記生体活性薬が、有機低分子、抗体、またはペプチドである、請求項３６に記載の方法。
【請求項２１】
前記活性が、Ｇタンパク質共役受容体活性、ヌクレオチド結合活性、核酸結合活性、カルシウム結合タンパク質活性、アポトーシス、細胞周期調節活性、クロマチンタンパク質転写因子活性、輸送タンパク質活性、シグナル伝達活性、核受容体活性、成長因子活性、タンパク質キナーゼ活性、タンパク質ホスホリラーゼ活性、ペプチダーゼ活性、電子伝達活性、チオレドキシン活性、セマフォリン活性、シグナル伝達、および運動性からなる群から選択される、請求項１７に記載のスクリーニング方法。
【請求項２２】
癌の診断方法であって、
ａ）第１の個体の第１の組織型において、表１〜４６に記載の配列群から選択される核酸配列を含む１つまたは複数の遺伝子の発現を決定する工程と、
ｂ）前記第１の個体由来の第２の正常な組織型または第２の罹患していない個体由来の該遺伝子の発現を比較する工程を含み、
前記発現の相違が、前記第１の個体が癌であるか癌に罹患しやすいことを示す
、方法。
【請求項２３】
癌の治療方法であって、ＣＡタンパク質（ＣＡＰ）のインヒビターを患者に投与する工程を含み、前記ＣＡＰが、表１〜４６に記載のヒト核酸配列からなる群から選択される核酸配列を含む核酸によってコードされる、方法。
【請求項２４】
前記癌が、リンパ腫、白血病、または癌腫である、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
前記癌が乳腺癌である、請求項２３に記載の方法。
【請求項２６】
前記ＣＡＰインヒビターがＣＡＰに結合する、請求項２３に記載の癌の治療方法。
【請求項２７】
サンプル中の癌の存在を診断するためのキットであって、前記キットが少なくとも２つのポリヌクレオチドを含み、それぞれの前記ポリヌクレオチドが、表１〜４６に示す配列番号
【数９】
のポリヌクレオチド配列からなる群から選択されるヌクレオチド配列またはその相補物を含むポリヌクレオチドと選択的にハイブリッド形成する、キット。
【請求項２８】
サンプル中の癌の存在を診断するためのキットであって、前記キットが少なくとも２つのポリヌクレオチドを含み、それぞれの前記ポリヌクレオチドが、表１〜４６に示す配列番号
【数１０】
のポリヌクレオチド配列からなる群から選択されるヌクレオチド配列、そのフラグメント、またはその相補物を含むポリヌクレオチドと選択的にハイブリッド形成する、キット。
【請求項２９】
表１〜４６に示す配列番号
【数１１】
のポリヌクレオチド配列またはその相補物からなる群から選択される少なくとも２つの配列の少なくとも１０個の連続したヌクレオチドをそれぞれが含む少なくとも２つの核酸プローブを含む癌関連（ＣＡ）核酸を検出するための核酸アレイ。
【請求項３０】
前記プローブが、少なくとも１５個の連続するヌクレオチドを含む、請求項２９に記載の核酸アレイ。
【請求項３１】
前記プローブが、少なくとも２０個の連続するヌクレオチドを含む、請求項２９に記載の核酸アレイ。
【請求項３２】
少なくとも２つの単離ポリペプチドを含むペプチドアレイであって、それぞれの前記単離ポリペプチドが、表１〜４６に示す配列番号
【数１２】
からなる群から選択されるＣＡ配列またはその相補物のオープンリーディングフレーム内でコードされる、ペプチドアレイ。
【請求項３３】
それぞれの前記ポリペプチドが、表１〜４６に示す配列番号
【数１３】
からなる群から選択されるポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列を含む、請求項３２に記載のペプチドアレイ。
【請求項３４】
それぞれの前記ポリペプチドが、表１〜４６に示す配列番号
【数１４】
からなる群から選択されるポリペプチドによってコードされるアミノ酸配列を含む、請求項３２に記載のペプチドアレイ。
【請求項３５】
それぞれの前記ポリペプチドが、表１〜４６に示す配列番号
【数１５】
からなる群から選択されるＣＡポリペプチドのアミノ酸配列のエピトープのアミノ酸配列を含む、請求項３２に記載のペプチドアレイ。
【請求項３６】
表１〜４６に示す配列番号
【数１６】
からなる群から選択される配列と少なくとも９５％相同なヌクレオチド配列を含む単離核酸分子。
【請求項３７】
前記ヌクレオチド配列が、表１〜４６に示す配列番号
【数１７】
からなる群から選択される配列と少なくとも９８％相同である、請求項３６に記載の単離核酸分子。
【請求項３８】
表１〜４６に示す配列番号
【数１８】
からなる群から選択される配列と少なくとも９５％相同なアミノ酸配列を含む単離ポリペプチド。
【請求項３９】
前記アミノ酸配列が、表１〜４６に示す配列番号
【数１９】
からなる群から選択される配列と少なくとも９８％相同である、請求項３８に記載の単離ポリペプチド。
【請求項４０】
請求項３８に記載のポリペプチドに結合する単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項４１】
前記抗体またはそのフラグメントが前記固体支持体に結合している、請求項４０に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項４２】
前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項４０に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項４３】
前記抗体がポリクローナル抗体である、請求項４０に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項４４】
前記抗体またはそのフラグメントが検出可能な標識をさらに含む、請求項４０に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項４５】
請求項４０に記載のポリペプチドに結合する化合物。
【請求項４６】
前記化合物が化学合成される、請求項４５に記載の化合物。
【請求項４７】
前記化合物が天然に存在する、請求項４５に記載の化合物。
【請求項４８】
個体における癌細胞の有無を検出する方法であって、前記個体由来のサンプルと請求項４０に記載の抗体とを接触させる工程と、前記サンプル由来の癌関連タンパク質（ＣＡＰ）と抗体との複合体を検出する工程と、前記複合体の検出が、前記個体における癌細胞の存在の指標である、方法。
【請求項４９】
前記抗体が検出可能に標識されている、請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】
（ａ）宿主動物を、前記ポリペプチドまたはその抗原結合フラグメントを含む組成物で免疫化する工程と、
（ｂ）抗原に対する抗体またはその抗原結合フラグメントを発現する前記宿主から細胞を回収する工程と
を含む方法によって調製される、請求項４０に記載のポリペプチドに結合する単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項５１】
前記モノクローナル抗体を、
（ａ）前記モノクローナル抗体を産生することができるハイブリドーマを準備する工程と、
（ｂ）前記ハイブリドーマによってモノクローナル抗体が産生される条件下で前記ハイブリドーマを培養する工程と含む過程によって調製される、請求項４３に記載のモノクローナル抗体。
【請求項５２】
請求項４３に記載のモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマ。
【請求項５３】
前記抗体がヒト化抗体である、請求項４０に記載の抗体。
【請求項５４】
請求項４０に記載の抗体を含む癌細胞を検出する方法。
【請求項５５】
前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項５４に記載のキット。
【請求項５６】
表１〜４６に示す配列番号
【数２０】
のポリヌクレオチド配列またはその相補物からなる群から選択される少なくとも２つのＣＡポリヌクレオチド配列またはそのフラグメントを含む電子ライブラリー。
【請求項５７】
配列番号
【数２１】
のポリヌクレオチド配列からなる群から選択される少なくとも２つのＣＡポリヌクレオチド配列またはそのフラグメントを含む電子ライブラリー。
【請求項５８】
表１〜４６に示す配列番号
【数２２】
のポリペプチド配列からなる群から選択される少なくとも２つのＣＡポリペプチド配列またはそのフラグメントを含む電子ライブラリー。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図２】
【図３】
【図４】
【公表番号】特表２００９−５２４４０５（Ｐ２００９−５２４４０５Ａ）
【公表日】平成２１年７月２日（２００９．７．２）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００７−５１９４７９（Ｐ２００７−５１９４７９）
【出願日】平成１７年７月１日（２００５．７．１）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００５／０２３５１８
【国際公開番号】ＷＯ２００６／００７５５８
【国際公開日】平成１８年１月１９日（２００６．１．１９）
【出願人】（５０６３５３６３３）サグレシュ ディスカバリー， インコーポレイテッド (8)
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２１年７月２日（２００９．７．２）
【国際特許分類】
【出願日】平成１７年７月１日（２００５．７．１）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００５／０２３５１８
【国際公開番号】ＷＯ２００６／００７５５８
【国際公開日】平成１８年１月１９日（２００６．１．１９）
【出願人】（５０６３５３６３３）サグレシュ ディスカバリー， インコーポレイテッド (8)
【Ｆターム（参考）】
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